JP2022014707A - キャリアペプチドフラグメントおよびその利用 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】ここに開示される真核細胞の外部から少なくとも該細胞の細胞質内に目的とする外来物質をインビトロにおいて導入する方法は、(1)配列番号1から成るキャリアペプチドフラグメントと、該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した上記目的とする外来物質と、を有する外来物質導入用構築物を用意する工程と、(2)上記外来物質導入用構築物を、目的とする真核細胞を含む試料中に供給する工程と、(3)上記外来物質導入用構築物が供給された上記試料をインキュベートして、上記試料中の真核細胞内に上記構築物を導入する工程と、を包含する。
【選択図】図1
Description
ポリペプチドや核酸等の外来物質を真核細胞内に導入する手段としては、例えば特許文献1および非特許文献1に記載されるように、細胞膜透過性ペプチドを使用することが挙げられる。特許文献1では、キャリアペプチドフラグメントと生理活性物質とを結合して外来物質導入用構築物を形成している。かかる構築物を真核細胞(幹細胞)に供給することで、生理活性物質を細胞内に導入している。そして、当該真核細胞が分化誘導され得ることが、この特許文献には記載されている。非特許文献1では、特許文献1とは異なる構成の細胞膜透過性ペプチドが開示されている。かかる細胞膜透過性ペプチドとオリゴヌクレオチドとのコンジュゲートは、筋強直性ジストロフィーの治療薬になり得る旨が記載されている。
即ち、ここで開示される技術によると、真核細胞(特に細胞壁を有しないヒトやそれ以外の哺乳動物に代表される種々の動物細胞)の外部(即ち細胞膜の外側)から少なくとも該細胞の細胞質内に目的とする外来物質をインビトロにおいて導入する(移送する)方法が提供される。
当該方法は、
(1)以下のアミノ酸配列:
TLKERCLQVVRSLVKKKRTLRKNDRKKR(配列番号1)
から成るキャリアペプチドフラグメントと、該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した前記目的とする外来物質と、を有する外来物質導入用構築物を用意する工程と、
(2)前記外来物質導入用構築物を、目的とする真核細胞を含む試料中に供給する工程と、
(3)前記外来物質導入用構築物が供給された前記試料をインキュベートして、前記試料中の真核細胞内に前記構築物を導入する工程と、
を包含する。
ここで、「外来物質」とは、上記キャリアペプチドフラグメントのN末端側又はC末端側に直接的又は適当なリンカーを介して間接的に結合可能な無機化合物及び有機化合物であって、真核細胞内に導入可能な分子サイズ及び化学的性質を有するものをいう。
ここで、「ポリペプチド」とは、複数のアミノ酸がペプチド結合により結合した構造を有するポリマーをいう。ポリペプチドは、ペプチド結合の数(即ち、アミノ酸残基数)によって限定されない。即ち、ポリペプチドは、アミノ酸残基数が10以上300未満程度の一般にペプチドと呼ばれるものと、一般にタンパク質(典型的には300以上のアミノ酸残基から成る高分子化合物)と呼ばれるものとを包含する。当該分野においては、ポリペプチドとタンパク質とは厳密に区分されていない。本明細書においては、複数のアミノ酸残基から成るポリマー(オリゴマーを包含する。)を、ポリペプチドと総称する。
また、「核酸」とは、ヌクレオチドの重合体をいい、DNAおよびRNAを包含する。。「核酸」は、塩基数によって限定されない。
かかる構成によると、上記成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドのアミノ酸配列と、キャリアペプチドフラグメントのアミノ酸配列とを有する合成ペプチドを、目的とする真核細胞内に導入することができる。
かかる構成によると、上記成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドのアミノ酸配列を、より効率よく、目的とする真核細胞内に導入することができる。
かかる構成は、外来物質をヒト又はヒト以外の哺乳動物の細胞に導入する場合に好適である。
当該外来物質導入用構築物は、
以下のアミノ酸配列:
TLKERCLQVVRSLVKKKRTLRKNDRKKR(配列番号1)
から成るキャリアペプチドフラグメントと、該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した前記目的とする外来物質と、を有する。
