JP2007530017A - ヒトの癌におけるpik3ca遺伝子の変異 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、癌の診断検査法および治療法の分野に関する。
PI3Kは、細胞表面受容体の下流のシグナル伝達因子として機能する脂質キナーゼであり、細胞の成長、増殖、接着、生存、および運動に重要な役割を果たす経路に関与する(1、2)。PI3Kの活性の上昇は、多くの結腸直腸の腫瘍および他の腫瘍で認められているが(3、4)、PI3Kの遺伝子内変異は同定されていない。
第1の態様では、患者が癌であることが疑われるヒト組織における癌を評価する方法を提供する。PIK3CAのコード配列における非同義の遺伝子内変異は、癌であることが疑われるヒトの身体試料中に検出される。このようなヒトは、PIK3CAのコード配列中の非同義の遺伝子内変異が身体試料中で見出された場合に、癌である可能性が高いと判断される。
PIK3CA中に変異が集中することから、同遺伝子は、疾患の早期検出のための、または疾患の進行を追跡するための優れたマーカーとなる。変異集中領域を中心に試験を行うことで、大半の変異対立遺伝子が得られる。
実施例1-本実施例は、PIK3CAの遺伝子が、この遺伝子ファミリーにおける主な標的であることを示す
PI3Kが腫瘍形成に遺伝学的に関与するか否かを評価するために、発明者らは、結腸直腸癌における、この遺伝子ファミリーの遺伝子群のDNA配列を直接調べた。
*PI3K遺伝子群は、過去に報告されたクラス(S3、S4)に分けられる。クラスI、クラスII、およびクラスIIIはPI3K触媒サブユニットを含み、クラスIVは、mTOR(target of rapamycin)、ATM(ataxia telangiectasia mutated)、およびDNAPK(DNA-dependent protein kinase)のサブファミリーのメンバーを含む、PI3K様遺伝子、ならびに過去に未同定の2つの遺伝子を含む。
1配列番号:6〜165(フォワードプライマー)
2配列番号:166〜325(リバースプライマー)
3配列番号:326〜485(配列決定用プライマー)
次に、別の199の結腸直腸癌を対象にPIK3CAの全コードエキソンを解析した結果、計74(32%)の腫瘍に変異の存在が明らかとなった(表3および図1の例)。
*変異に起因するヌクレオチドおよびアミノ酸の変化があるエキソン番号。ヌクレオチドの位置は、コード配列中の位置を示す(位置1は、開始コドンの先頭に対応する)。機能ドメインについては、図1のレジェンドに示す。#個々の腫瘍に見出された非同義変異の数。Colon=結腸直腸癌、GBM=膠芽腫、gastric=胃癌、breast=乳癌、lung=肺癌、pancreas=膵臓癌、medulloblastoma=髄芽腫、adenomas=良性の結腸直腸腫瘍。列挙した全ての変異は体細胞変異であるが、対応する正常組織が得られなかった5つの結腸直腸癌および1つの膠芽腫は例外とする。変異は、201例のミスマッチ修復(MMR)能を有する結腸直腸癌の58例で、33例のMMR能を有なさい結腸直腸癌の16例で同定された。PIK3CAに変異を有する一部の腫瘍は、KRASまたはBRAFに変異を含むが、他の腫瘍は含まない。この事実は、これらの遺伝子群が独立した経路で作用することを示唆している。7つの腫瘍は2つの体細胞変異を含んでいた。表に記載された92の非同義変異に加えて、発明者らは3つの同義変異を見出した。
新生物の進行中におけるPIK3CAの変異のタイミングを決定するために、発明者らは、大きさおよび異形成の程度が多様な76の前悪性結腸直腸腫瘍の評価を行った。直径が5 cmを上回り、腺管絨毛状の極めて進行した線種で、PIK3CAの2つの変異(E542KおよびE542V)のみが見出された。この結果は、PIK3CAの異常が、新形成の比較的後期、すなわち腫瘍が浸潤および転移を開始する時期の近くで現われることを示唆している。
次に発明者らは、他の種類の腫瘍における遺伝子変化に関してPIK3CAの評価を行った(表1)。変異は、膠芽腫の15例中4例(27%)で、胃癌の12例中3例(25%)で、乳癌の13例中1例(8%)で、また肺癌の24例中1例(4%)で同定された。膵臓癌の11例と髄芽腫の12例では変異は認められなかった。合計すると89の変異が認められた。そのうち3つの変異はヘテロ接合性であった。
5種類の異なる癌について、PIK3CAにかなりの数の変異が認められたことは、これらの変異が機能的に重要なことを強く示唆する。この結論は、別の2つの独立した証拠によって支持される。第1に、非同義変異と同義変異の比率の解析は、腫瘍の進行中における選択の適切な尺度となる。というのは、サイレントな変化に増殖上の利点がある可能性は低いからである。PIK3CAにおける非同義変異:同義変異の比は89:2であり、偶然による推定値2:1の比をはるかに上回った(P<1x10-4)。第2に、PI3Kの触媒ドメインおよびアクセサリードメインに位置する非同義的変化の出現率は、1 Mbの腫瘍DNAあたり約120であり、癌細胞のゲノム上に観察された非機能的変化のバックグラウンドの変異出現率より100倍以上高い(P<1x10-4)(9)。
96の結腸直腸癌を対象としたPIK3CAの定量的PCR解析では遺伝子増幅の証拠は得られず、遺伝子のコピー数の変化が、この腫瘍における活性化の重要な機構ではないことが示唆された。使用したプライマーを以下に示す:
リアルタイムPI3K hCT1640694 20-1F(イントロン)
;および
リアルタイムPI3K hCT1640694 20-1R
配列番号:1=コード配列のみ(配列番号:2のnt 13〜3201)
配列番号:2=mRNA配列(NM_006218)
配列番号:3=タンパク質配列(NP_006209)
配列番号:4=第9エキソン
