JP4438502B2 - マイクロチップ分析方法及び装置 - Google Patents
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Description
例えば、板状部材の内部に分離用流路を含む電気泳動流路を有するマイクロチップを使用し、その分離用流路の一端側に導入されたDNA、RNA又はタンパク質などの試料をその分離用流路の両端間に印加した電圧によりその分離用流路の他端方向に電気泳動させることにより分離させて分析するマイクロチップ電気泳動方法と装置に関するものである。
マイクロチップ電気泳動において、1つの電気泳動流路を有する単一のマイクロチップを繰り返し使用して、バッファ液の充填、試料分注、電気泳動及び分離された試料成分の検出を自動で行う装置が開発されている(特許文献1参照。)。
主流路で分離された試料成分の検出では蛍光検出が行なわれる。蛍光検出器では主流路の特定箇所又は主流路の所定の長さに沿って励起光を照射し、試料成分が励起されて発光する蛍光を検出する。その場合、励起波長と検出する蛍光波長はそれぞれ1種類に限られる。
蛍光検出において、試料数が12より少ない場合は使用されない電気泳動流路ができるため、無駄が生じ、コスト高となる。
蛍光検出において、例えば、DNAをCy3(励起波長550nm/蛍光波長570nm)とCy5(励起波長650nm/蛍光波長668nm)で蛍光染色したサンプルを同時に分析したい場合がある。しかし従来は、励起波長と蛍光波長の組み合わせが一つしかないため、2以上の蛍光を同時に分析することができない。
液体クロマトグラフィについても同じ問題がある。
ここで、「分析」の語は、マイクロチップ電気泳動における電気泳動分離及び検出、液体クロマトグラフィにおけるカラムでの分離・溶出及び検出、並びに反応装置における反応及び反応生成物の検出を含む意味で使用している。
前処理工程はまた、分離バッファ液を充填しようとする電気泳動流路が先に別の試料を処理したものである場合には、分離バッファ液の充填に先立ってその分離バッファ液でその電気泳動流路を洗浄する工程を含むことができる。
このマイクロチップ分析装置はマイクロチップ電気泳動装置とマイクロチップ液体クロマトグラフを含んでいる。
本発明を電気泳動分離に適用した場合には、分離バッファ液の充填を分注装置で行なうため、複数の分離バッファ液から試料に適したものを選択して分注することができる。
また泳動電圧の印加は電気泳動流路ごとに独立して設定できるので、試料ごとに電気泳動分離条件を設定することができる。
本方法はバッチ処理ではないので、試料数によらず無駄が生じない。
また、サンプル毎に励起波長と蛍光波長の組み合わせを独立して選択し分析できるので、複数の蛍光試薬で染色されたサンプルを同時に分析できる。すなわち多項目の分析ができる。サンプル数に関係なく処理ラインに無駄が生じず、ランニングコストが割高とならなくて、処理時間を短縮することができる。
2は分注部で、シリンジポンプ4により、分離バッファ液と試料を吸入しマイクロチップの電気泳動流路の一端に注入するものであり、複数の電気泳動流路について共通に設けられている。16は電気泳動流路の一端に注入された分離バッファ液を空気圧により電気泳動流路に充填し、不用な分離バッファ液を吸引ポンプ部23により排出する分離バッファ充填・排出部であり、分離バッファ充填・排出部16も処理しようとする複数の電気泳動流路について共通に設けられている。26は電気泳動流路のそれぞれに独立して泳動用電圧を印加する電気泳動用高圧電源部である。31は電気泳動流路で分離された試料成分を検出する検出部の例としての蛍光測定部である。38は制御部で、1つの電気泳動流路への分離バッファ液充填及び試料注入が終了すると次の電気泳動流路への分離バッファ液充填及び試料注入に移行するように分注部2の動作を制御し、試料注入が終了した電気泳動流路で泳動電圧を印加して電気泳動を起こさせるように電気泳動用高圧電源部26の動作を制御し、蛍光測定部31による検出動作を制御するものである。40はこのマイクロチップ電気泳動装置の動作を指示したり、蛍光測定部31が得たデータを取り込んで処理したりするための外部制御装置としてのパーソナルコンピュータである。
