JP2020011971A - ガンの治療方法 - Google Patents

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Abstract

【課題】ＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンの症状を治療または軽減する方法の提供。【解決手段】それを必要とする対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤および医薬組成物を投与する。対象は脳および中枢神経系ガン、頭頸部ガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、肺ガン、リンパ腫、骨髄腫、肉腫、乳がん、ならびに前立腺ガンからなる群から選択されるガンである。例えば、ＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンは、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体またはＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の１以上の成分の発現の減少および／または機能の喪失を特徴とする。【選択図】なし

Description

関連出願
本願は、２０１２年１０月１５日に出願された米国特許仮出願第６１／７１４，０４５号、２０１３年１月３１日に出願された同第６１／７５８，９７２号、２０１２年１０月１５日に出願された同第６１／７１４，１４０号、２０１２年１０月１５日に出願された同第６１／７１４，１４５号、２０１３年３月１３日に出願された同第６１／７８０，７０３号、および２０１３年３月１４日に出願された同第６１／７８６，２７７号の優先権および利益を請求する。これらの仮出願のそれぞれの全内容は、参照により全体として本明細書中に組み込まれる。
発明の分野
本発明は、概してガン治療、そして特にＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガン（すなわち、ＳＷＩ／ＳＮＦ介在性ガン）の治療に関する。さらに詳細には、本発明は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガンの症状を治療、軽減、予防、縮小または他の方法で改善する方法および組成物を提供する。
発明の背景
疾患関連クロマチン修飾酵素（たとえば、ＥＺＨ２）は、増殖性障害、代謝障害、および血液障害などの疾患に関与する。したがって、ＥＺＨ２の活性を調節できる小分子の開発が必要とされる。
本発明は、それを必要とする対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与することによって対象におけるＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンの症状を治療または軽減する方法であって、対象が脳および中枢神経系ガン、頭頸部ガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、肺ガン、リンパ腫、骨髄腫、肉腫、乳がん、ならびに前立腺ガンからなる群から選択されるガンを有する方法を提供する。例えば、ＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンは、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体またはＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の１以上の成分の発現の減少および／または機能の喪失を特徴とする。
例えば、対象は、髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍、および非定型奇形腫／ラブドイド腫瘍からなる群から選択されるガンを有する。
例えば、１以上の成分は、ＳＮＦ５、ＡＴＲＸ、およびＡＲＩＤ１Ａからなる群から選択される。
例えば、機能の喪失は、点突然変異、欠失、および／または挿入に起因する機能喪失突然変異によって引き起こされる。
例えば、対象はＳＮＦ５が欠失している。
例えば、対象は、配列番号５のアミノ酸位置６８８で野生型残基リジン（Ｋ）のアスパラギン（Ｎ）との置換（Ｋ６８８Ｎ）、および配列番号５のアミノ酸位置３６６で野生型残基メチオニン（Ｍ）のイソロイシン（Ｉ）との置換（Ｍ３６６Ｉ）からなる群から選択されるＡＴＲＸの突然変異を有する。
例えば、対象は、配列番号１１のアミノ酸位置８８４で野生型残基システイン（Ｃ）のナンセンス突然変異（Ｃ８８４＊）、アミノ酸位置９６６で野生型残基グルタミン酸（Ｅ）のリジン（Ｋ）での置換（Ｅ９６６Ｋ）、配列番号１１のアミノ酸位置１４１１で野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１４１１＊）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２０の野生型残基フェニルアラニン（Ｆ）でのフレームシフト突然変異（Ｆ１７２０ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８４７の野生型残基グリシン（Ｇ）の後のフレームシフト突然変異（Ｇ１８４７ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８７４の野生型残基システイン（Ｃ）でのフレームシフト突然変異（Ｃ１８７４ｆｓ）、アミノ酸位置１９５７の野生型残基アスパラギン酸（Ｄ）のグルタミン酸（Ｅ）での置換（Ｄ１９５７Ｅ）、配列番号１１のアミノ酸位置１４３０の野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１４３０＊）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２１の野生型残基アルギニン（Ｒ）でのフレームシフト突然変異（Ｒ１７２１ｆｓ）、アミノ酸位置１２５５の野生型残基グリシン（Ｇ）のグルタミン酸（Ｅ）での置換（Ｇ１２５５Ｅ）、配列番号１１のアミノ酸位置２８４の野生型残基グリシン（Ｇ）でのフレームシフト突然変異（Ｇ２８４ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２２の野生型残基アルギニン（Ｒ）でのナンセンス突然変異（Ｒ１７２２＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２７４の野生型残基メチオニン（Ｍ）でのフレームシフト突然変異（Ｍ２７４ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８４７の野生型残基グリシン（Ｇ）でのフレームシフト突然変異（Ｇ１８４７ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置５５９の野生型残基Ｐでのフレームシフト突然変異（Ｐ５５９ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１２７６の野生型残基アルギニン（Ｒ）でのナンセンス突然変異（Ｒ１２７６＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２１７６の野生型残基グルタミン（Ｑ）でのフレームシフト突然変異（Ｑ２１７６ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置２０３の野生型残基ヒスチジン（Ｈ）でのフレームシフト突然変異（Ｈ２０３ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置５９１の野生型残基アラニン（Ａ）でのフレームシフト突然変異（Ａ５９１ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１３２２の野生型残基グルタミン（Ｑ）でのナンセンス突然変異（Ｑ１３２２＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２２６４での野生型残基セリン（Ｓ）のナンセンス突然変異（Ｓ２２６４＊）、配列番号１１のアミノ酸位置５８６での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ５８６＊）、配列番号１１のアミノ酸位置５４８での野生型残基グルタミン（Ｑ）でのフレームシフト突然変異（Ｑ５４８ｆｓ）、および配列番号１１のアミノ酸位置７５６の野生型残基アスパラギン（Ｎ）でのフレームシフト突然変異（Ｎ７５６ｆｓ）からなる群から選択されるＡＲＩＤ１Ａの突然変異を有する。
本発明はまた、（ａ）対象から得られるサンプルにおいて、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し；（ｂ）ステップａにおける少なくとも１つの遺伝子の減少した発現レベルを有する対象を選択し；そして（ｃ）ステップｂにおいて選択された対象に、有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与し、それによって前記対象におけるガンの症状を治療または軽減することによって、それを必要とする対象におけるＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンを治療するかまたはその症状を軽減する方法も提供する。
本発明は、（ａ）対象から得られたサンプルにおけるヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し；（ｂ）ステップａにおける少なくとも１つの遺伝子の増加した発現レベルを有する対象を選択し；そして（ｃ）ステップｂにおいて選択された対象に、有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与し、それによって前記対象におけるガンの症状を治療または軽減することによって、それを必要とする対象におけるＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンを治療するかまたはその症状を軽減する方法をさらに提供する。
例えば、ガンは髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍または非定型奇形腫ラブドイド腫瘍であり得る。
例えば、神経分化遺伝子はＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、またはＰＴＰＲＫである。
例えば、細胞周期阻害遺伝子はＣＤＫＮ１ＡまたはＣＤＫＮ２Ａである。
例えば、腫瘍抑制遺伝子はＢＩＮ１である。
例えば、ヘッジホッグ経路遺伝子はＧＬＩ１またはＰＴＣＨ１である。
例えば、ｍｙｃ経路遺伝子はＭＹＣである。
例えば、ヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子はＥＺＨ２である。
本発明はまた、細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることによって神経分化、細胞周期阻害または腫瘍抑制を誘発する方法も提供する。ＥＺＨ２阻害剤は、ＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２ＡおよびＢＩＮ１からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現を増加させるために充分な量であってよい。
本発明はまた、細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることによってヘッジホッグシグナル伝達を阻害する方法も提供する。ＥＺＨ２阻害剤は、ＧＬＩ１および／またはＰＴＣＨ１の発現を減少させるために充分な量であり得る。
本発明はまた、細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることによって遺伝子発現を誘発する方法も提供する。ＥＺＨ２阻害剤は、神経分化、細胞周期阻害および／または腫瘍抑制を誘発するために充分な量であり得る。例えば、遺伝子は、ＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２ＡまたはＢＩＮ１であり得る。
本発明はまた、細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることによって遺伝子発現を阻害する方法も提供する。ＥＺＨ２阻害剤はヘッジホッグシグナル伝達を阻害するために充分な量である。例えば、遺伝子はＧＬＩ１またはＰＴＣＨ１であり得る。
例えば、細胞は、ＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、ＡＴＲＸ、および／またはＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分の機能喪失を有し得る。
例えば、機能喪失はＳＮＦ５の欠失に起因する。
例えば、細胞はガン細胞である。ガンは髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍または非定型奇形腫ラブドイド腫瘍であり得る。
例えば、ＥＺＨ２阻害剤は次式：


を有する化合物Ａ、その立体異性体、またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
例えば、ＥＺＨ２阻害剤は次式：


を有する化合物Ｂ、その立体異性体、またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
例えば、ＥＺＨ２阻害剤は次式：


を有する化合物Ｃ、その立体異性体、またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
例えば、ＥＺＨ２阻害剤は次式：


を有する化合物Ｄ、その立体異性体、またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
例えば、ＥＺＨ２阻害剤は次式：


を有する化合物Ｅ、その立体異性体、またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
別段の定めがない限り、本明細書中で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者によって通常理解されるのと同じ意味を有する。明細書中で、単数形は、文脈上そうでないとする明確な指示がない限り．複数形も包含する。本明細書中で記載するものと類似または等しい方法および材料を本発明の実施または試験で使用できるが、好適な方法および材料を後述する。本明細書中で引用される全ての刊行物、特許出願、特許および他の参考文献は、参照により組み込まれる。本明細書中で引用される参考文献は、請求される発明の先行技術であると認められるものではない。矛盾する場合、定義を含む本明細書が優先する。加えて、材料、方法および実施例は単に例示的であり、限定を意図するものではない。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から明らかになるであろう。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
対象におけるＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンの症状を治療または軽減するための方法であって、それを必要とする対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与することを含み、前記対象が、脳および中枢神経系ガン、頭頸部ガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、肺ガン、リンパ腫、骨髄腫、肉腫、乳がん、ならびに前立腺ガンからなる群から選択されるガンにかかっている、方法。
（項目２）
前記ＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンが、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体または前記ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の１以上の成分の減少した発現または機能喪失によって特徴づけられる、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記対象が、髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍および非定型奇形腫／ラブドイド腫瘍からなる群から選択されるガンにかかっている、項目１に記載の方法。
（項目４）
１以上の成分が、ＳＮＦ５、ＡＴＲＸおよびＡＲＩＤ１Ａからなる群から選択される、項目２に記載の方法。
（項目５）
機能喪失が、点突然変異、欠失および／または挿入に起因する機能喪失突然変異によって引き起こされる、項目２に記載の方法。
（項目６）
前記対象がＳＮＦ５の欠失を有する、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記対象が、配列番号５のアミノ酸位置６８８での野生型残基リジン（Ｋ）のアスパラギン（Ｎ）での置換（Ｋ６８８Ｎ）、および配列番号５のアミノ酸位置３６６での野生型残基メチオニン（Ｍ）のイソロイシン（Ｉ）での置換（Ｍ３６６Ｉ）からなる群から選択されるＡＴＲＸの突然変異を有する、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記対象が、配列番号１１のアミノ酸位置８８４での野生型残基システイン（Ｃ）のナンセンス突然変異（Ｃ８８４＊）、アミノ酸位置９６６での野生型残基グルタミン酸（Ｅ）のリジン（Ｋ）の置換（Ｅ９６６Ｋ）、配列番号１１のアミノ酸位置１４１１での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１４１１＊）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２０での野生型残基フェニルアラニン（Ｆ）のフレームシフト突然変異（Ｆ１７２０ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８４７での野生型残基グリシン（Ｇ）後のフレームシフト突然変異（Ｇ１８４７ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８７４での野生型残基システイン（Ｃ）でのフレームシフト突然変異（Ｃ１８７４ｆｓ）、アミノ酸位置１９５７での野生型残基アスパラギン酸（Ｄ）のグルタミン酸（Ｅ）の置換（Ｄ１９５７Ｅ）、配列番号１１のアミノ酸位置１４３０での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１４３０＊）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２１での野生型残基アルギニン（Ｒ）のフレームシフト突然変異（Ｒ１７２１ｆｓ）、アミノ酸位置１２５５での野生型残基グリシン（Ｇ）のグルタミン酸（Ｅ）の置換（Ｇ１２５５Ｅ）、配列番号１１のアミノ酸位置２８４での野生型残基グリシン（Ｇ）のフレームシフト突然変異（Ｇ２８４ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２２での野生型残基アルギニン（Ｒ）のナンセンス突然変異（Ｒ１７２２＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２７４での野生型残基メチオニン（Ｍ）でのフレームシフト突然変異（Ｍ２７４ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８４７での野生型残基グリシン（Ｇ）でのフレームシフト突然変異（Ｇ１８４７ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置５５９での野生型残基Ｐでのフレームシフト突然変異（Ｐ５５９ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１２７６での野生型残基アルギニン（Ｒ）のナンセンス突然変異（Ｒ１２７６＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２１７６での野生型残基グルタミン（Ｑ）でのフレームシフト突然変異（Ｑ２１７６ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置２０３での野生型残基ヒスチジン（Ｈ）でのフレームシフト突然変異（Ｈ２０３ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置５９１での野生型残基アラニン（Ａ）でのフレームシフト突然変異（Ａ５９１ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１３２２での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１３２２＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２２６４での野生型残基セリン（Ｓ）のナンセンス突然変異（Ｓ２２６４＊）、配列番号１１のアミノ酸位置５８６での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ５８６＊）、配列番号１１のアミノ酸位置５４８での野生型残基グルタミン（Ｑ）でのフレームシフト突然変異（Ｑ５４８ｆｓ）、および配列番号１１のアミノ酸位置７５６での野生型残基アスパラギン（Ｎ）でのフレームシフト突然変異（Ｎ７５６ｆｓ）からなる群から選択されるＡＲＩＤ１Ａの突然変異を有する、項目１に記載の方法。
（項目９）
それを必要とする対象においてＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンの症状を治療または軽減する方法であって：
ａ．前記対象から得られるサンプルにおいて、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し；
ｂ．ステップａにおける少なくとも１つの遺伝子の減少した発現レベルを有する対象を選択し；および
ｃ．ステップｂにおいて選択された前記対象に、有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与し、それによって前記対象におけるガンの症状を治療または軽減することを含む、方法。
（項目１０）
それを必要とする対象におけるＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンの症状を治療または軽減する方法であって：
ａ．前記対象から得られたサンプルにおいて、ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し、
ｂ．ステップａにおける少なくとも１つの遺伝子の増加した発現レベルを有する対象を選択し；および
ｃ．ステップｂにおいて選択された前記対象に、有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与し、それによって、前記対象におけるガンの症状を治療または軽減する
ことを含む、方法。
（項目１１）
前記ガンが、髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍、および非定型奇形腫ラブドイド腫瘍からなる群から選択される、項目９に記載の方法。
（項目１２）
前記ガンが、髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍、および非定型奇形腫ラブドイド腫瘍からなる群から選択される、項目１０に記載の方法。
（項目１３）
前記神経分化遺伝子がＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、またはＰＴＰＲＫである、項目９に記載の方法。
（項目１４）
前記細胞周期阻害遺伝子がＣＤＫＮ１ＡまたはＣＤＫＮ２Ａである、項目９に記載の方法。
（項目１５）
前記腫瘍抑制遺伝子がＢＩＮ１である、項目９に記載の方法。
（項目１６）
前記ヘッジホッグ経路遺伝子がＧＬＩ１またはＰＴＣＨ１である、項目１０に記載の方法。
（項目１７）
前記ｍｙｃ経路遺伝子がＭＹＣである、項目１０に記載の方法。
（項目１８）
前記ヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子がＥＺＨ２である、項目１０に記載の方法。
（項目１９）
細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることを含む、神経分化、細胞周期阻害または腫瘍抑制を誘発する方法。
（項目２０）
前記ＥＺＨ２阻害剤が、ＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、およびＢＩＮ１からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現を増加させるために充分な量である、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることを含む、ヘッジホッグシグナル伝達を阻害する方法。
（項目２２）
前記ＥＺＨ２阻害剤が、ＧＬＩ１および／またはＰＴＣＨ１の発現を減少させるために充分な量である、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることを含む、遺伝子発現を誘発する方法。
（項目２４）
前記ＥＺＨ２阻害剤が、神経分化、細胞周期阻害および／または腫瘍抑制を誘発するために充分な量である、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記遺伝子が、ＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、およびＢＩＮ１からなる群から選択される、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
細胞をＥＺＨ２阻害剤と接触させることを含む、遺伝子発現を阻害する方法。
（項目２７）
前記ＥＺＨ２阻害剤が、ヘッジホッグシグナル伝達を阻害するために充分な量である、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記遺伝子がＧＬＩ１またはＰＴＣＨ１である、項目２６に記載の方法。
（項目２９）
前記細胞が、ＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、ＡＴＲＸ、および／または前記ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分の機能喪失を含む、項目１９〜２８のいずれか１項に記載の方法。
（項目３０）
前記機能喪失がＳＮＦ５の欠失に起因する、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記細胞がガン細胞である、項目１９〜２８のいずれか１項に記載の方法。
（項目３２）
前記ガンが、髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍、および非定型奇形腫ラブドイド腫瘍からなる群から選択される、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記ＥＺＨ２阻害剤が：


またはその薬剤的に許容される塩である、項目１〜３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３４）
前記ＥＺＨ２阻害剤が：




