JP2022036976A - 阻害性キメラ抗原受容体 - Google Patents
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-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
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Abstract
Description
本発明の実施は、別段の指示がない限り、当技術分野の技術の範囲内である分子生物学(組換え技術を含む)、微生物学、細胞生物学、生化学、および免疫学の従来の技術を採用する。このような技術は、Molecular Cloning:A Laboratory Manual、second edition(Sambrookら、1989)Cold Spring Harbor Press;Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait編、1984);Methods in Molecular Biology、Humana Press;Cell Biology:A Laboratory Notebook(J.E.Cellis編、1998)Academic Press;Animal Cell Culture(R.I.Freshney編、1987);Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.MatherおよびP.E.Roberts、1998)Plenum Press;Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle、J.B.GriffithsおよびD.G.Newell編、1993~1998)J.Wiley and Sons;Methods in Enzymology(Academic Press,Inc.);Handbook of Experimental Immunology(D.M.WeirおよびC.C.Blackwell編);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(J.M.MillerおよびM.P.Calos編、1987);Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubelら編、1987);PCR:The Polymerase Chain Reaction(Mullisら編、1994);Current Protocols in Immunology(J.E.Coliganら編、1991);Short Protocols in Molecular Biology(Wiley and Sons、1999);Immunobiology(C.A.JanewayおよびP.Travers、1997);Antibodies(P.Finch、1997);Antibodies:a practical approach(D.Catty編、IRL Press、1988~1989);Monoclonal antibodies:a practical approach(P.ShepherdおよびC.Dean編、Oxford University Press、2000);Using antibodies:a laboratory manual(E.HarlowおよびD.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press、1999);The Antibodies(M.ZanettiおよびJ.D.Capra編、Harwood Academic Publishers、1995)などの文献に十分に説明されている。
以下の用語は、別段の指示がない限り、以下の意味を有するものと理解される。用語「単離された分子」は、その起源または由来源が理由で(1)天然では会合している(分子の天然状態で分子に付随している)成分と会合していない、(2)同一の由来源、例えば種、分子が発現される細胞、ライブラリーなどに由来する他の分子をほとんど含まない、(3)異なる種に由来する細胞によって発現される、または(4)天然にはない、分子(ここで、分子は、例えば、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、または抗体である)を指す。したがって、化学合成された、またはその天然の起源である細胞株と異なる細胞株において発現された分子は、その天然で会合している成分から「単離されている」ことになる。分子はまた、当技術分野において周知の精製技術を用いる単離によって、天然で会合している成分をほぼ含まないようにされ得る。分子の純度または均質性は、当技術分野において周知の多くの手段によってアッセイされ得る。例えば、ポリペプチド試料の純度は、当技術分野において周知の技術を用いるポリアクリルアミドゲル電気泳動およびポリペプチドを可視化するためのゲルの染色を用いてアッセイされ得る。特定の目的では、HPLCまたは当技術分野において周知の他の精製手段を用いることによって、より高い分解を得ることができる。
抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン、
膜貫通ドメイン、および
細胞内ドメイン
を含み、
細胞内ドメインが、免疫受容体チロシンベーススイッチモチーフITSMを含み、前記ITSMがアミノ酸配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1がアミノ酸であり、
X2がアミノ酸であり、
X3がアミノ酸であり、
X4がVまたはIである、
負シグナル(または阻害性)キメラ抗原受容体(N-CAR)に関する。
一部の実施形態において、細胞内ドメインは、配列
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nは0、1、または2以上の整数であり、
mは1、または2以上の整数であり
pは1、または2以上の整数であり、
L1は不在であるか、または
(a)ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、例えば、以下の表3に示される配列のいずれかもしくはその断片、
(b)ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、例えば以下の表1に示される配列のいずれかもしくはその断片、
(c)上記(b)内の配列にN末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、もしくはその断片、および
(d)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
L2およびL3のそれぞれは、不在であるか、または
(e)ITIMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、例えば以下の表4に示される配列のいずれか、もしくはその断片、
(f)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域、例えば以下の表6に示される配列のいずれか、もしくはその断片、
(g)ITIM.*ITSMモチーフを有するタンパク質のITIMとITSMとの間の天然の細胞内ドメイン、例えば以下の表5に示される配列のいずれか、もしくはその断片、
(h)上記(f)もしくは(g)内の配列にN末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、もしくはその断片、および
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
L4は不在であるか、または
(j)ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、例えば、以下の表7に示される配列のいずれかもしくはその断片、
(k)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、例えば以下の表8に示される配列のいずれか、もしくはその断片、
(l)上記(j)もしくは(k)内の配列にC末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、もしくはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
ITIMは配列X5X6YX7X8X9であり、式中、
X5はS、V、I、またはLであり、
X6はアミノ酸であり、
X7はアミノ酸であり、
X8はアミノ酸であり、
X9はV、I、またはLであり、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
(a)以下から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域、
(d)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む。
(e)以下から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む。
(j)以下から選択される、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nは0であり、
mは1であり、
pは1であり、
L3は、
(f)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域、例えば以下の表6に示される配列のいずれか、もしくはその断片、または
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つの配列を含み、
L4は、
(k)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、例えば以下の表8に示される配列のいずれか、またはその断片、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、またはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つまたは複数の、好ましくは1つまたは2つの配列を含み、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nは0であり、
mは1であり、
pは1であり、
L3は、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、またはその断片
からなる群から選択される1つの配列を含み、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nは0であり、
mは1であり、
pは1であり、
L3は、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、またはその断片
からなる群から選択される1つの配列を含み、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nは0であり、
mは1であり、
pは1であり、
L3は、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、またはその断片
を含み、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nは0であり、
mは1であり、
pは1であり、
L3は、
(l)上記(k)の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、またはその断片
を含み、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nは0であり、
mは1であり、
pは1または2であり、
L3は、
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つの配列を含み、
L4は、
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つまたは複数の、好ましくは1つまたは2つの配列を含み、
ITSMは配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1はアミノ酸であり、
X2はアミノ酸であり、
X3はアミノ酸であり、
X4はVまたはIである。
pは1、2、3、4、または5であり、
L1は、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域またはその断片、例えば、以下の表3に示される配列のいずれかまたはその断片であり、
L2は不在であり、
L3は、ITIM.*ITSMモチーフを有するタンパク質のITIMとITSMとの間の天然の細胞内ドメインまたはその断片、例えば、以下の表5に示される配列のいずれかまたはその断片であり、
L4は、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、例えば、以下の表7に示される配列のいずれかもしくはその断片、または、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、例えば、以下の表8に示される配列のいずれかもしくはその断片である。
(L1-ITIM-L2-L3-ITSM-L4)p
またはその変異体を含み、式中、
pは1、2、3、4、または5であり、
L1は、以下の配列
膜貫通ドメインに関して、様々な実施形態において、N-CARは、N-CARの細胞外ドメインに付加された膜貫通ドメインを含むように設計され得る。膜貫通ドメインは、膜貫通領域に隣接した1つまたは複数のさらなるアミノ酸、例えば、膜貫通ドメインの由来元であるタンパク質の細胞外領域に付随する1つもしくは複数のアミノ酸(例えば、細胞外領域の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、最大15のアミノ酸)、および/または膜貫通タンパク質の由来元であるタンパク質の細胞内領域に付随する1つもしくは複数のさらなるアミノ酸(例えば、細胞内領域の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、最大15のアミノ酸)を含み得る。一態様において、膜貫通ドメインは、N-CARの他のドメインの1つと会合しているドメインである。一部の場合において、膜貫通ドメインは、このようなドメインが同一のまたは異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインに結合することを避けるように、例えば、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小にするように、選択され得るか、またはアミノ酸置換によって修飾され得る。一態様において、膜貫通ドメインは、CAR T細胞表面上の別のCARとホモ二量体化し得る。異なる態様において、膜貫通ドメインのアミノ酸配列は、同一のCAR T細胞内に存在する天然結合パートナーの結合ドメインとの相互作用を最小にするように、修飾または置換され得る。
抗原結合ドメインは、限定はしないが、モノクローナル抗体、組換え抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、および機能的なその断片(限定はしないが、ラクダ科動物由来のナノボディの重鎖可変ドメイン(VH)、軽鎖可変ドメイン(VL)、および可変ドメイン(VHH)などの一本鎖ドメイン抗体を含む)を含むオフ組織抗原に、ならびに、組換えフィブロネクチンドメインなどの抗原結合ドメインとして機能することが当技術分野において知られている代替的な足場に結合する、あらゆるドメインであり得る。一部の場合において、抗原結合ドメインは、N-CARが最終的にその中で用いられる種と同一の種に由来することが有利である。例えば、ヒトにおける使用では、N-CARの抗原結合ドメインが抗体または抗体断片の抗原結合ドメインにヒト残基またはヒト化残基を含むことが有利であり得る。
(a)少なくとも
-免疫抑制物質の標的を発現する第1の遺伝子、および
-T細胞受容体(TCR)の成分をコードする第2の遺伝子
を不活化することによって、T細胞を修飾すること、
(b)前記細胞を場合によって前記免疫抑制物質の存在下で増殖させること
を含み得る。
(a)T細胞を好ましくは細胞培養物または血液試料から提供すること、
(b)免疫抑制物質の標的を発現する前記T細胞において遺伝子を選択すること、
(c)前記T細胞を、DNA切断によって、好ましくは二本鎖の破壊によって、
前記免疫抑制物質の標的をコードする前記遺伝子、および
T細胞受容体(TCR)の成分をコードする少なくとも1つの遺伝子
のそれぞれを選択的に不活化し得るレアカットエンドヌクレアーゼをコードする核酸で、形質転換すること、
(d)前記レアカットエンドヌクレアーゼを前記T細胞内で発現させること、
(e)TCRをその細胞表面上に発現しない形質転換されたT細胞を選別すること、
(f)前記細胞を場合によって前記免疫抑制物質の存在下で増殖させること
を含み得る。
a)FcsRIアルファ鎖の膜貫通ドメインおよび細胞外リガンド結合ドメインを含む1つのポリペプチド、
b)N末端およびC末端細胞質尾部の一部とFccRIベータ鎖の膜貫通ドメインとを含む1つのポリペプチド、ならびに/または
c)細胞質内尾部の一部およびFccRIガンマ鎖の膜貫通ドメインをそれぞれが含む2つのポリペプチドであって、それにより、個々のポリペプチドが自然発生的に共に多量体化して、二量体、三量体、または四量体CARを形成する2つのポリペプチド
のうちの少なくとも2つを含む。
N-CARにおいて用いられる阻害性ドメインの同定
いくつかの受容体、すなわち、CTLA-4、PD-1、BTLA、TIM-3、LAG3は、T細胞シグナル伝達を弱めるかまたは無効にするための負のシグナルを提供することが知られている。PD-1の細胞内シグナル伝達成分が、その活性に関与し得るモチーフを同定するために研究された。PD-1は、免疫受容体チロシン阻害性モチーフ(ITIM)および免疫受容体チロシンベーススイッチモチーフ(ITSM)の両方を含有し、データは、ITSMドメインが、CD3ゼータ(Riley JL.、Immunol Rev.2009 May;229(1):114~25;またはYokosuka Tら、J Exp Med.2012 Jun 4;209(6):1201~17を参照されたい)のように、上流シグナル伝達成分の不活化を可能にするホスファターゼ(すなわちSHP2)を動員する重要な役割を有することを示唆する。ITSMを有する他の受容体および分子が、P-CARの結合によって生じるT細胞の活性化を弱めるかまたは無効にする負のシグナルの提供においてこの配列モチーフを利用することを目的として、この配列モチーフの機能的役割の理解を助けるために、同定および分析された。細胞質性であると注釈がつけられた配列に限定してタンパク質配列をswissprotデータベースからダウンロードした。これらの細胞質配列のそれぞれを、目的のパターンについて検索した(ITIMモチーフ、ITSMモチーフ、またはITIMおよびITSMモチーフ)。
