JP2010517026A - 光学的測定方法及び電気的測定方法の両方を用いたアナライトの検出方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】1又は複数のアナライトが、前記アナライトに関係付け可能である1以上の標識で標識化されており、(a)前記1又は複数の標識化アナライトに対して光学的検出法を行い、前記1以上の標識から光学的データを得る工程と、(b)前記1又は複数の標識化アナライトに対して電気的検出法を行い、前記1以上の標識から電気的データを得る工程と、(c)前記光学的データ及び電気的データの両方に基づき前記1又は複数のアナライトの同定及び定量の少なくともいずれかを行う工程とを含む1又は複数のアナライトの検出方法の提供。
【選択図】図3
Description
本発明の好ましい実施形態においては、1以上の標識は、ナノ粒子、単一分子、特定のヌクレオチドやアミノ酸などの標的に内在する要素、及び化学発光酵素から選択される。適切な化学発光酵素としては、HRPやアルカリホスファターゼを挙げることができる。
本発明の好ましい実施形態においては、本発明の方法は、工程(a)の前に、1以上の標識を用いてアナライトを標識化する工程を更に含み、標識化アナライトを形成する。
光学的検出法は、発光検出法、吸光検出法、光散乱検出法、スペクトルシフト検出法、表面プラズモン共鳴イメージング法、及び吸着染料由来の表面増強ラマン散乱法からなる群から選択されるのが好ましい。
電気的検出法は、電気抵抗検出及び電気化学検出から選択されることが好ましい。
(i)標識化アナライトを、2個の電極を含む溶液中に投入して、1以上の標識を前記溶液に溶解させる工程と、
(ii)前記電極に析出電位を印加して、前記1以上の標識を前記電極の内の1個に析出させる工程と、
(iii)電極からの電気化学信号を検出する工程とを含む。
本発明の方法の工程(c)においては、工程(b)で得られた光学的データ及び電気的データの両方に基づき、1又は複数のアナライトの同定及び/又は定量を行う。
RNAは従来の技術に従い逆転写させて、ナノ粒子で標識化されたヌクレオチドを取り込ませる。
従来の方法に従って、標識を所定波長の光で励起して、その発光を所定波長で検出する。
<金電極の清浄>
リン酸緩衝生理食塩水(PBS)中、電気化学パルス法を1.4V(Ag/AgCl参照電極に対して)で用いて、金電極を30秒間清浄した。次いで、電極を超純水で室温にて5分間洗浄した。続いて、電極を窒素気流下室温にて1分間乾燥させた。
固定化に先立ち、5mMのTCEP(トリス(2‐カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩)のPBS溶液で30分間処理し、チオエート化オリゴヌクレオチドからジスルフィド保護基を脱離させ、続いてMicroSpin(商標)G‐25カラムを用いて精製した。オリゴヌクレオチド(HCVプローブ=5’−GGC AAT TCC GGT GTA CTC ACC GGT TCC GCA GAC CAC TAT GGC TCT CCC GGG AGG GGG GG−3’[5’]=SH)(10μM 75量体チオール修飾一本鎖DNA)を、PBS(10mM、137mM NaCl、2.7mM KCl、pH7.4)中、清浄した金電極上において30℃で16時間インキュベートした。電極に対し、PBSによる洗浄、NaCl(1M)による洗浄、次にPBSによる洗浄の一連の洗浄を3回(それぞれ10分間)行った。次いで、窒素気流下で室温にて1分間電極を乾燥させた。使用前は、2×SSC緩衝液中に4℃で電極を保管した。
電気化学インピーダンス分光法は、10mMの[Fe(CN)6]3−/4−を含有する2×SSC緩衝液(電気化学緩衝液(EB))中で、周波数窓100kHz〜100mHzにおけるAg/AgCl参照電極に対し、0.24Vの直流電圧を重畳した交流電圧10mVを用いて実施した。次に、室温にて1分間電極を水洗し、窒素気流下で1分間乾燥させた。HCV標的とハイブリダイズさせるために、100nMの標的DNA(A又はB)と電極とを、2×SSC緩衝液中、55℃で2時間インキュベートした。
