JP6694543B2 - ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 - Google Patents
ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6694543B2 JP6694543B2 JP2019201128A JP2019201128A JP6694543B2 JP 6694543 B2 JP6694543 B2 JP 6694543B2 JP 2019201128 A JP2019201128 A JP 2019201128A JP 2019201128 A JP2019201128 A JP 2019201128A JP 6694543 B2 JP6694543 B2 JP 6694543B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- pik3ca
- mutations
- mutation
- human
- sequence
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 230000035772 mutation Effects 0.000 title claims description 88
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title claims description 46
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 title claims description 19
- 101150063858 Pik3ca gene Proteins 0.000 title claims description 5
- 102100038332 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform Human genes 0.000 claims description 74
- 101000605639 Homo sapiens Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform Proteins 0.000 claims description 56
- 101710093328 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform Proteins 0.000 claims description 21
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 21
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 10
- 102200085639 rs104886003 Human genes 0.000 claims description 8
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 7
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 7
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 7
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 7
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 7
- 102200085641 rs121913273 Human genes 0.000 claims description 5
- 102200085789 rs121913279 Human genes 0.000 claims description 5
- 102200085792 rs121913286 Human genes 0.000 claims description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 3
- 102200085634 rs1057519927 Human genes 0.000 claims description 3
- 102200085622 rs121913272 Human genes 0.000 claims description 3
- 102200085790 rs121913281 Human genes 0.000 claims description 3
- 102200085787 rs121913283 Human genes 0.000 claims description 3
- 102200115761 rs35495399 Human genes 0.000 claims description 3
- 102200085697 rs772110575 Human genes 0.000 claims description 3
- 102200038545 rs104893885 Human genes 0.000 claims 2
- 102220032309 rs104895349 Human genes 0.000 claims 2
- 102200085623 rs1057519925 Human genes 0.000 claims 2
- 102220198237 rs1057519927 Human genes 0.000 claims 2
- 102200001994 rs121908462 Human genes 0.000 claims 2
- 102200019359 rs121908928 Human genes 0.000 claims 2
- 102200040404 rs121909210 Human genes 0.000 claims 2
- 102200085782 rs121913277 Human genes 0.000 claims 2
- 102200085788 rs121913279 Human genes 0.000 claims 2
- 102220197893 rs121913282 Human genes 0.000 claims 2
- 102220197892 rs121913284 Human genes 0.000 claims 2
- 102220107990 rs140041506 Human genes 0.000 claims 2
- 102200016380 rs16892150 Human genes 0.000 claims 2
- 102200004198 rs199472681 Human genes 0.000 claims 2
- 102200038836 rs199472824 Human genes 0.000 claims 2
- 102220014529 rs397517163 Human genes 0.000 claims 2
- 102200085793 rs397517201 Human genes 0.000 claims 2
- 102200085770 rs397517202 Human genes 0.000 claims 2
- 102220025838 rs74953290 Human genes 0.000 claims 2
- 102200145422 rs869312749 Human genes 0.000 claims 2
- 102220094315 rs876659785 Human genes 0.000 claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 33
- 108091007960 PI3Ks Proteins 0.000 description 20
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 19
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 14
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 14
- 102000010400 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity proteins Human genes 0.000 description 13
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 13
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 13
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 13
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 12
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 11
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 10
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 10
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 10
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 9
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 9
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 8
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 8
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 8
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 8
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 8
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 8
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 8
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 7
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 7
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 7
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 7
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 7
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 7
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 7
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 5
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 description 5
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 description 5
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 5
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 5
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 5
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 5
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 5
- 230000006870 function Effects 0.000 description 5
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 5
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 5
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 5
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 description 5
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 4
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 108010065917 TOR Serine-Threonine Kinases Proteins 0.000 description 4
- 102000013530 TOR Serine-Threonine Kinases Human genes 0.000 description 4
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 4
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 3
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 3
- 208000000172 Medulloblastoma Diseases 0.000 description 3
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 3
- 102000038030 PI3Ks Human genes 0.000 description 3
- 108090000829 Ribosome Inactivating Proteins Proteins 0.000 description 3
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 description 3
- 108091027967 Small hairpin RNA Proteins 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 102000057995 human PIK3CA Human genes 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 230000033607 mismatch repair Effects 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 3
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 3
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 3
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 7-Cyan-hept-2t-en-4,6-diinsaeure Natural products C1=2C(O)=C3C(=O)C=4C(OC)=CC=CC=4C(=O)C3=C(O)C=2CC(O)(C(C)=O)CC1OC1CC(N)C(O)C(C)O1 STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 2
- 108010006124 DNA-Activated Protein Kinase Proteins 0.000 description 2
- 102000005768 DNA-Activated Protein Kinase Human genes 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 101000785063 Homo sapiens Serine-protein kinase ATM Proteins 0.000 description 2
- 101000984753 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase B-raf Proteins 0.000 description 2
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 2
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108091030071 RNAI Proteins 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- 102100020824 Serine-protein kinase ATM Human genes 0.000 description 2
- 102100027103 Serine/threonine-protein kinase B-raf Human genes 0.000 description 2
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 2
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 2
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N daunorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 2
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 230000004077 genetic alteration Effects 0.000 description 2
- 231100000118 genetic alteration Toxicity 0.000 description 2
- -1 helix domain Proteins 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 102000003390 tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 2
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 2
- QDLHCMPXEPAAMD-UHFFFAOYSA-N wortmannin Natural products COCC1OC(=O)C2=COC(C3=O)=C2C1(C)C1=C3C2CCC(=O)C2(C)CC1OC(C)=O QDLHCMPXEPAAMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QDLHCMPXEPAAMD-QAIWCSMKSA-N wortmannin Chemical compound C1([C@]2(C)C3=C(C4=O)OC=C3C(=O)O[C@@H]2COC)=C4[C@@H]2CCC(=O)[C@@]2(C)C[C@H]1OC(C)=O QDLHCMPXEPAAMD-QAIWCSMKSA-N 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- PNDPGZBMCMUPRI-HVTJNCQCSA-N 10043-66-0 Chemical compound [131I][131I] PNDPGZBMCMUPRI-HVTJNCQCSA-N 0.000 description 1
- WUAPFZMCVAUBPE-NJFSPNSNSA-N 188Re Chemical compound [188Re] WUAPFZMCVAUBPE-NJFSPNSNSA-N 0.000 description 1
- 108010066676 Abrin Proteins 0.000 description 1
- 208000003200 Adenoma Diseases 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 241000228254 Aspergillus restrictus Species 0.000 description 1
- 101000669426 Aspergillus restrictus Ribonuclease mitogillin Proteins 0.000 description 1
- 108060000903 Beta-catenin Proteins 0.000 description 1
- 102000015735 Beta-catenin Human genes 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 102000002110 C2 domains Human genes 0.000 description 1
- 108050009459 C2 domains Proteins 0.000 description 1
- UJKPHYRXOLRVJJ-MLSVHJFASA-N CC(O)C1=C(C)/C2=C/C3=N/C(=C\C4=C(CCC(O)=O)C(C)=C(N4)/C=C4\N=C(\C=C\1/N\2)C(C)=C4C(C)O)/C(CCC(O)=O)=C3C Chemical compound CC(O)C1=C(C)/C2=C/C3=N/C(=C\C4=C(CCC(O)=O)C(C)=C(N4)/C=C4\N=C(\C=C\1/N\2)C(C)=C4C(C)O)/C(CCC(O)=O)=C3C UJKPHYRXOLRVJJ-MLSVHJFASA-N 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 description 1
- 102100022204 DNA-dependent protein kinase catalytic subunit Human genes 0.000 description 1
- WEAHRLBPCANXCN-UHFFFAOYSA-N Daunomycin Natural products CCC1(O)CC(OC2CC(N)C(O)C(C)O2)c3cc4C(=O)c5c(OC)cccc5C(=O)c4c(O)c3C1 WEAHRLBPCANXCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100520033 Dictyostelium discoideum pikC gene Proteins 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 206010058314 Dysplasia Diseases 0.000 description 1
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 1
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 108700004714 Gelonium multiflorum GEL Proteins 0.000 description 1
- 241001272567 Hominoidea Species 0.000 description 1
- 101000619536 Homo sapiens DNA-dependent protein kinase catalytic subunit Proteins 0.000 description 1
- 101100352301 Homo sapiens PIK3CD gene Proteins 0.000 description 1
- 101000721646 Homo sapiens Phosphatidylinositol 3-kinase C2 domain-containing subunit gamma Proteins 0.000 description 1
- 101000605630 Homo sapiens Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000595741 Homo sapiens Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform Proteins 0.000 description 1
- 101000595751 Homo sapiens Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform Proteins 0.000 description 1
- 101000721642 Homo sapiens Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000721645 Homo sapiens Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta Proteins 0.000 description 1
- 101000605014 Homo sapiens Putative L-type amino acid transporter 1-like protein MLAS Proteins 0.000 description 1
- 101000798015 Homo sapiens RAC-beta serine/threonine-protein kinase Proteins 0.000 description 1
- 101000864057 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase SMG1 Proteins 0.000 description 1
- 101000623857 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase mTOR Proteins 0.000 description 1
- 101000796673 Homo sapiens Transformation/transcription domain-associated protein Proteins 0.000 description 1
- 108700020121 Human Immunodeficiency Virus-1 rev Proteins 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000006496 Immunoglobulin Heavy Chains Human genes 0.000 description 1
- 108010019476 Immunoglobulin Heavy Chains Proteins 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- 101150008942 J gene Proteins 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 101100339600 Mus musculus Hprt1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000272144 Naja atra Species 0.000 description 1
- 101710204212 Neocarzinostatin Proteins 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 102000043276 Oncogene Human genes 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 239000012828 PI3K inhibitor Substances 0.000 description 1
- 101150026284 PIK3CD gene Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 102100035593 POU domain, class 2, transcription factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710084414 POU domain, class 2, transcription factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 102000014160 PTEN Phosphohydrolase Human genes 0.000 description 1
- 108010011536 PTEN Phosphohydrolase Proteins 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 241000009328 Perro Species 0.000 description 1
- 102100025063 Phosphatidylinositol 3-kinase C2 domain-containing subunit gamma Human genes 0.000 description 1
- 102100038329 Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100026169 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 108090000430 Phosphatidylinositol 3-kinases Proteins 0.000 description 1
- 102000003993 Phosphatidylinositol 3-kinases Human genes 0.000 description 1
- 102100036061 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform Human genes 0.000 description 1
- 102100036052 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform Human genes 0.000 description 1
- 102100025058 Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 102100025059 Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta Human genes 0.000 description 1
- 231100000742 Plant toxin Toxicity 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- 108700033844 Pseudomonas aeruginosa toxA Proteins 0.000 description 1
- 102100038206 Putative L-type amino acid transporter 1-like protein MLAS Human genes 0.000 description 1
- 102100032315 RAC-beta serine/threonine-protein kinase Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 240000003946 Saponaria officinalis Species 0.000 description 1
- 108010084592 Saporins Proteins 0.000 description 1
- 102000003800 Selectins Human genes 0.000 description 1
- 108090000184 Selectins Proteins 0.000 description 1
- 102100029938 Serine/threonine-protein kinase SMG1 Human genes 0.000 description 1
- 102100023085 Serine/threonine-protein kinase mTOR Human genes 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N Technetium-99 Chemical compound [99Tc] GKLVYJBZJHMRIY-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 102100032762 Transformation/transcription domain-associated protein Human genes 0.000 description 1
- 102000006747 Transforming Growth Factor alpha Human genes 0.000 description 1
- 101800004564 Transforming growth factor alpha Proteins 0.000 description 1
- 102000044209 Tumor Suppressor Genes Human genes 0.000 description 1
- 108700025716 Tumor Suppressor Genes Proteins 0.000 description 1
- 238000012452 Xenomouse strains Methods 0.000 description 1
- VWQVUPCCIRVNHF-OUBTZVSYSA-N Yttrium-90 Chemical compound [90Y] VWQVUPCCIRVNHF-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 229940009456 adriamycin Drugs 0.000 description 1
- 238000012382 advanced drug delivery Methods 0.000 description 1
- 239000002776 alpha toxin Substances 0.000 description 1
- REDXJYDRNCIFBQ-UHFFFAOYSA-N aluminium(3+) Chemical compound [Al+3] REDXJYDRNCIFBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000003497 anti-pneumococcal effect Effects 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 229940045988 antineoplastic drug protein kinase inhibitors Drugs 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000005784 autoimmunity Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 208000013489 benign neoplasm of large intestine Diseases 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- JCXGWMGPZLAOME-AKLPVKDBSA-N bismuth-212 Chemical compound [212Bi] JCXGWMGPZLAOME-AKLPVKDBSA-N 0.000 description 1
- JCXGWMGPZLAOME-RNFDNDRNSA-N bismuth-213 Chemical compound [213Bi] JCXGWMGPZLAOME-RNFDNDRNSA-N 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 description 1
- 229960004562 carboplatin Drugs 0.000 description 1
- 190000008236 carboplatin Chemical compound 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 210000004671 cell-free system Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 238000010924 continuous production Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 description 1
- 229960000975 daunorubicin Drugs 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229960004679 doxorubicin Drugs 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 231100000655 enterotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000037442 genomic alteration Effects 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000762 glandular Effects 0.000 description 1
- 229960003569 hematoporphyrin Drugs 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 1
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 1
- 239000012133 immunoprecipitate Substances 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 229940096397 interleukin-8 Drugs 0.000 description 1
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 230000002601 intratumoral effect Effects 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 238000000021 kinase assay Methods 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000004899 motility Effects 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- QZGIWPZCWHMVQL-UIYAJPBUSA-N neocarzinostatin chromophore Chemical compound O1[C@H](C)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](NC)[C@H]1O[C@@H]1C/2=C/C#C[C@H]3O[C@@]3([C@@H]3OC(=O)OC3)C#CC\2=C[C@H]1OC(=O)C1=C(O)C=CC2=C(C)C=C(OC)C=C12 QZGIWPZCWHMVQL-UIYAJPBUSA-N 0.000 description 1
- 230000009826 neoplastic cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 210000002445 nipple Anatomy 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 125000001095 phosphatidyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 1
- 229940043441 phosphoinositide 3-kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002428 photodynamic therapy Methods 0.000 description 1
- 239000003504 photosensitizing agent Substances 0.000 description 1
- IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N phthalocyanine Chemical compound N1C(N=C2C3=CC=CC=C3C(N=C3C4=CC=CC=C4C(=N4)N3)=N2)=C(C=CC=C2)C2=C1N=C1C2=CC=CC=C2C4=N1 IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NUSQOFAKCBLANB-UHFFFAOYSA-N phthalocyanine tetrasulfonic acid Chemical compound C12=CC(S(=O)(=O)O)=CC=C2C(N=C2NC(C3=CC=C(C=C32)S(O)(=O)=O)=N2)=NC1=NC([C]1C=CC(=CC1=1)S(O)(=O)=O)=NC=1N=C1[C]3C=CC(S(O)(=O)=O)=CC3=C2N1 NUSQOFAKCBLANB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000003123 plant toxin Substances 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 239000003909 protein kinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000002212 purine nucleoside Substances 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 230000027174 regulation of B cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- WUAPFZMCVAUBPE-IGMARMGPSA-N rhenium-186 Chemical compound [186Re] WUAPFZMCVAUBPE-IGMARMGPSA-N 0.000 description 1
- 238000005096 rolling process Methods 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005483 tyrosine kinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229940121358 tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 229950009268 zinostatin Drugs 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
本出願は、米国政府が拠出した資金によって実施された（助成金番号NIH-CA 62924およびNIH-CA 43460）。したがって米国政府は、本発明に一定の権利を保持する。
発明の分野
本発明は、癌の診断検査法および治療法の分野に関する。
本発明は、癌の診断検査法および治療法の分野に関する。
発明の背景
PI3Kは、細胞表面受容体の下流のシグナル伝達因子として機能する脂質キナーゼであり、細胞の成長、増殖、接着、生存、および運動に重要な役割を果たす経路に関与する（1、2）（非特許文献1、2）。PI3Kの活性の上昇は、多くの結腸直腸の腫瘍および他の腫瘍で認められているが（3、4）（非特許文献3、4）、PI3Kの遺伝子内変異は同定されていない。
PI3Kは、細胞表面受容体の下流のシグナル伝達因子として機能する脂質キナーゼであり、細胞の成長、増殖、接着、生存、および運動に重要な役割を果たす経路に関与する（1、2）（非特許文献1、2）。PI3Kの活性の上昇は、多くの結腸直腸の腫瘍および他の腫瘍で認められているが（3、4）（非特許文献3、4）、PI3Kの遺伝子内変異は同定されていない。
PIK3経路の構成要素は、癌で変化することが過去に報告されている。例として、機能がPI3Kが介在するリン酸化（17、18）（非特許文献5、6）を逆転させることであるPTEN腫瘍抑制遺伝子（15、16）（非特許文献7、8）が挙げられる。PIK3CAおよびAKT2を含む染色体領域の重複または増幅は、ヒトの一部の癌で報告されている（2、19、20）（非特許文献2、9、10）が、このような大規模な遺伝的事象の標的となる遺伝子は見つかっておらず、また容易に見つからない。
R. Katso et al., Annu Rev Cell Dev Biol 17, 615-75 (2001)
I. Nivanco, C. L. Sawyers, Nat Rev Cancer 2, 489-501 (Jul, 2002)
W. A. Phillips, F. St Clair, A. D. Munday, R. J. Thomas, C. A. Mitchell, Cancer 83, 41-7 (Jul 1, 1998)
E. S. Gershtein, V. A. Shatskaya, V. D. Ermilova, Ν. E. Kushlinsky, M. A. Krasil'nikov, Clin Chim Acta 287, 59-67 (Sep, 1999)
T. Maehama, J. E. Dixon, J Biol Chem 273, 13375-8 (May 29, 1998)
M. P. Myers et al., Proc Natl Acad Sci USA 95, 13513-8 (Nov 10, 1998)
J. Li et al., Science 275, 1943-7 (1997)
P. A. Steck et al., Nat Genet 15, 356-62 (1997)
L. Shayesteh et al., Nat Genet 21, 99-102 (Jan, 1999)
J. Q. Cheng et al., Proc Natl Acad Sci USA 89, 9267-71 (Oct 1, 1992)
発明の簡単な概要
第1の態様では、患者が癌であることが疑われるヒト組織における癌を評価する方法を提供する。PIK3CAのコード配列における非同義の遺伝子内変異は、癌であることが疑われるヒトの身体試料中に検出される。このようなヒトは、PIK3CAのコード配列中の非同義の遺伝子内変異が身体試料中で見出された場合に、癌である可能性が高いと判断される。
第1の態様では、患者が癌であることが疑われるヒト組織における癌を評価する方法を提供する。PIK3CAのコード配列における非同義の遺伝子内変異は、癌であることが疑われるヒトの身体試料中に検出される。このようなヒトは、PIK3CAのコード配列中の非同義の遺伝子内変異が身体試料中で見出された場合に、癌である可能性が高いと判断される。
本発明の第2の態様では、ヒトにおける腫瘍の進行を抑制する方法を提供する。アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスコンストラクトを腫瘍に投与する。アンチセンスオリゴヌクレオチド、またはアンチセンスコンストラクトから転写されるRNAは、PIK3CAから転写されるmRNAに相補的である。したがって、腫瘍が発現するp110αタンパク質の量は減少する。
本発明の別の態様は、ヒトにおける腫瘍の進行を抑制する方法を提供する。2ヌクレオチドの3'突出末端を有する、ヒトのPIK3CAのmRNAの19〜21 bpの2本鎖を含むsiRNAをヒトに投与する。2本鎖の一方の鎖は、PIK3CA（配列番号：2）から転写されるmRNAから選択される隣接配列を含む。したがって、腫瘍が発現するp110αタンパク質の量は減少する。
本発明の別の局面では、腫瘍の進行を抑制する方法を提供する。抗体結合領域を含む分子を腫瘍に投与する。抗体結合領域はPIK3CA（配列番号：3）に特異的に結合する。
本発明の別の態様は、化学療法剤候補を同定する方法を提供する。野生型または活性化変異体のp110α（配列番号：3）に被験化合物を接触させる。続いてP110αの活性を測定する。p110α活性を阻害する被験化合物は化学療法剤候補であると判断される。
本発明のさらに別の態様は、適切な化学療法剤を、治療を必要とする患者に輸送する方法である。PIK3CAのコード配列（配列番号：1）中の非同義の遺伝子内変異を、患者の被験組織を対象に決定する。p110α阻害剤を患者に投与する。
本発明の別の局面は、PIK3CAの増幅用および/または配列決定用の、一連の1つもしくは複数のプライマーを提供する。プライマーは、フォワードプライマー、リバースプライマー、および配列決定用プライマーからなる群より選択される。フォワードプライマーは配列番号：6〜158からなる群より選択され、リバースプライマーは配列番号：159〜310からなる群より選択され、また配列決定用プライマーは配列番号：311〜461からなる群より選択される。
発明の詳細な説明
PIK3CA中に変異が集中することから、同遺伝子は、疾患の早期検出のための、または疾患の進行を追跡するための優れたマーカーとなる。変異集中領域を中心に試験を行うことで、大半の変異対立遺伝子が得られる。
PIK3CA中に変異が集中することから、同遺伝子は、疾患の早期検出のための、または疾患の進行を追跡するための優れたマーカーとなる。変異集中領域を中心に試験を行うことで、大半の変異対立遺伝子が得られる。
ヒトのPIK3CAのコード配列は文献に報告されており、これを配列番号：1に示す。これは、ヒト集団の1人の特定の個体の配列である。ヒトは、その遺伝子配列が互いに異なる。こうした変化は非常に少なく、1つの遺伝子あたり約1〜10ヌクレオチドの頻度で生じることがある。任意の特定の遺伝子の異なる型が、ヒト集団には存在する。こうしたさまざまな型は対立遺伝子異型と呼ばれる。対立遺伝子異型は、コードされたタンパク質のアミノ酸配列を変化しないことが多い。このような異型は「同義」であると表現される。たとえこれらについて、コードされたアミノ酸（非同義）が変化しているとしても、タンパク質の機能は通常、影響を受けない。このような変化は、進化的または機能的に中性である。本出願において、ヒトのPIK3CAについて言う場合、全ての対立遺伝子異型が、この表現に含まれることが意図される。配列番号：1の配列は、野生型のヒト配列の代表例として提供されるに過ぎない。本発明は、PIK3CAのこの1つの対立遺伝子型に制限されない。変異を決定する目的で、被験試料中に見出されたPIK3CA配列を、ヒトのさまざまな組織中において見出された配列と比較することができる。2つの組織の配列に差が認められれば、体細胞変異の存在が明らかとなる。あるいは、被験試料中のPIK3CA遺伝子中に見出された配列を、配列番号：1の配列と比較することができる。被験試料の配列と、配列番号：1の間に差が認められれば、それを変異であると判定することができる。癌性であることが疑われる組織は、腫瘍または癌細胞から剥がれ落ちた細胞を含むことが推定可能な身体試料と同様に試験することができる。試験に適した身体試料には、血液、血清、血漿、痰、尿、便、乳頭吸引物、唾液、および脳脊髄液などがある。
PIK3CA上の変異は、第9エキソン（配列番号：4）および第20エキソン（配列番号：5）内に集中する。他の変異も存在するが、これら2つのエキソンが、変異のホットスポットであると考えられる。多くの変異は、PIK3CAのへリックスドメイン（配列番号：2のnt 1567〜2124）、およびPIK3CAのキナーゼドメイン（配列番号：2のnt 2095〜3096）に存在する。PIK3CAのP85BDドメイン（配列番号：2のnt 103〜335）内には変異はほとんど存在しない。変異は、第1エキソン、第2エキソン、第4エキソン、第5エキソン、第7エキソン、第9エキソン、第13エキソン、第18エキソン、および第20エキソン内に見出されている。これらのエキソンの任意の組み合わせを、任意選択で、他のエキソンの試験とともに試験することができる。変異の試験は、コード配列の全体を対象に行えるほか、変異が集中することがわかっている領域を特に対象とすることができる。特定の変異ホットスポットは、PIK3CAのコード配列のヌクレオチド位置1624、1633、1636、および3140である。
PIK3CAの変異は多種多様な腫瘍に見出されている。したがって、任意のさまざまな腫瘍を、PIK3CAの変異に関して試験することができる。このような組織には、結腸直腸組織、脳組織、胃組織、乳房組織、および肺組織などがあるが、これらに限定されない。
任意の種類の遺伝子内変異を検出することができる。このような変異には、置換変異、欠失変異、および挿入変異などがある。変異の長さは短いことが多く、1〜3ヌクレオチドの場合がある。検出可能な変異には、G1624A、G1633A、C1636A、A3140G、G113A、T1258C、G3129T、C3139T、およびG2702Tなどがあるが、これらに限定されない。これらの変異の任意の組み合わせを試験することができる。
PIK3CA中に見出される変異は活性化変異であると考えられる。したがって、p110αの活性または発現の阻害を含む治療法によって、ヒトにおける腫瘍の進行を抑制することができる。使用可能な阻害性分子には、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスコンストラクト、抗体結合領域を含む分子、およびsiRNA分子などがある。抗体結合領域を含む分子は、完全な抗体、1本鎖可変領域、抗体断片、抗体コンジュゲートなどの場合がある。抗体結合領域は、PIK3CAのキナーゼドメイン（配列番号：2のnt 2095〜3096）、PIK3CAのへリックスドメイン（配列番号：2のnt 1567〜2124）、またはPIK3CAのP85BDドメイン（配列番号：2のnt 103〜335）に含まれるエピトープに結合する可能性があるが、結合する必要は必ずしもない。
アンチセンスコンストラクト、アンチセンスオリゴヌクレオチド、RNA干渉コンストラクト、またはsiRNA 2本鎖RNA分子を用いて、PIK3CAの発現に干渉させることができる。典型的には、PIK3CAのmRNA配列の相補物の少なくとも15ヌクレオチド、17ヌクレオチド、19ヌクレオチド、または21ヌクレオチドが、アンチセンス分子として十分である。典型的には、PIK3CAの少なくとも19ヌクレオチド、21ヌクレオチド、22ヌクレオチド、または23ヌクレオチドが、RNA干渉分子として十分である。好ましくはRNA干渉分子は、2ヌクレオチドの3'突出末端を有する。仮にRNA干渉分子が、例えば所望のPIK3CA配列のヘアピン分子に由来する、または逆方向反復に由来するコンストラクトが由来する細胞中で発現されるならば、内因性の細胞装置が突出末端を作ることになる。siRNA分子は、化学合成、インビトロ転写、または長いdsRNAのRnase IIIもしくはDicerによる切断によって作製することができる。siRNA分子は細胞内に、トランスフェクション、エレクトロポレーション、または当技術分野で周知の他の方法で導入することができる。これについては文献を参照されたい（Hannon, GJ, 2002, RNA Interference, Nature 418: 244-251; Bernstein E et al., 2002, The rest is silence. RNA 7: 1509-1521; Hutvagner G et al., RNAi: Nature abhors a double-strand. Curr. Opin. Genetics & Developmet 12: 225-232; Brummelkamp, 2002, A system for stable expression of short interfering RNAs in mammalian cells. Science 296: 550-553; Lee NS, Dohjima T. Bauer G. Li H, Li M-J, Ehsani A, Salvaterra P. and Rossi J. (2002). Expression of small interfering RNAs targeted against HIV-1 rev transcripts in human cells. Nature Biotechnol. 20: 500-505; Miyagishi M, and Taira K. (2002). U6 promoter-driven siRNAs with four uridine 3' overhangs efficiently suppress targeted gene expression in mammalian cells. Nature Biotechnol. 20: 497-500; Paddison PJ, Caudy AA, Bernstein E, Hannon GJ, and Conklin DS. (2002). Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells. Genes & Dev. 16: 948-958; Paul CP, Good PD, Winer I, and Engelke DR. (2002). Effective expression of small interfering RNA in human cells. Nature Biotechnol. 20: 505-508; Sui G. Soohoo C, Affar E-B, Gay F, Shi A, Forrester WC, and Shi Y. (2002). A DNA vector-based RNAi technology to suppress gene expression in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99(6): 5515-5520; Yu J-Y, DeRuiter SL, and Turner DL. (2002). RNA interference by expression of short-interfering RNAs and hairpin RNAs in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99(9):6047-6052）。
アンチセンス分子またはRNA干渉分子は、インビトロで細胞に、またはインビボで例えば哺乳類の腫瘍に輸送することができる。当技術分野で周知の典型的な輸送手段を使用することができる。例えば、腫瘍への輸送は、腫瘍内への注入によって達成可能である。静脈内、筋肉内、腹腔内、動脈内、外科手術中の局所輸送、内視鏡経由、皮下、および経口を含むが、これらに限定されない他の輸送様式を使用することができる。マウスモデルでは、アンチセンス分子またはRNA干渉分子をインビトロで腫瘍細胞に導入することが可能であり、また続いて腫瘍細胞をマウスに投与することができる。ベクターは、任意の特定の応用を鑑みて、所望の特性を考慮して選択することができる。ベクターは、ウイルスベクターまたはプラスミドベクターの場合がある。アデノウイルスベクターは、この点で有用である。組織特異的なプロモーター、細胞型特異的なプロモーター、または調節型プロモーターを使用して、阻害性ポリヌクレオチド分子の転写を制御することができる。リポソームまたはナノ粒子などの非ウイルス担体を使用することもできる。
当業者であれば、本発明のp110αタンパク質を使用することで、対象タンパク質に特異的に結合する抗体を容易に作製することができる。このような抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナルの場合がある。このような抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体、または全体がヒト由来の抗体の場合がある。Fab、Fab'、Fab2、Fab'2、および1本鎖可変領域を含む、抗体の任意の機能性断片または誘導体を使用することができる。断片または誘導体は、内皮のマーカータンパク質に対する結合の特異性を保持している限りにおいて使用することができる。抗体の結合特異性は、任意の一連の条件で、無関係の抗原または抗原混合物に対する結合を、適切な抗原に対する結合と比較することで試験できる。仮に抗体が、無関係な抗原または抗原混合物に対する結合より、少なくとも2倍、5倍、7倍、および好ましくは10倍強く、適切な抗原と結合する場合は、結合は特異的であると見なされる。
このような部分的なヒト抗体または完全なヒト抗体を作製する手法は当技術分野で周知であり、またそのような任意の手法を使用することができる。1つの特に好ましい態様によれば、完全ヒト抗体の配列は、ヒトの重鎖および軽鎖の抗体遺伝子を発現するように作製されたトランスジェニックマウスで作製される。さまざまなクラスの抗体を産生可能な、このようなトランスジェニックマウスの多数の系列が作製されている。所望の抗体を産生するトランスジェニックマウスに由来するB細胞を融合させて、所望の抗体の連続産生用のハイブリドーマ細胞系列を作製することができる。これについては文献を参照されたい（Nina D. Russel, Jose R. F. Corvalan, Michael L. Gallo, C. Geoffrey Davis, Liise-Anne Pirofski. Production of Protective Human Antipneumococcal Antibodies by Transgenic Mice with Human Immunoglobulin Loci Infection and Immunity April 2000, p.1820-1826; Michael L. Gallo, Vladimir E. Ivanov, Aya Jakobovits, and C. Geoffrey Davis. The human immunoglobulin loci introduced into mice: V(D) and J gene segment usage similar to that of adult humans European Journal of Immunology 30: 534-540, 2000; Larry L. Green. Antibody engineering via genetic engineering of the mouse: XenoMouse strains are a vehicle for the facile generation of therapeutic human monoclonal antibodies. Journal of Immunological Methods 231 11-23, 1999; Yang X-D, Corvalan JRF, Wang P. Roy CM-N and Davis CG. Fully Human Anti-interleukin-8 Monoclonal Antibodies: Potential Therapeutics for the Treatment of Inflammatory Disease States. Journal of Leucocyte Biology Vol.66, pp401-410 (1999); Yang X-D, Jia X-C, Corvalan JRE:, Wang P. CG Davis and Jakobovits A. Eradication of Established Tumors by a Fully Human Monoclonal Antibody to the Epidermal Growth Factor Receptor without Concomitant Chemotherapy. Cancer Research Vol.59, Number 6, ppl236-1243. (1999); Jakobovits A. Production and selection of antigen-specific fully human monoclonal antibodies from mice engineered with human Ig loci. Advanced Drug Delivery Reviews Vol.31, pp:33-42 (1998); Green L and Jakobovits A. Regulation of B cell development by variable gene complexity in mice reconstituted with human immunoglobulin yeast artificial chromosomes. J. Exp. Med. Vol.188, Number 3, pp:483-495 (1998); Jakobovits A. The long-awaited magic bullets: therapeutic human monoclonal antibodies from transgenic mice. Exp. Opin. Invest. Drugs Vol.7(4), pp:607-614 (1998); Tsuda H. Maynard-Currie K, Reid L, Yoshida T. Edamura K, Maeda N. Smithies O. Jakobovits A. Inactivation of Mouse HPRT locus by a 203-bp retrotransposon insertion and a 55-kb gene-targeted deletion: establishment of new HPRT-Deficient mouse embryonic stem cell lines. Genomics Vol.42, pp:413-421 (1997); Sherman-Gold, R. Monoclonal Antibodies: The Evolution from '80s Magic Bullets To Mature, Mainstream Applications as Clinical Therapeutics. Genetic Engineering News Vol.17, Number 14 (August 1997); Mendez M, Green L, Corvalan J. Jia X-C, Maynard-Currie C, Yang X-d, Gallo M, Louie D, Lee D, Erickson K, Luna J. Roy C, Abderrahim H. Kirschenbaum F. Noguchi M, Smith D, Fukushima A, Hales J. Finer M, Davis C, Zsebo K, Jakobovits A. Functional transplant of megabase human immunoglobulin loci recapitulates human antibody response in mice. Nature Genetics Vol.15, pp:146-156 (1997); Jakobovits A. Mice engineered with human immunoglobulin YACs: A new technology for production of fully human antibodies for autoimmunity therapy. Weir's Handbook of Experimental Immunology, The Integrated Immune System Vol.IV, pp:194.1-194.7 (1996); Jakobovits A. Production of fully human antibodies by transgenic mice. Current Opinion in Biotechnology Vol.6, No.5, pp:561-566 (1995); Mendez M, Abderrahim H. Noguchi M, David N. Hardy M, Green L, Tsuda H. Yoast S. Maynard-Currie C, Garza D, Gemmill R. Jakobovits A, Klapholz S. Analysis of the structural integrity of; YACs comprising human immunoglobulin genes in yeast and in embryonic stem cells. Genomics Vol.26, pp:294-307 (1995); Jakobovits A. YAC Vectors: Humanizing the mouse genome. Current Biology Vol.4, No.8, pp:761-763 (1994); Arbones M, Ord D, Ley K, Ratech H. Maynard-Curry K, Otten G. Capon D, Tedder T. Lymphocyte homing and leukocyte rolling and migration are impaired in L- selectin-deficient mice. Immunity Vol.1, No.4, pp:247-260 (1994); Green L, Hardy M, Maynard-Curry K, Tsuda H. Louie D, Mendez M, Abderrahim H. Noguchi M, Smith D, Zeng Y. et. al. Antigen specific human monoclonal antibodies from mice engineered with human Ig heavy and light chain YACs. Nature Genetics Vol.7, No.1, pp:13-21 (1994); Jakobovits A, Moore A, Green L, Vergara G. Maynard-Curry K, Austin H. Klapholz S. Germ-line transmission and expression of a human-derived yeast artificial chromosome. Nature Vol.362, No.6417, pp:255-258 (1993); Jakobovits A, Vergara G. Kennedy J, Hales J, McGuinness R, Casentini-Borocz D, Brenner D, Otten G. Analysis of homozygous mutant chimeric mice: deletion of the immunoglobulin heavy-chain joining region blocks B-cell development and antibody production. Proceedings of the National Academy of Sciences USA Vol.90, No.6, pp:2551-2555 (1993); Kucherlapati et al., U.S. 6,1075,181）。
抗体は、ファージディスプレイ法で作製することもできる。このような手法で一次抗体を単離することができるほか、特異性または抗体結合力の特徴を変化させた異型を作製することができる。利便性を考慮して、1本鎖Fvを使用することもできる。これらは望ましいならば、ワクチンを接種したトランスジェニックマウスから作製することができる。抗体は、細胞培養で、ファージ中で、またはウシ、ウサギ、ヤギ、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、ヒツジ、イヌ、ネコ、サル、チンパンジー、類人猿を含むが、これらに限定されない、さまざまな動物で産生させることができる。
抗体は、放射性原子、発色団、フルオロフォアなどの検出用部分で標識することができる。このような標識された抗体を、インビボまたは単離された被験試料のいずれかを対象とした診断法に使用することができる。抗体には例えば、化学療法剤やトキシンなどの薬剤を結合させることも可能である。薬剤は、サイトカインに、リガンドに、または他の抗体に連結可能である。抗腫瘍作用を引き出すための、抗体とのカップリングに適した薬剤には、インターロイキン2（IL-2）や腫瘍壊死因子（TNF）などのサイトカイン；アルミニウム（III）フタロシアニンテトラスルホン酸、ヘマトポルフィリン、およびフタロシアニンを含む、光線力学療法に使用される光増感物質；ヨウ素-131（131I）、イットリウム-90（90Y）、ビスマス-212（212Bi）、ビスマス-213（213Bi）、テクネチウム-99m（99mTc）、レニウム-186（186Re）、およびレニウム-188（188Re）などの放射性核種；ドキソルビシン、アドリアマイシン、ダウノルビシン、メトトレキセート、ダウノマイシン、ネオカルチノスタチン、およびカルボプラチンなどの抗生物質；ジフテリアトキシン、シュードモナス属外毒素A、ブドウ球菌エンテロトキシンA、アブリン-Aトキシン、リシンA（脱グリコシル化リシンAおよび天然のリシンA）、TGF-アルファトキシン、タイワンコブラ（naja naja atra）の細胞毒、およびゲロニン（植物トキシン）などの、細菌、植物、および他のトキシン；レストリクトシン（restrictocin）（Aspergillus restrictusが産生するリボソーム不活性化タンパク質）、サポリン（サボンソウ（Saponaria officinalis）のリボソーム不活性化タンパク質）などの、植物、細菌、および真菌のリボソーム不活性化タンパク質ならびにRNase；チロシンキナーゼ阻害剤；ly207702（ジフルオロ化プリンヌクレオシド）；抗腫瘍剤（例えばアンチセンスオリゴヌクレオチド、トキシン（メトトレキセートなど）をコードするプラスミド）を含むリポソーム；ならびに他の抗体またはF(ab)などの抗体断片などがある。
当業者であれば、当技術分野で周知である、このような抗体誘導体を容易に理解して作製することができる。抗体は、それ自体が細胞障害性を有する場合があるほか、細胞毒性薬を体内の特定部位に輸送するために使用することができる。抗体は、治療を必要とする個体に、受動免疫の様式で投与することができる。
低分子タンパク質キナーゼ阻害剤の成功を考えれば、上記のような変異を有する癌患者、または一般に癌である多数の患者の治療用に、p110αの特異的もしくは非特異的な阻害剤を開発することができる。広域のPI3K阻害剤を開発することは、LY294002およびワートマニンに関する研究（2、21、22）で明らかにされているように、明らかに可能である。発明者らが得たデータは、p110αを標的とするが他のPI3Kは標的としない、特異性の高い阻害剤の開発が有用なことを示唆している。
化学療法剤候補は、p110αの活性または発現を阻害する薬剤として同定することができる。被験化合物は、合成化合物または天然化合物の場合がある。被験化合物は、生理的活性を有するか否かについて既知である可能性がある。化学療法剤候補に関する試験は、無細胞系を対象に、または細胞全体を対象として実施できる。p110αの活性は、当技術分野で既知の手段で試験することができる。このような手段には、参考文献2、22、およびTruitt et al., J. Exp. Med., 179, 1071-1076 (1994)に記載された方法などがある。発現は、PI3KCAのタンパク質またはmRNAを決定することで追跡できる。ウェスタンブロッティングなどの抗体を使用する方法でタンパク質を決定することができる。ノーザンブロッティングでmRNAを測定することができる。他の方法を使用することができるが、それらに限定されない。化学療法剤を試験する際は、アッセイ法で使用されるp110αは野生型または活性化型の場合がある。活性化型は、E542K、E545K、Q546K、およびH1047Rからなる群より選択される置換変異を含む場合がある。また阻害剤を試験して、p110αまたはp110αの活性化型のいずれかに対する特異性を決定することができる。比較試験をPIK3CB、PIK3CG、PIK3C2A、PIK3C2B、PIK3C2G、PIK3C3、A-TM、ATR、FRAP1、LAT1-3TM、SMG1、PRKDC、およびTRRAPを含む類似の酵素を対象に実施することで、p110α酵素に対する相対的な特異性を決定できる。
PIK3CAのコード配列中の非同義の遺伝子内変異が、患者の被験組織中に同定されたら、こうした情報を元に治療に関する判断を下すことができる。このような変異を有する患者は、p110α阻害剤を使用する治療の有力な候補となる。このような阻害剤は、阻害剤のファミリーに特異的な場合もあれば一般的な場合もある。このような阻害剤にはLY294002やワートマニンなどがある。このような阻害剤はさらに、p110αに特異的な抗体結合領域を含む分子を含む。このような分子については既に説明した。
PIK3CAの増幅用および/または配列決定用のプライマーのセットは、キットの状態で、または個々の成分がまとめられた状態で提供される場合がある。有用なプライマーセットは、任意選択で配列決定用プライマーと組み合わされた、フォワードプライマーとリバースプライマーの対を含む。フォワードプライマーを配列番号：6〜158に示す。リバースプライマーを配列番号：159〜310に示す。配列決定用プライマーを配列番号：311〜461に示す。対または三つ組、またはこれらの対もしくは三つ組の組み合わせを包装して、PIK3CA遺伝子の配列の一部を増幅および/または配列決定する際に、ともに使用することができる。プライマー対は、1個または複数の容器内に包装することができる。本発明の方法に用いるプライマーの使用に関する指示書は、利便性を考慮して、紙、電子媒体、またはワールドワイドウェブのアドレスを含む任意のメディアとして提供される場合がある。
本発明を、本発明の現時点で好ましい実施様式を含む特定の実施例に関して説明したが、当業者であれば、上述した系および手法に、添付の特許請求の範囲に記載された本発明の趣旨および範囲に含まれる数多くの変更や入れ替えがありうることを理解すると思われる。
実施例
実施例1-本実施例は、PIK3CAの遺伝子が、この遺伝子ファミリーにおける主な標的であることを示す
PI3Kが腫瘍形成に遺伝学的に関与するか否かを評価するために、発明者らは、結腸直腸癌における、この遺伝子ファミリーの遺伝子群のDNA配列を直接調べた。
実施例1-本実施例は、PIK3CAの遺伝子が、この遺伝子ファミリーにおける主な標的であることを示す
PI3Kが腫瘍形成に遺伝学的に関与するか否かを評価するために、発明者らは、結腸直腸癌における、この遺伝子ファミリーの遺伝子群のDNA配列を直接調べた。
PI3Kの触媒サブユニットは、その基質特異性に応じて3つの主なクラスに分けられる（5）。加えて、mTORファミリーのタンパク質を含む、より遠縁の一連のタンパク質は第4のクラスを構成する（6）。発明者らは、隠れマルコフモデルを用いて、ヒトゲノム上の既知のPI3Kのドメインに関連するキナーゼドメインを含む15のヒト遺伝子を同定した（7）。内訳は、PI3Kが7つ、mTORサブファミリーの遺伝子が6つ、および未同定のPI3K様遺伝子が2つである（表1）。
（表1）解析したPI3K遺伝子
*PI3K遺伝子群は、過去に報告されたクラス（S3、S4）に分けられる。クラスI、クラスII、およびクラスIIIはPI3K触媒サブユニットを含み、クラスIVは、mTOR（target of rapamycin）、ATM（ataxia telangiectasia mutated）、およびDNAPK（DNA-dependent protein kinase）のサブファミリーのメンバーを含む、PI3K様遺伝子、ならびに過去に未同定の2つの遺伝子を含む。
発明者らはまず、これらの遺伝子の推定キナーゼドメインをコードする111のエキソンを調べた（表2）。エキソンをポリメラーゼ連鎖反応（PCR）で増幅し、35の結腸直腸癌のゲノムDNAから配列を直接決定した（8）。1つの遺伝子（PIK3CA）のみが、いくつかの体細胞（すなわち腫瘍特異的な）変異を含んでいた。
（表2）PCRによる増幅および配列決定に使用したプライマー
1配列番号：6〜165（フォワードプライマー）
2配列番号：166〜325（リバースプライマー）
3配列番号：326〜485（配列決定用プライマー）
2配列番号：166〜325（リバースプライマー）
3配列番号：326〜485（配列決定用プライマー）
実施例2-本実施例は、PIK3CA遺伝子内における変異の顕著な集中について示す
次に、別の199の結腸直腸癌を対象にPIK3CAの全コードエキソンを解析した結果、計74（32%）の腫瘍に変異の存在が明らかとなった（表3および図1の例）。
次に、別の199の結腸直腸癌を対象にPIK3CAの全コードエキソンを解析した結果、計74（32%）の腫瘍に変異の存在が明らかとなった（表3および図1の例）。
（表3）ヒトの癌におけるPIK3CAの変異
*変異に起因するヌクレオチドおよびアミノ酸の変化があるエキソン番号。ヌクレオチドの位置は、コード配列中の位置を示す（位置1は、開始コドンの先頭に対応する）。機能ドメインについては、図1のレジェンドに示す。#個々の腫瘍に見出された非同義変異の数。Colon＝結腸直腸癌、GBM＝膠芽腫、gastric＝胃癌、breast＝乳癌、lung＝肺癌、pancreas＝膵臓癌、medulloblastoma＝髄芽腫、adenomas＝良性の結腸直腸腫瘍。列挙した全ての変異は体細胞変異であるが、対応する正常組織が得られなかった5つの結腸直腸癌および1つの膠芽腫は例外とする。変異は、201例のミスマッチ修復（MMR）能を有する結腸直腸癌の58例で、33例のMMR能を有なさい結腸直腸癌の16例で同定された。PIK3CAに変異を有する一部の腫瘍は、KRASまたはBRAFに変異を含むが、他の腫瘍は含まない。この事実は、これらの遺伝子群が独立した経路で作用することを示唆している。7つの腫瘍は2つの体細胞変異を含んでいた。表に記載された92の非同義変異に加えて、発明者らは3つの同義変異を見出した。
実施例3-本実施例は、PIK3CAの変異が腫瘍形成の後期に現われることを示す
新生物の進行中におけるPIK3CAの変異のタイミングを決定するために、発明者らは、大きさおよび異形成の程度が多様な76の前悪性結腸直腸腫瘍の評価を行った。直径が5 cmを上回り、腺管絨毛状の極めて進行した線種で、PIK3CAの2つの変異（E542KおよびE542V）のみが見出された。この結果は、PIK3CAの異常が、新形成の比較的後期、すなわち腫瘍が浸潤および転移を開始する時期の近くで現われることを示唆している。
新生物の進行中におけるPIK3CAの変異のタイミングを決定するために、発明者らは、大きさおよび異形成の程度が多様な76の前悪性結腸直腸腫瘍の評価を行った。直径が5 cmを上回り、腺管絨毛状の極めて進行した線種で、PIK3CAの2つの変異（E542KおよびE542V）のみが見出された。この結果は、PIK3CAの異常が、新形成の比較的後期、すなわち腫瘍が浸潤および転移を開始する時期の近くで現われることを示唆している。
実施例4-本実施例は、多種多様な種類の癌におけるPIK3CAの変異を示す
次に発明者らは、他の種類の腫瘍における遺伝子変化に関してPIK3CAの評価を行った（表1）。変異は、膠芽腫の15例中4例（27%）で、胃癌の12例中3例（25%）で、乳癌の13例中1例（8%）で、また肺癌の24例中1例（4%）で同定された。膵臓癌の11例と髄芽腫の12例では変異は認められなかった。合計すると89の変異が認められた。そのうち3つの変異はヘテロ接合性であった。
次に発明者らは、他の種類の腫瘍における遺伝子変化に関してPIK3CAの評価を行った（表1）。変異は、膠芽腫の15例中4例（27%）で、胃癌の12例中3例（25%）で、乳癌の13例中1例（8%）で、また肺癌の24例中1例（4%）で同定された。膵臓癌の11例と髄芽腫の12例では変異は認められなかった。合計すると89の変異が認められた。そのうち3つの変異はヘテロ接合性であった。
実施例5-本実施例は、認められた遺伝子変化がランダムではないことを示す
5種類の異なる癌について、PIK3CAにかなりの数の変異が認められたことは、これらの変異が機能的に重要なことを強く示唆する。この結論は、別の2つの独立した証拠によって支持される。第1に、非同義変異と同義変異の比率の解析は、腫瘍の進行中における選択の適切な尺度となる。というのは、サイレントな変化に増殖上の利点がある可能性は低いからである。PIK3CAにおける非同義変異：同義変異の比は89：2であり、偶然による推定値2：1の比をはるかに上回った（P＜1x10-4）。第2に、PI3Kの触媒ドメインおよびアクセサリードメインに位置する非同義的変化の出現率は、1 Mbの腫瘍DNAあたり約120であり、癌細胞のゲノム上に観察された非機能的変化のバックグラウンドの変異出現率より100倍以上高い（P＜1x10-4）（9）。
5種類の異なる癌について、PIK3CAにかなりの数の変異が認められたことは、これらの変異が機能的に重要なことを強く示唆する。この結論は、別の2つの独立した証拠によって支持される。第1に、非同義変異と同義変異の比率の解析は、腫瘍の進行中における選択の適切な尺度となる。というのは、サイレントな変化に増殖上の利点がある可能性は低いからである。PIK3CAにおける非同義変異：同義変異の比は89：2であり、偶然による推定値2：1の比をはるかに上回った（P＜1x10-4）。第2に、PI3Kの触媒ドメインおよびアクセサリードメインに位置する非同義的変化の出現率は、1 Mbの腫瘍DNAあたり約120であり、癌細胞のゲノム上に観察された非機能的変化のバックグラウンドの変異出現率より100倍以上高い（P＜1x10-4）（9）。
キナーゼ機能に対する、これらの変異の作用は、実験によって試験されていないものの、PIK3CA内における変異の位置および性質は、変異が活性化変異である可能性が高いことを意味している。切断型の変異は認められず、75%を上回る変異が第9エキソンおよび第20エキソンの2つの小さな集中領域中に認められた（表2および図1）。これらの集中領域内で変化した残基は、進化的に高度に保存されており、性質がマウス、ラット、およびニワトリで保持されている。特定のドメインにおける体細胞のミスセンス変異の集中は、RAS（10）、BRAF（11、12）、β-カテニン（13）、およびチロシンキノーム（14）の遺伝子などの他の癌遺伝子の活性化変異に関して認められた結果と同等である。
以上の遺伝学的データは、変異型のPIK3CAが、ヒトの癌における癌遺伝子として機能する可能性が高いことを示唆している。
実施例6-本実施例は、PIK3CAの遺伝子増幅が一般的ではないことを示す
96の結腸直腸癌を対象としたPIK3CAの定量的PCR解析では遺伝子増幅の証拠は得られず、遺伝子のコピー数の変化が、この腫瘍における活性化の重要な機構ではないことが示唆された。使用したプライマーを以下に示す：
リアルタイムPI3K hCT1640694 20-1F（イントロン）
；および
リアルタイムPI3K hCT1640694 20-1R
96の結腸直腸癌を対象としたPIK3CAの定量的PCR解析では遺伝子増幅の証拠は得られず、遺伝子のコピー数の変化が、この腫瘍における活性化の重要な機構ではないことが示唆された。使用したプライマーを以下に示す：
リアルタイムPI3K hCT1640694 20-1F（イントロン）
リアルタイムPI3K hCT1640694 20-1R
本出願の最後に添付した配列表は、以下の配列を含む：
配列番号：1＝コード配列のみ（配列番号：2のnt 13〜3201）
配列番号：2＝mRNA配列（NM_006218）
配列番号：3＝タンパク質配列（NP_006209）
配列番号：4＝第9エキソン
配列番号：5＝第20エキソン
配列番号：6〜165＝フォワードプライマー
配列番号：166〜325＝リバースプライマー
配列番号：326〜485＝配列決定用プライマー
配列番号：486および487＝増幅用プライマー
配列番号：1＝コード配列のみ（配列番号：2のnt 13〜3201）
配列番号：2＝mRNA配列（NM_006218）
配列番号：3＝タンパク質配列（NP_006209）
配列番号：4＝第9エキソン
配列番号：5＝第20エキソン
配列番号：6〜165＝フォワードプライマー
配列番号：166〜325＝リバースプライマー
配列番号：326〜485＝配列決定用プライマー
配列番号：486および487＝増幅用プライマー
参考文献および注記
7．PI3Kの触媒サブユニットは、Celera社の概要ヒトゲノム配列中に存在するInterPro（IPR）PI3Kドメイン（IPR000403）の解析によって同定された。この結果、15のPI3K遺伝子および関連するPI3K遺伝子が同定された。PIK3CD遺伝子のキナーゼドメインは、現時点のヒトゲノム概要配列には記載されていなかったので、本研究の対象から外した。
8．同定されたPI3Kのキナーゼドメインを含む、全ての注釈付きエキソンおよび隣接するイントロンの配列を、Celera社の概要ヒトゲノム配列（URLアドレス：wwwホストサーバ、ドメイン名celera.com）から抽出した。解析した全ての遺伝子のCelera社およびゲンバンクのアクセッション番号を表1に示す。PCRによる増幅および配列決定用のプライマーは、Primer 3プログラム（URLアドレス：httpファイル型式、www-genome.wi.mit.eduホストサーバ、cgi-binドメイン名、プライマーディレクトリ、primer3_www.cgiサブディレクトリ）を使用して設計され、MWG（High Point, NC）またはIDT（Coralville, IA）によって合成された。PCRによる増幅および配列決定は、初期の継代細胞系列、または一次腫瘍に由来する腫瘍のDNAを対象に、384キャピラリ自動配列決定装置（Spectrumedix, State College, PA）を使用して、文献（12）に記載された手順で実施された。配列の読み取り波形データを整列化して解析し、潜在的なゲノム変化を、Mutation Explorerソフトウェアパッケージ（SoftGenetics, State College, PA）を使用して同定した。抽出されたエキソンのうち96%の解析に成功した。PCRによる増幅および配列決定に使用された全てのプライマーの配列を表S1に示す。
8．同定されたPI3Kのキナーゼドメインを含む、全ての注釈付きエキソンおよび隣接するイントロンの配列を、Celera社の概要ヒトゲノム配列（URLアドレス：wwwホストサーバ、ドメイン名celera.com）から抽出した。解析した全ての遺伝子のCelera社およびゲンバンクのアクセッション番号を表1に示す。PCRによる増幅および配列決定用のプライマーは、Primer 3プログラム（URLアドレス：httpファイル型式、www-genome.wi.mit.eduホストサーバ、cgi-binドメイン名、プライマーディレクトリ、primer3_www.cgiサブディレクトリ）を使用して設計され、MWG（High Point, NC）またはIDT（Coralville, IA）によって合成された。PCRによる増幅および配列決定は、初期の継代細胞系列、または一次腫瘍に由来する腫瘍のDNAを対象に、384キャピラリ自動配列決定装置（Spectrumedix, State College, PA）を使用して、文献（12）に記載された手順で実施された。配列の読み取り波形データを整列化して解析し、潜在的なゲノム変化を、Mutation Explorerソフトウェアパッケージ（SoftGenetics, State College, PA）を使用して同定した。抽出されたエキソンのうち96%の解析に成功した。PCRによる増幅および配列決定に使用された全てのプライマーの配列を表S1に示す。
Claims (4)
- がんが疑われるヒト又はがんを有するヒトから採取したサンプル中のPIK3CAポリヌクレオチドの変異検出結果を提供する方法であって、
前記変異が、PIK3CAポリヌクレオチドの配列をシーケンサーで解析することにより検出された変異であり、
前記変異が、C112T, G113A, G263A, C311G, G317T, G323C, del332-334, G353A, G365A, C370A, T1035A, G1048C, T1132C, T1258C, G1357C, C1616G, G1624A, A1625G, A1625T, G1633A, A1634G, G1635T, C1636A, A1637C, C1981A, A2102C, G2702T, T2725C, T3022C, A3073G, C3074A, G3129T, C3139T, A3140G, A3140T, およびG3145Aからなる群より選択される少なくとも１の変異である、前記方法。 - ｐ１１０α阻害剤治療の候補患者を同定する方法であって、
がんを有するヒトから採取したサンプル中のPIK3CAポリヌクレオチドに変異がある場合は、前記治療の候補とすることを特徴とし、
前記変異が、PIK3CAポリヌクレオチドの配列をシーケンサーで解析することにより検出された変異であり、
前記変異が、C112T, G113A, G263A, C311G, G317T, G323C, del332-334, G353A, G365A, C370A, T1035A, G1048C, T1132C, T1258C, G1357C, C1616G, G1624A, A1625G, A1625T, G1633A, A1634G, G1635T, C1636A, A1637C, C1981A, A2102C, G2702T, T2725C, T3022C, A3073G, C3074A, G3129T, C3139T, A3140G, A3140T, およびG3145Aからなる群より選択される少なくとも１の変異である、前記方法。 - 前記変異が、がん患者から取得されたサンプル中に見られる、請求項１または２記載の方法。
- 前記変異が、前記サンプル中のPIK3CAポリヌクレオチドを増幅し、増幅されたPIK3CAポリヌクレオチドの配列をシーケンサーで解析し、解析によって得られた配列と野生型PIK3CA遺伝子配列と比較することにより検出された変異である、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US54888604P | 2004-03-02 | 2004-03-02 | |
| US60/548,886 | 2004-03-02 |
Related Parent Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2018090580A Division JP6695381B2 (ja) | 2004-03-02 | 2018-05-09 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2020038337A Division JP7169315B2 (ja) | 2004-03-02 | 2020-03-06 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2020028300A JP2020028300A (ja) | 2020-02-27 |
| JP2020028300A5 JP2020028300A5 (ja) | 2020-04-16 |
| JP6694543B2 true JP6694543B2 (ja) | 2020-05-13 |
Family
ID=35056655
Family Applications (10)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2007501815A Withdrawn JP2007530017A (ja) | 2004-03-02 | 2005-02-18 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2012052427A Active JP5336620B2 (ja) | 2004-03-02 | 2012-03-09 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2013100073A Active JP5894110B2 (ja) | 2004-03-02 | 2013-05-10 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2015245769A Active JP6250017B2 (ja) | 2004-03-02 | 2015-12-17 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2017202265A Active JP6395917B2 (ja) | 2004-03-02 | 2017-10-19 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2018090580A Active JP6695381B2 (ja) | 2004-03-02 | 2018-05-09 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2019201128A Active JP6694543B2 (ja) | 2004-03-02 | 2019-11-06 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2020038337A Active JP7169315B2 (ja) | 2004-03-02 | 2020-03-06 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2020078786A Active JP7001735B2 (ja) | 2004-03-02 | 2020-04-28 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2022022542A Active JP7304987B2 (ja) | 2004-03-02 | 2022-02-17 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
Family Applications Before (6)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2007501815A Withdrawn JP2007530017A (ja) | 2004-03-02 | 2005-02-18 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2012052427A Active JP5336620B2 (ja) | 2004-03-02 | 2012-03-09 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2013100073A Active JP5894110B2 (ja) | 2004-03-02 | 2013-05-10 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2015245769A Active JP6250017B2 (ja) | 2004-03-02 | 2015-12-17 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2017202265A Active JP6395917B2 (ja) | 2004-03-02 | 2017-10-19 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2018090580A Active JP6695381B2 (ja) | 2004-03-02 | 2018-05-09 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
Family Applications After (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2020038337A Active JP7169315B2 (ja) | 2004-03-02 | 2020-03-06 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2020078786A Active JP7001735B2 (ja) | 2004-03-02 | 2020-04-28 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
| JP2022022542A Active JP7304987B2 (ja) | 2004-03-02 | 2022-02-17 | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
Country Status (14)
| Country | Link |
|---|---|
| US (6) | US8026053B2 (ja) |
| EP (5) | EP2497836B1 (ja) |
| JP (10) | JP2007530017A (ja) |
| AU (2) | AU2005227148B2 (ja) |
| CA (1) | CA2560696C (ja) |
| CY (1) | CY1121975T1 (ja) |
| DK (3) | DK1730303T3 (ja) |
| ES (5) | ES2537633T3 (ja) |
| HU (1) | HUE045690T2 (ja) |
| LT (1) | LT3296407T (ja) |
| PL (2) | PL1730303T3 (ja) |
| PT (3) | PT3556866T (ja) |
| SI (2) | SI1730303T1 (ja) |
| WO (1) | WO2005091849A2 (ja) |
Families Citing this family (42)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| HUE045690T2 (hu) | 2004-03-02 | 2020-01-28 | Univ Johns Hopkins | A PIK3CA gén mutációi humán rákokban |
| EP1849877A1 (en) * | 2006-04-24 | 2007-10-31 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Replicative history of T-and B-cell subsets |
| WO2008109375A2 (en) * | 2007-03-02 | 2008-09-12 | Mdrna, Inc. | Nucleic acid compounds for inhibiting pik3c gene expression and uses thereof |
| GB2453173A (en) * | 2007-09-28 | 2009-04-01 | Dxs Ltd | Polynucleotide primers |
| EP2225376B1 (en) | 2007-12-03 | 2014-01-08 | Santaris Pharma A/S | Rna antagonist compounds for the modulation of pik3ca expression |
| WO2009152346A2 (en) * | 2008-06-11 | 2009-12-17 | Intradigm Corporation | Compositions comprising phosphoinositide 3-kinase sirna and methods of use thereof |
| CN101445832B (zh) * | 2008-12-23 | 2011-09-14 | 广州益善生物技术有限公司 | Pik3ca基因突变的检测探针、液相芯片及其检测方法 |
| CA2790416C (en) | 2010-03-26 | 2017-05-23 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Methods and materials for detecting colorectal neoplasm |
| AU2011329180A1 (en) * | 2010-11-15 | 2013-05-02 | Enzon Pharmaceuticals, Inc. | Methods of treating cancers with HER3 and PIK3CA antisense oligonucleotides |
| EP2640468A4 (en) * | 2010-11-16 | 2014-04-16 | Glaxosmithkline Ip No 2 Ltd | ADMINISTRATIVE AND TREATMENT PROCEDURES |
| US9157125B2 (en) | 2011-02-02 | 2015-10-13 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | GRIN2A mutations and use thereof for the diagnosis of melanoma |
| US9295673B2 (en) | 2011-02-23 | 2016-03-29 | Intellikine Llc | Combination of mTOR inhibitors and P13-kinase inhibitors, and uses thereof |
| CN110016499B (zh) | 2011-04-15 | 2023-11-14 | 约翰·霍普金斯大学 | 安全测序系统 |
| EP2736325B1 (en) * | 2011-07-28 | 2018-10-10 | F.Hoffmann-La Roche Ag | Pik3ca h1047r knock-in non-human animal breast cancer model |
| US9376715B2 (en) | 2011-12-09 | 2016-06-28 | Roche Molecular Systems, Inc | Methods for detecting mutations in the catalytic subunit of the phosphoinositol-3 kinase (PIK3CA) gene |
| WO2013177386A1 (en) | 2012-05-24 | 2013-11-28 | Abbvie Biotherapeutics Inc. | Biomarkers for predicting response to tweak receptor (tweakr) agonist therapy |
| CN102816839A (zh) * | 2012-07-06 | 2012-12-12 | 杭州艾迪康医学检验中心有限公司 | 用于检测结直肠癌pik3ca基因热点突变位点的试剂盒 |
| ES2701742T3 (es) | 2012-10-29 | 2019-02-25 | Univ Johns Hopkins | Prueba de Papanicolaou para cánceres de ovario y de endometrio |
| CN105229171A (zh) * | 2013-03-13 | 2016-01-06 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 在人pi3kca (pik3ca)基因中检测突变的方法和组合物 |
| US9994911B2 (en) | 2013-03-14 | 2018-06-12 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting neoplasm |
| KR101501826B1 (ko) * | 2013-04-05 | 2015-03-13 | 연세대학교 산학협력단 | 위암에 대한 예후 예측 모형의 제조방법 |
| WO2015017528A1 (en) * | 2013-07-30 | 2015-02-05 | Blueprint Medicines Corporation | Pik3c2g fusions |
| ES2812753T3 (es) | 2014-03-31 | 2021-03-18 | Mayo Found Medical Education & Res | Detección de neoplasma colorectal |
| CN106715723B (zh) * | 2014-08-07 | 2021-03-30 | 法马西斯特有限责任公司 | 测定样品中pik3ca突变状态的方法 |
| US10184154B2 (en) | 2014-09-26 | 2019-01-22 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting cholangiocarcinoma |
| CN104531854B (zh) * | 2014-11-10 | 2017-01-18 | 中国人民解放军第三〇七医院 | 检测西妥昔单抗治疗转移性结直肠癌耐药的试剂盒 |
| US10030272B2 (en) | 2015-02-27 | 2018-07-24 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting gastrointestinal neoplasms |
| US10435755B2 (en) | 2015-03-27 | 2019-10-08 | Exact Sciences Development Company, Llc | Detecting esophageal disorders |
| CA3235175A1 (en) | 2015-05-27 | 2016-12-01 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Compositions and methods for screening solid tumors |
| WO2017027653A1 (en) | 2015-08-11 | 2017-02-16 | The Johns Hopkins University | Assaying ovarian cyst fluid |
| US10006093B2 (en) | 2015-08-31 | 2018-06-26 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting gastric neoplasm |
| EP3383391A1 (en) | 2015-12-03 | 2018-10-10 | Novartis AG | Treatment of cancer with a pi3k inhibitor in a patient preselected for having a pik3ca mutation in the ctdna |
| RU2608960C1 (ru) * | 2016-03-18 | 2017-01-27 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский онкологический научный центр имени Н.Н. Блохина" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "РОНЦ им. Н.Н. Блохина" Минздрава России) | Клеточная линия crov Cel муцинозного рака яичников человека, предназначенная для разработки лечения таргетными препаратами |
| US10370726B2 (en) | 2016-04-14 | 2019-08-06 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Detecting colorectal neoplasia |
| KR102380690B1 (ko) | 2016-04-14 | 2022-03-29 | 메이오 파운데이션 포 메디칼 에쥬케이션 앤드 리써치 | 췌장 고도 이형성증의 검출방법 |
| CN118147307A (zh) | 2017-02-28 | 2024-06-07 | 梅约医学教育与研究基金会 | 用于表征来自人患者的样品的方法 |
| WO2018181863A1 (ja) * | 2017-03-30 | 2018-10-04 | 国立大学法人東京大学 | 異なる複数の目的遺伝子の評価方法 |
| JP7067896B2 (ja) | 2017-10-27 | 2022-05-16 | シスメックス株式会社 | 品質評価方法、品質評価装置、プログラム、および記録媒体 |
| EP3717644A4 (en) | 2017-11-30 | 2021-12-29 | Mayo Foundation for Medical Education and Research | Detecting breast cancer |
| CN111363827A (zh) * | 2020-04-30 | 2020-07-03 | 北京和合医学诊断技术股份有限公司 | 用于检测pik3ca基因突变的引物组及其应用方法 |
| DE102021126650A1 (de) | 2021-10-14 | 2023-04-20 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Körperschaft des öffentlichen Rechts | Verfahren zur bestimmung der ansprechwahrscheinlichkeit einer malignen erkrankung auf eine behandlung mit einem pharmazeutischen hemmwirkstoff |
| CN116219015A (zh) * | 2023-02-06 | 2023-06-06 | 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) | 基于pcr的dna中pik3ca基因突变检测试剂盒及检测方法 |
Family Cites Families (17)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5248671A (en) * | 1989-02-15 | 1993-09-28 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for treatment of cancer using oligonucleotides |
| US6075181A (en) | 1990-01-12 | 2000-06-13 | Abgenix, Inc. | Human antibodies derived from immunized xenomice |
| US5846824A (en) * | 1994-02-07 | 1998-12-08 | Ludwig Institute For Cancer Research | Polypeptides having kinase activity, their preparation and use |
| GB9208135D0 (en) | 1992-04-13 | 1992-05-27 | Ludwig Inst Cancer Res | Polypeptides having kinase activity,their preparation and use |
| US6274327B1 (en) | 1992-04-13 | 2001-08-14 | Ludwig Institute For Cancer Research | Polypeptides having kinase activity, their preparation and use |
| US5846624A (en) * | 1996-12-06 | 1998-12-08 | The Standard Register Company | Dual face pressure sensitive label |
| US7670767B1 (en) | 1997-01-16 | 2010-03-02 | The Regents Of The University Of California | Genetic alterations associated with cancer |
| US6277563B1 (en) | 1997-01-16 | 2001-08-21 | The Regents Of The University Of California | Genetic alterations associated with cancer |
| US6558903B1 (en) | 1999-06-30 | 2003-05-06 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Kinases and uses thereof |
| ES2302699T3 (es) * | 1999-08-27 | 2008-08-01 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Oligonucleotidos quimericos antisentido y formulaciones de transfeccion celular de los mismos. |
| WO2001055208A1 (en) * | 2000-01-31 | 2001-08-02 | Human Genome Sciences, Inc. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
| WO2002027028A1 (en) * | 2000-09-28 | 2002-04-04 | Atairgin Technologies, Inc. | A method of determining tumor characteristics by determining abnormal copy number or expression level of lipid-associated genes |
| US20020142305A1 (en) | 2001-03-27 | 2002-10-03 | Koei Chin | Methods for diagnosing and monitoring ovarian cancer by screening gene copy numbers |
| US20030135033A1 (en) * | 2002-01-04 | 2003-07-17 | Anke Klippel-Giese | Compounds and methods for the identification and/ or validation of a target |
| WO2004010900A1 (en) | 2002-07-25 | 2004-02-05 | Avantec Vascular Corporation | Devices delivering therapeutic agents and methods regarding the same |
| NZ542475A (en) * | 2003-04-03 | 2009-04-30 | Semafore Pharmaceuticals Inc | PI-3 kinase inhibitor prodrugs |
| HUE045690T2 (hu) | 2004-03-02 | 2020-01-28 | Univ Johns Hopkins | A PIK3CA gén mutációi humán rákokban |
-
2005
- 2005-02-18 HU HUE17197306A patent/HUE045690T2/hu unknown
- 2005-02-18 EP EP12164819.0A patent/EP2497836B1/en active Active
- 2005-02-18 ES ES12164819.0T patent/ES2537633T3/es active Active
- 2005-02-18 ES ES05723277.9T patent/ES2437590T3/es active Active
- 2005-02-18 PT PT191756063T patent/PT3556866T/pt unknown
- 2005-02-18 DK DK05723277.9T patent/DK1730303T3/da active
- 2005-02-18 DK DK17197306.8T patent/DK3296407T3/da active
- 2005-02-18 SI SI200531792T patent/SI1730303T1/sl unknown
- 2005-02-18 PL PL05723277T patent/PL1730303T3/pl unknown
- 2005-02-18 LT LTEP17197306.8T patent/LT3296407T/lt unknown
- 2005-02-18 PT PT17197306T patent/PT3296407T/pt unknown
- 2005-02-18 PT PT57232779T patent/PT1730303E/pt unknown
- 2005-02-18 EP EP05723277.9A patent/EP1730303B1/en active Active
- 2005-02-18 EP EP19175606.3A patent/EP3556866B1/en active Active
- 2005-02-18 CA CA2560696A patent/CA2560696C/en active Active
- 2005-02-18 PL PL17197306T patent/PL3296407T3/pl unknown
- 2005-02-18 EP EP17197306.8A patent/EP3296407B1/en active Active
- 2005-02-18 JP JP2007501815A patent/JP2007530017A/ja not_active Withdrawn
- 2005-02-18 ES ES15150891.8T patent/ES2663248T3/es active Active
- 2005-02-18 EP EP15150891.8A patent/EP2896703B1/en active Active
- 2005-02-18 AU AU2005227148A patent/AU2005227148B2/en active Active
- 2005-02-18 US US10/591,347 patent/US8026053B2/en active Active
- 2005-02-18 SI SI200532262T patent/SI3296407T1/sl unknown
- 2005-02-18 DK DK19175606.3T patent/DK3556866T3/da active
- 2005-02-18 WO PCT/US2005/005193 patent/WO2005091849A2/en active Application Filing
- 2005-02-18 ES ES19175606T patent/ES2869167T3/es active Active
- 2005-02-18 ES ES17197306T patent/ES2743125T3/es active Active
-
2011
- 2011-02-11 AU AU2011200600A patent/AU2011200600B2/en active Active
- 2011-08-16 US US13/210,736 patent/US20110319477A1/en not_active Abandoned
-
2012
- 2012-03-09 JP JP2012052427A patent/JP5336620B2/ja active Active
-
2013
- 2013-05-10 JP JP2013100073A patent/JP5894110B2/ja active Active
-
2014
- 2014-10-31 US US14/529,351 patent/US10422006B2/en active Active
-
2015
- 2015-12-17 JP JP2015245769A patent/JP6250017B2/ja active Active
-
2017
- 2017-10-19 JP JP2017202265A patent/JP6395917B2/ja active Active
- 2017-12-08 US US15/836,366 patent/US10704105B2/en active Active
-
2018
- 2018-05-09 JP JP2018090580A patent/JP6695381B2/ja active Active
-
2019
- 2019-08-21 CY CY20191100895T patent/CY1121975T1/el unknown
- 2019-10-07 US US16/595,055 patent/US11549150B2/en active Active
- 2019-11-06 JP JP2019201128A patent/JP6694543B2/ja active Active
-
2020
- 2020-03-06 JP JP2020038337A patent/JP7169315B2/ja active Active
- 2020-04-20 US US16/853,230 patent/US10787713B2/en active Active
- 2020-04-28 JP JP2020078786A patent/JP7001735B2/ja active Active
-
2022
- 2022-02-17 JP JP2022022542A patent/JP7304987B2/ja active Active
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP6694543B2 (ja) | ヒトの癌におけるｐｉｋ３ｃａ遺伝子の変異 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20191202 |
|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20191202 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20191129 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200306 |
|
| A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20200306 |
|
| A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20200309 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200316 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200319 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20200330 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20200417 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6694543 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |