JP5407858B2 - 腸内細菌科の細菌を用いたl−アミノ酸の製造方法 - Google Patents
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J. Biol. Chem., 267, 18073-18079(1992))。エシェリヒア・コリ細胞培養が嫌気条件から好気条件に移ると、adhE遺伝子の転写が軽減され、嫌気生活下で見られる範囲の10%以内で維持される(Chen, Y. M.,及びLin, E. C. C, J. Bacteriol. 173, 8009-8013(1991);Leonardo, M. R., Cunningham, P. R.,及びClark, D. P., J. Bacteriol.
175, 870-878(1993);Mikulskis, A., Aristarkhov, A.,及びLin, E. C. C., J. Bacteriol. 179, 7129-7134(1997);Membrillo-Hernandez, J.,及びLin, E. C. C., J. Bacteriol. 181, 7571-7579(1999))。翻訳も調節され、RNaseIIIを必要とする(Membrillo-Hernandez, J.,及びLin, E. C. C., J. Bacteriol. 181, 7571-7579(1999);Aristarkhov, A.他, J. Bacteriol. 178, 4327-4332(1996))。AdhEは、エシェリヒア・コリ細胞が過酸化水素ストレスを受けるときの主要な標的の1つとして同定されている(Tamarit, J., Cabiscol, E.,及びRos, J., J. Biol. Chem. 273, 3027-3032(1998))。
ark, D. P., J. Bacteriol. 175 870-878(1993))、AdhEタンパク質の半減期が、金属触媒酸化(MCO)によって好気的条件では短くなるために、野生型エシェリヒア・コリは、エタノールを唯一の炭素及びエネルギー源として増殖することはできない。
A)アルコールデヒドロゲナーゼを有する腸内細菌科のL−アミノ酸生産菌を、エタノールを含有する培地で培養すること、及び
B)前記L−アミノ酸を前記培地から単離すること、
を含むL−アミノ酸の製造方法であって、
前記アルコールデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子が、好気的条件で機能する非野生型プロモーターの制御下で発現されることを特徴とする方法を提供することである。
ルビニア・カロトボーラ、サルモネラ・ティフィムリウム、シゲラ・フレキシネリ、エルシニア・ペスティス、パントエア・アナナティス、ラクトバチルス・プランタラム、及びラクトコッカス・ラクチスからなる群から選択される細菌に由来する、前記方法を提供することである。
A)配列番号2における560番目のグルタミン酸残基の他のアミノ酸残基への置換、
B)配列番号2における566番目のフェニルアラニン残基の他のアミノ酸残基への置換、
C)配列番号2における、22番目のグルタミン酸残基、236番目のメチオニン残基、461番目のチロシン残基、554番目のイソロイシン残基、及び786番目のアラニン残基それぞれの他のアミノ酸残基への置換、並びに
D)これらの組合せ、
からなる群から選択される、前記方法を提供することである。
A)配列番号2における560番目のグルタミン酸残基のリジン残基への置換、
B)配列番号2における566番目のフェニルアラニン残基のバリン残基への置換、
C)配列番号2における、22番目のグルタミン酸残基のグリシン残基への置換、236番目のメチオニン残基のバリン残基への置換、461番目のチロシン残基のシステイン残基への置換、554番目のイソロイシン残基のセリン残基への置換、及び786番目のアラニン残基のバリン残基への置換、並びに
D)これらの組合せ、
からなる群から選択される、前記方法を提供することである。
816〜1293491に相補的な塩基配列);エルシニア・シュードツベルクローシス由来のadhE遺伝子(GenBankアクセッション番号NC_006155.1;gi:51596429の配列における塩基番号2478099〜2480774に相補的な塩基配列)、パントエア・アナナティス由来のadhE遺伝子(配列番号29)、ラクトバチルス・プランタラム由来のadhE遺伝子(UniProtKBエントリー:Q88RY9_LACPL)、ラクトコッカス・ラクチスMG1363由来のadhE遺伝子(EMBLアクセッション番号AJ001007)等が挙げられる(図2を参照されたい)。エシェリヒア・コリ由来のadhE遺伝子のヌクレオチド配列は配列番号1で表される。このadhE遺伝子によってコードされるアミノ酸配列は、配列番号2で表される。
(A)配列番号2で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号2で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号30で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号30で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号53で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号53で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号54で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号54で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号55で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号55で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号56で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号56で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号57で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号57で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
(A)配列番号58で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質、又は
(B)配列番号58で示されるアミノ酸配列の変異体タンパク質であって、アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質。
ク質間の高いレベルの相同性を示す(図2を参照されたい)。この点から、全ての上述のタンパク質で同一性がある(アスタリスクで示される)アミノ酸残基の置換又は欠失が、これらの機能に重要であると考えられる。タンパク質の活性を低下させずに、類似の(コロンで示される)アミノ酸残基を類似のアミノ酸残基に置換することが可能である。しかし、他の非保存的アミノ酸残基の改変では、アルコールデヒドロゲナーゼ活性は変化しないであろう。
生型アルコールデヒドロゲナーゼを使用することができるが、好気条件での不活性化に耐性がある変異型アルコールデヒドロゲナーゼが本発明においては好ましい。「好気条件での不活性化に耐性がある変異型アルコールデヒドロゲナーゼ」という語句は、変異型アルコールデヒドロゲナーゼが好気条件でその活性を維持するか、又は野生型アルコールデヒドロゲナーゼに比べて、活性がごく少量しか低減しないことを意味する。
A)配列番号2における560番目のグルタミン酸残基の他のアミノ酸残基、例えばリジン残基への置換、
B)配列番号2における566番目のフェニルアラニン残基の他のアミノ酸残基、例えばバリン残基への置換、
C)配列番号2における、22番目のグルタミン酸残基、236番目のメチオニン残基、461番目のチロシン残基、554番目のイソロイシン残基、及び786番目のアラニン残基の他のアミノ酸残基、例えばそれぞれ、グリシン残基、バリン残基、システイン残基、セリン残基及びバリン残基への置換、並びに
D)これらの組合せ、
からなる群から選択される付加的な変異を導入することによってエシェリヒア・コリの増殖が向上する。
