JP2014512819A - 発現構築物および植物の炭素、窒素、バイオマスおよび産出量の増強プロセス - Google Patents
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Abstract
【選択図】なし
Description
すなわち、本発明は、3つの遺伝子の過剰共発現を伴って形質転換された植物に関する。
i)配列番号10および配列番号11によって表されるプライマーを用いて配列番号1によって表されるcDNA配列をコードしている遺伝子を増幅する工程、配列番号8および配列番号9によって表されるプライマーを用いて配列番号2によって表されるcDNA配列をコードしている遺伝子を増幅する工程ならびに配列番号12および配列番号13によって表されるプライマーを用いて配列番号3によって表されるcDNA配列をコードしている遺伝子を増幅する工程;
ii)工程(i)で得られる配列番号1、2および3の増幅された生成物をpGEM−Tイージーベクターに独立にクローニングする工程;
iii)工程(ii)で得られた陽性クローンからプラスミドを独立にpCAMBIA1302と一緒に消化し、さらに消化された遺伝子生成物およびpCAMBIA1302をライゲーションし、大腸菌DH5α細胞に形質転換する工程;
iv)工程(iii)で得られた陽性コロニーからプラスミドの配列を決定して、AspAT::pCAMBIA1302;GS::pCAMBIA1302およびPEPCase::pCAMBIA1302のインフレームクローニングを確認する工程;
v)配列番号10および配列番号16;配列番号14および配列番号15ならびに配列番号17および配列番号18によって表されるプライマーを用いて工程(iv)で得られた生成物を増幅する工程;
vi)クローニングする工程、消化する工程、ライゲーションする工程および配列決定する工程を増幅されたGSコード配列に対して独立に再度行い、さらに消化されたGS+pCAMBIA1302を形成し、ならびに増幅されたAspATコード配列の陽性クローンのプラスミドをライゲーションしてAspAT+GS+pCAMBIA1302発現カセットを形成する工程;
vii)遺伝子AspA、GSおよびPEPCaseが独立したCaMV35SプロモーターおよびNos転写ターミネーターによって制御されるように、工程(vi)で得られるAspAT+GS+発現カセットで前もってクローニングされた目的pCAMBIA1302と、増幅されたPEPCaseコード配列の陽性クローンの消化されたプラスミドとをライゲーションして、配列番号7によって表される、単一植物の発現構築物AspAT+GS+PEPCaseを形成する工程、
を含むプロセスである。
a)請求項1に記載の発現構築物でアグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)菌種を形質転換する工程;
b)工程(a)で得られた組み換えアグロバクテリウム・ツメファシエンス菌種で外植体を形質転換する工程;
c)工程(b)の形質転換された外植体を選択して、野生型植物と比べて植物の炭素、窒素、バイオマスおよび産出量を増強された所望の形質転換植物を得る工程:
を含む、発現構築物を用いて、植物の炭素、窒素、バイオマスおよび産出量を増強するプロセスである。
(AspAT遺伝子の増幅およびクローニング)
ヌクレオチド配列をコードしたダイズのサイトソルAspAT遺伝子(配列番号1)を、ヌクレオチド配列のNCBIデーターベース(GenBank Accession No.AF034210.1;(http://www.ncbi.nlm.nih.pov/nuccore/AF034210.1)から得た。ダイズからのRNAを、iRIS Plant RNAキットを用いて単離した(Ghawanaら、米国特許第0344NF2004/IN号明細書)。cDNAを、製造業者の取扱い説明に従って、2 U DNase I(増幅等級、米国インビトロジェン(Invitrogen)製)で消化した後、1μgのオリゴ(dT)12−18および逆転写酵素Superscript II(インビトロジェン)の400Uの存在下で、全RNA調剤(2μg)を用いて合成した。その後、AspATの全コード領域を、制限酵素部位BglII(AGATCT)のようなプライマーAspATBglIIF(配列番号10)およびAspATPmlIR(配列番号11)を用いてダイズcDNAから増幅し、PmlI(CACGTG)をAspATのコード配列に組み込んだ。Qiagen High Fidelity Taqポリメラーゼ酵素を以下の条件を用いてPCRのために用いた:3分間、94℃での初期変性、30秒間94℃を30回、30秒間59℃でアニーリング、1分20秒間72℃でエクステンション、7分間72℃で最終エクステンション。増幅した生成物を、pGEM−Tイージーベクター(米国プロメガ(Promega)社)にクローニングした。陽性クローン由来のプラスミドとpCAMBIA1302プラスミドを、BglIIおよびPmlIで消化し、アガロースゲル電気泳動から単離した消化生成物をライゲーションし、タカラバイオ社(日本)から入手した大腸菌DH5α細胞(カタログ番号第9057)に形質転換した。当該陽性コロニー由来のプラスミドを配列し、pCAMBIA1302のCaMV35Sプロモーター(配列番号4)およびNosターミネーター(配列番号5)の間に位置するAspATコード配列のフレームクローニング中で確認し、得られたベクターをAspAT::pCAMBIA1302として設計した。
(GS遺伝子の増幅およびクローニング)
タバコのサイトソルGS遺伝子(配列番号2)をヌクレオチド配列のNCBIデーターベース(GenBank Accession No.X95932.1;(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/X95932.1))から得た。タバコ由来のRNAを、iRIS Plant RNAキットを用いて単離した(Ghawanaら、米国特許第0344NF2004/IN号明細書)。cDNAを、製造業者の取扱い説明に従って、2 U DNase I(米国インビトロジェン製、増幅等級)で消化した後、1μgオリゴ(dT)12−18および逆転写酵素Superscript II(インビトロジェン)の400Uの存在下で、全RNA調剤(2μg)を用いて合成した。GSの全コード領域を、制限酵素部位NcoI(CCATGG)(配列番号8)を伴ったプライマーGSNcoIFおよび制限酵素部位BstEII(GGTGACC)(配列番号9)を伴ったGSBstEIIRを用いてタバコのcDNAから増幅した。GSNcoIFプライマーを、BglIIサイトを除去するために、位置15の「A」ヌクレオチドを「G」で置換して変性した。
(トウモロコシPEPCase遺伝子の増幅およびクローニング)
ヌクレオチド配列をコードしたトウモロコシPEPCase遺伝子(配列番号3)をNCBIデーターベース(NCBI参照配列NM_001111948.1;(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM 001111948))から得た。トウモロコシからのRNAを、iRIS Plant RNAキットを用いて単離した(Ghawanaら、米国特許第0344NF2004/IN号明細書)。cDNAを、製造業者の取扱い説明に従って、2 U DNase I(米国インビトロジェン製、増幅等級)で消化した後、1μgオリゴ(dT)12−18および逆転写酵素 Superscript II(インビトロジェン)の400Uの存在下で、全RNA 調剤(2μg)を用いて合成した。
(シングルpCAMBIA1302ベクター中、AspAT、GSおよびPEPCaseのための発現カセットのアセンブリ)(オーストラリアの「Centre for Application of Molecular Biology to International Agriculture(CAMBIA)」製)
単一の植物の形質転換ベクターpCAMBIA1302へのAspAT、GSおよびPEPCaseのそれぞれの発現カセットの増幅および融合の段階的方法は以下に説明する通りである:CaMV35Sプロモーター、下流のクローンGSおよびノパリンシンターゼ(本願明細書において、「Nos」と称す。)、ターミネーターを含むGS発現カセットを、プライマー35SSpeIF(配列番号14)およびNosTAscI,BbvCI,PmlIR(配列番号15)を用いて、GS::pCAMBIA1302ベクターから増幅した(実施例2)。プライマーを順方向プライマー中のSpeI(ACTAGT)、および逆方向プライマー中のAscI(GGCGCGCC)、BbvCI(CCTCAGC)およびPmlI(CACGTG)に組み込み、pCAMBIA1302ベクターのSpeIおよびPmlI部位にGS発現カセットのサブクローニングを促進し、同様にベクター骨格中の3’末端に追加の制限酵素部位(AscI、BbvCI)を作成するように設計した。Qiagen High Fidelity Taqポリメラーゼ酵素を以下の条件を用いてPCRのために用いた:3分間、94℃での初期変性、30秒間94℃を30回、30秒間59℃でアニーリング、2分間72℃でエクステンション、7分間72℃で最終エクステンション。増幅した生成物を、pGEM−Tイージーベクター(米国プロメガ社)にクローニングした。陽性クローン由来のプラスミドをSpeIおよびPmlIで消化し、消化した生成物を、アガロースゲル電気泳動から単離し、pCAMBIA1302ベクターのSpeIおよびPmlI部位にライゲーションした。ライゲーションした生成物を大腸菌DH5α細胞に形質転換し、形質転換体をプラスミドの配列決定によって確認した。
(遺伝子AspAT、GSおよびPEPCaseを過剰共発現する遺伝子組み換えの シロイヌナズナの生育)
(植物発現ベクター(AspAT+GS+PEPCase)の生産)
簡単に植物発現ベクターを以下の通り構築した:cDNA配列をコードしたダイズのAspAT遺伝子(配列番号1)、タバコのサイトソルGS遺伝子(配列番号2)およびトウモロコシのPEPCase遺伝子(配列番号3)を、最初に独立にpCAMBIA1302ベクターにクローニングした。AspAT、GSおよびPEPCaseのための発現カセット用元素を、その後増幅し、そして遺伝子AspAT、GSおよびPEPCaseがCaMV35SプロモーターおよびNos転写ターミネーターのそれぞれに制御されるようにデスティネーションpCAMBIA1302に集めた。
AspAT+GS+PEPCaseをATCC番号アグロバクテリウム・ツメファシエンス(GV3101(pMP90RK)(C58誘導体)ATCC(登録商標番号:33970 参照:Hayashi H,Czaja I,Lubenow H,Schell J,Walden R,、1992年)と一緒にアグロバクテリウム・ツメファシエンス菌種GV3101に、標準の三親性(triparental)交配方法を用いて形質転換した。
形質転換植物由来の種の表面を2分間70%(v/v)のエタノール中に浸漬し、続いて10%(v/v)の次亜塩素酸ナトリウム溶液に浸漬して殺菌した。その後、種を殺菌した蒸留水で4回洗浄し、ハイグロマイシンBを20μgml−1(Sigma No.H3274)の濃度で補完されたMS培地を含有する1%の寒天に植え付けた。その後、種を4℃の暗所で2時間層状にした。層状化の後、プレートを、発芽の間16時間の光および8時間の暗闇のサイクルで栽培箱に移した。14日後、ハイグロマイシン耐性苗を推定上の第1の形質転換体(T0)として選択して、バーミキュライト、パーライトおよびココピートの混合物(1:1:1)を含有する鞘に移植し、生長および結実のための光、温度および湿度の条件を制御して成熟まで育てた。
T0の遺伝子組み換え植物から得られた種はMS+ハイグロマイシンB(20μgmL−1濃度)プレート上で発芽し、分離比3:1(ハイグロマイシンBに対する感度をスコアして)を示す遺伝子組み換えラインは遺伝子組み換え植物のT1の生産性を上げるために選択された。ホモ接合の遺伝子組み換え植物はT2の生産で得られ、異なる生理学および生化学的パラメーターを野生の対照植物と比較して評価される。
(AspAT+GS+PEPCaseで形質転換されたアラビドプシス・タリアナのゲノムDNAの分析)
AspAT+GS+PEPCaseで形質転換された2つの独特の遺伝子組み換えライン由来のシロイヌナズナを植物ゲノムに導入遺伝子の挿入を検証するために選択した。ゲノムDNAをDNeasy植物のミニキット(キノゲン社(QIAGEN Co.))を用いて単離した。PCRをハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ(hpt)遺伝子(配列番号6)(pCAMBIA1302ベクター由来の植物選択マーカー)にプライマーhpt F(配列番号19)およびhpt R(配列番号20)のアニーリングを鋳型として単離したDNAを用いて実施し、ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ(hpt)遺伝子(配列番号6)とした(pCAMBIA1302ベクター由来の植物選択マーカー)。
(逆転写酵素−ポリメラーゼ連鎖反応によるAspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換えの評価)
形質転換体のRNA分析を、AspAT、GSおよびPEPCaseの発現を確かめるために行った。全RNAをiRISプラントRNAキットを用いて、遺伝子組み換え植物の葉および根から単離した(Ghawanaら、米国特許第0344NF2004/IN号明細書)。cDNAを製造業者の取扱い説明に従って、2 U DNase I(米国インビトロジェン、増幅等級)で消化した後、1μgのオリゴ(dT)12−18および逆転写酵素Superscript II(インビトロジェン)の400Uの存在下で、全RNA調剤(2μg)を用いて合成した。導入遺伝子の発現をAspAT、GSおよびPEPCaseのための遺伝子の具体的なプライマーを用いて評価し、PEPCase Exp F(配列番号21)、PEPCase Exp R(配列番号22)、GS Exp F(配列番号23)、GS Exp R(配列番号24)、AspAT Exp F(配列番号25)およびAspAT ExpR(配列番号26)を設定した。RT−PCR用の陽性対照として、26S rRNAをプライマー 26S F(配列番号27)および26S R(配列番号28)を用いて増幅した。その分析結果を図2Bに示し、ここで、WTは野生を表し、L1およびL2は2つの遺伝子組み換えラインを表す。RT−PCR生成物の増幅を導入された遺伝子の発現を確定する遺伝子組み換えにおいてのみ観察した。
(野生型およびAspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換えシロイヌナズナからの酵素アッセイ)
AspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換え植物および野生植物の酵素アッセイを、以下の通り行った:
氷結した葉の試料(200mg)を、50mMのTris−Cl緩衝液(pH7.5)、1.0mMのMgCl2、5.0mMのDTT、1.0mMのPMSF、2%(w/v)のPVPP、10%(v/v)のグリセロールおよび0.1%(v/v)のトリトンX−10を含油する抽出緩衝液(1mL)中、乳鉢および乳棒ですりつぶした。抽出物を4℃で、10分間、12,000gで遠心分離し、その上清を酵素の活性の決定に用いた。PEPCaseを、過剰のMDHおよび乳酸脱水素酵素(Ashtonら、1990年)の存在下、340nmでの分光光度法で分析した。当該反応混合物は、50mMのTris−Cl(pH8.0)、5mMのMgCl2、5mMのDTT、1mMのNaHCO3、5mMのグルコース−6−リン酸塩、0.2mMのNADH、2単位のMDH、0.1単位の乳酸脱水素酵素および粗製抽出物を含有していた。
200mMのTris−Cl緩衝液(pH7.5)、2.0mMのEDTAおよび20%のグリセロールからなるAspAT用抽出緩衝液
GS(グルタミンシンテターゼ)を50mMのTris−Cl緩衝液(pH7.8)、1mMのEDTA、10mMのMgSO4、5mMのグルタミン酸ナトリウム、10%(v/v)のグリセロールおよび不溶性PVPP(2%w/v)を含有する粉砕媒体中で抽出した。酵素アッセイを以前Leaら(1990)により開示されているように行い、その活性を、α−グルタミルヒドロキサメートで調製した標準曲線から計算した。
野生型およびAspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換えシロイヌナズナ
におけるCおよびNの分析
AspAT+GS+PEPCaseを形質転換されたシロイヌナズナおよび野生型対照植物の種を20g/Lショ糖で補完された半分の濃度のMS培地において生長させた。14日たった種を、バーミキュライト、パーライトおよびココヤシの混合物(1:1:1)を含有する鞘に移植し、シロイヌナズナ生長チャンバー中、22℃で16時間光を当ておよび20℃で8時間暗闇に維持して長日性の条件で生長させた。ロゼット葉、幹、茎生葉、緑鞘を包含している異なる植物の部分を、65日経過した植物から採取し、80℃で48時間乾燥した。CおよびN元素の定量的な決定を標準物質としてスルファニルアミドを用いて、Elementar CHNS analyzerで行った。その結果を図6に示す。当該元素分析は、AspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換え植物の葉の全炭素含有量およびN含有量が、野生植物と比べてAspAT、GSおよびPEPCaseの過剰共発現によりかなり増加していることを示した。
野生型およびAspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換え植物における生長および産出量の調査
野生型およびAspAT+GS+PEPCase遺伝子組み換え植物を異なる生育特性に対して分析した。新芽の新鮮重量および乾燥重量、根の新鮮重量および乾燥重量を60日たった植物のため記録した。評価した異なるパラメーターを通して、AspAT+GS+PEPCase植物は増強した生育特性を示した。特に、遺伝子組み換え植物は、より大きな面積を有するロゼットにつきより多くの葉を有する。遺伝子組み換え植物は、新芽の乾燥重量において60%の増加し、新芽の新鮮重量において約70%の増加を示し、根の新鮮重量および根の乾燥重量のそれぞれにおいて約40%および30%の増加が見られた(図3参照)。
1.植物の炭素および窒素の状態を増強する努力がなされ、食事の安全への一歩である。
2.本発明は、PEPCaseの過剰発現が炭素骨格にAspATおよびGSの過剰発現を通して吸収された窒素を捕捉させる革新的なアプローチを提供する。
3.改善された炭素および窒素の捕獲に関する植物の能力は、植物の種および植物のバイオマス生産の両方の点で改善された植物の生産性にも反映された。
Claims (11)
- 配列番号1、配列番号2および配列番号3によって表されるヌクレオチド配列を含む、遺伝子AspAT、GSおよびPEPCaseの共発現のための配列番号7によって表される発現構築物であり、配列番号1はAspAT遺伝子を表し、配列番号2はGS遺伝子を表し、配列番号3はPEPCase遺伝子を表し、少なくとも1つの制御配列および転写ターミネーター配列に結合し、野生型または非形質転換植物と比べて、植物の炭素、窒素、バイオマスおよび産出量を増強するのに有効である、発現構築物。
- 前記制御配列が配列番号4によって表され、および前記転写ターミネーター配列が配列番号5によって表される、請求項1に記載の発現構築物。
- 前記制御配列が、CaMV35Sプロモーター、ルビスコプロモーター、ユビキチンプロモーター、アクチンプロモーターからなる群から選択される構成的プロモーターである、請求項1に記載の発現構築物。
- 用いられる前記ターミネーターが、好ましくはNosターミネーターおよびCaMV 3’UTRからなる群から選択される、請求項1に記載の発現構築物。
- 配列番号7を有するポリヌクレオチドが植物中で過剰発現される、請求項1に記載の発現構築物。
- i)配列番号10および配列番号11によって表されるプライマーを用いて配列番号1によって表されるcDNA配列をコードする遺伝子を増幅する工程、配列番号8および配列番号9によって表されるプライマーを用いて配列番号2によって表されるcDNA配列をコードする遺伝子を増幅する工程ならびに配列番号12および配列番号13によって表されるプライマーを用いて配列番号3によって表されるcDNA配列をコードする遺伝子を増幅する工程;
ii)工程(i)で得られる配列番号1、2および3の増幅された生成物をpGEM−Tイージーベクターに独立にクローニングする工程;
iii)工程(ii)で得られた陽性クローンからプラスミドを独立にpCAM BIA 1302と一緒に消化し、さらに消化された遺伝子生成物およびpCAM BIA 1302をライゲーションし、大腸菌DH5α細胞に形質転換する工程;
iv)工程(iii)で得られた陽性コロニーからプラスミドの配列を決定して、AspAT::pCAMBIA1302;GS::pCAMBIA1302およびPEPCase::pCAMBIA1302のインフレームクローニングを確認する工程;
v)配列番号10および配列番号16;配列番号14および配列番号15ならびに配列番号17および配列番号18によって表されるプライマーを用いて工程(iv)で得られた生成物を増幅する工程;
vi)クローニングする工程、消化する工程、ライゲーションする工程および配列決定する工程を増幅されたGSコード配列に対して独立に再度行い、さらに消化されたGS+pCAMBIA1302を形成し、増幅されたAspATコード配列の陽性クローンのプラスミドをライゲーションしてAspAT+GS+pCAMBIA1302発現カセットを形成する工程;
vii)遺伝子AspA、GSおよびPEPCaseが独立したCaMV35SプロモーターおよびNos転写ターミネーターによって制御されるように、工程(vi)で得られるAspAT+GS+発現カセットで前もってクローニングされた目的pCAMBIA1302と、増幅されたPEPCaseコード配列の陽性クローンの消化されたプラスミドとをライゲーションして、配列番号7によって表される、単一植物の発現構築物AspAT+GS+PEPCaseを形成する工程、
を含む、請求項1に記載の発現構築物の調製方法。 - 前記調製方法が、
a)請求項1に記載の発現構築物でアグロバクテリウム・ツメファシエンス菌種を形質転換する工程;
b)工程(a)で得られた組み換えアグロバクテリウム・ツメファシエンス菌種で外植体を形質転換する工程;
c)工程(b)の形質転換された外植体を選択して、野生型植物と比べて植物の炭素、窒素、バイオマスおよび産出量を増強された所望の形質転換植物を得る工程:
を含む、請求項1に記載の発現構築物を用いて、植物の炭素、窒素、バイオマスおよび産出量を増強する方法。 - 前記形質転換植物が、シロイヌナズナ、トマト、ポテト、タバコ、トウモロコシ、小麦、イネ、コットン、マスタード、キマメ、ササゲ、エンドウ、サトウキビ、ダイズおよびソルガムを含む群から選択される、請求項7に記載の方法。
- 野生型と比べて、前記形質転換植物がPEPCase活性において約45〜50%、GS活性において少なくとも55%、およびAspAT活性において55〜60%の増加を示し、結果的に植物の炭素および窒素レベルを増加する、請求項7に記載の方法。
- 野生型と比べて、前記形質転換植物は、増加した種子の産出量および/または鞘の産出量によって示される増加した産出量および/またはバイオマスを示す、請求項7に記載の方法
- 形質転換植物が、野生型または非形質転換植物と比べて、増加した新芽の新鮮重量、新芽の乾燥重量、根の新鮮重量および根の乾燥重量によって特徴づけられる増強された生長特性を示す、請求項7に記載の方法。
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