JP2011523057A - 構造化された照射および均一な照射の両方を用いて光学的に切片化された画像を生成するためのシステムおよび方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本特許出願は、2008年6月5日に出願され「Method of Optical Sectioning with Hybrid Structured and Uniform Illumination Imaging」と題された米国仮特許出願第61/130,999号からの優先権を主張する特許協力条約に基づく特許出願であり、該仮特許出願の全体は、参照により本明細書中に援用される。
本発明は、国立衛生研究所によって付与された契約番号第EB007338号のもとでの政府支援を用いてなされたものである。政府は一定の権利を有する。
本発明は、画像化に関し、より具体的には、光学的に切片化された画像(optically sectioned image)に関する。
典型的に、顕微鏡を用いて視覚化されるべき生物学的サンプルの全体は、横方向の構造を見るために、薄層にスライスされて載置される。よって、サンプルは、そのサンプルの厚さが実質的に低減されていることにより、2次元の性質を帯びており、その結果、スライスの平面内の構造は、平面の外部に存在するその他の構造からの追加的な背景を伴わずに見られ得る。しかしながら、多くのインビボ構造を含む一部の構造は、スライスされることが可能ではないことがあり得る。
本発明の第1の実施形態において、構造化された照射の画像データセットおよび均一な照射のデータセットの両方を用いて光学的に切片化された画像データセットを形成するための方法が提供される。構造化された照射のデータセットおよび均一な照射のデータセットは、DC空間周波数においてさえも光学的切片化を示す低解像度の画像構造の計算を可能にする。均一な照射のデータセットは、固有の光学的切片化を示す相補的な高解像度の画像構造を提供する。両方の画像セットの融合は、画像化システムの全帯域幅にわたる光学的切片化を示す最終的な画像データセットを提供する。この方法論は、プロセッサ内で利用され得る。画像化されるデータは、顕微鏡、内視顕微鏡(endomicroscope)または実質的に均一な照射および構造化された照射の両方を提供される別の画像化デバイスからの結果であり得る。
(定義)
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、以下の用語は、文脈が他のように要求していない限り、示されている意味を有する。用語「オブジェクト信号」は、例えば、反射率もしくは蛍光または他のエネルギー原理を介して、オブジェクトによって生成された信号を意味する。用語「画像化システム」および「光学的画像化装置」は、少なくとも1つの検出器アレイ(例えば、CCDカメラ、CMOSカメラなど)を含むシステムを意味する。画像化システムは、また、1つ以上の照射供給源を含み得る。照射は、供給源(例えば、ランプ、レーザー、ダイオードなど)によって生成されたエネルギーに由来し得る。用語「構造化された照射」は、空間的に変化する信号(すなわち、不均一なコントラストを示す信号)を生成する照射を意味する。構造化された照射は、空間的にランダムであり得るか、またはパターン化され得る。用語「均一な照射」は、照射が空間によって有意に変わらず、その結果、検出器アレイが異なる空間的位置における変化を認識しないことがあり得ることを意味する。構造化された照射は、均一な照射が、画像化アレイ電子エレクトロニクスの積分時間の間に複雑にランダム化された場合に均一な照射を模倣するようになされ得ることが注意される。用語「パターン生成器」は、均一な状態と構造化された状態との間で照射をトグルで切り替え得るデバイスをいう。
CN(p)=In(p)の標準偏差/In(p)の平均値
によって計算することとによって評価される(330)。分解領域のサイズは可変であるが、少なくとも単一のスペックル粒度を含むために十分に大きくなければならない。
In(p)=Iin(p)[1+Msin(Kgx+φ)]+Iout(p)
となる。ここで、pは、データの座標であり、グリッド照射は、任意の位相φ、変調コントラストMで、xの方向において、空間的周波数Kgの正弦パターンとしてモデル化される。焦点内の画像データのみが、変調されるように見える一方で、焦点外のデータは、変調されるようには見えない。これは、他ならず、後者が焦点外であるということによる。
R(p)=In(p)/Iu(p)という比により、
R(p)=1+C(p)Msin(Kgx+φ)
が導かれる。ここで、C(p)は、局所的な画像のコントラストである。このようにして、比R(p)が決定される。図4Aに示されているように、C(K)すなわちC(p)のFourier変換およびその複素共役は、+Kgまたは−Kgに中心を有する両側波帯において存在する。Fourier変換は、R(p)において実行され得、R(K)をもたらし得る。ここで、Kは空間的周波数である。単側波帯の復調を用いて、C(K)がR(K)から抽出され得る。まず、単側高域フィルタが適用されて、負の共役を除去し、それに続いて逆Fourier変換により、R(p)を復元する。側波帯が互いに良好に分離されている(すなわち、側波帯がオーバーラップしていない)と仮定すると、局所的な画像のコントラストは、
C(p)=[R+(p)R* +(p)]1/2/M
によって与えられる。結果として、
Iin(p)=C(p)Iu(p)
となり、Iin(p)が決定され得る(440)。
Isu(p)=[R+(p)R* +(p)]1/2Iu(p)
である。このようにして、Isu(p)が、比のデータセットR(p)および構造化された照射データセットに基づいて決定される。Isu(p)は、Kg以下である所定のカットオフ周波数Kcを有する低域フィルタをIsu(p)に適用することにより、Kgよりも小さい空間的周波数に制限される。LP[Isu(p)]は、サイズ2π/Kgのウィンドウを用いてIsu(p)を畳み込むことによって獲得され得る。Isu(p)をはっきり定義された帯域幅に制限することに加えて、このようなフィルタリングは、例えば、不完全な正弦的な照射パターンから生じる潜在的なアーチファクトを抑制することに役立つ。この低域フィルタは、ILP(p)によって記される低周波数の焦点内のデータセットの生成をもたらす(450)。
HP[Iu(p)]=Iu(p)−LP[Iu(p)]
となることに留意されたい。最終的な処理される画像は、
I(p)=ηILP(p)+IHP(p)
によって与えられる。ここで、スケーリング因子ηが、カットオフ周波数Kcにわたる周波数の内容のシームレスな移行を保証するために導入される。ηは、上述したのと同様の態様で計算され得る。そして、結果として生じる焦点内のデータセットI(p)は、その後の取り出しのためにメモリに格納され得るか、または、ディスプレイ上に表示され得る。
Claims (30)
- 実世界のオブジェクトの光学的に切片化されたデータセットを生成するための、プロセッサとともに用いる画像化方法であって、
該方法は、
該プロセッサにおいて、実質的に均一な照射を用いて照射された該実世界のオブジェクトの第1の画像データセットを受信することと、
該プロセッサにおいて、実質的に構造化された照射を用いて照射された該実世界のオブジェクトの第2の画像データセットを受信することと、
高周波数の焦点内のデータセットを生成する該第1の画像データセットを処理することと、
低周波数の焦点内のデータセットを生成する該第2の画像データセットを処理することと、
該高周波数の焦点内のデータセットと該低周波数の焦点内のデータセットとを組み合わせることにより、光学的に切片化された焦点内のデータセットを生成することと
を含む、画像化方法。 - 前記光学的に切片化された焦点内のデータセットをディスプレイデバイス上に表示すること
をさらに含む、請求項1に記載の画像化方法。 - 前記第1の画像データセットを処理することは、
該第1の画像データセットに高域フィルタを適用することにより、焦点外の内容を実質的に除去し、高周波数の焦点内の画像データセットを獲得すること
を含む、請求項1に記載の画像化方法。 - 前記第2の画像データセットを処理することは、
低解像度の局所的なコントラストのデータセットを生成する該第2の画像データセットの局所的なコントラストを決定することと、
該低解像度の局所的なコントラストのデータセットと該第1の画像データセットとを乗算することにより、該第1の画像データセットから低解像度の焦点内の内容を抽出することと
を含む、請求項3に記載の画像化方法。 - 前記第2の画像データセットを処理することは、
前記低解像度の焦点内の内容に低域フィルタを適用することであって、該低域フィルタは、前記高域フィルタと相補的である、こと
をさらに含む、請求項4に記載の画像化方法。 - 前記光学的に切片化されたデータセットは、前記第1のデータセットおよび前記第2のデータセットを生成する光学的画像化装置の帯域幅内の全ての周波数内容を含む、請求項5に記載の画像化方法。
- 局所的なコントラストを決定することは、
前記第1の画像データセットを用いて、オブジェクトのコントラストを補償するように、該局所的なコントラストを調整すること
を含む、請求項4に記載の画像化方法。 - 局所的なコントラストを決定することは、
前記第1の画像データセットを用いて、前記第2の画像データセットにおけるノイズによって誘起されるコントラストを補償するように、該局所的なコントラストを調整すること
を含む、請求項4に記載の画像化方法。 - ほぼ均一な照射を用いて、前記実世界のオブジェクトを表す第1の画像データセットを光学的画像化装置を用いて記録することであって、該第1の画像データセットは、焦点内の内容および焦点外の内容の両方を含む、ことと、
構造化された照射を用いて、該実世界のオブジェクトを表す第2の画像データセットを該光学的装置を用いて記録し、その結果、該第2の画像データセットが、空間的に変調されるようにすることと
をさらに含む、請求項1に記載の画像化方法。 - 前記光学的画像化装置は、光学的検出器アレイを含む、請求項9に記載の画像化方法。
- 前記光学的画像化装置は、照射供給源を含む、請求項10に記載の画像化方法。
- 前記局所的なコントラストは、局所的な画像の標準偏差を評価することによって決定される、請求項4に記載の画像化方法。
- 前記局所的なコントラストは、単側波帯の復調を用いて部分的に決定される、請求項4に記載の画像化方法。
- 前記局所的なコントラストは、両側波帯の復調を用いて部分的に決定される、請求項4に記載の画像化方法。
- 実世界のオブジェクトの光学的に切片化されたデータセットを生成するための、コンピュータとともに用いるコンピュータプログラム製品であって、該コンピュータプログラム製品は、コンピュータコードを有するコンピュータ読み取り可能な媒体を含み、
該コンピュータコードは、
実質的に均一な照射を用いて照射された該実世界のオブジェクトの第1の画像データセットを受信するためのコンピュータコードと、
実質的に構造化された照射を用いて照射された該実世界のオブジェクトの第2の画像データセットを受信するためのコンピュータコードと、
高周波数の焦点内のデータセットを生成する該第1の画像データセットを処理するためのコンピュータコードと、
低周波数の焦点内のデータセットを生成する該第2の画像データセットを処理するためのコンピュータコードと、
該高周波数の焦点内のデータセットと該低周波数の焦点内のデータセットとを組み合わせることにより、光学的に切片化された焦点内のデータセットを生成するためのコンピュータコードと
を含む、コンピュータプログラム製品。 - 前記第1の画像を処理するための前記コンピュータコードは、
前記第1の画像データセットに高域フィルタを適用することにより、焦点外の内容を実質的に除去するためのコンピュータコード
を含む、請求項15に記載のコンピュータプログラム製品。 - 前記第2の画像を処理するための前記コンピュータコードは、
局所的なコントラストのデータセットを生成する該第2の画像データセットの局所的なコントラストを決定するためのコンピュータコードと、
該局所的なコントラストのデータセットと低解像度の焦点内のデータセットを生成する該第1の画像データセットとを乗算するためのコンピュータコードと
を含む、請求項16に記載のコンピュータプログラム製品。 - 前記第2の画像を処理するための前記コンピュータコードは、
前記低解像度の焦点内のデータセットに低域フィルタを適用するためのコンピュータコード
をさらに含む、請求項17に記載のコンピュータプログラム製品。 - 局所的なコントラストを決定するための前記コンピュータコードは、
前記第1の画像データセットを用いて、前記第2の画像データセットにおけるオブジェクトのコントラストを補償するためのコンピュータコード
を含む、請求項17に記載のコンピュータプログラム製品。 - 局所的なコントラストを決定するための前記コンピュータコードは、
前記第1の画像データセットを用いて、前記第2の画像データセットにおけるノイズによって誘起されるコントラストを補償するためのコンピュータコード
を含む、請求項17に記載のコンピュータプログラム製品。 - 局所的なコントラストを決定するための前記コンピュータコードは、局所的な画像の標準偏差を評価することによって該局所的なコントラストを決定する、請求項17に記載のコンピュータプログラム製品。
- 局所的なコントラストを決定するための前記コンピュータコードは、単側波帯の復調を用いる、請求項17に記載のコンピュータプログラム製品。
- 局所的なコントラストを決定するための前記コンピュータコードは、両側波帯の復調を用いる、請求項17に記載のコンピュータプログラム製品。
- 実世界のオブジェクトの光学的に切片化された画像を生成するためのシステムであって、
該システムは、
照射供給源と、
空間的パターン生成器と、
光学的検出器アレイと、
該光学的検出器アレイから第1の画像データセットおよび第2の画像データセットを受信するプロセッサと
を含み、
該第1の画像データセットは、該照射供給源に応答して生成され、該第2の画像データセットは、該照射供給源および該空間的パターン生成器に応答して生成され、該プロセッサは、該第1の画像データセットからの高周波数の焦点内のデータと、該第1の画像データセットおよび該第2の画像データセットからの低周波数の焦点内のデータとを組み合わせることによって、光学的に切片化された画像を生成する、システム。 - 前記照射供給源は、少なくとも第1の照射供給源および第2の照射供給源を含む、請求項24に記載のシステム。
- 前記第1の照射供給源は、前記実世界のオブジェクトを均一に照射することが可能である、請求項25に記載のシステム。
- 前記第2の照射供給源は、前記空間的パターン生成器とともに、前記実世界のオブジェクトを構造的に照射することが可能である、請求項25に記載のシステム。
- 前記空間的パターン生成器は、空間的光変調器である、請求項24に記載のシステム。
- 前記空間的パターン生成器は、ディフューザである、請求項24に記載のシステム。
- 前記空間的パターン生成器は、前記照射供給源に暴露されたときに、幾何学的パターンを生成する、請求項24に記載のシステム。
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