N-CARの設計
少なくとも1つのITSMを単独で、または1つもしくは複数のITIMもしくは他の阻害性ドメイン、例えばTIM-3、LAG-3、もしくはCTLA4の阻害的ドメインと組み合わせて含むN-CARを、効果的なNOTゲートを生成するために調製する。
-複数のタンデムPD-1 ITIM-ITSMを含むN-CAR、
-複数のタンデムPD-1 ITSMを含むN-CAR、
-単一または複数の非PD1の天然のITSMまたはITIM-ITSMを含むN-CAR、
-合成ITSMまたはITIM-ITSMを含むN-CAR、
-少なくとも1つのITSMおよびTIM-3、LAG-3、またはCTLA4などの他の阻害性受容体のシグナル伝達ドメインを含むN-CAR。
不死化されたヒトT細胞におけるP-CARおよびN-CARを含むT細胞の活性
実験モデルを用いて、実施例2に従って設計されたN-CARを試験する。モデルは、N末端から、シグナル伝達ドメインまたは分泌シグナルドメイン(例えばCD8分泌シグナル配列)、抗CD-19一本鎖抗体、ヒンジ(例えばCD8アルファ)、膜貫通(例えばCD8アルファ)、および正の細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、41BBおよびCD3ゼータ)を含有する、正のシグナル伝達CAR(P-CAR)構築物からなる。P-CARの後ろまたは前には、P2AまたはIRESのいずれかによってP-CARから隔てられた蛍光マーカー(例えばEGFP)または抗生物質耐性遺伝子が存在する(例えば表9を参照されたい)。
Jurkat細胞(クローンE6-1 ATCC#TIB-152)を、10%ウシ胎児血清(hyclone)、1mMピルビン酸ナトリウム、1×glutaMAX、1×非必須アミノ酸(Mediatech)、および25mM HEPES緩衝液を含有するRPMI1640(Life Technologiles)内で0.4~2×106細胞/mLの密度で維持した。293T細胞(クローンHEK-293T/17、ATCC CRL-11268)を、4.5g/Lグルコース、10%ウシ胎児血清、1mMピルビン酸ナトリウム、1×glutaMAX、1×非必須アミノ酸、および25mM HEPESを含有するDMEM内でサブコンフルエントに維持した。
共培養アッセイのために、異なる組み合わせのP-CARおよびN-CARを発現するエフェクターJurkat細胞を、CD19を発現する(オン標的)、CD19およびPSMAの両方を発現する(オフ標的)、またはいずれの抗原も発現しない(空ベクターを形質導入された)AAPCと共培養した。AAPC標的細胞を、組織培養物で処理した平底の白い96ウェルプレート(Corning COSTAR)内で、ウェル当たり20000細胞の密度で播種した。プレートを37℃で、5%CO2内で24時間インキュベートし、その後、培地を除去し、P-CAR1またはP-CAR2を発現する10万の対照ΔPD1または試験対象N-CARを形質導入されたルシフェラーゼレポーターJurkat細胞を100uLの容積で各ウェルに添加した。37℃で16時間のインキュベーションの後、100uLのBright-Gloルシフェラーゼ基質(Promega)をウェルごとに添加し、プレートを2分振とうし、相対的ルシフェラーゼ単位(RLU)をPerkin Elmer EnVision Multilabel Readerで定量した。各Jurkat細胞株を6回試験し、結果を、標的AAPCとの共培養物の平均RLUに対する、オフ標的AAPCとの共培養物の平均RLU値の比率として表した。
-一次ヒトT細胞におけるP-CAR+/N-CAR+T細胞の活性
実施例2に従って設計されたN-CARを一次ヒトT細胞においても試験してよく、それは、Jurkat T細胞で得られた実施例3の結果が一次細胞にも当てはまることを確実にするためである。これは、当業者に知られている方法に従って得られた一次ヒトT細胞にN-CAR構築物をまず導入し、N-CAR抗原の不存在下および存在下での抗CD3/CD28刺激によるT細胞活性化の減少をモニタリングすることによって行うことができる。さらに、実施例3において開示されるP-CARおよびN-CAR構築物もまた、一次ヒトT細胞に形質導入し、CD19、PSMA、およびCD19/PSMA細胞で試験することができる。
異種移植片研究におけるP-CARおよびN-CARを含むT細胞の活性
実施例3において開示されるP-CAR構築物およびN-CAR構築物は、一次ヒトT細胞に形質導入し、CD19のみまたはCD19およびPSMAの両方を発現する腫瘍を移植されたNSG動物における異種移植片研究における有効性について試験することができる。NSGマウスに、CD19またはCD19およびPSMAを発現するルシフェラーゼ標識された105~106細胞を移植する。移植の数日後、これらの動物に104~106のP-CAR+/N-CAR+T細胞を静脈内注入する。動物にルシフェリンを投与し、その後、IVIS画像化システムで通常通り画像化して、腫瘍量をモニタリングする。
1.抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン、
膜貫通ドメイン、
細胞内ドメイン、
を含み、かつ、
細胞内ドメインが、免疫受容体チロシンベーススイッチモチーフITSMを含み、前記ITSMがアミノ酸配列TX1YX2X3X4であり、
X1がアミノ酸であり、
X2がアミノ酸であり、
X3がアミノ酸であり、
X4がVまたはIである、
阻害性キメラ抗原受容体(N-CAR)。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nが0、1、または2以上の整数であり、
mが1、または2以上の整数であり
pが1、または2以上の整数であり、
L1が不在であるか、または
(a)ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(b)ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(c)上記(b)内の配列にN末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(d)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
L2およびL3のそれぞれが不在であるか、または
(e)ITIMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(f)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(g)ITIM.*ITSMモチーフを有するタンパク質のITIMとITSMとの間の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、
(h)上記(f)もしくは(g)内の配列にN末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
L4が不在であるか、または
(j)ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(k)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(l)上記(j)もしくは(k)内の配列にC末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
ITIMが配列X5X6YX7X8X9であり、式中、
X5がS、V、I、またはLであり、
X6がアミノ酸であり、
X7がアミノ酸であり、
X8がアミノ酸であり、
X9がV、I、またはLであり、
ITSMが配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1がアミノ酸であり、
X2がアミノ酸であり、
X3がアミノ酸であり、
X4がVまたはIである、
実施形態1から5.4のいずれか1つに記載のN-CAR。
(a)表3に示される配列から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(b)表1に示される配列から選択される、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(c)上記(b)内の配列もしくはその断片にN末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(d)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
L2およびL3のそれぞれが不在であるか、または、
(e)表4に示される配列から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(f)表6に示される配列から選択される、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(g)表5に示される配列から選択される、ITIM.*ITSMモチーフを有するタンパク質のITIMとITSMとの間の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、
(h)上記(f)もしくは(g)内の配列もしくはその断片にN末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含み、
L4が不在であるか、または
(j)表7に示される配列から選択される、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(k)表8に示される配列から選択される、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(l)上記(j)もしくは(k)内の配列もしくはその断片にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
pが1、2、3、4、または5であり、
L1が、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域またはその断片、例えば、表3に示される配列のいずれかまたはその断片であり、
L2が不在であり、
L3が、ITIM.*ITSMモチーフを有するタンパク質のITIMとITSMとの間の天然の細胞内ドメインまたはその断片、例えば、表5に示される配列のいずれかまたはその断片であり、
L4が、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、例えば、表7に示される配列のいずれかもしくはその断片、または、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、例えば表8に示される配列のいずれか、もしくはその断片である、
実施形態6または7に記載のN-CAR。
(a)以下から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域、
(d)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む、実施形態6から8のいずれか1つに記載のN-CAR。
(e)以下から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む、実施形態6から9のいずれか1つに記載のN-CAR。
(j)以下から選択される、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つもしくは複数の、好ましくは1つの配列を含む、実施形態6から10のいずれか1つに記載のN-CAR。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1であり、
L3が、
(f)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域、例えば以下の表6に示される配列のいずれか、もしくはその断片、または
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つの配列を含み、
L4が、
(k)ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域、例えば以下の表8に示される配列のいずれか、またはその断片、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、またはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つまたは複数の、好ましくは1つまたは2つの配列を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1であり、
