JP2011517951A - 修飾された第ix因子ポリペプチドおよびそれらの使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、修飾された第IX因子ポリペプチド、例えば、1つ以上の導入されたグリコシル化部位を有する第IX因子ポリペプチドに関する。修飾された第IX因子ポリペプチドは、インビトロまたはインビボの安定性の増加、例えば、血漿中の半減期の延長を示し得る。本発明は、また、修飾された第IX因子ポリペプチドを製造する方法、および、例えば、血友病Bに罹患している患者を処置するための、修飾された第IX因子ポリペプチドを使用する方法に関する。
血友病Bは、男性34,500人に一人であり、凝固第IX因子(FIX)をコードする遺伝子における種々の遺伝子異常により引き起こされ、FIXタンパク質が血液中で少ない、または検出できないものとなる(Kurachi, et al., Hematol. Oncol. Clin. North Am. 6:991-997, 1992; Lillicrap, Haemophilia 4:350-357, 1998)。不十分なレベルのFIXは、凝血障害および出血が止まらなくなる症状を引き起こす。血友病Bは、すでに起こっている出血を止めるため、または出血が起こることを防止するため(予防)に、血漿由来または組換えFIXタンパク質のいずれかの静脈内注入により、有効に処置される(Dargaud, et al., Expert Opin. Biol. Ther. 7:651-663; Giangrande, Expert Opin. Pharmacother. 6:1517-1524, 2005)。有効な予防は、正常レベルの約1%のFIXの最小トラフレベルを維持することが必要である(Giangrande, Expert Opin. Pharmacother. 6:1517-1524, 2005)。天然のFIX(血漿由来または組換え)の半減期は約18から24時間であるため、FIXレベルは、ボーラス注射後3から4日以内に正常レベルの1%未満に落ち、これは有効な予防を達成するために平均3日ごとの反復注射を必要とする(Giangrande, Expert Opin. Pharmacother. 6:1517-1524, 2005)。このような頻繁な静脈内注射は、患者、とりわけ子供にとって問題であり、有効な予防を達成するための障害である(Petrini, Haemophilia 13 Suppl 2:16-22, 2007)。長い半減期を有するFIXタンパク質は頻繁な投与をより少なくすることが可能であり、したがって、医学的な利点から重要である。
本出願は、1つ以上のグリコシル化部位を導入することにより修飾されているアミノ酸配列を含むFIXポリペプチド(修飾されたFIXポリペプチド、FIX変異タンパク質またはFIX変異体としても称される)を提供する。いくつかの態様において、1つ以上のグリコシル化部位はN結合型グリコシル化部位であり得る。いくつかの態様において、ポリペプチドは凝固活性を有する。いくつかの態様において、修飾されたポリペプチドは、少なくとも1つの置換、例えば、限定はしないがR338AおよびV86Aを含み得る。いくつかの態様において、修飾されたポリペプチドはR338AおよびV86A置換の両方を含み得る。
(a)G4T;E33N;E36T;E36N;R37N;F75N;F77T;E83T;D85N;V86A;K91T;A103T;V107T;K122N;K122T;S138N;A146N;T148N;F150T;P151N;T159N;A161T;A161N;T169N;Q170N;T172N;D177N;D177E;F178T;K201N;K201T;K214T;V223N;G226N;Y226T;K228N;K228T;E239N;E242N;I251T;A262T;E294N;R338A;R338N;K341N;F353N;H354V;H354I;E355T;V370N;T371V;T371I;E372T;E374N;M391N;K392V;G393T;E410N;K413N;L414I;
本出願は、1つ以上のOまたはN結合型グリコシル化部位を含むFIXポリペプチドを提供する。治療用タンパク質のグリコシル化の増加は、1)免疫原性の減少;2)タンパク質の投与の頻度の減少;3)タンパク質安定性の増加、例えば、血清半減期の増加;および4)有害な副作用、例えば、炎症の減少を達成するために使用され得る。
本出願は、1つ以上の導入されたグリコシル化部位を含むFIXポリペプチド、すなわち、修飾されたFIXポリペプチドを提供する。本明細書において使用される“第IX因子”は、内因性凝固経路のメンバーであり、血液凝固に必須であるヒト血漿FIX糖タンパク質を意味する。この定義はヒト血漿FIX糖タンパク質の天然ならびに組換え形態を含むと理解されるべきである。特記されない限り、本明細書において使用されるFIXは、フラグメント、類似物、変異体および誘導体を含む、凝固において通常の役割のあらゆる機能性ヒトFIXタンパク質分子を意味する。本出願のポリペプチドにおいて言及するとき、“フラグメント”、“誘導体”、“類似物”、“変異タンパク質”および“変異体”なる用語は、実質的に同じ生物学的機能または活性を維持するポリペプチドのフラグメント、誘導体、類似物、変異タンパク質および変異体を意味する。
表1
(a)G4T;E33N;E36T;E36N;R37N;F75N;F77T;E83T;D85N;V86A;K91T;A103T;V107T;K122N;K122T;S138N;A146N;T148N;F150T;P151N;T159N;A161T;A161N;T169N;Q170N;T172N;D177N;D177E;F178T;K201N;K201T;K214T;V223N;G226N;Y226T;K228N;K228T;E239N;E242N;I251T;A262T;E294N;R338A;R338N;K341N;F353N;H354V;H354I;E355T;V370N;T371V;T371I;E372T;E374N;M391N;K392V;G393T;E410N;K413N;L414I;
YNSGKLEEFVQGNLERECMEEKCSFEEAREVFENTERTTEFWKQYVDGDQCESNPCLNGGSCKDDINSYECWCPFGFEGKNCELX85X86TCNIKNGRCEQFCKNSAX104NKVVCSCTEGYRLAENX121KSCEPAVPFPCGRVSVX138QTSKLTRAEX148VX150X151X152X153DYVNSX159EZ1X161Z2EZ3TZ4ILDNIX169QSX172QX174FNX177X178TRVVGGEDAKPGQFPWQVVLNGKVDAFCGGSIVNEKWIVTAAHCVETX226VX228ITVVAGEHNIEETEHTEQKRNVIRIIPHHNYNAAINKYNHDIALLELDEPLVLNSYVTPICIADKEYTNIFLKFGSGYVSGWGRVFHKGRSALVLQYLRVPLVDRATCLX338STKFTIYNNMFCAGX353X354X355GGRDSCQGDSGGPHX370X371X372VEGTSFLTGIISWGEECAX391X392X393KYGIYTKVSRYVNWIKE KTX413X414T(配列番号:3);
ここで、X85はDおよびEから選択され;
ここで、X86はA、E、P、SおよびVから選択され;
ここで、X104はD、NおよびTから選択され;
ここで、X121はN、QおよびTから選択され;
ここで、X138はN、SおよびTから選択され;
ここで、X148およびX150は以下から選択され:
(i)X148はTであり、そしてX150はFである;
(ii)X148はNであり、そしてX150はTである;および
(iii)X148はNであり、そしてX150はSである;
ここで、X151はA、PおよびTから選択され;
ここで、X151およびX153は以下から選択され:
(i)X151はPであり、そしてX153はVである;
(ii)X151はNであり、そしてX153はTである;および
(iii)X151はNであり、そしてX153はSである;
ここで、Z1、Z2、Z3およびZ4は、独立して以下から選択され
(i)0から12のアミノ酸残基、および
(ii)配列番号:2;
ここで、X152はD、NおよびTから選択され;
ここで、X159およびX161は以下から選択され:
(i)X159はTであり、そしてX161はAである;
(ii)X159はNであり、そしてX161はTである;および
(iii)X159はNであり、そしてX161はSである;
ここで、X169はTおよびNから選択され;
ここで、X172はTおよびNから選択され;
ここで、X174はSおよびTから選択され;
ここで、X177およびX178は以下から選択され:
(i)X177はDであり、そしてX178はFである;
(ii)X177はEであり、そしてX178はTである;および
(iii)X177はEまたはDであり、そしてX178はSである;
ここで、X226およびX228は以下から選択され:
(i)X226はGであり、そしてX228はKである;
(ii)X226はNであり、そしてX228はTである;および
(iii)X226はNであり、そしてX228はSである;
ここで、X338はRおよびAから選択され;
ここで、X353、X354およびX355は以下から選択され:
(i)X353はFであり、X354はHであり、X355はEである;
(ii)X353はNであり、X354はVであり、X355はTである;
(iii)X353はNであり、X354はIであり、X355はTである;および
(iv)X353はNであり、X354はH、VまたはIであり、X355はSである;
ここで、X370、X371およびX372は以下から選択され:
(i)X370はVであり、X371はTであり、X372はEである;
(ii)X370はNであり、X371はVであり、X372はTである;
(iii)X370はNであり、X371はIであり、X372はTである;および
(iv)X370はNであり、X371はT、VまたはIであり、X372はSである;
ここで、X391、X392およびX393は以下から選択され:
(i)X391はMであり、X392はKであり、X393はGである;
(ii)X391はNであり、X392はKであり、X393はTである;
(iii)X391はNであり、X392はVであり、X393はTである;および
(iv)X391はNであり、X392はVまたはKであり、X393はSである;
ここで、X413およびX414は以下から選択される:
(i)X413はKであり、そしてX414はLである;
(ii)X413はNであり、そしてX414はLである;および
(iii)X413はNであり、そしてX414はIである;(そして
ここで、該FIXポリペプチドは、配列番号:1を有するFIXポリペプチドと比較して、少なくとも1つの導入されるグリコシル化部位を含む)。
アミノ酸残基は、非天然グリコシル化部位を導入するために導入、欠失または置換され得る。例えば、グリコシル化部位はFIXのアミノ酸配列を変化することにより導入され得る。アミノ酸配列変化は、種々の技術により、例えば、部位特異的突然変異により対応する核酸配列を修飾することにより成し遂げられ得る。部位特異的突然変異のための技術は当分野で知られており、例えば、Zoller et al., (DNA 3:479-488, 1984)またはHorton, et al., (Gene 77:61-68, 1989, pp. 61-68)に記載されている。したがって、FIXのヌクレオチドおよびアミノ酸配列を使用して、1つに選択された変化が導入され得る。同様に、特定のプライマーを使用するポリメラーゼ連鎖反応を使用してDNA構築物を製造するための方法は当業者に知られている(例えば、PCR Protocols, 1990, Academic Press, San Diego, California, USA、参照)。
哺乳動物において上記同定された状態の処置のための有効性を決定するために使用される既知のアッセイに基づいて、および、これらの結果をこれらの状態を処置するために使用される既知の薬物の結果と共に比較することにより、本発明のポリペプチドの有効量は、それぞれの所望の適応の処置のために容易に決定され得る。これらの状態の1つの処置において投与される活性成分の量は、使用される特定のポリペプチドおよび投与単位、投与経路、処置期間、処置される患者の年齢および性別ならびに処置される状態の性質および程度にしたがって広範に変化することができる。
本明細書に記載されている組成物は、FIXの機能的欠陥またはFIXの欠失、例えば、FIXのインビボ半減期の短縮、FIXの結合特性の変化、FIXの遺伝子異常およびFIXの血漿濃度の減少と関連するあらゆる出血障害を処置するために使用され得る。FIXの遺伝子異常は、例えば、FIXをコードする核酸配列における塩基の欠失、付加および/または置換を含む。1つの態様において、出血障害は血友病Bであり得る。このような出血障害の症状は、例えば、重度の鼻出血、経口粘膜出血、関節血症、血腫、持続性血尿、消化器出血、後腹膜出血、舌/咽頭後出血、頭蓋内出血および外傷関連出血を含む。
本発明をより理解するために、以下の実施例を記載する。これらの実施例は説明の目的のみであり、どのような形であれ本発明の範囲を限定すると解釈すべきでない。本明細書に記載されているすべての文献は出典明示によりそれら全体を包含させる。
溶媒の接近可能性、既知の二次構造、既知の血友病B変異の位置、FVIIIおよびFX両方との相互作用の予測される部位への近接、ならびにFIXタンパク質安定性における与えられる変異の予測される効果に関するFIX配列のコンピュータ分析を、新しいN−グリコシル化部位コンセンサス配列の付加のための可能性のある部位を同定するために実施した。
活性化ペプチドにおける保存された、および保存されていない残基は、図1において示されているとおり多数の種の配列アラインメントにより同定された。
表3
多数の配列アラインメント(図1)は、また、ヒト、アカゲザル、ブタ、イヌおよびウサギのFIXと比較して、マウス、ラットおよびテンジクネズミは残基A161からE162にさらなるアミノ酸を有することを示した。これらのさらなるアミノ酸は3つの種間で7から10のサイズで変化し、ほとんどAspおよびある程度Ile残基を含む。この観察は、7から10のさらなる残基がFIX活性において有意な効果なしにラット、マウスおよびテンジクネズミにおいてこの部位で許容されていることを証明する。8つの種由来のFIX間の多数の配列アラインメントを成し遂げるために使用される基準に依存して、ラット、マウスおよびテンジクネズミにおけるさらなるアミノ酸が見られる見かけの部位は、部位がヒトFIXのE160からA161間、A161からE162間、E162からT163間またはT163からI164間のいずれかで変化させることができる。
表4a
変化したタンパク質配列を有するFIX遺伝子が哺乳動物細胞から発現され、分泌されるか否かを決定し、そしてFIX凝固活性におけるこれらの置換の効果を決定するために、これらのFIX変異体をコードする発現プラスミドをHKB11細胞にトランスフェクトした。HKB11はHEK293細胞およびB細胞リンパ腫の融合により生産されたヒト細胞株である。この実施例において、それぞれのグリコシル化部位の置換を、図3におけるHG1からHG8において見られるとおり第2の置換R338Aと組み合わせた。R338A置換は、aPTTアッセイにより測定されるとおりFIXの比活性を3から4倍に増加させる。2つのグリコシル化部位変異タンパク質およびR338Aのさらなる組合せも創造し、試験した(図3)。
