JP2017534285A5 - - Google Patents
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Claims (26)
- 以下を含む、遺伝子構築物:
第1DNA要素であって、
CRISPRガイド配列、および
足場配列
を含む、前記第1DNA要素;
第1DNA要素に隣接する第1適合末端要素および第2適合末端要素であって、ここで第1および第2適合末端要素は、互いにアニーリングすることができる、前記適合末端要素;
バーコード要素;
バーコード要素に隣接する第3適合末端要素および第4適合末端要素であって、ここで第3および第4適合末端要素は、互いにアニーリングすることができるが、しかし第1または第2適合末端要素にアニーリングすることはできない、前記適合末端要素;および
第4適合末端要素と第1適合末端要素の間に位置する分離部位であって、ここで、前記DNA要素、第1適合末端要素、および第2適合末端要素は分離部位の一方の側にあり、バーコード要素、第3適合末端要素、および第4適合末端要素は分離部位の反対側にある、前記分離部位。 - 第1DNA要素の上流にプロモーター要素をさらに含む、請求項1に記載の遺伝子構築物。
- 請求項1または2に記載の遺伝子構築物を含む、ベクター。
- 以下を含む、遺伝子構築物:
複数のDNA要素であって、ここで該複数のDNA要素の各DNA要素は、CRISPRガイド配列および足場配列を含む、前記複数のDNA要素;
複数のDNA要素に隣接する第1適合末端要素および第2適合末端要素であって、ここで第1および第2適合末端要素は、互いにアニーリングすることができる、前記適合末端要素;
複数のバーコード要素;
複数のバーコード要素に隣接する第3適合末端要素および第4適合末端要素であって、ここで第3および第4適合末端要素は、互いにアニーリングすることができるが、しかし第1または第2適合末端要素にアニーリングすることはできない、前記適合末端要素;および
複数のDNA要素と複数のバーコード要素の間に位置する、分離部位。 - 請求項4に記載の遺伝子構築物、および
CRISPRガイド配列の各々の上流に位置するプロモーター配列、
を含む、ベクター。 - コンビナトリアルベクターを生成するための、以下を含む方法:
(a)以下を含む第1遺伝子構築物を含有するベクターを提供すること:
CRISPRガイド配列;
CRISPRガイド配列に隣接する第2適合末端要素および第1制限酵素のための第1認識部位;
バーコード要素;および
バーコード要素に隣接する第3適合末端要素および第2制限酵素のための第2認識部位;
(b)第1遺伝子構築物を第1認識部位で切断して、第5適合末端要素を生じ、ベクターを第2認識部位で切断して、第6適合末端要素を生じること;
(c)以下を含む足場要素を提供すること:
足場配列;
第1適合末端要素および第4適合末端要素を含む、分離部位;および
足場要素に隣接する第7適合末端要素および第8適合末端要素、ここで第7適合末端要素は、第5適合末端要素にアニーリングすることができ、第8適合末端要素は、第6適合末端要素にアニーリングすることができる;
(d)足場要素を、切断された第1遺伝子構築物にアニーリングすること、ここでアニーリングは、互いにアニーリングすることができる、ベクターおよび足場要素内の適合末端要素で起こり、アニーリング後、足場要素はCRISPRガイド配列とバーコード要素の間に組み込まれ、分離部位は、足場配列とバーコード要素の間に位置し、こうしてコンビナトリアルベクターが作製される;
任意に、ここで、第1認識部位と第2認識部位は、同一の認識部位配列を有し、第1制限酵素と第2制限酵素が、同一の制限酵素である。 - 以下をさらに含む、請求項6に記載の方法:
(a)ベクターを、足場要素内の分離部位で切断して、第1適合末端要素および第4適合末端要素を生じること;
(b)以下を含む第2遺伝子構築物を提供すること:
CRISPRガイド配列;
足場配列;
バーコード要素;および
第2遺伝子構築物に隣接する第2適合末端要素および第3適合末端要素、ここで第2遺伝子構築物の第2適合末端要素は、ベクターの第1適合末端要素にアニーリングすることができ、第2遺伝子構築物の第3適合末端要素は、ベクターの第4適合末端要素にアニーリングすることができる;
(c)第2遺伝子構築物を切断ベクターにアニーリングすること、ここでアニーリングは、互いにアニーリングすることができる、第2遺伝子構築物およびベクター内の適合末端要素で起こり、アニーリング後に、第2遺伝子構築物はベクター内に組み込まれて、こうして、連結されたバーコード要素および連結されたCRISPRガイドと足場配列を含むコンビナトリアルベクターが作製される;
任意に、ここで、方法は反復的である。 - コンビナトリアルベクターが、CRISPRガイド配列の上流にプロモーター要素をさらに含む、請求項7に記載の方法。
- 以下を含む、遺伝子構築物:
少なくとも2つのCRISPRガイド配列;
バーコード要素;および
各CRISPRガイド配列の間、およびバーコード要素と該バーコード要素に最も近いCRISPRガイド配列との間に位置する、制限認識部位。 - 以下を含む、遺伝子構築物:
複数のDNA要素であって、各々が
CRISPRガイド配列;および
足場配列;
を含む、前記複数のDNA要素;
バーコード要素;および
前記複数のDNA要素の各DNA要素の上流に位置するプロモーター配列。 - バーコード要素が、遺伝子構築物の5’末端に位置する、または、バーコード要素が、遺伝子構築物の3’末端に位置する、請求項9または10に記載の遺伝子構築物。
- 請求項9〜11のいずれか一項に記載の遺伝子構築物のいずれかを含む、ベクター。
- コンビナトリアルベクターを生成するための、以下を含む方法:
(a)以下を含むベクターを提供すること:
複数のCRISPRガイド配列;
バーコード要素、ここでバーコード要素は、複数のCRISPRガイド配列の下流に位置する;
任意に、複数のCRISPRガイド配列の少なくとも1つの上流に位置する、プロモーター配列;および
複数の制限酵素のための複数の認識部位、ここで複数の認識部位の各々は、複数のCRISPRガイド配列の1つの下流に位置する;
(b)ベクターを、複数の認識部位の少なくとも1つにおいて、複数の制限酵素の少なくとも1つで切断して、第1適合末端要素および第2適合末端要素を生じること;
(c)以下を含む第1足場要素を提供すること:
足場配列、
任意にプロモーター配列、および
第1足場要素に隣接する第3適合末端要素および第4適合末端要素、ここで第3適合末端要素は、切断されたベクターの第1適合末端要素にアニーリングすることができ、第4適合末端要素は、切断されたベクターの第2適合末端要素にアニーリングすることができる;
(d)第1足場要素を、切断されたベクターにアニーリングすること、ここでアニーリングは、第1足場要素および切断されたベクター内の適合末端要素で起こり、アニーリング後、第1足場要素は、複数のCRISPRガイド配列の1つの下流に組み込まれ、こうしてコンビナトリアルベクターが生成される;
任意に、ここで、方法は反復的である。 - コンビナトリアルベクターを生成するための、以下を含む方法:
(a)以下を含むベクターを提供すること:
複数のCRISPRガイド配列、
バーコード要素、ここでバーコード要素は、複数のCRISPRガイド配列の上流に位置する、
任意に、複数のCRISPRガイド配列の少なくとも1つの上流に位置する、プロモーター配列、および
複数の制限酵素のための複数の認識部位、ここで複数の認識部位の各々は、複数のCRISPRガイド配列の1つの上流に位置する;
(b)ベクターを、複数の認識部位の少なくとも1つにおいて、複数の制限酵素の少なくとも1つで切断して、第1適合末端要素および第2適合末端要素を生じること;
(c)以下を含む第1足場要素を提供すること:
任意に足場配列、
プロモーター配列、および
第1足場要素に隣接する第3適合末端要素および第4適合末端要素、ここで第3適合末端要素は、切断されたベクターの第1適合末端要素にアニーリングすることができ、第4適合末端要素は、切断されたベクターの第2適合末端要素にアニーリングすることができる;
(d)第1足場要素を、切断されたベクターにアニーリングすること、ここでアニーリングは、第1足場要素および切断されたベクター内の適合末端要素で起こり、アニーリング後、第1足場要素は、複数のCRISPRガイド配列の1つの上流に組み込まれ、こうしてコンビナトリアルベクターが生成される;
任意に、ここで、方法は反復的である。 - 表2に記載のエピジェネティック遺伝子の組合わせから選択される2または3以上のエピジェネティック遺伝子を標的とする2または3以上の阻害剤を含む、組成物。
- 細胞の増殖を低減する方法であって、細胞を、表2に記載のエピジェネティック遺伝子の組合わせから選択される2または3以上のエピジェネティック遺伝子を標的とする2または3以上の阻害剤の組合わせと接触させることを含む、前記方法。
- 細胞が癌細胞であり、任意に、癌細胞が卵巣癌細胞である、請求項16に記載の方法。
- 対象における癌を処置する方法であって、対象に、表2に記載のエピジェネティック遺伝子の組合わせから選択される2または3以上のエピジェネティック遺伝子を標的とする2または3以上の阻害剤の組合わせを投与することを含み、ここで2または3以上の阻害剤の各々は、有効量で投与される、前記方法。
- 阻害剤の各々が、CRISPRガイド配列、shRNA、および小分子からなる群から選択され、任意に、2または3以上の阻害剤の各々が、エピジェネティック遺伝子の発現を低減もしくは防止するか、またはエピジェネティック遺伝子がコードするタンパク質の活性を低減もしくは防止する、請求項15〜18のいずれか一項に記載の方法。
- 組合わせで投与される2または3以上の阻害剤の各々の有効量が、組合わせで投与されない場合の阻害剤の有効量より少ない、請求項19に記載の方法。
- 阻害剤の各々が、CRISPRガイド配列および足場配列;shRNA;および小分子からなる群から選択され、任意に、阻害剤の少なくとも1つが、CRISPRガイド配列および足場配列であり;組成物がさらに、Cas9エンドヌクレアーゼを含むかまたはコードする、請求項15〜20のいずれか一項に記載の組成物。
- CRISPRガイド配列またはshRNAが、組換え発現ベクターから発現される、請求項21に記載の組成物。
- エピジェネティック遺伝子の組合わせが、BRD4とKDM4CまたはBRD4とKDM6Bを含む、請求項15〜22のいずれか一項に記載の組成物。
- BRD4の阻害剤が、JQ1((6S)−4−(4−クロロフェニル)−2,3,9−トリメチル−6H−チエノ[3,2−f][1,2,4]トリアゾロ[4,3−a][1,4]ジアゼピン−6−酢酸1,1−ジメチルエチルエステル)である;および/または
KDM4Cの阻害剤が、SD70(N−(フラン−2−イル(8−ヒドロキシキノリン−7−イル)メチル)イソブチルアミド)である;および/または
KDM6Bの阻害剤が、GSK-J4(エチル3−((6−(4,5−ジヒドロ−1H−ベンゾ[d]アゼピン−3(2H)−イル)−2−(ピリジン−2−イル)ピリミジン−4−イル)アミノ)プロパノアート、一塩酸塩)である、
請求項23に記載の組成物。 - 細胞の増殖を低減するエピジェネティック遺伝子の阻害剤の組合わせを同定するための方法であって、
第1細胞集団および第2細胞集団を、2または3以上のCRISPRガイド配列および足場配列およびCas9エンドヌクレアーゼの複数の組合わせと接触させること;
第1細胞集団および第2細胞集団を、第2細胞集団が第1細胞集団より長い期間培養されるように、培養すること;
