JP2002262896A - O−アセチル−l−セリンを発酵法で製造する方法 - Google Patents

O−アセチル−l−セリンを発酵法で製造する方法

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Abstract

(57)【要約】 【課題】 O−アセチル−L−セリンを発酵法で製造す
る方法 【解決手段】 野生型から誘導され、野生型に比べて高
められた内因性O−アセチル−L−セリン−形成性及び
野生型に比べて増強されたO−アセチル−L−セリン−
流出性を有する微生物−菌株を発酵培地中で培養するこ
とによりO−アセチル−L−セリンを発酵法で製造する
方法において、発酵培地中でpH値を5.1〜6.5の範
囲内に調節する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、発酵法を用いてO
−アセチル−L−セリンを製造する方法に関する。
【0002】
【従来の技術】アミノ酸の製造のための発酵法は、今日
広く普及している。これは、殊に、経済的に著しく重要
な20の蛋白質アミノ酸の代表、例えばL−グルタミン
酸、L−リシン、L−スレオニンの製法である。しかし
ながら、年間1000〜10000トンの範囲の小さい
市場での蛋白質アミノ酸、例えばL−フェニルアラニ
ン、L−システインの製造のための方法に関する報告も
増大している。
【0003】これに反して、20の蛋白質アミノ酸の生
合成前駆物質を製造するための相応する方法は全く知ら
れていない。しかしながら、これらの前駆物質は屡々キ
ラル中心を有し、薬剤有効物質の合成のための構成要素
として使用できるので、正にこの前駆物質は重要な生成
物でありうる。国際特許出願WO 00/44923明
細書中には、例えばシキミ酸、芳香族アミノ酸の生合成
の中間体の製造が記載されている。もう一つの例は、欧
州特許出願EP 0994190A2であり、ここに
は、発酵法によるL−ホモセリン、L−メチオニンの前
駆物質の製造が報告されている。
【0004】O−アセチル−L−セリンは、L−システ
インの生合成前駆物質である。これ自体はアミノ酸であ
り、細菌及び植物の物質代謝で、ヒドロキシル官能基の
所でのL−セリンのアセチル化により生じる。この反応
は、cysE−遺伝子によりコードされる酵素セリン−
O−アセチル−トランスフェラーゼ[EC 2.3.
1.30]により触媒作用される。O−アセチル−セリ
ンは、細胞中で更にL−システインまで変換される。こ
の場合には、チオール−官能基へのアセテート−官能基
の置換が行われる。
【0005】O−アセチル−L−セリンの発酵法による
製造の際の問題は、この物質が非常に不安定であり、
4.0より大きいpH値で異性化してN−アセチル−L
−セリンになる事実から生じる。この反応の速度は、
7.6のpH値で1%×min- の速度を有する(Tai
等、1995,Biochemistry 34:12311−12
322)。このことは、このような条件下で、通常少な
くとも一日半かかる発酵法の後に、有意義な量のO−ア
セチル−セリンが検出されないことを意味する。この異
性化反応は、不可逆的であり、pH値の増加に伴いその
速度が更に上昇する。O−アセチル−L−セリンとは反
対に、N−アセチル−L−セリンは、アミノ官能基のブ
ロッキングに基づき、もはやペプチド合成のためには使
用できない。
【0006】細胞中のO−アセチル−L−セリン−濃度
は非常に低く、強力な調節(Regulation)が根底にある
ことがもう一つの問題である。一方で、セリン−アセチ
ル−トランスフェラーゼは、L−システインによりアロ
ステリックに抑制され、これに伴い、μM−濃度のL−
システインの存在時には、O−アセチル−L−セリンの
合成は不可能である。他方、異性化生成物N−アセチル
−L−セリンは、硫黄レギュロン(Regulon)のインジ
ューサーとしての作用をし、これに伴い、O−アセチル
−L−セリンと硫化物とが迅速に反応して、L−システ
インをもたらす。
【0007】Dassler 等(2000、Mol. Microbiol.
