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Description
本明細書で使用される場合、「リアルタイムＴＭＡ」という用語とは、リアルタイム検出手段によってモニタリングされる標的核酸の単一プライマー転写媒介増幅（「ＴＭＡ」）をいう。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物であって、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドがＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドがサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、組成物。
（項目２）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目３）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目４）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０９に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目５）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目６）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目７）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目８）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１０）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１１）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物であって、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、組成物。
（項目１２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１１に記載の組成物。
（項目１３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１１に記載の組成物。
（項目１４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１１に記載の組成物。
（項目１５）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１６）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、３、４、５、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１７）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、３、４、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１８）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、３、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１９）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、６、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、２、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２０）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２１）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜１３のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜８、１１、または１２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２４）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、項目１〜２３のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２５）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、項目１、３、４、５、１１、１２、１３、１４、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、または２３のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２６）
検出オリゴヌクレオチドをさらに含む、項目１〜２５のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２７）
前記検出オリゴヌクレオチドがトーチオリゴヌクレオチドまたは分子ビーコンである、項目２６に記載の組成物。
（項目２８）
前記トーチオリゴヌクレオチドが配列番号６６、６７、６８、６９、７０、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目２７に記載の組成物。
（項目２９）
ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、項目１〜２５のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３０）
前記ブロッカーオリゴヌクレオチドが配列番号５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目２９に記載の組成物。
（項目３１）
配列番号１７またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号５０またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物。
（項目３２）
配列番号２６またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号４９またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物。
（項目３３）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３４）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３６）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３７）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３９）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４０）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４１）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４２）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４３）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４４）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４６）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマープロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４７）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキットであって、ここで、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、キット。
（項目４８）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目４９）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５０）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０９に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５１）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５２）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５５）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５３のいずれか１項に記載のキット。
（項目５６）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５７）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキットであって、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドが、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、キット。
（項目５８）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目５７に記載のキット。
（項目５９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目５７に記載のキット。
（項目６０）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目５７に記載のキット。
（項目６１）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７〜６０に記載のキット。
