JP2022058417A - 治療において使用するためのスルファミドリンカーを含むバイオコンジュゲート - Google Patents

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Abstract

【課題】バイオコンジュゲート、生体分子および標的分子のコンジュゲートの治療指数を増加させるための方法を提供する。【解決手段】方法は、式B-L-Dで表されるバイオコンジュゲート(式中:Bは、生体分子であり、該生体分子は糖タンパク質であり;Lは、BおよびDを連結させるリンカーであり;Dは、標的分子であり、該標的分子は薬物またはプロドラッグであり;ならびに「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分である)を、Lが式(1)に従う基またはその塩を含むように、標的分子D上の反応基を生体分子B上の官能基と反応させることにより、調製する工程を含む。TIFF2022058417000032.tif39149【選択図】なし

Description

本発明はバイオコンジュゲーションの分野にある。本発明はスルファミドリンカーおよびそのコンジュゲート、ならびにその調製方法に関する。より特定的には、本発明は、アシルスルファミド基および/またはカルバモイルスルファミド基を含むリンカーおよび前記リンカーを含むコンジュゲートに関する。発明はさらに、リンカーを含むバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスに関し、リンカーはアシルスルファミド基および/またはカルバモイルスルファミド基を含む。
バイオコンジュゲーションは、その少なくとも1つが生体分子である、2つ以上の分子を連結させるプロセスである。生体分子(複数可)は、「対象生体分子(複数可)」とも呼ばれ得、他の分子(複数可)は、「標的分子」または「対象分子」とも呼ばれ得る。典型的には、対象生体分子(BOI)はタンパク質(またはペプチド)、グリカン、核酸(またはオリゴヌクレオチド)、脂質、ホルモンまたは天然薬物(またはそれらの断片もしくは組み合わせ)から構成されるであろう。他の対象分子(MOI)もまた、生体分子であってもよく、よって、ホモまたはヘテロ二量体(または高級オリゴマー)の形成へと導かれ、または他の分子は、コンジュゲーションプロセスにより対象生体分子に付与される特別な特徴を有してもよい。例えば、検出および/または単離のための化学プローブを用いた共有結合的修飾によるタンパク質構造および機能の調節がプロテオームに基づく研究および生物医学適用における強力なツールとして発達してきた。タンパク質の蛍光または親和性タギングがそれらの生息環境におけるタンパク質の輸送の研究に重要である。タンパク質-炭水化物コンジュゲートに基づくワクチンはHIV、癌、マラリアおよび病原菌に対する闘いにおいて名を上げてきたが、一方、マイクロアレイ上に固定された炭水化物はグライコームの解明に役立つ。合成DNAおよびRNAオリゴヌクレオチド(ON)は、診断および治療適用、例えばマイクロアレイ技術、アンチセンスおよび遺伝子-サイレンシング療法、ナノテクノロジーおよび様々な材料科学適用のために、好適な官能基の導入を必要とする。例えば、細胞透過性リガンドの付着が、オリゴヌクレオチドに基づく治療(アンチセンス、siRNA)中に直面するONの低いインターナリゼーション速度に取り組むために最も一般的に適用される戦略である。同様に、オリゴヌクレオチドに基づくマイクロアレイの調製では、好適な固体表面、例えばガラス上でのONの選択的固定化が必要とされる。
2つ(またはそれ以上)の分子構造を共有結合により連結させるのに好適な化学反応の多くの例が存在する。しかしながら、生体分子のラベリングは、適用することができる反応条件に対し高い制限を有し(溶媒、濃度、温度)、一方、化学選択的ラベリングの要求は、反応基の選択を制限する。明らかな理由から、生物システムは一般に水性環境において最もよく繁栄し、バイオコンジュゲーションのための試薬は、水性系における適用に好適でなければならないことが意味される。一般に、2つの戦略構想はバイオコンジュゲーション技術の分野で認識することができる:(a)対象生体分子中にすでに存在する官能基、例えば、例として、チオール、アミン、アルコールまたはヒドロキシフェノール単位に基づくコンジュゲーションまたは(b)1つ(またはそれ以上)の特有の反応基のBOI中への改変操作、その後の実際のコンジュゲーションプロセスを含む2段プロセス。
第1のアプローチは典型的には、タンパク質中の反応性アミノ酸側鎖(例えばシステイン、リジン、セリンおよびチロシン)、またはグリカン(例えばアミン、アルデヒド)もしくは核酸(例えばプリンまたはピリミジン官能基またはアルコール)中の官能基を含む。とりわけ、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013(参照により組み込まれる)において要約されているように、多数の反応性官能基が、長年にわたって、これらの官能基の1つの化学選択的ターゲティングに使用可能になっており、例えばマレイミド、ハロアセトアミド、活性化エステル、活性化カーボネート、ハロゲン化スルホニル、活性化チオール誘導体、アルケン、アルキン、アレンアミドおよびそれ以上であり、その各々が、コンジュゲーションのためにそれ自体の特定的な条件(pH、濃度、化学量論、光、など)を必要とする。最も顕著に、システイン-マレイミドコンジュゲーションが、その高い反応速度および化学選択性のために、タンパク質コンジュゲーションについて傑出している。しかしながら、多くのタンパク質における、および確かに他の生体分子におけるように、システインがコンジュゲーションに使用できない場合、他の方法がしばしば要求され、各々がそれ自体の欠点に苦しむ。
バイオコンジュゲーションのための洗練された、広く適用可能な解決策は2段階アプローチに関与する。より骨が折れるが、官能基操作による2段階コンジュゲーションは典型的には、天然官能基に基づくコンジュゲーションよりも高い選択性(部位特異性)に導く。それ以外に、コンストラクトの適正な選択により、完全な安定性を達成することができ、それは、特にシステイン-マレイミドコンジュゲーションでは、天然官能基上での1段階コンジュゲーションの重要な欠点となり得る。BOI上に付与することができる官能基の典型的な例としては、(歪んだ)アルキン、(歪んだ)アルケン、ノルボルネン、テトラジン、アジド、ホスフィン、ニトリルオキシド、ニトロン、ニトリルイミン、ジアゾ化合物、カルボニル化合物、(O-アルキル)ヒドロキシルアミンおよびヒドラジンが挙げられ、それは、化学または分子生物学アプローチのいずれかにより達成することができる。上記官能基の各々は少なくとも1つの反応パートナーを有することが知られており、多くの場合完全相互反応性を含む。例えば、シクロオクチンは、選択的に、かつ排他的に1,3-双極子と、歪んだアルケンはテトラジンと、ホスフィンはアジドと反応し、完全に安定な共有結合が得られる。しかしながら、上記官能基のいくつかは、高親油性であるという不利益を有し、これは、特に、対象親油性分子と組み合わせた場合、コンジュゲーション効率を損なう可能性がある(下記を参照されたい)。
生体分子と他の対象分子の間の最終連結単位は優先的に、また、溶解度、安定性および生体適合性の観点から、水性環境と完全に適合可能でなければならない。例えば、高親油性リンカーは凝集を引き起こす可能性があり(コンジュゲーション中および/または後)、これは、特にMOIがまた、疎水性の性質を有する場合、著しく反応時間を増加させ、および/またはコンジュゲーション収率を低減させる可能性がある。同様に、高親油性リンカー-MOIの組み合わせは、同じまたは他の生体分子上の表面または特定の疎水性パッチへの非特異的結合を引き起こす可能性がある。リンカーが加水分解または他の水により誘導される開裂反応を受けやすい場合、元のバイオコンジュゲートを構成する成分は拡散により分離する。例えば、ある一定のエステル部分は鹸化のために好適ではなく、一方、β-ヒドロキシカルボニルまたはγ-ジカルボニル化合物は、それぞれ、レトロアルドールまたはレトロマイケル反応を引き起こす可能性がある。最後に、リンカーは、バイオコンジュゲート中に存在する官能基、またはバイオコンジュゲートの適用中に遭遇し得る任意の他の官能基に対して不活性でなければならず、特に、例えば、ケトンまたはアルデヒド部分(イミン形成に至る可能性がある)、α,β-不飽和カルボニル化合物(マイケル付加)、チオエステルまたは他の活性化エステル(アミド結合形成)を特徴とするリンカーの使用は排除される。
エチレングリコールの直鎖オリゴマーから生成される化合物、いわゆるポリエチレングリコール(PEG)リンカーは、最近、生体分子コンジュゲーションプロセスにおいて特に好評である。PEGリンカーは水溶性が高く、無毒性で、非抗原性で、凝集は無視でき、またはない。この理由から、多種多様の直鎖、二官能性PEGリンカーが様々な供給元から市販されており、これらは、いずれかの端で、対象(生体)分子で選択的に修飾することができる。PEGリンカーはエチレンオキシドの重合プロセスの生成物であり、よって、典型的には鎖長の確率的混合物として得られ、それらは部分的に約1、2、4kDaまたはそれ以上(最大60kDaまで)を中心とする平均重量分布を有するPEGコンストラクトに分解することができる。最大4kDaの分子量を有する均質の個別PEG(dPEG)も知られており、その分枝バージョンは最大15kDaになる。興味深いことに、PEG単位それ自体は、生体分子に特別な特徴を付与する。特に、タンパク質ペグ化は、インビボにおける滞留の延長、代謝酵素による分解の減少、およびタンパク質免疫原性の低減または消失に至ることがある。いくつかのペグ化タンパク質はFDAに認可されており、現在市場に出ている。
その高い極性のために、PEGリンカーは、水性条件下での小さい部分および/または水溶性部分のバイオコンジュゲーションに完全に好適である。しかしながら、疎水性の非水溶性対象分子のコンジュゲーションの場合において、PEG単位の極性は疎水性を相殺するのに不十分で、反応速度の著しい低減、より低い収率および凝集誘発の課題に至り得る。こうした場合において、長いPEGリンカーおよび/またはかなりの量の有機共溶媒が、試薬を可溶化するために必要とされることがある。例えば、抗体-薬物コンジュゲートの分野において、モノクローナル抗体への別々の数の毒性ペイロードの付着の制御が鍵であり、ペイロードは典型的には、アウリスタチンEもしくはF、マイタンシノイド、デュオカルマイシン、カリチアマイシンまたはピロロベンゾジアゼピン(PBD)の群から選択され、多くの他のものも検討中である。アウリスタチンFを除いて、全ての毒性ペイロードは非水溶性に乏しく、成功コンジュゲーションを達成するために、例えば25%ジメチルアセトアミド(DMA)または50%プロピレングリコール(PG)などの有機共溶媒を必要とする。疎水性ペイロードの場合において、前記共溶媒の使用にもかかわらず、大化学量論の試薬がコンジュゲーション中に必要とされることがあり、一方、効率および収率は、例えば、Nat.Biotechn.2014,24,1256-1263(参照により組み込まれる)においてSenterらによって記載されているように、凝集により著しく損なわれることがある(プロセス中または生成物単離後)。長いPEGスペーサ(12単位以上)の使用は、溶解度および/またはコンジュゲーション効率を部分的に増強することができるが、長いPEGスペーサはより急速なインビボクリアランスを引き起こす可能性があり、よって、ADCの薬物動態プロファイルに負の影響を及ぼすことが示されている。
従来のリンカー(例えばPEG)を使用すると、有効なコンジュゲーションは、とりわけ相対的水不溶性または疎水性標的分子が使用される場合に、水性媒体におけるリンカー-コンジュゲートの比較的低い溶解度によってしばしば妨げられる。疎水性部分の速く、効率的なコンジュゲーションを可能にする短い極性スペーサを求めて、発明者らは、リンカー-コンジュゲートの溶解度を改善し、ひいては、コンジュゲーションの効率を著しく改善し、プロセス中における凝集および生成物の凝集の両方を低減することが見出されたスルファミドリンカーを開発した。これは特許出願PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)(本明細書においてその全体が組み込まれる)に開示される。
リンカーは当技術分野で知られており、例えば、WO2008/070291号(参照により組み込まれる)に開示されている。WO2008/070291号は、アンカー成分へのターゲティング剤のカップリングのためのリンカーを開示する。リンカーは、ポリエチレングリコール(PEG)によって代表される親水性領域およびターゲティング剤にカップリングされるキラル中心を欠く伸長部を含む。
WO01/88535号(参照により組み込まれる)は、バイオコンジュゲーションのための表面用のリンカー系、特に、新規親水性スペーサ基を有するリンカー系を開示している。リンカー系における使用のための親水性原子または基は、O、NH、C=O(ケト基)、O-C=O(エステル基)およびCRからなる群より選択され、ここでRおよびRはH、OH、C-CアルコキシおよびC-Cアシルオキシからなる群より独立して選択される。
WO2014/100762号(参照により組み込まれる)は、適切な条件下で切断可能であるとともに親水基を組み込むことで化合物のより良好な溶解度を提供する、親水性自壊性リンカーを有する化合物を記載する。化合物は薬物部分、選択された細胞集団を標的にすることができるターゲティング部分、ならびにアシル単位、薬物部分とターゲティング部分との間の距離を提供するための任意的なスペーサ単位、適切な条件下で切断可能であり得るペプチドリンカー、親水性自壊性リンカー、および任意的な第2の自壊性スペーサまたは環化自己脱離リンカーを含むリンカーを含む。親水性自壊性リンカーは、例えばベンジルオキシカルボニル基である。
本発明はバイオコンジュゲート、生体分子および標的分子のコンジュゲートの治療指数を増加させるための方法に関する。発明者らは驚いたことに、式(1)に従う基またはその塩を含むリンカーLを含むように調製されたバイオコンジュゲート:
Figure 2022058417000001

