JP2015525800A - 関心のある化合物（目的化合物）を発現する形質転換細菌を含む局所用組成物 - Google Patents

関心のある化合物（目的化合物）を発現する形質転換細菌を含む局所用組成物 Download PDF

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Abstract

対象への局所適用のために配合される形質転換細菌の集団から構成される組成物を記載する。本形質転換細菌集団は、非病原性細菌から生成され、治療または美容目的のために関心のある化合物を発現するように形質転換される。ある実施形態において、本組成物は、紫外線からの皮膚の保護のためのものである。

Description

関連出願に対する相互参照
本願は、それぞれ、その全体において参照により本明細書中に組み込まれる、２０１２年８月７日提出の米国仮出願第６１／６８０，６２０号および２０１３年６月１８日提出の米国仮出願第６１／８３６，５９４号の利益を主張する。
本明細書中に記載の主題は、皮膚科学の分野、特に分子を発現する形質転換細菌または局所治療、美容もしくは皮膚科学的な目的のための化合物を含む、組成物および処置の方法に関する。
局所適用される薬剤で一般的に処置される皮膚科学的障害および状態の領域がある。ある処置において、薬剤は、例えば、乾癬、湿疹または皮膚炎を処置または改善するための治療目的を提示する。他の処置において、皮膚美白剤または脱色剤または日焼け止め剤などの薬剤は、美容または予防効果を提示する。美容および医療目的のための薬剤の局所適用にはある一定の制限がある。例えば、適用される薬剤は皮膚から容易に拭き取ることができるか、または薬剤が適用される処方物は、天然皮膚微生物叢のバランスを妨害し得る化学物質を含み得る。クリームおよび軟膏は、煩雑であり、べたつきがあり、扱いにくい場合があり、患者が処置できるのは、限られた領域の限られた数の病変のみであり、ある一定の解剖学的部位のみであり得る。結果として、局所製剤に対する処方箋のほぼ３５％は、薬局のカウンターから外に出ることはなく、患者は局所処方箋を受け取りに行こうとしない。これに対して、全身的薬剤に対する処方箋はより良好であり、受け取りに行かないのは僅か１４％のみであることが報告されている（非特許文献１）。
患者が適用すべき頻度および量を理解する点においても局所処置には欠点がある。日焼け止め剤の場合、単なる一例ではあるが、人々は一般的に日焼け止め剤を推奨されるものの半分未満の厚さで、推奨される頻度未満しか適用せず、したがってその保護効果が実質的に損なわれる（非特許文献２）。
医療、美容および予防目的のためにより効果的な局所処置組成物が依然として必要とされている。例として、ＵＶは皮膚癌および光による老化の発生増加の主要な原因であるので、より効果的なＵＶ防御の必要性が世界中で認識されている。別の例として、効果的で長期間の治療を伴う乾癬および湿疹および他の皮膚障害の局所処置が必要とされている。
健康なヒト表皮では、全ての人間において総皮膚微生物叢の約６０％を収容する主に５種類の目由来の細菌メンバーを含め、数千種類の細菌種がコロニー形成している。健康なヒト表皮では、数兆個の細菌細胞がコロニー形成しており、１平方センチメートルあたり平均およそ１０８個の細菌を生み出す。皮膚微生物フローラは、特有の皮膚の特質を引き出し、皮膚生態系を健康なバランスに維持するので、宿主との片利共生関係を形成してきた（非特許文献３）。様々な皮膚科学的ニーズに対して、皮膚細菌を使用する治療は、皮膚の天然生態系を維持し、特異的な皮膚科学的ニーズに対処するように天然の皮膚細菌を促進することもできる。
ストレス条件下で皮膚の免疫機能を改善するため、具体的には皮膚の免疫活性が正常化し、このような条件下での過剰反応を発現する傾向を抑えるための免疫抑制につなげるためのプロバイオティック微生物の使用が、当技術分野で、例えば特許文献１に記載されている。皮膚顔色の輝きを損なうことを処置および／または予防するために有用な活性物質としてのプロバイオティック微生物の美容のための使用も記載されている（特許文献２）。単独でのプロバイオティックの使用は、皮膚の局所処置のためのある１つのアプローチであるが、より長時間にわたる、および／またはより強力なアプローチが未だ必要とされている。
形質転換細菌は、食品、医薬および生体触媒適用のための組み換えタンパク質および様々な分子の産生のために現代のバイオテクノロジーにおいて集中的に使用されている。異種遺伝子によりコードされるタンパク質を産生し、分泌することが可能な細菌は、ヒトおよび動物成長ホルモン、インスリン、インターフェロン、サイトカインなど、医薬タンパク質の工業生産のために広く使用されている。このように大いに使用されるかまたは工業生産のために提案されるＥ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）以外の生物としては、培養哺乳動物および昆虫細胞、酵母および真菌および、多くのバチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）属を含む様々な細菌種が挙げられる。工業的な目的のために既に広く使用されている細菌の中でも、とりわけ、発酵食品のための出発培養物として、および調味料および保存剤として使用される乳酸菌が挙げられる。これらの特性は、これらの生物のある種の酵素、乳酸および無害な抗菌ポリペプチド、例えばナイシンなどの産生能力によるものである（例えば特許文献３参照）。
関連技術の先行例およびそれに関連する制限は、例示的なものであり、排他的ではないものとする。関連技術の他の制限は、本明細書を読み、図面を調べると当業者にとって明白となろう。
欧州特許第１３２２３１８号明細書 米国特許出願公開第２０１２／０３０１４５２号明細書 米国特許第６，２２１，６４８号明細書
Ｓｔｏｒｍ，Ａ． ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ａｃａｄ．Ｄｅｒｍａｔｏｌ．，５９：２７−３３（２００８） Ｓｔｅｒｎ，Ｒ．Ｓ．，Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ．Ｍｅｄ、３５０：１５２６−１５３４（２００４） Ｇｒｉｃｅ Ａ．Ｅ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２４：１１９０−１１９２（２００９）
下記に記載し、説明する次の態様およびその実施形態は、代表例および説明であり、範囲を限定するものではないものとする。
１つの態様において、対象への局所適用のために配合される形質転換細菌の集団を含む組成物が提供され、この形質転換細菌集団は、関心のある化合物を発現するように形質転換される非病原性細菌から生成される。
ある実施形態において、非病原性細菌の集団は、ヒト皮膚上の天然の細菌を含み；すなわち、この集団中の細菌はヒト皮膚微生物叢由来である。別の実施形態において、非病原性細菌の集団は、関心のある化合物を発現する、そしてある実施形態においては関心のある化合物を慢性的に発現する、生細菌の集団である。別の実施形態において、非病原性細菌の集団は、弱毒化細菌または死滅（死）細菌、無傷またはその断片の集団であり、この細菌は、弱毒化または死滅前に関心のある化合物を発現した。
ある実施形態において、関心のある化合物は、紫外線光を吸収または反射し得るものである。別の実施形態において、本化合物は、紫外線Ａ（３２０から４００ｎｍ）、紫外線Ｂ（３１５から２８０ｎｍ）またはその両方を吸収または反射し得る。
また別の実施形態において、形質転換細菌により発現される関心のある化合物は、ミコスポリン、ガズソール、オキソ−ミコスポリン、イミノ−ミコスポリンおよびミコスポリン様アミノ酸（ＭＡＡ）、スキトネミン、メラニン、ＵＶ−スクリーニング／観察アミノ酸様分子、フラボノイド、ベタラニン、ＵＶ−スクリーニング／観察色素（例えばカロテノイド／カロチノタンパク質、キサントフィルおよびポルフィリンベース／ヘム−ポルフィリンベース）、ＵＶ−スクリーニング／観察補因子（例えばテトラヒドロビオプテリン）、フェニルプロパノイド、ポリフェノール（例えばタンニン）、ピクノジェノール、チロシナーゼ（およびその基質および産物）、アルファヒドロキシ酸（ＡＨＡ）、多糖類（例えばグリコサミノグリカン、（ＧＡＧ）またはムコ多糖類）、皮膚関連補因子、ビタミンＥ、ポリマー、およびさらなる皮膚関連天然化合物、例えば：コラーゲン、ケラチン、エラスチン、リノール酸、ラミニン、トレチノイン、タザロテン、サルガキン酸、サルガクロメノール、フコキサンチン、レチノイド、抗炎症サイトカイン（ＩＩ−２）、コルチゾン、タクロリムス、シクロスポリン、レスベラトロール、ガロカテコール、ガロカテキン、没食子酸エピガロカテキン、レチノイド、ビタミンＡ、ビタミンＡ誘導体、ベータ−カロテン、ビタミンＤ、ビタミンＡ誘導体、含水化合物；コルチゾン、タクロリムスおよびシクロスポリン、ＤＮＡ修復酵素；フォトリアーゼ、エンドヌクレアーゼおよびグリコシラーゼからなる群から選択される。
また別の実施形態において、形質転換細菌の集団は、少なくとも約１０２細菌／ｃｍ２または少なくとも約１０３、１０４、１０５または１０６細菌／ｃｍ２を提供するために組成物中に配合される。
別の実施形態において、本組成物は、対象への局所適用のために配合される第二の形質転換細菌の集団を含み、ここで第二の形質転換細菌の集団は、（ｉ）本組成物中の第一の形質転換細菌の集団とは異なる非病原性細菌から生成されるかまたは（ｉｉ）本組成物中の第一の形質転換細菌の集団により発現される第一の関心のある化合物とは異なる関心のある化合物を発現するように形質転換されるかの何れかまたはその両方である。その他の実施形態において、本組成物は、少なくとも１つの形質転換細菌の集団、少なくとも２つの形質転換細菌の集団または２以上の形質転換細菌の集団を含む。
ある実施形態において、第二の非病原性細菌の集団は、ヒト皮膚微生物叢由来である。別の実施形態において、第二の非病原性細菌の集団は、関心のある化合物を発現する、および、ある実施形態においては関心のある化合物を慢性的に発現する、生きている細菌の集団である。別の実施形態において、第二の非病原性細菌の集団は、弱毒化細菌または死滅（死）細菌、無傷またはその断片の集団であり、弱毒化または死滅前の細菌が関心のある化合物を発現した。
さらに別の実施形態において、関心のある化合物は乾癬を処置するためのものである。代表的な化合物としては、レチノイド、ビタミンＡ、ベータ−カロテン、ビタミンＤ、抗炎症サイトカインからなる群から選択される化合物が挙げられるが限定されない。
ある実施形態において、関心のある化合物は抗酸化剤である。
また別の実施形態において、本化合物は、レスベラトロール、ビタミンＥ、ビタミンＣ、−エピガロカテキン−３−没食子酸塩およびパルミチン酸レチニル（レチノイド）、ルテイン、タマリンド、フラボノイド、ピクノジェノール、リコピンからなる群から選択される。
別の実施形態において、関心のある化合物は美容効果を提供する。例えば、本化合物は、コエンザイムＱ１０、チロシナーゼ、コラーゲン、ラミニン、セラミド、リノール酸、トレチノイン、タザロテンおよびコラーゲンからなる群から選択され得る。さらに別の実施形態において、美容効果は抗加齢である。
さらに別の実施形態において、関心のある化合物は、湿疹を処置するものである。代表的な関心のある化合物としては、コルチゾン、タクロリムスおよびシクロスポリンからなる群から選択される化合物が挙げられる。
その他の実施形態において、形質転換細菌の集団を含む組成物は、顔面に対する局所適用のために配合される。別の実施形態において、本組成物は、ヒト身体の粘膜面を除く皮膚に対する局所適用のための処方物である。
別の実施形態において、形質転換細菌の集団は、ヒトの皮膚上に常在する非病原性細菌の集団から生成される。すなわち、非病原性細菌の集団は、健康な非疾患者の皮膚上に一般的に常在する細菌を含む。
形質転換細菌の集団は、いくつかの実施形態において、アクチノミセターレス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔａｌｅｓ）、アナエロコッカス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、バシラーレス（Ｂａｃｉｌｌａｌｅｓ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、エンヒドロバクター（Ｅｎｈｙｄｒｏｂａｃｔｅｒ）、フィネゴルジア（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ）、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ロイコノストック（Ｌｅｕｎｃｏｎｏｓｔｏｃ）、マクロオッカス（Ｍａｃｒｏｏｃｃｕｓ）、マイクロコッキネア（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｉｎｅａｅ）、オエノコッカス（Ｏｅｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトニフィルス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ）、プロピオニバクテリウム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、サリニコッカス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ）、スフィンゴモナス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｏｃｏｃｃｕｓ）、テトラゲノックス（Ｔｅｔｒａｇｅｎｏｃｃｕｓ）およびワイセラ（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ）からなる群中のものから選択される非病原性細菌メンバーから生成される。
他の実施形態において、形質転換細菌の集団中の形質転換細菌は、プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ）、コリネオバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）の病原性株、Ｓ．アウレウス（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）またはＳ．エピデルミディス（Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）ではない。
さらに別の実施形態において、形質転換細菌の集団は、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ジェンセニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）、ビフィドバクテリウム・ログヌム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｇｎｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ロイテリ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ビフィドバクテリウム・ラクチス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）、プロピオニバクテリウム・アシジプロピオニシ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｉｄｉｐｒｏｐｉｏｎｉｃｉ）、プロピオニバクテリウム・フロイデンライヒ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）、プロピオニバクテリウム・トエニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｏｅｎｉｉ）およびプロピオニバクテリウム・ジェンセニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）からなる群中のものから選択される細菌から生成される。
また別の実施形態において、形質転換細菌の集団は、ガンマ−プロテオバクテリア（ｇａｍｍａ−ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、アルファ−プロテオバクテリア（ａｌｐｈａ−ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびバクテロイデート（ｂａｃｔｅｒｉｏｄｅｔｅ）からなる群から選択される門中のものから選択される細菌から生成される。
形質転換細菌の集団を含む局所組成物は、様々な実施形態において、クリーム、ローション、エマルジョン、ゲル、軟膏、液体またはスプレーであり得る。ある実施形態において、本局所組成物は少なくとも約１０２細菌／ｃｍ２を提供するために配合される。
別の態様において、疾患予防のために、または治療もしくは美容目的のために、本明細書中で記載のような組成物が対象、好ましくはヒト対象の皮膚に局所的に適用される、処置の方法が提供される。実施形態において、局所的に適用することは、ヒト身体の粘膜面（鼻腔、膣、直腸、口腔面）への局所適用を除外する。
上述の代表的な態様および実施形態に加えて、図面を参照することにより、および次の記述の検討によってさらなる態様および実施形態が明らかとなろう。
本方法および組成物などのさらなる実施形態は、次の記述、図面、実施例および特許請求の範囲から明らかになろう。先行するおよび次の記述から認められ得るように、本明細書中に記載のありとあらゆる特性ならびにこのような特性の２以上のありとあらゆる組み合わせが本開示の範囲内に含まれるが、ただし、このような組み合わせ中に含まれる特性は互いに矛盾していないものとする。さらに、何らかの特性または特性の組み合わせが本発明の何れかの実施形態から具体的に排除され得る。本発明のさらなる態様および長所は、特に付随する実施例および図面と組み合わせて検討した場合、続く記述および特許請求の範囲に記述されている。
図１Ａから１Ｃは、関心のある化合物の発現のための細菌を形質転換するための代表的なプラスミドまたはベクターのマップである。
Ｉ．定義
ここで様々な態様を本明細書中で以後より詳細に記載する。しかし、このような態様は、多くの異なる形態において具現化され得、本明細書中で示される実施形態に限定されるものと解釈すべきものではなく；むしろ、これらの実施形態は、この開示が完璧かつ完全となり、当業者に対しその範囲を完全に伝えるように提供される。
値の範囲が提供される場合、その範囲の上限と下限の間の途中にある各値および何らかの他の述べられるまたは述べられる範囲の途中にある値が本開示内に包含されるものとする。例えば、１μｍから８μｍの範囲が述べられる場合、２μｍ、３μｍ、４μｍ、５μｍ、６μｍおよび７μｍならびに、１μｍよりも大きいかまたはこれと同等の値の範囲および８μｍ未満またはこれと同等である値の範囲も明らかに開示されるものとする。
本明細書で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、内容から明らかに別段示されない限り、複数形への言及を含む。したがって、例えば、「賦形剤」に対する言及は、単数の賦形剤ならびに２以上の同じまたは異なる賦形剤を含む。
「両親媒性」とは、親水性および親油性（疎水性）の特性を合わせもつ分子を指す。
「希釈剤」は、処方物中の別の構成成分を溶解させるか、分散させるかまたはそうでなければ組み込むために処方物中に含まれ得る。希釈剤の例としては、水、緩衝性水溶液、有機親水性希釈剤、例えば一価アルコールおよび低分子量グリコールおよびポリオール（例えばプロピレングリコール、ポリプロピレングリコール、グリセロール、ブチレングリコール）が挙げられるが限定されない。
「ゲル」は、ゼリーなどの半固形材料を生成するように分散相が連続相と組み合わせられているコロイドである。
「親水性」とは、本明細書中で使用される場合、水と容易に相互作用する強い極性基を有する物質を指す。
「疎水性」とは、本明細書中で使用される場合、水と反発し、水を吸収しない傾向があり、水中で溶解されないかまたは水と混合されない、水に対する親和性を欠く物質を指す。
「親油性」とは、本明細書中で使用される場合、溶解度が、ヒマシ油などの疎水性液体中で５ｇ／１００ｍＬ以上である物質を指す。
「親油性」とは、脂質に対して親和性を有する化合物を指す。親油性物質の例としては、天然および合成油、脂肪、脂肪酸、レシチン、トリグリセリドおよびそれらの組み合わせが挙げられるが限定されない。
「油」は、少なくとも９５重量％の親油性物質を含有する組成物である。
「皮膚」は、個体、特にヒトの表皮の全てを示すものとし、いくつかの実施形態において、具体的記載の場合、皮膚の特定の領域、例えば顔面、頸部、腕、脚部、腹部、手、背中、臀部または足などを意図する。
「水溶性」は、本明細書中で使用される場合、５ｇ／１００ｍＬ水以上の溶解度を有する物質を指す。
ＩＩ．局所組成物
本明細書中に記載の組成物は、対象への局所適用のために配合される形質転換細菌の集団から構成される。下記セクションＡで記載されるものは、形質転換細菌の集団を生成させるのに適切な代表的な非病原性細菌である。セクションＢでは、形質転換細菌の集団により発現させようとする関心のある化合物を記載し、セクションＣでは、形質転換細菌集団を生成させるための技術を示す。セクションＤでは、形質転換細菌の集団を含む局所組成物を開示する。
Ａ．代表的な細菌
本明細書中に記載の組成物における、および記載される方法での使用のための細菌の集団は、関心のある化合物を発現、産生および／または分泌するように遺伝子改変された非病原性細菌から生成される。このセクションにおいて、代表的な非病原性細菌を記載する。ある実施形態において、集団中の細菌は非病原性および非侵襲性の微生物であり、ある一定の実施形態においてグラム陽性の食品グレードの細菌株であり得る。別の実施形態において、形質転換細菌の集団は、皮膚微生物叢中の天然の細菌から調製される。
ヒト皮膚には、皮膚微生物叢と呼ばれる皮膚上に常在する微生物が生息している。（健康な（非疾患）者における）皮膚上に常在する細菌微生物は通常非病原性であり、片利共生的であり（宿主にとって有害でなく）および／または共生的（利益を与える）である。ヒト皮膚上に一般的に常在する細菌を下記で示し、系統発生学的レベルにより示し、属レベルに至るまでそれらの系統発生学的な系統とともに記載する（Ｇｒｉｃｅ，Ｅ．Ａら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２４（５９３１）：１１９０−１１９２（２００９）；Ｃｏｓｔｅｌｌｏ，Ｅ．Ｋ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２６（５９６０）：１６９４−１６９７（２００９），Ｇｒｉｃｅ Ｅ．Ａ．およびＪ．Ａ．Ｓｅｇｒｅ，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，９：２４４−２５３（２０１１））。
本組成物中で細菌集団を形成し、１以上の関心のある化合物を発現させるために形質転換される細菌は、同じ細菌または様々な系統発生学的レベルの異なる細菌の混合物の一群であり得る。ある実施形態において、形質転換のための細菌集団は、稀な遊走事象は別として、細菌の他の群から分かれた領域におけるある１つの細菌種の個体の群である。実際に、しばしば任意に、所望の目的に対して、その領域の大きさおよび性質（例えば頬、前額部などの皮膚上の領域の大きさおよび場所）が定められる。別の実施形態において、組成物を調製するための形質転換のための細菌は、空間的および時間的に一緒に生じる異なる細菌種の集団の一群を意図する細菌の群集である。ある実施形態において、細菌の群集は、全ての種（すなわち、全ての栄養レベルおよび／または系統発生学的レベルにわたる）を含むか、または、あるいは全ての栄養的に同等な種（例えば、熱帯雨林の全植物）を含む。別の実施形態において、本組成物を調製するための形質転換のための細菌は、それらの間の遊走により連結される一連の局所的集団として存在するとされる集団の一群を意図する、メタ集団である。別の実施形態において、本組成物を調製するための形質転換のための細菌は、それぞれが、相互作用の可能性のある種の移動分散により連結される一連の局所的群衆として存在するとされる栄養的に同等の個体および種の群がりを意図するメタ群集である（Ｇｒｅｅｎ，Ｊ．Ｌら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２０（５８７９）：１０３９−４３（２００８））。
健康なヒトの皮膚上に常在する細菌としては、コリネバクテリウム属（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）およびプロピオニバクテリウム属（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）中の細菌を含め、アクチノバクテリウム（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）など、ヒトの顔面上に一般的に常在する細菌種が挙げられる。他の実施形態において、健康なヒト対象の皮膚上に常在する細菌としては、例えばバクテロイデート（ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅ）属およびプロテオバクテリア（ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）属中の細菌を含む、一般的に顔面以外の皮膚上に常在する細菌種が挙げられる。皮膚微生物叢中の他の細菌としては、本明細書中で以下に列挙されるものが挙げられる。
ある実施形態において、細菌は、プロピオニバクテリウム・アシディファシエンス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｉｄｉｆａｃｉｅｎｓ）、プロピオニバクテリウム・アシディプロピオニシ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｉｄｉｐｒｏｐｉｏｎｉｃｉ）、プロピオニバクテリウム・アシディプロピオニシ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｉｄｉｐｒｏｐｉｏｎｉｃｉ）株４９００、プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ）、プロピオニバクテリウム・オーストラリエンス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｕｓｔｒａｌｉｅｎｓｅ）、プロピオニバクテリウム・アビドゥム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｖｉｄｕｍ）、プロピオニバクテリウム・シクロヘキサニクム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｙｃｌｏｈｅｘａｎｉｃｕｍ）、プロピオニバクテリウム・フロイデンライヒ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）亜種フロイデンライヒ（Ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）、Ｐ．フロイデンライヒ（Ｐ．ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）ｓｓｐ．フロイデンライヒ（ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）株２０２７１、プロピオニバクテリウム・フロイデンライヒ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）亜種シェルマニイ（Ｓｈｅｒｍａｎｉｉ）、Ｐ．フロイデンライヒ（Ｐ．ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）ｓｓｐ．シェルマニイ（ｓｈｅｒｍａｎｉｉ）株４９０２、Ｐ．フロイデンライヒ（ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）ｓｓｐ．シェルマニイ（ｓｈｅｒｍａｎｉｉ）株４９０２、プロピオニバクテリウム・グラヌロスム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｇｒａｎｕｌｏｓｕｍ）、プロピオニバクテリウム・インノクム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｉｎｎｏｃｕｕｍ）、ジェンセニイ（ｊｅｎｓｅｎｉｉ）、Ｐ．ジェンセニイ（Ｐ．ｊｅｎｓｅｎｉｉ）株２０２７８、プロピオニバクテリウム・リンフォフィルム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｙｍｐｈｏｐｈｉｌｕｍ）、プロピオニバクテリウム・ミクロエアロフィルム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｉｃｒｏａｅｒｏｐｈｉｌｕｍ）、プロピオニバクテリウム・プロピオニクム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｒｏｐｉｏｎｉｃｕｍ）、プロピオニバクテリウム・トエニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｏｅｎｉｉ）およびＰ．トエニイ（Ｐ．ｔｈｏｅｎｉｉ）株２０２７７を含むが限定されない、プロピオニバクテリウム属（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）由来である。
別の実施形態において、細菌は、プロピオニバクテリウム・アシディプロピオニシ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｉｄｉｐｒｏｐｉｏｎｉｃｉ）、プロピオニバクテリウム・フロイデンライヒ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）亜種フロイデンライヒ（Ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）、プロピオニバクテリウム・フロイデンライヒ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）亜種シェルマニイ（ｓｈｅｒｍａｎｉｉ）、プロピオニバクテリウム・ジェンセニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）およびプロピオニバクテリウム・トエニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｏｅｎｉｉ）を含むが限定されない、プロピオニバクテリウム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属中の、「ｇｅｎｅｒａｌｌｙ ｒｅｇａｒｄｅｄ ａｓ ｓａｆｅ（一般に安全と認められる）」（ＧＲＡＳ）として分類される細菌の集団である。ある実施形態において、細菌はプロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ）ではない。
ある実施形態において、細菌は、Ｃ．アコレンス（Ｃ．ａｃｃｏｌｅｎｓ）、Ｃ．アフェルメンタン（Ｃ．ａｆｅｒｍｅｎｔａｎ）、Ｃ．アミコラツム（Ｃ．ａｍｙｃｏｌａｔｕｍ）、Ｃ．アルゲントラテンス（Ｃ．ａｒｇｅｎｔｏｒａｔｅｎｓｅ）、Ｃ．アクアチクム（Ｃ．ａｑｕａｔｉｃｕｍ）、Ｃ．アウリス（Ｃ．ａｕｒｉｓ）、Ｃ．ボビス（Ｃ．ｂｏｖｉｓ）、Ｃ．ジフテリア（Ｃ．ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）、Ｃ．エクイ（Ｃ．ｅｑｕｉ）（現在はロドコッカス・エクイ（Ｒｈｏｄｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ））、Ｃ．フラベセンス（Ｃ．ｆｌａｖｅｓｃｅｎｓ）、Ｃ．グルクロノリチカム（Ｃ．ｇｌｕｃｕｒｏｎｏｌｙｔｉｃｕｍ）、Ｃ．グルタミクム（Ｃ．ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ）、Ｃ．グラヌロサム（Ｃ．ｇｒａｎｕｌｏｓｕｍ）、Ｃ．ヘモリチクム（Ｃ．ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｍ）、Ｃ．ハロフィチカ（Ｃ．ｈａｌｏｆｙｔｉｃａ）、Ｃ．ジェイケイウム（Ｃ．ｊｅｉｋｅｉｕｍ）（群ＪＫ）、Ｃ．マクギンレイ（Ｃ．ｍａｃｇｉｎｌｅｙｉ）、Ｃ．マトルコティ（Ｃ．ｍａｔｒｕｃｈｏｔｉｉ）、Ｃ．ミヌティッシマム（Ｃ．ｍｉｎｕｔｉｓｓｉｍｕｍ）、Ｃ．パルブム（Ｃ．ｐａｒｖｕｍ）（プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ））、Ｃ．プロピンクーム（Ｃ．ｐｒｏｐｉｎｑｕｕｍ）、Ｃ．シュードジフテリチクム（Ｃ．ｐｓｅｕｄｏｄｉｐｈｔｈｅｒｉｔｉｃｕｍ）（Ｃ．ホフマンニイ（Ｃ．ｈｏｆｍａｎｎｉｉ））、Ｃ．シュードツベルキュロシス（Ｃ．ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、（Ｃ．オビス（Ｃ．ｏｖｉｓ））、Ｃ．ピオゲネス（Ｃ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ）、Ｃ．ウレアリチクム（Ｃ．ｕｒｅａｌｙｔｉｃｕｍ）（群Ｄ２）、Ｃ．レナーレ（Ｃ．ｒｅｎａｌｅ）、Ｃ．スペク（Ｃ．ｓｐｅｃ）、Ｃ．ストリアツム（Ｃ．ｓｔｒｉａｔｕｍ）、Ｃ．テヌイス（Ｃ．ｔｅｎｕｉｓ）、Ｃ．ウルセランス（Ｃ．ｕｌｃｅｒａｎｓ）、Ｃ．ウレアリチクム（Ｃ．ｕｒｅａｌｙｔｉｃｕｍ）およびＣ．キセロシス（Ｃ．ｘｅｒｏｓｉｓ）を含むが限定されないコリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属由来である。親油性および非親油性基がある細菌が企図され、この非親油性細菌は、発酵性のコリネバクテリウム（ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）および非発酵性のコリネバクテリウム（ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）を含み得る。
別の実施形態において、細菌は、コリネバクテリウム・アンモニアゲネス（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｍｍｏｎｉａｇｅｎｅｓ）、コリネバクテリウム・カゼイ（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃａｓｅｉ）、コリネバクテリウム・フラベセンス（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｌａｖｅｓｃｅｎｓ）およびコリネバクテリウム・バリアビレ（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｖａｒｉａｂｉｌｅ）を含むが限定されないコリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属中で「一般に安全と認められる」（ＧＲＡＳ）として分類される細菌の集団である。
ある実施形態において、細菌は、Ｃ．ジフテリア（Ｃ．ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａ）Ｃ．アミコラツム（Ｃ．ａｍｉｃｏｌａｔｕｍ）、Ｃ．ストリアツム（Ｃ．ｓｔｒｉａｔｕｍ）、Ｃ．ジェイケイウム（Ｃ．ｊｅｉｋｅｉｕｍ）、Ｃ．ウレアリチクム（Ｃ．ｕｒｅａｌｙｔｉｃｕｍ）およびＣ．キセロシス（Ｃ．ｘｅｒｏｓｉｓ）、Ｃ．シュードツベルキュロシス（Ｃ．ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、Ｃ．テヌイス（Ｃ．ｔｅｎｕｉｓ）、Ｃ．ストリアツム（Ｃ．ｓｔｒｉａｔｕｍ）またはＣ．ミヌティッシマム（Ｃ．ｍｉｎｕｔｉｓｓｉｍｕｍ）ではないが、それはこれらが病原性であり得るからである。
ある実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ細菌種アルトロバクター・アリライテンシス（Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓ）、アルトロバクター・ベルゲレイ（Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ ｂｅｒｇｅｒｅｉ）、アルトロバクター・グロビホルミス（Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ ｇｌｏｂｉｆｏｒｍｉｓ）、アルトロバクター・ニコチアナエ（Ａｒｔｈｒｏｂａｃｔｅｒ ｎｉｃｏｔｉａｎａｅ）、コクリア・リゾフィラ（Ｋｏｃｕｒｉａ ｒｈｉｚｏｐｈｉｌａ）、コクリア・バリアンス（Ｋｏｃｕｒｉａ ｖａｒｉａｎｓ）、ミクロコッカス・ルテウス（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ）、ミクロコッカス・リラエ（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｙｌａｅ）、ミクロバクテリウム・グベエネンス（Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｇｕｂｂｅｅｎｅｎｓｅ）、ブレビバクテリウム・オーランチアクム（Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｕｒａｎｔｉａｃｕｍ）、ブレビバクテリウム・カゼイ（Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃａｓｅｉ）、ブレビバクテリウム・リネンス（Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｎｅｎｓ）、ブラキバクテリウム・アリメンタリウム（Ｂｒａｃｈｙｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｌｉｍｅｎｔａｒｉｕｍ）およびブラキバクテリウム・チロフェルメンタンス（Ｂｒａｃｈｙｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｙｒｏｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）を含むが限定されないマイクロコッカス亜目（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｉｎｅａｅ）由来である。
ある実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ細菌種ストレプトミセス・グリセウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｇｒｉｓｅｕｓ）亜種グリセウス（Ｇｒｉｓｅｕｓ）を含むが限定されないアクチノミセターレス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔａｌｅｓ）目由来である。ある実施形態において、細菌ストレプトミセス・グリセウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ ｇｒｉｓｅｕｓ）は、チロシナーゼを発現しない。
別の実施形態において、細菌は、スタフィロコッカス・アグネティス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｇｎｅｔｉｓ）、Ｓ．アーレッテ（Ｓ．ａｒｌｅｔｔａｅ）、Ｓ．オーリキュラリス（Ｓ．ａｕｒｉｃｕｌａｒｉｓ）、Ｓ．カピチス（ｃａｐｉｔｉｓ）、Ｓ．カプレ（ｃａｐｒａｅ）、Ｓ．カルノサス（ｃａｒｎｏｓｕｓ）、スタフィロコッカス・カセオリチクス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｓｅｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．クロモゲネス（Ｓ．ｃｈｒｏｍｏｇｅｎｅｓ）、Ｓ．コーニイ（Ｓ．ｃｏｈｎｉｉ）、Ｓ．コンジメント（Ｓ．ｃｏｎｄｉｍｅｎｔ）、Ｓ．デルフィニ（Ｓ．ｄｅｌｐｈｉｎｉ）、Ｓ．デブリエセイ（Ｓ．ｄｅｖｒｉｅｓｅｉ）、Ｓ．エクオルム（Ｓ．ｅｑｕｏｒｕｍ）、Ｓ．フェリス（Ｓ．ｆｅｌｉｓ）、Ｓ．フレウレッティイ（Ｓ．ｆｌｅｕｒｅｔｔｉｉ）、Ｓ．ガリナルム（Ｓ．ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、Ｓ．ヘモリチクス（Ｓ．ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．ホミニス（Ｓ．ｈｏｍｉｎｉｓ）、Ｓ．ヒイクス（Ｓ．ｈｙｉｃｕｓ）、Ｓ．インテルメディウス（Ｓ．ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、Ｓ．クロオシイ（Ｓ．ｋｌｏｏｓｉｉ）、Ｓ．レエイ（Ｓ．ｌｅｅｉ）、Ｓ．レンツス（Ｓ．ｌｅｎｔｕｓ）、Ｓ．ルグズネンシス（Ｓ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ）、Ｓ．ルトラエ（Ｓ．ｌｕｔｒａｅ）、Ｓ．マッシリエンシス（Ｓ．ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）、Ｓ．ミクロチ（Ｓ．ｍｉｃｒｏｔｉ）、Ｓ．ムスカエ（Ｓ．ｍｕｓｃａｅ）、Ｓ．ネパレンシス（Ｓ．ｎｅｐａｌｅｎｓｉｓ）、Ｓ．パステウリ（Ｓ．ｐａｓｔｅｕｒｉ）、Ｓ．ペッテンコフェリ（Ｓ．ｐｅｔｔｅｎｋｏｆｅｒｉ）、Ｓ．ピスキフェルメンタンス（Ｓ．ｐｉｓｃｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｓ．シュードインテルメディウス（Ｓ．ｐｓｅｕｄｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、Ｓ．シュードルグズネンシス（Ｓ．ｐｓｅｕｄｏｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ）、Ｓ．プルベレリ（Ｓ．ｐｕｌｖｅｒｅｒｉ）、Ｓ．ロストラ（Ｓ．ｒｏｓｔｒａ）、Ｓ．サッカロリチクス（Ｓ．ｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．サプロフィチクス（Ｓ．ｓａｐｒｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．シュレイフェリ（Ｓｃｈｌｅｉｆｅｒｉ）、Ｓ．スキウリ（Ｓ．ｓｃｉｕｒｉ）、Ｓ．シミエ（Ｓ．ｓｉｍｉａｅ）、Ｓ．シムランス（Ｓ．ｓｉｍｕｌａｎｓ）、Ｓ．ステパノビキイ（Ｓ．ｓｔｅｐａｎｏｖｉｃｉｉ）、Ｓ．スクシヌス（Ｓ．ｓｕｃｃｉｎｕｓ）、Ｓ．ビツリヌス（Ｓ．ｖｉｔｕｌｉｎｕｓ）、Ｓ．ワルネリ（Ｓ．ｗａｒｎｅｒｉ）およびＳ．キシロサス（Ｓ．ｘｙｌｏｓｕｓ）を含むが限定されないスタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、スタフィロコッカス・カモサス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｍｏｓｕｓ）亜種カモサス（Ｃａｍｏｓｕｓ）、スタフィロコッカス・カモサス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｍｏｓｕｓ）亜種ユチリス（Ｕｔｉｌｉｓ）、スタフィロコッカス・コーニイ（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｈｎｉｉ）、スタフィロコッカス・コンジメンティ（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｎｄｉｍｅｎｔｉ）、スタフィロコッカス・エクオルム（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｏｒｕｍ）亜種エクオルム（Ｅｑｕｏｒｕｍ）、スタフィロコッカス・エクオルム（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｏｒｕｍ）亜種リネンス（Ｌｉｎｅｎｓ）、スタフィロコッカス・フレウレッティイ（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｆｌｅｕｒｅｔｔｉｉ）、スタフィロコッカス・ピスキフェルメンタンス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｐｉｓｃｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、スタフィロコッカス・サプロフィチクス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｐｒｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、スタフィロコクルス・スズリ（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｒｕｓ ｓｄｕｒｉ）亜種スズリ（Ｓｄｕｒｉ）、スタフィロコッカス・スクシヌス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｓｕｃｃｉｎｕｓ）亜種スクシヌス（ｓｕｃｃｉｎｕｓ）、スタフィロコッカス・スクシヌス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｓｕｃｃｉｎｕｓ）亜種カゼイ（Ｃａｓｅｉ）、スタフィロコッカス・ビツリヌス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｖｉｔｕｌｉｎｕｓ）、スタフィロコッカス・ワメリ（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｗａｍｅｒｉ）およびスタフィロコクルス・キシロサス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｒｕｓ ｘｙｌｏｓｕｓ）を含むが限定されない、スタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）目中の「一般に安全と認められる」（ＧＲＡＳ）として分類される細菌の集団である。
ある実施形態において、細菌は、Ｓ．アウレウス（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）またはＳ．エピデルミディス（Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）ではない。
別の実施形態において、細菌は、ストレプトコッカス・アシドミニムス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｏｍｉｎｉｍｕｓ）、ストレプトコッカス・アドジャセンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ａｄｊａｃｅｎｓ）、ストレプトコッカス・アガラクチエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ａｇａｌａｃｔｉａｅ）、ストレプトコッカス・アラクトリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ａｌａｃｔｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・アンギノサス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ａｎｇｉｎｏｓｕｓ）、ストレプトコッカス・アウストラリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｓｔｒａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・ボビス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｂｏｖｉｓ）、ストレプトコッカス・カバリイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｂａｌｌｉ）、ストレプトコッカス・カニス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｎｉｓ）、ストレプトコッカス・カプリヌス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｐｒｉｎｕｓ）、ストレプトコッカス・カストレウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｓｔｏｒｅｕｓ）、ストレプトコッカス・セコルム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｅｃｏｒｕｍ）、ストレプトコッカス・コンステラツス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｎｓｔｅｌｌａｔｕｓ）、ストレプトコッカス・コンステラツス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｎｓｔｅｌｌａｔｕｓ）亜種コンステラツス（Ｃｏｎｓｔｅｌｌａｔｕｓ）、ストレプトコッカス・コンステラツス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｎｓｔｅｌｌａｔｕｓ）亜種ファリンギス（Ｐｈａｒｙｎｇｉｓ）、ストレプトコッカス・クレモリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ストレプトコッカス・クリセチ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｒｉｃｅｔｉ）、ストレプトコッカス・クリスタツス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｒｉｓｔａｔｕｓ）、ストレプトコッカス・ダニエリエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄａｎｉｅｌｉａｅ）、ストレプトコッカス・デフェクチベス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｅｆｅｃｔｉｖｅｓ）、ストレプトコッカス・デンタプリ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｅｎｔａｐｒｉ）、ストレプトコッカス・デンチロウセッティ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｅｎｔｉｒｏｕｓｅｔｔｉ）、ストレプトコッカス・ジデルフィス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｉｄｅｌｐｈｉｓ）、ストレプトコッカス・ジフィシリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｉｆｆｉｃｉｌｉｓ）、ストレプトコッカス・デュランス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｕｒａｎｓ）、ストレプトコッカス・ジスガラクチエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｙｓｇａｌａｃｔｉａｅ）、ストレプトコッカス・ジスガラクチエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｙｓｇａｌａｃｔｉａｅ）亜種ジスガラクチエ（Ｄｙｓｇａｌａｃｔｉａｅ）、ストレプトコッカス・ジスガラクチエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｄｙｓｇａｌａｃｔｉａｅ）亜種エクイシミリス（Ｅｑｕｉｓｉｍｉｌｉｓ）、ストレプトコッカス・エンテリクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｎｔｅｒｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・エクイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ）、ストレプトコッカス・エクイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ）亜種エクイ（Ｅｑｕｉ）、ストレプトコッカス・エクイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ）亜種ルミナトルム（Ｒｕｍｉｎａｔｏｒｕｍ）、ストレプトコッカス・エクイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉ）亜種ズーエピデミクス（Ｚｏｏｅｐｉｄｅｍｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・エクインス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｅｑｕｉｎｅｓ）、ストレプトコッカス・フェカリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｆａｅｃａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・フェシウム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｆａｅｃｉｕｍ）、ストレプトコッカス・フェルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｆｅｒｕｓ）、ストレプトコッカス・ガリナセウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｌｌｉｎａｃｅｕｓ）、ストレプトコッカス・ガロリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｌｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・ガロリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｌｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）亜種ガロリチクス（Ｇａｌｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・ガロリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｌｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）亜種マセドニクス（Ｍａｃｅｄｏｎｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・ガロリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｌｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）亜種パステウリアヌス（Ｐａｓｔｅｕｒｉａｎｕｓ）、ストレプトコッカス・ガルビエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｒｖｉｅａｅ）、ストレプトコッカス・ゴルドニイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇｏｒｄｏｎｉｉ）、ストレプトコッカス・ハリコエリ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｈａｌｉｃｈｏｅｒｉ）、ストレプトコッカス・ハンセニイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｈａｎｓｅｎｉｉ）、ストレプトコッカス・ヘンリイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｈｅｎｒｙｉ）、ストレプトコッカス・ハイオインテスティナリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｈｙｏｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・ハイオバギナリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｈｙｏｖａｇｉｎａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・イクタルリ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｃｔａｌｕｒｉ）、ストレプトコッカス・インファンタリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｆａｎｔａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・インファンタリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｆａｎｔａｒｉｕｓ）亜種コリ（Ｃｏｌｉ）、ストレプトコッカス・インファンタリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｆａｎｔａｒｉｕｓ）亜種インファンタリウス（Ｉｎｆａｎｔａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・インファンティス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｆａｎｔｉｓ）、ストレプトコッカス・イニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｉａｅ）、ストレプトコッカス・インテルメディウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、ストレプトコッカス・インテスティナリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・ラクタリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・ラクチス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・ラクチス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種クレモリス（Ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ストレプトコッカス・ラクチス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ジアセチラクチス（Ｄｉａｃｅｔｉｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・ラクチス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ラクチス（Ｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・ルテチエンシス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｔｉｅｎｓｉｓ）、ストレプトコッカス・マカカ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍａｃａｃａｅ）、ストレプトコッカス・マセドニクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍａｃｅｄｏｎｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・マリマンマリウム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍａｒｉｍａｍｍａｌｉｕｍ）、ストレプトコッカス・マッシリエンシス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）、ストレプトコッカス・メリオニス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍｅｒｉｏｎｉｓ）、ストレプトコッカス・ミノル（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍｉｎｏｒ）、ストレプトコッカス・ミチス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍｉｔｉｓ）、ストレプトコッカス・モルビロルム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ）、ストレプトコッカス・ミュータンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｍｕｔａｎｓ）、ストレプトコッカス・オリゴフェルメンタンス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｏｌｉｇｏｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、ストレプトコッカス・オラリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｏｒａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・オリスラッティ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｏｒｉｓｒａｔｔｉ）、ストレプトコッカス・オビス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｏｖｉｓ）、ストレプトコッカス・パラサングイニス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｒａｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、ストレプトコッカス・パラウベリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｒａｕｂｅｒｉｓ）、ストレプトコッカス・パルブルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｒｖｕｌｕｓ）、ストレプトコッカス・パステウリアヌス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｓｔｅｕｒｉａｎｕｓ）、ストレプトコッカス・ペロリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｅｒｏｒｉｓ）、ストレプトコッカス・フォカエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｈｏｃａｅ）、ストレプトコッカス・プランタルム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ストレプトコッカス・プレオモルフス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｌｅｏｍｏｒｐｈｕｓ）、ストレプトコッカス・プルラニマリウム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｌｕｒａｎｉｍａｌｉｕｍ）、ストレプトコッカス・プルレクストルム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｌｕｒｅｘｔｏｒｕｍ）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、ストレプトコッカス・ポルシ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｏｒｃｉ）、ストレプトコッカス・ポルシヌス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｏｒｃｉｎｕｓ）、ストレプトコッカス・ポルコルム（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｏｒｃｏｒｕｍ）、ストレプトコッカス・シュードニューモニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｓｅｕｄｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、ストレプトコッカス・シュードポルシヌス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｓｅｕｄｏｐｏｒｃｉｎｕｓ）、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｙｏｇｅｎｅｓ）、ストレプトコッカス・ラフィノラクチス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｒａｆｆｉｎｏｌａｃｔｉｓ）、ストレプトコッカス・ラッティ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｒａｔｔｉ）、ストレプトコッカス・ルピカプレ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｒｕｐｉｃａｐｒａｅ）、ストレプトコッカス・サッカロリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）亜種サリバリウス（Ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）亜種サーモフィルス（Ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ストレプトコッカス・サングイニス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、ストレプトコッカス・シロイ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｈｉｌｏｉ）、ストレプトコッカス・シネンシス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ）、ストレプトコッカス・ソブリヌス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｏｂｒｉｎｕｓ）、ストレプトコッカス・スイス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｕｉｓ）、ストレプトコッカス・サーモフィルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ストレプトコッカス・ソラルテンシス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｔｈｏｒａｌｔｅｎｓｉｓ）、ストレプトコッカス・チグリヌス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｔｉｇｕｒｉｎｕｓ）、ストレプトコッカス・トログロジテ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔａｅ）、ストレプトコッカス・トログロジティディス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｉｄｉｓ）、ストレプトコッカス・ウベリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｕｂｅｒｉｓ）、ストレプトコッカス・ウリナリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｕｒｉｎａｌｉｓ）、ストレプトコッカス・ベスチブラリス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｖｅｓｔｉｂｕｌａｒｉｓ）およびストレプトコッカス・ワイ
ウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｗａｉｕｓ）を含むが限定されないストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ストレプトコッカス・サーモフィルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）株Ｔｈ４、ストレプトコッカス・ガロリチクス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｌｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）亜種マセドニクス（Ｍａｃｅｄｏｎｉｃｕｓ）、ストレプトコッカス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）亜種サリバリウス（Ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）およびストレプトコクルス・サリバリウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｒｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）亜種サーモフィルス（Ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）を含むが限定されないストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）属中の「一般に安全と認められる」（ＧＲＡＳ）として分類される細菌の集団である。
別の実施形態において、細菌は、ラクトコッカス・ガルビエ（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｒｖｉｅａｅ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種クレモリス（ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ホルドニエ（ｈｏｒｄｎｉａｅ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ラクチス（Ｌａｃｔｉｓ）、ラクトコッカス・ピスチウム（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｉｓｃｉｕｍ）、ラクトコッカス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトコッカス・ラフィノラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｒａｆｆｉｎｏｌａｃｔｉｓ）、ラクトバチルス・アセトトレランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｅｔｏｔｏｌｅｒａｎｓ）、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・アギリス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｇｉｌｉｓ）、ラクトバチルス・アルギズス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｌｇｉｄｕｓ）、ラクトバチルス・アリメンタリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｌｉｍｅｎｔａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・アミロリチクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・アミロフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・アミロボルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｖｏｒｕｓ）、ラクトバチルス・アニマリス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｎｉｍａｌｉｓ）、ラクトバチルス・アビアリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｖｉａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・アビアリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｖｉａｒｉｕｓ）亜種アラフィノサス（ａｒａｆｆｉｎｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・アビアリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｖｉａｒｉｕｓ）亜種アビアリウス（ａｖｉａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・ババリクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂａｖａｒｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・ビフェルメンタンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、ラクトバチルス・ブレビス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｒｅｖｉｓ）、ラクトバチルス・ブクネリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｕｃｈｎｅｒｉ）、ラクトバチルス・ブルガリクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・カルニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｒｎｉｓ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種アラクトサス（ａｌａｃｔｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種カゼイ（ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種シュードプランタルム（ｐｓｅｕｄｏｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種ラムノサス（ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種トレランス（ｔｏｌｅｒａｎｓ）、ラクトバチルス・カテナフォルミス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｔｅｎａｆｏｒｍｉｓ）、ラクトバチルス・セロビオサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｅｌｌｏｂｉｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・コリノイデス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｌｌｉｎｏｉｄｅｓ）、ラクトバチルス・コンフサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｎｆｕｓｕｓ）、ラクトバチルス・コリニフォルミス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）、ラクトバチルス・コリニフォルミス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）亜種コリニフォルミス（ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）、ラクトバチルス・コリニフォルミス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）亜種トルクエンス（ｔｏｒｑｕｅｎｓ）、ラクトバチルス・クリスパツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、ラクトバチルス・クルバツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｒｖａｔｕｓ）、ラクトバチルス・クルバツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｒｖａｔｕｓ）亜種クルバツス（ｃｕｒｖａｔｕｓ）、ラクトバチルス・クルバツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｒｖａｔｕｓ）亜種メリビオサス（ｍｅｌｉｂｉｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・デルブルエキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）、ラクトバチルス・デルブルエキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）亜種ブルガリクス（ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・デルブルエキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）亜種デルブルエキイ（ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）、ラクトバチルス・デルブルエキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）、ラクトバチルス・ディベルジェンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｉｖｅｒｇｅｎｓ）、ラクトバチルス・ファルシミニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆａｒｃｉｍｉｎｉｓ）、ラクトバチルス・フェルメンツム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、ラクトバチルス・フォルミカリス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｏｒｍｉｃａｌｉｓ）、ラクトバチルス・フルクチボランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｒｕｃｔｉｖｏｒａｎｓ）、ラクトバチルス・フルクトサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｒｕｃｔｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・ガリナルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、ラクトバチルス・ガセリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｇａｓｓｅｒｉ）、ラクトバチルス・グラミニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｇｒａｍｉｎｉｓ）、ラクトバチルス・ハロトレランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈａｌｏｔｏｌｅｒａｎｓ）、ラクトバチルス・ハムステリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈａｍｓｔｅｒｉ）、ラクトバチルス・ヘルベチクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・ヘテロイオキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｅｔｅｒｏｈｉｏｃｈｉｉ）、ラクトバチルス・ヒルガルディイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｉｌｇａｒｄｉｉ）、ラクトバチルス・ホモヒオキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｏｍｏｈｉｏｃｈｉｉ）、ラクトバチルス・イネルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｉｎｅｒｓ）、ラクトバチルス・インテスティナリス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、ラクトバチルス・ジェンセニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）、ラクトバチルス・ジョンソニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ）、ラクトバチルス・カンデレリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋａｎｄｌｅｒｉ）、ラクトバチルス・ケフィリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｅｆｉｒｉ）、ラクトバチルス・ケフラノファシエンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｅｆｕｒａｎｏｆａｃｉｅｎｓ）、ラクトバチルス・ケフィルグラヌム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｅｆｉｒｇｒａｎｕｍ）、ラクトバチルス・クンケエイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｕｎｋｅｅｉ）、ラクトバチルス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ラクトバチルス・リーシュマニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ）、ラクトバチルス・リンドネリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｉｎｄｎｅｒｉ）、ラクトバチルス・マレフェルメンタンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍａｌｅｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、ラクトバチルス・マリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍａｌｉ）、ラクトバチルス・マルタロミクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍａｌｔａｒｏｍｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・マニホチボランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍａｎｉｈｏｔｉｖｏｒａｎｓ）、ラクトバチルス・ミノル（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｉｎｏｒ）、ラクトバチルス・ミヌツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｉｎｕｔｕｓ）、ラクトバチルス・ムコサエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｕｃｏｓａｅ）、ラクトバチルス・ムリヌス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｕｒｉｎｕｓ）、ラクトバチルス・ナジェリイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｇｅｌｉｉ）、ラクトバチルス・オリス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｒｉｓ）、ラクトバチルス・パニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｎｉｓ）、ラクトバチルス・パラブクネリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｂｕｃｈｎｅｒｉ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｃａｓｅｉ）亜種パラカゼイ（ｐａｒａｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｃａｓｅｉ）亜種トレランス（ｔｏｌｅｒａｎｓ）、ラクトバチルス・パラケフィリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｋｅｆｉｒｉ）、ラクトバチルス・パラリメンタリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｌｉｍｅｎｔａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・パラプランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトバチルス・ペントサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｅｎｔｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・ペロレンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｅｒｏｌｅｎｓ）、ラクトバチルス・ピスキコラ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｉｓｃｉｃｏｌａ）、ラクトバチルス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトバチルス・ポンティス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｎｔｉｓ）、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ラクトバチルス・ラムノサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・ラムノサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）株５ＡＥ５ａ、ラクトバチルス・リマエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｉｍａｅ）、ラクトバチルス・ロゴサエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｏｇｏｓａｅ）、ラクトバチルス・ルミニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｕｍｉｎｉｓ）、ラクトバチルス・サケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｋｅｉ）、ラクトバチルス・サケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｋｅｉ）亜種カモサス（ｃａｍｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・サケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｋｅｉ）亜種サケイ（ｓａｋｅｉ）、ラクトバチルス・サリバリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・サリバリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）亜種サリチニウス（ｓａｌｉｃｉｎｉｕｓ）、ラクトバチルス・サリバリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）亜種サリバリウス（ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・サンフランシセンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｎｆｒａｎｃｉｓｃｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・シャルペエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｈａｒｐｅａｅ）、ラクトバチルス・スエビクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｅｂｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・トリコデス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｒｉｃｈｏｄｅｓ）、ラクトバチルス・ウリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｕｌｉ）、ラクトバチルス・バクシノステルクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｖａｃｃｉｎｏｓｔｅｒｃｕｓ）、ラクトバチルス・バギナリス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｖａｇｉｎａｌｉｓ）、ラクトバチルス・ビリデセンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｖｉｒｉｄｅｓｃｅｎｓ）、ラクトバチルス・ビツリヌス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｖｉｔｕｌｉｎｕｓ）、ラクトバチルス・キシロサス
（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｘｙｌｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・ヤマナシエンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｙａｍａｎａｓｈｉｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・ヤマナシエンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｙａｍａｎａｓｈｉｅｎｓｉｓ）亜種マリ（ｍａｌｉ）、ラクトバチルス・ヤマナシエンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｙａｍａｎａｓｈｉｅｎｓｉｓ）亜種ヤマナシエンシス（Ｙａｍａｎａｓｈｉｅｎｓｉｓ）およびラクトバチルス・ゼアエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｚｅａｅ）を含むが限定されないラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）株ＮＰ２８、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）株ＮＰ５１、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）株ＮＰ７、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）株ＮＣＩＭＢ３０２４２、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）株シロタ（Ｓｈｉｒｏｔａ）、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）株ＤＳＭ１７９３８、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）株ＮＣＩＭＢ３０２４２、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）ＮＣＦＭ、ラクトバチルス・ラムノサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）株ＨＮ００１、ミルクベースの培地中で産生されるラクトバチルス・ラムノサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）株ＨＮ００１、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）株ＤＳＭ１７９３８、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種ラムノサス（ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）株ＧＧ、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ラクトバチルス・アセトトレランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｅｔｏｔｏｌｅｒａｎｓ）、ラクトバチルス・アシディファリネ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｉｆａｒｉｎａｅ）、ラクトバチルス・アシディピスズ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｉｐｉｓｄｓ）、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・アリメンムリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｌｉｍｅｎｍｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・アミロリチクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・アミロボルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｖｏｒｕｓ）、ラクトバチルス・ブレビス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｒｅｖｉｓ）、ラクトバチルス・ブクネリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｂｕｃｈｎｅｒｉ）、ラクトバチルス・カカオヌム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｃａｏｎｕｍ）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）亜種カゼイ（Ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・コリノイデス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｌｌｉｎｏｉｄｅｓ）、ラクトバチルス・コンポスチ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏｍｐｏｓｔｉ）、ラクトバチルス・コリニフォルミス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏ−ｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）亜種コリニフォルミス（Ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）、ラクトバチルス・クリスパツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、ラクトバチルス・クルストルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｒｕｓｔｏｒｕｍ）、ラクトバチルス・クルバツス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｒｖａｔｕｓ）亜種クルバツス（Ｃｕｒｖａｔｕｓ）、ラクトバチルス・デルブルエッキ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）亜種ブルガリクス（Ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・デルブルエッキ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）亜種デルブルエッキ（Ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）、ラクトバチルス・デルブルエッキ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）亜種ラクチス（Ｌａｃｔｉｓ）、ラクトバチルス・デキストリニクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｅｘｔｒｉｎｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・ディオリボランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｄｉｏｌｉｖｏｒａｎｓ）、ラクトバチルス・ファビフェルメンタンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆａｂｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、ラクトバチルス・ファルシミニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆａｒｃｉｍｉｎｉｓ）、ラクトバチルス・フェルメンツム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、ラクトバチルス・フルクチボランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｒｕｃｔｉｖｏｒａｎｓ）、ラクトバチルス・フルメンティ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｆｒｕｍｅｎｔｉ）、ラクトバチルス・ガセリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｇａｓｓｅｒｉ）、ラクトバチルス・ガネンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｇｈａｎｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・ハメシイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈａｍｍｅｓｉｉ）、ラクトバチルス・ハルビネンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈａｒｂｉｎｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・ヘルベチクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・ヒルガルディイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｉｌｇａｒｄｉｉ）、ラクトバチルス・ホモヒオキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｏｍｏｈｉｏｃｈｉｉ）、ラクトバチルス・ホルデイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｈｏｒｄｅｉ）、ラクトバチルス・ジェンセニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）、ラクトバチルス・ジョンソニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ）、ラクトバチルス・ケフィリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｅｆｉｒｉ）、ラクトバチルス・ケフィラノファデンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｄｅｎｓ）亜種ケフィラノファシエンス（Ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｃｉｅｎｓ）、ラクトバチルス・ケフィラノファデンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｄｅｎｓ）亜種ケフィルグラヌム（Ｋｅｆｉｒｇｒａｎｕｍ）、ラクトバチルス・キムチイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｉｍｃｈｉｉ）、ラクトバチルス・キソネンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｋｉｓｏｎｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・マリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍａｌｉ）、ラクトバチルス・マニホチボランス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍａｎｉｈｏｔｉｖｏｒａｎｓ）、ラクトバチルス・ミンデンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｉｎｄｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・ムコサ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｕｃｏｓａｅ）、ラクトバチルス・ナジェリイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｇｅｌｉｉ）、ラクトバチルス・ナムレンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｍｕｒｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・ナンテンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｎｔｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・ノデンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｎｏｄｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・オエニ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｅｎｉ）、ラクトバチルス・オタキエンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｏｔａｋｉｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・パニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｎｉｓ）、ラクトバチルス・パラブレビス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｂｒｅｖｉｓ）、ラクトバチルス・パラブクネリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｂｕｃｈｎｅｒｉ）、ラクトバチルス・パラカゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｃａｓｅｉ）亜種パラカゼイ（Ｐａｒａｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・パラケフィリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｋｅｆｉｒｉ）、ラクトバチルス・パラリメンタリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｌｉｍｅｎｔａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・パラプランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐａｒａｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトバチルス・ペントサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｅｎｔｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・ペロレンス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｅｒｏｌｅｎｓ）、ラクトバチルス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｌａｎｔａｒｕｍ）亜種プランタルム（Ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、ラクトバチルス・ポブジヒイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｂｕｚｉｈｉｉ）、ラクトバチルス・ポンズ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｏｎｄｓ）、ラクトバチルス・ラピ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒａｐｉ）、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ラクトバチルス・ラムノサス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・ロシアエ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｏｓｓｉａｅ）、ラクトバチルス・サケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｋｅｉ）亜種カルノサス（ｃａｒｎｏｓｕｓ）、ラクトバチルス・サケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｋｅｉ）亜種サケイ（Ｓａｋｅｉ）、ラクトバチルス・サリバリウス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｌｉ ｖａｒｉｕｓ）亜種サリバリウス（Ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、ラクトバチルス・サンフランシセンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｎｆｒａｎｃｉｓｃｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・サツメンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓａｔｓｕｍｅｎｓｉｓ）、ラクトバチルス・セカリフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｅｃａｌｉｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・センマイズケイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｅｎｍａｉｚｕｋｅｉ）、ラクトバチルス・シリギニス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｉｌｉｇｉｎｉｓ）、ラクトバチルス・スピケリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐｉｃｈｅｒｉ）、ラクトバチルス・スエビクス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｅｂｉｃｕｓ）、ラクトバチルス・スンキイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｎｋｉｉ）、ラクトバチルス・トゥッセティ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｔｕｃｃｅｔｉ）、ラクトバチルス・バクドノステルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｖａｃｄｎｏｓｔｅｒｒｕｓ）、ラクトバチルス・ベルスモルデンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｖｅｒｓｍｏｌｄｅｎｓｉｓ）およびラクトバチルス・ヤマナシエンシス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｙａｍａｎａｓｈｉｅｎｓｉｓ）を含むが限定されない、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）属中の「一般に安全と認められる」（ＧＲＡＳ）として分類される細菌の集団である。
別の実施形態において、細菌は、ラクトコッカス・シュレイファー（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ Ｓｃｈｌｅｉｆｅｒ）、ラクトコッカス・チュンガンゲンシス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｃｈｕｎｇａｎｇｅｎｓｉｓ）、ラクトコッカス・フジエンシス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｆｕｊｉｅｎｓｉｓ）、ラクトコッカス・ガルビエ（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｇａｒｖｉｅａｅ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種クレモリス（Ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ホルドニエ（Ｈｏｒｄｎｉａｅ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ラクチス（Ｌａｃｔｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種トゥルクテ（Ｔｒｕｃｔａｅ）、ラクトコッカス・ピスキウム（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｉｓｃｉｕｍ）、ラクトコッカス・プランタルム（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｌａｎｔａｒｕｍ）およびラクトコッカス・ラフィノラクチ（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｒａｆｆｉｎｏｌａｃｔｉ）を含むが限定されないラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種クレモリス（Ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）およびラクトコッカス・ラフィノラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｒａｆｆｉｎｏｌａｃｔｉｓ）を含むが限定されない、ラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）属中の「一般に安全と認められる」（ＧＲＡＳ）として分類される細菌の集団である。
別の実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ細菌種エンテロコッカス・デュランス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｄｕｒａｎｓ）、エンテロコッカス・フェカリス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｆａｅｃａｌｉｓ）およびエンテロコッカス・フェシウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｆａｅｃｉｕｍ）を含むが限定されないエンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、テトラジェノコッカス・ハロフィルス（Ｔｅｔｒａｇｅｎｏｃｏｃｃｕｓ ｈａｌｏｐｈｉｌｕｓ）およびテトラジェノコッカス・コレエンシス（Ｔｅｔｒａｇｅｎｏｃｏｃｃｕｓ ｋｏｒｅｅｎｓｉｓ）を含むが限定されないテトラジェノコッカス（Ｔｅｔｒａｇｅｎｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ細菌種ワイセラ・コレエンシス（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｋｏｒｅｅｎｓｉｓ）、ワイセラ・パラメセンテロイデス（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｐａｒａｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ワイセラ・タイランデンシス（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｔｈａｉｌａｎｄｅｎｓｉｓ）、ワイセラ・コンフサ（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｃｏｎｆｕｓａ）、ワイセラ・ベニネンシス（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｂｅｎｉｎｅｎｓｉｓ）、ワイセラ・シバリア（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｃｉｂａｒｉａ）、ワイセラ・ファバリア（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｆａｂａｒｉａ）、ワイセラ・ガネンシス（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｇｈａｎｅｎｓｉｓ）およびワイセラ・ヘレニカ（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ ｈｅｌｌｅｎｉｃａ）を含むが限定されないワイセラ（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ細菌種ロイコノストック・カルノスム（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｃａｒｎｏｓｕｍ）、ロイコノストック・シトレウム（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｃｉｔｒｅｕｍ）、ロイコノストック・ファラックス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｆａｌｌａｘ）、ロイコノストック・ホルザプフェリイ（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｈｏｌｚａｐｆｅｌｉｉ）、ロイコノストック・インヘ（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｉｎｈａｅ）、ロイコノストック・キムチイ（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｋｉｍｃｈｉｉ）、ロイコノストック・ラクチス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｌａｃｔｉｓ）、ロイコノストック・メセンテロイデス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）亜種クレモリス（Ｃｒｅｍｏｒｉｓ）、ロイコノストック・メセンテロイデス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）亜種デクストラニクム（Ｄｅｘｔｒａｎｉｃｕｍ）、ロイコノストック・メセンテロイデス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）亜種メセンテロイデス（Ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ロイコノストック・パルメ（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｐａｌｍａｅ）およびロイコノストック・シュードメセンテロイデス（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ ｐｓｅｕｄｏｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ）を含むが限定されないロイコノストック（Ｌｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、オエノコッカス・オエニ（Ｏｅｎｏｃｏｃｃｕｓ ｏｅｎｉ）を含むが限定されないオエノコッカス（Ｏｅｎｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、サリニコッカス・ベントサ（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ Ｖｅｎｔｏｓａ）、サリニコッカス・アルブス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ａｌｂｕｓ）、サリニコッカス・アルカリフィルス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ａｌｋａｌｉｐｈｉｌｕｓ）、サリニコッカス・カルニカンクリ（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｃａｒｎｉｃａｎｃｒｉ）、サリニコッカス・ハロズランス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｈａｌｏｄｕｒａｎｓ）、サリニコッカス・ヒスパニクス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｈｉｓｐａｎｉｃｕｓ）、サリニコッカス・イラネンシス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｉｒａｎｅｎｓｉｓ）、サリニコッカス・ジェオトガリ（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｊｅｏｔｇａｌｉ）、サリニコッカス・クンミンゲンシス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｋｕｎｍｉｎｇｅｎｓｉｓ）、サリニコッカス・ルテウス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ）、サリニコッカス・キングダオネンシス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｑｉｎｇｄａｏｎｅｎｓｉｓ）、サリニコッカス・ロセウス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｒｏｓｅｕｓ）、サリニコッカス・サルシライエ（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｓａｌｓｉｒａｉａｅ）、サリニコッカス・セスビイ（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｓｅｓｕｖｉｉ）およびサリニコッカス・シアメンシス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ ｓｉａｍｅｎｓｉｓ）を含むが限定されないサリニコッカス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、マクロコッカス・カセオリチクス（Ｍａｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｓｅｏｌｙｔｉｃｕｓ）を含むが限定されないマクロコッカス（Ｍａｃｒｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ細菌種バチルス・アミロリケファシエンス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、バチルス・コアグランス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｏａｇｕｌａｎｓ）およびバチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｂｔｉｌｉｓ）を含むが限定されないバチルス目（Ｂａｃｉｌｌａｌｅｓ）由来である。
別の実施形態において、集団中の細菌は、フィネゴルジア・マグナ（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ ｍａｇｎａ）ではない。
別の実施形態において、細菌は、アナエロコッカス・ヒドロゲナリス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｈｙｄｒｏｇｅｎａｌｉｓ）、アナエロコッカス・ラクトリチクス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｏｌｙｔｉｃｕｓ）、アナエロコッカス・ムルドチイ（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｍｕｒｄｏｃｈｉｉ）、アナエロコッカス・オクタビウス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｏｃｔａｖｉｕｓ）、アナエロコッカス・ペルボティイ（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｐｒｅｖｏｔｉｉ）、アナエロコッカス・テトラディウス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｔｅｔｒａｄｉｕｓ）およびアナエロコッカス・バギナリス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ｖａｇｉｎａｌｉｓ）種を含むが限定されないアナエロコッカス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ペプトニフィルス・アサッカロリチクス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ａｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃｕｓ）、ペプトニフィルス・コクシイ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｃｏｘｉｉ）、ペプトニフィルス・デュエルデニイ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｄｕｅｒｄｅｎｉｉ）、ペプトニフィルス・ゴルバチイ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｇｏｒｂａｃｈｉｉ）、ペプトニフィルス・ハレイ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｈａｒｅｉ）、ペプトニフィルス・インドリクス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｉｎｄｏｌｉｃｕｓ）、ペプトニフィルス・イボリイ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｉｖｏｒｉｉ）、ペプトニフィルス・コエノエネニエ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｋｏｅｎｏｅｎｅｎｉａｅ）、ペプトニフィルス・ラクリマリス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｌａｃｒｉｍａｌｉｓ）、ペプトニフィルス・メチオニニボラクス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｉｖｏｒａｘ）、ペプトニフィルス・オルセニイ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｏｌｓｅｎｉｉ）およびペプトニフィルス・チレリエ（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｔｙｒｒｅｌｌｉａｅ）種を含むが限定されないペプトニフィルス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、エンヒドロバクター・アエロサクス（Ｅｎｈｙｄｒｏｂａｃｔｅｒ ａｅｒｏｓａｃｃｕｓ）種を含むが限定されないエンヒドロバクター（Ｅｎｈｙｄｒｏｂａｃｔｅｒ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、スフィンゴモナス・アバチ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｂａｃｉ）、スフィンゴモナス・アドヘシバ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｄｈａｅｓｉｖａ）、スフィンゴモナス・アエロラタ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｅｒｏｌａｔａ）、スフィンゴモナス・アエスツアリイ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｅｓｔｕａｒｉｉ）、スフィンゴモナス・アラスケンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｌａｓｋｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・アルピン（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｌｐｉｎｅ）、スフィンゴモナス・アクアチリス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｑｕａｔｉｌｉｓ）、スフィンゴモナス・アロマチシボランス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｒｏｍａｔｉｃｉｖｏｒａｎｓ）、スフィンゴモナス・アサッカロリチカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃａ）、スフィンゴモナス・アスタキサンチニファシエンス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｓｔａｘａｎｔｈｉｎｉｆａｃｉｅｎｓ）、スフィンゴモナス・アウランチアカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｕｒａｎｔｉａｃａ）、スフィンゴモナス・アゾチフィゲンス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ａｚｏｔｉｆｉｇｅｎｓ）、スフィンゴモナス・カプスラテ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｃａｐｓｕｌａｔｅ）、スフィンゴモナス・チャングバイエンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｃｈａｎｇｂａｉｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・クロロフェノリカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｃｈｌｏｒｏｐｈｅｎｏｌｉｃａ）、スフィンゴモナス・チュングブケンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｃｈｕｎｇｂｕｋｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・クロアカエ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｃｌｏａｃａｅ）、スフィンゴモナス・シナレ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｃｙｎａｒａｅ）、スフィンゴモナス・デシッカビリス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｄｅｓｉｃｃａｂｉｌｉｓ）、スフィンゴモナス・ドクドネンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｄｏｋｄｏｎｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・エキノイデス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｅｃｈｉｎｏｉｄｅｓ）、スフィンゴモナス・エンドフィチカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃａ）、スフィンゴモナス・ファエニ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｆａｅｎｉ）、スフィンゴモナス・フェニカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｆｅｎｎｉｃａ）、スフィンゴモナス・フォルモセンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｆｏｒｍｏｓｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・ギンセンギソリ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｇｉｎｓｅｎｇｉｓｏｌｉ）、スフィンゴモナス・ギンセノシジミュータンス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｇｉｎｓｅｎｏｓｉｄｉｍｕｔａｎｓ）、スフィンゴモナス・グラシアリス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｇｌａｃｉａｌｉｓ）、スフィンゴモナス・ハロアロマチカマンス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｈａｌｏａｒｏｍａｔｉｃａｍａｎｓ）、スフィンゴモナス・ハンクーケンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｈａｎｋｏｏｋｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・ヘルビシドボランス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｈｅｒｂｉｃｉｄｏｖｏｒａｎｓ）、スフィンゴモナス・ヒスチジニリチカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｈｉｓｔｉｄｉｎｉｌｙｔｉｃａ）、スフィンゴモナス・インディカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｉｎｄｉｃａ）、スフィンゴモナス・インスレ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｉｎｓｕｌａｅ）、スフィンゴモナス・ジャポニカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｊａｐｏｎｉｃａ）、スフィンゴモナス・ジャスプシ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｊａｓｐｓｉ）、スフィンゴモナス・ジェジュエンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｊｅｊｕｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・ジンジュエンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｊｉｎｊｕｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・カイステンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｋａｉｓｔｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・コレエンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｋｏｒｅｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・ラテラリエ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｌａｔｅｒａｒｉａｅ）、スフィンゴモナス・レイディイ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｌｅｉｄｙｉ）、スフィンゴモナス・マクロゴリタビダ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｍａｃｒｏｇｏｌｉｔａｂｉｄａ）、スフィンゴモナス・マクロゴルタビドゥス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｍａｃｒｏｇｏｌｔａｂｉｄｕｓ）、スフィンゴモナス・マリ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｍａｌｉ）、スフィンゴモナス・メロニス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｍｅｌｏｎｉｓ）、スフィンゴモナス・モルスコルム（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｍｏｌｌｕｓｃｏｒｕｍ）、スフィンゴモナス・ムコシッシマ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｍｕｃｏｓｉｓｓｉｍａ）、スフィンゴモナス・ナタトリア（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｎａｔａｔｏｒｉａ）、スフィンゴモナス・オリゴフェノリカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｏｌｉｇｏｐｈｅｎｏｌｉｃａ）、スフィンゴモナス・オリジテラエ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｏｒｙｚｉｔｅｒｒａｅ）、スフィンゴモナス・パンニ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐａｎｎｉ）、スフィンゴモナス・パラパウシモビリス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐａｒａｐａｕｃｉｍｏｂｉｌｉｓ）、スフィンゴモナス・パウチノビリス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐａｕｃｉｍｏｂｉｌｉｓ）、スフィンゴモナス・フィロスフェラ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐｈｙｌｌｏｓｐｈａｅｒａｅ）、スフィンゴモナス・ピツイトサ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐｉｔｕｉｔｏｓａ）、スフィンゴモナス・ポリアロマチシボランス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐｏｌｙａｒｏｍａｔｉｃｉｖｏｒａｎｓ）、スフィンゴモナス・プルニ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐｒｕｎｉ）、スフィンゴモナス・シュードサングイニス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｐｓｅｕｄｏｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、スフィンゴモナス・ロサ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｒｏｓａ）、スフィンゴモナス・ロセイフラバ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｒｏｓｅｉｆｌａｖａ）、スフィンゴモナス・ルブラ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｒｕｂｒａ）、スフィンゴモナス・サンギニス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、スフィンゴモナス・サンキサニゲネンス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓａｎｘａｎｉｇｅｎｅｎｓ）、スフィンゴモナス・セディミニコラ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｅｄｉｍｉｎｉｃｏｌａ）、スフィンゴモナス・ソリ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｏｌｉ）、スフィンゴモナス・スターンベルゲンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｔａｒｎｂｅｒｇｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・スチギア（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｔｙｇｉａ）、スフィンゴモナス・スバルクチカ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｕｂａｒｃｔｉｃａ）、スフィンゴモナス・スベリファシエンス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｕｂｅｒｉｆａｃｉｅｎｓ）、スフィンゴモナス・サブテラネアン（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｕｂｔｅｒｒａｎｅａｎ）、スフィンゴモナス・タエジョネンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｔａｅｊｏｎｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・テラエ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｔｅｒｒａｅ）、スフィンゴモナス・ツルエペリ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｔｒｕｅｐｅｒｉ）、スフィンゴモナス・ウルシンコラ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｕｒｓｉｎｃｏｌａ）、スフィンゴモナス・ウィチキイ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｗｉｔｔｉｃｈｉｉ）、スフィンゴモナス・ゼノファガ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｘｅｎｏｐｈａｇａ）、スフィンゴモナス・キシンジアンゲンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｘｉｎｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ）、スフィンゴモナス・ヤブウチエ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｙａｂｕｕｃｈｉａｅ）、スフィンゴモナス・ヤノイクヤエ（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｙａｎｏｉｋｕｙａｅ）およびスフィンゴモナス・ユンナネンシス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｙｕｎｎａｎｅｎｓｉｓ）種を含むが限定されないスフィンゴモナス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ハフニア・アルベイ（Ｈａｆｎｉａ ａｌｖｅｉ）を除く、ハロモナス・エロンガタ（Ｈａｌｏｍｏｎａｓ ｅｌｏｎｇａｔａ）、ハフニア・アルベイ（Ｈａｆｎｉａ ａｌｖｅｉ）などのガンマ−プロテオバクテリア（ｇａｍｍａ−ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）門中のＧＲＡＳ種である。
別の実施形態において、細菌は、ＧＲＡＳ種アセトバクター・アセチ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ａｃｅｔｉ）亜種アセチ（Ａｃｅｔｉ）、アセトバクター・ファバルム（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｆａｂａｒｕｍ）、アセトバクター・ロバニエンシス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｌｏｖａｎｉｅｎｓｉｓ）、アセトバクター・マロルム（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｍａｌｏｒｕｍ）、アセトバクター・オリエンタリス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｏｒｉｅｎｔａｌｉｓ）、アセトバクター・パステウリアヌス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｐａｓｔｅｕｒｉａｎｕｓ）亜種パステウリアヌス（Ｐａｓｔｅｕｒｉａｎｕｓ）、アセトバクター・ポモルム（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｐｏｍｏｒｕｍ）、アセトバクター・シジギイ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｙｚｙｇｉｉ）、アセトバクター・トロピカリス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ）を含むが限定されないアルファ−プロテオバクテリア（ａｌｐｈａ−ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）門の属由来である。
また、グルコンアセトバクター・アゾトカプタンス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ａｚｏｔｏｃａｐｔａｎｓ）、グルコンアセトバクター・ジアゾトロフィクス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｄｉａｚｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ）、グルコンアセトバクター・エンタニイ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｅｎｔａｎｉｉ）、グルコンアセトバクター・エウロパエウス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｅｕｒｏｐａｅｕｓ）、グルコンアセトバクター・ハンセニイ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｈａｎｓｅｎｉｉ）、グルコンアセトバクター・ジョハンネ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｊｏｈａｎｎａｅ）、グルコンアセトバクター・オボエジエンス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｏｂｏｅｄｉｅｎｓ）、グルコノバクター・オキシダンス（Ｇｌｕｃｏｎｏｂａｃｔｅｒ ｏｘｙｄａｎｓ）およびグルコンアセトバクター・キシリヌス（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｘｙｌｉｎｕｓ）も含まれる。
別の実施形態において、細菌は、ザイモモナス・モビリス（Ｚｙｍｏｍｏｎａｓ ｍｏｂｉｌｉｓ）亜種モビリス（Ｍｏｂｉｌｉｓ）である。
別の実施形態において、細菌は、バクテリオデス・キシラニソルベンス（Ｂａｃｔｅｒｉｏｄｅｓ ｘｙｌａｎｉｓｏｌｖｅｎｓ）株ＤＳＭ２３９６４を含むが限定されないバクテリオデート（ｂａｃｔｅｒｉｏｄｅｔｅ）門由来である。
別の実施形態において、細菌は、ビフィドバクテリウム・アドレセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・アドレセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）ＡＴＣＣ１５７０３、ビフィドバクテリウム・アドレセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）Ｌ２−３２、ビフィドバクテリウム・アングラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｇｕｌａｔｕｍ）、ビフィドバクテリウム・アングラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｇｕｌａｔｕｍ）ＤＳＭ２００９８＝ＪＣＭ７０９６、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種アニマリス（Ａｎｉｍａｌｉｓ）、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種アニマリス（ａｎｉｍａｌｉｓ）ＡＴＣＣ２５５２７、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（Ｌａｃｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＡＤ０１１、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＡＴＣＣ２７６７３、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）Ｂ４２０、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＢＢ−１２、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）Ｂｉ−０７、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＢＩ−０４、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＢＬＣ１、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＢＳ０１、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＣＮＣＭ Ｉ−２４９４、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＤＳＭ１０１４０、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）ＨＮ０１９、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）Ｖ９、ビフィドバクテリウム・アステロイズ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｓｔｅｒｏｉｄｓ）、ビフィドバクテリウム・アステロイデス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｓｔｅｒｏｉｄｅｓ）ＰＲＬ２０１１、ビフィドバクテリウム・ビアバティイ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉａｖａｔｉｉ）、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＡＴＣＣ２９５２１＝ＪＣＭ１２５５、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＢＧＮ４、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＣＥＣＴ７３６６、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＤＳＭ２０２１５、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＩＰＬＡ２００１５、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＪＣＭ１２５４、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＬＭＧ１３１９５、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＮＣＩＭＢ４１１７１、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）ＰＲＬ２０１０、ビフィドバクテリウム・ビフィドゥム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｉｄｕｍ）Ｓ１７、ビフィドバクテリウム・ボムビ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｏｍｂｉ）、ビフィドバクテリウム・ボウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｏｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＡＣＳ−０７１−Ｖ−Ｓｃｈ８ｂ、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＣＥＣＴ７２６３、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＤＰＣ６３３０、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＤＳＭ２０２１３＝ＪＣＭ１１９２、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＥＸ３３６９６０ＶＣ１８、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＥＸ３３６９６０ＶＣ１９、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＥＸ３３６９６０ＶＣ２１、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＥＸ５３３９５９ＶＣ２１、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＨＰＨ０３２６、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＪＣＰ７４９９、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）Ｓ２７、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）ＵＣＣ２００３、ビフィドバクテリウム・カリトリコス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃａｌｌｉｔｒｉｃｈｏｓ）、ビフィドバクテリウム・カテヌラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ）、ビフィドバクテリウム・カテヌラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ）ＤＳＭ１６９９２＝ＪＣＭ１１９４、ビフィドバクテリウム・コエリヌム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｅｒｉｎｕｍ）、ビフィドバクテリウム・コエリヌム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｅｒｉｎｕｍ）ＤＳＭ２０４３４、ビフィドバクテリウム・コアギュランス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、ビフィドバクテリウム・インディクム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｉｎｄｉｃｕｍ）、ビフィドバクテリウム・カシワノヘンス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｋａｓｈｉｗａｎｏｈｅｎｓｅ）、ビフィドバクテリウム・カシワノヘンス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｋａｓｈｉｗａｎｏｈｅｎｓｅ）ＪＣＭ１５４３９、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）３＿１＿３７ＤＦＡＡＢ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）ＡＧＲ２１３７、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）ＢＯＲＩ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）Ｄ２９５７、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）ＤＪＯ１０Ａ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）ＮＣＣ２７０５、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種インファンティス（Ｉｎｆａｎｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種インファンティス（Ｉｎｆａｎｔｉｓ）１５７Ｆ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種インファンティス（Ｉｎｆａｎｔｉｓ）ＡＴＣＣ１５６９７＝ＪＣＭ１２２２、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種インファンティス（Ｉｎｆａｎｔｉｓ）ＣＣＵＧ５２４８６、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（Ｌｏｎｇｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）１−６Ｂ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）２−２Ｂ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）３５Ｂ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）４４Ｂ、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＡＴＣＣ５５８１３、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＢＢＭＮ６８、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＣＥＣＴ７３４７、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＣＭＣＣ Ｐ０００１、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）Ｆ８、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＪＣＭ１２１７、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＪＤＭ３０１、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種ロンガム（ｌｏｎｇｕｍ）ＫＡＣＣ９１５６３、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）亜種スイス（Ｓｕｉｓ）、ビフィドバクテリウム・マグヌム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｇｎｕｍ）、ビフィドバクテリウム・マグヌム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｇｎｕｍ）ＤＳＭ２０２２２、ビフィドバクテリウム・コリネフォルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｏｒｙｎｅｆｏｒｍｅ）、ビフィドバクテリウム・クルジラクチス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｒｕｄｉｌａｃｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・クニクリ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｕｎｉｃｕｌｉ）、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｅｎｔｉｕｍ）、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｅｎｔｉｕｍ）ＡＴＣＣ２７６７８、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｅｎｔｉｕｍ）ＡＴＣＣ２７６７９、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｅｎｔｉｕｍ）Ｂｄ１、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｅｎｔｉｕｍ）ＪＣＭ１１９５、ビフィドバクテリウム・デンティウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｅｎｔｉｕｍ）ＪＣＶＩＨＭＰ０２２、ビフィドバクテリウム・ガリクム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｇａｌｌｉｃｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ガリクム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｇａｌｌｉｃｕｍ
）ＤＳＭ２００９３、ビフィドバクテリウム・ガリナルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、ビフィドバクテリウム・シミエ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｉｍｉａｅ）、ビフィドバクテリウム・ステレンボシェンス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｔｅｌｌｅｎｂｏｓｃｈｅｎｓｅ）、ビフィドバクテリウム・ステルコリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ）、ビフィドバクテリウム・サブチル（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｕｂｔｉｌｅ）、ビフィドバクテリウム・サブチル（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｕｂｔｉｌｅ）ＤＳＭ２００９６、ビフィドバクテリウム・メリチクム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｅｒｙｃｉｃｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ミニマム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｉｎｉｍｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ミニマム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｉｎｉｍｕｍ）ＤＳＭ２０１０２、ビフィドバクテリウム・モンゴリエンス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｏｎｇｏｌｉｅｎｓｅ）、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ）、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ）Ｄ２ＣＡ、ビフィドバクテリウム・シュードカテヌラツム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ）ＤＳＭ２０４３８＝ＪＣＭ１２００、ビフィドバクテリウム・シュードロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｌｏｎｇｕｍ）、ビフィドバクテリウム・シュードロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｌｏｎｇｕｍ）ＡＧＲ２１４５、ビフィドバクテリウム・シュードロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｌｏｎｇｕｍ）亜種グロボサム（Ｇｌｏｂｏｓｕｍ）、ビフィドバクテリウム・シュードロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｅｕｄｏｌｏｎｇｕｍ）亜種シュードロンガム（Ｐｓｅｕｄｏｌｏｎｇｕｍ）、ビフィドバクテリウム・サイクラエロフィルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｓｙｃｈｒａｅｒｏｐｈｉｌｕｍ）、ビフィドバクテリウム・プロラム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｕｌｌｏｒｕｍ）、ビフィドバクテリウム・プロラム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｕｌｌｏｒｕｍ）ＡＴＣＣ４９６１８、ビフィドバクテリウム・ロイテリ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ビフィドバクテリウム・ルミナンチウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ）、ビフィドバクテリウム・サエクラレ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓａｅｃｕｌａｒｅ）、ビフィドバクテリウム・サグイニ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓａｇｕｉｎｉ）、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｃａｒｄｏｖｉｉ）、ビフィドバクテリウム・スカルドビイ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｃａｒｄｏｖｉｉ）ＪＣＭ１２４８９、ビフィドバクテリウム・サーマシドフィルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｅｒｍａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｍ）、ビフィドバクテリウム・サーマシドフィルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｅｒｍａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｍ）亜種ポルシヌム（Ｐｏｒｃｉｎｕｍ）、ビフィドバクテリウム・サーマシドフィルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｅｒｍａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｍ）亜種サーマシドフィルム（Ｔｈｅｒｍａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｍ）、ビフィドバクテリウム・サーモフィルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｍ）、ビフィドバクテリウム・サーモフィルム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｍ）ＲＢＬ６７、ビフィドバクテリウム・ツルミエンス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｓｕｒｕｍｉｅｎｓｅ）、ビフィドバクテリウム・ツルミエンス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｓｕｒｕｍｉｅｎｓｅ）ＤＳＭ１７７７７、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．を含むが限定されないビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属由来である。
ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）Ｍ−１６Ｖ、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）株ＨＮ０１９、Ｂｉ−０７、Ｂｌ−０４およびＢ４２０、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）亜種ラクチス（ｌａｃｔｉｓ）株Ｂｆ−６、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）株ＢＢ５３６およびビフィドバクテリウム・ラクチス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ）株Ｂｂ１２。
別の実施形態において、細菌は、カルノバクテリウム・アルテルフンディツム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｌｔｅｒｆｕｎｄｉｔｕｍ）、カルノバクテリウム・ディバージェンス（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｉｖｅｒｇｅｎｓ）、カルノバクテリウム・フンディツム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｕｎｄｉｔｕｍ）、カルノバクテリウム・ガリナルム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、カルノバクテリウム・インヒベンス（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｉｎｈｉｂｅｎｓ）、カルノバクテリウム・ジェオトガリ（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｊｅｏｔｇａｌｉ）、カルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）、カルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）３８ｂ、カルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）ＡＴＣＣ３５５８６、カルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）ＬＭＡ２８、カルノバクテリウム・モビレ（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｏｂｉｌｅ）、カルノバクテリウム・プレイストセニウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｌｅｉｓｔｏｃｅｎｉｕｍ）、カルノバクテリウム・ビリジアンス（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｖｉｒｉｄｉａｎｓ）、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．「エイラチクム（ｅｉｌａｔｉｃｕｍ）０２１２１１」、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．１１−１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．１２２６６／２００９、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．１３−３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．１７−４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．２２−６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．２６７３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．２７Ｌ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．３５Ｌ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．３７−３−１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．３８ＡＮＡＶ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．４０Ｌ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．７１９６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ａ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ａ２Ｓ１０Ｌ１４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ａ４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ａ７２６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ａＧ５３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＡＲＣＴＩＣ−Ｐ２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＡＲＣＴＩＣ−Ｐ２６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＡＲＣＴＩＣ−Ｐ３５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＡＴ１２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＡＴ７、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｂ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｂ５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＢＡ−８ｌ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＢＢＤＰ５４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＢＢＤＰ７１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＢＭ−８、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＢＭ−８ｌ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｃ−１３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ｃ５８、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ｃＧ５３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓＰ．ＣＭ１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｄ３５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｄ４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｄ５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＥＫ−ｌ５３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＥＳ−１１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＦＢＴ１−１９、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＦＢＴ１−２２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＦＢＴ３−１４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＦＢＴ３−９、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＦＢＴ４−１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＦＢＴ４−１８、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｇ１５１６Ｊ１Ｌ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｇ４ａ−１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｇ５ａ−１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＧＣＭ１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｈ１２６ａ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｈｇ４−０３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｉ−Ｂｈ２０−１４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｉ−Ｂｈ４−２６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＫＡ−２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＫＡ−８、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＫＨ１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＫＯＰＲＩ８０１４２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＫＯＰＲＩ８０１５３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＫＯＰＲＩ８０１５５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｌ０２−６１２７、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＬＩＶ１０、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＬＭＧ２６６４２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＬＶ６２：Ｗ１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＬＶ６６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｍ７−Ｃ１０、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＭＡＲＬ１５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＭＫＪ３７、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＮＦＵ３５−２５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＮＪ−４６、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｒ−３６９８２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＲＩ２３４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓ１７１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓ１８１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｄ５ｔ１８、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｄ５ｔ５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｄ６ｔ１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｄ６ｔ１５、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｄ６ｔ１７、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｄ６ｔ１８、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＳＲ２−３１−Ｉ、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｓｔ２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｔ３０１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＵＩ４９、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＵＰＡＡ７７、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＵＳＴ０５０４１８−６５２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＦＰＩＳ００１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＮ１３５９、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＮ１３７０、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＮ１３７１、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＮ１３７２、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＮ１３７３、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．ＷＮ１３７４、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．Ｙ６、カルノバクテリウム・ディバージェンス（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｄｉｖｅｒｇｅｎｓ）、カルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）、カルノバクテリウム・ピスチコラ（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｉｓｃｉｃｏｌａ）、カルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）株ＣＢ１（生存能があり、熱処理）およびカルノバクテリウム・マルタロマチクム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍａｌｔａｒｏｍａｔｉｃｕｍ）株ＣＢ１を含むが限定されないカルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属由来である。
別の実施形態において、細菌は、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）７＿４、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）Ｄ３、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）ＤＳＭ２０２８４、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）ＭＡ１８／５Ｍ、ペディオコッカス・アルジェンチニクス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｒｇｅｎｔｉｎｉｃｕｓ）、ペディオコッカス・セリコラ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｃｅｌｌｉｃｏｌａ）、ペディオコッカス・クラウッセニイ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｃｌａｕｓｓｅｎｉｉ）、ペディオコッカス・クラウッセニイ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｃｌａｕｓｓｅｎｉｉ）ＡＴＣＣ ＢＡＡ−３４４、ペディオコッカス・ダムノサス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｄａｍｎｏｓｕｓ）、ペディオコッカス・ダムノサス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｄａｍｎｏｓｕｓ）９−６ｂ、ペディオコッカス・エタノリドゥランス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｅｔｈａｎｏｌｉｄｕｒａｎｓ）、ペディオコッカス・イノピナツス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｏｐｉｎａｔｕｓ）、ペディオコッカス・ロリイ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｌｏｌｉｉ）、ペディオコッカス・ロリイ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｌｏｌｉｉ）ＮＧＲＩ０５１０Ｑ、ペディオコッカス・パルブルス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｒｖｕｌｕｓ）、ペディオコッカス・パルブルス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｒｖｕｌｕｓ）ＣＩＲＭ７５０、ペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ）、ペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ）ＡＴＣＣ２５７４５、ペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ）ＩＥ−３、ペディオコッカス・シアメンシス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｓｉａｍｅｎｓｉｓ）、ペディオコッカス・スチレシイ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｓｔｉｌｅｓｉｉ）、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．１４．８．１７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＢＧＭ５９、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＢＺ−２００５、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＣＡＴ−１００ＢＣ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＣＲ−６Ｓ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＣＲＡ５１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＥＤＢ−ＬＩ４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ｅｐｓｉ２−ＭＳＥ−Ｅ３−２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ｅｐｓｉ３１−ＭＳＥ−Ｅ３−２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＦＵＡ３１３７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＦＵＡ３１４０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＦＵＡ３２２６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＧＳ４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＩＢＵＮ１８６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＩＥ３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＩＪ−Ｋ１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｊ−１１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＫＤＬＬＬ３−１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｌ０４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＬＡＢ４０１２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｌａｃｔ１０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＬＱＣ１９５３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＬＱＣ１９５７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＬＱＣ１９６３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＬＱＣ１９６６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＬＱＣ１９７２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＢ２Ｃ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＢ２Ｄ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＦＣ１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＭＺ６０Ａ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＵＵ１０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＵＵ１３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＵＵ２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＵＵ３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＭＵＵ４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０６００４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０６０１４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０６０１５、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０６０２８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０６０３２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７１７８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７１８６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７１９３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２１３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２１８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２２１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２２２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２４４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２５０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２５６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２６０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２６４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７２９９、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３０６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３０９、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３１０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３３１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３４３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３４６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＢＲＣ１０７３５０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＩＲ１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＮＩＲ３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．オメガ４１−ＦＨ−Ｅ３−２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐ１４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐｏｍ３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐｏｍ４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐｏｍ７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐｏｖ５、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐｏｖ７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｐｏｖ８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＣＨ−４２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＣＨ−６６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＣＨ−６７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−０３Ｇ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−０６ＣＨ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−０７Ｇ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−１１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−２１ＢＣ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−２３ＢＣ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−２４ＢＣ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＱＭＡ−２７ＢＣ、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｒｒｔ８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｒｒｔ９、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｒｒｖ１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｒｒｖ３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｓ１７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｓ１８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＳＤ２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．シャーサバル（Ｓｈａｈｓａｖａｒ）、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ｓｉｇａ１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｔ１Ｒ１Ｃ２３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｔ１Ｒ４Ｃ２４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｔｅ６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−０２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−０４、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−０９、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１０、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１１、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１２、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−１８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−２３、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−２５、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−２６、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＣＯ−２８、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．ＹＸＣ−１７、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）ｓｐ．Ｚ−１７、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）株ＮＰ３、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）、ペディオコッカス・アシジラクチシ（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ａｃｉｄｉｌａｃｔｉｃｉ）、ペディオコッカス・パルブルス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐａｒｖｕｌｕｓ）およびペディオコッカス・ペントサセウス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ ｐｅｎｔｏｓａｃｅｕｓ）を含むが限定されないペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）属由来である。
ある実施形態において、本明細書中で列挙されるか、さもなければ病原性であり、および／または日和見病原性の種であることが知られている細菌はすべて除外される。別の実施形態において、形質転換のためにおよび本組成物中に含めようと選択される細菌は、本明細書中で列挙される細菌属の何れか１つ、または本明細書中で列挙される特定の細菌種の何れか１つ、または本明細書中で列挙される第一および第二の細菌の何れかの群である。
ある実施形態において、本組成物での使用のための細菌は、皮膚、特にヒト皮膚上に存在可能な何らかの細菌であり、より特定には、ヒト皮膚上に常在する細菌であり、病原性および／または日和見性細菌を除くＧＲＡＳ細菌である。
ある実施形態において、本組成物は、形質転換細菌の集団および関心のある化合物を発現するように形質転換されていない細菌の集団を含み、例えば本組成物は、形質転換細菌集団および天然のまたはプロバイオティック細菌から構成される。細菌の複数の集団を含む組成物であって、各集団が、個々の細胞がそれぞれ複数の関心のある化合物を発現することができるかまたは個々の細胞がそれぞれ１つの化合物を発現するような、異なる関心のある化合物の発現のための個々の形質転換細菌の一群であり、関心のある異なる分子を発現する異なる個体の一群が異なる関心のある化合物を発現するか、またはある１つの集団が形質転換され、ある１つの集団が形質転換されていないもの、も企図される。ある実施形態において、本組成物は、対象への局所適用のために配合される形質転換細菌の第一および第二の集団を含む。ある実施形態において、第二の形質転換細菌の集団は、（ｉ）組成物中の第一の形質転換細菌集団とは異なる非病原性細菌から生成されるかまたは（ｉｉ）組成物中で第一の形質転換細菌集団により発現される第一の関心のある化合物とは異なる関心のある化合物を発現するように形質転換されているかの何れかまたはその両方である。
細菌は、生きている、弱毒化されている、半活性または不活性化または死細菌の形態で本組成物中に含まれ得る。ある特定の実施形態によると、これらの細菌は、生細菌の形態で使用され、それらが配合される組成物の局所適用時に関心のある化合物を慢性的に発現することが可能である。これらはまた、細胞構成成分の分画の形態または代謝産物の形態でも含まれ得る。細菌種、関心のある分子または分画はまた、培養上清の、採取された化合物の、凍結乾燥粉末の形態および／または適切な場合は濃縮形態でも導入され得る。
ある変法によると、本組成物は、２価無機陽イオンも含有し得る。本組成物は、選択される投与方法に対して通常利用可能なガレノス製剤（ｇａｌｅｎｉｃａｌ ｆｏｒｍｓ）の形態の何れかであり得る。（ある実施形態においては皮膚細菌である）細菌により合成される活性分子は、細菌中に留まり得るかまたは皮膚の外に分泌されるかの何れかであり得る。
制限因子は、細菌増殖を調節し得る。このような制限因子は、皮膚上に天然に存在し得、ある実施形態においては、処置しようとする対象に局所適用しようとする組成物中に含まれ得る。１以上の制限因子が本処方物中に含まれ得る。別の実施形態において、組成物を富化し、栄養分を与えるために、およびそれを活性であるかまたは生きているように保つために、石鹸、ボディーウォッシュ、シャンプー、ローションなどの補完製品に制限因子が添加される。制限因子についての例としては、アミノ酸、ビオチン、ニコチンアミドおよびチアミン、パントテン酸塩、リボフラビン、葉酸、ケラチン、脂質、乳酸塩およびメラニンが挙げられる。好ましい制限因子はアミノ酸Ｌ−アラニンであり得る。細菌増殖は、細菌周期を制限するための複製起点の機構によって制御され得る。細菌周期は、５０サイクルに制限され得るかまたは細菌周期は、２から４０サイクルに制限され得る。細菌増殖の制限はまた、ｐＨおよび温度のような物理的環境因子によっても達成され得る。
Ｂ．代表的な関心のある化合物
上述のように、本組成物に対して選択される細菌種は、関心のある化合物を発現させるための公知の組換え技術を用いて形質転換される。化合物が使用される、皮膚障害または状態または目的の指摘とともに、代表的な関心のある化合物を下記の表で列挙する。
Figure 2015525800
ある実施形態において、紫外線からの皮膚の保護における使用のための組成物が企図される。すなわち、この組成物は、日焼け止め剤としての使用のためのものであり、一般的には３２０から４００ｎｍの波長の紫外線Ａ波、一般的には３１５から２８０ｎｍの波長の紫外線Ｂ波を吸収または反射するかまたはＵＶＡおよびＵＶＢの両方を吸収および／または反射するものである。本組成物中の形質転換細菌は、次の群１、群２、群３、群４、群５、群６、群７、群８、群９、群１０、群１１および群１２の代表的な関心のある化合物のうち１以上を発現する：
群１−ミコスポリン、ガズソール、オキソ−ミコスポリン、イミノ−ミコスポリンおよびミコスポリン様アミノ酸（ＭＡＡ；グリコシル化またはオリゴ糖に共有結合される、オリゴ糖−連結ＭＡＡ）；および／または細胞内または細胞外ガズソール、デオキシガズソール、４−デオキシガズソール（Ｓ２）、シノリン、ポルフィラ−３３４、パリチン、パリテン、アステリナ−３３０、パリチノール、ミコスポリン−グリシン、ミコスポリンセリノール、ミコスポリン−タウリン、ミコスポリン−グリシン−バリン、ミコスポリン−２−グリシン、ミコスポリン−グリシン−グルタミン酸、ミコスポリン−グルタミン酸−グリシン、ミコスポリン−メチルアミン−セリン、ミコスポリン−メチルアミン−スレオニン、ウスジレン、デヒドロキシルウスジレン、プレイテニン酸（ｐｌａｙｔｈｅｎｉｃ ａｃｉｄ）−３３７、プレイテニン酸（ｐｌａｙｔｈｅｎｉｃ ａｃｉｄ）−３３５、パリチン−セリン、パリチン−スレオニン、パリチン−スレオニン−サルフェート、プレイチン（ｐｌａｙｔｈｉｎｅ）−セリン−サルフェート、オイハロテセ、ミコスポリン−アラニン（２−（ｅ）−２，３−ジヒドロキシプロ−１−エニルイミノ−ミコスポリン−アラニン）；
群２−スキトネミン；
群３−メラニン：オイメラニン−（またはジヒドロキシフェニルアラニン（ＤＯＰＡ）メラニン）、フェオメラニンアロメラニン、ピオメラニン、ドーパメラニン、ニューロメラニン；
群４−ＵＶ−スクリーニング／観察アミノ酸様分子：ウロカニン酸；
群５−フラボノイド：アントシアニンおよびアントキサンチン、アントシアニジン；
群６−ベタラニン：ベタシアニン、ベタキサンチン；
群７−ＭＡＡとの配列類似性を有する分子：デヒドロキネートシンターゼ相同体（ＤＨＱＳ相同体、ＡＴＰ−ｇｒａｓｐ；
群８−ＵＶ−スクリーニング／観察色素：カロテノイド／カルテノタンパク質（ｃａｒｔｅｎｏｐｒｏｔｅｉｎ）、カロテン、リコピン、キサントフィル、ルチン（ｌｕｔｉｎ）、ゼアキサンチン、ポルフィリンベース／ヘム−ポルフィリンベース、クロロフィル−ＩＩ；
群９−ＵＶ−スクリーニング／観察補因子、例えばテトラヒドロビオプテリンおよびビオプテリンなど；
群１０−フェニルプロパノイド；
群１１−タンニン：フロロタンニン、ジエコール、エコール；および
群１２−サルガキン酸、サルガクロメノール、スフェロホリン（デプシド）、パンナリン（デプシドン）；
群１３−ＵＶへの曝露により引き起こされる損傷を修復するＤＮＡ修復酵素、例えばフォトリアーゼ、エンドヌクレアーゼおよびＤＮＡグリコシラーゼなど。
ある実施形態において、関心のある化合物は、群１から１３の何れか１つにおいてのみ列挙される化合物のうち何れか１つである。
別の実施形態において、美容または抗加齢組成物としての使用のための、酸化ストレスの緩和をもたらすことにおける使用のための組成物が企図される。本組成物は、抗酸化組成物として、ＵＶ曝露からの緩和をもたらし得る。本組成物中の形質転換細菌は、群１、群２、群３、群４、群５、群６および群７における次の代表的な関心のある化合物のうち１以上を発現する：
群１−チロシナーゼ（およびその基質および産物）；
群２−アルファヒドロキシ酸（ＡＨＡ）：グリコール酸、乳酸およびクエン酸；
群３−多糖類：グリコサミノグリカン、（ＧＡＧ）、ムコ多糖類、ヒアルロナン（ヒアルロン酸またはヒアルロン酸塩またはＨＡとも呼ばれる。）；
群４−皮膚関連補因子：ビタミンＣまたはＬ−アスコルビン酸または単純にアスコルビン酸塩、ビタミンＡ、ビオプテリン、コエンザイムＡ（ＣｏＡ、ＣｏＡＳＨまたはＨＳＣｏＡ）、コエンザイムＱ１０（ユビキノン、ユビデカレノン、コエンザイムＱ、ＣｏＱ１０）、モリブドプテリン；
群５−ビタミンＥ：アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ−トコフェロール、アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ−トコトリエノール；
群６−ポリマー：ポリオール、グリセロール；
群７−さらなる皮膚関連天然化合物、例えばコラーゲン、ケラチン、エラスチン、リノール酸、ラミニン、トレチノイン、タザロテン、サルガキン酸、サルガクロメノール、フコキサンチン、レチノイド、抗炎症サイトカイン（ＩＬ−２など）、コルチゾン、タクロリムス、シクロスポリン、レスベラトロール、ガロカテコール、ガロカテキンおよび没食子酸エピガロカテキンなど。
他の実施形態において、活動性の皮膚炎、ざ瘡、火傷、虫刺され、蕁麻疹、ふけおよび体臭を処置することにおける使用のための組成物が企図される。当業者は、これらの状態の処置のために形質転換細菌中で発現させようとする関心のある化合物を同定し得る。
上記の表で列挙される化合物の配列との配列類似性を有する化合物も企図され、同一の化合物とみなされ得る。２つの配列のヌクレオチドまたはアミノ酸残基の配列がそれぞれ下記のように最大対応となるように並べられたときに少なくとも４０％の類似性を有する場合、この２つの配列は、「実質的に同一である、および同一である」と言われる。あるいは、パーセント同一性は、２０％から１００％の何らかの整数であり得る。より好ましい実施形態は、下記のような、標準的パラメーターを用いたＢＬＡＳＴなどの本明細書中に記載のプログラムを用いて、参照配列（例えば配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１８）と比較して、少なくとも：２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８または９９％を含む。この定義はまた、試験配列が参照配列と実質的な同一性を有する場合、試験配列の相補体も指す。
上記表で列挙される化合物のタンパク質のドメインの配列に対して配列類似性がある保存的タンパク質ドメインを有する化合物もまた企図され、同一化合物としてみなされ得る。
配列比較の場合、一般的には一方の配列を参照配列とし、それに対して試験配列を比較する。配列比較アルゴリズムを用いた場合、試験および参照配列をコンピュータに入力し、必要に応じて部分列座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。デフォルトプログラムパラメータを使用してもよいし、または代替パラメータを指定してもよい。次に、配列比較アルゴリズムは、プログラムパラメータに基づき、参照配列と比較して、試験配列についてパーセント配列同一性を計算する。
比較のための配列のアラインメントの方法は当技術分野で周知である。プログラムの使用の場合、相同性／同一性を決定するために（Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎにより提供される）次のプログラムが使用され得る：デフォルトパラメータとともに使用され得る、ＢＬＡＳＴ、ギャップ付きＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴＮおよびＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ。Ｗａｔｅｒｍａｎ、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ、Ｐｅａｒｓｏｎのアルゴリズムなどであるが限定されない当技術分野で公知の様々な方法によって、または手動アラインメントおよび目視検査によって、比較のための配列の最適アラインメントを行い得る。
遺伝コードの縮重ゆえに、多数の機能的に同一である核酸が、何らかの一定のタンパク質をコードする。当業者は、関心のある化合物のコードを可能にするように、コードされる配列において１個のアミノ酸またはごく一部のアミノ酸を変更、付加または欠失する、核酸、ペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質配列に対する個々のコドン使用を認識する。
当然のことながら、同じであるかまたは別の障害または状態の処置を対象とした既存の局所組成物と組み合わせて、本組成物を使用し得る。例えば、日焼け止め剤としての使用のための本明細書中に記載の組成物は、二酸化チタン（ＴｉＯ２）、酸化亜鉛（ＺｎＯ）、パラ−アミノ安息香酸、アボベンゾン、ブチルメトキシジベンゾイルメタン、エンスリゾール、２−フェニルベンズイミダゾール−５−スルホン酸、ホモサラート、サリチル酸ホモメンチル（ｈｏｍｏｍｅｎｔｈｙｌｓａｌｉｃｙｌａｔ）、メラジメート（ｍｅｒａｄｉｍａｔｅ）、メンチル２−ミノベンゾエート、メンチルアントラニレート、オクチノキセート、メンチル２−ミノベンゾエート メンチルアントラニレート、オクチサレート、２−エチルヘキシルサリチレート、サリチル酸オクチル、オクトクリレン、２−エチルヘキシル−２−シアノ−３，３ジフェニルアクリレート、オキシベンゾン、ベンゾフェノン−３、２−ヒドロキシ−４−メトキシベンゾフェノン、スリソベンゾン、ベンゾフェノン−４、ドロメトリゾールトリシロキサン、メキソリルＸＬ、エンザカメン（ｅｎｚａｃａｍｅｎｅ）、４−メチルベンジリデンカンファー、パジメート−Ｏ、オクチルジメチルＰＡＢＡ、σ−ＰＡＢＡ、テレフタリリデンジカンファースルホン酸、メキソリルＳＸ、３，３’−（１，４−フェニレンジメチリデン）ビス［７，７−ジメチル−２−オキソビシクロ［２．２．１］ヘプト−１−イルメタンスルホン酸）、シノキセート、２−エトキシエチル３−（４−メトキシフェニル）プロペノエート、ジエタノールアミン−メトキシシンナメート、ジオキシベンゾン、ベンゾフェノン−８、（２−ヒドロキシ−４−メトキシフェニル）−（２−ヒドロキシフェニル）メタノン、サリチル酸トリエタノールアミンおよびサリチル酸トロラミンを含む公知の日焼け止め剤製品と組み合わせて使用され得る。
関心のある化合物をコードする核酸配列が当業者によって同定され得、いくつかの例を本明細書中で示す：
配列番号１ シノリンオペロンに対するＤＮＡ配列；
配列番号２ シノリンｎｏｓｔｏｃに対するＤＮＡ配列；
配列番号３ アミノ酸アデニル化＿Ａｖａ＿３８５５に対するＡＡ配列；
配列番号４ ＡＴＰ−ｇｒａｓｐ酵素様タンパク質＿Ａｖａ＿３８５６に対するＡＡ配列；
配列番号５ Ｏ−メチルトランスフェラーゼ、ファミリー３＿Ａｖａ＿３８５７に対するＡＡ配列；
配列番号６ ３−デヒドロキネートシンターゼ＿Ａｖａ＿３８５８に対するＡＡ配列；
配列番号７ ＤＮＡ Ａｖａ＿３８５８＿３＿デヒドロキネートシンターゼ；
配列番号８ ＤＮＡ スペーサー１＿４８０４１２８＿４８０３９５３；
配列番号９ ＤＮＡ Ａｖａ＿３８５７＿Ｏ−メチルトランスフェラーゼ；
配列番号１０ ＤＮＡ スペーサー２＿４８０３１１４＿４８０３０９９；
配列番号１１ ＤＮＡ Ａｖａ＿３８５６＿ＡＴＰ−ｇｒａｓｐ酵素様タンパク質；
配列番号１２ ＤＮＡ スペーサー３＿４８０４１２８＿４８０３９５３；
配列番号１３ ＤＮＡ Ａｖａ＿３８５５＿アミノ酸アデニル化；
配列番号１６ シノリン＿オペロンに対する、ＤＮＡフォワード＿プライマー；
配列番号１７ シノリン＿オペロンに対する、ＤＮＡリバース＿プライマー；および
配列番号１８ チロシナーゼに対するＤＮＡ配列。
Ｃ．組み換え分子技術
本明細書中で列挙されるかまたはそうでなければ当技術分野で公知の細菌種の何れかの形質転換のための技術は、熟練者により理解される。いくつかの技術は、簡潔に本明細書中に記載されており、１．モジュール構造；２．ベクタータイプ；３．発現および印象技術の向上；４．挿入物の発現および検証；および５．形質転換を含め、このような技術において考慮すべき因子をここで論じる。
１．モジュール構造
形質転換細菌株は、組み換えタンパク質の技術分野で公知の何らかの方法により産生する、細胞工場またはビヒクルとみなされ得（本明細書中に参照により組み込まれる米国特許第４，２５９，４４４号）、一般的には関心のある化合物をコードする単離核酸分子の適切なベクターへのクローニングが含まれる。発現ベクターは、個別の条件における各構成成分の独立の設計および全ての必須エレメントの容易な交換を可能にする、モジュール構造で確立される。このようなモジュールベクターにおいて、必須エレメントとしては、一般的には、ＮＩＣＥ系のように、いくつかの系で示されるように（Ｍｉｅｒａｕ ＩおよびＫｌｅｅｒｅｂｅｚｅｍ Ｍ．，Ａｐｐｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．６８：７０５−１７（２００５）または潜在性のプラスミドに基づき（Ｓｈａｒｅｃｋ Ｊ．ら、Ｃｒｉｔ Ｒｅｖ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２４：１５５−２０８（２００４）、レプリコン、プロモーター（構成的または調節系を伴い誘導性）、関心のある遺伝子、マーカーまたはレポーター、耐性または制限因子、マルチクローニング部位（ＭＣＳ）、シャイン・ダルガーノ（リボソーム結合部位）およびターミネーターが挙げられる。
必要に応じて、プロモーター配列、ターミネーター断片、ポリアデニル化配列、エンハンサー配列および他の配列を含む、適切な調節配列を含有する適切なベクターを選択するかまたは構築し得る。配列がリボソーム結合部位および翻訳開始コドンを含む上述のもののように、さらなる配列が付加され得る。
適切な細菌発現ベクターは、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ：第２版、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓに記載のように、当業者にとって公知であり、Ｗａｎｇ Ｔ．Ｔ．およびＬｅｅ Ｂ．Ｈ．，Ｐｌａｓｍｉｄｓ ｉｎ Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ．Ｃｒｉｔ Ｒｅｖ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：２２７−７２（１９９７）による、および具体的には食品工業におけるＮｇｕｙｅｎ Ｔ．Ｔ．ら、Ｊ Ａｇｒｉｃ Ｆｏｏｄ Ｃｈｅｍ．５９：５６１７−２４（２０１１）によるもののように、ＬＡＢ株に対する発現ベクターを示すいくつかの研究がある。
関心のある分子の適切な発現のための、様々な組み合わせで骨格プラスミドのモジュール配置を可能にするベクターの代表的な必須の構成要素を下記の表で挙げる：
Figure 2015525800
モジュール構造は、細菌宿主細胞によるコード配列の発現が可能な構築物である。特にこのようなベクターは、例えばＳｔｅｉｄｌｅｒ Ｌ．ら、Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２１（７）：７８５−７８９（２００３）に記載のものまたはＰｅｒｅｚ−Ａｒｅｌｌａｎｏ Ｉ．ら、Ｐｌａｓｍｉｄ ４６：１０６−１６（２００１）によるものなど、発現ベクターまたは染色体組み込みベクターの何れかである。
細菌の形質転換のためのベクターは、熟練者により設計され得る。一例は、図１に、配列番号１５中の配列として、配列番号１４におけるような制限酵素とともに示す。ある実施形態において、ベクターは、使用中の細菌株に対して適合性の骨格複製起点、関心のある分子の発現のための適合性のプロモーターおよび適合性の耐性遺伝子を含有する。プラスミドは制限酵素の配列を含有し得る。
２．ベクタータイプ
４種類の主要なタイプのベクターは、プラスミド、ウイルスベクター、コスミドおよび人工染色体である。全ての改変ベクターに共通するものは、複製起点、マルチクローニング部位および選択可能マーカーである。これらの何れも、本明細書中での使用に適切である。
関心のある分子についての配列コードは、クローン、ベクター、シャトル、プラスミド、ＢＡＣに挿入され得るかまたは細菌ゲノムにも組み込まれ得る。
プラスミドのコピー数は、１細胞あたり５から５００コピー数であり得る。
代表的なプラスミドおよび発現ベクターとしては、ｐ２５２、ｐ２５６、ｐ３５３−２（Ｌｅｅｒら．１９９２）、ｐ８０１４−２、ｐＡ１、ｐＡＣＹＣ、ｐＡＪ０１、ｐＡＩ−由来（ＶｕｊｃｉｃおよびＴｏｐｉｓｉｒｏｖｉｃ １９９３）、ｐａＩＩ、ｐＡＭ−ベータ１、２、３、５、８（ｓｉｍｏｎおよびｃｈｏｐｉｎ １９８８）、ｐＡＲ１４１１、ｐＢＧ１０、ｐＢＫ、ｐＢＭ０２、ｐＢＲ３２２、ｐＢＲ３２８、ｐＢＳ−ｓｌｐＧＦＰ、ｐＣ１９４（ＭｃＫｅｎｚｉｅら、１９８６，１９８７；ＨｏｒｉｎｏｕｃｈｉおよびＷｅｉｓｂｌｕｍ １９８２ｂ）、ＰＣ１９４／ＰＵＢ１１０、ｐＣ３０ｉ１、ｐＣ３０ｉＩ（Ｓｋａｕｇｅｎ １９８９）、ｐＣＤ０３４−１、ｐＣＤ０３４−２、ｐＣＤ２５６、ｐＣＩ２０００、ｐＣＩ３０５、ｐＣＩ５２８、ｐＣＩＳ３、ｐＣＬ２．１、ｐＣＴ１１３８、ｐＤ１２５、ｐＥ１９４、ｐＥ１９４／ＰＬＳ１、ｐＥＧＦＰ−Ｃ１、ｐＥＨ、ｐＦ８８０１、ｐＦＧ２、ｐＦＫ−シリーズ、ｐＧＫ−シリーズ、ｐＧＫ１２、ｐＧＫ１３、ｐＩＡ、ｐＩＡＶ１、５、６、７、９、ｐＩＬ．ＣａｔＴ、ｐＩＬ２５２／３、ｐＩＬ２５３、ｐＩＬ７、ｐＩＳＡ（Ｅ．コリ（ｅ．ｃｏｌｉ）に対して低い）、ｐＪＷ５６３、ｐＫＲＶ３、ｐＬＡＢ１０００（Ｊｏｓｓｏｎら．１９９０）、ｐＬＢ４（ＢａｔｅｓおよびＧｉｌｂｅｒｔ １９８９、ｐＬＢＳ、ｐＬＥ１６、ｐＬＥＢ１２４、ｐＬＥＢ５９０、ｐＬＥＢ５９１、ｐＬＥＢ６００、ｐＬＥＢ６０４、ｐＬＥＰ２４Ｍｃｏｐ、ｐＬＪ１（Ｔａｋｉｇｕｃｈｉら．１９８９）、ｐＬＫＳ、ｐＬＴＫ２、ｐＷＣＦＳ１０１およびｐＭＤ５０５７（ＢａｔｅｓおよびＧｉｌｂｅｒｔ、１９８９；Ｓｋａｕｇｅｎ，１９８９；Ｌｅｅｒら、１９９２；ＶｕｊｃｉｃおよびＴｏｐｉｓｉｒｏｖｉｃ，１９９３；Ｅｇｕｃｈｉら、２０００；Ｋａｎｅｋｏら、２０００；Ｄａｎｉｅｌｓｅｎ，２００２；Ｄａｍｉｎｇら、２００３；ｄｅ ｌａｓ Ｒｉｖａｓら、２００４；ｖａｎ Ｋｒａｎｅｎｂｕｒｇら、２００５）、ｐＬＰ１／１８／３０、ｐＬＰ１８、ｐＬＰ３１７、ｐＬＰ３１７ｃｏｐ、ｐＬＰ３５３７、ｐＬＰ３５３７ｘｙｌ、ｐＬＰ４０２、ｐＬＰ８２５、ｐＬＰ８２５およびｐＬＰＥ３２３、ｐＬＰ８２Ｈ、ｐＬＰＣ３７、ｐＬＰＥ２３Ｍ、ｐＬＰＥ３２３、ｐＬＰＥ３５０、ｐＬＰＩ（Ｂｏｕｉａら、１９８９）、ｐＬＳ１、ｐＬＳ１およびｐＥ１９４（Ｌａｃｋｓら、１９８６；ＨｏｒｉｎｏｕｃｈｉおよびＷｅｉｓｂｌｕｍ １９８２ａ）、ｐｌｕｌ６３１、エリスロマイシン耐性遺伝子を有するＬ．ロイテリ（ｒｅｕｔｅｒｉ）からのｐＬＵＬ６３１、ｐＭ３、ｐＭ４、ｐＭＤ５０５７、ｐＭＧ３６ｅ、ｐＮＤ３２４、ｐＮＺ−シリーズ、ｐＰＳＣシリーズ、ｐＳＨ７１（ｄｅ ｖｏｓ、１９８７）、ｐＳＩＰ−シリーズ、ｐＳＫ１１Ｌ、ｐＳＬ２、ＰＳＮ２、ｐＳＮ２（ＫｈａｎおよびＮｏｖｉｃｋ １９８２）、ｐＴ１８１（Ｋｏｅｐｓｅｌら、１９８７）、（ＫｈａｎおよびＮｏｖｉｃｋ １９８３）、ｐＴ１８１、ｐＣ１９４およびｐＥ１９４は、Ｂ．サブチリス（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）において機能せず（Ｇｒｕｓｓら、１９８７）、ｐＴ１８１、ｐＥ１９４／ｐＬＳ１、ｐＣ１９４／ｐＵＢ１１０およびｐＳＮ２（Ｋｈａｎ、２００５）、ｐＴＬ、ｐＴＲＫファミリー、ｐＴＲＴファミリー、ｐＴＵＡＴ３５、ｐＵＢＩＩ０およびｐＣ１９４（ＭｃＫｅｎｚｉｅら、１９８６、１９８７；ＨｏｒｉｎｏｕｃｈｉおよびＷｅｉｓｂｌｕｍ １９８２ｂ）、ｐＵＣＬ２２、ｐＵＬＰ８／９、ｐＶＳ４０、ｐＷＣ１、ｐＷＣＦＳ１０１、ｐＷＶ０２、ｐＷＶ０４、ｐＷＶ０５、ＲｅｐＡ、系ＢｅｔＬが挙げられるが限定されない。
ある実施形態において、ラクトースホスホトランスフェラーゼ系は、場合によってはＥ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）バクテリオファージＴ７プロモーター；Ｌ．ラクチス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ）ｎｉｓＡプロモーター系；例えば低ｐＨでのみ活性があるＰ１７０プロモーターなど、環境条件により調節されるプロモーターを含むベクターに連結される。別の代表的なベクターは、コスミド、ラムダファージｃｏｓ配列を含有するハイブリッドプラスミド（クローニングベクターとして使用されることが多い）（ｃｏｓ部位＋プラスミド＝コスミド）である。ＤＮＡ配列は、元来ラムダファージ由来であり、ゲノムライブラリを構築するためにコスミドを使用し得る。別の例は、細菌人工染色体（ＢＡＣ）であり、これは、細菌、通常はＥ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）における形質転換およびクローニングのために使用される、機能的な稔性プラスミド（またはＦ−プラスミド）に基づくＤＮＡ構築物である。プロモーター配列、ターミネーター断片、ポリアデニル化配列、エンハンサー配列、マーカー遺伝子および適切な場合は他の配列を含む、適切な調節配列を含有する、適切なベクターが選択されるかまたは構築され得る。適切な細菌発現ベクターは、Ｎｏｕａｉｌｌｅ Ｓ．ら、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２：１０２−１１１（２００３）およびＭａｎｉａｔｉｓ，ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＦｒｉｔｓｃｈ．１９８２，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌに記載のように当業者にとって公知である。
３．発現および発現技術の向上
異種発現という用語は、例えば細胞、または核酸、タンパク質またはベクターに対して、関心のあるタンパク質または遺伝子が、そのタンパク質を通常は産生しない（すなわち発現しない）細胞に実験的に挿入されることを意味し、異種核酸またはタンパク質の導入またはネイティブ核酸またはタンパク質の改変により、細胞、核酸、タンパク質またはベクターが修飾されていること、または細胞がそのように修飾された細胞由来であることを示唆する。したがって、例えば、組み換え細胞は、ネイティブ（非組み換え）型の細胞内で見られない遺伝子を発現するか、またはそうでなければ異常に発現されるか、発現不足であるかまたは全く発現されないネイティブ遺伝子を発現する。また、核酸は、一般的に組み換え産生され、新しい機能的核酸を作製するように配置される非関連遺伝子からの２以上の配列、例えば、ある１つの起源由来のプロモーターおよび別の起源由来の関心のある分子に対するコード領域を有し得る。
宿主細胞中で特定の核酸の転写を可能にする一連の特定の核酸エレメントを有する、組み換え産生されるかまたは合成される核酸は、「発現カセット」と呼ばれる。発現カセットは、プラスミド、ウイルスまたは核酸断片の一部であり得る。一般的には、発現ベクターは、プロモーターに操作可能に連結される、転写させようとする核酸を含む。
さらに、発現カセットは、本発明の関心のある化合物の発現および局在を調節するための様々な構成成分を含み得る。例えば、発現カセットは、プロモーターエレメント、シグナル配列をコードする配列、関心のある化合物に対するコード配列、ターミネーターおよびアンカー配列を含み得る。
プロモーター−関心のある異種化合物の発現は構成的または誘導性であり得る。使用しようとするプロモーターは、例えば、誘導性ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）ｌａｃプロモーター、ＬｄｈＬ、Ｓｌｐ、ｅｒｎＢ、ｏｒｆＸであり得るか、または人工的に構成的であり得る（Ｒｕｄ Ｉ．ら、Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，１５２：１０１１−９２（２００６）。
プロモーターの例は、モジュール構築の表で列挙しており、例えば、Ｐ５９（ｖａｎ ｄｅｒ Ｖｏｓｓｅｎら、Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５８：３１４２−３１４９（１９９２））、Ｐ２３（Ｅｌｌｉｏｔら、Ｃｅｌｌ ３６：２１１−２１９（１９８４））プロモーター）、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）Ｌ（＋）−ラクテートデヒドロゲナーゼプロモーター（Ｐｏｕｗｅｌｓら、１９９３、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ｏｆ ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｉ：ｐｌａｓｍｉｄｓ ａｎｄ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，Ａｎｔｏｎｉｅ ｖａｎ Ｌｅｅｕｗｅｎｈｏｅｋ ６４：８５−１０７）、バチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）アミラーゼのプロモーター（Ｗｅｉｃｋｅｒｔら、Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．１７１：３６５６−６６（１９８９））またはキシロース（Ｋｉｍら．Ｇｅｎｅ １８１：７１−７６（１９９６））プロモーターであり得るが限定されず、またラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）ナイシンプロモーター（Ｅｉｃｈｅｎｂａｕｍら、Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．６４：２７６３−２７６９（１９９８））は誘導性発現を駆動するために使用され得る。さらなるプロモーターは、ラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）フルクトース−１，６−ジホスフェートアルドラーゼの発現を制御するｐ３２プロモーター（Ｖａｎ ｄｅ Ｇｕｃｈｔｅら、１９９０，Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５６：２６０６−２６１１）、Ｔ７遺伝子１０プロモーター（Ｗｅｌｌｓら、１９９３、Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．８：１１５５−１ １６２）、ラクトバチルス・アミロビルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｖｉｒｕｓ）のアルファアミラーゼプロモーター配列（Ｐｏｕｗｅｌｓら、１９９３，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ｏｆ ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｉ；ｐｌａｓｍｉｄｓ ａｎｄ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，Ａｎｔｏｎｉｅ ｖａｎ Ｌｅｅｕｗｅｎｈｏｅｋ ６４：８５−１０７）およびＬｄｈＬ、Ｓｌｐ、ｅｒｍＢ、ｏｒｆＸ、ｐ６（ｐＬＡ６）、ｐＬＴ７１、Ｔ７、ｐ１１、ｌａｃＴｐ、ｄｌｔｐ、ｃｃｐＡｐ、ｐｌｐの発現を制御するプロモーターおよび、Ｋｉｍ ＪＨおよびＭｉｌｌｓ ＤＡ．Ｐｌａｓｍｉｄ．５８：２７５−８３（２００７）により示されるような、ｌａｃプロモーター、ＬｄｈＬ、Ｓｌｐ、ｅｒｎＢ、ｏｒｆＸのような、誘導性ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）であり得る。
分子生物学的方法、核酸およびクローン構築、突然変異誘発、配列決定、細胞へのＤＮＡの導入およびタンパク質の分析を含め、発現を向上させるためのいくつかの組み換え技術、またはエレメントのクローニングおよび発現は公知であり、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，１９９２およびＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ：第２版、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓで詳述されている。また、より良好な発現のためにプロモーターの数およびそれらの長さを設定することが可能である（Ｙａｇｕｒ−Ｋｒｏｌｌ Ｓ．ら、Ｂｉｏｅｎｇ Ｂｕｇｓ，２０１０ １：１５１−３（２０１０）。
レプリコンの複製の機構は、ＲＣＲ機構のものであり得るか、またはシータ−複製プラスミドによるものであり得る。耐性遺伝子は、抗生物質、細菌マーカー、熱ショックまたは糖利用能、例えば：チミジル酸シンターゼ（ｔｈｙＡ）、ラクトースホスホトランスフェラーゼ（ｌａｃＦ）、ホスホ−β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＧ）またはアラニンレセマーゼ（ｒｅｃｅｍａｓｅ）（ａｌｒ）に基づくものであり得るが限定されない。ターミネーターは、より効率的な発現をもたらすために異なる位置で付加され得る。様々なシグナルおよびアンカー配列は、膜、細胞外腔または細胞壁へのポリペプチドの発現を指令することが知られている（例えばペプチドグリカンへの共有結合による）。
所望の遺伝子を含むことに加えて、細菌による関心のある分子の所望の発現の生成を促進する他の配列エレメントをコードするために微生物を操作することもできる。このような配列エレメントとしては、細菌中でタンパク質の構成的または誘導性発現を促進するかまたはタンパク質の過剰発現を促進するプロモーター／調節配列が挙げられるが限定されない。さらなる配列エレメントにはまた、細菌からのタンパク質の分泌、細菌内でのタンパク質の蓄積、および／または細菌からタンパク質を放出させるための細菌のプログラム化された溶菌を促進するものも含まれ得る。上記で言及される配列エレメントの多くは当業者にとって公知である（Ｍａｎｉａｔｉｓ、ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＦｒｉｔｓｃｈ．１９８２．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ）。
４．挿入物の発現および検証
異種遺伝子の発現は、バイオテクノロジー、特に工業的食品発酵において広く使用されており、風味、質感および保存に寄与している。
デノボシーケンス解析により、またはＰＣＲ増幅により、ベクター中で配列が挿入され得る。ＤＮＡポリメラーゼはＤＮＡ鋳型上の各塩基でその塩基と相補的であるヌクレオチドのみを組み込むので、ＤＮＡ配列が高い忠実度でコピーされる場合は、キャピラリー電気泳動法により、またはサンガー配列決定技術（Ｓａｎｇｅｒら（１９７４））に基づき、デノボ合成が行われる。水素結合を互いに形成し得るので、チミン（Ｔ）はアデニン（Ａ）に相補的であり、グアニン（Ｇ）はシトシン（Ｃ）に相補的である。
例えばＷａｌｌａｃｅら、Ｇｅｎｅ １６：２１−２６（１９８１）の２本鎖鋳型の配列決定を行うための連鎖停止法を用いて、クローニング後に、クローニングされた遺伝子および合成配列の配列を検証し得る。
本発明の関心のある化合物をコードする遺伝子を同定するための適切なプライマーおよびプローブは、当技術分野で記載の配列由来であり得る。ＰＣＲの全般的な概説については、Ｉｎｎｉｓら、ＰＣＲ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ：Ａ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，サンディエゴ（１９９０）を参照。
宿主細菌で発現される関心のある分子の濃度は、０．１ｍＭから１００ｍＭまで様々であり得る。この濃度は、様々なパラメータ、例えば細菌濃度、プラスミドのコピー数、プロモーターの活性および関心のある分子のキネティクスなどにより制御され得る。
関心のある化合物の公知の配列は、本明細書中でより詳細に記載されるように、市販のデータベースにおいて同定され得る。
ベクター内の関心のある分子の代表的な配列は、ＵＶをスクリーニングする分子をコードする遺伝子を伴うものである。特に、１００から５００ｎｍの範囲のＵＶをスクリーニングする分子をコードする遺伝子が企図される。ベクター内の関心のある分子に対する配列は、ＵＶにより生じる酸化ストレスを軽減する分子；抗酸化剤、抗活性酸素種（抗ＲＯＳ）をコードする遺伝子など、酸化ストレスを軽減する分子をコードする遺伝子を伴うものである。関心のある遺伝子をコードする配列はシアノバクテリア（Ｃｙａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）ｓｐ．由来のｓｃｙＡ−Ｆであり得る。シノリンなどの日焼け止め化合物は、サンゴ（スチロホラ・ピスタラータ（Ｓｔｙｌｏｐｈｏｒａ ｐｉｓｔａｌｌａｔａ））、魚（スカルス・スクレゲリ（Ｓｃａｒｕｓ ｓｃｈｌｅｇｅｌｉ）およびクロルルス・ソルジズス（Ｃｈｌｏｒｕｒｕｓ ｓｏｒｄｉｄｕｓ））、アルゲア（ａｌｇｅａ）（ポルフィラ・ウムビリカリス（Ｐｏｒｐｈｙｒａ ｕｍｂｉｌｉｃａｌｉｓ））、ミクロアルゲア（ｍｉｃｒｏａｌｇｅａ）および、細菌から、例えばシアノバクテリウム・ノストク（ｃｙａｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ Ｎｏｓｔｏｃ）ｓｐｐ．、（ノストク・フラジェリホルム（Ｎｏｓｔｏｃ ｆｌａｇｅｌｌｉｆｏｒｍｅ）またはノストク（Ｎｏｓｔｏｃ）ｓｐ．ＰＣＣ７５２４のようなもの）リングビア（Ｌｙｎｇｂｙａ）ｓｐｐ．、アナベナ（Ａｎａｂａｅｎａ）ｓｐｐ．およびノズラリア（Ｎｏｄｕｌａｒｉａ）ｓｐｐ．ノストク・パンクチホルム（Ｎｏｓｔｏｃ ｐｕｎｃｔｉｆｏｒｍｅ）ＰＣＣ７３１０２アナベナ（Ａｎａｂａｅｎａ）ｓｐ．、アナベナ・バリアビリス（Ａｎａｂａｅｎａ ｖａｒｉａｂｉｌｉｓ）、アナベナ・シリンドリカ（Ａｎａｂａｅｎａ ｃｙｌｉｎｄｒｉｃａ）ＰＣＣ７１２２、シアノテス（Ｃｙａｎｏｔｈｅｃｅ）ｓｐ．ＰＣＣ７４２４、シアノテス（Ｃｙａｎｏｔｈｅｃｅ）ｓｐ．ＰＣＣ８８０２、リブラリア（Ｒｉｖｕｌａｒｉａ）ｓｐ．ＰＣＣ７１１６、クロオコクシディオプシス・サーマリス（Ｃｈｒｏｏｃｏｃｃｉｄｉｏｐｓｉｓ ｔｈｅｒｍａｌｉｓ）ＰＣＣ７２０３、シリンドロスペルマム・スタグナーレ（Ｃｙｌｉｎｄｒｏｓｐｅｒｍｕｍ ｓｔａｇｎａｌｅ）ＰＣＣ７４１７、スタニエリア・シアノスフェラ（Ｓｔａｎｉｅｒｉａ ｃｙａｎｏｓｐｈａｅｒａ）ＰＣＣ７４３７、クリナリウム・エピプサムマム（Ｃｒｉｎａｌｉｕｍ ｅｐｉｐｓａｍｍｕｍ）ＰＣＣ９３３３、クリナリウム・エピプサムマム（Ｃｒｉｎａｌｉｕｍ ｅｐｉｐｓａｍｍｕｍ）ＰＣＣ９３３３、アナベナ（Ａｎａｂａｅｎａ）ｓｐ．９０染色体ｃｈＡＮＡ０１、グロエオカプサ（Ｇｌｏｅｏｃａｐｓａ）ｓｐ．ＰＣＣ７４２８、クロログロエオプシス・フリツシイ（Ｃｈｌｏｒｏｇｌｏｅｏｐｓｉｓ ｆｒｉｔｓｃｈｉｉ）、トリコデスミウム・エリスラエウム（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｓｍｉｕｍ ｅｒｙｔｈｒａｅｕｍ）ＩＭＳ１０１、ミクロシスティス・エルギノーサ（Ｍｉｃｒｏｃｙｓｔｉｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）ＰＣＣ７８０６、ミクロシスティス・エルギノーサ（Ｍｉｃｒｏｃｙｓｔｉｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）株ＵＶ０２７、プランクトスリクス・ルべセンス（Ｐｌａｎｋｔｏｔｈｒｉｘ ｒｕｂｅｓｃｅｎｓ）ＮＩＶＡ−ＣＹＡ９８、ミクロシスティス（Ｍｉｃｒｏｃｙｓｔｉｓ）ｓｐ．ＮＩＶＡ−ＣＹＡ１７２／５、ノストク（Ｎｏｓｔｏｃ）ｓｐ．ＧＳＶ２２４またはオスシラトリア・ニグロ−ビリディス（Ｏｓｃｉｌｌａｔｏｒｉａ ｎｉｇｒｏ−ｖｉｒｉｄｉｓ）ＰＣＣ７１１２のようなものから得られ得る。
ある実施形態において、関心のある化合物の発現のための配列は細菌のゲノムに組み込む。
プラスミドのコピー数は、１細胞あたり５から５００の間のコピー数であり得る。プロモーターは構成的または誘導性であり得る。
ある実施形態において、関心のある分子の精製を可能にするために、ベクターにＤＮＡおよびＨｉｓタグ様のアミノ酸エレメントを付加することが可能である。ｕｓｐ４５様のエレメントを付加することも可能であり、これは膜の外から関心のある分子を働かせるようにする。
ある実施形態において、関心のある分子をより良好に発現させるためにコドン使用を改善し得る。また、発現ベクターのＧＣ％を変化させるかおよび／または減少させ得る。
ある実施形態において、ベクターは制限因子を含むか、または別の実施形態において、相同組み換えを介して細菌ゲノムに制限因子が組み込まれる。
５．形質転換
形質転換技術に関して、例えばそれらの形質転換能、異種タンパク質発現能に対して、適切な細菌宿主株が選択される。細菌宿主は、塩化ルビジウム法またはエレクトロポレーションなど、標準的な技術を用いた形質転換について受容性にされる（Ｍａｎｉａｔｉｓ，ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＦｒｉｔｓｃｈ．１９８２．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ）。
本明細書中で以後、実験部分においてＬＡＢ株の形質転換のための特定の方法が提供されるが、当技術分野で公知の技術の例示であり、限定するものではない。
エレクトロポレーションによるラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）の形質転換は、例えば、Ｌｕｃｈａｎｓｋｙら（Ｊ．Ｄａｉｒｙ Ｓｃｉ．７４：３２９３−３３０２（１９９１）に記載されるような標準的方法を改変することによって行われ得る。簡潔に述べると、新鮮接種ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）ｓｐｐ．をＭＲＳブロス中で培養する（例えば３７℃および５％ＣＯ２で、ＯＤ６００で０．４から０．８まで）。細菌細胞を採取し、洗浄し、スクロースおよびＭｇＣｌ２の冷（例えば４℃）溶液中で再懸濁する。次に、コンピーテント細胞をＤＮＡと混合し、冷却したギャップキュベットに入れ、エレクトロポレーション処理する。後で、抗菌性の他の選択剤を含有する選択寒天プレート上にプレーティングする前に、予め温めた（例えば３７℃で約２時間）ブロス中で細胞を回収する。
ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）におけるエレクトロポレーションの最適化：これらの膣のラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）株におけるクローニングおよび異種タンパク質発現を支援するために、皮膚細菌への適用のためのエレクトロポレーション法を開発した。発明者らのコレクション中のＷＴラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）株に対する形質転換頻度を向上させる条件を決定するために、培養液、細胞増殖段階、ＤＮＡ濃度、洗浄またはエレクトロポレーション緩衝液組成、キュベットギャップサイズおよび電圧を含む様々なパラメータを評価した。改変を加えたＬｕｃｈａｎｓｋｙら（Ｊ．Ｄａｉｒｙ Ｓｃｉ．７４：３２９３−３０２（１９９１））によるエレクトロポレーションによってラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）株にＥ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）由来のプラスミドを形質転換した。簡潔に述べると、３７℃および５％ＣＯ２で、ＭＲＳブロス中で新鮮接種ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）株をＯＤ６００で０．６から０．７に培養した。細菌細胞を採取し、洗浄し、４℃で９５２ｍＭスクロースおよび３．５ｍＭ ＭｇＣｌ２中で再懸濁した。予め冷却した０．２ｃｍギャップキュベットを用いて、１から２μｇのプラスミドＤＮＡとともにコンピーテント細胞を添加し、２．５ｋＶ／ｃｍおよび２００オームですぐにエレクトロポレーション処理した。後に、２０μｇ／ｍＬエリスロマイシンとして抗生物質を含有する選択ＭＲＳ寒天プレート上にプレーティングする前に、３７℃で２時間にわたり予め温めたＭＲＳブロス中で細胞を回収した。
６．採取
遺伝子操作により、様々な発現された異種の所望タンパク質の様々な細胞株における過剰産生が可能となる。皮膚細菌から生物学的組み換え分子を過剰発現させ、回収し、所望の分子を採取することは、バイオテクノロジー産業の本質であり、当業者にとって公知である（Ｅｕｇｅｎｅ Ｒｕｓｓｏ，Ｎａｔｕｒｅ，４２１ ４５６−４５７（２００３）。
細菌から抽出された分子は、ＵＶ防御のためのような皮膚科学的有益性のために使用される。
採取手順は、細菌細胞をビーズで破砕するような機械的なもの、またはリゾチームを使用することによって細菌細胞を化学的に破壊するものを含み得る。
発現された分子の単離は、５％から９０％など、様々なクリーニングレベルであり得、分子および化学技術、例えばＨＰＬＣ、ＨＩＳ−タグにより使用され得、当業者にとって公知であり得る。
採取される化合物の濃度は、抽出前のバイオマスの１から５０％であり得る。
細菌細胞および／または細菌細胞の粒子を含む様々な化合物を抽出物中で溶解するかまたは懸濁し得る。最終抽出物は、リポタンパク質、リポペプチド、ペプチドグリカン、リポオリゴ糖、リポタイコ酸およびタイコ酸を含み得る。溶菌過程中、細菌細胞中の分子は、化学的に修飾されるようになり得る。ｐＨ、出発体積および温度のような様々なパラメータは、採取率を向上させるための範囲であり得る。
Ｄ．代表的な局所組成物
細菌の形質転換された非病原性集団は、対象の皮膚に対する局所適用用に配合される。制限するものではないが、代表的な実施形態の目的のために、本処方物がゲル、軟膏、ローション、エマルジョン、クリーム、フォーム、ムース、液体、スプレー、縣濁液、分散液またはエアロゾルであり得ることが企図される。本処方物は、皮膚への効果的な適用、被覆および接着のための、所望の形態および所望の粘度、流動性または他の物理学的または化学的特徴を提供するために１以上の賦形剤を含む。
本処方物中の賦形剤は、意図される処方物のタイプに基づき選択される。標準的な賦形剤としては、ゼラチン、カゼイン、レシチン、アラビアゴム、コレステロール、トラガカント、ステアリン酸、塩化ベンザルコニウム、ステアリン酸カルシウム、モノステアリン酸グリセリル、セトステアリルアルコール、セトマクロゴール乳化ろう、ソルビタンエステル、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンヒマシ油誘導体、ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル、ポリエチレングリコール、ステアリン酸ポリオキシエチレン、コロイド状二酸化ケイ素、リン酸塩、ドデシル硫酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロースカルシウム、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチセルロースフタレート、非結晶性セルロース、ケイ酸マグネシウムアルミニウム、トリエタノールアミン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、糖およびデンプンが挙げられる。
エマルジョンは、ある１種類の液体が第二の液体の主要部全体に小さな球状物で分布する調製物である。分散された液体は不連続相であり、分散媒は連続相である。油が分散液であり、水溶液が連続相である場合、これが水中油エマルジョンとして知られる一方、水または水溶液が分散相であり、油または油性物質が連続相である場合、これは油中水エマルジョンとして知られる。油相は、少なくとも一部、ＨＦＡ噴霧剤などの噴霧剤からなり得る。油相および水相の何れかまたは両方が、１以上の界面活性剤、乳化剤、エマルジョン安定化剤、緩衝液および他の賦形剤を含有し得る。好ましい賦形剤としては、界面活性剤、特に非イオン性界面活性剤；乳化剤、特に乳化ワックス；および液体非揮発性非水性材料、特にグリコール、例えばプロピレングリコールなどが挙げられる。油相は、他の油性の医薬的に承認された賦形剤を含有し得る。例えば、ヒドロキシル化ヒマシ油またはゴマ油などの材料は、界面活性剤または乳化剤として油相中で使用され得る。
「皮膚軟化剤」は皮膚を軟化するかまたは鎮静化する外用薬剤であり、当技術分野で一般に知られており、「Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ」，第４版、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐｒｅｓｓ，２００３などの概論に列挙されている。これらには、扁桃油、ヒマシ油、セラトニア抽出物、セトステアロイルアルコール、セチルアルコール、セチルエステルワックス、コレステロール、綿実油、シクロメチコン、パルミトステアリン酸エチレングリコール、グリセリン、モノステアリン酸グリセリン、モノオレイン酸グリセリル、ミリスチン酸イソプロピル、パルミチン酸イソプロピル、ラノリン、レシチン、軽鉱油、中鎖トリグリセリド、鉱油およびラノリンアルコール、ペトロラタム、ペトロラタムおよびラノリンアルコール、ダイズ油、デンプン、ステアリルアルコール、ヒマワリ油、キシリトールおよびそれらの組み合わせが含まれるが限定されない。ある実施形態において、皮膚軟化剤はステアリン酸エチルヘキシルおよびパルミチン酸エチルヘキシルである。
「界面活性剤」は、界面張力を低下させ、それにより生成物の乳化、発泡、分散、拡散および湿潤特性を向上させる表面活性剤である。適切な非イオン性界面活性剤としては、乳化ワックス、モノオレイン酸グリセリル、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンヒマシ油誘導体、ポリソルベート、ソルビタンエステル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、シクロデキストリン、モノステアリン酸グリセリン、ポロキサマー、ポビドンおよびそれらの組み合わせが挙げられる。ある実施形態において、非イオン性界面活性剤はステアリルアルコールである。
「乳化剤」は、ある１つの液体の別の液体中での懸濁を促進する界面活性物質であり、油および水の安定な混合物またはエマルジョンの形成を促進する。一般的な乳化剤は、金属石鹸、ある一定の動物および植物油および様々な極性化合物である。適切な乳化剤としては、アカシア、陰イオン性乳化ワックス、ステアリン酸カルシウム、カルボマー、セトステアリルアルコール、セチルアルコール、コレステロール、ジエタノールアミン、パルミトステアリン酸エチレングリコール、モノステアリン酸グリセリン、モノオレイン酸グリセリル、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒプロメロース、ラノリン、含水、ラノリンアルコール、レシチン、中鎖トリグリセリド、メチルセルロース、鉱油およびラノリンアルコール、リン酸一塩基性ナトリウム、モノエタノールアミン、非イオン性乳化ワックス、オレイン酸、ポロキサマー、ポロキサマー類、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンヒマシ油誘導体、ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル、ステアリン酸ポリオキシエチレン、アルギン酸プロピレングリコール、自己乳化モノステアリン酸グリセリル、クエン酸ナトリウム二水和物、ラウリル硫酸ナトリウム、ソルビタンエステル、ステアリン酸、ヒマワリ油、トラガカント、トリエタノールアミン、キサンタンガムおよびそれらの組み合わせが挙げられる。ある実施形態において、乳化剤はステアリン酸グリセロールである。
「ローション」は低から中程度の粘度の液体処方物である。ローションは、縣濁剤および分散剤の使用を通じて分散媒中で不溶性である微粉状物質を含有し得る。あるいは、ローションは、分散相としてビヒクルと非混合性であり、通常は乳化剤または他の適切な安定化剤により分散される液体物質を有し得る。ある実施形態において、ローションは、１００から１０００センチストークの粘度を有するエマルジョンの形態である。ローションの流動性により、広い表面積にわたり迅速で均一な適用が可能となる。ローションは、一般的には、皮膚表面上の薬用構成成分の薄いコーティングを残して皮膚上で乾燥するものである。
「クリーム」は、「水中油」または「油中水タイプ」の何れかの粘性のある液体または半固形エマルジョンである。クリームは、乳化剤および／または他の安定化剤を含有し得る。ある実施形態において、本処方物は、１０００センチストークを超える、一般的には２０，０００から５０，０００センチストークの範囲である粘度を有するクリームの形態である。クリームは、一般に、より拡散し易く、除去し易いので、軟膏よりも好ましいことが多い。
クリームとローションとの間の基本的な差は粘度であり、これは様々な油の量／使用および処方物を調製するために使用される水のパーセンテージに依存する。クリームは一般的にはローションより濃厚であり、様々な用途を有し得、しばしば、皮膚上の所望の効果に依存して、より様々な油／バターを使用する。クリーム処方物において、水ベースのパーセンテージは約６０から７５％であり、油ベースは、全部で約２０から３０％であり、他のパーセンテージは乳化剤、保存剤および添加物であり、全部で１００％となる。
「軟膏」は、軟膏基剤および場合によっては１以上の活性剤を含有する半固形調製物である。適切な軟膏基剤の例としては、炭化水素基剤（例えばペトロラタム、白色ペトロラタム、黄色軟膏および鉱油）；吸収基剤（親水性ペトロラタム、無水ラノリン、ラノリンおよびコールドクリーム）；水分除去基剤（例えば親水性軟膏）および水溶性基剤（例えばポリエチレングリコール軟膏）が挙げられる。ペーストは、それらが含有する固形物のパーセンテージがより大きいという点で一般的には軟膏とは異なる。ペーストは一般的に同じ成分で調製した軟膏よりも吸収性が高く、べとべと感が少ない。
「ゲル」は、液体ビヒクル中で溶解されるかまたは懸濁される増粘剤またはポリマー性材料の作用により固形物とされる、液体ビヒクル中の小分子または大分子の分散液を含有する半固形系である。この液体は、親油性構成成分、水性構成成分またはその両方を含み得る。一部のエマルジョンはゲルであり得るかまたは、そうでなければゲル構成成分を含む。しかし、一部のゲルは、非混合性構成成分の均一化混合物を含有しないので、エマルジョンではない。適切なゲル化剤としては、修飾セルロース、例えばヒドロキシプロピルセルロースおよびヒドロキシエチルセルロースなど；カルボポールホモポリマーおよびコポリマー；およびそれらの組み合わせが挙げられるが限定されない。液体ビヒクル中の適切な溶媒としては、ジグリコールモノエチルエーテル；アルクレン（ａｌｋｌｅｎｅ）グリコール、例えばプロピレングリコールなど；ジメチルイソソルビド；アルコール、例えばイソプロピルアルコールおよびエタノールなどが挙げられるが限定されない。溶媒は、一般的には、それらの薬物溶解能について選択される。処方物の皮膚の感触および／または柔軟性を改善する他の添加物も組み込まれ得る。このような添加物の例としては、ミリスチン酸イソプロピル、酢酸エチル、Ｃ１２−Ｃ１５アルキルベンゾエート、鉱油、スクアラン、シクロメチコン、カプリン／カプリルトリグリセリドおよびそれらの組み合わせが挙げられるが限定されない。
泡状物質は、ガス性の噴霧剤と組み合わせたエマルジョンからなる。ガス性噴霧剤は、主にヒドロフルオロアルカン（ＨＦＡ）からなる。適切な噴霧剤としては、１，１，１，２−テトラフルオロエタン（ＨＦＡ１３４ａ）および１，１，１，２，３，３，３−ヘプタフルオロプロパン（ＨＦＡ２２７）などのＨＦＡが挙げられるが、これらおよび現在承認されているかまたは医療での使用に対して承認されるようになり得る他のＨＦＡの混合物および混和物が適切である。噴霧剤は、好ましくは、噴霧中に可燃性または爆発性の蒸気を生成し得る炭化水素噴霧剤ガスではない。さらに、本組成物は、好ましくは使用中に可燃性または爆発性の蒸気を生成し得る揮発性アルコールを含有しない。
緩衝液は、組成物のｐＨを制御するために使用される。好ましくは、緩衝液は、ｐＨ約４からｐＨ約７．５、より好ましくはｐＨ約４からｐＨ約７、および最も好ましくはｐＨ約５からｐＨ約７である組成物を緩衝する。好ましい実施形態において、緩衝液はトリエタノールアミンである。
真菌および微生物の増殖を予防するために保存剤を使用し得る。適切な抗真菌および抗菌剤としては、安息香酸、ブチルパラベン、エチルパラベン、メチルパラベン、プロピルパラベン、安息香酸ナトリウム、プロピオン酸ナトリウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、ベンジルアルコール、塩化セチルピリジニウム、クロロブタノール、フェノール、フェニルエチルアルコールおよびチメロサールが挙げられるが限定されない。ある実施形態において、局所適用におけるその意図する目的に対して本組成物の有効性に影響を及ぼすことなく、真菌増殖を防ぐのに有効である保存剤の濃度が選択される。
浸透促進剤は、皮膚を横切る、特に角質層を横切る薬物の経皮送達を促進するために頻繁に使用される。一部の浸透促進剤は、皮膚刺激性、皮膚毒性および皮膚アレルギーを引き起こす。しかし、より一般的に使用されるものとしては、尿素、（カルボニルジアミド）、イミド尿素、Ｎ，Ｎ−ジエチルホルムアミド、Ｎ−メチル−２−ピロリジン、１−ドデカル−アザシクロフェプタン−２−オン、カルシウムチオグリケート、２−ピロリジン、Ｎ，Ｎ−ジエチル−ｍ−トルアミド、オレイン酸およびそのエステル誘導体、例えばメチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、ビニルおよびグリセリルモノオレイン酸エステル、ソルビタンエステル、例えばモノラウリン酸ソルビタンおよびモノオレイン酸ソルビタン、他の脂肪酸エステル、例えばラウリン酸イソプロピル、ミリスチン酸イソプロピル、パルミチン酸イソプロピル、アジピン酸ジイソプロピル、モノラウリン酸プロピレングリコール、モノオレイン酸プロピレングリコールおよび非イオン性デタージェント、例えばＢＲＩＪ（登録商標）７６（ステアリルポリ（１０オキシエチレンエーテル）、ＢＲＩＪ（登録商標）７８（ステアリルポリ（２０）オキシエチレンエーテル）、ＢＲＩＪ（登録商標）９６（オレイルポリ（１０）オキシエチレンエーテル）およびＢＲＩＪ（登録商標）７２１（ステアリルポリ（２１）オキシエチレンエーテル）（ＩＣＩ Ａｍｅｒｉｃａｓ Ｉｎｃ．Ｃｏｒｐ．）が挙げられる。
微生物は、少なくとも１０２コロニー形成単位（ｃｆｕ）から１０２０ｃｆｕ／ｃｍ２、特に１０５ｃｆｕから１０１２ｃｆｕ／ｃｍ２の有効量／単位用量（または／ｃｍ２）で送達され得る。Ｂａｌｓｋｕｓら（Ｓｃｉｅｎｃｅ ２０１０）に記載されるような方法に従い、ＵＶエレメントは、１０６ｃｆｕの場合、少なくとも０．５ｍＭから１ｍＭまで生成される。それに基づいて、当業者は、何らかの他の用量のｃｆｕで生成されるエレメントの範囲を計算し得る。
生物学的組成物は、処方物中で１以上の有益な化合物をさらに含み得、例えばＵＶ防御および化学的に（または生物学的に産生される）、ビタミンＡ添加を含み得る。
本組成物は、あらゆる公知の、またはそうでなければ選択される製品形態を配合または製造するために効果的な方法により調製され得る。ある実施形態において、本組成物は、鼻腔、膣、直腸、口腔面などの粘膜面を除くこととし、対象の皮膚表皮面への適用のために配合される。ある実施形態において、局所適用は、口腔ならびに身体の他の粘膜面を除外する。
本組成物は、関心のある化合物の所望の濃度を得るために特定の濃度で形質転換細菌を含むように配合され得る。例えば、本組成物は、微生物が、少なくとも約１０２コロニー形成単位（ｃｆｕ）から約１０２０ｃｆｕ／ｃｍ２、特に約１０２ｃｆｕから約１０２０ｃｆｕ／ｃｍ２の有効量／単位用量、（または／ｃｍ２）で送達され得るように、形質転換細菌の量を含み得る。本組成物は、組成物の総重量に対して、少なくとも約０．０００１％（乾燥重量により表す）の割合で、特に約０．０００１％から約９９％の割合で、より特定には約０．００１重量％から約９０重量％の割合で、特に約０．０１重量％から約８０重量％で、特に約０．１重量％から約７０重量％で形質転換細菌を用いて配合され得る。一般に、局所投与しようとする組成物は、生きている微生物の場合、約１０から約１０１５ｃｆｕ／ｇ、特に約１０５から約１０１５ｃｆｕ／ｇ、より特定には約１０７から約１０１２ｃｆｕ／ｇの微生物／ｇ（担体）を、または、不活性もしくは死滅微生物に対してまたは細菌分画に対して、または生成された代謝産物に対しては計算された同等用量を含み得る。ある実施形態において、局所投与しなければならない組成物、各細菌株および／または対応する分画および／または代謝産物の濃度は、約５ｘ１０５から約１０１５ｃｆｕ／ｄおよび特に約１０７から約１０１２ｃｆｕ／ｄの範囲の用量（細菌当量として表される）に対応するように調整され得る。局所適用のための組成物は、一般に約１０２から約１０１５ｃｆｕ／ｇ、特に約１０５から約１０１２ｃｆｕ／ｇおよびより特定には約１０６から約１０１２ｃｆｕ／ｇの細菌を含み得る。組成物が関心のある化合物を含む場合、組成物中の関心のある化合物の含有量は、約１０３から約１０１５ｃｆｕ、特に約１０５から約１０１２ｃｆｕおよびより特定には約１０６から約１０１２ｃｆｕの関心のある化合物／ｇ（担体）により生成可能な含有量に実質的に対応する。
ある実施形態において、ＵＶ防御のための皮膚への局所適用用の組成物が企図される。光による老化は、太陽からの紫外線への長期または繰り返し曝露の結果としての、皮膚の構造、機能および外観の変化である。これは男女両方における、加齢による皮膚の美容上の問題の９０％に及び、中等度から深刻な光老化徴候が３０歳未満の男性の７２％および女性の４７％で観察された。紫外線は、波長がより短く、エネルギーがより高い非可視領域スペクトルの光であり；これはおおよそ１５０ｎｍから４００ｎｍの範囲である。最大エネルギーＵＶ線の殆ど（２８０ｎｍ未満の波長のＵＶＣ線）は、オゾンおよび成層圏酸素により吸収される。２８０から３２０ｎｍの波長から構成されるＵＶＢ線および３２０から４００ｎｍの波長から構成されるＵＶＡ線は、生物において２つの顕著な損傷の原因である。ＤＮＡによるその吸収によって、体内の他のＤＮＡ、脂質およびタンパク質に損傷を与えるシクロブタンピリミジン２量体が生成されるので、ＵＶＢは、生物に特に有害である。これは皮膚癌の主要な原因である。ＵＶＡは、皮膚層により深く浸透するので生物に特に有害である。ある実施形態において本明細書中で企図される組成物は、ＵＶＡおよびＵＶＢの一方または両方から保護するために、１以上の関心のある化合物を発現させるための１以上の形質転換細菌を含む。本組成物は、化学物質（例えば、アミノ安息香酸（ＰＡＢＡ）、アボベンゾン、シノキセート、ジオキシベンゾン、エンスリゾール、ホモサラート、アントラニル酸メチル、メラジメート（ｍｅｒａｄｉｍａｔｅ）、オクトクリレン、メトキシけい皮酸オクチル、オクチサレート、サリチル酸オクチル、オクトクリレン、オキシベンゾン、パジメート−Ｏ、フェニルベンズイミダゾールスルホン酸、スリソベンゾンおよびミネラル：二酸化チタン、トロラミンサリチレート、酸化亜鉛）または物理的性質の何れかの既存の日焼け止め剤と組み合わせて皮膚に適用され得る。
形質転換細菌の組成物は、好ましくは、皮膚によるＵＶ吸収から防御する化合物を発現し、これは、シアノバクテリウム、真菌および藻類のような様々な生物により合成される、ＵＶ線を吸収する天然ミコスポリン様アミノ酸（ＭＡＡ）低分子であるシノリンであり得る。ある実施形態において、形質転換細菌の集団を含む組成物は、皮膚に適用される石鹸またはボディーウォッシュ組成物である。
微生物は、少なくとも約１０２コロニー形成単位（ｃｆｕ）から約１０２０ｃｆｕ／ｃｍ２、特に約１０２ｃｆｕから約１０２０ｃｆｕ／ｃｍ２の有効量／単位用量、（または／ｃｍ２）で送達され得る。関心のある化合物がＵＶ防御のためである実施形態において、ＵＶエレメントは、１０２から１０２０ｃｆｕの場合、少なくとも約０．１ｍＭから約１００ｍＭまで生成される。それに基づいて、当業者は、ｃｆｕの何らかの他の用量で生成されるエレメントの範囲を計算し得る。局所的に投与されなければならない組成物の特定の場合において、各細菌株および／または対応する分画および／または代謝産物の濃度は、（細菌当量として表される）約５ｘ１０５から約１０１５ｃｆｕ／ｄおよび特に約１０７から約１０１２ｃｆｕ／ｄの範囲の用量に対応するように調整され得る。
局所適用のための組成物は、一般に約１０２から約１０１５ｃｆｕ／ｇ、特に約１０５から約１０１２ｃｆｕ／ｇおよびより特定には約１０６から約１０１２ｃｆｕ／ｇの細菌を含み得る。
ある実施形態において、形質転換細菌が、ＵＶ損傷を防ぎ、体臭を改善し、獣医学的な皮膚科学的必要性に対処するために、イヌおよびネコを含む、ペットなどの動物の皮膚に適用される。
ＩＩＩ．処置の方法
別の態様において、皮膚に関連する障害または状態を処置または予防する方法が企図される。１以上の関心のある化合物を発現する形質転換細菌の１以上の集団を含む上記の組成物が、治療的有効量の関心のある化合物（複数も可）を提供するために有効な量で皮膚に適用される。本明細書中で使用される場合、治療的有効量は、患者または対象に投与される場合に、局所領域または局所組成物の適用の周辺において皮膚障害または状態を改善、除去および／または抑制する、局所組成物の量である。
ある実施形態において、日光曝露による損傷から皮膚を防御する方法が提供される。ＵＶにより引き起こされる酸化ストレスの緩和のための処置の方法、抗酸化剤、抗活性酸素種（抗ＲＯＳ））を提供する方法、皮膚保湿を提供するための方法、抗加齢を促進するための方法、および乾癬、湿疹、活動性の皮膚炎、ざ瘡、創傷治癒（糖尿病性創傷または潰瘍を含む）、間擦疹／おむつかぶれ、火傷、虫刺され、蕁麻疹、ふけ（鱗屑）を処置するための方法および悪臭防止または除去を提供するための方法が企図される。
ＩＶ．本組成物の包装
配合後、本組成物は、送達および最終使用者による使用に適切に包装される。
ある実施形態において、本組成物は、適切なディスペンサーに入れられ、最終使用者に出荷される。最終容器の例としては、ポンプボトル、スクイーズボトル、広口瓶、チューブ、カプセルまたはバイアルが挙げられ得る。
いくつかの実施形態において、包装は、組成物中における形質転換細菌の性質に留意する。例えば、呼吸を介して増殖させたラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｉ）は、発酵細胞よりも、長期間の保管後に顕著に良好に生存する（Ｇａｕｄｕら、Ａｎｔｏｎｉｅ ｖａｎ Ｌｅｅｕｗｅｎｈｏｅｋ，８２：２６３−２６９（２００２））。この長時間生存は、おそらく酸化ストレスから細胞を保護し得るチトクロムの誘導によるものである。酸化ストレスに対する防御機構でもある細胞内グルタチオンの存在の結果また、保管時のラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）の生存能も向上し得る（Ｌｉら、Ａｐｐｌ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ，６９（１０）：５７３９（２００３））。保管時のラクトコッカス属（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｉ）の生存能を向上させるための別のアプローチは、噴霧乾燥過程の調整および、細菌粒子を被覆するために使用され得る微結晶セルロース、カルボキシメチルセルロース、酢酸コハク酸ヒドロキシプロピルメチルセルロースまたはアルギン酸ナトリウムなどの加工助剤の使用に帰する（ＥＰ１７８９５２９ Ａ２）。ラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）に対するこれらの例は、熟練者が本明細書中に記載の細菌の何れかに対して識別し得る包装アプローチのタイプの実例となるものである。
別の実施形態において、本組成物中の細菌は、皮膚への適用の前または後の再構成のために凍結乾燥またはフリーズドライ処理される。ある実施形態において、形質転換細菌の保存可能期間を向上させるためにグリセロールまたは他の糖アルコールなどの１以上の賦形剤を用いて凍結乾燥またはフリーズドライ処理を行う。ある実施形態において、凍結乾燥組成物は、トレハロース（α−Ｄ−グルコピラノシル−１，１−α−Ｄ−グルコピラノシド）を含まない。
本組成物に対する包装は、１以上の容器のキット形態であり得る。例えば、単一のボトル、チューブ、容器またはカプセルは、２つの等量または等量でない部分に分割され得、１つの部分はそれらのパッキング形態で細菌を含有し（フリーズドライ／不活性など）、他方の部分は、液体またはゲルであり得る活性化材料を含有する。単一のボトルまたは容器は、最終使用者が、皮膚または他の表面上に形質転換細菌および活性化材料を施与するために、容器に単一力を適用して２つの容器部分中の内容物の全てまたは一部を分注し得るように設計され得る。本キットはまた、一方の容器は形質転換細菌の集団（複数も可）入りであり、他方は形質転換細菌の集団との混合のための処方物入りである、２以上の容器を含む形態でもあり得る。別の例では、一方の容器が形質転換細菌の集団入りであり、他方の容器が形質転換されていない天然の非病原性皮膚細菌入りであり、３番目の容器が形質転換細菌の集団との混合のための処方物入りである、２以上の容器である。別の例において、単一のボトルを構成する２以上の容器は、それぞれが異なるチャンバーから流出する、２本の個別のチューブに連結される１つのポンプを有した。本キットはまた、１以上の補完的生成物、例えばある一定のｐＨの、石鹸、ボディーウォッシュまたは保湿ローション、活性化合物、細菌および制限因子などを含有するローションまたはクリームなども含み得る。別の実施形態において、補完的生成物は、化合物の持続的または連続的発現を提供するために、関心のある化合物の、増殖、活性および／または発現を促進するであろう制限因子である。補完的生成物は、元の生成物の活性に有益である何らかの化合物を含み、持続的有効性のためにその活性を促進し得る。
別の企図される包装は、細菌を活性化させ、場合によっては再生／増殖因子も制限し得る包帯／フィルムの第二の層と組み合わせられる包帯またはフィルム上の層として形質転換細菌の集団が維持されるものである。
別の実施形態において、最終生成物は、活性状態である細菌とともに冷蔵保存され得る。
別の実施形態において、水溶性セルロースの小ビーズ中で細菌が保存される。このビーズを日焼け止め剤／保湿／ボディーウォッシュまたは石鹸などの何らかの溶液中で混合し得る。
ＩＩＩ．実施例
次の例は、実例となるものであり、何ら限定するものではない。
ベクターｐＢＴＯＰ１−シノリン１を用いたエレメントシノリンを有するラクトコッカス・ラクチス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔｉｓ）
Ａ．細菌
Ｌ．ラクチス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ）株の細菌が使用される。０．５％糖入りのＧＭ１７／Ｍ１７ブロス中５０％グリセロールにおいて−２０℃で株の保存溶液を保存する。０．５％糖入りのＧＭ１７培地／／Ｍ１７ブロス中でまたはＭＲＳ培地中で細菌を培養する。１６時間の温置後、遠心により細菌を採取し、２ｘ１０９細菌／１００μＬで、ＢＭ９培地で１０倍濃縮する。プレートまたは傾斜培地上で株は２から３週間生存する。
５ｍＬのブロスに傾斜培地からの細胞を接種することによって細菌の保存標品を調製する。細胞を３０℃で一晩増殖させる。次いで３ｍＬの完全増殖培養物を１ｍＬの６０％グリセロールに添加し、−８０℃で保存する。
Ｂ．ベクターへのゲノム組み込み
ｐＢＴＯＰ＿シノリンは、シノリンＤＮＡ配列（配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４）に対する完全オペロンを含有し、関心のある化合物の生成のために使用される。２種類の代表的な手順：分子クローニング手順（Ｂａｌｓｋｕｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ，３２９：１６５３−１６５６（２０１０））およびシノリンオペロンと一緒にプラスミド配列を合成するデノボシーケンス解析を使用して、シノリンのオペロンをベクター中で組み込んだ。
Ｂ１：分子クローニング
ゲノムアナベナ・バリアビリス（Ａｎａｂａｅｎａ ｖａｒｉａｂｉｌｉｓ）ＡＴＣＣ２９４１３からの増幅、アナベナ・バリアビリス（Ａｎａｂａｅｎａ ｖａｒｉａｂｉｌｉｓ）またはノストック（Ｎｏｓｔｏｃ）ｓｐｐの完全ゲノムによるデノボシーケンス解析またはアナベナ・バリアビリス（Ａｎａｂａｅｎａ ｖａｒｉａｂｉｌｉｓ）の増殖培養物からの増幅など、いくつかのソースからシノリンの配列を得ることができる。Ｂａｌｓｋｕｓら（前出）に記載されるような方法によれば、フォワードプライマーａｖａ３８５８−ｓｔａｒｔ１（ＮｄｅＩ制限部位あり−５’−ＧＡＧＡＴＣＣＣＡＴＡＴＧＡＧＴＡＴＣＧＴＣＣＡＡＧＣＡＡＡＧ−３’；配列番号１６）およびリバースプライマーａｖａ３８５５−ｓｔｏｐ１（ＸｈｏＩ制限部位あり５’−ＧＴＡＣＣＴＣＧＡＧＴＣＡＴＧＡＡＴＴＡＴＴＴＴＣＣＡＧＡＣＡＡＴＣＴＴＧ−３’配列番号１７）を用いて、アナベナ・バリアビリス（Ａｎａｂａｅｎａ ｖａｒｉａｂｉｌｉｓ）のゲノムＤＮＡから完全シノリン遺伝子クラスターをＰＣＲ増幅する。タグなしの遺伝子産物をコードするように、ｐＢＴＯＰ１ベクターへのライゲーションのためにプライマーを設計する。ＰＣＲ反応には、５０μＬの総体積中、２５μＬのマスター混合物、２ｎｇのＤＮＡ鋳型および１７ｐｍｏｌｅの各プライマーが含有された。次のパラメータを用いてＰＣＲ装置中で熱サイクリングを行う：９５℃で１分間にわたり変性、続いて９５℃で３０秒、５０℃で１分、７０℃で６分を５０サイクルおよび７０℃で１０分間の最終伸長時間。
３７℃で２．５時間にわたり制限酵素ＮｄｅＩおよびＸｈｏＩで増幅断片を消化する。消化物は、２μＬの水、６μＬのＮＥＢ緩衝液４（１０ｘ）、６μＬのＢＳＡ（１０ｘ）、４０μＬのＰＣＲ産物、３μＬのＮｄｅＩ（２０Ｕ／μＬ）および３μＬのＸｈｏＩ（２０Ｕ／μＬ）を含有する。アガロースゲル電気泳動を用いて制限消化物を直接精製し；ｌｌｌｕｓｔｒａ ＧＦＸキットを用いてゲル断片をさらに精製する。Ｔ４ ＤＮＡリガーゼを用いて、直線化ｐＢＴＯＰ１発現ベクターに消化物をライゲーションする。ライゲーション物を室温で２時間温置し、ライゲーション物には、３μＬの水、１μＬのＴ４リガーゼ緩衝液（１０ｘ）、１μＬの消化されたベクター、３μＬの消化された挿入ＤＮＡおよび２μＬのＴ４ ＤＮＡリガーゼ（４００Ｕ／μＬ）が含有された。選択された細菌株の１本のチューブを形質転換するために、５μＬの各ライゲーション物を使用する。精製プラスミドＤＮＡの配列決定を行うことによって、得られたｐＢＴＯＰ１構築物（シノリン配列）の同一性を確認する。
Ｂ２：配列決定
ＮＣＢＩのような公知のデータベースを用いてシノリンのオペロンの全長配列を検索し、同定し、プラスミドへの挿入物として合成されるデノボシーケンス解析用の鋳型として使用され得るか、またはプラスミド内で合成され得る、配列番号１、２、３，４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１８として本明細書中で示す。
Ｃ．形質転換
次の段階：細菌細胞の調製、形質転換、プラスミド抽出、細菌増殖、分光光度計測定および形質転換細菌の保存を含む、次のプロトコールに従い、シノリン配列（例えば配列番号１）を有するベクターシノリンまたは、ヒト皮膚に適用しようとする、ＵＶ線を阻止する目的のために構築される何らかのベクターをＬ．ラクチス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ）株に形質転換する。
細胞の調製：簡潔に述べると、３０℃で２４時間増殖させた−８０℃保存物からの１から１０ｍＬのＬ．ラクチス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ）株を接種する。培養物を１０Ｘ希釈し、３０℃で２４時間、増殖させる。５０ｍＬの培養物を１０Ｘ希釈し、ＯＤ６００が０．２から０．３になるまで（約３時間）増殖させ、細胞を４℃で、６０００ｘｇで２０分間沈降させ、４００μＬの０．５Ｍスクロース、１０％グリセロール（４℃）で細胞を洗浄し、沈降させ（６０００ｘｇ）、２００μＬの０．５Ｍスクロース、１０％グリセロール、５０ｍＭ ＥＤＴＡ（４℃）中で細胞を再懸濁し、縣濁液を氷上で１５分間維持し、沈降させる。１００ｍＬの０．５Ｍスクロース、１０％グリセロール（４℃）で細胞を洗浄し、沈降させる（６０００ｘｇ）。細胞を４ｍＬの０．５Ｍスクロース、１０％グリセロール（４℃）中で再懸濁し、１試料あたり４０μＬ（氷上）を使用するか、または−８０℃で少量の細胞を維持し、使用前にそれらを氷上で凍結融解させる。
エレクトロポレーションを介して細胞を形質転換するためのプロトコール：１μＬ ＤＮＡ（ＴＥ緩衝液で再構成）とともに１０から１００μＬの細胞を予め冷却したエレクトロポレーションキュベットに入れ、キュベットを氷上で維持する。次の調整：２０００Ｖ、２５Ｆ、２００Ω．パルス（通常の読み取りは４．５−５ｍｓｅｃである）とともにＢｉｏｒａｄ Ｇｅｎｅｐｕｌｓｅｒを使用し、１ｍＬの増殖培地＋２０ｍｇ ＭｇＣｌ２＋２ｍＭ ＣａＣｌ２を添加する。キュベットを氷上で５分間維持し、３０℃で１から１．５時間温置する。グルコースまたはラクトースおよび制限エレメント（プラスミドによる）とともに１０μＬ、１００μＬ、９００μＬをＭ１７寒天上に置き、１から２日間、３０℃で温置し；分光光度計分析のために液体中で細菌を増殖させ、プラスミド抽出を行う。
熱ショックを介して細胞を形質転換することもできる。
２７０ｎｍ、３１０ｎｍ、３３０ｎｍおよび３６０ｎｍのＵＶ波長を用いた通常の分光光度計において、１０分ごとに、１時間から１０日間まで、または２００から４００ｎｍで１０分ごとに１時間から１０日間まで、３種類の試料（ベクター（例えば配列番号１５）に挿入された関心のある分子を用いて形質転換された形質転換細菌（Ｌ．ラクチス（Ｌ．ｌａｃｔｉｓ））、細菌細胞のみ（形質転換なし）；およびシノリン配列が挿入されていない設計されたベクターを有する細菌株を調べる。
多くの代表的な態様および実施形態を上記で論じてきたが、当業者は、ある一定の修飾、変更、付加およびそれらの部分的組合せを認識するであろう。したがって、次の添付の特許請求の範囲および本明細書の後に導入される特許請求の範囲は、それらの真の精神および範囲内であるように、全てのこのような修飾、変更、付加およびそれらの部分的組合せを含むと解釈されるものとする。

Claims (37)

  1. 目的化合物を発現するように形質転換された非病原性細菌の集団を含む組成物であって、対象への局所適用のために配合された組成物。
  2. 前記非病原性細菌の集団が、前記目的化合物を発現する生きている細菌の集団である、請求項１に記載の組成物。
  3. 前記非病原性細菌の集団が、弱毒化の前もしくは後または死滅前に前記目的化合物を発現する弱毒化細菌または死細菌である、請求項２に記載の組成物。
  4. 前記非病原性細菌の集団が、形質転換された非病原性細菌の断片を含む、請求項３に記載の組成物。
  5. 前記形質転換された細菌が、少なくとも約１０２細菌／ｃｍ２を提供するために組成物に配合される、請求項１に記載の組成物。
  6. 前記化合物が紫外線光を吸収または反射し得る、請求項１に記載の組成物。
  7. 前記化合物が、紫外線Ａ（３２０から４００ｎｍ）、紫外線Ｂ（３１５から２８０ｎｍ）または両方を吸収または反射し得る、請求項６に記載の組成物。
  8. 前記形質転換された細菌により発現される前記目的化合物が、ミコスポリンアミノ酸様分子（ＭＡＡ；グリコシル化またはオリゴ糖に共有結合される、オリゴ糖−連結ＭＡＡ、細胞内または細胞外）、ガズソール、デオキシガズソール、４−デオキシガズソール（Ｓ２）、シノリン、ポルフィラ−３３４、パリチン、パリテン、アステリナ−３３０、パリチノール、ミコスポリン−グリシン、ミコスポリンセリノール、ミコスポリン−タウリン、ミコスポリン−グリシン−バリン、ミコスポリン−２−グリシン、ミコスポリン−グリシン−グルタミン酸、ミコスポリン−グルタミン酸−グリシン、ミコスポリン−メチルアミン−セリン、ミコスポリン−メチルアミン−スレオニン、ウスジレン、デヒドロキシルウスジレン、プレイテニン酸（ｐｌａｙｔｈｅｎｉｃ ａｃｉｄ）−３３７、プレイテニン酸（ｐｌａｙｔｈｅｎｉｃ ａｃｉｄ）−３３５、パリチン−セリン、パリチン−スレオニン、パリチン−スレオニン−サルフェート、プレイチン（ｐｌａｙｔｈｉｎｅ）−セリン−サルフェート、オイハロテセ、ミコスポリン−アラニン（２−（ｅ）−２，３−ジヒドロキシプロ−１−エニルイミノ−ミコスポリン−アラニン）およびスキトネミンからなる群から選択される、請求項６に記載の組成物。
  9. 前記目的化合物が、乾癬を処置するためのものである、請求項１に記載の組成物。
  10. 前記目的化合物が、レチノイド、ビタミンＡ、ビタミンＡ誘導体、ベータ−カロテン、ビタミンＤ、ビタミンＤ誘導体、抗炎症サイトカインからなる群から選択される、請求項９に記載の組成物。
  11. 前記目的化合物が抗酸化剤である、請求項１に記載の組成物。
  12. 前記目的化合物が、レスベラトロール、ビタミンＥ、ビタミンＣ、−エピガロカテキン−３−没食子酸塩およびパルミチン酸レチニル（レチノイド）、ルテイン、タマリンド、フラボノイド、ピクノジェノール、リコピンからなる群から選択される、請求項１１に記載の組成物。
  13. 前記目的化合物が美容効果を提供する、請求項１に記載の組成物。
  14. 前記目的化合物が、コエンザイムＱ１０、チロシナーゼ、コラーゲン、ラミニン、セラミド、リノール酸、トレチノイン、タザロテンおよびコラーゲンからなる群から選択される、請求項１３に記載の組成物。
  15. 前記美容効果が抗加齢である、請求項１３または請求項１４に記載の組成物。
  16. 前記美容効果が保湿である、請求項１３に記載の組成物。
  17. 前記目的化合物が湿疹を処置するものである、請求項１に記載の組成物。
  18. 前記目的化合物が、コルチゾン、タクロリムスおよびシクロスポリンからなる群から選択される、請求項１７に記載の組成物。
  19. 前記目的化合物が体臭を予防または抑制するためのものである、請求項１に記載の組成物。
  20. 前記形質転換細菌の集団が、顔面への局所適用用に配合される、請求項１から１９のいずれか一項に記載の組成物。
  21. 前記形質転換細菌の集団が、ヒトの皮膚上に常在する非病原性細菌の集団から生成される、請求項１から２０のいずれか一項に記載の組成物。
  22. 前記形質転換細菌の集団が、アシネトバクター（Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ）、アクチノミセターレス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔａｌｅｓ）、アナエロコッカス（Ａｎａｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、バシラーレス（Ｂａｃｉｌｌａｌｅｓ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、エンヒドロバクター（Ｅｎｈｙｄｒｏｂａｃｔｅｒ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、フィネゴルジア（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ）、カルノバクテリウム（Ｃａｒｎｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ラクトコッカス（Ｌａｃｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ロイコノストック（Ｌｅｕｎｃｏｎｏｓｔｏｃ）、マクロコッカス（Ｍａｃｒｏｏｃｃｕｓ）、マイクロコッキネア（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｉｎｅａｅ）、オエノコッカス（Ｏｅｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ペディオコッカス（Ｐｅｄｉｏｃｏｃｃｕｓ）、ペプトニフィルス（Ｐｅｐｔｏｎｉｐｈｉｌｕｓ）、プロピオニバクテリウム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、サリニコッカス（Ｓａｌｉｎｉｃｏｃｃｕｓ）、スフィンゴモナス（Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｏｃｏｃｃｕｓ）、テトラゲノックス（Ｔｅｔｒａｇｅｎｏｃｃｕｓ）およびワイセラ（Ｗｅｉｓｓｅｌｌａ）からなる群におけるものから選択される非病原性細菌のメンバーから生成される、請求項１から２１のいずれか一項に記載の組成物。
  23. 前記形質転換細菌が、プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ）、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）の病原性株、Ｓ．アウレウス（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）またはＳ．エピデルミディス（Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）ではない、請求項２２に記載の組成物。
  24. 前記形質転換細菌の集団が、ラクトバチルス・カゼイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｃａｓｅｉ）、ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ラクトバチルス・アシドフィルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、ラクトバチルス・ジェンセニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）、ビフィドバクテリウム・ログヌム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｇｎｕｍ）、ビフィドバクテリウム・ロイテリ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｕｔｅｒｉ）、ビフィドバクテリウム・ラクチス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ブレブ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）、ビフィドバクテリウム・アニマリス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｎｉｍａｌｉｓ）、プロピオニバクテリウム・アシディプロピオニシ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｉｄｉｐｒｏｐｉｏｎｉｃｉ）、プロピオニバクテリウム・フロイデンライヒ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｆｒｅｕｄｅｎｒｅｉｃｈｉｉ）、プロピオニバクテリウム・トエニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｈｏｅｎｉｉ）およびプロピオニバクテリウム・ジェンセニイ（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｊｅｎｓｅｎｉｉ）からなる群におけるものから選択される細菌から生成される、請求項１から２３のいずれかの一項に記載の組成物。
  25. 前記形質転換された非病原性細菌メンバーの集団が、ガンマ−プロテオバクテリア（ｇａｍｍａ−ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、アルファ−プロテオバクテリア（ａｌｐｈａ−ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）およびバクテロイデート（ｂａｃｔｅｒｉｏｄｅｔｅｓ）からなる群から選択される門のものから生成される、請求項１から２４のいずれか一項に記載の組成物。
  26. 前記形質転換細菌の集団が非病原性皮膚細菌の集団から生成される、請求項２２から２４のいずれか一項に記載の組成物。
  27. 前記形質転換細菌の集団がクリーム、ローション、エマルジョン、軟膏または液体として局所適用のための組成物に配合される、請求項１から２６のいずれか一項に記載の組成物。
  28. 前記形質転換細菌の集団が、少なくとも約１０２細菌／ｃｍ２を提供するために前記組成物に配合される、請求項２７に記載の組成物。
  29. 請求項１から２８のいずれか一項に記載の組成物を局所的に投与することを含む、処置の方法。
  30. 治療または美容目的のために皮膚に化合物を送達するための方法であって、
    目的化合物を発現させるために形質転換された非病原性細菌の集団を含む組成物を前記皮膚に適用することを含み、前記細菌集団が皮膚微生物叢中の細菌株から構成される、方法。
  31. 前記非病原性細菌の集団が、前記目的化合物を発現する生きている細菌である、請求項３０に記載の方法。
  32. 前記非病原性細菌の集団が、弱毒化の前もしくは後または死滅前に前記目的化合物を発現する弱毒化細菌または死細菌である、請求項３０に記載の方法。
  33. 前記非病原性細菌の集団が、形質転換された非病原性細菌の断片を含む、請求項３２に記載の方法。
  34. 皮膚微生物叢からの非病原性細菌の集団、目的化合物を発現するように形質転換された前記細菌集団の少なくとも一部を含む組成物であって、対象への局所適用のために配合される、組成物。
  35. 前記非病原性細菌の集団が、前記目的化合物を発現する生きている細菌の集団である、請求項３４に記載の組成物。
  36. 前記非病原性細菌の集団が、弱毒化前もしくは後または死滅前に前記目的化合物を発現する弱毒化細菌または死細菌である、請求項３４に記載の組成物。
  37. 前記非病原性細菌の集団が、形質転換された非病原性細菌の断片を含む、請求項３６に記載の組成物。
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