（項目６２）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４９、５０、５１、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６３）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４９、５０、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６４）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４９、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６５）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、６、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４８、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６６）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６７）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７〜６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６８）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７〜５９のいずれか１項に記載のキット。
（項目６９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５７、または５８のいずれか１項に記載のキット。
（項目７０）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、項目４７〜６９のいずれか１項に記載のキット。
（項目７１）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、項目４７、４９、５０、５１、５７、５８、５９、６０、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、または６９のいずれか１項に記載のキット。
（項目７２）
検出オリゴヌクレオチドをさらに含む、項目４７〜７１のいずれか１項に記載のキット。
（項目７３）
前記検出オリゴヌクレオチドがトーチオリゴヌクレオチドまたは分子ビーコンである、項目７２に記載のキット。
（項目７４）
前記トーチオリゴヌクレオチドが配列番号６６、６７、６８、６９、７０、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目７３に記載のキット。
（項目７５）
ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、項目４７〜７１のいずれか１項に記載のキット。
（項目７６）
前記ブロッカーオリゴヌクレオチドが配列番号５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目７５に記載のキット。
（項目７７）
配列番号１７またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号５０またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキット。
（項目７８）
配列番号２６またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号４９またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキット。
（項目７９）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８０）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８１）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８２）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８３）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８４）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８６）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８７）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８９）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９０）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９１）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９２）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマープロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９３）
サンプル中のサルモネラを検出するための方法であって、該方法はＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実行する工程を包含し、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、方法。
（項目９４）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９６）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０９に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９７）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９８）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１００）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０１）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０３）
サンプル中のサルモネラを検出するための方法であって、該方法は、Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実施する工程を包含し、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドが、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、方法。
（項目１０４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１０３に記載の方法。
（項目１０５）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１０３に記載の方法。
（項目１０６）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１０３に記載の方法。
（項目１０７）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３〜１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０８）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９５、９６、９７、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０９）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９５、９６、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１０）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９５、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１１）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、６、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９４、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１２）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３〜１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０３、１０４、または１０５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１５）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０３、または１０４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１６）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、項目９３〜１１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１７）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、項目９３、９５、９６、９７、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、または１１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１８）
検出オリゴヌクレオチドを用いて増幅された核酸を検出する工程をさらに含む、項目９３〜１１７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１９）
前記検出オリゴヌクレオチドがトーチオリゴヌクレオチドまたは分子ビーコンである、項目１１８に記載の方法。
（項目１２０）
前記トーチオリゴヌクレオチドが配列番号６６、６７、６８、６９、７０、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１１９に記載の方法。
（項目１２１）
ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、項目９３〜１２０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２２）
前記ブロッカーオリゴヌクレオチドが配列番号５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１２１に記載の組成物。
（項目１２３）
配列番号１７またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号５０またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための方法。
（項目１２４）
配列番号２６またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号４９またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための方法。