または


またはその薬剤的に許容される塩である、項目１〜３３のいずれか１項に記載の方法。
図１Ａは、野生型（ＲＤおよびＳＪＣＲＨ３０）ならびに突然変異体ＳＮＦ５を有する細胞系の一連のウェスタンブロット分析である。 図１Ｂは、野生型（ＲＤおよびＳＪＣＲＨ３０）ならびに突然変異体ＳＮＦ５を有する細胞系の一連のウェスタンブロット分析である。 図２Ａ〜２Ｅは、ＳＮＦ５突然変異体細胞系Ａ２０４（Ｃ）、Ｇ４０１（Ｄ）およびＧ４０２（Ｅ）が野生型細胞系ＲＤ（Ａ）およびＳＪＣＲＨ３０（Ｂ）と比べてＥＺＨ２化合物（化合物Ｅ）に対して選択的に応答することを証明する一連のグラフである。 図２Ａ〜２Ｅは、ＳＮＦ５突然変異体細胞系Ａ２０４（Ｃ）、Ｇ４０１（Ｄ）およびＧ４０２（Ｅ）が野生型細胞系ＲＤ（Ａ）およびＳＪＣＲＨ３０（Ｂ）と比べてＥＺＨ２化合物（化合物Ｅ）に対して選択的に応答することを証明する一連のグラフである。 図２Ａ〜２Ｅは、ＳＮＦ５突然変異体細胞系Ａ２０４（Ｃ）、Ｇ４０１（Ｄ）およびＧ４０２（Ｅ）が野生型細胞系ＲＤ（Ａ）およびＳＪＣＲＨ３０（Ｂ）と比べてＥＺＨ２化合物（化合物Ｅ）に対して選択的に応答することを証明する一連のグラフである。 図２Ａ〜２Ｅは、ＳＮＦ５突然変異体細胞系Ａ２０４（Ｃ）、Ｇ４０１（Ｄ）およびＧ４０２（Ｅ）が野生型細胞系ＲＤ（Ａ）およびＳＪＣＲＨ３０（Ｂ）と比べてＥＺＨ２化合物（化合物Ｅ）に対して選択的に応答することを証明する一連のグラフである。 図２Ａ〜２Ｅは、ＳＮＦ５突然変異体細胞系Ａ２０４（Ｃ）、Ｇ４０１（Ｄ）およびＧ４０２（Ｅ）が野生型細胞系ＲＤ（Ａ）およびＳＪＣＲＨ３０（Ｂ）と比べてＥＺＨ２化合物（化合物Ｅ）に対して選択的に応答することを証明する一連のグラフである。 図３Ａは、Ｇ４０１ ＳＮＦ突然変異体細胞系が野生型細胞ＲＤと比べて軟寒天中で７日後の化合物Ｅに応答することを示す一連の棒グラフである。Ａは、細胞系ＲＤ（５，０００細胞／ウェル）を示す。 図３Ｂは、Ｇ４０１ ＳＮＦ突然変異体細胞系が野生型細胞ＲＤと比べて軟寒天中で７日後の化合物Ｅに応答することを示す一連の棒グラフである。ＢはＧ４０１細胞（５，０００細胞／ウェル）を示す。 図３Ｃは、Ｇ４０１ ＳＮＦ突然変異体細胞系が野生型細胞ＲＤと比べて軟寒天中で７日後の化合物Ｅに応答することを示す一連の棒グラフである。Ｃは２Ｄ成長におけるＧ４０１を示す。 図３Ｄは、Ｇ４０１ ＳＮＦ突然変異体細胞系が野生型細胞ＲＤと比べて軟寒天中で７日後の化合物Ｅに応答することを示す一連の棒グラフである。ＤはＧ４０１細胞（１０，０００細胞／ウェル）を示す。 図４Ａ〜４Ｄは、Ｇ４０１ＳＮＦ５突然変異体細胞系がインビトロで化合物Ａに対して感受性であることを示す４つのグラフである。野生型細胞系ＳＪＣＲＨ３０（Ａ）およびＲＤ（Ｃ）ならびにＳＮＦ５突然変異体細胞系Ｇ４０１（Ｂ）およびＡ２０４（Ｄ）を表示された濃度の化合物Ａで７日間前処理し、第０日に再播種した。細胞の生存は、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ細胞生存度アッセイによって決定した。 図４Ａ〜４Ｄは、Ｇ４０１ＳＮＦ５突然変異体細胞系がインビトロで化合物Ａに対して感受性であることを示す４つのグラフである。野生型細胞系ＳＪＣＲＨ３０（Ａ）およびＲＤ（Ｃ）ならびにＳＮＦ５突然変異体細胞系Ｇ４０１（Ｂ）およびＡ２０４（Ｄ）を表示された濃度の化合物Ａで７日間前処理し、第０日に再播種した。細胞の生存は、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ細胞生存度アッセイによって決定した。 図４Ａ〜４Ｄは、Ｇ４０１ＳＮＦ５突然変異体細胞系がインビトロで化合物Ａに対して感受性であることを示す４つのグラフである。野生型細胞系ＳＪＣＲＨ３０（Ａ）およびＲＤ（Ｃ）ならびにＳＮＦ５突然変異体細胞系Ｇ４０１（Ｂ）およびＡ２０４（Ｄ）を表示された濃度の化合物Ａで７日間前処理し、第０日に再播種した。細胞の生存は、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ細胞生存度アッセイによって決定した。 図４Ａ〜４Ｄは、Ｇ４０１ＳＮＦ５突然変異体細胞系がインビトロで化合物Ａに対して感受性であることを示す４つのグラフである。野生型細胞系ＳＪＣＲＨ３０（Ａ）およびＲＤ（Ｃ）ならびにＳＮＦ５突然変異体細胞系Ｇ４０１（Ｂ）およびＡ２０４（Ｄ）を表示された濃度の化合物Ａで７日間前処理し、第０日に再播種した。細胞の生存は、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ細胞生存度アッセイによって決定した。 図５Ａ〜５Ｄは、化合物Ａ治療でのＧ４０１異種移植片（悪性ラブドイド腫瘍モデル）における永続的退縮を示す一連のグラフである。（Ａ）表示された用量での化合物Ａによって誘導される腫瘍退縮。 図５Ａ〜５Ｄは、化合物Ａ治療でのＧ４０１異種移植片（悪性ラブドイド腫瘍モデル）における永続的退縮を示す一連のグラフである。（Ｂ）表示された用量で化合物Ａを１日２回投与することによって誘導される腫瘍退縮。データは平均値±ＳＥＭを表す（ｎ＝８）。化合物投与を第２８日に停止させた。 図５Ａ〜５Ｄは、化合物Ａ治療でのＧ４０１異種移植片（悪性ラブドイド腫瘍モデル）における永続的退縮を示す一連のグラフである。（Ｃ）ＥＺＨ２は、第２１日にマウスの並行群から集められたＧ４０１異種移植腫瘍組織における阻害を標的とする。各点は、全Ｈ３に対するＨ３Ｋ２７Ｍｅ３の比を示す。水平線は群の平均値を表す。ＢＬＬＱ＝定量化の下限以下。 図５Ａ〜５Ｄは、化合物Ａ治療でのＧ４０１異種移植片（悪性ラブドイド腫瘍モデル）における永続的退縮を示す一連のグラフである。（Ｄ、Ｅ）ビヒクル処理マウス（Ｄ）および化合物Ａ処理マウス（Ｅ）（１２５ｍｇ／ｋｇ）由来の腫瘍サンプルの腫瘍ヒストンメチル化の免疫組織化学的染色。 図５Ａ〜５Ｄは、化合物Ａ治療でのＧ４０１異種移植片（悪性ラブドイド腫瘍モデル）における永続的退縮を示す一連のグラフである。（Ｄ、Ｅ）ビヒクル処理マウス（Ｄ）および化合物Ａ処理マウス（Ｅ）（１２５ｍｇ／ｋｇ）由来の腫瘍サンプルの腫瘍ヒストンメチル化の免疫組織化学的染色。 図６は、ＳＣＬＣ細胞系で特定されたＡＴＲＸ突然変異の位置を示すグラフである。 図７Ａは、ＬＮＣＡＰ前立腺ガン細胞が、インビトロの化合物Ｅ治療で用量に依存した細胞成長阻害を示すことを示すグラフである。 図７Ｂは、ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２およびＬＮＣＡＰ細胞について第１１日および第１４日での化合物ＥのＩＣ５０値を示すグラフである。 図８Ａ〜８Ｃは、ＡＴＲＸ突然変異体ＳＣＬＣ系ＮＣＩ−Ｈ４４６（Ａ）、ＳＷ１２７１（Ｂ）およびＮＣＩ−Ｈ８４１（Ｃ）が化合物Ｅに反応することを示す３つのグラフである。 図８Ａ〜８Ｃは、ＡＴＲＸ突然変異体ＳＣＬＣ系ＮＣＩ−Ｈ４４６（Ａ）、ＳＷ１２７１（Ｂ）およびＮＣＩ−Ｈ８４１（Ｃ）が化合物Ｅに反応することを示す３つのグラフである。 図８Ａ〜８Ｃは、ＡＴＲＸ突然変異体ＳＣＬＣ系ＮＣＩ−Ｈ４４６（Ａ）、ＳＷ１２７１（Ｂ）およびＮＣＩ−Ｈ８４１（Ｃ）が化合物Ｅに反応することを示す３つのグラフである。 図９Ａ〜９Ｃは、ＳＣＬＣ系ＮＣＩ−Ｈ８４１がビヒクル（Ａ）または４．１Ｅ−０２ｕＭ（Ｂ）もしくは３．３ｕＭ（Ｃ）の濃度の化合物Ｅで処置後に形態を変化させることを示す顕微鏡画像である。 図９Ａ〜９Ｃは、ＳＣＬＣ系ＮＣＩ−Ｈ８４１がビヒクル（Ａ）または４．１Ｅ−０２ｕＭ（Ｂ）もしくは３．３ｕＭ（Ｃ）の濃度の化合物Ｅで処置後に形態を変化させることを示す顕微鏡画像である。 図９Ａ〜９Ｃは、ＳＣＬＣ系ＮＣＩ−Ｈ８４１がビヒクル（Ａ）または４．１Ｅ−０２ｕＭ（Ｂ）もしくは３．３ｕＭ（Ｃ）の濃度の化合物Ｅで処置後に形態を変化させることを示す顕微鏡画像である。 図１０Ａ〜１０Ｃは、細胞の全体的ヒストンメチル化および細胞の生存に対する化合物Ａの効果を示す一連のグラフである。（Ａ）化合物Ａの化学構造。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞における細胞Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルの濃度依存性阻害。（Ｃ）インビトロでの化合物ＡによるＳＭＡＲＣＢ１欠失Ｇ４０１細胞の増殖の選択的阻害（ＡＴＰ含有量によって測定）。Ｇ４０１（パネルａおよびｂ）ならびにＲＤ細胞（パネルｃおよびｄ）を第７日にもとの播種密度で再度蒔いた。各点は、各濃度についての平均を表す（ｎ＝３）。 図１０Ａ〜１０Ｃは、細胞の全体的ヒストンメチル化および細胞の生存に対する化合物Ａの効果を示す一連のグラフである。（Ａ）化合物Ａの化学構造。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞における細胞Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルの濃度依存性阻害。（Ｃ）インビトロでの化合物ＡによるＳＭＡＲＣＢ１欠失Ｇ４０１細胞の増殖の選択的阻害（ＡＴＰ含有量によって測定）。Ｇ４０１（パネルａおよびｂ）ならびにＲＤ細胞（パネルｃおよびｄ）を第７日にもとの播種密度で再度蒔いた。各点は、各濃度についての平均を表す（ｎ＝３）。 図１０Ａ〜１０Ｃは、細胞の全体的ヒストンメチル化および細胞の生存に対する化合物Ａの効果を示す一連のグラフである。（Ａ）化合物Ａの化学構造。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞における細胞Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルの濃度依存性阻害。（Ｃ）インビトロでの化合物ＡによるＳＭＡＲＣＢ１欠失Ｇ４０１細胞の増殖の選択的阻害（ＡＴＰ含有量によって測定）。Ｇ４０１（パネルａおよびｂ）ならびにＲＤ細胞（パネルｃおよびｄ）を第７日にもとの播種密度で再度蒔いた。各点は、各濃度についての平均を表す（ｎ＝３）。 図１１Ａは、生化学的作用機序研究を示す一連のグラフである。化合物ＡのＩＣ５０値は、ＳＡＭ濃度（Ａ）の増加とともに増加し、オリゴヌクレオソーム濃度（Ｂ）の増加によってごくわずかしか影響を受けず、このことは、ＳＡＭ競合的およびヌクレオソーム−非競合的作用機序を示す。 図１１Ｂは、生化学的作用機序研究を示す一連のグラフである。化合物ＡのＩＣ５０値は、ＳＡＭ濃度（Ａ）の増加とともに増加し、オリゴヌクレオソーム濃度（Ｂ）の増加によってごくわずかしか影響を受けず、このことは、ＳＡＭ競合的およびヌクレオソーム−非競合的作用機序を示す。 図１２Ａは、細胞系におけるＳＭＡＲＣＢ１およびＥＺＨ２発現の検証ならびに細胞ヒストンメチル化の阻害に対する化合物Ａの特異性を示す一連のパネルである。（Ａ）細胞溶解物をＳＭＡＲＣＢ１、ＥＺＨ２およびアクチン（ローディング対照）に対して特異的な抗体でのイムノブロットによって分析した。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞における細胞Ｈ３Ｋ２７メチル化の選択的阻害。細胞を化合物Ａとともに４日間インキュベートし、そして酸抽出されたヒストンをイムノブロットによって分析した。 図１２Ｂは、細胞系におけるＳＭＡＲＣＢ１およびＥＺＨ２発現の検証ならびに細胞ヒストンメチル化の阻害に対する化合物Ａの特異性を示す一連のパネルである。（Ａ）細胞溶解物をＳＭＡＲＣＢ１、ＥＺＨ２およびアクチン（ローディング対照）に対して特異的な抗体でのイムノブロットによって分析した。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞における細胞Ｈ３Ｋ２７メチル化の選択的阻害。細胞を化合物Ａとともに４日間インキュベートし、そして酸抽出されたヒストンをイムノブロットによって分析した。 図１３Ａは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１−欠失ＭＲＴ細胞においてＧ１期停止およびアポトーシスを誘導することを示す一連の棒グラフである。ビヒクルまたは１μＭの化合物Ａのいずれかとともに最高１４日間インキュベーションする間のＲＤ（パネルＡ）またはＧ４０１細胞（パネルＢ）における細胞周期分析（フローサイトメトリーによる）およびアポトーシスの測定（ＴＵＮＥＬアッセイによる）。Ｇ１期停止は第７日現在で観察され、アポトーシスは第１１日現在で観察された。データは平均値±ＳＥＭ（ｎ＝２）として表される。示されるＤＭＳＯ対照値は各時点からの平均±ＳＥＭである。細胞を、第４日、第７日および第１１日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１３Ｂは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１−欠失ＭＲＴ細胞においてＧ１期停止およびアポトーシスを誘導することを示す一連の棒グラフである。ビヒクルまたは１μＭの化合物Ａのいずれかとともに最高１４日間インキュベーションする間のＲＤ（パネルＡ）またはＧ４０１細胞（パネルＢ）における細胞周期分析（フローサイトメトリーによる）およびアポトーシスの測定（ＴＵＮＥＬアッセイによる）。Ｇ１期停止は第７日現在で観察され、アポトーシスは第１１日現在で観察された。データは平均値±ＳＥＭ（ｎ＝２）として表される。示されるＤＭＳＯ対照値は各時点からの平均±ＳＥＭである。細胞を、第４日、第７日および第１１日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１４Ａ〜１４Ｂは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の発現および細胞形態における変化を誘導することを示す一連のグラフである。（ａ）ＲＤ対照細胞に対する、Ｇ４０１ ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞におけるＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の基本的発現（ｑＰＣＲにより測定、ｎ＝２）。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞をＤＭＳＯまたは１μＭ化合物Ａのいずれかとともに２、４および７日間インキュベートした。遺伝子発現をｑＰＣＲ（ｎ＝２）によって測定し、各時点でのＤＭＳＯ対照に対して表す。パネルａ〜ｊは、それぞれ遺伝子ＧＬＩ１、ＰＴＣｈ１、ＤＯＣＫ４、ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＢＩＮ１、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＥＺＨ２、およびＭＹＣに対応する。（Ｃ）Ｇ４０２細胞をＤＭＳＯ（左パネル）または１μＭ化合物Ａ（右パネル）のいずれかとともに１４日間インキュベートした。細胞を、第７日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１４Ａ〜１４Ｂは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の発現および細胞形態における変化を誘導することを示す一連のグラフである。（ａ）ＲＤ対照細胞に対する、Ｇ４０１ ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞におけるＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の基本的発現（ｑＰＣＲにより測定、ｎ＝２）。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞をＤＭＳＯまたは１μＭ化合物Ａのいずれかとともに２、４および７日間インキュベートした。遺伝子発現をｑＰＣＲ（ｎ＝２）によって測定し、各時点でのＤＭＳＯ対照に対して表す。パネルａ〜ｊは、それぞれ遺伝子ＧＬＩ１、ＰＴＣｈ１、ＤＯＣＫ４、ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＢＩＮ１、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＥＺＨ２、およびＭＹＣに対応する。（Ｃ）Ｇ４０２細胞をＤＭＳＯ（左パネル）または１μＭ化合物Ａ（右パネル）のいずれかとともに１４日間インキュベートした。細胞を、第７日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１４Ａ〜１４Ｂは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の発現および細胞形態における変化を誘導することを示す一連のグラフである。（ａ）ＲＤ対照細胞に対する、Ｇ４０１ ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞におけるＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の基本的発現（ｑＰＣＲにより測定、ｎ＝２）。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞をＤＭＳＯまたは１μＭ化合物Ａのいずれかとともに２、４および７日間インキュベートした。遺伝子発現をｑＰＣＲ（ｎ＝２）によって測定し、各時点でのＤＭＳＯ対照に対して表す。パネルａ〜ｊは、それぞれ遺伝子ＧＬＩ１、ＰＴＣｈ１、ＤＯＣＫ４、ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＢＩＮ１、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＥＺＨ２、およびＭＹＣに対応する。（Ｃ）Ｇ４０２細胞をＤＭＳＯ（左パネル）または１μＭ化合物Ａ（右パネル）のいずれかとともに１４日間インキュベートした。細胞を、第７日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１４Ａ〜１４Ｂは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の発現および細胞形態における変化を誘導することを示す一連のグラフである。（ａ）ＲＤ対照細胞に対する、Ｇ４０１ ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞におけるＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の基本的発現（ｑＰＣＲにより測定、ｎ＝２）。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞をＤＭＳＯまたは１μＭ化合物Ａのいずれかとともに２、４および７日間インキュベートした。遺伝子発現をｑＰＣＲ（ｎ＝２）によって測定し、各時点でのＤＭＳＯ対照に対して表す。パネルａ〜ｊは、それぞれ遺伝子ＧＬＩ１、ＰＴＣｈ１、ＤＯＣＫ４、ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＢＩＮ１、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＥＺＨ２、およびＭＹＣに対応する。（Ｃ）Ｇ４０２細胞をＤＭＳＯ（左パネル）または１μＭ化合物Ａ（右パネル）のいずれかとともに１４日間インキュベートした。細胞を、第７日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１４Ａ〜１４Ｂは、化合物ＡがＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の発現および細胞形態における変化を誘導することを示す一連のグラフである。（ａ）ＲＤ対照細胞に対する、Ｇ４０１ ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞におけるＳＭＡＲＣＢ１調節遺伝子の基本的発現（ｑＰＣＲにより測定、ｎ＝２）。（Ｂ）Ｇ４０１およびＲＤ細胞をＤＭＳＯまたは１μＭ化合物Ａのいずれかとともに２、４および７日間インキュベートした。遺伝子発現をｑＰＣＲ（ｎ＝２）によって測定し、各時点でのＤＭＳＯ対照に対して表す。パネルａ〜ｊは、それぞれ遺伝子ＧＬＩ１、ＰＴＣｈ１、ＤＯＣＫ４、ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＢＩＮ１、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＥＺＨ２、およびＭＹＣに対応する。（Ｃ）Ｇ４０２細胞をＤＭＳＯ（左パネル）または１μＭ化合物Ａ（右パネル）のいずれかとともに１４日間インキュベートした。細胞を、第７日に分割し、もとの播種密度で再播種した。 図１５Ａは、化合物Ａで治療された、Ｇ４０１異種移植片を有するマウスにおける体重、腫瘍退縮および血漿レベルを示す一連のグラフである。（Ａ）２８日間ＢＩＤスケジュールにて化合物Ａで治療された動物について、体重を１週間に２回測定した。データを平均値±ＳＥＭとして提示する（第２１日までｎ＝１６、第２２日から６０日までｎ＝８）。 図１５Ｂは、化合物Ａで治療された、Ｇ４０１異種移植片を有するマウスにおける体重、腫瘍退縮および血漿レベルを示す一連のグラフである。（Ｂ）表示された用量で２１日間化合物Ａの１日２回（ＢＩＤ）投与によって誘導された腫瘍退縮（平均値±ＳＥＭ、ｎ＝１６）。＊ｐ＜０．０５、＊＊ｐ＜０．０１、反復測定ＡＮＯＶＡ、Ｄｕｎｎｅｔｔ試験後対ビヒクル。 図１５Ｃは、化合物Ａで治療された、Ｇ４０１異種移植片を有するマウスにおける体重、腫瘍退縮および血漿レベルを示す一連のグラフである。（Ｃ）第２１日に安楽死させた８匹のマウスの腫瘍重量。＊＊＊＊ｐ＜０．０００１、フィッシャーの正確確率検定。 図１５Ｄは、化合物Ａで治療された、Ｇ４０１異種移植片を有するマウスにおける体重、腫瘍退縮および血漿レベルを示す一連のグラフである。（Ｄ）血漿を第２１日の化合物Ａ投薬の５分前および３時間後に集め、そして化合物レベルをＬＣ−ＭＳ／ＭＳによって測定した。動物を安楽死させ、そして腫瘍を第２１日の投薬の３時間後に集めた。腫瘍ホモジネートを生成させ、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析に供して、化合物Ａ濃度を測定した。異種移植片は第２１日では小さすぎるので、特に高用量群では、腫瘍化合物レベルをすべての動物から測定できるわけではなかったことに注意する。ドットは個々の動物についての値を表し、水平線は群の平均値を表す。 図１６Ａは、化合物Ａが、ＳＣＩＤマウスにおけるＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ異種移植片を除去することを示す一連のグラフである。（ａ）表示された用量で２８日間化合物Ａの１日２回（ＢＩＤ）投与によって誘導される腫瘍退縮。化合物投与を第２８日に停止させ、腫瘍を２０００ｍｍ３に達するまで再成長させた（データを平均値±ＳＥＭとして示す、ｎ＝８）。 図１６Ｂは、化合物Ａが、ＳＣＩＤマウスにおけるＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ異種移植片を除去することを示す一連のグラフである。（Ｂ）第２１日に安楽死させたマウスから集めたＧ４０１異種移植腫瘍組織におけるＥＺＨ２標的阻害。各点はＥＬＩＳＡによって測定された、Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３対全Ｈ３の比を示す。水平線は群の平均値を表す；灰色の記号はＥＬＩＳＡ標準曲線からはずれた値である。 図１６Ｃは、化合物Ａが、ＳＣＩＤマウスにおけるＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ異種移植片を除去することを示す一連のグラフである。（Ｃ）化合物Ａで２１日間治療されたマウスから集めたＧ４０１異種移植腫瘍組織における遺伝子発現の変化。パネルａ〜ｄはそれぞれ遺伝子ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＤＯＣＫ４、およびＧＬＩ１に相当する。データをビヒクルと比較した変化（倍）±ＳＥＭとして表す（ｎ＝６、５００ｍｇ／ｋｇ群についてｎ＝４）。＊ｐ＜０．０５、＊＊ｐ＜０．０１、＊＊＊＊ｐ＜０．０００１、対ビヒクル、フィッシャーの正確確率検定。
発明の詳細な説明
本発明は、一つには、ＥＺＨ２阻害剤があるバイオマーカーまたは遺伝子の変更された発現および／または機能喪失によって特徴づけられるＳＷＩ／ＳＮＦ関連ガンを効果的に治療できるという発見に基づく。特に、選択されたバイオマーカーまたは遺伝子の変更された発現および／または機能喪失を有する腫瘍または腫瘍細胞は、本発明のＥＺＨ２阻害剤に対して感受性である。したがって、本発明は、治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を対象に投与することによって、特にあるバイオマーカーまたは遺伝子の変更された発現および／または機能喪失に関連するガンを治療することによって、対象におけるガンの症状を治療または軽減する方法を提供する。例えば、バイオマーカーは、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の１つの成分である。例えば、遺伝子は、神経分化遺伝子、細胞周期遺伝子、阻害遺伝子、腫瘍抑制遺伝子、ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される。
ヒトにおけるＳＷＩ／ＳＮＦ複合体は、少なくとも進化的に保存されたコアサブユニットおよび可変サブユニットを含む。進化的に保存されたコアサブユニットは、ＳＮＦ５（ＳＭＡＲＣＢ１、ＩＮＩ１またはＢＡＦ４７とも呼ばれる）、ＳＭＡＲＣＡ４（ＢＲＭ／ＳＷＩ２関連遺伝子１、ＢＲＧ１とも呼ばれる）、ＢＡＦ１５５、およびＢＡＦ１７０を含む。可変サブユニットは、ＢＡＦ５３（ＡまたはＢ）、ＢＡＦ６０（Ａ、ＢまたはＣ）、ＢＡＦ５７、ＢＡＦ４５（Ａ、Ｂ、Ｃ、またはＤ）を含む。他のサブユニットは、ＡＲＩＤＩ１Ａ（ＳＭＡＲＣＦ１とも呼ばれる）、ＡＲＩＤ１Ｂ、ＳＭＡＲＣＡ２（ブラーマホモログ、ＢＲＭとも呼ばれる）、ＡＴＲＸ、ＢＡＦ２００、ＢＡＦ１８０（ＰＢＲＭ１とも呼ばれる）、およびブロモドメイン含有７（ＢＲＤ７）である。ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分は、複合体の任意の成分、例えば、本明細書中に記載されているかまたは当該技術分野で公知の成分／サブユニットであり得る。
本明細書中で提示される任意の方法において、神経分化遺伝子は、ＣＤ１３３（ＰＲＯＭ１とも呼ばれる）、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＰＲＯＭ２、ＬＨＸ１、ＬＨＸ６、ＬＨＸ９、ＰＡＸ６、ＰＡＸ７、ＶＥＦＧＡ、ＦＺＤ３Ｂ、ＦＹＮ、ＨＩＦ１Ａ、ＨＴＲＡ２、ＥＶＸ１、ＣＣＤＣ６４、またはＧＦＡＰであってよいが、これらに限定されるものではない。
本明細書中で提示される任意の方法において、細胞周期阻害遺伝子は、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＭＥＮ１、ＣＨＥＫ１、ＩＲＦ６、ＡＬＯＸ１５Ｂ、ＣＹＰ２７Ｂ１、ＤＢＣ１、ＮＭＥ６、ＧＭＮＮ、ＨＥＸＩＭ１、ＬＡＴＳ１、ＭＹＣ、ＨＲＡＳ、ＴＧＦＢ１、ＩＦＮＧ、ＷＮＴ１、ＴＰ５３、ＴＨＢＳ１、ＩＮＨＢＡ、ＩＬ８、ＩＲＦ１、ＴＰＲ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＥＴＳ１、ＨＰＧＤ、ＢＭＰ７、ＧＡＴＡ３、ＮＲ２Ｆ２、ＡＰＣ、ＰＴＰＮ３、ＣＡＬＲ、ＩＬ１２Ａ、ＩＬ１２Ｂ、ＰＭＬ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＳＯＸ２、ＴＡＦ６、ＤＮＡ２、ＰＬＫ１、ＴＥＲＦ１、ＧＡＳ１、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＭＬＦ１、ＰＴＥＮ、ＴＧＦＢ２、ＳＭＡＤ３、ＦＯＸＯ４、ＣＤＫ６、ＴＦＡＰ４、ＭＡＰ２Ｋ１、ＮＯＴＣＨ２、ＦＯＸＣ１、ＤＬＧ１、ＭＡＤ２Ｌ１、ＡＴＭ、ＮＡＥ１、ＤＧＫＺ、ＦＨＬ１、ＳＣＲＩＢ、ＢＴＧ３、ＰＴＰＲＫ、ＲＰＳ６ＫＡ２、ＳＴＫ１１、ＣＤＫＮ３、ＴＢＲＧ１、ＣＤＣ７３、ＴＨＡＰ５、ＣＲＬＦ３、ＤＣＵＮ１Ｄ３、ＭＹＯＣＤ、ＰＡＦ１、ＬＩＬＲＢ１、ＵＨＭＫ１、ＰＮＰＴ１、ＵＳＰ４７、ＨＥＸＩＭ２、ＣＤＫ５ＲＡＰ１、ＮＫＸ３−１、ＴＩＰＩＮ、ＰＣＢＰ４、ＵＳＰ４４、ＲＢＭ３８、ＣＤＴ１、ＲＧＣＣ、ＲＮＦ１６７、ＣＬＳＰＮ、ＣＨＭＰ１Ａ、ＷＤＲ６、ＴＣＦ７Ｌ２、ＬＡＴＳ２、ＲＡＳＳＦ１、ＭＬＴＫ、ＭＡＤ２Ｌ２、ＦＢＸＯ５、ＩＮＧ４、またはＴＲＩＭ３５であってよいが、これらに限定されるものではない。
本明細書中で提示される任意の方法において、腫瘍抑制遺伝子はＢＩＮ１であり得るが、これに限定されるものではない。本明細書中で用いられる場合、「腫瘍抑制遺伝子」という用語は、その当該技術分野で通常理解される意味を有し、すなわち、その発現および正常な機能が、腫瘍表現型を抑制するか、またはアポトーシスを誘導するか、または両方である遺伝子である。いくつかの実施形態では、腫瘍抑制遺伝子は細胞周期阻害遺伝子を包含する。それらの機能に基づく腫瘍抑制因子の例示的カテゴリーとしては、限定されるものではないが以下のものが挙げられる：
（１）細胞周期を阻害する遺伝子；
（２）細胞周期をＤＮＡ損傷につなげる遺伝子。細胞中に損傷されたＤＮＡがある場合、細胞は分裂しないはずである。損傷を修復できる場合、細胞周期は継続し得る。損傷を修復できない場合、細胞はアポトーシス（プログラムされた細胞死）を開始するはずである；
（３）腫瘍細胞が分散するのを防止し、接触阻止の損失をブロックし、そして転移を阻害する遺伝子。これらの遺伝子およびそれらのコード化されたタンパク質は転移抑制因子とも呼ばれる；そして
（４）ＤＮＡ修復タンパク質。これらの遺伝子における突然変異はガンのリスクを増加させる。
本明細書中で提示される任意の方法において、ヘッジホッグシグナル伝達経路遺伝子は、ＧＬＩ１、ＰＴＣＨ１、ＳＵＦＵ、ＫＩＦ７、ＧＬＩ２、ＢＭＰ４、ＭＡＰ３Ｋ１０、ＳＨＨ、ＴＣＴＮ３、ＤＹＲＫ２、ＰＴＣＨＤ１、またはＳＭＯであり得るが、これらに限定されるものではない。
本明細書中で提示される任意の方法において、ｍｙｃ経路遺伝子は、ＭＹＣ ＮＭＩ、ＮＦＹＣ、ＮＦＹＢ、Ｃｙｃｌｉｎ Ｔ１、ＲｕｖＢ様１、ＧＴＦ２Ｉ、ＢＲＣＡ１、Ｔ細胞リンパ腫浸潤および転移誘導タンパク質１、ＡＣＴＬ６Ａ、ＰＣＡＦ、ＭＹＣＢＰ２、ＭＡＰＫ８、Ｂｃｌ−２、転写開始タンパク質ＳＰＴ３ホモログ、ＳＡＰ１３０、ＤＮＭＴ３Ａ、mothers against decapentaplegicホモログ３、ＭＡＸ、mothers against decapentaplegicホモログ２、ＭＹＣＢＰ、ＨＴＡＴＩＰ、ＺＢＴＢ１７、形質転換／転写ドメイン関連タンパク質、ＴＡＤＡ２Ｌ、ＰＦＤＮ５、ＭＡＰＫ１、ＴＦＡＰ２Ａ、Ｐ７３、ＴＡＦ９、ＹＹ１、ＳＭＡＲＣＢ１、ＳＭＡＲＣＡ４、ＭＬＨ１、ＥＰ４００またはｌｅｔ−７であり得るが、これらに限定されるものではない。
本明細書中で提示される任意の方法において、ヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子はＥＺＨ２であり得るが、これに限定されるものではない。
本発明の化合物は、ＥＺＨ２またはその突然変異体のヒストンメチルトランスフェラーゼ活性を阻害し、したがって、本発明の１つの態様において、本明細書中で開示される化合物は、ある状態および疾患を治療または予防するための候補である。本発明は、ガンの症状または前ガン状態を治療、予防または軽減するための方法を提供する。方法は、それを必要とする対象に、治療有効量の本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体、溶媒和物、もしくは立体異性体を投与することを含む。治療することができるガンの例としては、髄芽腫、乏突起神経膠腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）、卵巣漿液性腺がん、膵管腺がん、膵臓内分泌腫瘍、
悪性ラブドイド腫瘍、星状細胞腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、脊索腫、性腺外胚細胞腫瘍、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、類上皮細胞（epitheloid）肉腫、腎髄質がん（renal medullo carcinoma）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫および特定不能（ＮＯＳ）肉腫が挙げられる。あるいは、本発明の化合物によって治療されるガンは非ＮＨＬガンである。
本発明は、ガンもしくは前ガンの治療において、またはそのようなガンもしくは前ガンの治療に有用な薬剤の調製のための、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物の使用をさらに提供する。治療できるガンの例としては、髄芽腫、乏突起神経膠腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）、卵巣漿液性腺がん、膵管腺がん、膵臓内分泌腫瘍、悪性ラブドイド腫瘍、星状細胞腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、脊索腫、性腺外胚細胞腫瘍、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、類上皮細胞（epitheloid）肉腫、腎髄質がん（renal medullo carcinoma）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫および特定不能（ＮＯＳ）肉腫が挙げられる。別法として、本発明の化合物を、非ＮＨＬガンの治療のため、または非ＮＨＬガンの治療に有用な薬剤の調製のために使用できる。
本発明の化合物は、タンパク質（たとえば、ヒストン）メチル化を調節するため、例えば、ヒストンメチルトランスフェラーゼまたはヒストンデメチラーゼ酵素活性を調節するために使用できる。本発明の化合物はタンパク質メチル化を調節するためにインビボまたはインビトロで使用できる。ＥＺＨ２によるメチル化調節が腫瘍特に、選択されたバイオマーカー／遺伝子の変更された発現および／または機能喪失を有する腫瘍の形成に関与するという驚くべき発見に基づいて、本明細書中で記載される化合物はこれらの疾患の治療、すなわちおおよそ、対応する正常細胞におけるそのレベルまでメチル化を減少させるか、またはメチル化を回復するための好適な候補である。
いくつかの実施形態において、本発明の化合物は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体関連腫瘍または腫瘍細胞の増殖を選択的に阻害することができる（図１〜９で示すとおり）。したがって、本発明は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体関連ガンの症状または前ガン状態を、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物によって治療、予防または軽減するための方法を提供する。本発明は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体関連ガンもしくは前ガン状態の治療において、またはそのようなガンもしくは前ガンの治療に有用な薬剤の調製のための本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物の使用をさらに提供する。
ガンを有する対象のＥＺＨ２阻害剤に対する反応性を測定するための方法も本発明で提供される。方法は、対象からサンプル（核酸サンプルまたはタンパク質サンプル）を得るステップ、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出するステップ、この成分の発現および／または機能を検出するステップを含み、そのような減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の存在は、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であることを示す。「サンプル」という語は、対象由来の任意の生物学的サンプルを意味し、細胞、組織サンプル、体液（粘液、血液、血漿、血清、尿、唾液、および精液を含むが、これらに限定されるものではない）、腫瘍細胞、および腫瘍組織を包含するが、これらに限定されるものではない。サンプルは治療または試験を受けている対象によって提供され得る。あるいは、サンプルは当該技術分野における慣例的な実施にしたがって医師によって得られる。
本発明はまた、対象からサンプルを得、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出することにより、ガンまたは前ガン状態に対する対象の素因を測定する方法も提供し、そのような減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の存在は、対象がＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分のそのような機能喪失のない対象と比較して、ガンまたは前ガン状態を発症する素因がある（すなわち高いリスクがある）ことを示す。
「素因がある」という語は、ガンまたは前ガン状態に関連して本明細書中で用いられる場合、対象間のガンまたは前ガン状態を有することについての他のリスク因子（たとえば、化学物質／環境、食物、喫煙歴など）が同じである状況下で、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を有しない別の対象がガンまたは前ガン状態にかかる可能性と比較して、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を有する対象がガンまたは前ガン状態にかかる可能性が増加すること（たとえば、可能性が少なくとも１％、５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１５０％、２００％、またはそれ以上増加）を意味すると理解されるべきである。
本発明に関連して「リスク」は、ある事象が特定の期間にわたって起こる可能性に関し、対象の「絶対」リスクまたは「相対」リスクを意味し得る。絶対リスクは、関連時間コホートの測定後の実際の観察に関連して、または関連期間追跡された統計的に妥当な歴史的コホートから得られた指数値に関連して測定できる。相対リスクは、低リスクコホートの絶対リスクまたは平均集団リスクのいずれかと比較した対象の絶対リスクの比を指し、これは、どのように臨床リスク因子を評価するかによって変わり得る。所与の試験結果について陽性事象と陰性事象の割合であるオッズ比も無変換に対して通常用いられる（オッズは、式ｐ／（１−ｐ）（式中、ｐは事象の起こる確率および（１−ｐ）は事象の起こらない確率である）にしたがう）。
したがって、本発明は、対象におけるＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の遺伝子スクリーニングによって対象のための個人化医療、治療および／またはガン管理を提供する。例えば、本発明は、対象のＥＺＨ２阻害剤に対する反応性を測定し、そして対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性である場合、対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤、またはその薬剤的に許容される塩、溶媒和物、もしくは立体異性体を投与することによって、ガンの症状または前ガン状態を治療、予防または軽減するための方法を提供する。反応性は、対象からサンプルを得、そしてＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分（例えば、ＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１ＡまたはＡＴＲＸ）の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出することによって決定され、そのような機能喪失の存在は、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であることを示す。
他の例では、ガンまたは前ガン状態に対する対象の素因を定期的に測定することによる、対象におけるガン管理の方法を提供する。方法は、対象からサンプルを得るステップ、ならびにＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出するステップを含み、そのような減少した発現、ハプロ不全、および／または機能の喪失の存在は、対象が、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分のそのような減少した発現、ハプロ不全、および／または機能の喪失のない対象と比較して、ガンまたは前ガン状態を発症する素因があることを示す。
単なる例示的な実施形態において、本明細書中で提示される治療方法は、（ａ）対象から得られた生物学的サンプルから核酸サンプルまたはタンパク質サンプルを集め、（ｂ）サンプル中のＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分の発現レベルまたは機能レベルを測定し、（ｃ）対照サンプル中のＳＷＩ／ＳＮＦの成分の発現レベルまたは機能レベルを測定し；（ｄ）試験したサンプル中のステップ（ｂ）で測定された成分の発現レベルまたは機能レベルを、対照サンプル中のステップ（ｃ）で測定された成分の発現レベルまたは機能レベル（または基準値）と比較し；（ｅ）ステップ（ｂ）で測定された成分の発現レベルまたは機能レベルが、ステップ（ｃ）で測定された成分の発現レベルまたは機能レベルと比較すると減少または失われる場合（例えば、ハプロ不全または機能喪失）、治療の候補として対象を特定し；そして（ｆ）ステップ（ｅ）で特定された対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与するか、またはステップ（ｅ）で特定された対象のために治療レジメンを選択するステップを含む。対象サンプル中の成分の発現レベルまたは機能レベルは、対照サンプル中の成分の発現レベルまたは機能レベルと比較すると、例えば、１０％、２５％、５０％または１倍、２倍、５倍もしくはそれ以上減少する。当該技術分野で公知の任意の好適な方法を利用して、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分の発現レベルまたは機能レベルを測定できる。いくつかの実施形態では、対象は悪性ラブドイド腫瘍、髄芽腫または非定型奇形腫ラブドイド腫瘍を有する。いくつかの実施形態では、成分は、ＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１ＡまたはＡＴＲＸである。
例えば、同定された対象を最新の全米総合ガン情報ネットワーク（ＮＣＣＮ）ガイドラインで記載されるような看護治療の基準で治療することができる。
例えば、対照サンプルは、健常な正常対象から得られる。別法として、対照サンプルは、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガンに苦しんでいない、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガンと診断されていない、またはＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガンを発症するリスクがない対象から得られる。
１つの好ましい態様において、本発明は、ＥＺＨ２阻害剤に対する対象の反応性を判定し、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であり、対象が脳およびＣＮＳガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、リンパ腫、骨髄腫、および／または肉腫からなる群から選択されるガンを有する場合、対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与することによって、対象におけるガンを治療またはガンの症状を軽減するための方法を提供する。そのような反応性は、対象からサンプルを得、そしてＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、および／またはＡＴＲＸの減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出することによって判定され、減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の存在は、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であることを示す。
別の好ましい態様において、本発明は、ＥＺＨ２阻害剤に対する対象の反応性を判定し、そして対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性である場合、治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を対象に投与することによって、対象における悪性ラブライド腫瘍の症状を治療または軽減するための方法を提供する。そのような反応性は、対象からサンプルを得、そしてＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、および／またはＡＴＲＸの減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出することによって判定され、減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の存在は、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であることを示す。
別の好ましい態様において、本発明は、ＥＺＨ２阻害剤に対する対象の反応性を判定し、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性である場合、治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を対象に投与することによって対象における髄芽腫の症状を治療または軽減するための方法を提供する。そのような反応性は、対象からサンプルを得、そしてＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、および／またはＡＴＲＸの減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出することによって判定され、減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の存在は、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であることを示す。
別の好ましい態様において、本発明は、ＥＺＨ２阻害剤に対する対象の反応性を判定し、そして対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性である場合、治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を対象に投与することによって、対象における非定型奇形腫ラブドイド腫瘍の症状を治療または軽減するための方法を提供する。そのような反応性は、対象からサンプルを得、そしてＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、および／またはＡＴＲＸの減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を検出することによって判定され、減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失の存在は、対象がＥＺＨ２阻害剤に対して反応性であることを示す。
悪性ラブドイド腫瘍（ＭＲＴ）および非定型奇形腫ラブドイド腫瘍（ＡＴＲＴ）は、非常に悪性であり、局所的に浸潤性であり、頻繁に転移し、そして特に致死的である、脳、腎臓、および軟組織の極度に攻撃的な小児がんである。それらは特徴的には二倍体であり、ゲノム異常はないが、ＳＭＡＲＣＢ１（ＳＮＦ５、ＩＮＩ１またはＢＡＦ４７とも呼ばれる）、ＳＷＩ／ＳＮＦクロマチンリモデリング複合体のコア成分の損失のほぼ完全な浸透率によって特徴づけられる。ＳＭＡＲＣＢ１の両アレル不活性化は本質的にＭＲＴおよびＡＴＲＴにおける唯一の遺伝的事象であり、このことは、この遺伝子異常に関する推進力の役割を示唆する。
いかなる理論によっても拘束されるものではないが、本発明の化合物は細胞のＨ３Ｋ２７メチル化を特異的に阻害し、ＳＭＡＲＣＢ１突然変異体ＭＲＴ細胞の選択的アポトーシス死に至る。例えば、化合物ＡでのＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞系のインビトロ治療は、ｎＭ範囲のＩＣ５０値で強力な抗増殖効果を誘導し；一方、対照（野生型）細胞系はごくわずかしか影響を受けなかった（図１０Ｃおよび表６）。さらに、本発明の化合物は、ヘッジホッグ経路遺伝子、ＭＹＣおよびＥＺＨ２の発現を抑制しつつ、神経分化、細胞周期阻害および腫瘍抑制の遺伝子を誘導する。例えば、最高７日までのＧ４０１ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞の化合物Ａ治療は、ＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４およびＰＴＰＲＫの発現を強力に誘導し、そして細胞周期阻害剤ＣＤＫＮ１ＡおよびＣＤＫＮ２Ａおよび腫瘍抑制因子ＢＩＮ１を上方調節し、すべては時間依存的であった（図１４Ｂ）。同時に、ヘッジホッグ経路遺伝子、ＭＹＣおよびＥＺＨ２の発現は減少した。特に、１４日間化合物Ａに暴露されたＧ４０２ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞はニューロン様形態をとった（図１４Ｃ）。
したがって、本発明は、（ａ）対象から得られるサンプルにおいて、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し；（ｂ）ステップ（ａ）における少なくとも１つの遺伝子の減少した発現レベルを有する対象を選択し；そして（ｃ）ステップ（ｂ）において選択された対象に有効量の本発明の化合物を投与し、かくして対象においてガンの症状を治療または軽減することによって、それを必要とする対象においてガンの症状を治療または軽減する方法をさらに提供する。
本発明はさらに、（ａ）ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを、対象から得られたサンプルにおいて測定し；（ｂ）ステップ（ａ）において少なくとも１つの遺伝子の増加した発現レベルを有する対象を選択し；そして（ｃ）ステップ（ｂ）において選択された対象に有効量の本発明の化合物を投与し、かくして対象におけるガンの症状を治療または軽減することによって、それを必要とする対象においてガンの症状を治療または軽減するための方法も提供する。
（ａ）対象から得られたサンプルにおいて、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子、および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し、そして（ｂ）対象が、ステップ（ａ）において少なくとも１つの遺伝子の減少した発現レベルを有する場合、がん治療を選択することによって、それを必要とする対象についてガン治療を選択する方法も本明細書中で提供され、この場合、がん治療は、有効量の本発明の化合物の対象への投与を含む。
本発明は、（ａ）対象から得られたサンプルにおいて、ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し、そして（ｂ）対象がステップ（ａ）において少なくとも１つの遺伝子の増加した発現レベルを有する場合、がん治療を選択することによって、それを必要とする対象についてガン治療を選択する方法をさらに提供し、この場合、ガン治療は有効量の本発明の化合物を対象に投与することを含む。
単なる例示的な実施形態において、本明細書中で提示される方法は、（ａ）核酸またはタンパク質サンプルを対象から得られた生物学的サンプルから集め、（ｂ）サンプルにおいて、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子、および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定し、（ｃ）対照サンプル中の同じ遺伝子（複数可）の発現レベルを測定し；（ｄ）試験サンプル中のステップ（ｂ）で測定された遺伝子の発現レベルを、対照サンプル中のステップ（ｃ）で測定された遺伝子の発現レベル（または基準値）と比較し；（ｅ）ステップ（ｂ）で測定された成分の発現レベルがステップ（ｃ）で測定された遺伝子の発現レベルと比較して減少している場合に、治療の候補として対象を特定し；そして（ｆ）ステップ（ｅ）において特定された対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与するか、またはステップ（ｅ）において特定された対象の治療レジメンを選択するステップを含み得る。試験対象における遺伝子の発現レベルは、対照サンプル中の遺伝子の発現レベルと比較して、例えば、１０％、２５％、５０％または１倍、２倍、５倍またはそれ以上減少する。
単なる例示的な実施形態において、本明細書中で提示される方法は、（ａ）対象から得られた生物学的サンプルから核酸またはタンパク質サンプルを集め、（ｂ）サンプルにおけるヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現を測定し、（ｃ）対照サンプルにおける同じ遺伝子（複数可）の発現レベルを測定し、（ｄ）試験サンプルにおけるステップ（ｂ）で測定された遺伝子の発現レベルを、対照サンプルにおけるステップ（ｃ）で測定された遺伝子の発現レベル（または基準値）と比較し；（ｅ）ステップ（ｂ）において測定された成分の発現レベルがステップ（ｃ）で測定された遺伝子の発現レベルと比較して増加する場合、治療の候補として対象を特定し；そして（ｆ）ステップ（ｅ）において特定された対象に治療有効量のＥＺＨ２阻害剤を投与するか、またはステップ（ｅ）において特定された対象の治療レジメンを選択するステップを含み得る。試験対象における遺伝子の発現レベルは、対照サンプルにおける遺伝子の発現レベルと比較して、例えば、１０％、２５％、５０％または１倍、２倍、５倍またはそれ以上増加する。
「発現レベル」という語は、関心対象の特定の遺伝子のタンパク質、ＲＮＡ、またはｍＲＮＡレベルを指す。当該技術分野で公知の任意の方法を利用して関心対象の特定の遺伝子の発現レベルを測定することができる。例としては、限定されるものではないが、逆転写および増幅アッセイ（例えば、ＰＣＲ、ライゲーションＲＴ−ＰＣＲもしくは定量的ＲＴ−ＰＣＴ）、ハイブリダイゼーションアッセイ、ノザンブロッティング、ドットブロッティング、インサイチュハイブリダイゼーション、ゲル電気泳動法、キャピラリー電気泳動法、カラムクロマトグラフィー，ウェスタンブロッティング、免疫組織化学、免疫染色、または質量分析が挙げられる。アッセイは、生物学的サンプルまたはサンプルから単離されたタンパク質／核酸に関して直接実施することができる。これらのアッセイを実施するのは関連する分野において慣例的な実施である。例えば、本明細書中で記載される任意の方法における測定ステップは、対象から得られた生物学的サンプル由来の核酸サンプルと、本明細書中で提示される関心対象の遺伝子と特異的にハイブリダイズする１以上のプライマーとを接触させることを含む。別法として、本明細書中で記載される任意の方法の測定ステップは、対象から得られた生物学的サンプル由来のタンパク質サンプルと本明細書中で提示される関心対象のバイオマーカーと結合する１以上の抗体とを接触させることを含む。
特定の遺伝子の減少した発現レベルとは、基準値または同じ対象から得られた異なる（もしくは以前の）サンプルにおいて測定されたこの遺伝子の発現レベルと比較して、その発現レベルの少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上の減少を意味する。
特定の遺伝子の増加した発現レベルは、基準値または同じ対象から得られた異なる（または以前の）サンプルにおいて測定されたこの遺伝子の発現レベルと比較して、その発現レベルの少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上の増加を意味する。
「基準またはベースラインレベル／値」は、本明細書中で用いられる場合、交換可能に使用することができ、類似の年齢範囲、疾患状態（たとえば、病期）、同じかもしくは類似した民族中の対象を含む集団研究から誘導される数値または値に対するもの、あるいはガンの治療を受けている対象の開始サンプルに対するものであることを意味する。そのような基準値は、ガンの数学アルゴリズムおよび計算された指数から得られる集団の統計分析および／またはリスク予測データから誘導できる。基準指数は、統計的および構造的分類のアルゴリズムおよび他の方法を用いて構築し、使用することもできる。
本発明のいくつかの実施形態において、基準またはベースライン値は、１以上の健常対象またはガンと診断されていない対象由来の対照サンプルにおける関心対象の特定の遺伝子の発現レベルである。
本発明のいくつかの実施形態において、基準またはベースライン値は、任意のガン治療前の同じ対象から得られたサンプルにおける関心対象の特定の遺伝子の発現レベルである。本発明の他の実施形態において、基準またはベースライン値は、ガン治療中に同じ対象から得られたサンプルにおける関心対象の特定の遺伝子の発現レベルである。あるいは、基準値またはベースライン値は、同じ対象から、または試験される対象と類似した年齢範囲、疾患状態（たとえば、病期）を有する対象から事前に得られたサンプルにおける関心対象の特定の遺伝子の発現レベルの以前の測定値である。
いくつかの実施形態では、有効量は、治療前の対象で減少している少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを増加させるために充分な量またはガンの１以上の症状を軽減するために充分な量を意味する。例えば、有効量は、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子、および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを、基準値または化合物で治療をしない発現レベルと比較して少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上増加させるために充分な量である。
いくつかの実施形態では、有効量とは、治療前に対象において増加した少なくとも１つの遺伝子の発現を減少させるために充分な量、またはガンの１以上の症状を軽減するために充分な量を意味する。例えば、有効量は、基準値または化合物の治療をしない発現レベルと比較して、ヘッジホッグ経路遺伝子、ＭＹＣおよびＥＺＨ２からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上減少させるために充分な量である。
対象についての正確な有効量は、対象の体重、サイズ、および健康；状態の性質および程度；ならびに投与について選択された治療薬に左右されるであろう。所定の状況に関する有効量は、臨床医の技術および判断の範囲内である日常的な実験によって決定することができる。
本発明はさらに、（ａ）対象から得られたサンプルにおいて、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子、および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定すること、（ｂ）ステップ（ａ）における少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを、基準値または以前の測定値と比較すること、および（ｃ）比較ステップに基づいてガン治療の有効性を判定することによって、それを必要とする対象におけるガン治療の有効性を判定する方法を提供する。ガン治療の一例は、試験される対象に本発明の化合物を投与することである。
治療は、１）基準値もしくは以前の測定値と比較して；あるいは２）モニタリングされる期間、例えば１、２、３、４、５、６、もしくは７日、または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０週間、または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２か月またはそれ以上にわたって、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の増加した発現を有する場合に有効である。既存の治療が有効でない場合、新規治療または既存の治療の増加した投薬量（例えば、対象に投与される化合物の投薬量を増加させる）が試験される対象のために求められなければならない。
本発明はまた、（ａ）対象から得られたサンプルにおいて、ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを測定すること、（ｂ）ステップ（ａ）における少なくとも１つの遺伝子の発現レベルを基準値または以前の測定値と比較すること、および（ｃ）比較ステップに基づいてガン治療の有効性を判定することによって、それを必要とする対象におけるガン治療の有効性を判定する方法も提供する。ガン治療の一例は、本発明のＥＺＨ２阻害剤を試験される対象に投与することである。
例えば、治療は、１）基準値もしくは以前の測定値と比較して、または２）モニタリングされる期間、例えば１、２、３、４、５、６、もしくは７日、または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０週間、または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２か月あるいはそれ以上にわたって、試験した対象が、ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の減少した発現を有する場合に有効である。既存の治療が有効でない場合、新規治療または既存の治療の投薬量の増加（例えば、対象に投与される化合物の投薬量を増加させる）を試験される対象について求められるべきである。
本明細書中で提示される任意の方法において、ガンは、脳および中枢神経系（ＣＮＳ）ガン、頭頸部ガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、肺ガン、リンパ腫、骨髄腫、肉腫、乳がん、および前立腺ガンからなる群から選択される。好ましくは、ガンは、髄芽腫、乏突起神経膠腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）、卵巣漿液性腺がん、膵管腺がん、膵臓内分泌腫瘍、悪性ラブドイド腫瘍
、星状細胞腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、脊索腫、性腺外胚細胞腫瘍、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、類上皮細胞（epitheloid）肉腫、腎髄質がん（renal medullo carcinomａ）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫および特定不能（ＮＯＳ）肉腫からなる群から選択される。さらに好ましくは、ガンは髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍、または非定型奇形腫ラブドイド腫瘍からなる群から選択される。
本明細書中で用いられる場合、「反応性」という語は、「反応性の」、「感受性の」、および「感受性」という語と交換可能であり、対象がＥＺＨ阻害剤を投与された場合に治療反応を示すこと、例えば、対象の腫瘍細胞または腫瘍組織がアポトーシスおよび／または壊死を受ける、および／または減少した成長、分裂、もしくは増殖を示すことを意味する。この語はまた、集団全体に対して、ＥＺＨ阻害剤を投与された場合に対象が治療反応を示すより高い可能性を将来有するかまたは有していること、例えば、対象の腫瘍細胞または腫瘍組織がアポトーシスおよび／または壊死を受けること、および／または減少した成長、分裂、もしくは増殖を示すことを意味する。
本明細書中で用いられる場合、「対象」は「それを必要とする対象」と交換可能であり、そのどちらも、ＥＺＨ２が介在するタンパク質メチル化が関与する障害にかかっている対象、または集団全体に対してそのような障害を発症するリスクが増大している対象を指す。それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連する障害を有する対象であり得る。それを必要とする対象は前ガン状態を有し得る。好ましくは、それを必要とする対象はガンを有する。それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガンを有し得る。それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分において機能喪失に関連するガンを有し得る。好ましい態様において、それを必要とする対象は、脳および中枢神経系（ＣＮＳ）ガン、頭頸部ガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、肺ガン、リンパ腫、骨髄腫、肉腫、乳がん、および前立腺ガンからなる群から選択される１以上のガンを有する。好ましくは、それを必要とする対象は、髄芽腫、乏突起神経膠腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）
、卵巣漿液性腺がん、膵管腺がん、膵臓内分泌腫瘍、悪性ラブドイド腫瘍、星状細胞腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、脊索腫、性腺外胚細胞腫瘍、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、類上皮細胞（epitheloid）肉腫、腎髄質がん（renal medullo carcinoma）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫および特定不能（ＮＯＳ）肉腫を有する。別法として、それを必要とする対象は非ＮＨＬガンを有する。
本明細書中で用いられる場合、「対象」は哺乳類を包含する。哺乳類は、例えばヒトまたは適切なヒト以外の哺乳類、例えば霊長類、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヤギ、ラクダ、ヒツジまたはブタであり得る。対象は、鳥または家禽でもあり得る。１つの実施形態において、哺乳類はヒトである。対象は男性または女性であり得る。
それを必要とする対象は、ガンまたは前ガン状態を有していると以前に診断も特定もされていない対象であり得る。それを必要とする対象は、ガンまたは前ガン状態を有すると以前に診断または特定された対象であり得る。それを必要とする対象は、ガンまたは前ガン状態を有する（かかっている）対象でもあり得る。別法として、それを必要とする対象は、集団全体に対してそのような障害を発症するリスクを有する対象（すなわち、集団全体に対してそのような障害を発症する素因がある対象）であり得る。
場合によって、それを必要とする対象は、ガンまたは前ガン状態のための少なくとも１つの治療的介入をすでに受けているか、または受けつつあるか、受ける予定である。
それを必要とする対象は、最新の治療に関して難治性ガンを有し得る。「難治性ガン」とは、治療に応答しないガンを意味する。ガンは、治療の開始時で耐性である可能性があるか、または治療中に耐性になる可能性がある。難治性ガンは耐性ガンとも呼ばれる。いくつかの実施形態では、それを必要とする対象は、最近の治療で寛解後にガンを再発している。いくつかの実施形態では、それを必要とする対象は、がん治療のあらゆる公知の有効な治療を受け、失敗した。いくつかの実施形態では、それを必要とする対象は少なくとも１つの前治療を受けた。
それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体に関連するガンまたは前ガン状態を有していたか、有しているか、または発症する素因がある対象であり得る。それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分の機能喪失と関連するガンまたは前ガン状態を有していたか、有しているか、または発症する素因を有する対象であり得る。好ましい態様において、それを必要とする対象は、脳および中枢神経系（ＣＮＳ）ガン、頭頸部ガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、肺ガン、リンパ腫、骨髄腫、肉腫、乳がん、および前立腺ガンからなる群から選択される１以上のガンを有していたか、有しているか、または発症する素因を有する対象である。好ましくは、それを必要とする対象とは、脳およびＣＮＳガン、腎臓ガン、卵巣ガン、膵臓ガン、白血病、リンパ腫、骨髄腫、ならびに／または肉腫を有していたか、有しているか、または発症する素因がある対象である。例示的脳および中枢ＣＮＳガンとしては、髄芽腫、乏突起神経膠腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、および松果体芽細胞腫が挙げられる。例示的卵巣ガンとしては、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）、および卵巣漿液性腺がんが挙げられる。例示的膵臓ガンとしては、膵管腺がんおよび膵臓内分泌腫瘍が挙げられる。例示的肉腫としては、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、および特定不能（ＮＯＳ）肉腫が挙げられる。あるいは、本発明の化合物によって治療されるガンは非ＮＨＬガンである。
あるいは、それを必要とする対象は、髄芽腫、乏突起神経膠腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）、卵巣漿液性腺がん、膵管腺がん、膵臓内分泌腫瘍、悪性ラブドイド腫瘍、星状細胞腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、脊索腫、性腺外胚細胞腫瘍、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、および特定不能（ＮＯＳ）肉腫からなる群から選択される１以上のガンを有していたか、有しているか、または発症する素因がある対象である。好ましくは、対象は、髄芽腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinomａ）、膵管腺がん、悪性ラブドイド腫瘍、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、グリア芽腫、髄膜腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、類上皮細胞（epitheloid）肉腫、腎髄質がん（renal medullo carcinoma）、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫および／またはＮＯＳ肉腫を有していたか、有しているか、または発症する素因がある対象である。さらに好ましくは、それを必要とする対象は、悪性ラブドイド腫瘍、髄芽腫および／または非定型奇形腫ラブドイド腫瘍を有していたか、有しているか、または発症する素因がある対象である。
本発明のいくつかの実施形態において、それを必要とする対象は、神経分化遺伝子、細胞周期阻害遺伝子、および腫瘍抑制遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の減少した発現レベルを有する。
いくつかの実施形態では、それを必要とする対象は、ヘッジホッグ経路遺伝子、ｍｙｃ経路遺伝子およびヒストンメチルトランスフェラーゼ遺伝子からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の増加した発現レベルを有する。
本発明のいくつかの実施形態において、それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分／サブユニットの機能喪失を有する。別法として、それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の少なくとも１つの成分／サブユニットの減少した発現またはハプロ不全を有する。ある実施形態では、それを必要とする対象は、ＳＮＦ５サブユニットの機能喪失を有する。
本発明の任意の方法において、それを必要とする対象は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の下流に少なくとも１つのシグナル伝達成分の減少した発現、ハプロ不全または機能喪失を有し得る。そのような下流成分としては、限定されるものではないが、ポリコーム複合体（ＰｃＧ）およびその標的が挙げられる。
本明細書中で用いられる場合、「機能の喪失」という語は、野生型と比較して遺伝子産物／タンパク質の機能が低いまたはないことを指す。ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体成分の機能喪失は、成分／サブユニットまたは全ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体がそれぞれ野生型成分／サブユニットまたは全ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体と比べて生物学的機能が少ないかまたはないことを意味する。機能喪失は、転写、転写後、または翻訳後機序に起因する可能性がある。本発明の１つの態様において、機能喪失は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体成分のポリペプチドまたはＳＷＩ／ＳＮＦ複合体成分のポリペプチドをコード化する核酸配列における点突然変異（たとえば、置換、ミスセンス突然変異、またはナンセンス突然変異）、挿入、および／または欠失に起因する機能喪失突然変異によって起こる。本明細書中で言及される突然変異は体細胞変異である。「体細胞変異」という語は、身体の各細胞において見いだされないが、単離された細胞においてのみ見いだされる少なくとも１つの対立遺伝子における有害な変化を指す。体細胞変異の特徴は、本明細書中で用いられる場合、それらが特定の組織またはさらには組織の部分もしくは組織内の細胞に限定され、組織または細胞を有する全生物中に存在しない。「野生型」という語は、天然に存在する源から単離される場合、自身の特徴を有する遺伝子または遺伝子産物を指す。野生型遺伝子は、集団中で最も頻繁に観察され、したがって任意にデザインされたその遺伝子の「正常」または「野生型」形態であるものである。
したがって、機能喪失突然変異または減少した発現は、当該技術分野で利用可能な任意の好適な方法を使用して検出できる。例えば、機能喪失突然変異は、遺伝子産物の生物学的機能、例えばＳＷＩ／ＳＮＦ複合体のＡＴＰ依存性クロマチン再構成活性を測定することによって検出できる。別法として、機能喪失突然変異は、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分をコード化する核酸配列における任意の変更を検出することによって決定できる。例えば、機能喪失突然変異を有するＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分をコード化する核酸配列は、当該技術分野で周知の方法にしたがって、好適に選択されたＤＮＡおよびポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）プライマー源を使用して、全ゲノム再配列決定または標的領域再配列決定（後者は標的化再配列決定とも呼ばれる）によって検出できる。方法は、特徴的および一般的には、ゲノムＤＮＡ精製、関心対象の領域を増幅するためのＰＣＲ増幅、サイクルシーケンス法、シーケンシング反応クリーンアップ（sequencing reaction cleanup）、キャピラリー電気泳動法、および／またはデータ解析のステップを伴う。代替的または付加的に、方法は、マイクロアレイに基づく標的化領域ゲノムＤＮＡ捕捉および／またはシーケンシングの使用を含み得る。適切なＰＣＲプライマーの選択および再配列決定の実施のための、キット、試薬、および方法は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ａｇｉｌｅｎｔ、およびＮｉｍｂｌｅＧｅｎ （Ｒｏｃｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ ＧｍｂＨ）から商業的に入手可能である。代替的または付加的に、機能喪失突然変異を有するＳＷＩ／ＳＮＦポリペプチドをコード化する核酸配列は、当該技術分野で周知の方法にしたがってサザンブロットを使用して検出することができる。場合によって、機能喪失突然変異は、成分ポリペプチドの発現が存在しないことを測定することによるか、または変異成分ポリペプチドの発現を測定することによって検出できる。（変異）ポリペプチド発現の検出は、ウェスタンブロット分析などの当該技術分野における任意の好適なイムノアッセイで実施できる。
ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分のヒト核酸およびアミノ酸配列はすでに記載されている。例えば、ＳＮＦ５についてはＧｅｎＢａｎｋ受入番号ＮＰ＿００３０６４．２、ＮＭ＿００３０７３．３、ＮＰ＿００１００７４６９．１、およびＮＭ＿００１００７４６８．１、ＡＴＲＸについてはＧｅｎＢａｎｋ受入番号ＮＭ＿０００４８９．３、ＮＰ＿０００４８０．２、ＮＭ＿１３８２７０．２、およびＮＰ＿６１２１１４．１、ＡＲＩＤ１ＡについてはＧｅｎＢａｎｋ受入番号ＮＰ＿００６００６．３、ＮＭ＿００６０１５．４、ＮＰ＿６２４３６１．１、およびＮＭ＿１３９１３５．２（それぞれはその全体が参照により本明細書中に組み込まれる）を参照のこと。
ヒトにおけるｈＳＮＦ５体細胞変異の領域は、参照によりその全体が本明細書中に組み込まれる、Sevenet et al., Human Molecular Genetics, 8: 2359-2368, 1999でも記載されている。
それを必要とする対象は、ＳＮＦ５の減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を有し得る。例えば、対象は、ＳＮＦ５ポリペプチドまたはＳＮＦ５ポリペプチドをコード化する核酸配列においてＳＮＦ５の欠失を含み得る。
それを必要とする対象は、ＡＴＲＸの減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を有し得る。例えば、対象は、配列番号５のアミノ酸位置６８８の野生型残基リジン（Ｋ）のアスパラギン（Ｎ）での置換（Ｋ６８８Ｎ）、および配列番号５のアミノ酸位置３６６での野生型残基メチオニン（Ｍ）のイソロイシン（Ｉ）での置換（Ｍ３６６Ｉ）からなる群から選択される突然変異を含み得る。
























