JP2023542080A - カルレティキュリンに結合する多機能性分子およびその使用 - Google Patents
カルレティキュリンに結合する多機能性分子およびその使用 Download PDFInfo
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Abstract
i)カルレティキュリンタンパク質に結合する抗原結合性ドメインと;(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される);(iii)サイトカイン分子;および/または(iv)間質改変部分のうちの1つ、2つ、またはすべてとを含む多機能性分子が開示される。さらに、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用してがんを処置する方法が開示される。【選択図】図20-2
Description
関連出願
[0001]本出願は、2020年8月26日に出願された米国仮特許出願第63/070,769号の利益を主張し、それぞれの内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[0001]本出願は、2020年8月26日に出願された米国仮特許出願第63/070,769号の利益を主張し、それぞれの内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[0002]骨髄増殖性新生物(MPN)は、血液細胞を骨髄において異常に成長させる状態の群である。一般的な骨髄増殖性新生物としては、原発性または特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、および慢性骨髄性白血病(CML)が挙げられる。原発性骨髄線維症は、過剰な瘢痕組織が骨髄に形成され、骨髄の正常な血液細胞を産生する能力を障害する慢性血液がんである。骨髄増殖性新生物、例えば骨髄線維症の処置の改善に関する存続している必要性を考慮すると、骨髄増殖性新生物を標的とする新たな組成物および処置が非常に望ましい。
[0003]とりわけ、ある態様では、(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型もしくは突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば、表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、もしくは表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表30、表31、表32、表10、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、またはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインとを含むポリペプチド分子を含む組成物が、本明細書に開示される。
[0004]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、多機能性ポリペプチド分子である。
[0005]一部の実施形態では、ポリペプチド分子は、多特異性ポリペプチド分子である。
[0006]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはTCRβVに結合する。
[0007]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはT細胞を活性化するか、または第2の抗原結合性ドメインはT細胞を活性化しない。
[0008]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはTCRβV12またはTCRβV6(例えば、配列番号1044のアミノ酸配列を含む)に結合する。
[0009]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表30、表31、表32、表10、表11、表12、または表13に列挙される1つまたは複数のアミノ酸配列を含む。
[0010]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0011]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0012]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0013]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0014]一部の実施形態では、本明細書に記載される組成物は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
[0015]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはNKp30に結合する。
[0016]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子、例えば抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択され、例えば、第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである。
[0017]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0018]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0019]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[0020]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[0021]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む。
[0022]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0023]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0024]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[0025]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[0026]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。
[0027]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[0028]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[0029]一部の実施形態では、本明細書に記載される組成物は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは、第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは、第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
[0030]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。
[0031]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。
[0032]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[0033]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインはカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第1の抗原結合性ドメインは配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。
[0034]一部の実施形態では、本明細書に記載される組成物は、
第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインであって、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6285、D1001または6286のアミノ酸配列を含む、第3の抗原結合性ドメイン
をさらに含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと同じである。
第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインであって、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6285、D1001または6286のアミノ酸配列を含む、第3の抗原結合性ドメイン
をさらに含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと同じである。
[0035]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリン分子は第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と同じである。
[0036]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリン分子は第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と異なる。
[0037]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。
[0038]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[0039]一部の実施形態では、第3の抗原結合性ドメインは第2のカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第3の抗原結合性ドメインは配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。
[0040]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVLを含む。
[0041]一部の実施形態では、多機能性分子は腫瘍標的化部分をさらに含む。
[0042]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は腫瘍抗原に結合する。
[0043]一部の実施形態では、腫瘍抗原は、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される。
[0044]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する抗体分子を含む。
[0045]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、例えば、表38または表20に列挙されるVHおよび/またはVL配列を含む。
[0046]一部の実施形態では、多機能性分子は、非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合し、任意選択で、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合は、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい。
[0047]一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択され、任意選択で、骨髄増殖性新生物細胞はJAK2 V617F突然変異を含まないか、または骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含まない。
[0048]一部の実施形態では、本明細書に記載の組成物は、リンカー、例えば、第1の抗原結合性ドメインと第2の抗原結合性ドメインとの間のリンカーをさらに含む。
[0049]一部の実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される。
[0050]一部の実施形態では、リンカーはペプチドリンカーである。
[0051]一部の実施形態では、ペプチドリンカーはGlyおよびSerを含む。
[0052]一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号6214~6217、または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む。
[0053]別の態様では、(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型もしくは突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば、表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、もしくは表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表30、表31、表32、表10、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、またはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインとを含む多機能性分子が、本明細書に開示される。
[0054]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、TCRβVに結合する。
[0055]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはT細胞を活性化するか、または第2の抗原結合性ドメインはT細胞を活性化しない。
[0056]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、TCRβV12またはTCRβV6(例えば、配列番号1044のアミノ酸配列を含む)に結合する。
[0057]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表30、表31、表32、表10、表11、表12、または表13に列挙される1つまたは複数のアミノ酸配列を含む。
[0058]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0059]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0060]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67AのVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68AのVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0061]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0062]一部の実施形態では、本明細書に記載される多機能性分子は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
[0063]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはNKp30に結合する。
[0064]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子、例えば抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択され、例えば、第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである。
[0065]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0066]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0067]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[0068]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[0069]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む。
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む。
[0070]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0071]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0072]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[0073]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[0074]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。
[0075]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[0076]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[0077]一部の実施形態では、本明細書に記載される多機能性分子は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは、第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは、第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
[0078]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は、配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、カルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。
[0079]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は、配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。
[0080]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[0081]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、カルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第1の抗原結合性ドメインが、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。
[0082]一部の実施形態では、本明細書に記載の多機能性分子は、第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインをさらに含み、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、(i)第3の抗原結合性ドメインは、第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または(ii)第3の抗原結合性ドメインは、第1の抗原結合性ドメインと同じである。
[0083]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリン分子は、第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と同じである。
[0084]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリン分子は、第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と異なる。
[0085]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。
[0086]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[0087]一部の実施形態では、第3の抗原結合性ドメインは、第2のカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第3の抗原結合性ドメインは、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。
[0088]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVLを含む。
[0089]一部の実施形態では、多機能性分子は、腫瘍標的化部分をさらに含む。
[0090]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、腫瘍抗原に結合する。
[0091]一部の実施形態では、腫瘍抗原は、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される。
[0092]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する抗体分子を含む。
[0093]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、例えば、表38または表20に列挙されるVHおよび/またはVL配列を含む。
[0094]一部の実施形態では、多機能性分子は、非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合し、任意選択で、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合は、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい。
[0095]一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択され、任意選択で、
骨髄増殖性新生物細胞はJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含まない。
骨髄増殖性新生物細胞はJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含まない。
[0096]一部の実施形態では、本明細書に記載の多機能性分子は、リンカー、例えば、第1の抗原結合性ドメインと第2の抗原結合性ドメインとの間のリンカーをさらに含む。
[0097]一部の実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される。
[0098]一部の実施形態では、リンカーは、ペプチドリンカーである。
[0099]一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、GlyおよびSerを含む。
[00100]一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号6214~6217または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む。
[00101]別の態様では、本明細書に記載の多機能性分子をコードする核酸分子が本明細書に提供される。
[00102]別の態様では、本明細書に記載の核酸分子を含む、ベクター、例えば、発現ベクターが本明細書に提供される。
[00103]別の態様では、本明細書に記載の核酸分子または本明細書に記載のベクターを含む細胞が本明細書に提供される。
[00104]別の態様では、本明細書に記載される多機能性分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適した条件下で、本明細書に記載される細胞を培養するステップを含む、方法が本明細書に提供される。
[00105]別の態様では、本明細書に記載の組成物、本明細書に記載の多機能性分子、本明細書に記載の核酸分子、本明細書に記載のベクター、または本明細書に記載の細胞と、薬学的に許容される担体、賦形剤、希釈剤、または安定化剤とを含む医薬組成物が本明細書に提供される。
[00106]別の態様では、がんを処置する方法であって、それを必要とする対象に、本明細書に記載の組成物、本明細書に記載の多機能性分子、本明細書に記載の核酸分子、本明細書に記載のベクター、本明細書に記載の細胞、または本明細書に記載の医薬組成物を投与するステップを含み、多機能性分子ががんを処置するのに有効な量で投与される、方法が本明細書に提供される。
[00107]別の態様では、がんを処置するための医薬の製造のための、本明細書に記載の組成物、本明細書に記載の多機能性分子、本明細書に記載の核酸分子、本明細書に記載のベクター、または本明細書に記載の細胞の使用が本明細書に提供される。
[00108]一部の実施形態では、対象は、第1および/または第2のカルレティキュリンタンパク質を発現するがん細胞を有する。
[00109]一部の実施形態では、対象は、JAK2 V617F突然変異を有する。
[00110]一部の実施形態では、対象は、JAK2 V617F突然変異を有しない。
[00111]一部の実施形態では、対象は、MPL突然変異を有する。
[00112]一部の実施形態では、対象は、MPL突然変異を有しない。
[00113]一部の実施形態では、がんは血液がんであり、任意選択で、がんは、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)であり、任意選択で、がんは骨髄線維症である。
[00114]一部の実施形態では、がんは、固形腫瘍がんである。
[00115]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法または本明細書に記載の使用は、第2の治療処置を施すステップをさらに含む。
[00116]一部の実施形態では、第2の治療処置は、治療剤(例えば、化学療法剤、生物学的製剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む。
[00117]一部の実施形態では、治療剤は、化学療法剤、または生物学的製剤から選択される。
[00118]別の態様では、試料または対象中のカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法であって、試料または対象を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに抗体分子と試料または対象との複合体の形成を検出するステップを含み、それによってカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する、方法が本明細書に提供される。
[00119]一部の実施形態では、カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)は、in vitroまたはin vivoで検出される。
[00120]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、参照試料または対象を、抗体分子と接触させるステップ;および抗体分子と参照試料または対象との複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または対象と比較した、試料または対象における複合体の形成における変化、例えば統計学的に有意な変化は、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の存在を示す。
[00121]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、対象から試料を取得するステップをさらに含む。
[00122]一部の実施形態では、試料は、血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えばリンパ節のうちの1つまたは複数を含む。
[00123]一部の実施形態では、試料は、凍結および/または固定されていない。
[00124]一部の実施形態では、試料は、凍結(例えば、瞬間凍結)および/または固定(例えば、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE))されている。
[00125]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある。
[00126]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、例えば、マルチパネル法を使用するフロー分析を実施するステップをさらに含む。
[00127]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、T細胞クローン性を評価して、例えば、T細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するステップをさらに含む。
[00128]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、生体試料からのカルレティキュリン+(例えば、野生型カルレティキュリン+および/または突然変異体カルレティキュリン+)細胞のレベルを測定するステップ(例えば、カルレティキュリン+細胞が、例えば、参照試料または対象と比較して枯渇しているかどうかを決定するステップ)をさらに含む。
[00129]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む。
[00130]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の膜レベルを測定するステップをさらに含む。
[00131]一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、例えば、(例えば、本明細書に記載の抗体分子を用いた)処置後に、疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)の予後、重症度、または存在もしくは非存在の変化について対象を評価するステップをさらに含む。
[00132]一部の実施形態では、抗体分子は、検出可能に標識される。
[00133]別の態様では、対象を評価する方法であって、対象からの試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに抗体分子と試料との複合体の形成を検出するステップを含み、それによって対象を評価する、方法が本明細書に提供される。
[00134]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある。
[00135]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されていない。
[00136]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されている。
[00137]別の態様では、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法における使用のための使用説明書とを含むキットが本明細書に提供される。
[00138]当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、単に日常的な実験を用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の実施形態に包含されることが意図される。
[00139]別途定義されない限り、本明細書において使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって広く理解されているものと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものに類似またはそれと同等の方法および材料を、本発明の実施または試験において使用することができるが、好適な方法および材料が、以下に記載されている。本明細書に記載されるすべての刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。矛盾が生じた場合には、定義を含め、本明細書が優先される。加えて、材料、方法、および実施例は、例示に過ぎず、限定することを意図するものではない。
[00140]本発明の他の特性および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から明らかであろう。
[00141]特許または出願ファイルは、カラーを付して作成された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面(複数可)を含むこの特許または特許出願公開の写しは、請求および必要な手数料の納付があった場合に特許庁によって提供される。
[00172](i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質および/またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、例えば、カルレティキュリンタンパク質が、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインと、(ii)(a)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー、(b)サイトカイン分子、(c)間質改変部分、および(d)腫瘍標的化部分(例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する)のうち1つ、2つまたはすべてとを含む、複数の(例えば、2つ以上の)機能性(または結合特異性)を含む多機能性分子(本明細書において「多特異性分子」とも呼ばれる)が、本明細書に開示される。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質または例えば、本明細書に記載される突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、表2または3に開示されるカルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、表2または3に開示される1型カルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、表2または3に開示される2型カルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する。一部の実施形態では、抗原結合性ドメインは、表2または3に開示される1型および2型カルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、TCRのベータサブユニットの可変鎖(TCRβV)、例えば、TCRβ V6またはTCRβ V12に結合する追加の抗原結合性ドメインを含む。
[00173]一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、二特異性(もしくは二機能性)分子、三特異性(もしくは三機能性)分子、または四特異性(もしくは四機能性)分子である。一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、二特異性分子である。
[00174]理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、カルレティキュリンタンパク質を、例えば、表面に発現する細胞の存在下で、免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞またはマクロファージから選択される免疫エフェクター細胞)に局在する(例えば、それを架橋する)および/またはそれを活性化すると予測される。本明細書に記載される多特異性または多機能性分子を使用して、カルレティキュリンタンパク質を発現する細胞の存在下で免疫細胞の近接性および/または活性を増大することは、標的細胞に対する免疫応答を増強し、それによって、より効果的な療法を提供すると予測される。
[00175](i)間質改変部分と、(ii)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質および/またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、例えば、カルレティキュリンタンパク質が、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインとを含む新規多機能性、例えば、多特異性分子が開示される。理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される多機能性分子は、とりわけ、がん部位を標的とする(例えば、それに局在する)、および腫瘍間質を変更する、例えば、がん部位付近の腫瘍微小環境を変更すると考えられる。多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーのうちの1つ、2つ、3つまたはすべてから選択される)および/またはサイトカイン分子のうちの一方または両方をさらに含み得る。したがって、とりわけ、前述の部分を含む多機能性、例えば、多特異性分子、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用してがんを処置する方法が本明細書で提供される。
[00176]したがって、とりわけ、前述の部分を含む多特異性または多機能性分子(例えば、多特異性または多機能性抗体分子)、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用して疾患または障害、例えば、がんを処置する方法が本明細書で提供される。
定義
[00177]一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャーを含む。「免疫細胞係合体」とは、免疫細胞、例えば、免疫応答に関与する細胞に結合および/または活性化する1つまたは複数の結合特異性を指す。一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、および/またはマクロファージ細胞から選択される。免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、受容体分子(例えば、全長受容体、受容体断片、またはそれらの融合体(例えば、受容体-Fc融合体))、または免疫細胞抗原(例えば、T細胞、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合するリガンド分子(例えば、全長リガンド、リガンド断片、またはそれらの融合体(例えば、リガンド-Fc融合体))であり得る。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、標的免疫細胞に特異的に結合し、例えば、標的免疫細胞に優先的に結合する。例えば、免疫細胞エンゲージャーが抗体分子である場合、それは、約10nM未満の解離定数で、免疫細胞抗原(例えば、T細胞抗原、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合する。
定義
[00177]一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャーを含む。「免疫細胞係合体」とは、免疫細胞、例えば、免疫応答に関与する細胞に結合および/または活性化する1つまたは複数の結合特異性を指す。一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、および/またはマクロファージ細胞から選択される。免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、受容体分子(例えば、全長受容体、受容体断片、またはそれらの融合体(例えば、受容体-Fc融合体))、または免疫細胞抗原(例えば、T細胞、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合するリガンド分子(例えば、全長リガンド、リガンド断片、またはそれらの融合体(例えば、リガンド-Fc融合体))であり得る。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、標的免疫細胞に特異的に結合し、例えば、標的免疫細胞に優先的に結合する。例えば、免疫細胞エンゲージャーが抗体分子である場合、それは、約10nM未満の解離定数で、免疫細胞抗原(例えば、T細胞抗原、NK細胞抗原、B細胞抗原、樹状細胞抗原、および/またはマクロファージ細胞抗原)に結合する。
[00178]本明細書で使用される場合、用語「T細胞受容体ベータ可変鎖」、「TCRVβ」、「TCRVb」および「TCRβV」は、同義的に使用され、T細胞受容体の抗原認識ドメインを含むT細胞受容体ベータ鎖の細胞外領域を指す。用語TCRVβまたはTCRβVは、TCRβVと少なくとも1つの共通エピトープを含む、アイソフォーム、哺乳動物、例えば、ヒトTCRβV、ヒトの種相同体およびアナログを含む。ヒトTCRβVは、限定されないがTCRβ V6 サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、またはTCRβ V29サブファミリーを含むサブファミリーを含む遺伝子ファミリーを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含む。一部の実施形態では、TCRβVは、TCRβ V6-5*01を含む。TCRβ V6-5*01は、TRBV65;TCRBV6S5;TCRBV13S1、またはTCRβ V13.1としても公知である。TCRβ V6-5*01、例えば、ヒトTCRβ V6-5*01のアミノ酸配列は、当該技術分野において公知であり、例えば、IMGT ID L36092によって提供される。一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号1043の核酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列によってコードされる。一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号1044のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
[00179]一部の実施形態では、多機能性分子は、サイトカイン分子を含む。本明細書で使用される場合、「サイトカイン分子」とは、サイトカインの全長、断片またはバリアント;さらに、受容体ドメイン、例えば、サイトカイン受容体二量化ドメインを含むサイトカイン;または、天然に存在するサイトカインの少なくとも1つの活性化を誘発する、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、サイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)を指す。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンγ、またはこれらの断片もしくはバリアント、または前述のサイトカインのいずれかの組合せから選択される。サイトカイン分子は、モノマーまたは二量体であり得る。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体二量体化ドメインをさらに含むことができる。他の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、IL-15RaまたはIL-21Rから選択されるサイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)である。
[00180]本明細書で使用される場合、例えば、抗体分子、サイトカイン分子、受容体分子において使用される用語「分子」は、改変されていない(例えば、天然に存在する)分子の少なくとも1つの機能および/または活性化が残る限り、全長の天然に存在する分子、ならびにバリアント、例えば、機能的バリアント(例えば、切断、断片、突然変異(例えば、実質的に類似の配列)またはその誘導体化された形態)を含む。
[00181]一部の実施形態では、多機能性分子は、間質改変部分を含む。「間質改変部分」とは、本明細書で使用される場合、間質の成分を変更、例えば、分解することができる薬剤、例えば、タンパク質(例えば、酵素)を指す。一部の実施形態では、間質の成分は、例えば、ECM成分、例えば、グリコサミノグリカン、例えば、ヒアルロナン(ヒアルロン酸またはHAとしても公知である)、コンドロイチン硫酸、コンドロイチン、デルマタン硫酸、ヘパリン硫酸、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカンおよびケラチン硫酸;または細胞外タンパク質、例えば、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、およびビトロネクチンから選択される。
[00182]特定の用語を以下に定義する。
[00183]本明細書で使用される場合、冠詞「ある(a)」および「ある(an)」は、冠詞の文法的対象物の1つまたは複数、例えば、少なくとも1つを指す。用語「ある(a)」または「ある(an)」の使用は、本明細書における用語「含んでいる」と共に使用される場合、「1つ」を意味し得るが、「1つまたは複数」、「少なくとも1つ」および「1または1を超える」の意味とも一致する。
[00184]本明細書で使用される場合、「約」および「ほぼ」は、一般に、測定の性質または精度を与えられて測定された量についての許容可能な誤差の程度を意味する。誤差の例示的な程度は、所定の範囲の値の20パーセント(%)以内であり、典型的には10%以内であり、より典型的には5%以内である。
[00185]本明細書で使用される「抗体分子」とは、少なくとも1つの免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む、タンパク質、例えば、免疫グロブリン鎖またはその断片を指す。抗体分子は、抗体(例えば、全長抗体)および抗体断片を包含する。ある実施形態では、抗体分子は、全長抗体の抗原結合もしくは機能的断片、または全長免疫グロブリン鎖を含む。例えば、全長抗体は、天然に存在するか、または正常な免疫グロブリン遺伝子断片の組換えプロセスによって形成される免疫グロブリン(Ig)分子(例えば、IgG抗体)である。一部の実施形態では、抗体分子は、免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な抗原結合部分、例えば、抗体断片を指す。抗体断片、例えば、機能性断片は、抗体の一部、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)2、F(ab)2、可変断片(Fv)、ドメイン抗体(dAb)、または一本鎖可変断片(scFv)である。機能性抗体断片は、インタクトな(例えば、全長)抗体によって認識されるものと同じ抗原に結合する。用語「抗体断片」または「機能性断片」はまた、重鎖および軽鎖の可変領域からなる「Fv」断片、または軽鎖および重鎖の可変領域がペプチドリンカーによって連結されている組換え一本鎖ポリペプチド分子(「scFvタンパク質」)などの可変領域からなる単離された断片を含む。一部の実施形態では、抗体断片は、抗原結合活性を有しない抗体の部分、例えば、Fc断片または単一アミノ酸残基を含まない。例示的な抗体分子は、全長抗体および抗体断片、例えば、dAb(ドメイン抗体)、一本鎖、Fab、Fab’、およびF(ab’)2断片、ならびに一本鎖可変断片(scFv)を含む。
[00186]本明細書で使用される場合、「免疫グロブリン可変ドメイン配列」とは、免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成することができるアミノ酸配列を指す。例えば、配列は、天然に存在する可変ドメインのアミノ酸配列の全部または一部を含み得る。例えば、配列は、1個、2個、もしくはそれ以上のN末端またはC末端アミノ酸を含むかまたは含まない場合があり、あるいはタンパク質構造の形成に適合する他の改変を含む場合がある。
[00187]一部の実施形態では、抗体分子は、単一特異性であり、例えば、単一のエピトープに対する結合特異性を含む。一部の実施形態では、抗体分子は、多特異性であり、例えば、それは、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第1のエピトープに対して結合特異性を有し、第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第2のエピトープに対して結合特異性を有する。一部の実施形態では、抗体分子は、二特異性抗体分子である。「二特異性抗体分子」とは、本明細書で使用される場合、1を超える(例えば、2、3、4、またはそれを超える)エピトープおよび/または抗原に対する特異性を有する抗体分子を指す。
[00188]本明細書で使用される「抗原」(Ag)とは、例えば、ある種の免疫細胞の活性化および/または抗体生成を伴う、免疫応答を引き起こすことができる分子を指す。ほとんどすべてのタンパク質またはペプチドを含む任意の高分子は、抗原であり得る。抗原はまた、ゲノム組換え体またはDNAから誘導され得る。例えば、免疫応答を誘導することができるタンパク質をコードするヌクレオチド配列または部分的ヌクレオチド配列を含む任意のDNAは、「抗原」をコードする。一部の実施形態では、抗原は、遺伝子の全長ヌクレオチド配列によってのみコードされる必要はなく、また、抗原は、遺伝子によって全くコードされる必要もない。一部の実施形態では、抗原は、生体試料、例えば、組織試料、腫瘍試料、細胞、または他の生体成分を有する流体から合成することができ、または誘導することができる。本明細書で使用される場合、「腫瘍抗原」または同義的に、「がん抗原」は、がん、例えば、がん細胞、または免疫応答を引き起こすことができる腫瘍微小環境上に存在するか、またはそれと関連する任意の分子を含む。本明細書で使用される場合、「免疫細胞抗原」とは、免疫応答を引き起こすことができる免疫細胞上に存在するか、またはそれと関連する任意の分子を含む。
[00189]抗体分子の「抗原結合部位」または「結合部位」とは、抗原結合に関与する抗体分子、例えば、免疫グロブリン(Ig)分子の一部を指す。一部の実施形態では、抗原結合部位は、重鎖(H)および軽鎖(L)の可変領域(V)のアミノ酸残基によって形成される。超可変領域と呼ばれる、重鎖および軽鎖の可変領域内の3つの高度に分岐ストレッチは、「フレームワーク領域」(FR)と呼ばれる、より保存された隣接領域間に配置される。FRは、免疫グロブリン中の超可変領域の間で、およびそれに隣接して天然に見出されるアミノ酸配列である。一部の実施形態では、抗体分子において、軽鎖の3つの超可変領域および重鎖の3つの超可変領域は、三次元空間において互いに対して配置されて、結合抗原の三次元表面に相補的な抗原結合表面を形成する。重鎖および軽鎖のそれぞれの3つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「CDR」と呼ばれる。フレームワーク領域およびCDRは、例えば、Kabat,E.A.ら(1991年)Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、U.S.Department of Health and Human Services、NIH公開番号91-3242、およびChothia,C.ら(1987年)J.Mol.Biol.196巻:901~917ページにおいて定義され、記載されている。各可変鎖(例えば、可変重鎖および可変軽鎖)は、典型的には、3つのCDRおよび4つのFRから構成され、アミノ酸の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、およびFR4でアミノ末端からカルボキシ末端に配列される。
[00190]本明細書で使用される「がん」は、すべてのタイプの発がんプロセスおよび/またはがん性増殖を包含することができる。一部の実施形態では、がんは、原発性腫瘍、ならびに転移性組織、または悪性に形質転換された細胞、組織、もしくは臓器を含む。一部の実施形態では、がんは、がんのすべての組織病理学および病期、例えば、浸潤性/重症度の病期を包含する。一部の実施形態では、がんは、再発がんおよび/または抵抗性がんを含む。用語「がん」および「腫瘍」は、互換的に使用することができる。例えば、両方の用語は、固形腫瘍および液体腫瘍を包含する。本明細書で使用される場合、用語「がん」または「腫瘍」は、前がん、ならびに悪性がんおよび腫瘍を含む。
[00191]本明細書で使用される場合、「免疫細胞」とは、免疫系において機能する、例えば、感染および異物の作用物質に対して防御する、種々の細胞のいずれかを指す。一部の実施形態では、この用語は、白血球、例えば、好中球、好酸球、好塩基球、リンパ球、および単球を含む。先天性白血球には、食細胞(例えば、マクロファージ、好中球、および樹状細胞)、肥満細胞、好酸球、好塩基球、およびナチュラルキラー細胞が含まれる。先天性白血球は、接触を通じてより大きな病原体を攻撃するか、微生物を飲み込んで殺滅させることによって病原体を特定し、排除し、適応免疫応答の活性化のメディエーターである。適応免疫系の細胞は、リンパ球と呼ばれる特殊なタイプの白血球である。B細胞およびT細胞は、重要なタイプのリンパ球であり、骨髄の造血幹細胞に由来する。B細胞は、体液性免疫応答に関与し、T細胞は、細胞性免疫応答に関与する。用語「免疫細胞」は、免疫エフェクター細胞を含む。
[00192]「免疫エフェクター細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、免疫応答、例えば、免疫エフェクター応答の促進に関与する細胞を指す。免疫エフェクター細胞の例は、限定されないが、T細胞、例えば、アルファ/ベータT細胞およびガンマ/デルタT細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT細胞、および肥満細胞を含む。
[00193]用語「エフェクター機能」または「エフェクター応答」は、細胞の特殊化された機能を指す。T細胞のエフェクター機能は、例えば、細胞溶解活性、またはサイトカインの分泌を含むヘルパー活性であり得る。
[00194]本発明の組成物および方法は、特定の配列、またはそれに対して実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、特定の配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%同一である、またはそれ以上同一である配列を有するポリペプチドおよび核酸を包含する。アミノ酸配列との関連で、用語「実質的に同一」が本明細書において使用され、第1および第2のアミノ酸配列が共通の構造ドメインおよび/または共通の機能活性を有し得るように、i)第2のアミノ酸配列と同一であるか、あるいはii)第2アミノ酸配列における整列されたアミノ酸残基の保存的置換である、十分な数または最小限の数のアミノ酸残基を含有する第1アミノ酸を指す。例えば、共通の構造ドメインを含有するアミノ酸配列は、参照配列、例えば、本明細書で提供される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有する。
[00195]ヌクレオチド配列との関連で、用語「実質的に同一」が本明細書において使用され、第1および第2ヌクレオチド配列が、共通の機能活性を有するポリペプチドをコードする、または共通のポリペプチド構造ドメインまたは共通のポリペプチド機能活性をコードするように、第2核酸配列におけるアラインされたヌクレオチドと同一である、十分な数または最小限の数のヌクレオチドを含有する第1核酸配列を指す。例えば、参照配列、例えば本明細書で提供される配列に対して少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するヌクレオチド配列。
[00196]用語「バリアント」とは、参照アミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドを指す。一部の実施形態では、バリアントは、機能的バリアントである。
[00197]用語「機能的バリアント」とは、参照アミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、または実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされ、参照アミノ酸配列の1つまたは複数の活性化を有し得るポリペプチドを指す。
[00198]配列間の相同性または配列同一性(これらの用語は本明細書において互換的に使用される)の計算は以下のように行われる。
[00199]2つのアミノ酸配列または2つの核酸配列の同一性パーセントを決定するため、最適な比較目的のために配列がアラインメントされる(例えば、最適アラインメントのために、第1および第2アミノ酸または核酸配列の1つまたは両方にギャップが導入され得、非相同配列は比較目的のために無視され得る)。好ましい実施形態では、比較目的のためにアラインされた参照配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、好ましくは少なくとも40%、さらに好ましくは少なくとも50%、60%、なおさらに好ましくは少なくとも70%、80%、90%、100%である。次に、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第1配列の位置が、第2配列での対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められる場合、分子は、その位置にて同一である(本明細書で使用される場合、アミノ酸または核酸「同一性」は、アミノ酸または核酸「相同性」と等しい)。
[00200]2つの配列間の同一性パーセントは、配列によって共有される同一位置の数の関数であり、2つの配列の最適アラインメントのために導入する必要がある、ギャップ数および各ギャップの長さが考慮に入れられる。
[00201]配列の比較および2つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成することができる。好ましい実施形態では、2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、Blossum62マトリックスまたはPAM250マトリックス、および16、14、12、10、8、6、または4のギャップの重みおよび1、2、3、4、5、または6の長さの重みのいずれかを用いて、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comにて入手可能である)のGAPプログラムに組み込まれているNeedlemanおよびWunsch((1970年)J.Mol.Biol.48巻:444~453ページ)アルゴリズムを用いて決定される。さらに別の好ましい実施形態では、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comにて入手可能である)のGAPプログラムを使用して、NWSgapdna.CMPマトリックスおよび40、50、60、70、または80のギャップの重みおよび1、2、3、4、5、または6の長さの重みを用いて決定される。特に好ましいセットのパラメーター(および別段の指定がない限り使用されるべきであるもの)は、ギャップペナルティ12、ギャップ伸張ペナルティ4、およびフレームシフトギャップペナルティ5を有するBlossum62スコアマトリックスである。
[00202]2つのアミノ酸配列間またはヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、PAM120残基重み付け表、ギャップ長ペナルティ12およびギャップペナルティ4を用いて、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれたE.MeyersおよびW.Miller((1989年)CABIOS、4巻:11~17ページ)のアルゴリズムを使用して決定することができる。
[00203]本明細書に記載される核酸およびタンパク質配列は、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために、公開データベースに対する検索を行うための「クエリー配列」として用いることができる。このような検索は、Altschulら(1990年)J.Mol.Biol.215巻:403~10ページのNBLASTおよびXBLASTプログラム(バージョン2.0)を用いて行うことができる。BLASTヌクレオチド検索は、本発明の核酸分子と相同なヌクレオチド配列を得るために、NBLASTプログラム、スコア=100、ワードレングス=12を用いて行うことができる。BLASTタンパク質検索は、本発明のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得るために、XBLASTプログラム、スコア=50、ワードレングス=3を用いて行うことができる。比較目的のためのギャップドアラインメントを得るために、ギャップドBLASTは、Altschulら(1997年)Nucleic Acids Res.25巻:3389~3402ページに記載されているように利用することができる。BLASTおよびギャップドBLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメーターを使用することができる。http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照。
[00204]本発明の分子は、それらの機能に実質的な影響を及ぼさない、さらなる保存的または非必須アミノ酸置換を有し得ることが理解される。
[00205]用語「アミノ酸」は、天然または合成のいずれであっても、アミノ官能性と酸官能性の両方を含み、天然に存在するアミノ酸のポリマーに含まれ得るすべての分子を包含することを意図する。例示的なアミノ酸には、天然に存在するアミノ酸;そのアナログ、誘導体および同族体;バリアント側鎖を有するアミノ酸アナログ;ならびに先述のいずれかのすべての立体異性体が含まれる。本明細書で使用される場合、用語「アミノ酸」は、DまたはL光学異性体とペプチド模倣体の両方を含む。
[00206]「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野において定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ分枝側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が含まれる。
[00207]用語「ポリペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」(一本鎖の場合)は、本明細書において互換的に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。ポリマーは、直鎖状または分枝鎖状であり得て、修飾アミノ酸を含み得、非アミノ酸により割り込まれ得る。これらの用語はまた、修飾されているアミノ酸ポリマー;例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、または標識成分とのコンジュゲーションなどの任意の他の操作を包含する。ポリペプチドは、天然源から単離することができ、真核生物もしくは原核生物宿主からの組換え技術により産生することができ、または合成手法の産生物であり得る。
[00208]用語「核酸」、「核酸配列」、「ヌクレオチド配列」、または「ポリヌクレオチド配列」、および「ポリヌクレオチド」は、互換的に使用される。それらは、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド、またはそれらのアナログのいずれかの長さのヌクレオチドのポリマー形態を指す。ポリヌクレオチドは、一本鎖または二本鎖のいずれかであり得、一本鎖である場合、コード鎖または非コード(アンチセンス)鎖であり得る。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびヌクレオチドアナログなどの修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド成分によって割り込まれ得る。ポリヌクレオチドは、重合後、例えば、標識成分とのコンジュゲーションによってさらに修飾され得る。核酸は、組換えポリヌクレオチド、またはゲノム、cDNA、天然に存在しないかもしくは非天然配列で別のポリヌクレオチドに連結されている半合成、または合成起源のポリヌクレオチドであり得る。
[00209]用語「単離された」とは、本明細書で使用される場合、その元の環境または天然の環境(例えば、天然に存在する場合には自然環境)から取り出される材料を指す。例えば、生きている動物に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されないが、天然系の共存物質の一部または全部からヒトの介入によって分離された同一のポリヌクレオチドまたはポリペプチドが単離される。このようなポリヌクレオチドは、ベクターの一部であり得、および/またはこのようなポリヌクレオチドもしくはポリペプチドは、組成物の一部であり得、このようなベクターまたは組成物は、天然に見出される環境の一部ではないという点で依然として単離され得る。
[00210]本明細書で使用される場合、用語「トランスフォーミング増殖因子ベータ-1(TGF-ベータ1)」とは、ヒトにおいて、遺伝子TGFB1、またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。Swiss-Prot受託番号P01137は、例示的なヒトTGF-ベータ1アミノ酸配列を提供する。例示的な未熟ヒトTGF-ベータ1アミノ酸配列は、配列番号6378で提供される。例示的な成熟ヒトTGF-ベータ1アミノ酸配列は、配列番号6395で提供される。
[00211]本明細書で使用される場合、用語「トランスフォーミング増殖因子ベータ-2(TGF-ベータ2)」とは、ヒトにおいて、遺伝子TGFB2、またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。Swiss-Prot受託番号P61812は、例示的なヒトTGF-ベータ2アミノ酸配列を提供する。例示的な未熟ヒトTGF-ベータ2アミノ酸配列は、配列番号6379で提供される。例示的な成熟ヒトTGF-ベータ2アミノ酸配列は、配列番号6396で提供される。
[00212]本明細書で使用される場合、用語「トランスフォーミング増殖因子ベータ-3(TGF-ベータ3)」とは、ヒトにおいて、遺伝子TGFB3、またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。Swiss-Prot受託番号P10600は、例示的なヒトTGF-ベータ3アミノ酸配列を提供する。例示的な未熟ヒトTGF-ベータ3アミノ酸配列は、配列番号6380で提供される。例示的な成熟ヒトTGF-ベータ3アミノ酸配列は、配列番号6397で提供される。
[00213]本明細書で使用される場合、「TGF-ベータ受容体ポリペプチド」とは、TGF-ベータ受容体(例えば、TGFBR1、TGFBR2またはTGFBR3)またはその断片、またはそのバリアントを指す。
[00214]本明細書で使用される場合、用語「トランスフォーミング増殖因子ベータ受容体1型(TGFBR1)」(ALK-5またはSKR4としても公知である)とは、ヒトにおいて、遺伝子TGFBR1、またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。Swiss-Prot受託番号P36897は、例示的なヒトTGFBR1アミノ酸配列を提供する。例示的な未熟ヒトTGFBR1アミノ酸配列は、配列番号6381、6382および6383で提供される。例示的な成熟ヒトTGFBR1アミノ酸配列は、配列番号6398、6399および6400で提供される。本明細書で使用される場合、「TGFBR1ポリペプチド」とは、TGFBR1またはその断片、またはそのバリアントを指す。
[00215]本明細書で使用される場合、用語「トランスフォーミング増殖因子ベータ受容体2型(TGFBR2)」とは、ヒトにおいて、遺伝子TGFBR2、またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。Swiss-Prot受託番号P37173は、例示的なヒトTGFBR2アミノ酸配列を提供する。例示的未熟ヒトTGFBR2アミノ酸配列は、配列番号6384および6385で提供される。例示的な成熟ヒトTGFBR2アミノ酸配列は、配列番号6401および6402で提供される。本明細書で使用される場合、「TGFBR2ポリペプチド」とは、TGFBR2またはその断片、またはそのバリアントを指す。
[00216]本明細書で使用される場合、用語「トランスフォーミング増殖因子ベータ受容体3型(TGFBR3)」とは、ヒトにおいて、遺伝子TGFBR3、またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。Swiss-Prot受託番号Q03167は、例示的なヒトTGFBR3アミノ酸配列を提供する。例示的な未熟ヒトTGFBR3アミノ酸配列は、配列番号6392および6393で提供される。例示的な成熟ヒトTGFBR3アミノ酸配列は、配列番号6403および6404で提供される。本明細書で使用される場合、「TGFBR3ポリペプチド」とは、TGFBR3またはその断片またはそのバリアントを指す。
[00217]本発明の種々の態様を以下にさらに詳細に説明する。追加の定義は、明細書全体にわたって記載される。
抗体分子
[00218]一部の実施形態では、本明細書で記載される多機能性分子、多特異性分子および/または抗原結合性ドメインは、抗体分子を含む。一実施形態では、抗体分子は、がん抗原、例えば、腫瘍抗原または間質抗原に結合する。一部の実施形態では、がん抗原は、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトのがん抗原である。他の実施形態では、抗体分子は、免疫細胞抗原、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトの免疫細胞抗原に結合する。例えば、抗体分子は、がん抗原または免疫細胞抗原上のエピトープ、例えば、線形エピトープまたは立体構造エピトープに特異的に結合する。
抗体分子
[00218]一部の実施形態では、本明細書で記載される多機能性分子、多特異性分子および/または抗原結合性ドメインは、抗体分子を含む。一実施形態では、抗体分子は、がん抗原、例えば、腫瘍抗原または間質抗原に結合する。一部の実施形態では、がん抗原は、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトのがん抗原である。他の実施形態では、抗体分子は、免疫細胞抗原、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトの免疫細胞抗原に結合する。例えば、抗体分子は、がん抗原または免疫細胞抗原上のエピトープ、例えば、線形エピトープまたは立体構造エピトープに特異的に結合する。
[00219]一実施形態では、抗体分子は単一特異性抗体分子であり、単一のエピトープに結合する。例えば、単一特異性抗体分子は、それぞれが同じエピトープに結合する複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を有する。
[00220]一実施形態では、抗体分子は、多特異性または多機能性抗体分子であり、例えば、それは複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列のうちの第1のものは第1のエピトープに対する結合特異性を有し、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列のうちの第2のものは第2のエピトープに対する結合特異性を有する。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップする。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップしない。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、多特異性抗体分子は、第3、第4または第5の免疫グロブリン可変ドメインを含む。一実施形態では、多特異性抗体分子は、二特異性抗体分子、三特異性抗体分子、または四特異性抗体分子である。
[00221]一実施形態では、多特異性抗体分子は二特異性抗体分子である。二特異性抗体は、2つだけの抗原に対して特異性を有する。二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列および第2のエピトープに対して結合特異性を有する第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列により特徴付けられる。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップする。一実施形態では、第1および第2のエピトープはオーバーラップしない。一実施形態では、第1および第2のエピトープは、異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列ならびに第2のエピトープに対して結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体および第2のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体、またはその断片、および第2のエピトープに対して結合特異性を有する半抗体、またはその断片を含む。一実施形態では、二特異性抗体分子は、第1のエピトープに対して結合特異性を有するscFvもしくはFab、またはその断片、および第2のエピトープに対して結合特異性を有するscFvもしくはFab、またはその断片を含む。
[00222]一実施形態では、抗体分子は、ダイアボディ、および一本鎖分子の他に、抗体の抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、およびFv)を含む。例えば、抗体分子は、重(H)鎖可変ドメイン配列(本明細書でVHと略記される)、および軽(L)鎖可変ドメイン配列(本明細書でVLと略記される)を含むことができる。一実施形態では、抗体分子は、重鎖および軽鎖を含むかまたはからなる(本明細書で半抗体と称される。別の例では、抗体分子は、2つの重(H)鎖可変ドメイン配列および2つの軽(L)鎖可変ドメイン配列を含み、それによって、2つの抗原結合性部位、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fc、Fd、Fd’、Fv、一本鎖抗体(例えばscFv)、単一可変ドメイン抗体、ダイアボディ(Dab)(二価および二特異性)、ならびにキメラ(例えば、ヒト化)抗体を形成し、これらは全長抗体の修飾によって産生されるか、または組換えDNA技術を使用してde novoで合成されるものであってもよい。これらの機能的抗体断片は、それらの各々の抗原または受容体と選択的に結合する能力を保持する。抗体および抗体断片は、IgG、IgA、IgM、IgD、およびIgEが挙げられるがそれに限定されない抗体の任意のクラスから、ならびに抗体の任意のサブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4)からのものであり得る。抗体分子の調製物は、モノクローナルまたはポリクローナルであり得る。抗体分子はまた、ヒト、ヒト化、CDRグラフト化、またはin vitroで生成された抗体であり得る。抗体は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4から選択される重鎖定常領域を有し得る。抗体はまた、例えば、カッパまたはラムダから選択される軽鎖を有し得る。「免疫グロブリン」(Ig)という用語は、本明細書で「抗体」という用語と交換可能に使用される。
[00223]抗体分子の抗原結合性断片の例としては、(i)VL、VH、CLおよびCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片、(ii)ヒンジ領域においてジスルフィド架橋によって連結された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab’)2断片、(iii)VHおよびCH1ドメインからなる、Fd断片、(iv)抗体の単一のアームのVLおよびVHドメインからなる、Fv断片、(v)VHドメインからなる、ダイアボディ(dAb)断片、(vi)ラクダまたはラクダ化可変ドメイン、(vii)一本鎖Fv(scFv)、例えば、Birdら、(1988) Science 242:423~426ページ;およびHustonら、(1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879~5883ページを参照)、(viii)単一ドメイン抗体が挙げられる。これらの抗体断片は、当業者に公知の従来技術を使用して得られ、断片は、インタクトな抗体と同じ方式で有用性についてスクリーニングされる。
[00224]抗体分子としては、インタクトな分子の他に、その機能的断片が挙げられる。抗体分子の定常領域は、抗体の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異され得る。
[00225]抗体分子はまた単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体は、その相補性(complementary)決定領域が単一ドメインポリペプチドの部分である抗体を含むことができる。例としては、重鎖抗体、軽鎖を天然に欠いている抗体、従来の4鎖抗体に由来する単一ドメイン抗体、操作された抗体および抗体に由来するもの以外の単一ドメインスキャフォールドが挙げられるがそれに限定されない。単一ドメイン抗体は、当該技術分野における任意のもの、または任意の将来的な単一ドメイン抗体であってもよい。単一ドメイン抗体は、マウス、ヒト、ラクダ、ラマ、魚、サメ、ヤギ、ウサギ、およびウシが挙げられるがそれに限定されない任意の種に由来してもよい。本発明の別の態様によれば、単一ドメイン抗体は、軽鎖を欠いている重鎖抗体として公知の天然に存在する単一ドメイン抗体である。そのような単一ドメイン抗体は、例えば、WO9404678に開示されている。明確性の理由から、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体に由来するこの可変ドメインは、4鎖免疫グロブリンの従来のVHからそれを区別するためにVHHまたはナノボディとして本明細書で知られる。そのようなVHH分子は、ラクダ科の種、例えば、ラクダ、ラマ、ヒトコブラクダ、アルパカおよびグアナコにおいて産生された抗体に由来することができる。ラクダ科以外の他の種が、軽鎖を天然に欠いている重鎖抗体を産生することがあり、そのようなVHHは本発明の範囲内である。
[00226]VHおよびVL領域は、「フレームワーク領域」(FRまたはFW)と称されるより保存された領域が差し挟まれた、「相補性決定領域」(CDR)と称される超可変性の領域にさらに分割することができる。
[00227]フレームワーク領域およびCDRの範囲は、多数の方法によって精密に定義されている(Kabat, E. A.ら、(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest、第5版、U.S. Department of Health and Human Services、NIH Publication No. 91-3242;Chothia, C.ら、(1987) J. Mol. Biol. 196:901~917ページ;およびOxford MolecularのAbM抗体モデリングソフトウェアによって使用されるAbMの定義を参照。一般に、例えば、「Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains」、Antibody Engineering Lab Manual(Duebel, S.およびKontermann, R.編、Springer-Verlag、Heidelberg)を参照)。
[00228]「相補性決定領域」、および「CDR」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原特異性および結合親和性を付与する抗体可変領域内のアミノ酸の配列を指す。一般に、各重鎖可変領域中に3つのCDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)および各軽鎖可変領域中に3つのCDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)がある。
[00229]所与のCDRの精密なアミノ酸配列の境界は、Kabatら、(1991)、「Sequences of Proteins of Immunological Interest」、第5版、Public Health Service、National Institutes of Health、Bethesda、MD(「Kabat」番号付けスキーム)、Al-Lazikaniら、(1997) JMB 273、927~948ページ(「Chothia」番号付けスキーム)に記載のものを含む、多数の公知のスキームのいずれかを使用して決定することができる。本明細書で使用される場合、「Chothia」番号スキームに従って定義されるCDRは、「超可変ループ」と称されることもある。
[00230]例えば、Kabatの下で、重鎖可変ドメイン(VH)中のCDRアミノ酸残基は、31~35(HCDR1)、50~65(HCDR2)、および95~102(HCDR3)と番号付けされ、軽鎖可変ドメイン(VL)中のCDRアミノ酸残基は、24~34(LCDR1)、50~56(LCDR2)、および89~97(LCDR3)と番号付けされる。Chothiaの下で、VH中のCDRアミノ酸は、26~32(HCDR1)、52~56(HCDR2)、および95~102(HCDR3)と番号付けされ、VL中のアミノ酸残基は、26~32(LCDR1)、50~52(LCDR2)、および91~96(LCDR3)と番号付けされる。
[00231]各VHおよびVLは、典型的には、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4でアミノ末端からカルボキシ末端へと並んだ3つのCDRおよび4つのFRを含む。
[00232]抗体分子は、ポリクローナルまたはモノクローナル抗体であり得る。
[00233]「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、本明細書で使用される場合、単一の分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性および親和性を表し示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術によって、またはハイブリドーマ技術を使用しない方法(例えば、組換え法)によって作製することができる。
[00234]抗体は、組換えによって産生することができ、例えば、ファージディスプレイまたはコンビナトリアル法によって産生することができる。
[00235]抗体を生成するためのファージディスプレイおよびコンビナトリアル法は、当該技術分野において公知である(例えば、Ladnerら、米国特許第5,223,409号;Kangら、国際公開WO92/18619;Dowerら、国際公開WO91/17271;Winterら、国際公開WO92/20791;Marklandら、国際公開WO92/15679;Breitlingら、国際公開WO93/01288;McCaffertyら、国際公開WO92/01047;Garrardら、国際公開WO92/09690;Ladnerら、国際公開WO90/02809;Fuchsら、(1991) Bio/Technology 9:1370~1372ページ;Hayら、(1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81~85ページ;Huseら、(1989) Science 246:1275~1281ページ;Griffthsら、(1993) EMBO J 12:725~734ページ;Hawkinsら、(1992) J Mol Biol 226:889~896ページ;Clacksonら、(1991) Nature 352:624~628ページ;Gramら、(1992) PNAS 89:3576~3580ページ;Garradら、(1991) Bio/Technology 9:1373~1377ページ;Hoogenboomら、(1991) Nuc Acid Res 19:4133~4137ページ;およびBarbasら、(1991) PNAS 88:7978~7982ページ(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載される通りである)。
[00236]一実施形態では、抗体は、完全ヒト抗体(例えば、ヒト免疫グロブリン配列からの抗体を産生するように遺伝子操作されたマウスにおいて作製される抗体)、または非ヒト抗体、例えば、齧歯動物(マウスもしくはラット)、ヤギ、霊長動物(例えば、サル)、ラクダ抗体である。好ましくは、非ヒト抗体は齧歯動物(マウスまたはラット抗体)である。齧歯動物抗体を産生する方法は当該技術分野において公知である。
[00237]ヒトモノクローナル抗体は、マウス系ではなくヒト免疫グロブリン遺伝子を持つトランスジェニックマウスを使用して生成することができる。目的の抗原を用いて免疫化されたこれらのトランスジェニックマウスからの脾臓細胞を使用して、ヒトタンパク質からのエピトープに対して特異的親和性を有するヒトmAbを分泌するハイブリドーマが産生される(例えば、Woodら、国際出願WO91/00906、Kucherlapatiら、PCT国際公開WO91/10741;Lonbergら、国際出願WO92/03918;Kayら、国際出願92/03917;Lonberg, N.ら、1994 Nature 368:856~859ページ;Green, L.L.ら、1994 Nature Genet. 7:13~21ページ;Morrison, S.L.ら、1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851~6855ページ;Bruggemanら、1993 Year Immunol 7:33~40ページ;Tuaillonら、1993 PNAS 90:3720~3724ページ;Bruggemanら、1991 Eur J Immunol 21:1323~1326ページを参照)。
[00238]抗体分子は、可変領域、またはその部分、例えば、CDRが、非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスにおいて生成されたものであり得る。キメラ、CDRグラフト化、およびヒト化抗体は、本発明の範囲内である。非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスにおいて生成され、次に、ヒトにおける抗原性を減少させるために、例えば、可変フレームワークまたは定常領域において修飾された抗体分子は、本発明の範囲内である。
[00239]「有効ヒト」タンパク質は、中和抗体応答、例えば、ヒト抗マウス抗体(HAMA)応答を実質的に誘起しないタンパク質である。HAMAは、多数の状況において、例えば、例えば慢性または再発性の疾患状態の処置において、抗体分子が繰り返し投与される場合に、問題となり得る。HAMA応答は、血清からの抗体クリアランスの増加(例えば、Salehら、Cancer Immunol. Immunother.、32:180~190ページ(1990)を参照)のため、そしてまた潜在的なアレルギー性反応(例えば、LoBuglioら、Hybridoma、5:5117~5123ページ(1986)を参照)のため、繰返しの抗体投与を潜在的に有効でないものとさせることがある。
[00240]キメラ抗体は、当該技術分野において公知の組換えDNA技術によって産生することができる(Robinsonら、国際公開PCT/US86/02269;Akiraら、欧州特許出願第184,187号;Taniguchi, M.、欧州特許出願第171,496号;Morrisonら、欧州特許出願第173,494号;Neubergerら、国際出願WO86/01533;Cabillyら、米国特許第4,816,567号;Cabillyら、欧州特許出願第125,023号;Betterら、(1988 Science 240:1041~1043ページ);Liuら、(1987) PNAS 84:3439~3443ページ;Liuら、1987、J. Immunol. 139:3521~3526ページ;Sunら、(1987) PNAS 84:214~218ページ;Nishimuraら、1987、Canc. Res. 47:999~1005ページ;Woodら、(1985) Nature 314:446~449ページ;およびShawら、1988、J. Natl Cancer Inst. 80:1553~1559ページを参照)。
[00241]ヒト化またはCDRグラフト化抗体は、ドナーCDRで置き換えられた(重およびまたは軽免疫グロブリン(immuoglobulin)鎖のうちの)少なくとも1つまたは2つであるが一般に3つすべてのレシピエントCDRを有する。抗体は、非ヒトCDRの少なくとも部分で置き換えられていてもよく、またはCDRの一部のみが非ヒトCDRで置き換えられていてもよい。抗原への結合のために要求されるCDRの数を置き換えることのみが必要である。好ましくは、ドナーは、齧歯動物抗体、例えば、ラットまたはマウス抗体であり、レシピエントは、ヒトフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークである。典型的には、CDRを提供する免疫グロブリンは「ドナー」と呼ばれ、フレームワークを提供する免疫グロブリンは「アクセプター」と呼ばれる。一実施形態では、ドナー免疫グロブリンは非ヒト(例えば、齧歯動物)である。アクセプターフレームワークは、天然に存在する(例えば、ヒト)フレームワークもしくはコンセンサスフレームワーク、またはそれに対して約85%もしくはより高い、好ましくは、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一である配列である。
[00242]本明細書で使用される場合、「コンセンサス配列」という用語は、関連配列のファミリーにおいて最も頻繁に生じるアミノ酸(またはヌクレオチド)から形成される配列を指す(例えば、Winnaker、From Genes to Clones(Verlagsgesellschaft、Weinheim、Germany 1987)を参照。タンパク質のファミリーにおいて、コンセンサス配列中の各位置は、ファミリーにおいてその位置において最も頻繁に生じるアミノ酸によって占有される。2つのアミノ酸が等しく頻繁に生じる場合、いずれかをコンセンサス配列に含めることができる。「コンセンサスフレームワーク」は、コンセンサス免疫グロブリン配列中のフレームワーク領域を指す。
[00243]抗体分子は、当該技術分野において公知の方法によってヒト化させることができる(例えば、Morrison, S. L.、1985、Science 229:1202~1207ページ、Oiら、1986、BioTechniques 4:214、ならびにQueenら、米国特許第5,585,089号、米国特許第5,693,761号および米国特許第5,693,762号(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00244]ヒト化またはCDRグラフト化抗体分子は、CDRグラフト化またはCDR置換によって産生することができ、それにおいて免疫グロブリン鎖の1つ、2つ、またはすべてのCDRを置き換えることができる。例えば、米国特許第5,225,539号;Jonesら、1986 Nature 321:552~525ページ;Verhoeyanら、1988 Science 239:1534;Beidlerら、1988 J. Immunol. 141:4053~4060ページ;Winter、米国特許第5,225,539号(これらのすべての内容はこれにより明示的に参照により本明細書に組み込まれる)を参照。Winterは、本発明のヒト化抗体を調製するために使用され得るCDRグラフト化方法を記載する(1987年3月26日に出願された英国特許出願第2188638A号;Winter、米国特許第5,225,539号)(その内容は明示的に参照により本明細書に組み込まれる)。
[00245]具体的なアミノ酸が置換、欠失または付加されたヒト化抗体分子もまた本発明の範囲である。ドナーからのアミノ酸を選択する基準は、米国特許第5,585,089号、例えば、米国特許第5,585,089号の第12~16欄、例えば、米国特許第5,585,089号の第12~16欄に記載されている(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)。抗体をヒト化する他の技術は、1992年12月23日に公開されたPadlanら、EP519596A1に記載されている。
[00246]抗体分子は一本鎖抗体であり得る。一本鎖抗体(scFv)は操作されていてもよい(例えば、Colcher, D.ら、(1999) Ann N Y Acad Sci 880:263~80ページ;およびReiter, Y.、(1996) Clin Cancer Res 2:245~52ページを参照)。一本鎖抗体は、二量体化または多量体化して、同じ標的タンパク質の異なるエピトープに対して特異性を有する多価抗体を生成することができる。
[00247]さらに他の実施形態では、抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の(例えば、ヒト)重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域を有する。別の実施形態では、抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダの(例えば、ヒト)軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。定常領域は、抗体の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、および/または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異され得る。一実施形態では、抗体は、エフェクター機能を有し、かつ補体を固定することができる。他の実施形態では、抗体は、エフェクター細胞をリクルートせず、かつ補体を固定しない。別の実施形態では、抗体は、Fc受容体に結合する低減した能力を有し、または該能力を有しない。例えば、それは、Fc受容体への結合をサポートしないアイソタイプまたはサブタイプ、断片または他の突然変異体であり、例えば、それは、突然変異誘発されたFc受容体結合性領域を有し、またはそれを欠失している。
[00248]抗体定常領域を変更する方法は当該技術分野において公知である。変更された機能、例えば、エフェクターリガンド、例えば、細胞上のFcR、または補体のC1成分に対する変更された親和性を有する抗体は、抗体の定常部分中の少なくとも1つのアミノ酸残基を異なる残基で置き換えることによって産生することができる(例えば、EP388,151A1、米国特許第5,624,821号および米国特許第5,648,260号(これらのすべての内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。マウス、または他の種の免疫グロブリンに応用された場合にこれらの機能を低減または排除する類似の種類の変更が記載され得る。
[00249]抗体分子は、誘導体化または別の機能分子(例えば、別のペプチドもしくはタンパク質)に連結させることができる。本明細書で使用される場合、「誘導体化」された抗体分子は、修飾された抗体分子である。誘導体化の方法としては、蛍光部分、放射性ヌクレオチド、毒素、酵素または親和性リガンド、例えば、ビオチンの付加が挙げられるがそれに限定されない。よって、本発明の抗体分子は、免疫接着分子を含む、本明細書に記載の抗体の誘導体化および他に修飾された形態を含むことが意図される。例えば、抗体分子は、1つまたは複数の他の分子実体、例えば、別の抗体(例えば、二特異性抗体もしくはダイアボディ)、検出可能な剤、細胞傷害剤、医薬剤、および/または抗体もしくは抗体部分の別の分子(例えば、ストレプトアビジンコア領域もしくはポリヒスチジンタグ)との会合を媒介することができるタンパク質もしくはペプチドに(化学的カップリング、遺伝子融合、非共有結合的会合またはその他によって)機能的に連結させることができる。
[00250]1つの種類の誘導体化された抗体分子は、(例えば、二特異性抗体を作出するために、同じ種類または異なる種類の)2つまたはより多くの抗体を架橋することによって産生される。好適なクロスリンカーとしては、適切なスペーサー(例えば、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル)またはホモ二官能性(例えば、スベリン酸ジサクシンイミジル)によって分離された2つの別個に反応性の基を有するヘテロ二官能性のものが挙げられる。そのようなリンカーは、Pierce Chemical Company、Rockford、Illから入手可能である。
多特異性または多機能性抗体分子
[00251]本明細書で定義される多特異性および多機能性分子の例示的な構造は、全体を通じて記載されている。例示的な構造は、Weidle Uら、(2013) The Intriguing Options of Multispecific Antibody Formats for Treatment of Cancer. Cancer Genomics & Proteomics 10: 1~18ページ(2013);およびSpiess Cら、(2015) Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Molecular Immunology 67: 95~106ページ(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)にさらに記載されている。
多特異性または多機能性抗体分子
[00251]本明細書で定義される多特異性および多機能性分子の例示的な構造は、全体を通じて記載されている。例示的な構造は、Weidle Uら、(2013) The Intriguing Options of Multispecific Antibody Formats for Treatment of Cancer. Cancer Genomics & Proteomics 10: 1~18ページ(2013);およびSpiess Cら、(2015) Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Molecular Immunology 67: 95~106ページ(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)にさらに記載されている。
[00252]一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、異なる部位が異なる抗原に特異的である1つより多くの抗原結合性部位を含むことができる。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、同じ抗原上の1つより多く(例えば、2つまたはより多く)のエピトープに結合することができる。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、標的細胞(例えば、がん細胞)に特異的な抗原結合性部位および免疫エフェクター細胞に特異的な異なる抗原結合性部位を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、二特異性、三特異性または四特異性抗体分子である。一実施形態では、多特異性抗体分子は二特異性抗体分子である。二特異性抗体分子は、5つの異なる構造群:(i)二特異性免疫グロブリンG(BsIgG)、(ii)追加の抗原結合性部分を付加されたIgG、(iii)二特異性抗体断片、(iv)二特異性融合タンパク質、および(v)二特異性抗体コンジュゲートに分類することができる。
[00253]BsIgGは、各抗原について一価のフォーマットである。例示的なBsIgGフォーマットとしては、crossMab、DAF(two-in-one)、DAF(four-in-one)、DutaMab、DT-IgG、ノブ・イン・ホール(knobs-in-holes)共通LC、ノブ・イン・ホールアセンブリー、電荷対、Fabアーム交換、SEEDボディ、triomab、LUZ-Y、Fcab、κλボディ、直交Fabが挙げられるがそれに限定されない。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。例示的なBsIgGとしては、抗CD3アームおよび抗EpCAMアームを含有するカツマキソマブ(Fresenius Biotech、Trion Pharma、Neopharm)、ならびにCD3およびHER2を標的化するエルツマキソマブ(Neovii Biotech、Fresenius Biotech)が挙げられる。一部の実施形態では、BsIgGは、ヘテロ二量体化のために操作された重鎖を含む。例えば、重鎖は、「ノブ・イントゥー・ホール」(knobs-into-holes)戦略、SEEDプラットフォーム、(例えば、κλボディ中の)共通重鎖、およびヘテロ二量体Fc領域の使用を使用してヘテロ二量体化のために操作することができる。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。BsIgGにおけるホモ二量体の重鎖対合を回避するために使用されてきた戦略としては、ノブ・イン・ホール、デュオボディ(duobody)、アジメトリック(azymetric)、電荷対、HA-TF、SEEDボディ、および差次的なプロテインA親和性が挙げられる。同文献を参照。BsIgGは、異なる宿主細胞中での成分抗体の別々の発現およびその後の精製/BsIgGへのアセンブリーによって産生することができる。BsIgGはまた、単一の宿主細胞中での成分抗体の発現によって産生することができる。BsIgGは、例えば、プロテインAおよび逐次的pH溶出を使用する、親和性クロマトグラフィーを使用して精製することができる。
[00254]追加の抗原結合性部分を付加されたIgGは、二特異性抗体分子の別のフォーマットである。例えば、単一特異性IgGは、例えば、重鎖または軽鎖のいずれかのNまたはC末端において、追加の抗原結合性単位を単一特異性IgGに付加することによって二特異性を有するように操作することができる。例示的な追加の抗原結合性単位としては、単一ドメイン抗体(例えば、可変重鎖または可変軽鎖)、操作されたタンパク質スキャフォールド、および対合した抗体可変ドメイン(例えば、単鎖可変断片または可変断片)が挙げられる。同文献を参照。付加されたIgGフォーマットの例としては、二重可変ドメインIgG(DVD-Ig)、IgG(H)-scFv、scFv-(H)IgG、IgG(L)-scFv、scFv-(L)IgG、IgG(L,H)-Fv、IgG(H)-V、V(H)-IgG、IgG(L)-V、V(L)-IgG、KIH IgG-scFab、2scFv-IgG、IgG-2scFv、scFv4-Ig、ザイボディ(zybody)、およびDVI-IgG(4-in-1)が挙げられる。Spiessら、Mol. Immunol. 67(2015):95~106ページを参照。IgG-scFvの例は、IGF-1RおよびHER3に結合するMM-141(Merrimack Pharmaceuticals)である。DVD-Igの例としては、IL-1αおよびIL-1βに結合するABT-981(AbbVie)、ならびにTNFおよびIL-17Aに結合するABT-122(AbbVie)が挙げられる。
[00255]二特異性抗体断片(BsAb)は、抗体定常ドメインの一部またはすべてを欠いた二特異性抗体分子のフォーマットである。例えば、一部のBsAbはFc領域を欠いている。一部の実施形態では、二特異性抗体断片は、単一の宿主細胞中でのBsAbの効率的な発現を許容するペプチドリンカーによって接続された重鎖および軽鎖領域を含む。例示的な二特異性抗体断片としては、ナノボディ、ナノボディ-HAS、BiTE、ダイアボディ、DART、TandAb、scDiabody、scDiabody-CH3、ダイアボディ-CH3、トリプルボディ、ミニ抗体、ミニボディ、TriBiミニボディ、scFv-CH3 KIH、Fab-scFv、scFv-CH-CL-scFv、F(ab’)2、F(ab’)2-scFv2、scFv-KIH、Fab-scFv-Fc、四価HCAb、scDiabody-Fc、ダイアボディ-Fc、タンデムscFv-Fc、およびイントラボディが挙げられるがそれに限定されない。同文献を参照。例えば、BiTEフォーマットはタンデムscFvを含み、成分scFvは、T細胞上のCD3およびがん細胞上の表面抗原に結合する。
[00256]二特異性融合タンパク質としては、例えば、追加の特異性および/または機能性を加えるために、他のタンパク質に連結された抗体断片が挙げられる。二特異性融合タンパク質の例は、HLA提示ペプチドを認識する親和性成熟したT細胞受容体に連結された抗CD3 scFvを含むimmTACである。一部の実施形態では、より高い価数を有する二特異性抗体分子を生成するためにドック-アンド-ロック(dock-and-lock)(DNL)法を使用することができる。また、アルブミン結合性タンパク質またはヒト血清アルブミンへの融合は、抗体断片の血清半減期を延長させることができる。同文献を参照。
[00257]一部の実施形態では、BsAb分子を作出するために化学的コンジュゲーション、例えば、抗体および/または抗体断片の化学的コンジュゲーションを使用することができる。同文献を参照。例示的な二特異性抗体コンジュゲートとしては、CovXボディフォーマットが挙げられ、該フォーマットでは、低分子量薬物が、各Fabアームまたは抗体もしくはその断片中の単一の反応性リシンに部位特異的にコンジュゲートしている。一部の実施形態では、コンジュゲーションは、低分子量薬物の血清半減期を向上させる。例示的なCovXボディは、VEGFまたはAng2のいずれかを阻害する2つの短いペプチドにコンジュゲートした抗体を含むCVX-241(NCT01004822)である。同文献を参照。
[00258]抗体分子は、例えば、宿主系中での少なくとも1つまたは複数の成分の、組換え発現によって産生することができる。例示的な宿主系としては、真核細胞(例えば、哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞、または昆虫細胞、例えば、SF9もしくはS2細胞)および原核細胞(例えば、E. coli)が挙げられる。二特異性抗体分子は、異なる宿主細胞中での成分の別々の発現およびその後の精製/アセンブリーによって産生することができる。代替的に、抗体分子は、単一の宿主細胞中での成分の発現によって産生することができる。二特異性抗体分子の精製は、例えば、プロテインAおよび逐次的pH溶出を使用する、親和性クロマトグラフィーなどの、様々な方法によって行うことができる。他の実施形態では、親和性タグ、例えば、ヒスチジン含有タグ、mycタグ、またはストレプトアビジンタグを精製のために使用することができる。
CDRグラフト化スキャフォールド
[00259]一部の実施形態では、抗体分子は、CDRグラフト化スキャフォールドドメインである。一部の実施形態では、スキャフォールドドメインは、フィブロネクチンドメイン、例えば、フィブロネクチンIII型ドメインに基づく。フィブロネクチンIII型(Fn3)ドメインの全体的なフォールドは、最小の機能的抗体断片、抗体重鎖の可変ドメインのそれに密接に関係する。Fn3の末端には3つのループがあり、BC、DEおよびFGループの位置は、抗体のVHドメインのCDR1、2および3のそれにおおよそ対応する。Fn3はジスルフィド結合を有さず、したがって、Fn3は、抗体およびそれらの断片とは異なり、還元条件下で安定である(例えば、WO98/56915、WO01/64942、WO00/34784を参照)。Fn3ドメインは、例えば、本明細書に記載の抗原/マーカー/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、本明細書に記載のCDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。
CDRグラフト化スキャフォールド
[00259]一部の実施形態では、抗体分子は、CDRグラフト化スキャフォールドドメインである。一部の実施形態では、スキャフォールドドメインは、フィブロネクチンドメイン、例えば、フィブロネクチンIII型ドメインに基づく。フィブロネクチンIII型(Fn3)ドメインの全体的なフォールドは、最小の機能的抗体断片、抗体重鎖の可変ドメインのそれに密接に関係する。Fn3の末端には3つのループがあり、BC、DEおよびFGループの位置は、抗体のVHドメインのCDR1、2および3のそれにおおよそ対応する。Fn3はジスルフィド結合を有さず、したがって、Fn3は、抗体およびそれらの断片とは異なり、還元条件下で安定である(例えば、WO98/56915、WO01/64942、WO00/34784を参照)。Fn3ドメインは、例えば、本明細書に記載の抗原/マーカー/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、本明細書に記載のCDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。
[00260]一部の実施形態では、スキャフォールドドメイン、例えば、フォールディングしたドメインは、抗体、例えば、モノクローナル抗体の重鎖可変ドメインから3つのベータ鎖を欠失させることにより作出される「ミニボディ」スキャフォールドに基づく(例えば、Tramontanoら、1994、J Mol. Recognit. 7:9、およびMartinら、1994、EMBO J. 13:5303~5309ページを参照)。「ミニボディ」は、2つの超可変ループを提示するために使用することができる。一部の実施形態では、スキャフォールドドメインは、V様ドメイン(例えば、Coiaら、WO99/45110を参照)、または2つのジスルフィド結合によって一緒に保持された74残基の6鎖ベータシートサンドイッチであるテンダミスタチン(tendamistatin)に由来するドメインである(例えば、McConnellおよびHoess、1995、J Mol. Biol. 250:460を参照)。例えば、テンダミスタチンのループは、例えば、本明細書に記載のマーカー/抗原/細胞に結合するドメインを選択するために、(例えば、CDRまたは超可変ループを使用して)修飾または変更することができる。別の例示的なスキャフォールドドメインは、CTLA-4の細胞外ドメインに由来するベータ-サンドイッチ構造である(例えば、WO00/60070を参照)。
[00261]他の例示的なスキャフォールドドメインとしては、T細胞受容体、MHCタンパク質、細胞外ドメイン(例えば、フィブロネクチンIII型リピート、EGFリピート)、プロテアーゼ阻害剤(例えば、Kunitzドメイン、エコチン、およびBPTIなど)、TPRリピート、トリフォイル(trifoil)構造、ジンクフィンガードメイン、DNA結合性タンパク質、特に、単量体DNA結合性タンパク質、RNA結合性タンパク質、酵素、例えば、プロテアーゼ(特に、不活性化プロテアーゼ)、RNase、シャペロン、例えば、チオレドキシン、および熱ショックタンパク質、ならびに細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、SH2およびSH3ドメイン)が挙げられるがそれに限定されない。例えば、米国特許出願公開第20040009530号および米国特許第7,501,121号(参照により本明細書に組み込まれる)を参照。
[00262]一部の実施形態では、スキャフォールドドメインは、例えば、以下の基準:(1)アミノ酸配列、(2)いくつかの相同ドメインの配列、(3)三次元構造、および/または(4)pH、温度、塩分、有機溶媒、酸化剤濃度の範囲にわたる安定性データのうちの1つまたは複数によって評価および選択される。一部の実施形態では、スキャフォールドドメインは、小さい、安定なタンパク質ドメイン、例えば、100個、70個、50個、40個または30個未満のアミノ酸のタンパク質である。ドメインは、1つもしくは複数のジスルフィド結合を含んでもよく、または金属、例えば、亜鉛をキレートしてもよい。
抗体ベースの融合物
[00263]抗体のNまたはC末端に取り付けられた追加の結合性実体を含有する様々なフォーマットを生成することができる。単鎖またはジスルフィド安定化FvもしくはFabを有するこれらの融合物は、各抗原に対して二価の結合特異性を有する四価分子の生成をもたらす。IgGとのscFvおよびscFabの組合せは、3つまたはより多くの異なる抗原を認識することができる分子の産生を可能にする。
抗体-Fab融合物
[00264]抗体-Fab融合物は、第1の標的に対する伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した第2の標的に対するFabを含む二特異性抗体である。一般的に、抗体およびFabは共通の軽鎖を有する。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
抗体-scFv融合物
[00265]抗体-scFv融合物は、伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した特有の特異性のscFvを含む二特異性抗体である。scFvは、直接的にまたはリンカーペプチドを通じてscFvの重鎖を通じてC末端に融合させることができる。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
可変ドメイン免疫グロブリンDVD
[00266]関連するフォーマットは、より短いリンカー配列によってVドメインのN末端に配置された第2の特異性のVHおよびVLドメインから構成される二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)である。
抗体ベースの融合物
[00263]抗体のNまたはC末端に取り付けられた追加の結合性実体を含有する様々なフォーマットを生成することができる。単鎖またはジスルフィド安定化FvもしくはFabを有するこれらの融合物は、各抗原に対して二価の結合特異性を有する四価分子の生成をもたらす。IgGとのscFvおよびscFabの組合せは、3つまたはより多くの異なる抗原を認識することができる分子の産生を可能にする。
抗体-Fab融合物
[00264]抗体-Fab融合物は、第1の標的に対する伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した第2の標的に対するFabを含む二特異性抗体である。一般的に、抗体およびFabは共通の軽鎖を有する。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
抗体-scFv融合物
[00265]抗体-scFv融合物は、伝統的な抗体および抗体重鎖のC末端に融合した特有の特異性のscFvを含む二特異性抗体である。scFvは、直接的にまたはリンカーペプチドを通じてscFvの重鎖を通じてC末端に融合させることができる。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作すること、および(2)標的DNAを好適な宿主細胞にトランスフェクトして融合タンパク質を発現させることにより産生させることができる。Coloma, Jら、(1997) Nature Biotech 15:159によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端との間の(Gly)-Serリンカーによって連結されてもよいようである。
可変ドメイン免疫グロブリンDVD
[00266]関連するフォーマットは、より短いリンカー配列によってVドメインのN末端に配置された第2の特異性のVHおよびVLドメインから構成される二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)である。
[00267]他の例示的な多特異性抗体フォーマットとしては、例えば、以下:米国特許出願公開第20160114057A1号、米国特許出願公開第20130243775A1号、米国特許出願公開第20140051833号、米国特許出願公開第20130022601号、米国特許出願公開第20150017187A1号、米国特許出願公開第20120201746A1号、米国特許出願公開第20150133638A1号、米国特許出願公開第20130266568A1号、米国特許出願公開第20160145340A1号、WO2015127158A1、米国特許出願公開第20150203591A1号、米国特許出願公開第20140322221A1号、米国特許出願公開第20130303396A1号、米国特許出願公開第20110293613号、米国特許出願公開第20130017200A1号、米国特許出願公開第20160102135A1号、WO2015197598A2、WO2015197582A1、米国特許第9359437号、米国特許出願公開第20150018529号、WO2016115274A1、WO2016087416A1、米国特許出願公開第20080069820A1号、米国特許第9145588B号、米国特許第7919257号、および米国特許出願公開第20150232560A1号に記載のものが挙げられる。全長抗体-Fab/scFabフォーマットを利用する例示的な多特異性分子としては、以下:米国特許第9382323B2号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20140308285A1号、米国特許出願公開第20130165638A1号、米国特許出願公開第20130267686A1号、米国特許出願公開第20140377269A1号、米国特許第7741446B2号、およびWO1995009917A1に記載のものが挙げられる。ドメイン交換フォーマットを利用する例示的な多特異性分子としては、以下:米国特許出願公開第20150315296A1号、WO2016087650A1、米国特許出願公開第20160075785A1号、WO2016016299A1、米国特許出願公開第20160130347A1号、米国特許出願公開第20150166670号、米国特許第8703132B2号、米国特許出願公開第20100316645号、米国特許第8227577B2号、米国特許出願公開第20130078249号に記載のものが挙げられる。
Fc含有実体(ミニ抗体)
[00268]ミニ抗体としても公知のFc含有実体は、scFvを定常重鎖領域ドメイン3のC末端(CH3-scFv)および/または異なる特異性を有する抗体のヒンジ領域(scFv-ヒンジ-Fc)に融合させることにより生成することができる。IgGのCH3ドメインのC末端に融合した(ペプチドリンカーを有しない)ジスルフィド安定化可変ドメインを有する三価の実体もまた作製することができる。
Fc含有多特異性分子
[00269]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)を含む。例示的なFc領域は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4の重鎖定常領域、より特には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択することができる。
Fc含有実体(ミニ抗体)
[00268]ミニ抗体としても公知のFc含有実体は、scFvを定常重鎖領域ドメイン3のC末端(CH3-scFv)および/または異なる特異性を有する抗体のヒンジ領域(scFv-ヒンジ-Fc)に融合させることにより生成することができる。IgGのCH3ドメインのC末端に融合した(ペプチドリンカーを有しない)ジスルフィド安定化可変ドメインを有する三価の実体もまた作製することができる。
Fc含有多特異性分子
[00269]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)を含む。例示的なFc領域は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4の重鎖定常領域、より特には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択することができる。
[00270]一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるために、変更、例えば、突然変異される。
[00271]他の実施形態では、第1および第2の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、第1および第2のFc領域)の境界部は、例えば、操作されていない境界部、例えば、天然に存在する境界部と比較して、二量体化を増加または減少させるために、変更、例えば、突然変異される。例えば、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)の二量体化は、第1および第2のFc領域のFc境界部に、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を提供し、それによって、例えば、操作されていない境界部と比較して、より高い比のヘテロ多量体:ホモ多量体が形成されることにより、増強させることができる。
[00272]一部の実施形態では、多特異性分子は、例えば、ヒトIgG1のFc領域の、347、349、350、351、366、368、370、392、394、395、397、398、399、405、407、または409のうちの1つまたは複数から選択される位置において、対になったアミノ酸置換を含む。例えば、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、T366S、L368A、またはY407V(例えば、孔またはホールに対応する)、およびT366W(例えば、突起またはノブに対応する)から選択される対になったアミノ酸置換を含むことができる。
[00273]他の実施形態では、多機能性分子は、半減期延長剤、例えば、ヒト血清アルブミンまたはヒト血清アルブミンに対する抗体分子を含む。
ヘテロ二量体化抗体分子および作製方法
[00274]正しくない重鎖対合の問題に対処するために多特異性抗体を産生する様々な方法が開示されてきた。例示的な方法は以下に記載される。例示的な多特異性抗体フォーマットおよび前記多特異性抗体を作製する方法もまた、例えば、Speissら、Molecular Immunology 67(2015)95~106ページ、およびKleinら、mAb 4:6、653~663ページ、2012年11月/12月(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
ヘテロ二量体化抗体分子および作製方法
[00274]正しくない重鎖対合の問題に対処するために多特異性抗体を産生する様々な方法が開示されてきた。例示的な方法は以下に記載される。例示的な多特異性抗体フォーマットおよび前記多特異性抗体を作製する方法もまた、例えば、Speissら、Molecular Immunology 67(2015)95~106ページ、およびKleinら、mAb 4:6、653~663ページ、2012年11月/12月(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00275]ヘテロ二量体化二特異性抗体は天然のIgG構造に基づき、2つの結合性アームが異なる抗原を認識する。定義された一価(および同時の)抗原結合を可能にするIgG由来のフォーマットは、軽鎖誤対合を最小化する技術(例えば、共通軽鎖)と組み合わせた強制的な重鎖ヘテロ二量体化により生成される。強制的な重鎖ヘテロ二量体化は、例えば、ノブ・イン・ホールまたは鎖交換操作ドメイン(SEED)を使用して、得ることができる。
[00276]ノブ・イン・ホール
[00277]米国特許第5,731,116号、米国特許第7,476,724号およびRidgway, Jら、(1996)Prot. Engineering 9(7):617~621ページに記載されるノブ・イン・ホールは、概して、(1)1つまたは両方の抗体のCH3ドメインを突然変異させてヘテロ二量体化を促進すること、および(2)ヘテロ二量体化を促進する条件下で突然変異した抗体を組み合わせることを伴う。「ノブ」または「突起」は、典型的には、親抗体中の小さいアミノ酸をより大きいアミノ酸で置き換えること(例えば、T366YまたはT366W)により作出され、「ホール」または「孔」は、親抗体中のより大きい残基をより小さいアミノ酸で置き換えること(例えば、Y407T、T366S、L368Aおよび/またはY407V)により作出される。
[00277]米国特許第5,731,116号、米国特許第7,476,724号およびRidgway, Jら、(1996)Prot. Engineering 9(7):617~621ページに記載されるノブ・イン・ホールは、概して、(1)1つまたは両方の抗体のCH3ドメインを突然変異させてヘテロ二量体化を促進すること、および(2)ヘテロ二量体化を促進する条件下で突然変異した抗体を組み合わせることを伴う。「ノブ」または「突起」は、典型的には、親抗体中の小さいアミノ酸をより大きいアミノ酸で置き換えること(例えば、T366YまたはT366W)により作出され、「ホール」または「孔」は、親抗体中のより大きい残基をより小さいアミノ酸で置き換えること(例えば、Y407T、T366S、L368Aおよび/またはY407V)により作出される。
[00278]Fcドメインを含む二特異性抗体のために、Fc部分の正しいヘテロ二量体化を促進するための重鎖の定常領域への特定の突然変異の導入を利用することができる。いくつかのそのような技術は、Kleinら(mAb(2012)4:6、1~11ページ)(その内容はこれにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)において総説されている。これらの技術としては、抗体重鎖のうちの1つのCH3ドメインのうちの1つへのバルク残基の導入を伴う「ノブ・イントゥー・ホール」(KiH)アプローチが挙げられる。このバルク残基は、対になった重鎖の他のCH3ドメイン中の相補的な「ホール」にフィットし、それによって、重鎖の正しい対合が促進される(例えば、米国特許第7642228号を参照)。
[00279]例示的なKiH突然変異としては、「ノブ」重鎖中のS354C、T366Wおよび「ホール」重鎖中のY349C、T366S、L368A、Y407Vが挙げられる。他の例示的なKiH突然変異は、追加の任意選択の安定化性Fcシステイン突然変異と共に、表1において提供される。
[00281]多特異性抗体のヘテロ二量体化を促進するための他の例示的なFc突然変異としては、以下の参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる):WO2016071377A1、米国特許出願公開第20140079689A1号、米国特許出願公開第20160194389A1号、米国特許出願公開第20160257763号、WO2016071376A2、WO2015107026A1、WO2015107025A1、WO2015107015A1、米国特許出願公開第20150353636A1号、米国特許出願公開第20140199294A1号、米国特許第7750128B2号、米国特許出願公開第20160229915A1号、米国特許出願公開第20150344570A1号、米国特許第8003774A1号、米国特許出願公開第20150337049A1号、米国特許出願公開第20150175707A1号、米国特許出願公開第20140242075A1号、米国特許出願公開第20130195849A1号、米国特許出願公開第20120149876A1号、米国特許出願公開第20140200331A1号、米国特許第9309311B2号、米国特許第8586713号、米国特許出願公開第20140037621A1号、米国特許出願公開第20130178605A1号、米国特許出願公開第20140363426A1号、米国特許出願公開第20140051835A1号および米国特許出願公開第20110054151A1号に記載のものが挙げられる。
[00282]安定化性システイン突然変異もまた、KiHおよび他のFcヘテロ二量体化促進性バリアントと組み合わせて使用されている(例えば、米国特許第7183076号を参照)。他の例示的なシステイン修飾としては、例えば、米国特許出願公開第20140348839A1号、米国特許第7855275B2号、および米国特許第9000130B2号に開示されるものが挙げられる。
[00283]鎖交換操作ドメイン(SEED)
[00284]鎖交換操作ドメイン(SEED)C(H)3ヘテロ二量体を工作することによって二特異性かつ非対称性の融合タンパク質の設計をサポートするヘテロ二量体Fcプラットフォームが公知である。ヒトIgGおよびIgA C(H)3ドメインのこれらの誘導体は、ヒトIgAおよびIgG C(H)3配列の交互のセグメントから構成される相補的なヒトSEED C(H)3ヘテロ二量体を作出する。もたらされるSEED C(H)3ドメインの対は、哺乳動物細胞中で発現された場合に優先的に会合してヘテロ二量体を形成する。SEEDボディ(Sb)融合タンパク質は、1つまたは複数の融合パートナーに遺伝子連結されていてもよい[IgG1ヒンジ]-C(H)2-[SEED C(H)3]からなる(例えば、Davis JHら、「SEEDbodies: fusion proteins based on strand exchange engineered domain (SEED) CH3 heterodimers in an Fc analogue platform for asymmetric binders or immunofusions and bispecific antibodies.」、Protein Eng Des Sel 2010;23:195~202ページ;PMID:20299542および米国特許第8871912号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00284]鎖交換操作ドメイン(SEED)C(H)3ヘテロ二量体を工作することによって二特異性かつ非対称性の融合タンパク質の設計をサポートするヘテロ二量体Fcプラットフォームが公知である。ヒトIgGおよびIgA C(H)3ドメインのこれらの誘導体は、ヒトIgAおよびIgG C(H)3配列の交互のセグメントから構成される相補的なヒトSEED C(H)3ヘテロ二量体を作出する。もたらされるSEED C(H)3ドメインの対は、哺乳動物細胞中で発現された場合に優先的に会合してヘテロ二量体を形成する。SEEDボディ(Sb)融合タンパク質は、1つまたは複数の融合パートナーに遺伝子連結されていてもよい[IgG1ヒンジ]-C(H)2-[SEED C(H)3]からなる(例えば、Davis JHら、「SEEDbodies: fusion proteins based on strand exchange engineered domain (SEED) CH3 heterodimers in an Fc analogue platform for asymmetric binders or immunofusions and bispecific antibodies.」、Protein Eng Des Sel 2010;23:195~202ページ;PMID:20299542および米国特許第8871912号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00285]デュオボディ
[00286]正しい重鎖対合を有する二特異性抗体を産生するための「デュオボディ」技術は公知である。デュオボディ技術は、産生後交換反応において安定な二特異性ヒトIgG1抗体を生成するための3つの基本的なステップを伴う。第1のステップにおいて、第3の定常(CH3)ドメイン中に単一のマッチした突然変異をそれぞれ含有する2つのIgG1が、標準的な哺乳動物組換え細胞系を使用して別々に産生される。その後に、これらのIgG1抗体は、回収および精製のための標準的な方法に従って精製される。産生および精製後(産生後)、2つの抗体は調整された実験室条件下で組み換えられて、非常に高い収率(典型的には>95%)で二特異性抗体産物をもたらす(例えば、Labrijnら、PNAS 2013;110(13):5145~5150ページおよびLabrijnら、Nature Protocols 2014;9(10):2450~63ページ(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00286]正しい重鎖対合を有する二特異性抗体を産生するための「デュオボディ」技術は公知である。デュオボディ技術は、産生後交換反応において安定な二特異性ヒトIgG1抗体を生成するための3つの基本的なステップを伴う。第1のステップにおいて、第3の定常(CH3)ドメイン中に単一のマッチした突然変異をそれぞれ含有する2つのIgG1が、標準的な哺乳動物組換え細胞系を使用して別々に産生される。その後に、これらのIgG1抗体は、回収および精製のための標準的な方法に従って精製される。産生および精製後(産生後)、2つの抗体は調整された実験室条件下で組み換えられて、非常に高い収率(典型的には>95%)で二特異性抗体産物をもたらす(例えば、Labrijnら、PNAS 2013;110(13):5145~5150ページおよびLabrijnら、Nature Protocols 2014;9(10):2450~63ページ(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00287]静電相互作用
[00288]ホモ二量体形成が静電気的に不都合であるように荷電性アミノ酸を有するCH3アミノ酸変化を使用して多特異性抗体を作製する方法が開示されている。EP1870459およびWO2009089004は、宿主細胞中での異なる抗体ドメインの共発現の際のヘテロ二量体形成に有利に働くための他の戦略を記載する。これらの方法において、重鎖定常ドメイン3(CH3)、両方のCH3ドメイン中のCH3-CH3境界部を作り上げる1つまたは複数の残基は、ホモ二量体形成が静電気的に不都合であり、かつヘテロ二量体化が静電気的に好都合であるように荷電性アミノ酸で置き換えられる。静電相互作用を使用して多特異性分子を作製する追加の方法は、米国特許出願公開第20100015133号、米国特許第8592562B2号、米国特許第9200060B2号、米国特許出願公開第20140154254A1号、および米国特許第9358286A1号を含む参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
[00288]ホモ二量体形成が静電気的に不都合であるように荷電性アミノ酸を有するCH3アミノ酸変化を使用して多特異性抗体を作製する方法が開示されている。EP1870459およびWO2009089004は、宿主細胞中での異なる抗体ドメインの共発現の際のヘテロ二量体形成に有利に働くための他の戦略を記載する。これらの方法において、重鎖定常ドメイン3(CH3)、両方のCH3ドメイン中のCH3-CH3境界部を作り上げる1つまたは複数の残基は、ホモ二量体形成が静電気的に不都合であり、かつヘテロ二量体化が静電気的に好都合であるように荷電性アミノ酸で置き換えられる。静電相互作用を使用して多特異性分子を作製する追加の方法は、米国特許出願公開第20100015133号、米国特許第8592562B2号、米国特許第9200060B2号、米国特許出願公開第20140154254A1号、および米国特許第9358286A1号を含む参考文献(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
[00289]共通軽鎖
[00290]軽鎖誤対合は、二特異性IgGの均質な調製物を生成するために回避される必要がある。これを達成する1つのやり方は、共通軽鎖の原理、すなわち、1つの軽鎖を共有するが依然として別々の特異性を有する2つのバインダーを組み合わせることの使用を通じたものである。単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変重鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変軽鎖を提供することによる。共通軽鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許第7183076B2号、米国特許出願公開第20110177073A1号、EP2847231A1、WO2016079081A1、およびEP3055329A1(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00290]軽鎖誤対合は、二特異性IgGの均質な調製物を生成するために回避される必要がある。これを達成する1つのやり方は、共通軽鎖の原理、すなわち、1つの軽鎖を共有するが依然として別々の特異性を有する2つのバインダーを組み合わせることの使用を通じたものである。単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変重鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変軽鎖を提供することによる。共通軽鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許第7183076B2号、米国特許出願公開第20110177073A1号、EP2847231A1、WO2016079081A1、およびEP3055329A1(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00291]CrossMab
[00292]軽鎖誤対合を低減するための別のオプションはCrossMab技術であり、これは、二特異性抗体の1つの半分のFab中のCH1およびCLドメインを交換することによって非特異的L鎖誤対合を回避する。そのようなクロスオーバーバリアントは結合特異性および親和性を保持するが、L鎖誤対合が予防されるように2つのアームを異なるものとさせる。(Kleinら、上掲に総説されるように)CrossMab技術は、正しい対合の形成を促進するように重鎖と軽鎖との間のドメインスワッピングを伴う。簡潔に述べれば、2つの別個の軽鎖-重鎖対を使用することによって2つの抗原に結合し得る二特異性IgG様CrossMab抗体を構築するために、2ステップ修飾プロセスが応用される。最初に、二量体化境界部は、ヘテロ二量体化アプローチ、例えば、ノブ・イントゥー・ホール(KiH)技術を使用して各重鎖のC末端中に操作されて、1つの抗体(例えば、抗体A)および第2の抗体(例えば、抗体B)からの2つの別個の重鎖のヘテロ二量体のみが効率的に形成されることが確実にされる。次に、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインを一貫したままに保って、1つの抗体の定常重鎖1(CH1)および定常軽鎖(CL)ドメインが交換される(抗体A)。CH1およびCLドメインの交換は、修飾抗体(抗体A)軽鎖は修飾抗体(抗体A)重鎖とのみ効率的に二量体化し、非修飾抗体(抗体B)軽鎖は非修飾抗体(抗体B)重鎖とのみ効率的に二量体化するため、所望の二特異性CrossMabのみが効率的に形成されることを確実にした(例えば、Cain, C.、SciBX 4(28);doi:10.1038/scibx.2011.783(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00292]軽鎖誤対合を低減するための別のオプションはCrossMab技術であり、これは、二特異性抗体の1つの半分のFab中のCH1およびCLドメインを交換することによって非特異的L鎖誤対合を回避する。そのようなクロスオーバーバリアントは結合特異性および親和性を保持するが、L鎖誤対合が予防されるように2つのアームを異なるものとさせる。(Kleinら、上掲に総説されるように)CrossMab技術は、正しい対合の形成を促進するように重鎖と軽鎖との間のドメインスワッピングを伴う。簡潔に述べれば、2つの別個の軽鎖-重鎖対を使用することによって2つの抗原に結合し得る二特異性IgG様CrossMab抗体を構築するために、2ステップ修飾プロセスが応用される。最初に、二量体化境界部は、ヘテロ二量体化アプローチ、例えば、ノブ・イントゥー・ホール(KiH)技術を使用して各重鎖のC末端中に操作されて、1つの抗体(例えば、抗体A)および第2の抗体(例えば、抗体B)からの2つの別個の重鎖のヘテロ二量体のみが効率的に形成されることが確実にされる。次に、可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)ドメインを一貫したままに保って、1つの抗体の定常重鎖1(CH1)および定常軽鎖(CL)ドメインが交換される(抗体A)。CH1およびCLドメインの交換は、修飾抗体(抗体A)軽鎖は修飾抗体(抗体A)重鎖とのみ効率的に二量体化し、非修飾抗体(抗体B)軽鎖は非修飾抗体(抗体B)重鎖とのみ効率的に二量体化するため、所望の二特異性CrossMabのみが効率的に形成されることを確実にした(例えば、Cain, C.、SciBX 4(28);doi:10.1038/scibx.2011.783(その内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00293]共通重鎖
[00294]単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変軽鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変重鎖を提供することによる。共通重鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許出願公開第20120184716号、米国特許出願公開第20130317200号、および米国特許出願公開第20160264685A1号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00294]単量体の混合物からの所望の二特異性抗体の形成を増強する例示的な方法は、二特異性抗体のヘテロマー可変軽鎖領域のそれぞれと相互作用するための共通の可変重鎖を提供することによる。共通重鎖を有する二特異性抗体の組成物およびその産生方法は、例えば、米国特許出願公開第20120184716号、米国特許出願公開第20130317200号、および米国特許出願公開第20160264685A1号(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00295]アミノ酸修飾
[00296]正しい軽鎖対合を有する多特異性抗体の代替的な組成物およびその産生方法としては、様々なアミノ酸修飾が挙げられる。例えば、Zymeworksは、軽鎖と重鎖との間の境界部の部分であり、各重鎖と所望の軽鎖との優先的な対合を作製する、CH1および/もしくはCLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、VHおよび/もしくはVLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、またはこれらの組合せを有し、それによって、ヘテロ二量体対の2つの重鎖および2つの軽鎖が細胞中で共発現された場合に、第1のヘテロ二量体の重鎖が、他のものよりも軽鎖の1つと優先的に対合する、ヘテロ二量体を記載する(例えば、WO2015181805を参照)。他の例示的な方法は、WO2016026943(Argen-X)、米国特許出願公開第20150211001号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20160039947A1号、および米国特許出願公開第20150368352号に記載されている。
[00296]正しい軽鎖対合を有する多特異性抗体の代替的な組成物およびその産生方法としては、様々なアミノ酸修飾が挙げられる。例えば、Zymeworksは、軽鎖と重鎖との間の境界部の部分であり、各重鎖と所望の軽鎖との優先的な対合を作製する、CH1および/もしくはCLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、VHおよび/もしくはVLドメイン中の1つもしくは複数のアミノ酸修飾、またはこれらの組合せを有し、それによって、ヘテロ二量体対の2つの重鎖および2つの軽鎖が細胞中で共発現された場合に、第1のヘテロ二量体の重鎖が、他のものよりも軽鎖の1つと優先的に対合する、ヘテロ二量体を記載する(例えば、WO2015181805を参照)。他の例示的な方法は、WO2016026943(Argen-X)、米国特許出願公開第20150211001号、米国特許出願公開第20140072581A1号、米国特許出願公開第20160039947A1号、および米国特許出願公開第20150368352号に記載されている。
[00297]ラムダ/カッパフォーマット
[00298]ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む多特異性分子(例えば、多特異性抗体分子)は、ヘテロ二量体化を可能とするために使用することができる。ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む二特異性抗体分子を生成する方法は、PCT公開番号WO2018057955(2017年9月22日に出願されたPCT/US17/53053に対応する)に開示され、これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる。
[00298]ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む多特異性分子(例えば、多特異性抗体分子)は、ヘテロ二量体化を可能とするために使用することができる。ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む二特異性抗体分子を生成する方法は、PCT公開番号WO2018057955(2017年9月22日に出願されたPCT/US17/53053に対応する)に開示され、これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる。
[00299]一部の実施形態では、多特異性分子は、多特異性抗体分子、例えば、2つの結合特異性を含む抗体分子、例えば、二特異性抗体分子を含む。多特異性抗体分子は、
第1のエピトープに特異的なラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)、
第1のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド1(HCP1)、
第2のエピトープに特異的なカッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)、および
第2のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド2(HCP2)
を含む。
第1のエピトープに特異的なラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)、
第1のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド1(HCP1)、
第2のエピトープに特異的なカッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)、および
第2のエピトープに特異的な重鎖ポリペプチド2(HCP2)
を含む。
[00300]「ラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイト重鎖可変領域と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な軽鎖(LC)配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、LLCP1は、LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、およびCH1、またはそのエピトープの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する(KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する)。本明細書の他の箇所に記載されるように、LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
[00301]「カッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイト重鎖可変領域と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP2と複合体化することができる十分な軽鎖(LC)配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、KLCP2は、LC-CDR1、LC-CDR2、LC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、およびCH1、またはそのエピトープの特異的結合を媒介し、HCP2と複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する(LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する)。
[00302]「重鎖ポリペプチド1(HCP1)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイトLLCP1と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な重鎖(HC)配列、例えば、HC可変領域配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、それは、CH2および/またはCH3領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、HCP1は、HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2、およびCH3、または(i)そのエピトープの特異的結合を媒介し、LLCP1と複合体化し、(ii)本明細書に記載されるように、KLCP2とは対照的にLLCP1に対して優先的に複合体化し、かつ(iii)本明細書に記載されるように、HCP1の別の分子とは対照的にHCP2に対して優先的に複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。HCP1は、そのLLCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する(KLCP2は、そのHCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する)。
[00303]「重鎖ポリペプチド2(HCP2)」は、その用語が本明細書で使用される場合、コグネイトLLCP1と組み合わせられた場合に、そのエピトープへの特異的結合を媒介し、HCP1と複合体化することができる十分な重鎖(HC)配列、例えば、HC可変領域配列を含むポリペプチドを指す。一実施形態では、それは、CH1領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、それは、CH2および/またはCH3領域のすべてまたは断片を含む。一実施形態では、HCP1は、HC-CDR1、HC-CDR2、HC-CDR3、FR1、FR2、FR3、FR4、CH1、CH2、およびCH3、または(i)そのエピトープの特異的結合を媒介し、KLCP2と複合体化し、(ii)本明細書に記載されるように、LLCP1とは対照的にKLCP2に対して優先的に複合体化し、かつ(iii)本明細書に記載されるように、HCP2の別の分子とは対照的にHCP1に対して優先的に複合体化するために十分なこれらからの配列を含む。HCP2は、そのKLCP2と共に、第2のエピトープに対する特異性を提供する(LLCP1は、そのHCP1と共に、第1のエピトープに対する特異性を提供する)。
[00304]本明細書に開示される多特異性抗体分子の一部の実施形態では、
[00305]LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有し、かつ/または
[00306]KLCP2は、HCP1に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有する。
[00305]LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有し、かつ/または
[00306]KLCP2は、HCP1に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有する。
[00307]一部の実施形態では、HCP1に対するLLCP1の親和性は、HCP2に対するその親和性より十分に高く、それによって、予め選択された条件下、例えば、例えばpH7の水性緩衝液中、例えばpH7の生理食塩水中、または生理的条件下で、多特異性抗体分子の少なくとも75、80、90、95、98、99、99.5、または99.9%は、HCP1と複合体化した、または結び付けられたLLCP1を有する。
[00308]本明細書に開示される多特異性抗体分子の一部の実施形態では、
HCP1は、HCP1の第2の分子に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有し、かつ/または
HCP2は、HCP2の第2の分子に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
HCP1は、HCP1の第2の分子に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有し、かつ/または
HCP2は、HCP2の第2の分子に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する。
一部の実施形態では、HCP2に対するHCP1の親和性は、HCP1の第2の分子に対するその親和性より十分に高く、それによって、予め選択された条件下、例えば、例えばpH7の水性緩衝液中、例えばpH7の生理食塩水中、または生理的条件下で、多特異性抗体分子の少なくとも75%、80、90、95、98、99 99.5または99.9%は、HCP2と複合体化した、または結び付けられたHCP1を有する。
[00309]別の態様では、多特異性抗体分子を作製、または産生する方法が本明細書に開示される。方法は、(i)~(iv)が会合する条件下で、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
[00310](iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLλ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLλ)、または両方)を提供するステップ、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLκ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLκ)、または両方)を提供するステップ
を含む。
(i)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供するステップ、
[00310](iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLλ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLλ)、または両方)を提供するステップ、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLκ)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLκ)、または両方)を提供するステップ
を含む。
[00311]一部の実施形態では、第1および第2の重鎖ポリペプチドは、ヘテロ二量体化を増強するFc境界部を形成する。
[00312]一部の実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、単一の細胞、例えば、単一の哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞に導入される。一部の実施形態では、(i)~(iv)は、細胞中で発現される。
[00313]一部の実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、異なる細胞、例えば、異なる哺乳動物細胞、例えば、2つまたはより多くのCHO細胞に導入される。一部の実施形態では、(i)~(iv)は、細胞中で発現される。
[00314]一実施形態では、方法は、例えば、ラムダおよび/またはカッパ特異的精製、例えば、親和性クロマトグラフィーを使用して、細胞発現抗体分子を精製するステップをさらに含む。
[00315]一部の実施形態では、方法は、細胞発現多特異性抗体分子を評価することをさらに含む。例えば、精製された細胞発現多特異性抗体分子は、質量分析を含む、当該技術分野において公知の技術によって分析することができる。一実施形態では、精製された細胞発現抗体分子は、切断、例えば、パパインを用いて消化されて、Fab部分をもたらし、質量分析を使用して評価される。
[00316]一部の実施形態では、方法は、高い収率、例えば、少なくとも75%、80、90、95、98、99 99.5または99.9%で、正しく対になったカッパ/ラムダ多特異性の、例えば、二特異性の抗体分子を産生する。
[00317]他の実施形態では、多特異性の、例えば、二特異性の、抗体分子は、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(HCP1)(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、HCP1、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(HCP2)(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、HCP2、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ軽鎖ポリペプチド(LLCP1)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLl)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLl)、または両方)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、LLCP1、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ軽鎖ポリペプチド(KLCP2)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLk)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLk)、または両方)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、KLCP2
を含む。
(i)第1の重鎖ポリペプチド(HCP1)(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、HCP1、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(HCP2)(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3、または両方)のうちの1つ、2つ、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、HCP2、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ軽鎖ポリペプチド(LLCP1)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLl)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLl)、または両方)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、LLCP1、および
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ軽鎖ポリペプチド(KLCP2)(例えば、ラムダ軽鎖可変領域(VLk)、ラムダ軽鎖定常鎖(VLk)、または両方)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、KLCP2
を含む。
[00318]一部の実施形態では、第1および第2の重鎖ポリペプチドは、ヘテロ二量体化を増強するFc境界部を形成する。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、Fc定常、CH2-CH3ドメイン(ノブ修飾を有する)に接続された第1の重鎖可変領域にヘテロ二量体化したハイブリッドVLl-CLlを含む第1の結合特異性、およびFc定常、CH2-CH3ドメイン(ホール修飾を有する)に接続された第2の重鎖可変領域にヘテロ二量体化したハイブリッドVLk-CLkを含む第2の結合特異性を有する。
カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメイン
[00319]本開示は、とりわけ、カルレティキュリン、例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する1つまたは複数の抗原結合性ドメインを含む、例えば、含有するように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。一部の実施形態では、多機能性分子は、野生型カルレティキュリンタンパク質および同様の親和性を有するカルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する。一部の実施形態では、多機能性分子は、野生型カルレティキュリンタンパク質を上回ってカルレティキュリン突然変異体タンパク質に優先的に結合する。
カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメイン
[00319]本開示は、とりわけ、カルレティキュリン、例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する1つまたは複数の抗原結合性ドメインを含む、例えば、含有するように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。一部の実施形態では、多機能性分子は、野生型カルレティキュリンタンパク質および同様の親和性を有するカルレティキュリン突然変異体タンパク質に結合する。一部の実施形態では、多機能性分子は、野生型カルレティキュリンタンパク質を上回ってカルレティキュリン突然変異体タンパク質に優先的に結合する。
[00320]例示的な野生型ヒトカルレティキュリンは、配列番号6285として示されている。
EPAVYFKEQFLDGDGWTSRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDEEKDKGLQTSQDARFYALSASFEPFSNKGQTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPNSLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKGKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDASKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGTWIHPEIDNPEYSPDPSIYAYDNFGVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKAAEKQMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEEAEDKEDDEDKDEDEEDEEDKEEDEEEDVPGQAKDEL(配列番号6285)
[00321]追加の例示的な野生型ヒトカルレティキュリンは、配列番号D1001:
MLLSVPLLLGLLGLAVAHHHHHHHHGGGGSEPAVYFKEQFLDGDGWTSRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDEEKDKGLQTSQDARFYALSASFEPFSNKGQTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPNSLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKGKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDASKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGTWIHPEIDNPEYSPDPSIYAYDNFGVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKAAEKQMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEEAEDKEDDEDKDEDEEDEEDKEEDEEEDVPGQA(配列番号D1001)として示される。
[00321]追加の例示的な野生型ヒトカルレティキュリンは、配列番号D1001:
MLLSVPLLLGLLGLAVAHHHHHHHHGGGGSEPAVYFKEQFLDGDGWTSRWIESKHKSDFGKFVLSSGKFYGDEEKDKGLQTSQDARFYALSASFEPFSNKGQTLVVQFTVKHEQNIDCGGGYVKLFPNSLDQTDMHGDSEYNIMFGPDICGPGTKKVHVIFNYKGKNVLINKDIRCKDDEFTHLYTLIVRPDNTYEVKIDNSQVESGSLEDDWDFLPPKKIKDPDASKPEDWDERAKIDDPTDSKPEDWDKPEHIPDPDAKKPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYKGEWKPRQIDNPDYKGTWIHPEIDNPEYSPDPSIYAYDNFGVLGLDLWQVKSGTIFDNFLITNDEAYAEEFGNETWGVTKAAEKQMKDKQDEEQRLKEEEEDKKRKEEEEAEDKEDDEDKDEDEEDEEDKEEDEEEDVPGQA(配列番号D1001)として示される。
[00322]カルレティキュリン突然変異体タンパク質が、同定され、骨髄がんと関連しているとわかった、例えば、Nangaliaら、N Engl J Med.2013年12月19日;369巻(25号):2391~2405頁、Klampflら、N Engl J Med.2013年12月19日;369巻(25号):2379~90頁および米国特許国際公開第20170269092号を参照(その内容全体はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)。突然変異体カルレティキュリンは、野生型カルレティキュリンのコード配列のエキソン9においてフレームシフトを有し、その結果、主に正に荷電したポリペプチドによる、野生型カルレティキュリンのC末端の負に荷電したアミノ酸の置換をもたらす。表2は、38種のカルレティキュリン突然変異体タンパク質の全長アミノ酸配列を開示する。表3は、36種のカルレティキュリン突然変異体タンパク質のC末端アミノ酸配列を開示する。38種のカルレティキュリン突然変異体タンパク質はすべて、RRKMSPARPRTSCREACLQGWTEA(配列番号6286)のアミノ酸配列を含む。
[00323]カルレティキュリンの主な突然変異は、1型および2型突然変異である(表2および3を参照)。1型突然変異は、52bpの欠失(c.1092_1143del)であるが、2型突然変異は、5bpの挿入(c.1154_1155insTTGTC)である。
[00325]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、例えば、表4に記載されるマウス16B11.1抗体に由来する1つ、2つ、3つのCDRを含むVHを含む。例えば、一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6358の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6360のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号227のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6358の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6360のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号227のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6358の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6360のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号227のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6358の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6360のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号227のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。
[00326]代替的に、またはマウス16B11.1抗体に由来する1つ、2つ、3つのCDRを含むVHを含むカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと組み合わせて、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、例えば、表4に記載されるマウス16B11.1抗体に由来する1つ、2つ、3つのCDRを含むVLを含む。例えば、一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号251の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号246のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号248のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号251のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号253のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号255のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号258のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号260のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号262のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号265のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号267のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号269のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号272のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号274のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号276のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号279のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号281のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号283のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00327]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6253の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6253のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00328]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6259のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00329]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、例えば、表4に記載されるヒト化16B11.1抗体に由来する1つ、2つ、3つ、または4つのフレームワーク領域を含むVHを含む。例えば、一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6357の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6359のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6361のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6273のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6362の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6363のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号226のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号229の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6369のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6371のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6373の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6369のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6371のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00330]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6374の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6375のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号247のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号249のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号250の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号252のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号254のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号256のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号257の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号259のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号261のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号263のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号264の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号266のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号268のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号270のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号271の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号273のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号275のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号277のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号278の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号280のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号282のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号284のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00331]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6224の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6226のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6228のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00332]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6347のアミノ酸配列(または配列番号6347に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6348のアミノ酸配列(または配列番号6348に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6349のアミノ酸配列(または配列番号6349に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6350のアミノ酸配列(または配列番号6350に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6351のアミノ酸配列(または配列番号6351に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6352のアミノ酸配列(または配列番号6352に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6353のアミノ酸配列(または配列番号6353に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6354のアミノ酸配列(または配列番号6354に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6355のアミノ酸配列(または配列番号6355に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6356のアミノ酸配列(または配列番号6356に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00333]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6247のアミノ酸配列(または配列番号6247に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6247のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6249のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6247のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6249のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00334]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、表4の1つの行に列挙される1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列、またはそれに対して(例えば、1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列に対して)少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、表5の1つの行に列挙される1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列、またはそれに対して(例えば、1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列に対して)少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、(i)表4の1つの行に列挙される1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列、またはそれに対して(例えば、1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列に対して)少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH;および(ii)表5の1つの行に列挙される1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列、またはそれに対して(例えば、1つ、2つ、もしくは3つ全部のCDR配列に対して)少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLを含む。
AKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGPTIKPCPPCKCPAPNLLGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLPAPIERTISKPKGSVRAPQVYVLPPPEEEMTKKQVTLTCMVTDFMPEDIYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK(配列番号D123)
[00338]一部の実施形態では、Fc領域は、例えば、本明細書に記載されるFc領域バリアントを含む。一部の実施形態では、Fc領域は、1つまたは複数の突然変異を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、LALAPG突然変異を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、マウスIgG2a-LALAPGバリアントのアミノ酸配列、例えば、以下の配列番号D124もしくはD125の配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む:
AKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGPTIKPCPPCKCPAPNAAGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLGAPIERTISKPKGSVRAPQVYVLPPPEEEMTKKQVTLTCMVTDFMPEDIYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK(配列番号D124)
AKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGPTIKPCPPCKCPAPNAAGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLGAPIERTISKPKGSVRAPQVYVLPPCEEEMTKKQVTLWCMVTDFMPEDIYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK(配列番号D125)
[00339]一部の実施形態では、Fc領域は、ヒトIgG2a N2976Aバリアントのアミノ酸配列、例えば、以下の配列番号D130の配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYGSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号D130)
[00340]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、軽鎖定常領域、例えば、CLカッパ領域、例えば、ヒトCLカッパ領域を含む。一部の実施形態では、軽鎖定常領域は、以下の配列番号D126のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む:
RADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC(配列番号D126)
[00341]一部の実施形態では、軽鎖定常領域は、以下の配列番号D131のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む:
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号D131)
追加のカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメイン
[00342]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、表16~19に開示される任意のCDRアミノ酸配列または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6253の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号243のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6253のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号243のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6259のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号244のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号245のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号244のアミノ酸配列を含むVHおよび/または配列番号245のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372、234、235、236もしくは237のアミノ酸配列を含むVH、またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号238、239、240、241もしくは242のアミノ酸配列を含むVL、またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号239のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号
236のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号240のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号241のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号6372のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号235のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号237のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号242のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00343]一部の実施形態では、カルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインは、配列番号236のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号238のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00344]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子の免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、免疫エフェクター細胞への結合、および/またはその活性化を媒介することができる。一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャー、またはこれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーのうちの1つ、2つ、3つ、もしくはすべて、またはこれらの組合せから選択される。免疫細胞エンゲージャーは、免疫系のアゴニストであり得る。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、抗体分子、リガンド分子(例えば、免疫グロブリン定常領域、例えば、Fc領域をさらに含むリガンド)、小分子、ヌクレオチド分子であり得る。
T細胞エンゲージャー
[00345]本開示は、とりわけ、T細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のT細胞エンゲージャーを含有するように操作されている多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。したがって、一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、TCRのベータサブユニットの可変鎖(例えば、TCRβV)、CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2またはCD226のうちの1つまたは複数に結合する(例えば、一部の実施形態では、それを活性化させる)抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。他の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、TCRβV、CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2またはCD226のうちの1つまたは複数に結合し、かつそれを活性化させない抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、TCRβVに結合する。
[00346]一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、CD3に結合する(例えば、CD3に結合する抗原結合性ドメインを含む)。一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、CD3に結合するT細胞エンゲージャー(例えば、CD3に結合する抗原結合性ドメインを含む)(例えば、CD3に結合する抗原結合性ドメインを含む)および例えば、本明細書に記載のカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインを含む。
[00347]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子(例えば、本明細書に記載される)は、CD3に結合する抗原結合性ドメインを含む。一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、CD3に結合する抗原結合性ドメインおよび例えば、本明細書に記載のカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインを含む。
[00348]一部の実施形態では、CD3に結合する抗原結合性ドメインは、表26および/もしくは表42に開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、CD3に結合する抗原結合性ドメインは、表26および/もしくは表42に開示される1つもしくは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、CD3に結合する抗原結合性ドメインは、表27に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
EVQLVESGGGLVQPGKSLKLSCEASGFTFSGYGMHWVRQAPGRGLESVAYITSSSINIKYADAVKGRFTVSRDNAKNLLFLQMNILKSEDTAMYYCARFDWDKNYWGQGTMVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLPASLGDRVTINCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTNKLADGVPSRFSGSGSGRDSSFTISSLESEDIGSYYCQQYYNYPWTFGPGTKLEIKGGGGSTIKPCPPCKCPAPNAAGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLGAPIERTISKPKGSVRAPQVCVLPPPEEEMTKKQVTLSCAVTDFMPEDIYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMVSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK(配列番号D127)。
[00350]一部の実施形態では、多機能性分子(例えば、二特異性抗体分子)は、以下のアミノ酸配列(またはそこに含まれるCDR(下線)、VH、もしくは定常領域配列)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSEYWMNWLRQAPGKGLEWVGVIKYKYSNYATEFAESVKGRFTISRDDSKSSVYLQMNSLKTEDTAVYYCARGRDVQDYWGQGTMVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号D212)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSEYWMNWLRQAPGKGLEWVGVIKYKYSNYATEFAESVKGRFTISRDDSKSSVYLQMNSLKTEDTAVYYCARGRDVQDYWGQGTMVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号D212)。
[00351]一部の実施形態では、多機能性分子(例えば、二特異性抗体分子)は、以下のアミノ酸配列(またはそこに含まれるCDR(下線)、VL、もしくは定常領域配列)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む:
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCSTSSSVTTNYLHWYQQKPGKAPKLLIYSTSNLASGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPEDFATYYCQQCLSSPCTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号D213)。
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCSTSSSVTTNYLHWYQQKPGKAPKLLIYSTSNLASGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPEDFATYYCQQCLSSPCTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号D213)。
[00352]一部の実施形態では、多機能性分子(例えば、scFv、例えば、二特異性scFv)は、以下のアミノ酸配列(またはそこに含まれるCDR(下線)、VH、もしくはVL配列)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYWMHWVRQAPGQGLEWMGNFNPNNGDTNYNEKFKTRVTMTVDKSTSTAYMELRSLRSDDMAVYYCARDDYGRYYFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCKSSQSLLNSRTRKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWAFTRESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCKQSFILRTFGGGTKVEIKDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号D214)。
ヒトT細胞受容体(TCR)複合体
[00353]T細胞受容体(TCR)は、T細胞の表面に見出すことができる。TCRは、細胞、例えば、抗原提示細胞の表面上に提示される、例えば、主要組織適合性複合体(MHC)分子に結合される、抗原、例えば、ペプチドを認識する。TCRはヘテロ二量体分子であり、アルファ鎖、ベータ鎖、ガンマ鎖またはデルタ鎖を含むことができる。アルファ鎖およびベータ鎖を含むTCRはまた、TCRαβと呼ばれる。TCRβ鎖は、以下の領域(セグメントとしても公知である):可変(V)、多様(D)、結合(J)および定常(C)からなる(Mayer G.およびNyland J.(2010年)10章:Major Histocompatibility Complex and T-cell Receptors-Role in Immune Responses.In:Microbiology and Immunology on-line、University of South Carolina School of Medicineを参照)。TCRα鎖は、V、JおよびC領域からなる。V(可変)、D(多様)、J(結合)、およびC(定常)領域の体細胞組換えによるT細胞受容体(TCR)の再編成は、T細胞の発生および成熟における決定的な事象である。TCR遺伝子再編成は、胸腺で起こる。
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYWMHWVRQAPGQGLEWMGNFNPNNGDTNYNEKFKTRVTMTVDKSTSTAYMELRSLRSDDMAVYYCARDDYGRYYFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCKSSQSLLNSRTRKNYLAWYQQKPGKAPKLLIYWAFTRESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCKQSFILRTFGGGTKVEIKDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号D214)。
ヒトT細胞受容体(TCR)複合体
[00353]T細胞受容体(TCR)は、T細胞の表面に見出すことができる。TCRは、細胞、例えば、抗原提示細胞の表面上に提示される、例えば、主要組織適合性複合体(MHC)分子に結合される、抗原、例えば、ペプチドを認識する。TCRはヘテロ二量体分子であり、アルファ鎖、ベータ鎖、ガンマ鎖またはデルタ鎖を含むことができる。アルファ鎖およびベータ鎖を含むTCRはまた、TCRαβと呼ばれる。TCRβ鎖は、以下の領域(セグメントとしても公知である):可変(V)、多様(D)、結合(J)および定常(C)からなる(Mayer G.およびNyland J.(2010年)10章:Major Histocompatibility Complex and T-cell Receptors-Role in Immune Responses.In:Microbiology and Immunology on-line、University of South Carolina School of Medicineを参照)。TCRα鎖は、V、JおよびC領域からなる。V(可変)、D(多様)、J(結合)、およびC(定常)領域の体細胞組換えによるT細胞受容体(TCR)の再編成は、T細胞の発生および成熟における決定的な事象である。TCR遺伝子再編成は、胸腺で起こる。
[00354]TCRは、アルファ鎖およびベータ鎖を含むTCRヘテロ二量体、ならびに二量体シグナル伝達分子、例えば、CD3共受容体、例えば、CD3δ/εおよび/またはCD3γ/εを含むTCR複合体として公知である受容体複合体を含み得る。
TCRベータV(TCRβV)
[00355]免疫系の多様性は、膨大な数の病原体に対する防御を可能にする。生殖系列ゲノムの大きさは限られているため、多様性は、V(D)J組換えの過程だけでなく、ヌクレオチドの接合部(V-DセグメントとD-Jセグメントの間の接合部)の欠失および偽ランダムで鋳型化されていないヌクレオチドの付加によっても達成される。TCRベータ遺伝子は、多様性を生み出すために遺伝子配列を受ける。
TCRベータV(TCRβV)
[00355]免疫系の多様性は、膨大な数の病原体に対する防御を可能にする。生殖系列ゲノムの大きさは限られているため、多様性は、V(D)J組換えの過程だけでなく、ヌクレオチドの接合部(V-DセグメントとD-Jセグメントの間の接合部)の欠失および偽ランダムで鋳型化されていないヌクレオチドの付加によっても達成される。TCRベータ遺伝子は、多様性を生み出すために遺伝子配列を受ける。
[00356]TCR Vベータレパートリーは、例えば、機能的遺伝子セグメントにおいて7つの頻繁に起こる不活性化多型、および2つのVベータ遺伝子セグメントを包含する大きな挿入/欠失関連多型のために、個体と集団との間で変化する。
[00357]本開示は、例えば、本明細書に記載されるように、例えば、ヒトTCRベータV鎖(TCRβV)、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー(グループとも呼ばれる)、例えば、TCRβVサブファミリー(サブグループとも呼ばれる)に結合する、例えば、特異的に結合する、とりわけ、抗体分子およびその断片を提供する。TCRベータVファミリーおよびサブファミリーは、当該技術分野において公知であり、例えばYassaiら(2009年)Immunogenetics 61巻(7号)493~502ページ;Wei S.およびConcannon P.(1994年)Human Immunology 41巻(3号)201~206ページに記載されている。本明細書に記載される抗体は、組換え抗体、例えば、組換え非マウス抗体、例えば、組換えヒトまたはヒト化抗体であり得る。
[00358]ある態様では、本開示は、ヒトTCRβV、例えば、TCRβVファミリー、例えば、遺伝子ファミリーまたはそのバリアントに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRBV遺伝子ファミリーは、例えば、本明細書に記載されるように、例えば、図3、表28または29に記載されるように、1つまたは複数のサブファミリーを含む。一部の実施態様では、TCRβV遺伝子ファミリーは、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、TCRβ V29サブファミリー、TCRβ V1サブファミリー、TCRβ V17サブファミリー、TCRβ V21サブファミリー、TCRβ V23サブファミリー、またはTCRβ V26サブファミリーを含む。
[00359]一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーはまた、TCRβ V13.1としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01、またはそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβV6は、TCRβ V6-9*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-8*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCR βV6-2*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-3*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00360]一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-5*01は、配列番号1Aおよび/または配列番号2Aによって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6、例えば、TCRβ V6-5*01は、配列番号9Aおよび/または配列番号10Aによって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V6は、配列番号9Aおよび/または配列番号11Aによって認識され、例えば結合される。
[00361]一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーはまた、TCRβ V12としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01、またはそれらのバリアントを含む。
[00362]一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはまた、TCRβ V8.1としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーは、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01、もしくはTCRβ V12-5*01、またはそれらのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V12は、配列番号15Aおよび/または配列番号16Aによって認識され、例えば結合される。一部の実施形態では、TCRβ V12は、配列番号23A~25Aのいずれか1つ、および/または配列番号26A~30Aのいずれか1つによって認識され、例えば結合される。
[00363]一部の実施形態では、TCRβ V5サブファミリーは、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01、またはそれらのバリアントから選択される。
[00364]一部の実施形態では、TCRβ V7サブファミリーは、TCRβ V7-7*01、TCRβ V7-6*01、TCRβ V7-8*02、TCRβ V7-4*01、TCRβ V7-2*02、TCRβ V7-2*03、TCRβ V7-2*01、TCRβ V7-3*01、TCRβ V7-9*03、もしくはTCRβ V7-9*01、またはそれらのバリアントを含む。
[00365]一部の実施形態では、TCRβ V11サブファミリーは、TCRβ V11-1*01、TCRβ V11-2*01もしくはTCRβ V11-3*01、またはそれらのバリアントを含む。
[00366]一部の実施形態では、TCRβ V14サブファミリーは、TCRβ V14*01、またはそのバリアントを含む。
[00367]一部の実施形態では、TCRβ V16サブファミリーは、TCRβ V16*01、またはそのバリアントを含む。
[00368]一部の実施形態では、TCRβ V18サブファミリーは、TCRβ V18*01、またはそのバリアントを含む。
[00369]一部の実施形態では、TCRβ V9サブファミリーは、TCRβ V9*01もしくはTCRβ V9*02、またはそのバリアントを含む。
[00370]一部の実施形態では、TCRβ V13サブファミリーは、TCRβV13*01、またはそのバリアントを含む。
[00371]一部の実施形態では、TCRβ V4サブファミリーは、TCRβ V4-2*01、TCRβ V4-3*01、もしくはTCRβ V4-1*01、またはそれらのバリアントを含む。
[00372]一部の実施形態では、TCRβ V3サブファミリーは、TCRβ V3-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00373]一部の実施形態では、TCRβ V2サブファミリーは、TCRβ V2*01、またはそのバリアントを含む。
[00374]一部の実施形態では、TCRβ V15サブファミリーは、TCRβ V15*01、またはそのバリアントを含む。
[00375]一部の実施形態では、TCRβ V30サブファミリーは、TCRβ V30*01、もしくはTCRβ V30*02、またはそのバリアントを含む。
[00376]一部の実施形態では、TCRβ V19サブファミリーは、TCRβ V19*01、もしくはTCRβ V19*02、またはそのバリアントを含む。
[00377]一部の実施形態では、TCRβ V27サブファミリーは、TCRβ V27*01、またはそのバリアントを含む。
[00378]一部の実施形態では、TCRβ V28サブファミリーは、TCRβ V28*01、またはそのバリアントを含む。
[00379]一部の実施形態では、TCRβ V24サブファミリーは、TCRβ V24-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00380]一部の実施形態では、TCRβ V20サブファミリーは、TCRβ V20-1*01、もしくはTCRβ V20-1*02、またはそのバリアントを含む。
[00381]一部の実施形態では、TCRβ V25サブファミリーは、TCRβ V25-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00382]一部の実施形態では、TCRβ V29サブファミリーは、TCRβ V29-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00383]低い配列類似性(例えば、異なるTCRβVサブファミリーを認識する異なる抗体分子の中での低い配列同一性)を有するにもかかわらず、TCRβVタンパク質上の構造的に保存された領域、例えば、ドメインを認識し、かつ類似の機能(例えば、類似のサイトカインプロファイル)を有する、抗体の新規のクラス、すなわち、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の発見が本明細書に開示される。そのため、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は構造-機能関係性を共有する。
[00384]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV:TCRアルファ複合体の境界部を認識しない、例えば、それに結合しない。
[00385]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の定常領域を認識しない、例えば、それに結合しない。TCRBV領域の定常領域に結合する例示的な抗体は、Vineyら(Hybridoma. 1992 Dec;11(6):701~13ページ)に記載されるJOVI.1である。
[00386]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβVタンパク質の相補性決定領域(例えば、CDR1、CDR2および/またはCDR3)のうちの1つまたは複数(例えば、すべて)を認識しない、例えば、それに結合しない。
[00387]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子は、TCRβV領域に結合する(例えば、特異的に結合する)。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRβV抗体分子の結合は、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルをもたらす。一部の実施形態では、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーは、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子)、またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む。一部の実施形態では、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーは、OKT3抗体またはSP34-2抗体である。
[00388]一態様では、本開示は、例えば、本明細書に、例えば、図3、表28、または表29に記載される、ヒトTCRβV、例えば、TCRβV遺伝子ファミリー、例えば、TCRβVサブファミリーのうちの1つまたは複数に結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6サブファミリー、TCRβ V10サブファミリー、TCRβ V12サブファミリー、TCRβ V5サブファミリー、TCRβ V7サブファミリー、TCRβ V11サブファミリー、TCRβ V14サブファミリー、TCRβ V16サブファミリー、TCRβ V18サブファミリー、TCRβ V9サブファミリー、TCRβ V13サブファミリー、TCRβ V4サブファミリー、TCRβ V3サブファミリー、TCRβ V2サブファミリー、TCRβ V15サブファミリー、TCRβ V30サブファミリー、TCRβ V19サブファミリー、TCRβ V27サブファミリー、TCRβ V28サブファミリー、TCRβ V24サブファミリー、TCRβ V20サブファミリー、TCRβ V25サブファミリー、TCRβ V29サブファミリー、TCRβ V1サブファミリー、TCRβ V17サブファミリー、TCRβ V21サブファミリー、TCRβ V23サブファミリー、もしくはTCRβ V26サブファミリーから選択される1つもしくは複数のTCRβVサブファミリー、またはそのバリアントに結合する。
[00389]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01もしくはTCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V6サブファミリーに結合する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-9*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-8*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-2*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-3*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00390]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V10サブファミリーに結合する。
[00391]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01もしくはTCRβ V12-5*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V12サブファミリーに結合する。
[00392]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01、またはそのバリアントを含むTCRβ V5サブファミリーに結合する。
[00393]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V12に結合しないか、または米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体もしくはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍低い)親和性および/もしくは結合特異性でTCRβ V12に結合する。
[00394]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V12に結合する。
[00395]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載される16G8マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V12以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
[00396]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、TCRβ V5-5*01にもTCRβ V5-1*01にも結合せず、または米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体もしくはそのヒト化バージョンの親和性および/もしくは結合特異性より低い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%もしくは約2、5、もしくは10倍低い)親和性および/もしくは結合特異性でTCRβ V5-5*01もしくはTCRβ V5-1*01に結合する。
[00397]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01に結合する。
[00398]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、米国特許第5,861,155号に記載されるTM23マウス抗体またはそのヒト化バージョンの親和性および/または結合特異性より高い(例えば、約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または約2、5、もしくは10倍高い)親和性および/または結合特異性でTCRβ V5-5*01またはTCRβ V5-1*01以外のTCRβV領域(例えば、本明細書に記載されるTCRβV領域、例えば、TCRβ V6サブファミリー(例えば、TCRβ V6-5*01)に結合する。
抗TCRβ V6抗体
[00399]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-9*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-8*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-2*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-3*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含む。
抗TCRβ V6抗体
[00399]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V6、例えば、TCRβ V6-4*01、TCRβ V6-4*02、TCRβ V6-9*01、TCRβ V6-8*01、TCRβ V6-5*01、TCRβ V6-6*02、TCRβ V6-6*01、TCRβ V6-2*01、TCRβ V6-3*01またはTCRβ V6-1*01を含むTCRβ V6サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V6サブファミリーは、TCRβ V6-5*01またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-4*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-9*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-8*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-5*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*02、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-6*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-2*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-3*01、またはそのバリアントを含む。一部の実施形態では、TCRβ V6は、TCRβ V6-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00400]一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号43Aの核酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有する配列によってコードされる。
[00401]配列番号43A
ATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCAGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTGGTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGTCTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCAGCAGTTACTC
[00402]一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号1044のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有するアミノ酸配列を含む。
ATGAGCATCGGCCTCCTGTGCTGTGCAGCCTTGTCTCTCCTGTGGGCAGGTCCAGTGAATGCTGGTGTCACTCAGACCCCAAAATTCCAGGTCCTGAAGACAGGACAGAGCATGACACTGCAGTGTGCCCAGGATATGAACCATGAATACATGTCCTGGTATCGACAAGACCCAGGCATGGGGCTGAGGCTGATTCATTACTCAGTTGGTGCTGGTATCACTGACCAAGGAGAAGTCCCCAATGGCTACAATGTCTCCAGATCAACCACAGAGGATTTCCCGCTCAGGCTGCTGTCGGCTGCTCCCTCCCAGACATCTGTGTACTTCTGTGCCAGCAGTTACTC
[00402]一部の実施形態では、TCRβ V6-5*01は、配列番号1044のアミノ酸配列、またはその85%、90%、95%、99%もしくはより高い同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[00403]配列番号1044
MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSY
[00404]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、ヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。
MSIGLLCCAALSLLWAGPVNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNHEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVGAGITDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASSY
[00404]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、ヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。
[00405]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、単離されているか、または組換えである。
[00406]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30におけるヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)の配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、可変領域またはその抗原結合性断片を含む。
[00407]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つ、2つ、3つまたは4つの可変領域を含む。
[00408]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体分子に由来する少なくとも1つまたは2つの重鎖可変領域を含む。
[00409]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号231Aまたは3290Aのコンセンサス配列を有する重鎖可変領域(VH)を含む。
[00410]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つまたは2つの軽鎖可変領域を含む。
[00411]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子は、配列番号230Aまたは3289Aのコンセンサス配列を有する軽鎖可変領域(VL)を含む。
[00412]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。さらに別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。一実施形態では、重鎖定常領域は、表32に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00413]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。一実施形態では、軽鎖定常領域は、表32に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00414]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域(VH)からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
[00415]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に示されるか、または表30に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表30に示されるか、または表30に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00416]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列、もしくは前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
[00417]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に示されるか、または表30に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表30に示されるか、または表30に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00418]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に示されるか、または表30に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表30に示されるか、または表30に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00419]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、または表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの6つすべてのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが2つ、3つもしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00420]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載の抗体の重鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表30に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00421]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載の抗体の軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表30に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00422]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載されるか、もしくは表30におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表30に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるKabatらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00423]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載されるか、もしくは表30におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる6つすべてのCDR(例えば、表30に示されるKabatの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるKabatらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00424]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2またはA-H.68の対応する超可変ループと同じカノニカルな構造、例えば、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じカノニカルな構造を有する少なくとも1つ、2つ、または3つの超可変ループを含む。例えば、超可変ループのカノニカルな構造の記載についてChothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799~817ページ;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776~798ページを参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載の表の検査によって決定することができる。
[00425]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載される抗体の重鎖可変領域に由来するChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表30に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00426]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載される抗体の軽鎖可変領域に由来するChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表30に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00427]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載されるか、もしくは表30におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表30に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるChothiaらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00428]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つから選択される抗体、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68、もしくは表30に記載されるか、もしくは表30におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる6つすべてのCDR(例えば、表30に示されるChothiaの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表30に示されるChothiaらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00429]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatら、Chothiaらに従って定義されるか、または表30に記載されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。
[00430]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、KabatおよびChothiaの定義によるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00431]一部の実施形態では、表30に示される組合せCDRは、Kabat CDRおよびChothia CDRを含むCDRである。
[00432]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30において組合せCDRとして同定されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に記載される「組合せ」CDRによるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00433]一実施形態、例えば、可変領域、CDR(例えば、組合せCDR、Chothia CDRもしくはKabat CDR)、または本明細書、例えば、表30において言及される他の配列を含む一実施形態では、抗体分子は、単一特異性抗体分子、二特異性抗体分子、二価抗体分子、二重パラトープ性抗体分子、または抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子、例えば、半抗体もしくは半抗体の抗原結合性断片である。ある特定の実施形態では、抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子を含む。
[00434]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号2A、配列番号10Aもしくは配列番号11Aの軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
(ii)配列番号1Aもしくは配列番号9Aの重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて
を含む。
(i)配列番号2A、配列番号10Aもしくは配列番号11Aの軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
(ii)配列番号1Aもしくは配列番号9Aの重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて
を含む。
[00435]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号2AのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号1AのHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
[00436]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号10AのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号9AのHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
[00437]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、配列番号11AのLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3、ならびに配列番号9AのHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3を含む。
[00438]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
(i)配列番号6のLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号3のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00439]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号6AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号3AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
(i)配列番号6AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号7AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号8AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号3AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号4AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号5AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00440]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号51AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
(i)配列番号51AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号45のHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00441]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号51AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号45AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
(i)配列番号51AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号52AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号53AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号45AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号46AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号47AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00442]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号54AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号48AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
(i)配列番号54AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号48AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00443]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
(i)配列番号54AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号48AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
(i)配列番号54AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号55AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号56AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号48AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号49AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号50AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00444]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、および任意選択でFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基のうちの少なくとも80%、85%、87% 90%、92%、93%、95%、97%、98%、もしくは100%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基の20%~80%、40%~60%、60%~90%、もしくは70%~95%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯動物フレームワーク)、または(d)例えば抗原性もしくは細胞傷害性決定因子を除去するように、修飾されている、例えば、脱免疫化(deimmunized)、もしくは部分的にヒト化されている非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態では、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一のまたは同一の軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
[00445]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つ、例えば、A-H.1、A-H.2またはA-H.68のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図1A、または配列番号9Aに示される、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
[00446]代替的に、または本明細書に記載の重鎖置換と組み合わせて、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つ、例えば、A-H.1、A-H.2またはA-H.68のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図1B、または配列番号10Aもしくは配列番号11Aに示される、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くのアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。
[00447]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、図1Aに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの重鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00448]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、図1Bに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの軽鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00449]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域1を含む。
[00450]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域2を含む。
[00451]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域3を含む。
[00452]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば図1Bに示される、A-H.1またはA-H.2の軽鎖フレームワーク領域4を含む。
[00453]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、Kabatの番号付けによる10位における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR1は、10位におけるフェニルアラニン、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00454]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域2(FR2)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR2は、Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR2は、Kabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00455]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00456]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号10Aのアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる10位におけるフェニルアラニン、例えば、10位における置換、例えば、セリンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、(b)Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、およびKabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含むフレームワーク領域2(FR2)、ならびに(c)Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00457]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号11Aのアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる36位におけるヒスチジン、例えば、36位における置換、例えば、チロシンからヒスチジンへの置換、およびKabatの番号付けによる46位におけるアラニン、例えば、46位における置換、例えば、アルギニンからアラニンへの置換を含むフレームワーク領域2(FR2)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる87位におけるフェニルアラニン、例えば、87位における置換、例えば、チロシンからフェニルアラニンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00458]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、(a)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域1(FR1)、(b)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域2(FR2)および(c)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00459]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域1を含む。
[00460]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域2を含む。
[00461]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域3を含む。
[00462]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、図1Aに示されるように、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域4を含む。
[00463]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる73位におけるスレオニン、例えば、73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる94位におけるグリシン、例えば、94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列重鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00464]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、配列番号10Aのアミノ酸配列に示されるように、Kabatの番号付けによる73位におけるスレオニン、例えば、73位における置換、例えば、グルタミン酸からスレオニンへの置換、およびKabatの番号付けによる94位におけるグリシン、例えば、94位における置換、例えば、アルギニンからグリシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む重鎖可変ドメインを含む。
[00465]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.1またはA-H.2の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号9A、または図1Aおよび1Bに示されるものを含む。
[00466]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.1の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号10A、または図1Aおよび1Bに示されるものを含む。
[00467]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.2の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号11A、または図1Aおよび1Bに示されるものを含む。
[00468]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.1の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号9A、およびA-H.1の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号10A、または図1Aおよび1Bに示されるものを含む。
[00469]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.2の重鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号9A、およびA-H.2の軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば配列番号11A、または図1Aおよび1Bに示されるものを含む。
[00470]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の重鎖もしくは軽鎖可変ドメイン、または両方は、本明細書に開示されるアミノ酸に対して実質的に同一である、例えば、本明細書に記載の抗体、例えば、A-H.1~A-H.85のうちのいずれか1つ、例えば、A-H.1、A-H.2もしくはA-H.68から選択されるか、もしくは表30に記載されるか、もしくは表30中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の可変領域に対して少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一である、または本明細書に記載の抗体の可変領域から少なくとも1個もしくは5個の残基、かつ40個、30個、20個、もしくは10個未満の残基が異なる、アミノ酸配列を含む。
[00471]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一である、もしくは表30に示される配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なる配列を有する少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に示されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表30に示される配列から3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが異なる配列を有する核酸によってコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
[00472]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
配列番号9Aのアミノ酸配列、配列番号9Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号10Aのアミノ酸配列、配列番号10Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号10Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号9Aのアミノ酸配列、配列番号9Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号10Aのアミノ酸配列、配列番号10Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号10Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00473]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、
配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号11Aのアミノ酸配列、配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号11Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号9のアミノ酸配列、配列番号9Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号9Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および/または
配列番号11Aのアミノ酸配列、配列番号11のアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、もしくは配列番号11Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00474]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、全長抗体またはその断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、もしくは一本鎖Fv断片(scFv))である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、モノクローナル抗体または単一の特異性を有する抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子はまた、ヒト化、キメラ、ラクダ、サメ、またはin vitroで生成された抗体分子であり得る。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、ヒト化抗体分子である。抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の重鎖および軽鎖は、全長であり得(例えば、抗体は、少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全重鎖、および少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全軽鎖を含むことができる)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、もしくは二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、もしくはラクダ抗体)を含むことができる。
[00475]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子の形態である。
[00476]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)を有する。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、またはIgG2)の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、重鎖定常領域はヒトIgG1である。一部の実施形態では、Fc領域は、例えば、本明細書に記載されるように、Fc領域バリアントを含む。
[00477]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態では、定常領域は、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異されている。例えば、定常領域は、例えば、ヒトIgG1と比較して、Fc受容体結合を変更するために296位(MからYへ)、298位(SからTへ)、300位(TからEへ)、477位(HからKへ)および478位(NからFへ)において突然変異されている(例えば、突然変異した位置は、配列番号212Aもしくは214Aの132位(MからYへ)、134位(SからTへ)、136位(TからEへ)、313位(HからKへ)および314位(NからFへ)、または配列番号215A、216A、217Aもしくは218Aの135位(MからYへ)、137位(SからTへ)、139位(TからEへ)、316位(HからKへ)および317位(NからFへ)に対応する)。
[00478]抗体A-H.1は、配列番号3278Aのアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72Aのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。抗体A-H.2は、配列番号3278Aのアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号3279Aのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。抗体A-H.68は、配列番号1337Aのアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00479]追加の例示的なヒト化抗TCRB V6抗体が表30において提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V6は、表30において提供されるように、抗体A、例えば、ヒト化された抗体A(抗体A-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表30において提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、ならびに/もしくは表30において提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはこれらに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Aは、表30において提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはこれらに対して少なくとも85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00480]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、表1に記載の抗体のVHおよび/もしくはVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、表1に記載の抗体のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、表1に記載の抗体のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
[00481]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、表1に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
[00482]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
[00483]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
[00484]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV6(例えば、抗TCRβV6-5*01)抗体分子は、A-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVH、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列;およびA-H.1、A-H.2、A-H.3、A-H.4、A-H.5、A-H.6、A-H.7、A-H.8、A-H.9、A-H.10、A-H.11、A-H.12、A-H.13、A-H.14、A-H.15、A-H.16、A-H.17、A-H.18、A-H.19、A-H.20、A-H.21、A-H.22、A-H.23、A-H.24、A-H.25、A-H.26、A-H.27、A-H.28、A-H.29、A-H.30、A-H.31、A-H.32、A-H.33、A-H.34、A-H.35、A-H.36、A-H.37、A-H.38、A-H.39、A-H.40、A-H.1、A-H.42、A-H.43、A-H.44、A-H.45、A-H.46、A-H.47、A-H.48、A-H.49、A-H.50、A-H.51、A-H.52、A-H.53、A-H.54、A-H.55、A-H.56、A-H.57、A-H.58、A-H.59、A-H.60、A-H.61、A-H.62、A-H.63、A-H.64、A-H.65、A-H.66、A-H.67、A-H.68、A-H.69、A-H.70、A-H.71、A-H.72、A-H.73、A-H.74、A-H.75、A-H.76、A-H.77、A-H.78、A-H.79、A-H.80、A-H.81、A-H.82、A-H.83、A-H.84、もしくはA-H.85のVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはそれ以上の同一性を有する配列を含む。
[00486]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、表30に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
[00487]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVb抗体は、配列番号230A(30位はG、E、AもしくはDであり、31位はNもしくはDであり、32位はRもしくはKであり、36位はYもしくはHであり、かつ/または56位はKもしくはSである)のコンセンサス配列を有するVLを有する抗原結合性ドメインを有する。
[00488]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVb抗体は、配列番号231A(27位はHもしくはTもしくはGもしくはYであり、28位はDもしくはTもしくはSであり、30位はHもしくはRもしくはDもしくはKもしくはTであり、31位はLもしくはDもしくはKもしくはTもしくはNであり、32位はWもしくはFもしくはTもしくはIもしくはYもしくはGであり、49位はRもしくはWであり、50位はVもしくはIもしくはFであり、51位はFもしくはSもしくはYであり、52位はAもしくはPであり、56位はNもしくはSであり、57位はTもしくはVもしくはYもしくはIであり、58位はKもしくはRであり、97位はGもしくはVであり、99位はYもしくはIであり、102位はYもしくはAであり、かつ/または103位はDもしくはGである)のコンセンサス配列を有するVHを有する抗原結合性ドメインを有する。
抗TCRβ V12抗体
[00489]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-4*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-3*01を含む。
抗TCRβ V12抗体
[00489]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V12、例えば、TCRβ V12-4*01、TCRβ V12-3*01またはTCRβ V12-5*01を含むTCRβ V12サブファミリーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-4*01を含む。一部の実施形態では、TCRβ V12サブファミリーはTCRβ V12-3*01を含む。
[00490]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は非マウス抗体分子、例えば、ヒトまたはヒト化抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト抗体分子である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト化抗体分子である。
[00491]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、単離されているか、または組換えである。
[00492]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの少なくとも1つの抗原結合性領域、例えば、可変領域もしくはその抗原結合性断片、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00493]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つ、2つ、3つまたは4つの可変領域を含む。
[00494]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つまたは2つの重鎖可変領域を含む。
[00495]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体に由来する少なくとも1つまたは2つの軽鎖可変領域を含む。
[00496]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。さらに別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。一実施形態では、重鎖定常領域は、表32に記載のアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00497]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。一実施形態では、軽鎖定常領域は、表32に記載のアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00498]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列、もしくは前記配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列によってコードされる抗体の重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
[00499]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に示されるか、または表31に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表31に示されるか、または表31に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00500]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、もしくは3つの相補性決定領域(CDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)である配列を含む。
[00501]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に示されるか、または表31に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表31に示されるか、または表31に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00502]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に示されるか、または表31に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(またはCDRのまとめてすべて)を含む。一実施形態では、CDRのうちの1つまたは複数(またはCDRのまとめてすべて)は、表31に示されるか、または表31に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
[00503]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体からの6つすべてのCDR、または密接に関連したCDR、例えば、同一であるか、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが2つ、3つもしくは4つ以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するCDRを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00504]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表31に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00505]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載される抗体の軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表31に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるKabatらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00506]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表31に示されるKabatの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるKabatらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00507]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされるような抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabatらによる6つすべてのCDR(例えば、表31に示されるKabatの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるKabatらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00508]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載の抗体の対応する超可変ループと同じカノニカルな構造、例えば、本明細書に記載の抗体の重鎖および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じカノニカルな構造を有する少なくとも1つ、2つ、または3つの超可変ループを含む。例えば、超可変ループのカノニカルな構造の記載についてChothiaら、(1992) J. Mol. Biol. 227:799~817ページ;Tomlinsonら、(1992) J. Mol. Biol. 227:776~798ページを参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載の表の検査によって決定することができる。
[00509]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表31に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00510]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載される抗体の軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表31に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるChothiaらによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00511]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表31に示されるChothiaの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるChothiaらによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00512]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされるような抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのChothiaらによる6つすべてのCDR(例えば、表31に示されるChothiaの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示されるChothiaらによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00513]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載される選択された抗体の重鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表31に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示される組合せCDRによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00514]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載される抗体の軽鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR(例えば、表31に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示される組合せCDRによる1つ、2つ、もしくは3つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00515]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31におけるヌクレオチド配列によってコードされる抗体の重鎖および軽鎖可変領域からの組合せCDRによる少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR(例えば、表31に示される組合せCDRの定義による少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示される組合せCDRによる1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。
[00516]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされるような抗体の重鎖および軽鎖可変領域からの組合せCDRによる6つすべてのCDR(例えば、表31に示される組合せCDRの定義による6つすべてのCDR)、または前述の配列のいずれかに対して実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一)であるか、もしくは表31に示される組合せCDRによる6つすべてのCDRと比較して、少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、2つ、3つもしくは4つ以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の任意のCDRを含んでもよい。
[00517]一部の実施形態では、表31に示される組合せCDRは、Kabat CDRおよびChothia CDRを含むCDRである。
[00518]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31において組合せCDRとして同定されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に記載される「組合せ」CDRによるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00519]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、KabatらおよびChothiaらに従って定義されるか、または表31に記載されるCDRまたは超可変ループの組合せを含む。
[00520]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、KabatおよびChothiaの定義によるCDRまたは超可変ループの任意の組合せを含有し得る。
[00521]一実施形態では、例えば、本明細書、例えば、表31において言及される可変領域、CDR(例えば、組合せCDR、Chothia CDRもしくはKabat CDR)、または他の配列を含む一実施形態では、抗体分子は、単一特異性抗体分子、二特異性抗体分子、二価抗体分子、二重パラトープ性抗体分子、または抗体の抗原結合性断片を含む抗体分子、例えば、半抗体もしくは半抗体の抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子を含む。
[00522]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号16A、配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aの軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
(ii)配列番号15A、配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aの重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべてを含む。
(i)配列番号16A、配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aの軽鎖相補性決定領域1(LC CDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LC CDR2)、および軽鎖相補性決定領域3(LC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべて、ならびに/または
(ii)配列番号15A、配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aの重鎖相補性決定領域1(HC CDR1)、重鎖相補性決定領域2(HC CDR2)、および重鎖相補性決定領域3(HC CDR3)のうちの1つ、2つもしくはすべてを含む。
[00523]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号20AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号22AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号17AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号19AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
(i)配列番号20AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号22AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号17AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号19AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00524]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号20AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21AのLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号2AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
(ii)配列番号17AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18AのHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号19AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
(i)配列番号20AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号21AのLC CDR2アミノ酸配列、および配列番号2AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、ならびに/または
(ii)配列番号17AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号18AのHC CDR2アミノ酸配列、および配列番号19AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00525]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号63AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号57AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
(i)配列番号63AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号57AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00526]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号63AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号57AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
(i)配列番号63AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号57AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00527]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号66AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号67AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号68AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号60AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号61AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号62AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
(i)配列番号66AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号67AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号68AのLC CDR3アミノ酸配列、および/または
(ii)配列番号60AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号61AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号62AのHC CDR3アミノ酸配列
を含む。
[00528]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
(i)配列番号63AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号57AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
(i)配列番号63AのLC CDR1アミノ酸配列、配列番号64AのLC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号65AのLC CDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、および/または
(ii)配列番号57AのHC CDR1アミノ酸配列、配列番号58AのHC CDR2アミノ酸配列、もしくは配列番号59AのHC CDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)
を含む。
[00529]一実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3、および任意選択でFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基のうちの少なくとも80%、85%、87% 90%、92%、93%、95%、97%、98%、もしくは100%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖もしくは重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列、もしくはヒトコンセンサス配列からの軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク残基の20%~80%、40%~60%、60%~90%、もしくは70%~95%を含む軽鎖もしくは重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯動物フレームワーク)、または(d)例えば抗原性もしくは細胞傷害性決定因子を除去するように、修飾されている、例えば、脱免疫化、もしくは部分的にヒト化されている非ヒトフレームワークから選択することができる。一実施形態では、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特に、FR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークに対して少なくとも70、75、80、85、87、88、90、92、94、95、96、97、98、99%同一のまたは同一の軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
[00530]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に記載のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図2Aおよび図2Bに示されるか、または配列番号23A~25Aにおける、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くの変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。
[00531]代替的に、または本明細書に記載の重鎖置換と組み合わせて、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、本明細書に記載の抗体のアミノ酸配列からの、例えば、例えば図2Aおよび図2Bに示されるか、または配列番号26A~30Aにおける、可変領域全体中のFR領域のアミノ酸配列からの少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、10個、15個、20個またはより多くのアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。
[00532]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、図2Aに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの重鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00533]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、図2Bに示される1つ、2つ、3つ、もしくは4つの軽鎖フレームワーク領域、またはそれに対して実質的に同一の配列を含む。
[00534]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域1を含む。
[00535]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域2を含む。
[00536]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域3を含む。
[00537]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Bに示される、軽鎖フレームワーク領域4を含む。
[00538]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数の、例えば、すべての、位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる1位におけるアスパラギン酸、例えば、1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる2位におけるアスパラギン、例えば、2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR1は、Kabatの番号付けによる4位におけるロイシン、例えば、4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含む。
[00539]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換、セリンからアスパラギンへの置換またはチロシンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域1(FR1)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00540]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数の、例えば、すべての、位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる66位におけるグリシン、例えば、66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる69位におけるアスパラギン、例えば、69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含む。一部の実施形態では、FR3は、Kabatの番号付けによる71位におけるチロシン、例えば、71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含む。
[00541]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、およびKabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リシンからグリシンへの置換、またはセリンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換、またはアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域、例えば、フレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00542]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号26Aのアミノ酸配列に示されるように、Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびにKabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00543]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号27Aのアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる1位における置換、例えば、アラニンからアスパラギン酸への置換、およびKabatの番号付けによる2位における置換、例えば、イソロイシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00544]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号28Aのアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、セリンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる4位における置換、例えば、メチオニンからロイシンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、フェニルアラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00545]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号29Aのアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、セリンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、リジンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、アラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00546]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、配列番号29Aのアミノ酸配列に示されるように、(a)Kabatの番号付けによる2位における置換、例えば、チロシンからアスパラギンへの置換を含むフレームワーク領域1(FR1)、ならびに(b)Kabatの番号付けによる66位における置換、例えば、セリンからグリシンへの置換、Kabatの番号付けによる69位における置換、例えば、スレオニンからアスパラギンへの置換、およびKabatの番号付けによる71位における置換、例えば、アラニンからチロシンへの置換を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖を含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00547]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、(a)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域1(FR1)、および(b)Kabatの番号付けによる本明細書に開示される1つまたは複数(例えば、すべて)の位置における変化、例えば、置換(例えば、保存的置換)を含むフレームワーク領域3(FR3)を含む軽鎖可変ドメインを含む。一部の実施形態では、置換は、ヒト生殖系列軽鎖フレームワーク領域配列と比較したものである。
[00548]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域1を含む。
[00549]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域2を含む。
[00550]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域3を含む。
[00551]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば図2Aに示される、重鎖フレームワーク領域4を含む。
[00552]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号20A~23A、または図2Aに示されるものを含む。
[00553]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号26A~30A、または図2Bに示されるものを含む。
[00554]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、重鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号23A~25A、ならびに軽鎖フレームワーク領域1~4、例えば、配列番号26A~30A、または図2Aおよび図2Bに示されるものを含む。
[00555]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の重鎖もしくは軽鎖可変ドメイン、または両方は、本明細書に開示されるアミノ酸に対して実質的に同一である、例えば、本明細書に記載の抗体、例えば、表31に記載されるか、もしくは表31中のヌクレオチド配列によってコードされる抗体の可変領域に対して少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%もしくはそれ以上同一である、または本明細書に記載の抗体の可変領域から少なくとも1個もしくは5個の残基、かつ40個、30個、20個、もしくは10個未満の残基が異なるアミノ酸配列を含む。
[00556]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に示されるアミノ酸配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表31に示される配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なる配列を有する少なくとも1つ、2つ、3つ、または4つの抗原結合性領域、例えば、可変領域を含む。別の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、表31に示されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるか、もしくは表31に示される配列から3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが異なる配列を有する核酸によってコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
[00557]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、
配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメイン;ならびに/または
配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23A、配列番号24Aもしくは配列番号25Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメイン;ならびに/または
配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26A、配列番号27A、配列番号28A、配列番号29Aもしくは配列番号30Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00558]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン;および
配列番号26Aのアミノ酸配列、配列番号26Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン;および
配列番号26Aのアミノ酸配列、配列番号26Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00559]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβV12抗体分子は、
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン;および
配列番号27Aのアミノ酸配列、配列番号27Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン;および
配列番号27Aのアミノ酸配列、配列番号27Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27Aのアミノ酸配列と1、2、5、10、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00560]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28Aのアミノ酸配列、配列番号28Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28Aのアミノ酸配列、配列番号28Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00561]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29Aのアミノ酸配列、配列番号29Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29Aのアミノ酸配列、配列番号29Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00562]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号23Aのアミノ酸配列、配列番号23Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号23Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00563]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26Aのアミノ酸配列、配列番号26Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26Aのアミノ酸配列、配列番号26Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00564]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27Aのアミノ酸配列、配列番号27Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27Aのアミノ酸配列、配列番号27Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00565]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28Aのアミノ酸配列、配列番号28Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28Aのアミノ酸配列、配列番号28Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00566]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29Aのアミノ酸配列、配列番号29Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29Aのアミノ酸配列、配列番号29Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00567]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号24Aのアミノ酸配列、配列番号24Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号24Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00568]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26Aのアミノ酸配列、配列番号26Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号26Aのアミノ酸配列、配列番号26Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号26Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00569]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27Aのアミノ酸配列、配列番号27Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号27Aのアミノ酸配列、配列番号27Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号27Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00570]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28Aのアミノ酸配列、配列番号28Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号28Aのアミノ酸配列、配列番号28Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号28Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00571]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29Aのアミノ酸配列、配列番号29Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号29Aのアミノ酸配列、配列番号29Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号29Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00572]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
配列番号25Aのアミノ酸配列、配列番号25Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号25Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVHドメイン、および
配列番号30Aのアミノ酸配列、配列番号30Aのアミノ酸配列に対して少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれ以上同一であるアミノ酸配列、または配列番号30Aのアミノ酸配列から1個、2個、5個、10個、もしくは15個以下のアミノ酸残基が異なるアミノ酸配列を含むVLドメイン
を含む。
[00573]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、全長抗体またはその断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、もしくは一本鎖Fv断片(scFv))である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V6(例えば、抗TCRβ V6-5*01)抗体分子は、モノクローナル抗体または単一の特異性を有する抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はまた、ヒト化、キメラ、ラクダ、サメ、またはin vitroで生成された抗体分子であり得る。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子はヒト化抗体分子である。抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の重鎖および軽鎖は、全長であり得(例えば、抗体は、少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全重鎖、および少なくとも1つ、好ましくは2つの、完全軽鎖を含むことができる)、または抗原結合性断片(例えば、Fab、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fv断片、単一ドメイン抗体、ダイアボディ(dAb)、二価抗体、もしくは二特異性抗体もしくはその断片、その単一ドメインバリアント、もしくはラクダ抗体)を含むことができる。
[00574]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば本明細書に記載される、多特異性分子、例えば、二特異性分子の形態である。
[00575]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、およびIgEの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)を有する。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、Fc領域は、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、またはIgG2)の重鎖定常領域から選択される。一部の実施形態では、重鎖定常領域はヒトIgG1である。
[00576]一部の実施形態では、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を有する。一実施形態では、定常領域は、抗TCRβV抗体分子、例えば、抗TCRβ V12抗体分子の特性を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるため)に変更、例えば、突然変異されている。例えば、定常領域は、Fc受容体結合を変更するために296位(MからYへ)、298位(SからTへ)、300位(TからEへ)、477位(HからKへ)および478位(NからFへ)において突然変異されている(例えば、突然変異した位置は、配列番号212Aもしくは214Aの132位(MからYへ)、134位(SからTへ)、136位(TからEへ)、313位(HからKへ)および314位(NからFへ)、または配列番号215A、216A、217Aもしくは218Aの135位(MからYへ)、137位(SからTへ)、139位(TからEへ)、316位(HからKへ)および317位(NからFへ)に対応する)。
[00577]抗体B-H.1は、配列番号3280Aのアミノ酸配列を含む第1の鎖および配列番号3281Aのアミノ酸配列を含む第2の鎖を含む。
[00578]本開示の追加の例示的な抗TCRβ V12抗体が表31において提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V12は、表31において提供されるように、抗体B、例えば、ヒト化された抗体B(抗体B-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表31において提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、ならびに/もしくは表31において提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Bは、表31において提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
[00579]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V5に結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V5サブファミリーは、TCRβ V5-5*01、TCRβ V5-6*01、TCRβ V5-4*01、TCRβ V5-8*01、TCRβ V5-1*01、またはそのバリアントを含む。
[00580]本開示の例示的な抗TCRβ V5抗体が表33において提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V5は、表33において提供されるように、抗体C、例えば、ヒト化された抗体C(抗体C-H)である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表33において提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、ならびに/もしくは表33において提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Cは、表33において提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
[00582]一部の実施形態では、抗体Eは、配列番号3284Aのアミノ酸配列を含む重鎖および/もしくは配列番号3285Aのアミノ酸配列を含む軽鎖、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
[00584]一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表33に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
[00585]一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表11に記載の抗体のVHおよび/もしくはVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
[00586]一部の実施形態では、抗TCRβ V5抗体分子は、表11に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
抗TCRβ V10抗体
[00587]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V10サブファミリーメンバーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V12としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01、またはそのバリアントを含む。
抗TCRβ V10抗体
[00587]よって、一態様では、本開示は、ヒトTCRβ V10サブファミリーメンバーに結合する抗TCRβV抗体分子を提供する。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V12としても公知である。一部の実施形態では、TCRβ V10サブファミリーは、TCRβ V10-1*01、TCRβ V10-1*02、TCRβ V10-3*01もしくはTCRβ V10-2*01、またはそのバリアントを含む。
[00588]本開示の例示的な抗TCRβ V10抗体が表12において提供される。一部の実施形態では、抗TCRβ V10は、表12において提供されるように、抗体D、例えば、ヒト化された抗体D(抗体D-H)である。一部の実施形態では、抗体Dは、表12において提供される1つもしくは複数(例えば、3つ)の軽鎖CDRおよび/もしくは1つもしくは複数(例えば、3つ)の重鎖CDR、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗体Dは、表12において提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
[00590]一部の実施形態では、抗TCRβ V10抗体分子は、表12に記載の抗体のVHおよびVL、またはそれに対して少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%もしくはより高い同一性を有する配列を含む。
追加の抗TCRVβ抗体
[00591]本開示の追加の例示的な抗TCRβV抗体が表13において提供される。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、例えば、表13において提供されるように、ヒト化された抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表13において提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、ならびに/もしくは表13において提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表13において提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
追加の抗TCRVβ抗体
[00591]本開示の追加の例示的な抗TCRβV抗体が表13において提供される。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、例えば、表13において提供されるように、ヒト化された抗体である。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表13において提供されるLC CDR1、LC CDR2、およびLC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、ならびに/もしくは表13において提供されるHC CDR1、HC CDR2、およびHC CDR3のうちの1つもしくは複数(例えば、3つすべて)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、抗TCRβV抗体は、表13において提供される可変重鎖(VH)および/もしくは可変軽鎖(VL)、またはこれらに対して少なくとも95%の同一性を有する配列を含む。
[00592]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、例えば、本明細書に記載されるFc領域を含む。一部の実施形態では、Fc領域は、野生型Fc領域、例えば、野生型ヒトFc領域である。一部の実施形態では、Fc領域は、バリアント、例えば、Fc領域において少なくとも1個のアミノ酸残基の付加、置換または欠失を含むFc領域を含み、これは、例えば、少なくとも1つのFc受容体に対する親和性の低減または除去をもたらす。
[00593]抗体のFc領域は、Fc受容体(例えば、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIIA)、補体タンパク質CIq、およびプロテインAおよびGなどの他の分子を含むいくつかの受容体またはリガンドと相互作用する。これらの相互作用は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞性ファゴサイトーシス(ADCP)および補体依存性細胞傷害(CDC)を含む様々なエフェクター機能および下流シグナル伝達事象にとって必須である。
[00594]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、Fc受容体、例えば、本明細書で記載されたFc受容体に対する親和性を低減した、例えば、除去した。一部の実施形態では、低減した親和性が、野生型Fc領域を有するその他の点では同様の抗体と比較される。
[00595]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、以下の特性のうちの1つまたは複数を有する:(1)エフェクター機能の低減(例えば、ADCC、ADCPおよび/またはCDCの低減);(2)1つまたは複数のFc受容体への結合の低減;および/または(3)C1q補体への結合の低減。一部の実施形態では、特性(1)~(3)のうちの任意の1つまたはすべての低減は、野生型Fc領域を有するその他の点では同様の抗体と比較される。
[00596]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、ヒトFc受容体、例えば、FcγRI、FcγRIIおよび/またはFcγRIIIに対する親和性を低減した。一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、ヒトIgG1領域またはヒトIgG4領域を含む。
[00597]一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、例えば、本明細書に記載されるT細胞を活性化するおよび/または拡大する。一部の実施形態では、バリアントFc領域を含む抗TCRVβ抗体は、本明細書で記載されるサイトカインプロファイル、例えば、TCRβV領域以外の受容体または分子に結合するT細胞エンゲージャー(「非TCRβV結合性T細胞エンゲージャー」)のサイトカインプロファイルとは異なるサイトカインプロファイルを有する。一部の実施形態では、非TCRβV結合性T細胞エンゲージャーは、CD3分子(例えば、CD3イプシロン(CD3e)分子);またはTCRアルファ(TCRα)分子に結合する抗体を含む。
[00598]例示的なFc領域バリアントは、表14で提供され、Saunders O、(2019) Frontiers in Immunology;10巻、論文1296(その内容全体はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
[00599]一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Fc領域バリアント、例えば、表14に開示される突然変異のうちの任意の1つもしくはすべて、または任意の組合せを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Asn297Ala(N297A)突然変異を含む。一部の実施形態では、本明細書に開示される抗TCRVβ抗体は、Leu234Ala/Leu235Ala(LALA)突然変異を含む。
[00600]ナチュラルキラー(NK)細胞は、抗体非依存性の方式で腫瘍およびウイルス感染細胞を認識および破壊する。NK細胞の調節は、NK細胞表面上の受容体を活性化および阻害することによって媒介される。活性化受容体の1つのファミリーは、NKp30、NKp44およびNKp46を含む天然細胞傷害性受容体(NCR)である。NCRは、がん細胞上のヘパラン硫酸の認識によって腫瘍標的化を開始させる。NKG2Dは、活性化キラー(NK)細胞において刺激性および共刺激性の両方の自然免疫応答を提供する受容体であり、細胞傷害活性に繋がる。DNAM1は、細胞間接着、リンパ球シグナル伝達、細胞傷害性ならびに細胞傷害性Tリンパ球(CTL)およびNK細胞によって媒介されるリンホカイン分泌に関与する受容体である。DAP10(HCSTとしても公知)は、リンパ球様および骨髄性細胞においてKLRK1と会合して活性化受容体KLRK1-HCSTを形成する膜貫通アダプタータンパク質であり、この受容体は、MHCクラスI鎖関連MICAおよびMICB、ならびにU(任意選択でL1)6結合性タンパク質(ULBP)などの細胞表面リガンドを発現する標的細胞に対する細胞傷害性の誘発において大きな役割を果たし、KLRK1-HCST受容体は、腫瘍に対する免疫サーベイランスにおいて役割を果たし、腫瘍細胞の細胞溶解のために要求され、実際に、KLRK1リガンドを発現しない黒色腫細胞は、NK細胞によって媒介される免疫サーベイランスを免れる。CD16は、IgGのFc領域に対する受容体であり、複合体化または凝集IgG、そして単量体IgGにも結合し、それによって、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)およびファゴサイトーシスなどの他の抗体依存性応答を媒介する。
[00601]本開示は、特に、NK細胞への結合および/またはNK細胞の活性化を媒介する1または複数のNK細胞エンゲージャーを含むように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。したがって、一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例えば、CD16a、CD16b、または両方)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(SLAMF4または2B4としても公知である)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E、またはCD160に結合する(例えば、活性化する)抗原結合性ドメインまたはリガンドから選択される。
[00602]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する抗原結合性ドメイン(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現するかまたは提示されるNKp30)であり、表7、8、35、36、9、10、または34に開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する抗原結合性ドメイン(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現するかまたは提示されるNKp30)であり、米国特許第6,979,546号、米国特許第9,447,185号、PCT出願公開第2015/121383A1号、PCT出願公開第2016/110468A1号、PCT出願公開第2004/056392A1号、または米国出願公開第20070231322A1号に開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含み、それらの配列は参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャー、例えば、NKp30に結合する抗原結合性ドメインの、NK細胞への結合は、NK細胞を活性化する。NKp30(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現するかまたは提示される、NKp30)に結合する抗原結合性ドメインは、NKp30、NK細胞、またはその両方を標的化すると言うことができる。
[00603]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表7、表34、または表8に開示される1つまたは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表7、表34、または表8に開示される1つまたは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00604]一部の実施形態ではNKP30に結合する抗原結合性ドメインは、表35および/もしくは表36に開示される1つもしくは複数のCDR(例えば、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、および/またはVLCDR3)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、NKP30に結合する抗原結合性ドメインは、表35および/もしくは表36に開示される1つもしくは複数のフレームワーク領域(例えば、VHFWR1、VHFWR2、VHFWR3、VHFWR4、VLFWR1、VLFWR2、VLFWR3、および/またはVLFWR4)、またはそれに対して少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00605]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表9に開示されるVHおよび/もしくはVL、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。一部の実施形態では、表9に開示されるVHドメインのいずれかは、表9に開示されるVLドメインのいずれかと対を形成して、NKp30に結合する抗原結合性ドメインを形成することができる。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、表10に開示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列を含む。
[00606]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2、およびVHCDR3を含むVH、ならびに軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)、VLCDR2、およびVLCDR3を含むVLを含む。
[00607]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、および7315のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、および6002のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6008、および6009のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7385、および7315のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、およびVHCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7318、および6009のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00608]一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7326、7327、および7329のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号6063、6064、および7293のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号6070、6071、および6072のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号6070、6064、および7321のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。
[00609]一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、7315、7326、7327、および7329のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6001、6002、6063、6064、および7293のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、6008、6009、6070、6071、および6072のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7385、7315、6070、6064、および7321のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、およびVLCDR3は、それぞれ、配列番号7313、7318、6009、6070、6064、および7321のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。
[00610]一部の実施形態では、VHは、配列番号7298もしくは7300~7304からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含み、および/またはVLは、配列番号7299もしくは7305~7309からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7302および7305のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7302および7309のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00611]一部の実施形態では、VHは、配列番号6121または6123~6128からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含み、および/またはVLは、配列番号7294または6137~6141からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHは、配列番号6122または6129~6134からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含み、および/またはVLは、配列番号6136または6142~6147からなる群から選択されるアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7295および7296のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号7297および7296のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、VHおよびVLは、それぞれ、配列番号6122および6136のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。
[00612]一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号7310のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号7311のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%の同一性を有する配列)を含む。一部の実施形態では、NKp30に結合する抗原結合性ドメインは、配列番号6187、6188、6189または6190のアミノ酸配列(またはそれと少なくとも85%、90%、95%、もしくは99%同一性を有する配列)を含む。
[00613]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6000のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00614]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6063のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00615]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVH、ならびに配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6000のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6063のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00616]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6007のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00617]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば置換、付加、または欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6070のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00618]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)を含むVH、ならびに配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列(または1、2、3、もしくは4個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30抗原結合性ドメインは、配列番号6007のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6070のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00619]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00620]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00621]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00622]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00623]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6066のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00624]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6003のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6066のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00625]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00626]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00627]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00628]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00629]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6073のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列(または、1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00630]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6010のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしく11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6073のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6076のVLFWR4のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00631]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6014の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6015のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6016のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6017のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00632]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6014のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6015のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6016のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6017のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00633]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6077の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6078のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6079のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6080のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00634]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6077のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6078のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6079のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6080のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00635]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6018の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6019のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6020のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6021のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00636]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6018のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6019のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6020のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6021のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00637]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6081の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6082のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6083のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6084のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00638]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6081のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6082のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6083のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6084のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00639]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6022の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6023のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6024のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6025のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00640]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6022のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6023のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6024のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6025のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00641]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6085の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6086のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6087のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6088のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00642]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6085のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6086のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6087のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6088のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00643]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6026の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6027のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6028のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6029のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00644]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6026のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6027のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6028のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6029のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00645]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6089の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6090のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6091のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6092のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00646]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6089のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6090のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6091のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6092のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00647]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6030の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6032のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6033のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6034のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00648]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6030のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6032のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6033のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6034のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00649]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6093の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6094のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6095のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6096のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00650]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6093のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6094のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6095のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6096のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00651]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6035の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6036のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6037のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6038のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00652]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6035のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6036のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6037のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6038のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00653]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6039の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6040のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6041のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6042のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00654]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6039のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6040のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6041のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6042のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00655]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6097の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6098のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6099のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6100のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00656]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6097のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6098のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6099のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6100のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00657]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6043の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6044のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6045のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6046のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00658]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6043のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6044のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6045のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6046のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00659]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6101の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6102のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6103のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6104のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00660]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6101のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6102のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6103のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6104のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00661]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6047の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6048のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6049のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6050のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00662]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6047のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6048のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6049のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6050のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00663]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6105の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6106のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6107のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6108のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00664]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6105のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6106のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6107のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6108のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00665]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6051の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6052のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6053のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6054のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00666]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6051のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6052のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6053のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6054のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00667]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6109の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6110のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6111のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6112のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00668]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6109のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6110のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6111のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6112のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00669]
[00670]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6055の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00670]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6055の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00671]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6055のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00672]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6113の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6114のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6115のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6116のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00673]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6113のVLFWR1アミノ酸配列(または1、2、もしくは3個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6114のVLFWR2アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6115のVLFWR3アミノ酸配列(または1個以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6116のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00674]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6059の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6060のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6061のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6062のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00675]一部の実施形態では、NKp30を標的とする抗原結合性ドメインは、配列番号6059のVHFWR1アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6060のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1、2、3、4、5、もしくは6個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、配列番号6061のVHFWR3アミノ酸配列(または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくは11個以下の突然変異、例えば、置換、付加、または欠失を有する配列)、および/または配列番号6062のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。
[00676]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6117の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6118のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6119のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6120のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00677]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6117のVLFWR1アミノ酸配列(もしくは1つ、2つ、もしくは3つだけの突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6118のVLFWR2アミノ酸配列(もしくは1つだけの突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6119のVLFWR3アミノ酸配列(もしくは1つだけの突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6120のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00678]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6148のアミノ酸配列(または配列番号6148に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6149のアミノ酸配列(または配列番号6149に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6150のアミノ酸配列(または配列番号6150に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6148のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6149のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6150のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00679]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6148のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6150のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6149のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6150のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00680]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列(または配列番号6151に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列(または配列番号6152に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6153のアミノ酸配列(または配列番号6153に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00681]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6151のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインは、配列番号6152のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6153のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00682]一部の実施形態では、NKp30を標的化する抗原結合性ドメインはscFvを含む。一部の実施形態では、scFvは、配列番号:6187~6190から選択されるアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
[00684]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKG2D(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるNKG2D)に結合する抗原結合性ドメインであり、表15において開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞へのNK細胞エンゲージャー、例えば、NKG2Dに結合する抗原結合性ドメインの結合はNK細胞を活性化させる。NKG2D(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるNKG2D)に結合する抗原結合性ドメインは、NKG2D、NK細胞、または両方を標的化すると言及され得る。
[00685]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるCD16)に結合する抗原結合性ドメインであり、表15において開示される任意のCDRアミノ酸配列、フレームワーク領域(FWR)アミノ酸配列、または可変領域アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞へのNK細胞エンゲージャー、例えば、CD16に結合する抗原結合性ドメインの結合はNK細胞を活性化させる。CD16(例えば、NK細胞の表面上に存在する、例えば、発現または提示されるCD16)に結合する抗原結合性ドメインは、CD16、NK細胞、または両方を標的化すると言及され得る。
[00687]DLKVEMMAGGTQITPLNDNVTIFCNIFYSQPLNITSMGITWFWKSLTFDKEVKVFEFFGDHQEAFRPGAIVSPWRLKSGDASLRLPGIQLEEAGEYRCEVVVTPLKAQGTVQLEVVASPASRLLLDQVGMKENEDKYMCESSGFYPEAINITWEKQTQKFPHPIEISEDVITGPTIKNMDGTFNVTSCLKLNSSQEDPGTVYQCVVRHASLHTPLRSNFTLTAARHSLSETEKTDNFS(配列番号6198)のアミノ酸配列、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6198のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00688]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、ウイルスHAである、NKp44またはNKp46のリガンドである。ウイルスヘマグルチニン(HA)は、ウイルスの表面上にある糖タンパク質である。HAタンパク質は、シアル酸糖部分を介してウイルスが細胞の膜に結合することを可能とし、これは細胞膜とのウイルス膜の融合に寄与する(例えば、Eur J Immunol. 2001 Sep;31(9):2680~9ページ、「Recognition of viral hemagglutinins by NKp44 but not by NKp30」;およびNature 2001 Feb 22;409(6823):1055~60ページ、「Recognition of haemagglutinins on virus-infected cells by NKp46 activates lysis by human NK cells」(これらのそれぞれの内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00689]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、MICA、MICB、またはULBP1から選択されるNKG2Dのリガンドであり、例えば、
(i)MICAは、
EPHSLRYNLTVLSWDGSVQSGFLTEVHLDGQPFLRCDRQKCRAKPQGQWAEDVLGNKTWDRETRDLTGNGKDLRMTLAHIKDQKEGLHSLQEIRVCEIHEDNSTRSSQHFYYDGELFLSQNLETKEWTMPQSSRAQTLAMNVRNFLKEDAMKTKTHYHAMHADCLQELRRYLKSGVVLRRTVPPMVNVTRSEASEGNITVTCRASGFYPWNITLSWRQDGVSLSHDTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRICQGEEQRFTCYMEHSGNHSTHPVPSGKVLVLQSHW(配列番号6199)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6199のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列
を含み、
(ii)MICBは、
AEPHSLRYNLMVLSQDESVQSGFLAEGHLDGQPFLRYDRQKRRAKPQGQWAEDVLGAKTWDTETEDLTENGQDLRRTLTHIKDQKGGLHSLQEIRVCEIHEDSSTRGSRHFYYDGELFLSQNLETQESTVPQSSRAQTLAMNVTNFWKEDAMKTKTHYRAMQADCLQKLQRYLKSGVAIRRTVPPMVNVTCSEVSEGNITVTCRASSFYPRNITLTWRQDGVSLSHNTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRIRQGEEQRFTCYMEHSGNHGTHPVPSGKVLVLQSQRTD(配列番号6200)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6200のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列
を含み、または
(iii)ULBP1は、
GWVDTHCLCYDFIITPKSRPEPQWCEVQGLVDERPFLHYDCVNHKAKAFASLGKKVNVTKTWEEQTETLRDVVDFLKGQLLDIQVENLIPIEPLTLQARMSCEHEAHGHGRGSWQFLFNGQKFLLFDSNNRKWTALHPGAKKMTEKWEKNRDVTMFFQKISLGDCKMWLEEFLMYWEQMLDPTKPPSLAPG(配列番号6201)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6201のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列
を含む。
(i)MICAは、
EPHSLRYNLTVLSWDGSVQSGFLTEVHLDGQPFLRCDRQKCRAKPQGQWAEDVLGNKTWDRETRDLTGNGKDLRMTLAHIKDQKEGLHSLQEIRVCEIHEDNSTRSSQHFYYDGELFLSQNLETKEWTMPQSSRAQTLAMNVRNFLKEDAMKTKTHYHAMHADCLQELRRYLKSGVVLRRTVPPMVNVTRSEASEGNITVTCRASGFYPWNITLSWRQDGVSLSHDTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRICQGEEQRFTCYMEHSGNHSTHPVPSGKVLVLQSHW(配列番号6199)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6199のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列
を含み、
(ii)MICBは、
AEPHSLRYNLMVLSQDESVQSGFLAEGHLDGQPFLRYDRQKRRAKPQGQWAEDVLGAKTWDTETEDLTENGQDLRRTLTHIKDQKGGLHSLQEIRVCEIHEDSSTRGSRHFYYDGELFLSQNLETQESTVPQSSRAQTLAMNVTNFWKEDAMKTKTHYRAMQADCLQKLQRYLKSGVAIRRTVPPMVNVTCSEVSEGNITVTCRASSFYPRNITLTWRQDGVSLSHNTQQWGDVLPDGNGTYQTWVATRIRQGEEQRFTCYMEHSGNHGTHPVPSGKVLVLQSQRTD(配列番号6200)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6200のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列
を含み、または
(iii)ULBP1は、
GWVDTHCLCYDFIITPKSRPEPQWCEVQGLVDERPFLHYDCVNHKAKAFASLGKKVNVTKTWEEQTETLRDVVDFLKGQLLDIQVENLIPIEPLTLQARMSCEHEAHGHGRGSWQFLFNGQKFLLFDSNNRKWTALHPGAKKMTEKWEKNRDVTMFFQKISLGDCKMWLEEFLMYWEQMLDPTKPPSLAPG(配列番号6201)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6201のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列
を含む。
[00690]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECTIN2またはNECL5から選択されるDNAM1のリガンドであり、例えば、
(i)NECTIN2は、
QDVRVQVLPEVRGQLGGTVELPCHLLPPVPGLYISLVTWQRPDAPANHQNVAAFHPKMGPSFPSPKPGSERLSFVSAKQSTGQDTEAELQDATLALHGLTVEDEGNYTCEFATFPKGSVRGMTWLRVIAKPKNQAEAQKVTFSQDPTTVALCISKEGRPPARISWLSSLDWEAKETQVSGTLAGTVTVTSRFTLVPSGRADGVTVTCKVEHESFEEPALIPVTLSVRYPPEVSISGYDDNWYLGRTDATLSCDVRSNPEPTGYDWSTTSGTFPTSAVAQGSQLVIHAVDSLFNTTFVCTVTNAVGMGRAEQVIFVRETPNTAGAGATGG(配列番号6202)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6202のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(ii)NECL5は、
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号6203)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6203のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
(i)NECTIN2は、
QDVRVQVLPEVRGQLGGTVELPCHLLPPVPGLYISLVTWQRPDAPANHQNVAAFHPKMGPSFPSPKPGSERLSFVSAKQSTGQDTEAELQDATLALHGLTVEDEGNYTCEFATFPKGSVRGMTWLRVIAKPKNQAEAQKVTFSQDPTTVALCISKEGRPPARISWLSSLDWEAKETQVSGTLAGTVTVTSRFTLVPSGRADGVTVTCKVEHESFEEPALIPVTLSVRYPPEVSISGYDDNWYLGRTDATLSCDVRSNPEPTGYDWSTTSGTFPTSAVAQGSQLVIHAVDSLFNTTFVCTVTNAVGMGRAEQVIFVRETPNTAGAGATGG(配列番号6202)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6202のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含み、または
(ii)NECL5は、
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号6203)のアミノ酸配列、その断片、もしくはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6203のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00691]さらに他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKG2Dのアダプターである、DAP10のリガンドである(例えば、Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 May 24;102(21):7641~7646ページ;およびBlood、15 September 2011 Volume 118、Number 11(これらのそれぞれの全内容はこれにより参照により本明細書に組み込まれる)を参照)。
[00692]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16a/bリガンドである、CD16のリガンド、例えば、抗体Fc領域をさらに含むCD16a/bリガンドである(例えば、Front Immunol. 2013;4:76を参照;これは、CD16を通じてNK細胞を誘発するために抗体がFcをどのように使用するのかを議論しており、その内容の全体は本明細書に組み込まれる)。
[00693]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECL2である、CRTAMのリガンドであり、例えば、NECL2は、アミノ酸配列:
QNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTTILTIITDSRAGEEGSIRAVDH(配列番号6204)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6204のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QNLFTKDVTVIEGEVATISCQVNKSDDSVIQLLNPNRQTIYFRDFRPLKDSRFQLLNFSSSELKVSLTNVSISDEGRYFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPRNLMIDIQKDTAVEGEEIEVNCTAMASKPATTIRWFKGNTELKGKSEVEEWSDMYTVTSQLMLKVHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQRYLEVQYKPQVHIQMTYPLQGLTREGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVRVDDEMPQHAVLSGPNLFINNLNKTDNGTYRCEASNIVGKAHSDYMLYVYDPPTTIPPPTTTTTTTTTTTTTILTIITDSRAGEEGSIRAVDH(配列番号6204)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6204のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00694]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD70である、CD27のリガンドであり、例えば、CD70は、アミノ酸配列:
QRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP(配列番号6205)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6205のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QRFAQAQQQLPLESLGWDVAELQLNHTGPQQDPRLYWQGGPALGRSFLHGPELDKGQLRIHRDGIYMVHIQVTLAICSSTTASRHHPTTLAVGICSPASRSISLLRLSFHQGCTIASQRLTPLARGDTLCTNLTGTLLPSRNTDETFFGVQWVRP(配列番号6205)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6205のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00695]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、L-セレクチン(CD62L)である、PSGL1のリガンドであり、例えば、L-セレクチンは、アミノ酸配列:
WTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYN(配列番号6206)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6206のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
WTYHYSEKPMNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSLTEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSGHGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSCSEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTFICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYN(配列番号6206)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6206のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00696]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NECL5である、CD96のリガンドであり、例えば、NECL5は、アミノ酸配列:
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号6203)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6203もしくは6204のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
WPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRN(配列番号6203)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6203もしくは6204のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00697]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD72である、CD100(SEMA4D)のリガンドであり、例えば、CD72は、アミノ酸配列:
RYLQVSQQLQQTNRVLEVTNSSLRQQLRLKITQLGQSAEDLQGSRRELAQSQEALQVEQRAHQAAEGQLQACQADRQKTKETLQSEEQQRRALEQKLSNMENRLKPFFTCGSADTCCPSGWIMHQKSCFYISLTSKNWQESQKQCETLSSKLATFSEIYPQSHSYYFLNSLLPNGGSGNSYWTGLSSNKDWKLTDDTQRTRTYAQSSKCNKVHKTWSWWTLESESCRSSLPYICEMTAFRFPD(配列番号6207)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6207のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
RYLQVSQQLQQTNRVLEVTNSSLRQQLRLKITQLGQSAEDLQGSRRELAQSQEALQVEQRAHQAAEGQLQACQADRQKTKETLQSEEQQRRALEQKLSNMENRLKPFFTCGSADTCCPSGWIMHQKSCFYISLTSKNWQESQKQCETLSSKLATFSEIYPQSHSYYFLNSLLPNGGSGNSYWTGLSSNKDWKLTDDTQRTRTYAQSSKCNKVHKTWSWWTLESESCRSSLPYICEMTAFRFPD(配列番号6207)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6207のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00698]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CLEC2B(AICL)である、NKp80のリガンドであり、例えば、CLEC2B(AICL)は、アミノ酸配列:
KLTRDSQSLCPYDWIGFQNKCYYFSKEEGDWNSSKYNCSTQHADLTIIDNIEEMNFLRRYKCSSDHWIGLKMAKNRTGQWVDGATFTKSFGMRGSEGCAYLSDDGAATARCYTERKWICRKRIH(配列番号6208)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6208のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
KLTRDSQSLCPYDWIGFQNKCYYFSKEEGDWNSSKYNCSTQHADLTIIDNIEEMNFLRRYKCSSDHWIGLKMAKNRTGQWVDGATFTKSFGMRGSEGCAYLSDDGAATARCYTERKWICRKRIH(配列番号6208)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6208のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00699]他の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD48である、CD244のリガンドであり、例えば、CD48は、アミノ酸配列:
QGHLVHMTVVSGSNVTLNISESLPENYKQLTWFYTFDQKIVEWDSRKSKYFESKFKGRVRLDPQSGALYISKVQKEDNSTYIMRVLKKTGNEQEWKIKLQVLDPVPKPVIKIEKIEDMDDNCYLKLSCVIPGESVNYTWYGDKRPFPKELQNSVLETTLMPHNYSRCYTCQVSNSVSSKNGTVCLSPPCTLARS(配列番号6209)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6209のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
QGHLVHMTVVSGSNVTLNISESLPENYKQLTWFYTFDQKIVEWDSRKSKYFESKFKGRVRLDPQSGALYISKVQKEDNSTYIMRVLKKTGNEQEWKIKLQVLDPVPKPVIKIEKIEDMDDNCYLKLSCVIPGESVNYTWYGDKRPFPKELQNSVLETTLMPHNYSRCYTCQVSNSVSSKNGTVCLSPPCTLARS(配列番号6209)、その断片、またはそれに対して実質的に同一の(例えば、それに対して95%~99.9%同一、もしくは配列番号6209のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00700]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーはウイルスヘマグルチニン(HA)であり、HAは、インフルエンザウイルスの表面上に見出される糖タンパク質である。それは、上気道中の細胞または赤血球などの膜上にシアル酸を有する細胞へのウイルスの結合の原因となる。HAは、少なくとも18の異なる抗原を有する。これらのサブタイプは、H1~H18と命名されている。NCRはウイルスタンパク質を認識することができる。NKp46は、インフルエンザのHAならびにセンダイウイルスおよびニューカッスル病ウイルスを含むパラミクソウイルスのHA-NAと相互作用できることが示されている。NKp46の他に、NKp44もまた、異なるインフルエンザサブタイプのHAと機能的に相互作用することができる。
[00701]本明細書で記載される多機能性分子のいずれかの一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、NK細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞への結合およびその活性化を媒介するNK細胞エンゲージャーまたはNK細胞への結合を媒介するが、その活性化を媒介しないNK細胞エンゲージャーである。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例えば、CD16a、CD16b、または両方)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(SLAMF4もしくは2B4としても公知)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E、またはCD160に結合する(例えば、それを活性化させる)、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択され、例えば、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである。ある特定の一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。
[00702]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NK細胞をエンゲージできる。
[00703]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30、NKp46、NKG2D、またはCD16に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。
[00704]一部の実施形態では、多機能性分子は、
(i)NKp30、NKp46、NKG2D、もしくはCD16のエピトープ、例えば、本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16抗体分子によって認識されるエピトープと同一もしくは同様のエピトープに特異的に結合する、
(ii)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくはCD16抗体分子と同一もしくは同様の結合親和性もしくは特異性、もしくは両方を示す、
(iii)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16抗体分子の結合を阻害する、例えば、競合的に阻害する、
(iv)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16抗体分子と同一もしくは重複するエピトープに結合する、または
(v)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16分子と結合について競合する、および/または本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16分子と同一エピトープに結合する。
(i)NKp30、NKp46、NKG2D、もしくはCD16のエピトープ、例えば、本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16抗体分子によって認識されるエピトープと同一もしくは同様のエピトープに特異的に結合する、
(ii)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくはCD16抗体分子と同一もしくは同様の結合親和性もしくは特異性、もしくは両方を示す、
(iii)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16抗体分子の結合を阻害する、例えば、競合的に阻害する、
(iv)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16抗体分子と同一もしくは重複するエピトープに結合する、または
(v)本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16分子と結合について競合する、および/または本明細書で記載される抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、もしくは抗CD16分子と同一エピトープに結合する。
[00705]一部の実施形態では、抗NKp30、抗NKp46、抗NKG2D、または抗CD16抗体分子は、表7、8、35、36、9、10、15、または34から選択される1つまたは複数のCDR、フレームワーク領域、可変ドメイン、重鎖または軽鎖、または抗原結合性ドメイン、またはそれと実質的に同一の配列を含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、リンパ腫細胞またはリンパ球の溶解は、NKp30によって媒介される。一部の実施形態では、多機能性分子は、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原またはリンパ球上のTRBC1もしくはTRBC2の不在下でNK細胞とともにインキュベートされた場合にNK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、NKp30発現性NK細胞であり、(1)リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在するか、または(2)リンパ球上のTRBC1もしくはTRBC2も存在する場合に、NK細胞を活性化する。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞がNKp30発現性NK細胞ではなく、(1)リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在するか、または(2)リンパ球上のTRBC1もしくはTRBC2も存在する場合には、NK細胞を活性化しない。
[00706]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[00707]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[00708]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、および/または
(2)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、および/または
(2)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[00709]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[00710]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6121のアミノ酸配列(または配列番号6121に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)配列番号7294のアミノ酸配列(または配列番号7294に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号6121のアミノ酸配列(または配列番号6121に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)配列番号7294のアミノ酸配列(または配列番号7294に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[00711]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6148もしくは6149のアミノ酸配列(または配列番号6148もしくは6149に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。
[00712]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6150のアミノ酸配列(または配列番号6150に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[00713]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6148もしくは6149のアミノ酸配列(または配列番号6148もしくは6149に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および配列番号6150のアミノ酸配列(または配列番号6150に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[00714]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6014の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6015のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6016のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6017のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00715]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6014の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6015のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6016のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6017のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00716]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6123のアミノ酸配列(または配列番号6123に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00717]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6018の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6019のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6020のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6021のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00718]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6018の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6019のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6020のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6021のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00719]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6124のアミノ酸配列(または配列番号6124に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00720]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6022の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6023のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6024のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6025のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6022の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6023のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6024のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6025のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6125のアミノ酸配列(または配列番号6125に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00721]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6026の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6027のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6028のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6029のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6026の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6027のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6028のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6029のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6126のアミノ酸配列(または配列番号6126に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00722]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6030の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6032のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6033のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6034のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6030の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6032のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6033のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6034のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6127のアミノ酸配列(または配列番号6127に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00723]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6035の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6036のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6037のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6038のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00724]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6035の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6036のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6037のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6038のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6128のアミノ酸配列(または配列番号6128に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00725]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6077の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6078のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6079のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6080のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6077の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6078のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6079のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6080のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6137のアミノ酸配列(または配列番号6137に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00726]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6081の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6082のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6083のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6084のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[00727]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6081の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6082のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6083のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6084のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6138のアミノ酸配列(または配列番号6138に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00728]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6085の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6086のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6087のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6088のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6085の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6086のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6087のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6088のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6139のアミノ酸配列(または配列番号6139に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00729]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6089の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6090のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6091のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6092のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6089の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6090のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6091のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6092のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6140のアミノ酸配列(または配列番号6140に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00730]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6093の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6094のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6095のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)または配列番号6096のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6093の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6094のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6095のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6096のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6141のアミノ酸配列(または配列番号6141に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00731]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)と、
(ii)配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)と
を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)と、
(ii)配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)と
を含む。
(i)配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)と、
(ii)配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つもしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)と
を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6007の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6008のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6009のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)と、
(ii)配列番号6070の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6071のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6072のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)と
を含む。
[00732]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(1)配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、および/または
(2)配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(1)配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)と、
(3)配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)と
を含む。
(1)配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、および/または
(2)配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、もしくは配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(1)配列番号6010の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6011のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6012のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6013のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)と、
(3)配列番号6073の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6074のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6075のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6076のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)と
を含む。
[00733]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、
(i)配列番号6122のアミノ酸配列(または配列番号6122に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)配列番号6136のアミノ酸配列(または配列番号6136に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号6122のアミノ酸配列(または配列番号6122に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)配列番号6136のアミノ酸配列(または配列番号6136に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[00734]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6151もしくは6152のアミノ酸配列(または配列番号6151もしくは6152に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。
[00735]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6153のアミノ酸配列(または配列番号6153に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[00736]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6151もしくは6152のアミノ酸配列(または配列番号6151もしくは6152に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖と、配列番号6153のアミノ酸配列(または配列番号6153に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖とを含む。
[00737]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6039の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6040のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6041のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6042のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00738]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6039の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6040のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6041のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6042のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6129のアミノ酸配列(または配列番号6129に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00739]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6043の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6044のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6045のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6046のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00740]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6043の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6044のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6045のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6046のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。
[00741]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6130のアミノ酸配列(または配列番号6130に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00742]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6047の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6048のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6049のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6050のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6047の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6048のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6049のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6050のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6131のアミノ酸配列(または配列番号6131に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00743]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6051の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6052のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6053のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6054のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6051の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6052のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6053のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6054のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6132のアミノ酸配列(または配列番号6132に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00744]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6055の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6055の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6056のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6057のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6058のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6133のアミノ酸配列(または配列番号6133に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00745]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6059の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6060のVHFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6061のVHFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6062のVHFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6059の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6060のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6061のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6062のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6134のアミノ酸配列(または配列番号6134に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。
[00746]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6097の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6098のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6099のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6100のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6097の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6098のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6099のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6100のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6142のアミノ酸配列(または配列番号6142に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00747]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6101の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6102のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6103のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6104のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6101の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6102のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6103のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6104のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6143のアミノ酸配列(または配列番号6143に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00748]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6105の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6106のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6107のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6108のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6105の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6106のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6107のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6108のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6144のアミノ酸配列(または配列番号6144に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00749]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6109の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6110のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6111のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6112のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6109の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6110のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6111のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6112のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6145のアミノ酸配列(または配列番号6145に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00750]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6113の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6114のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6115のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6116のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6113の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6114のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6115のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6116のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6146のアミノ酸配列(または配列番号6146に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00751]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6117の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6118のVLFWR2アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、配列番号6119のVLFWR3アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)、または配列番号6120のVLFWR4アミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6117の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6118のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6119のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6120のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6147のアミノ酸配列(または配列番号6147に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[00752]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp46に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。ある特定の実施形態では、リンパ腫細胞の溶解は、NKp46によって媒介される。一部の実施形態では、多機能性分子は、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原の不在下でNK細胞とともにインキュベートされる場合に、NK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、NKp46発現性NK細胞であり、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在する場合に、NK細胞を活性化する。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、NKp46発現性NK細胞ではなく、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在する場合には、NK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6182のアミノ酸配列(または配列番号6182に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6183のアミノ酸配列(または配列番号6183に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6181のアミノ酸配列(または配列番号6181に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFvを含む。
[00753]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKG2Dに結合する、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。ある特定の実施形態では、リンパ腫細胞の溶解は、NKG2Dによって媒介される。一部の実施形態では、多機能性分子は、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原の不在下でNK細胞とともにインキュベートされた場合に、NK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、NKG2D発現性NK細胞であり、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在する場合に、NK細胞を活性化する。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、NKG2D発現性NK細胞ではなく、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在する場合には、NK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6176のアミノ酸配列(または配列番号6176に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6177のアミノ酸配列(または配列番号6177に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6175のアミノ酸配列(または配列番号6175に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFvを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6179のアミノ酸配列(または配列番号6179に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6180のアミノ酸配列(または配列番号6180に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6178のアミノ酸配列(または配列番号6178に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFvを含む。
[00754]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16に結合する、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、リンパ腫細胞の溶解は、CD16によって媒介される。一部の実施形態では、多機能性分子は、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原の不在下でNK細胞とともにインキュベートされる場合に、NK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、CD16発現性NK細胞であり、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在する場合に、NK細胞を活性化する。一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞が、CD16発現性NK細胞ではなく、リンパ腫細胞上の腫瘍抗原も存在する場合には、NK細胞を活性化しない。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6185のアミノ酸配列(または配列番号6185に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6186のアミノ酸配列(または配列番号6186に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、配列番号6184のアミノ酸配列(または配列番号6184に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むscFvを含む。
[00755]一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、リガンドであり、任意選択で、リガンドは免疫グロブリン定常領域、例えば、Fc領域をさらに含む。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp44またはNKp46のリガンド、例えば、ウイルスHAである。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、DAP10のリガンド、例えば、NKG2Dの共受容体である。ある特定の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16のリガンド、例えば、CD16a/bリガンド、例えば、抗体Fc領域をさらに含むCD16a/bリガンドである。
B細胞、マクロファージおよび樹状細胞エンゲージャー
[00756]概括的に言えば、Bリンパ球としても公知のB細胞は、リンパ球サブタイプの白血球の一種である。それらは、抗体を分泌することによって適応免疫系の液性免疫成分において機能する。追加的に、B細胞は、抗原を提示し(それらはまた、プロフェッショナル抗原提示細胞(APC)として分類される)、サイトカインを分泌する。マクロファージは、ファゴサイトーシスを介して細胞残屑、外来物質、微小生物、がん細胞を貪食および消化する白血球の一種である。ファゴサイトーシスの他に、それらは非特異的な防御(自然免疫)において重要な役割を果たし、そしてまた、リンパ球などの他の免疫細胞を動員することによって特異的な防御機構(適応免疫)の開始を助ける。例えば、それらは、T細胞への抗原提示主体として重要である。炎症の増加および免疫系の刺激の他に、マクロファージはまた、重要な抗炎症性の役割を果たし、サイトカインの放出を通じて免疫反応を減少させることができる。樹状細胞(DC)は、抗原材料のプロセシングにおいて機能し、それを細胞表面上で免疫系のT細胞に対して提示する抗原提示細胞である。
B細胞、マクロファージおよび樹状細胞エンゲージャー
[00756]概括的に言えば、Bリンパ球としても公知のB細胞は、リンパ球サブタイプの白血球の一種である。それらは、抗体を分泌することによって適応免疫系の液性免疫成分において機能する。追加的に、B細胞は、抗原を提示し(それらはまた、プロフェッショナル抗原提示細胞(APC)として分類される)、サイトカインを分泌する。マクロファージは、ファゴサイトーシスを介して細胞残屑、外来物質、微小生物、がん細胞を貪食および消化する白血球の一種である。ファゴサイトーシスの他に、それらは非特異的な防御(自然免疫)において重要な役割を果たし、そしてまた、リンパ球などの他の免疫細胞を動員することによって特異的な防御機構(適応免疫)の開始を助ける。例えば、それらは、T細胞への抗原提示主体として重要である。炎症の増加および免疫系の刺激の他に、マクロファージはまた、重要な抗炎症性の役割を果たし、サイトカインの放出を通じて免疫反応を減少させることができる。樹状細胞(DC)は、抗原材料のプロセシングにおいて機能し、それを細胞表面上で免疫系のT細胞に対して提示する抗原提示細胞である。
[00757]本開示は、とりわけ、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞への結合および/またはその活性化を媒介する1つまたは複数のB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む、例えば、含有するように操作されている、多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。
[00758]よって、一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体のアゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの、例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)、もしくはTLR9アゴニスト);41BB;CD2;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択されるB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む。
[00759]一部の実施形態では、B細胞エンゲージャーは、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子である。
[00760]一部の実施形態では、マクロファージエンゲージャーはCD2アゴニストである。一部の実施形態では、マクロファージエンゲージャーは、CD40LもしくはCD40に結合する抗原結合性ドメインもしくはリガンド、Toll様受容体(TLR)アゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの)、例えば、TLR9もしくはTLR4(例えば、caTLR4(構成的活性型TLR4)、CD47、またはSTINGアゴニストに結合する抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)またはサイクリックジAMP(cdAMP)である。一部の実施形態では、STINGアゴニストはビオチン化されている。
[00761]一部の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーはCD2アゴニストである。一部の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーは、OX40L、41BB、TLRアゴニスト(例えば、本明細書に記載されるもの)(例えば、TLR9アゴニスト、TLR4(例えば、caTLR4(構成的活性型TLR4))、CD47、またはおよびSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数に結合するリガンド、受容体アゴニスト、または抗体分子である。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)またはサイクリックジAMP(cdAMP)である。一部の実施形態では、STINGアゴニストはビオチン化されている。
[00762]他の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞のうちの1つまたは複数への結合、またはその活性化を媒介する。例示的なB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体アゴニスト(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)もしくはTLR9アゴニスト);41BBアゴニスト;CD2;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択することができる。
[00763]一部の実施形態では、B細胞エンゲージャーは、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子のうちの1つまたは複数から選択される。
[00764]他の実施形態では、マクロファージ細胞エンゲージャーは、CD2アゴニスト;CD40L;OX40L;OX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4));CD47アゴニスト;またはSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数から選択される。
[00765]他の実施形態では、樹状細胞エンゲージャーは、CD2アゴニスト、OX40抗体、OX40L、41BBアゴニスト、Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4))、CD47アゴニスト、またはSTINGアゴニストのうちの1つまたは複数から選択される。
[00766]一実施形態では、OX40Lは、アミノ酸配列:
[00767]QVSHRYPRIQSIKVQFTEYKKEKGFILTSQKEDEIMKVQNNSVIINCDGFYLISLKGYFSQEVNISLHYQKDEEPLFQLKKVRSVNSLMVASLTYKDKVYLNVTTDNTSLDDFHVNGGELILIHQNPGEFCVL(配列番号6210)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6210のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00767]QVSHRYPRIQSIKVQFTEYKKEKGFILTSQKEDEIMKVQNNSVIINCDGFYLISLKGYFSQEVNISLHYQKDEEPLFQLKKVRSVNSLMVASLTYKDKVYLNVTTDNTSLDDFHVNGGELILIHQNPGEFCVL(配列番号6210)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6210のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00768]別の実施形態では、CD40Lは、アミノ酸配列:
[00769]MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL(配列番号6211)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6211のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00769]MQKGDQNPQIAAHVISEASSKTTSVLQWAEKGYYTMSNNLVTLENGKQLTVKRQGLYYIYAQVTFCSNREASSQAPFIASLCLKSPGRFERILLRAANTHSSAKPCGQQSIHLGGVFELQPGASVFVNVTDPSQVSHGTGFTSFGLLKL(配列番号6211)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6211のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00770]さらに他の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)、サイクリックジAMP(cdAMP)、またはこれらの組合せを含み、任意選択で2’,5’または3’,5’リン酸連結を有する。
[00771]一実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、41BBリガンド、例えば、アミノ酸配列:
[00772]ACPWAVSGARASPGSAASPRLREGPELSPDDPAGLLDLRQGMFAQLVAQNVLLIDGPLSWYSDPGLAGVSLTGGLSYKEDTKELVVAKAGVYYVFFQLELRRVVAGEGSGSVSLALHLQPLRSAAGAAALALTVDLPPASSEARNSAFGFQGRLLHLSAGQRLGVHLHTEARARHAWQLTQGATVLGLFRVTPEIPAGLPSPRSE(配列番号6212)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6212のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む41BBリガンドを含む。
Toll様受容体
[00773]Toll様受容体(TLR)は、ショウジョウバエTollタンパク質のホモログである進化的に保存された受容体であり、微生物病原体によって排他的に発現される病原体関連微生物パターン(PAMP)、または壊死したもしくは死にゆく細胞から放出される内因性分子である危険関連分子パターン(DAMP)として公知の高度に保存された構造モチーフを認識する。PAMPは、リポ多糖(LPS)、ペプチドグリカン(PGN)およびリポペプチドなどの様々な細菌細胞壁成分の他に、フラジェリン、細菌DNAおよびウイルス二本鎖RNAを含む。DAMPは、熱ショックタンパク質などの細胞内タンパク質の他に、細胞外基質からのタンパク質断片を含む。対応するPAMPまたはDAMPによるTLRの刺激は、シグナル伝達カスケードを開始させて、AP-1、NF-κBおよびインターフェロン調節因子(IRF)などの転写因子の活性化に繋がる。TLRによるシグナル伝達は、インターフェロン(IFN)、炎症促進性サイトカインおよび適応免疫応答を指令するエフェクターサイトカインの産生を含む、様々な細胞応答をもたらす。TLRは、多数の炎症性および免疫障害に結び付けられており、がんにおいて役割を果たす(Rakoff-Nahoum S.およびMedzhitov R.、2009. Toll-like receptors and cancer. Nat Revs Cancer 9:57-63ページ)。
[00772]ACPWAVSGARASPGSAASPRLREGPELSPDDPAGLLDLRQGMFAQLVAQNVLLIDGPLSWYSDPGLAGVSLTGGLSYKEDTKELVVAKAGVYYVFFQLELRRVVAGEGSGSVSLALHLQPLRSAAGAAALALTVDLPPASSEARNSAFGFQGRLLHLSAGQRLGVHLHTEARARHAWQLTQGATVLGLFRVTPEIPAGLPSPRSE(配列番号6212)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6212のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む41BBリガンドを含む。
Toll様受容体
[00773]Toll様受容体(TLR)は、ショウジョウバエTollタンパク質のホモログである進化的に保存された受容体であり、微生物病原体によって排他的に発現される病原体関連微生物パターン(PAMP)、または壊死したもしくは死にゆく細胞から放出される内因性分子である危険関連分子パターン(DAMP)として公知の高度に保存された構造モチーフを認識する。PAMPは、リポ多糖(LPS)、ペプチドグリカン(PGN)およびリポペプチドなどの様々な細菌細胞壁成分の他に、フラジェリン、細菌DNAおよびウイルス二本鎖RNAを含む。DAMPは、熱ショックタンパク質などの細胞内タンパク質の他に、細胞外基質からのタンパク質断片を含む。対応するPAMPまたはDAMPによるTLRの刺激は、シグナル伝達カスケードを開始させて、AP-1、NF-κBおよびインターフェロン調節因子(IRF)などの転写因子の活性化に繋がる。TLRによるシグナル伝達は、インターフェロン(IFN)、炎症促進性サイトカインおよび適応免疫応答を指令するエフェクターサイトカインの産生を含む、様々な細胞応答をもたらす。TLRは、多数の炎症性および免疫障害に結び付けられており、がんにおいて役割を果たす(Rakoff-Nahoum S.およびMedzhitov R.、2009. Toll-like receptors and cancer. Nat Revs Cancer 9:57-63ページ)。
[00774]TLRは、ロイシンリッチリピート(LRR)およびToll/IL-1受容体(TIR)ドメインと呼ばれる保存された領域を含有する細胞質テイルを含有する細胞外ドメインによって特徴付けられるI型膜貫通タンパク質である。10個のヒトおよび12個のマウスTLRが特徴付けられており、それらは、ヒトにおけるTLR1~TLR10、ならびにマウスにおけるTLR1~TLR9、TLR11、TLR12およびTLR13であり、TLR10のホモログは偽遺伝子である。TLR2は、細菌リポタンパク質、リポマンナンおよびリポタイコ酸を含む、グラム陽性細菌からの様々なPAMPの認識のために必須である。TLR3は、ウイルス由来の二本鎖RNAに結び付けられている。TLR4は、主に、リポ多糖によって活性化される。TLR5は細菌フラジェリンを検出し、TLR9は、非メチル化CpG DNAに対する応答のために要求される。最後に、TLR7およびTLR8は、小さい合成の抗ウイルス分子を認識し、一本鎖RNAはそれらの天然リガンドであることが報告された。TLR11は、尿路病原性E. coliおよびToxoplasma gondiiからのプロフィリン様タンパク質を認識することが報告されている。TLRの特異性のレパートリーは、互いとヘテロ二量体化するTLRの能力によって拡張されるようである。例えば、TLR2およびTLR6の二量体は、ジアシル化リポタンパク質に対する応答のために要求され、TLR2およびTLR1は、相互作用してトリアシル化リポタンパク質を認識する。TLRの特異性はまた、LPSに応答してTLR4と複合体を形成するMD-2およびCD14などの、様々なアダプターおよびアクセサリー分子によって影響される。
[00775]TLRシグナル伝達は、炎症性サイトカインの産生に繋がるMyD88依存性経路、ならびにIFN-βの刺激および樹状細胞の成熟と関連付けられるMyD88非依存性経路という少なくとも2つの別個の経路からなる。MyD88依存性経路は、TLR3を除いてすべてのTLRに共通である(Adachi Oら、1998、「Targeted disruption of the MyD88 gene results in loss of IL-1- and IL-18-mediated function.」、Immunity、9(1):143~50ページ)。PAMPまたはDAMPによって活性化されると、TLRは、ヘテロまたはホモ二量体化して、細胞質TIRドメインを介してアダプタータンパク質の動員を誘導する。個々のTLRは、異なるアダプター分子の使用によって異なるシグナル伝達応答を誘導する。TLR4およびTLR2シグナル伝達は、MyD88依存性経路に関与するアダプターTIRAP/Malを要求する。TLR3は、アダプターTRIF/TICAM-1を通じて、MyD88非依存性の方式で、二本鎖RNAに応答してIFN-βの産生を誘発する。TRAM/TICAM-2は、その機能がTLR4経路に制限されたMyD88非依存性経路に関与する別のアダプター分子である。
[00776]TLR3、TLR7、TLR8およびTLR9は、ウイルス核酸を認識し、I型IFNを誘導する。I型IFNの誘導に繋がるシグナル伝達の機序は、活性化されるTLRに依存して異なる。それらは、抗ウイルス防御、細胞成長および免疫調節において不可欠な役割を果たすことが公知の転写因子のファミリー、インターフェロン調節因子、IRFを伴う。3つのIRF(IRF3、IRF5およびIRF7)は、ウイルス媒介性のTLRシグナル伝達の直接的なトランスデューサーとして機能する。TLR3およびTLR4はIRF3およびIRF7を活性化させ、TLR7およびTLR8はIRF5およびIRF7を活性化させる(Doyle Sら、2002、「IRF3 mediates a TLR3/TLR4-specific antiviral gene program.」、Immunity、17(3):251~63ページ)。さらには、TLR9リガンドCpG-Aによって刺激されるI型IFN産生は、PI(3)KおよびmTORによって媒介されることが示されている(Costa-Mattioli M.およびSonenberg N. 2008、「RAPping production of type I interferon in pDCs through mTOR.」、Nature Immunol. 9:1097~1099ページ)。
[00777]TLR-9
[00778]TLR9は、DNA分子中の非メチル化CpG配列を認識する。CpG部位は、細菌ゲノムまたはウイルスDNAと比較して脊椎動物ゲノム上で比較的希少(約1%)である。TLR9は、Bリンパ球、単球、ナチュラルキラー(NK)細胞、および形質細胞性樹状細胞などの免疫系の多数の細胞によって発現される。TLR9は、細胞内、エンドソーム区画内において発現され、CpGモチーフリッチなDNAへの結合によって免疫系にウイルスおよび細菌感染を警告するように機能する。TLR9シグナルは、炎症促進性反応を開始させる細胞の活性化に繋がり、I型インターフェロンおよびIL-12などのサイトカインの産生をもたらす。
[00778]TLR9は、DNA分子中の非メチル化CpG配列を認識する。CpG部位は、細菌ゲノムまたはウイルスDNAと比較して脊椎動物ゲノム上で比較的希少(約1%)である。TLR9は、Bリンパ球、単球、ナチュラルキラー(NK)細胞、および形質細胞性樹状細胞などの免疫系の多数の細胞によって発現される。TLR9は、細胞内、エンドソーム区画内において発現され、CpGモチーフリッチなDNAへの結合によって免疫系にウイルスおよび細菌感染を警告するように機能する。TLR9シグナルは、炎症促進性反応を開始させる細胞の活性化に繋がり、I型インターフェロンおよびIL-12などのサイトカインの産生をもたらす。
[00779]TLRアゴニスト
[00780]TLRアゴニストは、1つまたは複数のTLR、例えば、ヒトTLR-1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10のうちの1つまたは複数をアゴナイズすることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載の付属的剤はTLRアゴニストである。一部の実施形態では、TLRアゴニストは、ヒトTLR-9を特異的にアゴナイズする。一部の実施形態では、TLR-9アゴニストはCpG部分である。本明細書で使用される場合、CpG部分は、配列:5’-C-ホスフェート-G-3’、すなわち、1つのみのホスフェートによって分離されたシトシンおよびグアニンを有する直鎖状ジヌクレオチドである。
[00780]TLRアゴニストは、1つまたは複数のTLR、例えば、ヒトTLR-1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10のうちの1つまたは複数をアゴナイズすることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載の付属的剤はTLRアゴニストである。一部の実施形態では、TLRアゴニストは、ヒトTLR-9を特異的にアゴナイズする。一部の実施形態では、TLR-9アゴニストはCpG部分である。本明細書で使用される場合、CpG部分は、配列:5’-C-ホスフェート-G-3’、すなわち、1つのみのホスフェートによって分離されたシトシンおよびグアニンを有する直鎖状ジヌクレオチドである。
[00781]一部の実施形態では、CpG部分は、少なくとも1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、30個、またはより多くのCpGジヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、CpG部分は、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、または30個のCpGジヌクレオチドからなる。一部の実施形態では、CpG部分は、1~5個、1~10個、1~20個、1~30個、1~40個、1~50個、5~10個、5~20個、5~30個、10~20個、10~30個、10~40個、または10~50個のCpGジヌクレオチドを有する。
[00782]一部の実施形態では、TLR-9アゴニストは合成ODN(オリゴデオキシヌクレオチド)である。CpG ODNは、特定の配列状況(CpGモチーフ)において非メチル化CpGジヌクレオチドを含有する短い合成の一本鎖DNA分子である。CpG ODNは、ゲノム細菌DNA中に見出される天然のホスホジエステル(PO)骨格とは対照的に、部分的または完全にホスホロチオエート化(PS)した骨格を持つ。クラスA、BおよびCというCpG ODNの3つの主要なクラスがあり、これらは免疫賦活活性において異なる。CpG-A ODNは、PO中央CpG含有パリンドロームモチーフおよびPS修飾3’ポリ-Gストリングによって特徴付けられる。それらは、pDCからの高いIFN-α産生を誘導するが、TLR9依存性NF-κBシグナル伝達および炎症促進性サイトカイン(例えば、IL-6)産生の弱い刺激因子である。CpG-B ODNは、1つまたは複数のCpGジヌクレオチドを有する全長PS骨格を含有する。それらは、B細胞およびTLR9依存性NF-κBシグナル伝達を強く活性化させるが、IFN-α分泌を弱く刺激する。CpG-C ODNは、クラスAおよびBの両方の特徴を兼ね備える。それらは、完全なPS骨格およびCpG含有パリンドロームモチーフを含有する。CクラスCpG ODNは、pDCからの強いIFN-α産生の他に、B細胞刺激を誘導する。
サイトカイン分子
[00783]サイトカインは、一般に、例えば、シグナル伝達経路を通じて、細胞活性に影響を及ぼすポリペプチドである。よって、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは有用であり、細胞膜の外側からシグナルを伝達して細胞内の応答をモジュレートする受容体媒介性のシグナル伝達と関連付けられ得る。サイトカインは、免疫応答のメディエーターであるタンパク質性のシグナル伝達化合物である。それらは、増殖、分化および細胞生存/アポトーシスを含む多くの異なる細胞機能を制御し、サイトカインはまた、ウイルス感染症および自己免疫疾患を含むいくつかの病態生理学的プロセスに関与する。サイトカインは、自然免疫系(単球、マクロファージ、樹状細胞)ならびに適応免疫系(TおよびB細胞)の両方の様々な細胞によって様々な刺激下で合成される。サイトカインは、炎症促進性および抗炎症性の2つの群に分類することができる。IFNγ、IL-1、IL-6およびTNF-アルファを含む炎症促進性サイトカインは、主に、自然免疫細胞およびTh1細胞に由来する。IL-10、IL-4、IL-13およびIL-5を含む抗炎症性サイトカインは、Th2免疫細胞から合成される。
サイトカイン分子
[00783]サイトカインは、一般に、例えば、シグナル伝達経路を通じて、細胞活性に影響を及ぼすポリペプチドである。よって、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは有用であり、細胞膜の外側からシグナルを伝達して細胞内の応答をモジュレートする受容体媒介性のシグナル伝達と関連付けられ得る。サイトカインは、免疫応答のメディエーターであるタンパク質性のシグナル伝達化合物である。それらは、増殖、分化および細胞生存/アポトーシスを含む多くの異なる細胞機能を制御し、サイトカインはまた、ウイルス感染症および自己免疫疾患を含むいくつかの病態生理学的プロセスに関与する。サイトカインは、自然免疫系(単球、マクロファージ、樹状細胞)ならびに適応免疫系(TおよびB細胞)の両方の様々な細胞によって様々な刺激下で合成される。サイトカインは、炎症促進性および抗炎症性の2つの群に分類することができる。IFNγ、IL-1、IL-6およびTNF-アルファを含む炎症促進性サイトカインは、主に、自然免疫細胞およびTh1細胞に由来する。IL-10、IL-4、IL-13およびIL-5を含む抗炎症性サイトカインは、Th2免疫細胞から合成される。
[00784]本開示は、とりわけ、1つまたは複数のサイトカイン分子、例えば、免疫調節性(例えば、炎症促進性)サイトカインおよびそのバリアント、例えば、機能的バリアントを含む、例えば、それを含有するように操作された多特異性(例えば、二、三、四特異性)または多機能性分子を提供する。よって、一部の実施形態では、サイトカイン分子は、インターロイキンまたはそのバリアント、例えば、機能的バリアントである。一部の実施形態では、インターロイキンは炎症促進性インターロイキンである。一部の実施形態では、インターロイキンは、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、インターロイキン-7(IL-7)、またはインターフェロンガンマから選択される。一部の実施形態では、サイトカイン分子は炎症促進性サイトカインである。
[00785]ある特定の実施形態では、サイトカインは一本鎖サイトカインである。ある特定の実施形態では、サイトカインは、多鎖サイトカインである(例えば、サイトカインは、2つまたはより多くの(例えば、2つの)ポリペプチド鎖を含む。例示的な多鎖サイトカインはIL-12である。
[00786]有用なサイトカインの例としては、GM-CSF、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-21、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1β、TGF-β、TNF-α、およびTNFβが挙げられるがそれに限定されない。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、GM-CSF、IL-2、IL-7、IL-8、IL-10、IL-12、IL-15、IL-21、IFN-α、IFN-γ、MIP-1α、MIP-1βおよびTGF-βの群から選択されるサイトカインである。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IFN-α、およびIFN-γの群から選択されるサイトカインである。ある特定の実施形態では、サイトカインは、N-および/またはO-グリコシル化部位を除去するために突然変異される。グリコシル化の排除は、組換え産生において得られ得る製造物の均質性を増加させる。ある特定の実施形態では、サイトカインは、TGF-βである。ある特定の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、TGF-β阻害剤を含む。
[00787]一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-2である。詳細な実施形態では、IL-2サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。別の特定の実施形態では、IL-2サイトカインは、IL-2受容体のアルファ-サブユニットに対して低減した結合親和性を有する突然変異体IL-2サイトカインである。ベータ-およびガンマ-サブユニット(それぞれCD122およびCD132としても公知)と共に、アルファ-サブユニット(CD25としても公知)は、ヘテロ三量体高親和性IL-2受容体を形成するが、β-およびγ-サブユニットのみからなる二量体受容体は、中親和性IL-2受容体と称される。PCT特許出願番号PCT/EP2012/051991(これにより参照により全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、IL-2受容体のアルファ-サブユニットに対して低減した結合を有する突然変異体IL-2ポリペプチドは、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、制御性T細胞中でIL-2シグナル伝達を誘導する低減した能力を有し、T細胞中でより少ない活性化誘導性細胞死(AICD)を誘導し、かつin vivoでの低減した毒性プロファイルを有する。低減した毒性を有するそのようなサイトカインの使用は、Fcドメインの存在に起因して長い血清半減期を有する本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドにおいて特に有利である。一実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドの突然変異体IL-2サイトカインは、突然変異されていないIL-2サイトカインと比較して、IL-2受容体のアルファ-サブユニット(CD25)に対する突然変異体IL-2サイトカインの親和性を低減しまたは消失させるが、中親和性IL-2受容体(IL-2受容体のβおよびγサブユニットからなる)に対する突然変異体IL-2サイトカインの親和性を保存する少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸突然変異はアミノ酸置換である。詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基42、45、および72に対応する位置から選択される1つ、2つまたは3つの位置における1つ、2つまたは3つのアミノ酸置換を含む。より詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基42、45および72に対応する位置における3つのアミノ酸置換を含む。よりいっそう詳細な実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、アミノ酸置換F42A、Y45AおよびL72Gを含むヒトIL-2である。一実施形態では、突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の3位に対応する位置におけるアミノ酸突然変異を追加的に含み、これはIL-2のO-グリコシル化部位を排除する。特に、前記追加のアミノ酸突然変異は、スレオニン残基をアラニン残基によって置き換えるアミノ酸置換である。本発明において有用な特定の突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基3、42、45および72に対応する位置における4つのアミノ酸置換を含む。特定のアミノ酸置換は、T3A、F42A、Y45AおよびL72Gである。PCT特許出願番号PCT/EP2012/051991および付加された実施例において実証されるように、前記四重突然変異体IL-2ポリペプチド(IL-2 qm)は、CD25への検出可能な結合を呈さず、T細胞においてアポトーシスを誘導する低減した能力を呈し、制御性T細胞(T.sub.reg cells)においてIL-2シグナル伝達を誘導する低減した能力を呈し、かつin vivoでの低減した毒性プロファイルを呈する。しかしながら、それは、エフェクター細胞においてIL-2シグナル伝達を活性化させ、エフェクター細胞の増殖を誘導し、かつNK細胞により二次的なサイトカインとしてIFN-γを生成させる能力を保持する。
[00788]上記の実施形態のいずれかによるIL-2または突然変異体IL-2サイトカインは、発現または安定性の増加などのさらなる利点を提供する追加の突然変異を含んでもよい。例えば、125位におけるシステインは、ジスルフィド架橋によるIL-2二量体の形成を回避するために、アラニンなどの中性アミノ酸で置き換えられてもよい。そのため、ある特定の実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2または突然変異体IL-2サイトカインは、ヒトIL-2の残基125に対応する位置における追加のアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、前記追加のアミノ酸突然変異はアミノ酸置換C125Aである。
[00789]特定の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号6364
[APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。別の特定の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号6365
[APASSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFAMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNGAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。
[APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。別の特定の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのIL-2サイトカインは、配列番号6365
[APASSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFAMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNGAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT]のポリペプチド配列を含む。
[00790]別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-12である。詳細な実施形態では、前記IL-12サイトカインは一本鎖IL-12サイトカインである。よりいっそう詳細な実施形態では、一本鎖IL-12サイトカインは、配列番号6366
[IWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGGSGGGGSGGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-12サイトカインは、NK細胞の増殖、NK細胞の分化、T細胞の増殖、およびT細胞の分化からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[IWELKKDVYVVELDWYPDAPGEMVVLTCDTPEEDGITWTLDQSSEVLGSGKTLTIQVKEFGDAGQYTCHKGGEVLSHSLLLLHKKEDGIWSTDILKDQKEPKNKTFLRCEAKNYSGRFTCWWLTTISTDLTFSVKSSRGSSDPQGVTCGAATLSAERVRGDNKEYEYSVECQEDSACPAAEESLPIEVMVDAVHKLKYENYTSSFFIRDIIKPDPPKNLQLKPLKNSRQVEVSWEYPDTWSTPHSYFSLTFCVQVQGKSKREKKDRVFTDKTSATVICRKNASISVRAQDRYYSSSWSEWASVPCSGGGGSGGGGSGGGGSRNLPVATPDPGMFPCLHHSQNLLRAVSNMLQKARQTLEFYPCTSEEIDHEDITKDKTSTVEACLPLELTKNESCLNSRETSFITNGSCLASRKTSFMMALCLSSIYEDLKMYQVEFKTMNAKLLMDPKRQIFLDQNMLAVIDELMQALNFNSETVPQKSSLEEPDFYKTKIKLCILLHAFRIRAVTIDRVMSYLNAS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-12サイトカインは、NK細胞の増殖、NK細胞の分化、T細胞の増殖、およびT細胞の分化からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[00791]別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-10である。詳細な実施形態では、前記IL-10サイトカインは一本鎖IL-10サイトカインである。よりいっそう詳細な実施形態では、一本鎖IL-10サイトカインは、配列番号6367
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRNGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSSPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。別の詳細な実施形態では、IL-10サイトカインは、単量体IL-10サイトカインである。より詳細な実施形態では、単量体IL-10サイトカインは、配列番号6368
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENGGGSGGKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-10サイトカインは、サイトカイン分泌の阻害、抗原提示細胞による抗原提示の阻害、酸素ラジカル放出の低減、およびT細胞増殖の阻害からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。サイトカインがIL-10である本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドは、例えば、炎症性障害の処置における、炎症の下方調節のために特に有用である。
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRNGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSSPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。別の詳細な実施形態では、IL-10サイトカインは、単量体IL-10サイトカインである。より詳細な実施形態では、単量体IL-10サイトカインは、配列番号6368
[SPGQGTQSENSCTHFPGNLPNMLRDLRDAFSRVKTFFQMKDQLDNLLLKESLLEDFKGYLGCQALSEMIQFYLEEVMPQAENQDPDIKAHVNSLGENLKTLRLRLRRCHRFLPCENGGGSGGKSKAVEQVKNAFNKLQEKGIYKAMSEFDIFINYIEAYMTMKIRN]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-10サイトカインは、サイトカイン分泌の阻害、抗原提示細胞による抗原提示の阻害、酸素ラジカル放出の低減、およびT細胞増殖の阻害からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。サイトカインがIL-10である本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドは、例えば、炎症性障害の処置における、炎症の下方調節のために特に有用である。
[00792]別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインはIL-15である。詳細な実施形態では、前記IL-15サイトカインは、IL-15受容体のα-サブユニットに対して低減した結合親和性を有する突然変異体IL-15サイトカインである。理論に拘泥するものではないが、IL-15受容体のアルファ-サブユニットへの低減した結合を有する突然変異体IL-15ポリペプチドは、野生型IL-15ポリペプチドと比較して、身体の全体を通じて線維芽細胞に結合する低減した能力を有し、向上した薬物動態および毒性プロファイルをもたらす。記載される突然変異体IL-2および突然変異体IL-15エフェクター部分などの低減した毒性を有するサイトカインの使用は、Fcドメインの存在に起因して長い血清半減期を有する本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドにおいて特に有利である。一実施形態では、本発明による多特異性または多機能性ポリペプチドの突然変異体IL-15サイトカインは、突然変異していないIL-15サイトカインと比較して、IL-15受容体のアルファ-サブユニットに対する突然変異体IL-15サイトカインの親和性を低減しまたは消失させるが、中親和性IL-15/IL-2受容体(IL-15/IL-2受容体のベータ-およびガンマ-サブユニットからなる)に対する突然変異体IL-15サイトカインの親和性を保存する少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。一実施形態では、アミノ酸突然変異はアミノ酸置換である。詳細な実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、ヒトIL-15の残基53に対応する位置においてアミノ酸置換を含む。より詳細な実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、アミノ酸置換E53Aを含むヒトIL-15である。一実施形態では、突然変異体IL-15サイトカインは、ヒトIL-15の79位に対応する位置においてアミノ酸突然変異を追加的に含み、これはIL-15のN-グリコシル化部位を排除する。特に、前記追加のアミノ酸突然変異は、アスパラギン残基をアラニン残基によって置き換えるアミノ酸置換である。よりいっそう詳細な実施形態では、IL-15サイトカインは、配列番号6370
[NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLASGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGAVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-15サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLASGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGAVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS]のポリペプチド配列を含む。一実施形態では、IL-15サイトカインは、活性化Tリンパ球細胞の増殖、活性化Tリンパ球細胞の分化、細胞傷害性T細胞(CTL)活性、活性化B細胞の増殖、活性化B細胞の分化、ナチュラルキラー(NK)細胞の増殖、NK細胞の分化、活性化T細胞またはNK細胞によるサイトカイン分泌、およびNK/リンパ球活性化キラー(LAK)抗腫瘍細胞傷害性からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[00793]多特異性または多機能性ポリペプチド中のエフェクター部分として有用な突然変異体サイトカイン分子は、当該技術分野において周知の遺伝学的または化学的方法を使用して欠失、置換、挿入または修飾によって調製することができる。遺伝学的方法は、コーディングDNA配列の部位特異的突然変異誘発、PCR、および遺伝子合成などを含んでもよい。正しいヌクレオチド変化は、例えばシークエンシングによって検証することができる。置換または挿入は、天然アミノ酸残基の他に非天然アミノ酸残基を伴ってもよい。アミノ酸修飾としては、グリコシル化部位の付加もしくは除去または炭水化物の取付けなどの化学修飾の周知の方法が挙げられる。
[00794]一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはGM-CSFである。詳細な実施形態では、GM-CSFサイトカインは、顆粒球、単球または樹状細胞において増殖および/または分化を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIFN-αである。詳細な実施形態では、IFN-αサイトカインは、ウイルス感染細胞におけるウイルス複製の阻害、および主要組織適合複合体I(MHC I)の発現の上方調節からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。別の詳細な実施形態では、IFN-αサイトカインは、腫瘍細胞において増殖を阻害することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIFNγである。詳細な実施形態では、IFN-γサイトカインは、マクロファージ活性の増加、MHC分子の発現の増加、およびNK細胞活性の増加の群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIL-7である。詳細な実施形態では、IL-7サイトカインは、Tおよび/またはBリンパ球の増殖を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはIL-8である。詳細な実施形態では、IL-8サイトカインは、好中球において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはMIP-1αである。詳細な実施形態では、MIP-1αサイトカインは、単球およびTリンパ球細胞において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはMIP-1βである。詳細な実施形態では、MIP-1βサイトカインは、単球およびTリンパ球細胞において走化性を誘発することができる。一実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカイン、特に一本鎖サイトカインはTGF-βである。詳細な実施形態では、TGF-βサイトカインは、単球における走化性、マクロファージにおける走化性、活性化マクロファージにおけるIL-1発現の上方調節、および活性化B細胞におけるIgA発現の上方調節からなる群から選択される細胞応答のうちの1つまたは複数を誘発することができる。
[00795]一実施形態では、本発明の多特異性または多機能性ポリペプチドは、対照サイトカインについてよりも少なくとも約1、1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5または10倍高い解離定数(KD)でサイトカイン受容体に結合する。別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、2つまたはより多くのエフェクター部分を含む対応する多特異性または多機能性ポリペプチドについてよりも少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、または10倍高いKDでサイトカイン受容体に結合する。別の実施形態では、多特異性または多機能性ポリペプチドは、2つまたはより多くのサイトカインを含む対応する多特異性または多機能性ポリペプチドについてよりも約10倍高い解離定数KDでサイトカイン受容体に結合する。
[00796]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性分子は、サイトカイン分子を含む。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカインの全長、断片もしくはバリアント;サイトカイン受容体ドメイン、例えば、サイトカイン受容体二量体化ドメイン;またはサイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、サイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)を含む。
[00797]一部の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-7、IL-21、もしくはインターフェロンガンマ、もしくはその断片もしくはバリアント、または上記のサイトカインの任意の組合せから選択される。サイトカイン分子は、単量体または二量体であり得る。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体二量体化ドメインをさらに含むことができる。
[00798]他の実施形態では、サイトカイン分子は、サイトカイン受容体のアゴニスト、例えば、IL-15RaまたはIL-21Rから選択されるサイトカイン受容体に対する抗体分子(例えば、アゴニスト抗体)である。
[00799]一実施形態では、サイトカイン分子は、IL-15、例えば、ヒトIL-15(例えば、アミノ酸配列:
NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号6191)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6191のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号6191)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6191のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
[00800]一部の実施形態では、サイトカイン分子は、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインを含む。一実施形態では、IL15Rアルファ二量体化ドメインは、アミノ酸配列:
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(配列番号6192)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6192のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、例えば、リンカー(例えば、Gly-Serリンカー、例えば、アミノ酸配列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(配列番号6193)を含むリンカーを介して共有結合によって連結される。他の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されておらず、例えば、非共有結合的に会合している。
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(配列番号6192)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、もしくは配列番号6192のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、例えば、リンカー(例えば、Gly-Serリンカー、例えば、アミノ酸配列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(配列番号6193)を含むリンカーを介して共有結合によって連結される。他の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されておらず、例えば、非共有結合的に会合している。
[00801]他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-2、例えば、ヒトIL-2(例えば、アミノ酸配列:
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号6194)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6194のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号6194)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6194のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
[00802]他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-18、例えば、ヒトIL-18(例えば、アミノ酸配列:YFGKLESKLSVIRNLNDQVLFIDQGNRPLFEDMTDSDCRDNAPRTIFIISMYKDSQPRGM
[00803]AVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNED(配列番号6195)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6195のアミノ酸配列に対して少なくとも1個のアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
[00803]AVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNED(配列番号6195)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6195のアミノ酸配列に対して少なくとも1個のアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
[00804]他の実施形態では、サイトカイン分子は、IL-21、例えば、ヒトIL-21(例えば、アミノ酸配列:
QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(配列番号6196)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6196のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(配列番号6196)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6196のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
[00805]さらに他の実施形態では、サイトカイン分子は、インターフェロンガンマ、例えば、ヒトインターフェロンガンマ(例えば、アミノ酸配列:
QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(配列番号6197)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6197のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
TGF-β阻害剤
[00806]一態様では、TGF-βの調節薬(例えば、TGF-β阻害剤)を含む多特異性または多機能性ポリペプチド(例えば、抗体分子)が本明細書で提供される。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、TGF-βに結合し、それを阻害する、例えば、TGF-βの活性を低減する。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β1を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β2を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β3を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β1およびTGF-β3を阻害する(例えば、それらの活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β1、TGF-β2、およびTGF-β3を阻害する(例えば、それらの活性を低減する)。
QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(配列番号6197)、その断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6197のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む)である。
TGF-β阻害剤
[00806]一態様では、TGF-βの調節薬(例えば、TGF-β阻害剤)を含む多特異性または多機能性ポリペプチド(例えば、抗体分子)が本明細書で提供される。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、TGF-βに結合し、それを阻害する、例えば、TGF-βの活性を低減する。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β1を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β2を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β3を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β1およびTGF-β3を阻害する(例えば、それらの活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGF-β1、TGF-β2、およびTGF-β3を阻害する(例えば、それらの活性を低減する)。
[00807]一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、TGF-βを阻害する(例えば、その活性を低減する)ことができるTGF-β受容体の一部分(例えば、TGF-β受容体の細胞外ドメイン)、またはTGF-β受容体の機能的断片もしくはバリアントを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)およびTGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)およびTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤はTGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)およびTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3またはその機能的バリアントの細胞外ドメイン)を含む。
[00808]TGF-β阻害剤として使用することができる例示的なTGF-β受容体ポリペプチドは、米国特許第8993524号、同第9676863号、同第8658135号、米国特許出願公開第20150056199号、同第20070184052号、および国際公開第2017037634号に開示されており、これらのすべては全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[00809]一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、TGFBR1またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6381またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6382またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6383またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6390のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6391のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。
[00810]一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、TGFBR2またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6384またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6385またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6386のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6387のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6388のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6389のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。
[00811]一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、TGFBR3またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6392またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6393またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、配列番号6394のアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも80%、85%、90%、もしくは95%同一の配列)を含む。
[00812]一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は1つ以下のTGF-β受容体細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、例えば、リンカーを介して互いに連結された2つ以上(例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上)のTGF-β受容体細胞外ドメインを含む。
[00813]一部の実施形態では、多特異性分子は図24A~24Dに示される構成を含む。一部の実施形態では、TGFβ阻害剤はTGF-ベータ受容体ECDホモ二量体を含む。一部の実施形態では、TGFβ阻害剤はTGF-ベータ受容体ECDヘテロ二量体を含む。一部の実施形態では、2つのTGFBR ECDドメインは2つのFc領域、例えば、2つのFc領域のC末端に連結される。一部の実施形態では、2つのTGFBR ECDドメインは、それぞれ、CH1およびCLに連結される。
[00814]固形腫瘍は、実質(新生細胞)、および新生細胞により誘導され、新生細胞が分散される、間質という、正常組織のものを模倣した、異なっているが相互依存性の2つのコンパートメントを含む別個の構造を有する。すべての腫瘍は、間質を有し、栄養サポートおよび老廃物の除去のために、間質を必要とする。細胞懸濁液として成長する腫瘍(例えば、白血病、腹水腫瘍)の場合、血漿が間質としての機能を果たす(Connolly JL et al. Tumor Structure and Tumor Stroma Generation. In: Kufe DW et al., editors. Holland-Frei Cancer Medicine. 6th edition. Hamilton: BC Decker; 2003)。間質には、細胞外マトリックス(ECM)および細胞外分子とともに、線維芽細胞/筋線維芽細胞、膠細胞、上皮細胞、脂肪細胞、血管細胞、平滑筋細胞、および免疫細胞を含む様々な細胞型が含まれる(Li Hanchen et al. Tumor Microenvironment: The Role of the Tumor Stroma in Cancer. J of Cellular Biochemistry 101: 805-815 (2007))。
[00815]本明細書に記載される間質改変部分としては、間質の成分、例えば、ECM成分、例えば、グリコサミノグリカン、例えば、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパリン硫酸塩、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、およびケラチン硫酸塩;または細胞外タンパク質、例えば、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、およびビトロネクチンを分解することができる部分(例えば、タンパク質、例えば、酵素)が挙げられる。
間質改変酵素
[00816]一部の実施形態では、間質改変部分は酵素である。例えば、間質改変部分としては、ヒアルロニダーゼ、コラゲナーゼ、コンドロイチナーゼ、マトリックスメタロプロテイナーゼ(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)を挙げることができるが、これらに限定されない。
間質改変酵素
[00816]一部の実施形態では、間質改変部分は酵素である。例えば、間質改変部分としては、ヒアルロニダーゼ、コラゲナーゼ、コンドロイチナーゼ、マトリックスメタロプロテイナーゼ(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)を挙げることができるが、これらに限定されない。
[00817]ヒアルロニダーゼ
[00818]ヒアルロニダーゼは動物界全体に見られる中性および酸性活性酵素の群である。ヒアルロニダーゼは基質特異性および作用の機序に関して多様である。ヒアルロニダーゼには3つの一般的なクラスがある:(1)主要な最終生成物として四糖および六糖を有するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼである、哺乳動物型ヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.35)。これらは、加水分解活性およびトランスグリコシダーゼ活性の両方を有し、ヒアルロナンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解することができ;(2)細菌ヒアルロニダーゼ(EC 4.2.99.1)は、ヒアルロナンを分解し、様々な程度で、コンドロイチン硫酸塩およびデルマタン硫酸塩を分解する。これらは、主として二糖の最終生成物をもたらすベータ脱離反応によって作動するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼであり;(3)ヒル、他の寄生虫、および甲殻類に由来するヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.36)は、ベータ1-3連結の加水分解を通じて四糖および六糖の最終生成物をもたらす、エンド-ベータ-グルクロニダーゼである。
[00818]ヒアルロニダーゼは動物界全体に見られる中性および酸性活性酵素の群である。ヒアルロニダーゼは基質特異性および作用の機序に関して多様である。ヒアルロニダーゼには3つの一般的なクラスがある:(1)主要な最終生成物として四糖および六糖を有するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼである、哺乳動物型ヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.35)。これらは、加水分解活性およびトランスグリコシダーゼ活性の両方を有し、ヒアルロナンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解することができ;(2)細菌ヒアルロニダーゼ(EC 4.2.99.1)は、ヒアルロナンを分解し、様々な程度で、コンドロイチン硫酸塩およびデルマタン硫酸塩を分解する。これらは、主として二糖の最終生成物をもたらすベータ脱離反応によって作動するエンド-ベータ-N-アセチルヘキソサミニダーゼであり;(3)ヒル、他の寄生虫、および甲殻類に由来するヒアルロニダーゼ(EC 3.2.1.36)は、ベータ1-3連結の加水分解を通じて四糖および六糖の最終生成物をもたらす、エンド-ベータ-グルクロニダーゼである。
[00819]哺乳動物ヒアルロニダーゼは、さらに2つの群に分けることができる:(1)中性活性酵素および(2)酸性活性酵素。ヒトゲノムには、HYAL1、HYAL2、HYAL3、HYAL4、HYALP1、およびPH20/SPAM1の6つのヒアルロニダーゼ様遺伝子がある。HYALP1は偽遺伝子であり、HYAL3はいずれの公知の基質に対しても酵素活性を有することが示されていない。HYAL4は、コンドロイチナーゼであり、ヒアルロナンに対する活性が欠如している。HYAL1は原型の酸性活性酵素であり、PH20は原型の中性活性酵素である。酸性活性ヒアルロニダーゼ、例えば、HYAL1およびHYAL2は、中性pHでは触媒活性が欠如している。例えば、HYAL1は、in vitroにおいて、pH4.5を超えると触媒活性を有しない(Frost and Stern, “A Microtiter-Based Assay for Hyaluronidase Activity Not Requiring Specialized Reagents”, Analytical Biochemistry, vol. 251, pp. 263-269 (1997)。HYAL2は酸性活性酵素であり、in vitroでの特異性活性は非常に低い。
[00820]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは哺乳動物ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは組換えヒトヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは中性活性ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは中性活性可溶性ヒアルロニダーゼである。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは組換えPH20中性活性酵素である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは組換えPH20中性活性可溶性酵素である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼはグリコシル化されている。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは少なくとも1つのN結合型グリカンを有する。組換えヒアルロニダーゼは、当業者に公知の従来的な方法、例えば、米国特許第7767429号におけるものを使用して、産生することができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
[00821]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼはrHuPH20である(Hylenex(登録商標)とも称され;現在Halozymeによって製造されており;2005年にFDAにより承認されている(例えば、Scodeller P (2014)Hyaluronidase and other Extracellular Matrix Degrading Enzymes for Cancer Therapy: New Uses and Nano- Formulations. J Carcinog Mutage 5:178;米国特許第7767429号;同第8202517号;同第7431380号;同第8450470号;同第8772246号;同第8580252号を参照されたく、これらのそれぞれのすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。rHuPH20は、ヒトヒアルロニダーゼPH20の可溶性断片をコードするDNAプラスミドを含む、遺伝子操作されたCHO細胞によって産生される。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼはグリコシル化されている。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼは少なくとも1つのN結合型グリカンを有する。組換えヒアルロニダーゼは、当業者に公知の従来的な方法、例えば、米国特許第7767429号におけるものを使用して、産生することができ、このすべての内容は、参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、rHuPH20は、
LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号6213)のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一の配列を有する。
LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号6213)のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一の配列を有する。
[00822]本明細書において提供される方法のうちのいずれかにおいて、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンを分解する薬剤であり得るか、またはヒアルロナンの合成を阻害する薬剤であり得る。例えば、抗ヒアルロナン剤はヒアルロナン分解酵素であり得る。別の例では、抗ヒアルロナン剤はヒアルロナンの合成を阻害する薬剤である。例えば、抗ヒアルロナン剤は、ヒアルロナンの合成を阻害する薬剤、例えば、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子であるか、または小分子薬である。例えば、抗ヒアルロナン剤は、4-メチルウンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。そのような誘導体としては、例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンまたは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンである、4-メチルウンベリフェロン(MU)の誘導体が挙げられる。
[00823]本明細書において提供される方法のさらなる例では、ヒアルロナン分解酵素はヒアルロニダーゼである。一部の例では、ヒアルロナン分解酵素は、PH20ヒアルロニダーゼ、またはC末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位もしくはGPI結合部位の一部分が欠如したその短縮形態である。特定の例では、ヒアルロニダーゼは、ヒト、サル、ウシ、ヒツジ、ラット、マウス、またはモルモットPH20から選択されるPH20である。例えば、ヒアルロナン分解酵素は、中性活性であり、N-グリコシル化されている、ヒトPH20ヒアルロニダーゼであり、これは、(a)全長PH20もしくはPH20のC末端短縮形態であるヒアルロニダーゼポリペプチドであって、短縮形態が配列番号6213の少なくともアミノ酸残基36~464、例えば、36~481、36~482、36~483を含み、全長PH20が配列番号6213に記載されるアミノ酸配列を有する、ヒアルロニダーゼポリペプチド;または(b)配列番号6213に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくは短縮形態と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ヒアルロニダーゼポリペプチド;または(c)アミノ酸置換を含み、それによって、ヒアルロニダーゼポリペプチドが配列番号6213に記載されるポリペプチドもしくはその対応する短縮形態と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、(a)もしくは(b)のヒアルロニダーゼポリペプチドから選択される。例示的な例では、ヒアルロナン分解酵素は、rHuPH20と表記される組成物を含むPH20である。
[00824]他の例では、抗ヒアルロナン剤は、ポリマーへのコンジュゲーションによって改変されたヒアルロナン分解酵素である。ポリマーはPEGであってもよく、抗ヒアルロナン剤はPEG化ヒアルロナン分解酵素である。したがって、本明細書において提供される方法の一部の例では、ヒアルロナン分解酵素はポリマーへのコンジュゲーションによって改変されている。例えば、ヒアルロナン分解酵素はPEGにコンジュゲートされており、したがって、ヒアルロナン分解酵素はPEG化されている。例示的な例では、ヒアルロナン分解酵素はPEG化PH20酵素(PEGPH20)である。本明細書において提供される方法では、コルチコステロイドは、コルチゾン、デキサメタゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾロン、およびプレドニゾンの中から選択されるグルココルチコイドであり得る。
[00825]コンドロイチナーゼ
[00826]コンドロイチナーゼは、エンドグリコシダーゼ反応を通じてグリコサミノグリカン、特に、コンドロイチンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解する、動物界全体に見られる酵素である。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは哺乳動物コンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは組換えヒトコンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼはHYAL4である。他の例示的なコンドロイチナーゼとしては、コンドロイチナーゼABC(プロテウス・ブルガリス由来;日本特許出願公開第6-153947号、T. Yamagata et al. J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968)、S. Suzuki et al, J. Biol. Chem., 243, 1543 (1968))、コンドロイチナーゼAC(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;T. Yamagata et al., J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968))、コンドロイチナーゼAC II(アルスロバクター・アウレッセンス由来;K. Hiyama, and S. Okada, J. Biol. Chem., 250, 1824 (1975)、K. Hiyama and S. Okada, J. Biochem. (Tokyo), 80, 1201 (1976))、ヒアルロニダーゼACIII(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al., Seikagaku, 61, 1023 (1989))、コンドロイチナーゼB(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. Biophys. Res. Commun., 56, 973 (1974)、Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. J., 151, 121 (1975)、Kenichi Maeyama et al, Seikagaku, 57, 1189 (1985))、コンドロイチナーゼC(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al, Seikagaku, 61, 1023 (1939))などが挙げられる。
[00826]コンドロイチナーゼは、エンドグリコシダーゼ反応を通じてグリコサミノグリカン、特に、コンドロイチンおよびコンドロイチン硫酸塩を分解する、動物界全体に見られる酵素である。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは哺乳動物コンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼは組換えヒトコンドロイチナーゼである。一部の実施形態では、コンドロイチナーゼはHYAL4である。他の例示的なコンドロイチナーゼとしては、コンドロイチナーゼABC(プロテウス・ブルガリス由来;日本特許出願公開第6-153947号、T. Yamagata et al. J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968)、S. Suzuki et al, J. Biol. Chem., 243, 1543 (1968))、コンドロイチナーゼAC(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;T. Yamagata et al., J. Biol. Chem., 243, 1523 (1968))、コンドロイチナーゼAC II(アルスロバクター・アウレッセンス由来;K. Hiyama, and S. Okada, J. Biol. Chem., 250, 1824 (1975)、K. Hiyama and S. Okada, J. Biochem. (Tokyo), 80, 1201 (1976))、ヒアルロニダーゼACIII(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al., Seikagaku, 61, 1023 (1989))、コンドロイチナーゼB(フラボバクテリウム・ヘパリヌム由来;Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. Biophys. Res. Commun., 56, 973 (1974)、Y. M. Michelacci and C. P. Dietrich, Biochem. J., 151, 121 (1975)、Kenichi Maeyama et al, Seikagaku, 57, 1189 (1985))、コンドロイチナーゼC(フラボバクテリウム種Hp102由来;Hirofumi Miyazono et al, Seikagaku, 61, 1023 (1939))などが挙げられる。
[00827]マトリックスメタロプロテイナーゼ
[00828]マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)は、細胞外マトリックス(ECM)分解に関与する主要なプロテアーゼである亜鉛依存性エンドペプチダーゼである。MMPは、広範な細胞外分子およびいくつかの生体活性分子を分解することができる。ヒトにおいて、24個のMMP遺伝子が特定されており、これらは、ドメイン構成および基質優先性に基づいて、6つの群に分類することができる:コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)、ゼラチナーゼ(MMP-2およびMMP-9)、ストロメライシン(MMP-3、-10、および-11)、マトリライシン(MMP-7およびMMP-26)、膜型(MT)-MMP(MMP-14、-15、-16、-17、-24、および-25)、ならびにその他(MMP-12、-19、-20、-21、-23、-27、および-28)。一部の実施形態では、間質改変部分はヒト組換えMMP(例えば、MMP-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、10、-11、-12、-13、-14、15、-15、-17、-18、-19、20、-21、-22、-23、または-24)である。
[00828]マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)は、細胞外マトリックス(ECM)分解に関与する主要なプロテアーゼである亜鉛依存性エンドペプチダーゼである。MMPは、広範な細胞外分子およびいくつかの生体活性分子を分解することができる。ヒトにおいて、24個のMMP遺伝子が特定されており、これらは、ドメイン構成および基質優先性に基づいて、6つの群に分類することができる:コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)、ゼラチナーゼ(MMP-2およびMMP-9)、ストロメライシン(MMP-3、-10、および-11)、マトリライシン(MMP-7およびMMP-26)、膜型(MT)-MMP(MMP-14、-15、-16、-17、-24、および-25)、ならびにその他(MMP-12、-19、-20、-21、-23、-27、および-28)。一部の実施形態では、間質改変部分はヒト組換えMMP(例えば、MMP-1、-2、-3、-4、-5、-6、-7、-8、-9、10、-11、-12、-13、-14、15、-15、-17、-18、-19、20、-21、-22、-23、または-24)である。
[00829]
[00830]コラゲナーゼ
[00831]3つの哺乳動物コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)は、コラーゲン性細胞外マトリックスを切断することができる主要な分泌型エンドペプチダーゼである。線維性コラーゲンに加えて、コラゲナーゼは、成長因子を含む複数の他のマトリックスおよび非マトリックスタンパク質を切断することができる。コラゲナーゼは、不活性な代替形態として合成され、一旦活性化されると、それらの活性は、特異的組織メタロプロテイナーゼ阻害剤、TIMPによって、ならびに非特異的プロテイナーゼ阻害剤によって阻害される(Ala-aho R et al. Biochimie. Collagenases in cancer. 2005 Mar-Apr;87(3-4):273-86)。一部の実施形態では、間質改変部分はコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはヒト組換えコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-1である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-8である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-13である。
[00830]コラゲナーゼ
[00831]3つの哺乳動物コラゲナーゼ(MMP-1、-8、および-13)は、コラーゲン性細胞外マトリックスを切断することができる主要な分泌型エンドペプチダーゼである。線維性コラーゲンに加えて、コラゲナーゼは、成長因子を含む複数の他のマトリックスおよび非マトリックスタンパク質を切断することができる。コラゲナーゼは、不活性な代替形態として合成され、一旦活性化されると、それらの活性は、特異的組織メタロプロテイナーゼ阻害剤、TIMPによって、ならびに非特異的プロテイナーゼ阻害剤によって阻害される(Ala-aho R et al. Biochimie. Collagenases in cancer. 2005 Mar-Apr;87(3-4):273-86)。一部の実施形態では、間質改変部分はコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはヒト組換えコラゲナーゼである。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-1である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-8である。一部の実施形態では、コラゲナーゼはMMP-13である。
[00832]
[00833]マクロファージメタロエラスターゼ
[00834]MMP-12としても知られるマクロファージメタロエラスターゼ(MME)は、MMPのストロメライシンサブグループのメンバーであり、可溶性および不溶性エラスチン、ならびにIV型コラーゲン、フィブロネクチン、ラミニン、ビトロネクチン、エンタクチン、ヘパラン、およびコンドロイチン硫酸塩を含む広範なマトリックスおよび非マトリックス基質の加水分解を触媒する(Erja Kerkela et al. Journal of Investigative Dermatology (2000)114, 1113-1119; doi:10.1046/j.1523-1747.2000.00993)。一部の実施形態では、間質改変部分はMMEである。一部の実施形態では、MMEはヒト組換えMMEである。一部の実施形態では、MMEはMMP-12である。
さらなる間質改変部分
[00835]一部の実施形態では、間質改変部分は、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生の減少;腫瘍線維形成の減少;間質腫瘍輸送の増加;腫瘍灌流の改善;腫瘍微小血管の拡大;腫瘍における間質液圧(IFP)の減少;または薬剤、例えば、がん治療薬もしくは細胞療法の、腫瘍もしくは腫瘍血管への浸透もしくは拡散の減少もしくは増強のうちの1つまたは複数を引き起こす。
[00833]マクロファージメタロエラスターゼ
[00834]MMP-12としても知られるマクロファージメタロエラスターゼ(MME)は、MMPのストロメライシンサブグループのメンバーであり、可溶性および不溶性エラスチン、ならびにIV型コラーゲン、フィブロネクチン、ラミニン、ビトロネクチン、エンタクチン、ヘパラン、およびコンドロイチン硫酸塩を含む広範なマトリックスおよび非マトリックス基質の加水分解を触媒する(Erja Kerkela et al. Journal of Investigative Dermatology (2000)114, 1113-1119; doi:10.1046/j.1523-1747.2000.00993)。一部の実施形態では、間質改変部分はMMEである。一部の実施形態では、MMEはヒト組換えMMEである。一部の実施形態では、MMEはMMP-12である。
さらなる間質改変部分
[00835]一部の実施形態では、間質改変部分は、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生の減少;腫瘍線維形成の減少;間質腫瘍輸送の増加;腫瘍灌流の改善;腫瘍微小血管の拡大;腫瘍における間質液圧(IFP)の減少;または薬剤、例えば、がん治療薬もしくは細胞療法の、腫瘍もしくは腫瘍血管への浸透もしくは拡散の減少もしくは増強のうちの1つまたは複数を引き起こす。
[00836]一部の実施形態では、減少する間質またはECM成分は、グリコサミノグリカンもしくは細胞外タンパク質、またはそれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、グリコサミノグリカンは、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパリン、ヘパリン硫酸塩、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、およびケラチン硫酸塩から選択される。一部の実施形態では、細胞外タンパク質は、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはビトロネクチンから選択される。一部の実施形態では、間質改変部分は、腫瘍間質または細胞外マトリックス(ECM)を分解する酵素分子を含む。一部の実施形態では、酵素分子は、ヒアルロニダーゼ分子、コラゲナーゼ分子、コンドロイチナーゼ分子、マトリックスメタロプロテイナーゼ分子(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)、または前述のもののいずれかのバリアント(例えば、断片)から選択される。「酵素分子」という用語には、酵素の全長、その断片、またはバリアント、例えば、天然に存在する酵素の少なくとも1つの機能的特性を保持する酵素バリアントが含まれる。
[00837]一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロン酸のレベルまたは産生を減少させる。他の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナン分解酵素、ヒアルロナン合成を阻害する薬剤、またはヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。
[00838]一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、ヒアルロニダーゼ分子、例えば、全長またはそのバリアント(例えば、その断片)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、中性または酸性のpH、例えば、約4~5のpHにおいて活性である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、哺乳動物ヒアルロニダーゼ分子、例えば、組換えヒトヒアルロニダーゼ分子、例えば、全長またはそのバリアント(例えば、その断片、例えば、短縮形態)である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1、HYAL2、もしくはPH-20/SPAM1、またはそのバリアント(例えば、その短縮形態)から選択される。一部の実施形態では、短縮形態は、C末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位またはGPI結合部位の一部分が欠如している。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、グリコシル化されている、例えば、少なくとも1つのN結合型グリカンを含む。
[00839]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、アミノ酸配列:
LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号6213)、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6213のアミノ酸配列に対して少なくとも1個のアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
LNFRAPPVIPNVPFLWAWNAPSEFCLGKFDEPLDMSLFSFIGSPRINATGQGVTIFYVDRLGYYPYIDSITGVTVNGGIPQKISLQDHLDKAKKDITFYMPVDNLGMAVIDWEEWRPTWARNWKPKDVYKNRSIELVQQQNVQLSLTEATEKAKQEFEKAGKDFLVETIKLGKLLRPNHLWGYYLFPDCYNHHYKKPGYNGSCFNVEIKRNDDLSWLWNESTALYPSIYLNTQQSPVAATLYVRNRVREAIRVSKIPDAKSPLPVFAYTRIVFTDQVLKFLSQDELVYTFGETVALGASGIVIWGTLSIMRSMKSCLLLDNYMETILNPYIINVTLAAKMCSQVLCQEQGVCIRKNWNSSDYLHLNPDNFAIQLEKGGKFTVRGKPTLEDLEQFSEKFYCSCYSTLSCKEKADVKDTDAVDVCIADGVCIDAFLKPPMETEEPQIFYNASPSTLS(配列番号6213)、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6213のアミノ酸配列に対して少なくとも1個のアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。
[00840]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、
(i)配列番号6213の36~464のアミノ酸配列;
(ii)PH20の36~481、36~482、もしくは36~483のアミノ酸配列、ここで、PH20は配列番号6213に記載されるアミノ酸配列を有する;
(iii)配列番号6213に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくはその短縮形態に対して少なくとも95%~100%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または
(iv)配列番号6213に記載されるアミノ酸配列に対して30個、20個、10個、5つ、もしくはそれよりも少ないアミノ酸置換を有するアミノ酸配列
を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、100%)同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のヌクレオチド配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一のヌクレオチド配列によってコードされる。
(i)配列番号6213の36~464のアミノ酸配列;
(ii)PH20の36~481、36~482、もしくは36~483のアミノ酸配列、ここで、PH20は配列番号6213に記載されるアミノ酸配列を有する;
(iii)配列番号6213に記載されるアミノ酸配列のポリペプチドもしくはその短縮形態に対して少なくとも95%~100%の配列同一性を有するアミノ酸配列;または
(iv)配列番号6213に記載されるアミノ酸配列に対して30個、20個、10個、5つ、もしくはそれよりも少ないアミノ酸置換を有するアミノ酸配列
を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、100%)同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のヌクレオチド配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一のヌクレオチド配列によってコードされる。
[00841]一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子はPH20、例えば、rHuPH20である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1であり、アミノ酸配列:
FRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW(配列番号6218)、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6218のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
FRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMW(配列番号6218)、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6218のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む。
[00842]一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、ポリマーをさらに含み、例えば、ポリマー、例えば、PEGにコンジュゲートされている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素はPEG化PH20酵素(PEGPH20)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択される、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)をさらに含む。一部の実施形態では、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)は、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子に連結、例えば、共有結合的に連結されている。一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体の結合、抗体のグリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞の機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるように、変更、例えば、突然変異されている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、二量体を形成する。
[00843]一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナンの合成、例えば、HAシンターゼの阻害剤を含む。一部の実施形態では、阻害剤は、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子を含むか、または小分子薬である。一部の実施形態では、阻害剤は、4-メチルウンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体(例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンもしくは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリン)、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。
[00844]一部の実施形態では、間質改変部分はヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。
[00845]一部の実施形態では、間質改変部分は、コラゲナーゼ分子、例えば、哺乳動物コラゲナーゼ分子、またはそのバリアント(例えば、断片)を含む。一部の実施形態では、コラゲナーゼ分子は、例えば、
YNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC(配列番号6219)のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6219のアミノ酸配列に対して少なくとも1個のアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む、コラゲナーゼ分子IVである。
標的化部分
[00846]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性および/または多機能性分子は腫瘍標的化部分を含む。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原を標的とする(例えば、それに結合する)。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分はG6Bを標的とする(例えば、それに結合する)。
YNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTVGGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDIDLGTGPTPTLGPVTPEICKQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPRDKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYWIYSASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKMDPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQSLKSVKFGSIKSDWLGC(配列番号6219)のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6219のアミノ酸配列に対して少なくとも1個のアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15個以下の変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む、コラゲナーゼ分子IVである。
標的化部分
[00846]一部の実施形態では、本明細書に開示される多特異性および/または多機能性分子は腫瘍標的化部分を含む。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原を標的とする(例えば、それに結合する)。一部の実施形態では、腫瘍標的化部分はG6Bを標的とする(例えば、それに結合する)。
[00847]G6Bとは、巨核球および血小板阻害受容体G6bまたはC6orf25としても公知のMPIG6Bを指す。Swiss-Prot受託番号O95866は例示的なヒトG6Bアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、G6BまたはG6B分子は天然に存在するG6Bまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00848]CD34とは、造血前駆細胞抗原CD34を指す。Swiss-Prot受託番号P28906は例示的なヒトCD34アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、CD34またはCD34分子は天然に存在するCD34またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00849]CD41とは、インテグリンアルファ-IIbとしても公知のITGA2Bを指す。Swiss-Prot受託番号P08514は例示的なヒトCD41アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、CD41またはCD41分子は天然に存在するCD41またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00850]P-セレクチンとは、CD62P、GMP-140、またはLECAM3としても公知のSELPを指す。Swiss-Prot受託番号P16109は例示的なヒトP-セレクチンアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、P-セレクチンまたはP-セレクチン分子は天然に存在するP-セレクチンまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00851]Clec2とは、C型レクチンドメインファミリー1メンバーBとしても公知のCLEC1Bを指す。Swiss-Prot受託番号Q9P126は例示的なヒトClec2アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、Clec2またはClec2分子は天然に存在するClec2またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00852]cKITとは、CD117としても公知の肥満/幹細胞成長因子受容体kitを指す。Swiss-Prot受託番号P10721は例示的なヒトcKITアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、cKITまたはcKIT分子は天然に存在するcKITまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00853]FLT3とは、CD135としても公知の受容体型チロシンタンパク質キナーゼFLT3を指す。Swiss-Prot受託番号P36888は例示的なヒトFLT3アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、FLT3またはFLT3分子は天然に存在するFLT3またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00854]MPLとは、CD110としても公知のトロンボポエチン受容体を指す。Swiss-Prot受託番号P40238は例示的なヒトMPLアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、MPLまたはMPL分子は天然に存在するMPLまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00855]ITGB3とは、CD61としても公知のインテグリンベータ-3を指す。Swiss-Prot受託番号P05106は例示的なヒトITGB3アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、ITGB3またはITGB3分子は天然に存在するITGB3またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00856]ITGB2とは、CD18としても公知のインテグリンベータ-2を指す。Swiss-Prot受託番号P05107は例示的なヒトITGB2アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、ITGB2またはITGB2分子は天然に存在するITGB2またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00857]GP5とは、CD42dとしても公知の血小板糖タンパク質Vを指す。Swiss-Prot受託番号P40197は例示的なヒトGP5アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、GP5またはGP5分子は天然に存在するGP5またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00858]GP6とは、血小板糖タンパク質VIを指す。Swiss-Prot受託番号Q9HCN6は例示的なヒトGP6アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、GP6またはGP6分子は天然に存在するGP6またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00859]GP9とは、CD42aとしても公知の血小板糖タンパク質IXを指す。Swiss-Prot受託番号P14770は例示的なヒトGP9アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、GP9またはGP9分子は天然に存在するGP9またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00860]GP1BAとは、CD42bとしても公知の血小板糖タンパク質Ibアルファ鎖を指す。Swiss-Prot受託番号P07359は例示的なヒトGP1BAアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、GP1BAまたはGP1BA分子は天然に存在するGP1BAまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00861]DSC2とは、カドヘリンファミリーメンバー2としても公知のデスモコリン-2を指す。Swiss-Prot受託番号Q02487は例示的なヒトDSC2アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、DSC2またはDSC2分子は天然に存在するDSC2またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00862]FCGR2Aとは、CD32としても公知のFc-ガンマ-RIIaを指す。Swiss-Prot受託番号P12318は例示的なヒトFCGR2Aアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、FCGR2AまたはFCGR2A分子は天然に存在するFCGR2Aまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00863]TNFRSF10Aとは、死受容体4、TNF関連アポトーシス誘導リガンド受容体1、TRAIL-R1、またはCD261としても公知の腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー10Aを指す。Swiss-Prot受託番号O00220は例示的なヒトTNFRSF10Aアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、TNFRSF10AまたはTNFRSF10A分子は天然に存在するTNFRSF10Aまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00864]TNFRSF10Bとは、死受容体5、TNF関連アポトーシス誘導リガンド受容体2、TRAIL-R2、またはCD262としても公知の腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー10Bを指す。Swiss-Prot受託番号O14763は例示的なヒトTNFRSF10Bアミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、TNFRSF10BまたはTNFRSF10B分子は天然に存在するTNFRSF10Bまたはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00865]TM4SF1とは、膜貫通4 L6ファミリーメンバー1を指す。Swiss-Prot受託番号P30408は例示的なヒトTM4SF1アミノ酸配列を提供する。一部の実施形態では、TM4SF1またはTM4SF1分子は天然に存在するTM4SF1またはその機能的バリアントもしくは断片である。
[00866]一部の実施形態では、多特異性および/または多機能性分子は1つまたは複数の追加の腫瘍標的化部分を含む。一部の実施形態では、1つまたは複数の追加の腫瘍標的化部分は、第1の腫瘍標的化部分と同じ腫瘍抗原を標的とする(例えば、それに結合する)。一部の実施形態では、1つまたは複数の追加の腫瘍標的化部分は、第1の腫瘍標的化部分と異なる腫瘍抗原を標的とする(例えば、それに結合する)。一部の実施形態では、多特異性および/または多機能性分子は、同じ細胞(例えば、腫瘍細胞)に存在する異なる腫瘍抗原を標的とする複数の腫瘍標的化部分を含む。一部の実施形態では、多特異性および/または多機能性分子は、異なる細胞(例えば、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、またはより多くの異なる腫瘍細胞)に存在する異なる腫瘍抗原を標的とする複数の腫瘍標的化部分を含む。一部の実施形態では、腫瘍抗原のそれぞれは、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される。
[00867]一部の実施形態では、多特異性および/または多機能性分子は、第1の腫瘍標的化部分(例えば、第1の腫瘍抗原を標的とする)および第2の腫瘍標的化部分(例えば、第2の腫瘍抗原を標的とする)を含む。一部の実施形態では、第1および第2の腫瘍抗原は同じ腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第1および第3の腫瘍抗原は同じ腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第2および第3の腫瘍抗原は同じ腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第1、第2、および第3の腫瘍抗原は同じ腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第1および第2の腫瘍抗原は異なる腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第1および第3の腫瘍抗原は異なる腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第2および第3の腫瘍抗原は異なる腫瘍細胞に存在する。一部の実施形態では、第1、第2、および第3の腫瘍抗原は異なる腫瘍細胞に存在する。
[00868]一部の実施形態では、第1、第2、および/または第3の腫瘍抗原は、腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞中で、非腫瘍細胞より高い発現を示す。一部の実施形態では、腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞中での第1、第2、および/または第3の腫瘍抗原の発現は、非腫瘍細胞中での第1、第2、および/または第3の腫瘍抗原の発現より少なくとも1.5、2、4、6、8、または10倍高い。一部の実施形態では、多機能性分子は非腫瘍細胞よりも腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合する。一部の実施形態では、多機能性分子と腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞との結合は、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい。一部の実施形態では、親和性、例えば、腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞に対する第1および第2の腫瘍標的化部分の親和性の組合せは、第1の腫瘍標的化部分または第2の腫瘍標的化部分のうちの一方のみを有する類似した多機能性分子の親和性より大きい。一部の実施形態では、親和性、例えば、腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞に対する第1および第2の腫瘍標的化部分の親和性の組合せは、第1の腫瘍標的化部分または第2の腫瘍標的化部分のうちの一方のみを有する類似した多機能性分子の親和性より少なくとも2、5、10、20、30、40、50、75、または100倍大きい。
[00869]一部の実施形態では、親和性、例えば、腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞に対する第1、第2、および第3の腫瘍標的化部分の親和性の組合せは、第1の腫瘍標的化部分、第2の腫瘍標的化部分、もしくは第3の腫瘍標的化部分のうちの1つのみを有する類似した多機能性分子、または第1の腫瘍標的化部分、第2の腫瘍標的化部分、もしくは第3の腫瘍標的化部分のうちの2つのみを有する類似した多機能性分子の親和性より大きい。一部の実施形態では、親和性、例えば、腫瘍細胞、例えば、骨髄増殖性新生物細胞に対する第1、第2、および第3の腫瘍標的化部分の親和性の組合せは、第1の腫瘍標的化部分、第2の腫瘍標的化部分、もしくは第3の腫瘍標的化部分のうちの1つのみを有する類似した多機能性分子、または第1の腫瘍標的化部分、第2の腫瘍標的化部分、もしくは第3の腫瘍標的化部分のうちの2つのみを有する類似した多機能性分子の親和性より少なくとも2、5、10、20、30、40、50、75、または100倍大きい。
[00870]一部の実施形態では、親和性、例えば、第1の腫瘍標的化部分および第2の腫瘍標的化部分の第1および第2の腫瘍抗原に対する親和性の組合せは、(iii)、(iv)、もしくは(v)単独または多機能性分子の部分としての(iii)、(iv)、もしくは(v)の、その対応する結合メンバーに対する親和性と等しいか、またはそれより大きい。一部の実施形態では、親和性、例えば、第1の腫瘍標的化部分および第2の腫瘍標的化部分の第1および第2の腫瘍抗原に対する親和性の組合せは、(iii)、(iv)、もしくは(v)単独または多機能性分子の部分としての(iii)、(iv)、もしくは(v)の、その対応する結合メンバーに対する親和性より少なくとも2、5、10、20、30、40、50、75、または100倍大きい。
[00871]一部の実施形態では、親和性、例えば、第1の腫瘍標的化部分、第2の腫瘍標的化部分、および第3の腫瘍標的化部分の第1、第2、および第3の腫瘍抗原に対する親和性の組合せは、(iii)、(iv)、もしくは(v)単独または多機能性分子の部分としての(iii)、(iv)、もしくは(v)の、その対応する結合メンバーに対する親和性と等しいか、またはそれより大きい。一部の実施形態では、親和性、例えば、第1の腫瘍標的化部分、第2の腫瘍標的化部分、および第3の腫瘍標的化部分の第1、第2、および第3の腫瘍抗原に対する親和性の組合せは、(iii)、(iv)、もしくは(v)単独または多機能性分子の部分としての(iii)、(iv)、もしくは(v)の、その対応する結合メンバーに対する親和性より少なくとも2、5、10、20、30、40、50、75、または100倍大きい。
[00872]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はCD41であり、第3の腫瘍抗原はG6Bである。
[00873]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はCD41であり、第3の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はG6Bであり、第3の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はG6Bであり、第3の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はCD41であり、第3の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はG6Bであり、第3の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はG6Bであり、第3の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第3の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第3の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第3の腫瘍抗原はClec2である。
[00874]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD34であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00875]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はCD41であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00876]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はG6Bであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00877]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はP-セレクチンであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00878]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はClec2であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00879]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はcKITであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00880]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFLT3であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00881]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はMPLであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00882]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB3であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00883]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はITGB2であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00884]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP5であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00885]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP6であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00886]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP9であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00887]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はGP1BAであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00888]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はDSC2であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00889]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はFCGR2Aであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00890]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Aであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00891]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTNFRSF10Bであり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
[00892]前述の態様の一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はCD34である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はG6Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はClec2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はITGB3である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はITGB2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はGP5である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はGP6である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はGP9である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はGP1BAである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Aである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1の腫瘍抗原はTM4SF1であり、第2の腫瘍抗原はTM4SF1である。
腫瘍抗原を標的とする抗体分子
[00893]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、表38に示されるCDR、フレームワーク領域、もしくは可変領域配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)を含む。
腫瘍抗原を標的とする抗体分子
[00893]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、表38に示されるCDR、フレームワーク領域、もしくは可変領域配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)を含む。
(i)配列番号2001(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2001(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2002(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2002(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00895]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はCD41である。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)配列番号2007(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2007(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2008(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2008(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)配列番号2007(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2007(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2008(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2008(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00896]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はP-セレクチンである。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)配列番号2013(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2013(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2014(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2014(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)配列番号2013(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2013(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2014(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2014(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00897]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はcKITである。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)配列番号2003(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2003(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2004(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2004(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)配列番号2003(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2003(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2004(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2004(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00898]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はFLT3である。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)配列番号2005(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2005(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2006(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2006(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)配列番号2005(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2005(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2006(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2006(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00899]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はMPLである。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)(a)配列番号2009(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2009(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2010(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2010(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(ii)(a)配列番号2011(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2011(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2012(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2012(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)(a)配列番号2009(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2009(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2010(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2010(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(ii)(a)配列番号2011(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2011(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2012(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2012(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00900]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はDSC2である。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)(a)配列番号2015(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2015(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2016(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2016(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(ii)(a)配列番号2017(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2017(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2018(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2018(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)(a)配列番号2015(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2015(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2016(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2016(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(ii)(a)配列番号2017(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2017(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2018(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2018(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00901]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はFCGR2Aである。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)(a)配列番号2019(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2019(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2020(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2020(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;
(ii)(a)配列番号2021(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2021(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2022(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2022(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL、あるいは
(iii)(a)配列番号2023(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2023(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2024(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2024(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)(a)配列番号2019(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2019(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2020(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2020(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;
(ii)(a)配列番号2021(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2021(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2022(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2022(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL、あるいは
(iii)(a)配列番号2023(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2023(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2024(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2024(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00902]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はTNFRSF10AまたはTNFRSF10Bである。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)(a)配列番号2025(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2025(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2026(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2026(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(ii)(a)配列番号2027(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2027(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2028(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2028(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;
(iii)(a)配列番号2029(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2029(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2030(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2030(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;
(iv)(a)配列番号2031(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2031(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2032(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2032(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(v)(a)配列番号2033(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2033(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2034(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2034(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)(a)配列番号2025(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2025(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2026(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2026(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(ii)(a)配列番号2027(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2027(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2028(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2028(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;
(iii)(a)配列番号2029(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2029(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2030(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2030(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;
(iv)(a)配列番号2031(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2031(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2032(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2032(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL;あるいは
(v)(a)配列番号2033(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(b)配列番号2033(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(c)配列番号2034(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/または
(d)配列番号2034(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00903]一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍抗原はTM4SF1である。一部の実施形態では、第1、第2、または第3の腫瘍標的化部分は、
(i)配列番号2035(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2035(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2036(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2036(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
(i)配列番号2035(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのHCDR1、HCDR2、および/またはHCDR3、
(ii)配列番号2035(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVH、
(iii)配列番号2036(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)からのLCDR1、LCDR2、および/またはLCDR3、ならびに/あるいは
(iv)配列番号2036(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)のVL
を含む。
[00904]例示的な抗CD34抗体配列
[00905]一態様では、CD34標的化部分を含む腫瘍標的化部分を含む多特異性または多機能性分子が本明細書で提供される。別の態様では、抗CD34抗体分子(例えば、モノクローナル抗CD34抗体分子)が本明細書で提供される。
[00905]一態様では、CD34標的化部分を含む腫瘍標的化部分を含む多特異性または多機能性分子が本明細書で提供される。別の態様では、抗CD34抗体分子(例えば、モノクローナル抗CD34抗体分子)が本明細書で提供される。
[00906]一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、表20または表21に開示される抗体またはその抗原結合性断片を含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、表20もしくは表21に開示されるCDR、フレームワーク領域、もしくは可変領域配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有する配列)を含む。
[00907]一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6239の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6241のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6243のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6239のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6241のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6243のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6245の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号1236のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6246のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6245のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号1236のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6246のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[00908]一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79、6225、6227、もしくは6229のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6231、6233、6235、もしくは6237のアミノ酸配列、またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6231のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6235のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6225のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6227のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号6229のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6237のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00909]一部の実施形態では、CD34標的化部分または抗CD34抗体分子は、配列番号79のアミノ酸配列を含むVH、および配列番号6233のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[00910]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、リンカー、例えば、抗原結合性ドメインとサイトカイン分子との間、抗原結合性ドメインと免疫細胞エンゲージャーとの間、抗原結合性ドメインと間質改変部分との間、サイトカイン分子と免疫細胞エンゲージャーとの間、サイトカイン分子と間質改変部分との間、免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分との間、抗原結合性ドメインと免疫グロブリン鎖定常領域との間、サイトカイン分子と免疫グロブリン鎖定常領域との間、免疫細胞エンゲージャーと免疫グロブリン鎖定常領域との間、または間質改変部分と免疫グロブリン鎖定常領域との間のうちの1つまたは複数におけるリンカーをさらに含み得る。一部の実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、もしくは非ヘリックスリンカー、またはこれらの組合せから選択される。
[00911]一実施形態では、多特異性分子は、1つ、2つ、3つ、または4つのリンカー、例えば、ペプチドリンカーを含み得る。一実施形態では、ペプチドリンカーは、GlyおよびSerを含む。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、GGGGS(配列番号6214);GGGGSGGGGS(配列番号6215);GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号6216);およびDVPSGPGGGGGSGGGGS(配列番号6217)から選択される。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、A(EAAAK)nA(配列番号6413)ファミリーのリンカー(例えば、Protein Eng. (2001) 14 (8): 529-532に記載される)である。これらは、nが2~5の範囲である剛直なヘリックスリンカーである。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、AEAAAKEAAAKAAA(配列番号6220);AEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号6221);AEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号77);およびAEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKAAA(配列番号78)から選択される。
核酸
[00912]前述の多特異性または多機能性分子をコードする核酸もまた、開示される。
核酸
[00912]前述の多特異性または多機能性分子をコードする核酸もまた、開示される。
[00913]ある特定の実施形態では、本発明は、本明細書に記載される抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域およびCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を特徴とする。例えば、本発明は、本明細書に開示される抗体分子のうちの1つまたは複数から選択される抗体分子の、重鎖および軽鎖可変領域をそれぞれコードする、第1および第2の核酸を特徴とする。核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に同一の配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一であるか、または3個、6個、15個、30個、もしくは45個以下のヌクレオチドが、本明細書の表に示される配列と異なる配列を含む。
[00914]ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。他の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。なおも別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるアミノ酸配列を有する重鎖および軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または1つもしくは複数の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。
[00915]ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する重鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、それに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、もしくは3つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。なおも別の実施形態では、核酸は、本明細書の表に記載されるヌクレオチド配列を有する重鎖および軽鎖可変領域に由来する少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つのCDRもしくは超可変ループをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同である配列(例えば、それに対して少なくとも約85%、90%、95%、99%、もしくはそれ以上同一である、かつ/または本明細書に記載されるストリンジェンシー条件下においてハイブリダイズすることができる配列)を含み得る。
[00916]ある特定の実施形態では、核酸は、本明細書に開示されるサイトカイン分子、免疫細胞エンゲージャー、または間質改変部分をコードするヌクレオチド配列を含み得る。
[00917]別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、本明細書において以下により詳細に記載されるように、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。
ベクター
[00918]さらに、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターが本明細書で提供される。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載の多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチドを含む。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載のヌクレオチド配列を含む。ベクターとしては、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)が挙げられるが、これらに限定されない。
ベクター
[00918]さらに、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターが本明細書で提供される。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載の多特異性または多機能性分子をコードするヌクレオチドを含む。一実施形態では、ベクターは、本明細書に記載のヌクレオチド配列を含む。ベクターとしては、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)が挙げられるが、これらに限定されない。
[00919]多数のベクター系を用いることができる。例えば、1つのクラスのベクターは、動物ウイルス、例えば、ウシパピローマウイルス、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、レトロウイルス(ラウス肉腫ウイルス、MMTV、もしくはMOMLV)、またはSV40ウイルスなどに由来するDNAエレメントを利用する。別のクラスのベクターは、RNAウイルス、例えば、セムリキ森林ウイルス、東部ウマ脳炎ウイルス、およびフラビウイルスに由来するRNAエレメントを利用する。
[00920]加えて、DNAが染色体に安定に組み込まれた細胞を、トランスフェクトされた宿主細胞の選択を可能にする1つまたは複数のマーカーを導入することによって、選択することができる。マーカーは、例えば、栄養要求性宿主に対するプロトトロピー、殺生物剤耐性(例えば、抗生物質)、または重金属、例えば、銅に対する耐性などを提供し得る。選択可能なマーカー遺伝子は、発現させようとするDNA配列に直接的に連結させるか、または共形質転換によって同じ細胞に導入するかのいずれかを行うことができる。最適なmRNAの合成には、追加のエレメントも必要とされ得る。これらのエレメントとしては、スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサー、および終結シグナルを挙げることができる。
[00921]構築物を含む発現ベクターまたはDNA配列を、発現のために調製した後、発現ベクターを、適切な宿主細胞にトランスフェクトまたは導入することができる。例えば、プロトプラスト融合、リン酸カルシウム沈降、エレクトロポレーション、レトロウイルス形質導入、ウイルストランスフェクション、遺伝子銃、脂質に基づくトランスフェクション、または他の従来的な技法など、様々な技法を用いてこれを達成することができる。プロトプラスト融合の場合、細胞を、培地において成長させ、適切な活性に関してスクリーニングする。結果として得られたトランスフェクトした細胞の培養、および産生される抗体分子の回収のための方法および条件は、当業者に公知であり、本明細書に基づいて、用いられる具体的な発現ベクターおよび哺乳動物宿主細胞に応じて変更または最適化することができる。
細胞
[00922]別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、または原核生物細胞、例えば、大腸菌であってもよい。例えば、哺乳動物細胞は、培養した細胞または細胞系であり得る。例示的な哺乳動物細胞としては、リンパ球細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞、およびトランスジェニック動物に由来する細胞、例えば、乳腺上皮細胞が挙げられる。
細胞
[00922]別の態様では、本出願は、本明細書に記載される核酸を含む宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、同じ宿主細胞または別個の宿主細胞に存在する単一のベクターまたは別個のベクターに存在し得る。宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞、または原核生物細胞、例えば、大腸菌であってもよい。例えば、哺乳動物細胞は、培養した細胞または細胞系であり得る。例示的な哺乳動物細胞としては、リンパ球細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞、およびトランスジェニック動物に由来する細胞、例えば、乳腺上皮細胞が挙げられる。
[00923]本発明はまた、本明細書に記載される抗体分子をコードする核酸を含む宿主細胞も提供する。
[00924]一実施形態では、宿主細胞は、抗体分子をコードする核酸を含むように遺伝子操作されている。
[00925]一実施形態では、宿主細胞は、発現カセットを使用することによって遺伝子操作されている。「発現カセット」という語句は、ヌクレオチド配列を指し、そのような配列と適合性のある宿主における遺伝子の発現を達成することができる。そのようなカセットとしては、プロモーター、イントロンありまたはなしのオープンリーディングフレーム、終結シグナルを挙げることができる。例えば、誘導性プロモーターなど、発現を達成するのに必要であるかまたは役に立つ追加の因子もまた、使用することができる。
[00926]本発明はまた、本明細書に記載されるベクターを含む宿主細胞も提供する。
[00927]細胞は、真核生物細胞、細菌細胞、昆虫細胞、またはヒト細胞であり得るが、これらに限定されない。好適な真核生物細胞としては、Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞、およびMDCKII細胞が挙げられるが、これらに限定されない。好適な昆虫細胞としては、Sf9細胞が挙げられるが、これに限定されない。
使用および組合せ治療
[00928]本明細書に記載される方法は、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子を使用して、例えば、本明細書に記載される医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するステップを含む。また、対象におけるがんの症状を低減または改善する方法、ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1つもしくは複数のがん細胞を殺滅させる方法が、提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される方法は、本明細書に記載されるものまたは本明細書に記載される医薬組成物が投与された対象において、腫瘍のサイズを減少させ、かつ/またはがん細胞の数を減少させる。
使用および組合せ治療
[00928]本明細書に記載される方法は、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子を使用して、例えば、本明細書に記載される医薬組成物を使用して、対象におけるがんを処置するステップを含む。また、対象におけるがんの症状を低減または改善する方法、ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1つもしくは複数のがん細胞を殺滅させる方法が、提供される。一部の実施形態では、本明細書に記載される方法は、本明細書に記載されるものまたは本明細書に記載される医薬組成物が投与された対象において、腫瘍のサイズを減少させ、かつ/またはがん細胞の数を減少させる。
[00929]一部の実施形態では、がんは、血液がんである。一部の実施形態では、血液がんは、白血病またはリンパ腫である。本明細書で使用される場合、「血液がん」は、造血系またはリンパ系組織の腫瘍、例えば、血液、骨髄、またはリンパ節に罹患する腫瘍を指す。例示的な血液悪性腫瘍としては、白血病(例えば、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ球性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、有毛細胞性白血病、急性単球性白血病(AMoL)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、若年性骨髄単球性白血病(JMML)、もしくは大顆粒リンパ球性白血病)、リンパ腫(例えば、AIDS関連リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫(例えば、古典的なホジキンリンパ腫もしくは結節性リンパ球優位型ホジキンリンパ腫)、菌状息肉腫、非ホジキンリンパ腫(例えば、B細胞非ホジキンリンパ腫(例えば、バーキットリンパ腫、小リンパ球性リンパ腫(CLL/SLL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、免疫芽球性大細胞型リンパ腫、前駆Bリンパ芽球性リンパ腫、もしくはマントル細胞リンパ腫)、またはT細胞非ホジキンリンパ腫(菌状息肉腫、未分化大細胞リンパ腫、もしくは前駆Tリンパ芽球性リンパ腫))、原発性中枢神経系リンパ腫、セザリー症候群、ワルデンシュトレーム型マクログロブリン血症)、慢性骨髄増殖性新生物、ランゲルハンス細胞組織球症、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、または骨髄異形成性/骨髄増殖性新生物が挙げられるが、これらに限定されない。
[00930]一部の実施形態では、がんは、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)である。一部の実施形態では、がんは、骨髄線維症である。一部の実施形態では、対象は、骨髄線維症を有する。一部の実施形態では、対象は、カルレティキュリン突然変異、例えば、本明細書に開示されるカルレティキュリン突然変異を有する。一部の実施形態では、対象は、JAK2-V617F突然変異を有しない。一部の実施形態では、対象は、JAK2-V617F突然変異を有する。一部の実施形態では、対象は、MPL突然変異を有する。一部の実施形態では、対象は、MPL突然変異を有しない。
[00931]一部の実施形態では、がんは、固形がんである。例示的な固形がんとしては、卵巣がん、直腸がん、胃がん、精巣がん、肛門領域のがん、子宮がん、結腸がん、直腸がん、腎細胞癌、肝臓がん、肺の非小細胞癌、小腸のがん、食道のがん、黒色腫、カポジ肉腫、内分泌系のがん、甲状腺のがん、副甲状腺のがん、副腎のがん、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、頭頸部のがん、皮膚もしくは眼球の悪性黒色腫、子宮がん、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、類表皮がん、子宮頸の癌 扁平上皮細胞がん、卵管の癌、子宮内膜の癌、膣の癌、軟部組織の肉腫、尿道のがん、外陰部の癌、陰茎のがん、膀胱のがん、腎臓もしくは尿管のがん、腎盂の癌、脊髄軸腫瘍、中枢神経系(CNS)の新生物、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、前記がんの転移病変、またはこれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
[00932]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子(または医薬組成物)は、処置または予防しようとする疾患に適した様式で投与される。投与の回数および頻度は、患者の状態、ならびに患者の疾患の種類および重症度などの因子によって決定される。適切な投薬量は、臨床試験によって決定され得る。例えば、「有効量」または「治療量」が示される場合、投与しようとする医薬組成物(または多特異性もしくは多機能性分子)の厳密な量は、腫瘍サイズ、感染または転移の程度、対象の年齢、体重、および状態における個々の違いを考慮して、医師によって決定され得る。一部の実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、104~109個の細胞/体重kg、例えば、105~106個の細胞/体重kgの投薬量で投与され得、これらの範囲内のすべての整数値が含まれる。一部の実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、これらの投薬量で複数回投与されてもよい。一部の実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、免疫療法において説明されている注入技法を使用して投与してもよい(例えば、Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988を参照されたい)。
[00933]一部の実施形態では、多特異性もしくは多機能性分子または医薬組成物は、対象に非経口投与される。一部の実施形態では、細胞は、静脈内、皮下、腫瘍内、節内(intranodally)、筋肉内、皮内、または腹腔内で、対象に投与される。一部の実施形態では、細胞は、腫瘍またはリンパ節に直接的に、投与される、例えば、注射される。一部の実施形態では、細胞は、注入(例えば、Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988に記載される)または静脈内プッシュ(intravenous push)として投与される。一部の実施形態では、細胞は、注射可能なデポー製剤として投与される。
[00934]一部の実施形態では、対象は、哺乳動物である。一部の実施形態では、対象は、ヒト、サル、ブタ、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、ラット、またはマウスである。実施形態では、対象は、ヒトである。一部の実施形態では、対象は、例えば、18歳未満、例えば、17歳未満、16歳未満、15歳未満、14歳未満、13歳未満、12歳未満、11歳未満、10歳未満、9歳未満、8歳未満、7歳未満、6歳未満、5歳未満、4歳未満、3歳未満、2歳未満、1歳未満、またはそれ未満の小児対象である。一部の実施形態では、対象は、成人、例えば、少なくとも18歳、例えば、少なくとも19歳、20歳、21歳、22歳、23歳、24歳、25歳、25~30歳、30~35歳、35~40歳、40~50歳、50~60歳、60~70歳、70~80歳、または80~90歳である。
併用療法
[00935]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、第2の治療剤または手法と併用して使用することができる。
併用療法
[00935]本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、第2の治療剤または手法と併用して使用することができる。
[00936]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子および第2の治療剤または手法は、対象ががんと診断された後、例えば、がんが対象から除去される前に、投与される/行われる。一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、同時にまたは並行して投与される/行われる。例えば、1つの処置の送達は、第2の送達を開始する場合、例えば、処置の投与に重複がある場合、なおも生じている。他の実施形態では、多特異性または多機能性分子、および第2の治療剤または手法は、連続的に投与される/行われる。例えば、一方の処置の送達は、他方の処置の送達が開始する前に停止する。
[00937]一部の実施形態では、併用療法は、いずれかの薬剤単独による単独療法よりも、より効果的な処置をもたらすことができる。一部の実施形態では、第1および第2の処置の併用は、第1または第2の処置単独よりも有効である(例えば、症状および/またはがん細胞のより大きな減少をもたらす)。一部の実施形態では、併用療法は、単独療法として投与された場合に類似の効果を達成するために通常必要とされる第1または第2の処置の用量と比較して、第1または第2の処置のより低い用量の使用を可能にする。一部の実施形態では、併用療法は、部分的な相加効果、完全な相加効果、または相加効果より大きい効果を有する。
[00938]一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、療法、例えば、がん療法(例えば、抗がん剤、免疫療法、光線力学的療法(PDT)、外科手術および/または放射線の1つまたは複数)と併用して投与される。用語「化学療法薬」、「化学療法剤」、および「抗がん剤」は、本明細書において互換的に使用される。多特異性または多機能性分子の投与および療法、例えば、がん療法は、連続的(重複を伴うまたは伴わない)であるかまたは同時であり得る。多特異性または多機能性分子の投与は、療法(例えば、がん療法)の経過中、連続的または断続的であり得る。本明細書に記載される特定の療法は、がんおよび非がん性疾患を処置するために使用することができる。例えば、PDTの有効性は、本明細書に記載された方法および組成物を用いて、がん性および非がん性状態(例えば、結核)において増強され得る(例えば、Agostinis,P.ら(2011年)CA Cancer J.Clin.61巻:250~281ページに概説される)。
抗がん療法
[00939]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、低分子量または小分子量の化学療法剤と併用して投与される。例示的な低分子量または小分子量の化学療法剤には、限定されないが、13-シス-レチノイン酸(イソトレチノイン、ACCUTANE(登録商標))、2-CdA(2-クロロデオキシアデノシン、クラドリビン、LEUSTATIN(商標))、5-アザシチジン(アザシチジン、VIDAZA(登録商標))、5-フルオロウラシル(5-FU、フルオロウラシル、ADRUCIL(登録商標))、6-メルカプトプリン(6-MP、メルカプトプリン、PURINETHOL(登録商標))、6-TG(6-チオグアニン、チオグアニン、THIOGUAN TABLOID(登録商標))、アブラキサン(パクリタキセルタンパク質-結合)、アクチノマイシン-D(ダクチノマイシン、COSMEGEN(登録商標))、アリトレチノイン(PANRETIN(登録商標))、オールトランスレチノイン酸(ATRA、トレチノイン、VESANOID(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン、HMM、HEXALEN(登録商標))、アメトプテリン(メトトレキサート、メトトレキサートナトリウム、MTX、TREXALL(商標)、RHEUMATREX(登録商標))、アミフォスチン(ETHYOL(登録商標))、アラビノシルシトシン(Ara-C、シタラビン、CYTOSAR-U(登録商標))、三酸化ヒ素(TRISENOX(登録商標))、アスパラギナーゼ(エルウィニアL-アスパラギナーゼ、L-アスパラギナーゼ、ELSPAR(登録商標)、KIDROLASE(登録商標))、BCNU(カルムスチン、BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(TREANDA(登録商標))、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))、ブレオマイシン(BLENOXANE(登録商標))、ブスルファン(BUSULFEX)(登録商標)、MYLERAN(登録商標))、カルシウムロイコボリン(シトロボラムファクター、フォリン酸、ロイコボリン)、カンプトテシン-11(CPT-11、イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、カルボプラチン(PARAPLATIN(登録商標))、カルムスチンウエハー(カルムスチンインプラントを有するプロリフェプロスパン20、GLIADEL(登録商標)ウエハー)、CCI-779(テムシロリムス、TORISEL(登録商標))、CCNU(ロムスチン、CeeNU)、CDDP(シスプラチン、PLATINOL(登録商標)、PLATINOL-AQ(登録商標))、クロラムブシル(ロイケラン)、シクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標)、NEOSAR(登録商標))、ダカルバジン(DIC、DTIC、イミダゾールカルボキサミド、DTIC-DOME(登録商標))、ダウノマイシン(ダウノルビシン、ダウノルビシン塩酸塩、ルビドマイシンハイドロクロライド、CERUBIDINE(登録商標))、デシタビン(DACOGEN(登録商標))、デキサゾキサン(ZINECARD(登録商標))、DHAD(ミトキサントロン、NOVANTRONE(登録商標))、ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標))、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、RUBEX(登録商標))、エピルビシン(ELLENCE(商標))、エストラムスチン(EMCYT(登録商標))、エトポシド(VP-16、リン酸エトポシド、TOPOSAR(登録商標)、VEPESID(登録商標)、ETOPOPHOS(登録商標))、フロクスウリジン(FUDR(登録商標))、フルダラビン(FLUDARA(登録商標))、フルオロウラシル(クリーム)(CARAC(商標)、EFUDEX(登録商標)、FLUOROPLEX(登録商標))、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、ヒドロキシ尿素(HYDREA(登録商標)、DROXIA(商標)、MYLOCEL(商標))、イダルビシン(IDAMYCIN(登録商標))、イフォスファミド(IFEX(登録商標))、イキサベピロン(IXEMPRA(商標))、LCR(ロイロクリスチン、ビンクリスチン、VCR、ONCOVIN(登録商標)、VINCASAR PFS(登録商標))、L-PAM(L-サルコリシン、メルファラン、フェニルアラニンマスタード、ALKERAN(登録商標))、メクロレタミン(塩酸メクロレタミン、ムスチン、ナイトロジェンマスタード、MUSTARGEN(登録商標))、メスナ(MESNEX(商標))、マイトマイシン(マイトマイシン-C、MTC、MUTAMYCIN(登録商標))、ネララビン(ARRANON(登録商標))、オキサリプラチン(ELOXATIN(商標))、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、ONXAL(商標))、ペガスパルガーゼ(PEG-L-アスパラギナーゼ、ONCOSPAR(登録商標))、PEMETREXED(ALIMTA(登録商標))、ペントスタチン(NIPENT(登録商標))、プロカルバジン(MATULANE(登録商標))、ストレプトゾシン(ZANOSAR(登録商標))、テモゾロミド(TEMODAR(登録商標))、テニポシド(VM-26、VUMON(登録商標))、TESPA(チオホスホアミド、チオテパ、TSPA、THIOPLEX(登録商標))、トポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ビンブラスチン(硫酸ビンブラスチン、ビンカロイコブラスチン、VLB、ALKABAN-AQ(登録商標)、VELBAN(登録商標))、ビノレルビン(酒石酸ビノレルビン、NAVELBINE(登録商標))、およびボリノスタット(ZOLINZA(登録商標))が含まれる。
抗がん療法
[00939]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、低分子量または小分子量の化学療法剤と併用して投与される。例示的な低分子量または小分子量の化学療法剤には、限定されないが、13-シス-レチノイン酸(イソトレチノイン、ACCUTANE(登録商標))、2-CdA(2-クロロデオキシアデノシン、クラドリビン、LEUSTATIN(商標))、5-アザシチジン(アザシチジン、VIDAZA(登録商標))、5-フルオロウラシル(5-FU、フルオロウラシル、ADRUCIL(登録商標))、6-メルカプトプリン(6-MP、メルカプトプリン、PURINETHOL(登録商標))、6-TG(6-チオグアニン、チオグアニン、THIOGUAN TABLOID(登録商標))、アブラキサン(パクリタキセルタンパク質-結合)、アクチノマイシン-D(ダクチノマイシン、COSMEGEN(登録商標))、アリトレチノイン(PANRETIN(登録商標))、オールトランスレチノイン酸(ATRA、トレチノイン、VESANOID(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン、HMM、HEXALEN(登録商標))、アメトプテリン(メトトレキサート、メトトレキサートナトリウム、MTX、TREXALL(商標)、RHEUMATREX(登録商標))、アミフォスチン(ETHYOL(登録商標))、アラビノシルシトシン(Ara-C、シタラビン、CYTOSAR-U(登録商標))、三酸化ヒ素(TRISENOX(登録商標))、アスパラギナーゼ(エルウィニアL-アスパラギナーゼ、L-アスパラギナーゼ、ELSPAR(登録商標)、KIDROLASE(登録商標))、BCNU(カルムスチン、BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(TREANDA(登録商標))、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))、ブレオマイシン(BLENOXANE(登録商標))、ブスルファン(BUSULFEX)(登録商標)、MYLERAN(登録商標))、カルシウムロイコボリン(シトロボラムファクター、フォリン酸、ロイコボリン)、カンプトテシン-11(CPT-11、イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、カルボプラチン(PARAPLATIN(登録商標))、カルムスチンウエハー(カルムスチンインプラントを有するプロリフェプロスパン20、GLIADEL(登録商標)ウエハー)、CCI-779(テムシロリムス、TORISEL(登録商標))、CCNU(ロムスチン、CeeNU)、CDDP(シスプラチン、PLATINOL(登録商標)、PLATINOL-AQ(登録商標))、クロラムブシル(ロイケラン)、シクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標)、NEOSAR(登録商標))、ダカルバジン(DIC、DTIC、イミダゾールカルボキサミド、DTIC-DOME(登録商標))、ダウノマイシン(ダウノルビシン、ダウノルビシン塩酸塩、ルビドマイシンハイドロクロライド、CERUBIDINE(登録商標))、デシタビン(DACOGEN(登録商標))、デキサゾキサン(ZINECARD(登録商標))、DHAD(ミトキサントロン、NOVANTRONE(登録商標))、ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標))、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、RUBEX(登録商標))、エピルビシン(ELLENCE(商標))、エストラムスチン(EMCYT(登録商標))、エトポシド(VP-16、リン酸エトポシド、TOPOSAR(登録商標)、VEPESID(登録商標)、ETOPOPHOS(登録商標))、フロクスウリジン(FUDR(登録商標))、フルダラビン(FLUDARA(登録商標))、フルオロウラシル(クリーム)(CARAC(商標)、EFUDEX(登録商標)、FLUOROPLEX(登録商標))、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、ヒドロキシ尿素(HYDREA(登録商標)、DROXIA(商標)、MYLOCEL(商標))、イダルビシン(IDAMYCIN(登録商標))、イフォスファミド(IFEX(登録商標))、イキサベピロン(IXEMPRA(商標))、LCR(ロイロクリスチン、ビンクリスチン、VCR、ONCOVIN(登録商標)、VINCASAR PFS(登録商標))、L-PAM(L-サルコリシン、メルファラン、フェニルアラニンマスタード、ALKERAN(登録商標))、メクロレタミン(塩酸メクロレタミン、ムスチン、ナイトロジェンマスタード、MUSTARGEN(登録商標))、メスナ(MESNEX(商標))、マイトマイシン(マイトマイシン-C、MTC、MUTAMYCIN(登録商標))、ネララビン(ARRANON(登録商標))、オキサリプラチン(ELOXATIN(商標))、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、ONXAL(商標))、ペガスパルガーゼ(PEG-L-アスパラギナーゼ、ONCOSPAR(登録商標))、PEMETREXED(ALIMTA(登録商標))、ペントスタチン(NIPENT(登録商標))、プロカルバジン(MATULANE(登録商標))、ストレプトゾシン(ZANOSAR(登録商標))、テモゾロミド(TEMODAR(登録商標))、テニポシド(VM-26、VUMON(登録商標))、TESPA(チオホスホアミド、チオテパ、TSPA、THIOPLEX(登録商標))、トポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ビンブラスチン(硫酸ビンブラスチン、ビンカロイコブラスチン、VLB、ALKABAN-AQ(登録商標)、VELBAN(登録商標))、ビノレルビン(酒石酸ビノレルビン、NAVELBINE(登録商標))、およびボリノスタット(ZOLINZA(登録商標))が含まれる。
[00940]別の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、生物製剤と併用して投与される。がんの処置に有用な生物製剤は、当該技術分野において公知であり、本発明の結合分子は、例えば、このような公知の生物製剤と組み合わせて投与することができる。例えば、FDAは、乳がんの処置のために次の生物製剤を承認している:HERCEPTIN(登録商標)(トラスツズマブ、Genentech Inc.、South San Francisco、Calif.;HER2陽性乳がんで抗腫瘍活性化を有するヒト化モノクローナル抗体);FASLODEX(登録商標)(フルベストラント、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP、Wilmington、Del.;乳がんの処置に使用されるエストロゲン受容体拮抗薬);ARIMIDEX(登録商標)(アナストロゾール、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP;エストロゲンの作製に必要な酵素であるアロマターゼを遮断する非ステロイド性アロマターゼ阻害剤);アロマシン(登録商標)(エキセメスタン、Pfizer Inc.、New York、N.Y.;乳がんの処置に使用される不可逆的なステロイド性アロマターゼ不活性化剤);FEMARA(登録商標)(レトロゾール、Novartis Pharmaceuticals、East Hanover、N.J.;FDAにより乳がんを処置するために承認された非ステロイドアロマターゼ阻害剤);およびNOLVADEX(登録商標)(タモキシフェン、AstraZeneca Pharmaceuticals、LP;FDAにより乳がんを処置するために承認された非ステロイド性抗エストロゲン剤)。本発明の結合分子と組み合わせることができる他の生物製剤には、以下が含まれる:AVASTIN(登録商標)(ベバシズマブ、Genentech Inc.;血管新生を阻害するように設計された最初のFDA承認療法);およびZEVALIN(登録商標)(イブリツモマブチウキセタン、Biogen Idec、Cambridge、Mass;B細胞リンパ腫の処置のために現在承認されている放射性標識モノクローナル抗体)。
[00941]さらに、FDAは、結腸直腸がんの処置のために以下の生物製剤を承認した:AVASTIN(登録商標);ERBITUX(登録商標)(セツキシマブ、ImClone Systems Inc.、New York、N.Y.、およびBristol-Myers Squibb、New York、N.Y.;上皮成長因子受容体(EGFR)に対して指向されるモノクローナル抗体);GLEEVEC(登録商標)(メシル酸イマチニブ;プロテインキナーゼ阻害剤);およびERGAMISOL(登録商標)(レバミゾール塩酸塩、Janssen Pharmaceutica Products、LP、Titusville、N.J.;デュークスのステージC結腸がんを有する患者の外科的切除後に5-フルオロウラシルと併用するアジュバント療法として1990年にFDAにより承認された免疫調節薬)。
[00942]肺がんの処置のために、例示的な生物製剤には、TARCEBA(登録商標)(エルロチニブHCL、OSI Pharmaceuticals Inc.、Melville、N.Y.;ヒト上皮成長因子受容体1(HER1)経路を標的とするように設計された小分子)が含まれる。
[00943]多発性骨髄腫の処置のために、例示的な生物製剤には、VELCADE(登録商標)ベルケイド(ボルテゾミブ、Millennium Pharmaceuticals、Cambridge Mass.、プロテアソーム阻害剤)が含まれる。追加の生物製剤には、THALIDOMID(登録商標)(サリドマイド、Clegene Corporation、Warren、N.J.;免疫調節剤であり、骨髄腫細胞の成長と生存を阻害する能力、および抗血管新生を含む複数の作用があるようである)が含まれる。
[00944]追加の例示的ながん療法用抗体には、限定されないが、3F8、アバゴボマブ、アデカツマブ、アフツズマブ、アラシズマブペゴル、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標)、MABCAMPATH(登録商標))、アルツモマブペンテテート(HYBRI-CEAKER(登録商標))、アナツモマブマフェナトックス、アンルキンズマブ(IMA-638)、アポリズマブ、アルシツモマブ(CEA-SCAN(登録商標))、バビツキシマブ、ベクツモマブ(LYMPHOSCAN(登録商標))、ベリムマブ(BENLYSTA(登録商標)、LYMPHOSTAT-B(登録商標))、ベシレソマブ(SCINTIMUN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、ビバツズマブマータンシン、ブリナツモマブ、ブレンツキシマブベドチン、カンツズマブメルタンシン、カプロマブペンデチド(PROSTASCINT(登録商標))、カツマキソマブ(REMOVAB(登録商標))、CC49、セツキシマブ(C225、ERBITUX(登録商標))、シタツズマブボガトックス、シクスツムマブ、クリバツズマブテトラキセタン、コナツムマブ、デセツズマブ、デノスマブ(PROLIA(登録商標))、デツモマブ、エクロメキシマブ、エドレコロマブ(PANOREX(登録商標))、エロツズマブ、エピツモマブシツキセタン、エプラツズマブ、エルツマキソマブ(REXOMUN(登録商標))、エタラシズマブ、ファルレツズマブ、フィギツムマブ、フレソリムマブ、ガリキシマブ、ゲムツズマブオゾガミシン(MYLOTARG(登録商標))、ギレンツキシマブ、グレンバツムマブベドチン、イブリツモマブ(イブリツモマブチウキセタン、ZEVALIN(登録商標))、イゴボマブ(INDIMACIS-125(登録商標))、インテツムマブ、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、イラツムマブ、ラベツズマブ(CEA-CIDE(登録商標))、レキサツムマブ、リンツズマブ、ルカツムマブ、ルミリキシマブ、マパツムマブ、マツズマブ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミツモマブ、ナコロマブタフェナトックス、ナプツモマブエスタフェナトックス、ネシツムマブ、ニモツズマブ(THERACIM(登録商標)、THERALOC(登録商標))、ノフェツモマブメルペンタン(VERLUMA(登録商標))、オファツムマブ(ARZERRA(登録商標))、オララツマブ、オポルツズマブモナトックス、オレゴボマブ(OVAREX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ペムツモマブ(THERAGYN(登録商標))、パーツズマブ(OMNITARG(登録商標))、ピンツモマブ、プリツムマブ、ラムシルマブ、ラニビズマブ(LUCENTIS(登録商標))、リロツムマブ、リツキシマブ(MABTHERA(登録商標)、RITUXAN(登録商標))、ロバツムマブ、サツモマブペンデチド、シブロツズマブ、シルツキシマブ、ソンツズマブ、タカツズマブテトラキセタン(AFP-CIDE(登録商標))、タプリツモマブパプトックス、テナツモマブ、TGN1412、チシリムマブ(トレメリムマブ)、チガツズマブ、TNX-650、トシツモマブ(BEXXAR(登録商標))、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、トレメリムマブ、ツコツズマブセルモロイキン、ベルツズマブ、ボロシキシマブ、ボツムマブ(HUMASPECT(登録商標))、ザルツムマブ(HUMAX-EGFR(登録商標))、およびザノリムマブ(HUMAX-CD4(登録商標))が含まれる。
[00945]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、ウイルスがん治療剤と併用して投与される。例示的なウイルスがん治療剤には、限定されないが、ワクシニアウイルス(vvDD-CDSR)、がん胎児性抗原発現麻疹ウイルス、組換えワクシニアウイルス(TK-欠失+GM-CSF)、セネカバレーウイルス-001、ニューカッスルウイルス、コクサッキーウイルスA21、GL-ONC1、EBNA1 C末端/LMP2キメラタンパク質発現組換え修飾ワクシニアアンカラワクチン、がん胎児性抗原発現麻疹ウイルス、G207腫瘍溶解性ウイルス、p53を発現する修飾ワクシニアウイルスアンカラワクチン、OncoVEX GM-CSF修飾ヘルペスシンプレックス1ウイルス、鶏痘ウイルスワクチンベクター、組換えワクシニア前立腺特異抗原ワクチン、ヒトパピローマウイルス16/18 L1ウイルス様粒子/AS04ワクチン、MVA-EBNA1/LMP2 Inj.ワクチン、4価HPVワクチン、4価ヒトパピローマウイルス(タイプ6、11、16、18)組換えワクチン(GARDASIL(登録商標))、組換え鶏痘-CEA(6D)/TRICOMワクチン;組換えワクシニア-CEA(6D)-TRICOMワクチン、組換え修飾ワクシニアAnkara-5T4ワクチン、組換え鶏痘-TRICOMワクチン、腫瘍崩壊性ヘルペスウイルスNV1020、HPV L1 VLPワクチンV504、ヒトパピローマウイルス二価(タイプ16および18)ワクチン(CERVARIX(登録商標))、単純ヘルペスウイルスHF10、Ad5CMV-p53遺伝子、組換えワクシニアDF3/MUC1ワクチン、組換えワクシニア-MUC-1ワクチン、組換えワクシニア-TRICOMワクチン、ALVAC MART-1ワクチン、ヒトプレプロエンケファリン(NP2)を発現する複製欠損単純ヘルペスウイルスI型(HSV-1)ベクター、野生型レオウイルス、レオウイルスタイプ3ディアリング(REOLYSIN(登録商標))、腫瘍溶解性ウイルスHSV1716、エプスタイン・バーウイルス標的抗原をコードする組換え改変ワクシニアアンカラ(MVA)ベースのワクチン、組換え鶏痘前立腺特異抗原ワクチン、組換えワクシニア前立腺特異抗原ワクチン、組換えワクシニア-B7.1ワクチン、rAd-p53遺伝子、Ad5-delta24RGD、HPVワクチン580299、JX-594(チミジンキナーゼ欠失ワクシニアウイルス+GM-CSF)、HPV-16/18 L1/AS04、鶏痘ウイルスワクチンベクター、ワクシニアチロシナーゼワクチン、MEDI-517 HPV-16/18 VLP AS04ワクチン、単純ヘルペスウイルスTK99UNのチミジンキナーゼを含むアデノウイルスベクター、HspE7、FP253/フルダラビン、ALVAC(2)黒色腫多抗原治療ワクチン、ALVAC-hB7.1、カナリア痘-hIL-12黒色腫ワクチン、Ad-REIC/Dkk-3、rAd-IFN SCH 721015、TIL-Ad-INFg、Ad-ISF35、およびコクサッキーウイルスA21(CVA21、CAVATAK(登録商標))が含まれる。
[00946]他の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、ナノ医薬品と併用して投与される。例示的ながんナノ医薬品には、限定されないが、ABRAXANE(登録商標)(パクリタキセル結合アルブミンナノ粒子)、CRLX101(直鎖シクロデキストリンベースのポリマーにコンジュゲートしたCPT)、CRLX288(ドセタキセルを生分解性ポリマーポリ(乳酸-co-グリコール酸)にコンジュゲートしている)、シタラビンリポソーム(リポソームAra-C、DEPOCYT(商標))、ダウノルビシンリポソーム(DAUNOXOME(登録商標))、ドキソルビシンリポソーム(DOXIL(登録商標)、CAELYX(登録商標))、カプセル化ダウノルビシンクエン酸リポソーム(DAUNOXOME(登録商標))、およびPEG抗VEGFアプタマー(MACUGEN(登録商標))が含まれる。
[00947]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、パクリタキセルまたはパクリタキセル製剤、例えば、TAXOL(登録商標)、タンパク質結合パクリタキセル(例えば、ABRAXANE(登録商標))と併用して投与される。例示的なパクリタキセル製剤には、限定されないが、ナノ粒子アルブミン結合パクリタキセル(ABRAXANE(登録商標)、Abraxis Bioscienceにより販売される)、ドコサヘキサエン酸結合パクリタキセル(DHA-パクリタキセル、タキソプレキシン、Protargaにより販売される)、ポリグルタミン酸結合パクリタキセル(PG-パクリタキセル、パクリタキセル・ポリグルメックス、CT-2103、XYOTAX、Cell Therapeuticにより販売される)、腫瘍活性化プロドラッグ(TAP)、ANG105(Angiopep-2はパクリタキセルの3つの分子に結合し、ImmunoGenにより販売される)、パクリタキセル-EC-1(パクリタキセルはerbB2認識ペプチドEC-1に結合する;Liら、Biopolymers(2007年)87巻:225~230ページを参照)、およびグルコースをコンジュゲートしたパクリタキセル(例えば、2’-パクリタキセルメチル2-グルコピラノシルスクシナート、Liuら、Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters(2007年)17巻:617~620ページを参照)が含まれる。
[00948]がんを処置するための例示的なRNAiおよびアンチセンスRNA剤には、限定されないが、CALAA-01、siG12D LODER(Local Drug EluteR)、およびALN-VSP02が含まれる。
[00949]他のがん治療剤には、限定されないが、サイトカイン(例えば、アルデスロイキン(IL-2、インターロイキン-2、PROLEUKIN(登録商標))、アルファインターフェロン(IFN-アルファ、インターフェロンアルファ、INTRON(登録商標)A(インターフェロンアルファ-2b)、ROFERON-A(登録商標)(インターフェロンアルファ-2a))、エポエチンアルファ(PROCRIT(登録商標))、フィルグラスチム(G-CSF、顆粒球-コロニー刺激因子、NEUPOGEN(登録商標))、GM-CSF(顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、サルグラモスチム、LEUKINE(商標))、IL-11(インターロイキン-11、オプレルベキン、NEUMEGA(登録商標))、インターフェロンアルファ-2b(PEGコンジュゲート)(PEGインターフェロン、PEG-INTRON(商標))、およびペグフィルグラスチム(NEULASTA(商標))、ホルモン療法剤(例えば、アミノグルテチミド(CYTADREN(登録商標))、アナストロゾール(ARIMIDEX(登録商標))、ビカルタミド(CASODEX(登録商標))、エキセメスタン(AROMASIN(登録商標))、フルオキシメステロン(HALOTESTIN(登録商標))、フルタミド(EULEXIN(登録商標))、フルベストラント(FASLODEX(登録商標))、ゴセレリン(ZOLADEX(登録商標))、レトロゾール(FEMARA(登録商標))、リュープロリド(ELIGARD(商標)、LUPRON(登録商標)、LUPRON DEPOT(登録商標)、VIADUR(商標))、メゲストロール(酢酸メゲストロール、MEGACE(登録商標))、ニルタミド(ANANDRON(登録商標)、NILANDRON(登録商標))、オクトレオチド(酢酸オクトレオチド、SANDOSTATIN(登録商標)、SANDOSTATIN LAR(登録商標))、ラロキシフェン(EVISTA(登録商標))、ロミプロスチム(NPLATE(登録商標))、タモキシフェン(NOVALDEX(登録商標))、およびトレミフェン(FARESTON(登録商標)))、ホスホリパーゼA2阻害剤(例えば、アナグレリド(AGRYLIN(登録商標)))、生物応答改変剤(例えば、BCG(THERACYS(登録商標)、TICE(登録商標))、およびダルベポエチンアルファ(ARANESP(登録商標)))、標的治療薬(例えば、ボルテゾミブ(VELCADE(登録商標))、ダサチニブ(SPRYCEL(商標))、デニロイキンジフチトックス(ONTAK(登録商標))、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、メシル酸イマチニブ(STI-571、GLEEVEC(商標))、ラパチニブ(TYKERB(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、およびSU11248(スニチニブ、SUTENT(登録商標)))、免疫調節薬および抗血管新生薬(例えば、CC-5013(レナリドマイド、REVLIMID(登録商標))、およびサリドマイド(THALOMID(登録商標)))、グルココルチコステロイド(例えば、コルチゾン(ヒドロコルチゾン、ヒドロコルチゾンリン酸ナトリウム、ヒドロコルチゾンコハク酸ナトリウム、ALA-CORT(登録商標)、HYDROCORT ACETATE(登録商標)、リン酸ヒドロコルトン LANACORT(登録商標)、SOLU-CORTEF(登録商標))、デカドロン(デキサメタゾン、デキサメタゾン酢酸塩、デキサメタゾンリン酸ナトリウム、DEXASONE(登録商標)、DIODEX(登録商標)、HEXADROL(登録商標)、MAXIDEX(登録商標))、メチルプレドニゾロン(6-メチルプレドニゾロン、酢酸メチルプレドニゾロン、メチルプレドニゾロンコハク酸ナトリウム、DURALONE(登録商標)、MEDRALONE(登録商標)、MEDROL(登録商標)、M-PREDNISOL(登録商標)、SOLU-MEDROL(登録商標))、プレドニゾロン(DELTA-CORTEF(登録商標)、ORAPRED(登録商標)、PEDIAPRED(登録商標)、PRELONE(登録商標))、およびプレドニゾン(DELTASONE(登録商標)、LIQUID PRED(登録商標)、METICORTEN(登録商標)、ORASONE(登録商標)))、およびビスホスホネート(例えば、パミドロネート(AREDIA(登録商標))、およびゾレドロン酸(ZOMETA(登録商標))が含まれる。
[00950]一部の実施形態では、多特異性または多機能性分子は、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、受容体チロシンキナーゼ(RTK)阻害剤)と併用して使用される。例示的なチロシンキナーゼ阻害剤には、限定されないが、上皮成長因子(EGF)経路阻害剤(例えば、上皮成長因子受容体(EGFR)阻害剤)、血管内皮成長因子(VEGF)経路阻害剤(例えば、VEGFに対する抗体、VEGFトラップ、血管内皮成長因子受容体(VEGFR)阻害剤(例えば、VEGFR-1阻害剤、VEGFR-2阻害剤、VEGFR-3阻害剤))、血小板由来成長因子(PDGF)経路阻害剤(例えば、血小板由来成長因子受容体(PDGFR)阻害剤(例えば、PDGFR-β阻害剤))、RAF-1阻害剤、KIT阻害剤およびRET阻害剤が含まれる。一部の実施形態では、AHCM剤と併用して使用される抗がん剤は、アキシチニブ(AG013736)、ボスチニブ(SKI-606)、セジラニブ(RECENTIN(商標)、AZD2171)、ダサチニブ(SPRYCEL(登録商標)、BMS-354825)、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、イマチニブ(Gleevec(登録商標)、CGP57148B、STI-571)、ラパチニブ(TYKERB(登録商標)、TYVERB(登録商標))、レスタウルチニブ(CEP-701)、ネラチニブ(HKI-272)、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、セマキサニブ(セマキシニブ、SU5416)、スニチニブ(SUTENT(登録商標)、SU11248)、トセラニブ(PALLADIA(登録商標))、バンデタニブ(ZACTIMA(登録商標)、ZD6474)、バタラニブ(PTK787、PTK/ZK)、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、リツキシマブ(RITUXAN(登録商標))、セツキシマブ(ERBITUX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ラニビズマブ(Lucentis(登録商標))、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、アレムツズマブ(CAMPATH(登録商標))、ゲムツズマブオゾガマイシン(MYLOTARG(登録商標))、ENMD-2076、PCI-32765、AC220、乳酸ドビチニブ(TKI258、CHIR-258)、BIBW 2992(TOVOK(商標))、SGX523、PF-04217903、PF-02341066、PF-299804、BMS-777607、ABT-869、MP470、BIBF 1120(VARGATEF(登録商標))、AP24534、JNJ-26483327、MGCD265、DCC-2036、BMS-690154、CEP-11981、チボザニブ(AV-951)、OSI-930、MM-121、XL-184、XL-647、XL228、AEE788、AG-490、AST-6、BMS-599626、CUDC-101、PD153035、ペリチニブ(EKB-569)、バンデタニブ(ザクティマ)、WZ3146、WZ4002、WZ8040、ABT-869(リニファニブ)、AEE788、AP24534(ポナチニブ)、AV-951(チボザニブ)、アキシチニブ、BAY 73-4506(レゴラフェニブ)、ブリバニブアラニネート(BMS-582664)、ブリバニブ(BMS-540215)、セジラニブ(AZD2171)、CHIR-258(ドビチニブ)、CP 673451、CYC116、E7080、Ki8751、マシチニブ(AB1010)、MGCD-265、モテサニブ二リン酸(AMG-706)、MP-470、OSI-930、パゾパニブ塩酸塩、PD173074、ソラフェニブトシレート(Bay 43-9006)、SU 5402、TSU-68(SU6668)、バタラニブ、XL880(GSK1363089、EXEL-2880)からなる群から選択される。選択されたチロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、またはソラフェニブから選択される。一実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブである。
[00951]一実施形態では、多特異性または多機能性分子は、抗血管新生剤、または血管標的剤または血管破壊剤のうちの1つまたは複数と併用して投与される。例示的な抗血管新生剤には、限定されないが、とりわけ、VEGF阻害剤(例えば、抗VEGF抗体(例えば、ベバシズマブ);VEGF受容体阻害剤(例えば、イトラコナゾール);細胞増殖および/または内皮細胞移動の阻害剤(例えば、カルボキシアミドトリアゾール、TNP-470);血管新生刺激剤の阻害剤(例えば、スラミン)が含まれる。血管標的剤(VTA)または血管破壊剤(VDA)は、中枢壊死を引き起こすがん腫瘍の血管系(血管)を損傷するように設計されている(例えば、Thorpe,P.E.(2004年)Clin.Cancer Res.Vol.10巻:415~427ページに概説される)。VTAは、小分子であり得る。例示的な小分子VTAには、限定されないが、微小管不安定化剤(例えば、コンブレタスタチンA-4リン酸二ナトリウム(CA4P)、ZD6126、AVE8062、Oxi 4503);およびバジメザン(ASA404)が含まれる。
免疫チェックポイント阻害剤
[00952]他の実施形態では、本明細書に記載される方法は、多特異性または多機能性分子と併用した免疫チェックポイント阻害剤の使用を含む。この方法は、in vivoの治療プロトコールにおいて使用することができる。
免疫チェックポイント阻害剤
[00952]他の実施形態では、本明細書に記載される方法は、多特異性または多機能性分子と併用した免疫チェックポイント阻害剤の使用を含む。この方法は、in vivoの治療プロトコールにおいて使用することができる。
[00953]一部の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、チェックポイント分子を阻害する。例示的なチェックポイント分子には、限定されないが、CTLA4、PD1、PD-L1、PD-L2、TIM3、LAG3、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、BTLA、KIR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、およびA2aRが含まれる。例えば、参照により本明細書に組み込まれるPardoll.Nat.Rev.Cancer 12.4(2012年):252~64ページを参照されたい。
[00954]一部の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1阻害剤、例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブなどの抗PD-1抗体である。ニボルマブ(MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538、またはBMS-936558とも呼ばれる)は、PD1を特異的に阻害する完全ヒトIgG4モノクローナル抗体である。例えば、米国特許第8,008,449号および国際公開第2006/121168号を参照されたい。ペンブロリズマブ(Lambrolizumab、MK-3475、MK03475、SCH-900475、またはKEYTRUDA(登録商標)とも呼ばれる;Merck)は、PD-1に結合するヒト化IgG4モノクローナル抗体である。例えば、Hamid,O.ら(2013年)New England Journal of Medicine 369巻(2号):134~44ページ、米国特許第8,354,509号および国際公開第2009/114335号を参照されたい。ピジリズマブ(CT-011またはCure Techとも呼ばれる)は、PD1に結合するヒト化IgG1kモノクローナル抗体である。例えば、国際公開第2009/101611号を参照されたい。一実施形態では、PD-1の阻害剤は、実質的に同一または類似の配列、例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブの配列に対して少なくとも85%、90%、95%同一であるまたはそれを超える配列を有する抗体分子である。追加の抗PD1抗体、例えば、AMP 514(Amplimmune)は、例えば、米国特許第8,609,089号、米国特許出願公開第2010/028330号、および/または米国特許出願公開第2012/0114649号に記載されている。
[00955]一部の実施形態では、PD-1阻害剤は、イムノアドヘシン、例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリンのFc領域)に融合されたPD-1リガンド(例えば、PD-L1またはPD-L2)の細胞外/PD-1結合部分を含むイムノアドヘシンである。一部の実施形態では、PD-1阻害剤は、B7-H1とPD-1の間の相互作用を遮断するPD-L2 Fc融合可溶性受容体であるAMP-224(B7-DCIg、例えば、国際公開第2011/066342号および国際公開第2010/027827号に記載される)である。
[00956]一部の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L1阻害剤、例えば、抗体分子である。一部の実施形態では、PD-L1阻害剤は、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、またはMDX-1105である。一部の実施形態では、抗PD-L1抗体は、MSB0010718C(A09-246-2とも呼ばれる;Merck Serono)であり、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。例示的なヒト化抗PD-L1抗体は、例えば、国際公開第2013/079174号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、抗PD-L1抗体、例えば、YW243.55.S70である。YW243.55.S70抗体は、例えば、国際公開第2010/077634号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、MDX-1105(BMS-936559とも呼ばれる)であり、例えば、国際公開第2007/005874号に記載されている。一実施形態では、PD-L1阻害剤は、MDPL3280A(Genentech/Roche)であり、PD-L1に対するヒトFc最適化IgG1モノクローナル抗体である。例えば、米国特許第7,943,743号および米国特許出願公開第2012/0039906号を参照されたい。一実施形態では、PD-L1の阻害剤は、実質的に同一または類似の配列、例えば、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、またはMDX-1105の配列に対して少なくとも85%、90%、95%同一であるまたはそれを超える配列を有する抗体分子である。
[00957]一部の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L2阻害剤、例えば、AMP-224(PD1とB7-H1の間の相互作用を遮断するPD-L2 Fc融合可溶性受容体である)である。例えば、国際公開第2010/027827号および国際公開第2011/066342号を参照されたい。
[00958]一実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、LAG-3阻害剤、例えば、抗LAG-3抗体分子である。一部の実施形態では、抗LAG-3抗体は、BMS-986016(BMS986016とも呼ばれる、Bristol-Myers Squibb)である。BMS-986016および他のヒト化抗LAG-3抗体は、例えば、米国特許出願公開第2011/0150892号、国際公開第2010/019570号、および国際公開第2014/008218号に記載されている。
[00959]一部の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、例えば、米国特許第8,552,156号、国際公開第2011/155607号、欧州特許第2581113号および米国特許出願公開第2014/044728号に記載される、抗TIM3抗体分子などのTIM-3阻害剤である。
[00960]一部の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、CTLA-4阻害剤、例えば、抗CTLA-4抗体分子である。例示的な抗CTLA4抗体には、トレメリムマブ(以前はチシリムマブ、CP-675,206として公知であるPfizerのIgG2モノクローナル抗体)、およびイピリムマブ(MDX-010とも呼ばれる、CAS No.477202-00-9)が含まれる。他の例示的な抗CTLA-4抗体は、例えば、米国特許第5,811,097号に記載されている。
CRSグレード付け
[00961]一部の実施形態では、本明細書に記載される組成物は、他の組成物と比較して、より低いレベルのサイトカイン放出症候群(CRS)を誘導し得る、および/またはCRSを引き起こすより少ない機会しか有しない場合がある(引き起こさない場合もある)。一部の実施形態では、CRSは、以下のように1~5の重症度でグレード付けすることができる。グレード1~3は、重度CRSよりも軽度である。グレード4~5は、重度CRSである。グレード1のCRSでは、対症療法のみが必要であり(例えば、悪心、発熱、疲労、筋肉痛、倦怠感、頭痛)、症状は生命を脅かすものではない。グレード2のCRSでは、症状には、中等度の介入が必要であり、一般に中等度の介入に応答する。グレード2のCRSを有する対象は、輸液もしくは1回の低用量昇圧剤のいずれかに応答する低血圧を発症するか、またはグレード2の臓器毒性もしくは低流量酸素(40%未満の酸素)に応答する軽度の呼吸器症状を発症する。グレード3のCRS対象では、低血圧は、一般に、輸液療法または1回の低用量昇圧剤によって回復することができない。これらの対象は、一般に、低流量酸素を超える必要があり、グレード3の臓器毒性(例えば、腎もしくは心機能障害または凝固障害)および/またはグレード4の高トランスアミナーゼ血症を有する。グレード3のCRS対象は、より積極的な介入、例えば、酸素40%以上、高用量昇圧剤、および/または複数の昇圧剤が必要である。グレード4のCRS対象は、グレード4の臓器毒性または人工呼吸器の必要性など、直ちに生命を脅かす症状に苦しんでいる。グレード4のCRS対象は、一般に、高トランスアミナーゼ血症を有しない。グレード5のCRS対象では、毒性は、死亡を引き起こす。CRSをグレード付けるための基準セットは、表39、表40、および表41として本明細書に提供される。別段の規定がない限り、本明細書で使用される場合CRSは、表40の基準に従ったCRSを指す。
CRSグレード付け
[00961]一部の実施形態では、本明細書に記載される組成物は、他の組成物と比較して、より低いレベルのサイトカイン放出症候群(CRS)を誘導し得る、および/またはCRSを引き起こすより少ない機会しか有しない場合がある(引き起こさない場合もある)。一部の実施形態では、CRSは、以下のように1~5の重症度でグレード付けすることができる。グレード1~3は、重度CRSよりも軽度である。グレード4~5は、重度CRSである。グレード1のCRSでは、対症療法のみが必要であり(例えば、悪心、発熱、疲労、筋肉痛、倦怠感、頭痛)、症状は生命を脅かすものではない。グレード2のCRSでは、症状には、中等度の介入が必要であり、一般に中等度の介入に応答する。グレード2のCRSを有する対象は、輸液もしくは1回の低用量昇圧剤のいずれかに応答する低血圧を発症するか、またはグレード2の臓器毒性もしくは低流量酸素(40%未満の酸素)に応答する軽度の呼吸器症状を発症する。グレード3のCRS対象では、低血圧は、一般に、輸液療法または1回の低用量昇圧剤によって回復することができない。これらの対象は、一般に、低流量酸素を超える必要があり、グレード3の臓器毒性(例えば、腎もしくは心機能障害または凝固障害)および/またはグレード4の高トランスアミナーゼ血症を有する。グレード3のCRS対象は、より積極的な介入、例えば、酸素40%以上、高用量昇圧剤、および/または複数の昇圧剤が必要である。グレード4のCRS対象は、グレード4の臓器毒性または人工呼吸器の必要性など、直ちに生命を脅かす症状に苦しんでいる。グレード4のCRS対象は、一般に、高トランスアミナーゼ血症を有しない。グレード5のCRS対象では、毒性は、死亡を引き起こす。CRSをグレード付けるための基準セットは、表39、表40、および表41として本明細書に提供される。別段の規定がない限り、本明細書で使用される場合CRSは、表40の基準に従ったCRSを指す。
[00962]一部の実施形態では、CRSは、表39に従ってグレード付けされる:
実施例1.α-TRBV6-5抗体クローン抗体Aのヒト化
[00963]マウスα-TCRβ抗体クローン抗体A VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号1Aおよび配列番号2Aは、それぞれ、抗体A VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV1S12*01であり、VL生殖系列はマウスIGKV6-15*01である。配列番号3A~5Aは、それぞれ、抗体A VH CDR領域1~3であり、配列番号6A~8Aは、VL CDR領域1~3に対応する(表30に記載される)。
[00963]マウスα-TCRβ抗体クローン抗体A VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号1Aおよび配列番号2Aは、それぞれ、抗体A VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV1S12*01であり、VL生殖系列はマウスIGKV6-15*01である。配列番号3A~5Aは、それぞれ、抗体A VH CDR領域1~3であり、配列番号6A~8Aは、VL CDR領域1~3に対応する(表30に記載される)。
[00964]抗体A VHおよびVL配列のヒト化は、類似の方法を用いて別々に行われた。CDRグラフト化の成功に重要であるフレームワーク領域においてアミノ酸位置を同定した。ヒト生殖系列配列は、必要な残基を保存し、全体的に高量の同一性を含むことが同定された。ヒト生殖系列フレームワーク配列が、一致する重要なアミノ酸を含まない場合、マウス配列と一致するように復帰突然変異させた。CDR領域を、未変化のヒト生殖系列にグラフト化した。抗体A VHをヒトIGHV1-69*01にヒト化し、抗体A VLをIGKV1-17*01およびIGKV1-27*01にヒト化した。3つすべてのヒト化配列は、ヒト化プロセスの結果として、NG、DG、NS、NN、DS、NT、NXS、またはNXTなどの、導入された負のポテンシャルの翻訳後修飾部位を含まないことが確認された。配列番号9Aは、ヒト化抗体A-H.1 VHであり、配列番号10Aおよび11Aは、それぞれ、ヒト化VL IGKV1-17*01およびIGKV1-27*01生殖系列である(表30に記載される)。図1Aおよび1Bは、CDRおよびフレームワーク領域(FR)を示す注釈付きのマウスおよびヒト化配列を示す。
実施例2:α-TRBV12-3およびTRBV12-4抗体クローン抗体Bのヒト化
[00965]マウスα-TCRβ抗体クローン抗体B VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号15Aおよび配列番号16Aは、それぞれ、抗体B VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV5-17*02であり、VL生殖系列はマウスIGKV4-50*01である。配列番号17A~19Aは、それぞれ、B-H VH CDR領域1~3であり、配列番号20A~22Aは、B-H VL CDR領域1~3である(表31に記載される)。
[00965]マウスα-TCRβ抗体クローン抗体B VHおよびVLの生殖系列は、IMGT命名法を用いて割り当てられ、CDR領域はKabatおよびChothia分類を組み合わせて定義された。配列番号15Aおよび配列番号16Aは、それぞれ、抗体B VHおよびVL配列であり、VH生殖系列はマウスIGHV5-17*02であり、VL生殖系列はマウスIGKV4-50*01である。配列番号17A~19Aは、それぞれ、B-H VH CDR領域1~3であり、配列番号20A~22Aは、B-H VL CDR領域1~3である(表31に記載される)。
[00966]実施例1に記載される抗体Aをヒト化するために適用された方法を用いて、抗体Bをヒト化した。抗体B VHをヒトIGHV3-30*01、IGHV3-48*01およびIGHV3-66*01にヒト化し、抗体B VLをヒトIGKV1-9*01、IGKV1-39*01、IGKV3-15*01、IGLV1-47*01およびIGLV3-10*01にヒト化した。配列番号23A~25Aは、B-H.1A、B-H.1B、およびB-H.1Cヒト化重鎖であり、配列番号26A~30Aは、B-H.1D、B-H.1E、B-H.1F、B-H.1G、およびB-H.1Hヒト化軽鎖である(表31に記載される)。図2Aおよび2Bは、CDRおよびフレームワーク領域(FR)を示す注釈付きのマウスおよびヒト化配列を示す。
実施例3:抗TCRβV抗体の特徴
[00967]導入
[00968]がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を再指向させるように設計された現在の二特異性構築物は、典型的には、T細胞受容体(TCR)のCD3eサブユニットに対して指向されるモノクローナル抗体(mAb)に由来する一本鎖可変断片(scFv)を利用する。しかしながら、このアプローチには限界があり、このような二特異性構築物の治療可能性の完全な実現を妨げる可能性がある。これまでの研究では、例えば、低い「活性化」用量の抗CD3e mAbが長期のT細胞機能不全を引き起こし、免疫抑制作用を発揮し得ることが示されている。さらに、抗CD3e mAbはすべてのT細胞に結合し、したがってすべてのT細胞を等しく活性化する。これは、T細胞の大量活性化に起因する抗CD3e mAbの初回投与時の副作用と関連している。これらの多数の活性化T細胞は相当量のサイトカインを分泌し、そのうち最も重要なものはインターフェロンガンマ(IFNg)である。この過剰量のIFNgは、次に、例えば、マクロファージを活性化し、その後、IL-1、IL-6およびTNF-αなどの炎症性サイトカインを過剰に産生することができ、サイトカイン放出症候群(CRS)として公知である「サイトカインストーム」を引き起こす。したがって、CRSを低減させるために必要なエフェクターT細胞のサブセットのみに結合し、活性化することができる抗体を開発することは有利であり得る。
[00967]導入
[00968]がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を再指向させるように設計された現在の二特異性構築物は、典型的には、T細胞受容体(TCR)のCD3eサブユニットに対して指向されるモノクローナル抗体(mAb)に由来する一本鎖可変断片(scFv)を利用する。しかしながら、このアプローチには限界があり、このような二特異性構築物の治療可能性の完全な実現を妨げる可能性がある。これまでの研究では、例えば、低い「活性化」用量の抗CD3e mAbが長期のT細胞機能不全を引き起こし、免疫抑制作用を発揮し得ることが示されている。さらに、抗CD3e mAbはすべてのT細胞に結合し、したがってすべてのT細胞を等しく活性化する。これは、T細胞の大量活性化に起因する抗CD3e mAbの初回投与時の副作用と関連している。これらの多数の活性化T細胞は相当量のサイトカインを分泌し、そのうち最も重要なものはインターフェロンガンマ(IFNg)である。この過剰量のIFNgは、次に、例えば、マクロファージを活性化し、その後、IL-1、IL-6およびTNF-αなどの炎症性サイトカインを過剰に産生することができ、サイトカイン放出症候群(CRS)として公知である「サイトカインストーム」を引き起こす。したがって、CRSを低減させるために必要なエフェクターT細胞のサブセットのみに結合し、活性化することができる抗体を開発することは有利であり得る。
[00969]結果
[00970]その目的で、TCR(TCR Vb)のベータサブユニットの可変鎖に指向される抗体を同定した。これらの抗TCR Vb抗体は、T細胞のサブセットに結合し、活性化するが、例えば、CRSが全く低減しないかまたは顕著には低減しない。プレート結合した抗TCR Vb13.1mAb(A-H.1およびA-H.2)を用いて、A-H.1での陽性染色によって定義されるT細胞の集団が、(0日目のT細胞の約5%から6日目の細胞培養での総T細胞のほぼ60%まで)拡大され得ることが示された(図4A~4C)。この実験のために、ヒトCD3+T細胞を磁気ビーズ分離を用いて単離し(負の選択)、100nMで、固定化(プレート被覆された)A-H.1またはOKT3(抗CD3e)抗体で6日間、活性化した。拡大されたVb13.1+T細胞は、精製CD3+T細胞と共培養した場合、形質転換された細胞系RPMI-8226に対して細胞溶解活性化を示す(図5A~5B)。
[00970]その目的で、TCR(TCR Vb)のベータサブユニットの可変鎖に指向される抗体を同定した。これらの抗TCR Vb抗体は、T細胞のサブセットに結合し、活性化するが、例えば、CRSが全く低減しないかまたは顕著には低減しない。プレート結合した抗TCR Vb13.1mAb(A-H.1およびA-H.2)を用いて、A-H.1での陽性染色によって定義されるT細胞の集団が、(0日目のT細胞の約5%から6日目の細胞培養での総T細胞のほぼ60%まで)拡大され得ることが示された(図4A~4C)。この実験のために、ヒトCD3+T細胞を磁気ビーズ分離を用いて単離し(負の選択)、100nMで、固定化(プレート被覆された)A-H.1またはOKT3(抗CD3e)抗体で6日間、活性化した。拡大されたVb13.1+T細胞は、精製CD3+T細胞と共培養した場合、形質転換された細胞系RPMI-8226に対して細胞溶解活性化を示す(図5A~5B)。
[00971]次に、抗TCR VB抗体によって活性化されたPBMCがサイトカインを産生する能力を評価した。抗TCR VB抗体で活性化されたPBMCのサイトカイン産生を、(i)抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2);(ii)抗TCR VA 12.1抗体6D6.6、抗TCR VA24JA18抗体6B11などの抗TCR Vα(TCR VA)抗体;(iii)抗TCRαβ抗体T10B9;および/または(iv)アイソタイプ対照(BGM0109)で活性化されたPBMCのサイトカイン産生と比較した。試験した抗TCR VB抗体には、ヒト化抗TCRVB 13.1抗体(A-H.1またはA-H.2)、マウス抗TCR VB5抗体E、マウス抗TCR VB8.1抗体B、およびマウス抗TCR VB12抗体Dが含まれる。BGM0109は、以下:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGGLNDIFEAQKIEWHEGGGGSEPRTDTDTCPNPPDPCPTCPTPDLLGGPSVFIFPPKPKDVLMISLTPKITCVVVDVSEEEPDVQFNWYVNNVEDKTAQTETRQRQYNSTYRVVSVLPIKHQDWMSGKVFKCKVNNNALPSPIEKTISKPRGQVRVPQIYTFPPPIEQTVKKDVSVTCLVTGFLPQDIHVEWESNGQPQPEQNYKNTQPVLDSDGSYFLYSKLNVPKSRWDQGDSFTCSVIHEALHNHHMTKTISRSLGNGGGGS(配列番号3282A)のアミノ酸配列を含む。
METDTLLLWVLLLWVPGSTGGLNDIFEAQKIEWHEGGGGSEPRTDTDTCPNPPDPCPTCPTPDLLGGPSVFIFPPKPKDVLMISLTPKITCVVVDVSEEEPDVQFNWYVNNVEDKTAQTETRQRQYNSTYRVVSVLPIKHQDWMSGKVFKCKVNNNALPSPIEKTISKPRGQVRVPQIYTFPPPIEQTVKKDVSVTCLVTGFLPQDIHVEWESNGQPQPEQNYKNTQPVLDSDGSYFLYSKLNVPKSRWDQGDSFTCSVIHEALHNHHMTKTISRSLGNGGGGS(配列番号3282A)のアミノ酸配列を含む。
[00972]図6Aに示されるように、プレート結合したA-H.1またはA-H.2、または抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)を用いて、ヒトPBMCを活性化した場合、T細胞サイトカインIFNgが誘導された(図6A)。試験したすべての抗TCR VB抗体は、IFNgの産生に対して類似の効果を有した(図6B)。抗TCR VA抗体は、類似のIFNg産生を誘導しなかった。
[00973]IL-2産生に関して、A-H.1およびA-H.2で活性化されたPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)で活性化されたPBMCと比較して、IL-2産生の増加(図7A)および遅延動態(図7B)をもたらした。図7Bは、抗TCR VB抗体で活性化されたPBMCが、活性化(プレート被覆された抗体とのインキュベーション)後の5日目または6日目にIL-2のピーク産生を実証することを示す。対照的に、OKT3で活性化されたPBMCにおけるIL-2産生は、活性化後の2日目でピークに達した。IFNGと同様に、IL-2効果(例えば、IL-2の産生の増強および遅延動態)は、試験したすべての抗TCR VB抗体にわたって類似していた(図7B)。
[00974]また、サイトカインIL-6、IL-1βおよびTNF-αの産生は、「サイトカインストーム」(適切にはCRS)と関連し、類似の条件下で評価された。図8A、9Aおよび10Aは、抗CD3e抗体で活性化されたPBMCがIL-6(図8A)、TNF-α(図9A)およびIL-1β(図10A)の産生を実証するが、A-H.1またはA-H.2で活性化したPBMCでは、これらのサイトカインの誘導は、全く観察されないかまたはほとんど観察されなかったことを示す。図9Bおよび10Bに示されるように、TNF-αおよびIL-1βの産生は、抗TCR VB抗体のいずれかを用いたPBMCの活性化によって誘導されなかった。
[00975]さらに、A-H.1活性化されたCD3+T細胞によるIFNg産生の動態は、抗CD3e mAb(OKT3およびSP34-2)によって活性化されたCD3+T細胞により産生されるものに比べて遅延することが注目された(図11Aおよび11B)。
[00976]最後に、TEMRAとして公知であるメモリーエフェクターT細胞のサブセットは、A-H.1またはA-H.2によって活性化されたCD8+T細胞において優先的に拡大することが観察された(図12)。単離したヒトPBMCは、100nMで、固定化(プレート被覆)された抗CD3eまたは抗TCR Vβ13.1で6日間、活性化された。6日間のインキュベーション後、T細胞サブセットは、ナイーブT細胞(CD8+、CD95-、CD45RA+、CCR7+)、T幹細胞メモリー(TSCM;CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7+)、Tセントラルメモリー(Tcm;CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7+)、Tエフェクターメモリー(Tem;CD8+、CD95+、CD45RA-、CCR7-)、およびTエフェクターメモリー再発現CD45RA(Temra;CD8+、CD95+、CD45RA+、CCR7-)の表面マーカーに対してFACS染色により同定された。抗TCR Vβ13.1抗体(A-H.1またはA-H.2)によって活性化されたヒトPBMCは、抗CD3e抗体(OKT3またはSP34-2)によって活性化されたPBMCと比較した場合、CD8+TSCMおよびTemra T細胞サブセットを増加させた。類似した拡大は、CD4+T細胞を用いて観察された。
[00977]結論
[00978]この実施例において提供されるデータは、TCR Vbに対して指向される抗体が、例えば、T細胞のサブセットを優先的に活性化し、例えば、腫瘍細胞溶解を促進し得るが、CRSを促進し得ないTEMRAの拡大を導くことができることを示す。したがって、FabもしくはscFv、またはTCR Vbに指向されるペプチドのいずれかを利用する二特異性構築物は、例えば、抗CD3e標的化に関連するCRSの有害な副作用なしに、がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を活性化および再指向させるために使用することができる。
[00978]この実施例において提供されるデータは、TCR Vbに対して指向される抗体が、例えば、T細胞のサブセットを優先的に活性化し、例えば、腫瘍細胞溶解を促進し得るが、CRSを促進し得ないTEMRAの拡大を導くことができることを示す。したがって、FabもしくはscFv、またはTCR Vbに指向されるペプチドのいずれかを利用する二特異性構築物は、例えば、抗CD3e標的化に関連するCRSの有害な副作用なしに、がん免疫療法のための腫瘍細胞溶解を促進するためにT細胞を活性化および再指向させるために使用することができる。
実施例4:BCMAおよびT細胞エンゲージャーに対する二重標的化抗体分子による多発性骨髄腫(MM)細胞のオンターゲットT細胞媒介性の細胞毒性
[00979]この実施例は、T細胞上のT細胞エンゲージャー、例えば、TCRVbおよびMM細胞上のBCMAを認識する二重標的化抗体分子による多発性骨髄腫(MM)細胞のオンターゲットT細胞媒介性の細胞毒性を示す。
[00979]この実施例は、T細胞上のT細胞エンゲージャー、例えば、TCRVbおよびMM細胞上のBCMAを認識する二重標的化抗体分子による多発性骨髄腫(MM)細胞のオンターゲットT細胞媒介性の細胞毒性を示す。
[00980]図13Aに示されるように、プレート結合した抗TCRVb抗体で5日間、活性化された精製ヒトT細胞は、プレート結合した抗CD3(OKT3)抗体で活性化された精製ヒトT細胞よりも高速で増殖する。T細胞の抗TCRVb抗体刺激は、CD45RA+エフェクターメモリーCD8+およびCD4+T細胞(TEMRA)細胞の選択的拡大をもたらした(図13B)。CD8+およびCD4+Temra細胞集団の両方は、抗TCRVb抗体で刺激された場合、非刺激細胞または抗CD3(SP34)抗体で刺激された細胞と比較してより拡大した。抗TCRVb抗体は、抗CD3抗体で刺激されたPBMCと比較して、抗TCRVb抗体で刺激されたPBMCによるIFN-gの分泌の遅延をもたらした(図13C)。さらに、抗TCRVb抗体または抗CD3抗体で刺激されたT細胞は、図13Dに示されるように、多発性骨髄腫標的細胞の同等の溶解をもたらした。図13E~13Fに示されるように、100ng/mlのプレート結合した抗TCRVb抗体、または抗CD3抗体で5日間、刺激されたT細胞は、パーフォリンおよびグランザイムBを分泌した。
[00981]抗TCRVb抗体によるPBMCの活性化は、抗OKT3抗体で活性化されたPBMCと比較して、IL-2および/またはIL-15のより高い産生および/または分泌をもたらした(図14A)。抗TCRVb抗体で活性化されたPBMCは、例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞の拡大および/または生存、例えば、増殖ももたらした(図14B)。対照的に、抗OKT3抗体で活性化されたPBMCSは、NK細胞拡大をもたらさなかった。さらに、実施例3に記載されるように、抗TCRVb抗体で活性化されたPBMCは、CRSと関連するサイトカインIL-6、IL-1βおよびTNF-αの産生をもたらさなかった(図15)。これらのin vitro特徴付け研究は、一部の実施形態では、抗TCRVb抗体は、例えば、T細胞を活性化および/または刺激して、標的細胞溶解、パーフォリン分泌およびグランザイムB分泌、ならびに、例えば、遅延動態を伴うIFN-gの分泌によって証明されるように、T細胞殺滅を促進することを示す。
[00982]次に、多発性骨髄腫(MM)細胞を標的とし、殺滅させる、一方のアームではBCMAを、他方のアームではTCRVbを標的とする二重標的化抗体分子の能力を試験した。健康なドナーPBMCは、RMPI8226 MM細胞系、および以下の二重標的化抗体分子:BCMA-TCRVb、BCMA-CD3、もしくは対照-TCRVbのうちの1つとともに同時インキュベートし、または、次に、フローサイトメトリーを用いてアイソタイプ対照標的細胞溶解を評価した。図16Aに示されるように、二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子は、in vitroでMM細胞の殺滅をもたらした。
[00983]二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子は、MMマウスモデルにおいてMM腫瘍成長を阻害するその能力についてin vivoでさらに試験された。NCI-H929細胞系を0日目にNOD-scid IL2rγヌル(NSG)レシピエントマウスに注射し、続いて、9日目にPBMCを送達した。12日目、15日目、18日目および21日目に、二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子を0.5mg/kgの用量で腹腔内注射により投与した。図16Bは、二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子によるin vivoでのMM腫瘍成長の予防、例えば、阻害を示す。これらの結果は、一部の実施形態では、二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子は、例えば、腫瘍細胞、例えば、MM腫瘍細胞をin vitroおよびin vivoで殺滅させることができることを実証する。したがって、一部の実施形態では、二重標的化BCMA-TCRVb抗体分子を、例えば、がん、例えば、血液がん、例えば、MMに対する療法として使用することができる。
実施例5:FcRH5およびT細胞エンゲージャーに対する二重標的化抗体分子のin vitro細胞毒性
[00984]この実施例は、T細胞上のT細胞エンゲージャー、例えば、TCRVb、およびMM細胞上のFcRH5を認識する二重標的化抗体分子による、多発性骨髄腫(MM)細胞におけるin vitro細胞毒性を示す。健康なドナーのPBMCまたは精製T細胞を、MOL8M MM細胞系と一方のアームではFcRH5および他方のアームではTCRVbを標的とする二重標的化抗体分子とともに、またはアイソタイプ対照抗体とともに同時インキュベートした。次に、フローサイトメトリーを用いて、標的細胞溶解を評価した。図17に示されるように、二重標的化FcRH5-TCRVb分子は、精製T細胞またはPBMCの両方によるMM細胞の殺滅をもたらした。これは、二重標的化FcRH5-TCRVb分子が、T細胞などの免疫細胞、例えば、PBMCによって、MM細胞の殺滅を標的化し、促進することができることを示す。
[00984]この実施例は、T細胞上のT細胞エンゲージャー、例えば、TCRVb、およびMM細胞上のFcRH5を認識する二重標的化抗体分子による、多発性骨髄腫(MM)細胞におけるin vitro細胞毒性を示す。健康なドナーのPBMCまたは精製T細胞を、MOL8M MM細胞系と一方のアームではFcRH5および他方のアームではTCRVbを標的とする二重標的化抗体分子とともに、またはアイソタイプ対照抗体とともに同時インキュベートした。次に、フローサイトメトリーを用いて、標的細胞溶解を評価した。図17に示されるように、二重標的化FcRH5-TCRVb分子は、精製T細胞またはPBMCの両方によるMM細胞の殺滅をもたらした。これは、二重標的化FcRH5-TCRVb分子が、T細胞などの免疫細胞、例えば、PBMCによって、MM細胞の殺滅を標的化し、促進することができることを示す。
実施例6:抗NKp30抗体を生成するためのアルメニアンハムスターの免疫化
[00985]簡単に述べると、アルメニアンハムスターを、フロイントの完全アジュバント中のヒトNKp30タンパク質の細胞外ドメインを用いて免疫化し、フロイントの不完全アジュバント(IFA)中のNKp30を用いて、14日目および28日目に2回追加免疫した。56日目にさらに1回のIFA中のブーストを与え、3日後に動物を回収した。脾臓を収集し、P3X63Ag8.653マウス骨髄腫細胞系と融合させた。125ul中の0.9×10^5細胞/ウェルを96ウェルプレートに入れ、選択用のHATまたはHT、ならびに7日目、11日目および必要に応じてその後のHybridoma Cloning Factor(最終1%)の非存在または存在下で20%のウシ胎仔血清、4mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、50Uのペニシリン、50μgのストレプトマイシンおよび50μMの2-MEを補足した125μlのI-20+2ME+HAT(IMDM(4g/Lグルコース)を与えた。融合の約2週後(細胞は約50%コンフルエント)に上清を収集し、結合についてアッセイした。
[00985]簡単に述べると、アルメニアンハムスターを、フロイントの完全アジュバント中のヒトNKp30タンパク質の細胞外ドメインを用いて免疫化し、フロイントの不完全アジュバント(IFA)中のNKp30を用いて、14日目および28日目に2回追加免疫した。56日目にさらに1回のIFA中のブーストを与え、3日後に動物を回収した。脾臓を収集し、P3X63Ag8.653マウス骨髄腫細胞系と融合させた。125ul中の0.9×10^5細胞/ウェルを96ウェルプレートに入れ、選択用のHATまたはHT、ならびに7日目、11日目および必要に応じてその後のHybridoma Cloning Factor(最終1%)の非存在または存在下で20%のウシ胎仔血清、4mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、50Uのペニシリン、50μgのストレプトマイシンおよび50μMの2-MEを補足した125μlのI-20+2ME+HAT(IMDM(4g/Lグルコース)を与えた。融合の約2週後(細胞は約50%コンフルエント)に上清を収集し、結合についてアッセイした。
実施例7:NKp30 mAbについてのハイブリドーマスクリーニング
[00986]Expi293細胞にBG160(hNKp30細胞抗原)をトランスフェクトし、18時間後にスクリーニングを行った。スクリーニングの日に、トランスフェクトされた細胞を0.05×10^6/mLに希釈し、抗アルメニアンハムスターFc Alexa Fluor 488を0.4ug/mLの最終濃度まで加えた。50uL(2,500細胞)のこの混合物を384ウェルプレートの各ウェルに加えた。二次(secondary)と共に同じ密度の非トランスフェクト293細胞を陰性対照として使用した。5uLのハイブリドーマ上清を細胞混合物に加え、プレートを37℃で1時間インキュベートした。プレートを次にMirrorball上でイメージングした。陽性クローンを同定し、段階希釈によりサブクローニングしてクローン選択ハイブリドーマを得た。同じプロトコールを使用した再確認後にハイブリドーマ細胞を回収し、対応する重鎖および軽鎖配列を取得した。対応する抗体のその後の発現およびさらなる検証のためにDNAをpcDNA3.4にサブクローニングした。
[00986]Expi293細胞にBG160(hNKp30細胞抗原)をトランスフェクトし、18時間後にスクリーニングを行った。スクリーニングの日に、トランスフェクトされた細胞を0.05×10^6/mLに希釈し、抗アルメニアンハムスターFc Alexa Fluor 488を0.4ug/mLの最終濃度まで加えた。50uL(2,500細胞)のこの混合物を384ウェルプレートの各ウェルに加えた。二次(secondary)と共に同じ密度の非トランスフェクト293細胞を陰性対照として使用した。5uLのハイブリドーマ上清を細胞混合物に加え、プレートを37℃で1時間インキュベートした。プレートを次にMirrorball上でイメージングした。陽性クローンを同定し、段階希釈によりサブクローニングしてクローン選択ハイブリドーマを得た。同じプロトコールを使用した再確認後にハイブリドーマ細胞を回収し、対応する重鎖および軽鎖配列を取得した。対応する抗体のその後の発現およびさらなる検証のためにDNAをpcDNA3.4にサブクローニングした。
実施例8:NK92細胞へのNKp30抗体の結合
[00987]0.5%のBSAおよび0.1%のアジ化ナトリウムを含有するPBS(染色緩衝液)を用いてNK-92細胞を洗浄し、200,000細胞/ウェルで96ウェルV底プレートに加えた。ハムスターNKp30抗体を2.0倍段階希釈で細胞に加え、室温で1時間インキュベートした。染色緩衝液を用いてプレートを2回洗浄した。AF647に共役したハムスターFcに対する二次抗体(Jackson、127-605-160)を1:100希釈(1.4mg/mlストック)で加え、細胞と共に4℃で30分間インキュベートし、続いて染色緩衝液を用いて洗浄した。細胞をその後に、4%のパラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定した。プレートをCytoFLEX LS(Beckman Coulter)上で読み取った。パーセント-AF747陽性集団としてデータを算出した(図22)。
[00987]0.5%のBSAおよび0.1%のアジ化ナトリウムを含有するPBS(染色緩衝液)を用いてNK-92細胞を洗浄し、200,000細胞/ウェルで96ウェルV底プレートに加えた。ハムスターNKp30抗体を2.0倍段階希釈で細胞に加え、室温で1時間インキュベートした。染色緩衝液を用いてプレートを2回洗浄した。AF647に共役したハムスターFcに対する二次抗体(Jackson、127-605-160)を1:100希釈(1.4mg/mlストック)で加え、細胞と共に4℃で30分間インキュベートし、続いて染色緩衝液を用いて洗浄した。細胞をその後に、4%のパラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定した。プレートをCytoFLEX LS(Beckman Coulter)上で読み取った。パーセント-AF747陽性集団としてデータを算出した(図22)。
実施例9:NK92細胞系を使用するNKp30抗体の活性を測定するためのバイオアッセイ
[00988]NKp30抗体をPBS中で3倍段階希釈し、平底96ウェルプレート中2~8℃で終夜インキュベートした。プレートをPBS中で2回洗浄し、IL-2を含有する増殖培地に40,000個のNK-92細胞を加えた。37℃、5%のCO2の加湿されたインキュベーターでプレートを16~24時間インキュベートした後に上清を収集した。MSDアッセイの使用説明書にしたがって上清中のIFNγレベルを測定した(図23)。ハムスターアイソタイプIgGとインキュベートされた細胞から収集した上清を陰性対照として使用し、NKp30モノクローナル抗体(R&D、クローン210847)とインキュベートされた細胞からの上清を陽性対照として利用した。ハムスター抗NKp30 mABを使用してデータを生成した。
[00988]NKp30抗体をPBS中で3倍段階希釈し、平底96ウェルプレート中2~8℃で終夜インキュベートした。プレートをPBS中で2回洗浄し、IL-2を含有する増殖培地に40,000個のNK-92細胞を加えた。37℃、5%のCO2の加湿されたインキュベーターでプレートを16~24時間インキュベートした後に上清を収集した。MSDアッセイの使用説明書にしたがって上清中のIFNγレベルを測定した(図23)。ハムスターアイソタイプIgGとインキュベートされた細胞から収集した上清を陰性対照として使用し、NKp30モノクローナル抗体(R&D、クローン210847)とインキュベートされた細胞からの上清を陽性対照として利用した。ハムスター抗NKp30 mABを使用してデータを生成した。
実施例10:抗カルレティキュリン抗体の特徴
[00989]配列番号6250のVHおよび配列番号6252のVLを含むマウス抗カルレティキュリン抗体AbM-1(BIM0031とも呼ばれる)をヒト化した。5種のヒト化VH(表16に示される配列番号6372および234~237)および5種のヒト化VL(表16に示される配列番号238~242)を生成した。すべてのヒト化VHは、HCDR2中にシステインからアラニンへの置換を含む。表19に開示されるような抗体BJM0040~BJM0064を合成し、生化学的および機能的活性について特性付けた。
[00989]配列番号6250のVHおよび配列番号6252のVLを含むマウス抗カルレティキュリン抗体AbM-1(BIM0031とも呼ばれる)をヒト化した。5種のヒト化VH(表16に示される配列番号6372および234~237)および5種のヒト化VL(表16に示される配列番号238~242)を生成した。すべてのヒト化VHは、HCDR2中にシステインからアラニンへの置換を含む。表19に開示されるような抗体BJM0040~BJM0064を合成し、生化学的および機能的活性について特性付けた。
[00990]簡単に述べると、プロテインA溶出後に精製タンパク質の発現レベルを測定した。タンパク質を分析用SECによって分析して、凝集を評価し、示差走査蛍光測定(DSF)によって試験して、より安定した候補を同定した。候補の結合親和性は、ヒトFcに融合した突然変異体カルレティキュリンC末端ペプチドに対するELISAアッセイで測定した。結果は、表22にまとめられた。HCDR2中にシステインからアラニンへの置換を含むヒト化抗体は、親のマウス抗体と比較して凝集の低減を実証した。
[00991]一連のハムスター抗NKp30抗体を選択した。これらの抗体は、ヒトNKp30およびカニクイザルNKp30に結合し、NK-90細胞からのIFNγ産生を誘導することが示された(データ示さず)。例示的なハムスター抗NKp30抗体15E1、9G1、15H6、9D9、3A12、および12D10のVHおよびVL配列を表9に開示する。15E1、9G1、および15H6に基づく例示的なヒト化抗NKp30抗体のVHおよびVL配列も表9に開示する。これらの抗体のKabat CDRを表34および表8に開示する。
[00992]15E1に基づく2つのヒト化された構築物を選択した。第1の構築物BJM0407は、配列番号7302のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号7305のアミノ酸配列を含むラムダ軽鎖可変領域を含むFabである。その対応するscFv構築物BJM0859は配列番号7310のアミノ酸配列を含む。第2の構築物BJM0411は、配列番号7302のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号7309のアミノ酸配列を含むカッパ軽鎖可変領域を含むFabである。その対応するscFv構築物BJM0860は配列番号7311のアミノ酸配列を含む。BJM0407およびBJM0411は、同等の生物物理学的特徴、例えば、NKp30に対する結合親和性および熱安定性を示した。scFv構築物BJM0859およびBJM0860もまた同等の生物物理学的特性を示した。
実施例12.野生型または突然変異体カルレティキュリンへの例示的な抗カルレティキュリン抗体分子の結合
[00993]この実施例では、例示的な抗カルレティキュリン抗体分子、BKM0106(抗体6C10の親IgG形態)は、2つのカルレティキュリン突然変異体(CALRinsおよびCALRdel、その配列はそれぞれ、配列番号D1002およびD1003として表2に列挙される)と比較した、野生型カルレティキュリン(CALR WT)ヘの結合を試験された。2つのELISA試験を実行し、その1つは、抗原がプレートに被覆され、その1つは抗体がプレートに被覆された。
[00993]この実施例では、例示的な抗カルレティキュリン抗体分子、BKM0106(抗体6C10の親IgG形態)は、2つのカルレティキュリン突然変異体(CALRinsおよびCALRdel、その配列はそれぞれ、配列番号D1002およびD1003として表2に列挙される)と比較した、野生型カルレティキュリン(CALR WT)ヘの結合を試験された。2つのELISA試験を実行し、その1つは、抗原がプレートに被覆され、その1つは抗体がプレートに被覆された。
[00994]抗原がプレートに被覆された実験のため、Maxisorpプレートを、CALR WT、CALRin、またはCALRdelタンパク質によって被覆した。プレートを3% BSAによってブロッキングした。BKM0106を100nMに希釈し、ウェルに添加した。抗ヒトHRP(Jackson Immunoresearch 309-035-008)1:20,000を各ウェルに添加した。1-Step Turbo TMB-ELISA基質溶液を添加し、1M HClを添加することによって反応を停止させた。プレートを450nmで読み取った。
[00995]抗体がプレートに被覆された実験のため、Maxisorpプレートを、BKM0106によって被覆した。プレートを3% BSAによってブロッキングした。CALR WT、CALRins、およびCALRdelを100nMに希釈し、別々のウェルに添加した。抗His-Tag-HRP(Southern Biotech 4603-05)1:5,000を各ウェルに添加した。1-Step Turbo TMB-ELISA基質溶液を添加し、1M HClを添加することによって反応を停止させた。プレートを450nmで読み取った。
[00996]図25A~25Bに示されるように、例示的な抗体BKM0106は、CALRinsおよびCALRdel突然変異体に結合するが、野生型カルレティキュリンには結合しなかった。
実施例13.突然変異体カルレティキュリンを発現する細胞への例示的な抗カルレティキュリン抗体分子の結合
[00997]この実施例では、例示的な抗カルレティキュリン抗体分子、BKM0106(抗体6C10の親IgG形態)は、突然変異体カルレティキュリン(CALRinsおよびCALRdel、その配列はそれぞれ、配列番号D1002およびD1003として表2に列挙される)を発現する細胞ヘの結合を試験された。簡単に述べると、Expi293F細胞(Thermo Fisher A14527)に、BH470(ヒトTpoR)、BH472(ヒトJAK2)およびヒトCALRins、ヒトCALR del、またはBH800(ヒトCALR WT)細胞抗原のいずれかを三重トランスフェクトした。0.78、1.56、3.125、6.25、12.5、25、および50nMのBKM0106およびhIgG1アイソタイプ対照をウェルに添加した。細胞を、二次抗体Alexa Fluor488 抗ヒトIgG(Jackson ImmunoResearch 109-545-088)1:200とインキュベートした。Zombie Violet BV412(BioLegend423114)Viability色素を1:100で細胞に添加した。
[00997]この実施例では、例示的な抗カルレティキュリン抗体分子、BKM0106(抗体6C10の親IgG形態)は、突然変異体カルレティキュリン(CALRinsおよびCALRdel、その配列はそれぞれ、配列番号D1002およびD1003として表2に列挙される)を発現する細胞ヘの結合を試験された。簡単に述べると、Expi293F細胞(Thermo Fisher A14527)に、BH470(ヒトTpoR)、BH472(ヒトJAK2)およびヒトCALRins、ヒトCALR del、またはBH800(ヒトCALR WT)細胞抗原のいずれかを三重トランスフェクトした。0.78、1.56、3.125、6.25、12.5、25、および50nMのBKM0106およびhIgG1アイソタイプ対照をウェルに添加した。細胞を、二次抗体Alexa Fluor488 抗ヒトIgG(Jackson ImmunoResearch 109-545-088)1:200とインキュベートした。Zombie Violet BV412(BioLegend423114)Viability色素を1:100で細胞に添加した。
[00998]図26A~26Bに示されるように、BKM0106は、類似の応答によりCALRinsおよびCALRdelの両方に結合した。
実施例14.二特異性抗体により免疫エフェクター細胞へとmtCALR+細胞を架橋することによるmtCALR+細胞標的化
[00999]この実施例では、一連の抗体分子は、同種移植マウスがんモデルにおいて治療有効性について試験された。簡単に述べると、mIgG2a骨格を有する代理分子が、例示的な抗カルレティキュリン抗体分子6C10および以下のエフェクターアームの各々から生成された。
[00999]この実施例では、一連の抗体分子は、同種移植マウスがんモデルにおいて治療有効性について試験された。簡単に述べると、mIgG2a骨格を有する代理分子が、例示的な抗カルレティキュリン抗体分子6C10および以下のエフェクターアームの各々から生成された。
・BKM0201-mutCALR-6C10モノクローナル-ADCC可能
・BKM0202-mutCALR-6C10×TCRvB(2×2)二特異性-LALAPG
・BKM0204-mutCALR-6C10×CD3-2C11(1×1)二特異性-LALAPG
[001000]上記の分子の治療有効性は、mtCALR、hMPL、およびhJAK2を発現する操作された細胞であるBa/F3細胞を使用して生成した全身性マウスモデルにおいて試験された。試験の1日目に、PBS中に懸濁した2×106個の操作されたBa/F3 mtCALR、hMPL、hJAK2細胞を、PBS中に懸濁し、雌のBalb/Cマウスに静脈内注射した。マウスを、1mg/kgまたは5mg/kgのCALRx/TCRvBおよび対照二特異性分子の3日毎の投与を、静脈内ボーラス注射により全部で4回(4、7、10および13日目)投与して処置した。動物は、人道的エンドポイントをモニターし、体重を週に2回モニターした。全ての動物は、15日目に安楽死させ、脾臓を摘出し、疾病負荷の代わりとして脾臓重量をモニターした。データは、Ba/F3 mtCALR、hMPL、hJAK2細胞を移植したマウスにおいて、ビヒクル処置したマウスが、ナイーブマウスと比較して、脾臓重量のほぼ3倍の増加を示し、疾病負荷が増加したことを示唆していることを示した。
・BKM0202-mutCALR-6C10×TCRvB(2×2)二特異性-LALAPG
・BKM0204-mutCALR-6C10×CD3-2C11(1×1)二特異性-LALAPG
[001000]上記の分子の治療有効性は、mtCALR、hMPL、およびhJAK2を発現する操作された細胞であるBa/F3細胞を使用して生成した全身性マウスモデルにおいて試験された。試験の1日目に、PBS中に懸濁した2×106個の操作されたBa/F3 mtCALR、hMPL、hJAK2細胞を、PBS中に懸濁し、雌のBalb/Cマウスに静脈内注射した。マウスを、1mg/kgまたは5mg/kgのCALRx/TCRvBおよび対照二特異性分子の3日毎の投与を、静脈内ボーラス注射により全部で4回(4、7、10および13日目)投与して処置した。動物は、人道的エンドポイントをモニターし、体重を週に2回モニターした。全ての動物は、15日目に安楽死させ、脾臓を摘出し、疾病負荷の代わりとして脾臓重量をモニターした。データは、Ba/F3 mtCALR、hMPL、hJAK2細胞を移植したマウスにおいて、ビヒクル処置したマウスが、ナイーブマウスと比較して、脾臓重量のほぼ3倍の増加を示し、疾病負荷が増加したことを示唆していることを示した。
[001001]図27に示されるように、3つの抗体で処置したマウス全てが、ビヒクル対照と比較して、脾臓重量の有意な減少を示した。
実施例15.例示的な抗NKp30抗体分子のBiacore分析
[001002]この実施例では、一連の例示的な抗NKp30抗体分子は、NKp30へのそれらの結合親和性について分析された。簡単に述べると、表面プラズモン共鳴(SPR)測定は、BIAcore T200を使用することによって実施した。ヒトNKp30(BKM0179)を、50RUの応答まで、抗マウスFc抗体によってCM5チップ上に固定化した。各例示的な抗体構築物を、3.9、7.8、15.6、31.2、62.5、および125nMの濃度、および流速20μl/minで、ヒトNKp30を固定化した表面に注入した。データは、1:1結合モデルを使用してフィットさせた。
[001002]この実施例では、一連の例示的な抗NKp30抗体分子は、NKp30へのそれらの結合親和性について分析された。簡単に述べると、表面プラズモン共鳴(SPR)測定は、BIAcore T200を使用することによって実施した。ヒトNKp30(BKM0179)を、50RUの応答まで、抗マウスFc抗体によってCM5チップ上に固定化した。各例示的な抗体構築物を、3.9、7.8、15.6、31.2、62.5、および125nMの濃度、および流速20μl/minで、ヒトNKp30を固定化した表面に注入した。データは、1:1結合モデルを使用してフィットさせた。
[001003]表23に示されるように、ほとんどの例示的な抗体は、親抗体と比較して、ヒトNKp30への保存された親和性を示した。
[001004]抗CD3抗体分子の産生
[001005]4匹のC57/BL6マウスを、配列QDGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTC(配列番号D215)を持つ、KLHコンジュゲートCD3eペプチドを用いて免疫化した。動物は、4回目の免疫化の3日後に採血し、力価をチェックした。4回目の免疫化後、抗原を用いて動物を2回ブーストした。最後のブーストの3~4日後、動物を、脾臓またはリンパ節組織の回収のために屠殺した。脾臓は、標準的な融合方法を使用して融合させ、20プレートのハイブリドーマ細胞を産生した。一次スクリーニングは、CD3eタンパク質に続くペプチドへの結合をチェックすることによって、ELISAを使用して実施した。1つのクローン、4D4を拡大、およびその後のサブクローニングプロトコールのために選択し、モノクローナルハイブリドーマを生成した。
[001006]in vitroでのCD3への抗CD3抗体分子の結合
[001007]この実施例では、例示的なヒト化抗CD3抗体分子BKM0020、BKM0025、BKM0028、BKM0038(本明細書に記載される)を、表面プラズモン共鳴(SPR)を使用して、ヒトまたはカニクイザルCD3eへのそれらの結合親和性について試験した。SPR測定は、BIAcore T200を使用することによって実施した。各構築物を、200RUの応答まで、抗ヒトFc抗体によってCM5チップ上に固定化した。ヒトCD3e(Acro Biosystems CDE-H5223)を500nMに希釈し、次いで、2倍希釈した。各濃度の分析物を、流速20μl/minで、各抗体を固定化した表面に注入した。データは、1:1結合モデルを使用してフィットさせた。結合親和性の結果は、図28に示す。ヒトCD3eへの親和性は、親と比較して保存され、カニクイザルCD3eへの親和性は、親抗体と比較して2~3倍低かった。
[001007]この実施例では、例示的なヒト化抗CD3抗体分子BKM0020、BKM0025、BKM0028、BKM0038(本明細書に記載される)を、表面プラズモン共鳴(SPR)を使用して、ヒトまたはカニクイザルCD3eへのそれらの結合親和性について試験した。SPR測定は、BIAcore T200を使用することによって実施した。各構築物を、200RUの応答まで、抗ヒトFc抗体によってCM5チップ上に固定化した。ヒトCD3e(Acro Biosystems CDE-H5223)を500nMに希釈し、次いで、2倍希釈した。各濃度の分析物を、流速20μl/minで、各抗体を固定化した表面に注入した。データは、1:1結合モデルを使用してフィットさせた。結合親和性の結果は、図28に示す。ヒトCD3eへの親和性は、親と比較して保存され、カニクイザルCD3eへの親和性は、親抗体と比較して2~3倍低かった。
[001008]細胞上に発現されたCD3への抗CD3抗体分子の結合
[001009]例示的なヒト化抗CD3抗体のCD3発現Jurkat細胞への結合は、FACSを使用して実施された。抗体は、10μg/mlから開始した一連の3倍希釈の濃度で試験し、AF647にコンジュゲートした抗ヒトIgG二次抗体を使用して検出した。図29に示されるように、ヒト化抗CD3mAbは、CD3を発現するJurkat細胞への強い結合を示した。
[001009]例示的なヒト化抗CD3抗体のCD3発現Jurkat細胞への結合は、FACSを使用して実施された。抗体は、10μg/mlから開始した一連の3倍希釈の濃度で試験し、AF647にコンジュゲートした抗ヒトIgG二次抗体を使用して検出した。図29に示されるように、ヒト化抗CD3mAbは、CD3を発現するJurkat細胞への強い結合を示した。
実施例17.抗カルレティキュリン(CALR)抗体の生成
[001010]2匹のアルメニアンハムスター(86および87)を、mutCALR5bpins(BJ028)抗原を用いて免疫化した。ハムスター#86を選択し、標準的な手順を使用して融合を実施した。融合により12個のハイブリドーマプレートを産生し、ELISAによってBJ028(mutCALRins)、BJ027(野生型CALR)およびBIM0167(ヒトFcに融合したCALR突然変異体ペプチド)への結合をスクリーニングした。15のクローンを、拡大およびサブクローニングのためにさらに選択した。2つのクローンを、さらなる特徴付けおよびシークエンシングのために選択し、V遺伝子配列を得た。ハムスター配列は、CDRをヒトフレームワーク上に移植することによってさらにヒト化された。生じるヒト化mAbは、例えば上記のように、BiacoreおよびFACSを使用して結合を試験した。
[001010]2匹のアルメニアンハムスター(86および87)を、mutCALR5bpins(BJ028)抗原を用いて免疫化した。ハムスター#86を選択し、標準的な手順を使用して融合を実施した。融合により12個のハイブリドーマプレートを産生し、ELISAによってBJ028(mutCALRins)、BJ027(野生型CALR)およびBIM0167(ヒトFcに融合したCALR突然変異体ペプチド)への結合をスクリーニングした。15のクローンを、拡大およびサブクローニングのためにさらに選択した。2つのクローンを、さらなる特徴付けおよびシークエンシングのために選択し、V遺伝子配列を得た。ハムスター配列は、CDRをヒトフレームワーク上に移植することによってさらにヒト化された。生じるヒト化mAbは、例えば上記のように、BiacoreおよびFACSを使用して結合を試験した。
実施例18.α-TRBV6-5抗体の最適化
[001011]抗TRBV6-5抗体を最適化し、ヒトおよびカニクイザル抗原への親和性を改善し、熱安定性を改善し、化学安定性傾向を示す配列モチーフを除去した。ScFvライブラリーは、無作為突然変異誘発(Caldwellら(1992年)Randomization of genes by PCR mutagenesis.PCR Meth.4月.2:28)か、またはKunkel突然変異誘発の改変バージョン(Kunkel TA.(1985年)Rapid and efficient site-specific mutagenesis without phenotypic selection.PNAS 82(2):488~92ページ)を使用して構築した。親和性改善のため、ヒトおよびカニクイザル抗原に対するライブラリー選択を、標準的なファージディスプレイ(Lee,CMら(2007年)Selection of human antibody fragments by phage display. Nature protocols 2,3001)およびイーストディスプレイ技術(Chao Gら(2006年)Isolating and engineering human antibodies using yeast surface display.Nature Protocols.1(2):755~69ページ)を使用して実施した。ファージまたはイースト集団の熱負荷を使用して、熱安定性が改善したクローンを選択した。選択は、ELISAおよびフローサイトメトリーなどの標準的なスクリーニング法に従い、改善した特性を有する個々のクローンを同定した。ヒットシークエンシングおよび突然変異-活性相関の分析後、第2世代のライブラリーを、上記と同じ方法を使用して構築した。ライブラリー選択および個々のクローンスクリーニングを、より厳しい条件を適用して最大の活性を有するクローンを選択する改変を用いて、上記のように繰り返した。ヒットシークエンシングの後、scFv遺伝子を、発現、精製、およびトリアージのため、生物学上関連がある抗体フォーマットへと再フォーマットした。
[001011]抗TRBV6-5抗体を最適化し、ヒトおよびカニクイザル抗原への親和性を改善し、熱安定性を改善し、化学安定性傾向を示す配列モチーフを除去した。ScFvライブラリーは、無作為突然変異誘発(Caldwellら(1992年)Randomization of genes by PCR mutagenesis.PCR Meth.4月.2:28)か、またはKunkel突然変異誘発の改変バージョン(Kunkel TA.(1985年)Rapid and efficient site-specific mutagenesis without phenotypic selection.PNAS 82(2):488~92ページ)を使用して構築した。親和性改善のため、ヒトおよびカニクイザル抗原に対するライブラリー選択を、標準的なファージディスプレイ(Lee,CMら(2007年)Selection of human antibody fragments by phage display. Nature protocols 2,3001)およびイーストディスプレイ技術(Chao Gら(2006年)Isolating and engineering human antibodies using yeast surface display.Nature Protocols.1(2):755~69ページ)を使用して実施した。ファージまたはイースト集団の熱負荷を使用して、熱安定性が改善したクローンを選択した。選択は、ELISAおよびフローサイトメトリーなどの標準的なスクリーニング法に従い、改善した特性を有する個々のクローンを同定した。ヒットシークエンシングおよび突然変異-活性相関の分析後、第2世代のライブラリーを、上記と同じ方法を使用して構築した。ライブラリー選択および個々のクローンスクリーニングを、より厳しい条件を適用して最大の活性を有するクローンを選択する改変を用いて、上記のように繰り返した。ヒットシークエンシングの後、scFv遺伝子を、発現、精製、およびトリアージのため、生物学上関連がある抗体フォーマットへと再フォーマットした。
参考文献による組み込み
[001012]本明細書に記載されるすべての刊行物および特許は、個々の刊行物または特許の各々が、参照により組み込まれるように具体的におよび個別に指示されているかのように、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
[001012]本明細書に記載されるすべての刊行物および特許は、個々の刊行物または特許の各々が、参照により組み込まれるように具体的におよび個別に指示されているかのように、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
均等物
[001013]当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、単に日常的な実験を用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。
[001013]当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、単に日常的な実験を用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の特許請求の範囲に包含されることが意図される。
例示的な実施形態
[001014]任意の前述の多機能分子、核酸、ベクター、宿主細胞、または方法の追加の特徴は、以下の例示的な実施形態の1つまたは複数を含む。
[001014]任意の前述の多機能分子、核酸、ベクター、宿主細胞、または方法の追加の特徴は、以下の例示的な実施形態の1つまたは複数を含む。
[001015]当業者は、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの均等物を、単に日常的な実験を用いて認識するか、または確認することができる。このような均等物は、以下の例示的な実施形態に包含されることが意図される。
例示的な実施形態1
[001016]本開示は、とりわけ、(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する抗原結合性ドメインと;(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される);(iii)サイトカイン分子;および/または(iv)間質改変部分のうちの1つ、2つまたはすべてとを含む新規な多特異性または多機能性分子に関する。用語「多特異性」または「多機能性」は、本明細書において交換可能に使用される。
[001016]本開示は、とりわけ、(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する抗原結合性ドメインと;(ii)免疫細胞エンゲージャー(例えば、NK細胞エンゲージャー、T細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される);(iii)サイトカイン分子;および/または(iv)間質改変部分のうちの1つ、2つまたはすべてとを含む新規な多特異性または多機能性分子に関する。用語「多特異性」または「多機能性」は、本明細書において交換可能に使用される。
[001017]理論に拘泥するものではないが、本明細書に開示される多特異性または多機能性分子は、免疫細胞(例えば、NK細胞、T細胞、B細胞、樹状細胞、もしくはマクロファージから選択される免疫エフェクター細胞)を、標的細胞、例えば、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型もしくは突然変異体カルレティキュリンタンパク質)を発現するがん細胞に標的化(例えば、局在化、架橋、および/もしくは活性化)し、かつ/または腫瘍間質を変更する、例えば、がん部位付近の腫瘍微小環境を変更することが予期される。本明細書に記載される多特異性分子を使用して免疫細胞の近接性および/または活性を増加させることは、標的細胞(例えば、がん細胞)に対する免疫応答を増強させ、それによって、より効果的な療法(例えば、より効果的ながん療法)を実現することが予期される。理論に拘泥するものではないが、標的細胞(例えば、がん細胞)に対する標的化され、局在化された免疫応答は、本明細書に記載される多特異性分子の全身毒性の効果を低下させると考えられる。
[001018]したがって、前述の部分を含む多特異性分子(例えば、多特異性または多機能性抗体分子)、それをコードする核酸、前述の分子を産生する方法、および前述の分子を使用してがんを処置する方法が、とりわけ、本明細書で提供される。
[001019]一態様では、本開示は、試料または対象中のカルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法であって、試料または対象を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン抗体分子と接触させるステップ;ならびに抗体分子と試料または対象との複合体の形成を検出するステップを含み、それによってカルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)を検出する、方法を特徴とする。
[001020]一部の実施形態では、カルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)は、in vitroまたはin vivoで検出される。
[001021]一部の実施形態では、方法は、参照試料または対象を、抗体分子と接触させるステップ;および抗体分子と参照試料または対象との複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または対象と比較した、試料または対象における複合体の形成における変化、例えば統計学的に有意な変化は、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)の存在を示す。
[001022]一部の実施形態では、方法は、対象から試料を取得するステップをさらに含む。
[001023]一部の実施形態では、試料は、血漿、組織(例えば、がん組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えばリンパ節のうちの1つまたは複数を含む。一部の実施形態では、試料は、凍結および/または固定されていない。一部の実施形態では、試料は、ホルマリン固定(例えば、ホルマリン固定、パラフィン包埋(FFPE))されている。一部の実施形態では、試料は、染色される(例えば、免疫組織化学による分析のため)。一部の実施形態では、試料は、凍結および/または固定されている。
[001024]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある。
[001025]一部の実施形態では、方法は、例えば、マルチパネル法を使用する、フローサイトメトリー分析を実施するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、免疫組織化学(IHC)分析、例えば、モノクロまたは多重染色フォーマットを実施するステップをさらに含む。一部の実施形態では、IHC法は、明視野発色IHCを含む。実施形態では、明視野発色IHC法は、例えば、異なる色素源によって直接標識される、一次抗体による抗原の直接検出を含む。一部の実施形態では、IHC法は、蛍光IHCを含む。実施形態では、蛍光IHC法は、例えば、異なる蛍光によって直接標識される、一次抗体による抗原の直接検出を含む。一部の実施形態では、方法は、試料、例えば、固定試料、例えばFFPE試料に免疫組織化学を実施するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、生体試料からのカルレティキュリン+(例えば、野生型カルレティキュリン+または突然変異体カルレティキュリン+)細胞のレベルを測定するステップ(例えば、カルレティキュリン+(例えば、野生型カルレティキュリン+または突然変異体カルレティキュリン+)細胞が、例えば、参照試料または対象と比較して枯渇しているかどうかを決定するステップ)をさらに含む。一部の実施形態では、方法は、カルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む。一部の実施形態では、方法は、カルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)の膜レベルを測定するステップをさらに含む。
[001026]一部の実施形態では、方法は、本明細書に記載される2つまたはそれ以上の検出方法を組み合わせるステップを含む。実施形態では、方法は、核酸ベースの方法および抗体ベースの方法を含む。
[001027]一部の実施形態では、方法は、例えば、(例えば、本明細書に記載の抗体分子を用いた)処置後に、疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)の予後、重症度、または存在もしくは非存在の変化について対象を評価するステップをさらに含む。
[001028]一部の実施形態では、抗体分子は、検出可能に標識される。一部の実施形態では、抗体分子は、抗カルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子である。
[001029]一態様では、本開示は、対象を評価する方法であって、対象からの試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;および
[001030]抗体分子と試料との複合体の形成を検出するステップを含み、それにより対象を評価する、方法を特徴とする。
[001030]抗体分子と試料との複合体の形成を検出するステップを含み、それにより対象を評価する、方法を特徴とする。
[001031]一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある。一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されていない。一部の実施形態では、対象は、本明細書に記載の抗体分子で処置されている。
[001032]一態様では、本開示は、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と、例えば、本明細書に記載の方法に従って、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法における使用のための使用説明書とを含むキットを特徴とする。
[001033]したがって、一態様では、本開示は、
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、または表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、
(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば表30、表31、表32、表33、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、またはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、または表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、
(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば表30、表31、表32、表33、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、またはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインと
を含む、多機能性分子を特徴とする。
[001034]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはTCRβVに結合する。
[001035]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはT細胞を活性化するか、または第2の抗原結合性ドメインはT細胞を活性化しない。
[001036]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはTCRβV12またはTCRβV6(例えば、配列番号1044のアミノ酸配列を含む)に結合する。
[001037]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表30、表31、表32、表33、表11、表12、または表13に列挙される1つまたは複数のアミノ酸配列を含む。
[001038]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001039]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001040]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001041]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
[001042](a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001042](a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001043]一部の実施形態では、多機能性分子は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
[001044]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインはNKp30に結合する。
[001045]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子、例えば抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択され、例えば、第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである。
[001046]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001047]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001048]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[001049]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[001050]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む。
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む。
[001051]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001052]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001053]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001054]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[001055]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む。
[001056]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[001057]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む。
[001058]一部の実施形態では、多特異性分子は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは、第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは、第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む。
[001059]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。
[001060]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。
[001061]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質は配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[001062]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインはカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第1の抗原結合性ドメインは配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。
[001063]一部の実施形態では、多特異性分子は、
第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインであって、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6285、D1001または6286のアミノ酸配列を含む、第3の抗原結合性ドメイン
をさらに含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと同じである。
第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインであって、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6285、D1001または6286のアミノ酸配列を含む、第3の抗原結合性ドメイン
をさらに含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと同じである。
[001064]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリン分子は第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と同じである。
[001065]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリン分子は第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と異なる。
[001066]一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。
[001067]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[001068]一部の実施形態では、第3の抗原結合性ドメインは第2のカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第3の抗原結合性ドメインは配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。
[001069]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、
(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);
(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);
(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;
(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;
(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは
(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVL
を含む。
(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);
(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);
(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;
(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;
(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは
(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVL
を含む。
[001070]一部の実施形態では、多機能性分子は腫瘍標的化部分をさらに含む。
[001071]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は腫瘍抗原に結合する。
[001072]一部の実施形態では、腫瘍抗原は、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される。
[001073]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する抗体分子を含む。
[001074]一部の実施形態では、腫瘍標的化部分は、例えば、表38または表20に列挙されるVHおよび/またはVL配列を含む。
[001075]一部の実施形態では、多機能性分子は、非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合し、任意選択で、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合は、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい。
[001076]一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択され、任意選択で、
骨髄増殖性新生物細胞はJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含まない。
骨髄増殖性新生物細胞はJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含まない。
[001077]一部の実施形態では、多特異性分子は、リンカー、例えば、第1の抗原結合性ドメインと第2の抗原結合性ドメインとの間のリンカーをさらに含む。
[001078]一部の実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される。
[001079]一部の実施形態では、リンカーはペプチドリンカーである。
[001080]一部の実施形態では、ペプチドリンカーはGlyおよびSerを含む。
[001081]一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号6214~6217、または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む。
[001082]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される多機能性分子をコードする核酸分子を提供する。
[001083]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される核酸分子を含むベクター、例えば、発現ベクターを提供する。
[001084]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される核酸分子またはベクターを含む宿主細胞を提供する。
[001085]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される多機能性分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適した条件下で、本明細書に記載される宿主細胞を培養するステップを含む、方法を提供する。
[001086]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される多機能性分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤または安定化剤とを含む医薬組成物を提供する。
[001087]別の態様では、本開示は、がんを処置する方法であって、それを必要とする対象に、本明細書に開示される多機能性分子を投与するステップを含み、多機能性分子ががんを処置するのに有効な量で投与される、方法を提供する。
[001088]別の態様では、本開示は、がんを処置する際における、本明細書に記載される多機能性分子の使用を提供する。別の態様では、本開示は、がんを処置する際における使用のための、本明細書に開示される多機能性分子を提供する。
[001089]一部の実施形態では、対象は第1および/または第2のカルレティキュリンタンパク質を発現するがん細胞を有する。
[001090]一部の実施形態では、対象はJAK2 V617F突然変異を有する。
[001091]一部の実施形態では、対象はJAK2 V617F突然変異を有しない。
[001092]一部の実施形態では、対象はMPL突然変異を有する。
[001093]一部の実施形態では、対象はMPL突然変異を有しない。
[001094]一部の実施形態では、がんは血液がんであり、任意選択で、がんは、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)であり、任意選択で、がんは骨髄線維症である。
[001095]一部の実施形態では、がんは固形腫瘍がんである。
[001096]一部の実施形態では、方法または使用は第2の治療処置を施すステップをさらに含む。
[001097]一部の実施形態では、第2の治療処置は、治療剤(例えば、化学療法剤、生物学的製剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む。
[001098]一部の実施形態では、治療剤は化学療法剤または生物学的製剤から選択される。
[001099]別の態様では、本開示は、
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー;
(b)サイトカイン分子;
(c)間質改変部分;または
(d)例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、もしくはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する腫瘍標的化部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)(a)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー;
(b)サイトカイン分子;
(c)間質改変部分;または
(d)例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、もしくはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する腫瘍標的化部分
のうちの1つ、2つ、またはすべてと
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
[001100]ある態様では、本開示は、
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)免疫細胞エンゲージャーを含む第2の抗原結合性ドメイン(例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、本明細書に記載される、例えば、TCRβVに結合する抗原結合性ドメイン)と
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)免疫細胞エンゲージャーを含む第2の抗原結合性ドメイン(例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、本明細書に記載される、例えば、TCRβVに結合する抗原結合性ドメイン)と
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
[001101]ある態様では、本開示は、
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する腫瘍標的化部分を含む第2の抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する腫瘍標的化部分を含む第2の抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
[001102]ある態様では、本開示は、
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)免疫細胞エンゲージャーを含む第2の抗原結合性ドメイン(例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、本明細書に記載される、例えば、TCRβVに結合する抗原結合性ドメイン、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子)と、
(iii)例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する腫瘍標的化部分を含む第3の抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)免疫細胞エンゲージャーを含む第2の抗原結合性ドメイン(例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、本明細書に記載される、例えば、TCRβVに結合する抗原結合性ドメイン、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子)と、
(iii)例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する腫瘍標的化部分を含む第3の抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子(例えば、それをコードするポリペプチドまたは核酸)を特徴とする。
[001103]一部の実施形態では、多機能性分子は、サイトカイン分子またはサイトカイン分子の調節薬、例えば、本明細書に記載される、例えば、TGF-β阻害剤をさらに含む。
[001104]一部の実施形態では、多機能性分子は、NK細胞エンゲージャー、例えば、本明細書に記載される、例えば、Nkp30に結合する抗原結合性ドメインをさらに含む。
[001105]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6285、D1001または6286のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、野生型カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリン突然変異体タンパク質は配列番号6286のアミノ酸配列を含む。
[001106]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、配列番号6224の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6226のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6228のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、配列番号6232の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6234のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6236のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)を含む。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[001107]一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6313~6346またはD002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は、表2または3に開示されるカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)である。一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6287のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6313のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6288のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6314のアミノ酸配列を含む。
[001108]一部の実施形態では、多機能性分子は、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に優先的に結合する第2の抗原結合性ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6286のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと異なる。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは第1の抗原結合性ドメインと同じである。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6287~6312から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は、表2または3に開示されるカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)である。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6287のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6313のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6288のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6314のアミノ酸配列を含む。
[001109]一部の実施形態では、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は1型カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)であり、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)は2型カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)である。一部の実施形態では、第1のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6287のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6288のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、第1のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6313のアミノ酸配列を含み、第1のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6314のアミノ酸配列を含む。
[001110]一部の実施形態では、野生型カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。
[001111]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、突然変異体カルレティキュリンタンパク質)および野生型カルレティキュリンタンパク質に対してほぼ同じ親和性(例えば、等しい親和性)を有する。
[001112]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、突然変異体カルレティキュリンタンパク質)および野生型カルレティキュリンタンパク質に対してほぼ同じ親和性(例えば、等しい親和性)を有する。
[001113]一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは、野生型カルレティキュリンタンパク質に対してより第1のカルレティキュリン突然変異体タンパク質に対してより高い親和性を有する。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインと第1のカルレティキュリン突然変異体タンパク質との結合に関するKDは、第1の抗原結合性ドメインと野生型カルレティキュリンタンパク質との結合に関するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは第1のカルレティキュリン突然変異体タンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合する。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは配列番号6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。一部の実施形態では、第1の抗原結合性ドメインは野生型カルレティキュリンタンパク質に結合しない。一部の実施形態では、野生型カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。
[001114]一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは、野生型カルレティキュリンタンパク質に対してより第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質に対してより高い親和性を有する。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインと第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質との結合に関するKDは、第2の抗原結合性ドメインと野生型カルレティキュリンタンパク質との結合に関するKDの40%、30%、20%、10%、1%、0.1%、または0.01%以下である。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合する。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは配列番号6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する。一部の実施形態では、第2の抗原結合性ドメインは野生型カルレティキュリンタンパク質に結合しない。一部の実施形態では、野生型カルレティキュリンタンパク質は配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む。
[001115]一部の実施形態では、多機能性分子は非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合する。一部の実施形態では、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合は、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択される。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞はJAK2 V617F突然変異を含まない。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含まない。
[001116]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6253の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[001117]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6253の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号6253の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001118]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6253のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6259のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
[001119]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6253のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6259のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
(i)配列番号6253のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号6254のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号6255のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6259のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
[001120]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6224の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6226のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6228のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[001121]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6224の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6226のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6228のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
(i)配列番号6224の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6226のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6228のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
[001122]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[001123]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
(i)配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
[001124]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[001125]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
(i)配列番号6263のVHFWR1アミノ酸配列、配列番号6264のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6265のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号228のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
[001126]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6247のアミノ酸配列(または配列番号6247に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[001127]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6247のアミノ酸配列(または配列番号6247に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および
(ii)配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号6247のアミノ酸配列(または配列番号6247に対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および
(ii)配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[001128]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6247のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6249のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号6247のアミノ酸配列を含むVH、および(ii)配列番号6249のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[001129]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6250に対して少なくとも70%または75%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6252に対して少なくとも85%または90%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号6250に対して少なくとも70%または75%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVH、および(ii)配列番号6252に対して少なくとも85%または90%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[001130]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6256の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6257のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6258もしくは116のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)を含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
[001131]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6256の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6257のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6258もしくは116のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)配列番号6256の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6257のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6258もしくは116のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6259の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6260のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6261のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
[001132]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6232の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6234のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6236のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[001133]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6232の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6234のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6236のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
(i)配列番号6232の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6234のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6236のVHFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6230のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6238の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6240のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号6242のVLFWR3アミノ酸配列、および/または配列番号6244のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
[001134]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6266の重鎖フレームワーク1(VHFWR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6267のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6268のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6269のVHFWR4アミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVLを含む。
[001135]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6266の重鎖フレームワーク1(VHFWR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6267のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6268のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6269のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
(i)配列番号6266の重鎖フレームワーク1(VHFWR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6267のVHFWR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6268のVHFWR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10、もしくは11以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6269のVHFWR4アミノ酸配列を含むVH、ならびに
(ii)配列番号6277のVLFWR1アミノ酸配列(または1つ、2つ、もしくは3つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6278のVLFWR2アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6279のVLFWR3アミノ酸配列(または1つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号6280のVLFWR4アミノ酸配列を含むVL
を含む。
[001136]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6248のアミノ酸配列(または配列番号6248に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVLを含む。
[001137]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、
(i)配列番号6248のアミノ酸配列(または配列番号6248に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および
(ii)配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
(i)配列番号6248のアミノ酸配列(または配列番号6248に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および
(ii)配列番号6249のアミノ酸配列(または配列番号6249に対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む。
[001138]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6248のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6249のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号6248のアミノ酸配列を含むVH、および(ii)配列番号6249のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[001139]一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6251に対して少なくとも70%または74%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVHを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、配列番号6252に対して少なくとも85%または90%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVLを含む。一部の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合性ドメインは、(i)配列番号6251に対して少なくとも70%もしくは74%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVH、および/または(ii)配列番号6252に対して少なくとも85%もしくは90%の配列同一性のアミノ酸配列を含むVLを含む。
[001140]一部の実施形態では、多機能性分子は、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャーを含む。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合し、それを活性化する。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、免疫細胞、例えば、エフェクター細胞に結合するが、それを活性化しない。
[001141]一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、T細胞エンゲージャー、例えば、T細胞への結合およびその活性化を媒介するT細胞エンゲージャー、またはT細胞への結合を媒介するが、その活性化を媒介しないT細胞エンゲージャーである。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、CD3、TCRα、TCRβ、TCRγ、TCRζ、ICOS、CD28、CD27、HVEM、LIGHT、CD40、4-1BB、OX40、DR3、GITR、CD30、TIM1、SLAM、CD2、またはCD226に結合する。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは抗CD3抗体分子である。一部の実施形態では、T細胞エンゲージャーは、抗TCRβ抗体分子、例えば、本明細書に記載される抗TCRβV抗体分子である。
[001142]一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、NK細胞エンゲージャー、例えば、NK細胞への結合およびその活性化を媒介するNK細胞エンゲージャー、またはNK細胞への結合を媒介するが、その活性化を媒介しないNK細胞エンゲージャーである。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30、NKp40、NKp44、NKp46、NKG2D、DNAM1、DAP10、CD16(例えば、CD16a、CD16b、もしくは両方)、CRTAM、CD27、PSGL1、CD96、CD100(SEMA4D)、NKp80、CD244(SLAMF4もしくは2B4としても公知)、SLAMF6、SLAMF7、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、KIR2DS3、KIR2DS5、KIR2DS1、CD94、NKG2C、NKG2E、またはCD160に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子、例えば抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択される。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp30またはNKp46に結合する抗体分子、例えば、抗原結合性ドメインである。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーはリガンドであり、任意選択で、リガンドは、免疫グロブリン定常領域、例えば、Fc領域をさらに含む。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、NKp44またはNKp46のリガンド、例えば、ウイルスHAである。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、DAP10のリガンド、例えば、NKG2Dに対する共受容体である。一部の実施形態では、NK細胞エンゲージャーは、CD16のリガンド、例えば、CD16a/bリガンド、例えば、抗体Fc領域をさらに含むCD16a/bリガンドである。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、B細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞のうちの1つまたは複数への結合、またはその活性化、または両方を媒介する。
[001143]一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、CD40リガンド(CD40L)もしくはCD70リガンド;CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;OX40に対する抗体分子;OX40リガンド(OX40L);Toll様受容体のアゴニスト(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)、もしくはTLR9アゴニスト);41BB;CD2アゴニスト;CD47;もしくはSTINGアゴニスト、またはこれらの組合せのうちの1つまたは複数から選択されるB細胞、マクロファージ、および/または樹状細胞エンゲージャーを含む。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、B細胞エンゲージャー、例えば、CD40L、OX40L、もしくはCD70リガンド、またはOX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子である。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、マクロファージ細胞エンゲージャー、例えば、CD2アゴニスト;CD40L;OX40L;OX40、CD40もしくはCD70に結合する抗体分子;Toll様受容体(TLR)のアゴニスト(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4)、もしくはTLR9アゴニスト);CD47;またはSTINGアゴニストである。一部の実施形態では、免疫細胞エンゲージャーは、樹状細胞エンゲージャー、例えば、CD2アゴニスト、OX40抗体、OX40L、41BBアゴニスト、Toll様受容体アゴニストもしくはその断片(例えば、TLR4、例えば、構成的活性型TLR4(caTLR4))、CD47アゴニスト、またはSTINGアゴニストである。一部の実施形態では、STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド、例えば、サイクリックジGMP(cdGMP)、サイクリックジAMP(cdAMP)、またはこれらの組合せを含み、任意選択で2’,5’または3’,5’リン酸連結を有し、例えば、STINGアゴニストは、多機能性分子に共有結合的にカップリングされる。
