JP2003526684A - 遺伝子の阻害剤またはサプレッサーおよびその遺伝子の発現産物に結合する分子を含有する混合物 - Google Patents
遺伝子の阻害剤またはサプレッサーおよびその遺伝子の発現産物に結合する分子を含有する混合物Info
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Abstract
Description
遺伝子産物もしくは他の修飾遺伝子産物の生物学的機能を調節するために使用さ
れる薬物を含む分子は、遺伝子産物および/またはそれらの誘導体を刺激するか
、または抑制している。刺激または抑制は、例えば、低分子量分子、ペプチド、
抗体等を含むアゴニストまたはアンタゴニストを使用することによって達成され
た。よく知られる例としては、H2拮抗薬およびβ遮断薬、またはHER2タン
パク質にもしくは免疫調節受容体に結合する抗体、ならびにホルモン受容体結合
分子が挙げられる。
誘導体によって達成することもできる。
を抑制することによる、遺伝子産物の抑制も用いられた。その例は、脳における
神経伝達物質受容体の発現の抑制、または細胞成長調節タンパク質、サイトカイ
ンおよび成長因子の抑制である。
伝子産物およびそれらの誘導体への分子の結合による遺伝子産物の抑制、または
その代わりに発現の抑制のいずれかが用いられてきた。
び前記遺伝子の発現産物に結合する少なくとも1種類の分子に関する。その少な
くとも1種類の分子は、発現産物の機能活性を抑制することが好ましい。
単一化合物の作用合計を少なくとも20%を超える、好ましくは50%を超える
、さらに好ましくは100%を超える、混合物の有効性として定義される。これ
は、a)それぞれの遺伝子を発現し、b)その遺伝子の発現がその系で測定可能
な作用を有する、生体外(in vitro)系または生体内(in vivo)系のいずれでも試
験することが可能である。
いことである。
ランスフォーミング成長因子α(TGF‐α)およびヒト上皮成長因子(γEG
F)の受容体に対するアンチセンスポリヌクレオチドが開示されている。それに
は、γEGFに対するアンチセンスポリヌクレオチドと、γEGFに対する抗体
(抗γEGF)との組み合わせが開示されているが、抗γEGFは、EGF受容
体の活性を抑制することができない。対照的に、抗γEGFは、その受容体の刺
激物質である。
導体であることが好ましい。その少なくとも1種類の核酸分子は、病態生理学的
現象において役割を果たす、遺伝子発現を抑制するかまたは遺伝子発現を妨げる
オリゴヌクレオチド、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび/またはリボザイ
ムであることが好ましい。
、例えばメチル化、リン酸化、グリコシル化等により受けたエディティングまた
は化学修飾を有するRNAまたはタンパク質である。
リーシステムに組み込むことは有用である可能性がある。DNAデリバリーシス
テムは、ウイルスもしくは非ウイルスベクターまたはその両方、さらにアニオン
脂質、カチオン脂質、非カチオン脂質またはそれらの混合物を含む。
オチド間の結合、例えばリン酸エステル結合のうちの1つまたは複数にて修飾さ
れることが好ましい。例えば、オリゴヌクレオチド、リボザイムおよび/または
核酸の修飾は、ホスホロチオエート(S‐ODN)ヌクレオチド間結合、メチル
ホスホネートヌクレオチド間結合、ホスホラミデイト(phosphoramidate)結合
、ペプチド結合の修飾、糖の2’‐O‐アルキル修飾、特にメチル、エチル、プ
ロピル、ブチル等、糖の2’‐メトキシエトキシ修飾および/または塩基の修飾
などの修飾を含む。様々な修飾をオリゴもしくはポリヌクレオチドにおいて組み
合わせることができる。
阻害活性のエンハンサーにそれを結合させることによって修飾することもできる
。
、例えばエストロゲン、プロゲステロン、コルチコステロイド、鉱質コルチコイ
ド、ペプチド、プロテオグリカン、糖脂質、リン脂質およびそれらの誘導体に、
