JP2015534983A5

JP2015534983A5 -

Info

Publication number: JP2015534983A5
Application number: JP2015538063A
Authority: JP
Filing date: 2013-10-18
Publication date: 2016-12-01
Anticipated expiration: 2033-10-18

Description

或る特定の実施の形態では、本発明は、植物においてＸ．ファスチジオーサ又はキサントモナス・アクソノポディス病原型シトリと関連するか、又はそれらによって引き起こされる症状又は病害を予防又は軽減する方法であって、上記植物と、Ｘ．ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス・アクソノポディス病原型シトリをその宿主域に含む毒性バクテリオファージとを接触させる工程を含み、さらに、上記バクテリオファージがＸｆａｓ１００ファージタイプ、及びＸｆａｓ３００ファージタイプからなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、上記Ｘｆａｓ１００タイプファージが、（ａ）上記バクテリオファージが上記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、（ｂ）上記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、（ｃ）上記ファージが、シホウイルス科に特有の形態である、直径５５μｍ〜７７μｍの範囲のカプシドを有する長い非収縮性尾部を呈する尾部を有するバクテリオファージの群に属すること、（ｄ）上記バクテリオファージのゲノムサイズが約５５５００ｂｐ〜５６２００ｂｐであること、及び（ｅ）上記バクテリオファージが植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減することからなる群から選択される選択される少なくとも１つの特性を有し、上記Ｘｆａｓ３００タイプファージが、（ａ）上記バクテリオファージが、上記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、（ｂ）上記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、（ｃ）上記ファージが、ポドウイルス科に特有の形態である、直径５８μｍ〜６８μｍの範囲のカプシドを有する短い非収縮性尾部を呈する尾部を有するバクテリオファージの群に属すること、（ｄ）上記バクテリオファージのゲノムサイズが約４３３００ｂｐ〜４４６００ｂｐであること、及び（ｅ）上記バクテリオファージが、植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減する活性を有することからなる群から選択される少なくとも１つの特性を有する、植物においてＸ．ファスチジオーサ又はキサントモナス・アクソノポディス病原型シトリと関連するか、又はそれらによって引き起こされる症状又は病害を予防又は軽減する方法を提供する。或る特定の実施の形態では、単一タイプの毒性バクテリオファージが植物に導入され、他の実施の形態では、２、３、４、５、６又はそれより多い毒性バクテリオファージ単離物又はタイプの組合せが、同時又は順次のいずれかで植物に導入される。或る特定の実施の形態では、上記バクテリオファージは、配列番号１１〜配列番号２４からなる群から選択されるＤＮＡ配列、又はそれらに少なくとも９０％、９５％、９８％、又は９９％同一のＤＮＡ配列を有するゲノムを含む。よって、或る特定の実施の形態では、植物に導入される上記バクテリオファージは、Ｘｆａｓ１０１、Ｘｆａｓ１０２、Ｘｆａｓ１０３、Ｘｆａｓ１０４、Ｘｆａｓ１０５、Ｘｆａｓ１０６、Ｘｆａｓ１０７、Ｘｆａｓ１１０、Ｘｆａｓ３０１、Ｘｆａｓ３０２、Ｘｆａｓ３０３、Ｘｆａｓ３０４、Ｘｆａｓ３０５、及びＸｆａｓ３０６からなる群から選択される。植物への送達用に製剤化され、かかるＸｆａｓ１００及び／又はＸｆａｓ３００タイプのバクテリオファージを含む植物病害の生物防除組成物もまた意図される。上記生物防除組成物は、担体を更に含んでもよい。幾つかの実施の形態では、上記担体は希釈剤、界面活性剤、及び／又はバッファーを含んでもよい。

本発明における有効成分としてのＸｆａｓ１００ファージタイプの毒性バクテリオファージは、以下の特性、（ａ）上記バクテリオファージは上記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することが可能な活性を有すること、（ｂ）上記バクテリオファージはＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、（ｃ）尾部を有する上記バクテリオファージは、シホウイルス科に特有の形態である、直径５５μｍ〜７７μｍの範囲のカプシドを有する長い非収縮性尾部を呈すること、（ｄ）上記バクテリオファージのゲノムサイズが約５５５００ｂｐ〜５６２００ｂｐであること、及び（ｅ）上記バクテリオファージは植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減する活性を有することの少なくとも１つを示す。

本発明における有効成分としてのＸｆａｓ３００ファージタイプの毒性バクテリオファージは、少なくとも１つの特性を有し、該特性は、（ａ）上記バクテリオファージは、上記キシレラ・ファスチジオーサ及びキサントモナス細菌を溶菌することが可能な活性を有すること、（ｂ）上記バクテリオファージはＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、（ｃ）尾部を有するバクテリオファージの群は、ポドウイルス科に特有の形態である、直径５８μｍ〜６８μｍの範囲のカプシドを有する短い非収縮性尾部を呈すること、（ｄ）上記バクテリオファージのゲノムサイズが約４３３００ｂｐ〜４４６００ｂｐであること、並びに（ｅ）上記バクテリオファージは、植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減する活性を有することである。本発明の組成物中の有効成分としての毒性バクテリオファージは、Ｘｆａｓ１００ファージタイプ及び／又はＸｆａｓ３００ファージタイプから選択される少なくとも１種のバクテリオファージを更に含み、上記ＸｆａｓファージタイプがＸｆａｓ１０３及びＸｆａｓ１０６であり、及び／又は上記Ｘｆａｓ３００ファージタイプがＸｆａｓ３０２、Ｘｆａｓ３０３、Ｘｆａｓ３０４及びＸｆａｓ３０６である。

