JPH07155188A - ニトロ還元酵素遺伝子 - Google Patents

ニトロ還元酵素遺伝子

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JPH07155188A
JPH07155188A JP5340061A JP34006193A JPH07155188A JP H07155188 A JPH07155188 A JP H07155188A JP 5340061 A JP5340061 A JP 5340061A JP 34006193 A JP34006193 A JP 34006193A JP H07155188 A JPH07155188 A JP H07155188A
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JP
Japan
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ala
sequence
val
leu
lys
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JP5340061A
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English (en)
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Shuhei Yoshino
修平 善野
Kaoru Saigo
薫 西郷
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JNC Corp
Original Assignee
Chisso Corp
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Publication date
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Abstract

(57)【要約】 【目的】大腸菌ニトロ還元酵素遺伝子を提供すること。 【構成】配列の長さ840の塩基配列を有するDNAか
らなるニトロ還元活性を有する酵素遺伝子。この遺伝子
がコードしている217個のアミノ酸からなる分子量2
3904のニトロ還元酵素。この遺伝子を含有する組換
えベクター、このベクターを含む細菌。

Description

【発明の詳細な説明】
【0010】
【技術分野】本発明は大腸菌のニトロ還元酵素遺伝子、
酵素、該遺伝子を含む組換えベクター、および該組換え
ベクターを含有する細菌に関する。
【0011】
【従来の技術】我々の身の回りには、遺伝子DNAに損
傷を与える物質(変異原)が多数存在しており、我々は
これらの物質に暴露されながら生活している。ニトロア
レーン類はこうした環境変異原の一グループであり、自
動車の排気ガス、焼却場の煙、都市の大気、河川の底
質、ストーブを焚く室内の空気、あるいは焼鳥の焦げた
部分に含まれている。変異原性、発癌性を示すニトロア
レーンとして2ーニトロフルオレンがよく知られてい
る。
【0012】 ニトロアレーン自体が直接反応してDN
Aを損傷するわけではなく、ニトロアレーンの代謝物が
突然変異を起こしDNAを損傷する。たとえばニトロフ
ルオレンは、微生物細胞内ではニトロ還元酵素によって
Nーヒドロキシ体に還元されて細胞内に入り、その後O
ーアセチル転移酵素によって活性化され、最終的に生じ
たニトレニウムイオンがDNAを攻撃するものと考えら
れる。従って、ニトロ還元酵素と2ーニトロフルオレン
との反応が2ーニトロフルオレンの変異原性発現の律速
段階と考えることができる。渡辺らは、サルモネラ菌か
らニトロ還元酵素遺伝子を単離し、(Watanab
e,M.,Ishidate,M.Jr.& Nohm
i,T.(1989)ミュウテーション リサーチ(M
utation Research),216,211
ー220)に開示している。また、その一次構造を明か
にし、(Watanabe,M.,Ishidate,
M.Jr.& Nohmi,T.(1990)ヌクレイ
ック アシッドリサーチ(Nucleic Acid
Research),18,1059)に示している。
【0013】 Bryantらはエンテロバクター菌か
らニトロ還元酵素遺伝子を単離し、その一次構造を決定
し、(Bryant,C.,Hubbard,L.,a
nd McElroy,W.D.(1991)ジャーナ
ル オブ バイオロジカル ケミストリー(J.Bio
l.Chem.),266,4126ー4130)に開
示している。Anlezarkらは、大腸菌からニトロ
還元酵素を精製し、その部分アミノ酸配列を決定し、
(Anlezark,G.M.,Melton,R.
G.,Sherwood,R.F.,Coles,
B.,Friedlos,F.,and Knox,
R.J.(1992)バイオケミカル ファーマコロジ
ー(Biochem.Pharmacol.),44
2289ー2295)に開示している。また、渡辺らは
ニトロ還元酵素遺伝子を導入したサルモネラ菌がニトロ
アレーンに対し高い感受性を示す指標菌株として用いる
ことができることを(Watanabe,M.,Ish
idate,M.Jr.& Nohmi,T.(198
9)ミュウテーション リサーチ(Mutation
Research),216,211ー220)に示し
ている。
【0014】 すなわち、ニトロ還元酵素遺伝子は、上
述の変異原性あるいは発癌性物質を検出する感度の向上
に有用である。しかしながら、いまだ大腸菌のニトロ還
元酵素遺伝子の単離、およびその大腸菌での生産につい
ては報告されていない。
【本発明が解決しようとする課題】
【0015】本発明者らは、鋭意研究の結果、大腸菌か
らニトロ還元活性を有する酵素遺伝子を単離し、その一
次構造を明かにすることに成功し、また該遺伝子を大量
に発現する細菌を作出することに成功し、本発明を完成
するに至った。すなわち、本発明の目的は、上述の技術
的事情に鑑み、大腸菌のニトロ還元酵素活性を有する酵
素遺伝子および酵素を提供することであり、さらに該遺
伝子を含む組換えベクター、および該組換えベクターを
含む細菌を提供することである。
【0016】
【課題を解決するための手段】本発明は次の(1)〜
(8)の構成を有する。 (1)配列番号1で表される塩基配列を含む、ニトロ還
元酵素遺伝子。 (2)配列番号2で表される塩基配列を含む前記(1)
項記載のニトロ還元酵素遺伝子。 (3)塩基配列が配列番号3で表されるニトロ還元酵素
遺伝子。 (4)配列番号4で表されるアミノ酸配列を有するニト
ロ還元酵素。 (5)塩基配列が配列番号1で表されるDNAを含有す
る組換えベクター。 (6)配列番号2で表される塩基配列を有する遺伝子が
プラスミドベクターへ挿入された前記(5)項記載の組
換えベクター。 (7)配列番号1で表される塩基配列を有するDNAを
含む組換えベクターを含有する細菌。 (8)塩基配列が配列番号1で表されるDNAを含む組
換えベクターで修飾されてなる細菌を培養することから
なる配列番号4で表されるアミノ酸配列を含む酵素の製
法。
【0017】本発明の構成と効果につき以下に詳述す
る。本発明の酵素遺伝子は、配列番号1で表される配列
の長さ651のヌクレオチド鎖を含むのが特徴である。
好ましく示す配列としては配列番号2で表されるヌクレ
オチド鎖を含む。塩基配列が配列番号3で表される配列
の長さが840のDNAであるが具体的に示すことがで
きる。配列の種類はゲノム DNAであり、例えば、大
腸菌Escherichia coli C600株か
ら単離されるものである。その配列の特徴は塩基、塩基
番号91から742までの217個のアミノ酸からなる
分子量23904の蛋白質をコードしている。本発明の
酵素遺伝子産物は、ニトロ還元活性を有し、たとえば、
ニトロフラゾン還元活性を有するものである。本発明の
酵素は、配列番号1、2、および3の塩基配列から予測
される配列番号4で表されるアミノ酸配列を有する蛋白
質である。その蛋白質は217個のアミノ酸からなり分
子量23904のものであり、大腸菌中でニトロ還元活
性を有する。
【0018】本発明の組換えベクターは、塩基配列が配
列番号1で表されるDNAを含有する。すなわち、本発
明の組換えベクターは、配列番号3で表される塩基配列
を有するDNAと、機能的同等物を含む。「機能的同等
物」とは適当な宿主において、実質的に同じ結果を得る
ために実質的に同じ方法で使用できるDNA断片のこと
である。すなわち、塩基配列が異なっても、同一のアミ
ノ酸配列を有する蛋白をコードしえるDNA断片や若干
の塩基配列の相違に伴う若干のアミノ酸配列の違いがあ
るもののニトロ還元活性を有する蛋白をコードしえるD
NA断片のことを意味する。具体的には配列番号1の塩
基配列および部位特異的変異導入された配列番号1の塩
基配列を有するDNA断片を示し、本発明の組換えベク
ターとしては、例えば、該塩基配列を含有するDNA断
片を挿入したプラスミドベクターが挙げられる。このベ
クターとしてpUC(Yanisch−Perron,
C.,Vieira,J.,and Messing,
J.(1985)ジーン(Gene),33,110ー
115)などが使用できる。
【0019】図3は、その組換えベクター(発現ベクタ
ー)構築行程を示す。すなわち、ニトロ還元酵素遺伝子
を有する大腸菌のDNAを制限酵素NruIとPstI
で消化し、該酵素の構造遺伝子領域を切り出し、pUC
8(Hanna,Z.,Fregeau,C.,Pre
fontatine,G.,Brousseau,R.