が、式(1)に従う基が存在しないリンカーを含む同じバイオコンジュゲート、すなわち同じ生体分子、同じ標的分子(例えば活性物質)および同じ生体分子薬物比と比べてより優れた治療指数を示すことを見出した。リンカーが、抗体-薬物-コンジュゲートなどのバイオコンジュゲートの治療指数に対して効果を有し得ることは、現在の知識に基づいては想起され得ない。本分野では、リンカーは治療に関しては不活性と考えられ、バイオコンジュゲートの調製の結果として存在するにすぎない。特定のリンカーの選択が治療指数に対して効果を有することは前例がなく、バイオコンジュゲート、特に抗体-薬物-コンジュゲートの分野における画期的発見である。
本発明によるバイオコンジュゲートは、一方で、異なるリンカーを含む同じバイオコンジュゲート、すなわち同じ生体分子、同じ標的分子(例えば活性物質)および同じ生体分子/標的分子比よりも効果的(治療的に有効)であり、他方で、より大きな耐容性を示す。この知見は、治療ウィンドウが広がるので、本発明によるバイオコンジュゲートを用いる被験体の治療に対して劇的な意義を有する。治療ウィンドウの拡大の結果として、治療投与量が低下され得、帰結として、潜在的な望まれない副作用が低減される。
本発明によるバイオコンジュゲートは、式(A)により表され:
B-L-D
(A)、
式中:
-Bは、生体分子であり;
-Lは、BおよびDを連結するリンカーであり;
-Dは、標的分子であり;ならびに
-「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分である。
式(1)に従う基では、
-aは0または1であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRはさらなる標的分子Dであり、ここでDは任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
よって、本発明は、第1の態様では、以上で規定されるリンカーLがバイオコンジュゲートに含まれるように式(A)のバイオコンジュゲートを調製する工程を含む、バイオコンジュゲートの治療指数を増加させるための方法に関する。1つの実施形態では、本発明による方法はバイオコンジュゲートをその必要のある被験体に投与することをさらに含む。第1の態様による発明はまた、バイオコンジュゲートの治療指数を増加させるための、バイオコンジュゲートにおける以上で規定されるリンカーLの使用と表すことができる。
さらなる態様では、本発明は、本発明によるバイオコンジュゲートの投与を含む、その必要のある被験体の治療に関する。典型的には、バイオコンジュゲートは治療的に有効な用量で投与される。治療有効性の増加を考慮すると、投与は従来のバイオコンジュゲートを用いる治療におけるよりも頻繁に行わない、および/またはより低い用量で行うことがある。あるいは、耐容性の増加を考慮すると、投与は従来のバイオコンジュゲートを用いる治療におけるよりも頻繁に、および/またはより高い用量で行うことができる。投与は単一用量であり得るか、または例えば、1ヶ月1-4回、好ましくは1ヶ月1-2回行うことができ、より好ましい投与は3週または4週毎に、最も好ましくは4週毎に1回行う。当業者によって認識されるように、本発明によるバイオコンジュゲートの用量は多くの因子に依存することがあり、最適用量は当業者によりルーチン実験を介して決定することができる。バイオコンジュゲートは典型的には、0.01-50mg/kg被験体体重、より正確には0.1-25mg/kgまたは最も正確には0.5-10mg/kgの用量で投与される。1つの実施形態では、本発明によるバイオコンジュゲートの投与は同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50よりも低い用量であり、好ましくは用量は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50のせいぜい99-90%、より好ましくはせいぜい89-60%、さらにいっそう好ましくは59-30%、最も好ましくはせいぜい29-10%である。あるいは、本発明によるバイオコンジュゲートの投与は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50より高い用量であり、好ましくは、用量は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50のせいぜい10-29%、より好ましくはせいぜい30-59%、さらにいっそう好ましくは60-89%、最も好ましくはせいぜい90-99%である。
バイオコンジュゲートの調製は典型的には、式Q-L-Dを有するリンカー-コンジュゲート(ここで、LおよびDは以上で規定される通りであり、Qは官能基Fと反応することができる反応基である)を、式B-Fを有する生体分子(ここで、Bは以上で規定される通りであり、Fは、Qと反応することができる官能基である)と反応させる工程を含む。ここで、QおよびFは反応し、式(A)に従うバイオコンジュゲート中、BとLの間のスペーサ部分に位置する連結基Zを形成する。
生体分子のコンジュゲーションの一般概念を示し:1つ以上の官能基Fを含む対象生体分子(BOI)は、特定のリンカーを介して反応基Qに共有結合された(過剰の)標的分子D(対象分子またはMOIとも呼ばれる)と共にインキュベートされる。バイオコンジュゲーションのプロセスにおいて、FとQとの間の化学反応が起き、よって、BOIとMOIの間の共有結合的連結を含むバイオコンジュゲートが形成される。BOIは、例えばペプチド/タンパク質、グリカンまたは核酸であってもよい。 例えば3-メルカプトプロピオニル基(11a)、アジドアセチル基(11b)、またはアジドジフルオロアセチル基(11c)を用いて2位で、またはアジドアジドアセチル基を用いてN-アセチルガラクトサミンの6位で(11d)修飾することができる、ガラクトサミンのUDP糖類の誘導体のいくつかの構造を示す。 UDP-糖類11a-dのいずれかを、ガラクトシルトランスフェラーゼ変異体またはGalNAc-トランスフェラーゼの作用下で、GlcNAc部分を含む糖タンパク質12(例えば、グリカンがエンドグリコシダーゼによってトリミングされているモノクローナル抗体)に付着させることができ、よって、GalNAc誘導体とGlcNAcの間にβ-グリコシド1-4連結を生成させる方法を概略的に表示する(それぞれ、化合物13a-d)。 修飾抗体13a-dが、マレイミドへの求核付加により(チオエーテルコンジュゲート14に至る3-メルカプトプロピオニル-ガラクトサミン修飾13a、またはチオエーテルコンジュゲート17に至る改変システイン残基へのコンジュゲーションに関する)、またはシクロオクチン試薬を用いる歪み促進付加環化で(それぞれ、トリアゾール15a、15bまたは16に至る13b、13cまたは13dに関する)バイオコンジュゲーションプロセスを受けることができる方法を示す。 N-マレイミジル反応基Qが従来リンカー単位17または本発明によるリンカー単位18を介してピレン基(D)に連結されているいくつかの化合物の構造を示す。 ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]反応基Q(BCN基とも呼ばれる)が従来リンカー単位(19、22)または本発明によるリンカー単位(20、21、23)を介してベンジルアミン(D)に連結されているいくつかの化合物の構造を示す。 ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]反応基Q(BCN基とも呼ばれる)またはジベンゾアゾシクロオクチン反応基Q(DIBAC基またはDBCO基とも呼ばれる)がリンカー単位を介してピレンに連結されているいくつかの化合物の構造を示す。リンカー26および29は本発明によるものであり、リンカー24、25、27および28は本発明によるものではない。 ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]反応基Q(BCN基とも呼ばれる)がリンカー単位を介してマイタンシンに連結されている、リンカー-コンジュゲート30および33の構造を示す。リンカー-コンジュゲート33は本発明によるものであり、リンカー-コンジュゲート30はそうではない。、トラスツズマブにコンジュゲートされたこれらの2つのリンカー-コンジュゲート(すなわちADC97および98)は実施例29および31の有効性および安全性研究において使用されてきた。 ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]反応基Q(BCN基とも呼ばれる)がリンカー単位を介してVal-Cit-PABA-デュオカルマイシンコンストラクトに連結されている2つの化合物の構造を示す。リンカー-コンジュゲート35は本発明によるものであり、一方、リンカー-コンジュゲート34はそうではない。 ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]反応基Q(BCN基とも呼ばれる)がスルファミドリンカーを介してVal-Cit-PABA-Ahx-マイタンシンにコンジュゲートされている、本発明によるリンカー-コンジュゲートとして好適な化合物36-39の構造を示す。 天然に存在するかまたは改変することによって導入されるかのいずれかである、生体分子における代表的な一組の官能基(F)であって、反応基Qとの反応で連結基Zに至る官能基(F)を示す。官能基Fはまた、任意の選択位置で生体分子に人工的に導入され得る(改変)。同じ官能基および反応性部分が、それぞれ、FおよびQとして好適に使用される。連結基Zはまた、FとQの間の反応の結果であってもよい。 実施例1-4において調製され、実施例29および31において使用される、抗体-薬物-コンジュゲート95-98の調製を示す。 実施例26-28において調製され、実施例30において使用される、抗体-薬物-コンジュゲート112-114の調製を示す。112では:R=-NH-(CHCHO)-C(O)-Val-Cit-MMAE(13dの111とのコンジュゲーションにより調製);113では:R=-NH-S(O)-NH-(CHCHO)-C(O)-Val-Cit-MMAE(13dの100とのコンジュゲーションにより調製);114では:R=-NH-(CH-C(O)-NH-S(O)-NM-(CHCHO)-C(O)-Val-Cit-MMAE(13dの108とのコンジュゲーションにより調製)。 実施例29の結果のグラフを示し、ここで腫瘍体積(mmで表される)が、本発明による2つのバイオコンジュゲート(95および97)および本発明以外のリンカーのみを有する2つの同じバイオコンジュゲート(96および98)を使用して、時間の経過に伴って示される。 実施例30の結果のグラフを示し、ここで、腫瘍体積中央値(mmで表される)が、本発明による2つのバイオコンジュゲート(113および114)ならびに本発明以外のリンカーのみを有する同じバイオコンジュゲート(112)を使用して、時間の経過に伴って示される。 本発明によるリンカーを含むバイオコンジュゲート97、および従来のPEG-リンカーを含む98についての、実施例31の安全性結果を示す。図16Aは、2および4日目での血小板数を示す(対照の%で表される)。 本発明によるリンカーを含むバイオコンジュゲート97、および従来のPEG-リンカーを含む98についての、実施例31の安全性結果を示す。図16Bは、2および4日目での体重を示す(対照の%で表される)。 図17a及び17bは、実施例49の結果を示し、ここで、平均腫瘍体積(mmで表される)が、本発明によるバイオコンジュゲート(116、図17b)および本発明の範囲外リンカーを有する同じバイオコンジュゲート(115、図17a)について、時間の経過に伴って示される。図17aおよび17bは、2つの別々のインビボ有効性研究(各研究においてアドセトリスを陽性対照として用いる)において測定された平均腫瘍体積を表す。異なる研究における腫瘍成長遅延に対するアドセトリスの効果の差は、細胞の倍加時間の差により合理的に説明することができる(ビヒクルで処置された群の腫瘍サイズにおいて明らかになる)。 図17a及び17bは、実施例49の結果を示し、ここで、平均腫瘍体積(mmで表される)が、本発明によるバイオコンジュゲート(116、図17b)および本発明の範囲外リンカーを有する同じバイオコンジュゲート(115、図17a)について、時間の経過に伴って示される。図17aおよび17bは、2つの別々のインビボ有効性研究(各研究においてアドセトリスを陽性対照として用いる)において測定された平均腫瘍体積を表す。異なる研究における腫瘍成長遅延に対するアドセトリスの効果の差は、細胞の倍加時間の差により合理的に説明することができる(ビヒクルで処置された群の腫瘍サイズにおいて明らかになる)。 図18a-cは、実施例50の安全性結果を示し、ここで、ラットは、112、113または114で処置した(全てのDAR2 ADCが同じ抗体ブレンツキシマブおよび同じペイロードMMAEを有する)。図18aは、112で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図18bは、113で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図18cは、114で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。これらの結果に基づき、MTDは、112-114の各々について、120mg/kgであることが確立される。 図18a-cは、実施例50の安全性結果を示し、ここで、ラットは、112、113または114で処置した(全てのDAR2 ADCが同じ抗体ブレンツキシマブおよび同じペイロードMMAEを有する)。図18aは、112で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図18bは、113で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図18cは、114で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。これらの結果に基づき、MTDは、112-114の各々について、120mg/kgであることが確立される。 図18a-cは、実施例50の安全性結果を示し、ここで、ラットは、112、113または114で処置した(全てのDAR2 ADCが同じ抗体ブレンツキシマブおよび同じペイロードMMAEを有する)。図18aは、112で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図18bは、113で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図18cは、114で80、120、140または160mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。これらの結果に基づき、MTDは、112-114の各々について、120mg/kgであることが確立される。 図19a-cは、実施例51の安全性結果を示し、ここで、ラットは、アドセトリス、115または116で処置した(全てのDAR4 ADCは同じ抗体ブレンツキシマブおよびペイロードMMAEを有する)。図19aはアドセトリスで15、20または40mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図19bは、115で40、60、70または80mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図19cは、116で40、60、70または80mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。これらの結果に基づき、MTDはアドセトリスについて15mg/kg(報告18mg/kg)および115および116の両方について60mg/kgとして確立される。 図19a-cは、実施例51の安全性結果を示し、ここで、ラットは、アドセトリス、115または116で処置した(全てのDAR4 ADCは同じ抗体ブレンツキシマブおよびペイロードMMAEを有する)。図19aはアドセトリスで15、20または40mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図19bは、115で40、60、70または80mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図19cは、116で40、60、70または80mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。これらの結果に基づき、MTDはアドセトリスについて15mg/kg(報告18mg/kg)および115および116の両方について60mg/kgとして確立される。 図19a-cは、実施例51の安全性結果を示し、ここで、ラットは、アドセトリス、115または116で処置した(全てのDAR4 ADCは同じ抗体ブレンツキシマブおよびペイロードMMAEを有する)。図19aはアドセトリスで15、20または40mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図19bは、115で40、60、70または80mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。図19cは、116で40、60、70または80mg/kgにて処置した群の平均体重を示す。これらの結果に基づき、MTDはアドセトリスについて15mg/kg(報告18mg/kg)および115および116の両方について60mg/kgとして確立される。 実施例52の結果を示し(MD-MBA-231における有効性研究)、ここで、腫瘍体積(mmで表される)が、本発明によるバイオコンジュゲート(118)および本発明以外のリンカーのみを有する同じバイオコンジュゲート(117)を使用して、時間の経過に伴って示される。
本発明との関連で、コンジュゲーション反応は、一方では官能基Fを含有する生体分子(BOI)、および他方では、反応基Qを含有する標的分子(MOI)、または本明細書で規定される「リンカー-コンジュゲート」を伴い、ここで、Qは、Fと反応し、バイオコンジュゲートにおいてBOIおよびMOIを接合させる連結基を形成する。本明細書では、反応基Qはリンカーを介してMOIに接合され、前記リンカーは式(1)に従うスルファミド部分を含む。
Figure 2022058417000002
反応基Qは、式(1)の部分のいずれかの端部に付着されてもよく、この場合、MOIは、式(1)の部分の反対端に付着される。1つの実施形態では、反応基Qは、カルボニル端を介して式(1)の部分に付着され、MOIは式(1)の部分のスルファミド端を介して付着される。1つの実施形態では、反応基Qは、スルファミド端を介して式(1)の部分に付着され、MOIは式(1)の部分のカルボニル端を介して付着される。
定義
「含むこと」という動詞、およびそれの活用は、本明細書および特許請求の範囲において使用される場合、その単語に追従する項目が含まれるが、具体的に記述されてない項目が除かれないことを意味する非限定的な意味において使用される。
加えて、不定冠詞「1つの(a、an)」による要素への言及は、要素のうちの1つおよび1つだけがあることを文脈が明確に必要としていない限り、1を超える要素が存在するという可能性を排除しない。よって、不定冠詞「1つの(a、an)」は、通常「少なくとも1つ」を意味する。
本明細書および特許請求の範囲に開示されている化合物は、1つ以上の不斉中心を含んでもよく、その化合物の異なるジアステレオマーおよび/または鏡像異性体が存在し得る。本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の記載は、別記されない限り、全てのジアステレオマー、およびそれらの混合物を含むことが意味される。加えて、本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の記載は、別記されない限り、個々の鏡像異性体、ならびに鏡像異性体の任意の混合物、ラセミまたはそうでないものの両方を含むことが意味される。化合物の構造が、特定の鏡像異性体として図示されている場合、本出願の発明は、その特定の鏡像異性体に限定されないことが理解されるべきである。
化合物は、異なる互変異性型で出現し得る。本発明による化合物は、別記されない限り、全ての互変異性型を含むことが意味される。化合物の構造が、特定の互変異性体として図示されている場合、本出願の発明は、その特定の互変異性体に限定されないことが理解されるべきである。
本明細書および特許請求の範囲において開示される化合物はエキソおよびエンドジアステレオ異性体としてさらに存在し得る。別記されない限り、本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の記載は、化合物の個々のエキソおよび個々のエンドジアステレオ異性体の両方、ならびにその混合物を含むことが意味される。化合物の構造が、特定のエンドまたはエキソジアステレオマーとして図示されている場合、本出願の発明は、その特定のエンドまたはエキソジアステレオマーに限定されないことが理解されるべきである。
さらに、本明細書および特許請求の範囲において開示される化合物は、シスおよびトランス異性体として存在してもよい。別記されない限り、本明細書および特許請求の範囲における任意の化合物の記載は、化合物の個々のシスおよび個々のトランス異性体の両方、ならびにその混合物を含むことが意味される。一例として、化合物の構造が、シス異性体として図示されている場合、対応するトランス異性体またはシスおよびトランス異性体の混合物は本出願の発明から排除されないことが理解されるべきである。化合物の構造が、特定のシスまたはトランス異性体として図示されている場合、本出願の発明は、その特定のシスまたはトランス異性体に限定されないことが理解されるべきである。
非置換アルキル基は一般式C2n+1を有し、直鎖または分枝であってもよい。任意で、アルキル基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基によって置換されている。アルキル基の例としてはメチル、エチル、プロピル、2-プロピル、t-ブチル、1-ヘキシル、1-ドデシル、などが挙げられる。
シクロアルキル基は環状アルキル基である。非置換シクロアルキル基は少なくとも3つの炭素原子を含み、一般式C2n-1を有する。任意で、シクロアルキル基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基によって置換されている。シクロアルキル基の例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルおよびシクロヘキシルが挙げられる。
アルケニル基は1つ以上の炭素-炭素二重結合を含み、直鎖または分枝であってもよい。1つのC-C二重結合を含む非置換アルケニル基は一般式C2n-1を有する。2つのC-C二重結合を含む非置換アルケニル基は一般式C2n-3を有する。アルケニル基は末端炭素-炭素二重結合および/または内部炭素-炭素二重結合を含んでもよい。末端アルケニル基は、炭素-炭素二重結合が炭素鎖の末端位置に位置するアルケニル基である。アルケニル基はまた、2つ以上の炭素-炭素二重結合を含んでもよい。アルケニル基の例としては、エテニル、プロペニル、イソプロペニル、t-ブテニル、1,3-ブタジエニル、1,3-ペンタジエニル、などが挙げられる。別記されない限り、アルケニル基は、下記で定義される1つ以上の、独立して選択された、置換基で任意で置換されてもよい。別記されない限り、アルケニル基は、O、NおよびSからなる群より独立して選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断されることがある。
アルキニル基は1つ以上の炭素-炭素三重結合を含み、直鎖または分枝であってもよい。1つのC-C三重結合を含む非置換アルキニル基は一般式C2n-3を有する。アルキニル基は末端炭素-炭素三重結合および/または内部炭素-炭素三重結合を含んでもよい。末端アルキニル基は、炭素-炭素三重結合が炭素鎖の末端位置に位置するアルキニル基である。アルキニル基はまた、2つ以上の炭素-炭素三重結合を含んでもよい。別記されない限り、アルキニル基は、下記で定義される1つ以上の、独立して選択された、置換基で任意で置換されてもよい。アルキニル基の例としては、エチニル、プロピニル、イソプロピニル、t-ブチニル、などが挙げられる。別記されない限り、アルキニル基は、O、NおよびSからなる群より独立して選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断されることがある。
アリール基は6~12個の炭素原子を含み、単環式および二環式構造を含み得る。任意で、アリール基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基により置換されてもよい。アリール基の例はフェニルおよびナフチルである。
アリールアルキル基およびアルキルアリール基は少なくとも7つの炭素原子を含み、単環式および二環式構造を含み得る。任意で、アリールアルキル基およびアルキルアリールは本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基によって置換されてもよい。アリールアルキル基は例えばベンジルである。アルキルアリール基は例えば4-t-ブチルフェニルである。
ヘテロアリール基は少なくとも2つの炭素原子(すなわち、少なくともC)および1つ以上のヘテロ原子N、O、PまたはSを含む。ヘテロアリール基は単環式または二環式構造を有してもよい。任意で、ヘテロアリール基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基により置換されてもよい。好適なヘテロアリール基の例としては、ピリジニル、キノリニル、ピリミジニル、ピラジニル、ピラゾリル、イミダゾリル、チアゾリル、ピロリル、フラニル、トリアゾリル、ベンゾフラニル、インドリル、プリニル、ベンゾキサゾリル、チエニル、ホスホリルおよびオキサゾリルが挙げられる。
ヘテロアリールアルキル基およびアルキルヘテロアリール基は少なくとも3つの炭素原子(すなわち、少なくともC)を含み、単環式および二環式構造を含み得る。任意で、ヘテロアリール基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基により置換されてもよい。
アリール基が、(ヘテロ)アリール基として示される場合、表記は、アリール基およびヘテロアリール基を含むことが意味される。同様に、アルキル(ヘテロ)アリール基は、アルキルアリール基およびアルキルヘテロアリール基を含むことが意味され、(ヘテロ)アリールアルキルは、アリールアルキル基およびヘテロアリールアルキル基を含むことが意味される。よって、C-C24(ヘテロ)アリール基はC-C24ヘテロアリール基およびC-C24アリール基を含むと解釈されるべきである。同様に、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基は、C-C24アルキルアリール基およびC-C24アルキルヘテロアリール基を含むことが意味され、C-C24(ヘテロ)アリールアルキルは、C-C24アリールアルキル基およびC-C24ヘテロアリールアルキル基を含むことが意味される。
シクロアルキニル基は環状アルキニル基である。1つの三重結合を含む非置換シクロアルキニル基は一般式C2n-5を有する。任意で、シクロアルキニル基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基により置換される。シクロアルキニル基の例はシクロオクチニルである。
ヘテロシクロアルキニル基は酸素、窒素および硫黄の群から選択されるヘテロ原子により中断されるシクロアルキニル基である。任意で、ヘテロシクロアルキニル基は、本文書においてさらに特定されている1つ以上の置換基により置換される。ヘテロシクロアルキニル基の例はアザシクロオクチニルである。
(ヘテロ)アリール基は、アリール基およびヘテロアリール基を含む。アルキル(ヘテロ)アリール基はアルキルアリール基およびアルキルヘテロアリール基を含む。(ヘテロ)アリールアルキル基はアリールアルキル基およびヘテロアリールアルキル基を含む。(ヘテロ)アルキニル基はアルキニル基およびヘテロアルキニル基を含む。(ヘテロ)シクロアルキニル基はシクロアルキニル基およびヘテロシクロアルキニル基を含む。
(ヘテロ)シクロアルキン化合物は本明細書で、(ヘテロ)シクロアルキニル基を含む化合物として規定される。
本明細書および特許請求の範囲において開示される化合物のいくつかは、縮合(ヘテロ)シクロアルキン化合物、すなわち第2の環構造が、(ヘテロ)シクロアルキニル基に縮合されている、すなわち環状化されている(ヘテロ)シクロアルキン化合物として記載することができる。例えば縮合(ヘテロ)シクロオクチン化合物において、シクロアルキル(例えばシクロプロピル)またはアレーン(例えばベンゼン)は(ヘテロ)シクロオクチニル基に環状化され得る。縮合(ヘテロ)シクロオクチン化合物における(ヘテロ)シクロオクチニル基の三重結合は、3つの可能な位置、即ち、シクロオクチン部分の2位、3位または4位(“IUPAC Nomenclature of Organic Chemistry”,Rule A31.2による番号付け)のうちのいずれか1つに位置し得る。本明細書および特許請求の範囲における任意の縮合(ヘテロ)シクロオクチン化合物の記載は、シクロオクチン部分の全ての3つの個々の位置異性体を含むことが意味される。
別記されない限り、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、アルキニル基、(ヘテロ)アリール基、(ヘテロ)アリールアルキル基、アルキル(ヘテロ)アリール基、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、(ヘテロ)アリーレン基、アルキル(ヘテロ)アリーレン基、(ヘテロ)アリールアルキレン基、(ヘテロ)アリールアルケニレン基、(ヘテロ)アリールアルキニレン基、アルケニル基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、(ヘテロ)アリールオキシ基、アルキニルオキシ基およびシクロアルキルオキシ基は、C-C12アルキル基、C-C12アルケニル基、C-C12アルキニル基、C-C12シクロアルキル基、C-C12シクロアルケニル基、C-C12シクロアルキニル基、C-C12アルコキシ基、C-C12アルケニルオキシ基、C-C12アルキニルオキシ基、C-C12シクロアルキルオキシ基、ハロゲン、アミノ基、オキソおよびシリル基からなる群より独立して選択される1つ以上の置換基で置換されてもよく、ここで、シリル基は、式(R20Si-により表すことができ、ここでR20はC-C12アルキル基、C-C12アルケニル基、C-C12アルキニル基、C-C12シクロアルキル基、C-C12アルコキシ基、C-C12アルケニルオキシ基、C-C12アルキニルオキシ基およびC-C12シクロアルキルオキシ基からなる群より独立して選択され、ここで、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、シクロアルキル基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アルキニルオキシ基およびシクロアルキルオキシ基は任意で置換されており、アルキル基、アルコキシ基、シクロアルキル基およびシクロアルコキシ基はO、NおよびSからなる群より選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断されている。
「糖」という一般用語は、本明細書では、単糖、例えばグルコース(Glc)、ガラクトース(Gal)、マンノース(Man)およびフコース(Fuc)を示すために使用される。「糖誘導体」という用語は、本明細書では、単糖の糖の誘導体、すなわち、置換基および/または官能基を含む単糖の糖を示すために使用される。糖誘導体の例としては、アミノ糖類および糖酸、例えばグルコサミン(GlcNH)、ガラクトサミン(GalNH)N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、N-アセチルノイラミン酸(NeuNAc)とも呼ばれるシアル酸(Sia)、ならびにN-アセチルムラミン酸(MurNAc)、グルクロン酸(GlcA)およびイズロン酸(IdoA)が挙げられる。
「ヌクレオチド」という用語は本明細書では、その通常の科学的意味で使用される。「ヌクレオチド」という用語は、核酸塩基、5-炭素糖(リボースまたは2-デオキシリボースのいずれか)、および1、2または3つのリン酸基で構成される分子を示す。リン酸基なしで、核酸塩基および糖がヌクレオシドを構成する。よって、ヌクレオチドはまた、ヌクレオシド一リン酸、ヌクレオシド二リン酸またはヌクレオシド三リン酸と呼ぶこともできる。核酸塩基はアデニン、グアニン、シトシン、ウラシルまたはチミンであり得る。ヌクレオチドの例としては、ウリジン二リン酸(UDP)、グアノシン二リン酸(GDP)、チミジン二リン酸(TDP)、シチジン二リン酸(CDP)およびシチジン一リン酸(CMP)が挙げられる。
「タンパク質」という用語は本明細書では、その通常の科学的意味で使用される。本明細書では、約10以上のアミノ酸を含むポリペプチドはタンパク質と考えられる。タンパク質は、天然だけでなく非天然のアミノ酸を含むことがある。
「糖タンパク質」という用語は、本明細書では、その通常の科学的意味で使用され、タンパク質に共有結合された1つ以上の単糖またはオリゴ糖鎖(「グリカン」)を含むタンパク質を示す。グリカンは、タンパク質上のヒドロキシル基(O-連結グリカン)に、例えば、セリン、スレオニン、チロシン、ヒドロキシリジンまたはヒドロキシプロリンのヒドロキシル基に、またはタンパク質(N-糖タンパク質)、例えばアスパラギンまたはアルギニン上のアミド官能基に、またはタンパク質(C-糖タンパク質)、例えばトリプトファン上の炭素に付着されてもよい。糖タンパク質は1を超えるグリカンを含んでもよく、1つ以上の単糖および1つ以上のオリゴ糖グリカンの組み合わせを含んでもよく、N-連結、O-連結およびC-連結グリカンの組み合わせを含んでもよい。全てのタンパク質の50%超はグリコシル化のいくつかの形態を有し、よって、糖タンパク質として認定されることが推定される。糖タンパク質の例としては、PSMA(前立腺特異的膜抗原)、CAL(カンジダアンタルチカ(candida antartica)リパーゼ)、gp41、gp120、EPO(エリスロポエチン)、不凍タンパク質および抗体が挙げられる。
「グリカン」という用語は本明細書では、その通常の科学的意味で使用され、タンパク質に連結された単糖またはオリゴ糖鎖を示す。よって、グリカンという用語は、糖タンパク質の炭水化物部分を示す。グリカンは、さらなる置換を有さなくてもよい(単糖)、またはそのヒドロキシル基の1つ以上でさらに置換されてもよい(オリゴ糖)1つの糖のC-1炭素を介してタンパク質に付着される。天然起源のグリカンは典型的には1~約10の糖部分を含む。しかしながら、より長い糖鎖がタンパク質に連結されている場合、前記糖鎖はまた、本明細書ではグリカンとも考えられる。糖タンパク質のグリカンは単糖であってもよい。典型的には、糖タンパク質の単糖グリカンは、タンパク質に共有結合された単一のN-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、グルコース(Glc)、マンノース(Man)またはフコース(Fuc)から構成される。グリカンはまた、オリゴ糖であってもよい。糖タンパク質のオリゴ糖鎖は、直鎖または分枝であってもよい。オリゴ糖において、タンパク質に直接付着された糖はコア糖と呼ばれる。オリゴ糖では、タンパク質に直接付着されておらず、少なくとも2つの他の糖類に付着された糖は内部糖と呼ばれる。オリゴ糖では、タンパク質に直接付着されていないが、単一の他の糖に付着されている糖、すなわち、その、他のヒドロキシル基の1つ以上でさらなる糖置換基を保有しない糖は末端糖と呼ばれる。疑いを回避するため、糖タンパク質のオリゴ糖において複数の末端糖類が存在することがあるが、コア糖はたった1つである。グリカンはO-連結グリカン、N-連結グリカンまたはC-連結グリカンであってもよい。O-連結グリカンでは、単糖またはオリゴ糖グリカンは、典型的にはセリン(Ser)またはスレオニン(Thr)のヒドロキシル基を介して、タンパク質のアミノ酸におけるO-原子に結合される。N-連結グリカンでは、単糖またはオリゴ糖グリカンは、タンパク質のアミノ酸におけるN-原子を介して、典型的にはアスパラギン(Asn)またはアルギニン(Arg)の側鎖におけるアミド窒素を介して、タンパク質に結合される。C-連結グリカンでは、単糖またはオリゴ糖グリカンはタンパク質のアミノ酸におけるC-原子に、典型的にはトリプトファン(Trp)のC-原子に結合される。
「抗体」という用語は本明細書では、その通常の科学的意味で使用される。抗体は、特異抗原を認識し、結合することができる、免疫系によって生成されたタンパク質である。抗体は糖タンパク質の例である。抗体という用語は本明細書では、その最も広い意味において使用され、具体的には、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、二量体、多量体、多重特異性抗体(例えば二重特異性抗体)、抗体断片、ならびに二重鎖および単鎖抗体が挙げられる。「抗体」という用語はまた、本明細書では、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体および癌抗原に特異的に結合する抗体を含むことが意味される。「抗体」という用語は、全抗体だけでなく、抗体の抗原結合断片、例えば抗体Fab断片、F(ab’)、切断された抗体由来のFv断片もしくはFc断片、scFv-Fc断片、ミニボディ、ダイアボディまたはscFvを含むことが意味される。さらに、この用語は遺伝子操作された抗体および抗体の誘導体を含む。抗体、抗体の断片および遺伝子操作された抗体は当技術分野で知られている方法により得ることができる。抗体の典型的な例としては、とりわけ、アブシキシマブ、リツキシマブ、バシリキシマブ、パリビズマブ、インフリキシマブ、トラスツズマブ、アレムツズマブ、アダリムマブ、トシツモマブ-I131、セツキシマブ、イブリツキシマブチウキセタン(ibrituximab tiuxetan)、オマリズマブ、ベバシズマブ、ナタリズマブ、ラニビズマブ、パニツムマブ、エクリズマブ、セルトリズマブペゴル、ゴリムマブ、カナキヌマブ、カツマキソマブ、ウステキヌマブ、トシリズマブ、オファツムマブ、デノスマブ、ベリムマブ、イピリムマブおよびブレンツキシマブが挙げられる。
リンカーは本明細書で、化合物の2つ以上の要素を連結する部分として規定される。例えば、バイオコンジュゲートでは、生体分子および標的分子は、リンカーを介して互いに共有結合により連結され;リンカー-コンジュゲートでは、反応基Qはリンカーを介して標的分子に共有結合により連結され;リンカー-コンストラクトでは、反応基Qは、リンカーを介して反応基Qに共有結合により連結される。リンカーは、1つ以上のスペーサ部分を含んでもよい。
スペーサ部分は本明細書で、間隔をあける(即ち、間に距離を提供する)とともに、リンカーの2つ(またはそれ以上)の部分を一緒に共有結合により連結させる部分として規定される。リンカーは、下記で定義される通り、例えば、リンカー-コンストラクト、リンカー-コンジュゲートまたはバイオコンジュゲートの一部であり得る。
リンカー-コンストラクトは本明細書で、反応基Qがリンカーを介して反応基Qに共有結合により連結される化合物として規定される。リンカー-コンストラクトは、生体分子上に存在する反応基と反応することができる反応基Q、および標的分子上に存在する反応基と反応することができる反応基Qを含む。QおよびQは同じであってもよく、または異なっていてもよい。リンカー-コンストラクトはまた、1を超える反応基Qおよび/または1を超える反応基Qを含んでもよい。リンカー-コンストラクトはまた、Q-Sp-Qとして表されてもよく、ここで、Qは生体分子上に存在する反応基Fと反応することができる反応基であり、Qは標的分子上に存在する反応基Fと反応することができる反応基であり、Spはスペーサ部分である。リンカー-コンストラクトが1を超える反応基Qおよび/または1を超える反応基Qを含む場合、リンカー-コンストラクトは、(Q-Sp-(Qとして表され得、ここで、yは1~10の範囲の整数であり、zは1~10の範囲の整数である。好ましくは、yは1、2、3または4であり、より好ましくはyは1または2であり、最も好ましくは、yは1である。好ましくは、zは1、2、3、4、5または6であり、より好ましくはzは1、2、3または4であり、さらにいっそう好ましくはzは1、2または3であり、さらによりいっそう好ましくはzは1または2であり、最も好ましくはzは1である。より好ましくは、yは1または2であり、好ましくは1であり、zは1、2、3または4であり、さらによりいっそう好ましくはyは1または2であり、好ましくは1であり、zは1、2または3であり、さらによりいっそう好ましくはyは1または2であり、好ましくは1であり、zは1または2であり、最も好ましくはyは1であり、zは1である。
バイオコンジュゲートは本明細書で、生体分子がリンカーを介して標的分子に共有結合により連結される化合物として規定される。バイオコンジュゲートは1つ以上の生体分子および/または1つ以上の標的分子を含む。リンカーは、1つ以上のスペーサ部分を含んでもよい。
化合物が本明細書で、α端およびω端を含む化合物と呼ばれる場合、前記化合物は2つ(またはそれ以上)の端を含み、第1端がα端と呼ばれ、第2端がω端と呼ばれる。前記化合物は、2を超える端を含んでもよく、すなわち第3、第4などの端が化合物中に存在してもよい。
生体分子は本明細書で、自然から単離することができる任意の分子として、または自然から誘導される巨大分子構造の構成要素、特に核酸、タンパク質、グリカンおよび脂質であるより小さな分子ビルディングブロックから構成される任意の分子として規定される。生体分子の例としては、酵素、(非触媒)タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、アミノ酸、オリゴヌクレオチド、単糖、オリゴ糖、多糖、グリカン、脂質およびホルモンが挙げられる。
対象分子(MOI)とも呼ばれる標的分子は本明細書で、コンジュゲーションで生体分子に付与される所望の特性を有する分子構造として規定される。
「その塩」という用語は、酸性プロトン、典型的には酸のプロトンが、カチオン、例えば金属カチオンまたは有機カチオンなどによって置き換えられる場合に形成される化合物を意味する。適用可能な場合、塩は薬学的に許容される塩であるが、これは患者への投与が意図されない塩には必要とされない。例えば、化合物の塩において、化合物は無機または有機酸によってプロトン化されてもよく、カチオンを形成し、塩のアニオン性成分として無機または有機酸の共役塩基を有する。
「薬学的に許容される」塩という用語は、患者、例えば哺乳類への投与に許容される塩(所定の投与計画について許容される哺乳類安全性を有する対イオンとの塩)を意味する。そのような塩は、薬学的に許容される無機または有機塩基から、薬学的に許容される無機または有機酸から誘導され得る。「薬学的に許容される塩」は、化合物の薬学的に許容される塩を示し、この塩は当技術分野で知られている様々な有機および無機対イオンから誘導され、例えば、ナトリウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、アンモニウム、テトラアルキルアンモニウム、など、および分子が塩基性官能基を含む場合には、有機または無機酸の塩、例えば塩酸塩、臭化水素酸塩、ギ酸塩、酒石酸塩、ベシル酸塩、メシル酸塩、酢酸塩、マレイン酸塩、シュウ酸塩、などが挙げられる。
本明細書では、スルファミドリンカーおよび前記スルファミドリンカーのコンジュゲートが開示される。「スルファミドリンカー」という用語は、スルファミド基、より特定的にはアシルスルファミド基[-C(O)-N(H)-S(O)-N(R)-]および/またはカルバモイルスルファミド基[-O-C(O)-N(H)-S(O)-N(R)-]を含むリンカーを示す。
本明細書では、「治療指数」(TI)という用語は当業者によく知られている従来の意味を有し、集団の50%において所望の薬理効果に至る用量(有効用量またはED50)によって割られた、集団の50%に毒性である(すなわち、標的適応症と適合性のない発生率または重症度で有害作用を引き起こす)薬物の用量(TD50)の比を示す。よって、TI=TD50/ED50。治療指数は臨床試験により、または例えば血漿曝露試験により決定されてもよい。Muller,et al.Nature Reviews Drug Discovery 2012,11,751-761もまた、参照されたい。初期開発段階では、薬物候補の臨床TIはしばしば、まだわかっていない。しかしながら、薬物候補の予備TIを理解することは、できるだけ早く、最も重要である。というのも、TIは薬物の成功した開発の確率の重要な指標となるからである。できるだけ早期の段階で潜在的に最適以下のTIを有する薬物候補を認識すると、軽減を開始する、または資源を潜在的に再配置することが助けられる。この初期段階では、TIは典型的には、安全性(マウスまたはラットにおける最大耐容量)と有効性(マウス異種移植片における最小有効用量)の間の量的比として規定される。
本明細書では、「治療有効性」という用語はある一定の治療効果、例えば腫瘍体積の低減を達成するための物質の能力を示す。治療効果は、典型的には同じ状況下で別の物質との比較において物質が所望の効果を達成し得る程度を決定して測定することができる。治療有効性のための好適な尺度はED50値であり、これは、例えば臨床試験中に、または血漿曝露試験により決定することができる。前臨床治療有効性決定の場合、バイオコンジュゲート(例えば、ADC)の治療効果は、マウスにおける患者由来の腫瘍異種移植片により検証することができ、この場合、有効性は、有益な効果を提供するためのADCの能力を示す。あるいは齧歯類安全性研究における前記ADCの耐容性はまた、治療効果の尺度となり得る。
本明細書では、「耐容性」という用語は、標的適応症と適合性のない発生率または重症度で有害作用を引き起こさない特定の物質の最高用量を示す。特定の物質についての耐容性の好適な尺度はTD50値であり、これは、例えば臨床試験中、または血漿曝露試験により決定することができる。
リンカー
本発明によるバイオコンジュゲートは生体分子Bと標的分子Dを連結させるリンカーLを含む。リンカーは式(1)に従う基またはその塩を含み:
Figure 2022058417000003

式中:
-aは0または1であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRはさらなる標的分子Dであり、ここでDは任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
式(1)の基が塩を含む場合、塩は好ましくは薬学的に許容される塩である。
好ましい実施形態では、本発明によるリンカーLは式(1)に従う基(式中、aは0である)、またはその塩を含む。この実施形態では、よって、リンカーLは式(2)に従う基またはその塩を含み:
Figure 2022058417000004

式中、Rは以上で規定される通りである。
別の好ましい実施形態では、本発明によるリンカーLは式(1)に従う基(式中、aは1である)、またはその塩を含む。この実施形態では、よって、リンカーLは式(3)に従う基またはその塩を含み:
Figure 2022058417000005

