JP2023073420A - 幹細胞培養法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2008年12月3日に提出された米国仮特許出願第61/200,808号に対して優先権を主張するものであり、その全体が全ての目的のために本明細書において組み入れられる。
胚性幹細胞(ESC)は、永久に自己再生し、体の全ての細胞型に分化する能力を有する多能性細胞である(Thomson, J.A. et al., Science 282 (5391):1145-1147 (1998)(非特許文献1); Thomson, J.A. and Odorico, J.S., Trends Biotechnol 18 (2):53-57 (2000)(非特許文献2))。この能力は、失われた細胞および損傷した細胞を置換するために、ならびに従来薬では力の及ばない治療方法を提供するために、やがてESCが使用される日が来るであろうという希望を与えるものである。しかしながら、hESCの臨床的可能性を十分に実現するためには、化学的に定義され、フィーダーを含まないおよび動物由来の生成物を含まない、確固とした培養条件を確立する必要がある。幾つかの化学的に定義された培地が報告されているが(Yao, S. et al., Proc Natl Acad Sci USA 103 (18):6907-6912 (2006)(非特許文献3); Lu, J. et al., Proc Natl Acad Sci USA 103 (15): 5688-5693 (2006)(非特許文献4); Ludwig, T.E. et al., Nat Biotechnol 24 (2):185-187 (2006)(非特許文献5))、それらの培地中の細胞は性能が最適以下であるため、その大部分は未だに満足できないものである。特にこれらの条件下において、細胞を、トリプシンによって単一細胞に継代する場合、これらは大規模な細胞死を起こす。hESCの自己再生を仲介する多数のシグナル伝達経路は、公知であり、FGF、TGF-β、Wnt等を含む(James, D. et al., Development 132 (6):1273-1282 (2005)(非特許文献6); Xu, R.H. et al., Nat Methods 2 (3):185-190 (2005)(非特許文献7); Beattie, G.M. et al., Stem Cells 23 (4):489-495 (2005)(非特許文献8); Greber B., Lehrach, H., and Adjaye, J., Stem Cells 25 (2):455-464 (2007)(非特許文献9); Sato, N. et al., Nat Med 10 (1):55-63 (2004)(非特許文献10))。しかしながら、このプロセスにおいて、それらのうちいずれも生存因子の役割を果たす様子はいずれにも無く、分子機構も分かりにくい。
本発明は、以下の式を有する化合物を提供する。
式中、
環Aは、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
環Bは、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
L1は-C(O)-NR2-または-C(O)-NR2-であり;
L2は結合、置換もしくは非置換のアルキレン、または置換もしくは非置換のヘテロアルキレンであり;かつ
R1およびR2は、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。
式中、yは0から3の整数であり;zは0から5の整数であり;Xは-N=、-CH=、または-CR5=であり;R3、R4、およびR5は、独立して、CN、S(O)nR6、NR7R8、C(O)R9、NR10-C(O)R11、NR12-C(O)-OR13、-C(O)NR14R15、-NR16S(O)2R17、-OR18、-S(O)2NR19、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、nは0から2の整数であり、ここでzが1よりも大きい場合、2つのR3部分は、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成してもよく;かつR6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、およびR19は、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。
式中、
環Dは置換もしくは非置換のアリールまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
L3は、-C(O)NH-または-S(O)2-NH-であり;
R20は、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
R21は、-NR22R23または-OR24であり;
R22およびR23は、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、置換もしくは非置換のヘテロアリールであるか、あるいは一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキルまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成し;
R24は、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであるか、あるいは一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキルの置換もしくは非置換のシクロアルキルを形成する。
式中、wは0から1の整数であり;qは0から7の整数であり;R25、R26、R27、およびR28は、独立して、-CN、-NR29R30、-C(O)R31、-NR32-C(O)R33、-NR34-C(O)-OR35、-C(O)NR36R37、-NR38S(O)2R39、-OR40、-S(O)2NR41、-S(O)vNR42、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、vは0から2の整数であり;R29、R30、R31、R32、R33、R34、R35、R36、R37、R38、R39、R40、R41、およびR42は、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここでR25およびR26、またはR26およびR27は、連結されて、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成してもよい。
本明細書中で使用されている略語は、化学および生物学の分野における通常の意味を有する。
(A)-OH、-NH2、-SH、-CN、-CF3、-NO2、オキソ、ハロゲン、非置換アルキル、非置換ヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、非置換ヘテロシクロアルキル、非置換アリール、非置換ヘテロアリール、および
(B)以下から選択される少なくとも1つの置換基により置換される、アルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリール:
(i)オキソ、-OH、-NH2、-SH、-CN、-CF3、-NO2、ハロゲン、非置換アルキル、非置換ヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、非置換ヘテロシクロアルキル、非置換アリール、非置換ヘテロアリール、および
(ii)以下から選択される少なくとも1つの置換基により置換される、アルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリール:
(a)オキソ、-OH、-NH2、-SH、-CN、-CF3、-NO2、ハロゲン、非置換アルキル、非置換ヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、非置換ヘテロシクロアルキル、非置換アリール、非置換ヘテロアリール、および
(b)オキソ、-OH、-NH2、-SH、-CN、-CF3、-NO2、ハロゲン、非置換アルキル、非置換ヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、非置換ヘテロシクロアルキル、非置換アリール、および非置換ヘテロアリールから選択される少なくとも1つの置換基により置換される、アルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール。
[本発明1001]
以下の式
を有する、化合物:
式中、
環Aが、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
環Bが、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
L1が-C(O)-NR2-または-NR2-C(O)-であり;
L2が、結合、置換もしくは非置換のアルキレン、または置換もしくは非置換のヘテロアルキレンであり;かつ
R1およびR2が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。
[本発明1002]
環Aが置換または非置換のアリールである、本発明1001の化合物。
[本発明1003]
環Aが置換または非置換のフェニルである、本発明1001の化合物。
[本発明1004]
環Bが、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである、本発明1001の化合物。
[本発明1005]
環Bが置換または非置換のヘテロアリールである、本発明1001の化合物。
[本発明1006]
環Bが、置換もしくは非置換のピラゾリル、置換もしくは非置換のフラニル、置換もしくは非置換のイミダゾリル、置換もしくは非置換のイソキサゾリル、置換もしくは非置換のオキサジアゾリル、置換もしくは非置換のオキサゾリル、置換もしくは非置換のピロリル、置換もしくは非置換のピリジル、置換もしくは非置換のピリミジル、置換もしくは非置換のピリダジニル、置換もしくは非置換のチアゾリル、置換もしくは非置換のトリアゾリル、置換もしくは非置換のチエニル、置換もしくは非置換のジヒドロチエノ-ピラゾリル、置換もしくは非置換のチアナフテニル、置換もしくは非置換のカルバゾリル、置換もしくは非置換のベンゾチエニル、置換もしくは非置換のベンゾフラニル、置換もしくは非置換のインドリル、置換もしくは非置換のキノリニル、置換もしくは非置換のベンゾトリアゾリル、置換もしくは非置換のベンゾチアゾリル、置換もしくは非置換のベンゾオキサゾリル、置換もしくは非置換のベンズイミダゾリル、置換もしくは非置換のイソキノリニル、置換もしくは非置換のイソインドリル、置換もしくは非置換のアクリジニル、置換もしくは非置換のベンゾイサゾリル、または置換もしくは非置換のジメチルヒダントインである、本発明1001の化合物。
[本発明1007]
L2が置換または非置換のC1-C10アルキルである、本発明1001の化合物。
[本発明1008]
L2が非置換C1-C10アルキルである、本発明1001の化合物。
[本発明1009]
L2がメチレンである、本発明1001の化合物。
[本発明1010]
環Aが置換または非置換のアリールであり;
環Bが置換または非置換のヘテロアリールであり;
R1が水素であり;かつ
L2が非置換C1-C10アルキルである、
本発明1001の化合物。
[本発明1011]
R2が水素である、本発明1001の化合物。
[本発明1012]
R1が水素または非置換C1-C10アルキルである、本発明1001の化合物。
[本発明1013]
R1が水素である、本発明1001の化合物。
[本発明1014]
以下の式
を有する、本発明1001の化合物:
式中、
yが0から3の整数であり;
zが0から5の整数であり;
Xが-N=、-CH=、または-CR5=であり;
R3、R4、およびR5が、独立して、-CN、-S(O)nR6、-NR7R8、-C(O)R9、-NR10-C(O)R11、-NR12-C(O)-OR13、-C(O)NR14R15、-NR16S(O)2R17、-OR18、-S(O)2NR19、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、nが0から2の整数であり、ここでzが1よりも大きい場合、2つのR3部分が、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成してもよく;かつ
R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、およびR19が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。
[本発明1015]
L2が置換または非置換のC1-C10アルキルである、本発明1014の化合物。
[本発明1016]
L2が非置換C1-C10アルキルである、本発明1014の化合物。
[本発明1017]
L2がメチレンである、本発明1014の化合物。
[本発明1018]
Xが-N=または-CH=である、本発明1014の化合物。
[本発明1019]
zが2であり、かつ隣接する頂点における2つのR3部分が、一緒に連結されて、置換または非置換のヘテロシクロアルキルを形成する、本発明1014の化合物。
[本発明1020]
zが1である、本発明1014の化合物。
[本発明1021]
yが0または1である、本発明1014の化合物。
[本発明1022]
R3が-OR18であり、かつR18が水素または非置換C1-C10アルキルである、本発明1014の化合物。
[本発明1023]
L2がメチレンであり;
Xが-N=または-CH=であり;
R1が水素であり;かつ
yおよびzが0である、
本発明1014の化合物。
[本発明1024]
以下の式
を有する、本発明1001の化合物。
[本発明1025]
以下の式
を有する、化合物:
式中、
環Dが、置換もしくは非置換のアリールまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
L3が、-C(O)-NH-または-S(O)2-NH-であり;
R20が、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
R21が、-NR22R23または-OR24であり;
R22およびR23が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、置換もしくは非置換のヘテロアリールであるか、あるいは一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成し;かつ
R24が、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、置換もしくは非置換のヘテロアリールであるか、あるいは一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキルの置換もしくは非置換のシクロアルキルを形成する。
[本発明1026]
環Dが、置換または非置換のフェニルである、本発明1025の化合物。
[本発明1027]
R20が、置換もしくは非置換のアルキルまたは置換もしくは非置換のシクロアルキルである、本発明1025の化合物。
[本発明1028]
R20が、置換もしくは非置換のC1-C10アルキル、または置換もしくは非置換の3~7員のシクロアルキルである、本発明1025の化合物。
[本発明1029]
R20が、置換もしくは非置換のC1-C5アルキル、または置換もしくは非置換の3~6員のシクロアルキルである、本発明1025の化合物。
[本発明1030]
R20が、非置換C1-C5アルキル、または非置換3~6員のシクロアルキルである、本発明1025の化合物。
[本発明1031]
R22が水素であり;
R23が、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである、
本発明1025の化合物。
[本発明1032]
R22が水素であり;かつ
R23が置換または非置換の置換または非置換のアリールである、
本発明1025の化合物。
[本発明1033]
R22およびR23が、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキルまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成する、本発明1025の化合物。
[本発明1034]
R22およびR23が、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のピロリル、置換もしくは非置換のイソインドリニル、置換もしくは非置換のピペリジニル、または置換もしくは非置換のテトラヒドロキノリニルを形成する、本発明1025の化合物。
[本発明1035]
以下の式
を有する、本発明1025の化合物:
式中、
wが0から1の整数であり;
qが0から7の整数であり;
R25、R26、R27、およびR28が、独立して、-CN、-NR29R30、-C(O)R31、-NR32-C(O)R33、-NR34-C(O)-OR35、-C(O)NR36R37、-NR38S(O)2R39、-OR40、-S(O)2NR41、-S(O)vNR42、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、vが0から2の整数であり;
R29、R30、R31、R32、R33、R34、R35、R36、R37、R38、R39、R40、R41、およびR42が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、
R25およびR26、またはR26およびR27が、連結されて、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成してもよい。
[本発明1036]
R28が-OR40であり、ここでR40が水素または非置換C1-C10アルキルである、本発明1035の化合物。
[本発明1037]
R40が、水素または非置換C1~C5アルキルである、本発明1036の化合物。
[本発明1038]
以下の式