(1984)Gene,30 247)のHincII/
PstI切断部位に挿入し組換えベクター(発現ベクタ
ー)pNR1を構築した。被構築物の方向付けのためア
ンピシリン耐性遺伝子(Ampr)に制限酵素切断部位
を示した。
【0020】本発明の細菌は、配列番号1で表される塩
基配列を含有する組換えベクターDNAを含む。本発明
の細菌の特徴はニトロ還元活性を有する蛋白質を生産す
る。
【0021】本発明の酵素の製法は、塩基配列が配列番
号1で表されるDNAを含む組換えベクター(発現ベク
ター)で修飾された細菌を培養し、配列番号4で表され
るアミノ酸配列を含む蛋白質を製造することである。細
菌としては大腸菌、枯草菌など、培地としてはLB培
地、YT培地などをあげることができる。以下、実施例
にて本発明で重要な遺伝子の単離とその同定に関する手
順をのべる。
【0022】
【実施例】
実施例1 大腸菌のニトロ還元酵素に関する遺伝子断片の単離 大腸菌 Escherichia coli C600
株をLB培地で37℃で一晩培養した。10000rp
mで遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・EDTA緩衝
液(以下、TE緩衝液という)に菌体を懸濁した。37
℃で1時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫酸ナトリ
ウム(以下SDSと略す)を添加して50℃で3時間プ
ロテネースK処理をした。その後、フェノール処理を3
回し、エタノール沈殿し、乾燥した後、TE緩衝液に溶
解し再度プロテネースK処理した。その後フェノール処
理3回後エタノール沈殿しゲノムDNAを回収した。そ
のゲノムDNAを鋳型として、渡辺らによって明らかに
されているニトロ還元酵素のアミノ酸配列と我々が以
前、明らかにしたニトロ還元酵素に相同性を有する発光
細菌Vibrio fischenのフラビン還元酵素
のアミノ酸配列(特願平04ー279029)の保存領
域に関するアミノ酸配列に対応する合成オリゴヌクレオ
チド・プライマーNR−2とNR−3を用いてPCR法
(Saiki,R.K.,D.H.Gelfand,
S.Stoffel,S.J.Scharf,R.Hi
guchi,G.T.Horn,K.B.Mullis
and H.A.Erlic(1988)サイエンス
(Science) 239 487)により増幅反応
し、そのDNA断片をpUC8プラスミドDNA(Ha
nna,Z.,Fregeau,C.,Prefont
atine,G.,Brousseau,R.(198
4)Gene,30 247)のHincII切断部位に
挿入した。
【0023】制限酵素切断部位のマッピングと塩基配列
の決定 (Hattori,M.& Sakaki,Y.(19
86)アナリティカルバイオケミストリー(Anal.
Biochem.)152 232)から大腸菌ニトロ
還元酵素遺伝子であることを確認した。このプラスミド
DNAから大腸菌のニトロ還元酵素遺伝子部分のDNA
断片をHindIII/EcoRIで切り出し、遺伝子マ
ッピングのプローブDNAとして用いた。プローブDN
Aの32P標識はランダム・プライミング法(Feinb
erg,A.Vogelstein,B.(1983)
アナリティカル バイオケミストリー(Anal.Bi
ochem.)132 6)で行った。大腸菌のゲノム
全域をほぼカバーする整列クローンライブラリ−(Ko
hara,Y.,Akiyama,K.,and Is
ono,K.(1987)セル(Cell),50,4
95ー508)のクローンDNAを一枚のナイロンメン
ブレン上に付着させたGene Mapping Me
mbrane(宝酒造製)をハイブリダイゼーション液
(20mlの6×SET緩衝液(20×SET緩衝液:
3MのNaCl、0.6Mのトリスー塩酸(pH8.
0)0.04MのEDTA)、10×Denhard
t’s液(牛血清アルブミン、ポリビニルピロリドン、
Ficollの各0.2%溶液)、0.1%SDS、サ
ケ精子DNA(熱変性したもの50μg/ml))に入
れ、68℃で1時間保温した。さらに液を入れ替えて1
時間保温後、32Pー標識プローブを加え65℃で一晩ハ
イブリダイゼーションした。溶液を捨てフィルターを6
×SET緩衝液で洗浄後、0.5×SET緩衝液65℃
20分間振とうした。この操作を2回繰り返した後、風
乾しオートラジオグラフィーにかけた。フィルターと現
像したX線フィルムを重ね、陽性クローンを決定した。
陽性クローンは21A9Sと2D12であった。21A
9SのDNAをHindIIIで消化後、6kbのDNA
断片をアガロース電気泳動により分離し、DE81ペー
パーからDNAを溶出し、フェノール処理3回後エタノ
ールで沈殿した。それを約200ng/μlになるよう
にTE緩衝液に溶解した。pUC8のHindIII消化
物とそのDNAをT4DNAリガーゼ(DNA鎖どうし
または、DNAとRNAの3’OHと5’P末端のホス
ホジエステルの結合をつなぐ酵素)をもって16℃一晩
連結反応した。連結反応液を大腸菌GM48株に形質転
換した。
【0024】実施例2 酵素遺伝子の構造決定 得られた形質転換株を37℃で一晩培養し、アルカリS
DS法(Sambrook,J.,Fritsch,
E.F.and Maniatis,T.(1989)
Molecular cloning:a labor
atory manual.cold Spring
Harbor Laboratory Press,C
old Spring Harbor,New Yor
k.)を用いてプラスミドDNA(pNR−H)を調製
した。実施例1にて得た部分DNA配列を基にして、合
成オリゴヌクレオチド・プライマーを調製し、完全なニ
トロ還元酵素遺伝子の配列をジデオキシ変法(Hatt
ori,M.& Sakaki,Y.(1986)アナ
リティカル バイオケミストリー(Anal.Bioc
hem.)152 232)にて決定し、配列表3に示
す一次構造を明らかにした。その結果、大腸菌のニトロ
還元酵素は、配列表4に示す217個のアミノ酸からな
る分子量23904のポリペプチドで、サルモネラ菌と
エンテロバクター菌のそれらと88%の相同性を示し
た。
【0025】実施例3 ニトロ還元酵素遺伝子の組換えベクター(発現ベクタ
ー)の構築(図3参照)組換えプラスミドpNR−Hの
DNAを制限酵素NruIとPstIで消化した後、ー
80℃で10分間処理した。それをアガロースゲル電気
泳動にかけ約1KbDNA断片をDE81ペーパーで分
離回収した。DE81ペーパーから1MのNaClでD
NA溶出し、フェノール処理3回後エタノール沈殿し
た。それを約200ng/μlになるようにて緩衝液に
溶解した。制限酵素HincII/PstIであらかじめ
切断し、アルカリホスファターゼ処理されたpUC8プ
ラスミドDNA(プラスミドベクター)に、上記DNA
をT4DNAリガーゼをもって16℃一晩連結反応し
た。連結反応液をJM109大腸菌に形質転換し5ープ
ロモークロロー3ーインドリルーβーD−ガラクシド
(Xgal)を含んだ培地で選択し、一晩培養を行い、
白コロニーを形成させた。この白コロニーがインサート
DNAを挿入したプラスミドを含有する形質転換株であ
る。それらの形質転換株からプラスミドDNAを調製
し、制限酵素試験して、発現ベクターpNR1を含有す
る株を得た。このpNR1はニトロ還元酵素遺伝子をラ
クトースオペロンのプロモーターの支配下で発現しえる
ように設計されている。
【0026】実施例4 ニトロ還元酵素の大腸菌による生産 これらの形質転換株の一晩培養液0.25mlをアンピ
シリンを含有したLB液体(10ml)培地に植菌し、
37℃で2時間振とう培養後、最終濃度が1mMになる
ようにイソプロピルーβーD(ー)ーチオガラクトピラ
ノシド(IPTGと略す)を添加し、さらに3時間培養
した。その菌体に対してドデシル硫酸ナトリウムーポリ
アクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGEと略
す)による分析を(Laemmli,U.K.(197
0)Nature,277,680)に記述されている
方法で行った。その結果、pNR1を含有する大腸菌で
は、プラスミドを含有しない大腸菌と比較して、大量に
発現している蛋白が、分子量26000に見いだされ
た。
【0027】IPTG誘導処理した培養液1.5mlを
10000rpmで遠心分離し上清を除く。菌体を50
mMリン酸カリウム・1mMジチオスレイトール緩衝液
0.5mlに懸濁し超音波破砕した。12000rp
m、4℃で30分間遠心分離しその上清を細胞抽出液と
した。その細胞抽出液に対して、酵素活性を測定した。
ニトロ還元酵素活性は(Watanabe,M.,Is
hibate,M.Jr.& Nohmi,T.(19
89)ミューテーション リサーチ(Mutation
research),216,211ー220)の方
法で行った。蛋白量はバイオラッド製の蛋白分析キット
を用いて色素結合法(Bradford,M.M.(1
976)アナリティカル バイオケミストリー(Ana
l.Biochem.)72,248ー254)により
決定した。pNR1を含有した大腸菌の抽出液におい
て、355nmol/min/mgタンパクの酵素活性
を有していたのに対して、プラスミドを含まない大腸菌
の抽出液の酵素活性は、7nmol/min/mgタン
パクであった。ニトロ還元酵素遺伝子を導入した大腸菌
では、導入していない菌の50倍のニトロ還元活性を示
したことになる。この遺伝子はニトロ還元活性を有する
酵素蛋白の遺伝子と同定できた。
【0028】
【発明の効果】本発明の酵素遺伝子は、大腸菌のニトロ
還元活性を有する酵素の遺伝子としては、初めて単離さ
れたものである。適当な宿主、たとえば大腸菌を宿主と
することにより変異原あるいは発癌性物質の好感受性株
を作出することにこれを使用できる。またその大腸菌か
ら大量に該還元酵素蛋白を調製することもできる。その
発現ベクターを適当な宿主たとえば、大腸菌に導入する
ことにより、ニトロ還元活性を有する酵素を大量に発現
する生物あるいは微生物を作出することが出来、さらに
その遺伝子導入生物から抽出することにより該遺伝子導
入生物あるいは微生物は上述した機能から変異原あるい
は発癌性物質に対して高い感受性を示し、高感度に変異
原あるいは発癌性物質を検出する指標として有用であ
る。
【0029】
【配列表】
【0030】配列番号:1 配列の長さ:654 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノム DNA 起源 生物名:Escherichia coli 株名:C600 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E