式中、Rは以上で規定される通りである。
式(1)、(2)および(3)による基では、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRはさらなる標的分子Dであり、ここでDは任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
好ましい実施形態では、Rは水素またはC-C20アルキル基であり、より好ましくは、Rは水素またはC-C16アルキル基であり、さらにいっそう好ましくは、Rは水素またはC-C10アルキル基であり、ここで、アルキル基は任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOにより任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基からなる群より独立して選択される。好ましい実施形態では、Rは水素である。別の好ましい実施形態では、RはC-C20アルキル基、より好ましくはC-C16アルキル基、さらにいっそう好ましくはC-C10アルキル基であり、ここで、アルキル基は、1つ以上のO-原子により任意で中断され、ここで、アルキル基は、-OH基、好ましくは末端-OH基で任意で置換される。この実施形態では、Rは末端-OH基を含む(ポリ)エチレングリコール鎖であることが、さらに好ましい。別の好ましい実施形態では、Rは水素、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルおよびt-ブチルからなる群より、より好ましくは水素、メチル、エチル、n-プロピルおよびi-プロピルからなる群より、さらにいっそう好ましくは水素、メチルおよびエチルからなる群より選択される。さらによりいっそう好ましくは、Rは水素またはメチルであり、最も好ましくは、Rは水素である。
別の好ましい実施形態では、Rはさらなる標的分子Dである。任意で、Dは1つ以上のスペーサ部分を介してNに連結される。スペーサ部分は、存在する場合、DとNとの間に間隔をあけ、すなわち、特定の距離を提供し、DおよびNを共有結合により連結する部分として規定される。
バイオコンジュゲーションの分野における標的分子は当業者に知られており、ペイロードとも呼ばれ得る。標的分子Dは、活性物質、レポーター分子、ポリマ、固体表面、ヒドロゲル、ナノ粒子、微小粒子および生体分子からなる群より選択され得る。
Dとの関連で、「活性物質」という用語は、薬理学的および/または生物学的物質、すなわち生物学的におよび/または薬学的に活性である物質、例えば薬物、プロドラッグ、診断薬、タンパク質、ペプチド、ポリペプチド、ペプチドタグ、アミノ酸、グリカン、脂質、ビタミン、ステロイド、ヌクレオチド、ヌクレオシド、ポリヌクレオチド、RNAまたはDNAに関する。ペプチドタグの例としては、ヒトラクトフェリンまたはポリアルギニンのような細胞透過性ペプチドが挙げられる。グリカンの例はオリゴマンノースである。アミノ酸の例はリジンである。
標的分子が活性物質である場合、活性物質は好ましくは薬物およびプロドラッグからなる群より選択される。より好ましくは、活性物質は薬学的に活性な化合物、特に低~中分子量化合物(例えば約200~約2500Da、好ましくは約300~約1750Da)からなる群より選択される。さらに好ましい実施形態では、活性物質は細胞毒、抗ウイルス薬、抗菌薬、ペプチドおよびオリゴヌクレオチドからなる群より選択される。細胞毒の例としては、コルヒチン、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タキサン、カリケアマイシン(calicheamycin)、ツブリシン、イリノテカン、阻害ペプチド、アマニチン、デボウガニン(deBouganin)、デュオカルマイシン、マイタンシン、アウリスタチンまたはピロロベンゾジアゼピン(PBD)が挙げられる。それらの難水溶性を考慮すると、好ましい活性物質としては、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、タキサン、ツブリシン、アマニチン、デュオカルマイシン、マイタンシン、アウリスタチンおよびピロロベンゾジアゼピン、特にビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、タキサン、ツブリシン、アマニチン、マイタンシンおよびアウリスタチンが挙げられる。
「レポーター分子」という用語は、本明細では、存在が容易に検出される分子、例えば診断薬、色素、フルオロフォア、放射性同位元素標識、造影剤、磁気共鳴イメージング剤または質量標識を示す。
蛍光プローブとも呼ばれる多種多様のフルオロフォアが、当業者に知られている。いくつかのフルオロフォアが、例えばG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013,Chapter 10:“Fluorescent probes”,p.395-463(参照により組み込まれる)においてより詳細に記載されている。フルオロフォアの例としては、Alexa Fluorの全ての種類(例えばAlexa Fluor 555)、シアニン色素(例えばCy3またはCy5)およびシアニン色素誘導体、クマリン誘導体、フルオレセインおよびフルオレセイン誘導体、ローダミンおよびローダミン誘導体、ホウ素ジピロメテン誘導体、ピレン誘導体、ナフタルイミド誘導体、フィコビリンタンパク質誘導体(例えばアロフィコシアニン)、クロモマイシン、ランタニドキレートならびに量子ドットナノ結晶が挙げられる。それらの難水溶性を考慮すると、好ましいフルオロフォアとしては、シアニン色素、クマリン誘導体、フルオレセインおよびその誘導体、ピレン誘導体、ナフタルイミド誘導体、クロモマイシン、ランタニドキレートならびに量子ドットナノ結晶、特にクマリン誘導体、フルオレセイン、ピレン誘導体およびクロモマイシンが挙げられる。
放射性同位元素標識の例としては、任意で、例えばDTPA(ジエチレントリアミン五酢酸無水物)、DOTA(1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-N,N’,N”,N’’’-四酢酸)、NOTA(1,4,7-トリアザシクロノナンN,N’,N”-三酢酸)、TETA(1,4,8,11-テトラアザシクロテトラデカン-N,N’,N”,N’’’-四酢酸)、DTTA(N-(p-イソチオシアナトベンジル)-ジエチレントリアミン-N,N,N,N-四酢酸)、デフェロキサミンまたはDFA(N’-[5-[[4-[[5-(アセチルヒドロキシアミノ)ペンチル]アミノ]-1,4-ジオキソブチル]ヒドロキシアミノ]ペンチル]-N-(5-アミノペンチル)-N-ヒドロキシブタンジアミド)またはHYNIC(ヒドラジノニコチンアミド)などのキレート部分を介して連結された99mTc、111In、114mIn、115In,18F、14C、64Cu、131I、125I、123I、212Bi、88Y、90Y、67Cu、186Rh、188Rh、66Ga、67Gaおよび10Bが挙げられる。同位元素標識技術は当業者に知られており、例えばG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013,Chapter 12:“Isotopic labelling techniques”,p.507-534(参照により組み込まれる)に、より詳細に記載されている。
本発明による化合物における標的分子Dとしての使用に好適なポリマは当業者に知られており、いくつかの例が、例えばG.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013,Chapter 18:“PEGylation and synthetic polymer modification”,p.787-838(参照により組み込まれる)に、より詳細に記載されている。標的分子Dがポリマである場合、標的分子Dは好ましくは、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリエチレンオキシド(PEO)、ポリプロピレングリコール(PPG)、ポリプロピレンオキシド(PPO)、1,x-ジアミノアルカンポリマ(ここで、xはアルカン中の炭素原子の数であり、好ましくはxは2~200、好ましくは2~10の範囲の整数である)、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば、1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタンおよびより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、多糖(例えばデキストラン)、ポリ(アミノ酸)(例えば、ポリ(L-リジン))およびポリ(ビニルアルコール)からなる群より独立して選択される。それらの難水溶性を考慮すると、好ましいポリマとしては、1,x-ジアミノアルカンポリマおよびポリ(ビニルアルコール)が挙げられる。
標的分子Dとしての使用に好適な固体表面は当業者に知られている。固体表面は、例えば機能性表面(例えば、ナノ材料、カーボンナノチューブ、フラーレンまたはウイルスカプシドの表面)、金属表面(例えばチタン、金、銀、銅、ニッケル、スズ、ロジウムまたは亜鉛表面)、金属合金表面(ここで、合金は、例えばアルミニウム、ビスマス、クロム、コバルト、銅、ガリウム、金、インジウム、鉄、鉛、マグネシウム、水銀、ニッケル、カリウム、プルトニウム、ロジウム、スカンジウム、銀、ナトリウム、チタン、スズ、ウラン、亜鉛および/またはジルコニウム由来である)、ポリマ表面(ここで、ポリマは、例えばポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリ(ジメチルシロキサン)またはポリメチルメタクリレート、ポリアクリルアミドである)、ガラス表面、シリコーン表面、クロマトグラフィー支持体表面(ここで、クロマトグラフィー支持体は例えばシリカ支持体、アガロース支持体、セルロース支持体またはアルミナ支持体である)、などである。標的分子Dが固体表面である場合、Dは機能性表面またはポリマ表面からなる群より独立して選択されることが好ましい。
ヒドロゲルは当業者に知られている。ヒドロゲルはポリマ構成要素間の架橋により形成される水膨潤ネットワークである。例えば、A.S.Hoffman,Adv.Drug Delivery Rev.2012,64,18(参照により組み込まれる)を参照されたい。標的分子がヒドロゲルである場合、ヒドロゲルは、ポリマ基礎としてポリ(エチレン)グリコール(PEG)から構成されることが好ましい。
標的分子Dとしての使用に好適なミクロおよびナノ粒子は当業者に知られている。様々な好適なミクロおよびナノ粒子は、例えば、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013,Chapter 14:“Microparticles and nanoparticles”,p.549-587(参照により組み込まれる)に記載される。ミクロまたはナノ粒子は、任意の形状、例えば球体、ロッド、チューブ、立方体、三角形および円錐であり得る。好ましくは、ミクロまたはナノ粒子は球状形状である。ミクロおよびナノ粒子の化学組成は変動し得る。標的分子Dがミクロまたはナノ粒子である場合、ミクロまたはナノ粒子は、例えば、ポリマミクロまたはナノ粒子、シリカミクロまたはナノ粒子または金ミクロまたはナノ粒子である。粒子がポリマミクロまたはナノ粒子である場合、ポリマは好ましくはポリスチレンまたはスチレンのコポリマ(例えば、スチレンとジビニルベンゼン、ブタジエン、アクリレートおよび/またはビニルトルエンのコポリマ)、ポリメチルメタクリレート(PMMA)、ポリビニルトルエン、ポリ(ヒドロキシエチルメタクリレート(pHEMA)またはポリエチレングリコールジメタクリレート/2-ヒドロキシエチルメタクリレート)[ポリ(EDGMA/HEMA)]である。任意で、ミクロまたはナノ粒子の表面は、例えば、界面活性剤を用いて、二次ポリマのグラフト重合により、または別のポリマもしくはスペーサ部分の共有結合による付着により、などにより修飾される。
標的分子Dはまた、生体分子であってもよい。生体分子、およびその好ましい実施形態は、より詳細に下記に記載されている。標的分子Dが生体分子である場合、生体分子はタンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、脂質、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖類、オリゴ糖類、酵素、ホルモン、アミノ酸および単糖類からなる群より選択されることが好ましい。
式(A)のバイオコンジュゲートを得るために、式(1)の基は、3つの選択肢のうちの1つに導入することができる。まず第1に、式(1)に従う基またはその塩を含むリンカーLはQ-Dにより表されるリンカー-コンジュゲート中に存在することができ、ここで、LはQとDの間のスペーサである。第2に、式(1)に従う基またはその塩を含むリンカーLは、B-Fにより表される生体分子中に存在することができ、ここで、Lは、BとFの間のスペーサである。第3に、式(1)に従う基またはその塩はコンジュゲーション反応自体中に形成され得る。後者の選択肢において、QおよびFは、それらの反応生成物、すなわち連結基Zが式(1)に従う基またはその塩を含む、または式(1)に従う基またはその塩であるように選択される。好ましくは、式(1)に従う基またはその塩は上記選択肢のうちの第1または第2に従って導入され、最も好ましくは第1の選択肢に従って導入される。式(1)に従う基またはその塩がコンジュゲーション反応中にそのようなものとしてすでに存在する場合、溶解度およびインプロセス凝集の非存在に対するプラス効果、上記で列挙されるように、コンジュゲーション反応の効率を改善する。式(1)に従う基またはその塩がリンカー-コンジュゲート中に存在する場合、疎水性薬物であっても、コンジュゲーション反応に容易に供することができる。
リンカー-コンジュゲート
リンカー-コンジュゲートは、Q-Dにより、好ましくはQ-L-Dにより表され、ここで、Dは標的分子であり、Lはさらに以上で規定されている通りのQおよびDを連結するリンカーであり、Qは生体分子上の官能基Fと反応することができる反応基であり、「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分である。1つの実施形態では、「-」は本明細書で規定される通りのスペーサ部分である。1つの実施形態では、「-」は、結合、典型的には共有結合である。リンカー-コンジュゲートは、標的分子が、好ましくはリンカーまたはスペーサを介して、最も好ましくは以上で規定されるリンカーLを介して、反応基Qに共有結合により連結される化合物である。リンカー-コンジュゲートは、リンカー-コンストラクト上に存在する反応基Qの標的分子上に存在する反応基との反応を介して得られ得る。
好ましくは、式(1)に従う基、またはその塩はQとDの間に位置する。言い換えれば、反応基Qは式(1)に従う基の第1の端に共有結合により結合され、標的分子Dは式(1)に従う基の第2の端に共有結合により結合される。本明細書では、「第1の端」および「第2の端」はどちらも、式(1)に従う基のカルボニルまたはカルボキシ端または式(1)に従う基のスルファミド端のいずれかを示すが、論理的には同じ端を示していない。
当業者によって認識されるように、本発明によるリンカー-コンジュゲートは、1を超える標的分子D、例えば2、3、4、5つなどを含んでもよい。その結果として、リンカー-コンジュゲートは、よって、1を超える「第2の端」を含んでもよい。同様に、リンカー-コンジュゲートは、1を超える反応基Qを含んでもよく、すなわち、リンカー-コンジュゲートは、1を超える第1の端を含んでもよい。1を超える反応基Qが存在する場合、基Qは同じか、または異なってもよく、1を超える標的分子Dが存在する場合、標的分子Dは同じか、または異なっていてもよい。
本発明によるリンカー-コンジュゲートはそのため、(QSp(D)と表すこともでき、ここで、yは1~10の範囲の整数であり、zは1~10の範囲の整数である。本明細書では:
-yは1~10の範囲の整数であり;
-zは1~10の範囲の整数であり;
-Qは生体分子上に存在する官能基Fと反応することができる反応基であり;
-Dは、標的分子であり;
-Spはスペーサ部分であり、ここでスペーサ部分は反応基Qおよび標的分子Dの間隔をあける(すなわち、その間にある一定の距離を提供する)と共に、それらを共有結合により連結させる部分として規定され、好ましくはここで、前記スペーサ部分は以上で規定されるリンカーLであり、よって式(1)に従う基またはその塩を含む。
好ましくは、yは1、2、3または4であり、より好ましくはyは1または2であり、最も好ましくは、yは1である。好ましくは、zは1、2、3、4、5または6であり、より好ましくはzは1、2、3または4であり、さらにいっそう好ましくはzは1、2または3であり、さらによりいっそう好ましくはzは1または2であり、最も好ましくはzは1である。より好ましくは、yは1または2であり、好ましくは1であり、zは1、2、3または4であり、さらによりいっそう好ましくはyは1または2であり、好ましくは1であり、zは1、2または3であり、さらによりいっそう好ましくはyは1または2であり、好ましくは1であり、zは1または2であり、最も好ましくはyは1であり、zは1である。好ましい実施形態では、リンカー-コンジュゲートは式QSp(D)、QSp(D)、QSp(D)またはQSpDに従うものである。
標的分子Dは以上で規定される。Dは好ましくは「活性物質」または「薬学的に活性な物質」であり、薬理学的および/または生物学的物質、すなわち生物学的におよび/または薬学的に活性な物質、例えば薬物、プロドラッグ、診断薬を示す。好ましくは、活性物質は、薬物およびプロドラッグからなる群より選択される。より好ましくは、活性物質は薬学的に活性な化合物、特に低~中分子量化合物(例えば約200~約2500Da、好ましくは約300~約1750Da)である。さらに好ましい実施形態では、活性物質は細胞毒、抗ウイルス薬、抗菌薬、ペプチドおよびオリゴヌクレオチドからなる群より選択される。細胞毒の例としては、コルヒチン、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タキサン、カリケアマイシン(calicheamycin)、ツブリシン、イリノテカン、阻害ペプチド、アマニチン、デボウガニン(deBouganin)、デュオカルマイシン、マイタンシン、アウリスタチンまたはピロロベンゾジアゼピン(PBD)が挙げられる。好ましい活性物質としては、ビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、タキサン、ツブリシン、アマニチン、デュオカルマイシン、マイタンシン、アウリスタチンおよびピロロベンゾジアゼピン、特にビンカアルカロイド、アントラサイクリン、カンプトテシン、タキサン、ツブリシン、アマニチン、マイタンシンおよびアウリスタチンが挙げられる。
リンカー-コンジュゲートは、生体分子上に存在する官能基Fと反応することができる反応基Qを含む。官能基は当業者に知られており、それを保有する分子に特定の特性を付与する任意の分子実体と規定することができる。例えば、生体分子における官能基はアミノ基、チオール基、カルボン酸、アルコール基、カルボニル基、リン酸基、または芳香族基を構成することができる。生体分子における官能基は天然に存在し得るか、または特定の技術、例えば(生)化学または遺伝的技術により生体分子に入れることができる。生体分子に入れられる官能基は本来天然に存在する官能基であってもよく、または化学合成により調製される官能基であってもよく、例えばアジド、末端アルキンまたはホスフィン部分である。本明細書では、「反応基」という用語は官能基を含むある一定の基を示してもよいが、官能基それ自体を示してもよい。例えば、シクロオクチニル基は官能基、すなわちC-C三重結合を含む反応基である。同様に、N-マレイミジル基は官能基としてC-C二重結合を含む反応基である。しかしながら、官能基、例えばアジド官能基、チオール官能基またはアミノ官能基は本明細書で、反応基とも呼ばれ得る。
リンカー-コンジュゲートは、1を超える反応基Qを含んでもよい。リンカー-コンジュゲートが2つ以上の反応基Qを含む場合、反応基Qは、互いに異なっていてもよい。好ましくは、リンカー-コンジュゲートは1つの反応基Qを含む。
リンカー-コンジュゲート中に存在する反応基Qは、生体分子中に存在する官能基Fと反応し、連結基Zを形成することができる。言い換えれば、反応基Qは、生体分子中に存在する官能基Fに相補的であることが必要とされる。本明細書では、前記反応基が、任意で他の官能基の存在下で、前記官能基と選択的に反応し、連結基Zを形成する場合、反応基は、官能基に「相補的」として示される。相補的反応基および官能基は当業者に知られており、より詳細に下記に記載されている。好ましくは、反応基Qおよび官能基Fは生体直交型反応において反応することができ、というのも、それらの反応はこの反応中に存在する生体分子を妨害しないからである。生体直交型反応およびそれらにおいて好適な官能基は、例えばGong and Pan,Tetrahedron Lett.2015,56,2123-2132から当業者に知られており、シュタウディンガーライゲーションおよび銅を含まないクリックケミストリーが挙げられる。よって、Qは1,3-双極子、アルキン、(ヘテロ)シクロオクチン、シクロオクテン、テトラジン、ケトン、アルデヒド、アルコキシアミン、ヒドラジンおよびトリフェニルホスフィンからなる群より選択されることが好ましい。
好ましい実施形態では、反応基Qは、任意で置換された、N-マレイミジル基、ハロゲン化N-アルキルアミド基、スルホニルオキシN-アルキルアミド基、エステル基、カーボネート基、ハロゲン化スルホニル基、チオール基またはその誘導体、アルケニル基、アルキニル基、(ヘテロ)シクロアルキニル基、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基、シクロアルケニル基、テトラジニル基、アジド基、ホスフィン基、ニトリルオキシド基、ニトロン基、ニトリルイミン基、ジアゾ基、ケトン基、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基、ヒドラジン基、ハロゲン化N-マレイミジル基、1,1-ビス(スルホニルメチル)メチルカルボニル基またはその脱離誘導体、ハロゲン化カルボニル基、アレンアミド基、1,2-キノン基またはトリアジン基からなる群より選択される。
好ましい実施形態では、QはN-マレイミジル基である。QがN-マレイミジル基である場合、Qは好ましくは非置換である。Qは、よって、好ましくは、下記に示されるように、式(9a)に従う。そのようなマレイミジル基の好ましい例は2,3-ジアミノプロピオン酸(DPR)マレイミジルであり、これは、カルボン酸部分を介して、リンカー-コンジュゲートの残りに連結され得る。
別の好ましい実施形態では、Qはハロゲン化N-アルキルアミド基である。Qがハロゲン化N-アルキルアミド基である場合、Qは、下記に示されるように、式(9b)に従うことが好ましく、ここで、kは1~10の範囲の整数であり、Rは-Cl、-Brおよび-Iからなる群より選択される。好ましくはkは1、2、3または4であり、より好ましくはkは1または2であり、最も好ましくはkは1である。好ましくは、Rは-Iまたは-Brである。より好ましくは、kは1または2であり、Rは-Iまたは-Brであり、最も好ましくはkは1であり、Rは-IまたはBrである。
別の好ましい実施形態では、QはスルホニルオキシN-アルキルアミド基である。QがスルホニルオキシN-アルキルアミド基である場合、Qは、下記に示されるように、式(9b)に従うことが好ましく、ここで、kは1~10の範囲の整数であり、Rは-O-メシル、-O-フェニルスルホニルおよび-O-トシルからなる群より選択される。好ましくはkは1、2、3または4であり、より好ましくはkは1または2であり、さらにいっそう好ましくはkは1である。最も好ましくはkは1であり、Rは-O-メシル、-O-フェニルスルホニルおよび-O-トシルからなる群より選択される。
別の好ましい実施形態では、Qはエステル基である。Qがエステル基である場合、エステル基は活性化エステル基であることが好ましい。活性化エステル基は当業者に知られている。活性化エステル基は本明細書で、良好な脱離基を含むエステル基として規定され、ここで、エステルカルボニル基は前記良好な脱離基に結合される。良好な脱離基は当業者に知られている。活性化エステルは、下記に示されるように、式(9c)に従うことが、さらに好ましく、ここで、Rは-N-スクシンイミジル(NHS)、-N-スルホ-スクシンイミジル(スルホ-NHS)、-(4-ニトロフェニル)、-ペンタフルオロフェニルまたは-テトラフルオロフェニル(TFP)からなる群より選択される。
別の好ましい実施形態では、Qはカーボネート基である。Qがカーボネート基である場合、カーボネート基は活性化カーボネート基であることが好ましい。活性化カーボネート基は当業者に知られている。活性化カーボネート基は本明細書で、良好な脱離基を含むカーボネート基として規定され、ここで、カーボネートカルボニル基は前記良好な脱離基に結合される。カーボネート基は、下記に示されるように、式(9d)に従うことが、さらに好ましく、ここで、Rは-N-スクシンイミジル、-N-スルホ-スクシンイミジル、-(4-ニトロフェニル)、-ペンタフルオロフェニルまたは-テトラフルオロフェニルからなる群より選択される。
別の好ましい実施形態では、Qは、下記に示されるように、式(9e)によるハロゲン化スルホニル基であり、ここで、XはF、Cl、BrおよびIからなる群より選択される。好ましくは、XはClまたはBrであり、より好ましくはClである。
別の好ましい実施形態では、Qはチオール基(9f)、またはチオール基の誘導体もしくは前駆体である。チオール基は、メルカプト基とも呼ばれ得る。Qがチオール基の誘導体または前駆体である場合、チオール誘導体は、好ましくは、下記に示されるように、式(9g)、(9h)または(9zb)に従い、ここで、Rは、任意で置換されたC-C12アルキル基またはC-C12(ヘテロ)アリール基であり、VはOまたはSであり、R16は、任意で置換されたC-C12アルキル基である。より好ましくは、Rは、任意で置換された、C-Cアルキル基またはC-C(ヘテロ)アリール基であり、さらにいっそう好ましくは、Rはメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル、t-ブチルまたはフェニルである。さらにいっそう好ましくは、Rはメチルまたはフェニルであり、最も好ましくはメチルである。より好ましくは、R16は任意で置換されたC-Cアルキル基であり、さらにいっそう好ましくは、R16はメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルまたはt-ブチルであり、最も好ましくはメチルである。Qが式(9g)または(9zb)に従うチオール-誘導体であり、Qが、生体分子上の反応基Fと反応させられる場合、前記チオール-誘導体はプロセス中にチオール基に変換される。Qが式(9h)に従う場合、Qは-SC(O)ORまたは-SC(S)OR、好ましくはSC(O)ORであり、ここで、Rおよびその好ましい実施形態は以上で規定される通りである。
別の好ましい実施形態では、Qはアルケニル基であり、ここで、アルケニル基は直鎖または分枝であり、ここで、アルケニル基は任意で置換される。アルケニル基は末端または内部アルケニル基であってもよい。アルケニル基は、1を超えるC-C二重結合を含んでもよく、そうであるならば、好ましくは、2つのC-C二重結合を含む。アルケニル基がジエニル基である場合、2つのC-C二重結合は1つのC-C単結合により分離されていることが、さらに好ましい(すなわち、ジエニル基は共役ジエニル基であることが好ましい)。好ましくは、前記アルケニル基はC-C24アルケニル基、より好ましくはC-C12アルケニル基、さらにいっそう好ましくはC-Cアルケニル基である。アルケニル基は末端アルケニル基であることが、さらに好ましい。より好ましくは、アルケニル基は下記に示されるように、式(9i)に従い、ここで、lは0~10の範囲、好ましくは0~6の範囲の整数であり、pは0~10、好ましくは0~6の範囲の整数である。より好ましくは、lは0、1、2、3または4であり、より好ましくはlは0、1または2であり、最も好ましくはlは0または1である。より好ましくは、pは0、1、2、3または4であり、より好ましくはpは0、1または2であり、最も好ましくはpは0または1である。pは0であり、lは0または1である、またはpは1であり、lは0または1であることが特に好ましい。
別の好ましい実施形態では、Qはアルキニル基であり、ここでアルキニル基は直鎖または分枝であり、アルキニル基は任意で置換される。アルキニル基は末端または内部アルキニル基であってもよい。好ましくは、前記アルキニル基はC-C24アルキニル基、より好ましくはC-C12アルキニル基、さらにいっそう好ましくはC-Cアルキニル基である。アルキニル基は末端アルキニル基であることが、さらに好ましい。より好ましくは、アルキニル基は下記に示されるように、式(9j)に従い、ここで、lは0~10の範囲、好ましくは0~6の範囲の整数である。より好ましくは、lは0、1、2、3または4であり、より好ましくはlは0、1または2であり、最も好ましくはlは0または1である。さらに好ましい実施形態では、アルキニル基は式(9j)に従い、ここでlは3である。
別の好ましい実施形態では、Qはシクロアルケニル基である。シクロアルケニル基は任意で置換される。好ましくは、前記シクロアルケニル基はC-C24シクロアルケニル基、より好ましくはC-C12シクロアルケニル基、さらにいっそう好ましくはC-Cシクロアルケニル基である。好ましい実施形態では、シクロアルケニル基はtrans-シクロアルケニル基、より好ましくはtrans-シクロオクテニル基(TCO基とも呼ばれる)であり、最も好ましくは下記に示されるように、式(9zi)または(9zj)に従うtrans-シクロオクテニル基である。別の好ましい実施形態では、シクロアルケニル基はシクロプロペニル基であり、ここでシクロプロペニル基は任意で置換される。別の好ましい実施形態では、シクロアルケニル基はノルボルネニル基、オキサノルボルネニル基、ノルボルナジエニル基またはオキサノルボルナジエニル基であり、ここで、ノルボルネニル基、オキサノルボルネニル基、ノルボルナジエニル基またはオキサノルボルナジエニル基は任意で置換される。さらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基は下記に示されるように、式(9k)、(9l)、(9m)または(9zc)に従い、ここで、TはCHまたはOであり、Rは水素、直鎖もしくは分枝C-C12アルキル基またはC-C12(ヘテロ)アリール基からなる群より独立して選択され、R19は水素およびフッ素化炭化水素からなる群より選択される。好ましくは、Rは独立して水素またはC-Cアルキル基であり、より好ましくは、Rは独立して水素またはC-Cアルキル基である。さらにいっそう好ましくは、Rは独立して水素またはメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルもしくはt-ブチルである。さらによりいっそう好ましくは、Rは独立して水素またはメチルである。さらに好ましい実施形態では、R19は、水素ならびに-CF、-C、-Cおよび-C、より好ましくは水素および-CFの群から選択される。さらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基は式(9k)に従い、ここで、一方のRは水素であり、他方のRはメチル基である。別のさらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基は式(9l)に従い、ここで、両Rは水素である。これらの実施形態ではlは0または1であることが、さらに好ましい。別のさらに好ましい実施形態では、シクロアルケニル基は、式(9m)に従うノルボルネニル(TはCHである)もしくはオキサノルボルネニル(TはOである)基、または式(9zc)に従うノルボルナジエニル(TはCHである)もしくはオキサノルボルナジエニル(TはOである)基であり、ここで、Rは水素であり、R19は水素または-CF、好ましくは-CFである。
別の好ましい実施形態では、Qは(ヘテロ)シクロアルキニル基である。(ヘテロ)シクロアルキニル基は任意で置換される。好ましくは、(ヘテロ)シクロアルキニル基は(ヘテロ)シクロオクチニル基、すなわちヘテロシクロオクチニル基またはシクロオクチニル基であり、ここで、(ヘテロ)シクロオクチニル基は任意で置換される。さらに好ましい実施形態では、(ヘテロ)シクロオクチニル基は1つ以上のハロゲン原子、好ましくはフッ素原子で置換され、より好ましくは(ヘテロ)シクロオクチニル基は、モノ-フルオロ-シクロオクトシン(octcyne)(MCFO)におけるように、1つのフッ素原子で置換される。好ましくは、モノ-フルオロ-シクロオクトシン(octcyne)基は式(9zo)に従う。さらに好ましい実施形態では、(ヘテロ)シクロオクチニル基は、DIBO基とも呼ばれる式(9n)、DIBAC基とも呼ばれる(9o)、またはBARAC基とも呼ばれる(9p)、またはCOMBO基とも呼ばれる(9zk)に従い、全て下記に示される通りであり、ここでUはOまたはNRであり、およびRの好ましい実施形態は以上で規定される通りである。(9n)における芳香環は任意で、1つ以上の位置でO-スルホニル化され、一方、(9o)および(9p)の環は1つ以上の位置でハロゲン化され得る。(9n)では、Uは好ましくはOである。
とりわけ好ましい実施形態では、化合物(4b)におけるRに付着された窒素原子はヘテロシクロアルキン基の環中の窒素原子、例えば(9o)における窒素原子である。言い換えれば、c、dおよびgは化合物(4b)において0であり、RおよびQ、それらに付着された窒素原子と一緒に、ヘテロシクロアルキン基、好ましくはヘテロシクロオクチン基、最も好ましくは式(9o)または(9p)に従うヘテロシクロオクチン基を形成する。本明細書では、(9o)のカルボニル部分は、式(1)に従う基のスルホニル基により置き換えられる。あるいは、Rに付着された窒素原子は式(9n)においてUと指定された原子と同じ原子である。言い換えれば、Qが式(9n)に従う場合、Uは式(1)に従う基の右の窒素原子であってもよく、またはU=NRであり、Rは式(1)に従う基の残りであり、Rはシクロオクチン部分である。
別の好ましい実施形態では、Qは、BCN基とも呼ばれる、任意で置換された、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基である。好ましくは、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基は下記に示されるように、式(9q)に従う。
別の好ましい実施形態では、QはDiels-Alder反応において反応することができる共役(ヘテロ)ジエン基である。好ましい(ヘテロ)ジエン基としては、任意で置換されたテトラジニル基、任意で置換された1,2-キノン基および任意で置換されたトリアジン基が挙げられる。より好ましくは、前記テトラジニル基は、下記に示されるように、式(9r)に従い、式中、Rは水素、直鎖または分枝C-C12アルキル基またはC-C12(ヘテロ)アリール基からなる群より選択される。好ましくは、Rは水素、C-Cアルキル基またはC-C10(ヘテロ)アリール基であり、より好ましくは、Rは水素、C-Cアルキル基またはC-C(ヘテロ)アリール基である。さらにいっそう好ましくは、Rは水素、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル、t-ブチルまたはピリジルである。さらによりいっそう好ましくは、Rは水素、メチルまたはピリジルである。より好ましくは、前記1,2-キノン基は式(9zl)または(9zm)に従う。前記トリアジン基は任意の位置異性体であってもよい。より好ましくは、前記トリアジン基は1,2,3-トリアジン基または1,2,4-トリアジン基であり、これは、例えば式(9zn)において示される任意の可能な位置を介して付着されてもよい。1,2,3-トリアジンはトリアジン基として最も好ましい。
別の好ましい実施形態では、Qは下記に示される式(9s)に従うアジド基である。
別の好ましい実施形態では、Qは、シュタウディンガーライゲーション反応を受けるのに好適な、任意で置換された、トリアリールホスフィン基である。好ましくは、ホスフィン基は下記に示される式(9t)に従い、式中、R10は(チオ)エステル基である。R10が(チオ)エステル基である場合、R10は-C(O)-V-R11であることが好ましく、ここで、VはOまたはSであり、R11はC-C12アルキル基である。好ましくは、R11はC-Cアルキル基であり、より好ましくはC-Cアルキル基である。最も好ましくは、R11はメチル基である。
別の好ましい実施形態では、Qは下記に示される式(9u)に従うニトリルオキシド基である。
別の好ましい実施形態では、Qはニトロン基である。好ましくはニトロン基は、下記に示される式(9v)に従い、式中、R12は直鎖または分枝C-C12アルキル基およびC-C12アリール基からなる群より選択される。好ましくは、R12はC-Cアルキル基であり、より好ましくは、R12はC-Cアルキル基である。さらにいっそう好ましくは、R12はメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルまたはt-ブチルである。さらによりいっそう好ましくは、R12はメチルである。
別の好ましい実施形態では、Qはニトリルイミン基である。好ましくは、ニトリルイミン基は下記に示される式(9w)または(9zd)に従い、式中、R13は直鎖または分枝C-C12アルキル基およびC-C12アリール基からなる群より選択される。好ましくは、R13はC-Cアルキル基であり、より好ましくは、R13はC-Cアルキル基である。さらにいっそう好ましくは、R13はメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルまたはt-ブチルである。さらによりいっそう好ましくは、R13はメチルである。
別の好ましい実施形態では、Qはジアゾ基である。好ましくは、ジアゾ基は下記に示される式(9x)に従い、式中、R14は水素またはカルボニル誘導体からなる群より選択される。より好ましくは、R14は水素である。
別の好ましい実施形態では、Qはケトン基である。より好ましくは、ケトン基は下記に示される式(9y)に従い、式中、R15は直鎖または分枝C-C12アルキル基およびC-C12アリール基からなる群より選択される。好ましくは、R15はC-Cアルキル基であり、より好ましくは、R15はC-Cアルキル基である。さらにいっそう好ましくは、R15はメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルまたはt-ブチルである。さらによりいっそう好ましくは、R15はメチルである。
別の好ましい実施形態では、Qは(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基である。より好ましくは、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基は下記に示される式(9z)に従う。
別の好ましい実施形態では、Qはヒドラジン基である。好ましくは、ヒドラジン基は下記に示される式(9za)に従う。
別の好ましい実施形態では、Qはハロゲン化N-マレイミジル基またはスルホニル化N-マレイミジル基である。Qがハロゲン化またはスルホニル化N-マレイミジル基である場合、Qは好ましくは下記に示される式(9ze)に従い、式中、Rは水素、F、Cl、Br、I-SR18aおよび-OS(O)18bからなる群より独立して選択され、ここで、R18aは任意で置換されたC-C12(ヘテロ)アリール基であり、好ましくはフェニルまたはピリジルであり、R18bは、任意で置換されたC-C12アルキル基およびC-C12(ヘテロ)アリール基、好ましくはトリルまたはメチルからなる群より選択され、ただし、少なくとも1つのRが水素ではないということを条件とする。Rがハロゲンである場合(すなわち、RがF、Cl、BrまたはIである場合)、RはBrであることが好ましい。1つの実施形態では、ハロゲン化N-マレイミジル基はハロゲン化2,3-ジアミノプロピオン酸(DPR)マレイミジルであり、これは、カルボン酸部分を介してリンカー-コンジュゲートの残りに連結され得る。
別の好ましい実施形態では、Qは下記に示される式(9zf)に従うハロゲン化カルボニル基であり、ここで、XはF、Cl、BrおよびIからなる群より選択される。好ましくは、XはClまたはBrであり、最も好ましくは、XはClである。
別の好ましい実施形態では、Qは式(9zg)に従うアレンアミド基である。
別の好ましい実施形態では、Qは式(9zh)に従う1,1-ビス(スルホニルメチル)メチルカルボニル基、またはその脱離誘導体であり、ここで、R18は、任意で置換されたC-C12アルキル基およびC-C12(ヘテロ)アリール基からなる群より選択される。より好ましくは、R18は、任意で置換されたC-Cアルキル基またはC-C(ヘテロ)アリール基であり、最も好ましくはフェニル基である。
Figure 2022058417000006