それを必要とする対象は、ＡＲＩＤ１Ａの減少した発現、ハプロ不全、および／または機能喪失を有し得る。例えば、対象は、配列番号１１のアミノ酸位置８８４での野生型残基システイン（Ｃ）のナンセンス突然変異（Ｃ８８４＊）、アミノ酸位置９６６での野生型残基グルタミン酸（Ｅ）のリジン（Ｋ）での置換（Ｅ９６６Ｋ）、配列番号１１のアミノ酸位置１４１１での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１４１１＊）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２０での野生型残基フェニルアラニン（Ｆ）のフレームシフト突然変異（Ｆ１７２０ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８４７での野生型残基グリシン（Ｇ）後のフレームシフト突然変異（Ｇ１８４７ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８７４での野生型残基システイン（Ｃ）でのフレームシフト突然変異（Ｃ１８７４ｆｓ）、アミノ酸位置１９５７での野生型残基アスパラギン酸（Ｄ）のグルタミン酸（Ｅ）での置換（Ｄ１９５７Ｅ）、配列番号１１のアミノ酸位置１４３０での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１４３０＊）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２１での野生型残基アルギニン（Ｒ）のフレームシフト突然変異（Ｒ１７２１ｆｓ）、アミノ酸位置１２５５での野生型残基グリシン（Ｇ）のグルタミン酸（Ｅ）での置換（Ｇ１２５５Ｅ）、配列番号１１のアミノ酸位置２８４での野生型残基グリシン（Ｇ）のフレームシフト突然変異（Ｇ２８４ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１７２２での野生型残基アルギニン（Ｒ）のナンセンス突然変異（Ｒ１７２２＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２７４での野生型残基メチオニン（Ｍ）でのフレームシフト突然変異（Ｍ２７４ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１８４７での野生型残基グリシン（Ｇ）でのフレームシフト突然変異（Ｇ１８４７ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置５５９での野生型残基Ｐでのフレームシフト突然変異（Ｐ５５９ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１２７６での野生型残基アルギニン（Ｒ）のナンセンス突然変異（Ｒ１２７６＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２１７６での野生型残基グルタミン（Ｑ）でのフレームシフト突然変異（Ｑ２１７６ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置２０３での野生型残基ヒスチジン（Ｈ）でのフレームシフト突然変異（Ｈ２０３ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置５９１での野生型残基アラニン（ａ）でのフレームシフト突然変異（Ａ５９１ｆｓ）、配列番号１１のアミノ酸位置１３２２での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ１３２２＊）、配列番号１１のアミノ酸位置２２６４での野生型残基セリン（Ｓ）のナンセンス突然変異（Ｓ２２６４＊）、配列番号１１のアミノ酸位置５８６での野生型残基グルタミン（Ｑ）のナンセンス突然変異（Ｑ５８６＊）、配列番号１１のアミノ酸位置５４８での野生型残基グルタミン（Ｑ）でのフレームシフト突然変異（Ｑ５４８ｆｓ）、および配列番号１１のアミノ酸位置７５６での野生型残基アスパラギン（Ｎ）でのフレームシフト突然変異（Ｎ７５６ｆｓ）からなる群から選択される突然変異を含み得る。本明細書中で用いられる「＊」は停止コドンを指す。本明細書中で用いられる「ｆｓ」はフレームシフトを指す。














本発明はまた、細胞を本発明の化合物（すなわち、ＥＺＨ２阻害剤）と接触させることによって神経分化を誘発する方法も提供する。好ましくは、化合物は、ＣＤ１３３（ＰＲＯＭ１とも呼ばれる）、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＰＲＯＭ２、ＬＨＸ１、ＬＨＸ６、ＬＨＸ９、ＰＡＸ６、ＰＡＸ７、ＶＥＦＧＡ、ＦＺＤ３Ｂ、ＦＹＮ、ＨＩＦ１Ａ、ＨＴＲＡ２、ＥＶＸ１、ＣＣＤＣ６４、およびＧＦＡＰからなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現を増加させるために充分な量である。
「神経分化を誘導する」という語は、本明細書中で用いられる場合、細胞に対する直接的または意図された効果の結果として、細胞を神経細胞系の細胞に発達させることを指す。
本発明はさらに、細胞を本発明の化合物と接触させることによって細胞周期阻害を誘導する方法も提供する。好ましくは、化合物は、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＭＥＮ１、ＣＨＥＫ１、ＩＲＦ６、ＡＬＯＸ１５Ｂ、ＣＹＰ２７Ｂ１、ＤＢＣ１、ＮＭＥ６、ＧＭＮＮ、ＨＥＸＩＭ１、ＬＡＴＳ１、ＭＹＣ、ＨＲＡＳ、ＴＧＦＢ１、ＩＦＮＧ、ＷＮＴ１、ＴＰ５３、ＴＨＢＳ１、ＩＮＨＢＡ、ＩＬ８、ＩＲＦ１、ＴＰＲ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＥＴＳ１、ＨＰＧＤ、ＢＭＰ７、ＧＡＴＡ３、ＮＲ２Ｆ２、ＡＰＣ、ＰＴＰＮ３、ＣＡＬＲ、ＩＬ１２Ａ、ＩＬ１２Ｂ、ＰＭＬ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＳＯＸ２、ＴＡＦ６、ＤＮＡ２、ＰＬＫ１、ＴＥＲＦ１、ＧＡＳ１、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＭＬＦ１、ＰＴＥＮ、ＴＧＦＢ２、ＳＭＡＤ３、ＦＯＸＯ４、ＣＤＫ６、ＴＦＡＰ４、ＭＡＰ２Ｋ１、ＮＯＴＣＨ２、ＦＯＸＣ１、ＤＬＧ１、ＭＡＤ２Ｌ１、ＡＴＭ、ＮＡＥ１、ＤＧＫＺ、ＦＨＬ１、ＳＣＲＩＢ、ＢＴＧ３、ＰＴＰＲＫ、ＲＰＳ６ＫＡ２、ＳＴＫ１１、ＣＤＫＮ３、ＴＢＲＧ１、ＣＤＣ７３、ＴＨＡＰ５、ＣＲＬＦ３、ＤＣＵＮ１Ｄ３、ＭＹＯＣＤ、ＰＡＦ１、ＬＩＬＲＢ１、ＵＨＭＫ１、ＰＮＰＴ１、ＵＳＰ４７、ＨＥＸＩＭ２、ＣＤＫ５ＲＡＰ１、ＮＫＸ３−１、ＴＩＰＩＮ、ＰＣＢＰ４、ＵＳＰ４４、ＲＢＭ３８、ＣＤＴ１、ＲＧＣＣ、ＲＮＦ１６７、ＣＬＳＰＮ、ＣＨＭＰ１Ａ、ＷＤＲ６、ＴＣＦ７Ｌ２、ＬＡＴＳ２、ＲＡＳＳＦ１、ＭＬＴＫ、ＭＡＤ２Ｌ２、ＦＢＸＯ５、ＩＮＧ４、およびＴＲＩＭ３５からなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現を増加させるために充分な量である。
「細胞周期阻害を誘導する」という語は、本明細書中で用いられる場合、細胞分裂および／または複製の間の任意の相で蓄積または停止を引き起こすことを指す。
本発明はさらに、細胞を本発明の化合物と接触させることによって腫瘍抑制を誘導する方法も提供する。好ましくは、化合物は、ＢＩＮ１または任意の腫瘍抑制因子の発現を増加させるために充分な量である。
「腫瘍抑制を誘導する」という語は、限定されるものではないが、腫瘍のサイズの減少、腫瘍体積の減少、腫瘍の数の減少、および原発腫瘍部位から離れた他の組織または器官における転移性病変の数の減少、担体単独を受容した集団と比較した治療対象の集団の平均生存時間の増加、未治療対象の集団と比較した治療対象の集団の平均生存時間の増加、本発明の化合物ではない薬物での単剤治療を受ける集団と比較した治療対象の集団の平均製造時間の増加、担体単独を受容する集団と比較した治療対象の集団の死亡率の減少、腫瘍成長速度の減少、または腫瘍再成長速度の減少を包含し得る。
本発明はさらに、細胞を本発明の化合物と接触させることによってヘッジホッグシグナル伝達を阻害する方法も提供する。好ましくは、化合物は、ＧＬＩ１、ＰＴＣＨ１、ＳＵＦＵ、ＫＩＦ７、ＧＬＩ２、ＢＭＰ４、ＭＡＰ３Ｋ１０、ＳＨＨ、ＴＣＴＮ３、ＤＹＲＫ２、ＰＴＣＨＤ１、およびＳＭＯからなる群から選択される少なくとも１つの遺伝子の発現を減少させるために十分な量である。
「ヘッジホッグシグナル伝達を阻害する」という言い回しは、化合物治療でのヘッジホッグシグナル伝達強度（strength/intensity）が、化合物治療をしないヘッジホッグシグナル伝達強度（strength/intensity）と比較して少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上減少することを意味する。
本発明はさらに、細胞を本発明の化合物と接触させることによって遺伝子発現を誘導する方法も提供する。好ましくは、化合物は、神経分化、細胞周期阻害および／または腫瘍抑制を誘発するために充分な量である。そのような遺伝子は、ＣＤ１３３（ＰＲＯＭ１とも呼ばれる）、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ、ＰＲＯＭ２、ＬＨＸ１、ＬＨＸ６、ＬＨＸ９、ＰＡＸ６、ＰＡＸ７、ＶＥＦＧＡ、ＦＺＤ３Ｂ、ＦＹＮ、ＨＩＦ１Ａ、ＨＴＲＡ２、ＥＶＸ１、ＣＣＤＣ６４、ＧＦＡＰ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ２Ａ、ＭＥＮ１、ＣＨＥＫ１、ＩＲＦ６、ＡＬＯＸ１５Ｂ、ＣＹＰ２７Ｂ１、ＤＢＣ１、ＮＭＥ６、ＧＭＮＮ、ＨＥＸＩＭ１、ＬＡＴＳ１、ＭＹＣ、ＨＲＡＳ、ＴＧＦＢ１、ＩＦＮＧ、ＷＮＴ１、ＴＰ５３、ＴＨＢＳ１、ＩＮＨＢＡ、ＩＬ８、ＩＲＦ１、ＴＰＲ、ＢＭＰ２、ＢＭＰ４、ＥＴＳ１、ＨＰＧＤ、ＢＭＰ７、ＧＡＴＡ３、ＮＲ２Ｆ２、ＡＰＣ、ＰＴＰＮ３、ＣＡＬＲ、ＩＬ１２Ａ、ＩＬ１２Ｂ、ＰＭＬ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＳＯＸ２、ＴＡＦ６、ＤＮＡ２、ＰＬＫ１、ＴＥＲＦ１、ＧＡＳ１、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＭＬＦ１、ＰＴＥＮ、ＴＧＦＢ２、ＳＭＡＤ３、ＦＯＸＯ４、ＣＤＫ６、ＴＦＡＰ４、ＭＡＰ２Ｋ１、ＮＯＴＣＨ２、ＦＯＸＣ１、ＤＬＧ１、ＭＡＤ２Ｌ１、ＡＴＭ、ＮＡＥ１、ＤＧＫＺ、ＦＨＬ１、ＳＣＲＩＢ、ＢＴＧ３、ＰＴＰＲＫ、ＲＰＳ６ＫＡ２、ＳＴＫ１１、ＣＤＫＮ３、ＴＢＲＧ１、ＣＤＣ７３、ＴＨＡＰ５、ＣＲＬＦ３、ＤＣＵＮ１Ｄ３、ＭＹＯＣＤ、ＰＡＦ１、ＬＩＬＲＢ１、ＵＨＭＫ１、ＰＮＰＴ１、ＵＳＰ４７、ＨＥＸＩＭ２、ＣＤＫ５ＲＡＰ１、ＮＫＸ３−１、ＴＩＰＩＮ、ＰＣＢＰ４、ＵＳＰ４４、ＲＢＭ３８、ＣＤＴ１、ＲＧＣＣ、ＲＮＦ１６７、ＣＬＳＰＮ、ＣＨＭＰ１Ａ、ＷＤＲ６、ＴＣＦ７Ｌ２、ＬＡＴＳ２、ＲＡＳＳＦ１、ＭＬＴＫ、ＭＡＤ２Ｌ２、ＦＢＸＯ５、ＩＮＧ４、ＴＲＩＭ３５、ＢＩＮ１および任意の腫瘍抑制因子からなる群から選択される。
「遺伝子発現を誘導する」という言い回しは、関心対象の特定の遺伝子の発現レベルを、化合物治療のないこの遺伝子の発現レベルと比較して、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上増加させることを意味する。
本発明はさらに、細胞を本発明の化合物と接触させることを含む、遺伝子発現を阻害する方法も提供する。好ましくは、化合物はヘッジホッグシグナル伝達を阻害するために充分な量である。そのような遺伝子は、ＧＬＩ１、ＰＴＣＨ１、ＳＵＦＵ、ＫＩＦ７、ＧＬＩ２、ＢＭＰ４、ＭＡＰ３Ｋ１０、ＳＨＨ、ＴＣＴＮ３、ＤＹＲＫ２、ＰＴＣＨＤ１、またはＳＭＯである。
「遺伝子発現を阻害する」という言い回しは、化合物治療をしないこの遺伝子の発現レベルと比較して、関心対象の特定の遺伝子の発現レベルを少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％，１０００％、１５００％、またはそれ以上減少させることを意味する。
神経分化、細胞周期阻害、腫瘍抑制およびヘッジホッグシグナル伝達阻害は、当該技術分野で公知の任意の方法によって決定することができる。
本明細書中で用いられる場合、細胞とは、本明細書中で記載される方法によって得ることができ、使用できる細胞を指す。例えば、細胞は細胞培養から得ることができる。別法として、細胞は対象から単離することができる。細胞とは、対象の細胞を指す場合もある。
細胞は、ＳＮＦ５、ＡＲＩＤ１Ａ、ＡＴＲＸ、および／またはＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の成分の機能喪失を含み得る。好ましくは、細胞はＳＮＦ５の欠失を含み得る。
細胞はガン細胞であってよく、この場合、ガンは、髄芽腫、乏突起神経膠腫、卵巣透明細胞腺がん、卵巣類子宮内膜腺癌（endomethrioid adenocarcinoma）、卵巣漿液性腺がん、膵管腺がん、膵臓内分泌腫瘍、悪性ラブドイド腫瘍、星状細胞腫、非定型奇形腫ラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、脈絡叢乳頭腫、上衣細胞腫、グリア芽腫、髄膜腫、神経膠腫、乏突起星細胞腫、乏突起神経膠腫、松果体芽細胞腫、がん肉腫、脊索腫、性腺外胚細胞腫瘍、腎外に発生するラブライド腫瘍、神経鞘腫、皮膚扁平上皮細胞がん、軟骨肉腫、軟組織の明細胞肉腫、ユーイング肉腫、消化管間質腫瘍、骨肉腫、横紋筋肉腫、類上皮細胞（epitheloid）肉腫、腎髄質がん（renal medullo carcinoma）、びまん性大細胞型Ｂ細
胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫および特定不能（ＮＯＳ）肉腫からなる群から選択される。さらに好ましくは、細胞は髄芽腫、悪性ラブドイド腫瘍、または非定型奇形腫ラブドイド腫瘍のガン細胞である。
治療されるガンは、対がん米国合同委員会（ＡＪＣＣ）ＴＮＭ分類体系にしたがって病期分類することができ、この場合、腫瘍（Ｔ）は、ＴＸ、Ｔ１、Ｔ１ｍｉｃ、Ｔ１ａ、Ｔ１ｂ、Ｔ１ｃ、Ｔ２、Ｔ３、Ｔ４、Ｔ４ａ、Ｔ４ｂ、Ｔ４ｃ、またはＴ４ｄの段階に割り当てられ、局所リンパ節（Ｎ）はＮＸ、Ｎ０、Ｎ１、Ｎ２、Ｎ２ａ、Ｎ２ｂ、Ｎ３、Ｎ３ａ、Ｎ３ｂ、またはＮ３ｃの段階に割り当てられ、遠隔転移（Ｍ）はＭＸ、Ｍ０、またはＭ１の段階に割り当てることができる。治療されるガンは、対がん米国合同委員会（ＡＪＣＣ）分類にしたがってステージＩ、ステージＩＩＡ、ステージＩＩＢ、ステージＩＩＩＡ、ステージＩＩＩＢ、ステージＩＩＩＣ、またはステージＩＶとして病期分類することができる。治療されるガンは、グレードＧＸ（たとえば、グレードは評価できない）、グレード１、グレード２、グレード３またはグレード４としてＡＪＣＣ分類によるグレードに割り当てることができる。治療されるガンは、ｐＮＸ、ｐＮ０、ＰＮ０（Ｉ−）、ＰＮ０（Ｉ＋）、ＰＮ０（ｍｏｌ−）、ＰＮ０（ｍｏｌ＋）、ＰＮ１、ＰＮ１（ｍｉ）、ＰＮ１ａ、ＰＮ１ｂ、ＰＮ１ｃ、ｐＮ２、ｐＮ２ａ、ｐＮ２ｂ、ｐＮ３、ｐＮ３ａ、ｐＮ３ｂ、またはｐＮ３ｃのＡＪＣＣ病理学的分類（ｐＮ）にしたがって病期分類することができる。
治療されるガンは、ＤＮＡサイトメトリー、フローサイトメトリー、またはイメージサイトメトリーによって評価できる。治療されるガンは、細胞分裂の合成ステージ（たとえば、細胞分裂のＳ期）における細胞の１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％を有するとして分類できる。治療されるガンは、低Ｓ期フラクションまたは高Ｓ期フラクションを有するとして分類できる。
本明細書中で用いられる場合、「正常細胞」は、「細胞増殖性障害」の一部として分類できない細胞である。正常細胞は、望ましくない状態または疾患の発症に至る可能性がある、無秩序もしくは異常な成長、または両者がない。好ましくは、正常細胞は正常に機能する細胞周期チェックポイント制御機序を有する。
本明細書中で用いられる場合、「細胞を接触させる」とは、化合物または他の組成物が細胞と直接接触している状態、または細胞において所望の生物学的効果を誘導するために充分近い状態を指す。
本明細書中で用いられる場合、「単剤治療」とは、単一の活性または治療化合物を、それを必要とする対象に投与することを指す。好ましくは、単剤治療は、治療有効量の活性化合物の投与を含む。例えば、ガンの治療を必要とする対象に対する本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体、溶媒和物、アナログもしくは誘導体のうちの１つでのガン単剤治療。単剤治療は、複数の活性化合物を、好ましくは治療有効量で存在する組み合わせの各成分とともに組み合わせで投与する併用療法と対比される。１つの態様において、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物での単剤治療は、所望の生物学的効果を誘導するのに併用療法よりも有効である。
本明細書中で用いられる場合、「治療する（treatingまたはtreat）」は、疾患、状態、または障害と闘う目的で患者の管理および看護を説明し、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物を、疾患、状態もしくは障害の１以上の症状もしくは合併症を軽減するため、または疾患、状態もしくは障害を除去するために投与することを包含する。「治療する」という語はまた、インビトロの細胞または動物モデルの処置も包含し得る。
本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物はさらに、疾患、状態もしくは障害を予防するためにも使用できる、またはそのような目的に好適な候補を特定するためにも使用できる。本明細書中で用いられる場合、「予防する（preventingまたはprevent）」は、疾患、状態または障害の症状または合併症の開始を減少ま
たは除去することを記載する。
本明細書中で用いられる場合、「軽減する」という語は、それによって障害の兆候または症状の重篤度を減少させるプロセスを記載することが意図される。重要なことに、兆候または症状は、除去されることなく軽減され得る。好ましい実施形態では、本発明の医薬組成物の投与は、兆候または症状の除去に至るが、除去は必要ではない。有効投薬量は、兆候または症状の重篤度を減少させることが期待される。例えば、複数の場所で起こり得る、ガンなどの障害の兆候または症状は、ガンの重篤度が複数の場所のうちの少なくとも１つで減少する場合、軽減される。
本明細書中で用いられる場合、「重篤度」という語は、ガンが、前ガン状態、または良性状態から悪性状態へ変換する可能性を説明することが意図される。代替的または付加的に、重篤度は例えば、ＴＮＭシステム（国際対ガン連合（ＵＩＣＣ）および対がん米国合同委員会（ＡＪＣＣ）によって承認）または他の当該技術分野で承認されている方法にしたがってガンの病期を記載することを意図する。ガンの病期は原発腫瘍の位置、腫瘍サイズ、腫瘍の数、およびリンパ節関与（リンパ節中へのガンの拡散）などの因子に基づくガンの程度または重篤度を指す。代替的または付加的に、重篤度は、当該技術分野で承認されている方法によって腫瘍グレードを記載することを意図する（国立ガン研究所、www.cancer.govを参照のこと）。腫瘍グレードは、顕微鏡下でそれらがどれほど異常に見えるか、そして腫瘍がどれほど急速に増殖し拡散しやすいかの点で、ガン細胞を分類するために使用されるシステムである。細胞の構造および成長パターンを含む多くの因子が、腫瘍グレードを決定する場合に考慮される。腫瘍グレードを決定する為に使用される特定の因子は、ガンの各型で変わる。重篤度はまた、分化とも呼ばれる組織学的グレードも記載し、これは、どれほど多くの腫瘍細胞が、同じ組織型の正常細胞と類似しているかを指す（国立ガン研究所、www.cancer.govを参照のこと）。さらに、重篤度は、腫瘍細胞中の核のサイズおよび形状、ならびに分裂する腫瘍細胞のパーセンテージを指す、核グレードを記載する（国立ガン研究所、ｗｗｗ．ｃａｎｃｅｒ．ｇｏｖを参照のこと）。
本発明の別の態様では、重篤度は、腫瘍が成長因子を分泌した程度、細胞外マトリックスを分解した程度、血管が新生されるようになった程度、隣接組織への接着性を喪失した程度、または転移した程度を記載する。さらに、重篤度は、原発腫瘍が転移した場所の数を記載する。最後に、重篤度は、様々な種類および場所の腫瘍を治療する困難さを包含する。例えば、手術不可能な腫瘍、複数の身体系へのアクセスが多いガン（血液学的および免疫学的腫瘍）、ならびに伝統的な治療に対して最も耐性であるものが最も重篤とみなされる。これらの状況で、対象の平均余命の延長および／または痛みの軽減、ガン性細胞の割合の減少または細胞の１つのシステムへの限定、およびガンの病期／腫瘍グレード／組織学的グレード／核グレードの改善は、ガンの兆候または症状を軽減するとみなされる。
本明細書中で用いられる場合、「症状」という語は、疾患、病気、損傷、または身体において正常でないものの適応症として定義される。症状は、その症状を経験している個体が感じるかまたは気づくが、他者からは容易に気づかれない可能性がある。他者は、非医療専門家と定義される。
本明細書中で用いられる場合、「兆候」という語も、身体において正常でないものの適応症として定義される。しかし、兆候は、医師、看護師、または他の医療専門家がわかるものとして定義される。
ガンは、ほとんどすべての兆候または症状も引き起こし得る疾患の群である。兆候および症状は、ガンがある場所、ガンのサイズ、および付近の臓器または構造にどれほど影響を及ぼすかによって左右される。ガンが拡散（転移）する場合、症状が身体の異なる部分で出現する可能性がある。
ガンの治療は、結果として腫瘍のサイズを減少させることができる。腫瘍のサイズの減少は、「腫瘍退縮」とも呼ばれる。好ましくは、治療後、腫瘍サイズは治療前のサイズに対して５％以上減少し；さらに好ましくは腫瘍サイズは１０％以上減少し；さらに好ましくは２０％以上減少し；さらに好ましくは３０％以上減少し；さらに好ましくは４０％以上減少し；なお一層好ましくは５０％以上減少し；そして最も好ましくは７５％以上減少する。腫瘍のサイズは、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。腫瘍のサイズは腫瘍の直径として測定することができる。
ガンの治療は、結果として腫瘍体積を減少させることができる。好ましくは、治療後、腫瘍体積は治療前のそのサイズに対して５％以上減少し；さらに好ましくは、腫瘍体積は１０％以上減少し；さらに好ましくは２０％以上減少し；さらに好ましくは３０％以上減少し；さらに好ましくは、４０％以上減少し；なお一層好ましくは５０％以上減少し；そして最も好ましくは７５％以上減少する。腫瘍体積は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。
ガンの治療は、結果として腫瘍の数を減少させる。好ましくは、治療後、腫瘍数は治療前の数に対して５％以上減少し；さらに好ましくは、腫瘍数は１０％以上減少し；さらに好ましくは２０％以上減少し；さらに好ましくは３０％以上減少し；さらに好ましくは４０％以上減少し；なお一層好ましくは、５０％以上減少し；そして最も好ましくは７５％以上減少する。腫瘍の数は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。腫瘍の数は、肉眼または特定の倍率でみることができる腫瘍をカウントすることによって測定することができる。好ましくは、特定の倍率は、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、または５０倍である。
ガンの治療は、結果として原発腫瘍部位から離れた他の組織または器官における転移性病変の数を減少させることができる。好ましくは、治療後、転移性病変の数は、治療前の数に対して５％以上減少し；さらに好ましくは、転移性病変の数は１０％以上減少し；さらに好ましくは２０％以上減少し；さらに好ましくは３０％以上減少し；さらに好ましくは４０％以上減少し；なお一層好ましくは５０％以上減少し；そして最も好ましくは７５％以上減少する。転移性病変の数は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。転移性病変の数は、肉眼または特定の倍率でみることができる転移性病変をカウントすることによって測定することができる。好ましくは、特定の倍率は、２倍、３倍、４倍、５倍、１０倍、または５０倍である。
ガンの治療は、結果として担体単独を受容した集団と比較した治療対象の集団の平均生存時間を増加させることができる。好ましくは、平均生存時間は、３０日超増加し；さらに好ましくは６０日超増加し；さらに好ましくは９０日超増加し；そして最も好ましくは１２０超増加する。集団の平均生存時間の増加は、任意の再現可能な手段によって測定することができる。集団の平均生存時間の増加は、例えば、集団について、活性化合物での治療開始後の生存の平均長さを算出することによって測定することができる。集団の平均生存時間の増加は、例えば、活性化合物での治療の第１ラウンドの完了後の生存の平均長さを集団について算出することによって測定することもできる。
ガンの治療の結果、未治療対象の集団と比較した治療対象の集団の平均生存時間を増加させることができる。好ましくは、平均生存時間は、３０日以上；さらに好ましくは６０日以上；さらに好ましくは９０日以上；そして最も好ましくは１２０日以上増加する。集団の平均生存時間の増加は、任意の再現可能な手段によって測定することができる。集団の平均生存時間の増加は、例えば、集団について活性化合物での治療開始後の生存の平均長さを計算することによって測定することができる。集団の平均生存時間の増加はまた、例えば活性化合物での治療の第１ラウンドの完了後の生存の平均長さを計算することによっても測定することができる。
ガンの治療の結果、本発明の化合物ではない薬物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体、溶媒和物、アナログもしくは誘導体での単剤治療を受ける集団と比較して治療対象の集団の平均生存時間を増加させることができる。好ましくは、平均生存時間は、３０日以上増加し；さらに好ましくは６０日以上増加し；さらに好ましくは９０日以上増加しそして最も好ましくは１２０日以上増加する。集団の平均生存時間の増加は、任意の再現可能な手段によって測定することができる。集団の平均生存時間の増加は、集団について活性化合物での治療完了後の生存の平均長さを計算することによって測定することができる。集団の平均生存時間の増加は、例えば、集団について活性化合物での治療の第１ラウンド完了後の生存の平均長さを計算することによっても測定することができる。
ガンの治療の結果、担体単独を受容する集団と比較して治療対象の集団の死亡率を減少させることができる。ガンの治療の結果、非治療集団と比較して、治療対象の集団の死亡率を減少させることができる。ガンの治療の結果、本発明の化合物でない薬物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体、アナログもしくは誘導体での単剤治療を受けている集団と比較して、治療対象の集団の死亡率を減少させることができる。好ましくは、死亡率は２％以上減少させることができ；さらに好ましくは５％以上；さらに好ましくは１０％以上；そして最も好ましくは２５％以上減少させることができる。治療対象の集団の死亡率の減少は、任意の再現可能な手段によって測定することができる。集団の死亡率の減少は、例えば、活性化合物での治療開始後の単位時間当たりの疾患に関連する死亡の平均数を集団について計算することによって測定することができる。集団の死亡率の減少は、例えば、活性化合物での治療の第１ラウンド完了後の単位時間当たりの疾患に関連する死亡の平均数を集団について計算することによっても測定することができる。
ガンの治療の結果、腫瘍成長速度を減少させることができる。好ましくは、治療後、腫瘍成長速度は、治療前の数に対して少なくとも５％減少し；さらに好ましくは、腫瘍成長速度は少なくとも１０％減少し；さらに好ましくは少なくとも２０％減少し；さらに好ましくは少なくとも３０％減少し；さらに好ましくは少なくとも４０％減少し；さらに好ましくは少なくとも５０％減少し；なお一層好ましくは少なくとも５０％減少し；そして最も好ましくは少なくとも７５％減少する。腫瘍成長速度は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。腫瘍成長速度は単位時間当たりの腫瘍直径の変化によって測定することができる。
ガンの治療の結果として腫瘍再成長を減少させることができる。好ましくは、治療後、腫瘍再成長は５％未満であり；さらに好ましくは、腫瘍再成長は、１０％未満；さらに好ましくは２０％未満；さらに好ましくは３０％未満；さらに好ましくは４０％未満；さらに好ましくは５０％未満；なお一層好ましくは５０％未満；そしてもっとも好ましくは７５％未満である。腫瘍再成長は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。腫瘍再成長は、例えば、治療後に起こる以前の腫瘍収縮後の腫瘍の直径の増加を測定することによって測定される。腫瘍再成長の減少は、治療を停止した後に腫瘍が再発しないことによって示される。
ガンの治療の結果、細胞増殖速度を減少させることができる。好ましくは、治療後、細胞増殖速度は少なくとも５％減少し；さらに好ましくは少なくとも１０％減少し；さらに好ましくは少なくとも２０％減少し；さらに好ましくは少なくとも３０％減少し；さらに好ましくは少なくとも４０％減少し；さらに好ましくは少なくとも５０％減少し；なお一層好ましくは、少なくとも５０％減少し；そして最も好ましくは少なくとも７５％減少する。細胞増殖速度は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。細胞増殖速度は、例えば、単位時間当たりの組織サンプル中の分裂細胞数を測定することによって測定される。
ガンの治療の結果、増殖する細胞の割合を減少させることができる。好ましくは、治療後、増殖する細胞の割合は少なくとも５％減少し；さらに好ましくは少なくとも１０％減少し；さらに好ましくは少なくとも２０％減少し；さらに好ましくは少なくとも３０％減少し；さらに好ましくは少なくとも４０％減少し；さらに好ましくは少なくとも５０％減少し；なお一層好ましくは少なくとも５０％減少し；そして最も好ましくは少なくとも７５％減少する。増殖する細胞の割合は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。好ましくは、増殖する細胞の割合は、例えば、組織サンプル中の非分裂細胞の数に対する分裂細胞の数を定量することによって測定される。増殖する細胞の割合は分裂指数に等しい可能性がある。
ガンの治療の結果、細胞増殖の部分または区域のサイズを減少させることができる。好ましくは、治療後、細胞増殖の部分または区域のサイズは、治療前のそのサイズに対して少なくとも５％減少し；さらに好ましくは少なくとも１０％減少し；さらに好ましくは少なくとも２０％減少し；さらに好ましくは少なくとも３０％減少し；さらに好ましくは少なくとも４０％減少し；さらに好ましくは少なくとも５０％減少し；なお一層好ましくは少なくとも５０％減少し；そして最も好ましくは少なくとも７５％減少する。細胞増殖の部分または区域のサイズは、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。細胞増殖の部分または区域のサイズは、細胞増殖の部分または区域の直径または幅として測定することができる。
ガンの治療の結果、異常な外観または形態を有する細胞の数または割合を減少させることができる。好ましくは、治療後、異常な形態を有する細胞の数は、治療前のサイズに対して少なくとも５％減少し；さらに好ましくは少なくとも１０％減少し；さらに好ましくは少なくとも２０％減少し；さらに好ましくは少なくとも３０％減少し；さらに好ましくは少なくとも４０％減少し；さらに好ましくは少なくとも５０％減少し；なお一層好ましくは少なくとも５０％減少し；そして最も好ましくは少なくとも７５％減少する。異常な細胞の外観または形態は、任意の再現可能な測定手段によって測定することができる。異常な細胞の形態は、顕微鏡法、例えば、倒立組織培養顕微鏡を用いて測定することができる。異常な細胞の形態は、核多形性（nuclear pleiomorphisｍ）の形態をとり得る。
ガンの治療は細胞死をもたらす可能性があり、好ましくは、細胞死は、集団中の細胞の数を少なくとも１０％減少させる。さらに好ましくは、細胞死は、少なくとも２０％の減少；さらに好ましくは少なくとも３０％の減少；さらに好ましくは少なくとも４０％の減少；さらに好ましくは少なくとも５０％の減少；最も好ましくは少なくとも７５％の減少を意味する。集団中の細胞の数は、任意の再現可能な手段によって測定することができる。集団中の細胞の数は、蛍光活性化細胞分類（ＦＡＣＳ）、免疫蛍光顕微鏡法および光学顕微鏡法によって測定できる。細胞死を測定する方法は、Li et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 100(5): 2674-8, 2003.で示されているとおりである。１つの態様では、細胞死はアポトーシスによって起こる。
本明細書中で用いられる場合、「選択的に」という語は、１つの集団で別の集団よりも高い頻度で起こる傾向を意味する。比較される集団は細胞集団であり得る。好ましくは、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、正常細胞に対してではなくガン細胞または前ガン細胞に対して選択的に作用する。好ましくは、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、１つの分子標的（たとえば、標的タンパク質メチルトランスフェラーゼ）を調節するために選択的に作用するが、別の分子標的（たとえば、非標的タンパク質メチルトランスフェラーゼ）を有意に調節しない。本発明はまた、タンパク質メチルトランスフェラーゼなどの酵素の活性を選択的に阻害するための方法も提供する。好ましくは、ある事象が集団Ｂと比較して集団Ａで２倍を超えて頻繁に起こる場合、それは集団Ｂに対して集団Ａにおいて選択的に起こる。ある事象は集団Ａにおいて５倍を超えて頻繁に起こる場合、それは選択的に起こる。ある事象が、集団Ａにおいて１０倍を超えて頻繁に起こる場合、；さらに好ましくは集団Ｂに比べて集団Ａにおいて５０倍を超えて；なお一層好ましくは１００倍を超えて；そして最も好ましくは１０００倍を超えて頻繁に起こる場合、それは選択的に起こる。例えば、細胞死は、正常細胞と比較して、ガン細胞で２倍を超えて頻繁に起こる場合、ガン細胞で選択的に起こるといわれる。
本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、分子標的（たとえば、標的タンパク質メチルトランスフェラーゼ）を調節できる。調節は、分子標的の活性を刺激または阻害することを指す。好ましくは、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、前記化合物の存在のみがないこと以外は同じ条件下での分子標的の活性と比べて少なくとも２倍分子標的の活性を刺激または阻害する場合、分子標的の活性を調節する。さらに好ましくは、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、前記化合物の存在のみがないことを除いて同じ条件下での分子標的の活性と比べて、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも２０倍、少なくとも５０倍、少なくとも１００倍分子標的の活性を刺激または阻害する場合、分子標的の活性を調節する。分子標的の活性は、任意の再現可能な手段によって測定することができる。分子標的の活性は、インビトロまたはインビボで測定できる。例えば、分子標的の活性は、酵素活性アッセイもしくはＤＮＡ結合アッセイによってインビトロで測定してもよいし、または分子標的の活性は、レポーター遺伝子の発現についてのアッセイによってインビボで測定してもよい。
本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、その化合物の添加が前記化合物の存在のみがないことを除いて同じ条件下での分子標的の活性と比べて１０％を越えて分子標的の活性を刺激または阻害しない場合、分子標的の活性を有意に調節しない。
本明細書中で用いられる場合、「アイソザイム選択的」という用語は、酵素の第２のイソ型と比較した酵素の第１のイソ型の刺激の優先的阻害または刺激（たとえば、タンパク質メチルトランスフェラーゼアイソザイムベータと比較したタンパク質メチルトランスフェラーゼアイソザイムアルファの優先的阻害または刺激）を意味する。好ましくは、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、生物学的効果を達成するために必要な投薬量で、最低４倍差、好ましくは１０倍差、さらに好ましくは５０倍差を示す。好ましくは、本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、阻害の範囲にわたってこの差を示し、この差は、関心対象の分子標的のＩＣ５０、すなわち５０％阻害で例示される。
本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物を細胞またはそれを必要とする対象に投与すると、関心対象のタンパク質メチルトランスフェラーゼの活性の調節（すなわち、刺激または阻害）が起こり得る。
Ｈ３−Ｋ２７のメチル化、トリメチル化Ｈ３−Ｋ２７の形成、モノメチル化Ｈ３−Ｋ２７のジメチル化Ｈ３−Ｋ２７への変換、またはジメチル化Ｈ３−Ｋ２７のトリメチル化Ｈ３−Ｋ２７への変換の検出は、任意の好適な方法を使用して達成することができる。例示的方法は、米国特許第ＵＳ２０１２００７１４１８号で見出すことができ、その内容は参照により本明細書中に組み込まれる。
本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物を細胞またはそれを必要とする対象に投与すると、細胞内標的（たとえば、基質）の活性の調節（すなわち、刺激または阻害）が起こる。限定されるものではないが、タンパク質メチルトランスフェラーゼをはじめとするいくつかの細胞内標的を本発明の化合物で調節できる。
好ましくは、有効量の本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物は、正常な細胞に対して著しく細胞毒性ではない。治療有効量の化合物は、この化合物の治療有効量での投与が、正常細胞の１０％超において細胞死を誘導しない場合は、正常細胞に対して著しく細胞毒性ではない。治療有効量の化合物は、治療有効量でのこの化合物の投与が正常細胞の１０％超において細胞死を誘発しない場合は、正常細胞の生存能力に著しい影響を及ぼさない。１つの態様では、細胞死はアポトーシスによって起こる。
細胞を本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物と接触させることによって、ガン細胞において選択的に細胞死を誘発または活性化することができる。それを必要とする対象に本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物を投与することによって、細胞死を選択的にガン細胞において誘発または活性化することができる。細胞を本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物と接触させることによって、細胞死を選択的に細胞増殖性障害に冒された１以上の細胞において誘発することができる。好ましくは、それを必要とする対象に本発明の化合物、またはその薬剤的に許容される塩、多形体もしくは溶媒和物を投与することによって、細胞死を選択的に細胞増殖性障害に冒された１以上の細胞において誘発する。
当業者は、本明細書中で検討する公知技術または同等の技術の詳細な説明について一般的参考文献を参照することができる。これらの文書としては以下の物が挙げられる。Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, Inc. (2005); Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual (3rd edition), Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, New York (2000); Coligan et al., Current Protocols in Immunology, John Wiley & Sons, N.Y.; Enna et al., Current Protocols in Pharmacology, John Wiley & Sons, N.Y.; Fingl et al., The Pharmacological Basis of Therapeutics (1975), Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, 18th edition (1990)。これらの文書も、もちろん本発明の態様の作製または使用において参照することができる。
本明細書中で記載する任意の方法で使用できる化合物（すなわち、ＥＺＨ２阻害剤）は次式Ｉ：


