JP2021007408A - がん転移の予後診断および処置のための方法 - Google Patents

がん転移の予後診断および処置のための方法 Download PDF

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Abstract

【課題】がん転移の予後診断および処置のための方法を提供すること。【解決手段】本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がん(ルミナルAおよびβを含む)における骨転移の予後診断のための方法に関し、その方法は、原発腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子が増幅されているかを決定する工程を含む。同様に、本発明は、他の器官における転移に関して骨転移を起こす傾向を決定するための方法にも関し、その方法は、c−MAF遺伝子の発現レベル、増幅または転座を決定する工程を含む。本発明は、乳がんに罹患している被験体における早期の骨転移を予測するための方法にも関する。【選択図】なし

Description

配列表への言及
本願とともに出願され、電子的に提出される配列表(「3190_001PC03_S
EQIDListing_ascii.txt」、48,269バイト、2013年3月
15日に作成)の内容は、その全体が参照により本明細書中に援用される。
発明の背景
発明の分野
本発明は、原発腫瘍サンプルにおけるc−MAF遺伝子のレベル、16q23または1
6q22−24遺伝子座の増幅または転座の決定に基づく、トリプルネガティブ(基底細
胞様(basal−like)を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がん(ルミナルタ
イプ(luminal type)AおよびルミナルタイプBを含む)における骨転移の
予後診断に関する。同様に、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん
またはあるいはER+乳がんを有する被験体において個別化治療(customized
therapy)をデザインするための方法にも関し、その方法は、c−MAF遺伝子
の発現レベル、16q23または16q22−24遺伝子座の増幅または転座を決定する
工程を含む。最後に、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんの転移
またはER+乳がんの転移、特に、骨転移の処置における治療薬としてのc−MAFイン
ヒビターの使用に関する。
背景技術
乳がんは、世界中で2番目に一般的なタイプのがん(10.4%;肺がんの次位)およ
び5番目に一般的ながんによる死亡原因(肺がん、胃がん、肝臓がんおよび結腸がんの次
位)である。女性の中で、乳がんは、最も一般的ながんによる死亡原因である。2005
年は、世界中で502,000人が乳がんによって死亡した(がんによる死亡数の7%;
全死亡数のほぼ1%)。1970年代から、世界中の症例数は著しく増加しており、これ
は、西洋諸国における現代的な生活様式に一部起因する現象である。
乳がんは、TNMシステムに従ってステージに分類される(American Joi
nt Committee on Cancer.AJCC Cancer Stagi
ng Manual.6th ed.New York,NY:Springer,20
02(その全体が参照により本明細書中に援用される)を参照のこと)。予後診断は、ス
テージ分類の結果と密接な関係があり、ステージ分類は、臨床試験と医療行為の両方にお
いて患者を処置に割り当てるためにも使用される。ステージに分類するための情報は、以
下のとおりである:
・TX:原発腫瘍の評価が不可能である。T0:腫瘍のエビデンスが無い。Tis:上皮
内癌腫(in situ carcinoma)で、浸潤無し。T1:腫瘍は、2cm以
下である。T2:腫瘍は、2cmより大きいが5cm未満である。T3:腫瘍は、5cm
より大きい。T4:胸壁もしくは皮膚において成長している任意のサイズの腫瘍、または
炎症性乳がん。
・NX:近傍のリンパ節の評価が不可能である。N0:がんは、領域リンパ節に広がって
いない。N1:がんは、1〜3つの腋窩リンパ節または1つの内乳腺リンパ節に広がって
いる。N2:がんは、4〜9つの腋窩リンパ節または複数の内乳腺リンパ節に広がってい
る。N3:以下のうちの1つに当てはまる:
・がんは、10個以上の腋窩リンパ節に広がっているか、またはがんは、鎖骨下リンパ節
に広がっているか、またはがんは、鎖骨上リンパ節に広がっているか、またはがんは、腋
窩リンパ節に波及していて、内乳腺リンパ節に広がっているか、またはがんは、4つ以上
の腋窩リンパ節に波及していて、最小限のがんが、内乳腺リンパ節またはセンチネルリン
パ節の生検材料に存在する。
・MX:遠隔拡散(転移)の存在の評価が不可能である。M0:遠隔拡散は無い。M1:
鎖骨上リンパ節を含まない遠隔器官への広がりが生じている。
固形腫瘍がんを有する患者のほとんどが転移後に死亡するという事実は、腫瘍を転移さ
せる分子機序および細胞機序を理解することが極めて重要であることを意味している。最
近の刊行物は、まだほとんど知られていない複雑な機序によってどのようにして転移が引
き起こされるか、およびまた、どのようにして種々の転移細胞型が特定の器官に対する指
向性を有するかを示してきた。これらの組織特異的な転移細胞は、それらを特定の器官に
転移増殖させる(colonize)、獲得した一連の機能を有する。
すべての細胞が、その表面上、細胞質内および細胞核内にレセプターを有する。ある特
定の化学メッセンジャー(例えば、ホルモン)は、上記レセプターに結合し、これにより
、細胞に変化が引き起こされる。乳がん細胞に影響し得る重要なレセプターは3つ存在す
る:エストロゲンレセプター(ER)、プロゲステロンレセプター(PR)およびHER
2/neuである。これらのレセプターのいずれかを有する細胞を命名する目的で、その
レセプターが存在するときは、陽性の符号がそれに付けられ、存在しないときは、陰性の
符号が付けられる:ER陽性(ER+)、ER陰性(ER−)、PR陽性(PR+)、P
R陰性(PR−)、HER2陽性(HER2+)およびHER2陰性(HER2−)。レ
セプターの状態は、特定の処置、例えば、タモキシフェンまたはトラスツズマブを使用す
る適格性を決定するものであるので、そのレセプターの状態は、すべての乳がんに対して
重大な評価になっている。
教師なし遺伝子発現アレイプロファイリングは、内因性サブタイプ(例えば、ルミナル
A、ルミナルB、HER2+/ER−および基底細胞様サブタイプ)の識別を通じて、乳
がんの不均質性に対する生物学的エビデンスを提供した。
トリプルネガティブがんは、エストロゲンレセプター(ER)、プロゲステロンレセプ
ター(PR)およびHER2に対する遺伝子を発現しない腫瘍と定義されている。このサ
ブグループは、全タイプの乳がんの15%を占め、閉経前のアフリカ人女性およびアフリ
カ系アメリカ人女性に生じる乳がんのより高いパーセンテージを占める。トリプルネガテ
ィブ乳がんは、エストロゲンレセプター陽性乳がんとは非常に異なる再発パターンを有す
る:再発のリスクは、最初の3〜5年間はかなり高いが、その後は、急激に低下し、エス
トロゲンレセプター陽性乳がんのリスクよりも実質的に低くなる。
基底細胞様サブタイプは、ERとHER2の両方の遺伝子クラスターの低発現を特徴と
するので、典型的には、臨床試験においてER陰性、PR陰性かつHER2陰性である;
この理由で、「トリプルネガティブ」乳がんと呼ばれることが多い(Breast Ca
ncer Research 2007,9(Suppl 1):S13)。基底細胞様
がんは、高分子量サイトケラチン(5/6、14および17)、P−カドヘリン、カベオ
リン1および2、ネスチン、αBクリスタリンならびに上皮成長因子レセプターを含む、
正常な乳房の「基底」/筋上皮細胞に通常見られる遺伝子を発現する(Reis−Fih
o J.ら、http://www.uscap.org/site〜/98th/pd
f/companion03h03.pdf)。
基底細胞様乳がんに対して国際的に認められた定義が存在しないことを考えると、トリ
プルネガティブ乳がんおよび基底細胞様乳がんが同義であるか否かに関する混乱が非常に
大きいことは、驚くべきことではない。いくつかのグループは、これらの用語を交換可能
に使用しているが、すべての基底細胞様がんが、ER、PRおよびHER2を欠くとは限
らず、すべてのトリプルネガティブがんが、基底細胞様の表現型を示すとも限らないこと
に注意すべきである。圧倒的多数のトリプルネガティブがんが、基底細胞様の表現型であ
る。同様に、「基底細胞」マーカーを発現している圧倒的多数の腫瘍が、トリプルネガテ
ィブである。しかしながら、基底細胞マーカーを発現しないかなりの数のトリプルネガテ
ィブがんおよびホルモンレセプターまたはHER2のいずれかを発現する基底細胞様がん
の小さいがなおもかなりのサブグループが存在することに注意すべきである。Bertu
cciら(Int J Cancer.2008 Jul 1;123(1):236−
40)は、この問題に真っすぐに取り組み、遺伝子発現プロファイリングによって解析さ
れたとき、すべてのトリプルネガティブ腫瘍が、基底細胞様がんとして分類されるとは限
らないこと(すなわち、71%しか基底細胞様の表現型でなかった)および発現アレイに
よって分類されたすべての基底細胞様乳がん腫が、トリプルネガティブ表現型を示すとは
限らないこと(すなわち77%)を立証した。
乳がんを処置する場合に要となるものは、腫瘍が限局性であるとき、実行可能なアジュ
バントホルモン療法(タモキシフェンまたはアロマターゼインヒビターを用いる)、化学
療法および/または放射線治療を伴う、手術である。現在、手術後の処置に対する提案(
補助療法)は、あるパターンに従う。世界的な多施設研究の実際の結果を議論する世界会
議がSt.Gallen,Switzerlandで2年ごとに開催されるので、このパ
ターンは、変更される可能性がある。同様に、上記パターンはまた、National
Institute of Health(NIH)のコンセンサス基準に従って見直さ
れる。これらの基準に基づくと、リンパ節に転移を有しない患者の85〜90%超が、ア
ジュバント全身療法を受ける候補になるだろう。
現在、Oncotype DXなどのPCRアッセイまたはMammaPrintなど
のマイクロアレイアッセイが、特定の遺伝子の発現に基づいて乳がん再発のリスクを予測
し得る。2007年2月に、MammaPrintアッセイは、Food and Dr
ug Administrationの公的認可を獲得した最初の乳がん指標になった。
特許出願EP1961825−A1には、骨、肺、肝臓または脳への乳がん転移の発生
率を予測するための方法が記載されており、その方法は、コントロールサンプルにおける
対応する発現レベルと比べて、腫瘍組織サンプルにおいて1つまたは複数のマーカー(c
−MAFを含む)の発現レベルを決定する工程を含む。しかしながら、この文書では、乳
がん患者の生存時間の決定を可能にするいくつかの遺伝子を同時に決定することが要求さ
れており、骨転移なしでの生存可能性の予測についての遺伝子シグネチャ(gene s
ignature)の能力の相関関係は、統計学的に有意でなかった。
特許出願US2011/0150979には、基底細胞様乳がんの予後を予測するため
の方法が記載されており、その方法は、FOXC1のレベルを検出する工程を含む。
特許出願US2010/0210738は、トリプルネガティブ乳がんを有する被験体
におけるがんを予後診断するための方法に関し、その方法は、サンプル中の、ランダムに
アップレギュレートされているかまたはダウンレギュレートされている一連の遺伝子の発
現レベルを検出する工程を含む。
特許出願US2011/0130296は、トリプルネガティブ乳がんの診断および予
後診断において有用なマーカー遺伝子の同定に関する。
トリプルネガティブ乳がんに罹患している被験体が転移を起こす確率の予測を可能にす
る新しいマーカーを同定する必要がある。新しい予後因子の同定は、最も適した処置の選
択において指針となり得る。
American Joint Committee on Cancer.AJCC Cancer Staging Manual.6th ed.New York,NY:Springer,2002 Breast Cancer Research 2007,9(Suppl 1):S13 Reis−Fiho J.ら、http://www.uscap.org/site〜/98th/pdf/companion03h03.pdf Bertucciら(Int J Cancer.2008 Jul 1;123(1):236−40)
1つの態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまた
はあるいはER+乳がん(ルミナルAおよびBを含む)に罹患している被験体における上
記がんの骨転移を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、
i)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを決定する工程、および
ii)工程i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、骨転移を起
こす上昇したリスクを示す。
別の態様において、本発明は、骨転移性トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳が
んまたはあるいは骨転移性ER+乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するための
インビトロでの方法に関し、その方法は、
i)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程、および
ii)工程i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、不良な臨床
転帰を示す。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザインするためのイ
ンビトロでの方法に関し、その方法は、
i)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ii)i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、その発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験
体は、骨転移の予防、阻害および/または処置を目指す治療を受けるのに適格である(is
susceptible to receive a therapy)。この方法の特定の態様において、被験体は
、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび/または処置する少なくとも1つの治療薬
を投与される。発現レベルが、上記参照値と比較して高くない場合、上記被験体は、骨転
移の予防、阻害および/または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない。この方法の
特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび/または処
置する少なくとも1つの治療薬を投与されない。
別の態様において、本発明は、乳がん、例えば、トリプルネガティブ乳がんまたはER
+乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを決定するための方法に関し、そ
の方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを決定する工程を含
み、ここで、平均値+1標準偏差より高い上記遺伝子の発現レベルは、早期の骨転移の上
昇したリスクを示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防
するかまたは阻害する少なくとも1つの治療薬を投与される。
別の態様において、本発明は、骨転移を伴うトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)
乳がんまたはER+乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのイン
ビトロでの方法に関し、その方法は、
i)上記被験体の骨転移サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、およ

ii)工程(i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、c−MAF遺伝子発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場
合、上記被験体は、骨分解を予防するための治療を受けるのに適格である。この方法の特
定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび/または処置
する少なくとも1つの治療薬を投与される。c−MAF遺伝子発現レベルが、上記参照値
と比較して上昇していない場合、上記被験体は、骨分解を予防するための治療を受けるの
に適格ではない。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する
、阻害するおよび/または処置する少なくとも1つの治療薬を投与されない。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するための
インビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が
、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、上記参
照遺伝子コピー数と比較したときのc−MAF遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇した
リスクを示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防するか
または阻害する少なくとも1つの治療薬を投与される。
別の態様において、本発明は、乳がん、例えば、トリプルネガティブ乳がんまたはER
+乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するためのインビトロで
の方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、転座してい
るかを決定する工程を含み、ここで、c−MAF遺伝子の転座は、骨転移を起こす上昇し
たリスクを示す。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する
かまたは阻害する少なくとも1つの治療薬を投与される。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方
法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピ
ー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数
と比較したときのc−MAF遺伝子の増幅は、不良な臨床転帰を示す。この方法の特定の
態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害するおよび/または処置する
少なくとも1つの治療薬を投与される。そのような増幅が観察されない場合、被験体は、
その後、骨転移を予防する、阻害するおよび/または処置する少なくとも1つの治療薬を
投与されない。別の実施形態において、本発明は、乳がんに罹患している患者の臨床転帰
を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc
−MAF遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、c−MAF遺伝子の
転座(すなわち、t(14,16))は、不良な臨床転帰を示す。いくつかの実施形態に
おいて、本発明は、c−MAFの増幅または転座を有する患者のために個別化治療をデザ
インすることに関する。いくつかの実施形態において、個別化治療は、骨転移を予防する
、阻害するおよび/または処置する少なくとも1つの治療薬である。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
ER+乳がんからの骨転移の予防において使用するためのc−MAF阻害剤に関する。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプル
と比較して上昇したc−MAFレベルを有する被験体における骨転移の処置において使用
するための、c−MAF阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができ
る薬剤に関する。
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移
を予測するためのキットに関し、そのキットは:a)上記被験体のサンプル中のc−MA
Fの発現レベルを定量するための手段;およびb)上記サンプル中の定量されたc−MA
Fの発現レベルを参照c−MAF発現レベルと比較するための手段を備える。
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移
を予測するためのキットに関し、そのキットは:a)上記被験体のサンプル中のc−MA
F遺伝子の転座を決定するための手段;およびb)上記サンプル中のc−MAFの転座を
参照c−MAFサンプルと比較するための手段を備える。本発明は、乳がんに罹患してい
る被験体における上記がんの骨転移を予測するための、そのようなキットの使用にも関す
る。1つの実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した結果に基づいて
、骨転移を予防する、阻害するおよび/もしくは処置する少なくとも1つの治療薬を投与
されるか、またはその治療薬が除外される。
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移
を予測するためのキットに関し、そのキットは:a)上記被験体のサンプル中のc−MA
F遺伝子の増幅、16q23または16q22−24遺伝子座の増幅または転座を定量す
るための手段;およびb)上記サンプル中のc−MAF遺伝子の増幅されたレベル、16
q23または16q22−24遺伝子座の増幅または転座を参照と比較するための手段を
備える。
別の態様において、本発明は、乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を
予測するためのキットに関し、そのキットは:a)上記被験体のサンプル中のc−MAF
の発現レベルを定量するための手段;およびb)上記サンプル中の定量されたc−MAF
の発現レベルを参照c−MAF発現レベルと比較するための手段を備える。本発明は、乳
がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するための、そのようなキット
の使用にも関する。1つの実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した
結果に基づいて、骨転移を予防する、阻害するおよび/もしくは処置する少なくとも1つ
の治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するた
めのキットに関し、そのキットは:a)上記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベ
ルを定量するための手段;b)上記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参
照c−MAF発現レベルと比較するための手段;ならびにc)定量された発現レベルと参
照発現レベルとの比較に基づいて、上記被験体において骨転移を予防するためおよび/ま
たは減少させるための治療を決定するための手段を備える。本発明は、乳がんに罹患して
いる被験体に対する治療を決定するための、そのようなキットの使用にも関する。1つの
実施形態において、被験体は、その後、そのキットを使用した結果に基づいて、骨転移を
予防する、阻害するおよび/もしくは処置する少なくとも1つの治療薬を投与されるか、
またはその治療薬が除外される。
別の態様において、本発明は、i)乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc−M
AFの発現レベルを定量するための試薬、およびii)骨転移のリスクと相関するように
予め決定されている1つまたは複数のc−MAF遺伝子発現レベル指標を備えるキットに
関する。本発明は、乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するた
めの、そのようなキットの使用にも関する。1つの実施形態において、被験体は、その後
、そのキットを使用した結果に基づいて、骨転移を予防する、阻害するおよび/もしくは
処置する少なくとも1つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外される。
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けす
るためのインビトロでの方法に関し、その方法は:
a)上記被験体からのサンプルを提供する工程;
b)上記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
c)定量されたc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較する
ことによって上記サンプルをタイプ分けする工程;
を含み、ここで、上記タイプ分けは、上記被験体における骨転移のリスクに関する予後情
報を提供する。1つの実施形態において、被験体は、タイプ分けによって提供される予後
情報に基づいて、少なくとも1つの治療薬を投与されるか、またはその治療薬が除外され
る。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんに罹患
している被験体における骨転移のリスクを予防するためまたは減少させるための方法に関
し、上記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を上記被験体に投与する工程
を含み、ここで、上記薬剤は、上記被験体におけるc−MAFの発現レベルの定量から決
定された処置レジメンに従って投与される。
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体をコホートに分類する方法
に関し、その方法は:a)上記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを決定する
工程;b)上記サンプル中のc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベ
ルと比較する工程;およびc)そのサンプル中のc−MAFの上記発現レベルに基づいて
、上記被験体をコホートに分類する工程を含む。特定の態様において、そのコホートは、
臨床試験を行うために使用される。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される:
(項目1)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんに罹患している被験体における前記がん
の骨転移を予測するためのインビトロでの方法であって、該方法は、
i)前記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを決定する工程、および
ii)工程i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、前記参照値と比較して上昇した前記遺伝子の発現レベルは、骨転移を起
こす上昇したリスクを示す、インビトロでの方法。
(項目2)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんからの骨転移に罹患している患者の臨床
転帰を予測するためのインビトロでの方法であって、該方法は、
i)前記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程、および
ii)工程i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、前記参照値と比較して上昇した前記遺伝子の発現レベルは、不良な臨床
転帰を示す、インビトロでの方法。
(項目3)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんに罹患している被験体のために個別化治
療をデザインするためのインビトロでの方法であって、該方法は、
i)前記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ii)i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該発現レベルが、前記参照値と比較して上昇した場合、前記被験体は、
骨転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格である、インビトロでの
方法。
(項目4)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんに罹患している被験体のために個別化治
療をデザインするためのインビトロでの方法であって、該方法は、
iii)前記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、および
iv)i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該発現レベルが、前記参照値と比較して上昇していない場合、前記被験
体は、骨転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない、インビ
トロでの方法。
(項目5)
平均より高い前記遺伝子の発現レベルが、骨転移の上昇したリスクを示し、このリスクは
、c−MAF発現のレベルに比例する、項目1に記載のインビトロでの方法。
(項目6)
乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを決定するためのインビトロでの方
法であって、該方法は、前記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを決定
する工程を含み、ここで、平均値+1標準偏差より高い前記遺伝子の発現レベルは、早期
の骨転移の上昇したリスクを示す、インビトロでの方法。
(項目7)
該乳がんが、トリプルネガティブ乳がん、基底細胞様乳がんまたはER+(ルミナルAお
よびBを含む)乳がんである、項目6に記載の方法。
(項目8)
該骨転移が、溶骨性転移である、項目1〜7のいずれかに記載の方法。
(項目9)
骨転移を伴うトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+(ルミナルA
およびBを含む)乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのインビ
トロでの方法であって、該方法は、
i)前記被験体の骨転移サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、およ

ii)工程(i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該c−MAF遺伝子発現レベルが、前記参照値と比較して上昇している
場合、前記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格である、インビトロで
の方法。
(項目10)
骨転移を伴うトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+(ルミナルA
およびBを含む)乳がんを有する被験体のために個別化治療をデザインするためのインビ
トロでの方法であって、該方法は、
iii)前記被験体の骨転移サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、
および
iv)工程(i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、該c−MAF遺伝子発現レベルが、前記参照値と比較して上昇していな
い場合、前記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格ではない、インビト
ロでの方法。
(項目11)
前記骨分解を予防する薬剤が、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTHおよ
びPTHLHのインヒビターまたはPRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−
1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター、エストロゲンレセプタ
ー調節因子、カルシトニン、ならびにカテプシンKインヒビターからなる群より選択され
る、項目3〜4または9〜10に記載の方法。
(項目12)
前記RANKLインヒビターが、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディお
よびオステオプロテゲリンからなる群より選択される、項目11に記載の方法。
(項目13)
前記RANKL特異的抗体が、デノスマブである、項目12に記載の方法。
(項目14)
前記RANKL特異的ナノボディが、ALX−0141である、項目12に記載の方法。
(項目15)
前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、項目11に記載の方法。
(項目16)
前記METおよびVEGFR2の二重インヒビターが、Cabozantinibである
、項目11に記載の方法。
(項目17)
ラジウム−223が、アルファラディンである、項目11に記載の方法。
(項目18)
前記c−MAF遺伝子発現レベルの定量が、前記遺伝子のメッセンジャーRNA(mRN
A)または前記mRNAのフラグメント、前記遺伝子の相補DNA(cDNA)または前
記cDNAのフラグメントを定量する工程を含む、項目1〜17のいずれかに記載の方法

