JP5002748B2 - β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 - Google Patents
β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5002748B2 JP5002748B2 JP2007522364A JP2007522364A JP5002748B2 JP 5002748 B2 JP5002748 B2 JP 5002748B2 JP 2007522364 A JP2007522364 A JP 2007522364A JP 2007522364 A JP2007522364 A JP 2007522364A JP 5002748 B2 JP5002748 B2 JP 5002748B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- polymorphism
- blocker
- receptor
- reactivity
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K49/00—Preparations for testing in vivo
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
- A61P9/04—Inotropic agents, i.e. stimulants of cardiac contraction; Drugs for heart failure
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Cardiology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Heart & Thoracic Surgery (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Description
A) ノルエピネフリントランスポーター(Norepinephrine transporter)、BNP(Natriuretic peptide precursor B:B型ナトリウム利尿ペプチド)、エンドセリン1(Endothelin 1)、エンドセリン受容体A(Endothelin rececptor A)、アンギオテンシン受容体2(Angiotensin II receptor type2)、アデニル酸シクラーゼ9(Adenylate cyclase 9)、インターロイキン10(Interleukin 10)、G蛋白βサブユニット4(G-protein βsubunit 4)、マトリックスメタロプロテアーゼ8(Matrix Metalloproteinase 8)、アドレナリンα1B受容体(Adrenergic receptor α1B)、ミネラルコルチコイド受容体、TNF(Tumor necrosis factor-α:腫瘍壊死因子)、リアノジン受容体3、アデゥーシン1、アデノシン1リン酸脱アミノ酵素1、アドレナリンα2C受容体、エンドセリン受容体B、アンギオテンシン受容体1、リアノジン受容体2、βアレスチン1、パラオキソナーゼ2、SOD(superoxide dismutase)2、アドレナリン受容体β3,エンドセリン2、ANP、パラオキソナーゼ1、GATA6、ADRBK1(アドレナリン受容体βK1)、およびアドレナリン受容体α1Aをそれぞれコードする遺伝子群から選ばれる1又は2以上の遺伝子の多型を検査し、その結果に基づき、被検者のβ遮断薬に対する反応性を予測する方法。
B) 心不全治療その他心機能の改善を目的とした薬物治療において、β遮断薬に対する患者の反応性予測に使用する、上記A)記載の方法。
C) 上記A)記載の方法において、2以上の遺伝子多型に基づいて被検者のβ遮断薬反応性を予測する方法であって、各遺伝子多型についてそれぞれの遺伝子型に対して固有の値を割り振り、各遺伝子多型の値を検査により決定した後、これらの値の合計値に基づき、β遮断薬反応性を予測する方法。
D) 上記A)記載の方法において、2以上の遺伝子多型に基づいて被検者のβ遮断薬反応性を予測する方法であって、各遺伝子多型について判別係数を設定すると共にそれぞれの遺伝子型に対して固有の値を割り振り、各遺伝子多型の値を検査により決定した後、各値にそれぞれの判別係数を乗じた値の合計値に基づき、β遮断薬反応性を予測する方法。
E) 上記判別係数は、各遺伝子多型とβ遮断薬反応性との関連を示す先のデータその他の情報を考慮して設定され、新たな情報に応じて適宜更新されることを特徴とする、上記D)記載の方法。
F) 上記A)記載の方法において、2以上の遺伝子多型に基づいて被検者のβ遮断薬反応性を予測する方法であって、2以上の遺伝子多型によって決定木を構成すると共に各遺伝子多型についてそれぞれの遺伝子型に対して固有の値を割り振り、各遺伝子多型の値を検査により決定した後、上記決定木にしたがってβ遮断薬反応性を予測する方法。
G) 上記C)〜F)のいずれかに記載の方法を用いて、被検者のβ遮断薬反応性予測をコンピュータに実行させる、β遮断薬反応性予測用プログラム。
H) 上記A)記載の方法において、遺伝子多型の検査は、被検者から調製したゲノムDNAを鋳型にして、多型部位を挟む遺伝子領域を増幅する工程と、得られた増幅断片をもとに遺伝子型を決定する工程とを含む方法。
I) 上記A)記載の方法において、DNAチップ等の遺伝子多型検査器具を用いて遺伝子多型を検査する方法。
J) 上記K)記載の方法に使用される、遺伝子多型検査用オリゴヌクレオチド。
K) 上記A)に記載される分子のいずれかを標的(創薬ターゲット)とした心機能改善薬のスクリーニング方法。
L) 上記A)〜F)のいずれかに記載の方法によるβ遮断薬反応性を予測のために使用する遺伝子多型マーカー。
M) 上記A〜F)のいずれかに記載の方法によるβ遮断薬反応性を予測するための遺伝子多型の使用。
N) 上記A〜F)のいずれかに記載の方法によるβ遮断薬反応性を予測して、前記β遮断薬を投与するβ遮断薬の投与方法。
O) 上記A〜F)のいずれかに記載の方法によりβ遮断薬反応性を予測して、β遮断薬を投与するか否かを診断する診断方法。
本発明者は、前述のように、解析対象として抽出した候補遺伝子に存在する各多型とβ遮断薬反応性との関連性の有無について網羅的な解析を行った結果、β遮断薬に対する反応性予測に有用な複数の遺伝子多型を見出した。図1及び図2はその結果の一例(A)であり、図12〜図14は、その他の例(B)である。
(i)翻訳開始点より下流に存在し、エキソン上にある遺伝子多型の場合:
各多型の数値は、翻訳開始点から当該遺伝子多型までのmRNA上における塩基数を示す。
たとえば、多型(イ)は「C2507T」と特定され、表記される。
(ii)翻訳開始点より下流に存在し、イントロン上にある遺伝子多型の場合:
各多型は、イントロンの番号と、そのイントロンの末端から当該遺伝子多型までの塩基数で示される。正の数の場合は、イントロンの上流末端から当該遺伝子多型までの塩基数、負の数の場合は、イントロンの下流末端から当該遺伝子多型までの塩基数を示す。たとえば、多型(ロ)は「イントロン3 A+60G」、多型(ハ)は「イントロン5 A-13C」とそれぞれ特定され、表記される。
(iii)翻訳開始点より上流に存在する遺伝子多型の場合:
各多型の数値は、翻訳開始点から当該遺伝子多型までの塩基数を負の数で示す。たとえば、多型(ニ)は「T-182C」、多型(ホ)は「G-1387A」とそれぞれ特定され、表記される。
本発明において、各遺伝子多型を調べる方法は特に制限されるものではなく、遺伝子上の多型を直接的または間接的に調べることが可能な従来公知の方法を適用することができ、今後開発される方法を使用してもよい。今回の解析に用いた、PCR法により各遺伝子多型を検査する方法は簡易な方法であり、精度も良好であるので、以下ではこの方法について簡単に説明する。
前述のように、心不全治療におけるβ遮断薬の有効性は現在認められているところであるが、しかし、β遮断薬の心機能改善効果がどのような作用機序によるものか、その薬理作用は依然として明らかになっていない。
Claims (8)
- 下記12種の遺伝子多型:
ノルエピネフリントランスポーター(Norepinephrine transporter) T-182C、
アンギオテンシン受容体2(Angiotensin II receptor type2) A-1342G、
G蛋白βサブユニット4 イントロン1 C-1809G、
BNP(Natriuretic peptide precursor B:B型ナトリウム利尿ペプチド) T-381C、
ミネラルコルチコイド受容体 Ile180Val(A538G)、
アンギオテンシン変換酵素 イントロン16 I/D、
インターロイキン10 A-1082G、
アドレナリンα2C受容体 Del 322-325、
アデゥーシン1 イントロン4 +1548 G/C、
リアノジン受容体3 Ile731Val(A2191G)、
アデノシン1リン酸脱アミノ酵素1 -1724 C/T、および
TNF(Tumor necrosis factor-α:腫瘍壊死因子) C-1037T
について判別係数を設定すると共にそれぞれの遺伝子型に対して固有の値を割り振り、各遺伝子多型の値を検査により決定した後、各値にそれぞれの判別係数を乗じた値の合計値に基づきβ遮断薬反応性を予測する方法。 - 上記判別係数は、各遺伝子多型とβ遮断薬反応性との関連を示す先のデータその他の情報を考慮して設定され、新たな情報に応じて適宜更新されることを特徴とする、請求項1記載の方法。
- 下記(a)の6種の遺伝子多型又は(b)の7種の遺伝子多型によって決定木を構成すると共に各遺伝子多型についてそれぞれの遺伝子型に対して固有の値を割り振り、各遺伝子多型の値を検査により決定した後、上記決定木にしたがってβ遮断薬反応性を予測する方法。
遺伝子多型(a):
エンドセリン受容体A(Endothelin rececptor A) C2507T、
ノルエピネフリントランスポーター(Norepinephrine transporter) T-182C、
エンドセリン受容体B A831G、
リアノジン受容体2 イントロン33+91 G/A、
アンギオテンシン受容体1 C-43646T、
エンドセリン1(Endothelin 1) Lys198Asn(T594G);
遺伝子多型(b):
エンドセリン1(Endothelin 1) Lys198Asn(T594G)、
アンギオテンシン受容体2(Angiotensin II receptor type2) イントロン1 A-29G、
リアノジン受容体2 イントロン33+91 G/A、
ノルエピネフリントランスポーター(Norepinephrine transporter) イントロン7 A-13C、
リアノジン受容体2 T1359C、
βアレスチン1 G1279A、
アデニル酸シクラーゼ9(Adenylate cyclase 9) イントロン9 G+60A - 心不全治療その他心機能の改善を目的とした薬物治療において、β遮断薬に対する患者の反応性予測に使用する、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法を用いて、被検者のβ遮断薬反応性予測をコンピュータに実行させる、β遮断薬反応性予測用プログラム。
- 請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法において、遺伝子多型の検査は、被検者から調製したゲノムDNAを鋳型にして、多型部位を挟む遺伝子領域を増幅する工程と、得られた増幅断片をもとに遺伝子型を決定する工程とを含む方法。
- 請求項1〜4又は6のいずれか1項に記載の方法において、遺伝子多型検査器具を用いて遺伝子多型を検査する方法。
- 請求項7記載の方法に使用される、遺伝子多型検査用オリゴヌクレオチド。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2007522364A JP5002748B2 (ja) | 2005-06-24 | 2006-06-22 | β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 |
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2005185355 | 2005-06-24 | ||
JP2005185355 | 2005-06-24 | ||
JP2007522364A JP5002748B2 (ja) | 2005-06-24 | 2006-06-22 | β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 |
PCT/JP2006/312519 WO2006137487A1 (ja) | 2005-06-24 | 2006-06-22 | β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2006137487A1 JPWO2006137487A1 (ja) | 2009-01-22 |
JP5002748B2 true JP5002748B2 (ja) | 2012-08-15 |
Family
ID=37570514
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2007522364A Expired - Fee Related JP5002748B2 (ja) | 2005-06-24 | 2006-06-22 | β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP5002748B2 (ja) |
WO (1) | WO2006137487A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR102343561B1 (ko) * | 2020-07-28 | 2021-12-28 | 이화여자대학교 산학협력단 | 조기진통 환자에 대한 리토드린 투여 반응성 예측용 adcy9 snp 마커 및 이의 용도 |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9062347B2 (en) * | 2007-07-27 | 2015-06-23 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Endothelin single nucleotide polymorphisms and methods of predicting β-adrenergic receptor targeting agent efficacy |
JP6053267B2 (ja) * | 2010-09-03 | 2016-12-27 | 公益財団法人東京都医学総合研究所 | アドレナリン受容体遺伝子解析による薬物感受性および疾患脆弱性の評価方法 |
US20140004105A1 (en) * | 2012-06-29 | 2014-01-02 | Sequenom, Inc. | Age-related macular degeneration diagnostics |
-
2006
- 2006-06-22 JP JP2007522364A patent/JP5002748B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2006-06-22 WO PCT/JP2006/312519 patent/WO2006137487A1/ja active Application Filing
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR102343561B1 (ko) * | 2020-07-28 | 2021-12-28 | 이화여자대학교 산학협력단 | 조기진통 환자에 대한 리토드린 투여 반응성 예측용 adcy9 snp 마커 및 이의 용도 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2006137487A9 (ja) | 2007-05-18 |
WO2006137487A1 (ja) | 2006-12-28 |
JPWO2006137487A1 (ja) | 2009-01-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6496003B2 (ja) | Fgf−18化合物に対する応答性を予測するための遺伝子マーカー | |
CN107760779B (zh) | 肺动脉高压相关的突变型bmp9基因及其应用 | |
JP6272860B2 (ja) | 軟骨障害の予後バイオマーカー | |
JP5002748B2 (ja) | β遮断薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 | |
KR20230154405A (ko) | 대사 증후군에 대한 정보 제공 방법 및 이를 이용한 키트 | |
JP5578536B2 (ja) | 高血圧の遺伝的リスク検出法 | |
KR102565803B1 (ko) | 고혈압에 대한 정보 제공 방법 및 이를 이용한 키트 | |
JP6516128B2 (ja) | 抗甲状腺薬誘発性無顆粒球症リスクを判定するための検査方法及び判定用キット | |
JP5002746B2 (ja) | 抗うつ薬に対する反応性予測に有用な遺伝子多型 | |
EP2410050B1 (en) | Fertility test method, polynucleotide, polypeptide and antibody | |
US20220235418A1 (en) | Use of Biomarkers for Degenerative Disc Disease | |
KR20220028329A (ko) | 심혈관계 질환에 대한 정보 제공 방법 및 이를 이용한 키트 | |
CN113265410A (zh) | Tomm40突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途 | |
CN113265405A (zh) | Samm50突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途 | |
JP5809205B2 (ja) | 骨粗鬆症感受性遺伝子、及び骨粗鬆症罹患リスクの測定方法 | |
JP5506013B2 (ja) | 骨粗鬆症感受性遺伝子、及び骨粗鬆症罹患リスクの測定方法 | |
CN113186193A (zh) | Hscb突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途 | |
CN113308534A (zh) | Vdac1突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途 | |
JP4686713B2 (ja) | 関節リウマチの検査方法、関節リウマチ診断薬、及びそれに用いられるプライマー | |
JP5791171B2 (ja) | 第1染色体長腕24領域、neurl遺伝子、またはcux2遺伝子の一塩基多型に基づく不整脈の検査方法 | |
JP2009065882A (ja) | 妊孕性に関連するポリヌクレオチドおよびその利用 | |
CN113215169A (zh) | Timm44突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途 | |
JP2010088342A (ja) | 高血圧発症に関する一塩基多型(snp)マーカー及びその使用方法 | |
JP2012231752A (ja) | 炎症性腸疾患患者におけるアザチオプリン(azt)の血中濃度の安定性を予測するジェネティックバイオマーカー | |
WO2009036513A1 (en) | Diagnostic and therapeutic protocols |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20090612 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20110920 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20111114 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20111206 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20120206 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20120228 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 Effective date: 20120327 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20120327 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20120327 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20150601 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S531 | Written request for registration of change of domicile |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313531 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |