JP2016114795A - 顕微鏡システム、設定値算出方法、及び、プログラム - Google Patents
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Landscapes
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Abstract
Description
10 顕微鏡制御装置
11 光源制御装置
12 ズーム制御装置
13 Z制御装置
14 補正環制御装置
20 演算装置
30 表示装置
40 キーボード
50 補正環操作装置
60 Z駆動部操作装置
100、200、300 顕微鏡
101、201 レーザー
102、204 走査ユニット
103、106、205 瞳投影光学系
104、206 ミラー
105、203 ダイクロイックミラー
107、210 光検出器
108、211 A/D変換器
109 Z駆動部
110 対物レンズ
111 補正環
202 ビームエクスパンダ
207 共焦点レンズ
208 共焦点絞り
209 集光レンズ
301 ランプハウス
302 光源
303 コレクタレンズ
304 蛍光キューブ
305 ズームレンズ
306 結像レンズ
307 撮像装置
S サンプル
CG カバーガラス
Claims (11)
- 球面収差を補正する補正装置を備え、前記補正装置の設定値が異なる複数の状態の各々でサンプルの観察対象面の画像データを取得して、複数の画像データを取得する顕微鏡装置と、
前記顕微鏡装置が取得した前記複数の画像データの各々に基づいて球面収差が補正されているほど大きな値を示す当該画像データの評価値を算出して、前記複数の画像データの複数の評価値を算出する演算装置と、を備え、
前記顕微鏡装置は、前記複数の画像データを取得する処理を、前記複数の状態で設定される前記補正装置の複数の設定値の分布範囲と平均間隔とが繰り返し毎に狭まり、且つ、前記分布範囲内に前記演算装置が算出した最大の評価値に対応する前記補正装置の設定値が含まれるように、繰り返し、
前記演算装置は、前記演算装置が算出した複数の評価値と当該複数の評価値に対応する複数の設定値に基づいて、前記観察対象面における球面収差が補正される前記補正装置の設定値である目標値を算出する
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 球面収差を補正する補正装置を備え、前記補正装置の設定値が異なる複数の状態の各々でサンプルの観察対象面の画像データを取得して、複数の画像データを取得する顕微鏡装置と、
前記顕微鏡装置が取得した前記複数の画像データの各々に基づいて球面収差が補正されているほど大きな値を示す当該画像データの評価値を算出して、前記複数の画像データの複数の評価値を算出する演算装置と、を備え、
前記演算装置は、前記演算装置が算出した評価値と当該評価値に対応する前記補正装置の設定値との組み合わせを第1の座標情報と定義すると、前記複数の画像データから選択された、前記複数の評価値のうちの最大値が算出された画像データを含む3つ以上の画像データの第1の座標情報に基づいて、補間又は関数近似により関数を算出し、算出した前記関数から前記観察対象面における球面収差が補正される前記補正装置の設定値である目標値を算出する
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 請求項1又は請求項2に記載の顕微鏡システムにおいて、
前記演算装置は、
前記顕微鏡装置に設けられた対物レンズのZ位置であって前記補正装置の設定値の変更によって生じる前記観察対象面の移動量よりも小さな距離だけ互いに異なるZ位置毎に前記目標値を算出して、複数のZ位置における複数の目標値を算出し、
前記複数のZ位置における前記複数の目標値と当該複数の目標値に対応する複数の評価値とに基づいて、画像データが取得されたときに評価値が最大となると推定される前記補正環の設定値とZ位置の組み合わせを算出する
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 請求項3に記載の顕微鏡システムにおいて、
前記演算装置は、前記複数の状態で設定される前記補正装置の複数の設定値を、Z位置毎に決定する
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 請求項1乃至請求項4のいずれか1項に記載の顕微鏡システムにおいて、
前記演算装置は、
前記顕微鏡装置が取得した画像データに基づいて、当該画像データの前記評価値を当該画像データの全体領域を分割した領域毎に算出し、且つ、前記目標値を前記領域毎に算出し、
前記領域毎に算出された複数の目標値から1つの目標値を算出する