核酸分子を結合させるか、またはそれらと混合する。
通りまたは複数通りを含む核酸分子から選択する: GTA GTA CAC GAT GG (配列番号1) CTG ATG TGT TGA AGA ACA (配列番号2) CTC TGA TGT GTT GAA G (配列番号3) CGG CAT GTC TAT TTT GTA (配列番号4) GCT TTC ACC AAA TTG GAA GC (配列番号5) CTG GCT TTT GGG TT (配列番号6) GCT GTT GAC TGC CC (配列番号7) CCC AGT ATT ACT GC (配列番号8) GGT TGA AGC CAT TG (配列番号9) GCC GCT CAA TCT TCA TC (配列番号10) GAA CAG TTC GTC CAT G (配列番号11) CCA GAG TTT CGG TTC (配列番号12) CTA GGA CTG GGA CAG (配列番号13) CAT CTT CTG CCA TTC (配列番号14) CGT AGG TGG TGC TG (配列番号15) GTG TTT TCC CAC CAG (配列番号16) GGT TTT GGT TCA CTA G (配列番号17)
配列を選択する方法は、例えばWO94/25588またはWO98/3390
4に記載されている。
もしくはRNAに結合することが可能であり、したがって遺伝子の発現を阻害ま
たは抑制する、ペプチド、タンパク質および/または低分子量物質である。適切
なタンパク質は、抗体および抗体フラグメントもまた含む。
、Fabフラグメント、一本鎖抗体などの抗体、抗体フラグメント、またはそれら
の組み合わせを含むことが好ましい。Fabフラグメント、一本鎖抗体などの抗体
、抗体フラグメント、またはそれらの組み合わせは、例えば、抗体ライブラリー
をスクリーニングし、かつ遺伝子の発現産物への結合について発現産物を試験す
ることによって、得ることが可能である。
ペプチドおよび/またはタンパク質であることが好ましい。そのペプチドおよび
/またはタンパク質は、例えば、発現ライブラリーをスクリーニングし、かつ遺
伝子の発現産物への結合について発現産物を試験することによって、得ることが
可能である。
リペプチドを遺伝子の発現産物への結合についてスクリーニングすることによっ
てもまた得ることが可能である。発現産物に結合するペプチドは、例えばEMBO J
. 20(2001) 340-349に開示されている。そのペプチドは、MIA(黒色腫阻害活
性)に結合し、したがってMIAの機能活性を抑制する。適切なペプチド(配列
番号18〜41)は例えば、 VPHIPPN MPPTQVS QMHPWPP QPPFWQF TPPQGLA IPPYNTL AVRPAPL GAKPHPQ QQLSPLP GPPPSPV LPLTPLP QLNVNHQARADQ TSASTRPELHYP TFLPHQMHPWPP VPHIPPNSMALT RLTLLVLIMPAP RKLPPRPRR VLASQIATTPSP TPLTKLPSVNHP PPNSFSSAGGQRT EQDSRQGQELTKKGL ETTIVITWTPAPR TSLLISWDAPAVT NSLLVSWQPPRAR である。
量分子を含有する。特に、その低分子量分子は、コンビナトリアル・ケミストリ
ーを用い、かつ遺伝子発現産物への結合について産物を試験することによって得
ることができる。
の原子と組み合わせて100個までの炭素原子を有する分子である。発現産物に
結合する適切な化合物が、図2に記載されており、すべてがMIAに結合する。
NAもしくはRNA分子、またはアプタマーおよび/もしくはSpiegelm
erを含むそれらの誘導体であることも可能である。
MIA、c‐jun、junB、c‐fos、VCAM、NF‐カッパーBp6
5、NF‐カッパーBp50、ICAM、VEGFおよびNF‐kB2からなる
群から選択される。
る。
と、腫瘍、免疫不全を治療するための、または造血幹細胞、および赤血球、白血