配列番号:5=第20エキソン
配列番号:6〜165=フォワードプライマー
配列番号:166〜325=リバースプライマー
配列番号:326〜485=配列決定用プライマー
配列番号:486および487=増幅用プライマー
7.PI3Kの触媒サブユニットは、Celera社の概要ヒトゲノム配列中に存在するInterPro(IPR)PI3Kドメイン(IPR000403)の解析によって同定された。この結果、15のPI3K遺伝子および関連するPI3K遺伝子が同定された。PIK3CD遺伝子のキナーゼドメインは、現時点のヒトゲノム概要配列には記載されていなかったので、本研究の対象から外した。
8.同定されたPI3Kのキナーゼドメインを含む、全ての注釈付きエキソンおよび隣接するイントロンの配列を、Celera社の概要ヒトゲノム配列(URLアドレス:wwwホストサーバ、ドメイン名celera.com)から抽出した。解析した全ての遺伝子のCelera社およびゲンバンクのアクセッション番号を表1に示す。PCRによる増幅および配列決定用のプライマーは、Primer 3プログラム(URLアドレス:httpファイル型式、www-genome.wi.mit.eduホストサーバ、cgi-binドメイン名、プライマーディレクトリ、primer3_www.cgiサブディレクトリ)を使用して設計され、MWG(High Point, NC)またはIDT(Coralville, IA)によって合成された。PCRによる増幅および配列決定は、初期の継代細胞系列、または一次腫瘍に由来する腫瘍のDNAを対象に、384キャピラリ自動配列決定装置(Spectrumedix, State College, PA)を使用して、文献(12)に記載された手順で実施された。配列の読み取り波形データを整列化して解析し、潜在的なゲノム変化を、Mutation Explorerソフトウェアパッケージ(SoftGenetics, State College, PA)を使用して同定した。抽出されたエキソンのうち96%の解析に成功した。PCRによる増幅および配列決定に使用された全てのプライマーの配列を表S1に示す。
Claims (65)
- 以下の段階を含む、癌を有することが疑われるヒトの身体試料における癌を評価する方法:
身体試料中のPIK3CAのコード配列中の非同義の遺伝子内変異を決定する段階であって、ここで野生型のPIK3CAのコード配列が、配列番号:2で表される配列を含む段階;
PIK3CAのコード配列中の非同義の遺伝子内変異が、身体試料中に認められる場合に、癌を有する可能性が高いヒトであると同定する段階。 - 身体試料が、新生物であることが疑われる第1の組織であり、かつ以下の段階をさらに含む、請求項1記載の方法:
第1および第2の組織がヒトから単離され、非同義変異の存在に関して、新生物であることが疑われていない第2の組織を試験する段階;
変異が第2の組織に存在しない場合に、非同義の遺伝子内変異が体細胞変異であると同定する段階。 - 非同義の遺伝子内変異が第9エキソン(配列番号:4)に存在する、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異が第20エキソン(配列番号:5)に存在する、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がPIK3CAのへリックスドメイン(配列番号:2のnt 1567〜2124)に存在する、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がPIK3CAのキナーゼドメイン(配列番号:2のnt 2095〜3096)に存在する、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がPIK3CAのP85BDドメイン(配列番号:2のnt 103〜335)に存在する、請求項1記載の方法。
- 身体試料が結腸直腸組織である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が脳組織である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が胃組織である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が乳房組織である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が肺組織である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が血液、血清、または血漿である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が痰である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が唾液である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が尿である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が便である、請求項1記載の方法。
- 身体試料が乳頭吸引物である、請求項1記載の方法。
- 第9エキソンおよび第20エキソンからなるPIK3CAのエキソンを試験して非同義変異を決定する、請求項1記載の方法。
- 第9エキソンおよび第20エキソンを含むPIK3CAのエキソンを試験して非同義変異を決定する、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異が置換変異である、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がG1624Aである、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がG1633Aである、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がC1636Aである、請求項1記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異がA3140Gである、請求項1記載の方法。
- 身体試料を、PIK3CAのコード配列のヌクレオチド位置1624、1633、1636、および3140における変異に関して試験する、請求項1記載の方法。
- 身体試料を、変異G1624A、G1633A、C1636A、およびA3140Gに関して試験する、請求項1記載の方法。
- 身体試料を、変異G113A、T1258C、G3129T、およびC3139Tに関して、さらに試験する、請求項21記載の方法。
- 身体試料を、変異G2702Tに関して、さらに試験する、請求項27記載の方法。
- 非同義の遺伝子内変異が欠失変異である、請求項1記載の方法。
- 以下の段階を含む、ヒトにおける腫瘍の進行を阻害する方法:
腫瘍に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスコンストラクトをヒトに投与する段階であって、ここでアンチセンスオリゴヌクレオチド、またはアンチセンスコンストラクトから転写されるRNAは、PIK3CA(配列番号:2)から転写されるmRNAに相補的であり、それによって腫瘍で発現されるp110αタンパク質の量を減少させる段階。 - アンチセンスオリゴヌクレオチド、またはアンチセンスコンストラクトから転写されるRNAが、mRNAの最初のメチオニンコドンを含む該mRNAの領域と相補的である、請求項31記載の方法。
- 以下の段階を含む、ヒトにおける腫瘍の進行を阻害する方法:
2ヌクレオチドの3'突出末端を有するヒトPIK3CAのmRNAの19〜21 bpの2本鎖を含むsiRNAをヒトに投与する段階であって、ここで2本鎖の一方の鎖は、PIK3CA(配列番号:2)から転写されるmRNAから選択される隣接配列を含み、それによって腫瘍で発現されるp110αタンパク質の量を減少させる段階。 - 隣接配列が、mRNAの最初のメチオニンコドンを含む、請求項33記載の方法。
- 以下の段階を含む、腫瘍の進行を阻害する方法:
p110α(配列番号:3)に特異的に結合する抗体結合領域を含む分子を腫瘍に投与する段階。 - 抗体結合領域が、PIK3CAのキナーゼドメイン(配列番号:2のnt 2095〜3096)に特異的に結合する、請求項35記載の方法。
- 抗体結合領域が、PIK3CAのへリックスドメイン(配列番号:2のnt 1567〜2124)に特異的に結合する、請求項35記載の方法。
- 抗体結合領域が、PIK3CAのP85BDドメイン(配列番号:2のnt 103〜335)に特異的に結合する、請求項35記載の方法。
- 以下の段階を含む、化学療法剤候補を同定する方法:
野生型または活性化変異型のp110α(配列番号:3)に被験化合物を接触させる段階;
p110α活性を測定する段階;
被験化合物がp110α活性を阻害した場合に、被験化合物を化学療法剤候補であると同定する段階。 - E542K、E545K、Q546K、およびH1047Rからなる群より選択される置換変異を含むp110αの変異型を被験化合物に接触させる、請求項39記載の方法。
- 被験化合物を、p110αの活性化変異を有する腫瘍の治療用の候補化学療法剤であると同定する、請求項39記載の方法。
- 被験化合物を、PIK3CAの置換変異を有する腫瘍の治療用の化学療法剤候補であると同定する、請求項39記載の方法。
- 被験化合物を、PIK3CAの活性化変異をPIK3CAのキナーゼドメイン(配列番号:2のnt 2095〜3096)に有する腫瘍の治療用の化学療法剤候補であると同定する、請求項39記載の方法。
- 被験化合物を、PIK3CAの活性化変異をPIK3CAのへリックスドメイン(配列番号:2のnt 1567〜2124)に有する腫瘍の治療用の化学療法剤候補であると同定する、請求項39記載の方法。
- 被験化合物を、PIK3CAの活性化変異をPIK3CAのP85BDドメイン(配列番号:2のnt 103〜335)に有する腫瘍の治療用の化学療法剤候補であると同定する、請求項39記載の方法。
- 以下の段階をさらに含む、請求項39記載の方法:
被験化合物を、PIK3CB、PIK3CG、PIK3C2A、PIK3C2B、PIK3C2G、PIK3C3、A-TM、ATR、FRAP1、LAT1-3TM、SMG1、PRKDC、およびTRRAPからなる群より選択される1つもしくは複数の酵素に接触させる段階;
被験化合物が、p110αを阻害するよりも、1つもしくは複数の該酵素を弱く阻害する場合に、被験化合物を特異的な化学療法剤候補であると同定する段階。 - PIK3CB、PIK3CG、PIK3C2A、PIK3C2B、PIK3C2G、およびPIK3C3を、p110α(PIK3CA)を阻害するよりも弱く阻害する被験化合物を、高度に特異的な化学療法剤候補であると同定する、請求項46記載の方法。
- PIK3CBおよびPIK3CGを阻害するよりも強くp110αを阻害する被験化合物を、高度に特異的であると同定する、請求項46記載の方法。
- 接触させる段階を無細胞系で行う、請求項39記載の方法。
- 接触させる段階を細胞全体において行う、請求項39記載の方法。
- 以下の段階を含む、それを必要とする患者に、適切な化学療法剤を輸送する方法:
患者の身体試料中のPIK3CAのコード配列(配列番号:1)中における非同義の遺伝子内変異を決定する段階;
p110α阻害剤を患者に投与する段階。 - p110α阻害剤がLY294002である、請求項51記載の方法。
- p110α阻害剤がワートマニンである、請求項51記載の方法。
- p110α阻害剤が、p110αに特異的な抗体結合領域を含む分子である、請求項51記載の方法。
- 抗体結合領域が、キナーゼドメイン(配列番号:2のnt 2095〜3096)と結合する、請求項54記載の方法。
- 抗体結合領域が、へリックスドメイン(配列番号:2のnt 1567〜2124)と結合する、請求項54記載の方法。
- 抗体結合領域が、P85BDドメイン(配列番号:2のnt 103〜335)と結合する、請求項54記載の方法。
- フォワードプライマーは配列番号:6〜165からなる群より選択され、リバースプライマーは配列番号:166〜325からなる群より選択され、かつ配列決定用プライマーは配列番号:326〜485からなる群より選択される、フォワードプライマー、リバースプライマー、および配列決定用プライマーからなる群より選択される、PIK3CAの増幅用および/または配列決定用の1つもしくは複数のプライマーのセット。
- 1つまたは複数のプライマーが、PIK3CAのセグメント増幅用の少なくとも1つのフォワードプライマーおよび少なくとも1つのリバースプライマーを含む、請求項58記載のセット。
- 1つまたは複数のプライマーが、PIK3CAのセグメントの増幅および配列決定用の少なくとも1つのフォワードプライマー、少なくとも1つのリバースプライマー、および少なくとも1つの配列決定用プライマーを含む、請求項58記載のセット。
- 1つまたは複数のプライマーが、フォワードプライマー、リバースプライマー、および配列決定用プライマーの全てを含む、請求項58記載のセット。
- 1つの分割された、または分割されていない容器内に収納された、請求項58記載のセット。
- 1つの分割された、または分割されていない容器内に収納された、請求項59記載のセット。
- 1つの分割された、または分割されていない容器内に収納された、請求項60記載のセット。
- 1つの分割された、または分割されていない容器内に収納された、請求項61記載のセット。
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Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2011505124A (ja) * | 2007-12-03 | 2011-02-24 | エンゾン ファーマシューティカルズ,インコーポレーテッド | Pik3ca発現をモジュレーションするためのrnaアンタゴニスト化合物 |
CN102816839A (zh) * | 2012-07-06 | 2012-12-12 | 杭州艾迪康医学检验中心有限公司 | 用于检测结直肠癌pik3ca基因热点突变位点的试剂盒 |
JP2016510982A (ja) * | 2013-03-13 | 2016-04-14 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | ヒトpi3kca(pik3ca)遺伝子変異検出のための方法及び組成物 |
JP2016515390A (ja) * | 2013-04-05 | 2016-05-30 | ユニバーシティ−インダストリー・ファンデーション・ヨンセイ・ユニバーシティ | 胃癌に対する予後予測模型の製造方法 |
WO2018181863A1 (ja) * | 2017-03-30 | 2018-10-04 | 国立大学法人東京大学 | 異なる複数の目的遺伝子の評価方法 |
Families Citing this family (37)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK3556866T3 (da) | 2004-03-02 | 2021-05-03 | Univ Johns Hopkins | Mutationer af pik3ca-genet i humane cancere |
EP1849877A1 (en) * | 2006-04-24 | 2007-10-31 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Replicative history of T-and B-cell subsets |
WO2008109375A2 (en) * | 2007-03-02 | 2008-09-12 | Mdrna, Inc. | Nucleic acid compounds for inhibiting pik3c gene expression and uses thereof |
GB2453173A (en) * | 2007-09-28 | 2009-04-01 | Dxs Ltd | Polynucleotide primers |
WO2009152346A2 (en) * | 2008-06-11 | 2009-12-17 | Intradigm Corporation | Compositions comprising phosphoinositide 3-kinase sirna and methods of use thereof |
CN101445832B (zh) * | 2008-12-23 | 2011-09-14 | 广州益善生物技术有限公司 | Pik3ca基因突变的检测探针、液相芯片及其检测方法 |
ES2633111T3 (es) | 2010-03-26 | 2017-09-19 | Hongzhi Zou | Métodos y materiales para detectar neoplasia colorrectal |
WO2012068000A2 (en) * | 2010-11-15 | 2012-05-24 | Enzon Pharmaceuticals, Inc. | Methods of treating cancers with her3 and pik3ca antisense oligonucleotides |
JP2013545756A (ja) * | 2010-11-16 | 2013-12-26 | グラクソスミスクライン、インテレクチュアル、プロパティー、ナンバー2、リミテッド | 投与および治療方法 |
WO2012106175A1 (en) | 2011-02-02 | 2012-08-09 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services | Trrap and grin2a mutations and use thereof for the diagnosis and treatment of melanoma |
TWI592411B (zh) | 2011-02-23 | 2017-07-21 | 英特爾立秦有限責任公司 | 激酶抑制劑之組合及其用途 |
WO2012142213A2 (en) | 2011-04-15 | 2012-10-18 | The Johns Hopkins University | Safe sequencing system |
WO2013015833A2 (en) * | 2011-07-28 | 2013-01-31 | Genentech, Inc | Pik3ca h1047r knock-in non-human animal breast cancer model |
WO2013083810A1 (en) | 2011-12-09 | 2013-06-13 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Identification of non-responders to her2 inhibitors |
WO2013177386A1 (en) | 2012-05-24 | 2013-11-28 | Abbvie Biotherapeutics Inc. | Biomarkers for predicting response to tweak receptor (tweakr) agonist therapy |
CN109457030B (zh) | 2012-10-29 | 2022-02-18 | 约翰·霍普金斯大学 | 卵巢和子宫内膜癌的帕帕尼科拉乌测试 |
ES2859645T3 (es) | 2013-03-14 | 2021-10-04 | Mayo Found Medical Education & Res | Detección de neoplasia |
US10875930B2 (en) * | 2013-07-30 | 2020-12-29 | Blueprint Medicines Corporation | PIK3C2G fusions |
ES2812753T3 (es) | 2014-03-31 | 2021-03-18 | Mayo Found Medical Education & Res | Detección de neoplasma colorectal |
PL3198026T3 (pl) | 2014-08-07 | 2020-05-18 | Pharmassist Ltd | Metody określania mutacji genu pik3ca w próbce |
US10184154B2 (en) | 2014-09-26 | 2019-01-22 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting cholangiocarcinoma |
CN104531854B (zh) * | 2014-11-10 | 2017-01-18 | 中国人民解放军第三〇七医院 | 检测西妥昔单抗治疗转移性结直肠癌耐药的试剂盒 |
US10030272B2 (en) | 2015-02-27 | 2018-07-24 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting gastrointestinal neoplasms |
CN115927612A (zh) | 2015-03-27 | 2023-04-07 | 精密科学公司 | 检测食管疾病 |
BR112017025254A2 (pt) | 2015-05-27 | 2018-08-07 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | ?métodos para detecção de pelo menos uma mutação em uma pluralidade de genes relacionados ao câncer, selecionar um indivíduo para tratamento e prever a probabilidade de capacidade de resposta ao tratamento? |
WO2017027653A1 (en) | 2015-08-11 | 2017-02-16 | The Johns Hopkins University | Assaying ovarian cyst fluid |
AU2016315924B2 (en) | 2015-08-31 | 2022-08-25 | Exact Sciences Corporation | Detecting gastric neoplasm |
WO2017093905A1 (en) | 2015-12-03 | 2017-06-08 | Novartis Ag | Treatment of cancer with a pi3k inhibitor in a patient preselected for having a pik3ca mutation in the ctdna |
RU2608960C1 (ru) * | 2016-03-18 | 2017-01-27 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский онкологический научный центр имени Н.Н. Блохина" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "РОНЦ им. Н.Н. Блохина" Минздрава России) | Клеточная линия crov Cel муцинозного рака яичников человека, предназначенная для разработки лечения таргетными препаратами |
US11078543B2 (en) | 2016-04-14 | 2021-08-03 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting pancreatic high-grade dysplasia |
US10370726B2 (en) | 2016-04-14 | 2019-08-06 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting colorectal neoplasia |
KR20190140901A (ko) | 2017-02-28 | 2019-12-20 | 메이오 파운데이션 포 메디칼 에쥬케이션 앤드 리써치 | 전립선 암의 검출 |
JP7067896B2 (ja) | 2017-10-27 | 2022-05-16 | シスメックス株式会社 | 品質評価方法、品質評価装置、プログラム、および記録媒体 |
AU2018374176A1 (en) | 2017-11-30 | 2020-06-11 | Exact Sciences Corporation | Detecting breast cancer |
CN111363827A (zh) * | 2020-04-30 | 2020-07-03 | 北京和合医学诊断技术股份有限公司 | 用于检测pik3ca基因突变的引物组及其应用方法 |
DE102021126650A1 (de) | 2021-10-14 | 2023-04-20 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Körperschaft des öffentlichen Rechts | Verfahren zur bestimmung der ansprechwahrscheinlichkeit einer malignen erkrankung auf eine behandlung mit einem pharmazeutischen hemmwirkstoff |
CN116219015A (zh) * | 2023-02-06 | 2023-06-06 | 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) | 基于pcr的dna中pik3ca基因突变检测试剂盒及检测方法 |
Family Cites Families (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5248671A (en) * | 1989-02-15 | 1993-09-28 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for treatment of cancer using oligonucleotides |
US6075181A (en) | 1990-01-12 | 2000-06-13 | Abgenix, Inc. | Human antibodies derived from immunized xenomice |
US6274327B1 (en) | 1992-04-13 | 2001-08-14 | Ludwig Institute For Cancer Research | Polypeptides having kinase activity, their preparation and use |
US5846824A (en) | 1994-02-07 | 1998-12-08 | Ludwig Institute For Cancer Research | Polypeptides having kinase activity, their preparation and use |
GB9208135D0 (en) | 1992-04-13 | 1992-05-27 | Ludwig Inst Cancer Res | Polypeptides having kinase activity,their preparation and use |
US5846624A (en) * | 1996-12-06 | 1998-12-08 | The Standard Register Company | Dual face pressure sensitive label |
US6277563B1 (en) | 1997-01-16 | 2001-08-21 | The Regents Of The University Of California | Genetic alterations associated with cancer |