かかる構成の外来物質導入用構築物を使用すると、目的とする真核細胞に、効率よく所望の外来物質を導入することができる。
本明細書中で引用されている全ての文献の全ての内容は本明細書中に参照として組み入れられている。
また、本明細書において「アミノ酸残基」とは、特に言及する場合を除いて、ペプチド鎖のN末端アミノ酸及びC末端アミノ酸を包含する用語である。
なお、本明細書中に記載されるアミノ酸配列は、常に左側がN末端側であり右側がC末端側である。
以下のアミノ酸配列:
TLKERCLQVVRSLVKKKRTLRKNDRKKR(配列番号1)
から成るキャリアペプチドフラグメントと、該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した前記目的とする外来物質と、を有する。
「キャリアペプチドフラグメント」は、配列番号1に示すアミノ酸配列により規定(把握)される配列であって、真核細胞の細胞膜透過性を発揮させるアミノ酸配列である。
配列番号1に示すアミノ酸配列は、VHL(フォン・ヒッペル・リンド)タンパク質のアミノ酸配列の第157番目~第171番目までの15個の連続するアミノ酸残基から成るアミノ酸配列、および、LIMキナーゼ2(LIM Kinase 2)の第491番目のアミノ酸残基から第503番目のアミノ酸残基までの合計13アミノ酸残基から成るアミノ酸配列が直接結合されてなるアミノ酸配列である。
なお、VHLタンパク質は、神経分化誘導性を示すことが知られている(非特許文献3)。また、LIMキナーゼ2細胞内情報伝達に関与するプロテインキナーゼの1種であり、ヒト内皮細胞に存在することが知られている。
上記LIMキナーゼ2の13アミノ酸残基からなるアミノ酸配列は、NoLSであることが知られている(特許文献1、非特許文献2)。そのため、配列番号1に示されるアミノ酸配列は、外来物質を外部から少なくとも該細胞の細胞質内に導入することができる。かかるアミノ酸配列は、外来物質をさらに核内(核膜の内部)に導入することができる。
本明細書における改変配列の典型例としては、例えば、1個、2個または3個のアミノ酸残基が保守的に置換したいわゆる同類置換(conservative amino acid replacement)によって生じた配列や、所定のアミノ酸配列について1個、2個または3個のアミノ酸残基が付加(挿入)した若しくは欠失した配列等が挙げられる。同類置換の典型例としては、例えば、塩基性アミノ酸残基が別の塩基性アミノ酸残基に置換した配列(例えばリジン残基とアルギニン残基との相互置換)や、疎水性アミノ酸残基が別の疎水性アミノ酸残基に置換した配列(例えばロイシン残基、イソロイシン残基、およびバリン残基の相互置換)等が挙げられる。
リンカーは、特に限定されるものではないが、ペプチド性リンカーであってもよく、非ペプチド性リンカーであってもよい。特に限定されるものではないが、ペプチド性リンカーを構成するアミノ酸配列は立体障害を生じさせず、かつ、柔軟なアミノ酸配列であることが好ましい。ペプチド性リンカーは、例えば、グリシン、アラニン、およびセリン等から選択されるアミノ酸残基を1種または2種以上含む、10個以下(より好ましくは1個以上5個以下、例えば1個、2個、3個、4個、または5個のアミノ酸残基)のアミノ酸残基からなるリンカーであり得る。また、かかるリンカーとして、βアラニンを用いてもよい。非ペプチド性リンカーとしては、特に限定されるものではないが、例えばアルキルリンカー、PEG(ポリエチレングリコール)リンカー、アミノヘキサノイルスペーサ等を用いてもよい。
外来物質は、例えば、ポリペプチドであり得る。外来物質がポリペプチドである場合には、該ポリペプチドを構成するアミノ酸配列と、キャリアペプチドフラグメントを構成するアミノ酸配列とを含むようにペプチド鎖を設計し、該ペプチド鎖を生合成或いは化学合成することによって、目的の外来物質導入用構築物を作製することができる。
上記のとおり、外来物質は、導入の目的となる真核細胞において、種々の機能を有する。特に限定するものではないが、外来物質が有する機能は、例えば、幹細胞の分化誘導の促進(幹細胞分化誘導活性)、腫瘍細胞の増殖抑制(抗腫瘍活性)、ウイルス感染細胞の増殖抑制(抗ウイルス活性)等であり得る。
キャリアペプチドフラグメントと結合する外来物質の数は特に限定されない。即ち、1のキャリアペプチドフラグメントに対して1又はそれ以上の外来物質を結合させてもよい。特に限定するものではないが、例えば、1のキャリアペプチドフラグメントのN末端側にポリペプチド、核酸、薬剤等を結合させておき、C末端側に色素を結合させてもよい。キャリアペプチドフラグメントに色素を結合させることは、外来物質導入用構築物の導入効率を評価する観点において好ましい。