球、血小板、栓球およびそれらの前駆細胞を含むそれらの誘導体の移植が含まれ
る臓器もしく細胞移植を改善するための、前記遺伝子の発現産物に結合する少な
くとも1種類の分子または因子と、を含む混合物を使用する方法に関する。臓器
移植には、肝臓、腎臓、心臓、肺、胃腸器官、骨、すい臓、軟骨、神経細胞、島
細胞、およびこれらの臓器をそれから誘導または再構成することができる幹細胞
の移植が含まれる。
もしくは阻害する少なくとも1種類の分子または因子と、前記遺伝子の発現産物
に結合する少なくとも1種類の因子との組み合わせを有効量投与することによっ
て臓器もしくは細胞移植を改善する方法に関するものであり、それによって、造
血幹細胞、および赤血球、白血球、血小板、栓球およびそれらの前駆細胞を含む
それらの誘導体の移植を含む、腫瘍増殖抑制、臓器もしくは細胞移植の改善、免
疫応答の増強もしくは抑制が、相乗作用的手法で高められる。臓器移植には、肝
臓、腎臓、心臓、肺、胃腸器官、骨、すい臓、軟骨、神経細胞、島細胞、および
これらの臓器をそれから誘導または再構成することができる幹細胞の移植が含ま
れる。
生体に対する本発明の混合物の効果を試験することによって、特定の病理学的状
態に関連する遺伝子を同定するのにもまた有用である。
はサプレッサーと、前記遺伝子の発現産物の機能活性を抑制する少なくとも1種
類の分子とを用いて、生物学的システムを同時にもしくは連続的に処置すること
を含む、生物学的システムにおいて遺伝子の機能活性を低減する方法に関する。
生物学的システムは、細胞、細胞培養、臓器または生物体であることが可能であ
る。
ラー細胞(LAK細胞)の免疫応答活性に対する、遺伝子産物の阻害剤としての
TGF‐β2に対する中和抗体、遺伝子発現の阻害剤としてのTGF‐β2に対
するアンチセンスオリゴヌクレオチド、およびその2つの組み合わせの効果を研
究するために、CARE‐LASSアッセイが用いられている(ヒテンフェルル
ス(Lichtenfels), R., ビディソン(Biddison), W.E.1 シュルツ(Schulz), H.1
ボイト(Voyt), A.B. およびマーティン(Martin). CARE-LASS (calcein-release
assay), an improved fluorescence based test system to measure cytotoxic
lymphocyte activity. J. Immunol. Meth., 172: 227-239,1994)。
、健常ドナーの静脈血から、末梢血単核細胞(PBMC)を単離した。簡単に説
明すると、等量の完全培地(10%(v/v)ウシ胎児血清および1mM L‐
グルタミンで懸濁したRMPI 1640培地)とヘパリン血を混合し、フィコ
ール-ハイパック(Pharmacia社、スウェーデン、ウプサラ)勾配上に
層状に重ねた。400gで室温にて30分間遠心分離した後、プラズマ‐フィコ
ール界面でバンド形成したPBMCを除去し、3回洗浄し、完全培地中に再懸濁
した。トリパンブルー排除によって決定した細胞生死判別は、>97%であった
。10U/mlのIL−1α、100U/mlのIL−2で処理することによっ
て、リンパ球を活性化した。
浄し、5%FCS/PBS中で10Mio細胞/mlにて懸濁した。Calce
in−AM(Molecular Probes社、米国)を最終濃度25μM
に添加した。その細胞を37℃で30分間標識し、次いで5%FCS/PBS中
で2回洗浄し、1Mio細胞/mlに調節し、最終濃度0.1Mio/100μ
L/1ウェルで96ウェルU字型マイクロタイタープレート(Nunc社、デン
マーク)に添加した。
〜5μM)、または −TGF‐β2に対する中和抗体(f.c.100mg/ml)、または −その2つの組み合わせ のいずれかを図に示すように添加するか、あるいは −その2つのどちらも添加しなかった。
00μMをウェルに添加して、所望のE:T比1:20とした。
100μlまたは溶解バッファー100μL(50nMホウ酸ナトリウム、0.
