CZ303194B6 - Izolovaný polypeptid, fúzní protein a DNA izolovaná molekula, pro použití jako léciva pro imunolécbu a diagnostikování tuberkulózy, vakcína, farmaceutický prostredek a kit je obsahující - Google Patents

Izolovaný polypeptid, fúzní protein a DNA izolovaná molekula, pro použití jako léciva pro imunolécbu a diagnostikování tuberkulózy, vakcína, farmaceutický prostredek a kit je obsahující Download PDF

Info

Publication number
CZ303194B6
CZ303194B6 CZ20080478A CZ2008478A CZ303194B6 CZ 303194 B6 CZ303194 B6 CZ 303194B6 CZ 20080478 A CZ20080478 A CZ 20080478A CZ 2008478 A CZ2008478 A CZ 2008478A CZ 303194 B6 CZ303194 B6 CZ 303194B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
alas
sequence number
amino acid
polypeptide
gin
Prior art date
Application number
CZ20080478A
Other languages
English (en)
Inventor
R. Alderson@Mark
C. Dillon@David
A. W. Skeiky@Yasir
Campos-Neto@Antonio
Original Assignee
Corixa Corporation
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Corixa Corporation filed Critical Corixa Corporation
Publication of CZ303194B6 publication Critical patent/CZ303194B6/cs

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/35—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Mycobacteriaceae (F)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A61P31/06—Antibacterial agents for tuberculosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A61P37/04—Immunostimulants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Rešení popisuje izolovaný polypeptid obsahující i) aminokyselinovou sekvenci císlo 138, ii) imunogenní variantu sekvence císlo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích a kde varianta je alespon z 90 % identická se sekvencí 138 nebo iii) imunogenní cást aminokyselinové sekvence císlo 138 mající délku alespon 9 aminokyselin, pro použití jako lécivo. Tyto polypeptidy mají schopnost indukce imunity vuci tuberkulóze, a mohou být proto použity ve forme vakcín a/nebo farmaceutických prípravku pro imunizaci proti infekci M. tuberculosis, nebo pro lécbu tuberkulózy.

