JP2022524882A - 養子移入療法(Adoptive transfer therapies)におけるTリンパ球及びNK細胞の拡大増殖及び分化のための方法 - Google Patents
養子移入療法(Adoptive transfer therapies)におけるTリンパ球及びNK細胞の拡大増殖及び分化のための方法 Download PDFInfo
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Abstract
Description
i)対象からのリンパ球系細胞の抽出、
ii)中間親和性IL-2受容体を介した優先的シグナル伝達(以下では、IL2Rβγに偏ったIL2シグナル伝達と称する)を誘導しながらの、リンパ球系細胞又は必要に応じて、さらに遺伝子操作されたリンパ球系細胞のインビトロ拡大増殖、及び
iii)がんを有する対象中への活性化された/拡大増殖された細胞の移入、
である。
-中間親和性IL2Rを介して優先的にシグナル伝達する可溶性IL-2変異タンパク質とともにリンパ球系細胞を培養すること。
-中間親和性IL2Rを介して優先的にシグナル伝達するIL2変異タンパク質を分泌するためのリンパ球系細胞の遺伝子改変。
-リンパ球系細胞を天然のIL-2とともに培養するが、
a)IL2-IL2Rα相互作用を遮断する薬剤を添加する、又は
b)IL2-IL2Rα相互作用を遮断する可溶性タンパク質を分泌するためのリンパ球系細胞を遺伝子操作すること、又は
c)細胞表面におけるIL2Rα受容体サブユニット(CD25)の発現を減少させるために、リンパ球系細胞を遺伝子操作すること、又は
d)細胞表面における中間親和性IL-2受容体の発現を増加させるために、リンパ球系細胞を遺伝子操作すること。
本方法で使用されるIL-2変異タンパク質は、本発明の配列番号1~6に対応する米国特許第9,206,243号に記載されているもの、本出願の配列番号7に対応するLevinらによって2012年に開示されたSuperkine H9、並びに本発明の配列番号8に対応する国際公開第2017/202786号の配列番号1に記載されたF42変異タンパク質を含む。しかし、これらの分子に限定されるものではない(Levinら:Nature(2012).48:529-535)。
本発明は、セントラルメモリー表現型を有するリンパ球の濃縮及び拡大増殖のためのエクスビボ方法であって、対象から得られた試料中のリンパ球又はこのような試料から単離されたリンパ球を拡大増殖することを含み、拡大増殖することがβ/γ二量体IL-2受容体の活性化を含む、方法を提供する。
-中間親和性IL2R(IL2Rβγ)を介して優先的に相互作用及びシグナル伝達する可溶性IL-2変異タンパク質を用いてリンパ球系細胞を培養すること。
-中間親和性IL2Rを介して優先的にシグナル伝達するIL2変異タンパク質を分泌するためのリンパ球系細胞の遺伝子操作。
-リンパ球系細胞を天然のIL-2の存在下で培養するが、
a)IL2-IL2Rα相互作用を遮断する薬剤を添加する、又は
b)IL2-IL2Rα相互作用を遮断する可溶性タンパク質を分泌するためにリンパ球系細胞を遺伝子操作すること、又は
c)細胞表面におけるIL2Rα受容体サブユニット(CD25)の発現を減少させるために、リンパ球系細胞を遺伝子操作すること、又は
d)細胞表面における中間親和性IL-2受容体の発現を増加させるために、リンパ球系細胞を遺伝子操作すること。
本発明の一実施形態は、IL2変異タンパク質を使用して、T細胞活性化及び拡大増殖プロトコルの間に中間親和性二量体IL2受容体-IL2Rβγ-を介したIL2シグナル伝達を特異的に誘導することに関する。IL2変異タンパク質には、低下したIL2Rα相互作用親和性を有するバリアント、例えば米国特許第9,206,243号に記載されているもの;増加したIL2Rβ相互作用親和性を有するバリアント、例えば、Levinら、2012に記載されているスーパーカインH9;又は両方の組み合わせを有するバリアント(より少ないIL2Rα、より多いIL2Rβ相互作用親和性)が含まれるが、これらに限定されない。リンパ球は、特異的TCRシグナル伝達、CD3/CD28活性化及び/又は他の生存サイトカインと組み合わせたこれらの変異タンパク質で活性化される。このIL2様シグナルは、培養全体にわたって維持することができ、又は培養の特定の段階で使用することができ、優先的には最初の活性化時点の間に提供されるべきである。変異タンパク質は、1ng/ml~1mg/mlの濃度範囲で使用することができる。
本発明の他の実施形態は、本発明で言及されるIL2変異タンパク質のいずれかを分泌するようにリンパ球系細胞を遺伝子改変することに関する。リンパ球系細胞の改変は、ACT技術との関連で広く使用されている十分に記載された形質移入又は形質導入方法のいずれをも用いて行うことができる。例えば、これは、変異タンパク質の遺伝子を有する構築物をT細胞上に導入するためにゲノム編集技術又はウイルスベクターを使用して達成することができる。構築物は、形質導入有効性を容易に追跡するためのレポータータンパク質及び形質導入された画分を濃縮するための抗生物質耐性遺伝子も含み得る。
本発明の他の実施形態は、天然のIL2がACTのためのインビトロリンパ球系細胞拡大増殖において使用される間に、IL2/IL2Rα相互作用を薬理学的に破壊する様々な方法に関する。このような薬剤の添加は、高親和性三量体IL2RへのIL2のアクセスを遮断することによって、天然のIL2のシグナルをIL2Rβγに偏ったIL2シグナルに変える。
本発明の他の実施形態は、IL2とIL2Rαの間の相互作用を特異的に遮断する可溶性タンパク質を分泌するようにリンパ球系細胞を遺伝子改変することに関する。リンパ球系細胞の改変は、ACT技術との関連で広く使用されている十分に記載された形質移入又は形質導入方法のいずれをも用いて行うことができる。例えば、これは、所望のタンパク質の遺伝子を有する構築物をT細胞上に導入するためにゲノム編集技術又はウイルスベクターを使用して達成することができる。形質移入/形質導入の効率は高くすべきである。少なくとも、リンパ球系細胞がIL2-IL2Rα相互作用を有意に遮断するのに十分な可溶性タンパク質を産生することを許容するのに十分な高さであり、インビトロ拡大増殖中にIL2Rβγに偏ったIL2シグナルをリンパ球系細胞自身に付与する。
本発明の別の実施形態は、細胞表面におけるIL2Rαの発現を低下させるためのリンパ球系細胞の遺伝子改変に関する。細胞工学のために、干渉RNA、ゲノム編集技術及びノックアウト戦略を含むがこれらに限定されないいくつかの戦略を使用することができる。リンパ球系細胞の改変は、ACT技術に関して広く使用されているよく記載された形質移入又は形質導入方法のいずれによっても行うことができる。例えば、リンパ球系細胞上のCD25発現の低下又は完全な抑制は、CD25の遺伝子を標的とするshRNAを有する構築物を細胞上に導入するためにウイルスベクターを使用して達成することができる。
本発明の別の実施形態は、細胞表面上の二量体受容体IL2Rβγの発現を増加させるために、リンパ球系細胞を遺伝子改変することに関する。これは、恒常的発現プロモーター下でCD122(IL2Rβ鎖)遺伝子(gen)又はCD132(IL2Rγ鎖)遺伝子(gen)を有する構築物をT細胞上に導入するためにウイルスベクターを使用して達成することができる。あるいは、この戦略のために、T細胞は、天然のCD122の代わりに増加したIL2親和性を有する変異されたCD122(IL2Rβ鎖)を発現するように改変することができる。これは、変異された又は野生型のCD122の遺伝子(gen)を有する構築物をリンパ球系細胞上に導入するためにゲノム編集技術又はウイルスベクターを使用して達成することができる。
関連する態様では、腫瘍を治療することを必要とする対象において腫瘍を治療する方法であって、本明細書に開示されている方法によって作製されたリンパ球の集団の有効量を対象に投与することを含む、方法が本明細書に開示される。特定の実施形態では、腫瘍は固形腫瘍である。特定の実施形態では、腫瘍は液性腫瘍(例えば、血液がん)である。
例1.IL2Rβγを介して優先的にシグナル伝達するIL2変異タンパク質による天然のIL2の置換は、リンパ球の生存性を維持し、セントラルメモリー様表現型を付与する。
ナイーブOT1マウス脾臓からCD8+T細胞を単離する。抗CD3/抗CD28でコーティングされたビーズをTCR刺激として7日間、天然のIL2又はIL2変異タンパク質とともに10日間使用し、IL2変異タンパク質は分子免疫学センターにおいて得られ(バッチ1201602)、米国特許第9,206,243号の配列番号6に開示されている。2日ごとに培養物を拡大増殖させて密度を1×106に保ち、サイトカインを新鮮な培地とともに添加する。多数のT細胞の拡大増殖の成功は、両方の培養条件において達成され、細胞数の同様の増加倍数が観察される。図1Aは、IL2変異タンパク質を使用した場合、天然のIL2と比較して培養物中の生存率が改善されることを示す(p<0.0001)。さらに、メモリー細胞の量及び阻害マーカーの発現をフローサイトメトリーによって測定した。IL2変異タンパク質を使用した場合、天然のIL2と比較して、セントラルメモリー様表現型(CD62L+/CD44+によって定義される)を有する細胞の有意に高い割合が細胞において観察された(図1B)。PD-1、Lag-3、Tim-3及びTigitマーカーの表現型分析は、IL2-変異タンパク質活性化された細胞が免疫チェックポイントリガンド(PD-1、Lag-3、Tim-3、Tigit)の発現を抑制することを示した(表1)。
他の著者らによって以前に記載されたように、IL7及びIL15のIL2との組み合わせは、IL2単独と比較された場合、T細胞の適応性を改善する(Redeker and Arens,2016,Front Immunol.6(7):345)。本発明者らの実験では、OT-I T細胞活性化/拡大増殖プロトコルのために、天然のIL2又はIL2変異タンパク質をIL7及びIL15と培養中で組み合わせた。
インビトロ及びインビボの両方において継続的なサイトカイン支持源を生成するために、本発明者らは、T細胞を遺伝子操作して、中間親和性IL2受容体を優先的に活性化するIL2変異タンパク質を産生させた。増強された緑色蛍光タンパク質(eGFP)及び天然のIL2又はIL2変異タンパク質をコードするレトロウイルス構築物を使用する。形質導入手順は、抗CD3/抗CD28コーティングされたビーズ及び天然のIL2又はIL2変異タンパク質で、単離された直後のナイーブOT-I T細胞を刺激することによって開始される。細胞を加えたレトロネクチンがコーティングされたプレートに、濃縮されたレトロウイルスベクター上清を24時間及び48時間で加える。形質導入後、IL7及びIL15とともに10日間、抗CD3/抗CD28コーティングされたビーズによるTCR刺激を7日間維持する。形質導入効率は、eGFP発現によって確認され、両構築物について80%より高かった(図6A)。分泌された分子をELISA(天然のIL2又はIL2変異タンパク質)によって検出した。
IL2α鎖遺伝子(gen)(CD25)の発現を遮断する目的で、eGFP及びil2raを標的とする低分子ヘアピン型RNA(shRNA)をコードするベクターを使用した。形質導入手順は、抗CD3/抗CD28コーティングされたビーズ及び天然のIL2で、単離された直後のナイーブOT1 T細胞を刺激することによって開始される。shRNAのための3つの異なる構築物を使用し、CD25の表面発現に基づいて可変のノックダウン効率を得た。スクランブルshRNAを含有するレンチウイルスによる形質導入を対照として使用する。2回の形質導入の後、天然のIL2(50U/ml)とともに5日間、細胞を培養下に維持する。異なる構築物による形質導入後のCD25表面発現の減少を、フローサイトメトリーによって評価した(図7A)。より良好なCD25下方制御が達成されるときに、5日間の天然のIL2刺激後のセントラルメモリー細胞の割合は優れている(図7B)。
中間親和性受容体IL2Rβγを介した天然のIL2シグナル伝達を優先的に指示するための別の試みでは、インビトロでのT細胞活性化中に天然のIL2とともに薬剤を培養に添加する。薬剤は、遮断効果を保証するために高濃度で添加される。抗CD3/抗CD28コーティングされたビーズ、50IU/mlのIL2及び10μg/mlの抗CD25モノクローナル抗体(BioLegendクローン3C7)とともに、OT-I T細胞を培養する。抗CD25は0日目から添加され、天然のIL2を加えた新鮮な培地を2日ごとに添加したときに新しくなる。無関係な特異性を有する抗体をアイソタイプ対照として使用する。10日間の培養後の細胞の表現型決定により、天然のIL2活性化中に抗CD25を添加することは、アイソタイプ対照と比較した場合に、細胞生存率(図8A)及びセントラルメモリー様集団(図8B)を増加させることが明らかとなった(p<0.0001)。さらに、CD25との天然のIL2の相互作用が抗体で破壊されると、疲弊マーカーの発現の減少が得られる(表4)。
IL2Rβγを介して活性化されたセントラルメモリーT細胞の機能的能力を評価するために、細胞傷害性アッセイを行った。例1、3に記載されているとおりに活性化されたOT1細胞を同族ペプチドSIINFEKLで16時間刺激し、フローサイトメトリー解析を行って、グランザイムβの産生量を測定した。OT-I T細胞の殺滅能力を評価するために、OVAノミナル抗原を1:1の割合で表面に発現するように形質導入されたB16黒色腫細胞(B16-OVA)とともにOT-I T細胞を共培養した。非形質導入B16黒色腫細胞を対照として使用した。IncuCyteCytotox試薬を添加し、60時間の間、2時間ごとに殺滅能力を評価した。対照細胞では溶解が観察されなかったため、標的細胞の溶解は抗原特異的であった。
B16/OVA腫瘍細胞株と合わせたOT1モデルは、最も使用されているモデルの1つであり、ACTの妥当な前臨床的近似に相当する。C57BL/6レシピエントマウスは、腫瘍細胞接種後0日目及び10日目に1×106個のOVA発現黒色腫細胞の皮下注射を受けた;マウスに致死量以下の放射線照射(5Gy)を行った。
群1:処置を受けなかった(対照群)。
群2:天然のIL2で活性化されたOT1 T細胞を与えられた(例1と同様)。
群3:IL2-変異タンパク質で活性化されたOT1 T細胞を与えられた(例1と同様)。
群4:天然のIL2+IL7+IL15で活性化されたOT1 T細胞を与えられた(例2と同様)。
ACTの有効性を改善するために、本発明者らは、IL2変異タンパク質を産生するようにT細胞を遺伝子操作した。遺伝子(gen)の挿入は、インビトロだけでなくインビボにおいてもT細胞上の継続的かつ持続的なIL2変異タンパク質シグナルを可能にする。C57BL/6レシピエントマウスは、腫瘍細胞接種後0日目及び10日目に1×106個のOVA発現黒色腫細胞の皮下注射を受けた;マウスに致死量以下の放射線照射(5Gy)を行った。動物を3つの処置群に分け、11日及び15日目に、以下のようにOT1マウスからの1×106個のT細胞の静脈内移入を受けた:
群1:処置を受けなかった(対照)。
群2:天然のIL2_操作されたOT1 T細胞を与えられた(例3に記載の形質導入プロトコルのとおりに)
群3:IL2変異タンパク質_操作されたOT1 T細胞を与えられた(例3に記載の形質導入プロトコルのとおりに)。
ACT療法はTILを使用して実施することができるので、本発明者らは、TIL拡大増殖に対するIL2変異タンパク質の効果を評価した。腫瘍浸潤リンパ球におけるβ/γ二量体IL2受容体の活性化の役割を研究するために、腫瘍細胞接種後19~21日目の間にC57BL/6マウスからMC38腫瘍を単離した。腫瘍を機械的に解離させ、IL2又はIL2-変異タンパク質の存在下で14~16日間培養した。本発明者らは、IL2-変異タンパク質を培養条件で使用した場合に、TILの拡大増殖がより高いことを見出した。一貫して、IL2-変異タンパク質は、Ki67マーカーに関してTILの増殖速度を増加させた(図12A及び図12B)。さらに、IL2-変異タンパク質とともにエクスビボで培養されたTILは、対照と比較して、セントラルメモリー様T細胞の有意な拡大増殖を示した(図12C)。全体として、これらのデータは、IL2-変異タンパク質が、セントラルメモリー分化表現型を促進するCD8+TIL拡大増殖を誘導することを示す。