B:非相補性HCV標的=5’−AGT GTT GAG GGC CGT AAG CGT GTT GTG TCC GAC GCT GCC TGC GCA CTG CCG GTG CGT GTC GTC CCA CGG TAT TTG−3’,[5]=Cy3
1回のハイブリダイゼーション実験の電気化学的検出及び光学的検出の結果を評価するために、電子移動抵抗(Ret)の検出は電気化学インピーダンス分光法によって行い(図1参照)、蛍光強度の測定はTecan LS reloadedマイクロアレイスキャナーを用いて行った(図2参照)。相補性標的DNAのハイブリダイゼーション後に、蛍光強度とRetの増加(10kΩ)が明らかに認められた(電極1参照)。プローブのみを有する電極の蛍光強度の値は27±57a.u.の範囲である。非相補性標的とのインキュベーションでは信号の変化量が明らかに減少するので(電極2参照)、相補性標的によりもたらされるイベントと明確に区別することができる。なお、各標的の結合作用の評価は、クロスコンタミネーションを排除するため異なる電極を用いて行った。
Claims (37)
- アナライトを検出する方法であって、
前記アナライトが、前記アナライトに関係付け可能である(relatable)1以上の標識で標識化されており、
(a)標識化アナライトに対して光学的検出法を行い、前記1以上の標識から光学的データを得る工程と、
(b)前記標識化アナライトに対して電気的検出法を行い、前記1以上の標識から電気的データを得る工程と、
(c)前記光学的データ及び電気的データの両方に基づきアナライトの同定及び定量の少なくともいずれかを行う工程とを含むことを特徴とするアナライトの検出方法。 - 1以上の標識が光学的検出及び電気的検出に適切であり、かつ工程(a)における1以上の標識が、工程(b)における1以上の標識と同一である請求項1に記載の方法。
- 工程(a)の前に、1以上の標識を用いてアナライトを標識化する工程を更に含み、標識化アナライトを形成する請求項2に記載の方法。
- 工程(a)における1以上の標識が光学的検出に適切であり、工程(b)における1以上の標識が電気的検出に適切であり、前記工程(a)における前記1以上の標識が前記工程(b)における前記1以上の標識と異なる請求項1に記載の方法。
- 工程(a)の前に、前記工程(a)における1以上の標識を用いてアナライトを標識化する工程、及び工程(b)における1以上の標識を用いてアナライトを標識化する工程を更に含み、同時又は別々に標識化アナライトを形成する請求項4に記載の方法。
- 複数のアナライトを検出する方法であって、
それぞれ異なる前記アナライトが、前記アナライトに関係付け可能である1以上の異なる標識で標識化されており、
(a)複数の標識化アナライトに対して光学的検出法を行い、前記標識から光学的データを得る工程と、
(b)前記複数の標識化アナライトに対して電気化学的検出法を行い、前記標識から電気的データを得る工程と、
(c)前記光学的データ及び電気的データの両方に基づき前記複数のアナライトの同定及び定量の少なくともいずれかを行う工程とを含むことを特徴とする複数のアナライトの検出方法。 - 1以上の標識が光学的検出及び電気的検出に適切であり、工程(a)における各アナライトの1以上の標識が工程(b)における各アナライトの1以上の標識と同一である請求項6に記載の方法。
- 工程(a)の前に、1以上の標識を用いて複数のアナライトを標識化する工程を更に含み、標識化アナライトを形成する請求項7に記載の方法。
- 工程(a)における1以上の標識が光学的検出に適切であり、工程(b)における1以上の標識が電気的検出に適切であり、工程(a)における各アナライトの1以上の標識が工程(b)における各アナライトの1以上の標識と異なる請求項6に記載の方法。
- 工程(a)の前に、前記工程(a)における1以上の標識を用いて複数のアナライトを標識化する工程、及び工程(b)における1以上の標識を用いて複数のアナライトを標識化する工程を更に含み、同時又は別々に標識化アナライトを形成する請求項9に記載の方法。
- 標識がナノ粒子、単一分子、化学発光酵素、及び蛍光色素分子から選択される請求項1から10のいずれかに記載の方法。
- 標識が分子及び原子の少なくともいずれかの集合物を含むナノ粒子である請求項11に記載の方法。
- ナノ粒子が金属、金属ナノシェル、二元金属化合物、及び量子ドットから選択される請求項12に記載の方法。
- ナノ粒子がCdSe、ZnS、CdTe、CdS、PbS、PbSe、HgI、ZnTe、GaAs、HgS、CdAs、CdP、ZnP、AgS、InP、GaP、GaInP、及びInGaNから選択される金属化合物である請求項13に記載の方法。
- ナノ粒子が金、銀、銅、カドミウム、セレン、パラジウム、及び白金から選択される請求項13に記載の方法。
- ナノ粒子の直径が100nm未満である請求項11から15のいずれかに記載の方法。
- ナノ粒子の直径が5nm〜50nmである請求項16に記載の方法。
- ナノ粒子の直径が10nm〜30nmである請求項17に記載の方法。
- それぞれ異なるアナライトにおける1以上の標識が、異なる物理的性質を有する請求項6から18のいずれかに記載の方法。
- 物理的性質がサイズ、形状、及び表面粗度の1以上の性質から選択される請求項19に記載の方法。
- それぞれ異なるアナライトの標識が、異なる組成を有する請求項6から20のいずれかに記載の方法。
- それぞれ異なるアナライトの標識が、異なる種類である請求項6から21のいずれかに記載の方法。
- 光学的検出法が発光検出法、吸光検出法、光散乱検出法、スペクトルシフト検出法、表面プラズモン共鳴イメージング法、及び吸着染料由来の表面増強ラマン散乱法から選択される請求項1から22のいずれかに記載の方法。
- 光学的検出法が発光検出法であって、標識の励起が可能な光に標識化アナライトを曝露する工程と、前記標識からの光放射の周波数及び強度を検出する工程とを含む請求項23に記載の方法。
- 光がレーザー光である請求項24に記載の方法。
- 光が赤外光、可視光、及び紫外光から選択される請求項24から25のいずれかに記載の方法。
- 光が白色光である請求項26に記載の方法。
- 電気的検出法が電気抵抗検出法及び電気化学検出法から選択される請求項1から27のいずれかに記載の方法。
- 電気的検出法が電気化学検出であり、
(i)標識化アナライトを、2個の電極を含む溶液中に投入して、1以上の標識を前記溶液に溶解させる工程と、
(ii)前記電極に析出電位を印加して、前記1以上の標識を前記電極の内の1個に析出させる工程と、
(iii)電極からの電気化学信号を検出する工程とを含む請求項28に記載の方法。 - 析出電位が−0.1Vから−1.0Vである請求項29に記載の方法。
- 電位が直流電圧に重畳された交流電圧である請求項30に記載の方法。
- 交流電圧が、約0.24Vの直流電圧に重畳された約10mVの交流電圧である請求項31に記載の方法。
- 工程(ii)が、電極に第2の電位を印加する工程を更に含み、析出した標識の酸化還元反応を生じさせる請求項29から32のいずれかに記載の方法。
- 第2の電位が+1.0V〜+2.0Vの範囲にある請求項33に記載の方法。
- 酸化還元反応が、析出した標識の酸化である請求項33から34のいずれかに記載の方法。
- アナライトが細胞、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、ペプチド断片、アミノ酸、DNA、及びRNAから選択される1以上の化合物を含む請求項1から35のいずれかに記載の方法。
- アナライトがDNA及びRNAのいずれかであり、工程(a)における1以上の標識及び工程(b)における1以上の標識で前記1又は複数のアナライトを標識化する工程が、
(i)工程(b)における電気的検出に適切な1以上の標識で標識化されたプライマーをDNA及びRNAのいずれかに結合させる工程と、
(ii)前記プライマーを、工程(a)における光学的検出に適切な1以上の標識で標識化した1以上のヌクレオシドを用いて酵素的に伸長させる工程と、を含む請求項5及び請求項10から36のいずれかに記載の方法。
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