JP2018535649A - 抗ox40抗体及びその診断用途 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願では、2015年9月22日に出願された米国仮特許出願第62/222105号の利益が主張され、当該仮出願の内容の全体が参照により援用される。
本発明は、ヒトOX40と反応する(抗OX40)抗体及びその使用方法に関する。
OX40は、腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリーメンバー4リガンド(OX40L及びCD252とも呼ばれる)の受容体として機能する、277アミノ酸の1回通過I型膜タンパク質である。OX40の活性化は、細胞傷害性Tリンパ球の増殖、生存、及びエフェクター機能を上昇させることが示されている(Curti et al., Cancer Res., Vol. 73, Issue 24, pp. 7189-98(2013年10月31日))。抗OX40抗体が抗腫瘍免疫応答の増強に有用な標的かどうかを決定するため、進行がんの患者において抗OX40抗体を試験する臨床試験が、現在進行中である。
用語「抗OX40抗体」、「OX40に特異的に結合する抗体」及び「OX40に結合する抗体」は、十分な親和性を有してOX40に結合することができる抗体であり、従って診断薬及び/又は治療剤としてOX40の標的化に有用である抗体を指す。ある実施態様において、無関係の非OX40タンパク質に対する抗OX40抗体の結合の程度は、例えばラジオイムノアッセイ(RIA)により測定される場合、当該抗体のOX40に対する結合の約10%未満である。ある実施態様において、OX40に結合する抗体は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、又は≦0.001nM(例えば10−8M以下、例えば10−8Mから10−13M、例えば10−9Mから10−13M)の解離定数(Kd)を有する。ある実施態様において、抗OX40抗体は、異なる種由来のOX40の間で保存されている、OX40のエピトープに結合する。
(a)アミノ酸残基26−32(L1)、50−52(L2)、91−96(L3)、26−32(H1)、53−55(H2)、及び96−101(H3)に生じる超可変ループ(Chothia et al. J. Mol. Biol. 196: 901-917, 1987);
(b)アミノ酸残基24−34(L1)、50−56(L2)、89−97(L3)、31−35b(H1)、50−65(H2)、及び95−102(H3)に生じるCDR(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest. 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991);
(c)アミノ酸残基27c−36(L1)、46−55(L2)、89−96(L3)、30−35b(H1)、47−58(H2)、及び93−101(H3)に生じる抗原コンタクト(MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745, 1996);及び
(d)HVRアミノ酸残基46−56(L2)、47−56(L2)、48−56(L2)、49−56(L2)、26−35(H1)、26−35b(H1)、49−65(H2)、93−102(H3)、及び94−102(H3)を含めた、(a)、(b)、及び/又は(c)の組み合わせ。特に指示しない限り、本明細書では、可変ドメイン内のHVR残基及び他の残基(例えばFR残基)は、上掲のKabat et al.に従って番号付けされる。
分率X/Yの100倍
ここで、Xは、AとBのそのプログラムのアラインメントにおいて、配列アラインメントプログラムALIGN−2により、完全な一致としてスコア付けされたアミノ酸残基の数であり、Yは、Bの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと同一でない場合、AのBに対する%アミノ酸配列同一性は、BのAに対する%アミノ酸配列同一性と同一でないことが理解されよう。特に指示しない限り、本明細書で使用される全ての%アミノ酸配列同一性の値は、ALIGN−2コンピュータープログラムを使用して、直前の段落に記載されるようにして得られる。
本発明は、OX40に結合する新規の抗体を提供する。本発明の抗体は、例えばOX40の存在又はOX40の発現レベル(例えば生体試料中の)を検出するのに有用である。
本発明は、例えば診断用途(例えば免疫組織化学(IHC)、免疫蛍光(IF)、及びイムノブロット(例えばウェスタンブロット))に有用な抗OX40抗体を提供する。ある例において、本発明は、OX40のC末端エピトープ(例えば配列番号1のアミノ酸残基266−277)に結合する抗OX40抗体を提供する。OX40のエピトープは、立体構造依存又は立体構造非依存である様式で認識され得る。
QSLEESGGRLVAPGGSLTLTCTVSGIDLSSDNIQWVRQAPGKGLEWIGAVDYNNKPFYANWAKGRFTISKTSSTTVDLKMTSLTTEDTATYFCAKNTFSPWGPGTLVTVSS(配列番号16)
DPAMTQTPSSTSAAVGGTVTINCQSSQSVYNANHLSWFQQKPGQPPKRLIYYISTPDSGVPPRFSGSGSGTQFTLTISGVQCDDAATYYCAALNSDEVFTFGGGTEVVVK(配列番号17)