を有する、本発明1035の化合物。
[本発明1039]
R20が非置換C1~C10アルキルである、本発明1038の化合物。
[本発明1040]
R28が-OR40であり、ここでR40が、水素または非置換C1~C10アルキル、または置換もしくは非置換のC3~C6シクロアルキルで置換されたC1~C10アルキルである、本発明1038の化合物。
[本発明1041]
qが1である、本発明1038の化合物。
[本発明1042]
以下の式
を有する、本発明1038の化合物。
[本発明1043]
以下の式
を有する、本発明1025の化合物。
[本発明1044]
動物細胞を安定化させるのに十分な量の式IまたはIIIの化合物(例えば、本発明1001~1043のいずれかの化合物のいずれか)と、該細胞を接触させる工程
を含む、分離された細胞をインビトロで安定化させる方法。
[本発明1045]
前記化合物の存在下において前記細胞の状態または環境を変化させる工程をさらに含み、該化合物の非存在下における該変化させる工程が、該細胞の細胞プログラミングに変化をもたらす、本発明1044の方法。
[本発明1046]
前記変化させる工程が、前記細胞を解凍することおよび該細胞を他の細胞から解離させることのうち少なくとも1つを含む、本発明1045の方法。
[本発明1047]
前記細胞が接着性である、本発明1044の方法。
[本発明1048]
前記細胞が懸濁液中にある、本発明1044の方法。
[本発明1049]
前記細胞の形質を決定する工程をさらに含む、本発明1044の方法。
[本発明1050]
動物より前記細胞を分離する工程を含む、本発明1044の方法。
[本発明1051]
前記動物がヒトである、本発明1050の方法。
[本発明1052]
前記動物が非ヒト動物である、本発明1050の方法。
[本発明1053]
前記化合物が式Iの化合物である、本発明1044の方法。
[本発明1054]
前記化合物が式IIIの化合物である、本発明1044の方法。
[本発明1055]
動物において状態を改善させる方法であって、
該状態を改善させるのに十分な量の式IまたはIIIの化合物(例えば、本発明1001~1043のいずれかの化合物のいずれか)を、それを必要とする動物に投与する工程
を含む、方法。
[本発明1056]
前記状態が、組織損傷、発作、および癌からなる群より選択される、本発明1055の方法。
[本発明1057]
前記組織が、膵臓、肝臓、腸、肺、および腎臓からなる群より選択される、本発明1056の方法。
[本発明1058]
前記状態が、移植された組織または臓器の少なくとも部分的な拒絶を含む、本発明1055の方法。
[本発明1059]
前記移植が、骨髄、臍帯血、精製された造血幹細胞もしくは造血前駆細胞、心臓細胞、神経系細胞、膵β細胞、または肝細胞の移植を含む、本発明1058の方法。
[本発明1060]
前記化合物が式Iの化合物である、本発明1055の方法。
[本発明1061]
前記化合物が式IIIの化合物である、本発明1055の方法。
[本発明1062]
細胞生存を維持するための方法であって、
分離された幹細胞、前駆細胞または分化細胞を産生する工程;および
該分離された細胞内のE-カドヘリンの安定化を誘導する工程により、細胞生存を維持する工程
を含む、方法。
[本発明1063]
前記誘導する工程が、前記分離された幹細胞を、式Iの化合物(例えば、本発明1001~1024のいずれかの化合物のいずれか)の非存在下の場合と比較して、分離された幹細胞の生存を少なくとも2倍向上させるのに十分な量の該化合物に、接触させることを含む、本発明1062の方法。
[本発明1064]
前記誘導する工程が、表面上で前記分離された幹細胞を培養することを含み、E-カドヘリン外部ドメインを含む分子が該表面に係留されている、本発明1062の方法。
[本発明1065]
分離された細胞内のE-カドヘリンを安定化させる分子の非存在下の場合と比較して、分離された細胞の生存を少なくとも2倍に向上させるのに十分な量の該分子を含む、該分離された細胞の集団。
[本発明1066]
前記分子が、式Iの化合物(例えば、本発明1001~1024のいずれかの化合物のいずれか)を含む、本発明1065の細胞の集団。
[本発明1067]
前記細胞が、幹細胞、誘導幹細胞、多能性幹細胞、前駆細胞、分化細胞、β細胞、および線維芽細胞からなる群より選択される、本発明1065の細胞の集団。
[本発明1068]
式IまたはIIIの化合物(例えば、本発明1001~1043のいずれかの化合物のいずれか)の非存在下の場合と比較して、分離された細胞の生存を少なくとも2倍向上させるのに十分な量の該化合物を含む、分離された細胞の集団。
[本発明1069]
前記細胞が、幹細胞、誘導幹細胞、多能性幹細胞、前駆細胞、分化細胞、β細胞、および線維芽細胞からなる群より選択される、本発明1068の集団。
[本発明1070]
幹細胞の生存を維持するための方法であって、
分離された細胞を産生する工程;および
該分離された細胞内のプロテインキナーゼC(PKC)を活性化する工程により、細胞生存を維持する工程
を含む、方法。
[本発明1071]
前記活性化する工程が、PMAの非存在下における生存率と比較して、前記分離された細胞の生存を向上させるのに十分な量のホルボール 12-ミリステート 13-アセテート(PMA)を、該細胞に接触させることを含む、本発明1070の方法。
[本発明1072]
プロテインキナーゼC活性化物質の非存在下の場合と比較して、分離された幹細胞の生存を少なくとも2倍向上させるのに十分な量のPKC活性化物質を含む、分離された幹細胞の集団。
[本発明1073]
各置換基が、独立して、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、-OR'、=O、=NR'、=N-OR'、-NR'R''、-SR'、-ハロゲン、-SiR'R''R'''、-OC(O)R'、-C(O)R'、-CO2R'、-CONR'R''、-OC(O)NR'R''、-NR''C(O)R'、-NR'-C(O)NR''R'''、-NR''C(O)2R'、-NR-C(NR'R''R''')=NR''''、-NR-C(NR'R'')=NR'''、-S(O)R'、-S(O)2R'、-S(O)2NR'R''、-NRSO2R'、-CN、-NO2、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群より選択され、ここで、R'、R''、R'''、およびR''''のそれぞれが、独立して、水素、C1-10アルキル基、C1-10ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、およびアリールアルキル基からなる群より選択される、本発明1001の化合物。
[本発明1074]
環Aが、1~5個のR3基でそれぞれ置換されてもよい、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり;
環Bが、1~5個のR4基でそれぞれ置換されてもよいヘテロシクロアルキルまたはヘテロアリールであり;
L1が-C(O)-NR2-または-NR2-C(O)-であり;
L2が、結合、C1-10アルキレン、またはC1-10ヘテロアルキレンであり;
R1およびR2が、独立して、水素、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、C3-8シクロアルキル、C3-8ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり;
R3およびR4のそれぞれが、独立して、-CN、-S(O)nR6、-NR7R8、-C(O)R9、-NR10-C(O)R11、-NR12-C(O)-OR13、-C(O)NR14R15、-NR16S(O)2R17、-OR18、-S(O)2NR19、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、ここで、nが0から2の整数であり、2つのR3部分が、一緒に連結されて、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはテロアリールを形成してもよく;かつ
R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、およびR19が、それぞれ独立して、水素、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールである、
本発明1001の化合物。
[本発明1075]
各置換基が、独立して、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、-OR'、=O、=NR'、=N-OR'、-NR'R''、-SR'、-ハロゲン、-SiR'R''R'''、-OC(O)R'、-C(O)R'、-CO2R'、-CONR'R''、-OC(O)NR'R''、-NR''C(O)R'、-NR'-C(O)NR''R'''、-NR''C(O)2R'、-NR-C(NR'R''R''')=NR''''、-NR-C(NR'R'')=NR'''、-S(O)R'、-S(O)2R'、-S(O)2NR'R''、-NRSO2R'、-CN、-NO2、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群より選択され、ここでR'、R''、R'''、およびR''''のそれぞれが、独立して、水素、C1-10アルキル基、C1-10ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、およびアリールアルキル基からなる群より選択される、
