JP2022512228A - 別の治療薬と組み合わせた免疫チェックポイント阻害剤による癌の治療方法 - Google Patents

Abstract

免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）による治療に応答しない癌患者を、ＩＣＩによる癌患者の治療に応答して生成された複数の宿主駆動型耐性因子の中から選択された優勢な因子の活性を遮断する薬剤と組み合わせて該ＩＣＩで患者を治療する方法が提供され、これらの因子は、癌患者のＩＣＩによる治療に対する好ましくない応答を予測する倍率変化を有する。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０１８年１２月１３日に出願された非仮米国出願第１６／２１９，２０３号の優先権の利益を主張する。先の出願の開示は、その一部とみなされ、参照によりその全体が本出願の開示に組み込まれる。

本発明は、腫瘍学の分野にあり、特に、別の治療薬と組み合わせた免疫チェックポイント阻害剤による癌患者の治療方法に関する。

臨床腫瘍学の治療に対する主な障害の１つは、初期腫瘍応答が観察される場合でも、腫瘍がしばしば療法に対して耐性を生じることである。多くの研究は、薬剤耐性を促進し、腫瘍の再増殖を説明できる腫瘍細胞の変異および遺伝的異常の寄与に焦点を合わせてきた。しかし、研究は、宿主が癌療法に応答して、腫瘍形成促進および転移促進効果を生成し、それが次に腫瘍の再増殖に寄与し、したがって薬物の抗腫瘍活性を無効にすることを示した（レビューについては、Ｋａｔｚ ａｎｄ Ｓｈａｋｅｄ，２０１５；Ｓｈａｋｅｄ，２０１６を参照されたい）。

抗癌治療に対する宿主媒介応答は、分子反応および／または細胞応答であり得る。化学療法薬で治療すると、宿主の骨髄由来細胞（ＢＭＤＣ）が骨髄区画から動員され、治療された腫瘍にコロニーを形成し、腫瘍の血管新生および癌の再増殖に寄与し、それによって療法に対する耐性を促進する（Ｓｈａｋｅｄ ｅｔ ａｌ．，２００６，２００８）。癌療法はまた、マクロファージおよび抗原提示細胞などの様々な免疫細胞の腫瘍形成促進活性化を誘発する（Ｂｅｙａｒ－Ｋａｔｚ ｅｔ ａｌ．，２０１６；Ｄｅ Ｐａｌｍａ ａｎｄ Ｌｅｗｉｓ，２０１３；Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．２０１２；Ｍａ ｅｔ ａｌ．，２０１３）。全体として、これらの前述の研究は、異なる抗癌治療に対する宿主媒介の分子および細胞応答が、免疫細胞の活性化または養成、ならびに様々な腫瘍形成促進因子の分泌を伴うことを示している。これらの併用効果は、腫瘍の再増殖および療法への耐性に寄与する。この比較的新しい現象は、癌の進行および癌療法に対する耐性を理解する上でパラダイムシフトをもたらした。

最近、新しい治療法である免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）を使用した免疫療法が、癌療法に革命をもたらしている。このような免疫調節薬は、黒色腫、前立腺癌、非小細胞肺癌、腎細胞癌、およびまたいくつかの血液悪性腫瘍などの進行性悪性腫瘍（ステージＩＶを含む）の治療に目覚ましい成功を収めている（Ｐｏｓｔｏｗ ｅｔ ａｌ．，２０１５）。ヒトの免疫系は癌性細胞に対する応答を認識して開始することができるが、この応答は腫瘍由来の阻害によって回避されることが多く、免疫寛容をもたらす。これに関して、腫瘍抗原特異的ＣＤ８^＋細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）およびやナチュラルキラー（ＮＫ）細胞などの腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）は、腫瘍微小環境にコロニーを形成することが判明している（Ｇａｊｅｗｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，２０１３）。しかし、腫瘍部位では、それらは腫瘍細胞に対して作用する能力を完全に欠いている（Ｏｓｔｒａｎｄ－Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ ａｎｄ Ｓｉｎｈａ，２００９）。これは、癌細胞、間質細胞、または骨髄由来抑制細胞（ＭＤＳＣ）および制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）などの他の抑制免疫細胞によって分泌される因子の直接的な阻害効果によるものである（Ｍａｋｋｏｕｋ ａｎｄ Ｗｅｉｎｅｒ，２０１５）。例えば、ＩＬ－１０は様々な種類の癌で頻繁に上方制御され、免疫系を抑制することが示された（Ｓａｔｏ ｅｔ ａｌ．，２０１１）。したがって、腫瘍細胞に対する免疫系を負に調節する分子を特定することは、腫瘍に対する免疫細胞の活性化を支援する免疫調節薬の開発につながる。

特に興味深いのは、ＣＴＬＡ－４、ＰＤ－１およびそのリガンドであるＰＤ－Ｌ１などの免疫チェックポイントタンパク質である。これらのチェックポイントタンパク質は、腫瘍細胞または他の免疫細胞によって発現され、ＣＴＬの疲弊に寄与する（Ｐｏｓｔｏｗ ｅｔ ａｌ．，２０１５；Ｔｏｐａｌｉａｎ ｅｔ ａｌ．，２０１５）。具体的には、それらは免疫応答を阻止し、腫瘍細胞に対するＴ細胞殺傷効果を阻害する。そのため、免疫抑制効果を阻害するためにチェックポイント阻害剤が開発されている。現在、免疫チェックポイントＣＴＬＡ－４およびＰＤ－１またはそのリガンドＰＤ－Ｌ１をブロックする抗体が開発されている（Ｐａｒｄｏｌｌ，２０１２）。これらのＩＣＩは現在、診療所で様々な悪性腫瘍の治療に使用されており、いくつかの有望で目覚ましい成功を収めている（Ｒｏｍａｎｏ ａｎｄ Ｒｏｍｅｒｏ，２０１５）。しかしながらＩＣＩは、癌患者の限られた部分（約１０～２０％）に対してのみ治療的有用性を示している。例えば、ＣＴＬＡ－４遮断抗体であるイピリムマブの臨床試験からのプールされたデータは、臨床応答の期間が約３年であり、最大１０年続く可能性があることを明らかにした。しかしながら、この劇的な治療効果は、一部の患者（約２０％）でのみ観察されている。したがって、患者の大多数は、このような治療に対して固有の耐性メカニズムを呈している。依然として、ＩＣＩに応答する患者の部分母集団を定義する分子的側面は完全には明らかではあない。腫瘍細胞によるＰＤ－Ｌ１発現、遺伝子変異量（ｍｕｔａｔｉｏｎａｌ ｂｕｒｄｅｎ）、リンパ球浸潤などのマーカーが、ＩＣＩ免疫療法に応答する癌患者を予測できることが示唆されている。しかしながら、これらの前述のバイオマーカーは、ＩＣＩ免疫療法に対する腫瘍の応答性またはＩＣＩに対する患者の耐性と常に相関しているわけではない。したがって、追加の可能なメカニズムは未だ不明である。

両方とも２０１８年６月４日に出願され、それぞれＷＯ２０１８／２２５０６２およびＷＯ２０１８／２２５０６３として公開された本出願人の国際特許出願Ｎｏ．ＰＣＴ／ＩＬ２０１８／０５０６０８およびＮｏ．ＰＣＴ／ＩＬ２０１８／０５０６０９において（その内容全体が、参照により本明細書に組み込まれる）、癌療法による癌治療に対する個別化された応答を予測する方法は、該癌療法に応答して癌患者によって循環に誘発される複数の因子／バイオマーカー（「宿主応答」）の特定および参照レベルと比較して、複数の因子のうちの１つ以上のそれぞれのレベルの変化が、該癌療法による治療に対する癌患者の好ましいか、または好ましくない応答をどのように予測するかを決定することを記載した。

有望なＩＣＩ免疫療法様式を含む癌療法のすべての様式に対する腫瘍耐性に寄与する宿主媒介性の細胞および分子メカニズムを明らかにすることが非常に望ましいであろう。これにより、そのような望ましくない宿主の効果を阻止する戦略の開発が可能になり、治療結果が改善され、癌療法に対する耐性を遅延させるであろう。

本発明は、癌療法に応答して、癌患者（「宿主」）が免疫チェックポイント阻害剤（以降「ＩＣＩ」）による癌免疫療法に対する一組の宿主駆動型耐性因子を生成し、宿主循環に誘発することができ、これがＩＣＩによる患者治療の有効性を制限または打ち消す可能性があり得ることを示す、本出願の背景セクションにおいて前述した以前の研究に基づく。これらの因子の決定により、ＩＣＩによる治療に対する患者の好ましいか、または好ましくない応答の個別化された形式での予測が可能になる。本明細書で互換的に「因子」または「バイオマーカー」と表示されるこれらの因子は、主にサイトカイン、ケモカイン、成長因子、可溶性受容体、酵素、および異なる器官または腫瘍微小環境のいずれかで、患者が治療されるＩＣＩによる癌療法に応答して、宿主細胞によって産生される他の分子である因子である。

したがって、一態様では、本発明は、癌患者を免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）で治療する方法を提供し、この方法は、以下の工程：
（ｉ）該ＩＣＩによる治療セッション後の時点で癌患者から得られた血漿、全血、血清、または末梢血単核球から選択された血液試料に対してアッセイを実施して、ＩＣＩによる治療に応答して、宿主（「癌患者」）によって駆動される複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のレベルを決定する工程であって、該複数の因子のうちの１つ以上が、個別化された形態で、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の応答性または非応答性を促進する、工程と、
（ｉｉ）ＩＣＩによる該治療セッションの前の時点で癌患者から得られた、工程（ｉ）の血液試料と同じ種類の血液試料中の該因子のそれぞれのレベルを決定することによって、工程（ｉ）の複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のそれぞれの基準レベルを得る工程と、
（ｉｉｉ）工程（ｉ）の各宿主駆動型耐性因子のレベルを同じ因子について工程（ｉｉ）の基準レベルと比較することによって、工程（ｉ）の複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のそれぞれについての倍率変化を確立する工程と、
（ｉｖ）工程（ｉ）の複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された倍率変化に基づいて、癌患者が該ＩＣＩによる治療に対して好ましいか、または好ましくない応答を有することを決定する工程と、
（ｉｖａ）複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された倍率変化に基づいて、癌患者が該ＩＣＩによる治療に対して好ましくない応答を有する場合、該好ましくない応答を示している倍率変化を示す１つ以上の宿主駆動型耐性因子の中で、優勢な因子を選択し、治療有効量のＩＣＩと共に、選択された優勢宿主駆動型耐性因子（本明細書では「優勢な因子」）またはその受容体の活性を遮断する治療有効量の薬剤で患者を治療する工程、あるいは
（ｉｖｂ）複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について（ｉｉｉ）で確立された倍率変化に基づいて、癌患者が該ＩＣＩによる治療に対して好ましい応答を有する場合、ＩＣＩ単独による癌患者の治療を継続する工程と、を含む。

ある特定の実施形態では、本発明は、免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）による治療に応答しない癌患者の治療のための方法に関し、この方法は、癌患者に、治療有効量のＩＣＩを、治療有効量の、優勢な因子またはその受容体の活性を遮断する薬剤と組み合わせて、癌患者に投与することを含み、優勢な因子は、ＩＣＩによる癌患者の治療に応答して生成される複数の宿主駆動型耐性因子の中から選択され、複数の宿主駆動型耐性因子が、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の好ましくない応答を予測する倍率変化を有し、倍率変化が、（ｉ）ＩＣＩによる治療セッション後に癌患者から得られた、血漿、全血、血清または末梢血単核球から選択される血液試料中の各宿主駆動型耐性因子のレベルを、（ｉｉ）ＩＣＩによる該治療セッション前に癌患者から得られた、（ｉ）と同じ種類の血液試料からの同じ因子について得られた基準レベルと比較することによって確立される。好ましくは、工程（ｉ）および（ｉｉ）の血液試料は、両方とも血漿である。

ある特定の実施形態では、本発明は、癌の治療で、該治療に応答しない患者で使用するための免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）に関し、治療有効量のＩＣＩを、優勢な因子、またはその受容体の活性を遮断する、有効量の薬剤と組み合わせて投与することを含み、優勢な因子は、ＩＣＩによる癌患者の治療に応答して生成される複数の宿主駆動型耐性因子の中から選択され、複数の宿主駆動型耐性因子が、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の好ましくない応答を予測する倍率変化を有し、倍率変化が、（ｉ）ＩＣＩによる治療セッション後に癌患者から得られた、血漿、全血、血清または末梢血単核球から選択される血液試料中の各宿主駆動型耐性因子のレベルを、（ｉｉ）ＩＣＩによる治療セッション前に癌患者から得られた、（ｉ）と同じ種類の血液試料からの同じ因子について得られた基準レベルと比較することによって確立される。好ましくは、工程（ｉ）および（ｉｉ）の血液試料は、両方とも血漿である。

乳癌のマウスモデルにおける原発腫瘍の増殖および生存に対するＭＭＰ９の遮断の効果を示している。図１Ａは、抗ＰＤ－Ｌ１とＭＭＰ－２／ＭＭＰ－９阻害剤ＳＢ－３ＣＴとの組み合わせで治療されたマウスが、ビヒクル、抗ＰＤ－Ｌ１またはＳＢ－３ＣＴ単独で治療されたマウスと比較して腫瘍サイズの縮小を呈することを示している。図１Ｂは、最後の実験日である２７日目の腫瘍体積を示している。図１Ｃは、他の治療群と比較して、併用療法で治療されたマウスのより良好な生存を示している。 乳癌のマウスモデルにおける原発腫瘍の増殖および生存に対するＭＭＰ９の遮断の効果を示している。図１Ａは、抗ＰＤ－Ｌ１とＭＭＰ－２／ＭＭＰ－９阻害剤ＳＢ－３ＣＴとの組み合わせで治療されたマウスが、ビヒクル、抗ＰＤ－Ｌ１またはＳＢ－３ＣＴ単独で治療されたマウスと比較して腫瘍サイズの縮小を呈することを示している。図１Ｂは、最後の実験日である２７日目の腫瘍体積を示している。図１Ｃは、他の治療群と比較して、併用療法で治療されたマウスのより良好な生存を示している。 乳癌のマウスモデルにおける原発腫瘍の増殖および生存に対するＭＭＰ９の遮断の効果を示している。図１Ａは、抗ＰＤ－Ｌ１とＭＭＰ－２／ＭＭＰ－９阻害剤ＳＢ－３ＣＴとの組み合わせで治療されたマウスが、ビヒクル、抗ＰＤ－Ｌ１またはＳＢ－３ＣＴ単独で治療されたマウスと比較して腫瘍サイズの縮小を呈することを示している。図１Ｂは、最後の実験日である２７日目の腫瘍体積を示している。図１Ｃは、他の治療群と比較して、併用療法で治療されたマウスのより良好な生存を示している。 大腸癌のマウスモデルにおける原発腫瘍の増殖および生存に対する宿主由来のアンフィレグリンの遮断の効果を示している。図２Ａ～２Ｂは、抗ＰＤ－Ｌ１、抗アンフィレグリン抗体（抗ＡＲＥＧ）、または抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＡＲＥＧとの併用療法で治療されたマウスの腫瘍体積を示している。図２Ｃは、他の治療群と比較して、併用療法で治療されたマウスのより良好な生存を示しているカプラン・マイヤー曲線である。 大腸癌のマウスモデルにおける原発腫瘍の増殖および生存に対する宿主由来のアンフィレグリンの遮断の効果を示している。図２Ａ～２Ｂは、抗ＰＤ－Ｌ１、抗アンフィレグリン抗体（抗ＡＲＥＧ）、または抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＡＲＥＧとの併用療法で治療されたマウスの腫瘍体積を示している。図２Ｃは、他の治療群と比較して、併用療法で治療されたマウスのより良好な生存を示しているカプラン・マイヤー曲線である。 大腸癌のマウスモデルにおける原発腫瘍の増殖および生存に対する宿主由来のアンフィレグリンの遮断の効果を示している。図２Ａ～２Ｂは、抗ＰＤ－Ｌ１、抗アンフィレグリン抗体（抗ＡＲＥＧ）、または抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＡＲＥＧとの併用療法で治療されたマウスの腫瘍体積を示している。図２Ｃは、他の治療群と比較して、併用療法で治療されたマウスのより良好な生存を示しているカプラン・マイヤー曲線である。 抗ＰＤ－Ｌ１または抗ＣＴＬＡ－４による治療後のＩＬ－６発現を示している。 抗ＰＤ－Ｌ１による治療後に誘発された宿主由来のＩＬ－６を遮断することの、原発腫瘍の増殖およびマウスの生存への影響を示している。図４Ａは、対照マウスまたは抗ＰＤ－Ｌ１または抗ＩＬ－６のみで治療されたマウスと比較して、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との組み合わせで治療されたマウスにおける腫瘍増殖の阻害を示している。図４Ｂは図４Ａに相当するが、個々の動物の腫瘍増殖を示し、図４Ｃは、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との両方の併用治療も他の治療群と比較してより良好な生存をもたらしたことを示している。 抗ＰＤ－Ｌ１による治療後に誘発された宿主由来のＩＬ－６を遮断することの、原発腫瘍の増殖およびマウスの生存への影響を示している。図４Ａは、対照マウスまたは抗ＰＤ－Ｌ１または抗ＩＬ－６のみで治療されたマウスと比較して、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との組み合わせで治療されたマウスにおける腫瘍増殖の阻害を示している。図４Ｂは図４Ａに相当するが、個々の動物の腫瘍増殖を示し、図４Ｃは、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との両方の併用治療も他の治療群と比較してより良好な生存をもたらしたことを示している。 抗ＰＤ－Ｌ１による治療後に誘発された宿主由来のＩＬ－６を遮断することの、原発腫瘍の増殖およびマウスの生存への影響を示している。図４Ａは、対照マウスまたは抗ＰＤ－Ｌ１または抗ＩＬ－６のみで治療されたマウスと比較して、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との組み合わせで治療されたマウスにおける腫瘍増殖の阻害を示している。図４Ｂは図４Ａに相当するが、個々の動物の腫瘍増殖を示し、図４Ｃは、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との両方の併用治療も他の治療群と比較してより良好な生存をもたらしたことを示している。 抗ＣＴＬＡ－４による治療後に誘発された宿主由来のＩＬ－６を遮断することの、原発腫瘍の増殖および生存への影響を示している。ＢＡＬＢ／ｃマウスを抗ＣＴＬＡ－４で治療すると、腫瘍増殖が減少し（図５Ａ）、対照マウスと比較して生存率が向上し（図５Ｂ）、これらの効果は、両方の抗ＣＴＬＡ－４と抗ＩＬ－６抗体の両方による併用治療によってさらに改善された（図５Ａ～５Ｂ）。 抗ＣＴＬＡ－４による治療後に誘発された宿主由来のＩＬ－６を遮断することの、原発腫瘍の増殖および生存への影響を示している。ＢＡＬＢ／ｃマウスを抗ＣＴＬＡ－４で治療すると、腫瘍増殖が減少し（図５Ａ）、対照マウスと比較して生存率が向上し（図５Ｂ）、これらの効果は、両方の抗ＣＴＬＡ－４と抗ＩＬ－６抗体の両方による併用治療によってさらに改善された（図５Ａ～５Ｂ）。

本発明の方法を説明する前に、本発明は、本明細書に記載される特定の方法論およびプロトコルに限定されないことを理解されたい。本明細書で使用される用語は、本発明の特定の実施形態を説明することのみを目的としており、他に定義されない場合、添付の特許請求の範囲に記載される本発明の範囲を限定することを意図しないことも理解されたい。

本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、文脈により明らかに別の意味が指示されない限り、複数の参照を含むことにも留意されなければならない。

本明細書で使用される場合、「癌療法」という用語は、「癌療法様式（ｃａｎｃｅｒ－ｍｏｄａｌｉｔｙ ｔｈｅｒａｐｙ）」という用語と交換可能に使用されてもよく、複数の参照、すなわち、単一の療法様式または２つ以上の療法様式の組み合わせを含む。

本明細書で使用される場合、「誘発される」、「駆動される」および「生成される」という用語は、癌治療に応答して癌患者によって循環に誘発される因子（「宿主応答」）を示すために交換可能に使用される。

癌療法において、治療のサイクルは、薬物がある時点で患者に投与され（例えば、１日または２日にわたる注射）、その後、治療がないいくらかの時間（例えば、１、２、または３週間）があることを意味する。本明細書で使用される場合、「治療セッション」は、治療サイクルの開始時にＩＣＩが患者に投与される「ある時点」を指す。治療と休止時間は、１つの「治療サイクル」を構成する。患者がサイクルの終わりに達すると、再び次のサイクルを開始する。一連の治療サイクルは「コース」と呼ばれる。

本明細書で使用される場合、「免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）」という用語は、単一のＩＣＩ、ＩＣＩの組み合わせ、およびＩＣＩと別の癌療法との組み合わせを指す。ＩＣＩは、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、完全ヒト抗体、融合タンパク質、またはこれらの組み合わせであり得る。

一態様では、本発明は、癌患者を免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）で治療する方法を提供し、この方法は、以下の工程：
（ｉ）該ＩＣＩによる治療セッション後の時点で癌患者から得られた血漿、全血、血清、または末梢血単核球から選択された血液試料に対してアッセイを実施して、ＩＣＩによる治療に応答して、宿主（「癌患者」）によって駆動される複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のレベルを決定する工程であって、該複数の因子のうちの１つ以上が、個別化された形態で、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の応答性または非応答性を促進する、工程と、
（ｉｉ）ＩＣＩによる該治療セッションの前の時点で癌患者から得られた、工程（ｉ）の血液試料と同じ種類の血液試料中の該因子のそれぞれのレベルを決定することによって、工程（ｉ）の複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のそれぞれの基準レベルを取る工程と、
（ｉｉｉ）工程（ｉ）の各宿主駆動型耐性因子のレベルを同じ因子について工程（ｉｉ）の基準レベルと比較することによって、工程（ｉ）の複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のそれぞれについての倍率変化を確立する工程と、
（ｉｖ）工程（ｉ）の複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された倍率変化に基づいて、癌患者が該ＩＣＩによる治療に対して好ましいか、または好ましくない応答を有することを決定する工程と、
（ｉｖａ）複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された倍率変化に基づいて、癌患者が該ＩＣＩによる治療に対して好ましくない応答を有する場合、該好ましくない応答を示している倍率変化を示す１つ以上の宿主駆動型耐性因子の中で、優勢な因子を選択し、治療有効量のＩＣＩと共に、選択された優勢宿主駆動型耐性因子（本明細書では「優勢な因子」）またはその受容体の活性を遮断する治療有効量の薬剤で患者を治療する工程、あるいは
（ｉｖｂ）複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について（ｉｉｉ）で確立された倍率変化に基づいて、癌患者が倍ＩＣＩによる治療に対して好ましい応答を有する場合、ＩＣＩ単独による癌患者の治療を継続する工程と、を含む。

癌患者の「好ましい応答」は、癌患者のＩＣＩによる治療に対する「応答性」を示し、すなわち、ＩＣＩと応答性がある癌患者の治療は、腫瘍退縮、腫瘍縮小もしくは腫瘍壊死、免疫系による抗腫瘍応答などの望ましい臨床転帰をもたらし、腫瘍の再発、腫瘍の増殖もしくは腫瘍の転移を防止または遅延する。この場合、上記の工程（ｉｖｂ）で定義されているように、ＩＣＩ単独で応答性がある癌患者の治療を継続することが可能である。

癌患者の「好ましくない応答」は、腫瘍形成促進性、例えば血管新生促進性、炎症誘発性／走化性もしくは増殖性成長因子、または転移促進因子であり得る宿主駆動型耐性因子の誘発による、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の「非応答性」を示し、したがってＩＣＩと非応答性の癌患者の治療は、望ましい臨床転帰をもたらさず、腫瘍の拡大、再発、および転移などの望ましくない転帰をもたらすであろう。望ましい臨床転帰を達成するために、工程（ｉｖａ）で上記で定義された優勢な因子を遮断し、ＩＣＩと選択された優勢な因子の活性を遮断する治療薬との組み合わせで非応答性の癌患者を治療する必要がある。

したがって、一実施形態では、本発明は、免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）による治療に応答しない癌患者の治療のための方法に関し、この方法は、癌患者に、治療有効量のＩＣＩを、優勢な因子、またはその受容体の活性を遮断する、有効量の薬剤と共に、癌患者に投与することを含み、優勢な因子は、ＩＣＩによる癌患者の治療に応答して生成される複数の宿主駆動型耐性因子の中から選択され、複数の宿主駆動型耐性因子が、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の好ましくない応答を予測する倍率変化を有し、倍率変化が、（ｉ）ＩＣＩによる治療セッション後に癌患者から得られた、血漿、全血、血清または末梢血単核球から選択される血液試料中の各宿主駆動型耐性因子のレベルを、（ｉｉ）ＩＣＩによる治療セッション前に癌患者から得られた、（ｉ）と同じ種類の血液試料からの同じ因子について得られた基準レベルと比較することによって確立される。

好ましい実施形態では、工程（ｉ）および（ｉｉ）の血液試料は、両方とも血漿である。

本発明の特定の実施形態では、ＩＣＩによる治療セッションは、複数の治療セッションのうちの１つである。ある特定の実施形態では、ＩＣＩによる複数の治療セッションのうちの１つは、該ＩＣＩによる最初の治療セッションであり、工程（ｉ）の血液試料は、該最初の治療セッション後、約２０、２４、３０、３６、４０、４８、５０、６０、７２時間以上（最大１週間以上、最大２週間以上、または最大３週間以上を含む）で癌患者から得られ、および工程（ｉｉ）の基準血液試料は、ＩＣＩによる該最初の治療セッション前、約７２時間以下を含む時点（約６０、５０、４８、４０、３６、３０、２４または２０時間以下を含む）、またはＩＣＩによる該最初の治療セッションの直前を含む時点で癌患者から得られる。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩによる癌患者の複数の治療セッションのうちの１つは、ＩＣＩによる治療が開始されるときの最初の治療セッションである。この場合、工程（ｉｉ）の基準／ベースライン試料、好ましくは血漿は、治療を開始する前約７２時間以下を含む時点（約６０、５０、４８、４０、３６、３０、２４または２０時間以下を含む）で、またはＩＣＩによる該最初の治療セッションの直前に癌患者から得られる。次いで、ＩＣＩによる該最初の治療セッション後、約２０、２４、３０、３６、４０、４８、５０、６０、７２時間以上（最大１週間以上、最大２週間以上、または最大３週間以上を含む）で癌患者から得られた血液試料、好ましくは血漿で決定された因子の濃度レベルの間で比較が行われる。

本発明の他の特定の実施形態では、ＩＣＩによる癌患者の治療セッションは、ＩＣＩによる最初の治療セッションではない複数の治療セッションのうちの１つである。この場合、血液試料は、ＩＣＩによる２つの連続する治療セッションの間の任意の時点で前記癌患者から得られ、血液試料が、同時に、工程（ｉ）の血液試料であり、工程（ｉｉ）による基準血液試料が、工程（ｉ）による次のセッションアッセイのためのものある。２つの連続する治療セッションの間の時間は、特定のＩＣＩに対して承認された治療プロトコルに依存し、例えば、ＩＣＩに応じて２週間または３週間であり得、血液試料は、２つの連続したセッションの間の１、２、３、７、１４、または２１日目に採取され得る。

本発明によれば、免疫チェックポイント阻害剤による治療に応答して宿主／癌患者によって生成される複数の因子のレベルは、ＩＣＩによる治療後に患者から得られる血液試料、好ましくは血漿において決定される。次いで、各因子について得られた値（ｐｇ／ｍＬでの因子濃度）が、同じ癌患者からあらかじめ採取された血液試料、好ましくは血漿で測定された同じ因子の濃度のベースラインレベルである基準レベルと比較される（以下「基準／ベースライン試料」）。基準／ベースライン試料と比較される、ＩＣＩによる治療後に癌患者から得られた血液試料で特定された因子のうちの１つ以上のレベルの変化は、各因子についての倍率変化によって定義される。各因子の倍率変化は、因子の治療：基準／ベースライン値の比率を計算することによって決定される。

複数の宿主促進型耐性因子のうちの１つ以上のそれぞれの倍率変化は、その値が因子の約１．５以上である場合、有意かつＩＣＩによる治療に対する癌患者の好ましくない応答を予測するとみなされ、上方制御を意味し、または倍率変化は、その値が０．５以下である場合、有意かつ癌患者の該ＩＣＩによる治療に対する好ましい応答を予測するとみなされ、因子の下方制御を意味する。

本発明によれば、ＩＣＩによる治療に対する癌患者の好ましいか、または好ましくない応答の予測は、宿主促進型耐性因子のうちの１つ以上、任意に２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上、７つ以上、８つ以上、９つ以上、１０個以上、１１個以上、１２個以上、１３個以上、１４個以上、１５個以上、２０個以上、または２５個以上の有意な倍率変化に基づく。

ＩＣＩによる治療に応答して癌患者の循環に誘発される因子／バイオマーカーには、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、酵素、および可溶性受容体などの分子因子が挙げられる。因子は、腫瘍形成促進因子または転移促進因子であり得る。腫瘍形成促進因子は、血管新生促進、炎症誘発性／走化性、または増殖性成長因子であり得る。

ある特定の実施形態では、治療セッションは、治療が開始されたときの、癌患者の複数の治療セッションの最初のセッションである。この場合、比較は、ＩＣＩによる治療を最初に開始した後に癌患者から得られた血液試料、好ましくは血漿で決定された因子と、ＩＣＩによる試料を開始する前に癌患者から得られた基準／ベースライン血液試料、好ましくは血漿で見られる同じ因子との間で行われる。結果は、患者を治療する腫瘍内科医が癌患者の治療を継続するかどうか、または継続する方法を決定するのに役立ち得る。

ある特定の実施形態では、本発明の方法は、ＩＣＩで治療されている癌患者において治療応答を監視するために実施される。この場合、治療セッションは、いくつかの治療セッションのうちの１つであるが、最初の治療セッションではない。結果は、治療を継続するかどうか、または継続する方法を決定する際に、腫瘍内科医を支援するであろう。

ある特定の実施形態では、腫瘍形成促進因子について決定された倍率変化は、癌療法に対する患者の好ましい応答を予測し、決定は、スケジュールされたものと同じＩＣＩで治療を継続することであり得る。

ある特定の実施形態では、腫瘍形成促進因子について決定された倍率変化は、ＩＣＩに対する患者の好ましくない応答を予測する。この場合、腫瘍形成促進因子の特定の生物学的活性に応じて、同じＩＣＩで治療を継続することを決定することができるが、例えば、因子が炎症誘発性である場合は抗炎症薬を治療に追加するか、または因子が血管新生促進性である場合は抗血管新生薬を治療に追加することによって、腫瘍形成因子の生物学的活性を遮断する薬剤を追加してもよい。

免疫チェックポイントは、免疫活性化の調節因子である。それらは、免疫恒常性の維持および自己免疫の予防において重要な役割を果たす。癌では、免疫チェックポイントメカニズムがしばしば活性化されて、発生期の抗腫瘍免疫応答を抑制する。免疫チェックポイント分子は、癌免疫療法の優れた標的とみなされている。免疫チェックポイント分子の遮断を引き起こす免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）は、複数の種類の癌で使用される可能性のある癌免疫療法薬の開発に適した候補とみなされており、すでに使用されているか、開発中である。

免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）薬の開発の標的としての候補である免疫チェックポイントの例としては、ＰＤ－Ｌ１およびＰＤ－Ｌ２の２つのリガンドを有するＰＤ－１（プログラム細胞死１）、ＣＴＬＡ－４（細胞傷害性Ｔリンパ球関連タンパク質４）、Ａ２ＡＲ（アデノシンＡ２Ａ受容体）（別名ＡＤＯＲＡ２Ａ）、ＢＴ－Ｈ３（ＣＤ２７６とも呼ばれる）、ＢＴ－Ｈ４（ＶＴＣＮ１とも呼ばれる）、ＢＴ－Ｈ５、ＢＴＬＡ（ＢおよびＴリンパ球アテニュエーター）（ＣＤ２７２とも呼ばれる）、ＩＤＯ（インドールアミン２，３－ジオキシゲナーゼ）、ＫＩＲ（キラー細胞免疫グロブリン様受容体）、ＬＡＧ－３（リンパ球活性化遺伝子－３）、ＴＤＯ（トリプトファン２，３－ジオキシゲナーゼ）、ＴＩＭ－３（Ｔ細胞免疫グロブリンドメインおよびムチンドメイン３）、ＶＩＳＴＡ（Ｔ細胞活性化のＶドメインＩｇサプレッサー）が挙げられる。

本発明のある特定の実施形態では、ＩＣＩは、ＰＤ－１経路を中和／遮断するＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に対するモノクローナル抗体（ｍＡｂ）である。ある特定の実施形態では、抗ＰＤ－１ｍＡｂは、進行性または切除不能な黒色腫、転移性非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、腎細胞癌（ＲＣＣ）、および頭頸部の再発性扁平上皮癌（ＳＣＣＨ）の治療について承認または試験されたペムブロリズマブ（キートルーダ（Ｋｅｙｔｒｕｄａ）、以前はランブロリズマブと呼ばれていた）である。ある特定の実施形態では、抗ＰＤ－１ｍＡｂは、ニボルマブ（オプジーボ）であり、ＮＳＣＬＣ、ＲＣＣ、黒色腫および結腸直腸癌（ＣＲＣ）について承認または試験されている。ある特定の実施形態では、抗ＰＤ－１ｍＡｂは、非ホジキンリンパ腫、慢性リンパ性白血病、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、および急性骨髄性白血病について承認または試験されたピジリズマブ（ＣＴ００１１）である。ある特定の実施形態では、抗ＰＤ－１ｍＡｂは、ＲＥＧＮ２８１０、ＡＭＰ－２２４、ＭＥＤＩ０６８０、またはＰＤＲ００１である。

本発明のある特定の他の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、ＰＤ－Ｌ１に対するｍＡｂである。ある特定の実施形態では、抗ＰＤ－Ｌ１ｍＡｂは、複数の癌に対して承認されたアテゾリズマブ（テセントリク）、アベルマブ（バベンシオ）、またはデュルバルマブ（インフィンジ）である。アテゾリズマブは、ベバシズマブ、ゲムシタビン、シスプラチン、ドセタキセル、パクリタキセル、ビンフルニンエンチノスタット、ダラツムマブ、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、カルボプラチン、Ｎａｂ－パクリタキセル、ラジウム－２２３ジクロリド、オビヌツズマブなどの１つまたは２つの他の抗癌剤と組み合わせて試験されている。

本発明のある特定の他の実施形態では、ＩＣＩは、ＣＴＬＡ－４に対するｍＡｂ抗体である。ある特定の実施形態では、抗ＣＴＬＡ－４は、進行性／転移性黒色腫および去勢抵抗性前立腺癌について承認または試験されたイピリムマブ（ヤーボイ）である。ある特定の他の実施形態では、抗ＣＴＬＡ－４ｍＡｂは、トレメリムマブ（以前のチシリムマブ）である。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩは、以下の：（ｉ）ＭＧＡ２７１などの抗Ｂ７－Ｈ３、（ｉｉ）エパカドスタットなどの抗ＩＤＯ、（ｉｉｉ）リリルマブなどの抗ＫＩＲ、（ｉｖ）レラトリマブ（ＢＭＳ－９８６０１６）、ＬＡＧ５２５、ＲＥＧＮ３７６７などの抗ＬＡＧ－３、（ｖ）ＴＳＲ０２２またはＭＢＧ４５３などの抗ＴＩＭ－３、および（ｖｉ）ＪＮＪ６１６１０５８８などの抗ＶＩＳＴＡを含む阻害剤である。

ある特定の実施形態では、２つのＩＣＩの組み合わせが本発明に従って使用される。ある特定の実施形態では、組み合わせは、抗ＰＤ－１および抗ＣＴＬＡ－４、例えば、ニボルマブ－イピリムマブおよびＲＥＧＮ２８１０－イピリムマブを含む。ある特定の実施形態では、組み合わせは、抗ＰＤ－Ｌ１および抗ＣＴＬＡ－４、例えば、デュルバルマブ－トレメリムマブを含む。ある特定の実施形態では、組み合わせは、抗ＰＤ－１および抗ＰＤ－Ｌ１、例えば、ニボルマブ－アテゾリムマブを含む。ある特定の実施形態では、組み合わせは、抗ＬＡＧ－３および抗ＰＤ－１、例えば、レラトリマブ－ニボルマブまたはＲＥＧＮ３７６７－ＲＥＧＮ２８１０を含む。ある特定の実施形態では、組み合わせは、抗ＰＤ－１およびＩＤＯ阻害剤、例えば、ペムブロリズマブおよびエパカドスタットならびにニボルマブ－エパカドスタットを含む。

ＣＤ１３７（４－１ＢＢ）、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、グルココルチコイド誘発性ＴＮＦＲ（ＧＩＴＲ、ＣＤ３５７）、ＣＤ４０などの共刺激分子は、活性化Ｔ細胞、活性化ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、Ｔｒｅｇ、およびその他の免疫細胞によって発現される。免疫チェックポイントＰＤ－１の阻害およびアゴニスト抗体による共刺激分子の刺激は、免疫応答を強化するための補完的な戦略であり、したがって、組み合わせて使用するための強力な理論的根拠を提供する。したがって、ある特定の実施形態では、本発明は、ＩＣＩと、抗ＩＣＯＳ ｍＡｂ、例えば、ＭＥＤＩ－５７０またはＢＭＳ－９８６２２６；抗ＯＸ４０ ｍＡｂ、例えば、ＭＯＸＲ０９１６、ＫＨＫ４０８３、ＭＥＤＩ０５６２またはＭＥＤＩ６４６９；抗ＣＤ４０ ｍＡｂ；ならびに抗ＣＤ１３７（４－ＩＢＢ）ｍＡｂ例えば、ウレルマブまたはウトミルマブを含むＴ細胞共刺激分子に対するアゴニストｍＡｂとの組み合わせを包含する。

本発明の特定の実施形態では、ＩＣＩは、化学療法、標的癌療法、および放射線療法を含む１つ以上の従来の癌療法と組み合わせて投与される。ＩＣＩと放射線療法の組み合わせは、複数の臨床試験で試験されている。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩは、化学療法薬の単一または組み合わせであり得る併用化学療法、またはメトロノミック化学療法で使用される。ペムブロリズマブ＋カルボプラチン＋パクリタキセル、ペムブロリズマブ＋ゲムシタビン＋ドセタキセル、ニボルマブ＋ゲムシタビン＋シスプラチン、イピリムマブ＋カルボプラチン＋パクリタキセルの組み合わせ、およびその他の組み合わせが試験されたか、または臨床試験で試験されている。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩ療法は、「分子標的療法」と呼ばれることもある標的癌療法と組み合わせて使用される。ある特定の実施形態では、標的療法薬は、ボルテゾミブ（ベルケイド）、スニチニブ（スーテント）などの小分子である。ある特定の実施形態では、標的療法薬は、ベバシズマブ（アバスチン）、パニツムマブ（ベクチビックス）、ダラツムマブ（ダルザレックス）などのモノクローナル抗体である。ある特定の実施形態では、抗ＰＤ－１は、ＲＣＣの治療について試験されたスニチニブ（スーテント）またはパゾパニブ（ヴォトリエント）と組み合わせて、または抗ＣＴＬＡ－４イピリムマブとＢＲＡＦ阻害剤ダブラフェニブ（タフィンラー）との組み合わせで使用される。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩ療法は、抗血管新生療法、例えば、ＶＥＧＦを標的とするｍＡｂと組み合わせて使用される。したがって、組み合わせはイピリムマブとベバシズマブの組み合わせであってもよい。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩ療法は、癌ワクチン、免疫調節剤、免疫刺激性サイトカイン、例えば、ＧＭ－ＣＳＦ、ＩＦＮ－α、ＴＧＦ－β、ＩＬ－１０、ＩＬ－２、ＩＬ－１２、ＩＬ－１５、ＩＬ－１８、およびＩＬ－２１、または腫瘍溶解性ウイルスなどの他の免疫療法と組み合わせて使用される。ある特定の実施形態では、抗ＣＴＬＡ－４イピリムマブまたは抗ＰＤ－１ペムブロリズマブは、腫瘍溶解性ウイルスのタリモジーン・ラハーパレプベック（ｔａｌｉｍｏｇｅｎｅ ｌａｈｅｒｐａｒｅｐｖｅｃ）（Ｔ－ＶＥＣ）と組み合わせて使用される。

本発明によれば、癌療法は、膀胱癌、骨癌、乳癌、脳癌、子宮頸癌、大腸癌、大腸直腸癌、食道癌、胃癌、胃腸癌、神経膠芽細胞腫、頭頚部癌、頭頚部扁平上皮癌、肝細胞癌、腎臓癌、肝臓癌、小細胞肺癌および非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）を含む肺癌、黒色腫、鼻咽頭癌、卵巣癌、膵臓癌、陰茎癌、前立腺癌、皮膚癌、精巣癌、胸腺癌、甲状腺癌、泌尿生殖器癌、もしくは子宮癌、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫ならびに肉腫を含む、原発性または転移性癌が挙げられるが、これらに限定されない、疾患の全てのステージにおける、原発性または転移性の全ての種類の癌に関するものである。

ある特定の実施形態では、癌は白血病であり、骨髄およびリンパ系を含む体の造血組織の癌である。ある特定の実施形態では、白血病は、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）または慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）から選択される。ある特定の実施形態では、癌は多発性骨髄腫である。

ある特定の実施形態では、癌は非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）である。ある特定の実施形態では、癌は進行した（ステージＩＩＩまたはＩＶ）または転移性のＮＳＣＬＣである。

ある特定の実施形態では、癌は、転移性黒色腫、腎細胞癌（ＲＣＣ）、古典的ホジキンリンパ腫（ＨＬ）、膀胱癌、メルケル細胞癌、頭頸部癌、またはミスマッチ修復機構欠損を伴う固形腫瘍である。

癌患者への免疫チェックポイント阻害剤の投与後に本発明の方法によって特定された宿主駆動型因子／バイオマーカーは、（ｉ）癌患者、および（ｉｉ）免疫チェックポイント阻害剤に特異的である。これは、癌患者に関する特定の情報を提供し、診断、治療の計画、治療がどの程度良く機能しているかの確認、または予後診断に役立つ個別化された形式での予測を可能にする「宿主応答」である。

治療が単一のＩＣＩで行われる場合、宿主／患者によって生成される因子は、この特定のＩＣＩに特異的である。治療が２つのＩＣＩの組み合わせで行われる場合、宿主／患者によって生成される因子は、このＩＣＩの組合せに特異的である。治療がＩＣＩと別の癌療法との組み合わせで行われる場合、宿主／患者によって生成される因子はこの組み合わせに特異的である。

ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、酵素または可溶性受容体などの分子因子である。これらの因子のいくつかは、腫瘍に影響を及ぼし、腫瘍の血管新生および癌の再増殖に寄与する細胞を誘発し、それによって使用される療法に対する耐性を促進する。このような細胞の例には、サイトカインならびにＧ－ＣＳＦおよびＳＤＦ－１αなどの成長因子によって骨髄区画から動員され、その後、治療された腫瘍にコロニーを形成し、癌療法耐性、特に、排他的ではなく、化学療法耐性を促進する骨髄由来細胞（ＢＭＤＣ）が挙げられる。他の細胞は、マクロファージおよび抗原提示細胞などの免疫細胞、または腫瘍の進行に極めて重要な役割を果たす腫瘍微小環境内の間質細胞である。

癌療法に対する腫瘍の耐性に寄与する宿主媒介性の細胞および分子メカニズムは、特定の癌療法によって宿主で生成される因子および／または細胞の生物学的機能に基づいている。各因子は、１つ以上の生物学的機能または活性を示し得る。

ある特定の実施形態では、因子は腫瘍形成性であり、腫瘍増殖に寄与する。ある特定の実施形態では、腫瘍形成因子は血管新生促進性である。他の実施形態では、腫瘍形成因子は炎症誘発性／走化性である。さらに他の実施形態では、腫瘍形成因子は増殖性成長因子である。

特定の実施形態では、血管新生促進因子には、ＡＮＧ（アンギオゲニン）、アンジオポエチン－１、アンジオポエチン－２、ｂＮＧＦ（塩基性神経成長因子）、カテプシンＳ、ガレクチン－７、ＧＣＰ－２（顆粒球走化性タンパク質、ＣＸＣＬ６）、Ｇ－ＣＳＦ（顆粒球コロニー刺激因子）、ＧＭ－ＣＳＦ（顆粒球－マクロファージコロニー刺激因子、コロニー刺激因子２、ＣＳＦ２としても知られている）、ＰＡＩ－１（プラスミノーゲン活性化因子阻害剤－１）、ＰＤＧＦ－ＡＡ、ＰＤＧＦ－ＢＢ、ＰＤＧＦ－ＡＢから選択されるＰＤＧＦ（血小板由来成長因子）、ＰｌＧＦ（またはＰＬＧＦ、胎盤成長因子）、ＰｌＧＦ－２、ＳＣＦ（幹細胞因子）、ＳＤＦ－１（ＣＸＣＬ１２、間質細胞由来因子－１）、Ｔｉｅ２（またはＴＩＥ－２、内皮受容体チロシンキナーゼ）、ＶＥＧＦ－Ａ、ＶＥＧＦ－ＣおよびＶＥＧＦ－Ｄ、ＶＥＧＦ－Ｒ１、ＶＥＧＦ－Ｒ２、ＶＥＧＦ－Ｒ３から選択されるＶＥＧＦ（血管内皮成長因子）が挙げられるが、これらに限定されない。

特定の実施形態では、炎症誘発性および／または走化性因子には、６Ｃｋｉｎｅ（ＣＣＬ２１、エクソダス－２）、アンジオポエチン－１、アンジオポエチン－２、ＢＬＣ（ＣＸＣＬ１３、Ｂリンパ球化学誘引物質またはＢ細胞誘引ケモカイン１（ＢＣＡ－１）、ＢＲＡＫ（ＣＸＣＬ１４）、ＣＤ１８６（ＣＸＣＲ６）、ＥＮＡ－７８（ＣＸＣＬ５、上皮細胞由来好中球活性化ペプチド７８、）、エオタキシン－１（ＣＣＬ１１）、エオタキシン－２（ＣＣＬ２４）、エオタキシン－３（ＣＣＬ２６）、ＥｐＣＡＭ（上皮細胞接着分子）、ＧＤＦ－１５（成長分化因子１５、マクロファージ阻害サイトカイン－１、ＭＩＣ－１としても知られる）、ＧＭ－ＣＳＦ、ＧＲＯ（成長調節腫瘍遺伝子）、ＨＣＣ－４（ＣＣＬ１６、ヒトＣＣケモカイン４）、Ｉ－３０９（ＣＣＬ１）、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１α、ＩＬ－１β、ＩＬ－１Ｒ４（ＳＴ２）、ＩＬ－２、ＩＬ－２Ｒ、ＩＬ－３、ＩＬ－３Ｒα、ＩＬ－５、ＩＬ－６、ＩＬ－６Ｒ、ＩＬ－７、ＩＬ－８、ＩＬ－８ ＲＢ（ＣＸＣＲ２、インターロイキン８受容体、β）、ＩＬ－１１、ＩＬ－１２、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１２ｐ７０、ＩＬ－１３、ＩＬ－１３ Ｒ１、ＩＬ－１３Ｒ２、ＩＬ－１５、ＩＬ－１５Ｒα、ＩＬ－１６、ＩＬ－１７、ＩＬ－１７Ｃ、ＩＬ－１７Ｅ、ＩＬ－１７Ｆ、ＩＬ－１７Ｒ、ＩＬ－１８、ＩＬ－１８ＢＰａ、ＩＬ－１８Ｒα、ＩＬ－２０、ＩＬ－２３、ＩＬ－２７、ＩＬ－２８、ＩＬ－３１、ＩＬ－３３、ＩＰ－１０（ＣＸＣＬ１０、インターフェロンγ誘発性タンパク質１０）、Ｉ－ＴＡＣ（ＣＸＣＬ１１、インターフェロン誘発性Ｔ細胞アルファ化学誘引物質）、ＬＩＦ（白血病抑制因子）、ＬＩＸ（ＣＸＣＬ５、リポ多糖誘発ＣＸＣケモカイン）、ＬＲＰ６（低密度リポタンパク質（ＬＤＬ）受容体関連タンパク質－６）、ＭａｄＣＡＭ－１（粘膜アドレッシン細胞接着分子１）、ＭＣＰ－１（ＣＣＬ２、単球走化性タンパク質１）、ＭＣＰ－２（ＣＣＬ８）、ＭＣＰ－３（ＣＣＬ７）、ＭＣＰ－４（ＣＣＬ１３）、Ｍ－ＣＳＦ（マクロファージコロニー刺激因子、コロニー刺激因子１（ＣＳＦ１）としても知られる）、ＭＩＦ（マクロファージ遊走阻止因子）、ＭＩＧ（ＸＣＬ９、γインターフェロンによって誘発されるモノカイン）、ＭＩＰ－１γ（ＣＣＬ９、マクロファージ炎症性タンパク質－１γ）、ＭＩＰ－１α（ＣＣＬ３）、ＭＩＰ－１β、ＭＩＰ－１δ（ＣＣＬ１５）、ＭＩＰ－３α（ＣＣＬ２０）、ＭＩＰ－３β（ＣＣＬ１９）、ＭＰＩＦ－１（ＣＣＬ２３、骨髄性前駆細胞阻害因子１）、ＰＡＲＣ（ＣＣＬ１８、肺および活性化調節ケモカイン）、ＰＦ４（ＣＸＣＬ４、血小板因子４）、ＲＡＮＴＥＳ（ＣＣＬ５、ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｎ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ，ｎｏｒｍａｌ Ｔ ｃｅｌｌ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ａｎｄ ｓｅｃｒｅｔｅｄ）、レジスチン、ＳＣＦ、ＳＣＹＢ１６（ＣＸＣＬ１６、小さな誘発性サイトカインＢ１６）、ＴＡＣＩ（膜貫通活性化因子およびＣＡＭＬインタラクター）、ＴＡＲＣ（ＣＣＬ１７、ＣＣ胸腺および活性化関連ケモカイン）、ＴＳＬＰ（胸腺間質リンホポイエチン）、ＴＮＦ－α（腫瘍壊死因子－α）、ＴＮＦ Ｒ１、ＴＲＡＩＬ－Ｒ４（ＴＮＦ関連アポトーシス誘発性リガンド受容体４）、ＴＲＥＭ－１（骨髄細胞で発現する誘発性受容体１）が挙げられるが、これらに限定されない。

ある特定の実施形態では、成長因子には、アクチビンＡ、アンフィレグリン、Ａｘｌ（ＡＸＬ、受容体型チロシンキナーゼ）、ＢＤＮＦ（脳由来神経栄養因子）、ＢＭＰ４（骨形成タンパク質４）、カテプシンＳ、ＥＧＦ（上皮成長因子）、ＦＧＦ－１（線維芽細胞成長因子１）、ＦＧＦ－２（ｂＦＧＦ、塩基性ＦＧＦとしても知られている）、ＦＧＦ－７、ＦＧＦ－２１、フォリスタチン（ＦＳＴ）、ガレクチン－７、Ｇａｓ６（成長停止特異的遺伝子６）、ＧＤＦ－１５、ＨＢ－ＥＧＦ（ヘパリン結合性ＥＧＦ）、ＨＧＦ、ＩＧＦＢＰ－１（インスリン様成長因子結合タンパク質－１）、ＩＧＦＢＰ－３、ＬＡＰ（レイテンシ－関連ペプチド）、ＮＧＦ Ｒ（神経成長因子受容体）、ＮｒＣＡＭ（神経細胞接着分子）、ＮＴ－３（ニューロトロフィン－３）、ＮＴ－４、ＰＡＩ－１、ＴＧＦ－α（形質転換成長因子－α）、ＴＧＦ－β、およびＴＧＦ－β３、ＴＲＡＩＬ－Ｒ４（ＴＮＦ関連アポトーシス誘発リガンド受容体４）が挙げられるが、これらに限定されない。

ある特定の実施形態では、転移促進因子には、ＡＤＡＭＴＳ１（トロンボスポンジンモチーフ１を有するディスインテグリンおよびメタロプロテイナーゼ１）、カテプシンＳ、ＦＧＦ－２、フォリスタチン（ＦＳＴ）、ガレクチン－７、ＧＣＰ－２、ＧＤＦ－１５、ＩＧＦＢＰ－６、ＬＩＦ、ＭＭＰ－９（マトリックスメタロペプチダーゼ９、９２ｋＤａゼラチナーゼまたはゼラチナーゼＢ（ＧＥＬＢ）としても知られる）、プロＭＭＰ９、ＲＡＮＴＥＳ（ＣＣＬ５）、ＳＤＦ－１（間質細胞由来因子－１、ＣＸＣＬ１２としても知られる）およびその受容体ＣＸＣＲ４が挙げられるが、これらに限定されない。

因子はまた、抗腫瘍形成因子、例えば、抗血管新生、抗炎症および／または抗増殖成長因子であってもよい。

ある特定の実施形態では、ＩＣＩに対する宿主応答性を示す循環因子には、ＡＤＡＭＴＳ１、アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＥＧＦ、エオタキシン－２、ＦＧＦ－２１、Ｇａｓ６、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＨＧＦ、ＩＦＮ－ガンマ、ＩＬ－１Ｒアルファ、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＴＡＣＩ、Ｍ－ＣＳＦ、ＭＭＰ－９、ＰＤＧＦ－ＢＢ、プロＭＭＰ９、ＳＣＦが挙げられるが、これらに限定されない。

本発明によれば、抗ＰＤ－１治療に応答して上方制御された因子の多くは、血管新生、炎症、走化性および増殖などの腫瘍形成促進および転移促進プロセスにおける中心的存在である。上方制御された血管新生促進因子には、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、およびＰＤＧＦ－ＢＢが挙げられる。上方制御された炎症誘発性および／または走化性因子には、ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１Ｒα、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３、およびＭ－ＣＳＦが挙げられる。上方制御された増殖性成長因子には、ＦＧＦ－２１ Ｇａｓ６、およびＨＧＦが挙げられる。上方制御された転移促進因子には、ＭＭＰ－９が挙げられる。

本発明によれば、抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して上方制御された因子の多くは、炎症、走化性および増殖などの腫瘍形成促進および転移促進プロセスにおける中心的存在である。上方制御された血管新生促進因子には、Ｇ－ＣＳＦ、およびＳＣＦが挙げられる。上方制御された炎症誘発性および／または走化性因子には、エオタキシン－２、Ｇ－ＣＳＦ、ＩＬ－１ｒａ、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＳＣＦ、およびＴＡＣＩが挙げられる。上方制御された増殖性成長因子には、アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＥＧＦ、およびＨＧＦが挙げられる。上方制御された転移促進因子には、ＡＤＡＭＴＳ１およびプロＭＭＰ９が挙げられる。

本明細書で使用される場合、「優勢な因子」という用語は、生細胞および生物にとって不可欠である生物学的プロセスに影響を与えるシグナル伝達経路の上流にあり得る強力な因子を意味する。これらの生物学的プロセスには、増殖、炎症、転移などが含まれ、最終的に生物学的プロセスの活性化または阻害につながるいくつかのシグナル伝達経路で構成されている。「シグナル伝達経路」は、同じ経路内のタンパク質が互いにシグナルを伝達する一連の事象である。経路の最初のタンパク質がシグナルを受信した後、それは別のタンパク質を活性化し、これが別のタンパク質を活性化するなど、最終的には１つ以上の細胞機能の活性化につながる。

「優勢な因子」は、他の多くの因子／タンパク質と高度に相互作用し、高度に影響を与える重要な因子であり得る。本発明によれば、優勢な因子は、文献に基づいて因子のタンパク質間相互作用を特定するアルゴリズムに基づいて選択される。因子がより多くの相互作用を有する場合、それはハブとして機能し、従ってそれは優勢な因子である。「タンパク質間相互作用」という用語は、シグナル伝達またはタンパク質活性の活性化または阻害をもたらす、２つ以上のタンパク質間の物理的相互作用またはクロストークを指す。「タンパク質ハブ」という用語は、生物学的プロセスにおいて中心的かつ本質的な役割を果たし、したがって、宿主に耐性を与え、癌療法様式による癌患者の治療の有効性を制限または打ち消す可能性がある、高度に接続されたタンパク質を指す。

「遮断する」、「中和する」または「阻害する」という用語は、本明細書では互換的に使用され、選択された優勢な因子がその機能／生物学的活性を発揮するのを防ぐ薬剤の能力を指す。

優勢な因子には、アンフィレグリン、ＥＧＦ、ＥＧＦＲ、ＦＧＦ、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＭＭＰ－９、ＰＤＧＦ、ＴＮＦ－αおよびＶＥＧＦ－Ａが挙げられる。

優勢な因子としてのそれらの必要条件を説明するために、これらの因子のいくつかの特性が、本明細書に提供される。インターロイキン－１β（ＩＬ－１β、ＩＬ－１ｂ）は、マクロファージを含む様々な免疫細胞によって産生されるＩＬ－１ファミリーのサイトカインメンバーである。これは炎症反応の強力なメディエーターであり、細胞増殖およびアポトーシス、ならびに細胞分化などのいくつかの生物学的プロセスに関与していることも知られている。ＩＬ－１ｂは主に、炎症誘発性カスケードを開始するタンパク質として調査された。ＣＡＳＰ１、ＩＬ１ＲＡ、ＩＬ１Ｒ１、ＣＭＡ１、ＩＬ１ＲＢ、ＩＬ１Ａ、ＩＬ１Ｒ２などの酵素と物理的に相互作用し、ＭＡＰＫ８ＩＰ２、ＺＮＦ６７５およびＵＢＥＮ２Ｎと遺伝的に相互作用し、また、Ａ２Ｍ、ＣＸＣＬ８、ＩＬ１８、ＣＡＡＳｐ１、ＩＬ１Ｒ１などと共発現している。したがって、ＩＬ－１ｂは、細胞増殖、アポトーシス、分化、炎症、血管新生など、いくつかの生物学的経路に影響を与える多数のタンパク質との相互作用のハブとして機能する。

別な優勢な因子はインターロイキン－６（ＩＬ－６）であり、これは、主に炎症誘発性因子として作用するだけでなく、時には筋肉細胞によって産生される抗炎症性因子としても作用し、その結果、ＩＬ－１、ＩＬ－１０およびＴＮＦ－αなどの多くの炎症誘発性タンパク質を下方制御するサイトカインである。ＩＬ－６は、骨形成、血液脳関門の破壊、マクロファージの活性化、および自然免疫系への寄与など、多くの生物学的プロセスに関与し、好中球およびＢ細胞の合成を刺激し、障害、ストレスおよびうつ病などの神経活動にも関与する。ＩＬ６は多数のタンパク質と相互作用し、影響を及ぼし、これはＨＲＨ１、ＯＳＭ、ＩＬ６ＳＴ、ＩＬ６Ｒ、およびＺＢＴＢ１６と物理的に相互作用し、ＰＴＰＲＥ、ＣＳＦ３、ＣＣＬ２、ＣＸＣＬ８、ＣＸＣＬ３、ＩＣＡＭ１ ＳＥＬＥ、ＮＦＫＢＩＺなどの多数のタンパク質と共発現されることが見出されている。ＩＬ６は、ＬＲＰＰＲＣ、ＯＳＭ、ＰＴＰＲＥ、ＰＩＡＳ１、およびＩＬ６Ｒなどのタンパク質によって媒介される多くの経路に関与している。そのため、ＩＬ６は、免疫細胞の活動、細胞の発生、および細胞間相互作用に関与する多くの生物学的プロセスの優勢な因子として機能する。

さらに優勢な因子である血管内皮成長因子Ａ（ＶＥＧＦ－Ａ）は、新しい血管の形成を刺激する成長因子である。血管新生（内皮細胞の増殖）ならびに脈管形成（骨髄由来の内皮細胞前駆体およびその分化）の両方に関与している。ＶＥＧＦは、胎児の胚細胞の発達および神経の発達に重要であり、白血球の増殖および分化、炎症、ならびに加齢性黄斑変性症および大多数の癌などのいくつかの疾患に関与している。ＮＲＰ１、ＮＲＰ２、ＫＤＲ、ＦＬＴ１、ＰＧＦ、ＴＨＢＳ１、ＳＰＡＲＣ、ＧＣＰ１およびＶＥＧＦＣなどの多数のタンパク質と物理的に相互作用し、これは、ＳＥＭＡ３Ｆ、ＳＨＢ、ＴＨＢＳ１、ＦＬＴ１およびＶＥＧＦＣと共発現し、ＰＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＩＱＧＡＰ１、ＮＥＤＤ４を含む様々な経路のタンパク質に関与しており、これは、血管新生、腫瘍形成、細胞生存性、増殖および分化などの多くの生物学的プロセスに影響を及ぼす。そのため、ＶＥＧＦ－Ａは優勢な因子であり、通常の生理学的状態ならびに病状の両方における様々な生物学的プロセスの重要な因子であると考えられている。

ある特定の実施形態では、選択された優勢な因子は、癌患者のＩＣＩによる治療に対する好ましくない応答を示す、１．５以上の倍率変化を示し、該ＩＣＩによる患者の治療が、該優勢な因子またはその受容体を遮断する薬剤と組み合わせて進めることができる。

優勢な因子には、アンフィレグリン、ＥＧＦ、ＥＧＦＲ、ＦＧＦ、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＭＭＰ９、ＰＤＧＦ、ＴＮＦ－αおよびＶＥＧＦ－Ａを含む因子から選択される。

ある特定の実施形態では、優勢な因子が、ＭＭＰ９であり、ＩＣＩが、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、癌患者が、ＳＢ－３ＣＴを含むＭＭＰ－９阻害剤と組み合わせたＩＣＩで治療される。

ある特定の実施形態では、優勢な因子が、アンフィレグリンであり、ＩＣＩが、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、癌患者が、抗アンフィレグリン抗体と組み合わせたＩＣＩで治療される。

次に、本発明を以下の非限定的な実施例によって説明する。

序論
前述のように、最近の臨床試験では、患者がＩＣＩに耐性を示す場合、またはＩＣＩ療法に応答しない場合があることが報告されている（Ｓｈａｒｍａ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。本明細書において、癌患者、すなわち宿主が、ＩＣＩ療法に応答して腫瘍形成促進因子を生成し、それが次に腫瘍の再増殖、進行、および治療への耐性に寄与することを説明する。このメカニズムに寄与する因子を特定するために、非腫瘍および腫瘍担持免疫担当マウスの両方で、インビボ実験を実施する。このアプローチにより、ＩＣＩの治療的抗腫瘍活性と宿主細胞に対するこれらの薬剤の効果とを区別することが可能となる。抗ＰＤ１、抗ＰＤ－Ｌ１、抗ＣＴＬ－４モノクローナル抗体を含む、診療所で広く使用されているＩＣＩに焦点を当て、特定のＩＣＩに応答または耐性があることが知られているマウス腫瘍モデルを使用する。たとえば、ＣＴ２６結腸およびＥＭＴ－６乳癌細胞株は、それぞれ抗ＣＴＬＡ－４および抗ＰＤ－Ｌ１に応答するが（Ｄｕｒａｉｓｗａｍｙ ｅｔ ａｌ．，２０１３；Ｓｗａｒｔ ｅｔ ａ．，２０１３）、ＭＣ３８結腸および４Ｔ１乳房癌細胞株は、我々の研究室でもテストされているように、一部のＩＣＩ（抗ＰＤ－１を含む）に対して耐性があるか、または中程度の応答しかない（Ｄｅ Ｈｅｎａｕ ｅｔ ａｌ．，２０１６；Ｋｏｄｕｍｕｄｉ ｅｔ ａｌ．，２０１６）（図示せず）。

材料および方法
材料
以下の抗体は、ＢｉｏＸＣｅｌｌ，Ｗｅｓｔ Ｌｅｂａｎｏｎ，ＮＨ，ＵＳＡから購入した：ＩｎＶｉｖｏＭａｂ抗マウス－ＣＴＬＡ－４（カタログ番号ＢＥ０１３１）、ＩｎＶｉｖｏＭａｂ抗マウス－ＩＬ－６（カタログ番号ＢＥ００４６）、ＩｎＶｉｖｏＭａｂ抗マウス－ＰＤ－１（カタログ番号ＢＥＯ１４６）、ＩｎＶｉｖｏＰｌｕｓ抗マウス－ＰＤ－Ｌ１（カタログ番号ＢＥＯ１０１）、およびＩｎＶｉｖｏＭＡｂアイソタイプ対照ＩｇＧ２ｂ抗体（カタログ番号ＢＥ００９０）。ＳＢ－３ＣＴ（ＩＵＰＡＣ名：２－（（（４－フェノキシフェニル）スルホニル）メチル）チイラン）は、ＭｅｄＫｏｏ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｉｎｃ（カタログ番号４０６５６３）から購入した。抗アンフィレグリン（カタログ番号ＡＦ９８９）はＲ＆Ｄ ｓｙｓｔｅｍｓから購入した。ＳＢ－３ＣＴの１０ｍＭストック溶液を１００％のＤＭＳＯ（Ｓｉｇｍａ）中で調製した。インビボ実験では、ストック溶液を、通常の生理食塩水中１０％のＤＭＳＯ中で、１．２５ｍｇ／ｍｌの最終濃度に希釈した。

（ｉ）腫瘍細胞培養物：マウスＥＭＴ６乳癌およびＣＴ２６マウス結腸癌の細胞株をＡｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ，ＵＳＡ）から購入した。細胞は、本物のストックから解凍されてから４ヶ月以内に培養に使用され、定期的にテストされ、マイコプラズマを含まないことが分かった（ＥＺ－ＰＣＲマイコプラズマテストキット、Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｄｕｓｔｒｉｅｓ，Ｉｓｒａｅｌ）。ＥＭＴ６細胞を、ダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）で培養し、ＣＴ２６細胞を、ＲＰＭＩ １６４０培地で培養し、両方の培地には、１０％ウシ胎児血清（ＦＢＳ）、１％Ｌ－グルタミン、１％ピルビン酸ナトリウム、および１％ペニシリン－ストレプトマイシン（Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｄｕｓｔｒｉｅｓ，Ｉｓｒａｅｌ）が補充されていた。細胞を５％のＣＯ_２中で３７℃で培養した。

（ｉｉ）動物処置プロトコルおよび腫瘍モデル：ナイーブな８～１０週齢の雌のＢＡＬＢ／ｃ、ＳＣＩＤまたはＮＯＤ－ＳＣＩＤマウス（Ｈａｒｌａｎ，Ｉｓｒａｅｌ）を本研究で使用した。実験は、Ｔｅｃｈｎｉｏｎ（Ｈａｉｆａ，Ｉｓｒａｅｌ）の動物倫理委員会に従って実施した。マウスに抗ＰＤ－１または無関係のＩｇＧラット抗マウス抗体（ＢｉｏＸＣｅｌｌ，Ｗｅｓｔ Ｌｅｂａｎｏｎ，ＮＨ，ＵＳＡ）を腹腔内注射した。

他の実験では、ナイーブな８～１０週齢の雌雄のＢＡＬＢ／ｃまたはＣ５７ｂｌ／６マウス（Ｈａｒｌａｎ，Ｉｓｒａｅｌ）に抗ＰＤ－Ｌ１または無関係のＩｇＧラット抗マウス抗体（ＢｉｏＸＣｅｌｌ，Ｗｅｓｔ Ｌｅｂａｎｏｎ，ＮＨ，ＵＳＡ）を腹腔内注射た。すべての場合において、抗体を、２００μｇ／２０ｇｒマウスの用量で、１週間にわたって１日おきに投与した（合計３回の注射）。

宿主由来のＩＬ－６を阻害することで抗ＣＴＬＡ－４治療の有効性が改善されるかどうかを調べるために、ＥＭＴ６マウス乳癌細胞（５×１０^５）を８～１０週齢のＢＡＬＢ／ｃマウスの乳腺脂肪体に同所移植した。腫瘍サイズは、幅^２×長さ×０．５の式を使用してベルニエノギスを用いて定期的に評価された。いくつかの実験では、マウスにＥＭＴ６細胞（２５×１０^３）を尾静脈から注射して、実験的な肺転移を形成した。マウスの生存を毎日監視した。腫瘍が１４０ｍｍ^３のサイズに達したときに、マウス（ｎ＝５）を、２００μｇの抗ＣＴＬＡ－４、２００μｇの抗ＩＬ－６または２つの抗体の組み合わせを、３日毎に１回、腹腔内（ＩＰ）注射した（合計で７回の注射）。対照マウス（ｎ＝８）は未処置のままにした。腫瘍の成長を定期的に監視し、腫瘍のサイズが１５００ｍｍ^３に達したときに、マウスを殺処分した。

宿主由来のＭＭＰ－９を阻害することで抗ＰＤ－Ｌ１療法の有効性が改善されるかどうかを調べるために、０．５×１０^６個のＥＭＴ６ ＧＦＰネズミ乳癌細胞（以前に、Ｍｕｎｏｚ ｅｔ ａｌ．，２００６において他の細胞株について記載された、ＥＭＴ６－Ｆ２と呼ばれる高選択性転移性クローン）を、８週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃマウス（ｎ＝７）の乳腺脂肪体に同所移植した。腫瘍のサイズが１００ｍｍ^３に達したとき、マウスに２００μｇの抗ＰＤ－Ｌ１、５０μｇのＳＢ－３ＣＴ（ＭＭＰ－２／ＭＭＰ－９選択的阻害剤）（Ｋｒｕｇｅｒ Ａ．，２００５、Ｂｏｎｆｉｌ ＲＤ．，２００６）、または抗ＰＤ－Ｌ１とＳＢ－３ＣＴとの組合せをＩＰ注射した。対照マウスまたは抗ＰＤ－Ｌ１単剤療法で治療されたマウスにビヒクル対照（２５％ＤＭＳＯ／６５％ＰＥＧ－２００／１０％ＰＢＳを注射した。腫瘍の増殖およびマウスの生存を監視し、エンドポイント（腫瘍のサイズが約１５００ｍｍ^３に達したとき、または２７日目に最大になったとき）にマウスを殺処分した。

宿主由来のアンフィレグリンを阻害することが、抗ＰＤ－Ｌ１療法の効力を改善するかどうかを決定するために、２×１０^６ＣＴ２６細胞を８～１０週齢ＢＡＬＢ／ｃマウスの右脇腹に皮下移植した。腫瘍のサイズが５０ｍｍ^３に達したとき、マウスに、２００μｇの抗ＰＤ－Ｌ１、５μｇの抗ＡＲＥＧ（Ｆｕｊｉｕ Ｋ．，２０１７で以前に実証された）、または抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＡＲＥＧとの組み合わせを、３日ごとにＩＰ注射した。対照マウスを未処置のままにした。腫瘍の増殖およびマウスの生存を監視した。

（ｉｉｉ）ＥＬＩＳＡによるＩＬ－６の定量化：７週齢の見処置雌ＢＡＬＢ／ｃマウス（ｎ＝４）に、２００μｇの抗ＰＤ－Ｌ１または抗ＣＴＬＡ－４を、３日ごとに合計３回、腹腔内注射した。対照マウス（ｎ＝４）は未処置のままにした。２４時間後、マウスを殺処分し、心臓穿刺によりＥＤＴＡコーティングチューブに血液を採取した。全血を、室温にて１３００ｇで１０分間遠心分離することにより血漿を単離した。上清（血漿層を表す）を採取し、ＩＬ－６のレベルを、ＥＬＩＳＡ（ＩＬ－６マウスＥＬＩＳＡキット、１００７１２ Ａｂｃａｍ）によって製造業者の指示に従って決定した。

（ｉｖ）血漿試料および馴化培地調製：対照ＩｇＧ、抗ＰＤ－１、または抗ＰＤ－Ｌ１処置マウスからの血液を、心臓穿刺によってＥＤＴＡコーティングチューブに採取した。続いて、全血を１０００ｇ、４℃で２０分間遠心分離することにより血漿を単離した。血漿は、さらに使用するまで－８０℃でアリコートで保存した。骨髄由来細胞は、ＩｇＧまたは抗ＰＤ－１処置マウスの大腿骨からフラッシュされた。骨髄細胞（１×１０^６細胞／ｍｌ）を、馴化培地（ＣＭ）を生成するために、無血清ＤＭＥＭ中で２４時間培養した。

（ｖ）抗体アレイ：３つのタンパク質プロファイリング実験を実施した。最初の実験では、ＩｇＧまたは抗ＰＤ－１で処置された雌のＢＡＬＢ／ｃマウスから抽出された血漿試料を、処置群ごとにプールした（ｎ＝５／群）。試料をメンブレンベースのＰｒｏｔｅｏｍｅ Ｐｒｏｆｉｌｅｒ Ｍｏｕｓｅ ＸＬ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ａｒｒａｙ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ番号：ＡＲＹ０２８）に、製造業者の指示に従って適用し、合計で１１１個の因子をスクリーニングした。２番目の実験では、ＩｇＧまたは抗ＰＤ－Ｌ１で処置された雌もしくは雄のＢＡＬＢ／ｃまたはＣ５７ｂｌ／６マウスから抽出された血漿試料を、群ごとにプールした（ｎ＝７／群）。試料を、スライドガラスベースのＱｕａｎｔｉｂｏｄｙ Ｍｏｕｓｅ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ａｒｒａｙ（ＲａｙＢｉｏｔｅｃｈ、カタログ番号：ＱＡＭ－ＣＡＡ－４０００）に、製造業者の指示に従って適用し、合計で２００個の因子をスクリーニングした。３番目の実験では、ＩｇＧまたは抗ＰＤ－１で処置した雌のＢＡＬＢ／ｃまたはＳＣＩＤマウスから抽出した血漿試料を、群ごとにプールした（群ごとにｎ＝７）。試料を、スライドガラスベースのＱｕａｎｔｉｂｏｄｙ Ｍｏｕｓｅ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ａｒｒａｙ（ＲａｙＢｉｏｔｅｃｈ、カタログ番号：ＱＡＭ－ＣＡＡ－４０００）に、製造業者の指示に従って適用し、合計で２００個の因子をスクリーニングした。メンブレンベースのアレイの場合、現像されたＸ線フィルムのピクセル密度は、透過モード濃度計および画像解析ソフトウェアを使用して解析された。スライドガラスベースのアレイの場合、蛍光の読み取り値は、レーザー蛍光スキャナーによって検出された。すべての場合において、データは正規化され、アレイ上の各因子の倍率変化は、処置：対照値の比率を計算することによって決定した。

（ｖｉ）統計分析：データを平均値±標準偏差（ＳＤ）として表す。差異の統計的有意性は、一元配置分散分析（ｏｎｅ－ｗａｙ ＡＮＯＶＡ）と、それに続くＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ ５ソフトウェア（Ｌａ Ｊｏｌｌａ，ＣＡ）を使用したＴｕｋｅｙ ａｄ ｈｏｃ統計検定によって評価した。一部の実験では、２つの群のみを比較するときにスチューデントのｔ検定を使用した。すべての群間の差異を互いに比較した。ＥＬＩＳＡによるＩＬ－６の定量化では、差異の統計的有意性を両側の対応のないｔ検定によって評価した。腫瘍増殖実験では、統計的有意性は複数のＴ検定によって評価される。生存分析では、ログランクマンテル・コックス（Ｍａｎｔｌｅ－Ｃｏｘ）によって差異が評価される。差異は、０．０５未満のｐ値で有意であるとみなされた。

実施例１．循環宿主由来因子に対する免疫チェックポイント阻害剤療法の効果－マウスにおけるタンパク質プロファイリングアプローチ
以前の実験は、抗ＰＤ－１療法が循環中の因子の上方制御を誘発し、それが最終的に腫瘍細胞の攻撃性を促進することを示唆している。このような影響は、他の種類の免疫チェックポイント阻害剤療法に応答して生じ得る。抗ＰＤ－１および抗ＰＤ－Ｌ１療法に応答してレベルが変化する宿主由来の循環因子を特定するために、ナイーブ（腫瘍を担持しない）マウスを使用して３つのタンパク質アレイベースのスクリーニングを実施した。ナイーブマウスを使用することで、腫瘍とは無関係に、療法に応答して宿主によって特異的に生成される因子を特定することが可能となる。

最初のスクリーニングでは、ナイーブな８～１０週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃマウス（ｎ＝３）に、抗ＰＤ－１ラット抗マウス抗体（ＢｉｏＸＣｅｌｌ，Ｗｅｓｔ Ｌｅｂａｎｏｎ，ＮＨ，ＵＳＡ）を２００μｇ／２０ｇｒマウスの用量で、１週間にわたって１日おきに腹腔内注射した（合計で３回の注射）。対照マウス（ｎ＝３）にも、ラット抗マウスＩｇＧ抗体を同じ用量で同様に注射した。最初の注射から１週間後に、マウスを殺処分し、心臓穿刺によりＥＤＴＡコーティングチューブに血液を採取した。全血を、室温にて１３００ｇで１０分間遠心分離することにより血漿を単離した。上清（血漿試料を表す）を採取し、群ごとにプールした。アリコートは、さらに使用するまで－８０℃で保存した。血漿試料をメンブレンベースのＰｒｏｔｅｏｍｅ Ｐｒｏｆｉｌｅｒ Ｍｏｕｓｅ ＸＬ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ａｒｒａｙ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ；カタログ番号：ＡＲＹ０２８）に適用し、合計で１１１個の因子をスクリーニングした。アレイによって検出されたサイトカイン、酵素、および成長因子の完全なリストを表１に示す。現像されたＸ線フィルムのピクセル密度は、透過モード濃度計および画像解析ソフトウェアを使用して解析された。正規化されたデータを分析して、抗ＰＤ－１治療に応答して循環レベルが変化した因子を特定した。具体的には、治療：対照値の比率を計算することにより、各因子についての倍率変化を決定した。１．５を超えるまたは０．５未満の倍率変化を示す因子は、抗ＰＤ－１治療に応答してそれぞれ上方制御または下方制御されると定義された。これらの因子およびそれぞれの倍率変化を表２に示す。抗ＰＤ－１治療に応答して上方制御された因子の多くは、血管新生、炎症、走化性および増殖などの腫瘍形成促進および転移促進プロセスにおける中心的存在である。上方制御された血管新生促進因子には、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、およびＰＤＧＦ－ＢＢが挙げられる。上方制御された炎症誘発性および／または走化性因子には、ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１Ｒα、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３、およびＭ－ＣＳＦが挙げられる。上方制御された増殖性成長因子には、ＦＧＦ－２１ Ｇａｓ６、およびＨＧＦが挙げられる。上方制御された転移促進因子には、ＭＭＰ－９が挙げられる。

２番目のスクリーニングでは、ナイーブな８～１０週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃ、雄ＢＡＬＢ／ｃ、雌Ｃ５７ＢＩ／６または雄Ｃ５７Ｂｌ／６マウス（群あたりｎ＝７のマウス）に抗ＰＤ－Ｌ１または対照ＩｇＧ抗体（ＢｉｏＸＣｅｌｌ，Ｗｅｓｔ Ｌｅｂａｎｏｎ，ＮＨ，ＵＳＡ）を、１回の注射当たり２００μｇ／２０ｇｒマウスの用量で、１週間にわたって１日おきに腹腔内注射した（合計で３回の注射）。最後の投与から２４時間後、マウスを殺処分して、採血し、血漿を調製した。各群からの血漿試料をプールし、スライドガラスベースのＱｕａｎｔｉｂｏｄｙ Ｍｏｕｓｅ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ａｒｒａｙ（ＲａｙＢｉｏｔｅｃｈ、カタログ番号：ＱＡＭ－ＣＡＡ－４０００）に、製造業者の指示に従って適用し、合計で２００個の因子をスクリーニングした。アレイによって検出されたサイトカイン、酵素、および成長因子の完全なリストを表３に示す。治療：対照値の比率を計算することにより、タンパク質アレイ上の各因子についての倍率変化を決定した。１．５を超えるまたは０．５未満の倍率変化を示す因子は、抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答してそれぞれ上方制御または下方制御されると定義された。これらの因子およびそれぞれの倍率変化を表４に示す。データは、異なるマウス系統間で比較した場合、または同じ系統の雄と雌との間で比較した場合、ア上方制御された因子および下方制御された因子のプロファイルが完全に重複しないことを示している。これは、抗ＰＤ－Ｌ１治療に対する応答が遺伝子型に依存していることを示唆している。これは、癌患者にも存在することが知られている差異を反映している可能性があり、したがって、患者の宿主の応答を個別化された方法でテストするための理論的根拠を提供する。抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して上方制御された因子の多くは、炎症、走化性および増殖などの腫瘍形成促進および転移促進プロセスにおける中心的存在である。上方制御された血管新生促進因子には、Ｇ－ＣＳＦ、およびＳＣＦが挙げられる。上方制御された炎症誘発性および／または走化性因子には、エオタキシン－２、Ｇ－ＣＳＦ、ＩＬ－１ｒａ、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＳＣＦ、およびＴＡＣＩが挙げられる。上方制御された増殖性成長因子には、アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＥＧＦ、およびＨＧＦが挙げられる。上方制御された転移促進因子には、ＡＤＡＭＴＳ１およびプロＭＭＰ９が挙げられる。

どの宿主細胞型がこれらの腫瘍形成促進因子を分泌するかについての洞察を得るために、抗ＰＤ－１または対照ＩｇＧ抗体で治療したＢＡＬＢ／ｃマウスとＳＣＩＤマウスを比較して同様のスクリーニングを行った。ＳＣＩＤマウスは、ＢＡＬＢ／ｃバックグラウンドで重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）変異を持っているため、機能的な適応免疫細胞型（Ｂ細胞およびＴ細胞）を欠いている。ナイーブな８～１０週齢の雌ＢＡＬＢ／ｃまたはＳＣＩＤマウス（群あたりｎ＝７のマウス）に、抗ＰＤ－１または対照ＩｇＧ抗体（ＢｉｏＸＣｅｌｌ，Ｗｅｓｔ Ｌｅｂａｎｏｎ，ＮＨ，ＵＳＡ）を、１回の注射当たり２００μｇ／２０ｇｒマウスの用量で、１週間にわたって１日おきに腹腔内注射した（合計で３回の注射）。最後の投与から２４時間後、マウスを殺処分して、採血し、血漿を調製した。各群からの血漿試料をプールし、スライドガラスベースのＱｕａｎｔｉｂｏｄｙ Ｍｏｕｓｅ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ａｒｒａｙ（ＲａｙＢｉｏｔｅｃｈ、カタログ番号：ＱＡＭ－ＣＡＡ－４０００）に、製造業者の指示に従って適用し、合計で２００個の因子をスクリーニングした。アレイによって検出されたサイトカイン、酵素、および成長因子の完全なリストを表３に示す。治療：対照値の比率を計算することにより、タンパク質アレイ上の各因子についての倍率変化を決定した。１．５を超えるまたは０．５未満の倍率変化を示す因子は、抗ＰＤ－１治療に応答してそれぞれ上方制御または下方制御されると定義された。これらの因子およびそれぞれの倍率変化を表５に示す。いくつかの因子が抗ＰＤ－１治療に応答して上方制御されることが見出され、そのうちのいくつかはＢＡＬＢ／ｃマウスに特異的であり、ＳＣＩＤマウスには特異的でははなかった（例えば、ＡＤＡＭＴＳ１、アンフィレグリン、Ｉ－ＴＡＣおよびＳＣＦ）。これらの結果は、これらの特定の因子が抗ＰＤ－１治療に応答して適応免疫系の細胞によって分泌されることを示唆している。

まとめると、これらの結果は、抗ＰＤ－１および抗ＰＤ－Ｌ１治療が、腫瘍の進行をサポートする応答を宿主に誘発し、免疫チェックポイント阻害剤療法の望ましい治療効果を打ち消すことを示している。

実施例２．原発性乳腺腫瘍モデルにおけるＩＣＩ療法に対する宿主由来のＭＭＰ－９レベルの低下の影響
マトリックスメタロペプチダーゼ９（ＭＭＰ９）は、細胞外マトリックスの分解に関与する亜鉛メタロプロテイナーゼファミリーに属する酵素である。ＭＭＰ－９は、上皮間葉転換、細胞増殖、血管新生、骨形成、および創傷治癒を含む、腫瘍形成促進および組織再生の生物学的プロセスなど、様々な生物学的プロセスに関与している。ＭＭＰ－９は、浸潤および転移に関与する重要な要因の１つである。ＭＭＰ－９は、抗癌剤として開発された癌の様々な主要な生物学的経路に関与しているため、ＩＣＩ療法に応答して誘発される主要な因子として機能し、その阻害により治療結果が改善され得る。

ＭＭＰ－９は、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１による治療後、ＢＡＬＢ／ｃマウスで誘発されることが分かっており、これは、ｉ）ＭＭＰ－９は、抗ＰＤ－１治療に応答して、ナイーブＢＡＬＢ／ｃの骨髄由来細胞から分泌されること、ｉｉ）ナイーブＢＡＬＢ／ｃマウスでは、抗ＰＤ－１治療に応答してＭＭＰ９の血漿レベルが５．４倍に増加すること（表２）、ｉｉｉ）ナイーブＢＡＬＢ／ｃマウスにおける抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して、プロＭＭＰ－９の血漿レベルが２～３倍増加すること（表４）を実証している。宿主由来のＭＭＰ９の阻害が抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１療法の有効性を改善するかどうかを調査するためにＭＭＰ２／ＭＭＰ９選択的阻害剤ＳＢ－３ＣＴを抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１抗体と組み合わせて使用する。ＥＭＴ６ネズミ乳癌細胞（５×１０^５）を、８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｈａｒｌａｎ，Ｉｓｒａｅｌ）の乳腺脂肪体に同所的に移植した。腫瘍サイズは、幅^２×長さ×０．５の式を使用してベルニエノギスを用いて定期的に評価した。腫瘍のサイズが１００ｍｍ^３に達すると、マウスをランダムに次の治療群に割り当てる（群当たりｎ＝６のマウス）：１）対照、ｉｉ）抗ＰＤ－１単剤療法、ｉｉｉ）抗ＰＤ－Ｌ１単剤療法、ｉｖ）ＭＭＰ２／ＭＭＰ９選択的阻害剤ＳＢ－３ＣＴ単剤療法、ｖ）抗ＰＤ－１とＳＢ－３ＣＴとの併用療法、およびｖｉ）抗ＰＤ－Ｌ１とＳＢ－３ＣＴとの併用療法。抗ＰＤ－１、抗ＰＤ－Ｌ１およびＩｇＧ対照抗体は、３日ごとに２００μｇ／２０ｇマウスの用量で腹腔内注射によって投与される。ＳＢ－３ＣＴは、３日ごとに１ｍｇ／２０ｇマウスの用量で腹腔内注射によって投与される。対照マウスには、ＩｇＧ抗体とビヒクル（通常の生理食塩水中の１０％のＤＭＳＯ）を注射する。抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１単剤療法を受けているマウスにも、ビヒクル（通常の生理食塩水中の１０％のＤＭＳＯ）を注射する。ＳＢ３－ＣＴ単剤療法を受けているマウスには、ＩｇＧ対照抗体も注射される。腫瘍の増殖およびマウスの生存を監視する。エンドポイント（腫瘍が約１５００ｍｍ^３サイズに達したとき、または実験が２７日に達するまで）で、マウスを殺処分する。

図１Ａおよび１Ｂに示されている結果（それぞれ、経時的なおよび最終実験日である２７日目の腫瘍体積）は、抗ＰＤ－Ｌ１とＭＭＰ－２／ＭＭＰ－９阻害剤ＳＢ－３ＣＴとの組み合わせで治療されたマウスが、ビヒクル、抗ＰＤ－Ｌ１またはＳＢ－３ＣＴ単独で治療されたマウスと比べて、腫瘍サイズの縮小を示すことを実証している。抗ＰＤ－Ｌ１単独での治療に対する併用治療の利点は、個々のマウスでのより涼子な応答率によって実証され（それぞれ図１Ｃ、黒対灰色）、併用治療で治療された８匹のマウスのうちの３匹が、他のマウスと比較して、エンドポイント（２７日目）で腫瘍サイズの縮小が示された。さらに、併用治療は腫瘍の増殖を阻害しただけでなく、マウスの生存率も改善した（図１Ｄ）。すなわち、併用療法で治療されたマウスは、対照マウス、抗ＰＤ－Ｌ１で治療されたマウス、またはＳＢ－３ＣＴで治療されたマウスと比較して生存率の増加を示した。これらの結果は、抗ＰＤ－Ｌ１治療と併用したＭＭＰ－２／ＭＭＰ－９の阻害が治療有効性を改善することができることを示唆している。

実施例３．原発性乳腺腫瘍モデルにおけるＩＣＩ療法に対する宿主由来のアンフィレグリンレベルの低下の影響
アンフィレグリンは、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）のリガンドの１つである。研究により、腫瘍形成のいくつかの態様におけるアンフィレグリンの機能的役割が実証されている。アンフィレグリンの血漿レベルが、ナイーブＢＡＬＢ／ｃおよびＣ５７／ｂｌ／６マウスでの抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して、アンフィレグリンの血漿レベルが２～３倍増加し（表４）、およびＢＡＬＢ／ｃマウスでの抗ＰＤ－１治療に応答して３．７倍増加する（表５）ことを示す、上記の実施例１に記載した発見に照らして、アンフィレグリンが選択された。

アンフィレグリンは、増殖、浸潤、血管新生、転移、アポトーシスへの耐性など、腫瘍の発生に重要な多くの生物学的プロセスに関与していることが知られており、その発現が癌治療に対する非応答性を示していることを提案している。さらに、アンフィレグリンは重要な癌促進受容体である上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）のリガンドの１つである。このように、それは腫瘍形成促進活性を有する優勢な因子であると考えられており、その阻害は治療有効性を改善することができる。

宿主由来のアンフィレグリン（抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１治療のいずれかに応答してＢＡＬＢ／ｃマウスで上方制御される）を阻害することで抗ＰＤ－Ｌ１療法の有効性が改善されるかどうかを調査するために、ＣＴ２６結腸癌細胞を、ＢＡＬＢ／ｃマウスに皮下移植した。腫瘍のサイズが５０ｍｍ^３に達したとき、マウスを抗ＰＤ－Ｌ１、抗ＡＲＥＧ、または抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＡＲＥＧとの併用療法のいずれかで治療し、対照マウスを未処置のままにした。腫瘍の増殖およびマウスの生存を監視した。