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM又は≦0.001nM(例えば10−8M以下、例えば10−8Mから10−13M、例えば10−9Mから10−13M)の解離定数(Kd)を有する。
ある実施態様において、本明細書に提供される抗体は、抗体断片である。抗体断片には、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)2、Fv、及びscFv断片、並びに下記の他の断片が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの抗体断片の総説については、Hudson et al. Nat. Med. 9: 129-134, 2003を参照されたい。scFv断片の総説については、例えばPluckthun. The Pharmacology of Monoclonal Antibodies. Vol. 113, pp. 269-315, Rosenburg and Moore eds. Springer-Verlag, New York, 1994を参照;国際公開第93/16185号;及び米国特許第5571894号及び第5587458号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、かつin vivo半減期を増加したFab及びF(ab’)2断片の議論については、米国特許第5869046号を参照されたい。
ある実施態様において、本明細書に記載の抗体は、キメラ抗体である。ある種のキメラ抗体は、例えば米国特許第4816567号;及びMorrison et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 81: 6851-6855, 1984に記載されている。ある例において、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えばマウス、ラット、ハムスター、ウサギ、又はサルなどの非ヒト霊長類由来の可変領域)とヒト定常領域とを含む。さらなる例において、キメラ抗体は、クラス又はサブクラスが親抗体のものから改変されている「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体には、その抗原結合断片が含まれる。
ある実施態様において、本明細書に提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる部位に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。ある実施態様において、結合特異性の1つはOX40に対してであり、その他は他の抗原に対してである。ある実施態様において、二重特異性抗体は、OX40の2つの異なるエピトープに結合し得る。二重特異性抗体は、OX40を発現する細胞に細胞傷害性剤を局在化させるために用いられることもあり得る。二重特異性抗体は、全長抗体又は抗体断片として調製することができる。
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体のアミノ酸配列変異体が、企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/又は他の生物学的特性を改善することが、望まれ得る。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な修飾を導入することにより、又はペプチド合成により調製され得る。このような改変には、例えば抗体のアミノ酸配列中の残基からの欠損、及び/又は残基への挿入、及び/又は残基の置換が含まれる。最終コンストラクトが所望の特性、例えば抗原結合を有していることを条件として、最終コンストラクトに到達するために、欠損、挿入、及び置換の任意の組み合わせがなされ得る。
ある実施態様において、1つ又は複数のアミノ酸置換を伴う抗体変異体が提供される。置換的変異の目的の部位には、HVR及びFRが含まれる。保存的置換は、「好ましい置換」の見出しで表1に示す。より実質的な改変は、「例示的置換」の見出しで表1に示し、アミノ酸側鎖のクラスに関してその下でさらに説明する。アミノ酸置換は、目的の抗体、及び所望の活性、例えば抗原結合の保持/改善、免疫原性の低下、又はADCC又はCDCの改善についてスクリーニングされたその産物に導入することができる。
アミノ酸は、以下の共通の側鎖特性に従ってグループ化することができる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性の親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖配向に影響する残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe
非保存的置換は、これらのクラスのうちの1クラスのメンバーを、別のクラスのものに交換することを必然的に伴う。
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増加又は減少させるために改変される。抗体へのグリコシル化部位の付加又は欠損は、1つ又は複数のグリコシル化部位が創出又は削除されるようにアミノ酸配列を改変することにより、簡便に達成することができる。
ある実施態様において、1つ又は複数のアミノ酸修飾を、本明細書で提供される発明(例えばSP197)の抗OX40抗体のFc領域に導入し、それによりFc領域変異体を生成することができる。Fc領域変異体は、1つ又は複数のアミノ酸位置におけるアミノ酸修飾(例えば置換)を含むヒトFc領域(例えばヒトIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4のFc領域)の配列を含み得る。
ある実施態様において、システイン改変抗体、例えば抗体の1つ又は複数の残基がシステイン残基で置換された「チオMab」を作製することが望ましいことがある。特定の実施態様において、置換される残基は、抗体の接近可能な部位で生じる。これらの残基をシステインで置換することによって、反応性チオール基が抗体の接近可能部位に配置され、抗体を薬物部分又はリンカー−薬剤部分などの他の部分にコンジュゲートさせ、本明細書中でさらに記載されるように免疫コンジュゲートを作製するために使用することができる。ある実施態様において、次の残基のいずれか1つ又はそれ以上がシステインと置換され得る:軽鎖のV205(Kabat番号付け)、重鎖のA118(EU番号付け);及び重鎖Fc領域のS400(EU番号付け)。システイン改変抗体は、例えば米国特許第7521541号に記載のように生成され得る。
ある実施態様において、本発明の抗OX40抗体(例えばSP197)は、当技術分野で周知であり容易に入手可能である、追加の非タンパク質部分を含むように、さらに修飾されることがあり得る。抗体の誘導体化に適した部分には、水溶性ポリマーが含まれるが、これらに限定されない。水溶性ポリマーの非限定的な例には、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールの共重合体、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ−1,3−ジオキソラン、ポリ−1,3,6−トリオキソラン、エチレン/無水マレイン酸共重合体、ポリアミノ酸(単独重合体又はランダム共重合体)及びデキストラン又はポリ(n−ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロピレングリコール単独重合体、プロピレンオキシド/エチレンオキシド共重合体、ポリオキシエチル化ポリオール(例えばグリセロール)、ポリビニルアルコール、及びこれらの混合物が含まれるが、これらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、その水中における安定性故に、製造上の利点を有し得る。ポリマーは、任意の分子量であってよく、かつ分枝状又は非分枝状でもよい。抗体に付着するポリマーの数は変化してもよく、1を超えるポリマーが付着する場合、それらは同一か又は異なる分子であってよい。一般に、誘導体化に使用されるポリマーの数及び/又はタイプは、改善されるべき抗体の特定の特性又は機能、その抗体誘導体が定義された条件下の治療に使用されるかどうかなどが含まれるが、これらに限定されない考慮事項に基づいて決定することができる。
抗体は、例えば米国特許第4816567号に記載されるような組換え方法及び組成物を用いて製造され得る。ある実施態様において、本明細書に記載される抗OX40抗体(例えばSP197)をコードする、単離された核酸が提供される。このような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列及び/又は抗体のVHを含むアミノ酸配列(例えば抗体の軽鎖及び/又は重鎖)をコードし得る。さらなる実施態様において、そのような核酸を含む1つ又は複数のベクター(例えば発現ベクター)が提供される。さらなる実施態様において、そのような核酸を含む宿主細胞が提供される。ある実施態様において、宿主細胞は以下を含む(例えば、以下で形質転換されている):(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列及び抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、又は(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第一のベクター及び抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第ニのベクター。ある実施態様において、宿主細胞は、真核生物細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞又はリンパ系細胞(例えばY0、NSO、Sp20細胞)である。ある実施態様において、抗OX40抗体を作製する方法が提供され、この方法は、抗体の発現に適した条件において上述のような抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を培養すること、及び必要に応じて宿主細胞(又は宿主細胞培地)から抗体を回収することを含む。
本明細書で提供される抗OX40抗体は、当分野で周知の様々なアッセイによって同定することができ、その物理的/化学的性質及び/又は生物学的活性についてスクリーニング又は特徴づけすることができる。
ある態様において、本発明の抗体は、例えばELISA、ウエスタンブロットなどの周知の方法により、その抗原結合活性について、試験される。
ある態様では、アッセイは、例えば免疫組織化学(IHC)又は免疫蛍光(IF)において、OX40の存在を検出すのに有用な抗OX40抗体を同定するために提供される。ある実施態様において、本発明の抗体は、そのような活性について試験される。
本発明は、放射性同位体などの、1つ又は複数の標識及び/又は薬剤に結合される、本明細書に記載の抗OX40抗体を含むイムノコンジュゲートも提供する。
ある事例において、本発明の抗OX40抗体(例えばSP197)は、当領域で周知の方法又は本明細書に記載の方法を用いて、生体試料におけるOX40の存在を検出するために用いることができる。
以下は本発明の方法及び組成物の実施例である。上に提供された一般的な説明を前提として、他の様々な実施態様が実施され得ることが理解されるべきである。
抗OX40ウサギモノクローナル抗体は、図1で模式的に示すようにして生成した。簡潔には、アミノ酸残基266−2のペプチド断片が合成された。免疫化を意図した12アミノ酸断片が、抗体産生を介する実質的な免疫応答を刺激するためのキャリアタンパク質として広く用いられる、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)にコンジュゲートされた。ニュージーランド白ウサギが、完全フロイントアジュバントで乳化されたKLHコンジュゲートOX40抗原、続いて不完全フロイントアジュバントで乳化された一連のOX40抗原ブースターにより免疫化された。抗体を発現する細胞は、OX40を用いる酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によりスクリーニングされた。全てのELISA陽性クローンは、免疫組織化学(IHC)により、さらにスクリーニングされ、最も高い特異性を有する抗体を生産するクローンが選択された。抗OX40抗体の組換え生産のため、抗体の重鎖配列と軽鎖配列をコードするcDNAがクローンされ、共トランスフェクションにより発現され、そして、IHCによりOX40への結合について、スクリーニングされた。抗OX40モノクローナル抗体SP197は、これらの方法により生産され、次いでプロテインAアフィニティークロマトグラフィーにより精製された。SP197抗体の重鎖及び軽鎖可変領域の配列は、以下の通りである。
QSLEESGGRLVAPGGSLTLTCTVSGIDLSSDNIQWVRQAPGKGLEWIGAVDYNNKPFYANWAKGRFTISKTSSTTVDLKMTSLTTEDTATYFCAKNTFSPWGPGTLVTVSS(配列番号16)
DPAMTQTPSSTSAAVGGTVTINCQSSQSVYNANHLSWFQQKPGQPPKRLIYYISTPDSGVPPRFSGSGSGTQFTLTISGVQCDDAATYYCAALNSDEVFTFGGGTEVVVK(配列番号17)
コントロール細胞及びFFPE組織における、ウサギ抗ヒトOX−40モノクローナル抗体(SP197)の特異的な免疫組織化学(IHC)染色が、示されている。IHCは、StdCC1細胞をultraViewユニバーサルDAB検出キット(Ventana Medical Systems社、ツーソン、アリゾナ州)で調整して用いることで、実施された。一次抗体は、BenchMark ULTRA自動スライド染色機(Ventana Medical Systems社、ツーソン、アリゾナ州)において、16分、37℃でインキュベートされた。結果は図に示されている。(A)モック細胞(ネガティブコントロール細胞);(B)OX−40をトランスフェクトされた細胞(ポジティブコントロール細胞);(C)反応性リンパ節;及び(D)前立腺がん。強い膜の染色が、ポジティブコントロール細胞(B)、並びに反応性リンパ節及び前立腺がんにおいて活性化されたT細胞で見られた。
前述の発明は、理解を明確にする目的のために、図及び例を通してある程度詳細に説明されているが、これらの説明及び例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書に引用される全ての特許及び科学文献の開示内容は、参照によりその全体が本明細書に援用される。
Claims (38)
- 配列番号1のアミノ酸266−277を含むOX40のC末端部分に特異的に結合することができる、単離された抗体。
- 以下の超可変領域(HVR):
(a)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H1;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び
(c)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−H3
を含む、請求項1に記載の抗体。 - 以下の重鎖可変ドメインフレームワーク領域(FR):
(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号7のアミノ酸配列を含むFR−H3;及び
(d)配列番号8のアミノ酸配列を含むFR−H4
をさらに含む、請求項2に記載の抗体。 - 以下のHVR:
(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−L1;
(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び
(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR−L3
をさらに含む、請求項2又は3に記載の抗体。 - 以下の軽鎖可変ドメインFR:
(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号15のアミノ酸配列を含むFR−L4
をさらに含む、請求項4に記載の抗体。 - 以下のHVR:
(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−L1;
(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び
(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR−L3
を含む、請求項1に記載の抗体。 - 以下の軽鎖可変ドメインFR:
(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(d)配列番号15のアミノ酸配列を含むFR−L4
をさらに含む、請求項6に記載の抗体。 - (a)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するVH配列;(b)配列番号17のアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するVL配列;又は(c)(a)に記載のVH配列及び(b)に記載のVL配列を含む、請求項1に記載の抗体。
- 配列番号16のVH配列を含む、請求項8に記載の抗体。
- 配列番号17のVL配列を含む、請求項8に記載の抗体。
- 以下のHVR:
(a)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H1;
(b)配列番号3のアミノ酸配列を含むHVR−H2;
(c)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−H3;
(d)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−L1;
(e)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び
(f)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR−L3
を含み、OX40に特異的に結合する、単離された抗体。 - 以下の重鎖可変ドメイン及び軽鎖可変ドメインFR:
(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むFR−H1;
(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むFR−H2;
(c)配列番号7のアミノ酸配列を含むFR−H3;
(d)配列番号8のアミノ酸配列を含むFR−H4;
(e)配列番号12のアミノ酸配列を含むFR−L1;
(f)配列番号13のアミノ酸配列を含むFR−L2;
(g)配列番号14のアミノ酸配列を含むFR−L3;及び
(h)配列番号15のアミノ酸配列を含むFR−L4
をさらに含む、請求項11に記載の抗体。 - 配列番号16のVH配列及び配列番号17のVL配列を含む、請求項11又は12に記載の抗体。
- 請求項1から13のいずれか1項に記載の抗体と、OX40への結合について競合する、単離された抗体。
- モノクローナル抗体である、請求項1から14のいずれか1項に記載の抗体。
- モノクローナル抗体がウサギモノクローナル抗体である、請求項15に記載の抗体。
- IgG抗体である、請求項1から16のいずれか1項に記載の抗体。
- OX40に特異的に結合する抗体断片である、請求項1から16のいずれか1項に記載の抗体。
- 抗体断片が、Fab、一本鎖可変断片(scFv)、Fv、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)2、及びダイアボディからなる群から選択される、請求項18に記載の抗体。
- 請求項1から19のいずれか1項に記載の単離された抗体をコードする、単離された核酸。
- 請求項20に記載の核酸を含むベクター。
- 請求項21に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項1から19のいずれか1項に記載の抗体を含むイムノコンジュゲート。
- 生体試料中のOX40の存在又は発現レベルの検出における使用のための、請求項1から19のいずれか1項に記載の抗体。
- 検出が免疫組織化学(IHC)、免疫蛍光(IF)又はイムノブロットによる、請求項24に記載の抗体。
- 検出がIHCによる、請求項25に記載の抗体。
- 試料が固定された組織を含む、請求項24から26のいずれか1項に記載の抗体。
- 固定された組織がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織である、請求項27に記載の抗体。
- 試料が、がん又は自己免疫疾患に罹患しているか、罹患しやすい対象由来である、請求項24から28のいずれか1項に記載の抗体。
- 請求項1から29のいずれか1項に記載の抗体に生体試料を接触させること、及び結合した抗体の存在を検出することを含む、生体試料中のOX40の存在又は発現レベルを検出する方法。
- 検出がIHC、IF又はイムノブロットによる、請求項30に記載の方法。
- 検出がIHCによる、請求項31に記載の方法。
- 試料が固定された組織を含む、請求項30から32のいずれか1項に記載の方法。
- 固定された組織がFFPE組織である、請求項33に記載の方法。
- 試料が、がん又は自己免疫疾患に罹患しているか、罹患しやすい対象由来である、請求項30から34のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項1から19及び24から29のいずれか1項に記載の抗体を含む溶液を含む、自動スライド染色機用の分注器。
- メモリー及びコンピュータープロセッサーを含む自動スライド染色機であって、メモリーが、請求項1から19及び24から29のいずれか1項に記載の抗体を用いて組織試料を標識するための自動スライド染色機の運転を制御するためのプロセッサーに指示するための指示書を含む、自動スライド染色機。
- 請求項1から19及び24から29のいずれか1項に記載の抗体を含むキット。
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