JP2020526180A - 医療検査用基板及びその遺伝子シーケンシング方法と遺伝子シーケンシングチップ - Google Patents

医療検査用基板及びその遺伝子シーケンシング方法と遺伝子シーケンシングチップ Download PDF

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Abstract

医療検査用基板及びその遺伝子シーケンシング方法を提供する。該医療検査用基板は、マイクロ流路基板(130)と、マイクロ流路基板(130)に対向して設置される第1基板(110)と、マイクロ流路基板(130)に対向して設置されマイクロ流路基板(130)の第1基板(110)から離れる側に設置される第2基板(120)とを含む。マイクロ流路基板(130)の第1基板(110)に対向する側には少なくとも1つの第1マイクロ流路(131)が設けられ、第1基板(110)は、第1マイクロ流路(131)に連通される第1サンプル入口(117)と第1サンプル出口(118)を含み、マイクロ流路基板(130)の第2基板(120)に対向する側には少なくとも1つの第2マイクロ流路(132)が設けられ、第2基板(120)は、第2マイクロ流路(132)に連通される第2サンプル入口(127)と第2サンプル出口(128)を含む。

Description

本開示の実施例は医療検査用基板、医療検査用基板の遺伝子シーケンシング方法および遺伝子シーケンシングチップに関する。
遺伝子シーケンシング技術の発展に伴い、遺伝子シーケンシング技術は、現代の分子生物学の研究において最も一般的な技術に益々なっていき、幅広く利用されている。そのため、遺伝子シーケンシング用装置は、より大きな市場を占めている。
1977年から第1世代の遺伝子シーケンシングが現在まで発展してきて、遺伝子シーケンシング技術はかなり大きな進歩を遂げ、第1世代がサンガ―シーケンシング技術であり、第2世代がハイスループットシーケンシング技術であり、第3世代が単分子シーケンシング技術であり、第4世代がナノポアシーケンシング技術であり、現在市場の主流であるシーケンシング技術はまだ第2世代のハイスループットシーケンシングを主としている。
第2世代のハイスループットシーケンシング技術は主にIllumina社の合成とシーケンシングを同時に行う技術と、Thermo Fisher社のイオン半導体シーケンシング技術と、接続法シーケンシング技術と、Roche社のピロリン酸シーケンシング技術等を含む。
本開示の実施例は医療検査用基板及びその遺伝子シーケンシング方法と遺伝子シーケンシングチップを提供する。
本開示の少なくとも1つの実施例は、マイクロ流路基板と、前記マイクロ流路基板に対向して設置される第1基板と、前記マイクロ流路基板に対向して設置され、且つ前記マイクロ流路基板の前記第1基板から離れる側に設置される第2基板と、を含み、前記マイクロ流路基板の前記第1基板に対向する面には少なくとも1つの第1マイクロ流路が設けられ、前記第1基板は、前記第1マイクロ流路に連通される第1サンプル入口と第1サンプル出口を含み、前記マイクロ流路基板の前記第2基板に対向する面には少なくとも1つの第2マイクロ流路が設けられ、前記第2基板は、前記第2マイクロ流路に連通される第2サンプル入口と第2サンプル出口を含む医療検査用基板を提供する。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記マイクロ流路基板上における前記第1マイクロ流路の正投影と、前記マイクロ流路基板上における前記第2マイクロ流路の正投影とは、少なくとも一部が重複する。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記マイクロ流路基板上における前記第1マイクロ流路の正投影と、前記マイクロ流路基板上における前記第2マイクロ流路の正投影とは重複しない。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記第1サンプル入口と前記第1サンプル出口はそれぞれ対応する前記第1マイクロ流路の両端に設けられ、前記第2サンプル入口と前記第2サンプル出口はそれぞれ対応する前記第2マイクロ流路の両端に設けられる。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記第1基板は、前記第1基板の前記マイクロ流路基板に近い側から前記第1基板に凹む第1シーケンシング井戸を複数含み、各前記第1シーケンシング井戸は、対応する前記第1マイクロ流路に連通され、対応する前記第1サンプル入口と前記第1サンプル出口との間に設置され、前記第1シーケンシング井戸は、検査予定のサンプルが置かれるように配置される。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記第2基板は、前記第2基板の前記マイクロ流路基板に近い側から前記第2基板に凹む第2シーケンシング井戸を複数含み、各前記第2シーケンシング井戸は、対応する前記第2マイクロ流路に連通され、前記第2サンプル入口と前記第2サンプル出口との間に設置され、前記第2シーケンシング井戸は、検査予定のサンプルが置かれるように配置される。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記第1マイクロ流路および前記第2マイクロ流路、又はそのいずれか一方の深さは10〜500ミクロンの範囲にある。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記第1マイクロ流路および前記第2マイクロ流路、又はそのいずれか一方の幅は100〜10000ミクロンの範囲にある。
例えば、本開示の一実施例に係る医療検査用基板においては、前記第1基板および第2基板、又はそのいずれか一方の材料は、石英、ガラスまたは有機樹脂を含む。
本開示の少なくとも1つの実施例は上記いずれか一つの医療検査用基板を含む、遺伝子検査チップをさらに提供する。
例えば、本開示の一実施例に係る遺伝子シーケンシングチップにおいては、前記第1マイクロ流路は、間隔をおいて設置される複数の第1シーケンシングエリアを含み、前記第1シーケンシングエリアは、検査予定のサンプルが置かれるように配置される。
例えば、本開示の一実施例に係る遺伝子シーケンシングチップにおいては、前記複数の第1シーケンシングエリアは前記第1マイクロ流路の延在する方向に沿って順次に設置される。
例えば、本開示の一実施例に係る遺伝子シーケンシングチップにおいては、前記第2マイクロ流路は、間隔をおいて設置される複数の第2シーケンシングエリアを含み、前記第2シーケンシングエリアは、検査予定のサンプルが置かれるように配置される。
例えば、本開示の一実施例に係る遺伝子シーケンシングチップにおいては、前記複数の第2シーケンシングエリアは前記第2マイクロ流路の延在する方向に沿って順次に設置される。
本開示の少なくとも1つの実施例は上記いずれか一項に記載の医療検査用基板の遺伝子シーケンシング方法を提供し、前記遺伝子シーケンシング方法は、前記第1サンプル入口を通って前記第1サンプル入口に連通される前記第1マイクロ流路に4種類の異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸を順次に添加することと、前記第2サンプル入口を通って前記第2サンプル入口に連通される前記第2マイクロ流路に4種類の異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸を順次に添加することとを含む。

本発明の実施例の技術案をより明瞭に説明するために、以下、実施例の図面を簡単に説明するが、勿論、以下の説明における図面は本発明の一部の実施例に関するものに過ぎず、本発明を制限するものではない。
医療検査用基板の構造を示す模式図である。 医療検査用基板の平面を示す模式図である。 医療検査用基板の側面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係る医療検査用基板の構造を示す模式図である。 本開示の一実施例に係る医療検査用基板の平面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係る医療検査用基板の側面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係る別の医療検査用基板の側面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係る遺伝子シーケンシングチップの断面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係るマイクロ流路基板の平面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係るマイクロ流路基板の断面を示す模式図である。 本開示の一実施例に係るマイクロ流路基板の遺伝子シーケンシング方法を示すフローチャートである。
