JP2019508439A - 造血器悪性腫瘍の治療のための、lsd1阻害剤の組合せ - Google Patents
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Abstract
Description
(I)、
の化合物を含む、多数のLSD1阻害剤を開示する。
(I)
の、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤との組合せに関する。
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤とを含む組合せを提供する。
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤とを含む組合せを対象とする。
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、治療的有効量の、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤とを前記患者に投与することを含む方法を対象とする。ある実施態様では、前記造血器悪性腫瘍は、骨髄性の造血器悪性腫瘍である。ある実施態様では、前記造血器悪性腫瘍は、リンパ性の造血器悪性腫瘍である。
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤との治療的有効量の組合せを前記患者に投与することを含む方法を対象とする。ある実施態様では、前記造血器悪性腫瘍は、骨髄性の造血器悪性腫瘍である。ある実施態様では、前記造血器悪性腫瘍は、リンパ性の造血器悪性腫瘍である。
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤とを含む医薬組成物を前記患者に投与することを含む方法を対象とする。ある実施態様では、前記造血器悪性腫瘍は、骨髄性の造血器悪性腫瘍である。ある実施態様では、前記造血器悪性腫瘍は、リンパ性の造血器悪性腫瘍である。
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩からなる群から選択される1つ以上の治療剤と、1つ以上の薬学的に許容される添加剤とを含む医薬組成物を提供する。
本発明は、式(I)の化合物、又は薬学的に許容されるその塩、及び他の治療剤が、ここに記載されたように、式(I)の化合物単独又は他の治療薬単独での治療により達成した結果よりも優位な結果で、造血器悪性腫瘍を治療するために組合せで使用され得るという発見に基づく。
式(I):
(I)
の化合物[CAS登録番号1431304−21−0]は、ORY−1001又は(trans)−N1−((1R,2S)−2−フェニルシクロプロピル)シクロヘキサン−1,4−ジアミンとしても知られ、例えば国際特許出願WO2013/0573222の実施例5に記載されている。塩酸塩[CAS登録番号1431303−72−8、二塩酸塩]を含めて、薬学的に許容されるその塩もそこに記載されている。最も特有の薬学的に許容される塩は二塩酸塩である。式(I)の化合物は選択的LSD1阻害剤として作用する。
トレチノイン[CAS登録番号302−79−4]は、ATRA又はall−transレチノイン酸としても知られ、かつ称され、例えば米国特許US27097123又は推奨INNリスト(Recommended INN List)114に記載されている。トレチノインは未熟な前骨髄球が分化することを引き起こす。ATRAは急性白血病の処置のための現在の標準治療の一つである。
(トレチノイン)
抗がん性、特に抗白血病活性を有することが文献で報告されたATRA誘導体は、本発明の組合せでも使用され得る。
ヌクレオシドアナログは、核酸アナログ及び糖を含有し、化学療法で使用されるいくつかを含めて、様々な障害に対する治療薬として使用されるヌクレオシドである。本発明の組合せでの使用にとって好ましいヌクレオシドアナログはシタラビンである。
シタラビン[CAS登録番号147−94−4]は、ARA−C又はアラビノフラノシルシチジンとしても知られ、かつ称され、例えばChu M.Y. et al.5又は推奨INNリスト(Recommended INN List)66に記載されている。シタラビンは、細胞周期がDNA合成の間のS期にあるときにDNAを傷害する、シトシンアラビノシド三リン酸に急速に変わる。ARA−Cは、通常例えばダウノルビシンなどのアントラサイクリンとの組合せで、急性白血病の処置のための現在の標準治療の一つである。
(シタラビン)
本発明の組合せで使用され得る他のヌクレオシドアナログは、サパシタビン、クロファラビン、エラシタラビン、フルダラビン、シタラビンオクホスファート、ゲムシタビン、2−クロロ−2−デオキシアデノシン(2−CDAとしても知られる)、トロキサシタビン、フォロデシン及びネララビンを含むが、限定されるものではない。
DOT1Lは、白血病、特にAML及びALLのあるサブタイプに関与していることが報告されている、ヒストンメチルトランスフェラーゼであり、DOT1Lの阻害剤は白血病の治療について開発中である。任意の既知のDOT1L阻害剤が本発明の組合せに原則として使用され得る。使用され得るDOT1L阻害剤の例は、限定されることなしに、ピノメトスタット、EPZ−004777、及びSGC−0946を含む。本発明の組合せでの使用にとって好ましいDOT1L阻害剤はピノメトスタットである。
ピノメトスタット[CAS登録番号1380288−87−8]は、EPZ−5676としても知られ、かつ称され、例えば国際特許出願WO20120753817又は提案INNリスト(Proposed INN List)1128に記載されている。ピノメトスタットはDOT1L阻害剤として作用する。
(ピノメトスタット)
EPZ−004777[CAS登録番号1338466−77−5]は、7−[5−デオキシ−5−[[3−[[[[4−(1,1−ジメチルエチル)フェニル]アミノ]カルボニル]アミノ]プロピル](1−メチルエチル)アミノ]−β−D−リボフラノシル]−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−4−アミンとしても知られ、例えばDaigle S.R. et al.9に記載されている。EPZ−004777はDOT1L阻害剤として作用する。
(EPZ−004777)
SGC0496[CAS登録番号1561178−17−3]は、化合物1−[3−[[[(2R,3S,4R,5R)−5−(4−アミノ−5−ブロモ−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−7−イル)−3,4−ジヒドロキシテトラヒドロフラン−2−イル]メチル](イソプロピル)アミノ]プロピル]−3−[4−(2,2−ジメチルエチル)フェニル]尿素であり、Yu et al.10に記載されている。SGC0496は以下の構造式:
(SGC0496)
を有する。
ヒストンデアセチラーゼ(HDAC)阻害剤は、いくつかの時期のがんの治療について承認されている又は臨床開発中である、ヒストンデアセチラーゼの機能に干渉する化合物のクラスである。任意の既知のHDAC阻害剤が本発明の組合せに原則として使用され得る。本発明の組合せでの使用にとって好ましいHDAC阻害剤は、ベリノスタット、パノビノスタット、ボリノスタット、リコリノスタット、エンチノスタット、モセチノスタット、アベキシノスタット、レスミノスタット、ギビノスタット又はキシノスタットである。
ボリノスタット[CAS登録番号149647−78−9]は、SAHA又はスベラニロヒドロキサム酸としても知られ、かつ称され、例えば国際特許出願WO930714811又は推奨INNリスト(Recommended INN List)5612に記載されている。ボリノスタットはヒストンデアセチラーゼ(HDAC)阻害剤として作用する。
(ボリノスタット)
リコリノスタット[CAS登録番号1316214−52−4]は、ロシリノスタット及びACY−1215としても知られ、かつ称され、例えば国際特許出願WO201109121313又は推奨INNリスト(Recommended INN List)7114に記載されている。リコリノスタットはヒストンデアセチラーゼ(HDAC)阻害剤として作用する。
(リコリノスタット)
エンチノスタット[CAS登録番号209783−80−2]は、SNDX−275としても知られ、例えば日本国特許出願JP1015246215又は推奨INNリスト(Recommended INN List)6116に記載されている。エンチノスタットはヒストンデアセチラーゼ(HDAC)阻害剤として作用する。
(エンチノスタット)
ベリノスタット[CAS登録番号866323−14−0]は、(22E)−N−ヒドロキシ−3−[3−(フェニルスルファモイル)フェニル]プロパ−2−エナミドとしても知られ、WO2009/04051717に開示されている。その化合物は以下の構造式:
(ベリノスタット)
を有する。
パノビノスタット[CAS登録番号404950−80−7]は、(2E)−N−ヒドロキシ−3−[4−({[2−(2−メチル−1H−インドール−3−イル)エチル]アミノ}メチル)フェニル]アクリルアミドとしても知られ、WO02/02257718に開示されている。その化合物は以下の構造式:
(パノビノスタット)
を有する。
低メチル化剤としても知られ、これらは特にDNAメチルトランスフェラーゼ(DNMT阻害剤)の活性を妨げることにより、DNAメチル化を阻害する薬物である。現在、このクラスの2つ(デシタビン及びアザシチジン)は骨髄異形成症候群の治療についてFDA承認されており、AML19を含む、多数の腫瘍について調べられている。本発明に使用され得るDNMT阻害剤は以下を含むが、これらに限定されるものではない。
デシタビン[CAS登録番号2353−33−5]は、5−アザ−2’−デオキシシチジンとしても知られる、例えばWolfrom I.M.L. et al.20又は推奨INNリスト(Recommended INN List)3021に記載されている。
(デシタビン)
アザシチジン[CAS登録番号320−67−2]は、5−アザ−2’−デオキシシチジンとしても知られ、例えば独国特許DE114094122又は推奨INNリスト(Recommended INN List)1921に記載されている。アザシチジンは急性白血病の処置のための現在の標準治療の一つである。
(アザシチジン)
グアデシタビン(SGI−110としても知られる)。この化合物はホスホジエステル結合を介してグアノシンに連結したデシタビンであり、デシタビンのプロドラッグとして作用する。リン酸化による代謝活性化及びDNAへの取込みの後で、グアデシタビンはDNAメチルトランスフェラーゼを阻害し、それによってゲノムワイドで非特異的な低メチル化を引き起こし、S期での細胞周期停止を誘導する。この薬剤はシチジンデアミナーゼに抵抗性があり、したがって細胞外及び細胞内の双方に徐々にデシタビンを放出し、より延長されたデシタビンへの曝露につながる。
ゼブラリン、5−フルオロ−2’−デオキシシチジン、6−ジヒドロ−5,6−アザシチジン、ヒドララジン、プロカインアミド、ヒドララジン、EGCG及びRG108は、本発明の組合せに使用され得る他のDNMT阻害剤である。
FMS関連チロシンキナーゼ3(FLT3)はがん原遺伝子である。FLT3受容体の変異は白血病の進展につながることがあり、実際にAMLで最も頻繁に変異していた遺伝子の1つである。FLT3阻害剤はいくつかの型のがんの治療のために開発されている。任意の既知のFLT3阻害剤が本発明の組合せに原則として使用され得る。本発明の組合せでの使用にとって好ましいFLT3阻害剤は、キザルチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ及びレスタウルチニブを含む。
キザルチニブ[CAS登録番号950769−58−1]は例えば国際特許出願WO200710912024又は推奨INNリスト(Recommended INN List)9925に記載されている。
(キザルチニブ)
Bcl2(B細胞性リンパ腫2)は重要な抗アポトーシスタンパク質と考えられており、がん遺伝子として分類されている。BCL2遺伝子の改変は多数のがんの原因として同定されており、Bcl2阻害剤は抗がん治療として開発されている。任意の既知のBcl2阻害剤が本発明の組合せに使用され得る。好ましいBcl2阻害剤は、ABT−737、ナビトクラックス(別名ABT−263)、ベネトクラックス(別名ABT−199)、及びオバトクラックスを含む。
ABT−737[CAS登録番号852808−04−9]は、4−[4−[[2−(4−クロロフェニル)フェニル]メチル]ピペラジン−1−イル]−N−[4−[[(2R)−4−(ジメチルアミノ)−1−フェニルスルファニルブタン−2−イル]アミノ]−3−ニトロフェニル]スルホニルベンズアミドとしても知られ、例えば国際特許出願WO200504959426に記載されている。
(ABT−737)
ナビトクラックス[CAS登録番号923564−51−6]は、ABT−263又は4−(4−{[2−(4−クロロフェニル)−5,5−ジメチル−1−クロロヘキセン−1−イル]メチル}−1−ピペラジニル)−N−[(4−{[(2R)−4−(4−モルホリニル)−1−(フェニルスルファニル)−2−ブタニル]アミノ}−3−[(トリフルオロメチル)スルホニル]フェニル)−スルホニル]ベンズアミドとしても知られ、例えばUS2007002713527に記載されている。
(ABT−263(ナビトクラックス))
オバトクラックス[CAS登録番号803712−67−6]は、2−(2−((3,5−ジメチル−1H−ピロール−2−イル)メチレン)−3−メトキシ−2H−ピロール−5−イル)−1H−インドールとしても知られ、例えば国際特許出願WO200410632828に記載されている。
(オバトクラックス)
ベネトクラックス[CAS登録番号1257044−40−8]は、ABT−199又は4−[4−[[2−(4−クロロフェニル)−4,4−ジメチルシクロヘキシ−1−エン−1−イル]メチル]ピペラジン−1−イル]−N−[[3−ニトロ−4−[[(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メチル]アミノ]フェニル]スルホニル]−2−[(1H−ピロロ[2,3−b]ピリジン−5−イル)オキシ]ベンズアミドとしても知られ、例えば国際特許出願WO201013858829に記載されている。
(ABT−199(ベネトクラックス))
マウスダブルマイニュート2ホモログ(Mouse double minute 2 homolog)(MDM2)は、がんでの他の役割の間で、p53腫瘍抑制因子の重要な負の制御因子と考えられている。Mdm2阻害剤は、Mdm2とp53の間の相互作用を阻害する化合物であり、中でもヌトリン類を含む。特に好ましいMDM2阻害剤はヌトリン−3Aである。
ヌトリン−3A[CAS登録番号675576−98−4]は、4−[[(4S,5R)−4,5−ビス(4−クロロフェニル)−4,5−ジヒドロ−2−[4−メトキシ−2−(1−メトキシエトキシ)フェニル]−1H−イミダゾール−1−イル]カルボニル]−2−ピペラジノンとしても知られ、例えば米国特許出願US2005028280330に記載されている。
(ヌトリン−3A)
c−KIT(肥満/幹細胞成長因子受容体(SCGFR)又はCD117としても知られる)は、ヒトにおいてはがん原遺伝子である受容体型チロシンキナーゼタンパク質である。この遺伝子における活性化変異は、急性骨髄性白血病を含む、多数のがんに関連している。任意の開示されたcKIT阻害剤が本発明の組合せに使用され得る。
ダサチニブ(CAS登録番号302962−49−8)は、化合物N−(2−クロロ−6−メチルフェニル)−2−[[6−[4−(2−ヒドロキシエチル)−1−ピペラジニル]−2−メチル−4−ピリミジニル]アミノ]−5−チアゾールカルボキシアミドであり、式:
(ダサチニブ)
を有する。
ダサチニブは、慢性骨髄性白血病(CML)及び急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する患者におけるファーストラインの使用について承認されている。
イマチニブ(CAS登録番号152459−95−5)は、化合物4−[(4−メチルピペラジン−1−イル)メチル]−N−(4−メチル−3−{[4−(ピリジン−3−イル)ピリミジン−2−イル]アミノ}フェニル)ベンズアミドであり、式:
(イマチニブ)
を有する。
イマチニブは、フィラデルフィア染色体陽性のCMLを含む、複数のがんの治療において用いられるチロシンキナーゼ阻害剤である。
BET阻害剤は、現在臨床試験中の、抗がん、免疫抑制、及び他の効果を有する薬物のクラスである。これらの分子は、ブロモドメイン及びエクストラターミナルモチーフ(Bromodomain and Extra-Terminal motif)(BET)タンパク質BRD2、BRD3、BRD4、及びBRDTのブロモドメインに可逆的に結合し、BETタンパク質とアセチル化ヒストンと転写因子の間のタンパク質−タンパク質相互作用を妨げる。任意の既報のBET阻害剤が本発明の組合せに使用され得る。BET阻害剤の例は以下を含むが、これらに限定されるものではない:
JQ1(CAS登録番号1268524−70−4)は、(S)−tert−ブチル2−(4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−イル)アセタートであり、WO201114365131に開示される。
(JQ1)