Description

Tento vynález se týká detekce, léčby a prevenci infekce způsobené Mycobacterium tuberculosis.
Vynález se podrobně týká polypeptidů pro Mycobacterium tuberculosis, nebo jejich částí či vari ant ajejich použití pro diagnostiku a vakcinaci proti infekci.
Dosavadní stav techniky
Tuberkulóza je chronická, infekční choroba, obecně způsobená infekcí Mycobacterium tuberculosis. Toto onemocnění se hojně vyskytuje především v rozvojových zemích a je stále rostoucím problémem (ročně 8 milionů nových případů a 3 miliony úmrtí). Infekce může být dlouhou dobu bez příznaků, nejčastěji se projevuje akutním zápalem plic, horečkami a kašlem. Pokud není pacient zavčasu léčen, přidávají se další komplikace a případ často končí smrtí.
Ačkoliv tuberkulóza může být léčena podáváním antibiotik, nezabraňuje to rozšiřování onemocnění. Nakažení jedinci nemusejí vykazovat příznaky onemocnění a přesto mohou být přenašeči. V průběhu léčby je velmi důležité dodržovat přísnou dietu (což je problém kontrolovat). Mnoho pacientů přeruší nebo nedodrží dietu, což může vést k neefektivní léčbě a k vzniku lékové rezistence.
Potlačení rozšíření tuberkulózy vyžaduje efektivní vakcinaci, přesnou a včasnou diagnostiku choroby. Obecně, vakcinace živými bakteriemi je pro vytvoření imunity nej účinnější. K tomuto účelu nej používanější mykobakterie je Bacillus Calmette-Guerin (BCG), nevíru lentní kmen Mycobacterium bovis. Avšak bezpečnost a účinnost BCG je předmětem mnoha sporů a některé země, jako např. USA, neprovádí vakcinaci obyvatelstva. Běžná diagnostika se provádí pomocí kožního testu, který představuje intradermální působení tuberkulinu PPD (protein-purified derivative). Výsledná odpověď antigen-specifických T-buněk je dána rozměrem ztvrdnuté oblasti kolem místa vpichu po 48 až 72 hodinách. Problémem tohoto testu je jeho citlivost a specifíta, jedince, kteří absolvovali vakcinaci BCG, nelze tímto způsobem rozlišit od jedinců infikovaných.
Zatímco makrofágy se ukázaly být efektorem imunity proti M. tuberculosis, T buňky jsou převládajícími induktory této imunity. Ukázkou základní role T buněk v ochraně proti infekci způsobené M. tuberculosis častý výskyt M. tuberculosis u pacientů nemocných AIDS, v důsledku vyčerpání CD4 T buněk (HIV interaguje s receptory CD4 T buněk). Mykobakterium-reaktivní CD4 T buňky ukázaly, že jsou potenciálními producenty gamma-interferonů IFN-γ), které spouštějí antimikrobíální efekty makrofágů u myší. Zatímco role lidských IFN-γ není zcela jasná, studie ukazují, že 1,25-dihydroxy-vitamin D3, sám nebo v kombinaci s IFN-γ nebo s tumor necrosis factorem-alpha, aktivuje lidské makrofágy, které inhibují infekci (M.tuberculosis). Dále je známo, že IFN-γ stimuluje výrobu 1,25-dihydroxy-vitamin D3 u lidských makrofágů. Obdobně, IL—12 má důležitou funkci při stimulaci rezistence vůči napadení M.tuberculosis. Podrobnější informace o imunologii infekce způsobené M.tuberculosis lze nalézt: Chán and Kaufmann in Tuberculosis: Pathogenesis, Protection and Control, Bloom (ed.) ASM Press, Washington, DC, 1994.
Je zřejmé, že je třeba zlepšit způsoby vakcinaci, metody prevence, léčení a detekce tuberkulózy. Tento vynález dále doplňuje současné metody, uvádí výhody a další zlepšení.
- 1 CZ 303194 B6
Podstata vynálezu
Tento vynález popisuje látky použitelné pro prevenci a diagnostiku tuberkulózy. Tento vynález popisuje izolovaný polypeptid obsahující i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138, ii) imunogenní variantu sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí 138 nebo iií) imunogenní část aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin. Tyto polypeptidy jsou vhodné pro použití jako léčivo.
Dále jsou uvedeny DNA sekvence kódující výše zmíněné polypeptidy, expresní vektory obsahující tyto DNA sekvence a hostitelské buňky transformované nebo transfekované takovými expresními vektory,
V neposlední řadě, tento vynález popisuje fúzi proteinů obsahujících první a druhé objevené polypeptidy, nebo, alternativně fúzi objevených polypeptidů a známého antigenu M. tuberculosis.
Vycházeje s těchto aspektů, tento vynález uvádí farmaceutické zpracování, které zahrnuje jeden nebo více výše zmíněných polypeptidů nebo molekulu DNA kódující takovéto polypeptidy a fyziologicky akceptovatelný nosič.
Vynález také uvádí vakcíny obsahující jeden nebo více z výše popsaných polypeptidů a na imunitní odpověď nespecifický nosič, společně s vakcínami zahrnujícími jednu nebo více DNA sekvencí kódující takovéto polypeptidy a nespecifický imunitní nosič.
Uváděné metody umožňují indukci protektivní imunity u pacienta, zahrnují dávkování efektivního množství jednoho nebo více uváděných polypeptidů.
V tomto patentu jsou dále uvedeny diagnostické kity pro určení diagnosy tuberkulózy u pacientů. Diagnostické kity obsahují jeden nebo více z uvedených polypeptidů a látku, umožňující dostatečný kontakt polypeptidů s kožními buňkami pacienta.
Dále jsou zde uvedeny metody jak pro detekci tuberkulózy u pacientů, tak metody zahrnující kontakt kožních buněk pacienta s jedním nebo více polypeptidy, kódovaných DNA sekvencí, které pochází ze skupiny sekvencí č.: 2 až 10, 102, 128, komplementy jmenovaných sekvencí, a hybridizované DNA sekvence č.: 2 až 10, 102, 128; dále pak detekce imunitní odpovědi na pacientově pokožce. Je zde také uveden popis diagnostického setu.
Tyto a další aspekty jsou podrobně popsány v referencích uvedených v detailním popisu a na přiložených obrázcích a schématech. Kompletní citace je uvedena vždy na místě, kde se na ni odkazuje.
Přehled obrázků na výkresech
Obrázky IA a IB ilustrují stimulaci proliferace a produkce interferonu-γ v T-buňkách odvozených rekombinací ORF-2 a syntetických peptídů od prvního PPD-pozitivního donoru (označovanýjako D7).
Obrázky 2A a 2B ilustrují stimulaci proliferace a produkci interferon-γ v T-buňkách odvozených rekombinací ORF-2 a syntetických peptidu od druhého PPD-pozitivního donoru (označovaný jako Dl 60).
-2CZ 303194 B6
Podrobný popis
Jak je popsáno výše, jsou zde popsány prostředky a způsoby použitelné pro prevenci, léčbu a stanovení diagnosy tuberkulózy. Popsány jsou polypeptidy, které obsahují nejméně jednu imunogenní část antigenů M. tuberculosis, nebo varianta takových antigenů lišící se pouze konzervativní substitucí a/nebo modifikací. Termínem „polypeptid“ se rozumí aminokyselinový řetězec bílkovinové povahy jakékoli délky (např. antigeny), v níž jsou aminokyseliny spojeny kovalentní peptidovou vazbou. Polypeptidy mohou obsahovat úplnou imunogenní část jednoho zvýše uvedených antigenů nebo obsahují nějaké doplňkové sekvence. Tyto doplňkové sekvence mohou být odvozeny od nativních antigenů ΛΖ tuberculosis a mohou mít, ale nemusí mít imunogenní charakter.
Termínem „imunogenní“ se rozumí schopnost vyvolat imunitní odpověď (např. buněčnou), a to jak u jedinců, tak u biologických vzorků. Antigeny, které mají imunogenní vlastnosti (a imunogenní části nebo varianty takových antigenů), jsou schopny stimulovat buněčnou proliferaci, produkci interleukinu 12 a/nebo produkci interferonu-γ v biologických vzorcích obsahujících jednu nebo více buněk ze skupiny T buněk, NK buněk, B buněk nebo makrofágů získaných z jedinců imunních vůči A/. tuberculosis. Polypeptidy, obsahující jednu nebo více imunogenních částí, mohou být obecně použity k detekci tuberkulózy nebo mohou být použity pro imunizaci pacienta.
Přípravky a metody popsané v tomto vynálezu mohou také obsahovat varianty výše zmíněných polypeptidů. „Polypeptidovou variantou“ je rozuměno to, že polypeptid se liší od původního polypeptidů jen v konzervativní substituci a/nebo také modifikaci, tak, že terapeutické, antigenní a/nebo imunogenní vlastnosti zůstanou zachovány a mají alespoň 90%, ideální je pak 95% shoda s původním polypeptidem. Varianty polypeptidů s imunoreaktivními vlastnostmi mohou být také identifikovány pomocí modifikace aminokyselinové sekvence na jednom z výše uvedených polypeptidů a vyhodnocením imunoreaktivity tohoto modifikovaného polypeptidů. Pro polypeptidy vhodné do diagnostických setů, mohou být jejich varianty identifikovány vyhodnocením modifikovaných polypeptidů v souvislosti se schopností vyvolat produkci protilátek, které signalizují přítomnost nebo nepřítomnost tuberkulózy. Obdobně, varianty antigenů, jež mohou být úspěšně použity ve výzkumných metodách, mohou být identifikovány vyhodnocením schopnosti modifikovaných polypeptidů reagovat na protilátky přítomné v séru tuberkulózou nakažených pacientů. Takové modifikované sekvence mohou být připraveny a testovány užitím zde popsaných metod.
„Konzervativní substituce“ je taková, kde jedna aminokyselina je nahrazena jinou aminokyselinou s podobnými vlastnostmi tak, že zůstane zachována sekundární struktura polypeptidů a podstatně se nezmění ani jeho hydrofilní(fobní) vlastnosti. Příklady takových zaměnitelných aminokyselin: (I) ala, pro, gly, glu, asp, gin, asn, ser, thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4) lys, arg, his; a (5) phe, tyr, trp, his.
Dalším způsobem modifikace je delece nebo adice aminokyseliny, jež má minimální vliv na imunogenní vlastnosti, sekundární strukturu a hydrofilitu (fobitu) polypeptidů. Například, polypeptid může být konjugován se signální (nebo vedoucí) sekvencí na TV-terminálním konci proteinu, který kotranslačně nebo posttranslačně řídí přenos proteinu. Pro usnadnění syntézy, purifikace a identifikace, případně pro vylepšení navázání polypeptidů na pevný nosič, může být polypeptid také konjugován s linkerem nebo jinou sekvencí (např. poly-His, konjugace s Fc oblastí imunoglobulinu),
Antigeny M tuberculosis a DNA sekvence kódující tyto antigeny, mohou být připraveny užitím různých metod. Např. genomová nebo cDNA knihovna získaná zAÍ tuberculosis, může být screenována přímo použitím PBMC nebo T buněk získaných z jedinců imunních vůči M. tuberculosis. Tato knihovna může být přímo použita jako zásobárna rekombinovaných proteinů se schopností indukovat proliferaci a/nebo produkci interferonu-γ v T buňkách získaných z
-3CZ 303194 B6 jedinců imunních vůči M. tuberculosis. T Buněčné antigeny mohou být selektovány na základě proti látkové reaktivity, jak je popsáno výše.
Alternativně, DNA sekvence kódující antigeny mohou být identifikovány screeningem příslušné genomové nebo cDNA (M tuberculosis) získané ze séra pacienta infikovaného M. tuberculosis. Metody jsou detailně popsány: Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989.
Čisté antigeny jsou hodnoceny podle svých schopností vyvolat příslušnou imunitní odpověď (např. buněčnou), typická metoda je popsána výše. Antigeny mohou být částečně sekvenovány dle tradičních metod: Edman and Berg, Eur. J. Biochem. 80: 116 až 132, 1967. Imunogenní antigeny mohou být také připraveny rekombinací užitím příslušné DNA, která se inkorporuje do expresního vektoru aje exprimována do příslušného hostitele.
DNA sekvence kódující objevené antigeny může být také získána screeningem příslušné M. tuberculosis cDNA nebo genomové DNA, hledá se hybridizovaná-degenerovaná sekvence, která by mohla kódovat aminokyselinovou sekvenci izolovaného antigenu. Degenerované oligonukleotidové sekvence pro takovéto použití mohou být navrženy a syntetizovány např. podle: Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989 (a citace uvedené zde). Dále může být použita např. metoda PCR (polymerase chain reaction) - potřebná matrice nukleových kyselin se izoluje z cDNA nebo se získá z genomové knihovny.
Bez ohledu na metodu přípravy, mají výše uvedené antigeny schopnost vyvolat imunitní odpověď. Konkrétněji, antigeny mají schopnost vyvolat proliferaci a/nebo produkci cytokinů (např. interferonu-γ a/nebo interleukinu 12) v T buňkách, B buňkách a/nebo makrofázích získaných od jedinců imunních vůči infekci M. tuberculosis. Výběr typu buněk pro imunitní odpověď na antigen bude samozřejmě záviset na požadované odpovědi. Např. produkce interleukinu-12 je snadno vyhodnocena užitím preparátů obsahující B buňky a/nebo makrofágy. Jedinec imunní vůči infekci M. tuberculosis je někdo kdo má rezistenci k tuberkulóze, má dostatečné množství efektivních T buněk. Takovýto jedinci pozitivně reagují na podkožní vpich PPD (tuberculosis protein) - vytvoří se skvrna kolem vpichu, cca 10 mm v průměru, jedinec dále nevykazuje žádné symptomy onemocnění tuberkulózou. T Buňky, NK buňky, B buňky a makrofágy od imunních jedinců jsou připravovány běžně užívanými metodami. PBMC mohou být získány bez separace dílčích buněk, např. gradientovou centrifugaci (Ficoll™, Withrop Laboratories, NY).
T Buňky, pro zde popsané použití, mohou být izolovány přímo z PBMC. Alternativně může být získána obohacená řada T buněk reaktivní proti mykobakteriálním proteinům, nebo klony T buněk reaktivní proti jednotlivým mykobakteriálním proteinům. Takovéto klony T buněk mohou být generovány např. kultivací PBMC z jedinců imunních vůči tuberkulóze, s mykobakteriálním i proteiny po dobu 2 až 4 týdnů. To umožní expanzi T buněk specifických pouze k mykobakteriálním proteinům. Získané buňky mohou být klonovány a testovány s jednotlivými proteiny, aby byla detailně definována jejich specifita. Obecně, antigeny pozitivně testované na proliferaci a/nebo produkci cytokinů (např. interferonu-γ a/nebo interleukinu 12) získané pomocí T buněk, NK buněk, B buněk a/nebo makrofágů z imunních jedinců jsou imunogenní. Takováto analýza může být např. provedena metodami popsanými dále. Imunogenní části mohou být testovány obdobně, polypeptidy zde popisované mohou být jejich součástí.
Schopnost polypeptidů (imunogenních antigenů, jejich části, případně variant) indukovat buněčnou proliferaci je hodnocena na základě kontaktu buněk (T buněk a/nebo NK buněk) s polypeptidy a měření následné proliferace. Dostatečné množství proteiny pro vyhodnocení asi 105 buněk je 10 ng až 1 OOgg/ml, optimální hodnota je 10gg/ml. Inkubace polypeptidů s buňkami je standardně prováděna při 37 °C, po dobu 6 dnů. Výsledky jsou vyhodnocovány standardními metodami, jako je např. vystavení buněk značenému thymidinu a měření jeho inkorporace do celulámí DNA. Polypeptid, který vykazuje nejméně trojnásobný nárůst množení ve srovnání se
-4CZ 303194 B6 slepým pokusem (např. množení buněk kultivovaných bez polypeptidů), je schopen indukovat množení. Schopnost polypeptidů stimulovat produkci interferonu-γ nebo interleukinu 12 v buňkách může být vyhodnocována spojením buněk s polypeptidem a měření úrovně jejich produkce. Dostatečné množství proteinu pro vyhodnocení asi 105 buněk je 10 ng až 100 pg/ml, optimální hodnota je 10 pg/ml. Polypeptid může, ale nemusí být imobilizován na pevném nosiči, loži nebo biodegradovatelných kuličkách, podle patentu: Patent US 4 8 268 a US 5 75 109. Inkubace polypeptidů s buňkami je standardně prováděna při teplotě 37 °C, 6 dnů. Při inkubaci buněk s polypeptidem je produkce interferonu-γ a/nebo interleukinu 12 sledována běžnými metodami, jako např. ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) nebo v případě 1L-12 heterodimeru P70 se měří proliferace T buněk. Obecně, polypeptid, jež vykazuje produkci nejméně 50 pg interferonu-γ na ml supematantu (104-105 T buněk na 1 ml) je považován za schopný stimulovat produkci interferonu-γ. Polypeptid, jež stimuluje produkci nejméně 50 pg/mL 1L-12 P70 podjednotky nebo také 100 pg/mL 1L-12 P40 podjednotky na 103 makrofágů nebo B buněk (nebo na 3 x 105 PBMC) je považován za vhodný pro stimulaci produkce IL—12.
Imunogenní antigeny jsou takové antigeny, které stimulují proliferaci a/nebo produkci cytokinů (interferonu-γ a interleukinu-12) vT buňkách, NK buňkách, B buňkách a/nebo makrofágách získaných z nejméně 25 % jedinců imunních vůči tuberkulózové infekci. Množství těchto imunogenních antigenů, polypeptidů majících významné terapeutické vlastnosti, může být určeno jak bylo uvedeno výše a na základě procentuálního počtu jedinců, u kterých byla odpověď pozorována. Antigeny mající významné terapeutické vlastnosti nebudou stimulovat růst a produkci cytokinů in viiro v buňkách získaných z více než 25 % jedinců, kteří nejsou imunní vůči infekci tuberkulózy. Odpověď M tuberculosis buněk není v tomto případě specifická. Tyto antigeny, jež indukují odpověď T buněk, NK buněk, B buněk a/nebo makrofágů připravených z jedinců imunních vůči M tuberculosis ve vysoké procentuální hodnotě (a s malou pravděpodobností odpovědí v buňkách z jiných jedinců), mají velký terapeutický význam.
Pokud antigen zásadně zeslabuje průběh infekce u experimentálních zvířat, může být použit jako součást vakcín. Vhodný postup pro přípravu vakcín pro použití na experimentálních zvířatech, je popsán níže. Účinnost vakcíny je určena schopností antigenů poskytovat nejméně 50% snížení bakterií, nebo nejméně 40% snížení úmrtnosti. Vhodnými experimentálními zvířaty jsou: myši, morčata a primáti.
Antigeny mající diagnostické vlastnosti mohou být identifikovány na základě schopnosti vyvolat odpověď při intradermální aplikaci u jedinců s aktivní tuberkulózou, ale ne u ne infikovaných jedinců. Kožní testy se provádějí, jak je uvedeno níže, s pozitivní odpovědí vytvoření skvrny o minimálním průměru 5 mm kolem vpichu.
Imunogenní části výše popsaných antigenů mohou být připraveny a identifikovány užitím dobře známých technik, které jsou shrnuty: Paul, Fundamental Immunology, 3d ed., Raven Press, 1993, p.. 243 až 247 a v referencích zde uvedených. Takovéto techniky zahrnují screening imunogenních vlastností polypeptidové části nativního antigenů. Representativní růst a produkce cytokinů, jak jsou zde citovány, může být použit v tomto screeningu. Imunogenní část polypeptidů je ta část, která během representativní analýzy vykazuje téměř shodnou imunitní odpověď jako antigen (proliferaci, růst produkce interferonu-^ a/nebo interleukinu 12). Jinými slovy, imunogenní část antigenů může vyvolat nejméně 20% (nejlépe 100%) růst ve srovnání s modelovým růstem indukovaným antigenem. Imunogenní část může také stimulovat 20 % (nejlépe 100 %) produkce interferonu-γ nebo interleukinu 12, ve srovnání s jejich produkcí stimulovanou antigenem.
Části a další varianty antigenů M tuberculosis mohou být generovány syntetickým nebo rekombinantním způsobem. Syntetické polypeptidy mají obvykle méně než 100 aminokyselin, ještě častěji méně než 50 aminokyselin a jsou připravovány běžnými metodami peptidové chemie, např. syntéza na pevné fázi, metody podle Merrifielda: Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85: 2149 až 2146, 1963. Vybavení pro automatické syntézy polypeptidů je komerčně dostupné, dodavateli
-5CZ 303194 B6 jsou např. Perkin Elmer/Applied BioSystems Division, Foster City, CA. Varianty nativních antigenů mohou být připraveny užitím standardních mutagenních technik (oligonucleotide-directed site-speciťic mutagenesis). Části DNA sekvencí mohou být odstraněny užitím standardních technik užívaných ke zkrácení polypeptidů.
Rekombinované polypeptidy, obsahující části nebo varanty nativních antigenů mohou být snadno připraveny z DNA sekvencí kódující polypeptid užitím standardních technik. Např. supernatant, po kultivaci vhodného hostitelského vektorového systému, který sekretuje rekombinantní protein do kultivačního média, je v prvním kroku zakoncentrován pomocí komerčně dostupných filtrů. Pro další koncentraci a purifikaci jsou standardně používány postupy jako: afinitní chromatografie, iontoměniče a v závěrečné fázi HPLC na reverzní fázi.
Expres může být dosaženo ve vhodné hostitelské buňce, jež byla transformována nebo transfektována s expresním vektorem obsahující DNA molekulu kódující rekombinantní polypeptid. Vhodné hostitelské buňky jsou: prokaryota, kvasinky nebo vyšší eukaryotické buňky. Častěji se používají E. coli, kvasinky nebo savčí buňky jako jsou COS nebo CHO. Expresní DNA sekvence mohou kódovat v přírodě se vyskytující antigeny nebo jejích části nebo další jejich varianty.
Bez ohledu na metody přípravy, polypeptidy zde uvedené, jsou připravovány v čisté formě (minimálně 80% čistota, lépe 90%, optimální je 99% čistota polypeptidu). Výše uvedené syntetické polypeptidy nalezly široké využití ve farmaceutickém průmyslu při výrobě farmaceutických přípravků a vakcín.
Obdobně, tento vynález uvádí sloučení proteinů obsahujících první a druhý zkoumaný polypeptid, případně polypeptid známého antigenu M. tuberculosis, jako je antigen 38 kDa, popsaný v: Andersen and Hansen, Infect. Immun, 57: 2481 až 2488, 1989, (Genbank Accession No. M30046), nebo antigen ESAT-6 již dříve objevený v M. bovis (Accession No. U34848) a v M. tuberculosis (Sorensen et al., Infect Immun. 63: 1710 až 1717, 1995). Rovněž jsou zde uvedeny varianty takovýchto fúzí. Fúze proteinů může zahrnovat i peptidový linker mezi prvním a druhým polypeptidem.
DNA sekvence kódující sloučení proteinu je, v tomto projektu, konstruována užitím známých DNA rekombinaěních technik tak, aby se získala separátní DNA sekvence kódující první a druhý polypeptid ve shodném expresním vektoru. 3' Konec DNA sekvence kódující první polypeptid je připojen peptídovým linkerem (a nebo bez něho) k 5' konci DNA sekvenci kódující druhý polypeptid tak, že čtecí rámce sekvencí jsou ve fázi pro uskutečnění mRNA translaci těchto dvou DNA sekvencí za vzniku jednoho proteinu, jež si zachová biologické vlastnosti jak prvního, tak i druhého polypeptidu.
Sekvence peptidového linkeru zajistí dostatečnou vzdálenost prvního a druhého polypeptidu, tak, aby zůstala zachována jejich sekundární a terciární struktura. Inkorporace tohoto linkeru do spojených proteinů patří mezi známé metody. Vhodné sekvence peptidového linkeru se vybírají s ohledem na následující faktory: (1) schopnost zaujímat flexibilní konformaci; (2) neschopnost zaujmout sekundární strukturu, jež by mohla interagovat s funkčními epitopy prvního nebo druhého polypeptidu; (3) nedostatek hydrofobních a nabitých zbytků, jež mohou reagovat s polypeptidovými funkčními epitopy. Použitelná sekvence peptidového linkeru obsahuje: Gly, Asn a Ser zbytky, dále neutrální aminokyseliny jako Thr a Ala. Aminokyselinové sekvence použitelné pro peptidové linkery byly popsány: Maratea et al., Gene 40: 39 až 46, 1985; Murphy et al., Proč, Nati. Acad. Sci. USA 83: 8258 až 8262, 1986; Patent US 4 751180. Linkerová sekvence má obvykle délku od 1 do asi 50 aminokyselin. Polypeptidové sekvence nevyžadují, aby první a druhý polypeptid měly neesenciální N-terminální aminokyselinovou oblast, kterou lze použít pro separaci funkčních domén a k ochraně sterické interference.
Spojené DNA sekvence jsou směrovány k vhodnému translaěnímu nebo transkripčnímu prvku.
Regulační prvky, odpovědné za expresi DNA se nalézají na 5' konci DNA sekvence kódující
-6CZ 303194 B6 první polypeptid. Podobně, u stop kodonů se požaduje, aby tyto ukončující signály pro transkripci a translaci byly přítomné pouze na 3' konci DNA kódující druhý polypeptid.
Dále je popsán způsob použití jednoho nebo více polypeptidů nebo sloučených polypeptidů (nebo
DNA molekul kódující tyto polypeptidy) k indukci ochranné imunity u tuberkulózou napadených jedinců. Jak zde bylo již uvedeno, termín „pacient“ znamená jakýkoliv teplokrevný organismus, zejména pak člověka. Pacient může, ale nemusí být postižen nemocí. Ochranná imunita může být indukována z preventivních důvodů.
ίο V takových způsobech, polypeptid, sloučený protein nebo DNA molekula jsou přítomny ve farmaceutické směsi nebo vakcíně. Farmaceutický přípravek se může skládat z jednoho nebo více polypeptidů, kde každý z nich může obsahovat jednu nebo více výše zmíněných sekvencí (nebo jejich varianty), a fyziologicky akceptovatelný nosič. Vakcíny se mohou skládat z jednoho nebo více výše zmíněných polypeptidů a nespecifického zesilovače imunitní odpovědi, což může být např. adjuvant nebo lipozom (do kterých jsou polypeptidy inkorporovány). Farmaceutické směsi a vakcíny mohou také obsahovat další antigeny M tuberculosis, buď inkorporované do kombinace peptidů, nebo přítomné v separovaném polypeptidů.
Alternativně, vakcina může obsahovat DNA kódující jeden nebo více polypeptidů, jež byly pop20 sány výše, tak, že polypeptid je syntetizován in šitu. V takových vakcínách může být DNA přítomna v jakékoli z variant transportního systému, obsahující expresní systém nukleových kyselin, bakteriální a viriální systémy, Vhodný expresní systém nukleových kyselin obsahuje DNA sekvence pro expresi v pacientovi (vhodný promotor a terminál ní signál). Cílový bakteriální systém (jako např. Bacillus-Calmette- Guerrin) umožňuje expresi imunogenních částí polypeptidů na buněčný povrch. DNA může být zavedena užitím virového expresního systému (vakcina nebo virus neštovic, retrovirus nebo adenovirus), který může obsahovat nepatogenní (defektivní), replikačně vhodný virus. Techniky pro vkládání DNA do expresních systémů jsou běžně užívanými technikami. DNA může být „obnažena“, jak je podrobně popsáno v: Ulmer et al, Science 259: 1745 až 1749, 1993 a nebo v review: Cohen, Science 259: 1691 až 1692, 1993. Životnost „obnažené“ DNA může být zvýšena zabalením do biodegradovatelných částic, které jsou účinně transportovány do buněk.
DNA vakcina, jak již bylo výše popsáno může být podávána současně s polypeptidem citovaným v tomto vynálezu, nebo s antigenem M. tuberculosis jako je např. výše popsaný antigen 38 kD.
Např. aplikace DNA kódující polypeptid uvedený v tomto vynálezu, a to buď samotného, nebo v transportním systému, což bylo také popsáno, může být následována aplikací antigenů tak, aby se zvýšil ochranný imunitní efekt vakcíny.
Způsob a frekvence aplikace, stejně tak jako dávkování je zcela individuální. Farmaceutické pří40 pravky mohou být podávány injekcí (do kůže, do svalu, do žíly nebo subkutánně), do nosu (nosní dutinou) nebo ústy. Mezi první a třetí dávkou se doporučuje doba 1 až 36 týdnů. Optimální je, když 3 dávky jsou aplikovány do 3 až 4 měsíců. Poté by pravidelně mělo probíhat přeočkování. Každý pacient by měl mít vlastní lékařskou zprávu. Vhodná dávka je množství polypeptidů nebo DNA jež, když je aplikováno jak je výše popsáno, je schopné zvýšit imunitní odpověd* v imuni45 zovaném pacientovi tak, aby byl pacient úspěšně ochráněn před infekcí M. tuberculosis, a to po dobu 1 až 2 let. Množství polypeptidů přítomné v jedné dávce(nebo produkované in šitu) je v rozsahu 1 pg až 100 mg na 1 kg hostitele, obvykle 10 pg až 1 mg na 1 kg hostitele, optimálně asi v rozsahu 1 pg až 1 pg na 1 kg hostitele. Vhodná velikost dávky je individuální v závislosti na pacientovi, obvykle 0,1 až 0,5 ml.
Pokud je znám vhodný nosič, může být použit do farmaceutického přípravku. Pro parenterální dávkování, jako je subkatenosní aplikace se jako nosič upřednostňuje voda, šalin, alkohol, tuky, vosk a pufry. Pro orální aplikace se používají pevné nosiče jako manitol, laktóza, škrob, stearát hořečnatý, sacharin sodný, mastek, celulóza, glukóza, sacharóza, uhličitan hořečnatý. Jako nosný
-7CZ 303194 B6 materiál se také používají biodegradabilní kuličky (většinou sacharidového charakteru). Seznam vhodných materiálů je uveden v patentu: Patent. US 4 897 268 a US 5 075 109.
Jakékoliv varianty adjuvantu mohou být užity ve vakcínách, tak, aby se zvýšila nespecifická imu5 nitní odpověď. Většina adjuvantů obsahuje látky, které chrání antigeny od rychlého katabolismu, např. hydroxid hlinitý, minerální olej a nespecifické stimulátory imunitní odpovědi, jako lipid A, Bordetella pertussis nebo Mycobacterium tuberculosis. Vhodné adjuvanty jsou komerčně dostupné, např. Freundovo kompletní adjuvant a Freundovo nekompletní adjuvant (Difco Laboratories) a Merck Adjuvant 65 (Merck and Company, lne., Rahway, NJ). Další adjuvanty obsaio hují kamenec, biodegradovatelné kuličky monofosforyl lipid A a quil A.
Tento vynález uvádí diagnostické kity pro použití v diagnose tuberkulózy kožním testem. Jak je zde uvedeno, „kožní test“ je prováděn intradermálním vpichem jednoho nebo více výše popsaných polypeptidů, je sledována následná reakce (DTH) hypersensitivních jedinců (jako je červe15 nání, svědění a zánět kůže). Injekce je připravena tak, aby bylo dosaženo vhodného kontaktu polypeptidu nebo polypeptidů s kožními buňkami pacientů (např. se používá tuberkulin syring nebo 1 ml syringů). Reakce se obvykle sleduje po dobu 48 hodin po vpichu, častěji 48 až 72 hodin po vpichu.
DHT reakce je reakce v buňkách s průměrnou imunitní odpovědí, může být odhalena již při předběžném testování antigenů (imunogenní části polypeptidu, nebo jeho variant), a je u pacientů nej rozšířenější. Odpověď lze měřit visuálně, použitím pravítka. Obecně, skvrna o průměru větším než je asi 0,5 cm, lépe větší než je asi 1,0 cm v průměru, je považována za pozitivní odpověď, indikuje infekci tuberkulózy, a může, ale nemusí znamenat aktivní chorobu.
V rámci tohoto vynálezu jsou polypeptidy popsány tak, aby mohly být použity v kožním testu a výsledkem byl farmaceutický přípravek obsahující polypeptid a fyziologicky akceptovatelný nosič, jak bylo již popsáno drive. Takové přípravky standardně obsahují jeden nebo více výše zmíněných polypeptidů v množství okolo asi 1 až asi 100 Bg, lépe asi 10 až asi 50 pg v objemu
0.1 mL, Nosič, který farmaceutický přípravek připravuje je obvykle roztok šalinu s příslušnými ochrannými složkami, jako např. fenol a/nebo Tween 80™.
Polypeptid používaný v kožním testu musí mít dostatečnou délku, tak, aby mohl působit na místě vpichu po celou dobu reakce (podléhá samozřejmě katabolickým procesům). Obecně, polypeptid, mající nejméně 9 aminokyselin je postačující. Výhodou je, může-li být polypeptid přerušen makrofágem během doby vpichu, umožní se tak vliv T buněk. Takovéto polypeptidy mohou obsahovat jednu nebo více repeticí v drive uvedených sekvencích a/nebo další imunogenní nebo neimunogenní sekvence.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Purifikace a charakterizace polypeptidů z M tuberculosis pomocí CD4+ buněčných linií generovaných z lidských PBMC
Antigeny M. tuberculosis citované v tomto vynálezu byly izolovány expresním klonováním 50 cDNA knihovny kmenů M tuberculosis H37Rv a klasickými metodami podle Erdmana popsanými v Sanderson et al. (J. Exp. Med., 1995, 182: 1751 až 1757) a dále byla ukázána indukce proliferace PBMC a IFN-γ v imunoreaktivních T buněčných linií. Dvě CD4+ T buněčné linie, nazvané DC-4 a DC-5 byly generovány proti dendritickým buňkám infikovaných M. tuberculosis. Konkrétně dendritické buňky byly připraveny z adherentních PBMC zjednoho donoru a následně infikovány tuberkulózou. Lymfofyty z téhož donoru byly kultivovány za limitního zře-8CZ 303194 B6 dění s infikovanými dendritickými buňkami, aby se generovaly CD4+ T buněčné linie typu DC ~4 a Dc-5. Ukázalo se, že tyto buněčné linie reagují s hrubým preparátem rozpuštěných proteinů z ΛΪ. tuberculosis, ale nereagují s Tb38-1. Limitní zředění bylo zachováno, aby byla získána třetí linie CD4+ T buněk, označených DC-6, která, jak se ukázalo reaguje jak s proteiny M tuberculosis, tak sTb38-l. Genomová DNA byla izolována z kmene A£ tuberculosis H37Rv a Erdman, a byla použita pro vytvoření expresní knihovny ve vektoru pBSK(-), použitím expresního Lambda ZAP expresního systému (Stratagene, La Jolla, CA). Tato knihovna byla transformována do E. coli, část indukovaných buněk byla inkubována s dendritickými buňkami a byla testována, jak je popsáno v příkladu 2, byla sledována schopnost inkubovaných dendriticio kých buněk stimulovat buněčnou proliferaci a produkci IFN-γ vCD4+ T buňkách Dc-6. Pozitivní části byly znovu testovány s čistými M tuberculosis klony. 19 Klonů bylo izolováno, u 9 bylo zjištěno, že obsahují již dříve identifikované antigeny hf. tuberculosis, TbH-9 a Tb38-1, popsaných v patentu: Patent US Application 08/533 634. Určení cDNA sekvencí pro zbylých 10 klonů zde uvedených (zde označených Tb224, Tb636, Tb424, Tb436, Tb398, Tb508, Tb441,
Tb475, Tb488 a Tb465) je provedeno v sekvencích č.: I až 10. Odpovídající aminokyselinové sekvence pro Tb224 a Tb636 jsou uvedeny v sekvencích č.: 13 a 14. Ukázalo se, že otevřené čtecí rámce pro dva antigeny jsou homologní s TbH-9, který je popsán výše. Zjistilo se také, že Tb224 a Tb636 se překrývají. Bylo zjištěno, že každý z Tb424, Tb436, Tb398, Tb508, Tb441, Tb475, Tb488 a Tb465 obsahuje dva malé otevřené čtecí rámce (označené ORF-1 a ORF-2) nebo jejich obdobu s minoritními změnami v ORF-1 a ORF-2. Aminokyselinová sekvence ORF—1 a ORF-2 pro Tb424, Tb436, Tb398, Tb508, Tb441, Tb475, Tb488 a Tb465 je uvedena v sekvencích č.: 16 a 17, 18 a 19, 20 a 21, 22 a23, 24 a 25, 26 a 27, 28 a 29, 30 a 31. A konečné klony Tb424 a Tb436 obsahují třetí objevený čtecí rámec, označený jako ORF-U. Aminokyselinová sekvence ORF-U pro Tb424 a Tb436 je uvedena v sekvencích ě.: 32 a 33. Bylo zjištěno, že Tb424 a Tb436 jsou překrývající se klony nebo dokonce duplikované/transposované kopie, jako Tb475 a Tb488. Tyto sekvence byly porovnány se známými sekvencemi v genomových knihovnách systémem BLASTN. Nebyly nalezeny homologní antigeny Tb226 a Tb431. Bylo zjištěno, že Tb636 je 100% identický sjiž dříve nalezeným antigenem vAÍ tuberculosis. Obdobně Tb508, Tb488, Tb398, Tb424, Tb436, Tb441, Tb465 a Tb475 jsou homologní s jíž známými klony M tuberculosis. Konečně, Tb488 je 100% homogenní sAT tuberculosis topoisomerázou I. Bylo syntetizováno 17 překrývajících se peptidů s otevřeným čtecím rámcem ORF-1 (označených 1-1 až 1-17, sekvence č.: 34 až 50) a 30 překrývajících se peptidů s otevřeným čtecím rámcem ORF-2 (označených 2-1 až 2-30, sekvence ě.: 51 až 80), metodou popsanou níže v příkladu 3. Byla zkoumána schopnost syntetických peptidů a rekombi35 nantních ORF-1 a ORF-2 indukovat proliferaci T buněk a produkci IFN-γ v PBMC z PPDaktivních donorů, viz. příklad 2. Obrázky 1A-B a 2A-B ilustrují stimulaci proliferace T buněk a produkce IFN-γ rekombinantním ORF-2 a syntézu peptidů 2-1 až 2-16 u dvou donorů, označených jako D7 a Dl60. Rekombinantní ORF-2 (také označovaný jako MTI) stimuluje proliferaci T buněk a produkci IFN-γ v PBMC u obou z donorů. Velikost stimulace PBMC je vidět na indi40 viduální syntéze peptidů, mění se v závislosti na donorů, to znamená, že každý donor rozhoduje o různosti epitopů na ORF-2. Proteiny kódované ORF-1, ORF-2 a ORF-U byly dále nazývány MTS, MTI a MSF. Bylo syntetizováno a níže je popsáno 18 překrývajících se peptidů, ze sekvence MF (označených zde MSF-l až MSF-18, sekvence č.: 84 až 101), byla sledována jejich schopnost stimulovat proliferaci T buněk a produkci IFN-γ v CD4+ T buněčné linii generované z kultivačního média M tuberculosis. Peptidy označené MSF-12 a MSF-13 (sekvence ě.: 95 a 96) prokázaly nejvyšší reaktivitu. Dále byly syntetizovány dva překrývající se peptidy (sekvence ě.: 81 a 82) s otevřeným čtecím rámem Tb224 a byla u nich prokázána indukce proliferaci T buněk a produkci IFN-γ v PBMC z PPD-pozitivních donorů. Dvě CD4+T buněčné linie u různých donorů byly generovány z M tuberculosis infikovaných dendritických buněk užitím výše zmíněných metod. Izolace dvou klonů označených jako Tb867 a Tb391 byla výsledkem screeningu knihovny cDNA M tuberculosis. Určená sekvence Tb867 (sekvence č.: 102) byla shledána identickou sjiž dříve izolovaným klonem Aí tuberculosis SCZ22G10 s 750 aminokyselinami velkou protein kinázou Aí tuberculosis s otevřeným řetězcem, S porovnání určené sekvence cDNA pro Tb391 (SEQ ID NO: 103) s genomovou bankou nebyla nalezena homologie s dosud
-9CZ 303194 B6 známou sekvencí. V dalších studií, CD4+T buněčné linie byly generovány z kultivačního média M tuberculosis, jak je popsáno v podtržené části dříve. Bylo izolováno 5 reaktivních klonů, označených Tb431, Tb472, Tb470, Tb838 a Tb962. Určené sekvence cDNA pro Tb431, Tb472, Tb470 aTb838 jsou uvedeny v sekvencích č.: 11, 12, 104 a 105, sekvence cDNA pro Tb962jsou uvedeny v sekvencích č.: 106 a 107. Odpovídající předpokládaná aminokyselinová sekvence pro Tb431 je uvedena v sekvenci č.: 15. Následné studie vedly k izolaci celé sekvence cDNA pro Tb472 (sekvence č.: 108). Překřížené peptidy byly syntetizovány a použity pro identifikaci reaktivního otevřeného čtecího rámce. Předpokládaná aminokyselinová sekvence pro protein kódovaný Tb472 (označený jako MSL) je uvedena v sekvenci č. 109. Srovnání sekvencí Tb472 a MSL s genomovou bankou, jak je popsáno výše, neukázalo, že žádnou známou homologií. 15 Překřížených peptidů se sekvencí MSL (označených MSL-1 až MSL-15, sekvence č.:l 10 až 124) bylo syntetizováno a testováno, jak je popsáno níže, pro schopnost stimulace proliferace T buněk a produkci IFN-γ v CD4+T buněčných linií získaných z kultivačního média M. tuberculosis. Peptidy označené jako MSL-10 (sekvence č.: 119) a MSL-11 (sekvence č.: 120) prokázaly vysokou reaktivitu. Srovnání určené cDNA sekvence Tb838 s genovou bankou ukázalo identitu s již dříve popsaným M. tuberculosis SCY07H7. Srovnání určené cDNA sekvence Tb962 s genovou bankou ukázalo homologií ke dvěma dříve popsaným M tuberculosis, jeden kóduje část bakteroferritinu. Bylo však zjištěno, že rekombinantní bakteroferritin není reaktivní sT buněčnou linií. Klon Tb470, popsaný výše, byl použit pro získání celého řetězce (sekvence č.: 125), který vykázal homologií s TbH9 a bylo zjištěno, že kóduje 40 kDA antigen, označovaný jako Mtb40. Určená aminokyselinová sekvence pro Mtb40 je uvedena v sekvenci č.: 126. Obdobně, studie subsekvencí vedly k izolaci celého řetězce cDNA pro Tb431, uvedené v sekvenci č.: 83, bylo zjištěno, že tato sekvence kóduje otevřený čtecí rámec kódovaný U—ORF-Iike antigenem. Výsledkem screeningu expresní knihovny M. tuberculosis Erdman cDNA s multipletními CD4+ T buněčnými liniemi získanými z kultivačního média M. tuberculosis byla izolace tří klonů, označených jako Tb366, Tb433 a Tb439. Určené cDNA sekvence pro Tb366, Tb433 a Tb439 je uvedena v sekvencích č.: 127, 128 a 129. Srovnání těchto sekvencí s genovou bankou neukázalo odpovídající homologií kTb366. Naopak, Tb433 byl nalezen homologním sjiž dříve určeným antigenem M. tuberculosis MPT83. Tb439 byl shledán 100% identický s dříve izolovaným M. tuberculosis SCY02B10. Linie CD4+ T buněk byla generována vůči M. tuberculosis PPD, podrobně popsáno výše, a použita pro screenování Erdmanovy cDNA expresní knihovny. Byl izolován reaktivní klon (označený jako Tb372), sekvence č.: 130 a 131. Při porovnání těchto sekvencí s genovou bankou, nebyla nalezena žádná homologie. V dalších studiích vedl screening M. tuberculosis cDNA expresní knihovny s CD4+ T buněčnou linií generovanou vůči dendritickým buňkám, které byly po dobu 8 dnů infikovány tuberkulózou, k izolaci dvou klonů, označených jako Tb390R5C6 a Tb390R2Cl 1. Určená sekvence pro Tb390R5C6 je uvedena v sekvenci č.: 132, sekvence pro Tb390R2Cl 1 je uvedena v pod Č.: 133 a 134. Tb390R5C6 vykazuje 100% identitu již dříve identifikovaným kosmidem M. tuberculosis. V následujících studiích, byly výše popsaná metodologie použita pro screen genomové DNA knihovny M. tuberculosis, připravené následovně. Genomová DNA zM tuberculosis (Erdmanův kmen) byla náhodně sestříhána na části o průměrné velikosti 2 kb, a ukončena Klenowovou polymerázou, následovanou přídavkem EciRI adaptoru. Insert byl následně ligován do screenovacího fágového vektoru (Novagen, Madison, Wi) a in vitro zabalen užitím fágového makrového extraktu (Novagen). Fágová knihovna (označovaná jako ErdXScreen library) byla zvětšena a její části byly konvertovány do plasmidové expresní knihovny autosubklonovacím mechanismem pomocí E. coli BM25.8 (Novagen). Plasmid DNA byl vyizolován zBM25.8 kultur obsahující pSCREEN rekombinanty a použit pro transformaci kompetentních buněk expresního hostitele - tj. kmen ML21 (DE3)pLysS. Transformované buňky byly alikvotné převedeny na mikrotitrační plotny (96 jamek), každá obsahovala místo pro přibližně 50 kolonií. Kopie takových ploten byly inkubovány s IPTG, aby došlo k expresi rekombinantních proteinů. Následovala indukce, plotny byly centrifugovány, aby se získaly pelety E. coli, které byly dále použity přímo v T buněčné expresi klonované CD4+T buněčné linie připravené z PPD-pozitivního donoru (donor 160), jak je popsáno výše. Část obsahující E. coli expresní antigeny ΛΖ tuberculosis byly následně rozděleny do dvou individuálních kolonií a opětovně analyzovány obdobným způsobem. Screening T buněčných linií z donoru 160 výše zmíněným způsobem vedl k získání 9 pozitivních odpovědí. Dřívější experimenty v rámci
- 10CZ 303194 B6 screeningu pBSK knihovny popsané výše sT buňkami zdonoru 160 předpokládaly, že většina nebo všechny pozitivní klony by měly být TbH-9, Tb-38-1 nebo MTI (Patent US application 08/533 634) nebo jejich varianty. Avšak, analýza (Southern) ukázala, že pouze 3 jamky hybridizovaly se směsí TbH-9, Tb-38-1 nebo MTI. Ze zbývajících 6 pozitivních jamek se dvě ukázaly identické. Určené sekvence 5' cDNA pro dva z izolovaných klonů (označených YI-26C1 a Yl86C11) jsou uvedena v sekvencích č.: 135 a 136. Celá cDNA sekvence pro izolovaný klon označený hTcc#t je uvedena v sekvenci č.: 137 a odpovídající předpokládaná aminokyselinová sekvence je uvedena v sekvenci č.: 138. Porovnáním sekvence hTcctfl s genovou bankou popsanou výše, se ukázalo, že hTcc#l je homologní sjiž dříve popsaným klonem Λ/. tuberculosis io MTCY07HB.06.
Příklad 2 i? Indukce T buněčné proliferace a interferonu-γ produkovaným antigeny M. tuberculosis
Schopnost rekombinantních antigenů M. tuberculosis indukovat T buněčnou proliferací a produkci interferonu-γ, může být určena následovně. Proteiny mohou být indukovány IPTG a izolovány gelovou chromatografii, jak bylo popsáno: Skeiky et al. J. Exp. Med., 1995, 181: 1527 až
1537. Purifikované polypeptidy jsou dále testovány na schopnost indukce proliferace T buněk v PBMC preparátech. TBMC z donorů, u kterých je známa pozitivní reakce v PPD kožních testech, a které podporují T buněčnou proliferací, jsou kultivovány v médiu obsahujícím RPMI 1640 s 10% lidského séra a 50 pg/ml gentamicinu. Purifikované polypeptidy jsou přidány v dvojnásobné koncentraci z 0.5 na 10 pg/mL. Po 6 dnech kultivace v 96 jamkových kruhových plotnách o objemu 200 pl, je 50 pl média z každé jamky odebráno pro stanovení IFN-γ hladiny, jak je popsáno níže. Dále je do každé jamky přidáno 1 pCi thymidinu značeného tritiem a za 18 hodin je výsledek analyzován na plynovém scintilátoru. Za pozitivní se považují frakce, kde proliferace ve dvou paralelách je třikrát větší než proliferace v normálním mediu. Produkce IFN-γ je měřena pomocí ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay). Po dobu 4 hodin za pokojové teploty jsou na ELISA desky navázány monoklonální myší protilátky proti lidskému IFN-γ (PharMingen, San Diego, CA). Jamky jsou blokovány PBS obsahujícím 5 % (W/v) netučného sušeného mléka po dobu 1 hodiny za pokojové teploty. Desky jsou poté promyty a do každé jamky je přidáno polyklonální anti-human IFN-γ sérum, zředěné 1:3000 v PBS/10% normálním kozím sérem. Desky jsou inkubovány po dobu dvou hodin za pokojové teploty, omyty a dále je do každé jamky přidán anti-králičí IgG označen křenovou peroxidázou (Sigma Chemical So., St. Louis, MO), zředěný 1:2000 Pbs/5% netučným sušeným mlékem. Po dalších dvou hodinách inkubace pri pokojové teplotě jsou desky omyty a je přidán TMB substrát. Reakce je zastavena po 20 minutách IN kyselinou sírovou. Je měřena optická hustota při 450 nm, vlnová délka 570 nm je použita jako referenční. Za pozitivní se považuje, když OD (ve dvou paralelách) je dvakrát větší než optická hustota z buněk kultivovaných v normálním médiu, plus 3 standardní odchylky.
Příklad 3
Purifikace a charakterizace polypeptidů zM. tuberculosis, používaných pro přípravu CD4+ T buněčných linií z myší nakažených M. tuberculosis
M. tuberculosis infekce u myši C57BL/6 ukazuje, že k rozvoji progresivní choroby dochází při50 bližně v 2. až 3. týdnu po nákaze. Postup choroby je zastaven následkem vývoje T buněk. Tento model byl použit pro generování T buněčné linie schopné rozpoznat ochranné antigeny M. tuberculosis. Byly získány buňky ze sleziny C57BL/6 myši infikované M. tuberculosis po dobu 28 dní a tyto buňky byly použity pro přípravu anti- M. tuberculosis T buněčných linií, jak bylo popsáno dříve. Získané CD4+ T buněčné linie, byly spolu s normálními antigeny přítomnými v buňkách
- 11 CZ 303194 B6 (zc sleziny) myši C57BL/6 použity pro testování knihovny Ní. tuberculosis ErdX.screen, jak bylo popsáno dříve. Byl nalezen a izolován jeden aktivní klon (Y288C10) s vysokou stimulací T buněk. Sekvenování tohoto klonu Y288C10 ukázalo, že obsahuje dva geny v tandemu. Nalezená sekvence pro tyto dva geny (označené jako mTCC#l a mTCC#2) je uvedena v sekvencích č.: 139 a 140, odpovídající aminokyselinové sekvence jsou uvedeny v pod č.: 141 a 142. Srovnáním sekvencí s genovou bankou se zjistila identita s neznámou sekvencí dříve nalezeného klonu Ní. tuberculosis MTY21C12, Předpokládaná aminokyselinová sekvence mTCC#l a mTCC#2 jsou identické s dříve popsanými členy TbH9 proteinové skupiny.
Příklad 4
Syntéza syntetických polypeptidů
Polypeptidy mohou být syntetizovány na Millipore 9050 peptidovém syntetizátoru užitím FMOC chemie s HPTU aktivací (0-Benzotriazol-N,N,N',N'-tetramethyIuronium hexafluorofosfát). Sekvence Gly-Cys-Gly může být připojena na konec peptidu metodou konjugace nebo značené peptidu. Odštěpení peptidů z pevného nosiče je prováděno užitím následující směsi: kyselina trifluoroctová: ethandiol: thioanisole : voda: fenol (40:1:2:2:3). Po dvou hodinách štěpení, mohou být peptidy precipitovány ve studeném methyl-t-butyl-etheru. Peptidové peletky mohou být rozpuštěny ve vodě obsahující 0.1 % trifluoroctové kyseliny (TFA) a lyofilizovány před purifikaci na Cl 8 reverzní koloně na HPLC, v gradientu 0 až 60 % acetonitrilu (obsahující 0.1% TFA) ve vodě (obsahující 0.1 TFA). Následuje lyofilizace čistých frakcí, peptidy mohou být analyzovány pomocí hmotnostní spektrometrie nebo aminokyselinovou analýzou.
Jak stojí v předem uvedeném závěru, začlenění tohoto vynálezu, zde popsané, bylo z ilustračních důvodů, ale v duchu a oboru tohoto vynálezu mohou být provedeny různé modifikace.
Seznam sekvencí
Sekvence č. 1 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1886 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 1
- 12CZ 303194 B6
CGCTCTGGTG ACCACCAACT TCTTCGGTGT CAACACCATC CCGATCGCCC TCAACGAGGC CGACTACCTG CGCATGTGGA TCCAGGCCGC CACCGTCATG AGCCACTATC AAGCCGTCGC GCACGAAATC TGGTGTCTCC ATGAATANGC CAGTTCGGGA AAGCCGTGGG CCAGTATCAC CACGGGTGCG CCGGGCTCAC CGGCCTCGAC CACTCGCAGT CGCACGCCGT TGGTATCAAC TAACCGTNCN GTANGTGCGC CCATCGTCTC ACCAAATCAC ACCGGGCACC GGCCTGAGAA GGGCTTGGGG AGCANCCAGA GGCGATTGTC GCGGGTGCTG CCGCGCATCA TTGATCGGCC GGCCGGACCA NTCGGGCCTC CCTTGACGTC CGGATCNCAC TTCCTGTGCA GCTGGCATGG CTACAGCTCA CAGTGACTGC CCCACGATTG CCGGCCAGGT CCAGTTCAAA TTCCGGTGAA TTCGCGGACA AAAGCAGCAG GTCAACCAAC CGCAGTCAGT CGAGGGTCCC AAACGTGAGC CAATCGGTGA AATGGCTTGC TGCAGTGACA CCGGTCACAG GCTTAGCCGA CAGCACCGGA ATAGCTCAGG CGGGCTATAG AGTCCTATAG AAACATTTGC TGATAGAATT AACCGCTGTC TTGGCGTGAT CTTGATACGG CTCGCCGTGC GACCGGTTGG CTCAGTAGCT GACCACCATG TAACCCATCC TCGGCAGGTG TCTACTAAGG CGAGACACCG CATTGGTGGG GCTGCATCGC AAATCGGTCC GAGCATGTAG CACTGCCGTT ATCCCGGGAT AGCAAACCAC CCGGAACCAG GGCTATCCCA GTCGCTCTCC GACGGAGGCC GTTTCGCTTT CCGTTGCCCG ATAACTCCCG AGTGGATATC GGCGTTATCA NATTCAGGCT TTTCTTCGCA AGGTACCGGT GTTCGCTATA TTCGGATATC TCGGACGGAT AATTACTAAA ACTTCAGTGG TTTAGATAAG GCCGCCGCAA TACTTCGCCG ATCTTGCCGA GCGCAACGGA TTTCCATCGT CGGTTTTCGT CGCCTTATCA AACATGATCG GAGATAATGA cagatcggcc tagctaggtg tttagcggac gcgatttagg ACAACCGAGA TTTGCTTTGC CTCGCAACCA TGAGAGCGCC CCGCTTCGAC GCCGAATCGG GTGAGTGATG GTGGGTTAGC ACAGCCCTGA TTGCGCCACC GGCGAGGTGA TTGTGCCCGC CACGAGGCCG CCGCCGGCTA GCCCCATGAG CACGNTATAT AGACTCTCCT GCAACAGATC TCATACCGAT CGAAGGCGAA GCGCAGGCAT CGACGTCGGA GACACTGCCT TGGGATCGCG CCGCCTACAC GGCGGTTGGC GCATTGTCGC AGCGCAGTTG CAGGAGGGCA AATGTGCGCA GACGATGTAG TCGACAACAA GTGNACATGC CGTCTTCACG AACTCAAAAC TGACGATCTG CTTAGCATGA AAAAAACTGT TGACATCGGC CAAGCATGAC AGCCAGACTG TAGGCCTACG CGTGCAATGC AGAACCAAGG NTATGCATGG AATCGACGAC CGTTGAGATA GGCGGCAGGC ATGAGCAGAG CGTTCATCAT CGATCCAACG ATCAGTGCCA TTGACGGCTT GTACGACCTT CTGGGGATTG GAATACCCAA CCAAGGGGGT ATCCTTTACT CCTCACTAGA GTACTTCGAA AAAGCCCTGG AGGAGCTGGC AGCAGCGTTT CCGGGTGATG GCTGGTTAGG TTCGGCCGCG GACAAATACG CCGGCAAAAA CCGCAACCAC GTGAATTTTT TCCAGGAACT GGCAGACCTC GATCGTCAGC TCATCAGCCT GATCCA
Sekvence č. 2 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 2305 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 2
GGCACGCGCT GGCCGCGCAA TACACCGAAA TTGCAACGGA ACTCGCAAGC GTGCTCGCTG CGGTGCAGGC AAGCTCGTGG CAGGGGCCCA GCGCCGACCG GTTCGTCGTC GCCCATCAAC CGTTCCGGTA TTGGCTAACC CACGCTGCCA CGGTGGCCAC CGCAGCAGCC GCCGCGCACN
120
180
240
300
360
420
480
540
600
66C
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
180C
1860
1886
120
180
- 13CZ 303194 B6
AAACGGCCGC
CGGCCAACCA
TCCCGATCGC
TGAGCCACTA
CGCCGCAGAT
CCAAATTGAT
AGCTGCTGCC
TCGTGTCCGG
TCGGACCGTT
GCCTCAAAAC
CCACTGCGGT
GTGATCCGAC
ATCAAATCCC
CGCGAGATAG
GAACCTCTGA
GAAGCGACCA
CACCAGTTGG
TCGAGCGGGA
ATCCGACAAC
CTGAGCGGGA
GCCCTCAACT
TTGGCGGCGA
GTCACCCTGC
GGGCAACTGA
GCTCAAATGC
GTGCAGGAAT
TTCCTGTTGG
CCGCAGATTT
GGTCATGCGG
GATCAGGTCA
GATGCCACGA
AACAGCGATA
ATTCTGNTGC
TTGTCGGCCC
TGGAGCCTGC
CTGCTCATTT
CGCCGGGTAT
TGCCATGCAC
CCTCAACGAG
TCAAGCCGTC
AGTGACCAGT
CCTGCAGCTA
GGGGCCGCTC
TCCAGTCTTC
CGCCCCGCTG
CGCCACCGGA
CGCCGAGTAT
GTCGCAGGTT
CCCGAGACCT
CAGAATTGCC
AGGAGACCAA
CCCTGCTCGA
CCGACGCCCT
TAGTCAACAC
TGGAAAATGC
CCGTCACCGA
CCAGCCCGGT
TTGTCCAGGC
AACAGACGCA
AGCAAGTCGT
AGCAAGGAGC
TGGTCGATCA
GGATCAAGCG
TTTCGAGGGA
CGCGGTACTT
ACGATATCCT
TAGGTCTGGC
TGAAATTCAT
GCGCACTTGT
TAGGCATAGG
CGGGACTGTC
CACGCATCCG
ACGTCCGCAT
GGCGCTCTGG
GCCGACTACC
GCGCACGAAA
GCGGCCAGCT
CTCAAGGATT
GGCGACCTCA
ACGTTTCTCG
ACGAGTCCGG
CTGACGCTGC
GTCGCCCAGC
GTCGAACCCG
GCGGACACCC
CAACATCGTG
GGTCTCGTTT
AGAGCACGGA
CGCCCAAATA
CCTGCAGGCC
GTCCCAATAT
TGCCGAACAA
GTGTAACAGC
GCAGGACGAC
GGAATACCAG
CAGCACCCTC
CAACGCTCTC
GGTCAAAAAG
GGATGCGGAC
CGAGTTCAAG
CGTGCAGAGC
CCGTGTTGCG
GGGGGTTCCG
CGTCATTGCG
GGNTCCGATA
AACTTTCGTT
CTTCATATTA
CGACG
TGGGGGGCAT
TGACCACCAA
TGCGCATGTG
GCGTGGCGGC
CGGCGGCTAG
TCCTGGAGCT
TCGCCCAGGT
CCTACCTGGT
TCCTGTTGCC
CACCTACCGT
AAATGTCTGG
CTCGTGCCGA
GGCGCGCTTG
ATGGTGCGGG
CAGGCTGGTG
GGCGAGCTGG
CGCAACGAAA
ATGATGGACC
GTCGGGCGCA
ATCGCCACTT
GATCCCGCCT
GGCCTGCTCA
ACACTCGCCC
AAAGCGGTCG
GCCGACGGCA
ATGGGCTCAG
AAGCCGTCAA
AAGGGCGCCC
GCGCTGAATC
GATTCCGCGC
ACTGCGCTGC
ACGATCGTTA
TATCTGATAG
TTCCAATTGA
TTGGTTGCCA
GCCTACGCTA
CTTCTTCGGT
GATCCAGGCC
GACCCCCAGC
CAGCAGCTTC
GCTGCGCTAT
GTTGGACTGG
GCTGGACCCA
TGCTGTGGAG
GATTTTCGAT
CAGCCGCCCA
ATTCGGCACG
CCGACATCGA
GCTTGACCCG
AAGTGGGCGG
ACCAGCTGAC
TCAATGGGGC
TGATGGGCGG
TGCGGGCTCT
GGGCCAGCCC
GTCGGACGTC
GGTCCATCAG
GGACGGTGAG
ACGGCCTACC
GCGCAGCGCT
GGCTCAACGA
TGGCGGGCTT
AGATTTTCCT
CGGCCACCAC
GACCGAATAC
GGGATATCCG
TCGTATTCTT
GCTCGGTGCT
TACTGGGCCA
TCGGCGCTGA
GCCGAGTTGG
GTCAACACCA
GCCACCGTCA
ACGCCGCCGG
CCCGACCCGA
CTGGCTGTTG
TTCATCTCGT
CTGATCTATT
TTACGCAACC
CATCCCACTC
ACGGAATCCG
AGTGCTGTTC
GATGATGTCC
ACCGAACGGG
CAAGCTCGAC
CGGCGGTGCG
CGTGGCCAGC
TGACAAGACC
GGGGGACAAT
TATGGTCAAC
GCGCGCACAG
AGCGCTAGCC
CACACTGGAC
CACCAAATTG
GGCGGCAGGC
GGCCGCCGAC
CAACATTCCA
GTCGGCCGAT
CGAGGCGATG
CGAACTCGAG
CGACTACTAC
GATTCTCGTC
GATTTCTTAC
GGAAATGCAT
CTACAACATG
240
300
36C
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
16Θ0
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
2280
2305
Sekvence ě. 3 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1742 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 3
CCGCTCTCTT TCAACGTCAT AAGTTCGGTG GGCCAGTCGG CCGCGCGTGC ATATGGCACC 60
AATAACGCGT GTCCCATGGA TACCCGGACC GCACGACGGT AGAGCGGATC AGCGCAGCCG 12 0
GTGCCGAACA CTACCGCGTC CACGCTCAGC CCTGCCGCGT TGCGGAAGAT CGAGCCCAGG 18 0
14CZ 303194 B6
TTCTCATGGT
GCAACGCTCG
CCGATCACCC
AGATCATCCT
CGTGAGGCCA
GTCGGCAGAT
TCGTCGGGAT
TCGGTCACGG
CACGCTCGCT
TGCTGGGATT
CTGGCAGCTG
GCCGCGGCTG
ACCGCGGCTC
GCCATTCACG
GAGGCGGCCA
GGGGAACATC
GGCGTCCATA
CACGTTTTAT
CCCAGACGGT
CGGGCTGGAG
CGTTTCGCAA
ACAANTACGA
CACAGCTGNG
CGGGGACGTC
GCATGAGGCC
GGTGGCTTGC
GG
CGTTAACGCC
GCTCCGGCAC
GTGCCATGAC
TGAGCTCGGC
GCATGCGCTG
CGGGACNACN
CGCAGACGTC
GCTTTCGTCG
GCGGTTCAGC
AATTGGGAGA
CGGCGGCGAA
CTCCAACCAC
AGTTTGCTGC
AAATGTTCGT
ACGCAGCCGC
CGGAGTTCTC
ACAGCAGACG
GACGGATCCG
GGAGGACGAG
TGGCATGGCC
CATCGTGAAC
ACAGCAAGAG
TACGNTTTCT
GACGCTCATG
ATCGTTCGTG
CAGGAGTTCA
TTCCAACACT
CCGGCGCGCG
ATCAGCCGAC
CAGCCGGCGG
CACCACCAGC
GTCGATGCTG
CTGAACATCG
ACCAGAGCCA
GTCGCGAGCC
GGAAGACAGC
CCTACAGGGT
CGGAGTAGTG
GCACGCGCAG
GAACACGCTG
TGCCGGCTGA
GGGTCAGGGG
ATCTAGGCAT
CATGCGATGC
GCTCGCCGGA
GAGGCGACCT
ATGCTGCACG
CAGGCCTCCC
CACATTAGGA
GCGCCATGAT
ATGTGTTGGC
TTACCCAGTT
GCGACGGTGC GCTGCCAACA GCTCGATAGT TCGGTGCCGA ACACCCTCGG TTCAGGTCAC AGGCCGTCGG GCATCAGATC GCTCAGCCAG ATGTCGTTCG ATTGGCACGA CCCGCAGCCG ATGTACCAAA GTGGCCAGTT ACGGGCTCGC TTGCGCCAGC TCAGTACTAA GGGACATGGC TGTGGGCGTC CGCTAGACAC GGGTGCGTGA AGCAGATCCT GAACACCAAT CCGCGCTCAG CGCGGGTGAC GGGCCGTAAC
GCGCCCCGGC
CCCCACGATT
ACGGCGCGCC
ACAGCGCCAG
CGATCACCAA
GGAAATCGTC
GGTGCTGGGC
OGCGGCGCTG
CCACTCTTGC
TGACCACACA
CAATGAACGC
CCGATGAAGT
CGGTCAGCGC
CTGGCTCATA
ACGAACCTGC
GCCCAGCCGA
GGAGACAGGC
GGGCCGTTTT
CGCGCAAAAC
CATGACCTAG
CGGGCTGGTT
GAGCAGNTAG
ATGACGATTA
GCGGCGTCGC
TTTTGGGGCG
TTCCAGGTGA
GACCACCTGA
GAGATGGAAG
GACACCGGCC
CGGCGTGAAC
CGCCTTGCCG
GAGCCGTGGG
ACAACGGCCT
CGCAGGATGT
AGAGAGCCGT
GCCGGAAGCC
CCAGAACGCG
ATCAGCGCTG
CCAGGCCGCG
CGCGGCCACC
TGAAGGAGAG
TTCAGNTATC
AACATGGCCT
GAGGTGCACG
ATTTCCGGTG
ATGAATCAGG
CGCGACGCCA
CGCCGAAAGC
ATTACCAGTT
TTGAGGCGGA
GCGCCGGTTC
TCTACGAGCA
240 300 360 420 480 540 600 660 720 7Θ0 840 900 960 1020 1080 114 0 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1742
Sekvence č. 4 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 2836 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) ío (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 4
GTTGATTCCG TTCGCGGCGC CGCCGAAGAC CACCAACTCC GCTGGGGTGG TCGCACAGGC GGTTGCGTCG GTCAGCTGGC CGAATCCCAA TGATTGGTGG CTCNGTGCGG TTGCTGGGCT CGATTACCCC CACGGAAAGG ACGACGATCG TTCGTTTGCT CGGTCAGTCG TACTTGGCGA CGGGCATGGC GCGGTTTCTT ACCTCGATCG CACAGCAGCT GACCTTCGGC CCAGGGGGCA CAACGGCTGG CTCCGGCGGA GCCTGGTACC CAACGCCACA ATTCGCCGGC CTGGGTGCAG GCCCGGCGGT GTCGGCGAGT TTGGCGCGGG CGGAGCCGGT CGGGAGGTTG TCGGTGCCGC CAAGTTGGGC CGTCGCGGCT CCGGCCTTCG CGGAGAAGCC TGAGGCGGGC ACGCCGATGT CCGTCATCGG CGAAGCGTCC AGCTGCGGTC AGGGAGGCCT GCTTCGAGGC ATACCGCTGG CGAGAGCGGG GCGGCGTACA GGCGCCTTCG CTCACCGATA CGGGTTCCGC CACAGCGTGA TTACCCGGTC TCCGTCGGCG GGATAGCTTT CGATCCGGTC TGCGCGGCCG CCGGAAATGC TGCAGATAGC GATCGACCGC GCCGGTCGGT AAACGCCGCA CACGGCACTA TCAATGCGCA CGGCGGGCGT TGATGCCAAA TTGACCGTCC CGACGGGGCT TTATCTGCGG CAAGATTTCA
120
180
240
300
360
420
480
S40
600
660
720
- 15CZ 303194 B6
TCCCCAGCCC GGTCGGTGGG CCGATAAATA CGCTGGTCAG CGCGACTCTT CCGGCTGAAT TCGATGCTCT GGGCGCCCGC TCGACGCCGA GTATCTCGAG TGGGCCGCAA ACCCGGTCAA ACGCTGTTAC TGTGGCGTTA CCACAGGTGA ATTTGCGGTG CCAACTGGTG AACACTTGCG AACGGGTGGC ATCGAAATCA ACTTGTTGCG TTGCAGTGAT CTACTCTCTT GCAGAGAGCC GTTGCTGGGA TTAATTGGGA GAGGAAGACA GCATGTCGTT CGTGACCACA CAGCCGGAAG CCCTGGCAGC TGCGGCGGCG AACCTACAGG GTATTGGCAC GACAATGAAC GCCCAGAACG CGGCCGCGGC TGCTCCAACC ACCGGAGTAG TGCCCGCAGC CGCCGATGAA GTATCAGCGC TGACCGCGGC TCAGTTTGCT GCGCACGCGC AGATGTACCA AACGGTCAGC GCCCAGGCCG CGGCCATTCA CGAAATGTTC GTGAACACGC TGGTGGCCAG TTCTGGCTCA TACGCGGCCA CCGAGGCGGC CAACGCAGCC GCTGCCGGCT GAACGGGCTC GCACGAACCT GCTGAAGGAG AGGGGGAACA TCCGGAGTTC TCGGGTCAGG GGTTGCGCCA GCGCCCAGCC GATTCAGCTA TCGGCGTCCA TAACAGCAGA CGATCTAGGC ATTCAGTACT AAGGAGACAG GCAACATGGC CTCACGTTTT ATGACGGATC CGCATGCGAT GCGGGACATG GCGGGCCGTT TTGAGGTGCA CGCCCAGACG GTGGAGGACG AGGCTCGCCG GATGTGGGCG TCCGCGCAAA ACATTTCCGG TGCGGGCTGG AGTGGCATGG CCGAGGCGAC CTCGCTAGAC ACCATGACCT AGATGAATCA GGCGTTTCGC AACATCGTGA ACATGCTGCA CGGGGTGCGT GACGGGCTGG TTCGCGACGC CAACAACTAC GAACAGCAAG AGCAGGCCTC CCAGCAGATC CTGAGCAGCT AGCGCCGAAA GCCACAGCTG CGTACGCTTT CTCACATTAG GAGAACACCA ATATGACGAT TAATTACCAG TTCGGGGACG TCGACGCTCA TGGCGCCATG ATCCGCGCTC AGGCGGCGTC GCTTGAGGCG GAGCATCAGG CCATCGTTCG TGATGTGTTG GCCGCGGGTG ACTTTTGGGG CGGCGCCGGT TCGGTGGCTT GCCAGGAGTT CATTACCCAG TTGGGCCGTA ACTTCCAGGT GATCTACGAG CAGGCCAACG CCCACGGGCA GAAGGTGCAG GCTGCCGGCA ACAACATGGC GCAAACCGAC AGCGCCGTCG GCTCCAGCTG GGCCTAAAAC TGAACTTCAG TCGCGGCAGC ACACCAACCA GCCGGTGTGC TGCTGTGTCC TGCAGTTAAC TAGCACTCGA CCGCTGAGGT AGCGATGGAT CAACAGAGTA CCCGCACCGA CATCACCGTC AACGTCGACG GCTTCTGGAT GCTTCAGGCG CTACTGGATA TCCGCCACGT TGCGCCTGAG TTACGTTGCC GGCCGTACGT CTCCACCGAT TCCAATGACT GGCTAAACGA GCACCCGGGG ATGGCGGTCA TGCGCGAGCA GGGCATTGTC GTCAACGACG CGGTCAACGA ACAGGTCGCT GCCCGGATGA AGGTGCTTGC CGCACCTGAT CTTGAAGTCG TCGCCCTGCT GTCACGCGGC AAGTTGCTGT ACGGGGTCAT AGACGACGAG AACCAGCCGC CGGGTTCGCG TGACATCCCT GACAATGAGT TCCGGGTGGT GTTGGCCCGG CGAGGCCAGC ACTGGGTGTC GGCGGTACGG GTTGGCAATG ACATCACCGT CGATGACGTG ACGGTCTCGG ATAGCGCCTC GATCGCCGCA CTGGTAATGG ACGGTCTGGA GTCGATTCAC CACGCCGACC CAGCCGCGAT CAACGCGGTC AACGTGCCAA TGGAGGAGAT CTCGTGCCGA ATTCGGCACG AGGCACGAGG CGGTGTCGGT GACGACGGGA TCGATCACGA TCATCGACCG GCCGGGATCC TTGGCGATCT CGTTGAGCAC GACCCGGGCC CGCGGGAAGC TCTGCGACAT CCATGGGTTC TTCCCG
Sekvence č. 5 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 900 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 5
AACATGCTGC ACGGGGTGCG TGACGGGCTG GTTCGCGACG CCAACAACTA CGAGCAGCAA GAGCAGGCCT CCCAGCAGAT CCTCAGCAGC TAACGTCAGC CGCTGCAGCA CAATACTTTT ACAAGCGAAG GAGAACAGGT TCGATGACCA TCAACTATCA GTTCGGTGAT GTCGACGCTC
780
840
900
960
1020
1060
1140
1200
1260
1320
13Θ0
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
2280
2340
2400
2460
2520
2580
2640
2700
2760
2820
2836
120
180
- 16CZ 303194 B6
ACGGCGCCAT
GTGATGTGTT
TCATTACCCA
AGAAGGTGCA
GGGCCTGACA
CCTTCGGGTG
TTCTTCGGTG
CCGTCCTTCG
CGAGGCGCGG
GCGTTCCTGG
CGCCAGCAGG
CAGAGCGTCG
GATCCGCGCT GACCGCGAGT ATTGGGCCGT GGCTGCCGGC CCAGGCCAAG GCAGTCTAGG CTGGTCAGTG ATCCATTCGT TCGGGGAAGA GGGTTGTTGG TCGGTGCGGG AGTACCCGAT caggccgggt
GACTTTTGGG
AACTTCCAGG
AACAACATGG
GCCAGGGACG
TGGTCAGTGC
CTGCTCGGGC
CGTGTTGTTC
TGCCCACGAC
ACCAGATTTG
CGGTGTCGAN
CATATTGGGC
TGCTGGAGGC
GCGGCGCCGG
TGATCTACGA
CGCAAACCGA
TGGTGTACGA
TGGGGTGTTG
TCGGGTGAGG
GGCGAGGACG
GTCGGTTCGG
GCGCCAGATC
GTGCTCGGCC
AACAACTGAT
CGAACATCAG
TTCGGCGGCC
ACAGGCCAAC
CAGCGCCGTC
GTGAAGC-TTC
GTGGTTTGCT
ACCTCGAGGC
GCTCCGACGA
CGTCGTACCT
TTCTTGGGGA
ACCGCGGGGA
TCGGCGTTGG
GCCATCATTC
TGCCAGGGGT
GCCCACGGGC
GGCTCCAGCT
CTCGCGTGAT
GCTTGGCGGG
CCAGGTAGCG
GGCGGATGAT
CTCGGTTGAG
AGGCGGTGAA
GTTTGTCGGT
GCTGGTCGTA
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
Sekvence Č. 6 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1905 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 6
GCTCGCCGGA TGTGGGCGTC CGCGCAAAAC ATTTCCGGTG CGGGCTGGAG TGGCATGGCC GAGGCGACCT CGCTAGACAC CATGGCCCAG ATGAATCAGG CGTTTCGCAA CATCGTGAAC ATGCTGCACG GGGTGCGTGA CGGGCTGGTT CGCGACGCCA ACAACTACGA GCAGCAAGAG CAGGCCTCCC AGCAGATCCT CAGCAGCTAA CGTCAGCCGC TGCAGCACAA TACTTTTACA AGCGAAGGAG AACAGGTTCG ATGACCATCA ACTATCAGTT CGGTGATGTC GACGCTCACG GCGCCATGAT CCGCGCTCAG GCCGGGTTGC TGGAGGCCGA GCATCAGGCC ATCATTCGTG ATGTGTTGAC CGCGAGTGAC TTTTGGGGCG GCGCCGGTTC GGCGGCCTGC CAGGGGTTCA TTACCCAGTT GGGCCGTAAC TTCCAGGTGA TCTACGAACA AGCCAACACC CACGGGCAGA AGGTGCAAGC TGCCGGCAAC AACATGGCGC AAACCGACAG CGCCGTCNGC TCCAGCTGGG CCTGACACCA GGCCAAGGCC AGGGACGTGG TGTACNAGTG AAGGTTCCTC GCGTGATCCT TCGGGTGGCA GTCTAGGTGG TCAGTGCTGG GGTGTTGGTG GTTTGCTGCT TGGCGGGTTC TTCGGTGCTG GTCAGTGCTGCTCGGGCTCG GGTGAGGACC TCGAGGCCCA GGTAGCGCCG TCCTTCGATC CATTCGTCGT GTTGTTCGGC GAGGACNGCT CCGACGANGC GGATGATCGA GGCGCGGTCG GGGAAGATGC CCACGACGTC GGTTCGGCGT CGTACCTCTC GGTTGAAGCG TTCCTGGGGG CCACCGCTTG GCGCCNANGC ACTCCACGCC AATTCGTCNC ACCTAACAGC GGTGGCCAAC GACTATGACT ACGACACCGT TTTTGCCAGG GCCCTCNAAA GGATCTGCGC GTCCCGGCGA CACGCTTTTT GCGATAAGTA CCTCCGGCAA TTCTATGAGT GTACTGCGGN CCGCGAAAAC CGCAAGGGAG TTGGGTGTGA CGGTTNTTGC AAATGACGGG CGAATCCGGC GGCCAGCTGG CAGAATTCGC AGATTTCTTG ATCAACGTCC CGTCACGCGA CACCGGGCGA ATCCAGGAAT CTCACATCGT TTTTATTCAT GCGATCTCCG AACATGTCGA ACACGCGCTT TTCGCGCCTC GCCAATAGGA AAGCCGATCC TTACGCGGCC ATTCGAAAGA TGGTCGCGGA ACGTGCGGGA CACCAATGGT GTCTCTTCCT CGATAGAGAC GGGGTCATCA ATCGACAAGT GGTCGGCGAC TACGTACGGA ACTGGCGGCA GTTTGAATGG TTGCCCGGGG CGGCGCGGGC GTTGAAGAAG CTACGGGCAT GGGCTCCGTA CATCGTTGTC GTGACAAACC AGCAGGGCGT GGGTGCCGGA TTGATGAGCG CCGTCGACGT GATGGTGATA CATCGGCACC TCCAAATGCA GCTTGCATCC GATGGCGTGC TGATAGATGG ATTTCAGGTT TGCCCGCACC ACCGTTCGCA GCGGTGTGGC TGCCGTAAGC CGAGACCGGG TCTGGTCCTC GACTGGCTCG GACGACACCC CGACAGTGAG CCATTGCTGA GCATCGTGGT TGGGGACAGC CTCAGCGATC TTGACATTGG CACACAACGT CGCCGCTGCT GCCGGTGCAT GTGCCAGTGT CCAGATAGGG GGCGCCAGTT CTGGCGGTGT CGCTGACGCG TCATTTGACT CGCTCTGGGA GTTCGCTGTC GCAGTCGGAC ATGCGČGGGG GGAGCGGGGC TAATGGCGAT CTTGCGCGGG CGAGCGCCGT NGCGGNTCGG ACTNNGCGGT GGCGGGACAG ACGTGGAACC GTACTCGAGC CAGTT
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1905
- 17CZ 303194 B6
Sekvence č. 7 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 2921 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis io (xi) Sekvence č. 7
CGGGATGCCG TGGTGGTTGG TATTGCCCAA ACCCTGGCGC TGGTCCCCGG GGTATCCAGG 60 tccgggtcga ccatcagcgc TGGACTGTTT ctcggactcg ACCGTGAACT GGCCGCCCGA 120
TTCGGATTCC tgctggccat tccagcggtg ttcgcctccg GGTTGTTCTC GTTGCCCGAC 180
GCATTCCACC CGGTAACCGA GGGCATGAGC GCTACTGGCC CGCAGTTGCT GGTGGCCACC 240
CTGATCGCGT TCGTCCTCGG TCTGACCGCG GTGGCCTGGC TGCTGCGGTT TCTGGTGCGA 300
CACAACATGT ACTGGTTCGT CGGCTACCGG GTGCTCGTCG GGACGGGCAT GCTCGTGCTG 360
CTGGCTACCG GGACGGTAGC CGCGACATGA CCGTCATCTT GCTACGCCAT GCCCGTTCCA 420
CCTCGAACAC CGCGGGCGTG CTGGCCGGCC GGTCCGGCGT CGACCTCGAC GAGAAGGGGC 480
GCGAGCAGGC CACCGGGTTG ATCGATCGAA TTGGTGACCT GCCGATCCGG GCGGTCGCGT 540
CTTCTCCAAT GCTGCGGTGT CAACGCACCG TCGAACCGCT GGCCGAGGCG CTGTGCCTGG 600
AGCCGCTCAT CGATGACCGG TTCTCCGAAG TCGACTACGG CGAATGGACT GGCAGAAAAA 660
TCGGTGACCT GGTCGACGAG CCGTTGTGGC GGGTAGTCCA GGCCCACCCC AGCGCGGCGG 720
TGTTTCCCGG CGGTGAGGGT TTGGCGCAGG TGCAGACGTG GTTGTCCTGA CGGATTTCCA 780
TGCCGGGGAA CACCAAGACC GGATCGGCAC TGGCGGTCGC CGGCGAAAAC CCGGCCGCCA 840
ATAGGGCGAC CGTCGCTGCG AATGCGCGTG GTACCAGGCG GACCACCTTG AACTCCCATC 900
CGTCGGGGCC AAGCGCATCG CCCGCCGCCG GTTACGGCTA AGGCGTACCA AAACCCGACG 960
GTAATACTTC GGCAATGTCG GGTCNCGACG TTACCGAGAC GTGACCAGNG AGGCNGCGGC 1020
ATTGGATTTA TCGATGGTGC GCGGTTCCCA NCCCGGCGGT CCGAANACGT AGCCCAGCCG 1080
ATCCCGCAGA CGTGTTGCCG ACCGCCA.GTC ACGCACGATC GCCACGTACT CGCGGGTCTG 114 0 CAGCTTCCAG ATGTTGAACG TGTCGACCCG CTTGGTCAGG CCATAATGCG GTCGGAATAG 1200
CTCCGGCTGA AAGCTACCGA ACAGGCGGTC CCAGATGATG AGGATGCCGC CATAGTTCTT 126 0
GTCCANATAC ACCGGGTCCA TTCCGTGGTG GACCCGGTGG TGCGACGGGG TATTGAAGAC 1320
GAATTCGAAC CACCGCGGCA GCCTGTCGAT CCGCTCGGTG TGCACCCAGA ACTGGTAGAT 1380
CAAGTTCAGC GACCAATTGC AGAACACCAT CCAAGGGGGA AGCCCCATCA GTGGCAGCGG 1440
AACCCACATG AGAATCTCGC CGCTGTTGTT CCANTTTCTG GCGCAGCGCG GTGGCGAAGT 1500
TGAAGTATTC GCTGGAGTGA TGCGCCTGGT GGGTAGCCCA GATCAGCCGA ACTCGGTGGG 1560
CGATGCGGTG ATAGGAGTAG TACAGCAGAT CGACACCAAC GATCGCGATC ACCCAGGTGT 1620
ACCACCGGTG GGCGGACAGC TGCCAGGGGG CAAGGTAGGC ATAGATTGCG GCATAACCGA 1680
GCAGGGCAAG GGACTTCCAG CCGGCGGTGG TGGCTATCGA AACCAGCCCC ATCGAGATGC . 174 0
TGGCCACCGA GTCGCGGGTG AGGTAAGCGC CCGAGGCGGG CCGTGGCTGC CCGGTAGCAG 1800
CGGTCTCGAT GCTTTCCAGC TTGCGGGCCG CCGTCCATTC GAGAATCAGC AGCAATAGAA 1860
AACATGGAAT GGCGKACAGT ACCGGGTCCC GCATTTCCTC GGGCAGCGCT GAGAAGAATC 1920
CGGCGACGGC ATGGCCGAGG CGACCTCGNT AGACACCATG ACCCAGATGA ATCAGGCGTT 1980
TCGCAACATC GTGAACATGC TGCACGGGGT GCGTGACGGG CTGGTTCGCG ACGCCAACAA 2040
NTACGAACAG CAAGAGCAGG CCTCCCAGCA GATCCTCAGC AGCTGACCCG GCCCGACGAC 2100
TCAGGAGGAC ACATGACCAT CAACTATCAA TTCGGGGACG TCGACGCTCA CGGCGCCATG 216 0
ATCCGCGCTC AGGCCGGGTC GCTGGAGGCC GAGCATCAGG CCATCATTTC TGATGTGTTG 22 2 0
ACCGCGAGTG ACTTTTGGGG CGGCGCCGGT TCGGCGGCCT GCCAGGGGTT CATTACCCAG 22 8 0
CTGGGCCGTA ACTTCCAGGT GATNTACGAG CAGGCCAACG CCCACGGGCA GAAGGTGCAG 23 4 0
GCTGCCGGCA ACAACATGGC ACAAACCGAC AGCGCCGTCG GCTCCAGCTG GGCATAAAGN 24 00 TGGCTTAAGG CCCGCGCCGT CAATTACAAC GTGGCCGCAC ACCGGTTGGT GTGTGGCCAC 24 6 0
GTTGTTATCT GAACGACTAA CTACTTCGAC CTGCTAAAGT CGGCGCGTTG ATCCCCGGTC 2 52 0
GGATGGTGCT GAACTGGGAA GATGGCCTCA ATGCCCTTGT TGCGGAAGGG ATTGAGGCCA 2 580
TCGTGTTTCG TACTTTAGGC GATCAGTGCT GGTTGTGGGA GTCGCTGCTG CCCGACGAGG 264 0
TGCGCCGACT GCCCGAGGAA CTGGCCCGGG TGGACGCATT GTTGGACGAT CCGGCGTTCT 2 7 00
TCGCCCCGTT CGTGCCGTTC TTCGACCCGC GCAGGGGCCG GCCGTCGACG CCGATGGAGG 2760
TCTATCTGCA GTTGATGTTT GTGAAGTTCC GCTACCGGCT GGGCTATGAG TCGCTGTGCC 2 82 0
GGGAGGTGGC TGATTCGATC ACCTGACGGC GGTTTTGCCG CATTGCGCTG GACGGGTCGG 288 0
TGCCGCATCC GACCACATTG ATGAAGCTCA CCACGCGTTG C 2 921
- 18CZ 303194 B6
Sekvence č. 8 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1704 párů bází 5 (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (vi) Původ zdroje:
io (A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 8
CGCGATCGTC GTCAACGANG TCGACCGTCA CCACGGACTG ATCAACAAGT TCGCAGGCGA 60
CGCCGCCCTG GCCATCTTCG GAGCCCCGAA CCGCCTCGAC CGTCCCGAAG ACGCCGCGCT 120
GGCCGCCGCC CGGGCCATAN CCGANCGGCT GGCCNACGAG ATGCCCGAGG TCCAAGCCGG 18 0
CATCGGGGTG GCGGCAGGCC ANATCGTCGC CGGCAATGTC GGCGCCAAGC AAAGATTCNA 24 0
ATACACAGTG GTCGGCAAGC CGGTCAACCA NGCGGCCCGA TTGTGCGAAC TGGCCAAATC 300
ACACCCCGCG CGATTGGGTC TCGCCCGCTC GGCTCATGGT CACCCAATTC AAGGACTACT 360
TTGGCCTGGC GCACGACCTG CCGAAGTGGG CGAGTGAAGG CGCCAAAGCC GCCGGTGAGG 42 0
CCGCCAAGGC GTTGCCGGCC GCCGTTCCGG CCATTCCGAG TGCTGGCCTG AGCGGCGTTG 480
CGGGCGCCGT CGGTCAGGCG GCGTCGGTCG GGGGATTGAA GGTTCCGGCC GTTTGGACCG 54 0
CCACGACCCC GGCGGCGAGC CCCGCGGTGC TGGCGGCGTC CAACGGCCTC GGAGCCGCGG 60 0
CCGCCGCTGA AGGTTCGACA CACGCGTTTG GCGGGATGCC GCTCATGGGT ANCGGTGCCG 66 0
GACGTGCGTT TAACAACTTC GCTGCCCCTC GATACGGATT CAAGCCGACC GTGATCGCCC 72 0
AACCGCCGGC TGGCGGATGA CCAACTACGT TCGTTGATCG AGGATCGAAT TCNACGATTC 78 0
AAAGGGAGGA ATTCATATGA CCTCNCGTTT TATGACGGAT CCGCACGCNA TNCGGGACAT 84 0
GGCGGGCCGT TTTGAGGTGC ACGCCCAGAC GGTGGAGGAC GAGGCTNGCN GGATGTGGGC 900
GTCCGCGCAA AACATTTCCG GTGCGGGCTG GAGTGGCATG GCCGAGGCGA CCTCGNTAGA 96 0
CAGCATGGCC CAGATGAATC AGGCGTTTCN CAACATCGTG AACATGCTGC ACGGGGTGNG 102 0
TGACGGGCTG GTTCGCGACG CCAACAACTA CGAACAGCAA GAGCAGGCCT CCCAGCAGAT 1080
CCTCAGCAGC TGACCCGGCC CGACGACTCA GGAGGACACA TGACCATCAA CTATCAATTC 1140
GGGGACGTCG ACGCTCATGG CGCCATGATC CGCGCTNTGG CCGGGTTGCT GGAGGCCGAG 1200
CATCAGGCCA TCATTTCTGA TGTGTTGACC GCGAGTGACT TTTGGGGCGG CGCCGGTTCG 126 0
GCGGCCTGCC AGGGGTTCAT TACCCAGTTG GGCCGTAACT TCCAGGTGAT TTACGAGCAG 132 0
GCCAACGCCC ACGGGCAGAA GGTGCAGGCT GCCGGCAACA ACATGGCACA AACCGACAGC 1380
GCCGTNGGNT CCAGCTGGGC CTAACCCGGG TCNTAAGTTG GGTCCGCGCA GGGCGGGCCG 144 0
ATCAGCGTNG ACTTTGGCGC CCGATACACG GGCATNTTNT NGTCGGGAAC ACTGCGCCCG 1500
CGTCAGNTGC CCGCTTCCCC TTGTTNGGCG ACGTGCTCGG TGATGGCTTT GACGACCGCT 156 0
TCGCCGGCGC GGCCAATCAA TTGGTCGCGC TTGCCTNTAG CCCATTCGTG CGACGCCCGC 162 0
GGCGCCGCGA GTTGTCCCTT GAAATAAGGA ATCACAGCAC GGGCGAACAG CTCATAGGAG 1680
TGAAAGGTTG CCGTGGCGGG GCCC 1704
Sekvence ě. 9 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 2286 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 9
- 19CZ 303194 B6
CCGTCTTGGC GTCTGGGCGC ATTGTGATCT GGGCCANTTG CCCCTCCACC CAGACCGCGC 60
CCAGCTTGTC GATCCAGCCC GCGACCCGGA TTGCCACCGC GCGAACCGGG AACGGATTCT 120
CCGCTGAATT CTGGGTCACT TCGCAGTCGC GCGGGTGATC CTGTTGGCGA NCAGCGTCTG 180
GAACGGGCGT CNAACGCGTG CCGTAAGCCC AGCGTGTACG CCGTCAGCCC GACGCCGATG 240
CCGAATGCCT TGCCGCCCAA GCTGAGCCGC GCGGGCTCCA CCAAGAGCGT CACGGTGAGC 300
CAGCCAACCA GATGCAAGGC GACGATCACC GCGAAGTGCC GAATTCGGCA CGAGAGGTGC 360
TGGAAATCCA GCAATACGCC CGCGAGCCGA TCTCGTTGGA CCAGACCATC GGCGACGANG 420
GCGACAGNCA GCTTGGCGAT TTCATCGAAA ACAGCGAGGC GGTGGTGGNC GTCGACGCGG 480
TGTCCTTCAC TTTGCTGCAT GATCAACTGC ANTCGGTGCT GGACACGCTC TCCGAGCGTG 540
AGGCGGGCGT GGTGCGGCTA CGCTTCGGCC TTACCGACGG CCAGCCGCGC ACCCTTGACG 600
AGATCGGCCA GGTCTACGGC GTGACCCGGG AACGCATCCG CCAGATCGAA TCCAAGACTA 660
TGTCGAAGTT GCGCCATCCG AGCCGCTCAC AGGTCCTGCG CGACTATCGT GCCGAATTCG 720
GCACGAGCCG TTTTGAGGTG CACGCCCAGA CGGTGGAGGA CGAGGCTCGC CGGATGTGGG 780
CGTCCGCGCA AAACATTTCC GGTGCGGGCT GGAGTGGCAT GGCCGANGCG ACCTCGCTAG 840
ACACCATGGC CCAGATGAAT CAGGCGTTTC GCAACATCGT GAACATGCTG CACGGGGTGC 900
GTGACGGGCT GGTTCGCGAC GCCAACAACT ACGAACAGCA AGAGCAGGCC TCCCAGCAGA 960
TCCTCAGCAG CTGACCCGGC CCGACGACTC AGGAGGACAC ATGACCATCA ACTATCAATT 1020
CGGGGACGTC GACGCTCATG GCGCCATGAT CCGCGCTCTG GCCGGGTTGC TGGAGGCCGA 1080
GCATCAGGCC ATCATTTCTG ATGTGTTGAC CGCGAGTGAC TTTTGGGGCG GCGCCGGTTC 1140
GGCGGCCTGC CAGGGGTTCA TTACCCAGTT GGGCCGTAAC TTCCAGGTGA TCTACGAGCA 1200
GGCCAACGCC CACGGGCAGA AGGTGCAGGC TGCCGGCAAC AACATGGCAC AAACCGACAG 1260
CGCCGTCGGC TCCAGCTGGG CCTAACCCGG GTCCTAAGTT GGGTCCGCGC AGGGCGGGCC 1320
GATCAGCGTC GACTTTGGCG CCCGATACAC GGGCATGTNG TNGTCGGGAA CACTGCGCCC 1380
GCGTCAGCTG CCCGCTTCCC CTTGTTCGGC GACGTGCTCG GTGATGGCTT TGACGACCGC 1440
TTCGCCGGCG CGGCCAATCA ATTGGTCGCG CTTGCCTCTA GCCTCGTGCC GAATTCGGCA 1500
CGAGGGTGCT GGTGCCGCGC TATCGGCAGC ACGTGAGCTC CACGACGAAC TCATCCCAGT 1560
GCTGGGTTCC GCGGAGTTCG GCATCGGCGT GTCGGCCGGA AGGGCCATCG CCGGCCACAT 1620
CGGCGCTCAA GCCCGCTTCG AGTACACCGT CATCGGCGAČ CCGGTCAACG AGGCCGCCCG 1680
GCTCACCGAA CTGGCCAAAG TCGAGGATGG CCACGTTCTG GCGTCGGCGA TCGČGGTCAG 1740
TGGCGCCCTG GACGCCGAAG CATTGTGTTG GGATGTTGGC GAGGTGGTTG AGCTCCGCGG 1800
ACGTGCTGCA CCCACCCAAC TAGCCAGGCC AATGAATNTG GCNGCACCCG AAGAGGTTTC 186 0
CAGCGAAGTA CGCGGCTAGT CGCGCTTGGC TGCNTTCTTC GCCGGCACCT TCCGGGCAGC 1920
TTTCCTGGCT GGCCGTTTTG CCGGACCCCG GGCTCGGCGA TCGGCCAACA GCTCGGCGGC 1980
GCGCTCGTCG GTTATGGAAG CCACGTNGTC GCCCTTACGC AGGCTGGCAT TGGTCTCACC 2040
GTCGGTGACG TACGGCCCGA ATCGGCCGTC CTTGATGACC ATTGGCTTGC CAGACGCCGG 2100
ATNTGNTCCC AGCTCGCGCA GCGGCGGAGC CGAAGCGCTT TGCCGGCCAC GACNTTTCGG 216 0
CTCTGNGTAG ATNTTCAGGG CTTCGTCGAG CGNGATGGTG AATATATGGT CTTCGGTGAC 2220
CAGTGATCGA GAATCGTTGC CGCGCTTTAG ATACGGTCNG TAGCGCCCGT TCTGCGCGGT 2280
GATNTC 2286
Sekvence č. 10 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1136 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 10
-20CZ 303194 B6
GGGCATCTTC CCCGACCGCG CCTCGATCAT CCGCCTCGTC GGAGCCGTCC TCGCCGAACA 60 ACACGACGAA TGGATCGAAG GACGGCGCTA CCTGGGCCTC GAGGTCCTCA CCCGAGCCCG 120 AGCAGCACTG ACCAGCACCG AAGAACCGCC AAGCAGCAAA CCACCAACAC CCCAGCACTG 190 ACCACCTAGA CTGCCACCCG AAGGATCACG CGAGGAACCT TCACTCGTAC ACCACGTCCC 240 TGGCCTTGGC CTGGTGTCAG GCCCAGCTGG AGCCGACGGC GCTGTCGGTT TGCGCCATGT 300 TGTTGCCGGC AGCCTGCACC TTCTGCCCGT GGGCGTTGGC CTGCTCGTAG ATCACCTGGA 360 AGTTACGGCC CAACTGGGTA ATGAACCCCT GGCAGGCCGC CGAACCGGCG CCGCCCCAAA 420 AGTCACTCGC GGTCAACACA TCACGAATGA TGGCCTGATG CTCGGCCTCC AGCAACCCGG 480 CCTGAGCGCG GATCATGGCG CCGTGAGCGT CGACATCACC GAACTGATAG TTGATGGTCA 540 TCGAACCTGT TCTCCTTCGC TTGTAAAAGT ATTGTGCTGC AGCGGCTGAC GTTAGCTGCT 600 GAGGATCTGC TGGGAGGCCT GCTCTTGCCT CGTGCCGAAT TCGGCACGAG AGGCCGCCTT 660 CGAAGAAATC CTTTGAGAAT TCGCCAAGGC CGTCGACCCA GCATGGGGTC AGCTCGCCAG 720 CCGCGCCGGC TGGCAACCGT TCCCGCTCGA GAAAGACCTG GAGGAATACC AGTGACAAAC 780 GACCTCCCAG ACGTCCGAGA GCGTGACGGC GGTCCACGTC CCGCTCCTCC TGCTGGCGGG 840 CCACGCTTGT CAGACGTGTG GGTTTACAAC GGGCGGGCGT ACGACCTGAG TGAGTGGATT 900 TCCAAGCATC CCGGCGGCGC CTTNTTCATT GGGCGGACCA AGAACCGCGA CATCACCGCA 960 ATCGTCAAGT CCTACCATCG TGATCCGGCG ATTGTCGAGC GAATCCTGCA GCGGAGGTAC 1020 GCGTTGGGCC GCGACGCAAC CCCTAGGGAC ATCCACCCCA AGCACAATGC ACCGGCATTT 1080 CTGTTCAAAG ACGACTTCAA CAGCTGGCGG GACACCCCGA AGTATCGATT NGACGA 1136
Sekvence č. 11 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 967 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence Č. 11
TGAGCGCCAA CCCTACCGTC GGTTCGTCAC ACGGACCGCA TGGCCTGCTC CGCGGACTGC 6 0 CGCTAGGGTC GCGGATCACT CGGCGTAGCG GCGCCTTTGC CCACCGATAT GGGTTCCGTC 12 0 ACAGTGTGGT TGCCCGCCCG CCATCGGCCG GATAACGCCA TGACCTCAGC TCGGCAGAAA 180 TGACAATGCT CCCAAAGGCG TGAGCACCCG AAGACAACTA AGCAGGAGAT CGCATGCCGT 24 0 TTGTGACTAC CCAACCAGAA GCACTGGCGG CGGCGGCCGG CAGTCTGCAG GGAATCGGCT 300 CCGCATTGAA CGCCCAGAAT GCGGCTGCGG CGACTCCCAC GACGGGGGTG GTCCGGCGGC 3 60 CGCCGATGAA NTGTCGGCGC TGACGGCGGC TCAGTTCGCG GCACACGCCC AGATCTATCA 42 0 GGCCGTCAGC GCCCAGGCCG CGGCGATTCA CGAGATGTTC GTCAACACTC TACAGATGAG 480 CTCAGGGTCG TATGCTGCTA CCGAGGCCGC CAACGCGGCC GCGGCCGGNT AGAGGAGTCA 54 0 CTGCGATGGA TTTTGGGGCG TTGCCGCCGG AGGTCAATTC GGTGCGGATG TATGCCGTTC 6 00 CTGGCTCGGC ACCAATGGTC GCTGCGGCGT CGGCCTGGAA CGGGTTGGCC GCGGAGCTGA 660 GTTCGGCGGC CACCGGTTAT GAGACGGTGA TCACTCAGCT CAGCAGTGAG GGGTGGCTAG 720 GTCCGGCGTC ÁGCGGCGATG GCCGAGGCAG TTGCGCCGTA TGTGGCGTGG ATGAGTGCCG 780 CTGCGGCGCA AGCCGAGCAG GCGGCCACAC AGGCCAGGGC CGCCGCGGCC GCTTTTGAGG 84 0 CGGCGTTTGC CGCGACGGTG CCTCCGCCGT TGATCGCGGC CAACCGGGCT TCGTTGATGC 900 AGCTGATCTC GACGAATGTC TTTGGTCAGA ACACCTCGGC GATCGCGGCC GCCGAAGCTC 96 C AGTACGG 967
Sekvence č. 12 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 585 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová)
-21 CZ 303194 B6 (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence Č. 12
TGGATTCCGA TAGCGGTTTC GGCCCCTCGA CGGGCGACCA CGGCGCGCAG GCCTCCGAAC GGGGGGCCGG GACGCTGGGA TTCGCCGGGA CCGCAACCAA AGAACGCCGG GTCCGGGCGG TCGGGCTGAC CGCACTGGCC GGTGATGAGT TCGGCAACGG CCCCCGGATG CCGATGGTGC CGGGGACCTG GGAGCAGGGC AGCAACGAGC CCGAGGCGCC CGACGGATCG GGGAGAGGGG GAGGCGACGG CTTACCGCAC GACAGCAAGT AACCGAATTC CGAATCACGT GGACCCGTAC GGGTCGAAAG GAGAGATGTT ATGAGCCTTT TGGATGCTCA TATCCCACAG TTGGTGGCCT CCCAGTCGGC GTTTGCCGCC AAGGCGGGGC TGATGCGGCA CACGATCGGT CAGGCCGAGC AGGCGGCGAT GTCGGCTCAG GCGTTTCACC AGGGGGAGTC GTCGGCGGCG TTTCAGGCCG CCCATGCCCG GTTTGTGGCG GCGGCCGCCA AAGTCAACAC CTTGTTGGAT GTCGCGCAGG CGAATCTGGG TGAGGCCGCC GGTACCTATG TGGCCGCCGA TGCTG
Sekvence č. 13 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 144 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina i o (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 15 (xi) Sekvence č. 13
120
1Θ0
240
300
360
420
4Θ0
540
565
Ala 1 Leu val Thr Thr 5 Asn Phe Phe Gly Val 10 Asn Thr Ile Pro Ile 15 Ala
Leu Asn Glu Ala Asp Tyr Leu Arg Met Trp Ile Gin Ala Ala Thr Val
20 25 30
Met Ser His Tyr Gin Ala Val Ala His Glu Ile Trp Cys Leu His Glu
35 40 45
Xaa Ala Ser Ser Gly Lys Pro Trp Ala Ser Ile Thr Thr Gly Ala Pro
50 ss 60
Gly Ser Pro Ala Ser Thr Thr Arg Ser Arg Thr Pro Leu Val Ser Thr
65 70 75 80
Asn Arg Xaa Val Xaa Ala Pro Ile Val Ser Pro Asn His Thr Gly His
85 90 95
Arg Pro Glu Lys Gly Leu Gly Ser Xaa Gin Arg Arg Leu Ser Arg Val
100 105 110
Leu Pro Arg Ile Ile Asp Arg Pro Ala Gly Pro Xaa Gly Pro Pro Leu
115 120 125
Thr Ser Gly Ser His Phe Leu Cys Ser Trp His Gly Tyr Ser Ser Gin
130 135 140
Sekvence č. 14 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 352 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 14
-22CZ 303194 B6
His Ala Leu Ala Ala Gin Tyr Thr Glu Ile Ala Thr Glu Leu Ala Ser
1 5 10 15
Val Leu Ala Ala Val Gin Ala Ser Ser Trp Gin Gly Pro Ser Ala Asp
20 25 30
Arg Phe Val Val Ala His Gin Pro Phe Arg Tyr Trp Leu Thr His Ala
35 40 45
Ala Thr Val Ala Thr Ala Ala Ala Ala Ala His Xaa Thr Ala Ala Ala
50 55 60
Gly Tyr Thr Ser Ala Leu Gly Gly Met Pro Thr Leu Ala Glu Leu Ala
65 70 75 80
Ala Asn His Ala Met His Gly Ala Leu val Thr Thr Asn Phe Phe Gly
85 90 95
Val Asn Thr Ile Pro Ile Ala Leu Asn Glu Ala Asp Tyr Leu Arg Met
100 105 110
Trp Ile Gin Ala Ala Thr Val Met Ser His Tyr Gin Ala Val Ala His
115 120 125
Glu Ser Val Ala Ala Thr Pro Ser Thr Pro Pro Ala Pro Gin Ile Val
130 13S 140
Thr Ser Ala Ala Ser Ser Ala Ala Ser Ser Ser Phe Pro Asp Pro Thr
14 5 ISO 155 160
Lys Leu Ile Leu Gin Leu Leu Lys Asp Phe Leu Glu Leu Leu Arg Tyr
165 170 175
Leu Ala Val Glu Leu Leu Pro Gly Pro Leu Gly ASp Leu Ile Ala Gin
100 185 190
Val Leu Asp Trp Phe Ile Ser Phe Val Ser Gly Pro Val Phe Thr Phe
195 200 205
Leu Ala Tyr Leu Val Leu Asp Pro Leu Ile Tyr Phe Gly Pro Phe Ala
210 215 220
Pro Leu Thr Ser Pro Val Leu Leu Pro Ala Val Glu Leu Arg Asn Arg
225 230 235 240
Leu Lys Thr Ala Thr Gly Leu Thr Leu Pro Pro Thr Val Ile Phe Asp
245 250 255
His Pro Thr Pro Thr Ala Val Ala Glu Tyr Val Ala Gin Gin Met Ser
260 265 270
Gly Ser Arg Pro Thr Glu Ser Gly Asp Pro Thr Ser Gin Val Val Glu
275 280 285
Pro Ala Arg Ala Glu Phe Gly Thr Ser Ala Val His Gin Ile Pro Pro
290 295 300
Arg Pro Ala Asp Thr Arg Arg Ala Cys Arg His Arg Asp Asp Val Pro
305 310 315 320
Arg Asp Ser Arg Ile Ala Gin His Arg Asp Gly Ala Gly Leu Asp Pro
325 330 335
Thr Glu Arg Gly Thr Ser Glu Gly ASp Gin Gly Leu Val Ser Gly Trp
340 345 350
Sekvence ě. 15 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 141 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence Č. 15
-23CZ 303194 B6
Met Asp Phe Gly Ala Leu Pro Pro Glu Val Asn Ser val Arg Met Tyr
1 S 10 15
Ala Val Pro Gly Ser Ala Pro Met Val Ala Ala Ala Ser Ala Trp Asn
20 25 30
Gly Leu Ala Ala Glu Leu Ser Ser Ala Ala Thr Gly Tyr Glu Thr val
35 40 45
Ile Thr Gin Leu Ser Ser Glu Gly Trp Leu Gly Pro Ala Ser Ala Ala
50 55 60
Met Ala Glu Ala Val Ala Pro Tyr Val Ala Trp Met Ser Ala Ala Ala
65 70 75 80
Ala Gin Ala Glu Gin Ala Ala Thr Gin Ala Arg Ala Ala Ala Ala Ala
85 90 95
Phe Glu Ala Ala Phe Ala Ala Thr Val Pro Pro Pro Leu Ile Ala Ala
100 105 110
Asn Arg Ala Ser Leu Met Gin Leu Ile Ser Thr Asn Val Phe Gly Gin
115 120 125
Asn Thr Ser Ala Ile Ala Ala Ala Glu Ala Gin Tyr Gly
130 135 140
Sekvence č. 16 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 58 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 16
Met 1 Ala Ser Arg Phe 5 Met Thr Asp Pro His 10 Ala Met Arg Asp Met 15 Ala
Gly Arg Phe Glu Val His Ala Gin Thr Val Glu Asp Glu Ala Axa Arg
20 25 30
Met Trp Ala Ser Ala Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly Met
35 40 45
Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr
50 5S
Sekvence č. 17 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 67 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 25 (xi) Sekvence č. 17
-24CZ 303194 B6
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gin Ala Ala Ser Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile val
20 25 30
Arg Asp Val Leu Ala Ala Gly Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Val
3S 40 45
Ala Cys Gin Glu Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin 65
Sekvence č. 18 (Í) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 58 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 18
Met Ala Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro'His Ala Met Arg Asp Met Ala
1 5 10 15
Gly Arg Phe Glu Val His Ala Gin Thr Val Glu Asp Glu Ala Arg Arg
20 25 30
Met Trp Ala Ser Ala Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly Met
35 40 45
Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr
50 55
Sekvence Č. 19 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 25 (xi) Sekvence ě. 19
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gin Ala Ala Ser Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Val
20 25 30
Arg Asp Val Leu Ala Ala Gly Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Val
35 40 45
Ala Cys Gin Glu Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin val Ile
50 S5 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
-25CZ 303194 B6
Sekvence č. 20 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 30 aminokyselin 5 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
i« (A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 20
Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp Ala Asn Asn 1 S 10 15
Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin Ile Leu Ser Ser
25 30
Sekvence ě. 21 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis
(xi) Sekvence č. 21
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Meť
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gin Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala. His Gly Gin Lys val Gin Ala Ala Gly Asn
6S 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
Sekvence č, 22 (í) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 69 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 35 (xi) Sekvence č. 22
-26CZ 303194 B6
Ala Arg Arg Met Trp Ala Ser Ala Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp
1 5 10 15
Ser Gly Met Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Ala Gin Met Asn
20 25 30
Gin Ala Phe Arg Asn Xle Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly
35 40 45
Leu Val Arg Asp Ala Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser Gin
50 55 60
Gin Ile Leu Ser Ser
65
Sekvence č. 23 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 23
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly ASp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gin Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Thr His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 60
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Xaa Ser Ser Trp Ala
65 90
is Sekvence č. 24 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 52 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 24
Gly Met Ala Glu Ala Thr Ser Xaa Asp Thr Met Thr Gin Met Asn Gin
1 5 10 15
Ala Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu
20 25 30
Val Arg Asp Ala Asn Xaa Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin
35 40 4S
Ile Leu Ser Ser
-27CZ 303194 B6
Sekvence č. 25 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis to (xi) Sekvence č. 25
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gin Ala Gly Ser Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Xaa
SO 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
Sekvence č. 26 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 98 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis
(xi) Sekvence ě. 26
Met Thr Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Ala Met Arg Asp Met Ala
1 5 10 15
Gly Arg Phe Glu Val His Ala Gin Thr Val Glu Asp Glu Ala Arg Arg
20 25 30
Met Trp Ala Ser Ala Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly Met
35 40 4S
Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Ala Gin Met Asn Gin Ala Phe
50 55 60
Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg
65 70 75 80
Asp Ala Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin Ile Leu
85 90 95
Ser Ser
Sekvence č. 27 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý
-28CZ 303194 B6 (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 5 (xi) Sekvence č. 27
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Xaa Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
SO 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
Sekvence č. 28 (i) Charakteristika sekvence:
io (A) Délka: 81 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 28
Arg Phe Glu Val His Ala Gin Thr Val Glu Asp Glu Ala Arg Arg Met
1 5 10 15
Trp Ala Ser Ala Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly Met Ala
20 25 30
Xaa Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Ala Gin Met Asn Gin Ala Phe Arg
35 40 45
Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp
50 55 60
Ala Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin Ile Leu Ser
65 70 75 80
Ser
Sekvence č. 29 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 29
-29CZ 303194 B6
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Leu Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
Sekvence č. 30 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 11 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 30
Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin Ile Leu Ser Ser i S 10
Sekvence Č. 31 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 94 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 31
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
I 5 10 15
Ile Arg Ala Gin Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile
20 25 30
Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
Sekvence č. 32 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 99 aminokyselin
-30CZ 303194 B6 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 32
Met Ser Phe Val Thr Thr Gin Pro Glu Ala Leu Ala Ala Ala Ala Ala
1 5 10 15
Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met Asn Ala Gin Asn Ala Ala Ala
20 25 30
Ala Ala Pro Thr Thr Gly Val Val Pro Ala Ala Ala Asp Glu Val Ser
35 40 45
Ala Leu Thr Ala Ala Gin Phe Ala Ala His Ala Gin Met Tyr Gin Thr
50 55 60
Val Ser Ala Gin Ala Ala Ala Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu
65 70 75 80
Val Ala Ser Ser Gly Ser Tyr Ala Ala Thr Glu Ala Ala Asn Ala Ala
8S 90 95
Ala Ala Gly
Sekvence č. 33 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 99 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina is (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 20 (xi) Sekvence č. 33
Met 1 Ser Phe Val Thr 5 Thr Gin Pro Glu Ala 10 Leu Ala Ala Ala Ala 15 Ala
Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met Asn Ala Gin Asn Ala Ala Ala
20 25 30
Ala Ala Pro Thr Thr Gly Val Val Pro Ala Ala Ala Asp Glu Val Ser
35 40 4S
Ala Leu Thr Ala Ala Gin Phe Ala Ala His Ala Gin Met Tyr Gin Thr
50 55 60
Val Ser Ala Gin Ala Ala Ala Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu
65 70 75 00
Val Ala Ser Ser Gly Ser Tyr Ala Ala Thr Glu Ala Ala Asn Ala Ala
85 90 95
Ala Ala Gly
Sekvence č. 34 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid
-31 CZ 303194 B6 (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 34
Asp Pro His Ala Met Arg Asp Met Ala Gly Arg Phe Glu Val His 1 5 10 15
Sekvence č. 35 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina io (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 35
Arg Asp Met Ala Gly Arg Phe Glu Val His Ala Gin Thr Val Glu 15 10 15
Sekvence č. 36 (i) Charakteristika sekvence:
2o (A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 36
Arg Phe Glu Val His Ala Gin Thr Val Glu Asp Glu Ala Arg Arg 15 10 is io Sekvence č. 37 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 37 4θ Ala Gin Thr Val Glu Asp Glu Ala Arg Arg Met Trp Ala Ser Ala 15 10 15
Sekvence č. 38 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin
-32CZ 303194 B6 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii)Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(Λ) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 38
Asp Glu Ala Arg Arg Met Trp Ala ser Ala Gin Asn. Ile Ser Gly 15 10 15 io Sekvence č. 39 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 39
Met Trp Ala Ser Ala Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly
Sekvence č. 40 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 25 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 40
Gin Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly Met Ala Glu Ala Thr 1 s 10 15
Sekvence č. 41 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 41
Ala Gly Trp Ser Gly Met Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr i s 10 15
-33CZ 303194 B6
Sekvence č. 42 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis io (xi) Sekvence č. 42
Met Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met. Ala Gin Met Asn Gin 15 10 15
Sekvence ě. 43 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 43
Ser Leu Asp Thr Met Ala Gin Met Asn Gin Ala Phe Arg Asn Ile 15 10 15
Sekvence č. 44 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 44
Ala Gin Met Asn Gin Ala Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His 35 1 5 10 15
Sekvence ě. 45 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 40 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 45
- 34CZ 303194 B6
Ala Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly 15 10 15
Sekvence e. 46 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 46
Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp Ala 1 5 10 15
Sekvence č. 47 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 47
Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg Asp Ala Asn Asn Tyr Glu Gin 1 5 10 15
Sekvence č. 48 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 48
Leu Val Arg Asp Ala Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser 1 5 10 15
Sekvence č. 49 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid
-35CZ 303194 B6 (ví) Původ zdroje:
(Λ) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 49
Asn Asn Tyr Glu Gin Gin Glu Gin Ala Ser Gin Gin Ile Leu Ser Ser 15 10 ís
Sekvence č. 50 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 17 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 50
Met Ala Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Ala Met Arg Asp Met Ala 15 io is
Gly
Sekvence č. 51 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 51
Met Thr Ile Asn Tyr Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala 15 10 15
Sekvence č. 52 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 52
Gin Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met Ile Arg Ala Gin 15 10 15
Sekvence č. 53 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin
-36CZ 303194 B6 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xí) Sekvence č. 53
Asp Ala His Gly Ala Met Ile Arg Ala Gin Ala Ala Ser Leu Glu 15 10 15 io Sekvence č. 54 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý is (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 54
Met Ile Arg Ala Gin Ala Ala Ser Leu Glu Ala Glu His Gin Ala 20 i 5 10 IS
Sekvence č. 55 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 25 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 55
Ala Ala Ser Leu Glu Ala Glu His- Gin Ala Ile Val Arg Asp Val 1 5 10 15
Sekvence č. 56 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 56
Ala Glu His Gin Ala ile Val Arg Asp Val Leu Ala Ala Gly Asp 15 10 15
-37CZ 303194 B6
Sekvence č. 57 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 5 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
id (A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 57
Ile Val Arg Asp Val· Leu Ala Ala Gly Asp Phe Trp Gly Gly Ala 15 10 15
Sekvence č. 58 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 58
Leu Ala Ala Gly Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Val Ala Cys Gin 15 10 15
Sekvence č. 59 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence Č. 59
Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Val Ala Cys Gin Glu Phe Ile Thr 1 5 10 15
Sekvence č. 60 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis
-38CZ 303194 B6 (xi) Sekvence č. 60
Gly Ser Val Ala Cys Gin Glu Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn 15 10 15
Sekvence č. 61 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 18 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 61
Gin Glu Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile Tyr Glu 15 io is
Gin Ala
Sekvence č. 62 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 62
Arg Asn Phe Gin Val Ile Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin 15 10 15
Sekvence č. 63 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č, 63
Ile Tyr Glu Gin Ala Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala 15 10 15
Sekvence č. 64 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý
-39CZ 303194 B6 (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 64
Asn Ala His Gly Gin Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn Asn Met Ala i 5 10 15
Sekvence č. 65 (í) Charakteristika sekvence: io (A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 65
Lys Val Gin Ala Ala Gly Asn Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala i 5 .10 15
Sekvence č. 66 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 66
Gly Asn Asn Met Ala Gin Thr Asp Ser Ala val Gly Ser Ser Trp Ala 30 L 5 10 15
Sekvence č. 67 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 35 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 67
Asp Ala His Gly Ala Met lle Arg Ala Leu Ala Gly Leu Leu Glu 15 10 15
-40CZ 303194 B6
Sekvence č. 68 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis io (xi) Sekvence Č. 68
Asp Ala His Gly Ala Met Ile Arg Ala Gin Ala Gly Leu Leu Glu 1 $ 10 15
Sekvence č. 69 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 69
Met Ile Arg Ala Leu Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala 15 10 15
Sekvence č. 70 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 70
Met Ile Arg Ala Gin Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala 35 1 5 10 15
Sekvence Č. 71 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 40 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ií) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 71
-41 CZ 303194 B6
Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile Ser Asp Val 1 5 10 15
Sekvence č. 72 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid io (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 72
Ala Gly Leu Leu Glu Ala Glu His Gin Ala Ile Ile Arg Asp Val 1 5 10 15
Sekvence č. 73 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 73
Ala Glu His Gin AJ.a ile ile Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp 15 10 15
Sekvence č. 74 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 30 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 74
Ala Glu His Gin Ala Ile Ile Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp 15 10 15
Sekvence Č. 75 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární
-42CZ 303194 B6 (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 75
Ile Tle Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala 15 10 15
Sekvence č. 76 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin ίο (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
is (A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 76
Ile Ile Arg Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala 15 10 15
Sekvence č. 77 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence ě. 77
Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala Ala Cys Gin 1 S 10 15
Sekvence ě. 78 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis 40 (xi) Sekvence č. 78
Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr 15 10 15
Sekvence ě. 79 (i) Charakteristika sekvence:
-43CZ 303194 B6 (A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (ví) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 79
Gly Ser Ala Ala Cys Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn 15 io is
Sekvence č. 80 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 80
Gin Gly Phe Ile Thr Gin Leu Gly Arg Asn Phe Gin Val Ile Tyr 15 10 15
Sekvence č. 81 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 25 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 81
Val Thr Thr Asn Phe Phe Gly Val Asn Thr Ile Pro Ile Ala Leu Asn 1 5 10 15
Glu Ala Asp Tyr Leu Arg Met Trp Ile
25
Sekvence č. 82 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 25 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (vi) Původ zdroje:
(A) Organismus: Mycobacterium tuberculosis (xi) Sekvence č. 82
-44CZ 303194 B6
Asn Glu Ala Asp Tyr Leu Arg Met Trp Ile Gin Ala Ala Thr Val Met 15 10 is
Ser His Tyr Gin Ala Val Ala His Glu
25
Sekvence č. 83 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 967 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA io (xi) Sekvence č. 83
TGAGCGCCAA CCCTACCGTC GGTTCGTCAC ACGGACCGCA TGGCCTGCTC CGCGGACTGC 6 0
CGCTAGGGTC GCGGATCACT CGGCGTAGCG GCGCCTTTGC CCACCGATAT GGGTTCCGTC 12 0
ACAGTGTGGT TGCCCGCCCG CCATCGGCCG GATAACGCCA TGACCTCAGC TCGGCAGAAA 18 0
TGACAATGCT CCCAAAGGCG TGAGCACCCG AAGACAACTA AGCAGGAGAT CGCATGCCGT 2 40
TTGTGACTAC CCAACCAGAA GCACTGGCGG CGGCGGCCGG CAGTCTGCAG GGAATCGGCT 300
CCGCATTGAA CGCCCAGAAT GCGGCTGCGG CGACTCCCAC GACGGGGGTG GTCCGGCGGC 36 0
CGCCGATGAA NTGTCGGCGC TGACGGCGGC TCAGTTCGCG GCACACGCCC AGATCTATCA 4 20
GGCCGTCAGC GCCCAGGCCG CGGCGATTCA CGAGATGTTC GTCAACACTC TACAGATGAG 4 80
CTCAGGGTCG TATGCTGCTA CCGAGGCCGC CAACGCGGCC GCGGCCGGNT AGAGGAGTCA S4 0
CTGCGATGGA TTTTGGGGCG TTGCCGCCGG AGGTCAATTC GGTGCGGATG TATGCCGTTC 6 00
CTGGCTCGGC ACCAATGGTC GCTGCGGCGT CGGCCTGGAA CGGGTTGGCC GCGGAGCTGA 66 0
GTTCGGCGGC CACCGGTTAT GAGACGGTGA TCACTCAGCT CAGCAGTGAG GGGTGGCTAG 72 0
GTCCGGCGTC AGCGGCGATG GCCGAGGCAG TTGCGCCGTA TGTGGCGTGG ATGAGTGCCG 78C
CTGCGGCGCA AGCCGAGCAG GCGGCCACAC AGGCCAGGGC CGCCGCGGCC GCTTTTGAGG 84 0
CGGCGTTTGC CGCGACGGTG CCTCCGCCGT TGATCGCGGC CAACCGGGCT TCGTTGATGC 90 0
AGCTGATCTC GACGAATGTC TTTGGTCAGA ACACCTCGGC GATCGCGGCC GCCGAAGCTC 96 0
AGTACGG 96 7
Sekvence Č. 84 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence ě. 84
Met Ser Phe Val Thr Thr Gin Pro Glu Ala Leu Ala Ala Ala Ala
Sekvence č. 85 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence Č. 84
Thr Gin Pro Glu Ala Leu Ala Ala Ala Ala Ala Asn Leu Gin Gly
-45CZ 303194 B6
Sekvence ě. 86 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 86
Leu Ala Ala Ala Ala Ala Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met 15 10 15
Sekvence ě. 87
I (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (íi) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 87
Ala Asn Leu Gin Gly Ile Gly Thr Thr Met Asn Ala Gin Asn Ala 15 10 15
Sekvence Č. 88 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 88
Ile Gly Thr Thr Met Asn Ala Gin Asn Ala Ala Ala Ala Ala Pro 15 10 15
Sekvence c. 89 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 89
Asn Ala Gin Asn Ala Ala Ala Ala Ala Pro Thr Thr Gly Val Val 1 5 10 1S
Sekvence č. 90 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý
-46CZ 303194 B6 (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 90
Ala Ala Ala Ala Pro Thr Thr Gly Val Val Pro Ala Ala Ala Asp 1 5 10 15
Sekvence č. 91 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina io (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence Č. 91
Thr Thr Gly Val Val Pro Ala Ala Ala Asp Glu Val Ser Ala Leu 15 10 15
Sekvence č. 92 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 92
Pro Ala Ala Ala Asp Glu Val Ser Ala Leu Thr Ala Ala Gin Phe 15 10 15
Sekvence c. 93 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 93
Glu Val Ser Ala Leu Thr Ala Ala Gin Phe Ala Ala His Ala Gin 15 10 15
Sekvence Č. 94 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 94
Thr Ala Ala Gin Phe Ala Ala His Ala Gin Met Tyr Gin Thr Val 15 10 15
-47CZ 303194 B6
Sekvence č. 95 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 5 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 95
Ala Ala His Ala Gin Met Tyr Gin Thr Val Ser Ala Gin Ala Ala 10 1 5 10 15
Sekvence č. 96 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin 15 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 96
Met Tyr Gin Thr Val Ser Ala Gin Ala Ala Ala Ile His Glu Met Phe 1 5 1 n -» r
Sekvence č. 97 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 25 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence ě. 97
Ser Ala Gin Ala Ala Ala ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu
Sekvence č. 98 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin 35 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 98
Ala Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu Val Ala Ser Ser Gly 1 5 10 15
Sekvence č. 99 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina
-48CZ 303194 B6 (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie; lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence c. 99
Phe Val Asn Thr Leu Val Ala Ser Ser Gly Ser Tyr Ala Ala Thr 15 10 is
Sekvence č. 100 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xí) Sekvence č. 100
Val Ala Ser Ser Gly Ser Tyr Ala Ala Thr Glu Ala Ala Asn Ala
5
Sekvence Č. 101 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 14 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 101
Ser Tyr Ala Ala Thr Glu Ala Ala 1 5
15
Asn Ala Ala Ala Ala Gly 10
Sekvence č. 102 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1784 párů bází 30 (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence ě. 102
-49CZ 303194 B6
ATTCGTTCCT
GCTGCATCGC
GCCGTCCGGT
CGATGGCCGA
ACTTTGTCGA
TCGGCGGGCA
CCTACCTGCT
ACGACCTGAA
GCGCGGTATC
CCGAGATCGT
TCGCGGCGCT
AAGACGACCC
ACCCCGATCC
TGTTGCGGGA
AGTCCCAGTC
ACGGGCAGGT
CGCTGGTCGA
CGGTGCAGAC
TCGATTNTCC
CGATGTGGCC
GCGATTGGTC
CAAACATTTC
GGCCGCCACC
GAGCACCAAC
AGGTGATCGG
GCCGCAGCTA
GCACGGCGGA
GGTGCTCAAG
ACGCCAGTTC
GCACACCGAC
ATCGCTCAAA
GGAGATCCTG
GCCGGAAAAC
GCGGATCAAC
GCGGACCGGT
CACGCTGGAC
GGTGCTGAAA
GCGGCAACGG
GGTGGTCGCC
GGTCGACATT
GCACGCGGAG
TCCGACCGAC
CCTAGACTCG
GAGTCAGTGG
AAGGCCACCC
TGGTACCGGG
ACCGAGGTGC
GCCGAACTAG
GACGGCGTGA
GTCGGCGCCG
AATCCCGGGG CTGGGCTGGA GGCCTGGTGC CTGGCCGAGG AGGCACGGGG CGCAGCAAGG CCGGCGCTGA ATCATGCTGA TCGTTCGGCT CCGACGGTGG CTGCCCACCC ACCTACGACT TTCACCACCG CAGACACCGG TGGAGTGGAC AAGCTGACCG GTCGCAGCTT NTGCGCGCGG AGCTGCCGCT GAAAACTCGA CCGTCGCCGA TGGATACCTT CCGGCAACAC TCTCGGCGGC TGCGCACGCT
ACATCGTCGC
TCTACCTCGC
ATTCCGGTGA
TGGTGCACCC
ATCCGGTCGG
GTCANAAACT
GCTACCTGCA
CCGAGGAACA
ACCTCTACGG
CCACCGACAT
GCAATGGCCG
CTTACGGCCG
CCGAAGAGAT
GGTGCCGCGG
TGCTGGTGGC
CCAACGAGAT
CGGTCCTGCA
CCCGCCACGG
AATGGAAGTC
CGATCTGGCC
GCTGCTCACC
TCCCGGCGAG
CGACGAACAC
TTTCGGACTG
CGACGAGGTA
CGGCCAGTAC
TCTCGACCGC
TGCCGAAGCG
GTCGATCGTG
CTACATCGTG
GCCCGTCGCG
TTCCATCGGC
GCTCAAGCTG
GACCCCAGGC
CTACACCGTG
TTATGTGGAT
GTTGCTGCGC
GTCCGCGCAA
CCAGGCTATC
GCACACCGAC
CGTGACCGCG
GGCCACGGTG
TGCGCTGGAC
CGCGCGCTGC
GAACGCGTTG
GGCGACTATG
CTGGCGCCCA
AAGTTCTATC
GCCAGAGCCC
CCGCCCACTT
GAGGTCAAAG
AATGTCAACG
CAGGCAATGG
CAGATCTTCA
ATGGAATACG
GAGGCCATCG
TTGGTCTACA
ATCGACCTGG
TTCCAGGCGC
GGACGCACGC
GGGCTACCCG
AGGGCCATCG
TTGACGGGCG
AACGATCTTC
GTGTATCTGG
CTGTCGGTGC
CTCTCCCAGC
GCCGACGGCG
TGGATCTCGG
GCTGGCGATG
ACTCGGCCAC
AGCTCGCCCT
AGACGGTGTG
GGTCGGCCGA
CTCGGCATTT
120
1Θ0
240
300
360
420
400
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
Sekvence č. 103 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 766 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA io (xi) Sekvence č. 103
ACAARACACT CGGYGGCKGC CGMTCCGGCC TGATCGTCGC- TGATCAGCYT CGTGCCAAAY TCGGCACAAG GTGCGCGCTR CCCAANGAGT TCTTCGCCGC RGTGCGMGCM KAACTGGCCT ATCNTGGTTG GGTGCCGTCC CGCAWAACCC GCGAACTTAA ACCCATTTTA ACCGGGCAGG AAGTTTCCTA CATYTACCCN RGSMANCCAA CCGGGCCGCC NANAAMTCCG TCCTGGANTC CGANCGGTTC CCGGTGTTCG CCGCACTGCT GACCGGCACG GARTATCCGC AGGCGGCGTT GGCCAACGCG TGGGTGCAAC TGGCCTACGG TGCGCACCAS GACGCCATCA CCGGCTCGGA GTCCGACCAG GTACTCAATG CTGGCGACCA CACCAGCCAG CAGACCAAAC TGGTGCACGC CGATCTCCAG GCGCGCCGGC CCGGTGGCAT ACGGATTGGT CGAAACCAAT CCGAAGGAAT TCATCACGGA CGGTCACGGA AAACGATCGC CCCAATGGGN GGACNACCCN AGCCAGGCGN ATTNACCGTT NAACAAGTTG GNGTAGGTTC TTTGATATCG AKCAACCGAT ACGGAKCGGM CCGCGGAATG GTAGACCACC ACCAGTGCCC NCAMGTMGTG CACCAGTTTG GTCATCGCCC GCAGATCGGT GACCCCGCCA AGCGTTCCGG ATGCGGAGAT GASGGTGACC AGCCYGGTTG ACCTGTTGAT CAGGTTNTCC CAGTGCCACG TCGGCAGCTG GCCGGT
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
766
Sekvence Č. 104 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1231 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 104
-50CZ 303194 B6
CGGCACGAGA ATGTCGCCTG TGCCTCGATA GCCACTTGCG TGTGGTCGCG CTGCCAGCGG GTCAGCCAGG TCGCCTGGTC CAGGCCATCG GGCCGGCGCA GGAGCGCGAT GTTGGCCAGA CCCGGTGTAC GAGAACCGGA CTCGACNAAG TGTCGGCGCT GACGGCGGCT CAGTTCGCGG CACACGCCCA GATCTATCAG GCCGTCAGCG CCCAGGCCGC GGCGATTCAC GAGATGTTCG TCAACACTCT ACAGATNANC TCAGGGTCGT ATGCTGCTAC CGAGGCCGCC AACGCGGCCG CGGCCGGCTA GAGGAGTCAC TGCGATGGAT TTTGGGGCGT TGCCGCCGGA GGTCAATTCG GTGCGGATGT ATGCCGGTCC TGGCTCGGCA CCAATGGTCG CTGCGGCGTC GGCCTGGAAC GGGTTGGCCG CGGAGCTGAG TTCGGCGGCC ACCGGTTATG AGACGGTGAT CACTCAGCTC AGCAGTGAGG GGTGGCTAGG TCCGGCGTCA GCGGCGATGG CCGAGGCAGT TGCGCCGTAT GTGGCGTGGA TGAGTGCCGC TGCGGCGCAA GCCGAGCAGG CGGCCACACA GGCCAGGGCC GCCGCGGCCG CTTTTGAGGC GGCGTTTGCC GCGACGGTGC CTCCGCCGTT GATCGCGGCC
Sekvence č. 105 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 2041 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA io (xi) Sekvence č. 105
CGGCACGAGC TCGTGCCGAT CAGTGCCATT GACGGCTTGT ACGACCTTCT GGGGATTGGA ATACCCAACC AAGGGGGTAT CCTTTACTCC TCACTAGAGT ACTTCGAAAA AGCCCTGGAG GAGCTGGCAG CAGCGTTTCC GGGTGATGGC TGGTTAGGTT CGGCCGCGGA CAAATACGCC GGCAAAAACC GCAACCACGT GAATTTTTTC CAGGAACTGG CAGACCTCGA TCGTCAGCTC ATCAGCCTGA TCCACGACCA GGCCAACGCG GTCCAGACGA CCCGCGACAT CCTGGAGGGC GCCAAGAAAG GTCTCGAGTT CGTGCGCCCG GTGGCTGTGG ACCTGACCTA CATCCCGGTC GTCGGGCACG CCCTATCGGC CGCCTTCCAN GCGCCGTTTT GCGCGGGCGC GATGGCCGTA GTGGGCGGCG CGCTTGCCTA CTTGGTCGTG AAAACGCTGA TCAACGCGAC TCAACTCCTC AAATTGCTTG CCAAATTGGC GGAGTTGGTC GCGGCCGCCA TTGCGGACAT CATTTCGGAT GTGGCGGACA TCATCAAGGG CATCCTCGGA GAAGTGTGGG AC-TTCATCAC AAACGCGCTC AACGGCCTGA AAGAGCTTTG GGACAAGCTC ACGGGGTGGG TGACCGGACT GTTCTCTCGA GGGTGGTCGA ACCTGGAGTC CTTCTTTGCG GGCGTCCCCG GCTTGACCGG CGCGACCAGC GGCTTGTCGC AAGTGACTGG CTTGTTCGGT GCGGCCGGTC TGTCCGCATC GTCGGGCTTG GCTCACGCGG ATAGCCTGGC GAGCTCAGCC AGCTTGCCCG CCCTGGCCGG CATTGGGGGC GGGTCCGGTT TTGGGGGCTT GCCGAGCCTG GCTCAGGTCC ATGCCGCCTC AACTCGGCAG GCGCTACGGC CCCGAGCTGA TGGCCCGGTC GGCGCCGCTG CCGAGCAGGT CGGCGGGCAG TCGCAGCTGG TCTCCGCGCA GGGTTCCCAA GGTATGGGCG GACCCGTAGG CATGGGCGGC ATGCACCCCT CTTCGGGGGC GTCGAAAGGG ACGACGACGA AGAAGTACTČ GGAAGGCGCG GCGGCGGGCA CTGAAGACGC CGAGCGCGCG CCAGTCGAAG CTGACGCGGG CGGTGGGCAA AAGGTGCTGG TACGAAACGT CGTCTAACGG CATGGCGAGC CAAATCCATT GCTAGCCAGC G CCTAAC AAC GCGCAATGCT AAACGGAAGG GACACGATCA ATGACGGAAA ACTTGACCGT CCAGCCCGAG CGTCTCGGTG TACTGGCGTC GCACCATGAC AACGCGGCGG TCGATGCHTC CTCGGGCGTC GAAGCTGCCG CTGGCCTAGG CGAATCTGTG GCGATCACTC ACGGTCCGTA CTGCTCACAG TTCAACGACA CGTTAAATGT GTACTTGACT GCCCACAATG CCCTGGGCTC GTCCTTGCAT ACGGCCGGTG TCGATCTCGC CAAAAGTCTT CGAATTGCGG CGAAGATATA TAGCGAGGCC GACQAAGCGT GGCGCAAGGC TATCGACGGG TTGTTTACCT GACCACGTTT GCTGCCCGCA GTGCAGGCCA CGACGTAGCG CAGGTCGTGT CCCTCGTAGG CGTGGATGCG ACCGGCCAGC ACCAGCACCC GGTGCGCACC GATGGGCACG GACAGTAGCT CGCCCGCATG CCCGGCTGCG GTTGGCGGCA CAAACCCGGG CAGTTCGGCC TGCGGCAGCA CGGTGGTNGG GGAGCCCAAC GCCGCAACGG CCGGTAACCA TCCCGACCCG AGCACGACCG AGACGTCATG TTCGCCGATC CCGGTGCGGT CAGCGATGAC CTGCGCCGCC GGCCGGGCCA GTTTGTCGGG ATCGGGGCGC GGGTCAGCCA CACTGGGCGA GCTTAACTGA GCCGCTCGCC GGGGAGCGGG TGCTNGTCGA TGAGATACTG CGAGCATGCC AGCAGCCAGC GCATCCGACC GCGTCGAGGA attggtgcgg CGCCGTGGTG gcgagctggt cgagctgtcc CATGCCATCC ACCTCGTGCC G
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
120
130
240
300
360
420
460
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800 íqeo
1920
1980
2040
2041
-51 CZ 303194 B6
Sekvence č, 106 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1202 páru bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence ě. 106
GAGCTCACCG CTATCAACCA ATACTTTCTG CACTCCAAGA TGCAGGACAA CTGGGGTTTT ACCGAGCTGG CGGCCCACAC CCGCGCGGAG TCGTTCGACG AAATGCGGCA CGCCGAGGAA ATCACCGATC GCATCTTGTT GCTGGATGGT TTGCCGAACT ACCAGCGCAT CGGTTCGTTG CGTATCGGCC AGACGCTCCG CGAGCAATTT GAGGCCGATC TGGCGATCGA ATACGACGTG TTGAATCGTC TCAAGCCAGG AATCGTCATG TGCCGGGAGA AACAGGACAC CACCAGCGCC GTACTGCTGG AGAAAATCGT TGCCGACGAG GAAGAACACA TCGACTACTT GGAAACGCAG CTGGAGCTGA TGGACAAGCT AGGAGAGGAG CTTTACTCGG CGCAGTGCGT CTCTCGCCCA CCGACCTGAT GCCCGCTTGA GGATTCTCCG ATACCACTCC GGGCGCCGCT GACAAGCTCT AGCATCGACT CGAACAGCGA TGGGAGGGCG GATATGGCGG GCCCCACAGC ACCGACCACT GCCCCCACCG CAATCCGAGC CGGTGGCCCG CTGCTCAGTC CGGTGCGACG CAACATTATT TTCACCGCAC TTGTGTTCGG GGTGCTGGTC GCTGCGACCG GCCAAACCAT CGTTGTGCCC GCATTGCCGA CGATCGTCGC CGAGCTGGGC AGCACCGTTG ACCAGTCGTG GGCGGTCACC AGCTATCTGC TGGGGGGAAC ACTSKVGXKK KTGKKGKSKS KSRMRMKCTC GGTGATCTGC TCGGCCGCAA CAGGGTGCTG CTAGGCTCCG TCGTGGTCTT CGTCGTTGGC TCTGTGCTGT GCGGGTTATC GCAGACGATG ACCATGCTGG CGATCTCTCG CGCACTGCAG GGCGTCGGTG CCGGTGCGAT TTCCGTCACC GCCTACGCGC TGGCCGCTGA GGTGGTCCCA CTGCGGGACC GTGGCCGCTA CCAGGGCGTC TTANGTGCGG TGTTCGGTGT CAACACGGTC ACCGGTCCGC TGCTGGGGGG CTGGCTCACC GACTATCTGA GCTGGCGGTG GGCGTTCCGA CCACCAGCCC CATCACCGAC CCGATCGCGG TCATCGCGGC GAACACCGCC CTCGCGGCGT TGCGGGCAGG TCCCTTGGGG AACGTGGTCC CACAGCGCCA GAACGGTCGG AAATGCGATG GCCGACCCAC AC
Sekvence ě. 107 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 496 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 107
GGCGGCGGCA GTTGGCCAGC AGTTNGGGCG GGGGAGCCGG TTCGGNGACC AAGAAATCGG CCTGGGCAAG CAGCCGGGAC CGCGNACCGT GATCAGTTNG GATCGCCGGG ACCGCCGCCG ACCAANGCCA TTCCGCCGNT GAGGAAGTCG GAANTNTGCG CAGTGATGAC GCCCTGCTGC AACGCNTCCC GGATTGCCGA GCGGATCGCC GCCGAACGGC GGTGCTCACC ACCGGCGAGC ACCCCTACNG ACAGGCCCGC ATAGCTGAAT GACGCCGGGT NACCGCCGTC CCNTCCACCG NGANATCGGC CCGGANGCAA AAGATCCGTC GGCGCTCCGC CTCGGCGACG ACAGCCACGT TCACCCGCGC GTTATCGGTG GCCGCGATCG CATACCAGGC GCCGTCAAGG TNGCCGTYGC GGTAGTCACG CACCGACAAG GTGATYTGGT CCATCGCCTN GACGGCGGGG GTGACGCTGG GGGCGATCAM GTGCAC
Sekvence č. 108 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 849 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 102 0 1080 114C 1200 1202
120
180
240
300
360 420 480 4 9f
-52CZ 303194 B6 (ϋ) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 108
TGGATTCCGA TAGCGGTTTC GGCCCCTCGA CGGGCGACCA CGGCGCGCAG GCCTCCGAAC 60
GGGGGGCCGG GACGCTGGGA TTCGCCGGGA CCGCAACCAA AGAACGCCGG GTCCGGGCGG 120
TCGGGCTGAC CGCACTGGCC GGTGATGAGT TCGGCAACGG CCCCCGGATG CCGATGGTGC ISO
CGGGGACCTG GGAGCAGGGC AGCAACGAGC CCGAGGCGCC CGACGGATCG GGGAGAGGGG 240
GAGGCGACGG CTTACCGCAC GACAGCAAGT AACCGAATTC CGAATCACGT GGACCCGTAC 300
GGGTCGAAAG GAGAGATGTT ATGAGCCTTT TGGATGCTCA TATCCCACAG TTGGTGGCCT 360
CCCAGTCC-GC GTTTGCCGCC AAGGCGGGGC TGATGCGGCA CACGATCGGT CAGGCCGAGC 420
AGGCGGCGAT C-TCGGCTCAG GCGTTTCACC AGGGGGAGTC GTCGGCGGCG TTTCAGGCCG 480
CCCATGCCCG GTTTGTGGCG GCGGCCGCCA AAGTCAACAC CTTGTTGGAT GTCGCGCAGC- 540
CGAATCTGGG TGAGGCCGCC GGTACCTATG TGGCCGCCGA TGCTGCGGCC GCGTCGACCT 600
ATACCGGGTT CTGATGGAAC CCTGCTGACC GAGAGGACTT GTGATGTCGC AAATCATGTA 660
CAACTACCCC GCGATGTTGG GTCACGCCGG GGATATGGCC GGATATGCCG GCACGCTGCA 720
GAGCTTGGGT GCCGAGATCG CCGTGGAGCA GGCCGCGTTG CAGAGTGCGT GGCAGGGCGA 780
TACCGGGATC ACGTATCAGG CGTGGCAGGC ACANTGGTAA CCANGCCANG GAAGATTTGG 840
TGCGGGCCT 849
Sekvence ě. 109 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 97 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý io (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi) Sekvence č. 109
Met 1 Ser Leu Leu Asp Ala 5 His Ile Pro Gin Leu 10 Val Ala Ser Gin 15 Ser
Ala Phe Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gin Ala
20 25 30
Glu Gin Ala Ala Met Ser Ala Gin Ala Phe His Gin Gly Glu Ser Ser
35 40 45
Ala Ala Phe Gin Ala Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys
50 55 60
Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Ala Gin Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala
65 70 75 80
Gly Thr Tyr Val Ala Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ser Thr Tyr Thr Gly
85 90 95
Phe
Sekvence č. 110 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence Č. 110
Sekvence č. 111 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence c. 111
Ala His Ile Pro Gin Leu Val Ala Ser Gin Ser Ala Phe Ala Ala 1 5 10 15
Sekvence č. 112 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ϋ) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 112
Leu Val Ala Ser Gin Ser Ala Phe Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met 1 5 10 15
Sekvence č. 113 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence ě, 113
Ser Ala Phe Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Xle Gly 15 10 15
Sekvence č. 114 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence ě. 114
Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gin Ala Glu Gin Ala 15 10 15
Sekvence č. 115 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence ě. 115
-54QZ 303194 B6
Arg His Thr Ile Gly Gin Ala Glu Gin Ala Ala Met Ser Ala Gin 15 10 15
Sekvence č. 1 16 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid io (xí) Sekvence č. 116
Gin Ala Glu Gin Ala Ala Met Ser Ala Gin Ala Phe His Gin Gly 1 5 10 15
Sekvence č. 117 (i) Charakteristika sekvence:
is (A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 117
Ala Met Ser Ala Gin Ala Phe His Gin Gly Glu Ser Ser Ala Ala i 5 10 15
Sekvence č. 118 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence £.118
Ala Phe His Gin Gly Glu Ser Ser Ala Ala Phe Gin Ala Ala His 15 10 15
Sekvence Č. 119 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 119
Glu Ser Ser Ala Ala Phe Gin Ala Ala His Ala Arg Phe Val Ala 1 5 10 15
Sekvence č. 120 (i) Charakteristika sekvence:
-55CZ 303194 B6 (A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 120
Phe Gin Ala Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys Val 1 5 10 IS
Sekvence č. 121 io (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 121
Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys Val Asn Thr Leu Leu Asp 15 10 15
Sekvence č. 122 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 122
Ala Ala Ala Lys Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Ala Gin Ala Asn 15 10 15
Sekvence č. 123 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 15 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 123
Asn Thr Leu Leu Asp Val Ala Gin Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala 15 10 15
Sekvence č. 124 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 18 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Sekvence č. 124
-56CZ 303194 B6
Val Ala Gin Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala Gly Thr Tyr Val Ala Ala 15 10 15
Asp Ala
Sekvence č. 125 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1752 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ϋ) Typ molekuly: cDNA ío (xi) Sekvence č. 125
CGGCACGAGA ATGTCGCCTG TGCCTCGATA GCCACTTGCG TGTGGTCGCG CTGCCAGCGC 60
GTCAGCCAGG TCGCCTGGTC CAGGCCATCG GGCCGGCGCA GGAGCGCGAT GTTGGCCAGA 120
CCCGGTGTAC GAGAACCGGA CTCGACNAAG TGTCGGCGCT GACGGCGGCT CAGTTCGCGG 180
CACACGCCCA GATCTATCAG GCCGTCAGCG CCCAGGCCGC GGCGATTCAC GAGATGTTCG 240
TCAACACTCT ACAGATNANC TCAGGGTCGT ATGCTGCTAC CGAGGCCGCC AACGCGGCCG 300
CGGCCGGCTA GAGGAGTCAC TGCGATGGAT TTTGGGGCGT TGCCGCCGGA GGTCAATTCG 360
GTGCGGATGT ATGCCGGTCC TGGCTCGGCA CCAATGGTCG CTGCGGCGTC GGCCTGGAAC 420
GGGTTGGCCG CGGAGCTGAG TTCGGCGGCC ACCGGTTATG AGACGGTGAT CACTCAGCTC 480
AGCAGTGAGG GGTGGCTAGG TCCGGCGTCA GCGGCGATGG CCGAGGCAGT TGCGCCGTAT 540
GTGGCGTGGA TGAGTGCCGC TGCGGCGCAA GCCGAGCAGG CGGCCACACA GGCCAGGGCC 600
GCCGCGGCCG CTTTTGAGGC GGCGTTTGCC GCGACGGTGC CTCCGCCGTT GATCGCGGCC 660
AACCGGGCTT CGTTGATGCA GCTGATCTCG ACGAATGTCT TTGGTCAGAA CACCTCGGCG 720
ATCGCGGCCG CCGAAGCTCA GTACGGCGAG ATGTGGGCCC AAGACTCCGC GGCGATGTAT 760
GGCTACGCGG GCAGTTCGGC GAGCGCCTCG GCGGTCACGC CGTTTAGCAC GCCGCCGCAG 840
ATTGCCAACC CGACCGCTCA GGGTACGCAG GCCGCGGCCG TGGCCACCGC CGCCGGTACC 900
GCCCAGTCGA CGCTGACGGA GATGATCACC GGGCTACCCA ACGCGCTGCA AAGCCTCACC 960
TCACNTCTGT TGCAGTCGTC TAACGGTCCG CTGTCGTGGC TGTGGCAGAT CTTGTTCGGC 1020
ACGCCCAATT TCCCCACCTC AATTTCGGCA CTGCTGACCG ACCTGCAGCC CTACGCGAGC 1090
ΤΤΝΤΓΝΤΑΤΑ ACACCGAGGG CCTGCCGTAC TTCAGCATCG GCATGGGCAA CAACTTCATT 1140
CAGTCGGCCA AGACCCTGGG ATTGATCGGC TAGGCGGCAC CGGCTGCGGT CGCGGCTGCT 1200
GGGGATGCCG CCAAGGGCTT GCCTGGACTG GGCGGGATGC TCGGTGGCGG GCCGGTGGCG 1260
GCGGGTCTGG GCAATGCGGC TTCGGTTGGC AAGCTGTCGG TGCCGCCGGT GTGGANTGGA 1320
CCGTTGCCCG GGTCGGTGAC TCCGGGGGCT GCTCCGCTAC CGGTGAGTAC GGTCAGTGCC 13Θ0
GCCCCGGAGG CGGCGCCCGG AAGCCTGTTG GGCGGCCTGC CGCTANCTGG TGCGGGCGGG 1440
GCCGGCGCGG GTCCACGCTA CGGATTCCRT CCCACCGTCA TGGCTCGCCC ACCCTTCGMC 1500
GGGATAGTCG CTGCCGCAAC GTATTAACGC GCCGGCCTCG GCTGGTGTGG TCCGCTGCGG 1560
GTGGCAATTG GTCNGCGCCG AAATCTCSGT GGGTTATTTR CGGTGGGATT TTTTCCCGAA 1620
GCCGGGTTCA RCACCGGATT TCCTAACGGT CCCGCKACTC TCGTGCCGAA TTCSGCACTA 1680
AGTGACGTCC GGCGGAAACC CGTTGGGTNT GAAAGCTTCA GAAAGGCCCG CTCCCAGGGG 1740
TTCGGCAAAC GG 1752
Sekvence č. 126 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 400 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi) Sekvence č. 126
-57CZ 303194 B6
Met 1 Asp Phe Gly Ala 5 Leu Pro Pro Glu Val 10 Asn Ser Val Arg Met 15 Tyr
Ala Glv Pro Gly 20 Ser Ala Pro Met Val 25 Ala Ala Ala Ser Ala 30 Trp Asn
Gly Leu Ala 35 Ala Glu Leu Ser Ser 40 Ala Ala Thr Gly Tyr 45 Glu Thr Val
Ile Thr 50 Gin Leu Ser Ser Glu 55 Gly Trp Leu Gly Pro 60 Ala Ser Ala Ala
Met 65 Ala Glu Ala Val Ala 70 Pro Tyr Val Ala Trp 75 Met Ser Ala Ala Ala 80
Ala Gin Ala Glu Gin 85 Ala Ala Thr Gin Ala 90 Arg Ala Ala Ala Ala 95 Ala
Phe Glu Ala Ala 100 Phe Ala Ala Thr val 105 Pro Pro Pro Leu Ile 110 Ala Ala
Asp. Arg Ala 115 Ser Leu Met Gin Leu 120 Ile Ser Thr Asn Val 125 Phe Gly Gin
Asn Thr 130 Ser Ala Ile Ala Ala 135 Ala Giu Ala Gin Tyr 140 Glv Glu Met Trp
Ala 145 Gin Asp Ser Ala Ala 150 Met Tyr Ala Tyr Ala 155 Gly Ser Ser Ala Ser 160
Ala Ser Ala Val Thr 165 Pro Phe Ser Thr Pro 170 Pro Gln Ile Ala Asn 175 Pro
Thr Ala Gin Gly 180 Thr Gin Ala Ala Ala 185 Val Ala Thr Ala Ala 190 Gly Thr
Ala Gin Ser 195 Thr Leu Thr Glu Met 200 Ile Thr Gly Leu .Pro 205 Asn Ala Leu
Gin Ser 210 Leu Thr Ser Xaa Leu 215 Leu Gin Ser Ser Asn 220 Gly Pro Leu Ser
Trp 225 Leu Trp Gin Ile Leu 230 Phe Gly Thr Pro Asn 235 Phe Pro Thr Ser Ile 240
Ser Ala Leu Leu Thr 245 Asp Leu Gin Pro Tyr 250 Ala Ser Xaa Xaa Tyr 255 Asn
Thr Glu Gly Leu 260 Pro Tyr Phe Ser Ile 265 Gly Met Gly Asn Asn 270 Phe Ile
Gin Ser Ala 275 Lys Thr Leu Gly Leu 280 Ile Gly Ser Ala Ala 285 Pro Ala Ala
Val Ala 290 Ala Ala Gly Asp Ala 295 Ala Lys Gly Leu Pro 300 Gly Leu Gly Gly
Met 305 Leu Gly Gly Gly Pro 310 Val Ala Ala Gly Leu 315 Gly Asn Ala Ala Ser 320
Val Gly Lys Leu Ser 325 Val Pro Pro Val Trp 330 Xaa Gly Pro Leu Pro 335 Gly
Ser Val Thr Pro Gly Ala Al« Pro Leu Pro Val Ser Thr Val •Ser Ala
340 345 350
Ala Pro Glu Ala Ala Pro Gly Ser Leu Leu Gly Gly Leu Pro Leu Xaa
355 360 365
Gly Ala Gly Gly Ala Gly Ala Gly Pro Arg Tyr Gly Phe Xaa Pro Thr
370 375 380
Val Met Ala Arg Pro Pro Phe Xaa Gly Ile Val Ala Ala Ala Thr Tyr
385 390 395 400
Sekvence Č. 127 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 475 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární
-58CZ 303194 B6 (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 127
GGCACGAGCA CCAGTTGACC CGCGAAGAAC CTGACCGCGC CACCCAGCGC CGCCCGCATC ACCGGCCCCG TCCCACGAAC CTTTTCGGTA AACGAGCCAC TCCAGCGGAG ATCGGTACCG CCCGACGCAT TTGGTGTAAG GACCACCTCG CCGAAGTAGT CCTGGACGGG TGTCCTCGCG CCAACCAGCT TGTAGACGTG GCGACGGTCC TGCTCATACT CGACGGTCTC TTCCTGCACG AACACCGGCC ACATGCCTAG TTTGCGGATG GCCCCGATGC CGCCGGGCGC GGGATCACCG CGTCGCGCCC AACTCGATTG AGCAACGATG GGCTTGGCCC AGGTCGCCCA GTTGCCACCG TCTGTCACGA GCCGAAACAA GGTTGCAGCC GGCGCGCTGC TGGTCTTGGT GACCTCGAAC GAAAATTTCC GACCCGACAT GCGCGACTCC CGAAACGACA ACTGAAGCTC GTGC
120 1Θ0 240 300 360 420 4 74
GAAAAAANTA
CCGAGGAACC
Sekvence Č. 128 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1431 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý io (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 128
CTGCGCGCCG GATGAGGCCG
TTAGGTCTTG GATCTGCCGG TGACAGAGTC GGTTCACGTC CCACACCATC GACGGCGTCG TGGCAACGGC AGCGGCCCTC CGTTGCGAGG TCGCGGGTGC GCTCGTCTCG ACTCAACCAT TTTGCCGTTG GCAGTGATGG GGTGTTGTTG CGCAGTTCGC CGCTGGGCGC GGTGTCACCG CGCCGGATGA GCGAGGCAAA TACTGTGCCG GGGGCATCAG CTCCGCCACA TACCAAACGG CAGGTCGGCA CCTTGCAGGT GCTATCACGT GGTAGGTCAG ATAGTGGCCG CCGGCAGCTT
CCGCCGTTGA GGGTGTCGAC CAGATTCACA GTCAGGGTAC TGAGCATCGG GTTGTTGGAA CCGGCCACCG ATCCGGGACC GGTGGGATTT ATCAGGTCCG CTGCGGTCAG CCATTGCCGC CGGTTTCGGG CTGGTGTCTT GCGACACGGG AATCGCGATG GCTGCGAGGC TCGCTGCTGC TTCGATTCCT TTGCTTCTGC GGCGGCGTTG
TTACTGGCAG
GACTAGTGCG
GACGGCAACG
GAACTCGCCA
AAGTCGCCGT
ACCGGACGGG
AATCCCGCAT
CGGCGCCGTG
TGATGTCTTC
GAGACGCGAC
TCATGCGCTT
CCGCCTACAC
CACCGTATCG
GCGTTGTTGA
CTGATGGGTG
GATGCTGCTG
GTCGAATGCG
GACCGGCAGA
AGGGTCAACA
AGTTGGCAGG
CCCGTCAGAT
CGTGGGTCAC
ATGCATGGTG
CATCGGTTAT
ACCGCTCACG
GCGAATGATA
GACCGGCACC
ATATTCCGGT
TCGTTGCCGT
CGAGCGCTGT
GCCACATCGG
CCTTGCGACG
ACCGAGATCG TCGGTGGTGT CGCCAGTGAG CTGCTTGCGT ATGCCGAAGC CGCCGCAGCA CGGGCTGCCT GCGGTCAGCA GCGCAACGGG GCCGGCCTGC ACGCGCCGTA GCAGCCCGGC TTCAGGAGGC ATGCTGCGGG GATCGGCTTG GGGATATCAC GTGATCTATC GGCACGAAGC GGGCTGCCTC GCCTTGACCG CGCCGAACGT ATCATGTACA CCGTCGCGTG GGCGGTGTGA CCATGAGTCG TCGCGGGCGC CTATCACCGT CCGTCGATCC TGCTCGGACT CGCCTGGCCG AGCAGCTTGG CGTCAGTCTT GAGTTGATCG GCGTTGGTGG GGGCGAAAAC GGTGTACTCG TCCGGGTTCA GCTTGCCCGA CAGAGCCGAG GCCGCGGTAG CGACCGGGTC TTGCGCCATT TGCGCCGCGT ATTGCGCGCA CCCACGACCA CGTGGTAACG GGCGCCGCCG GGCTGGTCGC TTTGGTGCTC GAACAACCCG CTAAGAACGC GGCCGGTTTG GCCTGAACGT TGATCATCGC AACGCCGTCC TCCTGGGTGG A
120
180
240
300
360
420
480
S40
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1322
1380
1431
Sekvence č. 129 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 279 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 129
-59CZ 303194 B6
GCACGAGAGT CGTATCTTTG CACCCAGCGC CCGTAGGAAA CCGCTGGCCT GGCTAACTCň 6 0
GATGCGGGCG GCCGTCGATT CGAGAGGTAA CCGATCGCCC GCCGACAATG GGTTACCCAC 12 0 CGAGACTGAT TGCCGCGCAG CCGCCTTCGA CGTGTAAGCG CCGGTTCGTG CATGCCCGGA 180
ACGGCTGCAC TCACGGACCT TCTACGTAGT ACGTGACGGA CTTTTACGCA TTATCGCTGA 240
CGATCTTTGC CTCCCAGGAC TCCAGAATCT ACTCGTGCC 279
Sekvence č. 130 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1470 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA io (xi) Sekvence č. 130
ACCGCCACCC GCAGCCCGGA ATCACCGTCG GTAACCTGCG AATACAATTT CTTCATCGAC 6 0
GACTTCGCGA ACAGCGAACC CGAGCCCACC GCCTGATAGC CTTCTTCCTC GATGTTCCAA 12 0
CCGCCGGCGG CGTCGAACGA AACGATACGA CCCGCGCTCT GCGGGTCAGA CGCATGAATG ISO
TCGTAGCCCG CCAGCAACGG CAACGCCAGC AGACCCTGCA TCGCGGCCGC CAGATTGCCA 24 0
CGCACCATAA TCGCCAGCCG GTTGATTTTG CCGGCAAACG TCAGCGGCAC ACCCTCGAGC 300
TTCTCGTAGT GCTCAAGTTC CACGGCATAC AGCCGGGCAA ACTCAACCGC GACCGCAGCC 360
GTGCCAGCGA TGCCGGTAGC GGTGTAGTCA TCGGTGATAT ACACCTTGCG CACATCACGC 420
CCAGAAATCA TGTTGCCCTG CGTCGAACGC CGGTCACCCG CCATGACAAC ACCGCCGGGG 4 80
TATTTCAGCG CGACAATGGT GGTGCCGTGC GGCAGTTGCG CATCGCCGCC TGCGAGTGGC 54 0
GCACCGCCGC TGATGCTTGC CGGCAGCAAC TCCGGCGCCT GGCGGCGCAG GAAGTCAAGT 600
GAAAGAAGAT AGGTCTACAG CGGGTGTTCC AGAGAGTGAA TTAATGGACA GGCGATCGGG 660
CAACGGCCAG GTCACTGTCC GCCCTTTTGG ACGTATGCGC GGACGAAGTC CTCGGCGTTC 720
TCCTCGAGGA CGTCGTCGAT TTCGTCGAGC AGATCGTCGG TCTCCTCGGT CAGCTTTTCG 780
CGACGCTCCT GGCCCGCGGC GGTGCTGCCG GCGATGTCGT CATCATCGCC GCCGCCACCG S40
CCACGCTTGG TCTGCTCTTG CGCCATCGCC GCCTCCTGCT TCCTCATGGC CTTTCAAAAG 900
GCCGCGGGTG CGCGTCACAC GCCCGCTGTC TTTCTCTCAC CTACCGGTCA ACACCAACGT 960
TTCCCGCCCT AACCAGGCTT AGCGAGGCTC AGCGGTCAGT TGCTCTACCA GCTCCACGGC 1020
ACTGTCCACC GAATCCAGCA ACGCACCAAC ATGCGCCTTA CTACCCCGCA ACGGCTCCAG 1080
CGTCGGGATG CGAACCAGCG AGTCGCCGCC AGGTCGAAGA TCACCGAGTC CCAGCTAGCC 1140
GCGGCGATAT CAGCCCCGAA CCGGCGCAGG CATTTCGCCG CGGAAATACG CGCGGGTGTC 1200
GGTCGGCGGT TCTCCACCGC ACTCAGCACC TGGTGTTTCG GTGACTAAAC GCTTTATCGA 12 60
GCCGCGCGCG ACCAGCCGGT TGTACAGGCC CTTGTCCAGC CGGACATCGG AGTACTGCAG 13 20
GTTGACGAGG TGCAGCCGGG GCGCCGACCA GCTCAGGTTC TCCCGCTGCC GGAAACCGTC 13 80
GAGCAGCCGC AGTTTGGCCG GCCAGTCCAG CAGCTCCGCG CAATCCATCG GGTCACGCTC 14 4 0
GAGCTGATCC AGCACGTGTG CCCAGGTTTC 14 70
Sekvence £.131 i? (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1059 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence £.131
-60CZ 303194 B6
ATTCCCATCG CTCCGGCACC TATCACCAGG TAGTCGGTTT CGATGGTTTT CGCCGGCCCT 6 0 TGCGTTGGCC TGGGCCACGG GTCGTTCATG GGCCCTCCTG TGCGGATTGG AATTTGTGAC 120 AACGAAATCG GGCGATCGGT GAGCAATCGT CGCCGATGCA AGACACGCTT TCCCTGCCGC 1ΘΟ GGCGTCAGGT GGAGTTTAGG CCAGCGTAAC AACGTAGACC GGCCACTGAC CAAACCCCAA 240 ACCCACAAAC CCTGGACGCA TGCGGGTCTC GGGCGTCAAA TTCCGGGTAG ATATCGTATA 3 00 CCGATATCGG ATGCCGTAGC CTTATCGAGG CATGAGACGC CCGCTAGACC CACGCGATAT 36C TCCAGATGAG CTGCGGCGAC GGCTGGGGCT CTTGGATGCG GTGGTGATCG GGCTTGGGTC 42 0 CATGATCGGT GCCGGAATCT TTGCTCGTGC CGAATTCGGC ACGAGCTCGT GCCGAATTCG 48C GCACGAGATT CCAATCCCCA GAAGGTCGTA CAAGCCGTCA ATGGCACTTG ATCGTTGGAT 54 0 CGATGATGAA CGCTCTGCTC ATGCCTGCCG CCTATCTCAA CGGTCGTCGA TTCCATGCAT 6 00 TAGCCTTGGT TCTGCATTGC ACGCGTAGGG CCTACAGTCT GGCTGTCATG CTTGGCCGAT 66 0 GTCAACAGTT TTTTTCATGC TAAGCAGATC GTCAGTTTTG AGTTCGTGAA GACGGCATGT 720 TCACTTGTTG TCGACTACAT CGTCTGCGCA CATTTGCCCT CCTGCAACTG CGCTGCGACA 780 ATGCGCCAAC CGCCGTGTAG CTCGTGCCGA ATTCGGCACG AGGATCCACC GGAGATGGCC 84 0 GACGACTACG ACGAGGCCTG GATGCTCAAC ACCGTGTTCG ACTATCACAA CGAGAACGCA 9 00 AAAGAAGAGG TCATCCATCT CGTGCCCGAC GTGAACAAGG AGAGGGGGCC CATCGAACTC 96 0 GTAACCAAGG TAGACAAAGA GGGACATCAG ACTCGTCTAC GATGGGGAGC CACGTTTTCA 10 2 0 TACAAGGAAC ATCCTAAGTT TTGATTCGGG AACATCCTA 10 5 9
Sekvence č. 132 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 153 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA io (xi) Sekvence č. 132
GCACGAGGCA TTGGCGGGCA TCTGCATAAA CGGTGACGTA ŤCAGCACAAA ACAGCGGAGA 6 0
GAACAACATG CGATCAGAAC GTCTCCGGTG GCTGGTAGCC GCAGAAGGTC CGTTCGCCTC 120
GGTGTATTTC GACGACTCGC ACGACTCGTG CCG 1S3
Sekvence č. 133 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 387 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence ě. 133
CCGCGCGGTC GATCAGCGAG CCAGGCAAAA ACTCCGTCGA GCCCGAGTCG ATGATGGTCA 60 CCCGGCGCAG CATCTGGCGA ACGATCACCT CGATGTGCTT GTCGTGGATC GACACACCTT 120 GGGCGCGGTA GACCTCCTGG ACCTCGCGAA CCAGGTGTAT CTGCACCTCG CGGGGGCCCT 180 GCACCCGCAG CACCTCATGC GGGTCGGCCG AGCCTTCCAT CAGCTGCTGG CCCACCTCGA 24 0 CGTGGTCGCC ATCGGAGAGC ACCCGTTCGG AACCGTCTTC GTGCTTGAAC ACCCGCAGCC 300 GCTGCCGCTT GGAGATCTTG TCGTAGACCA CTTCCTCACC GCCGTCGTCA GGAACGATGG 360 TGATCTTGTA GAACCGCTCG CCGTCCT 387
Sekvence ě. 134 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 389 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA
-61 CZ 303194 B6 (xi) Sekvence č. 134
GTTGAGCACG GCTATCCGAT TGTGCCGTTC GCTTCGGTGG GTGCTGAACA CGGCATCGAC 60 ATCGTGCTCG ACAACGAATC CCCACTGCTG GCACCGGTCC AGTTCCTCGC CGAGAAGCTG 12 0 CTCGGCACCA AAGACGGTCC GGCGCTGGTC CGTGGTGTCG GACTGACACC GGTACCGCGC 160 CCCGAACGGC AGTATTACTG GTTCGGCGAG CCAACCGACA CCACAGAGTT TATGGGGCAG 24 0 CAAGCCGACG ATAACGCCGC ACGCAGGGTG CGCGAGCGTG CCGCCGCCGC TATCGAACAC 300 GGCATCGAGC TGATGCTGGC CGAGCGCGCA GCCGATCCAA ATCGATCCCT GGTCGGACGG 36 0 CTCTTGCGCT CGGACGCCTA AGGCGCCCC 389
Sekvence č. 135 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 480 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence ě. 135
CCCGCGGTCG GAATGATCCC CGTCTCGTCG CGCGCCCATT TGATGCTGTT GATGAGCTGT 6 0 TTGGAGAAGC CCGGTTGGCG TACCGGTGAG CCGGAATATC TGTTGGAAGC GTCACCGGAT 12 0 GTNCACATGA ANTNCNTTGN CCCNGTNGCG GTNTTGGNTG NGGNAAACAC GTGTTGTNTA 180 AGCCTTGNTG GNCTCGNAAG NGCCGTNGAC GCCTGTGTCG CCGAAGATAA TGAGCACCTG 24 0 ACGGTTGGCG GGATCGCCGT TATCCCAAGG AATTCCGAGG TCGGTCCCGG AGATGCCGAA 3 00 GCGTTCCAGG GTCTTGTTGG GGCTGTCCGG TCCGGTCACC CACTCGGCGA GGGATGTGGN 360 AGCCCCGGCG AGCGTGGCAC CAGGATCCGG CGCCGCCGCC GGAGCAGGGT CGGNNGCTGN 42 0 NCTGNNTTCC TNNNGCCNAA TTNNACTCCN NCNACAANCT TGNNNCCGAC TCNNACCCGN 480
Sekvence č. 136 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 587 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 136
GCACGAGGCT ACCGGCGCGT CGCCCGCGAT GCCCTGGATG CACGCGTAGC CACCCGTNCA 60 TNCAGCGGGT CAGCCGCCGC GTCCGGGCTT AACGCTATAG CAGCTGCAAA CAACCCAGCG 120 CCGGCAATTA CTTTGATGTT GAACCGATGA CCATNGCCTN CGNGTNCAAT CTCNTCTCTT 180 NGCGCGCCNC TATTTNNGCC ATANATTTGG TTNNANNCGN AACGCTAGAC GTATCGAGTT 24 0 CCTTTTCGAC CACCGGCTCA ATTGTCAGCA TCCTATGGGG AACATGAGCC CCGCCGCACC 300 GGGCCGTTTC CAAATGGTGA CGTCACAACG GTGTCACAAG CCAGCGCAAT GTCCGCGGTA 360 GGGACGCGGC GGCTGGGATC GGTGGGGTGA GCGCCCGGCT TCTCAAAGCG AGGGGAGCCC 420 CGGGACTCTT ACCGGCCGAA GC-CGGCGGGT GTCACTGATC TAGGCTGACG GCCAGTGGTT 4 80 GNTNAGCCAA CAAGGATGAC NACAAATAAN CCGAGGANAG ACANGNGACG GNCCGANANG 54 0 CTNANCCGGN NTTGNNCNAA NNNNACNCAC TTNTACCGNN CTTATGN 5B7
Sekvence č. 137 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1200 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence ě. 137
62CZ 303194 B6
CAGGCATGAG CAGAGCGTTC ATCATCGATC CAACGATCAG TGCCATTGAC GGCTTGTACG 60
ACCTTCTGGG GATTGGAATA CCCAACCAAG GGGGTATCCT TTACTCCTCA CTAGAGTACT 120
TCGAAAAAGC CCTGGAGGAG CTGGCAGCAG CGTTTCCGGG TGATGGCTGG TTAGGTTCGG ISO
CCGCGGACAA ATACGCCGGC AAAAACCGCA ACCACGTGAA TTTTTTCCAG GAACTGGCAG 240
ACCTCGATCG TCAGCTCATC AGCCTGATCC ACGACCAGGC CAACGCGGTC CAGACGACCC 300
GCGACATCCT GGAGGGCGCC AAGAAAGGTC TCGAGTTCGT GCGCCCGGTG GCTGTGGACC 360
TGACCTACAT CCCGGTCGTC GGGCACGCCC TATCGGCCGC CTTCCAGGCG CCGTTTTGCG 420
CGGGCGCGAT GGCCGTAGTG GGCGGCGCGC TTGCCTACTT GGTCGTGAAA ACGCTGATCA 4θ0
ACGCGACTCA ACTCCTCAAA TTGCTTGCCA AATTGGCGGA GTTGGTCGCG GCCGCCATTG 540
CGGACATCAT TTCGGATGTG GCGGACATCA TCAAGGGCAC CCTCGGAGAA GTGTGGGAGT 600
TCATCACAAA CGCGCTCAAC GGCCTGAAAG AGCTTTGGGA CAAGCTCACG GGGTGGGTGA 66 0
CCGGACTGTT CTCTCGAGGG TGGTCGAACC TGGAGTCCTT CTTTGCGGGC GTCCCCGGCT 72 0
TGACCGGCGC GACCAGCGGC TTGTCGCAAG TGACTGGCTT GTTCGGTGCG GCCGGTCTGT 78 0
CCGCATCGTC GGGCTTGGCT CACGCGGATA GCCTGGCGAG CTCAGCCAGC TTGCCCGCCC 84 0
TGGCCGGCAT TGGGGGCGGG TCCGGTTTTG GGGGCTTGCC GAGCCTGGCT CAGGTCCATG 900
CCGCCTCAAC TCGGCAGGCG CTACGGCCCC GAGCTGATGG CCCGGTCGGC GCCGCTGCCG 960
AGCAGGTCGG CGGGCAGTCG CAGCTGGTCT CCGCGCAGGG TTCCCAAGGT ATGGGCGGAC 1020
CCGTAGGCAT GGGCGGCATG CACCCCTCTT CGGGGGCGTC GAAAGGGACG ACGACGAAGA 1080
AGTACTCGGA AGGCGCGGCG GCGGGCACTG AAGACGCCGA GCGCGCGCCA GTCGAAGCTG 114 0
ACGCGGGCGG TGGGCAAAAG GTGCTGGTAC GAAACGTCGT CTAACGGCAT GGCGAGCCAA 1200
Sekvence č. 138 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 392 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární io (ii) Typ molekuly: protein (xi) Sekvence č. 138
-63CZ 303194 B6
Met 1 Se r Arg Ala Phe 5 Ile Ile Asp Pro Thr 10 Ile Ser Ala Ile Asp 15 Gly
Leu Tyr Asp Lea Leu Gly :i~. Gly Ile Pro Asr. Gin Gly Gly Ile Leu
20 25 30
Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala
35 40 45
Ala Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala
50 55 60
Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gin Glu Leu Ala Asp Leu
65 70 75 60
Asp Arg Gin Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gin Ala Asn Ala Val Gin
85 90 95
Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val
100 105 110
Arg Pro Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala
115 120 12S
Leu Ser Al a Ala Phe Gin Ala Pro Phe Cys Ala Gly Ala Met Ala Val
130 135 140
Val Gly Gly Ala Leu Ala Tyr Leu Val Val Lys Thr Leu Ile Asn Ala
145 150 155 160
Thr Gin Leu Leu Lys Leu Leu Ala Lys Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala
165 170 175
Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser Asp Val Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr
180 185 190
Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys
195 200 205
Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg
210 21S 220
Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Ala Gly Val Pro Gly Leu Thr
225 230 235 240
Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gin Val Thr Gly Leu Phe • Gly Ala Ala
24S 250 255
Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala His Ala Asp Ser Leu Ala Ser
260 265 270
Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe
275 280 285
Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gin Val His Ala Ala Ser Thr Arg Gin
290 295 300
Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro Val Gly Ala Ala Ala Glu Gin
305 310 315 320
Val Gly Gly Gin Ser Gin Leu Val Ser Ala Gin Gly Ser Gin Gly Met
325 330 335
Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met HiS Pro Ser Ser Gly Ala Ser
340 345 350
Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser Glu Gly Ala Ala Ala Gly Thr
355 360 365
Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu Ala Asp Ala Gly Gly Gly Gin
370 375 380
Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val 385 390
Sekvence č. 139 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 439 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý
-64CZ 303194 B6 (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 139
ACGTTTACCC ATGCCGTCGG TGCAGAGCAA CGCCAGACAA CACAAAGTAG TCTAATTCCG 6 0
TTATAAAGCA GACATTTCCG TGGTTATGTA GAAGATGTCG ACCGATCAGA TGAAGCGA7C 12 0
CGCGTCAGGT GGTATCCGAT GTCTTTTGTG ACCATCCAGC CGGTGGTCTT GGCAGCCGCG 18 0
ACGGGGGACT TGCCGACGAT CGGTACCGCC GTGAGTGCTC GGAACACAGC CGTCTGTGCC 24 0
CCGACGACGG GGGTGTTACC CCCTGCTGCC AATGACGTGT CGGTCCTGAC GGCGGCCCGG 3 00
TTCACCGCGC ACACCAAGCA CTACCGAGTG GTGAGTAAGC CGGCCGCGCT GGTCCATGGC 3 60
ATGTTCGTGG CCCTCCCGGC GGCCACCGCC GATGCGTATG CGACCACCGA GGCCGTCAAT 420
GTGGTCGCGA CCGGTTAAG 4 3 9
Sekvence č. 140 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 1441 párů bází (B) Typ: nukleová kyselina io (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: cDNA (xi) Sekvence č. 140
GAGGTTGCTG GCAATGGATT TCGGGCTTTT ACCTCCGGAA GTGAATTCAA GCCGAATGTA 6 0 TTCCGGTCCG GGGCCGGAGT CGATGCTAGC CGCCGCGGCC GCCTGGGACG GTGTGGCCGC 12 0 GGAGTTGACT TCCGCCGCGG TCTCGTATGG ATCGGTGGTG TCGACGCTGA TCGTTGAGCC 18 0
GTGGATGGGG CCGGCGGCGG CCGCGATGGC GGCCGCGGCA ACGCCGTATG TGGGGTGGCT 240 GGCCGCCACG GCGGCGCTGG CGAAGGAGAC GGCCACACAG GCGAGGGCAG CGGCGGAAGC 300 GTTTGGGACG GCGTTCGCGA TGACGGTGCC ACCATCCCTC GTCGCGGCCA ACCGCAGCCG 360 GTTGATGTCG CTGGTCGCGG CGAACATTCT GGGGCAAAAC AGTGCGGCGA TCGCGGCTAC 4 20 CCAGGCCGAG TATGCCGAAA TGTGGGCCCA AGACGCTGCC GTGATGTACA GCTATGAGGG 4 80 GGCATCTGCG GCCGCGTCGG CGTTGCCGCC GTTCACTCCA CCCGTGCAAG GCACCGGCCC 54 0 GGCCGGGCCC GCGGCCGCAG CCGCGGCGAC CCAAGCCGCC GGTGCGGGCG CCGTTGCGGA 6 00 TGCACAGGCG ACACTGGCCC AGCTGCCCCC GGGGATCCTG AGCGACATTC TGTCCGCATT 66 0 GGCCGCCAAC GCTGATCCGC TGACATCGGG ACTGTTGGGG ATCGCGTCGA CCCTCAACCC 72 0 GCAAGTCGGA TCCGCTCAGC CGATAGTGAT CCCCACCCCG ATAGGGGAAT TGGACGTGAT 7 80 CGCGCTCTAC ATTGCATCCA TCGCGACCGG CAGCATTGCG CTCGCGATCA CGAACACGGC 84 0 CAGACCCTGG CACATCGGCC TATACGGGAA CGCCGGCGGG CTGGGACCGA CGCAGGGCCA 900 TCCACTGAGT TCGGCGACCG ACGAGCCGGA GCCGCACTGG GGCCCCTTCG GGGGCGCGGC 96 0 GCCGGTGTCC GCGGGCGTCG GCCACGCAGC ATTAGTCGGA GCGTTGTCGG TGCCGCACAG 102 0 CTGGACCACG GCCGCCCCGG AGATCCAGCT CGCCGTTCAG GCAACACCCA CCTTCAGCTC 10 8 0 CAGCGCCGGC GCCGACCCGA CGGCCCTAAA CGGGATGCCG GCAGGCCTGC TCAGCGGGAT 114 0 GGCTTTGGCG AGCCTGGCCG CACGCGGCAC GACGGGCGGT GGCGGCACCC GTAGCGGCAC 12 00 CAGCACTGAC GGCCAAGAGG ACGGCCGCAA ACCCCCGGTA GTTGTGATTA GAGAGCAGCC 12 6 0 GCCGCCCGGA AACCCCCCGC GGTAAAAGTC CGGCAACCGT TCGTCGCCGC GCGGAAAATG 13 2 0 CCTGGTGAGC GTGGCTATCC GACGGGCCGT TCACACCGCT TGTAGTAGCG TACGGCTATG 1380 GACGACGGTG TCTGGATTCT CGGCGGCTAT CAGAGCGATT TTGCTCGCAA CCTCAGCAAA 144 0 G 144 1
Sekvence č, 141 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 99 aminokyselin 20 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi) Sekvence Č. 141
-65CZ 303194 B6
Met 1 Ser Phe Val Thr 5 Ile Gin Pro Val val 10 Leu Ala Ala Ala Thr 15 Gly
Asp Leu Pro Thr Ile Gly Thr Ala Val Ser Ala Arg Asn Thr Ala Val
20 25 30
Cys Ala Pro Thr Thr Gly Val Leu Pro Pro Ala Ala Asn Asp Val Ser
35 40 45
Val Leu Thr Ala Ala Arg Phe Thr Ala His Thr Lys HiS Tyr Arg Val
50 55 60
Val Ser Lys Pro Ala Ala Leu Val His Gly Met Phe Val Ala Leu Pro
65 70 75 80
Al a Ala Thr Ala Asp Ala Tyr Ala Thr Thr Glu Ala Val Asn Val Val
85 90 95
Ala Thr Gly
Sekvence č. 142 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 423 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein io (xi) Sekvence č. 142
Met 1 Asp Phe Gly Leu 5 Leu Pro Pro Glu Val 10 Asn Ser Ser Arg Met Tyr 15
Ser Gly Pro Gly Pro Glu Ser Met Leu Ala Ala Ala Ala Ala Trp Asp
20 2$ 30
Gly Val Ala Ala Glu Leu Thr Ser Ala Ala Val Ser Tyr Gly Ser Val
35 40 45
Val Ser Thr Leu Ile Val Glu Pro Trp Met Gly Pro Ala Ala Ala Ala
50 55 60
Met Ala Ala Ala Ala Thr Pro Tyr Val Gly Trp Leu Ala Ala Thr Ala
65 70 75 80
Ala Leu Ala Lys Glu Thr Ala Thr Gin Ala Arg Ala Ala Ala Glu Ala
85 90 95
Phe Glv Thr Ala Phe Ala Met Thr Val Pro Pro Ser Leu Val Ala Ala
100 105 110
Asn Arg Ser Arg Leu Met Ser Leu Val Ala Ala Asn Ile Leu Gly Gin
115 120 125
Asn Ser Ala Ala Ile Ala Ala Thr Gin Ala Glu Tyr Ala Glu Met Trp
130 135 140
Ala Gin Asp Ala Ala Val Met Tyr Ser Tyr Glu Gly Ala Ser Ala Ala
145 150 155 160
Ala Ser Ala Leu Pro Pro Phe Thr Pro Pro Val Gin Gly Thr Gly Pro
165 170 175
Ala Glv Pro Ala Ala Ala Ala Ala Ala Thr Gin Ala Ala Gly Al a Gly
180 18S 190
Ala Val Ala ASp Ala Gin Ala Thr Leu Ala Gin Leu Pro Pro Gly Ile
195 200 20S
Leu Ser Asp Zle Leu Ser Ala Leu Ala Ala Asn Ala Asp Pro Leu Thr
210 215 220
Ser Gly Leu Leu Glv Ile Ala Ser Thr Leu Asn Pro Gin Val Gly Ser
225 230 235 240
Ala Gin Pro Ile Val Ile Pro Thr Pro Ile Gly Glu Leu Asp Val Ile
245 250 2S5
Ala Leu Tyr Ile Ala Ser Ile Ala Thr Gly Ser Ile Ala Leu Ala ile
260 26S 270
Thr Asn Thr Ala Arg Pro Trp His Ile Gly Leu Tyr Gly Asn Ala Gly
275 280 285
Gly Leu Gly Pro Thr Gin Gly His Pro Leu Ser Ser Ala Thr Asp Glu
290 295 300
Pro Glu Pro His Trp Gly Pro Phe Gly Gly Ala Ala Pro Val Ser Ala
305 310 315 320
Gly Val Gly His Ala Ala Leu Val Gly Ala Leu Ser Val Pro His Ser
32S 330 335
Trp Thr Thr Ala Ala Pro Glu Ile Gin Leu Ala Val Gin Ala Thr Pro
340 345 3 50
Thr Phe Ser Ser Ser Ala Gly Ala Asp Pro Thr Ala Leu Asn Gly Met
355 360 365
Pro Ala Gly Leu Leu. Ser Gly Met Ala Leu Ala Ser Leu Ala Ala Arg
370 37S 380
Gly Thr Thr Gly ' Gly Gly ' Gly Thr Arg Ser Gly Thr Ser Thr Asp Gly
385 390 395 400
Gin Glu Asp Gly Arg f Lys Pro Pro Val Val Val Ile Arg Glu Gin Pro
405 410 415
Pro Pro Gly Asn Prc > Pro Arg
420
-67CZ 303194 B6
Sekvence č. 143 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 97 aminokyselin 5 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi) Sekvence č. 143
Met Ser Leu Leu Asp Ala His Ile Pro Gin Leu Val Ala Ser Gin Ser
1 5 10 15
Ala Phe Ala Ala Lvs Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gin Ala
20 25 30
Glu Gin Ala Ala Mec Ser Ala Gin Ala Phe His Gin Gly Glu Ser Ser
35 40 45
Ala Ala Phe Gin Ala Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys
50 55 60
Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Ala Gin Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala
65 70 75 80
Gly Thr Tyr Val Ala Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ser Thr Tyr Thr Gly
90 95
Sekvence č. 144 (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 99 aminokyselin 15 (B) Typ: aminokyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: protein (xi) Sekvence č. 144
Cys Arg Leu Cys Leu Asp Ser His Leu Arg Val Val Ala Leu Pro Ala
1 5 10 15
Gly Gin Pro Gly Arg Leu Val Gin Ala Ile Gly Pro Ala Gin Glu Arg
20 25 30
Asp Val Gly Gin Thr Arg Cys Thr Arg Thr Gly Leu Asp Xaa Val Ser
35 40 45
Ala Leu Thr Ala Ala Gin Phe Ala Ala His Ala Gin Ile Tyr Gin Ala
50 55 60
Val Ser Ala Gin Ala Ala Ala Ile His Glu Met Phe Val Asn Thr Leu
70 75 80
Gin Xaa Xaa Ser Gly Ser Tyr Ala Ala Thr Glu Ala Ala Asn Ala Ala
90 95
Ala Ala Gly
-68CZ 303194 B6