[001144]一部の実施形態では、多機能性分子はサイトカイン分子またはその調節薬を含む。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、TGF-β、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-7(IL-7)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、もしくはインターフェロンガンマ、もしくはその断片もしくはバリアント、または上記のサイトカインの任意の組合せから選択される。一部の実施形態では、サイトカイン分子は単量体または二量体である。一部の実施形態では、サイトカイン分子は、受容体二量体化ドメイン、例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメインをさらに含む。一部の実施形態では、サイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合的に連結されず、例えば、非共有結合的に会合される。
[001145]一部の実施形態では、サイトカイン分子の調節薬はTGF-β阻害剤を含む。
[001146]一部の実施形態では、多機能性分子は間質改変部分を含む。一部の実施形態では、間質改変部分は、間質もしくは細胞外マトリックス(ECM)成分のレベルもしくは産生の減少;腫瘍線維形成の減少;間質腫瘍輸送の増加;腫瘍灌流の改善;腫瘍微小血管の拡大;腫瘍における間質液圧(IFP)の減少;または薬剤、例えば、がん治療薬もしくは細胞療法の、腫瘍もしくは腫瘍血管への浸透もしくは拡散の減少もしくは増強のうちの1つまたは複数を引き起こす。一部の実施形態では、減少される間質またはECM成分は、グリコサミノグリカンもしくは細胞外タンパク質、またはそれらの組合せから選択される。一部の実施形態では、グリコサミノグリカンは、ヒアルロナン(ヒアルロン酸もしくはHAとしても知られる)、コンドロイチン硫酸塩、コンドロイチン、デルマタン硫酸塩、ヘパラン硫酸塩、ヘパリン、エンタクチン、テネイシン、アグリカン、またはケラチン硫酸塩から選択される。一部の実施形態では、細胞外タンパク質は、コラーゲン、ラミニン、エラスチン、フィブリノーゲン、フィブロネクチン、またはビトロネクチンから選択される。一部の実施形態では、間質改変部分は、腫瘍間質または細胞外マトリックス(ECM)を分解する酵素分子を含む。一部の実施形態では、酵素分子は、ヒアルロニダーゼ分子、コラゲナーゼ分子、コンドロイチナーゼ分子、マトリックスメタロプロテイナーゼ分子(例えば、マクロファージメタロエラスターゼ)、または前述のもののいずれかのバリアント(例えば、断片)から選択される。一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロン酸のレベルまたは産生を減少させる。一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナン分解酵素、ヒアルロナン合成を阻害する薬剤、またはヒアルロン酸に対する抗体分子を含む。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、ヒアルロニダーゼ分子またはそのバリアント(例えば、その断片)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、中性または酸性のpH、例えば、約4~5のpHにおいて活性である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、哺乳動物ヒアルロニダーゼ分子、例えば、組換えヒトヒアルロニダーゼ分子またはそのバリアント(例えば、その短縮形態)である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1、HYAL2、もしくはPH-20/SPAM1、またはそのバリアント(例えば、その短縮形態)から選択される。一部の実施形態では、短縮形態は、C末端グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合部位またはGPI結合部位の一部分が欠如している。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、グリコシル化されている、例えば、少なくとも1つのN結合型グリカンを含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6213のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸残基36~464を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、PH20のアミノ酸残基36~481、36~482、または36~483を含み、ここで、PH20は配列番号6213のアミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸配列のポリペプチドまたはその短縮形態に対して少なくとも95%~100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸配列に対して30個、20個、10個、5つ、またはそれよりも少ないアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のアミノ酸配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、100%)同一のアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、配列番号6213のヌクレオチド配列に対して少なくとも95%(例えば、少なくとも96%、97%、98%、99%、100%)同一のヌクレオチド配列によってコードされる。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子はPH20、例えば、rHuPH20である。一部の実施形態では、ヒアルロニダーゼ分子は、HYAL1であり、配列番号6218のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6218のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)アミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、ポリマーをさらに含み、例えば、ポリマー、例えば、PEGにコンジュゲートされている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素は、PEG化PH20酵素(PEGPH20)である。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4の重鎖定常領域から選択される、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)をさらに含む。一部の実施形態では、免疫グロブリン定常領域(例えば、Fc領域)は、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子に連結、例えば、共有結合的に連結されている。一部の実施形態では、免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、Fc受容体の結合、抗体のグリコシル化、システイン残基の数、エフェクター細胞の機能、または補体機能のうちの1つまたは複数を増加または減少させるように、変更、例えば、突然変異されている。一部の実施形態では、ヒアルロナン分解酵素、例えば、ヒアルロニダーゼ分子は、二量体を形成する。一部の実施形態では、間質改変部分は、ヒアルロナンの合成、例えば、HAシンターゼの阻害剤を含む。一部の実施形態では、阻害剤は、HAシンターゼに対するセンスもしくはアンチセンス核酸分子を含むか、または小分子薬である。一部の実施形態では、阻害剤は、4-メチルウンベリフェロン(MU)もしくはその誘導体(例えば、6,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリンもしくは5,7-ジヒドロキシ-4-メチルクマリン)、またはレフルノミドもしくはその誘導体である。一部の実施形態では、間質改変部分は、コラゲナーゼ分子、例えば、哺乳動物コラゲナーゼ分子、またはそのバリアント(例えば、断片)を含む。一部の実施形態では、コラゲナーゼ分子は、例えば、配列番号6219のアミノ酸配列、もしくはその断片、またはそれに対して実質的に同一である(例えば、それに対して95%~99.9%同一であるか、または配列番号6219のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5個、10個、もしくは15個以下である変更(例えば、置換、欠失、もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有するアミノ酸配列を含む、コラゲナーゼ分子IVである。
[001147]一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)およびサイトカイン分子を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)および間質改変部分を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、サイトカイン分子および間質改変部分を含む。一部の実施形態では、多機能性分子は、免疫細胞エンゲージャー(例えば、T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、またはマクロファージ細胞エンゲージャー)、サイトカイン分子、および間質改変部分を含む。
[001148]一部の実施形態では、多機能性分子は少なくとも2つの非連続的ポリペプチド鎖を含む。
[001149]一部の実施形態では、多機能性分子は、以下の構成:
A,B-[二量体化モジュール]-C,-D
例えば、図1A、1B、および1Cに示される構成を含み、ここで、
(1)二量体化モジュールは、免疫グロブリン定常ドメイン、例えば、重鎖定常ドメイン(例えば、ホモ二量体もしくはヘテロ二量体重鎖定常領域、例えば、Fc領域)、または免疫グロブリン可変領域(例えば、Fab領域)の定常ドメインを含み;
(2)A、B、C、およびDは、独立して、不在であるか;(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくは突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメイン;(ii)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー;(iii)サイトカイン分子;または(iv)間質改変部分であるが、ただし
A、B、C、およびDのうちの少なくとも1つ、2つ、または3つが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含むこと、ならびに
残りのA、B、C、およびDのうちのいずれかは、不在であるか、または免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、もしくは間質改変部分のうちの1つを含むこと
を条件とする。
A,B-[二量体化モジュール]-C,-D
例えば、図1A、1B、および1Cに示される構成を含み、ここで、
(1)二量体化モジュールは、免疫グロブリン定常ドメイン、例えば、重鎖定常ドメイン(例えば、ホモ二量体もしくはヘテロ二量体重鎖定常領域、例えば、Fc領域)、または免疫グロブリン可変領域(例えば、Fab領域)の定常ドメインを含み;
(2)A、B、C、およびDは、独立して、不在であるか;(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくは突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメイン;(ii)T細胞エンゲージャー、NK細胞エンゲージャー、B細胞エンゲージャー、樹状細胞エンゲージャー、もしくはマクロファージ細胞エンゲージャーから選択される免疫細胞エンゲージャー;(iii)サイトカイン分子;または(iv)間質改変部分であるが、ただし
A、B、C、およびDのうちの少なくとも1つ、2つ、または3つが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含むこと、ならびに
残りのA、B、C、およびDのうちのいずれかは、不在であるか、または免疫細胞エンゲージャー、サイトカイン分子、もしくは間質改変部分のうちの1つを含むこと
を条件とする。
[001150]一部の実施形態では、
(i)Aが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子を含むか;
(ii)Aが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、サイトカイン分子を含むか;
(iii)Aが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、間質改変部分を含むか;
(iv)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子を含むか;
(v)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、サイトカイン分子を含むか;
(vi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、間質改変部分を含むか;
(vii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子を含むか;
(viii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、サイトカイン分子を含むか;
(ix)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、間質改変部分を含むか;
(x)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)サイトカイン分子を含むか;
(xi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xiii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)サイトカイン分子を含むか;
(xiv)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xv)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xvi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)サイトカイン分子を含むか;
(xvii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xviii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xix)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子、(b)サイトカイン分子、および(c)間質改変部分を含むか;
(xx)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子、(b)サイトカイン分子、および(c)間質改変部分を含むか;または
(xxi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子、(b)サイトカイン分子、および(c)間質改変部分を含む。
(i)Aが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子を含むか;
(ii)Aが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、サイトカイン分子を含むか;
(iii)Aが、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメインであって、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、間質改変部分を含むか;
(iv)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子を含むか;
(v)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、サイトカイン分子を含むか;
(vi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、間質改変部分を含むか;
(vii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子を含むか;
(viii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、サイトカイン分子を含むか;
(ix)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、間質改変部分を含むか;
(x)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)サイトカイン分子を含むか;
(xi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xiii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)サイトカイン分子を含むか;
(xiv)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xv)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xvi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)サイトカイン分子を含むか;
(xvii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xviii)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)サイトカイン分子および(b)間質改変部分を含むか;
(xix)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、B、C、もしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子、(b)サイトカイン分子、および(c)間質改変部分を含むか;
(xx)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Bが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、CもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子、(b)サイトカイン分子、および(c)間質改変部分を含むか;または
(xxi)Aが、第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインであって、第1のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第1の抗原結合性ドメインを含み、Cが、第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質もしくはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインであって、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、第2の抗原結合性ドメインを含み、BもしくはDが、(a)免疫細胞エンゲージャー、例えば、T細胞エンゲージャー、例えば、抗CD3抗体分子、(b)サイトカイン分子、および(c)間質改変部分を含む。
[001151]一部の実施形態では、二量体化モジュールは、対になった孔と突起(「ノブ・イン・ホール」)、静電相互作用、または鎖交換のうちの1つまたは複数を含む、1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)を含む。一部の実施形態では、1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、例えば、ヒトIgG1のFc領域の、347位、349位、350位、351位、366位、368位、370位、392位、394位、395位、397位、398位、399位、405位、407位、または409位のうちの1つまたは複数から選択される位置に、アミノ酸置換を含む。一部の実施形態では、1つまたは複数の免疫グロブリン鎖定常領域(例えば、Fc領域)は、T366S、L368A、もしくはY407V(例えば、孔もしくはホールに対応する)、またはT366W(例えば、突起もしくはノブに対応する)、またはこれらの組合せから選択されるアミノ酸置換を含む。
[001152]一部の実施形態では、多機能性分子は、リンカー、例えば、抗原結合性ドメインと免疫細胞エンゲージャーとの間、抗原結合性ドメインとサイトカイン分子との間、抗原結合性ドメインと間質改変部分との間、免疫細胞エンゲージャーとサイトカイン分子との間、免疫細胞エンゲージャーと間質改変部分との間、サイトカイン分子と間質改変部分との間、抗原結合性ドメインと二量体化モジュールとの間、免疫細胞エンゲージャーと二量体化モジュールとの間、サイトカイン分子と二量体化モジュールとの間、または間質改変部分と二量体化モジュールとの間のうちの1つまたは複数におけるリンカーをさらに含む。一部の実施形態では、リンカーは、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される。一部の実施形態では、リンカーは、ペプチドリンカーである。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、GlyおよびSerを含む。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号6214~6217または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む。
[001153]一態様では、本発明は、
(i)例えば、カルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメイン、および
(ii)CD3に結合する部分、例えば、CD3に結合する抗体分子
を含む、多機能性分子を提供する。
(i)例えば、カルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメイン、および
(ii)CD3に結合する部分、例えば、CD3に結合する抗体分子
を含む、多機能性分子を提供する。
[001154]一部の実施形態では、多機能性分子は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびCD3に結合する第1の部分(例えば、CD3に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でCD3に結合する第2の部分(例えば、CD3に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインを形成し、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択される。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびCD3に結合する第1の部分(例えば、CD3に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でCD3に結合する第2の部分(例えば、CD3に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインを形成し、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択される。
[001155]一部の実施形態では、多機能性分子は、図2Aまたは2Bの構成を含む。
[001156]一態様では、本発明は、
(i)例えば、カルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメイン、および
(ii)TCR(例えば、TCRβ)に結合する部分、例えば、TCR(例えば、TCRβ)に結合する抗体分子
を含む、多機能性分子を提供する。
(i)例えば、カルレティキュリン突然変異体タンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメイン、および
(ii)TCR(例えば、TCRβ)に結合する部分、例えば、TCR(例えば、TCRβ)に結合する抗体分子
を含む、多機能性分子を提供する。
[001157]一部の実施形態では、多機能性分子は、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択で、TCR(例えば、TCRβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインを形成し、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択される。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択で、TCR(例えば、TCRβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインを形成し、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択される。
[001158]一部の実施形態では、多機能性分子は、図3Aまたは3Bの構成を含む。
[001159]一態様では、本発明は、
(i)例えば、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する部分、例えば、NKp30に結合する(例えば、活性化する)抗体分子またはリガンド
を含む、多機能性分子を提供する。
(i)例えば、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する抗原結合性ドメイン、および
(ii)NKp30に結合する部分、例えば、NKp30に結合する(例えば、活性化する)抗体分子またはリガンド
を含む、多機能性分子を提供する。
[001160]一部の実施形態では、多機能性分子は、
[001161]例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインを形成し、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択される。
[001161]例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型カルレティキュリンタンパク質またはカルレティキュリン突然変異体タンパク質)に結合する第2の抗原結合性ドメインを形成し、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択される。
[001162]一部の実施形態では、多機能性分子は、図4Aまたは4Bの構成を含む。
[001163]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される任意の多特異性または多機能性分子をコードする単離された核酸分子を提供する。別の態様では、本開示は、本明細書に記載される多特異性もしくは多機能性分子のいずれかをコードするヌクレオチド配列、またはそれに対して実質的に相同(例えば、それに対して少なくとも80%、90%、95%、もしくは99.9%同一)であるヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。別の態様では、本開示は、本明細書に記載される核酸分子またはベクターを含む宿主細胞を提供する。
[001164]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子ポリペプチドを作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適した条件下で、本明細書に記載される宿主細胞を培養するステップを含む、方法を提供する。
[001165]別の態様では、本開示は、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子ポリペプチドと、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む医薬組成物を提供する。
[001166]別の態様では、本開示は、がんを処置する方法であって、それを必要とする対象に、本明細書に記載される多特異性または多機能性分子ポリペプチドを投与するステップを含み、多特異性抗体ががんを処置するのに有効な量で投与される、方法を提供する。一部の実施形態では、対象は、第1および/または第2のカルレティキュリン突然変異体を発現するがん細胞を有する。一部の実施形態では、対象は、第1、第2、または第3の腫瘍抗原を発現する腫瘍細胞を有する、例えば、対象は、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原を発現する腫瘍細胞を有する。一部の実施形態では、対象は、JAK2 V617F突然変異を有する。一部の実施形態では、対象は、JAK2 V617F突然変異を有しない。一部の実施形態では、対象は、MPL突然変異を有する。一部の実施形態では、対象は、MPL突然変異を有しない。一部の実施形態では、がんは血液がんであり、任意選択で、がんは、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)である。一部の実施形態では、がんは、骨髄線維症である。一部の実施形態では、がんは、固形腫瘍がんである。一部の実施形態では、固形腫瘍がんは、膵臓がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん、肺がん(例えば、小細胞もしくは非小細胞肺がん)、皮膚がん、卵巣がん、または肝臓がんのうちの1つまたは複数である。
[001167]一部の実施形態では、がん細胞は骨髄増殖性新生物細胞を含む。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択される。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は骨髄線維症細胞である。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は本態性血小板血症細胞である。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は真性赤血球増加症細胞である。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞は慢性骨髄がん細胞である。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞はJAK2突然変異(例えば、JAK2 V617F突然変異)を含む。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞はカルレティキュリン突然変異を含む。一部の実施形態では、骨髄増殖性新生物細胞はMPL突然変異を含む。
[001168]一部の実施形態では、方法は第2の治療処置を施すステップをさらに含む。一部の実施形態では、第2の治療処置は、治療剤(例えば、化学療法剤、生物学的製剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む。一部の実施形態では、治療剤は、化学療法剤、または生物学的製剤から選択される。
例示的実施形態2
[001169]1.(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば、表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、もしくは表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、
(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表30、表31、表32、表33、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、またはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子。
[001169]1.(i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば、表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、もしくは表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、
(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表30、表31、表32、表33、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、またはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子。
[001170]2.第2の抗原結合性ドメインがTCRβVに結合する、実施形態1に記載の多機能性分子。
[001171]3.第2の抗原結合性ドメインがT細胞を活性化するか、または第2の抗原結合性ドメインがT細胞を活性化しない、実施形態2に記載の多機能性分子。
[001172]4.第2の抗原結合性ドメインが、TCRβV12またはTCRβV6(例えば、配列番号1044のアミノ酸配列を含む)に結合する、実施形態2または3に記載の多機能性分子。
[001173]5.第2の抗原結合性ドメインが、表30、表31、表32、表33、表11、表12、または表13に列挙される1つまたは複数のアミノ酸配列を含む、実施形態2~4のいずれかに記載の多機能性分子。
[001174]6.第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
[001175]7.第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表33、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
[001176]8.第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66の軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
[001177]9.第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態2~5のいずれかに記載の多機能性分子。
[001178]10.例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
[001179]例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む、実施形態2~9のいずれかに記載の多機能性分子。
[001179]例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHは第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHは第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質は配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質は、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子は図3Aまたは3Bの構成を含む、実施形態2~9のいずれかに記載の多機能性分子。
[001180]11.第2の抗原結合性ドメインがNKp30に結合する、実施形態1に記載の多機能性分子。
[001181]12.第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子、例えば抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択され、例えば、第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである、実施形態11に記載の多機能性分子。
[001182]13.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態11または12に記載の多機能性分子。
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態11または12に記載の多機能性分子。
[001183]14.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態13に記載の多機能性分子。
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態13に記載の多機能性分子。
[001184]15.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、実施形態13または14に記載の多機能性分子。
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、実施形態13または14に記載の多機能性分子。
[001185]16.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、実施形態13~15のいずれかに記載の多機能性分子。
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、実施形態13~15のいずれかに記載の多機能性分子。
[001186]17.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む、実施形態13~16のいずれかに記載の多機能性分子。
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む、実施形態13~16のいずれかに記載の多機能性分子。
[001187]18.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態11または12に記載の多機能性分子。
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態11または12に記載の多機能性分子。
[001188]19.第2の抗原結合性ドメインが、
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態11、12または18のいずれかに記載の多機能性分子。
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態11、12または18のいずれかに記載の多機能性分子。
[001189]20.第2の抗原結合性ドメインが、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態19に記載の多機能性分子。
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、実施形態19に記載の多機能性分子。
[001190]21.第2の抗原結合性ドメインが、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、実施形態11、12または18~20のいずれかに記載の多機能性分子。
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、実施形態11、12または18~20のいずれかに記載の多機能性分子。
[001191]22.第2の抗原結合性ドメインが、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む、実施形態11、12または18~21のいずれかに記載の多機能性分子。
[001192]23.第2の抗原結合性ドメインが、表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む、実施形態11、12、または18~22のいずれかに記載の多機能性分子。
[001193]24.第2の抗原結合性ドメインが、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む、実施形態11、12、または18~23のいずれかに記載の多機能性分子。
[001194]25.例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチドを含み、
第1のVLおよび第1のVHが第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHが第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子が図3Aまたは3Bの構成を含む、
実施形態11~24のいずれかに記載の多機能性分子。
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチドを含み、
第1のVLおよび第1のVHが第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHが第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子が図3Aまたは3Bの構成を含む、
実施形態11~24のいずれかに記載の多機能性分子。
[001195]26.カルレティキュリンタンパク質が配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001196]27.カルレティキュリンタンパク質が配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001197]28.カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001198]29.第1の抗原結合性ドメインがカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第1の抗原結合性ドメインが配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001199]30.第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインをさらに含み、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと同じである、
先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
(i)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと同じである、
先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001200]31.第2のカルレティキュリン分子が第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と同じである、実施形態30に記載の多機能性分子。
[001201]32.第2のカルレティキュリン分子が第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と異なる、実施形態30に記載の多機能性分子。
[001202]33.第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態30~32のいずれかに記載の多機能性分子。
[001203]34.第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、実施形態33に記載の多機能性分子。
[001204]35.第3の抗原結合性ドメインが第2のカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第3の抗原結合性ドメインが配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、実施形態30~34のいずれかに記載の多機能性分子。
[001205]36.第1の抗原結合性ドメインが、
(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);
(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);
(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;
(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;
(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは
(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVL
を含む、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);
(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);
(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;
(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;
(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは
(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVL
を含む、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001206]37.腫瘍標的化部分をさらに含む、先行する実施形態のいずれかに記載の多機能性分子。
[001207]38.腫瘍標的化部分が腫瘍抗原に結合する、実施形態37に記載の多機能性分子。
[001208]39.腫瘍抗原が、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される、実施形態38に記載の多機能性分子。
[001209]40.腫瘍標的化部分が、例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する抗体分子を含む、実施形態37に記載の多機能性分子。
[001210]41.腫瘍標的化部分が、例えば、表38または表20に列挙されるVHおよび/またはVL配列を含む、実施形態40に記載の多機能性分子。
[001211]42.非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合し、任意選択で、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合が、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい、先行する実施形態のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001212]43.骨髄増殖性新生物細胞が、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択され、任意選択で、
骨髄増殖性新生物細胞がJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞がMPL突然変異を含まない、
実施形態42に記載の多機能性分子。
骨髄増殖性新生物細胞がJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞がMPL突然変異を含まない、
実施形態42に記載の多機能性分子。
[001213]44.リンカー、例えば、第1の抗原結合性ドメインと第2の抗原結合性ドメインとの間のリンカーをさらに含む、先行する実施形態のいずれか1つに記載の多機能性分子。
[001214]45.リンカーが、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される、実施形態44に記載の多機能性分子。
[001215]46.リンカーがペプチドリンカーである、実施形態44または45に記載の多機能性分子。
[001216]47.ペプチドリンカーがGlyおよびSerを含む、実施形態46に記載の多機能性分子。
[001217]48.ペプチドリンカーが、配列番号6214~6217または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態46に記載の多機能性分子。
[001218]49.先行する実施形態のいずれか1つに記載の多機能性分子をコードする核酸分子。
[001219]50.実施形態49に記載の核酸分子を含むベクター、例えば、発現ベクター。
[001220]51.実施形態49に記載の核酸分子または実施形態50に記載のベクターを含む細胞。
[001221]52.実施形態1~48のいずれか1つに記載の多機能性分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適した条件下で、実施形態51に記載の細胞を培養するステップを含む、方法。
[001222]53.実施形態1~48のいずれか1つに記載の多機能性分子と、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤とを含む医薬組成物。
[001223]54.がんを処置する方法であって、それを必要とする対象に、実施形態1~48のいずれか1つに記載の多機能性分子を投与するステップを含み、多機能性分子ががんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
[001224]55.がんを処置するための医薬の製造のための実施形態1~48のいずれか1つに記載の多機能性分子の使用。
[001225]56.対象が第1および/または第2のカルレティキュリンタンパク質を発現するがん細胞を有する、実施形態54に記載の方法または実施形態55に記載の使用。
[001226]57.対象がJAK2 V617F突然変異を有する、実施形態54もしくは56に記載の方法または実施形態55もしくは56に記載の使用。
[001227]58.対象がJAK2 V617F突然変異を有しない、実施形態54もしくは56に記載の方法または実施形態55もしくは56に記載の使用。
[001228]59.対象がMPL突然変異を有する、実施形態54もしくは56~58のいずれか1つに記載の方法または実施形態55~58のいずれか1つに記載の使用。
[001229]60.対象がMPL突然変異を有しない、実施形態54もしくは56~58のいずれか1つに記載の方法または実施形態55~58のいずれか1つに記載の使用。
[001230]61.がんが、血液がんであり、任意選択で、がんが、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)であり、任意選択で、がんが骨髄線維症である、実施形態54もしくは56~60のいずれか1つに記載の方法または実施形態55~60のいずれか1つに記載の使用。
[001231]62.がんが固形腫瘍がんである、実施形態54もしくは56~60のいずれか1つに記載の方法または実施形態55~60のいずれか1つに記載の使用。
[001232]63.第2の治療処置を施すステップをさらに含む、実施形態54もしくは56~62のいずれか1つに記載の方法または実施形態55~62のいずれか1つに記載の使用。
[001233]64.第2の治療処置が、治療剤(例えば、化学療法剤、生物学的製剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む、実施形態63に記載の方法または実施形態63に記載の使用。
[001234]65.治療剤が化学療法剤または生物学的製剤から選択される、実施形態64に記載の方法または実施形態64に記載の使用。
[001235]66.試料または対象中のカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法であって、
試料または対象を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに
抗体分子と試料または対象との複合体の形成を検出するステップ
を含み、それによってカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する、方法。
試料または対象を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに
抗体分子と試料または対象との複合体の形成を検出するステップ
を含み、それによってカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する、方法。
[001236]67.カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)がin vitroまたはin vivoで検出される、実施形態66に記載の方法。
[001237]68.参照試料または対象を、抗体分子と接触させるステップ;および抗体分子と参照試料または対象との複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または対象と比較した、試料または対象における複合体の形成における変化、例えば統計学的に有意な変化が、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の存在を示す、実施形態66または67に記載の方法。
[001238]69.対象から試料を取得するステップをさらに含む、実施形態66~68のいずれかに記載の方法。
[001239]70.試料が血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えばリンパ節のうちの1つまたは複数を含む、実施形態66~69のいずれかに記載の方法。
[001240]71.試料が凍結および/または固定されていない、実施形態66~70のいずれかに記載の方法。
[001241]72.試料が凍結(例えば、瞬間凍結)および/または固定(例えば、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE))されている、実施形態66~70のいずれかに記載の方法。
[001242]73.対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある、実施形態66~72のいずれかに記載の方法。
[001243]74.例えば、マルチパネル法を使用するフロー分析を実施するステップをさらに含む、実施形態66~73のいずれかに記載の方法。
[001244]75.T細胞クローン性を評価して、例えば、T細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するステップをさらに含む、実施形態66~74のいずれかに記載の方法。
[001245]76.生体試料からのカルレティキュリン+(例えば、野生型カルレティキュリン+および/または突然変異体カルレティキュリン+)細胞のレベルを測定するステップ(例えば、カルレティキュリン+細胞が、例えば、参照試料または対象と比較して枯渇しているかどうかを決定するステップ)をさらに含む、実施形態66~75のいずれかに記載の方法。
[001246]77.カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む、実施形態66~76のいずれかに記載の方法。
[001247]78.カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の膜レベルを測定するステップをさらに含む、実施形態66~77のいずれかに記載の方法。
[001248]79.例えば、(例えば、本明細書に記載の抗体分子を用いた)処置後に、疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)の予後、重症度、または存在もしくは非存在の変化について対象を評価するステップをさらに含む、実施形態66~78のいずれかに記載の方法。
[001249]80.抗体分子が検出可能に標識されている、実施形態66~79のいずれかに記載の方法。
[001250]81.対象を評価する方法であって、
対象からの試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに
抗体分子と試料との複合体の形成を検出するステップ
を含み、それによって対象を評価する、方法。
対象からの試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに
抗体分子と試料との複合体の形成を検出するステップ
を含み、それによって対象を評価する、方法。
[001251]82.対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある、実施形態81に記載の方法。
[001252]83.対象が本明細書に記載の抗体分子で処置されていない、実施形態81または82に記載の方法。
[001253]84.対象が本明細書に記載の抗体分子で処置されている、実施形態81または82に記載の方法。
[001254]85.本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法における使用のための使用説明書とを含むキット。
Claims (135)
- (i)野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインと、
(ii)TCRβVまたはNKp30に結合する第2の抗原結合性ドメインと
を含むポリペプチド分子を含む組成物であって、
(A)第1の抗原結合性ドメインが、(i)それぞれ表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VHCDR2およびVHCDR3のアミノ酸配列を有するVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/または(ii)それぞれ表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)、VLCDR2およびVLCDR3のアミノ酸配列を有するVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む;
(B)第2の抗原結合性ドメインが、(i)それぞれ表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3のアミノ酸配列を有するVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3を含むVH;ならびに/または(ii)それぞれ表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3のアミノ酸配列を有するVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3を含むVLを含む;または
(C)第2の抗原結合性ドメインが、(i)それぞれ表7、表35、表9、表10、もしくは表34におけるVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3のアミノ酸配列を有するVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3を含むVH;ならびに(ii)それぞれ表8、表36、表9、表10、もしくは表34におけるVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3のアミノ酸配列を有するVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3を含むVLを含む、組成物。 - ポリペプチド分子が多機能性ポリペプチド分子である、請求項1に記載の組成物。
- ポリペプチド分子が多特異性ポリペプチド分子である、請求項1または2に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインがTCRβVに結合する、請求項1から3のいずれか1項に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインがT細胞を活性化するか、または第2の抗原結合性ドメインがT細胞を活性化しない、請求項4に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインがTCRβV12またはTCRβV6に結合する、請求項4または5に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表30、表31、表32、表10、表11、表12、または表13に列挙される1つまたは複数のアミノ酸配列を含む、請求項4から6のいずれか1項に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)それぞれ表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3のアミノ酸配列を有するVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3を含むVH;ならびに/または(ii)それぞれ表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3のアミノ酸配列を有するVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3を含むVL;
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号7AのVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号8AのVLCDR3アミノ酸配列を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号52AのVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号53AのVLCDR3アミノ酸配列を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、または4つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、または4つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号55AのVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号56AのVLCDR3アミノ酸配列を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項4から7のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項4から7のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号21AのVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号22AのVLCDR3アミノ酸配列を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号64AのVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号65AのVLCDR3アミノ酸配列を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号67AのVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号68AのVLCDR3アミノ酸配列を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項4から7のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項4から7のいずれか1項に記載の組成物。 - 第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン、およびTCRVβに結合する第1の部分を含む第2のポリペプチド、
第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン、および任意選択でTCRVβに結合する第2の部分を含む第3のポリペプチド、
第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHが第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHが第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子が図3Aまたは3Bの構成を含む、
請求項4から11のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインがNKp30に結合する、請求項1から3のいずれか1項に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する抗体分子またはリガンドから選択される、請求項13に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)それぞれ表7、表35、表9、表10、もしくは表34におけるVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3のアミノ酸配列を有するVHCDR1、VHCDR2およびVHCDR3を含むVH;ならびに(ii)それぞれ表8、表36、表9、表10、もしくは表34におけるVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3のアミノ酸配列を有するVLCDR1、VLCDR2およびVLCDR3を含むVL
を含む、請求項13または14に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/または
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項15に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、請求項15または16に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、請求項15から17のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む、請求項15から18のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項13または14に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項13、14、および20のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項21に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、請求項13、14、および20から22のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2の抗原結合性ドメインが、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む、請求項13、14、および20から23のいずれか1項に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む、請求項13、14、および20から24のいずれか1項に記載の組成物。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む、請求項13、14、および20から25のいずれか1項に記載の組成物。
- 第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン、およびNKp30に結合する第1の部分を含む第2のポリペプチド、
第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分を含む第3のポリペプチド、
第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHが第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHが第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子が図3Aまたは3Bの構成を含む、
請求項13から26のいずれか1項に記載の組成物。 - カルレティキュリンタンパク質が配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1から27のいずれか1項に記載の組成物。
- カルレティキュリンタンパク質が配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む、請求項1から28のいずれか1項に記載の組成物。
- カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、請求項1から29のいずれか1項に記載の組成物。
- 第1の抗原結合性ドメインがカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第1の抗原結合性ドメインが配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、請求項1から30のいずれか1項に記載の組成物。
- 第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインをさらに含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと同じである、
請求項1から31のいずれか1項に記載の組成物。 - 第2のカルレティキュリン分子が第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と同じである、請求項32に記載の組成物。
- 第2のカルレティキュリン分子が第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と異なる、請求項32に記載の組成物。
- 第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項32から34のいずれか1項に記載の組成物。
- 第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、請求項35に記載の組成物。
- 第3の抗原結合性ドメインが第2のカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第3の抗原結合性ドメインが配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、請求項32から36のいずれか1項に記載の組成物。
- 第1の抗原結合性ドメインが、
(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列を有するVHCDR2、および表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);
(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列を有するVLCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列を有するVLCDR2、および表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);
(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;
(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;
(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは
(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVL
を含む、請求項1から37のいずれか1項に記載の組成物。 - 多機能性分子が腫瘍標的化部分をさらに含む、請求項1から38のいずれか1項に記載の組成物。
- 腫瘍標的化部分が腫瘍抗原に結合する、請求項39に記載の組成物。
- 腫瘍抗原が、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される、請求項40に記載の組成物。
- 腫瘍標的化部分が、例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する抗体分子を含む、請求項39に記載の組成物。
- 腫瘍標的化部分が、例えば、表38または表20に列挙されるVHおよび/またはVL配列を含む、請求項42に記載の組成物。
- 多機能性分子が、非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合し、任意選択で、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合が、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい、請求項1から43のいずれか1項に記載の組成物。
- 骨髄増殖性新生物細胞が、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択され、任意選択で、
骨髄増殖性新生物細胞がJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞がMPL突然変異を含まない、請求項44に記載の組成物。 - リンカー、例えば、第1の抗原結合性ドメインと第2の抗原結合性ドメインとの間のリンカーをさらに含む、請求項1から45のいずれか1項に記載の組成物。
- リンカーが、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される、請求項46に記載の組成物。
- リンカーがペプチドリンカーである、請求項46または47に記載の組成物。
- ペプチドリンカーがGlyおよびSerを含む、請求項48に記載の組成物。
- ペプチドリンカーが、配列番号6214~6217または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項48に記載の組成物。
- (i)カルレティキュリンタンパク質(例えば、野生型または突然変異体カルレティキュリンタンパク質)に結合する第1の抗原結合性ドメイン、例えば、表4、表5、表6、表24、表25、表16、表17、表18、もしくは表19のいずれか1つに開示されるカルレティキュリン標的化抗原結合性ドメインと、
(ii)TCRβVに結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表30、表31、表32、表10、表11、表12、もしくは表13のいずれか1つに開示される抗TCRβV抗原結合性ドメイン、または
NKp30に結合する第2の抗原結合性ドメイン、例えば、表7、表8、表35、表36、表9、表10、もしくは表34に開示される抗NKp30抗原結合性ドメインと
を含む多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインがTCRβVに結合する、請求項51に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインがT細胞を活性化するか、または第2の抗原結合性ドメインがT細胞を活性化しない、請求項52に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、TCRβV12またはTCRβV6(例えば、配列番号1044のアミノ酸配列を含む)に結合する、請求項52または53に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表30、表31、表32、表10、表11、表12、または表13に列挙される1つまたは複数のアミノ酸配列を含む、請求項52から54のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含み、
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号3Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号4AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号5AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号6Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号8AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号45Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号46AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号47AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号51Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号52AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号53AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(d)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号48Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号49AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号50AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号54Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号55AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号56AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項52から55のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、表30、表31、表10、表11、表12、もしくは表13におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、
(iii)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(iv)VLが、配列番号10Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号9Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号11Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号1312Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号1314Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項52から55のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号17Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号18AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号19AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号20Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号21AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号22AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号57Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号58AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号59AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号63Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号64AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号65AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(c)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号60Aの重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号61AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号62AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号66Aの軽鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号67AのVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号68AのVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項52から55のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(a)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、配列番号15Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含み、かつ/または
(ii)VLが、配列番号16Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL);ならびに/あるいは
(b)重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)であって、
(i)VHが、
配列番号23Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号24Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号25Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含み;かつ/または
(ii)VLが、
配列番号26Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号27Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号28Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、
配列番号29Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)、または
配列番号30Aのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む、重鎖可変領域(VH)および/または軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項52から55のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第1のscFv)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でTCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2の部分(例えば、TCR(例えば、TCRVβ)に結合する第2のscFv)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHが第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHが第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子が図3Aまたは3Bの構成を含む、
請求項52から59のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインがNKp30に結合する、請求項51に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子、例えば、抗原結合性ドメイン、またはリガンドから選択され、例えば、第2の抗原結合性ドメインが、NKp30に結合する(例えば、それを活性化させる)抗体分子またはリガンドである、請求項61に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに/あるいは
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR2、および/または表8、表36、表9、表10、もしくは表34におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項61または62に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7313の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7315のVHCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む重鎖可変領域(VH);ならびに/あるいは
(ii)配列番号7326の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、配列番号7327のVLCDR2アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)、および/または配列番号7329のVLCDR3アミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項63に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7298もしくは7300~7304のいずれかに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;および/または
(ii)配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかのアミノ酸配列(または配列番号7299もしくは7305~7309のいずれかに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、請求項63または64に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7305のアミノ酸配列(または7305に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;または
(ii)配列番号7302のアミノ酸配列(または7302に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および配列番号7309のアミノ酸配列(または7309に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、請求項63から65のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号7310のアミノ酸配列(または7310に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列);または
(ii)配列番号7311のアミノ酸配列(または7311に対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)
を含む、請求項63から66のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)配列番号6000の重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)アミノ酸配列、配列番号6001のVHCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号6002のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)配列番号6063の軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)アミノ酸配列、配列番号6064のVLCDR2アミノ酸配列、および/または配列番号7293のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項61または62に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(1)表7、表35、表9、表10、もしくは表34の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、または表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含む重鎖可変領域(VH)、および/あるいは
(2)表8、表36、表9、表10、もしくは表34の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR2のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR3のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、または表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLFWR4のアミノ酸配列(またはそれからの1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、もしくは6つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項61、62、または68のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(1)配列番号6003の重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)アミノ酸配列、配列番号6004のVHFWR2アミノ酸配列、配列番号6005のVHFWR3アミノ酸配列、または配列番号6006のVHFWR4アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、および
(3)配列番号6066の軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)アミノ酸配列、配列番号6067のVLFWR2アミノ酸配列、配列番号7292のVLFWR3アミノ酸配列、または配列番号6069のVLFWR4アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項69に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、
(i)表7、表35、表9、表10、もしくは表34のVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH、および/または
(ii)表8、表36、表9、表10、もしくは表34のVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL
を含む、請求項61、62、および68から70のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2の抗原結合性ドメインが、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖を含む、請求項61、62、および68から71のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む、請求項61、62、および68から72のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 第2の抗原結合性ドメインが、表10の重鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む重鎖、および表10の軽鎖のアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含む軽鎖を含む、請求項61、62、および68から73のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 例えば、N末端からC末端まで、第1のVLおよび第1のCLを含む第1のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第1のVH、第1のCH1、第1の二量体化ドメイン(例えば、第1のFc)、およびNKp30に結合する第1の部分(例えば、NKp30に結合する第1の抗体分子またはリガンド)を含む第2のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVH、第2のCH1、第2の二量体化ドメイン(例えば、第2のFc)、および任意選択でNKp30に結合する第2の部分(例えば、NKp30に結合する第2の抗体分子またはリガンド)を含む第3のポリペプチド、
例えば、N末端からC末端まで、第2のVLおよび第2のCLを含む第4のポリペプチド
を含み、
第1のVLおよび第1のVHが第1のカルレティキュリンタンパク質に結合する第1の抗原結合性ドメインを形成し、第2のVLおよび第2のVHが第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインを形成し、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、
任意選択で、第1および第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6313のアミノ酸配列を含む分子、または配列番号6314のアミノ酸配列を含む分子からそれぞれ独立して選択され、
任意選択で、多機能性分子が図3Aまたは3Bの構成を含む、
請求項61から74のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - カルレティキュリンタンパク質が配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、カルレティキュリンタンパク質が配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項51から75のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- カルレティキュリンタンパク質が配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含む、請求項51から76のいずれか1項に記載の多機能分子。
- カルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、請求項51から77のいずれか1項に記載の多機能分子。
- 第1の抗原結合性ドメインがカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第1の抗原結合性ドメインが配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、請求項51から78のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 第2のカルレティキュリンタンパク質に結合する第3の抗原結合性ドメインをさらに含み、例えば、第2のカルレティキュリン突然変異体タンパク質が、配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列を含み、任意選択で、
(i)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと異なるか、または
(ii)第3の抗原結合性ドメインが第1の抗原結合性ドメインと同じである、
請求項51から79のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 第2のカルレティキュリン分子が第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と同じである、請求項80に記載の多機能性分子。
- 第2のカルレティキュリン分子が第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリン分子と異なる、請求項80に記載の多機能性分子。
- 第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285~6312またはD1001から選択されるアミノ酸配列を含み、任意選択で、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6313~6346またはD1002~D1003から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項80から82のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 第1の抗原結合性ドメインによって結合されるカルレティキュリンタンパク質が配列番号6285またはD1001のアミノ酸配列を含み、第2のカルレティキュリンタンパク質が配列番号6286のアミノ酸配列を含む、請求項83に記載の多機能性分子。
- 第3の抗原結合性ドメインが第2のカルレティキュリンタンパク質のC末端内に位置するエピトープに結合し、任意選択で、第3の抗原結合性ドメインが配列番号6285、D1001、または6286のアミノ酸配列内に位置するエピトープに結合する、請求項80から84のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 第1の抗原結合性ドメインが、
(i)表4、表24、表25、もしくは表17における重鎖相補性決定領域1(VHCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表4、表24、表25、もしくは表17におけるVHCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む重鎖可変領域(VH);
(ii)表5、表24、表25、もしくは表18における軽鎖相補性決定領域1(VLCDR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR1、表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR2、および/または表5、表24、表25、もしくは表18におけるVLCDR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、もしくは4つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHCDR3を含む軽鎖可変領域(VL);
(iii)表24、表25、もしくは表16におけるVHのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約77%、80%、85%、90%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVH;
(iv)表24、表25、もしくは表16におけるVLのアミノ酸配列(またはそれに対して少なくとも約93%、95%、もしくは99%の配列同一性を有するアミノ酸配列)を含むVL;
(v)表4もしくは表6における重鎖フレームワーク領域1(VHFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR1、表4もしくは表6におけるVHFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR2、表4もしくは表6におけるVHFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR3、および/または表4もしくは表6におけるVHFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVHFWR4を含むVH、ならびに/あるいは
(vi)表5もしくは表6における軽鎖フレームワーク領域1(VLFWR1)のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR1、表5もしくは表6におけるVLFWR2のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR2、表5もしくは表6におけるVLFWR3のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR3、および/または表5もしくは表6におけるVLFWR4のアミノ酸配列(または1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、もしくは9つ以下の突然変異、例えば、置換、付加、もしくは欠失を有する配列)を有するVLFWR4を含むVL
を含む、請求項51から85のいずれか1項に記載の多機能性分子。 - 腫瘍標的化部分をさらに含む、請求項51から86のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 腫瘍標的化部分が腫瘍抗原に結合する、請求項87に記載の多機能性分子。
- 腫瘍抗原が、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される、請求項88に記載の多機能性分子。
- 腫瘍標的化部分が、例えば、G6B、CD34、CD41、P-セレクチン、Clec2、cKIT、FLT3、MPL、ITGB3、ITGB2、GP5、GP6、GP9、GP1BA、DSC2、FCGR2A、TNFRSF10A、TNFRSF10B、またはTM4SF1から選択される腫瘍抗原に結合する抗体分子を含む、請求項87に記載の多機能性分子。
- 腫瘍標的化部分が、例えば、表38または表20に列挙されるVHおよび/またはVL配列を含む、請求項90に記載の多機能性分子。
- 非腫瘍細胞よりも骨髄増殖性新生物細胞に優先的に結合し、任意選択で、多機能性分子と骨髄増殖性新生物細胞との結合が、多機能性分子と非腫瘍細胞との結合よりも10、20、30、40、50倍を超えて大きい、請求項51から91のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- 骨髄増殖性新生物細胞が、骨髄線維症細胞、本態性血小板血症細胞、真性赤血球増加症細胞、または慢性骨髄がん細胞から選択され、任意選択で、
骨髄増殖性新生物細胞がJAK2 V617F突然変異を含まないか、または
骨髄増殖性新生物細胞がMPL突然変異を含まない、請求項92に記載の多機能性分子。 - リンカー、例えば、第1の抗原結合性ドメインと第2の抗原結合性ドメインとの間のリンカーをさらに含む、請求項51から93のいずれか1項に記載の多機能性分子。
- リンカーが、切断性リンカー、非切断性リンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリックスリンカー、または非ヘリックスリンカーから選択される、請求項94に記載の多機能性分子。
- リンカーがペプチドリンカーである、請求項94または95に記載の多機能性分子。
- ペプチドリンカーがGlyおよびSerを含む、請求項96に記載の多機能性分子。
- ペプチドリンカーが、配列番号6214~6217または6220~6221および77~78から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項96に記載の多機能性分子。
- 請求項51から98のいずれか1項に記載の多機能性分子をコードする核酸分子。
- 請求項99に記載の核酸分子を含むベクター、例えば、発現ベクター。
- 請求項99に記載の核酸分子または請求項100に記載のベクターを含む細胞。
- 請求項51から98のいずれか1項に記載の多機能性分子を作製する、例えば、産生する方法であって、適切な条件、例えば、遺伝子発現および/またはホモもしくはヘテロ二量体化に適した条件下で、請求項101に記載の細胞を培養するステップを含む、方法。
- 請求項1から50のいずれか1項に記載の組成物、請求項51から98のいずれか1項に記載の多機能性分子、請求項99に記載の核酸分子、請求項100に記載のベクター、または請求項101に記載の細胞と、薬学的に許容される担体、賦形剤、希釈剤、または安定化剤とを含む医薬組成物。
- がんを処置する方法であって、それを必要とする対象に、請求項1から50のいずれか1項に記載の組成物、請求項51から98のいずれか1項に記載の多機能性分子、請求項99に記載の核酸分子、請求項100に記載のベクター、請求項101に記載の細胞、または請求項103に記載の医薬組成物を投与するステップを含み、多機能性分子ががんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
- がんを処置するための医薬の製造のための、請求項1から50のいずれか1項に記載の組成物、請求項51から98のいずれか1項に記載の多機能性分子、請求項99に記載の核酸分子、請求項100に記載のベクター、または請求項101に記載の細胞の使用。
- 対象が第1および/または第2のカルレティキュリンタンパク質を発現するがん細胞を有する、請求項104に記載の方法または請求項105に記載の使用。
- 対象がJAK2 V617F突然変異を有する、請求項104もしくは106に記載の方法または請求項105もしくは106に記載の使用。
- 対象がJAK2 V617F突然変異を有しない、請求項104もしくは106に記載の方法または請求項105もしくは106に記載の使用。
- 対象がMPL突然変異を有する、請求項104もしくは106から108のいずれか1項に記載の方法または請求項105から108のいずれか1項に記載の使用。
- 対象がMPL突然変異を有しない、請求項104もしくは106から108のいずれか1項に記載の方法または請求項105から108のいずれか1項に記載の使用。
- がんが血液がんであり、
任意選択で、がんが、骨髄増殖性新生物、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)、または慢性骨髄性白血病(CML)であり、任意選択で、がんが骨髄線維症である、請求項104もしくは106から110のいずれか1項に記載の方法または請求項105から110のいずれか1項に記載の使用。 - がんが固形腫瘍がんである、請求項104もしくは106から110のいずれか1項に記載の方法または請求項105から110のいずれか1項に記載の使用。
- 第2の治療処置を施すステップをさらに含む、請求項104もしくは106から112のいずれか1項に記載の方法または請求項105から112のいずれか1項に記載の使用。
- 第2の治療処置が、治療剤(例えば、化学療法剤、生物学的製剤、ホルモン療法)、放射線、または外科手術を含む、請求項113に記載の方法または請求項113に記載の使用。
- 治療剤が化学療法剤または生物学的製剤から選択される、請求項114に記載の方法または請求項114に記載の使用。
- 試料または対象中のカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法であって、
試料または対象を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに
抗体分子と試料または対象との複合体の形成を検出するステップ
を含み、それによってカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する、方法。 - カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)がin vitroまたはin vivoで検出される、請求項116に記載の方法。
- 参照試料または対象を、抗体分子と接触させるステップ;および抗体分子と参照試料または対象との複合体の形成を検出するステップをさらに含み、参照試料または対象と比較した、試料または対象における複合体の形成における変化、例えば統計学的に有意な変化が、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の存在を示す、請求項116または117に記載の方法。
- 対象から試料を取得するステップをさらに含む、請求項116から118のいずれか1項に記載の方法。
- 試料が血漿、組織(例えば、がん性組織)、生検、血液(例えば、全血)、PBMC、骨髄、および/またはリンパ組織、例えばリンパ節のうちの1つまたは複数を含む、請求項116から119のいずれか1項に記載の方法。
- 試料が凍結および/または固定されていない、請求項116から120のいずれか1項に記載の方法。
- 試料が凍結(例えば、瞬間凍結)および/または固定(例えば、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE))されている、請求項116から120のいずれか1項に記載の方法。
- 対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある、請求項116から122のいずれか1項に記載の方法。
- 例えば、マルチパネル法を使用するフロー分析を実施するステップをさらに含む、請求項116から123のいずれか1項に記載の方法。
- T細胞クローン性を評価して、例えば、T細胞悪性腫瘍の存在および/またはレベルを決定するステップをさらに含む、請求項116から124のいずれか1項に記載の方法。
- 生体試料からのカルレティキュリン+(例えば、野生型カルレティキュリン+および/または突然変異体カルレティキュリン+)細胞のレベルを測定するステップ(例えば、カルレティキュリン+細胞が、例えば、参照試料または対象と比較して枯渇しているかどうかを決定するステップ)をさらに含む、請求項116から125のいずれか1項に記載の方法。
- カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の細胞内レベルを測定するステップをさらに含む、請求項116から126のいずれか1項に記載の方法。
- カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)の膜レベルを測定するステップをさらに含む、請求項116から127のいずれか1項に記載の方法。
- 例えば、(例えば、本明細書に記載の抗体分子を用いた)処置後に、疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)の予後、重症度、または存在もしくは非存在の変化について対象を評価するステップをさらに含む、請求項116から128のいずれか1項に記載の方法。
- 抗体分子が検出可能に標識されている、請求項116から129のいずれか1項に記載の方法。
- 対象を評価する方法であって、
対象からの試料(例えば、本明細書に記載の試料)を、本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と接触させるステップ;ならびに
抗体分子と試料との複合体の形成を検出するステップ
を含み、それによって対象を評価する、方法。 - 対象が、本明細書に記載の疾患または障害(例えば、がん、例えば、骨髄線維症)を有する、または有するリスクがある、請求項131に記載の方法。
- 対象が本明細書に記載の抗体分子で処置されていない、請求項131または132に記載の方法。
- 対象が本明細書に記載の抗体分子で処置されている、請求項131または132に記載の方法。
- 本明細書に記載の抗カルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)抗体分子と、試料または対象におけるカルレティキュリン(例えば、野生型および/または突然変異体カルレティキュリン)を検出する方法における使用のための使用説明書とを含むキット。
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