本開示の実施例の目的、技術案及び利点をより明瞭にするために、以下は本開示の実施例の図面をもって、本開示の実施例の技術案を明瞭且つ完全に説明する。勿論、下記実施例は本開示の一部の実施例に過ぎず、全部の実施例ではない。下記本開示の実施例に基づいて、当業者が創造的な努力を必要とせずに想到し得るすべてのその他の実施例は、本開示の保護範囲に属する。
特に定義しない限り、使用される技術用語又は科学用語は、当業者が理解する一般的な意味である。本開示に使用される「第1」、「第2」及び類似する用語は順番、数又は重要性を示すのではなく、異なる構成要素を区別するものに過ぎない。「含む」又は「備える」のような用語は当該用語前に現れた素子又はデバイスが当該用語後に現れる素子又はデバイス及びその同等物を意味し、且つほかの素子又はデバイスを排除しない。「接続」又は「連結」のような用語は物理的又は機械的接続に限定されず、直接か間接に関わらず電気的接続を含む。
現在市場に主流となる第2世代の医療検査用基板はフローセル(flow−cell)シーケンシングチップであり、市場の90%以上の割合を占めている。しかしながら、通常のフローセル(flow−cell)シーケンシングチップは生産コストが高く、一方、通常のシーケンシングチップは主に二層構造で単層マイクロ流路を形成し、シーケンシング能力が限られている。よって、遺伝子シーケンシングの効率が低く、コストが高くなっている。
例えば、図1は医療検査用基板を示す模式図である。図1に示すように、医療検査用基板は、対向して設置される基板10とマイクロ流路基板30とを含む。マイクロ流路基板30の、基板10に近い面には少なくとも1つのマイクロ流路31が設けられ、図1にマイクロ流路が2つ示される。基板10には、少なくとも1つのマイクロ流路31に対応して設けられる少なくとも1対のサンプル入口17とサンプル出口18が設けられ、対応して設けられるサンプル入口17とサンプル出口18はマイクロ流路31に連通される。図1において、基板10とマイクロ流路基板30の構造をよりはっきり示すように、基板10とマイクロ流路基板30とは多少の間隔で離れている。しかしながら、使用過程において、基板10とマイクロ流路基板30とは接触するように設置される。図2は図1の医療検査用基板の平面をしめす模式図である。図2に示すように、マイクロ流路基板30には2つのマイクロ流路31が設けられ、基板10には、2つのマイクロ流路31に対応して設けられる2対のサンプル入口17とサンプル出口18が設けられる。図3は図1の医療検査用基板の側面を示す模式図である。図3に示すように、マイクロ流路31はマイクロ流路基板30の基板10に近い面からマイクロ流路基板30に凹む溝構造である。図1〜図3に示す医療検査用基板は、基板10とマイクロ流路基板30にマイクロ流路31と、対応して設けられるサンプル入口17とサンプル出口18とが形成されるため、そのシーケンシング能力が限られ、遺伝子シーケンシングの効率が低く、コストが高くなっている。
本開示の実施例は、医療検査用基板及びその遺伝子シーケンシング方法と遺伝子シーケンシングチップを提供する。該医療検査用基板は、マイクロ流路基板と、マイクロ流路基板に対向して設置される第1基板と、マイクロ流路基板に対向して設置されマイクロ流路基板の第1基板から離れる側に設置される第2基板と、を含む。マイクロ流路基板の第1基板に対向する側には少なくとも1つの第1マイクロ流路が設けられ、第1基板は、第1マイクロ流路に連通される第1サンプル入口と第1サンプル出口とを含み、マイクロ流路基板の第2基板に対向する側には少なくとも1つの第2マイクロ流路が設けられ、第2基板は、第2マイクロ流路に連通される第2サンプル入口と第2サンプル出口とを含む。それにより、マイクロ流路基板の両側に第1基板と第2基板を設置することによって、マイクロ流路基板を十分に利用し、マイクロ流路基板の両側に第1マイクロ流路と第2マイクロ流路とがそれぞれ形成されるため、該医療検査用基板の検査能力が倍になり、遺伝子検査に用いられる際に、シーケンシングフラックスと遺伝子シーケンシング效率を向上させ、遺伝子シーケンシングのコストを低減することができる。また、該医療検査用基板は、医療検査用基板の頻繁な置き換え及び化学試薬のロードに要する時間も同時に減少させ、遺伝子シーケンシング效率をさらに向上させることができる。
以下に、図面を結合し本開示の実施例に係る医療検査用基板及びその遺伝子シーケンシング方法と遺伝子検査基板を説明する。
