JP5237949B2 - 発光性ランタノイド標識試薬及びその用途 - Google Patents
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Description
本発明の1つの目的は、発光性ランタノイドキレートに保持された生体特異的結合反応性物質を含む検出可能な分子を提供することにある。
a) R1AとR1Bは各々、独立的に、水素原子、メチル、エチル、−COOH、−COO-、−CH2COOH、−CH2COO-、ヒドロキシル及び−OR2からなる群より選ばれ;
a) R1AとR1Bは各々、独立的に、水素原子、メチル、エチル、−COOH、−COO-、−CH2COOH、−CH2COO-、ヒドロキシル及び−OR2からなる群より選ばれ;
本発明の目的は、特異的生体親和性に基づく結合アッセイ(例えば、イムノアッセイ(不均質アッセイと均質アッセイの両方)、核酸ハイブリダイゼーションアッセイ、受容体結合アッセイ、免疫細胞化学アッセイ、又は蛍光分析又は時間分解蛍光分析による特異的発光の決定を利用する免疫組織化学アッセイ)において使用するための改良されたランタノイドキレート標識を得るための手段を提供することにある。
7.高い水溶性を与え、生体分子の標識の際の凝集体形成を防止でき、標識された生体分子の非特異的結合を防止できる官能基。
3−メトキシフェノール(2.0ml、18.2mmol)を乾燥したDMF(50ml)に溶解した。得られた混合物にヨウ化ナトリウム(3.3g、21.9mmol)とクロラミンT(5.0g、21.9mmol)とを添加し、攪拌しながら室温で1時間反応させた。得られた反応混合物を水(150ml)で希釈し、5%の塩酸で酸性化し、酢酸エチル(2×100ml)で抽出した。有機層を5%のチオ硫酸ナトリウム溶液(200ml)で洗浄し、硫酸ナトリウムを用いて乾燥した。得られた生成物を、シリカゲルを用いたフラッシュクロマトグラフィーを2回行うことによって精製した(溶離液として、1回目はジクロロメタンを用い、2回目は酢酸エチルの20%石油エーテル溶液を用いる)。収量は、0.82g(18%)であった。1H NMR(CDCl3、500MHz): δ 7.52(1H、d、J=8.5Hz)、6.63(1H、d、J=3.0Hz)、6.37(1H、dd、J=8.5Hz、3.0Hz)、5.27(1H、s)、3.81(3H、s)。
化合物1(0.8g、3.19mmol)を乾燥したDMF(30ml)に溶解した。乾燥させた炭酸カリウム(1.32g、9.57mmol)を添加し、得られた混合物をアルゴンで脱気した。得られた混合物にtert−ブチルブロモアセテート(0.71ml、4.78mmol)を添加し、攪拌しながら70℃で一晩反応させた。得られた反応混合物を室温にまで冷却し、水(20ml)で希釈した。得られた生成物をジエチルエーテル(3×50ml)で抽出し、硫酸ナトリウムを用いて乾燥した。得られた生成物を、シリカゲルを用いたフラッシュクロマトグラフィー(溶離液としてジクロロメタンを用いる)を行うことによって精製した。収量は、1.1g(96%)であった。1H NMR(CDCl3、500MHz): δ 7.66(1H、d、J=8.5Hz)、6.39(1H、dd、J=8.5Hz、2.5Hz)、6.34(1H、d、J=2.5)、4.57(2H、s)、3.79(3H、s)、1.51(9H、s)。
化合物2(1.05g、2.88mmol)を乾燥したDMF(20ml)に溶解した。ビス(ピナコラート)ジボロン(0.88g、3.46mmol)と酢酸カリウム(0.85g、8.64mmol)とを添加した。得られた反応混合物をアルゴンで脱気した。酢酸パラジウム(19.3mg、0.086mmol)を添加し、攪拌しながら85℃で3時間反応させた。得られた反応混合物を室温にまで冷却し、水(40ml)と酢酸エチル(40ml)とで希釈した。セライト(Celite)のパッドを用いた濾過によって黒色の粒子を除去した。有機層を分離し、水(30ml)で洗浄し、硫酸ナトリウムを用いて乾燥した。得られた生成物を、シリカゲルを用いたフラッシュクロマトグラフィー(溶離剤としてメタノールの3%ジクロロメタン溶液を用いる)を行うことによって精製した。収量は、0.26g(25%)であった。1H NMR(CDCl3、500MHz): δ 7.79(1H、d、J=8.5Hz)、6.59(1H、dd、J=8.5Hz、2.5Hz)、6.31(1H、d、J=2.5Hz)、4.54(2H、s)、3.83(3H、s)、1.55(9H、s)、1.28(12H、s)。