変異タンパク質HG1からHG8(図3)およびHG9(図5)の初期分析は、HG2、HG3、HG5、HG6、HG8およびHG9がSDS−PAGEゲルにおける見かけの分子量の増加により証明されるとおりグリコシル化が増加したことを証明した。HG2、HG3、HG5、HG6およびHG8に存在する置換の種々の組合せを含むさらなるFIXポリペプチドを生産した。例えば、以下の組合せを生産した:HG2/HG3、HG8/HG2、HG8/HG3、HG8/HG2/HG3。他の可能な組合せは、例えば、HG3/HG5、HG5/HG8、HG3/HG5/HG8、HG3/HG6、HG5/HG6、HG8/HG6、HG3/HG5/HG6、HG3/HG6/HG8、HG5/HG6/HG8およびHG3/HG5/HG6/HG8を含む。HG9との組合せもまた生産され得る。
FIXのアミノ酸V86は、野生型FIX(WT−FIX)またはFIX−R338Aのいずれかの文脈の中では部位特異的突然変異によりアラニンに変化していた。これらの構築物を含む発現ベクターをHKB11細胞にトランスフェクトし、培地を3日後に回収し、ELISAによりFIXタンパク質レベルおよびaPTTアッセイによりFIX凝固活性をアッセイした。両方の変異タンパク質は、WT−FIXおよびFIX−R338Aと同様のレベルで発現した。単一実験のデータは表6aに要約している。表6bは3つの実験の平均を要約している。
表6a
ヒトFIXcDNAのコード領域の5’および3’末端の配列に相補的なPCRプライマー対を、公開されたcDNA配列(NM_000133)から設計した。5’プライマー(FIXF1;
ヒトFIX配列内の種々のアミノ酸を変化させるために、一対のプライマーをStratageneから利用できるQuickchangeTMプライマー設計プログラムを使用して設計した。これらのプライマーは、製造業者の指示にしたがってQuickchangeTM II XL 部位特異的突然変異キット(Stratagene, San Diego, CA)を使用して、pAGE16−FIXプラスミドにおける変異を構築するために使用した。所望の置換を含むクローンは、全体のFIXコード領域のDNAシーケンシングにより同定した。以下の表7は置換を構築するために使用したセンス鎖オリゴヌクレオチドの配列を示す。
表7
表8
HKB11細胞(HEK293およびBurkitt B細胞リンパ腫系のハイブリッド、2B8)を、CO2(5%)インキュベーター中で37℃で10ng/mLの水溶性ビタミンK3(Sigma-Aldrich, St. Louis, MO)を補った無血清培地(RF#277)中で、オービタルシェーカー(100−125rpm)上で懸濁液培地を培養し、0.25から1.5×106細胞/mL密度で維持した。
細胞培養上清(50μL)を20μLの4×SDS−PAGE ローディング色素と混合し、95℃で5分加熱し、NuPAGE(登録商標) 4−12% SDS PAGEゲルに付し、次にニトロセルロース膜に移した。5%ミルク粉末で30分ブロッキング後、膜をヒトFIXに対するHRP−標識ヤギポリクローナル抗体(US Biological, Swampscott, Massachusetts, Catalog No. F0017-07B)と60分室温でインキュベートした。0.1%のTween(登録商標)−20バッファーを有するリン酸緩衝食塩水で洗浄後、HRP由来のシグナルをSuperシグナル(登録商標)Pico(Pierce, Rockford, IL)およびx線フィルムへの暴露を使用して検出した。
細胞培養上清におけるFIX抗原レベルは、FIX ELISAキット(Hyphen Biomed/Aniara, Mason, OH)を使用して測定した。細胞培養上清をサンプル希釈剤バッファー(キットにて提供される)で希釈し、標準曲線の範囲内でシグナルを達成させる。サンプル希釈剤で希釈されたヒト血漿(Hyphen Biomed/Aniara, Catalog No. RK032A、比活性196U/mg)から精製されたFIXタンパク質を、100ng/mLから0.2ng/mLの標準曲線を作成するために使用した。希釈されたサンプルおよび標準を、ポリクローナル抗−FIX捕捉抗体であらかじめ被覆されているELISAプレートに加えた。ポリクローナル検出抗体を加えた後、プレートを室温で1時間インキュベートし、大規模に洗浄し、次にキット製造業者により記載されているとおりTMB基質(3,3’,5,5’−テトラメチルベンジジン)を使用して現像し、SpectraMax(登録商標)プレートリーダー(Molecular Devices, Sunnyvale, CA)を使用して450nMでシグナルを測定した。標準曲線を2成分プロットに合わせ、未知の値を曲線から推定した。
FIX凝固活性は、ElectraTM 1800C 自動凝固分析器(Beckman Coulter, Fullerton, CA)を使用して、FIX欠損ヒト血漿におけるaPTTアッセイを使用して測定した。簡潔には、凝固希釈剤における上清サンプルの3つの希釈物を装置により製造し、次に100μLを100μLのFIX欠損血漿(Aniara, Mason, OH)および100μLの自動aPTT試薬(ウサギ脳リン脂質および微粉化シリカ(bioMerieux, Inc., Durham, NC)と混合した。100μLの25mMのCaCl2溶液の添加後、血塊形成のための時間を記録した。標準曲線を、ELISAアッセイにおいて標準として使用される同じ精製されたヒトFIX(Hyphen Biomed/Aniara)の連続希釈物を使用してそれぞれのに対して作成した。標準曲線は、日常的に0.95またはそれより良い相関係数を有する直線であり、未知のサンプルのFIX活性を測定するために使用された。
FIXポリペプチドの循環半減期はインビトロアッセイを使用して測定される。このアッセイは、肝細胞におけるアデノウイルス(Ad)の蓄積を介在するインビボおよびインビトロでのFIXの能力に基づく。簡潔には、FIXはAd線維ノブドメインに結合し、細胞表面ヘパラン硫酸プロテオグリカン(HSPG)を介してウイルス摂取への橋渡しを提供することができることが示されている(Shayakhmetov, et al., J. Virol 79:7478-7491, 2005)。線維ノブドメインにおいて変異を含むアデノウイルスベクター変異体のAd5mutは、FIXに結合しない。Ad5mutはインビボでの肝細胞に感染する能力および肝臓毒性を有意に減少させ、FIXが肝細胞へのAdベクターの標的化において主な役割を果たすことを示す(Shayakhmetov, et al., 2005)。肝細胞へAdベクターを標的化するFIXの能力は、タンパク質−HSPG相互作用の阻害剤によりブロックすることができる(Shayakhmetov, et al., 2005)。
Claims (23)
- 1つ以上のアミノ酸置換または挿入を導入することにより修飾されているアミノ酸配列を含む、第IX因子ポリペプチド。
- アミノ酸配列が1つ以上のグリコシル化部位を導入することにより修飾されている、請求項1に記載のポリペプチド。
- 1つ以上のグリコシル化部位がN結合型グリコシル化部位およびO結合型グリコシル化部位から選択される、請求項2に記載のポリペプチド。
- 1つ以上の導入されたグリコシル化部位に結合した炭水化物鎖をさらに含む、請求項2または3に記載のポリペプチド。
- 1つ以上のアミノ酸置換が以下のものから選択される、請求項1から4のいずれかに記載のポリペプチド:G4T;E33N;E36T;E36N;R37N;F75N;F77T;E83T;D85N;V86A;K91T;A103T;V107T;K122N;K122T;S138N;A146N;T148N;F150T;P151N;T159N;A161T;A161N;T169N;Q170N;T172N;D177N;D177E;F178T;K201N;K201T;K214T;V223N;G226N;Y226T;K228N;K228T;E239N;E242N;I251T;A262T;E294N;R338A;R338N;K341N;F353N;H354V;H354I;E355T;V370N;T371V;T371I;E372T;E374N;M391N;K392V;G393T;E410N;K413N;L414I;Y1NおよびS3T;S3NおよびK5T;G4NおよびL6T;K5NおよびE7T;L6NおよびE8T;E7NおよびF9T;F9NおよびQ11T;V10NおよびG12T;Q11NおよびN13T;G12NおよびL14T;N13およびE15T;L14NおよびR16T;E15NおよびE17T;M19NおよびE21T;E20NおよびK22T;S24NおよびE26T;F25NおよびE27T;E26NおよびA28T;E27NおよびR29T;A28NおよびE30T;R29NおよびV31T;E30NおよびF32T;V31NおよびE33T;F32NおよびN34T;T35NおよびR37T;T38NおよびE40T;T39NおよびF41T;E40NおよびW42T;F41NおよびK43T;W42NおよびQ44T;K43NおよびY45T;Q44NおよびV46T;Y45NおよびD47T;V46NおよびG48T;E52NおよびN54T;S53NおよびP55T;G59NおよびS61T;K63NおよびD65T;I66NおよびS68T;S68NおよびE70T;G76NおよびE78T;E78NおよびK80T;E83NおよびD85T;L84NおよびV86T;I90NおよびN92T;K100NおよびS102T;S102NおよびD104T;A103NおよびN105T;D104NおよびK106T;K106NおよびV108T;R116NおよびA118T;E119NおよびQ121T;Q121NおよびS123T;A127NおよびP129T;V135NおよびV137T;S136NおよびS138T;V137NおよびQ139T;Q139NおよびS141T;T140NおよびK142T;S141NおよびL143T;E147NおよびV149T;T148NおよびF150T;V149NおよびP151T;P151NおよびV153T;D152NおよびD154T;V153NおよびY155T;D154NおよびV156T;Y155NおよびN157T;V156NおよびS158T;S158NおよびE160T;T159NおよびA161T;E160NおよびE162T;E162NおよびI164T;T163NおよびL165T;I164NおよびD166T;L165NおよびN167T;D166NおよびI168T;I168NおよびQ170T;T169NおよびS171T;S171NおよびQ173T;T172NおよびS174T;Q173NおよびF175T;S174NおよびN176T;G184NおよびD186T;E185NおよびA187T;D186NおよびK188T;A187NおよびP189T;P189NおよびQ191T;G200NおよびV202T;K201NおよびD203T;V202NおよびA204T;E224NおよびG226T;T225NおよびV227T;G226NおよびK228T;V227NおよびI229T;H236NおよびI238T;I238NおよびE240T;E240NおよびE242T;T241NおよびH243T;H243NおよびE245T;K247NおよびN249T;V250NおよびR252T;I251NおよびI253T;I253NおよびP255T;A261NおよびI263T;A262NおよびN264T;D276NおよびP278T;V280NおよびN282T;F302NおよびS304T;S304NおよびY306T;R312NおよびF314T;V313NおよびH315T;F314NおよびK316T;H315NおよびG317T;K316NおよびR318T;G317NおよびS319T;S319NおよびL321T;A320NおよびV322T;R327NおよびP329T;P329NおよびV331T;D332NおよびA334T;L337NおよびS339T;S339NおよびK341T;T340NおよびF342T;T343NおよびY345T;G352NおよびH354T;F353NおよびE355T;H354NおよびG356T;E355NおよびG357T;G356NおよびR358T;G357NおよびD359T;E372NおよびE374T;W385NおよびE387T;G386NおよびE388T;A390NおよびK392T;D85N、K122TおよびI251T;D85N、K122TおよびE242N;E125N、P126AおよびA127T;P126N、V128TおよびP129A;T148N、F150TおよびP151A;F150N、P151AおよびD152T;P151N、V153TおよびA161N;P151N、V153TおよびT172N;V153N、Y155TおよびE294N;T172N、G226NおよびK228T;F353N、H354VおよびE355T;F353N、H354IおよびE355T;V370N、T371VおよびE372T;V370N、T371IおよびE372T;M391N、K392VおよびG393T;D85N、P151N、V153TおよびK228N;D85N、P151N、V153TおよびE242N;K122T、P151N、V153TおよびK228N;K122T、P151N、V153TおよびE242N;K122T、P151N、V153TおよびI251T;T148N、F150T、G226NおよびK228T;P151N、V153T、T172NおよびR338A;P151N、V153T、D177EおよびF178T;P151N、V153T、G226NおよびK228T;T172N、G226N、K228TおよびR338A;D85N、K122T、P151N、V153TおよびE242N;D85N、P151N、V153T、G226NおよびK228T;K122T、P151N、V153T、G226NおよびK228T;S138N、P151N、V153T、G226NおよびK228T;T148N、F150T、G226N、K228TおよびR338A;P151N、V153T、T172N、G226NおよびK228T;P151N、V153T、D177E、F178TおよびR338A;P151N、V153T、G226N、K228TおよびR338A;およびP151N、V153T、T172N、G226N、K228TおよびR338A;ならびにそれらの任意の組合せ。
- 1つ以上のアミノ酸置換が以下のものから選択される、請求項1から4のいずれかに記載のポリペプチド:R37N;D85N;K122T;S138N;A146N;A161N;Q170N;T172N;D177N;F178T;K201N;K228N;E239N;E242N;I251T;A262T;E294N;E374N;E410N;G59NおよびS61T;K63NおよびD65T;G76NおよびE78T;S102NおよびD104T;A103NおよびN105T;D104NおよびK106T;E119NおよびQ121T;Q121NおよびS123T;S136NおよびS138T;Q139NおよびS141T;T140NおよびK142T;T148NおよびF150T;V149NおよびP151T;P151NおよびV153T;D152NおよびD154T;V153NおよびY155T;D154NおよびV156T;V156NおよびS158T;S158NおよびE160T;E160NおよびE162T;E162NおよびI164T;T163NおよびL165T;I164NおよびD166T;D166NおよびI168T;I168NおよびQ170T;S171NおよびQ173T;T172NおよびS174T;Q173NおよびF175T;S174NおよびN176T;K201NおよびD203T;V202NおよびA204T;E224NおよびG226T;T225NおよびV227T;G226NおよびK228T;T241NおよびH243T;I251NおよびI253T;I253NおよびP255T;A262NおよびN264T;V280NおよびN282T;T343NおよびY345T;E372NおよびE374T;D85N、K122TおよびE242N;D85N、K122TおよびI251T;F150N、P151AおよびD152T;T172N、G226NおよびK228T;D85N、P151N、V153TおよびK228N;D85N、P151N、V153TおよびE242N;K122T、P151N、V153TおよびK228N;K122T、P151N、V153TおよびE242N;K122T、P151N、V153TおよびI251T;P151、V153T、G226NおよびK228T;D85N、K122T、P151N、V153TおよびE242N;D85N、P151N、V153T、G226NおよびK228T;S138N、P151N、V153T、G226NおよびK228T;P151N、V153T、T172N、G226NおよびK228T。
- 1つ以上のアミノ酸置換が以下のものから選択される、請求項1から4のいずれかに記載のポリペプチド:D85N;K122T;S138N;T172N;K201N;K228N;E239N;E242N;I251T;A262T;E294N;G59NおよびS61T;G76NおよびE78T;S102NおよびD104T;A103NおよびN105T;D104NおよびK106T;E119NおよびQ121T;Q121NおよびS123T;S136NおよびS138T;Q139NおよびS141T;T140NおよびK142T;T148NおよびF150T;V149NおよびP151T;P151NおよびV153T;D152NおよびD154T;S158NおよびE160T;E162NおよびI164T;T163NおよびL165T;T172NおよびS174T;Q173NおよびF175T;K201NおよびD203T;T225NおよびV227T;G226NおよびK228T;I253NおよびP255T;A262NおよびN264T;V280NおよびN282T;E372NおよびE374T;およびD85N、K122TおよびE242N;D85N、K122TおよびI251T;F150N、P151AおよびD152T;T172N、G226NおよびK228T;D85N、P151N、V153TおよびK228N;D85N、P151N、V153TおよびE242N;K122T、P151N、V153TおよびK228N;K122T、P151N、V153TおよびE242N;K122T、P151N、V153TおよびI251T;P151、V153T、G226NおよびK228T;D85N、K122T、P151N、V153TおよびE242N;D85N、P151N、V153T、G226NおよびK228T;S138N、P151N、V153T、G226NおよびK228T;P151N、V153T、T172N、G226NおよびK228T。
- 以下のアミノ酸配列を含む第IX因子ポリペプチド:
YNSGKLEEFVQGNLERECMEEKCSFEEAREVFENTERTTEFWKQYVDGDQCESNPCLNGGSCKDDINSYECWCPFGFEGKNCELX85X86TCNIKNGRCEQFCKNSAX104NKVVCSCTEGYRLAENX121KSCEPAVPFPCGRVSVX138QTSKLTRAEX148VX150X151X152X153DYVNSX159EZ1X161Z2EZ3TZ4ILDNIX169QSX172QX174FNX177X178TRVVGGEDAKPGQFPWQVVLNGKVDAFCGGSIVNEKWIVTAAHCVETX226VX228ITVVAGEHNIEETEHTEQKRNVIRIIPHHNYNAAINKYNHDIALLELDEPLVLNSYVTPICIADKEYTNIFLKFGSGYVSGWGRVFHKGRSALVLQYLRVPLVDRATCLX338STKFTIYNNMFCAGX353X354X355GGRDSCQGDSGGPHX370X371X372VEGTSFLTGIISWGEECAX391X392X393KYGIYTKVSRYVNWIKEKTX413X414T(配列番号:3);
ここで、X85はDおよびEから選択され;
ここで、X86はA、E、P、SおよびVから選択され;
ここで、X104はD、NおよびTから選択され;
ここで、X121はN、QおよびTから選択され;
ここで、X138はN、SおよびTから選択され;
ここで、X148およびX150は以下から選択され:
(i)X148はTであり、そしてX150はFである;
(ii)X148はNであり、そしてX150はTである;および
(iii)X148はNであり、そしてX150はSである;
ここで、X151はA、PおよびTから選択され;
ここで、X151およびX153は以下から選択され:
(i)X151はPであり、そしてX153はVである;
(ii)X151はNであり、そしてX153はTである;および
(iii)X151はNであり、そしてX153はSである;
ここで、Z1、Z2、Z3およびZ4は、独立して以下から選択され
(i)0から12のアミノ酸残基、および
(ii)配列番号:2;
ここで、X152はD、NおよびTから選択され;
ここで、X159およびX161は以下から選択され:
(i)X159はTであり、そしてX161はAである;
(ii)X159はNであり、そしてX161はTである;および
(iii)X159はNであり、そしてX161はSである;
ここで、X169はTおよびNから選択され;
ここで、X172はTおよびNから選択され;
ここで、X174はSおよびTから選択され;
ここで、X177およびX178は以下から選択され:
(i)X177はDであり、そしてX178はFである;
(ii)X177はEであり、そしてX178はTである;および
(iii)X177はEまたはDであり、そしてX178はSである;
ここで、X226およびX228は以下から選択され:
(i)X226はGであり、そしてX228はKである;
(ii)X226はNであり、そしてX228はTである;および
(iii)X226はNであり、そしてX228はSである;
ここで、X338はRおよびAから選択され;
ここで、X353、X354およびX355は以下から選択され:
(i)X353はFであり、X354はHであり、X355はEである;
(ii)X353はNであり、X354はVであり、X355はTである;
(iii)X353はNであり、X354はIであり、X355はTである;および
(iv)X353はNであり、X354はH、VまたはIであり、X355はSである;
ここで、X370、X371およびX372は以下から選択され:
(i)X370はVであり、X371はTであり、X372はEである;
(ii)X370はNであり、X371はVであり、X372はTである;
(iii)X370はNであり、X371はIであり、X372はTである;および
(iv)X370はNであり、X371はT、VまたはIであり、X372はSである;
ここで、X391、X392およびX393は以下から選択され:
(i)X391はMであり、X392はKであり、X393はGである;
(ii)X391はNであり、X392はKであり、X393はTである;
(iii)X391はNであり、X392はVであり、X393はTである;および
(iv)X391はNであり、X392はVまたはKであり、X393はSである;
ここで、X413およびX414は以下から選択される:
(i)X413はKであり、そしてX414はLである;
(ii)X413はNであり、そしてX414はLである;および
(iii)X413はNであり、そしてX414はIである;(そして
ここで、該FIXポリペプチドは、配列番号:1を有するFIXポリペプチドと比較して、少なくとも1つの導入されたグリコシル化部位を含む)。 - R338AおよびV86Aから選択されるアミノ酸置換をさらに含む、請求項6または7に記載のポリペプチド。
- アミノ酸配列が、1から10個のアミノ酸残基をヒト第IX因子のアミノ酸残基160−164間に導入することにより修飾されることにより、1つ以上のグリコシル化部位が導入されたものである、請求項1−9のいずれかに記載のポリペプチド。
- アミノ酸残基が、アミノ酸残基160−161間、アミノ酸残基161−162間、アミノ酸残基162−163間またはアミノ酸残基163−164間に挿入されている、請求項10に記載のポリペプチド。
- 配列番号:2のアミノ酸配列を含むポリペプチドがアミノ酸残基160−161間、アミノ酸残基161−162間、アミノ酸残基162−163間またはアミノ酸残基163−164間に導入されている、請求項11に記載のポリペプチド。
- 以下のものから選択されるアミノ酸置換をさらに含む、請求項11または12に記載のポリペプチド:V86A;R338A;V86AおよびR338A;T148NおよびF150T;D177EおよびF178T;P151NおよびV153T;P151N、V153TおよびT172N;G226NおよびK228T。
- アミノ酸配列が、1から10個のアミノ酸残基を第IX因子ポリペプチドのC末端に導入することにより、1つ以上のグリコシル化部位の導入をもたらされるように修飾された、請求項1−7のいずれかに記載のポリペプチド。
- 配列番号:4、配列番号:5、配列番号:6および配列番号:7から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドが第IX因子ポリペプチドのC末端に導入されている、請求項14に記載のポリペプチド。
- R338A置換およびV86A置換を含む第IX因子ポリペプチド。
- 1つ以上の導入されたグリコシル化部位での炭水化物鎖の結合が、導入されたグリコシル化部位を欠いているポリペプチドと比較して、ポリペプチドの血清半減期を少なくとも30%増加させる、請求項1から15のいずれかに記載のポリペプチド。
- ポリペプチドがポリペプチドのmgあたり少なくとも100単位の比活性を有する、請求項1から17のいずれかに記載のポリペプチド。
- 請求項1−18のいずれかに記載の第IX因子ポリペプチドおよび薬学的に許容される担体を含む医薬品。
- 治療有効量の請求項19に記載の医薬品を必要とする対象に投与することを含む、血友病Bを処置する方法。
- 請求項1−18のいずれかに記載のポリペプチドをコードするDNA配列。
- 宿主細胞が第IX因子ポリペプチドを発現することを可能とする様式における、請求項20に記載のDNA配列をトランスフェクトされた真核生物宿主細胞。
- (i)1つ以上のグリコシル化部位を導入することによりポリペプチドのアミノ酸配列を修飾し;(ii)1つ以上のグリコシル化部位でグリコシル化することを可能とする様式においてポリペプチドを発現させ;そして(iii)該ポリペプチドを精製することを含む、第IX因子ポリペプチドを生産する方法。
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