典型的には、外来物質導入用構築物として作製する合成ペプチドは、総アミノ酸残基数が数個乃至数十個(例えば10個)以上である。かかる総アミノ酸残基数は、1000以下が適当であり、好ましくは600以下であり、さらに好ましくは500以下であり、特に300以下(例えば10~300)が好適である。このような長さのポリペプチドは合成(生合成、化学合成)が容易であり、使用しやすい。
例えば、外来物質の導入する対象となる真核細胞がヒトその他哺乳動物の幹細胞である場合、当該幹細胞の分化誘導に関与する種々の生理活性を有するポリペプチドの成熟型又はその前駆体の利用が好ましい。なお、「幹細胞」は、体性幹細胞、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞(Induced pluripotent stem cells:以下iPS細胞という。)を包含する。また、外来物質の導入する対象となる真核細胞ががん細胞(腫瘍細胞)である場合、当該がん細胞(腫瘍細胞)のアポトーシス誘導に関与する種々のポリペプチドの利用が好ましい。あるいは、この場合においては、がん細胞(腫瘍細胞)が免疫監視機構の機能を抑制することを阻害し得るポリペプチドの利用が好ましい。さらに、導入の対象となる真核細胞が細菌感染細胞やウイルス感染細胞である場合、当該感染細胞のアポトーシス誘導に関与する種々のポリペプチドや、当該感染細胞において細菌もしくはウイルスが増殖することを抑制し得るポリペプチドや、当該感染細胞から細菌もしくはウイルスの感染が拡大することを抑制し得るポリペプチドの利用が好ましい。
なお、キャリアペプチドフラグメントと同様、外来物質としてのポリペプチドは、その機能を保持する限り、1個または数個のアミノ酸残基が置換、欠失及び/又は付加(挿入)されて形成される改変アミノ酸配列を含んでいてもよい。
例えば、キャリアペプチドフラグメントのN末端側に外来物質が結合している場合、キャリアペプチドフラグメントのC末端アミノ酸残基をアミド化することが好ましい。また、例えば外来物質がポリペプチドであり、かかるポリペプチドがキャリアペプチドフラグメントのC末端側に結合している場合は、当該ポリペプチドのC末端アミノ酸残基をアミド化することができる。
市販のペプチド合成機を用いた固相合成法により、上記のペプチド部分として、所望するアミノ酸配列、修飾(C末端アミド化等)部分を有するペプチド鎖を合成することができる。
一般的な技法によって、この組換えベクターを所定の宿主細胞(例えばイースト、昆虫細胞、植物細胞)に導入し、所定の条件で当該宿主細胞又は該細胞を含む組織や個体を培養する。このことにより、目的とするペプチドを細胞内で生産させることができる。そして、宿主細胞(分泌された場合は培地中)からペプチド部分を単離し、必要に応じてリフォールディング、精製等を行うことによって、目的のペプチド部分を得ることができる。
なお、組換えベクターの構築方法及び構築した組換えベクターの宿主細胞への導入方法等は、当該分野で従来から行われている方法をそのまま採用すればよく、かかる方法自体は特に本発明を特徴付けるものではないため、詳細な説明は省略する。
こうして得られるポリヌクレオチドは、上述のように、種々の宿主細胞中で又は無細胞タンパク質合成システムにて、ペプチド生産のための組換え遺伝子(発現カセット)を構築するための材料として使用することができる。
上記担体としては、例えば、希釈剤、賦形剤等としてペプチド医薬において一般的に使用される担体が好ましい。かかる担体としては、外来物質導入用構築物の用途や形態に応じて適宜異なり得るが、典型的には、水、生理学的緩衝液、種々の有機溶媒が挙げられる。また、かかる担体は、適当な濃度のアルコール(エタノール等)水溶液、グリセロール、オリーブ油のような不乾性油であり得、或いはリポソームであってもよい。また、医薬用組成物に含有させ得る副次的成分としては、種々の充填剤、増量剤、結合剤、付湿剤、表面活性剤、色素、香料等が挙げられる。
外来物質導入用構築物(主成分)及び種々の担体(副成分)を材料にして種々の形態の薬剤(組成物)を調製するプロセス自体は従来公知の方法に準じればよく、かかる製剤方法自体は本発明を特徴付けるものでもないため詳細な説明は省略する。処方に関する詳細な情報源として、例えばComprehensive Medicinal Chemistry, Corwin Hansch監修,Pergamon Press刊(1990)が挙げられる。