Claims (5)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    5 1. Izolovaný polypeptid obsahující
    i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138, ii) imunogenní variantu sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí číslo 138 nebo iii) imunogenní část aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin, io pro použití jako léčivo.
  2. 2. Izolovaný polypeptid podle nároku 1, obsahující
    i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138 nebo ii) imunogenní variantu sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích
    15 a/nebo modifikacích, a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí číslo 138.
  3. 3. Izolovaný polypeptid podle nároku 2, kde varianta je alespoň z 95 % identická se sekvencí číslo 138.
    ?.o
  4. 4. Izolovaný polypeptid podle nároku 1, skládající se z
    i) aminokyselinové sekvence číslo 138 nebo ii) imunogenní varianty sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích, a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí číslo 138.
    25 5. Izolovaný polypeptid podle nároku 4, kde varianta je alespoň z 95 % identická se sekvencí číslo 138.
    6. Izolovaný polypeptid podle nároku 1, obsahující i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138 nebo
    30 ii) imunogenní část aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin.
    7. Izolovaný polypeptid podle nároku 6, skládající se z
    i) aminokyselinové sekvence číslo 138 nebo ii) imunogenní části aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin.
    8. Izolovaný polypeptid podle nároku 1, obsahující aminokyselinovou sekvenci číslo 138.
    9. Izolovaný polypeptid podle nároku 8, skládající se z aminokyselinové sekvence číslo 138.
    40 10. Fúzní protein obsahující polypeptid podle některého z nároků 1 až 9 a druhý Mycobacterium tuberculosis antigen pro použití jako léčivo.
    11. Izolovaná DNA molekula obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid obsahující i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138 nebo
    45 ii) imunogenní variantu sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích, a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí číslo 138, nebo iii) imunogenní část aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin, pro použití jako léčivo.
    -69CZ 303194 B6
    12. Izolovaná DNA molekula podle nároku 11, obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid obsahující
    i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138 nebo ii) imunogenní variantu sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích 5 a/nebo modifikacích, a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí číslo 138.
    13. Izolovaná DNA molekula podle nároku 11, obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid obsahující
    i) aminokyselinovou sekvenci číslo 138 nebo io ii) imunogenní část aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin.
    14. Izolovaná DNA molekula podle nároku 11, obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci číslo 138.
    t5 15. Izolovaná DNA molekula podle nároku 12, obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid skládající se z
    i) aminokyselinové sekvence číslo 138 nebo ii) imunogenní varianty sekvence číslo 138, která se liší pouze v konzervativních substitucích a/nebo modifikacích, a kde varianta je alespoň z 90 % identická se sekvencí číslo 138.
    16. Izolovaná DNA molekula podle nároku 13, obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid skládající se z
    i) aminokyselinové sekvence Číslo 138 nebo i i) imunogenní části aminokyselinové sekvence číslo 138 mající délku alespoň 9 aminokyselin.
    17. Izolovaná DNA molekula podle nároku 13, obsahující nukleotidovou sekvenci kódující polypeptid skládající se z aminokyselinové sekvence číslo 138.
    18. DNA molekula obsahující nukleotidovou sekvenci kódující fúzní protein podle nároku 10, 30 pro použití jako léčivo.
    19. Farmaceutický prostředek, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden polypeptid podle některého z nároků 1 až 9 a fyziologicky přijatelný nosič.
    35 20. Farmaceutický prostředek, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden fúzní protein podle nároku 10 a fyziologicky přijatelný nosič.
    21. Farmaceutický prostředek, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jednu DNA molekulu podle některého z nároků 11 až 17 a fyziologicky přijatelný nosič.
    22. Farmaceutický prostředek, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jednu DNA molekulu podle nároku 18 a fyziologicky přijatelný nosič.
    23. Farmaceutický prostředek podle některého z nároků 19 až 22, vyznačující se tím, 45 že obsahuje dále Mycobacterium tuberculosis antigen.
    24. Vakcína obsahující zesilovač nespecifické imunitní odpovědi a antigen, vyznačující se t í m, že antigen je alespoň jeden polypeptid podle některého z nároků 1 až 9.
    50 25. Vakcína obsahující zesilovač nespecifické imunitní odpovědi a antigen, vyznačující se t í m, že antigen je alespoňjeden fúzní protein podle nároku 10.
    -70CZ 303194 B6
    26. Vakcína obsahující zesilovač nespecifické imunitní odpovědi a alespoň jednu DNA sekvenci kódující antigen, vyznačující se tím, že DNA sekvence kódující antigen je DNA molekula podle některého z nároků 11 až 17.
  5. 5 27. Vakcína obsahující zesilovač nespecifické imunitní odpovědi a alespoň jednu DNA sekvenci kódující antigen, vyznačující se tím, že DNA sekvence kódující antigen je DNA molekula podle nároku 18.
    28. Vakcína podle některého z nároků 24 až 27, vyznačující se tím, že zesilovač io nespecifické imunitní odpovědi je adjuvant.
    29. Použití polypeptidu podle některého z nároků 1 až 9, fúzního proteinu podle nároku 10 nebo DNA molekuly podle některého z nároků 11 až 18 pro přípravu farmaceutického prostředku pro vyvolání ochranné imunitní odpovědi u pacienta.
    30. Použití polypeptidu podle některého z nároků 1 až 9, fúzního proteinu podle nároku 10 nebo DNA molekuly podle některého z nároků 11 až 18 nebo farmaceutického přípravku podle některého z nároků 19 až 23 pro přípravu vakcíny pro vyvolání ochranné imunitní odpovědi u pacienta.
    31. Diagnostický kit pro detekci tuberkulózy, vyznačující se tím, že obsahuje polypeptid podle některého z nároků 1 až 9 nebo fúzní protein podle nároku 10, a aparát dostatečný ke kontaktu polypeptidu s kožními buňkami pacienta za účelem vyvolání ochranné imunitní odpovědi na kůži pacienta.
    25
    32. Diagnostický kit podle nároku 31, vyznačující se tím, že imunitní odpovědí je indurace.
CZ20080478A 1997-05-20 1998-05-20 Izolovaný polypeptid, fúzní protein a DNA izolovaná molekula, pro použití jako léciva pro imunolécbu a diagnostikování tuberkulózy, vakcína, farmaceutický prostredek a kit je obsahující CZ303194B6 (cs)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US85938197A 1997-05-20 1997-05-20
US09/073,010 US6613881B1 (en) 1997-05-20 1998-05-05 Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ303194B6 true CZ303194B6 (cs) 2012-05-23

Family

ID=26754016

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20080478A CZ303194B6 (cs) 1997-05-20 1998-05-20 Izolovaný polypeptid, fúzní protein a DNA izolovaná molekula, pro použití jako léciva pro imunolécbu a diagnostikování tuberkulózy, vakcína, farmaceutický prostredek a kit je obsahující
CZ0410099A CZ300866B6 (cs) 1997-05-20 1998-05-20 Izolovaný polypeptid, fúzní protein, DNA molekula, farmaceutický prostredek a vakcína je obsahující, jejich použití a diagnostický kit

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ0410099A CZ300866B6 (cs) 1997-05-20 1998-05-20 Izolovaný polypeptid, fúzní protein, DNA molekula, farmaceutický prostredek a vakcína je obsahující, jejich použití a diagnostický kit

Country Status (20)

Country Link
US (1) US6613881B1 (cs)
EP (4) EP1012293B1 (cs)
JP (4) JP4162155B2 (cs)
KR (4) KR100893118B1 (cs)
AT (1) ATE420180T1 (cs)
AU (1) AU742751B2 (cs)
BR (1) BR9809445A (cs)
CA (2) CA2783134A1 (cs)
CZ (2) CZ303194B6 (cs)
DE (1) DE69840449D1 (cs)
DK (1) DK1012293T3 (cs)
ES (1) ES2321039T3 (cs)
HU (1) HU226520B1 (cs)
IL (2) IL133056A0 (cs)
NO (4) NO324880B1 (cs)
NZ (1) NZ501310A (cs)
PL (1) PL191121B1 (cs)
PT (1) PT1012293E (cs)
TR (1) TR200000115T2 (cs)
WO (1) WO1998053075A2 (cs)

Families Citing this family (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6991797B2 (en) 1993-07-02 2006-01-31 Statens Serum Institut M. tuberculosis antigens
US6458366B1 (en) 1995-09-01 2002-10-01 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
US6290969B1 (en) * 1995-09-01 2001-09-18 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
US6592877B1 (en) * 1995-09-01 2003-07-15 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
US6982085B2 (en) 1997-04-02 2006-01-03 Statens Serum Institut TB diagnostic based on antigens from M. tuberculosis
US7037510B2 (en) 1997-04-18 2006-05-02 Statens Serum Institut Hybrids of M. tuberculosis antigens
WO1998055495A2 (en) * 1997-06-06 1998-12-10 Dynavax Technologies Corporation Immunostimulatory oligonucleotides, compositions thereof and methods of use thereof
AU750173B2 (en) * 1997-11-10 2002-07-11 Statens Serum Institut Nucleic acid fragments and polypeptide fragments derived from M. tuberculosis
JP4633931B2 (ja) 1998-11-04 2011-02-16 アイシス イノヴェイション リミテッド 結核診断試験
US20030027774A1 (en) * 1999-03-18 2003-02-06 Ronald C. Hendrickson Tuberculosis antigens and methods of use therefor
US8143386B2 (en) * 1999-04-07 2012-03-27 Corixa Corporation Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis antigens and their uses
AU779495B2 (en) * 1999-07-13 2005-01-27 Statens Serum Institut Tuberculosis vaccine and diagnostics based on the mycobacterium tuberculosis esat-6 gene family
JP2003510370A (ja) 1999-10-07 2003-03-18 コリクサ コーポレイション Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓの融合タンパク質
US6316205B1 (en) 2000-01-28 2001-11-13 Genelabs Diagnostics Pte Ltd. Assay devices and methods of analyte detection
AU2001241738A1 (en) * 2000-02-25 2001-09-03 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis and immunotherapy of tuberculosis
CA2405247A1 (en) * 2000-04-19 2001-10-25 Statens Serum Institut Tuberculosis antigens and methods of use thereof
DK2133100T3 (da) 2000-06-20 2012-01-23 Corixa Corp MTB32A-Antigen af Mycobacterium tuberculosis med inaktiveret aktivt sted og fusionsproteiner deraf
AU2003213118A1 (en) * 2002-02-15 2003-09-09 Corixa Corporation Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis
US7482116B2 (en) 2002-06-07 2009-01-27 Dna Genotek Inc. Compositions and methods for obtaining nucleic acids from sputum
US20050164168A1 (en) * 2003-03-28 2005-07-28 Cullum Malford E. Method for the rapid diagnosis of infectious disease by detection and quantitation of microorganism induced cytokines
US8475735B2 (en) * 2004-11-01 2013-07-02 Uma Mahesh Babu Disposable immunodiagnostic test system
KR101255870B1 (ko) 2004-11-16 2013-04-17 아에라스 글로벌 티비 백신 파운데이션 재조합 바이러스 벡터를 포함하는 다가 백신
EP1904848A2 (en) * 2005-04-29 2008-04-02 Fusion Antibodies Limited Assays for diagnosis of tuberculosis and uses thereof
BRPI0613168A2 (pt) 2005-07-01 2010-12-21 Forsyth Dental In Ry For Children Fa molécula de polipeptìdeo isolada; molécula de ácido nucléico isolada; vetor ou plasmìdeo; célula hospedeira; anticorpo; proteìna de fusão; método para estimular uma resposta imunogênica especìfica à tb em um indivìduo ou para prevenir ou reduzir a gravidade de doença causada pela tb; método para monitorar o tratamento da doença causada pela tb em um indivìduo; método de diagnóstico de doença causada pela tb em um indivìduo; método de distinção entre a doença causada pela tb e a imunidade à doença causada pela tb em um indivìduo; método para detecção da infecção por m. tuberculosis em uma amostra biológica; composição; kit para diagnóstico da presença ou da ausência de infecção por m. tuberculosis em uma pessoa; e composição farmacêutica
WO2007041539A1 (en) * 2005-09-30 2007-04-12 Transcutaneous Technologies, Inc. Iontophoresis apparatus and method for the diagnosis of tuberculosis
EP2441470B1 (en) 2006-03-14 2014-05-07 Oregon Health and Science University Methods for producing an immune response to tuberculosis
LT2315597T (lt) 2008-07-25 2018-02-12 Glaxosmithkline Biologicals S.A. Naujos kompozicijos ir būdai
CN102165064B (zh) 2008-07-25 2017-06-20 葛兰素史密丝克莱恩生物有限公司 结核病rv2386c蛋白、组合物及其用途
PT2315773T (pt) * 2008-07-25 2016-11-23 Glaxosmithkline Biologicals Sa Polipéptidos, polinucleótidos e composições para utilização no tratamento de tuberculose latente
JP6010463B2 (ja) 2010-01-27 2016-10-19 グラクソスミスクライン バイオロジカルズ ソシエテ アノニム 改変された結核抗原
GB201012072D0 (en) * 2010-07-19 2010-09-01 Sec Dep For Environment Food A Diagnostic reagents
CN106442039B (zh) 2011-06-19 2020-08-07 阿博根公司 用于样品采集的装置、溶液和方法
CN114965989A (zh) * 2015-02-09 2022-08-30 Dna吉诺特克股份有限公司 用于采集相关应用、分析和诊断的样本的设备、溶液和方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1997009429A2 (en) * 1995-09-01 1997-03-13 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
WO1997009428A2 (en) * 1995-09-01 1997-03-13 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4751180A (en) 1985-03-28 1988-06-14 Chiron Corporation Expression using fused genes providing for protein product
US4689397A (en) 1985-08-12 1987-08-25 Scripps Clinic And Research Foundation Synthetic polypeptides for detecting mycobacterial infections
US4935233A (en) 1985-12-02 1990-06-19 G. D. Searle And Company Covalently linked polypeptide cell modulators
US4879213A (en) 1986-12-05 1989-11-07 Scripps Clinic And Research Foundation Synthetic polypeptides and antibodies related to Epstein-Barr virus early antigen-diffuse
US4952395A (en) 1987-02-26 1990-08-28 Scripps Clinic And Research Foundation Mycobacterial recombinants and peptides
US4976958A (en) * 1987-02-26 1990-12-11 Scripps Clinic And Research Foundation Mycobacterial recombinants and peptides
US6037135A (en) * 1992-08-07 2000-03-14 Epimmune Inc. Methods for making HLA binding peptides and their uses
US5330754A (en) 1992-06-29 1994-07-19 Archana Kapoor Membrane-associated immunogens of mycobacteria
NZ278270A (en) * 1993-12-23 1997-12-19 Pastoral Agric Res Inst Nz Ltd Mycobacteria virulence factor proteins and coding sequences and their use
AU706367B2 (en) * 1995-03-13 1999-06-17 Astra Aktiebolag New DNA molecules
US6290969B1 (en) * 1995-09-01 2001-09-18 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
TR199901569T2 (xx) * 1996-10-11 2000-12-21 Corixa Corporation T�berk�lozun te�hisi i�in bile�ikler ve y�ntemler.

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1997009429A2 (en) * 1995-09-01 1997-03-13 Corixa Corporation Compounds and methods for diagnosis of tuberculosis
WO1997009428A2 (en) * 1995-09-01 1997-03-13 Corixa Corporation Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
databaze UniProt, Ac. No. O06267, 1.7.1997 *

Also Published As

Publication number Publication date
HU226520B1 (en) 2009-03-30
CZ300866B6 (cs) 2009-08-26
KR100924475B1 (ko) 2009-11-03
HUP0003402A2 (hu) 2000-12-28
KR20010012812A (ko) 2001-02-26
AU7690798A (en) 1998-12-11
IL133056A0 (en) 2001-03-19
NZ501310A (en) 2001-09-28
PL337330A1 (en) 2000-08-14
ATE420180T1 (de) 2009-01-15
KR100652513B1 (ko) 2006-12-01
PL191121B1 (pl) 2006-03-31
PT1012293E (pt) 2009-04-08
KR20070026886A (ko) 2007-03-08
NO995689L (no) 2000-01-18
IL133056A (en) 2010-11-30
NO20075902L (no) 2000-01-18
KR100893118B1 (ko) 2009-04-14
WO1998053075A3 (en) 1999-04-01
NO20075900L (no) 2000-01-18
KR100909640B1 (ko) 2009-07-27
KR20080036663A (ko) 2008-04-28
JP2008253260A (ja) 2008-10-23
DE69840449D1 (de) 2009-02-26
EP2248900B1 (en) 2012-07-18
JP4764445B2 (ja) 2011-09-07
NO20075901L (no) 2000-01-18
NO995689D0 (no) 1999-11-19
NO324880B1 (no) 2007-12-27
EP2270170A1 (en) 2011-01-05
JP4759011B2 (ja) 2011-08-31
AU742751B2 (en) 2002-01-10
EP1012293B1 (en) 2009-01-07
JP4162155B2 (ja) 2008-10-08
WO1998053075A2 (en) 1998-11-26
JP2002514084A (ja) 2002-05-14
BR9809445A (pt) 2000-06-13
CA2783134A1 (en) 1998-11-26
HUP0003402A3 (en) 2001-03-28
EP1012293A2 (en) 2000-06-28
DK1012293T3 (da) 2009-05-04
JP2008245644A (ja) 2008-10-16
TR200000115T2 (tr) 2000-11-21
JP2008283961A (ja) 2008-11-27
EP2172551A3 (en) 2010-11-10
US6613881B1 (en) 2003-09-02
EP2270170B1 (en) 2013-11-06
EP2248900A1 (en) 2010-11-10
CA2290774A1 (en) 1998-11-26
KR20060066139A (ko) 2006-06-15
EP2172551A2 (en) 2010-04-07
ES2321039T3 (es) 2009-06-01
JP4759010B2 (ja) 2011-08-31
CZ410099A3 (cs) 2000-05-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6613881B1 (en) Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
US6555653B2 (en) Compounds for diagnosis of tuberculosis and methods for their use
US20020098200A1 (en) Compounds and methods for diagnosis and immunotherapy of tuberculosis
CA2337638A1 (en) Compounds and methods for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis
CA2405247A1 (en) Tuberculosis antigens and methods of use thereof
US5985287A (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of mycobacterial infections
US20020081579A1 (en) Method for the isolation of novel antigens
HK1150852A (en) Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
HK1148775A (en) Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
HK1142098A (en) Compounds for immunotherapy and diagnosis of tuberculosis and methods of their use
AU4258800A (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of mycobacterial infections

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20140520