本発明1025の化合物。
[本発明1076]
環Dが、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよいアリールまたはヘテロアリールであり;
L3が、-C(O)NH-または-S(O)2NH-であり;
R20が、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよい、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり;
R21が、-NR22R23または-OR24であり;
R22およびR23が、独立して、水素、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリールであるか、または一緒に連結されて、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよいヘテロシクロアルキルもしくはヘテロアリールを形成し;
R24が、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよい、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリールであり;かつ
各R基が、独立して、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、-OR'、=O、=NR'、=N-OR'、-NR'R''、-SR'、-ハロゲン、-SiR'R''R'''、-OC(O)R'、-C(O)R'、-CO2R'、-CONR'R''、-OC(O)NR'R''、-NR''C(O)R'、-NR'-C(O)NR''R'''、-NR''C(O)2R'、-NR-C(NR'R''R''')=NR''''、-NR-C(NR'R'')=NR'''、-S(O)R'、-S(O)2R'、-S(O)2NR'R''、-NRSO2R'、-CN、-NO2、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群より選択され、ここで、R'、R''、R'''、およびR''''のそれぞれが 、独立して、水素、C1-10アルキル基、C1-10ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、およびアリールアルキル基からなる群より選択される、
本発明1025の化合物。
I.序論
本発明は、新規化合物およびその使用方法を提供する。細胞が分離された場合、または細胞がその通常の培地の外もしくは組織環境の外に存在する場合を含むがこれらに限定されず、細胞分化を妨げかつ細胞生存を促進する、2種類の低分子化合物を提供する。化合物は、多少異なる機構で作用するが、いずれも幾つもの異なる病気の徴候、例えば限定されないが、癌、組織損傷、および発作の予防的および治療的な化合物として有用である。
一つの側面において、細胞生存および/または分化抑制を促進する化合物が提供される。ある態様において、化合物は、以下の式を有する。
式(I)において、環Aは、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。環Bは、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。
式(II)において、yは0から3の整数であり、zは0から5の整数である。Xは-N=、-CH=、または-CR5=である。R1およびL2は、上記定義の式(I)に記載されているとおりである。
式(III)において、環Dは置換もしくは非置換のアリールまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールである。L3は、-C(O)NH-または-S(O)2NH-である。
式(IV)において、wは0から1の整数であり、qは0から7の整数である。R20は、式(III)の化合物の定義において上記定義のとおりである。R25、R26、R27、およびR28は、独立して、-CN、-NR29R30、-C(O)R31、-NR32-C(O)R33、-NR34-C(O)-OR35、-C(O)NR36R37、-NR38S(O)2R39、-OR40、-S(O)2NR41、-S(O)vNR42、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、vは0から2の整数である。
式(V)において、R20、R28、およびqは、式(IV)の定義において上記定義のとおりである。ある態様において、R20は、非置換C1~C10アルキルである。R28は-OR40であってよい。R40は、水素、または非置換C1~C10アルキル、または置換または非置換のC3~C6シクロアルキルで置換されたC1~C10アルキルである。記号qは、1であってもよい。
本発明の化合物は、多種多様な目的において有用である。例えば、(例えば、分離された細胞について)細胞が、別の場合にはアポトーシスを起こすかまたは別の場合には死滅する状況において、化合物は生存を促進する。ある態様において、細胞は、少なくとも特定の期間、例えば10分間、30分間、または1時間、2時間、4時間、6時間、8時間、10時間、24時間、48時間、または96時間安定化される。さらに、化合物は、細胞が別の場合には分化するかあるいは別の場合には細胞のプログラミングを変化させる状態の場合、細胞分化の現状を維持するために有用である。これらの効果は、結果として化合物のインビトロまたはインビボのいずれかにおける数々の使用を導く。
本発明の化合物は、組織障害の減少に有用であり、従って組織障害を治療、緩和、または予防するために投与することができる。ある態様において、本発明の化合物は、内臓に組織障害を有するか、またはその危険性を有する個体に投与される。内臓とは、以下に限定されないが、脳、膵臓、肝臓、腸、肺、腎臓、または心臓が挙げられ、例えば熱傷または切傷による傷を負っている。例えば、ある態様において、本発明の化合物は、虚血後再灌流障害において梗塞の大きさを減少させるのに効果的である。従って、本発明の化合物は、発作を起こす可能性がある、起こしている、または起こしたことのある個体に投与可能である。同様に、本発明の化合物は、心臓発作または心臓障害を起こす可能性がある、起こしている、または起こしたことのある個体に投与可能である。
本発明の化合物は、多種多様な条件に曝された細胞の安定化に効果的である。多くの動物細胞は、分離されると(懸濁液中、または接着性である場合)生存能力を失い、アポトーシスを起こす、および/またはプログラミングを変更する(例えば、幹細胞は分離された場合しばしば死滅するか、または分化する)。本発明の化合物は、このような細胞と混合すると、環境の変化に対するそのような細胞の応答の阻止に効果的である。ある態様において、細胞は、動物より分離され、かつ細胞能力の喪失および/または細胞プログラミングの変化を阻止するのに十分な量の本発明の化合物と接触させる。ある態様において、そのような分離された細胞は、分離プロセスおよび分離そのものに対する細胞の応答により、他の場合では細胞が失ってしまう形質を保持するため、診断に有用である。保持される形質の例としては、遺伝子発現パターン、刺激、リガンド、または薬物に対する細胞の応答性、細胞能力が含まれる。
下記の例に具体的に説明されているとおり、本発明者らは、本発明の化合物に対する細胞性応答における幾つかの遺伝子産物の役割について知り、これは、以下に説明されているとおり遺伝子産物を操作することによっても細胞を安定化できるという発見につながった。
本発明者らは、E-カドヘリン発現の増加が幹細胞生存を増強することを見出した。従って、本発明は、細胞中でE-カドヘリンの発現を安定化および/または増加させる方法を提供し、他の場合では細胞の生存能力に有害となり得る状態の変化に対して、これにより細胞を安定化させる。E-カドヘリンの安定化は、例えば、E-カドヘリンの発現を増加させるかまたはE-カドヘリンを何らかの様式でタンパク質切断から保護する化合物を、細胞と接触させる工程を含むことができる。
本発明は、細胞をプロテインキナーゼC活性化物質と接触させることによる細胞の安定化も提供する。本明細書に説明されているとおり、解離されたhESCをプロテインキナーゼC活性化物質で処理し、マトリゲルマトリックスの存在下で増殖させた結果、細胞接着およびコロニー形成が著しく向上され、それにより細胞生存能力が向上された。従って、本発明は、プロテインキナーゼC活性化物質の存在下での細胞培養により細胞生存能力の向上を提供し、それにより細胞の生存能力、増殖および/または接着を向上させる。ある態様において、プロテインキナーゼC活性化物質は、細胞の生存能力および/または生存時間および/または接着を向上させるのに十分な量で、幹細胞、前駆細胞、または分化細胞の集団と接触させる。幹細胞の例としては、多能性細胞、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞(iPS細胞)、または他に本明細書に記載されているものを含む。プロテインキナーゼC活性化物質の例としては、以下に限定されないが、ホルボールエステル(例えば、ホルボール 12-ミリステート 13-アセテート(PMA)または米国特許出願公開第20080226589号に記載されているホルボールエステル)またはペプチドアゴニスト(例えば、米国特許第6,165,977号に記載のとおり)が挙げられる。
本発明は、細胞をインテグリンβ1活性化物質と接触させることによる細胞の安定化も提供する。本明細書に説明されているとおり、解離されたhESCをインテグリンβ1活性化物質で処理し、ラミン上で細胞を増殖させた結果、細胞接着およびコロニー形成が著しく向上され、それにより細胞生存能力が向上された。従って、本発明は、インテグリンβ1活性化物質の存在下での細胞培養により細胞生存能力の向上を提供し、それにより細胞の生存能力、増殖および/または接着を向上させる。ある態様において、インテグリンβ1活性化物質は、細胞の生存能力および/または生存時間および/または接着を向上させるのに十分な量で、幹細胞、前駆細胞、または分化細胞の集団と接触させる。幹細胞の例としては、多能性細胞、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞(iPS細胞)、または他に本明細書に記載されているものを含む。インテグリンβ1活性化物質の例としては、以下に限定されないが、インテグリンβ1活性化抗体、例えばTS2/16(Thermo Scientific、イリノイ州、ロックフィールド等から市販されている)等が挙げられる。
本明細書に記載のとおり、本発明は、本明細書に記載の1つまたは複数の化合物(例えば、TzvおよびPt-、またはプロテインキナーゼC活性化物質、またはインテグリンβ1活性化物質を含むがこれらに限定されない、式IまたはIIIの化合物)との混合物(例えば、細胞培養液)中の細胞を提供する。ある態様において、化合物は、細胞の環境または状態の変化(例えば、解凍)に対する応答において生存能力または細胞プログラミングを維持するのに十分な濃度で混合物中に存在する。例えば、ある態様において、化合物は少なくとも0.1Mの濃度で存在し、例えば、少なくとも1、10、100、1000、10000、または100000nM、例えば0.1nM~100000nM、例えば1nM~10000nM、例えば10nM~10000nM、例えば1~10μMが挙げられる。ある態様において、混合物は人工的な容器(例えば、試験管、ペトリ皿、等)中に存在する。従って、ある態様において、細胞は、分離された細胞である(動物の一部ではない)。ある態様において、細胞は、接着細胞または懸濁液中の細胞である。ある態様において、細胞は、動物(ヒトまたは非ヒト)由来の組織試料(例えば、生検組織)より分離または解離され、容器に入れられ、本明細書に記載の1つまたは複数の化合物(例えば、式IまたはIIIの化合物)と接触させる。次に、細胞は培養し、任意に特定の細胞型もしくは細胞系列に分化するように刺激された後、または組換え発現カセットを細胞に導入した後、任意に同一または異なる動物に戻すことができる。
細胞は、当技術分野において公知の任意の方法により培養できる。細胞は、必要に応じて、懸濁液中でまたは接着細胞として培養できる。
製剤(例えば、投与に適したものを含むがそれに限定されない本発明の化合物を含む)は、水溶液および非水溶液、製剤を等張性の状態にする抗酸化剤、緩衝剤、静菌剤、および溶質を含有する等張滅菌溶液、懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、および保存剤を含有してもよい水性および非水性滅菌懸濁液を含有する。本発明の実施において、組成物は、例えば経口的、経鼻的、局所的、静脈内、腹腔内、またはくも膜下内に投与できる。化合物の製剤は、単位用量または複数回用量の密封容器、例えばアンプルおよびバイアル等で提供することができる。溶液および懸濁液は、前記の種類の無菌の粉末、顆粒、および錠剤から調整することができる。修飾物質もまた、調製された食品または薬物の一部として投与することができる。
下記の実施例は、特許請求される本発明を説明するために示されるが、特許請求される本発明を制限するために示すものではない。
化学的に定義された培地の条件を改善し、単一細胞解離後のhESCの死の分子機構を明らかにするために、本発明者らは、50,000個の合成化合物に対して高処理形質スクリーニングを実施し、トリプシン解離後にhESC生存を促進する小分子を特定した。このスクリーニングから、解離後に細胞生存を著しく増加させ、hESCコロニーの形態ならびにアルカリホスファターゼ(ALP)発現も維持させた2つの化合物群が特定された。更なる化合物の最適化および活性解析の結果、更なる機能的および機構的特徴づけを行う対象として2つのリード分子2,4-二置換チアゾール(チアゾビビン/Tzvと名付けられた)および2,4-二置換ピリミジン(ピリンテグリン/Ptnと名付けられた)(図1A)が見出された。
細胞培養
ヒトESC系統、H1、HUES7、およびHUES9は、2mM L-グルタミン、1×非必須アミノ酸、20%血清代替物(Invitrogen)、および10ng/mlの塩基性線維芽細胞増殖因子(Invitrogen)を添加したDMEM-F12中で、照射MEFフィーダー細胞上で培養した。化学的に定義され、フィーダーを含まないhESC培養液は、以前にも示されている(Yao, S. et al., Proc Natl Acad Sci USA 103 (18):6907-6912 (2006))。簡潔には、hESCは、マトリゲル被覆組織培養プレート上で、N2B27-CDM(1×N2補充物、1×B27補充物、2mM L-グルタミン、0.11mM 2-メルカプトエタノール、1×非必須アミノ酸、および0.5mg/mlのBSA(画分V)ならびに20ng/mlのbFGFを添加したDMEM-F12)および20ng/mLのbFGF中で増殖させた。ヒトESCは、0.05%のトリプシンと共に5~6日ごとに継代した。
ALP検出キットおよびインテグリン抗体はケミコンからのものであった。AG825(Erb2阻害剤)、AG1478(EGFR阻害剤)、PPP(IGFR1阻害剤)はCalbiochemより購入した。E-カドヘリンの細胞質内尾部に対して産生された抗体(Transduction Laboratories、ケンタッキー州、レキシントン)を免疫沈降に用いた。TS2/16抗体はPierceからのものであった。E-カドヘリン分子の細胞外領域に対する抗体は、Zymed(Carlsbad)からのものであった。細胞外シグナルにより制御されるキナーゼ/MAPK、EGFR1、ERB2、GADPH、およびリン酸化されたAKTに対する抗体は、Cell Signalingからのものであった。マウスモノクローナル抗リン酸化チロシン(4G-10クローン)は、Upstate Biotechnologyからのものであった。PtnおよびTzvは、2μMで培地に添加された。
トリプシン処理が可能なhESC系統HUES7またはHUES9を、スクリーニングに使用した。hESCは、上述のとおり、マトリゲル被覆プレート上、化学的に定義された培地中で培養された。次に細胞は、トリプシンを用いて回収した。hESCは、マトリゲル被覆された384ウェルプレートに1ウェルあたり4,000個蒔いた。一時間経過し細胞が沈下した後、50,000個の別々の複素環のライブラリーから得られた化合物を各ウェルに添加した(最終濃度2μM)。培地および化合物を3日目に交換しながら、さらに6日間培養した後、ALP発現を検出するために細胞を染色し、緻密なコロニー形態を検出するため検査を行った。
免疫染色は、既に説明されているとおりに実施した(Yao, S. et al., Proc Natl Acad Sci USA 103 (18):6907-6912 (2006))。簡潔には、細胞の固定は、4%パラホルムアルデヒドを用いて室温(RT)で15分間実施した。次に細胞を阻止緩衝液においてRTで一時間培養した。一次抗体インキュベーションは4℃で一晩実施した。下記の市販の抗体を、阻止緩衝液中1:100の濃度で使用した:抗SSEA4、抗Oct4(Chemicon)、抗Nanog(Chemicon)。染色は、FITC、cy3、またはcy5抱合型二次抗体(Jackson ImmunoResearch)を用いて可視化した。
奇形腫形成実験は、300万~500万個のhESC(化合物TvzまたはPtnの存在下で維持された細胞)をヌードマウスの腎臓皮膜下に注射することにより実施した。4~5週間後、全てのマウスに奇形腫が発生し、これを切除した後、スクリプス研究所研究用組織学サービスおよび動物資源(Scripps Research Institute Research Histology Service and Animal Resources)により免疫組織学的に分析された。化合物で処理された細胞は、Children's Hospital Oaklandの細胞遺伝子学研究所において標準的なGバンド形成により核型決定された。無作為に選ばれた10個の核から染色体異常は検出されなかった。
異なる処理を受けたhESCは、トリプシンにより解離され、4%パラホルムアルデヒドにより固定された。染色は、製造者(MBL Laboratories、マサチューセッツ州、ウォータータウン)の使用説明書に従って実施された。染色後、試料をFACS Caliburフローサイトメーター(BD)を用いたフローサイトメトリーにより分析した。
E-カドヘリン、活性化されたインテグリンおよびSSEA4の発現を評価するために、解離された細胞(3×105)をPBSで洗浄し、2%ヤギ血清を含むPBSに再懸濁した。次に細胞を適切な抗体と共に4℃で1時間インキュベートし、遮断溶液で洗浄し、FITC複合二次抗体を用いて4℃で30分間標識した。その後、細胞を洗浄し、FACS Caliburフローサイトメーター上で分析した。
細胞接着アッセイ法は、マトリゲルで被覆した96穴マイクロタイタープレート中で実施した。トリプシン処理後、hESCを、所望の化合物を含有する化学的に定義された培地に再度懸濁した。次に細胞をマイクロタイターウェルに加え、37℃で3時間インキュベートした。結合しない細胞および緩く結合した細胞は、振とうならびに洗浄することにより除去され、次に、残留した細胞を直ぐに固定した。200μlのH2Oでウェルを3回洗浄し、付着している細胞をクリスタルバイオレット(Sigma)で染色した。570nmにおける各ウェルの吸光度を次に測定した。遮断抗体を用いた実験には、細胞を抗体と氷上で30分間予めインキュベートし、接着アッセイ法を抗体の存在下で実施した。各試料のアッセイ法は独立して3回行われた。
hESCは、氷上で1.5 mg/mlのスルホサクシニミジル2-(ビオチンアミド)エチル-ジチオプロプリオン酸(スルホ-NHS-SS-ビオチン)(Pierce Chemical Co.)とインキュベートした後、洗浄し、反応を停止させた。E-カドヘリンのエンドサイトーシスは、Ca2+の枯渇および37℃でインキュベートすることにより惹起された。次に細胞は、0℃でグルタチオン溶液(60mMグルタチオン、0.83M NaCl、と共に使用前に加えた0.83M NaOHおよび1%BSA)による20分間の洗浄において2回インキュベートし、これにより細胞表面の全てのビオチン基が除去された。残されたビオチン化されたタンパク質は、エンドサイトーシスにより細胞内に隔離され、従ってグルタチオンによるストリッピングから保護された。ビオチン化されたタンパク質は、ストレプトアビジンビーズ上に回収され、SDS-PAGEで分析された。E-カドヘリンは免疫ブロット法により検出された。エンドサイトーシス前の表面E-カドヘリンの総量を参照として用いた。
化学合成
下記の化学合成の実施例および当技術分野において一般的に知られている化学合成法を用いて、当業者は本明細書に開示されている化合物(例えば、式(I)~(VI)の化合物)を作り出すことが可能である。
4-ホルミル-3,5-ジメトキシフェノキシメチルで官能性を持たせたポリスチレン樹脂(PAL)にベンジルアミンを還元的アミノ化により添加させ、PAL-ベンジルアミン樹脂を得た。Ding, S.; Grey, N.S. Wu, X.; Ding, Q.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1594-1596を参照のこと。PAL-ベンジルアミン樹脂(200mg、0.2mmol)、2-ブロモチアゾール-4-カルボン酸(83 mg、0.4 mmol)、塩化ビス(2-オキソ-3-オキサゾリジニル)ホスフィン酸(BOP-Cl)(153mg、0.6mmol)、およびジイソプロピルエチルアミン(0.17mL、1mmol)の入ったDMF(3mL)を含む反応フラスコを、24時間室温で振とうした。樹脂をメタノール、ジクロロメタンで洗浄し、真空下で乾燥させることによりPAL樹脂-N-ベンジル-2-ブロモチアゾール-4-カルボキサミドを得、これを火炎乾燥した反応バイアルに加え、次に4-アミノピリミジン(95mg、1mmol)、Pd2(dba)3(46mg、0.05mmol)、キサントホス(87mg、0.15mmol)、およびNaOtBu(192mg、2mmol)を加えた。バイアルは、確実で安全にキャップされ、脱気後、アルゴンと無水ジオキサン(1.5mL)を充填した。反応物を90℃で24時間振とうさせた。樹脂を、ジエチルジチオカルバミン酸ナトリウム溶液(DMF中0.05M)、メタノール、およびジクロロメタンで洗浄し、真空下で乾燥させた。次に、樹脂をTFA:CH2Cl2:H2O(45:55:5)(2mL)の切断カクテルで2時間切断した。樹脂を濾過し、濾液を回収し、真空下で乾燥させることにより粗精製物を得、次にこれをHPLCで精製することにより表題化合物を得た(30mg、48%)。
N-ベンジル-2-(ピリミジン-4-イルアミノ)チアゾール-4-カルボキサミド
C15H13N5OSの計算精密質量:311.1、実測値:LCMSm/z=334.1(M+Na+)。
n-ブタノール(10mL)中の2,4-ジクロロピリミジン(372mg、2.5mmol)、6-メトキシ-1,2,3,4-テトラヒドロキノリン(489mg、3mmol)、およびジイソプロピルエチルアミン(0.52mL、3mmol)を含む反応フラスコを、40℃で一晩加温した。溶媒を蒸発させ、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィーで精製し、2-クロロ-4-(6-メトキシ-3,4-ジヒドロキノリン-1(2H)-イル)ピリミジン(551mg、80%)を得た。この中間体(250mg、0.91mmol)をジクロロメタンに溶解し、BBr3(ジクロロメタン中1M)(1mL、1mmol)を用いて-78℃で処理した。反応混合物をゆっくりと室温まで昇温させ、1時間攪拌し、水に流し込み、ジクロロメタンで抽出した。混合した有機層を無水Na2SO4上で乾燥させ、濃縮した。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィーで精製することにより、2-クロロ-4-(6-ヒドロキシ-3,4-ジヒドロキノリン-1(2H)-イル)ピリミジン(154mg、65%)を得た。DMF(0.5mL)中の2-クロロ-4-(6-ヒドロキシ-3,4-ジヒドロキノリン-1(2H)-イル)ピリミジン(29mg、0.11mmol)および4-アミノ-N-(シクロプロピルメチル)ベンゼンスルホンアミド(27mg、0.12mmol)の攪拌溶液に、p-トルエンスルホン酸(ジオキサン中に2M)(55μL、0.11mmol)を加えた。反応混合物を90℃で一晩攪拌し、その後HPLCで精製することにより、表題化合物(27mg、56%)を得た。
N-(シクロプロピルメチル)-4-(4-(6-ヒドロキシ-3,4-ジヒドロキノリン-1(2H)-イル)ピリミジン-2-イルアミノ)ベンゼンスルホンアミド
C23H25N5O3Sの計算精密質量:451.2、実測値 LCMSm/z=452.3(M+H+)。
n-ブタノール中の2,4-ジクロロピリミジン4(1.0等量)、R1NH2(1.2等量)、およびジイソプロピルエチルアミン(1.2等量)の混合物を80℃で一晩加温した。溶媒を蒸発させ、残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィーで精製し、中間体10を優れた収率で得(>80%)、これをDMF中のR2NH2(1.2等量)で処理し、p-トルエンスルホン酸(ジオキサン中に2M)(1.2等量)を加えた。反応混合物を90℃で一晩攪拌し、次に調整用HPLCで直接精製することによりピリンテグリン誘導体11を優れた収率で得た。
Claims (76)
- 以下の式
を有する、化合物:
式中、
環Aが、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
環Bが、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
L1が-C(O)-NR2-または-NR2-C(O)-であり;
L2が、結合、置換もしくは非置換のアルキレン、または置換もしくは非置換のヘテロアルキレンであり;かつ
R1およびR2が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。 - 環Aが置換または非置換のアリールである、請求項1記載の化合物。
- 環Aが置換または非置換のフェニルである、請求項1記載の化合物。
- 環Bが、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである、請求項1記載の化合物。
- 環Bが置換または非置換のヘテロアリールである、請求項1記載の化合物。
- 環Bが、置換もしくは非置換のピラゾリル、置換もしくは非置換のフラニル、置換もしくは非置換のイミダゾリル、置換もしくは非置換のイソキサゾリル、置換もしくは非置換のオキサジアゾリル、置換もしくは非置換のオキサゾリル、置換もしくは非置換のピロリル、置換もしくは非置換のピリジル、置換もしくは非置換のピリミジル、置換もしくは非置換のピリダジニル、置換もしくは非置換のチアゾリル、置換もしくは非置換のトリアゾリル、置換もしくは非置換のチエニル、置換もしくは非置換のジヒドロチエノ-ピラゾリル、置換もしくは非置換のチアナフテニル、置換もしくは非置換のカルバゾリル、置換もしくは非置換のベンゾチエニル、置換もしくは非置換のベンゾフラニル、置換もしくは非置換のインドリル、置換もしくは非置換のキノリニル、置換もしくは非置換のベンゾトリアゾリル、置換もしくは非置換のベンゾチアゾリル、置換もしくは非置換のベンゾオキサゾリル、置換もしくは非置換のベンズイミダゾリル、置換もしくは非置換のイソキノリニル、置換もしくは非置換のイソインドリル、置換もしくは非置換のアクリジニル、置換もしくは非置換のベンゾイサゾリル、または置換もしくは非置換のジメチルヒダントインである、請求項1記載の化合物。