化合物3(0.11g、0.30mmol)とテトラ(tert−ブチル)−2,2’,2’’,2’’’−{[2−(4−アミノフェニル)エチルイミノ]ビス(メチレン)ビス(4−ブロモピリジン−6,2−ジイル}ビス(メチレンニトリロ)}テトラキス(アセテート)(0.10mg、0.10mmol)とを乾燥したDMF(5ml)に溶解した。得られた混合物をアルゴンで脱気した。得られた混合物に、炭酸セシウム(0.11g、0.34mmol)とテトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(4.6mg、0.004mmol)とを添加し、攪拌しながら80℃で一晩反応させた。得られた反応混合物を室温にまで冷却し、水(10ml)と酢酸エチル(10ml)とで希釈した。セライトのパッドを用いた濾過によって黒色の粒子を除去した。有機層を分離し、塩水(brine)(20ml)で洗浄し、硫酸ナトリウムを用いて乾燥した。得られた生成物を、シリカゲルを用いたフラッシュクロマトグラフィーを2回行うことによって精製した(溶離剤として、1回目はメタノールの5%ジクロロメタン溶液を用い、2回目はメタノールの10%ジクロロメタン溶液を用いる)。収量は、90.0mg(69%)であった。1H NMR(CDCl3、500MHz): δ 7.63−7.72(4H、m)、7.24(2H、s)、6.90(2H、d)、6.55(2H、d)、6.50(2H、d)、6.41(2H、s)、4.42(4H、s)、4.08(4H、s)、3.96(4H、s)、3.83(6H、s)、3.53(8H、s)、2.68−2.97(4H、m)、1.45(54H、m)。
化合物4(40.0mg、0.031mmol)をトリフルオロ酢酸(0.40ml)に溶解することによって得られる溶液を、室温で2時間攪拌した。加熱せずに蒸発を行った後、混合物をジエチルエーテル(10ml)でトリチュレート(triturate)して濾過した。濾過によって純粋な生成物が得られた。収量は、53mgであった。1H NMR (d6−DMSO、400MHz): δ 7.87(2H、m)、7.75(2H、s)、7.38(2H、m)、7.17(2H、m)、6.99(2H、m)、6.68(2H、d)、6.61(2H、m)、4.74(4H、s)、4.54(4H、s)、4.09(4H、m)、3.80(6H、s)、3.56(8H、s)、3.09(4H、m)。
化合物5(49.2mg、0.038mmol)を水(1ml)に溶解し、固体の炭酸水素ナトリウムを用いてpHを6.5に調整した。テルビウム(III)クロライドヘキサハイドレート(15.4mg、0.041mmol)を水(0.2ml)に溶解することによって得られる溶液を10分以内で添加し、固体の炭酸水素ナトリウムを用いてpHを6.5に維持した。攪拌しながら室温で2時間反応させた後、1Mの水酸化ナトリウムを用いてpHを8.5に上げ、得られる沈殿物を遠心分離によって除去した。濾液をアセトンで処理し、生成物を遠心分離によって集め、アセトンで洗浄した。生成物は精製せずに次の工程で用いた。収量は、19.6mg(47%)であった。UV(50mMのカーボネートバッファー、pHは9.8): 308、281。C48H48N6O16Tbのためのマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析計(MALDI TOF−MS): 計算値は1123.85、測定値は1122.85(M−1)-。
化合物6(18.4mg、0.016mmol)を水(0.5ml)に添加して得られる混合物をチオホスゲン(5.0μl、0.066mmol)、炭酸水素ナトリウム(6.9mg、0.082mmol)及びクロロホルム(0.5ml)の混合物に徐々に添加した。室温で1時間攪拌した後、水相をクロロホルム(3×1ml)で洗浄した。水溶液のpHを1Mの酢酸で7.0に調整し、アセトンを添加した。得られた生成物を遠心分離によって集め、アセトンで洗浄した。収量は、16.1mg(84%)であった。UV(50mMのカーボネートバッファー、pHは9.8): 310、278。C49H46N6O16STbのためのMALDI TOF−MS: 計算値は1165.91、測定値は1164.84(M−1)-。
開発したテルビウムキレートの、消光反応に基づく均質ハイブリダイゼーションアッセイにおける適合性を特徴付けるために、以下の配列:5'-AAT TTA GAA GTC ATT AGC GAG CAG GCT ACC G-3'(配列番号1)を有する5’アミノ修飾オリゴヌクレオチドプローブを、2種の異なるランタノイドキレートをそれぞれ用いた2種の個別の標識−精製反応によって標識し、精製した。使用したランタノイドキレートは、本発明のキレート(化合物7)、及び2,2’,2’’,2’’’−{{6,6’−{4’’−[2−(4−イソチオシアナトフェニル)エチル]−1H−ピラゾール−1’’,3’’−ジイル}ビス(ピリジン)−2,2’−ジイル}ビス(メチレンニトリロ)}テトラキス(アセタト)テルビウム(III)(米国特許第5,859,215号)である。本願明細書で使用する「消光反応に基づく均質ハイブリダイゼーションアッセイ」という用語は、例えば、Kiviniemi et al.(Clin Biochem. 2003 Nov; 36(8):633-40. A homogeneous high-throughput genotyping method based on competitive hybridization. Kiviniemi M, Nurmi J, Turpeinen H, Lovgren T, Ilonen J.)に記載されている核酸検出方法を意味する。Nurmi et al.(Anal Chem. 2002 Jul 15; 74(14):3525-32. High-performance real-time quantitative RT-PCR using lanthanoid probes and a dual-temperature hybridization assay. Nurmi J, Wikman T, Karp M, Lovgren T.)に記載された方法に従って各キレートでプローブを標識し、精製した。以下の実験では、同じ塩基配列を有するが、標識として異なるテルビウムキレートを保有する2種のプローブ、即ち、本発明のキレート(化合物7)で標識したプローブ及び従来技術のキレートで標識したプローブをそれぞれプローブ1及びプローブ2と称する。
1. 1×PCRバッファーIIと2.5mMのMgCl2(米国、フォスターシティー、Applied Biosystems社)で調製した17nMのプローブ1を含む50μlの反応系。
2. 1×PCRバッファーIIと2.5mMのMgCl2(米国、フォスターシティー、Applied Biosystems社)で調製した17nMのプローブ1と170nMの消光プローブを含む50μlの反応系。プローブ1とプローブ2に相補的な消光プローブの配列は5'-TCG CTA ATG ACT TCT AAA TT-3'(配列番号2)であり、3’末端に消光ラベルQSY7を保有している。
3. 1×PCRバッファーIIと2.5mMのMgCl2(米国、フォスターシティー、Applied Biosystems社)で調製した17nMのプローブ2を含む50μlの反応系。
4. 1×PCRバッファーIIと2.5mMのMgCl2(米国、フォスターシティー、Applied Biosystems社)で調製した17nMのプローブ2と170nMの消光プローブを含む50μlの反応系。
PCR産物の均質検出における本発明のテルビウムキレート(化合物7)の適合性を特徴付けるために、細菌であるListeria monocytogenesに特異的なポリメラーゼ連鎖反応(PCR)アッセイを用いてプローブ1(上記実施例8に記載)とプローブ2(上記実施例8に記載)を比較した。PCRアッセイにおけるシグナル発生の原理はNurmi et al.(Anal Chem. 2002 Jul 15;74(14):3525-32. High-performance real-time quantitative RT-PCR using lanthanide probes and a dual-temperature hybridization assay. Nurmi J, Wikman T, Karp M, Lovgren T.)に記載されている。
1. Listeria monocytogenesのDNAを含まない、プローブ1の負の対照反応系。
2. 反応によって増幅するためのListeria monocytogenesのDNAを1,000コピー含む、プローブ1の正の対照反応系。
3. Listeria monocytogenesのDNAを含まない、プローブ2の負の対照反応系。
4. 反応によって増幅するためのListeria monocytogenesのDNAを1,000コピー含む、プローブ2の正の対照反応系。
配列番号2: 公知でない
配列番号3: 公知でない
配列番号4: 公知でない
Claims (10)
