JP2014215043A5 - - Google Patents
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Description
また非特許文献1に記載の統計解析では、異なる試料のピーク行列データを統合する際には、上述のTICに基づく強度値の規格化が行われる。上述したように、TIC規格化によって、試料、前処理、測定日、測定条件などが異なることに起因する、試料毎のイオン強度値のばらつきやMALDIイオン源による測定点毎の生成イオン量のばらつき等に起因するばらつきの影響が軽減され、有効な統計解析を行うことができる。
上述のようにして測定中に圧縮した複数のイメージング質量分析データを比較した統計解析やイメージング画像の表示を行いたい場合には、処理対象のデータを読み込むのに先立って、比較したい複数の試料のイメージング質量分析データをあたかも一つのイメージング質量分析データとして取り扱うことができるように統合する処理を実行する。この場合、比較対象のデータの各測定点の圧縮マススペクトルを一旦伸張し、上述のイメージング質量分析データの統合処理を行う。
TICの値は一つのマススペクトルに現れる全てのイオン強度値の和であるため、XICと異なり値は一意に定まる。そのため、測定中のCPUの余剰能力を利用して事前に計算しておいてもよい。その場合、測定中に、データ収集部20で各測定点のマススペクトルデータを取得するたびに、所定の質量電荷比範囲に亘るマススペクトルに現れる全てのイオン強度値を加算してTICを算出し、その値を測定点の位置情報とともに、外部記憶装置4に格納しておく。
即ち、まず、全測定点においてIi×piの最大値を探索する。いま、a番目の測定点においてこの値が最大であったとする。このとき、Ia×paがMax_long(Max_short)になるようにリスケーリングすればよいから、各測定点の強度値に、Max_long/(Ia×pa)又はMax_short/(Ia×pa)を乗じることでリスケーリングすればよい。上記のリスケーリングに加えて、各測定点の強度値にはpiを乗じて規格化することになるから、結局、リスケーリングと規格化とを同時に行う場合、各測定点の強度値に(Max_long×Pa)/(Ia×Pi)又は(Max_short×Pa)/(Ia×Pi)を乗じればよい。
まず、上述した例えば図11に示した処理により、メインメモリ21の圧縮データ記憶領域211に格納されている圧縮データと規格化係数記憶領域213に格納されているTIC規格化係数又はXIC規格化係数とを用いて、全測定領域又は指定された関心領域における規格化された平均マススペクトル又は最大強度マススペクトルを算出する(ステップS51)。次に、ピーク行列作成部27はその平均マススペクトル又は最大強度マススペクトルに対しピーク検出を行い、検出されたピークの質量電荷比値を抽出したピークリストを作成する(ステップS52)。データ伸張処理部24は、その関心領域内の一つの測定点を選択する(ステップS53)。規格化演算処理部30はメインメモリ21の規格化係数記憶領域213に格納されている該測定点に対応したTIC規格化係数又はXIC規格化係数を読み出す(ステップS54)。
次に、規格化演算処理部30はステップS54で読み出したTIC規格化係数又はXIC規格化係数を、ステップS57で復元された強度値に乗じることにより強度値を修正し、これを規格化されたピーク行列の要素として、メインメモリ21のピーク行列記憶領域214に保存する(ステップS58)。一つの測定点についてステップS55〜S58の処理を繰り返し、全ピークについての処理が終了したならば(ステップS59でYes)、関心領域の中で未処理の測定点があるか否かを判定し(ステップ60)、関心領域の中で未処理の測定点がある場合にはステップS60からS53へと戻って、今度は関心領域内の別の測定点を選択してステップS54〜S59の処理を繰り返す。これによって、最終的に、規格化されたピーク行列を得ることができるから、これを統計解析に供すればよい。
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