JP2007325594A - 穀類の非貯蔵タンパクを融合キャリアとして使用する胚乳におけるポリペプチド発現方法及びその使用 - Google Patents
穀類の非貯蔵タンパクを融合キャリアとして使用する胚乳におけるポリペプチド発現方法及びその使用 Download PDFInfo
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Abstract
【解決手段】本発明は、穀類の非貯蔵タンパクを融合キャリアとして使用する胚乳におけるポリペプチド発現方法及びその使用に関し、以下の工程を含む:1)胚乳特異的プロモーターと、胚乳特異的シグナルペプチドをコードするリーダー配列DNAを提供する工程;2)融合タンパク質キャリアである穀類非貯蔵タンパク質と目的遺伝子を提供する工程;3)前記プロモーター及びリーダー配列DNAを含む発現ベクターと、融合タンパク質キャリアの遺伝子と、目的遺伝子とを構築する工程;4)宿主胚乳細胞において発現ベクターを発現する工程。また、本発明は、発現ベクター及びその使用に関する。
【選択図】なし
Description
強力な水稲胚乳特異的なプロモーター及びシグナルペプチドを取得するために、生物情報学の分析に基づき、水稲貯蔵タンパク質のグルテリン遺伝子ファミリーの一員であるGt13aを採用した(該プロモーターはかなり高い活性を有している)。Gt13aプロモーター及びそのシグナルペプチド配列を取得するために、遺伝子データバンクのGt13a(GenBank登録番号:AP003256)に基づき、PCR増幅にて一対のヌクレオチドプライマー(プライマー配列については、中国特許出願第200510019084.4号(中国特許出願公開第CN1896239号)の配列番号1と2(本願配列表の配列番号10および11)を参照)を合成した。クローニングの便を図るべく、フォワードプライマーの5’末端に粘着末端の制限酵素部位を導入し、リバースプライマーの5’末端に平滑末端の制限酵素部位を導入した。水稲品種:台北309の葉からゲノムDNAを抽出して該DNAを鋳型とし、標準のPCRプロトコールに従い、前記のプライマーを利用して1284塩基対を有するDNA断片を増幅取得した。DNA配列の分析の結果、該DNA断片が典型的なプロモーター構造を有しており、穀類胚乳における組換えタンパク質の発現を制御できるプロモーターとシグナルペプチドが得られたこと、更には該プロモーターとシグナルペプチドが配列番号1に記載のヌクレオチド配列を有していることが判った。
PCRを経てGt13aプロモーターとシグナルペプチドを得た後、PCR生成物を粘着末端及び平滑末端エンドヌクレアーゼにて消化し、次いでこの断片と、粘着末端及び平滑末端エンドヌクレアーゼにて消化したpBI221断片(米国 Clontech社)とを接続した。次いで、大腸菌菌株DH10B(米国 Invitrogen社製の製品)に導入し、Gt13aプロモーター、Gt13aシグナルペプチドとNosターミネーターを有する、水稲胚乳細胞が特異的に発現するプラスミドを形成した(このプラスミドをpOsPMP2と名づけた)。図1から該プラスミドが配列番号2に記載のヌクレオチド配列を有していることが判った。
米国のバイオテクノロジー情報センター(NCBI)のGenBankから水稲Bip遺伝子(GenBank登録番号:AAB63469)、小麦のPDI遺伝子(GenBank登録番号:AJ277377)とインシュリン様成長因子遺伝子(GenBank登録番号:CAA01955)のアミノ酸配列を取得し、DNA分析ソフトウェアであるMacベクター(Mac Vector、英国Accelrys社製の製品)でこれらの遺伝子のアミノ酸配列を、水稲好適遺伝コドンを含むヌクレオチド配列に転換した。これらの遺伝子は米国のBlue Heron Biotechnology社にて合成された。このようにして得られた水稲好適水稲Bip遺伝子のC末端は、配列番号3に示されたヌクレオチド配列を有している。このようにして得られた水稲好適小麦PDI遺伝子のC末端は、配列番号4に示されたヌクレオチド配列を有している。このようにして得られた水稲好適ヒトIGF−1遺伝子は、配列番号5に示されたヌクレオチド配列を有している。これらのもとの遺伝子配列と比べて、最適化されたこれらの遺伝子のヌクレオチド配列は11.2〜21.4%の割合で変化しており、遺伝コドンのそれは30.5〜54.3%の割合で変化していたが、そのアミノ酸の配列には変化がなかった(表1参照)。
1)pOsPMP25(Gt13a−PDIC−IGF−1−Nos)の構築:まず、pOsPMP2プラスミドDNAをMscIとXhoIで切断した後、PCR増幅されたヒトインシュリン様成長因子(human IGF−1)の最適化された遺伝子をpOsPMP2ベクター中にクローニングする。その結果物をE.coli宿主細胞DH10Bの形質転換に使って、IGF−1遺伝子を含む中間プラスミドを生成する。制限エンドヌクレアーゼNaeIとNcoIでpOsPMP3プラスミドDNAを消化し、PCR増幅されたPDICのDNA断片を中間プラスミドベクター中にクローニングし、最終的に水稲に特異的に発現する融合タンパク質発現ベクターpOsPMP25(Gt13a−PDIC−IGF−1−Nos)が形成される。
b.単子葉植物種子の貯蔵タンパク遺伝子のプロモーターとシグナルペプチドを利用することで、種子内に特異的に各種の医薬又は保健用のポリペプチドを発現させる、例えば、水稲胚乳に発現されたIGF−1融合タンパクの量は種子の乾燥重量の0.75%に達する。
c.種子内に発現された各種の医薬用のポリペプチドとは、アミノ酸配列が20〜100個であるポリペプチドを意味する。それは、ヒト血液中における各種の医用及び保健用ポリペプチド、各種の抗腫瘍ポリペプチド、各種の抗菌ポリペプチド、及び他の人体に対し治療と保健作用を有するポリペプチドを含んでいる。
d.水稲/大麦種子内に組換えヒトインシュリン様成長因子−1を発現させる。
pOsPMP2−−−水稲胚乳特異的遺伝発現の基本ベクター
pOsBipC−−−組換えBip−IGF−1融合タンパク遺伝子を有するベクター
pOsPDIC−−−組換えPDI−IGF−1融合タンパク遺伝子を有するベクター
pOsPMP3−−−水稲コドン好適IGF−1遺伝子を有するベクター
pOsPMP25−−水稲胚乳特異的発現組換え融合タンパク遺伝子(Bip−C−IGF)のベクタープラスミド
pOsPMP26−−水稲胚乳特異的発現組換え融合タンパク遺伝子(PDI−C−IGF)のベクタープラスミド
pOsPMP5−−−水稲組織特異的発現選択マーカー発現ベクター
図1は、構築された水稲胚乳特異的発現ベクターpOsPMP2(Gt13a Sp−Stuff−Nos)の制限エンドヌクレアーゼ地図である。
図2は、構築されたpOsPMP25(Gt13a−BipC−IGF−1)の制限エンドヌクレアーゼ地図である。
図3は、構築されたpOsPMP26(Gt13a−PDIC−IGF−1)の制限エンドヌクレアーゼ地図である。
図4は、構築された水稲カルス組織特異的発現の選択マーカー遺伝子ベクターpOsPMP05(CP−Hpt−Nos)の制限エンドヌクレアーゼ地図である。
図5は、クーマシーブリリアントブルーで染色されたポリアクリルアミドゲル染色の図である。矢印は効率よく発現されたBipC−IGF−1融合タンパクがクーマシーブリリアントブルーで染色されて明瞭に見られることを示している。一方、対照サンプルである台北309と遺伝的に分離された単株には相応するタンパク質バンドが欠落している。
図6は、IGF−1特異的抗体によるウェスタンブロット法の図である。矢印は効率よく発現されたBipC−IGF−1融合タンパクを示し、融合タンパクが遺伝子導入胚乳中に存在していることが明らかに分かる。一方、対照サンプルである台北309と遺伝的に分離された単株には相応するタンパク質バンドが欠落している。
図7は、Bip特異的抗体によるウェスタンブロット法の図である。矢印は効率よく発現されたBipC−IGF−1融合タンパクと内因性非融合Bipタンパクを示している。遺伝子導入胚乳中には内因性BipタンパクとBipC−IGF−1融合タンパクが含まれているが、対照サンプルである台北309と遺伝的に分離された単株には内因性Bipタンパクしかなく、組換えBip−IGF融合タンパクは欠落している。
図8は、クーマシーブリリアントブルーで染色されたポリアクリルアミドゲル染色の図である。矢印は効率よく発現されたPDIC−IGF−1融合タンパクがクーマシーブリリアントブルーで染色されて明瞭に見られることを示している。一方、対照サンプルである台北309と遺伝的に分離された単株には相応するタンパク質バンドが欠落している。
図9は、IGF−1特異的抗体によるウェスタンブロット法の図である。矢印は効率よく発現されたPDIC−IGF−1融合タンパクを示しており、融合タンパクが遺伝子導入胚乳中に存在していることが明らかに分かる。一方、対照サンプルである台北309と遺伝的に分離された単株には相応するタンパク質バンドが欠落している。
図8、図9は、水稲胚乳中に発現された組換え融合タンパクのポリアクリルアミドゲル染色とウェスタンブロット法の図を示している。組換え融合タンパクは遺伝子導入水稲胚乳から抽出された。遺伝子導入#25−12株系から13粒のT1代種子を取り出し、1mLのタンパク質抽出バッファーにて遺伝子導入水稲種子の各粒から全タンパクを抽出した。サンプル10μLを、12%ポリアクリルアミドゲルに加え、電気泳動をした後でクーマシーブリリアントブルー染色とウェスタンブロット法により検出した。
配列番号2は、水稲胚乳特異的発現の基本ベクターである。
配列番号3は、人工合成されたコドン優先性BipのC末端のヌクレオチド配列とアミノ酸配列である。
配列番号4は、人工合成されたコドン優先性PDIのC末端のヌクレオチド配列とアミノ酸配列である。
配列番号5は、人工合成されたコドン優先性IGF−1のヌクレオチド配列とアミノ酸配列である。
配列番号6は、PCRに用いられた水稲CPプロモーターのフォワードプライマーである。
配列番号7は、PCRに用いられた水稲CPプロモーターのリバースプライマーである。
配列番号8は、PCRに用いられたハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子のフォワードプライマーである。
配列番号9は、PCRに用いられたハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子のリバースプライマーである。
配列番号10は、プライマー配列である。
配列番号11は、プライマー配列である。
水稲ゲノム配列からグルテリンのGt13a遺伝子のプロモーターとシグナルペプチドをクローニングするために、上記配列番号1のプライマーを利用し、標準のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を採用して、台北309のゲノムDNAを増幅し、1284bpのDNA断片を得た。増幅された断片を制限エンドヌクレアーゼNaeIとXhoIにて消化し、ベクタープラスミドpBI221にクローニングし、水稲胚乳細胞特異的発現の発現ベクターpOsPMP2を産生した。DNA配列の解析により、このDNA断片が明瞭なプロモーター特徴とシグナルペプチドの配列(配列番号1)を有していることが分かった(図1参照)。
NIBCデータベースから水稲Bip遺伝子(GenBank登録番号:AAB63469)、小麦のPDI遺伝子(GenBank登録番号:AJ277377)と目的遺伝子であるヒトインシュリン様成長因子遺伝子−1(GenBank登録番号:CAA01955)のアミノ酸配列を取得し、DNA分析ソフトウェアであるMacベクターにて、融合タンパク遺伝子を、水稲遺伝コドンを含むヌクレオチド配列に転換した。その最適化された融合タンパクと目的遺伝子のデオキシヌクレオチドと遺伝コドンの変化について、その結果を表1に示す。しかしながら、そのアミノ酸配列は完全に同じである。これらの組換融合タンパク質と目的遺伝子は、米国 Blue Heron Biotechnology社にて人工合成された。遺伝子合成の過程において、遺伝子の両端にMylIとXho酵素部位を付加し、pUC119(米国 Blue Heron Biotechnology社)クローンベクタープラスミドベクターにクローニングし、水稲コドン好適BipC、PDICとIGF−1遺伝子(配列番号3、配列番号4、配列番号5)のpOsBipC、pOsPDICとpOsPMP3プラスミドを産生した。
まず、コドン好適ヒトインシュリン様成長因子(human IGF−1)遺伝子を、PCR法により増幅し、制限エンドヌクレアーゼMscIとXhoIにて消化したpOsPMP2プラスミドDNAにクローニングし、E.coli宿主細胞DH10Bを形質転換して、中間プラスミドpOsPMP3を産生した。pOsPMP3プラスミドDNAを制限エンドヌクレアーゼNaeIとNcoIにて消化すると共に、適当なエンドヌクレアーゼにてpOsPMP2(配列番号2参照)、pOsBipC、及びpOsPDICプラスミドDNAを消化し、融合タンパク質遺伝子と発現ベクタープラスミドpOsPMP2を結合した後で、大腸菌菌株DH10Bを形質転換した。産生された発現ベクタープラスミドはpOsPMP25とpOsPMP26である。そのプラスミドの制限エンドヌクレアーゼ地図を図2と図3に示す。
PCR法を採用して水稲ゲノムDNAから水稲システインプロティナーゼβ遺伝子のプロモーターをクローニングした。GenBankのヌクレオチド配列に基づいて二つのPCRプライマー(プライマーの配列については、配列番号6と配列番号7を参照)をデザインした。標準のPCR反応を利用し、水稲人工細菌染色体バンクからスクリーニングして陽性クローン42M2(BACクローン番号)を得た。BACクローンをXhoIにて消化して、その5kbの断片を得た。サザンブロットの結果、これがシステインプロティナーゼβ遺伝子の全配列を含んでいることが確認された。このBACクローンDNAを鋳型とし、標準のPCR反応を利用して、1113bpを有するDNA断片を得、この断片をpBI221ベクターにクローニングして、中間ベクターpOsPMP04を産生した。
pCAMBIA1301プラスミドDNAを鋳型とし、プライマー(配列番号8と配列番号9を参照)を使用し、標準のPCR反応を利用して増幅し、得られたPCR断片をSmaIとXhoIにて消化し、次いで、制限エンドヌクレアーゼNaeIとXhoIにて消化したpOsPMP4ベクターにクローニングし、水稲特異的発現選択マーカーベクターpOsPMP5を産生した(図4)。
水稲の品種である台北309の種子を、その殻の除去後、20%次亜塩素酸ナトリウム中で20分消毒し、滅菌水で3回(10分/回)リンスした後、カルス組織誘導培地上で20〜25日間誘導し、カルス組織を産生させた。0.5μgのプラスミドpOsPMP25又はpOsPMP25と0.5μgの選択マーカープラスミドpOsPMP5を有するDNAとを、50μLの金粉、250μLの1M塩化カルシウム、50μLの0.1Mスペルミジンと混合した後、室温(20〜25℃)で30分反応させた。100%エタノールで3回洗浄した後、DNAにて金粉を覆い、次いで米国 デュポン社の遺伝子銃方法に従って、二つのプラスミドDNAを台北309のカルス組織の細胞中で共形質転換させた。50μg/mLのハイグロマイシンBを含む選択培地上での45日間のスクリーニングを経過(そこで成長し続けたカルス組織はハイグロマイシンB耐性を有する陽性カルス組織である)後、ハイグロマイシンB耐性を有するカルス組織を再生培地に移し、光照射下で20日間程度、更に誘導した。カルス組織が緑色の小植物株に分化した後、該小植物株を根付き培地に移し、15〜20日間の誘導を行った(その結果、完全な植物株が形成された)。最後にこれらの植物株を温室又はテスト用地に移して成熟した種子まで成長させた。
遺伝子導入植物を温室又はテスト用地で開花し結実するまで成育させた(その種子をT1代種子と名づける)。T1代種子を収穫した後に、遺伝子導入植物の各株から10粒の種子を取り出し、10mLの抽出バッファー(50mM Tris、pH8.0、50mM NaCl、10mM EDTA)に加え、ホモジネートした。その溶液を遠心分離機にて10分遠心し(回転速度:14000rpm)、その上清に対して、ELISA定量試薬キットにて酵素結合免疫検出を行った。検出の結果、一粒の種子中のBip−IGF−1融合タンパク質の発現レベルが150μg程度に達していること、即ち、種子の乾燥重量の0.75%であることがわかった。T1代種子から融合タンパク質がハイレベルで発現された遺伝子導入個体をスクリーニングし、T1代から選択し続けて、融合タンパク質を安定的に発現する遺伝子導入品種を得た。それは大規模な融合タンパク質の生産に用いられた。
