JP2005040136A - ニトロリダーゼをコードするdna分子 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】既知のニトロリダクターゼ(EC.1.6.99.2)に比べてよりブロードな基質特異性を有する、大腸菌(Escherichia coli)B由来の新規ニトロリダクターゼ(約24kDaの分子量を有するフラボタンパク質)をコードするDNA分子の単離。
【効果】本酵素をターゲッティング因子、例えば腫瘍関連抗原と結合するモノクローナル抗体に接合して使用する、癌の化学療法の系を提供することができる。
【選択図】なし
Description
Robertsonら、J.Biol.Chem.261、15794−15799(1986)。
1.20〜60キロダルトンの範囲の分子量を有するフラボタンパク質である;
2.コファクターとしてNADHまたはNAD(P)Hまたはそれらの類似体を必要とする;
3.NADHまたはNAD(P)Hについて1〜100μMの範囲のKmを有する;そして
4.CB 1954およびその類似体のいずれかまたは両者のニトロ基を細胞障害性の形態、例えば、ヒドロキシルアミンに還元することができる。
1:約24kDaの分子量を有するフラボタンパク質である;
2:コファクターとしてNADHまたはNAD(P)Hを必要とする;
3:NADHまたはNAD(P)Hについて1〜100μMの範囲のKmを有する;および
4:CB 1954のいずれかまたは両者のニトロ基を細胞障害性の形態に還元することができる、
を有する大腸菌(Escherichia coli)Bのニトロリダクターゼをコードする単離されたDNA分子に関する。
cloacae)のニトロリダクターゼ、参照、Bryantら、J.Biol.Chem.266、4126(1991)またはウォーカー(Walker)細胞のニトロリダクターゼと異なるニトロリダクターゼであり、そして従来報告されたことのない酵素であることを確証するために十分な差を示す。
うな基である、
の新規な化合物を提供する。
R'=HかつR"=CH3;または
R'=CH3かつR"=H;または
R'=HかつR"=F;または
R'=FかつR"=H;
をもつこの化合物の類似体。
5またはNO2であるが、ただしX1およびX2の両者はNO2ではなく、ここでR
5はHまたは式IXに関して上に定義したカルボン酸アシルまたはヒドロカルビル基
であり、そしてYはHまたはCON(CH3)2である、
のヒドロキシルアミノ誘導体を提供する。2つのヒドロキシルアミノ基を含有する式Xの化合物において、基Rは同一であるか、あるいは異なることができるが、通常同一であろう。
<実施例I>
大腸菌(E.coli)Bからのニトロリダクターゼ酵素の分離および精製
200gの大腸菌(E.coli)B細胞のペーストを、合計の体積1リットルの0.3Mの硫酸アンモニウムを含有する20mMのリン酸塩緩衝液pH7.0に再懸濁させた。細胞をMSEソニプレプ(Soniprep)150崩壊装置により超音波で破壊した(全電力で3×30秒、60秒の間隔で熱を消散させた)。抽出液の清浄化を促進するために、DNアーゼ(23,000クニッツ(Kunitz)単位/l)およびRNアーゼ(24,000クニッツ単位/l)を添加した後、 8,000gで30分間遠心して細胞破片を除去した。透明な黄色がかった上澄み液をクロマトグラフィーの前に0.45μmのフィルターに通過させた。
pH7中のフェニル−セファローズ(Sepharose)CL−6B(ファルマシア(Pharmacia))のカラム(25×5cm)に、濾過した抽出液を適用した。2カラム体積の出発緩衝液で洗浄した後、カラムを10mM Tris−HCl緩衝液pH7.6で溶離した。活性の画分をプールし、そして20mM Tris−HCl、pH7.6に対して18時間透析して硫酸アンモニウムを除去した。透析した画分を50mlのアリコートで、20mM Tris−HCl、pH7.6の中のQ−セファローズ(Sepharose)−高性能に、4ml/分の流速で適用した。溶離は0.5MのKClの勾配で実施し、ニトロリダクターゼは0.1〜0.12MのKClで溶出した。活性の画分をプールし、そしてセファデックス(Sephadex)G25媒質のカラム(32×6cm)を使用して20mM Bis TrisプロパンpH7の中に脱塩した。これらの画分を、20mM Bis TrisプロパンpH7の中で平衡化したQ−セファローズ−高性能(ハイ−ロード(Hi−Load)カラム26/10カラム、ファルマシア(Pharmacia))に適用した。溶離は0〜0.1Mの勾配のKClにより実施した。ニトロリダクターゼは0.07〜0.09MのKClにおいて最初の主要なピークとして溶出した。
等電点の決定
ニトロリダクターゼの等電点は、等電点電気泳動(ファルマシア・ファストシステム、400vhの間のフォーカシング)およびモノ(Mono)Pカラム(ファルマシア・モノ(Pharmacis Mono)P HR5/20、20mM Bis−Tris pH6.3およびポリ緩衝液74、pH4.0)を使用するクロマトフォーカシングにより決定した。
含む水中の10〜60%のアセトニトリルの溶媒の勾配を使用して精 製した。自動化エドマン分解法によりアプライド・バイオシステムス
(Applied Biosystems)470A気相タンパク質配列決定装置(ケルビン・クロース(Kelvin Close)、英国ワーリントン)を使用して、配列の分析を実施した。
ニトロリダクターゼのアミノ酸配列の分析
上で分離された大腸菌(E.coli)のニトロリダクターゼをアミノ酸配列の分析にかけた。ウォーカー(Walker)腫瘍から分離された酵素EC.1.6.99.2と対照的に、本発明のニトロリダクターゼはN−末端においてブロックされず、そして31アミノ酸残基の明瞭なN−末端配列および、臭化シアンを使用する消化により発生した、それ以上の41残基のペプチドを与えた。これらの部分的配列を表2に記載する。
大腸菌(E.coli)のニトロリダクターゼ遺伝子をクローニングし、そしてそのヌクレオチド配列を両者の鎖のジデオキシ配列分析により決定した。ニトロリダクターゼをエンコードする651ヌクレオチドのオープンリーディングフレームを含有する1167塩基のNruI/Pst断片のヌクレオチド配列を表3に示す。シャイン・ダルガーノ(Shine−Dalgarno)の推定上の配列および転写停止シグナルを示す。
CB 1954の酵素的還元
CB 1954(100μMそしてまた1.6×105dpm/nmolで[U−3H]CB 1954を含有する)、NADHまたはNAD(P)H(500μM)を、実施例1に記載するようにして得られた活性酵素(一般に2μg/mlの大腸菌(E.coli)のニトロリダクターゼまたは35μg/mlのウォーカー(Walker)NAD(P)Hデヒドロゲナーゼ(キノン)EC.1.6.99.2)と10mMのリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)中で空気またはヘリウム下にインキュベーションした。種々の時間において、アリコートをパーチスフェアー(Partisphere)SCX(110×4.7mm)HPLCカラム上に注入し、そして100mMのNaH2PO4で無勾配的に(2ml/分)溶離した。
大腸菌(E.coli)ニトロリダクターゼ酵素の基質特異性
CB 1954以外のニトロ化合物を還元する本発明の大腸菌(E.coli)ニトロリダクターゼの能力を、HPLCによりその酸化から生ずるNADHのピーク区域の減少を追跡することによって決定した。実験は前述したように実施したが、アリコートをパーチスフェアー (Partisphere)SAX(110×4.7mm)HPLCカラム上に注入し、そして75mMのNaH2PO4で無勾配的に(1ml/分)溶離した。
種々のニトロベンズアミドおよびニトロベンゼンを大腸菌
(E.coli)ニトロリダクターゼ酵素で還元する相対
的速度。NADHの生ずる酸化により還元速度を決定した。
すべての反応は、37℃において空気中で、電子ドナーと
してNADH(500μM)を使用して、100μMの初
期基質濃度で実施した。
NADHの酸化速度
基質 ニトロリダクターゼ
CB 1954 1.0
2,4−ジニトロ−5−(2−ヒドロ
キシエチルアミノ)ベンズアミド 0.04
2−アミノ−5−(アジリジン−1−
イル)−4−ニトロベンズアミド <0.01
4−アミノ−5−(アジリジン−1−
イル)−4−ニトロベンズアミド <0.01
5−クロロ−2,4−ジニトロベ
ンズアミド 22.4
3,5−ジニトロベンズアミド 75.5
2−ニトロベンズアミド 0.06
3−ニトロベンズアミド 1.8
4−ニトロベンズアミド 5.1
2,4−ジニトロフェノール <0.01
5−ニトロ−2−フラルデヒド
セミカルバゾン(ニトロフラゾン) 3.6
酵素の反応速度論および阻害の研究
分光光度測定法により基質としてメナジオンおよび末端の電子アクセプターとしてシトクロムCを使用して、Knoxら、Biochem.Pharmac.37、4671−4677、1988に記載されているように、キノンリダクターゼ活性をアッセイした。線型回帰分析(r>0.995)およびRobertsら、Biochem.Pharmac.38、4137−4143、1989に記載されているように、生ずるプロットから決定された反応速度論のパラメーターにより、初期の反応速度を決定した。ウシ血清アルブミンに対して目盛り定めされた普通のタンパク質アッセイ(バイオ−ラド(Bio−Rad))を使用して、タンパク質濃度を決定した。
CB 1954以外の化合物を細胞障害性種に対して活性化する大腸菌(E.coli)Bニトロリダクターゼの能力
表7に示すように、大きい細胞障害性作用はヒトMAWI細胞においてプロドラッグCB 1837およびCB 10−107により観察されたが、それはプロドラッグがニトロリダクターゼ酵素により還元される条件下においてのみであった。
ニコチン酸リボシドまたはニコチン酸リボチドからの1,4−ジヒドロ−ニコチン酸リボシドの製造
(i)ニコチン酸リボチドからのニコチン酸リボシドの製造
水性緩衝液(トリス100mM;pH8.5;MgCl2;2.5ml)中のニコチン酸リボチド(ニコチン酸モノヌクレオチド)(シグマ(Sigma)、英国プーレ)(25mg)の溶液を、2000単位のアルカリ性ホスファターゼ、VII−S型(100μl;20,000単位/ml)(シグマ)で37℃において1時間処理した。アルカリ性ホスファターゼを消化物から遠心分子濾過(10,000の分子量限界;「セントリコン(Centricon)10」;アミコン(Amicon)、英国ハイワイコンベ)により分離した。この溶液の希釈物を、アルカリ性ホスファターゼによる消化の前および後に、アニオン交換高性能液体クロマトグラフィー(パーチスフェアー(Partisphere)5−3SAXカラム、0.1M NaH2PO4、pH5で無勾配的に溶離した、1.5ml/分、10μlの注入体積、260nmにおける紫外線吸収によりモニターした)により分析した。親化合物は1.18分の保持時間で溶出した。消化後の実験において、完全な変換が起こって、0.63分の保持時間で溶出する新規な表題化合物が生成し、脱リン酸化の指示とすると、リボシドが生ずることが示された。
JarmanおよびSearle(1972)の方法を採用した。この方法を上で製造したニコチン酸リボシドおよび、また、化学的に合成した物質の両者に適用した(Jarman 1969)。両者の由来源からの出発化合物を使用して同一の結果が得られた。
<実施例7>
大腸菌(E.coli)ニトロリダクターゼのためのコファクターとして作用する1,4−ジヒドロ−ニコチン酸リボシドの能力
CB 1954の還元のためにNADHまたはNADPHの代わりに合成コファクターを使用するできるニトロリダクターゼ酵素の能力を、第1図に示す。ニトロリダクターゼ酵素は、CB 1954の還元のためのコファクターとして等しい効能をもつ1,4−ジヒドロ−ニコチン酸リボシドおよびNADHの両者を使用することができる。対照的に、ウォーカー(Walker)DTジアホラーゼはこの合成コファクターを利用することができない。したがって、1,4−ジヒドロ−ニコチン酸リボシドは大腸菌(E.coli)ニトロリダクターゼ酵素のための選択的コファクターであり、そして哺乳動物のDTジアホラーゼにより使用されることができない。
<実施例8>
4−[ビス(2−クロロエチル)アミノ]フェニルカルバミン酸4’−ニトロベンジルエステル:
乾燥CHCl3(5ml)中の4−ニトロベンジルクロロホルメート(295mg)の撹拌した溶液に、乾燥CHCl3(5ml)中の4−[ビス(2−クロロエチル)アミノ]アニリン塩酸塩(367mgおよびNEt3(377μl)の溶液を5分かけて添加した。1時間後、この溶液を20℃に18時間保持し、次いで蒸発させた。残留物をシリカゲルのクロマトグラフィーにかけCHCl3で溶離すると、標題生成物が黄色固体として得られ、これをベンゼン/石油エーテルからプリズムとして再結晶化した、融点111−112゜。収量、361gm(64%)。CH4を使用する化学的イオン化質量スペクトル:m/z412におけるイオン(M+1、相対強度100)はM=411を示す。C18H19N2O4Cl2はM=411(Cl35アイソトープについて)を必要とする。
4−[ビス(2−クロロエチル)アミノ]フェニル4'−ニトロベンジルカーボネート
乾燥CHCl3(1.5ml)中の4−ニトロベンジルクロロホルメート(58mg)の溶液を、乾燥CHCl3(2ml)中の4−[ビス (2−クロロエチル)アミノ]フェノール塩酸塩(72mg)およびNEt3(74μl)の撹拌した氷冷溶液に添加した。21゜において18時間後、この溶液を蒸発させ、そして残留物をシリカゲルのクロマトグラフィーにかけ、CHCl3/石油エーテル(3:2)で溶離すると、標題化合物が得られ、これはETOAc/石油エーテルから淡黄色プリズムとして結晶化した、融点77−79゜(収量、102mg)。FAB MS:m/z413におけるイオンはM=412を示す(C18H18N2O5Cl2はM=412を必要とする)。
N−4−ニトロベンジルオキシカルボニル−アクチノマイシンD:
MeOH(5ml)中のアクチノマイシンD(AMD、41mg)を10%Pd/Cの存在下に2時間水素化し、次いで真空蒸発させた。窒素雰囲気下に残留物を乾燥CHCl3(1.5ml)中の4−ニトロベンジルクロロホルメートの溶液中に溶解し、そしてCHCl3(1.5ml)中のNEt3(10μl)の溶液を添加した。窒素雰囲気下に24時間撹拌した後、触媒を濾過し、そしてこの溶液をMeOH(200ml)で希釈した後、3日間通気した。この溶液を蒸発させ、そして生成物を逆相C18結合シリカの直径1cmのカラム上で半調製用HPLCに2回かけ、H2O中の50〜100%のMeCNの勾配で溶離してAMDを除去した。標題化合物は酢酸エチル/石油エーテルから赤色プリズムとして結晶化した。収量、31mg(66%)、電子噴射質量スペクトル:m/z1434.5(M+H)および1456.4(M+Na)におけるイオンはM=143.5を示す。C70H91N13O20(最低の質量のアイソトープ)はM=1433.65を必要とする。NMRはAMDと同一の信号+δ6.71(d、1H、ArCH2)、7.09(d、1H、ArCH3)および芳香族領域において追加の信号を示す。
<実施例11>
N−4−ニトロベンジルオキシカルボニル−ドキソルビシンVI
キソルビシン塩酸塩(2.25mg)を、トリエチルアミン(NEt3)を含有するジメチルホルムアミド(DMF)(0.3ml)中に溶解し、そしてDMF(0.1ml)中の4−ニトロベンジル−4'−ニトロフェニルカーボネート(1.4ml)を添加した。暗所で3日間撹拌した後、この混合物をC18逆相シリカのカラム(直径1cm)上のHPLCにかけ、0.01Mのギ酸塩緩衝液(pH4.0)中の25〜100%のMeCNの勾配で溶離することによって分離した。主要な赤色画分を濃縮し、そしてギ酸塩緩衝液の代わりにH2Oで再クロマトグラフィーにかけた。真空蒸発させると、生成物(2.1mg)が非晶質赤色粉末として得られた。電子噴射MS:723(M+H)におけるイオンはM=722を示す。C35H34N2O15M=722を必要とする。
<実施例12>
実施例11N−4−ニトロベンジルオキシカルボニル−マイトマイシンC
NEt3(14μl)を含有するジメチルホルムアミド(DMF)
(2ml)中のマイトマイシンC(36mg)の溶液を4−ニトロベンジルクロロホルメート(30mg)に添加し、そしてこの混合物を21゜において4時間撹拌した。真空蒸発後、残留物をシリカゲルのカラムのクロマトグラフィーにかけ、EtOAcで溶離すると、標題化合物が暗色赤色固体(49mg)として得られた。電子噴射MS:514(M+H)におけるイオンはM=513を示す。C23H23N5O9M=513を必要とする。
<実施例13>
プロドラッグVへのニトロリダクターゼの作用によるアクチノマイシンDの形成
V(100μM)およびコファクター(500μMのNADH)を、酵素(2μg/mlの実施例1の大腸菌(E.coli)Bニトロリダクターゼ)と10mMのリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)中で空気下に37℃においてインキュベーションした。種々の時間において、アリコート(20μl)をマイクロソーブ(Microsorb)C18逆相(240×4.7mm)HPLCカラム上に注入し、そして水中の80%アセトニトリルで無勾配的(1ml/分)に溶離した。溶出液を280nmにおける吸収について連続的にモニターし、そしてHPLCの形跡上のこの化合物に相当するピークの積分により薬物の濃度を計算した。酵素が存在するときにのみ、アクチノマイシンDはプロドラッグから解放された。