を有し得るか、またはその薬剤的に許容される塩であり；式中、
Ｒ７０１は、Ｈ、Ｆ、ＯＲ７０７、ＮＨＲ７０７、−（Ｃ≡Ｃ）−（ＣＨ２）ｎ７−Ｒ７０８、フェニル、５もしくは６員ヘテロアリール、Ｃ３〜８シクロアルキル、または１〜３個のヘテロ原子を含む４〜７員ヘテロシクロアルキルであり、ここで、フェニル、５もしくは６員ヘテロアリール、Ｃ３〜８シクロアルキルまたは４〜７員ヘテロシクロアルキルは、各々独立して、ハロ、Ｃ１〜３アルキル、ＯＨ、Ｏ−Ｃ１〜６アルキル、ＮＨ−Ｃ１〜６アルキル、および、Ｃ３〜８シクロアルキルまたは１〜３個のヘテロ原子を含有する４〜７員ヘテロシクロアルキルで置換されたＣ１〜３アルキルから選択される１以上の基で場合によって置換されていてもよく、ここで、Ｏ−Ｃ１〜６アルキルおよびＮＨ−Ｃ１〜６アルキルの各々は、ヒドロキシル、Ｏ−Ｃ１〜３アルキルまたはＮＨ−Ｃ１〜３アルキルで場合によって置換されていてもよく、Ｏ−Ｃ１〜３アルキルおよびＮＨ−Ｃ１〜３アルキルの各々は、Ｏ−Ｃ１〜３アルキルまたはＮＨ−Ｃ１〜３アルキルで場合によってさらに置換されていてもよい；
Ｒ７０２およびＲ７０３のそれぞれは独立して、Ｈ、ハロ、Ｃ１〜４アルキル、Ｃ１〜６アルコキシルまたはＣ６〜Ｃ１０アリールオキシであり、それぞれは場合によって１以上のハロで置換されていてもよい；
Ｒ７０４およびＲ７０５のそれぞれは独立してＣ１〜４アルキルである；
Ｒ７０６はＮ（Ｃ１〜４アルキル）２で置換されたシクロヘキシルであり、Ｃ１〜４アルキルの一方もしくは両方はＣ１〜６アルコキシで置換されている；またはＲ７０６はテトラヒドロピラニルである；
Ｒ７０７は、ヒドロキシル、Ｃ１〜４アルコキシ、アミノ、モノ−もしくはジ−Ｃ１〜４アルキルアミノ、Ｃ３〜８シクロアルキル、および１〜３個のヘテロ原子を含有する４〜７員ヘテロシクロアルキルから選択される１以上の基で場合によって置換されていてもよいＣ１〜４アルキルであり、ここで、Ｃ３〜８シクロアルキルまたは４〜７員ヘテロシクロアルキルは、それぞれ独立して、Ｃ１〜３アルキルで場合によってさらに置換されていてもよい；
Ｒ７０８は、ＯＨ、ハロ、およびＣ１〜４アルコキシから選択される１以上の基で場合によって置換されていてもよいＣ１〜４アルキル、１〜３個のヘテロ原子を含む４〜７員ヘテロシクロアルキル、またはＯ−Ｃ１〜６アルキルであり、ここで、４〜７員ヘテロシクロアルキルは、ＯＨまたはＣ１〜６アルキルで場合によってさらに置換されている可能性がある；そして
ｎ７は０、１または２である。
例えば、Ｒ７０６は、Ｎ（Ｃ１〜４アルキル）２で置換されたシクロヘキシルであり、ここで、Ｃ１〜４アルキルの１つは非置換であり、他のものはメトキシで置換されている。
例えば、Ｒ７０６は


である。
例えば、化合物は式ＩＩ：


のものである。
例えば、Ｒ７０２がメチルまたはイソプロピルであり、Ｒ７０３はメチルまたはメトキシルである。
例えば、Ｒ７０４はメチルである。
例えば、Ｒ７０１はＯＲ７０７であり、Ｒ７０７は、ＯＣＨ３またはモルホリンで場合によって置換されていてもよいＣ１〜３アルキルである。
例えば、Ｒ７０１がＨまたはＦである。
例えば、Ｒ７０１がテトラヒドロピラニル、フェニル、ピリジル、ピリミジル、ピラジニル、イミダゾリル、またはピラゾリルであり、そのそれぞれが、メチル、メトキシ、モルホリンで置換されたエチル、または−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３で場合によって置換されていてもよい。
例えば、Ｒ７０８は、モルホリン、ピペリジン、ピペラジン、ピロリジン、ジアゼパン、またはアゼチジンであり、そのそれぞれは、ＯＨまたはＣ１〜６アルキルで場合によって置換されていてもよい。
例えば、Ｒ７０８はモルホリンである。
例えば、Ｒ７０８は、Ｃ１〜６アルキルで置換されたピペラジンである。
例えば、Ｒ７０８は、メチル、ｔ−ブチルまたはＣ（ＣＨ３）２ＯＨである。
本明細書中で記載する任意の方法で使用できる化合物（すなわち、ＥＺＨ２阻害剤）は次式ＩＩＩ：


を有し得るかまたはその薬剤的に許容される塩である。
この式中：
Ｒ８０１は、Ｃ１〜６アルキル、Ｃ２〜６アルケニル、Ｃ２〜６アルキニル、Ｃ３〜８シクロアルキル、１〜３個のヘテロ原子を含有する４〜７員ヘテロシクロアルキル、フェニルまたは５もしくは６員ヘテロアリールであり、そのそれぞれはＯ−Ｃ１〜６アルキル−ＲｘまたはＮＨ−Ｃ１〜６アルキル−Ｒｘで置換され、ここで、Ｒｘはヒドロキシル、Ｏ−Ｃ１〜３アルキルまたはＮＨ−Ｃ１〜３アルキルであり、そしてＲｘがヒドロキシルである場合を除いて、ＲｘはＯ−Ｃ１〜３アルキルまたはＮＨ−Ｃ１〜３アルキルで場合によってさらに置換されていてもよい；あるいはＲ８０１は−Ｑ２−Ｔ２で置換されたフェニルであり、ここで、Ｑ２は結合、またはハロ、シアノ、ヒドロキシルもしくはＣ１〜Ｃ６アルコキシで場合によって置換されていてもよいＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、Ｔ２は場合によって置換されていてもよい４〜１２員ヘテロシクロアルキルである；そしてＲ８０１は場合によってさらに置換されていてもよい；
Ｒ８０２およびＲ８０３のそれぞれは独立して、Ｈ、ハロ、Ｃ１〜４アルキル、Ｃ１〜６アルコキシルまたはＣ６〜Ｃ１０アリールオキシであり、そのそれぞれは、場合によって１以上のハロで置換されていてもよい；
Ｒ８０４およびＲ８０５のそれぞれは独立してＣ１〜４アルキルである；そして Ｒ８０６は、−Ｑｘ−Ｔｘであり、ここで、Ｑｘは結合またはＣ１〜４アルキルリンカーであり、Ｔｘは、Ｈ、場合によって置換されていてもよいＣ１〜４アルキル、場合によって置換されていてもよいＣ３〜Ｃ８シクロアルキルまたは場合によって置換されていてもよい４〜１４員ヘテロシクロアルキルである。
例えば、ＱｘおよびＱ２の各々は独立して結合またはメチルリンカーであり、そしてＴｘおよびＴ２の各々は独立してテトラヒドロピラニル、１、２、もしくは３個のＣ１〜４アルキル基で置換されたピペリジニル、またはＮ（Ｃ１〜４アルキル）２で置換されたシクロヘキシルであり、ここでＣ１〜４アルキルの一方または両方はＣ１〜６アルコキシで場合によって置換されていてもよい；
例えば、Ｒ８０６はＮ（Ｃ１〜４アルキル）２で置換されたシクロヘキシルであるか、またはＲ８０６はテトラヒドロピラニルである。
例えば、Ｒ８０６は


である。
例えば、Ｒ８０１はＯ−Ｃ１〜６アルキル−Ｒｘで置換されたフェニルまたは５もしくは６員ヘテロアリールであるか、あるいはＲ８０１はＣＨ２−テトラヒドロピラニルで置換されたフェニルである。
例えば、本発明の化合物は、式ＩＶａまたはＩＶｂの化合物：


または


（式中、Ｚ’はＣＨまたはＮであり、そしてＲ８０７はＣ２〜３アルキル−Ｒｘである）である。
例えば、Ｒ８０７は、−ＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、または−ＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３である。
例えば、Ｒ８０２はメチルまたはイソプロピルであり、Ｒ８０３はメチルまたはメトキシルである。
例えば、Ｒ８０４はメチルである。
本発明の化合物は、次式（Ｖ）：


を有し得るか、またはその薬剤的に許容される塩もしくはエステルである。
この式中：
Ｒ２、Ｒ４およびＲ１２は、それぞれ独立してＣ１〜６アルキルである；
Ｒ６は、Ｃ６〜Ｃ１０アリールまたは５もしくは６員ヘテロアリールであり、各々は１以上の−Ｑ２−Ｔ２で場合によって置換されていてもよく、ここで、Ｑ２は、結合またはハロ、シアノ、ヒドロキシルもしくはＣ１〜Ｃ６アルコキシで場合によって置換されていてもよいＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、そしてＴ２は、Ｈ、ハロ、シアノ、−ＯＲａ、−ＮＲａＲｂ、−（ＮＲａＲｂＲｃ）＋Ａ−、−Ｃ（Ｏ）Ｒａ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲａ、−Ｃ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲｂＣ（Ｏ）Ｒａ、−ＮＲｂＣ（Ｏ）ＯＲａ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒａ、−Ｓ（Ｏ）２ＮＲａＲｂ、またはＲＳ２であり、ここで、Ｒａ、Ｒｂ、およびＲｃの各々は独立してＨまたはＲＳ３であり、Ａ−は薬剤的に許容されるアニオンであり、ＲＳ２およびＲＳ３の各々は独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであるか、あるいはＲａおよびＲｂは、それらが結合しているＮ原子と一緒になって、０または１個のさらなるヘテロ原子を有する４〜１２員ヘテロシクロアルキル環を形成し、そしてＲＳ２、ＲＳ３、ならびにＲａおよびＲｂによって形成される４〜１２員ヘテロシクロアルキル環のそれぞれは１以上の−Ｑ３−Ｔ３で場合によって置換されていてもよく、この場合、Ｑ３は結合またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、それぞれはハロ、シアノ、ヒドロキシルもしくはＣ１〜Ｃ６アルコキシで場合によって置換されていてもよく、そしてＴ３は、ハロ、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、５もしくは６員ヘテロアリール、ＯＲｄ、ＣＯＯＲｄ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒｄ、−ＮＲｄＲｅ、および−Ｃ（Ｏ）ＮＲｄＲｅからなる群から選択され、ＲｄおよびＲｅの各々は独立してＨもしくはＣ１〜Ｃ６アルキルであるか、または−Ｑ３−Ｔ３はオキソである；または任意の２つの隣接する−Ｑ２−Ｔ２は、それらが結合している原子と一緒になって、Ｎ、ＯおよびＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を場合によって含み、そしてハロ、ヒドロキシル、ＣＯＯＨ、Ｃ（Ｏ）Ｏ−Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、および５もしくは６員ヘテロアリールからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい５または６員環を形成する；
Ｒ７は−Ｑ４−Ｔ４であり、ここで、Ｑ４は、結合、Ｃ１〜Ｃ４アルキルリンカー、またはＣ２〜Ｃ４アルケニルリンカーであり、各リンカーは、ハロ、シアノ、ヒドロキシルまたはＣ１〜Ｃ６アルコキシで場合によって置換されていてもよく、そしてＴ４は、Ｈ、ハロ、シアノ、ＮＲｆＲｇ、−ＯＲｆ、−Ｃ（Ｏ）Ｒｆ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲｆ、−Ｃ（Ｏ）ＮＲｆＲｇ、−Ｃ（Ｏ）ＮＲｆＯＲｇ、−ＮＲｆＣ（Ｏ）Ｒｇ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒｆ、またはＲＳ４であり、ここで、ＲｆおよびＲｇの各々は独立してＨまたはＲＳ５であり、ＲＳ４およびＲＳ５の各々は独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであり、そしてＲＳ４およびＲＳ５の各々は１以上の−Ｑ５−Ｔ５で場合によって置換されていてもよく、ここで、Ｑ５は結合、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）ＮＲｋ、ＮＲｋＣ（Ｏ）、Ｓ（Ｏ）２、またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、ＲｋはＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルであり、そしてＴ５は、Ｈ、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、５もしくは６員ヘテロアリール、またはＳ（Ｏ）ｑＲｑであり、ここで、ｑは０、１、または２であり、ＲｑはＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであり、そしてＴ５は、Ｔ５がＨ、ハロ、ヒドロキシル、またはシアノである場合を除いて、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、および５もしくは６員ヘテロアリールからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい；あるいは−Ｑ５−Ｔ５はオキソである；そして
Ｒ８は、Ｈ、ハロ、ヒドロキシル、ＣＯＯＨ、シアノ、ＲＳ６、ＯＲＳ６、またはＣＯＯＲＳ６であり、ここで、ＲＳ６は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、またはジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノであり、そしてＲＳ６は、ハロ、ヒドロキシル、ＣＯＯＨ、Ｃ（Ｏ）Ｏ−Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、およびジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい；またはＲ７およびＲ８は、それらが結合しているＮ原子と一緒になって、０〜２個のさらなるヘテロ原子を有する４〜１１員ヘテロシクロアルキル環を形成する、そしてＲ７およびＲ８によって形成される４〜１１員ヘテロシクロアルキル環は、１以上の−Ｑ６−Ｔ６で場合によって置換されていてもよく、ここで、Ｑ６は、結合、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）ＮＲｍ、ＮＲｍＣ（Ｏ）、Ｓ（Ｏ）２、またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、Ｒｍは、ＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルであり、そしてＴ６は、Ｈ、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、５もしくは６員ヘテロアリール、またはＳ（Ｏ）ｐＲｐであり、ここで、ｐは、０、１、または２であり、ＲｐはＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであり、そしてＴ６がＨ、ハロ、ヒドロキシル、またはシアノである場合を除いて、Ｔ６は、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、および５もしくは６員ヘテロアリールからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい；あるいは−Ｑ６−Ｔ６はオキソである。
例えば、Ｒ６はＣ６〜Ｃ１０アリールまたは５もしくは６員ヘテロアリールであり、その各々は場合によって独立して１以上の−Ｑ２−Ｔ２で置換されていてもよく、ここで、Ｑ２は結合またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、そしてＴ２は、Ｈ、ハロ、シアノ、−ＯＲａ、−ＮＲａＲｂ、−（ＮＲａＲｂＲｃ）＋Ａ−、−Ｃ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲｂＣ（Ｏ）Ｒａ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒａ、またはＲＳ２であり、ここで、ＲａおよびＲｂの各々は独立してＨまたはＲＳ３であり、ＲＳ２およびＲＳ３の各々は独立してＣ１〜Ｃ６アルキルである、またはＲａおよびＲｂはそれらが結合しているＮ原子と一緒になって、０もしくは１個のさらなるヘテロ原子を有する４〜７員ヘテロシクロアルキル環を形成し、そしてＲＳ２、ＲＳ３、ならびにＲａおよびＲｂによって形成される４〜７員ヘテロシクロアルキル環の各々は場合によって独立して１以上の−Ｑ３−Ｔ３で置換されていてもよく、ここで、Ｑ３は結合またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、Ｔ３は、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、４〜７員ヘテロシクロアルキル、ＯＲｄ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒｄ、および−ＮＲｄＲｅからなる群から選択され、ＲｄおよびＲｅの各々は独立してＨもしくはＣ１〜Ｃ６アルキルである、または−Ｑ３−Ｔ３はオキソである；あるいは任意の２つの隣接する−Ｑ２−Ｔ２は、それらが結合している原子と一緒になって、Ｎ、ＯおよびＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を場合によって含んでもよい５または６員環を形成する。
例えば、本発明の化合物は、式（ＶＩ）：


を有するもの、またはその薬剤的に許容される塩であり、式中、Ｑ２は結合またはメチルリンカーであり、Ｔ２は、Ｈ、ハロ、−ＯＲａ、−ＮＲａＲｂ、−（ＮＲａＲｂＲｃ）＋Ａ−、または−Ｓ（Ｏ）２ＮＲａＲｂであり、Ｒ７は、ピペリジニル、テトラヒドロピラン、シクロペンチル、またはシクロヘキシルであり、それぞれは１つの−Ｑ５−Ｔ５で場合によって置換されていてもよく、そしてＲ８はエチルである。
本発明の化合物は、次式（ＶＩａ）：


を有し得、式中、
ＲａおよびＲｂの各々は独立してＨまたはＲＳ３であり、ＲＳ３はＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであるか、あるいはＲａおよびＲｂは、それらが結合しているＮ原子と一緒になって、０または１個のさらなるヘテロ原子を有する４〜１２員ヘテロシクロアルキル環を形成し、そしてＲＳ３ならびにＲａおよびＲｂによって形成される４〜１２員ヘテロシクロアルキル環の各々は１以上の−Ｑ３−Ｔ３で場合によって置換されていてもよく、この場合、Ｑ３は結合またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、それぞれはハロ、シアノ、ヒドロキシルもしくはＣ１〜Ｃ６アルコキシで場合によって置換されていてもよく、そしてＴ３は、ハロ、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜１２員ヘテロシクロアルキル、５もしくは６員ヘテロアリール、ＯＲｄ、ＣＯＯＲｄ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒｄ、−ＮＲｄＲｅ、および−Ｃ（Ｏ）ＮＲｄＲｅからなる群から選択され、ＲｄおよびＲｅの各々は独立してＨもしくはＣ１〜Ｃ６アルキルであるか、または−Ｑ３−Ｔ３はオキソである；
Ｒ７は−Ｑ４−Ｔ４であり、ここで、Ｑ４は、結合、Ｃ１〜Ｃ４アルキルリンカー、またはＣ２〜Ｃ４アルケニルリンカーであり、各リンカーは、ハロ、シアノ、ヒドロキシルまたはＣ１〜Ｃ６アルコキシで場合によって置換されていてもよく、そしてＴ４は、Ｈ、ハロ、シアノ、ＮＲｆＲｇ、−ＯＲｆ、−Ｃ（Ｏ）Ｒｆ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲｆ、−Ｃ（Ｏ）ＮＲｆＲｇ、−Ｃ（Ｏ）ＮＲｆＯＲｇ、−ＮＲｆＣ（Ｏ）Ｒｇ、−Ｓ（Ｏ）２Ｒｆ、またはＲＳ４であり、ここで、ＲｆおよびＲｇの各々は独立してＨまたはＲＳ５であり、ＲＳ４およびＲＳ５の各々は独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであり、そしてＲＳ４およびＲＳ５の各々は１以上の−Ｑ５−Ｔ５で場合によって置換されていてもよく、ここで、Ｑ５は結合、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）ＮＲｋ、ＮＲｋＣ（Ｏ）、Ｓ（Ｏ）２、またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、ＲｋはＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルであり、そしてＴ５は、Ｈ、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、５もしくは６員ヘテロアリール、またはＳ（Ｏ）ｑＲｑであり、ここで、ｑは０、１、または２であり、ＲｑはＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであり、そしてＴ５がＨ、ハロ、ヒドロキシル、またはシアノである場合を除いて、Ｔ５は、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、および５もしくは６員ヘテロアリールからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい；あるいは−Ｑ５−Ｔ５はオキソである；ただし、Ｒ７はＨでないとする；そして
Ｒ８は、Ｈ、ハロ、ヒドロキシル、ＣＯＯＨ、シアノ、ＲＳ６、ＯＲＳ６、またはＣＯＯＲＳ６であり、ここで、ＲＳ６はＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、またはジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノであり、そしてＲＳ６は、ハロ、ヒドロキシル、ＣＯＯＨ、Ｃ（Ｏ）Ｏ−Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、およびジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい；またはＲ７およびＲ８は、それらが結合しているＮ原子と一緒になって、４〜１１員ヘテロシクロアルキル環を形成し、これは０〜２個のさらなるヘテロ原子を有し、１以上の−Ｑ６−Ｔ６で場合によって置換されていてもよく、ここで、Ｑ６は、結合、Ｃ（Ｏ）、Ｃ（Ｏ）ＮＲｍ、ＮＲｍＣ（Ｏ）、Ｓ（Ｏ）２、またはＣ１〜Ｃ３アルキルリンカーであり、ＲｍはＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルであり、そしてＴ６はＨ、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、５もしくは６員ヘテロアリール、またはＳ（Ｏ）ｐＲｐであり、ここで、ｐは０、１、または２であり、ＲｐはＣ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、または５もしくは６員ヘテロアリールであり、そしてＴ６がＨ、ハロ、ヒドロキシル、またはシアノである場合を除いて、Ｔ６は、ハロ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ヒドロキシル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、ジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、４〜７員ヘテロシクロアルキル、および５もしくは６員ヘテロアリールからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい；または−Ｑ６−Ｔ６はオキソである。
例えば、ＲａおよびＲｂはそれらが結合しているＮ原子と一緒になって、そのＮ原子に対して０または１個のさらなるヘテロ原子を有する４〜７員ヘテロシクロアルキル環を形成し、この環は、１以上の−Ｑ３−Ｔ３で場合によって置換されていてもよく、ここで、ヘテロシクロアルキルは、アゼチジニル、ピロリジニル、イミダゾリジニル、ピラゾリジニル、オキサゾリジニル、イソキサゾリジニル、トリアゾリジニル、ピペリジニル、１，２，３，６−テトラヒドロピリジニル、ピペラジニル、またはモルホリニルである。
例えば、Ｒ７は、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキルまたは４〜７員ヘテロシクロアルキルであり、それぞれ１以上の−Ｑ５−Ｔ５で場合によって置換されていてもよい。
例えば、Ｒ７は、ピペリジニル、テトラヒドロピラン、テトラヒドロ−２Ｈ−チオピラニル、シクロペンチル、シクロヘキシル、ピロリジニル、またはシクロヘプチルであり、それぞれ場合によって１以上の−Ｑ５−Ｔ５で置換されていてもよい。
例えば、Ｒ８は、ＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルであり、これは、ハロ、ヒドロキシル、ＣＯＯＨ、Ｃ（Ｏ）Ｏ−Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシル、アミノ、モノ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノ、およびジ−Ｃ１〜Ｃ６アルキルアミノからなる群から選択される１以上の置換基で場合によって置換されていてもよい。
いくつかの実施形態では、本明細書中で提示される任意の方法で使用され得る化合物は：


その立体異性体またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
いくつかの実施形態では、本明細書中で提示される任意の方法で使用され得る化合物は：


その立体異性体またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
いくつかの実施形態では、本明細書中で提示される任意の方法で使用され得る化合物は：


その立体異性体またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
いくつかの実施形態では、本発明の方法で使用するために好適な化合物としては式（ＶＩＩ）：


（式中、
Ｖ１はＮまたはＣＲ７であり、
Ｖ２はＮまたはＣＲ２であり、ただし、Ｖ１がＮである場合、Ｖ２はＮであるとし、
ＸおよびＺは、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、非置換もしくは置換（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、非置換もしくは置換（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、非置換もしくは置換（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ６〜Ｃ１０）ビシクロアルキル、非置換もしくは置換ヘテロシクロアルキル、非置換もしくは置換ヘテロシクロアルキル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換アリール、非置換もしくは置換アリール−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換ヘテロアリール、非置換もしくは置換ヘテロアリール−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、ハロ、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂからなる群から独立して選択される；
Ｙは、Ｈまたはハロである；
Ｒ１は、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、非置換もしくは置換（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、非置換もしくは置換（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、非置換もしくは置換（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換（Ｃ６〜Ｃ１０）ビシクロアルキル、非置換もしくは置換ヘテロシクロアルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換ヘテロシクロアルキル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、非置換もしくは置換アリール、非置換もしくは置換アリール−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、非置換もしくは置換ヘテロアリール、非置換もしくは置換ヘテロアリール−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは−（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂである；
Ｒ２は、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、トリフルオロメチル、アルコキシ、またはハロであり、ここで、前記（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルは、アミノおよび（Ｃ１〜Ｃ３）アルキルアミノから選択される１〜２個の基で場合によって置換されていてもよい；
Ｒ７は、水素、（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、またはアルコキシである；
Ｒ３は、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、シアノ、トリフルオロメチル、−ＮＲａＲｂ、またはハロである；
Ｒ６は、水素、ハロ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、非置換もしくは置換（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、非置換もしくは置換（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、非置換もしくは置換（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、非置換もしくは置換（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ６〜Ｃ１０）ビシクロアルキル、非置換もしくは置換ヘテロシクロアルキル、非置換もしくは置換ヘテロシクロアルキル−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、非置換もしくは置換アリール、非置換もしくは置換アリール−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、非置換もしくは置換ヘテロアリール、非置換もしくは置換ヘテロアリール−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂからなる群から選択される；
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール基は、−Ｏ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル（Ｒｃ）１〜２、−Ｓ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル（Ｒｃ）１−２、−（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル（Ｒｃ）１〜２、−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル−ヘテロシクロアルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル−ヘテロシクロアルキル、ハロ、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ，−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、およびヘテロアリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルからなる群から独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；
ここで、前記アリール、ヘテロアリール、アリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、またはヘテロアリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルの任意のアリールまたはヘテロアリール部分は、ハロ、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ，−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂからなる群から独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；
ＲａおよびＲｂはそれぞれ独立して、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ６〜Ｃ１０）ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、前記（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリール基は、ハロ、ヒドロキシル、（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）アミノ、−ＣＯ２Ｈ、−ＣＯ２（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＣＯＮＨ２，−ＣＯＮＨ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＣＯＮ（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）、−ＳＯ２（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＳＯ２ＮＨ２，−ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、およびＳＯ２Ｎ（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）から独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；
またはＲａおよびＲｂはそれらが結合している窒素と一緒になって、酸素、窒素、およびイオウから選択されるさらなるヘテロ原子を場合によって含んでいてもよい５〜８員飽和または不飽和環を表し、ここで前記環は、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、（Ｃ１〜Ｃ４）ハロアルキル、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）アミノ、ヒドロキシル、オキソ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ、および（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよく、ここで前記環は、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環と場合によって縮合していてもよい；
あるいはＲａおよびＲｂは、それらが結合している窒素と一緒になって、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環を場合によって縮合していてもよい６〜１０員架橋２環式環系を表す；
各Ｒｃは独立して、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＲｂ、または−ＣＯ２Ｒａである）の化合物またはその塩が挙げられる。
式（Ｉ）の一般構造に含まれる化合物のサブグループは次のように表される：
式（ＶＩＩ）のサブグループＡ
ＸおよびＺは、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、−ＮＲａＲｂ、および−ＯＲａからなる群から選択される；
ＹはＨまたはＦである；
Ｒ１は、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、およびヘテロアリールからなる群から選択される；
Ｒ２は、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、トリフルオロメチル、アルコキシ、またはハロであり、ここで、前記（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルは、アミノおよび（Ｃ１〜Ｃ３）アルキルアミノから選択される１〜２個の基で場合によって置換されていてもよい；
Ｒ７は、水素、（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、またはアルコキシである；
Ｒ３は、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、シアノ、トリフルオロメチル、−ＮＲａＲｂ、およびハロからなる群から選択される；
Ｒ６は、水素、ハロ、シアノ、トリフルオロメチル、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル；，アリール、ヘテロアリール、アシルアミノ；（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、アリールアルキニル、ヘテロアリールアルキニル；−ＳＯ２Ｒａ；−ＳＯ２ＮＲａＲｂおよび−ＮＲａＳＯ２Ｒｂからなる群から選択される；
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、アリールアルキニル、ヘテロアリールアルキニル基は、−Ｏ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル（Ｒｃ）１〜２、−Ｓ（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル（Ｒｃ）１〜２、−（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル（Ｒｃ）１〜２、−（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル−ヘテロシクロアルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル−ヘテロシクロアルキル、ハロ、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、およびヘテロアリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；
ＲａおよびＲｂはそれぞれ独立して、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ６〜Ｃ１０）ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、前記（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリール基は、ハロ、ヒドロキシル、（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）アミノ、−ＣＯ２Ｈ、−ＣＯ２（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＣＯＮＨ２、−ＣＯＮＨ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＣＯＮ（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）、−ＳＯ２（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＳＯ２ＮＨ２，−ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、および−ＳＯ２Ｎ（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）から独立して選択される１，２または３個の基によって場合によって置換されていてもよい；
またはＲａおよびＲｂはそれらが結合している窒素と一緒になって、酸素、窒素、およびイオウから選択されるさらなるヘテロ原子を場合によって含んでいてもよい５〜８員飽和または不飽和環を表し、ここで前記環は、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、（Ｃ１〜Ｃ４）ハロアルキル、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）アミノ、ヒドロキシル、オキソ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ、および（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよく、ここで前記環は、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環と場合によって縮合していてもよい；
あるいはＲａおよびＲｂは、それらが結合している窒素と一緒になって、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環と場合によって縮合していてもよい６〜１０員架橋２環式環系を表す。この特定のサブグループＡにおけるアリールまたはヘテロアリール基は、フラン、チオフェン、ピロール、オキサゾール、チアゾール、イミダゾール、ピラゾール、オキサジアゾール、チアジアゾール、トリアゾール、テトラゾール、ベンゾフラン、ベンゾチオフェン、ベンゾオキサゾール、ベンゾチアゾール、フェニル、ピリジン、ピリダジン、ピリミジン、ピラジン、トリアジン、テトラジン、キノリン、シンノリン、キナゾリン、キノキサリン、および ナフチリジンまたは次のような別のアリールもしくはヘテロアリール基：からなる群から独立して選択される。


（（１）において、
ＡはＯ、ＮＨ、もしくはＳであり；ＢはＣＨもしくはＮであり、Ｃは水素もしくはＣ１〜Ｃ８アルキルである）；または


（（２）において、
ＤはＮ、または水素もしくはＣ１〜Ｃ８アルキルで場合によって置換されていてもよいＣである）；あるいは


（（３）において、
ＥはＮＨまたはＣＨ２であり；ＦはＯまたはＣＯであり；そしてＧはＮＨまたはＣＨ２である）；あるいは


（（４）において、
ＪはＯ、ＳまたはＣＯである）；あるいは


（（５）において、
ＱはＣＨまたはＮである；
ＭはＣＨまたはＮである；そして
Ｌ／（５）は、水素、ハロ、アミノ、シアノ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ，−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、または−ＯＲａであり、
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル基は、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよく；ここで、ＲａおよびＲｂは前記定義のとおりである）；または


（（６）において、
Ｌ／（６）はＮＨもしくはＣＨ２である）；または


（７において、
Ｍ／（７）は、水素、ハロ、アミノ、シアノ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ，−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、または−ＯＲａであり、
ここで任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、またはヘテロシクロアルキル基は、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；、ここで、ＲａおよびＲｂは前記定義のとおりである）；または


（（８）において、
Ｐは、ＣＨ２、ＮＨ、Ｏ、もしくはＳであり；Ｑ／（８）はＣＨもしくはＮであり；ｎは０〜２である）；または


（（９）において、
Ｓ／（９）およびＴ／（９）はＣであるか、またはＳ／（９）はＣであり、Ｔ／（９）はＮであるか、またはＳ／（９）はＮであり、Ｔ／（９）はＣである；
Ｒは、水素、アミノ、メチル、トリフルオロメチル、またはハロである；
Ｕは、水素、ハロ、アミノ、シアノ、ニトロ、トリフルオロメチル、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ，−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＯＲａ、または４−（１Ｈ−ピラゾール−４−イル）であり、
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたは（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル基は、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ，−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂから独立して選択される１、２もしくは３個の基で場合によって置換されていてもよい；ここで、ＲａおよびＲｂは前記定義のとおりである）。
式（ＶＩＩ）のサブグループＢ
ＸおよびＺは、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、−ＮＲａＲｂ、および−ＯＲａからなる群から独立して選択される；
ＹはＨである；
Ｒ１は、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである；
Ｒ２は、水素、（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、またはハロであり、ここで、前記（Ｃ１〜Ｃ３）アルキルは、アミノおよび（Ｃ１〜Ｃ３）アルキルアミノから選択される１〜２個の基で場合によって置換されていてもよい；
Ｒ７は、水素、（Ｃ１〜Ｃ３）アルキル、またはアルコキシである；
Ｒ３は、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキルまたはハロである；
Ｒ６は、水素、ハロ、シアノ、トリフルオロメチル、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アシルアミノ；（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、アリールアルキニル、ヘテロアリールアルキニル、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、または−ＮＲａＳＯ２Ｒｂである；
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、アリールアルキニル、またはヘテロアリールアルキニル基は、ハロ、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、ヘテロシクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、およびヘテロアリール（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；
ＲａおよびＲｂはそれぞれ独立して、水素、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ６〜Ｃ１０）ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、ここで、前記（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルケニル、（Ｃ２〜Ｃ８）アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ビシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリール基は、ハロ、ヒドロキシル、（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）アミノ、−ＣＯ２Ｈ、−ＣＯ２（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＣＯＮＨ２，−ＣＯＮＨ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＣＯＮ（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）、−ＳＯ２（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、−ＳＯ２ＮＨ２、−ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、および−ＳＯ２Ｎ（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）から独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；
またはＲａおよびＲｂはそれらが結合している窒素と一緒になって、酸素、窒素、およびイオウから選択されるさらなるヘテロ原子を場合によって含んでいてもよい５〜８員飽和または不飽和環を表し、ここで前記環は、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル、（Ｃ１〜Ｃ４）ハロアルキル、アミノ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルアミノ、（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）（（Ｃ１〜Ｃ４）アルキル）アミノ、ヒドロキシル、オキソ、（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ、および（Ｃ１〜Ｃ４）アルコキシ（Ｃ１〜Ｃ４）アルキルから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよく、ここで前記環は、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環と場合によって縮合していてもよい；
あるいはＲａおよびＲｂは、それらが結合している窒素と一緒になって、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環と場合によって縮合していてもよい６〜１０員架橋２環式環系を表す。この定義におけるアリールおよびヘテロアリールは、フラン、チオフェン、ピロール、オキサゾール、チアゾール、イミダゾール、ピラゾール、オキサジアゾール、チアジアゾール、トリアゾール、テトラゾール、ベンゾフラン、ベンゾチオフェン、ベンゾオキサゾール、ベンゾチアゾール、フェニル、ピリジン、ピリダジン、ピリミジン、ピラジン、トリアジン、テトラジン、キノリン、シンノリン、キナゾリン、キノキサリン、およびナフチリジンまたは次のような別のアリールもしくはヘテロアリール基の化合物からなる群から選択される：


（（１）において、
Ａは、Ｏ、ＮＨ、またはＳであり；ＢはＣＨまたはＮであり、Ｃは水素またはＣ１〜Ｃ８アルキルである）；あるいは


（（２）において、
ＤはＮまたは水素もしくはＣ１〜Ｃ８アルキルで場合によって置換されていてもよいＣである）；あるいは


（（３）において、
ＥはＮＨまたはＣＨ２であり；ＦはＯまたはＣＯであり；そしてＧはＮＨまたはＣＨ２である）；あるいは


（（４）において、
ＪはＯ、ＳまたはＣＯである）；あるいは


（（５）において、
ＱはＣＨまたはＮである；
ＭはＣＨまたはＮである；そして
Ｌ／（５）は、水素、ハロ、アミノ、シアノ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ，−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、または−ＯＲａであり、
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、基は、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよく、
ここで、ＲａおよびＲｂは前記定義のとおりである）；または


（（６）において、
Ｌ／（６）はＮＨもしくはＣＨ２である）；または


（（７）において、
Ｍ／（７）は、水素、ハロ、アミノ、シアノ、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＣＯＮＲａＮＲａＲｂ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ，−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、または−ＯＲａであり、
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル基は、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、− ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＲａ、−ＳＯＲａ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよい；ここで、ＲａおよびＲｂは前記定義のとおりである）；または