- 発光性ランタノイドキレートに保持された生体特異的結合反応性物質を含む検出可能な分子であって、該発光性ランタノイドキレートが、ランタノイドイオンと、下記式(I)で表されるキレートリガンドからなる、ことを特徴とする検出可能な分子。
a) R1AとR1Bは各々、独立的に、水素原子、メチル、エチル、−COOH、−COO-、−CH2COOH、−CH2COO-、ヒドロキシル及び−OR2からなる群より選ばれ;
b) R2は、−CH3、−C(CH3)3 及び−C(CR4)3からなる群より選ばれ、但しR4は炭素数1〜6のアルキル、−CH2COOH、−CH2COO-、
c) R3は生体特異的結合反応性物質に連結するためのリンカーであり、チオウレア(−NH−CS−NH−)、アミノアセトアミド(−NH−CO−CH2−NH−)、アミド(−NH−CO−と−CO−NH−)、脂肪族チオエーテル(−S−)、ジスルフィド(−S−S−)及び6−置換−1,3,5−トリアジン−2,4−ジアミンからなる群より選ばれ;そして
d) ランタノイドイオンは、ユーロピウム(III)、テルビウム(III)、ジスプロジウム(III)及びサマリウム(III)からなる群より選ばれる。 - 生体特異的結合反応性物質が、抗体、抗原、受容体リガンド、特異的結合性タンパク質又はペプチド、核酸分子、DNA又はRNAプローブ、核酸誘導体、及び、核酸と核酸誘導体からなる群より選ばれる少なくとも1種を含むキメラ分子、からなる群より選ばれることを特徴とする請求項1に記載の検出可能な分子。
- 生体特異的結合反応性物質に保持された発光性ランタノイドキレートが{2,2’,2’’,2’’’−{[2−(4−イソチオシアナトフェニル)エチルイミノ]ビス(メチレン)ビス{4−[2−メトキシ−4−(カルボキシメトキシ)フェニル]ピリジン−6,2−ジイル}ビス(メチレンニトリロ)}テトラキス(アセタト)}テルビウム(III)であることを特徴とする請求項1に記載の検出可能な分子。
- リンカーであるR3が6−置換−1,3,5−トリアジン−2,4−ジアミンであり、6位の置換基が、水素原子、ハロゲン原子、アルコキシ、アリーロキシ、アミノ、炭素数1〜6のアルキル、置換アミノ及び置換チオエーテルからなる群より選ばれる、ことを特徴とする請求項1に記載の検出可能な分子。
- 6位の置換基が、塩素原子、フッ素原子、エトキシ、2−メトキシエトキシ、2−シアノエトキシ、2,2,2−トリフルオロエトキシ、チオフェノキシ及びエトキシカルボニルチオメトキシからなる群より選ばれる、ことを特徴とする請求項4に記載の検出可能な分子。
- ランタノイドイオンと、下記式(I)で表されるキレートリガンドからなる、ことを特徴とする発光性ランタノイドキレート。
a) R1AとR1Bは各々、独立的に、水素原子、メチル、エチル、−COOH、−COO-、−CH2COOH、−CH2COO-、ヒドロキシル及び−OR2からなる群より選ばれ;
b) R2は、−CH3、−C(CH3)3 及び−C(CR4)3からなる群より選ばれ、但しR4は炭素数1〜6のアルキル、−CH2COOH、−CH2COO-、
c) R3は生体特異的結合反応性物質に連結するためのリンカーであり、アミノ、アミノオキシ、カルボキシ、アルデヒド、メルカプト及びそれらの活性誘導体からなる群より選ばれ;そして
d) ランタノイドイオンは、ユーロピウム(III)、テルビウム(III)、ジスプロジウム(III)及びサマリウム(III)からなる群より選ばれる。 - リンカーであるR3が、イソシアナト、イソチオシアナト、ジアゾニウム、ブロモアセトアミド、ヨードアセトアミド、反応性エステル類、ピリジル−2−ジチオ及び6−置換−4−クロロ−1,3,5−トリアジン−2−イルアミノからなる群より選ばれる活性誘導体である、ことを特徴とする請求項6に記載の発光性ランタノイドキレート。
- リンカーであるR3が6−置換−4−クロロ−1,3,5−トリアジン−2−イルアミノであり、6位の置換基が、水素原子、ハロゲン原子、アルコキシ、アリーロキシ、アミノ、炭素数1〜6のアルキル、置換アミノ及び置換チオエーテルからなる群より選ばれる、ことを特徴とする請求項6に記載の発光性ランタノイドキレート。
- 6位の置換基が、塩素原子、フッ素原子、エトキシ、2−メトキシエトキシ、2−シアノエトキシ、2,2,2−トリフルオロエトキシ、チオフェノキシ及びエトキシカルボニルチオメトキシからなる群より選ばれる、ことを特徴とする請求項8に記載の発光性ランタノイドキレート。
- 生体から得た試料を分析するための生体特異的結合アッセイにおける、請求項1〜5のいずれかの検出可能な分子の使用。
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