−アミノ酸を生産するのに用いられる細菌株が改変される。このような改変は、adhE遺伝子が非野生型プロモーターと発現可能に連結するように、染色体上のadhE遺伝子の野生型プロモーターを好気条件で機能する非野生型プロモーターに置換することによって達成できる。好気条件で機能する非野生型プロモーターとして、好気条件で或る特定レベルを超えてadhE遺伝子を発現することができる任意のプロモーターを用いることができる。本発明におけるAdhEタンパク質のレベルに関して、Clark及びCronan(J. Bacteriol., 141, 177-183 (1980))の方法によって測定された無細胞抽出物におけるアルコールデヒドロゲナーゼ活性は、タンパク質1mg当たり1.5ユニット以上、好ましくは5ユニット以上、及びより好ましくは10ユニット以上である必要がある。好気条件は、振盪、通気及び撹拌等の方法によって酸素が供給される細菌の培養に通常用いられるものであり得る。具体的に、好気条件で遺伝子を発現することが知られている任意のプロモーターを用いることができる。例えば、解糖、ペントースリン酸経路、TCAサイクル、アミノ酸生合成経路等に関与する遺伝子のプロモーターを用いることができる。さらに、λファージのPtacプロモーター、lacプロモーター、trpプロモーター、trcプロモーター、PRプロモーター、又はPLプロモーターは全て、好気条件で機能する強いプロモーターであることが知られており、これらを用いることが好ましい。
受性プラスミドを使用した遺伝子置換と同じように行うことができる。
Society for Microbiology, Washington D.C., 1208, Table 1)により記載される細菌が本発明に包含される。
本発明の変異型アルコールデヒドロゲナーゼを有するように改変された本発明の細菌としては、芳香族L−アミノ酸または非芳香族L−アミノ酸を生産できる細菌を使用できる。
本発明のL−スレオニン生産菌を誘導するための親株の例としては、E. coli TDH-6/pVIC40 (VKPM B-3996) (米国特許第5,175,107号、米国特許第5,705,371号)、E. coli 472T23/pYN7 (ATCC 98081) (米国特許第5,631,157号)、E. coli NRRL-21593 (米国特許第5,939,307号)、E. coli FERM BP-3756 (米国特許第5,474,918号)、E. coli FERM BP-3519及びFERM BP-3520 (米国特許第5,376,538号)、E. coli MG442 (Gusyatiner et al., Genetika (in Russian), 14, 947-956 (1978))、E. coli VL643及びVL2055 (EP 1149911 A)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。
スレオニンによるフィードバック阻害に耐性のアスパルトキナーゼホモセリンデヒドロ
ゲナーゼIをコードする変異thrA遺伝子
ホモセリンキナーゼをコードするthrB遺伝子
スレオニンシンターゼをコードするthrC遺伝子
推定トランスメンブランタンパク質をコードするrhtA遺伝子
アスパルテート−β−セミアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードするasd遺伝子
アスパルテートアミノトランスフェラーゼ(アスパルテートトランスアミナーゼ)をコ
ードするaspC遺伝子
GenBank アクセッション番号 NC_000913.2, gi: 49175990)。thrC遺伝子は、E. coli K-12の染色体において、thrB遺伝子とyaaXオープンリーディングフレームとの間に位置する。これら三つの遺伝子は、全て、単一のスレオニンオペロンとして機能する。スレオニンオペロンの発現を増大させるには、転写に影響するアテニュエーター領域を、好ましくは、オペロンから除去する(WO2005/049808, WO2003/097839)。
エシェリヒア属に属するL−リジン生産菌の例としては、L−リジンアナログに耐性を有する変異株が挙げられる。L−リジンアナログはエシェリヒア属に属する細菌の生育を阻害するが、この阻害は、L−リジンが培地に共存するときには完全にまたは部分的に解除される。L−リジンアナログの例としては、オキサリジン、リジンヒドロキサメート、S−(2−アミノエチル)−L−システイン(AEC)、γ−メチルリジン、α−クロロカプロラクタムなどが挙げられるが、これらに限定されない。これらのリジンアナログに対して耐性を有する変異株は、エシェリヒア属に属する細菌を通常の人工変異処理に付すことによって得ることができる。L−リジンの生産に有用な細菌株の具体例としては、Es
cherichia coli AJ11442 (FERM BP-1543, NRRL B-12185; 米国特許第4,346,170号参照)及びEscherichia coli VL611が挙げられる。これらの微生物では、アスパルトキナーゼのL−リジンによるフィードバック阻害が解除されている。
A)、ニコチンアミドヌクレオチドトランスヒドロゲナーゼをコードする遺伝子(pntAB) (米国特許第5,830,716号)、ybjE遺伝子(WO2005/073390)、または、これらの組み合わせの発現レベルが増大していてもよい。
本発明のL−システイン生産菌を誘導するための親株の例としては、フィードバック阻害耐性のセリンアセチルトランスフェラーゼをコードする複数種のcysEアレルで形質転換されたE. coli JM15(米国特許第6,218,168号、ロシア特許出願第2003121601号)、細胞に毒性の物質を排出するのに適したタンパク質をコードする遺伝子を過剰発現するE. coli W3110 (米国特許第5,972,663号)、システインデスルフォヒドラーゼ活性が低下したE. coli株 (JP11155571A2)、cysB遺伝子によりコードされるシステインレギュロンの正の転写制御因子の活性が上昇したE. coli W3110 (WO0127307A1)などのエシェリヒア属に属する
株が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明のL−ロイシン生産菌を誘導するための親株の例としては、ロイシン耐性のE. coil株 (例えば、57株 (VKPM B-7386, 米国特許第6,124,121号))またはβ−2−チエニルアラニン、3−ヒドロキシロイシン、4−アザロイシン、5,5,5−トリフルオロロイシンなどのロイシンアナログ耐性のE.coli株(特公昭62-34397号及び特開平8-70879号)、WO96/06926に記載された遺伝子工学的方法で得られたE. coli株、E. coli H-9068 (特開平8-70879号)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明のL−ヒスチジン生産菌を誘導するための親株の例としては、E. coli 24株 (VKPM B-5945, RU2003677)、E. coli 80株 (VKPM B-7270, RU2119536)、E. coli NRRL B-12116−B12121 (米国特許第4,388,405号)、E. coli H-9342 (FERM BP-6675)及びH-9343 (FERM BP-6676) (米国特許第6,344,347号)、E. coli H-9341 (FERM BP-6674) (EP1085087)、E. coli AI80/pFM201 (米国特許第6,258,554号)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明のL−グルタミン酸生産菌を誘導するための親株の例としては、E. coli VL334thrC+ (EP 1172433)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。E. coli VL334 (VKPM B-1641)は、thrC遺伝子及びilvA遺伝子に変異を有するL−イソロイシン及びL−スレオニン要求性株である(米国特許第4,278,765号)。thrC遺伝子の野生型アレルは、野生型E. coli K12株 (VKPM B-7)の細胞で増殖したバクテリオファージP1を用いる一般的形質導入法により導入された。この結果、L−イソロイシン要求性のL−グルタミン酸生産菌VL334thrC+ (VKPM B-8961) が得られた。
エシェリヒア・コリW3110sucA::KmR
エシェリヒア・コリAJ12624 (FERM BP-3853)
