HU219267B - Dna fragments coding for neisseria meningitidis transferrin receptor subunits and method for their preparation - Google Patents
Dna fragments coding for neisseria meningitidis transferrin receptor subunits and method for their preparation Download PDFInfo
- Publication number
- HU219267B HU219267B HU9301791A HU9301791A HU219267B HU 219267 B HU219267 B HU 219267B HU 9301791 A HU9301791 A HU 9301791A HU 9301791 A HU9301791 A HU 9301791A HU 219267 B HU219267 B HU 219267B
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- amino acid
- strain
- gly
- ser
- lye
- Prior art date
Links
- 239000012634 fragment Substances 0.000 title claims abstract description 94
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 title claims abstract description 38
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 title claims abstract description 30
- 102000007238 Transferrin Receptors Human genes 0.000 title claims abstract description 30
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 18
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims description 7
- 101150101515 tbpl2 gene Proteins 0.000 claims abstract description 61
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 58
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 52
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 claims abstract description 40
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 32
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 18
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 15
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 99
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 49
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 36
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 18
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 13
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 9
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 8
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims description 7
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims description 4
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 3
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 claims description 3
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 15
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 8
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims 7
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 claims 7
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 abstract description 20
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 abstract description 20
- 201000009906 Meningitis Diseases 0.000 abstract description 6
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 abstract description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 abstract description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 84
- ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N Tin Chemical compound [Sn] ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 61
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 51
- 241000272161 Charadriiformes Species 0.000 description 48
- BQYJATMQXGBDHF-UHFFFAOYSA-N difenoconazole Chemical compound O1C(C)COC1(C=1C(=CC(OC=2C=CC(Cl)=CC=2)=CC=1)Cl)CN1N=CN=C1 BQYJATMQXGBDHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 48
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N phenylalanine group Chemical group N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 43
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 38
- 230000006870 function Effects 0.000 description 30
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 19
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 18
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 17
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 15
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 14
- 101150080060 TBP2 gene Proteins 0.000 description 14
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 14
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 13
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 13
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 12
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 12
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 12
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 12
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 12
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 11
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 11
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 10
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 10
- 101100245206 Dictyostelium discoideum psmC4 gene Proteins 0.000 description 9
- PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 9
- MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 9
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 9
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 9
- 101150095556 tbpB gene Proteins 0.000 description 9
- HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N Ile-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 8
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 8
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 8
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 8
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 8
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 8
- 108010053037 kyotorphin Proteins 0.000 description 8
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 8
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N Arg-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 7
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 7
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 7
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 7
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 7
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 7
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 7
- UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N Glu-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 6
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 6
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 6
- TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N L-tryptophan-L-tyrosine Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 6
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 6
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 6
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N Tyr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 6
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 6
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 6
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 6
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 6
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 6
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 6
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 6
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 6
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 6
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 6
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 6
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 5
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- 101000766306 Homo sapiens Serotransferrin Proteins 0.000 description 5
- 241001435619 Lile Species 0.000 description 5
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 5
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 5
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 5
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 5
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 5
- QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 5
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 5
- JXNRXNCCROJZFB-RYUDHWBXSA-N Tyr-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 JXNRXNCCROJZFB-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 5
- DYEGCOJHFNJBKB-UFYCRDLUSA-N Tyr-Arg-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 DYEGCOJHFNJBKB-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 5
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 5
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 5
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 5
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 5
- XNSAINXGIQZQOO-SRVKXCTJSA-N protirelin Chemical compound NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)CC1=CN=CN1 XNSAINXGIQZQOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 5
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 5
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 5
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 4
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 4
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 4
- UQJNXZSSGQIPIQ-FBCQKBJTSA-N Gly-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN UQJNXZSSGQIPIQ-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 4
- DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 4
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 4
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 4
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- HGLKOTPFWOMPOB-MEYUZBJRSA-N Leu-Thr-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HGLKOTPFWOMPOB-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 4
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 4
- AGYXCMYVTBYGCT-ULQDDVLXSA-N Phe-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AGYXCMYVTBYGCT-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 4
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 4
- FSXRLASFHBWESK-HOTGVXAUSA-N Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 4
- WXUBSIDKNMFAGS-IHRRRGAJSA-N Ser-Arg-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WXUBSIDKNMFAGS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N Ser-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N 0.000 description 4
- PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N Ser-Thr-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 4
- BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N Thr-Glu Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 4
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 4
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 4
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 4
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N 0.000 description 4
- QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QAYSODICXVZUIA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 4
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- JAQGKXUEKGKTKX-HOTGVXAUSA-N Tyr-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 JAQGKXUEKGKTKX-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 4
- 108010024078 alanyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 4
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 4
- SYUXAJSOZXEFPP-UHFFFAOYSA-N glutin Natural products COc1c(O)cc2OC(=CC(=O)c2c1O)c3ccccc3OC4OC(CO)C(O)C(O)C4O SYUXAJSOZXEFPP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N glyclproline Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- 108010074027 glycyl-seryl-phenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- NABSCJGZKWSNHX-RCWTZXSCSA-N Arg-Arg-Thr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N NABSCJGZKWSNHX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- YBZMTKUDWXZLIX-UWVGGRQHSA-N Arg-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YBZMTKUDWXZLIX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- QHVRVUNEAIFTEK-SZMVWBNQSA-N Arg-Pro-Trp Chemical compound N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O QHVRVUNEAIFTEK-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 3
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MPZWMIIOPAPAKE-BQBZGAKWSA-N Glu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N MPZWMIIOPAPAKE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 3
- GGAPHLIUUTVYMX-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)C[NH3+])CC1=CC=CC=C1 GGAPHLIUUTVYMX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- JSLVAHYTAJJEQH-QWRGUYRKSA-N Gly-Ser-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JSLVAHYTAJJEQH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 3
- FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N Ile-Leu-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O)N FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 3
- QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N L-Prolyl-L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- LIINDKYIGYTDLG-PPCPHDFISA-N Leu-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LIINDKYIGYTDLG-PPCPHDFISA-N 0.000 description 3
- FAELBUXXFQLUAX-AJNGGQMLSA-N Leu-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C FAELBUXXFQLUAX-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 3
- XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N Leu-Leu-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 3
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N N-L-tyrosyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NPLGQVKZFGJWAI-QWHCGFSZSA-N Phe-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O NPLGQVKZFGJWAI-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 3
- VGTJSEYTVMAASM-RPTUDFQQSA-N Phe-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VGTJSEYTVMAASM-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 3
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- UQFYNFTYDHUIMI-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO UQFYNFTYDHUIMI-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N Ser-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- GYDFRTRSSXOZCR-ACZMJKKPSA-N Ser-Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GYDFRTRSSXOZCR-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- FVFUOQIYDPAIJR-XIRDDKMYSA-N Ser-Trp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CO)N FVFUOQIYDPAIJR-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N Ser-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OQSQCUWQOIHECT-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- VPZKQTYZIVOJDV-LMVFSUKVSA-N Thr-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VPZKQTYZIVOJDV-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 3
- XYEXCEPTALHNEV-RCWTZXSCSA-N Thr-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O XYEXCEPTALHNEV-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O LUMXICQAOKVQOB-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 3
- YOOAQCZYZHGUAZ-KATARQTJSA-N Thr-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YOOAQCZYZHGUAZ-KATARQTJSA-N 0.000 description 3
- IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N Thr-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N 0.000 description 3
- MUAFDCVOHYAFNG-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O MUAFDCVOHYAFNG-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 3
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 3
- KAFKKRJQHOECGW-JCOFBHIZSA-N Thr-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(O)=O)=CNC2=C1 KAFKKRJQHOECGW-JCOFBHIZSA-N 0.000 description 3
- IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N Trp-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 3
- HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N Tyr-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=C(O)C=C1 HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- ZPFLBLFITJCBTP-QWRGUYRKSA-N Tyr-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O ZPFLBLFITJCBTP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- ZZDYJFVIKVSUFA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O ZZDYJFVIKVSUFA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 3
- YAJCHEVQCOHZDC-QMMNLEPNSA-N actrapid Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H]2C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C=CC(O)=CC=3)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3N=CNC=3)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC1=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@H](C)O)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=O)CSSC[C@@H](C(N2)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)[C@H](C)CC)[C@H](C)CC)[C@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)C(N)=O)C1=CNC=N1 YAJCHEVQCOHZDC-QMMNLEPNSA-N 0.000 description 3
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 3
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- 101150097746 araB gene Proteins 0.000 description 3
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 3
- 108010043240 arginyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010000434 glycyl-alanyl-leucine Proteins 0.000 description 3
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 3
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 3
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 3
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 3
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 3
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 3
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 108700004896 tripeptide FEG Proteins 0.000 description 3
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 3
- GSJBKPNSLRKRNR-UHFFFAOYSA-N $l^{2}-stannanylidenetin Chemical compound [Sn].[Sn] GSJBKPNSLRKRNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PIPTUBPKYFRLCP-NHCYSSNCSA-N Ala-Ala-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PIPTUBPKYFRLCP-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N Arg-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- WVNFNPGXYADPPO-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Ser Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WVNFNPGXYADPPO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- COXMUHNBYCVVRG-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O COXMUHNBYCVVRG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- DPLFNLDACGGBAK-KKUMJFAQSA-N Arg-Phe-Glu Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N DPLFNLDACGGBAK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- MNBHKGYCLBUIBC-UFYCRDLUSA-N Arg-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MNBHKGYCLBUIBC-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 2
- ATABBWFGOHKROJ-GUBZILKMSA-N Arg-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ATABBWFGOHKROJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- RYQSYXFGFOTJDJ-RHYQMDGZSA-N Arg-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RYQSYXFGFOTJDJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 2
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 2
- IZUNQDRIAOLWCN-YUMQZZPRSA-N Cys-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N IZUNQDRIAOLWCN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 description 2
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- BUAKRRKDHSSIKK-IHRRRGAJSA-N Glu-Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 BUAKRRKDHSSIKK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- OAGVHWYIBZMWLA-YFKPBYRVSA-N Glu-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O OAGVHWYIBZMWLA-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- VGUYMZGLJUJRBV-YVNDNENWSA-N Glu-Ile-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VGUYMZGLJUJRBV-YVNDNENWSA-N 0.000 description 2
- ZHNHJYYFCGUZNQ-KBIXCLLPSA-N Glu-Ile-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O ZHNHJYYFCGUZNQ-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 2
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N Glu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- ZTVGZOIBLRPQNR-KKUMJFAQSA-N Glu-Met-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZTVGZOIBLRPQNR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- ITVBKCZZLJUUHI-HTUGSXCWSA-N Glu-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ITVBKCZZLJUUHI-HTUGSXCWSA-N 0.000 description 2
- RFTVTKBHDXCEEX-WDSKDSINSA-N Glu-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RFTVTKBHDXCEEX-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- JWNZHMSRZXXGTM-XKBZYTNZSA-N Glu-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWNZHMSRZXXGTM-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- MFVQGXGQRIXBPK-WDSKDSINSA-N Gly-Ala-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MFVQGXGQRIXBPK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N Gly-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VSVZIEVNUYDAFR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N Gly-Glu-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- KAJAOGBVWCYGHZ-JTQLQIEISA-N Gly-Gly-Phe Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KAJAOGBVWCYGHZ-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YWAQATDNEKZFFK-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- AFWYPMDMDYCKMD-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 AFWYPMDMDYCKMD-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- WSWWTQYHFCBKBT-DVJZZOLTSA-N Gly-Thr-Trp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O WSWWTQYHFCBKBT-DVJZZOLTSA-N 0.000 description 2
- FXTUGWXZTFMTIV-GJZGRUSLSA-N Gly-Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)CN FXTUGWXZTFMTIV-GJZGRUSLSA-N 0.000 description 2
- IROABALAWGJQGM-OALUTQOASA-N Gly-Trp-Tyr Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)NC(=O)CN IROABALAWGJQGM-OALUTQOASA-N 0.000 description 2
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- RCFDOSNHHZGBOY-ACZMJKKPSA-N Ile-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N Ile-Arg-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N 0.000 description 2
- LPFBXFILACZHIB-LAEOZQHASA-N Ile-Gly-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N LPFBXFILACZHIB-LAEOZQHASA-N 0.000 description 2
- IVXJIMGDOYRLQU-XUXIUFHCSA-N Ile-Pro-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IVXJIMGDOYRLQU-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 2
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- YBKKLDBBPFIXBQ-MBLNEYKQSA-N Ile-Thr-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)O)N YBKKLDBBPFIXBQ-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 2
- HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N L-arginyl-L-glutamic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N L-isoleucyl-L-alanine Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N Leu-Gly-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- GCXGCIYIHXSKAY-ULQDDVLXSA-N Leu-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GCXGCIYIHXSKAY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- YWKNKRAKOCLOLH-OEAJRASXSA-N Leu-Phe-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YWKNKRAKOCLOLH-OEAJRASXSA-N 0.000 description 2
- QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N Leu-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- CHJKEDSZNSONPS-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CHJKEDSZNSONPS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- SQUFDMCWMFOEBA-KKUMJFAQSA-N Leu-Ser-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SQUFDMCWMFOEBA-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- GZRABTMNWJXFMH-UVOCVTCTSA-N Leu-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZRABTMNWJXFMH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 2
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- OIFHHODAXVWKJN-ULQDDVLXSA-N Met-Phe-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OIFHHODAXVWKJN-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- HLZORBMOISUNIV-DCAQKATOSA-N Met-Ser-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HLZORBMOISUNIV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 2
- BRDYYVQTEJVRQT-HRCADAONSA-N Phe-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O BRDYYVQTEJVRQT-HRCADAONSA-N 0.000 description 2
- JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- GNRMAQSIROFNMI-IXOXFDKPSA-N Phe-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GNRMAQSIROFNMI-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- GCFNFKNPCMBHNT-IRXDYDNUSA-N Phe-Tyr-Gly Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)NCC(=O)O)N GCFNFKNPCMBHNT-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- CQZNGNCAIXMAIQ-UBHSHLNASA-N Pro-Ala-Phe Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O CQZNGNCAIXMAIQ-UBHSHLNASA-N 0.000 description 2
- NMELOOXSGDRBRU-YUMQZZPRSA-N Pro-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 NMELOOXSGDRBRU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- FEPSEIDIPBMIOS-QXEWZRGKSA-N Pro-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 FEPSEIDIPBMIOS-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 2
- HFNPOYOKIPGAEI-SRVKXCTJSA-N Pro-Leu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HFNPOYOKIPGAEI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- SUENWIFTSTWUKD-AVGNSLFASA-N Pro-Leu-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SUENWIFTSTWUKD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- GFHXZNVJIKMAGO-IHRRRGAJSA-N Pro-Phe-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GFHXZNVJIKMAGO-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- SPLBRAKYXGOFSO-UNQGMJICSA-N Pro-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O SPLBRAKYXGOFSO-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- GOMUXSCOIWIJFP-GUBZILKMSA-N Pro-Ser-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GOMUXSCOIWIJFP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- QKDIHFHGHBYTKB-IHRRRGAJSA-N Pro-Ser-Phe Chemical compound N([C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 QKDIHFHGHBYTKB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- ZYJMLBCDFPIGNL-JYJNAYRXSA-N Pro-Tyr-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O ZYJMLBCDFPIGNL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- QMABBZHZMDXHKU-FKBYEOEOSA-N Pro-Tyr-Trp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O QMABBZHZMDXHKU-FKBYEOEOSA-N 0.000 description 2
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Tyr Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- YIUWWXVTYLANCJ-NAKRPEOUSA-N Ser-Ile-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O YIUWWXVTYLANCJ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N Ser-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- MQUZANJDFOQOBX-SRVKXCTJSA-N Ser-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MQUZANJDFOQOBX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N Ser-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- DYEGLQRVMBWQLD-IXOXFDKPSA-N Ser-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O DYEGLQRVMBWQLD-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- ZWSZBWAFDZRBNM-UBHSHLNASA-N Ser-Trp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZWSZBWAFDZRBNM-UBHSHLNASA-N 0.000 description 2
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WFUAUEQXPVNAEF-ZJDVBMNYSA-N Thr-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CCCN=C(N)N WFUAUEQXPVNAEF-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 2
- AMXMBCAXAZUCFA-RHYQMDGZSA-N Thr-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AMXMBCAXAZUCFA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N Thr-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 2
- XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N Thr-Ser-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N)O XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- QYDKSNXSBXZPFK-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QYDKSNXSBXZPFK-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 2
- FBQHKSPOIAFUEI-OWLDWWDNSA-N Thr-Trp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FBQHKSPOIAFUEI-OWLDWWDNSA-N 0.000 description 2
- XGUAUKUYQHBUNY-SWRJLBSHSA-N Thr-Trp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XGUAUKUYQHBUNY-SWRJLBSHSA-N 0.000 description 2
- PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 2
- LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 2
- ICPRIGUXAFULPH-ILWGZMRPSA-N Trp-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CC3=CNC4=CC=CC=C43)N)C(=O)O ICPRIGUXAFULPH-ILWGZMRPSA-N 0.000 description 2
- IIJWXEUNETVJPV-IHRRRGAJSA-N Tyr-Arg-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)O IIJWXEUNETVJPV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- HIINQLBHPIQYHN-JTQLQIEISA-N Tyr-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 HIINQLBHPIQYHN-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- AZGZDDNKFFUDEH-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gly-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AZGZDDNKFFUDEH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- GGXUDPQWAWRINY-XEGUGMAKSA-N Tyr-Ile-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 GGXUDPQWAWRINY-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 2
- AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- CGWAPUBOXJWXMS-HOTGVXAUSA-N Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 CGWAPUBOXJWXMS-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 2
- LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N Tyr-Thr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 2
- AGDDLOQMXUQPDY-BZSNNMDCSA-N Tyr-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AGDDLOQMXUQPDY-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- KSGKJSFPWSMJHK-JNPHEJMOSA-N Tyr-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KSGKJSFPWSMJHK-JNPHEJMOSA-N 0.000 description 2
- RMRFSFXLFWWAJZ-HJOGWXRNSA-N Tyr-Tyr-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 RMRFSFXLFWWAJZ-HJOGWXRNSA-N 0.000 description 2
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010081404 acein-2 Proteins 0.000 description 2
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010069926 arginyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- PZZHMLOHNYWKIK-UHFFFAOYSA-N eddha Chemical compound C=1C=CC=C(O)C=1C(C(=O)O)NCCNC(C(O)=O)C1=CC=CC=C1O PZZHMLOHNYWKIK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 2
- 108010006664 gamma-glutamyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 125000000291 glutamic acid group Chemical group N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010050475 glycyl-leucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 2
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 2
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-M hexadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010051673 leucyl-glycyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 2
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 2
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 2
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 2
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 2
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 2
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 2
- 108010017949 tyrosyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BCOSEZGCLGPUSL-UHFFFAOYSA-N 2,3,3-trichloroprop-2-enoyl chloride Chemical compound ClC(Cl)=C(Cl)C(Cl)=O BCOSEZGCLGPUSL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IPAMZHCXCQLRJR-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-amino-3-methylbutanoyl)amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]-4-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(N)C(C)C IPAMZHCXCQLRJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XWTNPSHCJMZAHQ-QMMMGPOBSA-N 2-[[2-[[2-[[(2s)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]acetyl]amino]acetic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XWTNPSHCJMZAHQ-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 125000000022 2-aminoethyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])N([H])[H] 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HKJKONMZMPUGHJ-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-hydroxy-3-[(4-nitrophenyl)diazenyl]-6-phenyldiazenylnaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=C(N=NC=3C=CC=CC=3)C(O)=C2C(N)=C1N=NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 HKJKONMZMPUGHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DEXFNLNNUZKHNO-UHFFFAOYSA-N 6-[3-[4-[2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)pyrimidin-5-yl]piperidin-1-yl]-3-oxopropyl]-3H-1,3-benzoxazol-2-one Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C1CCN(CC1)C(CCC1=CC2=C(NC(O2)=O)C=C1)=O DEXFNLNNUZKHNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- DWYROCSXOOMOEU-CIUDSAMLSA-N Ala-Met-Glu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N DWYROCSXOOMOEU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OMNVYXHOSHNURL-WPRPVWTQSA-N Ala-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMNVYXHOSHNURL-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- NCQMBSJGJMYKCK-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NCQMBSJGJMYKCK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ALZVPLKYDKJKQU-XVKPBYJWSA-N Ala-Tyr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 ALZVPLKYDKJKQU-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- QRIYOHQJRDHFKF-UWJYBYFXSA-N Ala-Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=C(O)C=C1 QRIYOHQJRDHFKF-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- IASNWHAGGYTEKX-IUCAKERBSA-N Arg-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)NCC(O)=O IASNWHAGGYTEKX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N Arg-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- AUFHLLPVPSMEOG-YUMQZZPRSA-N Arg-Gly-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AUFHLLPVPSMEOG-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- SYAUZLVLXCDRSH-IUCAKERBSA-N Arg-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N SYAUZLVLXCDRSH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- ZZZWQALDSQQBEW-STQMWFEESA-N Arg-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZZZWQALDSQQBEW-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- QYLJIYOGHRGUIH-CIUDSAMLSA-N Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N QYLJIYOGHRGUIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- UAOSDDXCTBIPCA-QXEWZRGKSA-N Arg-Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UAOSDDXCTBIPCA-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LRPZJPMQGKGHSG-XGEHTFHBSA-N Arg-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O LRPZJPMQGKGHSG-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- AUZAXCPWMDBWEE-HJGDQZAQSA-N Arg-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AUZAXCPWMDBWEE-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N Arg-Thr-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MOGMYRUNTKYZFB-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- ZJBUILVYSXQNSW-YTWAJWBKSA-N Arg-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O ZJBUILVYSXQNSW-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 1
- INOIAEUXVVNJKA-XGEHTFHBSA-N Arg-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O INOIAEUXVVNJKA-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- DRDWXKWUSIKKOB-PJODQICGSA-N Arg-Trp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DRDWXKWUSIKKOB-PJODQICGSA-N 0.000 description 1
- XTWSWDJMIKUJDQ-RYUDHWBXSA-N Arg-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XTWSWDJMIKUJDQ-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N Arg-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DNYRZPOWBTYFAF-IHRRRGAJSA-N Asn-Arg-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O DNYRZPOWBTYFAF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- CJUKAWUWBZCTDQ-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-Lys Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O CJUKAWUWBZCTDQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LIJXJYGRSRWLCJ-IHRRRGAJSA-N Asp-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O LIJXJYGRSRWLCJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N Asp-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 101100136076 Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) pel1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100228196 Caenorhabditis elegans gly-4 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100228210 Caenorhabditis elegans gly-7 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- KKCUFHUTMKQQCF-SRVKXCTJSA-N Glu-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KKCUFHUTMKQQCF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N Glu-Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IQACOVZVOMVILH-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O IQACOVZVOMVILH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- QIQABBIDHGQXGA-ZPFDUUQYSA-N Glu-Ile-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QIQABBIDHGQXGA-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- ZSWGJYOZWBHROQ-RWRJDSDZSA-N Glu-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZSWGJYOZWBHROQ-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- UGSVSNXPJJDJKL-SDDRHHMPSA-N Glu-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N UGSVSNXPJJDJKL-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- WIKMTDVSCUJIPJ-CIUDSAMLSA-N Glu-Ser-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N WIKMTDVSCUJIPJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- RJIVPOXLQFJRTG-LURJTMIESA-N Gly-Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N RJIVPOXLQFJRTG-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N Gly-Glu-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N Gly-Glu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- BEQGFMIBZFNROK-JGVFFNPUSA-N Gly-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)CN)C(=O)O BEQGFMIBZFNROK-JGVFFNPUSA-N 0.000 description 1
- KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KMSGYZQRXPUKGI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- INLIXXRWNUKVCF-JTQLQIEISA-N Gly-Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 INLIXXRWNUKVCF-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- HMHRTKOWRUPPNU-RCOVLWMOSA-N Gly-Ile-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O HMHRTKOWRUPPNU-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N Gly-Ile-Leu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- UYPPAMNTTMJHJW-KCTSRDHCSA-N Gly-Ile-Trp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O UYPPAMNTTMJHJW-KCTSRDHCSA-N 0.000 description 1
- NSTUFLGQJCOCDL-UWVGGRQHSA-N Gly-Leu-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N NSTUFLGQJCOCDL-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- WMGHDYWNHNLGBV-ONGXEEELSA-N Gly-Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 WMGHDYWNHNLGBV-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- WZSHYFGOLPXPLL-RYUDHWBXSA-N Gly-Phe-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WZSHYFGOLPXPLL-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)C[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- LCRDMSSAKLTKBU-ZDLURKLDSA-N Gly-Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN LCRDMSSAKLTKBU-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- IMRNSEPSPFQNHF-STQMWFEESA-N Gly-Ser-Trp Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C12)C(=O)O IMRNSEPSPFQNHF-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- ZZWUYQXMIFTIIY-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ZZWUYQXMIFTIIY-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- FFALDIDGPLUDKV-ZDLURKLDSA-N Gly-Thr-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FFALDIDGPLUDKV-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- HQSKKSLNLSTONK-JTQLQIEISA-N Gly-Tyr-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 HQSKKSLNLSTONK-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- KOYUSMBPJOVSOO-XEGUGMAKSA-N Gly-Tyr-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O KOYUSMBPJOVSOO-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N Gly-Val-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- IZVICCORZOSGPT-JSGCOSHPSA-N Gly-Val-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IZVICCORZOSGPT-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- 238000003794 Gram staining Methods 0.000 description 1
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000798114 Homo sapiens Lactotransferrin Proteins 0.000 description 1
- KTGFOCFYOZQVRJ-ZKWXMUAHSA-N Ile-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O KTGFOCFYOZQVRJ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- WZDCVAWMBUNDDY-KBIXCLLPSA-N Ile-Glu-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N WZDCVAWMBUNDDY-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- TVSPLSZTKTUYLV-ZPFDUUQYSA-N Ile-Glu-Met Chemical compound N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O TVSPLSZTKTUYLV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- SPQWWEZBHXHUJN-KBIXCLLPSA-N Ile-Glu-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SPQWWEZBHXHUJN-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- JXMSHKFPDIUYGS-SIUGBPQLSA-N Ile-Glu-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N JXMSHKFPDIUYGS-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 1
- UCGDDTHMMVWVMV-FSPLSTOPSA-N Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O UCGDDTHMMVWVMV-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- CDGLBYSAZFIIJO-RCOVLWMOSA-N Ile-Gly-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O CDGLBYSAZFIIJO-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)[C@@H](C)CC BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N 0.000 description 1
- YNMQUIVKEFRCPH-QSFUFRPTSA-N Ile-Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)O)N YNMQUIVKEFRCPH-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N Ile-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N TWPSALMCEHCIOY-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N Ile-Leu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- TUYOFUHICRWDGA-CIUDSAMLSA-N Ile-Met Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCSC TUYOFUHICRWDGA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WMDZARSFSMZOQO-DRZSPHRISA-N Ile-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 WMDZARSFSMZOQO-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZLFNNVATRMCAKN-ZKWXMUAHSA-N Ile-Ser-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)O)N ZLFNNVATRMCAKN-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N Ile-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 BVRPESWOSNFUCJ-LKTVYLICSA-N 0.000 description 1
- RMJWFINHACYKJI-SIUGBPQLSA-N Ile-Tyr-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N RMJWFINHACYKJI-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 1
- PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N Ile-Tyr-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)NCC(=O)O)N PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N Ile-Tyr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 241000546112 Infectious salmon anemia virus Species 0.000 description 1
- LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N L-leucine-L-tyrosine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LHSGPCFBGJHPCY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010063045 Lactoferrin Proteins 0.000 description 1
- 102000010445 Lactoferrin Human genes 0.000 description 1
- WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N Leu-Ala-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XBBKIIGCUMBKCO-JXUBOQSCSA-N Leu-Ala-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XBBKIIGCUMBKCO-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N Leu-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N Leu-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- UCDHVOALNXENLC-KBPBESRZSA-N Leu-Gly-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 UCDHVOALNXENLC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- AVEGDIAXTDVBJS-XUXIUFHCSA-N Leu-Ile-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AVEGDIAXTDVBJS-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- JDBQSGMJBMPNFT-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JDBQSGMJBMPNFT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IRMLZWSRWSGTOP-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IRMLZWSRWSGTOP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MVHXGBZUJLWZOH-BJDJZHNGSA-N Leu-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MVHXGBZUJLWZOH-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- HWMQRQIFVGEAPH-XIRDDKMYSA-N Leu-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 HWMQRQIFVGEAPH-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N Leu-Thr-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- VDIARPPNADFEAV-WEDXCCLWSA-N Leu-Thr-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O VDIARPPNADFEAV-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- KLSUAWUZBMAZCL-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KLSUAWUZBMAZCL-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- FPPCCQGECVKLDY-IHRRRGAJSA-N Leu-Val-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C FPPCCQGECVKLDY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 241000208202 Linaceae Species 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N Lys-Glu-Gly Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CCC([O-])=O)C(=O)NCC([O-])=O GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- WVJNGSFKBKOKRV-AJNGGQMLSA-N Lys-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WVJNGSFKBKOKRV-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- 241001656420 Lysilla Species 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010027202 Meningitis bacterial Diseases 0.000 description 1
- 208000034762 Meningococcal Infections Diseases 0.000 description 1
- WDTLNWHPIPCMMP-AVGNSLFASA-N Met-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WDTLNWHPIPCMMP-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- OLWAOWXIADGIJG-AVGNSLFASA-N Met-Arg-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O OLWAOWXIADGIJG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- PJWDQHNOJIBMRY-JYJNAYRXSA-N Met-Arg-Tyr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PJWDQHNOJIBMRY-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- FRWZTWWOORIIBA-FXQIFTODSA-N Met-Asn-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N FRWZTWWOORIIBA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZYTPOUNUXRBYGW-YUMQZZPRSA-N Met-Met Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCSC ZYTPOUNUXRBYGW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- HUURTRNKPBHHKZ-JYJNAYRXSA-N Met-Phe-Val Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HUURTRNKPBHHKZ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- GMMLGMFBYCFCCX-KZVJFYERSA-N Met-Thr-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GMMLGMFBYCFCCX-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- QAVZUKIPOMBLMC-AVGNSLFASA-N Met-Val-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C QAVZUKIPOMBLMC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- BACYUWVYYTXETD-UHFFFAOYSA-N N-Lauroylsarcosine Chemical compound CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC(O)=O BACYUWVYYTXETD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100205189 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000588701 Pectobacterium carotovorum Species 0.000 description 1
- 101710171190 Peroxidase 68 Proteins 0.000 description 1
- OZILORBBPKKGRI-RYUDHWBXSA-N Phe-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 OZILORBBPKKGRI-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- MPGJIHFJCXTVEX-KKUMJFAQSA-N Phe-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MPGJIHFJCXTVEX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- GNUCSNWOCQFMMC-UFYCRDLUSA-N Phe-Arg-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 GNUCSNWOCQFMMC-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N Phe-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- JJHVFCUWLSKADD-ONGXEEELSA-N Phe-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JJHVFCUWLSKADD-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N Phe-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- RFCVXVPWSPOMFJ-STQMWFEESA-N Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RFCVXVPWSPOMFJ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N Phe-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O GLJZDMZJHFXJQG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N Phe-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FGWUALWGCZJQDJ-URLPEUOOSA-N 0.000 description 1
- KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N Phe-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ICTZKEXYDDZZFP-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Pro Chemical compound N([C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 ICTZKEXYDDZZFP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CYQQWUPHIZVCNY-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CYQQWUPHIZVCNY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LXVLKXPFIDDHJG-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LXVLKXPFIDDHJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DMKWYMWNEKIPFC-IUCAKERBSA-N Pro-Gly-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O DMKWYMWNEKIPFC-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- QEWBZBLXDKIQPS-STQMWFEESA-N Pro-Gly-Tyr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QEWBZBLXDKIQPS-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- WCNVGGZRTNHOOS-ULQDDVLXSA-N Pro-Lys-Tyr Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O WCNVGGZRTNHOOS-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- MHBSUKYVBZVQRW-HJWJTTGWSA-N Pro-Phe-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MHBSUKYVBZVQRW-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- NAIPAPCKKRCMBL-JYJNAYRXSA-N Pro-Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 NAIPAPCKKRCMBL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- KIDXAAQVMNLJFQ-KZVJFYERSA-N Pro-Thr-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KIDXAAQVMNLJFQ-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- VEUACYMXJKXALX-IHRRRGAJSA-N Pro-Tyr-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VEUACYMXJKXALX-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VDHGTOHMHHQSKG-JYJNAYRXSA-N Pro-Val-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O VDHGTOHMHHQSKG-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- IYCBDVBJWDXQRR-FXQIFTODSA-N Ser-Ala-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O IYCBDVBJWDXQRR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N Ser-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QVOGDCQNGLBNCR-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- LALNXSXEYFUUDD-GUBZILKMSA-N Ser-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LALNXSXEYFUUDD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VQBCMLMPEWPUTB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WSTIOCFMWXNOCX-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N WSTIOCFMWXNOCX-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IFPBAGJBHSNYPR-ZKWXMUAHSA-N Ser-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O IFPBAGJBHSNYPR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- GVMUJUPXFQFBBZ-GUBZILKMSA-N Ser-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GVMUJUPXFQFBBZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LRZLZIUXQBIWTB-KATARQTJSA-N Ser-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRZLZIUXQBIWTB-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- GZGFSPWOMUKKCV-NAKRPEOUSA-N Ser-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO GZGFSPWOMUKKCV-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- XGQKSRGHEZNWIS-IHRRRGAJSA-N Ser-Pro-Tyr Chemical compound N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O XGQKSRGHEZNWIS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RXUOAOOZIWABBW-XGEHTFHBSA-N Ser-Thr-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N RXUOAOOZIWABBW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- PCJLFYBAQZQOFE-KATARQTJSA-N Ser-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O PCJLFYBAQZQOFE-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- VAIWUNAAPZZGRI-IHPCNDPISA-N Ser-Trp-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)NC(=O)[C@H](CO)N VAIWUNAAPZZGRI-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- RTXKJFWHEBTABY-IHPCNDPISA-N Ser-Trp-Tyr Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N RTXKJFWHEBTABY-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N Ser-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZVBCMFDJIMUELU-BZSNNMDCSA-N Ser-Tyr-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CO)N ZVBCMFDJIMUELU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- OSFZCEQJLWCIBG-BZSNNMDCSA-N Ser-Tyr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O OSFZCEQJLWCIBG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N Thr-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- TYVAWPFQYFPSBR-BFHQHQDPSA-N Thr-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O TYVAWPFQYFPSBR-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 1
- DGDCHPCRMWEOJR-FQPOAREZSA-N Thr-Ala-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 DGDCHPCRMWEOJR-FQPOAREZSA-N 0.000 description 1
- GZYNMZQXFRWDFH-YTWAJWBKSA-N Thr-Arg-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O GZYNMZQXFRWDFH-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 1
- XOTBWOCSLMBGMF-SUSMZKCASA-N Thr-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XOTBWOCSLMBGMF-SUSMZKCASA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- IMULJHHGAUZZFE-MBLNEYKQSA-N Thr-Gly-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O IMULJHHGAUZZFE-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N Thr-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GXUWHVZYDAHFSV-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 1
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N Thr-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- MXNAOGFNFNKUPD-JHYOHUSXSA-N Thr-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MXNAOGFNFNKUPD-JHYOHUSXSA-N 0.000 description 1
- NWECYMJLJGCBOD-UNQGMJICSA-N Thr-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NWECYMJLJGCBOD-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N Thr-Ser-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- HUPLKEHTTQBXSC-YJRXYDGGSA-N Thr-Ser-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HUPLKEHTTQBXSC-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N Thr-Tyr-Arg Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- LVRFMARKDGGZMX-IZPVPAKOSA-N Thr-Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 LVRFMARKDGGZMX-IZPVPAKOSA-N 0.000 description 1
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N Thr-Val-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- GRQCSEWEPIHLBI-JQWIXIFHSA-N Trp-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 GRQCSEWEPIHLBI-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- HJTYJQVRIQXMHM-XIRDDKMYSA-N Trp-Asp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N HJTYJQVRIQXMHM-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- MYVYPSWUSKCCHG-JQWIXIFHSA-N Trp-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 MYVYPSWUSKCCHG-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- UJGDFQRPYGJBEH-AAEUAGOBSA-N Trp-Ser-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)O)N UJGDFQRPYGJBEH-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N Trp-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- NIHNMOSRSAYZIT-BPNCWPANSA-N Tyr-Ala-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NIHNMOSRSAYZIT-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N Tyr-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NOOMDULIORCDNF-IRXDYDNUSA-N Tyr-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NOOMDULIORCDNF-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- ULHJJQYGMWONTD-HKUYNNGSSA-N Tyr-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O ULHJJQYGMWONTD-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- NMKJPMCEKQHRPD-IRXDYDNUSA-N Tyr-Gly-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 NMKJPMCEKQHRPD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N Tyr-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KHCSOLAHNLOXJR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- WDGDKHLSDIOXQC-ACRUOGEOSA-N Tyr-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 WDGDKHLSDIOXQC-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- VTCKHZJKWQENKX-KBPBESRZSA-N Tyr-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O VTCKHZJKWQENKX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- OGPKMBOPMDTEDM-IHRRRGAJSA-N Tyr-Met-Ser Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N OGPKMBOPMDTEDM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FASACHWGQBNSRO-ZEWNOJEFSA-N Tyr-Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N FASACHWGQBNSRO-ZEWNOJEFSA-N 0.000 description 1
- VBFVQTPETKJCQW-RPTUDFQQSA-N Tyr-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VBFVQTPETKJCQW-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 1
- SZEIFUXUTBBQFQ-STQMWFEESA-N Tyr-Pro-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O SZEIFUXUTBBQFQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- HRHYJNLMIJWGLF-BZSNNMDCSA-N Tyr-Ser-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 HRHYJNLMIJWGLF-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- XUIOBCQESNDTDE-FQPOAREZSA-N Tyr-Thr-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O XUIOBCQESNDTDE-FQPOAREZSA-N 0.000 description 1
- HZDQUVQEVVYDDA-ACRUOGEOSA-N Tyr-Tyr-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HZDQUVQEVVYDDA-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- ABSXSJZNRAQDDI-KJEVXHAQSA-N Tyr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ABSXSJZNRAQDDI-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- VMRFIKXKOFNMHW-GUBZILKMSA-N Val-Arg-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N VMRFIKXKOFNMHW-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PMDOQZFYGWZSTK-LSJOCFKGSA-N Val-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)C(C)C PMDOQZFYGWZSTK-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- VHRLUTIMTDOVCG-PEDHHIEDSA-N Val-Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VHRLUTIMTDOVCG-PEDHHIEDSA-N 0.000 description 1
- UMPVMAYCLYMYGA-ONGXEEELSA-N Val-Leu-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O UMPVMAYCLYMYGA-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N Val-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 1
- GJNDXQBALKCYSZ-RYUDHWBXSA-N Val-Phe Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 GJNDXQBALKCYSZ-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- XBJKAZATRJBDCU-GUBZILKMSA-N Val-Pro-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XBJKAZATRJBDCU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YQYFYUSYEDNLSD-YEPSODPASA-N Val-Thr-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O YQYFYUSYEDNLSD-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- JVGDAEKKZKKZFO-RCWTZXSCSA-N Val-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O JVGDAEKKZKKZFO-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- QPMSXSBEVQLBIL-CZRHPSIPSA-N ac1mix0p Chemical compound C1=CC=C2N(C[C@H](C)CN(C)C)C3=CC(OC)=CC=C3SC2=C1.O([C@H]1[C@]2(OC)C=CC34C[C@@H]2[C@](C)(O)CCC)C2=C5[C@]41CCN(C)[C@@H]3CC5=CC=C2O QPMSXSBEVQLBIL-CZRHPSIPSA-N 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010070783 alanyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 230000027645 antigenic variation Effects 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 108700003859 araC Genes Proteins 0.000 description 1
- 101150044616 araC gene Proteins 0.000 description 1
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010059459 arginyl-threonyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 201000009904 bacterial meningitis Diseases 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 101150102678 clu1 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 108010030074 endodeoxyribonuclease MluI Proteins 0.000 description 1
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 235000011389 fruit/vegetable juice Nutrition 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 150000002333 glycines Chemical class 0.000 description 1
- 108010090037 glycyl-alanyl-isoleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010010096 glycyl-glycyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010045126 glycyl-tyrosyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 102000050459 human LTF Human genes 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000036737 immune function Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 239000000797 iron chelating agent Substances 0.000 description 1
- CSSYQJWUGATIHM-IKGCZBKSSA-N l-phenylalanyl-l-lysyl-l-cysteinyl-l-arginyl-l-arginyl-l-tryptophyl-l-glutaminyl-l-tryptophyl-l-arginyl-l-methionyl-l-lysyl-l-lysyl-l-leucylglycyl-l-alanyl-l-prolyl-l-seryl-l-isoleucyl-l-threonyl-l-cysteinyl-l-valyl-l-arginyl-l-arginyl-l-alanyl-l-phenylal Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 CSSYQJWUGATIHM-IKGCZBKSSA-N 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 229940078795 lactoferrin Drugs 0.000 description 1
- 235000021242 lactoferrin Nutrition 0.000 description 1
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010073093 leucyl-glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010012058 leucyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000029226 lipidation Effects 0.000 description 1
- 101150070838 lptE gene Proteins 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020004084 membrane receptors Proteins 0.000 description 1
- 108010085203 methionylmethionine Proteins 0.000 description 1
- KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N methyl acetate Chemical compound COC(C)=O KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 1
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 101150040383 pel2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150050446 pelB gene Proteins 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N phenol group Chemical group C1(=CC=CC=C1)O ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010072637 phenylalanyl-arginyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 238000013492 plasmid preparation Methods 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 108700004121 sarkosyl Proteins 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M sodium;(6r,7r)-3-[[[5-(dimethylamino)naphthalen-1-yl]sulfonylamino]methyl]-8-oxo-7-[(2-thiophen-2-ylacetyl)amino]-5-thia-1-azabicyclo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylate Chemical compound [Na+].N([C@H]1[C@@H]2N(C1=O)C(=C(CS2)CNS(=O)(=O)C1=C2C=CC=C(C2=CC=C1)N(C)C)C([O-])=O)C(=O)CC1=CC=CS1 BZQWDGWNCKYCHR-DYNCTKRQSA-M 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- GOLXNESZZPUPJE-UHFFFAOYSA-N spiromesifen Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1C(C(O1)=O)=C(OC(=O)CC(C)(C)C)C11CCCC1 GOLXNESZZPUPJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 108010051423 streptavidin-agarose Proteins 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 101150020633 tbp-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 108010087967 type I signal peptidase Proteins 0.000 description 1
- 108010005834 tyrosyl-alanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010035534 tyrosyl-leucyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 239000012130 whole-cell lysate Substances 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/22—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Neisseriaceae (F)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70582—CD71
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
- C07K16/1203—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria
- C07K16/1217—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria from Neisseriaceae (F)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Oncology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
A találmány tárgya izolált DNS-fragment, amely N. meningitidistranszferrinreceptor Tbp2 alegységét és/vagy egy szignálpeptidet vagyezek bármelyikével legalább 75%-os homológiát mutatóaminosavszekvenciájú peptidet, polipeptidet vagy fehérjét kódol, ésamely fragment expressziós terméke alkalmas arra, hogy N. meningitidisIM2394-es vagy IM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleniantiszérum felismerje. A találmány tárgya továbbá a DNS-fragmentettartalmazó expressziós kazetta, az azzal transzformált gazdasejt,eljárás a peptid, polipeptid vagy fehérje előállítására, továbbá aDNS-fragmentet tartalmazó vektort, és a peptidet, polipeptidet vagyfehérjét tartalmazó gyógyászati készítmények. A találmány szerintimegoldás Neisseria meningitidis okozta agyhártyagyulladás kezelése ésmegelőzése területén alkalmazható. ŕ
Description
A jelen találmány tárgyát a Neisseria meningitidis DNS-ffagmentjei képezik, amelyek a transzferrinreceptor alegységeit kódolják, valamint eljárás az egyes alegységek előállítására rekombináns módszerekkel.
A agyhártyagyulladások virális vagy bakteriális eredetűek. A fő bakteriális kórokozók a Neisseria meningitidis és a Haemophilus influenzáé, amelyek a bakteriális eredetű agyhártyagyulladásoknak körülbelül 40-50%-át okozzák.
Franciaországban a Neisseria meningitidis által okozott agyhártyagyulladások száma évente 600 és 800 között változik. Az Amerikai Egyesült Államokban az esetek száma évente 2500 és 3000 között van.
A Neisseria meningitidis fajt szerocsoportokra osztják, a kapszuláris poliszacharid természetétől függően. Jóllehet körülbelül tizenkét szerocsoport létezik, az agyhártyagyulladásos esetek 90%-át három szerocsoport okozza, az A, B és C.
A kapszuláris poliszacharidokon alapuló hatékony vakcinák léteznek a Neisseria meningitidis A, B és C szerocsoportjai által okozott agyhártyagyulladások megelőzésére. Ezek a poliszacharidok önmagukban egyáltalán nem, vagy csak nagyon gyengén immunogének a két év alatti gyermekekben, és nem indukálják az immunológiai memóriát. Ezek a hátrányok azonban leküzdhetők, ha ezeket a poliszacharidokat egy hordozó fehérjével konjugáljuk.
Ezzel szemben a Neisseria meningitidis B csoportjának poliszacharidja egyáltalán nem, vagy csak csekély mértékben immunogén emberben, függetlenül attól, hogy konjugált formában van-e vagy sem. Ezért nagyon kívánatosnak tűnne egy olyan vakcina kidolgozásának a B szerocsoportba tartozó Neisseria meningitidis által okozott agyhártyagyulladás fertőzés ellen, amely nem poliszacharidalapú.
Ebből a célból a Neisseria meningitidis külső membránjában levő számos fehérje felhasználását javasolták már. Ez főleg a humán transzferrin membránreceptor.
Általában a baktériumok nagy többségének vasra van szükségük a növekedésükhöz, és ezért ennek a fémnek a megszerzésére specifikus rendszereket dolgoztak ki. Különösen ami a Neisseria meningitidist illeti, amely szigorúan patogén emberre, a vas csak a humán vastranszport-fehéqékből, például a transzferrinből és a laktoferrinből származhat, mivel a szabad állapotban levő vas mennyisége az emberben elhanyagolható (10 18 mol/1 nagyságrendben van), és ezért egy esetben sem teszi lehetővé a bakteriális növekedést.
Tehát a Neisseria meningitidisnek humán transzferrin- és humán laktoferrinreceptora van, amely lehetővé teszi számára, hogy megkösse ezeket a fémkelátképző fehérjéket, majd ezt követően a növekedéséhez szükséges vasat befogja.
A Neisseria meningitidis B16B6 törzs transzferrinreceptorát Schryvers és munkatársai izolálták és tisztítottá (WO 90/12591) egy membránkivonatból. Ez a fehérje, a tisztítást követően lényegében két típusú polipeptidet tartalmaz: egy nagy látszólagos molekulatömeggel (körülbelül 100 kDa) rendelkező polipeptidet, és egy alacsonyabb látszólagos molekulatömeggel rendelkező polipeptidet, az SDS-poli(akrilamid) gélelektroforézis alapján.
A Schryvers által azonosított tisztított terméket az önkényes meghatározás alapján és a jelen találmány céljaira transzferrinreceptomak nevezzük és az alkotóelemeit, alegységeit is. Az alább következő szövegben a nagy molekulatömegű és a kis molekulatömegű alegységek jelzése Tbpl, illetve Tbp2.
A Schryvers és munkatársai által közölt tisztítási eljárás azonban nem alkalmazható a transzferrinreceptor nagy mennyiségben való tisztítására. Ennek a receptornak tisztított formában, ipari méretekben történő előállítása szükségszerűen magában foglalja egy heterológ expressziős rendszer alkalmazását.
Ebből a célból a találmány tárgyát olyan DNS-fragmentek képezik, amelyek a Neisseria meningitidis transzferrinreceptor alegységeit kódolják.
Továbbá Schryvers és munkatársai úttörő munkája óta felfedezték, hogy valójában legalább két különböző típusú törzs létezik, amelyek a transzferrinreceptoraik összetételében különböznek. Ezt úgy igazolták, hogy több tucat, különböző eredetű Neisseria meningitidis törzs membránkivonatát vizsgálták. Ezeket a membránkivonatokat először SDS poli(akrilamid) gélelektroforézisnek vetették alá, majd nitro-cellulóz-membrán membránra vitték át elektromos áram segítségével. A nitro-cellulóz-membránokat az alábbi körülmények között inkubálták:
a) egy nyúlantiszérum jelenlétében, amely a Neisseria meningitidis B16B6 törzsből tisztított transzferrinreceptorra specifikus, jele IM2394;
b) egy nyúlantiszérum jelenlétében, amely a Neisseria meningitidis IM2169 törzsből tisztított transzferrinreceptorra specifikus;
c) peroxidázzal konjugált humán transzferrin jelenlétében.
Az a) és b) esetben a transzferrinreceptor-alegységek felismerését peroxidázhoz kapcsolt antinyúlimmunoglobulin antitest hozzáadásával, majd az ezzel az enzimmel reagáló szubsztrát hozzáadásával teszik láthatóvá.
Az alábbi I. és II. jelű táblázatok néhány jellemző törzs profilját mutatják, ahogy a 7,5%-os poli(akrilamid)-gélen az SDS gélelektroforézis után láthatók; a sávokat a kilodaltonban (kDa) kifejezett látszólagos molekulatömegük alapján jellemezzük:
HU 219 267 Β
I. táblázat Törzsek
2394 (B;2a;P1.2:L2,3) 2228 (B;nd) 2170 (B;2a:P1.2:L3) | 2234 (Y;nd) 2154 (C;nd) 2448 (B;nd) | 550 (C;2a:) 179 (C;2a:P1.2) | |
Kimutatás anti-2394 | 93 | 93 | 99 |
receptorantiszérummal | 68 | 69 | 69 |
Kimutatás anti-2169 receptorantiszérummal | 93 | 93 | 99 |
Kimutatás transzferrin-peroxidázzal | 68 | 69 | 69 |
A zárójelekben a szerocsoport, a szerotípus, a szubtípus és az immunotípus látható, ebben a sorrendben.
11. táblázat Törzsek
2169 (B:9: Pl.9) | 1000 (B:nd) | 1604 (B:nd) | 132 (C: 15 Pl.16) | 1001 (A:4: Pl.9) | 876 (B:19 Pl.6) | 1951 (A:nd) | 2449 (B:nd) | 867 (B:2b: Pl .2) | |
Kimutatás anti-2394 receptorantiszérummal | 96 | 98 | 98 | 98 | 98 | 96 | 94 | 94 | 93 |
Kimutatás anti-2169 | 96 | 98 | 98 | 98 | 98 | 96 | 94 | 94 | 93 |
receptorantiszérummal | 87 | 85 | 83 | 81 | 79 | 88 | 87 | 85 | 85 |
Kimutatás transzferrin-peroxidáz antiszérummal | 87 | 85 | 83 | 81 | 79 | 88 | 87 | 85 | 85 |
A zárójelekben a szerocsoport, a szerotípus, a szubtípus cs az immunotípus látható, ebben a sorrendben.
A táblázatok első két sorában látható eredmények azt mutatják, hogy kétféle típusú törzs létezik.
Az első típus (I. táblázat) olyan törzseknek felel meg, amelyeknek a receptorában levő két alegységet az alkalmazott kísérleti körülmények között az antiIM2394 receptorantiszérum felismeri, míg csak a nagy molekulatömegű alegységet ismeri fel az anti-IM2169 receptorantiszérum.
A második típus (II. táblázat) olyan törzseknek felel meg, amelyeknek a receptorában levő két alegységet az alkalmazott kísérleti körülmények között az antiIM2169 receptorantiszérum felismeri, míg csak a nagy molekulatömegű alegységet ismeri fel az anti-IM2394 receptorantiszérum.
Ennek következtében antigéndiverzitás létezik az alacsonyabb molekulatömegű alegység szintjén. Ez a diverzitás azonban korlátozott, mivel csak két fő típusa létezik, szemben azzal, amit Griffiths és munkatársai állítanak [FEMS Microbiol. Lett., 69, 31 (1990)].
Ezeknek a megfigyeléseknek az alapján azt feltételezhetjük, hogy az összes Neisseria meningitidis fertőzés ellen hatásos vakcina készíthető a megfelelő módon, a nagy molekulatömegű alegységből, függetlenül attól, hogy melyik törzsből származik a receptor, mivel az említett alegységet az antiszérum két különböző típusa is felismeri. Úgy tűnik azonban, hogy ez nem járható út, mivel a nagy molekulatömegű alegységről úgy gondolják, hogy nem képes semlegesítő típusú antitestek termelését indukálni. A két receptoralegység közül csak a kisebbről derült ki, hogy képes ellátni ezt a funkciót. Mivel ezt a kisebb molekulatömegű alegységet jelentős antigénvariáció jellemzi az egyes és kettes típusú törzsek között, ezért egyetlen típusú transzferrinreceptor nem lehet elegendő ahhoz, hogy az összes Neisseria meningitidis fertőzéssel szemben vakcináim lehessen vele. Ennek következtében egy vakcinának az egyes törzsek (az IM2394 és az IM2169) alegységei közül legalább a kisebb molekulatömegűeket vagy azok ekvivalenseit tartalmaznia kell, és optimális esetben legalább egy Neisseria meningitidis törzs nagy molekulatömegű alegységét is tartalmaznia kell.
Ennek megfelelően a találmány tárgyát egy olyan izolált DNS-fragment képezi, amely olyan peptidet, polipeptidet vagy fehérjét kódol, amelyet az IM2394 vagy az IM2169 Neisseria meningitidis törzsek receptora ellen készített antiszérum felismer.
Egy ilyen DNS-fragment speciális esetben egy olyan nukleotidszekvenciát tartalmaz, amely az alábbiakban definiált szekvenciákkal mutat homológiát:
- az egyes számú szekvenciaazonosítóval (SEQ ID NO. 1), amely az 1-es pozícióban egy ciszteincsoporttal kezdődik, és az 579-es pozícióban egy glutamincsoporttal végződik;
- a SEQ ID NO. 3-mal, amely az 1-es pozícióban glutaminsavval kezdődik, és a 884-es pozícióban fenil-alanin-csoporttal végződik;
- a SEQ ID NO. 5-tel, amely az 1-es pozícióban glutaminsavval kezdődik, és a 887-es pozícióban fenil-alanin-csoporttal végződik;
- a SEQ ID NO. 7-tel, amely az 1-es pozícióban ciszteincsoporttal kezdődik, és a 691-es pozícióban glutamincsoporttal végződik.
HU 219 267 Β
Tájékoztatás céljából specifikáljuk, hogy a jelen találmány szerinti DNS-fragment tartalmazhat még egy további nukleotidszekvenciát, amely további aminosavszekvenciákat kódol; a két nukleotidszekvenciáról azt állítjuk, hogy egy nyitott leolvasási keretet hoznak létre, és ezáltal egy hibrid fehérjét vagy egy prekurzort kódolnak.
Egy, a jelen találmány szerinti DNS-ffagmentet előnyösen az alábbi csoportból választhatunk:
i) egy első, izolált DNS-ffagment, amelynek nukleotidszekvenciája egy olyan fehérjét kódol, amelynek aminosavszekvenciája homológ a SEQ ID NO. 1-ben leírt szekvenciával, az 1-es pozícióban ciszteincsoporttal kezdődik, és az 579-es pozícióban glutamincsoporttal végződik;
ii) egy második, izolált DNS-fragment, amelynek nukleotidszekvenciája egy olyan fehérjét kódol, amelynek aminosavszekvenciája homológ a SEQ ID NO. 3-ban leírt szekvenciával, az 1-es pozícióban glutaminsavcsoporttal kezdődik, és az 884-es pozícióban fenil-alanin-csoporttal végződik;
iii) egy harmadik, izolált DNS-fragment, amelynek nukleotidszekvenciája egy olyan fehérjét kódol, amelynek aminosavszekvenciája homológ a SEQ ID NO. 5-ben leírt szekvenciával, az 1-es pozícióban glutaminsavcsoporttal kezdődik, és az 887-es pozícióban fenil-alanin-csoporttal végződik;
iv) egy negyedik, izolált DNS-ffagment, amelynek nukleotidszekvenciája egy olyan fehérjét kódol, amelynek aminosavszekvenciája homológ a SEQ ID NO. 7-ben leírt szekvenciával, az 1-es pozícióban ciszteincsoporttal kezdődik, és a 691-es pozícióban glutamincsoporttal végződik.
A „homológ aminosavszekvencia” jelentése olyan szekvencia, amely a fentiekben referenciaként említett szekvenciákkal legalább 75%-os, előnyösen legalább 80%-os, még előnyösebben legalább 90%-os, legelőnyösebben 100%-os homológiát mutat. Meg kell jegyeznünk, hogy a fentiek szerint meghatározott „homológ” kifejezés az azonosságot is magában foglalja, speciális esetként.
A homológia mértékét könnyen ki lehet számítani oly módon, hogy a szekvenciákat egymás mellé illesztjük olyan elrendezésben, hogy a maximális homológiát kapjuk; ennek eléréséhez szükséges lehet, hogy mesterséges üres helyeket szúrjunk be a szekvenciákba, amint az a 7. ábrán látható. Helyspecifrkus mutagenezis egyszer az optimális elrendezést elértük, akkor a homológia mértékét úgy határozzuk meg, hogy feljegyezzük az összes olyan pozíciót, amelyben a két szekvencia aminosavjai egybeesnek, és ezt az összes pozíció számára vonatkoztatjuk.
Nagyon terjedelmes lenne leírni a homológ szekvenciákat az általánostól eltérő módon, mivel a kombinációk száma túl nagy. A szakterületen jártas szakember azonban ismeri az általános szabályokat, amelyek lehetővé teszik, hogy az egyik aminosavat egy másikkal helyettesítsük anélkül, hogy a fehérje biológiai vagy immunológiai funkcióit tönkretennénk.
Egy izolált, legelőnyösebb tulajdonságokkal rendelkező DNS-fragment az alábbiakat kódoló nukleotidszekvenciát tartalmazza:
i) az IM2394 törzs Tbpl alegysége, amelynek az aminosavszekvenciáját a SEQ ID NO. 3-ban mutatjuk be, amely az 1-es pozícióban glutaminsawal kezdődik, és a 884-es pozícióban fenilalanin-csoporttal végződik;
ii) az IM2394 törzs Tbp2 alegysége, amelynek az aminosavszekvenciáját a SEQ ID NO. 1-ben mutatjuk be, amely az 1-es pozícióban ciszteinnel kezdődik, és az 579-es pozícióban glutamincsoporttal végződik;
iii) az IM2169 törzs Tbpl alegysége, amelynek az aminosavszekvenciáját a SEQ ID NO. 5-ben mutatjuk be, amely az 1-es pozícióban glutaminsawal kezdődik, és a 887-es pozícióban fenilalanin-csoporttal végződik;
iv) az IM2169 törzs Tbp2 alegysége, amelynek az aminosavszekvenciáját a SEQ ID NO. 7-ben mutatjuk be, amely az 1-es pozícióban ciszteinnel kezdődik, és az 691-es pozícióban glutamincsoporttal végződik.
Mivel a transzferrinreceptor egy membránfehérje, ezért mindegyik alegysége először prekurzor formájában keletkezik, amely egy szignálpeptidet tartalmaz az érett forma N-terminális pozíciójában. Ennek megfelelően, a jelen találmány tárgyát képezi egy olyan izolált DNS-egység, amely egy szignálpeptidet kódol, amelynek aminosavszekvenciája legalább 80%-os, előnyösen 100%-os homológiát mutat az alábbi szekvenciákkal:
i) SEQ ID NO. 3, amely a -24-es pozícióban metionincsoporttal kezdődik, és alanincsoporttal végződik a -1-es pozícióban;
ii) SEQ ID NO. 5, amely a -24-es pozícióban metionincsoporttal kezdődik, és alanincsoporttal végződik a -1-es pozícióban;
iii) SEQ ID NO. 7, amely a -20-as pozícióban metionincsoporttal kezdődik, és alanincsoporttal végződik a -1-es pozícióban.
Egy, a találmány szerinti DNS-fragmentet kiválaszthatunk egy ötödik, hatodik, hetedik és nyolcadik DNSfragmentet tartalmazó csoportból is, amelyek egy olyan prekurzort kódolnak, amelynek aminosavszekvenciája homológ az SEQ ID NO. 1-ben, 3-ban, 5-ben vagy 7ben bemutatott szekvenciával.
Az „izolált DNS-fragment vagy -egység” szakkifejezésjelentése olyan genomiális eredetű DNS-fragment vagy -egység, amely
i) be van építve egy virális vagy plazmidvektorba, vagy ii) egy olyan promoter szabályozása alá van helyezve, amelyre vonatkozóan heterológ.
Továbbá azt a DNS-egységet, amely a találmány szerinti szignálpeptidet kódolja, amellett még izoláltnak tekintjük, ha ez a DNS-egység egy DNS-fragmenthez van kapcsolva, amely fragment egy, a szignálpeptidhez viszonyítva heterológ fehérjét kódol oly módon, hogy egy hibrid prekurzort kódoló nyitott leolvasási keretet alkot.
HU 219 267 Β
A találmány tárgyát képezi egy fehérjét, polipeptidet, peptidet expresszáló kazetta, amely expreszsziós terméket a Neisseria meningitidis IM2169 vagy IM2394-es törzs receptora elleni antiszérum felismeri, és amely kazetta legalább egy, a találmány szerinti DNS-ffagmentet tartalmaz, olyan elemek szabályozóhatása alá helyezve, amelyek képesek végrehajtani az expresszióját egy megfelelő gazdasejtben.
Az expressziós kazettában a találmány szerinti első, második, harmadik vagy negyedik DNS-fragment, amely egy érett formát kódol, vagy kapcsolatban van vagy nincs egy olyan DNS-egységgel, amely egy szignálpeptidet kódol, attól függően, hogy a fehérje szekréciója kívánatos-e vagy sem. Előnyösen ez a szekréció kívánatos. Ebben az utóbbi esetben a DNS-egység egy olyan szignálpeptidet kódol, amely az érett formával homológ vagy heterológ, és ennek eredménye egy természetes, illetve hibrid prekurzor szintézise.
A találmány szerinti DNS-ffagment expressziójához nélkülözhetetlen elemek az alábbiak: transzkripciós promoter, transzlációs start- és stopkodon, és szükség esetén egy transzkripciós terminátor. A promoter lehet konstitutív vagy indukálható. Rá kell mutatnunk, hogy az a DNS-ffagment, amely a Neisseria meningitidis IM2394 törzs Tbp2 alegységét kódolja, toxikusnak látszik egy heterológ sejtben, főleg Escherichia coliban. Az ilyen esetben előnyös lehet egy indukálható promoter alkalmazása, például a Salmonella typhimurium araB génjének promotere.
Az elemek, például egy DNS-egység, amely egy heterológ szignálpeptidet (szignálrégió) kódol, vagy egy promoter már meglehetősen nagy számban léteznek, és a szakterületen jártas szakember számára ismertek. A szakember általános képzettsége teszi lehetővé, hogy egy szignálrégiót vagy egy specifikus promotert válasszon, amelyet ahhoz a gazdasejthez adaptál, amelyben az expressziót végre kívánja hajtani.
Pontosabban meg kell jegyeznünk, hogy a Tbp2 alegység egy lipoproteinnek tűnik, mivel prekurzora egy olyan szignálpeptidet tartalmaz, amely a lipoprotein prekurzorokra jellemző, és azért is, mivel egy ciszteint tartalmaz az N-terminális pozícióban és olyan aminosavakat, amelyeknek erős hajlamuk van arra, hogy elfogadjanak „kanyar” típusú konformációt, valamivel az Nterminális tisztein után (4 glicin) [Wu and Tokunaga, Current Top. Microb. Immunoi., 125, 127 (1986)]. A lipidált állapot fokozhatja a Tbp2 alegység immunogén hatását.
Tehát egy prokariótarendszerben kívánatos lenne, ha a Tbp2 alegységet vagy a természetes prekurzorából vagy egy olyan prekurzorból kapnánk, amely egy alkalmas heterológ szignálpeptidet tartalmaz, amely lehetővé teszi a lipidációt; azaz egy olyan lipoprotein szignálpeptidet, amely nem a Tbp2-ből származik. Egy ilyen szignálpeptid azzal a specifikus jellemzővel rendelkezik, hogy a ΙΙ-es típusú szignálpeptidázzal hasítható. A szignálpeptid hasítási helyének szekvenciája megfelel a konszenzusszekvenciának (L,V,I) (A,S,T,G) (G,A) C, azaz cisztein az első aminosav az érett szekvenciában. A heterológ szignálpeptidekre példaként említhetjük a ColEl, ColE3, Lpp, NlpA, OsmB, Pál, RlpB és Trat lipoproteineket, amelyeknek a szekvenciáját a
SEQ ID NO. 9-24-ben mutatjuk be, valamint a megfelelő nukleinsavszekvenciákat is.
Ennek következtében egy specifikus megvalósítási mód szerint egy, a találmány szerinti expressziós kazetta, amelyet azzal a céllal állítunk elő, hogy egy, az alábbi szekvenciákkal homológ fehérjét kódoljon:
- a SEQ ID NO. 1, amely az 1-es pozícióban levő ciszteincsoporttal indul, és az 579-es pozícióban levő glutamincsoporttal végződik, vagy
- a SEQ ID NO. 7, amely az 1-es pozícióban levő ciszteincsoporttal indul, és a 691-es pozícióban levő glutamincsoporttal végződik;
tartalmaz:
i) egy olyan DNS-egységet, amely a Tbp2 alegységtől eltérő lipoproteint tartalmaz, például az Rlpb szignálpeptidet és ii) egy, az említett fehérjét kódoló DNS-ffagment. Végezetül, a találmány tárgyát képezi
i) eljárás egy peptid, polipeptid vagy fehérje előállítására, amelyet a Neisseria meningitidis IM2394 vagy IM2169 törzs receptora elleni antiszérum felismer, amely eljárás szerint egy, a találmány szerinti expressziós kazettát tartalmazó gazdasejtet szaporítunk, és az említett peptidet, polipeptidet vagy fehérjét kinyerjük a tenyészetből; valamint ii) az említett eljárással készülő peptid, polipeptid vagy fehérje, és iii) a fehérjé(ke)t tartalmazó gyógyszerkészítmények, főleg vakcinák.
A jelen találmány szerinti eljárás céljaira a gazdasejt lehet emlőssejt, egy élesztő vagy egy baktérium. Ebben az esetben is, egy specifikus vonal megválasztása a szakterületen jártas szakember köteles tudásához tartozik.
Egy másik módszer szerint egy, a találmány szerinti gyógyászati készítmény aktív adalékanyagként tartalmazhat egy virális vagy bakteriális vektort, amelynek a genomjába egy, a találmány szerinti DNS-ffagment van beillesztve, az expressziójához szükséges elemek szabályozása alá helyezve. A megfelelő vektor alatt érthetünk például himlővírusokat, adenovírusokat és tejsavbaktériumokat.
Egy, a jelen találmány szerinti gyógyászati készítmény különösen hasznos egy Neisseria meningitidis fertőzés megelőzésében vagy kezelésében. A szokványos módon állítható elő. Pontosabban egy gyógyászatilag hatásos mennyiséget kombinálunk egy hordozóval vagy egy hígítóval. Bármely, a vakcinálás szakterületén ismert úton beadhatjuk, például enterálisan vagy parenterálisan. A beadás lehet egyetlen dózisban, illetve egy bizonyos időtartam után megismételhető. A beadás útja változhat különböző paraméterek függvényében, például függhet a kezelt szervezettől is (állapot, kor és hasonlók). A készítmény emellett tartalmazhat egy gyógyászatilag elfogadható komplett adjuvánst.
Abból a célból, hogy meghatározzuk a jelen találmány tárgyát, specifikálni kell, hogy a Neisseria meningitidis 1M2394 (másik neve B16B6) és 1M2169 (má5
HU 219 267 Β sik neve M982) törzsek szabadon hozzáférhetők a Collection de Institute Pasteurnél, 25 rue de Dr. Roux 75015 Párizs, a CIP79808 és a CIP7917 szám alatt.
A Neisseria meningitidis IM2394 vagy IM2169 törzs transzferrinreceptorára specifikus antiszérumot az alábbi példákban ismertetett módon állíthatjuk elő.
A találmányt az alábbi példákkal tesszük jobban érthetővé, valamint az 1-8. ábrákkal.
Az 1. ábrán a lambda ΖΑΡ II fág szerkezete látható, és sematikusan mutatja az ehhez kapcsolódó klónozási módszereket is. A lambda ΖΑΡ II egy inszerciós vektor, amelyet a plazmidrészben található többszörös klónozási hellyel láttak el (pBluescript SK). Ezt a plazmidrészt in vivő ki lehet vágni, ha egy segítőfággal együtt fertőzünk meg vele egy sejtet, majd plazmidvektorrá alakul. Ha egy kódolószekvenciát fázisban fuzionáltatunk a lacZ-vel, illetve ha egy DNS-fragment tartalmaz egy promotert, amely Escherichia coliban működik, akkor előállíthatjuk a számunkra érdekes fehérjét, és specifikus antitestekkel ki lehet mutatni.
A 2. ábrán a pTG1265 plazmid szerkezete látható. A pTG1265-ös plazmid a pGB2 plazmidból származik [Churchward et al., Gene, 31, 165 (1984)], az alábbiak szerint: a pGB2 plazmidot EcoRI és HindlII restrikciós enzimekkel emésztjük, Klenow-polimerázzal kezeljük, majd a pT7T3 184 plazmidból [Mead et al., Protein Engineering, 1, 67 (1986), Pharmacia] izolált 1 kb méretű SspI-PvuII fragmenttel ligáljuk, amely tartalmazza az fl-ori-t, a lacZ szekvenciát, a T3 és T7 promotereket, valamint többszörös klónozóhelyeket.
A 3. ábrán az IM2394 törzs DNS-régiójának genomiális térképe látható, amely a Tbpl-et és Tbp2-t kódoló szekvenciákat tartalmazza, valamint a különböző klónozott ffagmenteket. B=BamHI, E=EcoRI, H=HincII, R=EcoRV, X=XbaI, C=ClaI.
A 4. ábrán az IM2169 törzs DNS-régiójának genomiális térképe látható, amely a Tbpl-et és Tbp2-t kódoló szekvenciákat tartalmazza, valamint a különböző klónozott ffagmenteket. C=ClaI, H=HincII, M=MluI, X=XbaI, ?=pontatlan pozíció.
Az 5. ábrán a pARA13 plazmid szerkezete látható. A pARA13 plazmid képes Escherichia coliban replikálódni, és tartalmazza a Salmonella typhimurium BAD arabinóz operonját (ParaB), a TATA box szintjén módosítva, valamint az AraC gént. A ParaB promoter után többszörös hasítási helyek találhatók. A pARA plazmidsorozatot Cagnon és munkatársai írták le [Protein Engineering, 4, 843 (1991)].
A 6. ábrán a pTG3786-os expressziós vektor készítésére használt módszer látható.
A 7. ábrán az IM2394 és IM2169 törzsek Tbpl alegységek származtatott aminosavszekvenciái láthatók. A homológia mértékét körülbelül 76%-ra becsüljük.
A 8. ábrán az IM2394 és IM2169 törzsek Tbp2 alegységek származtatott aminosavszekvenciái láthatók. A homológia mértékét körülbelül 47%-ra becsüljük.
A 9. ábrán a pTG3779 expressziós vektor készítésére használt módszer leírása látható.
A 10. ábrán a pTG4710 expressziós vektor készítésére használt módszer leírása látható.
All. ábrán a pTG4764 expressziós vektor készítésére használt módszer leírása látható.
1. példa
Az IM2394 törzs transzferrinreceptora Tbpl és
Tbp2 alegységeit kódoló DNS-ffagmentek klónozása
1A)—A törzs szaporítása és a transzferrinreceptor tisztítása
A Neisseria meningitidis IM2394 törzs fagyasztva szárított sejtjeit körülbelül 1 ml Muller-Hinton-táptalajban (MHB, Difco) vesszük fel. A baktériumszuszpenziót ezután szilárd Muller-Hinton-táptalajra viszszük, amely forralt vért tartalmaz (5%).
óra hosszat 37 °C-on inkubáljuk 10% CO2-t tartalmazó atmoszférában, majd a baktériumréteget kinyerjük azzal a céllal, hogy 150 ml MHB-táptalajt oltsunk vele (pH=7,2, 3 db 250 ml-es Erlenmeyer-lombikba elosztva). Az inkubálást 3 óra hosszat folytatjuk 37 °C-on, kevertetés közben. Az így előállított mindhárom tenyészettel oltható 400 ml MHB (pH=7,2, kiegészítve 30 pmol/l etilén-diamin-di(o-hidroxi-fenilecetsav)-val (EDDHA, Sigma), amely szabad formájában egy vaskelátot képező vegyület.
Miután 16 óra hosszat tenyésztettük kevertetés közben, a tenyészetek tisztaságát Gram-festést követően mikroszkóposán megvizsgáljuk. A szuszpenziót centrifugáljuk, majd a patogén mikroorganizmust tartalmazó üledéket leméijük és -20 °C-on tároljuk.
A tisztítást lényegében a Schryvers és munkatársai által közölt módszerrel végezzük, az alábbiak szerint.
A baktériumüledéket megolvasztjuk, majd 200 ml 50 mmol/1 TRIS-HC1 pH=8,0 pufferben (A puffer) szuszpendáljuk. A szuszpenziót centrifugáljuk (20 perc, 15 000xg, 4 °C). Az üledéket kinyeqük, majd ismét az A pufferben szuszpendáljuk 150 g/1 végkoncentrációban. 150 ml-es frakciókat kezelünk 8 percig 80 Mpa nyomással egy sejtfeltáró berendezésben (Rannie, 8.30H modell). Az így kapott sejtlizátumot 15 percig centrifugáljuk 4 °C-on 15 000xg-vei. A felülúszót kinyerjük, majd 75 percig 4 °C-on 200 000 χ g-vel centrifugáljuk. A felülúszó eltávolítása után az üledéket A pufferben vesszük fel, majd Lowry-féle módszerrel végzett fehéijemérés után a szuszpenzió koncentrációját 5 mg/ml-re állítjuk.
1,4 ml membránszuszpenzióhoz 1,75 mg, Schryvers által leírt módszerrel biotinilezett humán transzferrint adunk. A membránfrakció végkoncentrációja mg/ml. Az elegyet 1 óra hosszat inkubáljuk 37 °C-on, majd 100 000 χ g-vel centrifugáljuk 75 percig 4 °C-on. A membránüledéket 0,1 mol/1 NaCl-ot tartalmazó A pufferben vesszük fel, majd 60 percig szobahőmérsékleten inkubáljuk.
Miután oldatba vittük, olyan térfogatú 30%-os (tömeg/térfogat) N-lauroil-szarkozint és 500 mmol/1 EDTA-t adunk ehhez a szuszpenzióhoz úgy, hogy a szarkozil és az EDTA végkoncentrációja 0,5%, illetve mmol/1 legyen. Miután 15 percig inkubáltuk 37 °C-on kevertetés közben, 1 ml streptavidinagarózt (Pierce) adunk hozzá, amelyet előzőleg A pufferben mostunk.
HU 219 267 Β
A szuszpenziót 15 percig szobahőmérsékleten inkubáljuk, majd lOOOxg-vel 10 percig centrifugáljuk. A gyantát ezután oszlopba töltjük, és a közvetlen eluátumot elöntjük.
A gyantát 3 oszloptérfogatnyi 50 mmol/1 TRIS-HC1 pH=8,0 pufferrel mossuk, amely 1 mol/1 NaCl-ot, 10 mmold EDTA-t, 0,5% szarkozilt tartalmaz (B puffer), majd 1 oszloptérfogatnyi, 750 mmol/1 guanidinHCl-ot tartalmazó B pufferrel mossuk. A transzferrinreceptort ezután 2 mol/1 guanidin-HCl-ot tartalmazó B pufferrel eluáljuk. Az eluátumot frakciókban gyűjtjük, olyan csövekbe, amelyek azonos térfogatú 50 mmol/1 TRIS-HC1 pH=8,0,1 mol/1 NaCl összetételű puffért tartalmaznak. Az eluátum optikai sűrűségét 280 nm-en mérjük, az oszlopból való kilépés pontjánál, UV-detektorral.
Az elúciós csíknak megfelelő frakciókat kinyeljük, 10 mmol/1 foszfátpufferrel (pH=8,0) szemben dializáljuk, amely 0,05% szarkozilt tartalmaz, majd fagyasztva szárítjuk. A fagyasztva szárított terméket vízben felvesszük, 10-szer nagyobb töménységben. Az oldatot másodszor is dializáljuk 50 mmol/1 foszfátpuffer, pH=8,0, 0,05% szarkozil (C puffer) összetételű oldattal szemben, majd az oldatot 0,22 pm-es pórusméretű membránon szűrjük át.
A fehérjetartalmat meghatározzuk, majd 1 mg/mlre állítjuk C puffer hozzáadásával, aszeptikus körülmények között. Ezt a készítményt -70 °C-on tároljuk.
IB) -A transzferrinreceptorra specifikus készítmény előállítása
New-Zealand albínó nyulaknak bőr alá és intramuszkulárisan 100 pg IM2394 receptort adunk be komplett Freund-féle adjuváns jelenlétében. Az első injekció után 21, illetve 42 nappal a nyulaknak ismét beadunk 100 pg-ot a tisztított receptorból, de ez alkalommal inkomplett Freund-féle adjuváns jelenlétében. Az utolsó injekció után 15 nappal az állatokból szérumot gyűjtünk, és komplementmentesítjük, majd 0,45 pm-es pórusméretű membránon szüljük át. A szűrletet ezt követően IM2394-es törzzsel érintkezésbe hozva kimerítjük, amely törzset ennek a műveletnek a végrehajtása céljából előzőleg szabad formájú vas jelenlétében tenyésztettünk (ilyen körülmények között a transzferrinreceptor szintézise represszálva van). Az érintkeztetés feltételei az alábbiak: 10 ml szűrletet adunk 1010 cfu-hoz (telepképző egység) az IM2394 törzs tenyészetéből. Az adszorpciót éjszakán át folytatjuk 4 °C-on, kevertetés közben. A baktériumokat ezután centrifugálással távolítjuk el. A felülúszót kinyerjük, majd két egymást követő adszorpciós műveletnek vetjük alá, a fentiek alapján.
IC) - Azoknak apeptidszekvenciáknak a meghatározása, amelyek lehetővé teszik a DNS-fragmentek azonosítását
Az 1A) pontban kapott anyag alikvot részeit megszárítjuk, majd újra oldatba visszük kétszeres töménységű Laemmli-pufferben (65 mmol/1 TRIS, 3% SDS, 10% glicerin, 5% β-merkapto-etanol). Azonos térfogatú vizet adunk hozzá.
Ultrahangos besugárzást követően az anyagot 2 percre 90 °C-ra melegítjük, poli(akrilamid) gélelektroforézisnek vetjük alá. Az ily módon elválasztott alegységeket PVDF membránra (Immobilon, Millipore) visszük át, 16 óra hosszat 400 mA áramerősség mellett 50 mmol/1 TRIS-borát pufferben (pH=8,3). Az elektrotranszferált alegységeket amido-black festékkel festjük, majd a Tbpl-nek, illetve Tbp2-nek megfelelő csíkokat kinyeqük, és az N-terminális szekvenciáját mikroszekvenálással határozzuk meg.
Ezt többször megismételjük, míg az alábbi, N-terminális konszenzusszekvenciát megkapjuk:
Tbpl IM2394: EXVQAEQAQEKQLDTIQV
Tbp2 IM2394: XLXXXXSFDLDSVEXVQXMX (X jelentése meghatározatlan aminosav).
Abból a célból, hogy a Tbp2 belső régióinak aminosavszekvenciáját is meghatározzuk, a PVDF membránon található fehéijét tripszines emésztésnek vetjük alá 0,1 mol/1 TRIS-HC1 pH=8,2 pufferben. 4 óra hoszszat 37 °C-on végezzük a reakciót, majd a peptideket 70%-os hangyasavval majd 0,1%-os trifluor-ecetsawal (TFA) extraháljuk. Ezeket a peptideket azután HPLCvel választjuk el.
Az IM2394 Tbp2-nél a meghatározott belső szekvenciák az alábbiak:
S1122: NNIVLFGPDGYLYYK
S1125: YTIQA
S”770: DGENAAGPATEXVIDAYR
S”766: XQIDSFGDVK
S1126: AAFXXXI
S”769: XNXXXMFLQGVR
S”771: TPVSDVAAR
S”767: XSPAFT
S”762: NAIEMGGSFXFPGNAPEG(K)
S1128: XQPESQQDVSENX
ID) —A genomiális DNS előállítása
Az 1A) pontban kapott baktériumüledéket körülbelül 25 ml A oldatban szuszpendáljuk (25 mmol/1 TRIS-HC1 pH=8, 50 mmol/1 glükózt és 10 mmol/1 EDTA-t tartalmaz), amelyet 10 mg proteináz K-val egészítünk ki.
Ezután 12,5 ml A oldatot adunk hozzá, amely 10 mg lizozimet tartalmaz. Az elegyet ismét hagyjuk 10 percig állni szobahőmérsékleten. Az elegyet ezután 0,5 ml 10%-os szarkozillal rétegezzük le. Az elegyet 10 percig 4 °C-on inkubáljuk.
Ezután 2 mg RNáz-t adunk hozzá, és az inkubálást 9 percig folytatjuk 37 °C-on. A DNS-t négy egymás után végzett fenolos extrakcióval tisztítjuk. A az utolsó vizes fázisban található DNS-t etanollal kicsapjuk. A nagy molekulatömegű DNS-t CSC1 gradiensen való elválasztással kapjuk.
IE) -Klónozás
Az első DNS-könyvtárat a lambda ZAP vektorban (1. ábra) állítjuk elő, az alábbiak szerint.
Egy genomiális DNS-készítményt ultrahangos kezeléssel fragmentálunk. Az így kapott ffagmentek végeit T4 polimerázzal tompa végűre alakítjuk. A fragmenteket metilezzük. A metilezés után a ffagmenteket EcoRI adapterekhez kapcsoljuk, EcoRI restrikciós enzimmel kezeljük, majd a lambda ZAP II fág (Stratagene) EcoRI hasítási helyére építjük be.
HU 219 267 Β
Az Escherichia coli XLl-blue törzsét (Stratagene) az így kapott DNS-könyvtárral fertőzzük. A fehér lízistarfoltokat (ez a rekombináns fágok jelenlétére utal) az IB) pontban leírt módon előállított IM2394 törzs receptoraira specifikus antiszérummal vizsgáljuk meg. Ily módon lehetségessé vált két lambda ΖΑΡII klón azonosítása. Az ezekben a kiónokban található pBluescript plazmidokat segítő fággal együtt fertőzve kihasítjuk, ezek jele pBMTl és pBMT2.
A pBMTl és pBMT2 plazmid is tartalmaz egy EcoRI-EcoRI fragmentet, melyeknek mérete 3,8 kb, illetve 1,3 kb. Ezeket a 3. ábrán mutatjuk be.
A pBMTl EcoRI-EcoRI inszert szekvenálását a shotgun módszerrel végezzük [Bankier and Barrell, Biochemistry, B5, 508 (1983)], az alábbiak szerint.
A pBMTl EcoRI-EcoRI inszertet tisztítjuk, majd ultrahangos kezeléssel fragmentáljuk. Az így kapott fragmentek végeit T4 polimerázos kezeléssel tompa végűre alakítjuk. Az így kezelt fragmenteket az M13TG131 fág [Kieny et al., Gene, 26, 91 (1983)] egy megfelelő pontjára beépítjük. Az ebből a preparátumból kapott körülbelül 200 kiónnak meghatározzuk a szekvenciáját. Ezeknek a szekvenciáknak a számítógépes elemzése lehetővé teszi, hogy rekonstruáljuk a pBMTl EcoRI-EcoRI inszertjének teljes szekvenciáját.
A Tbpl N-terminálisát kódoló szekvenciát a 3. ábrán látható módon lokalizáljuk. Mivel a Tbpl molekulatömege adott, ezért világos, hogy ez az inszert nem tartalmazza a Tbpl-et kódoló teljes DNS-fragmentet. Egy nyitott leolvasási keretet azonosíthatunk a tbpl gén 5’ vége előtt, de a tbp2 gén N-terminálisát kódoló régiót nem lehet tisztán azonosítani.
A Tbp2 belső régióinak mikroszekvenálásával megerősítettük az IC) pontban leírtakat. A C-terminális felé eső belső szekvenciák valóban megfelelnek a tbpl előtt található nyitott leolvasási keret 3’ részének.
Továbbá az IM2394 törzs genomiális DNS-ét, amelyet előzőleg HincII restrikciós enzimmel emésztettünk, Southem-blot-módszerrel vizsgáljuk, a pBMTl 3,8 kb méretű inszert 1,5 kb méretű HincII-HincII régiójának megfelelő radioaktív DNS-próba felhasználásával; ily módon két csík tehető láthatóvá. Ez lehetővé tette annak igazolását, hogy a pBMTl-ból származó inszert a két eltérő lokusz szekvenciáinak kombinációjából származó műtermék. Ennek következtében a tbp2 5’ szekvenciája hiányzik.
Az előzőkben leírt, lambda ZAP fágban előállított genomiális DNS-könyvtárat ismét átvizsgáljuk, ez alkalommal a pBMT2 EcoRI-EcoRI fragmentjét használva próbaként. A körülbelül 200 000 átvizsgált tarfolt közül 29 jelölt maradt. Csak a pTG2749 származékplazmidról látszott, hogy a pBMTl-hez és a pBMT2-höz viszonyítva egy új inszertet hordoz. A pTG2749 plazmidban levő inszertet a 3. ábrán mutatjuk be. Az EcoRV hasítási hely előtti inszertrégiót (EcoRV-EcoRI régió) M13TG31 plazmidba klónozzuk, majd Sanger és munkatársai módszerével szekvenáljuk [Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 74, 5463 (1977)], szintetikus indítómolekulák alkalmazásával. így kapjuk a Tbp2 N-terminálisának megfelelő szekvenciát.
Az IM2394 törzs Tbp2-jét kódoló DNS-fragment szekvenciáját rendre a SEQ ID NO. 1-ben, illetve 2-ben mutatjuk be, a megfelelő aminosavszekvenciával együtt.
Közvetlenül az érett Tbp2-t kódoló szekvencia előtt a pTG2749 egy másik lokuszból származó, eltérő genomiális régiót tartalmaz. Ebben az esetben is ez egy klónozási műtermék, a pBMTl-nél tapasztalt esethez hasonló.
A megfigyelt átrendeződések miatt, valamint azért, mert hiányzik a tbpl 3’ szekvenciája és a tbp2 5’ szekvenciája, a lambda ZAP-ban készített genomiális DNSkönyvtárat alkalmatlannak ítéljük arra, hogy a klónozást ezzel folytassuk.
Ennélfogva egy második genomiális DNS-könyvtárat készítettünk egy alacsony kópiaszámú plazmidban az alábbiak szerint: egy genomiális DNS-preparátumot részletesen emésztünk Sau3A enzimmel. A körülbelül
4-6 kb méretű DNS-fragmenteket szacharózgradiensen végzett frakcionálás után tisztítjuk, és a pTG1265 plazmid BamHI hasítási helyére építjük be. Ezt a plazmidpreparátumot használjuk az Escherichia coli 5K törzs transzformálására. Becslésünk szerint ez a könyvtár körülbelül 18 000 független kiónt tartalmaz.
A második könyvtárból körülbelül 50 000 kiónt vizsgáltunk át a pBMT2 EcoRI-EcoRI inszertjének megfelelő radioaktív próba alkalmazásával. Csak egyetlen klón volt megfigyelhető, azaz a pTG2759 jelű plazmid, amely egy 1,8 kb méretű inszertet tartalmaz. Ennek az inszertnek a méretét nem tartjuk elegendőnek ahhoz, hogy a teljes Tbpl-et kódoló gént tartalmazza.
Az előző paragrafusban leírt módszer alkalmazásával egy harmadik DNS-könyvtárat állítunk elő, azzal a különbséggel, hogy az Escherichia coli 5K törzs helyett Escherichia coli SURE törzset (Stratagene) használunk. Becslésünk szerint ez a könyvtár körülbelül 60 000 független kiónt tartalmaz.
A harmadik DNS-könyvtárból körülbelül 70 000 kiónt vizsgálunk meg, az alábbi, 2 példában leírt és a 4. ábrán bemutatott pTG2754 plazmid inszertjéből származó 2,4 kb méretű Mlui-HincII fragmentnek megfelelő radioaktív próba alkalmazásával. Két klón mutatható ki, azaz a pTG2780 és a pTG2781 jelű plazmidok, amelyeket a 3. ábrán mutatunk be.
A pTG2780 és a pTG2781 inszertek szekvenciáját a Sanger-módszerrel állapítottuk meg. A nukleotidszekvenciát, valamint a megfelelő aminosavszekvenciát rendre a SEQ ID NO. 3-on, illetve 4-en mutatjuk be.
Egy negyedik könyvtárat is készítünk. A genomiális DNS-t Sau3A restrikciós enzimmel emésztjük, majd a körülbelül 7 kb méretű fragmenteket tartalmazó frakciót szacharózgradiensen tisztítjuk. Ez a frakció tartalmaz egy olyan fragmentet, amely a tbpl,2 lokusznak felel meg, mivel a tbp2-re specifikus DNS-próba felismeri. EcoRV és Xbal enzimekkel végzett emésztés, majd Smal és Xbal enzimekkel emésztett pTG1265 plazmidba való ligálás után Escherichia coli 5K törzset transzformálunk a ligálóeleggyel. A kiónokat tbp2-re specifikus próbával vizsgáljuk át. A pozitív kiónok közül a pTG3791 plazmidot vizsgáltuk át alaposabban, és azt
HU 219 267 Β találtuk, hogy tbp2 5’ szekvenciákat tartalmaz, beleértve azt a szekvenciát is, amely a Tbp2 feltételezett szignálpeptidjét kódolja.
2. példa 5
Az IM2169 törzs transzferrinreceptorának Tbpl és
Tbp2 alegységeit kódoló DNS-ffagment klónozása
2A)-Az IM2169 törzs tenyésztését és a transzferrinreceptor tisztítását az IA) példában leírtak alapján hajtjuk végre.
2B)-Az IM2169 törzs receptora elleni antiszérumot az IB) példában leírtak alapján állítjuk elő.
2C)-A DNS-fragmentek azonosítását lehetővé tevő peptidszekvenciákat az IC) példában leírtak alapján határozzuk meg. A megállapított mikroszekvenciák az alábbiak.
A Tbpl N-terminálisának konszenzus szekvenciája:
ENVQAGQAQEKQLXXIQVX A Tbpl belső peptidek szekvenciái:
S1031: XLS(E,W)NAGXVLXPADX S1032: QLDTIQVK S1033: TAGSSGAINEEIEYENXX S1034: YVTWENVDXXXXXX A Tbp2 N-terminálisának konszenzus szekvenciája:
SLVXAXSFDLXSV A Tbp2 belső peptidjeinek szekvenciái:
S1037: XXDNLSNAX
S1035: XGDDGYIFYXGEKPX S1036: XQGXYGFAMX S1040: XQATGHENFQYVYSGXFYK
2D)-Az IM2169 törzs genomiális DNS-t az ID) példában leírtak alapján hajtjuk végre.
2E)- Klónozás
Az első genomiális DNS-könyvtárat (a DNS Sau3Aval végzett részleges emésztésével kapott fragmentek; pTG1265; Escherichia coli 5K) az 1. példában leírtak alapján készítjük. A becsléseink szerint ez a könyvtár körülbelül 40 000 független kiónt tartalmaz, amelyeknek körülbelül 70%-ban található 4-6 kb méretű inszert.
Ebből a könyvtárból 130 000 kiónt vizsgálunk át a pBMT2 EcoRI-EcoRl inszertjének megfelelő radioaktív próba felhasználásával. 42 kiónt vizsgáltunk meg alaposabban, ezek közül kettőt megtartottunk, a pTG2753 és a pTG2754 plazmidokat, amelyeket a 4. ábrán mutatunk be. A Southern biot elemzések azt mutatták, hogy a pTG2753 és a pTG2754 inszertjeinek a restrikciós térképei megfelelnek a genomiális DNS restrikciós térképének.
A nukleotidszekvenciák meghatározása, valamint az olyan régiók keresése, amelyek az N-terminálist, illetve a belső régiókat kódolják, az alábbiakat igazolta:
- a pTG2753 1,9 kb méretű inszertje tartalmazza a tbp2 gén 3’ részét és a tbpl gén 5’ részét; és
- a pTG2754 inszert tartalmazza a tbp2 gén 3’ részét, valamint a tbpl gén 5’ és 3’ részét oly módon, hogy közöttük a leolvasási fázis elromlott.
Ez az első könyvtár tehát nem tette lehetővé, hogy a Tbpl-et vagy Tbp2-t kódoló teljes DNS-fragmenteket klónozzuk.
A fentiek szerint egy második genomiális könyvtárat állítunk elő, de az Xbal restrikciós enzimmel emésztett genomiális DNS-ből. A DNS-fragmenteket szacharózgradiensen végzett frakcionálás után tisztítjuk. Mindegyik frakciót (körülbelül 500 pl) Southern blottal vizsgálunk, a tbpl 3’ végének (a pTG2754 inszert fragmentje) megfelelő radioaktív próba alkalmazásával. Azt a frakciót, amely hibridizációs reakciót mutat, és körülbelül 6 kb méretű fragmenteket tartalmaz, pTG1265 plazmidba klónozzuk. Az Escherichia coli 5K törzset transzformáljuk a ligálóeleggyel.