1%トリトン×100、pH9.0)それぞれを、ウェルに予め添加した。その
プレートを37℃で4時間インキュベートした後、上清(50μL)を新しいウ
ェルに移し、自動蛍光スキャナー(Titertek Fluoroskan
II、ドイツ)を用いて測定した。その細胞毒性を以下の等式から決定した:
は臍帯血(臍帯血幹細胞)から動員し、免疫精製で得たCD34+細胞を濃縮し
た後に、造血幹細胞をアフェレーシスにより回収した。
床用途に重大な関連性がある。現在の幹細胞移植の問題は、最適化されたサイト
カインカクテルによって産生された幹細胞数が少ないことである。さらに、長期
的な成功に対する重要な問題は、サイトカインカクテルでの現在の処置による多
分化能前駆体画分の休止および成熟である。
で処理することによって、細胞の数および骨髄幹細胞の増殖能力のどちらも改善
することができる。
リゴヌクレオチド、両方の組み合わせが、強い相乗作用を有した。
化能増殖性前駆細胞の数は、対照と比較して85%増大した。
は、対照と比較して63%増大した。
両方の組み合わせで処理することによって、多分化能増殖性前駆細胞の数は、対
照と比較して350%を超えて増大した。
ドの両方の組み合わせは、多分化能増殖性造血前駆細胞の増殖に対して同様の強
い相乗作用を有した。
ドで処理することによって、対照と比較して85%増大した。
よって、対照と比較して57%増大した。
1アンチセンスオリゴヌクレオチド両方の組み合わせで処理することによって、
対照と比較して3倍超えて増大した。
は、ヒト乳癌の30〜45%において、膵臓癌、卵巣癌、胃癌、非小細胞肺癌、
口腔扁平上皮癌の50%までにおいて、増幅および/または過剰発現する。
化抗体が、乳癌患者の治療に使用されている。臨床研究では当初、優れた治療可
能性が示されたが、現在の臨床研究では議論の余地のある結果が示されている。
本発明者らは、cerbB‐2遺伝子発現の阻害剤と、cerbB‐2遺伝子産
物に結合する分子との組み合わせによって、各分子単の効果が単独で強く増強さ
れることを見出した。
は18%〜31%であり、抗体では13〜34%であったが、その2つの組み合
わせでは85%を超えた。
: GGCAGGGCCAGCGGTAGGCTGAGCTCACTGGCAGTA
GAAATCCCATTTGTCTGTCTTCACATCGACTTTGCC
AGGTTTCAGGGTCTGGTCCTCTCGGACAATGCTACT
GGGGAAATAGCCCAGGCGAGCAGCCAGATCTCCATA
GTAATCTCCCTGAACGCTGCCTCCCCAGAAGAGCCG
CCCACGGCCCTTCAGCTTGGAGAAGACATACACCAC
TTGGCCCCGGTGAATGGTCAGGAATCGGCAGTCGGG
GGCCATGTAGTCCTGAAGGGCCACAGCCATGGAGAT
AGGGTGGCTGCACTCCTGGTCCGCACACAGCTTCCG
GTCAGCCAGCTTGGGCATAGGACCACCCCTGACACC
AGGTCCGGAGAAGGCAGACAGCAAGATGATGACACC
AAGGCACACCAGGGACCGGGCCATCGTGGACTGTGA
GCAAGAGAGTGAGCAAGGGGGTGCTGG または、この配列の一部を発現する移入ベクターによる、内因性MIA合成の抑
制は、それらの移動活性を低減しただけではなく、基質に対するそれらの接着を
増大した。この両方により、MIA阻害剤および腫瘍浸潤および転移の強い抑制
作用が示唆されている。
合ペプチドと、上記のアンチセンス配列を発現する移入ベクターとの組み合わせ
によって達成された。
たは成長因子、例えばTGF‐β、MIA、VCAM、ICAM、c‐jun、
junB、NF‐カッパーB、VEGFもしくはインテグリン遺伝子の制御配列
に結合する転写因子またはその結合ドメインを、受容体、酵素、転写因子、細胞
接着分子、サイトカインまたは成長因子、例えばTGF‐β、MIA、VCAM
、IACM、c‐jun、junB、NF‐カッパーB、VEGFもしくはイン
テグリンに結合する、例えばコンビナトリアル・ケミストリーによって得られる
低分子量分子と組み合わせることによってもまた達成することができる。
たは成長因子、例えばTGF‐β、MIA、VCAM、ICAM、c‐jun、
junB、NF‐カッパーB、VEGFもしくはインテグリン遺伝子から転写さ
れたmRNAに結合する、ペプチドまたはタンパク質を、受容体、酵素、転写因
子、細胞接着分子、サイトカインまたは成長因子、例えばTGF‐β、MIA、
VCAM、ICAM、c‐jun、junB、NF‐カッパーB、VEGFもし
くはインテグリンに結合する小分子と組み合わせることによってもまた達成する
ことができる。
因子、例えばTGF‐β、MIA、VCAM、ICAM、c‐jun、junB
、NF‐カッパーB、VEGFもしくはインテグリン遺伝子の制御配列に結合す
る、ペプチド、タンパク質、例えば転写因子またはその結合ドメインを、受容体
、酵素、転写因子、細胞接着分子、サイトカインまたは成長因子、例えばTGF
‐β、MIA、VCAM、ICAM、c‐jun、junB、NF‐カッパーB
、VEGFもしくはインテグリンに結合するSpiegelmerと組み合わせ
ることによってもまた達成することができる。
は成長因子、例えばTGF‐β、MIA、VCAM、ICAM、c‐jun、j
unB、NF‐カッパーB、VEGFもしくはインテグリン遺伝子の制御配列に
結合する、転写因子またはその結合ドメインを、受容体、酵素、転写因子、細胞
接着分子、サイトカインまたは成長因子、例えばTGF‐β、MIA、VCAM
、ICAM、c‐jun、junB、NF‐カッパーB、VEGFもしくはイン
テグリンに結合するペプチドと組み合わせることによってもまた達成することが
できる。
る分子と組み合わせることによって、相乗作用を達成することもできる。かかる
混合物は、虚血、低酸素、変性または過剰刺激に対して神経細胞を保護するのに
有用である。
び抗TGF‐β1抗体の組み合わせの効果を調べた。この理由で、末梢血から精
製したヒトCD34陽性細胞を最初に、オリゴヌクレオチドなしで、またはアン
チセンスTGF‐β1オリゴヌクレオチドもしくはミスセンス対照の存在下にて
、サイトカイン(IL‐3、IL‐6、GM‐CSF、G‐CSF、SCF)を
含有する培地中で72時間培養した。続いて、HPP‐Q‐アッセイ(高増殖可
能性の休止細胞アッセイ)において、抗TGF‐β1抗体と共に、または抗TG
F‐β1抗体を用いることなく、細胞をさらに培養した。
L‐11、G‐CSF、GM‐CSF、SCFおよびEpo)を含有する対照培
地中で培養した細胞を、抗TGF‐β1阻止抗体の存在下にて、同一のサイトカ
インを含有する培地中で培養した細胞と比較する。その対照は、サイトカイン応
答性前駆体を示し、阻止TGF‐β抗体を添加することによって、休止前駆体が
誘導される。
により説明されているように、HPP‐Q‐アッセイを行った。簡単に説明する
と、1.6×104培養細胞を、35mm組織シャーレ中にアリコート1mlで
各培地に対して3通りにプレーティングした。18日後、コロニー数(CFU=
得られた最も未成熟な細胞)をカウントした。
性細胞に対する抗TGF‐β1抗体(TGF‐β1AB)の効果が2倍超えて増
大することが示されている。つまり、アンチセンスTGF‐β1の存在下では、
細胞数が、抗体のみと比較して2倍を超える数となる。
対するアンチセンスTGF‐β1の効果が、抗体よって増幅することもまた示さ
れている:TGF‐β1抗体もまた添加した場合、アンチセンスTGF‐β1の
みで得られた細胞数は、ほぼ3倍増大する。
せは、アンチセンスまたは抗体のみと比較して、細胞数の増大が2倍を超える結
果となる。
断両方の組み合わせの強い相乗作用を示す図である。
ある。
Claims (23)
- 【請求項1】 遺伝子発現の少なくとも1種類の阻害剤またはサプレッサー
と、前記遺伝子の発現産物の機能活性を抑制する少なくとも1種類の分子と、を
含有する混合物。 - 【請求項2】 前記の少なくとも1種類の阻害剤またはサプレッサーが、核
酸分子またはその誘導体である、請求項1に記載の混合物。 - 【請求項3】 前記核酸分子が、オリゴヌクレオチド、アンチセンスオリゴ
ヌクレオチド、および/またはリボザイム分子である、請求項2に記載の混合物
。 - 【請求項4】 前記オリゴヌクレオチド、前記アンチセンスオリゴヌクレオ
チド、および/または前記リボザイム分子が、アニオン脂質、カチオン脂質、非
カチオン脂質およびそれらの混合物の群から選択される脂質と共にウイルスベク
ターおよび/または非ウイルスベクターを含むDNAデリバリーシステムに組み
込まれる、請求項3に記載の混合物。 - 【請求項5】 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび/またはリボザ
イム分子が、糖部位、塩基および/またはヌクレオチド間結合のうちの1つまた
は複数において、かつ/あるいは取り込み活性および/または阻害活性のエンハ
ンサーにアンチセンスおよび/またはリボザイム分子を結合させることによって
修飾される、請求項3に記載の混合物。 - 【請求項6】 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号1〜17のヌクレオチ
ド配列のいずれか1つを有する、請求項2に記載の混合物。 - 【請求項7】 前記の少なくとも1種類の阻害剤またはサプレッサーが、ペ
プチドおよび/またはタンパク質である、請求項1に記載の混合物。 - 【請求項8】 遺伝子発現産物に結合する前記の少なくとも1種類の分子が
、Fabフラグメント、一本鎖抗体などの抗体、抗体フラグメント、またはその組
み合わせである、請求項1から7のいずれか一項に記載の混合物。 - 【請求項9】 Fabフラグメント、一本鎖抗体などの前記抗体、抗体フラグ
メント、またはそれらの組み合わせが、抗体ライブラリーをスクリーニングし、
かつ遺伝子発現産物への結合について発現産物を試験することによって得られる
、請求項8に記載の混合物。 - 【請求項10】 遺伝子発現産物に結合する前記の少なくとも1種類の分子
が、ペプチドおよび/またはタンパク質である、請求項1から7のいずれか一項
に記載の混合物。 - 【請求項11】 前記ペプチドおよび/またはタンパク質が、発現ライブラ
リーをスクリーニングし、かつ遺伝子発現産物への結合について発現産物を試験
することによって得られる、あるいは遺伝子発現産物への結合についてランダム
に合成されたペプチドおよび/またはタンパク質をスクリーニングすることによ
って得られる、請求項10に記載の混合物。 - 【請求項12】 遺伝子発現産物に結合する前記分子または因子が、低分子
量分子である、請求項1に記載の混合物。 - 【請求項13】 前記低分子量分子の阻害剤が、コンビナトリアル・ケミス
トリーを用い、かつ遺伝子の発現産物への結合について産物を試験して得られる
、請求項12に記載の混合物。 - 【請求項14】 遺伝子発現産物に結合する前記分子が、DNAもしくはR
NA分子、またはアプタマーおよび/もしくはSpiegelmerを含むそれ
らの誘導体である、請求項1に記載の混合物。 - 【請求項15】 遺伝子発現の前記の少なくとも1種類の阻害剤またはサプ
レッサーが、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび前記遺伝子の発現産物の機
能活性を抗体として抑制する前記の少なくとも1種類の分子である、請求項3お
よび8に記載の混合物。 - 【請求項16】 前記遺伝子が、TGF‐β、erbB‐2、MIA、c‐
jun、junB、c‐fos、VCAM、NF‐カッパーBp65、NF‐カ
ッパーBp50、ICAM、VEGFおよびNF‐kB2からなる群から選択さ
れる、請求項1から15のいずれか一項に記載の混合物。 - 【請求項17】 配列番号1〜17の配列を有するオリゴヌクレオチド。
- 【請求項18】 請求項1から16のいずれか一項に記載の混合物を含有す
る薬物。 - 【請求項19】 腫瘍、免疫不全を治療するのに用いる、あるいは臓器もし
くは細胞移植または細胞増殖を改善するために用いる、薬物を製造するための、
請求項1から16に記載の混合物の使用。 - 【請求項20】 腫瘍成長の抑制、臓器もしくは細胞移植、細胞増殖の改善
、免疫応答の増強もしくは抑制が、相乗的手法で高められる、請求項18に記載
の使用。 - 【請求項21】 遺伝子発現の少なくとも1種類の阻害剤またはサプレッサ
ーと、前記遺伝子の発現産物の機能活性を抑制する少なくとも1種類の分子とを
用いて、生物学的システムを同時にまたは連続的に処置することを含む、生物学
的システムにおいて遺伝子産物の機能活性を低減する方法。 - 【請求項22】 前記生物学的システムが、細胞、細胞培養物、臓器または
生物体である、請求項21に記載の方法。 - 【請求項23】 前記生物学的システムが、遺伝子産物の機能活性を受ける
患者である、請求項21に記載の方法。
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