エシェリヒア・コリAJ12628 (FERM BP-3854)
エシェリヒア・コリAJ12949 (FERM BP-4881)
エシェリヒア・コリW3110sucA::KmR は、エシェリヒア・コリW3110のα−ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼ遺伝子(以下、sucA遺伝子という)を破壊することにより得られた株である。この株は、α−ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼ活性を完全に欠損している。
本発明のL−フェニルアラニン生産菌を誘導するための親株の例としては、E.coli AJ12739 (tyrA::Tn10, tyrR) (VKPM B-8197)、変異型pheA34遺伝子を保持するE.coli HW1089
(ATCC 55371) (米国特許第 5,354,672号)、E.coli MWEC101-b (KR8903681)、E.coli NRRL B-12141, NRRL B-12145, NRRL B-12146及びNRRL B-12147 (米国特許第4,407,952号)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。また、親株として、E. coli K-12 [W3110 (tyrA)/pPHAB] (FERM BP-3566)、E. coli K-12 [W3110 (tyrA)/pPHAD] (FERM BP-12659)、E. coli K-12 [W3110 (tyrA)/pPHATerm] (FERM BP-12662)及びAJ 12604と命名されたE. coli K-12 [W3110 (tyrA)/pBR-aroG4, pACMAB] (FERM BP-3579)も使用できる(EP 488424 B1)。さらに、yedA遺伝子またはyddG遺伝子にコードされるタンパク質の活性が増大したエシェリヒア属に属するL−フェニルアラニン生産菌も使用できる(米国特許出願公開2003/0148473 A1及び2003/0157667 A1)。
本発明のL−トリプトファン生産菌を誘導するための親株の例としては、変異trpS遺伝子によりコードされるトリプトファニル−tRNAシンテターゼが欠損したE. coli JP4735/pMU3028 (DSM10122)及びJP6015/pMU91 (DSM10123) (米国特許第5,756,345号)、セリンによるフィードバック阻害を受けないフォスフォグリセリレートデヒドロゲナーゼをコードするserAアレル及びトリプトファンによるフィードバック阻害を受けないアントラニレートシンターゼをコードするtrpEアレルを有するE. coli SV164 (pGH5) (米国特許第6,180,373号)、トリプトファナーゼが欠損したE. coli AGX17 (pGX44) (NRRL B-12263)及びAGX6(pGX50)aroP (NRRL B-12264) (米国特許第4,371,614号)、ホスホエノールピルビン酸生産能が増大したE. coli AGX17/pGX50,pACKG4-pps (WO9708333, 米国特許第6,319,696号)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。yedA遺伝子またはyddG遺伝子にコードされるタンパク質の活性が増大したエシェリヒア属に属するL−トリプトファン生産菌も使用できる(米国特許出願公開2003/0148473 A1及び2003/0157667
A1)。
本発明のL−プロリン生産菌を誘導するための親株の例としては、ilvA遺伝子が欠損し、L−プロリンを生産できるE. coli 702ilvA (VKPM B-8012) (EP 1172433)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明の細菌は、L−プロリン生合成に関与する遺伝子の一種以上の発現を増大することにより改良してもよい。L−プロリン生産菌に好ましい遺伝子の例としては、L−プロリンによるフィードバック阻害が解除されたグルタミン酸キナーゼをコードするproB遺伝子(ドイツ特許第3127361号)が挙げられる。さらに、本発明の細菌は、細菌の細胞からL−アミノ酸を排出するタンパク質をコードする遺伝子の一種以上の発現を増大させることにより改良してもよい。このような遺伝子としては、b2682遺伝子及びb2683遺伝子(ygaZH遺伝子) (EP1239041 A2)が挙げられる。
本発明のL−アルギニン生産菌を誘導するための親株の例としては、E. coli 237株 (VKPM B-7925) (米国特許出願公開2002/058315 A1)、及び、変異N-アセチルグルタミン酸シンターゼを保持するその誘導株(ロシア特許出願第2001112869号)、E. coli 382株 (VKPM B-7926) (EP1170358A1)、N-アセチルグルタミン酸シンテターゼをコードするargA遺伝子が導入されたアルギニン生産株(EP1170361A1)などのエシェリヒア属に属する株が挙げられるが、これらに限定されない。
遺伝子の例としては、N−アセチルグルタミルフォスフェートレダクターゼ遺伝子(argC)、オルニチンアセチルトランスフェラーゼ遺伝子(argJ)、N−アセチルグルタミン酸キナーゼ遺伝子(argB)、アセチルオルニチントランスアミナーゼ遺伝子(argD)、オルニチンカルバモイルトランスフェラーゼ遺伝子(argF)、アルギノコハク酸シンテターゼ遺伝子(argG)、アルギノコハク酸リアーゼ遺伝子(argH)、カルバモイルフォスフェートシンテターゼ遺伝子(carAB)が挙げられる。
本発明のL−バリン生産菌を誘導するための親株の例としては、ilvGMEDAオペロンを過剰発現するように改変された株(米国特許第5,998,178号)が挙げられるが、これらに限定されない。アテニュエーションに必要なilvGMEDAオペロンの領域を除去し、生産されるL−バリンによりオペロンの発現が減衰しないようにすることが好ましい。さらに、オペロンのilvA遺伝子が破壊され、スレオニンデアミナーゼ活性が減少することが好ましい。
さらに、生育にリポ酸を要求する、及び/または、H+-ATPaseを欠失している変異株(WO96/06926)を親株として用いることができる。
本発明のL−イソロイシン生産菌を誘導するための親株の例としては、6−ジメチルアミノプリンに耐性を有する変異株(特開平5-304969号)、チアイソロイシン、イソロイシンヒドロキサメートなどのイソロイシンアナログに耐性を有する変異株、さらにDL−エチオニン及び/またはアルギニンヒドロキサメートに耐性を有する変異株(特開平5-130882号)が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、スレオニンデアミナーゼ、アセトヒドロキシ酸シンターゼなどのL−イソロイシン生合成に関与するタンパク質をコードする遺伝子で形質転換された組換え株もまた親株として使用できる(特開平2-458号, FR 0356739, 及び米国特許第5,998,178号)。
及びエタノール等のアルコールが挙げられる。本発明においては、エタノールを単独あるいはグルコース及びスクロース等の他の炭化水素と併せて用いることができる。窒素源としては、アンモニア及び硫酸アンモニウム等の種々のアンモニウム塩、アミン等の窒素化合物、ペプトン、大豆炭化水素及び消化発酵微生物等の天然窒素源を用いることができる。無機塩類としては、一リン酸カリウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸鉄、硫酸マンガン、塩化カルシウム等を用いることができる。ビタミンとしては、チアミン、酵母抽出液等を用いることができる。必要に応じて更なる栄養素を加えることもできる。たとえば、細菌の生育のためにL−アミノ酸が必要な時は(L−アミノ酸要求性)、十分な量のL−アミノ酸を培養培地に添加してもよい。
エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*の調製
cat遺伝子を用いて、エシェリヒア・コリMG1655(ATCC700926)でスレオニンデヒドロゲナーゼをコードする野生型tdh遺伝子の不活性化を行った後に、高濃度のスレオニン(40mg/ml超)及びホモセリン(5mg/ml超)に対する耐性を与えるrhtA23変異(rhtA*)を導入することによって、L−スレオニン生産エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*(pVIC40)株を構築した。それから、得られた株をエシェリヒア・コリVKPM B−3996由来のプラスミドpVIC40で形質転換した。プラスミドpVIC40は、米国特許第5,705,371号に詳細に記載されている。