GSK1210151A(I−BET151)(CAS登録番号1300031−49−5)は、7,3,5−ジメチル−4−イソキサゾリル−1,3−ジヒドロ−8−メトキシ−1−[1R−1−(2−ピリジニル)エチル]−2H−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2−オンであり、WO201105484332に開示される。
(GSK1210151A)
MS436(CAS登録番号1395084−25−9)は、4−[(1E)−2−(2−アミノ−4−ヒドロキシ−5−メチルフェニル)ジアゼニル]−N−2−ピリジニル−ベンゼンスルホンアミドであり、WO201211617033に開示される。
(MS436)
I−BET762(GSK525762)は:
(I−BET762)
である。
OTX−015(CAS登録番号202590−98−5)は、(6S)−4−(4−クロロフェニル)−N−(4−ヒドロキシフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−アセタミドであり、US571227434に開示される。
(OTX−015)
CPI−203(CAS登録番号1446144−04−2)は、(6S)−4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−アセタミドであり、WO201413458335に開示される。
(CPI−203)。
GSK1324726A(I−BET726)(CAS登録番号1300031−52−0)は、4−[(2S,4R)−1−アセチル−4−[(4−クロロフェニル)アミノ]−1,2,3,4−テトラヒドロ−2−メチル−6−キノリニル]−安息香酸であり、WO201105484336に開示される。
(GSK1324726A)
化合物(I)との組合せに使用され得る他のBET阻害剤は、ABBV−075、BAY1238097、CPI−0610及びTEN−010を含む。
アントラサイクリン(又はアントラサイクリン系抗生物質)は、ストレプトマイセス属微生物(Streptomyces peucetius var. caesius)由来の、がん化学療法において使用される薬物のクラスである。これらの化合物は、白血病を含む、多くのがんを治療するために使用される。本発明の組合せでの使用のためのアントラサイクリンの例は、ドキソルビシン、イダルビシン、及びダウノルビシンを含む。
例えばダウノルビシン、ドキソルビシン及びイダルビシンなどのアントラサイクリンは、特定の型の白血病(例えば、急性骨髄性白血病及び急性リンパ性白血病)を治療するために、大抵、例えばシタラビンなどの他の化学療法薬との組合せで使用される。
(ダウノルビシン)
(ドキソルビシン)
(イダルビシン)
三酸化ヒ素は、例えばATRAなどの「ファーストライン」の薬剤に反応しない急性前骨髄球性白血病の治療について、米国FDAに承認されている化学療法剤である。三酸化ヒ素は、がん細胞がアポトーシスを起こすのを誘導することが示される。急性骨髄性白血病の難治性の前骨髄球性(M3)サブタイプの治療における、細胞増殖抑制薬として使用する。三酸化ヒ素とオールトランスレチノイン酸(ATRA)の併用療法は、ある白血病の治療についてFDAに承認されている。経口投与が可能な三酸化ヒ素の液剤が開発されている。
ヒドロキシ尿素(CAS登録番号127−07−1)は、ヒドロキシカルバミドとしても知られ、CMLを含む骨髄増殖性疾患において使用される抗悪性腫瘍薬である。ヒドロキシカルバミドは、NDPの還元に関連するチロシルフリーラジカルの除去による酵素リボヌクレオチドレダクターゼの阻害を介して、デオキシリボヌクレオチドの生産を減少させる。
(ヒドロキシ尿素)
用語「薬学的に許容される酸付加塩」は、例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、炭酸、リン酸などの無機酸、並びに脂肪族、環状脂肪族、芳香族、芳香脂肪族、複素環式、カルボン酸及びスルホン酸のクラスから選択される有機酸、例えば、ギ酸、酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、グルコン酸、乳酸、ピルビン酸、シュウ酸、リンゴ酸、マレイン酸、マロン酸(maloneic acid)、コハク酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、アスパラギン酸、アスコルビン酸、グルタミン酸、アントラニル酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、エンボン酸、フェニル酢酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、p−トルエンスルホン酸及びサリチル酸などで形成された塩で、薬学的に許容されるものを意味する。
−骨髄性の造血器悪性腫瘍、例えば急性骨髄性白血病(AML)(例えば赤白血病、急性巨核芽球性白血病、急性好酸球性白血病、急性好塩基球性白血病、急性骨髄単球性白血病、急性骨髄芽球性白血病);慢性骨髄性白血病;骨髄異形成症候群;慢性骨髄単球性白血病;及び骨髄増殖性疾患(例えば骨髄線維症、急性混合性白血病、真性多血症、慢性好酸球性白血病/好酸球増加症候群、本態性血小板血症、及び慢性好酸球性白血病/好酸球増加症候群)など
−リンパ性の造血器悪性腫瘍、例えば急性リンパ芽球性白血病(ALL)、T細胞リンパ芽球性白血病/リンパ腫
この実施例の目的はORY−1001と他の治療剤の間に存在する相乗作用を決定することである。表1は併用療法において試験された化合物及び使用された細胞株を要約する。
表1:ORY−1001との組合せで試験されるであろう化合物のリスト。*リコリノスタット及びACY−1215としても知られる。
1.1.1 細胞株及び培養条件
AML細胞株は、5%CO2雰囲気で制御された加湿インキュベーター内で、RPMI10%FBS培地中37℃で維持された。細胞凍結及び解凍はATCCからの推奨に従って行われた。使用された細胞株の遺伝子プロファイリングは表2で利用できる。
表2:本文書において報告されたAML細胞株の遺伝特性。
細胞は、予め決められたように(KASUMI−1細胞の場合の16000細胞/ウェルを除いて、4000細胞/ウェル)、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、最適密度で播種された(処理の間の直線的な増殖を保証するため)。3つのウェルは各実験例の条件が指定された;それぞれバックグラウンド補正及び正規化のために、培地のみ及びビヒクル処理されたコントロールも加えられた。播種の後、ORY−1001(又は組合せ処置のための他のいくつかの候補)の8段階の希釈液(1:3)を含有する50μLの培地が細胞に加えられた。アラマーブルー(登録商標)(ThermoFisher Scientific,Waltham,MA/USA)生存染色を用いて細胞生存を評価する前に、細胞はその後制御された5%CO2雰囲気において37℃で96時間インキュベートされた。アラマーブルー(登録商標)は、生細胞の天然還元力を用いてレサズリンを蛍光分子、レゾルフィンに変換する、細胞生存インジケーターである43。手短に、アラマーブルー原液は培地で1:20に希釈され、3時間のインキュベートの後、蛍光がTECAN Infinity 2000プレートリーダー(Tecan Group Ltd.,Mannedorf,CH;540−570nm励起波長、580−610nm放出波長)を用いて検出された。各条件について、平均蛍光は3回の技術的反復から計算された;バックグラウンド補正は培地のみのコントロールの蛍光から計算された。ベストフィット曲線及びEC50値を計算するために、データはGraphPad PRISM(登録商標)version5.01(GraphPad Software,Inc.,La Jolla,CA/USA)を用いて解析された。
各マトリックスアッセイは以下の図1で説明されたスキームに従って、2つのプレートに分配された。
細胞は、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、最適密度(4000細胞/ウェル、予め決められたように)で播種された;プレートの縁のウェルは、バックグラウンド補正のために、細胞なしの100μLの培地と共に置かれた。2つの化合物のそれぞれは25μLの中に加えられ、結果的に最終体積100μLの培地とされた。図1に示したように、マトリックスは左から右へORY−1001の濃度の上昇を、上から下へ目的化合物(図1参照)の濃度の上昇を表す。2つのプレートに渡って再現性を確認するために、プレート#1の最初と最後の列はプレート#2(図1において赤い矢印によって示した)において繰り返された。マトリックス上の水平及び垂直に中心にされた双方の化合物のEC50を得るためにデザインされた(図1に示したように、ORY−1001及び右から及び下から5番目に対応する他の化合物のEC50)、双方の化合物について試験された濃度は、8回の1:2希釈ステップを通じて得られた256倍の範囲をカバーしていた。マトリックスアッセイにおいて試験された化合物のEC50値は、セクション1.1.2において詳述したように単剤アッセイを通じて以前に得られた。広い濃度範囲が試験された化合物(デシタビン、アザシチジン及びヌトリン3A)について段階希釈は1:3のステップで行われた。
生存はその後セクション1.1.2において詳述したようにアラマーブルー染色を用いて決定された。
各マトリックスアッセイについて、次の式に従って相対生存のパーセンテージの値を得るために、データはその後ビヒクル処理されたコントロール(<0.4%DMSO、左上コーナー)を対照として正規化された:
%相対生存=RFU処理された細胞/RFUビヒクルコントロール×100
その後、生存率の値は、GraphPad PRISM(登録商標)version5.01(GraphPad Software,Inc.,La Jolla,CA/USA)を用いて解析され、ベストフィット曲線及びEC50値を計算した。
この時点において画分の影響(Fractional Effect)(Fa)は式
Fa=1−(相対生存%/100)
次の条件:
・単剤としてORY−1001の段階希釈液を用いて処理された細胞(各マトリックスアッセイの第1及び第2のプレートの最初の行の平均)
・単剤として目的化合物の段階希釈液を用いて処理された細胞(マトリックスアッセイの最初の列)
・EC50値の比に対応する固定比でのORY−1001及び目的化合物を用いて処理された細胞(マトリックスアッセイの対角線における相対生存%の値;図1中でハイライトされた)
を用いて計算された。
Calcusynを用いた解析の前に、前述のFa値はその後2回の技術的反復に渡って平均化された。
Calcusynソフトウェア(http://www.biosoft.com/w/calcusyn.htm,Biosoft,Cambridge,UK)は、Median Effect原理(Median Effect Principle)及びコンビネーションインデックス定理(Combination Index Theorem)に基づいて、2つの化合物の間の相互作用の性質(相乗的、相加的又は拮抗的)を決定するためにデザインされる44。情報を与える結果を生み出すために、Calcusynを用いて処理されるであろうデータは(単剤と薬物組合せの双方について)、これらの理論モデルを用いて当てはめる必要がある。この理由のために、外れ値及びMedian Effect原理(Median Effect Principle)への不十分なフィットによって特徴付けられるデータポイントを除去することは極めて重要である45。これを達成するために、次のストラテジーがデータフィルタリングに適用された。
最初のステップで:
1)Fa<0.1
2)前のポイントに比べて、Faの増加<0.03(Fa>0.9の場合)
によって特徴付けられるポイントを除去することで、データばらつきは減らされた。
これらの条件は用量反応曲線のプラトーを定義し、細胞は非常に低い又は非常に高い濃度の化合物(又は組合せ)で処理されて、結果的に0%又は100%(Fa値がそれぞれ0又は1と同等である)に近い生存の減少となる。用量反応曲線のこの範囲において、アラマーブルーシグナルにおける変化は非常に小さく、大概、とても小さい生物学的意義を有するランダムノイズの結果であることが注意される。
次に、各データポイントについて、Log10(濃度)及びLog10(Fa/(1−Fa))は計算され、x軸で前者の値、y軸で後者の値を報告するドットプロットグラフが生成された。Excelを用いて、回帰曲線がその後得られた(Median Effect方程式(Median Effect Equation)に対応している)。
この時点で各データポイントについて、回帰曲線からの距離が式:
距離(ax+by+c=0;X,Y)=(aX+bY+c)/√(a2+b2)
を用いて計算された。
外れ値は、グラブス検定を用いて、Median Effect方程式(Median Effect Equation)からの距離に基づいて同定される。各データポイントについて、グラブス検定は、次の式(グラブス検定についての変数はG又はZと互換的に呼ばれ得ることが注意される):
G=(Xn−Xaverage)/s
により距離の絶対値に行われた。
ここでXnは回帰曲線からの各ポイントの距離の絶対値を表し、Xaverageは全てのXn値の平均を表し、sは標準偏差を表す。Gcrit(下に示すようにα=0.2で計算される)の上のGの値はMedian Effect方程式(Median Effect Equation)上でフィットしない外れ値を同定する。そのようなデータポイントは、Calcusynを用いてコンビネーションインデックスを成功裏に計算するために除去される。
可能な場合、多数の外れ値を除去するために:
1.さらなる外れ値が同定されない又は
2.R2>0.95である。データの質を測定するために、R値はCalcusynソフトウェアによっても計算される(よいデータは0.95を上回るR値によって特徴付けられる
まで、検定は複数回繰り返された46。
x軸上で、画分の影響(Fractional Effect)(影響を受けた画分(Fraction Affected)とも呼ばれ、テキスト中でFaと称される)が報告され、処理(細胞傷害性の処理の場合において、画分の影響(Fractional Effect)は、ビヒクルコントロールと比較した生存減少に対応し、1は100%に等しい)によって影響を受けた細胞の画分を表す。y軸上で、コンビネーションインデックスが報告され、それらは相乗的(CI<1)、相加的(CI=1)又は拮抗的(CI>1)のいずれかであり得る。クロスは実験のデータポイントを表し、中心の線はCI曲線であり、上と下の線はCIの上と下の1.96標準偏差(SD)の幅を定義する。
細胞は、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、2500細胞/ウェルの密度で播種された;プレートの縁のウェルは、バックグラウンド補正のために、細胞なしの100μLの培地と共に置かれた。2つの化合物のそれぞれは25μLの中に加えられ、結果的に最終体積100μLの培地とされた。細胞はORY−1001とダサチニブ又はJQ−1の段階1:3希釈液を用いて処理された。ORY−1001/ダサチニブ及びORY−1001/JQ1の比はそれぞれ1:1000及び1:200であった。
生存はその後セクション1.1.2において詳述したようにアラマーブルー染色を用いて決定された。
データ解析はセクション1.1.3.1に記載のとおり行われた。
Calcusynソフトウェアのアウトプットはセクション1.1.3.2に記載のとおりである。
細胞は、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、4000細胞/ウェルの密度で播種された;プレートの縁のウェルは、バックグラウンド補正のために、細胞なしの100μLの培地と共に置かれた。2つの化合物のそれぞれは25μLの中に加えられ、結果的に最終体積100μLの培地とされた。細胞は、固定された濃度のORY−1001(5nM)又はビヒクル(0.05%)の存在下で、ヒドロキシ尿素の段階1:3希釈液を用いて処理された。
生存はその後セクション1.1.2において詳述したようにアラマーブルー染色を用いて決定された。データは、GraphPad PRISM(登録商標)version 5.01(GraphPad Software, Inc.,La Jolla,CA/USA)を用いて解析され、ベストフィット曲線及びEC50値を計算した。
細胞は、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、2500細胞/ウェルの密度で播種された;プレートの縁のウェルは、バックグラウンド補正のために、細胞なしの100μLの培地と共に置かれた。2つの化合物のそれぞれは25μLの中に加えられ、結果的に最終体積100μLの培地とされた。細胞は、固定された濃度のORY−1001(5nM)又はビヒクル(0.05%)の存在下で、三酸化ヒ素の段階1:3希釈液を用いて処理された。
生存はその後セクション1.1.2において詳述したようにアラマーブルー染色を用いて決定された。データは、GraphPad PRISM(登録商標)version 5.01(GraphPad Software, Inc.,La Jolla,CA/USA)を用いて解析され、ベストフィット曲線及びEC50値を計算した。
1.2.1 ORY−1001単剤
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はORY−1001の段階1:3希釈液(0.015から100nMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。OCI−AML2を除いて、試験されたAML細胞株において、ORY−1001は、サブナノモルの範囲のEC50値で、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少を引き起こした。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はATRAの段階1:3希釈液(0.015から100nMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1(EC50=1.7nM)、MV(4;11)(EC50=2.8nM)、HL−60(EC50=2.7nM)、OCI−AML2(EC50=5.9nM)、OCI−AML3(EC50=0.8nM)及びMOLM−13細胞(EC50=4.8nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
ATRA(0.16−40nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図2A及び2Bに示される。
試験された条件において、相乗作用(CI<1)は、ORY−1001とATRAの間で、MV(4;11)細胞(n=2)において0.5を、MOLM−13細胞(n=2)において0.8を、超えるFa値で検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はARA−Cの段階1:3希釈液(0.15から1000nMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1(EC50=251.7nM)、MV(4;11)(EC50=198nM)、HL−60(EC50=43.5nM))、OCI−AML2(EC50=26.5nM)、OCI−AML3(EC50=144.8nM)、KASUMI−1(EC50=28.7nM)及びMOLM−13細胞(EC50=78.5nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
ARA−C(6.25−1600nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4−11)、OCI−AML3及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図3A、3B及び3Cに示される。
試験された条件において、ORY−1001は、MV(4;11)細胞のARA−Cへの反応をFa>0.5(n=1)で相乗的に高める。OCI−AML3及びMOLM−13細胞において、ARA−CとORY−1001の間の相乗作用は、Fa>0.7及びFa>0.6でそれぞれ検出された(n=2)。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はEPZ5676の段階1:3希釈液(1.5nMから10μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。MV(4;11(EC50=16nM)及びMOLM−13細胞(EC50=44.7nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
EPZ5676(1.25−320nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図4A及び4Bに示される。
試験された条件において、ORY−1001とEPZ56756の間の相乗作用は、MV(4;11)細胞(n=2)においてFa>0.4で、MOLM−13細胞(n=2)においてFa>0.3で検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.2%)又はEPZ004777の段階1:3希釈液(2.5nMから16.7μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。MV(4;11)(EC50=118nM)及びMOLM−13細胞(EC50=108.3nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はSAHAの段階1:3希釈液(1.5nMから10μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML2、OCI−AML3、KASUMI−1及びMOLM−13細胞において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された(100−1000nM範囲のEC50)。
SAHA(6.25−1600nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図5A及び5Bに示される。
試験された条件において、ORY−1001とSAHAの間の相乗的相互作用は、MV(4;11)細胞において0.3から0.8の間のFa値(n=2)で、MOLM−13細胞においてFa>0.4(n=1)で検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はロシリノスタットの1:3段階希釈液(1.5nMから10μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML2、OCI−AML3、KASUMI−1及びMOLM−13細胞において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された(0.5−3μM範囲のEC50)。
ロシリノスタット(15.6−4000nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)、OCI−AML3及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図6A、6B及び6Cに示される。
試験された条件において、ORY−1001はロシリノスタットと、MV(4;11) 細胞においてFa>0.6(n=2)で、OCI−AML3細胞においてFa>0.4(n=2)で相乗的に相互作用する。MOLM−13細胞において、相互作用はFa>0.8(n=2)で検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.1%)又はエンチノスタットの1:3段階希釈液(7.6nMから50μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1(EC50=230nM)、MV(4;11)(EC50=98.5nM)、HL−60(EC50=42nM)、OCI−AML2(EC50=106.5nM)、OCI−AML3(EC50=55.2nM)、KASUMI−1(EC50=167.5nM)及びMOLM−13細胞(EC50=52nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はアザシチジンの1:3段階希釈液(15nMから100μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1(EC50=2881.5nM)、MV(4;11)(EC50=1112nM)、HL−60(EC50=1812nM)、OCI−AML2(EC50=1851.7nM)、OCI−AML3(EC50=889.4nM)、KASUMI−1(EC50=2281.7nM)及びMOLM−13細胞(EC50=322.8nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
アザシチジン(9.5nM−62.3μM)及びORY−1001(0.001−8nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図7A及び7Bに示される。
試験された条件において、MV(4;11)及びMOLM−13細胞の双方において、ORY−1001はアザシチジンとFa>0.3(n=2)で相乗作用する。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はデシタビンの1:3段階希釈液(1.5nMから10μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1(EC50=95nM)、MV(4;11)(EC50=79.5nM)、HL−60(EC50=42.1nM)、OCI−AML2(EC50=36nM)、OCI−AML3(EC50=100.5nM)、KASUMI−1(EC50=24nM)及びMOLM−13細胞(EC50=12.6nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
デシタビン(0.4−2430nM)及びORY−1001(0.004−24.3nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図8A及び8Bに示される。
試験された条件において、ORY−1001とデシタビンの間の相乗効果は、MV(4;11)及びMOLM−13細胞の双方においてFa>0.5(n=2)で検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.1%)又はキザルチニブの1:3段階希釈液(2.3nMから15μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。増強された感度により、範囲はMV(4;11)(0.0015−10nM)及びMOLM−13細胞(0.01−60nM)に調整された。MV(4;11)(EC50<1nM)、OCI−AML2(EC50=830nM)及びMOLM−13細胞(EC50<1nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
キザルチニブ(0.031−8nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図9A及び9Bに示される。
試験された条件において、MV(4;11)及びMOLM−13細胞において(両者はFLT3−ITD変異を有している)、ORY−1001/キザルチニブの組合せについてのコンビネーションインデックスはFa>0.2(n=2)で1より低い(相乗的相互作用)。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はABT737の1:3段階希釈液(0.15nMから1μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。MV(4;11)(EC50=6.3nM)、HL−60(EC50= 113.4nM)、OCI−AML2(EC50=14nM)、KASUMI−1(EC50=124nM)及びMOLM−13細胞(EC50=25nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
ABT373(0.3−80nM)及びORY−1001(0.006−1.6nM)を用いたマトリックス処理が、MV(4;11)、OCI−AML3及びMOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図10A及び10Bに示される。
MV(4;11)(n=2)及びMOLM−13細胞(n=1)において、ORY−1001とABT737の間の相乗作用は、Fa>0.7及びFa>0.9でそれぞれ検出された。
THP−1、MV(4;11)、HL−60、OCI−AML3、KASUMI−1、OCI−AML2及びMOLM−13のAML細胞株の最適増殖条件を決定した後で、セクション1.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.2%)又はヌトリン3Aの1:3段階希釈液(0.6nMから4μMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。THP−1(EC50=323.7nM)、OCI−AML2(EC50=446.5nM)、OCI−AML3(EC50=659nM)及びMOLM−13細胞(EC50=127.7nM)において、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きい生存の減少が検出された。
ヌトリン3A(1.1−7290nM)及びORY−1001(0.001−8.1nM)を用いたマトリックス処理が、MOLM−13細胞で、セクション1.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図11に示される。
試験された条件において、MOLM−13細胞において、ORY−1001はヌトリン3Aと0.8を超えるFa値で相乗的相互作用を示す(n=2)。
ダサチニブ(6nM−40μM)及びORY−1001(0.006−40nM)を用いた処理が、MV(4;11)細胞で、セクション1.1.4に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.4.1に報告したとおりである。得られた結果は図12に示される。
試験された条件において、MV(4;11)細胞において、ORY−1001はダサチニブと0.4から0.9の間のFa値で相乗的相互作用を示す(n=1)。
JQ1 (0.9nM−6000nM)及びORY−1001(0.004−30nM)を用いた処理が、MV(4;11)細胞で、セクション1.1.4に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は1.1.4.1に報告したとおりである。得られた結果は図13に示される。
試験された条件において、MV(4;11)細胞において、ORY−1001はJQ1と0.6から0.9の間のFa値で相乗的相互作用を示す(n=3)。
ヒドロキシ尿素(0.076−500nM)の段階希釈液を用いた処理が、ORY−1001(5nM)又はビヒクル(DMSO 0.05%)の存在下で、MV(4;11)細胞で、セクション1.1.5に記載したように行われた。得られた結果は図14に示される。
試験された条件において、ORY−1001はMV(4;11)細胞のヒドロキシ尿素への反応を増強する(n=1)。
三酸化ヒ素(0.039−10nM)の段階希釈液を用いた処理が、ORY−1001(5nM)又はビヒクル(DMSO 0.05%)の存在下で、MV(4;11)細胞で、セクション1.1.6に記載したように行われた。得られた結果は図15に示される。
試験された条件において、ORY−1001はMV(4;11)細胞の三酸化ヒ素への反応を増強する(n=1)。
この実施例の目的はORY−1001と他の治療剤の間に存在する相乗作用を決定することである。表3は併用療法で試験された化合物及び使用された細胞株を要約する。
表3:ORY−1001との組合せで試験されるであろう化合物のリスト。*リコリノスタット及びACY−1215としても知られる。
2.1.1 細胞株及び培養条件
MOLT4細胞は、5%CO2雰囲気で制御された加湿インキュベーター内で、RPMI10%FBS培地中37℃で維持された。細胞凍結及び解凍はATCCからの推奨に従って行われた。使用された細胞株の遺伝子プロファイリングは表4で利用できる。
表4:本文書において報告されたALL細胞株の遺伝特性。
より短い処理(96時間)は細胞株の生存に影響を及ぼしていないので(データは示していない)、MOLT4細胞の生存へのORY−1001の効果は10日間の処理の後で評価された。
MOLT4細胞は、予め決められたように(5000細胞/ウェル)、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、最適密度で播種された。3つのウェルは各実験例の条件が指定された;それぞれバックグラウンド補正及び正規化のために、培地のみ及びビヒクル処理されたコントロールも加えられた。播種の後、ORY−1001の8つの1:3段階希釈液を含有する50μLの培地が細胞に加えられた(範囲0.015−100nM)。細胞はその後制御された5%CO2雰囲気において37℃で6日間インキュベートされた。6日目に、100μLのORY−1001の段階希釈液(前述のとおり)を用いた培地又はビヒクルが細胞に加えられた。化合物なしの培地(100μ)はバックグラウンドコントロールに加えられた。
追加の4日間のインキュベーションの後で、細胞生存は、セクション1.1.2で詳述したとおり、アラマーブルー(登録商標)染色を用いて評価された。
各マトリックスアッセイは1.1.3に記載したとおり、2つのプレートに渡って分配された。マトリックスアッセイは上記セクション(2.1.2)で報告した観察に従って適応された。
MOLT4細胞は、50μLの培地を用いて96ウェルのプレートにおいて、最適密度(5000細胞/ウェル、予め決められたように)で播種された。プレートの縁のウェルは、バックグラウンド補正のために、100μLの培地のみで満たされた。ORY−1001を用いた最初の前処理のために、50μLの培地が細胞に加えられ、結果的に最終体積100μLの培地とされた。マトリックス上の垂直方向に中心にあるORY−1001についてのEC50値を得るためにデザインされた、8回の1:2希釈ステップを通じて得られた、さまざまな濃度のORY−1001を用いて、6日間の前処理は行われた。より広い濃度範囲が試験された化合物(デシタビン及びアザシチジン)について、段階希釈は1:3のステップで行われた。細胞はその後5%CO2で制御された雰囲気で6日間インキュベートされた。
6日目に、ORY−1001及び目的化合物の双方の段階希釈液を含有する追加の100μLの培地が各ウェルに加えられた(200μL最終体積)。前述のとおり、バックグラウンド補正のために、細胞なしの100μLの培地もプレートの縁に加えられた(200μL最終体積)。図1に示したように、マトリックスは左から右へORY−1001の濃度の上昇を、上から下へ目的化合物の濃度の上昇を表す。2つのプレートに渡って再現性を確認するために、プレート#1の最初と最後の列はプレート#2(図1において赤い矢印によって示された)において繰り返された。マトリックス上の水平方向及び垂直方向に中心にある双方の化合物のEC50を得るためにデザインされた(図1に示したように、右から及び下から5番目に対応するORY−1001及び他の化合物のEC50)、双方の化合物について試験された濃度は、8回の1:2の希釈ステップを通じて得られた256倍の範囲をカバーしていた。マトリックスアッセイにおいて試験された化合物のEC50値は、セクション1.1.2において詳述したように単剤アッセイを通じて以前に得られた。広い濃度範囲が試験された化合物(デシタビン、アザシチジン及びヌトリン3A)について、段階希釈は1:3のステップで行われた。この時点で、細胞は双方の化合物を用いてさらに96時間インキュベートされた。
ORY−1001及び目的化合物を用いた4日間の併用処理の後で(10日目)、アラマーブルー(登録商標)原液は培地で1:20に希釈され、3時間のインキュベートの後、蛍光はTECAN Infinity 2000プレートリーダー(Tecan Group Ltd.,Mannedorf,CH;540−570nm励起波長、580−610nm放出波長)を用いて検出された。各条件について、バックグラウンド補正は培地のみのコントロールの蛍光から計算された。マトリックスアッセイは2回の技術的反復で行われた。
データ解析はセクション1.1.3.1に記載のとおり行われた。
Calcusynソフトウェアのアウトプットはセクション1.1.3.2に記載のとおりである。
2.2.1 ORY−1001単剤
MOLT4細胞の最適増殖条件を決定した後で、セクション2.1.2で記載したように、ビヒクル(DMSO 0.05%)又はORY−1001の1:3段階希釈液(0.015から100nMの範囲)を用いてインキュベーションが行われた。試験された条件において、最も高いORY−1001濃度(100nM)での生存減少は、サブナノモルの範囲のEC50値で、(ビヒクルコントロールに比較して)20%より大きかった。
ARA−C(6.25−1600nM)及びORY−1001(0.08−20nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。得られた結果は図16に示される。
試験された条件において、MOLT4細胞において、ORY−1001は、0.2を超えるFa値で(n=2)、相乗的にARACの効果を増強する。
SAHA(12.5−3200nM)及びORY−1001(0.08−20nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は2.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図17に示される。
試験された条件において、ORY−1001とSAHAの間の相乗的相互作用は、0.3から0.8の間からなるFa値(n=2)で検出された。
ロシリノスタット(31.25−8000nM)及びORY−1001(0.08−20nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は2.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図18に示される。
試験された条件において、SAHAについて前に観察されたように、ORY−1001とロシリノスタットの間の相乗作用は、0.2から0.6の間のFa値(n=1)で検出された。
エンチノスタット(15.6−4000nM)及びORY−1001(0.08−20nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は2.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図19に示される。
試験された条件において、SAHAについて以前に観察されたように、ORY−1001とエンチノスタットの間の相乗作用は、0.2から0.9の間のFa値(n=2)で検出された。
アザシチジン(13.72nM−90μM)及びORY−1001(0.012−81nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は2.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図20に示される。
試験された条件において、ORY−1001とアザシチジンの間の相乗作用は、0.2から0.4の間の値を持つFa(n=2)の狭い範囲内でのみ検出された。
デシタビン(1.5nM−10μM)及びORY−1001(0.012−81nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は2.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図21に示される。
試験された条件において、デシタビンはFa値の広い範囲内で(0.1から0.9の間のFA値;n=1)ORY−1001と強力に相乗作用する。
ABT737(19.53−5000nM)及びORY−1001(0.08−20nM)を用いたマトリックス処理が、MOLT−4細胞で、セクション2.1.3に記載したように行われた。データ解析及びコンビネーションインデックスの計算は2.1.3.1に報告したとおりである。得られた結果は図22に示される。
試験された条件において、MOLT4細胞において、ORY−1001とABT737の間の相乗作用は0.6を超えるFa値で(n=2)で検出された。
2 WO 2013/057322 A1
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Claims (48)
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ、ヌクレオシドアナログ、DOT1L阻害剤、HDAC阻害剤、脱メチル化剤、FLT3阻害剤、BCL2阻害剤、MDM2阻害剤、c−KIT阻害剤、BET阻害剤、アントラサイクリン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩から選択される1つ以上の治療剤とを含む組合せ。 - 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、トレチノイン、シタラビン、サパシタビン、クロファラビン、エラシタラビン、フルダラビン、シタラビンオクホスファート、ゲムシタビン、2−クロロ−2−デオキシアデノシン(2−CDAとしても知られる)、トロキサシタビン、フォロデシン、ネララビン、ピノメトスタット、EPZ−004777、SGC−0946、ベリノスタット、パノビノスタット、ボリノスタット、リコリノスタット、エンチノスタット、モセチノスタット、アベキシノスタット、レスミノスタット、ギビノスタット、キシノスタット、デシタビン、アザシチジン、グアデシタビン、キザルチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、レスタウルチニブ、ABT−737、ナビトクラックス、ベネトクラックス、オバトクラックス、ヌトリン−3A、ダサチニブ、イマチニブ、JQ1、GSK1210151A、MS436、GSK525762、OTX−015、CPI−203、GSK1324726A、ダウノルビシン、ドキソルビシン、イダルビシン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩から選択される1つ以上の治療剤とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、トレチノイン、シタラビン、ピノメトスタット、EPZ−004777、ボリノスタット、リコリノスタット、エンチノスタット、デシタビン、アザシチジン、キザルチニブ、ABT−737、ヌトリン−3A、ダサチニブ、JQ1、ダウノルビシン、三酸化ヒ素、ヒドロキシ尿素、及び薬学的に許容されるそれらの塩から選択される1つ以上の治療剤とを含む、請求項1又は2に記載の組合せ。 - 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、レチノイン酸アナログ又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - レチノイン酸アナログが、トレチノイン又は薬学的に許容されるその塩である、請求項4に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、ヌクレオシドアナログ又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - ヌクレオシドアナログが、シタラビン又は薬学的に許容されるその塩である、請求項6に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、DOT1L阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - DOT1L阻害剤が、ピノメトスタット、EPZ−004777若しくはSGC−0946、又は薬学的に許容されるそれらの塩である、請求項8に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、HDAC阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - HDAC阻害剤が、ベリノスタット、パノビノスタット、ボリノスタット、リコリノスタット、エンチノスタット、モセチノスタット、アベキシノスタット、レスミノスタット、ギビノスタット、キシノスタット、又は薬学的に許容されるそれらの塩である、請求項10に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、脱メチル化剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - 脱メチル化剤が、デシタビン若しくはアザシチジン、又は薬学的に許容されるその塩である、請求項12に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、FLT3阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - FLT3阻害剤が、キザルチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、及びレスタウルチニブ、又は薬学的に許容されるそれらの塩である、請求項14に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、BCL2阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - BCL2阻害剤が、ABT−737、ナビトクラックス、ベネトクラックス、オバトクラックス、又は薬学的に許容されるそれらの塩である、請求項16に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、MDM2阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - MDM2阻害剤が、ヌトリン−3A又は薬学的に許容されるその塩である、請求項18に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、c−KIT阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - c−KIT阻害剤が、ダサチニブ若しくはイマチニブ、又は薬学的に許容されるその塩である、請求項20に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、BET阻害剤又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - BET阻害剤が、JQ1、GSK1210151A、MS436、GSK525762、OTX−015、CPI−203、GSK1324726A、又は薬学的に許容されるそれらの塩である、請求項22に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、アントラサイクリン又は薬学的に許容されるその塩とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - アントラサイクリンが、ダウノルビシン、イダルビシン、又は薬学的に許容されるそれらの塩である、請求項24に記載の組合せ。
- シタラビン又は薬学的に許容されるその塩をさらに含む、請求項25に記載の組合せ。
- 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、三酸化ヒ素とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - 式(I):
(I)
の化合物又は薬学的に許容されるその塩と、ヒドロキシ尿素とを含む、請求項1に記載の組合せ。 - 請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せと、1つ以上の薬学的に許容される添加剤とを含む、医薬組成物。
- 造血器悪性腫瘍の治療に有用である、請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せを含む製品。
- 治療活性物質としての使用のための、請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せ。
- 造血器悪性腫瘍の治療における使用のための、請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せ。
- 必要とする患者における造血器悪性腫瘍の治療のための方法であって、治療的有効量の、請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せを、前記患者に投与することを含む、方法。
- 必要とする患者における造血器悪性腫瘍の治療のための方法であって、請求項29に記載の医薬組成物を前記患者に投与することを含む、方法。
- 造血器悪性腫瘍の治療のための、請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せの使用。
- 造血器悪性腫瘍の治療に有用な医薬の調製のための、請求項1から28のいずれか一項に記載の組合せの使用。
- 造血器悪性腫瘍が骨髄性の造血器悪性腫瘍である、請求項30に記載の製品、請求項32に記載の組合せ、請求項33若しくは34に記載の方法、又は請求項35若しくは36に記載の使用。
- 骨髄性の造血器悪性腫瘍が急性骨髄性白血病である、請求項37に記載の製品、請求項37に記載の組合せ、請求項37に記載の方法、又は請求項37に記載の使用。
- 骨髄性の造血器悪性腫瘍が慢性骨髄性白血病である、請求項37に記載の製品、請求項37に記載の組合せ、請求項37に記載の方法、又は請求項37に記載の使用。
- 骨髄性の造血器悪性腫瘍が骨髄異形成症候群である、請求項37に記載の製品、請求項37に記載の組合せ、請求項37に記載の方法、又は請求項37に記載の使用。
- 骨髄性の造血器悪性腫瘍が骨髄増殖性疾患である、請求項37に記載の製品、請求項37に記載の組合せ、請求項37に記載の方法、又は請求項37に記載の使用。
- 骨髄増殖性疾患が、骨髄線維症、急性混合性白血病、真性多血症、慢性好酸球性白血病/好酸球増加症候群、本態性血小板血症、及び慢性好酸球性白血病/好酸球増加症候群からなる群から選択される、請求項37に記載の製品、請求項37に記載の組合せ、請求項37に記載の方法、又は請求項37に記載の使用。
- 骨髄性の造血器悪性腫瘍が、MLL、AF9、AF4、AF10、AML1、ETO、CALMに関する転座又は再構成;又はNPM1若しくはNotch1における変異、又はLSD1過剰発現を有する骨髄性の造血器悪性腫瘍である、請求項37に記載の製品、請求項37に記載の組合せ、請求項37に記載の方法、又は請求項37に記載の使用。
- 造血器悪性腫瘍がリンパ性の造血器悪性腫瘍である、請求項30に記載の製品、請求項32に記載の組合せ、請求項33若しくは34に記載の方法、又は請求項35若しくは36に記載の使用。
- リンパ性の造血器悪性腫瘍が急性リンパ芽球性白血病である、請求項44に記載の製品、請求項44に記載の組合せ、請求項44に記載の方法、又は請求項44に記載の使用。
- リンパ性の造血器悪性腫瘍が、MLL、AF9、AF4、AF10、AML1、ETO、CALMに関する転座又は再構成;又はNPM1若しくはNotch1における変異、又はLSD1過剰発現を有するリンパ性の造血器悪性腫瘍である、請求項44に記載の製品、請求項44に記載の組合せ、請求項44に記載の方法、又は請求項44に記載の使用。
- 患者がヒトである、請求項33、34、又は37から46のいずれか一項に記載の方法。
- 上記のような発明。
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