（（８）において、 Ｐは、ＣＨ２、ＮＨ、Ｏ、もしくはＳであり；Ｑ／（８）はＣＨもしくはＮであり；ｎは０〜２である）；または


（（９）において、
Ｓ／（９）およびＴ／（９）はＣであるか、またはＳ／（９）はＣであり、Ｔ／（９）はＮであるか、またはＳ／（９）はＮであり、Ｔ／（９）はＣである；
Ｒは、水素、アミノ、メチル、トリフルオロメチル、ハロである；
Ｕは、水素、ハロ、アミノ、シアノ、ニトロ、トリフルオロメチル、（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ、−ＣＯＮＲａＲｂ、−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ，−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＲｂ、−ＮＲａＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＯＲａ、または４−（１Ｈ−ピラゾール−４−イル）であり、
ここで、任意の（Ｃ１〜Ｃ８）アルキル、または（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル基は、（Ｃ１〜Ｃ６）アルキル、（Ｃ３〜Ｃ８）シクロアルキル、（Ｃ５〜Ｃ８）シクロアルケニル、（Ｃ１〜Ｃ６）ハロアルキル、シアノ、−ＣＯＲａ、−ＣＯ２Ｒａ，−ＣＯＮＲａＲｂ，−ＳＯＲａ，−ＳＯ２Ｒａ、−ＳＯ２ＮＲａＲｂ、ニトロ、−ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）Ｒｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂ、−ＮＲａＣ（Ｏ）ＯＲａ、−ＮＲａＳＯ２Ｒｂ、−ＮＲａＳＯ２ＮＲａＲｂ、−ＯＲａ、−ＯＣ（Ｏ）Ｒａ、および−ＯＣ（Ｏ）ＮＲａＲｂから独立して選択される１、２または３個の基で場合によって置換されていてもよく、ここで、ＲａおよびＲｂは前記定義のとおりである）。
いくつかの実施形態では、ＥＺＨ２阻害剤は：


その立体異性体またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
いくつかの実施形態では、ＥＺＨ２阻害剤は


その立体異性体またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物である。
本明細書中で記載される化合物は、当該技術分野で公知の任意の方法にしたがって合成できる。例えば、式（ＶＩＩ）を有する化合物は、そのそれぞれが参照により全体として組み込まれる、国際公開第２０１１／１４０３２５号；同第２０１１／１４０３２４号；および同第２０１２／００５８０５号で記載される方法にしたがって合成できる。
本明細書中で用いられる場合、「アルキル」、「Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５もしくはＣ６アルキル」または「Ｃ１〜Ｃ６アルキル」は、Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５もしくはＣ６直鎖（線状）飽和脂肪族炭化水素基およびＣ３、Ｃ４、Ｃ５もしくはＣ６分枝飽和脂肪族炭化水素基を包含することが意図される。例えば、Ｃ１〜Ｃ６アルキルは、Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５およびＣ６アルキル基を包含することが意図される。アルキルの例としては、１〜６個の炭素原子を有する部分、例えば限定されるものではないが、メチル、エチル、ｎ−プロピル、ｉ−プロピル、ｎ−ブチル、ｓ−ブチル、ｔ−ブチル、ｎ−ペンチル、ｓ−ペンチルまたはｎ−ヘキシルが挙げられる。
ある実施形態において、直鎖または分枝アルキルは、６個以下の炭素原子（たとえば、直鎖についてはＣ１〜Ｃ６、分枝鎖についてはＣ３〜Ｃ６）を有し，別の実施形態では、直鎖または分枝アルキルは４個以下の炭素原子を有する。
本明細書中で用いられる場合、「シクロアルキル」という語は、３〜３０個の炭素原子を有する（たとえば、Ｃ３〜Ｃ１０）飽和または不飽和非芳香族炭化水素単環または多環（たとえば、縮合、架橋、またはスピロ環）系を指す。シクロアルキルの例としては、限定されるものではないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、シクロヘプテニル、およびアダマンチルが挙げられる。「ヘテロシクロアルキル」という語は、特別の定めのない限り、１以上のヘテロ原子（例えばＯ、Ｎ、Ｓ、またはＳｅ）を有する飽和または不飽和非芳香族３〜８員単環、７〜１２員２環（縮合、架橋、もしくはスピロ環）、または１１〜１４員３環系（縮合、架橋、もしくはスピロ環）を指す。ヘテロシクロアルキル基の例としては、限定されるものではないが、ピペリジニル、ピペラジニル、ピロリジニル、ジオキサニル、テトラヒドロフラニル、イソインドリニル、インドリニル、イミダゾリジニル、ピラゾリジニル、オキサゾリジニル、イソキサゾリジニル、トリアゾリジニル、テトラヒドロフラニル、オキシラニル、アゼチジニル、オキセタニル、チエタニル、１，２，３，６−テトラヒドロピリジニル、テトラヒドロピラニル、ジヒドロピラニル、ピラニル、モルホリニル、１，４−ジアゼパニル、１，４−オキサゼパニル、２−オキサ−５−アザビシクロ［２．２．１］ヘプタニル、２，５−ジアザビシクロ［２．２．１］ヘプタニル、２−オキサ−６−アザスピロ［３．３］ヘプタニル、２，６−ジアザスピロ［３．３］ヘプタニル、１，４−ジオキサ−８−アザスピロ［４．５］デカニルなどが挙げられる。
「場合によって置換されていてもよいアルキル」という語は、非置換アルキルまたは炭化水素骨格の１以上の炭素上の１以上の水素原子を置換する指定の置換基を有するアルキルを指す。そのような置換基としては、例えば、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナート、ホスフィナート、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分を挙げることができる。
「アリールアルキル」または「アラルキル」部分は、アリールで置換されたアルキル（例えば、フェニルメチル（ベンジル））である。「アルキルアリール」部分は、アルキルで置換されたアリール（たとえば、メチルフェニル）である。
本明細書中で用いられる場合、「アルキルリンカー」は、Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５またはＣ６直鎖（線状）飽和二価脂肪族炭化水素基およびＣ３、Ｃ４、Ｃ５またはＣ６分枝飽和脂肪族炭化水素基を包含することが意図される。例えば、Ｃ１〜Ｃ６アルキルリンカーは、Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５およびＣ６アルキルリンカー基を包含することが意図される。アルキルリンカーの例としては、１〜６個の炭素原子を有する部分、例えば限定されるものではないが、メチル（−ＣＨ２−）、エチル（−ＣＨ２ＣＨ２−）、ｎ−プロピル（−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−）、ｉ−プロピル（−ＣＨＣＨ３ＣＨ２−）、ｎ−ブチル（−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−）、ｓ−ブチル（−ＣＨＣＨ３ＣＨ２ＣＨ２−）、ｉ−ブチル（−Ｃ（ＣＨ３）２ＣＨ２−）、ｎ−ペンチル（−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−）、ｓ−ペンチル（−ＣＨＣＨ３ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−）またはｎ−ヘキシル（−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−）が挙げられる。
「アルケニル」は、少なくとも１つの二重結合を含む以外は上述のアルキルと長さおよび可能な置換が類似している不飽和脂肪族基を包含する。例えば、「アルケニル」という語は、直鎖アルケニル基（たとえば、エテニル、プロペニル、ブテニル、ペンテニル、ヘキセニル、ヘプテニル、オクテニル、ノネニル、デセニル）、および分枝アルケニル基を包含する。ある実施形態では、直鎖または分枝アルケニル基はその骨格中に６個以下の炭素原子を有する（たとえば、直鎖についてはＣ２〜Ｃ６、分枝鎖についてはＣ３〜Ｃ６）。「Ｃ２〜Ｃ６」という語は、２〜６個の炭素原子を含むアルケニル基を包含する。「Ｃ３〜Ｃ６」という語は、３〜６個の炭素原子を含むアルケニル基を包含する。
「場合によって置換されていてもよいアルケニル」という語は、非置換アルケニルまたは指定の置換基が１以上の炭化水素主鎖炭素原子上の１以上の水素原子と置換している置換アルケニルを指す。そのような置換基としては、例えば、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナート、ホスフィナート、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分を挙げることができる。
「アルキニル」は、少なくとも１つの三重結合を含む以外は上述のアルキルと長さおよび可能な置換が類似している不飽和脂肪族基を包含する。例えば、「アルキニル」は、直鎖アルキニル基（たとえば、エチニル、プロピニル、ブチニル、ペンチニル、ヘキシニル、へプチニル、オクチニル、ノニニル、デシニル）、および分枝アルキニル基を包含する。ある実施形態では、直鎖または分枝アルキニル基はその骨格中に６個以下の炭素原子を有する（たとえば、直鎖についてはＣ２〜Ｃ６、分枝鎖についてはＣ３〜Ｃ６）。「Ｃ２〜Ｃ６」という語は、２〜６個の炭素原子を含むアルキニル基を包含する。「Ｃ３〜Ｃ６」という語は、３〜６個の炭素原子を含むアルキニル基を包含する。
「場合によって置換されていてもよいアルキニル」という語は、非置換アルキニルまたは１以上の炭化水素主鎖炭素原子上の１以上の水素原子を置換する指定の置換基を有するアルキニルを指す。そのような置換基としては、例えば、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナート、ホスフィナート、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分を挙げることができる。
他の場合によって置換されていてもよい部分（例えば場合によって置換されていてもよいシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール）には、非置換部分および１以上の指定の置換基を有する部分の両方が含まれる。例えば、置換ヘテロシクロアルキルには、１以上のアルキル基で置換されたもの、例えば２，２，６，６−テトラメチル−ピペリジニルおよび２，２，６，６−テトラメチル−１，２，３，６−テトラヒドロピリジニルが含まれる。
「アリール」は、少なくとも１つの芳香環を有する「共役」すなわち多環系を含む芳香族性を有する基を包含し、その環構造中にヘテロ原子を含まない。例としては、フェニル、ベンジル、１，２，３，４−テトラヒドロナフタレニルなどが挙げられる。
「ヘテロアリール」基は、１〜４個のヘテロ原子を環構造中に有する以外は前記定義のとおりのアリール基であり、「アリールヘテロ環」または「ヘテロ芳香族」と呼ばれる場合もある。本明細書中で用いられる場合、「ヘテロアリール」との用語は、炭素原子と１以上のヘテロ原子、例えば窒素、酸素およびイオウからなる群から独立して選択される１もしくは１〜２もしくは１〜３もしくは１〜４もしくは１〜５もしくは１〜６個のヘテロ原子、または例えば１、２、３、４、５、もしくは６個のヘテロ原子とからなる、安定な５、６、もしくは７員単環、または７、８、９、１０、１１、もしくは１２員２環式芳香族ヘテロ環を包含することが意図される。窒素原子は置換または非置換であってよい（すなわち、ＮまたはＮＲ、ここで、ＲはＨまたは定義されるような他の置換基である）。窒素およびイオウヘテロ原子は場合によって酸化されていてもよい（すなわち、Ｎ→ＯおよびＳ（Ｏ）ｐ、ここで、ｐ＝１または２）。芳香族ヘテロ環中のＳおよびＯ原子の総数は１以下であることに留意すべきである。
ヘテロアリール基の例としては、ピロール、フラン、チオフェン、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、トリアゾール、テトラゾール、ピラゾール、オキサゾール、イソオキサゾール、ピリジン、ピラジン、ピリダジン、ピリミジンなどが挙げられる。
さらに、「アリール」および「ヘテロアリール」という語は、多環式アリールおよびヘテロアリール基、例えば、３環式、２環式、例えば、ナフタレン、ベンゾオキサゾール、ベンゾジオキサゾール、ベンゾチアゾール、ベンゾイミダゾール、ベンゾチオフェン、メチレンジオキシフェニル、キノリン、イソキノリン、ナフチリジン、インドール、ベンゾフラン、プリン、ベンゾフラン、デアザプリン、インドリジンを包含する。
多環式芳香環の場合、環のうちの１つだけが芳香族である必要がある（たとえば、２，３−ジヒドロインドール）が、環のすべてが芳香族であってもよい（例えば、キノリン）。第２の環がさらに縮合または架橋していてもよい。
シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリール環は、１以上の環の位置（たとえば、環を形成する炭素またはＮなどのヘテロ原子）にて、上述のような置換基、例えば、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルコキシ、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アルキルアミノカルボニル、アラルキルアミノカルボニル、アルケニルアミノカルボニル、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アラルキルカルボニル、アルケニルカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、ホスフェート、ホスホナート、ホスフィナート、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分で置換されている可能性がある。アリールおよびヘテロアリール基はまた、脂環式またはヘテロ環式環と縮合または架橋され得、これらは多環系（たとえば、テトラリン、メチレンジオキシフェニル）を形成するような芳香族でない。
本明細書中で用いられる場合、「炭素環」または「炭素環」は、指定された数の炭素を有する任意の安定な単環、２環式または３環式環を包含することが意図され、それらのいずれも飽和、不飽和、または芳香族であり得る。炭素環はシクロアルキルおよびアリールを包含する。例えば、Ｃ３〜Ｃ１４炭素環は、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４個の炭素原子を有する単環、２環式または３環式環を包含することが意図される。炭素環の例としては、限定されるものではないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロブテニル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘプテニル、シクロヘプチル、シクロヘプテニル、アダマンチル、シクロオクチル、シクロオクテニル、シクロオクタジエニル、フルオレニル、フェニル、ナフチル、インダニル、アダマンチル およびテトラヒドロナフチルが挙げられる。架橋環も、例えば、［３．３．０］ビシクロオクタン、［４．３．０］ビシクロノナン、［４．４．０］ビシクロデカンおよび［２．２．２］ビシクロオクタンをはじめとする炭素環の定義に含まれる。架橋環は、１個以上の炭素原子が２個の隣接しない炭素原子を連結する場合に生じる。１つの実施形態において、架橋環は１または２個の炭素原子である。ブリッジは常に単環を３環式環に変えることに注意する。環が架橋されている場合、環について言及される置換基はブリッジ上にも存在し得る。縮合（たとえば、ナフチル、テトラヒドロナフチル）およびスピロ環も含まれる。
本明細書中で用いられる場合、「ヘテロ環」または「ヘテロ環式基」は、少なくとも１つの環ヘテロ原子（たとえば、Ｎ、ＯまたはＳ）を含む任意の環構造（飽和、不飽和、または芳香族）を含む。ヘテロ環には、ヘテロシクロアルキルおよびヘテロアリールが含まれる。ヘテロ環の例としては、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジン、オキセタン、ピラン、テトラヒドロピラン、アゼチジン、およびテトラヒドロフランが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
ヘテロ環式基の例としては、限定されるものではないが、アクリジニル、アゾシニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾチオフラニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾオキサゾリニル、ベンゾチアゾリル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾテトラゾリル、ベンゾイソオキサゾリル、ベンゾイソチアゾリル、ベンゾイミダゾリニル、カルバゾリル、４ａＨ−カルバゾリル、カルボリニル、クロマニル、クロメニル、シンノリニル、デカヒドロキノリニル、２Ｈ，６Ｈ−１，５，２−ジチアジニル、ジヒドロフロ［２，３−ｂ］テトラヒドロフラン、フラニル、フラザニル、イミダゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリル、１Ｈ−インダゾリル、インドレニル、インドリニル、インドリジニル、インドリル、３Ｈ−インドリル、イサチノイル、イソベンゾフラニル、イソクロマニル、イソインダゾリル、イソインドリニル、イソインドリル、イソキノリニル、イソチアゾリル、イソオキサゾリル、メチレンジオキシフェニル、モルホリニル、ナフチリジニル、オクタヒドロイソキノリニル、オキサジアゾリル、１，２，３−オキサジアゾリル、１，２，４−オキサジアゾリル、１，２，５−オキサジアゾリル、１，３，４−オキサジアゾリル、１，２，４−オキサジアゾ−ル５（４Ｈ）−オン、オキサゾリジニル、オキサゾリル、オキシインドリル、ピリミジニル、フェナントリジニル、フェナントロリニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサチニル、フェノキサジニル、フタラジニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピペリドニル、４−ピペリドニル、ピペロニル、プテリジニル、プリニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリジニル、ピラゾリニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドオキサゾール、ピリドイミダゾール、ピリドチアゾール、ピリジニル、ピリジル、ピリミジニル、ピロリジニル、ピロリニル、２Ｈ−ピロリル、ピロリル、キナゾリニル、キノリニル、４Ｈ−キノリジニル、キノキサリニル、キヌクリジニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラヒドロキノリニル、テトラゾリル、６Ｈ−１，２，５−チアジアジニル、１，２，３−チアジアゾリル、１，２，４−チアジアゾリル、１，２，５−チアジアゾリル、１，３，４−チアジアゾリル、チアントレニル、チアゾリル、チエニル、チエノチアゾリル、チエノオキサゾリル、チエノイミダゾリル、チオフェニル、トリアジニル、１，２，３−トリアゾリル、１，２，４−トリアゾリル、１，２，５−トリアゾリル、１，３，４−トリアゾリルおよびキサンテニルが挙げられる。
「置換された」という語は、本明細書中で用いられる場合、指定の原子上のいずれか１個以上の水素原子が表示された基から選択されたもので置換されていることを意味し、ただし、指定の原子の通常の価数を超えないものとし、置換の結果、安定な化合物が得られるものとする。置換基がオキソまたはケト（すなわち＝Ｏ）である場合、原子上の２個の水素原子は置換される。ケト置換基は芳香族部分上に存在しない。環二重結合は、本明細書中で用いられる場合、２つの隣接する環原子間で形成される二重結合（たとえば、Ｃ＝Ｃ、Ｃ＝ＮまたはＮ＝Ｎ）である。「安定な化合物」および「安定な構造」は、反応混合物から有用な程度の純度まで単離し、そして有効な治療薬に処方するのに耐えるために十分強固な化合物を指すことを意図する。
置換基に対する結合が、環中の２個の原子を連結する結合を横断するように示されている場合、そのような置換基は環中の任意の原子と結合することができる。ある置換基が、そのような置換基が所与の式の化合物の残部と結合するのに介する原子を表示せずに記載されている場合、そのような置換基はかかる式中のどの原子を介しても結合することができる。置換基および／または変数の組み合わせは、そのような組み合わせの結果、安定な化合物が得られる場合に限り、許容される。
任意の変数（たとえば、Ｒ１）がある化合物の任意の構成成分または式中に複数個ある場合、各場合でのその定義は他のすべてでのその定義とは独立している。したがって、例えば、ある基が０〜２個のＲ１部分で置換されていることが示されている場合、その基は２個までのＲ１部分で場合によって置換されていてもよく、各場合でのＲ１はＲ１の定義から独立して選択される。また、置換基および／または変数の組み合わせは、そのような組み合わせの結果、安定な化合物が得られる場合に限り、許容される。
「ヒドロキシ」または「ヒドロキシル」という語は、−ＯＨまたは−Ｏ−を有する基を包含する。
本明細書中で用いられる場合、「ハロ」または「ハロゲン」は、フルオロ、クロロ、ブロモおよびヨードを指す。「過ハロゲン化」という語は、概して、全ての水素がハロゲン原子で置換されている部分を指す。「ハロアルキル」または「ハロアルコキシル」という語は、１以上のハロゲン原子で置換されたアルキルまたはアルコキシルを指す。
「カルボニル」という語は、二重結合で酸素原子に結合した炭素を含む化合物および部分を包含する。カルボニルを含む部分の例としては、アルデヒド、ケトン、カルボン酸、アミド、エステル、無水物などが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
「カルボキシル」という語は、−ＣＯＯＨまたはそのＣ１〜Ｃ６アルキルエステルを指す。
「アシル」は、アシルラジカル（Ｒ−Ｃ（Ｏ）−）またはカルボニル基を含む部分を包含する。「置換アシル」は、１以上の水素原子が、例えば、アルキル基、アルキニル基、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナート、ホスフィナート、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分で置換されているアシル基を包含する。
「アロイル」は、カルボニル基に結合したアリールまたはヘテロ芳香族部分を有する部分を包含する。アロイル基の例としては、フェニルカルボキシ、ナフチルカルボキシなどが挙げられる。
「アルコキシアルキル」、「アルキルアミノアルキル」、および「チオアルコキシアルキル」は、前述のようなアルキル基であって、酸素、窒素、またはイオウ原子が１以上の炭化水素主鎖炭素原子と置換しているものを包含する。
「アルコキシ」または「アルコキシル」という語は、酸素原子と共有結合した置換および非置換アルキル、アルケニルおよびアルキニル基を包含する。アルコキシ基またはアルコキシルラジカルの例としては、メトキシ、エトキシ、イソプロピルオキシ、プロポキシ、ブトキシおよびペントキシ基が挙げられるが、これらに限定されるものではない。置換アルコキシ基の例としては、ハロゲン化アルコキシ基が挙げられる。アルコキシ基は、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、ホスフェート、ホスホナート、ホスフィナート、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノ、およびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分などの基で置換され得る。ハロゲン置換アルコキシ基の例には、フルオロメトキシ、ジフルオロメトキシ、トリフルオロメトキシ、クロロメトキシ、ジクロロメトキシおよびトリクロロメトキシが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
「エーテル」または「アルコキシ」という語は、２個の炭素原子またはヘテロ原子に結合した酸素を含む化合物または部分を包含する。例えば、この語は、「アルコキシアルキル」を包含し、これはアルキル基と共有結合する酸素原子に共有結合したアルキル、アルケニル、またはアルキニル基を指す。
「エステル」という語は、カルボニル基の炭素に結合した酸素原子に結合した炭素またはヘテロ原子を含む化合物または部分を包含する。「エステル」という語は、メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、プロポキシカルボニル、ブトキシカルボニル、ペントキシカルボニルなどのアルコキシカルボキシ基を包含する。
「チオアルキル」という語は、イオウ原子と結合したアルキル基を含む化合物または部分を包含する。チオアルキル基は、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキルカルボニルオキシ、アリールカルボニルオキシ、アルコキシカルボニルオキシ、アリールオキシカルボニルオキシ、カルボキシレート、カルボキシ酸（carboxyacid），アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルコキシカルボニル、アミノカ
ルボニル、アルキルアミノカルボニル、ジアルキルアミノカルボニル、アルキルチオカルボニル、アルコキシル、アミノ（アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アリールアミノ、ジアリールアミノおよびアルキルアリールアミノを含む）、アシルアミノ（アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイドを含む）、アミジノ、イミノ、スルフヒドリル，アルキルチオ，アリールチオ、チオカルボキシレート、スルフェート、アルキルスルフィニル、スルホナート、スルファモイル、スルホンアミド、ニトロ、トリフルオロメチル、シアノ、アジド、ヘテロシクリル、アルキルアリール、または芳香族もしくはヘテロ芳香族部分などの基で置換され得る。
「チオカルボニル」または「チオカルボキシ」という語は、イオウ原子と二重結合で結合した炭素を含む化合物および部分を包含する。
「チオエーテル」という語は、２個の炭素原子またはヘテロ原子と結合したイオウ原子を含む部分を包含する。チオエーテルの例としては、限定されるものではないが、アルクチオアルキル（alkthioalkyl）、アルクチオアルケニル（alkthioalkenyl）、およびアルクチオアルキニル（alkthioalkynyl）が挙げられる。「アルクチオアルキル（alkthioalkyl）」という語は、アルキル基と結合したイオウ原子に結合したアルキル、アルケニル、またはアルキニル基を有する部分を包含する。同様に、「アルクチオアルケニル（alkthioalkenyl）」という語は、アルキル、アルケニルまたはアルキニル基がイオウ原子に結合し、このイオウ原子がアルケニル基と共有結合している部分を指し；そして「アルクチオアルキニル（alkthioalkynyl）」は、アルキル、アルケニルまたはアルキニル基がイオウ原子に結合し、このイオウ原子がアルキニル基に共有結合している部分を指す。
本明細書中で用いられる場合、「アミン」または「アミノ」は、非置換または置換−ＮＨ２を指す。「アルキルアミノ」は、−ＮＨ２の窒素が少なくとも１つのアルキル基に結合している基を包含する。アルキルアミノ基の例としては、ベンジルアミノ、メチルアミノ、エチルアミノ、フェネチルアミノなどが挙げられる。「ジアルキルアミノ」は、−ＮＨ２の窒素が少なくとも２個のさらなるアルキル基に結合している基を包含する。ジアルキルアミノ基の例としては、限定されるものではないが、ジメチルアミノおよびジエチルアミノを挙げられる。「アリールアミノ」および「ジアリールアミノ」は、窒素が少なくとも１または２個のアリール基にそれぞれ結合している基を包含する。「アミノアリール」および「アミノアリールオキシ」は、アミノで置換されたアリールおよびアリールオキシを指す。「アルキルアリールアミノ」、「アルキルアミノアリール」または「アリールアミノアルキル」は、少なくとも１つのアルキル基および少なくとも１つのアリール基と結合しているアミノ基を指す。「アルクアミノアルキル（alkaminoalkyl）」は、窒素原子に結合しているアルキル、アルケニル、またはアルキニル基であって、この窒素がまたアルキル基にも結合しているものを指す。「アシルアミノ」は、窒素がアシル基に結合している基を包含する。アシルアミノの例としては、限定されるものではないが、アルキルカルボニルアミノ、アリールカルボニルアミノ、カルバモイルおよびウレイド基を包含する。
「アミド」または「アミノカルボキシ」という語は、カルボニルまたはチオカルボニル基の炭素に結合している窒素原子を含む化合物または部分を包含する。この語は、カルボニルまたはチオカルボニル基の炭素に結合しているアミノ基に結合しているアルキル、アルケニルまたはアルキニル基を包含する「アルクアミノカルボキシ（alkaminoicarboxy）」基を包含する。それは、カルボニルまたはチオカルボニル基の炭素に結合しているアミノ基に結合しているアリールまたはヘテロアリール部分を包含する「アリールアミノカルボキシ」基も包含する。「アルキルアミノカルボキシ」、「アルケニルアミノカルボキシ」、「アルキニルアミノカルボキシ」および「アリールアミノカルボキシ」という語は、それぞれアルキル、アルケニル、アルキニルおよびアリール部分が窒素原子に結合し、この窒素が次にカルボニル基の炭素に結合している部分を包含する。アミドは、直鎖アルキル、分枝アルキル、シクロアルキル、アリール、ヘテロアリールまたはヘテロ環などの置換基で置換することができる。アミド基上の置換基はさらに置換されていてもよい。
本明細書において、化合物の構造式は、ある場合では便宜上ある異性体を表すが、本発明は、幾何異性体、不斉炭素に基づく光学異性体、立体異性体、互変異性体などのあらゆる異性体を包含し、全ての異性体が同じレベルの活性を有し得るわけではないと理解される。加えて、結晶多形が式によって表される化合物について存在し得る。任意の結晶形態、結晶形態の混合物、またはその無水物もしくは水和物が本発明の範囲内に含まれることに注意する。さらに、本発明の化合物のインビボでの分解によって生じる、いわゆる代謝産物は本発明の範囲内に含まれる。
「異性」とは、同じ分子式を有するが、それらの原子の結合の配列または空間におけるそれらの原子の配置が異なる化合物を意味する。空間におけるそれらの原子の配置が異なる異性体を「立体異性体」と称する。互いに鏡像でない立体異性体を「ジアステレオマー」と称し、互いに重ねあわすことができない鏡像である立体異性体を「エナンチオマー」または場合によっては光学異性体と称する。反対のキラリティーを有する個々のエナンチオマー形態の等量の混合物を「ラセミ混合物」と称する。
４個の同一でない置換基に結合した炭素原子は、「キラル中心」と称される。
「キラル異性体」は、少なくとも１つのキラル中心を有する化合物を意味する。複数のキラル中心を有する化合物は、個々にジアステレオマーとして、または「ジアステレオマー混合物」と称されるジアステレオマーの混合物としてのいずれかで存在し得る。１つのキラル中心が存在する場合、立体異性体はキラル中心の絶対配置（ＲまたはＳ）によって特徴づけることができる。絶対配置は、キラル中心に結合した置換基の空間における配置を指す。検討中のキラル中心に結合した置換基は、カーン・インゴルド・プレローグ順位則にしたがって整列される。（Cahn et al., Angew. Chem. Inter. Edit. 1966, 5, 385; errata 511; Cahn et al., Angew. Chem. 1966, 78, 413; Cahn and Ingold, J. Chem. Soc. 1951 (London), 612; Cahn et al., Experientia 1956, 12, 81; Cahn, J. Chem. Educ.1964, 41, 116）
「幾何異性体」は、それらの存在が二重結合またはシクロアルキルリンカー（例えば、１，３−シクロブチル）の周りの束縛回転のおかげであるジアステレオマーを意味する。これらの立体配置は、カーン・インゴルド・プレローグ順位則にしたがって、その基が分子中の二重結合の同じ側または反対側にあることを示す、接頭語シスおよびトランス、またはＺおよびＥによってその名前で区別される。
本発明の化合物は、異なるキラル異性体または幾何異性体として示することができると理解されるべきである。化合物がキラル異性体または幾何異性体を有する場合、全ての異性体が本発明の範囲内に含まれることが意図されることも理解されるべきであり、化合物の命名はいかなる異性体も排除せず、すべての異性体が同じレベルの活性を有し得るとは限らないと理解される。
さらに、本明細書中で検討する構造および他の化合物はそのすべてのアトロピック異性体を包含し、全てのアトロピック異性体が同じレベルの活性を有し得るとは限らないと理解される。「アトロピック異性体」は、２つの異性体の原子が空間において異なって配置されている立体異性体の一種である。アトロピック異性体の存在は、中心の結合の周りの大きな基の回転の妨害に起因する制限された回転のおかげである。そのようなアトロピック異性体は特徴的には混合物として存在するが、クロマトグラフィー技術の近年の進歩の結果、限定された場合で２つのアトロピック異性体の混合物を分離することが可能になった。
「互変異性体」は、平衡状態で存在し、１つの異性体から別の異性体へ容易に変換される２以上の構造異性体の１つである。この変換の結果、隣接する共役二重結合のスイッチに付随する水素原子の形式的な移動が起こる。互変異性体は、溶液中互変異性体のセットの混合物として存在する。互変異性化が可能な溶液中で、互変異性体の化学平衡が達成される。互変異性体の正確な比は、温度、溶媒およびｐＨをはじめとするいくつかの要因に左右される。互変異性化によって相互転換可能である互変異性体の概念は互変異性と呼ばれる。
可能な互変異性の様々な種類のうち、２つが通常観察される。ケト−エノール互変異性では、電子と水素原子の同時シフトが起こる。環−鎖互変異性は、糖鎖分子中のアルデヒド基（−ＣＨＯ）が同じ分子中のヒドロキシ基（−ＯＨ）の１つと反応する結果として起こり、それをグルコースによって示されるような環状（環の形状）形態にする。
一般的な互変異性体対は：ケトン−エノール、アミド−ニトリル、ラクタム−ラクチム、ヘテロ環中のアミド−イミド酸互変異性（例えば、グアニン、チミンおよびシトシンなどの核酸塩基中）、イミン−エナミンおよびエナミン−エナミンである。ケト−エノール平衡の一例は、以下で示すようなピリジン−２（１Ｈ）−オンと対応するピリジン−２−オール間である。
本発明の化合物は異なる互変異性体として示すことができると理解されるべきである。化合物が互変異性体を有する場合、全ての互変異性体は本発明の範囲内に含まれることが意図されることも理解すべきであり、化合物の命名はいかなる互変異性体も排除しない。ある互変異性体は他よりも高いレベルの活性を有し得ると理解される。
「結晶多形」、「多形体」または「結晶形態」という語は、化合物（またはその塩もしくは溶媒和物）が異なる結晶充填配置（packing arrangement）で結晶化することができ、そのすべてが同じ元素組成を有する結晶構造を意味する。異なる結晶形態は、通常、異なるＸ線回折パターン、赤外スペクトル、融点、密度硬度（density hardness）、結晶形、光学および電気特性、安定性および溶解度を有する。再結晶溶媒、晶析速度、貯蔵温度および他の因子は、１つの結晶形態が優勢になる原因となり得る。化合物の結晶多形は、異なる条件下での結晶化によって調製できる。
本明細書中で開示される式のいずれかの化合物としては、妥当な場合、化合物自体、ならびにそれらの塩またはそれらの溶媒和物が挙げられる。例えば、アニオンと、アリール−またはヘテロアリール−置換ベンゼン化合物上の正電荷を持つ基（たとえば、アミノ）との間に塩が形成され得る。好適なアニオンとしては、クロリド、ブロミド、ヨージド、スルフェート、ビスルフェート、スルファメート、ニトレート、ホスフェート、シトレート、メタンスルホネート、トリフルオロアセテート、グルタメート、グルクロネート、グルタレート、マレート、マレエート、スクシネート、フマレート、タータレート（tartrate）、トシレート、サリチレート、ラクテート、ナフタレンスルホネート、およびアセテート（たとえば、トリフルオロアセテート）が挙げられる。「薬剤的に許容されるアニオン」という語は、薬剤的に許容される塩を形成するために好適なアニオンを指す。同様に、塩は、カチオンとアリール−またはヘテロアリール−置換ベンゼン化合物上の負電荷を有する基（たとえば、カルボキシレート）との間にも形成され得る。好適なカチオンとしては、ナトリウムイオン、カリウムイオン、マグネシウムイオン、およびアンモニウムカチオン、例えばテトラメチルアンモニウムイオンが挙げられる。アリールまたはヘテロアリール置換ベンゼン化合物は、四級窒素原子を含む塩も包含する。
さらに、本発明の化合物、たとえば化合物の塩は、水和もしくは非水和（無水）形態で、または他の溶媒分子との溶媒和物として存在し得る。水和物の非限定的例としては、一水和物、二水和物などが挙げられる。溶媒和物の非限定的例としては、エタノール溶媒和物、アセトン溶媒和物などが挙げられる。
「溶媒和物」とは、化学量論量または非化学量論量のいずれかの溶媒を含む溶媒付加形態を意味する。一部の化合物は結晶性固体状態で一定のモル比の溶媒分子をトラップする傾向があり、かくして溶媒和物を形成する。溶媒が水である場合、形成される溶媒和物は水和物であり；溶媒がアルコールである場合、形成される溶媒和物はアルコラートである。水和物は、１以上の水分子と、水がＨ２Ｏとしてその分子状態を保持する物質１分子との組み合わせによって形成される。
本明細書中で用いられる場合、「アナログ」という語は、構造的に互いに類似しているが、組成が若干異なる（１つの原子が異なる元素の原子によって置換されていることにおいて、もしくは特定の官能基の存在において、または１つの官能基が別の官能基によって置換されていることにおいて）化合物を指す。したがって、アナログは、参考化合物に対して、機能および外観が類似または匹敵しているが、構造または起源が異なる化合物である。
本明細書中で定義されるように、「誘導体」という語は、共通のコア構造を有し、本明細書中で記載される様々な基で置換されている化合物を指す。例えば、式（Ｉ）によって表される化合物はすべてアリールまたはヘテロアリール置換ベンゼン化合物であり、共通のコアとして式（Ｉ）を有する。
「生物学的等価体（bioisostere）」という語は、ある原子または原子団と、別の大まかに類似している原子または原子団との交換から得られる化合物を指す。生物学的等価体置換の目的は、親化合物に類似した生物学的特性を有する新規化合物を作製することである。生物学的等価体置換は、物理化学的またはトポロジー的ベースであり得る。カルボン酸生物学的等価体の例としては、限定されるものではないが、アシルスルホンイミド、テトラゾール、スルホネートおよびホスホネートが挙げられる。例えば、Patani and LaVoie, Chem. Rev. 96, 3147-3176, 1996を参照のこと。
本発明は、本発明の化合物中に存在する原子のすべての同位体を包含することが意図される。同位体は、同じ原子番号を有するが、異なる質量数を有する原子を包含する。一般的な例として、限定されるものではないが、水素の同位体は、三重水素および重水素を包含し、炭素の同位体はＣ−１３およびＣ−１４を包含する。
本発明は、本明細書中で開示される任意の式の化合物の合成法を提供する。本発明はまた、実施例で示すような以下のスキームにしたがって、本発明の様々な開示された化合物を合成するための詳細な方法も提供する。
記載全体にわたって、組成物が特定の成分を有する、包含する、または含むと記載されている場合、組成物はまた、記載された成分から本質的になる、または記載された成分からなることが想定される。同様に、方法またはプロセスが特定のプロセスステップを有する、包含する、または含むと記載されている場合、そのプロセスはまた、記載された加工ステップから本質的になるか、または記載された加工ステップからなる。さらに、本発明が操作可能なままである限り、ステップの順序またはある動作を実施する順序は重要ではない。さらに、２以上のステップまたは動作を同時に実施することができる。
本発明の合成法は、様々な官能基を許容でき、したがって、様々な置換された出発物質を使用できる。方法は、概して方法全体の最後または最後付近で所望の最終化合物を提供するが、場合によっては、化合物をその薬剤的に許容される塩、多形体または溶媒和物にさらに変換することが望ましいい場合もある。
本発明の化合物は、市販の出発物質、文献で公知の化合物を使用して、または容易に調製される中間体から、当業者に公知であるか、または本明細書中の教示を照らして当業者には明らかである標準的合成法および手順を使用することにより、様々な方法で調製することができる。有機分子調製および官能基変換および操作のための標準的合成法および手順は、関連する科学文献または当該技術分野の標準的な教科書から得ることができる。いずれか１つまたはいくつかの出典に限定されないが、古典的教科書、例えば、Smith, M. B., March, J., March’s Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure, 5th edition, John Wiley & Sons: New York, 2001; Greene, T.W., Wuts, P.G. M., Protective Groups in Organic Synthesis, 3rd edition, John Wiley & Sons: New York, 1999; R. Larock, Comprehensive Organic Transformations, VCH Publishers (1989); L. Fieser and M. Fieser, Fieser and Fieser’s Reagents for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1994); and L. Paquette, ed., Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1995)（参照により本明細書中に組み込まれる）は、当業者に公知の有機合成の有用で認識された参考教科書である。合成法の以下の説明は、説明のために設計され、本発明の化合物の調製のための一般的手順を限定するものではない。
本発明の化合物は、当業者に周知の様々な方法によって都合よく調製することができる。本明細書中で開示される任意の式を有する本発明の化合物は、下記スキーム１〜１０で示される手順に従って、市販の出発物質または文献の手順を用いて調製できる出発物質から調製することができる。スキーム１〜１０中のＺおよびＲ基（例えば、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４、Ｒ６、Ｒ７、Ｒ８、およびＲ１２）は、特別の定めのない限り、本明細書中で開示された式のいずれかで定義されるとおりである。
本明細書中で記載される反応シーケンスおよび合成スキームの間、あるステップの順序、例えば保護基の導入および除去は変更できることに当業者は気づくであろう。
当業者は、ある基が保護基の使用により反応条件からの保護を必要とする場合があることを認めるであろう。保護基は、分子中の類似した官能基を区別するために使用することもできる。保護基のリストおよびこれらの基を導入し、除去する方法は、Greene, T.W.,
Wuts, P.G. M., Protective Groups in Organic Synthesis, 3rd edition, John Wiley & Sons: New York, 1999で見いだすことができる。
好ましい保護基としては、限定されるものではないが、以下のものが挙げられる：
ヒドロキシル部分については：ＴＢＳ、ベンジル、ＴＨＰ、Ａｃ
カルボン酸については：ベンジルエステル、メチルエステル、エチルエステル、アリルエステル
アミンについては：Ｃｂｚ、ＢＯＣ、ＤＭＢ
ジオールについては：Ａｃ（×２）ＴＢＳ（×２）、または一緒になった場合アセトニド
チオールについては：Ａｃ
ベンゾイミダゾールについては：ＳＥＭ、ベンジル、ＰＭＢ、ＤＭＢ
アルデヒドについては：ジメトキシアセタールまたはジエチルアセチルなどのジ−アルキルアセタール。
明細書中で記載する反応スキームで、複数の立体異性体が生じる可能性がある。特定の立体異性体が表示されていない場合、反応から生じ得るすべての可能な立体異性体を意味すると理解される。当業者は、１つの異性体が優先的に得られるように反応を最適化することができる、または単一の異性体を製造するための新規スキームを考案できることを当業者は認めるであろう。混合物が生じる場合、分取薄層クロマトグラフィー、分取ＨＰＬＣ、分取キラルＨＰＬＣ、または分取ＳＦＣなどの技術を使用して異性体を分離することができる。
以下の略語を明細書全体にわたって使用し、以下のように定義される：
Ａｃ アセチル
ＡｃＯＨ 酢酸
ａｑ． 水性
ＢＩＤまたはｂ．ｉ．ｄ． ｂｉｓ ｉｎ ｄｉｅ（１日２回）
ＢＯＣ ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル
Ｃｂｚ ベンジルオキシカルボニル
ＣＤＣｌ３ 重クロロホルム
ＣＨ２Ｃｌ２ ジクロロメタン
ＤＣＭ ジクロロメタン
ＤＭＢ ２，４ ジメトキシベンジル
ＤＭＦ Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド
ＤＭＳＯ ジメチルスルホキシド
ＥＡまたはＥｔＯＡｃ 酢酸エチル
ＥＤＣまたはＥＤＣＩ Ｎ−（３−ジメチルアミノプロピル）−Ｎ’−エチルカルボジイミド
ＥＳＩ− エレクトロスプレー 陰イオンモード
ＥＳＩ＋ エレクトロスプレー 陽イオンモード
ＥｔＯＨ エタノール
ｈ 時間
Ｈ２Ｏ 水
ＨＯＢｔ １−ヒドロキシベンゾトリアゾール
ＨＣｌ 塩化水素または塩酸
ＨＰＬＣ 高性能液体クロマトグラフィー
Ｋ２ＣＯ３ 炭酸カリウム
ＬＣ／ＭＳまたはＬＣ−ＭＳ 液体クロマトグラフィー質量スペクトル
Ｍ モル濃度
ＭｅＣＮ アセトニトリル
ｍｉｎ 分
Ｎａ２ＣＯ３ 炭酸ナトリウム
Ｎａ２ＳＯ４ 硫酸ナトリウム
ＮａＨＣＯ３ 重炭酸ナトリウム
ＮａＨＭＤｓ ナトリウムヘキサメチルジシラジド
ＮａＯＨ 水酸化ナトリウム
ＮａＨＣＯ３ 重炭酸ナトリウム
Ｎａ２ＳＯ４ 硫酸ナトリウム
ＮＭＲ 核磁気共鳴
Ｐｄ（ＯＨ）２ 二水酸化パラジウム
ＰＭＢ パラメトキシベンジル
ｐ．ｏ． ｐｅｒ ｏｓ （経口投与）
ｐｐｍ １００万分の１部
ｐｒｅｐ ＨＰＬＣ 分取高性能液体クロマトグラフィー
ＰＹＢＯＰ（ベンゾトリアゾール−１−イルオキシ）トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート
ＲｔまたはＲＴ 室温
ＴＢＭＥ ｔｅｒｔ−ブチルメチルエーテル
ＴＦＡ トリフルオロ酢酸
ＴＨＦ テトラヒドロフラン
ＴＨＰ テトラヒドロピラン
本発明は、少なくとも１つの薬剤的に許容される賦形剤または担体と組み合わされた本明細書中で開示される任意の式の化合物を含む医薬組成物も提供する。
「医薬組成物」は、対象への投与に適した形態の本発明の化合物を含む配合物である。１つの実施形態において、医薬組成物はバルクで、または単位投与形態である。単位投与形態は、例えば、カプセル、ＩＶバッグ、錠剤、エアロゾル吸入器上の単一ポンプ（single pump）またはバイアルをはじめとする様々な形態のいずれかである。単位用量の組成物中の活性成分（たとえば、開示された化合物またはその塩、水和物、溶媒和物もしくは異性体の処方）の量は有効量であり、関連する特定の治療によって変わる。患者の年齢および状態に応じて投薬量に慣例的な変動を加える必要がある場合があることを当業者は理解するであろう。投薬量は投与経路に左右される。経口、肺、直腸、非経口、経皮、皮下、静脈内、筋肉内、腹腔内、吸入、口腔、舌下、胸膜内、くも膜下腔内、鼻腔内などをはじめとする様々な経路が想定される。本発明の化合物の局所または経皮投与用の投与形態としては、粉末、スプレー、軟膏、ペースト、クリーム、ローション、ゲル、溶液、貼付剤および吸入剤が挙げられる。１つの実施形態では、活性化合物を無菌条件下で薬剤的に許容される担体、必要とされる任意の防腐剤、緩衝液、またはプロペラントと混合する。
本明細書中で用いられる場合、「薬剤的に許容される」という表現は、健全な医学的判断の範囲内であり、過度の毒性、刺激、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症がなくヒトよび動物の組織と接触した使用に好適であり、妥当な損益比で釣り合う化合物、アニオン、カチオン、材料、組成物、担体、および／または投与形態を指す。
「薬剤的に許容される賦形剤」とは、一般的に安全、非毒性で、生物学的にも、またその他でも望ましくないものではない、医薬組成物の調製に有用な賦形剤を意味し、獣医学的用途ならびにヒト製薬学的用途について許容される賦形剤を包含する。明細書および特許請求の範囲で使用される「薬剤的に許容される賦形剤」は、１以上のそのような賦形剤を包含する。
本発明の医薬組成物は、その意図される投与経路に適合するように処方される。投与経路の例としては、非経口、例えば静脈内、皮内、皮下、経口（例えば吸入）、経皮（局所）、および経粘膜投与が挙げられる。非経口、皮内、または皮下適用に使用される溶液または懸濁液は、以下の成分を含み得る：滅菌希釈剤、例えば注射用水、生理食塩水、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒；抗菌剤、例えばベンジルアルコールまたはメチルパラベン；抗酸化剤、例えばアスコルビン酸または亜硫酸水素ナトリウム；キレート剤、例えばエチレンジアミンテトラ酢酸；緩衝液、例えばアセテート、シトレートまたはホスフェート、ならびに塩化ナトリウムまたはデキストロースなどの張度を調節するための作用物質。ｐＨは酸または塩基、例えば塩酸または水酸化ナトリウムで調節することができる。非経口製剤は、ガラスまたはプラスチック製のアンプル、使い捨て注射器または複数回投与用バイアル中に封入することができる。
本発明の化合物または医薬組成物を、化学療法のために現在使用される周知の方法の多くで対象に投与することができる。例えば、ガンの治療に関しては、本発明の化合物を腫瘍に直接注入、血流もしくは体腔中に注入または経口摂取または貼付剤で皮膚を通して適用することができる。選択される用量は、有効な治療を構成するために充分でなければならないが、許容されない副作用を引き起こすほど高くてはならない。疾患状態（例えば、ガン、前ガン、およびその他）ならびに患者の健康は、治療中または治療後妥当な期間、注意深くモニタリングしなければならない。
「治療有効量」という語は、本明細書中で用いられる場合、特定された疾患もしくは状態を治療、改善、または予防する、あるいは検出可能な治療効果または阻害効果を示す医薬品の量を指す。効果は、当該技術分野で公知の任意のアッセイ法によって検出できる。対象に関する正確な有効量は、対象の体重、サイズ、および健康；状態の性質および程度；ならびに投与のために選択された治療薬または治療薬の組み合わせに左右される。所与の状況に関する治療有効量は、臨床医の技術および判断の範囲内である日常的な実験によって決定することができる。好ましい態様において、治療される疾患または状態はガンである。別の態様では、治療される疾患または状態は細胞増殖性障害である。
任意の化合物について、治療有効量は、例えば新生細胞の細胞培養アッセイにおいて、または動物モデル、通常はラット、ウサギ、イヌ、もしくはブタにおいてのいずれかでまず推定することができる。動物モデルは、適切な濃度範囲および投与経路を決定するためにも使用できる。そのような情報は次いでヒトにおける投与のために有用な用量および経路を決定するために使用できる。治療／予防効果および毒性、例えばＥＤ５０（集団の５０％で治療上有効な用量）およびＬＤ５０（集団の５０％に対して致死的な用量）は、細胞培養または実験動物における標準的な調剤手順によって決定することができる。毒性効果と治療効果との用量比は治療指数であり、これは比ＬＤ５０／ＥＤ５０として表すことができる。大きな治療指数を示す医薬組成物が好ましい。投薬量は、用いられる投与形態、患者の感受性、および投与経路に応じてこの範囲内で変動し得る。
充分なレベルの活性剤（複数可）を提供するため、または所望の効果を維持するために、投薬量および投与を調節する。考慮され得る因子としては、疾患状態の重篤度、対象の全体的健康状態、対象の年齢、体重、および性別、食事、投与時間および頻度、薬物の組み合わせ、反応感受性、ならびに治療に対する寛容性／応答が挙げられる。長時間作用型医薬組成物は、特定の処方の半減期およびクリアランス率に応じて、３〜４日ごと、毎週、または２週間ごとに１回投与することができる。
本発明の活性化合物を含む医薬組成物は、一般的に公知の方法で、例えば通常の混合、溶解、造粒、糖衣錠作製、ゲル化（levigating）、乳化、カプセル化、捕捉、または凍結乾燥法によって製造することができる。医薬組成物は、活性化合物を薬剤的に使用できる製剤に加工するのを促進する賦形剤および／または補助薬を含む１以上の薬剤的に許容される担体を使用する通常の方法で処方することができる。もちろん、適切な処方は、選択された投与経路に左右される。
注射用途に好適な医薬組成物は、無菌注射溶液もしくは分散液の即時調製のための無菌水溶液（水溶性の場合）または分散液および無菌粉末を含む。静脈内投与に関して、好適な担体としては、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ ＥＬ（商標）（ＢＡＳＦ、ニュージャージー州パーシッパニー）またはリン酸塩緩衝食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、組成物は無菌でなければならず、容易に注射針に通過する程度まで流動性でなければならない。それは、製造および貯蔵条件下で安定でなければならず、細菌および真菌などの微生物の汚染作用に対して保護されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、ならびにそれらの好適な混合物を含む溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用、分散液の場合は必要とされる粒子サイズの維持、そして界面活性剤の使用により維持することができる。微生物の作用の予防は、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなどの様々な抗菌剤および抗真菌剤によって達成できる。多くの場合、組成物中に等張剤、例えば糖、マンニトールおよびソルビトールなどのポリアルコール、ならびに塩化ナトリウムを含むのが好ましい。注射可能な組成物の持続的吸収は、組成物中に、吸収を遅らせる薬剤、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを含めることによってもたらすことができる。
無菌注射溶液は、活性化合物を必要とされる量で適切な溶媒中、必要とされる上述の成分の１つまたは組み合わせとともに組み入れ、続いて濾過滅菌することによって調製できる。概して、分散液は、基本分散媒および上述のものからの必要とされる他の成分を含む無菌ビヒクル中に活性化合物を組み入れることによって調製される。無菌注射溶液の調製のための無菌粉末の場合、調製方法は、真空乾燥および凍結乾燥であり、これによって、あらかじめ滅菌ろ過されたその溶液から活性成分と任意のさらなる所望の成分の粉末を得る。
経口組成物は概して不活性希釈剤または可食性の薬剤的に許容される担体を含む。それらはゼラチンカプセル中に封入することができるか、または圧縮して錠剤にすることができる。経口治療投与のために、活性化合物を賦形剤とともに組み入れることができ、錠剤、トローチ、またはカプセルの形態で使用することができる。経口組成物は、洗口剤として使用される流体担体を使用して調製することもでき、この場合、流体担体中の化合物を経口適用し、くちゅくちゅし、吐き出すかまたは飲み込む。薬剤的に適合性の結合剤、および／またはアジュバント材料を組成物の一部として含めることができる。錠剤、ピル、カプセル、トローチなどは、以下の成分のいずれか、または類似の性質の化合物を含み得る：バインダー、例えば微結晶セルロース、トラガカントガムもしくはゼラチン；賦形剤、例えばデンプンもしくはラクトース、崩壊剤、例えばアルギン酸、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、もしくはコーンスターチ；潤滑剤、例えばステアリン酸マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓ；流動促進剤、例えばコロイド状二酸化珪素；甘味剤、例えばスクロースもしくはサッカリン；または香味剤、例えばペパーミント、サリチル酸メチル、もしくはオレンジフレーバー。
吸入による投与のために、化合物は、好適なプロペラント、例えば二酸化炭素などのガスを含む加圧容器もしくはディスペンサー、またはネブライザーからのエアロゾルスプレーの形態で送達される。
全身投与は、経粘膜または経皮手段によるものでもあり得る。経粘膜または経皮投与に関しては、透過されるバリヤに適切な浸透剤を処方で使用する。そのような浸透剤は、概して当該技術分野で公知であり、例えば経粘膜投与については、洗剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与は、鼻スプレーまたは坐剤の使用により達成することができる。経皮投与のために、活性化合物は、当該技術分野で一般的に公知の軟膏（ｏｉｎｔｍｅｎｔ）、軟膏（ｓａｌｖｅ）、ゲル、またはクリームに処方される。
インプラントおよびマイクロカプセル化送達システムをはじめとする制御放出処方などの、身体からの迅速排除から化合物を保護する薬剤的に許容される担体を用いて、活性化合物を調製できる。生分解性、生体適合性ポリマー、例えばエチレン酢酸ビニル、ポリ酸無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸を使用できる。そのような処方の調製のための方法は、当業者には明らかである。材料は、Ａｌｚａ ＣｏｒｐｏｒａｔｉｏｎおよびＮｏｖａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ， Ｉｎｃ．から商業的に入手することもできる。リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体で感染した細胞を標的とするリポソームを含む）は、薬剤的に許容される担体として使用することもできる。これらは、当業者に公知の方法、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号で記載されているようにして調製することができる。
投与の容易性および投薬量の均一性のために、単位投与形態の経口または非経口組成物に処方することが特に有利である。本明細書中で用いられる場合、単位投与形態は、治療される対象に単位投薬量として適した物理的に独立した単位を指す；各単位は、必要とされる医薬担体と組み合わせて所望の治療効果をもたらすように計算されたあらかじめ決められた量の活性化合物を含む。本発明の単位投与形態についての明細は、活性化合物の独自の特性および達成される特定の治療効果によるか、または直接依存して決定される。
治療適用において、本発明にしたがって使用される医薬組成物の投薬量は、選択された投薬量に影響を及ぼす他の因子の中でも、薬剤、受容患者の年齢、体重、および臨床状態、ならびに治療を施す臨床医または開業医の経験および判断によって変わる。概して、用量は、腫瘍成長の遅延、およびこのましくは退縮をもたらし、そしてまた好ましくはガンの完全退縮を引き起こすのに充分でなければならない。投薬量は、１日あたり約０．０１ｍｇ／ｋｇから１日あたり約５０００ｍｇ／ｋｇの範囲であり得る。好ましい態様において、投薬量は１日当たり約１ｍｇ／ｋｇから１日あたり約１０００ｍｇ／ｋｇの範囲であり得る。１つの態様では、用量は、単回、分割、または持続用量で、約０．１ｍｇ／日〜約５０ｇ／日；約０．１ｍｇ／日〜約２５ｇ／日；約０．１ｍｇ／日〜約１０ｇ／日；約０．１ｍｇ〜約３ｇ／日；または約０．１ｍｇ〜約１ｇ／日の範囲内である（この用量は、患者の体重（ｋｇ）、体表面積（ｍ２）、および年齢（歳）について調節することができる）。医薬品の有効量は、臨床医または他の資格のある観察者によって指摘される客観的に確認可能な改善を提供するものである。例えば、患者における腫瘍の退縮は、腫瘍の直径に関連して測定することができる。腫瘍の直径の減少は退縮を意味する。退縮は、治療をやめた後に腫瘍が再発しないことによっても示される。本明細書中で用いられる場合、「効果的な投薬量（dosage effective manner）」とは、対象または細胞において所
望の生物学的効果をもたらす活性化合物の量を指す。
医薬組成物を容器、パック、またはディスペンサー中に投与のための使用説明書とともに含めることができる。
本発明の化合物はさらに塩を形成する可能性がある。これらの形態のいずれも請求される発明の範囲内に含まれることが想定される。
本明細書中で用いられる場合、「薬剤的に許容される塩」は、親化合物がその酸または塩基塩を作製することによって修飾される本発明の化合物の誘導体を指す。薬剤的に許容される塩の例としては、限定されるものではないが、アミン、アルカリなどの塩基性残基の鉱酸もしくは有機酸塩またはカルボン酸などの酸性残基の有機塩などが挙げられる。薬剤的に許容される塩としては、例えば非毒性無機または有機酸から形成される親化合物の通常の非毒性塩または四級アンモニウム塩が挙げられる。例えば、そのような通常の非毒性塩としては、限定されるものではないが、２−アセトキシ安息香酸、２−ヒドロキシエタンスルホン酸、酢酸、アスコルビン酸、ベンゼンスルホン酸、安息香酸、重炭酸、炭酸、クエン酸、エデト酸、エタンジスルホン酸、１，２−エタンスルホン酸、フマル酸、グルコへプトン酸、グルコン酸、グルタミン酸、グリコール酸、グリコール酸、グリコリルアルサニル酸（glycollyarsanilic）、ヘキシルレゾルシン酸、ヒドラバミン酸、臭化水素酸、塩酸、ヨウ化水素酸、ヒドロキシマレイン酸、ヒドロキシナフトエ酸、イソチオン酸、乳酸、ラクトビオン酸、ラウリルスルホン酸、マレイン酸、リンゴ酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、ナプシル酸、硝酸、シュウ酸、パモ酸、パントテン酸、フェニル酢酸、リン酸、ポリガラクツロン酸、プロピオン酸、サリチル（ｓａｌｉｃｙｃｌｉｃ）酸、ステアリン酸、スバセチン酸、コハク酸、スルファミン酸、スルファニリン酸、硫酸、タンニン酸、酒石酸、トルエンスルホン酸、および一般的に存在するアミン酸、例えばグリシン、アラニン、フェニルアラニン、アルギニンなどから選択される無機および有機酸由来のものが挙げられる。
薬剤的に許容される塩の他の例としては、ヘキサン酸、シクロペンタンプロピオン酸、ピルビン酸、マロン酸、３−（４−ヒドロキシベンゾイル）安息香酸、桂皮酸、４−クロロベンゼンスルホン酸、２−ナフタレンスルホン酸、４−トルエンスルホン酸、カンファースルホン酸、４−メチルビシクロ−［２．２．２］−オクト−２−エン−１−カルボン酸、３−フェニルプロピオン酸、トリメチル酢酸、第３ブチル酢酸、ムコ酸などが挙げられる。本発明はまた、親化合物中に存在する酸性プロトンが、金属イオン、例えばアルカリ金属イオン、アルカリ土類金属、またはアルミニウムイオンによって置換されている場合に形成される塩；またはエタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミン、トロメタミン、Ｎ−メチルグルカミンなどの有機塩基との配位体を包含する。塩形態において、化合物と塩のカチオンまたはアニオンとの比は、１：１、または１：１以外の任意の他の比、例えば３：１、２：１、１：２、または１：３であり得ると理解される。
薬剤的に許容される塩に関するすべての言及は、同じ塩の本明細書中で定義されるような溶媒付加形態（溶媒和物）または結晶形態（多形体）を包含すると理解されるべきである。
本発明の化合物は、エステル、例えば薬剤的に許容されるエステルとして調製することもできる。例えば、化合物中のカルボン酸官能基は、その対応するエステル、例えばメチル、エチルまたは他のエステルに変えることができる。また、化合物中のアルコール基は、その対応するエステル、例えば酢酸エステル、プロピオン酸エステルまたは他のエステルに変えることができる。
化合物、またはその薬剤的に許容される塩もしくは溶媒和物を経口、経鼻、経皮、肺、吸入、口腔、舌下、腹腔内、皮下、筋肉内、静脈内、直腸、胸膜内、くも膜下腔内および非経口投与する。１つの実施形態では、化合物を経口投与する。当業者はある投与経路の利点を認めるであろう。
化合物を利用する投薬計画は、患者のタイプ、種、年齢、体重、性別および医学的状態；治療される状態の重篤度；投与経路；患者の腎機能および肝機能；および用いられる特定の化合物またはその塩をはじめとする様々な因子にしたがって選択される。通常の技術を有する医師または獣医師は状態を予防、対抗または状態の進行を阻止するために必要な薬物の有効量を容易に決定し、処方することができる。
開示された本発明の化合物の処方および投与のための技術は、Remington: the Science and Practice of Pharmacy, 19th edition, Mack Publishing Co., Easton, PA (1995)で見出すことができる。１つの実施形態において、本明細書中で記載され
る化合物、およびその薬剤的に許容される塩を、薬剤的に許容される担体または希釈剤と組み合わせた製剤で使用する。好適な薬剤的に許容される担体には、不活性固体フィラーまたは希釈剤および滅菌水溶液または有機溶液が含まれる。化合物は、そのような医薬組成物中、本明細書中で記載される範囲内の所望の投薬量を提供するために充分な量で存在する。
本明細書中で用いられるすべてのパーセンテージおよび比は、別段の指示がない限り、重量基準である。本発明の他の特徴および利点は、様々な実施例から明らかである。提供した実施例は、本発明の実施に有用な様々な成分および方法を示す。実施例は請求される発明を限定しない。本開示に基づいて、当業者は、本発明の実施に有用な他の成分および方法を特定でき、利用できる。
本明細書中で記載される合成スキームにおいて、化合物は、簡単にするために１つの特定の立体配置で描くことができる。そのような特定の立体配置は、本発明を１つまたは別の異性体、互変異性体、位置異性体または立体異性体に限定すると解釈されるべきではなく、また異性体、互変異性体、位置異性体または立体異性体を排除するものでもない；しかしながら、所与の異性体、互変異性体、位置異性体または立体異性体は、別の異性体、互変異性体、位置異性体、または立体異性体よりも高い活性レベルを有し得ると理解される。
上述の方法によって設計、選択および／または最適化された化合物は、一旦製造されると、化合物が生物学的活性を有するかどうかを判定する当業者に公知の様々なアッセイを使用して特徴づけることができる。例えば、分子は、限定されるものではないが、それらが予想される活性、結合活性、および／または結合特異性を有するかどうかを判定するための後述するアッセイをはじめとする通常のアッセイによって特徴づけることができる。
さらに、ハイスループットスクリーニングを使用して、そのようなアッセイを用いる分析を迅速化することができる。 その結果、本明細書中に記載される分子を活性について、当該技術分野で公知の技術を用いて迅速にスクリーニングすることが可能であり得る。ハイスループットスクリーニングを実施するための一般的方法は、例えば、Devlin (1998) High Throughput Screening, Marcel Dekker;および米国特許第５，７６３，２６３号で記載されている。 ハイスループットアッセイは、限定されるものではないが、後述するものをはじめとする１以上の異なるアッセイ技術を使用できる。
本発明のＥＺＨ２阻害剤を、所望により、ＥＺＨ２阻害剤を含む１以上の単位投与形態を含んでもよいキット（たとえば、パックまたはディスペンサーデバイス）で提供してもよい。パックは、例えば金属またはプラスチックホイルを含んでもよく、例えばブリスターパックなどである。パックまたはディスペンサーデバイスは、投与のための説明書を添付してもよい。適合性の医薬担体中に処方された本発明のＥＺＨ２阻害剤を含む組成物も、調製し、適切な容器中に入れ、そして必要を示す状態の治療のためにラベルを貼ることができる。使用説明書も提供され得る。
また、本明細書では、メチル化Ｈ３−Ｋ２７を検出する複数のメチル化検出試薬を含むキットも提供される。例えば、キットは、モノ−メチル化Ｈ３−Ｋ２７、ジ−メチル化Ｈ３−Ｋ２７およびトリメチル化Ｈ３−Ｋ２７検出試薬を含む。検出試薬は、例えば抗体もしくはそのフラグメント、ポリペプチドまたはアプタマーである。
キットはまた、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体のうちの少なくとも１つの成分の機能喪失を検出する試薬、例えば、キットの形態で一緒にパッケージされた、突然変異体成分核酸配列の一部に対して相補性である、オリゴヌクレオチド配列などの相同性核酸配列を有することによって突然変異体成分核酸配列を特異的に同定する核酸あるいは野生型および／または突然変異体成分核酸によってコード化されるタンパク質に対する抗体も含んでもよい。オリゴヌクレオチドは、成分遺伝子のフラグメントであり得る。たとえば、オリゴヌクレオチドは、２００、１５０、１００、５０、２５、１０またはそれ以下のヌクレオチド長であり得る。キットは、別個の容器中に、とりわけ、アプタマーまたは抗体、対照処方（陽性および／もしくは陰性）／または検出可能な標識、例えばフルオレセイン、緑色蛍光タンパク質、ローダミン、シアニン染料、アレクサ染料、ルシフェラーゼ、放射性標識を含んでもよい。加えて、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体の生物学的活性（例えばそのクロマチンリモデリング活性）を検出するための試薬もキット中に含めることができる。
アッセイを実施するための説明書（たとえば、書面、テープ、ＶＣＲ、ＣＤ−ＲＯＭなど）をキットに含めてもよい。アッセイは、例えば当該技術分野で公知のウェスタンブロット分析、免疫組織化学（ＩＨＣ）、免疫蛍光（ＩＦ）、シーケンシングおよび質量分析（ＭＳ）の形態であってよい。
実施例１：ＥＺＨ２の阻害による遺伝子学的に変更されたリンパ腫および悪性ラブドイド腫瘍における耐久性腫瘍退縮
化合物ＡはＥＺＨ２の強力かつ選択的な阻害剤である：放射性標識されたＳＡＭおよびＨ３Ｋ２７に対応するニワトリ赤血球オリゴヌクレオソームまたはペプチドのいずれかを基質として含む無細胞生化学アッセイは、化合物Ａが、２．５±０．５ｎｍｏｌ／Ｌの阻害定数（Ｋｉ）値および１１±５ｎＭ（ヌクレオソームアッセイ）または１６±１２ｎＭ（ペプチドアッセイ）のＩＣ５０値で、野生型ＥＺＨ２を含むヒトＰＲＣ２の活性を選択的に阻害したことを示した。ＩＣ５０値は、ヒトおよびラットＥＺＨ２酵素について、すべての公知リンパ腫機能転換突然変異を有するＥＺＨ２タンパク質についてと同様に類似していた。化合物ＡのＩＣ５０値はＳＡＭの濃度が増加するにつれ増加したが、オリゴヌクレオソームの量の増加によってごくわずかしか影響を受けず、このことはＳＡＭ競合的およびヌクレオソーム非競合的阻害様式と一致する。ＨＭＴ選択性を示すために、リジンおよびアルギニンＨＭＴの両方を含むＥＺＨ２以外のＨＭＴのパネルに対して化合物Ａによる阻害を評価した。化合物Ａは、ＥＺＨ１に対して３５倍の選択性を示し、試験した他の１４のＨＭＴに対して４５００倍高い選択性を示した。
化合物Ａは細胞における細胞性Ｈ３Ｋ２７メチル化を特異的に阻害する：ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２ ＥＺＨ２ Ｙ６４１Ｆ突然変異体リンパ腫細胞を化合物Ａとともに４日間インキュベートする場合、０．２６μＭの平均ＩＣ５０値（ＥＬＩＳＡによって測定したＨ３Ｋ２７Ｍｅ３レベル）で、全体的Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルにおいて濃度に依存した減少が観察された。メチル化阻害の動力学を調査する場合、９０％阻害が３〜４日のインキュベーション後にのみ達成されるので、Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３の半減期は約１日であった。ＯＣＩ−ＬＹ１９ ＥＺＨ２野生型リンパ腫細胞を２．７μＭの化合物Ａとともに４日間インキュベートした場合、影響を受けた唯一のメチルマークは、ＰＲＣ２触媒作用の３つの公知生成物であるＨ３Ｋ２７Ｍｅ１、Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ２およびＨ３Ｋ２７Ｍｅ３であった。化合物Ａとともにインキュベーションすることによって、Ｈ３Ｋ２７アセチル化も増加した。化合物Ａが全体的Ｈ３Ｋ２７トリメチル化レベルを減少させる能力を、野生型または変異ＥＺＨ２のいずれかを発現する系を含むいくつかの他のヒトリンパ腫細胞系でさらに試験した。化合物Ａは、ＥＺＨ２状態と関係なくすべての細胞系において類似の有効性でＨ３Ｋ２７Ｍｅ３を減少させた（表１）。
化合物Ａは、ＥＺＨ２点突然変異を有するリンパ腫細胞系の選択的死滅に至る：化合物ＡとともにＷＳＵ−ＤＬＣＬ２ ＥＺＨ２ Ｙ６４１Ｆ突然変異体細胞をインキュベーションすると、６日増殖アッセイにおいて０．２８±０．１４μＭの平均ＩＣ５０値で抗増殖効果に至る。生存細胞数に対する化合物Ａの効果の動力学を１１日の延長期間にわたってさらに試験した。化合物Ａの抗増殖効果は、化合物Ａが介在する細胞性Ｈ３Ｋ２７メチル化阻害の動力学と一致して、ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞を４日を超える期間化合物に暴露した後に明らかであった。１１日アッセイにおけるＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞の増殖の化合物Ａ阻害のＩＣ５０値（０．００８６μＭ、表１）は、６日増殖アッセイで得られた結果と比較した場合、低く、このことは、インキュベーション期間が長くなると感受性が増大したことを示唆する。ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞と対照的に、１１日にわたるＯＣＩ−ＬＹ１９ヒトリンパ腫細胞（残基Ｙ６４１に関してＥＺＨ２野生型）の成長は、両細胞系に関するＨ３Ｋ２７Ｍｅ３阻害の匹敵するＩＣ５０値にもかかわらず、有意に影響を受けなかった（表１）。１１日の全インキュベーション期間を考慮して細胞が増殖を停止する濃度を特定するために、特定の細胞系の最小細胞毒性濃度（ＬＣＣ）を計算した。ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２ ＥＺＨ２ Ｙ６４１Ｆ突然変異体ヒトリンパ腫細胞のＬＣＣ値は、ＥＺＨ２の野生型であるＯＣＩ−ＬＹ１９細胞と比較した場合に有意に低かった（表１）。この状況に特異的な細胞死滅は、拡張されたリンパ腫細胞系パネルでの１１日増殖アッセイから得られる結果によってさらに裏付けられた。ＲＬ細胞系（ＥＺＨ２ Ｙ６４１Ｎ）を除く、ＥＺＨ２突然変異を有するすべての細胞系は、野生型ＥＺＨ２を有する細胞系と比較した場合、化合物Ａの抗増殖効果に対してより感受性であった（表１）。ファイファー細胞系（ＥＺＨ２ Ａ６７７Ｇ）は、化合物Ａに対する感受性においてＹ６４１突然変異体細胞系よりも、それぞれＩＣ５０値およびＬＣＣによって測定されるように、２０〜３００倍の増加を示した。次に、細胞死滅を持続するために必要な化合物暴露の最低時間を洗い流し実験によって調査した。化合物Ａとともに７日間（続いて７日の化合物洗い流し）、または１４日間連続してインキュベートしたＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞の第１１日または第１４日でのＬＣＣ値は類似していた（表２）。しかしながら、４日間だけの薬物暴露は、連続インキュベーションと類似したＬＣＣ値を誘導するには十分ではなかった。
化合物ＡはＥＺＨ２突然変異体リンパ腫細胞においてＧ１期停止およびアポトーシスを誘導する：次に、ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞における細胞周期の進行およびアポトーシスに対する化合物Ａ（１μＭ）との７日間インキュベーションの効果を評価した。Ｇ１期における細胞のパーセンテージの増加、ならびにＳ期およびＧ２／Ｍ期における細胞のパーセンテージの減少は、化合物Ａインキュベーションの２日後に明らかであった。最大の効果は４日後に達成された。サブＧ１フラクションにおいて明らかな増加はなく、このことは、アポトーシスが７日間の化合物Ａインキュベーションによって誘導されなかったことを示唆する。これは、７日のインキュベーション後にのみ細胞毒性効果が観察されたことを示唆する、化合物Ａの存在下でのＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞の成長曲線と一致する。ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞を化合物Ａとともに最高１４日までインキュベーションした後、ＴＵＮＥＬアッセイによって決定されたアポトーシスを起こした細胞の割合は、ビヒクルと比べて第１４日で有意に増加し、このことは、化合物Ａが介在する細胞死がアポトーシスの誘導によって起こったことを示す。
化合物Ａの経口投与は、マウスにおいてＥＺＨ２突然変異体異種移植片モデルでのＥＺＨ２標的阻害に至る：ＥＺＨ２突然変異体リンパ腫異種移植片を有するマウスにおける化合物の全身暴露およびインビボ標的阻害に対する化合物Ａの経口投薬の効果を調査した。まず、ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２異種移植片を皮下移植したＳＣＩＤマウスに化合物Ａを４または７日間経口投薬した。最終用量の５分前または３時間後のいずれかに化合物Ａ血漿レベルを測定することによって、暴露において明らかに用量に依存した増加が明らかになった。１６０ｍｇ／ｋｇＴＩＤまたは２１３ｍｇ／ｋｇＢＩＤで投薬された動物だけが、投薬サイクル中ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞のＬＣＣを上回る血漿中平均化合物レベルを維持した（１６５２ｎｇ／ｍＬ、マウス血漿タンパク質の結合を考慮して）。最終用量の３時間後に集められた腫瘍からのホモジネートにおける化合物測定によって、最高用量群についてのみ、２コンパートメント中の化合物レベルが類似していたことが明らかになった。腫瘍中のＨ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルを分析した場合、用量に依存したＥＺＨ２標的阻害が観察された。２１３ｍｇ／ｋｇ ＱＤで投薬されたマウス由来の腫瘍でＨ３Ｋ２７Ｍｅ３阻害は低く、このことは、投薬サイクル全体にわたってＬＣＣよりも高く血漿濃度を維持することが最適標的阻害のために必要であることを示唆する。４日間１６０ｍｇ／ｋｇ ＴＩＤで投薬すると、同じ用量およびスケジュールで７日間投薬するよりも若干低い標的阻害が得られ、このことは、投薬を延長するとＷＳＵ−ＤＬＣＬ２腫瘍における標的阻害度が増加することを意味する。ＢＩＤおよびＱＤスケジュールの両方を評価するＫＡＲＡＰＳ−４２２異種移植片を皮下移植したヌードマウスにおける同様の７日実験を実施した。化合物Ａは両レジメンで、腫瘍Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルの用量に依存した減少を誘導した。
化合物Ａは、いくつかのＥＺＨ２突然変異体リンパ腫異種移植片において有意な抗腫瘍効果を誘導する：ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２ ＥＺＨ２ Ｙ６４１Ｆ突然変異体異種移植腫瘍を有するＳＣＩＤマウスを化合物Ａで２８日間治療した場合、１５０ｍｇ／ｋｇ ＴＩＤの最高用量で５８％の、用量に依存した腫瘍成長阻害が観察された。最高用量を投与された動物だけが投薬サイクル中ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞のＬＣＣより高い平均化合物Ａ血漿レベルを維持した。化合物Ａを２８日間投薬すると、７日投薬で観察されるものと対照的に、血漿と比べて腫瘍組織において相対的な化合物の蓄積に至った。第２８日に集められた腫瘍からのヒストンのＥＬＩＳＡ分析は、用量に依存した標的阻害を示した。ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２異種移植片におけるＨ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルは、７日間投薬されたマウスと比べて２８日間投薬されたマウスで低く、このことは、化合物Ａの投与の延長が標的阻害の程度を増加させたことを示す。ＫＡＲＰＡＳ−４２２ ＥＺＨ２ Ｙ４６１Ｎ突然変異体異種移植片において、ＢＩＤスケジュールで化合物Ａを２８日投薬すると、はるかに劇的な効果があった。８０．５ｍｇ／ｋｇ ＢＩＤ程度の低い用量で腫瘍成長阻害が観察されたが、さらに高い用量は異種移植片を根絶させ、投薬停止後、最高９０日間再成長が観察されなかった。２サイクルの７日オン／７日オフおよび２１日オン／７日オフのスケジュールで、間欠投薬スケジュールを、ＫＡＲＰＡＳ−４２２異種移植片を有するマウスにおいて調査した場合、化合物Ａはここでも有意な用量依存性抗腫瘍効果を示した。すべての投薬スケジュールについて、腫瘍成長阻害および完全退縮がそれぞれ９０および３６１ｍｇ／ｋｇ ＢＩＤで観察された。ファイファーＥＺＨ２ Ａ６７７Ｇ突然変異体異種移植片モデルは、インビトロでこの細胞系に対する化合物Ａの強力な抗増殖効果によって示唆されるように、最も感受性の高い腫瘍モデルであった。最低のもの（３０ｍｇ／ｋｇ ＱＤ）を除くすべての化合物Ａ用量群（ＱＤスケジュール）はすべての動物において完全な腫瘍退縮を示した。ここでも、腫瘍再成長は実験の最後（化合物Ａ投与の停止後３６日）まで観察されなかった。腫瘍再成長は３０ｍｇ／ｋｇ ＱＤで観察されたが、この非常に低い用量は投与期間中に腫瘍うっ滞を誘導した。耐容性の問題のために、１１４０ｍｇ／ｋｇ ＱＤを投与したマウスについて第１２日で投薬を停止した；それでも、化合物Ａに１２日間暴露しただけのこの群で耐久性の完全退縮が観察された。
化合物ＡはインビトロおよびインビボでＳＭＡＲＣＢ１突然変異体ＭＲＴ細胞を選択的に殺す：ＥＺＨ２阻害がＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞の成長または生存に対して影響を及ぼしたかどうかを試験した。ＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞系Ｇ４０１およびＡ２０４を化合物Ａとともに１４日増殖アッセイにおいてインビトロでインキュベートすると、ｎＭ範囲のＩＣ５０値で強力な抗増殖効果が誘導され、一方、ＳＭＡＲＣＢ１を発現した対照細胞系ＲＤおよびＳＪＣＲＨ３０はごくわずかしか影響を受けなかった（表３）。皮下Ｇ４０１異種移植片を有するＳＣＩＤのマウスに化合物Ａを２６６または５３２ｍｇ／ｋｇ ＢＩＤで２８日間投薬すると、非常に急速に成長する腫瘍が除去された。ＫＡＲＰＡＳ−４２２およびファイファーＥＺＨ２突然変異体ＮＨＬ異種移植片モデルと同様に、再成長は、実験の最後、投薬停止後３２日で観察されなかった。１３３ｍｇ／ｋｇで投薬された化合物Ａは、投与期間中にうっ滞を誘導し、投薬停止後にビヒクルに比べて有意な腫瘍成長遅延をもたらした。第２１日に各群からのマウスのサブセットから収集した腫瘍は、全ての用量で強力なＥＺＨ２標的阻害を示した。
化合物Ａは用量に依存して非腫瘍組織におけるＨ３Ｋ２７メチル化を阻害する：上記データは、化合物ＡがＳＷＩ／ＳＮＦによって推進されるガンおよびＭＲＴの新規治療様式の代表であることを示す。投薬後の薬力学的バイオマーカー調節の測定を、多くの場合、初期臨床試験で実施して、前臨床モデルからのデータに基づいて応答を生じることが予測される標的阻害の程度を評価する。投薬後腫瘍バイオプシーの収集は多くの場合不可能であるので、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、皮膚または骨髄などのより容易に利用可能な代用組織を多くの場合は代わりに集める。代用組織におけるＥＺＨ２標的阻害を試験するために、オスおよびメススプラグ・ドーリーラットに１００、３００、または１０００ｍｇ／ｋｇの化合物Ａを２８日間経口投与し、そしてＰＢＭＣ、骨髄および皮膚サンプルを実験の最後で集めた。化合物Ａの血漿レベルはオスおよびメスラット両方で用量に依存して増加し、血漿レベルはオスにおいてと比較するとメスにおいての方が概して高かった。耐容性問題のために、１０００ｍｇ／ｋｇ群のメスは第２３日で安楽死させなければならなかった。ＥＬＩＳＡによって測定される、用量依存性標的阻害が、化合物Ａを投薬したラット由来のＰＢＭＣおよび骨髄で観察された。標的阻害の程度は、２８日間投薬されたオス（１０００ｍｇ／ｋｇの同じ用量）と比較して、２２日間投薬されたメス由来のＰＢＭＣについてはあまり顕著ではなかった。ＩＨＣアッセイによって評価されるＨ３Ｋ２７Ｍｅ３陽性細胞における用量依存性減少が、化合物Ａ投薬ラットの皮膚の表皮で観察された。最大の効果は、最高の用量で観察され、化合物Ａ投与の２２日後ですでに明白であった。
化合物Ａは、インビトロで他のＥＺＨ２阻害剤と類似の特性を示し、例えば他のＨＭＴと比較した場合、生化学アッセイにおいてＥＺＨ２について非常に高い特異性、およびＥＺＨ２変異ＮＨＬ細胞系の状況特異的な殺滅に至る細胞性Ｈ３Ｋ２７メチル化の特異的阻害を示した。しかしながら、この化合物は有効性において約１０倍の増加を達成し、これは生化学的および細胞機能アッセイで決定される減少したＫｉおよびＩＣ５０値によって反映される。加えて、化合物Ａはげっ歯類に投与された場合に優れた経口バイオアベイラビリティーを示し、これは異種移植腫瘍および非腫瘍組織での用量依存性ＥＺＨ２標的阻害に至る。重要なことに、化合物Ａの投薬は、ＥＺＨ２突然変異体リンパ腫異種移植片を有するマウスにおいて有意な抗腫瘍効果を誘導した。応答は、腫瘍根絶（投薬停止後に再成長しない）から用量依存性腫瘍成長阻害まで及ぶ。抗腫瘍活性の遅延した発生（４〜７日後）は、細胞を化合物Ａとともにインビトロでインキュベーションすることによって誘導されるメチル化阻害および抗増殖性活性の動力学と一致していた。化合物Ａ血漿レベルを投薬サイクル中ＬＣＣより高く保つことが、ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２異種移植片モデルにとって最大標的阻害および抗腫瘍応答を誘導するために必要であった。しかしながら、他の２つのリンパ腫異種移植片モデル（ＫＡＲＰＡＳ−４２２およびファイファー）は化合物Ａ投与に対して極度に感受性であり、血漿レベルをＬＣＣより高く保つことは必要ではなかった。ファイファーＥＺＨ２ Ａ６７７Ｇ突然変異体異種移植腫瘍は、非常に低い用量または短い投薬期間で恒久的に消滅し、このことは、このタイプの遺伝的に定義されたＮＨＬを有する患者が化合物Ａで有意な治療効果を有することを示唆した。
ＭＲＴは、非常に悪性で、局所的に侵襲性であり、頻繁に転移し、そして特に致死的である脳、腎臓、および軟組織の極度に攻撃的な小児がんであるが、それらは特徴的には二倍体であり、ゲノム異常がない。しかしながら、それらはＳＷＩ／ＳＮＦクロマチンリモデリング複合体のコア成分であるＳＭＡＲＣＢ１の発現の損失のほぼ完全な浸透率によって特徴づけられる。例えば突然変異によって誘導されるＳＭＡＲＣＢ１の両アレル不活性化は、本質的にＭＲＴにおける唯一の遺伝的事象であり、このことは、この遺伝子異常の推進力の役割を示唆する。遺伝学的研究により、ＰＲＣ２およびＳＷＩ／ＳＮＦはＲＢ、Ｃｙｃｌｉｎ Ｄ１およびＭＹＣ経路付近の遺伝子発現を拮抗的に調節することが示唆される。ここで、薬理学的ＥＺＨ２阻害はＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞系において抗増殖効果を誘導し、マウスにおいてＭＲＴ異種移植片を恒久的に根絶させたことが示された。このことは、ＥＺＨ２自体は遺伝子学的に変更されていないガンのＰＲＣ２活性に対する依存性を裏付ける。
化合物Ａは、ＮＨＬの遺伝的に定義されたサブセットおよびＭＲＴに関する新規治療様式の代表である。皮膚、ＰＢＭＣおよび骨髄におけるＨ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルの用量に依存した変化を測定する能力は、ヒト臨床試験における非侵襲性薬力学バイオマーカーとしてのこれらの代用組織からのシグナルの使用の前兆となる。
実施例２：ＥＺＨ２の阻害による遺伝的に改変された悪性ラブドイド腫瘍における耐久性腫瘍退縮
化合物ＡはＥＺＨ２の強力かつ選択的阻害剤である：化合物Ａを反復医薬化学反応によって開発した（図１０Ａ）。化合物Ａは、野生型ＥＺＨ２を含むヒトＰＲＣ２の活性を２．５±０．５ｎＭの阻害定数（Ｋｉ）値で阻害し、同様の効性が、すべての公知リンパ腫機能転換突然変異を有するＥＺＨ２タンパク質について観察された（表５）。化合物は定常状態速度論研究によってＳＡＭ競合的かつヌクレオソーム非競合的であることが見いだされた（図１１）。リジンおよびアルギニンＨＭＴの両方を含むＥＺＨ２以外のＨＭＴのパネルに対する化合物Ａによる阻害も評価した。化合物Ａは、ＥＺＨ１に対して３５倍の選択性を示し、試験した他の１４のＨＭＴに対して４５００倍を超える選択性を示した（表５）。


化合物Ａは、細胞Ｈ３Ｋ２７メチル化を特異的に阻害し、ＳＭＡＲＣＢ１突然変異体ＭＲＴ細胞の選択的アポトーシス死に至る：ＳＭＡＲＣＢ１欠損ＭＲＴ細胞およびＳＭＡＲＣＢ１野生型対照細胞のパネル（イムノブロットによって確認、図１２Ａ）を化合物Ａで４日間処理し、その結果、全体的Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３レベルが濃度に依存して減少した（図１０Ｂおよび表６）。野生型または突然変異体細胞のいずれかの処理の結果、Ｈ３Ｋ２７上のメチルマークだけが縮小し、他のヒストンメチルマークは影響を受けなかった（図１２Ｂ）。ＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞系の化合物Ａでのインビトロ処理は、ｎＭ範囲のＩＣ５０値で強力な抗増殖効果を誘導し；一方、対照（野生型）細胞系はごくわずかしか影響を受けなかった（図１０Ｃおよび表６）。抗増殖効果は化合物暴露の７日後のＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞で明らかであったが、最大活性には１４日の暴露が必要であった。化合物Ａ（１μＭ）とともに１４日間インキュベーションすることの、Ｇ４０１およびＲＤ細胞における細胞周期の進行およびアポトーシスに対する影響も評価した。ＲＤ ＳＭＡＲＣＢ１野生型細胞の化合物Ａインキュベーションは、ＤＭＳＯ対照と比較して細胞周期またはアポトーシスにおいて変化を示さなかった（図１３Ａ）。対照的に、Ｇ４０１ ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞は、Ｇ１期における細胞のパーセンテージの増加と、付随して、７日後のＳ期およびＧ２／Ｍ期で減少を示した（図１３Ｂ）。第７日中でサブＧ１フラクションにおいて明らかな増加はなく、このことは、アポトーシスがその時までにはまだ誘導されていないことを示唆した。これは、インキュベーションの７日後にのみ細胞毒性を示す化合物Ａの存在下でのＧ４０１細胞の成長曲線と一致する（図１０Ｃ）。Ｇ４０１細胞を最高１４日まで化合物Ａで処理した後、サブＧ１における細胞のフラクションならびにＴＵＮＥＬアッセイによって測定されたアポトーシス細胞は、１１〜１４日で時間に依存して増加し、このことは、化合物Ａが介在する細胞死がアポトーシスの誘導によって起こったことを示す（図１３Ｂ）。
化合物Ａは、ヘッジホッグ経路遺伝子、ＭＹＣおよびＥＺＨ２の発現を抑制しつつ神経分化および細胞周期阻害の遺伝子を誘導する：ＳＭＡＲＣＢ１損失は、重要なガン経路の同時エピジェネティック摂動によりガン形成を誘導することを示唆する。このデータは、すでに記載された、神経分化に重要な遺伝子（ＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４、ＰＴＰＲＫ）、細胞周期阻害に重要な遺伝子（ＣＤＫＮ２Ａ）および腫瘍抑制に重要な遺伝子（ＢＩＮ１）の減少した発現、ならびに対照細胞と比較したＳＭＡＲＣＢ１欠失Ｇ４０１細胞におけるヘッジホッグ経路遺伝子ＧＬＩ１の増加した発現（図１４Ａ）を裏付けた。７日までのＧ４０１細胞の化合物Ａ処理はＣＤ１３３、ＤＯＣＫ４およびＰＴＰＲＫの発現を強力に誘導し、細胞周期阻害剤ＣＤＫＮ１ＡおよびＣＤＫＮ２Ａならびに腫瘍抑制因子ＢＩＮ１を上方調節し、全て時間依存性であった（図１４Ｂ）。同時に、ヘッジホッグ経路遺伝子、ＭＹＣおよびＥＺＨ２の発現は減少した。特に、化合物Ａに１４日間暴露されたＧ４０２ＳＭＡＲＣＢ１欠失細胞はニューロン様形態をとった（図１４Ｃ）。対照的に、ＲＤ対照細胞の化合物Ａインキュベーションは、上記遺伝子の発現に対する影響が最小の影響であった。
化合物ＡはＳＭＡＲＣＢ１突然変異体ＭＲＴ異種移植片を除去する：化合物Ａの経口投与は、ＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ異種移植片を有するマウスにおいて化合物の全身暴露、インビボ標的阻害および抗腫瘍活性に至った。皮下Ｇ４０１異種移植片を有するＳＣＩＤマウスにおける実験を実施し、この場合、動物に２１日間化合物を投与した。１群につきマウスの半分を第２１日に安楽死させて、血液および組織を集め、一方、残りの動物はさらなる７日間は治療し、別の３２日間は投薬せずに放置した。化合物Ａはすべての用量で充分耐容性であり、体重に対する効果は最小であった（図１５Ａ）。２５０または５００ｍｇ／ｋｇで１日２回（ＢＩＤ）、２１〜２８日間の投薬は、迅速に成長するＧ４０１腫瘍を実際に除去した（図１５Ｂ、１４Ｃおよび１６Ａ）。投薬停止後３２日間再成長は観察されなかった。１２５ｍｇ／ｋｇで投与された化合物Ａは、投与期間中、腫瘍うっ滞を誘導し、投薬期間後のビヒクルと比較して有意な腫瘍成長遅延を生じた。第２１日の投薬の５分前または３時間後のいずれかの化合物Ａ血漿レベルを測定することによって、全身暴露において明らかな用量に依存した増加が明らかになった（図１５Ｄ）。第２１日に各群からのマウスのサブセットから収集した腫瘍は、Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３の強力な阻害を示し、抗腫瘍活性と相関した（最大効果は２５０ｍｇ／ｋｇで達成された、図１６Ｂ）。加えて、ＣＤ１３３、ＰＴＰＲＫ、ＤＯＣＫ４およびＧＬＩ１の発現における用量に依存した変化がＧ４０１異種移植腫瘍で検出された（図１６Ｃ）。
このデータは、ＥＺＨ２の薬理学的阻害が抗増殖性効果を特にＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴ細胞系において誘導し、そしてマウスにおいてＭＲＴ異種移植片を永久的に除去したことを示す。このことは、ＥＺＨ２自体はこれに関連して遺伝的に改変されていないという事実にかかわらず、そのようなガンのＰＲＣ２活性に対する依存性を裏付ける。本明細書中で提示されるデータは、ＳＭＡＲＣＢ１欠失ＭＲＴの関連で、ＥＺＨ２の阻害が、ＧＬＩ１、ＰＴＣＨ１、ＭＹＣおよびＥＺＨ２を減少させつつ、ＳＭＡＲＣＢ１代理として機能し、神経分化遺伝子、細胞周期阻害剤および腫瘍抑制因子を活性化することを示す。複数のガン経路に対する化合物Ａ介在性ＥＺＨ２阻害の効果の合計は、ＭＲＴモデルにおいてみられる劇的かつ永久的な抗腫瘍活性の原因である。したがって、化合物Ａは、致死的小児腫瘍のためのこれらの新規治療手順の代表である。
さらに、ＳＷＩ／ＳＮＦ複合体のいくつかのメンバーはＭＲＴ以外の他のガン型では遺伝的に改変されるので、ＥＺＨ２はまた、様々なガン型において腫瘍維持および生存に関与すると考えられる。ＥＺＨ２突然変異体を有する非ホジキンリンパ腫の選択的殺滅におけるＥＺＨ２阻害剤の有効性を示す最近の報告と組み合わせて、このデータは、ＥＺＨ２の小分子に基づく阻害が、標的に直接的または間接的のいずれかの遺伝子変化がＥＺＨ２酵素活性に対して増殖性依存状態を付与する様々な血液系および固体腫瘍における治療的介入の有効な機構であることを示す。
実施例３：材料および方法
細胞培養：細胞系２９３Ｔ、ＲＤ、ＳＪＣＲＨ３０、Ａ２０４、Ｇ４０１、Ｇ４０２、およびＫＹＭ−１。２９３Ｔ（ＣＲＬ−１１２６８）、ＲＤ（ＣＲＬ−１３６）、ＳＪＣＲＨ３０（ＣＲＬ−２０６１）、Ａ２０４（ＨＴＢ−８２）、Ｇ４０１（ＣＲＬ−１４４１）、およびＧ４０２（ＣＲＬ−１４４０）をＡＴＣＣから入手した。ＫＹＭ−１（ＪＣＲＢ０６２７）をＪＣＲＢから入手した。２９３ＴおよびＲＤ細胞をＤＭＥＭ＋１０％ＦＢＳ中で培養した。ＳＪＣＲＨ３０細胞をＲＰＭＩ＋１０％ＦＢＳ中で培養した。Ａ２０４、Ｇ４０１、およびＧ４０２細胞をＭｃＣｏｙｓ ５ａ＋１０％ＦＢＳ中で培養した。ＫＹＭ−１細胞をＤＭＥＭ／ハムのＦ１２＋１０％ＦＢＳ中で培養した。
ウェスタンブロット分析：ヒストンをすでに記載されたようにして酸抽出した（Daigle et al., Blood. 2013 Aug 8;122(6):1017-25）。酸で抽出されたヒストンについてのウェスタンブロットをすでに記載されているようにして実施した（Knutson et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 May 7;110(19):7922-7）。全細胞溶解物（ＷＣＬ）を、修飾ＲＩＰＡ緩衝液（１０ｘＲＩＰＡ Ｌｙｓｉｓ緩衝液（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ ＃２０−１８８）、０．１％ＳＤＳ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ ＡＭ９８２３）、プロテアーゼミニ錠剤（Ｒｏｃｈｅ ＃１８３６１５３））を用いて実施した。細胞をペレット化し、氷冷ＰＢＳで洗浄し、氷冷ＲＩＰＡ緩衝液中に再懸濁させた。５分間氷上でインキュベートする。溶解物を３回１０秒間、５０％出力で音波処理し、次いで氷上で１０分間インキュベートした。溶解物を次いで最大速度にて１５分間、４度にて卓上遠心分離機中で遠心分離した。清澄化された溶解物を新しい管に等分し、そしてＷＣＬのタンパク質濃度をＢＣＡアッセイ（Ｐｉｅｒｃｅ）によって測定した。１０マイクログラムの各溶解物を１０〜２０％トリス−グリシンゲル（Ｂｉｏｒａｄ）上で分画し、ｉＢｌｏｔ（プログラム３で７分、ニトロセルロース転送スタックを使用）を用いて移し、そしてＯｄｙｓｓｅｙブロッキング緩衝液中で以下の抗体でプローブした：ＳＮＦ５（ＣＳＴ ＃８７４５），ＥＺＨ２（ＣＳＴ ＃５２４６）、およびベータ−アクチン（ＣＳＴ ＃３７００）。
インビトロ細胞アッセイ：接着細胞系増殖アッセイ（懸濁細胞系についてすでに記載されているようにして分析したＫＹＭ−１を除くすべての細胞系（(Daigle et al., Blood. 2013 Aug 8;122(6):1017-25）、各細胞系の播種密度を成長曲線（ＡＴＰ生存率によって測定）および７日間の時間経過にわたる密度に基づいて決定した。化合物処理の前日に、細胞を９６ウェルプレート中に３連で（第０日〜第７日の時間経過）または６ウェルプレート（残りの時間経過のために第７日に再播種するため）のいずれかで播種した。第０日に、細胞を、非処理、ＤＭＳＯ処理、または１０ｕＭで始めて、３倍もしくは４倍希釈で減少する化合物Ａで処理のいずれかであった。プレートを第０日、第４日、および第７日にＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）（Ｐｒｏｍｅｇａ）を使用して読み取り、化合物／培地を第４日に補充した。第７日に、６ウェルプレートをトリプシン処理し、遠心分離し、そしてＶｉ−Ｃｅｌｌによってカウントするために新鮮な培地中に再懸濁させた。各処理からの細胞を９６ウェルプレート中に３連で元の密度にて再播種した。細胞をプレートに一晩付着させ、そして細胞を第０日と同様に処理した。第７日、第１１日および第１４日に、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）を使用してプレートを読み取り、化合物／培地を第１１日に補充した。３連の平均を用いて、増殖を経時的にプロットし、ＩＣ５０値を算出した。細胞周期およびアポトーシスについて、Ｇ４０１およびＲＤ細胞を１５ｃｍの皿中に２連で１×１０６細胞／プレートの密度にて播種した。細胞を１ｕＭの化合物Ａとともに、合計２５ｍＬ中で１４日にわたってインキュベートし、細胞を分割して第４日、第７日、および第１１日に元の播種密度に戻した。細胞周期分析およびＴＵＮＥＬアッセイを、Ｇｕａｖａ（登録商標）フローサイトメーターを使用し、製造業者のプロトコルにしたがって実施した。
遺伝子発現分析：Ｇ４０１およびＲＤ細胞をＴ−７５フラスコ中にそれぞれ１７５，０００細胞／フラスコおよび１１７，０００細胞／フラスコで播種し、一晩付着させた。第０日に、細胞をＤＭＳＯまたは１ｕＭの化合物Ａで２連で処理した。細胞を第２日、第４日、および第７日に収集し、ペレット化し、培地および化合物を第４日に補充した。２１日間投薬した（ビヒクル、１２５ｍｇ／ｋｇ、および２５０ｍｇ／ｋｇ（それぞれ６匹の動物）ならびに５００ｍｇ／ｋｇ（４匹の動物）化合物Ａ投与群）Ｇ４０１異種移植片動物の腫瘍組織を遺伝子発現分析のために使用した。全ｍＲＮＡを細胞ペレットおよび腫瘍組織から、ＲＮｅａｓｙ Ｍｉｎｉキット（Ｑｉａｇｅｎ ＃７４１０６）を使用して抽出し、Ｈｉｇｈ Ｃａｐａｃｉｔｙ ｃＤＮＡ逆転写キット（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ （ＡＢ）＃４３６８８１３）によって逆転写した。ＲＴ−ＰＣＲを、ＴａｑＭａｎ Ｆａｓｔ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（ＡＢ ＃４４４４９６４）および以下の表中のＴａｑＭａｎプライマー／プローブセットを使用するＶｉｉＡ（商標）７ Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍｓ（ＡＢ）によって実施した。遺伝子発現を１８Ｓ（ＡＢ ＃Ｈｓ９９９９９９０１＿ｓ１）に対して正規化し、ΔΔＣｔ法を用いて変化（倍）を算出した。インビボサンプルについて、平均Ｃｔ値＋／−ＳＤを各用量群について決定し、ビヒクル用量群と比較した変化（倍）を、ΔΔＣｔ法を用いて算出した。
ＥＬＩＳＡ：ヒストンを前述のように腫瘍から単離し（Ｄａｉｇｌｅ ｅｔ ａｌ）そしてコーティング緩衝液（０．０５％ＢＳＡを含むＰＢＳ）中、等濃度（Ｈ３について０．５ｎｇ／ｕｌおよびＨ３Ｋ２７Ｍｅ３について４ｎｇ／ｕｌ）で調製した。サンプルまたは標準（１００μＬ）を２つの９６ウェルＥＬＩＳＡプレート（Ｔｈｅｒｍｏ Ｌａｂｓｙｓｔｅｍｓ， Ｉｍｍｕｌｏｎ ４ＨＢＸ ＃３８８５）に２連で添加した。ＤＭＳＯまたは１０μｍｏｌ／Ｌ化合物Ａで４日間処理したＧ４０１細胞から単離されたヒストンを対照ウェルに腫瘍ヒストンサンプルと同じヒストン濃度で添加した。プレートを密封し、一晩４℃でインキュベートした。翌日、プレートをＢｉｏ Ｔｅｋプレートウォッシャーで、３００μＬ／ウェルのＰＢＳＴ（０．０５％Ｔｗｅｅｎ ２０を有するＰＢＳ；１０ｘＰＢＳＴ、ＫＰＬ ＃５１−１４−０２）で３回洗浄した。プレートを３００μＬ／ウェルの希釈剤（ＰＢＳ＋２％ＢＳＡ＋０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）でブロックし、室温で２時間インキュベートし、そしてＰＢＳＴで３回洗浄した。すべての抗体を希釈剤中で希釈した。１００ｕＬ／ウェルの抗Ｈ３Ｋ２７Ｍｅ３（ＣＳＴ＃９７３３、５０％グリセロールストック１：１０００）または抗全Ｈ３（Ａｂｃａｍ ＃ａｂ１７９１、５０％ グリセロールストック１：１０，０００）を各プレートに添加した。プレートを９０分間室温でインキュベートし、そしてＰＢＳＴで３回洗浄した。１００μＬ／ウェルの抗Ｒｂ−ＩｇＧ−ＨＲＰ（Ｃｅｌｌ Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， ７０７４）を１：２０００でＨ３Ｋ２７Ｍｅ３プレートに添加し、１：６０００でＨ３プレートに添加し、そして９０分間室温でインキュベートした。プレートをＰＢＳＴで４回洗浄した。検出のために、１００μＬ／ウェルのＴＭＢ基質（ＢｉｏＦｘ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ， ＃ＴＭＢＳ）を添加し、そしてプレートを暗所で室温にて５分間インキュベートした。１００μＬ／ウェルの１Ｎ Ｈ２ＳＯ４で反応を停止させた。４５０ｎｍでの吸光度をＳｐｅｃｔｒａＭａｘ Ｍ５マイクロプレートリーダーで読み取った。
異種移植片研究：この実験での動物取り扱い、世話および治療に関するすべての手順は、実験動物ケア評価認証協会（ＡＡＡＬＡＣ）のガイドラインにしたがったＳｈａｎｇｈａｉ Ｃｈｅｍｐａｒｎｅｒの動物ケアおよび使用委員会（ＩＡＣＵＣ）により承認されたガイドラインにしたがって実施した。インビボ実験に関して、腫瘍発生のために、マウスの右脇腹に０．２ｍｌの基本培地とＭａｔｒｉｇｅｌとの混合物（ＭｃＣｏｙ’ｓ ５Ａ： Ｍａｔｒｉｇｅｌ＝１：１）中Ｇ−４０１腫瘍細胞（５ｘ１０６／マウス）を皮下接種した。腫瘍有効性研究について、腫瘍サイズが約１５７ｍｍ３に達したら、治療を開始した（１群あたりｎ＝１６）。化合物Ａまたはビヒクル（水中０．５％のＮａＣＭＣ＋０．１％のＴｗｅｅｎ−８０）を１０μＬ／ｇの投薬体積でＢＩＤにて２１または２８日間経口投与した。動物の体重を最初の１週間毎日測定し、その後、実験の残りは１週間に２回測定した。腫瘍サイズを１週間に２回、カリパーを用いて２つの寸法で測定し、体積をｍｍ３で表した。ＰＫ／ＰＤ分析のために、最大の腫瘍負荷を有する８匹のマウスを、２１日の投薬後に腫瘍および血液収集のために安楽死させた。残りのマウスはさらに１週間投薬を続け、第２９日から、治療を停止し、マウスを腫瘍成長遅延試験に登録した。マウスを腫瘍重量終点（２０００ｍｍ３）に達するまで、または第６０日まで（どちらか早いほう）、個別に観察した。
薬物動態分析：デキサメタゾンを内部標準として使用した。３０μＬ血漿サンプルのアリコートを３０μＬのＩＳ（デキサメタゾン、１０００ｎｇ／ｍＬ）および１５０μＬのＡＣＮとともに添加した。混合物を５分間ボルテックスし、１４０００ｒｐｍで５分間遠心分離した。２μＬの上清のアリコートをＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析のために注入した（Ｑ−ｔｒａｐ ３２００）。１０倍希釈血漿サンプルについて、３μＬ血漿サンプルのアリコートに２７μＬのブランク血漿を添加し、希釈係数は１０であり、次いで３０μＬのＩＳ（デキサメタゾン、１０００ｎｇ／ｍＬ）および１５０μＬのＡＣＮを添加した。混合物を５分間ボルテックスし、１４０００ｒｐｍで５分間遠心分離した。２μＬ上清のアリコートをＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析のために注入した。腫瘍サンプルをＢｅａｄｂｅａｔｅｒ（登録商標）で３０秒間３ｘＰＢＳ（ｗ／ｖ）で均質化して、腫瘍ホモジネートを得た。３０μＬ腫瘍ホモジネートサンプルのアリコートに３０μＬのＩＳ（デキサメタゾン、１０００ｎｇ／ｍＬ）および１５０μＬのＡＣＮを添加した。混合物を５分間ボルテックスし、１４０００ｒｐｍで５分間遠心分離した。２μＬ上清のアリコートをＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析のために注入した。
実施例４：一般的実験手順
ＮＭＲ
特に指定のない限り、ＣＤＣｌ３を使用して１Ｈ−ＮＭＲスペクトルを取得し、そしてＶａｒｉａｎまたはＯｘｆｏｒｄ ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ ｍａｇｎｅｔ（５００ＭＨｚ）装置を使用して４００ＭＨｚまたは５００ＭＨｚで記録した。表示された多重度は、ｓ＝一重線、ｄ＝二重線、ｔ＝三重線、ｑ＝四重線、ｑｕｉｎｔ＝五重線、ｓｘｔ＝六重線、ｍ＝多重線、ｄｄ＝二重線の二重線、ｄｔ＝三重線の二重線である；ｂｒはブロードなシグナルを示す。
ＬＣＭＳおよびＨＰＬＣ
Ｓｈｉｍａｄｚｕ ＬＣ−Ｑ、Ｓｈｉｍａｄｚｕ ＬＣＭＳ−２０１０ＥＶまたはＷａｔｅｒｓ Ａｃｑｕｉｔｙ Ｕｌｔｒａ Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ ＬＣ。ＨＰＬＣ：生成物を、１５０×４．５ｍｍ ＹＭＣ ＯＤＳ−Ｍ８０カラムまたは１５０×４．６ｍｍ
ＹＭＣ−パック Ｐｒｏ Ｃ１８カラムを有するＳｈｉｍａｄｚｕ ＳＰＤ−２０Ａにより１．０ｍｌ／分で分析した。
移動相はＭｅＣＮ：Ｈ２Ｏ＝３：２（０．３％ＳＤＳおよび０．０５％Ｈ３ＰＯ４を含む）、０．０５％ 水中ＴＦＡ、０．０５％アセトニトリル中ＴＦＡ（勾配 初期２０％、次いで０．０５％ＴＦＡ／ＭｅＣＮから３分で濃度〜９５％、０．５分間保持、３．５１〜４．５０分で、次いで０．０５％ＴＦＡ／ＭｅＣＮ濃度２０％）。
あるいは、ＬＣＭＳ、２つの異なる方法を使用した；我々が最も使用するものは、高ｐＨ（ＭＥＴＣＲ１６００）であり、もう１つはより標準的な化合物についてである（ＭＥＴＣＲ１４１６）。
０．１％水中ギ酸−移動相「Ａ」 ０．１％アセトニトリル中ギ酸−移動相「Ｂ」、Ｗａｔｅｒｓ Ａｔｌａｎｔｉｓ ｄＣ１８、２．１ｍｍ×１００ｍｍ、３μｍカラムを、流量＝０．６ｍｌ／ｍｉｎ カラム温度＝４０℃；時間（分）％Ｂ ０．００分 ５％Ｂ． ５．０分 １００％ Ｂ、５．４分 １００％ Ｂおよび０．４２分 ５％Ｂで使用。
３．５分法とは、Ａｔｌａｎｔｉｓ ｄＣ１８、２．１ｍｍ×５０ｍｍ、３μｍカラム、４０℃で１ｍｌ／分の流量を指す。移動相Ａ ギ酸（水溶液）０．１％ 移動相Ｂ ギ酸（ＭｅＣＮ） ０．１％、注入３μＬ、勾配 ０分（５％有機）、２．５分（１００％有機）、２．７分（１００％有機）、２．７１分（５％有機）、３．５分（５％有機）
７．０分法は、Ａｔｌａｎｔｉｓ ｄＣ１８、２．１ｍｍ×１００ｍｍ、３μｍカラム、４０℃で流量６ｍｌ／ｍｉｎ 移動相Ａ ギ酸（水溶液）０．１％ 移動相Ｂ ギ酸（ＭｅＣＮ） ０．１％、注入 ３μＬ、勾配 ０分（５％有機）、５分（１００％有機）、５．４分（１００％有機）、５．４２分（５％有機）、７分（５％有機）を指す。
３．５および７分法の両方を、ＬＣ−２０ＡＢポンプおよびＳＰＤ−Ｍ２０Ａ ＰＤＡ検出器を利用するＭＳ１８ Ｓｈｉｍａｄｚｕ ＬＣＭＳ−２０１０ＥＶまたはＭＳ１９ Ｓｈｉｍａｄｚｕ ＬＣＭＳ−２０１０ＥＶシステムで実施した。
３１００ Ｍａｓｓ Ｄｅｔｅｃｔｏｒを有するＷａｔｅｒｓ ＡｕｔｏＰｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍを使用するＨＰＬＣ／ＭＳによって生成物を精製した。
ＨＰＬＣ分析はまた、Ｓｈｉｍｄａｚｕ ＬＣ−２０１０ＣＨＴでＹＭＣ ＯＤＳ−Ａ、Ｃ１８、（１５０×４．６×５μｍ）カラムを周囲温度にて１．４ｍｌ／分の流量で使用して実施してもよい。１０μｌの注入体積を使用し、検出はＵＶ／ＰＤＡによって行う。移動相Ａは水中５％ＴＦＡであり、移動相Ｂはアセトニトリル中０．０５％ＴＦＡであり、勾配プログラムは最初５％Ｂから８分で９５％Ｂ、１．５分間保持、９．５１〜１２分Ｂ。濃度０．５％。希釈剤は移動相である。
その他
自動フラッシュクロマトグラフィーを、１２ｍｌ／分で流す１０ｇ ＳＮＡＰカートリッジまたは２５ｍｌ／分で流す２５ｇ ＳＮＡＰカートリッジならびに２５４ｎｍおよび２８０ｎｍで検出するＢｉｏｔａｇｅ Ｉｓｏｌｅｒａ ｖｅｒｓｉｏｎ ４で実施した。
選択的なニトリル還元は、実験手順で記載した条件にしたがってＴｈａｌｅｓＮａｎｏ Ｈ−Ｃｕｂｅ（登録商標）で実施することができる。
他の関連する一般的手順は、ＰＣＴ公開番号ＷＯ１２／１１８８１２、ＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＵＳ２０１２／０３３６４８およびＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＵＳ２０１２／０３３６６２でも見出すことができ、そのそれぞれは全体として参照により本明細書中に組み込まれる。
実施例５：Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−５−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミドの合成
ステップ１：５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸の合成
２−メチル−３−ニトロ安息香酸（１００ｇ、５５２ミリモル）の濃Ｈ２ＳＯ４（４００ｍＬ）中撹拌溶液に、１，３−ジブロモ−５，５−ジメチル−２，４−イミダゾリジンジオン（８８ｇ、３０８ミリモル）を室温で少しずつ添加し、反応混合物を次いで室温で５時間撹拌した。反応混合物を氷冷水上に注ぎ、析出した固体を濾過で除去し、水で洗浄し、真空下で乾燥して、所望の化合物を固体として得た（１４０ｇ、９８％）。単離された化合物を次のステップに直接使用した。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 8.31 (s, 1H), 8.17 (s, 1H), 2.43 (s, 3H)．
ステップ２：５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸メチルの合成
室温の５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸（２８５ｇ、１１０５ミリモル）のＤＭＦ（２．８Ｌ）中撹拌溶液に、炭酸ナトリウム（４６８ｇ、４４１５ミリモル）を添加し、続いてヨウ化メチル（６２６．６ｇ、４４１５ミリモル）を添加した。結果として得られた反応混合物を６０℃で８時間加熱した。完了（ＴＬＣによってモニタリング）後、反応混合物を濾過（炭酸ナトリウムを除去）し、酢酸エチル（１Ｌ×３）で洗浄した。合したろ液を水で洗浄し（３Ｌ×５）、水相を酢酸エチルで逆抽出した（１Ｌ×３）。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、表題化合物を固体として得た（２９０ｇ、９７％収率）。単離された化合物を次のステップに直接使用した。1H NMR (CDCl3, 400 MHz) δ 8.17 (s, 1H), 7.91 (s, 1H), 3.96
(s, 3H), 2.59 (s, 3H).
ステップ３：３−アミノ−５−ブロモ−２−メチル安息香酸メチルの合成
５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸メチル（２９０ｇ、１０５８ミリモル）のエタノール（１．５Ｌ）中撹拌溶液に、塩化アンモニウム水溶液（２８３ｇ、５２９０ミリモル、１．５Ｌの水中に溶解）を添加した。結果として得られた混合物を８０℃で撹拌し、これに鉄粉（４７２ｇ、８４５１ミリモル）を少しずつ添加した。結果として得られた反応混合物を８０℃で１２時間加熱した。ＴＬＣによって確認して反応が完了したら、反応混合物をセライト（登録商標）上で熱時濾過し、セライト床をメタノール（５Ｌ）で洗浄し、続いて３０％のＤＣＭ中ＭｅＯＨ（５Ｌ）で洗浄した。合したろ液を真空中で濃縮し、得られた残留物を重炭酸ナトリウム水溶液（２Ｌ）で希釈し、酢酸エチル（５Ｌ×３）で抽出した。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、表題化合物を固体として得た（２２０ｇ、８５％）。化合物を次のステップに直接使用した。1H NMR (CDCl3, 400 MHz) δ 7.37 (s, 1H), 6.92 (s, 1H), 3.94 (s, 3H), 3.80 (bs, 2H), 2.31 (s, 3H).
ステップ４：５−ブロモ−２−メチル−３−（（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）安息香酸メチルの合成
３−アミノ−５−ブロモ−２−メチル安息香酸メチル（１５ｇ、６１．５ミリモル）およびジヒドロ−２Ｈ−ピラン−４（３）−オン（９．２ｇ、９２ミリモル）のジクロロエタン（３００ｍＬ）中撹拌溶液に、酢酸（２２ｇ、３６９ミリモル）を添加し、反応混合物を室温で１５分間撹拌し、次いで反応混合物を０℃まで冷却し、ナトリウムトリアセトキシボロヒドリド（３９ｇ、１８４ミリモル）を添加した。反応混合物を室温で一晩撹拌した。ＴＬＣによって確認して反応が完了したら、ｐＨ７〜８が得られるまで、重炭酸ナトリウム水溶液を反応混合物に添加した。有機相を分離し、水相を酢酸エチルで抽出した。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮した。粗化合物をカラムクロマトグラフィー（１００〜２００メッシュシリカゲル）によって精製し、酢酸エチル：ヘキサンで溶出させて、所望の化合物を固体として得た（１４ｇ、６９％）。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 7.01 (s, 1H), 6.98 (s, 1H), 5.00 (d, 1H, J=7.6 Hz), 3.84-3.87 (m, 2H), 3.79 (s, 3H), 3.54-3.56 (m, 1H), 3.43 (t, 2H, J=12 Hz), 2.14 (s, 3H), 1.81-1.84 (m, 2H), 1.47-1.55 (m, 2H).
ステップ５：５−ブロモ−３−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチルの合成
５−ブロモ−２−メチル−３−（（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）安息香酸メチル（１４ｇ、４２．７ミリモル）のジクロロエタン（１５０ｍＬ）中撹拌溶液に、アセトアルデヒド（３．７５ｇ、８５．２ミリモル）および酢酸（１５．３ｇ、２５６ミリモル）を添加した。結果として得られた反応混合物を室温で１５分間撹拌した。混合物を０℃まで冷却し、ナトリウムトリアセトキシボロヒドリド（２７ｇ、１２８ミリモル）を添加した。反応混合物を室温で３時間撹拌した。ＴＬＣによって確認して反応が完了したら、ｐＨ７〜８が得られるまで重炭酸ナトリウム水溶液を反応混合物に添加し、有機相を分離し、水相を酢酸エチルで抽出した。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮した。粗化合物をカラムクロマトグラフィー（１００〜２００メッシュシリカゲル）により精製し、酢酸エチル：ヘキサンで溶出させて、所望の化合物を粘稠性液体として得た（１４ｇ、９３％）。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 7.62 (s, 1H), 7.52 (s, 1H), 3.80 (bs, 5H), 3.31 (t, 2H), 2.97-3.05 (m, 2H), 2.87-2.96 (m, 1H), 2.38 (s, 3H), 1.52-1.61 (m, 2H), 1.37-1.50 (m, 2H), 0.87 (t, 3H, J=6.8 Hz).
ステップ６：５−ブロモ−Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−３−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−２−メチルベンズアミドの合成
５−ブロモ−３−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−２−メチルベンゾエート（１４ｇ、３９．４ミリモル）のエタノール（１００ｍＬ）中撹拌溶液に、ＮａＯＨ水溶液（２．３６ｇ、２５ｍＬの水中５９．２ミリモル）を添加し、結果として得られた混合物を６０℃で１時間撹拌した。ＴＬＣによって確認して反応が完了したら、溶媒を減圧下で除去し、ｐＨ７が得られるまで、得られた残留物を１Ｎ ＨＣｌで酸性化し、次いでｐＨ５〜６が得られるまでクエン酸水溶液を添加した。水層を１０％ＤＣＭ中ＭｅＯＨで抽出し（２００ｍＬ×３）、合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、各酸を得た（１４ｇ、１００％）。
上記酸（１４ｇ、４０．９ミリモル）を次いでＤＭＳＯ（７０ｍＬ）中に溶解させ、３−（アミノメチル）−４，６−ジメチルピリジン−２（１Ｈ）−オン（１２．４ｇ、８１．９ミリモル）をそれに添加した。反応混合物を室温で１５分間撹拌し、次いでＰＹＢＯＰ（３１．９ｇ、６１．４ミリモル）を添加し、撹拌を室温で一晩続けた。ＴＬＣによって確認して反応が完了したら、反応混合物を氷冷水（７００ｍＬ）中に注ぎ、３０分間撹拌し、析出した固体を濾過によって集め、水（５００ｍＬ）で洗浄し、風乾した。得られた固体をアセトニトリル（７５ｍＬ×２）とともに撹拌し、ろ過し、風乾した。得られた固体を再度５％ＤＣＭ中ＭｅＯＨ（１００ｍＬ）とともに撹拌し、ろ過し、真空下で完全に乾燥して、表題化合物を固体として得た（１４ｇ、７４％）。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 11.47 (s, 1H), 8.23 (t, 1H), 7.30 (s, 1H), 7.08 (s, 1H), 5.85 (s, 1H), 4.23 (d, 2H, J=4.4 Hz), 3.81 (d, 2H, J=10.4 Hz), 3.20-3.26 (m, 2H), 3.00-3.07 (m, 1H), 2.91-2.96 (m, 2H), 2.18 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 1.58-1.60 (m, 2H), 1.45-1.50 (m, 2H), 0.78 (t, 3H, J=6.8 Hz).
ステップ７：Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−５−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミドの合成
５−ブロモ−Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−３−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−２−メチルベンズアミド（１４ｇ、２９．５ミリモル）のジオキサン／水混合物（７０ｍＬ／１４ｍＬ）中撹拌溶液に、４−（４−（４，４，５，５−テトラメチル−１，３，２−ジオキサボロラン−２−イル）ベンジル）モルホリン（１３．４ｇ、４４．２ミリモル）を添加し、続いてＮａ２ＣＯ３（１１．２ｇ、１０６．１ミリモル）を添加した。溶液をアルゴンで１５分間パージし、次いでＰｄ（ＰＰｈ３）４（３．４０ｇ、２．９４ミリモル）を添加し、そして溶液を再度アルゴンでさらに１０分間パージした。反応混合物を１００℃で４時間加熱した。完了（ＴＬＣによってモニタリング）後、反応混合物を水で希釈し１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭで抽出した。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮した。粗化合物をカラムクロマトグラフィー（１００〜２００メッシュシリカゲル）により精製し、メタノール：ＤＣＭで溶出させて、固体としての表記化合物を得た（１２ｇ、７１％）。分析データ：ＬＣＭＳ：５７３．３５（Ｍ＋１）＋；ＨＰＬＣ：９９．５％（＠２５４ｎｍ）（Ｒｔ；３．９９９；方法：カラム：ＹＭＣ ＯＤＳ−Ａ １５０ｍｍ×４．６ｍｍ×５μ；移動相：Ａ；０．０５％水中ＴＦＡ／Ｂ；０．０５％アセトニトリル中ＴＦＡ；注入体積：１０μＬ、カラム温度：３０℃；流量：１．４ｍＬ／分；勾配：８分で５％Ｂから９５％Ｂ、１．５分間保持、９．５１〜１２分５％Ｂ）； 1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 11.46 (s, 1H), 8.19 (t, 1H), 7.57 (d, 2H, J=7.2 Hz), 7.36-7.39 (m, 3H), 7.21 (s, 1H), 5.85 (s, 1H), 4.28 (d, 2H, J=2.8 Hz), 3.82 (d, 2H, J=9.6 Hz), 3.57 (bs, 4H), 3.48 (s, 2H), 3.24 (t, 2H, J=10.8Hz), 3.07-3.09 (m, 2H), 3.01 (m, 1H), 2.36 (m, 4H), 2.24 (s, 3H), 2.20 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 1.64-1.67 (m, 2H), 1.51-1.53 (m, 2H), 0.83 (t, 3H, J=6.4 Hz).
ステップ８：Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−５−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド三塩酸塩の合成
Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−５−（エチル（テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル）アミノ）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド（１２ｇ、２１．０ミリモル）をメタノール性ＨＣｌ（２００ｍＬ）中に溶解させ、室温で３時間撹拌した。３時間撹拌後、反応混合物を減圧下で濃縮した。得られた固体をエーテル（１００ｍＬ×２）とともに撹拌して、所望の塩を固体として得た（１１ｇ、７７％）。３ＨＣｌ塩の分析データ：ＬＣＭＳ：５７３．４０（Ｍ＋１）＋；ＨＰＬＣ：９９．１％（＠２５４ｎｍ）（Ｒｔ；３．９６１；方法：カラム：ＹＭＣ ＯＤＳ−Ａ １５０ｍｍ×４．６ｍｍ×５μ；移動相：Ａ；０．０５％水中ＴＦＡ／Ｂ；０．０５％アセトニトリル中ＴＦＡ；注入体積：１０μＬ、カラム温度：３０℃；流量：１．４ｍＬ／分；勾配：８分で５％Ｂから９５％Ｂ、１．５分間保持、９．５１〜１２分５％Ｂ）； 1H NMR (D2O 400 MHz) δ 7.92 (bs, 1H,) 7.80 (s, 1H), 7.77 (d, 2H, J=8 Hz), 7.63 (s, 1H), 7.61 (s, 1H), 6.30 (s, 1H), 4.48 (s, 2H), 4.42 (s, 2H), 4.09-4.11 (m, 4H), 3.95-3.97 (m, 2H), 3.77 (t, 3H, J=10.4 Hz), 3.44-3.47 (m, 3H), 3.24-3.32 (m, 3H), 2.42 (s, 3H), 2.35 (s, 3H), 2.26 (s, 3H), 2.01 (m, 2H), 1.76 (m, 2H), 1.04 (t, 3H, J=6.8 Hz).
実施例６：Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−５−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（ジメチルアミノ）シクロヘキシル）（エチル）アミノ）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド
ステップ１：５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸
２−メチル−３−ニトロ安息香酸（１００ｇ、５５２．４８ミリモル）の濃Ｈ２ＳＯ４（４００ｍＬ）中撹拌溶液に、１，３−ジブロモ−５，５−ジメチル−２，４−イミダゾリジンジオン（８７．９８ｇ、３０７．７０ミリモル）を室温で少しずつ添加した。反応混合物を次いで室温で５時間撹拌した。反応混合物を氷冷水中に注ぎ、析出した固体を濾過によって集め、水で洗浄し、真空下で乾燥させて、所望の５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸を灰白色固体として得た（１４０ｇ、９７．９０％収率）。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 8.31 (s, 1H), 8.17 (s, 1H), 2.43 (s, 3H).
ステップ２：５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸メチル
５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸（２８５ｇ、１１０４．６５ミリモル）のＤＭＦ（２．８Ｌ）中撹拌溶液に、炭酸ナトリウム（４６８ｇ、４４１５．０９ミリモル）を添加し、続いてヨウ化メチル（６２６．６３ｇ、４４１５ミリモル）を室温で添加した。結果として得られた反応混合物を６０℃で８時間撹拌した。反応混合物を次いで濾過して懸濁された固体を除去し、これを酢酸エチルでよく洗浄した（３×１Ｌ）。合したろ液を水でよく洗浄し（５×３Ｌ）、水相を酢酸エチルで逆抽出した（３×１Ｌ）。合した有機抽出物を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸メチルを灰白色固体として得た（２９０ｇ、９７％収率）。1H NMR (CDCl3, 400 MHz) δ 8.17 (s, 1H), 7.91 (s, 1H), 3.96 (s, 3H), 2.59 (s, 3H).
ステップ３：３−アミノ−５−ブロモ−２−メチル安息香酸メチル
５−ブロモ−２−メチル−３−ニトロ安息香酸メチル（２９０ｇ、１０５８．３９ミリモル）のエタノール（１．５Ｌ）中撹拌溶液に、塩化アンモニウム水溶液（２８３ｇ、５２９０ミリモルを１．５Ｌの水中に溶解させた）を添加した。結果として得られる混合物を攪拌し８０℃で加熱し、続いて鉄粉（４７２ｇ、８４５１ミリモル）を数回に分けて８０℃にて添加した。結果として得られた反応混合物を８０℃で１２時間加熱した。反応混合物を次いでセライト（登録商標）を通して熱時濾過し、セライト（登録商標）床をメタノール（５Ｌ）、次いで３０％ＤＣＭ中ＭｅＯＨ（５Ｌ）でよく洗浄した。合したろ液を真空中で濃縮し、得られた残留物を重炭酸塩水溶液（２Ｌ）で希釈し、酢酸エチルで抽出した（３×５Ｌ）。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、３−アミノ−５−ブロモ−２−メチル安息香酸メチルを褐色固体として得た（２２０ｇ、８９．４１％収率）。
生成物の一部（５ｇ）を熱エタノール（２０ｍＬ）中に溶解させ、不溶性残留物を濾過して除去し、母液を濃縮して３−アミノ−５−ブロモ−２−メチル安息香酸メチル（３．５ｇ、７０％収率）をＨＰＬＣ純度９３．８１％で明褐色固体として得た。1H NMR (CDCl3, 400 MHz) δ 7.37 (s, 1H), 6.92 (s, 1H), 3.94 (s, 3H), 3.80 (bs, 2H), 2.31 (s, 3H).
ステップ４：５−ブロモ−３−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）シクロヘキシル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチル
３−アミノ−５−ブロモ−２−メチル安息香酸メチル（５ｇ、２０．５ミリモル）および（４−オキソシクロヘキシル）カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチル（５．６９ｇ、２６．７ミリモル）のジクロロエタン（５０ｍＬ）中撹拌溶液に、酢酸（７．４ｇ、１２３ミリモル）を添加し、反応を室温で１０分間撹拌した。ナトリウムトリアセトキシボロヒドリド（１３．１ｇ、６１．７ミリモル）を次いで０℃で添加し、反応を室温で１６時間撹拌した。反応を重炭酸ナトリウム水溶液でクエンチし、有機相を分離し、水相をジクロロメタンで抽出した。合した有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、真空中で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（１００〜２００メッシュサイズ）によって精製し、１０％ヘキサン中酢酸エチルで溶出させて、３．５ｇのより極性の（トランス）異性体、５−ブロモ−３−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）シクロヘキシル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチルを固体として得た（３８．４６％）。1H NMR (CDCl3, 400 MHz) δ 7.21 (s, 1H), 6.80 (s, 1H), 4.41 (bs, 1H), 3.85 (s, 3H), 3.60 (m, 1H), 3.45 (m, 1H), 3.20 (m, 1H), 2.22 (s, 3H), 2.15 (bs, 2H), 2.05 (bs, 2H), 1.45 (s, 9H), 1.30 (m, 4H)．
ステップ５：５−ブロモ−３−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）シクロヘキシル）−（エチル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチル
５−ブロモ−３−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）−シクロヘキシル）（エチル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチル（５５ｇ、０．１２４モル）およびアセトアルデヒド（１１ｇ、０．２５モル）のジクロロエタン（５５０ｍＬ）中撹拌溶液に、酢酸（４４．６４ｇ、０．７４４モル）を添加し、反応混合物を室温で１０分間撹拌した。ナトリウムトリアセトキシボロヒドリド（７９ｇ、０．３７２モル）を次いで０℃で添加し、反応混合物を室温で１６時間撹拌した。反応を重炭酸ナトリウム水溶液でクエンチし、有機相を分離し、水相をジクロロメタンで抽出した。合した抽出物を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、真空中で濃縮した。粗化合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（１００〜２００メッシュサイズ）により精製し、１０％のヘキサン中酢酸エチルで溶出して、４４ｇの５−ブロモ−３−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）シクロヘキシル）−（エチル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチル（７５．２％）を固体として得た。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 7.55 (s, 1H), 7.45 (s, 1H), 6.65 (d, 1H), 3.80 (s, 3H), 3.15 (bs, 1H), 3.05 (q, 2H), 2.60 (m, 1H), 2.30 (s, 3H), 1.75 (m, 4H), 1.40 (m, 2H), 1.35 (s, 9H), 1.10 (m, 2H), 0.80 (t, 3H).
ステップ６：（（１ｒ，４ｒ）−４−（（５−ブロモ−３−（（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）カルバモイル）−２−メチルフェニル）（エチル）アミノ）シクロヘキシル）カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチル
ＮａＯＨ水溶液（１０ｍＬのＨ２Ｏ中３．５ｇ、０．０８モル）を５−ブロモ−３−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）シクロヘキシル）−（エチル）アミノ）−２−メチル安息香酸メチル（２５ｇ、０．０５３モル）のＥｔＯＨ（１００ｍＬ）中溶液に添加し、そして６０℃で１時間撹拌した。エタノールを次いで減圧下で除去し、希ＨＣｌでｐＨ８に、そしてクエン酸でｐＨ６に酸性化した。混合物を１０％ＤＣＭ中メタノールで抽出した（３×２００ｍＬ）。合した有機層を乾燥し、濃縮して、各酸を得た（２４．２ｇ、９９．０％）。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 13.13 (s, 1H), 7.54 (s, 1H), 7.43 (s, 1H), 6.68 (d, 1H), 3.14 (bs, 1H), 3.03 (q, 2H), 2.56 (m, 1H), 2.33 (s, 3H), 1.80-1.65 (m, 4H), 1.40 (m, 2H), 1.35 (s, 9H), 1.10 (m, 2H), 0.77 (t, 3H).
酸（２４ｇ、０．０５３モル）をＤＭＳＯ（１００ｍＬ）中に溶解させ、そして３−（アミノメチル）−４，６−ジメチルピリジン−２（１Ｈ）−オン（１６ｇ、０．１０６モル）およびトリエチルアミン（５．３ｇ、０．０５３モル）を添加した。反応混合物を室温で１５分間撹拌した後、ＰｙＢｏｐ（４１ｇ、０．０７９ミリモル）を添加し、撹拌を一晩室温で続けた。反応混合物を氷水（１Ｌ）中に注いだ。結果として得られた沈殿を濾過によって集め、水（２×１Ｌ）でよく洗浄し、乾燥した。得られた生成物をアセトニトリル（３×２００ｍＬ）およびＤＣＭ（１００ｍＬ）で洗浄することによってさらに精製して、（（１ｒ，４ｒ）−４−（（５−ブロモ−３−（（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）カルバモイル）−２−メチルフェニル）（エチル）アミノ）シクロヘキシル）−カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチルを得た（２４ｇ、７７％）。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 11.47 (s, 1H), 8.24 (t, 1H), 7.25 (s, 1H), 7.04 (s, 1H), 6.67 (d, 1H), 5.85 (s, 1H), 4.24 (d, 2H), 3.13 (bs, 1H), 3.01 (q, 2H), 2.53 (m, 1H), 2.18 (s, 3H), 2.10 (s, 6H), 1.80-1.65 (m, 4H), 1.40 (m, 2H), 1.35 (s, 9H), 1.10 (m, 2H), 0.77 (t, 3H).
ステップ７：（（１ｒ，４ｒ）−４−（（５−（（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）カルバモイル）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−イル）（エチル）アミノ）シクロヘキシル）カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチル
（（１ｒ，４ｒ）−４−（（５−ブロモ−３−（（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）カルバモイル）−２−メチルフェニル）（エチル）アミノ）シクロヘキシル）−カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチル（２４ｇ、０．０４１モル）および４−（４−（４，４，５，５−テトラメチル−１，３，２−ジオキサボロラン−２−イル）ベンジル）モルホリン（１８ｇ、０．０６１モル）のジオキサン／水混合物（１６０ｍＬ＋４０ｍＬ）中撹拌溶液に、Ｎａ２ＣＯ３（１５ｇ、０．１５モル）を添加し、溶液をアルゴンで１５分間パージした。Ｐｄ（ＰＰｈ３）４（４．７ｇ、０．０４１モル）を次いで添加し、反応混合物を再度アルゴンで１０分間パージした。反応混合物を１００℃で４時間加熱した。反応混合物を次いで１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ（５００ｍＬ）で希釈し、濾過した。ろ液を濃縮し、水（５００ｍＬ）で希釈し、そして１０％のＤＣＭ中ＭｅＯＨ（３×５００ｍＬ）で抽出した。合した有機層をＮａ２ＳＯ４上で乾燥し、溶媒を減圧下で除去した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（１００〜２００メッシュ）により精製し、７％のＤＣＭ中ＭｅＯＨで溶出させて、（（１ｒ，４ｒ）−４−（（５−（（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）カルバモイル）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−イル）（エチル）アミノ）シクロヘキシル）カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチル（２０ｇ、７１．４３％）を得た。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 11.46 (s, 1H), 8.20 (t, 1H), 7.56 (d, 2H), 7.36 (m, 3H), 7.17 (s, 1H), 6.66 (d, 1H), 5.85 (s, 1H), 4.28 (d, 2H), 3.57 (bs, 4H), 3.48 (s, 2H), 3.20-3.05 (m, 3H), 2.62 (m, 1H), 2.36 (bs, 4H), 2.20 (s, 6H), 2.10 (s, 3H), 1.75 (m, 4H), 1.42 (m, 2H), 1.35 (s, 9H), 1.10 (m, 2H), 0.82 (t, 3H).
ステップ８：５−（（（１ｒ，４ｒ）−４−アミノシクロヘキシル）（エチル）アミノ）−Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド
０℃で（（１ｒ，４ｒ）−４−（（５−（（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）カルバモイル）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−イル）（エチル）アミノ）シクロヘキシル）カルバミン酸ｔｅｒｔ−ブチル（２０ｇ、０．０３モル）のＤＣＭ（２００ｍＬ）中撹拌溶液に、ＴＦＡ（７５ｍＬ）を添加し、反応を室温で２時間撹拌した。反応混合物を次いで濃縮乾固し、残留物を飽和重炭酸塩水溶液（３００ｍＬ）でｐＨ８に塩基性化した。混合物を２０％ＤＣＭ中メタノール（４×２００μｍ）で抽出した。合した抽出物をＮａ２ＳＯ４上で乾燥し、溶媒を減圧下で除去して、５−（（（１ｒ，４ｒ）−４−アミノシクロヘキシル）（エチル）アミノ）−Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド（１５．５ｇ、９１％）を得、これをそのまま次の反応で使用した。1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 8.18 (bs, 1H), 7.57 (d, 2H), 7.38 (m, 3H), 7.20 (s, 1H), 5.85 (s, 1H), 4.29 (d, 2H), 3.57 (bs, 4H), 3.48 (s, 2H), 3.31 (bs, 2H), 3.10 (m, 2H), 2.91 (m, 1H), 2.67 (m, 1H), 2.36 (bs, 4H), 2.21 (s, 3H), 2.20 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 1.90 (m, 2H), 1.83 (m, 2H), 1.45 (m, 2H), 1.23 (m, 2H), 0.83 (t, 3H).
ステップ９：Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−５−（（（１ｒ，４ｒ）−４−（ジメチルアミノ）シクロヘキシル）（エチル）アミノ）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド
５−（（（１ｒ，４ｒ）−４−アミノシクロヘキシル）（エチル）アミノ）−Ｎ−（（４，６−ジメチル−２−オキソ−１，２−ジヒドロピリジン−３−イル）メチル）−４−メチル−４’−（モルホリノメチル）−［１，１’−ビフェニル］−３−カルボキサミド（１４ｇ、０．０２３モル）のジクロロメタン（１５０ｍＬ）中撹拌溶液に３５％ホルムアルデヒド水溶液（２．４ｇ、０．０８０モル）を０℃で添加した。２０分間撹拌した後、Ｎａ（ＯＡｃ）３ＢＨ（１２．２ｇ、０．０５７モル）を添加し、撹拌を２時間０℃で続けた。水（１００ｍＬ）を次いで反応混合物に添加し、そして混合物を２０％ＤＣＭ中メタノール（３×２００ｍＬ）で抽出した。合した抽出物をＮａ２ＳＯ４上で乾燥し、溶媒を減圧下で除去した。粗生成物を塩基性アルミナカラムクロマトグラフィーにより精製し、６〜７％ＤＣＭ中ＭｅＯＨで溶出させて、表題化合物を得た（１０ｇ、６３．６％）。ＬＣＭＳ：６１４．６５（Ｍ＋１）＋；ＨＰＬＣ：９８．８８％（＠２１０〜３７０ｎｍ）（Ｒｔ；３．７２４；方法：カラム：ＹＭＣ ＯＤＳ−Ａ １５０ｍｍ×４．６ｍｍ×５μ；移動相：Ａ；０．０５％水中ＴＦＡ／Ｂ；０．０５％アセトニトリル中ＴＦＡ；注入体積：１０μＬ、カラム温度：３０℃；流量：１．４ｍＬ／分；勾配：８分で５％Ｂから９５％Ｂ、１．５分間保持、９．５１〜１２分５％Ｂ）； 1H NMR (DMSO-d6, 400 MHz) δ 11.45 (s, 1H), 8.17 (t, 1H), 7.56 (d, 2H, J=8 Hz), 7.36 (m, 3H), 7.17 (s, 1H), 5.85 (s, 1H), 4.29 (d, 2H, J=4.4 Hz), 3.57 (bs, 4H), 3.48 (s, 2H), 3.09 (q, 2H), 2.66 (m, 1H), 2.36 (bs, 4H), 2.21 (s, 3H), 2.20 (s, 3H), 2.11 (s, 9H), 1.79 (m, 4H), 1.36 (m, 2H), 1.11 (m, 2H), 0.82 (t, 3H, J=6.4&6.8 Hz).
実施例７：バイオアッセイプロトコルおよび一般的方法
野生型および突然変異体ＰＲＣ２酵素アッセイのプロトコル
一般的材料。Ｓ−アデノシルメチオニン（ＳＡＭ）、Ｓ−アデノシルホモシステイン（ＳＡＨ）、ビシン、ＫＣｌ、Ｔｗｅｅｎ２０、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）および牛皮ゼラチン（ＢＳＧ）をＳｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈから可能な最高レベルの純度で購入した。ジチオトレイトール（ＤＴＴ）をＥＭＤから購入した。３Ｈ−ＳＡＭを８０Ｃｉ／ｍｍｏｌの比活性でＡｍｅｒｉｃａｎ Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓから購入した。３８４ウェルストレプトアビジンＦｌａｓｈプレートをＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒから購入した。
基質。非修飾リジン２７（Ｈ３Ｋ２７ｍｅ０）またはジメチル化リジン２７（Ｈ３Ｋ２７ｍｅ２）のいずれかを含むヒトヒストンＨ３残基２１〜４４の代表的なペプチドを、２１ｓｔ Ｃｅｎｔｕｒｙ ＢｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｓによりＣ末端Ｇ（Ｋ−ビオチン）リンカー−親和性タグモチーフおよびＣ末端アミドキャップを用いて合成した。ペプチドを高性能液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）で、９５％を超える純度まで精製し、液体クロマトグラフィー質量分析（ＬＣ−ＭＳ）により確認した。配列を以下に記載する。
Ｈ３Ｋ２７ｍｅ０：ＡＴＫＡＡＲＫＳＡＰＡＴＧＧＶＫＫＰＨＲＹＲＰＧＧＫ（ビオチン）−アミド（配列番号１３）
Ｈ３Ｋ２７ｍｅ２：ＡＴＫＡＡＲＫ（ｍｅ２）ＳＡＰＡＴＧＧＶＫＫＰＨＲＹＲＰＧＧＫ（ビオチン）−アミド（配列番号１４）
ニワトリ赤血球オリゴヌクレオソームをニワトリ血液から確立された手順にしたがって精製した。
組換えＰＲＣ２複合体。ヒトＰＲＣ２複合体を、バキュロウイルス発現系を用いてＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ（ｓｆ９）細胞において同時発現された４−成分酵素複合体として精製した。発現されたサブユニットは、野生型ＥＺＨ２構築物、ＥＥＤ（ＮＭ＿００３７９７）、Ｓｕｚ１２（ＮＭ＿０１５３５５）およびＲｂＡｐ４８（ＮＭ＿００５６１０）から生成された野生型ＥＺＨ２（ＮＭ＿００４４５６）またはＥＺＨ２ Ｙ６４１Ｆ、Ｎ、Ｈ、ＳもしくはＣ突然変異体であった。ＥＥＤサブユニットは、全４−成分複合体をｓｆ９細胞溶解物から精製するために使用したＮ末端ＦＬＡＧタグを含んでいた。複合体の純度は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびＡｇｉｌｅｎｔ Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ分析によって測定して９５％を満たすかまたは超過する。酵素ストック濃度の濃度（概して０．３〜１．０ｍｇ／ｍＬ）は、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）標準に対するＢｒａｄｆｏｒｄアッセイを使用して測定した。
ペプチド基質に対するＰＲＣ２酵素アッセイの一般的手順。アッセイはすべて、２０ｍＭビシン（ｐＨ＝７．６）、０．５ｍＭ ＤＴＴ、０．００５％ＢＳＧおよび０．００２％ Ｔｗｅｅｎ２０からなり、使用当日に調製された緩衝液中で実施した。１００％ＤＭＳＯ（１μＬ）中化合物をポリプロピレン製３８４ウェルＶ底プレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ）中に、３８４チャンネルピペットヘッド（Ｔｈｅｒｍｏ）を装備したＰｌａｔｅｍａｔｅ２Ｘ３を使用してスポットした。ＤＭＳＯ（１μＬ）を最大シグナル対照について、１１、１２、２３、２４列、Ａ〜Ｈ行に添加し、公知製品であり、ＰＲＣ２の阻害剤であるＳＡＨ（１μＬ）を最小シグナル対照について、１１、１２、２３、２４列、Ｉ〜Ｐ行に添加した。野生型ＰＲＣ２酵素およびＨ３Ｋ２７ｍｅ０ペプチドまたはＹ６４１突然変異体酵素およびＨ３Ｋ２７ｍｅ２ペプチドのいずれかを含むカクテル（４０μＬ）を、Ｍｕｌｔｉｄｒｏｐ Ｃｏｍｂｉ（Ｔｈｅｒｍｏ）によって添加した。化合物をＰＲＣ２と３０分間２５℃でインキュベートし、次いで非放射性および３Ｈ−ＳＡＭの混合物を含むカクテル（１０μＬ）を添加して、反応を開始した（最終体積＝５１μＬ）。全ての場合において、最終濃度は次のとおりであった：野生型または突然変異体ＰＲＣ２酵素は４ｎＭであり、最小シグナル対照ウェル中のＳＡＨは１ｍＭであり、ＤＭＳＯ濃度は１％であった。残りの成分の最終濃度を以下の表７に示す。非放射性ＳＡＭ（１０μＬ）を６００μＭの最終濃度まで添加し、それにより３Ｈ−ＳＡＭを、ペプチド基質中へのその取り込みがもはや検出可能でなくなるレベルまで希釈することによって、アッセイを停止した。３８４ウェルポリプロピレンプレート中の５０μＬの反応を次いで３８４ウェルＦｌａｓｈプレートに移し、ビオチニル化ペプチドをストレプトアビジン表面に少なくとも１時間結合させた後、Ｂｉｏｔｅｋ ＥＬｘ４０５プレートウォッシャー中０．１％Ｔｗｅｅｎ２０で３回洗浄した。プレートを次いでＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ ＴｏｐＣｏｕｎｔプレートリーダーで読み取って、１分あたりの崩壊（ｄｐｍ）として測定されるかあるいは１分あたりのカウント（ｃｐｍ）と称される、Ｆｌａｓｈプレート表面に結合した３Ｈ標識されたペプチドの量を測定した。
オリゴヌクレオソーム基質に関する野生型ＰＲＣ２酵素アッセイの一般的手順。アッセイは、２０ｍＭ ビシン（ｐＨ＝７．６）、０．５ｍＭ ＤＴＴ、０．００５％ ＢＳＧ、１００ｍＭ ＫＣｌおよび０．００２％ Ｔｗｅｅｎ２０からなり、使用当日に調製された緩衝液中で実施した。１００％ＤＭＳＯ（１μＬ）中化合物をポリプロピレン製３８４ウェルＶ底プレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ）中に、３８４チャンネルピペットヘッド（Ｔｈｅｒｍｏ）を装備したＰｌａｔｅｍａｔｅ２Ｘ３を使用してスポットした。ＤＭＳＯ（１μＬ）を最大シグナル対照について、１１、１２、２３、２４列、Ａ〜Ｈ行に添加し、公知製品であり、ＰＲＣ２の阻害剤であるＳＡＨ（１μＬ）を最小シグナル対照について、１１、１２、２３、２４列、Ｉ〜Ｐ行に添加した。野生型ＰＲＣ２酵素およびニワトリ赤血球オリゴヌクレオソームを含むカクテル（４０μＬ）をＭｕｌｔｉｄｒｏｐ Ｃｏｍｂｉ（Ｔｈｅｒｍｏ）で添加した。化合物をＰＲＣ２と３０分間２５℃でインキュベートし、次いで非放射性および３Ｈ−ＳＡＭの混合物を含むカクテル（１０μＬ）を添加して、反応を開始した（最終体積＝５１μＬ）。最終濃度は次のとおりであった：野生型ＰＲＣ２酵素は４ｎＭであり、非放射性ＳＡＭは４３０ｎＭであり、３Ｈ−ＳＡＭは１２０ｎＭであり、ニワトリ赤血球オリグノヌクレオソーム（ｏｌｉｇｎｏｎｕｃｌｅｏｓｏｍｅ）は１２０ｎＭであり、最小シグナル対照ウェル中のＳＡＨは１ｍＭであり、そしてＤＭＳＯ濃度は１％であった。非放射性ＳＡＭ（１０μＬ）を６００μＭの最終濃度まで添加し、これによって３Ｈ−ＳＡＭを、ニワトリ赤血球オリグノヌクレオソーム（ｏｌｉｇｎｏｎｕｃｌｅｏｓｏｍｅ）基質中へのその取り込みがもはや検出可能でないレベルまで希釈することによって、アッセイを停止した。３８４ウェルポリプロピレンプレート中の５０μＬの反応を３８４ウェルＦｌａｓｈプレートに移し、ニワトリ赤血球ヌクレオソームをプレートの表面に固定し、これをＢｉｏｔｅｋ ＥＬｘ４０５プレートウォッシャー中０．１％Ｔｗｅｅｎ２０で３回洗浄した。プレートを次いでＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ ＴｏｐＣｏｕｎｔプレートリーダーで読み取って、１分あたりの崩壊（ｄｐｍ）として測定されるか、または１分あたりのカウントと称される、Ｆｌａｓｈプレート表面に結合した３Ｈ標識ニワトリ赤血球オリゴヌクレオソームの量を測定した。
％阻害計算
式中、ｄｐｍ＝１分あたりの崩壊、ｃｍｐｄ＝アッセイウェル中のシグナル、ｍｉｎおよびｍａｘはそれぞれ最小および最大シグナル対照である。
４パラメータＩＣ５０適合
式中、ｔｏｐおよびｂｏｔｔｏｍは通常は変動していてもよいが、３パラメータ適合ではそれぞれ１００または０に固定され得る。ヒル係数は通常変動してもよいが、これもまた３パラメータ適合では１に適合され得る。Ｙは％阻害であり、Ｘは化合物濃度である。
ペプチド基質（たとえば、ＥＺＨ２野生型およびＹ６４１Ｆ）に関するＰＲＣ２酵素アッセイのＩＣ５０値を以下の表８に提示する。
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２メチル化アッセイ
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２懸濁細胞をＤＳＭＺ（Ｇｅｒｍａｎ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（独国ブラウンシュヴァイク））から購入した。ＲＰＭＩ／Ｇｌｕｔａｍａｘ培地、ペニシリン−ストレプトマイシン、熱不活性化ウシ胎仔血清、およびＤ−ＰＢＳはＬｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（米国ニューヨーク州グランドアイランド）から購入した。抽出緩衝液および中和緩衝液（５Ｘ）はＡｃｔｉｖｅ Ｍｏｔｉｆ（米国カリフォルニア州カールスバッド）から購入した。ウサギ抗ヒストンＨ３抗体はＡｂｃａｍ（米国マサチューセッツ州ケンブリッジ）から購入した。ウサギ抗Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３およびＨＲＰ結合型抗ウサギＩｇＧは、Ｃｅｌｌ Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（米国マサチューセッツ州ダンバーズ）から購入した。ＴＭＢ「超感受性の」基質はＢｉｏＦＸ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ（米国メリーランド州オウイングズミルズ）から調達した。ＩｇＧを含まないウシ血清アルブミンはＪａｃｋｓｏｎ ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ（米国ペンシルベニア州ウェストグローブ）から購入した。Ｔｗｅｅｎを含むＰＢＳ（１０ＸＰＢＳＴ）はＫＰＬ（米国メリーランド州ゲイサーズバーグ）から購入した。硫酸はＲｉｃｃａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ（米国テキサス州アーリントン）から購入した。Ｉｍｍｕｌｏｎ ＥＬＩＳＡプレートはＴｈｅｒｍｏ（米国ニューヨーク州ロチェスター）から購入した。Ｖ底細胞培養プレートは、Ｃｏｒｎｉｎｇ Ｉｎｃ．（米国ニューヨーク州コーニング）から購入した。Ｖ底ポリプロピレンプレートは、Ｇｒｅｉｎｅｒ Ｂｉｏ−ＯＮＥ（米国ノースカロライナ州モンロー）から購入した。
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２懸濁細胞を成長培地（１０％ｖ／ｖ熱不活性化ウシ胎仔血清および１００単位／ｍＬのペニシリン−ストレプトマイシンを添加したＲＰＭＩ１６４０）中で維持し、そして３７℃にて５％ＣＯ２下で培養した。アッセイ条件下で、細胞をアッセイ培地（２０％熱不活性化ウシ胎仔血清および１００単位／ｍＬペニシリン−ストレプトマイシンを添加したＲＰＭＩ１６４０）中、３７℃にて５％ＣＯ２下、プレートシェーカー上でインキュベートした。
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞を、１ウェルあたり２００μＬの９６ウェルＶ底細胞培養プレートに５０，０００細胞／ｍＬの濃度でアッセイ培地中に蒔いた。９６ウェルソースプレートからの化合物（１μＬ）をＶ底細胞プレートに直接添加した。プレートをタイタープレートシェーカーで３７℃、５％ＣＯ２にて９６時間インキュベートした。４日のインキュベーション後、プレートを２４１×ｇで５分間スピンさせ、細胞ペレットを乱すことなく細胞プレートの各ウェルから培地を穏やかに吸引した。ペレットを２００μＬのＤＰＢＳ中に再懸濁させ、プレートを２４１×ｇで５分間再度スピンさせた。上清を吸引し、冷（４℃）抽出緩衝液（１００μＬ）をウェルごとに添加した。プレートを４℃にてオービタルシェーカーで２時間インキュベートした。プレートを３４２７×ｇ×１０分間でスピンさせた。上清（８０μＬ／ウェル）を９６ウェルＶ底ポリプロピレンプレート中のそれぞれのウェルに移した。中和緩衝液５Ｘ（２０μＬ／ウェル）を、上清を含むＶ底ポリプロピレンプレートに添加した。粗ヒストン調製物（ＣＨＰ）を含むＶ底ポリプロピレンプレートをオービタルシェーカーで５分間インキュベートした。粗ビストン調製物を、１００μＬのＣｏａｔｉｎｇ緩衝液（１ＸＰＢＳ＋ＢＳＡ０．０５％ｗ／ｖ）を含む２連の９６ウェルＥＬＩＳＡプレート中の各ウェルに添加した（２μＬ／ウェル）。プレートを密封し、一晩４℃でインキュベートした。翌日、プレートを３００μＬ／ウェルの１Ｘ ＰＢＳＴで３回洗浄した。ウェルを２時間、３００μＬ／ウェルのＥＬＩＳＡ希釈剤（（ＰＢＳ（１Ｘ）ＢＳＡ（２％ｗ／ｖ）およびＴｗｅｅｎ２０（０．０５％ｖ／ｖ））でブロックした。プレートを１Ｘ ＰＢＳＴで３回洗浄した。ヒストンＨ３検出プレートについて、ＥＬＩＳＡ希釈剤中で１：１０，０００に希釈した抗ヒストン−Ｈ３抗体（Ａｂｃａｍ、ａｂ１７９１）を１ウェルあたり１００μＬ添加した。Ｈ３Ｋ２７トリメチル化検出プレートについて、ＥＬＩＳＡ希釈剤中で１：２０００に希釈した抗Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３を１ウェルあたり１００μＬ添加した。プレートを室温で９０分間インキュベートした。プレートを１ウェルあたり３００μＬの１ＸＰＢＳＴで３回洗浄した。ヒストンＨ３検出に関して、ＥＬＩＳＡ希釈剤中１：６０００に希釈したＨＲＰ結合型抗ウサギＩｇＧ抗体を１ウェルあたり１００μＬ添加した。Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３検出に関して、ＥＬＩＳＡ希釈剤中で１：４０００に希釈されたＨＲＰ結合型抗ウサギＩｇＧ抗体を１ウェルあたり１００μＬ添加した。プレートを室温で９０分間インキュベートした。プレートを１ウェルあたり１ＸＰＢＳＴ ３００μＬで４回洗浄した。１ウェルあたりＴＭＢ基質１００μＬを添加した。ヒストンＨ３プレートを５分間室温でインキュベートした。Ｈ３Ｋ２７ｍｅ３プレートを室温で１０分間インキュベートした。硫酸１Ｎ（１００μＬ／ウェル）で反応を停止させた。各プレートの吸光度を４５０ｎｍで読み取った。
まず、各ウェルの比を：


によって決定した。
各プレートは、ＤＭＳＯのみの処理（最小阻害）の８つの対照ウェルならびに最大阻害（バックグラウンドウェル）の８つの対照ウェルを含んでいた。
各対照タイプの比の値の平均を算出し、使用して、プレート中の各試験ウェルについての阻害パーセントを決定した。試験化合物を、２５μＭから始めて、合計１０の試験濃度についてＤＭＳＯ中で連続して３倍希釈した。化合物の濃度ごとに２連のウェルを使用して、パーセント阻害を決定し、ＩＣ５０曲線を作製した。アッセイのＩＣ５０値を以下の表８に提示する。
細胞増殖分析
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２懸濁細胞をＤＳＭＺ（Ｇｅｒｍａｎ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（独国ブラウンシュヴァイク））から購入した。ＲＰＭＩ／Ｇｌｕｔａｍａｘ培地、ペニシリン−ストレプトマイシン、熱不活化ウシ胎仔血清はＬｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（米国ニューヨーク州グランドアイランド）から購入した。Ｖ底ポリプロピレン ３８４ウェルプレートはＧｒｅｉｎｅｒ Ｂｉｏ−Ｏｎｅ（米国ノースカロライナ州モンロー）から購入した。細胞培養３８４ウェル乳白色プレートは、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ（米国マサチューセッツ州ウォルサム）から購入した。Ｃｅｌｌ−Ｔｉｔｅｒ Ｇｌｏ（登録商標）は、Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（米国ウィスコンシン州マディソン）から購入した。ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ Ｍ５プレートリーダーは、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ ＬＬＣ（米国カリフォルニア州サニーベール）から購入した。
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２懸濁細胞を成長培地（１０％ｖ／ｖ熱不活性化ウシ胎仔血清を添加したＲＰＭＩ１６４０中で維持し、そして３７℃にて５％ＣＯ２下で培養した。アッセイ条件下で、細胞をアッセイ培地（２０％熱不活性化ウシ胎仔血清および１００単位／ｍＬペニシリン−ストレプトマイシンを添加したＲＰＭＩ１６４０）中、３７℃にて５％ＣＯ２下でインキュベートした。
ＷＳＵ−ＤＬＣＬ２細胞系の増殖に関する化合物の効果の評価のために、対数増殖期細胞を５０μｌのアッセイ培地の最終体積中１２５０細胞／ｍｌの密度で３８４ウェル乳白色プレート中に蒔いた。１０ｍＭから開始して、ＤＭＳＯ中で３連の９点３倍連続希釈を実施することによって化合物ソースプレートを調製した（アッセイ中の化合物の最終最高濃度は２０μＭであり、ＤＭＳＯは０．２％であった）。細胞プレート中の各ウェルに化合物ストックプレートからの１００ｎＬアリコートを添加した。１００％阻害対照は、２００ｎＭの最終濃度のスタウロスポリンで処理された細胞から構成され、０％阻害対照はＤＭＳＯ処理された細胞から構成されていた。化合物の添加後、アッセイプレートを６日間３７℃、５％ＣＯ２、相対湿度９０％超でインキュベートした。細胞の生存度を細胞培養物中に存在するＡＴＰの定量により、３５μｌのＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）試薬を細胞プレートに添加することによって測定した。ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ Ｍ５で発光を読み取った。正規化用量応答曲線の４パラメータ適合を用いて細胞の生存度を５０％阻害する濃度を決定した。
参考文献の組み入れ
本明細書中で言及される特許文書および科学論文のそれぞれの全開示はあらゆる目的のために参照により本明細書中に組み込まれる。
本明細書中で言及されるすべての刊行物および特許文書は、そのような刊行物または文書のそれぞれが、参照により本明細書中に組み込まれることが具体的かつ個別に示されるかのように、参照により本明細書中に組み込まれる。 刊行物および特許文書の言及は、いずれも関連のある先行技術であることを認めることを意図せず、またその内容または日付に関する承認を構成するものでもない。明細書によって本発明を説明してきたが、本発明は様々な実施形態で実施することができ、前記説明および前記実施例は例示のためであり、以下の特許請求の範囲を限定するものではないことは当業者には理解されるであろう。
等価物
本発明は、その主旨または本質的な特性から逸脱することなく、他の特定の形態で具体化することができる。前記実施形態は、したがって、本明細書中で記載する本発明に関して限定的であるよりもむしろあらゆる点で例示的であると見なされるべきである。発明の範囲は、したがって前述の説明によってではなく、むしろ添付の特許請求の範囲によって示され、請求項の同等の意味および範囲内に含まれるすべての変更も含まれることが意図される。

Claims (1)

  1. 本明細書および図面に記載の物、方法またはシステム。
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