Figure 2022058417000007

式中、k、l、X、T、U、V、R、R、R、R、R、R、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18およびR19は以上で規定される通りである。
本明細書において下記で記載される本発明によるコンジュゲーションプロセスの好ましい実施形態では、コンジュゲーションはDiels-Alder反応または1,3-双極子付加環化、好ましくは1,3-双極子付加環化などの付加環化を介して達成される。この実施形態によれば、反応基Q(ならびに生体分子上のF)は付加環化反応において反応性の基から選択される。本明細書では、反応基QおよびFは相補的であり、すなわち、それらは付加環化反応において互いと反応することができ、得られた環状部分は連結基Zである。
Diels-Alder反応では、FおよびQのうちの一方はジエンであり、FおよびQのうちの他方はジエノフィルである。当業者により認識されるように、「ジエン」という用語は、Diels-Alder反応との関連で1,3-(ヘテロ)ジエンを示し、共役ジエン(RC=CR-CR=CR)、イミン(例えばRC=CR-N=CRまたはRC=CR-CR=NR、RC=N-N=CR)およびカルボニル(例えばRC=CR-CR=OまたはO=CR-CR=O)が含まれる。NおよびO含有ジエンとのヘテロ-Diels-Alder反応は当業者に知られている。Diels-Alder反応に好適であると当技術分野で知られている任意のジエンは、反応基QまたはFとして使用され得る。好ましいジエンとしては、以上で記載されるテトラジン、以上で記載される1,2-キノンおよび以上で記載されるトリアジンが挙げられる。Diels-Alder反応に好適であると当技術分野で知られている任意のジエノフィルは、反応基QまたはFとして使用され得るが、ジエノフィルは好ましくは、以上で記載されるアルケンまたはアルキン基、最も好ましくはアルキン基である。Diels-Alder反応を介するコンジュゲーションでは、Fはジエンであり、Qはジエノフィルであることが好ましい。本明細書では、Qがジエンである場合、Fはジエノフィルであり、Qがジエノフィルである場合、Fはジエンである。最も好ましくは、Qはジエノフィルであり、好ましくはQはアルキニル基であり、またはこれを含み、Fはジエン、好ましくはテトラジン、1,2-キノンまたはトリアジン基である。
1,3-双極子付加環化では、FおよびQのうちの一方は1,3-双極子であり、FおよびQのうちの他方は親双極子である。1,3-双極子付加環化に好適であるとは当技術分野で知られている任意の1,3-双極子は、反応基QまたはFとして使用され得る。好ましい1,3-双極子としては、アジド基、ニトロン基、ニトリルオキシド基、ニトリルイミン基およびジアゾ基が挙げられる。1,3-双極子付加環化に好適であると当技術分野で知られている任意の親双極子は、反応基QまたはFとして使用され得るが、親双極子は好ましくはアルケンまたはアルキン基、最も好ましくはアルキン基である。1,3-双極子付加環化を介するコンジュゲーションでは、Fは1,3-双極子であり、Qは親双極子であることが好ましい。本明細書では、Qが1,3-双極子である場合、Fは親双極子であり、Qが親双極子である場合、Fは1,3-双極子である。最も好ましくは、Qは親双極子であり、好ましくはQはアルキニル基であり、またはこれを含み、Fは1,3-双極子、好ましくはアジド基である。
よって、好ましい実施形態では、Qは親双極子およびジエノフィルから選択される。好ましくは、Qはアルケンまたはアルキン基である。とりわけ好ましい実施形態では、Qはアルキン基を含み、好ましくは、以上で記載されるアルキニル基、以上で記載されるシクロアルケニル基、以上で記載される(ヘテロ)シクロアルキニル基およびビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基から選択され、より好ましくはQは、以上で規定され、下記で図示される式(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9zk)および(9zo)から選択され、例えば式(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)および(9zk)から選択され、より好ましくは式(9n)、(9o)、(9p)、(9q)および(9zk)から、または式(9j)、(9n)、(9q)および(9zo)から選択される。最も好ましくは、Qは、好ましくは式(9q)の、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基である。これらの基は本明細書で記載されるアジド官能化生体分子とのコンジュゲーションにおいて高度に有効であると知られており、本発明によるスルファミドリンカーがそのようなリンカー-コンジュゲートにおいて用いられる場合、任意の凝集は有益に最小に低減される。
以上で記載された通り、リンカー-コンジュゲートでは、Qは生体分子上に存在する反応基Fと反応することができる。反応基Qに対する相補的反応基Fは当業者に知られており、より詳細に下記に記載されている。FとQの間の反応および連結基Zを含むその対応する生成物のいくつかの代表例は、図11に図示されている。
以上で記載される通り、DおよびQは本発明によるリンカー-コンジュゲートにおいて、好ましくは以上で規定されるリンカーLを介して、共有結合により付着される。リンカーへのDの共有結合は、例えば、D上に存在する官能基Fのリンカー上に存在する反応基Qとの反応を介して起こり得る。リンカーへのDの付着のために好適な有機反応は当業者に知られており、官能基Fは反応基Qに相補的であるからである。その結果として、Dは、リンカーに連結基Zを介して付着されてもよい。
「連結基」という用語は、本明細では、化合物の1つの部分および同じ化合物の別の部分を連結させる構造要素を示す。当業者により理解されるように、連結基の性質は、前記化合物の部分間の連結が得られた有機反応の型に依存する。一例として、R-C(O)-OHのカルボキシル基が、HN-R’のアミノ基と反応させられ、R-C(O)-N(H)-R’を形成する場合、RがR’に連結基Zを介して連結され、Zは-C(O)-N(H)-基により表され得る。
反応基Qは、同様の様式でリンカーに付着されてもよい。その結果として、Qは、スペーサ部分に連結基Zを介して付着されてもよい。
標的分子のリンカーへの付着および反応基Qのリンカーへの付着について多くの反応が当技術分野で知られている。その結果として、多種多様の連結基Zがリンカー-コンジュゲート中に存在し得る。
1つの実施形態では、リンカー-コンジュゲートは下記式に従う化合物であり:
(Q(Z)Sp(Z)(D)
式中:
-yは1~10の範囲の整数であり;
-zは1~10の範囲の整数であり;
-Qは生体分子上に存在する官能基Fと反応することができる反応基であり;
-Dは、標的分子であり;
-Spは、QおよびDの間隔をあける(すなわち、間にある一定の距離を提供する)とともにQおよびDを共有結合により連結させる部分として規定されるスペーサ部分であり;
-ZはQを前記スペーサ部分に連結させる連結基であり;
-ZはDを前記スペーサ部分に連結させる連結基であり;ならびに
前記スペーサ部分はリンカーLであり、よって、式(1)に従う基またはその塩を含み、ここで、式(1)に従う基は以上で規定される通りである。
好ましい実施形態では、式(1)に従う基におけるaは0である。別の好ましい実施形態では、式(1)に従う基におけるaは1である。
yおよびzについての好ましい実施形態は(QSp(D)について以上で規定される通りである。化合物は式Q(Z)Sp(Z)(D)、Q(Z)Sp(Z)(D)、Q(Z)Sp(Z)(D)またはQ(Z)Sp(Z)D、より好ましくはQ(Z)Sp(Z)(D)またはQ(Z)Sp(Z)D、最も好ましくはQ(Z)Sp(Z)Dに従うことが、さらに好ましく、ここで、ZおよびZは以上で規定される通りである。
好ましくは、ZおよびZは、-O-、-S-、-NR-、-N=N-、-C(O)-、-C(O)NR-、-OC(O)-、-OC(O)O-、-OC(O)NR、-NRC(O)-、-NRC(O)O-、-NRC(O)NR-、-SC(O)-、-SC(O)O-、-SC(O)NR-、-S(O)-、-S(O)-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-ONRC(O)-、-ONRC(O)O-、-ONRC(O)NR-、-NROC(O)-、-NROC(O)O-、-NROC(O)NR-、-ONRC(S)-、-ONRC(S)O-、-ONRC(S)NR-、-NROC(S)-、-NROC(S)O-、-NROC(S)NR-、-OC(S)-、-OC(S)O-、-OC(S)NR-、-NRC(S)-、-NRC(S)O-、-NRC(S)NR-、-SS(O)-、-SS(O)O-、-SS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-ONRS(O)-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)-、-OP(O)(R-、-SP(O)(R-、-NRP(O)(R-およびその2つ以上の組み合わせからなる群より独立して選択され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
DおよびQについての好ましい実施形態は以上で規定される通りである。
1つの実施形態では、リンカー-コンジュゲートは、式(4a)または(4b)に従う化合物、またはその塩であり:
Figure 2022058417000008

式中:
-aは独立して0または1であり;
-bは独立して0または1であり;
-cは0または1であり;
-dは0または1であり;
-eは0または1であり;
-fは1~150の範囲の整数であり;
-gは0または1であり;
-iは0または1であり;
-Dは、標的分子であり;
-Qは生体分子上に存在する官能基Fと反応することができる反応基であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-ZはQまたはSpをSp、OまたはC(O)またはN(R)に連結させる連結基であり;
-ZはDまたはSpをSp、N(R)、OまたはC(O)に連結させる連結基であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され;または
-RはD、-[(Sp(Z(SpD]または-[(Sp(Z(Sp]であり、ここでDはさらなる標的分子であり、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、Z、Q、b、c、d、e、gおよびiは以上で規定される通りである。
好ましい実施形態では、式(4a)または(4b)に従う化合物においてaは1である。別の好ましい実施形態では、式(4a)または(4b)に従う化合物においてaは0である。
以上で規定されるように、ZはQまたはSpをSp、OまたはC(O)またはN(R)に連結させる連結基であり、ZはDまたはSpをSp、N(R)、OまたはC(O)に連結させる連結基である。上記でより詳細に記載されるように、「連結基」という用語は、化合物の1つの部分と同じ化合物の別の部分を連結させる構造要素を示す。
式(4a)に従う化合物では、連結基Zは、存在する場合(すなわちdが1である場合)、Q(任意でスペーサ部分Spを介して)を式(4a)に従う化合物のO-原子またはC(O)基に、任意でスペーサ部分Spを介して連結させる。より特定的には、Zが存在する(すなわちdが1である)場合、ならびにSpおよびSpが存在しない(すなわちgが0であり、cが0である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのO-原子(aが1である)またはC(O)基(aが0である)にQを連結させる。Zが存在し(すなわちdが1である場合)、Spが存在し(すなわちgが1である)およびSpが存在しない(すなわちcが0である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのO-原子(aが1である)またはC(O)基(aが0である)にスペーサ部分Spを連結させる。Zが存在する(すなわちdが1である)場合、ならびにSpおよびSpが存在する(すなわちgが1であり、cが1である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのスペーサ部分Spにスペーサ部分Spを連結させる。Zが存在し(すなわちdが1である場合)、Spが存在せず(すなわちgが0である)、およびSpが存在する(すなわちcが1である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのスペーサ部分SpにQを連結させる。
式(4b)に従う化合物では、連結基Zは、存在する場合(すなわちdが1である場合)、式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートにおけるN(R)基のN-原子にQ(任意でスペーサ部分Spを介して)を、任意でスペーサ部分Spを介して連結させる。より特定的には、Zが存在する(すなわちdが1である)場合、ならびにSpおよびSpが存在しない(すなわちgが0であり、cが0である)場合、Zは、式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートのN(R)基のN-原子にQを連結させる。Zが存在し(すなわちdが1である場合)、Spが存在し(すなわちgが1である)ならびにSpが存在しない(すなわちcが0である)場合、Zは、式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートのN(R)基のN-原子にスペーサ部分Spを連結させる。Zが存在する(すなわちdが1である)場合、ならびにSpおよびSpが存在する(すなわちgは1であり、cが1である)場合、Zは、式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートのスペーサ部分Spにスペーサ部分Spを連結させる。Zが存在し(すなわちdが1である場合)、Spが存在せず(すなわちgが0である)、ならびにSpが存在する(すなわちcが1である)場合、Zは、式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートのスペーサ部分SpにQを連結させる。
式(4a)に従う化合物において、c、dおよびgがすべて0である場合、Qは式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのO-原子(aが1である場合)またはC(O)基(aが0である場合)に直接付着される。
式(4b)に従う化合物において、c、dおよびgがすべて0である場合、Qは式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートのN(R)基のN-原子に直接付着される。
式(4a)に従う化合物において、連結基Zは、存在する場合(すなわちeが1である場合)、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートにおけるN(R)基のN-原子にD(任意でスペーサ部分Spを介して)を、任意でスペーサ部分Spを介して連結させる。より特定的には、Zが存在する(すなわちeが1である)場合、ならびにSpおよびSpが存在しない(すなわちbが0であり、iが0である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのN(R)基のN-原子にDを連結させる。Zが存在し(すなわちeが1である場合)、Spが存在し(すなわちiが1である)ならびにSpが存在しない(すなわちbが0である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのN(R)基のN-原子にスペーサ部分Spを連結させる。Zが存在する(すなわちeが1である)場合、ならびにSpおよびSpが存在する(すなわちbは1であり、iが1である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのスペーサ部分Spにスペーサ部分Spを連結させる。Zが存在し(すなわちeが1である場合)、Spが存在せず(すなわちiが0である)ならびにSpが存在する(すなわちbが1である)場合、Zは、式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのスペーサ部分SpにDを連結させる。
式(4a)に従う化合物において、b、eおよびiがすべて0である場合、Dは式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートのN(R)基のN-原子に直接付着される。
式(4b)に従う化合物において、b、eおよびiがすべて0である場合、Dは式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートのO-原子(aが1である場合)またはC(O)基(aが0である場合)に直接付着される。
当業者により理解されるように、連結基の性質は、前記化合物の特定の部分間の連結が得られた有機反応の型に依存する。反応基Qをスペーサ部分に連結させるのに、および標的分子をスペーサ部分に連結させるのに多数の有機反応が使用可能である。その結果として、多種多様の連結基ZおよびZが存在する。
式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートの好ましい実施形態では、ZおよびZは-O-、-S-、-SS-、-NR-、-N=N-、-C(O)-、-C(O)NR-、-OC(O)-、-OC(O)O-、-OC(O)NR、-NRC(O)-、-NRC(O)O-、-NRC(O)NR-、-SC(O)-、-SC(O)O-、-S-C(O)NR-、-S(O)-、-S(O)-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-ONRC(O)-、-ONRC(O)O-、-ONRC(O)NR-、-NROC(O)-、-NROC(O)O-、-NROC(O)NR-、-ONRC(S)-、-ONRC(S)O-、-ONRC(S)NR-、-NROC(S)-、-NROC(S)O-、-NROC(S)NR-、-OC(S)-、-OC(S)O-、-OC(S)NR-、-NRC(S)-、-NRC(S)O-、-NRC(S)NR-、-SS(O)-、-SS(O)O-、-SS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-ONRS(O)-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)-、-OP(O)(R-、-SP(O)(R-、-NRP(O)(R-およびその2つ以上の組み合わせからなる群より独立して選択され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
以上で記載される通り、式(4a)または(4b)に従う化合物において、Sp、Sp、SpおよびSpはスペーサ部分である。Sp、Sp、SpおよびSpは、独立して、存在してもしなくてもよい(b、c、gおよびiは、独立して、0または1である)。Spは、存在する場合、Sp(存在する場合)、Spおよび/またはSp(存在する場合)とは異なっていてもよい。
スペーサ部分は当業者に知られている。好適なスペーサ部分の例としては、(ポリ)エチレングリコールジアミン(例えば1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタンまたはより長いエチレングリコール鎖を含む等価物)、ポリエチレングリコール鎖またはポリエチレンオキシド鎖、ポリプロピレングリコール鎖またはポリプロピレンオキシド鎖および1,x-ジアミノアルカン(xはアルカンにおける炭素原子の数である)が挙げられる。
好適なスペーサ部分の別のクラスは切断可能なスペーサ部分、または切断可能なリンカーを含む。切断可能なリンカーは当技術分野でよく知られている。例えばShabat et al.,Soft Matter 2012,6,1073(参照により本明細書に組み込まれる)は、生物学的トリガー、例えば酵素切断または酸化事象で放出される自壊性部分を含む切断可能なリンカーを開示する。好適な切断可能なリンカーのいくつかの例は、還元で切断されるジスルフィド-リンカー、プロテアーゼ、例えばカテプシン、プラスミンまたはメタロプロテアーゼによる特異的認識で切断されるペプチド-リンカー、またはグリコシダーゼ、例えばグルコロニダーゼ(glucoronidase)による特異的認識で切断されるグリコシドベースのリンカー、または酸素の乏しい低酸素性領域で還元されるニトロ芳香族である。本明細書では、好適な切断可能なスペーサ部分としては、アミノ酸の特定の、切断可能な、配列を含むスペーサ部分も挙げられる。例として、例えば、Val-Ala(バリン-アラニン)またはVal-Cit(バリン-シトルリン)部分を含むスペーサ部分が挙げられる。
式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートの好ましい実施形態では、スペーサ部分Sp、Sp、Spおよび/またはSpは、存在する場合、アミノ酸の配列を含む。アミノ酸の配列を含むスペーサ部分は当技術分野で知られており、ペプチドリンカーとも呼ばれ得る。例としては、Val-Cit部分を含むスペーサ部分、例えばVal-Cit-PABC、Val-Cit-PAB、Fmoc-Val-Cit-PAB、などが挙げられる。好ましくは、Val-Cit-PABC部分がリンカー-コンジュゲートにおいて用いられる。
式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートの好ましい実施形態では、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C200アルキレン基、C-C200アルケニレン基、C-C200アルキニレン基、C-C200シクロアルキレン基、C-C200シクロアルケニレン基、C-C200シクロアルキニレン基、C-C200アルキルアリーレン基、C-C200アリールアルキレン基、C-C200アリールアルケニレン基およびC-C200アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基が以上で規定される1つ以上のヘテロ原子により中断される場合、前記基は1つ以上のO-原子、および/または1つ以上のS-S基により中断されることが好ましい。
より好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C100アルキレン基、C-C100アルケニレン基、C-C100アルキニレン基、C-C100シクロアルキレン基、C-C100シクロアルケニレン基、C-C100シクロアルキニレン基、C-C100アルキルアリーレン基、C-C100アリールアルキレン基、C-C100アリールアルケニレン基およびC-C100アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
さらにいっそう好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C50アルキレン基、C-C50アルケニレン基、C-C50アルキニレン基、C-C50シクロアルキレン基、C-C50シクロアルケニレン基、C-C50シクロアルキニレン基、C-C50アルキルアリーレン基、C-C50アリールアルキレン基、C-C50アリールアルケニレン基およびC-C50アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
さらによりいっそう好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基、C-C20アルケニレン基、C-C20アルキニレン基、C-C20シクロアルキレン基、C-C20シクロアルケニレン基、C-C20シクロアルキニレン基、C-C20アルキルアリーレン基、C-C20アリールアルキレン基、C-C20アリールアルケニレン基およびC-C20アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
これらの好ましい実施形態では、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は非置換であり、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOにより任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基、好ましくは水素またはメチルからなる群より独立して選択されることが、さらに好ましい。
最も好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。この実施形態では、アルキレン基は非置換であり、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOおよび/またはSにより任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基、好ましくは水素またはメチルからなる群より独立して選択されることが、さらに好ましい。
よって、好ましいスペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpとしては、-(CH-、-(CHCH-、-(CHCHO)-、-(OCHCH-、-(CHCHO)CHCH-、-CHCH(OCHCH-、-(CHCHCHO)-、-(OCHCHCH-、-(CHCHCHO)CHCHCH-および-CHCHCH(OCHCHCH-が挙げられ、ここで、nは1~50の範囲、好ましくは1~40の範囲、より好ましくは1~30の範囲、さらにいっそう好ましくは1~20の範囲、さらによりいっそう好ましくは1~15の範囲の整数である。より好ましくはnは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは1、2、3、4、5、6、7または8、さらにいっそう好ましくは1、2、3、4、5または6、さらによりいっそう好ましくは1、2、3または4である。
Sp、Sp、SpおよびSpは独立して選択されるので、Spは、存在する場合、Sp(存在する場合)、Spおよび/またはSp(存在する場合)とは異なっていてもよい。
反応基Qはより詳細に以上で記載されている。式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートでは、反応基Qは、任意で置換された、N-マレイミジル基、ハロゲン化N-アルキルアミド基、スルホニルオキシN-アルキルアミド基、エステル基、カーボネート基、ハロゲン化スルホニル基、チオール基またはその誘導体、アルケニル基、アルキニル基、(ヘテロ)シクロアルキニル基、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基、シクロアルケニル基、テトラジニル基、アジド基、ホスフィン基、ニトリルオキシド基、ニトロン基、ニトリルイミン基、ジアゾ基、ケトン基、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基、ヒドラジン基、ハロゲン化N-マレイミジル基、ハロゲン化カルボニル基、アレンアミド基および1,1-ビス(スルホニルメチル)メチルカルボニル基またはその脱離誘導体からなる群より選択されることが好ましい。さらに好ましい実施形態では、Qは式(9a)、(9b)、(9c)、(9d)、(9e)、(9f)、(9g)、(9h)、(9i)、(9j)、(9k)、(9l)、(9m)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9r)、(9s)、(9t)、(9u)、(9v)、(9w)、(9x)、(9y)、(9z)、(9za)、(9zb)、(9zc)、(9zd)、(9ze)、(9zf)、(9zg)、(9zh)、(9zi)、(9zj)または(9zk)に従い、ここで、(9a)、(9b)、(9c)、(9d)、(9e)、(9f)、(9g)、(9h)、(9i)、(9j)、(9k)、(9l)、(9m)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9r)、(9s)、(9t)、(9u)、(9v)、(9w)、(9x)、(9y)、(9z)、(9za)、(9zb)、(9zc)、(9zd)、(9ze)、(9zf)、(9zg)、(9zh)、(9zi)、(9zj)、(9zk)、(9zo)およびその好ましい実施形態は以上で規定される通りである。好ましい実施形態では、Qは式(9a)、(9b)、(9c)、(9f)、(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9s)、(9t)、(9zh)、(9zo)または(9r)に従う。さらにいっそう好ましい実施形態では、Qは式(9a)、(9j)、(9n)、(9o)、(9q)、(9p)、(9t)、(9zh)、(9zo)または(9s)に従い、特に好ましい実施形態では、Qは、以上で規定される、式(9a)、(9q)、(9n)、(9o)、(9p)、(9t)、(9zo)または(9zh)、およびその好ましい実施形態に従う。
式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートにおける標的分子Dおよび標的分子Dのための好ましい実施形態は以上で規定される通りである。
以上で記載される通り、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRはD、-[(Sp(Z(SpD]または-[(Sp(Z(Sp]であり、ここで、Dはさらなる標的分子であり、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、Z、Q、b、c、d、e、gおよびiは以上で規定される通りである。
好ましい実施形態では、Rは水素またはC-C20アルキル基であり、より好ましくは、Rは水素またはC-C16アルキル基であり、さらにいっそう好ましくは、Rは水素またはC-C10アルキル基であり、ここでアルキル基は任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOにより任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基からなる群より独立して選択される。さらに好ましい実施形態では、Rは水素である。別のさらに好ましい実施形態では、RはC-C20アルキル基、より好ましくはC-C16アルキル基、さらにいっそう好ましくはC-C10アルキル基であり、ここで、アルキル基は、1つ以上のO-原子により任意で中断され、ここで、アルキル基は、-OH基、好ましくは末端-OH基で任意で置換される。この実施形態では、Rは末端-OH基を含むポリエチレングリコール鎖であることが、さらに好ましい。別のさらに好ましい実施形態では、RはC-C12アルキル基、より好ましくはC-Cアルキル基、さらにいっそう好ましくはC-Cアルキル基であり、さらによりいっそう好ましくは、Rはメチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチルおよびt-ブチルからなる群より選択される。
別の好ましい実施形態では、Rはさらなる標的分子D、-[(Sp(Z(SpD]または-[(Sp(Z(Sp]であり、ここで、Dは標的分子であり、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、Z、Q、b、c、d、e、gおよびiは以上で規定される通りである。RがDまたは-[(Sp(Z(SpD]である場合、リンカー-コンジュゲートは式(4a)に従うことが、さらに好ましい。この実施形態では、リンカー-コンジュゲート(4a)は2つの標的分子Dを含み、それらは同じか、または異なっていてもよい。Rが-[(Sp(Z(SpD]である場合、-[(Sp(Z(SpD]におけるSp、b、Z、e、Sp、iおよびDは、N(R)のN-原子に付着される-[(Sp(Z(SpD]におけるSp、b、Z、e、Sp、iおよびDと同じか、または異なっていてもよい。好ましい実施形態では、N(R)のN-原子上の-[(Sp(Z(SpD]および-[(Sp(Z(SpD]はどちらも同じである。
が-[(Sp(Z(Sp]である場合、リンカー-コンジュゲートは式(4b)に従うことが、さらに好ましい。この実施形態では、リンカー-コンジュゲート(4b)は2つの標的分子Qを含み、それらは同じか、または異なっていてもよい。Rが-[(Sp(Z(Sp]である場合、-[(Sp(Z(SpD]におけるSp、c、Z、d、Sp、gおよびDはN(R)のN-原子に付着される他の-[(Sp(Z(Sp]におけるSp、b、Z、e、Sp、iおよびQと同じか、または異なっていてもよい。好ましい実施形態では、N(R)のN-原子上の-[(Sp(Z(Sp]基は同じである。
式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートでは、fは1~150の範囲の整数である。よって、リンカー-コンジュゲートは1を超える式(1)に従う基を含んでもよく、式(1)に従う基は以上で規定される通りである。1を超える式(1)に従う基が存在する場合、すなわちfが2以上である場合、a、b、SpおよびRは独立して選択される。言い換えれば、fが2以上である場合、各aは独立して0または1であり、各bは独立して0または1であり、各Spは同じか、または異なっていてもよく、各Rは同じか、または異なっていてもよい。好ましい実施形態では、fは1~100の範囲、好ましくは1~50の範囲、より好ましくは1~25の範囲、さらにいっそう好ましくは1~15の範囲の整数である。より好ましくは、fは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10であり、さらにいっそう好ましくはfは1、2、3、4、5、6、7または8であり、さらによりいっそう好ましくはfは1、2、3、4、5または6であり、さらによりいっそう好ましくはfは1、2、3または4であり、最も好ましくはfはこの実施形態では1である。別の好ましい実施形態では、fは2~150の範囲、好ましくは2~100の範囲、より好ましくは2~50の範囲、より好ましくは2~25の範囲、さらにいっそう好ましくは2~15の範囲の整数である。より好ましくは、fは2、3、4、5、6、7、8、9または10であり、さらにいっそう好ましくはfは2、3、4、5、6、7または8であり、さらによりいっそう好ましくはfは2、3、4、5または6であり、さらによりいっそう好ましくはfは2、3または4であり、最も好ましくはfはこの実施形態では2である。
以上で記載される通り、好ましい実施形態では、式(4a)または(4b)に従う化合物においてaは0である。リンカー-コンジュゲートはそのため、式(6a)または(6b)に従う化合物、またはその塩であってもよく:
Figure 2022058417000009