(項目19)
前記発現レベルが、定量的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、またはDNA、RNAアレ
イ、またはヌクレオチドハイブリダイゼーション法によって定量される、項目18に記載
の方法。
(項目20)
前記c−MAF遺伝子発現レベルの定量が、前記遺伝子によってコードされるタンパク質
またはそのバリアントのレベルを定量する工程を含む、項目1〜17のいずれかに記載の
方法。
(項目21)
前記タンパク質のレベルが、ウエスタンブロット、ELISA、免疫組織化学またはタン
パク質アレイによって定量される、項目20に記載の方法。
(項目22)
前記参照値が、転移に罹患していない被験体由来のトリプルネガティブ乳がんまたはある
いはER+乳がん(ルミナルAおよびBを含む)のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レ
ベルである、項目1〜21のいずれかに記載の方法。
(項目23)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がん(ルミナル
AおよびBを含む)に罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのイ
ンビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が
、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここで、前記参
照遺伝子コピー数と比較したときの前記c−MAF遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇
したリスクを示す、方法。
(項目24)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんに罹患している被験体における前記がん
の骨転移を予測するためのインビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサン
プル中の前記c−MAF遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含む、方法。
(項目25)
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目23〜24のいずれか1項に記載の方法。
(項目26)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測す
るためのインビトロでの方法であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中のc−MA
F遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程を含み、ここ
で、前記参照遺伝子コピー数と比較したときの前記c−MAF遺伝子の増幅は、不良な臨
床転帰を示す、方法。
(項目27)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がん(ルミナル
AおよびBを含む)に罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法
であって、前記方法は、前記被験体のサンプル中の前記c−MAF遺伝子が、転座してい
るかを決定する工程を含み、ここで、前記c−MAF遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を
示す、方法。
(項目28)
遺伝子座16q23または16q22−q24が、転座している、項目24および27の
いずれかに記載の方法。
(項目29)
遺伝子座16q23または16q22−q24が、14番染色体の遺伝子座14q32に
転座している、項目24、27または28のいずれかに記載の方法。
(項目30)
前記がんに罹患している被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数
と比べて増幅されているかを決定する工程をさらに含み、ここで、前記参照遺伝子コピー
数と比較したときの前記c−MAF遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇したリスクを示
す、項目23〜29のいずれかに記載の方法。
(項目31)
前記c−MAF遺伝子の増幅および転座が、遺伝子座16q23または16q22−q2
4の増幅または転座を決定することによって決定される、項目23〜30のいずれかに記
載の方法。
(項目32)
前記c−MAF遺伝子の増幅または転座が、c−MAF遺伝子特異的プローブを使用する
ことによって決定される、項目23〜31のいずれかに記載の方法。
(項目33)
前記c−MAF遺伝子特異的プローブが、Vysis LSI/IGH MAF Dua
l Color Dual Fusion Probeである、項目32に記載の方法。
(項目34)
前記参照遺伝子コピー数が、転移に罹患していない被験体由来のトリプルネガティブ乳が
んの腫瘍組織サンプル中の遺伝子コピー数である、項目23〜33のいずれかに記載の方
法。
(項目35)
前記増幅が、インサイチュハイブリダイゼーションまたはPCRによって決定される、項
目23〜34のいずれかに記載の方法。
(項目36)
前記被験体サンプルが、前記c−MAF遺伝子の倍数体であるかをさらに決定する工程を
含む、項目23〜35のいずれかに記載の方法。
(項目37)
前記サンプルが、腫瘍組織サンプルである、項目1〜36のいずれかに記載の方法。
(項目38)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+乳がんからの骨転移の予防
において使用するためのc−MAF阻害剤。
(項目39)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+(ルミナルAおよびBを含
む)乳がんに罹患しており、かつ転移性腫瘍組織サンプルにおいて、コントロールサンプ
ルと比較して上昇したc−MAFレベルを有する被験体における骨転移の処置において使
用するための、c−MAF阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することがで
きる薬剤。
(項目40)
前記c−MAF阻害剤が、c−MAF特異的siRNA、c−MAF特異的アンチセンス
オリゴヌクレオチド、c−MAF特異的リボザイム、c−MAF阻害性抗体もしくはナノ
ボディ、ドミナントネガティブc−MAFバリアント、表1もしくは表2の化合物、c−
MAF特異的小分子、c−MAF特異的抗体、c−MAF特異的抗体様分子、c−MAF
特異的な構造的に制約された(環状の)ペプチド、c−MAF特異的ステープルドペプチ
ド、またはc−MAF特異的アルファボディからなる群より選択される、項目38または
39のいずれかに記載の使用のためのc−MAF阻害剤。
(項目41)
前記薬剤が、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTHもしくはPTHLHイ
ンヒビターまたはPRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−1インヒビター、
METおよびVEGFR2の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カル
シトニン、ラジウム−223およびカテプシンKインヒビターからなる群より選択される
、項目39に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる
薬剤。
(項目42)
前記RANKLインヒビターが、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディお
よびオステオプロテゲリンの群から選択される、項目41に記載の、使用するための、骨
分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
(項目43)
前記RANKL特異的抗体が、デノスマブである、項目42に記載の、使用するための、
骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
(項目44)
前記RANKL特異的ナノボディが、ALX−0141である、項目42に記載の、使用
するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
(項目45)
前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、項目41に記載の、使用するための、
骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
(項目46)
前記METおよびVEGFR2の二重インヒビターが、Cabozantinibである
、項目41に記載の、使用するための、骨分解を回避するかまたは予防することができる
薬剤。
(項目47)
前記ラジウム−223が、アルファラディンである、項目41に記載の、使用するための
、骨分解を回避するかまたは予防することができる薬剤。
(項目48)
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目38〜47のいずれかに記載の、使用するための
、c−MAF阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができる薬剤。
(項目49)
乳がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのキットであって
、前記キットは:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するため
の手段;およびb)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−MA
F発現レベルと比較するための手段を備える、キット。
(項目50)
乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するためのキットであって、
前記キットは:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための
手段;およびb)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−MAF
発現レベルと比較するための手段を備える、キット。
(項目51)
乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するためのキットであって、前記キット
は:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段;b)
前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−MAF発現レベルと比較
するための手段;ならびにc)定量された発現レベルと参照発現レベルとの比較に基づい
て、前記被験体において骨転移を予防するためおよび/または減少させるための治療を決
定するための手段を備える、キット。
(項目52)
i)乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するため
の試薬、およびii)骨転移のリスクと相関するように予め決定されている1つまたは複
数のc−MAF遺伝子発現レベル指標を備える、キット。
(項目53)
発現を定量するための前記手段が、c−MAF遺伝子、16q23遺伝子座または16q
22−16q24染色体領域に特異的に結合および/または増幅するプローブおよび/ま
たはプライマーのセットを含む、項目49〜52のいずれか1項に記載のキット。
(項目54)
前記がんが、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+(ルミナルA
およびBを含む)乳がんである、項目49〜53のいずれか1項に記載のキット。
(項目55)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がん(ルミナル
AおよびBを含む)に罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするためのインビトロ
での方法であって、前記方法は:
(a)前記被験体からサンプルを提供する工程;
(b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
(c)定量されたc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較す
ることによって前記サンプルをタイプ分けする工程;
を含み、ここで、前記タイプ分けは、前記被験体における骨転移のリスクに関する予後情
報を提供する、インビトロでの方法。
(項目56)
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+乳がんに罹患している被験
体における骨転移のリスクを予防するためまたは減少させるための方法であって、前記方
法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を前記被験体に投与する工程を含み、こ
こで、前記薬剤は、前記被験体におけるc−MAFの発現レベルの定量から決定された処
置レジメンに従って投与される、方法。
(項目57)
乳がんに罹患している被験体をコホートに分類する方法であって、前記方法は、a)前記
被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを決定する工程;b)前記サンプル中のc
−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較する工程;およびc)
前記サンプル中のc−MAFの前記発現レベルに基づいて、前記被験体をコホートに分類
する工程を含む、方法。
(項目58)
前記コホートが、前記参照発現レベルと比較して、匹敵するc−MAF発現レベルを有す
ると決定された少なくとも1つの他の個体を含む、項目57に記載の方法。
(項目59)
前記サンプル中のc−MAFの前記発現レベルが、前記所定の参照レベルと比べて上昇し
ており、前記コホートのメンバーが、骨転移の上昇したリスクを有すると分類される、項
目57または58に記載の方法。
(項目60)
前記コホートが、臨床試験を行うためのコホートである、項目57〜58のいずれかに記
載の方法。
(項目61)
前記乳がんが、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはER+(ルミナル
AおよびBを含む)乳がんである、項目57〜60のいずれかに記載の方法。
(項目62)
前記サンプルが、腫瘍組織サンプルである、項目55〜60のいずれかに記載の方法。
(項目63)
c−MAF遺伝子、16q23または16q22−16q24染色体領域が、増幅されて
いるか、または転座されている、項目55〜60のいずれかに記載の方法。
(項目64)
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、mTorインヒビタ
ーである、項目3に記載の方法。
(項目65)
前記mTorインヒビターが、Everolimusである、項目64に記載の方法。
(項目66)
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、Srcキナーゼイン
ヒビターである、項目3に記載の方法。
前記Srcキナーゼインヒビターが、ダサチニブである、項目66に記載の方法。
(項目67)
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、COX−2インヒビ
ターである、項目3に記載の方法。
(項目68)
第2の処置が、前記COX−2インヒビターと組み合わせて使用される、項目67に記載
の方法。
(項目70)
骨転移を処置するためまたは予防するために使用される前記治療が、Alpharadi
nである、項目3に記載の方法。
各スコアの密度プロット。ESR1、ERBB2、PGR、ルミナル、増殖。 Triple Negative(トリプルネガティブ)乳がんを有する患者に対する骨転移までの時間のカプラン・マイヤーグラフ(p値0.04)。各グラフの群は、c−MAFのレベルによって定義される。(−)、(uk)および(+)は、以下のようなc−MAF発現レベルを表す:(−)(<平均値−SD)、(uk)(≧平均値−SDおよび≦平均値+SD)および(+)(>平均値+SD)。SDは、標準偏差を表す。 c−MAF(mRNA)は、ER+乳がんにおける乳がんの骨転移に対する臨床的バイオマーカーである。 ER+原発性乳がん患者における、骨(左)、脳(右上)および肺(右下)への無転移生存率のカプラン・マイヤー曲線(GSE2603、GSE2034およびGSE12276のデータセットの組み合わせまたはコホートI)。低、中および高は、以下のようなc−MAF発現レベルを表す:低(<平均値−SD)、中(≧平均値−SDおよび≦平均値+SD)および高(>平均値+SD)。骨転移を有する患者は、脳転移および肺転移の解析から除外された。 c−MAF(タンパク質)は、乳がんの骨転移に対する臨床的バイオマーカーである。a)原発性乳がん組織の代表的なc−MAF免疫染色。症例1は、c−MAF陰性腫瘍を表す(OD<1000)。症例2および症例3は、MAF陽性腫瘍である(それぞれOD>1000および>25000)。b)プロットは、380個の原発性乳がん腫瘍のコホート(コホートII)におけるc−MAFタンパク質発現(OD)を示している。BCサブタイプ(ER+、HER2+およびTN)に従って腫瘍を分ける。下の灰色の目盛りは、骨転移を有する腫瘍を示している。OD:c−MAF免疫染色に基づく光学密度。c,d)380個の原発性乳がん腫瘍(ステージI、IIおよびIII)のコホートにおける無病生存率(c)および無骨転移生存率(d)のカプラン・マイヤー曲線。c−MAF高群(赤線,OD>1000);c−MAF低群(緑線,OD<1000)。e)種々のBCサブタイプ(ER+、HER2+およびTN)におけるc−MAFの骨転移の診断性能を表している表。CI(信頼区間);Se−感度;Sp−特異度;PPV(正の予後値);NPV(負の予後値)。 乳がん細胞の骨転移に対するc−MAFの寄与。 a)c−MAF(短および長アイソフォーム)発現ありまたはなしの親MCF7細胞をマウスの左心室に注射し、インビボ生物発光(bioluminiscent)イメージングによって骨転移増殖(bone colonization)を解析した。無骨転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。エンドポイントにおける代表的な骨の全光子束、HandE染色およびCTスキャンに対応する画像が、示されている。 乳がん細胞の骨転移に対するc−MAFの寄与。 b)c−MAF(短および長アイソフォーム)発現ありまたはなしの親T47D細胞をマウスの左心室に注射し、骨転移増殖をインビボ生物発光イメージングによって解析した。無骨転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。 乳がん細胞の骨転移に対するc−MAFの寄与。 c)c−MAF(短および長アイソフォームの組合せまたは単独)の発現が枯渇したまたはその発現に対してレスキューされたBoM2骨転移性MCF7細胞派生物(cell derivatives)を、マウスの左心室に注射し、骨転移増殖をインビボ生物発光イメージングによって解析した。無骨転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。エンドポイントにおける代表的な骨の全光子束、HandE染色およびCTスキャンに対応する画像が示されている。 乳がん細胞の骨転移に対するc−MAFの寄与。 d)c−MAF(短および長アイソフォーム)発現ありまたはなしの親MCF7細胞をマウスの尾静脈を介して注射し、肺転移増殖(lung colonization)をインビボ生物発光イメージングによって解析した。無肺転移生存率のカプラン・マイヤープロットが示されている。ウィルコクソン符号付き順位検定によって統計的差異を決定した。 MCF7親および骨転移誘導物BoM2におけるMAFレベル。 a)コントロール、c−MAF短、c−MAF長またはc−MAF短および長アイソフォーム発現構築物でトランスフェクトされた親細胞(左)、ならびにBoM2コントロール、shMAFまたはRescue(レスキュー)BoM2細胞(右)におけるMAF発現レベル。MAF長の発現レベルを、TaqManプローブを使用して決定し、Bo2Mレベルに対して正規化した。MAF短の内因性レベルを、示したプライマーを用いるSyber Green反応を使用して決定し、ベータアクチンレベルに対して正規化した。異所的に発現されたc−MAF短アイソフォームの存在を、PCR反応を使用して検出した。 b)親コントロール、MAF短およびMAF長アイソフォームを(同時に)過剰発現している細胞、ならびにBoM2コントロール、shMAFまたはRescue BoM2細胞におけるc−MAFタンパク質レベルを示しているWB。α−チューブリンをローディングコントロールとして使用した。 c)a)およびb)に記載されたようなMCF7とBoM2とMAF枯渇BoM2との間のc−MAF mRNAおよびタンパク質の発現の直接比較。 d)コントロール、c−MAF短アイソフォーム、c−MAF長アイソフォームまたはc.MAF短および長アイソフォームを発現するベクターで一過性にトランスフェクトされた親細胞におけるC−MARE(c−MAF応答エレメント)レポータープラスミドのRenilla活性。C−MAREプロモーターの活性は、コントロール条件に対して正規化され、任意単位で提示されている。データは、sdを伴う、3つの独立した実験の平均値である。 MAFは、実験的乳がん転移マウスモデルにおいて骨転移を駆動する。 (左)無骨転移生存率のカプラン・マイヤー曲線。親コントロールを過剰発現している細胞ならびにc−MAF短アイソフォームを過剰発現している細胞およびc−MAF長アイソフォームを過剰発現している細胞を左心室に注射し、転移を生物発光によって決定した。(右)各群に対する、マウス後肢の代表的なCTスキャンおよび骨転移のH&E染色とともに、0日目およびエンドポイントである54日目における代表的な生物発光の画像が示されている。スケールバー,100μm。溶骨性の領域−黄色破線。(右)エキソビボでの後肢の全光子束をエンドポイントである54日目に計測し、0日目に対して正規化した。コントロールおよびc−MAF短発現ベクターとc−MAF長発現ベクターの両方で、同時に(左)または別々に(右)トランスフェクトされた親細胞を比較することによって、P値を計算した。 c−MAFは、骨への乳がん転移の原因媒介物質である。 骨転移発生の生物発光イメージングプロットが示されている。値は、0日目に対して正規化されている。コントロール、shMAFまたはRescue BoM2細胞をヌードマウスの左心室に注射した。 骨転移を再発した動物だけを含む統計値を計算した。 c−MAFは、乳がんの骨転移病変において破骨細胞の分化の引き金を引く。 a)骨病変の総数(ルミネセンスによって計測)あたりの溶骨性病変(X線によって計測)のパーセンテージ。親細胞、c−MAF短、c−MAF長ならびにc−MAF短および長を発現している親細胞、ならびにBoM2骨転移性MCF7細胞派生物をマウスの左心室に注射し、インビボ生物発光イメージングによって骨転移増殖を解析した。 b)MCF7親細胞、またはc−MAFアイソフォーム(短−短アイソフォームおよび長−長アイソフォーム)のいずれかを過剰発現している細胞を起源とする馴化培地を使用した、マウス骨髄由来前駆細胞からの破骨細胞分化のアッセイ。破骨細胞の数を、TRAP技法によって測定する(>3個の多核細胞)。 cおよびd)親細胞、c−MAF短を発現している親細胞、c−MAF長を発現している親細胞ならびにc−MAF短および長を発現している親細胞、ならびにBoM2骨転移性MCF7細胞派生物を心臓内に(intracardiacally)注射されたマウスからの代表的な骨転移性病変のTRAP染色。骨腫瘍境界面に沿ったTRAP陽性破骨細胞(紫色)を、4匹の独立したマウスの少なくとも4つの異なる視野において数え、SD値とともにプロットした。スケールバー50μM。群間の統計的差異を、両側ウィルコクソン検定によって評価する。 c−MAFは、乳がんの骨転移病変において破骨細胞の分化の引き金を引く。 a)骨病変の総数(ルミネセンスによって計測)あたりの溶骨性病変(X線によって計測)のパーセンテージ。親細胞、c−MAF短、c−MAF長ならびにc−MAF短および長を発現している親細胞、ならびにBoM2骨転移性MCF7細胞派生物をマウスの左心室に注射し、インビボ生物発光イメージングによって骨転移増殖を解析した。 b)MCF7親細胞、またはc−MAFアイソフォーム(短−短アイソフォームおよび長−長アイソフォーム)のいずれかを過剰発現している細胞を起源とする馴化培地を使用した、マウス骨髄由来前駆細胞からの破骨細胞分化のアッセイ。破骨細胞の数を、TRAP技法によって測定する(>3個の多核細胞)。 cおよびd)親細胞、c−MAF短を発現している親細胞、c−MAF長を発現している親細胞ならびにc−MAF短および長を発現している親細胞、ならびにBoM2骨転移性MCF7細胞派生物を心臓内に(intracardiacally)注射されたマウスからの代表的な骨転移性病変のTRAP染色。骨腫瘍境界面に沿ったTRAP陽性破骨細胞(紫色)を、4匹の独立したマウスの少なくとも4つの異なる視野において数え、SD値とともにプロットした。スケールバー50μM。群間の統計的差異を、両側ウィルコクソン検定によって評価する。 c−MAFは、乳がんの増殖を支援しない。 皮下注射の模式的表示。(上)親コントロールまたはc−MAF短アイソフォームおよびc−MAF長アイソフォームを(同時に)過剰発現している細胞からの(form)皮下腫瘍の成長曲線。値は、sdを伴う平均値を表している。(下)コントロールまたはc−MAF短アイソフォームおよびc−MAF長アイソフォームを(同時に)過剰発現している細胞からの皮下腫瘍におけるKi67陽性細胞のパーセンテージ。各腫瘍について、最低10個のランダムな視野を、Ki67陽性細胞について数えた。値は、sdを伴う平均値である(n=4)。 c−MAFの下流のPTHLHは、乳がんの骨転移に寄与し、媒介する。 a)B2Mの発現レベルに対して正規化された、親細胞、c−MAF短を発現している親細胞、c−MAF長を発現している親細胞ならびにc−MAF短および長を発現している親細胞、ならびにBoM2骨転移性MCF7細胞派生物におけるPTHLHの相対的な発現レベル。p値<0.05。 b)GSE14020データセットからのヒト乳がん転移におけるPTHLHの標準化された発現に対するMAFの標準化された発現のドットチャート。赤色の点は、骨転移を示しており、黒色の点は、他の軟部組織転移を示している。点線は、転移サンプルにおける平均MAF発現または平均PTHLH発現を示した。 c)破骨細胞分化培地と、親細胞、c−MAF短および長を発現している親細胞ならびにBoM2骨転移性MCF7細胞派生物の馴化培地(CM)との50:50、またはCM無しだがヒトPTHLHアンタゴニストペプチド(7−34)(5μg/ml)で処理した骨髄細胞。破骨細胞の数を、TRAP技法によって測定し(破骨細胞(Ostoclasts)は、白矢印で強調されている、>3個の多核細胞である)、コントロールに対して正規化する。 d)親細胞、ルシフェラーゼ遺伝子で標識されたc−MAF短および長を発現している親細胞を、マウスの左心室に注射し、インビボ生物発光イメージングによって骨転移増殖を解析した。c−MAF短および長を発現している親細胞を注射されたマウスを、実験の経過中、1日に2回、腹腔内に接種される(6μg/動物)PTHLHアンタゴニストペプチド(7−34)で処置したかまたは処置しなかった。そのプロットは、実験終点におけるエキソビボでの全光子束を表しており、これは、病変1つあたりの転移細胞の数を反映している(左パネル)。溶骨性骨転移の病変が示されている(右パネル)。 e)1群あたりの代表的な溶骨性病変のX線(CTスキャン)画像。骨腫瘍境界面に沿ったTRAP陽性破骨細胞(白矢印で強調されている黒色)が、種々の群について示されている。病変から骨腫瘍境界面に沿ったTRAP陽性破骨細胞(黒色)を、独立した各マウスからの少なくとも4つの異なる視野において数え、SD値とともにプロットした。スケールバー50μM。群間の統計的差異を、両側ウィルコクソン検定によって評価する。 四次スプライン(パッケージphenoTestにおけるsmoothCoxph関数)を用いるCox回帰モデルによる、c−MAFの発現と骨転移のハザード比との関係の推定。これらのプロットは、記載の群に対応する:c−MAF発現レベルが平均(0と命名)より高い腫瘍における骨転移を予測するc−MAFの能力のHR比およびp値(GSE2603、GSE2034およびGSE12276データセットの組み合わせ,コホートI)。続いて、発現レベルにおける1は、1標準偏差を示す。 四次スプライン(パッケージphenoTestにおけるsmoothCoxph関数)を用いるCox回帰モデルによる、c−MAFの発現と骨転移のハザード比との関係の推定。これらのプロットは、記載の群に対応する:c−MAF発現レベルが平均(0と命名)より高い腫瘍における骨転移を予測するc−MAFの能力のHR比およびp値(GSE2603、GSE2034およびGSE12276データセットの組み合わせ,コホートI)。続いて、発現レベルにおける1は、1標準偏差を示す。 c−MAF発現および骨転移リスクの決定。本発明者らは、どの程度こまでc−MAFの用量が高くなると骨再発のリスクが高くなるかを検証コホートIIにおいてアッセイした。本発明者らは、上に記載されたようなコンピュータ処理システムを使用した染色の光学密度の決定(図4a,b)を用いて免疫組織化学(IHC)によってc−MAF発現を定量した。2つのタイプのc−MAF陽性乳がん腫瘍に基づいて、それらが二峰性の挙動を有するとき、本発明者らは、それらを2群に分離し得る(左パネル)。この2つのカテゴリーを基礎にして、本発明者らは、c−MAFの染色が強いほど、骨転移のリスクが高く(HR(骨転移)=19.45;p値<0.001)、より早く骨転移が生じる(右パネル)という観察結果を検証する。 種々の時点におけるc−MAFおよび骨転移の独立性を試験するためのフィッシャーの正確検定の結果を示しているグラフ(GSE2603、GSE2034およびGSE12276データセットの組み合わせ、コホートI)。分割表およびフィッシャー検定のp値の比率が、各パネルに示されている。 c−MAFの過剰発現は、コピー数の変化に起因して起き得る。 a)遺伝子発現に基づくコピー数の変化の解析(ACEアルゴリズム)。影の領域は、ER+乳がん腫瘍において再発と有意に関連するDNAゲノム増幅を表している(GSE2603、GSE2034およびGSE12276データセットの組み合わせ、コホートI)。 b)MAF遺伝子コピー(16q23)とIGH(14q32)遺伝子コピーとの比に基づいて、親細胞およびMAF遺伝子が増幅しているBoM2骨転移細胞のパーセンテージを示しているパネル。FISHで染色した親細胞およびBoM2細胞の代表的な画像。 c)16番染色体について、黒色の点および灰色の横線は、それぞれ、正規化されたlog2強度比およびセグメントを表している。BoM2は、MCF7親細胞に対して比較される。下に灰色で16q22−24DNAゲノム増幅が強調されている。 c−MAFの過剰発現は、コピー数の変化に起因して起き得る。 a)遺伝子発現に基づくコピー数の変化の解析(ACEアルゴリズム)。影の領域は、ER+乳がん腫瘍において再発と有意に関連するDNAゲノム増幅を表している(GSE2603、GSE2034およびGSE12276データセットの組み合わせ、コホートI)。 b)MAF遺伝子コピー(16q23)とIGH(14q32)遺伝子コピーとの比に基づいて、親細胞およびMAF遺伝子が増幅しているBoM2骨転移細胞のパーセンテージを示しているパネル。FISHで染色した親細胞およびBoM2細胞の代表的な画像。 c)16番染色体について、黒色の点および灰色の横線は、それぞれ、正規化されたlog2強度比およびセグメントを表している。BoM2は、MCF7親細胞に対して比較される。下に灰色で16q22−24DNAゲノム増幅が強調されている。 16q22−24ゲノムDNA領域の増幅は、乳がんの骨転移と関連する。aおよびb)ステージI、IIおよびIIIのBCヒト原発腫瘍セットにおける無骨転移生存率(a)または全生存率(bt)のカプラン・マイヤー曲線(n=334)(コホートII)。腫瘍1つあたり3つのコアを使用して、平均として細胞1つあたり16q23の2.5コピーというカットオフに基づく16q23 FISH陰性群および16q23 FISH陽性群に従って、患者を層別化した。Se−感度;Sp−特異度;HR−ハザード比。c)I、IIおよびIIIのBCヒト原発腫瘍セットにおけるER陽性患者(左)またはトリプルネガティブ患者(右)における無骨転移生存率のカプラン・マイヤー曲線(それぞれn=250およびn=43)(コホートIIより)。腫瘍1つあたり3つのコアを使用して、平均として細胞1つあたり16q23に対する2.5コピーというカットオフに基づいて、患者を16q23 FISH陰性群および16q23 FISH陽性群に分けた。HR−ハザード比。d,e)全体(d)およびER+乳がん(e)における16q23増幅の診断性能についての受信者動作特性(ROC)曲線。ROC曲線において、真陽性率(感度)を、種々のカットオフ点に対する偽陽性率(100−特異度)の関数でプロットする。ROC曲線上の各点は、特定の決定閾値に対応する感度/特異度対を表す。
発明の詳細な説明
一般的な用語および表現の定義
本明細書中で使用されるとき、「骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤」と
は、骨芽細胞の増殖を刺激するか、または破骨細胞の増殖を阻害するか、または骨の構造
を固定することによって、骨分解を予防するか、阻害するか、処置するか、減少させるか
、または停止することができる任意の分子のことを指す。
本明細書中で使用されるとき、用語「遺伝子の増幅」とは、遺伝子または遺伝子フラグ
メントの様々なコピーが、個別の細胞または細胞系において形成されるプロセスのことを
指す。その遺伝子のコピーは、必ずしも同じ染色体に位置するとは限らない。その重複領
域は、「アンプリコン」と呼ばれることが多い。通常は、生成されるmRNAの量、すな
わち、遺伝子発現レベルは、特定の遺伝子のコピー数に比例して増加する。
本明細書中で使用されるとき、用語「基底細胞様」「基底細胞様サブタイプ」、「基底
細胞様サブタイプの乳がん」などは、本明細書中で使用されるとき、2つのレセプターE
RおよびHER2が陰性であること、ならびにCK5/6、CK14、CK17およびE
GFRからなる群のうちの少なくとも1つのレセプターが陽性であることを特徴とする特
定のサブタイプの乳がんのことを指す。したがって、トリプルネガティブ乳がん(ER、
HER−2、PgR)を引き合いに出し、言及する本願中のすべての文は、ERおよびH
ER2が陰性であり、CK5/6、CK14、CK17およびEGFRのうちの少なくと
も1つが陽性である、基底細胞様乳がんのことも引き合いに出し、言及し得る。あるいは
、「基底細胞様」とは、以下の10個の遺伝子のアップレギュレーションおよび/または
ダウンレギュレーションに基づく遺伝子発現プロファイルを特徴とする乳がんのことも指
す:(1)フォークヘッドボックスCI(FOXC1);(2)メラノーマ阻害活性(M
IA);(3)NDC80ホモログ,キネトコア複合体構成要素(KNTC2);(4)
中心体タンパク質55kDa(CEP55);(5)アニリン(Anillin),アク
チン結合タンパク質(ANLN);(6)母性胚性(Maternal embryon
ic)ロイシンジッパーキナーゼ(MELK);(7)Gタンパク質共役レセプター16
0(GPR160);(8)膜貫通タンパク質45B(TMEM45B);(9)エスト
ロゲンレセプター1(ESR1);(10)フォークヘッドボックスAl(FOXA1)
。乳がん腫瘍を基底細胞様サブタイプとして分類するために使用される遺伝子発現プロフ
ァイルは、エストロゲンレセプター、プロゲステロンレセプターまたはHer2を含まな
いので、トリプルネガティブ乳がんと非トリプルネガティブ乳がんの両方が、基底細胞様
サブタイプとして分類され得る。
本明細書中で使用されるとき、「トリプルネガティブ乳がん」とは、ERとPRの両方
の検出可能な発現を欠くことを特徴とする乳がんのことを指し(好ましくは、ERおよび
PRの発現の測定が、M.Elizabeth Hら、Journal of Clin
ical Oncology,28(16):2784−2795,2010によって開
示された方法によって行われるとき)、その腫瘍細胞では、正常には細胞表面上に位置す
るレセプターである上皮成長因子レセプタータイプ2(HER2またはErbB2)が増
幅されていない。標準的な免疫組織化学的技法を用いて、5パーセント未満の腫瘍細胞核
しか、ERおよびPR発現について染色されない場合、その腫瘍細胞は、ERおよびPR
の発現について陰性であると考えられる。本明細書中で使用されるとき、腫瘍細胞は、ポ
リクローナル抗HER2一次抗体を使用する半定量的免疫組織化学的アッセイであるHe
rcepTestTMKit(Code K5204,Dako North Amer
ica,Inc.,Carpinteria,CA)を用いて試験されたときに0もしく
は1+もしくは2+という試験結果スコアをもたらす場合、またはHER2 FISHが
陰性である場合、HER2過剰発現について陰性であると考えられる。
本明細書中で使用されるとき、「c−MAF遺伝子」(MAFまたはMGC71685
としても知られるv−maf筋腱膜性線維肉腫癌遺伝子ホモログ(鳥類))は、ホモ二量
体またはヘテロ二量体のように作用するロイシンジッパーを含む転写因子である。DNA
結合部位に応じて、コードされるタンパク質は、転写活性化因子または転写抑制因子であ
り得る。c−MAFをコードするDNA配列は、アクセッション番号NG_016440
(配列番号1(ゲノム))としてNCBIデータベースに記載されている。c−MAFの
コード配列は、配列番号13に示されている。本発明の方法は、コード配列またはゲノム
DNA配列を利用し得る。上記DNA配列からは2つのメッセンジャーRNAが転写され
、その各々が、2つのc−MAFタンパク質アイソフォーム、αアイソフォームおよびβ
アイソフォームのうちの1つを生じる。上記アイソフォームの各々に対する相補DNA配
列は、それぞれ、アクセッション番号NM_005360.4(配列番号2)およびNM
_001031804.2(配列番号3)としてNCBIデータベースに記載されている
本明細書中で使用されるとき、「c−MAF阻害剤」とは、c−MAF遺伝子発現を完
全にまたは部分的に阻害することができる(その両方が、上記遺伝子の発現産物の生成を
妨げること(c−MAF遺伝子の転写を妨害することおよび/またはc−MAF遺伝子発
現に由来するmRNAの翻訳を阻止すること)およびc−MAFタンパク質活性を直接阻
害することによって)任意の分子のことを指す。C−MAF遺伝子発現インヒビターは、
国際特許出願WO2005/046731(その全内容が本明細書によって参照により援
用される)に示されているような、c−MAFがインビトロにおける細胞増殖を促進する
能力をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法、WO2008098351(
その全内容が本明細書によって参照により援用される)に記載されているような、c−M
AFを発現する細胞においてサイクリンD2プロモーターもしくはc−MAF応答領域(
MAREまたはc−MAF応答エレメント)を含むプロモーターの支配下のレポーター遺
伝子の転写能力をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法、またはUS200
9048117A(その全内容が本明細書によって参照により援用される)に記載されて
いるような、NFATc2およびc−MAFを発現する細胞においてPMA/イオノマイ
シンによる刺激に応答してIL−4プロモーターの支配下のレポーター遺伝子の発現をい
わゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法を用いて同定され得る。
本明細書中で使用されるとき、ラパマイシンの哺乳動物における標的(mTOR)また
は「mTor」とは、EC2.7.11.1に相当するタンパク質のことを指す。mTo
r酵素は、セリン/トレオニンタンパク質キナーゼであり、細胞増殖、細胞運動性、細胞
成長、細胞生存および転写を制御する。
本明細書中で使用されるとき、「mTorインヒビター」とは、mTor遺伝子の発現
を完全にまたは部分的に阻害することができる(その両方が、上記遺伝子の発現産物の生
成を妨げること(mTor遺伝子の転写を妨害することおよび/またはmTor遺伝子発
現に由来するmRNAの翻訳を阻止すること)およびmTorタンパク質活性を直接阻害
することによって)任意の分子のことを指す。二重またはそれより多くの標的および中で
もmTorタンパク質活性を有するインヒビターを含む。
本明細書中で使用されるとき、「Src」とは、EC2.7.10.2に相当するタン
パク質のことを指す。Srcは、非レセプターチロシンキナーゼおよび癌原遺伝子である
。Srcは、細胞成長および胚発生において役割を果たし得る。
本明細書中で使用されるとき、「Srcインヒビター」とは、Src遺伝子の発現を完
全にまたは部分的に阻害することができる(その両方が、上記遺伝子の発現産物の生成を
妨げること(Src遺伝子の転写を妨害することおよび/またはSrc遺伝子発現に由来
するmRNAの翻訳を阻止すること)およびSrcタンパク質活性を直接阻害することに
よって)任意の分子のことを指す。
本明細書中で使用されるとき、「プロスタグランジン−エンドペルオキシドシンターゼ
2」、「シクロオキシゲナーゼ−2」または「COX−2」とは、EC1.14.99.
1に相当するタンパク質のことを指す。COX−2は、アラキドン酸からのプロスタグラ
ンジンエンドペルオキシドH2への変換に関与する。
本明細書中で使用されるとき、「COX−2インヒビター」とは、COX−2遺伝子の
発現を完全にまたは部分的に阻害することができる(その両方が、上記遺伝子の発現産物
の生成を妨げること(COX−2遺伝子の転写を妨害することおよび/またはCOX−2
遺伝子発現に由来するmRNAの翻訳を阻止すること)およびCOX−2タンパク質活性
を直接阻害することによって)任意の分子のことを指す。
本明細書中で使用されるとき、「転帰」または「臨床転帰」とは、結果として生じる疾
患の経過および/または疾患の進行のことを指し、例えば、再発、再発までの期間、転移
、転移までの期間、転移の数、転移の部位の数および/または疾患に起因する死亡によっ
て特徴付けられ得る。例えば、良好な臨床転帰としては、治癒、再発の予防、転移の予防
および/または一定の期間内の生存(再発なし)が挙げられ、不良な臨床転帰としては、
疾患の進行、転移および/または一定の期間内の死亡が挙げられる。
本明細書中で使用されるとき、「ER+乳がん」は、その腫瘍細胞がエストロゲンレセ
プター(ER)を発現する乳がんとして理解される。このおかげで上記腫瘍はエストロゲ
ンに感受性になり、これは、エストロゲンががん性の乳房腫瘍を成長させることを意味す
る。対照的に、「ER−乳がん」は、その腫瘍細胞がエストロゲンレセプター(ER)を
発現しない乳がんとして理解される。ER+乳がんには、ルミナルAおよびBサブタイプ
が含まれる。
本明細書中で使用されるとき、本明細書中で使用される遺伝子の「発現レベル」という
用語は、被験体のサンプル中の遺伝子によって生成される遺伝子産物の測定可能な量のこ
とを指し、ここで、その遺伝子産物は、転写産物または翻訳産物であり得る。したがって
、発現レベルは、核酸遺伝子産物(例えば、mRNAまたはcDNA)またはポリペプチ
ド遺伝子産物に関係し得る。発現レベルは、被験体のサンプルおよび/または参照サンプ
ル(複数可)から得られ、例えば、新規に検出され得るか、または事前の測定値に対応し
得る。発現レベルは、例えば、当業者に公知であるような、マイクロアレイ法、PCR法
(例えば、qPCR)および/または抗体ベースの方法を用いて、決定され得るかまたは
測定され得る。
本明細書中で使用されるとき、用語「遺伝子コピー数」とは、細胞における核酸分子の
コピー数のことを指す。遺伝子コピー数は、細胞のゲノム(染色体)DNAにおける遺伝
子コピー数を含む。正常な細胞(非腫瘍細胞)では、遺伝子コピー数は、通常、2コピー
(染色体対の各メンバーにおいて1コピー)である。遺伝子コピー数は、時折、細胞集団
のサンプルから採取された遺伝子コピー数の半数を含む。
「上昇した発現レベル」は、それが参照サンプルまたはコントロールサンプルにおける
c−MAF遺伝子のレベルよりも高いレベルのことを指すときの発現レベルと理解される
。この上昇したレベルは、ある遺伝子または16q23もしくは16q22−24染色体
遺伝子座の増幅または転座によって、他の機序を排除せずに引き起こされ得る。特に、患
者から単離されたサンプル中の発現レベルが、参照またはコントロールと比較して、少な
くとも、約1.1倍、1.5倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60
倍、70倍、80倍、90倍、100倍またはなおもそれより高いとき、そのサンプルは
、高いc−MAF発現レベルを有すると考えられ得る。
「プローブ」は、本明細書中で使用されるとき、目的の特定の核酸配列に相補的なオリ
ゴヌクレオチド配列のことを指す。いくつかの実施形態において、プローブは、転座を起
こすと知られている染色体の領域に特異的であり得る。いくつかの実施形態において、プ
ローブは、特異的な標識またはタグを有する。いくつかの実施形態において、タグは、フ
ルオロフォアである。いくつかの実施形態において、プローブは、その標識が核酸および
タンパク質への白金の安定な配位結合(coordinative binding)に
基づくDNAインサイチュハイブリダイゼーションプローブである。いくつかの実施形態
において、プローブは、米国特許出願12/067532および米国特許出願12/18
1,399(これらの全体が参照により援用される)に記載されているか、またはSwe
nnenhuisら、「Construction of repeat−free f
luorescence in situ hybridization probes
」Nucleic Acids Research 40(3):e20(2012)に
記載されている。
「タグ」または「標識」は、本明細書中で使用されるとき、プローブまたはプローブの
位置を可視化するか、マークするか、または別途捕捉することを可能にする、プローブと
直接または間接的に会合されている任意の物理的な分子のことを指す。
「転座」は、本明細書中で使用されるとき、等しくない量または等しい量で染色体間で
染色体材料が交換することを指す。場合によっては、転座は、同じ染色体上で起きる。場
合によっては、転座は、異なる染色体間で起きる。転座は、乳がんおよび白血病を含む多
くのタイプのがんにおいて高頻度で生じる。転座は、主要な相互転座またはより複雑な二
次転座であり得る。多くのがんの起因事象を構成すると考えられている免疫グロブリン(
immunoglobin)重鎖(IgH)遺伝子座が関わる主要な転座がいくつかある
(Eychene,A.,Rocques,N.,およびPuoponnot,C.,A
new MAFia in cancer.2008.Nature Reviews
:Cancer.8:683−693)。
「倍数体」または「倍数性」は、本明細書中で使用されるとき、細胞が、2より多いコ
ピーの目的の遺伝子を含むことを示す。場合によっては、目的の遺伝子は、MAFである
。いくつかの実施形態において、倍数性は、目的の遺伝子の発現の蓄積に関連する。いく
つかの実施形態において、倍数性は、ゲノム不安定性に関連する。いくつかの実施形態に
おいて、ゲノム不安定性は、染色体転座に至り得る。
「ホールゲノムシーケンシング」は、本明細書中で使用されるとき、生物のゲノム全体
が1回で配列決定されるプロセスである。例えば、Ng.,P.C.amd Kirkn
ess,E.F.,Whole Genome Sequencing.2010.Me
thods in Molecular Biology.628:215−226を参
照のこと。
「エクソームシーケンシング」は、本明細書中で使用されるとき、生物のDNAのコー
ド領域全体が配列決定されるプロセスである。エクソームシーケンシングでは、mRNA
が配列決定される。ゲノムの非翻訳領域は、エクソームシーケンシングに含められない。
例えば、Choi,M.ら、Genetic diagnosis by whole
exome capture and massively parallel DNA
sequencing.2009.PNAS.106(45):19096−1910
1を参照のこと。
「転移」は、本明細書中で使用されるとき、最初にがんが生じた器官から異なる器官へ
のがんの伝播として理解されている。転移は、通常、血液またはリンパ系を通じて起きる
。がん細胞が広がって、新しい腫瘍を形成するとき、後者は、二次性腫瘍または転移性腫
瘍と呼ばれる。二次性腫瘍を形成しているがん細胞は、元の腫瘍のがん細胞に似ている。
乳がんが、例えば、肺に広がる(転移する)場合、二次性腫瘍は、悪性の乳がん細胞から
形成される。その肺における疾患は、転移性乳がんであって、肺がんではない。本発明の
方法の特定の実施形態において、転移は、骨に広がった(転移した)トリプルネガティブ
乳がんまたはあるいはER+乳がん(管腔タイプAおよびタイプBを含む)である。
「予測する」は、本明細書中で使用されるとき、トリプルネガティブ(基底細胞様を含
む)乳がんまたはあるいは(alternatiavely)ER+乳がんに罹患してい
る被験体が遠隔器官への転移を起こす可能性の決定のことを指す。本明細書中で使用され
るとき、「予後良好」は、被験体が、一定期間内において生存するおよび/または再発も
しくは遠隔転移を有しないかもしくは有するリスクが低いと予想される(例えば、予測さ
れる)ことを示す。用語「低い」は、相対的な用語であり、本願の文脈において、臨床転
帰(再発、遠隔転移など)に関して「低」発現グループのリスクのことを指す。「低」リ
スクは、不均一ながん患者集団に対する平均リスクより低いリスクと考えられ得る。Pa
ikら(2004)の研究では、再発の全体的な「低」リスクは、15パーセントより低
いと考えられた。そのリスクはまた、期間に応じて変動し得る。その期間は、がんの最初
の診断の後または予後診断が行われた後の、例えば、5年、10年、15年またはなおも
20年であり得る。
本明細書中で使用されるとき、「予後不良」は、被験体が、一定期間内において生存し
ないおよび/または再発もしくは遠隔転移を有するかもしくは有するリスクが高いと予想
される、例えば、予測されることを示す。用語「高い」は、相対的な用語であり、本願の
文脈において、臨床転帰(再発、遠隔転移など)に関して「高」発現グループのリスクの
ことを指す。「高」リスクは、不均一ながん患者集団に対する平均リスクより高いリスク
と考えられ得る。Paikら(2004)の研究では、再発の全体的な「高」リスクは、
15パーセントより高いと考えられた。そのリスクはまた、期間に応じて変動し得る。そ
の期間は、がんの最初の診断のまたは予後診断が行われた後の、例えば、5年、10年、
15年またはなおも20年であり得る。
「参照値」は、本明細書中で使用されるとき、患者または患者から回収されたサンプル
の臨床検査によって得られた値/データに対する参照として使用される検査値のことを指
す。参照値または参照レベルは、絶対値;相対値;上限および/もしくは下限を有する値
;一連の値;平均値(average value);中央値、平均値(mean va
lue)、または特定のコントロール値もしくはベースライン値と比較される値であり得
る。参照値は、個別のサンプル値、例えば、試験されている被験体から得られた値などで
あるが、より早い時点における値に基づき得る。参照値は、多数のサンプル(例えば、暦
年齢が一致する群の被験体の集団由来)に基づいてもよいし、試験されるべきサンプルを
含むまたは除外したサンプルのプールに基づいてもよい。
本明細書中で使用されるとき、「被験体」または「患者」とは、哺乳動物として分類さ
れるすべての動物のことを指し、それらとしては、家畜(domestic anima
l)および家畜(farm animal)、霊長類およびヒト、例えば、人間、非ヒト
霊長類、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコまたはげっ歯類が挙げられるが、
これらに限定されない。好ましくは、被験体は、任意の年齢または人種のヒトの男性また
は女性である。
用語「処置」は、本明細書中で使用されるとき、本明細書中に記載されるような臨床状
態を終結させるか、予防するか、回復させるか、またはその臨床状態への罹患性を低下さ
せることを目指す任意のタイプの治療のことを指す。好ましい実施形態において、処置と
いう用語は、本明細書中で定義されるような障害または状態の予防的処置(すなわち、臨
床状態への罹患性を低下させる治療)に関する。したがって、「処置」、「処置する」お
よびそれらの等価な用語は、ヒトを含む哺乳動物において、病理学的な状態または障害の
任意の処置を包含する、所望の薬理学的効果または生理学的効果を得ることを指す。その
効果は、障害もしくはその徴候を完全にもしくは部分的に予防することに関して予防的で
あり得、かつ/または障害および/もしくはその障害に起因し得る有害作用に対する部分
的もしくは完全な治癒に関して治療的であり得る。すなわち、「処置」は、(1)被験体
において障害が生じることもしくは再発することを予防すること、(2)障害を阻害する
こと、例えば、その進行を停止すること、(3)例えば、失った機能、不足している機能
もしくは不完全な機能を再建するかもしくは修復するか、または非効率なプロセスを刺激
することによって、宿主が障害もしくはその徴候にもはや罹患していないように、障害も
しくはそれに関連する少なくとも徴候を停止することもしくは終結させること(例えば、
障害またはその徴候の後退を引き起こすこと)、または(4)障害もしくはそれに関連す
る徴候を軽減すること、緩和すること、もしくは回復させること(ここで、回復させるこ
ととは、少なくとも、パラメータ(例えば、炎症、疼痛または免疫不全)の大きさの減少
のことを指すために広い意味において使用される)を含む。
本明細書中で使用されるとき、「サンプル」または「生物学的サンプル」は、被験体か
ら単離された生物学的材料を意味する。生物学的サンプルは、c−MAF遺伝子の発現レ
ベルの決定に適した任意の生物学的材料を含み得る。サンプルは、任意の好適な生物学的
組織または体液(例えば、腫瘍組織、血液、血漿、血清、尿または脳脊髄液(CSF)な
ど)から単離され得る。
「腫瘍組織サンプル」は、原発性トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん腫瘍
またはあるいはER+乳がん腫瘍を起源とする組織サンプルと理解される。上記サンプル
は、従来の方法、例えば、関連する医学的技法の当業者に周知の方法を用いる生検によっ
て、得ることができる。
「溶骨性骨転移」とは、骨吸収(骨密度の進行性消失)が、腫瘍細胞による破骨細胞活
性の刺激に起因する転移の近くにおいて生じる転移のタイプのことを指し、重篤な疼痛、
病理学的骨折、高カルシウム血症、脊髄圧迫、および神経圧迫に起因する他の症候群を特
徴とする。
c−MAFの発現レベルに基づいてトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんま
たはER+乳がんの骨転移を予測するための方法
驚いたことに、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんのサンプル中およびE
R+乳がんのサンプル中のc−MAFの発現レベルが、骨転移に罹患するリスクと相関す
ることが見出された。さらに、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)原発腫瘍および
ER+原発腫瘍におけるc−MAFの遺伝子発現は、骨転移の再発と有意に相関し、無骨
転移生存率および生存率と逆相関した。さらに、c−MAF発現レベルが、用量依存的様
式で骨転移を予測することが見出された。
第1の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまた
はあるいはER+乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するため
のインビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第1の方法)に関し、その方法は:
i)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを決定する工程、および
ii)工程i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、骨転移を起
こす上昇したリスクを示す。
本発明の方法は、第1の工程に、被験体由来のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベ
ルを決定する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルで
ある。
生検サンプルを得るための方法は、腫瘍を大きな片に分割する工程、または顕微解剖、
または当該分野で公知の他の細胞分離方法を含む。腫瘍細胞は、さらに、小ゲージ針を用
いた吸引による細胞診によって得ることができる。サンプルの保存および取扱いを単純に
するために、サンプルは、ホルマリン中で固定されて、パラフィンに浸され得るか、また
はまず凍結されて、次いで、急速凍結を可能にする極低温媒体(highly cryo
genic medium)への浸漬によってOCT化合物などの組織凍結媒体に浸され
得る。
好ましい実施形態において、本発明の第1の方法は、c−MAF遺伝子発現レベルだけ
を単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマー
カーの発現レベルを決定する工程も含まない。
当業者が理解するように、遺伝子発現レベルは、上記遺伝子の、または上記遺伝子によ
ってコードされるタンパク質のメッセンジャーRNAレベルならびに上記遺伝子を含むゲ
ノム領域のコピー数または転座数を測定することによって、定量され得る。
この目的のために、生物学的サンプルは、組織または細胞の構造を物理的にまたは機械
的に壊すように処理されて、細胞内の構成要素が核酸を調製するための水溶液中または有
機溶液中に放出され得る。核酸は、当業者に公知の商業的に利用可能な方法によって抽出
される(Sambrook,J.ら、「Molecular Cloning:a La
boratory Manual」,第3版,Cold Spring Harbor
Laboratory Press,N.Y.,1−3巻)。
したがって、c−MAF遺伝子発現レベルは、上記遺伝子の転写に起因するRNA(メ
ッセンジャーRNAまたはmRNA)またはあるいは上記遺伝子の相補DNA(cDNA
)から定量され得る。ゆえに、本発明の特定の実施形態において、c−MAF遺伝子発現
レベルの定量は、c−MAF遺伝子のメッセンジャーRNAもしくは上記mRNAのフラ
グメント、c−MAF遺伝子の相補DNAもしくは上記cDNAのフラグメントまたはそ
れらの混合物の定量を含む。
c−MAF遺伝子によってコードされるmRNAレベルまたはその対応するcDNAの
mRNAレベルを検出するためおよび定量するために、実質的に任意の従来の方法を本発
明の範囲内で使用することができる。非限定的な例証として、上記遺伝子によってコード
されるmRNAレベルは、従来の方法、例えば、mRNA増幅および上記mRNA増幅産
物の定量を含む方法(例えば、電気泳動および染色、またはあるいはサザンブロットおよ
び好適なプローブの使用、ノーザンブロットおよび目的の遺伝子(c−MAF)のmRN
Aの、またはその対応するcDNAの特異的プローブの使用、S1ヌクレアーゼを用いた
マッピング、RT−PCR、ハイブリダイゼーション、マイクロアレイなど)を用いて、
好ましくは、好適なマーカーを使用するリアルタイム定量的PCRによって、定量され得
る。同様に、c−MAF遺伝子によってコードされる上記mRNAに対応するcDNAレ
ベルもまた、従来の技法を用いることによって定量され得る;この場合、本発明の方法は
、対応するmRNAの逆転写(RT)によって、対応するcDNAを合成し、それに続く
増幅および上記cDNA増幅産物の定量のための工程を含む。発現レベルを定量するため
の従来の方法は、例えば、Sambrookら、2001(上掲)に見出すことができる
。これらの方法は、当該分野で公知であり、当業者は、各技法に必要な正規化に精通して
いる。例えば、多重PCRを使用して生成された発現の測定値は、測定された遺伝子の発
現をいわゆる「ハウスキーピング」遺伝子(その発現は、すべてのサンプルにわたって一
定であるはずであるので、比較するためのベースライン発現を提供する)またはその発現
ががんによって調節されると知られている他のコントロール遺伝子と比較することによっ
て正規化されるべきである。
特定の実施形態において、c−MAF遺伝子発現レベルは、定量的ポリメラーゼ連鎖反
応(PCR)またはDNA/RNAアレイまたはヌクレオチドハイブリダイゼーション法
によって定量される。
さらに、c−MAF遺伝子発現レベルは、上記遺伝子によってコードされるタンパク質
、すなわち、c−MAFタンパク質(c−MAF)[NCBI,アクセッション番号O7
5444]またはc−MAFタンパク質の任意の機能的に等価なバリアントの発現レベル
を定量することによっても定量され得る。2つのc−MAFタンパク質アイソフォーム、
403アミノ酸で構成されているαアイソフォーム(NCBI,NP_005351.2
)(配列番号4)および373アミノ酸で構成されているβアイソフォーム(NCBI,
NP_001026974.1)(配列番号5)が存在する。c−MAF遺伝子発現レベ
ルは、いずれかのc−MAFタンパク質アイソフォームの発現レベルを定量することによ
って定量され得る。したがって、特定の実施形態において、c−MAF遺伝子によってコ
ードされるタンパク質のレベルの定量は、c−MAFタンパク質の定量を含む。
本発明の文脈において、「c−MAFタンパク質の機能的に等価なバリアント」は、(
i)アミノ酸残基の1つまたは複数が、保存されたまたは保存されていないアミノ酸残基
(好ましくは、保存されたアミノ酸残基)によって置換された、c−MAFタンパク質(
配列番号4または配列番号5)のバリアント(ここで、そのような置換されたアミノ酸残
基は、遺伝暗号によってコードされるアミノ酸残基であってもよいし、そうでなくてもよ
い)または(ii)1つまたは複数のアミノ酸の挿入または欠失を含みかつc−MAFタ
ンパク質と同じ機能を有する、すなわち、DNA結合転写因子として作用するバリアント
と理解される。c−MAFタンパク質のバリアントは、国際特許出願WO2005/04
6731(その全体が参照により本明細書中に援用される)に示されているような、c−
MAFがインビトロにおける細胞増殖を促進する能力に基づく方法、WO2008098
351(その全体が参照により本明細書中に援用される)に記載されているような、c−
MAFを発現する細胞においてサイクリンD2プロモーターまたはc−MAF応答領域(
MAREまたはc−MAF応答エレメント)を含むプロモーターの支配下のレポーター遺
伝子の転写能力をいわゆるインヒビターが阻止する能力に基づく方法、またはUS200
9048117A(その全体が参照により本明細書中に援用される)に記載されているよ
うな、NFATc2およびc−MAFを発現する細胞においてPMA/イオノマイシンに
よる刺激に応答してIL−4プロモーターの支配下のレポーター遺伝子の発現をいわゆる
インヒビターが阻止する能力に基づく方法を用いて同定され得る。
本発明に係るバリアントは、好ましくは、いずれかのc−MAFタンパク質アイソフォ
ーム(配列番号4または配列番号5)のアミノ酸配列と少なくとも約50%、少なくとも
約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも
約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも
約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%または少なく
とも約99%の配列類似性を有する。バリアントと先に定義された特定のc−MAFタン
パク質配列との間の類似性の程度は、当業者に広く公知のアルゴリズムおよびコンピュー
タプロセスを用いて決定される。2つのアミノ酸配列間の類似度は、好ましくは、BLA
STPアルゴリズム[BLAST Manual,Altschul,S.ら、NCBI
NLM NIH Bethesda,Md.20894,Altschul,S.ら、
J.Mol.Biol.215:403−410(1990)]を用いて決定される。
c−MAFタンパク質発現レベルは、被験体由来のサンプル中の上記タンパク質の検出
および定量を可能にする任意の従来の方法によって定量され得る。非限定的な例証として
、上記タンパク質レベルは、例えば、c−MAF結合能を有する抗体(または抗原決定基
を含むそのフラグメント)を使用し、続いて、形成された複合体を定量することによって
、定量され得る。これらのアッセイにおいて使用される抗体は、標識されていてもよいし
、されていなくてもよい。使用され得るマーカーの例証的な例としては、放射性同位体、
酵素、フルオロフォア、化学発光試薬、酵素基質または補因子、酵素インヒビター、粒子
、色素などが挙げられる。標識されていない抗体(一次抗体)および標識された抗体(二
次抗体)を使用する本発明において使用され得る幅広い公知のアッセイがある;これらの
技法としては、ウエスタンブロットまたはウエスタントランスファー、ELISA(酵素
結合免疫吸着測定法)、RIA(ラジオイムノアッセイ)、競合EIA(競合酵素免疫測
定法)、DAS−ELISA(二重抗体サンドイッチELISA)、免疫細胞化学的およ
び免疫組織化学的技法、特異的抗体を含むタンパク質マイクロアレイもしくはバイオチッ
プの使用に基づく技法、またはディップスティックなどの形式でのコロイド沈殿に基づく
アッセイが挙げられる。上記c−MAFタンパク質を検出するためおよび定量するための
他の方法としては、アフィニティークロマトグラフィー法、リガンド結合アッセイなどが
挙げられる。免疫学的方法が使用されるとき、c−MAFタンパク質に高親和性で結合す
ると知られている任意の抗体または試薬が、その量を検出するために使用され得る。それ
にもかかわらず、抗体、例えば、ポリクローナル血清、ハイブリドーマの上清またはモノ
クローナル抗体、抗体フラグメント、Fv、Fab、Fab’およびF(ab’)2、s
cFv、ヒト化ダイアボディ、トリアボディ(triabody)、テトラボディ(te
trabody)、ナノボディ、アルファボディ、ステープルド(stapled)ペプ
チド、シクロペプチドおよび抗体の使用が、好ましい。本発明の状況において使用され得
る市販の抗c−MAFタンパク質抗体は、販売されている(例えば、抗体ab427、a
b55502、ab55502、ab72584、ab76817、ab77071(A
bcam plc,330 Science Park,Cambridge CB4
0FL,United Kingdom)、AbD SerotecのO75444モノ
クローナル抗体(マウス抗ヒトMAFアジド不含モノクローナル抗体、非結合体化、クロ
ーン6b8(Mouse Anti−Human MAF Azide free Mo
noclonal antibody,Unconjugated,Clone 6b8
))など)。抗c−MAF抗体を提供している多くの営利会社がある(例えば、Abno
va Corporation、Bethyl Laboratories、Santa
Cruz Biotechnology、Bioworld Technology、
GeneTexなど)。
特定の実施形態において、c−MAFタンパク質レベルは、ウエスタンブロット、EL
ISAまたはタンパク質アレイによって定量される。
別の特定の実施形態において、c−MAFタンパク質レベルは、エキソソームまたは循
環(circulating)DNAから定量される。エキソソームは、インビボおよび
インビトロにおいてほとんどの細胞型によって分泌される40〜100nmの膜ベシクル
である。エキソソームは、コンパートメントの内腔に内向きに出芽することによって、多
胞体(MVB)と呼ばれるエンドソームの特定の集団として形成する。MVBと原形質膜
とが融合すると、これらの内部ベシクルが分泌される。エキソソームは、当該分野で周知
のいくつかの方法によって多種多様な細胞系または体液から単離され得る(Thery
C.ら、Curr Protoc Cell Biol.2006 Apr;Chapt
er 3:Unit 3.22)(その全内容が、本明細書中に参照により援用される)
。ExoQuickTMまたはExoTestTMなどのいくつかの市販キットが、エキ
ソソームを単離するために利用可能である。
本発明の第1の方法は、第2の工程に、被験体由来のサンプル(例えば、腫瘍サンプル
)において得られたc−MAF遺伝子発現レベルを参照値と比較する工程を含む。
いったん、乳がん、例えば、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあ
るいはER+乳がんを有する被験体由来のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルが、
測定されて、参照値と比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、上記参照値と比較して
上昇している場合、上記被験体は、骨転移を起こす傾向がより高いと結論づけられ得る。
c−MAF遺伝子発現レベルの決定は、参照値と相関するはずである。
ある実施形態において、本明細書中で意図されるような参照値(複数可)は、c−MA
Fの絶対量を伝達し得る。別の実施形態において、試験されている被験体由来のサンプル
中のいずれか1つまたは複数のバイオマーカーの量は、参照値と直接比べて決定され得る
(例えば、増加もしくは減少または増加率もしくは減少率に関して)。有益なことに、こ
れにより、いずれの1つまたは複数のバイオマーカーのそれぞれの絶対量を最初に決定す
る必要なく、被験体由来のサンプル中の該1つまたは複数のバイオマーカーの量を参照値
と比較すること(換言すれば、参照値に対する被験体由来のサンプル中のいずれか1つま
たは複数のバイオマーカーの相対量を測定すること)が可能になり得る。
好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサンプルまたは参照サンプルにお
けるc−MAF遺伝子発現レベルである。解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コント
ロールサンプルまたは参照サンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、予後が評価
されるべき事象において、参照サンプルは、転移していないトリプルネガティブ(基底細
胞様を含む)乳がんもしくはあるいはER+乳がんを有する被験体由来のサンプル、また
は転移していないトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんもしくはあるいはER
+乳がんを有する被験体由来の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定された
c−MAF遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
上記参照サンプルは、代表的には、被験体集団由来の等量のサンプルを合わせることに
よって得られる。一般に、代表的な参照サンプルは、臨床的に十分に考証されている被験
体および転移が無いことが十分に特徴付けられている被験体から得られる。そのようなサ
ンプルでは、バイオマーカー(c−MAF遺伝子)の正常濃度(参照濃度)が、例えば、
参照集団の平均濃度を提供することによって決定され得る。マーカーの参照濃度を決定す
る場合に、様々な考慮がなされる。そのような考慮すべき事柄は、患者の年齢、体重、性
別、全般的な身体的状態などである。例えば、好ましくは、上記の考慮すべき事柄に従っ
て、例えば、様々な年齢カテゴリーに従って分類された、等量の少なくとも約2人、少な
くとも約10人、少なくとも約100人から好ましくは、約1000人を超える被験体の
群が、参照群としてみなされる。参照レベルが由来するサンプル集合は、好ましくは、そ
の研究の患者対象と同じタイプのがんに罹患している被験体によって形成される。
特定の実施形態において、c−MAF発現の「上昇した」または「低下した」発現に対
する参照値は、有している疾患が上で述べられた方法のいずれかによって十分に考証され
た被験体から単離された1つまたはいくつかのサンプルにおいてアッセイを行うことを含
む従来の手段によってc−MAF発現レベルのパーセンタイルを計算することによって決
定される。次いで、c−MAFの「低下した」レベルは、好ましくは、c−MAF発現レ
ベルが正常集団における50パーセンタイル以下である(例えば、正常集団における60
パーセンタイル以下、正常集団における70パーセンタイル以下、正常集団における80
パーセンタイル以下、正常集団における90パーセンタイル以下および正常集団における
95パーセンタイル以下である発現レベルを含む)サンプルに対して割り当てられ得る。
次いで、「上昇した」c−MAF遺伝子発現レベルは、好ましくは、c−MAF遺伝子発
現レベルが正常集団における50パーセンタイル以上である(例えば、正常集団における
60パーセンタイル以上、正常集団における70パーセンタイル以上、正常集団における
80パーセンタイル以上、正常集団における90パーセンタイル以上および正常集団にお
ける95パーセンタイル以上である発現レベルを含む)サンプルに対して割り当てられ得
る。
当業者は、原発性乳房腫瘍が転移する傾向の予測が、同定されるすべての被験体(すな
わち、被験体の100%)に対して正しくある必要はないことを理解する。それにもかか
わらず、その用語は、被験体の統計学的に有意な一部(例えば、コホート研究におけるコ
ホート)の同定を可能にすることを必要とする。ある一部が統計学的に有意であるかどう
かは、当業者によって、様々な周知の統計評価ツール、例えば、信頼区間の決定、p値の
決定、スチューデントt検定、マン・ホイットニー検定などを使用する単純な様式で決定
され得る。詳細は、DowdyおよびWearden,Statistics for
Research,John Wiley and Sons,New York 19
83に提供されている。好ましい信頼区間は、少なくとも90%、少なくとも95%、少
なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%である。p値は、好ましくは
、0.1、0.05、0.01、0.005または0.0001である。より好ましくは
、集団の被験体の少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%または少なく
とも90%が、本発明の方法によって適切に同定され得る。
なおも別の実施形態において、骨への転移は、溶骨性骨転移である。
なおも別の実施形態において、平均より高いc−MAFの発現レベルは、骨転移の上昇
したリスクを示し、上記リスクは、c−MAF発現のレベルに比例する。したがって、乳
がんに罹患している被験体における骨転移のリスクは、用量依存的である。
c−MAFの発現レベルに基づいて、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん
またはあるいはER+乳がんからの骨転移に罹患している患者の臨床転帰を予測するため
の方法
別の態様において、本発明は、骨転移性トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳が
んまたはあるいは骨転移性ER+骨がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するための
インビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第2の方法)に関し、その方法は:
i)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程、および
ii)工程i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、上記参照値と比較して上昇した上記遺伝子の発現レベルは、不良な臨床
転帰を示す。
本発明の第2の方法は、第1の工程に、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳が
んまたはあるいはER+乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子発
現レベルを定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サン
プルである。
好ましい実施形態において、本発明の第2の方法は、c−MAF遺伝子発現レベルだけ
を単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマー
カーの発現レベルを決定する工程も含まない。
第2の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたc−MAF遺伝子発現レ
ベルは、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサン
プル中の上記遺伝子の発現レベルである。c−MAF遺伝子発現レベルの決定は、コント
ロールサンプルまたは参照サンプルの値と相関するはずである。解析されるべき腫瘍のタ
イプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し得る。したがって、本発明の
第2の方法を含む場合において、参照サンプルは、骨転移に罹患していない乳がんを有す
る被験体のサンプルまたは転移に罹患していない乳がんを有する被験体の生検サンプルの
腫瘍組織コレクションにおいて測定されたc−MAF遺伝子発現レベルの中央値に対応す
るサンプルである。
いったん、サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルが、測定されて、コントロールサ
ンプルと比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、コントロールサンプル中の発現レベ
ルと比較して上昇している場合、それは、不良な臨床転帰を示す。
具体的な実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
別の具体的な実施形態において、c−MAF遺伝子発現レベルの定量は、上記遺伝子の
メッセンジャーRNA(mRNA)または上記mRNAのフラグメント、上記遺伝子の相
補DNA(cDNA)または上記cDNAのフラグメントを定量する工程を含む。より好
ましい実施形態において、発現レベルは、定量的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)または
DNAアレイもしくはRNAアレイにより定量される。
別の実施形態において、c−MAF遺伝子発現レベルの定量は、上記遺伝子によってコ
ードされるタンパク質またはそのバリアントのレベルを定量する工程を含む。なおもより
好ましい実施形態において、タンパク質レベルは、ウエスタンブロット、免疫組織化学検
査、ELISAまたはタンパク質アレイにより決定される。
別の実施形態において、参照サンプルは、転移に罹患していない被験体由来のトリプル
ネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がんの腫瘍組織サンプル
である。
患者の臨床転帰の決定のために広く認められている任意のパラメータが、本発明におい
て使用され得、それらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・本明細書中で使用されるとき、研究中の期間に疾患を再発しなかった完全寛解の被験体
の比率のことを記載する、無病進行。
・本明細書とともに使用されるとき、被験体が疾患の兆候なしに生存している、その疾患
に対する処置後の時間の長さと理解される、無病生存率(DFS)。
・本発明において使用されるとき、完全奏効または部分奏効がみとめられる処置された被
験体の比率のことを記載する、客観的奏効。
・本発明において使用されるとき、6ヶ月以上、完全奏効、部分奏効、低奏功(mino
r response)または安定病態がみとめられる、処置された被験体の比率に関す
る、腫瘍制御(tumour control)。
・本明細書中で使用されるとき、処置開始からがんの成長が最初に決定されるまでの時間
と定義される、無進行生存期間。
・本明細書中で使用されるとき、疾患が処置された後、疾患が悪化し始めるまでの時間に
関する、進行までの期間(TTP)。用語「進行」は、先に定義されている。
・本明細書中で使用されるとき、治療の開始後、最初の6ヶ月で進行しない被験体のパー
センテージに関する、6ヶ月無進行生存率または「PFS6」率、および
・本明細書中で使用されるとき、研究に登録された被験体の半数が未だ生存している時間
に関する、生存期間中央値。
用語「不良」または「良好」は、本明細書中で使用されるとき、被験体が好ましいまた
は好ましくない転帰を示すことを意味する臨床転帰のことを指す。当業者によって理解さ
れるように、そのような確率の評価は、診断される被験体の100%に対して正しいこと
が好ましいが、正しくない場合もある。しかしながら、この用語は、被験体の統計学的に
有意な一部が、所与の転帰についての素因を有すると同定され得ることを要求する。ある
一部が統計学的に有意であるかどうかは、当業者によって、様々な周知の統計評価ツール
、例えば、信頼区間の決定、p値の決定、スチューデントt検定、マン・ホイットニー検
定などを使用して容易に決定され得る。詳細には、DowdyおよびWearden,S
tatistics for Research,John Wiley & Sons
,New York 1983に見出される。好ましい信頼区間は、少なくとも約50%
、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%
、少なくとも約95%である。p値は、好ましくは、0.05、0.01、0.005も
しくは0.0001またはそれ未満である。より好ましくは、集団の被験体の少なくとも
約60パーセント、少なくとも約70パーセント、少なくとも約80パーセントまたは少
なくとも約90パーセントが、本発明の方法によって適切に同定され得る。
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳房腫瘍もしくはあるいはER+乳房腫瘍、
またはSrc応答性シグネチャ(SrcResponsiveSignature)+も
しくはHER2+乳房腫瘍を有する患者において個別化治療をデザインするための方法
当該分野において公知であるように、がんに罹患している被験体に施されるべき処置は
、後者が悪性腫瘍であるかどうか、すなわち、それが転移を起こす高い確率を有するかど
うか、または後者が良性の腫瘍であるかどうかに左右される。第1の仮定では、一般に好
まれる処置は、化学療法などの全身性処置であり、第2の仮定では、一般に好まれる処置
は、放射線治療などの局所性処置である。
ゆえに、本発明に記載されるように、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん
細胞またはあるいはER+乳がん細胞におけるc−MAF遺伝子の過剰発現が、骨転移の
存在に関係することを考えれば、c−MAF遺伝子の発現レベルは、上記癌に罹患してい
る被験体に最も適した治療に関して決定するために有用である。
したがって、別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)
乳がんまたはあるいはER+乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザイン
するためのインビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第3の方法)に関し、その方
法は、
i)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、および
ii)i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、その発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場合、上記被験
体は、骨転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格である。その発現
レベルが、上記参照値と比較して上昇していない場合、上記被験体は、骨転移の予防およ
び/または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない。
特定の実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
本発明の第3の方法は、第1の工程に、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳が
んまたはあるいはER+乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子発
現レベルを定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サン
プルである。
別の特定の実施形態において、本発明の第3の方法は、c−MAF遺伝子発現レベルだ
けを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマ
ーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
本発明の第3の方法の場合、サンプルは、被験体の原発腫瘍組織サンプルであり得る。
第2の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたc−MAF遺伝子発現レ
ベルは、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロールサン
プル中の上記遺伝子のc−MAF遺伝子発現レベルである。c−MAF遺伝子発現レベル
の決定は、コントロールサンプルまたは参照サンプルの値と関係づけられるはずである。
解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し得る
。したがって、好ましくは、参照サンプルは、転移していないトリプルネガティブ(基底
細胞様を含む)乳がんもしくはあるいはER+乳がんを有する被験体のサンプル、または
転移していないトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんもしくはあるいはER+
乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたc−M
AF遺伝子発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
いったん、サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルが、測定されて、参照値と比較さ
れたら、上記遺伝子の発現レベルが、参照値と比較して上昇している場合、上記被験体は
、転移の予防(被験体がまだ転移を起こしていない場合)および/または処置(被験体が
すでに転移を受けている場合)を目指す治療を受けるのに適格であると結論づけられ得る
がんが転移していたとき、化学療法、ホルモン処置、免疫療法またはそれらの組み合わ
せを含むがこれらに限定されない全身性処置が使用され得る。さらに、放射線治療および
/または手術が使用され得る。処置の選択は、通常、原発がんのタイプ、サイズ、転移の
位置、患者の年齢、全般的な健康状態、および以前に使用された処置のタイプに左右され
る。
全身性処置は、全身に到達する処置であり、例えば:
・化学療法は、がん細胞を破壊する医薬の使用である。それらの医薬は、通常、経口また
は静脈内の経路によって投与される。時折、化学療法は、放射線処置とともに使用される
。乳がんに対する好適な化学療法処置としては、アントラサイクリン(ドキソルビシン、
エピルビシン、ペグ化リポソームドキソルビシン)、タキサン(パクリタキセル、ドセタ
キセル、アルブミンナノ粒子結合型パクリタキセル)、5−フルオロウラシル(5−FU
持続注入、カペシタビン)、ビンカアルカロイド(ビノレルビン、ビンブラスチン)、ゲ
ムシタビン、白金塩(シスプラチン、カルボプラチン)、シクロホスファミド、エトポシ
ド、および上記の1つまたは複数の組み合わせ、例えば、シクロホスファミド/アントラ
サイクリン +/− 5−フルオロウラシルレジメン(例えば、ドキソルビシン/シクロ
ホスファミド(AC)、エピルビシン/シクロホスファミド、(EC)シクロホスファミ
ド/エピルビシン/5−フルオロウラシル(CEF)、シクロホスファミド/ドキソルビ
シン/5−フルオロウラシル(CAF)、5−フルオロウラシル/エピルビシン/シクロ
ホスファミド(FEC))、シクロホスファミド/メトトレキサート(metothre
xate)/5−フルオロウラシル(CMF)、アントラサイクリン/タキサン(例えば
、ドキソルビシン/パクリタキセルまたはドキソルビシン/ドセタキセル)、ドセタキセ
ル/カペシタビン、ゲムシタビン/パクリタキセル、タキサン/白金レジメン(例えば、
パクリタキセル/カルボプラチンまたはドセタキセル/カルボプラチン)が挙げられるが
これらに限定されない。
・免疫療法は、がんと戦う患者の免疫系自体を助ける処置である。患者における転移を処
置するために使用される免疫療法にはいくつかのタイプがある。これらとしては、サイト
カイン、モノクローナル抗体および抗腫瘍ワクチンが挙げられるがこれらに限定されない
別の態様において、処置は、アルファラディン(ラジウム−223二塩化物)である。
アルファラディンは、がん細胞を殺すために、ラジウム−223の崩壊からのアルファ線
を使用する。ラジウム−223は、天然に、カルシウム模倣物としてのその特性のおかげ
で骨転移に対して自身を標的化する。アルファ線は、2〜10個の細胞という非常に短い
範囲(ベータまたはガンマ線に基づく現行の放射線治療と比べて)を有するので、周囲の
健常な組織(特に骨髄)にもたらす損傷はより少ない。カルシウムとよく似た特性を有す
るので、ラジウム−223は、身体内の骨を構築するためにカルシウムが使用されている
位置(去勢抵抗性の進行前立腺がんを有する男性の骨格転移に見られるようなより速い異
常な骨成長の部位を含む)に引き込まれる。ラジウム−223は、注射後、異常に骨が成
長している部位に血流によって運ばれる。がんが身体内で生じ始めた位置は、原発腫瘍と
して公知である。これらの細胞のうちのいくつかは、離脱して、血流によって身体の別の
部位に運ばれ得る。次いで、それらのがん細胞は、身体のその位置に定着して、新しい腫
瘍を形成し得る。これが起きる場合、それは、二次がんまたは転移と呼ばれる。末期の前
立腺がんを有するほとんどの患者は、骨にその疾患の最大の負担を被る。ラジウム−22
3を用いる目的は、この二次がんを選択的に標的化することである。骨に取り込まれない
任意のラジウム−223は、すみやかに腸へと経路を定められ、排泄される。
別の態様において、処置は、mTorインヒビターである。いくつかの態様において、
mTorインヒビターは、mTor/PI3キナーゼの二重インヒビターである。いくつ
かの態様において、mTorインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために
使用される。いくつかの態様において、mTorインヒビターは:ABI009(シロリ
ムス)、ラパマイシン(シロリムス)、Abraxane(パクリタキセル)、Abso
rb(エベロリムス)、Afinitor(エベロリムス)、Gleevecと併用のA
finitor、AS703026(ピマセルチブ(pimasertib))、Axx
ess(ウミロリムス(umirolimus))、AZD2014、BEZ235、B
iofreedom(ウミロリムス)、BioMatrix(ウミロリムス)、BioM
atrix flex(ウミロリムス)、CC115、CC223、Combo Bio
−engineered Sirolimus Eluting Stent ORBU
SNEICH(シロリムス)、Curaxin CBLC102(メパクリン)、DE1
09(シロリムス)、DS3078、Endeavor DES(ゾタロリムス)、En
deavor Resolute(ゾタロリムス)、Femara(レトロゾール)、H
ocena(アントロキノノール(antroquinonol))、INK128、I
nspiron(シロリムス)、IPI504(レタスピマイシン(retaspimy
cin)塩酸塩)、KRN951(チボザニブ(tivozanib))、ME344、
MGA031(テプリズマブ(teplizumab))、MiStent SES(シ
ロリムス)、MKC1、Nobori(ウミロリムス)、OSI027、OVI123(
コルジセピン)、Palomid 529、PF04691502、Promus El
ement(エベロリムス)、PWT33597、Rapamune(シロリムス)、R
esolute DES(ゾタロリムス)、RG7422、SAR245409、SF1
126、SGN75(ボルセツズマブマホドチン(vorsetuzumab mafo
dotin))、Synergy(エベロリムス)、Taltorvic(リダフォロリ
ムス(ridaforolimus))、Tarceva(エルロチニブ)、Toris
el(テムシロリムス)、Xience Prime(エベロリムス)、Xience
V(エベロリムス)、Zomaxx(ゾタロリムス)、Zortress(エベロリムス
)、ゾタロリムス溶出性末梢ステント(Peripheral Stent)MEDTR
ONIC(ゾタロリムス)、AP23841、AP24170、ARmTOR26、BN
107、BN108、Canstatin GENZYME(カンスタチン(canst
atin))、CU906、EC0371、EC0565、KI1004、LOR220
、NV128、Rapamycin ONCOIMMUNE(シロリムス)、SB260
2、Sirolimus PNP SAMYANG BIOPHARMACEUTICA
LS(シロリムス)、TOP216、VLI27、VS5584、WYE125132、
XL388、Advacan(エベロリムス)、AZD8055、Cypher Sel
ect Plus シロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、Cypher シ
ロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、薬物コーティングされたバルーン(シロ
リムス)、E−Magic Plus(シロリムス)、Emtor(シロリムス)、Es
prit(エベロリムス)、Evertor(エベロリムス)、HBF0079、LCP
−Siro(シロリムス)、Limus CLARIS(シロリムス)、mTORインヒ
ビター CELLZOME、Nevo シロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)
、nPT−mTOR、Rapacan(シロリムス)、Renacept(シロリムス)
、ReZolve(シロリムス)、Rocas(シロリムス)、SF1126、Siro
lim(シロリムス)、Sirolimus NORTH CHINA(シロリムス)、
Sirolimus RANBAXY(シロリムス)、Sirolimus WATSO
N(シロリムス)Siropan(シロリムス)、Sirova(シロリムス)、Sup
ralimus(シロリムス)、Supralimus−Core(シロリムス)、Ta
crolimus WATSON(タクロリムス)、TAFA93、Temsiroli
mus ACCORD(テムシロリムス)、Temsirolimus SANDOZ(
テムシロリムス)、TOP216、Xience Prime(エベロリムス)、Xie
nce V(エベロリムス)からなる群より選択される。具体的な態様において、mTo
rインヒビターは、Afinitor(エベロリムス)(http://www.afi
nitor.com/index.jsp?usertrack.filter_app
lied=true&NovaId=4029462064338207963;最終ア
クセス日2012年11月28日)である。別の態様において、エベロリムスは、アロマ
ターゼインヒビターと組合わされる(例えば、Baselga,J.ら、Everoli
mus in Postmenopausal Hormone−Receptor P
ositive Advanced Breast Cancer.2012.N.En
gl.J.Med.366(6):520−529(これは本明細書中で参照により援用
される)を参照のこと)。別の態様において、mTorインヒビターは、当該分野で公知
の方法によって特定され得る(例えば、Zhou,H.ら、Updates of mT
or inhibitors.2010.Anticancer Agents Med
.Chem.10(7):571−81(これは本明細書中で参照により援用される)を
参照のこと)。いくつかの態様において、mTorインヒビターは、ホルモンレセプター
が陽性である患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために
使用される(例えば、Baselga,J.ら、Everolimus in Post
menopausal Hormone−Receptor Positive Adv
anced Breast Cancer.2012.N.Engl.J.Med.36
6(6):520−529を参照のこと)。いくつかの実施形態において、患者は、ER
+である。いくつかの態様において、mTorインヒビターは、進行乳がんを有する患者
において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いく
つかの態様において、mTorインヒビターは、第2の処置と組み合わせて使用される。
いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
別の態様において、処置は、Srcキナーゼインヒビターである。いくつかの態様にお
いて、Srcインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。い
くつかの態様において、Srcキナーゼインヒビターは、以下の群:AZD0530(サ
ラカチニブ(saracatinib))、Bosulif(ボスチニブ(bosuti
nib))、ENMD981693、KD020、KX01、Sprycel(ダサチニ
ブ(dasatinib))、Yervoy(イピリムマブ(ipilimumab))
、AP23464、AP23485、AP23588、AZD0424、c−Srcキナ
ーゼインヒビター KISSEI、CU201、KX2361、SKS927、SRN0
04、SUNK706、TG100435、TG100948、AP23451、Das
atinib HETERO(ダサチニブ)、Dasatinib VALEANT(ダ
サチニブ)、Fontrax(ダサチニブ)、Srcキナーゼインヒビター KINEX
、VX680(トザセルチブ(tozasertib)乳酸塩)、XL228およびSU
NK706から選択される。いくつかの実施形態において、Srcキナーゼインヒビター
は、ダサチニブである。別の態様において、Srcキナーゼインヒビターは、当該分野で
公知の方法によって特定され得る(例えば、Sen,B.and Johnson,F.
M.Regulation of Src Family Kinases in Hu
man Cancers.2011.J.Signal Transduction.2
011:14 pages(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)
。いくつかの態様において、Srcキナーゼインヒビターは、SRC応答性シグネチャ(
SRS)が陽性である患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害す
るために使用される。いくつかの態様において、患者は、SRS+かつER−である(例
えば、Zhang,CH.−F,ら、Latent Bone Metastasis
in Breast Cancer Tied to Src−Dependent s
urvival signals.2009.Cancer Cell.16:67−7
8(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつかの態様におい
て、Srcキナーゼインヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するた
めまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、Sr
cキナーゼインヒビターは、第2の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様にお
いて、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
別の態様において、処置は、COX−2インヒビターである。いくつかの態様において
、COX−2インヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。い
くつかの態様において、COX−2インヒビターは、以下の群:ABT963、Acet
aminophen ER JOHNSON(アセトアミノフェン)、Acular X
(ケトロラクトロメタミン)、BAY1019036(アスピリン)、BAY98711
1(ジフェンヒドラミン、ナプロキセンナトリウム)、BAYl1902(ピロキシカム
)、BCIBUCH001(イブプロフェン)、Capoxigem(アプリコキシブ(
apricoxib))、CS502、CS670(ペルビプロフェン(pelubip
rofen))、Diclofenac HPBCD(ジクロフェナク)、Diract
in(ケトプロフェン)、GW406381、HCT1026(ニトロフルルビプロフェ
ン(nitroflurbiprofen))、Hyanalgese−D(ジクロフェ
ナク)、HydrocoDex(アセトアミノフェン、デキストロメトルファン、ヒドロ
コドン)、Ibuprofen Sodium PFIZER(イブプロフェンナトリウ
ム)、Ibuprofen with Acetaminophen PFIZER(ア
セトアミノフェン、イブプロフェン)、Impracor(ケトプロフェン)、IP88
0(ジクロフェナク)、IP940(インドメタシン)、ISV205(ジクロフェナク
ナトリウム)、JNS013(アセトアミノフェン、トラマドール塩酸塩)、Ketop
rofen TDS(ケトプロフェン)、LTNS001(ナプロキセンエテメシル(n
aproxen etemesil))、Mesalamine SALIX(メサラミ
ン)、Mesalamine SOFAR(メサラミン)、Mesalazine(メサ
ラミン)、ML3000(リコフェロン(licofelone))、MRX7EAT(
エトドラク)、Naproxen IROKO(ナプロキセン)、NCX4016(ニト
ロアスピリン)、NCX701(ニトロアセトアミノフェン)、Nuprin SCOL
R(イブプロフェン)、OMS103HP(アミトリプチリン塩酸塩、ケトプロフェン、
オキシメタゾリン塩酸塩)、Oralease(ジクロフェナク)、OxycoDex(
デキストロメトルファン、オキシコドン)、P54、PercoDex(アセトアミノフ
ェン、デキストロメトルファン、オキシコドン)、PL3100(ナプロキセン、ホスフ
ァチジルコリン)、PSD508、R−Ketoprofen(ケトプロフェン)、Re
mura(ブロムフェナクナトリウム)、ROX828(ケトロラクトロメタミン)、R
P19583(ケトプロフェンリジン)、RQ00317076、SDX101(R−エ
トドラク)、TDS943(ジクロフェナクナトリウム)、TDT070(ケトプロフェ
ン)、TPR100、TQ1011(ケトプロフェン)、TT063(S−フルルビプロ
フェン)、UR8880(シミコキシブ(cimicoxib))、V0498TA01
A(イブプロフェン)、VT122(エトドラク、プロプラノロール)、XP20B(ア
セトアミノフェン、デキストロプロポキシフェン)、XP21B(ジクロフェナクカリウ
ム)、XP21L(ジクロフェナクカリウム)、Zoenasa(アセチルシステイン、
メサラミン)、Acephen、Actifed Plus、Actifed−P、Ac
ular、Acular LS、Acular PF、Acular X、Acuvai
l、Advil、Advil Allergy Sinus、Advil Cold a
nd Sinus、Advil Congestion Relief、Advil P
M、Advil PM Capsule、Air Salonpas、Airtal、A
lcohol−Free NyQuil Cold & Flu Relief、Ale
ve、Aleve ABDI IBRAHIM、Aleve−D、Alka−Seltz
er、Alka−Seltzer BAYER、Alka−Seltzer Extra
Strength、Alka−Seltzer Lemon−Lime、Alka−S
eltzer Original、Alka−Seltzer Plus、Alka−S
eltzer plus Cold and Cough、Alka−Seltzer
plus Cold and Cough Formula、Alka−Seltzer
Plus Day and Night Cold Formula、Alka−Se
ltzer Plus Day Non−Drowsy Cold Formula、A
lka−Seltzer Plus Flu Formula、Alka−Seltze
r Plus Night Cold Formula、Alka−Seltzer P
lus Sinus Formula、Alka−Seltzer Plus Spar
kling Original Cold Formula、Alka−Seltzer
PM、Alka−Seltzer Wake−Up Call、Anacin、Ana
prox、Anaprox MINERVA、Ansaid、Apitoxin、Apr
anax、Apranax abdi、Arcoxia、Arthritis Form
ula Bengay、Arthrotec、Asacol、Asacol HD、As
acol MEDUNA ARZNEIMITTEL、Asacol ORIFARM、
Aspirin BAYER、Aspirin Complex、Aspirin Mi
gran、AZD3582、Azulfidine、Baralgan M、BAY10
19036、BAY987111、BAYl1902、BCIBUCH001、Bena
dryl Allergy、Benadryl Day and Night、Beny
lin 4 Flu、Benylin Cold and Flu、Benylin C
old and Flu Day and Night、Benylin Cold a
nd Sinus Day and Night、Benylin Cold and
Sinus Plus、Benylin Day and Night Cold an
d Flu Relief、Benylin1 All−In−One、Brexin、
Brexin ANGELINI、Bromday、Bufferin、Buscopa
n Plus、Caldolor、Calmatel、Cambia、Canasa、C
apoxigem、Cataflam、Celebrex、Celebrex ORIF
ARM、Children’s Advil Allergy Sinus、Child
ren’s Tylenol、Children’s Tylenol Cough a
nd Runny Nose、Children’s Tylenol plus co
ld、Children’s Tylenol plus Cold and Coug
h、Children’s Tylenol plus cold and stuff
y nose、Children’s Tylenol plus Flu、Child
ren’s Tylenol plus cold & allergy、Childr
en’s Tylenol plus Cough & Runny Nose、Chi
ldren’s Tylenol plus Cough & Sore Throat
、Children’s Tylenol plus multi symptom c
old、Clinoril、Codral Cold and Flu、Codral
Day and Night Day Tablets、Codral Day and
Night Night Tablets、Codral Nightime、Col
azal、Combunox、Contac Cold plus Flu、Conta
c Cold plus Flu Non−Drowsy、Coricidin D、C
oricidin HBP Cold and Flu、Coricidin HBP
Day and Night Multi−Symptom Cold、Coricid
in HBP Maximum Strength Flu、Coricidin HB
P Nighttime Multi−Symptom Cold、Coricidin
II Extra Strength Cold and Flu、CS502、CS
670、Daypro、Daypro Alta、DDS06C、Demazin Co
ld and Flu、Demazin Cough、Cold and Flu、De
mazin day/night Cold and Flu、Demazin PE
Cold and Flu、Demazin PE day/night Cold a
nd Flu、Diclofenac HPBCD、Dimetapp Day Rel
ief、Dimetapp Multi−Symptom Cold and Flu、
Dimetapp Night Relief、Dimetapp Pain and
Fever Relief、Dimetapp PE Sinus Pain、Dime
tapp PE Sinus Pain plus Allergy、Dipentum
、Diractin、Disprin Cold ’n’ Fever、Disprin
Extra、Disprin Forte.Disprin Plus、Drista
n Cold、Dristan Junior、Drixoral Plus、Duex
is、Dynastat、Efferalgan、Efferalgan Plus V
itamin C、Efferalgan Vitamin C、Elixsure I
B、Excedrin Back and Body、Excedrin Migrai
ne、Excedrin PM、Excedrin Sinus Headache、E
xcedrin Tension Headache、Falcol、Fansamac
、Feldene、FeverAll、Fiorinal、Fiorinal with
Codeine、Flanax、Flector Patch、Flucam、For
tagesic、Gerbin、Giazo、Gladio、Goody’s Back
and Body Pain、Goody’s Cool Orange、Goody
’s Extra Strength、Goody’s PM、Greaseless
Bengay、GW406381、HCT1026、He Xing Yi、Hyana
lgese−D、HydrocoDex、Ibuprofen Sodium PFIZ
ER、Ibuprofen with、Acetaminophen PFIZER、I
cy Hot SANOFI AVENTIS、Impracor、Indocin、I
ndomethacin APP PHARMA、Indomethacin MYLA
N、Infants’ Tylenol、IP880、IP940、Iremod、IS
V205、JNS013、Jr.Tylenol、Junifen、Junior St
rength Advil、Junior Strength Motrin、Keto
profen TDS、Lemsip Max、Lemsip Max All in
One、Lemsip Max All Night、Lemsip Max Cold
and Flu、Lialda、Listerine Mouth Wash、Llo
yds Cream、Lodine、Lorfit P、Loxonin、LTNS00
1、Mersyndol、Mesalamine SALIX、Mesalamine
SOFAR、Mesalazine、Mesasal GLAXO、Mesasal S
ANOFI、
Mesulid、Metsal Heat Rub、Midol Complete、M
idol Extended Relief、Midol Liquid Gels、M
idol PM、Midol Teen Formula、Migranin COAT
ED TABLETS、ML3000、Mobic、Mohrus、Motrin、Mo
trin Cold and Sinus Pain、Motrin PM、Moval
is ASPEN、MRX7EAT、Nalfon、Nalfon PEDINOL、N
aprelan、Naprosyn、Naprosyn RPG LIFE SCIEN
CE、Naproxen IROKO、NCX4016、NCX701、NeoProf
en LUNDBECK、Nevanac、Nexcede、Niflan、Norge
sic MEDICIS、Novalgin、Nuprin SCOLR、Nurofe
n、Nurofen Cold and Flu、Nurofen Max Stren
gth Migraine、Nurofen Plus、Nuromol、NyQuil
with Vitamin C、Ocufen、OMS103HP、Oralease
、Orudis ABBOTT JAPAN、Oruvail、Osteluc、Oxy
coDex、P54、Panadol、Panadol Actifast、Parad
ine、Paramax、Parfenac、Pedea、Pennsaid、Pent
asa、Pentasa ORIFARM、Peon、Percodan、Percod
an−Demi、PercoDex、Percogesic、Perfalgan、PL
2200、PL3100、Ponstel、Prexige、Prolensa、PSD
508、R−Ketoprofen、Rantudil、Relafen、Remura
、Robaxisal、Rotec、Rowasa、ROX828、RP19583、R
Q00317076、Rubor、Salofalk、Salonpas、Sarido
n、SDX101、Seltouch、sfRowasa、Shinbaro、Sinu
max、Sinutab、Sinutab、sinus、Spalt、Sprix、St
refen、Sudafed Cold and Cough、Sudafed Hea
d Cold and Sinus、Sudafed PE Cold plus Co
ugh、Sudafed PE Pressure plus Pain、Sudafe
d PE、Severe Cold、Sudafed PE Sinus Day pl
us Night Relief Day Tablets、Sudafed PE S
inus Day plus Night Relief Night Tablets
、Sudafed PE Sinus plus Anti−inflammatory
Pain Relief、Sudafed Sinus Advance、Surga
m、Synalgos−DC、Synflex、Tavist allergy/sin
us/headache、TDS943、TDT070、Theraflu Cold
and Sore Throat、Theraflu Daytime Severe
Cold and Cough、Theraflu Daytime Warming
Relief,Theraflu Warming Relief Caplets D
aytime Multi−Symptom Cold、Theraflu Warmi
ng Relief Cold and Chest Congestion、Thom
apyrin、Thomapyrin C、Thomapyrin Effervesc
ent、Thomapyrin Medium、Tilcotil、Tispol、To
lectin、Toradol、TPR100、TQ1011、Trauma−Salb
e、Trauma−Salbe Kwizda、Treo、Treximet、Trov
ex、TT063、Tylenol、Tylenol Allergy Multi−S
ymptom、Tylenol Back Pain、Tylenol Cold &
Cough Daytime、Tylenol Cold & Cough Night
time、Tylenol Cold and Sinus Daytime、Tyle
nol Cold and Sinus Nighttime、Tylenol Col
d Head Congestion Severe、Tylenol Cold Mu
lti Symptom Daytime、Tylenol Cold Multi S
ymptom Nighttime Liquid、Tylenol Cold Mul
ti Symptom Severe、Tylenol Cold Non−Drows
iness Formula、Tylenol Cold Severe Conges
tion Daytime、Tylenol Complete Cold,Cough
and Flu Night time、Tylenol Flu Nighttim
e、Tylenol Menstrual、Tylenol PM、Tylenol S
inus Congestion & Pain Daytime、Tylenol S
inus Congestion & Pain Nighttime、Tylenol
Sinus Congestion & Pain Severe、Tylenol
Sinus Severe Congestion Daytime、Tylenol
Ultra Relief、Tylenol with Caffeine and C
odeine phosphate、Tylenol with Codeine ph
osphate、Ultra Strength Bengay Cream、Ultr
acet、UR8880、V0498TA01A、Vicks NyQuil Cold
and Flu Relief、Vicoprofen、Vimovo、Voltar
en Emulgel、Voltaren GEL、Voltaren NOVARTI
S CONSUMER HEALTH GMBH、Voltaren XR、VT122
、Xefo、Xefo Rapid、Xefocam、Xibrom、XL3、Xodo
l、XP20B、XP21B、XP21L、ZipsorおよびZoenasaから選択
される。別の態様において、COX−2インヒビターは、当該分野で公知の方法によって
特定され得る(例えば、Dannhardt,G.and Kiefer,W.Cycl
ooxygenase inhibitors−current status and
future prospects.2001.Eur.J.Med.Chem.36
:109−126(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつ
かの態様において、COX−2インヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を
処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様にお
いて、COX−2インヒビターは、第2の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態
様において、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。いくつかの態様
において、COX−2インヒビターは、デノスマブ、Zometa(http://ww
w.us.zometa.com/index.jsp?usertrack.filt
er_applied=true&NovaId=29353769344676336
33;最終アクセス日2012年12月2日)、CarbozantinibまたはCa
bozantinib、PTHLH(副甲状腺ホルモン様ホルモン)またはPTHrP(
副甲状腺ホルモン関連タンパク質)を阻止する抗体またはペプチドおよびEveroli
musからなる群より選択される第2の処置と組み合わせて使用される。
別の態様において、骨分解を回避するためおよび/または予防するために使用される処
置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・副甲状腺ホルモン(PTH)インヒビターおよび副甲状腺様ホルモン(PTHLH)イ
ンヒビター(阻止抗体を含む)またはそれらの組換え型(PTHのアミノ酸7〜34に対
応するテリパラチド)。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによ
って作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細
胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤(dual action bone age
nts)」(DABA)と呼ばれる薬物の群の一部を形成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子(modulator)」(SERM)は、機序に
関係なくエストロゲンがレセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のこ
とを指す。エストロゲンレセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロ
ゲスターゲン、エストラジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェ
ン(lasofoxifene)、TSE−424、タモキシフェン、イドキシフェン(
idoxifene)、LY353381、LY117081、トレミフェン、フルベス
トラント(fluvestrant)、4−[7−(2,2−ジメチル−1−オキソプロ
ポキシ−4−メチル−2−[4−[2−(1−ピペリジニル)エトキシ]フェニル]−2
H−1−ベンゾピラン−3−イル]−フェニル−2,2−ジメチルプロパノエート 4,
4’ジヒドロキシベンゾフェノン−2,4−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびSH6
46が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カ
ルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん(後者は、乳がんおよび前立腺
がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない)などの、骨吸収および再吸収
を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第5の方法
によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素
含有ビスホスホネート(例えば、パミドロネート、ネリドロネート(neridrona
te)、オルパドロネート(olpadronate)、アレンドロネート、イバンドロ
ネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネート(zoledronate
)またはゾレドロン酸など)および窒素非含有ビスホスホネート(例えば、エチドロネー
ト、クロドロネート、チルドロネートなど)が挙げられるが、これらに限定されない。
・「カテプシンKインヒビター」とは、カテプシンKシステインプロテアーゼ活性に干渉
する化合物のことを指す。カテプシンKインヒビターの非限定的な例としては、4−アミ
ノ−ピリミジン−2−カルボニトリル誘導体(Novartis Pharma GMB
Hの名称下の国際特許出願WO03/020278に記載されている)、公報WO03/
020721(Novartis Pharma GMBH)および公報WO04/00
0843(ASTRAZENECA AB)に記載されているピロロ−ピリミジン、なら
びにAxys Pharmaceuticalsの公報PCT WO00/55126、
Merck Frosst Canada & Co.およびAxys Pharmac
euticalsのWO01/49288に記載されているインヒビターが挙げられる。
・本明細書中で使用されるとき「DKK−1(Dickkopf−1)インヒビター」は
、DKK−1活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。DKK−1は、
主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギ
ュレートされる、可溶性Wnt経路アンタゴニストである。DKK−1を標的化する薬剤
は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患の予防に役割を果たし得る。Novarti
s製のBHQ880は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗DKK−1中和抗体
である。前臨床試験は、BHQ880が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する
溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している(Ettenberg S.ら、Ame
rican Association for Cancer Research An
nual Meeting.April 12−16,2008;San Diego,
Calif.要旨)。
・本明細書中で使用されるとき「METおよびVEGFR2の二重インヒビター」は、M
ETによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路お
よびVEGF経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。METは
、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞(骨を形成する細胞)および破骨細胞(
骨を除去する細胞)においても発現される。HGFは、これらの細胞型のすべてにおいて
METに結合し、MET経路に複数のオートクラインループおよびパラクリンループにお
ける重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるMETの活性化は、転移性の骨病変の確立に
おいて重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるMET経路の活
性化は、異常な骨の成長(すなわち、芽細胞性の病変)または破壊(すなわち、溶解性の
病変)を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、MET経路の標的化は
、転移性の骨病変の確立および進行を予防する実行可能なストラテジーであり得る。以前
はXL184(CAS849217−68−1)として知られていたカボザンチニブ(c
abozantinib)(Exelixis,Inc)は、METによって駆動される
腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力
な二重インヒビターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を
死滅させ、転移を減少させ、血管新生(腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形
成)を阻害することが示されている。別の好適な二重インヒビターは、E7050(N−
[2−フルオロ−4−({2−[4−(4−メチルピペラジン−1−イル)ピペリジン−
1−イル]カルボニルアミノピリジン−4−イル}オキシ)フェニル]−N’−(4−フ
ルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド(2R,3R)−タルトレ
ート)(CAS928037−13−2)またはフォレチニブ(foretinib)(
GSK1363089、XL880、CAS849217−64−7としても知られる)
である。
・本明細書中で使用されるとき「RANKLインヒビター」は、RANK活性を低下させ
ることができる任意の化合物のことを指す。RANKLは、ストローマ細胞およびT−リ
ンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見出され、これらのT−リンパ球細胞は、それを分泌
する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞で
ある破骨細胞の活性化である。RANKLインヒビターは、RANKLがそのレセプター
(RANK)に結合するのを阻止すること、RANK媒介性シグナル伝達を阻止すること
、またはRANKLの転写もしくは翻訳を阻止することによってRANKLの発現を減少
させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したRANKLアンタゴニス
トまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・RANKLに結合することができ、RANKタンパク質の細胞外ドメインの全体または
フラグメントを含む、好適なRANKタンパク質。可溶性RANKは、マウスもしくはヒ
トRANKポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、または
あるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはRANKL結合能を有するそのバリアント。
・RANKL特異的アンチセンス分子。
・RANKLの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗RANKL抗体。「抗RANKL抗体またはRANKLに対し指向する抗体
」は、1つまたは複数のRANKLの機能を阻害する、核因子κBに対する活性化レセプ
ターのリガンド(RANKL)に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書
中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。し
たがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによ
って調製される。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Natu
re,1975,256:495)に記載されている方法を用いて調製される。本発明の
文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな
抗体、フラグメント「Fab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scF
v、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗RANKLナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構
造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療タンパク質である。ナノボディ技術は、ラ
クダ科動物(ラクダおよびラマ)が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の
後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
であり、ここで、FR1からFR4は、フレームワーク領域1〜4であり、CDR1から
CDR3は、相補性決定領域1〜3である。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン(
VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。重要なことには、ク
ローニングされ、単離されたVHHドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有す
る完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新
しく発見されたVHHドメインは、Ablynxがナノボディと名付けた新世代の治療用
抗体の基礎を形成している。
1つの実施形態において、RANKLインヒビターは、RANKL特異的抗体、RAN
KL特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される。具体的な
実施形態において、抗RANKL抗体は、モノクローナル抗体である。なおもより具体的
な実施形態において、抗RANKL抗体は、デノスマブ(denosumab)(Pag
eau,Steven C.(2009).mAbs 1(3):210−215、CA
S番号615258−40−7)(その全内容が本明細書によって参照により援用される
)である。デノスマブは、RANKLに結合して、その活性化を妨げる完全にヒトのモノ
クローナル抗体である(これは、RANKレセプターには結合しない)。デノスマブの様
々な態様が、米国特許第6,740,522号;同第7,411,050号;同第7,0
97,834号;同第7,364,736号(これらの各々の全内容が本明細書によって
その全体において参照により援用される)によって包含されている。別の実施形態におい
て、RANKLインヒビターは、デノスマブと同じエピトープに結合する抗体、抗体フラ
グメントまたは融合構築物。
好ましい実施形態において、抗RANKLナノボディは、WO2008142164(
その内容は参照により本願に援用される)に記載されているようなナノボディのいずれか
である。なおもより好ましい実施形態において、抗RANKL抗体は、ALX−0141
(Ablynx)である。ALX−0141は、閉経後の骨粗鬆症、関節リウマチ(re
umatoid arthritis)、がんおよびある特定の医薬に関連する骨減少を
阻害するように、および健常な骨代謝のバランスを再建するように、デザインされた。
好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネート、RANKL
インヒビター、PTHおよびPTHLHインヒビターまたはPRGアナログ、ラネル酸ス
トロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター
、エストロゲンレセプター調節因子、ラジウム−223カルシトニンならびにカテプシン
Kインヒビターからなる群より選択される。より好ましい実施形態において、骨分解を予
防する薬剤は、ビスホスホネートである。なおもより好ましい実施形態において、ビスホ
スホネートは、ゾレドロン酸である。
1つの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、骨への原発性乳がん腫瘍の転移
を予防するためまたは阻害するために投与される。1つの実施形態において、CCR5ア
ンタゴニストは、大分子である。別の実施形態において、CCR5アンタゴニストは、小
分子である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、マラビロク(m
araviroc)(Velasco−Vela’quez,M.ら、2012.CCR
5 Antagonist Blocks Metastasis of Basal
Breast Cancer Cells.Cancer Research.72:3
839−3850)である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、
ビクリビロク(vicriviroc)(Velasco−Vela’quez,M.ら
、2012.CCR5 Antagonist Blocks Metastasis
of Basal Breast Cancer Cells.Cancer Rese
arch.72:3839−3850)である。いくつかの態様において、CCR5アン
タゴニストは、アプラビロク(aplaviroc)(Demarest J.F.ら、
2005.Update on Aplaviroc:An HIV Entry In
hibitor Targeting CCR5.Retrovirology 2(S
uppl.1):S13)である。いくつかの態様において、CCR5アンタゴニストは
、スピロピペリジンCCR5アンタゴニスト(Rotstein D.M.ら、2009
.Spiropiperidine CCR5 antagonists.Bioorg
anic & Medicinal Chemistry Letters.19(18
):5401−5406)である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニス
トは、INCB009471(Kuritzkes,D.R.2009.HIV−1 e
ntry inhibitors:an overview.Curr.Opin.HI
V AIDS.4(2):82−7)である。
好ましい実施形態において、METおよびVEGFR2の二重インヒビターは、カボザ
ンチニブ、フォレチニブおよびE7050からなる群より選択される。
好ましい実施形態において、ラジウム223治療は、アルファラディンである。
あるいは、転移を処置するためおよび/もしくは予防するために上で述べられた薬剤の
うちの2つ以上の薬剤が組み合わされる組合せ処置が行われ得るか、または上記薬剤は、
他のサプリメント(例えば、カルシウムまたはビタミンD)もしくはホルモン処置と組合
わされ得る。
乳がん患者における早期の骨転移を予測するための方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんなどの乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを決定
するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MA
F遺伝子の発現レベルを決定する工程を含み、ここで、平均値+1標準偏差より高い上記
遺伝子の発現レベルは、早期の骨転移の上昇したリスクを示す。
好ましい実施形態において、骨転移は、非常に早期の骨転移である。
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
「早期の骨転移」は、本明細書中で使用されるとき、乳がんの患者における手術後5年
より前に現れる骨転移に関する。
「非常に早期の骨転移」は、本明細書中で使用されるとき、乳がんの患者における手術
後3年より前に現れる骨転移に関する。
本発明の第4の方法は、第1の工程に、トリプルネガティブ(基底細胞様)乳がんまた
はあるいはER+乳がんなどの乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc−MAF遺
伝子発現レベルを定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組
織サンプルである。
好ましい実施形態において、本発明の第4の方法は、c−MAF遺伝子発現レベルだけ
を単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、
その方法は、いかなる追加のマーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。c−M
AF遺伝子発現レベルは、本発明の第1の方法に対して先に開示されたように定量され得
る。
好ましい実施形態において、乳がんは、基底細胞様乳がんを含むトリプルネガティブ乳
がんまたはあるいはルミナルAおよびBを含むER+乳がんである。
第2の工程において、平均値+1標準偏差より高い上記遺伝子の発現レベルは、早期の
骨転移の上昇したリスクを示す。
「平均レベル」は、本明細書中で使用されるとき、一群の等しくない値の全体的な有意
性を要約するかまたは表す、c−MAF発現レベルの単一の値(平均値、最頻値または中
央値として)に関する。好ましい実施形態において、平均レベルは、乳がん腫瘍の代表的
なコホートから得られる発現レベルの平均に対応する。その患者コホートは、評価しよう
としている個々の患者を代表する年齢によって定義される。
「標準偏差」は、本明細書中で使用されるとき、数値の集合のばらつきの尺度に関する
。例えば、c−MAFの正常な平均レベルに対する標準偏差は、乳房腫瘍サンプルに見出
されるc−MAFレベルの集合のばらつきである。そのデータから離れて広がるほど、偏
差は大きくなる。標準偏差は、度数分布における平均値からの、実測値の平方偏差の平均
値の平方根を求めることによって得ることができる。
いったん、乳がん(例えば、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあ
るいはER+乳がん)を有する被験体由来のサンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルが
、測定されて、平均レベルと比較されたら、上記遺伝子の発現レベルが、平均レベルと比
較して平均+1標準偏差より高い場合、上記被験体は、早期の骨転移を起こす傾向がより
高いと結論づけられ得る。
骨転移を伴うトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん患者またはあるいはER
+乳がん患者において個別化治療をデザインするための方法
別の態様において、本発明は、骨転移を伴うトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)
乳がんまたはあるいは骨転移を伴うER+乳がんを有する被験体のために個別化治療をデ
ザインするためのインビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第5の方法)に関し、
その方法は、
i)上記被験体の骨転移サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、およ

ii)工程(i)において得られた発現レベルを参照値と比較する工程
を含み、ここで、c−MAF遺伝子発現レベルが、上記参照値と比較して上昇している場
合、上記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格である。
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
本発明の第5の方法は、第1の工程に、乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc
−MAF遺伝子発現レベル(またはc−MAFの転座もしくは増幅)を定量する工程を含
む。本発明の第5の方法の場合、サンプルは、骨転移からの組織サンプルであり得る。
好ましい実施形態において、本発明の第5の方法は、c−MAF遺伝子発現レベルだけ
を単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマー
カーの発現レベルを決定する工程も含まない。
第2の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたc−MAF遺伝子発現レ
ベル(またはc−MAFの転座もしくは増幅)は、参照値と比較される。好ましい実施形
態において、参照値は、コントロールサンプルにおけるc−MAF遺伝子発現レベルであ
る。解析されるべき腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確な性質は変動し
得る。したがって、本発明の第5の方法を含む場合において、参照サンプルは、転移に罹
患していない乳がんを有する被験体のサンプル、または転移に罹患していない乳がんを有
する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたc−MAF遺伝子
発現レベルの中央値に対応するサンプルである。
いったん、サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルが、測定されて、参照値(例えば
、コントロールサンプルのc−MAF遺伝子発現レベル)と比較されたら、上記遺伝子の
発現レベルが、参照値と比較して上昇している場合、これは、上記被験体が、骨分解の回
避または予防を目指す治療を受けるのに適格であることを示している。
骨分解の回避および/または予防のために使用される薬剤の例証的な例としては、以下
が挙げられるが、これらに限定されない:
・副甲状腺ホルモン(PTH)インヒビターおよび副甲状腺様ホルモン(PTHLH)イ
ンヒビター(阻止抗体を含む)またはそれらの組換え型(PTHのアミノ酸7〜34に対
応するテリパラチド)。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによ
って作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細
胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤」(DABA)と呼ばれる薬物の群の一部を形
成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子」(SERM)は、機序に関係なくエストロゲンが
レセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲン
レセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラ
ジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン、TSE−424、タ
モキシフェン、イドキシフェン、LY353381、LY117081、トレミフェン、
フルベストラント、4−[7−(2,2−ジメチル−1−オキソプロポキシ−4−メチル
−2−[4−[2−(1−ピペリジニル)エトキシ]フェニル]−2H−1−ベンゾピラ
ン−3−イル]−フェニル−2,2−ジメチルプロパノエート 4,4’ジヒドロキシベ
ンゾフェノン−2,4−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびSH646が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カ
ルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん(後者は、乳がんおよび前立腺
がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない)などの、骨吸収および再吸収
を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第5の方法
によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素
含有ビスホスホネート(例えば、パミドロネート、ネリドロネート、オルパドロネート、
アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネ
ートまたはゾレドロン酸など)および窒素非含有ビスホスホネート(例えば、エチドロネ
ート、クロドロネート、チルドロネートなど)が挙げられるが、これらに限定されない。
・アルファラディン(ラジウム−223二塩化物)。アルファラディンは、がん細胞を死
滅させるために、ラジウム−223の崩壊からのアルファ線を使用する。ラジウム−22
3は、カルシウム模倣物としてのその特性のおかげで骨転移に向けて自然に自身を標的化
する。アルファ線は、2〜10個の細胞という非常に短い範囲(ベータまたはガンマ線に
基づく現行の放射線治療と比べて)を有するので、周囲の健常な組織(特に骨髄)にほと
んど損傷をもたらさない。カルシウムとよく似た特性を有するので、ラジウム−223は
、身体内の骨を構築するためにカルシウムが使用されている位置(去勢抵抗性の進行前立
腺がんを有する男性の骨格転移に認められるようなより速い異常な骨成長の部位を含む)
に引き込まれる。ラジウム−223は、注射後、異常に骨が成長している部位に血流によ
って運ばれる。がんが身体内で生じ始めた位置は、原発腫瘍として公知である。これらの
細胞のうちのいくつかは、離脱して、血流によって身体の別の部位に運ばれ得る。次いで
、それらのがん細胞は、身体のその位置に定着して、新しい腫瘍を形成し得る。これが起
きる場合、それは、二次がんまたは転移と呼ばれる。後期の前立腺がんを有するほとんど
の患者は、骨にその疾患の最大の負荷を被る。ラジウム−223を用いる目的は、この二
次がんを選択的に標的化することである。骨に取り込まれない任意のラジウム−223は
、すみやかに腸を経由して排泄される。
・「カテプシンKインヒビター」とは、カテプシンKシステインプロテアーゼ活性に干渉
する化合物のことを指す。カテプシンKインヒビターの非限定的な例としては、4−アミ
ノ−ピリミジン−2−カルボニトリル誘導体(Novartis Pharma GMB
Hの名称下の国際特許出願WO03/020278に記載されている)、公報WO03/
020721(Novartis Pharma GMBH)および公報WO04/00
0843(ASTRAZENECA AB)に記載されているピロロ−ピリミジン、なら
びにAxys Pharmaceuticalsの公報PCT WO00/55126、
Merck Frosst Canada & Co.およびAxys Pharmac
euticalsのWO01/49288に記載されているインヒビターが挙げられる。
・本明細書中で使用されるとき「DKK−1(Dickkopf−1)インヒビター」は
、DKK−1活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。DKK−1は、
主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギ
ュレートされる、可溶性Wnt経路アンタゴニストである。DKK−1を標的化する薬剤
は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患の予防に役割を果たし得る。Novarti
s製のBHQ880は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗DKK−1中和抗体
である。前臨床試験は、BHQ880が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する
溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している(Ettenberg S.ら、Ame
rican Association for Cancer Research An
nual Meeting.4月 12−16,2008;San Diego,Cal
if.要旨)。
・本明細書中で使用されるとき「METおよびVEGFR2の二重インヒビター」は、M
ETによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路お
よびVEGF経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。METは
、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞(骨を形成する細胞)および破骨細胞(
骨を除去する細胞)においても発現される。HGFは、これらの細胞型のすべてにおける
METに結合し、MET経路に、複数のオートクラインループおよびパラクリンループに
おいて重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるMETの活性化は、転移性の骨病変の確立
において重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるMET経路の
活性化は、異常な骨の成長(すなわち、芽細胞性の病変)または破壊(すなわち、溶解性
の病変)を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、MET経路の標的化
は、転移性の骨病変の確立および進行の予防の実行可能なストラテジーであり得る。以前
はXL184(CAS849217−68−1)として知られていたカボザンチニブ(E
xelixis,Inc)は、METによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するよう
にデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力な二重インヒビターである。複
数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を死滅させ、転移を減少させ、血
管新生(腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成)を阻害することが示されて
いる。別の好適な二重インヒビターは、E7050(N−[2−フルオロ−4−({2−
[4−(4−メチルピペラジン−1−イル)ピペリジン−1−イル]カルボニルアミノピ
リジン−4−イル}オキシ)フェニル]−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパ
ン−1,1−ジカルボキサミド(2R,3R)−タルトレート)(CAS928037−
13−2)またはフォレチニブ(GSK1363089、XL880、CAS84921
7−64−7としても知られる)である。
・本明細書中で使用されるとき「RANKLインヒビター」は、RANK活性を低下させ
ることができる任意の化合物のことを指す。RANKLは、ストローマ細胞およびT−リ
ンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見出され、これらのT−リンパ球細胞は、それを分泌
する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞で
ある破骨細胞の活性化である。RANKLインヒビターは、RANKLがそのレセプター
(RANK)に結合するのを阻止すること、RANK媒介性シグナル伝達を阻止すること
、またはRANKLの転写もしくは翻訳を阻止することによってRANKLの発現を減少
させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したRANKLアンタゴニス
トまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・RANKLに結合することができ、RANKタンパク質の細胞外ドメインの全体または
フラグメントを含む、好適なRANKタンパク質。可溶性RANKは、マウスもしくはヒ
トRANKポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、または
あるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはRANKL結合能を有するそのバリアント。
・RANKL特異的アンチセンス分子。
・RANKLの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗RANKL抗体。「抗RANKL抗体またはRANKLに対し指向する抗体
」は、1つまたは複数のRANKLの機能を阻害する、核因子κBに対する活性化レセプ
ターのリガンド(RANKL)に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書
中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。し
たがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによ
って調製される。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Natu
re,1975,256:495)に記載されている方法を用いて調製される。本発明の
文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな
抗体、フラグメント「Fab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scF
v、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗RANKLナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構
造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療タンパク質である。ナノボディ技術は、ラ
クダ科動物(ラクダおよびラマ)が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の
後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
であり、ここで、FR1からFR4は、フレームワーク領域1〜4であり、CDR1から
CDR3は、相補性決定領域1〜3である。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン(
VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。重要なことには、ク
ローニングされ、単離されたVHHドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有す
る完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新
しく発見されたVHHドメインは、Ablynxがナノボディと名付けた新世代の治療用
抗体の基礎を形成している。
1つの実施形態において、RANKLインヒビターは、RANKL特異的抗体、RAN
KL特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される。具体的な
実施形態において、抗RANKL抗体は、モノクローナル抗体である。なおもより具体的
な実施形態において、抗RANKL抗体は、デノスマブ(Pageau,Steven
C.(2009).mAbs 1(3):210−215、CAS番号615258−4
0−7)(その全内容が本明細書によって参照により援用される)である。デノスマブは
、RANKLに結合して、その活性化を妨げる完全にヒトのモノクローナル抗体である(
これは、RANKレセプターには結合しない)。デノスマブの様々な態様が、米国特許第
6,740,522号;同第7,411,050号;同第7,097,834号;同第7
,364,736号(これらの各々の全内容が本明細書によって参照により援用される)
によって包含されている。別の実施形態において、RANKLインヒビターは、デノスマ
ブと同じエピトープに結合する抗体、抗体フラグメントまたは融合構築物。
好ましい実施形態において、抗RANKLナノボディは、WO2008142164(
その内容は参照により本願に援用される)に記載されているようなナノボディのいずれか
である。なおもより好ましい実施形態において、抗RANKL抗体は、ALX−0141
(Ablynx)である。ALX−0141は、閉経後の骨粗鬆症、関節リウマチ、がん
およびある特定の薬剤に関連する骨減少を阻害するように、および健常な骨代謝のバラン
スを再建するように、デザインされた。
好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネート、RANKL
インヒビター、PTHおよびPTHLHインヒビターまたはPRGアナログ、ラネル酸ス
トロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター
、エストロゲンレセプター調節因子、ラジウム−223、カルシトニンならびにカテプシ
ンKインヒビターからなる群より選択される。より好ましい実施形態において、骨分解を
予防する薬剤は、ビスホスホネートである。なおもより好ましい実施形態において、ビス
ホスホネートは、ゾレドロン酸である。
1つの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、骨への原発性乳がん腫瘍の転移
を予防するためまたは阻害するために投与される。1つの実施形態において、CCR5ア
ンタゴニストは、大分子である。別の実施形態において、CCR5アンタゴニストは、小
分子である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、Maravir
oc(Velasco−Vela’quez,M.ら、2012.CCR5 Antag
onist Blocks Metastasis of Basal Breast
Cancer Cells.Cancer Research.72:3839−385
0)である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、Vicrivi
roc(Velasco−Vela’quez,M.ら、2012.CCR5 Anta
gonist Blocks Metastasis of Basal Breast
Cancer Cells.Cancer Research.72:3839−38
50)である。いくつかの態様において、CCR5アンタゴニストは、Aplaviro
c(Demarest J.F.ら、2005.Update on Aplaviro
c:An HIV Entry Inhibitor Targeting CCR5.
Retrovirology 2(Suppl.1):S13)である。いくつかの態様
において、CCR5アンタゴニストは、スピロピペリジンCCR5アンタゴニスト(Ro
tstein D.M.ら、2009.Spiropiperidine CCR5 a
ntagonists.Bioorganic & Medicinal Chemis
try Letters.19(18):5401−5406)である。いくつかの実施
形態において、CCR5アンタゴニストは、INCB009471(Kuritzkes
,D.R.2009.HIV−1 entry inhibitors:an over
view.Curr.Opin.HIV AIDS.4(2):82−7)である。
好ましい実施形態において、METおよびVEGFR2の二重インヒビターは、Cab
ozantinib、ForetinibおよびE7050からなる群より選択される。
好ましい実施形態において、ラジウム223治療は、アルファラディンである。
あるいは、転移を処置するためおよび/もしくは予防するために上で述べられた薬剤の
うちの2つ以上の薬剤が組み合わされる組合せ処置が行われ得るか、または上記薬剤は、
他のサプリメント(例えば、カルシウムまたはビタミンD)もしくはホルモン処置と組合
わされ得る。
c−MAF遺伝子の増幅の検出に基づく、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳
がんまたはあるいはER+乳がんにおける転移の予後診断の方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している被験体における上記がんの骨転移を予測するための
インビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第6の方法)に関し、その方法は、上記
被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されている
かを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのc−MAF
遺伝子の増幅は、骨転移を起こす上昇したリスクを示す。
いくつかの実施形態において、増幅は、16q23遺伝子座の領域における増幅である
。いくつかの実施形態において、増幅は、およそ16番染色体の約79,392,959
bp〜約79,663,806bp(セントロメアからテロメアまで)の染色体領域の任
意の部分における増幅である。いくつかの実施形態において、増幅は、16番染色体の約
79,392,959bp〜約79,663,806bpであるがDNA反復エレメント
を排除したゲノム領域における増幅である。いくつかの実施形態において、増幅は、その
領域に特異的なプローブを使用して測定される。
特定の実施形態において、c−MAF遺伝子の増幅の程度は、上記遺伝子を含む染色体
領域の増幅の決定によって決定され得る。好ましくは、その増幅がc−MAF遺伝子の増
幅の存在を示す染色体領域は、c−MAF遺伝子を含む遺伝子座16q22−q24であ
る。遺伝子座16q22−q24は、16番染色体、上記染色体の長腕およびバンド22
〜バンド24の範囲に位置する。この領域は、NCBIデータベースにおいてコンティグ
NT_010498.15およびNT_010542.15と対応する。別の好ましい実
施形態において、c−MAF遺伝子の増幅の程度は、上記遺伝子に特異的なプローブを使
用することによって決定され得る。別の好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の
増幅は、14q32および16q23に対するプローブを含むVysis LSI IG
H/MAF Dual Color二重融合プローブを使用することによって決定される
本発明の第6の方法は、第1の工程に、c−MAF遺伝子が被験体のサンプルにおいて
増幅されているかを決定する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍
組織サンプルである。その目的のために、腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子の増幅は、
コントロールサンプルと比較される。
特定の実施形態において、乳がんを有する被験体において骨転移を起こす傾向の予後診
断のための本発明の第6の方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子コピー数
を決定する工程および上記コピー数をコントロールサンプルまたは参照サンプルのコピー
数と比較する工程を含み、ここで、c−MAFコピー数が、コントロールサンプルのc−
MAFコピー数より多い場合、その被験体は、骨転移を起こす傾向がより高い。
コントロールサンプルとは、転移に罹患していないトリプルネガティブ(基底細胞様を
含む)乳がんもしくはあるいはER+乳がんを有する被験体のサンプル、または転移に罹
患していない、それぞれトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんもしくはER+
乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定されたc−M
AF遺伝子コピー数の中央値に対応するサンプルのことを指す。上記参照サンプルは、代
表的には、被験体集団由来の等量のサンプルを合わせることによって得られる。c−MA
F遺伝子コピー数が、コントロールサンプル中の上記遺伝子のコピー数と比較して増加し
ている場合、被験体は、転移を起こす傾向がより高い。
好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子コピー数が、参照サンプルまたはコント
ロールサンプルが有するコピー数より多いとき、c−MAF遺伝子は、参照遺伝子コピー
数と比較して、増幅されている。1つの例において、c−MAF遺伝子のゲノムコピー数
が、試験サンプルにおいて、コントロールサンプルと比べて少なくとも、2倍増加してい
る(すなわち、6コピー)、3倍増加している(すなわち、8コピー)、4倍、5倍、6
倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、4
5倍または50倍増加している場合、c−MAF遺伝子は、「増幅されている」と言われ
る。別の例において、細胞1つあたりのc−MAF遺伝子のゲノムコピー数が、少なくと
も3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、1
8、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30などで
ある場合、c−MAF遺伝子は、「増幅されている」と言われる。
特定の実施形態において、増幅またはコピー数は、インサイチュハイブリダイゼーショ
ンまたはPCRによって決定される。
c−MAF遺伝子または染色体領域16q22−q24が増幅されているかを決定する
ための方法は、当該分野において広く公知である。上記方法としては、インサイチュハイ
ブリダイゼーション(ISH)(例えば、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション(F
ISH)、色素形成インサイチュハイブリダイゼーション(CISH)またはシルバーイ
ンサイチュハイブリダイゼーション(SISH))、ゲノム比較ハイブリダイゼーション
またはポリメラーゼ連鎖反応(例えば、リアルタイム定量的PCR)が挙げられるがこれ
らに限定されない。いずれのISH法の場合も、増幅またはコピー数は、染色体または核
における、蛍光の点、有色の点または銀を有する点の数を数えることによって測定され得
る。
蛍光インサイチュハイブリダイゼーション(FISH)は、染色体における特定のDN
A配列の有無を検出するためおよびその特定のDNA配列の位置を特定するために使用さ
れる、細胞遺伝学的技法である。FISHは、染色体のいくつかの部分にだけ結合する蛍
光プローブ(このプローブは、それらの部分と高い程度の配列類似性を示す)を使用する
。代表的なFISH法では、DNAプローブは、ニックトランスレーションまたはPCR
などの酵素反応を用いてDNAに組み込まれる、代表的には、フッ素−dUTP、ジゴキ
シゲニン−dUTP、ビオチン−dUTPまたはハプテン−dUTPの形態の、蛍光分子
またはハプテンで標識される。遺伝物質(染色体)を含むサンプルを、スライドガラスに
載せ、ホルムアミド処理によって変性させる。次いで、標識されたプローブを、当業者が
決定する好適な条件下で、その遺伝物質を含むサンプルとハイブリダイズさせる。ハイブ
リダイゼーションの後、直接(フッ素で標識されたプローブの場合)または間接的に(ハ
プテンを検出する蛍光標識された抗体を使用して)サンプルを観察する。
CISHの場合、プローブを、ジゴキシゲニン、ビオチンまたはフルオレセインで標識
し、好適な条件において、遺伝物質を含むサンプルとハイブリダイズさせる。
DNAに結合し得る任意のマーキング分子または標識分子が、本発明の第4の方法にお
いて使用されるプローブを標識するために使用され得、それにより、核酸分子の検出が可
能になる。標識するための標識の例としては、放射性同位体、酵素基質、補因子、リガン
ド、化学発光剤、フルオロフォア、ハプテン、酵素およびそれらの組み合わせが挙げられ
るが、これらに限定されない。標識するための方法および種々の目的のために適した標識
を選択するための指針は、例えば、Sambrookら(Molecular Clon
ing:A Laboratory Manual,Cold Spring Harb
or,New York,1989)およびAusubelら(In Current
Protocols in Molecular Biology,John Wile
y and Sons,New York,1998)に見られ得る。
c−MAF遺伝子の増幅、16q23遺伝子座の増幅を直接決定すること、または遺伝
子座16q22−q24の増幅を決定することによって、増幅の存在が決定され、コント
ロールサンプル中の上記遺伝子の増幅と比較されたら、その後、c−MAF遺伝子におけ
る増幅が検出される場合、被験体が骨転移を起こす傾向がより高いという事実が示される
c−MAF遺伝子の増幅の決定は、転移に罹患していない乳がんを有する被験体のサン
プルにおいて計測されたc−MAF遺伝子の増幅のレベルに対応するか、または転移に罹
患していない乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて測定
されたc−MAF遺伝子の増幅の中央値に対応する、コントロールサンプルまたは参照サ
ンプルの値と相関させることを必要とする。上記参照サンプルは、代表的には、被験体集
団由来の等量のサンプルを合わせることによって得られる。一般に、代表的な参照サンプ
ルは、臨床的に十分に考証されている被験体および転移が無いことが十分に特徴付けられ
ている被験体から得られる。参照レベルが由来するサンプルコレクションは、好ましくは
、その研究の患者対象と同じタイプのがんに罹患している被験体で構成されている。いっ
たん、この中央値が確立されたら、患者の腫瘍組織におけるc−MAFの増幅のレベルは
、この中央値と比較され得、ゆえに、増幅が存在する場合、被験体は、転移を起こす傾向
がより高い。
好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性骨転移である。本明細書中で使用される
とき、「溶骨性骨転移」と言う表現は、腫瘍細胞による破骨細胞活性の刺激に起因して転
移の近傍で骨吸収(骨密度の進行性消失)が生じ、重篤な疼痛、病理学的骨折、高カルシ
ウム血症、脊髄圧迫、および神経圧迫に起因する他の症候群を特徴とする、転移のタイプ
を指す。
c−MAF遺伝子の転座の検出に基づく、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳
がんまたはあるいはER+乳がんにおける転移の予後診断の方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方
法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、転座しているか
を決定する工程を含み、ここで、c−MAF遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を示す。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方
法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、転座しているか
を決定する工程を含み、ここで、c−MAF遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を示す。
いくつかの実施形態において、転座遺伝子は、16q23遺伝子座の領域由来である。
いくつかの実施形態において、転座遺伝子は、およそ16番染色体の約79,392,9
59bp〜約79,663,806bp(セントロメアからテロメアまで)の染色体領域
の任意の部分由来である。いくつかの実施形態において、転座遺伝子は、およそ16番染
色体の約79,392,959bp〜約79,663,806bpであるがDNA反復エ
レメントを排除したゲノム領域由来である。いくつかの実施形態において、転座は、その
領域に特異的なプローブを使用して測定される。
特定の実施形態において、c−MAF遺伝子の転座は、上記遺伝子を含む染色体領域の
転座の決定によって決定され得る。1つの実施形態において、転座は、t(14,16)
転座である。別の実施形態において、転座している染色体領域は、遺伝子座16q22−
q24由来である。遺伝子座16q22−q24は、16番染色体、上記染色体の長腕お
よびバンド22〜バンド24の範囲に位置する。この領域は、NCBIデータベースにお
いてコンティグNT_010498.15およびNT_010542.15と対応する。
好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子は、14番染色体の遺伝子座14q32に
転座し、転座t(14,16)(q32,q23)が生じる。この転座は、IgH遺伝子
座における強力なエンハンサーの隣にMAF遺伝子に配置し、このことは、場合によって
はMAFの過剰発現をもたらす(Eychene,A.,Rocques,N.,and
Puoponnot,C.,A new MAFia in cancer.2008
.Nature Reviews:Cancer.8:683−693)。
好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の転座は、上記転座に特異的なプローブ
を使用することによって決定され得る。いくつかの実施形態において、転座は、二色プロ
ーブを使用して測定される。いくつかの実施形態において、転座は、二重融合プローブを
使用して測定される。いくつかの実施形態において、転座は、二色の二重融合プローブを
使用して測定される。いくつかの実施形態において、転座は、2つの別個のプローブを使
用して測定される。
別の好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の転座は、14q32および16q
23に対するプローブを含むVysis LSI IGH/MAF Dual Colo
r二重融合プローブ(http://www.abbottmolecular.com
/us/products/analyte−specific−reagent/fi
sh/vysis−lsi−igh−maf−dual−color−dual−fus
ion−probe.html;最終アクセス日2012年11月5日)を使用して決定
される。別の好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の転座は、Kreatech
diagnostics MAF/IGH gt(14;16)Fusionプローブ
(http://www.kreatech.com/products/repeat
−freetm−poseidontm−fish−probes/hematolog
y/maf−igh−gt1416−fusion−probe.html;最終アクセ
ス日2012年11月5日)、Abnova MAF FISHプローブ(http:/
/www.abnova.com/products/products_detail
.asp?Catalog_id=FA0375;最終アクセス日2012年11月5日
)、Cancer Genetics Italia IGH/MAF Two Col
or,Two Fusion転座プローブ(http://www.cancergen
eticsitalia.com/dna−fish−probe/ighmaf/;最
終アクセス日2012年11月5日)、Creative Bioarray IGH/
MAF−t(14;16)(q32;q23)FISHプローブ(http://www
.creative−bioarray.com/products.asp?cid=
35&page=10;最終アクセス日2012年11月5日)、Arup Labor
atoriesのFISHによる多発性骨髄腫パネル(http://www.arup
lab.com/files/technical−bulletins/Multip
le%20Myeloma%20%28MM%29%20by%20FISH.pdf;
最終アクセス日2012年11月5日)、Agilentの16q23または14q32
に特異的なプローブ(http://www.genomics.agilent.co
m/ProductSearch.aspx?chr 16&start=794837
00&end=79754340;最終アクセス日2012年11月5日;http:/
/www.genomics.agilent.com/ProductSearch.
aspx?Pageid=3000&ProductID=637;最終アクセス日20
12年11月5日)、Dakoの16q23または14q32に特異的なプローブ(ht
tp://www.dako.com/us/ar42/psg42806000/ba
seproducts_surefish.htm?setCountry=true&
purl=ar42/psg42806000/baseproducts_suref
ish.htm?undefined&submit=Accept%20countr
y;最終アクセス日2012年11月5日)、Cytocell IGH/MAF Tr
anslocation,Dual Fusion Probe(http://www
.zentech.be/uploads/docs/products_info/p
renatalogy/cytocell%202012−2013%20catalo
gue%5B3%5D.pdf;最終アクセス日2012年11月5日)、Metasy
stems XL IGH/MAF Translocation −Dual Fus
ion Probe(http://www.metasystems−interna
tional.com/index.php?option=com_joodb&vi
ew=article&joobase=5&id=12%3Ad−5029−100−
og&Itemid=272;最終アクセス日2012年11月5日)、Zeiss F
ISH Probes XL,100μl,IGH/MAFB(https://www
.micro−shop.zeiss.com/?s=440675675dedc6&
l=en&p=uk&f=r&i=5000&o=&h=25&n=1&sd=0000
00−0528−231−uk;最終アクセス日2012年11月5日)またはGeny
cell Biotech IGH/MAF Dual Fusion Probe(h
ttp://www.google.com/url?sa=t&rct=j&q=&e
src=s&source=web&cd=1&ved=0CCQQFjAA&url=
http%3A%2F%2Fwww.genycell.es%2Fimages%2F
productos%2Fbrochures%2Flphmie6_86.ppt&e
i=MhGYUOi3GKWH0QGlt4DoDw&usg=AFQjCNEqQMb
T8vQGjJbi9riEf3lVgoFTFQ&sig2=V5IS8juEMVH
B18Mv2Xx_Ww;最終アクセス日2012年11月5日)を使用して決定される
いくつかの実施形態において、プローブ上の標識は、フルオロフォアである。いくつか
の実施形態において、プローブ上のフルオロフォアは、橙色である。いくつかの実施形態
において、プローブ上のフルオロフォアは、緑色である。いくつかの実施形態において、
プローブ上のフルオロフォアは、赤色である。場合によっては、プローブ上のフルオロフ
ォアは、黄色である。いくつかの実施形態において、1つのプローブは、赤色フルオロフ
ォアで標識され、1つは、緑色フルオロフォアで標識される。いくつかの実施形態におい
て、1つのプローブは、緑色フルオロフォアで標識され、1つは、橙色フルオロフォアで
標識される。場合によっては、プローブ上のフルオロフォアは、黄色である。例えば、M
AF特異的プローブが、赤色フルオロフォアで標識され、IGH特異的プローブが、緑色
フルオロフォアで標識され、白色が見られる場合、それは、それらのシグナルが重なって
おり、転座が起きていることを示す。
いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、SpectrumOrangeであ
る。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、SpectrumGreenであ
る。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、DAPIである。いくつかの実施
形態において、フルオロフォアは、PlatinumBright405である。いくつ
かの実施形態において、フルオロフォアは、PlatinumBright415である
。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、PlatinumBright49
5である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、PlatinumBrig
ht505である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、Platinum
Bright550である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、Plat
inumBright547である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、
PlatinumBright570である。いくつかの実施形態において、フルオロフ
ォアは、PlatinumBright590である。いくつかの実施形態において、フ
ルオロフォアは、PlatinumBright647である。いくつかの実施形態にお
いて、フルオロフォアは、PlatinumBright495/550である。いくつ
かの実施形態において、フルオロフォアは、PlatinumBright415/49
5/550である。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、DAPI/Pla
tinumBright495/550である。いくつかの実施形態において、フルオロ
フォアは、FITCである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、Texa
s Redである。いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、DEACである。
いくつかの実施形態において、フルオロフォアは、R6Gである。いくつかの実施形態に
おいて、フルオロフォアは、Cy5である。いくつかの実施形態において、フルオロフォ
アは、FITC、Texas RedおよびDAPIである。いくつかの実施形態におい
て、DAPI対比染色は、転座、増幅またはコピー数の変化を可視化するために使用され
る。
本発明の1つの実施形態は、第1の工程においてc−MAF遺伝子が被験体のサンプル
中で転座しているかを決定する方法を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫
瘍組織サンプルである。
特定の実施形態において、乳がんを有する被験体において骨転移を起こす傾向の予後診
断のための本発明の方法は、c−MAF遺伝子が転座している上記被験体のサンプル中の
c−MAF遺伝子コピー数を決定する工程および上記コピー数をコントロールサンプルま
たは参照サンプルのコピー数と比較する工程を含み、ここで、そのc−MAFのコピー数
が、コントロールサンプルのc−MAFのコピー数と比較して多い場合、その被験体は、
骨転移を起こす傾向がより高い。
c−MAF遺伝子または染色体領域16q22−q24が転座しているかを決定するた
めの方法は、当該分野において広く公知であり、c−MAFの増幅について先に記載され
た方法を含む。上記方法としては、インサイチュハイブリダイゼーション(ISH)(例
えば、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション(FISH)、色素形成インサイチュハ
イブリダイゼーション(CISH)またはシルバーインサイチュハイブリダイゼーション
(SISH))、ゲノム比較ハイブリダイゼーションまたはポリメラーゼ連鎖反応(例え
ば、リアルタイム定量的PCR)が挙げられるがこれらに限定されない。いずれのISH
方法の場合も、増幅、コピー数または転座は、染色体または核における、蛍光の点、有色
の点または銀を有する点の数を数えることによって決定され得る。他の実施形態において
、コピー数の変化および転座の検出は、ホールゲノムシーケンシング、エクソームシーケ
ンシングの使用、または任意のPCRに由来する技術の使用によって検出され得る。例え
ば、PCRは、転座を検出するためにゲノムDNAのサンプルにおいて行われ得る。1つ
の実施形態において、定量的PCRが使用される。1つの実施形態において、PCRは、
c−MAF遺伝子に特異的なプライマーおよびIGHプロモーター領域に特異的なプライ
マーを用いて行われる;生成物が生成される場合、転座が生じている。
いくつかの実施形態において、c−MAF遺伝子の増幅およびコピー数は、c−MAF
遺伝子の転座が決定された後に、決定される。いくつかの実施形態において、プローブを
使用して、細胞がc−MAF遺伝子倍数体であるかが決定される。いくつかの実施形態に
おいて、倍数性の決定は、目的の遺伝子からの2種より多いシグナルが存在するかを決定
することによって行われる。いくつかの実施形態において、倍数性は、目的の遺伝子に特
異的なプローブからのシグナルを測定し、それをセントロメアプローブまたは他のプロー
ブと比較することによって決定される。
c−MAF遺伝子の増幅の検出に基づく、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳
がんまたはあるいはER+乳がんにおける臨床転帰の予後診断の方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方
法(本明細書中以後、本発明の第7の方法)に関し、その方法は、上記被験体のサンプル
中のc−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかを決定する工程
を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのc−MAF遺伝子の増幅は、
不良な臨床転帰を示す。
本発明の第7の方法は、第1の工程に、c−MAF遺伝子が被験体のサンプルにおいて
増幅されているかを決定する工程を含む。c−MAFの増幅の決定は、本質的に本発明の
第5の方法に記載されているように行われる。好ましい実施形態において、サンプルは、
腫瘍組織サンプルである。好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の増幅は、遺伝
子座16q23または16q22−q24の増幅を決定することによって決定される。別
の好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の増幅は、c−MAF遺伝子特異的プロ
ーブを使用することによって決定される。
第2の工程において、本発明の第7の方法は、上記コピー数をコントロールサンプルま
たは参照サンプルのコピー数と比較する工程を含み、ここで、そのc−MAFコピー数が
、コントロールサンプルのc−MAFコピー数と比べて多い場合、これは、不良な臨床転
帰を示す。
好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子コピー数が、参照サンプルまたはコント
ロールサンプルが有するコピー数より多いとき、c−MAF遺伝子は、参照遺伝子コピー
数と比較して、増幅されている。1つの例において、c−MAF遺伝子のゲノムコピー数
が、試験サンプルにおいて、コントロールサンプルと比べて少なくとも、2倍増加(すな
わち、6コピー)、3倍増加(すなわち、8コピー)、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、
9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、45倍または50倍
増加している場合、c−MAF遺伝子は、「増幅されている」と言われる。別の例におい
て、細胞1つあたりのc−MAF遺伝子のゲノムコピー数が、少なくとも、3、4、5、
6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20
、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30などである場合、c−
MAF遺伝子は、「増幅されている」と言われる。
別の実施形態において、参照遺伝子コピー数は、骨転移に罹患していない被験体由来の
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいはER+乳がんのサンプル
中の遺伝子コピー数である。
別の実施形態において、増幅は、インサイチュハイブリダイゼーションまたはPCRに
よって決定される。
トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳房腫瘍またはあるいはER+乳房腫瘍また
はHER2+乳房腫瘍を有する患者において個別化治療をデザインするための方法
当該分野において公知であるように、がんに罹患している被験体に施されるべき処置は
、後者が悪性腫瘍であるか否か、すなわち、それが転移を起こす高い確率を有するか否か
、または後者が良性の腫瘍であるか否かに左右される。第1の仮定では、一般に好まれる
処置は、化学療法などの全身性処置であり、第2の仮定では、一般に好まれる処置は、放
射線治療などの局所性処置である。
ゆえに、本願に記載されるように、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん細
胞またはあるいはER+乳がん細胞におけるc−MAF遺伝子の増幅または転座が、骨転
移の存在に関係することを考えれば、c−MAF遺伝子の増幅または転座は、上記がんに
罹患している被験体に最も適した治療に関して決定するために有用である。好ましい実施
形態において、c−MAF遺伝子の増幅は、遺伝子座16q23または16q22−q2
4の増幅を決定することによって決定される。別の好ましい実施形態において、c−MA
F遺伝子の増幅は、c−MAF遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される
したがって、別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)
乳がんまたはあるいはER+乳がんに罹患している被験体のために個別化治療をデザイン
するためのインビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第3の方法)に関し、その方
法は、
iii)上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子の増幅または転座を定量する工程、
および
iv)i)において得られた遺伝子の増幅または転座を参照値と比較する工程
を含み、ここで、c−MAF遺伝子の増幅または転座が、上記参照値と比較して増加して
いる場合、上記被験体は、骨転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適
格である。c−MAF遺伝子の増幅または転座が、上記参照値と比較して増加していない
場合、上記被験体は、骨転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格で
はない。好ましい実施形態において、c−MAF遺伝子の増幅は、遺伝子座16q23ま
たは16q22−q24の増幅を決定することによって決定される。別の好ましい実施形
態において、c−MAF遺伝子の増幅は、c−MAF遺伝子特異的プローブを使用するこ
とによって決定される。
特定の実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
本発明の別の方法は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたはあるいは
ER+乳がんに罹患している被験体におけるサンプル中のc−MAF遺伝子の増幅または
転座を定量する工程を含む。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプル
である。
別の特定の実施形態において、本発明の方法は、c−MAF遺伝子の増幅または転座だ
けを単一マーカーとして定量する工程を含み、すなわち、その方法は、いかなる追加のマ
ーカーの発現レベルを決定する工程も含まない。
本発明のこの特定の方法の場合、サンプルは、被験体の原発腫瘍組織サンプルであり得
る。
第2の工程において、被験体の腫瘍サンプルにおいて得られたc−MAF遺伝子の増幅
または転座は、参照値と比較される。好ましい実施形態において、参照値は、コントロー
ルサンプルにおける上記遺伝子のc−MAF遺伝子の増幅または転座である。c−MAF
遺伝子の増幅または転座の測定は、コントロールサンプルまたは参照サンプルの値と関連
させなければならない。解析される腫瘍のタイプに応じて、コントロールサンプルの正確
な性質は変動し得る。したがって、好ましくは、参照サンプルは、転移していないトリプ
ルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんもしくはあるいはER+乳がんを有する被験体
のサンプル、または転移していないトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんもし
くはあるいはER+乳がんを有する被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおい
て測定されたc−MAF遺伝子の増幅もしくは転座に対応するサンプルである。
いったん、サンプル中のc−MAF遺伝子の増幅または転座が、計測されて、参照値と
比較されたら、上記遺伝子の遺伝子の増幅または転座が、参照値と比較して増加している
場合、上記被験体は、転移の予防(被験体がまだ転移を起こしていない場合)および/ま
たは転移の処置(被験体がすでに転移を受けている場合)を目指す治療を受けるのに適格
であると結論づけられ得る。
がんが転移していたとき、化学療法、ホルモン処置、免疫療法またはそれらの組み合わ
せを含むがこれらに限定されない全身性処置が使用され得る。さらに、放射線治療および
/または手術が使用され得る。処置の選択は、通常、原発がんのタイプ、サイズ、転移の
位置、患者の年齢、全般的な健康状態、および以前に使用された処置のタイプに左右され
る。
全身性処置は、全身に到達する処置であり、例えば:
・化学療法は、がん細胞を破壊する医薬の使用である。それらの医薬は、通常、経口また
は静脈内の経路によって投与される。時折、化学療法は、放射線処置とともに使用される
。乳がんに対する好適な化学療法処置としては、アントラサイクリン(ドキソルビシン、
エピルビシン、ペグ化リポソームドキソルビシン)、タキサン(パクリタキセル、ドセタ
キセル、アルブミンナノ粒子結合型パクリタキセル)、5−フルオロウラシル(5−FU
持続注入、カペシタビン)、ビンカアルカロイド(ビノレルビン、ビンブラスチン)、ゲ
ムシタビン、白金塩(シスプラチン、カルボプラチン)、シクロホスファミド、エトポシ
ド、および上記の1つまたは複数の組み合わせ、例えば、シクロホスファミド/アントラ
サイクリン +/− 5−フルオロウラシルレジメン(例えば、ドキソルビシン/シクロ
ホスファミド(AC)、エピルビシン/シクロホスファミド、(EC)シクロホスファミ
ド/エピルビシン/5−フルオロウラシル(CEF)、シクロホスファミド/ドキソルビ
シン/5−フルオロウラシル(CAF)、5−フルオロウラシル/エピルビシン/シクロ
ホスファミド(FEC))、シクロホスファミド/メトトレキサート/5−フルオロウラ
シル(CMF)、アントラサイクリン/タキサン(例えば、ドキソルビシン/パクリタキ
セルまたはドキソルビシン/ドセタキセル)、ドセタキセル/カペシタビン、ゲムシタビ
ン/パクリタキセル、タキサン/白金レジメン(例えば、パクリタキセル/カルボプラチ
ンまたはドセタキセル/カルボプラチン)が挙げられるがこれらに限定されない。
・免疫療法は、がんと戦う患者の免疫系自体を助ける処置である。患者における転移を処
置するために使用される免疫療法にはいくつかのタイプがある。これらとしては、サイト
カイン、モノクローナル抗体および抗腫瘍ワクチンが挙げられるがこれらに限定されない
別の態様において、処置は、アルファラディン(ラジウム−223二塩化物)である。
アルファラディンは、がん細胞を殺すために、ラジウム−223の崩壊からのアルファ線
を使用する。ラジウム−223は、天然に、カルシウム模倣物としてのその特性のおかげ
で骨転移に対して自身を標的化する。アルファ線は、2〜10個の細胞という非常に短い
範囲(ベータまたはガンマ線に基づく現行の放射線治療と比べて)を有するので、周囲の
健常な組織(特に骨髄)にもたらす損傷はより少ない。カルシウムとよく似た特性を有す
るので、ラジウム−223は、身体内の骨を構築するためにカルシウムが使用されている
位置(去勢抵抗性の進行前立腺がんを有する男性の骨格転移に見られるようなより速い異
常な骨成長の部位を含む)に引き込まれる。ラジウム−223は、注射後、異常に骨が成
長している部位に血流によって運ばれる。がんが身体内で生じ始めた位置は、原発腫瘍と
して公知である。これらの細胞のうちのいくつかは、離脱して、血流によって身体の別の
部位に運ばれ得る。次いで、それらのがん細胞は、身体のその位置に定着して、新しい腫
瘍を形成し得る。これが起きる場合、それは、二次がんまたは転移と呼ばれる。末期の前
立腺がんを有するほとんどの患者は、骨にその疾患の最大の負担を被る。ラジウム−22
3を用いる目的は、この二次がんを選択的に標的化することである。骨に取り込まれない
任意のラジウム−223は、すみやかに腸へと経路を定められ、排泄される。
別の態様において、処置は、mTorインヒビターである。いくつかの態様において、
mTorインヒビターは、mTor/PI3キナーゼの二重インヒビターである。いくつ
かの態様において、mTorインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために
使用される。いくつかの態様において、mTorインヒビターは:ABI009(シロリ
ムス)、ラパマイシン(シロリムス)、Abraxane(パクリタキセル)、Abso
rb(エベロリムス)、Afinitor(エベロリムス)、Gleevecと併用のA
finitor、AS703026(ピマセルチブ)、Axxess(ウミロリムス)、
AZD2014、BEZ235、Biofreedom(ウミロリムス)、BioMat
rix(ウミロリムス)、BioMatrix flex(ウミロリムス)、CC115
、CC223、Combo Bio−engineered Sirolimus El
uting Stent ORBUSNEICH(シロリムス)、Curaxin CB
LC102(メパクリン)、DE109(シロリムス)、DS3078、Endeavo
r DES(ゾタロリムス)、Endeavor Resolute(ゾタロリムス)、
Femara(レトロゾール)、Hocena(アントロキノノール)、INK128、
Inspiron(シロリムス)、IPI504(レタスピマイシン塩酸塩)、KRN9
51(チボザニブ)、ME344、MGA031(テプリズマブ)、MiStent S
ES(シロリムス)、MKC1、Nobori(ウミロリムス)、OSI027、OVI
123(コルジセピン)、Palomid529、PF04691502、Promus
Element(エベロリムス)、PWT33597、Rapamune(シロリムス
)、Resolute DES(ゾタロリムス)、RG7422、SAR245409、
SF1126、SGN75(ボルセツズマブマホドチン(vorsetuzumab m
afodotin))、Synergy(エベロリムス)、Taltorvic(リダフ
ォロリムス)、Tarceva(エルロチニブ)、Torisel(テムシロリムス)、
Xience Prime(エベロリムス)、Xience V(エベロリムス)、Zo
maxx(ゾタロリムス)、Zortress(エベロリムス)、ゾタロリムス溶出性末
梢ステント(Peripheral Stent) MEDTRONIC(ゾタロリムス)
、AP23841、AP24170、ARmTOR26、BN107、BN108、Ca
nstatin GENZYME(カンスタチン)、CU906、EC0371、EC0
565、KI1004、LOR220、NV128、Rapamycin ONCOIM
MUNE(シロリムス)、SB2602、Sirolimus PNP SAMYANG
BIOPHARMACEUTICALS(シロリムス)、TOP216、VLI27、
VS5584、WYE125132、XL388、Advacan(エベロリムス)、A
ZD8055、Cypher Select Plus シロリムス溶出性冠動脈ステン
ト(シロリムス)、Cypher シロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、薬
物コーティングされたバルーン(シロリムス)、E−Magic Plus(シロリムス
)、Emtor(シロリムス)、Esprit(エベロリムス)、Evertor(エベ
ロリムス)、HBF0079、LCP−Siro(シロリムス)、Limus CLAR
IS(シロリムス)、mTORインヒビター CELLZOME、Nevo シロリムス
溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、nPT−mTOR、Rapacan(シロリムス
)、Renacept(シロリムス)、ReZolve(シロリムス)、Rocas(シ
ロリムス)、SF1126、Sirolim(シロリムス)、Sirolimus NO
RTH CHINA(シロリムス)、Sirolimus RANBAXY(シロリムス
)、Sirolimus WATSON(シロリムス)Siropan(シロリムス)、
Sirova(シロリムス)、Supralimus(シロリムス)、Supralim
us−Core(シロリムス)、Tacrolimus WATSON(タクロリムス)
、TAFA93、Temsirolimus ACCORD(テムシロリムス)、Tem
sirolimus SANDOZ(テムシロリムス)、TOP216、Xience
Prime(エベロリムス)、Xience V(エベロリムス)からなる群より選択さ
れる。具体的な態様において、mTorインヒビターは、Afinitor(エベロリム
ス)(http://www.afinitor.com/index.jsp?use
rtrack.filter_applied=true&NovaId=402946
2064338207963;最終アクセス日2012年11月28日)である。別の態
様において、エベロリムスは、アロマターゼインヒビターと組合わされる(例えば、Ba
selga,J.ら、Everolimus in Postmenopausal H
ormone−Receptor Positive Advanced Breast
Cancer.2012.N.Engl.J.Med.366(6):520−529
(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。別の態様において、mT
orインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る(例えば、Zhou,
H.ら、Updates of mTor inhibitors.2010.Anti
cancer Agents Med.Chem.10(7):571−81(これは本
明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつかの態様において、mTor
インヒビターは、ホルモンレセプターが陽性である患者において転移を処置するためまた
は予防するためまたは阻害するために使用される(例えば、Baselga,J.ら、E
verolimus in Postmenopausal Hormone−Rece
ptor Positive Advanced Breast Cancer.201
2.N.Engl.J.Med.366(6):520−529を参照のこと)。いくつ
かの実施形態において、患者は、ER+である。いくつかの態様において、mTorイン
ヒビターは、進行乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためま
たは阻害するために使用される。いくつかの態様において、mTorインヒビターは、第
2の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書
中に記載される任意の処置である。
別の態様において、処置は、Srcキナーゼインヒビターである。いくつかの態様にお
いて、Srcインヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。い
くつかの態様において、Srcキナーゼインヒビターは、以下の群:AZD0530(サ
ラカチニブ)、Bosulif(ボスチニブ)、ENMD981693、KD020、K
X01、Sprycel(ダサチニブ)、Yervoy(イピリムマブ)、AP2346
4、AP23485、AP23588、AZD0424、c−Srcキナーゼインヒビタ
ー KISSEI、CU201、KX2361、SKS927、SRN004、SUNK
706、TG100435、TG100948、AP23451、Dasatinib
HETERO(ダサチニブ)、Dasatinib VALEANT(ダサチニブ)、F
ontrax(ダサチニブ)、Srcキナーゼインヒビター KINEX、VX680(
トザセルチブ乳酸塩)、XL228およびSUNK706から選択される。いくつかの実
施形態において、Srcキナーゼインヒビターは、ダサチニブである。別の態様において
、Srcキナーゼインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る(例えば
、Sen,B.and Johnson,F.M.Regulation of Src
Family Kinases in Human Cancers.2011.J.
Signal Transduction.2011:14 pages(これは本明細
書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつかの態様において、Srcキナー
ゼインヒビターは、SRC応答性シグネチャ(SRS)が陽性である患者において転移を
処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様にお
いて、患者は、SRS+かつER−である(例えば、Zhang,CH.−F,ら、La
tent Bone Metastasis in Breast Cancer Ti
ed to Src−Dependent survival signals.200
9.Cancer Cell.16:67−78(これは本明細書中で参照により援用さ
れる)を参照のこと)。いくつかの態様において、Srcキナーゼインヒビターは、進行
乳がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するため
に使用される。いくつかの態様において、Srcキナーゼインヒビターは、第2の処置と
組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書中に記載さ
れる任意の処置である。
別の態様において、処置は、COX−2インヒビターである。いくつかの態様において
、COX−2インヒビターは、転移を予防するためまたは阻害するために使用される。い
くつかの態様において、COX−2インヒビターは、以下の群:ABT963、Acet
aminophen ER JOHNSON(アセトアミノフェン)、Acular X
(ケトロラクトロメタミン)、BAY1019036(アスピリン)、BAY98711
1(ジフェンヒドラミン、ナプロキセンナトリウム)、BAYl1902(ピロキシカム
)、BCIBUCH001(イブプロフェン)、Capoxigem(アプリコキシブ)
、CS502、CS670(ペルビプロフェン)、Diclofenac HPBCD(
ジクロフェナク)、Diractin(ケトプロフェン)、GW406381、HCT1
026(ニトロフルルビプロフェン)、Hyanalgese−D(ジクロフェナク)、
HydrocoDex(アセトアミノフェン、デキストロメトルファン、ヒドロコドン)
、Ibuprofen Sodium PFIZER(イブプロフェンナトリウム)、I
buprofen with Acetaminophen PFIZER(アセトアミ
ノフェン、イブプロフェン)、Impracor(ケトプロフェン)、IP880(ジク
ロフェナク)、IP940(インドメタシン)、ISV205(ジクロフェナクナトリウ
ム)、JNS013(アセトアミノフェン、トラマドール塩酸塩)、Ketoprofe
n TDS(ケトプロフェン)、LTNS001(ナプロキセンエテメシル)、Mesa
lamine SALIX(メサラミン)、Mesalamine SOFAR(メサラ
ミン)、Mesalazine(メサラミン)、ML3000(リコフェロン)、MRX
7EAT(エトドラク)、Naproxen IROKO(ナプロキセン)、NCX40
16(ニトロアスピリン)、NCX701(ニトロアセトアミノフェン)、Nuprin
SCOLR(イブプロフェン)、OMS103HP(アミトリプチリン塩酸塩、ケトプ
ロフェン、オキシメタゾリン塩酸塩)、Oralease(ジクロフェナク)、Oxyc
oDex(デキストロメトルファン、オキシコドン)、P54、PercoDex(アセ
トアミノフェン、デキストロメトルファン、オキシコドン)、PL3100(ナプロキセ
ン、ホスファチジルコリン)、PSD508、R−Ketoprofen(ケトプロフェ
ン)、Remura(ブロムフェナクナトリウム)、ROX828(ケトロラクトロメタ
ミン)、RP19583(ケトプロフェンリジン)、RQ00317076、SDX10
1(R−エトドラク)、TDS943(ジクロフェナクナトリウム)、TDT070(ケ
トプロフェン)、TPR100、TQ1011(ケトプロフェン)、TT063(S−フ
ルルビプロフェン)、UR8880(シミコキシブ)、V0498TA01A(イブプロ
フェン)、VT122(エトドラク、プロプラノロール)、XP20B(アセトアミノフ
ェン、デキストロプロポキシフェン)、XP21B(ジクロフェナクカリウム)、XP2
1L(ジクロフェナクカリウム)、Zoenasa(アセチルシステイン、メサラミン)
、Acephen、Actifed Plus、Actifed−P、Acular、A
cular LS、Acular PF、Acular X、Acuvail、Advi
l、Advil Allergy Sinus、Advil Cold and Sin
us、Advil Congestion Relief、Advil PM、Advi
l PM Capsule、Air Salonpas、Airtal、Alcohol
−Free NyQuil Cold & Flu Relief、Aleve、Ale
ve ABDI IBRAHIM、Aleve−D、Alka−Seltzer、Alk
a−Seltzer BAYER、Alka−Seltzer Extra Stren
gth、Alka−Seltzer Lemon−Lime、Alka−Seltzer
Original、Alka−Seltzer Plus、Alka−Seltzer
plus Cold and Cough、Alka−Seltzer plus C
old and Cough Formula、Alka−Seltzer Plus
Day and Night Cold Formula、Alka−Seltzer
Plus Day Non−Drowsy Cold Formula、Alka−Se
ltzer Plus Flu Formula、Alka−Seltzer Plus
Night Cold Formula、Alka−Seltzer Plus Si
nus Formula、Alka−Seltzer Plus Sparkling
Original Cold Formula、Alka−Seltzer PM、Al
ka−Seltzer Wake−Up Call、Anacin、Anaprox、A
naprox MINERVA、Ansaid、Apitoxin、Apranax、A
pranax abdi、Arcoxia、Arthritis Formula Be
ngay、Arthrotec、Asacol、Asacol HD、Asacol M
EDUNA ARZNEIMITTEL、Asacol ORIFARM、Aspiri
n BAYER、Aspirin Complex、Aspirin Migran、A
ZD3582、Azulfidine、Baralgan M、BAY1019036、
BAY987111、BAYl1902、BCIBUCH001、Benadryl A
llergy、Benadryl Day and Night、Benylin 4
Flu、Benylin Cold and Flu、Benylin Cold an
d Flu Day and Night、Benylin Cold and Sin
us Day and Night、Benylin Cold and Sinus
Plus、Benylin Day and Night Cold and Flu
Relief、Benylin1 All−In−One、Brexin、Brexin
ANGELINI、Bromday、Bufferin、Buscopan Plus
、Caldolor、Calmatel、Cambia、Canasa、Capoxig
em、Cataflam、Celebrex、Celebrex ORIFARM、Ch
ildren’s Advil Allergy Sinus、Children’s
Tylenol、Children’s Tylenol Cough and Run
ny Nose、Children’s Tylenol plus cold、Chi
ldren’s Tylenol plus Cold and Cough、Chil
dren’s Tylenol plus cold and stuffy nose
、Children’s Tylenol plus Flu、Children’s
Tylenol plus cold & allergy、Children’s T
ylenol plus Cough & Runny Nose、Children’
s Tylenol plus Cough & Sore Throat、Child
ren’s Tylenol plus multi symptom cold、Cl
inoril、Codral Cold and Flu、Codral Day an
d Night Day Tablets、Codral Day and Night
Night Tablets、Codral Nightime、Colazal、C
ombunox、Contac Cold plus Flu、Contac Cold
plus Flu Non−Drowsy、Coricidin D、Coricid
in HBP Cold and Flu、Coricidin HBP Day an
d Night Multi−Symptom Cold、Coricidin HBP
Maximum Strength Flu、Coricidin HBP Nigh
ttime Multi−Symptom Cold、Coricidin II Ex
tra Strength Cold and Flu、CS502、CS670、Da
ypro、Daypro Alta、DDS06C、Demazin Cold and
Flu、Demazin Cough、Cold and Flu、Demazin
day/night Cold and Flu、Demazin PE Cold a
nd Flu、Demazin PE day/night Cold and Flu
、Diclofenac HPBCD、Dimetapp Day Relief、Di
metapp Multi−Symptom Cold and Flu、Dimeta
pp Night Relief、Dimetapp Pain and Fever
Relief、Dimetapp PE Sinus Pain、Dimetapp P
E Sinus Pain plus Allergy、Dipentum、Dirac
tin、Disprin Cold ’n’ Fever、Disprin Extra
、Disprin Forte.Disprin Plus、Dristan Cold
、Dristan Junior、Drixoral Plus、Duexis、Dyn
astat、Efferalgan、Efferalgan Plus Vitamin
C、Efferalgan Vitamin C、Elixsure IB、Exce
drin Back and Body、Excedrin Migraine、Exc
edrin PM、Excedrin Sinus Headache、Excedri
n Tension Headache、Falcol、Fansamac、Felde
ne、FeverAll、Fiorinal、Fiorinal with Codei
ne、Flanax、Flector Patch、Flucam、Fortagesi
c、Gerbin、Giazo、Gladio、Goody’s Back and B
ody Pain、Goody’s Cool Orange、Goody’s Ext
ra Strength、Goody’s PM、Greaseless Bengay
、GW406381、HCT1026、He Xing Yi、Hyanalgese−
D、HydrocoDex、Ibuprofen Sodium PFIZER、Ibu
profen with、Acetaminophen PFIZER、Icy Hot
SANOFI AVENTIS、Impracor、Indocin、Indomet
hacin APP PHARMA、Indomethacin MYLAN、Infa
nts’ Tylenol、IP880、IP940、Iremod、ISV205、J
NS013、Jr.Tylenol、Junifen、Junior Strength
Advil、Junior Strength Motrin、Ketoprofen
TDS、Lemsip Max、Lemsip Max All in One、Le
msip Max All Night、Lemsip Max Cold and F
lu、Lialda、Listerine Mouth Wash、Lloyds Cr
eam、Lodine、Lorfit P、Loxonin、LTNS001、Mers
yndol、Mesalamine SALIX、Mesalamine SOFAR、
Mesalazine、Mesasal GLAXO、Mesasal SANOFI、
Mesulid、Metsal Heat Rub、Midol Complete、M
idol Extended Relief、Midol Liquid Gels、M
idol PM、Midol Teen Formula、
Migranin COATED TABLETS、ML3000、Mobic、Moh
rus、Motrin、Motrin Cold and Sinus Pain、Mo
trin PM、Movalis ASPEN、MRX7EAT、Nalfon、Nal
fon PEDINOL、Naprelan、Naprosyn、Naprosyn R
PG LIFE SCIENCE、Naproxen IROKO、NCX4016、N
CX701、NeoProfen LUNDBECK、Nevanac、Nexcede
、Niflan、Norgesic MEDICIS、Novalgin、Nuprin
SCOLR、Nurofen、Nurofen Cold and Flu、Nuro
fen Max Strength Migraine、Nurofen Plus、N
uromol、NyQuil with Vitamin C、Ocufen、OMS1
03HP、Oralease、Orudis ABBOTT JAPAN、Oruvai
l、Osteluc、OxycoDex、P54、Panadol、Panadol A
ctifast、Paradine、Paramax、Parfenac、Pedea、
Pennsaid、Pentasa、Pentasa ORIFARM、Peon、Pe
rcodan、Percodan−Demi、PercoDex、Percogesic
、Perfalgan、PL2200、PL3100、Ponstel、Prexige
、Prolensa、PSD508、R−Ketoprofen、Rantudil、R
elafen、Remura、Robaxisal、Rotec、Rowasa、ROX
828、RP19583、RQ00317076、Rubor、Salofalk、Sa
lonpas、Saridon、SDX101、Seltouch、sfRowasa、
Shinbaro、Sinumax、Sinutab、Sinutab、sinus、S
palt、Sprix、Strefen、Sudafed Cold and Coug
h、Sudafed Head Cold and Sinus、Sudafed PE
Cold plus Cough、Sudafed PE Pressure plu
s Pain、Sudafed PE、Severe Cold、Sudafed PE
Sinus Day plus Night Relief Day Tablets
、Sudafed PE Sinus Day plus Night Relief
Night Tablets、Sudafed PE Sinus plus Anti
−inflammatory Pain Relief、Sudafed Sinus
Advance、Surgam、Synalgos−DC、Synflex、Tavis
t allergy/sinus/headache、TDS943、TDT070、T
heraflu Cold and Sore Throat、Theraflu Da
ytime Severe Cold and Cough、Theraflu Day
time Warming Relief,Theraflu Warming Rel
ief Caplets Daytime Multi−Symptom Cold、T
heraflu Warming Relief Cold and Chest Co
ngestion、Thomapyrin、Thomapyrin C、Thomapy
rin Effervescent、Thomapyrin Medium、Tilco
til、Tispol、Tolectin、Toradol、TPR100、TQ101
1、Trauma−Salbe、Trauma−Salbe Kwizda、Treo、
Treximet、Trovex、TT063、Tylenol、Tylenol Al
lergy Multi−Symptom、Tylenol Back Pain、Ty
lenol Cold & Cough Daytime、Tylenol Cold
& Cough Nighttime、Tylenol Cold and Sinus
Daytime、Tylenol Cold and Sinus Nighttim
e、Tylenol Cold Head Congestion Severe、Ty
lenol Cold Multi Symptom Daytime、Tylenol
Cold Multi Symptom Nighttime Liquid、Tyl
enol Cold Multi Symptom Severe、Tylenol C
old Non−Drowsiness Formula、Tylenol Cold
Severe Congestion Daytime、Tylenol Comple
te Cold,Cough and Flu Night time、Tylenol
Flu Nighttime、Tylenol Menstrual、Tylenol
PM、Tylenol Sinus Congestion & Pain Dayt
ime、Tylenol Sinus Congestion & Pain Nigh
ttime、Tylenol Sinus Congestion & Pain Se
vere、Tylenol Sinus Severe Congestion Day
time、Tylenol Ultra Relief、Tylenol with C
affeine and Codeine phosphate、Tylenol wi
th Codeine phosphate、Ultra Strength Beng
ay Cream、Ultracet、UR8880、V0498TA01A、Vick
s NyQuil Cold and Flu Relief、Vicoprofen、
Vimovo、Voltaren Emulgel、Voltaren GEL、Vol
taren NOVARTIS CONSUMER HEALTH GMBH、Volt
aren XR、VT122、Xefo、Xefo Rapid、Xefocam、Xi
brom、XL3、Xodol、XP20B、XP21B、XP21L、Zipsorお
よびZoenasaから選択される。別の態様において、COX−2インヒビターは、当
該分野で公知の方法によって特定され得る(例えば、Dannhardt,G.and
Kiefer,W.Cyclooxygenase inhibitors−curre
nt status and future prospects.2001.Eur.
J.Med.Chem.36:109−126(これは本明細書中で参照により援用され
る)を参照のこと)。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、進行乳がん
を有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用
される。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、第2の処置と組み合わせ
て使用される。いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の
処置である。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、デノスマブ、Zom
eta(http://www.us.zometa.com/index.jsp?u
sertrack.filter_applied=true&NovaId=2935
376934467633633;最終アクセス日2012年12月2日)、Carbo
zantinibまたはCabozantinib、PTHLH(副甲状腺ホルモン様ホ
ルモン)またはPTHrP(副甲状腺ホルモン関連タンパク質)を阻止する抗体またはペ
プチドおよびEverolimusからなる群より選択される第2の処置と組み合わせて
使用される。
別の態様において、骨分解を回避するためおよび/または予防するために使用される処
置剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・副甲状腺ホルモン(PTH)インヒビターおよび副甲状腺様ホルモン(PTHLH)イ
ンヒビター(阻止抗体を含む)またはそれらの組換え型(PTHのアミノ酸7〜34に対
応するテリパラチド)。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによ
って作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細
胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤」(DABA)と呼ばれる薬物の群の一部を形
成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子」(SERM)は、機序に関係なくエストロゲンが
レセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲン
レセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラ
ジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン、TSE−424、タ
モキシフェン、イドキシフェン、LY353381、LY117081、トレミフェン、
フルベストラント、4−[7−(2,2−ジメチル−1−オキソプロポキシ−4−メチル
−2−[4−[2−(1−ピペリジニル)エトキシ]フェニル]−2H−1−ベンゾピラ
ン−3−イル]−フェニル−2,2−ジメチルプロパノエート4,4’ジヒドロキシベン
ゾフェノン−2,4−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびSH646が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カ
ルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん(後者は、乳がんおよび前立腺
がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない)などの、骨吸収および再吸収
を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第5の方法
によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素
含有ビスホスホネート(例えば、パミドロネート、ネリドロネート、オルパドロネート、
アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネ
ートまたはゾレドロン酸など)および窒素非含有ビスホスホネート(例えば、エチドロネ
ート、クロドロネート、チルドロネートなど)が挙げられるが、これらに限定されない。
・「カテプシンKインヒビター」とは、カテプシンKシステインプロテアーゼ活性を干渉
する化合物のことを指す。カテプシンKインヒビターの非限定的な例としては、4−アミ
ノ−ピリミジン−2−カルボニトリル誘導体(Novartis Pharma GMB
Hの名称における国際特許出願WO03/020278に記載されている)、公報WO0
3/020721(Novartis Pharma GMBH)および公報WO04/
000843(ASTRAZENECA AB)に記載されているピロロ−ピリミジン、
ならびにAxys Pharmaceuticalsの公報PCT WO00/5512
6、Merck Frosst Canada & Co.およびAxys Pharm
aceuticalsのWO01/49288に記載されているインヒビターが挙げられ
る。
・本明細書中で使用されるとき「DKK−1(Dickkopf−1)インヒビター」は
、DKK−1活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。DKK−1は、
主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギ
ュレートされる、可溶性Wnt経路アンタゴニストである。DKK−1を標的化する薬剤
は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患を予防する際に役割を果たし得る。Nova
rtis製のBHQ880は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗DKK−1中
和抗体である。前臨床試験は、BHQ880が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘
導する溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している(Ettenberg S.ら、
American Association for Cancer Research
Annual Meeting.April 12−16,2008;San Die
go,Calif.Abstract)。
・本明細書中で使用されるとき「METおよびVEGFR2の二重インヒビター」は、M
ETによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路お
よびVEGF経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。METは
、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞(骨を形成する細胞)および破骨細胞(
骨を除去する細胞)においても発現される。HGFは、これらの細胞型のすべてにおける
METに結合し、MET経路に複数のオートクラインループおよびパラクリンループにお
ける重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるMETの活性化は、転移性の骨病変の確立に
おいて重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるMET経路の活
性化は、異常な骨の成長(すなわち、芽細胞性の病変)または破壊(すなわち、溶解性の
病変)を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、MET経路の標的化は
、転移性の骨病変の確立および進行を予防する際の実行可能なストラテジーであり得る。
以前はXL184(CAS849217−68−1)として知られていたCabozan
tinib(Exelixis,Inc)は、METによって駆動される腫瘍エスケープ
を阻止するようにデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力な二重インヒビ
ターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を殺し、転移を減
少させ、血管新生(腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成)を阻害すると示
されている。別の好適な二重インヒビターは、E7050(N−[2−フルオロ−4−(
{2−[4−(4−メチルピペラジン−1−イル)ピペリジン−1−イル]カルボニルア
ミノピリジン−4−イル}オキシ)フェニル]−N’−(4−フルオロフェニル)シクロ
プロパン−1,1−ジカルボキサミド(2R,3R)−タルトレート)(CAS9280
37−13−2)またはForetinib(GSK1363089、XL880、CA
S849217−64−7としても知られる)である。
・本明細書中で使用されるとき「RANKLインヒビター」は、RANK活性を低下させ
ることができる任意の化合物のことを指す。RANKLは、ストローマ細胞およびT−リ
ンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見られ、これらのT−リンパ球細胞は、それを分泌す
る能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞であ
る破骨細胞の活性化である。RANKLインヒビターは、RANKLがそのレセプター(
RANK)に結合するのを阻止すること、RANK媒介性シグナル伝達を阻止すること、
またはRANKLの転写もしくは翻訳を阻止することによってRANKLの発現を減少さ
せることによって、作用し得る。本発明における使用に適したRANKLアンタゴニスト
またはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・RANKLに結合することができ、RANKタンパク質の細胞外ドメインの全体または
フラグメントを含む、好適なRANKタンパク質。可溶性RANKは、マウスもしくはヒ
トRANKポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、または
あるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはRANKL結合能を有するそのバリアント。
・RANKL特異的アンチセンス分子。
・RANKLの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗RANKL抗体。「抗RANKL抗体またはRANKLに対する抗体」は、
1つまたは複数のRANKLの機能を阻害する、核因子κBに対する活性化レセプターの
リガンド(RANKL)に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書中で理
解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。したがっ
て、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調
製される。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Nature,
1975,256:495)に記載されている方法を用いて調製される。本発明の文脈に
おいて好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、
フラグメント「Fab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scFv、ダ
イアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗RANKLナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構
造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療的タンパク質である。ナノボディ技術は、
ラクダ科動物(ラクダおよびラマ)が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見
の後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
であり、ここで、FR1からFR4は、フレームワーク領域1〜4であり、CDR1から
CDR3は、相補性決定領域1〜3である。これらの重鎖抗体は、1つの可変ドメイン(
VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。重要なことには、ク
ローニングされ、単離されたVHHドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有す
る完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新
しく発見されたVHHドメインは、Ablynxがナノボディと名付けた治療用抗体の新
時代の基礎を形成している。
1つの実施形態において、RANKLインヒビターは、RANKL特異的抗体、RAN
KL特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される。具体的な
実施形態において、抗RANKL抗体は、モノクローナル抗体である。なおもより具体的
な実施形態において、抗RANKL抗体は、デノスマブ(Pageau,Steven
C.(2009).mAbs 1(3):210−215、CAS番号615258−4
0−7)(その全内容が本明細書によって参照により援用される)である。デノスマブは
、RANKLに結合して、その活性化を妨げる完全にヒトのモノクローナル抗体である(
これは、RANKレセプターには結合しない)。デノスマブの様々な態様が、米国特許第
6,740,522号;同第7,411,050号;同第7,097,834号;同第7
,364,736号(これらの各々の全内容が本明細書によって参照により援用される)
によって包含されている。別の実施形態において、RANKLインヒビターは、デノスマ
ブと同じエピトープに結合する抗体、抗体フラグメントまたは融合構築物。
好ましい実施形態において、抗RANKLナノボディは、WO2008142164(
その内容は参照により本願に援用される)に記載されているようなナノボディのいずれか
である。なおもより好ましい実施形態において、抗RANKL抗体は、ALX−0141
(Ablynx)である。ALX−0141は、閉経後の骨粗鬆症、関節リウマチ、がん
およびある特定の薬剤に関連する骨減少を阻害するように、および健常な骨代謝のバラン
スを再建するように、デザインされた。
好ましい実施形態において、骨分解を予防する薬剤は、ビスホスホネート、RANKL
インヒビター、PTHおよびPTHLHインヒビターまたはPRGアナログ、ラネル酸ス
トロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター
、エストロゲンレセプター調節因子、ラジウム−223カルシトニンならびにカテプシン
Kインヒビターからなる群より選択される。より好ましい実施形態において、骨分解を予
防する薬剤は、ビスホスホネートである。なおもより好ましい実施形態において、ビスホ
スホネートは、ゾレドロン酸である。
1つの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、骨への原発性乳がん腫瘍の転移
を予防するためまたは阻害するために投与される。1つの実施形態において、CCR5ア
ンタゴニストは、大分子である。別の実施形態において、CCR5アンタゴニストは、小
分子である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、Maravir
oc(Velasco−Vela’quez,M.ら、2012.CCR5 Antag
onist Blocks Metastasis of Basal Breast
Cancer Cells.Cancer Research.72:3839−385
0)である。いくつかの実施形態において、CCR5アンタゴニストは、Vicrivi
roc(Velasco−Vela’quez,M.ら、2012.CCR5 Anta
gonist Blocks Metastasis of Basal Breast
Cancer Cells.Cancer Research.72:3839−38
50)である。いくつかの態様において、CCR5アンタゴニストは、Aplaviro
c(Demarest J.F.ら、2005.Update on Aplaviro
c:An HIV Entry Inhibitor Targeting CCR5.
Retrovirology 2(Suppl.1):S13)である。いくつかの態様
において、CCR5アンタゴニストは、スピロピペリジンCCR5アンタゴニスト(Ro
tstein D.M.ら、2009.Spiropiperidine CCR5 a
ntagonists.Bioorganic & Medicinal Chemis
try Letters.19(18):5401−5406)である。いくつかの実施
形態において、CCR5アンタゴニストは、INCB009471(Kuritzkes
,D.R.2009.HIV−1 entry inhibitors:an over
view.Curr.Opin.HIV AIDS.4(2):82−7)である。
好ましい実施形態において、METおよびVEGFR2の二重インヒビターは、Cab
ozantinib、ForetinibおよびE7050からなる群より選択される。
好ましい実施形態において、ラジウム223治療は、アルファラディンである。
あるいは、転移を処置するためおよび/もしくは予防するために上で述べられた薬剤の
うちの2つ以上の薬剤が組み合わされる組合せ処置が行われ得るか、または上記薬剤は、
他のサプリメント(例えば、カルシウムまたはビタミンD)もしくはホルモン処置と組み
合わされ得る。
c−MAF阻害剤を使用して、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんからの骨転移を処置するための方法
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんからの骨転移の処置または予防において使用するためのc−MAF
阻害剤(本明細書中以後、本発明の阻害剤)に関する。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんからの骨転移の処置または予防のための医薬を製造するための、c
−MAF阻害剤の使用に関する。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんからの骨転移の処置または予防を必要とする被験体へのc−MAF
阻害剤の投与を含む、上記被験体におけるそのような処置または予防のための方法に関す
る。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している被験体における骨転移のリスクを予防するためまた
は減少させるための方法に関し、上記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤
を上記被験体に投与する工程を含み、ここで、上記薬剤は、上記被験体におけるc−MA
Fの発現レベルの定量から決定された処置レジメンに従って投与される。
非限定的な例証として、本発明における使用に適したc−MAF阻害剤としては、アン
チセンスオリゴヌクレオチド、干渉RNA(siRNA)、触媒RNA、特異的なリボザ
イム、阻害性抗体もしくはナノボディ、ドミナントネガティブc−MAFバリアント、ま
たは表1もしくは表2の化合物が挙げられる。
アンチセンスオリゴヌクレオチド
本発明のさらなる態様は、発現を阻害する、例えば、活性が阻害されるべきであるc−
MAFをコードする核酸の転写および/または翻訳を阻害するための、単離された「アン
チセンス」核酸の使用に関する。アンチセンス核酸は、従来の塩基相補性によって、また
は、例えば、二重らせんの主溝(large groove)における特異的な相互作用
を介して二本鎖DNAに結合する場合、薬物の潜在的な標的に結合し得る。通常、これら
の方法は、当該分野において通常使用される一連の技法のことを指し、それらには、オリ
ゴヌクレオチド配列への特異的結合に基づく任意の方法が含まれる。
本発明のアンチセンス構築物は、例えば、細胞において転写されるときに、c−MAF
をコードする細胞mRNAの少なくとも1つの独特の部分に相補的なRNAを生成する発
現プラスミドとして、分配され得る。あるいは、アンチセンス構築物は、細胞に導入され
たら、標的核酸のmRNAおよび/または遺伝子配列とハイブリダイズして遺伝子発現の
阻害をもたらす、エキソビボにおいて生成されたオリゴヌクレオチドプローブである。そ
のようなオリゴヌクレオチドプローブは、好ましくは、内因性ヌクレアーゼ、例えば、エ
キソヌクレアーゼおよび/またはエンドヌクレアーゼに抵抗性であるがゆえにインビボに
おいて安定である、改変されたオリゴヌクレオチドである。アンチセンスオリゴヌクレオ
チドとしてそれらを使用するための核酸分子の例は、ホスホルアミデート、ホスホチオネ
ートおよびメチルホスホネートのDNAアナログである(米国特許第5,176,996
号;同第5,264,564号;および同第5,256,775号も参照のこと)(これ
らの各々は、その全体が参照により本明細書中に援用される)。さらに、アンチセンス治
療において有用なオリゴマーを構築するための一般的なアプロキシメーション(appr
oximations)は、例えば、Van der Krolら、BioTechni
ques 6:958−976,1988;およびSteinら、Cancer Res
48:2659−2668,1988に概説されている。
アンチセンスオリゴヌクレオチドに関して、標的遺伝子の翻訳開始部位由来のオリゴデ
オキシリボヌクレオチド領域、例えば、−10〜+10が、好ましい。アンチセンスアプ
ロキシメーションは、標的ポリペプチドをコードするmRNAに相補的なオリゴヌクレオ
チドのデザイン(DNAまたはRNAのいずれか)を含む。アンチセンスオリゴヌクレオ
チドは、転写されたmRNAに結合して、翻訳が妨げられる。
mRNAの5’末端、例えば、開始コドンAUGを含むそこまでの非翻訳5’配列に相
補的なオリゴヌクレオチドは、翻訳を阻害するために最も効率的な様式で機能するに違い
ない。それにもかかわらず、mRNAの非翻訳3’配列に相補的な配列もまた、mRNA
翻訳を阻害するために効率的であることが最近示された(Wagner,Nature
372:333,1994)。ゆえに、mRNAの翻訳を阻害するアンチセンスアプロキ
シメーションでは、遺伝子の非コード領域である非翻訳5’または3’領域において相補
的なオリゴヌクレオチドが、使用され得る。mRNAの非翻訳5’領域に相補的なオリゴ
ヌクレオチドは、開始コドンAUGの相補体を含まなければならない。mRNAのコード
領域に相補的なオリゴヌクレオチドは、それほど効率的な翻訳インヒビターでないが、そ
れらも、本発明に従って使用され得る。それらが、mRNAの5’領域、3’領域または
コード領域とハイブリダイズするようにデザインされる場合、アンチセンス核酸は、少な
くとも6ヌクレオチド長を有しなければならず、好ましくは、およそ100未満、より好
ましくは、およそ50、25、17または10未満のヌクレオチド長を有しなければなら
ない。
好ましくは、まず、アンチセンスオリゴヌクレオチドが遺伝子発現を阻害する能力を定
量するインビトロ研究を行う。好ましくは、これらの研究は、オリゴヌクレオチドのアン
チセンス遺伝子阻害と非特異的な生物学的作用とを識別するコントロールを使用する。ま
た、好ましくは、これらの研究は、標的RNAまたはタンパク質のレベルをRNAまたは
タンパク質の内部コントロールのレベルと比較した。アンチセンスオリゴヌクレオチドを
使用して得られる結果は、コントロールオリゴヌクレオチドを使用して得られる結果と比
較され得る。好ましくは、コントロールオリゴヌクレオチドは、アッセイされるオリゴヌ
クレオチドとほぼ同じ長さであり、オリゴヌクレオチド配列は、標的配列への特異的なハ
イブリダイゼーションを妨げるために必要であると考えられるアンチセンス配列にすぎな
いものと異ならない。
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、一本鎖もしくは二本鎖のDNAもしくはRNA、
またはそれらのキメラ混合物もしくは誘導体もしくは修飾されたバージョンであり得る。
オリゴヌクレオチドは、例えば、分子の安定性、そのハイブリダイゼーション能力などを
改善するために、塩基の基、糖の基またはリン酸骨格において修飾され得る。オリゴヌク
レオチドは、他の結合基(例えば、ペプチド(例えば、オリゴヌクレオチドを宿主細胞の
レセプターに導くためのペプチド)または細胞膜を通じた輸送を促進するための物質(例
えば、Letsingerら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.8
6:6553−6556,1989;Lemaitreら、Proc.Natl.Aca
d.Sci.84:648−652,1987;PCT公開番号WO88/09810を
参照のこと)もしくは血液脳関門を通じた輸送を促進するための物質(例えば、PCT公
開番号WO89/10134を参照のこと)、挿入剤(例えば、Zon,Pharm.R
es.5:539−549,1988を参照のこと))を含み得る。このために、オリゴ
ヌクレオチドは、別の分子、例えば、ペプチド、輸送剤(transporting a
gent)、ハイブリダイゼーションによって惹起される切断剤などに結合体化され得る
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、修飾された塩基の少なくとも1つの基を含み得る
。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アラビノース、2−フルオロアラビノース、キシ
ルロースおよびヘキソースを含むがこれらに限定されない群から選択される少なくとも1
つの修飾された糖の基も含み得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、中性ペプチドに
類似の骨格も含み得る。そのような分子は、ペプチド核酸(PNA)オリゴマーとして知
られており、例えば、Perry−O’Keefeら、Proc.Natl.Acad.
Sci.U.S.A.93:14670,1996およびEglomら、Nature
365:566,1993に記載されている。
なおも別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの
修飾されたリン酸骨格を含む。なおも別の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレ
オチドは、アルファ−アノマーオリゴヌクレオチドである。
標的mRNA配列のコード領域に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを使用する
ことができるが、転写される非翻訳領域に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを使
用することもできる。
場合によっては、内因性のmRNA翻訳を抑制するのに十分な細胞内濃度のアンチセン
スに到達することが難しいことがある。ゆえに、好ましいアプロキシメーションは、アン
チセンスオリゴヌクレオチドを強力なpol IIIまたはpol IIプロモーターの
支配下に配置した組換えDNA構築物を使用する。
あるいは、遺伝子制御領域(すなわち、プロモーターおよび/またはエンハンサー)に
相補的なデオキシリボヌクレオチド配列に、体内の標的細胞において遺伝子転写を妨げる
三重らせん構造を形成するように指示することによって、標的遺伝子発現を減少させるこ
とができる(Helene,Anticancer Drug Des.6(6):56
9−84,1991を広く参照のこと)。ある特定の実施形態において、アンチセンスオ
リゴヌクレオチドは、アンチセンスモルホリンである。
siRNA
低分子干渉RNAまたはsiRNAは、RNA干渉によって標的遺伝子の発現を阻害す
ることができる物質である。siRNAは、化学的に合成され得るか、インビトロ転写に
よって得ることができるか、または標的細胞においてインビボで合成され得る。代表的に
は、siRNAは、15〜40ヌクレオチド長の二本鎖RNAからなり、1〜6ヌクレオ
チドの3’および/または5’突出領域を含み得る。その突出領域の長さは、siRNA
分子の全長と無関係である。siRNAは、転写後の標的メッセンジャーの分解またはサ
イレンシングによって作用する。
本発明のsiRNAは、c−MAFをコードする遺伝子のmRNAまたは上記タンパク
質をコードする遺伝子配列と実質的に相同である。「実質的に相同」は、siRNAが、
RNA干渉によって後者を分解することができるほど、標的mRNAと十分に相補的また
は類似である配列を有すると理解される。上記干渉を引き起こすために適したsiRNA
としては、RNAによって形成されるsiRNA、ならびに種々の化学修飾を含むsiR
NA、例えば:
・ヌクレオチド間の結合が天然に見られる結合と異なる(例えば、ホスホロチオネート結
合)siRNA
・フルオロフォアなどの機能的な試薬とRNA鎖の結合体
・2’位の種々のヒドロキシル官能基での修飾による、RNA鎖の末端、特に3’末端の
修飾
・2’−O−メチルリボースまたは2’−O−フルオロリボースのような2’位における
O−アルキル化残基などの改変された糖を有するヌクレオチド
・ハロゲン化された塩基(例えば、5−ブロモウラシルおよび5−ヨードウラシル)、ア
ルキル化された塩基(例えば、7−メチルグアノシン)などの改変された塩基を有するヌ
クレオチド
が挙げられる。
siRNAは、そのままで、すなわち、上述の特徴を有する二本鎖RNAの形態で、使
用され得る。あるいは、siRNAのセンス鎖配列およびアンチセンス鎖配列を含むベク
ターを、目的の細胞におけるその発現に好適なプロモーターの支配下で使用することが、
可能である。
siRNAの発現に適したベクターは、siRNAの2本の鎖をコードする2つのDN
A領域が、転写の際にループを形成するスペーサー領域によって分断された1本の同じD
NA鎖においてタンデムに配置されているベクターであり、単一のプロモーターが、sh
RNAを生じるDNA分子の転写を指示する。
あるいは、siRNAを形成する各鎖が、異なる転写単位の転写から形成されるベクタ
ーを使用することも可能である。これらのベクターは、その後、分岐(divergen
t)転写ベクターと収束(convergent)転写ベクターとに分割される。分岐転
写ベクターでは、siRNAを形成する各DNA鎖の転写が、同じであっても異なっても
よいそれ自体のプロモーターに依存するように、その各DNA鎖をコードする転写単位が
、ベクター内でタンデムに配置される(Wang,J.ら、2003,Proc.Nat
l.Acad.Sci.USA.,100:5103−5106およびLee,N.S.
ら、2002,Nat.Biotechnol.,20:500−505)。収束転写ベ
クターでは、siRNAを生じるDNA領域は、2つの逆方向のプロモーターに隣接した
DNA領域のセンス鎖およびアンチセンス鎖を形成する。センスおよびアンチセンスのR
NA鎖の転写の後、後者は、機能的siRNAを形成するためにハイブリッドを形成する
。2つのU6プロモーター(Tran,N.ら、2003,BMC Biotechno
l.,3:21)、マウスU6プロモーターおよびヒトH1プロモーター(Zheng,
L.ら、2004,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,135−140
およびWO2005026322)ならびにヒトU6プロモーターおよびマウスH1プロ
モーター(Kaykas,A.and Moon,R.,2004,BMC Cell
Biol.,5:16)が使用される逆方向プロモーター系を有するベクターが記載され
ている。
収束発現ベクターまたは分岐発現ベクターからのsiRNAの発現におけるその使用に
適したプロモーターには、siRNAを発現させようとする細胞と適合性の任意のプロモ
ーターまたはプロモーター対が含まれる。したがって、本発明に適したプロモーターとし
ては、構成的プロモーター(例えば、真核生物ウイルス(例えば、ポリオーマウイルス、
アデノウイルス、SV40、CMV、トリ肉腫ウイルス、B型肝炎ウイルス)のゲノムに
由来するプロモーター)、メタロチオネイン遺伝子プロモーター、単純ヘルペスウイルス
のチミジンキナーゼ遺伝子プロモーター、レトロウイルスLTR領域、免疫グロブリン遺
伝子プロモーター、アクチン遺伝子プロモーター、EF−1アルファ遺伝子プロモーター
、ならびにタンパク質発現が分子または外来性シグナルの添加に依存する誘導性プロモー
ター、例えば、テトラサイクリンシステム、NFカッパーB/UV光システム、Cre/
Loxシステムおよび熱ショック遺伝子プロモーター、WO/2006/135436に
記載されている制御可能なRNAポリメラーゼIIプロモーターならびに組織特異的プロ
モーター(例えば、WO2006012221に記載されているPSAプロモーター)が
挙げられるが、必ずしもこれらに限定されない。好ましい実施形態において、プロモータ
ーは、恒常的に作用するRNAポリメラーゼIIIプロモーターである。RNAポリメラ
ーゼIIIプロモーターは、限られた数の遺伝子(例えば、5S RNA、tRNA、7
SL RNAおよびU6 snRNA)にしか見られない。他のRNAポリメラーゼII
Iプロモーターとは異なり、III型プロモーターは、いかなる遺伝子内配列も必要とせ
ず、むしろ、−34および−24位におけるTATAボックス、−66〜−47の近位配
列エレメントすなわちPSE、および場合によっては、−265〜−149位の遠位配列
エレメントすなわちDSEを含む5’方向の配列を必要とする。好ましい実施形態におい
て、III型RNAポリメラーゼIIIプロモーターは、ヒトまたはマウスのH1遺伝子
およびU6遺伝子のプロモーターである。なおもより好ましい実施形態において、プロモ
ーターは、2つのヒトまたはマウスのU6プロモーター、マウスU6プロモーターおよび
ヒトH1プロモーターまたはヒトU6プロモーターおよびマウスH1プロモーターである
。本発明の文脈において、ERアルファ遺伝子プロモーターまたはサイクリンD1遺伝子
プロモーターは、特に好適であり、ゆえに、乳房腫瘍、好ましくは、トリプルネガティブ
(基底細胞様を含む)乳房腫瘍において目的の遺伝子を特異的に発現させるために特に好
ましい。
siRNAは、siRNAを形成する逆平行鎖がループまたはヘアピン領域によって接
続されていることを特徴とするいわゆるshRNA(短ヘアピンRNA)から細胞内に産
生され得る。shRNAは、プラスミドまたはウイルス、特にレトロウイルスによってコ
ードされ得、プロモーターの支配下にある。shRNAの発現に適したプロモーターは、
siRNAの発現についての上記のパラグラフにおいて示されたプロモーターである。
siRNAおよびshRNAの発現に適したベクターとしては、原核生物発現ベクター
(例えば、pUC18、pUC19、Bluescriptおよびそれらの誘導体、mp
18、mp19、pBR322、pMB9、CoIEl、pCRl、RP4)、ファージ
ベクターおよびシャトルベクター(例えば、pSA3およびpAT28)、酵母発現ベク
ター(例えば、2−ミクロンプラスミドタイプのベクター、インテグレーションプラスミ
ド、YEPベクター、セントロメアプラスミドなど)、昆虫細胞発現ベクター(例えば、
pACシリーズベクターおよびpVLシリーズベクター)、植物発現ベクター(例えば、
pIBI、pEarleyGate、pAVA、pCAMBIA、pGSA、pGWB、
pMDC、pMY、pOREシリーズベクターなど)およびウイルスベクターベース(ア
デノウイルス、アデノウイルス随伴ウイルスならびにレトロウイルス、特にレンチウイル
ス)の高等真核生物細胞発現ベクターまたは非ウイルスベクター(例えば、pcDNA3
、pHCMV/Zeo、pCR3.1、pEFl/His、pIND/GS、pRc/H
CMV2、pSV40/Zeo2、pTRACER−HCMV、pUB6/V5−His
、pVAXl、pZeoSV2、pCI、pSVLおよびpKSV−10、pBPV−1
、pML2dおよびpTDTl)が挙げられる。好ましい実施形態において、ベクターは
、レンチウイルスベクターである。
本発明のsiRNAおよびshRNAは、当業者に公知の一連の技法を用いて得ること
ができる。siRNAをデザインするための基礎と考えられるヌクレオチド配列の領域は
、限定的でなく、それは、コード配列(開始コドンと終止コドンの間)の領域を含み得る
か、またはあるいは、好ましくは、25〜50ヌクレオチド長で、開始コドンに対して3
’方向の任意の位置の非翻訳5’または3’領域の配列を含み得る。siRNAをデザイ
ンする1つの方法は、AA(N19)TTモチーフの識別(ここで、Nは、c−MAF遺
伝子配列内の任意のヌクレオチドであり得る)および高G/C含有量を有するそれらのモ
チーフの選択を含む。上記モチーフが見つからない場合、NA(N21)モチーフ(ここ
で、Nは、任意のヌクレオチドであり得る)を識別することができる。
c−MAF特異的siRNAには、WO2005046731に記載されているsiR
NAが含まれ、その鎖のうちの一方は、ACGGCUCGAGCAGCGACAA(配列
番号6)である。他のc−MAF特異的siRNA配列としては、CUUACCAGUG
UGUUCACAA(配列番号7)、UGGAAGACUACUACUGGAUG(配列
番号8)、AUUUGCAGUCAUGGAGAACC(配列番号9)、CAAGGAG
AAAUACGAGAAGU(配列番号10)、ACAAGGAGAAAUACGAGA
AG(配列番号11)およびACCUGGAAGACUACUACUGG(配列番号12
)が挙げられるが、これらに限定されない。
DNA酵素
他方で、本発明は、本発明のc−MAF遺伝子の発現を阻害するDNA酵素の使用も企
図する。DNA酵素は、アンチセンス技術とリボザイム技術の両方の機構的な特色のいく
つかを組み込んでいる。DNA酵素は、アンチセンスオリゴヌクレオチドと同様の特定の
標的核酸配列を認識するが、それにもかかわらず、リボザイムと同様に触媒性であり、標
的核酸を特異的に切断するように、デザインされる。
リボザイム
活性が阻害されるべきであるc−MAFをコードするmRNAの翻訳を妨げるために標
的mRNAの転写産物を触媒的に切断するためにデザインされたリボザイム分子もまた、
使用され得る。リボザイムは、特定のRNAの切断を触媒することができる酵素的RNA
分子である(概説として、Rossi,Current Biology 4:469−
471,1994を参照のこと)。リボザイムの作用機序は、相補的な標的RNAへのリ
ボザイム分子配列の特異的なハイブリダイゼーションとその後のエンドヌクレアーゼによ
る切断事象を含む。リボザイム分子の組成は、好ましくは、標的mRNAに相補的な1つ
または複数の配列およびmRNAの切断を担う周知の配列または機能的に等価な配列を含
む(例えば、米国特許第5093246号を参照のこと)。
本発明において使用されるリボザイムは、エンドリボヌクレアーゼRNAであるハンマ
ーヘッド型リボザイム(本明細書中以後、「Cech型リボザイム」)(Zaugら、S
cience 224:574−578,1984を含む。
リボザイムは、改変されたオリゴヌクレオチド(例えば、安定性、標的化などを改善す
るように改変されたオリゴヌクレオチド)によって形成され得、そしてそれらはインビボ
で標的遺伝子を発現する細胞に分配されるべきである。好ましい分配方法は、トランスフ
ェクトされた細胞が、内因性の標的メッセンジャーを破壊して翻訳を阻害するのに十分な
量のリボザイムを産生するように、強力な構成的pol IIIまたはpol IIプロ
モーターの支配下においてリボザイムを「コードする」DNA構築物を使用することを含
む。リボザイムは、触媒的であるので、他のアンチセンス分子とは異なり、その効率のた
めに、低い細胞内濃度しか必要ない。
阻害性抗体
本発明の文脈において、「阻害性抗体」は、c−MAFタンパク質に特異的に結合して
、上記タンパク質の機能の1つまたは複数、好ましくは、転写に関連する機能を阻害する
ことができる任意の抗体と理解される。それらの抗体は、当業者に公知である任意の方法
(そのうちのいくつかが上で述べられた)を使用して、調製され得る。したがって、ポリ
クローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される
。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Nature,1975
,256:495)によって記載された方法を用いて調製される。本発明の文脈において
、好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、「F
ab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scFvフラグメント、ダイア
ボディ、二重特異性抗体、アルファボディ、シクロペプチドおよびステープルドペプチド
が挙げられる。いったん、c−MAFタンパク質結合能を有する抗体が同定されたら、こ
のタンパク質の活性を阻害することができる抗体が、阻害剤識別アッセイを用いて選択さ
れる。
阻害性ペプチド
本明細書中で使用されるとき、用語「阻害性ペプチド」とは、上で説明されたようにc
−MAFタンパク質に結合してその活性を阻害することができる、すなわち、c−MAF
の遺伝子転写を活性化させることができることを妨げる、ペプチドのことを指す。
ネガティブc−MAFドミナント
MAFファミリーのタンパク質は、ホモ二量体化およびAP−1ファミリーの他のメン
バー(例えば、FosおよびJun)とのヘテロ二量体化をすることができるので、c−
MAF活性を阻害する1つの方法は、c−MAFと二量体化することができるが転写を活
性化させる能力を欠くネガティブドミナントの使用によるものである。したがって、ネガ
ティブc−MAFドミナントは、細胞に存在し、トランス活性化ドメイン(例えば、ma
fK、mafF、mafgおよびpi8)を含むアミノ末端の3分の2を欠く、任意の小
さいmafタンパク質であり得る(Fujiwaraら(1993)Oncogene
8,2371−2380;Igarashiら(1995)J.Biol.Chem.2
70,7615−7624;Andrewsら(1993)Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA 90,11488−11492;Kataokaら(1995)M
ol.Cell.Biol.15,2180−2190)(Kataokaら(1996
)Oncogene 12,53−62)。
あるいは、ネガティブc−MAFドミナントには、他のタンパク質と二量体化する能力
を維持しているが転写を活性化する能力を欠くc−MAFバリアントが含まれる。これら
のバリアントは、例えば、タンパク質のN末端に位置するc−MAFトランス活性化ドメ
インを欠いているバリアントである。したがって、例証的な様式では、ネガティブc−M
AFドミナントバリアントには、少なくともアミノ酸1〜122、少なくともアミノ酸1
〜187または少なくともアミノ酸1〜257(米国特許第6274338号に記載され
ているようなヒトc−MAFのナンバリングを考慮することによって)が除去されている
バリアントが含まれる。
本発明は、ネガティブc−MAFドミナントバリアントと、標的細胞における発現に適
したプロモーターの作動性の支配下のc−MAFをコードするポリヌクレオチドとの両方
の使用を企図する。本発明のポリヌクレオチド転写を制御するために使用され得るプロモ
ーターは、構成的プロモーター、すなわち、基底レベルの転写を指示するプロモーター、
または転写活性に外部のシグナルが必要である誘導性プロモーターであり得る。転写の制
御に適した構成的プロモーターは、とりわけ、CMVプロモーター、SV40プロモータ
ー、DHFRプロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルス(MMTV)プロモーター、1a伸
長因子(EF1a)プロモーター、アルブミンプロモーター、ApoA1プロモーター、
ケラチンプロモーター、CD3プロモーター、免疫グロブリン重鎖または軽鎖プロモータ
ー、ニューロフィラメントプロモーター、ニューロン特異的エノラーゼプロモーター、L
7プロモーター、CD2プロモーター、ミオシン軽鎖キナーゼプロモーター、HOX遺伝
子プロモーター、チミジンキナーゼプロモーター、RNAポリメラーゼIIプロモーター
、MyoD遺伝子プロモーター、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)遺伝子プロモー
ター、低密度リポタンパク質(LDL)プロモーター、アクチン遺伝子プロモーターであ
る。好ましい実施形態において、トランス活性化因子の発現を制御するプロモーターは、
PGK遺伝子プロモーターである。好ましい実施形態において、本発明のポリヌクレオチ
ド転写を制御するプロモーターは、T7ファージのRNAポリメラーゼプロモーターであ
る。
好ましくは、本発明の文脈において使用され得る誘導性プロモーターは、誘導剤(indu
cer agent)の非存在下ではゼロまたは無視できる基底発現を示す誘導剤に応答するプロ
モーターであり、3’位に位置する遺伝子の活性化を促進することができる。誘導剤のタ
イプに応じて、誘導性プロモーターは、Tet on/offプロモーター(Gosse
n,M.and H.Bujard(1992)Proc.Natl.Acad.Sci
.USA,89:5547−5551;Gossen,M.ら、1995,Scienc
e 268:1766−1769;Rossi,F.M.V.and H.M.Blau
,1998,Curr.Opin.Biotechnol.9:451−456);Pi
p on/offプロモーター(米国特許第6287813号);抗黄体ホルモン依存性
プロモーター(US2004132086)、エクジソン依存性プロモーター(Chri
stophersonら、1992,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,
89:6314−6318;Noら、1996,Proc.Natl.Acad.Sci
.USA,93:3346−3351,Suhrら、1998,Proc.Natl.A
cad.Sci.USA,95:7999−8004およびWO9738117)、メタ
ロチオネイン依存性プロモーター(WO8604920)およびラパマイシン依存性プロ
モーター(Riveraら、1996,Nat.Med.2:1028−32)として分
類される。
ネガティブc−MAFドミナントバリアントをコードするポリヌクレオチドの発現に適
したベクターとしては、原核生物発現ベクター由来のベクター(例えば、pUC18、p
UC19、Bluescriptおよびそれらの誘導体、mp18、mp19、pBR3
22、pMB9、ColEl、pCRl、RP4)、ファージおよびシャトルベクター(
例えば、pSA3およびpAT28)、酵母発現ベクター(例えば、2−ミクロンタイプ
のプラスミドベクター、インテグレーションプラスミド、YEPベクター、セントロメア
プラスミドなど)、昆虫細胞発現ベクター(例えば、pACシリーズベクターおよびpV
Lシリーズベクター)、植物発現ベクター(例えば、pIBI、pEarleyGate
、pAVA、pCAMBIA、pGSA、pGWB、pMDC、pMY、pOREシリー
ズベクターなど)およびウイルスベクターベース(アデノウイルス、アデノウイルス随伴
ウイルスならびにレトロウイルスおよび特にレンチウイルス)の高等真核生物細胞発現ベ
クターまたは非ウイルスベクター(例えば、pSilencer 4.1−CMV(Am
bion)、pcDNA3、pcDNA3.1/hyg pHCMV/Zeo、pCR3
.1、pEFl/His、pIND/GS、pRc/HCMV2、pSV40/Zeo2
、pTRACER−HCMV、pUB6/V5−His、pVAXl、pZeoSV2、
pCI、pSVLおよびpKSV−10、pBPV−1、pML2dおよびpTDTl)
が挙げられる。
小分子
本発明における使用に適した他のc−MAF阻害性化合物としては:




他のc−MAFインヒビターは、特許出願WO2005063252(その全体が本明
細書中に参照により援用される)に記載されている(例えば、以下の表(表2)に示され
るもの)。


好ましい実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
c−MAF阻害剤は、代表的には、薬学的に許容され得るキャリアとともに投与される
用語「キャリア」とは、希釈剤または賦形剤のことを指し、それによって、活性成分が
投与される。そのような薬学的キャリアは、滅菌された液体(例えば、水および油(石油
、動物、植物または合成起源のものを含む(例えば、落花生油、大豆油、鉱油、ゴマ油な
ど)))であり得る。特に注射可能な溶液用の、水または食塩水溶液ならびにデキストロ
ース水溶液およびグリセロール水溶液が、キャリアとして使用されるのが好ましい。好適
な薬学的キャリアは、E.W.Martin,1995によって「Remington’
s Pharmaceutical Sciences」に記載されている。好ましくは
、本発明のキャリアは、州政府もしくは連邦政府の規制当局によって承認されたものであ
るか、または米国薬局方、もしくは動物、より具体的には人間におけるその使用について
一般に認識されている他の薬局方に列挙されているものである。
本発明の薬学的組成物の所望の薬学的剤形を製造するために必要なキャリアおよび補助
物質は、他の因子のなかでも、選択される薬学的剤形に依存する。薬学的組成物の前記薬
学的剤形は、当業者に公知の従来の方法に従って製造されるだろう。活性成分を投与する
ための種々の方法、使用されるべき賦形剤およびそれらを生成するためのプロセスの概説
は、「Tratado de Farmacia Galenica」,C.Fauli
i Trillo,Luzan 5,S.A.1993 Editionに見られる。
薬学的組成物の例としては、経口投与、局所投与または非経口投与用の、任意の固体組成
物(錠剤、丸剤、カプセル剤、顆粒剤など)または液体組成物(溶液、懸濁液またはエマ
ルジョン)が挙げられる。さらに、薬学的組成物は、必要であると見なされる場合、安定
剤、懸濁剤、保存剤、界面活性剤などを含み得る。
医薬において使用するために、c−MAF阻害剤は、単離されたものとして、またはさ
らなる活性剤とともに、プロドラッグ、塩、溶媒和化合物もしくは包接化合物の形態で見
出され得、薬学的に許容され得る賦形剤とともに製剤化され得る。本発明におけるその使
用にとって好ましい賦形剤としては、糖、デンプン、セルロース、ゴムおよびタンパク質
が挙げられる。特定の実施形態において、本発明の薬学的組成物は、固体の薬学的剤形(
例えば、錠剤、カプセル剤、丸剤、顆粒剤、坐剤、液体の形態を得るために再構成され得
る滅菌された結晶または無定形固体など)、液体の薬学的剤形(例えば、溶液、懸濁液、
エマルジョン、エリキシル剤、ローション、軟膏など)または半固体の薬学的剤形(ゲル
、軟膏、クリームなど)として製剤化されるだろう。本発明の薬学的組成物は、経口経路
、静脈内経路、筋肉内経路、動脈内経路、髄内(intramedularry)経路、
鞘内経路、心室内経路(intraventricular router)、経皮的経
路、皮下経路、腹腔内経路、鼻腔内経路、腸管経路、局所経路、舌下経路または直腸経路
が挙げられるがこれらに限定されない任意の経路によって投与され得る。活性成分を投与
するための種々の方法、使用されるべき賦形剤およびそれらの製造プロセスの概説は、T
ratado de Farmacia Galenica,C.Fauli i Tr
illo,Luzan 5,S.A.,1993 EditionおよびRemingt
on’s Pharmaceutical Sciences(A.R.Gennaro
,Ed.),20th edition,Williams & Wilkins PA
,USA(2000)に見られる。薬学的に許容され得るキャリアの例は、当該分野にお
いて公知であり、それらとしては、リン酸緩衝食塩水溶液、水、エマルジョン(例えば、
油/水エマルジョン)、種々のタイプの湿潤剤、滅菌された溶液などが挙げられる。前記
キャリアを含む組成物は、当該分野で公知の従来のプロセスによって製剤化され得る。
核酸(siRNA、siRNAもしくはshRNAをコードするポリヌクレオチド、ま
たはネガティブc−MAFドミナントをコードするポリヌクレオチド)が投与される場合
、本発明は、前記核酸を投与するために個々に調製された薬学的組成物を企図する。その
薬学的組成物は、前記裸の核酸、すなわち、身体のヌクレアーゼによる分解から核酸を保
護する化合物の非存在下の核酸を含み得、それは、トランスフェクションのために使用さ
れる試薬に関連する毒性が排除されるという利点を必要とする。裸の化合物に適した投与
経路としては、血管内経路、腫瘍内経路、頭蓋内経路、腹腔内経路、脾臓内経路、筋肉内
経路、網膜下経路、皮下経路、粘膜経路、局所経路および経口経路が挙げられる(Tem
pleton,2002,DNA Cell Biol.,21:857−867)。あ
るいは、それらの核酸は、コレステロールに結合体化された、または細胞膜を通過して転
座を促進することができる化合物(例えば、HIV−1 TATタンパク質由来のTat
ペプチド、D.melanogasterアンテナペディアタンパク質のホメオドメイン
の3番目のらせん、単純ヘルペスウイルスVP22タンパク質、アルギニンオリゴマー、
およびWO07069090に記載されているようなペプチド)に結合体化された、リポ
ソームの一部を形成して、投与され得る(Lindgren,A.ら、2000,Tre
nds Pharmacol.Sci,21:99−103、Schwarze,S.R
.ら、2000,Trends Pharmacol.Sci.,21:45−48、L
undberg,Mら、2003,Mol Therapy 8:143−150および
Snyder,E.L.and Dowdy,S.F.,2004,Pharm.Res
.21:389−393)。あるいは、そのポリヌクレオチドは、アデノ随伴ウイルスま
たはレトロウイルス(例えば、マウス白血病ウイルス(MLV)またはレンチウイルス(
HIV、FIV、EIAV)に基づくウイルス)において、プラスミドベクターまたはウ
イルスベクター、好ましくは、アデノウイルスベースのベクターの一部を形成して、投与
され得る。
c−MAF阻害剤またはそれらを含む薬学的組成物は、体重1キログラムあたり10m
g未満、好ましくは、体重1kgあたり5、2、1、0.5、0.1、0.05、0.0
1、0.005、0.001、0.0005、0.0001、0.00005または0.
00001mg未満の用量で投与され得る。単位用量は、注射、吸入または局所投与によ
って投与され得る。
用量は、処置される状態の重症度および応答に依存し、それは、数日間〜数ヶ月間また
はその状態が鎮静するまで、変動し得る。患者の身体におけるその薬剤の濃度を定期的に
測定することによって、最適な投与量が決定され得る。動物モデルにおける事前のインビ
トロまたはインビボアッセイによって得られるEC50値から、最適な用量が決定され得
る。単位用量は、1日に1回または1日に1回未満、好ましくは、2、4、8または30
日ごとに1回未満で投与され得る。あるいは、開始用量の後、1回または数回の維持用量
(通常、開始用量よりも少ない量)を投与することが可能である。維持レジメンは、0.
01μg〜1.4mg/kg体重/日、例えば、10、1、0.1、0.01、0.00
1または0.00001mg/kg体重/日の用量範囲での患者の処置を含み得る。維持
用量は、好ましくは、5、10または30日ごとにせいぜい1回投与される。処置は、患
者が罹患している障害のタイプ、その重症度および患者の状態に従って変動する時間にわ
たって継続されなければならない。処置の後、その疾患がその処置に応答しない場合、用
量を増加すべきかどうか、またはその疾患の改善がみとめられる場合もしくは望まれない
副作用がみとめられる場合、用量を減少させるかどうかを決定するために、患者の進行を
モニターしなければならない。
上昇したc−MAFレベルを有する、骨転移を伴う乳がん患者における骨分解の処置ま
たは予防
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプル
と比較して上昇したc−MAFレベルを有する被験体における骨転移の処置において使用
するための、c−MAF阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防することができ
る薬剤に関する。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロールサンプル
と比較して上昇したc−MAFレベルを有する被験体における骨転移の処置のための医薬
を製造するための、c−MAF阻害剤、または骨分解を回避するかもしくは予防すること
ができる薬剤の使用に関する。
あるいは、本発明は、乳がんに罹患しており、かつ転移サンプルにおいてコントロール
サンプルと比較して上昇したc−MAFレベルを有する被験体における分解の予防および
/または処置の方法に関し、その方法は、c−MAF阻害剤、または骨分解を回避するた
めもしくは予防するための薬剤を前記被験体に投与する工程を含む。
特定の実施形態において、骨転移は、溶骨性転移である。
本発明に記載される治療方法に適した、c−MAF阻害剤、および骨分解を回避するか
または予防することができる薬剤は、個別化治療法の文脈において、上で詳細に記載され
ている。
参照サンプルまたはコントロールサンプルは、転移に罹患していないトリプルネガティ
ブ(基底細胞様を含む)乳がんもしくはあるいはER+乳がんを有する被験体のサンプル
、または転移に罹患していないトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんを有する
被験体の生検サンプルの腫瘍組織コレクションにおいて計測されたc−MAF遺伝子発現
レベルの中央値に対応するサンプルである。
c−MAFレベルがコントロールサンプルと比較して上昇しているかどうかを決定する
ためまたは定量するための方法は、本発明の第1の方法に関して詳細に記載されてきたが
、骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤にも等しく適用可能である。
あるいは、骨分解を回避するためまたは予防するための、上で述べられた薬剤のうちの
2つ以上の薬剤が組合わされることにより転移が処置されるおよび/もしくは予防される
組合わせ処置が行われ得るか、または前記薬剤が、他のサプリメント(例えば、カルシウ
ムまたはビタミンD)もしくはホルモンと組合わされ得る。
骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤は、代表的には、薬学的に許容され得
るキャリアとともに投与される。用語「キャリア」およびキャリアのタイプは、c−MA
F阻害剤、ならびにそれらが投与され得る形態および用量について上で定義されてきたが
、骨分解を回避するためまたは予防するための薬剤にも等しく適用可能である。
以下の例は、本発明を例証するものであって、その範囲を限定しない。
本発明のキット
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するための
キットに関し、そのキットは:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを
定量するための手段;およびb)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを
参照c−MAF発現レベルと比較するための手段を備える。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブの基底細胞様乳がんまたはあるいは
ER+乳がんからの骨転移に罹患している被験体の臨床転帰を予測するためのキットに関
し、そのキットは:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するた
めの手段;およびb)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−M
AF発現レベルと比較するための手段を備える。
別の態様において、本発明は、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんまたは
あるいはER+乳がんに罹患している被験体に対する治療を決定するためのキットに関し
、そのキットは:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するため
の手段;b)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−MAF発現
レベルと比較するための手段;およびc)定量された発現レベルと参照発現レベルとの比
較に基づいて、前記被験体において骨転移を予防するためおよび/または減少させるため
の治療を決定するための手段を備える。
別の態様において、本発明は、i)トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がんま
たはあるいはER+乳がんに罹患している被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベル
を定量するための試薬、およびii)骨転移のリスクと相関するように予め決定されてい
る1つまたは複数のc−MAF遺伝子発現レベル指標を備えるキットに関する。
16q23および16q22−24遺伝子座の増幅および転座を含む前記被験体のサン
プル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段は、先に詳細に記載された。
好ましい実施形態において、発現を定量するための手段は、c−MAF遺伝子に特異的
に結合および/または増幅するプローブおよび/またはプライマーのセットを含む。
特定の実施形態において、乳がんは、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん
またはER+(ルミナルAおよびBを含む)乳がんである。
本発明の方法の特定の実施形態のすべてが、本発明のキットおよびそれらの使用に適用
可能である。
乳がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするための方法
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けす
るためのインビトロでの方法に関し、その方法は:
a)前記被験体からサンプルを提供する工程;
b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
c)定量されたc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較する
ことによって前記サンプルをタイプ分けする工程;
を含み、ここで、前記タイプ分けは、前記被験体における骨転移のリスクに関する予後情
報を提供する。
16q23および16q22−24遺伝子座の増幅および転座を含む、前記被験体のサ
ンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段は、先に詳細に記載された。
特定の実施形態において、乳がんは、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん
またはER+(ルミナルAおよびBを含む)乳がんである。
好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
乳がんに罹患している被験体を分類するための方法
別の態様において、本発明は、乳がんに罹患している被験体をコホートに分類するため
の方法に関し、その方法は:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを決
定する工程;b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参
照レベルと比較する工程;およびc)そのサンプル中のc−MAFの前記発現レベルに基
づいて、前記被験体をコホートに分類する工程を含む。
16q23および16q22−24遺伝子座の増幅および転座を含む、前記被験体のサ
ンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段は、先に詳細に記載された。
特定の実施形態において、乳がんは、トリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん
またはER+(ルミナルAおよびBを含む)乳がんである。
好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプルである。
好ましい実施形態において、前記コホートは、前記参照発現レベルと比較して、匹敵す
るc−MAF発現レベルを有すると判定された少なくとも1つの他の個体を含む。
別の好ましい実施形態において、前記サンプル中のc−MAFの前記発現レベルは、前
記所定の参照レベルと比べて上昇しており、コホートのメンバーは、骨転移の上昇したリ
スクを有すると分類される。別の好ましい実施形態において、前記コホートは、臨床試験
を行うためのコホートである。好ましい実施形態において、サンプルは、腫瘍組織サンプ
ルである。
コホートI.乳がん原発腫瘍コホートの発見
ヒト乳房腫瘍を、PAM50 Breast Cancer Intrinsic C
lassifierに記載されているような5つのサブタイプに分類し、次いで、これら
の腫瘍におけるc−MAF(MAF)発現が所与のサブタイプのいくつかにおいて骨転移
事象と相関するかを確かめるために、適切な統計解析を行った。PAM50は、基底細胞
様と命名されたサブタイプを有する。その代わりに、トリプルネガティブの群を使用した
。患者の情報は、GEO(T.Barrett,D.B.Troup,S.E.Wilh
ite,P.Ledoux,D.Rudnev,C.Evangelista,I.F.
Kim,A.Soboleva,M.Tomashevsky,and R.Edgar
.NCBI GEO:mining tens of millions of exp
ression profiles−database and tools upda
te.Nucleic Acids Research,35,January 200
7.ISSN 1362−4962))からダウンロードした。以下のデータセットを使
用した:GSE2603、GSE2034およびGSE12276の組み合わせ。この組
み合わせコホートは、560人の患者を有した。体系的なバイアス(systematic biase
)を排除するために、マージする前に、すべての遺伝子の発現の測定値をz−スコアに変
換した。すべての統計解析を、Bioconductor(R.C.Gentleman
,V.J.Carey,D.M.Bates,B.Bolstad,M.Dettlin
g,oS.Du−doit,B.Ellis,L.Gautier,Y.Ge,J.Ge
ntry,K.Hornik,T.Hothorn,W.Huber,S.Iacus,
R.Irizarry,F.Leisch,C.Li,M.Maechler, A.J
.Rossini,G.Sawitzki,C.Smith,G.Smyth,L.Ti
erney,J.Y.H.Yang,and J.Zhang.Bioconducto
r:Open software development for computa−
tional biology and bioinformatics.Genome
Biology,5:R80,2004.URL http://genomebio
logy.com/2004/5/10/R80)を使用して行った。
コホートII.乳がん原発腫瘍サンプルコホートの検証:
上記の患者腫瘍サンプルコホートIで見出された仮説を検証するために、第2のヒト乳
房腫瘍コホートを使用した。独立した検証セットは、ステージI、IIまたはIII B
Cを有し、追跡の注釈が付けられている患者由来の380個より多くの原発乳がん検体か
ら構成される(Rojo F.,Ann Oncol(2012)23(5):1156
−1164)。組織マイクロアレイを標準的な手順に従って処理した。腫瘍を、ER+、
トリプルネガティブおよびHER2+に従って3つのサブタイプに分類し、次いで、これ
らの腫瘍におけるc−MAF(MAF)発現および16q22−24増幅が所与のサブタ
イプのいくつかにおいて骨転移事象と相関するかを確かめるために、適切な統計解析を行
った。
この第2のコホートにおける統計解析は、以下の前提に基づいた:
i)ベースラインの特徴の比較(表3および6)。
年齢の分散の一様性を、Folded F検定を用いて検定する。年齢の平均値の差異
を、分散の一様性に応じて、プールされた(pooled)t検定またはSatterh
waite t検定(複数のカテゴリーを比較するための、ANOVAまたはKrusk
al−Wallis)を用いて検定する。適用できる場合、分類変数を、カイ二乗検定ま
たはFisher検定を用いて比較する。
ii)FISHおよびIHCの診断性能
p<0:2の変数を算入するためのp値の判定基準および調整後のモデルにおいてp<
0.10の変数を保持するための判定基準を用いるステップワイズ選択(stepwis
e selection)を介して、多変量解析を行う。診断性能は、ROC曲線のAU
Cを比較することによって評価される。モデルの適合度は、Hosmer−Lemesh
ow検定を用いて評価される(有意である場合、さらなる解析は行わない)。
最も予測的な変数(16q23 FISHおよびMAF IHC)に基づいて、各分類
カテゴリーに対して感度(Se)、特異度(Sp)、陽性予測値(PPV)および陰性予
測値(NPV)を計算する。データの過適合の問題を克服するために、PPVおよびNP
Vのブートストラッピングを行う。
iii)予後診断の役割
骨転移までの結果時間(outcome time)のCox回帰モデリングを、同順
位の「efron」マネジメントを用いて行う。事象の数は、それらのモデルに入れられ
る変数の数を操る(各5〜10事象につき約1変数)。
比例ハザード仮説は、SAS9.3に実装されているように、比例ハザード仮説につい
て上限検定(supremum test)を用いて調べられる。この仮説が棄却される
場合、この検定は、有意なp値をもたらす。
乳がんサブタイプの分類
組み合わせコホート(発見コホートI)のPAM50遺伝子を、PAM50遺伝子シグ
ネチャにおいてコントロール遺伝子として記載されている遺伝子に対して正規化した。各
患者について、その同じ患者に対するコントロール遺伝子の平均値を減算することによっ
て、発現の推定値を正規化した。
5つのスコアを計算することにより、患者を分類した:
・ESR1の状態:遺伝子ESR1の分布は、双峰性を示した(図1)。それらの2つの
モードは、ESR1低の患者およびESR1高の患者を識別する。パッケージ「mclu
st」を使用して、正規分布の混合物を2成分に当てはめ、各患者がESR1低およびE
SR1高の成分に属する事後確率を得た。この群に属する事後確率が80%より高い場合
、患者をESR1低と見なした。同じ判定基準をESR1高に対しても使用した。患者が
、ESR1高でもESR1低でもない場合、ESR1中間と見なした。
・管腔の状態:各患者について、ルミナル遺伝子リストにおけるすべての遺伝子の発現を
平均することによって、ルミナルスコアを計算した。ルミナルスコアの分布は、双峰性を
示した(図1)ので、ルミナルの状態は、ESR1の状態と同じように記載された。
・増殖の状態;各患者について、ルミナル遺伝子リストにおけるすべての遺伝子の発現を
平均することによって、増殖スコアを計算した。増殖遺伝子の平均値は、双峰性を示さな
かった(図1)。ゆえに、最も低い平均値を有する患者の半数を、増殖少と見なした。残
りは、増殖多と見なした。
・PGR1の状態:遺伝子PGR1は、双峰分布を示す(図1)ので、PGR1の状態は
、ルミナルの状態と同じように記載された。
・ERBB2の状態:遺伝子ERBB2は、双峰分布を示さない(図1)。ERBB2の
発現値が、ERBB2の平均値+ERBB2の1標準偏差より高いとき、サンプルをER
BB2高と記載した。その他の場合は、サンプルをERBB2低と見なした。
2つのルミナル遺伝子および1つの増殖遺伝子は、組み合わせコホートに存在しなかっ
た。それらを使用しなかった。すべての患者をPAM50に従ってサブタイプに割り当て
た。
PAM50の分類に従っていずれのサブタイプにも割り当てることができない患者が5
8人いた。本発明者らは、2つ以上のサブタイプに属する患者を見出さなかった。
エストロゲンレセプター陽性(ER+)腫瘍は、ESR1高と定義される。
トリプルネガティブ腫瘍は、ESR1、PGR1およびERBB2低と定義される。
検証コホートIIの場合、患者の分類は、診断目的に従う通例の病理学者スコアに基づ
いた。ER+腫瘍は、ESR1を発現する腫瘍と定義された。トリプルネガティブ乳がん
腫瘍は、ESR1、PRおよびHER2を発現しない腫瘍と定義された。HER2+腫瘍
は、病理学者スコアに従って2+および3+HER2腫瘍と定義された。上記サブタイプ
のいずれにも割り当てることができない患者が6人いた。本発明者らは、2つ以上のサブ
タイプに属する患者を見出さなかった。
トリプルネガティブ乳がんのコホートにおける、転移、骨転移を予測するc−MAF遺
伝子発現の能力の解析
コホートIにおいて骨転移を解析するとき、骨転移と別の転移を同時に有することに起
因して、33人の患者が除外され、事象までの1つの時間だけを報告した。本発明者らは
、最初の転移に関心があり、どの転移が最初であるかを知る方法がない場合、本発明者ら
は、2つの転移部位の注釈を有する患者を解析から除外した。
いったん、本発明者らは、目的のサブタイプであるトリプルネガティブ(これには、基
底細胞様乳がんの大部分が含まれる)を識別し、その患者を選択したら、調整変数(ad
justment variable)としてのコホートを含めて、Cox比例ハザード
モデル(Packaged survivalのR関数coxphを使用する)を調整し
て、サブタイプおよびc−MAF発現によって各表現型(骨転移)を説明できるかを確か
めた。c−MAFは、サブタイプと統計学的に有意な相互作用を有した(p=0.043
)。これは、本発明者らに、c−MAFと生存率との関連性が、患者のサブタイプに従っ
て有意に異なることを知らせた。トリプルネガティブ乳がん原発腫瘍におけるc−MAF
の遺伝子発現は、骨転移と有意に相関した(表3および図2)。
c−MAFは、トリプルネガティブ乳がん(これには、基底細胞様乳がんの大部分が含
まれる)を有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断を決定するために使用する
ことができる(表3および図2)。
ER+乳がん腫瘍における転移、骨転移を予測するc−MAF遺伝子発現の能力の解析
本発明者らは、ER+乳がん(これには、AおよびBサブタイプを含むルミナル乳がん
の大部分が含まれる)に焦点を当てた。本発明者らは、Cox比例ハザードモデル(Pa
ckaged survivalのR関数coxphを使用する)を調整して、c−MA
F発現によって各表現型(骨転移、肺転移または脳転移)を説明できるかを確かめた。E
R+乳がん原発腫瘍におけるc−MAFの遺伝子発現は、骨転移と有意に相関した(表4
および図3)。
c−MAFは、ER+乳がん(これには、AおよびBサブタイプを含むルミナル乳がん
の大部分が含まれる)を有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断を決定するた
めに使用することができる(表4および図3)。
コホートII、特にER+およびTNにおいて、c−MAFが乳がんの骨転移に対する
臨床的バイオマーカーであることの免疫組織化学による検証
Dako Linkプラットフォームにおいて正に帯電したスライドガラス上に置かれ
た3μmヒトBC腫瘍組織切片を使用して、c−MAF免疫染色を行った。脱パラフィン
後、pH6.1,0.01mol/Lクエン酸ベース緩衝液(Dako)中で加熱抗原回
復を行った。内因性ペルオキシダーゼをクエンチした。ウサギポリクローナル抗MAF抗
体を、室温において30分間1:100希釈で使用し、その後、ペルオキシダーゼと結合
した抗ウサギIgデキストランポリマー(Flex+,Dako)とともにインキュベー
ションした。次いで、3,3’−ジアミノベンジジン(DAB)を用いて切片を可視化し
、ヘマトキシリンで対比染色した。
c−MAF抗体感度(1:100)は、1:10から1:1000まで一次抗体のクレ
セント希釈度(crescent dilution)の範囲において算出された。親MCF7およびT4
7DヒトBC細胞ならびにc−MAFを過剰発現する(+c−MAF長/短)MCF7お
よびT47DヒトBC細胞を使用して、特異度を決定した。ホルマリン固定された細胞ペ
レットを、IHCについて記載されたように処理し、全溶解産物からのウエスタンブロッ
トによって結果を確認した。特異度は、BALB−cヌードマウスにおける異所性MCF
7およびc−MAF過剰発現MCF7の異種移植でも示された。一次抗体の代わりに正常
なウサギIgG2(IS600,Dako)とインキュベートされた同じ検体からの切片
を、ネガティブコントロールとして使用した。
MAF免疫染色を、コンピュータ処理された測定値によってスコア付けした。各検体の
9つの代表的な画像を、Nuance FX Multispectral Imagi
ng System(CRI Inc)を備えたDM2000Leica顕微鏡を使用し
て420〜700nmにおいて10nm波長の間隔で取得した。画像のスペクトルデータ
セットを取得する前に、各波長においてデバイスのウェルをおよそ90%満たすのに必要
な露出時間を決定するためにスライドのブランク領域をイメージングしつつ、自動露出ル
ーチンを行い、線源強度、フィルター透過効率およびカメラ感度のばらつきを補償した。
純粋なDABおよびヘマトキシリン色素の色のライブラリーを作製し、Nuance1.
6.4ソフトウェアを使用してそれらの色を分離(unmix)するために使用した。次
いで、参照のキューブ(種々の波長において撮影された大量の画像)を、各新規症例に対
して取得した後、同じ露出時間を使用して3つの代表的な組織の視野のスペクトルイメー
ジングを得た。画像の逆重畳の後、照明の不均一を補償するためにスペクトルデータをフ
ラットフィールド処理し(flat fielded)、バックグラウンドにフィルター
にかけた。ベールの法則の変換を使用して、参照キューブで除算したサンプルの比の負の
logを得ることによって、陽性シグナルを透過濃度から光学密度単位に変換した。コン
ピュータ支援閾値(computer−aided threshold)を設定した。
それにより、すべての陽性シグナルを強調する疑似カラー画像が生成される。解析によっ
て、目的の領域の平均強度からc−MAFの定量的データが得られた。上皮細胞(正常お
よび悪性)の核だけが、異なるサイズ閾値を設定することによって自動的に検出され、ス
トローマ細胞またはリンパ球の核はそうではなく、それらは、病理学者によって確認され
た。各症例を、統計解析のために目的の全領域のシグナル強度の平均値について算出した
。コンピュータ処理された測定値の出力によって、c−MAF発現について56〜70,
367の範囲の連続データが生成された。
原発性乳がん組織の代表的なc−MAF免疫染色(IHC)が示されている(図4a)
。症例1は、c−MAF陰性腫瘍を表す(OD<1000)。症例2および3は、c−M
AF陽性腫瘍である(それぞれOD>1000および>25000)(図4a)。次に、
380個の原発性乳がん腫瘍のコホートにおけるc−MAFタンパク質の発現(コンピュ
ータ処理された測定値、光学密度の任意単位,ODとして表現されている)を表している
プロットから、すべての腫瘍IHCシグナルの定量が要約された。BCサブタイプ(ER
+、HER2+およびTN)に従って腫瘍を分けた(図4b)。上記のIHC染色に基づ
いて、c−MAF(陽性または陰性)層別化に従って、380個の原発性乳がん腫瘍(ス
テージI、IIおよびIII)のコホートにおける、無病生存率(図4c)および無骨転
移生存率(図4d)のカプラン・マイヤー曲線を描いた。また、種々のBCサブタイプ(
ER+、HER2+およびTN)におけるc−MAFの診断性能(図4e)も計算した。
ベースラインの特徴およびCox多変量解析を、上で定義されたように行うことにより、
他の任意の臨床的な病理学的パラメータの原発性乳がん腫瘍における骨転移予測に対する
層別化基準としてのc−MAFに対する影響を決定した(表5および6)。示されるよう
に、9つを超えるリンパ節陽性を有する場合を除いて、他の任意のパラメータとの有意な
関連はない。


骨転移増殖アッセイ(bone metastasis colonization
assay)におけるc−MAFの機能的検証
c−MAFの因果的寄与は、前臨床実験的異種移植マウスモデルを使用した骨転移増殖
アッセイにおいて機能的に検証された。GFP/ルシフェラーゼベクターで標識されたE
R+ヒト乳腺細胞系、すなわち、MCF7およびT47Dを使用し、心室内または尾静脈
注射によって免疫不全マウスに接種した。これらのマウスは、異種移植モデルにおいて近
接した腫瘍細胞に確実にホルモンを供給するためにエストロゲンペレット剤を有しなけれ
ばならない。
標準的なアプローチは、機能喪失および機能獲得実験であった。MCF7親、T47D
、または高レベルのc−MAF発現について選択された高度に骨転移性の細胞派生物(B
oM2)において、c−MAFを発現させるかまたはサイレンシングすることにより、転
移におけるその機能を検証した(図5および6)。c−MAF遺伝子の骨転移機能を、マ
ウスの心臓内に接種された転移細胞の生物発光検出を使用してインビボにおいて決定した
。本発明者らは、BoM2細胞において、内因性c−MAFのレベルを80%超低下させ
、c−MAFの外来性過剰発現によってレスキューされ得る、shRNA媒介性c−MA
Fノックダウンを生じさせた(図6)。さらに、本発明者らは、各c−MAFアイソフォ
ームを個別にまたは集合的に発現する細胞も作製し、レポーターアッセイにおいて転写活
性化因子としてのその機能性を試験した(図6)。親MCF7細胞、c−MAF(集合的
にまたは独立して、短および長アイソフォーム)を有するかまたは有しない親T47D細
胞、およびc−MAF(短および長アイソフォーム)の発現が枯渇したまたはレスキュー
されたBoM2骨転移性MCF7細胞派生物を、マウスの左心室に注射し、骨転移増殖を
インビボ生物発光イメージングによって解析した。すべての場合において、対応するコン
トロールを接種した(図5、6、7および8)。
注射後52日目における、shControl BoM2細胞(すなわち、c−MAF
を発現する細胞)における90%またはレスキュー群における50%(図5cおよび8)
と比べて、BoM2 c−MAFノックダウン細胞を接種されたマウスのわずか23%し
か骨転移を起こさなかった。c−MAF枯渇細胞における骨転移の減少は、後肢の溶骨性
病変の範囲の急激な減少を伴った(図5c)。それどころか、MAF過剰発現(各アイソ
フォームの個別または集団的)は、心臓内注射後に骨に転移するER+乳がん細胞(MC
F7およびT47D)の能力を高め、転移量を増加させた(図5a,bおよび7)。興味
深いことに、MAFを発現する細胞は、親MCF7細胞と比べてより溶骨性の骨転移をも
たらし(図5a、6および9a)、転移性病変の周囲の長さにおける酒石酸耐性酸性ホス
ファターゼ(TRAP+)破骨細胞の数の増加が検出され得る(図9b,c,d)。MA
F過剰発現は、皮下に植え込まれたとき、親MCF7細胞の固有の増殖活性を増加させな
かった(図10)。高レベルのMAF発現は、肺転移増殖を助けなかった(図5d)。
機能喪失実験および機能獲得実験は、乳がん原発腫瘍における臨床的検証とともに、エ
ストロゲンレセプター陽性(ルミナルAおよびB分子サブタイプを含む)およびトリプル
ネガティブ(基底細胞様分子サブタイプを含む)乳がんサブタイプにおける骨転移プロセ
スにおける、予後マーカーおよび予測マーカーならびに原因となる標的遺伝子としてのc
−MAFの機能的検証に至った。
MAFは、破骨細胞分化の腫瘍細胞刺激、例えば、PTHLHサイトカインの転写調節
を介して、溶骨性骨転移を媒介する
乳がん細胞に骨転移機能を提供する際にc−MAFの直接的な活性はなく、その代わり
にc−MAFは、ホーミング能および骨リモデリング能を高める遺伝子の活性を転写的に
調節することにより、骨に転移増殖させ得る。PTHLHの発現は、c−MAFの支配下
だった。所見は、qPCR解析によって確かめられた(図11a)。さらに、骨において
成長している患者の乳がん転移(GSE14020)は、他の箇所の転移と比べて、c−
MAF発現を保持した(図11b)。さらに、平均より高いMAFおよびPTHLHを発
現している転移の77%が、骨転移だった(図11b)。PTHLHは、悪性の体液性高
カルシウム血症に関与する因子として同定された。さらに、それは、部分的に破骨細胞分
化の刺激に起因して、溶骨性骨転移において基本的役割を果たすことが示された。実際に
、c−MAFを発現している細胞からの馴化培地は、PTHLHアンタゴニストペプチド
(7−34Aa、PTHLH−AN)との同時インキュベーションの際には妨げられるプ
ロセスである、破骨細胞分化の誘導をインビトロにおいて増加させた(図11c)。
PTHLHが、乳がん細胞において、c−MAFによって駆動される骨転移を媒介する
かを試験するために、本発明者らは、c−MAFを発現しているMCF7乳がん細胞を心
臓内に注射し、PTHLH−ANの存在下または非存在下において骨転移を確立し、成長
する能力を47日間にわたって評価した。インビボにおいてPTHLH活性を阻止するた
めに、PBSに溶解された6μgの(7−34Aa)PTHLH−ANを1日に2回、動
物に投与した。コントロール群は、PBSで処置した。c−MAFを発現している細胞は
、類似の浸透度で骨転移を起こすが、PTHLH−ANでの処置は、後肢の溶骨性病変の
範囲を劇的に減少させる(図11d,e)。この減少は、転移性病変の周囲の長さにおけ
る破骨細胞(TRAP+細胞)の数の減少を伴った(図11d,e)。これらの結果は、
c−MAFが、乳がんの溶骨性骨転移を駆動することを示す。さらに、PTHLHの発現
は、c−MAFによって駆動される乳がんの溶骨性骨転移にとって必要な因子である。最
後に、破骨細胞分化プロセスを阻止することによって、c−MAFによって駆動される乳
がんの骨転移が妨げられる。
骨への転移を予測するc−MAFの能力は用量依存的である
まず、本発明者らは、骨転移を予測するc−MAF発現の能力が用量依存的であるかを
評価した。
患者の情報は、GEO(Barrettら(2007))からダウンロードした。以下
のデータセットを使用した:GSE2603、GSE2034およびGSE12276の
組み合わせ。この組み合わせコホートは、560人の患者を有した。体系的なバイアスを
排除するために、マージする前に、すべての遺伝子の発現の測定値をz−スコアに変換し
た。
すべての統計解析を、Bioconductor(Gentleman RCら、Ge
nome Biology,5:R80,2004.URL http://genom
ebiology.com/2004/5/10/R80)を使用して行った。
本発明者らは、四次スプライン(パッケージphenoTestにおけるsmooth
Coxph関数)を用いるCox回帰モデルによる、c−MAFの発現と骨転移のハザー
ド比との関係の滑らかな推定値を得た。パッケージphenoTestにおけるsmoo
thCoxph関数は、遺伝子発現レベルによって平滑化されたCox比例ハザードをプ
ロットする。したがって、ハザードが所与の遺伝子の種々の発現レベルにわたってどのよ
うに挙動するのかを示すプロットが構築される。信頼区間もまた提供される(使用法:s
moothCoxph(時間、事象、x、xlim、ylim、その他)。アーギュメン
ト:時間)変数(ここで、生存時間が保存される);事象)変数(ここで、生存事象が保
存される);x)所与の遺伝子の発現レベルを含む数;Xlim)プロット用のxlim
;Ylim)プロット用のylim;その他)プロットするためにパスされる他のアーギ
ュメント)。
四次スプラインを用いるCox回帰モデルによる、c−MAFの発現と骨転移のハザー
ド比との関係性は、図12に見られ得る。組み合わせコホートに存在するすべての乳がん
腫瘍、組み合わせコホートにおけるエストロゲンレセプター陽性乳がん腫瘍および組み合
わせコホートにおけるトリプルネガティブ腫瘍。その解析を行い、c−MAF発現レベル
が平均(0と命名)より高い腫瘍における骨転移を予測するc−MAFの能力のハザード
比(HR)およびp値が示された。発現レベルにおける1は、1標準偏差を示し、次いで
、それに続くなど。
本発明者らは、「高c−MAF」を発現している乳がん原発腫瘍を、乳がん原発腫瘍の
代表的なコホートにおいて平均発現を超えてc−MAFを発現する腫瘍の群と定義した。
本発明者らは、「低c−MAF」を発現している乳がん原発腫瘍を、乳がん原発腫瘍の代
表的なコホートにおいて得られる平均を下回ってc−MAFを発現する腫瘍の群と定義し
た。
高c−MAF発現レベルを有する乳がん腫瘍では、c−MAF発現は、用量依存的様式
で骨転移のリスクを予測する(図12)。同様に、ER陽性(ルミナルAおよびB分子サ
ブタイプを含む)およびトリプルネガティブ(基底細胞様分子サブタイプを含む)乳がん
サブタイプにおいても、本発明者らは、同じ挙動をみとめた(図12)。
結論として、c−MAF発現レベルが高くなるほど、骨転移に対するハザードリスクが
、代表的な乳がん腫瘍セットの平均値を超えてc−MAFレベルを発現したER+および
TN乳がん腫瘍において高くなる。
本発明者らは、どこまでc−MAFの用量が高くなると骨再発のリスクが高くなるかを
検証コホートIIにおいてアッセイした。この目的を達成するために、本発明者らは、上
に記載されたようなコンピュータ処理システムを使用した染色の光学密度の決定(図4a
,b)を用いて免疫組織化学(IHC)によってc−MAF発現を定量した。c−MAF
染色は、腫瘍細胞に特異的である(図4a)。染色に基づくと、本発明者らは、2つのタ
イプのc−MAF陽性乳がん腫瘍(症例2および3,図4a、b)をみとめることができ
る。c−MAF陽性乳がん腫瘍におけるこれらの2つのタイプのc−MAF IHC染色
に従って、それらが双峰性の挙動を有するとき、本発明者らは、それらを2群に分離し得
る(図13,左パネル)。これらの2つのカテゴリーを基礎にして、本発明者らは、c−
MAFの染色が強いほど、骨転移のリスクが高く(HR(骨転移)=19.45;p値<
0.001)、より早く骨転移が生じる(図13,右パネル)という観察結果を検証した
早期の骨転移を予測するc−MAFの能力
乳がん腫瘍を、原発腫瘍の検出および外科的切除と遠位再発の観察時点との間の期間に
応じて、早期(<5年)の再発性腫瘍と遅発性(>5年)の再発性腫瘍とに分類した。実
際に、ある特定の状況下において、早期の遠位再発は、より短い期間にさらに限定された
。ER陽性腫瘍およびER陰性腫瘍が、早期の骨再発に関して異なって挙動すると記載さ
れるなら、この分類は、臨床的に重要である。詳細には、トリプルネガティブおよび基底
細胞様腫瘍を含むER陰性腫瘍は、早い時点において再発する一方で、ER陽性腫瘍は、
遅い時点と早い時点とで再発する傾向は同じである(Knight WAら、Cance
r Research 1997:37,4669−4671,Goss PE Nat
ure Rev Cancer 2010:10,871−877)。
本発明者らは、c−MAF発現が、乳がん、ER陽性(ルミナルAおよびBを含む)お
よびトリプルネガティブ(基底細胞様を含む)乳がん原発腫瘍において早期の骨転移を予
測し得るかを評価した。
患者の情報は、GEOからダウンロードした。以下のデータセットを使用した:GSE
2603、GSE2034およびGSE12276の組み合わせ。この組み合わせコホー
トは、560人の患者を有する。体系的なバイアスを除去するために、マージする前に、
すべての遺伝子の発現の測定値をz−スコアに変換した。すべての統計解析を、Bioc
onductorを使用して行った。
本発明者らは、種々の時点におけるc−MAFと骨転移との非依存を検定するためにフ
ィッシャーの正確検定を行った。分割表の比率およびフィッシャー検定p値は、図14に
見られ得る。
本発明者らは、「非常に高いc−MAF」を発現している乳がん原発腫瘍を、平均値+
1標準偏差を超えてc−MAFを発現する腫瘍の群と定義する。本発明者らは、「低いc
−MAF」を発現している乳がん原発腫瘍を、乳がん原発腫瘍の代表的なコホートにおい
て平均値+1標準偏差を下回ってc−MAFを発現する腫瘍の群と定義した。
乳がん原発腫瘍において、非常に高いc−MAFレベル(RNAまたはタンパク質)は
、乳がん原発腫瘍の手術の3年後と5年後の両方において早期の骨転移を予測する(図1
4)。
特に、エストロゲンレセプター陽性(ルミナルAおよびB分子サブタイプを含む)にお
いて、c−MAFレベル(RNAまたはタンパク質)が、それぞれ手術の3年後と5年後
の両方において早期の骨転移を有する腫瘍の比率を有意に定義する(図14)ことが示さ
れる。
結論として、高レベルのc−MAF発現は、早期の乳がん骨転移を含む骨転移のリスク
が高い乳がん原発腫瘍を区別するためまたは予測するために使用することができる。
表7は、乳がん原発腫瘍(GSE2603、GSE2034およびGSE12276の
組み合わせ)、エストロゲンレセプター陽性(ルミナルAおよびB分子サブタイプを含む
)乳がん原発腫瘍およびトリプルネガティブ(基底細胞様分子サブタイプを含む)乳がん
サブタイプにおける骨転移、早期の骨転移および非常に早期の骨転移の予測を示している

c−MAFを含む16q22−q24に位置する染色体領域の増幅は骨転移と関連する
本発明者らは、ACEアルゴリズムを適用することによって、転移のリスクに関連する
原発性乳がん検体においてコピー数の変化(CNA)を同定した(発現データによるCN
Aの解析)(図15a)。中でも、染色体16q22−q24に位置する増幅された領域
は、転移のリスクと有意に(p<0.05)関連し、その発現の増加が、個別におよび独
立して、ER+ヒト乳がんにおける骨転移のリスクと関連する遺伝子であるc−MAFを
含んだ(HR=1.22 p=0.032、GSE2603、GSE2034およびGS
E12276の組み合わせに基づく乳がん原発腫瘍データセット)。同様に、FISH(
16q23)および比較ゲノムハイブリダイゼーション(CGH)によって親MCF7(
ER+)を骨転移性MCF7派生物(BoM2)細胞と比較したとき、本発明者らは、1
6q22−24染色体領域の獲得を確認した(図15b,c)。親細胞のサブセット(3
2.7%)が、このゲノム増幅を保有していたが、インビボでの骨転移選択により、この
残余集団がその残りを引き継ぐこととなった(88.6%)。したがって、本発明者らは
、16q22−q24が、転移、特に骨転移のリスクを有する乳がんにおいて増幅されて
おり、インビボにおいて選択された細胞において、骨に転移する能力について裏付けられ
ることを示す。
コホートIIにおける、FISH決定による16q22−24DNAゲノム増幅の骨転
移を予測する予後診断能力の検証
16q22−24ゲノム増幅が骨転移リスクを特異的に予測する能力をさらに検証する
ために、本発明者らは、ステージI、IIまたはIIIのBCを有し、追跡の注釈が付け
られている患者由来の334個の原発性乳がん検体から構成される独立した検証セットに
おいて、FISHによって(本発明者らは、16q23ゲノム領域を決定する商業的に入
手可能な診断プローブ,IGH/MAF Abbot Vysisプローブを使用した)
、16q22−24染色体領域ゲノムの獲得を解析した(Rojo F.,Ann On
col(2012)23(5):1156−1164)。組織マイクロアレイを標準的な
手順に従って処理した。スライドを、MAF(16q23)およびIGH(14q32)
プローブ混合物(Abbot vysisプローブ)とともにインキュベートした。DA
PI対比染色を適用し、適切な顕微鏡を用いて画像を取得した。
ステージI、IIおよびIIIのBCヒト原発腫瘍セット(n=334)における無骨
転移生存率(図16a)または全生存率(図16b)のカプラン・マイヤー曲線を決定し
た。腫瘍1つあたり3つのコアを使用して、平均として細胞1つあたり2.5コピーの1
6q23というカットオフに基づく16q23 FISH陰性群および16q23 FI
SH陽性群に従って、患者を層別化した(図16aおよびb)。骨転移を予測するマーカ
ーのハザード比(hazard ration)(骨転移)、特異度および感度を算出し
た。データセットのベースラインの特徴および乳がん全体に対するCox多変量解析を、
上に記載されたように行った(表8および9)。
I、IIおよびIIIのBCヒト原発腫瘍セットにおけるER陽性患者(左)またはト
リプルネガティブ患者(右)に対する無骨転移生存率のカプラン・マイヤー曲線(それぞ
れn=250およびn=43)(図16c)も決定した。腫瘍1つあたり3つのコアを使
用して、平均として細胞1つあたり2.5コピーの16q23というカットオフに基づい
て、患者を16q23 FISH陰性群および16q23 FISH陽性群に分けた。E
R+乳がんに対するCox多変量解析を上に記載されたように行った(表10)。