例9の方法で得られたTILを、拡大増殖前に機能的及び表現型的に特徴付け、抗CD3及び抗CD2抗体の存在下で4時間刺激した。
拡大増殖された総TIL中のNK細胞の割合におけるβ/γ二量体IL2受容体の活性化の役割を研究するために、腫瘍細胞接種後19~21日の間にC57BL/6マウスからMC38腫瘍を単離した。腫瘍を機械的に解離させ、天然のIL2又はIL2-変異タンパク質の存在下で14~16日間培養した。IL2-変異タンパク質とともにエクスビボで培養されたTILは、合計からの割合に関して(図14A)及び絶対数に関して(図14B)、天然のIL2と比較してNK細胞の有意な拡大増殖を示した。
Claims (30)
- 養子細胞移入療法(Adoptive cell transfer therapies)において有用なセントラルメモリー表現型を有する、Tリンパ球及びNK細胞の分化及び拡大増殖のための方法であって、3つの段階:
i)対象からのリンパ球系細胞の抽出と、
ii)中間親和性IL-2受容体(IL2Rβγ)を介した優先的シグナル伝達を誘導しながらの、さらに遺伝子操作された、Tリンパ球及びNK細胞のインビトロ拡大増殖及び分化と、
iii)がんを有する対象への活性化された細胞の移入と、
を含む、上記方法。 - リンパ球系細胞を拡大増殖しながら中間親和性IL2受容体(IL2Rβγ)を介した優先的シグナル伝達を誘導するための戦略が、
-中間親和性IL2R(IL2Rβγ)と優先的に相互作用し、中間親和性IL2R(IL2Rβγ)を介して優先的にシグナル伝達する可溶性IL-2変異タンパク質とともにリンパ球系細胞を培養すること、
-中間親和性IL2Rと優先的に相互作用し、中間親和性IL2Rを介して優先的にシグナル伝達するIL2変異タンパク質を分泌するようにリンパ球系細胞を遺伝子操作すること、
-天然のIL-2及びIL2-IL2Rα相互作用を遮断する薬剤の存在下で、Tリンパ球及びNK細胞を培養すること、
-天然のIL-2の存在下でTリンパ球及びNK細胞を培養すること、並びにIL2-IL2Rα相互作用を遮断する可溶性タンパク質を分泌するようにこのような細胞を遺伝子操作すること、
-天然のIL-2の存在下でTリンパ球及びNK細胞を培養すること、並びに細胞表面でのIL2Rα受容体サブユニットの発現を減少するようにこのような細胞を遺伝子操作すること、
-天然のIL-2の存在下でTリンパ球及びNK細胞を培養すること、並びに細胞表面での中間親和性IL-2受容体の発現を増加するようにこのような細胞を遺伝子操作すること、
を含む群から選択される、請求項1に記載の方法。 - IL-2変異タンパク質が、
-配列番号1、
-配列番号2、
-配列番号3、
-配列番号4、
-配列番号5、
-配列番号6及び
-配列番号7、
を含む群から選択される、請求項2に記載の方法。 - IL2-IL2Rα相互作用を遮断する薬剤が、
-IL2Rα又はIL2のいずれかに結合する抗体又は抗体断片
-IL2Rα又はIL2のいずれかに結合するペプチド又は化学的に定義された小分子、
-IL2Rαの可溶性形態又はその改変されたバリアントバリアント、
を含む群から選択される、請求項2に記載の方法。 - 段階(iii)が、同じドナーにおいて又は異なるドナーにおいて行われ得る、請求項1に記載の方法。
- 段階iiにおける中間親和性IL-2受容体によるシグナル伝達が、細胞培養の異なる時点で起こり得る、又はシグナル伝達がインビトロ(in vitro)及びインビボ(in vivo)で維持され得る、請求項2に記載の方法。
- 移入された細胞の持続性並びにより高いインビトロ(in vitro)及びインビボ(in vivo)抗腫瘍効果を延長するための、請求項1~6に記載の方法。
- -IL12、
-IL17、
-IL15及び
-IL21、