- L2が置換または非置換のC1-C10アルキルである、請求項1記載の化合物。
- L2が非置換C1-C10アルキルである、請求項1記載の化合物。
- L2がメチレンである、請求項1記載の化合物。
- 環Aが置換または非置換のアリールであり;
環Bが置換または非置換のヘテロアリールであり;
R1が水素であり;かつ
L2が非置換C1-C10アルキルである、
請求項1記載の化合物。 - R2が水素である、請求項1記載の化合物。
- R1が水素または非置換C1-C10アルキルである、請求項1記載の化合物。
- R1が水素である、請求項1記載の化合物。
- 以下の式
を有する、請求項1記載の化合物:
式中、
yが0から3の整数であり;
zが0から5の整数であり;
Xが-N=、-CH=、または-CR5=であり;
R3、R4、およびR5が、独立して、-CN、-S(O)nR6、-NR7R8、-C(O)R9、-NR10-C(O)R11、-NR12-C(O)-OR13、-C(O)NR14R15、-NR16S(O)2R17、-OR18、-S(O)2NR19、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、nが0から2の整数であり、ここでzが1よりも大きい場合、2つのR3部分が、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成してもよく;かつ
R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、およびR19が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである。 - L2が置換または非置換のC1-C10アルキルである、請求項14記載の化合物。
- L2が非置換C1-C10アルキルである、請求項14記載の化合物。
- L2がメチレンである、請求項14記載の化合物。
- Xが-N=または-CH=である、請求項14記載の化合物。
- zが2であり、かつ隣接する頂点における2つのR3部分が、一緒に連結されて、置換または非置換のヘテロシクロアルキルを形成する、請求項14記載の化合物。
- zが1である、請求項14記載の化合物。
- yが0または1である、請求項14記載の化合物。
- R3が-OR18であり、かつR18が水素または非置換C1-C10アルキルである、請求項14記載の化合物。
- L2がメチレンであり;
Xが-N=または-CH=であり;
R1が水素であり;かつ
yおよびzが0である、
請求項14記載の化合物。 - 以下の式
を有する、化合物:
式中、
環Dが、置換もしくは非置換のアリールまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
L3が、-C(O)-NH-または-S(O)2-NH-であり;
R20が、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり;
R21が、-NR22R23または-OR24であり;
R22およびR23が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、置換もしくは非置換のヘテロアリールであるか、あるいは一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成し;かつ
R24が、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、置換もしくは非置換のヘテロアリールであるか、あるいは一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキルの置換もしくは非置換のシクロアルキルを形成する。 - 環Dが、置換または非置換のフェニルである、請求項25記載の化合物。
- R20が、置換もしくは非置換のアルキルまたは置換もしくは非置換のシクロアルキルである、請求項25記載の化合物。
- R20が、置換もしくは非置換のC1-C10アルキル、または置換もしくは非置換の3~7員のシクロアルキルである、請求項25記載の化合物。
- R20が、置換もしくは非置換のC1-C5アルキル、または置換もしくは非置換の3~6員のシクロアルキルである、請求項25記載の化合物。
- R20が、非置換C1-C5アルキル、または非置換3~6員のシクロアルキルである、請求項25記載の化合物。
- R22が水素であり;
R23が、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールである、
請求項25記載の化合物。 - R22が水素であり;かつ
R23が置換または非置換の置換または非置換のアリールである、
請求項25記載の化合物。 - R22およびR23が、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキルまたは置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成する、請求項25記載の化合物。
- R22およびR23が、一緒に連結されて、置換もしくは非置換のピロリル、置換もしくは非置換のイソインドリニル、置換もしくは非置換のピペリジニル、または置換もしくは非置換のテトラヒドロキノリニルを形成する、請求項25記載の化合物。
- 以下の式
を有する、請求項25記載の化合物:
式中、
wが0から1の整数であり;
qが0から7の整数であり;
R25、R26、R27、およびR28が、独立して、-CN、-NR29R30、-C(O)R31、-NR32-C(O)R33、-NR34-C(O)-OR35、-C(O)NR36R37、-NR38S(O)2R39、-OR40、-S(O)2NR41、-S(O)vNR42、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、ここで、vが0から2の整数であり;
R29、R30、R31、R32、R33、R34、R35、R36、R37、R38、R39、R40、R41、およびR42が、独立して、水素、置換もしくは非置換のアルキル、置換もしくは非置換のヘテロアルキル、非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールであり、
R25およびR26、またはR26およびR27が、連結されて、置換もしくは非置換のシクロアルキル、置換もしくは非置換のヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換のアリール、または置換もしくは非置換のヘテロアリールを形成してもよい。 - R28が-OR40であり、ここでR40が水素または非置換C1-C10アルキルである、請求項35記載の化合物。
- R40が、水素または非置換C1~C5アルキルである、請求項36記載の化合物。
- R20が非置換C1~C10アルキルである、請求項38記載の化合物。
- R28が-OR40であり、ここでR40が、水素または非置換C1~C10アルキル、または置換もしくは非置換のC3~C6シクロアルキルで置換されたC1~C10アルキルである、請求項38記載の化合物。
- qが1である、請求項38記載の化合物。
- 動物細胞を安定化させるのに十分な量の式IまたはIIIの化合物(例えば、請求項1~43記載のいずれか一項記載の化合物のいずれか)と、該細胞を接触させる工程
を含む、分離された細胞をインビトロで安定化させる方法。 - 前記化合物の存在下において前記細胞の状態または環境を変化させる工程をさらに含み、該化合物の非存在下における該変化させる工程が、該細胞の細胞プログラミングに変化をもたらす、請求項44記載の方法。
- 前記変化させる工程が、前記細胞を解凍することおよび該細胞を他の細胞から解離させることのうち少なくとも1つを含む、請求項45記載の方法。
- 前記細胞が接着性である、請求項44記載の方法。
- 前記細胞が懸濁液中にある、請求項44記載の方法。
- 前記細胞の形質を決定する工程をさらに含む、請求項44記載の方法。
- 動物より前記細胞を分離する工程を含む、請求項44記載の方法。
- 前記動物がヒトである、請求項50記載の方法。
- 前記動物が非ヒト動物である、請求項50記載の方法。
- 前記化合物が式Iの化合物である、請求項44記載の方法。
- 前記化合物が式IIIの化合物である、請求項44記載の方法。
- 動物において状態を改善させる方法であって、
該状態を改善させるのに十分な量の式IまたはIIIの化合物(例えば、請求項1~43のいずれか一項記載の化合物のいずれか)を、それを必要とする動物に投与する工程
を含む、方法。 - 前記状態が、組織損傷、発作、および癌からなる群より選択される、請求項55記載の方法。
