HU226520B1 - Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use - Google Patents

Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use Download PDF

Info

Publication number
HU226520B1
HU226520B1 HU0003402A HUP0003402A HU226520B1 HU 226520 B1 HU226520 B1 HU 226520B1 HU 0003402 A HU0003402 A HU 0003402A HU P0003402 A HUP0003402 A HU P0003402A HU 226520 B1 HU226520 B1 HU 226520B1
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
seq
gin
gly
polypeptide
type
Prior art date
Application number
HU0003402A
Other languages
English (en)
Inventor
Mark R Alderson
Davin C Dillon
Yasir A W Skeiky
Antonio Campos-Neto
Original Assignee
Corixa Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Corixa Corp filed Critical Corixa Corp
Publication of HUP0003402A2 publication Critical patent/HUP0003402A2/hu
Publication of HUP0003402A3 publication Critical patent/HUP0003402A3/hu
Publication of HU226520B1 publication Critical patent/HU226520B1/hu

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/35—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Mycobacteriaceae (F)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A61P31/06—Antibacterial agents for tuberculosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A61P37/04—Immunostimulants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Description

A jelen találmány tárgyát általában a Mycobacterlum tuberculosis fertőzés kimutatása, kezelése és megelőzése képezi. Pontosabban, a jelen találmány tárgyát a Mycobacterium tuberculosis antigént, vagy annak egy részét, vagy annak variánsát tartalmazó polipeptidek képezik, valamint az ilyen polipeptideknek az alkalmazása a Mycobacterium tuberculosis fertőzés diagnosztizálására és vakcinálására.
A tuberkulózis egy krónikus, fertőző betegség, amit általában a Mycobacterium tuberculosis fertőzés okoz. Ez az egyik legfőbb betegség a fejlődő országokban, valamint egy egyre növekvő probléma a világ fejlett területein, mivel évente nyolcmillió új esetet írnak le, és hárommillió ember hal meg ebben a betegségben. Bár a fertőzés elég hosszú ideig tünetmentes lehet, a betegség általában a tüdők akut gyulladása formájában nyilvánul meg, ami lázat és száraz köhögést okoz. Ha nem kezelik, akkor súlyos komplikációk léphetnek fel, és a vége általában halál.
Bár a tuberkulózist általában kiterjedt antibiotikumkezeléssel kordában lehet tartani, az ilyen kezelés nem elegendő ahhoz, hogy megakadályozzuk a betegség elterjedését. A fertőzött egyedek bizonyos ideig lehetnek tünetmentesek, de fertőzőek. Emellett, bár kritikus, hogy mennyire tartják be a kezelés előírásait, a beteg viselkedését nehezen lehet ellenőrizni. Néhány beteg nem fejezi be a kezelést, ami hatástalan kezelést és gyógyszer-rezisztencia kifejlődését eredményezi.
A tuberkulózis elterjedésének gátlása hatékony vakcinálást és a betegség pontos, korai diagnosztizálását igényli. Jelenleg a védőimmunitás kialakításában a leghatékonyabb módszer az élő baktériummal végzett vakcinálás. Az erre a célra legelterjedtebben használt Mycobacterium a Bacillus Calmette-Guerin (BCG), a Mycobacterium őov/s-nak egy avirulens törzse. Azonban a BCG biztonságossága és hatékonysága vita tárgyát képezi, és néhány országban, azaz például az Amerikai Egyesült Államokban nem végeznek vele általános vakcinálást. A diagnózist általában egy bőrteszttel hajtják végre, ami abból áll, hogy tuberkulin PPD-vel (fehérjetisztított származék) végeznek intradermális kezelést. Az antigénspecifikus T-sejt-válaszok az injekció helyének mérhető megkeményedését okozzák az injekció után 48-72 órával, ami azt mutatja, hogy mikobakteriális antigének vannak jelen. Ebben a vizsgálatban azonban az érzékenység és a specifitás mindig problematikus volt, és a BCG-vel vakcináit embereket nem lehet megkülönböztetni a fertőzött emberektől.
Miközben a makrofágokról kimutatták, hogy a Mycobacterium tuberculosis immunitás legfőbb hordozói, a T-sejtek a legfőbb indukálói az ilyen immunitásnak. A T-sejtek esszenciális szerepét a Mycobacterium tuberculosis fertőzés elleni védelemben az mutatja, hogy a Mycobacterium tuberculosis gyakran fordul elő AIDSbetegekben, a CD4 T-sejteknek a humán immundeficiencia vírus (HÍV) fertőzéshez kapcsolható kimerülése miatt. A mikobaktériumokkal reagáló CD 4 T-sejtekről kimutatták, hogy a gamma-interferon (IFN-γ) hatékony termelői, amiről viszont kimutatták, hogy egerekben beindítja a makrofágok antimikobakteriális hatásait. Míg az emberekben az IFN-γ szerepe kevésbé világos, a vizsgálatok kimutatták, hogy az 1,25-dihidroxi-D3-vitamin, önmagában vagy IFN-y-val vagy tumornekrózisfaktor-alfával kombinálva aktiválja a humán makrofágokat a Mycobacterium tuberculosis fertőzés gátlására. Emellett az is ismert, hogy az IFN-γ arra serkenti a humán makrofágokat, hogy 1,25-dihidroxi-D3-vitamint állítsanak elő. Hasonlóképpen, az IL- 12-ről kimutatták, hogy szerepet játszik a Mycobacterium tuberculosis fertőzés elleni rezisztencia serkentésében [Chan és Kaufmann: „Tuberculosis: Pathogenesis, Protection and Control”, szerk.: Bloom; ASM Press, Washinton (1994)].
Ennek megfelelően a szakterületen szükség van javított vakcinákra a tuberkulózis megelőzéséhez, kezeléséhez és kimutatásához. A jelen találmány megfelel ezeknek az igényeknek, és emellett más előnyöket is biztosít.
Röviden, a találmány tárgyát olyan izolált polipeptidek képezik, amelyek egy M. tuberculosis antigén egy immunogén részét tartalmazzák, ahol az említett antigén a 109. számú aminosavszekvenciából vagy az említett aminosavszekvenciának az azzal legalább 90%ban megegyező variánsából áll. A találmány egyik előnyös kiviteli alakja szerint az izolált polipeptid a 110-124. számú szekvenciák valamelyikét tartalmazza vagy azok valamelyikéből áll. A találmány még előnyösebb kiviteli alakja szerint az izolált polipeptid a 119. vagy 12. számú szekvenciát tartalmazza vagy azok valamelyikéből áll.
A találmány tárgyát képezik továbbá a fenti polipeptideket kódoló DNS-, ezeket a DNS-szekvenciákat tartalmazó expressziós vektorok, valamint az ilyen vektorokkal transzformált gazdasejtek.
Szintén a találmány tárgyát képezik a találmány szerinti polipeptideket tartalmazó fúziós fehérjék.
A találmány tárgyát képezik továbbá gyógyászati készítmények, amelyek a fenti polipeptideket, az azokat kódoló DNS-molekulákat vagy a fentiekben említett fúziós fehérjéket és egy fiziológiásán elfogadható hordozót tartalmaznak.
Szintén a találmány tárgyát képezik a fenti polipeptideket, az azokat kódoló DNS-molekulákat vagy a fentiekben említett fúziós fehérjéket, valamint egy immunválasz-fokozót tartalmazó vakcinák.
A találmány tárgyát képezi továbbá a polipeptidek, a DNS-ek és a fúziós fehérjék alkalmazása valamely páciensben tuberkulózis elleni védőimmunitás kiváltására alkalmas gyógyszerkészítmény előállítására.
Szintén a találmány tárgyát képezi a polipeptid alkalmazása a tuberkulózis kimutatására alkalmas bőrtesztben használható diagnosztikai kompozíció előállítására, valamint a polipeptidet tartalmazó diagnosztikai kit.
A jelen találmánynak ezek és más szempontjai világosak lesznek a mellékelt leírás és a csatolt rajzok alapján. Az összes itt megadott publikációt teljes egészében referenciának tekintjük.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a csatolt ábrákat.
HU 226 520 Β1
Az 1A. és 1B. ábra illusztrálja a szaporodás és az interferon-y-termelődés serkentését egy első PPD-pozitív donorból (D7-ként említjük) származó T-sejtből, egy rekombináns ORF2-vel és az ORF2 szintetikus peptidjeivel.
A 2A. és 2B. illusztrálja a szaporodás és az interferon-y-termelődés serkentését egy második PPD-pozitív donorból (D160-ként említjük) származó T-sejtből, egy rekombináns ORF2-vel és az ORF2 szintetikus peptidjeivel.
Amint azt az előzőkben említettük, a jelen találmány tárgyát általában a tuberkulózis megelőzésére, kezelésére és diagnosztizálására szolgáló készítmények képezik. A jelen találmány szerinti készítmények közé tartoznak azok a polipeptidek, amik egy Mycobacterium tuberculosis antigénnek legalább egy immunogén részét, vagy egy ilyen antigénnek egy variánsát tartalmazzák, ami csak konzervatív helyettesítésekben és/vagy módosításokban tér el. A továbbiakban a „polipeptid szakkifejezés bármilyen hosszúságú aminosavláncra vonatkozik, beleértve a teljes hosszúságú fehérjéket (azaz például antigéneket), amikben az aminosavcsoportokat kovalens peptidkötések tartják össze. Tehát a fenti antigének közül az egyiknek egy immunogén részét tartalmazó polipeptid állhat teljes egészében az immunogén részből, vagy tartalmazhat további szekvenciákat is. A további szekvenciák származhatnak a természetes Mycobacterium tuberculosis antigénből, vagy lehetnek heterológok, és az ilyen szekvenciák lehetnek (de nem szükséges) immunogének.
Az „immunogén” szakkifejezés jelentése a továbbiakban arra a képességre utal, hogy immunválaszt (azaz például celluláris immunválaszt) vált ki egy páciensben, azaz például egy emberben és/vagy egy biológiai mintában. Pontosabban az immunogén antigének (és az ilyen antigének immunogén részei vagy más variánsai) képesek serkenteni a sejtszaporodást, az interleukin-12 termelését és/vagy az interferon-γtermelést biológiai mintákban, amik egy vagy több sejtet tartalmaznak az alábbi csoportból: T-sejtek, NK-sejtek, B-sejtek és makrofágok, ahol is a sejtek egy Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedből származnak. Egy vagy több Mycobacterium tuberculosis antigénnek legalább egy immunogén részét tartalmazó polipeptideket általában arra lehet használni, hogy kimutassuk a tuberkulózist, vagy védőimmunitást indukáljunk tuberkulózis ellen a páciensekben.
A jelen találmány szerinti készítmények és alkalmazások vonatkoznak az említett polipeptidek variánsaira is. Egy polipeptid-„variáns” szakkifejezés jelentése a továbbiakban egy olyan polipeptid, ami az ismertetett polipeptidtől csak konzervatív helyettesítésekben és/vagy módosításokban tér el, oly módon, hogy a polipeptid terápiás, antigén és/vagy immunogén tulajdonságai megmaradnak. A polipeptidvariánsok előnyösen legalább körülbelül 90%-os és legelőnyösebben legalább körülbelül 95%-os azonosságot mutatnak az azonosított polipeptidekkel. Az immunreaktív tulajdonságokkal rendelkező polipeptidek esetében a variánsokat egy másik változat szerint úgy azonosíthatjuk, hogy a fenti polipeptidek egyikének módosítjuk az aminosavszekvenciáját, majd kiértékeljük a módosított polipeptid immunreaktivitását. A diagnosztikai kötőágensek generálására használható polipeptidek esetében egy variánst úgy azonosíthatunk, hogy kiértékelünk egy módosított polipeptídet, abból a szempontból, hogy képes-e olyan ellenanyagokat generálni, amik kimutatják a tuberkulózis jelenlétét vagy távollétét. Egy másik változat szerint a szabadalmi igénypontokban szereplő antigének variánsait, amiket jól lehet használni a találmány szerinti diagnosztikai módszerekben, úgy azonosíthatjuk, hogy a módosított polipeptideknek kiértékeljük azt a tulajdonságát, hogy képesek-e kimutatni a tuberkulózissal fertőzött páciensek szérumában levő ellenanyagokat. Az ilyen módosított szekvenciákat elkészíthetjük és vizsgálhatjuk például az itt ismertetett reprezentatív eljárásokkal.
A „konzervatív helyettesítés” szakkifejezés jelentése olyan helyettesítés, aminek során egy aminosavat egy másik, hasonló tulajdonságokkal rendelkező aminosawal helyettesítünk, amitől a peptidkémiában jártas szakember azt várhatja, hogy a polipeptid szekunder struktúrája és hidropátiás természete lényegében változatlan marad. Általában az alábbi aminosavcsoportok jelentenek konzervatív változásokat: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gin, asn, ser, thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4) lys, arg, his; és (5) phe, tyr, trp, his.
A variánsokat emellett (vagy egy másik változat szerint) módosíthatjuk például úgy, hogy kivághatjuk vagy hozzáadhatjuk azokat az aminosavakat, amiknek minimális hatásuk van a polipeptid immunogén tulajdonságaira, szekunder struktúrájára és hidropátiás természetére. Például egy polipeptídet konjugálhatunk egy szignál- (vagy vezér-) szekvenciához a fehérje N-terminálisán, ami kotranszlációsan vagy poszttranszlációsan irányítja a fehérje transzferét. A polipeptidet emellett konjugálhatjuk egy linker vagy más szekvenciához, hogy megkönnyítsük a fehérje szintézisét, tisztítását vagy azonosítását (azaz például poli-His), vagy hogy fokozzuk a polipeptidnek egy szilárd hordozóhoz való kötődését. Egy polipeptídet például konjugálhatunk egy immunglobulin Fc régiójához.
A Mycobacterium tuberculosis antigéneket, valamint az ilyen antigéneket kódoló DNS-szekvenciákat általában számos különböző eljárással elkészíthetjük. Például a Mycobacterium tuberculosis-bó\ származó genomiális vagy cDNS-könyvtárakat közvetlenül átvizsgálhatjuk, Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó perifériális vér mononukleáris sejteket (PBMC-k) vagy T-sejtvonalakat vagy kiónokat használva. A könyvtárak közvetlen szűrővizsgálatát általában úgy végezhetjük el, hogy vizsgáljuk az expresszált rekombináns fehérjék pooljainak azt a tulajdonságát, hogy képesek-e szaporodást és/vagy interferon-y-termelődést indukálni Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó T-sejtekben. A potenciális T-sejt-antigéneket először az ellenanyag3
HU 226 520 Β1 reaktivitás alapján szelektáljuk, amint azt az előzőkben ismertetjük.
Egy másik változat szerint az antigéneket kódoló DNS-szekvenciákat úgy azonosíthatjuk, ha megfelelő Mycobacterium tuberculosis genomiális vagy cDNS expressziós könyvtárat vizsgálunk át Mycobacterium tuberculosis-sza\ fertőzött betegekből kapott szérumokkal. Ezeket a szűrővizsgálatokat általában a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára jól ismert technikák alkalmazásával végezhetjük el [Sambrook és munkatársai: Molecular Cloning: A Laboratory Manual; 2. kiadás, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)].
A tisztított antigéneket azután azon az alapon értékeljük ki, hogy képesek-e megfelelő (azaz például celluláris) immunválaszt kiváltani például az itt ismertetett reprezentatív módszerekkel. Az immunogén antigéneket azután részlegesen szekvenálhatjuk, például a hagyományos Edman-kémia alkalmazásával [Edman és Berg: Eur. J. Biochem. 80, 116-132 (1967)]. Az immunogén antigéneket előállíthatjuk rekombináns DNS technikákkal is, az antigént kódoló DNS-szekvencia alkalmazásával, amit egy expressziós vektorba szúrtunk be és egy megfelelő gazdaszervezetben expresszáltunk.
A találmány szerinti antigéneket kódoló DNS-szekvenciákat úgy is megkaphatjuk, hogy egy megfelelő Mycobacterium tuberculosis cDNS vagy genomiális DNS könyvtárat átvizsgálunk, olyan szekvenciákat keresve, amik híbrídizálódnak az izolált antigének részleges aminosavszekvenciáiból származó degenerált oligonukleotidokhoz. Az ilyen szűrővizsgálatban használható degenerált oligonukleotidszekvenciák a szakirodalomban ismertetett módszerekkel tervezhetők és szintetizálhatók meg, valamint szintén a szakirodalomban ismertetett módon vizsgálhatók át [Sambrook és munkatársai: Molecular Cloning: A Laboratory Manual; 2. kiadás, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989), valamint az ebben idézett publikációk], Polimeráz-láncreakciót (PCR) is használhatunk, az előzőkben említett oligonukleotidokat használva a szakterületen jártas szakember számára jól ismert módszerekben, azzal a céllal, hogy izoláljunk egy nukleinsavpróbát egy cDNS vagy genomiális könyvtárból. A könyvtár átvizsgálását az izolált próbákkal végezhetjük el.
A készítés módjától függetlenül az itt ismertetett antigéneknek (és ezek immunogén részeinek) megvan az a tulajdonságuk, hogy immunogén választ indukálnak. Még pontosabban, az antigéneknek megvan az a képességük, hogy a szaporodást és/vagy a citokintermelést (azaz például az interferon-γ és/vagy interleukin-12 termelődését) indukálja egy Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedből származó T-sejtekben, NK-sejtekben, B-sejtekben és/vagy makrofágokban. Az egy antigénre adott immunogén válasz kiértékelésére használható sejttípus kiválasztása függ természetesen a kívánt választól. Például az interleukin-12-termelődést legegyszerűbben B-sejteket és/vagy makrofágokat tartalmazó készítmények alkalmazásával lehet kiértékelni. Egy egyed akkor immúnis Mycobacterium tuberculosis-ra, ha rezisztens a tuberkulózis kifejlődésére, mivel hatékony T-sejt-választ fejtett ki a Mycobacterium tuberculosis ellen (azaz lényegében tünetmentes). Az ilyen egyedeket a tuberkulózisfehérjére (PPD) adott erősen pozitív (azaz nagyobb mint körülbelül 10 mm átmérőjű) intradermális bőrtesztválasz és a tuberkulózis betegség bármilyen jelének vagy tünetének hiánya alapján lehet azonosítani. A Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó T-sejteket, NK-sejteket, B-sejteket és makrofágokat a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert módszerekkel lehet előállítani. Például a PBMC-k (azaz perifériális vér mononukleáris sejtek) készítménye használható a komponens sejtek további elválasztása nélkül. A PBMC-ket általában például Ficoll™-on (Winthrop Laboratories, NY) keresztül történő sűrűségcentrifugálással lehet előállítani.
Az itt ismertetett vizsgálatokban felhasználható T-sejteket is tisztíthatjuk közvetlenül PBMC-kből. Egy másik változat szerint egy dúsított, mikobakteriális fehérjék elleni T-sejtvonal, vagy az egyes mikobakteriális fehérjékkel reagáló T-sejt-klónok használhatók. Az ilyen T-sejt-klónokat előállíthatjuk például Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó PBMC-ket mikobakteriális fehérjékkel tenyésztve 24 hétig. Ez lehetővé teszi, hogy csak a mikobakteriális fehérjékre specifikus T-sejtek szaporodjanak, aminek az az eredménye, hogy olyan sejtvonalat kapunk, ami csak ilyen sejtekből áll. Ezeket a sejteket azután klónozhatjuk, és az egyes fehérjékkel tesztelhetjük, a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert módszereket alkalmazva, hogy pontosabban meghatározzuk az egyes T-sejtek speclfitását. Általában azokat az antigéneket tekintjük immunogénnek, amelyek pozitívnak bizonyulnak Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó T-sejtek, NK-sejtek, B-sejtek és/vagy makrofágok felhasználásával végzett szaporodási és/vagy citokintermelési vizsgálatokban (azaz például interferon-γés/vagy interleukin-12-termelődés). Az ilyen vizsgálatokat elvégezhetjük például az alábbiakban ismertetett reprezentatív eljárásokkal. Az ilyen antigének immunogén részeit hasonló vizsgálatokkal azonosíthatjuk, és ezek jelen lehetnek az itt ismertetett polipeptidekben.
Egy polipeptidnek (azaz például immunogén antigén, vagy annak egy része vagy más variánsa) azt a képességét, hogy sejtszaporodást indukál, úgy értékelhetjük ki, hogy a sejteket (azaz például a T-sejteket és/vagy NK-sejteket) érintkezésbe hozzuk a polípeptiddel, és mérjük a sejtek szaporodását. A körülbelül 105 sejt kiértékeléséhez elegendő polipeptid mennyisége általában körülbelül 10 ng/ml és 100 pg/ml között változik, és előnyösen körülbelül 10 pg/ml. A polipeptidnek a sejtekkel való inkubálását általában 37 °C-on hajtjuk végre, körülbelül hat napig. A polipeptiddel való inkubálás után a sejteket megvizsgáljuk, hogy adnak-e szaporodási választ, amit azután a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert mód4
HU 226 520 Β1 szerekkel értékelhetünk ki, azaz például úgy, hogy a sejteket radioaktív izotóppal jelzett timidinnel impulzusjelezzük, és mérjük a jelölés beépülésének mértékét a celluláris DNS-be. Általában azt a polipeptidet tekintjük a szaporodás indukálására képesnek, amely a háttérnél (azaz a polipeptid nélkül tenyésztett sejteknél megfigyelt szaporodásnál) legalább háromszor magasabb szaporodási szintet ad.
Egy polipeptidnek azt a képességét, hogy képes serkenteni az interferon-γ és/vagy az interleukin-12 sejtek termelődését, úgy értékeljük ki, hogy a sejteket érintkezésben hozzuk a polipeptiddel, és mérjük a sejtek által termelt interferon-γ vagy interleukin-12 mennyiségét. Általában a körülbelül 105 sejt kiértékeléséhez elegendő polipeptid mennyisége körülbelül 10 ng/ml és 100 pg/ml között van, előnyösen körülbelül 10 pg/ml. A polipeptidet immobilizálhatjuk (de nem szükséges) egy szilárd hordozóhoz, azaz például egy gyöngyhöz vagy egy biológiailag lebontható mikrogömbhöz (4,897,268 és 5,075,109 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi leírás). A polipeptidnek a sejtekkel való indukálását általában 37 °C-on végezzük, körülbelül hat napig. A polipeptiddel való inkubálás után a sejteket interferon-y-ra és/vagy interleukin-12-re (vagy azok egy vagy több alegységére) átvizsgáljuk, amit a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert módszerekkel értékelhetünk ki, azaz például enzimhez kötött immunszorbens vizsgálattal (ELISA), vagy az interleukin-12 esetében P70 heterodimerrel, ami egy olyan biológiai vizsgálati módszer, amit a T-sejtek szaporodásának mérésére lehet használni. Általában egy olyan polipeptidet, ami 50 pg/ ml tenyészet-felülúszó (ami 104— 105 sejtet tartalmaz milliliterenként) koncentrációjú interferon-γ termelődését eredményezi, úgy tekintünk, hogy képes serkenteni az interferon-γ termelődését. Egy polipeptidet, ami legalább 10 pg/ml interleukin-12 P70 alegység, és/vagy legalább 100 pg/ml interleukin-12 P40 alegység termelődését serkenti 105 makrofágra vagy B-sejtre (vagy 3*105 PBMC-re) számítva, úgy tekintünk, hogy képes serkenteni az interleukin-12 termelődését.
Általában azok az antigének az immunogén antigének, amik serkentik a szaporodást és/vagy a citokintermelést (azaz például interferon-γ- és/vagy interleukin-12-termelődés) legalább körülbelül 25%-ban Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó T-sejtekben, NK-sejtekben, B-sejtekben és/vagy makrofágokban. Ezek között az immunogén antigének között a kiemelkedő terápiás profillal rendelkező polipeptideket azon az alapon különböztethetjük meg, hogy milyen nagy választ adnak a fenti vizsgálatokban, valamint az egyedek hány százalékában figyelhető meg válasz. Emellett a kiemelkedő terápiás tulajdonságokkal rendelkező antigének in vitro nem serkentik a szaporodást és/vagy a citokintermelődést olyan sejtekben, amik körülbelül több mint 25%-ban olyan egyedekből származnak, akik nem immúnisak a Mycobacterium tuberculosis-ra, ezzel eliminálva az olyan válaszokat, amik nem specifikusan a Mycobacterium tuberculosis-ra reagáló sejtek következményei. Azok az antigének, amik Mycobacterium tuberculosis-ra immúnis egyedekből származó T-sejtek, NK-sejtek, B-sejtek és/vagy makrofág készítmények nagy százalékában indukálnak választ (és kis gyakorisággal más egyedekből származó sejtkészítményekben), kiemelkedő terápiás tulajdonságokkal rendelkeznek.
A kiemelkedő terápiás tulajdonságokkal rendelkező antigéneket azon az alapon is azonosíthatjuk, hogy képesek csökkenteni a Mycobacterium tuberculosis fertőzés súlyosságát kísérleti állatokban, ha vakcinaként adjuk be. A kísérleti állatokban használható megfelelő vakcinakészítményeket az alábbiakban részletesen ismertetjük. A hatékonyságot azon az alapon határozhatjuk meg, hogy az antigén képes-e a kísérleti fertőzés után legalább körülbelül 50%-os csökkenést okozni a baktériumok számában, és/vagy legalább körülbelül 40%-os csökkenést a mortalitásban. A használható kísérleti állatok közé tartoznak az egerek, a tengerimalacok és a főemlősök.
A kiemelkedő diagnosztikai tulajdonságokkal rendelkező antigéneket általában azon az alapon azonosíthatjuk, hogy képesek-e választ kiváltani egy aktív tuberkulózissal rendelkező egyeden végzett intradermális bőrtesztben, és hogy nem képes választ kiváltani egy olyan egyedben, aki nem fertőzött Mycobacterium tuberculosis-sza\. A bőrteszteket általában az alábbiakban ismertetett módon hajthatjuk végre, és azokat a válaszokat tekintjük pozitívnak, amik legalább 5 mm-es keményedést okoznak.
Az itt ismertetett antigének immunogén részeit jól ismert technikákkal készíthetjük el és azonosíthatjuk [Paul: „Fundamental Immunology, 3. kiadás, 243-247. oldal, Raven Press (1993), valamint az ebben idézett publikációk]. Az ilyen technikák közé tartozik a természetes antigén részeinek szűrővizsgálata immunogén tulajdonságok alapján. Az itt ismertetett reprezentatív szaporodási és citokintermelési vizsgálatokat általában használhatjuk ezekben a szűrővizsgálatokban. Egy polipeptidnek az a része az immunogén rész, amely az ilyen reprezentatív vizsgálatokban olyan immunválaszt generál (azaz például szaporodást, interferon-y-termelést és/vagy interleukin-12-termelést), ami lényegében hasonlít a teljes hosszúságú antigén által generált immunválaszra. Más szóval, egy antigénnek egy immunogén része legalább körülbelül 20%-át, de előnyösen körülbelül 100%-át képes generálni annak a szaporodásnak, amit a teljes hosszúságú antigén generál az itt ismertetett modell szaporodási vizsgálatban. Egy immunogén rész emellett, vagy egy másik változat szerint, képes legalább a körülbelül 20%-át, előnyösen körülbelül 100%-át serkenteni annak az interferon-γés/vagy interleukin-12-termelésnek, amit a teljes hosszúságú antigén generál az itt ismertetett modellvizsgálatban.
A Mycobacterium tuberculosis antigének részeit és más variánsait szintetikus és rekombináns DNS eszközökkel lehet létrehozni. A körülbelül 100 aminosavnál, általában körülbelül 50 aminosavnál kevesebb aminosavat tartalmazó szintetikus polipeptideket a szakterü5