本開示の少なくとも1つの実施例は医療検査用基板を提供する。医療検査用基板は、マイクロ流路基板と、マイクロ流路基板に対向して設置される第1基板と、マイクロ流路基板に対向して設置されマイクロ流路基板の第1基板から離れる側に設置される第2基板とを含む。マイクロ流路基板の第1基板に対向する側には少なくとも1つの第1マイクロ流路が設けられ、第1基板は、第1マイクロ流路に連通される第1サンプル入口と第1サンプル出口とを含み、マイクロ流路基板の第2基板に対向する側には少なくとも1つの第2マイクロ流路が設けられ、第2基板は、第2マイクロ流路に連通される第2サンプル入口と第2サンプル出口とを含む。
図4は本開示の一実施例に係る医療検査用基板の構造を示す模式図である。図1に示すように、該医療検査用基板は第1基板110と、第2基板120と、マイクロ流路基板130とを含む。第1基板110はマイクロ流路基板130に対向して設置され、第2基板120はマイクロ流路基板130に対向して設置されマイクロ流路基板130の第1基板110から離れる側に設置され、つまり、第1基板110と第2基板120とはそれぞれマイクロ流路基板130の2つの側面に対向して設置される。マイクロ流路基板130の第1基板110に対向する面(即ち、マイクロ流路基板130の第1基板110に臨む面)には少なくとも1つの第1マイクロ流路131が設けられ、第1基板110は、第1マイクロ流路131に連通される第1サンプル入口117と第1サンプル出口118とを含む。マイクロ流路基板130の第2基板120に対向する面(即ち、マイクロ流路基板130の第2基板120に臨む面)には少なくとも1つの第2マイクロ流路132が設けられ、第2基板120は、第2マイクロ流路132に連通される第2サンプル入口127と第2サンプル出口128とを含む。なお、第1マイクロ流路の数は複数でもよく、第2マイクロ流路の数も複数でもよい。マイクロ流路基板が第1マイクロ流路を複数含む際に、第1基板もペアになる第1サンプル入口と第1サンプル出口を複数含み、各第1マイクロ流路が1対の第1サンプル入口と第1サンプル出口とに対応して設置され、マイクロ流路基板が第2マイクロ流路を複数含む際に、第2基板もペアになる第2サンプル入口と第2サンプル出口を複数含み、各第2マイクロ流路が1対の第2サンプル入口と第2サンプル出口とに対応して設けられる。
本実施例に係る医療検査用基板において、マイクロ流路基板の両側にある第1マイクロ流路と第2マイクロ流路において同時に遺伝子シーケンシングを完成するように、第1サンプル入口と第1サンプル出口を通って第1マイクロ流路に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液を添加または排出し、第2サンプル入口と第2サンプル出口を通って第2マイクロ流路に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液を添加または排出する。該医療検査用基板はマイクロ流路基板を十分に利用することができ、マイクロ流路基板の両側に第1マイクロ流路と第2マイクロ流路をそれぞれ形成し、よって、該医療検査用基板の検査能力が倍にり、遺伝子検査に用いられる際に、その遺伝子シーケンシング能力が倍になり、シーケンシングフラックスと遺伝子シーケンシング效率を向上させ、遺伝子シーケンシングのコストを低減することができる。また、該医療検査用基板は、一回に収納可能な検査予定のサンプルが増加するため、医療検査用基板の頻繁な置き換え及び化学試薬のロードに要する時間も同時に減少し、遺伝子シーケンシング效率をさらに向上させることができる。なお、本開示の実施例に係る医療検査用基板は他の医療検査の応用に適用することができる。
なお、図4において、第1基板110、第2基板120、マイクロ流路基板130の構造をはっきり示すように、第1基板110とマイクロ流路基板130が多少の間隔で離れ、第2基板120とマイクロ流路基板130が多少の間隔で離れているが、実際の使用において、第1基板110とマイクロ流路基板130が接触して設置され、第2基板120とマイクロ流路基板130も接触して設置される。
例えば、第1マイクロ流路131はマイクロ流路基板130の第1基板110に近い面からマイクロ流路基板130に凹む溝構造であり、第2マイクロ流路132はマイクロ流路基板130の第2基板120に近い面からマイクロ流路基板130に凹む溝構造である。
図5は図4の医療検査用基板の平面を示す模式図である。図5に示すように、第1サンプル入口117と第1サンプル出口118はそれぞれ対応する第1マイクロ流路131の両端に設けられ、第2サンプル入口127と第2サンプル出口128はそれぞれ対応する第2マイクロ流路132の両端に設けられる。それにより、第1サンプル入口と第1サンプル出口を通って第1マイクロ流路に各種の化学試薬を添加または排出する際、及び第2サンプル入口と第2サンプル出口を通って第2マイクロ流路に各種の化学試薬を添加または排出する際に、効率を向上させ、化学試薬の残存を避けることができる。