Claims

植物においてキシレラ・ファスチジオーサ（Ｘｙｌｅｌｌａｆａｓｔｉｄｉｏｓａ）又はキサントモナス（Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ）によって引き起こされる症状又は病害を予防又は軽減する方法であって、該植物と、その宿主域にＸ．ファスチジオーサ及び／又はキサントモナスを含む毒性バクテリオファージとを接触させることを含む、方法。
前記バクテリオファージが、Ｘｆａｓ１００ファージ、Ｘｆａｓ３００ファージからなる群から選択される少なくとも１種のＸｆａｓ１００タイプ又はＸｆａｓ３００タイプのバクテリオファージであり、前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプが、以下の特性：
（ａ）前記バクテリオファージが前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｂ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｃ）前記バクテリオファージが、シホウイルス科に特有の形態である、非収縮性尾部を含み、直径５５μｍ〜７７μｍの範囲のカプシドサイズを有すること、
（ｄ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約５５５００ｂｐ〜５６２００ｂｐであること、及び
（ｅ）前記バクテリオファージが植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示し、
さらに、前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプが、以下の特性：
（ｆ）前記バクテリオファージが、前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｇ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｈ）前記バクテリオファージが、直径５８μｍ〜６８μｍの範囲のカプシドサイズを有する非収縮性尾部を特徴とするポドウイルス科に特有の形態を含むこと、
（ｉ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約４３３００ｂｐ〜４４６００ｂｐであること、及び
（ｊ）前記バクテリオファージが、植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示す、請求項１に記載の方法。
接触が、バクテリオファージ粒子を前記植物に導入することを含む、請求項１又は２に記載の方法。
前記植物が、ブドウ蔓、柑橘類、アーモンド、コーヒー、アルファルファ、キョウチクトウ、オーク、モミジバフウ、アメリカハナズオウ、ニレ、モモ、アンズ、プラム、ブラックベリー、クワ、又はチタルパ・タシュケンテンシス植物である、請求項３に記載の方法。
前記接触が、注入により、媒介昆虫により、根系を介して、注入により、スプレーにより、噴霧により、又は植物と散布接触する（dust contacting）ことにより、バクテリオファージを植物に導入することを含む、請求項４に記載の方法。
前記媒介昆虫がヨコバイである、請求項５に記載の方法。
前記植物に導入される前記バクテリオファージの数が１ＰＦＵ／ｍｌ〜１×１０^１２ＰＦＵ／ｍｌである、請求項５に記載の方法。
キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス種に対して毒性のある２株、３株、４株、５株又は６株のバクテリオファージを前記植物に同時に又は順次導入する、請求項１又は２に記載の方法。
植物集団においてＸ．ファスチジオーサによって引き起こされる症状を予防又は軽減するために植物集団とバクテリオファージとを接触させることを含むと規定される、請求項１又は２に記載の方法。
前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプが、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、及び配列番号１８からなる群から選択されるＤＮＡ配列を有するゲノムを含み、又は前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプが、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、及び配列番号２４からなる群から選択されるＤＮＡ配列を有するゲノムを含む、請求項１又は２に記載の方法。
前記毒性バクテリオファージが、前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプ及び／又は前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプから選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、該Ｘｆａｓ１００ファージタイプがＸｆａｓ１０３及びＸｆａｓ１０６からなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、該Ｘｆａｓ３００ファージタイプがＸｆａｓ３０２、Ｘｆａｓ３０３、Ｘｆａｓ３０４及びＸｆａｓ３０６からなる群から選択される少なくとも１つのバクテリオファージであり、前記ファージタイプが、ファージＸｆａｓ１０３、ファージＸｆａｓ１０６、ファージＸｆａｓ３０２、ファージＸｆａｓ３０３、ファージＸｆａｓ３０４、及びファージＸｆａｓ３０６に対してそれぞれ、ＡＴＣＣアクセッション番号ＰＴＡ−１３０９６、ＰＴＡ−１３０９５、ＰＴＡ−１３０９８、ＰＴＡ−１３０９９、ＰＴＡ−１３１００、及びＰＴＡ−１３０９７により寄託されている、請求項１又は２に記載の方法。
植物への送達用に製剤化された植物病害の生物防除組成物であって、前記組成物が、少なくとも１種の担体、及びＸｆａｓ１００ファージタイプ、Ｘｆａｓ３００ファージタイプからなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージを含み、前記バクテリオファージがキシレラ・ファスチジオーサ及びキサントモナス種に対して毒性である、植物病害の生物防除組成物。
前記バクテリオファージが、前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプ及び前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプからなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプが、以下の特性：
（ａ）前記バクテリオファージが前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｂ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｃ）前記バクテリオファージが、シホウイルス科に特有の形態である、非収縮性尾部を含み、直径５５μｍ〜７７μｍの範囲のカプシドサイズを有すること、
（ｄ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約５５５００ｂｐ〜５６２００ｂｐであること、及び
（ｅ）前記バクテリオファージが植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示し、
さらに、前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプが、以下の特性：
（ｆ）前記バクテリオファージが、前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｇ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｈ）前記バクテリオファージが、直径５８μｍ〜６８μｍの範囲のカプシドサイズを有する非収縮性尾部を特徴とするポドウイルス科に特有の形態を含むこと、
（ｉ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約４３３００ｂｐ〜４４６００ｂｐであること、及び
（ｊ）前記バクテリオファージが、植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示す、請求項１２に記載の植物病害の生物防除組成物。
前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプがＸｆａｓ１０３ファージ及びＸｆａｓ１０６ファージからなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプがＸｆａｓ３０２ファージ、Ｘｆａｓ３０３ファージ、Ｘｆａｓ３０４ファージ及びＸｆａｓ３０６ファージからなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、前記ファージタイプの代表試料が、ファージＸｆａｓ１０３、ファージＸｆａｓ１０６、ファージＸｆａｓ３０２、ファージＸｆａｓ３０３、ファージＸｆａｓ３０４、及びファージＸｆａｓ３０６に対してそれぞれ、ＡＴＣＣアクセッション番号ＰＴＡ−１３０９６、ＰＴＡ−１３０９５、ＰＴＡ−１３０９８、ＰＴＡ−１３０９９、ＰＴＡ−１３１００、及びＰＴＡ−１３０９７により寄託されている、請求項１２に記載の植物病害の生物防除組成物。
前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプが、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、及び配列番号１８からなる群から選択されるＤＮＡ配列を有するゲノムを含み、前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプが、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、及び配列番号２４からなる群から選択されるＤＮＡ配列を有するゲノムを含む、請求項１２に記載の植物病害の生物防除組成物。
注入、スプレー、噴霧又は散布を介して植物に導入するために製剤化されると更に定義される、請求項１２〜１５のいずれかに記載の組成物。
キシレラ・ファスチジオーサ及びキサントモナス種に対して毒性のある単離されたバクテリオファージであって、前記バクテリオファージがＸｆａｓ１００ファージタイプ及びＸｆａｓ３００ファージタイプからなる群から選択される少なくとも１種である、単離されたバクテリオファージ。
前記バクテリオファージがキシレラ・ファスチジオーサ及びキサントモナス種に対して毒性であり、前記バクテリオファージが前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプ及び前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプからなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプが、以下の特性、
（ａ）前記バクテリオファージが前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｂ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｃ）前記バクテリオファージが、シホウイルス科に特有の形態である、非収縮性尾部を含み、直径５５μｍ〜７７μｍの範囲のカプシドサイズを有すること、
（ｄ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約５５５００ｂｐ〜５６２００ｂｐであること、及び
（ｅ）前記バクテリオファージが植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示し、
さらに、前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプが、以下の特性、
（ｆ）前記バクテリオファージが、前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｇ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｈ）前記バクテリオファージが、直径５８μｍ〜６８μｍの範囲のカプシドサイズを有する非収縮性尾部を特徴とするポドウイルス科に特有の形態を含むこと、
（ｉ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約４３３００ｂｐ〜４４６００ｂｐであること、
（ｊ）前記バクテリオファージが、植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示す、請求項１７に記載の単離されたバクテリオファージ。
前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプがＸｆａｓ１０３及びＸｆａｓ１０６からなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージを含み、前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプがＸｆａｓ３０２、Ｘｆａｓ３０３、Ｘｆａｓ３０４、及びＸｆａｓ３０６からなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージを含み、前記ファージタイプが、ファージＸｆａｓ１０３、ファージＸｆａｓ１０６、ファージＸｆａｓ３０２、ファージＸｆａｓ３０３、ファージＸｆａｓ３０４、及びファージＸｆａｓ３０６に対してそれぞれ、ＡＴＣＣアクセッション番号ＰＴＡ−１３０９６、ＰＴＡ−１３０９５、ＰＴＡ−１３０９８、ＰＴＡ−１３０９９、ＰＴＡ−１３１００、及びＰＴＡ−１３０９７により寄託されている、請求項１７に記載の単離されたバクテリオファージ。
前記Ｘｆａｓ１００ファージタイプが配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、及び配列番号１８の群から選択されるＤＮＡ配列を有するゲノムを含み、Ｘｆａｓ３００ファージタイプが配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、及び配列番号２４の群から選択されるＤＮＡ配列を有するゲノムを含む、請求項１７に記載の単離されたバクテリオファージ。
植物においてキサントモナス・アクソノポディス（Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）病原型シトリによって引き起こされる症状又は病害を予防又は軽減する方法であって、該植物と、キサントモナス・アクソノポディス病原型シトリに対して毒性のバクテリオファージと接触することを含み、前記バクテリオファージがＸｆａｓ３００ファージタイプである、方法。
前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプの毒性バクテリオファージが、以下の特性：
（ａ）前記バクテリオファージが前記キシレラ・ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することができること、
（ｂ）前記バクテリオファージがＩＶ型線毛に結合することによって細胞に感染すること、
（ｃ）前記バクテリオファージが、ポドウイルス科に特有の形態である、直径５８μｍ〜６８μｍの範囲のカプシドサイズを有する非収縮性尾部を含むこと、
（ｄ）前記バクテリオファージのゲノムサイズが約４３３００ｂｐ〜４４６００ｂｐであること、及び
（ｅ）前記バクテリオファージが植物（単数又は複数）においてピアス病と関連する症状を予防又は軽減すること、
の少なくとも１つを示す、請求項２１に記載の方法。
接触が、バクテリオファージ粒子を前記植物に導入することを含む、請求項２１又は２２に記載の方法。
前記植物が、シトラス（Ｃｉｔｒｕｓ）属の１種、フォーチュネラ（Ｆｏｒｔｕｎｅｌｌａ）属の１種、ポンキルス（Ｐｏｎｃｉｒｕｓ）属の１種、ライム、レモン、オレンジ、グレープフルーツ、ポメロ、又は台木に使用されるカラタチのハイブリッドである、請求項２３に記載の方法。
前記バクテリオファージが、注入により、若しくは媒介昆虫により植物へと導入されるか、又は注入により、スプレーにより、噴霧により、若しくは植物に散布することにより根系を介して送達される、請求項２３に記載の方法。
前記媒介昆虫がヨコバイである、請求項２３に記載の方法。
前記植物に導入される前記バクテリオファージの数が１ＰＦＵ／ｍｌ〜１×１０^１２ＰＦＵ／ｍｌである、請求項２４に記載の方法。
植物集団において、キサントモナス・アクソノポディス及びその病原型と関連する症状を予防又は軽減するために植物集団と前記バクテリオファージ粒子とを接触することを含むと規定される、請求項２４に記載の方法。
前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプが配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、及び配列番号２４からなる群から選択されるＤＮＡ配列を含むゲノムを含む、請求項２４に記載の方法。
前記Ｘｆａｓ３００ファージタイプのゲノムが配列番号２１を含む、請求項２４に記載の方法。
前記バクテリオファージが、Ｘｆａｓ３０２、Ｘｆａｓ３０３、Ｘｆａｓ３０４及びＸｆａｓ３０６からなる群から選択される少なくとも１種のバクテリオファージであり、前記バクテリオファージのＸｆａｓ３０２、Ｘｆａｓ３０３、Ｘｆａｓ３０４及びＸｆａｓ３０６の代表試料が、ＡＴＣＣアクセッション番号ＰＴＡ−１３０９８、ＰＴＡ１３０９９、ＰＴＡ−１３１００、及びＰＴＡ−１３０９７により寄託されている、請求項２４に記載の方法。
前記毒性バクテリオファージがＸｆａｓ３０３であり、その試料がＡＴＣＣアクセッション番号ＰＴＡ−１３０９９により寄託されている、請求項２４に記載の方法。
Ｘ．ファスチジオーサをその宿主域に含む毒性バクテリオファージを増殖する方法であって、（ａ）前記毒性バクテリオファージをキサントモナス細菌の培養物に感染させる工程、（ｂ）前記バクテリオファージを増殖させる工程、及び（ｃ）前記培養物から毒性バクテリオファージ粒子を単離する工程を含む、方法。
前記バクテリオファージが、植物、廃水、及び／又は土壌水から単離された、請求項３３に記載の方法。
前記キサントモナス細菌の培養物が、ＡＴＣＣアクセッション番号ＰＴＡ−１３１０１により寄託されたキサントモナス株ＥＣ−１２を含む、請求項３３に記載の方法。
前記バクテリオファージの成長のため寒天重層の使用を更に含む、請求項３３に記載の方法。
Ｘ．ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌と、毒性バクテリオファージの集団を含む試料とを接触すること、並びに該集団から該Ｘ．ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌を溶菌することが可能な少なくとも第１のバクテリオファージを単離することを含む、ピアス病に対する候補となる生物防除剤を得る方法。
前記試料が、植物、廃水、及び／又は土壌水から単離された、請求項３７に記載の方法。
Ｘ．ファスチジオーサ及び／又はキサントモナス細菌宿主の培養重層上の毒性バクテリオファージのゾーン又はプラークの形成を検出することを更に含む、請求項３７に記載の方法。