JP2010517531A - Cxcr3に対するヒト化抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2007年2月1日出願の米国仮出願第60/898,709号に基づく優先権を主張し、その開示は、参照により完全に本明細書に組み入れられる。
ケモカインとそれらの受容体との間の相互作用は、白血球遊走の制御における重要な段階である。ケモカインは、細胞関連サイトカイン応答の誘導および増強を含む、走化性とは無関係の多様な効果も媒介する。
ケモカイン受容体CXCR3(GenBank gi:4504099参照)に特異的に結合する抗原結合ポリペプチド分子が開示される。ポリペプチドは、ヒト化重鎖可変領域およびヒト化軽鎖可変領域を含む。例えば、ポリペプチドは、親モノクローナル抗体の抗原結合特異性を実質的に保持しつつ、ヒト抗体の軽鎖および重鎖の可変領域のフレームワーク(FR)領域を含み得る。ヒト化重鎖可変領域および/またはヒト化軽鎖可変領域は、CDRを除き、少なくとも約90%ヒト化(好ましくは少なくとも約95%ヒト化、より好ましくは少なくとも約98%ヒト化、さらに好ましくは少なくとも約100%ヒト化)されている。抗原結合ポリペプチド分子は、モノクローナル抗体ドナー(例えば、マウスモノクローナル抗体ドナー)に由来し得、モノクローナル抗体に由来するCDR(例えば、マウスモノクローナルCDR)を含み得る。ポリペプチドは、CXCR3受容体のアンタゴニストとして機能し得る。
(a)
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含むヒト化抗体重鎖可変領域と、
(b)
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含むヒト化抗体軽鎖可変領域と
を含む。ポリペプチドは、
のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み得る。
(1)CDR-H1は
のアミノ酸配列からなり;
(2)CDR-H2は
のアミノ酸配列からなり;
(3)CDR-H3は
のアミノ酸配列からなり;
(4)CDR-L1は
のアミノ酸配列からなり;
(5)CDR-L2は
のアミノ酸配列からなり;かつ
(6)CDR-L3は
のアミノ酸配列からなる。例えば、CDR-H3は
のアミノ酸配列からなり得る。
のヒト化抗体重鎖可変領域を含む。例えば、ポリペプチドは、
のヒト化抗体重鎖可変領域を含み得る。いくつかの態様において、ポリペプチドは、
のヒト化抗体軽鎖可変領域を含む。例えば、ポリペプチドは、
のヒト化抗体軽鎖可変領域を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含み得る。例えば、ヒト化抗体重鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含む。例えば、ヒト化抗体重鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含む。例えば、ヒト化抗体重鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含む。例えば、ヒト化抗体重鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含む。例えば、ヒト化抗体重鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-H1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-H2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-H3
を含む。例えば、ヒト化抗体重鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含み得る。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
(1)
のアミノ酸配列を含むCDR-L1;
(2)
のアミノ酸配列を含むCDR-L2;および
(3)
のアミノ酸配列を含むCDR-L3
を含む。例えば、ヒト化抗体軽鎖可変領域は
のアミノ酸配列を含み得る。
定義
抗体とは、本明細書に記載されるように、全長の(即ち、天然に存在する、もしくは正常な免疫グロブリン遺伝子断片組み換え(recombinatorial)過程により形成される)免疫グロブリン分子(例えば、IgG抗体)、または抗体断片のような免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な(即ち特異的に結合する)部分をさす。
ハイブリドーマ技術を使用したマウスIgG1,k CXCR-3結合抗体の単離
BALB/cマウスを、CXCR-3発現NSO細胞により免疫感作した。典型的な手法で、50ulのRIBIアジュバント(Sigma)中の5×106細胞を後足蹠に注射した(1足蹠当たり25ul)。RIBIアジュバントでの注射を、さらに2回、2週間間隔で与え、続いてPBSでの最終追加刺激を行った。3日後、マウスを屠殺し、膝窩リンパ節を採集し、融合のためにリンパ球を単離した。融合剤としてPEG/DMSO(Sigma)を使用して、5:1比で、リンパ球をP3X63Ag8.653形質細胞腫細胞と融合させた。融合細胞を選択HAT培地に再懸濁させた後、96穴プレートに1ウェル当たり106細胞で播種した。HAT選択で生存したハイブリドーマからの上清を、マウスIgGの存在についてELISAによりスクリーニングした。IgG産生ハイブリドーマを同定し、それらの上清を、さらに、CXCR3発現NSO細胞(CXCR3+NSO)と結合する抗体についてFACS分析によりスクリーニングした。次いで、CXCR3+NSO細胞結合陽性と同定されたハイブリドーマを、CXCR3特異的クローンを同定するため、CXCR3+NSO細胞およびPC-NSO(ベクター対照)細胞との差次的な結合についてスクリーニングした。CXCR3特異的ハイブリドーマを、限界希釈により2回サブクローニングした。ハイブリドーマサブクローンを無血清培地で増幅し、抗体をプロテイン-Aカラムで精製し、リード候補を選出するためにさらに特徴決定した。
抗CXCR3抗体のヒト化における一つの目標は、最初の結合親和性および特異性の90〜100%を保持している60〜80%ヒト化されたVHドメインおよびVKドメインを入手することであった。結合親和性および特異性を維持しつつ、抗体をさらにヒト化するため、VHおよびVKにおける個々の高リスク位置の部位特異的変異誘発を使用した。
VH3-23生殖系列
。マウスVK配列については、(V-baseで名付けられたような)ヒト生殖系列配列A14およびL6が、最適なマッチとして同定された:
L6生殖系列
;および
A14生殖系列
。
ハイブリドーマ細胞をペレット化し、PBSで3回洗浄し、製造業者のプロトコルに従いTrizol試薬(Invitrogen, Cat. No. 15596-026)を使用してRNAを抽出した。全RNAを、製造業者のプロトコルに従い、5'RACEキット(Rapid Amplification of cDNA Ends, Invitrogen, Cat. No. 18374-058)を使用して、cDNAに変換した。簡単に説明すると、RNAをランダムヘキサマープライマー、ランダムN6にライゲートさせ、superscript II RNAaseH陰性逆転写酵素を使用して第1鎖cDNAを作成した。cDNAを、キットと共に提供されたGlassMaxスピンカートリッジを使用して精製し、次いで、cDNAの5'末端にC塩基対を添付するためにdCTPの存在下でTdT(ターミナルデオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ)と反応させた。dCテールを有するcDNAを、dCテールに特異的なアンカープライマー、ならびにVHについてはマウス定常重鎖1(CH1)およびVKについては定常κ(CK)における高度に保存されたDNA配列にハイブリダイズする遺伝子特異的プライマーを使用してPCR増幅した。得られたPCR産物を、完全なVHドメインまたはVKドメインに対応する正確なサイズについてゲル電気泳動により分析し、次いで精製し、製造業者のプロトコルに従いTopo TAベクター(Invitrogen Cat. No. 45-0071)にライゲートさせた。細菌への形質転換の後、正確なサイズのインサートを含有しているクローンからDNAを調製し、製造業者のプロトコルに従い、Big Dyeターミネーター配列決定反応ミックス(Applied Biosystems, Part No. 4336699)および3700 ABI/Prism DNA分析機を使用してDNA配列を決定した。
まず、単一のリードマウス抗CXCR3抗体V44D7を、前記のようにして作成された結合データおよび配列データに基づき同定した。この抗体からのVHドメインおよびVKドメインのアミノ酸配列を、現在入手可能な公的データベース(即ち、NCBIのBlast for IgGおよびMRCのV-base)を使用して、全ての公知のヒト生殖系列VHドメインおよびVKドメインと整列化した。フレームワーク領域内のアラインメントに焦点を当てることにより、高度に相同なヒト生殖系列VHドメイン、VH3-23、および2個の異なるヒト生殖系列VKドメイン、A14およびL6が同定された。マウス配列がヒト生殖系列と異なっているフレームワーク内の位置においては、対応するヒト生殖系列フレームワークとマッチするよう、マウスフレームワークを変換するかまたは変異させるために反復過程を使用した。さらに、フレームワーク残基変化による親和性の損失の補償を可能性として補助するために、VHおよびVKの両方のCDR3におけるある種の残基を、チロシンとの交換により変異させた(即ち、親和性熟成させた)。親和性成熟されヒト化されたマウスVHドメインおよびVKドメインを、重複する合成DNAオリゴヌクレオチドのパネルを使用して、ポリメラーゼ連鎖反応過程により作成した。合成遺伝子設計過程の一部として、コドン最適化戦略を使用した。即ち、遺伝子発現のため哺乳動物細胞により優先的に利用される各アミノ酸のトリプレットコードを、各位置に組み入れた。完全にヒトのIgG1、G4、またはκ抗体骨格の情況において、対応するドメインが発現されることを可能にする、専門の哺乳動物発現ベクターに、合成のVHドメインおよびVKドメインをクローニングした。ヒト化抗体の小規模作製は、製造業者のプロトコルに従いリポフェクタミン(Invitrogen)を用いた、293F細胞へのIgG1またはG4構築物のκ構築物とのコトランスフェクションにより達成された。一過性トランスフェクションからの上清を、プロテインAまたはG樹脂に通し、細胞に基づくアッセイでの試験のため均質になるまでIgGを精製した。
様々な市販のCXR3mAbを、ユウロピウム(Eu)で標識されたマウスCXCR3mAbを使用した競合結合アッセイにおいて試験した。様々な販売元からのCXCR3mAbが、CXCR3へのEu-CXCR3mAbの結合を阻害した。このデータは、マウスCXCR3mAb抗体および市販の抗体が、CXCR3上の重複するエピトープと結合することを示した(図13)。
マウスCXCR3mAbおよびヒト化CXCR3mAbの結合親和性および活性は、125IおよびEuで標識されたケモカイン、ならびにEuで標識されたCXCR3mAbを使用した様々な競合結合アッセイ、ならびに以下のものを含むTh1走化性アッセイにより決定された:125I-CXCL10結合アッセイ;125I-CXCL11結合アッセイ;Eu-CXCL10結合アッセイ;Th1走化性アッセイ;およびEu-マウスCXCR3mAb結合アッセイ。
臍帯血から作成された初代Th1細胞を、全ての結合アッセイに使用した。文献に記載されるように、CXCR3発現は、FACS分析により決定されるように、Th1細胞にのみ観察され、Th2細胞には観察されなかった(図14)。Th2細胞はCCR4を特異的に発現した。
マウスCXCR3mAb抗体の結合親和性は、放射標識されたCXCL10およびCXCL11とTh1細胞との結合を阻害する能力に基づき決定された(図15、16、18、および19、ならびに表1)。これらの結合研究および走化性アッセイに基づき、3つのマウスCXCRmAbがさらなる研究のために選択された。
Ab#1-5D4A;Ab#2-8A5A;Ab#3-19G2;Ab#4-V36E5A;Ab#5-V44D7A;Ab#6-37B5A;Ab#7-21A4A;Ab#8-V15F4A;Ab#9-V3G6A;Ab#10-23E12A;Ab#11-35C4;Ab#12-39E10。
CXCR3に対するマウスCXCR3抗体の結合親和性は、ユウロピウムで標識されたマウスCXCR3抗体を使用した直接飽和結合アッセイにより決定された。1つのマウスCXCR3mAbを使用したこのアッセイの一例が、図17に示される。この研究からのデータは、CXCR3へのEu-CXCR3mAbの結合が特異的であり、nM以下(0.47nM)のKdの結合親和性で飽和可能であることを示した。
マウス抗体ハイブリドーマ(20000)を、Eu-二次抗体を使用して、CXCR3+およびCXCR3-NSO膜を用いた差次的スクリーニングアッセイ(DELFIA)によりスクリーニングした。CXCR3+膜と結合した抗体(〜2000)を、CXCR3+/CXCR3- NSOおよびTh1細胞を使用したFACSによりさらに試験した。CXCR3発現細胞へのCXCR3mAbの特異的な結合についての一例は、図3に示される。
親マウスCXCR3mAbを、FACSにより、偏向ラットTh1細胞との結合について試験した。ウサギ抗マウスCXCR3 Ab(陽性対照)のみがラットTh1細胞と結合した。マウス親CXCR3mAbは、図20に示されるように、ラットTh1細胞と結合しなかった。
結合アッセイ:CXCR3mAbは、125Iで標識されたIP-10およびI-Tacの、初代Th1細胞への結合を特異的に阻害した。標識されたMigが入手不可能であったため、それは結合アッセイにおいて試験されなかった。走化性アッセイ:CXCR3mAbは、CXCR3ケモカインにより媒介されるTh1細胞遊走を阻害した。