<実施例14>
プロドラッグVIIへのニトロリダクターゼ酵素の作用によるマイトマイシンCの形成
プロドラッグVII(100μM)およびコファクター(500μMのNADH)を酵素(5μg/mlの実施例1の大腸菌(E.coli)Bニトロリダクターゼ)と、10mMのリン酸ナトリウム緩衝液(pH7)中の空気下に37℃においてインキュベーションした。種々の時間において、アリコート(10μl)をパーチシスフェアーC18逆相 (150×4.7mm)HPLCカラム上に注入し、そして水中の50%メタノールで無勾配的(2.0ml/分)に溶離した。溶出液を260および340nmにおける吸収について連続的にモニターし、そしてHPLCの形跡上のこの化合物に相当するピークの積分により薬物の濃度を計算した。
<実施例15>
ニトロリダクターゼによるR1NH2=IIIのプロドラッグIおよびプロドラッグVによる活性化
プロドラッグ4−[ビス(2−クロロエチル)アミノ]フェニルカルバミン酸4'−ニトロベンジルエステルI(IここでR1NH2=III)およびN−4−ニトロベンジルオキシ−カルボニル−アクチノマイシンD(V)への実施例1の大腸菌(E.coli)ニトロリダクターゼの作用による細胞障害性の発生を表8に示す。
抗体:酵素結合体の製造および結合
ヘテロ2官能性剤のスクシニミジル4−(p−マレイミドフェニル)ブチレート(SMPB)を使用して活性マレイミド基を免疫グロブリンの中に挿入し、そして2−メルカプト−[S−アセチル]酢酸N−ヒドロキシスクシンイミド(SATA)を使用して大腸菌(E.coli)ニトロリダクターゼをチオレート化することによって、A57B7 F(ab)2の抗体:酵素結合体:ニトロリダクターゼを製造した。タンパク質を混合すると、マレイミド基はチールと反応してチオエーテル結合を形成した。使用したSMPB:免疫グロブリンのモル比は10:1であり、そしてSATA:ニトロリダクターゼのモル比は4:1であった。こうして製造された抗体:酵素結合体を、高分子量の凝集体および結合しない成分から、セファデックス(Sephadex)G200の目盛り定めしたカラム(16×700mm)を使用する濾過クロマトグラフィーにより単離した。このカラムをリン酸塩緩衝液(PBS)中で平衡化し、そして同一緩衝液で1.0ml/分の流速において溶離した。分子量が2:1および1:1結合体(それぞれ、316kDaおよび 233kDa)に相当する物質を含有する画分をプールし、そして同一カラム上の再クロマトグラフィーにかけ、そしてプールした画分から の試料を非還元性条件下に目盛り定めタンパク質と一緒に4〜15% SDS−PAGE(ファーマシア・ファストゲル、60vhの間の展 開)上で展開した。結合体は分子量125kDaの物質(1:1のF (ab')2:ニトロリダクターゼおよびより高い分子量の結合体ならびに少量の遊離のF(ab')2およびニトロリダクターゼに相当する)として存在した。
<実施例17>
プロドラッグのin vivo活性
式VのアクチノマイシンDプロドラッグ(AMDPD)をマウスにおいて毒性について試験した。3匹のマウスのグループに、1、10または100mg/kg体重i.p.のAMPDを与え、そして3匹のマウスの他のグループに、落花生油中に溶解した1および10mg/kg体重i.p.のアクチノマイシンD(AMD)を与えた。3匹のマウスの他のグループは未処置であり、そして3匹の最後のグループに落花生油i.p.のみを与えた。
Claims (2)
- 下記の特徴:
1:約24kDaの分子量を有するフラボタンパク質である;
2:コファクターとしてNADHまたはNAD(P)Hを必要とする;
3:NADHまたはNAD(P)Hについて1〜100μMの範囲のKmを有する;および
4:CB 1954のいずれかまたは両者のニトロ基を細胞障害性の形態に還元することができる、
を有する大腸菌(Escherichia coli)Bのニトロリダクターゼをコードする単離されたDNA分子。 - 配列番号:2のアミノ酸配列を有するニトロリダーゼをコードする単離されたDNA分子。
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