図6は図4の医療検査用基板の側面を示す模式図である。図6に示すように、マイクロ流路基板130上における第1マイクロ流路131の正投影と、マイクロ流路基板130上における第2マイクロ流路132の正投影とは重複しない。それにより、隣り合う第1マイクロ流路と第2マイクロ流路との干渉を低減することができる。もちろん、本開示の実施例はこれを含むが、これに限定されるものではない。
例えば、図7は本実施例に係る別の医療検査用基板の側面を示す模式図である。図7に示すように、マイクロ流路基板130上における第1マイクロ流路131の正投影と、マイクロ流路基板130上における第2マイクロ流路132の正投影とは少なくとも一部が重複し、ひいては完全に重複している。隣り合う第1マイクロ流路の間の間隔及び隣り合う第2マイクロ流路の間の間隔を低減することによって、医療検査用基板における第1マイクロ流路と第2マイクロ流路の数を増加できる。
いくつかの例示において、第1マイクロ流路の数の範囲は1〜10である。もちろん、本開示の実施例はこれを含むが、これに限定されるものではなく、第1マイクロ流路の数は10より大きくなってもよい。
いくつかの例示において、第2マイクロ流路の数の範囲は1〜10である。もちろん、本開示の実施例はこれを含むが、これに限定されるものではなく、第2マイクロ流路の数は10より大きくなってもよい。
いくつかの例示において、第1マイクロ流路の深さの範囲は10〜500ミクロンであってもよく、第2マイクロ流路の範囲は10-500ミクロンであってもよい。もちろん、本開示の実施例ははこれを含むが、これに限定されるものではない。
いくつかの例示において、第1マイクロ流路の幅の範囲は100〜10000ミクロンであり、第2マイクロ流路の幅の範囲は100〜10000ミクロンである。もちろん、本開示の実施例ははこれを含むが、これに限定されるものではない。
いくつかの例示において、第1基板の材料は、石英、ガラスまたは有機樹脂を含み、第2基板の材料は、石英、ガラスまたは有機樹脂を含む。
図8は本実施例に係る別の遺伝子シーケンシングチップの断面を示す模式図である。図8に示すように、第1基板110は、第1基板110のマイクロ流路基板130に近い側から第1基板110に凹む第1シーケンシング井戸115を複数含む。各第1シーケンシング井戸115は、それに対応する第1マイクロ流路131に連通され、対応する第1サンプル入口117と第1サンプル出口118との間に設置される。第1シーケンシング井戸115に検査予定のサンプルが置かれてもよい。それにより、第1サンプル入口117を通って第1マイクロ流路131に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液が添加され、次に各種の化学試薬が検査予定のサンプルの置かれるそれぞれの第1シーケンシング井戸115に流入して検査予定のサンプルと反応し、次に第1サンプル出口118を通って排出され、検査予定のサンプルに対する遺伝子シーケンシングが完了する。
いくつかの例において、図8に示すように、第2基板120は、第2基板120のマイクロ流路基板130に近い側から第2基板120に凹む第2シーケンシング井戸125を複数含む。各第2シーケンシング井戸125は、それに対応する第2マイクロ流路132に連通され、対応する第2サンプル入口127と第2サンプル出口128との間に設置される。第2シーケンシング井戸125に検査予定のサンプルが置かれてもよい。それにより、第2サンプル入口127を通って第2マイクロ流路132に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液が添加され、次に各種の化学試薬が検査予定のサンプルの置かれるそれぞれの第2シーケンシング井戸125に流入して検査予定のサンプルと反応し、次に第2サンプル出口128を通って排出され、検査予定のサンプルに対する遺伝子シーケンシングが完了する。
例えば、第1シーケンシング井戸または第2シーケンシング井戸の横断面は円形や正多角形等であってもよい。