マウスCXCR3mAbを、Th1細胞におけるca動員の誘導におけるアゴニスト活性について試験した。図24に示されるように、いずれの抗体も、Ca++流入の誘導におけるアゴニスト活性を示さなかった。
Claims (98)
- 抗体分子、Fab断片、Fab'断片、F(ab')2断片、およびscFv分子からなる群より選択される、請求項1〜10のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 分子が抗体分子である、請求項11記載のポリペプチド。
- 抗体が、ヒト重鎖定常領域とヒト軽鎖定常領域とを含むキメラ抗体である、請求項12記載のポリペプチド。
- 抗体が、IgG分子(例えば、IgG1分子またはIgG4分子)である、請求項12または13記載のポリペプチド。
- scFv分子である、請求項1記載のポリペプチド。
- scFvがNH2-L-VH-X-VK-COOHおよびNH2-L-VK-X-VH-COOHからなる群より選択される式を有し、式中、Lはリーダー配列であり;VHはヒト化抗体重鎖可変領域であり;Xは連結ポリペプチドであり;かつVKはヒト化抗体軽鎖可変領域である、請求項15記載のポリペプチド。
- 治療剤または診断剤と結合している、請求項1〜16のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 治療剤が、細胞障害剤、放射性標識、免疫調節剤、ホルモン、酵素、オリゴヌクレオチド、光活性治療剤、またはそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項17記載のポリペプチド。
- 診断剤が、放射性標識、光活性診断剤、超音波増強剤、または非放射性標識からなる群より選択される、請求項18記載のポリペプチド。
- CXCR3のアンタゴニストである、請求項1〜19のいずれか一項記載のポリペプチド。
- CXCR3のアゴニストではない、請求項1〜20のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 少なくとも約106M-1(好ましくは少なくとも約107M-1、より好ましくは少なくとも約108M-1、さらに好ましくは少なくとも約109M-1)の親和性定数でCXCR3に結合する、請求項1〜21のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 請求項1〜22のいずれか一項記載のポリペプチドと担体とを含む、薬学的組成物。
- 付加的な治療剤または診断剤をさらに含む、請求項23記載の薬学的組成物。
- 請求項23または24記載の組成物をその必要がある患者に投与する段階を含む、炎症性の疾患または状態を処置または診断する方法。
- 請求項23または24記載の組成物をその必要がある患者に投与する段階を含む、免疫性の疾患または状態を処置または診断する方法。
- 請求項23または24記載の組成物をその必要がある患者に投与する段階を含む、悪性の疾患または状態を処置または診断する方法。
- 疾患または状態が、自己免疫疾患(例えば、狼瘡)、炎症性腸疾患(IBD)、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、関節炎(例えば、関節リウマチ)、多発性硬化症、移植片拒絶、中枢神経系損傷、クローン病、乾癬、および白血病またはリンパ腫(例えば、慢性リンパ球性白血病(CLL))からなる群より選択される、請求項24〜27のいずれか一項記載の方法。
- 請求項1〜22のいずれか一項記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 請求項29〜36のいずれか一項記載のポリヌクレオチドに機能的に連結されたプロモーター配列を含む、組換えポリヌクレオチド。
- 請求項37記載のポリヌクレオチドにより形質転換された、単離された細胞。
- 以下の段階を含む、請求項37記載の組換えポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドを作製する方法:
(a)組換えポリヌクレオチドにより形質転換された細胞を培養して、コードポリペプチドを発現させる段階;および
(b)そのように発現されたポリペプチドを回収する段階。 - 請求項40〜51のいずれか一項記載のヒト化重鎖および請求項52〜67のいずれか一項記載のヒト化軽鎖を含む、CXCR3に特異的に結合する抗原結合ポリペプチド。
- 請求項48または49記載のヒト化重鎖および請求項52または53記載のヒト化軽鎖を含む、請求項68記載のポリペプチド。
- 請求項48または49記載のヒト化重鎖および請求項64または65記載のヒト化軽鎖を含む、請求項68記載のポリペプチド。
- 請求項48または49記載のヒト化重鎖および請求項54または55記載のヒト化軽鎖を含む、請求項68記載のポリペプチド。