(1)配列番号1に示されるアミノ酸配列からなるキャリアペプチドフラグメントと、該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した前記目的とする外来物質と、を有する外来物質導入用構築物を用意する工程
(2)外来物質導入用構築物を、目的とする真核細胞を含む試料中に供給する工程
(3)外来物質導入用構築物が供給された試料をインキュベートして、該試料中の真核細胞内にかかる構築物を導入する工程
なお、インビトロにおける導入方法について、一例を下記実施例において示している。
表1に示す3種の合成ペプチド(ペプチド1~3)を用意した。具体的には次のとおりである。
ペプチド1は、ここで開示される配列番号1に示されるキャリアペプチドフラグメントからなるペプチドである。
ペプチド2は、LIMキナーゼ2のNoLSからなるペプチドである(配列番号2)。
ペプチド3は、上記非特許文献1で開示されている細胞膜透過性ペプチドPip6aである(配列番号3)。なお、表1の「配列」欄中、「X」はaminohexanoic acidを示している。同欄中、「B」はβ-アラニンを示している(表2についても同様である。)。
ペプチド1およびペプチド2はいずれも、C末端アミノ酸のカルボキシル基(-COOH)はアミド化(-CONH2)されている。ペプチド1およびペプチド2はいずれも、市販のペプチド合成機を用いてマニュアルどおりに固相合成法(Fmoc法)を実施することによって、合成された。ペプチド3はケンブリッジリサーチバイオケミカルズ社製の市販品(カタログ番号:crb1000352h)である。
なお、ペプチド合成機の使用態様自体は本発明を特徴付けるものではないため、詳細な説明は省略する。
ペプチド1に基づく外来物質導入用構築物の構成を表2に示す。以下、これをサンプル1と呼称する。
ペプチド2に基づく外来物質導入用構築物の構成を表2に示す。以下、これをサンプル2と呼称する。
ペプチド3に基づく外来物質導入用構築物の構成を表2に示す。以下、これをサンプル3と呼称する。
こうして得られた各サンプルをそれぞれDMSOに希釈し、サンプル濃度が2mMのサンプル溶液(ストック)を計3種類作製した。
真核細胞としてHeLa細胞(ヒト子宮頸がん細胞由来の樹立細胞株)を使用し、上記実施例1で得られた3種のサンプル(外来物質導入用構築物)の細胞膜透過機能を調べた。
本実施例において、以下に示すように使用するペプチドの種類に応じて例1~3を設定した。また、例4,5として、ペプチド無添加区を設定した。以下合計5の区分の試験を以下のとおり実施した。なお、以下に記載の濃度は、下記の20時間のインキュベートの際の最終濃度である。
例1:サンプル1 10μM
例2:サンプル2 10μM
例3:サンプル3 10μM
例4:サンプル(ペプチド)添加なし、FAM 10μM
例5:サンプル(ペプチド)添加なし
なお、いずれの例でも、下記20時間のインキュベートの際にDMSOの濃度が0.5%となるように調製した。また、上記各例の試験ウェル数(n)を、いずれも3に設定した。
90%イーグルMEM培地(0.1%の非必須アミノ酸、2mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、1.5g/Lの炭酸水素ナトリウムを含む。)および10%血清(FBS:fetal bovine serum)の混合液を培養液として使用し、HeLa細胞を培養した。
HeLa細胞に対して、0.25%トリプシン/EDTA溶液で37℃3分間のトリプシン処理を行った。上記処理後、上記培養液を用いてトリプシンを失活させた。遠心分離を行い、その遠心上清を取り除いた。遠心分離によって得られた細胞ペレットを、フレッシュな培養液で懸濁した。当該培養液により細胞濃度が凡そ1×105cells/ウェルとなる細胞懸濁液(外来物質導入用の試料)を調製し、市販の6ウェルプレート(Iwaki社製)の各ウェルに2mlずつ播種した。そして、5%CO2条件下、37℃で4時間培養し、播種した細胞の接着を確認した。
そして、プレートを5%CO2条件下、37℃で20時間インキュベートした。
かかる20時間のインキュベート後、細胞を1ml/ウェルのPBSで2回洗浄した。次いで、200μL/ウェルの0.25%トリプシン/EDTA溶液を用いてウェル中の細胞を37℃で3分間処置した。次いで、さらに400μL/ウェルの培養液を添加して細胞をチューブに回収した。その後、さらに600μL/ウェルのPBSでウェルを洗浄して、さらにウェル中に残った細胞を上記チューブに回収した。このチューブを4℃、210×gの条件で5分間遠心分離した。遠心上清を取り除き、細胞ペレットを1mlのPBSで懸濁(洗浄)し、上記と同じ条件で遠心分離した。この操作を2回繰り返した。
かかる解析において、上記のようにして得られた細胞を50μlのPBSで懸濁した。この懸濁液に、さらに50μlの上記フローサイトメータ用の2×sample bufferを加えて、解析用の細胞懸濁液を用意した。
サンプルの種類をサンプル2(例2)、サンプル3(例3)とした以外は例1と同じ材料およびプロセスで例2,3を行った。
-例4-
本例では、サンプルの添加を行わず、FAMを上記の濃度で添加した。それ以外は例1と同じ材料およびプロセスで例4を行った。
-例5-
本例では、サンプルおよびFAMのいずれも添加しなかった。それ以外は例1と同じ材料およびプロセスで例5を行った。
上記実施例1で得られた3種のサンプル(外来物質導入用構築物)のうち、サンプル1にかかる外来物質導入用構築物は、配列番号1に示されるアミノ酸配列からなるキャリアペプチドフラグメントを含むことによって、優れた細胞膜透過性を示すことが確認された。また、本発明者らの検討によって、外来物質が蛍光色素のみならず、ポリペプチド、核酸、および薬剤のいずれであっても、かかる外来物質は、効率よく細胞の外部から、細胞膜を通して細胞質内に導入されることが確認された。
Claims (9)
- 真核細胞の外部から少なくとも該細胞の細胞質内に目的とする外来物質をインビトロにおいて導入する方法であって、
(1)以下のアミノ酸配列:
TLKERCLQVVRSLVKKKRTLRKNDRKKR(配列番号1)
から成るキャリアペプチドフラグメントと、
該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した前記目的とする外来物質と、
を有する外来物質導入用構築物を用意する工程と、
(2)前記外来物質導入用構築物を、目的とする真核細胞を含む試料中に供給する工程と、
(3)前記外来物質導入用構築物が供給された前記試料をインキュベートして、前記試料中の真核細胞内に前記構築物を導入する工程と、
を包含する方法。 - 前記外来物質は、ポリペプチド、核酸、色素及び薬剤から成る群から選択されるいずれかの有機化合物である、請求項1に記載の方法。
- 前記外来物質は、何れかの生物種由来の成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドであり、前記外来物質導入用構築物は、該外来物質としての成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドに対応するアミノ酸配列と前記キャリアペプチドフラグメントのアミノ酸配列とを有する合成ポリペプチドである、請求項2に記載の方法。
- 前記外来物質としての成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドに対応するアミノ酸配列は、前記キャリアペプチドフラグメントのN末端側に配置されている、請求項3に記載の方法。
- 前記外来物質導入用構築物を導入する対象の真核細胞がヒト又はヒト以外の哺乳動物の細胞である、請求項1~4の何れか一項に記載の方法。
- 真核細胞の外部から少なくとも該細胞の細胞質内に目的とする外来物質を導入するために作製された外来物質導入用構築物であって、
以下のアミノ酸配列:
TLKERCLQVVRSLVKKKRTLRKNDRKKR(配列番号1)
から成るキャリアペプチドフラグメントと、
該キャリアペプチドフラグメントのN末端側及び/又はC末端側に結合した前記目的とする外来物質と、
を有する外来物質導入用構築物。 - 前記外来物質は、ポリペプチド、核酸、色素及び薬剤から成る群から選択されるいずれかの有機化合物である、請求項6に記載の構築物。
- 前記外来物質は、何れかの生物種由来の成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドであり、該外来物質としての成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドに対応するアミノ酸配列と前記キャリアペプチドフラグメントのアミノ酸配列とを有する合成ポリペプチドである、請求項7に記載の構築物。
- 前記外来物質としての成熟ポリペプチド又はその前駆体ポリペプチドに対応するアミノ酸配列は、前記キャリアペプチドフラグメントのN末端側に配置されている、請求項8に記載の構築物。
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