なお、本開示の実施例に係る遺伝子シーケンシングチップは、第1基板上に第1シーケンシング井戸が設置されなくてもよく、第2基板上に第2シーケンシング井戸が設置されなくてもよい。図9Aは本実施例に係るマイクロ流路基板の平面を示す模式図である。図9Aに示すように、第1マイクロ流路131は、間隔をおいて設置される第1シーケンシングエリア1310を複数含み、第1シーケンシングエリア1310には検査予定のサンプルが置かれてもよい。それにより、第1マイクロ流路131に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液を添加することによって、異なる第1シーケンシングエリア1310において異なる検査予定のサンプルと直接に反応することができ、このように、検査予定のサンプルに対する遺伝子シーケンシングが完了する。例えば、図9Aに示すように、第2マイクロ流路132は、間隔をおいて設置される第2シーケンシングエリア1320を複数含み、第2シーケンシングエリア1320には検査予定のサンプルが置かれもよい。それにより、第2マイクロ流路132に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液を加えることによって、異なる第2シーケンシングエリア1320において異なる検査予定のサンプルと直接に反応することができ、このように、検査予定のサンプルに対する遺伝子シーケンシングが完了する。
なお、検査予定のサンプルが第1マイクロ流路または第2マイクロ流路を流動することを防止するように、検査予定のサンプルは第1シーケンシングエリアまたは第2シーケンシングエリアに固定されてもよい。例えば、図9Bに示すように、第1シーケンシングエリア1310または第2シーケンシングエリア1320にゲル層910が形成され、ゲル層910上に接続子920が設置されている。検査予定のサンプルを一対になるようにゲル層910の接続子920に付着させ、このように、検査予定のサンプルが第1シーケンシングエリア1310または第2シーケンシングエリア1320内に固定される。ゲル層は通常の材料を利用してもよく、例えば水ゲルを含んでもよい。さらに、例えば、コロイド状構造の材料、重合体網状構造の材料、または交叉結合される重合体構造の材料を利用してもよく、コロイド状構造の材料は例えばアガロースを含み、重合体網状構造の材料は例えばゼラチンを含み、交叉結合される重合体構造の材料は例えばポリアクリルアミドを含む。ゲル層の材料は、シランフリーアクリルアミドまたはN-[5-(2- ブロモアセチル)アミノペンチル] アクリルアミド(BRAPA)であってもよい。
例えば、図9Aに示すように、複数の第1シーケンシングエリア1310は第1マイクロ流路131の延在する方向に沿って順次に設置されてもよい。
例えば、図9Aに示すように、複数の第2シーケンシングエリア1320は第2マイクロ流路132の延在する方向に沿って順次に設置されてもよい。
本開示の少なくとも1つの実施例は、医療検査用基板の遺伝子シーケンシング方法を提供する。該医療検査用基板は、上記いずれか一項に記載の医療検査用基板を利用してもよい。図10は医療検査用基板の遺伝子シーケンシング方法を示すフローチャートである。該遺伝子シーケンシング方法は以下のステップS201〜S202を含む。
ステップS201:第1サンプル入口を通って第1サンプル入口に連通される第1マイクロ流路に4種類の異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸を順次に添加する。
ステップS202:第2サンプル入口を通って第2サンプル入口に連通される第2マイクロ流路に4種類の異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸を順次に添加する。
なお、上記ステップS201とステップS202は時間的な順序がなく、即ちステップS201とステップS202とは同時に行ってもよい。
本実施例に係る医療検査用基板の遺伝子シーケンシング方法において、マイクロ流路基板の両側の第1マイクロ流路と第2マイクロ流路において同時に遺伝子シーケンシングを完了させるように、第1サンプル入口と第1サンプル出口を通って第1マイクロ流路に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液を添加または排出し、第2サンプル入口と第2サンプル出口を通って第2マイクロ流路に各種の化学試薬、例えば異なる塩基デオキシリボヌクレオシド三リン酸を含む4種類の溶液を添加または排出する。該遺伝子シーケンシング方法はマイクロ流路基板の両側の第1マイクロ流路と第2マイクロ流路を十分に利用することができ、よって、遺伝子シーケンシング能力が倍になり、シーケンシングフラックスと遺伝子シーケンシング效率を向上させ、遺伝子シーケンシングのコストを低減することができる。