36:1101−1112)により、膜蛋白質YdeD
(=Orf299)を過剰生産する細胞は、培地中にL
−システイン、2−メチル−チアゾリジン−2,4−ジ
カルボン酸及び更にO−アセチル−L−セリンをも分泌
することが記載された。しかしながら、後者は0.12
g/lの非常に少量でのみ、かつ振動フラスコ実験にお
いてのみ検出できた。これに反して、より良好な栄養物
質供給に基づきより高い収率を可能とする発酵実験で
は、N−アセチル−L−セリンのみが得られた。O−ア
セチル−L−セリンは、4〜5のpH範囲の場合にのみ
充分に安定であることが論じられた。しかしながら、こ
のpH範囲は、好中球性細菌、例えばエセリキア・コリ
ーの悪い成長に基づき発酵法的製造のためには好適では
ない。
【0008】pH7.0で、Orf299の使用下での
N−アセチル−L−セリンの発酵法による製造が、同様
に欧州特許出願EP 0885962A1に記載され
た。ここでは,orf299−遺伝子(この出願中でS
EQ.ID.NO:3で示されている)が適当なcys
E−アレルと組み合わされた。これは、L−システイン
による低下されたフィードバック−阻害の基礎になって
いるセリン−アセチル−トランスフェラーゼをコードし
ていた。これによって、細胞中のO−アセチル−L−セ
リンの増強された生産が達成され、最終的に迅速な異性
化に基づきN−アセチル−L−セリンが蓄積された。
【0009】国際特許出願WO 97/15673明細
書中に記載のような低下されたフィードバック阻害を有
するcysE−アレルの単独使用は、同様にO−アセチ
ル−L−セリンの蓄積をもたらさない。細胞内ではO−
アセチル−セリンの増大した形成が得られる。しかしな
がらこの処置法では、細胞外で−従って初めて生成物と
して補足可能である−L−システインが検出できただけ
である。
【0010】更に、O−アセチル−L−セリンの製造の
場合の大きな問題は、Dassler 等(2000,Mol. Mic
robiol.36:1101−1112)により記載された
事実、即ち、Orf299の過剰生産が、細菌成長の強
力な妨害をもたらす事実である。このことは、インジュ
ーサーであるN−アセチル−L−セリンの細胞内での不
足に基づく硫黄レギュロンの誘導不足に基づく。
【0011】
【発明が解決しようとする課題】本発明の課題は、O−
アセチル−L−セリンの不安定性及び細胞からの有効な
O−アセチル−L−セリン−エクスポート(Exports)の
負の生理学的結果にも関わらず、O−アセチル−L−セ
リンの高い収率を生じる発酵法を提供することであっ
た。
【0012】
【課題を解決するための手段】この課題は、1野生型か
ら誘導され、野生型に比べて高められた内因性O−アセ
チル−L−セリン−形成性及び野生型に比べて増強され
たO−アセチル−L−セリン−流出性(Efflux)を有す
る微生物−菌株を、発酵培地中で培養することにより解
決され、この際、発酵培地中のpH値を5.1〜6.5の
範囲内に調節することを特徴とする。
【0013】即ち、意外にも、次のことが判明した: - 前記のような特徴を有する微生物菌株は、多量のO
−アセチル−L−セリンを分泌する、 - O−アセチル−L−セリンは5.1〜6.5のpH値
で発酵培地中で充分安定であり、かつ - 同時に、O−アセチル−L−セリンの増加供給によ
るO−アセチル−L−セリン−分泌細胞の前記の生理学
的問題は、フィードバック抵抗性のcysE−アレルを
用いて充分に取り除くことができる。
【0014】この発酵の間の発酵培地のpH値は、有利
に5.5〜6.5のpH範囲、特に有利に5.5〜6.0の
pH範囲である。
【0015】本発明の方法で使用できる微生物菌株は、
それらが、 - O−アセチル−L−セリンの高い内因性形成性を有
し、かつ - 増強されたO−アセチル−L−セリン−流出性を有
することで優れている。
【0016】このような菌株は、技術水準で公知であ
る。O−アセチル−L−セリンの高い内因性形成は、修
飾されたcysE−アレル(Allel)を、例えば - WO 97/15673(ここで、参照文献として
添付)又は - Nakamori S. 等の,1998, Appl. Env. Microbiol. 6
4: 1607-1611 (ここで、参照文献として添付)又は - Takagi H. 等の 1999, FEBES Lett. 452: 323-327に
記載のように、微生物菌株中に入れることにより達成す
ることができる。
【0017】cysE−アレルは、システインによる低
下されたフィードバック-阻害の基礎となっているセリ
ン−O−アセチル−トランスフェラーゼをコードする。
これによって、O−アセチル−L−セリンの形成は、充
分に細胞のシステイン−濃度により止められる。
【0018】増強されたO−アセチル−L−セリン−流
出性(Efflux)は、その遺伝子産生物がO−アセチル−L
−セリンのエクスポートに作用するエフラックス−遺伝
子(Efflux-Gen)の高められた発現によって得ることが
できる。
【0019】特に有利なこのようなエフラックス−遺伝
子は、Dassler等により(2000、Mol. Microbiol. 3
6: 1101-1112) 及びEP0885962A1(整理番号
SN09/097759の米国特許出願に相当:ここ
で、参考文献として添付)に記載されたydeD−遺伝
子である。
【0020】修飾されたcysE−アレル又はエフラッ
クス−遺伝子は、使用菌株中に単独コピー又は高いコピ
ー数で存在しうる。これらは染色体コードしているか又
は自己複製因子、例えばプラスミド上に局在することが
できる。
【0021】この遺伝子の増強された発現は、例えば当
業者に公知である適当なプロモーター系の使用により行
うことができる。
【0022】本発明の有利な1実施形では、cysE−
アレル又はydeD−遺伝子を、本来の又はgapDH
−プロモーターと共に含有する微生物をプラスミド上で
中程度のコピー数で使用する。このような構造は、例え
ばpACYC184−cysEX−GAPDH−ORF
306であり、これはEP0885962A1中に詳細
に記載されている。
【0023】このような菌株の製造のためには、原則的
に、遺伝学的方法に使用でき、発酵法で良好に培養でき
る全ての微生物菌株が好適である。腸内菌(Enterobakt
eriacee)類の細菌が有利に使用される。特に有利に大腸
菌(Escherichia coli)類の微生物が使用される。この
ような菌株の製造は、前記の文献中に記載されており、
本発明の部分ではない。
【0024】本発明の方法に好適な菌株は、EP 08
85962A1(米国特許出願整理番号SN 09/0
97759に相当:ここで参考文献として添付)に記載
のように、システイン及びシステイン−誘導体の製造の
ためにも好適である。しかしながら、後者のためには、
L−システイン又はその誘導体の最適量を得るために、
無機硫黄源、例えば硫酸塩又はチオ硫酸塩の充分な供給
が必要である。
【0025】しかしながら、本発明の方法では、O−ア
セチル−L−セリンが更にシステインまで変換すること
は望ましくないので、この発酵の間に硫黄源は供給され
ない。単に、培地中に充分な量の硫黄源(例えば硫酸
塩、チオ硫酸塩)が存在して、細胞の蛋白質合成のため
のシステインの需要がカバーされることが確保されるべ
きであるだけである。栄養培地中の充分量は、有利に硫
黄5〜50mMである。
【0026】微生物菌株を用いるO−アセチル−L−セ
リンの製造のための本発明の方法は、発酵槽中で、公知
方法であるが、発酵の間の著しく低いpH値の調節下に
実施される。
【0027】発酵槽中での微生物菌株の培養は、連続的
培養法として、回分式培養法として又は有利には流加培
養法として行われる。この発酵の間にC−源を連続的に
供給することが特に有利である。
【0028】C−源としては、有利に糖、糖アルコール
又は有機酸が使用される。本発明の方法では特に有利に
C−源としてグルコース、ラクトース又はグリセリンが
使用される。
【0029】C−源の配量添加は、発酵の間の発酵槽中
の含分が0.1〜50g/lの範囲内に保持されること
を確保する形であるのが有利である。0.5〜10g/
lの範囲が特に有利である。
【0030】N−源として、本発明の方法では有利にア
ンモニア、アンモニウム塩又は蛋白質加水分解生成物が
使用される。pH安定化のための調整剤としてのアンモ
ニアの使用の際には、この発酵の間に、このN−源が定
期的に後供給される。
【0031】更なる培地添加物として、元素 リン、塩
素、ナトリウム、マグネシウム、窒素、カリウム、カル
シウム、鉄の塩及び微量(即ちμM濃度で)の元素 モ
リブデン、硼素、コバルト、マンガン、亜鉛及びニッケ
ルの塩を添加することができる。
【0032】更に、有機酸(例えば酢酸塩、クエン酸
塩)、アミノ酸(例えばイソロイシン)及びビタミン
(例えばB1、B6)をこの培地に添加することができ
る。
【0033】複合栄養源として、例えば酵母エキス、コ
ーンステイープリカー、大豆粉又は麦芽エキスを使用す
ることができる。
【0034】インキュベーシヨン温度は、15〜45℃
である。30〜37℃の温度が有利である。
【0035】この発酵は、好気性成長条件下に実施する
のが有利である。発酵槽中への酸素導入は、圧搾空気又
は純粋酸素を用いて行われる。
【0036】記載の方法で発酵される微生物は、1〜3
日の発酵時間内に、O−アセチル−L−セリンを高い効
率で培地中に分泌する。
【0037】
【実施例】本発明を更に詳述するために次の実施例を使
用する。例を実施するために使用されている細菌菌株エ
セリキア・コリーW3110/pACYC184−cy
sEX−GAPDH−ORF306は、DSM(Deutsch
e Sammlung fuer Mikroorganismen und Zellkulturen G
mbH、 D-38142 Braunschweig) にDSM13495なる
番号で寄託された。
【0038】例1:O−アセチル−L−セリンをN−ア
セチル−L−セリンにする異性化 発酵に近い条件下での異性化反応を介しての正確な印象
を得るために、発酵培地100ml中でO−アセチル−
L−セリン(例3参照)0.9gを使用した。更に25
%アンモニアを用いてpH7.0にpH値を調節し、3
2℃の反応温度で、種々異なる時点で試料を取り出し
た。これらを逆相HPLCによりLUNA5μC18
(2)−カラム(Phenomenex, Aschaffenburg, Deutsch
land ) で分析した。溶離液として、希リン酸(濃リン
酸0.1ml/l)を、流速0.5ml/minで用い
た。結果は図1に示されている。
【0039】例2:生産菌株の前培養液 この発酵のための前培養液として、付加的にテトラサイ
クリン15mg/lを含有するLB−培地(トリプトン
10g/l、酵母エキス5g/l、NaCl10g/
l)20mlに、菌株W3110/pACYC184−
cysEX−GAPDH−ORF306(米国特許出願
整理番号SN 09/097759に相当するEP 0
885962A1(ここで参考文献として添付)に記載
されている)を接種し、30℃及び150rpmで振動
装置中でインキュベートした。7時間後に、全内容物
を、グルコース 5g/l;ビタミンB1 0.5mg
/l及びテトラサイクリン 15mg/lが補充された
SM1−培地(KHPO12g/l;KHPO
3g/l;(NHSO 5g/l;MgSO
×7HO 0.3g/l;CaCl×2H
0.015g/l;FeSO×7HO 0.002g
/l;Naクエン酸塩×2HO 1g/l;NaC
l 0.1g/l:微量元素溶液(NaMoO×2
O0.15g/l;NaBO2.5g/l;C
oCl×6HO0.7g/l;CuSO×5H
O0.25g/l;MnCl×4HO1.6g/l;
ZnSO×7HO0.3g/lからなる)1ml/
l)100ml中に移した。30℃、150rpmで更
に17時間インキュベートを行った。
【0040】例3:O−アセチル−L−セリンの発酵法
による製造 発酵槽として、最大培養液量2リットルを有するFirma
Braun Biotech (Melsungen, D)社のBiostat M
−装置を用いた。例2に記載の前培養液(600nmで
の光学密度約3)を、発酵培地900ml(グルコース
15g/l;トリプトン10g/l;酵母エキス5g/
l;(NHSO5g/l;KH PO1.5
g/l;NaCl0.5g/l;MgSO×7H
0.3g/l;CaCl×2HO0.015g/l;
FeSO×7HO0.075g/l;Naクエン
酸塩×2HO1g/l及び前記の微量元素溶液1ml
/l、ビタミンB1 5mg/l及びテトラサイクリン
15mg/lを25%アンモニアでpH6.0に調節)
を有する発酵槽に接種した。この発酵の間に、32℃の
温度に調節し、pH値を25%アンモニアの配量添加に
より6.0の値で一定に保持した。この培養液に除菌し
た圧搾空気を1.5v/v/minで通気し、200r
pmの撹拌回転数で撹拌した。酸素飽和が50%の値ま
で低下した後に、50%酸素飽和を保持するために(p
−ゾンデを用いて測定、900rpmで100%飽
和に対して較正)、コントロール装置を用いて回転数を
1200rpmの値まで高めた。発酵槽中のグルコース
含分が当初の15g/lから約5〜10g/lまで低下
したら直ちに、56%グルコール溶液の配量添加を行っ
た。この供給を6〜12ml/hの流速で行い、この際
に、発酵槽中のグルコース濃度を0.5〜10g/lの
間に保持した。グルコース測定は Firma YSI (Yellow S
prings, Ohio, USA) 社のグルコース分析装置(Glukose-
Analysator)を用いて実施した。発酵時間は、28時間
であった。この時間の後に、試料を取り出し、細胞を遠
心分離により培養培地から分離した。生じた培養上澄み
を逆相HPLCにより例1に記載と同様に分析した。第
1表は、培養上澄み中の得られた主要物質代謝生成物の
含分を示している。
【0041】
【表1】
【0042】pH5.5までの範囲で、類似の値が得ら
れた。
【図面の簡単な説明】
【図1】例1で取り出された試料の逆相HPLCによる
分析結果を示す図
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (71)出願人 390009003 Zielstattstraβe 20,D −81379 Munchen,F.R.Ge rmany (72)発明者 トビアス ダスラー ドイツ連邦共和国 ミュンヘン ヒマラヤ シュトラーセ 14 (72)発明者 アウグスト ベック ドイツ連邦共和国 ゲルテンドルフ リン デンシュトラーセ 10 Fターム(参考) 4B064 AE08 CA02 CC04 CC07 CC09 CC12

Claims (19)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 野生型から誘導され、野生型に比べて高
    められた内因性O−アセチル−L−セリン−形成性及び
    野生型に比べて増強されたO−アセチル−L−セリン−
    流出性を有する微生物−菌株を発酵培地中で培養するこ
    とによりO−アセチル−L−セリンを発酵法で製造する
    場合に、発酵培地中でpH値を5.1〜6.5の範囲内に
    調節することを特徴とする、O−アセチル−L−セリン
    を発酵法で製造する方法。
  2. 【請求項2】 発酵法による製造の間の発酵培地のpH
    値は、5.5〜6.5、特に有利に5.5〜6.0のpH範
    囲内にある、請求項1に記載の方法。
  3. 【請求項3】 野生型に比べて高められた内因性O−ア
    セチル−L−セリン−形成性を低下されたフィードバッ
    ク阻害を有するセリン−アセチル−トランスフェラーゼ
    をコードするcysE−アレルにより達成させる、請求
    項1又は2に記載の方法。
  4. 【請求項4】 野生型に比べて高められたO−アセチル
    −L−セリン−流出性をydeD−遺伝子により達成さ
    せる、請求項1から3までのいずれか1項に記載の方
    法。
  5. 【請求項5】 微生物菌株はエセリキア・コリーであ
    る、請求項1から4までのいずれか1項に記載の方法。
  6. 【請求項6】 発酵槽中の微生物菌株を、連続的培養
    法、回分培養法又は有利には流加培養法として培養す
    る、請求項1から5までのいずれか1項に記載の方法。
  7. 【請求項7】 栄養培地は、硫黄5〜50mMの濃度で
    S−源を含有する、請求項1から6までのいずれか1項
    に記載の方法。
  8. 【請求項8】 発酵法での製造の間に、C−源を連続的
    に供給する、請求項1から7までのいずれか1項に記載
    の方法。
  9. 【請求項9】 C−源を、糖、糖アルコール又は有機酸
    の群から選択する、請求項8に記載の方法。
  10. 【請求項10】 C−源を、グルコール、ラクトース又
    はグリセリンの群から選択する、請求項8又は9に記載
    の方法。
  11. 【請求項11】 C−源を、発酵の間にそれが0.1〜
    50g/lの範囲内で存在するように供給する、請求項
    8から10までのいずれか1項に記載の方法。
  12. 【請求項12】 N−源として、アンモニア、アンモニ
    ウム塩又は蛋白質加水分解生成物を添加する、請求項1
    から11までのいずれか1項に記載の方法。
  13. 【請求項13】 発酵培地に、元素 リン、塩素、ナト
    リウム、マグネシウム、窒素、カリウム、カルシウム、
    鉄の塩及び微量の(即ちμM濃度の)元素モリブデン、
    硼素、コバルト、マンガン、亜鉛及びニッケルの塩を添
    加する、請求項1から12までのいずれか1項に記載の
    方法。
  14. 【請求項14】 有機酸(例えば酢酸塩、クエン酸
    塩)、アミノ酸(例えばイソロイシン)及びビタミン
    (例えばB1、B6)を発酵培地に添加する、請求項1
    から13までのいずれか1項に記載の方法。
  15. 【請求項15】 酵母エキス、コーンステイープリカ
    ー、大豆粉又は麦芽エキスを発酵培地に添加する、請求
    項1から14までのいずれか1項に記載の方法。
  16. 【請求項16】 インキュベーシヨン温度は15〜45
    ℃、有利に30〜37℃である、請求項1から15まで
    のいずれか1項に記載の方法。
  17. 【請求項17】 好気性成長条件下に実施する、請求項
    1から16までのいずれか1項に記載の方法。
  18. 【請求項18】 圧搾空気及び純粋酸素を用いて発酵槽
    中に酸素を導入することにより好気性成長条件を製造す
    る、請求項17に記載の方法。
  19. 【請求項19】 1〜3日の発酵時間を選択する、請求
    項1から18までのいずれか1項に記載の方法。
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