ES2199938T3 - Fragmentos de adn codificante de las subunidades del receptor de la meningitis neisseria. - Google Patents

Fragmentos de adn codificante de las subunidades del receptor de la meningitis neisseria.

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ES2199938T3
ES2199938T3 ES93401531T ES93401531T ES2199938T3 ES 2199938 T3 ES2199938 T3 ES 2199938T3 ES 93401531 T ES93401531 T ES 93401531T ES 93401531 T ES93401531 T ES 93401531T ES 2199938 T3 ES2199938 T3 ES 2199938T3
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Bernadette Bouchon-Theisen
Anthony B. Schryvers
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Abstract

LA PRESENTE INVENCION TIENE POR OBJETO UN FRAGMENTO DE CODIFICANTE ADN PARA UNA PROTEINA CAPAZ DE SER RECONOCIDA MEDIANTE UN ANTISUERO ANTIRRECEPTOR DE LA TRANSFERRINA DEL TRONCO DE N. MENINGITIDIS IM2394 O IM169, ASI COMO UN PROCEDIMIENTO DE OBTENCION DE LA CITADA PROTEINA MEDIANTE UNA VIA RECOMBINANTE. A TITULO DE EJEMPLOS, UN TAL FRAGMENTO DE ADN CODIGO PARA LA SUBUNIDAD TBP1 DEL TRONCO IM2394 O IM2169 O PARA LA SUBUNIDAD TBP2 DEL TRONCO IM2394 O IM2169.

Description

Fragmentos de ADN codificante de las subunidades del receptor de la meningitis neisseria.
La presente invención tiene por objetivo los fragmentos de DNA de Neisseria meningitidis que codifican para las subunidades del receptor de la transferrina, así como un procedimiento de fabricación de cada una de las subunidades mediante tecnología del DNA recombinante.
En general, las meningitis son de origen viral, o de origen bacteriano. Las bacterias principalmente responsables son: N. meningitidis y Haemophilus influenzae, implicadas respectivamente en aproximadamente el 40 y 50% de los casos de meningitis bacteriana.
En Francia, se estiman alrededor de 600 a 800 casos anuales de meningitis debida a N. meningitidis. En los Estados Unidos, el número de casos se eleva a aproximadamente 2500 a 3000 por año.
La especie N. meningitidis está subdividida en grupos séricos según la naturaleza de los polisacáridos capsulares. A pesar de que existe una docena de grupos séricos, el 90% de los casos son atribuibles a 3 grupos séricos: A, B y C.
Existen vacunas eficaces a base de polisacáridos capsulares para prevenir las meningitis de los grupos séricos de N. meningitidis A y C. Estos polisacáridos, para prevenir las meningitis de los grupos séricos A y C de N. meningitidis. Estos polisacáridos, tal cual, son poco o nada inmunogénicos en los niños de menos de 2 años y no inducen memoria inmunológica. Sin embargo, estos inconvenientes se pueden sobrellevar conjugando estos polisacáridos a una proteína portadora.
En cambio, el polisacárido del grupo B de N. meningitidis es poco o nada inmunogénico en el hombre, bien si está en la forma conjugada o no. En consecuencia, es más recomendable la búsqueda de una vacuna para las meningitis inducidas principalmente por N. meningitidis del grupo sérico B que una vacuna a base de polisacáridos.
Con dicho fin, se han propuesto diferentes proteínas de la membrana externa de N. meningitidis. Más precisamente, se trata del receptor de membrana de la transferrina humana.
De forma general, la mayor parte de bacterias necesitan hierro para su crecimiento y para ello han desarrollado sistemas específicos de adquisición de hierro. En relación con N. meningitidis que es un patógeno estricto del hombre, el hierro sólo se puede conseguir a partir de las proteínas humanas de transporte del hierro, como la transferrina y la lactoferrina, ya que la cantidad de hierro en forma libre es despreciable en el hombre (del orden de 10^{-18} M), en todo caso es insuficiente para permitir el crecimiento bacteriano.
Así, N. meningitidis posee un receptor de la transferrina humana y un receptor de la lactoferrina humana que le permiten fijar estas proteínas quelantes del hierro y de captar a continuación el hierro necesario para su crecimiento.
El receptor de la transferrina de la cepa de N. meningitidis B16B6 ha sido purificado por Schyvers y col. (patente internacional WO 90/12519) a partir de un extracto de membranas. Esta proteína purificada está constituida esencialmente por 2 tipos de polipéptidos: un polipéptido de un alto peso molecular aparente de 100 KD y un polipéptido de un bajo peso molecular aparente de unos 70 KD, según se observó tras electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de SDS.
Para las necesidades de la presente solicitud de patente, se ha designado al producto de la purificación obtenido por Schryvers de denominación provisional, receptor de la transferrina y a sus polipéptidos constituyentes, subunidades. Por ello, en el texto en curso las subunidades de alto peso molecular y de bajo peso molecular se denominan respectivamente Tbp1 y Tbp2. Sin embargo, el procedimiento de purificación descrito por Schryvers y col., no puede utilizarse para la producción a gran escala del receptor de la transferrina. La preparación industrial de este receptor en la forma purificada pasa necesariamente por una etapa de producción con ayuda de un sistema de expresión heteróloga.
Por dicho motivo, la invención se propone proporcionar los fragmentos del DNA codificante de las subunidades del receptor de la transferrina de N. meningitidis.
Por otra parte, gracias a los trabajos pioneros de Schryvers y col., se ha descubierto la existencia de por lo menos 2 tipos de cepas que difieren en la constitución de sus receptores de transferrina respectivos. Ello se puso en evidencia gracias al estudio de los extractos de membrana de varias decenas de cepas de N. meningitidis de orígenes diversos. En primer lugar, se sometieron estos extractos de membranas a una electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de SDS y luego a una electro-transferencia en filtros de nitrocelulosa. Y a continuación estos filtros de nitrocelulosa se incubaron en:
a) presencia de un antisuero de conejo dirigido contra el receptor de la transferrina purificado a partir de la cepa N. meningitidis B16B6, denominada también IM2394;
b) presencia de una antisuero de conejo dirigido contra el receptor de la transferrina purificado a partir de la cepa de N. meningitidis IM2169; o
c) en presencia de la transferrina humana conjugada con la peroxidasa.
Respecto a a) y b), las subunidades del receptor de la transferrina se pusieron de manifiesto gracias a la adición de un anticuerpo anti-inmunoglobulinas de conejo conjugado a la peroxidasa y la adición posterior del sustrato de esta enzima.
Las tablas I y II siguientes indican el perfil de algunas cepas representativas, tal como aparece en el gel de poliacrilamida al 7,5% después de una electroforesis en presencia de SDS; las bandas se caracterizan por sus pesos moleculares aparentes expresados en kilodaltons (KD):
Cepas
Tabla I 2394 (B:2a:P1.2:L2,3) 2234 (Y; nd)
2228 (B:nd) 2154 (C, nd) 550 (C: 2a:)
2170 (B:2a:P1.2:L3) 2448 (B; nd) 179 (C: 2a: P1.2)
Detección con el 93 93 99
antisuero anti-
receptor 2394 68 69 69
Detección con el
antisuero anti- 93 93 99
receptor 2169
Detección con la
transferrina- 68 69 69
peroxidasa
N.B.: entre paréntesis, se indican por orden cronológico el grupo sérico, el serotipo, el subtipo y el inmunotipo.
Cepas
Tabla II 2169 1000 1604 132 1001 876 1951 2449 867
(B:9:P (B:nd) (B:nd) (C:15: (A:4:P (B:19: (A:nd) (B:nd) (B:2b:
1.9 P1.16) 1.9) P1.6) P1.2)
Detección con el
antisuero anti- 96 98 98 98 98 96 94 94 93
receptor 2394
Detección con el 96 98 98 98 98 96 94 94 93
antisuero anti-
receptor 2169 87 85 83 81 79 88 87 85 85
Detección con la
transferrina- 87 85 83 81 79 88 87 85 85
peroxidasa
N.B.: Entre paréntesis, se indican por orden cronológico el grupo sérico, el serotipo, el subtipo y el inmunotipo.
Los resultados representados en las dos primeras líneas de las tablas muestran que existen 2 tipos de cepas:
El primer tipo (Tabla I) corresponde a las cepas que poseen un receptor, cuyas dos subunidades en las condiciones experimentales utilizadas son reconocidas por el antisuero anti-receptor IM2394, mientras que únicamente se reconoce por el antisuero anti-receptor IM2169 la subunidad de alto peso molecular.
El segundo tipo (Tabla II) corresponde a las cepas que poseen un receptor, cuyas 2 subunidades en las condiciones experimentales utilizadas son reconocidas por el antisuero anti-receptor IM2169, mientras que únicamente se reconoce por el antisuero anti-receptor IM2394 la subunidad de alto peso molecular.
\newpage
En consecuencia, existe una diversidad antigénica a nivel de la subunidad de menor peso molecular. De todas formas, esta diversidad está restringida ya que se resuelve en dos grandes tipos, contrariamente a lo sugerido por Griffiths y col., FEMS Microbiol. Lett. (1990) 69:31.
Según estas observaciones, se podía suponer que una vacuna eficaz contra todas las infecciones de N. meningitidis podría estar constituida de forma adecuada por la subunidad de alto peso molecular, independientemente de la cepa de origen del receptor, ya que esta subunidad es reconocida por los dos tipos de antisueros. De todas formas, no parece ser éste el caso ya que la subunidad de alto peso molecular no sería capaz de inducir la producción de anticuerpo de tipo neutralizante. Solamente la menor de las 2 subunidades sería capaz de cumplir esta función. Ya que esta subunidad de menor peso molecular se caracteriza por una variación antigénica significativa del primero al segundo tipo de cepa, un único tipo de receptor de la transferrina no debería ser suficiente para vacunar contra todas las infecciones de N. meningitidis. En consecuencia, una vacuna deberá contener por lo menos una subunidad de menor peso molecular de cada una de las cepas IM2394 e IM2169 o de sus equivalentes respectivos y, opcionalmente, la subunidad de alto peso molecular de por lo menos una cepa de N. meningitidis.
Es por ello que la invención proporciona un fragmento del DNA aislado codificante para un péptido, un polipéptido o una proteína capaz de ser reconocida por un antisuero anti-receptor de la cepa de N. meningitidis IM2394 o IM2169.
Un tal fragmento de DNA puede comprender en particular una secuencia nucleotídica codificante para una secuencia de aminoácidos homóloga a la que se muestra:
- en el identificador de secuencia (SEC ID N° 1) n° 1, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y acaba con el residuo glutamina en posición 579;
- en la SEC ID N° 3, que comienza con el residuo ácido glutámico en posición 1 y acaba con el residuo fenilalanina en posición 884;
- en la SEC ID N° 5, que comienza con el residuo ácido glutámico en posición 1 y se acaba en el residuo fenilalanina en posición 887; o
- en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y se acaba con el residuo glutamina en posición 691.
- A título indicativo, se precisa que un fragmento de DNA de acuerdo con la presente invención puede comprender además una secuencia nucleotídica adicional codificante para cualquier otra secuencia de aminoácidos; en donde las dos secuencias nucleotídicas consideradas forman un marco abierto de lectura que codifica una proteína híbrida o un precursor.
De acuerdo con la presente invención, se puede seleccionar de forma conveniente un fragmento de DNA a partir de:
i) Un primer fragmento de DNA aislado, con una secuencia nucleotídica codificante para una proteína con una secuencia aminoacídica homóloga a la secuencia que se muestra en la SEC ID N° 1, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y se acaba con el residuo glutamina en posición 579.
ii) Un segundo fragmento de DNA aislado de una secuencia nucleotídica codificante para una proteína con una secuencia aminoacídica homóloga a la mostrada en la SEC ID N° 3, que comienza con el residuo ácido glutámico en posición 1 y se acaba con el residuo fenilalanina en posición 884.
iii) Un tercer fragmento de DNA aislado a partir de una secuencia nucleotídica codificante para una proteína con una secuencia aminoacídica homóloga a la mostrada en la SEC ID N° 5, que comienza con el residuo ácido glutámico en posición 1 y se acaba con el residuo fenilalanina en posición 887.
iv) Un cuarto fragmento de DNA aislado con una secuencia nucleotídica codificante para una proteína con una secuencia aminoacídica homóloga a la mostrada en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y se acaba con el residuo glutamina en posición 691.
Se entiende por "secuencia aminoacídica homóloga" una secuencia que presenta un grado de homología de por lo menos el 75%, preferentemente de por lo menos el 80%, más preferentemente de por lo menos el 90%, todavía más preferentemente de por lo menos el 100%, con la secuencia aminoacídica citada de referencia. Se tendrá en cuenta que el término "homólogo", tal como se define aquí, incluye el caso particular de identidad.
El grado de homología puede calcularse fácilmente alineando las secuencias para obtener el máximo grado de homología; para ello, puede ser necesario introducir artificialmente sitios vacíos, como se muestra en la Figura 7. Una vez realizada la alineación óptima, se establece el grado de homología contabilizando todas las posiciones en las que los aminoácidos de dos secuencias son idénticos, en relación con el número de posiciones totales.
\newpage
Sería engorroso describir las secuencias homólogas de forma distinta a la genérica, debido al elevado número de combinaciones posibles. El experto en la materia conoce de todas formas las reglas generales que permiten reemplazar un aminoácido por otro sin abolir la función biológica o inmunológica de la proteína.
Es preferible un fragmento de DNA aislado que una secuencia nucleotídica codificante para:
i) La subunidad Tbp1 de la cepa IM2394, cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 3, que comienza con el residuo ácido glutámico en posición 1 y se acaba con el residuo fenilalanina en posición 884;
ii) La subunidad Tbp2 de la cepa IM2394, cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 1, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y se acaba con el residuo glutamina en posición 579;
iii) La subunidad Tbp1 de la cepa IM2169, cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 5, que comienza con el residuo ácido glutámico en posición 1 y se acaba con el residuo fenilalanina en posición 887; o
iv) La subunidad Tbp2 de la cepa IM2169, cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y se acaba con el residuo glutamina en posición 691.
Cada una de las subunidades del receptor de la transferrina, que es una proteína de membrana en la forma madura, se produce inicialmente en forma de un precursor constituido por un péptido señal asociado en posición N-terminal.
Por dicha razón, la presente invención tiene por objetivo proporcionar un bloque de DNA aislado codificante para un péptido señal, cuya secuencia aminoacícida presenta un grado de homología de por lo menos el 80% y preferentemente del 100% con la secuencia mostrada en:
i) la SEC ID N° 3, que comienza con el residuo metionina en posición -24 y se acaba con el residuo alanina en posición -1;
ii) la SEC ID N° 5, que comienza con el residuo metionina en posición -24 y se acaba con el residuo alanina en posición -1; o
iii) la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y se acaba con el residuo alanina en posición -1.
De acuerdo con la presente invención, también puede seleccionarse un fragmento de DNA entre un quinto, sexto, séptimo y octavo fragmentos de DNA que codifican respectivamente para un precursor, cuya secuencia aminoacídica es homóloga a la secuencia presentada en la SEC ID N° 1, 3, 5 ó 7.
El término "fragmento o bloque de DNA aislado" hace referencia a un fragmento o bloque de DNA de origen genómico que está i) insertado en un vector viral o plasmídico o ii) situado bajo el control de un promotor heterólogo.
Además, se considera que el bloque de DNA codificante para el péptido señal, de acuerdo con la presente invención, está aislado cuando está asociado a un fragmento de DNA codificante para una proteína heteróloga al péptido señal; de modo que se forma un marco de lectura abierto que codifica un precursor híbrido.
La presente invención hace referencia a una caja de expresión de un péptido, de un polipéptido o de una proteína capaz de ser reconocida por un antisuero anti-receptor de la cepa de N. meningitidis IM2394 o IM2169, que comprende por lo menos un fragmento de DNA de acuerdo con la invención, situado bajo el control de elementos capaces de asegurar su expresión en una célula huésped adecuada.
En la caja de expresión, el primero, segundo, tercero o cuarto fragmento de DNA, de acuerdo con la invención, codificante para una forma madura, puede estar o no asociado con un bloque de DNA codificante para un péptido señal, dependiendo de si interesa o no la secreción de la proteína. Preferentemente, se buscará esta secreción. En este último caso, el bloque de DNA puede codificar para un péptido señal homólogo o heterólogo de la forma madura, obteniéndose como resultados respectivos, la síntesis de un precursor natural o híbrido.
Los elementos indispensables de la expresión de un fragmento de DNA de acuerdo con la invención son un promotor de transcripción, los codones de inicio y de terminalización de la traducción y, opcionalmente, un terminador de la transcripción. El promotor puede ser constitutivo o inducible. Se ha descrito que el fragmento de DNA codificante para la subunidad Tbp2 de la cepa IM2394 parece ser tóxico para una célula heteróloga, en particular para E. coli. En dicho caso, sería preferible utilizar un promotor inducible; por ejemplo, el promotor del gen araB de Salmonella thyphimurium.
Elementos como los del bloque de DNA codificante para un péptido señal heterólogo (región señal) o un promotor ya existen en número importante y son conocidos por los expertos en la materia, cuyas competencias les permitirán elegir una región señal o un promotor determinado que se adaptarán a la célula huésped donde se pretende realizar la expresión.
En particular, se ha de resaltar que la subunidad Tbp2 parece ser una lipoproteína, ya que su precursor comprende un péptido señal característico de los precursores de lipoproteínas y que posee una cisteína en posición N-terminal y aminoácidos con una fuerte tendencia a adoptar una conformación de tipo "giro" ligeramente corriente abajo de la cisteína N-terminal (4 glicinas). Ver como referencias, Wu y Tokunaga, Current Top. Microb. Immunol. (1986) 125:127. La lipidación podría reforzar la inmunogenicidad de la subunidad Tbp2.
Así, en un sistema procariota, sería deseable obtener la subunidad Tbp2 a partir de su precursor natural, es decir a partir de un precursor que comprende un péptido señal heterólogo adaptado, que autorice la lipidación; es decir un péptido señal de una lipoproteína distinta a la de Tbp2. Dicho péptido señal presenta en particular la característica de ser liberado mediante corte del precursor por una peptidasa señal de tipo II. La secuencia en el sitio de corte del péptido señal corresponde con la secuencia consensus (L, V, I)(A, S, T, G)(G, A) C, siendo la cisteína (C) el primer aminoácido de la secuencia madura. A título de ejemplo del péptido señal heterólogo, se indican en particular las lipoproteínas ColE1, ColE3, Lpp, NIpA, OsmB, Pal, RIpB y TraT, cuyas secuencias se representan respectivamente en las SEC ID N° 9 a 24, así como las secuencias nucleotídicas correspondientes.
En consecuencia, según un modelo de realización determinado, una caja de expresión de acuerdo con la invención, destinada a la producción de una proteína con una secuencia aminoacídica homóloga a la mostrada en:
- la SEC ID N° 1, que empieza con el residuo cisteína en posición 1 y que se acaba con el residuo glutamina en posición 579 o
- la SEC ID N° 7, que empieza con el residuo cisteína en posición 1 y se acaba con el residuo glutamina en posición 691;
comprende:
i) un bloque de DNA codificante para un péptido señal de una lipoproteína distinta a la subunidad Tbp2, como el péptido señal RIpB y
ii) un fragmento de DNA codificante para la mencionada proteína.
Por último, la presente invención proporciona (i) un procedimiento de fabricación de un péptido, de un polipéptido o de una proteína capaz de ser reconocida por un antisuero anti-receptor de la cepa de N. meningitidis IM2394 o IM2169, según el cual se cultiva una célula huésped que contiene una caja de expresión de acuerdo con la presente invención y se recoge el citado péptido, polipéptido o proteína a partir del cultivo; así como (ii) el péptido, el polipéptido o la proteína producida por este procedimiento y (iii) las composiciones farmacéuticas, en particular las vacunas y los envases.
Con el fin de proceder de acuerdo con la invención, la célula huésped puede ser una célula de mamífero, una levadura o una bacteria. Aquí también, la elección de una línea determinada está al alcance del experto en la materia.
De forma alternativa, una composición farmacéutica de acuerdo con la invención puede contener a título de principio activo, un vector viral o bacteriano en cuyo genoma se ha insertado un fragmento de DNA de acuerdo con la invención, situado bajo el control de los elementos necesarios para su expresión. A título de ejemplo de un vector adecuado, se incluyen en particular los poxvirus, los adenovirus y las bacterias lácticas.
De acuerdo con la invención, una composición farmacéutica es particularmente útil para tratar o prevenir una infección de N. meningitidis, pudiéndose fabricar de forma convencional. En particular, se asocia una cantidad eficaz desde un punto de vista terapéutico a un soporte o a un diluyente. Dicha composición se puede administrar mediante cualquier vía convencional utilizada en el dominio de la materia; p. ej., en el dominio de las vacunas, principalmente por vía entérica o parenteral. La administración puede producirse en dosis únicas o repetidas después de un cierto intervalo de tiempo. La vía de administración varía en función de diversos parámetros, por ejemplo del individuo tratado (condición, edad, etc.). Una composición puede además contener un adyuvante aceptable desde un punto de vista farmacéutico.
Con el fin de determinar el objetivo de la presente invención, es necesario que las cepas de N. meningitidis IM2394 (también denominadas B16B6) y IM2169 (también denominadas M982) estén disponibles públicamente por el Institut Pasteur, 25 calle del Dr. Roux, 75015 Paris, con los números de registro respectivos CIP7908 y CIP79017.
Un antisuero específico del receptor de la transferrina de la cepa N. meningitidis IM2394 e IM2169 puede obtenerse tal como se especifica en el ejemplo descrito más adelante.
La invención se describe con más detalle mediante los ejemplos siguientes y las Figuras 1 a 8.
La Figura 1 representa la estructura del fago lambda ZAP II y esquematiza la metodología de clonaje y expresión. Lambda ZAP II es un vector de inserción equipado con dianas de clonaje múltiples localizadas en la parte plasmídica (pBluescript SK). Esta parte plasmídica puede escindirse in vivo mediante co-infección con un fago auxiliar y convertirse en un vector plasmídico. Si una secuencia codificante se fusiona en fase con lac Z, o si un fragmento de DNA clonado comprende un promotor funcional en E. coli, se posibilita la producción de una proteína de interés que a su vez podrá detectarse con ayuda de anticuerpos específicos.
La Figura 2 muestra la estructura del plásmido pTG1265. Dicho plásmido se deriva del pGB2 (Churchward y col., Gene (1984) 31:165) de la manera siguiente: se digiere pGB2 con EcoRI y HindIII, se trata con la polimerasa de Klenow y luego se liga al fragmento SspI-PvuII de 1 Kb aislado de pT7T3 184 (Mead y col., Protein Engineering (1986) 1: 67; Pharmacia) que comprende el f1-ori, la secuencia lac Z, los promotores T3 y T7, así como las dianas de clonaje múltiple.
La Figura 3 muestra el mapa genómico de la región de DNA de la cepa IM2394 que comprende las secuencias codificantes para Tbp1 y Tbp2, así como los distintos fragmentos que han sido clonados. B = BamHI; E = EcoRI;
H = HincII; R = EcoRV; X = XbaI; C = ClaI.
La Figura 4 muestra el mapa genómico de la región de DNA de la cepa IM2169 que comprende las secuencias codificantes para Tbp1 y Tbp2, así como los diferentes fragmentos que se han clonado. C = ClaI; H = HincII;
M = MluI; X = XbaI; ? = posición imprecisa.
La Figura 5 muestra la estructura del plásmido para13. Dicho plásmido es un plásmido capaz de replicarse en E. coli y que comprende el promotor del operón arabinosa BAD (ParaB) de Salmonella typhimurium (modificado a nivel de la TATA box), así como el gen AraC. Corriente abajo del promotor ParaB se halla la inserción de las dianas de clonaje múltiple. La serie de plásmidos Para se describe en Cagnon y col., Prot. Eng. (1991) 4: 843.
La Figura 6 muestra la metodología utilizada para la construcción del vector de expresión pTG3786.
La Figura 7 compara las secuencias aminoacídicas predecidas de las subunidades Tbp1 de las cepas IM2394 e IM2169. El grado de homología puede estimarse a aproximadamente el 76%.
La Figura 8 compara las secuencias aminoacídicas predecidas de las subunidades Tbp1 de las cepas IM2394 e IM2169. El grado de homología puede estimarse a aproximadamente el 47%.
La Figura 9 muestra la metodología utilizada para la construcción del vector de expresión pTG3779.
La Figura 10 muestra la metodología utilizada para la construcción del vector de expresión pTG4710.
La Figura 11 muestra la metodología utilizada para la construcción del vector de expresión pTG4764.
Ejemplo 1 Clonaje de los fragmentos de DNA codificantes para las subunidades Tbp1 y Tbp2 del receptor de la transferrina de la cepa IM2394 1A. Cultivo de la cepa y purificación del receptor de la transferrina
Se resuspende un liofilizado de la cepa N. meningitidis IM2394 en aproximadamente 1 ml de caldo de cultivo Muller-Hinton (BMH, Difco). La suspensión bacteriana se extiende a continuación sobre el medio sólido de Muller-Hinton que contiene sangre cocida (5%).
Al cabo de 24 h de incubación a 37°C en una atmósfera que contiene el 10% de CO_{2}, se recoge la capa bacteriana para sembrar 150 ml de BMH pH 7,2, repartidos en 3 erlenmeyers de 250 ml. La incubación se prosigue durante 3 h a 37°C en agitación. Cada uno de los 3 cultivos así realizados permite sembrar 400 ml de BMH pH 7,2 suplementado con Etilendiamina-Di-O-Hidroxifenil-ácido acético (EDDA, Sigma) 30 \muM, que es un agente quelante del hierro en la forma libre.
Al cabo de 16 h de cultivo a 37°C en agitación, se analiza la pureza de los cultivos mediante observación al microscopio después de una tinción de Gram. La suspensión se centrifuga, se pesa el sedimento que contiene los gérmenes y se guarda a -20°C.
La purificación se realiza esencialmente mediante el procedimiento descrito por Schryvers y col. (supra), de la manera siguiente:
Se descongela el sedimento bacteriano y a continuación se resuspende en 200 ml de tampón Tris HCl 50 mM, pH 8,0 (tampón A). La suspensión se centrifuga durante 20 min a 15.000 xg a 4°C (tampón A). Se recupera el sedimento y a continuación se resuspende en tampón A a la concentración final de 150 g/l. Se tratan fracciones de 150 ml durante 8 min a 800 bars en un lisador de células a alta presión (Rannie, modelo 8.30H). El lisado celular así obtenido se centrifuga durante 15 min a 4°C a 15.000 xg. Se recupera el sobrenadante y luego se centrifuga durante 75 min a 4°C a 200.000 xg. Después de la eliminación del sobrenadante; se resuspende el sedimento en tampón A y se realiza la cuantificación de proteínas según el método Lowry y se ajusta la concentración de la suspensión a 5 mg/ml.
A 1,4 ml de la suspensión de membranas se añade 1,75 mg de transferrina humana biotinilada según el procedimiento descrito por Schryvers. La concentración final de la fracción de membranas es de 4 mg/ml. La mezcla se incuba 1 hora a 37°C y luego se centrifuga a 100.000 xg durante 75 minutos a 4°C. El sedimento de membranas se resuspende en el tampón A que contiene NaCl 0,1 M y se incuba durante 60 min a temperatura ambiente.
Después de la solubilización, se añade a esta suspensión un determinado volumen de N-Lauroil Sarkosin al 30% (p/v) y de EDTA 500 mM de forma que las concentraciones finales de Sarkosil y de EDTA son del 0,5% y de 5 mM, respectivamente. Después de una incubación de 15 minutos a 37°C en agitación, se añade 1 ml de resina estreptavidina-agarosa (Pierce) previamente lavada con tampón A. La suspensión se incuba 15 min a temperatura ambiente y luego se centrifuga a 1000 xg durante 10 min. La resina se introduce a continuación en una columna y se elimina el eluido directo.
La resina se lava con 3 volúmenes de columna con tampón Tris-HCl 50 mM pH 8,0 con NaCl 1mM, EDTA 10 mM, Sarkosil al 0,5% (tampón B) y luego con un volumen de columna con tampón B que contiene guanidina-HCl 750 mM. A continuación se eluye el receptor de la transferrina con el tampón B que contiene guanidina-HCl 2 M. El eluido se recoge en fracciones, en tubos que contienen un volumen idéntico de Tris-HCl 50 mM, pH 8,0, NaCl 1 M. Y se mide la densidad óptica a 280 nm del eluido al salir de la columna con ayuda de un detector UV.
Las fracciones correspondientes al pico de elución se recogen, se dializan con tampón fosfato 10 mM, pH 8,0 que contiene Sarkosil al 0,05% y se liofilizan. El liofilizado se resuspende en agua a una concentración 10 veces superior. La solución se dializa una segunda. vez con tampón fosfato 50 mM, pH 8,0 que contiene Sarkosil al 0,05% (tampón C) y luego la solución se filtra con una membrana de 0,22 \mum de porosidad.
Se determina el contenido proteico y se ajusta a 1 mg/ml mediante adición de tampón C en condiciones asépticas. Esta preparación se guarda a -70°C.
1B. Preparación de un antisuero específico del receptor de la transferrina
Conejos neo-zelandeses albinos reciben por vía subcutánea e intramuscular 100 \mug del receptor IM2394 en presencia de adyuvante completo de Freund. Veintiún días y 42 días después de la primera inyección, los conejos reciben de nuevo 100 \mug del receptor purificado, pero esta vez en presencia de adyuvante incompleto de Freund. Quince días después de la primera inyección, se extrae el suero de los animales, se descomplementa y se filtra en una membrana de 0,45 \mum de porosidad. A continuación, el filtrado se agota en contacto con la cepa IM2394, que ha sido cultivada previamente en presencia de hierro en forma libre (en estas condiciones, se inhibe la síntesis del receptor de la transferrina). Las modalidades de contacto son las siguientes: 10 ml del filtrado se añaden a 10^{10} cfu (unidades formadoras de colonias) de un cultivo de la cepa IM2394. La adsorción se prosigue durante una noche a 4°C, en agitación. Las bacterias se eliminan a continuación mediante centrifugación. El sobrenadante se recupera y luego se somete de nuevo a 2 operaciones de adsorción sucesivas como las descritas anteriormente.
1C. Determinación de las secuencias peptídicas que permiten la identificación de los fragmentos de DNA
Las fracciones alicuotadas del material obtenido en 1A se secan y luego se resolubilizan en el tampón de Laemmli dos veces concentrado (Tris 65 mM, SDS al 3%, glicerol al 10%, 2-mercaptoetanol al 5%). Y se añade un volumen de agua equivalente.
Después de la sonificación, el material se caliente a 90°C durante 2 minutos y luego se somete a una electroforesis en gel de poliacrilamida. Las subunidades así preparadas se transfieren a una membrana de PVDF (Immobilon, Millipore) durante 16 horas a 400 mA en tampón Tris borato 50 mM, pH 8,3. Las subunidades electrotransferidas se colorean con negro de almidón, se recuperan las bandas correspondientes a Tbp1 y Tbp2 y a continuación se someten a microsecuenciación del extremo N-terminal.
Esto se repite varias veces para establecer las secuencias consensus N-terminales siguientes:
Tbp1 IM2394: EXVQAEQAEKQLDTIQV
Tbp2 IM2394: XLXXXXSFDLDSVEXVQXMX
(X= aminoácido no determinado)
Con el fin de secuenciar las regiones internas de Tbp2, la proteína unida a la membrana PVDF se somete a la digestión por tripsina en tampón Tris 0,1 M, pH 8,2. Al cabo de 4 h de reacción a 37°C, se extraen los péptidos mediante ácido fórmico al 70%, luego mediante ácido trifluoroacético (TFA) al 0,1%. A continuación, estos péptidos se separan mediante HPLC.
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Para Tbp2 IM2394, las secuencias internas que se han establecido son las siguientes:
S1122: NNIVLFGPDGYLYYK
S1125: YTIQA
S''770: DGNAAGPATEXVIDAYR
S''766: XQIDSFGDVK
S1126: AAFXXXI
S''769: XNXXXMFLQGVR
S''771: TPVSDVAAR
S''767: XSPAFT
S''762: NAIEMGGSFXFPGNAPEG(K)
S1128: XQPESQQDVSENX
1D. Preparación del DNA genómico
El sedimento bacteriano obtenido en 1A se resuspende en aproximadamente 25 ml de solución A (Tris 25 mM, pH que contiene glucosa 50 mM y EDTA 10 mM) con 10 mg de proteinasa K. La mezcla se deja 10 minutos a temperatura ambiente.
A continuación, se añaden 12,5 ml de solución A que contiene 10 mg de lisozima. La mezcla se deja de nuevo durante 10 minutos a temperatura ambiente. Se completa el volumen con 0,5 ml de sarkosil al 10%. La mezcla se incuba 10 min a 4°C.
Se añaden 2 mg de RNAsa y se continua la incubación 90 minutos a 37°C. El DNA se purifica mediante cuatro extracciones fenólicas sucesivas. El DNA presente en la última fase acuosa se precipita con etanol. Se obtiene DNA de alto peso molecular mediante separación en gradiente de ClCs.
1E. Clonaje
Se realizó una primera genoteca de DNA en el vector lambda ZAP (Figura 1), de la manera siguiente:
Se fragmentó una preparación de DNA genómico mediante ultrasonidos. Los extremos de los fragmentos así obtenidos se convirtieron en extremos romos mediante tratamiento con la T4 polimerasa. Luego, se metilaron los fragmentos. Y a continuación, los fragmentos se unen a adaptadores EcoRI, se tratan con la enzima EcoRI y luego se inserta en la diana EcoRI del fago lambda ZAP II (Stratagene).
La cepa de E. coli XL-Blue (Stratagene) se infectó con la genoteca preparada de la forma anterior. Se analizaron las calvas de lisis blancas (presencia de fagos recombinantes) con ayuda de un antisuero específico del receptor de la transferrina de la cepa IM2394, preparada tal como se describió en 1B. Ello permitió identificar dos clones lambda ZAP II. Los plásmidos pBluescript contenidos en estos clones se excisaron mediante co-infección con el fago "auxiliar" y se denominaron pBMT1 y pBMT2.
Los plásmidos pBMT1 y pBMT2 contienen cada uno un fragmento EcoRI-EcoRI de 3,8 Kb y 1,3 Kb, respectivamente. Dichos plásmidos se representan en la Figura 3.
La secuenciación del inserto EcoRI-EcoRI de pBMT1 se realizó según el procedimiento del "shotgun" (Bankier y Barrell, Biochemistry (1983) B5:508), de la manera siguiente:
El inserto EcoRI-EcoRI de pBMT1 se purificó y luego se fragmentó con ultrasonidos. Los extremos de los fragmentos así obtenidos se convirtieron en romos mediante tratamiento con la T4 polimerasa. Los fragmentos así tratados se introdujeron en una diana del fago M13TG131 (descrito por Kieny y col., Gene (1983) 26:91). Se secuenciaron unas 200 colonias aisladas de esta preparación. El análisis de estas secuencias por ordenador permitió reconstituir la secuencia completa del inserto EcoRI-EcoRI de pBMT1.
Se localizó La secuencia codificante para la extremidad N-terminal de Tbp1, tal como se muestra en la Figura 3. Teniendo en cuenta la masa molecular de Tbp1, era evidente que dicho inserto no comprendía el fragmento de DNA completo codificante de la Tbp1. Cadena arriba del extremo 5' del gen tbp1, se ha puesto en evidencia un marco de lectura abierto, pero no ha sido posible identificar claramente una región codificante del extremo N-terminal del gen tbp2.
La microsecuenciación de las regiones internas de Tbp2 se llevó a cabo tal como se describió anteriormente en 1C. Las secuencias internas localizadas hacia el extremo C-terminal, correspondieron con la región 3' del marco de lectura abierto cadena arriba de tbp1.
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Por otra parte, el DNA genómico de la cepa IM2394, previamente digerido con HincII se analizó mediante transferencia de Southern con ayuda de una sonda de DNA radioactiva correspondiente a la zona HincII-HincII de 1,5 Kb del inserto de 3,8 Kb de pBMT1; de este modo se pusieron de manifiesto dos bandas. Esto ha permitido demostrar que el inserto de pBMT1 procedía de la unión artefactual de secuencias derivadas de dos locus distintos. En consecuencia, la secuencia 5' de tbp2 estaba ausente.
La genoteca de DNA genómico en lambda ZAP anteriormente descrita se rastreó de nuevo; esta vez utilizando el inserto EcoRI-EcoRI de pBMT2 como sonda. Se seleccionaron 29 candidatos de entre las 200.000 calvas de fagos analizadas. Solamente el plásmido derivado pTG2749 parecía poseer un nuevo inserto en relación con pBMT1 y pBMT2. El inserto de pTG2749 es el representado en la Figura 3. La región del inserto cadena arriba de la diana EcoRV (región EcoRV-EcoRI) se subclonó en M13TG131 y se secuenció según el procedimiento de Sanger y col., PNAS (1977) 74:5463 con ayuda de cebadores sintéticos. De esta manera se localizó la secuencia correspondiente al extremo N-terminal de Tbp2.
La secuencia del fragmento de DNA codificante para Tbp2 de la cepa IM2394 se representa en la SEC ID N° 1, así como la secuencia aminoacídica correspondiente (SEC ID N° 2).
Justo cadena arriba de la secuencia codificante de Tbp2 madura, el inserto de pTG2749 comprende una región genómica distinta procedente de otro locus. Aquí también, se trata de un artefacto de clonaje análogo al puesto en evidencia en el caso de pBMT1.
Teniendo en cuenta las reordenaciones observadas y la ausencia de secuencias 3' de tbp1 y 5' de tbp2, la genoteca del DNA genómico construida en lambda ZAP se juzgó inadecuada para la continuación del clonaje.
Se construyó entonces una segunda genoteca a partir del DNA genómico en un plásmido de bajo número de copias, de la manera siguiente: se digirió parcialmente una preparación de DNA genómico con Sau3A. Los fragmentos de DNA de aproximadamente de 4 a 6 Kb se purificaron después de su fraccionamiento en gradiente de sacarosa y se insertaron en la diana BamHI del plásmido pTG1265. Esta preparación plasmídica sirvió para transformar la cepa de E. coli 5K. Se estimó que esta biblioteca contenía aproximadamente 18.000 clones independientes.
Se analizaron aproximadamente 50.000 clones de la segunda genoteca con ayuda de una sonda radioactiva que correspondía con un inserto EcoRI-EcoRI de pBMT2. Se hibridó un solo clon; el plásmido pTG2759 que posee un inserto de 1,8 Kb. El tamaño de este inserto se juzgó insuficiente para contener el gen completo codificante de Tbp1.
Se construyó una tercera genoteca según el procedimiento descrito en el párrafo anterior, excepto que la cepa de E. coli 5K se reemplazó por la cepa de E. coli SURE (Stratagene). Se estimó que esta biblioteca contenía aproximadamente 60.000 clones independientes.
Se analizaron aproximadamente 70.000 clones de la tercera genoteca de DNA con ayuda de una sonda radioactiva correspondiente al fragmento MluI-HincII de 2,4 Kb aislado del inserto de pTG2754 descrito en el Ejemplo 2 de más adelante y representado en la Figura 4. Se seleccionaron dos clones, los plásmidos pTG2780 y pTG2781, representados en la Figura 3.
Se determinó la secuencia de los insertos de pTG2780 y pTG2781 según el procedimiento de Sanger. Dicha secuencia se representa en la SEC ID N° 3, así como la secuencia aminoacídica correspondiente (SEC ID N° 4).
Se construyó una cuarta biblioteca de DNA. El DNA genómico se digirió con Sau3A y una fracción que contenía los fragmentos de aproximadamente 7 Kb se purificó en gradiente de sacarosa. Esta fracción contenía un fragmento que correspondía con el locus tbp1,2 ya que fue reconocido por una sonda de DNA específica de tbp2. Después de la digestión con EcoRV e XbaI y ligación con pTG1265 digerido con SmaI e XbaI, se transformó en E. coli 5K. Se realizó un rastreo de clones con ayuda de una sonda específica de tbp2. Entre una serie de clones positivos, el plásmido pTG3791 se estudió de forma particular y se demostró que contenía las secuencias 5' de tbp2 incluyendo la secuencia codificante del péptido señal putativo de Tbp2.
Ejemplo 2 Clonaje de los fragmentos de DNA codificantes de las subunidades Tbp1 y Tbp2 del receptor de la transferrina de la cepa IM2169.
2A. El cultivo de la cepa IM2169 y la purificación del receptor de la transferrina se efectuaron en condiciones idénticas a las descritas en el Ejemplo 1A.
2B. La preparación de un antisuero anti-receptor de la cepa IM2169 se realizó según el protocolo descrito en el Ejemplo 1B.
2C. Las secuencias peptídicas que permiten la identificación de los fragmentos de DNA se determinaron según el procedimiento descrito en el Ejemplo 1C. Las microsecuencias que se han establecido son las siguientes: Secuencia consensus del extremo N-terminal de Tbp1: ENVQAGQAQEKQLXXIQVX
Secuencias de los péptidos internos de Tbp1:
S1031: XLS(E,W)NAGXVLXPADX
51032: QLDTIQVK
51033: TAGSSGAINEIEYENXX
51034: YVTWENVDXXXXXX
Secuencia consensus del extremo N-terminal de Tbp2:
SLVXAXSFDLXSV
Secuencias de los péptidos internos de Tbp2:
S1037: XXDNLSNAX
S1035: XGDDYIFYXGEKPX
S1036: XQGXYGFAMX
S1040: XQATGHENFQYVYSGXFYK
2D. La preparación del DNA genómico de la cepa IM2169 se realizó según el protocolo descrito en el Ejemplo 1D.
2E. Clonaje
Una primera genoteca (fragmentos de DNA genómico de la digestión parcial con Sau3A; pTG1265; E. coli 5K) se construyó al igual que se describió anteriormente en el Ejemplo 1. Se estimó que esta genoteca contenía aproximadamente 40.000 clones independientes, de los cuales el 70% poseían un inserto de 4-6 Kb.
Se analizaron 130.000 clones de esta genoteca con ayuda de una sonda radioactiva que correspondía con el inserto EcoRI-EcoRI de pBMT2. De éstos se seleccionaron a continuación 42 clones, de entre los cuales solamente se retuvieron 2 clones: los plásmidos pTG2753 y pTG2754, que se muestran en la Figura 4. Los análisis de transferencia de Southern mostraron que los mapas de restricción de los insertos de pTG2753 y pTG2754 correspondían con los mapas de restricción del DNA genómico.
La determinación de las secuencias nucleotídicas y la búsqueda de las regiones codificantes de los extremos
N-terminales y las regiones internas demostraron que:
- el inserto de 1,9 Kb de pTG2753 contiene la región 3' del gen tbp2 y la región 5' del gen tbp1; y
- el inserto de pTG2754 contiene la región 3' del gen tbp2 y las regiones 5' y 3' del gen tbp1, en rotura de fase. Este primera genoteca no permitió clonar los fragmentos de DNA completos codificantes de Tbp1 o Tbp2.
Se construyó una segunda genoteca al igual que antes, pero a partir de DNA genómico digerido con XbaI. Los fragmentos de DNA se purificaron después del fraccionamiento en gradiente de sacarosa. Cada fracción (aproximadamente 500 \mul) se analizó mediante transferencia de Southern con una sonda radioactiva correspondiente al extremo 3' de tbp1 (fragmento del inserto de pTG2754). La fracción que hibridó y que contenía los fragmentos de aproximadamente 6 Kb se clonó en pTG1265 y se transformó en la cepa de E. coli K5.
Se analizaron aproximadamente 2400 clones de esta genoteca con ayuda de una sonda radioactiva que correspondía al fragmento HincII-MluI de 0,6 Kb aislado de pTG2754. Se caracterizaron 5 clones, entre los que se retuvieron 2: pTG3720 y pTG3721, que se muestran en la Figura 4 y que contienen los dos genes tbp1 y tbp2.
Para completar la secuencia nucleotídica codificante de Tbp1, se secuenció el inserto de pTG3720 en la región donde se situaba la rotura de fase descubierta en el inserto de pTG2754. Esta secuenciación permitió poner en evidencia que la ruptura de fase del inserto de pTG2754 era debida a una deleción de 22 pb. La secuencia completa del fragmento de DNA es la que se muestra en la SEC ID N° 5.
Se continuó con la secuenciación del inserto de pTG3720 para establecer la secuencia de tbp2. Una vez identificada dicha secuencia, se observó también una ruptura de fase.
Por último, la secuencia de tbp2 se determinó a partir del plásmido pTG3721. Dicha secuencia es la que se muestra en la SEC ID N° 7.
Ejemplo 3 Expresión del fragmento de DNA codificante de la subunidad Tbp2 de la cepa IM2394. 3A. Construcción del vector de expresión pTG3749
La diana SphI del plásmido para13 (Figura 5; Cagnon y col., Prot. Eng. (1991) 4:843) se destruyó mediante tratamiento con la polimerasa Klenow, para generar el plásmido pTG3704. Dicho plásmido se linearizó mediante corte con NcoI, se trató con la polimerasa Klenow para convertir los extremos en romos y luego se digirió con HindIII.
Por otra parte, se sintetizaron los oligonucleótidos OTG4015 y OTG4016 complementarios:
70
El fragmento de DNA de cadena doble OTG4015/OTG4016 se insertó en el para13 tratado tal como se describió anteriormente, para generar el plásmido pTG3717 en donde se había reconstituido la secuencia codificante para el extremo N-terminal del precursor de la proteína PelB de Erwinia carotovora (Lei y col., J. Bact. (1987) 169:4379), tal como se aprecia a continuación:
46
(los extremos de pTG3704 aparecen subrayados).
A partir del plásmido pTG2749, se generó por PCR con ayuda de los cebadores OTG4011 y OTG4012, un fragmento que incluye la región codificante para la región N-terminal de Tbp2, hasta la diana interna MluI, tal como se muestra en la Figura 6.
47
El fragmento generado por PCR se digirió con BamHI, luego se insertó en la diana BamHI del fago M13TG131, para generar M13TG3724. La secuencia de este fragmento se verificó mediante secuenciación.
A partir de M13TG3724, se recuperó la región codificante para la región N-terminal de Tbp2 en forma de un fragmento SphI-MluI que a continuación se insertó en pTG3717, previamente digerido con SphI y MluI, para generar el plásmido pTG3743.
A partir del plásmido pBMT1, se recuperó la región codificante para la región C-terminal de Tbp2 en forma de un fragmento MluI-BanI, en donde el extremo cohesivo BanI se convirtió en romo mediante el tratamiento con la polimerasa Klenow. Se insertó este fragmento en pTG3743, previamente digerido con HindIII, se trató con la polimerasa Klenow y finalmente se digirió con MluI. De esta forma se obtuvo el plásmido pTG3749.
3B. Producción de la subunidad Tbp2
La cepa de E. coli MC106 (Casadaban & Cohen, J. Mol. Biol. (1980) 138:179) se transformó con pTG3749 y luego se cultivó a 37°C, en medio LB suplementado con 2 g/l de glicerol y 100 \mug/ml de ampicilina. Al cultivo en fase exponencial, se añadió 0,2 g/1 de arabinosa. La incubación se prosiguió durante 6 h más. La expresión se observó al cabo de menos de una hora después de la adición de arabinosa.
La electroforesis en gel de acrilamida de una muestra del lisado celular puso en evidencia la presencia de una proteína de aproximadamente 70KD, capaz de fijar la transferrina humana marcada con la peroxidasa.
Ejemplo 4 Expresión del fragmento de DNA codificante de la subunidad Tbp2 de la cepa IM2169. 4A. Construcción del vector de expresión pTG3779
En el plásmido pTG3704 digerido con NcoI y HindIII, se insertó un fragmento sintético constituido de los cebadores OTG4038 y OTG4039, previamente apareados, generándose de esta forma el plásmido pTG3756.
71
A partir del plásmido pTG2754, se generó mediante PCR con ayuda de los cebadores OTG4037 y OTG4014 un fragmento que incluía la región codificante del extremo N-terminal del precursor de Tbp1 hasta la diana MluI.
48
Este fragmento de PCR se digirió con BamHI y se clonó en la diana BamHI de M13TG131 para generar
M13TG3738, cuya secuencia se verificó.
A continuación, se linearizó M13TG3738 con SphI, se trató con la T4 DNA polimerasa para convertir los extremos en romos, luego se digirió con MluI para aislar el fragmento portador de la región codificante del extremo N-terminal del precursor de Tbp1.
Este fragmento se insertó en pTG3756 digerido con NcoI, se trató con la T4 DNA polimerasa y luego se digirió con M1uI, para generar el plásmido pTG3778. Y se verificó la secuencia de la unión NcoI°/SphI°.
El fragmento MluI-XbaI de pTG3720 codificante de la mayor parte de Tbp1 (3'tbp1) se insertó en el plásmido pTG3778. El plásmido final así obtenido es el plásmido pTG3779.
4B. Producción de la subunidad Tbp1
Se transformó E. coli MC1061 con pTG3779 y luego se puso en cultivo a 37°C en medio LB. Al cultivo en fase exponencial, se añadió 0,2 g/l de arabinosa y se prosiguió la incubación durante 4 horas.
La electroforesis en gel de acrilamida de una muestra del lisado celular total puso en evidencia la presencia de una proteína de aproximadamente 100 KD, que es reconocida por los anticuerpos anti-receptor.
Ejemplo 5 Expresión del fragmento de DNA codificante de la subunidad Tbp2 de la cepa IM2394 (construcción con la secuencia señal homóloga). 5A. Construcción del vector de expresión pTG4710
A partir del plásmido pTG3749, se generó mediante PCR con ayuda de los cebadores OTG4247 y OTG4248 un fragmento codificante de la región C-terminal de Tbp2 (a partir de la diana interna BamHI) y que contiene una diana de restricción HindIII cadena abajo del codón de terminación de la traducción de tbp2.
49
El fragmento generado por PCR se digirió con HindIII y BamHI y se insertó simultáneamente con el fragmento SphI-BamHI de pTG3749, codificante de la región N-terminal de Tbp2 madura, en el vector pTG3743 digerido con SphI y HindIII, para generar el plásmido pTG3786. Y se verificó la secuencia de dicho fragmento amplificado por PCR.
A partir del plásmido pTG3791, se generó por PCR con ayuda de los cebadores OTG4491 y OTG4494 un fragmento codificante para la región N-terminal del precursor de Tbp2 hasta la diana interna EcoRV.
50
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A continuación, el fragmento generado por PCR se digirió con BspHI y EcoRV y se ligó simultáneamente a los fragmentos NcoI-SstI de pTG3704, que contienen el gen araC y el promotor araB y EcoRV-SstI de pTG3786, que contiene la región 3' del gen tbp2 y el terminador araB. El plásmido resultante pTG4710 se verificó mediante secuenciación (secuencia del fragmento amplificado por PCR).
5B. Producción de la subunidad Tbp2
Se transformó E. coli Xac-I (Normanly y col., Proc. Natl. Acad. Sci. (1986) 83:6548) con el plásmido pTG4710 y luego se cultivó a 37°C en medio M9 + succinato al 0,5% + arginina 50 \mug/ml + ampicilina 100 \mug/ml. En la fase exponencial, se añadió arabinosa al 0,2%. Después de diferentes tiempos de inducción (1 h a 3 h), se recogieron las células y se prepararon los extractos. El análisis de transferencia de Western y del revelado de Tbp2 mediante la transferrina-peroxidasa permitió demostrar que la mayoría de Tbp2 se hallaba en forma de precursor. El análisis de los extractos en SDS-PAGE seguido de una tinción de proteínas con azul de Coomassie permitió demostrar una producción importante de la proteína (que se evaluó en un 5-10% de las proteínas totales). Las experiencias de marcaje in vivo con Palmitato y con glicerol tritiados permitieron demostrar que únicamente la forma madura está lipidada.
Ejemplo 6 Expresión del fragmento de DNA codificante para la subunidad Tbp2 de la cepa IM2394 (construcción con la secuencia señal rlpb). 6A. Construcción del vector de expresión pTG4764
A partir de pTG3768 se generó por PCR con ayuda de los cebadores OTG4494 y OTG4651 un fragmento codificante del péptido señal RIpB (Takase y col., J. Bacteriol. (1987) 169: 5692) y el inicio de la secuencia codificante de Tbp2 madura hasta la diana interna EcoRV.
51
A continuación, se digirió el fragmento de PCR con BspHI y EcoRV y se insertó simultáneamente con el fragmento EcoRV-HindIII de pTG3786 portador de la región 3' del gen tbp2, en el vector pTG3704 digerido con NcoI y
HindIII, para generar el plásmido pTG4764. La secuencia de este fragmento amplificado por PCR se verificó mediante secuenciación.
6B. Producción de la subunidad Tbp2
Se transformó E. coli Xac-I con el plásmido pTG4764 y luego se cultivó a 37°C en medio M9 + succinato I al 0,5% + arginina 50 \mug/ml + ampicilina 100 \mug/ml. En la fase exponencial, se añadió arabinosa al 0,2%.
Al cabo de diferentes tiempos de inducción (1h a 3h), se recogieron las células y se prepararon los extractos. El análisis de transferencia de Western seguido del revelado con transferrina-peroxidasa puso en evidencia una banda mayoritaria cuyo peso molecular correspondía con el de la Tbp2 madura y purificada. La proteína se detectó en los extractos después de SDS-PAGE y tinción de proteínas con azul de Coomassie (evaluándose el nivel de producción a aproximadamente el 2-5% de las proteínas totales). Los experimentos de marcaje in vivo con palmitato y glicerol tritiados permitieron demostrar que la proteína así producida está lipidada. La cantidad de la forma madura y lipidada de Tbp2 producida a partir de la cepa Xac-I/pTG4764 es superior a la producida por la cepa Xac-I/pTG4710.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Pasteur Mérieux Sérums & Vaccins
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CALLE: 58, Avenue Leclerc
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Lyon
\vskip0.333000\baselineskip
(E)
PAIS: Francia
\vskip0.333000\baselineskip
(F)
CODIGO POSTAL: 69007
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Transgén
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CALLE: 11, rue de Moisheim
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Strasbourg
\vskip0.333000\baselineskip
(E)
PAIS: Francia
\vskip0.333000\baselineskip
(F)
CODIGO POSTAL: 67000
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Fragmentos de DNA codificantes de las subunidades del receptor de la transferrina de Neisseria meningitidis y procedimientos para su expresión.
\vskip0.666000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE LAS SECUENCIAS: 24
\vskip0.666000\baselineskip
(iv)
FORMATO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TIPO DE SOPORTE: disco de 3^{1/4}
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
SISTEMA DE EXPLOTACIÓN: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
SOPORTE LÓGICO: Patentin Release #1.0, Versión #1.25 (OEB)
\vskip0.666000\baselineskip
(v)
DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE DEPÓSITO: EP 93401531.4
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE DEPÓSITO: FR 92 07493
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
FECHA DE DEPÓSITO: 19 de junio de 1992
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 1:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1808 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
ORIGEN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: DNA codificante de la subunidad Tbp2 del receptor de la transferrina
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CEPA: Neisseria meningitidis IM2394
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....60
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido maduro
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 61....1797
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....1797
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA ID N° 1:
1
2
3
4
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 2:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 599 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 2:
5
6
7
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 3:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2800 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
ORIGEN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: DNA codificante de la subunidad Tbp1 del receptor de la transferrina
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CEPA: Neisseria meningitidis IM2394
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRA CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 40....111
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido maduro
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 112....2763
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 40....2763
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 3:
8
9
10
11
12
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 4:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 908 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 4:
13
14
15
16
17
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 5:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2809 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
ORIGEN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: DNA codificante de la subunidad Tbp1 del receptor de la transferrina
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CEPA: Neisseria meningitidis IM2169
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 71....142
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido maduro
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 143....2803
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 71....2803
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 5:
18
180
19
190
20
200
21
210
22
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 6:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 911 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 6:
23
24
25
26
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 7:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2230 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
ORIGEN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: DNA codificante de la subunidad Tbp2 del receptor de la transferrina
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CEPA: Neisseria meningitidis IM2169
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 60....119
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido maduro
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 120....2192
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 60....2192
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 7:
27
28
280
29
290
30
300
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 8:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 711 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 8:
31
310
32
320
33
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº 9:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 51 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....51
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....51
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG AGG AAA AGA TTT TTT GTG GGA ATA TTC GCG ATA AAC CTC CTT GTT
\hfill
48 \sa{Met Arg Lys Arg Phe Phe Val Gly Ile Phe Ala Ile Asn Leu Leu Val}
\vskip1.000000\baselineskip
GGA 51
Gly
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 10:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Arg Lys Arg Phe Phe Val Gly Ile Phe Ala Ile Asn Leu Leu Val}
\vskip1.000000\baselineskip
Gly
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 11:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 57 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....57
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....57
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG AAA AAA ATA ACA GGG ATT ATT TTA TTG CTT CTT GCA GTC ATT ATT
\hfill
48 \sa{Met Lys Lys Ile Thr Gly Ile Ile Leu Leu Leu Leu Ala Val Ile Ile}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
CTG TCT GCA
\hfill
57
Leu Ser Ala
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 12:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 19 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Lys Lys Ile Thr Gly Ile Ile Leu Leu Leu Leu Ala Val Ile Ile}
\vskip1.000000\baselineskip
Leu Ser Ala
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 13:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 60 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....60
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....60
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG AAA GCT ACT AAA CTG GTA CTG GGC GCG GTA ATC CTG GGT TCT ACT
\hfill
48 \sa{Met Lys Ala Thr Lys Leu Val Leu Gly Ala Val Ile Leu Gly Ser Thr Leu Leu Ala Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
CTG CTG GCA GGT
\hfill
60
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 14:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Lys Ala Thr Lys Leu Val Leu Gly Ala Val Ile Leu Gly Ser Thr Leu Leu Ala Gly}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 15:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 69 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....69
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....69
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG AAA CTG ACA ACA CAT CAT CTA CGG ACA GGG GCC GCA TTA TTG GTG
\hfill
48 \sa{Met Lys Leu Thr Thr His His Leu Arg Thr Gly Ala Ala Leu Leu Val}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
GCC GGA ATT CTG CTG GCA GGT
\hfill
69
\sac{Ala Gly Ile Leu Leu Ala Gly}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 16:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Lys Leu Thr Thr His His Leu Arg Thr Gly Ala Ala Leu Leu Val}
\vskip1.000000\baselineskip
\sac{Ala Gly Ile Leu Leu Ala Gly}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 17:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 69 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....69
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....69
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG TTT GTA ACG AGC AAA AAA ATG ACC GCG GCT GTT CTG GCA ATT ACT
\hfill
48 \sa{Met Phe Val Thr Ser Lys Lys Met Thr Ala ala Val Leu Ala Ile Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
TTG GCA ATG TCT CTG AGT GCA
\hfill
69
\sac{Leu Ala Met Ser Leu Ser Ala}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 18:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Phe Val Thr Ser Lys Lys Met Thr Ala Ala Val Leu Ala Ile Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\sac{Leu Ala Met Ser Leu Ser Ala}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 19:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 63 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....63
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....63
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG CAA CTG AAC AAA GTG CTG AAA GGG CTG ATG ATT GCT CTG CCT GTT
\hfill
48 \sa{Met Gln Leu Asn Lys Val Leu Lys Gly Leu Met Ile Ala Leu Pro Val}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG GCA ATT GCG GCA
\hfill
63
\sac{Met Ala Ile Ala Ala}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 20:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Gln Leu Asn Lys Val Leu Lys Gly Leu Met Ile Ala Leu Pro Val}
\vskip1.000000\baselineskip
\sac{Met Ala Ile Ala Ala}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 21:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 54 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....54
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....54
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG AGA TAC CTG GCA ACA TTG TTG TTA TCT CTG GCG GTG TTA ATC ACC
\hfill
48 \sa{Met Arg Tyr Leu Ala Thr Leu Leu Leu Ser Leu Ala Val Leu Ile Thr Ala Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
GCC GGG
\hfill
54
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 22:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Arg Tyr Leu Ala Thr Leu Leu Leu Ser Leu Ala Val Leu Ile Thr Ala Gly}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 23:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....66
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA ADICIONAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
PALABRE CLAVE: péptido señal
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1....66
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
ATG AAA CAT AAC GTT AAG CTG ATG GCA ATG ACT GCC GTT TTA TCC TCT
\hfill
48 \sa{Met Lys His Asn Val Lys Leu Met Ala Met Thr Ala Val Leu Ser Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
GTC CTC GTG CTC TCC GGG
\hfill
66
\sac{Val Leu Val Leu Ser Gly}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID N° 24:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID N° 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Lys His Asn Val Lys Leu Met Ala Met Thr Ala Val Leu Ser Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\sac{Val Leu Val Leu Ser Gly}

Claims (20)

1. Fragmento de DNA aislado que tiene una secuencia nucleotídica codificante de una proteína que tiene una secuencia aminoacídica que presenta un grado de identidad de por lo menos el 75% con la secuencia que se muestra en:
-
la SEC ID N° 1, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y acaba con el residuo glutamina en posición 579; o
-
la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y acaba con el residuo glutamina en posición 691;
siendo reconocido el producto de expresión de dicho fragmento por un antisuero anti-receptor de la transferrina de la cepa N. meningitidis IM2394 o IM2169.
2. Fragmento de DNA de acuerdo con la reivindicación 1, que contiene una secuencia nucleotídica codificante de:
i)
la subunidad Tbp2 de la cepa IM2394 cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 1, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y acaba con el residuo glutamina en posición 579; o
ii)
la subunidad Tbp2 de la cepa IM2169 cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y acaba con el residuo glutamina en posición 691.
3. Fragmento de DNA de acuerdo con la reivindicación 1, que contiene una secuencia nucleotídica codificante de un precursor que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 75% con la secuencia que se muestra:
-
en la SEC ID N° 1, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y acaba con el residuo glutamina en posición 579;
-
en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y acaba con el residuo glutamina en posición 691;
que puede ser reconocida por un antisuero anti-receptor de la transferrina de la cepa N. meningitidis IM 2394 o
IM 2169.
4. Fragmento de DNA de acuerdo con la reivindicación 3, que tiene una secuencia nucleotídica codificante de:
i)
el precursor de la subunidad Tbp2 de la cepa IM2394, cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 1, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y acaba con el residuo glutamina en posición 579; o
ii)
el precursor de la subunidad Tbp2 de la cepa IM2169, cuya secuencia aminoacídica se muestra en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y acaba con el residuo glutamina en posición 691.
5. Fragmento de DNA de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 80% con la secuencia de referencia.
6. Fragmento de DNA de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 90% con la secuencia de referencia.
7. Cassette de expresión destinada a la producción de un péptido, polipéptido o proteína que se puede reconocer por un antisuero anti-receptor de transferrina de la cepa N. meningitidis IM2394 o IM2169, que comprende un fragmento de DNA de acuerdo con una de las reivindicaciones 1 a 6 situado bajo el control de los elementos necesarios para su expresión.
8. Cassette de expresión de acuerdo con la reivindicación 7, en donde dicho fragmento de DNA se halla situado bajo control de los elementos que comprenden el promotor araB de S. typhimurium.
9. Cassette de expresión de acuerdo con la reivindicación 7 u 8, destinada a la producción de una proteína que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 75% con la secuencia mostrada:
-
en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo cisteína en posición 1 y acaba con el residuo glutamina en posición 691;
\newpage
que comprende:
i)
un bloque de DNA codificante del péptido señal RipB y
ii)
un fragmento de DNA codificante de dicha proteína.
10. Cassette de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 7 a 9, destinada a la producción de una proteína que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 80% con la secuencia de referencia.
11. Cassette de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 7 a 9, destinada a la producción de una proteína que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 90% con la secuencia de referencia.
12. Cassette de expresión de acuerdo con la reivindicación 9, destinada a la producción de la subunidad Tbp2 de N. meningitidis IM2394 o IM2169, que comprende:
i)
un bloque de DNA codificante del péptido señal RipB y
ii)
un fragmento de DNA codificante de dicha subunidad.
13. Célula hospedadora transformada con un cassette de expresión de acuerdo con una de las reivindicaciones 7 a 12.
14. Procedimiento de producción de un péptido, polipéptido o proteína que puede ser reconocido por un antisuero anti-receptor de la transferrina de la cepa de N. meningitidis IM2394 o IM2169, según el cual se cultiva una célula hospedadora de acuerdo con la reivindicación 13 y se recoge dicho péptido, polipéptido o proteína a partir de dicho cultivo.
15. Composición farmacéutica que comprende como principio activo, un péptido, polipéptido o proteína que puede ser reconocido por un antisuero anti-receptor de la transferrina de la cepa de N. meningitidis IM2394 o IM2169, obtenido mediante el procedimiento de acuerdo con la reivindicación 14.
16. Composición farmacéutica que comprende como principio activo, un vector viral o bacteriano en cuyo genoma se ha insertado un fragmento de DNA de acuerdo con una de las reivindicaciones 1 a 6, en donde dicho fragmento está colocado bajo el control de los elementos necesarios para su expresión.
17. Bloque de DNA aislado codificante de un péptido señal que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 75% con la secuencia mostrada:
-
en la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y acaba con el residuo alanina en posición -1;
-
y que puede ser reconocida por un antisuero anti-receptor de la transferrina de la cepa de N. meningitidis IM2394 o IM2169.
18. Bloque de DNA aislado que codifica un péptido señal que tiene una secuencia aminoacídica que se muestra en:
-
la SEC ID N° 7, que comienza con el residuo metionina en posición -20 y acaba con el residuo alanina en posición -1.
19. Bloque de DNA de acuerdo con la reivindicación 17 que codifica un péptido señal que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 80% con la secuencia de referencia.
20. Bloque de DNA de acuerdo con la reivindicación 17 que codifica un péptido señal que tiene una secuencia aminoacídica con un grado de identidad de por lo menos el 90% con la secuencia de referencia.
ES93401531T 1992-06-19 1993-06-15 Fragmentos de adn codificante de las subunidades del receptor de la meningitis neisseria. Expired - Lifetime ES2199938T3 (es)

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