HU 226 520 Β1 létén átlagos jártassággal rendelkező szakember számára jól ismert technikákkal állíthatjuk elő. Az ilyen polipeptideket például megszintetizálhatjuk bármelyik kereskedelmi forgalomban levő szilárd fázisú technikával, azaz például a Merrifield-féle szintézismódszerrel, amiben az aminosavakat egymás után adjuk hozzá a növekvő aminosavlánchoz [Merrifield: J. Am. Chem. Soc. 85, 2149-2146 (1963)]. A polipeptidek automatizált szintéziséhez szükséges berendezések különböző gyártóktól szerezhetők be, például a Perkin-EImer/Applied BioSystems Divisiontól (Foster City, CA), és ezek a gyártó utasításai szerint használhatók. A természetes antigén variánsait standard mutagenezis technikákkal állíthatjuk elő, azaz például oligonukleotiddal vezérelt helyspecifikus mutagenezissel. A DNSszekvencia szekcióit standard technikákkal távolíthatjuk el, ami lehetővé teszi a csonkított polipeptidek előállítását.
Az egy természetes antigén részeit és/vagy variánsait tartalmazó rekombináns polipeptidek könnyen előáll íthatók a polipeptidet kódoló DNS-szekvenciából, a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára jól ismert technikák alkalmazásával. Például a megfelelő, a rekombináns fehérjét a tenyészetbe szekretáló gazda-vektor rendszerek felülúszójából először koncentráljuk, egy kereskedelmi forgalomban levő szűrő alkalmazásával. A töményítés után a koncentrátumot megfelelő tisztítóközegre, azaz például affinitásközegre vagy ioncserélő közegre vihetjük. Végezetül egy vagy több fordított fázisú HPLC lépést alkalmazhatunk, hogy tovább tisztítsuk a rekombináns fehérjét.
A szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert számos különböző expressziós vektor közül bármelyik alkalmazható, hogy a találmány szerinti rekombináns polipeptideket expresszáljuk. Az expressziót elérhetjük egy megfelelő gazdasejtben, amit a rekombináns polipeptidet kódoló DNS-molekulát tartalmazó expressziós vektorral transzformáltunk vagy transzfektáltunk. A megfelelő gazdasejtek közé tartoznak például a prokarióták, az élesztő- és a magasabb rendű eukarióta sejtek. Az alkalmazott gazdasejtek előnyösen az Escherichia coli, az élesztő- vagy egy emlőssejtvonal, azaz például a COS vagy a CHO. Az ily módon expresszált DNSszekvenciák kódolhatnak természetben előforduló antigéneket, a természetben előforduló antigének részeit, vagy ezek más variánsait.
Általában, a készítés módjától függetlenül, az itt ismertetett polipeptideket lényegében tiszta formában állítjuk elő. A polipeptidek előnyösen legalább körülbelül 80%-ban tiszták, előnyösebben legalább körülbelül 90%-ban tiszták, és legelőnyösebben legalább körülbelül 99%-ban tiszták. Bizonyos előnyben részesített megvalósítási módok szerint, amiket az alábbiakban részletesen ismertetünk, a lényegében tiszta polipeptideket gyógyászati készítményekbe vagy vakcinákba visszük be, amiket egy vagy több, az alábbiakban ismertetett módszerekben alkalmazunk.
Az egyik megvalósítási mód szerint a jelen találmány tárgyát olyan polipeptidek képezik, amik egy Mycobacterium tubercu/osis antigénnek egy immunogén részét (vagy egy ilyen antigénnek egy variánsát) tartalmazzák, aminek az aminosavszekvenciája a 109. számú szekvencia, valamint ennek variánsai.
A jelen találmány szerinti Mycobacterium tuberculosis antigének közé tartoznak olyan variánsok, amiket olyan DNS-szekvenciák kódolnak, amik lényegében homológok egy vagy több, az előzőkben ismertetett DNSszekvenciával. A „lényeges homológja szakkifejezés a továbbiakban olyan DNS-szekvenciákra vonatkozik, amik képesek közepesen szigorú körülmények között hibridizálódni. A használható közepesen szigorú körülmények közé tartozik az előmosós 5XSSC, 0,5% SDS, 1,0 mmol/l EDTA (pH=8,0) összetételű oldatban; hibridizálás 50-65 °C-on, 5*SSC-ben, éjszakán át, vagy a fajok közötti homológia esetében 45 °C-on, 0,5*SSC-ben; ezt követi két mosás 65 °C-on 20-20 percig, 0,1% SDS-t tartalmazó 2*, 0,5* és 0,2><SSC-vel. Az ilyen hibridizálódó szekvenciák szintén a jelen találmány oltalmi körébe tartoznak, mivel vannak olyan nukleotidszekvenciák, amik a kód degenerációja következtében olyan immunogén polipeptidet kódolnak, amit egy hibridizálódó DNS-szekvencia kódol.
A jelen találmány tárgyát képezik tovább fúziós fehérjék, amik egy első és egy második, találmány szerinti polipeptidet tartalmaznak, vagy egy másik változat szerint egy, a jelen találmány szerinti polipeptidet és egy ismert Mycobacterium tuberculosis antigént, azaz például az Andersen és Hansen által leírt 38 kDa-os antigént [Andersen és Hansen: Infection and Immunity 57, 2481-2488 (1989)], Genbank letéti száma M30046, vagy a Mycobacterium bovis-bart és Mycobacterium tuberculosis-ban korábban azonosított ESAT6-ot (letéti szám U34848) [Sorensen és munkatársai: Infection and Immunity 63, 1710-1717 (1995)]. Az ilyen fúziós fehérjék variánsai is a találmány tárgyát képezik. A jelen találmány szerinti fúziós fehérjék közé tartozik egy linker peptid, az első és a második polipeptid között.
A jelen találmány szerinti fúziós fehérjét kódoló DNS-szekvenciát ismert rekombináns DNS technikákkal állítjuk elő, amikkel a különböző, az első és a második polipeptidet kódoló DNS-szekvenciákat egy megfelelő expressziós vektorba visszük. Az első polipeptidet kódoló DNS-szekvencia 3’-végét, egy linker peptiden keresztül vagy anélkül, a második polipeptidet kódoló DNS-szekvencia 5’-végéhez kapcsoljuk, oly módon, hogy a szekvenciák leolvasási keretei fázisban legyenek, ami lehetővé teszi, hogy a két DNS-ről készült mRNS-ről egyetlen fúziós fehérje keletkezzen, ami megtartja mind az első, mind a második polipeptid biológiai aktivitását.
Egy peptid linker szekvenciát alkalmazhatunk, hogy az első és a második polipeptidet egy megfelelő távolsággal elválasszuk, ami biztosítja, hogy mindegyik peptid felvegye a szekunder és tercier struktúráját. Egy ilyen peptid linker szekvenciát a szakterületen ismert standard technikákkal illesztünk be a fúziós fehérjébe. A megfelelő peptid linker szekvenciákat az alábbi faktorok alapján lehet kiválasztani: (1) azon képességük
HU 226 520 Β1 alapján, hogy képesek-e felvenni egy flexibilis kiterjesztett konformációt; (2) arra való képtelenségük alapján, hogy olyan szekunder struktúrát vegyenek fel, ami képes kölcsönhatásba lépni az első és második polipeptiden levő funkcionális epitopokkal; és (3) a hidrofób vagy töltött csoportok hiánya, ami reagálhat a polipeptid funkcionális epitopjaival. Az előnyben részesített peptid linker szekvenciák tartalmaznak Gly, Asn és Ser csoportokat. Más, közel semleges aminosavak, azaz például a Thr és az Alá is használható a linker szekvenciában. A linkerként használható aminosavszekvenciák közé tartoznak azok, amiket a szakirodalomban ismertettek [Maratea és munkatársai: Gene 40, 3946 (1985); Murphy és munkatársai: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 83, 8258-8262 (1986); 4,935,233 és 4,751,180 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi leírás]. A linker szekvencia hossza 1 és 50 aminosav között lehet. A peptidszekvenciákra nincs szükség, ha az első és a második polipeptid nem esszenciális N-terminális aminosavrégiókat, amiket arra lehet használni, hogy elválasszák a funkcionális doméneket, és megakadályozza a térbeli gátlásokat.
A ligáit DNS-szekvenciákat működés szempontjából megfelelő transzkripciós vagy transzlációs szabályozószekvenciákhoz kapcsoljuk. A DNS expressziójáért felelős szabályozóelemek az első polipeptideket kódoló DNS-szekvenciának csak az 5'-végén találhatók. Hasonlóképpen, a transzláció leállításához szükséges stopkodonok és a transzkripciós terminációs szignálok csak a második polipeptidet kódoló DNSszekvencia után, 3’-pozícióban találhatók.
Egy másik megvalósítási mód szerint a jelen találmány tárgya az előzőkben említett polipeptidek vagy fúziós fehérjék (vagy az ilyen polipeptideket kódoló DNS-molekulák) alkalmazása egy páciensben a tuberkulózis ellen védőimmunitás indukálására alkalmas gyógyszerkészítmény előállítására. A továbbiakban a „páciens” szakkifejezés jelentése lehet bármilyen meleg vérű állat, előnyösen egy ember. Egy pácienst érinthet egy betegség, vagy mentes lehet a kimutatható betegségtől és/vagy fertőzéstől. Más szóval, védőimmunitás indukálható a tuberkulózis megelőzésére vagy kezelésére.
Ebben a megvalósítási módban a polipeptid, a fúziós fehérje vagy a DNS-molekula általában egy gyógyászati készítményben és/vagy egy vakcinában található. A gyógyászati készítmények tartalmazhatnak egy vagy több polipeptidet, amik az előzőkben említett szekvenciákból (vagy ezek variánsaiból) tartalmazhatnak egyet vagy többet, valamint tartalmazhatnak egy gyógyászatilag elfogadható hordozót. A vakcinák tartalmazhatnak a fenti polipeptidekből egyet vagy többet, valamint tartalmazhatnak egy aspecifikus immunválasz-fokozót, azaz például egy adjuvánst vagy egy liposzómát (amibe a polipeptidet tesszük). Az ilyen gyógyászati készítmények és vakcinák tartalmazhatnak más Mycobacteríum tuberculosis antigéneket, akár egy kombinációs polipeptidbe beépítve, akár egy külön polipeptidben.
Egy másik változat szerint egy vakcina tartalmazhat egy DNS-t, ami az előzőkben említett polipeptidek közül egyet vagy többet tartalmazhat, oly módon, hogy a polipeptid in situ keletkezik. Ilyen vakcinákban a DNS a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert különböző bejuttatórendszerekben lehet jelen, beleértve a nukleinsav expressziós rendszereket, bakteriális és virális expressziós rendszereket. A bakteriális bejuttatórendszerek közé tartozik egy baktérium (azaz például a Bacillus Calmette-Guerin), ami a polipeptidnek egy immunogén részét expresszálja a felszínén. Egy előnyös megvalósítási mód szerint a DNS-t egy virális expressziós rendszer (azaz például vakcinia vagy más himlővírus, retrovírus vagy adenovírus) alkalmazásával juttathatjuk be, ami magában foglalja egy apatogén (detektív), de replikációra képes vírus használatát. A szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára a DNS-nek egy ilyen expressziós rendszerbe való beépítéséhez szükséges technikák jól ismertek. A DNS lehet „pucér” is, amint azt a szakirodalomban már leírták [Cohen: Science 259, 1691-1692 (1993)]. A pucér DNS felvételét fokozhatjuk, ha a DNS-sel biológiailag lebontható gyöngyöket borítunk be, amik hatékonyan bejuttathatok a sejtekbe.
Egy másik megvalósítási módban egy előzőkben ismertetett DNS-vakcinát beadhatunk egy időben vagy egymás után egy, a jelen találmány szerinti polipeptiddel, vagy egy ismert Mycobacteríum tuberculosis antigénnel, azaz például az előzőkben ismertetett 38 kDa-os antigénnel. Például egy, a jelen találmány szerinti polipeptidet kódoló DNS beadását, akár „pucér formában, akár egy, az előzőkben ismertetett bejuttatórendszerben, egy antigén beadása követheti, azzal a céllal, hogy fokozzuk a vakcina védő immunhatását.
A beadás módjai és gyakorisága, valamint a dózis egyénenként változik, és párhuzamos lehet azokkal, amiket jelenleg alkalmaznak a BCG-vel végzett immunizáláshoz. A gyógyászati készítményeket és a vakcinákat általában beadhatjuk injekcióban (azaz például intrakután, intramuszkuláris, intravénás vagy szubkután injekcióban), intranazálisan (azaz például belégzéssel) vagy orálisan. 13 dózist adhatunk be egy 1-36 hetes periódusban. Előnyösen 3 dózist alkalmazunk, 3-4 hónapos intervallumokban, és ezután periodikusan erősítő injekciókat adhatunk be. Az egyes páciensekhez eltérő protokollokat használhatunk. A megfelelő dózis egy olyan mennyiségű polipeptid vagy DNS, amit ha az előzőkben ismertetett módon beadunk, akkor képes akkora immunválaszt kiváltani egy immunizált betegben, ami a pácienst 12 évig megvédi a Mycobacteríum tuberculosis fertőzéstől. Az egy dózisban levő (vagy a dózisban levő DNS-ről in situ keletkező) polipeptid mennyisége általában körülbelül 1 pg és körülbelül 100 mg között változik (a gazdaszervezet testsúly-kg-jára számítva), tipikus esetben körülbelül 10 pg és körülbelül 1 mg között, előnyösen pedig körülbelül 100 pg és körülbelül 1 pg között. A megfelelő dózisméretek változnak a beteg méretétől függően, de általában körülbelül 0,15 ml között változnak.
HU 226 520 Β1
Miközben bármilyen, a szakterületen átlagos jártassággal rendelkező szakember számára ismert hordozó használható a jelen találmány szerinti gyógyászati készítményben, a hordozó típusa a beadás módjától függően változik. A parenterális beadáshoz, azaz például a szubkután injekcióhoz a hordozó előnyösen lehet víz, sóoldat, alkohol, lipidek, viasz vagy egy puffer. Az orális beadáshoz az előzőkben említett hordozók, vagy egy szilárd hordozó, azaz például mannit, laktóz, keményítő, magnézium-sztearát, nátrium-szacharinát, talkum, cellulóz, glükóz, szacharóz és magnézium-karbonát is használható. A biológiailag lebomló mikrogömbök (azaz például politejsavgalaktid) is használhatók a jelen találmány szerinti gyógyászati készítmények hordozójaként. A megfelelő, biológiailag lebomló mikrogömböket a 4,897,268 és 5,075,109 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi leírásban ismertetik.
A számos különböző adjuváns közül bármelyik használható a jelen találmány szerinti vakcinákban, hogy aspecifikusan fokozzák az immunválaszt. A legtöbb adjuváns egy olyan anyagot tartalmaz, amit úgy terveztek meg, hogy megvédje az antigént a gyors katabolizmustól, azaz például alumínium-hidroxidot vagy ásványi olajat, valamint az immunválasz egy aspecifikus serkentőjét, azaz például lipid A-t, Bordetella pertussis-t vagy Mycobacterium tuberculosis-t. Az alkalmas adjuvánsok kereskedelmi forgalomban vannak, mint például a Freund-féle inkomplett adjuváns és a Freund-féle komplett adjuváns (Difco Laboratories) és a Merck Adjuvant 65 (Merck and Company, Inc., Rahway, NJ). Más megfelelő adjuváns például az alum, a biológiailag lebomló mikrogömbök, a monofoszforil lipid A és a quil A.
A jelen találmány egy másik megvalósítási módja szerint a jelen találmány tárgyát egy vagy több, az előzőkben ismertetett polipeptid alkalmazása képezi a tuberkulózis diagnosztizálására, egy bőrtesztet alkalmazva. A továbbiakban a „börteszt szakkifejezés alatt egy olyan vizsgálatot értünk, amit közvetlenül egy olyan páciensen végzünk el, akiben egy késleltetett típusú hiperszenzitivitási (DTH) reakciót (azaz például duzzadás, vörösödés vagy dermatitis) mérünk egy vagy több, az előzőkben ismertetett polipeptid intradermális injekciózásával. Az ilyen injekciót bármilyen megfelelő berendezéssel beadhatjuk, ami alkalmas ama, hogy a polipeptidet vagy polipeptideket érintkezésbe hozzuk a beteg bőrsejtjeivel; ilyen berendezés lehet egy tuberkulinfecskendő vagy 1 ml-es fecskendő. A reakciót előnyösen legalább 48 órával az injekciózás után mérjük, előnyösebben 48-72 órával később.
A DTH reakció egy sejtek által közvetített immunválasz, ami nagyobb azokban a betegekben, akik korábban érintkezésbe kerültek a vizsgált antigénnel (azaz például a használt polipeptid immunogén része, vagy annak egy variánsa). A választ mérhetjük vizuálisan, egy vonalzóval. Általában ha a válasz nagyobb, mint körülbelül 0,5 cm átmérőjű, előnyösen nagyobb, mint körülbelül 1,0 cm átmérőjű, akkor ez egy pozitív válasz, ami tuberkulózis fertőzésre utalhat, ami vagy megnyilvánul aktív betegség formájában, vagy nem.
A jelen találmány szerinti polipeptidek egy bőrtesztben való felhasználáshoz általában formulázva vannak, olyan gyógyászati készítményekként, amik egy polipeptidet és fiziológiásán elfogadható hordozót tartalmaznak, az előzőkben ismertetett módon. Az ilyen készítmények tipikus esetben egy vagy több polipeptidet tartalmaznak, amiknek a mennyisége körülbelül 1 g-100 g között változik, előnyösen körülbelül 10 g-50 g között, 0,1 ml térfogatban. Az ilyen gyógyászati készítményekben alkalmazott hordozó előnyösen egy sóoldat, ami megfelelő konzerválószereket, azaz például fenolt és/vagy Tween 80™-at tartalmaz.
Egy előnyös megvalósítási mód szerint egy bőrtesztben alkalmazott polipeptid mérete akkora, hogy az injekció helyén marad a reakció ideje alatt. Általában egy legalább 9 aminosavból álló polipeptid elegendő. A polipeptideket előnyösen a makrofágok lebontják, órákkal az injekciózás után, ezzel lehetővé teszik a T-sejteknek való bemutatást. Az ilyen polipeptidek a fenti szekvenciák, és/vagy más immunogén vagy nem immunogén szekvenciáik egy vagy több ismétlődését tartalmazzák.
Az alábbi példákat illusztrálás céljából adjuk meg, és nem célunk a találmány oltalmi körének korlátozása.
1. példa
A Mycobacterium tuberculosis polipeptidek tisztítása és jellemzése, humán PBMC-ből készített CD4+ T-sejtvonalak felhasználásával
A jelen találmány szerinti Mycobacterium tuberculosis antigéneket Mycobacterium tuberculosis H37Rv és Erdman törzsekből készített cDNS-könyvtárak expressziós klónozásával izoláljuk, lényegében Sanderson és munkatársai publikációja alapján [Sanderson és munkatársai: J. Exp. Med. 182, 1751-1757 (1995)], és kimutattuk róla, hogy indukálja a PBMC szaporodását és az interferon-y-t egy immunreaktív T-sejtvonalban.
Két, DC4 és DC5 jelöléssel ellátott CD4+ T-sejtvonalat készítünk Mycobacterium tuberculosis-sza\ fertőzött dendrites sejtek ellen. Specifikusan, a dendrites sejteket egyetlen donorból származó, tapadó PBMCből készítjük, majd ezt követően Mycobacterium tuberculosis-sza\ fertőzzük. Az ugyanebből a donorból származó limfocitákat korlátozott határhígítási körülmények között együtt tenyésztjük a fertőzött dendrites sejtekkel, hogy a DC4 és DC5 jelű CD4+ T-sejtvonalakat előállítsuk. Ezekről a sejtekről kimutatjuk, hogy reagálnak Mycobacterium tuberculosis-bó\ származó nyers, oldható fehérjékkel, de nem reagálnak Tb381-gyel. A korlátozott határhígítási körülményeket azért alkalmazzuk, hogy egy harmadik CD4+ T-sejtvonalat kapjunk (ennek jele DC6), amiről kimutattuk, hogy reagál mind az oldható fehérjékkel és a Tb381-gyel.
A genomiális DNS-t Mycobacterium tuberculosis H37Rv és Erdman törzsekből izoláljuk, és arra használjuk, hogy expressziós könyvtárakat készítsünk a pBSK() vektorban, a Lambda ZAP expressziós rendszer felhasználásával (Stratagene, La Jolla, CA). Ezeket a könyvtárakat Escherichia coli-ba transzformáljuk, majd az indukált Escherichia coli tenyészeteket dendri8
HU 226 520 Β1 tes sejtekkel inkubáljuk, majd a kapott inkubált dendrites sejteknek azt a képességét, hogy serkentik a sejtszaporodást és az interferon-y-termelést a DC6 jelű CD4+ T-sejtvonalban, az alábbiakban, a 2. példában ismertetett módon vizsgáljuk. A pozitív poolokat frakcionáljuk és újra vizsgáljuk, ameddig tiszta Mycobacterium tuberculosis kiónokat kapunk. Tizenkilenc kiónt izoláltunk, ami közül kilencről derült ki, hogy tartalmazza a korábban azonosított TbH9 és Tb381 Mycobacterium tuberculosis antigéneket, amiket a 08/533,634 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi bejelentésben ismertetnek. A többi tíz klón (jelzésük Tb224, Tb636, Tb424, Tb436, Tb398, Tb508, Tb441, Tb475, Tb488 és Tb465) meghatározott cDNS-szekvenciáját a 110. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. A Tb224nek és a Tb636-nak megfelelő, megjósolt aminosavszekvenciákat a 13. és 14. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. Ennek a két antigénnek a nyitott leolvasási kereteiről kiderült, hogy bizonyos homológiát mutatnak az előzőkben ismertetett TbH9-cel. A Tb224-ről és a Tb636-ról kiderült, hogy egymással átlapoló kiónok.
A Tb424, Tb436, Tb398, Tb508, Tb441, Tb475, Tb488 és Tb465 klónokról kiderült, hogy mindegyik tartalmaz két kis, nyitott leolvasási keretet (jelzésük ORF1 és ORF2), vagy ezek csonkított formáját, azzal, hogy mind az ORF1-ben, mind az ORF2-ben találhatók minor variációk. A Tb424, Tb436, Tb398, Tb508, Tb441, Tb475, Tb488 és Tb465 ORF1 és ORF2 nyitott leolvasási keretének megjósolt aminosavszekvenciáját a 16. és 17., a 18. és 19., a 20. és 21., a 22. és 23., a 24. és 25., a 26. és 27., a 28. és 29, valamint a 30. és 31. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. Emellett a Tb424 és Tb436 kiónokról kiderült, hogy tartalmaznak egy harmadik, látszólagos nyitott leolvasási keretet, aminek ORF-U a jelzése. A TB424-ben és a Tb436-ban levő ORF-U megjósolt aminosavszekvenciáját a 32. és 33. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. A Tb424-ről és a Tb436-ról kiderült, hogy vagy egymással átlapoló kiónok, vagy nemrég duplikálódott/transzponálódott kópiák, ugyanúgy, mint a Tb475 és a Tb488.
Ezeket a szekvenciákat hasonlítjuk össze a génbankban levő ismert szekvenciákkal, a BLASTN rendszer alkalmazásával. A Tb224 és Tb431 antigénekkel homológ szekvenciákat nem találtunk. A Tb636-ról kiderült, hogy 100%-ban azonos egy korábban Mycobacterium tuberculosis-bao azonosított kozmiddal. Hasonlóképpen, a Tb508, Tb488, Tb398, Tb424, Tb436, Tb441, Tb465 és Tb475 klónokról kiderült, hogy homológiát mutatnak ismert Mycobacterium tuberculosis kozmidokkal. Emellett a Tb488 kiónról kiderült, hogy 100%-os homológiát mutat a Mycobacterium tuberculosis topoizomeráz l-gyel.
Az ORF1 nyitott leolvasási keret tizenhét átlapoló peptidjét (jelölésük 11-117; 34-50. számú szekvenciák), és az ORF2 nyitott leolvasási keret harminc átlapoló peptidjét (jelölésük 21-230; 51-80. számú szekvenciák) az alábbi, 3. példában ismertetett eljárással szintetizáljuk meg.
A szintetikus peptideknek, valamint a rekombináns ORF1-nek és ORF2-nek azt a képességét, hogy serkentik a T-sejtek szaporodását és az interferon-γ termelődését PPD-pozitív donorokból származó PBMCben, az alábbi, 2. példában ismertetett módon vizsgáljuk. Az 1AB. és 2AB. ábra illusztrálja a T-sejt szaporodását és az interferon-γ serkentését a rekombináns ORF2-vel és a 21-216 szintetikus peptidekkel, két donor esetében (ezek jelzése D7 és D160). A rekombináns ORF2 (a továbbiakban MTI-nek jelöljük) mindkét donorból származó PBMC-ben serkenti a T-sejt szaporodását és az interferon-γ termelődését. Az egyes szintetikus peptidekkel megfigyelhető PBMC-serkentés mennyisége változik az egyes donoroknál, jelezve, hogy mindegyik donor más epitopot ismer fel az ORF2-n. Az ORF1, az ORF2 és az ORF-U által kódolt fehérjéket ezután MTS, MTI és MSF néven említjük.
Az MSF szekvencia tizennyolc átlapoló peptidjét (jelölésük MSF-1 MSF-18; 84-101. számú szekvenciák) megszintetizáltuk, és az alábbiakban ismertetett módon vizsgáltuk azt a tulajdonságukat, hogy miképpen serkentik a T-sejtek szaporodását és az interferon-γ termelődését egy Mycobacterium tuberculosis tenyészet szűrlete ellen készített CD4+ T-sejtvonalban. Az MSF-12 és MSF-13 peptidekről (95. és 96. számú szekvencia) kiderült, hogy ezek rendelkeznek a legmagasabb reakcióképességgel. A Tb224 nyitott leolvasási keretének két átlapoló peptidjét (81. és 82. számú szekvencia) megszintetizáltuk, és kimutattuk, hogy indukálják a T-sejtek szaporodását, valamint az interferon-γ termelődését PPD-pozitív donorokból származó PBMC-ben.
Különböző donorokból származó két CD4+ T-sejtvonalat készítünk Mycobacterium tuberculosis-szaí fertőzött dendrites sejtek ellen, az előzőkben ismertetett módszer alkalmazásával. Az előzőkben ismertetett Mycobacterium tuberculosis cDNS expressziós könyvtárnak ezzel a sejtvonallal való átvizsgálásával két kiónt kaptunk, ezek jelzése Tb867 és Tb391. A Tb867 meghatározott cDNS-szekvenciájáról (102. számú szekvencia) kiderült, hogy azonos a korábban izolált Mycobacterium tuberculosis SCY22G10 kozmiddal, ahol is a reaktív nyitott leolvasási keret jelölt egy 750 aminosavból álló Mycobacterium tuberculosis fehérjekinázt kódol. A Tb391 meghatározott cDNS-szekvenciájának (103. számú szekvencia) a génbankban levő többi szekvenciával való összehasonlításából kiderült, hogy az ismert szekvenciákkal nem mutat jelentős homológiát.
A további vizsgálatokban CD4+ T-sejtvonalakat készítettünk Mycobacterium tuberculosis tenyészet szűrlet ellen, lényegében az előzőkben ismertetett módon, és arra használtuk, hogy a Mycobacterium tuberculosis Erdman cDNS expressziós könyvtárat az előzőkben ismertetett módon átvizsgáljuk, öt reakcióképes kiónt izoláltunk, jelzésük Tb431, Tb472, Tb470, Tb838 és Tb962. A Tb431, Tb472, Tb470 és Tb838 kiónok meghatározott cDNS-szekvenciáját a 11., 12., 104. és 105. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be, míg a Tb962 klón meghatározott cDNS-szekvenciáját a 106. és 107. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. A Tb431 megfelelő, megjósolt aminosavszekvenciáját a 15. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be.
HU 226 520 Β1
Az ezt követő vizsgálatok vezettek a Tb472 teljes hosszúságú cDNS-szekvenciájának az izolálásához (108. számú szekvencia). Átlapoló peptideket szintetizálunk, és használjuk a reakcióképes nyitott leolvasási keret azonosítására. A Tb472 klón által kódolt fehérje (jelzése MSL) megjósolt aminosavszekvenciáját a 109. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. A Tb472 és az MSL szekvenciáit a génbankban levő szekvenciákkal az előzőkben ismertetett módon összehasonlítva nem találtunk homológiát az ismert szekvenciákkal. Az MSL szekvenciájának tizenöt átlapoló peptidjét (jelzésük MSL-1 MSL-15; 110-124. számú szekvenciák) megszintetizáltuk, és azt a képességüket, hogy serkentik a T-sejtek szaporodását és az interferon-γ termelődését a Mycobacteríum tuberculosis tenyészet szűrlete ellen készített CD4+ T-sejtvonalban, az alábbiakban ismertetett módon vizsgáltuk meg. Az MSL-10 (119. számú szekvencia) és az MSL-11 (120. számú szekvencia) jelű peptidekről kiderült, hogy ezeknek a legmagasabb a reakcióképességük.
A Tb838 meghatározott cDNS-szekvenciáját a génbank szekvenciáival összehasonlítva kiderült, hogy azonos a korábban izolált Mycobacteríum tuberculosis SCY07H7 kozmidéval. A Tb962 klón meghatározott cDNS-szekvenciáját a génbankban levő szekvenciákkal összehasonlítva homológiát találtunk két korábban azonosított Mycobacteríum tuberculosis kozmid szekvenciájával, amik közül az egyik baktoferritint kódol. A rekombináns baktoferritin azonban nem bizonyult reakcióképesnek a Tb962 izolálásához használt T-sejtvonallal.