（項目１２５）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２６）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２７）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２９）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３０）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３１）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３４）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３６）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３７）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマープロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３９）
前記増幅された核酸を検出する工程がリアルタイムで行われる、項目１１９に記載の方法。
（項目１４０）
密接に関連する腸内細菌の存在下でサルモネラ核酸が特異的に検出される、項目１３９に記載の方法。
（項目１４１）
サルモネラ核酸が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ、Ｐｓｕｅｄｏｍｏｎａｓ、およびＬｉｓｔｅｒｉａのうちの少なくとも１種の存在下で特異的に検出される、項目１３９に記載の方法。
（項目１４２）
サルモネラ核酸が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｅ．ｖｕｌｎｅｒｉｓ、Ｅ．ｈｅｒｍａｎｎｉｉ、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ、Ｅ．ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅ．ｈｏｓｈｉｎａｅ、Ｐ．ｍｉｒａｂｉｌｉｓ、Ｃ．ｂｒａｋｉｉ、Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ、Ｓ．ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｃ．ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃ．ｋｏｓｅｒｉ／ｄｉｖｅｒｓｕｓ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｓ．ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｌ．ｉｎｎｏｃｕａ、Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｃ．ｊｅｊｕｎｉ、Ｃ．ｃｏｌｉ、Ｓ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅのうちの少なくとも１種の存在下で特異的に検出される、項目１３９に記載の方法。
（項目１４３）
サルモネラ２３Ｓリボソーム核酸の３５０領域のフラグメントを増幅するように設計された２つ以上の増幅オリゴヌクレオチドを含む、サンプル中のサルモネラを検出するための組成物。
（項目１４４）
サルモネラ２３Ｓリボソーム核酸を検出するための１種以上のプローブをさらに含む、項目１４３に記載の組成物。
（項目１４５）
項目１４３に記載の増幅オリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実施する工程、および増幅された核酸を項目１４４に記載の１種以上のプローブを用いて検出する工程を包含する、サンプル中のサルモネラの存在を検出するための方法。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物であって、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドがＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドがサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、組成物。
（項目２）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目３）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目４）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０９に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目５）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目６）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１に記載の組成物。
（項目７）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目８）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１０）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１１）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物であって、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、組成物。
（項目１２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１１に記載の組成物。
（項目１３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１１に記載の組成物。
（項目１４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１１に記載の組成物。
（項目１５）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１６）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、３、４、５、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１７）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、３、４、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１８）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、３、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目１９）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、６、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、２、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２０）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１、１１、１２、１３、または１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２１）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜１４のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜１３のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１〜８、１１、または１２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２４）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、項目１〜２３のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２５）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、項目１、３、４、５、１１、１２、１３、１４、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、または２３のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２６）
検出オリゴヌクレオチドをさらに含む、項目１〜２５のいずれか１項に記載の組成物。
（項目２７）
前記検出オリゴヌクレオチドがトーチオリゴヌクレオチドまたは分子ビーコンである、項目２６に記載の組成物。
（項目２８）
前記トーチオリゴヌクレオチドが配列番号６６、６７、６８、６９、７０、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目２７に記載の組成物。
（項目２９）
ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、項目１〜２５のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３０）
前記ブロッカーオリゴヌクレオチドが配列番号５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目２９に記載の組成物。
（項目３１）
配列番号１７またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号５０またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物。
（項目３２）
配列番号２６またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号４９またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物。