Claims (17)
- 穀類非貯蔵タンパク質を融合タンパクキャリアとして宿主胚乳細胞において効率よく小分子ポリペプチドを発現する方法であって、以下の工程を含むことを特徴とする方法:
1)胚乳特異的プロモーターと、胚乳特異的シグナルペプチドをコードするリーダー配列DNAを提供する工程;
2)融合キャリアとしての穀類非貯蔵タンパク質の遺伝子と目的遺伝子を提供する工程;
3)前記プロモーター及びリーダー配列DNAと、融合キャリアの遺伝子と、目的遺伝子とを含む発現ベクターを構築する工程;
4)宿主胚乳細胞において発現ベクターを発現する工程。 - 発現ベクターを構築する前に、さらに、宿主優先性コドンに前記プロモーター及びリーダー配列DNA、前記融合キャリアの遺伝子と前記目的遺伝子の少なくとも一種を最適化させることを含む、請求項1に記載の方法。
- さらに、選択マーカーベクターで共形質転換することを含む、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記プロモーター及びリーダー配列DNAがGtl3a遺伝子に由来し、前記宿主が水稲、小麦又は大麦であり、前記非貯蔵タンパク質が水稲、小麦又は水稲由来のBip又はPDIのC末端であり、前記目的遺伝子が治療用小分子ポリペプチドである、請求項3に記載の方法。
- 前記宿主が水稲であり、前記非貯蔵タンパク質が水稲由来の小胞体結合タンパク質(Bip)又はジスルフィド結合イソメラーゼ(PDI)のC末端であり、前記治療用小分子ポリペプチドがヒトインシュリン様成長因子−1(IGF−1)である、請求項4に記載の方法。
- 前記宿主が大麦であり、前記非貯蔵タンパク質が小麦由来のBip又はPDIのC末端であり、前記治療用小分子ポリペプチドがヒトIGF−1である、請求項4に記載の方法。
- 穀類胚乳細胞中にハイレベルで特異的に任意のポリペプチドを発現するための発現ベクターであって、
(a)胚乳特異的プロモーター、
(b)胚乳特異的シグナルペプチドをコードするリーダー配列DNA、
(c)融合キャリアとしての穀類非貯蔵タンパク質の遺伝子、
(d)目的遺伝子、
を含むキメラ遺伝子を有し、
前記融合キャリア遺伝子と目的遺伝子が宿主胚乳細胞において融合タンパク質を発現させるように前記(a)、(b)、(c)と(d)を結合してなる、発現ベクター。 - 前記プロモーター及びリーダー配列DNA、前記融合キャリアの遺伝子と前記目的遺伝子の少なくとも一種が、宿主細胞中に発現されるようにコドン最適化される、請求項7に記載の発現ベクター。
- 前記プロモーター及びリーダー配列DNAがGtl3a遺伝子に由来し、前記融合キャリアの遺伝子が任意の穀類の非貯蔵タンパク質由来のBip又はPDIのC末端であり、前記目的遺伝子が任意の治療用ペプチドである、請求項8に記載の発現ベクター。
- 前記ベクターが、さらに、複製起点、選択マーカー、翻訳ターミネーターおよび転写ターミネーターからなる群から選ばれる少なくとも一種を含む、請求項9に記載の発現ベクター。
- 前記穀類が水稲であり、前記目的遺伝子がヒトIGF−1である、請求項10に記載の発現ベクター。
- 前記穀類が大麦であり、前記目的遺伝子がヒトIGF−1である、請求項10に記載の発現ベクター。
- 融合キャリアとしての穀類非貯蔵タンパク質の植物細胞における小分子ポリペプチドの発現における使用。
- 前記穀類非貯蔵タンパク質が、任意の穀類の非貯蔵タンパク質由来のBip又はPDIのC末端である、請求項13に記載の使用。
- 前記穀類が水稲、小麦又は大麦であり、前記小分子ポリペプチドが治療用ペプチドである、請求項13に記載の使用。
- 前記穀類が水稲であり、前記小分子ポリペプチドがIGF−1である、請求項15に記載の使用。
- 前記穀類が大麦であり、前記小分子ポリペプチドがIGF−1である、請求項15に記載の使用。
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