LED30−1、30−2は蛍光色素Cy3を励起するのに適した550nmの波長光を含む発光するLEDであり、それらのLED30−1、30−2により励起された蛍光が導かれるフィルタ34−1は570nmの蛍光を透過させる干渉フィルタである。
LED30−3、30−4は蛍光色素Cy5を励起するのに適した650nmの波長光を含む発光するLEDであり、それらのLED30−1、30−2により励起された蛍光が導かれるフィルタ34−2は668nmの蛍光を透過させる干渉フィルタである。
LED30−1〜30−4を互いに時間をずらして発光させることにより、1つの光電子増倍管36で4つの蛍光を識別して検出することができる。
なお、励起光の光源としては、LEDに限らずLD(レーザダイオード)を用いてもよい。
LED31−1〜31−4は蛍光色素Cy3を励起するのに適した550nmの波長光を含む発光するLEDであり、それらのLED31−1〜31−4により励起された蛍光が導かれるフィルタ34−1は570nmの蛍光を透過させる干渉フィルタである。
LED31−5〜31−8は蛍光色素Cy5を励起するのに適した650nmの波長光を含む発光するLEDであり、それらのLED31−5〜31−8により励起された蛍光が導かれるフィルタ34−2は668nmの蛍光を透過させる干渉フィルタである。
上記各光学系の光源を順に点灯し同時に蛍光検出して、時間的に複数の流路をスキャンする。
各工程は時間で設定され、前処理工程は40秒、電気泳動・測光工程は120秒に設定されており、1つのマイクロチップについての1サイクルは160秒である。
最上段の数値は時間(秒)を表わしている。「マイクロチップ」の欄は1つのマイクロチップにおける処理の内容を示したものである。「分注部」欄はシリンジポンプ4により行なわれるプローブ8からの分離バッファ液と試料の吸引と吐出動作を示している。
4 シリンジポンプ
5,5−1〜5−4 マイクロチップ
8 プローブ
16 分離バッファ充填・排出部
26(26−1〜26−4) 電気泳動用高圧電源部
30−1〜30−4 31−1〜31−8 LED
32−1〜32−8 33−1〜33−8 光ファイバ
36 光電子増倍管
38 制御部
Claims (12)
- 1台の共通の分注装置と分析用の複数の処理部を備えた分析装置を用い、板状部材の内部に溶液が移動しつつ分析が行なわれる主流路を少なくとも備えたマイクロチップを使用して分析を行なうマイクロチップ分析方法において、
前記主流路の複数個を、各主流路が前記処理部のそれぞれに対応するように保持部に配置しておき、
前記分注装置を用い、前記保持部に配置された状態の主流路に対して、1つの主流路における前処理工程が終了すると次の主流路の前処理工程に移行するように進められる前処理工程と、
前記保持部に配置された状態の主流路に対して、主流路ごとに独立して行なわれ、前処理工程が終了した主流路では前処理工程に続いて分析工程が開始されることにより他の主流路の分析工程とは異なる開始時間をもって実行される分析工程と、を備え、
前記分析工程での検出は主流路毎に励起波長と蛍光波長を設定して蛍光検出を行なうことを特徴とするマイクロチップ分析方法。 - 前記主流路には1つの主流路での検出を複数の励起波長と蛍光波長により行なうものを含んでいる請求項1に記載のマイクロチップ分析方法。
- 分析依頼時に励起波長と蛍光波長の組み合わせからなる分析項目を選択する請求項1又は2に記載のマイクロチップ分析方法。
- 前記マイクロチップは主流路としての分離用流路を含む電気泳動流路を備えており、前記分析工程は前記分離用流路の一端側に導入された前記溶液としての試料をその分離用流路の両端間に印加した電圧によりその分離用流路の他端方向に電気泳動させることにより分離させて検出する電気泳動工程であり、