【0031】 配列 1 ATG GAK ATM ATM QRS GTL GCL XTY AAJ WGZ CAK QRS ACL AAJ GCL TTK 48 1 Met Asp Ile Ile Ser Val Ala Leu Lys Arg His Ser Thr Lys Ala Phe 16 49 GAK GCL QRS AAJ AAJ XTY ACL CCL GAJ CAJ GCL GAJ CAJ ATM AAJ ACL 96 17 Asp Ala Ser Lys Lys Leu Thr Pro Glu Gln Ala Glu Gln Ile Lys Thr 32 97 XTY XTY CAJ TAK QRS CCL QRS QRS ACL AAK QRS CAJ CCL TGG CAK TTK 144 33 Leu Leu Gln Tyr Ser Pro Ser Ser Thr Asn Ser Gln Pro Trp His Phe 48 145 ATM GTL GCL QRS ACL GAJ GAJ GGL AAJ GCL WGZ GTL GCL AAJ QRS GCL 192 49 Ile Val Ala Ser Thr Glu Glu Gly Lys Ala Arg Val Ala Lys Ser Ala 64 193 GCL GGL AAK TAK GTL TTK AAK GAJ WGZ AAJ ATG XTY GAK GCL QRS CAK 240 65 Ala Gly Asn Tyr Val Phe Asn Glu Arg Lys Met Leu Asp Ala Ser His 80 241 GTL GTL GTL TTK TGK GCL AAJ ACL GCL ATG GAK GAK GTL TGG XTY AAJ 288 81 Val Val Val Phe Cys Ala Lys Thr Ala Met Asp Asp Val Trp Leu Lys 96 289 XTY GTL GTL GAK CAJ GAJ GAK GCL GAK GGL WGZ TTK GCL ACL CCL GAJ 336 97 Leu Val Val Asp Gln Glu Asp Ala Asp Gly Arg Phe Ala Thr Pro Glu 112 337 GCL AAJ GCL GCL AAK GAK AAJ GGL WGZ AAJ TTK TTK GCL GAK ATG CAK 384 113 Ala Lys Ala Ala Asn Asp Lys Gly Arg Lys Phe Phe Ala Asp Met His 128 385 WGZ AAJ GAK XTY CAK GAK GAK GCL GAJ TGG ATG GCL AAJ CAJ GTL TAK 432 129 Arg Lys Asp Leu His Asp Asp Ala Glu Trp Met Ala Lys Gln Val Tyr 144 433 XTY AAK GTL GGL AAK TTK XTY XTY GGL GTL GCL GCL XTY GGL XTY GAK 480 145 Leu Asn Val Gly Asn Phe Leu Leu Gly Val Ala Ala Leu Gly Leu Asp 160 481 GCL GTL CCL ATM GAJ GGL TTK GAK GCL GCL ATM XTY GAK GCL GAJ TTK 528 161 Ala Val Pro Ile Glu Gly Phe Asp Ala Ala Ile Leu Asp Ala Glu Phe 176 529 GGL XTY AAJ GAJ AAJ GGL TAK ACL QRS XTY GTL GTL GTL CCL GTL GGL 576 177 Gly Leu Lys Glu Lys Gly Tyr Thr Ser Leu Val Val Val Pro Val Gly 192 577 CAK CAK QRS GTL GAJ GAK TTK AAK GCL ACL XTY CCL AAJ QRS WGZ XTY 624 193 His His Ser Val Glu Asp Phe Asn Ala Thr Leu Pro Lys Ser Arg Leu 208 625 CCL CAJ AAK ATM ACL XTY ACL GAJ GTL TAA 654 209 Pro Gln Asn Ile Thr Leu Thr Glu Val *** 218 (ただし、塩基の3文字連鎖は、左側に5’末端を及び
右側に3’末端を表している。この文字はヌクレオチド
配列を形成するプリン又はピリミジン塩基を表す。ま
た、A:アデニン、G:グアニン、C:シトシン、J:
AもしくはG、K:TもしくはC、L:A、T、Cもし
くはG、M:A、CもしくはT、T:チミン、X:Yが
AもしくはGの場合はTまたはC、或いはYがCもしく
はTの場合はC、Y:XがCの場合はA、G、Cまたは
T、或いはXがTの場合はAまたはG、W:ZがCもし
くはTの場合はCまたはあ、或いはZがCもしくはTの
場合はC、Z:WがGの場合はA、G、CまたはT、或
いはWがAの場合はあまたはG、QR:SがA,G、C
もしくはTの場合はTC、***はTAA TAG も
しくはTGAを表す。)
【0032】配列番号:2 配列の長さ:654 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノム DNA 起源 生物名:Escherichia coli 株名:C600 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E
【0033】 配列 1 ATG GAT ATC ATT TCT GTC GCC TTA AAG CGT CAT TCC ACT AAG GCA TTT 48 1 Met Asp Ile Ile Ser Val Ala Leu Lys Arg His Ser Thr Lys Ala Phe 16 49 GAT GCC AGC AAA AAA CTT ACC CCG GAA CAG GCC GAG CAG ATC AAA ACG 96 17 Asp Ala Ser Lys Lys Leu Thr Pro Glu Gln Ala Glu Gln Ile Lys Thr 32 97 CTA CTG CAA TAC AGC CCA TCC AGC ACC AAC TCC CAG CCG TGG CAT TTT 144 33 Leu Leu Gln Tyr Ser Pro Ser Ser Thr Asn Ser Gln Pro Trp His Phe 48 145 ATT GTT GCC AGC ACG GAA GAA GGT AAA GCG CGT GTT GCC AAA TCC GCT 192 49 Ile Val Ala Ser Thr Glu Glu Gly Lys Ala Arg Val Ala Lys Ser Ala 64 193 GCC GGT AAT TAC GTG TTC AAC GAG CGT AAA ATG CTT GAT GCC TCG CAC 240 95 Ala Gly Asn Tyr Val Phe Asn Glu Arg Lys Met Leu Asp Ala Ser His 80 241 GTC GTG GTG TTC TGT GCA AAA ACC GCG ATG GAC GAT GTC TGG CTG AAG 288 81 Val Val Val Phe Cys Ala Lys Thr Ala Met Asp Asp Val Trp Leu Lys 96 289 CTG GTT GTT GAC CAG GAA GAT GCC GAT GGC CGC TTT GCC ACG CCG GAA 336 97 Leu Val Val Asp Gln Glu Asp Ala Asp Gly Arg Phe Ala Thr Pro Glu 112 337 GCG AAA GCC GCG AAC GAT AAA GGT CGC AAG TTC TTC GCT GAT ATG CAC 384 113 Ala Lys Ala Ala Asn Asp Lys Gly Arg Lys Phe Phe Ala Asp Met His 128 385 CGT AAA GAT CTG CAT GAT GAT GCA GAG TGG ATG GCA AAA CAG GTT TAT 432 129 Arg Lys Asp Leu His Asp Asp Ala Glu Trp Met Ala Lys Gln Val Tyr 144 433 CTC AAC GTC GGT AAC TTC CTG CTC GGC GTG GCG GCT CTG GGT CTG GAC 480 145 Leu Asn Val Gly Asn Phe Leu Leu Gly Val Ala Ala Leu Gly Leu Asp 160 481 GCG GTA CCC ATC GAA GGT TTT GAC GCC GCC ATC CTC GAT GCA GAA TTT 528 161 Ala Val Pro Ile Glu Gly Phe Asp Ala Ala Ile Leu Asp Ala Glu Phe 176 529 GGT CTG AAA GAG AAA GGC TAC ACC AGT CTG GTG GTT GTT CCG GTA GGT 576 177 Gly Leu Lys Glu Lys Gly Tyr Thr Ser Leu Val Val Val Pro Val Gly 192 577 CAT CAC AGC GTT GAA GAT TTT AAC GCT ACG CTG CCG AAA TCT CGT CTG 624 193 His His Ser Val Glu Asp Phe Asn Ala Thr Leu Pro Lys Ser Arg Leu 208 625 CCG CAA AAC ATC ACC TTA ACC GAA GTG TAA 654 209 Pro Gln Asn Ile Thr Leu Thr Glu Val *** 218
【0034】配列番号:3 配列の長さ:840 配列の型:核酸 鎖の数:1 トポロジー:直鎖 配列の種類:ゲノム DNA 起源 生物名:Escherichia coli 株名:C600 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:91ー745 特徴を決定した方法:E
【0035】 配列 1 GGA AAT CTA TAG CGC ATT TTT CTC GCT TAC CAT TTC TCG TTG AAC CTT 48 49 GTA ATC TGC TGG CAC GCA AAA TTA CTT TCA CAT GGA GTC TTT ATG GAT 96 1 Met Asp 2 97 ATC ATT TCT GTC GCC TTA AAG CGT CAT TCC ACT AAG GCA TTT GAT GCC 144 3 Ile Ile Ser Val Ala Leu Lys Arg His Ser Thr Lys Ala Phe Asp Ala 18 145 AGC AAA AAA CTT ACC CCG GAA CAG GCC GAG CAG ATC AAA ACG CTA CTG 192 19 Ser Lys Lys Leu Thr Pro Glu Gln Ala Glu Gln Ile Lys Thr Leu Leu 34 193 CAA TAC AGC CCA TCC AGC ACC AAC TCC CAG CCG TGG CAT TTT ATT GTT 240 35 Gln Tyr Ser Pro Ser Ser Thr Asn Ser Gln Pro Trp His Phe Ile Val 50 241 GCC AGC ACG GAA GAA GGT AAA GCG CGT GTT GCC AAA TCC GCT GCC GGT 288 51 Ala Ser Thr Glu Glu Gly Lys Ala Arg Val Ala Lys Ser Ala Ala Gly 66 289 AAT TAC GTG TTC AAC GAG CGT AAA ATG CTT GAT GCC TCG CAC GTC GTG 336 67 Asn Tyr Val Phe Asn Glu Arg Lys Met Leu Asp Ala Ser His Val Val 82 337 GTG TTC TGT GCA AAA ACC GCG ATG GAC GAT GTC TGG CTG AAG CTG GTT 384 83 Val Phe Cys Ala Lys Thr Ala Met Asp Asp Val Trp Leu Lys Leu Val 98 385 GTT GAC CAG GAA GAT GCC GAT GGC CGC TTT GCC ACG CCG GAA GCG AAA 432 99 Val Asp Gln Glu Asp Ala Asp Gly Arg Phe Ala Thr Pro Glu Ala Lys 114 433 GCC GCG AAC GAT AAA GGT CGC AAG TTC TTC GCT GAT ATG CAC CGT AAA 480 115 Ala Ala Asn Asp Lys Gly Arg Lys Phe Phe Ala Asp Met His Arg Lys 130 481 GAT CTG CAT GAT GAT GCA GAG TGG ATG GCA AAA CAG GTT TAT CTC AAC 528 131 Asp Leu His Asp Asp Ala Glu Trp Met Ala Lys Gln Val Tyr Leu Asn 146 529 GTC GGT AAC TTC CTG CTC GGC GTG GCG GCT CTG GGT CTG GAC GCG GTA 576 147 Val Gly Asn Phe Leu Leu Gly Val Ala Ala Leu Gly Leu Asp Ala Val 162 577 CCC ATC GAA GGT TTT GAC GCC GCC ATC CTC GAT GCA GAA TTT GGT CTG 624 163 Pro Ile Glu Gly Phe Asp Ala Ala Ile Leu Asp Ala Glu Phe Gly Leu 178 625 AAA GAG AAA GGC TAC ACC AGT CTG GTG GTT GTT CCG GTA GGT CAT CAC 672 179 Lys Glu Lys Gly Tyr Thr Ser Leu Val Val Val Pro Val Gly His His 194 673 AGC GTT GAA GAT TTT AAC GCT ACG CTG CCG AAA TCT CGT CTG CCG CAA 720 195 Ser Val Glu Asp Phe Asn Ala Thr Leu Pro Lys Ser Arg Leu Pro Gln 210 721 AAC ATC ACC TTA ACC GAA GTG TAA TTC TCT CTT GCC GGG CAT CTG CCC 768 211 Asn Ile Thr Leu Thr Glu Val *** 218 769 GCT ATT TCC TCT CAG ATT CTC CTG ATT TGC ATA ACC CTG TTT CAG CCG 816 817 TCA TCA TAG GCT GCT GTT GTA TAA 840
【0036】配列番号:4 配列の長さ:217 配列の型:アミノ酸 配列の種類:蛋白質
【0037】 配列 10 N- Met Asp Ile Ile Ser Val Ala Leu Lys Arg His Ser Thr Lys Ala Phe 20 30 Asp Ala Ser Lys Lys Leu Thr Pro Glu Gln Ala Glu Gln Ile Lys Thr 40 Leu Leu Gln Tyr Ser Pro Ser Ser Thr Asn Ser Gln Pro Trp His Phe 50 60 Ile Val Ala Ser Thr Glu Glu Gly Lys Ala Arg Val Ala Lys Ser Ala 70 80 Ala Gly Asn Tyr Val Phe Asn Glu Arg Lys Met Leu Asp Ala Ser His 90 Val Val Val Phe Cys Ala Lys Thr Ala Met Asp Asp Val Trp Leu Lys 100 101 Leu Val Val Asp Gln Glu Asp Ala Asp Gly Arg Phe Ala Thr Pro Glu 120 Ala Lys Ala Ala Asn Asp Lys Gly Arg Lys Phe Phe Ala Asp Met His 130 140 Arg Lys Asp Leu His Asp Asp Ala Glu Trp Met Ala Lys Gln Val Tyr 150 160 Leu Asn Val Gly Asn Phe Leu Leu Gly Val Ala Ala Leu Gly Leu Asp 170 Ala Val Pro Ile Glu Gly Phe Asp Ala Ala Ile Leu Asp Ala Glu Phe 180 190 Gly Leu Lys Glu Lys Gly Tyr Thr Ser Leu Val Val Val Pro Val Gly 200 His His Ser Val Glu Asp Phe Asn Ala Thr Leu Pro Lys Ser Arg Leu 210 Pro Gln Asn Ile Thr Leu Thr Glu Val *** -C
【図面の簡単な説明】
【図1】ニトロ還元酵素とフラビン還元酵素の間で保存
されるアミノ酸配列と合成オリゴヌクレオチド・プライ
マー(NR−2及びNR−3)を示す。番号はサルモネ
ラ菌のニトロ還元酵素のアミノ酸の位置を示す。
【図2】本発明の酵素遺伝子の制限酵素地図およびシー
クエンスストラテジーを示す。矢印は塩基配列を決定し
た方向を示す。ボックスで示したところが酵素遺伝子に
相当する部分である。
【図3】本発明に係わる大腸菌のニトロ還元活性を有す
る酵素遺伝子を含有する本発明の組換えベクター(発現
ベクターpNR1)の構築工程を示す。
【符号の説明】 lacP ラクトースプロモーター Ampr アンピシリン耐性遺伝子 pUC8 プラスミド・ベクター pNR1 発現ベクター NruI 6塩基認識制限酵素 PstI 6塩基認識制限酵素 KpnI 6塩基認識制限酵素 EcoRV 6塩基認識制限酵素 HincII 6塩基認識制限酵素 BglII 6塩基認識制限酵素 SmaI 6塩基認識制限酵素 pNRーH 組換えプラスミド
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 //(C12N 15/09 ZNA C12R 1:19) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12N 9/02 C12R 1:19) C12R 1:19)

Claims (8)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】配列番号1で表される塩基配列を含む、ニ
    トロ還元酵素遺伝子。 【配列表1】
  2. 【請求項2】配列番号2で表される塩基配列を含む請求
    項1記載のニトロ還元酵素遺伝子。 【配列表2】
  3. 【請求項3】塩基配列が配列番号3で表されるニトロ還
    元酵素遺伝子。 【配列表3】
  4. 【請求項4】配列番号4で表されるアミノ酸配列を有す
    るニトロ還元酵素。 【配列表4】
  5. 【請求項5】塩基配列が配列番号1で表されるDNAを
    含有する組み換えベクター。 【配列表1】
  6. 【請求項6】配列番号2で表される塩基配列を有する遺
    伝子がプラスミドベクターへ挿入された請求項5記載の
    組み換えベクター。 【配列表2】
  7. 【請求項7】配列番号1で表される塩基配列を有するD
    NAを含む組み換えベクターを含有する細菌。 【配列表1】
  8. 【請求項8】塩基配列が配列番号1で表されるDNAを
    含む組み換えベクターで修飾されてなる細菌を培養する
    ことからなる配列番号4で表されるアミノ酸配列を含む
    酵素の製法。 【配列表1】 【配列表4】
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH09266A (ja) * 1995-06-19 1997-01-07 Chisso Corp 大腸菌のフラビン還元酵素
JP2007513622A (ja) * 2003-12-11 2007-05-31 ユニバーシティ オブ ウェールズ バンゴール ニトロ化合物を検出するためのニトロレダクターゼ用バイオセンサ
CN112680498A (zh) * 2020-12-28 2021-04-20 华南理工大学 一种遗传毒性物质的高通量筛查方法

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WO1993008288A1 (en) * 1991-10-23 1993-04-29 Cancer Research Campaign Technology Limited Bacterial nitroreductase for the reduction of cb 1954 and analogues thereof to a cytotoxic form

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