JP5594137B2 - カプシノイドを生合成する遺伝子改変植物 - Google Patents
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Description
本発明者らは、かかる仮説を立証すべく、辛味品種であるタカノツメにpAMTのアンチセンス核酸を導入したトランスジェニック植物を作製した。得られたトランスジェニック植物のうち、pAMT遺伝子の発現が顕著に低下した系統では、カプサイシノイドの産生が低下する一方、カプシノイドの産生が大きく増大していることを見出した。
本発明者らは、これらの知見に基づいてさらに研究を重ねた結果、本発明を完成するに至った。
[1]野生株と比べて、バニリンからバニリルアミンへのアミノ基転移反応を触媒する酵素の発現または活性が低下していることを特徴とする、カプシノイド類産生能を有する遺伝子改変植物;
[2]前記酵素がpAMT遺伝子産物である、上記[1]に記載の植物;
[3]前記酵素の発現または活性の低下が、該酵素遺伝子の破壊もしくは変異、該遺伝子転写産物の分解もしくは翻訳抑制、または該酵素のバニリンへの作用の阻害によるものである、上記[1]または[2]に記載の植物;
[4]野生株がカプサイシノイド生合成系を有する、上記[1]〜[3]のいずれかに記載の植物;
[5]野生株がトウガラシ属に属する植物である、上記[4]に記載の植物;
[6]カプサイシノイド生合成系を有する植物において、バニリンからバニリルアミンへのアミノ基転移反応を触媒する酵素の発現または活性を低下せしめる遺伝子改変を行うことを含む、カプシノイド類産生能を有する遺伝子改変植物の作出方法;
[7]遺伝子改変が、前記酵素遺伝子に対するアンチセンスRNA、iRNA、リボザイムもしくはドミナントネガティブ変異体をコードするDNAの導入、ノックアウト法もしくは変異原処理による該遺伝子の破壊、および該酵素に対する抗体をコードする遺伝子の導入からなる群より選択される、上記[6]に記載の方法;
[8]前記酵素がpAMT遺伝子産物である、上記[6]または[7]に記載の方法;
[9]カプサイシノイド生合成系を有する植物がトウガラシ属に属する、上記[6]〜[8]のいずれかに記載の方法;および
[10]上記[1]〜[5]のいずれかに記載の植物の果実からカプシノイド類を回収することを含む、カプシノイド類の製造方法。
酵素遺伝子をノックアウトする具体的な手段としては、遺伝子改変の対象となる植物(即ち、野生株)由来の該酵素遺伝子(ゲノムDNA)を常法に従って単離し(例えば、pAMT遺伝子の場合、配列番号1に示されるCH−19辛由来のpAMT cDNAの塩基配列の全部もしくは一部を含む核酸をプローブとして、野生株から単離したゲノムDNAより作製したゲノムDNAライブラリーから、コロニーもしくはプラークハイブリダイゼーション法によりpAMTゲノムDNAをクローン化することができる)、例えば、(1)そのエキソン部分やプロモーター領域に他のDNA断片(例えば、薬剤耐性遺伝子やレポーター遺伝子等の選択マーカー遺伝子)を挿入することによりエキソンもしくはプロモーターの機能を破壊するか、(2)Cre-loxP系やFlp-frt系を用いて酵素遺伝子の全部または一部を切り出して該遺伝子を欠失させるか、(3)蛋白質コード領域内へ終止コドンを挿入して完全な蛋白質の翻訳を不能にするか、あるいは(4)転写領域内部へ遺伝子の転写を終結させるDNA配列(例えば、ポリアデニル化シグナルなど)を挿入して、完全なmRNAの合成を不能にすることによって、結果的に遺伝子を不活性化するように構築したDNA配列を有するDNA鎖(ターゲッティングベクター)を、相同組換えにより野生株の酵素遺伝子座に組み込ませる方法などが好ましく用いられ得る。
選択マーカー遺伝子は、対象植物の細胞内で機能し得る任意のプロモーターを含む発現カセットの形態であることが好ましいが、該遺伝子が標的酵素遺伝子の内在性プロモーターの制御下におかれるように挿入される場合、選択マーカー遺伝子にはプロモーターを必要としない。
標的酵素のmRNAの塩基配列と実質的に相補的な塩基配列とは、対象植物体内の生理的条件下において、該mRNAの標的配列に結合してその翻訳を阻害し得る程度の相補性を有する塩基配列を意味し、具体的には、例えば、該mRNAの塩基配列と完全相補的な塩基配列(すなわち、mRNAの相補鎖の塩基配列)と、オーバーラップする領域に関して、約80%以上、好ましくは約90%以上、より好ましくは約95%以上、最も好ましくは約97%以上の類似性を有する塩基配列である。本発明における「塩基配列の類似性」は、相同性計算アルゴリズムNCBI BLAST(National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool)を用い、以下の条件(期待値=10;ギャップを許す;フィルタリング=ON;マッチスコア=1;ミスマッチスコア=-3)にて計算することができる。
(a) 標的酵素のmRNAに対するアンチセンスRNA
(b) 標的酵素のmRNAに対するiRNA(interfering RNA)
(c) 標的酵素のmRNAに対するリボザイム
本発明における「アンチセンスRNA」とは、標的mRNAの塩基配列と相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含む核酸であって、標的mRNAと特異的かつ安定した二重鎖を形成して結合することにより、タンパク質合成を抑制する機能を有するものである。アンチセンスRNAの標的領域は、該アンチセンスRNAがハイブリダイズすることにより、結果として標的mRNAから酵素蛋白質への翻訳が阻害されるものであればその長さに特に制限はなく、該酵素をコードするmRNAの全配列であっても部分配列であってもよく、短いもので約10塩基程度、長いものでmRNAの全配列が挙げられる。
さらに、本発明のアンチセンスRNAは、標的酵素のmRNAとハイブリダイズしてタンパク質への翻訳を阻害するだけでなく、二本鎖DNAである該酵素の遺伝子と結合して三重鎖(トリプレックス)を形成し、RNAへの転写を阻害し得るもの(アンチジーン)であってもよい。
本明細書においては、標的酵素のmRNAに相補的なオリゴRNAとその相補鎖とからなる二本鎖RNA、いわゆるiRNAもまた、標的酵素のmRNAの塩基配列と相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含む核酸に包含されるものとして定義される。二本鎖RNAを細胞内に導入するとそのRNAに相補的なmRNAが分解される、いわゆるRNA干渉(RNAi)と呼ばれる現象は、以前から線虫、昆虫、植物等で知られていたが、この現象が動物細胞でも広く起こることが確認されて以来[Nature, 411(6836): 494-498 (2001)]、リボザイムの代替技術として汎用されている。iRNAは標的となるmRNAの塩基配列情報に基づいて、市販のソフトウェア(例:RNAi Designer;Invitrogen)を用いて適宜設計することができる。
リボザイムとして最も汎用性の高いものとしては、ウイロイドやウイルソイド等の感染性RNAに見られるセルフスプライシングRNAがあり、ハンマーヘッド型やヘアピン型等が知られている。ハンマーヘッド型は約40塩基程度で酵素活性を発揮し、ハンマーヘッド構造をとる部分に隣接する両端の数塩基ずつ(合わせて約10塩基程度)をmRNAの所望の切断部位と相補的な配列にすることにより、標的mRNAのみを特異的に切断することが可能である。このタイプのリボザイムは、RNAのみを基質とするので、ゲノムDNAを攻撃することがないというさらなる利点を有する。標的酵素のmRNAが自身で二本鎖構造をとる場合には、RNAヘリカーゼと特異的に結合し得るウイルス核酸由来のRNAモチーフを連結したハイブリッドリボザイムを用いることにより、標的配列を一本鎖にすることができる[Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98(10): 5572-5577 (2001)]。さらに、細胞質への移行を促進するために、tRNAを改変した配列をさらに連結したハイブリッドリボザイムとすることもできる[Nucleic Acids Res., 29(13): 2780-2788 (2001)]。
標的酵素のmRNAに対するiRNAをコードするDNAは、mRNA上の標的配列(例えば200〜500塩基程度)をRT-PCRにより増幅して2本鎖DNAを調製した後、制限酵素およびリガーゼを用いて、2つの該2本鎖DNAを適当なリンカー配列を介してセンスの向きとアンチセンスの向きとに連結して、ヘアピン型dsRNAをコードするDNAとして構築することができる。リンカー配列は、構築されたDNAが転写された際にヘアピン型dsRNAを形成し得るようなループを形成しうる限り、その配列や長さに特に制限はないが、例えば、β−グルクロニダーゼ遺伝子のようなレポーター遺伝子をリンカー配列として用いると、ヘアピン型dsRNAからのiRNAの切り出しを該レポーター遺伝子の発現を検出することによりモニターすることができる。
標的酵素のmRNAに対するリボザイムをコードするDNAは、デザインされたリボザイムの塩基配列を有するDNAを、DNA/RNA自動合成機を用いて合成することにより調製することができる。
好ましくは、本発明の遺伝子改変植物は、対象植物(野生株)細胞で機能し得るプロモーターの制御下にある上記核酸を含む発現ベクターで、該野生株の細胞を形質転換することにより得られる、トランスジェニック植物である。
さらに、大量調製および精製を容易にするために、該発現ベクターは、大腸菌での自律複製を可能にする複製起点および大腸菌での選択マーカー遺伝子(例えばアンピシリン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子等)を含むことが望ましい。本発明の発現ベクターは、簡便には、pUC系またはpBR系の大腸菌ベクターのクローニング部位に上記核酸の発現カセットと必要に応じて選択マーカー遺伝子を挿入することにより構築することができる。
トウガラシ植物の種子を滅菌後、適当な種子発芽用培地(例、MS培地、LS培地、B5培地など)に播種し、無菌的に栽培する。一方で、プロモーターに目的核酸が接続され、且つカナマイシン耐性遺伝子およびハイグロマイシン耐性遺伝子を有するプラスミドにより形質転換したアグロバクテリウムを培養し、適当な培地で希釈してアグロバクテリウム液を調製する。発芽した子葉をアグロバクテリウム液に約10分間程度浸漬した後、所望の植物ホルモン(例えば、IAA、NAAなどのオーキシン類、カイネチン、ベンジルアデニンなどのサイトカイニン類)およびカナマイシンおよびハイグロマイシン系抗生物質を添加した選択培地(例、MS培地、LS培地、B5培地など)に移植し、20〜30℃で培養する。得られたカナマイシンおよびハイグロマイシン耐性のカルスや実生を、必要に応じてベンジルアデニンを添加した再分化(発根)培地(例、MS培地、LS培地、B5培地など)に移植して再分化(発根)を誘導し、幼植物体を得る。数枚の本葉が観察されたら、幼植物体を土壌に移植して馴化させ、バイオトロン等の制御された温室内で栽培を行う。このようにして得られた形質転換体から種子や果実を得ることができる。
また、形質転換体や、非形質転換体より、常法に従ってRNAを抽出し、標的酵素のmRNAの発現量の変化を定量的RT−PCR、ノーザンハイブリダイゼーション等により調べることができる。あるいは、形質転換体や、非形質転換体より、常法に従って蛋白質を抽出し、標的酵素に対する抗体を用いて、標的酵素の蛋白質の発現量の変化をイムノアッセイ(RIA法、ELISA法、FIA法など)により調べることができる。上述のように、植物における遺伝子組換え事象の大半は非相同組換えによることから、導入された核酸が組み込まれた染色体領域の位置効果のために、すべてのトランスジェニック植物において、標的酵素の発現が野生株と比べて低下するとは限らない。したがって、上記のようにして、形質転換体と非形質転換体とで、標的酵素のRNAレベルまたは蛋白質レベルでの発現量を測定し、比較することにより、トランスジェニック植物において標的酵素の発現が野生株に比べて低下していることを確認することにより、目的の遺伝子改変植物を取得することができる。
CH−19甘から抽出したcDNAよりRT-PCRで増幅したpAMT遺伝子を、Ti-プラスミドベクターpIG121-HmのGUS領域にアンチセンス方向に挿入した(図2)。このプラスミドをAgrobacterium tumefaciens EHA101株に導入し、トウガラシの形質転換に用いた。
タカノツメの種子を70%エタノールで1分、2%次亜塩素酸ナトリウムで15分間表面殺菌し、滅菌水で3回濯ぎ、MS培地に播種した。10日後に発芽した子葉を切り取り、10 mg/lベンジルアデニン(BA)を含むMS培地に置床した。16時間日長、25℃で24時間培養を行った後、50 mg/lカナマイシンおよび50 mg/lハイグロマイシンを含むYEP培地で24時間培養したアグロバクテリウム液に10分間浸漬させた。余分なアグロバクテリウム液を取り除くために、滅菌した濾紙に葉片を載せ、その後、再度10 mg/l ベンジルアデニン(BA)を含むMS培地に置床した。暗所で3日間Co-cultivationを行った後、葉片は10 mg/l BA、50 mg/lカナマイシンおよび300 mg/lカルベニシリンを含むMS培地(選抜培地)に移植し、16時間日長、25℃で培養を行った。アグロバクテリウムの増殖を抑えるために、選抜培地は10日〜2週間ごとに新しい培地に移植した。選抜を開始してから1〜2ヶ月後に再分化したシュートは、50 mg/lカナマイシンおよび300 mg/lカルベニシリンを含むMS培地(発根培地)に移植し、発根を誘導した。発根した16株の植物を土壌に移植し,バイオトロンにて栽培を行った。選抜した個体の葉片よりDNAを抽出し、ベクター内のNPTII遺伝子を増幅させるプライマーを用いて、ゲノムPCR解析を行った。PCR産物は、1.5%アガロースゲルで電気泳動を行い、エチジウムブロマイドで染色した。その結果、選抜した個体にはNPTII遺伝子が導入されていることが分かった(図3)。