- 前記組織が、膵臓、肝臓、腸、肺、および腎臓からなる群より選択される、請求項56記載の方法。
- 前記状態が、移植された組織または臓器の少なくとも部分的な拒絶を含む、請求項55記載の方法。
- 前記移植が、骨髄、臍帯血、精製された造血幹細胞もしくは造血前駆細胞、心臓細胞、神経系細胞、膵β細胞、または肝細胞の移植を含む、請求項58記載の方法。
- 前記化合物が式Iの化合物である、請求項55記載の方法。
- 前記化合物が式IIIの化合物である、請求項55記載の方法。
- 細胞生存を維持するための方法であって、
分離された幹細胞、前駆細胞または分化細胞を産生する工程;および
該分離された細胞内のE-カドヘリンの安定化を誘導する工程により、細胞生存を維持する工程
を含む、方法。 - 前記誘導する工程が、前記分離された幹細胞を、式Iの化合物(例えば、請求項1~24のいずれか一項記載の化合物のいずれか)の非存在下の場合と比較して、分離された幹細胞の生存を少なくとも2倍向上させるのに十分な量の該化合物に、接触させることを含む、請求項62記載の方法。
- 前記誘導する工程が、表面上で前記分離された幹細胞を培養することを含み、E-カドヘリン外部ドメインを含む分子が該表面に係留されている、請求項62記載の方法。
- 分離された細胞内のE-カドヘリンを安定化させる分子の非存在下の場合と比較して、分離された細胞の生存を少なくとも2倍に向上させるのに十分な量の該分子を含む、該分離された細胞の集団。
- 前記分子が、式Iの化合物(例えば、請求項1~24のいずれか一項記載の化合物のいずれか)を含む、請求項65記載の細胞の集団。
- 前記細胞が、幹細胞、誘導幹細胞、多能性幹細胞、前駆細胞、分化細胞、β細胞、および線維芽細胞からなる群より選択される、請求項65記載の細胞の集団。
- 式IまたはIIIの化合物(例えば、請求項1~43のいずれか一項記載の化合物のいずれか)の非存在下の場合と比較して、分離された細胞の生存を少なくとも2倍向上させるのに十分な量の該化合物を含む、分離された細胞の集団。
- 前記細胞が、幹細胞、誘導幹細胞、多能性幹細胞、前駆細胞、分化細胞、β細胞、および線維芽細胞からなる群より選択される、請求項68記載の集団。
- 幹細胞の生存を維持するための方法であって、
分離された細胞を産生する工程;および
該分離された細胞内のプロテインキナーゼC(PKC)を活性化する工程により、細胞生存を維持する工程
を含む、方法。 - 前記活性化する工程が、PMAの非存在下における生存率と比較して、前記分離された細胞の生存を向上させるのに十分な量のホルボール 12-ミリステート 13-アセテート(PMA)を、該細胞に接触させることを含む、請求項70記載の方法。
- プロテインキナーゼC活性化物質の非存在下の場合と比較して、分離された幹細胞の生存を少なくとも2倍向上させるのに十分な量のPKC活性化物質を含む、分離された幹細胞の集団。
- 各置換基が、独立して、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、-OR'、=O、=NR'、=N-OR'、-NR'R''、-SR'、-ハロゲン、-SiR'R''R'''、-OC(O)R'、-C(O)R'、-CO2R'、-CONR'R''、-OC(O)NR'R''、-NR''C(O)R'、-NR'-C(O)NR''R'''、-NR''C(O)2R'、-NR-C(NR'R''R''')=NR''''、-NR-C(NR'R'')=NR'''、-S(O)R'、-S(O)2R'、-S(O)2NR'R''、-NRSO2R'、-CN、-NO2、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群より選択され、ここで、R'、R''、R'''、およびR''''のそれぞれが、独立して、水素、C1-10アルキル基、C1-10ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、およびアリールアルキル基からなる群より選択される、請求項1記載の化合物。
- 環Aが、1~5個のR3基でそれぞれ置換されてもよい、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり;
環Bが、1~5個のR4基でそれぞれ置換されてもよいヘテロシクロアルキルまたはヘテロアリールであり;
L1が-C(O)-NR2-または-NR2-C(O)-であり;
L2が、結合、C1-10アルキレン、またはC1-10ヘテロアルキレンであり;
R1およびR2が、独立して、水素、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、C3-8シクロアルキル、C3-8ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり;
R3およびR4のそれぞれが、独立して、-CN、-S(O)nR6、-NR7R8、-C(O)R9、-NR10-C(O)R11、-NR12-C(O)-OR13、-C(O)NR14R15、-NR16S(O)2R17、-OR18、-S(O)2NR19、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、ここで、nが0から2の整数であり、2つのR3部分が、一緒に連結されて、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはテロアリールを形成してもよく;かつ
R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、およびR19が、それぞれ独立して、水素、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールである、
請求項1記載の化合物。 - 各置換基が、独立して、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、-OR'、=O、=NR'、=N-OR'、-NR'R''、-SR'、-ハロゲン、-SiR'R''R'''、-OC(O)R'、-C(O)R'、-CO2R'、-CONR'R''、-OC(O)NR'R''、-NR''C(O)R'、-NR'-C(O)NR''R'''、-NR''C(O)2R'、-NR-C(NR'R''R''')=NR''''、-NR-C(NR'R'')=NR'''、-S(O)R'、-S(O)2R'、-S(O)2NR'R''、-NRSO2R'、-CN、-NO2、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群より選択され、ここでR'、R''、R'''、およびR''''のそれぞれが、独立して、水素、C1-10アルキル基、C1-10ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、およびアリールアルキル基からなる群より選択される、
請求項25記載の化合物。 - 環Dが、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよいアリールまたはヘテロアリールであり;
L3が、-C(O)NH-または-S(O)2NH-であり;
R20が、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよい、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり;
R21が、-NR22R23または-OR24であり;
R22およびR23が、独立して、水素、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリールであるか、または一緒に連結されて、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよいヘテロシクロアルキルもしくはヘテロアリールを形成し;
R24が、1~5個のR基でそれぞれ置換されてもよい、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリールであり;かつ
各R基が、独立して、C1-10アルキル、C1-10ヘテロアルキル、-OR'、=O、=NR'、=N-OR'、-NR'R''、-SR'、-ハロゲン、-SiR'R''R'''、-OC(O)R'、-C(O)R'、-CO2R'、-CONR'R''、-OC(O)NR'R''、-NR''C(O)R'、-NR'-C(O)NR''R'''、-NR''C(O)2R'、-NR-C(NR'R''R''')=NR''''、-NR-C(NR'R'')=NR'''、-S(O)R'、-S(O)2R'、-S(O)2NR'R''、-NRSO2R'、-CN、-NO2、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群より選択され、ここで、R'、R''、R'''、およびR''''のそれぞれが 、独立して、水素、C1-10アルキル基、C1-10ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、およびアリールアルキル基からなる群より選択される、
請求項25記載の化合物。
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