第1細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせ、および第2細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせを同定すること;
第1細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の各組合わせの存在量を、第2細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の各組合わせの存在量と比較すること;および
第2細胞集団においては不在であるかまたは低減された存在量であるが、第1細胞集団においては存在するかまたは増加した存在量である、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせを、細胞増殖を低減するCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせとして同定すること;
を含む、前記方法。 - 細胞の増殖を低減するために阻害すべき遺伝子の組合わせを同定する方法であって、
第1細胞集団および第2細胞集団を、2または3以上のCRISPRガイド配列および足場配列およびCas9エンドヌクレアーゼの複数の組合わせと接触させること;
第1細胞集団および第2細胞集団を、第2細胞集団が第1細胞集団より長い期間培養されるように、培養すること;
第1細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせ、および第2細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせを同定すること;
第1細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の各組合わせの存在量を、第2細胞集団における、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の各組合わせの存在量と比較すること;および
第2細胞集団においては不在であるかまたは低減された存在量であるが、第1細胞集団においては存在するかまたは増加した存在量である、2または3以上のCRISPRガイド配列と足場配列の組合わせを、増殖を低減するために阻害すべき遺伝子として同定すること;
を含む、前記方法。
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IL294014B1 (en) | 2015-10-23 | 2024-03-01 | Harvard College | Nucleobase editors and their uses |
MX2018008345A (es) | 2016-01-11 | 2018-12-06 | Univ Leland Stanford Junior | Proteínas quiméricas y métodos de inmunoterapia. |
US9856497B2 (en) | 2016-01-11 | 2018-01-02 | The Board Of Trustee Of The Leland Stanford Junior University | Chimeric proteins and methods of regulating gene expression |
US10752904B2 (en) * | 2016-04-26 | 2020-08-25 | Massachusetts Institute Of Technology | Extensible recombinase cascades |
US10767175B2 (en) | 2016-06-08 | 2020-09-08 | Agilent Technologies, Inc. | High specificity genome editing using chemically modified guide RNAs |
AU2017280353B2 (en) | 2016-06-24 | 2021-11-11 | Inscripta, Inc. | Methods for generating barcoded combinatorial libraries |
WO2018005691A1 (en) * | 2016-06-29 | 2018-01-04 | The Regents Of The University Of California | Efficient genetic screening method |
AU2017306676B2 (en) | 2016-08-03 | 2024-02-22 | President And Fellows Of Harvard College | Adenosine nucleobase editors and uses thereof |
CA3033327A1 (en) | 2016-08-09 | 2018-02-15 | President And Fellows Of Harvard College | Programmable cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
WO2018039438A1 (en) | 2016-08-24 | 2018-03-01 | President And Fellows Of Harvard College | Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing |
CA3035910A1 (en) * | 2016-09-07 | 2018-03-15 | Flagship Pioneering, Inc. | Methods and compositions for modulating gene expression |
CN110214180A (zh) | 2016-10-14 | 2019-09-06 | 哈佛大学的校长及成员们 | 核碱基编辑器的aav递送 |
WO2018119359A1 (en) | 2016-12-23 | 2018-06-28 | President And Fellows Of Harvard College | Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection |
JP7142637B2 (ja) * | 2016-12-29 | 2022-09-27 | ヨハン ウォルフガング ゲーテ-ウニベルジテート フランクフルト アム マイン | より高次のゲノム編集ライブラリーを生成する方法 |
US11873496B2 (en) | 2017-01-09 | 2024-01-16 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Methods of altering gene expression by perturbing transcription factor multimers that structure regulatory loops |
US10995333B2 (en) | 2017-02-06 | 2021-05-04 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid preparation |
WO2018145041A1 (en) * | 2017-02-06 | 2018-08-09 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for nucleic acid preparation |
US11898179B2 (en) | 2017-03-09 | 2024-02-13 | President And Fellows Of Harvard College | Suppression of pain by gene editing |
JP2020510439A (ja) | 2017-03-10 | 2020-04-09 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | シトシンからグアニンへの塩基編集因子 |
KR20190130613A (ko) | 2017-03-23 | 2019-11-22 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | 핵산 프로그램가능한 dna 결합 단백질을 포함하는 핵염기 편집제 |
WO2018209320A1 (en) | 2017-05-12 | 2018-11-15 | President And Fellows Of Harvard College | Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation |
US9982279B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-05-29 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
US10011849B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-07-03 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
WO2019023680A1 (en) | 2017-07-28 | 2019-01-31 | President And Fellows Of Harvard College | METHODS AND COMPOSITIONS FOR EVOLUTION OF BASIC EDITORS USING PHAGE-ASSISTED CONTINUOUS EVOLUTION (PACE) |
JP2020533957A (ja) | 2017-07-31 | 2020-11-26 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッドRegeneron Pharmaceuticals, Inc. | Crisprリポーター非ヒト動物およびその使用 |
KR20200032693A (ko) | 2017-07-31 | 2020-03-26 | 리제너론 파마슈티칼스 인코포레이티드 | Cas-형질전환 마우스 배아 줄기 세포 및 마우스 및 이것의 용도 |
US11319532B2 (en) | 2017-08-30 | 2022-05-03 | President And Fellows Of Harvard College | High efficiency base editors comprising Gam |
US11795443B2 (en) | 2017-10-16 | 2023-10-24 | The Broad Institute, Inc. | Uses of adenosine base editors |
WO2019089803A1 (en) * | 2017-10-31 | 2019-05-09 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for studying cell evolution |
US20210308171A1 (en) * | 2018-08-07 | 2021-10-07 | The Broad Institute, Inc. | Methods for combinatorial screening and use of therapeutic targets thereof |
US20230193251A1 (en) | 2018-09-19 | 2023-06-22 | The University Of Hong Kong | Improved high-throughput combinatorial genetic modification system and optimized cas9 enzyme variants |
JP7144618B2 (ja) * | 2018-12-20 | 2022-09-29 | 北京大学 | バーコード付きガイドrna構築体を使用する効率的な遺伝子スクリーニングのための組成物及び方法 |
EP3942040A1 (en) | 2019-03-19 | 2022-01-26 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for editing nucleotide sequences |
EP4041894A1 (en) | 2019-09-23 | 2022-08-17 | Omega Therapeutics, Inc. | COMPOSITIONS AND METHODS FOR MODULATING HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 4-ALPHA (HNF4a) GENE EXPRESSION |
CN110652589A (zh) * | 2019-10-12 | 2020-01-07 | 中国人民解放军陆军军医大学 | Gasc1抑制剂在制备治疗肝癌的药物中的应用 |
WO2021119435A1 (en) * | 2019-12-12 | 2021-06-17 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | High performance platform for combinatorial genetic screening |
CN115397996A (zh) * | 2020-04-16 | 2022-11-25 | 香港大学 | 用于分析靶相互作用的三元组合crispr筛选系统及其方法 |
MX2022014008A (es) | 2020-05-08 | 2023-02-09 | Broad Inst Inc | Métodos y composiciones para la edición simultánea de ambas cadenas de una secuencia de nucleótidos de doble cadena objetivo. |
WO2022159402A1 (en) * | 2021-01-19 | 2022-07-28 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Composition and method for high-multiplexed genome engineering using synthetic crispr arrays |
WO2022195582A1 (en) * | 2021-03-15 | 2022-09-22 | G.T.A.I Innovation Ltd. | A method and apparatus for lab tests |
CN113599522B (zh) * | 2021-08-03 | 2022-09-20 | 深圳市北科生物科技有限公司 | Kdm6作为靶标在制备用于提高早期神经外胚层分化效率的药物中的应用 |
CA3230927A1 (en) | 2021-09-10 | 2023-03-16 | Agilent Technologies, Inc. | Guide rnas with chemical modification for prime editing |
CN116019811B (zh) * | 2023-02-07 | 2024-04-12 | 华中科技大学协和深圳医院 | Gsk-j4用于制备抗革兰氏阳性菌感染药物中的应用 |
Family Cites Families (24)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005108568A1 (en) * | 2004-05-10 | 2005-11-17 | Basf Plant Science Gmbh | Methods for assembling multiple expression constructs |
EP2239264A4 (en) * | 2007-12-28 | 2012-01-11 | Mitsubishi Tanabe Pharma Corp | ANTITUMOR AGENT |
BR112012029057A2 (pt) * | 2010-05-14 | 2020-10-13 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | composições e métodos de tratamento de leucemia |
AR084070A1 (es) * | 2010-12-02 | 2013-04-17 | Constellation Pharmaceuticals Inc | Inhibidores del bromodominio y usos de los mismos |
PT2800811T (pt) * | 2012-05-25 | 2017-08-17 | Univ California | Métodos e composições para modificação de adn alvo dirigida por arn e para modulação dirigida por arn de transcrição |
CN103516916B (zh) | 2012-06-28 | 2018-03-27 | 中兴通讯股份有限公司 | 拨号方法及装置 |
EP2867361B1 (en) * | 2012-06-29 | 2017-11-01 | Massachusetts Institute of Technology | Massively parallel combinatorial genetics |
ES2654143T3 (es) * | 2012-10-02 | 2018-02-12 | Gilead Sciences, Inc. | Inhibidores de desmetilasas de histonas |
US9073878B2 (en) * | 2012-11-21 | 2015-07-07 | Zenith Epigenetics Corp. | Cyclic amines as bromodomain inhibitors |
CN103833671B (zh) * | 2012-11-27 | 2016-12-21 | 中国科学院上海药物研究所 | 一类二氢噻唑酮类化合物及其药物组合物和用途 |
ES2769310T3 (es) * | 2012-12-06 | 2020-06-25 | Sigma Aldrich Co Llc | Modificación y regulación del genoma basada en CRISPR |
US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
US20140310830A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-10-16 | Feng Zhang | CRISPR-Cas Nickase Systems, Methods And Compositions For Sequence Manipulation in Eukaryotes |
MX2015007550A (es) * | 2012-12-12 | 2017-02-02 | Broad Inst Inc | Suministro, modificación y optimización de sistemas, métodos y composiciones para la manipulación de secuencias y aplicaciones terapéuticas. |
ES2901396T3 (es) * | 2013-03-14 | 2022-03-22 | Caribou Biosciences Inc | Composiciones y métodos de ácidos nucleicos dirigidos a ácido nucleico |
EP2978757B1 (en) | 2013-03-27 | 2017-02-08 | Boehringer Ingelheim International GmbH | Indolinone analogues as brd4 inhibitors |
WO2014204728A1 (en) * | 2013-06-17 | 2014-12-24 | The Broad Institute Inc. | Delivery, engineering and optimization of systems, methods and compositions for targeting and modeling diseases and disorders of post mitotic cells |
MX2016007328A (es) * | 2013-12-12 | 2017-07-19 | Broad Inst Inc | Suministro, uso y aplicaciones terapeuticas de sistemas y composiciones crispr-cas para edicion del genoma. |
KR20160089530A (ko) * | 2013-12-12 | 2016-07-27 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | Hbv 및 바이러스 질병 및 질환을 위한 crisprcas 시스템 및 조성물의 전달,용도 및 치료적 적용 |
CN106536729A (zh) * | 2013-12-12 | 2017-03-22 | 布罗德研究所有限公司 | 使用粒子递送组分靶向障碍和疾病的crispr‑cas系统和组合物的递送、用途和治疗应用 |
WO2015153940A1 (en) * | 2014-04-03 | 2015-10-08 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for the production of guide rna |
US20170044107A1 (en) * | 2014-04-28 | 2017-02-16 | The J. David Gladstone Institutes | Inhibitors of JMJD2C as Anticancer Agents |
US20170232030A1 (en) * | 2014-08-13 | 2017-08-17 | Epizyme, Inc. | Combination therapy for treating cancer |
WO2016049024A2 (en) * | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for modeling competition of multiple cancer mutations in vivo |
-
2015
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