Az előzőkben ismertetett Tb470 kiónt használjuk a teljes hosszúságú nyitott leolvasási keret (125. számú szekvencia) kinyerésére, ami homológiát mutat a TbH9-cel, és kiderült róla, hogy egy Mtb40 jelzésű, 40 kDa méretű antigént kódol. Az Mtb40 meghatározott aminosavszekvenciáját a 126. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. Hasonlóképpen, az ezt követő vizsgálatok vezettek a Tb431 teljes hosszúságú cDNSszekvenciájának az izolálásához, amit a 83. számú szekvenciavázlaton adunk meg, és amiről kiderítettük, hogy egy, az Mtb40-et kódoló nyitott leolvasási keretet tartalmaz. A Tb470-ről és a Tb431-ről az is kiderült, hogy tartalmaz egy UORF-szerű antigént kódoló, potenciális nyitott leolvasási keretet.
Egy Mycobacteríum tuberculosis Erdman cDNS expressziós könyvtárnak Mycobacteríum tuberculosis tenyészet szűrlete ellen készített többszörös CD4+ T-sejtvonallal való átvizsgálása eredményezte három kiónnak, jelzésük Tb366, Tb433 és Tb439, az izolálását. A Tb366, a Tb433 és a Tb439 meghatározott cDNS-szekvenciáját a 127., 128. és 129. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. Ezeknek a szekvenciáknak a génbankban levő szekvenciákkal való összehasonlításából kiderült, hogy nincs a Tb366-tal szignifikáns homológia. A Tb433-ról kiderült, hogy mutat valamennyi homológiát a korábban azonosított MPT83 Mycobacteríum tuberculosis antigénnel. A Tb439-ről kiderült, hogy 100%-os homológiát mutat a korábban izolált Mycobacteríum tuberculosis SCY02B10 kozmiddal.
Mycobacteríum tuberculosis PPD ellen egy CD4+ T-sejtvonalat készítettünk, lényegében az előzőkben ismertetett módon, majd arra használtuk, hogy átvizsgáljuk az előzőkben említett Mycobacteríum tuberculosis Erdman cDNS expressziós könyvtárat. Egy reakcióképes kiónt izoláltunk (jelzése Tb372), és a meghatározott cDNS-szekvenciát a 130. és 131. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. Ezeknek a szekvenciáknak a génbankban levő szekvenciákkal való összehasonlításával nem találtunk szignifikáns homológiát.
A további vizsgálatokban egy Mycobacteríum tuberculosis cDNS expressziós könyvtárnak 8 napja tuberkulózissal fertőzött dendritikus sejtek ellen készített CD4+ T-sejtvonallal az előzőkben ismertetett módon való átvizsgálása két klón izolálását eredményezte, ezek jelzése: Tb390R5C6 és Tb390R2C11. A Tb390R5C6 meghatározott cDNS-szekvenciáját a 132. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be, és a Tb390R2C11 meghatározott cDNS-szekvenciáját a 133. és 134. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. A Tb390R5C6-ról kiderült, hogy 100%-os azonosságot mutat egy korábban izolált Mycobacteríum tuberculosis kozmiddal.
Az ezt követő vizsgálatokban a fent ismertetett módszert használtuk egy, az alábbiak szerint készített Mycobacteríum tuberculosis genomiális DNS könyvtár átvizsgálására. A Mycobacteríum tuberculosis Erdman törzsből származó genomiális DNS-t véletlenszerűen mechanikailag eltörtük, körülbelül 2 kilobázis méretre, majd Klenow-polimerázzal tompa végűre alakítottuk, utána pedig EcoRI adaptereket adtunk hozzá. Az inszertet ezután yScreen fágvektorba (Novagen, Madison, Wl) ligáltuk, majd in vitro pakoltuk, a PhageMaker extraktum (Novagen) alkalmazásával. A fágkönyvtárat (a továbbiakban Érd yScreen könyvtár néven említjük) amplifikáljuk, majd egy részét egy plazmid expressziós könyvtárrá alakítjuk, egy autoszubklónozási mechanizmus alkalmazásával az Escherichia coli BM25.8 törzs (Novagen) felhasználásával. A pSCREEN rekombinánsokat tartalmazó BM25.8 tenyészetekből tisztított plazmid-DNS-t használjuk az expresszáló BL21(DE3)pLys gazdatörzs kompetens sejtjeinek a transzformálására. A transzformált sejtekből aliquot részeket teszünk 96 lyukas mikrotiterlemezekre, amikben mindegyik lyuk egy körülbelül 50 telep méretű poolt tartalmaz. A 96 lyukas plazmid könyvtár formájú lemezek lenyomatait izopropil-tiogalaktopiranoziddal indukáljuk, hogy beinduljon a rekombináns fehérje expressziója. Az indukciót követően a lemezeket centrifugáljuk az Escherichia coli ülepítésére, amit azután közvetlenül egy PPD-pozitív donorból (160-as donor) készített CD4+ T-sejtvonal T-sejt expressziós klónozására használunk. A Mycobacteríum tuberculosis T-sejt-antigéneket expresszáló Escherichia coli-t tartalmazó poolokat azután egyedi telepekre választjuk szét, és az előzővel azonos módon újból átvizsgáljuk, hogy azonosítsuk a pozitív találatokat.
A 160-as donorból származó T-sejtvonalnak az Érd yScreen könyvtárból egy 96 lyukas lemeznyi mennyiséggel való átvizsgálás kilenc pozitív találatot kapunk. Az előzőkben ismertetett pBSK könyvtáron a 160-as do10
HU 226 520 Β1 norból származó T-sejtekkel végzett korábbi kísérletek azt sugallják, hogy az összes, vagy a legtöbb pozitív klón TbH-9, Tb38-1 vagy MTI (amit a 08/533,634 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi bejelentésben ismertettek), vagy ezek variánsai. Azonban a Southern-blot-elemzés kiderítette, hogy csak három lyuk hibridizál a TbG-9, Tb38-1 és MTI kevert próbájával. A többi hat pozitív lyuk közül kettőről kiderült, hogy azonosak (ezek jelzése Y1-26C1 és Y1-86C11), ezeknek a szekvenciáját a 135. és 136. számú szekvenciavázlaton adjuk meg. Az izolált klón teljes hosszúságú cDNSszekvenciáját (jelzése hTcc#) a 137. számú szekvenciavázlaton adjuk meg, és az ennek megfelelő, megjósolt aminosavszekvenciát a 138. számú szekvenciavázlaton adjuk meg. A hTcc# szekvenciákat a génbankban levő szekvenciákkal az előzőkben ismertetett módon összehasonlítva kiderült, hogy van bizonyos homológia a korábban izolált Mycobacteríum tuberculosis MTCY07H7B.06 kozmiddal.
2. példa
A T-sejtek szaporodásának és az interferon^ termelésnek az indukciói a Mycobacteríum tuberculosis antigénekkel
A rekombináns Mycobacteríum tuberculosis antigéneknek azt a tulajdonságát, hogy a T-sejtek szaporodását és az interferon-γ termelését indukálják, az alábbiak szerint lehet meghatározni.
A fehérjéket IPTG-vel indukáljuk, majd gélből eluálva tisztítjuk, Skeiky és munkatársai publikációjának megfelelően [Skeiky és munkatársai: J. Exp. Med. 181, 1527-1537 (1995)]. A tisztított polipeptideket azután átvizsgáljuk, hogy képesek-e a T-sejtek szaporodását indukálni a PBMC-készítményekben. Azokat a PBMCket, amik olyan donorokból származnak, akikről tudott, hogy PPD bőrteszt pozitívak, és akiknek a T-sejtjeiről ismert, hogy a PPD-re adott válaszként szaporodnak, 10% poolozott humán szérumot és 50 pg/ml gentamicint tartalmazó RPMI 1640 táptalajban tenyésztjük. A tisztított polipeptideket azután két párhuzamosban adjuk hozzá, 0,5-10 pg/ml koncentrációkban. Miután a sejteket hat napig 96 lyukas, kerek fenekű lemezekben 200 μΙ térfogatban tenyésztettük, a közegből 50 μΙ-t eltávolítunk mindegyik lyukból, az interferon-y-szinteknek az előzőkben ismertetett módon való meghatározásához. A lemezeket azután további 18 óra hosszat 1 pCi/lyuk tríciált timidinnel impulzusjelezzük, összegyűjtjük, majd a felvett trícium mennyiségét gázszcintillációs számlálóval határozzuk meg. Azokat a frakciókat, amik mindkét párhuzamosban háromszor akkora szaporodást okoznak, mint a csak a táptalajt tartalmazó sejtek esetében megfigyelt szaporodás, pozitívnak tekintjük.
Az interferon-y-t enzimhez kötött immunszorbens vizsgálattal (ELISA) mérjük. Az ELISA lemezeket humán interferon-γ ellen készített monoklonális ellenanyaggal (PharMingen, San Diego, CA) borítjuk PBSben, négy óra hosszat szobahőmérsékleten. A lyukakat azután 5 tömeg/térfogat% zsírmentes szárított tejjel kiegészített PBS-sel blokkoljuk, 1 óra hosszat, szobahőmérsékleten. A lemezeket hatszor mossuk PBS/0,2% TWEEN-20 összetételű oldattal, majd az ELISA lemezeken levő, 1:2 arányban hígított mintákat éjszakán át szobahőmérsékleten inkubáljuk. A lemezeket ismét mossuk, és poliklonális nyúl antihumán interferon-γ szérumot adunk minden egyes lyukhoz, amit 1:3000 arányban hígítottunk PBS/10% normál kecskeszérumoldattal. A lemezeket azután két óra hosszat szobahőmérsékleten inkubáljuk, mossuk, majd tormaperoxidázhoz kapcsolt antinyúl IgG-t (Sigma Chemical So., St. Louis, MO) adunk hozzá, 1:2000 arányban hígítva PBS/5% zsírmentes szárított tej összetételű oldattal. További kétórás, szobahőmérsékleten végzett inkubálás után a lemezeket mossuk és TMB szubsztrátot adunk hozzá. A reakciót 20 perc elteltével 0,5 mol/l koncentrációjú kénsavval állítjuk le. Az optikai sűrűséget 450 nm-en határozzuk meg, referenciaként 570 nm-es hullámhosszú fényt használva. Azokat a frakciókat tekintjük pozitívnak, amik mindkét párhuzamosban kétszer nagyobb OD-értéket adnak, mint a csak táptalajban tenyésztett sejtek OD-értékének átlaga plusz 3 standard deviáció.
3. példa
A Mycobacteríum tuberculosis polipeptidek tisztítása és jellemzése, egy egér Mycobacteríum tuberculosis modellből generált CD4+
T-sejtvonalak felhasználásával
A C57BL/6 egerek Mycobacteríum tuberculosisszal való fertőzése a progresszív betegség kifejlődését eredményezi, körülbelül 2-3 héten belül. A betegség előrehaladása azután leáll, egy erős védő T-sejtek által közvetített immunválasz kialakulása miatt. Ezt a fertőzési modellt használtuk olyan T-sejtvonalak generálására, amik képesek felismerni a védő Mycobacteríum tuberculosis antigéneket.
Pontosabban, a lépsejteket 28 napja Mycobacteríum tuberculosis-sza\ fertőzött C57BL/6 egerekből kapjuk, és arra használjuk, hogy specifikus, az előzőkben ismertetett anti-Mycobacteríum tuberculosis T-sejtvonalakat kapjunk. A kapott CD4+ T-sejtvonalakat a C57BL/6 egerekből kapott normális, antigénbemutató (lép)sejtekkel kombinálva arra használjuk, hogy az előzőkben ismertetett módon átvizsgáljuk a Mycobacteríum tuberculosis Érd yScreen könyvtárat. A reakcióképes könyvtár poolok közül az egyiket, amiről kiderült, hogy erősen serkenti a T-sejteket, kiválasztjuk, majd a megfelelő aktív kiónt (ennek jelzése Y288C10) izoláljuk.
Az Y288C10 klón szekvenálásából kiderült, hogy egymás után tartalmaz két potenciális gént. Ennek a két génnek a meghatározott cDNS-szekvenciáját Qelzésük mTCC#1 és mTCC#2) a 139. és 140. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be, és az ezeknek megfelelő, megjósolt aminosavszekvenciát a 141. és 142. számú szekvenciavázlaton mutatjuk be. Ezeknek a szekvenciáknak a génbankban levő szekvenciákkal való összehasonlításából kiderült, hogy van azonosság korábban Mycobacteríum tuberculosis MTY21C12 kozmidban megtalált, ismeretlen szekvenciákkal. Az mTCC#1 és az mTCC#2 megjósolt aminosavszekven11
HU 226 520 Β1 ciáiról kiderült, hogy bizonyos homológiát mutatnak a TbH9 fehérjecsalád korábban azonosított, az előzőkben tárgyalt tagjaival.
4. példa 5
Szintetikus polipeptidek szintézise A polipeptideket egy Millipore 9050 peptidszintetizátorral szintetizálhatjuk FMOC kémia alkalmazásával, HPTU (O-benzotriazol-N,N,N’N’-tetrametil-uróniumhexafluorofoszfát) aktiválással. Egy Gly-Cys-Gly szekvenciát hozzákapcsolhatunk egy peptidnek az N-terminálisához, hogy biztosítsuk a peptid konjugációját vagy jelölését. A peptidnek a szilárd hordozóról való lehasítását az alábbi hasítási keverékkel végezhetjük el: trifluor-ecetsav:etándiol:tioanizol:víz:fenol (40:1:2:2:3).
Két óra hosszat végzett hasítás után a peptideket jéghideg metil-terc-butil-éterrel kicsaphatjuk. A peptidüledékeket azután 0,1% trifluor-ecetsavat (TFA) tartalmazó vízben oldjuk, majd a C18 fordított fázisú HPLC-n végzett tisztítás előtt liofilizáljuk. Acetonitril (ami 0,1% trifluor-ecetsavat tartalmaz) 0,1% trifluor-ecetsavat tartalmazó vízben készített 0-60%-os gradiensét használhatjuk a peptidek eluálására. A tiszta frakciók liofilezése után a peptideket elektronpermet tömegspektroszkópiával és aminosavelemzéssel jellemezhetjük.
Az előzőkből nyilvánvaló, hogy bár a jelen találmánynak illusztrálás céljából a specifikus megvalósítási módjait ismertetjük, különböző módosításokat tehetünk benne, anélkül hogy eltérnénk a találmány szellemétől és oltalmi körétől.
A SZEKVENCIÁK JEGYZÉKE (1) ÁLTALÁNOS INFORMÁCIÓ:
(i) BENYÚJTÓ: Alderson, Mark
Dillon, Davin C.
Skeiky, Yasir A. W.
Campos-Neto, Antonio (ii) A TALÁLMÁNY CÍME: Vegyületek a tuberkulózis immunterápiájára és diagnosztizálására, valamint alkalmazásuk módszerei (iii) A SZEKVENCIÁK SZÁMA: 144 (iv) LEVELEZÉSI CÍM:
(A) CÍMZETT: Seed és Berry (B) UTCA: 6300 Columbia Center, 701 Fifth Ave.
(C) VÁROS: Seattle (D) ÁLLAM:
(E) ORSZÁG: USA (F) IRÁNYÍTÓSZÁM: 98104 (v) SZÁMÍTÓGÉPES FORMA:
(A) A HORDOZÓ TÍPUSA: FLOPPY LEMEZ (B) SZÁMÍTÓGÉP: IBM PC KOMPATIBILIS (C) OPERÁCIÓS RENDSZER: PC-DOS/MS-DOS (D) PROGRAM: PATENTIN RELEASE #1.0, VERSION #1.30 (vi) A JELENLEGI BENYÚJTÁS ADATAI:
(A) A BENYÚJTÁS SORSZÁMA:
(B) A BENYÚJTÁS IDŐPONTJA: 1998. május 5.
(C) OSZTÁLYOZÁS:
(Vili) ÜGYVIVŐ/ÜGYNÖK INFORMÁCIÓ:
(A) NÉV: Maki, Dávid J.
(B) REGISZTRÁCIÓS SZÁM: 31,392 (C) REFERENCIA/LAJSTROMSZÁM: 210121.440C1 (IX) TELEKOMMUNIKÁCIÓS INFORMÁCIÓ:
(A) TELEFON: 206-622-4900 (B) TELEFAX: 206-682-6031
1. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1886 bázispár (B) Típus: nukleinsav
HU 226 520 Β1 (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 1. számú szekvencia
CGCTCTGGTG ACCACCAACT TCTTCGGTGT CAACACCATC CCGATCGCCC TCAACGAGGC 60 CGACTACCTG CGCATGTGGA TCCAGGCCGC CACCGTCATG AGCCACTATC AAGCCGTCGC 120 GCACGAAATC TGGTGTCTCC ATGAATANGC CAGTTCGGGA AAGCCGTGGG CCAGTATCAC 180 CACGGGTGCG CCGGGCTCAC CGGCCTCGAC CACTCGCAGT CGCACGCCGT TGGTATCAAC 240 TAACCGTNCN GTANGTGCGC CCATCGTCTC ACCAAATCAC ACCGGGCACC GGCCTGAGAA 300 GGGCTTGGGG AGCANCCAGA GGCGATTGTC GCGGGTGCTG CCGCGCATCA TTGATCGGCC 360 GGCCGGACCA NTCGGGCCTC CCTTGACGTC CGGATCNCAC TTCCTGTGCA GCTGGCATGG 420 CTACAGCTCA CAGTGACTGC CCCACGATTG CCGGCCAGGT CCAGTTCAAA TTCCGGTGAA 480 TTCGCGGACA AAAGCAGCAG GTCAACCAAC CGCAGTCAGT CGAGGGTCCC AAACGTGAGC 540 CAATCCGTGA AATGGCTTGC TGCAGTGACA CCGGTCACAG GCTTAGCCGA CAGCACCGGA 600 ATAGCTCAGG CGGGCTATAG AGTCCTATAG AAACATTTGC TGATAGAATT AACCGCTGTC 660 TTGGCGTGAT CTTGATACGG CTCGCCGTGC GACCGGTTGG CTCAGTAGCT GACCACCATG 720 TAACCCATCC TCGGCAGGTG TCTACTAAGG CGAGACACCG CATTGGTGGG GCTGCATCGC 780 AAATCGGTCC GAGCATGTAG CACTGCCGTT ATCCCGGGAT AGCAAACCAC CCGGAACCAG 840 GGCTATCCCA GTCGCTCTCC GACGGAGGCC GTTTCGCTTT CCGTTGCCCG ATAACTCCCG 900 AGTGGATATC GGCGTTATCA NATTCAGGCT TTTCTTCGCA AGGTACCGGT GTTCGCTATA 960 TTCGGATATC TCGGACGGAT AATTACTAAA ACTTCAGTGG TTTAGATAAG GCCGCCGCAA 1020 TACTTCGCCG ATCTTGCCGA GCGCAACGGA TTTCCATCGT CGGTTTTCGT CGCCTTATCA 1080 AACATGATCG GAGATAATGA CAGATCGGCC TAGCTAGGTG TTTAGCGGAC GCGATTTAGG 1140 ACAACCGAGA TTTGCTTTGC CTCGCAACCA TGAGAGCGCC CCGCTTCGAC GCCGAATCGG 1200 GTGAGTGATG GTGGGTTAGC ACAGCCCTGA TTGCGCCACC GGCGAGGTGA TTGTGCCCGC 1260 CACGAGGCCG CCGCCGGCTA GCCCCATGAG CACGNTATAT AGACTCTCCT GCAACAGATC 1320 TCATACCGAT CGAAGGCGAA GCGCAGGCAT CGACGTCGGA GACACTGCCT TGGGATCGCG 1380 CCGCCTACAC GGCGGTTGGC GCATTGTCGC AGCGCAGTTG CAGGAGGGCA AATGTGCGCA 1440 GACGATGTAG TCGACAACAA GTGNACATGC CGTCTTCACG AACTCAAAAC TGACGATCTG 1500 CTTAGCATGA AAAAAACTGT TGACATCGGC CAAGCATGAC AGCCAGACTG TAGGCCTACG 1560 CGTGCAATGC AGAACCAAGG NTATGCATGG AATCGACGAC CGTTGAGATA GGCGGCAGGC 1620 ATGAGCAGAG CGTTCATCAT CGATCCAACG ATCAGTGCCA TTGACGGCTT GTACGACCTT 1680 CTGGGGATTG GAATACCCAA CCAAGGGGGT ATCCTTTACT CCTCACTAGA GTACTTCGAA 1740 AAAGCCCTGG AGGAGCTGGC AGCAGCGTTT CCGGGTGATG GCTGGTTAGG TTCGGCCGCG 1800 GACAAATACG CCGGCAAAAA CCGCAACCAC GTGAATTTTT TCCAGGAACT GGCAGACCTC 1860 GATCGTCAGC TCATCAGCCT GATCCA 1886
2. számú szekvanciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 2305 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 2. számú szekvencia
GGCACGCGCT GGCCGCGCAA TACACCGAAA TTGCAACGGA ACTCGCAAGC GTGCTCGCTG 60
CGGTGCAGGC AAGCTCGTGG CAGGGGCCCA GCGCCGACCG GTTCGTCGTC GCCCATCAAC 120
CGTTCCGGTA TTGGCTAACC CACGCTGCCA CGGTGGCCAC CGCAGCAGCC GCCGCGCACN 180
HU 226 520 Β1
AAACGGCCGC CGCCGGGTAT ACGTCCGCAT TGGGGGGCAT GCCTACGCTA GCCGAGTTGG 240 CGGCCAACCA TGCCATGCAC GGCGCTCTGG TGACCACCAA CTTCTTCGGT GTCAACACCA 300 TCCCGATCGC CCTCAACGAG GCCGACTACC TGCGCATGTG GATCCAGGCC GCCACCGTCA 360 TGAGCCACTA TCAAGCCGTC GCGCACGAAA GCGTGGCGGC GACCCCCAGC ACGCCGCCGG 420 CGCCGCAGAT AGTGACCAGT GCGGCCAGCT CGGCGGCTAG CAGCAGCTTC CCCGACCCGA 480 CCAAATTGAT CCTGCAGCTA CTCAAGGATT TCCTGGAGCT GCTGCGCTAT CTGGCTGTTG 540 AGCTGCTGCC GGGGCCGCTC GGCGACCTCA TCGCCCAGGT GTTGGACTGG TTCATCTCGT 600 TCGTGTCCGG TCCAGTCTTC ACGTTTCTCG CCTACCTGGT GCTGGACCCA CTGATCTATT 660 TCGGACCGTT CGCCCCGCTG ACGAGTCCGG TCCTGTTGCC TGCTGTGGAG TTACGCAACC 720 GCCTCAAAAC CGCCACCGGA CTGACGCTGC CACCTACCGT GATTTTCGAT CATCCCACTC 780 CCACTGCGGT CGCCGAGTAT GTCGCCCAGC AAATGTCTGG CAGCCGCCCA ACGGAATCCG 840 GTGATCCGAC GTCGCAGGTT GTCGAACCCG CTCGTGCCGA ATTCGGCACG AGTGCTGTTC 900 ATCAAATCCC CCCGAGACCT GCGGACACCC GGCGCGCTTG CCGACATCGA GATGATGTCC 960 CGCGAGATAG CAGAATTGCC CAACATCGTG ATGGTGCGGG GCTTGACCCG ACCGAACGGG 1020 GAACCTCTGA AGGAGACCAA GGTCTCGTTT CAGGCTGGTG AAGTGGGCGG CAAGCTCGAC 1080 GAAGCGACCA CCCTGCTCGA AGAGCACGGA GGCGAGCTGG ACCAGCTGAC CGGCGGTGCG 1140 CACCAGTTGG CCGACGCCCT CGCCCAAATA CGCAACGAAA TCAATGGGGC CGTGGCCAGC 1200 TCGAGCGGGA TAGTCAACAC CCTGCAGGCC ATGATGGACC TGATGGGCGG TGACAAGACC 1260 ATCCGACAAC TGGAAAATGC GTCCCAATAT GTCGGGCGCA TGCGGGCTCT GGGGGACAAT 1320 CTGAGCGGGA CCGTCACCGA TGCCGAACAA ATCGCCACTT GGGCCAGCCC TATGGTCAAC 1380 GCCCTCAACT CCAGCCCGGT GTGTAACAGC GATCCCGCCT GTCGGACGTC GCGCGCACAG 1440 TTGGCGGCGA TTGTCCAGGC GCAGGACGAC GGCCTGCTCA GGTCCATCAG AGCGCTAGCC 1500 GTCACCCTGC AACAGACGCA GGAATACCAG ACACTCGCCC GGACGGTGAG CACACTGGAC 1560 GGGCAACTGA AGCAAGTCGT CAGCACCCTC AAAGCGGTCG ACGGCCTACC CACCAAATTG 1620 GCTCAAATGC AGCAAGGAGC CAACGCTCTC GCCGACGGCA GCGCAGCGCT GGCGGCAGGC 1680 GTGCAGGAAT TGGTCGATCA GGTCAAAAAG ATGGGCTCAG GGCTCAACGA GGCCGCCGAC 1740 TTCCTGTTGG GGATCAAGCG GGATGCGGAC AAGCCGTCAA TGGCGGGCTT CAACATTCCA 1800 CCGCAGATTT TTTCGAGGGA CGAGTTCAAG AAGGGCGCCC AGATTTTCCT GTCGGCCGAT 1860 GGTCATGCGG CGCGGTACTT CGTGCAGAGC GCGCTGAATC CGGCCACCAC CGAGGCGATG 1920 GATCAGGTCA ACGATATCCT CCGTGTTGCG GATTCCGCGC GACCGAATAC CGAACTCGAG 1980 GATGCCACGA TAGGTCTGGC GGGGGTTCCG ACTGCGCTGC GGGATATCCG CGACTACTAC 2040 AACAGCGATA TGAAATTCAT CGTCATTGCG ACGATCGTTA TCGTATTCTT GATTCTCGTC 2100 ATTCTGNTGC GCGCACTTGT GGNTCCGATA TATCTGATAG GCTCGGTGCT GATTTCTTAC 2160 TTGTCGGCCC TAGGCATAGG AACTTTCGTT TTCCAATTGA TACTGGGCCA GGAAATGCAT 2220 TGGAGCCTGC CGGGACTGTC CTTCATATTA TTGGTTGCCA TCGGCGCTGA CTACAACATG 2280 CTGCTCATTT CACGCATCCG CGACG 2305
3. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1742 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 3. számú szekvencia
CCGCTCTCTT TCAACGTCAT AAGTTCGGTG GGCCAGTCGG CCGCGCGTGC ATATGGCACC 60 AATAACGCGT GTCCCATGGA TACCCGGACC GCACGACGGT AGAGCGGATC AGCGCAGCCG 120 GTGCCGAACA CTACCGCGTC CACGCTCAGC CCTGCCGCGT TGCGGAAGAT CGAGCCCAGG 180 TTCTCATGGT CGTTAACGCC TTCCAACACT GCGACGGTGC GCGCCCCGGC GACCACCTGA 240 GCAACGCTCG GCTCCGGCAC CCGGCGCGCG GCTGCCAACA CCCCACGATT GAGATGGAAG 300 CCGATCACCC GTGCCATGAC ATCAGCCGAC GCTCGATAGT ACGGCGCGCC GACACCGGCC 360 AGATCATCCT TGAGCTCGGC CAGCCGGCGG TCGGTGCCGA ACAGCGCCAG CGGCGTGAAC 420 CGTGAGGCCA GCATGCGCTG CACCACCAGC ACACCCTCGG CGATCACCAA CGCCTTGCCG 480 GTCGGCAGAT CGGGACNACN GTCGATGCTG TTCAGGTCAC GGAAATCGTC GAGCCGTGGG 540
HU 226 520 Β1
TCGTCGGGAT CGCAGACGTC CTGAACATCG AGGCCGTCGG GGTGCTGGGC ACAACGGCCT 600 TCGGTCACGG GCTTTCGTCG ACCAGAGCCA GCATCAGATC GGCGGCGCTG CGCAGGATGT 660 CACGCTCGCT GCGGTTCAGC GTCGCGAGCC GCTCAGCCAG CCACTCTTGC AGAGAGCCGT 720 TGCTGGGATT AATTGGGAGA GGAAGACAGC ATGTCGTTCG TGACCACACA GCCGGAAGCC 780 CTGGCAGCTG CGGCGGCGAA CCTACAGGGT ATTGGCACGA CAATGAACGC CCAGAACGCG 840 GCCGCGGCTG CTCCAACCAC CGGAGTAGTG CCCGCAGCCG CCGATGAAGT ATCAGCGCTG 900 ACCGCGGCTC AGTTTGCTGC GCACGCGCAG ATGTACCAAA CGGTCAGCGC CCAGGCCGCG 960 GCCATTCACG AAATGTTCGT GAACACGCTG GTGGCCAGTT CTGGCTCATA CGCGGCCACC 1020 GAGGCGGCCA ACGCAGCCGC TGCCGGCTGA ACGGGCTCGC ACGAACCTGC TGAAGGAGAG 1080 GGGGAACATC CGGAGTTCTC GGGTCAGGGG TTGCGCCAGC GCCCAGCCGA TTCAGNTATC 1140 GGCGTCCATA ACAGCAGACG ATCTAGGCAT TCAGTACTAA GGAGACAGGC AACATGGCCT 1200 CACGTTTTAT GACGGATCCG CATGCGATGC GGGACATGGC GGGCCGTTTT GAGGTGCACG 1260 CCCAGACGGT GGAGGACGAG GCTCGCCGGA TGTGGGCGTC CGCGCAAAAC ATTTCCGGTG 1320 CGGGCTGGAG TGGCATGGCC GAGGCGACCT CGCTAGACAC CATGACCTAG ATGAATCAGG 1380 CGTTTCGCAA CATCGTGAAC ATGCTGCACG GGGTGCGTGA CGGGCTGGTT CGCGACGCCA 1440 ACAANTACGA ACAGCAAGAG CAGGCCTCCC AGCAGATCCT GAGCAGNTAG CGCCGAAAGC 1500 CACAGCTGNG TACGNTTTCT CACATTAGGA GAACACCAAT ATGACGATTA ATTACCAGTT 1560 CGGGGACGTC GACGCTCATG GCGCCATGAT CCGCGCTCAG GCGGCGTCGC TTGAGGCGGA 1620 GCATCAGGCC ATCGTTCGTG ATGTGTTGGC CGCGGGTGAC TTTTGGGGCG GCGCCGGTTC 1680 GGTGGCTTGC CAGGAGTTCA TTACCCAGTT GGGCCGTAAC TTCCAGGTGA TCTACGAGCA 1740 GG 1742
4. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 2836 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 4. számú szekvencia
GTTGATTCCG TTCGCGGCGC CGCCGAAGAC CACCAACTCC GCTGGGGTGG TCGCACAGGC 60 GGTTGCGTCG GTCAGCTGGC CGAATCCCAA TGATTGGTGG CTCNGTGCGG TTGCTGGGCT 120 CGATTACCCC CACGGAAAGG ACGACGATCG TTCGTTTGCT CGGTCAGTCG TACTTGGCGA 180 CGGGCATGGC GCGGTTTCTT ACCTCGATCG CACAGCAGCT GACCTTCGGC CCAGGGGGCA 240 CAACGGCTGG CTCCGGCGGA GCCTGGTACC CAACGCCACA ATTCGCCGGC CTGGGTGCAG 300 GCCCGGCGGT GTCGGCGAGT TTGGCGCGGG CGGAGCCGGT CGGGAGGTTG TCGGTGCCGC 360 CAAGTTGGGC CGTCGCGGCT CCGGCCTTCG CGGAGAAGCC TGAGGCGGGC ACGCCGATGT 420 CCGTCATCGG CGAAGCGTCC AGCTGCGGTC AGGGAGGCCT GCTTCGAGGC ATACCGCTGG 480 CGAGAGCGGG GCGGCGTACA GGCGCCTTCG CTCACCGATA CGGGTTCCGC CACAGCGTGA 540 TTACCCGGTC TCCGTCGGCG GGATAGCTTT CGATCCGGTC TGCGCGGCCG CCGGAAATGC 600 TGCAGATAGC GATCGACCGC GCCGGTCGGT AAACGCCGCA CACGGCACTA TCAATGCGCA 660 CGGCGGGCGT TGATGCCAAA TTGACCGTCC CGACGGGGCT TTATCTGCGG CAAGATTTCA 720 TCCCCAGCCC GGTCGGTGGG CCGATAAATA CGCTGGTCAG CGCGACTCTT CCGGCTGAAT 780 TCGATGCTCT GGGCGCCCGC TCGACGCCGA GTATCTCGAG TGGGCCGCAA ACCCGGTCAA 840 ACGCTGTTAC TGTGGCGTTA CCACAGGTGA ATTTGCGGTG CCAACTGGTG AACACTTGCG 900 AACGGGTGGC ATCGAAATCA ACTTGTTGCG TTGCAGTGAT CTACTCTCTT GCAGAGAGCC 960 GTTGCTGGGA TTAATTGGGA GAGGAAGACA GCATGTCGTT CGTGACCACA CAGCCGGAAG 1020 CCCTGGCAGC TGCGGCGGCG AACCTACAGG GTATTGGCAC GACAATGAAC GCCCAGAACG 1080 CGGCCGCGGC TGCTCCAACC ACCGGAGTAG TGCCCGCAGC CGCCGATGAA GTATCAGCGC 1140 TGACCGCGGC TCAGTTTGCT GCGCACGCGC AGATGTACCA AACGGTCAGC GCCCAGGCCG 1200 CGGCCATTCA CGAAATGTTC GTGAACACGC TGGTGGCCAG TTCTGGCTCA TACGCGGCCA 1260 CCGAGGCGGC CAACGCAGCC GCTGCCGGCT GAACGGGCTC GCACGAACCT GCTGAAGGAG 1320 AGGGGGAACA TCCGGAGTTC TCGGGTCAGG GGTTGCGCCA GCGCCCAGCC GATTCAGCTA 1380 TCGGCGTCCA TAACAGCAGA CGATCTAGGC ATTCAGTACT AAGGAGACAG GCAACATGGC 1440
HU 226 520 Β1
CTCACGTTTT ATGACGGATC CGCATGCGAT GCGGGACATG GCGGGCCGTT TTGAGGTGCA 1500 CGCCCAGACG GTGGAGGACG AGGCTCGCCG GATGTGGGCG TCCGCGCAAA ACATTTCCGG 1560 TGCGGGCTGG AGTGGCATGG CCGAGGCGAC CTCGCTAGAC ACCATGACCT AGATGAATCA 1620 GGCGTTTCGC AACATCGTGA ACATGCTGCA CGGGGTGCG7 GACGGGCTGG TTCGCGACGC 1680 CAACAACTAC GAACAGCAAG AGCAGGCCTC CCAGCAGATC CTGAGCAGCT AGCGCCGAAA 1740 GCCACAGCTG CGTACGCTTT CTCACATTAG GAGAACACCA ATATGACGAT TAATTACCAG 1800 TTCGGGGACG TCGACGCTCA TGGCGCCATG ATCCGCGCTC AGGCGGCGTC GCTTGAGGCG 1860 GAGCATCAGG CCATCGTTCG TGATGTGTTG GCCGCGGGTG ACTTTTGGGG CGGCGCCGGT 1920 TCGGTGGCTT GCCAGGAGTT CATTACCCAG TTGGGCCGTA ACTTCCAGGT GATCTACGAG 1980 CAGGCCAACG CCCACGGGCA GAAGGTGCAG GCTGCCGGCA ACAACATGGC GCAAACCGAC 2040 AGCGCCGTCG GCTCCAGCTG GGCCTAAAAC TGAACTTCAG TCGCGGCAGC ACACCAACCA 2100 GCCGGTGTGC TGCTGTGTCC TGCAGTTAAC TAGCACTCGA CCGCTGAGGT AGCGATGGAT 2160 CAACAGAGTA CCCGCACCGA CATCACCGTC AACGTCGACG GCTTCTGGAT GCTTCAGGCG 2220 CTACTGGATA TCCGCCACGT TGCGCCTGAG TTACGTTGCC GGCCGTACGT CTCCACCGAT 2280 TCCAATGACT GGCTAAACGA GCACCCGGGG ATGGCGGTCA TGCGCGAGCA GGGCATTGTC 2340 GTCAACGACG CGGTCAACGA ACAGGTCGCT GCCCGGATGA AGGTGCTTGC CGCACCTGAT 2400 CTTGAAGTCG TCGCCCTGCT GTCACGCGGC AAGTTGCTGT ACGGGGTCAT AGACGACGAG 2460 AACCAGCCGC CGGGTTCGCG TGACATCCCT GACAATGAGT TCCGGGTGGT GTTGrCCCGG 2520 CGAGGCCAGC ACTGGGTGTC GGCGGTACGG GTTGGCAATG ACATCACCGT CGATGACGTG 2580 ACGGTCTCGG ATAGCGCCTC GATCGCCGCA CTGGTAATGG ACGGTCTGGA GTCGATTCAC 2640 CACGCCGACC CAGCCGCGAT CAACGCGGTC AACGTGCCAA TGGAGGAGAT CTCGTGCCGA 2700 ATTCGGCACG AGGCACGAGG CGGTGTCGGT GACGACGGGA TCGATCACGA TCATCGACCG 2760 GCCGGGATCC TTGGCGATCT CGTTGAGCAC GACCCGGGCC CGCGGGAAGC TCTGCGACAT 2820 CCATGGGTTC TTCCCG 2836
5. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 900 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 5. számú szekvencia
AACATGCTGC ACGGGGTGCG TGACGGGCTG GTTCGCGACG CCAACAACTA CGAGCAGCAA 60 GAGCAGGCCT CCCAGCAGAT CCTCAGCAGC TAACGTCAGC CGCTGCAGCA CAATACTTTT 120 ACAAGCGAAG GAGAACAGGT TCGATGACCA TCAACTATCA GTTCGGTGAT GTCGACGCTC 180 ACGGCGCCAT GATCCGCGCT CAGGCCGGGT TGCTGGAGGC CGAACATCAG GCCATCATTC 240 GTGATGTGTT GACCGCGAGT GACTTTTGGG GCGGCGCCGG TTCGGCGGCC TGCCAGGGGT 300 TCATTACCCA ATTGGGCCGT AACTTCCAGG TGATCTACGA ACAGGCCAAC GCCCACGGGC 360 AGAAGGTGCA GGCTGCCGGC AACAACATGG CGCAAACCGA CAGCGCCGTC GGCTCCAGCT 420 GGGCCTGACA CCAGGCCAAG GCCAGGGACG TGGTGTACGA GTGAAGGTTC CTCGCGTGAT 480 CCTTCGGGTG GCAGTCTAGG TGGTCAGTGC TGGGGTGTTG GTGGTTTGCT GCTTGGCGGG 540 TTCTTCGGTG CTGGTCAGTG CTGCTCGGGC TCGGGTGAGG ACCTCGAGGC CCAGGTAGCG 600 CCGTCCTTCG ATCCATTCGT CGTGTTGTTC GGCGAGGACG GCTCCGACGA GGCGGATGAT 660 CGAGGCGCGG TCGGGGAAGA TGCCCACGAC GTCGGTTCGG CGTCGTACCT CTCGGTTGAG 720 GCGTTCCTGG GGGTTGTTGG ACCAGATTTG GCGCCAGATC TTCTTGGGGA AGGCGGTGAA 780 CGCCAGCAGG TCGGTGCGGG CGGTGTCGAN GTGCTCGGCC ACCGCGGGGA GTTTGTCGGT 840 CAGAGCGTCG AGTACCCGAT CATATTGGGC AACAACTGAT TCGGCGTTGG GCTGGTCGTA 900
6. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1905 bázispár (B) Típus: nukleinsav
HU 226 520 Β1 (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 6. számú szekvencia