図２Ａに示されているように、抗ＰＤ－Ｌ１と組み合わせた抗ＡＲＥＧによる治療は、対照マウスおよび抗ＡＲＥＧ治療マウスと比較して低い腫瘍増殖を示した。併用療法と抗ＰＤ－Ｌ１で治療されたマウスの平均腫瘍体積の間に大きな差異は観察されなかったが、併用療法は治療されたマウスの２５％で完全な応答（腫瘍の消失）を示し、一方抗ＰＤ－Ｌ１で治療されたマウスはこの現象を示さなかった（図２Ｂ；縦の破線は治療を施した日数を表す）。併用治療のより高い有効性は、マウスの生存と直接相関している（図２Ｃ）。したがって、抗ＰＤ－Ｌ１と組み合わせてアンフィレグリン阻害剤で治療されたマウスは、対照マウス、抗ＰＤ－Ｌ１で治療されたマウス、または抗ＡＲＥＧ単剤療法で治療されたマウスと比較して、より良好な生存率を示した。

実施例４．ＩＬ－６の発現は、ＩＣＩ治療に応答して誘発される
ＩＬ－６は、ＩＣＩ療法に応答して高度に誘発されることが上記で実証されたもう１つの優勢な因子である。提示されているように、ＩＬ－６は、ＢＡＬＢ／ｃマウスでの抗ＰＤ－１治療に応答して１５．６倍（表２）、ナイーブＢＡＬＢ／ｃおよびＣ５７／ｂｌ／６での抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して１．７～１．８倍（表４）、ならびにＳＣＩＤマウスでの抗ＰＤ－１治療に応答して１．８倍（表５）増加した。

ＩＣＩ治療後のＩＬ－６発現の誘発は、ＥＬＩＳＡを使用してさらに検証された。抗ＰＤ－Ｌ１、抗ＣＴＬＡ－４を注射したマウスまたは未処置のマウス（対照マウス）を、ＥＬＩＳＡ（ＩＬ－６マウスＥＬＩＳＡキット、ａｂ１００７１２、Ａｂｃａｍ）を使用して血漿中のＩＬ－６レベルについて分析した。図４に示すように、抗ＰＤ－Ｌ１および抗ＣＴＬＡ－４で治療したマウスは、ＩＬ－６が検出できない対照マウスと比較して、ＩＬ－６濃度の顕著な誘発（それぞれ１３．４および６．１５ｐｇ／ｍｌ）を示した（それぞれ、０．０３および０．０２のｐ値）。この実験は、ナイーブなマウスを使用して行ったため、ＩＬ－６が腫瘍の存在とは無関係に、免疫チェックポイント阻害剤に応答して宿主細胞によって生成されることを示している。

実施例５．抗ＰＤ－Ｌ１誘発性の宿主由来ＩＬ－６の遮断は、原発腫瘍の増殖を阻害し、マウスの生存を改善する
ＩＬ－６は、増殖、血管新生、炎症、分化、アポトーシスへの耐性など、腫瘍の発生に不可欠な多くの生物学的プロセスに関与していることが知られている。さらに、ＩＬ－６は炎症誘発性サイトカインであり、癌の予後因子として説明されている。ＩＬ－６は炎症誘発性カスケードの最上部に位置し、転移と相関することが実証されているため、腫瘍形成促進および転移促進活性を伴う主要な因子とみなされている。

このため、宿主由来のＩＬ－６の遮断が抗ＰＤ－Ｌ１治療の有効性を改善するかどうかを試験した。ＢＡＬＢ／ｃマウスにＣＴ２６ネズミ結腸癌細胞を皮下注射した。腫瘍が５０ｍｍ^３のサイズに達した時、マウスを、抗ＰＤ－Ｌ１、抗ＩＬ－６、または２つの抗体の組合せでＩＰ注射し、対照マウスは、未処置のままにした。腫瘍の増殖を定期的に監視し、腫瘍のサイズが約２０００ｍｍ^３に達したときに、マウスを殺処分した。図５Ａに示すように、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との組み合わせで治療したマウスは、対照、抗ＰＤ－Ｌ１、または抗ＩＬ－６で治療したマウスと比較して腫瘍増殖の縮小を示した（それぞれ、０．００３、０．１９２および０．００９のｐ値）。単一マウスの腫瘍増殖を比較すると、腫瘍増殖の阻害における抗ＰＤ－Ｌ１または抗ＩＬ－６治療と比較した併用治療の利点がより強調された。図５Ｂに示すように、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との組み合わせで治療された６匹のマウスのうち４匹（５７％）は、治療に対して完全な応答を示し、腫瘍が消失したが、一方抗ＰＤ－Ｌ１治療群では、６匹中１匹のマウス（１６．７％）だけが完全な応答および腫瘍の消失を示した。

図５Ｃに示すように、抗ＰＤ－Ｌ１と抗ＩＬ－６との併用治療は、腫瘍の増殖を縮小させただけではなく、対照、抗ＰＤ－Ｌ１、または抗ＩＬ－６（それぞれ、３１、３９．５および３１日の生存期間の中央値）と比べて、マウスの生存期間を改善し（生存期間中央値は未定義）（それぞれ０．００２６、０．３５５２および０．０３８６のｐ値）、約４０日後の生存率は、抗ＰＤ－Ｌ１単独群の５０％と比較して、約７０％であった。

実施例６．抗ＣＴＬＡ－４誘発宿主由来ＩＬ－６の遮断は、原発腫瘍の増殖を阻害し、マウスの生存を改善する
抗ＣＴＬＡ－４治療に応答して上方制御された宿主由来ＩＬ－６の遮断（図４に示す）が治療の有効性を改善するかどうかを研究するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスにＥＭＴ６ネズミ乳癌細胞を乳腺脂肪体に同所的に注射した。腫瘍が１００ｍｍ^３のサイズに達した時、マウスに、抗ＣＴＬＡ－４、抗ＩＬ－６または抗ＣＴＬＡ－４と抗ＩＬ－６との組み合わせを、３日ごとに１回ＩＰ注射した（合計で４回の注射）。対照マウスを未処置のままにした。腫瘍の増殖を定期的に監視し、腫瘍のサイズが約１５００ｍｍ^３に達したときに、マウスを殺処分した。

図５Ａは、対照、抗ＣＴＬＡ－４単独または抗ＩＬ－６処置マウスと比較して、併用治療（抗ＣＴＬＡ－４および抗ＩＬ－６）の増強された抗腫瘍効果を明確に示している（それぞれ、ｐ値０．００２、０．１３７および＜０．００１のｐ値）。さらに、抗ＣＴＬＡ－４と抗ＩＬ－６との併用治療で治療された５匹のマウスのうち３匹（６０％）は、抗ＣＴＬＡ－４群の１匹のマウスとは対照的に、治療に対して完全な応答を示し、それらの腫瘍は約３５日目に完全に消失し、併用治療が腫瘍の増殖を阻害するだけでなく、腫瘍を根絶したことを示している。

抗ＣＴＬＡ－４と組み合わせて宿主由来のＩＬ－６を遮断することも、マウスの生存を改善した。図５Ｂに示すように、抗ＣＴＬＡ－４を抗ＩＬ－６と組み合わせて治療したマウスは、抗ＣＴＬＡ－４、抗ＩＬ－６で治療したマウス、または対照（それぞれ、４９、２７および２７日の生存期間中央値）と比較して、生存率の向上（生存期間中央値は未定義）を示し、ｐ値はそれぞれ０．０７６、０．０００８および０．０００５であった。

付録

参考文献
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Claims (37)