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 請求項1乃至請求項5のいずれか1項に記載の顕微鏡システムにおいて、さらに、
前記演算装置で算出された前記目標値に、前記補正装置の設定値を変更する補正装置制御装置と、
前記補正装置の設定値が前記目標値であるときに前記顕微鏡装置で取得される画像データに基づいて、前記サンプルに照射するレーザー光のパワーを制御するレーザー制御装置と、を備える
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 請求項1乃至請求項6のいずれか1項に記載の顕微鏡システムにおいて、
前記補正装置は、前記顕微鏡装置の対物レンズ内のレンズを移動させる補正環である
ことを特徴とする顕微鏡システム。 - 球面収差を補正する補正装置を備える顕微鏡装置が、前記補正装置の設定値が異なる複数の状態の各々でサンプルの観察対象面の画像データを取得して、複数の画像データを取得し、
演算装置が、前記顕微鏡装置が取得した前記複数の画像データの各々に基づいて球面収差が補正されているほど大きな値を示す当該画像データの評価値を算出して、前記複数の画像データの複数の評価値を算出し、
前記顕微鏡装置が、前記複数の画像データを取得する処理を、前記複数の状態で設定される前記補正装置の複数の設定値の分布範囲と平均間隔とが繰り返し毎に狭まり、且つ、前記分布範囲内に前記演算装置が算出した最大の評価値に対応する前記補正装置の設定値が含まれるように、繰り返し、
前記演算装置が、前記演算装置が算出した複数の評価値と当該複数の評価値に対応する複数の設定値に基づいて、前記観察対象面における球面収差が補正される前記補正装置の設定値である目標値を算出する
ことを特徴とする設定値算出方法。 - 球面収差を補正する補正装置を備える顕微鏡装置が、前記補正装置の設定値が異なる複数の状態の各々でサンプルの観察対象面の画像データを取得し、複数の画像データを取得し、
演算装置が、前記顕微鏡装置が取得した前記複数の画像データの各々に基づいて球面収差が補正されているほど大きな値を示す当該画像データの評価値を算出して、前記複数の画像データの複数の評価値を算出し、
前記演算装置が算出した評価値と当該評価値に対応する前記補正装置の設定値との組み合わせを第1の座標情報と定義すると、前記演算装置が、前記複数の画像データから選択された3つ以上の画像データであって、前記複数の評価値のうちの最大値が算出された画像データを含む3つ以上の画像データの第1の座標情報に基づいて、補間又は関数近似により関数を算出し、算出した前記関数から前記観察対象面における球面収差が補正される前記補正装置の設定値である目標値を算出する
ことを特徴とする設定値算出方法。 - 球面収差を補正する補正装置を備える顕微鏡装置が前記補正装置の設定値が異なる複数の状態の各々で取得したサンプルの観察対象面の画像データに基づいて、球面収差が補正されているほど大きな値を示す当該画像データの評価値を算出して、前記複数の状態で取得した複数の画像データの複数の評価値を算出する処理と、
前記複数の状態で設定される前記補正装置の複数の設定値の分布範囲と平均間隔が狭まり、且つ、前記複数の設定値の分布範囲内に前記複数の評価値のうちの最大の評価値に対応する前記補正装置の設定値が含まれるように、新たな複数の設定値を算出する処理と、を繰り返し、
繰り返し算出した複数の評価値と当該複数の評価値に対応する複数の設定値に基づいて、前記観察対象面における球面収差が補正される前記補正装置の設定値である目標値を算出する
処理をコンピュータに実行させることを特徴とするプログラム。 - 球面収差を補正する補正装置を備える顕微鏡装置が前記補正装置の設定値が異なる複数の状態の各々で取得したサンプルの観察対象面の画像データに基づいて、球面収差が補正されているほど大きな値を示す当該画像データの評価値を算出して、前記複数の状態で取得した複数の画像データの複数の評価値を算出し、
評価値と当該評価値に対応する前記補正装置の設定値との組み合わせが第1の座標情報と定義される場合に、前記複数の画像データから選択された3つ以上の画像データであって、前記複数の評価値のうちの最大値が算出された画像データを含む3つ以上の画像データの第1の座標情報に基づいて、補間又は関数近似により関数を算出し、算出した前記関数から前記観察対象面における球面収差が補正される前記補正装置の設定値である目標値を算出する
処理をコンピュータに実行させることを特徴とするプログラム。
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Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2018017970A (ja) * | 2016-07-29 | 2018-02-01 | オリンパス株式会社 | 光シート顕微鏡、及び、光シート顕微鏡の制御方法 |
WO2018087820A1 (ja) * | 2016-11-08 | 2018-05-17 | 株式会社ニコン | 画像群生成装置、球面収差補正算出装置、顕微鏡、プログラム及び球面収差補正算出方法 |
JP2019148617A (ja) * | 2018-02-26 | 2019-09-05 | オリンパス株式会社 | 顕微鏡システム |
JP2020148857A (ja) * | 2019-03-12 | 2020-09-17 | 株式会社Screenホールディングス | 光学系調整方法、画像取得方法、および画像取得装置 |
CN115047610A (zh) * | 2022-08-17 | 2022-09-13 | 杭州德适生物科技有限公司 | 一种自动拟合显微对焦平面的染色体核型分析装置及方法 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008164834A (ja) * | 2006-12-27 | 2008-07-17 | Olympus Corp | 顕微鏡及び顕微鏡の明るさ調整方法 |
JP2011191617A (ja) * | 2010-03-16 | 2011-09-29 | Panasonic Corp | 撮像装置 |
JP2012042525A (ja) * | 2010-08-13 | 2012-03-01 | Nikon Corp | 3次元形状測定装置およびプログラム |
JP2013160815A (ja) * | 2012-02-01 | 2013-08-19 | Olympus Corp | 顕微鏡 |
JP2014160213A (ja) * | 2013-02-20 | 2014-09-04 | Olympus Corp | 顕微鏡システム及びプログラム |
-
2014
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Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008164834A (ja) * | 2006-12-27 | 2008-07-17 | Olympus Corp | 顕微鏡及び顕微鏡の明るさ調整方法 |
JP2011191617A (ja) * | 2010-03-16 | 2011-09-29 | Panasonic Corp | 撮像装置 |
JP2012042525A (ja) * | 2010-08-13 | 2012-03-01 | Nikon Corp | 3次元形状測定装置およびプログラム |
JP2013160815A (ja) * | 2012-02-01 | 2013-08-19 | Olympus Corp | 顕微鏡 |
JP2014160213A (ja) * | 2013-02-20 | 2014-09-04 | Olympus Corp | 顕微鏡システム及びプログラム |
Cited By (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2018017970A (ja) * | 2016-07-29 | 2018-02-01 | オリンパス株式会社 | 光シート顕微鏡、及び、光シート顕微鏡の制御方法 |
WO2018087820A1 (ja) * | 2016-11-08 | 2018-05-17 | 株式会社ニコン | 画像群生成装置、球面収差補正算出装置、顕微鏡、プログラム及び球面収差補正算出方法 |
JPWO2018087820A1 (ja) * | 2016-11-08 | 2019-09-26 | 株式会社ニコン | 画像群生成装置、球面収差補正算出装置、顕微鏡、プログラム及び球面収差補正算出方法 |
JP2019148617A (ja) * | 2018-02-26 | 2019-09-05 | オリンパス株式会社 | 顕微鏡システム |
JP7041550B2 (ja) | 2018-02-26 | 2022-03-24 | オリンパス株式会社 | 顕微鏡システム |
JP2020148857A (ja) * | 2019-03-12 | 2020-09-17 | 株式会社Screenホールディングス | 光学系調整方法、画像取得方法、および画像取得装置 |
JP7162843B2 (ja) | 2019-03-12 | 2022-10-31 | 株式会社Screenホールディングス | 光学系調整方法、画像取得方法、および画像取得装置 |
CN115047610A (zh) * | 2022-08-17 | 2022-09-13 | 杭州德适生物科技有限公司 | 一种自动拟合显微对焦平面的染色体核型分析装置及方法 |
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