US7670767B1 (en) * | 1997-01-16 | 2010-03-02 | The Regents Of The University Of California | Genetic alterations associated with cancer |
US6558903B1 (en) | 1999-06-30 | 2003-05-06 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Kinases and uses thereof |
DE60038220T2 (de) | 1999-08-27 | 2009-03-12 | Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc., Emeryville | Chimerische antisense-oligonukleotide und zelltransfektions-zusammensetzungen davon |
CA2395827A1 (en) * | 2000-01-31 | 2001-08-02 | Human Genome Sciences, Inc. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
WO2002027028A1 (en) * | 2000-09-28 | 2002-04-04 | Atairgin Technologies, Inc. | A method of determining tumor characteristics by determining abnormal copy number or expression level of lipid-associated genes |
US20020142305A1 (en) | 2001-03-27 | 2002-10-03 | Koei Chin | Methods for diagnosing and monitoring ovarian cancer by screening gene copy numbers |
US20030135033A1 (en) * | 2002-01-04 | 2003-07-17 | Anke Klippel-Giese | Compounds and methods for the identification and/ or validation of a target |
AU2003261100A1 (en) | 2002-07-25 | 2004-02-16 | Avantec Vascular Corporation | Devices delivering therapeutic agents and methods regarding the same |
EA012240B1 (ru) * | 2003-04-03 | 2009-08-28 | Семафор Фармасьютикалз, Инк. | Пролекарства ингибиторов киназы pi-3 |
DK3556866T3 (da) | 2004-03-02 | 2021-05-03 | Univ Johns Hopkins | Mutationer af pik3ca-genet i humane cancere |
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Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
JPN6010056030, "Cancer Research", 2003, Vol.63, pp.4225−4231 * |
JPN6010056031, "Oncogene", 2000, Vol.19, pp.2739−2744 * |
JPN6010056032, "Nature Genetics", 1999, Vol.21, pp.99−102 * |
JPN6010056033, "Journal of Biological Chemistry", 2000, Vol.275, No.6, pp.3741−3744 * |
JPN6010056035, "Proceedings. Annual Meeting of the American Association for Cancer Research", 2002, Vol.43, p.602 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2011505124A (ja) * | 2007-12-03 | 2011-02-24 | エンゾン ファーマシューティカルズ,インコーポレーテッド | Pik3ca発現をモジュレーションするためのrnaアンタゴニスト化合物 |
CN102816839A (zh) * | 2012-07-06 | 2012-12-12 | 杭州艾迪康医学检验中心有限公司 | 用于检测结直肠癌pik3ca基因热点突变位点的试剂盒 |
JP2016510982A (ja) * | 2013-03-13 | 2016-04-14 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | ヒトpi3kca(pik3ca)遺伝子変異検出のための方法及び組成物 |
JP2016515390A (ja) * | 2013-04-05 | 2016-05-30 | ユニバーシティ−インダストリー・ファンデーション・ヨンセイ・ユニバーシティ | 胃癌に対する予後予測模型の製造方法 |
WO2018181863A1 (ja) * | 2017-03-30 | 2018-10-04 | 国立大学法人東京大学 | 異なる複数の目的遺伝子の評価方法 |
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