1. 癌患者を免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）で治療する方法であって、
   （ｉ）前記ＩＣＩによる治療セッション後の時点で前記癌患者から得られた血漿、全血、血清、または末梢血単核球から選択された血液試料に対してアッセイを実施して、前記ＩＣＩによる治療に応答して、宿主（「前記癌患者」）によって駆動される複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上のレベルを決定する工程であって、前記複数の因子のうちの１つ以上が、個別化された形態で、前記ＩＣＩによる前記治療に対する前記癌患者の応答性または非応答性を促進する、工程と、
   （ｉｉ）前記ＩＣＩによる前記治療セッションの前の時点で前記癌患者から得られた、工程（ｉ）の前記血液試料と同じ種類の血液試料中の前記因子のそれぞれのレベルを決定することによって、工程（ｉ）の前記複数の宿主駆動型耐性因子のうちの前記１つ以上のそれぞれの基準レベルを得る工程と、
   （ｉｉｉ）工程（ｉ）の各宿主駆動型耐性因子の前記レベルを同じ因子について工程（ｉｉ）の前記基準レベルと比較することによって、工程（ｉ）の前記複数の宿主駆動型耐性因子のうちの前記１つ以上のそれぞれについての倍率変化を確立する工程と、
   （ｉｖ）工程（ｉ）の前記複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された前記倍率変化に基づいて、前記癌患者が前記ＩＣＩによる前記治療に対して好ましい、または好ましくない応答を有することを決定する工程と、
   （ｉｖａ）前記複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された前記倍率変化に基づいて、前記癌患者が前記ＩＣＩによる前記治療に対して好ましくない応答を有する場合、前記好ましくない応答を示している倍率変化を示す前記１つ以上の宿主駆動型耐性因子の中で、優勢な因子を選択し、治療有効量の、前記優勢な因子またはその受容体の活性を遮断する薬剤と組み合わせた、治療有効量の前記ＩＣＩで前記患者を治療する工程、あるいは、
   （ｉｖｂ）前記複数の宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上について工程（ｉｉｉ）で確立された前記倍率変化に基づいて、前記癌患者が前記ＩＣＩによる前記治療に対して好ましい応答を有する場合、前記ＩＣＩ単独による前記癌患者の前記治療を継続する工程と、を含む、方法。
2. 免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）による治療に応答しない癌患者の治療のための方法であって、前記方法が、前記癌患者に、治療有効量の前記ＩＣＩを、治療有効量の、優勢な因子、またはその受容体の活性を遮断する薬剤と組み合わせて、前記癌患者に投与することを含み、前記優勢な因子が、前記ＩＣＩによる前記癌患者の治療に応答して生成される複数の宿主駆動型耐性因子の中から選択され、前記複数の宿主駆動型耐性因子が、前記ＩＣＩによる前記治療に対する前記癌患者の好ましくない応答を予測する倍率変化を有し、前記倍率変化が、（ｉ）前記ＩＣＩによる治療セッション後に前記癌患者から得られた、血漿、全血、血清または末梢血単核球から選択される血液試料中の各宿主駆動型耐性因子のレベルを、（ｉｉ）前記ＩＣＩによる前記治療セッション前に前記癌患者から得られた、（ｉ）と同じ種類の血液試料からの同じ因子について得られた基準レベルと比較することによって確立される、方法。
3. 工程（ｉ）および工程（ｉｉ）の前記血液試料が、両方とも血漿である、請求項１または２に記載の方法。
4. 前記ＩＣＩによる前記治療セッションが、
   （ａ）前記ＩＣＩによる最初の治療セッションであり、工程（ｉ）の前記血液試料が、前記最初の治療セッション後、約２０、２４、３０、３６、４０、４８、５０、６０、７２時間以上（最大１週間以上、最大２週間以上または最大３週間以上を含む）の時点で前記癌患者から得られ、工程（ｉｉ）の前記基準血液試料が、前記ＩＣＩによる前記最初の治療セッション前、約７２時間以下を含む時点（約６０、５０、４８、４０、３６、３０、２４、または２０時間以下を含む）、または前記ＩＣＩによる前記最初の治療セッションの直前を含む時点で前記癌患者から得られるか、
   （ｂ）前記ＩＣＩによる前記最初の治療セッションではない複数の治療セッションのうちの１つであり、血液試料が、２つの連続する治療セッションの間の任意の時点で前記癌患者から得られ、前記血液試料が、同時に、工程（ｉ）の前記血液試料であり、工程（ｉｉ）による前記基準血液試料が、工程（ｉ）による次のセッションアッセイのためのものであるか、あるいは
   （ｃ）２つの連続する治療セッションの間の時間が、前記ＩＣＩに応じて２週間または３週間であり、前記血液試料が、前記ＩＣＩによる前記最初の治療セッションではない前記治療セッション後、１日目、２日目、３日目、７日目、１４日目、または２１日目に得られる、請求項１～３のいずれか一項に記載の方法。
5. 前記複数の宿主駆動型耐性因子のうちの前記１つ以上のそれぞれについての前記倍率変化は、その値が約１．５以上である場合、増加／上方制御を意味し、有意かつ前記ＩＣＩによる前記治療に対する前記癌患者の好ましくない応答を予測するとみなされ、あるいは前記倍率変化は、その値が約０．５以下である場合、減少／下方制御を意味し、有意かつ前記癌患者の前記ＩＣＩによる前記治療に対する好ましい応答を予測するとみなされる、請求項１～４のいずれか一項に記載の方法。
6. 前記ＩＣＩによる前記治療に対する前記癌患者の好ましいか、または好ましくない応答の前記予測が、前記宿主駆動型耐性因子のうちの１つ以上、任意に２つ以上、３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上、７つ以上、８つ以上、９つ以上、１０個以上、１１個以上、１２個以上、１３個以上、１４個以上、１５個以上、２０個以上、または２５個以上の有意な倍率変化に基づく、請求項１～５のいずれか一項に記載の方法。
7. 前記ＩＣＩが、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＣＴＬＡ－４、Ａ２ＡＲ、ＢＴ－Ｈ３、ＢＴ－Ｈ４、ＢＴ－Ｈ５、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ１、ＫＩＲ、ＬＡＧ－３、ＴＤＯ、ＴＩＭ－３、ＴＩＧＩＴ、ＶＩＳＴＡ、またはこれらの組み合わせから選択される免疫チェックポイントに対する阻害剤である、請求項１～６のいずれか一項に記載の方法。
8. 前記ＩＣＩが、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、セミプリマブ、ＡＭＰ－２２４、ＭＥＤＩ０６８０、もしくはスパルタリズマブから選択される抗ＰＤ－１モノクローナル抗体、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブもしくはＭＤＸ－１１０５から選択される抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体、イピリムマブもしくはトレメリムマブから選択される抗ＣＴＬＡ－４モノクローナル抗体、レラトリマブ、ＬＡＧ５２５もしくはＲＥＧＮ３７６７から選択される抗ＬＡＧ－３モノクローナル抗体、ＴＳＲ０２２もしくはＭＢＧ４５３から選択される抗ＴＩＭ－３モノクローナル抗体、抗ＫＩＲモノクローナル抗体リリルマブ、抗ＴＩＧＩＴモノクローナル抗体ＯＭＰ－３１Ｍ３２、抗ＶＩＳＴＡモノクローナル抗体ＪＮＪ－６１６１０５８８（オンバチリマブ）、またはこれらの組み合わせである、請求項７に記載の方法。
9. 前記患者が、（ａ）２つのＩＣＩの組み合わせであって、ニボルマブ（抗ＰＤ－１）およびイピリムマブ（抗ＣＴＬＡ－４）、ニボルマブ（抗ＰＤ－１）およびアテゾリムマブ（抗ＰＤ－Ｌ１）、ならびにデュルバルマブ（抗ＰＤ－Ｌ１）およびトレメリムマブ（抗ＣＴＬＡ－４）から選択される、２つのＩＣＩの組み合わせ、（ｂ）前記ＩＣＩと、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＯＸ４０、およびＣＤ１３７（４－ＩＢＢ）から選択されるＴ細胞共刺激分子に対するアゴニストモノクローナル抗体との組み合わせ、または（ｃ）前記ＩＣＩと、化学療法、標的癌療法、および放射線療法を含む１つ以上の従来の癌療法との組み合わせ、により治療される、請求項１～８のいずれか一項に記載の方法。
10. 前記宿主駆動型耐性因子が、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、酵素および可溶性受容体を含む分子因子であり、前記因子が腫瘍形成促進性または転移促進性因子であり得、前記腫瘍形成促進因子が、血管新生促進、炎症誘発性／走化性、または増殖性成長因子であり得る、請求項１～９のいずれか一項に記載の方法。
11. 前記宿主駆動型耐性因子が、ＡＤＡＭＴＳ１、アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＥＧＦ、エオタキシン－２、ＦＧＦ－２１、Ｇａｓ６、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＨＧＦ、ＩＦＮ－ガンマ、ＩＬ－１Ｒアルファ、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＴＡＣＩ、Ｍ－ＣＳＦ、ＭＭＰ－９、ＰＤＧＦ－ＢＢ、プロＭＭＰ９、またはＳＣＦを含む、請求項１０に記載の方法。
12. 前記ＩＣＩが抗ＰＤ－１であり、前記抗ＰＤ－１治療に応答して上方制御される前記宿主駆動型耐性因子が、（ｉ）Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦおよびＰＤＧＦ－ＢＢを含む血管新生促進因子、（ｉｉ）ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＩＦＮ－ガンマ、ＩＬ－１Ｒアルファ、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３およびＭ－ＣＳＦを含む炎症誘発性および／または走化性因子、（ｉｉｉ）ＦＧＦ－２１、Ｇａｓ６およびＨＧＦを含む増殖性成長因子、ならびに（ｉｖ）前記転移促進因子ＭＭＰ－９から選択される、請求項１１に記載の方法。
13. 前記ＩＣＩが抗ＰＤ－Ｌ１であり、抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して上方制御される前記宿主駆動型耐性因子が、（ｉ）Ｇ－ＣＳＦおよびＳＣＦを含む血管新生促進因子、（ｉｉ）エオタキシン－２、Ｇ－ＣＳＦ、ＩＬ－１ｒａ、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＳＣＦ、およびＴＡＣＩを含む炎症誘発性および／または走化性因子、（ｉｉｉ）アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＥＧＦ、およびＨＧＦを含む増殖性成長因子、ならびに（ｉｖ）ＡＤＡＭＴＳ１およびプロＭＭＰ９を含む転移促進因子から選択される、請求項１１に記載の方法。
14. 前記選択された優勢な因子が、前記癌患者の前記ＩＣＩによる前記治療に対する好ましくない応答を示す、１．５以上の倍率変化を有し、前記優勢な因子またはその受容体を遮断する薬剤と組み合わせた前記ＩＣＩによる前記癌患者の治療を進める、請求項１または２に記載の方法。
15. 前記ＩＣＩおよび前記優勢な因子または前記その受容体を遮断する前記薬剤が、いずれかの順序で同時にまたは逐次的に投与される、請求項１４に記載の方法。
16. 前記優勢な因子が、アンフィレグリン、ＥＧＦ、ＥＧＦＲ、ＦＧＦ、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＭＭＰ９、ＰＤＧＦ、ＴＮＦ－αおよびＶＥＧＦ－Ａを含む、請求項１４または１５に記載の方法。
17. 前記優勢な因子が、ＭＭＰ９であり、前記ＩＣＩが、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、前記癌患者が、ＳＢ－３ＣＴなどのＭＭＰ９阻害剤と組み合わせた前記ＩＣＩで治療される、請求項１６に記載の方法。
18. 前記優勢な因子が、アンフィレグリンであり、前記ＩＣＩが、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、前記癌患者が、抗アンフィレグリン抗体と組み合わせた前記ＩＣＩで治療される、請求項１６に記載の方法。
19. 前記優勢な因子が、ＩＬ－６であり、前記ＩＣＩが、抗ＣＴＬＡ－４、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、前記癌患者が、（ｉ）シルツキシマブ、オロキズマブ、エルシリモマブ、クラザキズマブ、ゲリリムズマブ、ＥＢＩ－０３１およびシルクマブを含む、抗ＩＬ－６モノクローナル抗体、またはそのバイオシミラー、（ｉｉ）ＢＣＤ－０８９、トシリズマブ、ＬｕｓｉＮＥＸ、およびサリルマブを含む、抗ＩＬ－６Ｒモノクローナル抗体またはそのバイオシミラー、（ｉｉｉ）ナノボディボバリリズマブ、ならびに（ｉｖ）オラムキセプトを含むＩＬ－６Ｒアンタゴニストから選択される抗ＩＬ－６または抗ＩＬ－６受容体（抗ＩＬ－６Ｒ）と組み合わせた前記ＩＣＩで治療される、請求項１６に記載の方法。
20. 前記抗ＰＤ－１モノクローナル抗体が、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、セミプリマブ、ＡＭＰ－２２４、ＭＥＤＩ０６８０、もしくはスパルタリズマブであり、前記抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体が、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、もしくはＭＤＸ－１１０５であり、前記抗ＣＴＬＡ－４モノクローナル抗体が、イピリムマブもしくはトレメリムマブ、またはこれらの組み合わせである、請求項１７～１９のいずれか一項に記載の方法。
21. 前記癌が、膀胱癌、骨癌、乳癌、脳癌、子宮頸癌、大腸癌、大腸直腸癌、食道癌、胃癌、胃腸癌、神経膠芽細胞腫、頭頚部癌、頭頚部扁平上皮癌、肝細胞癌、腎臓癌、肝臓癌、小細胞肺癌および非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）を含む肺癌、黒色腫、鼻咽頭癌、卵巣癌、膵臓癌、陰茎癌、前立腺癌、皮膚癌、精巣癌、胸腺癌、甲状腺癌、泌尿生殖器癌、もしくは子宮癌、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫ならびに肉腫を含む、原発性または転移性癌である、請求項１～２０のいずれか一項に記載の方法。
22. 癌の治療において、前記治療に応答しない患者で使用するための免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）であって、前記治療が、治療有効量の前記ＩＣＩを、治療有効量の、優勢な因子、またはその受容体の活性を遮断する薬剤と組み合わせて投与することを含み、前記優勢な因子が、前記ＩＣＩによる前記癌患者の治療に応答して生成される複数の宿主駆動型耐性因子の中から選択され、前記複数の宿主駆動型耐性因子が、前記ＩＣＩによる治療に対する前記癌患者の好ましくない応答を予測する倍率変化を有し、前記倍率変化が、（ｉ）前記ＩＣＩによる治療セッション後に前記癌患者から得られた、血漿、全血、血清または末梢血単核球から選択される血液試料中の各宿主駆動型耐性因子のレベルを、（ｉｉ）前記ＩＣＩによる治療セッション前に前記癌患者から得られた、（ｉ）と同じ種類の血液試料からの同じ因子について得られた基準レベルと比較することによって確立される、免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
23. 前記ＩＣＩが、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＣＴＬＡ－４、Ａ２ＡＲ、ＢＴ－Ｈ３、ＢＴ－Ｈ４、ＢＴ－Ｈ５、ＢＴＬＡ、ＩＤＯ１、ＫＩＲ、ＬＡＧ－３、ＴＤＯ、ＴＩＭ－３、ＴＩＧＩＴ、ＶＩＳＴＡ、またはこれらの組み合わせから選択される免疫チェックポイントに対する阻害剤である、請求項２２に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
24. 前記ＩＣＩが、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、セミプリマブ、ＡＭＰ－２２４、ＭＥＤＩ０６８０、およびスパルタリズマブから選択される抗ＰＤ－１モノクローナル抗体、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブおよびＭＤＸ－１１０５から選択される抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体、イピリムマブおよびトレメリムマブから選択される抗ＣＴＬＡ－４モノクローナル抗体、レラトリマブ、ＬＡＧ５２５およびＲＥＧＮ３７６７から選択される抗ＬＡＧ－３モノクローナル抗体、ＴＳＲ０２２およびＭＢＧ４５３から選択される抗ＴＩＭ－３モノクローナル抗体、抗ＫＩＲモノクローナル抗体リリルマブ、抗ＴＩＧＩＴモノクローナル抗体ＯＭＰ－３１Ｍ３２、抗ＶＩＳＴＡモノクローナル抗体ＪＮＪ－６１６１０５８８（オンバチリマブ）、またはこれらの組み合わせである、請求項２３に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
25. （ａ）２つのＩＣＩの組み合わせであって、ニボルマブ（抗ＰＤ－１）およびイピリムマブ（抗ＣＴＬＡ－４）、ニボルマブ（抗ＰＤ－１）およびアテゾリムマブ（抗ＰＤ－Ｌ１）、またはデュルバルマブ（抗ＰＤ－Ｌ１）およびトレメリムマブ（抗ＣＴＬＡ－４）から選択される、２つのＩＣＩの組み合わせ、（ｂ）前記ＩＣＩと、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＯＸ４０、およびＣＤ１３７（４－ＩＢＢ）から選択されるＴ細胞共刺激分子に対するアゴニストモノクローナル抗体との組み合わせ、あるいは（ｃ）前記ＩＣＩと、化学療法、標的癌療法、および放射線療法を含む１つ以上の従来の癌療法様式との組み合わせから選択される、請求項２３または２４に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
26. 前記宿主駆動型耐性因子が、サイトカイン、ケモカイン、成長因子、酵素および可溶性受容体を含む分子因子であり、前記因子が、腫瘍形成促進性または転移促進性因子であり得、前記腫瘍形成促進因子が、血管新生促進、炎症誘発性／走化性、または増殖性成長因子であり得る、請求項２２～２５のいずれか一項に記載免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
27. 前記宿主駆動型耐性因子が、ＡＤＡＭＴＳ１、アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＥＧＦ、エオタキシン－２、ＦＧＦ－２１、Ｇａｓ６、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＨＧＦ、ＩＦＮ－ガンマ、ＩＬ－１Ｒアルファ、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＴＡＣＩ、Ｍ－ＣＳＦ、ＭＭＰ－９、ＰＤＧＦ－ＢＢ、プロＭＭＰ９、またはＳＣＦを含む、請求項２６に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
28. 前記ＩＣＩが抗ＰＤ－１であり、前記抗ＰＤ－１治療に応答して上方制御される前記宿主駆動型耐性因子が、（ｉ）Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦおよびＰＤＧＦ－ＢＢを含む血管新生促進因子、（ｉｉ）ＣＣＬ１７／ＴＡＲＣ、ＣＣＬ５／ＲＡＮＴＥＳ、Ｇ－ＣＳＦ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＩＦＮ－ガンマ、ＩＬ－１Ｒアルファ、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ４０、ＩＬ－１３、ＩＬ－３３およびＭ－ＣＳＦを含む炎症誘発性および／または走化性因子、（ｉｉｉ）ＦＧＦ－２１、Ｇａｓ６およびＨＧＦを含む増殖性成長因子、および（ｉｖ）転移促進因子ＭＭＰ－９から選択される、請求項２７に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
29. 前記ＩＣＩが抗ＰＤ－Ｌ１であり、前記抗ＰＤ－Ｌ１治療に応答して上方制御される前記宿主駆動型耐性因子が、（ｉ）Ｇ－ＣＳＦおよびＳＣＦを含む血管新生促進因子、（ｉｉ）エオタキシン－２、Ｇ－ＣＳＦ、ＩＬ－１ｒａ、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－３３、Ｉ－ＴＡＣ、ＭａｄＣＡＭ－１、ＭＣＰ－５、ＳＣＦ、およびＴＡＣＩを含む炎症誘発性および／または走化性因子、（ｉｉｉ）アンフィレグリン、Ａｘｌ、ＥＧＦ、およびＨＧＦを含む増殖性成長因子、ならびに（ｉｖ）ＡＤＡＭＴＳ１およびプロＭＭＰ９を含む転移促進因子から選択される、請求項２７に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
30. 前記選択された優勢な因子が、１．５以上の倍率変化を有する、請求項２２～２９のいずれか一項に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
31. 前記ＩＣＩおよび前記優勢な因子またはその受容体を遮断する前記薬剤が、いずれかの順序で同時にまたは逐次的に投与される、請求項３０に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
32. 前記優勢な因子が、アンフィレグリン、ＥＧＦ、ＥＧＦＲ、ＦＧＦ、ＩＦＮ－γ、ＩＬ－１β、ＩＬ－２、ＩＬ－６、ＭＭＰ９、ＰＤＧＦ、ＴＮＦ－αおよびＶＥＧＦ－Ａを含む、請求項２６～３１のいずれか一項に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
33. 前記優勢な因子が、ＭＭＰ９であり、前記ＩＣＩが、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、前記癌患者が、ＳＢ－３ＣＴなどのＭＭＰ９阻害剤と組み合わせた前記ＩＣＩで治療される、請求項３２に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
34. 前記優勢な因子が、アンフィレグリンであり、前記ＩＣＩが、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、前記癌患者が、抗アンフィレグリン抗体と組み合わせた前記ＩＣＩで治療される、請求項３２に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
35. 前記優勢な因子が、ＩＬ－６であり、前記ＩＣＩが、抗ＣＴＬＡ－４、抗ＰＤ－１または抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体であり、前記癌患者が、（ｉ）シルツキシマブ、オロキズマブ、エルシリモマブ、クラザキズマブ、ゲリリムズマブ、ＥＢＩ－０３１およびシルクマブを含む、抗ＩＬ－６モノクローナル抗体、またはそのバイオシミラー、（ｉｉ）ＢＣＤ－０８９、トシリズマブ、ＬｕｓｉＮＥＸ、およびサリルマブを含む、抗ＩＬ－６Ｒモノクローナル抗体またはそのバイオシミラー、（ｉｉｉ）ナノボディボバリリズマブ、ならびに（ｉｖ）オラムキセプトを含むＩＬ－６Ｒアンタゴニストから選択される抗ＩＬ－６または抗ＩＬ－６受容体（抗ＩＬ－６Ｒ）と組み合わせた前記ＩＣＩで治療される、請求項３２に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
36. 前記抗ＣＴＬＡ－４モノクローナル抗体が、イピリムマブもしくはトレメリムマブであり、前記抗ＰＤ－１モノクローナル抗体が、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、ピジリズマブ、セミプリマブ、ＡＭＰ－２２４、ＭＥＤＩ０６８０、もしくはスパルタリズマブであり、および前記抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体が、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、もしくはＭＤＸ－１１０５、またはこれらの組み合わせである、請求項３３～３５のいずれか一項に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
37. 前記癌が、膀胱癌、骨癌、乳癌、脳癌、子宮頸癌、大腸癌、大腸直腸癌、食道癌、胃癌、胃腸癌、神経膠芽細胞腫、頭頚部癌、頭頚部扁平上皮癌、肝細胞癌、腎臓癌、肝臓癌、小細胞肺癌および非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）を含む肺癌、黒色腫、鼻咽頭癌、卵巣癌、膵臓癌、陰茎癌、前立腺癌、皮膚癌、精巣癌、胸腺癌、甲状腺癌、泌尿生殖器癌、もしくは子宮癌、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫ならびに肉腫を含む、原発性または転移性癌である、請求項２２～３６のいずれか一項に記載の免疫チェックポイント阻害剤（ＩＣＩ）。
    
    

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