L3が、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、例えば表2に示される配列のいずれか、またはその断片
からなる群から選択される1つの配列を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1であり、
L3が、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、好ましくはKIR2DL2、またはその断片
からなる群から選択される1つの配列を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1であり、
L3が、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、好ましくはKIR2DL2、またはその断片
を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1であり、
L3が、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメイン、またはその断片
から選択される配列を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1または2であり、
L3が、
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つの配列を含み、
L4が、
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つまたは複数の、好ましくは1つまたは2つの配列を含む、
実施形態6に記載のN-CAR。
pが1、2、3、4、または5であり、
L1が、以下の配列
I、SSYIKV、SSYNSV、SSYQEI、SSYRKV、SSYRRV、SSYSDI、SSYTPL、SSYTRL、SSYTSV、SSYTTI、SSYVKL、STYAEV、STYAGI、STYAHL、STYALV、STYAPI、STYDHV、STYDKV、STYDQV、STYDRI、STYEEL、STYEYL、STYILV、STYLPL、STYMAV、STYQTL、STYRKL、STYSQL、STYTSI、STYYQV、SVYATL、SVYCFL、SVYCNL、SVYDSV、SVYDTI、SVYEKV、SVYEML、SVYGSV、SVYPII、SVYQPI、SVYRKV、SVYSHL、SVYSRV、SVYTAL、SVYTEL、SVYWKV、SWYDSI、SWYFTV、SYYKAI、SYYLKL、SYYSFV、SYYVTI、VAYADL、VAYARI、VAYARV、VAYDQL、VAYGHV、VAYKQV、VAYKRL、VAYNLL、VAYQRV、VAYSGV、VAYSQV、VCYCIV、VCYGLV、VCYGRL、VCYIVV、VCYLLV、VDYDCI、VDYDFL、VDYFTI、VDYFVL、VDYGEL、VDYILV、VDYIQV、VDYKNI、VDYMSI、VDYNLV、VDYPDV、VDYSDL、VDYSSV、VDYTTL、VDYVDV、VDYVGV、VDYVIL、VDYVQV、VEYAPL、VEYDPL、VEYGTI、VEYHRL、VEYLEV、VEYQLL、VEYRPL、VEYSSI、VEYSTV、VFYAEI、VFYLAV、VFYRQV、VFYVGV、VFYYVI、VFYYVL、VGYETI、VHYALL、VHYARL、VHYETL、VHYGGV、VHYHSL、VHYIPV、VHYKEI、VHYLQV、VHYNSL、VHYQSV、VHYRSL、VIYAQL、VIYDRL、VIYENV、VIYEPL、VIYERL、VIYIDV、VIYKKI、VIYKRI、VIYPFL、VIYPNI、VIYSDL、VIYSML、VIYSSV、VIYSWI、VKYADI、VKYARL、VKYATL、VKYEGL、VKYGDL、VKYGSV、VKYLLV、VKYNPV、VKYPPI、VKYQRL、VKYQVI、VKYSEV、VKYSNV、VKYSRL、VKYSTL、VKYVDL、VLYADI、VLYAML、VLYASV、VLYCLL、VLYCLV、VLYCVL、VLYDCL、VLYFHI、VLYFTV、VLYGDL、VLYGQL、VLYPMV、VLYPRL、VLYPRV、VLYSEL、VLYSRV、VLYTAV、VLYTIL、VMYDAV、VNYESI、VNYSAL、VNYSKI、VNYSSI、VPYALL、VPYDTL、VPYEDV、VPYEEL、VPYKTI、VPYLRV、VPYNDL、VPYPAL、VPYQEL、VPYRLL、VPYSEL、VPYTLL、VPYTPL、VPYTTL、VPYVEL、VPYVMV、VPYVSL、VQYKAV、VQYKEI、VQYNIV、VQYRPV、VQYSQI、VQYSTV、VQYTEV、VQYYNI、VRYARL、VRYDNL、VRYGRI、VRYKKL、VRYKRV、VRYLDV、VRYRTI、VRYSDI、VRYTQL、VRYVCL、VSYAEL、VSYASV、VSYEPI、VSYGDI、VSYIGL、VSYILV、VSYMML、VSYNNI、VSYNNL、VSYQEI、VSYQPI、VSYSAV、VSYSFL、VSYSLV、VSYSPV、VSYTML、VSYTNL、VSYTPL、VSYVKI、VSYVLL、VTYADL、VTYAEL、VTYAEV、VTYAKV、VTYAPV、VTYAQL、VTYATL、VTYATV、VTYGNI、VTYITI、VTYQII、VTYQIL、VTYQLL、VTYSAL、VTYSTL、VTYTLL、VTYTQL、VTYVNL、VVYADI、VVYEDV、VVYFCL、VVYKTL、VVYQKL、VVYSEV、VVYSQV、VVYSVV、VVYTVL、VVYYRI、VYYHWLまたはVYYLPLから選択される、実施形態7から45のいずれか1つに記載のN-CAR。
膜貫通ドメイン、
細胞内ドメイン、
を含むP-CAR
および実施形態1から96のいずれか1つに記載のN-CAR
を含む、単離された免疫細胞。
Claims (25)
- 抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン、
膜貫通ドメイン、
細胞内ドメイン、
を含み、
細胞内ドメインが、免疫受容体チロシンベーススイッチモチーフITSMを含み、前記ITSMがアミノ酸配列TX1YX2X3X4であり、
X1がアミノ酸であり、
X2がアミノ酸であり、
X3がアミノ酸であり、
X4がVまたはIである、
阻害性キメラ抗原受容体(N-CAR)。 - 細胞内ドメインがヒトPD-1、ヒトCD244、またはヒトBTLAの細胞内ドメインではない、請求項1に記載のN-CAR。
- 細胞内ドメインが、配列
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
またはその変異体を含み、式中、
nが0、1、または2以上の整数であり、
mが1、または2以上の整数であり
pが1、または2以上の整数であり、
L1が不在であるか、または
(a)表3に示される配列から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(b)表1に示される配列から選択される、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(c)上記(b)内の配列もしくはその断片にN末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(d)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の配列を含み、
L2およびL3のそれぞれが不在であるか、または
(e)表4に示される配列から選択される、ITIMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(f)表6に示される配列から選択される、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、
(g)表5に示される配列から選択される、ITIM.*ITSMモチーフを有するタンパク質のITIMとITSMとの間の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、
(h)上記(f)もしくは(g)内の配列もしくはその断片にN末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の配列を含み、
L4が不在であるか、または
(j)表7に示される配列から選択される、ITIM.*ITSM細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(k)表8に示される配列から選択される、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域もしくはその断片、
(l)上記(j)もしくは(k)内の配列もしくはその断片にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインもしくはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つもしくは複数の配列を含み、
ITIMが配列X5X6YX7X8X9であり、式中、
X5がS、V、I、またはLであり、
X6がアミノ酸であり、
X7がアミノ酸であり、
X8がアミノ酸であり、
X9がV、I、またはLであり、
ITSMが配列TX1YX2X3X4であり、式中、
X1がアミノ酸であり、
X2がアミノ酸であり、
X3がアミノ酸であり、
X4がVまたはIである、
請求項1または2に記載のN-CAR。 - 細胞内ドメインが、配列
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1であり、
L3が、
(f)以下の表6に示される配列から選択される、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のN末端隣接領域もしくはその断片、または
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つの配列を含み、
L4が、
(k)以下の表8に示される配列から選択される、ITSMのみの細胞内ドメインの天然のC末端隣接領域またはその断片、
(l)上記(k)内の配列にC末端で隣接している、表2に示される配列から選択される、既知の阻害性受容体の天然の細胞内ドメインまたはその断片、および
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列、
からなる群から選択される1つまたは複数の、好ましくは1つまたは2つの配列を含む、
請求項3に記載のN-CAR。 - 細胞内ドメインが、配列
((L1-ITIM-L2)n-(L3-ITSM-L4)m)p
を含み、式中、
nが0であり、
mが1であり、
pが1または2であり、
L3が、
(i)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
から選択される1つの配列を含み、
L4が、
(m)1から500までの間のアミノ酸を含む非天然の配列
からなる群から選択される1つの配列を含む、
請求項4に記載のN-CAR。 - ITSMが、または、いくつかのITSMが細胞内ドメイン内に存在する場合にはITSMの少なくとも1つが、TAYELV、TAYGLI、TAYNAV、TCYGLV、TCYPDI、TDYASI、TDYDLV、TDYLSI、TDYQQV、TDYYRV、TEYASI、TEYATI、TEYDTI、TEYPLV、TEYSEI、TEYSEV、TEYSTI、TEYTKV、TFYHVV、TFYLLI、TFYNKI、TFYPDI、TGYEDV、TGYLSI、THYKEI、TIYAQV、TIYAVV、TIYCSI、TIYEDV、TIYERI、TIYEVI、TIYHVI、TIYIGV、TIYLKV、TIYSMI、TIYSTI、TIYTYI、TKYFHI、TKYMEI、TKYQSV、TKYSNI、TKYSTV、TLYASV、TLYAVV、TLYFWV、TLYHLV、TLYPMV、TLYPPI、TLYRDI、TLYRDV、TLYSKI、TLYSLI、TLYSPV、TMYAQV、TMYCQV、TNYKAV、TNYNLV、TPYAGI、TPYPGV、TPYVDI、TQYGRV、TQYNQV、TRYAYV、TRYGEV、TRYHSV、TRYKTI、TRYLAI、TRYMAI、TRYQKI、TRYQQI、TRYSNI、TRYSPI、TSYGTV、TSYMEV、TSYQGV、TSYTTI、TTYRSI、TTYSDV、TTYVTI、TVYAQI、TVYASV、TVYEVI、TVYGDV、TVYKGI、TVYQRV、TVYSEV、TVYSTV、TYYHSI、TYYLQI、またはTYYYSVから選択される、請求項1から8のいずれか一項に記載のN-CAR。
- ITSMが、または、いくつかのITSMが細胞内ドメイン内に存在する場合にはITSMの少なくとも1つが、TEYASI、TEYSEI、TEYSTI、またはTVYSEVから選択される、請求項1から9のいずれか一項に記載のN-CAR。
- 抗原結合ドメインが一本鎖可変断片(scFv)である、請求項1から11のいずれか一項に記載のN-CAR。
- 細胞内ドメインが、配列番号2000、配列番号2001、配列番号2002、配列番号2003、配列番号2004、配列番号2005、配列番号2006、配列番号2007、配列番号2008、配列番号2009、配列番号2010、配列番号2011、配列番号2012、配列番号2013、配列番号2014、配列番号2015、配列番号2016および配列番号2017またはその変異体から選択される、請求項1に記載のN-CAR。
- 抗原結合ドメインが、ITGAX、CD1E、CD34、CD1C、CD123またはCD141、ZP2、GABRA6、CRTAM、GRM4、MDGA1、ZP2、GABRA6、CRTAM、GRM4、MDGA1、SFTPC、ROS1、SLC6A4、AGTR2、LRRC26、HTR3A、TMEM211、MRGPRX3、MEP1B、TMIGD1、CEACAM20、ALPI、TMPRSS11B、CYP17A1、ATP4B、GP2、MUC21、CLCA4またはSLC27A6に結合する、請求項1から12のいずれか一項に記載のN-CAR。
- 膜貫通ドメインが、T細胞受容体のアルファ、ベータ、またはゼータ鎖、PD-1、4-1BB、OX40、ICOS、CTLA-4、LAG3、2B4、BTLA4、TIM-3、TIGIT、SIRPA、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137またはCD154の膜貫通領域を含む、請求項1から13のいずれか一項に記載のN-CAR。
- 膜貫通ドメインがPD-1またはCD8アルファの膜貫通領域を含む、請求項1から14のいずれか一項に記載のN-CAR。
- 膜貫通ドメインが、ヒンジを介してN-CARの細胞外ドメインに付加されている、請求項1から15のいずれか一項に記載のN-CAR。
- ヒンジがIgG4ヒンジ、CD8アルファヒンジ、またはPD-1ヒンジである、請求項16に記載のN-CAR。
- 抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン、
膜貫通ドメイン、
細胞内ドメイン、
を含むP-CAR
および請求項1から17のいずれか一項に記載のN-CAR
を含む、単離された免疫細胞。 - - P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がCD33であり、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がITGAX、CD1E、CD34、CD1C、CD123、もしくはCD141である、または
- P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がFLT3であり、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がZP2、GABRA6、CRTAM、GRM4、もしくはMDGA1である、または
- P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がMSLNであり、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がSFTPC、ROS1、SLC6A4、もしくはAGTR2である、または
- P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がMUC16であり、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がLRRC26、HTR3A、TMEM211、もしくはMRGPRX3である、または
- P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がMUC17であり、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がMEP1B、TMIGD1、CEACAM20、もしくはALPIである、または
- P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原が膵管腺癌の腫瘍細胞内に存在し、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がTMPRSS11B、CYP17A1、もしくはATP4Bである、または
- P-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原が腎臓明細胞癌の腫瘍細胞内に存在し、N-CARの抗原結合ドメインが結合する抗原がGP2、MUC21、CLCA4、およびSLC27A6である、
請求項18に記載の免疫細胞。 - 免疫細胞がヒトT細胞である、請求項18または19に記載の免疫細胞。
- がんの治療に用いるための、請求項18から20のいずれか一項に記載の免疫細胞。
- (a)免疫細胞を提供すること、(b)N-CARおよびP-CARを前記細胞の表面で発現させることを含む、請求項18から21のいずれか一項に記載の免疫細胞を操作する方法。
- a)請求項18から21のいずれか一項に記載の免疫細胞を提供すること、およびb)前記T細胞を患者に投与することを含む、治療が必要な患者を治療するための方法。
- 請求項1から17のいずれか一項に記載のN-CARをコードする核酸配列を含むポリヌクレオチド。
- 請求項24に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
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