式中、a、b、c、d、e、f、g、i、D、Q、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、ZおよびR、ならびにそれらの好ましい実施形態は(4a)および(4b)について以上で規定される通りである。
以上で記載される通り、別の好ましい実施形態では、式(4a)または(4b)に従う化合物においてaは1である。リンカー-コンジュゲートはそのため、式(7a)または(7b)に従う化合物、またはその塩であってもよく:
Figure 2022058417000010

式中、a、b、c、d、e、f、g、i、D、Q、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、ZおよびR、ならびにそれらの好ましい実施形態は(4a)および(4b)について以上で規定される通りである。
式(4a)に従うリンカー-コンジュゲートにおいてSpが存在しない場合、すなわちiが0である場合、DはZ(eが1である場合)に、Sp(eが0であり、bが1である場合)に、またはN(R)(eが0であり、bが0である場合)に連結される。式(4b)に従うリンカー-コンジュゲートにおいてSpが存在しない場合、すなわちiが0である場合、DはZ(eが1である場合)に、Sp(eが0であり、bが1である場合)に、O-原子(aが1であり、bおよびeが0である場合)に、またはC(O)基(aが0であり、bおよびeが0である場合)に連結される。リンカー-コンジュゲートはそのため、式(4c)または(4d)に従う化合物、またはその塩であってもよく:
Figure 2022058417000011

式中、a、b、c、d、e、f、g、D、Q、Sp、Sp、Sp、Z、ZおよびR、ならびにそれらの好ましい実施形態は(4a)および(4b)について以上で規定される通りである。
好ましい実施形態では、式(4c)または(4d)に従うリンカー-コンジュゲートにおいて、aは0である。別の好ましい実施形態では、式(4c)または(4d)に従うリンカー-コンジュゲートにおいて、aは1である。
リンカー-コンジュゲート、特に式(4a)、(4b)、(4c)、(4d)、(6a)、(6b)、(7a)または(7b)に従うリンカー-コンジュゲートの特定の実施形態では、Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRからなる群より選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基からなる群より独立して選択され、Qは式(9a)、(9b)、(9c)、(9d)、(9e)、(9f)、(9g)、(9h)、(9i)、(9j)、(9k)、(9l)、(9m)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9r)、(9s)、(9t)、(9u)、(9v)、(9w)、(9x)、(9y)、(9z)、(9za)、(9zb)、(9zc)、(9zd)、(9ze)、(9zf)、(9zg)(9zh)、(9zi)、(9zj)または(9zk)に従い、ここで、(9a)、(9b)、(9c)、(9d)、(9e)、(9f)、(9g)、(9h)、(9i)、(9j)、(9k)、(9l)、(9m)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9r)、(9s)、(9t)、(9u)、(9v)、(9w)、(9x)、(9y)、(9z)、(9za)、(9zb)、(9zc)、(9zd)、(9ze)、(9zf)、(9zg)、(9zh)、(9zi)、(9zj)、(9zk)、(9zo)およびその好ましい実施形態は以上で規定される通りである。好ましい実施形態では、Qは式(9a)、(9b)、(9c)、(9f)、(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9s)(9t)、(9zh)、(9zo)または(9r)に従う。さらにいっそう好ましい実施形態では、Qは式(9a)、(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9t)、(9zh)、(9zo)または(9s)に従い、特に好ましい実施形態では、Qは、以上で規定される、式(9a)、(9q)、(9n)、(9p)、(9t)、(9zh)、(9zo)または(9o)、およびその好ましい実施形態に従う。
好ましくは、以上で規定される、式(4a)、(4b)、(4c)、(4d)、(6a)、(6b)、(7a)または(7b)に従うリンカー-コンジュゲートに含まれるリンカーL、以上で規定されるリンカーは、それぞれ式(8a)および(8b)により表すことができる:
Figure 2022058417000012
当業者により理解されるように、スペーサ部分(8a)および(8b)の好ましい実施形態は、例えば、リンカー-コンジュゲートにおける反応基QおよびDの性質、リンカー-コンジュゲートを調製するための合成方法(例えば、標的分子上の相補的官能基Fの性質)、リンカー-コンジュゲートを使用して調製されるバイオコンジュゲートの性質(例えば、生体分子上の相補的官能基Fの性質)に依存し得る。
が例えば、以上で規定される、式(9n)、(9o)、(9p)、(9q)または(9zk)に従うシクロオクチニル基である場合、好ましくはSpが存在する(gが1である)。
例えば、リンカー-コンジュゲートが、式(9n)、(9o)、(9p)、(9q)または(9zk)に従うシクロオクチニル基である反応基Qのアジド官能基Fとの反応を介して調製された場合、好ましくはSpが存在する(iが1である)。
さらに、Sp、Sp、SpおよびSpの少なくとも1つは存在する、すなわちb、c、g、およびiの少なくとも1つは0ではないことが好ましい。別の好ましい実施形態では、SpおよびSpの少なくとも1つおよびSpおよびSpの少なくとも1つは存在する。
fが2以上である場合、Spは存在することが好ましい(bは1である)。
リンカー-部分(8a)および(8b)のこれらの好ましい実施形態はまた、下記でより詳細に記載されるように、本発明によるバイオコンジュゲートに含まれる場合、リンカー-コンジュゲートにも成り立つ。
Sp、Sp、SpおよびSpの好ましい実施形態は以上で規定される通りである。
生体分子
生体分子は、B-Fにより表され、ここでBは生体分子であり、Fは、リンカー-コンジュゲート上の反応基Qと反応することができる官能基であり、「-」は結合またはスペーサ部分である。1つの実施形態では、「-」は本明細書で規定される通りのスペーサ部分である。1つの実施形態では、「-」は、結合、典型的には共有結合である。生体分子は、「対象生体分子」(BOI)とも呼ばれ得る。生体分子は天然起源の生体分子であってもよく、ここで、官能基Fは、対象生体分子、例えば例としてチオール、アミン、アルコールまたはヒドロキシフェノール単位中にすでに存在する。リンカー-コンジュゲートとのコンジュゲーションはその後、以上で規定される第1のアプローチを介して生じる。あるいは、生体分子は修飾生体分子であってもよく、ここで、官能基Fは対象生体分子に特異的に組み込まれ、リンカー-コンジュゲートとのコンジュゲーションは、この官能基操作、すなわち以上で規定されるバイオコンジュゲーションの2段階アプローチを介して生じる。特定の官能基を組み込むための生体分子のそのような修飾は、例えばWO2014/065661号(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)から知られている。
本発明によるバイオコンジュゲートにおいて、生体分子Bは好ましくは、タンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、脂質、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖類、オリゴ糖類、酵素、ホルモン、アミノ酸および単糖類からなる群より選択される。より好ましくは、生体分子Bはタンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖類、オリゴ糖類および酵素からなる群より選択される。より好ましくは、生体分子Bはタンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチドおよびグリカンからなる群より選択される。最も好ましくは、生体分子Bは抗体またはその抗原結合断片である。
官能基Fはリンカー-コンジュゲート上の反応基Qと反応して、連結基Zを形成することができる。当業者には、どの官能基Fが相補的反応基Qと反応することができるか明らかである。以上で規定される通りの、当業者に知られている反応基Qに相補的な官能基Fは、より詳細に下記に記載されている。FとQの間の反応および連結基Zを含むそれらの対応する生成物のいくつかの代表例は、図11に図示されている。
本発明によるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスでは、リンカー-コンジュゲート中に存在する反応基Qは、典型的には官能基Fと反応させられる。1を超える官能基Fが生体分子中に存在してもよい。2つ以上の官能基が存在する場合、前記基は同じか、または異なっていてもよい。別の好ましい実施形態では、生体分子は2つ以上の官能基Fを含み、それらは同じか、または異なっていてもよく、2つ以上の官能基はリンカー-コンジュゲートの相補的反応基Qと反応する。例えば、2つの官能基F、すなわちFおよびFを含む生体分子は、同じか、または異なっていてもよい官能基Qを含む2つのリンカー-コンジュゲートと反応して、バイオコンジュゲートを形成してもよい。
生体分子における官能基Fの例は、アミノ基、チオール基、カルボン酸、アルコール基、カルボニル基、リン酸基、または芳香族基を含む。生体分子における官能基は天然に存在してもよく、または特定の技術、例えば(生)化学または遺伝的技術により生体分子に入れられてもよい。生体分子に入れられる官能基は本来天然に存在する官能基であってもよく、または化学合成により調製される官能基、例えばアジド、末端アルキン、シクロプロペン部分またはホスフィン部分であってもよい。付加環化によるコンジュゲーションの好ましい様式を考慮すると、Fは付加環化において反応することができる基、例えばジエン、ジエノフィル、1,3-双極子または親双極子であることが好ましく、好ましくはFは、1,3-双極子(典型的には、アジド基、ニトロン基、ニトリルオキシド基、ニトリルイミン基またはジアゾ基)または親双極子(典型的にはアルケニルまたはアルキニル基)から選択される。本明細書では、Fは、Qが親双極子である場合、1,3-双極子であり、Fは、Qが1,3-双極子である場合、親双極子であり、またはFは、Qがジエノフィルである場合、ジエンであり、Fは、Qがジエンである場合ジエノフィルである。最も好ましくは、Fは1,3-双極子であり、好ましくはFはアジド基であり、またはこれを含む。
生体分子に入れられる官能基のいくつかの例は図2に示されている。図2はガラクトサミンのUDP糖類の誘導体のいくつかの構造を示し、それらは、例えばチオプロピオニル基(11a)、アジドアセチル基(11b)、またはアジドジフルオロアセチル基(11c)を用いて2位で、またはアジド基を用いてN-アセチルガラクトサミン(11d)の6位で修飾されてもよい。1つの実施形態では、官能基Fはチオプロピオニル基、アジドアセチル基、またはアジドジフルオロアセチル基である。
図3はどのようにして、UDP-糖類11a-dのいずれかが、GlcNAc部分を含む糖タンパク質12(例えばグリカンがエンドグリコシダーゼによってトリミングされているモノクローナル抗体)に、ガラクトシルトランスフェラーゼ変異体またはGalNAc-トランスフェラーゼの作用下で付着され、それによってGalNAc誘導体とGlcNAcの間にβ-グリコシド1-4連結を生成することができるかを概略的に表示する(それぞれ、化合物13a-d)。
天然に存在する官能基Fの好ましい例としては、チオール基およびアミノ基が挙げられる。生体分子への組込みのための化学合成により調製される官能基の好ましい例としては、ケトン基、末端アルキン基、アジド基、シクロ(ヘテロ)アルキン基、シクロプロペン基、またはテトラジン基が挙げられる。
以上で記載された通り、相補的反応基Qおよび官能基Fは当業者に知られており、QおよびFのいくつかの好適な組み合わせは以上で記載されており、図11に示されている。相補的基QおよびFのリストは、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013(ISBN:978-0-12-382239-0)の3章の230-232ページ、表3.1に開示されており、この表の内容は参照により本明細書に明確に組み込まれる。
バイオコンジュゲート
バイオコンジュゲートは本明細書で、生体分子がリンカーを介して標的分子Dに共有結合により連結される化合物として規定される。バイオコンジュゲートは1つ以上の生体分子および/または1つ以上の標的分子を含む。リンカーは、1つ以上のスペーサ部分を含んでもよい。本発明によるバイオコンジュゲートは便宜上本発明によるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスにより調製され、ここで、反応基Qを含むリンカー-コンジュゲートは官能基Fを含む生体分子にコンジュゲートされる。このコンジュゲーション反応において、QおよびF基は互いに反応し、連結基Zを形成し、これは標的分子Dを生体分子Bと連結させる。よって、リンカー-コンジュゲートおよび生体分子について本明細書で記載される全ての好ましい実施形態は、QおよびFについて言われたこと全てを除き、本発明によるバイオコンジュゲートに同様に当てはまり、ここで、本発明によるバイオコンジュゲートは、QおよびFの反応生成物、すなわち連結基Zを含む。
本発明によるバイオコンジュゲートは式(A)を有し:
B-L-D
(A)、
式中:
-Bは、生体分子であり;
-Lは、BおよびDを連結させるリンカーであり;
-Dは、標的分子であり;ならびに
-「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分であり、
ここで、Lは式(1)に従う基またはその塩を含み:
Figure 2022058417000013

式中:
-aは0または1であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され;またはRは標的分子Dであり、ここでDは任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
1つの実施形態では、「-」は本明細書で規定される通りのスペーサ部分である。1つの実施形態では、「-」は結合、典型的には共有結合である。
好ましい実施形態では、バイオコンジュゲートはB-Z-L-Dにより表され、ここで、B、L、Dおよび「-」は以上で規定される通りであり、ZはQとFとの反応により得ることができる連結基である。好ましくは、部分Zは付加環化、好ましくは1,3-双極子付加環化反応により得ることができ、最も好ましくはZは1,2,3-トリアゾール環であり、これは、スペーサ部分、好ましくはBとLとの間、最も好ましくはBと式(1)に従う基のカルボニルまたはカルボキシル端との間のスペーサ部分に位置する。
本発明によるバイオコンジュゲートが式(1)に従う基の塩を含む場合、塩は好ましくは、薬学的に許容される塩である。
本発明によるバイオコンジュゲートは、1を超える標的分子を含んでもよい。同様に、バイオコンジュゲートは、1を超える生体分子を含んでもよい。生体分子Bおよび標的分子D、ならびにその好ましい実施形態はより詳細に以上で記載される。本発明によるバイオコンジュゲートにおけるDについての好ましい実施形態は、より詳細に以上で記載された本発明によるリンカー-コンジュゲートにおけるDの好ましい実施形態に対応する。本発明によるバイオコンジュゲートにおけるリンカー(8a)または(8b)についての好ましい実施形態は、より詳細に以上で記載された、リンカー-コンジュゲートにおけるリンカーの好ましい実施形態に対応する。本発明によるバイオコンジュゲートにおけるBについての好ましい実施形態は、より詳細に以上で記載された、本発明による生体分子におけるBの好ましい実施形態に対応する。
本発明によるバイオコンジュゲートはまた、生体分子がスペーサ部分を介して標的分子にコンジュゲートされるバイオコンジュゲートとして規定されてもよく、ここで、スペーサ部分は式(1)に従う基、またはその塩を含み、ここで、式(1)に従う基は以上で規定される通りである。
本発明によるバイオコンジュゲートはまた、(B)Sp(D)として表されてもよく、ここで、yは1~10の範囲の整数であり、zは1~10の範囲の整数である。
よって、発明はまた、下記式に従うバイオコンジュゲートに関し:
(B)Sp(D)
式中:
-yは1~10の範囲の整数であり;
-zは1~10の範囲の整数であり;
-Bは、生体分子であり;
-Dは、標的分子であり;
-Spはスペーサ部分であり、ここで、スペーサ部分は、生体分子Bおよび標的分子Dの間隔をあける(すなわち間にある一定の距離を提供する)と共に生体分子Bおよび標的分子Dを共有結合により連結させる部分として規定され;ならびに、前記スペーサ部分は式(1)に従う基またはその塩を含み、ここで式(1)に従う基は以上で規定される通りである。
好ましい実施形態では、前記スペーサ部分は、付加環化、好ましくは1,3-双極子付加環化反応、最も好ましくは1,2,3-トリアゾール環(Bと式(1)に従う前記基との間に位置する)により得ることができる部分をさらに含む。
好ましくは、yは1、2、3または4であり、より好ましくはyは1または2であり、最も好ましくは、yは1である。好ましくは、zは1、2、3、4、5または6であり、より好ましくはzは1、2、3または4であり、さらにいっそう好ましくはzは1、2または3であり、さらによりいっそう好ましくはzは1または2であり、最も好ましくはzは1である。より好ましくは、yは1または2であり、好ましくは1であり、zは1、2、3または4であり、さらによりいっそう好ましくはyは1または2であり、好ましくは1であり、zは1、2または3であり、さらによりいっそう好ましくはyは1または2であり、好ましくは1であり、zは1または2であり、最も好ましくはyは1であり、zは1である。好ましい実施形態では、バイオコンジュゲートは式BSp(D)、BSp(D)、BSp(D)またはBSpDに従う。
以上で記載される通り、本発明によるバイオコンジュゲートは、以上で規定される式(1)に従う基、またはその塩を含む。好ましい実施形態では、バイオコンジュゲートは、式(1)に従う基(式中、aは0である)、またはその塩を含む。この実施形態では、よって、バイオコンジュゲートは式(2)に従う基またはその塩を含み、ここで(2)は以上で規定される通りである。
別の好ましい実施形態では、バイオコンジュゲートは、式(1)に従う基(aは1である)、またはその塩を含む。この実施形態では、よって、バイオコンジュゲートは式(3)に従う基またはその塩を含み、ここで(3)は以上で規定される通りである。
本発明によるバイオコンジュゲートにおいて、R、スペーサ部分Sp、ならびにRおよびSpの好ましい実施形態は、本発明によるリンカー-コンジュゲートについて以上で規定される通りである。
好ましい実施形態では、バイオコンジュゲートは式(5a)または(5b)、またはその塩に従い:
Figure 2022058417000014

式中、
-a、b、c、d、e、f、g、h、i、D、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、Z、ZおよびR、およびその好ましい実施形態はリンカー-コンジュゲート(4a)および(4b)について以上で規定される通りであり;ならびに
-hは0または1であり;
-Zは、BをSp、Z、Sp、OまたはC(O)に連結させる連結基であり;ならびに
-Bは生体分子である。
好ましくは、hは1である。
生体分子Bの好ましい実施形態は以上で規定される通りである。
本発明によるバイオコンジュゲートが(5a)または(5b)の塩である場合、塩は好ましくは、薬学的に許容される塩である。
は連結基である。以上で記載される通り、「連結基」という用語は、本明細では、化合物の1つの部分および同じ化合物の別の部分を連結させる構造要素を示す。典型的には、バイオコンジュゲートは、リンカー-コンジュゲート中に存在する反応基Qと生体分子中に存在する官能基Fとの反応を介して調製される。当業者により理解されるように、連結基Zの性質は、生体分子とリンカー-コンジュゲートの間の連結を確立するために使用された有機反応の型に依存する。言い換えれば、Zの性質は、リンカー-コンジュゲートの反応基Qの性質および生体分子における官能基Fの性質に依存する。生体分子とリンカー-コンジュゲートとの間の連結を確立するために使用可能な多数の異なる化学反応が存在するので、その結果として、Zについて多数の可能性がある。
を含むリンカー-コンジュゲートが相補的官能基Fを含む生体分子にコンジュゲートされる場合にバイオコンジュゲート中に存在するFおよびQの好適な組み合わせ、ならびに連結基Zのいくつかの例は図11に示されている。
が例えばチオール基である場合、相補的基QとしてはN-マレイミジル基およびアルケニル基が挙げられ、対応する連結基Zは図11に示される通りである。Fがチオール基である場合、相補的基Qとしては、アレンアミド基も挙げられる。
が例えばアミノ基である場合、相補的基Qとしては、ケトン基および活性化エステル基が挙げられ、対応する連結基Zは図11に示される通りである。
が例えばケトン基である場合、相補的基Qとしては、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基およびヒドラジン基が挙げられ、対応する連結基Zは図11に示される通りである。
が例えばアルキニル基である場合、相補的基Qとしては、アジド基が挙げられ、対応する連結基Zは図11に示される通りである。
が例えばアジド基である場合、相補的基Qとしては、アルキニル基が挙げられ、対応する連結基Zは図11に示される通りである。
が例えばシクロプロペニル基、trans-シクロオクテン基またはシクロオクチン基である場合、相補的基Qとしては、テトラジニル基が挙げられ、対応する連結基Zは図11に示される通りである。これらの特別な場合において、Zは中間体構造にすぎず、Nを排出し、それによってジヒドロピリダジン(アルケンとの反応から)またはピリダジン(アルキンとの反応から)を生成させる。
およびQの追加の好適な組み合わせ、ならびに結果として得られる連結基Zの性質は当業者に知られており、例えば、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013(ISBN:978-0-12-382239-0)、特に第3章、229-258ページ(参照により組み込まれる)に記載される。バイオコンジュゲーションプロセスに好適な相補的反応基のリストは、G.T.Hermanson,“Bioconjugate Techniques”,Elsevier,第3版 2013(ISBN:978-0-12-382239-0)の第3章の、230-232ページ、表3.1に開示されており、この表の内容は、参照により本明細書に明確に組み込まれる。
(5a)および(5b)に従うバイオコンジュゲートにおいて、Z、Sp、ZおよびSpの少なくとも1つは存在する、すなわちh、g、dおよびcの少なくとも1つは0ではないことが好ましい。Sp、ZおよびSpの少なくとも1つは存在する、すなわちb、eおよびiの少なくとも1つは0ではないこともまた好ましい。より好ましくは、Z、Sp、ZおよびSpの少なくとも1つは存在し、Sp、ZおよびSpの少なくとも1つは存在し、すなわちb、eおよびiの少なくとも1つは0ではなく、h、g、dおよびcの少なくとも1つは0ではないことが好ましい。
バイオコンジュゲートの調製のためのプロセス
本発明の様々な態様では、本発明によるバイオコンジュゲートは典型的には、本明細書で規定されるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスにより得られる。バイオコンジュゲートのリンカーLにおける式(1)に従う基またはその塩の存在が本発明の鍵であるので、バイオコンジュゲートを調製する任意の方法は、得られたバイオコンジュゲートが、本明細書で規定されるリンカーLを含む限り使用することができる。式(1)に従う基はBとZの間のリンカーL中に存在してもよく、すなわち生体分子に由来し、またはZとDの間、すなわちリンカー-コンジュゲートに由来し、またはZは式(1)に従う基であるかもしくはこれを含み、すなわち式(1)に従う基はコンジュゲーションで形成される。好ましくは、式(1)に従う基はBとZの間またはZとDの間のリンカーL中に存在し、最も好ましくは、式(1)に従う基はZとDの間のリンカーL中に存在する。同様に、QおよびFの性質を含めて、コンジュゲーションの正確な様式は、本発明との関連で大きなフレキシビリティを有する。BOIをMOIにコンジュゲートするための多くの技術が当業者に知られており、本発明との関連で使用することができる。コンジュゲーションは、反応基Qが、生体分子の官能基Fと反応させられ、生体分子をリンカー-コンジュゲートに共有結合により連結させるような条件下で起こる。
1つの実施形態では、コンジュゲーションの様式は、図11に図示されているコンジュゲーション様式のいずれかから、すなわち、(10a)または(10b)として表され得る連結部分Zを形成するためのチオール-アルケンコンジュゲーション(好ましくはシステイン-アルケンコンジュゲーション、好ましくはここで、アルケンはペンダントアルケン(-C=CH)またはマレイミド部分、最も好ましくはマレイミド部分である)、(10c)として表され得る連結部分Zを形成するためのアミノ-(活性化)カルボン酸コンジュゲーション(ここで、(活性化)カルボン酸は、-C(O)Xにより表され、ここでXは脱離基である)、(10d)(ここで、Y=NHである)として表され得る連結部分Zを形成するためのケトン-ヒドラジノコンジュゲーション(好ましくはアセチル-ヒドラジノコンジュゲーション)、(10d)(ここで、Y=Oである)として表され得る連結部分Zを形成するためのケトン-オキシアミノコンジュゲーション(好ましくはアセチル-オキシアミノコンジュゲーション)、(10e)、(10f)、(10i)、(10g)、(10j)または(10k)、好ましくは(10e)、(10f)または(10g)として表され得る連結部分Zを形成するためのアルキン-アジドコンジュゲーション(好ましくはここで、アルキンはペンダントアルキン(-C≡CH)またはシクロオクチン部分、最も好ましくはシクロオクチン部分である)、(10h)(これからNが脱離し、ジヒドロピリダジン生成物を与える)として表され得る連結部分Zを形成するためのアルケン-1,2,4,5-テトラジンコンジュゲーションまたはアルキン-1,2,4,5-テトラジンコンジュゲーションから選択される。とりわけ好ましいコンジュゲーション様式はシステイン-アルケンコンジュゲーションおよびアルキン-アジドコンジュゲーションであり、より好ましくはシステイン-マレイミドコンジュゲーションおよびシクロオクチン-アジドコンジュゲーションである。
1つの実施形態では、コンジュゲーション様式は、下記により表される通りの、(10e)、(10i)、(10g)、(10j)または(10k)により、好ましくは(10e)、(10i)、(10g)により、最も好ましくは(10g)により表される連結部分Zを形成するための、(シクロ)アルキン-アジドコンジュゲーションであり:
Figure 2022058417000015

式中、環Aは7-10-員(ヘテロ)環状部分である。連結部分(10e)、(10j)および(10k)は可能な2つの位置異性体のいずれか1つで存在し得る。
本発明によるバイオコンジュゲートは典型的には、本明細書で規定されるようにリンカー-コンジュゲートの反応基Qを、生体分子とも呼ばれる生体分子の官能基Fと反応させる工程を含むプロセスにより調製される。リンカー-コンジュゲートおよび生体分子、ならびにその好ましい実施形態は、より詳細に以上で記載される。そのようなプロセスは、コンジュゲーションまたはバイオコンジュゲーションとして当業者に知られている。図1は生体分子のコンジュゲーションの一般概念を示す:1つ以上の官能基Fを含む対象生体分子(BOI)は、特定のリンカーを介して反応基Qに共有結合された、(過剰の)標的分子D(対象分子またはMOIとも呼ばれる)と共にインキュベートされる。バイオコンジュゲーションのプロセスにおいて、FとQとの間に化学反応が起き、それによって、BOIとMOIの間の共有結合を含むバイオコンジュゲートが形成される。BOIは、例えば、ペプチド/タンパク質、グリカンまたは核酸であり得る。
バイオコンジュゲーション反応は典型的には、リンカー-コンジュゲートの反応基Qを生体分子の官能基Fと反応させる工程を含み、式(A)のバイオコンジュゲートが形成され、ここで、リンカーLは式(1)に従う基またはその塩を含み:
Figure 2022058417000016

式中:
-aは0または1であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRはさらなる標的分子Dであり、これは任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
好ましい実施形態では、バイオコンジュゲートは、付加環化、例えば(4+2)-付加環化(例えば、Diels-Alder反応)または(3+2)-付加環化(例えば1,3-双極子付加環化)を介して調製される。好ましくは、コンジュゲーションはDiels-Alder反応または1,3-双極子付加環化である。好ましいDiels-Alder反応は逆電子要求Diels-Alder付加環化である。別の好ましい実施形態では、1,3-双極子付加環化、より好ましくはアルキン-アジド付加環化が使用され、最も好ましくはここで、Qはアルキン基であるかまたはこれを含み、Fはアジド基である。Diels-Alder反応および1,3-双極子付加環化などの付加環化は当技術分野で知られており、当業者はどのようにそれらを実施するかを知っている。
がFと反応する場合、生体分子とリンカー-コンジュゲートに由来する標的分子の間の共有結合的連結が形成される。相補的反応基Qおよび官能基Fはより詳細に以上および以下で記載される。
バイオコンジュゲートを調製するためのプロセスの好ましい実施形態では、式(1)に従う基においてaは0である。この実施形態では、よって、リンカー-コンジュゲートは以上で規定される式(2)に従う基を含む。バイオコンジュゲートを調製するためのプロセスの別の好ましい実施形態では、式(1)に従う基においてaは1である。この実施形態では、よって、リンカー-コンジュゲートは、以上で規定される式(3)に従う基を含む。
生体分子はより詳細に以上で記載される。好ましくは、本発明によるプロセスでは、生体分子はタンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、脂質、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖類、オリゴ糖類、酵素、ホルモン、アミノ酸および単糖類からなる群より選択される。より好ましくは、生体分子Bはタンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチド、グリカン、核酸、オリゴヌクレオチド、多糖類、オリゴ糖類および酵素からなる群より選択される。より好ましくは、生体分子Bはタンパク質(糖タンパク質および抗体を含む)、ポリペプチド、ペプチドおよびグリカンからなる群より選択される。最も好ましくは、Bは抗体またはその抗原結合断片である。
バイオコンジュゲートを調製するためのプロセスにおいて、反応基Qは、任意で置換された、N-マレイミジル基、ハロゲン化N-アルキルアミド基、スルホニルオキシN-アルキルアミド基、エステル基、カーボネート基、ハロゲン化スルホニル基、チオール基またはその誘導体、アルケニル基、アルキニル基、(ヘテロ)シクロアルキニル基、ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基、シクロアルケニル基、テトラジニル基、アジド基、ホスフィン基、ニトリルオキシド基、ニトロン基、ニトリルイミン基、ジアゾ基、ケトン基、(O-アルキル)ヒドロキシルアミノ基、ヒドラジン基、ハロゲン化N-マレイミジル基、1,1-ビス(スルホニルメチル)メチルカルボニル基またはその脱離誘導体、ハロゲン化カルボニル基およびアレンアミド基からなる群より選択されることが好ましい。
さらに好ましい実施形態では、Qは式(9a)、(9b)、(9c)、(9d)、(9e)、(9f)、(9g)、(9h)、(9i)、(9j)、(9k)、(9l)、(9m)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9r)、(9s)、(9t)、(9u)、(9v)、(9w)、(9x)、(9y)、(9z)、(9za)、(9zb)、(9zc)、(9zd)、(9ze)、(9zf)、(9zg)、(9zh)、(9zi)、(9zj)または(9zk)に従い、ここで、(9a)、(9b)、(9c)、(9d)、(9e)、(9f)、(9g)、(9h)、(9i)、(9j)、(9k)、(9l)、(9m)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9r)、(9s)、(9t)、(9u)、(9v)、(9w)、(9x)、(9y)、(9z)、(9za)、(9zb)、(9zc)、(9zd)、(9ze)、(9zf)、(9zg)、(9zh)、(9zi)、(9zj)、(9zk)、(9zo)、およびその好ましい実施形態は、本発明によるリンカー-コンジュゲートについて以上で規定される通りである。より好ましくは、Qは式(9a)、(9b)、(9c)、(9f)、(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9s)、(9t)、(9ze)、(9zh)、(9zo)または(9r)に従う。さらにいっそう好ましくは、Qは式(9a)、(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9t)、(9ze)、(9zh)、(9zo)または(9s)に従い、最も好ましくは、Qは、以上で規定される、式(9a)、(9p)、(9q)、(9n)、(9t)、(9ze)、(9zh)、(9zo)または(9o)、およびその好ましい実施形態に従う。
とりわけ好ましい実施形態では、Qは、好ましくは以上で記載されるアルキニル基、以上で記載されるシクロアルケニル基、以上で記載される(ヘテロ)シクロアルキニル基およびビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基から選択されるアルキン基を含み、より好ましくは、Qは以上で規定される式(9j)、(9n)、(9o)、(9p)、(9q)、(9zo)および(9zk)から選択される。最も好ましくは、Qは、好ましくは式(9q)のビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イル]基である。
バイオコンジュゲートを調製するためのプロセスのさらに好ましい実施形態では、リンカー-コンジュゲートは式(4a)または(4b)、またはその塩に従い:
Figure 2022058417000017