を含む群から選択される他のサイトカインと組み合わせた、請求項1~6に記載の方法。 - 前記方法の対象となるリンパ球系細胞が、以下のいずれか:T細胞の混合物;精製されたCD4又はCD8 T細胞;NK細胞;NKT細胞であり得る、請求項1に記載の方法。
- Tリンパ球及びNK細胞が、末梢血単核球、腫瘍排出リンパ節又は腫瘍浸潤物のいずれかから、段階iにおいて取得されることができる、請求項1に記載の方法。
- 前記方法におけるリンパ球系細胞が、CARを発現し、所望の特異性のTCRを発現し、細胞膜中で関心の対象の他の受容体を発現し、関心の対象の異なるサイトカイン又は可溶性タンパク質を分泌するようにさらに操作され得る、請求項1に記載の方法。
- 養子細胞移入療法のための、請求項1~11のいずれか一項に記載の方法の使用。
- 腫瘍浸潤リンパ球又はキメラ抗原受容体Tを得るための、請求項9に記載の使用。
- がんの治療のための、請求項11~12に記載の使用。
- 請求項1~6のいずれか一項に記載の方法によって得られる細胞。
- セントラルメモリー表現型を有するリンパ球のエクスビボ(ex vivo)での濃縮及び拡大増殖のための方法であって、
a.対象からリンパ球の集団を取得することと、
b.β/γ二量体IL-2受容体を活性化する条件で細胞を培養するリンパ球を拡大増殖することと、
を含む、上記方法。 - 工程(b)が、少なくとも1つのIL2変異タンパク質を使用することによって行われる、請求項16に記載の方法。
- 工程(b)が、IL-2受容体の少なくとも1つのサブユニットの発現を調節することによって行われる、請求項16に記載の方法。
- IL-2受容体のサブユニットがα(CD25)、β又はγサブユニットである、請求項18に記載の方法。
- 工程(b)が、IL-2受容体とその同族タンパク質との相互作用を阻害することによって行われる、請求項16に記載の方法。
- IL-2受容体とその同族タンパク質との相互作用の阻害が、IL-2受容体のαサブユニットを下方制御することによって、又はβ及びγサブユニットを上方制御することによって起こる、請求項20に記載の方法。
- IL-2受容体とその同族タンパク質との相互作用の阻害が、抗CD25抗体とともに細胞をインキュベートすることによって起こる、請求項20に記載の方法。
- 工程(b)が、変異体IL-2配列の発現及び分泌をコードする核酸でリンパ球を形質導入することによって行われる、請求項16に記載の方法。
- 請求項16~23のいずれか一項によって得られる細胞の組成物。
- がんの治療を必要とする対象においてがんを治療する方法であって、セントラルメモリー表現型を有するリンパ球を投与することを含み、
a.対象からリンパ球の集団を取得することと;
b.該リンパ球中でβ/γ二量体IL-2受容体を活性化することによってリンパ球集団を拡大増殖させることと;
c.治療有効投与量の、工程(b)からのリンパ球を対象に投与することと;
を含む、上記方法。 - β/γ二量体IL-2受容体を活性化することが、該リンパ球を変異体IL-2とともにインキュベートすることを含む、請求項25に記載の方法。
- β/γ二量体IL-2受容体を活性化することが、変異体IL-2をコードするヌクレオチド配列を該リンパ球中に導入することを含む、請求項25に記載の方法。
- β/γ二量体IL-2受容体を活性化することが、IL-2受容体のサブユニットβ/γの発現を上方制御するためのヌクレオチド配列を該リンパ球中に導入することと、野生型IL-2とともに該リンパ球をインキュベートすることとを含む、請求項25に記載の方法。
- β/γ二量体IL-2受容体を活性化することが、IL-2受容体のαサブユニットの発現を下方制御するためのヌクレオチド配列を該リンパ球中に導入することと、野生型IL-2とともに該リンパ球をインキュベートすることとを含む、請求項25に記載の方法。
- β/γ二量体IL-2受容体を活性化することが、該リンパ球を野生型IL-2及び抗CD25抗体とともにインキュベートすることを含む、請求項25に記載の方法。
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