Ebből a könyvtárból körülbelül 2400 kiónt vizsgálunk át, a pTG2754-ből nyert 0,6 kb méretű HincIIMlul fragmentnek megfelelő radioaktív próba felhasználásával. Öt kiónt jellemeztünk, amelyek közül kettőt tartottunk meg, azaz a pTG3720-at és a pTG3721-et, amelyet a 4. ábrán mutatunk be. Mindkettő tartalmazza a tbpl és tbp2 géneket.
Abból a célból, hogy teljesen meghatározzuk a Tbpl-et kódoló nukleotidszekvenciát, a pTG3720 inszertet abban a régióban szekvenáljuk, ahol a leolvasási fázis elromlását figyeltük meg a pTG2754-ben. Ez a szekvenálás kimutatta, hogy a pTG2754 inszertben a fázis elromlását egy 22 bp méretű deléció okozta. A DNS-ffagment teljes szekvenciáját a SEQ ID NO. 5ben mutatjuk be.
A pTG3720 inszertjének szekvenciáját is meghatároztuk, azzal a céllal, hogy a tbp2 szekvenciáját megkapjuk. Az említett szekvenciát ismét sikerült azonosítani, de ebben az esetben is elromlott a leolvasási fázis.
Végezetül a tbp2 szekvenciáját a pTG3721 plazmidból határoztuk meg. Ez a SEQ ID NO. 7-en látható.
3. példa
Az IM2394 törzs Tbp2 alegységét kódoló DNSffagment expressziója 3A) A pTG3749 expressziós vektor készítése A pARA13 plazmid [5. ábra; Cagnon et al., Prot.
Eng., 4, 843 (1991)] Sphl hasítási helyét Klenow-polimerázzal kezelve elrontjuk, így kapjuk a pTG3704 plazmidot. A pTG3704 plazmidot Ncol hasítással linearizáljuk, tompa végek előállítása céljából Klenow-polimerázzal kezeljük, majd Hindin restrikciós enzimmel emésztjük.
Ezek mellett az OTG4015 és az OTG4016 jelű oligonukleotidokat is megszintetizáljuk, majd egymáshoz illesztjük őket.
OTG4015: 5’ AAATACCTATTGCCTACGGCAGCCGCTGGACTGTTATTACT
CGCTGCCCAACCAGCGATGGCATGCTTTCCCACGCGTTTTCCCA 3’
OTG4 016: 5’AGCTTGGGAAAACGCGTGGGAAAGCATGCCATCGCTGGTTGGGCA GCGAGTAATAACAGTCCAGCGGCTGCCGTAGGCAATAGGTATTT 3’
HU 219 267 Β
Az OTG4015/OTG4016 kétszálú fragmentet a fentiek szerint kezelt pARA13 plazmidba építjük be, így kapjuk a pTG3717 jelű plazmidot, amelyben az Erwinia carotovora pelB fehérjéje prekurzorának N-terminális részét kódoló szekvencia ezáltal ismét helyreáll [Lei et al., Journal of Bacteriology, 169, 4379 (1987)], azaz:
.ATG AAA TAC CTA TTG CCT ACG GCA GCC | GCT | GGA | CTG | ||||||||
Me t | Ly s | Tyr | Leu | Leu | Pro | Thr | Alá Alá | Alá | Gly | Leu | |
Sphl | |||||||||||
TTA | TTA | CTC | GCT | GCC | CAA | CCA | GCG | ATG GCA | TGCTTT | ||
Leu | Leu | Leu | Al a | Al a | Gin | Pro | Al a | Met Alá |
Miül HindlII
CCCACGCGTTTTCCCA AGCTT....................
(A pTG3704 végei alá vannak húzva)
A pTG2749 plazmidból kiindulva PCR-módszerrel, az OTG4011 és az OTG4012 indítómolekulák felhasználásával előállítunk egy fragmentet, amely kódolja a
Tbp2 N-terminális részét, egészen a belső Miül hasítási helyig (6. ábra).
OTG4011:
BamHI Sphl
5’ AAAAAGGATCC/GCA | TGC | CTG | GGT GGC | GGC | GGC | AGT | TTC 3 |
Cys | Leu | Gly ... | |||||
OTG4012: | |||||||
BamHI | Miül | ||||||
5’ AAAAGGATCCG AAT | GGT | GTA | ACG CGT | AGT | TTT | TAT | 3’ |
A PCR-rel előállított fragmentet BamHI restrikciós enzimmel emésztjük, majd az M13TG131 fág BamHI hasítási helyére építjük be, így kapjuk az M13TG3724 fágot. Ennek a fragmentnek a szekvenciáját szekvenálással határozzuk meg.
A Tbp2 N-terminálisát kódoló régiót kinyeijük az M13TG3724-ből egy Sphl-Mlul fragment formájában, majd az előzetesen Sphl és Miül enzimekkel emésztett pTG3727 plazmidba juttatjuk be, így kapjuk a pTG3743 plazmidot. A pBMTl plazmidból kiindulva a Tbp2 Cterminálisát kódoló régiót egy Mlul-Banl fragment formájában nyeljük ki, amelynek a tapadós a Báni végét Klenow-polimerázos kezeléssel tompa végűvé alakítjuk. Ezt a fragmentet az előzetesen Hindii restrikciós enzimmel emésztett, Klenow-polimerázzal tompa végűvé alakított, majd Miül restrikciós enzimmel emésztett pTG3743 plazmidba építjük be. így kapjuk a pTG3749 plazmidot.
3B) A Tbp2 alegység előállítása
Az Escherichia coli MC1061 törzse [Casadaban and Cohen, Journal of Molecular Biology, 138, 197 (1980)] transzformáljuk a pTG3749 plazmiddal, majd 2 g/1 glicerinnel és 100 pg/ml ampicillinnel kiegészített LB-táptalajban inkubáljuk 37 °C-on. Az exponenciális fázisban levő tenyészethez 0,2 g/1 arabinózt adunk. Az inkubálást további 6 óra hosszat folytatjuk. Az expressziót az arabinóz hozzáadása után 1 órán belül észleltük.
Egy teljes sejtlizátumminta poli(akrilamid)-gélen végzett elektroforézisével ki lehet mutatni egy körülbelül 70 kDa méretű fehéije jelenlétét, amely képes a peroxidázzal jelzett humán transzferrinhez kötődni.
4. példa
Az IM2169 törzs Tbp2 alegységét kódoló DNS-fragment expressziója
4A) A pTG3779 expressziós vektor készítése
Az előzőleg egymással párosított OTG4038 és OTG4039 oligonukleotidokat tartalmazó szintetikus fragmentet építünk be a pTG3704 plazmidba, amelyet Ncol és HindlII restrikciós enzimekkel emésztettünk, így kapjuk a pTG3756 plazmidot.
OTG4038:
5’ CATGGCTGCAGGRACCACGCGTGAATTCCCCGGGTCTAGA 3’ OTG4039:
5’ AGCTTCTAGACCCGGGGAATTCACGCGTGGTACCTGCAGC 3’
A pTG2754 plazmidból PCR-módszerrel, az val állítjuk elő a Tbpl N-terminális prekurzorát kódoló OTG4037 és az OTG4014 indítómolekulák alkalmazásá- 55 régiót tartalmazó fragmentet, az Miül hasítási helyig.
OTG4037:
5’ TTTCCCGGATCCGC ATG CAA CAG CAA CAT TTG TTC CGA TTA 3’
BamHI Sphl
Me t Gin Gin Gin ...
HU 219 267 Β
OTG4014:
5’ AAAAGGATCCGGGGTCGTAACGCGTCAGGTCGCGG 3’ BamHI Miül
Ezt a PCR-fragmentet BamHI restrikciós enzim- 5 mel emésztjük, majd az M13TG131 plazmid BamHI hasítási helyére klónozzuk, így kapjuk az M13TG3738 plazmidot. Ennek a fragmentnek a szekvenciáját igazoljuk.
Az M13TG3738 plazmidot azután Sphl restrikciós enzimmel linearizáljuk, a végeket T4 DNS-polimerázzal kezeljük, hogy tompa végeket állítsunk elő, majd Miül restrikciós enzimmel emésztjük, hogy azt a fragmentet állítsuk elő, amely a Tbpl prekurzor N-terminálisát kódoló régiót hordozza. 15
Ezt a fragmentet Ncol restrikciós enzimmel emésztett, majd T4 DNS-polimerázzal tompa végűvé tett, és Miül restrikciós enzimmel emésztett pTG3756 plazmidba építjük be, így állítjuk elő a pTG3778 plazmidot Az Ncol°/Sphl° kapcsolódás szekvenciáját meg- 20 határozzuk.
A pTG3720 plazmid Mlul-Xbal fragmentjét, amely a Tbpl legnagyobb részét kódolja (3’ tbpl) a pTG3778 plazmidba építjük be. A végeredményben kapott plazmid jele pTG3779.
4B) A Tbpl alegység előállítása
Az Escherichia coli MC1061 törzset a pTG3779 plazmiddal transzformáljuk, majd 37 °C-on LB-táptalajban tenyésztjük. Az exponenciális fázisban levő tenyészethez 0,2 g/1 arabinózt adunk. Az inkubálást ιοί 0 vábbi 4 óra hosszat folytatjuk.
Egy teljes sejtlizátum poli(akrilamid) gélelektroforézisével igazolható egy körülbelül 100 kDa méretű feltétje jelenléte, amelyet az antireceptor antitestek felismernek.
5. példa
Az IM2394 törzs Tbp2 alegységét kódoló DNSfragment expressziója (előállítás a homológ szignálszekvenciával)
5A) A pTG4710 expressziós vektor készítése
A pTG3749 plazmidból PCR-eljárással, az OTG4247 és OTG4248 indítómolekulák alkalmazásával előállítjuk a Tbp2 C-terminálisát kódoló fragmentet (a belső BamHI helytől), amely egy HindlII restrikciós hasítási helyet tar25 talmaz a tbp2 transzlációs terminációs kodonja előtt.
OTG4247:
5’ GGCTTTGCGCTGGATCCGCAAAATACC 3’
BamHI
OTG4248:
5’ CCCAAAAGATCTCCAAGCTTGAAGCCTTATTCTCGATTGTTCGGCAGCC 3’ HindlII
A PCR-rel előállított fragmentet HindlII és BamHI restrikciós enzimekkel emésztjük, és a pTG3749 plaz- 35 midből származó SphI-BamHI fragmenttel együtt, amely az érett Tbp2 N-terminálisát kódolja, egyszerre beépítjük a pTG3743 vektorba, amelyet Sphl és HindlII restrikciós enzimekkel emésztettünk, így kapjuk a pTG3786 plazmidot. A PCR-rel amplifikált fragment szekvenciáját ellenőrizzük.
A pTG3791 plazmidból az OTG4491 és OTG4494 indítómolekulák segítségével PVR-módszerrel előállítunk egy fragmentet, amely a Tbp2 prekurzor N-terminális részét kódolja, az EcoRV belső hasítási helyig.
OTG4491:
BspHI , TTTTTTGGATCCTCATG CCA TTG GTA CAG GCT
Met Asn Asn Pro Leu Val Asn Glu Alá
Spgl
GCT ATC GTG CTG CCT GTC TTT TTG TTG AGT GCA TGC CTG GGT
Alá Met Val Leu Pro Val Phe Leu Leu Ser Alá Cys Leu Gly
A szignálpeptid hasítási helye
OTG4494:
5’ TTTTTTGGATCCGATATCCGTCAGGTCCAAAAAGAACTATATTATTC 3’ EcoRV
A PCR-rel előállított fragmentet BspHI és EcoRV restrikciós enzimekkel emésztjük, majd a pTG3704 plazmid NcoI-SstI fragmentjével együtt, amely az araC gént és az araB promotert, valamint a pTG3786 EcoRV-SstI részével együtt, amely a tbp2 gén 3’ részét és az araB terminátort tartalmazza, egyszerre ligáljuk. A keletkező pTG4710 plazmidot szekvenálással ellenőrizzük (a PCR-rel amplifikált részt).
5B) A Tbp2 alegység előállítása
Az Escherichia coli Xac-I törzset [Normanly et al.,
Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 83, 6548 (1986)] transzformáljuk a pTG4710 plazmiddal, majd 37 °C-on tenyésztjük, M9+szukcinát+ +50 pg/ml arginin+100 pg/ml ampicillin összetételű táptalajban. Az exponenciális fázisban 0,2% arabinózt adunk hozzá. Különböző indukciós idő alkalmazása
HU 219 267 Β után (1-3 óra) a sejteket kinyerjük, és kivonatot készítünk belőlük. A Westem-blottal végzett elemzéssel ki lehet mutatni, a Tbp2 transzferrin-peroxidázzal való előhívása után, hogy a Tbp2 legnagyobb része prekurzor formában található. A kivonatok SDS-PAGE-vel való elválasztása, majd Coomassie-val való elemzése után ki lehet mutatni a fehérje nagy mennyiségben való termelődését (körülbelül 5-10%-a az összfehéije mennyiségének). A triciált palmitáttal és triciált glicerinnel végzett in vivő jelzési kísérletek lehetővé tették annak igazolását, hogy csak az érett forma van lipidálva.
6. példa
Az IM2394 törzs Tbp2 alegységét kódoló DNSfragment expressziója (a konstrukció az rlpB szignálszekvenciával készül)
6A) A pTG4764 expressziós vektor készítése
A pTG3786 plazmidból PCR-módszerrel, az
OTG4494 és az OTG4651 indítómolekulák alkalmazásával előállítunk egy fragmentet, amely az RlpB szignálpeptidet kódolja [Takase et al., Journal of Bacte10 riology, 169, 5692 (1987)], valamint az érett Tbp2 szekvenciának az elejét a belső EcoRV hasítási helyig.
OTG4494:
5’ TTTTTTGGATCCGATATCCGTCAGGTCCAAAAAGAACTATATTATTC 3’
EcoRV
OTG4651:
BspHI
5’ TTTTTTTCATG AGA TAC CTG GCA ACA TTG TTG TTA TCT Met Arg Tyr Leu Ala Thr Leu Leu Leu Ser
CTG GCG GTG TTA ATC ACC GCC GGG TGC CTG GGT GGC
Leu Ala Val Leu Ile Thr Ala Gly Cys Leu Gly ...
A szignálpeptid hasítási helye
GGC GGC AGT TTC 3’
A PCR-fragmentet azután BspHI és EcoRV enzimekkel emésztjük, majd a pTG3786 plazmid EcoRVHindlII fragmentjével együtt, amely a tbp2 gén 3’ részét kódolja, egyszerre építjük be az Ncol és HindlII restrikciós enzimekkel emésztett pTG3704 plazmidba, így kapjuk a pTG4764 plazmidot. A PCR-rel ampli- 30 fikáit fragment szekvenciáját ellenőrizzük.
6B) A Tbp2 alegység előállítása
Az Escherichia coli Xac-1 törzset transzformáljuk a pTG4764 plazmiddal, majd 37 °C-on tenyésztjük M9+0,5% szukcinát+50 pg/ml arginin+100 pg/ml 35 ampicillin összetételű táptalajban. Az exponenciális fázisban 0,2% arabinózt adunk hozzá. Különböző indukciós idő alkalmazása után (1-3 óra) a sejteket kinyerjük, és kivonatot készítünk belőlük. Western blottal végzett elemzéssel a Tbp2 transzferrin-peroxidázzal való 40 előhívása után ki lehet mutatni egy fő csíkot, amely a molekulatömeg alapján tisztított, érett Tbp2-nek felel meg. A kivonatok SDS-PAGE-vel való elválasztása, majd Coomassie-val való elemzése után ki lehet mutatni a fehérje nagy mennyiségben való termelődését (kő- 45 rülbelül 2-5%-a az összfehérje mennyiségének). A triciált palmitáttal és triciált glicerinnel végzett in vivő jelzési kísérletek lehetővé tették annak igazolását, hogy csak az érett forma van lipidálva. Az Xac-I/pTG4764 gazdavektorrendszerrel előállított érett, lipidált Tbp2 mennyisége nagyobb az Xac-I/pTG4710 gazdavektorrendszerrel előállítottnál.
Szekvencialista
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 1-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 1808 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (iv) EREDETE:
(A) ORGANIZMUS: a transzferrinreceptor Tbp2 alegységét kódoló DNS (B) FORRÁS: Neisseria meningitidis IM2394 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...60 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: érett fehéije (B) NUKLEOTIDOK: 61...1797 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1...1797 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 1:
atc Két -20 | AAC Adn | AAT Asn | CCA TTG GTA | AAT Aon | CAG Cin | CCT Ala | GCT Ala | ATG Két -10 | GTG Val | CTG Leu | CCT Pro | GTG Val | TTT Phe -5 | 48 | ||
bro | Leu | Val -15 | ||||||||||||||
TTC | TTG | AGT | GCT | TCT | CTG | GGT | GGC | CGC | GGC | AGT | TTC | CAT | TTG | CAC | AGC | 96 |
Leu | Led | Ser | Ala | Cye | Leu | Cly | cly | Cly | Gly | Ser | Phe | Aop | Leu | Anp | Ser |
HU 219 267 Β
10
GTG | GAÁ | ACC | GTC | CAA | GAT | ATG | CAC | TCC | AAA | CCT AAG | TAT | GAG | CAT | CAA | 144 |
Val | Clu | Thr | Val | Gin | Aep | Met | lile | Ser | Lye | Pro Lye | Tyr | Glu | Aep | Clu | |
Í5 | 20 | 25 | |||||||||||||
ΛΑΛ | AGC | cAg | CCT | GAA | AGC | CAA | CAG | GAT | GTA | TCG GAA | AAC | AGC | GCC | GCG | 192 |
Lye | Ser | Gin | t>ro | Glu | Ser | Gin | Gin | Anp | Val | Ser Clu | Aen | Ser | Cly | Ala | |
30 | 35 | 40 | |||||||||||||
GCT | TAT | CGC | TTT | GCA | GTA | AAA | CTA | CCT | CGC | CCG AAT | GCA | CAT | TTT | AAT | 240 |
Ala | Tyr | Ciy | Phe | Ala | Val | Lye | Leu | Pro | Arg | Arg Aen | Ala | lile | Phe | Aen | |
45 | 50 | 55 | 60 | ||||||||||||
CCT | AÁA | TAT | AAG | GAA | AAG | CAC | AAA | CCA | TTG | GCT TCA | ATC | CAT | TGG | AAA | 288 |
Pro | Lye | Tyr | ty e | clu | Lye | Hle | Lye | Pro | L e u | Cly Ser | Met | Aep | Trp | Ly e | |
65 | 70 | 75 | |||||||||||||
ΛΛΛ | CTG | CAA | ACA | GGA | CAA | CCA | AAT | AGT | TTT | AGT GAC | AGG | CAT | GAA | TTG | 336 |
Lye | Leu | Gin | Arg | Gly | Glu | Pro | Aen | Ser | Phe | Ser Glu | Arg | Aep | Glu | Leu | |
80 | 85 | 90 | |||||||||||||
CAA | AAA | AAA | CGG | GGT | AGT | TCT | GAA | CTT | ATT | GAA TCA | AAA | TGG | GAA | CAT | 384 |
Glu | Lye | Ly b | Arg | Gly | Ser | Ser | Glu | Leu | Ile | Glu Ser | Lye | Trp | Clu | Anp | |
95 | 100 | 105 | |||||||||||||
GGG | CAA | AGT | CGT | GTA | GTT | GGT | TAT | ACA | AAT | TTC ACT | TAT | CTC | CGT | TCG | 432 |
Gly | Gin | Ser | Arg | Val | Val | Gly | Tyr | Thr | Ann | Phe Thr | Tyr | Val | Arg | Ser | |
110 | 115 | 120 | |||||||||||||
GCA | TAT | GTT | TAC | CTT | AAT | AAA | AAT | AAT | ATT | GAT ATT | AAG | AAT | AAT | ΛΤΛ | 480 |
Gly | Tyr | val | Tyr | Leu | Aen | Lye | Ann | Aen | I le | Anp Ile | Lye | Ann | Ann | I le | |
125 | 130 | 135 | 140 | ||||||||||||
GTT | CTT | TTT | GGA | CCT | CAC | CCA | TAT | CTT | TAC | TAT AAA | GCG | AAA | CAA | CCT | 528 |
Val | Leu | Plie | Gly | Pro | Aep | Gly | Tyr | Leu | Tyr | Tyr Lye | Gly | Lye | Clu | Pro | |
145 | ISO | 155 | |||||||||||||
TCC | AAG | GAG | CTG | CCA | TCC | GAA | AAG | ΛΤΛ | ACT | TAT AAA | GGT | ACT | TGG | GAT | 576 |
Ser | Lys | Glu | LeU | Pro | Ser | Glu | Lye | 1 Le | Thr | Tyr Lyn | ciy | Thr | Trp | Aep | |
160 | 165 | 1 70 | |||||||||||||
TAT | CTT | ACT | GAT | GCT | ATC | GAA | AAA | CAA | AGC | TTT GAA | GCA | TTC | GGT | AGT | 624 |
Tyr | Val | Thr | Ab( | Ala | Met | Glu | Lye | Gin | Arg | Phe Glu | Gly | Leu | Gly | Ser | |
175 | 180 | 185 | |||||||||||||
GCA | GCA | GGA | GGA | GAT | AAA | TCG | GGG | GCG | TTG | TCT GCA | TTA | CAA | CAA | GGG | 672 |
Ala | Alá | Gly | Gly | Aep | Lye | Ser | Gly | Ala | Leu | Ser Ala | Leu | Glu | Glu | Cly | |
190 | 195 | 200 | |||||||||||||
CTA | TTG | CGT | AAT | CAG | CCA | GAG | GCA | TCA | TCC | GGT CAT | ACC | GAT | TTT | GGT | 720 |
Val | Leu | Arg | Aen | Gin | Ala | Clu | Ala | Ser | Ser | Gly lile | Thr | Aep | Phe | Gly | |
205 | 210 | 215 | 220 |
HU 219 267 Β
atc /let | ACT AGT GAG | TTT GAC GTT GAT TTT | TCT CAT | ΛΛΛ ACA ATA AAC GCC | 768 | |||||||||
Thr | Ser Glu | Phe 225 | Glu | val | Aep | Phe | Ser 230 | Aep | Lye | Thr | I le | Lye Gly 235 | ||
ACA | CTT | TAT CGT | aAc | AAC | CGT | ATT | ACT | CAA | AAT | AAT | AGT | GAA | AAC AAA | 816 |
Thr | Leu | Tyr Arg | Aen | Aen | Arg | I le | Thr | Cin | Aen | Aon | Ser | GlU | Ann Lye | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||
CAA | ATA | AAA ACT | ACG | CGT | TAC | ACC | ATT | CAA | CCA | ACT | CTT | CAC | GGC AAC | 864 |
Gin | lle | Lye Thr | Thr | Arg | Tyr | Thr | 1 le | Cin | Alá | Thr | Leu | Ilin | Gly Aen | |
255 | 260 | 265 | ||||||||||||
CGT | TTC | AAA GGT | AAG | CCC | TTC | GCG | CCA | GAT | AAA | GGT | GCA | ACA | AAT GGA | 912 |
Arg | Phe | Lye Gly | Lye | Alá | Leu | Alá | Alá | Aep | Ly e | Cly | Alá | Thr | Aen Gly | |
270 | 275 | 280 | ||||||||||||
ACT | CAT | CCC TTT | ATT | TCC | GAC | TCC | GAC | AGT | TTG | CAA | GGC | CGA | TTT TAC | 960 |
Ser | Hle | t>ro Phe | Ile | Ser | Aep | Ser | Aep | Ser | Leu | Glu | cly | Gly | Phe Tyr | |
285 | 290 | 295 | 300 | |||||||||||
GGG | CCC | AAA GGC | GAC | GAA | CTT | GCC | GGT | AAA | TTC | TTC | ACC | AAC | CAC AAC | 1008 |
Gly | Pro | Lye Cly | Clu | Clu | Leu | Alá | Gly | Lyo | Phe | Leu | Ser | Ann | Aop Aen | |
305 | 310 | 315 | ||||||||||||
AAA | GTT | GCA CCG | GTC | TTT | GGT | GCG | AAG | CAC | AAA | GAT | AAC | AAG | GAT GCG | 1056 |
Lye | vál | Alá λ la· | Val | Phe | Gly | A le | Lye | Gin | Lye | Aop | Lye | Lyo | Aep Gly | |
320 | 325 | 330 | ||||||||||||
GAA | AAC | GCG GCA | GGC | CCT | GCA | ACG | CAA | ACC | GTG | ATA | CAT | CCA | TAC CGT | 1104 |
Glu | λβη | Alá Alá | Cly | Pro | Alá | Thr | Glu | Thr | Val | Ile | Λβρ | Alá | Tyr Arg | |
335 | 340 | 345 | ||||||||||||
ATT | ACC | GGC CAG | GAG | TTT | AAG | AAA | GAG | CAA | ATA | CAC | ACT | TTT | GGA CAT | 1152 |
Ile | Thr | Gly GlU | clu | Phe | Lye | Lye | Glu | Gin | Ile | Aep | Sor | 1’ he | Gly Anp | |
350 | 355 | 360 | ||||||||||||
GTC | AAA | AAC CTC | CTG | GTT | GAC | CGA | GTC | GAC | CTT | TCA | CTG | CTG | CCC TCT | 1200 |
val | Lye | Lye Leu | Leu | Val | Aep | Gly | Val | Gl«i | Leu | Ser | Leu | Leu | Pro Set | |
365 | 370 | 375 | 380 | |||||||||||
GAC | CCC | AAT AAG | CCC | CCA | TTT | CAG | CAC | GAC | ATT | GAC | CAA | AAC | CCC GTG | 1248 |
Glu | Gly | Aen Lye | Alá | Alá | Phe | Cin | (í i e | Glu | I le | Clu | Gin | Aon | Cly Val | |
385 | 390 | 395 | ||||||||||||
AAG | GCA | ACG GTG | TGT | TGT | TCC | AAC | TTG | GAT | TAC | ATG | AGT | TTT | GGG AAC | 1296 |
Lye | Alá | Thr val | Cye | Cye | Ser | Ann | Leu | Aep | Tyr | Mel | Ser | Phe | Gly Lye | |
400 | 405 | 410 | ||||||||||||
CTG | TCA | AAA GAA | AAT | AAA | GAC | CAT | ATG | TTC | CTC | CAA | CGT | CTC | CGC ACT | 1344 |
Leu | Ser | Lye Glu | Aen | Lye | Aep | Aep | Met | Phe | Leu | Gin | Cly | Val | Arg Thr | |
415 | 420 | 425 | ||||||||||||
CCA | GTA | TCC CAT | GTC | GCG | GCA | AGG | ACG | CAG | CCA | AAC | GCC | AAA | TAT CGC | 1392 |
Pro | Val | Set Aep | Val | Alá | Alá | Arg | Thr | Clu | Alá | Aen | Alá | Lye | Tyr Arg | |
430 | 435 | 440 |
HU 219 267 Β
GCT Gly 445 | ACT Thr | TGC Trp | TAC Tyr | GGA TAT ATT GCC AAC GGC ACA AC-C TGG ACC CCC CAA | 1440 | |||||||||||
Gly | Tyr 450 | Ile | Ala | Ann | Cly | Tilt 455 | Sec | Trp | Ser | Cly | Clu 460 | |||||
GCC | TCC | ΛΛΤ | CAG | CAA | GGT | GCT | ΑΛΤ | ACG | CCA | CAG | TTT | GAC | GTC | GAT | TTT | 1488 |
Ala | Ser | Aen | Cin | GlU | Gly | Gly | Aen | Arg | Ala | Glu | Phe | Aep | Val | Aep | Phe | |
465 | 470 | 475 | ||||||||||||||
TCC | ACT | AAA | AAA | ATC | ACT | GGC | ACA | CTG | ACG | GCA | AAA | GAC | CGT | ACG | TCT | 1536 |
Ser | Thr | Lys | Lyd | ile | Ser | Cly | Thr | Leu | Thr | Ala | Lye | Aep | Arg | The | Ser | |
480 | 485 | 490 | ||||||||||||||
CCT | CCC | TTT | ACT | ATT | ACT | CCC | ATC | ATT | AAG | CAC | AAC | CCT | TTT | TCA | CCT | 1584 |
Pro | Ala | Phe | Thr | Ile | Thr | Ala | Két | He | Ly β | Aep | Aen | Cly | The | Ser | Oly | |
495 | 500 | 505 | ||||||||||||||
GTG | tíCG | AÁA | ACC | GGT | GAA | AAC | CGC | TTT | GCG | CTC | GAT | CCC | CAA | ΛΛΤ | ACC | 1632 |
Val | Alá | Lye | Thr | Gly | Glu | Aon | Gly | Phe | Ala | Leu | Aep | Pro | Cin | Aen | Thr | |
510 | 515 | 520 | ||||||||||||||
GGA | ΛΛΤ | TCC | CAC | TAT | ACG | CAT | ATT | GAA | GCC | ACT | GTA | TCC | CCC | GGT | TTC | 1680 |
Gly | Aen | Ser | ille | Tyr | Thr | lile | Ile | Glu | Ala | The | Val | Ser | Cly | Gly | Phe | |
525 | 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
TAC | GGC | AAA | AAC ,bcC | ATC | CAG | ATG | CCC | GCA | TCG | TTC | TCA | TTT | CCC | GGA | 1728 | |
Tyr | Cly | Lys | Áeh | Ala | iíe | Glu | Két | Gly | Cly | Ser | Phe | Ser | Phe | Pro | Cly | |
545 | 550 | 555 | ||||||||||||||
ΑΛΤ | GCA | CCA | GAG | GCA | ΛΑΛ | CAA | GAA | AAA | GCA | TCC | GTG | CTA | TTC | GCT | GCG | 1776 |
Asn | Alá | Pro | Glu | Gly | Lye | Gin | Glu | Lye | Ala | Ser | Val | Val | Phe | Gly | Ala | |
560 | 565 | 570 | ||||||||||||||
ΛΛΛ | CCC | CAA | CAG | CTT | CTC | CAA | TAAGCACCCC | T | 1808 | |||||||
Lye | Arg | Cin | Gin | Leu | Val | Gin |
575
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 2-RŐL (C) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: 40 (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje
(A) | HOSSZ: 595 | aminc | isav | (xi)A | SZÉK | VENC | IALE! | [RASA | : SEQ | ' ID NO. 2 | |||||
(B) | TÍPUS | : amin | losav | ||||||||||||
Hét | Aen | Aen | Pro | Leu | val | Aen | Gin | Ala | Ala | Met | Val | Leu | Pro | Val | Phe |
-20 | -15 | -10 | -5 | ||||||||||||
Leu | Leu | Ser | Ala | Cye | Leu | Gly | Gly | Gly | Gly | Ser | Phe | Aep | Leu | Aep | 5er |
1 | 5 | 10 | |||||||||||||
Val | Glu | Thr | Val | GÍn | Aep | Met | lile | Ser | Lye | Pro | Lye | Tyr | Glu | Aep | Glu |
Í5 | 20 | 25 | |||||||||||||
Lys | Ser | Gin | Pro | Glu | Ser | Gin | Gin | Aep | Val | Ser | Glu | Aen | Ser | Gly | Ala |
30 | 35 | 40 | |||||||||||||
Ala | Tyr | Cly | Phe | Ma | Val | Lye | Leu | Pro | Arg | Arg | Aen | Ala | lile | Phe | Aeh |
45 | 50 | 55 | 60 |
HU 219 267 Β
Pro | Lye | Tyr | Lye | Glu 65 | Lye | lile | Lye | Pro | Leu 70 | Gly | Ser | Hét Aop Trp ' 75 | Ly e |
Lye | Leu | Cin | Ar$ 80 | Giy | Glu | Pro | Aen | Ser 85 | Phe | Sec | Glu | Arg Anp Glu 90 | Leu |
Glu | Lys | Lye 95 | Arg | Gly | Ser | Ser | Glu 100 | Leu | Ile | Clu | Ser | Lye Trp Glu , 105 | Aep |
Gly | Gin 110 | Ser | Arg | Val | Val | Gly 115 | Tyr | Thr | Aen | Phe | Thr 120 | Tyr Val Arg | Ser |
Gly 125 | Tyr | Val | Tyr | Leu | Aen 130 | Lye | Aon | Aon | Un | Aep 135 | Ile | Lyo Aen Aon | Ile 140 |
Val | Led | Phe | Gly | Pro 145 | Aep | Gly | Tyr | Leu | Tyr 150 | Tyr | Lys | Gly Lye Clu 155 | rto |
Ser | Lye | Clu | Leu 160 | Pro | Ser | Clu | Lye | Ile 165 | Thr | Tyr | Lye | Gly Thr Trp 170 | Anp |
Tyr | Val | Thr 175 | Aep | Ála | Hét | Glu | Lye 180 | Gin | Arg | Phe | Glu | Gly Leu Gly 185 | Ser |
Ma | Alá 190 | Gly | Gly | Aep | Lye | Ser 195 | Gly | Alá | Leu | Ser | Alá 200 | Leu Glu Glu | Gly |
Val 205 | Leu | Arg | Aen | Gin | Alá 210 | Glu | Alá | Ser | Ser | Gly 215 | lile | Thr Aep Phe | Gly 220 |
Hét | Thr | Ser | Glu | Phe 225 | Glu | val | Aep | Phe | Ser 230 | Aep | Lye | Thr Ile Lyo 235 | Gly |
Thr | Leu | Tyr | Arg 240 | Asn | Aen | Arg | He | Thr 245 | Cin | Aen | Aen | Ser Glu Aon 250 | Lyn |
Gin | Ile | Lye 255 | Thr | Thr | Arg | Tyr | Thr 260 | Ile | Gin | Alá | Thr | Leu Illő Gly 265 | Ann |
Arg | Phe 270 | Lye | Gly | Lye | Alá | Leu 275 | Alá | Alá | Anp | Lye | Gly 280 | Alá Thr Aon | Gly |
Ser 285 | lile | Pro | Phe | ile | Ser 290 | Aep | Ser | Aep | Ser | Leu 295 | Glu | Gly Gly Phe | Tyr 300 |
Gly | Pro | Lye | Oly | Glu 305 | Glu | Leu | Alá | Gly | Lye 310 | Phe | Leu | Ser Aen Aep 315 | Ann |
Lye | Val | Alá | Ma | val | Phe | Gly | Alá | Lye | Gin | Lye | Aep | Lyo Lyo Aep | Gly |
320 325 330
HU 219 267 Β
Glu | Aen | Alá | Alá | Gly | Pro | Alá | Thr | Glu | Thr | Val | Ile | Aep | Aln Tyr | Arg |
3Í5 | 340 | 345 | ||||||||||||
Ile | thr | Cly | clu | Gld | Phe | Lye | Lye | Glu | Cin | Ile | Aep | Ser | Phe Gly | Aep |
350 | 355 | 360 | ||||||||||||
Val | Lye | Lys | Led | Led | Val | Aep | Gly | Val | Clu | Leu | Ser | Leu | Leu Pro | Sér |
365 | 370 | 375 | 380 | |||||||||||
Clu | Gly | Aen | Lye | Alá | Alá | Phe | Gin | lile | Glu | Ile | Clu | Gin | Aen Cly | vál |
385 | 390 | 395 | ||||||||||||
Lye | Alá | Thk | Val | Cye | Cye | Ser | Aen | Leu | Aep | Tyr | Met | Ser | Phe Gly | Lye |
400 | 405 | 410 | ||||||||||||
Leu | Ser | Lyá | Glu | Aen | Lye | Aep | Aep | Met | Phe | Leu | Gin | Gly | Val Arg | Thr |
415 | 420 | 425 | ||||||||||||
Pro | val | Ser | Apd | Val | Alá | Alá | Arg | Thr | Glu | Aln | Aen | Alá | Lyn Tyr | Arg |
430 | 435 | 440 | ||||||||||||
Gly | Thr | Trp | Tyr | Gly | Tyr | Ile | Alá | Aen | Gly | Thr | Ser | Trp | Ser Gly | Glu |
445 | 450 | 455 | 460 | |||||||||||
Alá | Ser | Aen | Gin | Glu | Gly | Gly | Aen | Arg | A 1<1 | Clu | Phe | Anp | Val Anp | Pho |
465 | 470 | 475 | ||||||||||||
Ser | Thr | Lye | Lye | Ile | Ser | Gly | Thr | Leu | Thr | Alá | Lye | Aep | Arg Thr | Ser |
480 | 405 | 490 | ||||||||||||
Pro | Alá | Phe | Thr | Ile | Thr | Alá | Met | Ile | Lye | Agp | Aen | Gly | Phe Ser | Gly |
495 | 500 | 505 | ||||||||||||
val | Alá | Lye | Thr | Cly | Glu | Aen | Cly | Phe | Alá | Leu | Aep | Pro | Gin Aen | Thr |
510 | 515 | 520 | ||||||||||||
Cly | Aen | Ser | lile | Tyr | Thr | lile | I le | Glu | A l a | Thr | val | Ser | Gly Gly | Phe |
525 | 530 | 535 | 540 | |||||||||||
Tyr | Gly | Lye | Aen | Alá | Ile | Glu | Met | Gly | Gly | Ser | Phe | Ser | Phe Pro | Gly |
545 | 550 | 555 | ||||||||||||
Aan | Alá | Pro | Glu | Cly | Lye | Gin | Glu | Lye | Alá | Ser | Val | val | Phe Cly | Alá |
560 | 565 | 570 | ||||||||||||
Lys | Arg | Glh | Gin | Leu | Val | Gin |
575
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 3-RÓL 55 (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 2800 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris 60 (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (iv) EREDETE:
(A) ORGANIZMUS: a transzferrinreceptor Tbpl alegységét kódoló DNS (B) FORRÁS: Neisseria meningitidis IM2394 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
HU 219 267 Β (A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 40...111 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: érett fehérje (B) NUKLEOTIDOK: 112...2763 5 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 40.. .2763 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 3
CTTCCGATCC CGTCtGAAAG CGAACATTAC GCAAACACT ATG CAA CAG CAA CAT 54
Met Gin Gin Gin Illő -24 -20
TTC | TTC | CCA | ΤΤΛ | AAT | ATT | ΤΤΛ | TGC | CTG | TCT ΤΤΛ | ATG | ACC | GCG | CTG | CCC | 102 |
Leu | Phe | Arg | Led | Aeh | Ile | Leu | Cy e | Leu | Ser Leu | Met | Thr | Ala | Leu | Pro | |
-15 | -10 | -5 | |||||||||||||
GTT | TAT | CCA | GAA | AAT | GTG | CAA | GCC | GAA | CAA CCA | CAC | GAA | AAA | CAG | TTG | 150 |
Val | Tyr | Alá | Glu | Aen | Val | Gin | Ala | Glu | Gin Ala | Cin | Glu | Lyo | Gin | Leu | |
1 | 5 | 10 | |||||||||||||
CAT | ACC | ATA | CAC | GTA | AAA | GCC | AAA | AAA | CAG AAA | ACC | CGC | CGC | GAT | AAC | 198 |
Aep | Thr | ile | Gin | Val | Lye | Ala | Lye | Lye | Gin Lyo | Thr | Arg | Arg | Aop | Aen | |
15 | 20 | 25 | |||||||||||||
CAA | CTA | ACC | GGG | CTG | GGC | AAG | TTG | GTC | AAG TCT | TCC | CAT | ACG | CTA | AGT | 246 |
Clu | Val | Thr | Gly | Leu | Gly | Lye | Leu | Val | Lye Ser | Ser | Aop | Thr | Leu | Ser | |
30 | 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
ΛΛΛ | CAA | CAC | GTT | TTG | AAT | ATC | CCA | CAC | CTG ACC | CGT | TAT | CAT | CCC | CCT | 294 |
Lye | Clu | Cin | Val | Leu | Aen | Ile | Arg | Aep | Leu Thr | Arg | Tyr | Aep | Pro | Gl y | |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
ATT | CCC | GTC | GTC | GAA | CAG | CGT | CCG | GGC | GCA AGT | TCC | CGC | TAT | TCA | ATA | 342 |
Ile | Ala | Val | Val | Glu | Gin | Cly | Arg | Cly | Ala Ser | Ser | Gly | Tyr | Ser | I le | |
65 | 70 | 75 | |||||||||||||
CGC | GCC | ATG | GAT | AAA | AAC | CCC | CTT | TCC | ΤΤΛ ACC | GTA | CAC | CGC | GTT | TCG | 390 |
Arg | Gly | Met | Aep | Ly b | Aen | Arg | val | Ser | Leu Thr | Val | Aep | Gly | Val | Ser | |
eö | 85 | 90 | |||||||||||||
CAA | ATA | cAc | TCC | TAC | ACC | GCG | CAG | GCG | GCA TTG | CGT | GGG | ACG | AGG | ACG | 438 |
Gin | líe | Cin | 5er | Tyr | Thr | Ala | Gin | Ala | Ala Leu | Cly | cly | Thr | Arg | Thr | |
95 | 100 | 105 | |||||||||||||
GCG | GCT | AGC | Acc | GGC | CCA | ATC | AAT | CAA | ATC CAG | TAT | CAA | AAC | GTC | AAG | 486 |
Ala | Gly | Sér | Ser | Gly | Ala | Ile | Aen | Clu | Ile Glu | Tyr | Glu | Aen | Val | Lye | |
110 | 115 | 120 | 125 | ||||||||||||
GCC | GTT | GAA | ATC | AGC | AAC | GGT | TCG | AAT | TCA TCA | GAA | TAC | CGA | AAC | CGC | 534 |
Ala | Val | Gld | Ile | Set | Lye | Gly | Ser | Aen | Ser Ser | Glu | Tyr | Gly | Aon | Gly | |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
CCA | TTG | GCA | GGT | TCG | CTC | CCA | TTT | CAA | ACC ΛΛΛ | ACC | CCA | CCC | CAC | ATT | 582 |
Ala | Leu | Ala | Gly | Ser | Val | Ala | Phe | Gin | Thr Lye | Thr | Ala | Ala | Aep | Ile | |
145 | ISO | 155 | |||||||||||||
ATC | CCA | CAG | CCA | AAA | CAC | TGC | GGC | ATT | CAG ACT | AAA | ACT | GCC | TAT | TCG | 630 |
Ile | Gly | Glu | Gly | Lye | Gin | Trp | Gly | He | Gin Ser | Lye | Thr | Ala | Tyr | Ser |
160 165 170
HU 219 267 Β
CGA | AÁA | CAC | CAT | GCC | CTG | ACG ' | CAA | TCC ' | CTT GCG ι | CTT 1 | GCG GGA ι | CCC AGC | 678 | |
Cly | Lye | Aep | BLe | Alá | Leu | Thr 1 | Gin | Ser | Leu Alá | Leu | Alá ι | Cly | Arg Ser | |
175 | 180 | 105 | ||||||||||||
GGC | GGC. | GCG | CAA | GCC | CTC | CTT | ATT | TAT | ACT AAA | CCG | CGC | CGT | CGC GAA | 726 |
Gly | Gly | Ma | Glu | Alá | Leu | Leu | Ile | Tyr | Thr Lye | Arg | Arg | Gly | Arg Glu | |
190 | 195 | 200 | 205 | |||||||||||
ATC | CAT | GCC | CAT | ΛΛΛ | GAT | GCC | GCC | AAG | GGT GTG | CAC | AGC | TTC | AAC CGG | 774 |
Ile | HÍe | Alá | Hle | Lye | Aep | Alá | Cly | Lye | Gly Val | Cin | Ser | Phe | Aen Arg | |
2Í0 | 215 | 230 | ||||||||||||
CTG | GTG | TTG | GAC | GAG | GAC | AAC | AAG | GAG | CGT CGC | AGT | CAC | TAC | ACA TAT | 822 |
LeU | val | Leu | Aep | clu | Aep | Lye | Lye | Clu | Gly Gly | Ser | Cin | Tyr | Arg Tyr | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||
TTC | ATT | CTC | GAA | GAA | GAA | TGC | CAC | AAT | GCA TAT | CCC | GCC | TGT | AAA AAC | 870 |
Phe | He | Val | GlU | GlU | Clu | Cye | lile | Ann | Gly Tyr | Alá | Alá | Cye | Lye Aen | |
240 | 24 5 | 250 | ||||||||||||
AAG | CTG | AAA | GAA | GAT | GCC | TCC | CTC | AAA | GAT CAG | CGC | AAA | ACC | CTC ACC | 918 |
Lye | Leu | Lye | GlU | Λβρ | Alá | Ser | Val | Lye | Anp Clu | Arg | Lye | Thr | Val Ser | |
25S | 260 | 265 | ||||||||||||
ACC | CAC | GAT | TAT | ACC | CGC | TCC | AAC | CCC | ΤΤΛ CTT | GCC | AAC | CCG | CTT CAG | 966 |
Thr | Cin | Aep | Tyr | Thr | Gly | Ser | Aen | Arg | Leu Leu | Alá | Aen | Pro | Leu Glu | |
270 | 275 | 280 | 285 | |||||||||||
TAT | GGC | AGC | CAA | TCA | TGG | CTG | TTC | CGA | CCG GGT | TGC | CAT | TTC | GAC AAC | 1014 |
Tyr | Gly | Ser | Gin | Ser | Trp | Leu | Phe | Arg | Tro Gly | Trp | lile | Leu | Aep Aen | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||
CGC | CAT | TAT | GTC | GGA | GCC | GTT | CTC | GAA | CGT ACG | CAG | CAG | ACC | TTT GAT | 1062 |
Arg | Hle | tyr | Val | Gly | Alá | Val | Leu | Clu | Arg Thr | Gin | Cin | Thr | Phe Aep | |
305 | 310 | 315 | ||||||||||||
ACA | CGC | GAT | ATG | ACT | GTT | CCT | GCC | TAT | TTT ACC | AGT | CAA | CAT | TAT CTA | 1110 |
Thr | Arg | Aep | Hét | Thr | Val | Pro | Alá | Tyr | Phe Thr | Ser | Glu | Anp | Tyr Val | |
320 | 325 | 330 | ||||||||||||
CCC | CGT | TCC | CTG | AAA | GCT | CTT | GCC | AAA | TAT TCG | CCC | GAT | AAT | AAG GCA | 1158 |
Pro | Giy | Sét | Leu | Lye | Gly | Leu | cly | Lye | Tyr Sec | Gly | Aep | Aen | Lye Alá | |
335 | 340 | 345 | ||||||||||||
GAA | ACtí | CTC | TTT | GTT | CAG | GCA | GAG | CGC | ACT ACA | TTG | CAG | CCT | ATC CCT | 1206 |
Glu | Arg | LeU | Phe | Vál | Gin | Gly | Glu | Gly | Ser Thr | Leu | Gin | Cly | Ile Gly | |
350 | 355 | 360 | 365 | |||||||||||
TAC | CCT | Acc | GCC | CTG | TTT | TAT | GAT | GAA | CCC CAT | ACT | ΛΛΛ | AAC | CCC ΤΛΟ | 1254 |
Tyr | Gly | Thr | Gly | Val | Phe | Tyr | Aep | Glu | Arg lile | Tbc | Lye | Ann | heg Tyr | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||
GGC | GTC | GAA | TAT | CTT | TAC | CAT | AAT | GCT | ' CAT AAG | GAT | ACC | TGG | CCC CAT | 1302 |
Gly | Val | Glu | Tyr | Vil | Tyr | Hle | Aen | Alá | ι Anp Lye | Aep | Thr | Trp | ' Alá Anp |
385 390 395
HU 219 267 Β
TAC | GCC | CCA | CTT | TCT | TAT | CAC | CGC | CAA | CGT | ATA | GAT | TTC | CAC | AAC | CCT | 1350 |
Tyr | Alá | Arg | teu | Ser | Tyr | Aep | Arg | Gin | Cly | He | Aep | Leu | Aep | Ann | Arg | |
4oo | 405 | 410 | ||||||||||||||
TTC | CAC | CAG | ACG | CAT | TCC | TCT | CAC | GAC | GCT | TCC | CAT | AAA | AAT | TGC | CCT | 1398 |
LeU | Gin | Cin | Thr | lile | Cye | Ser | lile | Aep | Cly | Ser | Aep | Lye | Aon | Cye | Arg | |
415 | 420 | 425 | ||||||||||||||
CCC | CAC | CGC | AAT | ΑΛΑ | CCG | TAT | TCT | TTC | TAT | AAA | TCC | GAC | CCC | ATC | ATT | 1446 |
Pro | Aep | Cly | Aen | Lye | Pro. | Tyr | Ser | Phe | Tyr | Lye | Ser | Aep | Arg | Két | I le | |
430 | 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
TAT | GAA | gAa | AGC | CG A | AAC | CTC | TTC | CAA | GCA | CTA | TTT | AAA | AAC | CCA | TTT | 1494 |
Tyr | Glu· | clu | Ser | Arg | Aen | Leu | Phe | Gin | Alá | Val | Phe | Lye | Lye | Alá | Phe | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
CAT | ACC | CCC | AAA | ATC | CGT | CAC | AAT | TTC | ACT | ATC | AAT | CTA | GGC | TAC | GAC | 1542 |
Asp | Thr | Alá | Lye | Ile | Arg | Hl β | Aen | Leu | Ser | Ile | Aon | Leu | Cly | Tyr | Aep | |
465 | 470 | 475 | ||||||||||||||
CCC | TTT | AAG | TCC | CAA | TTC | TCC | CAC | ACC | CAT | TAT | TAT | CTT | CAA | AAC | CCA | 1590 |
Arg | Fhe | Lye | Ser | Cin | Leu | Ser | IIL e | Ser | Aep | Tyr | Tyr | Leu | Gin | Aen | Alá | |
480 | 485 | 490 | ||||||||||||||
GTT | CAG | CCA | TAT | CAT | TTC | ATA | ACC | CCC | ΛΛΑ | AAC | CCT | CCC | TTT | CCC | AAC | 1638 |
val | Gin | Alá | Tyr | Αβρ | Leu | Ile | Thr | Pro | Lye | Lye | Pro | Pro | The | Pro | Aon | |
435 | 500 | 505 | ||||||||||||||
CCA | ACC | AAA | CAC | Aac | CCG | TAT | AGG | CTG | TCT | ATC | CGC | AAC | ACC | ACG | GTC | 1686 |
Gly | Ser | Lye | Aep | Aen | Pro | Tyr | Arg | Vnl | Sec | Ile | cly | Ly n | Thr | Thr | Val | |
510 | 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
AAT | ACA | TCG | CCC | Ata | TCC | CCT | TTC | CCC | ΛΛΤ | AAC | ACC | TAT | ACA | CAC | TGC | 1734 |
Agn | Tht | Ser | Pro | Ile | Cy e | Arg | Phe | Cly | Aon | Aen | Thr | Tyr | Thr | Aep | Cye | |
530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
ACA | CCC | ACG | AAT | ATC | CGC | CGC | AAC | GGT | TAT | TAT | GCA | GCC | GTT | CAA | GAC | 1782 |
Thr | Pro | Arg | Aen | íle | Cly | cly | Agn | Cly | Tyr | Tyr | Alá | Alá | val | Cin | Aep | |
545 | 550 | 555 | ||||||||||||||
AAT | CTC | CCT | TTC | CCC | ACC | TCC | CCC | CAT | CTC | CCA | CCA | CCC | ATA | CGT | TAC | 1830 |
Agn | Vaí | Arg | Leu | Cly | Arg | Trp | Alá | Aep | Val | Cly | Alá | Cly | Ile | Arg | Tyr | |
560 | 565 | 570 | ||||||||||||||
CAT | TAC | CGC | ACC | ACC | CAT | TCG | CAA | GAT | AAC | AGT | CTC | TCT | ACC | CCC | ACT | 1878 |
Aep | Tyr | Arg | Set | Thr | Hle | Sec | Clu | Aep | Lye | Ser | Val | Ser | Thr | Gly | Thr | |
575 | 580 | 58S | ||||||||||||||
CAC | CCC | AÁc | CTT | TCT | TGC | AAC | CCG | GGC | CTA | ere | CTC | AAA | CCT | TTC | ACC | 1926 |
Hle | Arg | Aen | Leu | Set | Trp | Aon | Alá | Cly | Val | Val | Leu | Lye | Pro | Phe | Thr | |
590 | 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
TCC | ATC | CAT | TTC | ACT | TAT | CCC | CCT | TCT | ACG | CGC | TTC | CCT | CTC | CCC | TCC | Í974 |
Trp | Hét | Aep | Led | thr | Tyr | Arg | Alá | Sec | Tbc | Cly | Phe | Arg | Leu | Pro | Ser |
610 615 620
HU 219 267 Β
TTT ccc Phe Ma | CAA ATC | TAT GCC Tyr Gly | TGC Trp | AGA GCC CGG CAC TCT TTG AAA ACG TTG | 2022 | |||||||||||
Cld | Hét 625 | Arg | Ma Gly 630 | Glu | Ser | Led | Lyo 635 | Thr | Leu | |||||||
GAT | CTG | ΛΛΛ | CCC | CAA | AAA | TCC | TTT | AAT | ACA | CAC | CCA | GCT | ATT | CTA | TTT | 2070 |
Asp | Leu | Lys | Pro | clu | Lye | Ser | phe | Aen | Arg | Glu | Alá | Cly | Ile | Val | Phe | |
640 | 645 | 650 | ||||||||||||||
AAA | CCC | CAC | TTC | GCC | AAT | TTC | GAA | GCC | ACC | TAT | TTC | AAC | AAT | CCC | TAT | 2118 |
Lye | Cly | Aep | Phe | Cly | Aen | Leu | Clu | Alá | Ser | Tyr | Phe | Aen | Aon | AJ.a | Tyr | |
655 | 660 | 665 | ||||||||||||||
CCC | CAC | CTC | ATT | CCA | TTC | CGT | TAT | CAA | ACC | CCA | ACT | CAA | AAC | CCC | CAA | 2166 |
Arg | Aep | Leu | I le | Ma | Phe | Cly | Tyr | Clu | Thr | Acg | Thr | Cin | Aon | Cly | Cin | |
670 | 675 | 600 | 605 | |||||||||||||
ACT | TCC | CCT | TCT | CCC | CAC | CCC | CCA | TAC | CCA | AAT | CCC | CAA | AAT | CCA | CCG | 2214 |
Thr | Ser | Alá | Ser | Cly | Aep | Pro | Cly | Tyr | Arg | Aen | Ma | Cin | Aen | Me | Acg | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
ATA | CCC | GCT | ATC | Αλτ | ATT | TTG | GGT | AAA | ATC | GAT | TGG | CAC | GGC | GTA | TGG | 2262 |
Ile | Alá | ciy | He | Aen | Ile | Leu | Gly | Ly 0 | Ile | Aep | Trp | lile | Cly | Val | Trp | |
705 | 710 | 715 | ||||||||||||||
CCC | CCC | TTC | CCG | CAC | GCG | TTC | TAT | TCC | ACG | CTT | CCC | TAT | AAC | CGT | ATC | 2310 |
Cly | Cly | Leu | Pro | Aep | Gly | Leu | Tyr | Ser | Thr | Leu | Alá | Tyr | Aön | Arg | 1 le | |
720 | 725 | 730 | ||||||||||||||
AAG | Ctc | AAA | CAT | CCC | CAT | ATA | CGC | GCC | CAC | ACG | ACC | TTT | GTA | ACT | TCA | 2358 |
Lye | val | Lye | Aep | Alá | Aep | Ile | Arg | Alá | Aep | Arg | Thr | Phe | Val | Thr | Ser | |
735 | 740 | 745 | ||||||||||||||
TAT | CTC | TTT | CAT | GCC | CTC | CAA | CCT | TCA | CGA | TAT | GTA | TTC | CGT | TTC | GGT | 2406 |
Tyr | Leu | Phe | Aep | Alá | Val | Cin | Pro | Ser | Arg | Tyr | Val | Leu | Gly | Leu | Cly | |
750 | 755 | 7 60 | 765 | |||||||||||||
TAC | CAC | CAT | CCT | CAC | CCA | ATA | TCC | CCC | ATC | AAT | ACC | ATC | TTT | ACT | TAT | 2454 |
Tyr | Asp | Hle | Pro | Aep | Cly | Ile | Trp | Cly | He | Aen | Thr | Hét | Phe | Thr | Tyr | |
770 | 775 | 780 | ||||||||||||||
TCC | AAG | CCA | ΛΛΛ | TCT | CTT | CAC | GAA | CTC | CTC | CCC | ACC | CAG | CCC | CTG | TTC | 2502 |
Ser | Lyb | Alá | LyÖ | Ser | Val | Aep | Clu | Leu | Leu | Gly | Ser | Gin | Alá | Leu | Leu | |
785 | 790 | 795 | ||||||||||||||
AAC | GGT | AAT | GCC | AAT | GCT | AAA | AAA | GCA | CCA | TCA | CCC | CCC | ACC | CCC | CCT | 2550 |
Aen | Gly | Aeh | Alá | Aen | Ma | Lys | Lye | Alá | Alá | Ser | Arg | Arg | Thr | Arg | Pro | |
800 | 805 | 010 | ||||||||||||||
TGG | TAT | GtT | ACG | CAT | CTT | TCC | CGA | TAT | TAC | AAT | ATC | AAG | AAA | CAC | CTC | 2598 |
Trp | Tyr | vái | Thr | Λβρ | Val | Ser | Cly | Tyr | Tyr | Aen | I le | Lye | Lyo | II Ln | Leu | |
815 | 820 | 025 | ||||||||||||||
ACC | CTC | CGC | CCA | CGT | GTC | TAC | AAC | CTC | CTC | AAC | TAC | CCC | TAT | GTT | ACT | 2646 |
Thr | Led | Arg | Alá’ | Cly | vál | Tyr | Aen | Leu | Leu | Aen | Tyr | Arg | Tyr | Val | Thr | |
830 | 835 | 840 | 045 |
HU 219 267 Β
TCG Trp | GAA ΑΛΤ GTG CGG | CAA Gin | ACT Thr | GCC Alá | GCC GCC | GCA GTC AAC CAA CAC AAA | 2694 | ||||||
GlU | Aen | Val Arg 850 | Gly | Gly 855 | Alá | Val | Ann Gin lile 060 | l.y 8 | |||||
AAT | CTC | GCC | GTT TAC | AAC | CCA | TAT | GCC | GCC | CCC | CGC | CCA AAC TAC | ACA | 2742 |
Aen | Val | Gly | Val Tyr | Aen | Arg | Tyr | Alá | Alá | Pro | Gly | Arg Aon Tyr | Thr | |
865 | 870 | 875 | |||||||||||
TTT | ACC | TTG | CAA ATC | AAG | TTT | TAAACCTCCA | AACGCCGCAA ATGCCGTCTG | 2793 | |||||
Phe | Ser | LeU | Glu Hét | Ly e | The |
880
AAAGGCT 2800
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 4-RŐL 15 (C) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (A) HOSSZ: 908 aminosav (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 4
(B) TÍPUS: aminosav | Phe | Arg | Leu | Agn -15 | He | Leu | Cye | Leu | Ser -10 | Leu | |||||
Hét -24 | Cin Glh | Gin | lile -20 | Leu | |||||||||||
Hét | Thr | Alá | Leu | Pro | Val | Tyr | Alá | Glu | Aon | Val | Cin | Alá | Glu | Gin | Alá |
-5 | 1 | 5 | |||||||||||||
Gin | Glu | Lys | Glh | Leu | Aep | Thr | Ile | GJ n | Val | Lye | Ma | Lyo | Lye | Gin | Lye |
10 | 15 | 20 | |||||||||||||
Thr | Arg | Arg | Aep | Αβπ | Glu | val | Thr | Gly | Leu | Gly | Ly 9 | Leu | Val | Lye | Ser |
25 | 30 | 35 | 40 | ||||||||||||
Ser | Aep | thr | Leu | Seí | Ly β | Glu | Cin | val | Leu | Aen | Ile | Arg | Aep | Leu | Thr |
4s | 50 | 55 | |||||||||||||
Arg | Tyr | Aep | Pro | GÍy | Ile | Alá | val | Val | Glu | Gin | Cly | Arg | Gly | Aln | Ser |
60 | 65 | 70 | |||||||||||||
Ser | GÍy | Tyr | Ser | Ile | Arg | Gly | Hét | Anp | Lye | Aon | Arg | val | Ser | Leu | Thr |
75 | 00 | 05 | |||||||||||||
val | Asp | Gly | val | Ser | Cin | Ile | Gin | Ser | Tyr | Thr | Alá | Gin | Alá | Alá | Leu |
90 | 95 | 100 | |||||||||||||
Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Alá | Gly | Ser | Ser | Gly | A In | He | Ann | Glu | Ile | Glu |
105 | 110 | 115 | 120 | ||||||||||||
Tyr | Glu | Aen | Val | Lye | Alá | Val | Glu | Ile | Ser | Lye | Cly | Ser | Aon | Ser | Ser |
125 | 130 | 135 | |||||||||||||
Glu | Tyr | Oly | Aen | Gly | Alá | Leu | Alá | Gly | Ser | Val | Alá | Phe | Gin | Thr | Lyn |
140 | 145 | 150 | |||||||||||||
Thr | Alá | Ála | Aep | Ile | Ile | Gly | Glu | Gly | Lyn | Gin | Trp | Gly | I le | Gin | Ser |
155 | 160 | 165 |
HU 219 267 Β
Lys | Thr Alá Tyr Ser Cly Lye | Agp | lile Alá Leu The 180 | Cin | Ser | Leu | Alá | ||||||||
170 | 175 | ||||||||||||||
Leu | Alá | Gly | Arg | Sec | Cly | Gly | Alá | Glu | A la | Leu | Leu | lle | Tyr | Thr | Lye |
185 | Í9Q | 195 | 200 | ||||||||||||
Arg | Arg | Cly | Arg | Glu | lle | lile | Alá | ll Le | Ly 9 | Λπρ | Alá | Cly | Ly n | Cly | val |
205 | 210 | 215 | |||||||||||||
Cin | Ser | Phe | Aen | Arg | Leu | Val | Leu | Aep | Glu | Aep | Ly a | Lye | Glu | Gly | Gly |
220 | 225 | 230 | |||||||||||||
Ser | Gin | Tyr | Arg | Tyr | Phe | lle | Val | Glu | Glu | Glu | Cyn | II Le | Aen | Gly | Tyr |
235 | 240 | 245 | |||||||||||||
Alá | Alá | Cye | Lye | Aen | Lye | Leu | Ly e | Clu | Ληρ | Alá | Ser | Val | Ly n | Ληρ | Clu |
250 | 255 | 2 60 | |||||||||||||
Arg | Lye | Thr | Val | Ser | Thr | Gin | Aep | Tyr | Thr | Gly | Ser | Aen | Arg | Leu | Leu |
265 | 270 | 275 | 280 | ||||||||||||
Alá | Aen | Pro | Leu | GÍu | Tyr | Gly | Ser | Gin | Ser | Trp | Leu | Phe | Arg | Pro | Gly |
285 | 290 | 295 | |||||||||||||
Trp | H Le | LeU | Aep | Aen | Arg | lile | Tyr | Val | Cly | Alá | Val | Leu | clu | Arg | Thr |
300 | 305 | 310 | |||||||||||||
Cin | Cin | Thr | Phe | Aep | Thr | Arg | Aep | Hét | The | Val | Pro | Alá | Tyr | Phe | The |
315 | 320 | 325 | |||||||||||||
Ser | GlU | Aep | Tyr | Váí | Pro | Cly | Ser | Leu | Lye | Gly | Leu | Gly | Ly o | Tyr | Ser |
330 | 335 | 340 | |||||||||||||
Cly | Aep | Aen | Lye | Ma | Clu | Arg | Leu | Phe | Val | Gin | Gly | Clu | Gly | Ser | Thr |
345 | 350 | 355 | 360 | ||||||||||||
Leu | Cin | Gly | lle | Öly | Tyr | Gly | Thr | Gly | Val | Phe | Tyr | Aep | Glu | Arg | 11 JLb |
365 | 370 | 375 | |||||||||||||
Thr | Lye | Abn | Arg | Tyr | Cly | Val | Clu | Tyr | Val | Tyr | II le | Aen | Alá | Aep | LyB |
380 | 385 | 390 | |||||||||||||
Aep | Thr | Trp | hla | Aep | Tyr | Alá | Arg | Leu | Ser | Tyr | Aep | Arg | Gin | Cly | 1 le |
395 | 400 | 405 | |||||||||||||
Aep | Leu | Aep | Aen | Arg | Leu | Cin | Cin | Thr | Hlu | Cye | Ser | Illa | Aep | Cly | Sec |
410 | 415 | 420 | |||||||||||||
Aep | Lye | Aen | Cye | Arg | Pro | Aep | Gly | Aen | Ly 0 | Pro | Tyr | Ser | Phe | Tyr | Lye |
425 | 430 | 435 | 440 | ||||||||||||
Sec | Abp | Arg | Bet | lle | Tyr | Glu | Glu | Ser | Arg | Ann | Leu | Phe | Cin | Alá | val |
445 450 455
HU 219 267 Β
Phe Lye Lye Ma | Phe | Aep | Thr | Alá | Ly9 465 | lle | Arg | II le | Asn | Leu 470 | Ser | 1 le | |||
460 | |||||||||||||||
Aen | Leu | Gly | Tyr | Aep | Arg | Phe | Ly 9 | Ser | Gin | Leu | Ser | lile | Ser | Anp | Tyr |
475 | 400 | 405 | |||||||||||||
Tyr | Leu | Cin | Aen | Alá | val | Cin | M a | Tyr | Anp | Leu | lle | Thr | Pro | Lye | I.y n |
490 | 495 | 500 | |||||||||||||
Pro | Pro | Phe | Pro | Aen | Gly | Ser | Lye | Aep | Ann | Pro | Tyr | Arg | val | Ser | lle |
505 | 5Ϊ0 | 515 | 520 | ||||||||||||
Cly | Lye | Thr | Thr | Val | Aen | Thr | Ser | Pro | I le | Cye | Arg | Phe | Cly | Agn | Ann |
525 | 530 | 535 | |||||||||||||
The | Tyr | Thr | Aep | Cye | Thr | Pro | Arg | Aen | I le | Cly | Cly | Aen | Cly | Tyr | Tyr |
540 | 545 | 550 | |||||||||||||
Alá | Alá | Val | Cin | Aep | Aen | Val | Arg | Leu | Gly | Arg | Trp | Alá | Anp | Val | Gly |
555 | 560 | 565 | |||||||||||||
Ma | Cíy | lle | Arg | Tyr | Aep | Tyr | Arg | Ser | Thr | lile | Ser | Clu | Aep | Lye | Sec |
570 | 575 | 580 | |||||||||||||
val | Ser | Thr | Cly | Thr | lile | Arg | Aen | Leu | Ser | Trp | Aen | A1. a | Cly | Val | Val |
585 | 590 | 595 | 600 | ||||||||||||
Led | Lye | Pro | Phe | Thr | Trp | Met | Aep | Leu | Thr | Tyr | Arg | Alá | Ser | Thr | Cly |
605 | 610 | 615 | |||||||||||||
Phe | Arg | Led | Pro | Ser | Phe | Alá | Glu | Met | Tyr | Gly | Trp | Arg | Alá | Cly | Clu |
620 | 625 | 630 | |||||||||||||
Ser | Léu | Lye | Thr | Leit | Aep | Leu | Lye | Pro | Cl.u | Lye | Ser | The | Aen | Arg | Glu |
635 | 640 | 645 | |||||||||||||
Ma | Cly | 1 lé | Val | Phe | Lye | Cly | Aep | Phe | Cly | Aen | Leu | Clu | Alá | Ser | Tyr |
650 | 655 | 660 | |||||||||||||
Phe | Aen | Aen | Alá | Tyr | Arg | Aep | Leu | lle | Alá | The | Gly | Tyr | Clu | Thr | Arg |
66S | 670 | 675 | 600 | ||||||||||||
Thr | tíln | Aeri | Gly | Cin | Thr | Ser | Alá | Ser | Gly | Aep | Pro | Gly | Tyr | Arg | Ann |
685 | 690 | 695 | |||||||||||||
Ma | Gin | Arin | Alá | Átg | lle | Alá | Gly | He | Ann | I le | Leu | Cly | Lyo | lle | Anp |
700 | 705 | 710 | |||||||||||||
Trp | Hle | GÍy | Val | Trp | Cly | Gly | Led | Pro | Aep | Gly | Leu | Tyr | Sec | Thr | Leu |
7i5 | 7 20 | 725 | |||||||||||||
Ma | Tyr | Λβπ | Arg | lle | Lye | Val | Lye | Aep | Ma | Aep | lle | Arg | Alá | Anp | Arg |
730 735 740
HU 219 267 Β
Thr | Phe | Val Thr Ser | Tyr | Leu | Phe | Aep | Alá | val | Cin Pro | Ser | Arg | Ty r |
745 | 750 | 755 | 760 | |||||||||
val | Led | Gly Leu Gly | Tyr | Aep | lile | Pro | Aep | Gly | Ile Trp | Gly | I le | Aen |
765 | 770 | 775 | ||||||||||
Thr | Hét | Phe Thr Tyr | Sér | Lye | Alá | Lye | Se r | Val | Aep Glu | Len | Leu | Gly |
7Θ0 | 705 | 790 | ||||||||||
Ser | Cin | Alá Leu Leu | Aen | Gly | Aen | Alá | Ann | Alá | Lyo Lye | Alá | Alá | Ser |
795 | 800 | 005 | ||||||||||
Arg | Arg | Thr Arg Pro | Trp | Tyr | Val | Thr | Anp | Val | Ser Gly | Tyr | Tyr | Aon |
8Í0 | 015 | 020 | ||||||||||
Ile | tye | Lye Hle Led | Thr | Leu | Arg | Alá | Gly | Val | Tyr Aen | Leu | Leu | Aen |
Θ25 | 830 | 835 | 040 | |||||||||
Tyr | Xrg | Tyr Val Thr | Trp | Glu | Aen | Val | Arg | Gin | Thr Alá | Gly | Gly | A la |
845 | 050 | 055 | ||||||||||
val | Aen | Gin ílle Lye | Aen | Val | Gly | Val | Tyr | Aen | Arg Tyr | Alá | Alá | Tro |
860 | 065 | 070 | ||||||||||
Gly | Arg | Aen Tyr Thr | Phe | Ser | Leu | Glu | Bet | Lye | Phe |
075 080
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 5-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A)HOSSZ: 2809bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (iv) EREDETE:
(A) ORGANIZMUS: A transzferrinreceptor Tbpl alegységét kódoló DNS (B) FORRÁS: Neisseria meningitidis IM2169 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 71...142 35 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: érett fehérje (B) NUKLEOTIDOK: 143... 2803 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A)NÉV/FUNKCIÓ: cDNS 40 (B) NUKLEOTIDOK: 71...2803 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 5
ATCAACAATA AGGCTTCAGA CGGCATCGCT CCTTCCCATA CCGTCTCAAA
GCGAAGATTA
GGGAAACATT ATG CAA CAG CAA CAT TTC TTC CGA TTA AAT ATT TTA TGC 109
Bek Gin Cin cin IlLe Leu Phe.Arg Leu Aen Ile Leu Gye -24 -20 -15
CTG LeU | TCG Set -10 | CTG Leu | ATG Bet | ACT Thr | GCG CTG | CCT GCT TAT | GCA GAA Aln Glu 1 | AAT GTG CAA | GCC Alá 5 | 157 | ||||||
Alá | Leu -5 | Pro | Alá | Tyr | Aen | Val | Gin | |||||||||
GGA | CAA | GCA | CAG | gXa | ΛΛΛ | CAC | TTC | GAT | ACC | ATA | CAG | CTA | AAA | GCC | ΛΛΛ | 205 |
Gly | Gin | Alá | Gin | Glu | Lye | Gin | Leu | Aep | The | Ile | Gin | val | Ly b | Alá | Lye | |
lo | 15 | 20 | ||||||||||||||
AAA | CAG | AAA | ACC | CCC | CGC | CAT | AAC | GAA | CTA | ACC | GCT | CTG | GGC | AAA | TTG | 253 |
Ly β | Glh | Lye | Thr | Arg | Arg | Asp | Aen | Glu | V.il | Thr | Cly | Leu | Gly | Ly n | Leu |
30 35
HU 219 267 Β
GTC | AAA | ACC | GCC | GAC | ACC | CTC | AGC | AAG | GAA | CAG | GTA | CTC ' | CAT i | ATC ' | CGC | 301 |
Val | Lye | Thr | Al a | λβρ | Thr | Leu | Ser | J.y o | Glu | Cin | val | Leu , | Aep | Ile | Acg | |
40 | 45 | 50 | ||||||||||||||
CAC | CTG | ACC | CCT | TAC | GAC | CCC | GGC | ATC | GCC | GTG | GTC | GAA | CAG i | GGC | CGC | 349 |
Aep | Leu | Thr | Arg | Tyr | Aep | Pro | Gly | Ile | Alá | Val | val | Glu | Gin | Gly | Arg | |
55 | 60 | 65 | ||||||||||||||
GGC | GCA | AGT | TCG | GGC | TAC | TCG | AT A | CGC | GGT | ATG | CAC | AAA | AAC | CGC | CTT | 397 |
Gly | Alá | Sér | Ser | Gly | Tyr | Ser | I le | Arg | Gly | Két | Aep | Lye | Aen | Arg | Val | |
70 | 75 | 80 | 85 | |||||||||||||
TCC | TTG | Acg | GTG | GAC | GCC | TTG | GCG | CAA | ΛΤΛ | CAG | TCC | TAC | ACC | GCC | CAG | 445 |
Ser | Leu | Thr | val | Aep | Gly | Leu | Alá | Gin | Ile | Cin | Ser | Tyr | Thr | Alá | Cin | |
90 | 95 | 100 | ||||||||||||||
GCG | CCA | TTG | GGC | GGG | ACC | ACC | ACC | GCC | GCC | AGC | AGC | CCC | GCA | ATC | AAT | 493 |
Alá | Alá | Leu | ciy | Oly | Thr | Arg | Thr | Alá | G J y | Ser | Ser | Cly | Aln | Ile | Aen | |
105 | 1)0 | Π5 | ||||||||||||||
CAA | ATC | CAG | TAT | CAA | AAC | CTC | AAA | GCT | GTC | CAA | ATC | AGC | AAA | GGC | TCA | 541 |
Glu | Ile | Glu | Tyr | Cili | Aen | Val | Lye | Alá | Va). | Glu | Ile | Ser | Lye | Gly | Ser | |
120 | 125 | 130 | ||||||||||||||
AAC | TCG | GTC | gAa | CAA | CGC | ACC | GGC | GCA | TTG | GCC | CGT | TCC | CTC | GCA | TTT | 589 |
Aen | Ser | Vél | CluI | Gin | Gly | Ser | Cly | Aln | Leu | Alá | cly | Ser | Val | Alá | Phe | |
Í35 | 140 | 145 | ||||||||||||||
CAA | ACC | AAA | ACC | GCC | GAC | CAT | CTT | ATC | CCG | CAA | CGC | AGG | CAC | TGG | GGC | 637 |
Gin | Thr | Lyá | thr | Alá | Aep | Aep | Val | 1 le | Gly | Clu | cly | Arg | Cin | Trp | Cly | |
150 | lss | 160 | 16S | |||||||||||||
ATT | CAG | AGT | AaA | ACC | CCC | TAT | TCC | GGC | ΛΛΛ | AAC | CCG | GCG | CTT | ACC | CAA | 685 |
Ile | Cin | Ser | Lye | Thr | Alá | Tyr | Ser | Gly | Lye | Aon | Arg | Cly | Leu | Thr | Gin | |
Í7O | 175 | 100 | ||||||||||||||
TCC | ATC | GCG | CTG | GCG | GGG | CCC | ATC | GGC | CGT | GCG | CAG | GCT | TTG | CTG | AfC | 733 |
Ser | Ile | Alá | Led | Ála | Cly | Arg | Ile | Gly | Gly | Λ1Λ | Clu | Alá | Leu | Leu | Ile | |
185 | 190 | 195 | ||||||||||||||
CAC | ACC | CGC | CCG | CCC | GCG | GGG | GAA | ATC | CCC | GCA | CAC | GAA | GAT | GCC | CCA | 781 |
Hle | Thr | Gly | Arg | Arg | Alá | Gly | Clu | 1 le | Arg | Alá | lile | Glu | Anp | Alá | Gly | |
200 | 205 | 210 | ||||||||||||||
CGC | CGC | GTT | CAG | AGC | TTT | AAC | AGC | CTG | GTG | CCG | GTT | GAA | CAC | AGC | AGC | 829 |
Arg | Gly | Val | Gin | Ser | Phe | Aen | Arg | Leu | Val | Pro | Val | Glu | Aep | Ser | Ser | |
215 | 220 | 225 | ||||||||||||||
CAA | TAC | GCC | TAT | TTC | ATC | CTT | CAA | CAT | GAA | TGC | GAA | GCC | AAA | AAT | TAC | 877 |
Glu | Tyr | Alá | Tyr | Phe | Ile | Val | Glu | Aep | Glu | Cy e | Glu | Gly | Lye | Aen | Tyr | |
230 | 235 | 240 | 245 | |||||||||||||
GAA | ACG | TGT | ΑΛΛ | AGC | AAA | CCC | AAA | AAA | GAT | CTT | GTC | CGC | AAA | CAC | GAA | 925 |
Glu | Thr | CyB | Lye | Ser | Lye | Pro | Lye | Lye | Aep | val | Val | Gly | Lye | Aep | Glu | |
250 | 255 | 260 |
HU 219 267 Β
CCT | CAA | ACG | GTT | TCC | ACC | CGA | CAC | TAC | ACG | GGC | CCC | AAC CGC | TTC | CTC | 973 |
Acg | Cin | Thr | Val | Ser | Thr | Acg | Aep | Tyr | Thr | Gly | Pro | Ann Acg | Phe | Leu | |
265 | 270 | 275 | |||||||||||||
GCC | CAT | CCG | CTT | TCA | TAC | GAA | AGC | CGA | TCG | TGG | CTG | TTC CGC | CCC | GGT | 1021 |
Mi | Aöp | Pro | Led | Ser | Tyr | Glu | Ser | Arg | Ser | Trp | Leu | Phe Arg | Pro | Gly | |
280 | 285 | 290 | |||||||||||||
TTT | CGT | TTT | GAA | AAC | AAA | CGG | CAC | TAC | ATC | GGC | GGC | ATA CTC | CAA | CAC | 1069 |
Phe | Arg | Phe | Gld | Aen | Lye | Arg | Hle | Tyr | Ile | Gly | Cly | Ile Leu | Glu | lile | |
295 | 300 | 305 | |||||||||||||
ACC | CAA | CAA | ACT | TTC | CAC | ACG | CGC | GAT | ATC | ACG | GTT | CCG CCA | TTC | CTG | 1117 |
Tht | Gin | Glh | Tht | Phe | Aep | Thr | Arg | Aep | Met | Thr | Val | Pro Ala | Phe | Leu | |
310 | 315 | 320 | 325 | ||||||||||||
ACC | AAG | GCC | GTT | TTT | GAT | CCA | AAT | TCA | AAA | CAG | CCC | GCT TCT | TTG | CCC | 1165 |
Thr | Lys | Xla | Val | Phe | Aep | Ala | Aen | Ser | Lys | Gin | Ala | Gly Ser | Leu | Pro | |
330 | 335 | 340 | |||||||||||||
CGC | AAC | GGC | AAA | TAC | CCC | GGC | AAC | CAC | AAA | TAC | CCC | GCA CTG | TTT | ACC | 1213 |
Gly | Aen | Gly | Lye | Tyr | Ala | Gly | Aen | lile | Lye | Tyr | Gly | Gly Leu | Phe | Thr | |
345 | 350 | 355 | |||||||||||||
AAC | GCC | CAA | AAC, | CGT | CCC | CTG | CTG | CGC | CCG | CAA | TAC | CGT ACC | CGC | CTG | 1261 |
Aen | Cly | Gld | Aen | Gly | Ala | Leu | Val | Gly | Ala | Glu | Tyr | Gly Thr | Gly | Val | |
360 | 365 | 370 | |||||||||||||
TTT | TAC | GAC | GAG | ACC | CAC | ACC | AAA | AGC | CCC | TAC | GGT | TTG CAA | TAT | CTC | 1309 |
Phe | Tyr | Aep | Glu | The | lile | Thr | Lye | Ser | Arg | Tyr | Cly | Leu Glu | Tyr | Val | |
375 | 380 | 385 | |||||||||||||
TAT | ACC | AAT | GCC | CAT | AAA | CAC | ACT | TGC | CCG | CAT | TAT | CCC CGC | CTC | TCT | 1357 |
Tyr | Thr | Aen | Ala | Aep | Lye | Aep | Thr | Trp | Ala | Aep | Tyr | Ala Arg | Leu | Ser | |
390 | 395 | 400 | 405 | ||||||||||||
TAC | CAC | CGG | CAG | GGC | ATC | GGT | TTG | GAC | AAT | CAT | TTT | CAG CAG | ACC | CAC | 1405 |
Tyr | Aep | Arg | Gin | Gly | He | Gly | Leu | Aep | Aon | lile | Phe | Cin Gin | Thr | II l e | |
440 | 415 | 420 | |||||||||||||
TGT | TCT | GCC | CAC | CGT | TCC | GAC | AAA | TAT | TGC | CGC | CCG | AGT CCC | CAC | AAG | 14S3 |
Cye | Ser | Ala | Aep | Gly | Ser | Aep | Lye | Tyr | Cye | Arg | Pro | Ser Ala | Anp | Ly ο | |
425 | 430 | 435 | |||||||||||||
CCG | TTT | TCC | TAT | TAC | AAA | TCC | GAC | CGC | CTC | ATT | TAC | GCG CAA | AGC | CAC | 1501 |
Pro | Phe | Ser | Tyr | Tyr | Lye | Ser | Aep | Arg | Val | Ile | Tyr | Cly Glu | Ser | Illő | |
440 | 445 | 450 | |||||||||||||
AGG | CTC | TTC | CAC | GCG | GCA | TTC | AAA | AAA | rcc | TTC | GAT | ACC CCC | AAA | ATC | 1549 |
Arg | Led | Led | Gin | Ala | Ala | Phe | Lye | Ly o | Sec | The | Aop | The Ala | Ly o | I le | |
455 | 460 | 465 | |||||||||||||
CGC | CAC | AAC | CTG | AGC | GTG | AAT | CTC | GGG | TTT | CAC | CGC | TTT GAC | TCT | AAT | 1597 |
Arg | Mle | Aen | Led | Ser | Val | Aen | Leu | Cly | The | Aep | Arg | The Aop | ι Ser | Aen | |
470 | 475 | 4 00 | 485 |
HU 219 267 Β
CTC | CGC | CAT | CAC | CAT | TAT | TAT | TAT | CAA CAT CCC | AAC CGC | GCC | TAT | TCG | 1645 |
Led | Arg | Hle | Gin | Áep | Tyr | Tyr | Tyr | Gin lile Alá | Aen Arg | Alá | tyr | Ser | |
490 | 495 | 500 | |||||||||||
TCC | AAA | ACG | CCC | CCT | AAA | ACC | GCC | AAC CCC AAC | GGC GAC | AAG | AGC | AAA | 1693 |
Ser | Lys | Thr | Pro | Pro | Lye | The | Alá | Aen Tco Apn | Gly Aep | Lye | Ser | Lye | |
505 | 510 | 515 | |||||||||||
CCC | TAT | TGG | GTC | AGC | ATA | GGC | GGG | GCA AAT GTC | GTT ACC | GGG | CAA | ATC | 1741 |
Pro | Tyr | Trp | Val | Set | lle | Gly | Gly | Gly Aon Val | Val Thr | Gly | Gin | I le | |
620 | 525 | 530 | |||||||||||
TCC | CTC | TTT | GCC | AAC | AAT | ACT | TAT | ACC CAC TCC | ACG CCC | CGC | ACC | ATC | 1789 |
Cye | Led | Phe | Gly | Aen | Aen | The | Tyr | The Aep Cye | The Pro | Arg | Ser | he | |
535 | 540 | 545 | |||||||||||
MC | CGC | K.AA | ACC | TAT | TAC | GCG | GCA | CTT CGG CAC | AAT CTC | CGT | TTG | CGC | 1837 |
Aen | Cly | Lye | Ser | Tyfc | Tyr | Alá | Alá | Val Arg Aep | Aen Val | Arg | Leu | Gly | |
550 | 555 | 560 | 565 | ||||||||||
AGG | TGG | GCG | GAT | GTC | GGC | CCG | GGG | TTG CGC TAC | GAC TAC | CGC | AGC | ACG | 1885 |
Arg | Trp | Alá | Aep | Val | Gly | Alá | Gly | Leu Arg Tyr | Aep Tyr | Arg | Ser | Thr | |
57Ö | 575 | 580 | |||||||||||
CAT | TCC | CAC | CAC | cCc | AGC | CTT | TCC | ACC CCC ACC | CAC CGC | ACC | CI'G | TCC | 1933 |
Hie | ser | Aep | Aep Gly | Ser | val | Ser | Thr Gly Thr | Illa Arg | Thr | Leu | Ser | ||
585 | 590 | 595 | |||||||||||
TGC | AAC | CCC | CGC | ATC | GTC | CTC | AAA | CCT GCC GAC | TGG CTG | GAT | TTG | ACT | 1981 |
Trp | Aen | Alá | Cly | lle | Val | Leu | Lye | Pro Alii Aep | Trp Leu | Aop | Leu | Thr | |
600 | 605 | 610 | |||||||||||
TAC | CCC | ACT | TCA | ACC | GGC | TTC | CGC | CTG CCC TCG | TTT GCC | CAA | ATG | TAC | 2029 |
Tyr | Arg | Τίΐζ | Ser | Thr | Cly | Phe | Arg | Leu Pro Sec | Phe Alá | Glu | Met | Tyr | |
615 | 620 | 625 | |||||||||||
GGC | TGG | CGG | TCG | GGT | GTT | CAA | AGC | AAG GCG CTC | AAA ATC | CAT | CCC | GAA | 2077 |
Gly | trp | Arg | Ser | Cly | Val | Cin | Ser | Lye Alá Val | Lye lle | Aop | P co | Glu | |
630 | 635 | 640 | 64 5 | ||||||||||
AAA | TCG | TTC | AAC | AAA | GAA | CCC | GGC | ATC GTG TTT | AAA CGC | CAT | TTC | GGC | 2125 |
Lye | Ser | Phe | Aen | Lye | Clu | Alá | Gly | lle Val Phe | Lye Cly | Aep | Phe | Gly | |
650 | 655 | 660 | |||||||||||
AAC | TTC | GAC | GCA | AGT | TGG | TTC | AAC | AAT CCC TAC | CGC CAT | TTG | ATT | GTC | 2173 |
Asn | Leu | Glu | Alá | Ser | Trp | Phe | Ληη | Aen Alá Tyr | Arg Aop | Leu | lle | Val | |
665 | 670 | 675 | |||||||||||
CGG | CGT | TAT | GAA | CCG | CAA | ATT | AAA | AAC GCC AAA | GAA CAA | CCC | AAA | GGC | 2221 |
Arg | Gly | tyr | Glu | Alá | Gin | He | Lye | Aen Cly Lye | Glu Glu | Alá | Lye | Gly | |
680 | 685 | 690 | |||||||||||
GAC | CCG | GCT | TAC | CTC | AAT | GCC | CAA | AGC CCG CGG | ATT ACC | GGC | ATC | AAT | 2269 |
Asp | Pro | AÍa | tyr | LeU | Aen | Alá | Cin | Ser Alá Arg | lle Thr | Gly | lle | Aen | |
695 | 700 | 705 |
HU 219 267 Β 2
ATT | TTG | GGC | AAA | ATC | GAT | TCG | AAC | CCC | GTA | TGG | GAT | AAA | TTG | CCC | GAA | 2317 |
Ile | LeU | Gly | Lye | I le | Aep | Trp | Asn | Cly | Vnl | Trp | Asp | Lys | Leu | Pro | Glu | |
710 | 715 | 720 | 725 | |||||||||||||
GGT | TGG | TAT | TCT | ACA | TTT | GCC | TAT | AAT | CGT | GTC | CAT | GTC | CGC | CAC | ATC | 2365 |
Gly | Trp | Tyr | Ser | Thr | Phe | Alá | Tyr | Aen | Arg | Vnl | lile | Val | Arg | Aep | Ile | |
730 | 735 | 740 | ||||||||||||||
AAA | AAA | CGC | CCA | GAC | CGC | ACC | CAT | ATT | CAA | TCA | CAC | CTG | TTT | CAT | GCC | 2413 |
Lye | Lye | Arg | Alá | Aep | Arg | Thr | Aep | Ile | Gin | Ser | lile | Leu | Phe | Aep | Alá | |
745 | 750 | 755 | ||||||||||||||
ATC | CAA | CCC | TCG | CGC | TAT | GTC | GTC | CGC | TTG | CGC | TAT | CAC | CAA | CCG | GAA | 2461 |
Ile | Cin | Pto | Ser | Arg | Tyr | Val | Val | Gly | Leu | Gly | Tyr | Aep | Gin | Pro | Glu | |
760 | 765 | 770 | ||||||||||||||
GGC | Αλα | TtíG | GGT | GTG | AAC | CCT | ATG | CTG | ACT | TAT | TCC | AAA | GCC | AAG | GAA | 2509 |
Gly | Lye | trp | Gly | Val | Aen | Cly | Hét | Leu | Thr | Tyr | Ser | Lye | Alá | Lye | Clu | |
775 | 700 | 705 | ||||||||||||||
ATC | ACA | CAG | TTG | TTG | GGC | ACC | CCG | GCT | TTC | CTC | AAC | CCC | AAC | AGC | CGC | 2557 |
Ile | Thr | GlU | Leu | Leu | Cly | Ser | Arg | Alá | Len | Leu | Aen | Cly | Aen | Ser | Arg | |
790 | 795 | 000 | 005 | |||||||||||||
AAT | ACA | AAA | CCC | ACC | GCC | CGC | CCT | ACC | CGC | CCT | TCG | TAT | ATT | GTG | GAT | 2605 |
Aen | Thr | Lye | Alá | Thr | Alá | Arg | Arg | Thr | Arg | Pro | Trp | Tyr | Ile | Val | Aop | |
810 | 015 | 020 | ||||||||||||||
CTG | TCC | CGT | TAT | TAC | ACC | ATT | AAA | AAA | CAC | TTC | ACC | CTC | CGT | GCC | GGC | 2653 |
Val | Ser | Cly | Tyr | Tyr | Thr | Ile | Lye | Lye | lile | The | Thr | Leu | Arg | Alá | Gly | |
825 | 030 | 035 | ||||||||||||||
GTC | TAC | AAC | CTC | CTC | AAC | TAC | CCC | TAT | CTT | ACT | TGC | GAA | AAT | GTC | CCG | 2701 |
Val | Tyr | Aen | Leu | Leu | Aen | Tyr | Arg | Tyr | v.il | Thr | Trp | Glu | Aen | val | Arg | |
840 | 045 | 050 | ||||||||||||||
CAA | ACT | GCC | GGC | CGC | GCA | GTC | AAC | CAA | CAC | AAA | AAT | GTC | GGC | GTT | TAC | 2749 |
Gin | Thr | Alá | Gly | Gly | Alá | Val | Aon | Gin | lile | • Lye | Aen | Val | Gly | Val | Tyr | |
855 | 860 | 865 | ||||||||||||||
AAC | CCA | TAT | GCC | GCC | CCC | GGC | CCA | AAC | TAC | ACA | TTT | AGC | TTG | GAA | ATG | 2797 |
Asn | Arg | Tyr | Alá | Alá | Pro | Cly | Arg | Λβπ | Tyr | Thr | Phe | Ser | Leu | Glu | Hét | |
870 | 875 | 800 | 005 | |||||||||||||
AAG | TTT | TAAACG | 2009 |
Lye Phe
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 6-RÓL 50 (C) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI: (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehéije (A) HOSSZ: 911 aminosav (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 6 (B) TÍPUS: aminosav
Kel -24 | Cin | Glri | Gin | His -20 | Leu | The | Arg | Leu | Ann -15 | I le | Leu Cye | Leu | Ser -10 | Leu |
Hét | Thr | Alá | Leu | Pro | Alá | Tyr | Alá | Glu | Ann | Val | Gin Alá | Gly | Cin | Alá |
-5 1 5
HU 219 267 Β
Gin Glu Lys Gin Leu Αβρ Thr | 1 le | Gin Val | Lye | Alá 20 | Lyo | Lye Cin | Lye | ||||||||
10 | 15 | ||||||||||||||
Thr | Arg | Arg | Aep | Aen | Clu | Val | Thr | Gly | Leu | Cly | Lyo | Leu | Val | Lyo | The |
25 | 30 | 35 | 40 | ||||||||||||
Alá | Aep | Thr | Leu | Ser | Lye | Glu | Gin | Val | Leu | Anp | Ile | Arg | Aop | Leu | The |
45 | 50 | 55 | |||||||||||||
Arg | Tyr | Aep | Pro | Gly | Ile | Alá | Val | Val | Glu | Gin | Gly | Arg | Gly | AI a | Ser |
60 | 65 | 70 | |||||||||||||
Ser | Gly | Tyt | Ser | Ile | Arg | Gly | Hét | Aep | Lye | Aen | Arg | Val | Ser | Leu | Thr |
75 | 80 | 85 | |||||||||||||
val | Αβρ | Gly | Leu | Alá | Cin | Ile | Gin | Ser | Tyr | Thr | Alá | Gin | Alá | Aln | Leu |
90 | 95 | 100 | |||||||||||||
Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Alá | Gly | Ser | Sec | Gly | Alá | Ile | Aon | Glu | Ile | GJu |
105 | 110 | 1)5 | 120 | ||||||||||||
Tyr | Glü | Aen | Val | Lye | Alá | val | Clu | Ile | Ser | Lye | Gly | Ser | Aen | Ser | Val |
125 | 130 | 135 | |||||||||||||
Glu | Gin | Gly | Ser | Gly | Alá | Leu | Alá | cly | Ser | val | Alá | Phe | Gin | Thr | Lyo |
Í40 | 145 | 150 | |||||||||||||
Thr | Alá | Aep | Aep | Val | Ile | Gly | Glu | Gly | Arg | Cin | Trp | Gly | He | Gin | Ser |
1S5 | 160 | 165 | |||||||||||||
Lye | Thr | Alá | Tyr | Ser | Gly | Lye | Aen | Arg | Gly | Leu | Thr | Cin | Ser | De | Alá |
170 | 175 | 180 | |||||||||||||
Leu | Alá | Gly | Arg | He | Gly | Gly | Alá | Glu | Aln | Leu | Leu | Ile | Illa | Thr | Gly |
185 | 190 | 195 | 200 | ||||||||||||
Arg | Arg | Alá | Cly | Glu | Ile | Arg | Alá | lile | Glu | Anp | Alá | Gly | Arg | Cly | Val |
205 | 210 | 215 | |||||||||||||
Gin | Ser | Phe | Α9Π | Arg | Leu | Val | Pro | Val | Glu | Aep | Ser | Ser | Glu | Tyr | Alá |
220 | 225 | 230 | |||||||||||||
Tyr | Phe | He | val | Glu | Aep | Glu | Cye | Clu | Gly | Lyo | Aon | Tyr | Glu | Thr | Cy a |
235 | 240 | 245 | |||||||||||||
Lye | Ser | Lye | Pro | Lye | Lye | Aep | val | Val | cly | Lye | Aop | Glu | Arg | Gin | Thr |
250 | 255 | 260 | |||||||||||||
vaí | Ser | Thr | Arg | Aep | Tyr | Thr | Cly | Pro | Aon | Arg | Phe | Leu | Alá | Agp | Pro |
265 | 270 | 275 | 280 | ||||||||||||
Leu | Ser | Tyr | Glu | Ser | Arg | Ser | Trp | Leu | Phe | Arg | Pro | ciy | Phe | Arg | The |
285 | 290 | 295 | |||||||||||||
clu | Aen | Lye | Arg | lile | Tyr | Ile | Gly | Gly | 7 le | Leu | Glu | lile | Thr | Gin | Gin |
300 305 310
HU 219 267 Β
Thr | Phe | Aep 315 | Thr | Arg | Aep | Hét | Thr 320 | Val Pro | Ala | Phe | Leu 325 | Thr | Lye | Ala |
Val | Phe | Aep | Ala | Abn | Ser | Lye | Gin | Ala Gly | Ser | Leu | Pro | Cly | Aon | Cly |
j30 | 335 | 340 | ||||||||||||
Lye | Tyr | Alá | Gly | Asn | lile | Lye | Tyr | Gly Gly | Leu | Phe | Thr | Ann | Gly | Glu |
345 | 350 | 355 | 360 | |||||||||||
Aen | Gly | Ala | Leu | val | Gly | Ala | Glu | Tyr Gly | Thr | Gly | val | Phe | Tyr | Aop |
365 | 370 | 375 | ||||||||||||
Glu | Thr | lile | Thr | Lye | Ser | Arg | Tyr | Gly Leu | Glu | Tyr | Val | Tyr | Thr | Ann |
380 | 305 | 390 | ||||||||||||
Ala | Aep | Lye | Aep | Thr | Trp | Ala | Aep | Tyr Ala | Arg | Leu | Ser | Tyr | Aep | Arg |
395 | 400 | 405 | ||||||||||||
Gin | Gly | ile | Gly | Leu | Aep | Aen | lile | Phe Cin | Gin | Thr | lile | Cye | Ser | Ala |
410 | 415 | 420 | ||||||||||||
Λβρ Gly | Ser | A9p | Lye | Tyr | Cye | Arg | Pro Ser | Ala | Agp | Lye | Pro | Phe | Ser | |
425 | 430 | 435 | 440 | |||||||||||
Tyr | Tyr | Lye | Ser | Aep | Arg | val | Ile | Tyr Gly | Glu | Ser | lile | Arg | Leu | Leu |
445 | 450 | 455 | ||||||||||||
Gin | Ala | Ala | Phe | Lye | Ly9 | Ser | Phe | Aep Thr | Ala | Lyn | Ile | Arg | Ilin | Aon |
4 60 | 465 | 470 | ||||||||||||
Leu | Ser | Val | Aen | Leu | Gly | Phe | Aep | Arg Phe | Anp | Ser | Aon | Leu | Arg | ille |
475 | 480 | 485 | ||||||||||||
Gin | Aep | Tyr | Tyr | Tyr | Gin | lile | Ala | Aen Arg | Ala | Tyr | Ser | Ser | Lyn | Thr |
490 | 495 | 500 | ||||||||||||
Pro | Pro | Lye | Thr | Ala | Aen | Pro | Aen | Cly Anp | Lye | Ser | Lye | Pro | Tyr | Trp |
505 | 510 | 515 | 520 | |||||||||||
Val | Ser | Ile | Gly | Gly | Gly | Aen | Val | Val Thr | Gly | Gin | Ile | Cye | Leu | Phe |
525 | 530 | 535 | ||||||||||||
Gly | Aen | Aen | The | Tyr | Thr | Aep | Cye | Thr Pro | Arg | Sec | Ile | Λβη | Gly | Lyo |
540 | 545 | 550 | ||||||||||||
Ser | Tyr | Tyr | Ala | Ala | Val | Arg | Aep | Aen Val | Arg | Leu | Gly | Arg | Trp | Ala |
555 | 560 | 565 | ||||||||||||
Aep | Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Arg | Tyr | Agp Tyr | Arg | Ser | Thr | lile | Ser | Aep |
570 | 575 | 580 |
HU 219 267 Β
Asp | Gly | Ser | Val | Ser | Thr | Gly | Thr | lile | Arg | Thr | Leu | Ser | Trp | Agn | Alá |
585 | 590 | 595 | 600 | ||||||||||||
Gly | Ile | Vál | Leü | Lye | Pro | Alá | Aep | Trp | Leu | Aep | Leu | Thr | Tyr | Arg | Thr |
605 | 610 | 615 | |||||||||||||
Ser | Thr | Gly | Phe | Arg | Leu | Pro | Ser | Phe | Alá | Glu | Bet | Tyr | Gly | Trp | Arg |
620 | 625 | 630 | |||||||||||||
Ser | Gly | Val | Gin | Ser | Lye | Alá | Val | Lye | Ile | Anp | Pro | Glu | Lyo | Ser | Phe |
635 | 640 | 645 | |||||||||||||
Aen | Lye | Glu | Alá | Cly | Ile | Val | Phe | Lye | Gly | Anp | Phe | Cly | Ann | Leu | Glu |
650 | 655 | 660 | |||||||||||||
Alá | Ser | Trp | Éhe | Aen | Aen | Alá | Tyr | Arg | Aep | Leu | Ile | Val | Arg | Gly | Tyr |
665 | 670 | 675 | 600 | ||||||||||||
Glu | Alá | Gin | Ile | Lye | Aen | Gly | Lye | Glu | Glu | Alá | Lye | Gly | Agp | Pro | A la |
685 | 690 | 695 | |||||||||||||
Tyr | Leu | Aen | Alá | Gin | Ser | Alá | Arg | 1 le | Thr | GJy | I le | ftnn | Ile | Leu | Gly |
700 | 705 | 710 | |||||||||||||
Lye | Ile | Aep | Trp | Aen | Gly | Val | Trp | Agp | Lyo | Leu | Pro | Glu | Gly | Trp | Tyr |
715 | 720 | 725 | |||||||||||||
Ser | Thr | Phe | Alá | Tyr | Agn | Arg | Val | Hle | v,i 1 | Arg | Agp | Ile | Lyg | Lye | Arg |
730 | 735 | 740 | |||||||||||||
Alá | Aep | Arg | Thr | App | Ile | Gin | Ser | Ili Θ | Len | Phe | Ar.p | A1 a | 11 e | Cl n | P ro |
745 | 750 | 755 | 7 60 | ||||||||||||
Ser | Arg | Tyr | Val | Val | Gly | Leu | Gly | Tyr | Aep | Gin | Pro | Glu | Gly | Lye | Trp |
765 | 770 | 775 | |||||||||||||
Gly | val | Aen | Gly | Hét | Leu | Thr | Tyr | Ser | Lyn | Alá | Lye | Glu | Ile | Thr | Glu |
780 | 705 | 790 | |||||||||||||
Leu | Leu | Cly | Ser | Arg | Alá | Leu | Leu | Agn | Cly | Agn | Ser | Arg | Ann | The | Lyo |
795 | 800 | 005 | |||||||||||||
Alá | Thr | Alá | Arg | Arg | Thr | Arg | Pro | Trp | Tyr | Ile | Val | Agp | Val | Ser | Gly |
ölő | 815 | 820 | |||||||||||||
Tyr | tyr | Thr | Ile | Lye | Lye | Hle | Phe | Thr | Leu | Arg | Alá | cly | Val | Tyr | Aen |
825 | 830 | 835 | b4o | ||||||||||||
Leu | Leu | Aeh | tyr | Arg | Tyr | Val | Thr | Trp | Glu | Agn | Val | Arg | Gin | Thr | Alá |
845 050 055
HU 219 267 Β
Gly GÍy
Alá Alá
Alá Val 860
Pro Gly 875
Aen Gin
Arg Aon lile Lys
Tyr The 880
Aen Val 865
Phe Ser
Gly Val
Leu Glu
Tyr Aon 870
Hét Lye 885
Arg Tyr
Phe
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 7-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 2230 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (iv) EREDETE:
(A) ORGANIZMUS: A transzferrinreceptor Tbp2 alegységét kódoló DNS (B) FORRÁS: Neisseria meningitidis IM2169 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 60...119 10 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: érett fehéije (B) NUKLEOTIDOK: 120...2192 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A)NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 60...2192 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 7
ΛΤΤ7 | GTTA | ΑΛ ΑΛΤΛΛΛΤΛΛΛ AT | ΛΛΤΑ | ATCC | TTA | TCAT | TCT | ΤΤΛΛ | TTGA | AT T | CCCT | ΤΤΛΤ | 59 | |||
ATC | AAC | ΛΛΤ | CCA | TTG | GTA | ΛΛΤ | CAG | GCT | GCT | ATC | CTG | CTC | CCT | CTC | TTT | 107 |
Met | Aen | Aen | Pro | Leu | Val | Aen | Gin | Alá | Alá | Hét | Val | Leu | Pro | Val | Phe | |
-20 | -15 | -10 | -5 | |||||||||||||
TTG | TTG | Kgt | GCC | TGT | CTG | GGC | GGC | GCC | CCC | ACT | TTC | CAT | CTT | GAT | TCT | 155 |
LeU | Lfeu | Ser | hla | Cye | Leu | cly | Gly | Gly | Cly | Ser | Phe | Aep | Leu | Aep | Ser | |
i | 5 | 10 | ||||||||||||||
GTC | CAT | ACC | GAA | CCC | CCG | CCT | CCC | CCC | CCA | AAG | TAT | CAA | CAT | CTT | TCT | 203 |
Val | Asp | Thr | GlU | Alá | Pro | Arg | Pro | Alá | Pro | Lys | Tyr | Gin | Aep | Val | Ser | |
15 | 20 | 25 | ||||||||||||||
TCC | GAA | AAA | CCG | CAA | CCC | CAA | AAA | CAC | CAA | GCC | GGA | TAC | GCT | TTT | CCC | 251 |
Ser | GlU | Lyd | Pro | Cin | Alá | Gin | Lye | Aep | Cin | Gly | Gly | Tyr | Gly | Phe | Alá | |
30 | 35 | 40 | ||||||||||||||
ATC | AGG | TTO | AAA | CCG | AGG | AAT | TGC | TAT | CCC | GGC | CCA | GAA | CAA | ACC | CAC | 299 |
Met | Arg | Leu | Lye | Arg | Arg | Aen | Trp | Tyr | Pro | Gly | Alá | Clu | Clu | Ser | Clu | |
45 | 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
CTT | AAA | CTG | AAC | CAG | ACT | GAT | TCG | CAG | GCC | ACG | CCA | TTC | CCC | ACA | AAA | 347 |
val | Lye | Leu | Aen | Glu | Ser | Aep | Trp | Clu | Alá | Thr | Gly | Leu | Pro | Thr | I.y e | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
CCC | AAG | GAA | CTT | CCT | AAA | CGC | CAA | AAA | TCG | CTT | ATT | CAA | AAA | CTA | CAA | 395 |
Pro | Lye | Gld | Leu | Pío | Lys | Arg | Gin | Lye | Ser | Val | Ile | Clu | Lye | Val | Clü | |
80 | 85 | 90 | ||||||||||||||
ACA | GAC | GGC | GAC | ACC | GAT | ATT | TAT | TCT | TCC | CCC | TAT | CTC | ACA | CCA | TCA | 443 |
Thr | Aep | Gly | Aep | Ser | Aep | Ile | Tyr | Ser | Ser | Pro | Tyr | Leu | Thr | Pro | Ser | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
AAC | CAT | CAA | AAC | GGC | AGC | CCT | GGC | AAC | GGT | GTA | AAT | CAA | CCT | AAA | AAT | 491 |
Aen | Hle | Cin | Aen | ' Cly | Ser | Alá | Cly | Aon | Cly | Val | Aon | Cin | Pro | t.y e | Ann | |
110 | 115 | 120 | ||||||||||||||
CAG | GCA | ACA | GGT | CAC | GAA | ΛΛΤ | TTC | CAA | TAT | GTT | TAT | TCC | GGT | TCG | TTT | 539 |
Gin | Alá | Thr | Gly | Hle | Glu | Aen | Phe | Gin | Tyr | Val | Tyr | Ser | Cly | Trp | Phe | |
125 | 130 | 135 | 140 |
HU 219 267 Β
TAT | AAA | CAT | GCA | GCC | AGT ' | GAA | AAA | GAT | TTC | AGT | AAC | AAA | AAA | ATT | AAG |
Tyr | Lye | Hle | Alá | Al» | Ser | Glu | Lye | Anp | Phe | Ser | Aon | Lye | Lyo | I le | Lye |
145 | J50 | 155 | |||||||||||||
TCA | GCC | GAC | CAT | GCT | TAT | ATC | TTC | TAT | CAC | CCT | CAA | AAA | CCT | TCC | CGA |
Ser | Gly | Aep | Aep | Cly | Tyr | He | rhe | Tyr | ní.e | Cly | Glu | Lye | rro | Sec | Arg |
160 | 165 | 170 | |||||||||||||
CAA | CTT | CCT | GCT | TCT | GGA | ΛΛΛ | GTT | ATC | TAC | AAA | GGT | GTG | TCG | CAT | TTT |
Gin | Leu | Pro | Alá | Ser | Gly | Lye | val | Ile | Tyr | Lye | Gly | val | Trp | lile | Phe |
175 | 180 | 185 | |||||||||||||
GTA | ACC | CAT | ACA | AAA | AAG | GCT | CAA | GAT | TTT | CGT | CAA | ATT | ATC | CAG | CCT |
Val | Thr | Aep | Thr | Lye | Lye | Gly | Cin | Anp | Phe | Arg | Glu | Ile | 1) e | Gin | Pro |
190 | 195 | 200 | |||||||||||||
TCA | ΛΛΛ | AAA | CAA | GCC | CAC | AGG | TAT | AGC | GGA | TTT | TCT | GGT | GAT | CGC | ACC |
Ser | Lye | Lye | Gin | Gly | Aep | Arg | Tyr | Sec | Gly | Phe | Ser | Gly | Aep | Gly | Ser |
205 | 210 | 215 | 220 | ||||||||||||
GAA | GAA | TAT | TCC | AAC | AAA | AAC | GAA | TCC | ACG | CTG | AAA | CAT | GAT | CAC | GAG |
Glu | Glu | Tyr | Ser | Aen | Lye | Aen | Glu | Ser | Thr | Leu | Lye | Aep | Aep | Me | Clu |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
CGT | TAT | CGT | TTT | ACC | TCG | AAT | ΤΤΛ | CAA | CTC | CAT | TTC | CGC | AAT | AAC | AAA |
Gly | Tyr | Gly | Phe | Thr | Ser | Aen | Leu | Clu | va l | Aep | The | Gly | Aen | Lye | Lye |
240 | 245 | 250 | |||||||||||||
TTC | ACG | GGT | AAA | ΤΤΛ | ATA | CGC | AAT | AAT | CCG | AGC | CTA | AAT | AAT | AAT | ACT |
Leu | Thr | Gly | Lye | Leu | lle | Arg | Aen | Aen | Alá | Ser | Leu | Aen | Ann | Aen | Thr |
255 | 260 | 265 | |||||||||||||
AAT | AAT | GAC | AAA | CAT | ACC | ACC | CAA | TAC | TAC | AGC | CTT | CAT | CCA | CAA | ATA |
Aen | Aen | Aep | Lye | Hle | The | Thr | Gin | Tyr | Tyr | Ser | Leu | Asp | Alá | Gin | 1 le |
270 | 275 | 280 | |||||||||||||
ACA | GGC | AAc | CGC | TTC | AAC | GGC | ACG | CCA | ACC | GCA | ACT | CAC | AAA | AAA | GAG |
Thr | Gly | Aen | Arg | t>he | Aen | Gly | The | Alá | Thr | Alá | Thr | Anp | Lye | Lye | Glu |
285 | 290 | 295 | 300 | ||||||||||||
AAT | GAA | ACC | AAA | CTA | CAT | CCC | TTT | GTT | TCC | CAC | TCC | TCT | TCT | TTC | AGC |
Aen | Clu | Thr | Lye | Leu | lile | Pro | Phe | val | Ser | Aep | Ser | Ser | Ser | Leu | Ser |
305 | 310 | 315 | |||||||||||||
GGC | GCC | TTT | TTC | CGC | CCG | CAG | CGT | GAC | GAA | TTG | GGT | TTC | CCC | TTT | TTG |
Gly | Gly | Phe | Phe | Gly | Pro | Gin | Gly | Glu | Glu | Leu | ciy | Phe | Arg | Phe | Leu |
320 | 325 | 330 | |||||||||||||
AGC | GAC | GAT | CAA | •AAA | CTT | CCC | GTT | GTC | GGC | ACC | CCG | AAA | ACC | AAA | CAC |
Ser | Aep | Aep | Gin | Lyé | val | Alá | val | Val | Gly | Ser | Alá | Lye | The | Lye | Αθρ |
335 | 340 | 345 | |||||||||||||
AAA | CTG | GAA | AAT | GGC | CCG | CCG | GCT | TCA | GGC | AGC | ACA | CGT | GCC | CCA | GCA |
Lye | Leu | Glu | Aen | Gly | Alá | Alá | Ma | Ser | Gly | Ser | Thr | Cly | Alá | Alá | A1 a |
350 355 360
587
635
683
731
779
827
875
923
971
1019
1067
1115
1163
1211
HU 219 267 Β
TCC Ser 365 | CCC Gly | GGT Gly | CCG GCA CCC | ACG Thr | TCG TCT GAA AAC AGT AAG | CTG Leu | ACC ACG Thr Thr 300 | 1259 | ||||
Ala | Ala | Cly 370 | Ser | Ser Glu Aen Ser 375 | Ly9 | |||||||
GTT | TTG | GAT | GCG | GTT | GAA | TTC | ACA | CTA AAC GAC AAG | AAA | ATC | ΑΛΑ ΛΛΤ | 1307 |
Val | Leu | Aep | Ala | Val | Glu | Leu | Thr | Leu Agn Aep Lye | Lye | Ile | Lye Aen | |
385 | 390 | 395 | ||||||||||
CTC | GAC | AAC | TTC | AGC | AAT | GCC | CCC | CAA CTG GTT CTC | GAC | CGC | ATT Arc | 1355 |
LeU | Aep | Aen | Phe | Ser | Aen | Ala | Ala | Gin Leu Val Val | Anp | ciy | Ile Met | |
400 | 405 | 410 | ||||||||||
ATT | CCG | CTC | CTG | CCC | AAG | CAT | TCC | CAA ACC CGG AAC | ACT | CAC | CCA GAT | 1403 |
Ile | Pro | Leu | Leu | Pro | Lye | Aep | Ser | Glu Ser Cly Aen | Thr | Cin | Ala Aep | |
415 | 420 | 425 | ||||||||||
AAA | GGT | AAA | AAC | GGC | GGA | ACA | GAA | TTT ACC CGC AAA | TTT | GAA | CAC ACG | 1451 |
Lye | Gly | Lye | Aen | Gly | Gly | Thr | Glu | Phe Thr Arg Lyo | Phe | Glu | Ilin Thr | |
4 30 | 435 | 440 | ||||||||||
CCG | GAA | ACT | CAT | AAA | AAA | GAC | CCC | CAA GCA CGT ACG | CAC | ACG | AAT GGG | 1499 |
Pro | GlU | Ser | Aep | Lye | Lye | Aep | Ala | Gin Ala Cly Thr | Gin | Thr | Aen Cly | |
445 | 450 | 455 | 460 | |||||||||
CCG | CAA | ACC | GCT | TCA | AAT | ACG | GCA | GGT GAT ACC AAT | GGC | AAA | ACA AAA | 1547 |
Ala | Gin | Thr | Ala | Ser | Aen | Thr | Ala | Gly Agp Thr Aen | Cly | Lye | Thr Lye | |
465 | 470 | 475 | ||||||||||
ACC | TAT | CAA | GTC | CAA | GTC | TGC | TGT | TCC AAC CTC AAT | TAT | CTG | AAA TAC | 1595 |
Thr | Tyr | clu | Val | GlU | Val | Cye | Cye | Ser Aen Leu Aen | Tyr | Leu | Lye Tyr | |
480 | 485 | 490 | ||||||||||
CCA | AtC | TTG | ACG | CGC | AAA | AAC | AGC | AAG TCC GCG ATG | CAC | GCA | GGA GGA | 1643 |
Cly | Bet | Leu | Thr | Arg | Lye | Aen | Ser | Lye Ser Ala Met | Gin | Ala | Cly Gly | |
495 | 500 | 505 | ||||||||||
AAC | ACT | ACT | CAA | GCT | CAT | CCT | AAA | ACG CAA CAA GTT | CAA | CAA | AGT ATG | 1691 |
Aen | Ser | Ser | Gin | Ala | Aop | Ala | Lye | Thr Clu Cin Val | Glu | Cin | Ser Met | |
510 | 515 | 520 | ||||||||||
TTC | CTC | CAA | GGC | GAG | CGT | ACC | CAT | GAA AAA GAC ATT | CCA | ACC | GAC CAA | 1739 |
Phe | Leu | Gin | Gly | Glu | Arg | Thr | Agp | Glu Lye Clu Ile | Pro The | Aep Gin | ||
525 | 530 | 535 | 540 | |||||||||
AAC | CTC | GTT | TAT | CCC | CCC | TCT | TGG | TAC CCC CAT ATT | CCC AAC GGC ACA | 1787 | ||
Aen | Val | Val | Tyr | Arg | ciy | Ser | Trp | Tyr Gly Mlo Ile | Ala Aon Gly Thr | |||
545 | 550 | 555 | ||||||||||
AGC | TCC | AGC | GGC | KhT | GCT | TCT | GAT | AAA GAG GGC GGC | AAC AGG GCG GAA | 1835 | ||
Ser | Trp | Ser | Gly | Aen | Ala | Ser | Aep | Lye Clu Gly Gly | Asn Arg Ala GlU | |||
560 | 565 | 570 | ||||||||||
TTT | ACT | GTC | AAT | TTT | CCC | CAT | AAA | , AAA ATT ACC CGC | : AAC TTA ACC GCT | 1883 | ||
Phe | Thr | val | Aen | Phe | Ala | Aop | Lye | Lye Ile Thr Cly | Lye Leu Thr Ala |
575 580 585
HU 219 267 Β
0ΛΛ AAC AGC | CAG Gin | GCC Alá | CAA ACC TTT ACC | ATT GAG GCA De Glu Gly 600 | ATG Hét | ATT Ile | CAG Gin | GGC Gly | 1931 | ||||
Glu | Aen 590 | Arg | Cin | Thr 595 | Phe Thr | ||||||||
AAC | GGC | TTT | GAA | GGT | ACG | GCG | AAA ACT | GCT GAG TCA | GGT | TTT | CAT | CTC | 1979 |
Aen | Gly | Phe | Glu | Gly | Thr | Alá | Lye Thr | A,a Glu Ser | Gly | Phe | Aep | Leu | |
605 | 610 | 615 | 620 | ||||||||||
GAT | CAA | AAA | AAT | ACC | ACC | CGC | ACG CCT | AAG CCA TAT | ATC | ACA | GAT | GCC | 2027 |
Aep | Gin | Lyo | Asn | Thr | Thr | Arg | Thr Pro | Lyn Alá Tyr | I le | Thr | A«ip | Alá | |
625 | 630 | 635 | |||||||||||
AAG | GTA | AAG | GGC | CGT | TTT | TAC | CCG CCT | AAA GCC GAA | CAG | TTG | GCC | GGA | 2075 |
Lye | Val | Lye | Cly | Cly | Phe | Tyr | Gly Pro | Lyn Alá Glu | Glu | Leu | Cly | Gly | |
640 | 645 | 650 | |||||||||||
TGG | TTT | GCC | TAT | CCG | CCC | GAT | AAA CAA | ACG CAA AAG | CCA | ACA | GCT | ACA | 2123 |
Trp | Phe | Alá | Ty t | Pro | Cly | Aep | Lye Cin | Thr Glu Lyo | Alá | Thr | Alá | Thr | |
655 | 660 | 665 | |||||||||||
TCC | AGC | GAT | GGA | AAT | TCA | GCA | AGC AGC | GCG ACC GTG | GTA | TTC | GGT | GCG | 2171 |
Ser | Ser | Aep | Gly | Aen | Ser | Alá | Ser Ser | Ma Thr Val | Val | Phe | Gly | Alá | |
670 | 675 | 680 | |||||||||||
AAA | CGC | CAA | CAG | CCT | GTG | CAA | TAAGCACCGT TGCCGAACAA TCAAGAATAA | 2222 | |||||
Lye | Arg | Gin | Gin | Pro | val | Cin |
685 690
CCCTTCAC
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 8-RÓL (i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZ: 711 aminosav (B) TÍPUS: aminosav
Met Xen Aen Pro Leu Val Aen Gin Alá -20 -15
2230 (C)KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehéije (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 8
Alá Hét Val Leu Pro Val Phe -10 -5
Leu Leu Ser Alá Cye Leu Cly Gly Cly Gly Ser Phe 1 5
Anp
Leu Aep 10
Ser
Val Aep Thr Glu Alá 15
Pro Arg
Pro 7»la 20
Pro Lye Tyr
Cin Aep Val 25
Ser
Ser | Glu 30 | Lye | Pro | Clri Ma | Gin 35 | Lye | A9p | Gin Cly Gly 40 | Tyr | Gly | Phe | Al a | ||
Hét | Arg | Leu | Lye | Arg | Arg | Ann | Trp | Tyr | Pro Gly | Al A | Glu | Glu | Ser | Glu |
45 | 50 | 55 | 60 |
Val | Lye | Leu | Aen | Glu | Ser | Aep | Trp | Glu | Aln | Thr | Gly | Leu | Pro | Thr Lyn |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||
Pro | Lye | Glu | Leu | Pro. | Lye | Arg | Cin | Ly e | Ser | Val | Ile | Glu | Lyo | Val GLu |
05 90
HU 219 267 Β
Thr Aep Cly Agp Shr 95 | Aep | Ile | Tyr 100 | Ser | Ser | Γιο | Tyr | Leu 105 | Thr | Γγο | Ser | ||||
Agn | Hle | Gin | Aen | Gly | Ser | Alá | Gly | Aen | Cly | Val | Αδη | Gin | Pro | Lye | Aen |
110 | 115 | 120 | |||||||||||||
Cin | Alá | Tht | Gly | Híg | Glu | Agn | Phe | Cin | Tyr | val | Tyr | Ser | Gly | Trp | Phe |
125 | 130 | 135 | 140 | ||||||||||||
Tyr | Lye | Hle | Alá | Alá | Ser | Clu | Ly o | Agp | The | Ser | Aen | Ly n | Lye | Ile | Ly o |
145 | 150 | 155 | |||||||||||||
Ser | Gly | Aep | Aep | Gly | Tyr | Ile | Phe | Tyr | 11» 3 | Cly | Clu | Lye | Pro | Ser | Arg |
Í60 | 165 | 170 | |||||||||||||
Gin | Leu | Pro | Alá | Ser | Gly | Lys | Val | 1 le | Tyr | Lye | Cly | Val | Trp | lile | Phe |
175 | 180 | 105 | |||||||||||||
Val | Thr | Aep | Thr | Lye | Lye | Cly | Gin | Asp | Phe | Arg | Clu | Ile | Ile | Cin | Pro |
190 | 195 | 200 | |||||||||||||
Ser | Lye | Lye | Gin | Gly | Aep | Arg | Tyr | Ser | Gly | Phe | Ser | Gly | Agp | Cly | Ser |
205 | 210 | 215 | 220 | ||||||||||||
Glü | Glu | Tyr | Ser | Aen | Lye | Aen | Glu | Ser | Thr | Leu | Lye | Aep | Aep | 111b | Glu |
225 | 230 | 235 | |||||||||||||
Cly | Tyr | Cly | Phe | Thr | Ser | Aen | Leu | Clu | Val | Aep | Phe | Gly | Aen | Lye | Lye |
240 | 245 | 250 | |||||||||||||
Leu | Thr | Cly | Lys | Leu | Ile | Arg | Aen | Agn | Ma | Ser | Leu | Aen | Aen | Aen | Thr |
255 | 260 | 265 | |||||||||||||
Aen | Aen | Aep | Lye | H1b | Thr | Thr | Cin | Tyr | Tyr | Ser | Leu | Aep | Alá | Gin | Ile |
270 | 2 75 | 200 | |||||||||||||
Thr | Cly | Aon | Arg | Phe | Aen | Cly | Thr | Alá | Thr | A1 a | Thr | Anp | Lye | Ly n | Cl»» |
28S | 290 | 295 | 300 | ||||||||||||
Aen | Clu | Thr | Lye | Leu | IIIb | Pro | Phe | Val | Ser | Aep | Ser | Ser | Ser | Leu | Ser |
305 | 310 | 315 | |||||||||||||
Gly | Gly | Phe | Phe | Gly | Pro | Gin | Gly | Clu | Cin | Leu | Gly | Phe | Arg | Pho | Leu |
320 | 325 | 330 | |||||||||||||
Ser | Aep | Agp | Cin | Lye | val | Alá | Val | Val | Gly | Ser | Alá | Lye | Thr | Lye | Anp |
335 | 340 | 345 | |||||||||||||
Lye | Leu | Clu | Agn | Gly | Alá | Alá | Alá | Ser | Gly | Ser | Thr | Cly | Alá | Alá | A1 a |
350 355 360
HU 219 267 Β
Ser 365 | Gly | Gly | Alá | Alá | Gly 370 | Thr | Ser | Ser | Glu | Aon 375 | Ser | l.y e | Leu | Thr | Thr 300 |
val | Leu | Aep | Alá | Val 385 | Glu | Leu | Thr | Leu | Agn 390 | Anp | Ly n | Lye | T le | Lye 395 | Ann |
Leu | Aep | Agn | Phe 400 | Ser | Aen | Alá | Alá | Gin 405 | Leu | Vg l | val | Aep | Gly 410 | lle | Heh |
lle | Pro | Leu 415 | Leu | Pro | Lye | Agp | Ser 420 | Glu | Ser | Gly | Aen | Thr 425 | Gin | Alá | Aep |
Lys | Gly 430 | Lye | Aen | Gly | Gly | Thr 435 | Glu | Phe | Thr | Arg | Lye 440 | Phe | Glu | il Le | Thr |
Pro 445 | Glu | Ser | Aep | Lye | Lye 450 | Agp | Alá | Gin | Alá | Gly 455 | Thr | Cin | Thr | Ann | Gly 4 60 |
Ma | Gin | Thr | Alá | Ser 465 | Agn | Thr | Alá | Gly | Agp 4 70 | Thr | Aon | Gly | Lye | Thr 475 | Lye |
Thr | Tyr | Clu | Val 480 | Glu | Val | Cye | CyB | Ser 405 | Aon | Leu | Aen | Tyr | Leu 490 | Lye | Tyr |
Gly | Hét | Leu 495 | Thr | hrg | Lye | Aen | Ser 500 | Lyn | Ser | Alá | Hét | Cin 505 | Alá | Gly | ciy |
Aen | Ser | Ser | Gin | Alá | Aep | Alá | Lye | Thr | Glu | Gin | val | Glu | Gin | Ser | Hét |
510 515 520
The | LeU | Gin | Gly | Glu | Arg | Thr | Aep | Glu | Lye | Glu | He | Pro | Thr | Aep | Gin |
525 | 530 | 535 | 540 | ||||||||||||
Aen | Val | Val | Tyr | Xrg | Gly | Ser | Trp | Tyr | Gly | lile | lle | Alá | Ann | Cly | Thr |
54S | 550 | 555 | |||||||||||||
Ser | Trp | Ser | Cly | Asn | Alá | Ser | Anp | Lys | Glu | Gly | Cly | Aen | Arg | Alá | Glu |
560 | 56S | 570 | |||||||||||||
Phe | Thr | Val | Aen | Phe | Alá | Aep | Lyn | Lyp | I le | Thr | Cly | Lye | Leu | Thr | Al η |
575 | 500 | 5 05 | |||||||||||||
Glu | Aen | Arg | Cin | Alá | Gin | Thr | Phe | Thr | I le | Glu | Gly | Hét | He | Gin | Gly |
590 | 595 | 600 | |||||||||||||
Aen | Cly | Phe | Glű | Gly | Thr | Ma | Lye | Thr | Alá | Clu | Ser | Cly | Pite | Anp | Leu |
605 | 610 | 615 | r,2o |
HU 219 267 Β
625 | 630 | 635 | |||||||||||||
Lye | val | Lye | Gly | Cly | Phe | Tyr | Gly | Tro | Lyn | Ma | Glu | Glu | Leu | Gly | Gly |
640 | 645 | 650 | |||||||||||||
Trp | Phe | Alá | Tyr | Pro | Gly | Aep | Lye | Gin | Thr | Glu | Lye | Alá | Thr | Alá | Thr |
655 | 660 | 665 | |||||||||||||
Ser | Ser | Aep | Gly | Aen | Ser | Ma | Ser | Ser | Alá | Thr | Val· | Val | Pho | Gly | Alá |
670 | 675 | 680 | |||||||||||||
Lye | Arg | Gin | Gin | Pro | Val | Gin |
685 ego
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 9-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A)HOSSZ: 51 bázispár 20 (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális)
ATC ACC AAA ACA TTT TTT CTC CCA ATA TTC Hét Arg Lye Arg phe Phe Val Cly Ile Phe
Ϊ 5 10 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A)NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1...51 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 9
CCC ATA AAC CTC CTT CTT 48
Alá Ile Aon I.eu Leu Val
CCA
Gly
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 10-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 17bázispár (B) TÍPUS: aminosav
Met Arg Lys Arg Phe Phe Val Gly Ile 1 5 (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ IDNO. 10
Phe Alá Ile Ann Leu Leu Val 10 15
Gly
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 11-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 57 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1...57 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...57 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 11
ATG AAA AAA ATA ACA GCG ATT ATT TTA TTG CTT CTT CCA GTC ATT ATT Met Lye Lye Ile Thr Gly Ile Ile Leu Leu Leu Leu Alá Val Ile Ile
10 15
CTC TCT GCA
Leu Ser Alá
HU 219 267 Β
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 12-RŐL (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (1) A szekvencia jellemzői: (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (i) (A) HOSSZ: 19 bázispár (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 12 (B) TÍPUS: aminosav
Met Lye Lye lle Thr Gly lle lle Leu Leu Leu Leu Ma Vnl lle lle 1 5 10 1Γ»
Leu Ser Alá
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 13-RÓL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A)HOSSZ: 60bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1... 60 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...60 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 13
ATG ΑΛΑ GCT ACT AAA CTG CTA CTG GGC CCG GTA ATC CTG GCT TCT ACT Met Lye Alá Thr Lye Leu Val Leu Gly Alá Vnl lle Leu Gly Ser Thr | 49 | ||||
1 | 5 | JO | 15 | ||
CTG CTG GCA Led Leu Alá | GCT Gly 20 | 60 | |||
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 14-RŐL (1) A szekvencia jellemzői: (i) (A) HOSSZ: 20 bázispár (B) TÍPUS: aminosav | 30 | (D)KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 14 |
Met Lye Ma Thr Lye Leu val Leu 1 5
Leu Leu Alá Gly 20
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 15-RŐL (1) A szekvencia jellemzői: 40 (i) (A)HOSSZ: 69bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) 45
Gly Alá Val lle Leu Gly Ser Th 10 15 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK :1...69 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...69 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 15
ATC AAA CTC | ACA Thr | ACA Thr 5 | CAT CAT CTA | CCG Arg | ACA Thr 10 | GGG cly | GCC Alá | GCA Alá | ΤΤΛ Leu | TTC Leu 15 | GTC Val | 49 | ||||
Hét 1 | Lye | Leu | Me | lile | Leu | |||||||||||
GCC | GCA | ATT | CTG | CTC | GCA | GGT | 69 | |||||||||
Alá | GÍy | lle | Led | Leu | Alá | Gly | ||||||||||
20 |
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 16-RÓL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A)HOSSZ: 23 bázispár (B) TÍPUS: aminosav (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ IDNO. 16
HU 219 267 Β
Hét Lye Leu Thr Thr Hie lile Leu Arg Thr Gly Alá Alá Leu Leu v,al 15 10 15
Alá Gly Ile Leu Leu Alá Gly
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 17-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 69bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1.. .69 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...69 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 17
ATC Hét 1 | TTT Phe | GTA Val | ACG Thr | AGC Ser 5 | AAA LyB | AAA Lye | ATC Hét | ACC CCG | GCT CTT | CTC Leu | CCA Alá | ATT Ile 15 | ACT Thr | 48 | ||
Thr | Alá 10 | A), a | Val | |||||||||||||
TTC | CCA | ATC | TCT | CTG | AGT | GCA | 69 | |||||||||
Leu | Alá | Met | Ser | Leu | Ser | Alá | ||||||||||
20 |
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 18-RÓL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 23 bázispár (B)TÍPUS: aminosav
Met Phe Val Thr Ser Lye Lye 1 5 (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehéije (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 18
Met Thr Alá Alá Val Leu Alá Ile Thr 10 15
Leu Alá Met Ser Leu Ser Alá 20
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 19-RŐL (1) A szekvencia jellemzői: 35 (i) (A)HOSSZ: 63 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) 40 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1.. .63 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1.. .63 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 19
ATC Met 1 | CAA Cin | CTC Leu | AAC Aen | AAA Lye 5 | CTC val | CTC ΛΛΛ Leu Lye |
ATG | CCA | ATT | GCC | GCA | ||
Met | Alá | Ile | Alá | Alá | ||
20 |
GGG CTG ATC ATT GCT CTG CCT CTT 48
Gly Leu Hét· Ile Alá Leu Tro Val
15
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 20-RÓL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 21 bázispár (B) TÍPUS: aminosav
Hét Gin Leu Aen Lye Val Leu 1 5
Hét Alá Ile Alá Alá 20 (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 20
LyP Cly Leu Hét Ile Alá Leu Pro Val 10 15
HU 219 267 Β
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 21-ROL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 54 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1...54 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...54 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 21
ATC Met 1 | AGA Arg | TAC Tyr | CTG Leu | GCA Ala 5 | ACA Thr | TTG Leu | TTG TTA Leu Le» |
GCC | GGG | ||||||
Ala | Cly |
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 22-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 18bázispár (B)TÍPUS: aminosav
Met Arg Tyr Leu Λ1» Thr Leu Le 1 5
TCT CTC CCC CTC TTA ATC ACC 4Θ
Ser I.pu Ala Val Len Ile Thr
15 (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehérje (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 22:
» Leu Ser Leu Ms Val Leu Ile Thr )0 J5
Ála Cly
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 23-RÓL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 66 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAK SZÁMA: egyszálú (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genomiális) (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: cDNS (B) NUKLEOTIDOK: 1...66 (ix) TOVÁBBI JELLEMZŐK:
(A) NÉV/FUNKCIÓ: szignálpeptid (B) NUKLEOTIDOK: 1...66 (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 23
ATG ΛΛΛ CAT AAC | GTT Val 5 | AAC Lyo | CTG Leu | ATC Met | |||
Met 1 | Lys | illa | Aen | ||||
GTC | CTC | GTG | CTC | TCC | GCC | ||
Val | Leu | Val | Leu | Ser | Cly | ||
20 |
CCA ATC ACT GCC GTT TTA TCC TCT 48
Ma Met Thr Ma Val Leu Ser Snr
JO 15
INFORMÁCIÓ A SEQ ID NO. 24-RŐL (1) A szekvencia jellemzői:
(i) (A) HOSSZ: 22 bázispár (B)TÍPUS: aminosav
Met Lye illa Aan Val Lye Le 1 5 val Leu val Leu Ser Gly 20 (D) KONFIGURÁCIÓ: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: fehéije (xi) A SZEKVENCIA LEÍRÁSA: SEQ ID NO. 24:
Met AJ.a Met The Ala Val Leu Ser Ser
15
Claims (20)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1. Izolált DNS-fragment, azzal jellemezve, hogy nukleotidszekvenciája az alábbi aminosavszekvenciák bármelyikével legalább 75%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú fehérjét kódol:55 - 1. azonosítószámon megadott, az 1. ciszteinnel kezdődő és az 579. glutaminnal végződő szekvencia,- 7. azonosítószámon megadott, az 1. ciszteinnel kezdődő és a 691. glutaminnal végződő szekvencia, és amely fragment expressziós terméke alkal60 más arra, hogy az N. meningitidis IM2394-es vagyHU 219 267 ΒIM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleni antiszérum felismerje.
- 2. Az 1. igénypont szerinti DNS-fragment, azzal jellemezve, hogy nukleotidszekvenciájai) az IM2394-es törzs 1. azonosítószámon megadott, 1. ciszteinnel kezdődő és 579. glutaminnal végződő aminosavszekvenciájú Tbp2 alegységét vagy ii) az IM2169-es törzs 7. azonosítószámon megadott, 1. ciszteinnel kezdődő és 691. glutaminnal végződő aminosavszekvenciájú Tbp2 alegységét kódolja.
- 3. Az 1. igénypont szerinti DNS-fragment, azzal jellemezve, hogy nukleotidszekvenciája az alábbi aminosavszekvenciák bármelyikével legalább 75%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú prekurzort kódoli) az 1. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és 579. glutaminnal végződő szekvencia vagy ii) az 7. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és 691. glutaminnal végződő szekvencia, és amely prekurzor alkalmas arra, hogy az N. meningitidis IM2394-es vagy IM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleni antiszérum felismerje.
- 4. Az 1. igénypont szerinti DNS-fragment, azzal jellemezve, hogy nukleotidszekvenciájai) az IM2394-es törzs 1. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és 579. glutaminnal végződő aminosavszekvenciájú Tbp2 alegységének prekurzorát vagy ii) az IM2169-es törzs 7. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és 691. glutaminnal végződő aminosavszekvenciájú Tbp2 alegységének prekurzorát kódolja.
- 5. Az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti DNSfragment, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája legalább 80%-os homológiát mutat a megfelelő vonatkoztatási szekvenciával.
- 6. Az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti DNSfragment, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája legalább 90%-os homológiát mutat a megfelelő vonatkoztatási szekvenciával.
- 7. Expressziós kazetta N. meningitidis IM2394-es vagy IM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleni antiszérum által történő felismerésre alkalmas peptid, polipeptid vagy fehérje előállítására, azzal jellemezve, hogy az 1-6. igénypontok bármelyike szerinti DNSfragmentet tartalmaz annak expressziójához szükséges elemek szabályozóhatása alatt.
- 8. A 7. igénypont szerinti expressziós kazetta, azzal jellemezve, hogy a DNS-fragment S. typhimurium araB-promoterét tartalmazó elemek szabályozóhatása alatt áll.
- 9. A 7. vagy 8. igénypont szerinti expressziós kazetta, azzal jellemezve, hogy a 7. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és 691. glutaminnal végződő aminosavszekvenciával legalább 75%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú fehérje előállítására szolgál, ési) RlpB-szignálpeptidet kódoló DNS-egységet és ii) a fehérjét kódoló DNS-fragmentet tartalmaz.
- 10. A 7-9. igénypontok bármelyike szerinti expressziós kazetta, azzal jellemezve, hogy a megfelelő vonatkoztatási szekvenciával legalább 80%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú fehérje előállítására szolgál.
- 11. A 7-9. igénypontok bármelyike szerinti expreszsziós kazetta, azzal jellemezve, hogy a megfelelő vonatkoztatási szekvenciával legalább 90%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú fehéije előállítására szolgál.
- 12. A 9. igénypont szerinti expressziós kazetta, azzal jellemezve, hogy N. meningitidis IM2394-es vagy IM2169-es törzse Tbp2 alegységének előállítására szolgál, ési) RlpB-szignálpeptidet kódoló DNS-egységet és ii) az alegységet kódoló DNS-fragmentet tartalmaz.
- 13. A 7-12. igénypontok bármelyike szerinti expressziós kazettával transzformált gazdasejt.
- 14. Eljárás N. meningitidis IM2394-es vagy IM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleni antiszérum által történő felismerésre alkalmas peptid, polipeptid vagy fehérje előállítására, azzal jellemezve, hogy 13. igénypont szerinti gazdasejtet tenyésztünk, és a pepiidet, a polipeptidet vagy a fehérjét kinyerjük a tenyészetből.
- 15. Gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy hatóanyagként a 14. igénypont szerinti eljárással előállított, N. meningitidis IM2394-es vagy IM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleni antiszérum által történő felismerésre alkalmas peptidet, polipeptidet vagy fehérjét tartalmaz.
- 16. Gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy hatóanyagként olyan virális vagy bakteriális vektort tartalmaz, amely genomjában, inszertálva, az 1-6. igénypontok bármelyike szerinti DNS-fragmentet tartalmaz, annak expressziójához szükséges elemek szabályozóhatása alatt.
- 17. Izolált DNS-egység, azzal jellemezve, hogy a 7. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és -1. alaninnal végződő aminosavszekvenciával legalább 75%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú szignálpeptidet kódol, amely szignálpeptid alkalmas arra, hogy a A. meningitidis IM2394-es vagy IM2169-es törzsének transzferrinreceptora elleni antiszérum felismeqe.
- 18. Izolált DNS-egység, azzal jellemezve, hogy a 7. azonosítószámon megadott, -20. metioninnal kezdődő és -1. alaninnal végződő aminosavszekvenciájú szignálpeptidet kódol.
- 19. A 17. igénypont szerinti DNS-egység, azzal jellemezve, hogy a megfelelő vonatkoztatási szekvenciával legalább 80%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú szignálpeptidet kódol.
- 20. A 17. igénypont szerinti DNS-egység, azzal jellemezve, hogy a megfelelő vonatkoztatási szekvenciával legalább 90%-os homológiát mutató aminosavszekvenciájú szignálpeptidet kódol.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FR9207493A FR2692592B1 (fr) | 1992-06-19 | 1992-06-19 | Fragments d'ADN codant pour les sous-unités du récepteur de la transferrine de Neisseria meningitidis et procédés les exprimant. |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9301791D0 HU9301791D0 (en) | 1993-10-28 |
HUT68443A HUT68443A (en) | 1995-06-28 |
HU219267B true HU219267B (en) | 2001-03-28 |
Family
ID=9430946
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9301791A HU219267B (en) | 1992-06-19 | 1993-06-18 | Dna fragments coding for neisseria meningitidis transferrin receptor subunits and method for their preparation |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6028049A (hu) |
EP (1) | EP0586266B1 (hu) |
JP (1) | JPH06277066A (hu) |
AT (1) | ATE242810T1 (hu) |
AU (1) | AU679911B2 (hu) |
CA (1) | CA2098448A1 (hu) |
DE (1) | DE69333036T2 (hu) |
ES (1) | ES2199938T3 (hu) |
FI (1) | FI932826A (hu) |
FR (1) | FR2692592B1 (hu) |
HU (1) | HU219267B (hu) |
NO (1) | NO932222L (hu) |
Families Citing this family (45)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP3532563B2 (ja) | 1990-08-23 | 2004-05-31 | ザ ユニバーシティー オブ ノースカロライナ アット チャペル ヒル | Neisseria gonorrhoeaeおよびNeisseria meningitidis由来トランスフェリン結合蛋白質 |
US5912336A (en) * | 1990-08-23 | 1999-06-15 | University Of North Carolina At Chapel Hill | Isolated nucleic acid molecules encoding transferrin binding proteins from Neisseria gonorrhoeae and Neisseria meningitidis |
FR2692592B1 (fr) * | 1992-06-19 | 1995-03-31 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Fragments d'ADN codant pour les sous-unités du récepteur de la transferrine de Neisseria meningitidis et procédés les exprimant. |
CA2173142C (en) * | 1993-10-01 | 2000-11-14 | Thomas Bosselmann | Method and device for measuring an electrical alternating quantity with temperature compensation |
FR2720408B1 (fr) * | 1994-05-31 | 1996-08-14 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Fragments Tbp2 de Neisseria meningitidis. |
FR2724936A1 (fr) * | 1994-09-22 | 1996-03-29 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Recepteur lactoferrine d'helicobacter |
WO1997013784A1 (fr) * | 1995-10-09 | 1997-04-17 | Pasteur Merieux Serums Et Vaccins | Recepteur lactoferrine d'helicobacter |
FR2739624B1 (fr) * | 1995-10-10 | 1997-12-05 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Nouvelle sous-unite tbp2 de neisseria meningitidis |
US6290970B1 (en) * | 1995-10-11 | 2001-09-18 | Aventis Pasteur Limited | Transferrin receptor protein of Moraxella |
US6610506B1 (en) | 1995-12-01 | 2003-08-26 | University Technologies International, Inc. | Transferrin binding proteins of Pasteurella haemolytica and vaccines containing same |
FR2767060B1 (fr) * | 1997-08-07 | 2000-02-11 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Vaccin meningocoque comportant la valence de souche bz83 |
ATE344325T1 (de) * | 1997-08-15 | 2006-11-15 | Univ Utrecht | Neisseria lactoferrin-bindendes protein |
BR9910089A (pt) | 1998-05-01 | 2004-06-08 | Chiron Corp | Composições e antìgenos de neisseria meningitidis |
US10967045B2 (en) | 1998-11-02 | 2021-04-06 | Secretary of State for Health and Social Care | Multicomponent meningococcal vaccine |
US6391316B1 (en) | 1999-03-10 | 2002-05-21 | University Of Saskatchewan | Vaccine compositions comprising Haemophilus somnus transferrin-binding proteins and methods of use |
ES2397918T3 (es) | 1999-04-30 | 2013-03-12 | Novartis Vaccines And Diagnostics S.R.L. | Antígenos Neisseriales conservados |
CN100338218C (zh) * | 1999-05-19 | 2007-09-19 | 启龙股份公司 | 组合式奈瑟球菌组合物 |
AU6490500A (en) * | 1999-07-16 | 2001-02-05 | Gerald R. Potts | Methods and systems for dynamic force measurement |
GB9928196D0 (en) * | 1999-11-29 | 2000-01-26 | Chiron Spa | Combinations of B, C and other antigens |
US6388434B1 (en) | 2000-01-17 | 2002-05-14 | Bechtel Bwxt Idaho, Llc | Electro-optic high voltage sensor |
EP2270030B1 (en) * | 2000-02-28 | 2012-05-23 | Novartis Vaccines and Diagnostics S.r.l. | Heterologous expression of Neisserial proteins |
GB0007433D0 (en) * | 2000-03-27 | 2000-05-17 | Microbiological Res Authority | Recombinant transferrin binding proteins |
US20030232055A1 (en) * | 2000-07-31 | 2003-12-18 | Ruslan Medzhitov | Innate immune system-directed vaccines |
US20030175287A1 (en) * | 2001-01-03 | 2003-09-18 | Yale University | Innate immune system-directed vaccines |
US7138267B1 (en) | 2001-04-04 | 2006-11-21 | Epicentre Technologies Corporation | Methods and compositions for amplifying DNA clone copy number |
GB0121591D0 (en) | 2001-09-06 | 2001-10-24 | Chiron Spa | Hybrid and tandem expression of neisserial proteins |
EP2390308A1 (en) | 2002-02-25 | 2011-11-30 | Vaxiion Therapeutics Inc | Minicell compositions and methods |
TWI360424B (en) * | 2002-08-02 | 2012-03-21 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Vaccine |
GB0220194D0 (en) * | 2002-08-30 | 2002-10-09 | Chiron Spa | Improved vesicles |
PT1549338E (pt) | 2002-10-11 | 2011-02-23 | Novartis Vaccines & Diagnostic | Vacinas polipeptídicas para protecção alargada contra linhagens meningocócicas hipervirulentas |
JP2006504801A (ja) | 2002-11-01 | 2006-02-09 | グラクソスミスクライン バイオロジカルズ ソシエテ アノニム | 乾燥方法 |
PL1670506T3 (pl) | 2003-10-02 | 2013-04-30 | Novartis Ag | Płynne szczepionki przeciw wielu grupom serologicznym meningokoków |
ES2346314T3 (es) | 2003-10-02 | 2010-10-14 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Antigenos de b. pertussis y uso de los mismos en vacunacion. |
US7628995B2 (en) | 2003-12-23 | 2009-12-08 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | Outer membrane vesicles and uses thereof |
GB0408977D0 (en) | 2004-04-22 | 2004-05-26 | Chiron Srl | Immunising against meningococcal serogroup Y using proteins |
GB0505996D0 (en) | 2005-03-23 | 2005-04-27 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Fermentation process |
JP5275983B2 (ja) | 2006-06-12 | 2013-08-28 | グラクソスミスクライン バイオロジカルズ ソシエテ アノニム | ワクチン |
GB0700562D0 (en) | 2007-01-11 | 2007-02-21 | Novartis Vaccines & Diagnostic | Modified Saccharides |
AU2010247254A1 (en) | 2009-05-14 | 2012-01-12 | Sanofi Pasteur | Menigococcus vaccine containing lipooligosaccharide (LOS) from modified strains of L6 immunotype Neisseria meningitidis |
EP2429658B1 (fr) * | 2009-05-14 | 2016-04-20 | Sanofi Pasteur | Procédé pour adjuver le lipopolysaccharide (LPS) des bactéries à gram-négatif |
EP2544713A1 (en) | 2010-03-10 | 2013-01-16 | GlaxoSmithKline Biologicals S.A. | Immunogenic composition |
WO2012032498A2 (en) | 2010-09-10 | 2012-03-15 | Novartis Ag | Developments in meningococcal outer membrane vesicles |
TWI689314B (zh) | 2010-11-30 | 2020-04-01 | 建南德克公司 | 低親和力血腦障壁受體抗體及其用途 |
CN104602704B (zh) | 2012-06-14 | 2019-08-06 | 诺华股份有限公司 | 针对血清组x脑膜炎球菌的疫苗 |
EA037909B1 (ru) | 2013-12-02 | 2021-06-04 | Инжиниред Антидженз Инк. | Иммуногенные композиции и вакцины, полученные из рецепторных белков поверхности бактерий |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5141743A (en) * | 1989-04-27 | 1992-08-25 | University Technologies International, Inc. | Method for isolating and purifying transferrin and lactoferrin receptor proteins and vaccines containing the same |
US5292869A (en) * | 1989-04-27 | 1994-03-08 | The Board Of Governors Of The University | Method for isolating and purifying transferrin and lactoferrin receptor proteins from bacteria and the preparation of vaccines containing the same |
JP3532563B2 (ja) * | 1990-08-23 | 2004-05-31 | ザ ユニバーシティー オブ ノースカロライナ アット チャペル ヒル | Neisseria gonorrhoeaeおよびNeisseria meningitidis由来トランスフェリン結合蛋白質 |
FR2682114B1 (fr) * | 1991-10-03 | 1996-02-23 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Vaccin de sous-unite contre les infections a neisseria meningitidis et sous-unites correspondantes a l'etat purifie. |
FR2682041B1 (fr) * | 1991-10-03 | 1994-01-14 | Pasteur Merieux Serums Vaccins | Vaccin contre les infections a neisseria meningitidis. |
FR2692592B1 (fr) * | 1992-06-19 | 1995-03-31 | Pasteur Merieux Serums Vacc | Fragments d'ADN codant pour les sous-unités du récepteur de la transferrine de Neisseria meningitidis et procédés les exprimant. |
-
1992
- 1992-06-19 FR FR9207493A patent/FR2692592B1/fr not_active Expired - Fee Related
-
1993
- 1993-06-08 AU AU40098/93A patent/AU679911B2/en not_active Ceased
- 1993-06-15 AT AT93401531T patent/ATE242810T1/de active
- 1993-06-15 ES ES93401531T patent/ES2199938T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1993-06-15 EP EP93401531A patent/EP0586266B1/fr not_active Expired - Lifetime
- 1993-06-15 CA CA002098448A patent/CA2098448A1/en not_active Abandoned
- 1993-06-15 DE DE69333036T patent/DE69333036T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1993-06-16 NO NO932222A patent/NO932222L/no unknown
- 1993-06-18 FI FI932826A patent/FI932826A/fi unknown
- 1993-06-18 HU HU9301791A patent/HU219267B/hu not_active IP Right Cessation
- 1993-06-21 JP JP5173773A patent/JPH06277066A/ja active Pending
-
1995
- 1995-05-23 US US08/448,194 patent/US6028049A/en not_active Expired - Lifetime
-
1997
- 1997-06-03 US US08/867,921 patent/US6326350B1/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
FR2692592A1 (fr) | 1993-12-24 |
EP0586266A1 (fr) | 1994-03-09 |
AU679911B2 (en) | 1997-07-17 |
US6028049A (en) | 2000-02-22 |
FR2692592B1 (fr) | 1995-03-31 |
HUT68443A (en) | 1995-06-28 |
JPH06277066A (ja) | 1994-10-04 |
NO932222D0 (no) | 1993-06-16 |
HU9301791D0 (en) | 1993-10-28 |
CA2098448A1 (en) | 1993-12-20 |
EP0586266B1 (fr) | 2003-06-11 |
NO932222L (no) | 1993-12-20 |
FI932826A0 (fi) | 1993-06-18 |
DE69333036D1 (de) | 2003-07-17 |
AU4009893A (en) | 1993-12-23 |
ES2199938T3 (es) | 2004-03-01 |
ATE242810T1 (de) | 2003-06-15 |
DE69333036T2 (de) | 2004-05-13 |
FI932826A (fi) | 1993-12-20 |
US6326350B1 (en) | 2001-12-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
HU219267B (en) | Dna fragments coding for neisseria meningitidis transferrin receptor subunits and method for their preparation | |
EP0625043B1 (en) | Recombinant multivalent m protein vaccine | |
JP3215109B2 (ja) | 肺炎球菌タンパクの構造遺伝子 | |
US5856170A (en) | Structural gene of pneumococcal protein | |
Baudry et al. | Nucleotide sequence of the invasion plasmid antigen B and C genes (ipaB and ipaC) of Shigella flexneri | |
ES2540281T3 (es) | Antígenos de estreptococos del grupo B | |
US20070053937A1 (en) | Antigen of hybrid M protein and carrier for group a streptococcal vaccine | |
PT2566507T (pt) | Vacinas de bioconjugado de bactérias gram-positivas capsulares | |
JPH07508972A (ja) | 分類できないヘモフイルス・インフルエンザエに対するワクチン | |
AU667715B2 (en) | Carrier system against GnRH | |
NO324089B1 (no) | Hybrid nukleinsyremolekyl for fremstilling av lipiderte rekombinante proteiner fra Borrelia-arter. | |
JPS6119490A (ja) | 原虫類抗原用dnaのクロ−ニング | |
EP0040922A1 (en) | DNA sequences, recombinant DNA molecules and processes for producing polypeptides with the specificity of foot and mouth disease viral antigens | |
Woods et al. | Conserved lipoprotein H. 8 of pathogenic Neisseria consists entirely of pentapeptide repeats | |
PL177302B1 (pl) | Szczepionka sprzężona zdolna do nadania gospodarzowi odporności na infekcje Streptococcus grupy B, cząsteczka rekombinanta, wektor rekombinanta i komórka gospodarza | |
PL186847B1 (pl) | Konstrukcja DNA, wektor ekspresyjny, gospodarz, białko fuzyjne i sposób przygotowania bakterii | |
JP3023997B2 (ja) | 組み換えコクシジウム症ワクチン−5−7アイメリア表面抗原 | |
HUT64596A (en) | Recombinant vaccine against swine pleuropneumonie | |
JP3055687B2 (ja) | Vp7をコードするヒトロタウイルス血清型4遺伝子9の分子クローニング、糖タンパク質特異的主要外部カプシド中和及びワクチンに使用するためのvp7及びそのフラグメントの発現 | |
AU743165B2 (en) | Live attenuated bacteria of the species Actinobacillus pleuropneumoniae | |
EP0373168A1 (en) | POLYPEPTIDES FOR USE IN DIAGNOSIS OF COCKIDIA INFECTION AND RECOMBINANT DNA, METHOD FOR PRODUCING THE SAME. | |
US6783764B1 (en) | Actinobacillus pleuropneumoniae subunit vaccine | |
JP3135060B2 (ja) | ヘモフィルスインフルエンザb型菌の外皮膜タンパク質P2の部分断片を用いた接合体 | |
JP4749641B2 (ja) | ワクチン用の肺炎球菌タンパク質の相同体および断片 | |
GB2079288A (en) | DNA Sequences, Recombinant DNA Molecules and Processes for Producing Polypeptides with the Specificity of Foot and Mouth Disease Viral Antigens |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HMM4 | Cancellation of final prot. due to non-payment of fee |