（項目３３）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３４）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３６）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３７）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目３９）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４０）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４１）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４２）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４３）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４４）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４６）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマープロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目１、１１、３１、または３２のいずれか１項に記載の組成物。
（項目４７）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキットであって、ここで、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、キット。
（項目４８）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目４９）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５０）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０９に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５１）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５２）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７に記載のキット。
（項目５３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５５）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５３のいずれか１項に記載のキット。
（項目５６）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目４７〜５２のいずれか１項に記載のキット。
（項目５７）
Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキットであって、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドが、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、キット。
（項目５８）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目５７に記載のキット。
（項目５９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目５７に記載のキット。
（項目６０）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目５７に記載のキット。
（項目６１）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７〜６０に記載のキット。
（項目６２）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４９、５０、５１、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６３）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４９、５０、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６４）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４９、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６５）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、６、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４８、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６６）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、５７、５８、５９、または６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６７）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７〜６０のいずれか１項に記載のキット。
（項目６８）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７〜５９のいずれか１項に記載のキット。
（項目６９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５７、または５８のいずれか１項に記載のキット。
（項目７０）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、項目４７〜６９のいずれか１項に記載のキット。
（項目７１）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、項目４７、４９、５０、５１、５７、５８、５９、６０、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、または６９のいずれか１項に記載のキット。
（項目７２）
検出オリゴヌクレオチドをさらに含む、項目４７〜７１のいずれか１項に記載のキット。
（項目７３）
前記検出オリゴヌクレオチドがトーチオリゴヌクレオチドまたは分子ビーコンである、項目７２に記載のキット。
（項目７４）
前記トーチオリゴヌクレオチドが配列番号６６、６７、６８、６９、７０、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目７３に記載のキット。
（項目７５）
ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、項目４７〜７１のいずれか１項に記載のキット。
（項目７６）
前記ブロッカーオリゴヌクレオチドが配列番号５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目７５に記載のキット。
（項目７７）
配列番号１７またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号５０またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキット。
（項目７８）
配列番号２６またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号４９またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキット。
（項目７９）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８０）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８１）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８２）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８３）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８４）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８６）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８７）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目８９）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９０）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９１）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９２）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマープロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目４７、５７、７７、または７８のいずれか１項に記載のキット。
（項目９３）
サンプル中のサルモネラを検出するための方法であって、該方法はＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実行する工程を包含し、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、方法。
（項目９４）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９６）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０９に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９７）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９８）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２７９〜３０２に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３に記載の方法。
（項目９９）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１００）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０１）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目９３〜９８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０３）
サンプル中のサルモネラを検出するための方法であって、該方法は、Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実施する工程を包含し、該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドはサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、そして該プライマーオリゴヌクレオチドはＥ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とし、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドが、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とする、方法。
（項目１０４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１０３に記載の方法。
（項目１０５）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１０３に記載の方法。
（項目１０６）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、項目１０３に記載の方法。
（項目１０７）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３〜１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０８）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９５、９６、９７、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０９）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９５、９６、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１０）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９５、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１１）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、６、７、８、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９４、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１２）
前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、１０３、１０４、１０５、または１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３〜１０６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１４）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０３、１０４、または１０５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１５）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０３、または１０４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１６）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、項目９３〜１１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１７）
前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、項目９３、９５、９６、９７、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、または１１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１８）
検出オリゴヌクレオチドを用いて増幅された核酸を検出する工程をさらに含む、項目９３〜１１７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１１９）
前記検出オリゴヌクレオチドがトーチオリゴヌクレオチドまたは分子ビーコンである、項目１１８に記載の方法。
（項目１２０）
前記トーチオリゴヌクレオチドが配列番号６６、６７、６８、６９、７０、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１１９に記載の方法。
（項目１２１）
ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、項目９３〜１２０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２２）
前記ブロッカーオリゴヌクレオチドが配列番号５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、およびそれらの相補物の配列から選択される、項目１２１に記載の組成物。
（項目１２３）
配列番号１７またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号５０またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための方法。
（項目１２４）
配列番号２６またはその相補物の配列のＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチド、配列番号４９またはその相補物の配列のプライマーオリゴヌクレオチド、配列番号６６またはその相補物の配列の検出オリゴヌクレオチド、配列番号５９またはその相補物の配列のブロッカーオリゴヌクレオチド、および配列番号７４またはその相補物の配列の標的捕捉オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のための方法。
（項目１２５）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２６）
前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２７）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２９）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３０）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３１）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３２）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して少なくとも９０％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３３）
前記プライマーオリゴヌクレオチドが、前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して１００％相補的である１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３４）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、１個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３５）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、２個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３６）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、３個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３７）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマーオリゴヌクレオチドが、４個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３８）
前記標的とされるサルモネラ核酸配列に対して相補的であるプライマープロバイダーオリゴヌクレオチドが、５個のミスマッチを有する１５〜３５ヌクレオチドを含む、項目９３、１０３、１２３、または１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３９）
前記増幅された核酸を検出する工程がリアルタイムで行われる、項目１１９に記載の方法。
（項目１４０）
密接に関連する腸内細菌の存在下でサルモネラ核酸が特異的に検出される、項目１３９に記載の方法。
（項目１４１）
サルモネラ核酸が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ、Ｐｓｕｅｄｏｍｏｎａｓ、およびＬｉｓｔｅｒｉａのうちの少なくとも１種の存在下で特異的に検出される、項目１３９に記載の方法。
（項目１４２）
サルモネラ核酸が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｅ．ｖｕｌｎｅｒｉｓ、Ｅ．ｈｅｒｍａｎｎｉｉ、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ、Ｅ．ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅ．ｈｏｓｈｉｎａｅ、Ｐ．ｍｉｒａｂｉｌｉｓ、Ｃ．ｂｒａｋｉｉ、Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ、Ｓ．ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｃ．ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃ．ｋｏｓｅｒｉ／ｄｉｖｅｒｓｕｓ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｓ．ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｌ．ｉｎｎｏｃｕａ、Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｃ．ｊｅｊｕｎｉ、Ｃ．ｃｏｌｉ、Ｓ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅのうちの少なくとも１種の存在下で特異的に検出される、項目１３９に記載の方法。
（項目１４３）
サルモネラ２３Ｓリボソーム核酸の３５０領域のフラグメントを増幅するように設計された２つ以上の増幅オリゴヌクレオチドを含む、サンプル中のサルモネラを検出するための組成物。
（項目１４４）
サルモネラ２３Ｓリボソーム核酸を検出するための１種以上のプローブをさらに含む、項目１４３に記載の組成物。
（項目１４５）
項目１４３に記載の増幅オリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実施する工程、および増幅された核酸を項目１４４に記載の１種以上のプローブを用いて検出する工程を包含する、サンプル中のサルモネラの存在を検出するための方法。
Claims (10)
- それぞれがサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とするＴ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよびプライマーオリゴヌクレオチドを含む、サンプル中のサルモネラを検出するための核酸増幅アッセイにおける使用のための組成物であって、
ここで、該増幅アッセイにおいて使用される該Ｔ７オリゴヌクレオチドおよび該プライマーオリゴヌクレオチドは、増幅される該サルモネラ核酸配列の逆ストランドを標的とし、
該Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドは、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約２６８〜３２０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とするか、および／または
該プライマーオリゴヌクレオチドは、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基約３３８〜３９５に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、組成物。 - 前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基２６８〜３０２もしくは塩基２７９〜３１０に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とするか、および／または前記プライマーオリゴヌクレオチドが、Ｅ．ｃｏｌｉ ２３Ｓ ｒＲＮＡの塩基３４９〜３７４もしくは塩基３４９〜３６６に対応するサルモネラ核酸の領域中の配列を標的とする、請求項１に記載の組成物。
- 前記Ｔ７プロバイダーが、配列番号１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、およびそれらの相補物の配列から選択される、請求項１に記載の組成物。
- 前記プライマーオリゴヌクレオチドが、配列番号３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、およびそれらの相補物の配列から選択される、請求項１に記載の組成物。
- 前記Ｔ７プロバイダーが配列番号１７またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号５０またはその相補物の配列である、請求項１に記載の組成物。
- 前記Ｔ７プロバイダーが配列番号２６またはその相補物の配列であり、前記プライマーオリゴヌクレオチドが配列番号４９またはその相補物の配列である、請求項１に記載の組成物。
- ブロッカーオリゴヌクレオチドをさらに含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
- 請求項１〜７のいずれか１項に記載の組成物および検出オリゴヌクレオチドを含む、サルモネラ核酸増幅アッセイにおける使用のためのキット。
- サンプル中のサルモネラを検出するための方法であって、該方法は、請求項１〜７のいずれか１項に記載の組成物の前記Ｔ７プロバイダーオリゴヌクレオチドおよび前記プライマーオリゴヌクレオチドを使用して核酸増幅アッセイを実施する工程、ならびに増幅されたサルモネラ核酸を検出する工程を包含し、ここで該サルモネラ核酸は、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｅ．ｖｕｌｎｅｒｉｓ、Ｅ．ｈｅｒｍａｎｎｉｉ、Ｅ．ｃｌｏａｃａｅ、Ｅ．ａｅｒｏｇｅｎｅｓ、Ｅ．ｈｏｓｈｉｎａｅ、Ｐ．ｍｉｒａｂｉｌｉｓ、Ｃ．ｂｒａｋｉｉ、Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ、Ｓ．ｆｌｅｘｎｅｒｉ、Ｃ．ｆｒｅｕｎｄｉｉ、Ｃ．ｋｏｓｅｒｉ／ｄｉｖｅｒｓｕｓ、Ｋ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｓ．ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、Ｌ．ｉｎｎｏｃｕａ、Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ、Ｃ．ｊｅｊｕｎｉ、Ｃ．ｃｏｌｉ、Ｓ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ、Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒ、Ｓｈｉｇｅｌｌａ、Ｐｓｕｅｄｏｍｏｎａｓ、およびＬｉｓｔｅｒｉａからなる群より選択される１以上の密接に関連した腸内細菌からの核酸の存在下で特異的に検出され得る、方法。
- 前記増幅された核酸を検出する工程がリアルタイムで行われる、請求項９に記載の方法。
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| US6060237A (en) | 1985-02-26 | 2000-05-09 | Biostar, Inc. | Devices and methods for optical detection of nucleic acid hybridization |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
| US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
| US4751177A (en) | 1985-06-13 | 1988-06-14 | Amgen | Methods and kits for performing nucleic acid hybridization assays |
| US4800159A (en) | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
| ES2112824T5 (es) * | 1986-11-24 | 2008-03-01 | Gen-Probe Incorporated | Sondas de acidos nucleicos para deteccion y/o cuantificacion de organismos no virales. |
| US6150517A (en) * | 1986-11-24 | 2000-11-21 | Gen-Probe | Methods for making oligonucleotide probes for the detection and/or quantitation of non-viral organisms |
| US5541308A (en) | 1986-11-24 | 1996-07-30 | Gen-Probe Incorporated | Nucleic acid probes for detection and/or quantitation of non-viral organisms |
| DE3708541A1 (de) | 1987-03-17 | 1988-10-13 | Agfa Gevaert Ag | Haertungsmittel fuer proteine, eine damit gehaertete bindemittelschicht und ein eine solche schicht enthaltendes fotografisches aufzeichnungsmaterial |
| WO1989001050A1 (en) * | 1987-07-31 | 1989-02-09 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Selective amplification of target polynucleotide sequences |
| US5639604A (en) | 1987-09-21 | 1997-06-17 | Gen-Probe Incorporated | Homogeneous protection assay |
| US5585481A (en) | 1987-09-21 | 1996-12-17 | Gen-Probe Incorporated | Linking reagents for nucleotide probes |
| US6004745A (en) | 1987-09-21 | 1999-12-21 | Gen-Probe Incorporated | Hybridization protection assay |
| US6031091A (en) | 1987-09-21 | 2000-02-29 | Gen-Probe Incorporated | Non-nucleotide linking reagents for nucleotide probes |
| US5185439A (en) | 1987-10-05 | 1993-02-09 | Gen-Probe Incorporated | Acridinium ester labelling and purification of nucleotide probes |
| US5030557A (en) | 1987-11-24 | 1991-07-09 | Ml Technology Venture | Means and method for enhancing nucleic acid hybridization |
| US5130238A (en) | 1988-06-24 | 1992-07-14 | Cangene Corporation | Enhanced nucleic acid amplification process |
| US5118801A (en) | 1988-09-30 | 1992-06-02 | The Public Health Research Institute | Nucleic acid process containing improved molecular switch |
| CA2002076A1 (en) | 1988-11-21 | 1990-05-21 | Brent A. Burdick | Diagnostic kit and method using a solid phase capture means for detecting nucleic acids |
| US5656207A (en) | 1989-06-24 | 1997-08-12 | Gen Probe Incorporated | Detecting or quantifying multiple analytes using labelling techniques |
| CA2020958C (en) | 1989-07-11 | 2005-01-11 | Daniel L. Kacian | Nucleic acid sequence amplification methods |
| US5480784A (en) | 1989-07-11 | 1996-01-02 | Gen-Probe Incorporated | Nucleic acid sequence amplification methods |
| US5455166A (en) | 1991-01-31 | 1995-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Strand displacement amplification |
| US5539082A (en) | 1993-04-26 | 1996-07-23 | Nielsen; Peter E. | Peptide nucleic acids |
| US5270184A (en) | 1991-11-19 | 1993-12-14 | Becton, Dickinson And Company | Nucleic acid target generation |
| CA2137563C (en) | 1992-06-08 | 2005-06-28 | Thomas B. Ryder | Preparation of nucleic acid from mononuclear cells |
| DE9317325U1 (de) | 1993-11-12 | 1994-01-05 | INA Wälzlager Schaeffler KG, 91074 Herzogenaurach | Stößel für einen Ventiltrieb einer Brennkraftmaschine |
| US5925517A (en) | 1993-11-12 | 1999-07-20 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits |
| US5648211A (en) | 1994-04-18 | 1997-07-15 | Becton, Dickinson And Company | Strand displacement amplification using thermophilic enzymes |
| DE69535240T2 (de) | 1994-10-28 | 2007-06-06 | Gen-Probe Inc., San Diego | Zusammensetzungen und Verfahren für die gleichzeitige Detektion und Quantifizierung von einer Mehrheit spezifischer Nuklein Säure Sequenzen |
| US5731148A (en) | 1995-06-07 | 1998-03-24 | Gen-Probe Incorporated | Adduct protection assay |
| US5636599A (en) | 1995-06-07 | 1997-06-10 | Russell; Robert L. | Cylinder assembly |
| JPH1026621A (ja) | 1996-07-12 | 1998-01-27 | Dai Ichi Pure Chem Co Ltd | イムノアッセイ法 |
| AU726821B2 (en) | 1996-07-16 | 2000-11-23 | Gen-Probe Incorporated | Methods for detecting and amplifying nucleic acid sequences using modified oligonucleotides having increased target specific Tm |
| JP3756313B2 (ja) | 1997-03-07 | 2006-03-15 | 武 今西 | 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体 |
| JP4222635B2 (ja) | 1997-05-02 | 2009-02-12 | ジェン−プローブ・インコーポレーテッド | ２段階ハイブリダイゼーションおよびポリヌクレオチドの捕捉 |
| US6534273B2 (en) | 1997-05-02 | 2003-03-18 | Gen-Probe Incorporated | Two-step hybridization and capture of a polynucleotide |
| US6794499B2 (en) | 1997-09-12 | 2004-09-21 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
| DE69900592T2 (de) * | 1998-02-27 | 2002-08-22 | Pamgene Bv | Verfahren zur unspezifischen amplifizierung einer nukleinsäure |
| AU762728B2 (en) | 1998-07-02 | 2003-07-03 | Gen-Probe Incorporated | Molecular torches |
| GB9827585D0 (en) * | 1998-12-15 | 1999-02-10 | Celsis Int Plc | Assay method |
| DE19915141C2 (de) | 1999-03-26 | 2002-11-21 | Artus Ges Fuer Molekularbiolog | Detektion von Nucleinsäure-Amplifikaten |
| CA2417986C (en) * | 2000-08-11 | 2013-11-26 | University Of Utah Research Foundation | Single-labeled oligonucleotide probes |
| US6611678B1 (en) | 2000-09-29 | 2003-08-26 | Ibm Corporation | Device and method for trainable radio scanning |
| DE60132924T2 (de) * | 2000-10-23 | 2009-03-05 | Gen-Probe Inc., San Diego | Zusammensetzungen und methoden zur detektion von humanem immundefizienz virus 2 (hiv-2) |
| WO2003095677A1 (en) | 2002-05-09 | 2003-11-20 | Medigenes | Nucleic acid probes for detection of non-viral organisms |
| ATE519861T1 (de) * | 2002-06-14 | 2011-08-15 | Gen Probe Inc | Zusammensetzungen zum nachweis von hepatitis-b- virus |
| US7582470B2 (en) * | 2002-07-31 | 2009-09-01 | Gen-Probe Incorporated | Device for amplifying and detecting a target nucleic acid |
| AU2003288018A1 (en) * | 2002-11-20 | 2004-06-15 | Pharmacia Italia S.P.A. | Method for the detection of microorganisms in pharmaceutical products |
| JP2006523460A (ja) * | 2003-04-17 | 2006-10-19 | ジェン−プロウブ インコーポレイテッド | 試料中のｓａｒｓコロナウイルスの存在を決定するための組成物および方法 |
| WO2006007567A2 (en) | 2004-07-01 | 2006-01-19 | Gen-Probe Incorporated | Methods and compositions to detect nucleic acids in a biological sample |
| AU2005280162B2 (en) | 2004-08-27 | 2012-04-26 | Gen-Probe Incorporated | Single-primer nucleic acid amplification methods |
| US7713697B2 (en) * | 2004-08-27 | 2010-05-11 | Gen-Probe Incorporated | Methods and kits for amplifying DNA |
| KR100850193B1 (ko) * | 2004-08-28 | 2008-08-04 | 주식회사 진인 | 모든 세균의 감별을 위한 세균 특이적, 속 특이적 및 종특이적 올리고뉴클레오티드, 이를 포함하는 진단 키트, 및이를 이용한 검출 방법 |
| CA2929741A1 (en) * | 2004-09-30 | 2006-04-13 | Gen-Probe Incorporated | Assay for detecting and quantifying hiv-1 |
| EP2322940B1 (en) | 2005-03-10 | 2014-10-29 | Gen-Probe Incorporated | Systems amd methods to perform assays for detecting or quantifing analytes within samples |
| ES2381279T3 (es) * | 2005-05-06 | 2012-05-24 | Gen-Probe Incorporated | Métodos y productos para la captura de ácido nucleico diana |
| JP5254012B2 (ja) * | 2005-06-06 | 2013-08-07 | ジェン−プロウブ インコーポレイテッド | テスト試料中のＣｈｌａｍｙｄｏｐｈｉｌａｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの存在を決定するための、組成物、方法およびキット |
| WO2006138679A2 (en) * | 2005-06-15 | 2006-12-28 | Gen-Probe Incorporated | Methods for quantitative analysis of a nucleic acid amplification reaction |
| AU2006304721B2 (en) * | 2005-10-17 | 2012-01-19 | Gen-Probe Incorporated | Compositions and methods to detect Legionella pneumophila nucleic acid |
| US20100062421A1 (en) * | 2007-04-25 | 2010-03-11 | Wensheng Xia | Compositions, methods, and devices for isolating biological materials |
| US8703421B2 (en) * | 2008-05-30 | 2014-04-22 | Gen-Probe Incorporated | Compositions, kits and related methods for the detection and/or monitoring of Salmonella |
-
2009
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