例えば、上記デオキシリボヌクレオシド三リン酸はリバーシブルターミネーションデオキシリボヌクレオシド三リン酸であり、該遺伝子シーケンシング方法は、反応セルに加えられたリバーシブルターミネーションデオキシリボヌクレオシド三リン酸を洗浄してメルカプト試薬を添加するステップをさらに含む。検査予定のサンプル(例えば、DNA断片)の一つ前の位置にある塩基タイプの検査が完成した後に、反応セルに添加されたリバーシブルターミネーションデオキシリボヌクレオシド三リン酸を洗浄してメルカプト試薬を添加する必要がある。なお、一般のデオキシリボヌクレオシド三リン酸に異なり、リバーシブルターミネーションデオキシリボヌクレオシド三リン酸の3’端は1つのアジド基に接続され、DNAの合成過程においてホスホジエステル結合が形成されないため、DNAの合成が中止される。メルカプト試薬が添加されると、アジド基が破断され、元の位置にヒドロキシルが形成される。メルカプト試薬が添加された後に、次の位置にある塩基タイプの検査が続き、検査方法は上記方法と同じであり、ここで省略する。
例えば、検査予定のサンプルがDNA断片である際に、上記リバーシブルターミネーションデオキシリボヌクレオシド三リン酸は、リバーシブルターミネーション三リン酸アデニンデオキシリボヌクレオチドと、リバーシブルターミネーション三リン酸チミンデオキシリボヌクレオチドと、リバーシブルターミネーション三リン酸シトシンデオキシリボヌクレオチドと、リバーシブルターミネーション三リン酸グアニンデオキシリボヌクレオチドとを含んでもよい。反応セルに添加され反応するデオキシリボヌクレオシド三リン酸が三リン酸アデニンデオキシリボヌクレオチドである場合に、この際に検査予定のサンプル(例えば、DNA断片)における塩基はチミンである。反応セルに添加され反応するデオキシリボヌクレオシド三リン酸が三リン酸チミンデオキシリボヌクレオチドである場合に、この際に検査予定のサンプル(例えば、DNA断片)における塩基はアデニンである。反応セルに添加され反応するデオキシリボヌクレオシド三リン酸が三リン酸シトシンデオキシリボヌクレオチドである場合に、この際に検査予定のサンプル(例えば、DNA断片)における基はグアニンである。反応セルに添加され反応するデオキシリボヌクレオシド三リン酸が三リン酸グアニンデオキシリボヌクレオチドである場合に、この際に検査予定のサンプル(例えば、DNA断片)における塩基はシトシンである。
以下を説明する必要がある。
(1)本開示の実施例の図面は、本開示の実施例に係る構造のみに関し、他の構造は通常の設計を参照してもよい。
(2)矛盾しない限り、本開示の同一の実施例は異なる実施例における特徴と互いに組み合わせてもよい。
以上説明したのは本開示の具体的な実施形態に過ぎないが、本開示の保護範囲を制限するものではなく、当業者が本開示に開示された技術範囲内において容易に想到し得る変更または置換が、本開示の保護範囲内に含まれるべきである。そのため、本開示の保護範囲は前記請求項の保護範囲に準ずるべきである。
本願は、2017年7月10日付出願した中国特許出願第201710557848.8号の優先権を要求し、ここで、上記中国特許出願に開示された全内容が本願の一部として援用される。
10 基板
17 サンプル入口
18 サンプル出口
30 マイクロ流路基板
31 マイクロ流路
110 第1基板
115 第1シーケンシング井戸
117 第1サンプル入口
118 第1サンプル出口
120 第2基板
125 第2シーケンシング井戸
127 第2サンプル入口
128 第2サンプル出口
130 マイクロ流路基板
131 第1マイクロ流路
132 第2マイクロ流路
910 ゲル層
920 接続子
1310 第1シーケンシングエリア
1320 第2シーケンシングエリア

Claims (17)

  1. マイクロ流路基板と、
    前記マイクロ流路基板に対向して設置される第1基板と、
    前記マイクロ流路基板に対向して設置され、且つ前記マイクロ流路基板の前記第1基板から離れる側に設置される第2基板と、を含み、
    前記マイクロ流路基板の前記第1基板に対向する面には少なくとも1つの第1マイクロ流路が設けられ、前記第1基板は、前記第1マイクロ流路に連通される第1サンプル入口と第1サンプル出口を含み、
    前記マイクロ流路基板の前記第2基板に対向する面には少なくとも1つの第2マイクロ流路が設けられ、前記第2基板は、前記第2マイクロ流路に連通される第2サンプル入口と第2サンプル出口を含むことを特徴とする医療検査用基板。
  2. 前記マイクロ流路基板上における前記第1マイクロ流路の正投影と、前記マイクロ流路基板上における前記第2マイクロ流路の正投影とは、少なくとも一部が重複することを特徴とする請求項1に記載の医療検査用基板。
  3. 前記マイクロ流路基板上における前記第1マイクロ流路の正投影と、前記マイクロ流路基板上における前記第2マイクロ流路の正投影とは重複しないことを特徴とする請求項1に記載の医療検査用基板。
  4. 前記第1サンプル入口と前記第1サンプル出口はそれぞれ対応する前記第1マイクロ流路の両端に設置され、前記第2サンプル入口と前記第2サンプル出口はそれぞれ対応する前記第2マイクロ流路の両端に設置されることを特徴とする請求項1〜3のいずれか一項に記載の医療検査用基板。
  5. 前記第1基板は、前記第1基板の前記マイクロ流路基板に近い側から前記第1基板に凹む第1シーケンシング井戸を複数含み、各前記第1シーケンシング井戸は、対応する前記第1マイクロ流路に連通され、対応する前記第1サンプル入口と前記第1サンプル出口との間に設置され、前記第1シーケンシング井戸は、検査予定のサンプルが置かれるように配置されることを特徴とする請求項4に記載の医療検査用基板。
  6. 前記第2基板は、前記第2基板の前記マイクロ流路基板に近い側から前記第2基板に凹む第2シーケンシング井戸を複数含み、各前記第2シーケンシング井戸は、対応する前記第2マイクロ流路に連通され、前記第2サンプル入口と前記第2サンプル出口との間に設置され、前記第2シーケンシング井戸は、検査予定のサンプルが置かれるように配置されることを特徴とする請求項4に記載の医療検査用基板。
  7. 前記第1マイクロ流路および前記第2マイクロ流路、又はそのいずれか一方の深さは10〜500ミクロンの範囲にあることを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載の医療検査用基板。
  8. 前記第1マイクロ流路および前記第2マイクロ流路、又はそのいずれか一方の幅は100〜10000ミクロンの範囲にあることを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載の医療検査用基板。
  9. 前記第1基板および前記第2基板、又はそのいずれか一方の材料は、石英、ガラスまたは有機樹脂を含むことを特徴とする請求項1〜8のいずれか一項に記載の医療検査用基板。
  10. 請求項1〜9のいずれか一項に記載の医療検査用基板を含むことを特徴とする遺伝子シーケンシングチップ。
  11. 前記第1マイクロ流路は、間隔をおいて設置される複数の第1シーケンシングエリアを含み、前記第1シーケンシングエリアは、検査予定のサンプルが置かれるように配置されることを特徴とする請求項10に記載の遺伝子シーケンシングチップ。
  12. 前記第1シーケンシングエリアに設置されるゲル層と、
    前記ゲル層上に設置され、検査予定のサンプルに付着されるように配置される接続子と、をさらに含むことを特徴とする請求項10に記載の遺伝子シーケンシングチップ。
  13. 前記複数の第1シーケンシングエリアは前記第1マイクロ流路の延在する方向に沿って順次に設置されることを特徴とする請求項12に記載の遺伝子シーケンシングチップ。
  14. 前記第2マイクロ流路は、間隔をおいて設置される複数の第2シーケンシングエリアを含み、前記第2シーケンシングエリアは、検査予定のサンプルが置かれるように配置されることを特徴とする請求項10に記載の遺伝子シーケンシングチップ。
  15. 前記第2シーケンシングエリアに設置されるゲル層と、
    前記ゲル層上に設置され、検査予定のサンプルに付着されるように配置される接続子と、をさらに含むことを特徴とする請求項14に記載の遺伝子シーケンシングチップ。
  16. 前記複数の第2シーケンシングエリアは前記第2マイクロ流路の延在する方向に沿って順次に設置されることを特徴とする請求項15に記載の遺伝子シーケンシングチップ。
  17. 請求項1〜9のいずれか一項に記載の医療検査用基板の遺伝子シーケンシング方法であって、前記遺伝子シーケンシング方法は、
    前記第1サンプル入口を通って前記第1サンプル入口に連通される前記第1マイクロ流路に4種類の異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸を順次に添加することと、
    前記第2サンプル入口を通って前記第2サンプル入口に連通される前記第2マイクロ流路に4種類の異なるデオキシリボヌクレオシド三リン酸を順次に添加することとを含むことを特徴とする遺伝子シーケンシング方法。
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