乳がん全体(図16d)およびER+乳がん(図16e)における16q23増幅の診
断性能に対する受信者動作特性(ROC)曲線も、診断性能を推定するために算出した。
ROC曲線において、真陽性率(感度)は、種々のカットオフ点に対する偽陽性率(10
0−特異度)の関数としてプロットされる。ROC曲線上の各点は、特定の決定閾値に対
応する感度/特異度対を表す。
要約すると、16q23 FISHプローブを用いて本明細書中で測定された16q2
2−24増幅は、乳がん原発腫瘍、特に、TNおよびER+乳がんサブタイプにおける骨
転移のリスクを有意に予測する。
c−MAF発現レベルに基づいてトリプルネガティブ乳がんと診断された被験体におけ
る処置レジメンの決定
腫瘍組織サンプルを、トリプルネガティブ乳がんを有すると診断された被験体から得る
。そのサンプルを、組織の薄切片に切断し、パラフィンに包埋する。各パラフィン切片を
スライドの上に載せる。そのスライドを抗MAF抗体とともにインキュベートする。MA
Fに結合した抗体の可視化および検出のために、蛍光色素と結合体化された抗体を使用す
る。その蛍光色素に励起ビームを提供することによって、スライドを可視化する。蛍光顕
微鏡によって蛍光シグナルの画像を得る。その腫瘍サンプル中の蛍光シグナルを参照サン
プルの蛍光シグナルと比較することによって、腫瘍サンプルにおけるc−MAFの相対的
な発現レベルを得る。腫瘍サンプルにおける強度は、参照サンプルにおける強度と相関し
、ここで、参照サンプルと比べて腫瘍サンプルにおけるより高い強度は、原発性乳がんを
有する被験体の骨への転移の上昇したリスクと相関する。あるいは、16q22−24遺
伝子座、16q23遺伝子座またはc−MAF遺伝子の増幅または転座が、インサイチュ
ハイブリダイゼーション技法または類似のものを用いて決定される。
上昇した骨転移のリスクの予後診断に基づいて、骨転移に対する予防的処置として抗R
ANKL抗体デノスマブを被験体に投与する。120mgのデノスマブを6ヶ月間にわた
って1ヶ月に1回、被験体の皮下に(SC)投与する。次の4年半にわたって、120m
gのSCを3ヶ月ごとに投与する。5年間にわたって、経口カルシウム(少なくとも50
0mg)およびビタミンD(少なくとも400IU)。5年後、被験体は、骨転移のいか
なる証拠もない。上昇していない骨転移のリスクの予後診断に基づいて、患者は、この抗
RANKL抗体を投与されない。
本明細書中に記載される例および実施形態は、単なる例証目的であり、それを考慮した
様々な改変または変更が、当業者に示唆され、本願の精神および範囲とともに含められる
べきであることが理解される。
本明細書に引用されたすべての刊行物、特許、特許出願、インターネットサイトおよび
アクセッション番号/データベース配列(ポリヌクレオチド配列とポリペプチド配列の両
方を含む)は、各個別の刊行物、特許、特許出願、インターネットサイトまたはアクセッ
ション番号/データベース配列が、参照により援用されると具体的かつ個別に示されたの
と同程度にすべての目的のためにそれらの全体が本明細書中に参照により援用される。

Claims (1)

  1. 本願図面に記載の発明。
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