前記前処理工程は、前記電気泳動流路への分離バッファ液充填と試料注入を少なくとも含んでいる請求項1〜3に記載のマイクロチップ分析方法。 - 前記前処理工程は、分離バッファ液を充填しようとする電気泳動流路が先に別の試料を分析したものである場合には、分離バッファ液の充填に先立ってその分離バッファ液でその電気泳動流路を洗浄する工程を含んでいる請求項4に記載のマイクロチップ分析方法。
- 前記電気泳動流路は分離用流路に交差して試料導入用流路が設けられたクロスインジェクション方式の流路であり、前記電気泳動工程は試料導入用流路の一端に導入された試料を分離用流路との交差部に導入する工程と、交差部に導入された試料を分離用流路で分離して検出する工程とを含んでいる請求項4又は5に記載のマイクロチップ分析方法。
- 前記マイクロチップは主流路として分離用カラムを含む送液流路を備えており、前記分析工程は前記分離用カラムの一端側に導入された前記溶液としての試料をその分離用カラムの他端方向に移動させることにより分離させて検出する液体クロマトグラフィ工程であり、
前記前処理工程は、前記分離用カラムへの試料注入を少なくとも含んでいる請求項1〜3に記載のマイクロチップ分析方法。 - 前記マイクロチップには前記主流路は1つだけ設けられている請求項1から7のいずれかに記載のマイクロチップ分析方法。
- 板状部材の内部に溶液が移動しつつ分析が行なわれる主流路を少なくとも備えたマイクロチップを保持する保持部であって、該保持部に配置される主流路の数が複数個となるようにマイクロチップを保持しておく保持部と、
前記主流路における分析工程に先立って前処理工程を行なうための1台の共通の前処理部と、
前記保持部に配置された前記主流路における分析工程を主流路のそれぞれで独立して行なわせるように前記保持部に配置される主流路ごとに設置された処理部であって、それぞれに独立した励起波長と蛍光波長を選択できる蛍光検出部を備えた処理部と、
1つの主流路における前処理工程が終了すると次の主流路用の前処理工程に移行するように前記前処理部の動作を制御し、前処理工程が終了した主流路では前処理工程に続いて分析工程を行なわせることによりその主流路での分析工程が他の主流路の分析工程とは異なる開始時間をもって実行されるように前記処理部の動作を制御する制御部とを備えたマイクロチップ分析装置。 - 前記マイクロチップは主流路としての分離用流路を含む電気泳動流路を備えたものであり、
前記前処理部は前記電気泳動流路への分離バッファ液充填と試料注入を少なくとも行なう分注部であり、
前記処理部は前記電気泳動流路のそれぞれに独立して泳動用電圧を印加することのできる電気泳動用高圧電源部と、前記電気泳動流路で分離された試料成分を検出する前記蛍光検出部とを含んでおり、
前記制御部は、1つの電気泳動流路への前処理工程が終了すると次の電気泳動流路の前処理工程に移行するように前記分注部の動作を制御し、前処理工程が終了した電気泳動流路で泳動電圧を印加して電気泳動を起こさせるように前記電気泳動用高圧電源部の動作を制御するものである請求項9に記載のマイクロチップ分析装置。 - 前記マイクロチップは主流路として分離用カラムを含む送液流路を備え、前記分離用カラムの一端側に導入された前記溶液としての試料をその分離用カラムの他端方向に移動させることにより分離させて検出する処理を行なう液体クロマトグラフィを行なうものであり、
前記前処理部は前記分離用カラムへの試料注入を少なくとも行なう分注部であり、
前記処理部は前記分離用カラムのそれぞれに独立して移動相を供給することのできる移動相供給機構と、前記分離用カラムで分離された試料成分を検出する前記蛍光検出部とを含んでおり、
前記制御部は、1つの分離用カラムへの前処理工程が終了すると次の分離用カラムの前処理工程に移行するように前記分注部の動作を制御し、前処理工程が終了した分離用カラムで移動相を供給して分離を起こさせるように前記移動相供給機構の動作を制御するものである請求項9に記載のマイクロチップ分析装置。 - 前記蛍光検出部は複数の励起波長と蛍光波長で測定できるものである請求項9又は10のいずれかに記載のマイクロチップ分析装置。
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