JP2014202582A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2014202582A5 JP2014202582A5 JP2013078428A JP2013078428A JP2014202582A5 JP 2014202582 A5 JP2014202582 A5 JP 2014202582A5 JP 2013078428 A JP2013078428 A JP 2013078428A JP 2013078428 A JP2013078428 A JP 2013078428A JP 2014202582 A5 JP2014202582 A5 JP 2014202582A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- signal intensity
- scaling
- mass spectrum
- peak
- mass
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 claims description 14
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 238000000034 method Methods 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
Description
上記第1のスケーリングは例えば、そのマススペクトル中の任意のピーク又は任意のデータ点の信号強度値を、該マススペクトル中のピーク(通常は複数のピーク)の信号強度値又は任意のデータ点の標準偏差で除する処理とすることができる。これは、複数のマススペクトル間での信号強度値のばらつきの程度を揃えることを意味する。また、上記第2のスケーリングは例えば、そのマススペクトル中の任意のピーク又は任意のデータ点の信号強度値を、そのマススペクトル中のピーク又は任意のデータ点の信号強度値から求まる変動係数(=標準偏差/平均値)で除する、換言すれば変動係数の逆数を重みとして乗じる処理とすることができる。これは、一つのマススペクトルにおける信号強度値のばらつきに関するマススペクトル間の相対的な差異を反映させることを意味する。
また本発明に係るクロマトグラフ質量分析データ処理装置の別の態様として、上記マススペクトルスケーリング処理部は、一つのマススペクトル中のピークの信号強度の対数をとるスケーリングを行う構成としてもよい。
また本発明に係るクロマトグラフ質量分析データ処理装置の別の態様として、上記マススペクトルスケーリング処理部は、一つのマススペクトル中のピークの信号強度の対数をとるスケーリングを行う構成としてもよい。
また上記実施例の液体クロマトグラフ質量分析システムでは、(1)式に基づきマススペクトルに対し可変スケーリングを行っていたが、別の手法による可変スケーリングを用いることもできる。
具体的には、次の(2)式で示すようなlogスケーリングを用いることができる。
TICRT=t=ΣlogInti …(2)
ここで、Σ、TICRT=t 、Intiの定義は(1)式と同じである。即ち、この式では、マススペクトル上の各ピーク信号強度値の対数を求め、保持時間毎に再計算した全信号強度値を用いてRTアライメントを行うことになる。このようなlogスケーリングは、ピークの大小関係を維持し(つまり、どの保持時間のマススペクトルに信号強度が大きなピークがあるかがTICに反映される)つつ信号強度が大きなピークの影響を相対的に抑えるスケーリングであり、それによって、マススペクトル中に他のピークと比べて信号強度が極端に大きなピークが存在した場合でも、該ピークによって信号強度が小さい他のピークの影響が覆い隠されることを回避することができる。
具体的には、次の(2)式で示すようなlogスケーリングを用いることができる。
TICRT=t=ΣlogInti …(2)
ここで、Σ、TICRT=t 、Intiの定義は(1)式と同じである。即ち、この式では、マススペクトル上の各ピーク信号強度値の対数を求め、保持時間毎に再計算した全信号強度値を用いてRTアライメントを行うことになる。このようなlogスケーリングは、ピークの大小関係を維持し(つまり、どの保持時間のマススペクトルに信号強度が大きなピークがあるかがTICに反映される)つつ信号強度が大きなピークの影響を相対的に抑えるスケーリングであり、それによって、マススペクトル中に他のピークと比べて信号強度が極端に大きなピークが存在した場合でも、該ピークによって信号強度が小さい他のピークの影響が覆い隠されることを回避することができる。
1…液体クロマトグラフ部
2…スポッティング部
3…質量分析部
31…MALDIイオン源
32…TOF型質量分離部
33…検出器
4…アナログデジタル変換器
5…データ処理部
51…三次元データ格納部
52…マススペクトルスケーリング計算部
53…全信号強度値計算部
54…修正TIC作成部
55…RTアライメント実行部
56…差異解析部
2…スポッティング部
3…質量分析部
31…MALDIイオン源
32…TOF型質量分離部
33…検出器
4…アナログデジタル変換器
5…データ処理部
51…三次元データ格納部
52…マススペクトルスケーリング計算部
53…全信号強度値計算部
54…修正TIC作成部
55…RTアライメント実行部
56…差異解析部
Claims (1)
- 請求項1に記載のクロマトグラフ質量分析データ処理装置であって、
前記マススペクトルスケーリング処理部は、一つのマススペクトル中のピークの信号強度の対数をとるスケーリングを行うことを特徴とするクロマトグラフ質量分析データ処理装置。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013078428A JP6020314B2 (ja) | 2013-04-04 | 2013-04-04 | クロマトグラフ質量分析データ処理装置 |
US14/177,302 US9472386B2 (en) | 2013-04-04 | 2014-02-11 | Chromatograph mass spectrometry data processing apparatus |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013078428A JP6020314B2 (ja) | 2013-04-04 | 2013-04-04 | クロマトグラフ質量分析データ処理装置 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2014202582A JP2014202582A (ja) | 2014-10-27 |
JP2014202582A5 true JP2014202582A5 (ja) | 2015-08-20 |
JP6020314B2 JP6020314B2 (ja) | 2016-11-02 |
Family
ID=51655052
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013078428A Active JP6020314B2 (ja) | 2013-04-04 | 2013-04-04 | クロマトグラフ質量分析データ処理装置 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9472386B2 (ja) |
JP (1) | JP6020314B2 (ja) |
Families Citing this family (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5947567B2 (ja) * | 2012-03-02 | 2016-07-06 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析システム |
JP6020314B2 (ja) * | 2013-04-04 | 2016-11-02 | 株式会社島津製作所 | クロマトグラフ質量分析データ処理装置 |
CN106662556B (zh) * | 2014-08-08 | 2018-06-19 | 株式会社岛津制作所 | 制备型液相色谱装置及制备条件探索方法 |
GB2532430B (en) * | 2014-11-18 | 2019-03-20 | Thermo Fisher Scient Bremen Gmbh | Method for time-alignment of chromatography-mass spectrometry data sets |
JP6245387B2 (ja) | 2015-01-26 | 2017-12-13 | 株式会社島津製作所 | 3次元スペクトルデータ処理装置及び処理方法 |
WO2016145331A1 (en) * | 2015-03-12 | 2016-09-15 | Thermo Finnigan Llc | Methods for data-dependent mass spectrometry of mixed biomolecular analytes |
JP6715451B2 (ja) * | 2015-04-08 | 2020-07-01 | 国立大学法人山梨大学 | マススペクトル解析システム,方法およびプログラム |
WO2017158673A1 (ja) | 2016-03-14 | 2017-09-21 | 株式会社島津製作所 | 質量分析データ解析装置及び質量分析データ解析用プログラム |
EP3285190A1 (en) * | 2016-05-23 | 2018-02-21 | Thermo Finnigan LLC | Systems and methods for sample comparison and classification |
GB2550591B (en) * | 2016-05-24 | 2018-06-27 | Microsaic Systems Plc | A method for extracting mass information from low resolution mass-to-charge ratio spectra of multiply charged species |
US9779922B1 (en) * | 2017-01-17 | 2017-10-03 | Advion Inc. | Generation of discovery ion currents and mass spectrometry and uses thereof |
WO2020121547A1 (ja) * | 2018-12-13 | 2020-06-18 | 株式会社島津製作所 | 分取クロマトグラフ |
WO2020152871A1 (ja) * | 2019-01-25 | 2020-07-30 | 株式会社島津製作所 | クロマトグラフを用いた物質同定方法 |
CN116106396B (zh) * | 2023-04-13 | 2023-06-27 | 杭州汇健科技有限公司 | 质谱数据的全谱拟合动态校正方法、装置、介质及质谱仪 |
Family Cites Families (16)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5175430A (en) * | 1991-05-17 | 1992-12-29 | Meridian Instruments, Inc. | Time-compressed chromatography in mass spectrometry |
WO2003095978A2 (en) * | 2002-05-09 | 2003-11-20 | Surromed, Inc. | Methods for time-alignment of liquid chromatography-mass spectrometry data |
US20060194329A1 (en) * | 2003-03-31 | 2006-08-31 | Atsushi Ogiwara | Sample analyzing method and sample analyzing program |
CA2521034A1 (en) * | 2003-04-02 | 2004-10-21 | Merck & Co., Inc. | Mass spectrometry data analysis techniques |
US20060255258A1 (en) * | 2005-04-11 | 2006-11-16 | Yongdong Wang | Chromatographic and mass spectral date analysis |
JP5103089B2 (ja) * | 2006-10-13 | 2012-12-19 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析装置を用いた定量分析方法 |
US7982181B1 (en) * | 2008-01-15 | 2011-07-19 | Thermo Finnigan Llc | Methods for identifying an apex for improved data-dependent acquisition |
JP5337144B2 (ja) * | 2008-04-03 | 2013-11-06 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析装置を用いた定量分析方法 |
JP2011237311A (ja) * | 2010-05-12 | 2011-11-24 | Shimadzu Corp | クロマトグラフ質量分析用データ処理装置 |
EP2728350B1 (en) * | 2011-06-29 | 2018-04-18 | Shimadzu Corporation | Method and system for processing analysis data |
EP2745227A4 (en) * | 2011-08-17 | 2015-07-01 | Smiths Detection Inc | SHIFT CORRECTION FOR SPECTRAL ANALYSIS |
JP5947567B2 (ja) * | 2012-03-02 | 2016-07-06 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析システム |
JP5757270B2 (ja) * | 2012-04-26 | 2015-07-29 | 株式会社島津製作所 | クロマトグラフ質量分析用データ処理装置 |
US9582909B2 (en) * | 2012-11-15 | 2017-02-28 | Shimadzu Corporation | Chromatograph mass spectrometry data processing device |
US10794880B2 (en) * | 2013-02-28 | 2020-10-06 | Shimadzu Corporation | Chromatograph mass spectrometer |
JP6020314B2 (ja) * | 2013-04-04 | 2016-11-02 | 株式会社島津製作所 | クロマトグラフ質量分析データ処理装置 |
-
2013
- 2013-04-04 JP JP2013078428A patent/JP6020314B2/ja active Active
-
2014
- 2014-02-11 US US14/177,302 patent/US9472386B2/en not_active Expired - Fee Related
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2014202582A5 (ja) | ||
JP2013224858A5 (ja) | ||
JP2013238605A5 (ja) | ||
EP2797104A3 (en) | Imaging mass analysis data processing method and imaging mass spectrometer | |
IN2014DN09363A (ja) | ||
JP2014134385A5 (ja) | ||
JP2014215043A5 (ja) | ||
US20150051843A1 (en) | Systems and Methods to Process Data in Chromatographic Systems | |
MX2017016933A (es) | Determinacion de resoluciones nativas de secuencias de video. | |
JP2013231715A5 (ja) | ||
JP2011185743A5 (ja) | ||
US20200264141A1 (en) | Real-time peak detection | |
JP2013242302A5 (ja) | ||
JP2019502436A5 (ja) | ||
WO2018004769A3 (en) | Systems and methods for collision induced dissociation of ions in an ion trap | |
JP2015184253A5 (ja) | ||
EP3408862B1 (en) | A method for extracting mass information from low resolution mass-to-charge ratio spectra of multiply charged species and mass spectrometer | |
JP6493076B2 (ja) | ピーク波形処理装置 | |
JP2012182623A5 (ja) | ||
JP2019521329A5 (ja) | ||
JP2012052940A5 (ja) | ||
US10369521B2 (en) | System and method for real-time isotope identification | |
JP2017514140A5 (ja) | ||
JP2016001137A5 (ja) | ||
WO2017025893A3 (en) | Library search tolerant to isotopes |