式中:
-aは独立して0または1であり;
-bは独立して0または1であり;
-cは0または1であり;
-dは0または1であり;
-eは0または1であり;
-fは1~150の範囲の整数であり;
-gは0または1であり;
-iは0または1であり;
-Dは、標的分子であり;
-Qは生体分子上に存在する官能基Fと反応することができる反応基であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-Spはスペーサ部分であり;
-ZはQまたはSpをSp、OまたはC(O)またはN(R)に連結させる連結基であり;
-ZはDまたはSpをSp、N(R)、OまたはC(O)に連結させる連結基であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され;あるいはRはD、-[(Sp(Z(SpD]または-[(Sp(Z(Sp]であり、ここで、Dは標的分子であり、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、Z、Q、b、c、d、e、gおよびiは以上で規定される通りである。
Sp、Sp、SpおよびSpは、独立して、スペーサ部分であり、言い換えれば、Sp、Sp、SpおよびSpは、互いに異なっていてもよい。Sp、Sp、SpおよびSpは存在してもしなくてもよい(b、c、gおよびiは、独立して、0または1である)。しかしながら、Sp、Sp、SpおよびSpの少なくとも1つは存在することが好ましく、すなわち、b、c、gおよびiの少なくとも1つは0ではないことが好ましい。
存在する場合、好ましくはSp、Sp、SpおよびSpは直鎖または分枝C-C200アルキレン基、C-C200アルケニレン基、C-C200アルキニレン基、C-C200シクロアルキレン基、C-C200シクロアルケニレン基、C-C200シクロアルキニレン基、C-C200アルキルアリーレン基、C-C200アリールアルキレン基、C-C200アリールアルケニレン基およびC-C200アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基が、以上で規定される1つ以上のヘテロ原子により中断される場合、前記基は1つ以上のO-原子、および/または1つ以上のS-S基により中断されることが好ましい。
より好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C100アルキレン基、C-C100アルケニレン基、C-C100アルキニレン基、C-C100シクロアルキレン基、C-C100シクロアルケニレン基、C-C100シクロアルキニレン基、C-C100アルキルアリーレン基、C-C100アリールアルキレン基、C-C100アリールアルケニレン基およびC-C100アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
さらにいっそう好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C50アルキレン基、C-C50アルケニレン基、C-C50アルキニレン基、C-C50シクロアルキレン基、C-C50シクロアルケニレン基、C-C50シクロアルキニレン基、C-C50アルキルアリーレン基、C-C50アリールアルキレン基、C-C50アリールアルケニレン基およびC-C50アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
さらによりいっそう好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基、C-C20アルケニレン基、C-C20アルキニレン基、C-C20シクロアルキレン基、C-C20シクロアルケニレン基、C-C20シクロアルキニレン基、C-C20アルキルアリーレン基、C-C20アリールアルキレン基、C-C20アリールアルケニレン基およびC-C20アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
これらの好ましい実施形態では、アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は非置換であり、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOにより任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基、好ましくは水素またはメチルからなる群より独立して選択されることが、さらに好ましい。
最も好ましくは、スペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。この実施形態では、アルキレン基は非置換であり、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子、好ましくはOおよび/またはS-Sにより任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基、好ましくは水素またはメチルからなる群より独立して選択されることが、さらに好ましい。
特に好ましいスペーサ部分Sp、Sp、SpおよびSpとしては-(CH-、-(CHCH-、-(CHCHO)-、-(OCHCH-、-(CHCHO)CHCH-、-CHCH(OCHCH-、-(CHCHCHO)-、-(OCHCHCH-、-(CHCHCHO)CHCHCH-および-CHCHCH(OCHCHCH-が挙げられ、ここで、nは1~50の範囲、好ましくは1~40の範囲、より好ましくは1~30の範囲、さらにいっそう好ましくは1~20の範囲、さらによりいっそう好ましくは1~15の範囲の整数である。より好ましくは、nは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは1、2、3、4、5、6、7または8、さらにいっそう好ましくは1、2、3、4、5または6、さらによりいっそう好ましくは1、2、3または4である。
本発明によるプロセスの別の好ましい実施形態では、式(4a)および(4b)に従うリンカー-コンジュゲートにおいて、スペーサ部分Sp、Sp、Spおよび/またはSpは、存在する場合、アミノ酸の配列を含む。アミノ酸の配列を含むスペーサ部分は当技術分野で知られており、ペプチドリンカーとも呼ばれ得る。例としては、Val-Ala部分またはVal-Cit部分を含むスペーサ部分、例えばVal-Cit-PABC、Val-Cit-PAB、Fmoc-Val-Cit-PAB、などが挙げられる。
以上で記載される通り、ZおよびZは連結基である。本発明によるプロセスの好ましい実施形態では、ZおよびZは-O-、-S-、-NR-、-N=N-、-C(O)-、-C(O)NR-、-OC(O)-、-OC(O)O-、-OC(O)NR、-NRC(O)-、-NRC(O)O-、-NRC(O)NR-、-SC(O)-、-SC(O)O-、-SC(O)NR-、-S(O)-、-S(O)-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-ONRC(O)-、-ONRC(O)O-、-ONRC(O)NR-、-NROC(O)-、-NROC(O)O-、-NROC(O)NR-、-ONRC(S)-、-ONRC(S)O-、-ONRC(S)NR-、-NROC(S)-、-NROC(S)O-、-NROC(S)NR-、-OC(S)-、-OC(S)O-、-OC(S)NR-、-NRC(S)-、-NRC(S)O-、-NRC(S)NR-、-SS(O)-、-SS(O)O-、-SS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-ONRS(O)-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)-、-OP(O)(R-、-SP(O)(R-、-NRP(O)(R-およびその2つ以上の組み合わせからなる群より独立して選択され、ここで、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される。
本発明による特に好ましいプロセスでは、Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基からなる群より独立して選択され、アルキレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRからなる群より選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここで、Rは水素およびC-Cアルキル基からなる群より独立して選択され、ここで、Qは式(9a)、(9j)、(9p)、(9q)、(9n)、(9t)、(9ze)、(9zh)、(9zo)または(9o)に従い:
Figure 2022058417000018

式中:
-lは0~10の範囲の整数であり;
-R10は(チオ)エステル基であり;ならびに
-R18は、任意で置換された、C-C12アルキル基およびC-C12(ヘテロ)アリール基からなる群より選択される。
バイオコンジュゲートを調製するためのプロセスの一実施形態は、図4に図示される。図4は、修飾抗体13a-dが、マレイミドを用いた求核付加の手段により(3-メルカプトプロピオニル-ガラクトサミン修飾13aではチオエーテルコンジュゲート14に至り、または改変システイン残基へのコンジュゲーションでは、チオエーテルコンジュゲート17に至る)またはシクロオクチン試薬を用いた歪み促進付加環化で(13b、13cまたは13dでは、それぞれ、トリアゾール15a、15bまたは16に至る)、バイオコンジュゲーションプロセスをどのように受け得るかを示す。
本発明によるバイオコンジュゲートの治療指数の増加に加えて、本明細書で記載されるバイオコンジュゲート、および本発明によるリンカー-コンジュゲートおよびスルファミドリンカーの調製のためのプロセスのさらなる利点は、コンジュゲーション効率が、典型的なポリエチレングリコール(PEG)スペーサの代わりにスルファミドリンカーが使用される場合において増加することである。スルファミド基、特にアシルスルファミドまたはカルバモイルスルファミド基の追加の利点は、そのような基を含むリンカーの溶解度に対して、ならびにコンジュゲーション前、中、後の全体としてのコンストラクトに対してプラス効果を付与する、その高い極性である。この増加された極性を考慮すると、本発明によるスルファミドリンカーを含有するリンカー-コンジュゲートを用いるコンジュゲーションは、疎水性標的化合物を生体分子にコンジュゲートさせるのに特に好適である。スルファミドの高い極性は、疎水性部分が、コンジュゲーション中に大量の有機共溶媒を必要とするおよび/またはバイオコンジュゲートの凝集を誘発することが知られている対象生体分子にコンジュゲートされる場合においてもプラスの影響を持つ。高レベルの共溶媒(25%までのDMFまたはDMA、プロピレングリコール、またはDMSOの実に50%)はコンジュゲーションプロセス中にタンパク質変性を誘発することがあり、および/または製造プロセスにおいて特別な機器を必要とすることがある。よって、バイオコンジュゲートにおける疎水性連結部分と関連する凝集の問題は、バイオコンジュゲートの形成において、リンカー-コンジュゲートにおける標的分子と反応基Qの間のスペーサに本発明によるスルファミドリンカーを使用することにより、効率的に解決される。発明によるスルファミドリンカーおよびバイオコンジュゲーションプロセスにおけるその使用の追加の利点はその合成の簡便さおよび高収率である。
本発明によるスルファミドリンカーの使用のこれらの有益な効果の証拠について、PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)、特にその中の表1-3、図11-14、23および24、ならびに実施例57、58、60および61が参照される。PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)のこれらの表、図および実施例は本明細書に組み込まれる。
第1の態様による方法
よって、発明は、第1の態様では、バイオコンジュゲートの治療指数を増加させるための方法に関し、方法は、式(A)のバイオコンジュゲート:
B-L-D
(A)、
式中:
-Bは、生体分子であり;
-Lは、BおよびDを連結させるリンカーであり;
-Dは、標的分子であり;ならびに
-「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分である、
を、Lが式(1)に従う基またはその塩を含むように、標的分子(D)上の反応基Qを生体分子(B)上の官能基Fと反応させることにより、調製する工程を含み:
Figure 2022058417000019

式中:
-aは0または1であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRは追加の標的分子Dであり、ここでDは任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
式(A)のバイオコンジュゲートは非常に詳細に上記で記載され、これは同様に、発明の第1の態様において使用されるバイオコンジュゲートに当てはまる。
本明細書では、治療指数は、リンカーLは式(1)に従う基またはその塩を含まない、式(A)のバイオコンジュゲートと比べて増加される。発明者らは驚いたことに、本発明によるバイオコンジュゲートの治療指数は、本発明によるリンカーLが使用された場合、例え、他の因子全て、特に生体分子の型および標的分子の型ならびに生体分子-標的分子-比が一定に維持されても、著しく増加されたことを見出した。治療指数の増加はもっぱら、リンカー中の式(1)に従う基の存在に起因することがあり得る。
治療指数の増加は好ましくは癌の治療における治療指数の増加である。
発明の第1の態様による方法はまた、バイオコンジュゲートの治療指数を増加させるための方法として表現することもでき、これは式(A)により表されるバイオコンジュゲートを提供する工程を含み:
B-L-D
(A)、
式中:
-Bは、生体分子であり;
-Lは、BおよびDを連結させるリンカーであり;
-Dは、標的分子であり;ならびに
-「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分であり、
ここで、Lは式(1)に従う基またはその塩を含み:
Figure 2022058417000020

