JP2020529848A - 遺伝子操作されたベンジルイソキノリンアルカロイドエピメラーゼおよびベンジルイソキノリンアルカロイドの生成方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2017年8月3日に出願された米国特許仮出願第62/541,038号の恩典を主張するものであり、この出願は、参照により本明細書に組み入れられる。
本明細書において言及した刊行物、特許および特許出願はすべて、参照により、あたかも個々の各刊行物、特許または特許出願が参照により組み入れられて具体的に個々に示されているのと同程度に、本明細書に組み入れられる。
本開示により、デヒドロレチクリンシンターゼ(DRS)とデヒドロレチクリンレダクターゼ(DRR)酵素の独立した発現ならびに(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化におけるDRS酵素とDRR酵素の使用により、多様なアルカロイド生成物の生成を融合型DRS-DRRエピメラーゼの使用と比べて増大させる方法を提供する。また、本開示により、遺伝子操作されたエピメラーゼを用いた遺伝子操作された宿主細胞内での多様なベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)の生成のための方法を提供する。さらに、本開示により、遺伝子操作された宿主細胞内での一組の遺伝子操作されたエピメラーゼの産生のための方法を提供する。一部の場合では、DRS酵素およびDRR酵素が親エピメラーゼに由来し得る。一部の場合では、DRS酵素およびDRR酵素が各々、分離型の親エピメラーゼに由来し得る。一部の場合では、DRS酵素およびDRR酵素が1種または複数種の親エピメラーゼに由来し得る。本明細書において論考しているように、DRSとDRRの独立した発現では、融合型DRS-DRRの発現と比較した場合、(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの、例えば(S)-レチクリンの(R)-レチクリンへの変換が相当改善される。特定の場合では、本開示により、遺伝子操作された宿主細胞内での(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換の増大によってビスベンジルイソキノリン、プロモルフィナン、モルフィナン、ナル-オピオイドおよびノル-オピオイドアルカロイド生成物を生成させるための方法を提供する。さらなる特定の場合では、本開示により、遺伝子操作された宿主細胞内での(S)-レチクリンの(R)-レチクリンへの変換の増大によってプロモルフィナン、モルフィナン、ナル-オピオイドおよびノル-オピオイドアルカロイド生成物を生成させるための方法を提供する。さらなる特定の場合では、本開示により、(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換の増大によって多様なアルカロイド生成物を生成させるための方法を提供する。
関心対象のBIAを生成する宿主細胞を提供する。一部の例では、宿主細胞の遺伝子操作された株、例えば、本発明の遺伝子操作された株は、いくつかの構造分類、例えば非限定的に、前駆体BIA、ベンジルイソキノリン、プロモルフィナン、モルフィナン、ビスベンジルイソキノリン、ナル-オピオイド、ノル-オピオイドなどを越えて関心対象のベンジルイソキノリンアルカロイドおよびその改変体を生成するためのプラットフォームを提供し得る。これらの分類の各々は、該分類のメンバーをもたらし得る遺伝子操作された宿主細胞の生合成経路の任意の簡便なメンバーの生合成前駆体、中間体およびその代謝産物を包含していることを意味する。化合物の非限定的な例を以下に、これらの構造分類の各々について示す。一部の場合において、所与の例の構造は、それ自体がベンジルイソキノリンアルカロイドと特性評価される場合もあり、されない場合もある。本発明での化学物質は、考えられ得るすべての異性体、例えば1種のエナンチオマー、ラセミ混合物、光学的に純粋な形態、ジアステレオマー混合物および中間体混合物を包含していることを意味する。
任意の簡便な細胞が主題の宿主細胞および方法に使用され得る。一部の場合では、宿主細胞が非植物細胞である。一部の例では、宿主細胞が微生物細胞であると特性評価され得る。一部の特定の場合では、宿主細胞が昆虫細胞、哺乳動物細胞、細菌細胞、真菌細胞または酵母細胞である。任意の簡便な型の宿主細胞が、主題のBIA生成細胞を作製するのに使用され得、例えばUS2008/0176754、US2014/0273109、PCT/US2014/063738、PCT/US2016/030808、PCT/US2015/060891、PCT/US2016/031506およびPCT/US2017/057237を参照されたく、これらの開示内容は参照によりその全体が組み入れられる。関心対象の宿主細胞としては、非限定的に、細菌細胞、例えば枯草菌(Bacillus subtilis)、大腸菌(Escherichia coli)、ストレプトマイセス属、アナベナ属、アルスロバクター属、アセトバクター属、アセトバクテリウム属、バチルス属、ビフィドバクテリウム属、ブラキバクテリウム属、ブレビバクテリウム属、カルノバクテリウム属、クロストリジウム属、コリネバクテリウム属、エンテロバクター属、エシェリキア属、グルコンアセトバクター属、グルコノバクター属、ハフニア属、ハロモナス属、クレブシエラ属、コクリア属、ラクトバチルス属、ロイコノストック属、マクロコッカス(Macrococcus)属、メチロモナス属、メチロバクター属、メチロセラ属、メチロコッカス属、ミクロバクテリウム属、ミクロコッカス属、ミクロキスティス属、ムーレラ属、オエノコッカス属、ペディオコッカス属、プロクロロコッカス属、プロピオニバクテリウム属、プロテウス属、シュードアルテロモナス属、シュードモナス属、サイクロバクター属、ロドバクター属、ロドコッカス属、ロドシュードモナス属、セラチア属、スタフィロコッカス属、ストレプトコッカス属、ストレプトマイセス属、シネココッカス属、シネコシスティス属、テトラジェノコッカス属、ワイセラ属、ザイモモナス属、およびネズミチフス菌(Salmonella typhimuium)細胞、昆虫細胞、例えばキイロショウジョウバエ(Drosophila melanogaster)S2およびツマジロクサヨトウ(Spodoptera frugiperda)Sf9細胞、ならびに酵母細胞、例えば出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)、分裂酵母(Schizosaccharomyces pombe)およびピキア酵母(Pichia pastoris)細胞が挙げられる。一部の例では、宿主細胞が酵母細胞または大腸菌(E.coli)細胞である。一部の場合では、宿主細胞が酵母細胞である。一部の場合では、宿主細胞が、関心対象のBIA、例えば(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを生成するように遺伝子操作された酵母株に由来する。一部の場合では、宿主細胞が、関心対象の酵素を生成するように遺伝子操作された酵母株に由来する。一部の場合では、宿主細胞が、遺伝子操作されたエピメラーゼを生成するように遺伝子操作された酵母株に由来する。一部の態様では、遺伝子操作されたエピメラーゼが、遺伝子操作された分割型エピメラーゼであり得る。一部の態様では、遺伝子操作されたエピメラーゼが、遺伝子操作された融合型エピメラーゼであり得る。一部の態様では、エピメラーゼ活性が分離型のオキシダーゼ酵素とレダクターゼ酵素にコードされ得る。さらに、一部の態様では、遺伝子操作されたエピメラーゼが(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに、親エピメラーゼと比べてより効率的に変換でき得る。一部の態様では、親エピメラーゼが野生型エピメラーゼであり得る。一部の態様では、親エピメラーゼが野生型エピメラーゼとかなり類似したものであり得る。一部の場合では、野生型エピメラーゼとかなり類似している親エピメラーゼが、野生型エピメラーゼのアミノ酸配列と少なくとも75%以上、80%以上、81%以上、82%以上、83%以上、84%以上、85%以上、86%以上、87%以上、88%以上、89%以上、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上または99%以上類似しているアミノ酸配列を有し得る。一部の態様では、遺伝子操作されたエピメラーゼが、対応する親エピメラーゼと比べて(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドにより効率的に変換するオキシダーゼ活性とレダクターゼ活性を示す小型酵素に分離され得る。
宿主細胞は、関心対象のBIAの生成をもたらす1つまたは複数の改変(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上の改変)を含むように遺伝子操作され得る。付加的または代替的に、宿主細胞は、関心対象の酵素の産生をもたらす1つまたは複数の改変(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上の改変)を含むように遺伝子操作され得る。一部の場合では、改変は遺伝子改変、例えば、遺伝子もしくはその断片の変異、付加もしくは欠失、または遺伝子もしくはその断片の転写調節である。本明細書で用いる場合、用語「変異」は、参照の配列またはモチーフに対するアミノ酸残基またはヌクレオチド残基の欠失、挿入または置換をいう。変異は特異的変異として、天然遺伝子の本来の遺伝子座に組込まれ得る。一部の場合では、変異は、別個の遺伝子座における組込み遺伝子として導入された遺伝子の追加コピーとして、またはエピゾーマルベクター上、例えば、2μもしくはセントロメアプラスミド上の追加コピーとして組込まれ得る。一部の特定の場合では、該酵素の基質阻害コピーが天然細胞の転写調節下に存在している。一部の例では、該酵素の基質阻害コピーが、合成プロモーターの制御下に配置することによるタンパク質発現の遺伝子操作された構成的または動的な調節を伴って導入される。一部の例では、1つまたは複数の改変の対象物が天然遺伝子であり得る。一部の例では、1つまたは複数の改変の対象物が非天然遺伝子であり得る。一部の例では、非天然遺伝子が宿主細胞内に挿入され得る。さらなる例では、非天然遺伝子が、宿主細胞内に挿入される前に1つまたは複数の改変によって変更され得る。
一部の例では、遺伝子操作された宿主細胞は、1つまたは複数の基質阻害緩和変異(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上)を該細胞の1つまたは複数の生合成酵素遺伝子内に含む細胞である。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって天然である(例えば、非改変細胞内に存在する)。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって非天然である。本明細書で用いる場合、用語「基質阻害緩和変異」は、該細胞の基質阻害制御機構を緩和する変異をいう。
一部の例では、遺伝子操作された宿主細胞は、1つまたは複数の補因子回復促進機構(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上)を該細胞の1つまたは複数の生合成酵素遺伝子内に含む細胞である。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって天然である(例えば、非改変細胞内に存在する)。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって非天然である。本明細書で用いる場合、用語「補因子回復促進機構」は、該細胞の補因子回復制御機構を促進させる機構をいう。
一部の例では、遺伝子操作された宿主細胞は、1つまたは複数の産物阻害緩和変異(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上)を該細胞の1つまたは複数の生合成酵素遺伝子内に含む細胞である。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって天然である(例えば、非改変細胞内に存在する)。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって非天然である。本明細書で用いる場合、用語「産物阻害緩和変異」は、遺伝子操作された宿主細胞の短期間および/または長期間の産物阻害の制御機構を緩和する変異をいう。短期間の産物阻害は、共基質の結合部位への競合的結合がみられる該細胞の制御機構である。長期間の産物阻害は、所望の経路外の化合物の不可逆的結合がみられる該細胞の制御機構である。
一部の例では、遺伝子操作された宿主細胞は、1つまたは複数のフィードバック阻害緩和変異(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上)を該細胞の1つまたは複数の生合成酵素遺伝子内に含む細胞である。一部の場合では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって天然である(例えば、非改変細胞内に存在する)。付加的または代替的に、一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって非天然である。本明細書で用いる場合、用語「フィードバック阻害緩和変異」は、遺伝子操作された宿主細胞のフィードバック阻害の制御機構を緩和する変異をいう。フィードバック阻害は、調節対象化合物の合成経路内の酵素が、該化合物がある一定レベルまで蓄積されたら阻害され、それにより細胞内の該化合物の量を均衡する該細胞の制御機構である。フィードバック阻害を緩和する変異は、遺伝子操作された宿主細胞における調節対象酵素の阻害を対照細胞と比べて低減させる。このようにして、遺伝子操作された宿主細胞は調節対象化合物またはその下流の生合成産物のレベル上昇をもたらす。一部の場合では、調節対象酵素の阻害を緩和するとは、阻害のIC50を2倍以上、例えば3倍以上、5倍以上、10倍以上、30倍以上、100倍以上、300倍以上、1000倍以上またはさらにはそれ以上、高めることを意味する。レベル上昇とは、宿主細胞内の調節対象化合物またはその下流産物のレベルが対照細胞内の調節対象化合物またはその下流産物のものの110%以上、例えば120%以上、130%以上、140%以上、150%以上、160%以上、170%以上、180%以上、190%以上もしくは200%以上、例えば少なくとも3倍以上、少なくとも5倍以上、少なくとも10倍以上またはさらにはそれ以上になることを意味する。
宿主細胞は、該細胞の1つまたは複数の生合成酵素遺伝子の1つまたは複数の転写モジュレーション改変(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上の改変)を含み得る。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって天然である。一部の例では、該1つまたは複数の生合成酵素遺伝子は該細胞にとって非天然である。該細胞の任意の簡便な生合成酵素遺伝子が転写モジュレーションのために標的化され得る。転写モジュレーションとは、改変細胞内の関心対象の遺伝子の発現が、対照細胞(例えば、非改変細胞)と比べてモジュレートされる、例えば、増大または低減、向上または抑制されることを意味する。一部の場合では、関心対象の該遺伝子の転写モジュレーションとしては、発現の増大または増強が挙げられる。発現の増大または増強とは、関心対象の該遺伝子の発現レベルが、対照、すなわち改変されていない同じ細胞での発現と比べて(例えば、任意の簡便な遺伝子発現アッセイを使用することにより)2倍以上、例えば5倍以上、場合によっては25-、50-もしくは100倍以上、特定の態様では300倍以上またはそれより大きく増大していることを意味する。代替的に、細胞における関心対象の該遺伝子の発現が非常に少なくて検出不可能である場合では、関心対象の該遺伝子の発現レベルは、発現が容易に検出可能であるレベルまで増大しているならば、増大しているとみなす。一部の特定の場合では、関心対象の該遺伝子の転写モジュレーションとしては、発現の低減または抑制が挙げられる。発現の低減または抑制とは、関心対象の該遺伝子の発現レベルが、対照と比べて2倍以上、例えば5倍以上、場合によっては25-、50-もしくは100倍以上、特定の態様では300倍以上またはそれより大きく低減されていることを意味する。一部の場合では、発現は、検出不可能なレベルまで低減される。主題の宿主細胞における使用のために適合され得る関心対象の宿主細胞プロセスの改変は、Smolke et al.による米国特許出願公開第20140273109(14/211,611)号に記載されており、その開示内容は参照によりその全体が本明細書に組み入れられる。
遺伝子操作された宿主細胞は、該細胞の酵素に対する1つまたは複数の不活性化変異(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上)を含み得る。1つまたは複数の不活性化変異を含めることにより、合成経路の遺伝子操作された宿主細胞のフラックスが、関心対象のBIAまたはこれをもたらす望ましい酵素もしくは前駆体のレベルが上昇するように改変され得る。一部の例では、該1つまたは複数の不活性化変異が、該細胞にとって天然の酵素に対するものである。付加的または代替的に、該1つまたは複数の不活性化変異が、該細胞にとって非天然の酵素に対するものである。本明細書で用いる場合、「不活性化変異」とは、該細胞の遺伝子または調節性DNA配列に対する1つまたは複数の変異であって、該変異により、関心対象の該遺伝子によって発現されるタンパク質の生物学的活性が不活性化されることを意味する。一部の場合では、該遺伝子は該細胞にとって天然である。一部の例では、該遺伝子は、不活性化され、かつ、宿主細胞が生成する関心対象のBIAの合成経路の一部であるかまたは該合成経路と関連している酵素を、コードしている。一部の例では、不活性化変異は、関心対象の遺伝子を制御する調節性DNA配列内に配置される。一部の特定の場合では、不活性化変異は、遺伝子のプロモーターに対するものである。任意の簡便な変異(例えば、本明細書に記載のようなもの)が、関心対象の遺伝子または調節性DNA配列を不活性化させるために使用され得る。「不活性化される」または「不活性化させる」とは、変異された該遺伝子によって発現されるタンパク質の生物学的活性が、非変異対照遺伝子によって発現される対照タンパク質と比べて10%以上、例えば20%以上、30%以上、40%以上、50%以上、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、95%以上、97%以上または99%以上低下することを意味する。一部の場合では、該タンパク質が酵素であり、不活性化変異によって該酵素の活性が低下する。
本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムにより、(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を説明する。このような方法、プロセスおよびシステムの一部は遺伝子操作された宿主細胞を含み得る。一部の例では、(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換が、基質の多様な範囲のアルカロイドへの変換のカギとなる工程である。一部の例では、(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換が遺伝子操作されたエピメラーゼによるエピマー化反応を含む。一部の場合では、基質アルカロイドのエピマー化が、図3に示し、スキーム1に一般的に示すように、(S)-基質を対応するシッフ塩基またはイミン中間体に酸化させ、次いで、この中間体を(R)-生成物に立体特異的に還元することにより行われ得る。スキーム1に示すように、R1、R2、R3およびR4はHまたはCH3であり得る。R5はH、OHまたはOCH3であり得る。
スキーム1
の化合物またはその塩であり、式中:
R3は、水素およびC1〜C4アルキルから選択され;
R6およびR7は独立して、各存在において、ヒドロキシ、フルオロ、クロロ、ブロモ、カルボキシアルデヒド、C1〜C4アシル、C1〜C4アルキルおよびC1〜C4アルコキシから選択され;
nは0、1、2、3または4であり;
n'は0、1、2、3、4または5である。
本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムによりプロモルフィナンアルカロイドのモルフィナンアルカロイドへの変換を説明する。一部の該方法、プロセスおよびシステムにより、四環系骨格の五環系骨格への変換を説明する(図28)。一部の該方法、プロセスおよびシステムは遺伝子操作された宿主細胞を含み得る。一部の例では、四環式の前駆体またはプロモルフィナンアルカロイドからの五環式テバインまたはモルフィナンアルカロイドの生成を説明する。一部の例では、プロモルフィナンアルカロイドのテバインへの変換が、基質の多様な範囲のベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換のカギとなる工程である。
スキーム2
の化合物またはその塩であり、式中:
R1、R2およびR3は独立して、水素およびメチルから選択され;
R4が、メチル、エチル、プロピルおよび他の適切なアルキル基から選択される。
本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムにより、親エピメラーゼ酵素に由来する2つの分離型エピメラーゼ酵素を用いることによる、対応する融合型酵素を用いることによるビスBIAの生成と比較した場合のビスベンジルイソキノリンアルカロイド(ビスBIA)の生成の増大を説明する。一例では、対応する融合型酵素が、2つの分離型エピメラーゼ酵素の対応するオキシダーゼ領域とレダクターゼ領域を有する融合型エピメラーゼを含む。一例では、2つの分離型エピメラーゼ酵素がオキシダーゼとレダクターゼを含み得る。ビスBIAは、2つのBIA単量体間のカップリング反応によって形成され得る二量体型分子である。一例では、ビスBIAは炭素-酸素間のカップリング反応によって形成され得る。他の例では、ビスBIAは炭素-炭素間のカップリング反応によって形成され得る。一部の例では、ビスBIA二量体型分子は、2つの同一のBIA単量体を含むホモ二量体である。一例では、遺伝子操作された宿主細胞が1種のBIA単量体を生成させ得る。このような例では、BIA単量体は、1種または複数種のカップリング酵素と接触させた場合、ホモ二量体を形成し得る。他の例では、ビスBIA二量体型分子が、2つの異なるBIA単量体を含むヘテロ二量体である。例えば、ビスBIAは、互いにエナンチオマーであるBIA単量体を含むヘテロ二量体であり得る。一部の例では、遺伝子操作された宿主細胞が2種類以上のBIA単量体を生成させ得る。このような例では、BIA単量体は、1種または複数種のカップリング酵素と接触させた場合、ホモ二量体およびヘテロ二量体を形成し得る。
のいずれか1つの化合物またはその塩であり、式中:
R1a、R1b、R2aおよびR2bは独立して、水素およびC1〜C4アルキルから選択され;
R3a、R3b、R6a、R6b、R8aおよびR8bは独立して、水素、ヒドロキシ、フルオロ、クロロ、ブロモ、カルボキシアルデヒド、C1〜C4アシル、C1〜C4アルキル、およびC1〜C4アルコキシから選択され;
R4aおよびR5aは独立して、水素およびC1〜C4アルキルから選択されるか、またはR4aとR5aが一体となってメチレン結合を形成しており;
R4bおよびR5bは独立して、水素およびC1〜C4アルキルから選択されるか、またはR4bとR5bが一体となってメチレン結合を形成しており;および
R7a、R7bおよびR9aは独立して、水素およびC1〜C4アルキルから選択される。
スキーム3
本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムにより、O-結合型メチル基の除去による第1ベンジルイソキノリンアルカロイドの第2ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を説明する。一部のこのような方法、プロセスおよびシステムは遺伝子操作された宿主細胞を含み得る。一部の例では、第1ベンジルイソキノリンアルカロイドの第2ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換が、基質のノル-オピオイドまたはナル-オピオイドへの変換のカギとなる工程である。一部の例では、第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換がデメチラーゼ反応を含む。
本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムにより、N-結合型メチル基の除去による第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換を説明する。一部のこのような方法、プロセスおよびシステムは遺伝子操作された宿主細胞を含み得る。一部の例では、第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換が、基質のノル-オピオイドまたはナル-オピオイドへの変換のカギとなる工程である。一部の例では、第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換がデメチラーゼ反応を含む。
本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムにより、N-結合型側鎖基の付加による第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換を説明する。本明細書において提供する一部の方法、プロセスおよびシステムにより、共基質から第1アルカロイドへの側鎖基の転移による第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換を説明する。一部のこのような方法、プロセスおよびシステムは遺伝子操作された宿主細胞を含み得る。一部の例では、第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換が、基質のナル-オピオイドへの変換のカギとなる工程である。一部の例では、第1アルカロイドの第2アルカロイドへの変換がメチルトランスフェラーゼ反応を含む。
一部の例では、遺伝子操作された宿主細胞が、遺伝子操作された宿主細胞が所望の関心対象の酵素および/または関心対象のBIA、例えば、本明細書に記載のようなものを生成することを可能にする活性(1つまたは複数)をコードしている1つまたは複数の異種コード配列(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上)を有している。本明細書で用いる場合、用語「異種コード配列」は、宿主生物体内には通常存在しないが適正な条件下で該宿主の細胞内で発現され得るペプチドまたはタンパク質またはその等価なアミノ酸配列、例えば酵素をコードしているか、または最終的にコードする任意のポリヌクレオチドを示すために用いている。そのため、「異種コード配列」は、宿主細胞内には通常存在するコード配列の多重コピーを含んでおり、該細胞が、該細胞内には通常存在しないコード配列のさらなるコピーを発現するようになる。異種コード配列は、RNAもしくはその任意の型、例えばmRNA、DNAもしくはその任意の型、例えばcDNA、またはRNA/DNAハイブリッドであり得る。関心対象のコード配列としては、非限定的に、コード配列、イントロン、プロモーター領域、3'-UTRおよびエンハンサー領域などの特徴を含む完全長の転写単位が挙げられる。
BIA生成のために宿主細胞を培養するための方法
上記に要約したように、本発明の一部の局面は、関心対象のベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)を調製する方法を含む。さらに、本発明の一部の局面は、関心対象の酵素を調製する方法を含む。そのため、本発明の一部の局面は、遺伝子操作された宿主細胞を、1つまたは複数の宿主細胞改変(例えば、本明細書に記載のようなもの)が機能的に発現されて該細胞が関心対象の出発化合物を生成物である関心対象の酵素および/またはBIAに変換するような条件下で培養することを含む。また、遺伝子操作された宿主細胞を、1つまたは複数の異種コード配列が機能的に発現されて関心対象の出発化合物が、生成物である酵素あるいは関心対象のBIAに変換されるようなタンパク質の産生に適した条件下で培養する工程を含む方法も提供する。一例では、該方法は、ベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)を調製する方法であって、遺伝子操作された宿主細胞(例えば、本明細書に記載のようなもの)を培養する工程;出発化合物を該細胞培養物に添加する工程;および、該BIAを該細胞培養物から回収する工程を含む、方法である。一部の例では、該方法は、遺伝子操作された宿主細胞(例えば、本明細書に記載のようなもの)を培養する工程;出発化合物を該細胞培養物に添加する工程;および、該酵素を該細胞培養物から回収する工程を含む、酵素を調製する方法である。
また、主題の方法に、関心対象の酵素および/またはBIAを細胞培養物から回収する工程を含めてもよい。分離および単離の任意の簡便な方法(例えば、クロマトグラフィー法または沈降法)が、関心対象の酵素および/またはBIAを細胞培養物から回収するための主題の方法における使用のために適合され得る。濾過法は、細胞培養物の可溶性画分を不溶性画分から分離するために使用され得る。一部の場合では、液体クロマトグラフィー法(例えば、逆相HPLC、サイズ排除、順相クロマトグラフィー)が、関心対象のBIAを細胞培養物の他の可溶性成分から分離するために使用され得る。一部の場合では、抽出法(例えば、液体抽出、pHに基づいた精製、固相抽出、アフィニティクロマトグラフィー、イオン交換など)が、関心対象の酵素および/またはBIAを細胞培養物の他の成分から分離するために使用され得る。
後続の精製工程は、関心対象のBIA生成物が富化された発酵後の溶液を、関心対象の個々の生成物種を高純度で回収するための当技術分野において公知の方法を用いて処理することを伴い得る。
1-ベンジルイソキノリンアルカロイド、ビスベンジルイソキノリンアルカロイド、プロモルフィナンアルカロイド、モルフィナンアルカロイド、ナル-オピオイド、およびノル-オピオイドを含む関心対象のBIA化合物は液体クロマトグラフィーを用いて分離され、質量分析を用いて検出および定量され得る。化合物の実体は特性溶出時間、質量電荷比(m/z)および断片化パターン(MS/MS)によって確認され得る。定量は、化合物のピーク面積を既知の参照標準化合物の標準曲線と比較することによって行なわれ得る。さらに、関心対象のBIAは、代替的な方法、例えばGC-MS、UV-vis分光法、NMR、LC-NMR、LC-UV、TLCおよびキャピラリー電気泳動によって検出され得る。
脱メチル化反応のハイスループットスクリーニングには、purpaldアッセイが使用され得る。例えば、2-オキソグルタル酸依存性ジオキシゲナーゼによって触媒される脱メチル化により、ホルムアルデヒドが、一般化学反応式:[基質]+2-オキソグルタレート+O2 ⇔[生成物]+ホルムアルデヒド+スクシネート+CO2に示す生成物として生成する。アルカリ性条件でのpurpald試薬はホルムアルデヒドの存在下で色変化を生じ、これが、1 nMという低濃度まで分光測光器で510 nmにて定量され得る。
清澄化した酵母培養培地(CYCM)中には複数種の不純物が含まれ得る。清澄化した酵母培養培地は真空および/または熱によって脱水され、アルカロイド富化粉末が得られ得る。この生成物は、ケシを栽培している国が輸出しAPI製造業者が購入する、けしがら濃縮物(concentrate of poppy straw)(CPS)またはアヘンと類似している。本発明の解釈上、CPSは、所望のアルカロイド生成物が最終的にさらに精製され得る任意の型の精製植物エキスの代表例である。表10および表11に、CYCMもしくはCPSのいずれかに特異的であり得るかまたは両方に存在し得る、この2種類の生成物中の不純物を明示している。一部のBIAは不純物として色素を有し得る一方、他のBIAはそれ自体が色素として分類され得る。したがって、このようなBIAは、不純物について非色素不純物に基づいて評価され得る。起源不明の生成物をこのような不純物のサブセットについて解析することにより、当業者は、生成物が、酵母系生産宿主に由来するのか植物系生産宿主に由来するのかを判定することができよう。
化学合成によって作製されるナル-オピオイド中には複数種の不純物が含まれ得る。このような不純物は、多くの異なる原因、例えば、未反応の出発物質、不完全な反応、副生成物の形成、中間体の残存、二量体化または分解によって生じ得る。未反応の出発物質の一例は、ナルトレキソンの調製において残存するオキシモルホンであり得る。不完全な反応により生じる不純物の一例は、テバインの不完全な3-O-脱メチル化により生じる3-O-メチルブプレノルフィンであり得る。化学修飾によりオフターゲット部位の官能基の付加または除去がもたらされ得る。例えば、ナルトレキソン合成において10-ヒドロキシナルトレキソンおよび10-ケトナルトレキソンが生じるC10の酸化、またはブプレノルフィン合成において6-O-デスメチルブプレノルフィンが得られる6-O-メチル基の除去。不純物は、反応中間体の残存、例えば、N-脱メチル化プロセス中に形成されるオキシモルホンN-オキシドなどのN-オキシドの残存により生じ得る。不純物の別の原因は二量体化である、2つのオピオイド分子、例えば、2つのブプレノルフィン分子(2,2'-ビスブプレノルフィン)、2つのナルトレキソン分子(2,2'-ビスナルトレキソン)または2つのナロキソン分子(2,2'-ビスナロキソン)のコンジュゲーションである。不純物は、出発物質、反応中間体または反応生成物の分解によっても生じ得る。化学合成において使用される極端な物理的条件は分解の存在をより起こりやすくする。分解により生じ得る不純物の一例は、ブプレノルフィン合成時の酸化条件によって生じるデヒドロブプレノルフィンである。
また、関心対象の酵素および/またはBIAを生成する目的のための宿主細胞の遺伝子操作方法も含む。宿主細胞内へのDNAの挿入は任意の簡便な方法を用いて行なわれ得る。該方法は、異種コード配列を遺伝子操作された宿主細胞内に、該宿主細胞が酵素を機能的に発現し、関心対象の出発化合物を生成物である関心対象の酵素および/またはBIAに変換するように挿入するために使用される。
例えば上記のもののような本発明の遺伝子操作された宿主細胞および方法は、さまざまな用途における利用が見出される。関心対象の用途としては、非限定的に:研究用途および治療用途が挙げられる。本発明の方法は、さまざまな異なる用途、例えば、酵素および/またはBIAの生成が関心対象となる任意の簡便な用途における利用が見出される。
本発明の局面は、本発明の方法において使用される1種または複数種の成分、例えば、本明細書に記載のような遺伝子操作された宿主細胞、出発化合物、異種コード配列、ベクター、培養培地などを含み得るキットおよびシステムをさらに含む。いくつかの態様では、主題のキットは、遺伝子操作された宿主細胞(例えば、本明細書に記載のようなもの)と、以下のもの:出発化合物、異種コード配列および/または該配列を含むベクター、ベクター、増殖用フィードストック、発現系における使用に適した成分(例えば、細胞、クローニングベクター、マルチクローニングサイト(MCS)、双方向プロモーター、内部リボソーム進入部位(IRES)など)および培養培地から選択される1種または複数種の成分とを含む。
宿主細胞は、関心対象のBIAおよび/または関心対象の酵素の生成をもたらす1つまたは複数の改変(例えば、2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上またはさらにはそれ以上の改変)を含むように遺伝子操作され得る。表3に、遺伝子操作された宿主細胞において関心対象のBIAの生成および/または関心対象の酵素の産生をもたらすような1つまたは複数の改変に作用され得る例示的な遺伝子を列記する。
ハカマオニゲシ由来のDRS-DRRのアミノ酸配列(Farrow et al.2015,GenBank:AKO60179.1)を出芽酵母内での発現のためにコドン最適化し(例えばSEQ.ID 16参照)(IDTのコドン最適化アルゴリズム)、プロテインエンジニアリングおよび酵素改善を可能にするためのいろいろなプロモーター強度を有するベクター内にクローニングした。得られたプラスミドpDW10およびpDW18(図11参照)は、それぞれ強発現のための出芽酵母(S.cerevisiae)TDH3プロモーターおよび弱発現のためのCYC1プロモーターの制御下のDRS-DRRを有し、これらを将来的な酵素の遺伝子操作の取り組み用のベースライン構築物として使用した。この実施例のスクリーニング株は、BIA経路内のDRS-DRRまでの酵素を発現するがDRS-DRRは含まない遺伝子操作された出芽酵母Cen.PK株YA106の派生株であった。LCMS法を用いた(S)-レチクリンと(R)-レチクリンのハイスループット区別における限界のため、ハカマオニゲシSalSynを高レベルで発現する株を構築し、DRS-DRR酵素の改善について、サルタリジンの生成量に基づいてスクリーニングした。SalSyn活性は、プラスミドベースのDRS-DRR活性よりかなり高いと経験論的に判断し、これにより、(S)-レチクリンの(R)-レチクリンへの変換の増大をサルタリジンの生成量によって検出することを可能にした。したがって、プロテインエンジニアリングによるDRS-DRR(またはDRS単独)に対する改善を、培養培地中のサルタルジンの相対濃度によって測定した。スクリーニング株の形質転換の際にプラスミドが染色体に組み込まれないことを確実にするため、TRP1遺伝子座をURA3の組込みによってノックアウトし、この実施例および後続の実施例で使用するレポーター株DW24を得た。
詳細なLC-MS解析を行い、DRS-DRRに由来するDRS酵素とDRR酵素の独立した発現の複数のBIA経路中間体のレベルに対する効果を調べた。BIA中間体の検出のため、TDH3プロモーターの制御下のDRS-DRR由来分離型DRS酵素およびTEF1プロモーターの制御下の分離型DRR酵素を有するプラスミド(pJL29)を、pDW10プラスミドにより発現させた融合型親酵素との比較のために構築した。プロモーター強度に基づき、このプラスミドでは、分離型酵素と融合型酵素の間で同等発現の最も近い近似値が得られた。これらのプラスミドで実施例1に記載の出芽酵母レポーター株を別々に形質転換した。これらの株を実施例1に記載のようにして培養し、BIA代謝産物を上清み中で直接、LC-MS解析によって測定した。図19に示されるように、pJL29を有する酵母株では対照プラスミドpDW10を有する株と比べて、ほぼすべてのBIA経路中間体のレベルが上昇している。上流経路中間体、特にコクラウリンとN-メチル-コクラウリンが、分離型のDRS酵素およびDRR酵素を発現している株において、融合型DRS-DRR酵素を発現している株と比べて増加し、これは、DRSとDRRを別々に発現する細胞の方が経路全体において能力が高いことを示す。この実験のレチクリンレベルはほぼ同じであったが、実施例3は、この実験のレチクリンのほとんどがおそらくR-配置であったことを示す。S-レチクリンのR-レチクリンへの効率的な変換およびその後のサルタリジンへの変換により、上流酵素が、その活性の生成物阻害(例えば、S-レチクリンによる)の減少のため、よりよく機能することが可能になるということが考えられ得る。図18に示された結果と同様、分離型のDRS酵素とDRR酵素を発現している細胞では融合型の親DRS-DRR酵素を発現している細胞と比べて多くの量のサルタリジンが生成した。
融合型親DRS-DRRまたは分離型のDRS酵素とDRR酵素のいずれかを発現している実施例1に記載のYA106の派生株の2種類のBIA経路酵母株を、S-レチクリンおよびR-レチクリンの生成能について解析した。レチクリンを酵母培地から、12.5 mLの酵母培養液をペレット化して上清み1 mLあたり30 mgのXAD-4樹脂を添加し、回転装置上で室温にて一晩インキュベートし、上清み1 mLあたり100μLのメタノールを用いて溶出させることによって濃縮した。試料を乾燥させ、100μLの水中に再懸濁させた。試料を逆相HPLC(Pursuit XRs-C18、50 mm×10 mm、5μm)により定組成15%メタノールを用いて分画した。
分離型のDRS酵素がどのようにしてフォールディングして機構的挙動を示すのかをよりよく理解するため、およびプロテインエンジニアリングの取り組みのためのフレームワークを構築するため、DRSの構造的相同性モデルを、無料で入手可能なSWISS-MODELアルゴリズム(https://swissmodel.expasy.org/)を用いて構築した。異なるCYP17酵素(PDB 4NKXおよび4R20)をベースにした2つの構造モデルを構築し、詳細に解析した。これらの2つの異なるCYPをベースにした構造モデルは互いにほぼ同一にマッチし、これらの型のシトクロムP450分子間の広い構造的相同性が示された。さらに、両モデルにはDRSの保存されたEXXRモチーフおよびC末端システイン残基(すべてのP450に共通)が親構造と同一の場所にマッピングされ、このような分子のコア構造が類似していることが示唆された。図22および23は、4NKXをベースにしたDRSの構造モデルを示す。残部のN末端ERアンカードメインを図の左下に示すとともに、酵素活性部位の近くに存在するヘム結合領域(4R20からモデル設計)のおよその場所も示す。図示したモデルの正面は、電子移動が起こるシトクロムP450レダクターゼ(CPR)の提案される一般的な結合領域であり、図22および23に示したモデルの裏側はミクロソーム膜に近位であることが提案される。DRSの相同性モデルにより、潜在的機能的役割を、確認された残基の位置およびアミノ酸変化に基づいていずれかのプロテインエンジニアリングインプルーブメントに帰属させることが可能になる。
DRS酵素とDRR酵素の別々の発現に関するさらなる実験を実施し、どの活性が異種細胞において制限的であるのかを調べた。DRSまたはDRRのいずれかのどの酵素活性が律速的であるのかをよりよく理解するため、異なるプロモーター強度下で両方の酵素を発現する一連のベクターを構築した。pDW21を親構築物として使用し、元のTEF1プロモーターより強いTDH3プロモーターをDRR発現の駆動のために挿入して使用し、プラスミドpJL32を得た。また、pDW21を親構築物として使用し、TDH3プロモーターをDRSの駆動のために挿入して使用し、プラスミドpJL29を得た。pJL29を親構築物として使用し、TEF1よりかなり弱いCYC1プロモーターをDRRの駆動のために挿入して使用し、プラスミドpJL35を得た。これらのプラスミドで実施例1に記載のレポーター酵母株を別々に形質転換した。これらの株を実施例1に記載のようにして培養し、BIA代謝産物を上清み中で直接、LC-MS解析によって測定した。図21は、DRS発現が低く(CYC1プロモーター)、DRR発現が高い(TDH3またはTEF1のいずれか)場合、およそ10μMのサルタリジンが酵母株から生成されることを示す。しかしながら、DRS発現が高い(TDH3プロモーター)場合、両方の構築物で酵母株から、DRSが低レベルで発現された株で観察されたもののほぼ倍のおよそ20μMのサルタリジンの生成がもたらされるため、DRR発現が低い(CYC1)か中間体レベルである(TEF1)かは重要でない可能性がある。この結果は、DRRと比べてDRSの細胞内活性が制限的であること、およびさらなるプロテインエンジニアリングの取り組みをDRS酵素に適用するとその活性がさらに改善され得ることを示す。
本発明者らは、DRSライブラリーをスクリーニングして改善されたDRS酵素変異体を同定するための変異誘発ベースの酵素遺伝子操作ストラテジーを実施した。pDW21内のDRSオープンリーディングフレームを、GeneMorph II(Agilent)ランダム変異誘発キットを製造業者が推奨するプロトコルに従って用いてエラープローンPCRに供した。次いでDRSの完全長の変異誘発PCR産物を、pDW21プラスミドを直接再増幅および再生させるためのプライマーとして使用するか、または、Gibson Assembly kit(NEB)を製造業者が推奨するプロトコルに従って用いて線状化pDW21と直接再結合させるかのいずれかとした。次いで、得られたプラスミドで大腸菌を形質転換し、精製プラスミドの変異誘発プールを精製し、続いて実施例1に記載の出芽酵母レポーター株を形質転換した。個々のコロニーを採取し、培養し、サルタリジンレベルを上清み中で直接、LC-MS解析によって測定した。およそ5,000個の個々の変異体をLC-MSにより、サルタリジン生成の増大についてスクリーニングした。
図24に示すように、ヒナゲシ由来のPbDRS-DRR対デヒドロレチクリンシンターゼ(DRS)およびデヒドロレチクリンレダクターゼ(DRR)の一次アミノ酸配列のアラインメントを、Clustal Omega(http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/)を用いて作成した。ヒナゲシ由来のDRRとのアラインメントに基づき、本発明者らは、PbDRS-DRRをDRS酵素およびDRR酵素に分離する切断点を特定した。ここにはM569の位置に保存メチオニン残基がみられる(Seq.ID 16)。この残基はSeq.ID 18の1位に対応する。残基D568とM569の間の黒矢印はPbDRS-DRRが切断された部位を表す。PbDRS-DRRベースの分離型DRS酵素はD568の位置で終結するように設計した。点線の矢印は、ヒナゲシ由来のDRSまたはDRRのいずれかに保存されていないか、または相同性でないPbDRS-DRR領域を示す。黒で囲んだK557から始まってD568で終わる配列のこれらの非保存残基の各々の後ろでの切断体を生成させ、DRSの各連続切断体の活性を、pDW21と同一の(TEF1プロモーターの制御下のDRRを有する)ベクター骨格においてアッセイした。このようなプラスミドで実施例1に記載のレポーター酵母株を別々に形質転換した。これらの株を実施例1に記載のようにして培養し、サルタリジンを上清み中で直接、LC-MS解析によって測定した。
DRS酵素内の30個の特有の残基において、酵母のエピメラーゼ活性を改善し、プロモルフィナンアルカロイドである高力価のサルタリジンをもたらす変異を同定した(実施例6参照)。このような変異のいくつかのDRS活性およびテバイン生成に対する影響を、選択したDRS内の点変異をプラスミド内にクローニングすることによって検証した。解析に選択した点変異はV16A、A17T、A50T、H69Q、V70I、M110IおよびR160Rであった(コドン置換)。これらのプラスミドでスクリーニング株yA511を形質転換した。yA511は、テバインまでの完全な生合成経路を有するが機能性DRS酵素は欠損しているように遺伝子操作されている。形質転換されたコロニーを前培養増殖メディーズ(medies)中に採取し、実施例1に記載のようにして一晩培養した。細胞を生産(production)培地中に戻し希釈した。2日間の生産増殖後、培養物の上清みを単離し、LC-MS/MS解析を用いて測定した。DRS変異型変異体を発現している細胞では培養培地中に、野生型(WT)DRSを発現している対照株と比較して最大1.4倍多いテバインが蓄積された(図25)。
BIAのカギとなる分岐点中間体(S)-レチクリンをL-チロシンから生成するプラットフォーム酵母株を構築した(図12)。具体的には、4種類の多遺伝子発現構築物を酵母株のゲノム内に組み込んだ。この4つの構築物の組成を図26に示す。各構築物は、酵母プロモーターにより発現される4つまたは5つの遺伝子で構成されている。遺伝子は各遺伝子座に、模式図上部のアノテーションに明記したとおりのプロモーター、遺伝子のオープンリーディングフレームおよびターミネーターを含む完全発現カセットとして位置している。模式図には、所与の遺伝子を表す矢印の方向によって各発現カセットの向きを示している。選択マーカーをアノテーションにおいてイタリック体で示し、模式図においてグレーの矢印で示す。各選択マーカーは、遺伝子座からの該マーカーの除去を可能にするloxP部位に隣接する。さらに、各構築物は、該マーカーがCreレコンビナーゼによって除去され得るようにloxP部位に隣接した選択マーカーを有する。
酵母株は、初期段階の前駆体、例えばチロシンからのモルフィナンアルカロイドテバインの生成のために遺伝子操作され得る。一例として、実施例9に記載のプラットフォーム酵母株は、L-チロシンからモルフィナンアルカロイド生成物を生成するようにさらに遺伝子操作され得る(図14)。
酵母株を、実施例9および10に記載のようにして、五環式モルフィナンアルカロイドテバインが単糖(例えば、グルコース)および標準的な増殖培地中に存在する窒素源から直接生成されるように遺伝子操作した。具体的には、CEN.PK株の出芽酵母を、以下の異種酵素:TyrH、DODC、PTPS、SepR、PCD、QDHPR、NCS、6OMT、CNMT、CYP80B1、CPR、4OMT、DRS、DRR、SalSyn、SalR、SalATおよびTSが発現されるように酵母染色体内への組込みによって遺伝子操作した。この実施例では、SalSyn酵素は、そのリーダー配列がハナビシソウ(Eschscholzia californica)ケランチフォリン(chelanthifoline)シンターゼ(EcCFS)のN末端由来の83個のアミノ酸で置き換えられているように遺伝子操作される。この株に対して、BIA前駆体の蓄積を増大させるためのさらなる改変、例えば:ARO10の過剰発現、TYR1の過剰発現、フィードバック耐性ARO4(ARO4Q166K)の発現およびフィードバック耐性ARO7(ARO7T226I)の発現を行った。テバインシンターゼ活性(TS)、例えばSEQ ID NO.35(すなわち、TS1)、37(すなわち、TS2)をコードしているいろいろな変異体の酵素を有するか、最初の22個のアミノ酸のN末端切断体(すなわち、tTS1)を有するSEQ ID NO.35の変異体を有するか、テバインシンターゼ酵素(YA397)を有しない別個の遺伝子操作された酵母株を記載のようにして作製した。これらの酵素変異体の配列を表2に示す。
酵母株は、初期段階の前駆体、例えばチロシンからの下流のモルフィナンアルカロイドの生成のために遺伝子操作され得る。一例として、実施例10に記載のプラットフォーム酵母株は、L-チロシンから下流のモルフィナンアルカロイド生成物を生成するようにさらに遺伝子操作され得る(図14)。
酵母株は、初期段階の前駆体、例えばチロシンからの下流のモルフィナンアルカロイドの生成のために遺伝子操作され得る。一例として、実施例9および10に記載の酵母株は、L-チロシンから半合成オピオイド生成物を生成するようにさらに遺伝子操作され得る(図15)。
モルフィナンアルカロイドに対してO-デメチラーゼ活性を示した表4に列記した酵素を、モルフィナンアルカロイドをデノボで生合成する微生物株(出芽酵母または大腸菌のいずれか)に組み込んだ(実施例10に記載のようにして)。完全なBIA生合成経路では、宿主細胞によって生成された、および/または培養培地中に補給されたL-チロシンが使用される。2分子のチロシンが改変され、縮合して、ノルコクラウリンまたはノルラウダノソリンのいずれかであり得る第1のベンジルイソキノリン構造を形成する。このベンジルイソキノリンはさらに改変されて(S)-レチクリンを形成し、次いで、遺伝子操作された分割型エピメラーゼ酵素の活性によって立体化学的に反転され、(R)-レチクリンが生じる。(R)-レチクリンは炭素-炭素間のカップリング反応を受けて、第1のプロモルフィナンであるサルタリジンを形成し、さらに改変された後、テバインシンターゼによって触媒される酸素-炭素間のカップリング反応を受け、第1のモルフィナンアルカロイド構造であるテバインが得られる(図14参照)。表3に、完全な経路内の酵素および活性を列記する。
モルフィナンアルカロイドに対してN-デメチラーゼ活性を示した表5に列記した酵素を、モルフィナンアルカロイドをデノボで生合成する微生物株(出芽酵母または大腸菌のいずれか)に組み込んだ(実施例10に記載のようにして)。完全なBIA生合成経路では、宿主細胞によって生成された、および/または培養培地中に補給されたL-チロシンが使用される。2分子のチロシンが改変され、縮合して、ノルコクラウリンまたはノルラウダノソリンのいずれかであり得る第1のベンジルイソキノリン構造を形成する。このベンジルイソキノリンはさらに改変されて(S)-レチクリンを形成し、次いで遺伝子操作された分割型エピメラーゼ酵素の活性によって立体化学的に反転され、(R)-レチクリンが生じる。(R)-レチクリンは炭素-炭素間のカップリング反応を受けて、第1のプロモルフィナンであるサルタリジンを形成し、さらに改変された後、テバインシンターゼによって触媒される酸素-炭素間のカップリング反応を受け、第1のモルフィナンアルカロイド構造であるテバインが得られる(図14参照)。表3に、完全な経路内の酵素および活性を列記する。
モルフィナンアルカロイド分子生成株におけるN-デメチラーゼ活性を検出するため、プラスミドベクターまたは染色体組込みカセットのいずれかにより候補酵素を発現している細胞を発酵によって増殖させ、細胞上清みを収集し、全オピオイドプロフィールを解析した(上記のとおり)。完全なBIA経路を有する株内でのオピオイド分子のN-脱メチル化をLC-MSによって検出した(上記のとおり)。具体的には、オキシモルホンのノルオキシモルホンへの変換を検出した。生物触媒作用によるN-脱メチル化活性を検出するため、株を選択培地中で培養し、次いでガラスビーズでの破壊によって溶解させた。細胞ライセートにオピオイド基質(図7参照)および酵素機能に必要な他の補因子を外来的に供給した。オピオイド分子のN-脱メチル化をLC-MSによって検出した。
モルフィナンアルカロイドに対してN-メチラーゼ活性を示した表6に列記した酵素を、モルフィナンアルカロイドをデノボで生合成する微生物株(出芽酵母または大腸菌のいずれか)に組み込んだ(実施例10に記載のようにして)。図10は、前駆体分子テバインから最終ナル-オピオイド化合物のナロキソンおよびナルトレキソンまでの完全な反応スキームの一例を示す。このような株は、完全なBIA経路によるノル-オピオイド化合物の生成を担う、実施例14および15ならびに表3の酵素をさらに発現する。また、N-メチラーゼ酵素を、生合成経路がない微生物株内(例えば、出芽酵母ではCen.PK2または大腸菌ではBL21のいずれか)で発現させ、外来的に供給したいくつかの異なる基質分子の生物触媒作用能を有する株を作製した。完全なBIA生合成経路では、宿主細胞によって生成された、および/または培養培地中に補給されたチロシンが使用される。2分子のチロシンが改変され、縮合して、ノルコクラウリンまたはノルラウダノソリンのいずれかであり得る第1のベンジルイソキノリン構造を形成する。このベンジルイソキノリンはさらに改変されて(S)-レチクリンを形成し、次いで遺伝子操作された分割型エピメラーゼ酵素の活性によって立体化学的に反転され、(R)-レチクリンが生じる。(R)-レチクリンは炭素-炭素間のカップリング反応を受けて、第1のプロモルフィナンであるサルタリジンを形成し、さらに改変された後、テバインシンターゼによって触媒される酸素-炭素間のカップリング反応を受け、第1のモルフィナンアルカロイド構造であるテバインが得られる(図14参照)。表3に、完全な経路内の酵素および活性を列記する。
1.遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された分割型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化により、同様の条件での融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化と比べてアルカロイド生成物の生成を増大させる方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させ、それによりアルカロイド生成物の生成を増大させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換される、
方法。
2.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼがオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、項1の方法。
3.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項1の方法。
4.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項1の方法。
5.前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項2の方法。
6.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも80%相同な配列を含む、項2の方法。
7.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも85%相同な配列を含む、項2の方法。
8.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも90%相同な配列を含む、項2の方法。
9.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも95%相同な配列を含む、項2の方法。
10.前記オキシダーゼ成分が、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、項6の方法。
11.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、項2の方法。
12.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも85%相同な配列を含む、項2の方法。
13.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも90%相同な配列を含む、項2の方法。
14.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも95%相同な配列を含む、項2の方法
15.遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された分割型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化により、同様の条件での融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化と比べてアルカロイド生成物の生成を増大させる方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させ、それによりアルカロイド生成物の生成を増大させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換され、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で融合型エピメラーゼよりも少なくとも1%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、
方法。
16.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも3%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
17.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼより少なくとも5%多くの前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
18.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも10%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
19.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも15%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
20.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも20%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
21.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも25%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
22.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも30%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項15の方法。
23.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項15の方法。
24.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項23の方法。
25.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼがオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、項15の方法。
26.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも80%相同な配列を含む、項25の方法。
27.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも85%相同な配列を含む、項25の方法。
28.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも90%相同な配列を含む、項25の方法。
29.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも95%相同な配列を含む、項25の方法。
30.前記オキシダーゼ成分が、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、項25の方法。
31.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、項25の方法。
32.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも85%相同な配列を含む、項25の方法。
33.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも90%相同な配列を含む、項25の方法。
34.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも95%相同な配列を含む、項25の方法。
35.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を、同様の条件下での融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換と比べて増大させる、遺伝子操作された分割型エピメラーゼ
を含む、遺伝子操作された宿主細胞。
36.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼでは、前記アルカロイド生成物の生成が、同様の条件下での融合型の親エピメラーゼを介するエピマー化と比べて増大する、項35の遺伝子操作された宿主細胞。
37.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼでは、前記アルカロイド生成物の生成が、野生型融合型エピメラーゼを介するエピマー化と比べて増大する、項35の遺伝子操作された宿主細胞。
38.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項35の遺伝子操作された宿主細胞。
39.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項35の遺伝子操作された宿主細胞。
40.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼがオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、項35の遺伝子操作された宿主細胞。
41.前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項40の遺伝子操作された宿主細胞。
42.前記オキシダーゼ成分が、
SEQ ID NO.17と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項40の遺伝子操作された宿主細胞。
43.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、項40の遺伝子操作された宿主細胞。
44.局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
45.オキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、項44の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
46.野生型融合型エピメラーゼと比較して高い活性を有する、項44の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
47.自身の活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項44の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
48.前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項45の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
49.前記オキシダーゼ成分が、
SEQ ID NO.17と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項45の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
50.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、項45の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
51.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を、同様の条件下での融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換と比べて増大させる、遺伝子操作された分割型エピメラーゼ
を含む、遺伝子操作された宿主細胞。
52.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項51の遺伝子操作された宿主細胞。
53.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項51の遺伝子操作された宿主細胞。
54.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼがオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、項51の遺伝子操作された宿主細胞。
55.前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項54の遺伝子操作された宿主細胞。
56.前記オキシダーゼ成分が、
SEQ ID NO.17と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項54の遺伝子操作された宿主細胞。
57.局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
58.野生型融合型エピメラーゼと比較して高い活性を有する、項57の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
59.自身の活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項57の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
60.オキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、項57の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
61.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも80%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
62.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも85%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
63.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも90%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
64.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも95%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
65.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
66.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも85%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
67.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも90%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
68.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも95%相同な配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
69.前記オキシダーゼ成分が1つまたは複数の変異を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
70.前記オキシダーゼ成分が、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、項60の遺伝子操作された分割型エピメラーゼ。
71.遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された分割型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化によりアルカロイド生成物を生成する方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させ、それによりアルカロイド生成物の生成を増大させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換され、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼはオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含み、前記オキシダーゼ成分はSEQ ID NO.17と少なくとも80%相同な配列を含み、前記レダクターゼ成分はSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、
方法。
72.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項71の方法。
73.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項71の方法。
74.前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項71の方法。
75.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも85%相同な配列を含む、項71の方法。
76.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも90%相同な配列を含む、項71の方法。
77.前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも95%相同な配列を含む、項71の方法。
78.前記オキシダーゼ成分が、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、項71の方法。
79.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも85%相同な配列を含む、項71の方法。
80.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも90%相同な配列を含む、項71の方法。
81.前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも95%相同な配列を含む、項71の方法。
82.前記融合型エピメラーゼが野生型エピメラーゼである、先の項のいずれかの方法。
83.前記融合型エピメラーゼが前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの親エピメラーゼである、先の項のいずれかの方法。
84.前記融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの前記オキシダーゼ成分と同じ配列を有するオキシダーゼドメインを含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、先の項のいずれかの方法。
85.前記融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの前記レダクターゼ成分と同じ配列を有するレダクターゼドメインを含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、先の項のいずれかの方法。
86.前記融合型エピメラーゼが野生型エピメラーゼである、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
87.前記融合型エピメラーゼが前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの親エピメラーゼである、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
88.前記融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの前記オキシダーゼ成分と同じ配列を有するオキシダーゼドメインを含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
89.前記融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの前記レダクターゼ成分と同じ配列を有するレダクターゼドメインを含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
90.オキシダーゼ成分がシトクロムP450オキシダーゼ様ドメインを有する、先の項のいずれかの方法。
91.レダクターゼ成分がコデイノンレダクターゼ様ドメインを有する、先の項のいずれかの方法。
92.遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化により、アルカロイド生成物を生成する方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させる工程であって、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼは、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換される、
方法。
93.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項92の方法。
94.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項92の方法。
95.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、項92の方法。
96.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも80%相同な配列を含む、項92の方法。
97.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも85%相同な配列を含む、項92の方法。
98.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも90%相同な配列を含む、項92の方法。
99.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも95%相同な配列を含む、項92の方法。
100.遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化により、同様の条件での野生型融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化と比べてアルカロイド生成物の生成を増大させる方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させ、それによりアルカロイド生成物の生成を増大させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換され、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも1%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、
方法。
101.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも3%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
102.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも5%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
103.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも10%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
104.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも15%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
105.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも20%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
106.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも25%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
107.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも30%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、項100の方法。
108.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項100の方法。
109.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項100の方法。
110.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項100の方法。
111.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、項100の方法。
112.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも80%相同な配列を含む、項100の方法。
113.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも85%相同な配列を含む、項100の方法。
114.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも90%相同な配列を含む、項100の方法。
115.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼがSEQ ID NO.16と少なくとも95%相同な配列を含む、項100の方法。
116.遺伝子操作された融合型エピメラーゼを含む遺伝子操作された宿主細胞であって、前記エピメラーゼは(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を増大させ、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼより多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、遺伝子操作された宿主細胞。
117.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項116の遺伝子操作された宿主細胞。
118.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項116の遺伝子操作された宿主細胞。
119.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項116の遺伝子操作された宿主細胞。
120.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項116の遺伝子操作された宿主細胞。
121.局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼ。
122.野生型融合型エピメラーゼと比較して高い活性を有する、項121の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
123.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項121の遺伝子操作された融合型エピメラーゼ。
124.1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、野生型配列と比べてSEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、項121の遺伝子操作された融合型エピメラーゼ。
125.SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項121の遺伝子操作された融合型エピメラーゼ。
126.ベンジルイソキノリンアルカロイド生成物を有する生成物流を形成するための方法であって、
(a)遺伝子操作された宿主細胞と、栄養物および水を含むフィードストックとをバッチ式反応器に供給する工程であって、該遺伝子操作された宿主細胞は、少なくとも1種の遺伝子操作されたエピメラーゼをコードしている少なくとも1つの異種コード配列を含み、該遺伝子操作されたエピメラーゼは先の項のいずれかの遺伝子操作された分割型エピメラーゼまたは遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、工程;
(b)前記バッチ式反応器内で、前記遺伝子操作された宿主細胞を少なくとも約5分間インキュベートすることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞を発酵に供して、前記ベンジルイソキノリンアルカロイド生成物と細胞材料を含む溶液を生成させる工程;および
(c)前記ベンジルイソキノリンアルカロイド生成物を前記細胞材料から分離するために少なくとも1つの分離ユニットを用いて、前記ベンジルイソキノリンアルカロイド生成物を含む前記生成物流を得る工程
を含む、方法。
127.バッチ式反応器の少なくとも1つのプロセスパラメータが、得られるベンジルイソキノリンアルカロイド生成物の組成が変更されるように修正可能である、項126の方法。
128.修正可能である該少なくとも1つのプロセスパラメータが、溶存酸素、pH、撹拌速度、エアレーション速度および細胞密度のうちの少なくとも1つを含む、項126の方法。
129.先の項のいずれかにより生成されるベンジルイソキノリンアルカロイド生成物を含む医療用製剤品。
130.がん治療特性を有する、項129の医療用製剤品。
131.鎮痛特性を有する、項129の医療用製剤品。
132.抗マラリア特性を有する、項129の医療用製剤品。
133.鎮咳特性を有する、項129の医療用製剤品。
134.オピオイド過剰摂取処置特性を有する、項129の医療用製剤品。
135.抗依存症特性を有する、項129の医療用製剤品。
136.前記生成物が前記遺伝子操作された宿主細胞内でさらなる処理を受けてナル-オピオイド生成物が生成される、先の項のいずれかの方法。
137.前記生成物が前記遺伝子操作された宿主細胞内でさらなる処理を受けてノル-オピオイド生成物が生成される、先の項のいずれかの方法。
138.前記生成物が前記遺伝子操作された宿主細胞内でさらなる処理を受けてビスベンジルイソキノリンアルカロイド生成物が生成される、先の項のいずれかの方法。
139.前記生成物をナル-オピオイド生成物に変換するように遺伝子操作されている、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
140.前記生成物をノル-オピオイド生成物に変換するように遺伝子操作されている、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
141.前記生成物をビスベンジルイソキノリンアルカロイド生成物に変換するように遺伝子操作されている、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
142.前記生成物をプロモルフィナンアルカロイド生成物に変換するように遺伝子操作されている、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
143.前記生成物をモルフィナンアルカロイド生成物に変換するように遺伝子操作されている、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
144.遺伝子操作された融合型エピメラーゼがオキシダーゼドメインとレダクターゼドメインを含む、先の項のいずれかの方法。
145.オキシダーゼドメインがシトクロムP450オキシダーゼ様ドメインである、項144の方法。
146.レダクターゼドメインがコデイノンレダクターゼ様ドメインである、項144の方法。
147.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが(S)-レチクリンである、先の項のいずれかの方法。
148.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが(R)-レチクリンである、先の項のいずれかの方法。
149.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを4環式のプロモルフィナンアルカロイドに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
150.4環式のプロモルフィナンアルカロイドがサルタリジンである、項75の方法。
151.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを5環式のモルフィナンアルカロイドに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
152.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドをビスベンジルイソキノリンアルカロイドに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
153.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドをナル-オピオイドに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
154.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドをノル-オピオイドに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
155.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドをプロモルフィナンに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
156.(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドをモルフィナンに変換する工程
をさらに含む、先の項のいずれかの方法。
157.遺伝子操作された宿主細胞内に存在する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが、遺伝子操作された微生物細胞内で生成される、先の項のいずれかの方法。
158.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが、遺伝子操作された宿主細胞内で、L-チロシンから始まる代謝経路によって生成される、先の項のいずれかの方法。
159.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが、遺伝子操作された宿主細胞内で、糖質と窒素源から始まる代謝経路によって生成される、先の項のいずれかの方法。
160.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが:(S)-ノルレチクリン;(S)-レチクリン;(S)-テトラヒドロパパベリン;(S)-ノルコクラウリン;(S)-コクラウリン;(S)-N-メチルコクラウリン;(S)-3’-ヒドロキシ-N-メチルコクラウリン;(S)-ノルイソオリエンタリン;(S)-オリエンタリン;(S)-イソオリエンタリン;(S)-ノルプロトシノメニン;(S)-プロトシノメニン;(S)-ノルラウダノソリン;(S)-ラウダノソリン;(S)-4’-O-メチルラウダノソリン;(S)-6-O-メチルノルラウダノソリン;および(S)-4’-O-メチルノルラウダノソリンからなる群より選択される、先の項のいずれかの方法。
161.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが式I:
の化合物であり、
式中:
R1、R2、R3およびR4は独立して水素またはメチルであり;
R5は水素、ヒドロキシまたはメトキシである、
先の項のいずれか1つの方法。
162.前記遺伝子操作された宿主細胞が遺伝子操作された非植物細胞である、上記の項のいずれか1つの方法。
163.前記遺伝子操作された宿主細胞が遺伝子操作された酵母細胞である、上記の項のいずれか1つの方法。
164.前記遺伝子操作された宿主細胞が遺伝子操作された細菌細胞である、上記の項のいずれか1つの方法。
165.遺伝子操作された融合型エピメラーゼがオキシダーゼドメインとレダクターゼドメインを含む、先の項のいずれかの遺伝子操作された宿主細胞。
166.オキシダーゼ成分がシトクロムP450オキシダーゼ様ドメインを有する、項165の遺伝子操作された宿主細胞。
167.レダクターゼ成分がコデイノンレダクターゼ様ドメインを有する、項165の遺伝子操作された宿主細胞。
168.遺伝子操作された非植物細胞である、上記の項のいずれか1つの遺伝子操作された宿主細胞。
169.遺伝子操作された酵母細胞である、上記の項のいずれか1つの遺伝子操作された宿主細胞。
170.遺伝子操作された細菌細胞である、上記の項のいずれか1つの遺伝子操作された宿主細胞。
171.遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作されたエピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化によりアルカロイド生成物の生成を増大させる方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作されたエピメラーゼと接触させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作されたエピメラーゼと接触させることにより、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換される、
方法。
172.前記遺伝子操作されたエピメラーゼが、遺伝子操作された分割型エピメラーゼである、項171の方法。
173.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼでは、野生型融合型エピメラーゼを介するエピマー化と比べて前記前記アルカロイド生成物の生成が増大する、項172の方法。
174.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項172の方法。
175.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項172の方法。
176.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが1つまたは複数の変異を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内の位置に相当する位置に存在する、項172の方法。
177.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項172の方法。
178.前記遺伝子操作されたエピメラーゼが、遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、項171の方法。
179.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項178の方法。
180.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項178の方法。
181.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが1つまたは複数の変異を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内の位置に相当する位置に存在する、項178の方法。
182.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項178の方法。
183.前記遺伝子操作された宿主細胞が遺伝子操作された非植物細胞である、上記の項171〜182のいずれか1つの方法。
184.(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を増大させる遺伝子操作されたエピメラーゼを含む遺伝子操作された宿主細胞。
185.前記遺伝子操作されたエピメラーゼが、遺伝子操作された分割型エピメラーゼである、項184の遺伝子操作された宿主細胞。
186.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼでは、前記アルカロイド生成物の生成が野生型融合型エピメラーゼを介するエピマー化と比べて増大する、項185の遺伝子操作された宿主細胞。
187.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項185の遺伝子操作された宿主細胞。
188.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項185の遺伝子操作された宿主細胞。
189.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが1つまたは複数の変異を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内の位置に相当する位置に存在する、項185の遺伝子操作された宿主細胞。
190.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項185の遺伝子操作された宿主細胞。
191.前記遺伝子操作されたエピメラーゼが、遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、項184の遺伝子操作された宿主細胞。
192前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項191の遺伝子操作された宿主細胞。
193.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、項191の遺伝子操作された宿主細胞。
194.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが1つまたは複数の変異を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内の位置に相当する位置に存在する、項191の遺伝子操作された宿主細胞。
195.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項191の遺伝子操作された宿主細胞。
196.前記遺伝子操作された宿主細胞が遺伝子操作された非植物細胞である、項184〜195のいずれか1つの遺伝子操作された宿主細胞。
197.局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む遺伝子操作されたエピメラーゼ。
198.遺伝子操作された分割型エピメラーゼである、項197の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
199.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが野生型融合型エピメラーゼと比較して高い活性を有する、項197の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
200.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、項197の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
201.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが1つまたは複数の変異を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.16内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内の位置に相当する位置に存在する、項197の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
202.前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項197の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
203.局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである遺伝子操作されたエピメラーゼ。
204.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、SEQ ID NO.16の対応する位置に1つまたは複数の変異を含み、前記1つまたは複数の変異が、16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応する、項203の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
205.前記遺伝子操作された融合型エピメラーゼが、
SEQ ID NO.16と少なくとも80%相同であり、かつ
野生型配列と比べて75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.16内のアミノ酸位置に相当するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列にコードされている
配列を含む、項203の遺伝子操作されたエピメラーゼ。
Claims (37)
- 遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された分割型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化により、同様の条件での融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化と比べてアルカロイド生成物の生成を増大させる方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させ、それによりアルカロイド生成物の生成を増大させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換される、
方法。 - 前記融合型エピメラーゼが野生型エピメラーゼである、請求項1記載の方法。
- 前記融合型エピメラーゼが前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの親エピメラーゼである、請求項1記載の方法。
- 前記融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの前記オキシダーゼ成分と同じ配列を有するオキシダーゼドメインを含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、請求項1記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、請求項1記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、請求項1記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼがオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、請求項1記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、請求項7記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも80%相同な配列を含む、請求項7記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも95%相同な配列を含む、請求項7記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分が、
野生型配列と比べて75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含む、DNA配列
にコードされた配列を含む、請求項7記載の方法。 - 前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、請求項7記載の方法。
- 前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも95%相同な配列を含む、請求項7記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で前記融合型エピメラーゼよりも少なくとも1%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、請求項1記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも3%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、請求項1記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼにより、同様の条件下で野生型融合型エピメラーゼよりも少なくとも5%多い前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが生成される、請求項1記載の方法。
- 遺伝子操作された宿主細胞内での遺伝子操作された分割型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへのエピマー化によりアルカロイド生成物を生成する方法であって、
前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと前記遺伝子操作された宿主細胞内で接触させ、それによりアルカロイド生成物の生成を増大させる工程
を含み、
ここで、前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドを前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼと接触させることにより、前記遺伝子操作された宿主細胞内で前記(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドが前記(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドに変換され、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼはオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含み、前記オキシダーゼ成分はSEQ ID NO.17と少なくとも80%相同な配列を含み、前記レダクターゼ成分はSEQ ID NO.18と少なくとも80%相同な配列を含む、
方法。 - 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの活性を高める1つまたは複数の変異を含む、請求項17記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼが、局在変異、シトクロムP450レダクターゼ相互作用変異および到達性変異からなる群より選択される1つまたは複数の変異を含む、請求項17記載の方法。
- 前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼがオキシダーゼ成分とレダクターゼ成分を含む、請求項17記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分が、1つまたは複数の変異を含むDNA配列にコードされた配列を含み、該変異の各々が、SEQ ID NO.17内の16位、17位、37位、50位、64位、69位、70位、110位、128位、155位、232位、234位、244位、293位、303位、328位、354位、387位、393位、427位および477位からなる群より選択される位置に対応するコドン位置に存在する、請求項20記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも85%相同な配列を含む、請求項20記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも90%相同な配列を含む、請求項20記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分がSEQ ID NO.17と少なくとも95%相同な配列を含む、請求項20記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分が、
野生型配列と比べて、75位、160位、191位、256位、359位、366位および500位からなる群より選択されるSEQ ID NO.17内のアミノ酸位置に対応するコドン位置に1つまたは複数のコドン置換を含むDNA配列
にコードされた配列を含む、請求項20記載の方法。 - 前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも85%相同な配列を含む、請求項20記載の方法。
- 前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも90%相同な配列を含む、請求項20記載の方法。
- 前記レダクターゼ成分がSEQ ID NO.18と少なくとも95%相同な配列を含む、請求項20記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分をコードしている第1の核酸が第1の翻訳開始部位を有し、前記レダクターゼ成分をコードしている第2の核酸が第2の翻訳開始部位を有する、請求項7または20記載の方法。
- 前記第1の核酸が前記第2の核酸と分離されている、請求項29記載の方法。
- 前記第1の核酸が前記第2の核酸と同じ核酸である、請求項29記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分が第1のメッセンジャーRNAにコードされており、前記レダクターゼ成分が第2のメッセンジャーRNAにコードされている、請求項7または20記載の方法。
- 前記オキシダーゼ成分が第1の分子を含み、前記レダクターゼ成分が第2の分子を含み、ここで、前記第1の分子は前記第2の分子と分離されている、請求項7または20記載の方法。
- (S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換を、同様の条件下での融合型エピメラーゼを介する(S)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドの(R)-1-ベンジルイソキノリンアルカロイドへの変換と比べて増大させる、遺伝子操作された分割型エピメラーゼ
を含む、遺伝子操作された宿主細胞。 - 前記融合型エピメラーゼが野生型エピメラーゼである、請求項34記載の遺伝子操作された宿主細胞。
- 前記融合型エピメラーゼが前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの親エピメラーゼである、請求項34記載の遺伝子操作された宿主細胞。
- 前記融合型エピメラーゼが、前記遺伝子操作された分割型エピメラーゼの前記オキシダーゼ成分と同じ配列を有するオキシダーゼドメインを含む遺伝子操作された融合型エピメラーゼである、請求項34記載の遺伝子操作された宿主細胞。
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EP3678667A4 (en) * | 2017-09-08 | 2021-10-20 | Eleszto Genetika, Inc. | MICROORGANISMS AND PROCEDURES IN THE FERMENTATION OF BENZYLISOCHINOLINE ALKALOIDS |
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CN114302951A (zh) * | 2019-03-26 | 2022-04-08 | 安思雅公司 | 提高吗啡喃生物碱和衍生物的产量的方法 |
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CN110179859B (zh) * | 2019-06-27 | 2021-09-24 | 香港科技大学深圳研究院 | 防己提取物及防己诺林碱在制药中的应用 |
AU2020363960A1 (en) * | 2019-10-10 | 2022-04-21 | River Stone Biotech Aps | Genetically modified host cells producing benzylisoquinoline alkaloids |
CN111592989B (zh) * | 2020-06-28 | 2021-09-17 | 曲靖师范学院 | 一种曲霉菌Aspergillus sp.G12及其发酵制备异紫堇定碱的方法 |
WO2024100063A1 (en) | 2022-11-08 | 2024-05-16 | River Stone Biotech Aps | Genetically modified benzylisoquinoline alkaloid-producing host cells with modified efflux transporter gene expression |
CN116463310B (zh) * | 2022-11-11 | 2024-08-20 | 浙江中医药大学 | 一种粉防己4’-氧甲基转移酶4’-omt及应用 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015173590A1 (en) * | 2014-05-16 | 2015-11-19 | The Unversity Of York | Novel cytochrome p450 fusion protein |
WO2016081371A1 (en) * | 2014-11-17 | 2016-05-26 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Noscapinoid-producing microbes and methods of making and using the same |
WO2016183023A1 (en) * | 2015-05-08 | 2016-11-17 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods of producing epimerases and benzylisoquinoline alkaloids |
Family Cites Families (58)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US3785927A (en) | 1973-02-12 | 1974-01-15 | Merck & Co Inc | Process for converting(-)reticuline to(+)salutaridine |
GB8910958D0 (en) | 1989-05-12 | 1989-06-28 | Bruce Neil C | Assay |
AUPO887297A0 (en) | 1997-08-29 | 1997-09-25 | Johnson & Johnson Research Pty. Limited | Cytochrome p450 reductase from poppy plants |
AUPP946399A0 (en) | 1999-03-26 | 1999-04-22 | Johnson & Johnson Research Pty. Limited | Codeinone reductase from alkaloid poppy |
ATE532874T1 (de) | 2001-02-15 | 2011-11-15 | Univ Chicago | Verfahren zum nachweis in hefe für mittels die proteinfaltung beeinflussen |
EP1270727A1 (en) | 2001-06-11 | 2003-01-02 | Institut für Pflanzenbiochemie | Salutaridinol 7-O-acetyltransferase and derivatives thereof |
DE10232930A1 (de) | 2002-07-19 | 2004-02-05 | Consortium für elektrochemische Industrie GmbH | Verfahren zur fermentativen Herstellung von Aminosäuren und Aminosäure-Derivaten der Phosphoglycerat-Familie |
EP1512748A1 (en) | 2003-09-03 | 2005-03-09 | Johnson & Johnson Research Pty Limited | O-methyltransferases of tetrahydrobenzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in papaver somniferum |
DE112004001708T5 (de) | 2003-09-17 | 2006-10-26 | Kyoto University | Verfahren zur Herstellung einer nützlichen Zwischenstufe in der Alkaloid-Biosynthese unter Verwendung von RNAi-Technik |
TWI223707B (en) | 2003-12-30 | 2004-11-11 | Univ Nat Yunlin Sci & Tech | Drug sensor for the alkaloid measurement, the preparation thereof, and measuring systems comprising the same |
US7482140B2 (en) | 2004-06-15 | 2009-01-27 | Ajinomoto Co., Inc. | L-tyrosine-producing bacterium and a method for producing L-tyrosine |
EP1632565A1 (en) | 2004-08-12 | 2006-03-08 | Johnson & Johnson Research Pty Limited | Modulation of alkaloid biosynthesis in plants and plants having altered alkaloid biosynthesis |
US8318474B1 (en) | 2005-05-23 | 2012-11-27 | California Institute Of Technology | Engineered yeast cells and uses thereof |
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WO2008067070A2 (en) | 2006-10-19 | 2008-06-05 | California Institute Of Technology | Compositions and methods for producing benzylisoquinolines alkaloids |
US20080102499A1 (en) | 2006-10-27 | 2008-05-01 | Lori Jean Templeton | Method of enhancing L-tyrosine production in recombinant bacteria |
WO2008153094A1 (ja) | 2007-06-12 | 2008-12-18 | Kyoto University | アルカロイド類の生産方法 |
JP2009225669A (ja) | 2008-03-19 | 2009-10-08 | Ishikawa Pref Gov | 植物ベンジルイソキノリンアルカロイドの生産方法 |
AU2009233315B2 (en) | 2008-03-31 | 2013-08-29 | Sun Pharmaceutical Industries Ltd. | An improved process for the preparation of morphinane analogues |
US8541647B2 (en) | 2008-05-29 | 2013-09-24 | Tasmania Alkaloids Pty, Ltd. | Papaver somniferum with high concentration of codeine |
WO2011058446A2 (en) | 2009-11-12 | 2011-05-19 | Uti Limited Partnership | Thebaine 6-o-demethylase and codeine o-demethylase from papaver somniferum |
EP2585479B1 (en) | 2010-06-22 | 2019-06-12 | Sun Pharmaceutical Industries (Australia) Pty Limited | Methyltransferase nucleic acids and polypeptides |
ES2664569T3 (es) | 2010-07-22 | 2018-04-20 | Sun Pharmaceutical Industries (Australia) Pty Limited | Citocromo P450 de plantas |
JP5761723B2 (ja) | 2010-09-22 | 2015-08-12 | 石川県公立大学法人 | 植物ベンジルイソキノリンアルカロイドの生産方法 |
US20140013465A1 (en) | 2010-11-01 | 2014-01-09 | Tpi Enterprises Ltd. | Papaver bracteatum with modified alkaloid content |
CN103282500A (zh) | 2010-11-05 | 2013-09-04 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 用于增加植物中产量和精细化学品生产的方法 |
WO2012135389A2 (en) | 2011-03-28 | 2012-10-04 | The Regents Of The University Of California | Host cells and methods for oxidizing aromatic amino acids |
EP2565262A1 (en) | 2011-08-31 | 2013-03-06 | VTU Holding GmbH | Protein expression |
US8809028B2 (en) | 2011-11-07 | 2014-08-19 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Biosynthesis of caffeic acid and caffeic acid derivatives by recombinant microorganisms |
WO2013096993A1 (en) | 2011-12-27 | 2013-07-04 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Processes for producing lipids |
GB201204407D0 (en) | 2012-03-13 | 2012-04-25 | Glaxosmithkline Australia Pty Ltd | Nucleic acid molecule |
WO2014143744A2 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Benzylisoquinoline alkaloids (bia) producing microbes, and methods of making and using the same |
CA2921468C (en) | 2013-08-16 | 2022-08-23 | Epimeron Inc. | Compositions and methods for making noscapine and synthesis intermediates thereof |
AU2014203805A1 (en) * | 2013-09-18 | 2015-04-02 | Capillary Technologies International Pte Ltd | Systems and methods for managing customer engagements |
WO2015066642A1 (en) | 2013-11-04 | 2015-05-07 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Benzylisoquinoline alkaloid (bia) precursor producing microbes, and methods of making and using the same |
ES2961516T3 (es) | 2013-12-04 | 2024-03-12 | Antheia Inc | Composiciones y métodos para elaborar (r)-reticulina y precursores de la misma |
US20160340704A1 (en) | 2014-01-13 | 2016-11-24 | Valorbec Société en Commandite | Method of making a benzylisoquinoline alkaloid (bia) metabolite, enzymes therefore |
WO2015164960A1 (en) | 2014-04-29 | 2015-11-05 | Epimeron Inc. | Improved methods for making and using polynucleotide sequences in the synthesis of alkaloid compounds |
AU2015278205B2 (en) | 2014-06-19 | 2021-11-18 | Willow Biosciences Inc. | Compositions and methods for making (S)-norcoclaurine and (S)-norlaudanosoline, and synthesis intermediates thereof |
AU2015306046A1 (en) | 2014-08-22 | 2017-04-13 | Willow Biosciences Inc. | Compositions and methods for making alkaloid morphinans |
WO2016049364A2 (en) | 2014-09-26 | 2016-03-31 | The Regents Of The University Of California | Tyrosine hydroxylase variants and methods of use thereof |
US11085060B2 (en) | 2015-01-02 | 2021-08-10 | Georgia Tech Research Corporation | Pterin-dependent biocatalysts and uses thereof |
BR112017019357A2 (pt) | 2015-03-10 | 2018-06-05 | Rhodes Tech | sal acetato de buprenorfina e métodos para preparar buprenorfina |
WO2016149821A1 (en) | 2015-03-23 | 2016-09-29 | Valorbec Société en Commandite | Methods of making morphinan alkaloids and enzymes therefore |
EP3292203A4 (en) | 2015-05-04 | 2019-10-09 | The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University | BENZYL ISOCHINOLIN ALKALOID (BIA) Precursor Producing Microbicides and Method for the Preparation and Use Thereof |
GB201511156D0 (en) | 2015-06-24 | 2015-08-05 | Glaxosmithkline Australia Pty Ltd And University Of York | Production of alkaloids |
IL241462A0 (en) | 2015-09-10 | 2015-11-30 | Yeda Res & Dev | Heterologous engineering of betalain pigments in plants |
WO2017083632A1 (en) | 2015-11-13 | 2017-05-18 | President And Fellows Of Harvard College | Host cells and systems for membrane protein expression |
GB2546285A (en) | 2016-01-13 | 2017-07-19 | Sun Pharmaceutical Ind Australia Pty Ltd | Modified plant |
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TW201815821A (zh) * | 2016-07-18 | 2018-05-01 | 美商再生元醫藥公司 | 抗茲卡病毒抗體及使用方法 |
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AU2017322099B2 (en) | 2016-09-02 | 2023-11-30 | Tasmanian Alkaloids Pty Ltd | P. somniferum plants for the production of codeine |
WO2018136654A1 (en) | 2017-01-19 | 2018-07-26 | Donald Danforth Plant Science Center | Morphinan n-demethylase isolated from the methylobacterium thebainfresser and methods of use thereof |
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Patent Citations (3)
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BIOCHEMISTRY, vol. 50, no. 19, JPN6021040568, 2011, pages 3957 - 3967, ISSN: 0004775635 * |
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