に導入されたtdh遺伝子の5’領域と相同性がある35ヌクレオチドを含有する。プライマーP2は、細菌染色体へのさらなる組込みのために導入されたtdh遺伝子の3’領域と相同性がある32ヌクレオチドを含有する。
0.4%グルコースを含有するM9最小培地で形質導入体を選択した。
エシェリヒア・コリMG1655::PL-tacadhEの構築
MG1655株におけるadhE遺伝子の野生型プロモーター領域のPL-tacプロモーターへの置換によって、エシェリヒア・コリMG1655::PL-tacadhを得た。
エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhEの構築
MG1655::PL-tacadhE株からMG1655Δtdh,rhtA*株へのPL-tacプロモーターの形質導入によって、エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhEを得た。
L−スレオニン生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
L−スレオニン生産に対するadhE遺伝子の発現促進の影響を評価するために、エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE株及びMG1655Δtdh,rhtA*株の両方を、プラスミドpVIC40で形質転換した。
発酵培地組成(g/l):
エタノール 24又は16
グルコース 0(表1)又は3(表2)
(NH4)2SO4 16
K2HPO4 0.7
MgSO4・7H2O 1.0
MnSO4・5H2O 0.01
FeSO4・7H2O 0.01
チアミン塩酸塩 0.002
酵母エキス 1.0
L−イソロイシン 0.01
CaCO3 33
MgSO4・7H2O及びCaCO3はそれぞれ別々に滅菌した。
エシェリヒア・コリMG1655ΔadhEの構築
kan遺伝子によるエシェリヒア・コリMG1655における野生型adhE遺伝子の不活性化によって構築した。
子の誘導に使用する)を添加したSOB培地(5g/lの酵母エキス、0.5g/lのNaCl、20g/lのトリプトン、2.5mMのKCl、10mMのMgCl2)で100倍に希釈して、細菌培養物の光学密度がOD600=0.4〜0.7に達するまで30℃で増殖させた。細菌培養物10mlに由来する細胞を氷冷した脱イオン水で3回洗浄した後、水100μlで懸濁した。脱イオン水に溶解したDNA断片10μl(100ng)を細胞懸濁液に添加した。製造業者の指示書に従って、「Bio-Rad」のエレクトロポレーター(米国)(No.165〜2098、バージョン2〜89)で、エレクトロポレーションを行った。通電された細胞をSOC培地(Sambrook他著「分子クローニング実験マニュアル、第2版(Molecular Cloning A Laboratory Manual, Second Edition)」 Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989))1mlに添加し、37℃で2時間インキュベートした後、20μg/mlのカナマイシンを含有するL寒天上に広げた。24時間以内に増殖したコロニーを、プライマーP11(配列番号14)及びプライマーP12(配列番号15)を用いるPCRによって、野生型adhE遺伝子を置換するKmRマーカーの存在に関して試験した。この目的のために、新たに単離したコロニーを水20μlに懸濁した後、得られた懸濁液のうち1μlをPCRに用いた。温度プロファイルは、初期DNA変性(95℃で5分間);その後30サイクルの変性(95℃で30秒間)、アニーリング(55℃で30秒間)、及び伸長(72℃で30秒間);並びに最終伸長(72℃で5分間)である。幾つかの試験したKmRコロニーは、所望の約1030bpのDNA断片を含有し、adhE遺伝子の3135bpの断片の代わりに、KmRマーカーDNAの存在が確認された。37℃で培養することによって、得られた株の1つが熱感受性のプラスミドpKD46を回復し、この株をエシェリヒア・コリMG1655ΔadhEと称した。
エシェリヒア・コリMG1655::PL-tacadhE*の構築
Glu568Lys(E568K)変異型のadhE遺伝子への導入によって、エシェリヒア・コリMG1655::PL-tacadhE*を得た。初めに、鋳型としてエシェリヒア・コリMG1655のゲノムDNA、並びにプライマーP13(配列番号16)及びプライマーP12(配列番号15)を用いるPCRによって、E568K変異を保有するadhE遺伝子の1.05kbpの断片を得た。プライマーP15は、adhE遺伝子の1662bp〜1701bp及び1703bp〜1730bpの領域に対して相同性があり、太字で示される(1702bp位の)g/a置換を含み、プライマーP12は、adhE遺伝子の3’末端に対して相同性がある。「Gene Amp PCR System 2700」増幅装置(Applied Biosystems)を利用してPCRを行った。反応混合物(全量50μl)を、MgCl2(タカラバイオ株式会社、日本)、それぞれ250μMのdNTP、それぞれ25pmolの設計されたプライマー、及び2.5UのPyrobestDNAポリメラーゼ(タカラバイオ株式会社、日本)、および10×PCR緩衝液5μlから構成した。PCRのために、エシェリヒア・コリMG1655のゲノムDNA約20ngを鋳型として反応混合物中に添加した。温度プロファイルは、最初のDNA変性(95℃で5分間);その後35サイクルの変性(95℃で30秒間)、アニーリング(54℃で30秒間)、及び伸長(72℃で1分間);並びに最後の伸長(72℃で5分間)であった。得られた断片をアガロースゲル電気泳動で精製し、「GenElute Spin Columns」(「Sigma」、米国)を用いて抽出し、エタノールで沈澱させた。
て相同性がある。「Gene Amp PCR System 2700」増幅装置(Applied Biosystems)を利用してPCRを行った。反応混合物(全量50μl)を、10×PCR緩衝液(タカラバイオ株式会社、日本)5μl、25mMのMgCl2、それぞれ250μMのdNTP、プライマーP11 10ng、第2のプライマーとして1.05kbpの断片1μg及び2.5Uのタカラバイオ株式会社のLA DNAポリメラーゼ(タカラバイオ株式会社、日本)から構成した。PCRのために、エシェリヒア・コリMG1655::PL-tacadhEのゲノムDNA約20ngを鋳型として反応混合物中に添加した。温度プロファイルは、初期DNA変性(95℃で5分間);その後35サイクルの変性(95℃で30秒間)、アニーリング(54℃で30秒間)、及び伸長(72℃で3.5分間);並びに最終伸長(72℃で7分間)であった。得られた断片をアガロースゲル電気泳動で精製し、「GenElute Spin Columns」(「Sigma」、米国)を用いて抽出し、エタノールで沈澱させた。
エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*の構築
MG1655::PL-tacadhE*株からのPL-tacadhE*変異の形質導入によって、エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*を得た。
で増殖させたP1virファージに感染させ、MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*株を得た。この株で、唯一の炭素源として2%エタノールを有するM9プレートでの増殖を調べた。増殖速度は、MG1655::PL-tacadhE*株と同じであった。
エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568の構築
Glu568Lys変異を有する単一変異型adhEを得る第2の試みを行った。この目的のために、エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−wtΔ34株を構築した。
と称した。
エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,adhE*の構築
MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*株において野生型adhEプロモーターを再構築することによって、エシェリヒア・コリMG1655Δtdh,rhtA*,adhE*株を得た。PL-tacプロモーター、及びMG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*株の染色体中のcat遺伝子でコードされるクロラムフェニコール耐性
マーカー(CmR)を保有するDNA断片を、野生型adhEプロモーター、及びkan遺伝子でコードされるカナマイシン耐性マーカー(KmR)を保有する断片で置換した。鋳型としてのMG1655株のDNA、並びにプライマーP20(配列番号23)及びプライマーP21(配列番号24)を用いるPCRによって野生型PadhEを得た。プライマーP20は、その5’末端にEcoRI認識部位を含有し、kan遺伝子とのさらなる連結に必要であり、プライマーP21は、adhE遺伝子の5’領域と相同性がある30ヌクレオチドを含有する(50bp〜20bp)。
l, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989))1mLに添加し、37℃で2時間インキュベートした後、20μg/mlのカナマイシンを含有するL寒天上に広げた。
L−スレオニン生産に対する変異型adhE遺伝子発現増大の影響
スレオニン生産に対する変異型adhE遺伝子の発現促進の影響を評価するために、エシェリヒア・コリ株MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568(cl.18);MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568,Val566(cl.1);MG1655Δtdh,rhtA*,adhE*、及び親株MG1655Δtdh,rhtA*を、プラスミドpVIC40で
形質転換した。
L−リジン生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
リジン生産に対するPL-tacプロモーターの制御下でのadhE遺伝子の発現促進の影響を試験するために、上記株MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568(cl.18);MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568,Val566(cl.1);MG1655Δtdh,rhtA*,adhE*の染色体由来のDNA断片を、P1形質導入によって、リジン生産エシェリヒア・コリWC196ΔcadAΔldc(pCABD2)株に移入した(Miller, J.H.(1972)著, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press、ニューヨーク州プレーンビュー)。pCABD2は、L−リジンによるフィードバック阻害を脱感作する変異を有するジヒドロジピコリン酸シンターゼをコードするdapA遺伝子、L−リジンによるフィードバック阻害を脱感作する変異を有するアスパルトキナーゼIIIをコードするlysC遺伝子、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼをコードするdapB遺伝子、及びジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼをコードするddh遺伝子を含むプラスミドである(米国特許第6,040,160号)。
エタノール 20.0
(NH4)2SO4 24.0
K2HPO4 1.0
MgSO4・7H2O 1.0
FeSO4・7H2O 0.01
MnSO4・5H2O 0.01
酵母エキス 2.0
エシェリヒア・コリMG1655ΔargR,PL-tacadhΕ*の構築
1.MG1655ΔargR株の構築
エシェリヒア・コリMG1655において、L−アルギニン生合成経路の抑制因子をコードする野生型argR遺伝子をkan遺伝子で不活性化することによって、この株を構築した。野生型argR遺伝子を置換するために、Red-driven integrationによって、野生型argR遺伝子の代わりに、kan遺伝子でコードされるカナマイシン耐性マーカー(KmR)を保有するDNA断片をエシェリヒア・コリMG1655の染色体(ATCC700926)に組込んだ。
100倍に希釈して、細菌培養物の光学密度がOD600=0.4〜0.7に達するまで30℃で増殖した。細菌培養物10mlに由来する増殖細胞を氷冷した脱イオン水で3回洗浄した後、水100μlで懸濁した。脱イオン水に溶解したDNA断片10μl(100ng)を細胞懸濁液に添加した。製造業者の指示書に従って、「Bio-Rad」のエレクトロポレーター(米国)(No.165〜2098、バージョン2〜89)で、エレクトロポレーションを行った。刺激された細胞をSOC培地1mLに添加し、37℃で2時間インキュベートした後、25μg/mlのクロラムフェニコールを含有するL寒天上に広げた。プライマーP28(配列番号33)及びプライマーP29(配列番号34)を用いるPCRによって、野生型argR遺伝子を置換するKmRマーカーの存在に関して、24時間以内に増殖したコロニーを試験した。この目的のために、新たに単離したコロニーを水20μlに懸濁させた後、得られた懸濁液のうち1μlをPCRに用いた。温度プロファイルは、初期DNA変性(95℃で5分間);その後30サイクルの変性(95℃で30秒間)、アニーリング(55℃で30秒間)、及び伸長(72℃で30秒間);最終伸長(72℃で5分間)である。幾つかの試験したKmRコロニーは、所望の1110bpのDNA断片を含有し、argR遺伝子の660bpの断片の代わりにKmRマーカーDNAの存在が確認された。37℃で培養することによって、得られた株の1つが熱感受性プラスミドpKD46を回復し、この株をエシェリヒア・コリMG1655ΔargRと称した。
MG1655::PL-tacadhE*株からPL-tacadhE*変異を形質導入することによって、エシェリヒア・コリMG1655ΔargR,PL-tacadhE*を得た。
pMW119−ArgA4プラスミドの構築
単一変異を有するArgA遺伝子は、fbr(フィードバック耐性)表現型を与え(特開2002-253268、欧州特許第1170361号)、それ自身のプロモーターの制御下、pMW119ベクターにクローニングされた。
(ArgA遺伝子に関して)又は20秒間(PargAプロモーターに関して))、及び最終伸長(72℃で5分間)であった。次に、増幅したDNA断片を、アガロースゲル電気泳動で精製し、「GenElute Spin Columns」(Sigma、米国)を用いて抽出し、エタノールで沈澱させた。
L−アルギニン生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
L−アルギニン生産に対する変異型adhE遺伝子の発現促進の影響を評価するために、エシェリヒア・コリMG1655ΔargR PL-tacadhE*株及びMG1655ΔargR株をそれぞれ、プラスミドpMW119−ArgA4で形質転換した。各種形質転換体の10個の得られたコロニーを、150mg/lのApを補充した栄養ブイヨン中で、37℃で18時間培養し、それぞれ得られた培養物0.1mlを、20mm×200mmの試験管中の発酵培地2mlに接種し、回転式振盪培養機を用いて32℃で96時間培養した。培養後、培地中に蓄積するL−アルギニンの量を、以下の移動相(ブタノール:酢酸:水=4:1:1(v/v))を用いるペーパークロマトグラフィによって求めた。ニンヒドリンのアセトン溶液(2%)を可視化試薬として用いた。L−アルギニンを含有するスポットを切り出し、L−アルギニンをCdCl2の0.5%水溶液中で溶出し、L−アルギニンの量を540nmで分光光度法により推定した。表4に、10個の独立した試験管発酵の結果を示す。以下の表4の通り、MG1655ΔargR PL-tacadhE*の方が、MG1655ΔargR PL-tacadhE*と比べて、グルコースを補充した培地及びグルコースを含まない培地の両方で、多量のL−アルギニンを生産した。
エタノール 20
グルコース 0/5
(NH4)2SO4 25
K2HPO4 2
MgSO4・7H2O 1.0
塩酸チアミン 0.002
酵母エキス 5.0
CaCO3 33
MgSO4・7H2O、エタノール及びCaCO3はそれぞれ、別個に滅菌した。
L−ロイシン生産エシェリヒア・コリNS1391株の構築
NS1391株は、以下のようにして得た。
ΔilvGM::catからクロラムフェニコール耐性マーカーを除去した。結果として、B−7 ΔilvIH ΔilvGM株が得られた。
ΔilvIH ΔilvGM株を、このような変更形態の元株として用いた。Red-driven integrationの手順に従って、PCRプライマーP42(配列番号47)及びPCRプライマーP43(配列番号48)を構築した。オリゴヌクレオチドP42(配列番号47)は、ilvB遺伝子の上流領域、及びBW25113 cat−PL−yddGの染色体DNAに存在する抗生物質耐性を与える遺伝子に隣接する領域と相同である。オリゴヌクレオチドP43(配列番号48)は、ilvB領域、及びBW25113 cat−PL−yddGの染色体に存在するPLプロモーター下流領域の両方と相同である。BW25113 cat−PL−yddGを得ることは以前に詳述されている(欧州特許第1449918号(A1)、ロシア特許第2222596号)。BW25113 cat−PL−yddG株の染色体DNAをPCR用の鋳型として用いた。PCR条件は、変性(95℃で3分間);2回の最初のサイクルのプロファイル(95℃で1分間、34℃で30秒間、72℃で40秒間);最後の30サイクルのプロファイル(95℃で30秒間、50℃で30秒間、72℃で40秒間);最終工程(72℃で5分間)であった。結果として、PCR産物が得られ(配列番号49)、アガロースゲルで精製し、温度感受性反復を有するプラスミドpKD46を含有するエシェリヒア・コリB−7 ΔilvIH ΔilvGMのエレクトロポレーションに用いた。エレクトロコンピテントな細胞を以下の通り調製した:エシェリヒア・コリB−7 ΔilvIH ΔilvGM株を、アンピシリン(100mg/l)を含有するLB培地中で、30℃で一晩増殖させ、培養物を、アンピシリン及びL−アラビノース(1mM)を含むSOB培地(Sambrook他著, Molecular Cloning A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989))5
mlで100倍に希釈した。細胞を、30℃で通気しながらOD600=約0.6まで増殖させた後、100倍に濃縮し、氷冷した脱イオンH2Oで3回洗浄することによってエレクトロコンピテントにした。細胞70μl及びPCR産物=約100ngを用いてエレクトロポレーションを実施した。エレクトロポレーション後、細胞を、37℃で2.5時間、SOC培地(Sambrook他著, Molecular Cloning A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989))1mlでインキュベートした後、L寒天上に平板培養し、37℃で増殖させてCmR組換え株を選択した。次に、pKD46プラスミドを除去するために、42℃で、Cmを含むL寒天上で2回、継代培養を実施し、アンピシリンに対する感受性に関して、得られたコロニーを試験した。
L−ロイシン生産に対する変異型adhE遺伝子発現増大の影響
L−ロイシン生産に対するPL-tacプロモーター制御下でのadhE遺伝子の発現促進の影響を試験するために、P1形質導入によって、上記MG1655 PL-tacadhE*株の染色体由来のDNA断片を、L−ロイシン生産エシェリヒア・コリNS1391株に移入して(Miller, J.H.(1972)著, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring
Harbor Lab. Press、ニューヨーク州プレーンビュー)、NS1391 PL-tacadhE*株を得た。
グルコース 60.0
エタノール 0/10.0/20.0/30.0
(NH4)2SO4 25.0
K2HPO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
チアミン 0.01
CaCO3 25.0
グルコース、エタノール及びCaCO3は、別個に滅菌した。
L−フェニルアラニン生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
フェニルアラニン生産に対するPL-tacプロモーター制御下でのadhE遺伝子の発現促進の影響を試験するために、P1形質導入によって、上記株MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568(cl.18);MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568,Val566(cl.1);MG1655Δtdh,rhtA*,adhE*の染色体由来のDNA断片を、フェニルアラニン生産エシェリヒア・コリAJ12739株に移入することができる(Miller, J.H.(1972)著, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press、ニューヨーク州プレーンビュー)。AJ12739株は、2001年11月6日に、ロシア国立工業用微生物収集所(VKPM)(Russia, 117545 Moscow, 1 Dorozhny proezd, 1)に、アクセッション番号VKPM B-8197で寄託された後、2002年8月23日に、ブダペスト条約に基づく寄託に移管されている。
エタノール 20.0
(NH4)2SO4 16.0
K2HPO4 0.1
MgSO4・7H2O 1.0
FeSO4・7H2O 0.01
MnSO4・5H2O 0.01
塩酸チアミン 0.0002
酵母エキス 2.0
チロシン 0.125
CaCO3 20.0
エタノール及び硫酸マグネシウムは別個に滅菌する。CaCO3は、180℃で2時間、乾熱滅菌する。pHは7.0に調整する。
L−トリプトファン生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
トリプトファン生産に対するPL-tacプロモーター制御下でのadhE遺伝子の発現促進の影響を試験するために、P1形質導入によって、上記株MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568(cl.18);MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568,Val566(cl.1);MG1655Δtdh,rhtA*,adhE*の染色体由来のDNA断片を、トリプトファン生産エシェリヒア・コリSV164(pGH5)株に移入することができる(Miller, J.H.著, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, (1972), ニューヨーク州プレーンビュー)。SV164株は、トリプトファンによるフィードバック阻害を受けないアントラニル酸シンターゼをコードするtrpE対立遺伝子を有する。プラスミドpGH5は、セリンによるフィードバック阻害を受けないホスホグリセリン酸デヒドロゲナーゼをコードする変異型serA遺伝子を内部に有する。SV164(pGH5)株に関しては、米国特許第6,180,373号又は欧州特許第0662143号に詳述されている。
L−ヒスチジン生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
ヒスチジン酸生産に対するPL-tacプロモーター制御下でのadhE遺伝子の発現促進の影響を試験するために、P1形質導入によって、上記株MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568(cl.18);MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568,Val566(cl.1);MG1655Δtdh,rhtA*,adhE*の染色体由来のDNA断片を、ヒスチジン生産エシェリヒア・コリ80株に移入することができる(Miller, J.H.著, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, (1972), ニューヨーク州プレーンビュー)。80株は、ロシア特許第2119536号に記載され、1999年10月15日に、ロシア国立工業用微生物収集所(Russia, 117545 Moscow, 1 Dorozhny proezd, 1)に、アクセッション番号VKPM B-7270で寄託された後、2004年7月12日に、ブダペスト条約に基づく寄託に移管されている。
エタノール 20.0
豆濃(大豆加水分解物) 総窒素として0.2
L−プロリン 1.0
(NH4)2SO4 25.0
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
FeSO4・7H2O 0.01
MnSO4 0.01
チアミン 0.001
ベタイン 2.0
CaCO3 60.0
エタノール、プロリン、ベタイン及びCaCO3は、別個に滅菌する。滅菌前にpHを6.0に調整する。
L−グルタミン酸生産に対するadhE遺伝子発現増大の影響
グルタミン酸生産に対するPL-tacプロモーター制御下でのadhE遺伝子の発現促進の影響を試験するために、P1形質導入によって、上記株MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE*;MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568(cl.18);MG1655Δtdh,rhtA*,PL-tacadhE−Lys568,Val566(cl.1);MG1655Δtdh,rhtA*,adhE*の染色体由来のDNA断片を、グルタミン酸生産エシェリヒア・コリVL334thrC+株(欧州特許第1172433号)に移入することができる(Miller, J.H.著, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab. Press, (1972), ニューヨーク州プレーンビュー)。VL334thrC+株は、2004年12月6日に、ロシア国立工業用微生物収集所(VKPM)(Russia, 117545
Moscow, 1 Dorozhny proezd, 1)にアクセッション番号VKPM B-8961で寄託された後、2004年12月8日に、ブダペスト条約に基づく寄託に移管されている。
エタノール 20.0
硫酸アンモニウム 25.0
KH2PO4 2.0
MgSO4・7H2O 1.0
チアミン 0.0001
L−イソロイシン 0.05
CaCO3 25.0
エタノール及びCaCO3は、別個に滅菌した。
Claims (7)
- A)アルコールデヒドロゲナーゼを有する腸内細菌科のL−アミノ酸生産菌を好気的条件下でエタノールを含有する培養培地で培養すること、及び
B)前記L−アミノ酸を前記培養培地から単離すること、
を含む、発酵によるL−アミノ酸の製造方法であって、
前記アルコールデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子が好気条件で機能する非野生型プロモーターの制御下で発現されることにより、野生型株と比較してアルコールデヒドロゲナーゼ活性が増大していることを特徴とし、
前記アルコールデヒドロゲナーゼが好気条件での不活性化に耐性であり、
前記L−アミノ酸生産菌が、エシェリヒア属、エンテロバクター属、エルビニア属、クレブシエラ属、パントエア属、プロビデンシア属、サルモネラ属、セラシア属、シゲラ属、及びモルガネラ属からなる群から選択される属に属する、方法。 - 前記非野生型プロモーターが、Ptac、Plac、Ptrp、Ptrc、PR、及びPLからなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記アルコールデヒドロゲナーゼが、配列番号2に記載のアミノ酸配列において、568番目のグルタミン酸残基がアスパラギン酸残基以外のアミノ酸残基に置換されていることを含む、請求項1または2に記載の方法。
- 前記アルコールデヒドロゲナーゼが、配列番号2に記載のアミノ酸配列において、568番目のグルタミン酸残基がリジン残基に置換されていることを含む、請求項1または2に記載の方法。
- 前記アルコールデヒドロゲナーゼが、配列番号2に記載のアミノ酸配列において、568番目のグルタミン酸残基が他のアミノ酸残基に置換される変異を有し、さらに、
A)配列番号2における560番目のグルタミン酸残基の他のアミノ酸残基への置換、
B)配列番号2における566番目のフェニルアラニン残基の他のアミノ酸残基への置換、
C)配列番号2における、22番目のグルタミン酸残基、236番目のメチオニン残基、461番目のチロシン残基、554番目のイソロイシン残基、及び786番目のアラニ
ン残基それぞれの他のアミノ酸残基への置換、並びに
D)これらの組合せ、
からなる群から選択される変異を有する、請求項1または2に記載の方法。 - 配列番号2における、22番目のグルタミン酸残基、236番目のメチオニン残基、461番目のチロシン残基、554番目のイソロイシン残基、及び786番目のアラニン残基が、それぞれ、グリシン残基、バリン残基、システイン残基、セリン残基、及びバリン残基へ置換される、請求項5に記載の方法。
- 前記L−アミノ酸が、L−スレオニン、L−リジン、L−ヒスチジン、L−フェニルアラニン、L−アルギニン、L−トリプトファン、L−グルタミン酸、及びL−ロイシンからなる群から選択される、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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Families Citing this family (33)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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US7915018B2 (en) * | 2004-10-22 | 2011-03-29 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing L-amino acids using bacteria of the Enterobacteriaceae family |
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EP2149608A4 (en) * | 2007-04-16 | 2013-02-20 | Ajinomoto Kk | PROCESS FOR PRODUCING AN ORGANIC ACID |
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US8383372B2 (en) * | 2008-03-06 | 2013-02-26 | Ajinomoto Co., Inc. | L-cysteine producing bacterium and a method for producing L-cysteine |
JP2011167071A (ja) * | 2008-05-22 | 2011-09-01 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
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JP2013176301A (ja) * | 2010-07-01 | 2013-09-09 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
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WO2012157699A1 (ja) * | 2011-05-18 | 2012-11-22 | 味の素株式会社 | 動物用免疫賦活剤、それを含む飼料及びその製造方法 |
RU2011134436A (ru) | 2011-08-18 | 2013-10-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | Способ получения l-аминокислоты с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae, обладающей повышенной экспрессией генов каскада образования флагелл и клеточной подвижности |
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CN103642765B (zh) * | 2013-12-25 | 2015-11-18 | 南京工业大学 | 醇脱氢酶突变体及其应用 |
CN104004742A (zh) * | 2014-04-08 | 2014-08-27 | 北京贝奥康泰医药科技有限公司 | 用于培养微生物表达肝素酶iii的培养基 |
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MY186949A (en) * | 2015-01-27 | 2021-08-26 | Cysbio Aps | Genetically modified microorganisms having improved tolerance towards l-serine |
CN112725254B (zh) * | 2017-10-13 | 2023-07-11 | 湖南利尔生物科技有限公司 | 一种l-高丝氨酸的生产菌株及其构建方法和应用 |
CN110004081B (zh) * | 2019-03-25 | 2022-09-13 | 江西省科学院微生物研究所 | 一种能拆分(+/-)γ-内酰胺得到(+)γ-内酰胺的菠萝泛菌及其应用 |
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KR20220034220A (ko) * | 2019-08-28 | 2022-03-17 | 이너 몽골리아, 에펜 바이오테크 컴퍼니 리미티드 | 대장균 기반 재조합 균주 및 이의 구축 방법과 응용 |
Family Cites Families (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SU943282A1 (ru) * | 1979-07-13 | 1982-07-15 | Всесоюзный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов | Способ получени L-треонина |
WO1990004636A1 (en) * | 1988-10-25 | 1990-05-03 | Vsesojuzny Nauchno-Issledovatelsky Institut Genetiki I Selektsii Promyshlennykh Mikroorganizmov (Vniigenetika) | Strain of bacteria escherichia coli, producer of l-threonine |
JP3473042B2 (ja) * | 1992-04-28 | 2003-12-02 | 味の素株式会社 | 変異型アスパルトキナーゼ遺伝子 |
US6132999A (en) * | 1992-09-21 | 2000-10-17 | Ajinomoto Co., Inc. | L-threonine-producing microbacteria and a method for the production of L-threonine |
JP3331472B2 (ja) * | 1992-11-10 | 2002-10-07 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl−スレオニンの製造法 |
DE69429452C5 (de) * | 1993-10-28 | 2012-10-25 | Ajinomoto Co., Inc. | Herstellungsverfahren einer substanz |
JPH07155184A (ja) * | 1993-12-08 | 1995-06-20 | Ajinomoto Co Inc | 発酵法によるl−リジンの製造法 |
ES2256850T5 (es) * | 1994-12-09 | 2013-04-15 | Ajinomoto Co., Inc. | Nuevo gen de la lisina descarboxilasa y procedimiento para la producción de L-lisina |
JP4032441B2 (ja) * | 1995-08-30 | 2008-01-16 | 味の素株式会社 | L−アミノ酸の製造方法 |
JP4088982B2 (ja) * | 1996-10-15 | 2008-05-21 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 |
RU2144564C1 (ru) * | 1998-10-13 | 2000-01-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | ФРАГМЕНТ ДНК rhtB, КОДИРУЮЩИЙ СИНТЕЗ БЕЛКА RhtB, ПРИДАЮЩЕГО УСТОЙЧИВОСТЬ К L-ГОМОСЕРИНУ БАКТЕРИЯМ ESCHERICHIA COLI, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ |
RU2148642C1 (ru) * | 1998-12-23 | 2000-05-10 | ЗАО "Научно-исследовательский институт АДЖИНОМОТО-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | Фрагмент днк rhtc, кодирующий синтез белка rhtc, придающего повышенную устойчивость к l-треонину бактериям escherichia coli, и способ получения l-аминокислоты |
JP2000201692A (ja) * | 1999-01-13 | 2000-07-25 | Ajinomoto Co Inc | 発酵法によるl―グルタミン酸の製造法 |
JP4380029B2 (ja) * | 2000-07-05 | 2009-12-09 | 味の素株式会社 | 微生物を利用した物質の製造法 |
JP4265093B2 (ja) * | 2000-08-11 | 2009-05-20 | 味の素株式会社 | スレオニン及びイソロイシンの製造法 |
RU2244007C2 (ru) * | 2002-02-27 | 2005-01-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | Способ получения l-треонина, штамм escherichia coli - продуцент треонина (варианты) |
DE602004014158D1 (de) * | 2003-07-29 | 2008-07-10 | Ajinomoto Kk | Verfahren zur herstellung von l-lysin oder l-threonin unter verwendung von escherichia-bakterien mit abgeschwächter malatenzymaktivität |
JP4380305B2 (ja) * | 2003-11-21 | 2009-12-09 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 |
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BRPI0506369B1 (pt) * | 2004-01-30 | 2020-11-03 | Ajinomoto Co., Inc | microorganismo transgênico, e, método para produzir um l-aminoácido |
DE102004008445A1 (de) * | 2004-02-19 | 2005-09-08 | Degussa Ag | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren aus D-Aminosäuren |
US7915018B2 (en) * | 2004-10-22 | 2011-03-29 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing L-amino acids using bacteria of the Enterobacteriaceae family |
US20070004014A1 (en) * | 2005-06-29 | 2007-01-04 | Yuichiro Tsuji | Method for producing l-threonine |
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
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