式中:
-aは0または1であり;ならびに
-Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、ここでRは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRは追加の標的分子Dであり、ここで、標的分子は任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
発明者らは、本発明によるリンカーは、本発明によるバイオコンジュゲートに含まれている場合、治療指数の両方の観点:(a)治療有効性および(b)耐容性について効果を有することを見出した。よって、治療指数を増加させるための方法は好ましくは、式(A)のバイオコンジュゲートの(a)治療有効性を増加させる、および/または(b)耐容性を増加させるためである。
よって、1つの実施形態では、第1の態様による方法は、式(A)のバイオコンジュゲートの治療有効性を増加させるためである。本明細書では、「治療有効性を増加させること」はまた、「有効用量を低下させること」または「ED50値を低下させること」または「保護指数を増加させること」と表すことができる。同様に、1つの実施形態では、第1の態様による方法は、式(A)のバイオコンジュゲートの耐容性を増加させるためである。本明細書では、「耐容性を増加させること」はまた、「最大耐容量(MTD)を増加させること」、「TD50値を増加させること」または「毒性を低減させること」と表すことができる。1つのとりわけ好ましい実施形態では、第1の態様による方法は、式(A)のバイオコンジュゲートの(a)治療有効性を増加させるため、および(b)耐容性を増加させるためである。
第1の態様による方法は非常に非医学的である。1つの実施形態では、方法はバイオコンジュゲートの治療有効性を増加させるための非医学的または非治療的方法である。
発明の第1の態様はまた、式(A)のバイオコンジュゲートの治療有効性を改善するのに使用するためのリンカーLと表すことができ、ここで、Lおよび(A)は以上で規定される通りである。言い換えれば、第1の態様はバイオコンジュゲートの治療有効性を改善するための、式(A)のバイオコンジュゲートの調製のためのリンカーLの使用に関し、ここで、Lおよび(A)は以上で規定される通りである。第1の態様による発明はまた、バイオコンジュゲートの治療有効性を増加させるための、式(A)のバイオコンジュゲート、または式(A)のバイオコンジュゲートの調製におけるリンカーLの使用と表すことができ、ここで、Lおよび(A)は以上で規定される通りである。本明細書で規定される使用は非医学的または非治療的使用と呼ばれ得る。
本態様による方法において使用されるバイオコンジュゲートは好ましくは、以上で規定されるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスにより得ることができ、より好ましくは、バイオコンジュゲートは以上で規定されるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスにより得られる。このように得られたバイオコンジュゲートは、さらにもっと改善された治療指数を有したことが見出された。
1つの実施形態では、発明の第1の態様による使用のための方法、使用またはリンカーは、その必要のある被験体、最も好適には癌患者への本発明によるバイオコンジュゲートの投与をさらに含む。抗体-薬物-コンジュゲートなどのバイオコンジュゲートの使用は、癌治療の分野でよく知られており、本発明によるバイオコンジュゲートは、この点においてとりわけ適している。
典型的には、バイオコンジュゲートは治療的有効用量で投与される。投与は単一用量であってもよく、または、例えば、1ヶ月1-4回、好ましくは1ヶ月1-2回行い得る。好ましい実施形態では、投与は3週または4週毎に、最も好ましくは4週毎に1回行う。治療有効性の増加を考慮すると、投与は従来のバイオコンジュゲートを用いる治療中の場合よりも頻繁には行わなくてもよい。当業者によって認識されるように、本発明によるバイオコンジュゲートの用量は多くの因子に依存することがあり、最適投与計画は当業者によりルーチン実験を介して決定することができる。バイオコンジュゲートは典型的には、0.01-50mg/kg被験体体重、より正確には0.1-25mg/kg、または最も正確には0.5-10mg/kgの用量で投与される。1つの実施形態では、投与は静脈内注射を介して行う。
第2の態様による方法
発明は、第2の態様では、以上で規定される式(A)のバイオコンジュゲートの投与を含む、その必要のある被験体の治療のための方法に関する。その必要のある被験体は最も好ましくは癌患者である。抗体-薬物-コンジュゲートなどのバイオコンジュゲートの使用は、癌治療の分野においてよく知られており、本発明によるバイオコンジュゲートは、この点においてとりわけ適している。記載されている方法は典型的には癌の治療に適している。式(A)のバイオコンジュゲートは以上で非常に詳細に記載され、これは、発明の第2の態様で使用されるバイオコンジュゲートに同様にあてはまる。
発明の第2の態様はまた、その必要のある被験体の治療において、好ましくは癌の治療のために使用するための、式(A)のバイオコンジュゲートと表すことができ、ここで、(A)は以上で規定される通りである。言い換えれば、第2の態様は、その必要のある被験体の治療における使用のための、好ましくは癌の治療における使用のための薬剤の調製のための式(A)のバイオコンジュゲートの使用に関し、ここで、(A)は以上で規定される通りである。
第2の態様による方法はまた、腫瘍細胞をターゲティングするための方法と表すことができる。本態様との関連で、腫瘍細胞のターゲティングは、腫瘍細胞を治療すること、画像化すること、診断すること、その増殖を防止すること、封じ込めることおよび低減することの1つ以上を含む。第2の態様による方法はまた、腫瘍をターゲティングするための方法と表すことができる。本態様との関連で、腫瘍細胞のターゲティングは、腫瘍を治療すること、画像化すること、診断すること、その増殖を防止すること、封じ込めることおよび低減することの1つ以上を含む。最も好ましくは、本態様は腫瘍の治療のためである。
当業者は、標的分子Dの選択は、本態様による本発明によるバイオコンジュゲートの特定の使用目的により決定され得ることを理解する。例えば、本態様による方法が治療するためのものである場合、標的分子Dは薬物、より好ましくは細胞毒であることが好ましい。同様に、本態様による方法が画像化するまたは診断するためのものである場合、標的分子Dはレポーター分子であることが好ましい。本態様による方法との関連で、生体分子Bは抗体であることが好ましい。同様に、バイオコンジュゲートは抗体-薬物-コンジュゲートであることが好ましい。
本態様による方法において使用されるバイオコンジュゲートは、好ましくは、以上で規定されるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスにより得ることができ、より好ましくは、バイオコンジュゲートは、以上で規定されるバイオコンジュゲートの調製のためのプロセスにより得られる。
第2の態様による方法において、バイオコンジュゲートは典型的には治療的有効用量で投与される。投与は単一用量であってもよく、または、例えば1ヶ月1-4回、好ましくは1ヶ月1-2回行ってもよい。好ましい実施形態では、投与は3週または4週毎に、最も好ましくは4週毎に1回行う。当業者によって認識されるように、本発明によるバイオコンジュゲートの用量は多くの因子に依存することがあり、最適投与計画は当業者によりルーチン実験を介して決定することができる。バイオコンジュゲートは典型的には、0.01-50mg/kg被験体体重、より正確には0.1-25mg/kg、最も正確には0.5-10mg/kgの用量で投与される。1つの実施形態では、投与は静脈内注射を介して行う。
治療有効性の増加を考慮すると、投与は従来のバイオコンジュゲートを用いる治療におけるよりも頻繁に行わなくてもよく、および/またはより低い用量で行ってもよい。1つの実施形態では、本発明によるバイオコンジュゲートの投与は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50よりも低い用量であり、好ましくは、用量は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50のせいぜい99-90%、より好ましくはせいぜい89-60%、さらにいっそう好ましくはせいぜい59-30%、最も好ましくはせいぜい29-10%である。1つの実施形態では、本発明によるバイオコンジュゲートの投与は同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののED50よりも低い用量であり、好ましくは、用量は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののED50のせいぜい99-90%、より好ましくはせいぜい89-60%、さらにいっそう好ましくはせいぜい59-30%、最も好ましくはせいぜい29-10%である。1つの実施形態では、本発明によるバイオコンジュゲートの投与は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないものについて行う投与よりも頻繁に行わず、好ましくは、投与事象の数は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないものの投与事象の数のせいぜい75%、より好ましくはせいぜい50%である。あるいは、耐容性の増加を考慮すると、投与は従来のバイオコンジュゲートを用いる治療におけるより高い用量で行ってもよい。1つの実施形態では、本発明によるバイオコンジュゲートの投与は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50より高い用量であり、好ましくは、用量は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50のせいぜい25-50%、より好ましくはせいぜい50-75%、最も好ましくはせいぜい75-100%である。1つの実施形態では、用量は、同じバイオコンジュゲートであるが本発明によるリンカーを含まないもののTD50の少なくとも1.1-1.49倍高く、より好ましくは少なくとも1.5-1.99倍高く、さらにいっそう好ましくは2-4.99倍高く、最も好ましくは少なくとも5-10倍高い。
本発明による方法、またはそのモデルにおいて使用されるリンカー-コンジュゲートとして好適な下記化合物の合成のために、PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)が参照される:
・化合物18(実施例20);
・化合物20(実施例21、23-25);
・化合物21(実施例26-27);
・化合物23(実施例29-31);
・化合物26(実施例36-38);
・化合物30(実施例43-1、32);
・化合物33(実施例36-37、47);
・化合物35(実施例36-37、49);
・化合物36(実施例29、50);
・化合物37(実施例51-53);
・化合物38(実施例29、54-55);
・化合物39(実施例29、54、56)。
本発明による方法において使用される生体分子として好適な、下記修飾生体分子の調製は、PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)に記載される:
・トラスツズマブ(GalNProSH)13a(実施例1-6、12-14);
・トラスツズマブ(GalNAz)13b(実施例12、13、15、16-1);
・トラスツズマブ(F-GalNAz)13c(実施例1、7-13、16-2)
本発明によるバイオコンジュゲートは、PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)の実施例59に従い調製することができる。リンカー-コンジュゲート30または33の修飾生体分子13bまたは13cとのコンジュゲートはそのようなものとして調製されており(コンジュゲート95-98、実施例1-4および図12を参照されたい)、実施例29および31のインビボ研究において使用される。
PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)の前記実施例は全て、参照により本明細書に組み込まれる。
還元モノクローナル抗体のRP-HPLC分析
RP-HPLC分析前に、試料を、10μgの(修飾)IgGの溶液を15分間37℃で10mM DTTおよび100mM Tris pH8.0と共に50μLの総体積でインキュベートすることにより還元させた。49%ACN、49%MQおよび2%ギ酸の溶液(50μL)を還元試料に添加した。Agilent 1100 HPLC上でZORBAX Phoroshell 300SB-C8 1×75 5μm(Agilent Technologies)カラムを使用し、1ml/分で70℃にて25~50%バッファーBの16.9分直線勾配(バッファーA=90%MQ、10%ACN、0.1%TFAおよびバッファーB=90%ACN、10%MQ、0.1%TFAを用いる)を使用して実行して、逆相HPLCを実施した。
モノクローナル抗体の質量スペクトル分析
質量スペクトル分析前に、IgGを、軽鎖および重鎖の両方の分析を可能にするDTTで処理したか、またはFc/2断片の分析を可能にするFabricator(商標)(Genovis,Lund,Swedenから市販)で処理した。軽鎖および重鎖の両方の分析のために、20μg(修飾)IgGの溶液を5分間37℃で、100mM DTTと共に4μLの総体積でインキュベートした。存在する場合、アジド-官能基を、これらの条件下で、アミンに還元する。Fc/2断片の分析のために、20μgの(修飾)IgGの溶液を1時間の間37℃で、Fabricator(商標)(1.25U/μL)と共にホスフェート-緩衝生理食塩水(PBS)pH6.6中にて、10μLの総体積でインキュベートした。還元またはFabricator-消化後、試料をmilliQを用いて、アミコンウルトラ-0.5、Ultracel-10 Membrane(Millipore)を使用して、2回洗浄し、およそ40μLの最終試料体積を得た。次に、試料をエレクトロスプレーイオン化飛行時間(ESI-TOF)により、JEOL AccuTOF上で分析した。Magtranソフトウェアを使用して、デコンボリューションされたスペクトルを得た。
実施例1:コンジュゲート96を得るための13bの30とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物30の生体分子としての修飾生体分子13bへのコンジュゲーションにより調製した。トラスツズマブ(アジド)(13b)(15.5mL、255mg、PBS pH7.4中16.47mg/ml)の溶液にDMA(1.45mL)および化合物30(255μL、40mM DMA溶液)を添加した。反応物を一晩室温でインキュベートし、続いて、HiLoad 26/600 Superdex200 PGカラム(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。還元試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲート重鎖に対応する1つの主要な重鎖生成物を示した(観察質量50938Da、総重鎖断片のおよそ80%)。
実施例2:コンジュゲート95を得るための13bの33とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物33の生体分子としての修飾生体分子13bへのコンジュゲーションにより調製した。トラスツズマブ(アジド)(13b)(607μL、10mg、PBS pH7.4中16.47mg/ml)の溶液に、MilliQ(50μL)および化合物33(10μL、40mM DMA溶液)を添加した。反応物を一晩室温でインキュベートし、続いて、Superdex200 10/300 GL(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。還元試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲート重鎖に対応する1つの主要な重鎖生成物を示した(観察質量50982Da、総重鎖断片のおよそ80%)。
実施例3:コンジュゲート98を得るための13cの30とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物30の生体分子としての修飾生体分子13cへのコンジュゲーションにより調製した。トラスツズマブ(アジド)(13c)(14.25mL、250mg、PBS pH7.4中17.55mg/ml)の溶液にDMA(1.4mL)および化合物30(250μL、40mM DMA溶液)を添加した。反応物を一晩室温でインキュベートし、続いて、HiLoad 26/600 Superdex200 PGカラム(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。還元試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲート重鎖に対応する1つの主要な重鎖生成物を示した(観察質量50969Da、総重鎖断片のおよそ70%)。
実施例4:コンジュゲート97を得るための13cの33とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物33の生体分子としての修飾生体分子13cへのコンジュゲーションにより調製した。トラスツズマブ(アジド)(13c)(14.25mL、250mg、PBS pH7.4中17.55mg/ml)の溶液に、化合物33(188μL、40mM DMA溶液)を添加した。反応物を一晩室温でインキュベートし、続いて、HiLoad 26/600 Superdex200 PGカラム(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。還元試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲート重鎖に対応する1つの主要な重鎖生成物を示した(観察質量51020Da、総重鎖断片のおよそ90%)。
実施例5-16:リンカーコンジュゲート100、108および111の調製
本発明によるリンカー-コンジュゲート100および108、ならびに対照リンカー-コンジュゲート111の合成は本明細書で記載される。化合物100、108および111に向かう合成スキームはここで以下に図示される。
Figure 2022058417000021
実施例5:化合物100の調製
化合物99(PCT/NL2015/050697号(WO2016/053107号)の実施例50において開示され、これに従い調製された化合物58の活性化を介して調製;4.7mg、9.0μmol)を含むDMF(200μL)の溶液を固体Val-Cit-PAB-MMAE(vc-PABMMAE、10mg、8.1μmol)に添加し、続いて、EtN(3.7μL、2.7mg、27μmol)を添加した。23時間後、2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(1.3μL、1.3mg、8.9μmol)を含むDMFを添加した(13μLの10%DMF溶液)。混合物を4時間の間放置し、逆相(C18)HPLCクロマトグラフィーを介して精製した(30→90%MeCN(1%AcOH)を含むHO(1%AcOH)。生成物を無色フィルムとして得た(10.7mg、7.1μmol、87%)LCMS(ESI) C741171219(M+H)について計算1509.83 観測1510.59
実施例6:化合物101の調製
BCN-OSu(1.00g、3.43mmol)を含むTHFおよび水の混合物(80mL/80mL)の溶液にγ-アミノ酪酸(0.60g、5.12mmol)およびEtN(1.43mL、1.04g、10.2mmol)を添加した。混合物を、4時間の間撹拌し、続いて、DCM(200mL)およびNHClの飽和水溶液(80mL)を添加した。分離後、水層をDCM(2×200mL)で抽出した。有機層を合わせて、乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣をカラムクロマトグラフィーを用いて精製した(MeOHを含むDCM0→10%)。生成物を無色濃厚油として得た(730mg、2.61mmol、76%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)4.81(bs、1H)、4.15(d、J=8.4Hz、2H)、3.30-3.21(m、2H)、2.42(t、J=7.2Hz、2H)、2.35-2.16(m、6H)、1.85(五重線、J=6.9Hz、2H)、1.64-1.51(m、2H)、1.35(五重線、J=8.4Hz、1H)、1.00-0.90(m、2H)
実施例7:化合物102の調製
クロロスルホニルイソシアネート(CSI;0.91mL、1.48g、10mmol)を、tert-ブタノール(5.0mL、3.88g、52mmol)を含むEtO(50mL)の冷却(-78℃)溶液に添加した。反応混合物を室温まで温めさせ、濃縮した。残渣をDCM(200mL)に懸濁させ、その後、EtN(4.2mL、3.0g、30mmol)および2-(2-アミノエトキシ)エタノール(1.0mL、1.05g;10mmol)を添加した。得られた混合物を10分間撹拌させ、濃縮させた。残渣を2回カラムクロマトグラフィーを用いて精製した(MeOHを含むDCM0→10%)。生成物を無色濃厚油として得た(2.9g、10mmol、100%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)5.75(bs、1H)、3.79-3.74(m、2H)、3.67-3.62(m、2H)、3.61-3.57(m、2H)、3.35-3.28(m、2H)、1.50(s、9H)。
実施例8:化合物103の調製
102(2.9g、10mmol)を含むDCM(40mL)の溶液にAcO(2.9mL、3.11g、30.5mmol)およびEtN(12.8mL、9.29g、91.8mmol)を添加した。反応混合物を、2時間の間撹拌し、NaHCOの飽和水溶液(50mL)で洗浄し、乾燥させた(NaSO)。残渣を2回カラムクロマトグラフィーを用いて精製した(20%→100%EtOAcを含むヘプタン)。生成物を無色油として得た(2.5g、7.7mmol、77%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)5.48(bs、1H)、4.25-4.20(m、2H)、3.70-3.60(m、4H)、3.33-3.23(m、2H)、2.10(s、3H)、1.50(s、9H)
実施例9:化合物104の調製
103(80mg、0.25mmol)を含むDCM(8mL)の溶液にTFA(2mL)を添加した。40分後、反応混合物を濃縮させた。残渣をトルエン(30mL)に入れ、混合物を濃縮させた。生成物を無色油として得た(54mg、0.24mmol、95%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)5.15(bs、2H)、4.26-4.18(m、2H)、3.71-3.60(m、4H)、3.35-3.27(m、2H)、2.08(s、3H)。
実施例10:化合物105の調製
BCNGABA(101)(67mg、0.24mmol)および104(54mg、0.24mmol)を含むDCM(20mL)の混合物にN-(3-ジメチルアミノプロピル)-N’-エチルカルボジイミド塩酸塩(EDCI.HCl;55mg、0.29mmol)およびDMAP(2.8mg、23μmol)を添加した。混合物を16の間撹拌し、NHClの飽和水溶液(20mL)で洗浄した。分離後、水層をDCMで抽出した(20mL)。有機層を合わせて、乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣をカラムクロマトグラフィーを用いて精製した(MeOHを含むDCM0→10%)。生成物を無色濃厚油として得た(50mg、0.10mmol、42%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)5.83-5.72(m、1H)、5.14-5.04(m、1H)、4.23-4.19(m、2H)、4.15(d、J=8.1Hz、2H)、3.67-3.57(m、4H)、3.29-3.18(m、4H)、2.41-2.32(m、2H)、2.31-2.15(m、6H)、2.10(s、3H)、1.85(五重線、J=6.6Hz、2H)、1.65-1.49(m、2H)、1.38-1.28(m、1H)、1.00-0.89(m、2H)
実施例11:化合物106の調製
105(50mg、0.10mmol)を含むMeOH(10mL)の溶液に、KCO(43mg、0.31mmol)を添加した。混合物を3時間の間撹拌し、NHClの飽和水溶液(20mL)で希釈した。混合物をDCM(3×20mL)で抽出した。有機層を合わせて、乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。生成物を無色フィルムとして得た(39mg、0.088mmol、88%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)6.25(bs、1H)、5.26-5.18(m、1H)、4.15(d、J=8.0Hz、2H)、3.77-3.71(m、2H)、3.63-3.53(m、4H)、3.33-3.27(m、2H)、3.27-3.17(m、2H)、2.45-2.34(m、2H)、2.34-2.14(m、6H)、1.85(五重線、J=6.7hz、2H)、1.65-1.48(m、2H)、1.41-1.28(m、1H)、1.01-0.88(m、2H)。
実施例12:化合物107の調製
106(152mg、0.34mmol)を含むDCM(20mL)の溶液にクロロギ酸p-ニトロフェニル(PNP-COCl;69mg、0.34mmol)およびピリジン(28μL、27mg、0.34mmol)を添加した。混合物を1.5時間の間撹拌し、濃縮させた。残渣をカラムクロマトグラフィーを用いて精製した(50%→100%EtOAcを含むヘプタン)。生成物を無色濃厚油として得た(98mg、0.16mmol、47%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)8.31-8.26(m、2H)、7.46-7.40(m、2H)、5.69-5.59(m、1H)、4.98-4.91(m、1H)、4.46-4.42(m、2H)、4.18(d、J=8.1Hz、2H)、3.79-3.75(m、2H)、3.69-3.64(m、2H)、3.33-3.24(m、4H)、2.39-2.31(m、2H)、2.32-2.18(m、6H)、1.84(五重線、J=6.3Hz2H)、1.65-1.50(m、2H)、1.35(五重線、J=8.5Hz、1H)、1.01-0.91(m、2H)。
実施例13:化合物108の調製
Val-Cit-PAB-MMAE(16.4mg、13.2μmol)を含むDMF(400μL)の溶液にEtN(3.4μL、2.5mg、24μmol)を添加した。得られた溶液を、107(6.7mg、11μmol)を含むDMF(300μL)の溶液に添加した。DMF(50μL)を添加した。21.5時間後、2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(1.2μL、1.2mg、8.2μmol)を含むDMFを添加した(12μLの10%DMF溶液)。混合物を逆相(C18)HPLCクロマトグラフィーを介して精製した(30→90%MeCN(1%AcOH)を含むHO(1%AcOH)。生成物を無色フィルムとして得た(4.3mg、2.7μmol、25%)LCMS(ESI) C781241320(M+H)について計算1594.88 観測1594.97
実施例14:化合物109の調製
2-(2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)エタノール(256mg、1.32mmol)を含むDCM(30mL)の溶液に、BCN-OSu(351mg、1.20mmol)およびEtN(502μL、364mg、3.60mmol)を添加した。得られた溶液を30分間撹拌し、NHClの飽和水溶液で洗浄した。分離後、水相をDCM(30mL)で抽出した。有機相を合わせて乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣をカラムクロマトグラフィーを用いて精製した(MeOHを含むDCM0→10%)。生成物を無色油として得た(397mg、1.07mmol、90%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)5.93(bs、1H)、4.14(d、J=8.1Hz、2H)、3.77-3.69(m、4H)、3.68-3.59(m、8H)、3.58-3.52(m、2H)、3.42-3.32(m、2H)、2.34-2.16(m、6H)、1.66-1.51(m、2H)、1.36(五重線、J=8.7Hz、1H)、1.00-0.85(m、2H)。
実施例15:化合物110の調製
109(0.40g、1.08mmol)を含むDCM(50mL)の溶液に、クロロギ酸p-ニトロフェニル(PNP-COCl;240mg、1.19mmol)およびEtN(452μL、328mg、3.24mmol)を添加した。混合物を、20時間の間撹拌し、濃縮させた。残渣をカラムクロマトグラフィーを用いて精製した(20%→70%EtOAcを含むヘプタン)。生成物を無色油として得た(424mg、0.79mmol、73%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)8.31-8.26(m、2H)、7.42-7.37(m、2H)、5.20(bs、1H)、4.47-4.43(m、2H)、4.15(d、J=8.4Hz、2H)、3.84-3.80(m、2H)、3.75-3.60(m、8H)、3.59-3.54(m、2H)、3.42-3.32(m、2H)、2.35-2.16(m、6H)、1.66-1.50(m、2H)、1.40-1.30(m、1H)、1.00-0.85(m、2H)。
実施例16:化合物111の調製
Val-Cit-PAB-MMAE(vc-PABMMAE;13.9mg;0.011mmolを含むDMF(400μL)の溶液に、EtN(3.4μL、2.5mg、24.3μmol)および110(3.0mg、5.6μmol)を含むDMF(200μL)の溶液を添加した。25分後、EtN(1.1μL、0.80mg、7.9μmol)および追加の、110(2.2mg、4.1μmol)を含むDMF(33μL)の溶液。17.5時間後、2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(1.2μL、1.2mg、8.1μmol)を含むDMFを添加した(12μLの10%DMF溶液)。混合物を一晩、フリーザー内で放置し、逆相(C18)HPLCクロマトグラフィーを介して精製した(30→90%MeCN(1%AcOH)を含むHO(1%AcOH)。生成物を無色フィルムとして得た(10.9mg、7.2μmol.74%)LCMS(ESI) C781241119 (M+H)について計算1518.91 観測1519.09。
実施例17-21:EndoSH
1つの態様では、発明は2つのエンドグリコシダーゼを含む融合酵素に関する。特定の例では、2つのエンドグリコシダーゼEndoSおよびEndoHはリンカー、好ましくは-(GlySer)-(His)-(GlySer)-リンカーを介して連結される。本発明による融合酵素はEndoSHとも呼ばれる。本発明による酵素はSEQ.ID NO:1と少なくとも50%の配列同一性、SEQ.ID NO:1と好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%の配列同一性、例えば、SEQ.ID NO:1と少なくとも81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の配列同一性を有する。同一性は公知の方法および/または当技術分野で知られているコンピュータプログラム法、例えばNCBIおよび他の供給元から公的に入手可能なBLASTP(BLAST Manual,Altschul,S.,et al.,NCBI NLM NIH Bethesda,MD 20894;Altschul,S.,et al.,J.Mol.Biol.215:403-410(1990))により容易に計算することができる。好ましくは、SEQ.ID NO:1に対して上記で示される配列同一性を有する発明の酵素は、EndoSおよびEndoH活性を有する。最も好ましくは、本発明による酵素はSEQ.ID NO:1と100%の配列同一性を有する。
EndoSおよびEndoHの融合酵素もまた包含され、ここで、リンカーは、当技術分野で知られている別の好適なリンカーにより置き換えられ、ここで、前記リンカーは剛性であっても可撓性であってもよい。好ましくは、前記リンカーは、隣接するタンパク質ドメインが互いに対して相対的に自由に動くことを可能にする可撓性リンカーである。好ましくは、前記可撓性リンカーは、グリシン、セリン、ヒスチジンおよび/またはアラニンのようなアミノ残基から構成され、3~59アミノ酸残基、好ましくは10~45または15~40アミノ酸残基、例えば15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39もしくは40アミノ酸残基、または20~38、25~37もしくは30~36アミノ酸残基の長さを有する。任意で、融合酵素は、Fc-タグ、FLAG-タグ、ポリ(His)-タグ、HA-タグおよびMyc-タグなど、当技術分野で知られている精製およびまたは検出を容易にするためのタグに共有結合により連結され、またはこれを含む。
糖タンパク質のトリミングは当技術分野で、例えばWO2007/133855号またはWO2014/065661号から知られている。本発明による酵素はEndoSおよびEndoH活性の両方を示し、糖タンパク質(抗体など)上のグリカンをコアGlcNAc単位でトリミングし、糖タンパク質上のコアGlcNAc残基だけを残すことができ(EndoS活性)、ならびに高マンノースグリカンを分離することもできる(EndoH活性)。驚いたことに、融合酵素の両活性は約7-8のpHで円滑に機能し、一方、モノマEndoHは、最適に動作するために、6のpHを必要とする。
本発明による融合酵素は酵素コード配列を含む発現ベクター(例えばプラスミド)を宿主細胞(例えば大腸菌)に導入して発現させるなどの、当技術分野におけるルーチン技術により調製することができ、宿主細胞から、酵素は単離することができる。本発明による融合酵素の調製および精製のための可能なアプローチは実施例17-19で与えられ、その機能は実施例20および21で証明されており、ここで、トラスツズマブおよび高マンノーストラスツズマブは単一工程で効率的にトリミングされる。融合タンパク質EndoSHによるグリカンの効率的なトリミングの別の例は実施例24で提供される。
実施例17:融合タンパク質EndoSHの(pET22B)発現ベクターへのクローニング
EcoRI-HindIII部位間にEndoS-(GS)-(His)-(GS)-EndoH(EndoSH)コード配列(EndoSHはSEQ.ID NO:1により同定される)を含有するpET22B-ベクターをGenscriptから得た。EndoSH融合タンパク質のためのDNA配列は、N末端連結グリシン-セリン(GS)リンカーを介してEndoHに縮合されたEndoSのコード残基48-995から構成される。グリシン-セリン(GS)リンカーは、-(GS)-(His)-(GS)-フォーマットを含み、2つの酵素のスペーシングを可能にし、同時にIMAC-精製タグを導入する。
実施例18:融合タンパク質EndoSHの大腸菌発現
EndoSH融合タンパク質(SEQ.ID NO:1により同定される)の発現は、プラスミド(pET22b-EndoSH)のBL21細胞中への形質転換で開始する。次の工程はBL21細胞を用いた500mL培養物(LB培地+Ampilicin)の接種である。OD600が0.7に到達した時に、培養物を1mM IPTG(500μLの1M原液)で誘発した。
実施例19:大腸菌からの融合タンパク質EndoSHの精製
37℃での一晩誘発後、培養物を遠心分離によりペレット化した。ペレットを40mLのPBS中に再懸濁させ、氷上で5mlのリゾチーム(10mg/mL)と共に30分間インキュベートした。半時間後、5mlの10%トリトン-X-100を添加し、氷上で超音波処理した(10分)。音波処理後、細胞デブリを遠心分離(10分8000xg)により除去し、続いて、0,22μM-孔径フィルターを介して濾過した。可溶性抽出物をHisTrap HP 5mLカラム(GE Healthcare)にロードした。カラムを最初にバッファーA(20mM Trisバッファー、20mMイミダゾール、500mM NaCl、pH7.5)で洗浄した。保持されたタンパク質をバッファーB(20mM Tris、500mM NaCl、250mMイミダゾール、pH7.5、10mL)で溶出した。画分をSDS-PAGEによりポリアクリルアミドゲル(12%)上で分析した。精製標的タンパク質を含有した画分を合わせ、バッファーを、一晩4℃で実施された透析により20mM Tris pH7.5および150mM NaClに対して交換した。アミコンウルトラ-0.5、Ultracel-10 Membrane(Millipore)を使用して、精製タンパク質を少なくとも2mg/mLに濃縮した。生成物をさらなる使用の前に-80℃で貯蔵する。
実施例20:EndoSHによるトラスツズマブのトリミング
25mM TrisバッファーpH8中のトラスツズマブ(Epirus biopharma(Utrecht、オランダ)から入手;14mg/mL)を0.1または1w/w%のいずれかの濃度のEndoSHを用いてトリミングした。反応物、350μgトラスツズマブ(25μL)および適切な量のEndoSHを37℃で撹拌し、MS分析により時間と共に、1~3時間分析した。試料を分析前にFabricator処理に供した。トリミング生成物(コアGlcNAc糖残基にトリミングされている)への完全変換を37℃で0.1w/w% EndoSHを用いて1時間後に観察した。
実施例21:融合タンパク質EndoSHによる高マンノーストラスツズマブのトリミング
25mM TrisバッファーpH8中の、高マンノースグリカンを有するトラスツズマブ(Evitria(Zurich、スイス)により実施された、キフネンシンの存在下でのCHO K1細胞における一過性発現を介して得られた)(14mg/mL)を、0.1または1w/w%のいずれかの濃度のEndoSHを用いてトリミングした。反応物、350μg高マンノーストラスツズマブ(25μL)および適切な量のEndoSHを37℃で撹拌し、MS分析により時間と共に、1~3時間分析した。試料を分析前にFabricator処理に供した。トリミング生成物(コアGlcNAc糖残基にトリミングされている)への完全変換を37℃で1w/w% EndoSHを用いて3時間後に観察した。
実施例22-28:cAC10バイオコンジュゲートの調製
修飾生体分子13dの調製を以下で記載される手順に従い、cAC10のグリカンのトリミングのためのエンドグリコシダーゼ融合タンパク質EndoS-リンカー-EndoH(EndoSHとも呼ばれ、SEQ.ID NO:1により同定される)を使用して、実施する。第2の工程ではトリミングされたcAC10を、His-TnGalNAcTの作用により、基質としての6-N-GalNAc-UDP(GlycoHubから市販)の存在下で、アジド修飾mAb13dに変換させた。cAC10バイオコンジュゲートの調製は、図13に概略的に図示される。修飾生体分子13e(抗体mAb-3に基づくが、その他の点では13dに同一)を、さらに下記で記載されるように、同じ様に調製した。
実施例22:cAC10の一過性発現および精製
cAC10をCHO K1細胞中にEvitria(Zurich、スイス)により5Lスケールで一過性発現させた。上清を、50mLプロテインAセファロースで充填されたXK 26/20カラムを用いて精製した。単一実行で、5Lの上清をカラムにロードし、続いて、少なくとも10カラム体積の25mM Tris pH7.5、150mM NaClで洗浄した。保持されたタンパク質を0.1MグリシンpH2.7で溶出した。溶出したcAC10を1.5M Tris-HCl pH8.8で直ちに中和し、25mM Tris pH8.0に対して透析した。次に、Vivaspin Turbo 15限外濾過ユニット(Sartorius)を使用して、IgGをおよそ20mg/mLまで濃縮し、さらなる使用の前に-80℃で貯蔵した。
実施例23:His-TnGalNAcT(33-421)の一過性発現および精製
His-TnGalNAcT(33-421)(SEQ.ID NO:2により同定される)をCHO K1細胞中にEvitria(Zurich、スイス)により5Lスケールで一過性発現させた。上清を、25mL Niセファロースエクセル(GE Healthcare)で充填されたXK 16/20カラムを用いて精製した。各実行でおよそ1.5L上清をカラムにロードし、続いて、少なくとも10カラム体積のバッファーA(20mM Trisバッファー、5mMイミダゾール、500mM NaCl、pH7.5)で洗浄した。保持されたタンパク質をバッファーB(20mM Tris、500mM NaCl、500mMイミダゾール、pH7.5)で溶出した。HiPrep H26/10脱塩カラム(GE Healthcare)を使用して、溶出画分のバッファーを25mM Tris pH8.0に交換した。Vivaspin Turbo 4限外濾過ユニット(Sartorius)を使用して、精製タンパク質を少なくとも3mg/mLまで濃縮し、さらなる使用の前に-80℃で貯蔵した。
実施例24:融合タンパク質EndoSHによるトリミングされたcAC10の調製
cAC10(Evitria(Zurich、スイス)により実施されたCHO K1細胞における一過性発現を介して得られた)のグリカントリミングを、融合タンパク質EndoSHを用いて実施した。よって、cAC10(14.5mg/mL)を、EndoSH(1w/w%)と共に25mM Tris pH7.5中、150mM NaClと共におよそ16時間の間37℃でインキュベートした。トリミングされたIgGを、3×1Lの25mM Tris-HCl pH8.0に対して透析した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析はコアGlcNAc(Fuc)-置換cAC10に対応する1つの主要生成物(観察質量24105Da、総Fc/2断片のおよそ80%)、および、コアGlcNAc-置換cAC10およびC末端リジンを有するコアGlcNAc(Fuc)-置換cAC10に対応する2つの微量生成物(観察質量23959および24233Da、総Fc/2断片のおよそ5および15%)に属するFc/2-断片の3つのピークを示した。
実施例25:TnGalNAcTの作用下でのトリミングされたcAC10への6-N-GalNAc-UDPの糖転移
基質6-N-GalNAc-UDP(11d)を、発明との関連で生体分子として好適な修飾生体分子cAC10-(6-N-GalNAc)13dの調製のために使用する。実施例24において以上で記載される通りのcAC10のEndoSH処理により得られた、トリミングされたcAC10(10mg/mL)を基質6-N-GalNAc-UDP(2.5mM、GlycoHubから市販)および0.5mg/mL His-TnGalNAcT(33-421)(5w/w%)と共に10mM MnClおよび25mM Tris-HCl pH8.0中、30℃でインキュベートした。3時間後、His-TnGalNAcT(33-421)の量を1mg/mL(10w/w%)の最終濃度まで増加させ、反応物を一晩30℃でインキュベートした。生体分子13dを反応混合物から、HiTrap MabSelect SuRe 5mlカラム(GE Healthcare)上でAKTA清浄機-10(GE Healthcare)を使用して精製した。溶出IgGを1.5M Tris-HCl pH8.8で直ちに中和し、PBS pH7.4.に対して透析した。次に、IgGをアミコンウルトラ-0.5、Ultracel-10 Membrane(Millipore)を使用して、23.38mg/mLの濃度まで濃縮した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析はコア6-N-GalNAc-GlcNAc(Fuc)-置換cAC10に対応する1つの主要生成物(観察質量24333Da、総Fc/2断片のおよそ80%)、および、コア6-N-GalNAc-GlcNAc-置換cAC10およびC末端リジンを有する6-N-GalNAc-GlcNAc(Fuc)-置換cAC10に対応する2つの微量生成物(観察質量24187および24461Da、総Fc/2断片のおよそ5および15%)に属するFc/2-断片の3つのピークを示した。
実施例26:コンジュゲート113を得るための13dの100とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物100の生体分子としての修飾生体分子13dへのコンジュゲーションにより調製した。cAC10(アジド)(13d)(287μL、6.7mg、PBS pH7.4中23.38mg/ml)の溶液にPBS pH7.4(133μL)および化合物100(27μL、10mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、続いて、Superdex200 10/300 GL(GE Healthcare)上でAKTA清浄機-10(GE Healthcare)にて精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物を示した(観察質量25844Da、総Fc/2断片のおよそ80%)。還元試料のRP-HPLC分析は1.88の平均DARを示した。
実施例27:コンジュゲート114を得るための13dの108とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物108の生体分子としての修飾生体分子13dへのコンジュゲーションにより調製した。cAC10(アジド)(13d)(287μL、6.7mg、PBS pH7.4中23.38mg/ml)の溶液にPBS pH7.4(133μL)および化合物108(27μL、10mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、続いて、Superdex200 10/300 GL(GE Healthcare)上でAKTA清浄機-10(GE Healthcare)にて精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物を示した(観察質量25928Da、総Fc/2断片のおよそ70%)。還元試料のRP-HPLC分析は1.85の平均DARを示した。
実施例28:コンジュゲート112を得るための13dの111とのコンジュゲーション
対照バイオコンジュゲートを、リンカー-コンジュゲートとしての化合物111の生体分子としての修飾生体分子13dへのコンジュゲーションにより調製した。cAC10(アジド)(13d)(287μL、6.7mg、PBS pH7.4中23.38mg/ml)の溶液に、PBS pH7.4(48.2μL)および化合物111(111.8μL、4mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、続いて、Superdex200 10/300 GL(GE Healthcare)上でAKTA清浄機-10(GE Healthcare)にて精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物を示した(観察質量25853Da、総Fc/2断片のおよそ80%)。還元試料のRP-HPLC分析は1.88の平均DARを示した。
実施例29-32:トラスツズマブおよびcAC10 ADCを用いたインビボ有効性および毒性研究
実施例29:トラスツズマブADC95-98を用いて実施したインビボ有効性研究
雌SHOマウス(Crl:SHO-Prkdcscid Hrhr、実験相の初めに6~9週齢、Charles River Laboratories、L’Arbresles、フランスから入手)をケタミン/キシラジンで麻酔し、皮膚を、クロルヘキシジン溶液で消毒し、肩甲骨間領域のレベルで切開し、20mm腫瘍断片20(HBCx-13B乳癌患者由来異種移植片モデル)を皮下組織内に置き、皮膚をクリップで閉じた。腫瘍体積が60-200mmの範囲にあった場合、4匹のマウス群にビヒクル、95(3mg/kgおよび9mg/kg)、96(3mg/kgおよび9mg/kg)、97(3mg/kgおよび9mg/kg)、98(3mg/kgおよび9mg/kg)のいずれかをi.v.注射した。腫瘍を毎週2回測定した。
腫瘍体積についての結果は、図14に図示されている。リンカーの型は腫瘍体積に著しい効果を有することが見出された。本発明によるリンカーを含むADC(95および97)はPEG-リンカーを有するADC(96および98)よりも著しく優れている。
実施例30:cAC10 ADC112-114を用いて実施したインビボ有効性研究
Charles River Laboratories、USA)から得られたCR雌CB.17 SCIDマウス、実験相の初めに8~12週齢を50%マトリゲル中1×10 KARPAS-299腫瘍細胞を皮下、側腹部に(Karpas-299細胞異種移植片モデル)注射した。腫瘍体積が100-150mmの範囲にあった場合、8匹のマウスの群にビヒクル、112(1mg/kg)、113(1mg/kg)、および114(1mg/kg)のいずれかをi.v.注射した。腫瘍を毎週2回測定した。
腫瘍体積についての結果は、図15に図示されている。リンカーの型は腫瘍体積に著しい効果を有することが見出された。本発明によるリンカーを含むADC(113および114)はPEG-リンカーを有するADC(112)よりも著しく優れている。
実施例31:トラスツズマブADC97および98を用いて実施されたラット安全性研究
スプラーグドーリーラット(1群当たり3匹の雄および3匹の雌):OFA:SD、実験相の初めに6週齢、Charles River Laboratories、Saint-Germain-Nuelles、フランスから入手を、97((1)20mg/kgおよび(2)40mg/kg)、または98((1)20mg/kgおよび(2)40mg/kg)静脈内(ボーラス)注射を用いて、尾静脈に導入されたマイクロフレックス注入セットを使用して(1mL/分で2mL/kg)処置した。1つの動物群(対照)をビヒクルで処置した。投与後、全ての動物を5日の観察期間の間維持した。生存する動物を5日目に死亡させた。各動物を無作為化/選択時に、投与前に(0日目)ならびに2日目および4日目に秤量した。全ての動物(死亡が見出された、または瀕死で死亡させたものを含む)を完全剖検手順に供した。肝臓、脾臓および坐骨神経の病理組織学的検査を、全ての動物について実施した。血液試料(瀕死で死亡させた動物に対するものを含む)を回収し、血液学的ならびに血清臨床的化学パラメータの両方の決定に供した。
血小板数および体重についての結果は、図16A及び図16Bに図示されており、動物は本発明によるコンジュゲート(97)および従来リンカーを有するコンジュゲート(98)に同等に良好に耐容性を示すことができたことを証明する。血小板数および体重における有意な差異は観察されなかったが、両方のパラメータはビヒクル処置ラットでは急速に減少した。
実施例32-42:リンカー-コンジュゲート121、124、129および130の調製
本発明によるリンカー-コンジュゲート124、126および130、ならびに対照リンカー-コンジュゲート121、125および129の合成が本明細書で記載される。
Figure 2022058417000022
実施例32:化合物119の調製
110(0.90g;1.69mmol)を含むDCM(50mL)の溶液に、ジエタノールアミン(DEA、231mg;2.20mmol)を含むDMF(7mL)の溶液およびEtN(707μL;513mg;5.07mmol)を添加した。得られた混合物を室温で43時間の間撹拌し、NHClの飽和水溶液(50mL)で洗浄した。水相をDCM(50mL)で抽出し、有機層を合わせて、乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM→MeOH/DCM 1/9)により精製した。生成物を無色フィルムとして得た(784mg;1.57mmol;93%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)5.67-5.60(m、1H)、4.32-4.27(m、2H)、4.14(d、J=8.4Hz、2H)、3.89-3.79(m、4H)、3.75-3.60(m、10H、3.58-3.53(m、2H)、3.53-3.44(m、4H)、3.40-3.33(m、2H)、2.35-2.18(m、6H)、1.62-1.56(m、2H)、1.42-1.30(m、1H)、1.00-0.88(m、2H)。
実施例33:化合物120の調製
119(0.78g;1.55mmol)を含むDCM(20mL)の溶液にクロロギ酸4-ニトロフェニル(938mg;4.65mmol)およびEtN(1.08mL;784mg;7.75mmol)を添加した。得られた混合物を室温で17時間の間撹拌し、濃縮させた。残渣を2度フラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM→MeOH/DCM 1/9(カラム1)、50%EtOAcを含むヘプタン→EtOAc(カラム2))により精製した。生成物を淡黄色油として得た(423mg;0.51mmol;33%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)8.31-8.25(m、4H)、7.42-7.35(m、4H)、5.22-5.14(m、1H)、4.48-4.43(m、4H)、4.33-4.28(m、2H)、4.14(d、J=8.4Hz、2H)、3.78-3.68(m、6H)、3.67-3.59(m、8H)、3.57-3.51(m、2H)、3.39-3.32(m、2H)、2.34-2.16(m、6H)、1.60-1.55(m、2H)、1.40-1.30(m、1H)、0.99-0.88(m、2H)。
実施例34:リンカー-コンジュゲート121の調製
120(34mg、41μmol)を含むDMF(400μL)の溶液に、トリエチルアミン(28μl;20mg;201μmol)およびvc-PABC-MMAE.TFA(83mg;67μmol)を含むDMF(1.0mL)の溶液を添加した。混合物をDMF(1200μL)で希釈し、41時間の間放置し、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(47μL、48mg、322μmol)を添加した。80分後、反応混合物をRP HPLCにより精製した(C18、30%→90%MeCN(1%AcOH)を含む水(1%AcOH)。所望の生成物を無色油として得た(66mg、24μmol、58%(120に基づく)。LCMS(ESI) C1422262235 2+(M+2H)について計算1400.33 観測1401.08。
実施例35:化合物122の調製
化合物99(0.39g;0.734mmol)を含むDCM(30mL)の溶液に、ジエタノールアミン(DEA、107mg;1.02mmol)を含むDMF(2mL)の溶液およびEtN(305μL;221mg;2.19mmol)を添加した。得られた混合物を室温で17時間の間撹拌し、NHClの飽和水溶液(30mL)で洗浄した。水相をDCM(30mL)で抽出し、有機層を合わせて、乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製した(DCM→MeOH/DCM 1/9)。生成物を無色フィルムとして得た(163mg;0.33mmol;45%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)6.29(bs、1H)、4.33-4.29(m、2H)、4.28(d、J=8.2Hz、2H)、3.90-3.80(m、4H)、3.69-3.64(m、2H)、3.61(t、J=4.8Hz、2H)、3.52(t、J=5.0Hz、4H)、3.32(t、J=5.1Hz、2H)、2.37-2.18(m、6H)、1.60-1.55(m、2H)、1.39(五重線、J=8.7Hz、1H)、1.05-0.94(m、2H)。
実施例36:化合物123の調製
122(163mg、0.33mmol)およびクロロギ酸4-ニトロフェニル(134mg、0.66mmol)を含むDCM(10mL)の溶液に、EtN(230μL;167mg;1.65mmol)を添加した。反応混合物を、17時間の間撹拌し、濃縮させた。残渣をフラッシュカラムクロマトグラフィーにより精製した(50%EtOAcを含むヘプタン→100%EtOAc)。生成物を無色油として得た(69mg;0.084mmol;25%)。H NMR(400MHz、CDCl)δ(ppm)8.29-8.23(m、4H)、7.42-7.35(m、4H)、5.81-5.71(m、1H)、4.53-4.43(m、4H)、4.36-4.30(m、2H)、4.25(d、J=8.2Hz、2H)、3.81-3.70(m、4H)、3.70-3.65(m、2H)、3.62-3.56(m、2H)、3.32-3.24(m、2H)、2.34-2.14(m、6H)、1.60-1.45(m、2H)、1.35(五重線、J=8.7Hz、1H)、1.02-0.91(m、2H)。
実施例37:リンカー-コンジュゲート124の調製
123(27mg、33μmol)を含むDMF(400μL)の溶液に、トリエチルアミン(22μl;16mg;158μmol)および、vc-PABC-MMAE.TFA(96mg;78μmol)を含むDMF(1.0mL)の溶液を添加した。混合物を19時間の間放置し、2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(37μL、38mg、253μmol)を添加した。2時間後、反応混合物をDMFで希釈し(100μL)、RP HPLCにより精製した(C18、30%→90%MeCN(1%AcOH)を含む水(1%AcOH)。所望の生成物を無色フィルムとして得た(41mg、14.7μmol、45%)。LCMS(ESI) C13821923352+(M+2H)について計算1395.79 観測1396.31。
Figure 2022058417000023
実施例38:化合物125の調製
BCN-OSuカーボネート(66mg、0.23mmol)、アミノ-dPEG-酸(100mg、0.23mmol)およびEtN(69mg、94μL、0.678mmol)を含むTHF/水(10mL/10mL)の混合物を一晩撹拌した。リン酸カリウムバッファー(0.5M、pH3.0)を添加し、pHを、1N HCl水溶液の添加により3.0とした。水溶液をEtOAc(20mL)で抽出した。有機相を乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。生成物を無色油として得た(138mg、0.22mmol;97%)。H NMR(400MHz、CDCl)δppm5.43-5.35(m、1H)、4.14(d、2H、J=8.0Hz)、3.77(t、2H、J=6.0Hz)、3.68-3.60(m、28H)、3.58-3.53(m、2H)、3.40-3.33(m、2H)、2.60(t、2H、J=6.0Hz)、2.35-2.16(m、6H)、1.65-1.50(m、2H)、1.40-1.30(m、1H)、1.00-0.85(m、2H)。
実施例39:化合物126の調製
BCNアルコール(0.384g、2.55mmole)を含むMeCN(25mL)の溶液をN雰囲気下で0℃まで冷却し、クロロスルホニルイソシアネート(CSI)を1滴ずつ添加した(0.255mL、415mg、2.93mmole、1.15当量)。15分間の撹拌後、EtNを1滴ずつ添加し(1.42mL、1.03g、10.2mmole、4当量)、撹拌をさらに10分間続けた。次に、2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)酢酸(1.0g、6.1mmole、2.4当量)を含むHO(5mL)の溶液を添加し、反応混合物を室温まで2時間の間撹拌した。この時間の後、CHCl(50mL)およびHO(100mL)を添加し、層を分離した。分液漏斗中の水層に、CHCl(100mL)を添加し、pHを、1N HClを用いて4に調整し、その後、層を分離した。水層を2回CHCl(2×100mL)で抽出し、有機層を合わせ、乾燥させ(NaSO)、濾過し、濃縮させた。残渣を、フラッシュカラムクロマトグラフィーによりシリカ上で、CHCl~20%MeOHを含むCHClで溶離して精製した。無色粘着性ろうとしての126の収率0.42g(1.0mmole、39%)。
Figure 2022058417000024
実施例40:化合物128の調製
パラジウムテトラキストリフェニルホスフィンPd(PPh(4.8mg、4.15μmol)を秤量し、Nの雰囲気下に置く。ピロリジン(5.0μL、4.3mg、60μmol)を含むDCM(1mL)の溶液を、Nを溶液に通してバブリングすることにより脱気する。127(27mg、24μmol)を含むDCM(6mL)の溶液を、Nを溶液に通してバブリングすることにより脱気する。Nを依然として溶液に通してバブリングさせながら、ピロリジンの脱気溶液を添加する。秤量したPd(PPhをCHCl(1mL)に溶解し、0.9mLのこの溶液を添加する。Nの50分のバブリング後、CHCl(25mL)を添加し、混合物を飽和NHCl水溶液(25mL)で洗浄する。分離後、水層をCHCl(2×25mL)で抽出する。有機層を合わせて乾燥させ(NaSO)、濃縮させる。残渣をRP-HPLCにより精製する(30-90%MeCN(0.1%ギ酸)を含むHO(0.1%ギ酸)。画分を合わせ、SPE(HCO )カラムに通過させ、濃縮させる。MeCN(50mL)の添加後、混合物を再び濃縮する。得られた残渣を次の工程で使用する。
実施例41:化合物129の調製
128(6.8mg、7.4μmol)および125(5.6mg、9.0μmol)を含むCHCl(400μL)の混合物をEDC.HCl(2.6mg、13.5μmol)に添加した。混合物を1.5時間の間放置し、EDC.HCl(2.6mg、13.6μmol)および2,2’-(エチレンジオキシ)ビス(エチルアミン)(1.3μL、1.3mg、8.8μmol)を添加した。混合物を一晩放置し、DCM(10mL)で希釈した。有機溶液を飽和NHCl水溶液で洗浄し、乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣を逆相(C18)HPLCクロマトグラフィーを介して精製した(30→90%MeCN(酸なし)を含むHO(0.01%ギ酸)。HPLC捕集管を5%(NH)HCO水溶液で充填し、その後、収集する。所望の生成物を含む画分をプールし、ジクロロメタン(10mL)で抽出した。有機相を乾燥させ(NaSO)、濃縮させ、これにより、所望の生成物を得た(4.6mg、3.0μmol、41%)。LCMS(ESI) C7910922 (M+H)について計算1521.77 観測1521.99。
実施例42:化合物130の調製
128を含むCHCl(5mL)の溶液に、126(15mg、36μmol)を含むCHCl(0.8mL)の溶液を添加する。得られた混合物を固体EDC.HCl(4.7mg、25μmol)に添加し、CHCl(5mL)を添加し、混合物を16時間の間放置した。DCM(30mL)を添加し、得られた混合物を水(30mL)で洗浄する。分離後、水相をDCM(30mL)で抽出する。有機層を合わせて乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。残渣をRP-HPLC(30-90%MeCN(酸なし)を含むHO(0.01%ギ酸)により精製する。HPLC捕集管を5%(NH)HCO水溶液で充填し、その後、収集する。HPLC画分を合わせ、DCM(3×20mL)で抽出する。有機層を合わせて乾燥させ(NaSO)、濃縮させた。生成物130を淡黄色油として得る(21mg、16μmol、mw1323g/mole、127から2工程で67%)。
実施例43-44:cAC10バイオコンジュゲートの調製
実施例43:コンジュゲート115を得るための13dの121とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートをリンカー-コンジュゲートとしての化合物121の生体分子13dとしてのアジド修飾cAC10へのコンジュゲーションにより調製した。cAC10-(6-N-GalNAc)(13d)(8.408mL、246.0mg、PBS pH7.4中29.3mg/ml)の溶液に、プロピレングリコール(11.909mL)および化合物121(410.6μL、40mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温でおよそ40時間の間インキュベートした。反応混合物をPBS pH7.4に対して透析し、HiLoad 26/600 Superdex200 PG(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物を示した(観察質量27132Da、総Fc/2断片のおよそ80%)。還元試料のRP-HPLC分析は3.81の平均DARを示した。
実施例44:コンジュゲート116を得るための13dの124とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートを、リンカー-コンジュゲートとしての化合物124の生体分子13dとしてのアジド修飾cAC10へのコンジュゲーションにより調製した。よって、cAC10-(6-N-GalNAc)(13d)(9.95mL、205mg、PBS pH7.4中20.7mg/ml)の溶液に、PBS pH7.4(1.0mL)、DMF(2.568mL)および化合物124(171.7μL、40mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、続いて、透析し、HiLoad 26/600 Superdex200 PG(GE Healthcare)上AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物を示した(観察質量27124Da、総Fc/2断片のおよそ80%)。還元試料のRP-HPLC分析は3.79の平均DARを示した。
実施例45-48:mAb-3バイオコンジュゲートの調製
修飾生体分子13eの調製を、cAC10について以上で記載されるのと同様の手順に従い、mAb-3のグリカンのトリミングのためのエンドグリコシダーゼ融合タンパク質EndoSHを使用して、実施する。第2の工程では、トリミングされたmAb-3を、His-TnGalNAcTの作用により、基質としての6-N3-GalNAc-UDP(GlycoHubから市販)の存在下、アジド修飾抗体13eに変換させた。
実施例45:融合タンパク質EndoSHによりトリミングされたmAb-3の調製
mAb-3のグリカントリミングを、融合タンパク質EndoSHを用いて実施した。mAb-3の溶液(23.21mL、200mg、PBS pH7.4中8.6mg/ml)にEndoSH(526μL、2.0mg、25mM Tris-HCl pH7.5中3.8mg/ml)を添加した。反応物をおよそ16時間の間37℃でインキュベートした。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コアGlcNAc(Fuc)-置換mAb-3に対応する、1つの主要生成物(観察質量24139Da、総Fc/2断片のおよそ90%)に属するFc/2-断片の1つの主要ピークを示した。トリミングされたIgGを、2×1Lの25mM Tris-HCl pH8.0(150mM NaClを有する)に対して透析し、続いて、スピン濾過(アミコンウルトラ-4、Ultracel-10 Membrane、Millipore)により、21.5mg/mLに濃縮した
実施例46:TnGalNAcTの作用下での6-N-GalNAc-UDPのトリミングされたmAb-3への糖転移
基質6-N-GalNAc-UDP(11d)を、発明との関連で生体分子として好適な、修飾生体分子mAb-3-(6-N-GalNAc)13eの調製のために使用する。実施例48で得られた、トリミングされたmAb-3(9.297mL、200mg、150mM NaClを有する25mM Tris-HCl pH8.0中21.5mg/ml)の溶液に、MnCl(133μL、MQ中0.1M)、His-TnGalNAcT(33-421)(3.112mL、15mg、25mM Tris-HCl pH8.0中4.82mg/ml)および6-N-GalNAc-UDP(1.0mL、63mg、MQ中0.1M)を添加した。反応物をおよそ16時間の間30℃でインキュベートした。生体分子13eを反応混合物から、HiTrap MabSelect SuRe 5mlカラム(直列に連結された3つのカラム、GE Healthcare)上で、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)を使用して精製した。溶出IgGを1.5M Tris-HCl pH8.8で直ちに中和し、PBS pH7.4に対して透析した。次に、IgGをアミコンウルトラ-4、Ultracel-10 Membrane(Millipore)を使用して、20.17mg/mLの濃度に濃縮した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コア6-N-GalNAc-GlcNAc(Fuc)-置換mAb-3に対応する、1つの主要生成物(観察質量24365Da、総Fc/2断片のおよそ90%)に属するFc/2-断片の1つの主要ピークを示した。
実施例47:コンジュゲート117を得るための13eの129とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートを、リンカー-コンジュゲートとしての化合物129の生体分子としてのアジド修飾mAb-3へのコンジュゲーションにより調製した。よって、mAb-3-(6-N-GalNAc)(13e)(1.667mL、40.6mg、PBS pH7.4中24.6mg/ml)の溶液にPBS pH7.4(636μL)、DMF(163μL)および化合物129(244μL、10mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、続いて、透析し、Superdex200 10/300 GL(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物(観察質量25890Da、総Fc/2断片のおよそ90%)を示した。還元試料のRP-HPLC分析は1.96の平均DARを示した。
実施例48:コンジュゲート118を得るための13eの130とのコンジュゲーション
本発明によるバイオコンジュゲートを、リンカー-コンジュゲートとしての化合物130の生体分子としてのアジド修飾mAb-3へのコンジュゲーションにより調製した。よって、mAb-3-(6-N-GalNAc)(13e)(1.667mL、40.6mg、PBS pH7.4中24.6mg/ml)の溶液にPBS pH7.4(636μL)、DMF(190μL)および化合物130(217μL、10mM DMF溶液)を添加した。反応物を室温で一晩インキュベートし、続いて、透析し、Superdex200 10/300 GL(GE Healthcare)上、AKTA清浄機-10(GE Healthcare)で精製した。fabricator消化試料の質量スペクトル分析は、コンジュゲートFc/2断片に対応する、1つの主要生成物(観察質量25691Da、総Fc/2断片のおよそ90%)を示した。還元試料のRP-HPLC分析は1.98の平均DARを示した。
実施例49-51:mAb-3 ADCを用いたインビボ有効性および毒性研究
実施例49:cAC10 ADC115および116を用いて実施したインビボ有効性研究
CR雌CB.17 SCIDマウス、実験相の初めに8~12週齢、Charles River Laboratories、USAから入手)に50%マトリゲル中1×107KARPAS-299腫瘍細胞を皮下、側腹部に注射した(Karpas-299細胞異種移植片モデル)。腫瘍体積が100-150mmの範囲にあった場合、8匹のマウスの群に、ビヒクル、115(1および2mg/kg)およびアドセトリス(登録商標)(1および2mg/kg)のいずれかをi.v.注射した。腫瘍を毎週2回測定した。腫瘍体積についての結果は、図17aに図示されている。
別々であるが同一の研究において、8匹のマウスの群に、ビヒクル、116(1mg/kg)およびアドセトリス(登録商標)(1mg/kg)のいずれかを注射した。腫瘍を毎週2回測定した。腫瘍体積についての結果は、図17bに図示されている。
リンカーの型は腫瘍体積に著しい効果を有することが見出された。本発明によるリンカーを含むADC(116)はアドセトリス(登録商標)よりも同じ用量で著しく優れていたが、一方、別の研究では、先行技術PEG-リンカーを有するADC(115)の有効性はアドセトリス(登録商標)よりも同じ用量で小さくなる。
実施例50:cAC10 ADC112-114を用いて実施されたラット安全性研究
雌ウィスターラット(1群あたり2匹の雌)、実験相の初めに5~6週齢、Charles River Laboratories、USAから入手を、112(40、60、70または80mg/kg)、113(40、60、70または80mg/kg)または114(40、60、70または80mg/kg)で処置した。試験アイテムを、尾静脈に導入されたマイクロフレックス注入セットを使用して、静脈内(ボーラス)注射により投与した(1mL/分で2mL/kg)。1つの動物群をビヒクルで処置した(対照)。投与後、全ての動物を12日の観察期間の間維持した。生存する動物を12日目に安楽死させた。各動物を無作為化/選択時に、投与前に(0日目)ならびに12日目までのその後の日にち全てで秤量した。>30%体重減少の1回の観察または>25%体重減少の3回連続測定を有するいずれの個々の動物も安楽死させた。全ての動物(死亡が見出された、または瀕死で死亡させたものを含む)を完全剖検手順に供した。肝臓、脾臓および坐骨神経の病理組織学的検査を、全ての動物について実施した。血液試料(瀕死で死亡させた動物に対するものを含む)を回収し、血液学的ならびに血清臨床的化学パラメータの両方の決定に供した。
ADCについての異なる投与計画に対するラットの体重減少パーセンテージについての結果は、図18a-cに図示されている。これらの結果から、112-114全てについての最大耐容量(MTD)は60mg/kgであると見出されることは明らかである。
実施例51:cAC10 ADC115、116およびアドセトリス(登録商標)を用いて実施されたラット安全性研究
雌ウィスターラット(1群あたり2匹の雌)、実験相の初めに5~6週齢、Charles River Laboratories、USAから入手を、115(80、120、140または160mg/kg)、116(80、120、40または160mg/kg)またはアドセトリス(登録商標)(15、20または40mg/kg)で処置した。試験アイテムを、尾静脈に導入されたマイクロフレックス注入セットを使用して、静脈内(ボーラス)注射により投与した(1mL/分で2mL/kg)。1つの動物群をビヒクルで処置した(対照)。投与後、全ての動物を12日の観察期間の間維持した。生存する動物を12日目に安楽死させた。各動物を無作為化/選択時に、投与前に(0日目)ならびに12日目までのその後の日にち全てで秤量した。>30%体重減少の1回の観察または>25%体重減少の3回連続測定を有するいずれの個々の動物も安楽死させた。全ての動物(死亡が見出された、または瀕死で死亡させたものを含む)を完全剖検手順に供した。肝臓、脾臓および坐骨神経の病理組織学的検査を、全ての動物について実施した。血液試料(瀕死で死亡させた動物に対するものを含む)を回収し、血液学的ならびに血清臨床的化学パラメータの両方の決定に供した。
ADCについての異なる投与計画に対するラットの体重減少パーセンテージについての結果は、図19a-cに図示されている。これらの結果から、アドセトリスについての最大耐容量(MTD)は15mg/kg~20mg/kgであり、一方、ADC115および116についてのMTDは120mg/kgであると見出されることは明らかである。
実施例52-53:mAb-3 ADCを用いたインビボ有効性および毒性研究
実施例52:mAb-3 ADC117および118を用いて実施したインビボ有効性研究
5×10 MDA‐MB‐231腫瘍細胞を雌胸腺欠損ヌードマウスに皮下移植した。ビヒクル、117、118または(標的陰性)対照ADCの投与を10匹のマウスの群において、腫瘍体積が88-172mmに到達した時に開始した。全ての処置を、尾静脈注射により1回静脈内(i.v.)投与した。投与体積を10mL/kg体重とし、各個々の動物の体重まで増大させた。動物を、それらの腫瘍体積が1500mmのエンドポイント体積に到達した場合または研究の終わりに、どちらか最初に来た方で安楽死させた。群の平均腫瘍体積の計算については、下記規則を適用した:動物が腫瘍サイズのために研究を外れた場合、その動物について記録された最終腫瘍体積は、その後の時間点での平均体積を計算するために使用されるデータと共に含めた。腫瘍体積および体重値は、群内の動物の50%未満が研究に残っていた場合、群平均腫瘍体積/体重を計算するために使用しなかった。Prism(GraphPad、San Diego、CA)をグラフィカルプレゼンテーションおよび統計分析のために使用した。エラーバーはSEMを示す。4つ全ての群についての平均腫瘍体積は図20においてグラフにより図示される。
実施例53:mAb-3 ADC117および118を用いて実施されたラット安全性研究
ラット耐容性研究を、Covance Laboratoriesで米国農務省(USDA)動物福祉法、実験動物研究協会からの実験動物の管理と使用に関するガイドライン、および国立衛生研究所(NIH)ガイドラインを順守して実施した。24匹の、およそ250グラムの体重を有するCrl:CD(SD)雄ラットを各々3匹の動物の群に無作為化した。ラットに単一i.v.用量(2、3または6mg/kg)の117、118またはビヒクルを尾静脈注射により与えた。投与体積は5mL/kg体重とし、各個々の動物の体重まで増大させた。動物を、それらが不良臨床状態を示した場合または研究の終わりに、どちらか最初に来た方で安楽死させた。動物の臨床観察を研究期間中定期的に実施した。血液試料(100μL~1.8mL)を1日目の1、3および6時間;ならびに2、3、7、8、14および21日目(研究日の最後)に収集した。
結果:117は3mg/kgで良好な耐容性を示したが、6mg/kgでは、良好ではない耐容性を示し、10日目に、不良臨床状態のために早期屠殺となった。118は3mg/kgおよび6mg/kgで良好な耐容性を示した。これらの群全てにおける体重増加は、研究の持続期間にわたって、ビヒクル処置群で観察されたものより著しく低く、これは摂食量の低減と関連した。網状赤血球、赤血球量、血小板、好中球、単球、白血球およびリンパ球における用量依存低減が、117および118で、試験した用量の両方にて(3および6mg/kg)処置した動物において観察された。3mg/kgの118で処置した動物は、21日目までにこれらのパラメータの可逆性のエビデンスを示した。117および118についてのMTDを、それぞれ3および6mg/kgと確立した。
Figure 2022058417000025
His-TnGalNAcT(33-421)の配列(SEQ.ID NO:2):
1 MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MSPLRTYLYT PLYNATQPTL RNVERLAANWPKKIPSNYIE
61 DSEEYSIKNI SLSNHTTRAS VVHPPSSITE TASKLDKNMT IQDGAFAMISPTPLLITKLM
121 DSIKSYVTTE DGVKKAEAVV TLPLCDSMPP DLGPITLNKT ELELEWVEKKFPEVEWGGRY
181 SPPNCTARHR VAIIVPYRDR QQHLAIFLNH MHPFLMKQQI EYGIFIVEQEGNKDFNRAKL
241 MNVGFVESQK LVAEGWQCFV FHDIDLLPLD TRNLYSCPRQ PRHMSASIDK LHFKLPYEDI
301 FGGVSAMTLE QFTRVNGFSN KYWGWGGEDD DMSYRLKKIN YHIARYKMSIARYAMLDHKK
361 STPNPKRYQL LSQTSKTFQK DGLSTLEYEL VQVVQYHLYT HILVNIDERS

