JP3683778B2 - 新規成長因子およびそれをコードする遺伝子配列 - Google Patents

新規成長因子およびそれをコードする遺伝子配列 Download PDF

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Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は一般に血管内皮成長因子様特性を有する単離分子およびそれをコードする遺伝子配列に関する。この分子は脈管構造および/または血管の透過性の増大または低減を要する症状の、ある領域の処置、予防および診断に有用である。本発明の分子はまた主要かつ中枢ニューロンの有用なエフェクターであり、大グリア細胞の増殖を誘導し得る。
【0002】
【従来の技術および発明が解決しようとする課題】
血管内皮成長因子(vascular endothorial growth factor、以下「VEGF」という)は、血管作動性透過因子ともいうが、内皮組織を特異的に活性化するホモ2量体グリコプロテインと共有結合して分泌される(Sengerら、1993年)。ある領域の機能はVEGFに起因するものであり、そのかかわりあいは黄体の形成(Yanら、1993年)および胎盤発達(Sharkeyら、1994年)を含む正常な脈管形成、血管透過性の制御(Sengerら、1993年)、炎症性の脈管形成(Sunderkotterら、1994年)および自家移植(Dissenら、1994年)、腫瘍助長脈管形成(Folkman & Shing、1992年)、リューマチ性関節炎(Kochら、1994年)および糖尿病性網膜症(Folkman & Shing)などのヒトの疾患である。
【0003】
従って、VEGFはVEGFまたはその作用に基づく治療、予防および診断の研究の有力な価値ある標的となる重要な分子である。また、VEGFの代わりとしてまたはVEGFと関連させて使用する同族体または他の関連分子を確認する必要性が存在する。
【0004】
この発明の糸口となる研究において、発明者らは多数の内分泌新形成タイプI感受性遺伝子(multiple endocrine neoplasia type I:MEN1)を追及していた。驚くべきことに、発明者らはMEN1遺伝子の候補としては除外していた遺伝子配列が、それにもかかわらずVEGFとある類似性を有する新規な成長因子であることを発見した。さらに、本発明の成長因子は主要かつ中枢ニューロンのエフェクター分子である。
【0005】
【課題を解決するための手段】
すなわち、本発明の1つの態様は、アミノ酸配列:
(i)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列に少なくとも約15%類似しており;
(ii)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列に少なくとも5%非類似である
を含む生物学的に分離されたタンパク様分子を含む。
【0006】
本発明の他の態様は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分に少なくとも約15%類似しているが、少なくとも5%非類似であり;
(ii)少なくとも1つVEGFと共通の性質を示す
を含む生物学的に分離されたタンパク様分子を提供する。
【0007】
本発明の関連した態様は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列に少なくとも約15%の類似性を有するが、少なくとも5%の非類似性を有し;
(ii)下記の特性:
(a)血管内皮細胞の増殖を誘導する能力
(b)受容体のflt-1/flk-1族と相互作用する能力
(c)細胞移動、細胞生存および/またはアルカリホスファターゼの細胞内濃度
の増大を誘導する能力
を示す;を含む生物学的に分離されたタンパク様分子を含む。
【0008】
「生物学的に分離された」とは、分子が生物学的資源から少なくとも1工程の精製が行われたことをいう。好ましくは、また、組成物中の他の化合物に対して組成物が、重量で測定された分子の少なくとも約20%、より好ましくは少なくとも約40%、さらに好ましくは約65%、なお好ましくは少なくとも約80−90%またはそれ以上の活性または他の有用な手段を含むという生物学的に純粋な意味であることをいう。最も好ましくは分子が配列的に純粋であることをいう。
【0009】
本明細書中で著者により引用された刊行物の書誌学的詳細については明細書の末尾にすべて記載した。本明細書中のヌクレオチドおよびアミノ酸配列の配列番号(SEQ ID NO)は書誌学的記載のつぎに定義した。
【0010】
この明細書を通して、特に断らない限り、「含む(comprise、comprisesまたはcomprising)」とは当該要素もしくは整数、または要素もしくは整数の群の包含をいい、他の要素もしくは整数、または要素もしくは整数の群の排除をいうものではないと理解されるべきである。
【0011】
本発明の他の好ましい態様は組換え体の分子を提供する。
【0012】
【発明の実施の形態】
本発明のこの態様によれば、
アミノ酸配列:
(i)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列に少なくとも約15%類似しており;
(ii)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列に少なくとも5%非類似である
を含む組換え分子を提供する。
【0013】
本発明の関連する態様は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分に少なくとも約15%の類似性を有するが、少なくとも5%の非類似性を有し;
(ii)少なくとも1つVEGFと共通の性質を示す
を有する組換え分子である。
【0014】
本発明のさらに関連する態様は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列に少なくとも約15%の類似性を有するが、少なくとも約5%の非類似性を有し;
(ii)少なくとも1つの下記の特性:
(a)血管内皮細胞の増殖を誘導する能力
(b)受容体のflt-1/flk-1族と相互作用する能力
(c)細胞移動、細胞生存および/またはアルカリホスファターゼの細胞内濃度
の増大を誘導する能力
を示す;を有する組換え分子を含む。
【0015】
本発明はまた、SEQ ID NO:1に少なくとも約15%のアミノ酸類似性を有するが、少なくとも約5%非類似性であるタンパク質性分子をコードしているゲノムまたは部分的ゲノムクローンを含む。
【0016】
SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列はヒトVEGFに対応する(以下、「VEGF165」という)。従って、本発明の分子はVEGF様であるか、またはVEGFの同族体であるが、VEGFのアミノ酸配列に類似しているが、同一ではないアミノ酸配列を含む。本発明はヒトVEGF様分子を用いて例示することができるが、これは本発明が、同族体分子であり、家畜類(例えば、羊、豚、馬および牛)、愛玩動物(例えば、犬および猫)および実験動物(例えば、マウス、ラツト、家兎およびモルモット)などの哺乳動物ならびに鳥類(例えば、家きん類)などの非哺乳動物、魚および爬虫類などの非哺乳動物からのコード配列を含むものとして理解されねばならない。最も好ましい具体例では、VEGF様分子は、ヒト由来のものであり、染色体11q13に位置する遺伝子によってコードされている。本発明は従って、当該VEGF様分子をコードするゲノム配列またはその部分に及ぶ。
【0017】
好ましくは、類似性のパーセントが、SEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分の少なくとも約30%、より好ましくは少なくとも約40%、さらに好ましくは少なくとも約50%、よりさらに好ましくは少なくとも約60−70%、なおさらに好ましくは少なくとも約80−95%である。
【0018】
特に好ましい具体例において、本発明のVEGF様分子はSEQ ID NO:4に記載のアミノ酸配列を含むか、またはそれらの部分、フラグメント、誘導体または類似体である。特に好ましい類似性は約19−20%および29−30%である。ここに引用された誘導体もまたスプライス変異体を含む。従って、本発明はSOM175のスプライス変異体に及ぶ。本発明に含まれるスプライス変異体の例としてはSEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8および/またはSEQ ID NO:10の少なくとも1つに実質的に記載されたアミノ酸配列を有する変異体、またはそれらの突然変異体もしくは誘導体、またはそれらのさらなるスプライス変異体を含むがこれに限られない。
【0019】
他の具体例は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:4に実質的に記載されたアミノ酸配列または、その全部または部分に少なくとも約15%の類似性(ただし、上記アミノ酸配列はSEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分に少なくとも約5%非類似である)を有し;
(ii)少なくとも1つのVEGFと共通の生物学的性質を示す;
を有する組換分子を提供する。
【0020】
他の具体例は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:6に実質的に記載されたアミノ酸配列または、その全部またはその部分に少なくとも約15%の類似性(ただし、上記アミノ酸配列はSEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分に少なくとも約5%非類似である)を有し;
(ii)少なくとも1つのVEGFと共通の生物学的性質を示す;
を有する組換分子を提供する。
【0021】
他の具体例は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:8に実質的に記載されたアミノ酸配列または、その全部またはその部分に少なくとも約15%の類似性(ただし、上記アミノ酸配列はSEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分に少なくとも約5%非類似である)を有し;
(ii)少なくとも1つのVEGFと共通の生物学的性質を示す;
を有する組換分子を提供する。
【0022】
他の具体例は、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:10に実質的に記載されたアミノ酸配列または、その全部またはその部分に少なくとも約15%の類似性(ただし、上記アミノ酸配列はSEQ ID NO:2に記載のアミノ酸配列の全部または部分に少なくとも約5%非類似である)を有し;
(ii)少なくとも1つのVEGFと共通の生物学的性質を示す;
を有する組換分子を提供する。
【0023】
上記のVEGFの性質は、
(a)血管内皮細胞の増殖を誘導する能力;
(b)受容体のflt-1/flk-1族と相互作用する能力;
(c)細胞移動、細胞生存および/またはアルカリホスファターゼの細胞内濃度
の増大を誘導する能力;
の少なくとも1つを含む。
【0024】
本発明によれば、類似性は好ましくは少なくとも約40%、より好ましくは少なくとも約50%およびさらに好ましくは少なくとも約65%の類似性である。
【0025】
本発明のさらなる態様は、SEQ ID NO:4に記載のアミノ酸配列の一部または、例えば、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8またはSEQ ID NO:10に記載のアミノ酸配列などのそのスプライス変異体またはそれらの化学的均等物を含む。本発明の生物学的に分離されたまたは組換分子は天然にグリコシル化されたものであってもよく、またはそれが分離されまたは合成された細胞により変化する変異グリコシル化形態を含んでいてもよい。例えば、もし、原核細胞中に組換手段によつて産生されたならば、分子は非グリコシル化のものである。分子は全長であってもよく、または一部を切り取ったかまたは誘導された形態であってもよい。
【0026】
さらに本発明の他の態様はここに記載のVEGF様分子をコードする核酸分子を含む。さらに具体的には、本発明は、SEQ ID NO:3に実質的に記載されたヌクレオチドの配列、またはその全部または分子に少なくとも15%の類似性を有するヌクレオチド配列、またはSEQ ID NO:3に記載の逆相補性のヌクレオチド配列に低いストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るヌクレオチド配列(ただし、核酸はSEQ ID NO:3に記載のヌクレオチド配列に少なくとも約15%の類似性を有するが、30%の非類似性を有する)を提供する。SEQ ID NO:3に記載のヌクレオチドはまた「SOM175」ともいう。好ましくは、非類似の%は約35%、より好ましくは約39%およびさらに好ましくは約40−50%である。
【0027】
ストリンジェントの程度を定義する目的で、簡略化のために、Sambrook et al (1989)の9.47−9.51頁を引用することができ、ここに引用して明細書の記載とし、そこに記載の洗浄工程を高いストリンジェントな条件とみなす。低いストリンジェントな条件とは、この明細書では、4−6X SSC/0.1−0.5% w/v SDS、37−45℃にて2−3時間と定義される。ハイブリダイズにおける核酸の資源および濃度により異なるが、≧45℃にて1−4X SSC/0.25−0.5% w/v SDS、2−3時間のこの明細書でみなされる中程度のストリンジェントな条件、または60℃にて0.1−1X SSC/0.1% w/v SDS、1−3時間のこの明細書でみなされる高いストリンジェントな条件などの別のストリンジェントな条件を採用することもできる。
【0028】
さらに、本発明は、SEQ ID NO:3に少なくとも15%のヌクレオチド配列の相同性を有する、上記VEGF様分子をコードする核酸分子を含む。好ましい相同性の程度は少なくとも約40%、より好ましくは約60−70%である。
【0029】
本発明はさらに、ヒトVEGFのマウス相同体(ここでは「mVRF」という)を含む。ヒトVEGFと比較してmVRFは約85%の同一性を有し、ヒトVEGFと比較して全コード領域にわたって92%のアミノ酸残基の保存率を有する。mVRFは、実質的に図9に記載のヌクレオチド配列を含む核酸分子によってコードされている。
【0030】
本発明のVEGF様分子は、単独またはVEGFなどの他の分子と組み合わせてある領域の治療および/または診断への適用に有用である。本発明は従って、VEGF様分子、その部分、フラグメント、誘導体、相同体または類似体とともに1つまたはそれ以上の医薬的に許容され得る担体または希釈剤を含む医薬組成物に及ぶ。さらに、本発明はSEQ ID NO:3に記載の核酸配列またはそれに少なくとも約15%、より好ましくは約40%、さらに好ましくは少なくとも約60−70%の類似性を有するが、それに少なくとも約30%、より好ましくは少なくとも30%、さらに好ましくは約39%の非類似性を有するベクター、およびこれを含む宿主に及ぶ。さらに、本発明は、SEQ ID NO:3に基づくリボザイムおよびアンチセンス分子ならびにVEGF様分子の中和抗体に及ぶ。このような分子は、例えば、腫瘍の脈管形成または血管新生に至るVEGF様遺伝子の過剰発現の効果を改善するのに有効である。
【0031】
本発明の他の態様は哺乳動物における大グリア細胞増殖を誘導する方法であって、上記方法が、下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:2に記載の配列に少なくとも約15%の類似性を有するが、少なくとも5%の非類似性を有するアミノ酸配列を含み;
(ii)少なくとも1つ血管内皮成長因子(VEGF)と共通の性質を示す
を有する組換タンパク質性分子の有効量を上記哺乳動物に投与し、上記投与が大グリア細胞の増殖を誘導するのに十分な期間および条件であることを特徴とする方法である。
【0032】
好ましくは、組換タンパク質性分子はSEQ ID NO:3またはSEQ IDNO:6に記載のアミノ酸配列を含む。
【0033】
本発明のさらなる態様は、哺乳動物における神経の生存および/または増殖を促進する方法であって、上記方法が下記の特徴:
(i)SEQ ID NO:2に記載の配列に少なくとも約15%の類似性を有するが、少なくとも約5%の非類似性を有するアミノ酸配列を含み;
(ii)少なくとも1つ血管内皮成長因子(VEGF)と共通の性質を示す
を有する組換タンパク質性分子の有効量を上記哺乳動物に投与し、上記投与が大グリア細胞の増殖を誘導するのに十分な期間および条件であることを特徴とする方法を提供する。
【0034】
好ましくは、組換タンパク質性分子はSEQ ID NO:3またはSEQ IDNO:6に記載のアミノ酸配列を含む。
【0035】
本発明はまた、診断剤として有用なVEGF様分子に対す抗体またはVEGF様分子をコードする遺伝子に対する核酸プローブを含む。
【0036】
本発明はさらに下記の図面および/または実施例によって説明されるが、これに限定されるものではない。
【表1】
Figure 0003683778
【0037】
【実施例】
実施例
ヒト c DNAクローン
ヒト胎児脳ライブラリー(λzapII、Stratagene)をコスミドD11S750(Larssonら、1992)でスクリーニングすることにより、最初のSOM175 cDNAを単離した。プラスミドを「インビボ」において切断して、一本鎖の1.1kbのcDNAを得た。上述のSOM175挿入断片をプローブとして使用して、3つの独立したSOM175 cDNAクローンもまた、ヒト胎児脾臓ライブラリー(Stratagene、Unizap)から分離した。3つのクローンを得た:SOM175−4A、−5A、および−6A。SOM175−5Aは、エクソン4が欠けている、選択的スプライシングされたクローン(SOM175−e4)である。ライブラリーの製造業者(Stratagene)により推奨されるハイブリダイゼーション条件とランダム感作SOM175の挿入断片とを使用して、これらのライブラリーのスクリーニングを行った。2つの部分的なヒトSOM175 cDNAもまた、λGT11ヒト黒色腫セルライン A2058ライブラリー(Clontech)から分離した。ChurchおよびGilbert、1984に記載のハイブリダイゼーション条件を使用して、cDNAライブラリーのスクリーニングを行った。各々の場合において、SOM175から誘導されたPCR産物(18f−700r)のランダム感作により、プローブを発生させた。
【0038】
マウス c DNAクローン
再びヒトSOM175を使用して、マウス新生児全脳cDNAライブラリー(Unizap、Stratagene)をスクリーニングした。4つの非キメラクローンを分離した:M175−A、B、C、D。クローンは全て部分的なcDNAであって、M175−Cは幾つかのイントロンを含んでいた。これらのcDNAのうち3つは、エクソン6が欠けていた。
M1と呼ばれる別のクローンは完全に配列決定されており、完全なオープンリーディングフレーム+5'utrの一部と3'utr全体を含むことが分かった。
【0039】
実施例
DNA配列分析
cDNAクローン(SOM175)の全体配列をまとめて、その対応するアミノ酸配列と共に図2に示す。MAPプログラム(GCG、ウィスコンシン大学)を使用して、この配列をオープンリーディングフレームに関してスクリーニングした。672bpの一本鎖のオープンリーディングフレームが観察された(図2を参照)。5'非翻訳化配列は殆ど無いようである(2bp)。3'非翻訳化領域は、ポリアデニル化シグナルおよびポリA尾部が含まれることから完全であるらしい。
BLASTアルゴリズムを使用して、データーベース相同性調査を行った(NCBIで操作する、米国)。この分析は、幾つかの哺乳動物型のVEGFに対する相同性を明らかにした(図3を参照)。BESTFITプログラム(GCG、ウィスコンシン大学;図4および5を参照)を使用して、SOM175とヒトVEGF165との間の相同性の程度を測定した。BESTFIT分析を使用して、ヌクレオチドの相同性は69.7%であると推定され、またタンパク質の相同性は少なくとも33.3%の同一性と52.5%の保存性と推定された。ヌクレオチド配列に関するBLAST分析では、ヒト発現配列タグ EST06302(Adamsら、1993)にほぼ完全に対応することが明らかになった。
【0040】
これらのデータは、SOM175がVEGFに対して構造上の類似性を有する成長因子をコードすることを示す。両方の遺伝子が同じような位置に開始および停止コドンを示し、また不連続の相同性の固まりをもっている。二量化に関与すると考えられている8つのシステイン全て、さらにはまた多数の他のVEGF残基は保存されている。これらの残基は、システイン−47、プロリン−70、システイン−72、バリン−74、アルギニン−77、システイン−78、グリシン−80、システイン−81、システイン−82、システイン−89、プロリン−91、システイン−122、およびシステイン−124であって、図6に示す。VEGFとSOM175遺伝子産物との間の構造上の保存があれば、それらが両方とも機能上の類似性を有することもまた可能となる。SOM175は、VEGFと幾つかの性質を共有するが、それ自身の独自の性質を有するVEGF様分子をコードすることが提唱される。VEGF165のヌクレオチド配列および対応するアミノ酸配列を図1に示す。
【0041】
実施例
Clustal法、MegAlignソフトウェア、DNASTAR、ウィスコンシンを使用して、VEGF165ファミリーとSOM175ファミリー(タンパク質)との間の類似性および相違性のパーセントを分析した。結果を表2.1および2.2に示す。選択的にスプライシングされた型のSOM175を、SOM175−e6(エクソン6が全て欠失している);SOM175−e6並びに7(エクソン6と7が全て欠失している);およびSOM175−e4(エクソン4が全て欠失している)と略す。スプライシングされた型のSOM175を図7に示す。イントロン/エクソンの境界を示すSOM175のゲノムマップを図8aおよび図8bに示す。
【0042】
【表2】
Figure 0003683778
【0043】
【表3】
Figure 0003683778
【0044】
【表4】
Figure 0003683778
【0045】
【表5】
Figure 0003683778
【0046】
実施例
SOM175の機能を測定するためのバイオアッセイ
SOM175が内皮細胞機能、脈管形成、および創傷治癒に対してVEGFと同様の活性を有するかどうかを評価するためにアッセイを行う。受容体結合分布試験の結果に基づいて他のアッセイを行う。
【0047】
内皮細胞機能のアッセイ
内皮細胞増殖。FerraraおよびHenzel(1989)およびGospodarowiczら(1989)に記載の内皮細胞成長アッセイ。
【0048】
脈管透過性アッセイ。モルモットでのマイルス(Miles)試験を利用するこのアッセイは、MilesおよびMiles(1952)に記載と同様に行う。
【0049】
細胞接着アッセイ。ポリモルフの内皮細胞への接着に対するSOM175の影響を分析する。
【0050】
走化性。これは、標準的なボイデン(Boyden)チャンバー走化性アッセイを使用して行う。
【0051】
プラスミノーゲンアクチベータアッセイ。SOM175の添加によるプラスミノーゲンアクチベータおよびプラスミノーゲンアクチベータ阻害物質産生に関して、内皮細胞を試験する(Pepperら(1991))。
【0052】
内皮細胞移動アッセイ。内皮細胞を刺激して、移動させ管を形成させるSOM175の能力を、Montesanoら(1986)に記載と同様にしてアッセイする。
【0053】
脈管形成アッセイ
雛の漿尿膜での脈管形成応答のSOM175誘導を、Leungら(1989)に記載と同様にして評価する。
【0054】
次のアッセイを使用して、SOM175の潜在的神経栄養作用を評価する。
【0055】
軸索外殖アッセイおよび遺伝子誘導 ( PC12細胞 )
PC12細胞(クロム親和性細胞腫セルライン)は、NGFおよび他の神経栄養因子に応答し、初期並びに後期遺伝子の誘導、および神経の伸長を含む交感神経ニューロンの特性を発達させる。これらの細胞をSOM175に暴露して、それらの応答をモニターする(Drinkwaterら(1991);およびDrinkwaterら(1993))。
【0056】
末梢神経系 ( PNS ) 由来の培養されたニューロン
次のPNSニューロンの初代培養物をSOM175に暴露して、幾つかの応答に関してモニターする:
−神経冠および背根神経節由来の感覚ニューロン、
−交感神経系神経節由来の交感神経ニューロン、
−節状神経節由来のプラコード(placode)誘導感覚ニューロン、
−脊髄由来の運動ニューロン。
そのアッセイは、Suterら(1992)およびMarinouら(1992)に記載されている。
【0057】
インビトロにおける応答が観察された場合には、取込みおよび逆行性輸送などの性質に関するインビボにおけるアッセイを、Hendryら(1992)に記載と同様にして行う。
【0058】
神経再生 ( PNS )
SOM175の神経栄養効果が観察された場合には、軸索を切断した感覚ニューロン、交感神経ニューロン、および運動ニューロンの再生におけるその可能な役割を、Ottoら(1989);Yipら(1984);およびHendryら(1976)の方法により分析する。
【0059】
CNSニューロンに対するSOM175の作用
中枢神経系ニューロンの生存を増進するSOM175の能力を、Haggら(1992);Williamsら(1986);Hefti(1986);およびKromer(1987)に記載と同様にして分析する。
【0060】
創傷治癒
創傷治癒を支えるSOM175の能力を、Schillingら(1959)に記載され、Huntら(1967)により利用いるのと同様にして、利用できる最も臨床的に適切なモデルで試験する。
【0061】
造血系
造血系の特異的な細胞集団に対して、様々なインビトロおよびインビボ・アッセイが可能であり、また以下に概略を述べる。
【0062】
幹細胞
マウス
FACS−精製細胞を使用して、様々な新規のインビトロ・マウス幹細胞アッセイが開発されている。
【0063】
(a)再増殖する幹細胞
致死量を照射したマウスの骨髄を再増殖することができる細胞があって、Lin−、Rhhi、Ly−6A/E+、c−kit+表現型を有する。試験物質を、これらの細胞に対して単独で、または複数の因子との同時インキュベーションにより試験した後、3H チミジンの取込みにより、細胞増殖を測定する。
【0064】
(b)後期幹細胞
比較的僅かな骨髄再増殖能しか有していないが、D13 CFU−Sを発生させることができる細胞がある。これらの細胞は、Lin−、Rhhi、Ly−6A/E+、c−kit+表現型を有する。試験物質をこれらの細胞と共に一定時間インキュベートし、致死量を照射したレシピエントに注射して、D13脾臓コロニーの数を数える。
【0065】
(c)前駆体に富む細胞
インビトロにおいて単一の成長因子に応答する細胞があって、Lin−、Rhhi、Ly−6A/E+、c−kit−表現型を有する。このアッセイは、SOM175が造血前駆体細胞に直接作用することができるかどうかを示すで。試験物質をこれらの細胞と共に寒天培養でインキュベートして、7−14日後にコロニーの数を数える。
【0066】
アテローム性動脈硬化症
平滑筋細胞は、収縮状態から合成状態へのそれらの表現型の変えながら、アテローム性動脈硬化症の発生または開始において重要な役割を果す。マクロファージ、内皮細胞、Tリンパ球、および血小板は全て、平滑筋細胞の成長および表現型修飾に影響を及ぼすことにより、アテローム性動脈硬化症プラークの発生において重要な役割を果す。多細胞環境での平滑筋細胞の増殖率および表現型修飾を測定するインビトロにおけるアッセイを使用して、平滑筋細胞に対するSOM175の効果を評価する。そのシステムは、様々な細胞の種類をカバーガラスの両側に播種する、変型ローズ(Rose)チャンバーを使用する。
【0067】
骨に対するSOM175の効果
骨芽細胞の増殖を調節するSOM175の能力を、Loweら(1991)に記載と同様にしてアッセイする。骨吸収に対する幾つかの効果を、Loweら(1991)に記載と同様にしてアッセイする。細胞内分子における骨芽細胞移動および変化に対する効果(例えば、cAMPの蓄積、アルカリ性ホスファターゼ濃度)を、Midyら(1994)に記載と同様にして分析する。
【0068】
骨格筋細胞に対する効果
筋原細胞の増殖および筋管の発達に対するSOM175の効果は、Ewtonら(1980)により、またGospodarowiczら(1976)に記載と同様にして測定することができる。
【0069】
実施例
マウスVEGF DNAのクローニング
c DNAの単離
マウスVRF(mVRF)クローンを、λ Zap新生全脳cDNAライブラリー(Stratagene)から選択した。上記のhVRF cDNA(pSOM175)からPCRにより発生した、682bpの32P−標識化プローブとのハイブリダイゼーションにより、高密度フィルター(5×104pfu/プレート)から得られた一次ファージを同定した。ChurchおよびGilbert(1984)に記載と同様の条件下、ハイブリダイゼーションおよびナイロン膜(Hybond−N)のストリンジェント洗浄を65℃で行った。陽性のプラークを採取し、精製し、インビボにおいて切断して、pBluescript SK−中にcDNAクローンを含む細菌コロニーを産生させた。
【0070】
ゲノムクローンの単離
ゲノムクローンを、λ Fix IIベクター(Stratagene)にクローン化したマウス菌株SV/129ライブラリーから単離した。高密度フィルター(5×104pfu/フィルター)を、mVRF cDNAのヌクレオチド233−798領域のPCR増幅により創生させた、563bpの32P−標識化プローブでスクリーニングした(図9を参照)。陽性のクローンをプラグして(plugged)、400−800pfuを含むフィルターで再びスクリーニングした。QIAGEN λキットを使用して、またはZnCl2精製(Santos、1991)により、大量のファージ調製物を製造した。
【0071】
ヌクレオチド配列決定および分析
様々なベクターに基づいたプライマーおよび内部プライマーを、製造業者の使用説明書に従って、Applied Biosystems Incorporated(ABI)の色素ターミネーター配列決定キットと共に使用して、cDNAを両方の鎖に関して配列決定した。配列をABIの373A型 自動化DNAシークエンサーで分析した。BESTFITプログラム(GCG、ウィスコンシン)を使用して、ペプチドの相同性アラインメントを行った。
【0072】
イントロン/エクソンの境界の同定
ゲノムDNAまたはmVRF ゲノムλクローンをテンプレートとして用いるPCRを使用して、エクソンの境界およびフランキング領域の同定を行った。イントロンを同定するためにPCRで使用するプライマーは、hVRF配列から誘導し、また可能性のあるヒト−マウス配列のミスマッチを考慮して、推定されるTmより低い5−10℃のアニーリング温度を使用した。PCR産物を全て、アガロースゲル電気泳動によりサイズ分けして、QIA急速スピンカラム(Qiagen)を使用して精製したゲルとイントロン/エクソンの境界とを、これらの産物から直接配列決定した。加えて、幾つかのスプライス部位を、サブクローン化したMVRFのゲノムフラグメントから配列決定した。cDNAとゲノムDNAの配列を比較することにより、イントロン/エクソンの境界を同定した。
【0073】
ノーザン分析
ChomczynskiおよびSacchi(1987)の方法を使用して、全ての細胞RNAを新鮮な正常成熟マウス組織(脳、腎臓、肝臓、筋肉)のパネルから調製した。合計20μgのRNAを電気泳動し、ナイロン膜(Hybond−N、Amersham)に移して、標準的な条件下(ChurchおよびGilbert、1984)にハイブリダイズさせた。フィルターを65℃の0.1×SSC(20×SSCは、3M NaCl/0.3M クエン酸三ナトリウム)、0.1% SDS中で洗浄して、増感紙を用いるX線フィルムに−70℃で1−3日間暴露した。
【0074】
m VRF c DNAの特性決定
マウスcDNAライブラリーをhVRF cDNAクローンでスクリーニングすることにより、マウスVRF相同体を分離した。0.8−1.5kbと様々なサイズの5つのクローンを回収して、配列決定した。cDNA配列決定によれば、オープンリーディングフレーム全体(スプライス型によって、621bpまたは564bp、下記参照)を含む全長1041bpのcDNA配列、および3'UTR(379bp)、さらにはまた163bpの5'UTRである(図9)。
【0075】
予想される開始コドンは、hVRFにおける開始コドンの位置に一致した。フレームATG以外の他のコドンは−47の位置にあって、2つの終止コドンは推定上の開始コドンと共に上流(各々、−9並びに−33の位置)およびフレーム内で観察された。
【0076】
予想されるhVRFのN末端シグナルペプチドは、81%の同一性(17/21アミノ酸)でmVRFに存在すると思われる。mVRF内でのペプチド切断は、残基21の後で起こるものと思われる(図10)。これらのデータは、成熟mVRFが分泌され、また従って、恐らく成長因子として機能し得ることを示す。
【0077】
hVRFに関しては、2つのオープンリーディングフレーム(ORF)が、ライブラリースクリーニングにより分離されたcDNAにおいて検出された。5つのクローンのうち4つは、選択的にスプライシングされて、hVRFのエクソン6に相同である101bpのフラグメントに欠けることが判明した。mVRFの2つの異性体(isoform)の予想されるペプチド配列を決定して、対応するヒト異性体と整列化した(図10)。
【0078】
メッセージをコードするmVRF186は、エクソン7の末端に向かって、+622の位置で終わるコード配列を有する621bpのORFを含む。より小さなメッセージをコードするmVRF167は、実際には、101bpのエクソン6からのスプライシングに起因するフレームシフトと、エクソン8の始まりに近い、+666の位置での終止コドン(TGA)の導入により、+622のTAG部位の下流で終止する(図9)。
【0079】
mVRF186タンパク質は、VEGFのアミノ部分および中心部分に対して強い相同性を有するが、カルボキシル末端は全く違って、アラニンに富む。mVRF167は、これらの類似性を有しており、mVEGFの右からC末端までの相同性も維持している(図11)。hVRF167に対するmVRF167の全体にわたる相同性は各々、85%の同一性と92%の類似性であった(図10)。同様に、mVRF167とmVEGFとの間の相同性(Breierら、1992)は各々、49%の同一性と71%の保存的アミノ酸置換であった(図11)。
【0080】
模範的な脊椎動物のポリアデニル化シグナル(AATAAA)(Birnstielら、1986)は、mVRF cDNAには存在していなかったが、しかし、ぴったりと一致する配列 GATAAAが、マウスとヒトの両方のVRF cDNAにおいて同じような位置に存在する。hVRFとは対照的に、mVRFは、ACジヌクレオチドの反復を3'UTRのいちばん端の3'末端(ヌクレオチドの998〜1011の位置、図9)に含むことが判明した。この反復領域の多様性は、7〜11にわたるジヌクレオチド数の、幾つかのmVRF cDNAの間で観察された。
【0081】
m VRFのゲノム特性決定
対応するhVRFの境界に相同な配列に隣接するプライマーを使用して、イントロン/エクソンの境界(表3)をマップした。mVRFのイントロンI、III、IV、およびVI(表3、図12)は、hVRFの介在配列より小さかった。完全なゲノム配列は、mVRFの増幅したイントロンとクローン化したゲノム部分を配列決定することにより、mVRFの5'UTRから最も大きな介在領域(2.2kb)であるイントロンVIまでにまとめられていた。mVRFとhVRFとの間にはゲノム構造において1つだけ大きな相違があって、それは、mVRFのエクソン7/イントロンVIの境界が、cDNA配列との関係でさらに10bp下流にあることであり、従って、mVRFにおけるエクソン7は、hVRFにおいて対応するエクソンより10bp長い。
【0082】
エクソン6および7は、ヒト相同体で見受けられることが分かっているように、mVRFで隣接している。mVRFとhVRFのエクソン6の間の強い配列相同性(図10)は、この配列が保持されたイントロン配列ではないが、どちらかといえばVRF186異性体(isoform)の機能部分をコードすることを示す。
【0083】
一般的なイントロン/エクソンの構造は、VEGF遺伝子ファミリーの様々なメンバー(VEGF、PIGF、hVRF)の間で保存され、また従って、mVRF遺伝子のゲノム組織全体がこれらの遺伝子に大変似ていることは驚くべきことではない(図12)。
【0084】
先の比較マッピング試験は、染色体11q13遺伝子座上のヒト複合内分泌腺新生物タイプ1疾患部を取り囲む領域が、マウス染色体19の近位セグメントとシンテニック(syntenic)であることを示している(Rochelleら、1992)。発明者らは、hVRF遺伝子を1kbのヒトMENl遺伝子座内にマップしていることから(上記参照)、多分、マウスVRF遺伝子は、染色体19のセントロメア付近にマップされるであろう。
【0085】
m VRFの発現試験
成人マウス組織(筋肉、心臓、肺、および肝臓)由来のRNAのノーザン分析は、発現が偏在するらしく、約1.3kbの大きさの主要なバンドとして存在することを示した(図14)。これは、2.0および5.5kbの2つの主要なバンドが試験した全ての組織で同定されているという、hVRFの場合に観察されるパターンとは幾分異なっている。1.3kbのマウスメッセージは、恐らく、より短いヒト転写物に対応するであろうし、またその大きさの変化は、多分、各々の5'UTRの長さにおける相違によるものであろう。
【0086】
実施例
分娩前および分娩後のマウスにおけるマウスVEGFの発現
動物
妊娠期の同じマウス(n=4)および若年の成熟マウス(n=2)(C57近交系、ALAB、スウェーデン)を二酸化炭素で屠殺し、関連のある組織を採取して、チャック(chuck)上で凍結した。さらに使用するまで、組織を−70℃で保存した。2つの妊娠年齢をこの試験に使用した;胚日数8(E8)、14、およびE17。
【0087】
in situ ハイブリダイゼーション組織化学
前記(Dagerlindら、1992)と同様にして、in situハイブリダイゼーションを行った。簡単に言えば、横切片(14μm)を低温槽(Microm、独国)中で切断し、プローブ−オン(Probe−On)スライド(Fisher Scientific、米国)上で解凍して、使用するまで、光を遮断しシールされた箱の中に−70℃で保存した。mVRFをコードするmRNAに相補的な合成の42−merのオリゴヌクレオチドの配列は、
ACCACCACCTCCCTGGGCTGGCATGTGGCACGT
GCATAAACG[配列番号11](nt 120−161に相補的である)および
AGTTGTTTGACCACATTGCCCATGAGTTCCATG
CTCAGAGGC[配列番号12](nt 162−203に相補的である)であった。2つの選択的なスプライス型を検出するために、オリゴヌクレオチド
GATCCTGGGGCTGGAGTGGGATGGATGATGTCA
GCTGG[配列番号13](nt xxx−xxxに相補的である)および
GCGGGCAGAGGATCCTGGGGCTGTCTGGCCTCA
CAGCACT[配列番号14]を使用した。プローブは、ターミナルデオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ(IBI、米国)を使用して、デオキシアデノシン−α[チオ]トリホスフェート[35S](NEN、米国)で7−10×108cpm/μgの比放射能まで3'末端を標識して、前処理することなく、切片に42℃で16−18時間ハイブリダイズさせた。そのハイブリダイゼーション混合物は、以下のものを含んでいた:50% v/v ホルムアミド、4×SSC(1×SSC=0.15M NaClおよび0.015M クエン酸ナトリウム)、1×Denhardt溶液(各々、0.02% ポリビニルピロリドン、BSA、およびフィコール)、1% v/v サルコシル(N−ラウロイルサルコシン;Sigma)、0.02M リン酸緩衝液(pH 7.0)、10% w/v 硫酸デキストラン(Pharmacia、スウェーデン)、250μg/ml 酵母tRNA(Sigma)、500μg/ml 切断して熱変性させたサケ精子DNA(Sigma)、および200mM ジチオトレイトール(DTT;LKB、スウェーデン)。対照切片では、そのハイブリダイゼーション混合物に20倍過剰の非標識化プローブを添加することにより、両方のプローブの特異性を調べた。加えて、隣接した切片を、異なった発現パターンを与える、この試験には関係のないプローブとハイブリダイズさせた。ハイブリダイゼーションに続いて、その切片を55℃の1×SSC中で数回洗浄し、エタノール中で脱水して、NTB2核トラックエマルション(Kodak、米国)に浸漬した。3−5週間後、その切片をD−19展開剤(Kodak、米国)中で展開して、カバーグラスをかけた。いくつかの場合には、エマルションに浸漬する前に、切片をオートラジオグラフフィルム(β−マックスオートラジオグラフフィルム、Amersham Ltd、英国)と対置させた。
【0088】
4つの異なったプローブは、試験した全ての組織において同一のハイブリダイゼーションパターンを与えた。マウスVRF発現は、E8胚において既に検出されており、ニューロン管にもっともよく対応するであろう構造に対して、陽性のシグナルが記録された。E14マウス胚の縦切片では、最も強いハイブリダイゼーションシグナルが心臓に、および神経系、特に大脳皮質において存在していた(図14A)。低レベルの発現は、全ての他の組織において存在していた。妊娠後期E17では、高いmVRF mRNAシグナルは、心臓および首の後ろ並びに周りにある褐色脂肪組織に限られていた(図14B)。明らかに陽性のハイブリダイゼーションシグナルが脊髄の灰白質において、および舌において存在していた(図14B)。大脳皮質での発現は、14日目に比べて明らかに減少した。例えば、筋肉におけるE14胚で見られる弱いバックグラウンド発現は、この妊娠年齢で減少した。強いmVRF mRNAハイブリダイゼーションシグナルは、若年の成熟マウスにおける心臓に対して、および褐色脂肪においてのみ存在していた(図14C)。心臓上のシグナルは、乳頭筋を含め、心室壁全体にわたって均一に分布していた(図14D)。過剰の冷プローブとハイブリダイズした心臓組織の切片では、バックグラウンドシグナルの特異的な標識化は全く記録されなかった(図14E)。
【0089】
心臓とは別に、mVRF mRNAシグナルは、形態学的には、褐色脂肪に似ている胸郭の外側にある、ある組織全体に存在していた。これは、同じ領域で強い染色を示す、ズダン黒対比染色で確認された(図15Aおよび15B)。成熟マウス脊髄の横切片では、mVRFプローブは、灰白質に対してニューロン染色パターンを与えた(図15C)。トルイジンでの対比染色(図15D)は、前角における運動ニューロン(図15Cおよび15D)、後角の深部における、および中心管の周りの介在ニューロン(図15C)の大部分が、mVRF mRNAに陽性であることを示した。
【0090】
実施例
ヒナの感覚ニューロンに対するVEGFおよびSOM175タンパク質の効果Nurcombeら(1992)の方法を使用して、胚8日目のニワトリのヒナの感覚ニューロンに対するVEGFおよびSOM175タンパク質の効果を測定した。試験ウェル当たり2000細胞を使用して、ニューロンの試験を48時間目に計数した。3H−チミジン計数を使用して結果を得た。NGFを陽性の対照として、また様々な濃度のVEGF、ヘパリンの存在下におけるVEGF、およびヘパリンと5μM 5'−フルオロウラシル(5FU)の存在下におけるVEGFを使用して、ニューロンの生存のパーセント、神経外殖、および平均の神経の長さ(μm)を測定した。5FUは神経膠細胞を殺す。
【0091】
結果を図16に示す。その結果は、VEGFがニューロンの生存を増進するのに有効であるが、これには、神経膠細胞の存在が必要であることを示す。図17は、3種類の雛の神経膠に対するVEGFおよびSOM175の効果の結果を示す。試験した神経膠は、CNS神経膠、末梢神経膠、およびCNS希突起神経膠細胞であった。全ての培養において、ヘパリンを10μg/mlとして使用して、試験を24時間目に計数した。ウェル毎に2000細胞を使用して、結果を3H−チミジン計数で測定した。その結果は、ヒナの中枢および末梢ニューロンの場合には、大神経膠細胞が著しく刺激されて、ヘパリンの存在下においてSOM175により増殖したが、ヒナの希突起神経膠細胞は分裂速度は無視できるほどの増加であったことを示す。
【0092】
実施例
マウス一次および中枢ニューロンに対するSOM175タンパク質の効果
実施例7での結果は、VEGF異性体が、大神経膠細胞の作用によって、ヒナの一次および中枢ニューロンに対する効果を有していたことを示す。同様の実験をマウス細胞で繰返した。
【0093】
培養条件
「Methods in Neurosciences(第2巻):Cell Culture」 P.M.Conn編、Academic Press、サンディエゴ、1990、大神経膠細胞に関しては33−46頁、希突起神経膠細胞に関しては56−74頁、および中枢ニューロンに関しては87−102頁に記載されている方法に従って、全てのインビトロにおける実験のためにニューロンおよび神経膠細胞を調製して、培養した。
ポリ−L−オルニチン(0.1mg/ml、1時間)で被覆した24ウェルの培養クラスター(Nunc)に、細胞を2,000細胞/ウェルの密度で塗布した。培養してから48時間後、十分確立された方法(Marutaら、1993)を使用して、ニューロンを逆相光(inverted phase light)の下にウェル中で計数し、以下のようにして、神経膠細胞を[3H]チミジンの取込みで評価して、細胞分裂速度をモニターした。ことわらなければ、ヘパリン(10μg/ml、低分子量画分、Sigma Chemical Corp.)は常時、培地中に存在していた。ニューロン培養物に5mM 5−フルオロ−2−デオキシウリジン(Sigma)を補って、バックグラウンドの神経膠細胞増殖を抑制した。
【0094】
神経膠細胞増殖に関する3H−チミジン取込みアッセイ
細胞を、標準的な培地中、0.1mCi/mlの保存濃度から3H−チミジン(比放射能 103μCi/ug)で14時間パルスして、最終的に20μl/ウェルのインキューベート容量になった。ウェルの内容物を収集して、ニトロセルロース紙(Titertek、Flow)に吸収させた。トリプシン/ベルセン(versene)(CSL Limited、ビクトリア、オーストラリア)と共に5分間インキュベーションすることにより、残りの付着細胞を取り除いた。この手順を2回行った。最初に蒸留水を、次いでメタノールを使用して、ニトロセルロースディスクを標準的なTitertek 収集装置(Flow)で洗浄した。そのニトロセルロースディスクを乾燥させ、シンチレーション液(5% v/v Triton−Xを含む)を添加して、そのディスクをシンチレーションカウンターで計数した。
【0095】
最大活性は、マウス大神経膠細胞培養物でのエクソン6が欠けているSOM175(SOMΔX6)の製剤で見られ、ヘパリンと共に投与した場合には、それらの増殖に対して重要な刺激があった(図16)。わずかな刺激が希突起神経膠細胞の増殖に与えられ(図17)、また単離された前脳ニューロンの生存応答の極僅かに認められる増強作用が与えられた(図18)。各々の点に対する3つのグラフ全てに関する標準偏差は8%未満であった。
【0096】
神経膠細胞の増殖を増進することにより、ニューロンの生存率を維持することができる。さらにまた、SOMΔX6は、大神経膠細胞の良好な誘導物質であって、中枢神経系の内皮細胞での大神経膠細胞の終末球の形成と共に発現され得る。
【0097】
当業者は、ここに記載する本発明が、具体的に記載したもの以外にも変化および変更が可能であることが分かるであろう。本発明には、そのような変化および変更が全て含まれることが理解されるべきである。本発明にはまた、本明細書中に言及した、または示した工程、特徴、組成物、および化合物も全て個々に、または総合的に含まれ、および該工程または特徴のいずれか2つまたはそれ以上の、幾つか、および全ての組み合わせもまた含まれる。
【0098】
【表6】
Figure 0003683778
大文字および小文字は各々、エクソン配列およびイントロン配列を示す。
*は、エクソン1の5'末端がまだ決定されていないことを示す。
【0099】
参考文献
【表7】
Figure 0003683778
【0100】
【表8】
Figure 0003683778
【0101】
【表9】
Figure 0003683778
【0102】
【配列表】
【0103】
配列番号1の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:649塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:DNA
(ix) 配列の特徴:
(A) 特徴を表す記号:CDS
(B) 存在位置:17...589
(xi) 配列:SEQ ID NO.1:
【化1】
Figure 0003683778
【0104】
配列番号2の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:191アミノ酸
(B) 型:アミノ酸
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:タンパク質
(xi) 配列:SEQ ID NO.2:
【化2】
Figure 0003683778
【0105】
配列番号3の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:1094塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:DNA
(ix) 配列の特徴:
(A) 特徴を表す記号:CDS
(B) 存在位置:3..624
(xi) 配列:SEQ ID NO.3:
【化3】
Figure 0003683778
【化4】
Figure 0003683778
【0106】
配列番号4の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:207アミノ酸
(B) 型:アミノ酸
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:タンパク質
(xi) 配列:SEQ ID NO.4:
【化5】
Figure 0003683778
【0107】
配列番号5の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:993塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:DNA
(ix) 配列の特徴:
(A) 特徴を表す記号:CDS
(B) 存在位置:3..566
(xi) 配列:SEQ ID NO.5:
【化6】
Figure 0003683778
【化7】
Figure 0003683778
【0108】
配列番号6の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:188アミノ酸
(B) 型:アミノ酸
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:タンパク質
(xi) 配列:SEQ ID NO.6:
【化8】
Figure 0003683778
【0109】
配列番号7の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:858塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:DNA
(ix) 配列の特徴:
(A) 特徴を表す記号:CDS
(B) 存在位置:3..431
(xi) 配列:SEQ ID NO.7:
【化9】
Figure 0003683778
【0110】
配列番号8の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:143アミノ酸
(B) 型:アミノ酸
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:タンパク質
(xi) 配列:SEQ ID NO.8:
【化10】
Figure 0003683778
【0111】
配列番号9の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:910塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:DNA
(ix) 配列の特徴:
(A) 特徴を表す記号:CDS
(B) 存在位置:3..305
(xi) 配列:SEQ ID NO.9:
【化11】
Figure 0003683778
【0112】
配列番号10の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:101アミノ酸
(B) 型:アミノ酸
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:タンパク質
(xi) 配列:SEQ ID NO.10:
【化12】
Figure 0003683778
【0113】
配列番号11の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:42塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:SEQ ID NO.11:
【化13】
Figure 0003683778
【0114】
配列番号12の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:42塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:SEQ ID NO.12:
【化14】
Figure 0003683778
【0115】
配列番号13の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:38塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:SEQ ID NO.13:
【化15】
Figure 0003683778
【0116】
配列番号14の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:40塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:1本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:SEQ ID NO.14:
【化16】
Figure 0003683778

【図面の簡単な説明】
【図1】 VEGF165のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:1]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:2]
【図1i】 VEGF165のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:1]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:2]
【図1ii】 VEGF165のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:1]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:2]
【図1iii】 VEGF165のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:1]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:2]
【図1iv】 VEGF165のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:1]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:2]
【図2】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図2i】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図2ii】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図2iii】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図2iv】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図2v】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図2vi】 SOM175のヌクレオチド配列[SEQ ID NO:3]および対応するアミノ酸配列[SEQ ID NO:4]
【図3】 SOM175タンパク質配列によるBLAST検索の結果
【図3i】 SOM175タンパク質配列によるBLAST検索の結果
【図3ii】 SOM175タンパク質配列によるBLAST検索の結果
【図4】 VEGF cDNAおよびSOM175 cDNAのBESTFIT配列
【図4i】 VEGF cDNAおよびSOM175 cDNAのBESTFIT配列
【図4ii】 VEGF cDNAおよびSOM175 cDNAのBESTFIT配列
【図4iii】 VEGF cDNAおよびSOM175 cDNAのBESTFIT配列
【図4iv】 VEGF cDNAおよびSOM175 cDNAのBESTFIT配列
【図5】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図5i】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図5ii】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図5iii】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図5iv】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図5v】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図5vi】 SOM175およびヌクレオチドレベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図6】 SOM175およびアミノ酸レベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図6i】 SOM175およびアミノ酸レベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図6ii】 SOM175およびアミノ酸レベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図6iii】 SOM175およびアミノ酸レベルのスプライス変異体とVEGF165の複数の配列
【図7】 SOM175およびそのスブライス変異体の図式表現
【図8a】 エクソン/イントロン地図を示すヒトSOM175ゲノム構造の図式表現
【図8b】 エクソン/イントロン境界を示すヒトSOM175ゲノム構造の図式表現
【図9】 mVRF cDNAクローンから誘導されたヌクレオチドおよび推定ペプチド配列。ヌクレオチドの番号は左側に記載され、開始コドンのAから始まる。アミノ酸の番号は右側に記載され、推定シグナルペプチドが除去された後、予測成熟タンパク質の最初の残基から始まる。別にスプライスされた領域は2重下線で示し、各mRNAから得られたペプチド配列が含まれている。主要なポリアデニル化の標識は太字で示されている。mVRF167およびmVRF186の開始および終止コドンは下線で示され、3' UTR中の多形のACの反復は破線で囲って示した。イントロン/エクソンの境界の位置は矢印で示した。
【図9i】 mVRF cDNAクローンから誘導されたヌクレオチドおよび推定ペプチド配列。ヌクレオチドの番号は左側に記載され、開始コドンのAから始まる。アミノ酸の番号は右側に記載され、推定シグナルペプチドが除去された後、予測成熟タンパク質の最初の残基から始まる。別にスプライスされた領域は2重下線で示し、各mRNAから得られたペプチド配列が含まれている。主要なポリアデニル化の標識は太字で示されている。mVRF167およびmVRF186の開始および終止コドンは下線で示され、3' UTR中の多形のACの反復は破線で囲って示した。イントロン/エクソンの境界の位置は矢印で示した。
【図9ii】 mVRF cDNAクローンから誘導されたヌクレオチドおよび推定ペプチド配列。ヌクレオチドの番号は左側に記載され、開始コドンのAから始まる。アミノ酸の番号は右側に記載され、推定シグナルペプチドが除去された後、予測成熟タンパク質の最初の残基から始まる。別にスプライスされた領域は2重下線で示し、各mRNAから得られたペプチド配列が含まれている。主要なポリアデニル化の標識は太字で示されている。mVRF167およびmVRF186の開始および終止コドンは下線で示され、3' UTR中の多形のACの反復は破線で囲って示した。イントロン/エクソンの境界の位置は矢印で示した。
【図9iii】 mVRF cDNAクローンから誘導されたヌクレオチドおよび推定ペプチド配列。ヌクレオチドの番号は左側に記載され、開始コドンのAから始まる。アミノ酸の番号は右側に記載され、推定シグナルペプチドが除去された後、予測成熟タンパク質の最初の残基から始まる。別にスプライスされた領域は2重下線で示し、各mRNAから得られたペプチド配列が含まれている。主要なポリアデニル化の標識は太字で示されている。mVRF167およびmVRF186の開始および終止コドンは下線で示され、3' UTR中の多形のACの反復は破線で囲って示した。イントロン/エクソンの境界の位置は矢印で示した。
【図9iv】 mVRF cDNAクローンから誘導されたヌクレオチドおよび推定ペプチド配列。ヌクレオチドの番号は左側に記載され、開始コドンのAから始まる。アミノ酸の番号は右側に記載され、推定シグナルペプチドが除去された後、予測成熟タンパク質の最初の残基から始まる。別にスプライスされた領域は2重下線で示し、各mRNAから得られたペプチド配列が含まれている。主要なポリアデニル化の標識は太字で示されている。mVRF167およびmVRF186の開始および終止コドンは下線で示され、3' UTR中の多形のACの反復は破線で囲って示した。イントロン/エクソンの境界の位置は矢印で示した。
【図10】 ヒトおよびマウスVRFタンパク質異性体のBESTFIT配列 A:mVRF167およびhVRF167; B:配列が各167アミノ酸異性体と異なる点からのmVRF186およびhVRF186; アミノ酸の同一性は縦棒で示し、保存アミノ酸は黒点で示した。矢印はヒトおよびマウスVRFの予測シグナルペプチド開裂部位を示す。
【図10i】 ヒトおよびマウスVRFタンパク質異性体のBESTFIT配列 A:mVRF167およびhVRF167; B:配列が各167アミノ酸異性体と異なる点からのmVRF186およびhVRF186; アミノ酸の同一性は縦棒で示し、保存アミノ酸は黒点で示した。矢印はヒトおよびマウスVRFの予測シグナルペプチド開裂部位を示す。
【図10ii】 ヒトおよびマウスVRFタンパク質異性体のBESTFIT配列 A:mVRF167およびhVRF167; B:配列が各167アミノ酸異性体と異なる点からのmVRF186およびhVRF186; アミノ酸の同一性は縦棒で示し、保存アミノ酸は黒点で示した。矢印はヒトおよびマウスVRFの予測シグナルペプチド開裂部位を示す。
【図11】 mVRF167およびmVRF188(Breier ら、1992年)ペプチド配列のBESTFIT配列。矢印はmVEGFのシグナルペプチド開裂部位を示す。同一のアミノ酸は縦棒で示し、保存的置換は黒点で示した。アミノ酸の番号は図9の方法で記載した。
【図11i】 mVRF167およびmVRF188(Breier ら、1992年)ペプチド配列のBESTFIT配列。矢印はmVEGFのシグナルペプチド開裂部位を示す。同一のアミノ酸は縦棒で示し、保存的置換は黒点で示した。アミノ酸の番号は図9の方法で記載した。
【図11ii】 mVRF167およびmVRF188(Breier ら、1992年)ペプチド配列のBESTFIT配列。矢印はmVEGFのシグナルペプチド開裂部位を示す。同一のアミノ酸は縦棒で示し、保存的置換は黒点で示した。アミノ酸の番号は図9の方法で記載した。
【図12】 VRF(マウスとヒトの相同体のイントロン/エクソン構造はほぼ同一であるから、一般的なVRF遺伝子を示した)とヒトVEGF/PIGF/PDGF遺伝子族の他の構成員との遺伝子構造の比較。エクソンは四角で示した。タンパク質コード領域および非翻訳領域は内部を埋めた四角または白ぬきの四角で示した。VRFの斜線領域はVRF186異性体の別のスプライシングによって形成された追加的3' UTR配列を示す。各遺伝子の別の主要なスプライス生成物を示した。
【図13】 mVRF cDNAクローンとハイブリダイズした種々の成熟マウス組織(表示した)からの全RNAのノーザンブロットのオートラジオグラム。主要な1.3kbの転写はすべての試料から検出された。
【図14】 マウスにおけるmVRFおよびmRNAの発現パターンを示すフィルムオートラジオグラフ(A−C)および暗視野照明顕微鏡写真(D−E)。E14マウス胎芽(A)において、陽性のシグナルが現れている心臓(Ha)および大脳皮質(Cx)に見られる。バックグランドの低いシグナルが他の組織の断面に存在する。E17胎芽(B)において、心臓(Ha)は強いハイブリダイズのシグナルのためにはっきりと見える。同じ位の強さのシグナルが背中および胸郭付近の茶色の脂肪組織(Fa)に存在する。中程度のハイブリダイゼーションのシグナルが脊髄(SC)および舌(T)に存在する。バックグラウンドシグナルはE14胎芽と比較して調整した。若年マウス(C-D)では、陽性のシグナルは心臓(Ha)および胸郭付近の脂肪組織(Fa)に見られ、一方、例えば、肺(Lu)はラベルされていない。心臓のハイブリダイゼーションシグナルは乳頭筋肉を含む左心室全体に平等に分布している(D)。過剰の冷プローブとハイブリダイズさせたE17心臓には、陽性のシグナルは存在しなかった(E)。尺度=0.5mm(A)、1.2mm(B)、1mm(C)、0.3mm(D)、0.1mm(E)
【図15】 マウス脂肪組織(A−B)および脊髄(CおよびD)におけるmVRFmRNA発現を示す暗−(AおよびC)および明−(BおよびD)視野顕微鏡写真。ズタンブラック染色部分の強い標識によって示されているように(B)、強いハイブリダイズシグナルが脂肪に存在する(A)。弱いシグナルがまた骨格筋(A−B中M)に存在する。成熟脊髄(C)には、mVRFプローブは灰白質にニューロンの発色パターンを示す。mVRFmRNAに対して強い陽性を示す腹側灰白柱(D)中の運動ニューロン、背側灰白柱の深部および中央管付近の介在ニューロンを示すトルイジン対比染色。尺度=0.1mm(A)、0.1mm(B)、0.25mm(C)、0.015mm(D)。
【図16】 生存%、神経成長%および平均神経の長さ(μm)で測定された、胎芽8日令ヒナ感覚神経に対するVEGFの作用。
【図17】 ニワトリのヒナのグリアに対するVEGFおよびSOM175の作用。CNSグリア、末梢グリアおよびCNS乏突起膠細胞が試験された。
【図18】 マウス大グリア細胞に対する種々のSOM175タンパク質の作用
■3H(cpm)
1.FGF−2(10ng/ml)陽性コントロール
2.SOM△X6* 1ng/ml
3.SOM△X6 10ng/ml
4.SOM△X6 100ng/ml
5.SOM△X6 1000ng/ml
6.SOM△X6 1000ng/ml ヘパリンなし
7.SOMX6** 1ng/ml
8.SOMX6 10ng/ml
9.SOMX6 100ng/ml
10.SOMX6 100ng/ml
11.SOMX6 1000ng/ml ヘパリンなし
*:エクソン6を欠くSOM175を意味する。
**:SOM175を意味する。
【図19】 マウス乏突起神経膠細胞に対する種々のSOM175タンパク質の作用
■3H(cpm)
1.FGF−2(10ng/ml)陽性コントロール
2.SOM△X6* 1ng/ml
3.SOM△X6 10ng/ml
4.SOM△X6 100ng/ml
5.SOM△X6 1000ng/ml
6.SOM△X6 1000ng/ml ヘパリンなし
7.SOMX6** 1ng/ml
8.SOMX6 10ng/ml
9.SOMX6 100ng/ml
10.SOMX6 1000ng/ml
11.SOMX6 1000ng/ml ヘパリンなし
*:エクソン6を欠くSOM175を意味する。
**:SOM175を意味する。
【図20】 マウス前脳ニューロンに対する種々のSOM175タンパク質の作用
■生存率%
1.FGF−2(10ng/ml)陽性コントロール
2.SOM△X6* 1ng/ml
3.SOM△X6 10ng/ml
4.SOM△X6 100ng/ml
5.SOM△X6 100ng/ml
6.SOM△X6 1000ng/ml ヘパリンなし
7.SOMX6** 1ng/ml
8.SOMX6 10ng/ml
9.SOMX6 100ng/ml
10.SOMX6 1000ng/ml
11.SOMX6 1000ng/ml ヘパリンなし
*:エクソン6を欠くSOM175を意味する。
**:SOM175を意味する。

Claims (21)

  1. 血管内皮細胞の増殖を誘導する分離されたポリペプチドであって、上記ポリペプチドが、SEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列、またはSEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列もしくはその相補形と60℃にて1−3時間、0.1−1×SSC/0.1%w/vSDSの高いストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るヌクレオチド配列によってコードされたアミノ酸配列を含むことを特徴とする、分離されたポリペプチド。
  2. 血管内皮細胞の増殖を誘導する分離されたポリペプチドであって、上記ポリペプチドが、SEQ ID NO:4に記載されたアミノ酸配列を含むことを特徴とする、分離されたポリペプチド。
  3. SEQ ID NO:4に記載されたアミノ酸配列、または、SEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列、またはSEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列もしくはその相補形と60℃にて1−3時間、0.1−1×SSC/0.1%w/vSDSの高いストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るヌクレオチド配列によってコードされたアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1記載の分離されたポリペプチド。
  4. 上記ポリペプチドが大グリア細胞増殖を誘導する能力を有する、請求項1−3のいずれか1項記載の分離されたポリペプチド。
  5. 上記ポリペプチドがヒト由来のものである、請求項1−4記載のいずれか1項記載の分離されたポリペプチド。
  6. 血管内皮細胞の増殖を誘導する能力を示す分離されたポリペプチドであって、上記ポリペプチドが、SEQ ID NO:4に記載されたアミノ酸配列、またはそれらの部分、またはSEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列もしくはその相補形と60℃にて1−3時間、0.1−1×SSC/0.1%w/vSDSの高いストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るヌクレオチド配列によってコードされたアミノ酸配列を含む、分離されたポリペプチド。
  7. 血管内皮細胞の増殖を誘導する能力を示す、SEQ ID NO:4に記載されたアミノ酸配列の一部に対応する分離されたポリペプチドフラグメント。
  8. SEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列、またはSEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列もしくはその相補形と60℃にて1−3時間、0.1−1×SSC/0.1%w/vSDSの高いストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るヌクレオチド配列を含み、上記ヌクレオチド配列から血管内皮細胞の増殖を誘導するポリペプチドが発現される、分離された核酸分子。
  9. SEQ ID NO:4に記載されたアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、請求項8記載の分離された核酸分子。
  10. 血管内皮細胞の増殖を誘導するポリペプチドをコードする、SEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列を含む、分離された核酸分子。
  11. 上記ポリペプチドが大グリア細胞増殖を誘導する能力を有する、請求項9または10記載の分離された核酸分子。
  12. 上記核酸分子がヒト由来のものである、請求項8−11のいずれか1項記載の分離された核酸分子。
  13. 請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチドの製造方法であって、上記ポリペプチドをコードするSEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列、またはSEQ ID NO:3に記載されたヌクレオチド配列もしくはその相補形と60℃にて1−3時間、0.1−1×SSC/0.1%w/vSDSの高いストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るヌクレオチド配列を、上記ポリペプチドの合成に効果的な条件下で適当な宿主細胞によって発現させ、上記ポリペプチドを分離することを特徴とする方法。
  14. 請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチド、および1またはそれ以上の医薬的に許容され得る担体および/または希釈剤を含む、医薬組成物。
  15. 哺乳動物(人を除く)における大グリア細胞増殖の誘導方法であって、上記方法が、上記哺乳動物に、請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチドの有効量を投与し、上記投与が大グリア細胞の増殖を誘導するのに適切な期間および条件下で行われることを特徴とする方法。
  16. 哺乳動物(人を除く)におけるニューロンの生存および/または増殖を促進する方法であって、上記方法が、上記哺乳動物に、請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチドの有効量を投与し、上記投与が大グリア細胞の増殖を誘導するのに適切な期間および条件下で行われることを特徴とする方法。
  17. 有効成分として、請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチドの有効量を含む、哺乳動物における大グリア細胞を増殖するための医薬組成物。
  18. 有効成分として、請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチドの有効量を含む、哺乳動物におけるニューロンの生存および/または増殖を促進するための医薬組成物。
  19. 請求項8−12のいずれか1項に記載の核酸分子を含む宿主細胞。
  20. 請求項8−12のいずれか1項に記載の核酸分子を含むベクター。
  21. 請求項1−7のいずれか1項に記載のポリペプチド、または請求項8−12のいずれか1項に記載の核酸分子でコードされたポリペプチドに対する分離された中和抗体。
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