- 請求項48または49記載のヒト化重鎖および請求項56または57記載のヒト化軽鎖を含む、請求項68記載のポリペプチド。
- 請求項48または49記載のヒト化重鎖および請求項58または59記載のヒト化軽鎖を含む、請求項68記載のポリペプチド。
- 請求項48または49記載のヒト化重鎖および請求項60または61記載のヒト化軽鎖を含む、請求項68記載のポリペプチド。
- 抗体分子、Fab断片、Fab'断片、F(ab')2断片、およびscFv分子からなる群より選択される、請求項68〜74のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 分子が抗体分子である、請求項75記載のポリペプチド。
- 抗体が、ヒト重鎖定常領域とヒト軽鎖定常領域とを含むキメラ抗体である、請求項76記載のポリペプチド。
- 抗体が、IgG分子(例えば、IgG1分子またはIgG4分子)である、請求項76または77記載のポリペプチド。
- 分子がscFv分子である、請求項75記載のポリペプチド。
- scFvがNH2-L-VH-X-VK-COOHおよびNH2-L-VK-X-VH-COOHからなる群より選択される式を有し、式中、Lはリーダー配列であり;VHはヒト化抗体重鎖可変領域であり;Xは連結ポリペプチドであり;かつVKはヒト化抗体軽鎖可変領域である、請求項79記載のポリペプチド。
- 治療剤または診断剤と結合している、請求項68〜80のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 治療剤が、細胞障害剤、放射性標識、免疫調節剤、ホルモン、酵素、オリゴヌクレオチド、光活性治療剤、またはそれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項81記載のポリペプチド。
- 診断剤が、放射性標識、光活性診断剤、超音波増強剤、または非放射性標識からなる群より選択される、請求項81記載のポリペプチド。
- CXCR3のアンタゴニストである、請求項68〜83のいずれか一項記載のポリペプチド。
- CXCR3のアゴニストではない、請求項68〜84のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 少なくとも約106M-1(好ましくは少なくとも約107M-1、より好ましくは少なくとも約108M-1、さらに好ましくは少なくとも約109M-1)の親和性定数でCXCR3に結合する、請求項68〜85のいずれか一項記載のポリペプチド。
- 請求項68〜86のいずれか一項記載のポリペプチドと担体とを含む、薬学的組成物。
- 付加的な治療剤または診断剤をさらに含む、請求項81記載の薬学的組成物。
- 請求項87または88記載の組成物をその必要がある患者に投与する段階を含む、炎症性の疾患または状態を処置または診断する方法。
- 請求項87または88記載の組成物をその必要がある患者に投与する段階を含む、免疫性の疾患または状態を処置または診断する方法。
- 請求項87または88記載の組成物をその必要がある患者に投与する段階を含む、悪性の疾患または状態を処置または診断する方法。
- 疾患または状態が、自己免疫疾患(例えば、狼瘡)、炎症性腸疾患(IBD)、慢性閉塞性肺疾患(COPD)、関節炎(例えば、関節リウマチ)、多発性硬化症、移植片拒絶、中枢神経系損傷、クローン病、乾癬、および白血病またはリンパ腫(例えば、慢性リンパ球性白血病(CLL))からなる群より選択される、請求項89〜91のいずれか一項記載の方法。
- 請求項40〜51のいずれか一項記載のヒト化重鎖可変領域をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項52〜67のいずれか一項記載のヒト化軽鎖可変領域をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項68〜86のいずれか一項記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 請求項93〜95のいずれか一項記載のポリヌクレオチドに機能的に連結されたプロモーター配列を含む、組換えポリヌクレオチド。
- 請求項96記載のポリヌクレオチドにより形質転換された、単離された細胞。
- 以下の段階を含む、請求項96記載の組換えポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドを作製する方法:
(a)組換えポリヌクレオチドにより形質転換された細胞を培養して、コードポリペプチドを発現させる段階;および
(b)そのように発現されたポリペプチドを回収する段階。
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