GCTCGCCGGA TGTGGGCGTC CGCGCAAAAC ATTTCCGGTG CGGGCTGGAG TGGCATGGCC 60 GAGGCGACCT CGCTAGACAC CATGGCCCAG ATGAATCAGG CGTTTCGCAA CATCGTGAAC 120 ATGCTGCACG GGGTGCGTGA CGGGCTGGTT CGCGACGCCA ACAACTACGA GCAGCAAGAG 180 CAGGCCTCCC AGCAGATCCT CAGCAGCTAA CGTCAGCCGC TGCAGCACAA TACTTTTACA 240 AGCGAAGGAG AACAGGTTCG ATGACCATCA ACTATCAGTT CGGTGATGTC GACGCTCACG 300 GCGCCATGAT CCGCGCTCAG GCCGGGTTGC TGGAGGCCGA GCATCAGGCC ATCATTCGTG 360 ATGTGTTGAC CGCGAGTGAC TTTTGGGGCG GCGCCGGTTC GGCGGCCTGC CAGGGGTTCA 420 TTACCCAGTT GGGCCGTAAC TTCCAGGTGA TCTACGAACA AGCCAACACC CACGGGCAGA 480 AGGTGCAAGC TGCCGGCAAC AACATGGCGC AAACCGACAG CGCCGTCNGC TCCAGCTGGG 540 CCTGACACCA GGCCAAGGCC AGGGACGTGG TGTACNAGTG AAGGTTCCTC GCGTGATCCT 600 TCGGGTGGCA GTCTAGGTGG TCAGTGCTGG GGTGTTGGTG GTTTGCTGCT TGGCGGGTTC 660 TTCGGTGCTG GTCAGTGCTG CTCGGGCTCG GGTGAGGACC TCGAGGCCCA GGTAGCGCCG 720 TCCTTCGATC CATTCGTCGT GTTGTTCGGC GAGGACNGCT CCGACGANGC GGATGATCGA 780 GGCGCGGTCG GGGAAGATGC CCACGACGTC GGTTCGGCGT CGTACCTCTC GGTTGAAGCG 840 TTCCTGGGGG CCACCGCTTG GCGCCNANGC ACTCCACGCC AATTCGTCNC ACCTAACAGC 900 GGTGGCCAAC GACTATGACT ACGACACCGT TTTTGCCAGG GCCCTCNAAA GGATCTGCGC 960 GTCCCGGCGA CACGCTTTTT GCGATAAGTA CCTCCGGCAA TTCTATGAGT GTACTGCGGN 1020 CCGCGAAAAC CGCAAGGGAG TTGGGTGTGA CGGTTNTTGC AAATGACGGG CGAATCCGGC 1080 GGCCAGCTGG CAGAATTCGC AGATTTCTTG ATCAACGTCC CGTCACGCGA CACCGGGCGA 1140 ATCCAGGAAT CTCACATCGT TTTTATTCAT GCGATCTCCG AACATGTCGA ACACGCGCTT 1200 TTCGCGCCTC GCCAATAGGA AAGCCGATCC TTACGCGGCC ATTCGAAAGA TGGTCGCGGA 1260 ACGTGCGGGA CACCAATGGT GTCTCTTCCT CGATAGAGAC GGGGTCATGA ATCGACAAGT 1320 GGTCGGCGAC TACGTACGGA ACTGGCGGCA GTTTGAATGG TTGCCCGGGG CGGCGCGGGC 1380 GTTGAAGAAG CTACGGGCAT GGGCTCCGTA CATCGTTGTC GTGACAAACC AGCAGGGCGT 1440 GGGTGCCGGA TTGATGAGCG CCGTCGACGT GATGGTGATA CATCGGCACC TCCAAATGCA 1500 GCTTGCATCC GATGGCGTGC TGATAGATGG ATTTCAGGTT TGCCCGCACC ACCGTTCGCA 1560 GCGGTGTGGC TGCCGTAAGC CGAGACCGGG TCTGGTCCTC GACTGGCTCG GACGACACCC 1620 CGACAGTGAG CCATTGCTGA GCATCGTGGT TGGGGACAGC CTCAGCGATC TTGACATTGG 1680 CACACAACGT CGCCGCTGCT GCCGGTGCAT GTGCCAGTGT CCAGATAGGG GGCGCCAGTT 1740 CTGGCGGTGT CGCTGACGCG TCATTTGACT CGCTCTGGGA GTTCGCTGTC GCAGTCGGAC 1800 ATGCGCGGGG GGAGCGGGGC TAATGGCGAT CTTGCGCGGG CGAGCGCCGT NGCGGNTCGG 1860 ACTNNGCGGT GGCGGGACAG ACGTGGAACC GTACTCGAGC CAGTT 1905
7. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 2921 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 7. számú szekvencia
CGGGATGCCG TGGTGGTTGG TATTGCCCAA ACCCTGGCGC TGGTCCCCGG GGTATCCAGG 60
TCCGGGTCGA CCATCAGCGC TGGACTGTTT CTCGGACTCG ACCGTGAACT GGCCGCCCGA 120
TTCGGATTCC TGCTGGCCAT TCCAGCGGTG TTCGCCTCCG GGTTGTTCTC GTTGCCCGAC 180
HU 226 520 Β1
GCATTCCACC CGGTAACCGA GGGCATGAGC GCTACTGGCC CGCAGTTGCT GGTGGCCACC 240
CTGATCGCGT TCGTCCTCGG TCTGACCGCG GTGGCCTGGC TGCTGCGGTT TCTGGTGCGA 300
CACAACATGT ACTGGTTCGT CGGCTACCGG GTGCTCGTCG GGACGGGCAT GCTCGTGCTG 360
CTGGCTACCG GGACGGTAGC CGCGACATGA CCGTCATCTT GCTACGCCAT GCCCGTTCCA 420
CCTCGAACAC CGCGGGCGTG CTGGCCGGCC GGTCCGGCGT CGACCTCGAC GAGAAGGGGC 480
GCGAGCAGGC CACCGGGTTG ATCGATCGAA TTGGTGACCT GCCGATCCGG GCGGTCGCGT 540
CTTCTCCAAT GCTGCGGTGT CAACGCACCG TCGAACCGCT GGCCGAGGCG CTGTGCCTGG 600
AGCCGCTCAT CGATGACCGG TTCTCCGAAG TCGACTACGG CGAATGGACT GGCAGAAAAA 660
TCGGTGACCT GGTCGACGAG CCGTTGTGGC GGGTAGTCCA GGCCCACCCC AGCGCGGCGG 720
TGTTTCCCGG CGGTGAGGGT TTGGCGCAGG TGCAGACGTG GTTGTCCTGA CGGATTTCCA 780
TGCCGGGGAA CACCAAGACC GGATCGGCAC TGGCGGTCGC CGGCGAAAAC CCGGCCGCCA 840
ATAGGGCGAC CGTCGCTGCG AATGCGCGTG GTACCAGGCG GACCACCTTG AACTCCCATC 900
CGTCGGGGCC AAGCGCATCG CCCGCCGCCG GTTACGGCTA AGGCGTACCA AAACCCGACG 960
GTAATACTTC GGCAATGTCG GGTCNCGACG TTACCGAGAC GTGACCAGNG AGGCNGCGGC 1020
ATTGGATTTA TCGATGGTGC GCGGTTCCCA NCCCGGCGGT CCGAANACGT AGCCCAGCCG 1080
ATCCCGCAGA CGTGTTGCCG ACCGCCAGTC ACGCACGATC GCCACGTACT CGCGGGTCTG 1140
CAGCTTCCAG ATGTTGAACG TGTCGACCCG CTTGGTCAGG CCATAATGCG GTCGGAATAG 1200
CTCCGGCTGA AAGCTACCGA ACAGGCGGTC CCAGATGATG AGGATGCCGC CATAGTTCTT 1260
GTCCANATAC ACCGGGTCCA TTCCGTGGTG GACCCGGTGG TGCGACGGGG TATTGAAGAC 1320
GAATTCGAAC CACCGCGGCA GCCTGTCGAT CCGCTCGGTG TGCACCCAGA ACTGGTAGAT 1380
CAAGTTCAGC GACCAATTGC AGAACACCAT CCAAGGGGGA AGCCCCATCA GTGGCAGCGG 1440
AACCCACATG AGAATCTCGC CGCTGTTGTT CCANTTTCTG GCGCAGCGCG GTGGCGAAGT 1500
TGAAGTATTC GCTGGAGTGA TGCGCCTGGT GGGTAGCCCA GATCAGCCGA ACTCGGTGGG 1560
CGATGCGGTG ATAGGAGTAG TACAGCAGAT CGACACCAAC GATCGCGATC ACCCAGGTGT 1620
ACCACCGGTG GGCGGACAGC TGCCAGGGGG CAAGGTAGGC ATAGATTGCG GCATAACCGA 1680
GCAGGGCAAG GGACTTCCAG CCGGCGGTGG TGGCTATCGA AACCAGCCCC ATCGAGATGC 1740
TGGCCACCGA GTCGCGGGTG AGGTAAGCGC CCGAGGCGGG CCGTGGCTGC CCGGTAGCAG 1800
CGGTCTCGAT GCTTTCCAGC TTGCGGGCCG CCGTCCATTC GAGAATCAGC AGCAATAGAA 1860
AACATGGAAT GGCGAACAGT ACCGGGTCCC GCATTTCCTC GGGCAGCGCT GAGAAGAATC 1920
CGGCGACGGC ATGGCCGAGG CGACCTCGNT AGACACCATG ACCCAGATGA ATCAGGCGTT 1980
TCGCAACATC GTGAACATGC TGCACGGGGT GCGTGACGGG CTGGTTCGCG ACGCCAACAA 2040
NTACGAACAG CAAGAGCAGG CCTCCCAGCA GATCCTCAGC AGCTGACCCG GCCCGACGAC 2100
TCAGGAGGAC ACATGACCAT CAACTATCAA TTCGGGGACG TCGACGCTCA CGGCGCCATG 2160
ATCCGCGCTC AGGCCGGGTC GCTGGAGGCC GAGCATCAGG CCATCATTTC TGATGTGTTG 2220
ACCGCGAGTG ACTTTTGGGG CGGCGCCGGT TCGGCGGCCT GCCAGGGGTT CATTACCCAG 2280
CTGGGCCGTA ACTTCCAGGT GATNTACGAG CAGGCCAACG CCCACGGGCA GAAGGTGCAG 2340
GCTGCCGGCA ACAACATGGC ACAAACCGAC AGCGCCGTCG GCTCCAGCTG GGCATAAAGN 2400
TGGCTTAAGG CCCGCGCCGT CAATTACAAC GTGGCCGCAC ACCGGTTGGT GTGTGGCCAC 2460
GTTGTTATCT GAACGACTAA CTACTTCGAC CTGCTAAAGT CGGCGCGTTG ATCCCCGGTC 2520
GGATGGTGCT GAACTGGGAA GATGGCCTCA ATGCCCTTGT TGCGGAAGGG ATTGAGGCCA 2580
TCGTGTTTCG TACTTTAGGC GATCAGTGCT GGTTGTGGGA GTCGCTGCTG CCCGACGAGG 2640
TGCGCCGACT GCCCGAGGAA CTGGCCCGGG TGGACGCATT GTTGGACGAT CCGGCGTTCT 2700
TCGCCCCGTT CGTGCCGTTC TTCGACCCGC GCAGGGGCCG GCCGTCGACG CCGATGGAGG 2760
TCTATCTGCA GTTGATGTTT GTGAAGTTCC GCTACCGGCT GGGCTATGAG TCGCTGTGCC 2820
GGGAGGTGGC TGATTCGATC ACCTGACGGC GGTTTTGCCG CATTGCGCTG GACGGGTCGG 2880
TGCCGCATCC GACCACATTG ATGAAGCTCA CCACGCGTTG C 2921
8. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1704 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 8. számú szekvencia
CGCGATCGTC GTCAACGANG TCGACCGTCA CCACGGACTG ATCAACAAGT TCGCAGGCGA 60 CGCCGCCCTG GCCATCTTCG GAGCCCCGAA CCGCCTCGAC CGTCCCGAAG ACGCCGCGCT 120 GGCCGCCGCC CGGGCCATAN CCGANCGGCT GGCCNACGAG ATGCCCGAGG TCCAAGCCGG 180 CATCGGGGTG GCGGCAGGCC ANATCGTCGC CGGCAATGTC GGCGCCAAGC AAAGATTCNA 240 ATACACAGTG GTCGGCAAGC CGGTCAACCA NGCGGCCCGA TTGTGCGAAC TGGCCAAATC 300 ACACCCCGCG CGATTGGGTC TCGCCCGCTC GGCTCATGGT CACCCAATTC AAGGACTACT 360 TTGGCCTGGC GCACGACCTG CCGAAGTGGG CGAGTGAAGG CGCCAAAGCC GCCGGTGAGG 420 CCGCCAAGGC GTTGCCGGCC GCCGTTCCGG CCATTCCGAG TGCTGGCCTG AGCGGCGTTG 480 CGGGCGCCGT CGGTCAGGCG GCGTCGGTCG GGGGATTGAA GGTTCCGGCC GTTTGGACCG 540 CCACGACCCC GGCGGCGAGC CCCGCGGTGC TGGCGGCGTC CAACGGCCTC GGAGCCGCGG 600 CCGCCGCTGA AGGTTCGACA CACGCGTTTG GCGGGATGCC GCTCATGGGT ANCGGTGCCG 660 GACGTGCGTT TAACAACTTC GCTGCCCCTC GATACGGATT CAAGCCGACC GTGATCGCCC 720 AACCGCCGGC TGGCGGATGA CCAACTACGT TCGTTGATCG AGGATCGAAT TCNACGATTC 780 AAAGGGAGGA ATTCATATGA CCTCNCGTTT TATGACGGAT CCGCACGCNA TNCGGGACAT 840 GGCGGGCCGT TTTGAGGTGC ACGCCCAGAC GGTGGAGGAC GAGGCTNGCN GGATGTGGGC 900 GTCCGCGCAA AACATTTCCG GTGCGGGCTG GAGTGGCATG GCCGAGGCGA CCTCGNTAGA 960 CACCATGGCC CAGATGAATC AGGCGTTTCN CAACATCGTG AACATGCTGC ACGGGGTGNG 1020 TGACGGGCTG GTTCGCGACG CCAACAACTA CGAACAGCAA GAGCAGGCCT CCCAGCAGAT 1080 CCTCAGCAGC TGACCCGGCC CGACGACTCA GGAGGACACA TGACCATCAA CTATCAATTC 1140 GGGGACGTCG ACGCTCATGG CGCCATGATC CGCGCTNTGG CCGGGTTGCT GGAGGCCGAG 1200 CATCAGGCCA TCATTTCTGA TGTGTTGACC GCGAGTGACT TTTGGGGCGG CGCCGGTTCG 1260 GCGGCCTGCC AGGGGTTCAT TACCCAGTTG GGCCGTAACT TCCAGGTGAT TTACGAGCAG 1320 GCCAACGCCC ACGGGCAGAA GGTGCAGGCT GCCGGCAACA ACATGGCACA AACCGACAGC 1380 GCCGTNGGNT CCAGCTGGGC CTAACCCGGG TCNTAAGTTG GGTCCGCGCA GGGCGGGCCG 1440 ATCAGCGTNG ACTTTGGCGC CCGATACACG GGCATNTTNT NGTCGGGAAC ACTGCGCCCG 1500 CGTCAGNTGC CCGCTTCCCC TTGTTNGGCG ACGTGCTCGG TGATGGCTTT GACGACCGCT 1560 TCGCCGGCGC GGCCAATCAA TTGGTCGCGC TTGCCTNTAG CCCATTCGTG CGACGCCCGC 1620 GGCGCCGCGA GTTGTCCCTT GAAATAAGGA ATCACAGCAC GGGCGAACAG CTCATAGGAG 1680 TGAAAGGTTG CCGTGGCGGG GCCC 1704
9. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 2286 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 9. számú szekvencia
CCGTCTTGGC GTCTGGGCGC ATTGTGATCT GGGCCANTTG CCCCTCCACC CAGACCGCGC 60 CCAGCTTGTC GATCCAGCCC GCGACCCGGA TTGCCACCGC GCGAACCGGG AACGGATTCT 120 CCGCTGAATT CTGGGTCACT TCGCAGTCGC GCGGGTGATC CTGTTGGCGA NCAGCGTCTG 180 GAACGGGCGT CNAACGCGTG CCGTAAGCCC AGCGTGTACG CCGTCAGCCC GACGCCGATG 240 CCGAATGCCT TGCCGCCCAA GCTGAGCCGC GCGGGCTCCA CCAAGAGCGT CACGGTGAGC 300 CAGCCAACCA GATGCAAGGC GACGATCACC GCGAAGTGCC GAATTCGGCA CGAGAGGTGC 360 TGGAAATCCA GCAATACGCC CGCGAGCCGA TCTCGTTGGA CCAGACCATC GGCGACGANG 420 GCGACAGNCA GCTTGGCGAT TTCATCGAAA ACAGCGAGGC GGTGGTGGNC GTCGACGCGG 480 TGTCCTTCAC TTTGCTGCAT GATCAACTGC ANTCGGTGCT GGACACGCTC TCCGAGCGTG 540 AGGCGGGCGT GGTGCGGCTA CGCTTCGGCC TTACCGACGG CCAGCCGCGC ACCCTTGACG 600 AGATCGGCCA GGTCTACGGC GTGACCCGGG AACGCATCCG CCAGATCGAA TCCAAGACTA 660 TGTCGAAGTT GCGCCATCCG AGCCGCTCAC AGGTCCTGCG CGACTATCGT GCCGAATTCG 720 GCACGAGCCG TTTTGAGGTG CACGCCCAGA CGGTGGAGGA CGAGGCTCGC CGGATGTGGG 780 CGTCCGCGCA AAACATTTCC GGTGCGGGCT GGAGTGGCAT GGCCGANGCG ACCTCGCTAG 840
HU 226 520 Β1
ACACCATGGC CCAGATGAAT CAGGCGTTTC GCAACATCGT GAACATGCTG CACGGGGTGC 900 GTGACGGGCT GGTTCGCGAC GCCAACAACT ACGAACAGCA AGAGCAGGCC TCCCAGCAGA 960 TCCTCAGCAG CTGACCCGGC CCGACGACTC AGGAGGACAC ATGACCATCA ACTATCAATT 1020 CGGGGACGTC GACGCTCATG GCGCCATGAT CCGCGCTCTG GCCGGGTTGC TGGAGGCCGA 1080 GCATCAGGCC ATCATTTCTG ATGTGTTGAC CGCGAGTGAC TTTTGGGGCG GCGCCGGTTC 1140 GGCGGCCTGC CAGGGGTTCA TTACCCAGTT GGGCCGTAAC TTCCAGGTGA TCTACGAGCA 1200 GGCCAACGCC CACGGGCAGA AGGTGCAGGC TGCCGGCAAC AACATGGCAC AAACCGACAG 1260 CGCCGTCGGC TCCAGCTGGG CCTAACCCGG GTCCTAAGTT GGGTCCGCGC AGGGCGGGCC 1320 GATCAGCGTC GACTTTGGCG CCCGATACAC GGGCATGTNG TNGTCGGGAA CACTGCGCCC 1380 GCGTCAGCTG CCCGCTTCCC CTTGTTCGGC GACGTGCTCG GTGATGGCTT TGACGACCGC 1440 TTCGCCGGCG CGGCCAATCA ATTGGTCGCG CTTGCCTCTA GCCTCGTGCC GAATTCGGCA 1500 CGAGGGTGCT GGTGCCGCGC TATCGGCAGC ACGTGAGCTC CACGACGAAC TCATCCCAGT 1560 GCTGGGTTCC GCGGAGTTCG GCATCGGCGT GTCGGCCGGA AGGGCCATCG CCGGCCACAT 1620 CGGCGCTCAA GCCCGCTTCG AGTACACCGT CATCGGCGAC CCGGTCAACG AGGCCGCCCG 1680 GCTCACCGAA CTGGCCAAAG TCGAGGATGG CCACGTTCTG GCGTCGGCGA TCGCGGTCAG 1740 TGGCGCCCTG GACGCCGAAG CATTGTGTTG GGATGTTGGC GAGGTGGTTG AGCTCCGCGG 1800 ACGTGCTGCA CCCACCCAAC TAGCCAGGCC AATGAATNTG GCNGCACCCG AAGAGGTTTC 1860 CAGCGAAGTA CGCGGCTAGT CGCGCTTGGC TGCNTTCTTC GCCGGCACCT TCCGGGCAGC 1920 TTTCCTGGCT GGCCGTTTTG CCGGACCCCG GGCTCGGCGA TCGGCCAACA GCTCGGCGGC 1980 GCGCTCGTCG GTTATGGAAG CCACGTNGTC GCCCTTACGC AGGCTGGCAT TGGTCTCACC 2040 GTCGGTGACG TACGGCCCGA ATCGGCCGTC CTTGATGACC ATTGGCTTGC CAGACGCCGG 2100 ATNTGNTCCC AGCTCGCGCA GCGGCGGAGC CGAAGCGCTT TGCCGGCCAC GACNTTTCGG 2160 CTCTGNGTAG ATNTTCAGGG CTTCGTCGAG CGNGATGGTG AATATATGGT CTTCGGTGAC 2220 CAGTGATCGA GAATCGTTGC CGCGCTTTAG ATACGGTCNG TAGCGCCCGT TCTGCGCGGT 2280 GATNTC 2286
10. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1136 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet:
(xi) A szekvencia leírása: 10. számú szekvencia
GGGCATCTTC CCCGACCGCG CCTCGATCAT CCGCCTCGTC GGAGCCGTCC TCGCCGAACA 60 ACACGACGAA TGGATCGAAG GACGGCGCTA CCTGGGCCTC GAGGTCCTCA CCCGAGCCCG 120 AGCAGCACTG ACCAGCACCG AAGAACCGCC AAGCAGCAAA CCACCAACAC CCCAGCACTG 180 ACCACCTAGA CTGCCACCCG AAGGATCACG CGAGGAACCT TCACTCGTAC ACCACGTCCC 240 TGGCCTTGGC CTGGTGTCAG GCCCAGCTGG AGCCGACGGC GCTGTCGGTT TGCGCCATGT 300 TGTTGCCGGC AGCCTGCACC TTCTGCCCGT GGGCGTTGGC CTGCTCGTAG ATCACCTGGA 360 AGTTACGGCC CAACTGGGTA ATGAACCCCT GGCAGGCCGC CGAACCGGCG CCGCCCCAAA 420 AGTCACTCGC GGTCAACACA TCACGAATGA TGGCCTGATG CTCGGCCTCC AGCAACCCGG 480 CCTGAGCGCG GATCATGGCG CCGTGAGCGT CGACATCACC GAACTGATAG TTGATGGTCA 540 TCGAACCTGT TCTCCTTCGC TTGTAAAAGT ATTGTGCTGC AGCGGCTGAC GTTAGCTGCT 600 GAGGATCTGC TGGGAGGCCT GCTCTTGCCT CGTGCCGAAT TCGGCACGAG AGGCCGCCTT 660 CGAAGAAATC CTTTGAGAAT TCGCCAAGGC CGTCGACCCA GCATGGGGTC AGCTCGCCAG 720 CCGCGCCGGC TGGCAACCGT TCCCGCTCGA GAAAGACCTG GAGGAATACC AGTGACAAAC 780 GACCTCCCAG ACGTCCGAGA GCGTGACGGC GGTCCACGTC CCGCTCCTCC TGCTGGCGGG 740 CCACGCTTGT CAGACGTGTG GGTTTACAAC GGGCGGGCGT ACGACCTGAG TGAGTGGATT 900 TCCAAGCATC CCGGCGGCGC CTTNTTCATT GGGCGGACCA AGAACCGCGA CATCACCGCA 960 ATCGTCAAGT CCTACCATCG TGATCCGGCG ATTGTCGAGC GAATCCTGCA GCGGAGGTAC 1020 GCGTTGGGCC GCGACGCAAC CCCTAGGGAC ATCCACCCCA AGCACAATGC ACCGGCATTT 1080 CTGTTCAAAG ACGACTTCAA CAGCTGGCGG GACACCCCGA AGTATCGATT NGACGA 1136
HU 226 520 Β1
11. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 967 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 11. számú szekvencia
TGAGCGCCAA CCCTACCGTC GGTTCGTCAC ACGGACCGCA TGGCCTGCTC CGCGGACTGC CGCTAGGGTC GCGGATCACT CGGCGTAGCG GCGCCTTTGC CCACCGATAT GGGTTCCGTC ACAGTGTGGT TGCCCGCCCG CCATCGGCCG GATAACGCCA TGACCTCAGC TCGGCAGAAA TGACAATGCT CCCAAAGGCG TGAGCACCCG AAGACAACTA AGCAGGAGAT CGCATGCCGT TTGTGACTAC CCAACCAGAA GCACTGGCGG CGGCGGCCGG CAGTCTGCAG GGAATCGGCT CCGCATTGAA CGCCCAGAAT GCGGCTGCGG CGACTCCCAC GACGGGGGTG GTCCGGCGGC CGCCGATGAA NTGTCGGCGC TGACGGCGGC TCAGTTCGCG GCACACGCCC AGATCTATCA GGCCGTCAGC GCCCAGGCCG CGGCGATTCA CGAGATGTTC GTCAACACTC TACAGATGAG CTCAGGGTCG TATGCTGCTA CCGAGGCCGC CAACGCGGCC GCGGCCGGNT AGAGGAGTCA CTGCGATGGA TTTTGGGGCG TTGCCGCCGG AGGTCAATTC GGTGCGGATG TATGCCGTTC CTGGCTCGGC ACCAATGGTC GCTGCGGCGT CGGCCTGGAA CGGGTTGGCC GCGGAGCTGA GTTCGGCGGC CACCGGTTAT GAGACGGTGA TCACTCAGCT CAGCAGTGAG GGGTGGCTAG GTCCGGCGTC AGCGGCGATG GCCGAGGCAG TTGCGCCGTA TGTGGCGTGG ATGAGTGCCG CTGCGGCGCA AGCCGAGCAG GCGGCCACAC AGGCCAGGGC CGCCGCGGCC GCTTTTGAGG CGGCGTTTGC CGCGACGGTG CCTCCGCCGT TGATCGCGGC CAACCGGGCT TCGTTGATGC AGCTGATCTC GACGAATGTC TTTGGTCAGA ACACCTCGGC GATCGCGGCC GCCGAAGCTC AGTACGG
12. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 585 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: kétszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: DNS (genomiális) (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 12. számú szekvencia
TGGATTCCGA TAGCGGTTTC GGCCCCTCGA CGGGCGACCA CGGCGCGCAG GCCTCCGAAC GGGGGGCCGG GACGCTGGGA TTCGCCGGGA CCGCAACCAA AGAACGCCGG GTCCGGGCGG TCGGGCTGAC CGCACTGGCC GGTGATGAGT TCGGCAACGG CCCCCGGATG CCGATGGTGC CGGGGACCTG GGAGCAGGGC AGCAACGAGC CCGAGGCGCC CGACGGATCG GGGAGAGGGG GAGGCGACGG CTTACCGCAC GACAGCAAGT AACCGAATTC CGAATCACGT GGACCCGTAC GGGTCGAAAG GAGAGATGTT ATGAGCCTTT TGGATGCTCA TATCCCACAG TTGGTGGCCT CCCAGTCGGC GTTTGCCGCC AAGGCGGGGC TGATGCGGCA CACGATCGGT CAGGCCGAGC AGGCGGCGAT GTCGGCTCAG GCGTTTCACC AGGGGGAGTC GTCGGCGGCG TTTCAGGCCG CCCATGCCCG GTTTGTGGCG GCGGCCGCCA AAGTCAACAC CTTGTTGGAT GTCGCGCAGG CGAATCTGGG TGAGGCCGCC GGTACCTATG TGGCCGCCGA TGCTG
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
967
120
180
240
300
360
420
480
540
585
13. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 144 aminosav
HU 226 520 Β1 (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 13. számú szekvencia
Ala 1 Leu Val Thr Thr 5 Asn Phe Phe Gly Val 10 Asn Thr Ile Pro Ile 15 Ala
Leu Asn Glu Ala Asp Tyr Leu Arg Met Trp Ile Gin Ala Ala Thr Val
20 25 30
Met Ser His Tyr Gin Ala Val Ala His Glu Ile Trp Cys Leu His Glu
35 40 45
Xaa Ala Ser Ser Gly Lys Pro Trp Ala Ser Ile Thr Thr Gly Ala Pro
50 55 60
Gly Ser Pro Ala Ser Thr Thr Arg Ser Arg Thr Pro Leu Val Ser Thr
65 70 75 80
Asn Arg Xaa Val Xaa Ala Pro Ile Val Ser Pro Asn His Thr Gly His
85 90 95
Arg Pro Glu Lys Gly Leu Gly Ser Xaa Gin Arg Arg Leu Ser Arg Val
100 105 110
Leu Pro Arg Ile Ile Asp Arg Pro Ala Gly Pro Xaa Gly Pro Pro Leu
115 120 125
Thr Ser Gly Ser His Phe Leu Cys Ser Trp His Gly Tyr Ser Ser Gin
130 135 140
14. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 352 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 14. számú szekvencia
His 1 Ala Leu Ala Ala 5 Gin Tyr Thr Glu Ile 10 Ala Thr Glu Leu Ala 15 Ser
Val Leu Ala Ala Val Gin Ala Ser Ser Trp Gin Gly Pro Ser Ala Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Ala His Gin Pro Phe Arg Tyr Trp Leu Thr His Ala
40 45
HU 226 520 Β1
Alá Thr Val Alá Thr Alá Alá Alá Alá Alá His Xaa 60 Thr Alá Alá Alá
50 55
Gly Tyr Thr Ser Alá Leu Gly Gly Met Pro Thr Leu Alá Glu Leu Alá
65 70 75 80
Alá Asn His Alá Met His Gly Alá Leu Val Thr Thr Asn Phe Phe Gly
85 90 95
Val Asn Thr Ile Pro Ile Alá Leu Asn Glu Alá Asp Tyr Leu Arg Met
100 105 110
Trp Ile Gin Alá Alá Thr Val Met Ser His Tyr Gin Alá Val Alá His
115 120 125
Glu Ser Val Alá Alá Thr Pro Ser Thr Pro Pro Alá Pro Gin Ile Val
130 135 140
Thr Ser Alá Alá Ser Ser Alá Alá Ser Ser Ser Phe Pro Asp Pro Thr
145 150 155 160
Lys Leu Ile Leu Gin Leu Leu Lys Asp Phe Leu Glu Leu Leu Arg Tyr
165 170 175
Leu Alá Val Glu Leu Leu Pro Gly Pro Leu Gly Asp Leu Ile Alá Gin
180 185 190
Val Leu Asp Trp Phe Ile Ser Phe Val Ser Gly Pro Val Phe Thr Phe
195 200 205
Leu Alá Tyr Leu Val Leu Asp Pro Leu Ile Tyr Phe Gly Pro Phe Alá
210 215 220
Pro Leu Thr Ser Pro Val Leu Leu Pro Alá Val Glu Leu Arg Asn Arg
225 230 235 240
Leu Lys Thr Alá Thr Gly Leu Thr Leu Pro Pro Thr Val Ile Phe Asp
245 250 255
His Pro Thr Pro Thr Alá Val Alá Glu Tyr Val Alá Gin Gin Met Ser
260 265 270
Gly Ser Arg Pro Thr Glu Ser Gly Asp Pro Thr Ser Gin Val Val Glu
275 280 285
Pro Alá Arg Alá Glu Phe Gly Thr Ser Alá Val His Gin Ile Pro Pro
290 295 300
Arg Pro Alá Asp Thr Arg Arg Alá Cys Arg His Arg Asp Asp Val Pro
305 310 315 320
Arg Asp Ser Arg Ile Alá Gin His Arg Asp Gly Alá Gly Leu Asp Pro
325 330 335
Thr Glu Arg Gly Thr Ser Glu Gly Asp Gin Gly Leu Val Ser Gly Trp
340 345 350
15. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 141 aminosav
HU 226 520 Β1 (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 15. számú szekvencia
Met 1 Asp Phe Gly Alá 5 Leu Pro Pro Glu Val 10 Asn Ser Val Arg Met 15 Tyr
Alá Val Pro Gly Ser Alá Pro Met Val Alá Alá Alá Ser Alá Trp Asn
20 25 30
Gly Leu Alá Alá Glu Leu Ser Ser Alá Alá Thr Gly Tyr Glu Thr Val
35 40 45
He Thr Gin Leu Ser Ser Glu Gly Trp Leu Gly Pro Alá Ser Alá Alá
50 55 60
Met Alá Glu Alá Val Alá Pro Tyr Val Alá Trp Met Ser Alá Alá Alá
65 70 75 80
Alá Gin Alá Glu Gin Alá Alá Thr Gin Alá Arg Alá Alá Alá Alá Alá
85 90 95
Phe Glu Alá Alá Phe Alá Alá Thr Val Pro Pro Pro Leu He Alá Alá
100 105 110
Asn Arg Alá Ser Leu Met Gin Leu He Ser Thr Asn Val Phe Gly Gin
115 120 125
Asn Thr Ser Alá He Alá Alá Alá Glu Alá Gin Tyr Gly
130 135 140
16. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 58 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 16. számú szekvencia
Met Alá 1 Ser Arg Phe 5 Met Thr Asp Pro His 10 Alá Met Arg Asp Met 15 Alá
Gly Arg Phe Glu 20 Val His Alá Gin Thr 25 Val Glu Asp Glu Alá 30 Arg Arg
HU 226 520 Β1
Met Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp Ser Gly Met 35 40 45
Alá Glu Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr 50 55
11. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 67 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 17. számú szekvencia
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Alá His Gly Alá Met
1 5 10 15
Ile Arg Alá Gin Alá Alá Ser Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Val
20 25 30
Arg Asp Val Leu Alá Alá Gly Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Val
35 40 45
Alá Cys Gin Glu Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin
18. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 58 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 18. számú szekvencia
Met Alá Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Alá Met Arg Asp Met Alá
1 5 10 15
Gly Arg Phe Glu Val His Alá Gin Thr Val Glu Asp Glu Alá Arg Arg
20 25 30
Met Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp Ser Gly Met
35 40 45
Alá Glu Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr
50 55
HU 226 520 Β1
19. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 19. számú szekvencia
Met 1 Thr Ile Asn Tyr 5 Gin Phe Gly Asp Val 10 Asp Alá His Gly Alá 15 Met
He Arg Alá Gin Alá Alá Ser Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Val
20 25 30
Arg Asp Val Leu Alá Alá Gly Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Val
35 40 45
Alá Cys Gin Glu Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Gly Ser Ser Trp Alá
85 90
20. számú szekvenciavázlat (I) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 30 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 20. számú szekvencia
Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp Alá Asn Asn
1 5 10 15
Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Alá Ser Gin Gin Ile Leu Ser Ser
25 30
21. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
HU 226 520 Β1 (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 21. számú szekvencia
Met 1 Thr Ile Asn Tyr 5 Gin Phe Gly Asp Val 10 Asp Alá His Gly Alá 15 Met
Ile Arg Alá Gin Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Ile
20 25 30
Arg Asp Val Leu Thr Alá Ser Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Alá
35 40 45
Alá Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Gly Ser Ser Trp Alá
90
22. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 69 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 22. számú szekvencia
Alá Arg Arg Met Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp
1 5 10 15
Ser Gly Met Alá Glu Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Alá Gin Met Asn
20 25 30
Gin Alá Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly
35 40 45
Leu Val Arg Asp Alá Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Alá Ser Gin
50 55 60
Gin Ile Leu Ser Ser
23. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
HU 226 520 Β1 (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 94. számú szekvencia
Met 1 Thr He Asn Tyr 5 Gin Phe Gly Asp Val 10 Asp Alá His Gly Alá 15 Met
He Arg Alá Gin Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá He He
20 25 30
Arg Asp Val Leu Thr Alá Ser Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Alá
35 40 45
Alá Cys Gin Gly Phe He Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val He
50 55 60
Tyr Glu Gin Alá Asn Thr His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Xaa Ser Ser Trp Alá
85 90
24. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 52 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 24. számú szekvencia
Gly 1 Met Alá Glu Alá 5 Thr Ser Xaa Asp Thr 10 Met Thr Gin Met Asn 15 Gin
Alá Phe Arg Asn 20 He Val Asn Met Leu 25 His Gly Val Arg Asp 30 Gly Leu
Val Arg Asp 35 Alá Asn Xaa Tyr Glu 40 Gin Gin Glu Gin Alá 45 Ser Gin Gin
He Leu 50 Ser Ser
25. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 25. számú szekvencia
Met 1 Thr Ile Asn Tyr 5 Gin Phe Gly Asp Val Asp Alá 10 His Gly Alá 15 Met
Ile Arg Alá Gin Alá Gly Ser Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Alá Ser Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Alá
35 40 45
Alá Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Xaa
50 55 60
Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Gly Ser Ser Trp Alá
90
26. számú szekvenciavázlat
(i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 98 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
(ii) A molekula típusa: peptid
(vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis
(xi) A szekvencia leírása: 26. számú szekvencia
Met Thr Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Alá Met Arg Asp Met Alá
1 5 10 15
Gly Arg Phe Glu Val His Alá Gin Thr Val Glu Asp Glu Alá Arg Arg
20 25 30
Met Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp Ser Gly Met
35 40 45
Alá Glu Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Alá Gin Met Asn Gin Alá Phe
50 55 60
Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg
65 70 75 80
Asp Alá Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Alá Ser Gin Gin Ile Leu
85 90 95
Ser Ser
27. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav
HU 226 520 Β1 (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 27. számú szekvencia
Met 1 Thr Ile Asn Tyr Gin 5 Phe Gly Asp Val 10 Asp Alá His Gly Alá 15 Met
Ile Arg Alá Xaa Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Alá Ser Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Alá
35 40 45
Alá Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Gly Ser Ser Trp Alá
85 90
28. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 81 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 28. számú szekvencia
Arg 1 Phe Glu Val His 5 Alá Gin Thr Val Glu 10 Asp Glu Alá Arg Arg 15 Met
Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp Ser Gly Met Alá
20 25 30
Xaa Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Alá Gin Met Asn Gin Alá Phe Arg
35 40 45
Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp
50 55 60
Alá Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Alá Ser Gin Gin Ile Leu Ser
65 70 75 80
Ser
HU 226 520 Β1
29. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 29. számú szekvencia
Met 1 Thr Ile Asn Tyr 5 Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala 10 His Gly Ala 15 Met
Ile Arg Ala Leu Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
90
30. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 11 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 30. számú szekvencia
Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin Ile Leu Ser Ser 15 10
31. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 94 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 31. számú szekvencia
Met 1 Thr Ile Asn Tyr Gin 5 Phe Gly Asp Val 10 Asp Alá His Gly Alá 15 Met
Ile Arg Alá Gin Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Ile
20 25 30
Arg Asp Val Leu Thr Alá Ser Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Alá
35 40 45
Alá Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Gly Ser Ser Trp Alá
85 90
32. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 99 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 32. számú szekvencia
Met 1 Ser Phe Val Thr 5 Thr Gin Pro Glu Alá 10 Leu Alá Alá Alá Alá 15 Alá
Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met Asn Alá Gin Asn Alá Alá Alá
20 25 30
Alá Alá Pro Thr Thr Gly Val Val Pro Alá Alá Alá Asp Glu Val Ser
35 40 45
Alá Leu Thr Alá Alá Gin Phe Alá Alá His Alá Gin Met Tyr Gin Thr
50 55 60
Val Ser Alá Gin Alá Alá Alá Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu
65 70 75 80
Val Alá Ser Ser Gly Ser Tyr Alá Alá Thr Glu Alá Alá Asn Alá Alá
90 95
Alá Alá Gly
33. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 99 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
HU 226 520 Β1 (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 33. számú szekvencia
Met 1 Ser Phe Val Thr 5 Thr Gin Pro Glu Alá 10 Leu Alá Alá Alá Alá 15 Alá
Asn Leu Gin Gly 20 Ile Gly Thr Thr Met 25 Asn Alá Gin Asn Alá 30 Alá Alá
Alá Alá Pro 35 Thr Thr Gly Val Val 40 Pro Alá Alá Alá Asp 45 Glu Val Ser
Alá Leu 50 Thr Alá Alá Gin Phe 55 Alá Alá His Alá Gin 60 Met Tyr Gin Thr
Val 65 Ser Alá Gin Alá Alá 70 Alá Ile His Glu Met 75 Phe Val Asn Thr Leu 80
Val Alá Ser Ser Gly Ser Tyr Alá Alá Thr Glu Alá Alá Asn Alá Alá
90 95
Alá Alá Gly
34. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 34. számú szekvencia
Asp Pro His Alá Met Arg Asp Met Alá Gly Arg Phe Glu Val His 15 10 15
35. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 35. számú szekvencia
Arg Asp Met Alá Gly Arg Phe Glu Val His Alá Gin Thr Val Glu 15 10 15
HU 226 520 Β1
36. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 36. számú szekvencia
Arg Phe Glu Val His Alá Gin Thr Val Glu Asp Glu Alá Arg Arg 15 10 15
37. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 37. számú szekvencia
Alá Gin Thr Val Glu Asp Glu Alá Arg Arg Met Trp Alá Ser Alá 15 10 15
38. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 38. számú szekvencia
Asp Glu Alá Arg Arg Met Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly 15 10 15
39. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 39. számú szekvencia
Met Trp Alá Ser Alá Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp Ser Gly 15 10 15
40. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 40. számú szekvencia
Gin Asn Ile Ser Gly Alá Gly Trp Ser Gly Met Alá Glu Alá Thr 15 10 15
41. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 16 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 41. számú szekvencia
Alá Gly Trp Ser Gly Met Alá Glu Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr 15 10 15
42. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 42. számú szekvencia
Met Alá Glu Alá Thr Ser Leu Asp Thr Met Alá Gin Met Asn Gin 15 10 15
HU 226 520 Β1
43. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 43. számú szekvencia
Ser Leu Asp Thr Met Alá Gin Met Asn Gin Alá Phe Arg Asn Ile 15 10 15
44. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 44. számú szekvencia
Alá Gin Met Asn Gin Alá Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His 15 10 15
45. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 45. számú szekvencia
Alá Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly 15 10 15
46. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 46. számú szekvencia
Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp Alá 15 10 15
47. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 47. számú szekvencia
Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp Alá Asn Asn Tyr Glu Gin 15 10 15
48. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 48. számú szekvencia
Leu Val Arg Asp Alá Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Alá Ser 15 10 15
49. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 16 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 49. számú szekvencia
Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Alá Ser Gin Gin Ile Leu Ser Ser 15 10 15
HU 226 520 Β1
50. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 17 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 50. számú szekvencia
Met Alá Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Alá Met Arg Asp Met Alá 15 10 15
51. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 51. számú szekvencia
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Alá His Gly Alá 15 10 15
52. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 52. számú szekvencia
Gin Phe Gly Asp Val Asp Alá His Gly Alá Met Ile Arg Alá Gin 15 10 15
53. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
HU 226 520 Β1 (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 53. számú szekvencia
Asp Alá His Gly Alá Met Ile Arg Alá Gin Alá Alá Ser Leu Glu 15 10 15
54. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 54. számú szekvencia
Met Ile Arg Alá Gin Alá Alá Ser Leu Glu Alá Glu His Gin Alá 15 10 15
55. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 55. számú szekvencia
Alá Alá Ser Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Val Arg Asp Val 15 10 15
56. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 56. számú szekvencia
Alá Glu His Gin Alá Ile Val Arg Asp Val Leu Alá Alá Gly Asp 15 10 15
HU 226 520 Β1
57. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 57. számú szekvencia
Ile Val Arg Asp Val Leu Alá Alá Gly Asp Phe Trp Gly Gly Alá 15 10 15
58. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 16 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum. tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 58. számú szekvencia
Leu Alá Alá Gly Asp Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Val Alá Cys Gin 15 10 15
59. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 59. számú szekvencia
Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Val Alá Cys Gin Glu Phe Ile Thr 15 10 15
60. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 60. számú szekvencia
Gly Ser Val Alá Cys Gin Glu Phe lle Thr Gin Leu Gly Arg Asn 15 10 15
61. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 18 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: pepiid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 61. számú szekvencia
Gin Glu Phe lle Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val lle Tyr Glu 15 10 15
Gin Alá
62. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 62. számú szekvencia
Arg Asn Phe Gin Val He Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin 15 10 15
63. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 63. számú szekvencia lle Tyr Glu Gin Alá Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá 15 10 15
HU 226 520 Β1
64. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 64. számú szekvencia
Asn Alá His Gly Gin Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn Asn Met Alá 15 10 15
65. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 65. számú szekvencia
Lys Val Gin Alá Alá Gly Asn Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá 15 10 15
66. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 16 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 66. számú szekvencia
Gly Asn Asn Met Alá Gin Thr Asp Ser Alá Val Gly Ser Ser Trp Alá 15 10 15
67. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 67. számú szekvencia
Asp Alá His Gly Alá Met He Arg Alá Leu Alá Gly Leu Leu Glu 15 10 15
68. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 68. számú szekvencia
Asp Alá His Gly Alá Met Ile Arg Alá Gin Alá Gly Leu Leu Glu 15 10 15
69. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 69. számú szekvencia
Met Ile Arg Alá Leu Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá 15 10 15
70. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacteríum tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 70. számú szekvencia
Met Ile Arg Alá Gin Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá 15 10 15
HU 226 520 Β1
71. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 71. számú szekvencia
Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Ile Ser Asp Val 15 10 15
72. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 72. számú szekvencia
Alá Gly Leu Leu Glu Alá Glu His Gin Alá Ile Ile Arg Asp Val 15 10 15
73. számú szekvenciavázlat (í) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 73. számú szekvencia
Alá Glu His Gin Alá Ile Ile Ser Asp Val Leu Thr Alá Ser Asp 15 10 15
74. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 74. számú szekvencia
Ala Glu His Gin Ala Ile Ile Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp 15 10 15
75. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 75. számú szekvencia
Ile Ile Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala 15 10 15
76. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 76. számú szekvencia
Ile Ile Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala 15 10 15
77. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 16 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 77. számú szekvencia
Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala Ala Cys Gin 15 10 15
HU 226 520 Β1
78. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 78. számú szekvencia
Phe Trp Gly Gly Alá Gly Ser Alá Alá Cys Gin Gly Phe Ile Thr 15 10 15
79. számú szekvenciavázlat (I) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 79. számú szekvencia
Gly Ser Alá Alá Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn 15 10 15
80. számú szekvenciavázlat (I) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 80. számú szekvencia
Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile Tyr 15 10 15
81. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 25 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 81. számú szekvencia
Val Thr Thr Asn Phe Phe Gly Val Asn Thr Ile Pro Ile Alá Leu Asn 15 10 15
Glu Alá Asp Tyr Leu Arg Met Trp Ile 20 25
82. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 25 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 82. számú szekvencia
Asn Glu Alá Asp Tyr Leu Arg Met Trp Ile Gin Alá Alá Thr Val Met 15 10 15
Ser His Tyr Gin Alá Val Alá His Glu 20 25
83. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 967 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 83. számú szekvencia
TGAGCGCCAA CCCTACCGTC GGTTCGTCAC ACGGACCGCA TGGCCTGCTC CGCGGACTGC 60
CGCTAGGGTC GCGGATCACT CGGCGTAGCG GCGCCTTTGC CCACCGATAT GGGTTCCGTC 120
ACAGTGTGGT TGCCCGCCCG CCATCGGCCG GATAACGCCA TGACCTCAGC TCGGCAGAAA 180
TGACAATGCT CCCAAAGGCG TGAGCACCCG AAGACAACTA AGCAGGAGAT CGCATGCCGT 240
TTGTGACTAC CCAACCAGAA GCACTGGCGG CGGCGGCCGG CAGTCTGCAG GGAATCGGCT 300
CCGCATTGAA CGCCCAGAAT GCGGCTGCGG CGACTCCCAC GACGGGGGTG GTCCGGCGGC 360
CGCCGATGAA NTGTCGGCGC TGACGGCGGC TCAGTTCGCG GCACACGCCC AGATCTATCA 420
GGCCGTCAGC GCCCAGGCCG CGGCGATTCA CGAGATGTTC GTCAACACTC TACAGATGAG 480
CTCAGGGTCG TATGCTGCTA CCGAGGCCGC CAACGCGGCC GCGGCCGGNT AGAGGAGTCA 540
CTGCGATGGA TTTTGGGGCG TTGCCGCCGG AGGTCAATTC GGTGCGGATG TATGCCGTTC 600
CTGGCTCGGC ACCAATGGTC GCTGCGGCGT CGGCCTGGAA CGGGTTGGCC GCGGAGCTGA 660
GTTCGGCGGC CACCGGTTAT GAGACGGTGA TCACTCAGCT CAGCAGTGAG GGGTGGCTAG 720
GTCCGGCGTC AGCGGCGATG GCCGAGGCAG TTGCGCCGTA TGTGGCGTGG ATGAGTGCCG 780
CTGCGGCGCA AGCCGAGCAG GCGGCCACAC AGGCCAGGGC CGCCGCGGCC GCTTTTGAGG 840
CGGCGTTTGC CGCGACGGTG CCTCCGCCGT TGATCGCGGC CAACCGGGCT TCGTTGATGC 900
AGCTGATCTC GACGAATGTC TTTGGTCAGA ACACCTCGGC GATCGCGGCC GCCGAAGCTC 960
AGTACGG 967
HU 226 520 Β1
84. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 84. számú szekvencia
Met Ser Phe Val Thr Thr Gin Pro Glu Alá Leu Alá Alá Alá Alá 15 10 15
85. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 85. számú szekvencia
Thr Gin Pro Glu Alá Leu Alá Alá Alá Alá Alá Asn Leu Gin Gly 15 10 15
86. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 86. számú szekvencia
Leu Alá Alá Alá Alá Alá Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met 15 10 15
87. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 87. számú szekvencia
Alá Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met Asn Alá Gin Asn Alá 15 10 15
88. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav
HU 226 520 Β1 (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 88. számú szekvencia
Ile Gly Thr Thr Met Asn Alá Gin Asn Alá Alá Alá Alá Alá Pro 15 10 15
89. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 89. számú szekvencia
Asn Alá Gin Asn Alá Alá Alá Alá Alá Pro Thr Thr Gly Val Val 15 10 15
90. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 90. számú szekvencia
Alá Alá Alá Alá Pro Thr Thr Gly Val Val Pro Alá Alá Alá Asp 15 10 15
91. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 91. számú szekvencia
Thr Thr Gly Val Val Pro Alá Alá Alá Asp Glu Val Ser Alá Leu 15 10 15
92. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 92. számú szekvencia
Pro Alá Alá Alá Asp Glu Val Ser Alá Leu Thr Alá Alá Gin Phe 15 10 15
93. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 93. számú szekvencia
Glu Val Ser Alá Leu Thr Alá Alá Gin Phe Alá Alá His Alá Gin 15 10 15
94. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (vi) Eredeti forrás:
(A) Szervezet: Mycobacterium tuberculosis (xi) A szekvencia leírása: 94. számú szekvencia
Thr Alá Alá Gin Phe Alá Alá His Alá Gin Met Tyr Gin Thr Val 15 10 15
95. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 95. számú szekvencia
Alá Alá His Alá Gin Met Tyr Gin Thr Val Ser Alá Gin Alá Alá 15 10 15
96. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 16 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 96. számú szekvencia
Met Tyr Gin Thr Val Ser Alá Gin Alá Alá Alá Ile His Glu Met Phe 15 10 15
97. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltfpus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 97. számú szekvencia
Ser Alá Gin Alá Alá Alá Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu 15 10 15
98. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 98. számú szekvencia
Alá Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu Val Alá Ser Ser Gly 15 10 15
99. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 99. számú szekvencia
Phe Val Asn Thr Leu Val Alá Ser Ser Gly Ser Tyr Alá Alá Thr 15 10 15
100. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 100. számú szekvencia
Val Alá Ser Ser Gly Ser Tyr Alá Alá Thr Glu Alá Alá Asn Alá 15 10 15
HU 226 520 Β1
101. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 14 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 101. számú szekvencia
Ser Tyr Alá Alá Thr Glu Alá Alá Asn Alá Alá Alá Alá Gly 15 10
102. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1784 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 102. számú szekvencia
ATTCGTTCCT GCCGCAGCTA AATCCCGGGG ACATCGTCGC CGGCCAGTAC GAGGTCAAAG 60
GCTGCATCGC GCACGGCGGA CTGGGCTGGA TCTACCTCGC TCTCGACCGC AATGTCAACG 120
GCCGTCCGGT GGTGCTCAAG GGCCTGGTGC ATTCCGGTGA TGCCGAAGCG CAGGCAATGG 180
CGATGGCCGA ACGCCAGTTC CTGGCCGAGG TGGTGCACCC GTCGATCGTG CAGATCTTCA 240
ACTTTGTCGA GCACACCGAC AGGCACGGGG ATCCGGTCGG CTACATCGTG ATGGAATACG 300
TCGGCGGGCA ATCGCTCAAA CGCAGCAAGG GTCANAAACT GCCCGTCGCG GAGGCCATCG 360
CCTACCTGCT GGAGATCCTG CCGGCGCTGA GCTACCTGCA TTCCATCGGC TTGGTCTACA 420
ACGACCTGAA GCCGGAAAAC ATCATGCTGA CCGAGGAACA GCTCAAGCTG ATCGACCTGG 480
GCGCGGTATC GCGGATCAAC TCGTTCGGCT ACCTCTACGG GACCCCAGGC TTCCAGGCGC 540
CCGAGATCGT GCGGACCGGT CCGACGGTGG CCACCGACAT CTACACCGTG GGACGCACGC 600
TCGCGGCGCT CACGCTGGAC CTGCCCACCC GCAATGGCCG TTATGTGGAT GGGCTACCCG 660
AAGACGACCC GGTGCTGAAA ACCTACGACT CTTACGGCCG GTTGCTGCGC AGGGCCATCG 720
ACCCCGATCC GCGGCAACGG TTCACCACCG CCGAAGAGAT GTCCGCGCAA TTGACGGGCG 780
TGTTGCGGGA GGTGGTCGCC CAGACACCGG GGTGCCGCGG CCAGGCTATC AACGATCTTC 840
AGTCCCAGTC GGTCGACATT TGGAGTGGAC TGCTGGTGGC GCACACCGAC GTGTATCTGG 900
ACGGGCAGGT GCACGCGGAG AAGCTGACCG CCAACGAGAT CGTGACCGCG CTGTCGGTGC 960
CGCTGGTCGA TCCGACCGAC GTCGCAGCTT CGGTCCTGCA GGCCACGGTG CTCTCCCAGC 1020
CGGTGCAGAC CCTAGACTCG NTGCGCGCGG CCCGCCACGG TGCGCTGGAC GCCGACGGCG 1080
TCGATTNTCC GAGTCAGTGG AGCTGCCGCT AATGGAAGTC CGCGCGCTGC TGGATCTCGG 1140
CGATGTGGCC AAGGCCACCC GAAAACTCGA CGATCTGGCC GAACGCGTTG GCTGGCGATG 1200
GCGATTGGTC TGGTACCGGG CCGTCGCCGA GCTGCTCACC GGCGACTATG ACTCGGCCAC 1260
CAAACATTTC ACCGAGGTGC TGGATACCTT TCCCGGCGAG CTGGCGCCCA AGCTCGCCCT 1320
GGCCGCCACC GCCGAACTAG CCGGCAACAC CGACGAACAC AAGTTCTATC AGACGGTGTG 1380
GAGCACCAAC GACGGCGTGA TCTCGGCGGC TTTCGGACTG GCCAGAGCCC GGTCGGCCGA 1440
AGGTGATCGG GTCGGCGCCG TGCGCACGCT CGACGAGGTA CCGCCCACTT CTCGGCATTT 1500
CACCACGGCA CGGCTGACCA GCGCGGTGAC TCTGTTGTCC GGCCGGTCAA CGAGTGAAGT 1560
CACCGAGGAA CAGATCCGCG ACGCCGCCCG AAGAGTGGAG GCGCTGCCCC CGACCGAACC 1620
ACGCGTGCTG CAGATCCGCG CCCTGGTGCT GGGTGGCGCG CTGGACTGGC TGAAGGACAA 1680
CAAGGCCAGC ACCAACCACA TCCTCGGTTT CCCGTTCACC AGTCACGGGC TGCGGCTGGG 1740
TGTCGAGGCG TCACTGCGCA GCCTGGCCCG GGTAGCTCCC ACTC 1784
103. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 766 bázispár (B) Típus: nukleinsav
HU 226 520 Β1 (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 103. számú szekvencia
ACAARACACT CGGYGGCKGC CGMTCCGGCC TGATCGTCGG TGATCAGCYT CGTGCCAAAY 60 TCGGCACAAG GTGCGCGCTR CCCAANGAGT TCTTCGCCGC RGTGCGMGCM KAACTGGCCT 120 ATCNTGGTTG GGTGCCGTCC CGCANAACCC GCGAACTTAA ACCCATTTTA ACCGGGCAGG 180 AAGTTTCCTA CATYTACCCN RGSMANCCAA CCGGGCCGCC NANAAMTCCG TCCTGGANTC 240 CGANCGGTTC CCGGTGTTCG CCGCACTGCT GACCGGCACG GARTATCCGC AGGCGGCGTT 300 GGCCAACGCG TGGGTGCAAC TGGCCTACGG TGCGCACCAS GACGCCATCA CCGGCTCGGA 360 GTCCGACCAG GTACTCAATG CTGGCGACCA CACCAGCCAG CAGACCAAAC TGGTGCACGC 420 CGATCTCCAG GCGCGCCGGC CCGGTGGCAT ACGGATTGGT CGAAACCAAT CCGAAGGAAT 480 TCATCACGGA CGGTCACGGA AAACGATCGC CCCAATGGGN GGACNACCCN AGCCAGGCGN 540 ATTNACCGTT NAACAAGTTG GNGTAGGTTC TTTGATATCG AKCAACCGAT ACGGAKCGGM 600 CCGCGGAATG GTAGACCACC ACCAGTGCCC NCAMGTMGTG CACCAGTTTG GTCATCGCCC 660 GCAGATCGGT GACCCCGCCA AGCGTTCCGG ATGCGGAGAT GASGGTGACC AGCCYGGTTG 720 ACCTGTTGAT CAGGTTNTCC CAGTGCCACG TCGGCAGCTG GCCGGT 766
104. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1231 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 104. számú szekvencia
CGGCACGAGA ATGTCGCCTG TGCCTCGATA GCCACTTGCG TGTGGTCGCG CTGCCAGCGG 60 GTCAGCCAGG TCGCCTGGTC CAGGCCATCG GGCCGGCGCA GGAGCGCGAT GTTGGCCAGA 120 CCCGGTGTAC GAGAACCGGA CTCGACNAAG TGTCGGCGCT GACGGCGGCT CAGTTCGCGG 180 CACACGCCCA GATCTATCAG GCCGTCAGCG CCCAGGCCGC GGCGATTCAC GAGATGTTCG 240 TCAACACTCT ACAGATNANC TCAGGGTCGT ATGCTGCTAC CGAGGCCGCC AACGCGGCCG 300 CGGCCGGCTA GAGGAGTCAC TGCGATGGAT TZTGGGGCGT TGCCGCCGGA GGTCAATTCG 360 GTGCGGATGT ATGCCGGTCC TGGCTCGGCA CCAATGGTCG CTGCGGCGTC GGCCTGGAAC 420 GGGTTGGCCG CGGAGCTGAG TTCGGCGGCC ACCGGTTATG AGACGGTGAT CACTCAGCTC 480 AGCAGTGAGG GGTGGCTAGG TCCGGCGTCA GCGGCGATGG CCGAGGCAGT TGCGCCGTAT 540 GTGGCGTGGA TGAGTGCCGC TGCGGCGCAA GCCGAGCAGG CGGCCACACA GGCCAGGGCC 600 GCCGCGGCCG CTTTTGAGGC GGCGTTTGCC GCGACGGTGC CTCCGCCGTT GATCGCGGCC 660 AACCGGGCTT CGTTGATGCA GCTGATCTCG ACGAATGTCT TTGGTCAGAA CACCTCGGCG 720 ATCGCGGCCG CCGAAGCTCA GTACGGCGAG ATGTGGGCCC AAGACTCCGC GGCGATGTAT 780 GCCTACGCGG GCAGTTCGGC GAGCGCCTCG GCGGTCACGC CGTTTAGCAC GCCGCCGCAG 840 ATTGCCAACC CGACCGCTCA GGGTACGCAG GCCGCGGCCG TGGCCACCGC CGCCGGTACC 900 GCCCAGTCGA CGCTGACGGA GATGATCACC GGGCTACCCA ACGCGCTGCA AAGCCTCACC 960 TCACNTCTGT TGCAGTCGTC TAACGGTCCG CTGTCGTGGC TGTGGCAGAT CTTGTTCGGC 1020 ACGCCCAATT TCCCCACCTC AATTTCGGCA CTGCTGACCG ACCTGCAGCC CTACGCGAGC 1080 TTNTTNTATA ACACCGAGGG CCTGCCGTAC TTCAGCATCG GCATGGGCAA CAACTTCATT 1140 CAGTCGGCCA AGACCCTGGG ATTGATCGGC TAGGCGGCAC CGGCTGCGGT CGCGGNTGCT 1200 GGGGATNCCG CCAAGGGCTT GCCTCGTGCC G 1231
105. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 2041 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
HU 226 520 Β1 (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 105. számú szekvencia
CGGCACGAGC TCGTGCCGAT CAGTGCCATT GACGGCTTGT ACGACCTTCT GGGGATTGGA 60 ATACCCAACC AAGGGGGTAT CCTTTACTCC TCACTAGAGT ACTTCGAAAA AGCCCTGGAG 120 GAGCTGGCAG CAGCGTTTCC GGGTGATGGC TGGTTAGGTT CGGCCGCGGA CAAATACGCC 180 GGCAAAAACC GCAACCACGT GAATTTTTTC CAGGAACTGG CAGACCTCGA TCGTCAGCTC 240 ATCAGCCTGA TCCACGACCA GGCCAACGCG GTCCAGACGA CCCGCGACAT CCTGGAGGGC 300 GCCAAGAAAG GTCTCGAGTT CGTGCGCCCG GTGGCTGTGG ACCTGACCTA CATCCCGGTC 360 GTCGGGCACG CCCTATCGGC CGCCTTCCAN GCGCCGTTTT GCGCGGGCGC GATGGCCGTA 420 GTGGGCGGCG CGCTTGCCTA CTTGGTCGTG AAAACGCTGA TCAACGCGAC TCAACTCCTC 480 AAATTGCTTG CCAAATTGGC GGAGTTGGTC GCGGCCGCCA TTGCGGACAT CATTTCGGAT 540 GTGGCGGACA TCATCAAGGG CATCCTCGGA GAAGTGTGGG AGTTCATCAC AAACGCGCTC 600 AACGGCCTGA AAGAGCTTTG GGACAAGCTC ACGGGGTGGG TGACCGGACT GTTCTCTCGA 660 GGGTGGTCGA ACCTGGAGTC CTTCTTTGCG GGCGTCCCCG GCTTGACCGG CGCGACCAGC 720 GGCTTGTCGC AAGTGACTGG CTTGTTCGGT GCGGCCGGTC TGTCCGCATC GTCGGGCTTG 780 GCTCACGCGG ATAGCCTGGC GAGCTCAGCC AGCTTGCCCG CCCTGGCCGG CATTGGGGGC 840 GGGTCCGGTT TTGGGGGCTT GCCGAGCCTG GCTCAGGTCC ATGCCGCCTC AACTCGGCAG 900 GCGCTACGGC CCCGAGCTGA TGGCCCGGTC GGCGCCGCTG CCGAGCAGGT CGGCGGGCAG 960 TCGCAGCTGG TCTCCGCGCA GGGTTCCCAA GGTATGGGCG GACCCGTAGG CATGGGCGGC 1020 ATGCACCCCT CTTCGGGGGC GTCGAAAGGG ACGACGACGA AGAAGTACTC GGAAGGCGCG 1080 GCGGCGGGCA CTGAAGACGC CGAGCGCGCG CCAGTCGAAG CTGACGCGGG CGGTGGGCAA 1140 AAGGTGCTGG TACGAAACGT CGTCTAACGG CATGGCGAGC CAAATCCATT GCTAGCCAGC 1200 GCCTAACAAC GCGCAATGCT AAACGGAAGG GACACGATCA ATGACGGAAA ACTTGACCGT 1260 CCAGCCCGAG CGTCTCGGTG TACTGGCGTC GCACCATGAC AACGCGGCGG TCGATGCNTC 1320 CTCGGGCGTC GAAGCTGCCG CTGGCCTAGG CGAATCTGTG GCGATCACTC ACGGTCCGTA 1380 CTGCTCACAG TTCAACGACA CGTTAAATGT GTACTTGACT GCCCACAATG CCCTGGGCTC 1440 GTCCTTGCAT ACGGCCGGTG TCGATCTCGC CAAAAGTCTT CGAATTGCGG CGAAGATATA 1500 TAGCGAGGCC GACGAAGGGT GGCGCAAGGC TATCGACGGG TTGTTTACCT GACCACGTTT 1560 GCTGCCCGCA GTGCAGGCCA CGACGTAGCG CAGGTCGTGT CCCTCGTAGG CGTGGATGCG 1620 ACCGGCCAGC ACCAGCACCC GGTGCGCACC GATGGGCACG GACAGTAGCT CGCCCGCATG 1680 CCCGGCTGCG GTTGGCGGCA CAAACCCGGG CAGTTCGGCC TGCGGCAGCA CGGTGGTNGG 1740 GGAGCCCAAC GCCGCAACGG CCGGTAACCA TCCCGACCCG AGCACGACCG AGACGTCATG 1800 TTCGCCGATC CCGGTGCGGT CAGCGATGAC CTGCGCCGCC CGCCGGGCCA GTTTGTCGGG 1860 ATCGGGGCGC GGGTCAGCCA GACTGGGCGA GCTTAACTGA GCCGCTCGCC GGGGAGCGGG 1920 TGCTNGTCGA TGAGATACTG CGAGCATGGC AGCAGCCAGG GCATCCGACC GCGTCGAGGA 1980 ATTGGTGCGG CGCCGTGGTG GCGAGCTGGT CGAGCTGTCC CATGCCATCC ACCTCGTGCC 2040 G 2041
106. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1202 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 106. számú szekvencia
GAGCTCACCG CTATCAACCA ATACTTTCTG CACTCCAAGA TGCAGGACAA CTGGGGTTTT 60 ACCGAGCTGG CGGCCCACAC CCGCGCGGAG TCGTTCGACG AAATGCGGCA CGCCGAGGAA 120 ATCACCGATC GCATCTTGTT GCTGGATGGT TTGCCGAACT ACCAGCGCAT CGGTTCGTTG 180 CGTATCGGCC AGACGCTCCG CGAGCAATTT GAGGCCGATC TGGCGATCGA ATACGACGTG 240 TTGAATCGTC TCAAGCCAGG AATCGTCATG TGCCGGGAGA AACAGGACAC CACCAGCGCC 300 GTACTGCTGG AGAAAATCGT TGCCGACGAG GAAGAACACA TCGACTACTT GGAAACGCAG 360 CTGGAGCTGA TGGACAAGCT AGGAGAGGAG CTTTACTCGG CGCAGTGCGT CTCTCGCCCA 420 CCGACCTGAT GCCCGCTTGA GGATTCTCCG ATACCACTCC GGGCGCCGCT GACAAGCTCT 480 AGCATCGACT CGAACAGCGA TGGGAGGGCG GATATGGCGG GCCCCACAGC ACCGACCACT 540
HU 226 520 Β1
GCCCCCACCG CAATCCGAGC CGGTGGCCCG CTGCTCAGTC CGGTGCGACG CAACATTATT 600 TTCACCGCAC TTGTGTTCGG GGTGCTGGTC GCTGCGACCG GCCAAACCAT CGTTGTGCCC 660 GCATTGCCGA CGATCGTCGC CGAGCTGGGC AGCACCGTTG ACCAGTCGTG GGCGGTCACC 720 AGCTATCTGC TGGGGGGAAC ACTSKYGKKK KTGKKGKSKS KSRMRMKCTC GGTGATCTGC 780 TCGGCCGCAA CAGGGTGCTG CTAGGCTCCG TCGTGGTCTT CGTCGTTGGC TCTGTGCTGT 840 GCGGGTTATC GGAGACGATG ACCATGCTGG CGATCTCTCG CGCACTGCAG GGCGTCGGTG 900 CCGGTGCGAT TTCCGTCACC GCCTACGCGC TGGCCGCTGA GGTGGTCCCA CTGCGGGACC 960 GTGGCCGCTA GCAGGGCGTC TTANGTGCGG TGTTCGGTGT CAACACGGTC ACCCGTCCGC 1020 TGCTGGGGGG CTGCGTCACC GACTATCTGA GCTGCCGGTG GGCGTTCCGA CCACCAGCCC 1080 CATCACCGAC CCGATCGCGG TCATCGCGGC GAACACCGCC CTCGCGGCGT TGCGGGCAGG 1140 TCCCTTGGGG AACGTGGTCC CACAGCGCCA GAACGGTCGG AAATGCGATG GCCGACCCAC 1200 AC 1202
107. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 496 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 107. számú szekvencia
GGCGGCGGCA GTTGGCCAGC AGTTNGGGCG GGGGAGCCGG TTCGGNGACC AAGAAATCGG 60 CCTGGGCAAG CAGCCGGGAC CGCGNACCGT GATCAGTTNG GATCGCCGGG ACCGCCGCCG 120 ACCAANGCCA TTCCGCCGNT GAGGAAGTCG GAANTNTGCG CAGTGATGAC GCCCTGCTGC 180 AACGCNTCCC GGATTGCCGA GCGGATCGCC GCCGAACGGC GGTGCTCACC ACCGGCGAGC 240 ACCCCTACNG ACAGGCCCGC ATAGCTGAAT GACGCCGGGT NACCGCCGTC CCNTCCACCG 300 NGANATCGGC CCGGANGCAA AAGATCCGTC GGCGCTCCGC CTCGGCGACG ACAGCCACGT 360 TCACCCGCGC GTTATCGGTG GCCGCGATCG CATACCAGGC GCCGTCAAGG TNGCCGTYGC 420 GGTAGTCACG CACCGACAAG GTGATYTGGT CCATCGCCTN GACGGCGGGG GTGACGCTGG 480 GGGCGATCAM GTGCAC 496
108. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 849 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 108. számú szekvencia
TGGATTCCGA TAGCGGTTTC GGCCCCTCGA CGGGCGACCA CGGCGCGCAG GCCTCCGAAC 60 GGGGGGCCGG GACGCTGGGA TTCGCCGGGA CCGCAACCAA AGAACGCCGG GTCCGGGCGG 120 TCGGGCTGAC CGCACTGGCC GGTGATGAGT TCGGCAACGG CCCCCGGATG CCGATGGTGC 180 CGGGGACCTG GGAGCAGGGC AGCAACGAGC CCGAGGCGCC CGACGGATCG GGGAGAGGGG 240 GAGGCGACGG CTTACCGCAC GACAGCAAGT AACCGAATTC CGAATCACGT GGACCCGTAC 300 GGGTCGAAAG GAGAGATGTT ATGAGCCTTT TGGATGCTCA TATCCCACAG TTGGTGGCCT 360 CCCAGTCGGC GTTTGCCGCC AAGGCGGGGC TGATGCGGCA CACGATCGGT CAGGCCGAGC 420 AGGCGGCGAT GTCGGCTCAG GCGTTTCACC AGGGGGAGTC GTCGGCGGCG TTTCAGGCCG 480 CCCATGCCCG GTTTGTGGCG GCGGCCGCCA AAGTCAACAC CTTGTTGGAT GTCGCGCAGG 540 CGAATCTGGG TGAGGCCGCC GGTACCTATG TGGCCGCCGA TGCTGCGGCC GCGTCGACCT 600 ATACCGGGTT CTGATCGAAC CCTGCTGACC GAGAGGACTT GTGATGTCGC AAATCATGTA 660 CAACTACCCC GCGATGTTGG GTCACGCCGG GGATATGGCC GGATATGCCG GCACGCTGCA 720 GAGCTTGGGT GCCGAGATCG CCGTGGAGCA GGCCGCGTTG CAGAGTGCGT GGCAGGGCGA 780 TACCGGGATC ACGTATCAGG CGTGGCAGGC ACANTGGTAA CCANGCCANG GAAGATTTGG 840 TGCGGGCCT 849
HU 226 520 Β1
109. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 97 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 109. számú szekvencia
Met 1 Ser Leu Leu Asp 5 Alá His Ile Pro Gin 10 Leu Val Alá Ser Gin 15 Ser
Alá Phe Alá Alá 20 Lys Alá Gly Leu Met 25 Arg His Thr Ile Gly 30 Gin Alá
Glu Gin Alá 35 Alá Met Ser Alá Gin 40 Alá Phe His Gin Gly 45 Glu Ser Ser
Alá Alá 50 Phe Gin Alá Alá His 55 Alá Arg Phe Val Alá 60 Alá Alá Alá Lys
Val 65 Asn Thr Leu Leu Asp 70 Val Alá Gin Alá Asn 75 Leu Gly Glu Alá Alá 80
Gly Thr Tyr Val Alá Alá Asp Alá Alá Alá Alá Ser Thr Tyr Thr Gly
90 95
Phe
110. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 110. számú szekvencia
Met Ser Leu Leu Asp Alá His Ile Pro Gin Leu Val Alá Ser Gin 15 10 15
111. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 111. számú szekvencia
Alá His Ile Pro Gin Leu Val Alá Ser Gin Ser Alá Phe Alá Alá 15 10 15
HU 226 520 Β1
112. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 112. számú szekvencia
Leu Val Alá Ser Gin Ser Alá Phe Alá Alá Lys Alá Gly Leu Met 15 10 15
113. számú szekvenciavázlat (í) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 113. számú szekvencia
Ser Alá Phe Alá Alá Lys Alá Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly 15 10 15
114. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 114. számú szekvencia
Lys Alá Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gin Alá Glu Gin Alá 15 10 15
115. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 115. számú szekvencia
Arg His Thr Ile Gly Gin Alá Glu Gin Alá Alá Met Ser Alá Gin 15 10 15
116. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav
HU 226 520 Β1 (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 116. számú szekvencia
Gin Alá Glu Gin Alá Alá Met Ser Alá Gin Alá Phe His Gin Gly 15 10 15
117. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 117. számú szekvencia
Alá Met Ser Alá Gin Alá Phe His Gin Gly Glu Ser Ser Alá Alá 15 10 15
118. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 118. számú szekvencia
Alá Phe His Gin Gly Glu Ser Ser Alá Alá Phe Gin Alá Alá His 15 10 15
119. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 119. számú szekvencia
Glu Ser Ser Alá Alá Phe Gin Alá Alá His Alá Arg Phe Val Alá 15 10 15
120. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 120. számú szekvencia
Phe Gin Alá Alá His Alá Arg Phe Val Alá Alá Alá Alá Lys Val 15 10 15
121. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 121. számú szekvencia
Alá Arg Phe Val Alá Alá Alá Alá Lys Val Asn Thr Leu Leu Asp 15 10 15
122. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 122. számú szekvencia
Alá Alá Alá Lys Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Alá Gin Alá Asn 15 10 15
123. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 15 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid (xi) A szekvencia leírása: 123. számú szekvencia
Asn Thr Leu Leu Asp Val Alá Gin Alá Asn Leu Gly Glu Alá Alá 15 10 15
124. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 18 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: peptid
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 124. számú szekvencia
Val Ala Gin Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala Gly Thr Tyr Val Ala Ala 15 10 15
Asp Ala
125. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1752 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 125. számú szekvencia
CGGCACGAGA ATGTCGCCTG TGCCTCGATA GCCACTTGCG TGTGGTCGCG CTGCCAGCGG 60
GTCAGCCAGG TCGCCTGGTC CAGGCCATCG GGCCGGCGCA GGAGCGCGAT GTTGGCCAGA 120
CCCGGTGTAC GAGAACCGGA CTCGACNAAG TGTCGGCGCT GACGGCGGCT CAGTTCGCGG 180
CACACGCCCA GATCTATCAG GCCGTCAGCG CCCAGGCCGC GGCGATTCAC GAGATGTTCG 240
TCAACACTCT ACAGATNANC TCAGGGTCGT ATGCTGCTAC CGAGCCCGCC AACGCGGCCG 300
CGGCCGGCTA GAGGAGTCAC TGCGATGGAT TTTGGGGCGT TGCCGCCGGA GGTCAATTCG 360
GTGCGGATGT ATGCCGGTCC TGGCTCGGCA CCAATGGTCG CTGCGGCGTC GGCCTGGAAC 420
GGGTTGGGGG CGGAGGTGAG TTCGGCGGCG ACCGGTTATG AGACGGTGAT CAGTCAGCTC 480
AGGAGTGAGG GGTGGGTAGG TCCGGGGTCA GCGGGGATGG CCGAGGCAGT TGGGCOGTAT 540
GTGGGGTGGA TGAGTGCCGC TGCGGCGCAA GCCGAGCAGG GGGCCACACA GGCCAGGGCC 600
GCCGCGGCGG CTTTTGAGGC GCCGTTTGGC GCGACGGTGC CTCCGCCGTT GATCGOGGOG 660
AACCGGGCTT CGTTGATGCA GCTGATCTCG ACGAATGTCT TTGGTCAGAA CACCTCGGGG 720
ATCGCGGCCG CCGAAGCTCA GTACGGCGAG ATGTGGGCCG AAGACTCCGC GGGGATGTAT 780
GCGTAGGCGG GCAGTTCGGC GAGGGCCTCG GCGGTCACGC CGTTTAGCAC GGGGCGGCAG 840
ATTGGCAACC CGACCGGTCA GGGTACGCAG GCGGGGGCGG TGGGCACCGC CGCCGGTACG 900
GCCCAGTCGA GGCTGACGGA GATGATCACC GGGCTACCGA ACGCGCTGCA AAGCCTOAGC 960
TCACNTCTGT TGCAGTCGTC TAACGGTCCG CTGTCGTGGC TGTGGCAGAT CTTGTTOGGG 1020
ACGCCGAATT TGCCCACGTC AATTTCGGGA CTGGTGACCG AGCTGCAGCC CTACGGGAGC 1080
TTNTTNTATA ACACCGAGGG CCTGCCGTAC TTCAGCATGG GCATGGGCAA CAACTTGATT 1140
CAGTCGGCGA AGACCCTGGG ATTGATCGGC TAGGGGGCAC CGGGTGGGGT CGCGGCTGGT 1200
GGGGATGCCG CGAAGGGGTT GCGTGGACTG GGCGGGATGG TCGGTGGGGG GCGGCTGGCG 1260
GCGGGTCTGG GGAATGCGGC TTGGGTTGGC AAGCTGTCGG TGCGGGCGGT GTGGAMTGGA 1320
CCGTTGCCCG GGTCGGTGAC TCCGGGGGCT GCTCCGCTAC CGGTGAGTAC GGTCAGTGCG 1380
GCCCCGGAGG CGGCGCCGGG AAGCCTGTTG GGCGGCCTGG CGGTANCTGG TGCGCGGGGC 1440
GCCGGCGCGG GTCCACGCTA CGGATTCCRT CCCACCGTGA TGGCTCGCCC ACCCTTCGMC 1500
GGGATAGTCG GTGCCGCAAC GTATTAACGC GCCGGCCTCG GCTGGTGTGG TCCGCTGCGG 1560
GTGGGAATTG GTCNGCGCCG AAATCTCSGT GGGTTATTTR CGGTGGGATT TTTTCCGGAA 1620
GCCGGGTTCA RCACCGGATT TCGTAACGGT CCCGCKACTC TCGTGCCGAA TTCSGCACTA 1680
AGTGACGTCC GGCGGAAACC CGTTGGGTNT GAAAGCTTGA GAAAGGCCCG CTCCCAGGGG 1740
TTCGGCAAAC GG 1752
126. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 400 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: fehérje
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 126. számú szekvencia
Met Asp Phe Gly Alá Leu Pro Pro 1 5
Alá Gly Pro Gly Ser Alá Pro Met 20
Gly Leu Alá Alá Glu Leu Ser Ser 35 40
Ile Thr Gin Leu Ser Ser Glu Gly 50 55
Met Alá Glu Alá Val Alá Pro Tyr 65 70
Alá Gin Alá Glu Gin Alá Alá Thr 85
Phe Glu Alá Alá Phe Alá Alá Thr 100
Asn Arg Alá Ser Leu Met Gin Leu 115 120
Asn Thr Ser Alá Ile Alá Alá Alá 130 135
Alá Gin Asp Ser Alá Alá Met Tyr 145 150
Alá Ser Alá Val Thr Pro Phe Ser 165
Thr Alá Gin Gly Thr Gin Alá Alá 180
Alá Gin Ser Thr Leu Thr Glu Met 195 200
Gin Ser Leu Thr Ser Xaa Leu Leu 210 215
Trp Leu Trp Gin Ile Leu Phe Gly 225 230
Ser Alá Leu Leu Thr Asp Leu Gin 245
Thr Glu Gly Leu Pro Tyr Phe Ser 260
Gin Ser Alá Lys Thr Leu Gly Leu 275 280
Val Alá Alá Alá Gly Asp Alá Alá 290 205
Glu Val Asn Ser Val Arg Met Tyr 10 15
Val Alá Alá Alá Ser Alá Trp Asn 25 30
Alá Alá Thr Gly Tyr Glu Thr Val 45
Trp Leu Gly Pro Alá Ser Alá Alá 60
Val Alá Trp Mát Ser Alá Alá Alá 75 80
Gin Alá Arg Alá Alá Alá Alá Alá 90 95
Val Pro Pro Pro Leu Ile Alá Alá 105 110
Ile Ser Thr Asn Val Phe Gly Gin 125
Glu Alá Gin Tyr Gly Glu Met Trp 140
Alá Tyr Alá Gly Ser Ser Alá Ser 155 160
Thr Pro Pro Gin Ile Alá Asn Pro 170 175
Alá Val Alá Thr Alá Alá Gly Thr 185 190
Ile Thr Gly Leu Pro Asn Alá Leu 205
Gin Ser Ser Asn Gly Pro Leu Ser 220
Thr Pro Asn Phe Pro Thr Ser Ile 235 240
Pro Tyr Alá Ser Xaa Xaa Tyr Asn 250 255
Ile Gly Met Gly Asn Asn Phe Ile 265 270
Ile Gly Ser Alá Alá Pro Alá Alá 285
Lya Gly Leu Pro Gly Leu Gly Gly 300
HU 226 520 Β1
Met Leu Gly Gly Gly Pro Val Alá Alá Gly Leu Gly Asn Alá Alá Ser
305 310 315 320
Val Gly Lys Leu Ser Val Pro Pro Val Trp Xaa Gly Pro Leu Pro Gly
325 330 335
Ser Val Thr Pro Gly Alá Alá Pro Leu Pro Val Ser Thr Val Ser Alá 340 345 350
Alá Pro Glu Alá Alá Pro Gly Ser Leu Leu Gly Gly Leu Pro Leu Xaa 355 360 365
Gly Alá Gly Gly Alá Gly Alá Gly Pro Arg Tyr Gly Phe Xaa Pro Thr 370 375 380
Val Met Alá Arg Pro Pro Phe Xaa Gly Ile Val Alá Alá Alá Thr Tyr 385 390 395 400
127. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 474 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 127. számú szekvencia
GGCACGAGCA CCAGTTGACC CGCGAAGAAC CTGACCGCGC CACCCAGCGC CGCCCGCATC 60 ACCCGCCCCC TCCCACGAAC CTTTTCGGTA AACGAGCCAC TCCAGCGGAG ATCGGTACCG 120 CCCGACGCAT TTGGTGTAAG GACCACCTCG CCGAAGTAGT CCTGGACGGG TGTCCTCGCG 180 CCAACCAGCT TGTAGACGTG GCGACGGTCC TGCTCATACT CGACGGTCTC TTCCTGCACG 240 AACACCGGCC ACATGCCTAG TTTGCGGATG GCCCCGATGC CGCCGGGCGC GGGATCACCG 300 CGTCGCGCCC AACTCGATTG AGCAACGATG GGCTTGGCCC AGGTCGCCCA GTTGCCACCG 360 TCTGTCACGA GCCGAAACAA GGTTGCAGCC GGGGCGCTGC TGGTCTTGGT GACCTCCAAC 420 GAAAATTTCC GACCCGACAT GCGCGACTCC CGAAACGACA ACTGAAGGTC GTGC 474
128. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1431 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 128. számú szekvencia
CTGCGCGCCG GAAAAAANTA TTACTGGCAG GACCGGCAGA ATGCATGGTG ATATTCCGGT 60 GATGAGGCCG CCGAGGAACC GACTAGTGCG AGGGTCAACA CATCGGTTAT TCGTTGCCGT 120 TTAGGTCTTG GATCTGCCGG GACGGCAACG AGTTGGCAGG ACCGCTCACG CGAGCGCTGT 180 TGACAGAGTC GGTTCACGTC GAACTCGCCA CCCGTCAGAT GCGAATGATA GCCACATCGG 240 CCACACCATC GACGGCGTCG AAGTCGCCGT CGTGGGTCAC GACCGGCACC CCTTGCGACG 300 TGGCAACGGC AGCGGCCCTC ACCGGACGGG ACCGAGATCG TCGGTGGTGT CGCCAGTGAG 360 CGTTGCGAGG TCGCGGGTGC AATCCCGCAT CTGCTTGCGT ATGCCGAAGC CGCCGCAGCA 420 GCTCGTCTCG ACTCAACCAT CGGCGCCGTG CGGGCTGCCT GCGGTCAGCA GCGCAACGGG 480 TTTGCCGTTG GCAGTGATGG TGATGTCTTC GCCGGCCTGC ACGCGCCGTA GCAGCCCGGC 540 GGTGTTGTTG CGCAGTTCGC GAGACGCGAC TTCAGCAGGC ATGCTGCGGG GATCGGCTTG 600 CCCTGGCCGC GGTGTCACCG TCATGCGCTT GGGATATCAC GTGATCTATC GGCACGAAGC 660
HU 226 520 Β1
CGCCGGATGA GCGAGGCAAA CCGCCTACAC GGGCTGCCTC GCCTTGACCG CGCCGAACGT 720 TACTGTGCCG GGGGCATCAG CACCGTATCG ATCATGTACA CCGTCGCGTG GGCGGTGTGA 780 CTCCGCCACA TACCAAACGG GCGTTGTTGA CCATGAGTCG TCGCGGGCGC CTATCACCGT 840 CAGGTCGGCA CCTTGCAGGT CTGATGGGTG CCGTCGATCC TGCTCGGACT CGCCTGGCCG 900 GCTATCACGT GGTAGGTCAG GATGCTGCTG AGCAGCTTGG CGTCAGTCTT GAGTTGATCG 960 ATAGTGGCCG CCGGCAGCTT GTCGAATGCG GCGTTGGTGG GGGCGAAAAC GGTGTACTCG 1020 CCGCCGTTGA GGGTGTCGAC CAGATTCACA TCCGGGTTCA GCTTGCCCGA GAGAGCCGAG 1080 GTCAGGGTAC TGAGGATCGG GTTGTTGGAA GCCGCGGTAG CGACCGGGTC TTGCGCCATT 1140 CCGGCCACCG ATCCGGGACC GGTGGGATTT TGCGCCGCGT ATTGCGCGCA CCCACGACCA 1200 ATCAGGTCOG CTGCGGTCAG CCATTGCCGC CGTGGTAACG GGCGCCGCCG GGCTGGTCGC 1260 CGGTTTCGGG CTGGTGTCTT GCGACACGGG TTTGGTGCTC GAACAACCCG CTAAGAACGC 1320 AATCGCGATG GCTGCGAGGC TCGCTGCTGC GGCCGGTTTG GCCTGAACGT TGATCATCGC 1380 TTCGATTCCT TTGCTTCTGC GGCGGCGTTG AACGCCGTCC TCCTGGGTGG A 1431
129. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 279 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 129. számú szekvencia
GCACGAGAGT CGTATCTTTG CACCCAGCGC CCGTAGGAAA CCGCTGGCCT GGCTAACTCA 60 GATGCGGGCG GCCGTCGATT CGAGAGGTAA CCGATCGCCC GCCGACAATG GGTTACCCAC 120 CGAGACTGAT TGCCGCGCAG CCGCCTTCGA CGTGTAAGCG CCGGTTCGTG CATGCCCGGA 180 ACGGCTGCAC TCACGGACCT TCTACGTAGT ACGTGACGGA CTTTTACGCA TTATCGCTGA 240 CGATCTTTGC CTCCCAGGAC TCCAGAATCT ACTCGTGCC 279
130. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1470 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 130. számú szekvencia
ACCGCCACCC GCAGCCCGGA ATCACCGTCG GTAACCTGCG AATACAATTT CTTCATCGAC 60 GACTTCGCGA ACAGCGAACC CGAGCCCACC GCCTGATAGC CTTCTTCCTC GATGTTCCAA 120 CCGCCGGCGG CGTCGAACGA AACGATACGA CCCGCGCTCT GCGGGTCAGA CGCATGAATG 180 TCGTAGCCCG CCAGCAACGG CAACGCCAGC AGACCCTGCA_TCGCGGCCGC CAGATTGCCA 240 CGCACCATAA TCGCCAGCCG GTTGATTTTG CCGGCAAACG TCAGCGGCAC ACCCTCGAGC 300 TTCTCGTAGT GCTCAAGTTC CACGGCATAC AGCCGGGCAA ACTCAACCGC GACCGCAGCC 360 GTGCCAGCGA TGCCGGTAGC GGTGTAGTCA TCGGTGATAT ACACCTTGCG CACATCACGC 420 CCAGAAATCA TGTTGCCCTG CGTCGAACGC CGGTCACCCG CCATGACAAC ACCGCCGGGG 480 TATTTCAGCG CGACAATGGT GGTGCCGTGC GGCAGTTGCG CATCGCCGCC TGCGAGTGGC 540 GCACCGCCGC TGATGCTTGC CGGCAGCAAC TCCGGCGCCT GGCGGCGCAG GAAGTCAAGT 600 GAAAGAAGAT AGGTCTACAG CGGGTGTTCC AGAGAGTGAA TTAATGGACA GGCGATCGGG 660 CAACGGCCAG GTCACTGTCC GCCCTTTTGG ACGTATGCGC GGACGAAGTC CTCGGCGTTC 720 TCCTCGAGGA CGTCGTCGAT TTCGTCGAGC AGATCGTCGG TCTCCTCGGT CAGCTTTTCG 780 CGACGCTCCT GGCCCGCGGC GGTGCTGCCG GCGATGTCGT CATCATCGCC GCCGCCACCG 840 CCACGCTTGG TCTGCTCTTG CGCCATCGCC GCCTCCTGCT TCCTCATGGC CTTTCAAAAG 900 GCCGCGGGTG CGCGTCACAC GCCCGCTGTC TTTCTCTCAC CTACCGGTCA ACACCAACGT 960 TTCCCGGCCT AACCAGGCTT AGCGAGGCTC AGCGGTCAGT TGCTCTACCA GCTCCACGGC 1020 ACTGTCCACC GAATCCAGCA ACGCACCAAC ATGCGCCTTA CTACCCCGCA ACGGCTCCAG 1080
HU 226 520 Β1
CGTCGGGATG CGAACCAGCG AGTCGCCGCC AGGTCGAAGA TCACCGAGTC CCAGCTAGCC GCGGCGATAT CAGCCCCGAA CCGGCGCAGG CATTTCGCCG CGGAAATACG CGCGGGTGTC GGTCGGCGGT TCTCCACCGC ACTCAGCACC TGGTGTTTCG GTGACTAAAC GCTTTATCGA GCCGCGCGCG ACCAGCCGGT TGTACAGGCC CTTGTCCAGC CGGACATCGG AGTACTGCAG GTTGACGAGG TGCAGCCGGG GCGCCGACCA GCTCAGGTTC TCCCGCTGCC GGAAACCGTC GAGCAGCCGC AGTTTGGCCG GCCAGTCCAG CAGCTCCGCG CAATCCATCG GGTCACGCTC GAGCTGATCC AGCACGTGTG CCCAGGTTTC
131. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1059 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 131. számú szekvencia
ATTCCCATCG CTCCGGCACC TATCACCAGG TAGTCGGTTT CGATGGTTTT CGCCGGCCCT TGCGTTGGCC TGGGCCACGG GTCGTTCATG GGCCCTCCTG TGCGGATTGG AATTTGTGAC AACGAAATCG GGCGATCGGT GAGCAATCGT CGCCGATGCA AGACACGCTT TCGCTGCCGC GGCGTCAGGT GGAGTTTAGG CCAGCGTAAC AACGTAGACC GGCCACTGAC CAAACCCCAA ACCCACAAAC CCTGGACGCA TGCGGGTCTC GGGCGTCAAA TTCCGGGTAG ATATCGTATA CCGATATCGG ATGCCGTAGC CTTATCGAGG CATGAGACGC CCGCTAGACC CACGCGATAT TCCAGATGSG CTGCGGCGAC GGCTGGGGCT CTTGGATGCG GTGGTGATCG GGCTTGGGTC CATGATCGGT GCCGGAATCT TTGCTCGTGC CGAATTCGGC ACGAGCTCGT GCCGAATTCG GCACGAGATT CCAATCCCCA GAAGGTCGTA CAAGCCGTCA ATGGCACTTG ATCGTTGGAT CGATGATGAA CGCTCTGCTC ATGCCTGCCG CCTATCTCAA CGGTCGTCGA TTCCATGCAT TAGCCTTGGT TCTGCATTGC ACGCGTAGGG CCTACAGTCT GGCTGTCATG CTTGGCCGAT GTCAACAGTT TTTTTCATGC TAAGCAGATC GTCAGTTTTG AGTTCGTGAA GACGGCATGT TCACTTGTTG TCGACTACAT CGTCTGCGCA CATTTGCCCT CCTGCAACTG CGCTGCGACA ATGCGCCAAC CGCCGTGTAG CTCGTGCCGA ATTCGGCACG AGGATCCACC GGAGATGGCC GACGACTACG ACGAGGCCTG GATGCTCAAC ACCGTGTTCG ACTATCACAA CGAGAACGCA
AAAGAAGAGG TCATCCATCT CGTGCCCGAC GTGAACAAGG AGAGGGGGCC CATCGAACTC
GTAACCAAGG TAGACAAAGA GGGACATCAG ACTCGTCTAC GATGGGGAGC CACGTTTTCA
TACAAGGAAC ATCCTAAGTT TTGATTCGGG AACATCCTA
132. számú szekvenciavázlat (I) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 153 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 132. számú szekvencia
GCACGAGGCA TTGGCGGGCA TCTGCATAAA CGGTGACGTA TCAGCACAAA ACAGCGGAGA
GAACAACATG CGATCAGAAC GTCTCCGGTG GCTGGTAGCC GCAGAAGGTC CGTTCGCCTC
GGTGTATTTC GACGACTCGC ACGACTCGTG CCG
133. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 387 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1470
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1059
120
153
HU 226 520 Β1 (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 133. számú szekvencia
CCGCGCGGTC GATCAGCGAG CCAGGCAAAA ACTCCGTCGA GCCCGAGTCG ATGATGGTCA 60 CCCGGCGCAG CATCTGGCGA ACGATCACCT CGATGTGCTT GTCGTGGATC GACACACCTT 120 GGGCGCGGTA GACCTCCTGG ACCTCGCGAA CCAGGTGTAT CTGCACCTCG CGGGGGCCCT 180 GCACCCGCAG CACCTCATGC GGGTCGGCCG AGCCTTCCAT CAGCTGCTGG CCCACCTCGA 240 CGTGGTCGCC ATCGGAGAGC ACCCGTTCGG AACCGTCTTC GTGCTTGAAC ACCCGCAGCC 300 GCTGCCGCTT GGAGATCTTG TCGTAGACCA CTTCCTCACC GCCGTCGTCA GGAACGATGG 360 TGATCTTGTA GAACCGCTCG CCGTCCT 387
134. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 389 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 134. számú szekvencia
GTTCAGCACG GCTATCCGAT TGTGCCGTTC GCTTCGGTGG GTGCTGAACA CGGCATCGAC 60 ATCGTGCTCG ACAACGAATC CCCACTGCTG GCACCGGTCC AGTTCCTCGC CGAGAAGCTG 120 CTCGGCACCA AAGACGGTCC GGCGCTGGTC CGTGGTGTCG GACTGACACC GGTACCGCGC 180 CCCCAACGGC AGTATTACTG GTTCGGCGAG CCAACCGACA CCACAGAGTT TATGGGGCAG 240 CAAGCCGACG ATAACGCCGC ACGCAGGGTG CGCGAGCGTG CCGCCGCCGC TATCGAACAC 300 GGCATCGAGC TGATGCTGGC CGAGCGCGCA GCCGATCCAA ATCGATCCCT GGTCGGACCG 360 CTCTTGGGCT CGGACGCCTA AGGCGCCCC 389
135. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 480 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 135. számú szekvencia
CCCGCGGTCG GAATGATCCC CGTCTCGTCG CGCGCCCATT TGATGCTGTT GATGAGCTGT 60 TTGGAGAAGC CCGGTTGGCG TACCGGTGAG CCGGAATATC TGTTGGAAGC GTCACCGGAT 120 GTNCACATGA ANTNCNTTGN CCCNGTNGCG GTNTTGGNTG NGGNAAACAC GTGTTGTNTA 180 AGCCTTGNTG GNCTCGNAAG NGCCGTNGAC GCCTGTGTCG CCGAAGATAA TGAGCACCTG 240 ACGGTTGGCG GGATCGCCGT TATCCCAAGG AATTCCGAGG TCGGTCCCGG AGATGCCGAA 300 GCGTTCCAGG GTCTTGTTGG GGCTGTCCGG TCCGGTCACC CACTCGGCGA GGGATGTGGN 360 AGCCCCGGCG AGCGTGGCAC CAGGATCCGG CGCCGCCGCC GGAGCAGGGT CGGNNGCTGN 420 NCTGNNTTCC TNNNGCCNAA TTNNACTCCN NCNACAANCT TGNNNCCGAC TCNNACCCGN 480
136. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 587 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS
HU 226 520 Β1 (xi) A szekvencia leírása: 136. számú szekvencia
GCACGAGGCT ACCGGCGCGT CGCCCGCCAT GCCCTGGATG CACGCGTAGC CACCCGTNCA 60 TNCAGCGGGT CAGCCGCCGC GTCCGGGCTT AACGCTATAG CAGCTGCAAA CAACCCAGCG 120 CCGGCAATTA CTTTGATGTT GAACCGATGA CCATNGCCTN CGNGTNCAAT CTCNTCTCTT 180 NGCGCGCCNC TATTTNNGCC ATANATTTGG TTNNANNCGN AACGCTAGAC GTATCGAGTT 240 CCTTTTCGAC CACCGGCTCA ATTGTCAGCA TCCTATGGGG AACATGAGCC CCGCCGCACC 300 GGGCCGTTTC CAAATGGTGA CGTCACAACG GTGTCACAAG CCAGCGCAAT GTCCGCGGTA 360 GGGACGCGGC GGCTGGGATC GGTGGGGTGA GCGCCCGGCT TCTCAAAGCG AGGGGAGCCC 420 CGGGACTCTT ACCGGCCGAA GGCGGCGGGT GTCACTGATC TAGGCTGACG GCCAGTGGTT 480 GNTNAGCCAA CAAGGATGAC NACAAATAAN CCGAGGANAG ACANGNGACG GNCCGANANG 540 CTNANCCGGN NTTGNNCNAA NNNNACNCAC TTNTACCGNN CTTATGN 587
137. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1200 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 137. számú szekvencia
CAGGCATGAG CAGAGCGTTC ATCATCGATC CAACGATCAG TGCCATTGAC GGCTTGTACG 60 ACCTTCTGGG GATTGGAATA CCCAACCAAG GGGGTATCCT TTACTCCTCA CTAGAGTACT 120 TCGAAAAAGC CCTGGAGGAG CTGGCAGCAG CGTTTCCGGG TGATGGCTGG TTAGGTTCGG 180 CCGCGGACAA ATACGCCGGC AAAAACCGCA ACCACGTGAA TTTTTTCCAG GAACTGGCAG 240 ACCTCGATCG TCAGCTCATC AGCCTGATCC ACGACCAGGC CAACGCGGTC CAGACGACCC 300 GCGACATCCT GGAGGGCGCC AAGAAAGGTC TCGAGTTCGT GCGCCCGGTG GCTGTGGACC 360 TGACCTACAT CCCGGTCGTC GGGCACGCCC TATCGGCCGC CTTCCAGGCG CCGTTTTGCG 420 CGGGCGCGAT GGCCGTAGTG GGCGGCGCGC TTGCCTACTT GGTCGTGAAA ACGCTGATCA 480 ACGCGACTCA ACTCCTCAAA TTGCTTGCCA AATTGGCGGA GTTGGTCGCG GCCGCCATTG 540 CGGACATCAT TTCGGATGTG GCGGACATCA TCAAGGGCAC CCTCGGAGAA GTGTGGGAGT 600 TCATCACAAA CGCGCTCAAC GGCCTGAAAG AGCTTTGGGA CAAGCTCACG GGGTGGGTGA 660 CCGGACTGTT CTCTCGAGGG TGGTCGAACC TGGAGTCCTT CTTTGCGGGC GTCCCCGGCT 720 TGACCGGCGC GACCAGCGGC TTGTCGCAAG TGACTGGCTT GTTCGGTGCG GCCGGTCTGT 780 CCGCATCGTC GGGCTTGGCT CACGCGGATA GCCTGGCGAG CTCAGCCAGC TTGCCCGCCC 840 TGGCCGGCAT TGGGGGCGGG TCCGGTTTTG GGGGCTTGCC GAGCCTGGCT CAGGTCCATG 900 CCGCCTCAAC TCGGCAGGCG CTACGGCCCC GAGCTGATGG CCCGGTCGGC GCCGCTGCCG 960 AGCAGGTCGG CGGGCAGTCG CAGCTGGTCT CCGCGCAGGG TTCCCAAGGT ATGGGCGGAC 1020 CCGTAGGCAT GGGCGGCATG CACCCCTCTT CGGGGGCGTC GAAAGGGACG ACGACGAAGA 1080 AGTACTCGGA AGGCGCGGCG GCGGGCACTG AAGACGCCGA GCGCGCGCCA GTCGAAGCTG 1140 ACGCGGGCGG TGGGCAAAAG GTGCTGGTAC GAAACGTCGT CTAACGGCAT GGCGAGCCAA 1200
138. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 392 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 138. számú szekvencia
Met Ser Arg Alá Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Alá Ile Asp Gly 15 10 15
HU 226 520 Β1
Leu Tyr Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gin Gly Gly Ile Leu 20 25 30
Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Alá Leu Glu Glu Leu Alá Alá 35 40 45
Alá Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Alá Alá Asp Lys Tyr Alá 50 55 60
Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gin Glu Leu Alá Asp Leu
70 75 80
Asp Arg Gin Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gin Alá Asn Alá Val Gin
90 95
Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Alá Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val 100 105 110
Arg Pro Val Alá Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Alá 115 120 125
Leu Ser Alá Alá Phe Gin Alá Pro Phe Cys Alá Gly Alá Met Alá Val 130 135 140
Val Gly Gly Alá Leu Alá Tyr Leu Val Val Lys Thr Leu Ile Asn Alá
145 150 155 160
Thr Gin Leu Leu Lys Leu Leu Alá Lys Leu Alá Glu Leu Val Alá Alá
165 170 175
Alá Ile Alá Asp Ile Ile Ser Asp Val Alá Asp Ile Ile Lys Gly Thr 180 185 190
Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn Alá Leu Asn Gly Leu Lys 195 200 205
Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg 210 215 220
Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Alá Gly Val Pro Gly Leu Thr
225 230 235 240
Gly Alá Thr Ser Gly Leu Ser Gin Val Thr Gly Leu Phe Gly Alá Alá
245 250 255
Gly Leu Ser Alá Ser Ser Gly Leu Alá His Alá Asp Ser Leu Alá Ser 260 265 270
Ser Alá Ser Leu Pro Alá Leu Alá Gly Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe 275 280 285
Gly Gly Leu Pro Ser Leu Alá Gin Val His Alá Alá Ser Thr Arg Gin 290 295 300
Alá Leu Arg Pro Arg Alá Asp Gly Pro Val Gly Alá Alá Alá Glu Gin 305 310 315 320
Val Gly Gly Gin Ser Gin Leu Val Ser Alá Gin Gly Ser Gin Gly Met 325 330 335
HU 226 520 Β1
Gly Gly Pro Val 340 Gly Met Gly Gly Met 345 His Pro Ser Ser Gly 350 Alá Ser
Lys Gly Thr 355 Thr Thr Lys Lys Tyr 360 Ser Glu Gly Alá Alá 365 Alá Gly Thr
Glu Asp 370 Alá Glu Arg Alá Pro 375 Val Glu Alá Asp Alá 380 Gly Gly Gly Gin
Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val
385 390
139. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 439 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 139. számú szekvencia
ACGTTTACCC ATGCCGTCGG TGCAGAGCAA CGCCAGACAA CACAAAGTAG TCTAATTCCG 60 TTATAAAGCA GACATTTCCG TGGTTATGTA GAAGATGTCG ACCGATCAGA TGAAGCGATC 120 CGCGTCAGGT GGTATCCGAT GTCTTTTGTG ACCATCCAGC CGGTGGTCTT GGCAGCCGCG 180 ACGGGGGACT TGCCGACGAT CGGTACCGCC GTGAGTGCTC GGAACACAGC CGTCTGTGCC 240 CCGACGACGG GGGTGTTACC CCCTGCTGCC AATGACGTGT CGGTCCTGAC GGCGGCCCGG 300 TTCACCGCGG ACACCAAGCA CTACCGAGTG GTGAGTAAGC CGGCCGCGCT GGTCCATGGC 360 ATGTTCGTGG CCCTCCCGGC GGCCACCGCC GATGCGTATG CGACCACCGA GGCCGTCAAT 420 GTGGTCGCGA CCGGTTAAG 439
140. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 1441 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: cDNS (xi) A szekvencia leírása: 140. számú szekvencia
GAGGTTGCTG GCAATGGATT TCGGGCTTTT ACCTCCGGAA GTGAATTCAA GCCGAATGTA 60 TTCCGGTCCG GGGCCGGAGT CGATGCTAGC CGCCGCGGCC GCCTGGGACG GTGTGGCCGC 120 GGAGTTGACT TCCGCCGCGG TCTCGTATGG ATCGGTGGTG TCGACGCTGA TCGTTGAGCC 180 GTGGATGGGG CCGGCGGCGG CCGCGATGGC GGCCGCGGCA ACGCCGTATG TGGGGTGGCT 240 GGCCGCCACG GCGGCGCTGG CGAAGGAGAC GGCCACACAG GCGAGGGCAG CGGCGGAAGC 300 GTTTGGGACG GCGTTCGCGA TGACGGTGCC ACCATCCCTC GTCGCGGCCA ACCGCAGCCG 360 GTTGATGTCG CTGGTCGCGG CGAACATTCT GGGGCAAAAC AGTGCGGCGA TCGCGGCTAC 420 CCAGGCCGAG TATGCCGAAA TGTGGGCCCA AGACGCTGCC GTGATGTACA GCTATGAGGG 480 GGCATCTGCG GCCGCGTCGG CGTTGCCGCC GTTCACTCCA CCCGTGCAAG GCACCGGCCC 540 GGCCGGGCCC GCGGCCGCAG CCGCGGCGAC CCAAGCCGCC GGTGCGGGCG CCGTTGCGGA 600 TGCACAGGCG ACACTGGCCC AGCTGCCCCC GGGGATCCTG AGCGACATTC TGTCCGCATT 660 GGCCGCCAAC GCTGATCCGC TGACATCGGG ACTGTTGGGG ATCGCGTCGA CCCTCAACCC 720 GCAAGTCGGA TCCGCTCAGC CGATAGTGAT CCCCACCCCG ATAGGGGAAT TGGACGTGAT 780 CGCGCTCTAC ATTGCATCCA TCGCGACCGG CAGCATTGCG CTCGCGATCA CGAACACGGC 840 CAGACCCTGG CACATCGGCG TATACGGGAA GGCCGGCGGG GTGGGACCGA CGCAGGGCCA 900 TCCACTGAGT TCGGCGACCG ACGAGCCGGA GCCGCACTGG GGCCCCTTCG GGGGCGCGGC 960 GCCGGTGTCC GCGGGCGTCG GCCACGCAGC ATTAGTCGGA GCGTTGTCGG TGCCGCACAG 1020
HU 226 520 Β1
CTGGACCACG GCCGCCCCGG AGATCCAGGT CGCCGTTCAG GCAACACCCA CCTTCAGCTC CAGCGCCGGC GCCGACCCGA CGGCCCTAAA CGGGATGCCG GCAGGCCTGC TCAGCGGGAT GGCTTTGGCG AGCCTGGCCG CACGCGGCAC GACGGGGGGT GGCGGCACCC GTAGCCCCAC CAGCACTGAC GGCCAAGAGG ACGGCCGCAA ACCCCCGGTA GTTGTGATTA GAGAGCAGCC GCCGCCCGGA AACCCCCCGC GGTAAAAGTG CGGCAACCGT TCGTCGCCGC GCGGAAAATG CCTGGTGAGC GTGGCTATCC GACGGGCCGT TCACACCGCT TGTAGTAGCG TACGGCTATG GACGACGGTG TCTGGATTCT CGGCGGCTAT CAGAGCGATT TTGCTCGCAA CCTCAGCAAA G
141. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 99 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 141. számú szekvencia
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1441
Met 1 Ser Phe Val Thr 5 lle Gin Pro Val Val 10 Leu Alá Alá Alá Thr 15 Gly
Asp Leu Pro Thr He Gly Thr Alá Val Ser Alá Arg Asn Thr Alá Val
20 25 30
Cys Alá Pro Thr Thr Gly Val Leu Pro Pro Alá Alá Asn Asp Val Ser
35 40 45
Val Leu Thr Alá Alá Arg Phe Thr Alá His Thr Lys His Tyr Arg Val
50 55 60
Val Ser Lys Pro Alá Alá Leu Val His Gly Met Phe Val Alá Leu Pro
65 70 75 80
Alá Alá Thr Alá Asp Alá Tyr Alá Thr Thr Glu Alá Val Asn Val Val
85 90 95
Alá Thr Gly
142. számú szekvenciavázlat
(i) A szekvencia jellemzői: (A) Hossz: 423 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
(ii) A molekula típusa: fehérje
(xi) A szekvencia leírása: 142. számú szekvencia
Met Asp Phe Gly Leu Leu Pro Pro Glu Val Asn Ser Ser Arg Met Tyr
15 10 15
Ser Gly Pro Gly Pro Glu Ser Met Leu Alá Alá Alá Alá Alá Trp Asp
20 25 30
Gly Val Alá Alá Glu Leu Thr Ser Alá Alá Val Ser Tyr Gly Ser Val
35 40 45
HU 226 520 Β1
Val Ser Thr Leu Ile Val Glu Pro 50 55
Met Alá Alá Alá Alá Thr Pro Tyr 65 70
Alá Leu Alá Lys Glu Thr Alá Thr 85
Phe Gly Thr Alá Phe Alá Met Thr 100
Asn Arg Ser Arg Leu Met Ser Leu 115 120
Asn Ser Alá Alá Ile Alá Alá Thr 130 135
Alá Gin Asp Alá Alá Val Met Tyr 145 150
Alá Ser Alá Leu Pro Pro Phe Thr 165
Alá Gly Pro Alá Alá Alá Alá Alá 180
Alá Val Alá Asp Alá Gin Alá Thr 195 200
Leu Ser Asp Ile Leu Ser Alá Leu 210 215
Ser Gly Leu Leu Gly Ile Alá Ser 225 230
Alá Gin Pro Ile Val Ile Pro Thr 245
Alá Leu Tyr Ile Alá Ser Ile Alá 260
Thr Asn Thr Alá Arg Pro Trp His 275 280
Gly Leu Gly Pro Thr Gin Gly His 290 295
Pro Glu Pro His Trp Gly Pro Phe 305 310
Gly Val Gly His Alá Alá Leu Val 325
Trp Thr Thr Alá Alá Pro Glu Ile 340
Thr Phe Ser Ser Ser Alá Gly Alá 355 360
Trp Met Gly Pro Alá Alá Alá Alá 60
Val Gly Trp Leu Alá Alá Thr Alá 75 80
Gin Alá Arg Alá Alá Alá Glu Alá 90 95
Val Pro Pro Ser Leu Val Alá Alá 105 110
Val Alá Alá Asn Ile Leu Gly Gin 125
Gin Alá Glu Tyr Alá Glu Met Trp 140
Ser Tyr Glu Gly Alá Ser Alá Alá 155 160
Pro Pro Val Gin Gly Thr Gly Pro 170 175
Alá Thr Gin Alá Alá Gly Alá Gly 185 190
Leu Alá Gin Leu Pro Pro Gly Ile 205
Alá Alá Asn Alá Aap Pro Leu Thr 220
Thr Leu Asn Pro Gin Val Gly Ser 235 240
Pro Ile Gly Glu Leu Asp Val Ile 250 255
Thr Gly Ser Ile Alá Leu Alá Ile 265 270
Ile Gly Leu Tyr Gly Asn Alá Gly 285
Pro Leu Ser Ser Alá Thr Asp Glu 300
Gly Gly Alá Alá Pro Val Ser Alá 315 320
Gly Alá Leu Ser Val Pro His Ser 330 335
Gin Leu Alá Val Gin Alá Thr Pro 345 350
Asp Pro Thr Alá Leu Asn Gly Met 365
HU 226 520 Β1
Pro Alá Gly Leu Leu Ser Gly Met Alá Leu Alá Ser Leu Alá Alá Arg
370 375 380
Gly Thr Thr Gly Gly Gly Gly Thr Arg Ser Gly Thr Ser Thr Asp Gly
385 390 395 400
Gin Glu Asp Gly Arg Lys Pro Pro Val Val Val Ile Arg Glu Gin Pro
405 410 415
Pro Pro Gly Asn Pro Pro Arg
420
143. számú szekvenciavázlat
0) A szekvencia jellemzői: (A) Hossz: 97 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris
(ii) A molekula típusa: fehérje
(xi) A szekvencia leírása: 143. számú szekvencia
Met Ser Leu Leu Asp Alá His Ile Pro Gin Leu Val Alá Ser Gin Ser
1 5 10 15
Alá Phe Alá Alá Lys Alá Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gin Alá
20 25 30
Glu Gin Alá Alá Met Ser Alá Gin Alá Phe His Gin Gly Glu Ser Ser
35 40 45
Alá Alá Phe Gin Alá Alá His Alá Arg Phe Val Alá Alá Alá Alá Lys
50 55 60
Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Alá Gin Alá Asn Leu Gly Glu Alá Alá
65 70 75 80
Gly Thr Tyr Val Alá Alá Asp Alá Alá Alá Alá Ser Thr Tyr Thr Gly
85 90 95
Phe
144. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hossz: 99 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Száltípus: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) A molekula típusa: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 144. számú szekvencia
Cys Arg Leu Cys Leu Asp Ser His Leu Arg Val Val Alá Leu Pro Alá 15 10 15
Gly Gin Pro Gly Arg Leu Val Gin Alá Ile Gly Pro Alá Gin Glu Arg 20 25 30
HU 226 520 Β1
Asp Val Gly 35 Gin Thr Arg Cys Thr 40 Arg
Alá Leu 50 Thr Alá Alá Gin Phe 55 Alá Alá
Val 65 Ser Alá Gin Alá Alá 70 Alá Ile His
Gin Xaa Xaa Ser Gly 85 Ser Tyr Alá Alá
Gly Leu Asp 45 Xaa Val Ser
Alá Gin 60 Ile Tyr Gin Alá
Met 75 Phe Val Asn Thr Leu 80
Glu Alá Alá Asn Alá 95 Alá
Alá Alá Gly

