JP2019525918A5 - - Google Patents
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Description
非限定的な開示と参照による援用
限定するものではないが、特許、特許出願、記事、書籍、論文ならびにGenBank及びNCBIリファレンス配列記録を含む、本出願に引用される全ての文献または文献の一部は、その全体が参照により明示的に本明細書に援用される。
国際出願時の特許請求の範囲
〔項1〕14〜25個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、SMN2 pre−mRNAに相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、式IIの
構造を有し、
式IIの各ヌクレオシドについて、
Bxは、独立して選択される核酸塩基であり、
R1及びR2は、それぞれ独立して、水素及びメチルから選択され、
あるいは、R1は、水素であり、R2は、独立して、エチル、プロピルまたはイソプロピルから選択される、前記オリゴマー化合物。
〔項2〕R1及びR2の一方が水素ではない式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1に記載のオリゴマー化合物。
〔項3〕式IIの構造を有する少なくとも1つのヌクレオシドについて、R1が水素であり、R2がメチル、エチル、プロピルまたはイソプロピルから選択される、請求項1または2に記載のオリゴマー化合物。
〔項4〕R1が水素であり、R2がメチルまたはエチルから選択される式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項5〕R1及びR2の少なくとも一方がメチルである式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1〜4いずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項6〕R1及びR2の一方が水素であり、R1及びR2の他方がメチルである式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項7〕R1の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドの少なくとも2つについて異なる、請求項1〜6のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項8〕 R2の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドの少なくとも2つについて異なる、請求項1〜7のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項9〕R1の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドのそれぞれについて同一であり、R2の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドのそれぞれについて同一である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項10〕Bxが、アデニン、グアニン、シトシン、チミン、ウラシル及び5−メチルシトシンから選択される、請求項1〜9のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項11〕R1がメチルである、請求項1または2に記載のオリゴマー化合物。
〔項12〕前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項13〕前記修飾オリゴヌクレオチドの7個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項14〕前記修飾オリゴヌクレオチドの8個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項15〕前記修飾オリゴヌクレオチドの9個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項16〕前記修飾オリゴヌクレオチドの10個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項17〕前記修飾オリゴヌクレオチドの11個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項18〕前記修飾オリゴヌクレオチドの12個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項19〕前記修飾オリゴヌクレオチドの13個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項20〕前記修飾オリゴヌクレオチドの14個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項21〕前記修飾オリゴヌクレオチドの15個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項22〕前記修飾オリゴヌクレオチドの16個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項23〕前記修飾オリゴヌクレオチドの17個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項24〕前記修飾オリゴヌクレオチドの18個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項25〕前記修飾オリゴヌクレオチドの19個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項26〕前記修飾オリゴヌクレオチドの20個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項27〕式IIの構造を有する少なくとも1つのヌクレオシドのR1がメチルである、請求項1〜26のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項28〕R1が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドの全てについて同一である、請求項1〜27のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項29〕14〜25個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、SMN2 pre−mRNAに相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、前記オリゴマー化合物。
〔項30〕2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む各ヌクレオシドの前記糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)及び2’−O−(N−エチルアセトアミド)から選択される、請求項29に記載のオリゴマー化合物。
〔項31〕前記修飾オリゴヌクレオチドの7個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項32〕前記修飾オリゴヌクレオチドの8個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項33〕前記修飾オリゴヌクレオチドの9個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項34〕前記修飾オリゴヌクレオチドの10個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項35〕前記修飾オリゴヌクレオチドの11個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項36〕前記修飾オリゴヌクレオチドの12個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項37〕前記修飾オリゴヌクレオチドの13個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項38〕前記修飾オリゴヌクレオチドの14個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項39〕前記修飾オリゴヌクレオチドの15個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項40〕前記修飾オリゴヌクレオチドの16個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項41〕前記修飾オリゴヌクレオチドの17個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項42〕前記修飾オリゴヌクレオチドの18個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項43〕前記修飾オリゴヌクレオチドの19個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項44〕前記修飾オリゴヌクレオチドの20個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項45〕2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む前記ヌクレオシドのうち少なくとも1つの前記糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分である、請求項29〜44のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項46〕前記2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分のそれぞれのN−アルキル基が、同じN−アルキル基である、請求項29〜45のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項47〕前記2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分のそれぞれが、2’−O−(N−メチルアセトアミド)糖部分である、請求項29〜46のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項48〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分である、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項49〕少なくとも1つの糖部分が2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分でない、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項50〕少なくとも1つの糖部分が2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分でない、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項51〕少なくとも1つの糖部分が、2’−MOEヌクレオシド、2’−OMeヌクレオシド、2’−Fヌクレオシド、(4’−CH2−O−2’)二環式ヌクレオシド、(4’−(CH2)2−O−2’)二環式ヌクレオシド、(4’−C(CH3)H−O−2’)二環式ヌクレオシド;及びモルホリノから選択される修飾糖部分である、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項52〕少なくとも1つの糖部分が非修飾糖部分である、請求項29〜51のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項53〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、16〜23個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項1〜52のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項54〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、18〜20個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項1〜52のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項55〕前記修飾オリゴヌクレオチドが16個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項56〕前記修飾オリゴヌクレオチドが17個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項57〕前記修飾オリゴヌクレオチドが18個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項58〕前記修飾オリゴヌクレオチドが19個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項59〕前記修飾オリゴヌクレオチドが20個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項60〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項1〜59のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項61〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1〜60のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項62〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びリン酸ヌクレオシド間結合から選択される、請求項61に記載のオリゴマー化合物。
〔項63〕前記リン酸ヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項64〕前記修飾オリゴヌクレオチドが5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項65〕前記修飾オリゴヌクレオチドが6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項66〕前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項67〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1〜66のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項68〕前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾核酸塩基を含む、請求項1〜67のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項69〕前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの5−メチルシトシンを含む、請求項1〜68のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項70〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基が、チミン、5−メチルシトシン、シトシン、アデニン、ウラシル及びグアニンから選択される、請求項1〜69のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項71〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各シトシンが5−メチルシトシンである、請求項1〜70のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項72〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基が、チミン、5−メチルシトシン、アデニン及びグアニンから選択される、請求項1〜65のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項73〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも70%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項74〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも75%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項75〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも80%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項76〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも85%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項77〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも90%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項78〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも95%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項79〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも100%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項80〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのイントロン7に相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項81〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのISS−N1に相補的である、請求項1〜80のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項82〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号1、2または3から選択される配列を含む、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項83〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号12〜239または241〜265のいずれかから選択される配列を含む、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項84〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264または265のいずれかから選択される配列を含む、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項85〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号1、2、3または12〜239または241〜265のいずれかから選択される配列からなる、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項86〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264または265のいずれかから選択される配列からなる、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項87〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのエクソン7に相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項88〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのイントロン6に相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項89〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのエクソン7にあるエクソン性スプライシングエンハンサーに相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項90〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのエクソン7にある異常なエクソン性スプライシングサイレンサーに相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項91〕前記オリゴマー化合物がコンジュゲート基を含む、請求項1〜90のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項92〕前記コンジュゲート基が脂質または親油基を含む、請求項91に記載のオリゴマー化合物。
〔項93〕前記脂質または親油基が、コレステロール、C10〜C26飽和脂肪酸、C10〜C26不飽和脂肪酸、C10〜C26アルキル、トリグリセリド、トコフェロールまたはコール酸から選択される、請求項92に記載のオリゴマー化合物。
〔項94〕前記脂質または親油基が、飽和炭化水素鎖または不飽和炭化水素鎖である、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項95〕前記脂質または親油基がC16脂質である、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項96〕前記脂質または親油基がC18脂質である、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項97〕前記脂質または親油基がC16アルキルである、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項98〕前記脂質または親油基がC18アルキルである、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項99〕前記脂質または親油基がコレステロールである、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項100〕前記脂質または親油基がトコフェロールである、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項101〕前記脂質または親油基が飽和C16である、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項102〕前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項91〜101のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項103〕前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項91〜101のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項104〕前記コンジュゲート基が切断可能リンカーを含む、請求項91〜103のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項105〕前記切断可能リンカーが1つ以上のリンカーヌクレオシドを含む、請求項105に記載のオリゴマー化合物。
〔項106〕前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項1〜105のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項107〕前記修飾オリゴヌクレオチド及び前記コンジュゲート基からなる、請求項91〜105のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項108〕前記オリゴマー化合物がSMN2 pre−mRNAのスプライシングを調節する、請求項1〜108のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項109〕前記オリゴマー化合物が一本鎖である、請求項1〜108のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項110〕前記オリゴマー化合物が相補的オリゴマー化合物と対合して二本鎖化合物を形成した、請求項1〜108のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項111〕前記相補的オリゴマー化合物がコンジュゲート基を含む、請求項110に記載のオリゴマー化合物。
〔項112〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物と、少なくとも1つの薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
〔項113〕請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または組成物と細胞、組織または器官を接触させることを含む、SMN2 pre−mRNAのスプライシングを調節する方法。
〔項114〕細胞、組織または器官においてSMN2 mRNAのエクソン7の包含を促進する方法であって、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物と前記細胞、組織または器官を接触させることを含む、前記方法。
〔項115〕前記細胞、組織または器官が動物内にある、請求項113または114に記載の方法。
〔項116〕前記細胞、組織または器官がヒト内にある、請求項113または114に記載の方法。
〔項117〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を対象に投与することを含む、方法。
〔項118〕前記対象がSMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項119〕前記対象がI型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項120〕前記対象がII型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項121〕前記対象がIII型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項122〕前記対象がIV型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項123〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症を治療する方法。
〔項124〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症I型を治療する方法。
〔項125〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症II型を治療する方法。
〔項126〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症III型を治療する方法。
〔項127〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症IV型を治療する方法。
〔項128〕前記オリゴマー化合物が中枢神経系に投与される、請求項122〜127のいずれか一項に記載の方法。
〔項129〕前記オリゴマー化合物が髄腔内投与される、請求項128に記載の方法。
〔項130〕前記オリゴマー化合物が全身投与される、請求項123〜127のいずれか一項に記載の方法。
〔項131〕前記オリゴマー化合物が皮下投与される、請求項130に記載の方法。
〔項132〕前記オリゴマー化合物が筋肉内投与される、請求項130に記載の方法。
〔項133〕前記オリゴマー化合物が中枢神経系及び全身に投与される、請求項122〜132のいずれか一項に記載の方法。
〔項134〕前記オリゴマー化合物が第2の化合物と共投与される、請求項122〜132のいずれか一項に記載の方法。
〔項135〕前記第2の化合物が、小分子及びオリゴマー化合物から選択される、請求項134に記載の方法。
〔項136〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物である、請求項135に記載の方法。
〔項137〕前記第2の化合物がCSFに投与される、請求項134〜136のいずれか一項に記載の方法。
〔項138〕前記第2の化合物が髄腔内投与される、請求項137に記載の方法。
〔項139〕第2の化合物が、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する第2の修飾オリゴヌクレオチドを含む第2のオリゴマー化合物である、請求項134〜138のいずれか一項に記載の方法。
〔項140〕前記第2のオリゴマー化合物の前記第2の修飾オリゴヌクレオチドの前記修飾ヌクレオシドの前記修飾糖部分が、2’−OMe及び2’−MOEから選択される、請求項139に記載の方法。
〔項141〕前記第2の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾糖部分を含む、請求項139または140に記載の方法。
〔項142〕前記第2のオリゴヌクレオチドの前記修飾糖部分が2’−MOE糖部分である、請求項141に記載の方法。
〔項〕前記第2の化合物が、モルホリノオリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物である、請求項139に記載の方法。
〔項144〕前記第2のオリゴマー化合物が、配列番号1の核酸塩基配列を有する、請求項134〜143のいずれか一項に記載の方法。
〔項145〕前記第2のオリゴマー化合物が、Isis396443の核酸塩基配列及び化学修飾モチーフを有する、請求項144に記載の方法。
〔項146〕前記第2のオリゴマー化合物が前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項134〜145のいずれか一項に記載の方法。
〔項147〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の投与の前に投与される、請求項134〜146のいずれか一項に記載の方法。
〔項148〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の投与の後に投与される、請求項134〜146のいずれか一項に記載の方法。
〔項149〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の投与よりも少ない頻度で投与される、請求項134〜146のいずれか一項に記載の方法。
〔項150〕治療法に使用するための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物。
〔項151〕脊髄性筋萎縮症I型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項152〕脊髄性筋萎縮症II型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項153〕脊髄性筋萎縮症III型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項154〕脊髄性筋萎縮症IV型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項155〕脊髄性筋萎縮症を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物の使用。
〔項156〕(i)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物を全身投与することと、(ii)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項157〕(i)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または組成物を含む化合物を全身投与することと、(ii)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項158〕(i)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物を全身投与することと、(ii)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項159〕(i)請求項85〜106のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物を全身投与することと、(ii)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項160〕(i)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む少なくとも1つの修飾ヌクレオシドとコンジュゲートとを有する修飾オリゴヌクレオチドを全身投与することと、(ii)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項161〕(i)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む少なくとも1つの修飾ヌクレオシドとコンジュゲート基とを有する修飾オリゴヌクレオチドを全身投与することと、(ii)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項162〕前記コンジュゲート基が、コレステロール、C10〜C26飽和脂肪酸、C10〜C26不飽和脂肪酸、C10〜C26アルキル、トリグリセリド、トコフェロールまたはコール酸から選択される脂質または親油基を含む、請求項160に記載の方法。
〔項163〕前記SMN2 pre−mRNAが、配列番号10、11または240のいずれかから選択される核酸塩基配列である、請求項1〜162のいずれか一項に記載の化合物または方法。
限定するものではないが、特許、特許出願、記事、書籍、論文ならびにGenBank及びNCBIリファレンス配列記録を含む、本出願に引用される全ての文献または文献の一部は、その全体が参照により明示的に本明細書に援用される。
国際出願時の特許請求の範囲
〔項1〕14〜25個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、SMN2 pre−mRNAに相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、式IIの
構造を有し、
式IIの各ヌクレオシドについて、
Bxは、独立して選択される核酸塩基であり、
R1及びR2は、それぞれ独立して、水素及びメチルから選択され、
あるいは、R1は、水素であり、R2は、独立して、エチル、プロピルまたはイソプロピルから選択される、前記オリゴマー化合物。
〔項2〕R1及びR2の一方が水素ではない式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1に記載のオリゴマー化合物。
〔項3〕式IIの構造を有する少なくとも1つのヌクレオシドについて、R1が水素であり、R2がメチル、エチル、プロピルまたはイソプロピルから選択される、請求項1または2に記載のオリゴマー化合物。
〔項4〕R1が水素であり、R2がメチルまたはエチルから選択される式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項5〕R1及びR2の少なくとも一方がメチルである式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1〜4いずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項6〕R1及びR2の一方が水素であり、R1及びR2の他方がメチルである式IIのヌクレオシドを少なくとも1つ含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項7〕R1の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドの少なくとも2つについて異なる、請求項1〜6のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項8〕 R2の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドの少なくとも2つについて異なる、請求項1〜7のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項9〕R1の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドのそれぞれについて同一であり、R2の選択が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドのそれぞれについて同一である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項10〕Bxが、アデニン、グアニン、シトシン、チミン、ウラシル及び5−メチルシトシンから選択される、請求項1〜9のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項11〕R1がメチルである、請求項1または2に記載のオリゴマー化合物。
〔項12〕前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項13〕前記修飾オリゴヌクレオチドの7個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項14〕前記修飾オリゴヌクレオチドの8個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項15〕前記修飾オリゴヌクレオチドの9個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項16〕前記修飾オリゴヌクレオチドの10個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項17〕前記修飾オリゴヌクレオチドの11個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項18〕前記修飾オリゴヌクレオチドの12個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項19〕前記修飾オリゴヌクレオチドの13個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項20〕前記修飾オリゴヌクレオチドの14個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項21〕前記修飾オリゴヌクレオチドの15個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項22〕前記修飾オリゴヌクレオチドの16個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項23〕前記修飾オリゴヌクレオチドの17個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項24〕前記修飾オリゴヌクレオチドの18個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項25〕前記修飾オリゴヌクレオチドの19個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項26〕前記修飾オリゴヌクレオチドの20個のヌクレオシドのそれぞれが、式IIから独立して選択される構造を有する、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項27〕式IIの構造を有する少なくとも1つのヌクレオシドのR1がメチルである、請求項1〜26のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項28〕R1が、式IIの構造を有する前記ヌクレオシドの全てについて同一である、請求項1〜27のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項29〕14〜25個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、SMN2 pre−mRNAに相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、前記オリゴマー化合物。
〔項30〕2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む各ヌクレオシドの前記糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)及び2’−O−(N−エチルアセトアミド)から選択される、請求項29に記載のオリゴマー化合物。
〔項31〕前記修飾オリゴヌクレオチドの7個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項32〕前記修飾オリゴヌクレオチドの8個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項33〕前記修飾オリゴヌクレオチドの9個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項34〕前記修飾オリゴヌクレオチドの10個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項35〕前記修飾オリゴヌクレオチドの11個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項36〕前記修飾オリゴヌクレオチドの12個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項37〕前記修飾オリゴヌクレオチドの13個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項38〕前記修飾オリゴヌクレオチドの14個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項39〕前記修飾オリゴヌクレオチドの15個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項40〕前記修飾オリゴヌクレオチドの16個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項41〕前記修飾オリゴヌクレオチドの17個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項42〕前記修飾オリゴヌクレオチドの18個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項43〕前記修飾オリゴヌクレオチドの19個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項44〕前記修飾オリゴヌクレオチドの20個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、請求項29または30に記載のオリゴマー化合物。
〔項45〕2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む前記ヌクレオシドのうち少なくとも1つの前記糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分である、請求項29〜44のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項46〕前記2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分のそれぞれのN−アルキル基が、同じN−アルキル基である、請求項29〜45のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項47〕前記2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分のそれぞれが、2’−O−(N−メチルアセトアミド)糖部分である、請求項29〜46のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項48〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分である、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項49〕少なくとも1つの糖部分が2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分でない、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項50〕少なくとも1つの糖部分が2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分でない、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項51〕少なくとも1つの糖部分が、2’−MOEヌクレオシド、2’−OMeヌクレオシド、2’−Fヌクレオシド、(4’−CH2−O−2’)二環式ヌクレオシド、(4’−(CH2)2−O−2’)二環式ヌクレオシド、(4’−C(CH3)H−O−2’)二環式ヌクレオシド;及びモルホリノから選択される修飾糖部分である、請求項29〜47のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項52〕少なくとも1つの糖部分が非修飾糖部分である、請求項29〜51のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項53〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、16〜23個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項1〜52のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項54〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、18〜20個の結合されたヌクレオシドからなる、請求項1〜52のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項55〕前記修飾オリゴヌクレオチドが16個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項56〕前記修飾オリゴヌクレオチドが17個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項57〕前記修飾オリゴヌクレオチドが18個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項58〕前記修飾オリゴヌクレオチドが19個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項59〕前記修飾オリゴヌクレオチドが20個のヌクレオシドからなる、請求項1〜53のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項60〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項1〜59のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項61〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1〜60のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項62〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びリン酸ヌクレオシド間結合から選択される、請求項61に記載のオリゴマー化合物。
〔項63〕前記リン酸ヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項64〕前記修飾オリゴヌクレオチドが5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項65〕前記修飾オリゴヌクレオチドが6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項66〕前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項62に記載のオリゴマー化合物。
〔項67〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1〜66のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項68〕前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの修飾核酸塩基を含む、請求項1〜67のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項69〕前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1つの5−メチルシトシンを含む、請求項1〜68のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項70〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基が、チミン、5−メチルシトシン、シトシン、アデニン、ウラシル及びグアニンから選択される、請求項1〜69のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項71〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各シトシンが5−メチルシトシンである、請求項1〜70のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項72〕前記修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基が、チミン、5−メチルシトシン、アデニン及びグアニンから選択される、請求項1〜65のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項73〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも70%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項74〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも75%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項75〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも80%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項76〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも85%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項77〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも90%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項78〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも95%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項79〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも100%相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項80〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのイントロン7に相補的である、請求項1〜72のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項81〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのISS−N1に相補的である、請求項1〜80のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項82〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号1、2または3から選択される配列を含む、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項83〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号12〜239または241〜265のいずれかから選択される配列を含む、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項84〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264または265のいずれかから選択される配列を含む、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項85〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号1、2、3または12〜239または241〜265のいずれかから選択される配列からなる、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項86〕前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264または265のいずれかから選択される配列からなる、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項87〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのエクソン7に相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項88〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのイントロン6に相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項89〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのエクソン7にあるエクソン性スプライシングエンハンサーに相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項90〕前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのエクソン7にある異常なエクソン性スプライシングサイレンサーに相補的である、請求項1〜79のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項91〕前記オリゴマー化合物がコンジュゲート基を含む、請求項1〜90のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項92〕前記コンジュゲート基が脂質または親油基を含む、請求項91に記載のオリゴマー化合物。
〔項93〕前記脂質または親油基が、コレステロール、C10〜C26飽和脂肪酸、C10〜C26不飽和脂肪酸、C10〜C26アルキル、トリグリセリド、トコフェロールまたはコール酸から選択される、請求項92に記載のオリゴマー化合物。
〔項94〕前記脂質または親油基が、飽和炭化水素鎖または不飽和炭化水素鎖である、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項95〕前記脂質または親油基がC16脂質である、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項96〕前記脂質または親油基がC18脂質である、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項97〕前記脂質または親油基がC16アルキルである、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項98〕前記脂質または親油基がC18アルキルである、請求項92〜94のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項99〕前記脂質または親油基がコレステロールである、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項100〕前記脂質または親油基がトコフェロールである、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項101〕前記脂質または親油基が飽和C16である、請求項93に記載のオリゴマー化合物。
〔項102〕前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項91〜101のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項103〕前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項91〜101のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項104〕前記コンジュゲート基が切断可能リンカーを含む、請求項91〜103のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項105〕前記切断可能リンカーが1つ以上のリンカーヌクレオシドを含む、請求項105に記載のオリゴマー化合物。
〔項106〕前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項1〜105のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項107〕前記修飾オリゴヌクレオチド及び前記コンジュゲート基からなる、請求項91〜105のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項108〕前記オリゴマー化合物がSMN2 pre−mRNAのスプライシングを調節する、請求項1〜108のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項109〕前記オリゴマー化合物が一本鎖である、請求項1〜108のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項110〕前記オリゴマー化合物が相補的オリゴマー化合物と対合して二本鎖化合物を形成した、請求項1〜108のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
〔項111〕前記相補的オリゴマー化合物がコンジュゲート基を含む、請求項110に記載のオリゴマー化合物。
〔項112〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物と、少なくとも1つの薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
〔項113〕請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または組成物と細胞、組織または器官を接触させることを含む、SMN2 pre−mRNAのスプライシングを調節する方法。
〔項114〕細胞、組織または器官においてSMN2 mRNAのエクソン7の包含を促進する方法であって、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物と前記細胞、組織または器官を接触させることを含む、前記方法。
〔項115〕前記細胞、組織または器官が動物内にある、請求項113または114に記載の方法。
〔項116〕前記細胞、組織または器官がヒト内にある、請求項113または114に記載の方法。
〔項117〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を対象に投与することを含む、方法。
〔項118〕前記対象がSMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項119〕前記対象がI型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項120〕前記対象がII型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項121〕前記対象がIII型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項122〕前記対象がIV型SMAを有する、請求項117に記載の方法。
〔項123〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症を治療する方法。
〔項124〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症I型を治療する方法。
〔項125〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症II型を治療する方法。
〔項126〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症III型を治療する方法。
〔項127〕請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、患者の脊髄性筋萎縮症IV型を治療する方法。
〔項128〕前記オリゴマー化合物が中枢神経系に投与される、請求項122〜127のいずれか一項に記載の方法。
〔項129〕前記オリゴマー化合物が髄腔内投与される、請求項128に記載の方法。
〔項130〕前記オリゴマー化合物が全身投与される、請求項123〜127のいずれか一項に記載の方法。
〔項131〕前記オリゴマー化合物が皮下投与される、請求項130に記載の方法。
〔項132〕前記オリゴマー化合物が筋肉内投与される、請求項130に記載の方法。
〔項133〕前記オリゴマー化合物が中枢神経系及び全身に投与される、請求項122〜132のいずれか一項に記載の方法。
〔項134〕前記オリゴマー化合物が第2の化合物と共投与される、請求項122〜132のいずれか一項に記載の方法。
〔項135〕前記第2の化合物が、小分子及びオリゴマー化合物から選択される、請求項134に記載の方法。
〔項136〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物である、請求項135に記載の方法。
〔項137〕前記第2の化合物がCSFに投与される、請求項134〜136のいずれか一項に記載の方法。
〔項138〕前記第2の化合物が髄腔内投与される、請求項137に記載の方法。
〔項139〕第2の化合物が、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する第2の修飾オリゴヌクレオチドを含む第2のオリゴマー化合物である、請求項134〜138のいずれか一項に記載の方法。
〔項140〕前記第2のオリゴマー化合物の前記第2の修飾オリゴヌクレオチドの前記修飾ヌクレオシドの前記修飾糖部分が、2’−OMe及び2’−MOEから選択される、請求項139に記載の方法。
〔項141〕前記第2の修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾糖部分を含む、請求項139または140に記載の方法。
〔項142〕前記第2のオリゴヌクレオチドの前記修飾糖部分が2’−MOE糖部分である、請求項141に記載の方法。
〔項〕前記第2の化合物が、モルホリノオリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物である、請求項139に記載の方法。
〔項144〕前記第2のオリゴマー化合物が、配列番号1の核酸塩基配列を有する、請求項134〜143のいずれか一項に記載の方法。
〔項145〕前記第2のオリゴマー化合物が、Isis396443の核酸塩基配列及び化学修飾モチーフを有する、請求項144に記載の方法。
〔項146〕前記第2のオリゴマー化合物が前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項134〜145のいずれか一項に記載の方法。
〔項147〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の投与の前に投与される、請求項134〜146のいずれか一項に記載の方法。
〔項148〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の投与の後に投与される、請求項134〜146のいずれか一項に記載の方法。
〔項149〕前記第2の化合物が、請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の投与よりも少ない頻度で投与される、請求項134〜146のいずれか一項に記載の方法。
〔項150〕治療法に使用するための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物。
〔項151〕脊髄性筋萎縮症I型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項152〕脊髄性筋萎縮症II型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項153〕脊髄性筋萎縮症III型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項154〕脊髄性筋萎縮症IV型を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜111のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項112に記載の組成物の使用。
〔項155〕脊髄性筋萎縮症を治療するための薬剤の調製のための請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物の使用。
〔項156〕(i)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物を全身投与することと、(ii)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項157〕(i)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または組成物を含む化合物を全身投与することと、(ii)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項158〕(i)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物を全身投与することと、(ii)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項159〕(i)請求項85〜106のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物を全身投与することと、(ii)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項160〕(i)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む少なくとも1つの修飾ヌクレオシドとコンジュゲートとを有する修飾オリゴヌクレオチドを全身投与することと、(ii)請求項1〜112のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物を含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項161〕(i)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む少なくとも1つの修飾ヌクレオシドとコンジュゲート基とを有する修飾オリゴヌクレオチドを全身投与することと、(ii)2’−OMe及び2’−MOEから選択される修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを少なくとも1つ有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物をCNSに投与することとを含む、方法。
〔項162〕前記コンジュゲート基が、コレステロール、C10〜C26飽和脂肪酸、C10〜C26不飽和脂肪酸、C10〜C26アルキル、トリグリセリド、トコフェロールまたはコール酸から選択される脂質または親油基を含む、請求項160に記載の方法。
〔項163〕前記SMN2 pre−mRNAが、配列番号10、11または240のいずれかから選択される核酸塩基配列である、請求項1〜162のいずれか一項に記載の化合物または方法。
Claims (21)
- 14〜25個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドは、SMN2 pre−mRNAに相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオシドは、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、前記オリゴマー化合物。
- 請求項1に記載のオリゴマー化合物であって、
(a)前記修飾オリゴヌクレオチドの7個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(b)前記修飾オリゴヌクレオチドの8個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(c)前記修飾オリゴヌクレオチドの9個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(d)前記修飾オリゴヌクレオチドの10個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(e)前記修飾オリゴヌクレオチドの11個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(f)前記修飾オリゴヌクレオチドの12個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(g)前記修飾オリゴヌクレオチドの13個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(h)前記修飾オリゴヌクレオチドの14個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(i)前記修飾オリゴヌクレオチドの15個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(j)前記修飾オリゴヌクレオチドの16個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(k)前記修飾オリゴヌクレオチドの17個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(l)前記修飾オリゴヌクレオチドの18個のヌクレオシドのそれぞれが、2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(m)前記修飾オリゴヌクレオチドの19個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む;
(n)前記修飾オリゴヌクレオチドの20個のヌクレオシドのそれぞれが、独立して選択される2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分を含む、
前記オリゴマー化合物。 - 前記2’−O−(N−アルキルアセトアミド)修飾糖部分のそれぞれが、2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分である、請求項1または請求項2に記載のオリゴマー化合物。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの各糖部分が、2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分である、請求項1〜3のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 請求項1〜4のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物であって、
(a)前記修飾オリゴヌクレオチドが、16〜23個の結合されたヌクレオシドからなる;または
(b)前記修飾オリゴヌクレオチドが、18〜20個の結合されたヌクレオシドからなる、前記オリゴマー化合物。 - 請求項1〜4のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物であって、
(a)前記修飾オリゴヌクレオチドが16個のヌクレオシドからなる;
(b)前記修飾オリゴヌクレオチドが17個のヌクレオシドからなる;
(c)前記修飾オリゴヌクレオチドが18個のヌクレオシドからなる;
(d)前記修飾オリゴヌクレオチドが19個のヌクレオシドからなる;または
(e)前記修飾オリゴヌクレオチドが20個のヌクレオシドからなる、前記オリゴマー化合物。 - 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びホスホジエステルヌクレオシド間結合から選択される、請求項1〜6のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 請求項7に記載のオリゴマー化合物であって
(a)前記修飾オリゴヌクレオチドが5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する;
(b)前記修飾オリゴヌクレオチドが6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する;または
(c)前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、前記オリゴマー化合物。 - 請求項1〜8のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物であって、
(a)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも70%相補的である;
(b)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも75%相補的である;
(c)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも80%相補的である;
(d)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも85%相補的である;
(e)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも90%相補的である;
(f)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに少なくとも95%相補的である;または
(g)前記修飾オリゴヌクレオチドが、SMN2 pre−mRNAに100%相補的である、前記オリゴマー化合物。 - 前記オリゴマー化合物がコンジュゲート基を含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 前記コンジュゲート基が脂質または親油基を含む、請求項10に記載のオリゴマー化合物であって、任意に、
(a)前記脂質または親油基が、コレステロール、C10〜C26飽和脂肪酸、C10〜C26不飽和脂肪酸、C10〜C26アルキル、トリグリセリド、トコフェロールまたはコール酸から選択される;
(b)前記脂質または親油基が、飽和炭化水素鎖または不飽和炭化水素鎖である;
(c)前記脂質または親油基がC16アルキルである;または
(d)前記脂質または親油基が飽和C16である、前記オリゴマー化合物。 - 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記SMN2 pre−mRNAのISS−N1に相補的である、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が、配列番号1、2または3から選択される配列を含む、請求項1〜12のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基の配列が配列番号3からなる、請求項1〜13のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 化合物がナトリウムまたはカリウム塩である、請求項1〜14のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物。
- 配列番号3の核酸塩基配列を有し、18個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分を含み、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びホスホジエステルヌクレオシド間結合から選択される、前記修飾オリゴヌクレオチド。
- 配列番号1の核酸塩基配列を含む18〜20個の結合されたヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、修飾オリゴヌクレオチドの18個のヌクレオシドのそれぞれが2’−O−(N−メチルアセトアミド)修飾糖部分を含み、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びホスホジエステルヌクレオシド間結合から選択される、前記修飾オリゴヌクレオチド。
- 請求項1〜15のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項16もしくは請求項17に記載の修飾オリゴヌクレオチドと、少なくとも1つの薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、医薬組成物。
- 組成物が薬学的に許容される希釈剤を含み、該薬学的に許容される希釈剤がリン酸緩衝生理食塩水(PBS)である、請求項18に記載の医薬組成物。
- 前記医薬組成物が前記化合物及びPBSからなる、請求項18または請求項19に記載の医薬組成物。
- 請求項1〜15のいずれか一項に記載のオリゴマー化合物または請求項16もしくは請求項17に記載の修飾オリゴヌクレオチドを含有する、または請求項18〜20のいずれかに記載の組成物である、患者の脊髄性筋萎縮症を治療するために使用される医薬。
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