Claims (15)

  1. バイオコンジュゲートの治療指数を増加させるための方法であって、式(A)のバイオコンジュゲート:
    B-L-D
    (A)、
    式中:
    -Bは、生体分子であり;
    -Lは、BおよびDを連結させるリンカーであり;
    -Dは、標的分子であり;ならびに
    -「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分である、
    を、Lが式(1)に従う基またはその塩を含むように、標的分子(D)上の反応基Qを生体分子(B)上の官能基Fと反応させることにより、調製する工程を含み:
    Figure 2022058417000026

    式中:
    -aは0または1であり;ならびに
    -Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、前記C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意で置換され、および、O、SまたはNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、Rは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRは追加の標的分子Dであり、前記標的分子は任意で、スペーサ部分を介してNに連結される、方法。
  2. 前記バイオコンジュゲートをその必要のある被験体に投与する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記被験体は癌患者である、請求項2に記載の方法。
  4. 前記生体分子は抗体であり、前記バイオコンジュゲートは抗体-薬物-コンジュゲートである、前記請求項のいずれかに記載の方法。
  5. 標的分子Dは活性物質、好ましくは細胞毒である、前記請求項のいずれかに記載の方法。
  6. 前記バイオコンジュゲートは式B-Z-L-Dを有し、Zは前記反応基Qを前記官能基Fと反応させることにより得られる、前記請求項のいずれかに記載の方法。
  7. は式Q-L-D(式中、Lは式(1)に従う基またはその塩を含む)を有するリンカー-コンジュゲート:
    Figure 2022058417000027

    を、式B-Fを有する生体分子と反応させることにより得られ、B、D、aおよびRは請求項1で規定される通りである、請求項6に記載の方法。
  8. 前記リンカー-コンジュゲートは式(4a)または(4b)、またはその塩に従い:
    Figure 2022058417000028

    式中:
    -aは独立して0または1であり;
    -bは独立して0または1であり;
    -cは0または1であり;
    -dは0または1であり;
    -eは0または1であり;
    -fは1~150の範囲の整数であり;
    -gは0または1であり;
    -iは0または1であり;
    -Dは、標的分子であり;
    -Qは生体分子上に存在する官能基Fと反応することができる反応基であり;
    -Spはスペーサ部分であり;
    -Spはスペーサ部分であり;
    -Spはスペーサ部分であり;
    -Spはスペーサ部分であり;
    -ZはQまたはSpをSp、OまたはC(O)またはN(R)に連結させる連結基であり;
    -ZはDまたはSpをSp、N(R)、OまたはC(O)に連結させる連結基であり;ならびに
    -Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、前記C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、Rは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され;あるいはRはD、-[(Sp(Z(SpD]または-[(Sp(Z(Sp]であり、Dは標的分子であり、Sp、Sp、Sp、Sp、Z、Z、D、Q、b、c、d、e、gおよびiは以上で規定される通りである、請求項7に記載の方法。
  9. Sp、Sp、SpおよびSpは直鎖または分枝C-C200アルキレン基、C-C200アルケニレン基、C-C200アルキニレン基、C-C200シクロアルキレン基、C-C200シクロアルケニレン基、C-C200シクロアルキニレン基、C-C200アルキルアリーレン基、C-C200アリールアルキレン基、C-C200アリールアルケニレン基およびC-C200アリールアルキニレン基からなる群より独立して選択され、前記アルキレン基、アルケニレン基、アルキニレン基、シクロアルキレン基、シクロアルケニレン基、シクロアルキニレン基、アルキルアリーレン基、アリールアルキレン基、アリールアルケニレン基およびアリールアルキニレン基は任意で置換され、および、O、SおよびNRの群から選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、前記アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される、請求項8に記載の方法。
  10. およびZは、-O-、-S-、-NR-、-N=N-、-C(O)-、-C(O)NR-、-OC(O)-、-OC(O)O-、-OC(O)NR、-NRC(O)-、-NRC(O)O-、-NRC(O)NR-、-SC(O)-、-SC(O)O-、-SC(O)NR-、-S(O)-、-S(O)-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-OS(O)-、-OS(O)O-、-OS(O)NR-、-ONRC(O)-、-ONRC(O)O-、-ONRC(O)NR-、-NROC(O)-、-NROC(O)O-、-NROC(O)NR-、-ONRC(S)-、-ONRC(S)O-、-ONRC(S)NR-、-NROC(S)-、-NROC(S)O-、-NROC(S)NR-、-OC(S)-、-OC(S)O-、-OC(S)NR-、-NRC(S)-、-NRC(S)O-、-NRC(S)NR-、-SS(O)-、-SS(O)O-、-SS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-NROS(O)-、-NROS(O)O-、-NROS(O)NR-、-ONRS(O)-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)O-、-ONRS(O)NR-、-ONRS(O)-、-OP(O)(R-、-SP(O)(R-、-NRP(O)(R-およびその2つ以上の組み合わせからなる群より独立して選択され、Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24アルケニル基、C-C24アルキニル基およびC-C24シクロアルキル基からなる群より独立して選択され、前記アルキル基、アルケニル基、アルキニル基およびシクロアルキル基は任意で置換される、請求項8または9に記載の方法。
  11. Sp、Sp、SpおよびSpは、存在する場合、直鎖または分枝C-C20アルキレン基からなる群より独立して選択され、前記アルキレン基は任意で置換され、および、O、SまたはNRからなる群より選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、Rは水素およびC-Cアルキル基からなる群より独立して選択され、Qは式(9a)、(9q)、(9n)、(9o)または(9p)、(9t)または(9zh)に従い:
    Figure 2022058417000029

    式中:
    -UはOまたはNRであり、Rは水素、直鎖または分枝C-C12アルキル基またはC-C12(ヘテロ)アリール基であり;
    -R10は(チオ)エステル基であり;ならびに
    -R18は、任意で置換された、C-C12アルキル基およびC-C12(ヘテロ)アリール基からなる群より選択される、請求項8-10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 反応基Qと官能基Fの間の前記反応は、(10a)または(10b)として表され得る連結部分Zを形成するためのチオール-アルケンコンジュゲーション、(10c)として表され得る連結部分Zを形成するためのアミノ-(活性化)カルボン酸コンジュゲーション、(10d)(式中、Y=NHである)として表され得る連結部分Zを形成するためのケトン-ヒドラジノコンジュゲーション、(10d)(式中、Y=Oである)として表され得る連結部分Zを形成するためのケトン-オキシアミノコンジュゲーション、(10e)または(10g)として表され得る連結部分Zを形成するためのアルキン-アジドコンジュゲーションならびにNが脱離する(10h)として表され得る連結部分Zを形成するためのアルケン-1,2,4,5-テトラジンコンジュゲーションまたはアルキン-1,2,4,5-テトラジンコンジュゲーションから選択されるコンジュゲーション反応であり、部分(10a)、(10b)、(10c)、(10d)、(10e)、(10g)および(10h)は、下記式により表される、前記請求項のいずれかに記載の方法:
    Figure 2022058417000030

    式中、Zは水素、メチルおよびピリジルから選択される。
  13. a=0である、前記請求項のいずれかに記載の方法。
  14. その必要のある被験体の治療において使用するためのバイオコンジュゲートであって、式(A)により表される、バイオコンジュゲート:
    B-L-D
    (A)、
    式中:
    -Bは、生体分子であり;
    -Lは、BおよびDを連結させるリンカーであり;
    -Dは、標的分子であり;ならびに
    -「-」の各出現は、独立して、結合またはスペーサ部分であり、
    Lは式(1)に従う基またはその塩を含み:
    Figure 2022058417000031

    式中:
    -aは0または1であり;ならびに
    -Rは水素、C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基からなる群より選択され、前記C-C24アルキル基、C-C24シクロアルキル基、C-C24(ヘテロ)アリール基、C-C24アルキル(ヘテロ)アリール基およびC-C24(ヘテロ)アリールアルキル基は、任意で置換され、および、O、SおよびNRから選択される1つ以上のヘテロ原子により任意で中断され、Rは独立して水素およびC-Cアルキル基からなる群より選択され、またはRは追加の標的分子Dであり、前記標的分子は任意で、スペーサ部分を介してNに連結される。
  15. 癌の治療において使用するための、請求項14に記載の使用のためのバイオコンジュゲート。
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