形質転換トウガラシ16株および遺伝子を導入していないタカノツメより、それぞれ果実を採取し、常法に従ってカプシエイトおよびカプサイシンの含量の測定を行った。その結果、形質転換トウガラシ3個体(TG-3, 8 および14)は、対照のタカノツメよりも多量のカプシエイトを含んでいることが分かった。また、TG-3およびTG-8は、他の株に比べてカプサイシン含量が低かった(図4(a)および4(b))。
カプシエイト含量が高かった株の果実よりRNAを抽出し、内在性のpAMT遺伝子の転写量についてRT-PCR分析を行った結果、カプシエイト含量が高かった株はpAMT遺伝子の転写発現が抑制されていることが分かった。一方、遺伝子が導入されていてもカプシエイト含量が高くなかった株では、内在性のpAMT遺伝子の転写発現が抑制されていないことが分かった(図5)。以上の結果より、pAMT遺伝子の発現を抑制することで、人為的にカプシエイトを合成するように植物を改変できることが分かった。
CH−19辛より単離したpAMT遺伝子の全長を大腸菌での発現系のベクター(pColdIベクター,タカラバイオ(株))のマルチクローニングサイトに挿入した。得られたベクターはChaperon Competent Cell BL21(タカラバイオ(株))に形質転換した。20 mg/lクロラムフェニコール、50 mg/lアンピシリン、10μl/lテトラサイクリン、1 g/l L-アラビノースを含むLB培地500 mlで、10時間37℃で振とう培養した。培養液のOD600が0.6になったら、1 mMのIPTGを添加し、15℃で24時間振とう培養を行った。
増殖した菌を遠心分離によって回収し、QIAexpress Ni-NTA Fast Start Kit (QIAGEN社)を用いて、タンパク質の抽出およびHisタグ精製を行った。精製したタンパク質はSDS-PAGEにより確認を行った。このタンパク質をウサギに注射し、ポリクローナル抗体の作製を行った。
作製したポリクローナル抗体を用いて、果実より抽出したタンパク質を1 mg SDS-PAGEで電気泳動し、ウエスタンブロット解析を行った。その結果、カプシエイトの蓄積が認められたTG-3およびTG-8ではpAMTタンパク質量が顕著に減少し、TG-14においてもCH-19辛に比べて減少していることが分かった(図6)。
Claims (4)
- カプサイシノイド生合成系を有する、トウガラシ属に属する辛味品種植物において、バニリンからバニリルアミンへのアミノ基転移反応を触媒する酵素の発現または活性を低下せしめる遺伝子改変を行うこと、並びに遺伝子改変前の植物におけるカプシノイド類産生量と比べて、カプシノイド類産生量が増大した植物を選択することを含む、カプシノイド類産生能が増大した遺伝子改変植物の作出方法であって、該酵素は、
(a)配列番号2で表されるアミノ酸配列からなるCH−19辛由来のputative aminotransferase(pAMT)蛋白質;あるいは
(b)(a)の蛋白質の天然のアレル変異体もしくは遺伝子多型、またはCH−19辛以外の品種における(a)の蛋白質のオルソログ
である、方法。 - 前記酵素の発現または活性の低下が、該酵素遺伝子の破壊もしくは変異、該遺伝子転写産物の分解もしくは翻訳抑制、または該酵素のバニリンへの作用の阻害によるものである、請求項1に記載の方法。
- 遺伝子改変が、前記酵素遺伝子に対するアンチセンスRNA、iRNA、リボザイムもしくはドミナントネガティブ変異体をコードするDNAの導入、ノックアウト法もしくは変異原処理による該遺伝子の破壊、および該酵素に対する抗体をコードする遺伝子の導入からなる群より選択される、請求項1または2に記載の方法。
- 請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法により得られたカプシノイド類産生能が増大した遺伝子改変植物の果実からカプシノイド類を回収することを含む、カプシノイド類の製造方法。
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