Claims (28)

  1. SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1. Izolált polipeptid, amely (i) a 109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigén egy immunogén részét, vagy (ii) a 109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigénnek a 109. számú szekvenciával legalább 90%-os azonosságot mutató variánsát tartalmazza.
  2. 2. Az 1. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a
    109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigént, vagy a 109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigénnek a 109. számú szekvenciával legalább 90%-os azonosságot mutató variánsát tartalmazza.
  3. 3. A 2. igénypont szerinti izolált polipeptid, ahol az említett variáns legalább 95%-os azonosságot mutat a 109. számú szekvenciával.
  4. 4. Az 1. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a 109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigén egy immunogén részét tartalmazza.
  5. 5. Egy, a 4. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a 110-124. számú szekvenciák valamelyikét tartalmazza.
  6. 6. Az 5. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a
    119. számú szekvenciát tartalmazza.
  7. 7. A 6. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a
    119. számú szekvenciából áll.
  8. 8. Az 5. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a
    120. számú szekvenciát tartalmazza.
  9. 9. A 4. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a
    120. számú szekvenciából áll.
  10. 10. A 4. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a 109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigént tartalmazza.
  11. 11. A 10. igénypont szerinti izolált polipeptid, amely a 109. számú szekvenciával rendelkező M. tuberculosis antigénből áll.
  12. 12. Fúziós fehérje, amely az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet tartalmazza.
  13. 13. Izolált DNS-molekula, amely egy olyan nukleotidszekvenciát tartalmaz, amely egy, az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet vagy egy, a 12. igénypont szerinti fúziós fehérjét kódol.
  14. 14. Egy, a 13. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 108. számú nukleotidszekvenciát tartalmazza.
  15. 15. Egy, a 14. igénypont szerinti izolált DNS-molekula, amely a 108. számú szekvenciából áll.
  16. 16. Expressziós vektor, amely a 13-15. igénypontok bármelyike szerinti DNS-molekulát tartalmazza.
  17. 17. Izolált gazdasejt, amelyet a 16. igénypont szerinti expressziós vektorral transzformáltunk.
  18. 18. A 17. igénypont szerinti gazdasejt, ahol is a gazdasejtet az alábbi csoportból választhatjuk: Escherichia coli, élesztő- és emlőssejt.
  19. 19. Gyógyászati kompozíció, amely legalább egy, az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti szerinti polipeptidet vagy egy, a 12. igénypont szerinti fúziós fehérjét és egy fiziológiailag elfogadható hordozót tartalmaz.
  20. 20. Gyógyászati kompozíció, amely legalább egy, a 13-15. igénypontok bármelyike szerinti DNS-molekulát és egy fiziológiailag elfogadható hordozót tartalmaz.
  21. 21. Vakcina, amely legalább egy, az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet, valamint egy, a 12. igénypont szerinti fúziós fehérjét és egy aspecifikus immunválasz-fokozót tartalmaz.
  22. 22. Vakcina, amely legalább egy, a 13-15. igénypontok bármelyike szerinti DNS-molekulát és egy aspecifikus immunválasz-fokozót tartalmaz.
  23. 23. A 21. vagy 22. igénypont szerinti vakcina, amelyben az aspecifikus immunválasz-fokozó egy adjuváns.
  24. 24. Az 1-11, igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, a 12. igénypont szerinti fúziós fehérje vagy a 13-15. igénypontok bármelyike szerinti DNS-molekula valamely páciens tuberkulózis elleni protektív immunitásának kiváltására.
  25. 25. Az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, a 12. igénypont szerinti fúziós fehérje vagy a 13-15. igénypontok bármelyike szerinti DNS-molekula alkalmazása valamely páciens tuberkulózis elleni protektív immunitásának kiváltására szolgáló gyógyászati kompozíció előállítására.
  26. 26. Az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, a 12. igénypont szerinti fúziós fehérje vagy a 13-15. igénypontok bármelyike szerinti DNS-molekula
    HU 226 520 Β1 alkalmazása valamely páciens tuberkulózis elleni protektív immunitásának kiváltására szolgáló vakcina előállítására.
  27. 27. Az 1-12. igénypontok bármelyike szerinti polipeptíd alkalmazása a tuberkulózis kimutatására alkalmas bőrtesztben használható diagnosztikai kompozíció előállítására.
  28. 28. Diagnosztikai kit, amely az alábbi komponenseket tartalmazza:
    (a) az 1-11. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid vagy egy 12. igénypont szerinti fúziós fehérje; és
    5 (b) berendezés, amely alkalmas arra, hogy az említett polipeptidet egy páciens bőrsejtjeivel hozzuk érintkezésbe.
HU0003402A 1997-05-20 1998-05-20 Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use HU226520B1 (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US85938197A 1997-05-20 1997-05-20
US09/073,010 US6613881B1 (en) 1997-05-20 1998-05-05 Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
PCT/US1998/010407 WO1998053075A2 (en) 1997-05-20 1998-05-20 Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use

Publications (3)

Publication Number Publication Date
HUP0003402A2 HUP0003402A2 (hu) 2000-12-28
HUP0003402A3 HUP0003402A3 (en) 2001-03-28
HU226520B1 true HU226520B1 (en) 2009-03-30

Family

ID=26754016

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU0003402A HU226520B1 (en) 1997-05-20 1998-05-20 Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use

Country Status (20)

Country Link
US (1) US6613881B1 (hu)
EP (4) EP2172551A3 (hu)
JP (4) JP4162155B2 (hu)
KR (4) KR100893118B1 (hu)
AT (1) ATE420180T1 (hu)
AU (1) AU742751B2 (hu)
BR (1) BR9809445A (hu)
CA (2) CA2290774A1 (hu)
CZ (2) CZ300866B6 (hu)
DE (1) DE69840449D1 (hu)
DK (1) DK1012293T3 (hu)
ES (1) ES2321039T3 (hu)
HU (1) HU226520B1 (hu)
IL (2) IL133056A0 (hu)
NO (4) NO324880B1 (hu)
NZ (1) NZ501310A (hu)
PL (1) PL191121B1 (hu)
PT (1) PT1012293E (hu)
TR (1) TR200000115T2 (hu)
WO (1) WO1998053075A2 (hu)

Families Citing this family (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6991797B2 (en) 1993-07-02 2006-01-31 Statens Serum Institut M. tuberculosis antigens
US6290969B1 (en) * 1995-09-01 2001-09-18 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
US6458366B1 (en) 1995-09-01 2002-10-01 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
US6592877B1 (en) 1995-09-01 2003-07-15 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
US6982085B2 (en) 1997-04-02 2006-01-03 Statens Serum Institut TB diagnostic based on antigens from M. tuberculosis
US7037510B2 (en) 1997-04-18 2006-05-02 Statens Serum Institut Hybrids of M. tuberculosis antigens
JP4101888B2 (ja) 1997-06-06 2008-06-18 ダイナバックス テクノロジーズ コーポレイション 免疫刺激オリゴヌクレオチド、その組成物およびその使用方法
CA2319380A1 (en) * 1997-11-10 1999-05-20 Statens Serum Institut Nucleic acid fragments and polypeptide fragments derived from m. tuberculosis
AU6480999A (en) 1998-11-04 2000-05-22 Isis Innovation Limited Tuberculosis diagnostic test
US20030027774A1 (en) * 1999-03-18 2003-02-06 Ronald C. Hendrickson Tuberculosis antigens and methods of use therefor
US8143386B2 (en) * 1999-04-07 2012-03-27 Corixa Corporation Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis antigens and their uses
CA2378763A1 (en) 1999-07-13 2001-01-18 Statens Serum Institut Tuberculosis vaccine and diagnostics based on the mycobacterium tuberculosis esat-6 gene family
CA2386841A1 (en) 1999-10-07 2001-04-12 Corixa Corporation Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis
US6316205B1 (en) 2000-01-28 2001-11-13 Genelabs Diagnostics Pte Ltd. Assay devices and methods of analyte detection
WO2001062893A2 (en) * 2000-02-25 2001-08-30 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis and immunotherapy of tuberculosis
EP1278769A2 (en) * 2000-04-19 2003-01-29 Statens Serum Institut Tuberculosis antigens and methods of use thereof
CA2413959C (en) * 2000-06-20 2015-07-07 Corixa Corporation Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis
US7026465B2 (en) * 2002-02-15 2006-04-11 Corixa Corporation Fusion proteins of Mycobacterium tuberculosis
US7482116B2 (en) 2002-06-07 2009-01-27 Dna Genotek Inc. Compositions and methods for obtaining nucleic acids from sputum
WO2005118884A1 (en) * 2004-05-28 2005-12-15 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy A method for the rapid diagnosis of infectious disease by detection and quantitation of microorganism induced cytokines
US8475735B2 (en) * 2004-11-01 2013-07-02 Uma Mahesh Babu Disposable immunodiagnostic test system
NZ555907A (en) * 2004-11-16 2009-12-24 Aeras Global Tb Vaccine Found Multivalent vaccines comprising recombinant viral vectors
CA2606962A1 (en) * 2005-04-29 2006-11-09 Fusion Antibodies Limited Assays for diagnosis of tuberculosis and uses thereof
ATE530569T1 (de) 2005-07-01 2011-11-15 Forsyth Dental In Ry For Children Fa Assays zum nachweis von tuberkulose- antigenen, und impfstoffe
WO2007041539A1 (en) * 2005-09-30 2007-04-12 Transcutaneous Technologies, Inc. Iontophoresis apparatus and method for the diagnosis of tuberculosis
EP2397856B1 (en) 2006-03-14 2013-11-13 Oregon Health and Science University Methods for detecting a mycobacterium tuberculosis infection
ES2647321T3 (es) 2008-07-25 2017-12-20 Glaxosmithkline Biologicals S.A. Composiciones y procedimientos novedosos
CN106866801A (zh) 2008-07-25 2017-06-20 葛兰素史密丝克莱恩生物有限公司 结核病rv2386c蛋白、组合物及其用途
CA2731499C (en) * 2008-07-25 2017-01-10 Glaxosmithkline Biologicals S.A. Composition and use thereof for treating or preventing latent tuberculosis
DK2528621T3 (da) 2010-01-27 2017-01-02 Glaxosmithkline Biologicals Sa Modificerede tuberkuloseantigener
GB201012072D0 (en) 2010-07-19 2010-09-01 Sec Dep For Environment Food A Diagnostic reagents
EP2721140B1 (en) 2011-06-19 2016-11-23 Abogen, Inc. Devices, solutions and methods for sample collection
US20180031543A1 (en) * 2015-02-09 2018-02-01 Abogen, Inc. Devices, solutions and methods for sample collection related applications, analysis and diagnosis

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4751180A (en) 1985-03-28 1988-06-14 Chiron Corporation Expression using fused genes providing for protein product
US4689397A (en) 1985-08-12 1987-08-25 Scripps Clinic And Research Foundation Synthetic polypeptides for detecting mycobacterial infections
US4935233A (en) 1985-12-02 1990-06-19 G. D. Searle And Company Covalently linked polypeptide cell modulators
US4879213A (en) 1986-12-05 1989-11-07 Scripps Clinic And Research Foundation Synthetic polypeptides and antibodies related to Epstein-Barr virus early antigen-diffuse
US4952395A (en) 1987-02-26 1990-08-28 Scripps Clinic And Research Foundation Mycobacterial recombinants and peptides
US4976958A (en) * 1987-02-26 1990-12-11 Scripps Clinic And Research Foundation Mycobacterial recombinants and peptides
US6037135A (en) * 1992-08-07 2000-03-14 Epimmune Inc. Methods for making HLA binding peptides and their uses
US5330754A (en) 1992-06-29 1994-07-19 Archana Kapoor Membrane-associated immunogens of mycobacteria
NZ278270A (en) * 1993-12-23 1997-12-19 Pastoral Agric Res Inst Nz Ltd Mycobacteria virulence factor proteins and coding sequences and their use
IE960132A1 (en) * 1995-03-13 1996-09-18 Astra Ab New DNA molecules
WO1997009429A2 (en) 1995-09-01 1997-03-13 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
US6290969B1 (en) * 1995-09-01 2001-09-18 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
TR200806258T2 (tr) 1995-09-01 2008-10-21 Corixa Corporation Tüberkülozun teşhisi ve immünoterapi yolu ile önlenmesine mahsus yöntemler ve bileşikler
AU4750597A (en) * 1996-10-11 1998-05-11 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis

Also Published As

Publication number Publication date
KR100893118B1 (ko) 2009-04-14
EP2248900A1 (en) 2010-11-10
CZ303194B6 (cs) 2012-05-23
AU742751B2 (en) 2002-01-10
DE69840449D1 (de) 2009-02-26
NO995689D0 (no) 1999-11-19
HUP0003402A3 (en) 2001-03-28
JP2002514084A (ja) 2002-05-14
ATE420180T1 (de) 2009-01-15
KR20060066139A (ko) 2006-06-15
KR20070026886A (ko) 2007-03-08
CA2290774A1 (en) 1998-11-26
JP4764445B2 (ja) 2011-09-07
JP4162155B2 (ja) 2008-10-08
KR100924475B1 (ko) 2009-11-03
NO995689L (no) 2000-01-18
EP2172551A3 (en) 2010-11-10
TR200000115T2 (tr) 2000-11-21
EP2270170B1 (en) 2013-11-06
EP1012293B1 (en) 2009-01-07
NO20075900L (no) 2000-01-18
JP2008283961A (ja) 2008-11-27
JP2008253260A (ja) 2008-10-23
KR100909640B1 (ko) 2009-07-27
KR20010012812A (ko) 2001-02-26
NZ501310A (en) 2001-09-28
PL191121B1 (pl) 2006-03-31
ES2321039T3 (es) 2009-06-01
PL337330A1 (en) 2000-08-14
NO324880B1 (no) 2007-12-27
WO1998053075A3 (en) 1999-04-01
NO20075902L (no) 2000-01-18
US6613881B1 (en) 2003-09-02
PT1012293E (pt) 2009-04-08
EP2270170A1 (en) 2011-01-05
NO20075901L (no) 2000-01-18
CZ300866B6 (cs) 2009-08-26
JP2008245644A (ja) 2008-10-16
DK1012293T3 (da) 2009-05-04
JP4759010B2 (ja) 2011-08-31
BR9809445A (pt) 2000-06-13
CA2783134A1 (en) 1998-11-26
EP1012293A2 (en) 2000-06-28
JP4759011B2 (ja) 2011-08-31
WO1998053075A2 (en) 1998-11-26
CZ410099A3 (cs) 2000-05-17
EP2172551A2 (en) 2010-04-07
HUP0003402A2 (hu) 2000-12-28
AU7690798A (en) 1998-12-11
KR100652513B1 (ko) 2006-12-01
IL133056A (en) 2010-11-30
IL133056A0 (en) 2001-03-19
EP2248900B1 (en) 2012-07-18
KR20080036663A (ko) 2008-04-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6613881B1 (en) Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
US6555653B2 (en) Compounds for diagnosis of tuberculosis and methods for their use
US20020098200A1 (en) Compounds and methods for diagnosis and immunotherapy of tuberculosis
CA2268008A1 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
PT1398379E (pt) Compostos para imunoterapia e diagnóstico de tuberculose
WO1999042076A9 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
CA2405247A1 (en) Tuberculosis antigens and methods of use thereof
US20020081579A1 (en) Method for the isolation of novel antigens
ES2445209T3 (es) Compuestos para inmunoterapia y diagnóstico de la tuberculosis y métodos de su uso

Legal Events

Date Code Title Description
HC9A Change of name, address

Owner name: CORIXA CORPORATION, US

Free format text: FORMER OWNER(S): CORIXA CORPORATION, US

MM4A Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees