HU211476A9 - Cd2-binding domain of lymphocyte function associated antigen 3 - Google Patents
Cd2-binding domain of lymphocyte function associated antigen 3 Download PDFInfo
- Publication number
- HU211476A9 HU211476A9 HU95P/P00680P HU9500680P HU211476A9 HU 211476 A9 HU211476 A9 HU 211476A9 HU 9500680 P HU9500680 P HU 9500680P HU 211476 A9 HU211476 A9 HU 211476A9
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- lfa
- ser
- polypeptide
- leu
- seq
- Prior art date
Links
- 108010084313 CD58 Antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 234
- 230000027455 binding Effects 0.000 title claims abstract description 118
- 102100030984 Lymphocyte function-associated antigen 3 Human genes 0.000 title claims description 12
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 183
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 175
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 174
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims abstract description 77
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims abstract description 77
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims abstract description 75
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims abstract description 75
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 74
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 64
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 63
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 48
- 102100025237 T-cell surface antigen CD2 Human genes 0.000 claims abstract 23
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 218
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 68
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 65
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 49
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 27
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 23
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 claims description 22
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 claims description 17
- 101001001645 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase pim-3 Proteins 0.000 claims description 15
- 102100036119 Serine/threonine-protein kinase pim-3 Human genes 0.000 claims description 15
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 13
- LMVOVCYVZBBWQB-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN LMVOVCYVZBBWQB-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 13
- MCIXMYKSPQUMJG-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MCIXMYKSPQUMJG-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 13
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 13
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 claims description 13
- PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N Ile-Tyr-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)NCC(=O)O)N PRTZQMBYUZFSFA-XEGUGMAKSA-N 0.000 claims description 12
- ZGGVHTQAPHVMKM-IHPCNDPISA-N Leu-Trp-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N ZGGVHTQAPHVMKM-IHPCNDPISA-N 0.000 claims description 11
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 claims description 11
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 claims description 11
- 101001063392 Homo sapiens Lymphocyte function-associated antigen 3 Proteins 0.000 claims description 10
- OWQXAJQZLWHPBH-FXQIFTODSA-N Pro-Ser-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O OWQXAJQZLWHPBH-FXQIFTODSA-N 0.000 claims description 10
- MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N Ser-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N 0.000 claims description 10
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 10
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 10
- ANAHQDPQQBDOBM-UHFFFAOYSA-N Arg-Val-Tyr Natural products CC(C)C(NC(=O)C(N)CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O ANAHQDPQQBDOBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OHUKZZYSJBKFRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 9
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 claims description 9
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 8
- FXJLRZFMKGHYJP-CFMVVWHZSA-N Ile-Tyr-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N FXJLRZFMKGHYJP-CFMVVWHZSA-N 0.000 claims description 8
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 claims description 8
- JDMKQHSHKJHAHR-UHFFFAOYSA-N Phe-Phe-Leu-Tyr Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)CC1=CC=CC=C1 JDMKQHSHKJHAHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 108010054813 diprotin B Proteins 0.000 claims description 8
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 claims description 8
- IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N 0.000 claims description 7
- XSYJDGIDKRNWFX-SRVKXCTJSA-N Ser-Cys-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XSYJDGIDKRNWFX-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 7
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 7
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 claims description 7
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 7
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 6
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 6
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 6
- XOQYDFCQPWAMSA-KKHAAJSZSA-N Asn-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XOQYDFCQPWAMSA-KKHAAJSZSA-N 0.000 claims description 5
- WVLZTXGTNGHPBO-SRVKXCTJSA-N Cys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WVLZTXGTNGHPBO-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 5
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N 0.000 claims description 5
- SPXWRYVHOZVYBU-ULQDDVLXSA-N Phe-His-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N SPXWRYVHOZVYBU-ULQDDVLXSA-N 0.000 claims description 5
- MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N Thr-Val-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N 0.000 claims description 5
- AYHSJESDFKREAR-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AYHSJESDFKREAR-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims description 5
- BSCBBPKDVOZICB-KKUMJFAQSA-N Tyr-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BSCBBPKDVOZICB-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims description 5
- NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N Val-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)C(C)C NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N 0.000 claims description 5
- GUIYPEKUEMQBIK-JSGCOSHPSA-N Val-Tyr-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)NCC(O)=O GUIYPEKUEMQBIK-JSGCOSHPSA-N 0.000 claims description 5
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 5
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 210000005105 peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 5
- RRKCPMGSRIDLNC-AVGNSLFASA-N Asp-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O RRKCPMGSRIDLNC-AVGNSLFASA-N 0.000 claims description 4
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- TVTIDSMADMIHEU-KKUMJFAQSA-N His-Cys-Phe Chemical compound N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O TVTIDSMADMIHEU-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims description 4
- DNEJSAIMVANNPA-DCAQKATOSA-N Lys-Asn-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O DNEJSAIMVANNPA-DCAQKATOSA-N 0.000 claims description 4
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims description 4
- FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N Ser-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N 0.000 claims description 4
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 claims description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 4
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 claims description 4
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 claims description 4
- GZXOUBTUAUAVHD-ACZMJKKPSA-N Asn-Ser-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GZXOUBTUAUAVHD-ACZMJKKPSA-N 0.000 claims description 3
- ITGFVUYOLWBPQW-KKHAAJSZSA-N Asp-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ITGFVUYOLWBPQW-KKHAAJSZSA-N 0.000 claims description 3
- JHSRJMUJOGLIHK-GUBZILKMSA-N Glu-Met-Glu Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N JHSRJMUJOGLIHK-GUBZILKMSA-N 0.000 claims description 3
- YCKPUHHMCFSUMD-IUKAMOBKSA-N Ile-Thr-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N YCKPUHHMCFSUMD-IUKAMOBKSA-N 0.000 claims description 3
- POZULHZYLPGXMR-ONGXEEELSA-N Leu-Gly-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O POZULHZYLPGXMR-ONGXEEELSA-N 0.000 claims description 3
- ULUQBUKAPDUKOC-GVXVVHGQSA-N Lys-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ULUQBUKAPDUKOC-GVXVVHGQSA-N 0.000 claims description 3
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 claims description 3
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 claims description 3
- JLKWJWPDXPKKHI-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Asn Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O JLKWJWPDXPKKHI-FXQIFTODSA-N 0.000 claims description 3
- KDGBLMDAPJTQIW-RHYQMDGZSA-N Thr-Met-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O KDGBLMDAPJTQIW-RHYQMDGZSA-N 0.000 claims description 3
- JXWGBRRVTRAZQA-ULQDDVLXSA-N Val-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N JXWGBRRVTRAZQA-ULQDDVLXSA-N 0.000 claims description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 3
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims description 3
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 3
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 claims description 2
- STWGDDDFLUFCCA-GVXVVHGQSA-N His-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O STWGDDDFLUFCCA-GVXVVHGQSA-N 0.000 claims description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 2
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 claims description 2
- CTDPLKMBVALCGN-JSGCOSHPSA-N Tyr-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O CTDPLKMBVALCGN-JSGCOSHPSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 2
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 claims 2
- HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(C)C)C(O)=O HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N 0.000 claims 1
- 102000023732 binding proteins Human genes 0.000 claims 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 claims 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 claims 1
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 claims 1
- 230000001902 propagating effect Effects 0.000 claims 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 abstract description 40
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 abstract description 5
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 56
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 54
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 52
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 46
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 38
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 38
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 33
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 33
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 32
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 31
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 31
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 28
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 26
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 24
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 23
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 22
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 20
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 19
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 19
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 18
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 18
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 17
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 17
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 17
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 16
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 15
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 15
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 15
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 14
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 14
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 14
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 14
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 14
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 13
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 12
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 12
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 11
- 101100221606 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) COS7 gene Proteins 0.000 description 11
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 11
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 11
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 11
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 10
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 10
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 10
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 10
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 10
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 10
- 238000007799 mixed lymphocyte reaction assay Methods 0.000 description 10
- 108091027305 Heteroduplex Proteins 0.000 description 9
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 9
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 9
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 9
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 9
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 9
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 9
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 8
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 8
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 8
- DSGYZICNAMEJOC-AVGNSLFASA-N Ser-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O DSGYZICNAMEJOC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 8
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 8
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 8
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 8
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 8
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 8
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 8
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 8
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 8
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 8
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 7
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 7
- CLVUXCBGKUECIT-HJGDQZAQSA-N Leu-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CLVUXCBGKUECIT-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 7
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 7
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 7
- 229940009976 deoxycholate Drugs 0.000 description 7
- KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N deoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N 0.000 description 7
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 7
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 7
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 7
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 7
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 7
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 6
- YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 6
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 6
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 6
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 6
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 6
- XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N N-L-cysteinyl-L-phenylalanine Natural products SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 6
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 6
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 6
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 6
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 6
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 6
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 6
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 6
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 6
- 101710139410 1-phosphatidylinositol phosphodiesterase Proteins 0.000 description 5
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 5
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- HMJULNMJWOZNFI-XHNCKOQMSA-N Glu-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O HMJULNMJWOZNFI-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 5
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 5
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 5
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 5
- 102100037097 Protein disulfide-isomerase A3 Human genes 0.000 description 5
- XDARBNMYXKUFOJ-GSSVUCPTSA-N Thr-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XDARBNMYXKUFOJ-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 5
- SCCKSNREWHMKOJ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Asn-Ser Chemical compound N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SCCKSNREWHMKOJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 5
- CDHQEOXPWBDFPL-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gly-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 CDHQEOXPWBDFPL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 5
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 5
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 5
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 5
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 5
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 5
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 5
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 5
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 5
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 5
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 5
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 5
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 5
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 5
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 5
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 5
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 5
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 5
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 5
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 4
- JEPNYDRDYNSFIU-QXEWZRGKSA-N Asn-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(O)=O JEPNYDRDYNSFIU-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 4
- DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N Asp-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 4
- PEZINYWZBQNTIX-NAKRPEOUSA-N Cys-Met-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)N PEZINYWZBQNTIX-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 4
- SAEVTQWAYDPXMU-KATARQTJSA-N Cys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SAEVTQWAYDPXMU-KATARQTJSA-N 0.000 description 4
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N Glu-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- LRQXRHGQEVWGPV-NHCYSSNCSA-N Gly-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN LRQXRHGQEVWGPV-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 4
- VNNRLUNBJSWZPF-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ser-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O VNNRLUNBJSWZPF-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- NURNJECQNNCRBK-FLBSBUHZSA-N Ile-Thr-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NURNJECQNNCRBK-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 4
- AEDWWMMHUGYIFD-HJGDQZAQSA-N Leu-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AEDWWMMHUGYIFD-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 4
- UFPLDOKWDNTTRP-ULQDDVLXSA-N Leu-Tyr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CC=C(O)C=C1 UFPLDOKWDNTTRP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 4
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- ZCWWVXAXWUAEPZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Met-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZCWWVXAXWUAEPZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 4
- ZRACLHJYVRBJFC-ULQDDVLXSA-N Met-Lys-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZRACLHJYVRBJFC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 4
- PNHRPOWKRRJATF-IHRRRGAJSA-N Met-Tyr-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PNHRPOWKRRJATF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- RMKGXGPQIPLTFC-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RMKGXGPQIPLTFC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N Pro-Arg-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- 239000012979 RPMI medium Substances 0.000 description 4
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 4
- GYUUYCIXELGTJS-MEYUZBJRSA-N Thr-Phe-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O GYUUYCIXELGTJS-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 4
- FMOSEWZYZPMJAL-KKUMJFAQSA-N Tyr-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N FMOSEWZYZPMJAL-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 4
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 4
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 4
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 4
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 4
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 4
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 4
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 4
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 4
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 4
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 4
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 230000007896 negative regulation of T cell activation Effects 0.000 description 4
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 4
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 4
- 108010071097 threonyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 4
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 4
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 3
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 3
- HEPLXMBVMCXTBP-QWRGUYRKSA-N Cys-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O HEPLXMBVMCXTBP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- 102100024746 Dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 3
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- HZWWOGWOBQBETJ-CUJWVEQBSA-N His-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O HZWWOGWOBQBETJ-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 3
- FBOMZVOKCZMDIG-XQQFMLRXSA-N His-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N FBOMZVOKCZMDIG-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 3
- PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N Ile-Leu-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N 0.000 description 3
- DZMWFIRHFFVBHS-ZEWNOJEFSA-N Ile-Tyr-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)O)N DZMWFIRHFFVBHS-ZEWNOJEFSA-N 0.000 description 3
- WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- DDEMUMVXNFPDKC-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N DDEMUMVXNFPDKC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- OMHLATXVNQSALM-FQUUOJAGSA-N Leu-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N OMHLATXVNQSALM-FQUUOJAGSA-N 0.000 description 3
- LJBVRCDPWOJOEK-PPCPHDFISA-N Leu-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LJBVRCDPWOJOEK-PPCPHDFISA-N 0.000 description 3
- ALSRJRIWBNENFY-DCAQKATOSA-N Lys-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ALSRJRIWBNENFY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 3
- VPFGPKIWSDVTOY-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-His Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O VPFGPKIWSDVTOY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- SNGZLPOXVRTNMB-LPEHRKFASA-N Pro-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O SNGZLPOXVRTNMB-LPEHRKFASA-N 0.000 description 3
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 3
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 3
- TYYBJUYSTWJHGO-ZKWXMUAHSA-N Ser-Asn-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O TYYBJUYSTWJHGO-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 3
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 3
- VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N Thr-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 3
- MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 3
- YFOCMOVJBQDBCE-NRPADANISA-N Val-Ala-Glu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N YFOCMOVJBQDBCE-NRPADANISA-N 0.000 description 3
- UGFMVXRXULGLNO-XPUUQOCRSA-N Val-Ser-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O UGFMVXRXULGLNO-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 3
- PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N Val-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N 0.000 description 3
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 3
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 3
- 244000309466 calf Species 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 3
- 230000017455 cell-cell adhesion Effects 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 3
- -1 cysteine amino acid Chemical class 0.000 description 3
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 108020001096 dihydrofolate reductase Proteins 0.000 description 3
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 3
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 3
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 3
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 3
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 3
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 3
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 3
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 3
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 3
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 3
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 3
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 3
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 3
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 3
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 3
- QMXCRMQIVATQMR-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-pyridin-2-ylsulfanylpropanoate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCSC1=CC=CC=N1 QMXCRMQIVATQMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FJQZXCPWAGYPSD-UHFFFAOYSA-N 1,3,4,6-tetrachloro-3a,6a-diphenylimidazo[4,5-d]imidazole-2,5-dione Chemical compound ClN1C(=O)N(Cl)C2(C=3C=CC=CC=3)N(Cl)C(=O)N(Cl)C12C1=CC=CC=C1 FJQZXCPWAGYPSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 102000006306 Antigen Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010083359 Antigen Receptors Proteins 0.000 description 2
- BYLSYQASFJJBCL-DCAQKATOSA-N Asn-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BYLSYQASFJJBCL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 2
- QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N Asp-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QNMKWNONJGKJJC-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N Asp-Pro-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AHWRSSLYSGLBGD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- YUELDQUPTAYEGM-XIRDDKMYSA-N Asp-Trp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N YUELDQUPTAYEGM-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 2
- ZALVANCAZFPKIR-GUBZILKMSA-N Cys-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CS)N ZALVANCAZFPKIR-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 2
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 2
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 2
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 2
- IBYOLNARKHMLBG-WHOFXGATSA-N Gly-Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IBYOLNARKHMLBG-WHOFXGATSA-N 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 2
- WSDOHRLQDGAOGU-BQBZGAKWSA-N His-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 WSDOHRLQDGAOGU-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CAHCWMVNBZJVAW-NAKRPEOUSA-N Ile-Pro-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N CAHCWMVNBZJVAW-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- FBGXMKUWQFPHFB-JBDRJPRFSA-N Ile-Ser-Cys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N FBGXMKUWQFPHFB-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 2
- 102100024319 Intestinal-type alkaline phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 101710184243 Intestinal-type alkaline phosphatase Proteins 0.000 description 2
- PWWVAXIEGOYWEE-UHFFFAOYSA-N Isophenergan Chemical compound C1=CC=C2N(CC(C)N(C)C)C3=CC=CC=C3SC2=C1 PWWVAXIEGOYWEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N L-tryptophan-L-tyrosine Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 2
- PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N Leu-Gly-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N Leu-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N Leu-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 2
- BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 2
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- ODTZHNZPINULEU-KKUMJFAQSA-N Lys-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ODTZHNZPINULEU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- YKBSXQFZWFXFIB-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O YKBSXQFZWFXFIB-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- PESQCPHRXOFIPX-RYUDHWBXSA-N Met-Tyr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- NHCKESBLOMHIIE-IRXDYDNUSA-N Phe-Gly-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 NHCKESBLOMHIIE-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N Phe-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 2
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 2
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 2
- TUYWCHPXKQTISF-LPEHRKFASA-N Pro-Cys-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O TUYWCHPXKQTISF-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- NXEYSLRNNPWCRN-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NXEYSLRNNPWCRN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- UIMCLYYSUCIUJM-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 UIMCLYYSUCIUJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- ZLXKLMHAMDENIO-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZLXKLMHAMDENIO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- XZBYTHCRAVAXQQ-DCAQKATOSA-N Pro-Met-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XZBYTHCRAVAXQQ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- GOMUXSCOIWIJFP-GUBZILKMSA-N Pro-Ser-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GOMUXSCOIWIJFP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 2
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- VQBLHWSPVYYZTB-DCAQKATOSA-N Ser-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CO)N VQBLHWSPVYYZTB-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N Ser-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O DKKGAAJTDKHWOD-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 2
- IXCHOHLPHNGFTJ-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N IXCHOHLPHNGFTJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- HMRAQFJFTOLDKW-GUBZILKMSA-N Ser-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HMRAQFJFTOLDKW-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N Ser-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N Ser-Thr-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNXUIBACCONSOH-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 2
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- ZLNWJMRLHLGKFX-SVSWQMSJSA-N Thr-Cys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZLNWJMRLHLGKFX-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 2
- KWQBJOUOSNJDRR-XAVMHZPKSA-N Thr-Cys-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O KWQBJOUOSNJDRR-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 2
- LGNBRHZANHMZHK-NUMRIWBASA-N Thr-Glu-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)O LGNBRHZANHMZHK-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- FIFDDJFLNVAVMS-RHYQMDGZSA-N Thr-Leu-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O FIFDDJFLNVAVMS-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- WFAUDCSNCWJJAA-KXNHARMFSA-N Thr-Lys-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(O)=O WFAUDCSNCWJJAA-KXNHARMFSA-N 0.000 description 2
- ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N Thr-Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 2
- NBHGNEJMBNQQKZ-UBHSHLNASA-N Trp-Asp-Cys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N NBHGNEJMBNQQKZ-UBHSHLNASA-N 0.000 description 2
- UUIYFDAWNBSWPG-IHPCNDPISA-N Trp-Lys-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N UUIYFDAWNBSWPG-IHPCNDPISA-N 0.000 description 2
- LHADRQBREKTRLR-DCAQKATOSA-N Val-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LHADRQBREKTRLR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N Val-Leu-Ser Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- ZHWZDZFWBXWPDW-GUBZILKMSA-N Val-Val-Cys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O ZHWZDZFWBXWPDW-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N Val-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC([O-])=O AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- 108010024078 alanyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 2
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 238000000211 autoradiogram Methods 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000008614 cellular interaction Effects 0.000 description 2
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 2
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 2
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 108010054812 diprotin A Proteins 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000012997 ficoll-paque Substances 0.000 description 2
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 2
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010013768 glutamyl-aspartyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010028188 glycyl-histidyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 2
- 229940094991 herring sperm dna Drugs 0.000 description 2
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M lithium chloride Chemical compound [Li+].[Cl-] KWGKDLIKAYFUFQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 2
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 2
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 2
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 2
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 2
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical group C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N (2s,3r,4s,5r,6r)-2-[[(1s,3s,4s,5s,8r)-3-[(2s,3r,4s,5s,6r)-2-[[(1s,3r,4s,5s,8r)-3,4-dihydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5- Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@H]1[C@H]2OC[C@@H]1O[C@@H](O[C@@H]1[C@H]([C@H](O[C@H]3[C@H]4OC[C@@H]3O[C@@H](O)[C@H]4O)O[C@H](CO)[C@@H]1O)O)[C@H]2O MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 3-[3-[3,5-dihydroxy-6-methyl-4-(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]oxydecanoyloxy]decanoic acid;hydrate Chemical compound O.OC1C(OC(CC(=O)OC(CCCCCCC)CC(O)=O)CCCCCCC)OC(C)C(O)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(C)O1 HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 4-Nitrophenyl Phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HWQQCFPHXPNXHC-UHFFFAOYSA-N 6-[(4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-yl)amino]-3',6'-dihydroxyspiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-1-one Chemical compound C=1C(O)=CC=C2C=1OC1=CC(O)=CC=C1C2(C1=CC=2)OC(=O)C1=CC=2NC1=NC(Cl)=NC(Cl)=N1 HWQQCFPHXPNXHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- 101100301148 Arabidopsis thaliana RCCR gene Proteins 0.000 description 1
- JSLGXODUIAFWCF-WDSKDSINSA-N Arg-Asn Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JSLGXODUIAFWCF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GRRXPUAICOGISM-RWMBFGLXSA-N Arg-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O GRRXPUAICOGISM-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- SYFHFLGAROUHNT-VEVYYDQMSA-N Arg-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SYFHFLGAROUHNT-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- WHLDJYNHXOMGMU-JYJNAYRXSA-N Arg-Val-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WHLDJYNHXOMGMU-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- OLVIPTLKNSAYRJ-YUMQZZPRSA-N Asn-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N OLVIPTLKNSAYRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Asn Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)C(=O)N REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- QNNBHTFDFFFHGC-KKUMJFAQSA-N Asn-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O QNNBHTFDFFFHGC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NYLBGYLHBDFRHL-VEVYYDQMSA-N Asp-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NYLBGYLHBDFRHL-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- PDECQIHABNQRHN-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PDECQIHABNQRHN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- PGUYEUCYVNZGGV-QWRGUYRKSA-N Asp-Gly-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PGUYEUCYVNZGGV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Asp-Ile Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- LBOVBQONZJRWPV-YUMQZZPRSA-N Asp-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O LBOVBQONZJRWPV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UEFODXNXUAVPTC-VEVYYDQMSA-N Asp-Thr-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O UEFODXNXUAVPTC-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- ZUNMTUPRQMWMHX-LSJOCFKGSA-N Asp-Val-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ZUNMTUPRQMWMHX-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710150190 Beta-secretase 2 Proteins 0.000 description 1
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 1
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 description 1
- 108010041884 CD4 Immunoadhesins Proteins 0.000 description 1
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000005367 Carboxypeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010006303 Carboxypeptidases Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 241000252203 Clupea harengus Species 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- FWYBFUDWUUFLDN-FXQIFTODSA-N Cys-Asp-Arg Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)CN=C(N)N FWYBFUDWUUFLDN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- NXTYATMDWQYLGJ-BQBZGAKWSA-N Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CS NXTYATMDWQYLGJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- MKMKILWCRQLDFJ-DCAQKATOSA-N Cys-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O MKMKILWCRQLDFJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- BNCKELUXXUYRNY-GUBZILKMSA-N Cys-Lys-Glu Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N BNCKELUXXUYRNY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 150000008574 D-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 101100352762 Drosophila melanogaster pnut gene Proteins 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 108010059378 Endopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000005593 Endopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 241001452028 Escherichia coli DH1 Species 0.000 description 1
- 241000620209 Escherichia coli DH5[alpha] Species 0.000 description 1
- 241001131785 Escherichia coli HB101 Species 0.000 description 1
- 241001302584 Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 Species 0.000 description 1
- 102000018389 Exopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010091443 Exopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- RDDSZZJOKDVPAE-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RDDSZZJOKDVPAE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- ZMVCLTGPGWJAEE-JYJNAYRXSA-N Glu-His-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O ZMVCLTGPGWJAEE-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N Glu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- QDMVXRNLOPTPIE-WDCWCFNPSA-N Glu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QDMVXRNLOPTPIE-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- ALMBZBOCGSVSAI-ACZMJKKPSA-N Glu-Ser-Asn Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N ALMBZBOCGSVSAI-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N Glu-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N Glu-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- VIPDPMHGICREIS-GVXVVHGQSA-N Glu-Val-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VIPDPMHGICREIS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JXYMPBCYRKWJEE-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JXYMPBCYRKWJEE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N Gly-Ile-Leu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UESJMAMHDLEHGM-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- GMTXWRIDLGTVFC-IUCAKERBSA-N Gly-Lys-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GMTXWRIDLGTVFC-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N Gly-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)C[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 QAMMIGULQSIRCD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- NIKBMHGRNAPJFW-IUCAKERBSA-N His-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 NIKBMHGRNAPJFW-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- VHOLZZKNEBBHTH-YUMQZZPRSA-N His-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 VHOLZZKNEBBHTH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- BXOLYFJYQQRQDJ-MXAVVETBSA-N His-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N BXOLYFJYQQRQDJ-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- FHKZHRMERJUXRJ-DCAQKATOSA-N His-Ser-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 FHKZHRMERJUXRJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CSTDQOOBZBAJKE-BWAGICSOSA-N His-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)O CSTDQOOBZBAJKE-BWAGICSOSA-N 0.000 description 1
- 101000840258 Homo sapiens Immunoglobulin J chain Proteins 0.000 description 1
- 101000599852 Homo sapiens Intercellular adhesion molecule 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 1
- TVYWVSJGSHQWMT-AJNGGQMLSA-N Ile-Leu-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N TVYWVSJGSHQWMT-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- IVXJIMGDOYRLQU-XUXIUFHCSA-N Ile-Pro-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IVXJIMGDOYRLQU-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N Ile-Ser-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 1
- 108010091135 Immunoglobulin Fc Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000018071 Immunoglobulin Fc Fragments Human genes 0.000 description 1
- 102100029571 Immunoglobulin J chain Human genes 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 102100022339 Integrin alpha-L Human genes 0.000 description 1
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 125000000510 L-tryptophano group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C2N([H])C([H])=C(C([H])([H])[C@@]([H])(C(O[H])=O)N([H])[*])C2=C1[H] 0.000 description 1
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- BTNXKBVLWJBTNR-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BTNXKBVLWJBTNR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N Leu-Ser-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- GZRABTMNWJXFMH-UVOCVTCTSA-N Leu-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GZRABTMNWJXFMH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 208000005446 Lupus vulgaris Diseases 0.000 description 1
- 108010064548 Lymphocyte Function-Associated Antigen-1 Proteins 0.000 description 1
- RDIILCRAWOSDOQ-CIUDSAMLSA-N Lys-Cys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N RDIILCRAWOSDOQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- PBLLTSKBTAHDNA-KBPBESRZSA-N Lys-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PBLLTSKBTAHDNA-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- WGILOYIKJVQUPT-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WGILOYIKJVQUPT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N Lys-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N IKXQOBUBZSOWDY-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 1
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 1
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 1
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 1
- 102100025354 Macrophage mannose receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 108010031099 Mannose Receptor Proteins 0.000 description 1
- HLQWFLJOJRFXHO-CIUDSAMLSA-N Met-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HLQWFLJOJRFXHO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- RKIIYGUHIQJCBW-SRVKXCTJSA-N Met-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RKIIYGUHIQJCBW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YGNUDKAPJARTEM-GUBZILKMSA-N Met-Val-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YGNUDKAPJARTEM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 108010086093 Mung Bean Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 1
- 108010079246 OMPA outer membrane proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 101150012394 PHO5 gene Proteins 0.000 description 1
- OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N Phe-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N Phe-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- KNYPNEYICHHLQL-ACRUOGEOSA-N Phe-Leu-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 KNYPNEYICHHLQL-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- AXIOGMQCDYVTNY-ACRUOGEOSA-N Phe-Phe-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 AXIOGMQCDYVTNY-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- IIEOLPMQYRBZCN-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Cys Chemical compound N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O IIEOLPMQYRBZCN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 102000006486 Phosphoinositide Phospholipase C Human genes 0.000 description 1
- 108010044302 Phosphoinositide phospholipase C Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 208000000474 Poliomyelitis Diseases 0.000 description 1
- XWYXZPHPYKRYPA-GMOBBJLQSA-N Pro-Asn-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O XWYXZPHPYKRYPA-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- KIPIKSXPPLABPN-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 KIPIKSXPPLABPN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- UEHYFUCOGHWASA-HJGDQZAQSA-N Pro-Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 UEHYFUCOGHWASA-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- UREQLMJCKFLLHM-NAKRPEOUSA-N Pro-Ile-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UREQLMJCKFLLHM-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- FYPGHGXAOZTOBO-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 FYPGHGXAOZTOBO-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- MCWHYUWXVNRXFV-RWMBFGLXSA-N Pro-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 MCWHYUWXVNRXFV-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N Ser-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N Ser-Asn-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VAUMZJHYZQXZBQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KNZQGAUEYZJUSQ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asp-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N KNZQGAUEYZJUSQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- HBTCFCHYALPXME-HTFCKZLJSA-N Ser-Ile-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HBTCFCHYALPXME-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 1
- IUXGJEIKJBYKOO-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N IUXGJEIKJBYKOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XVWDJUROVRQKAE-KKUMJFAQSA-N Ser-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CC1=CC=CC=C1 XVWDJUROVRQKAE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N Ser-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 description 1
- 239000008049 TAE buffer Substances 0.000 description 1
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- ASJDFGOPDCVXTG-KATARQTJSA-N Thr-Cys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ASJDFGOPDCVXTG-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- IHAPJUHCZXBPHR-WZLNRYEVSA-N Thr-Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N IHAPJUHCZXBPHR-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 1
- IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N Thr-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N 0.000 description 1
- XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N Thr-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- NQQMWWVVGIXUOX-SVSWQMSJSA-N Thr-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NQQMWWVVGIXUOX-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- ZESGVALRVJIVLZ-VFCFLDTKSA-N Thr-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O ZESGVALRVJIVLZ-VFCFLDTKSA-N 0.000 description 1
- BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N Thr-Tyr-Arg Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- PGEFRHBWGOJPJT-KKUMJFAQSA-N Tyr-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PGEFRHBWGOJPJT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YYLHVUCSTXXKBS-IHRRRGAJSA-N Tyr-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYLHVUCSTXXKBS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ASQFIHTXXMFENG-XPUUQOCRSA-N Val-Ala-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O ASQFIHTXXMFENG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- UUYCNAXCCDNULB-QXEWZRGKSA-N Val-Arg-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UUYCNAXCCDNULB-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- NXRAUQGGHPCJIB-RCOVLWMOSA-N Val-Gly-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NXRAUQGGHPCJIB-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N Val-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 1
- HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 208000038016 acute inflammation Diseases 0.000 description 1
- 230000006022 acute inflammation Effects 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000000961 alloantigen Effects 0.000 description 1
- 150000001371 alpha-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000008206 alpha-amino acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000009435 amidation Effects 0.000 description 1
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical group 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 230000009831 antigen interaction Effects 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 238000005574 benzylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 description 1
- 235000011089 carbon dioxide Nutrition 0.000 description 1
- 230000007910 cell fusion Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 241000902900 cellular organisms Species 0.000 description 1
- 230000033077 cellular process Effects 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 208000037976 chronic inflammation Diseases 0.000 description 1
- 230000006020 chronic inflammation Effects 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 230000009137 competitive binding Effects 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 1
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 description 1
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 1
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N diethanolamine Chemical compound OCCNCCO ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 229940066758 endopeptidases Drugs 0.000 description 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000006862 enzymatic digestion Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 210000003386 epithelial cell of thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000032050 esterification Effects 0.000 description 1
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000002825 functional assay Methods 0.000 description 1
- 230000006251 gamma-carboxylation Effects 0.000 description 1
- 238000001641 gel filtration chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 235000019514 herring Nutrition 0.000 description 1
- 210000004754 hybrid cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000033444 hydroxylation Effects 0.000 description 1
- 238000005805 hydroxylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000037189 immune system physiology Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 239000012133 immunoprecipitate Substances 0.000 description 1
- 229960003444 immunosuppressant agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000005732 intercellular adhesion Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000009940 knitting Methods 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000000693 micelle Substances 0.000 description 1
- 238000001000 micrograph Methods 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 238000004161 plant tissue culture Methods 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 238000011176 pooling Methods 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 235000021251 pulses Nutrition 0.000 description 1
- 238000000163 radioactive labelling Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000001568 sexual effect Effects 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000012029 structural testing Methods 0.000 description 1
- 230000019635 sulfation Effects 0.000 description 1
- 238000005670 sulfation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000006277 sulfonation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 201000000596 systemic lupus erythematosus Diseases 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- CNHYKKNIIGEXAY-UHFFFAOYSA-N thiolan-2-imine Chemical compound N=C1CCCS1 CNHYKKNIIGEXAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003573 thiols Chemical group 0.000 description 1
- 206010043778 thyroiditis Diseases 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N tris acetate Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N valinyl-arginine Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003556 vascular endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000003260 vortexing Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70528—CD58
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/02—Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
- A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
- C07K2317/73—Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/02—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/74—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
- C07K2319/75—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S424/00—Drug, bio-affecting and body treating compositions
- Y10S424/809—Drug, bio-affecting and body treating compositions involving immunoglobulin or antibody fragment, e.g. fab', fv, fc, heavy chain or light chain
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/81—Packaged device or kit
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S530/00—Chemistry: natural resins or derivatives; peptides or proteins; lignins or reaction products thereof
- Y10S530/868—Chemistry: natural resins or derivatives; peptides or proteins; lignins or reaction products thereof involving autoimmunity, allergy, immediate hypersensitivity, delayed hypersensitivity, immunosuppression, or immunotolerance
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Rheumatology (AREA)
- Transplantation (AREA)
- Dermatology (AREA)
- Physical Education & Sports Medicine (AREA)
- Pain & Pain Management (AREA)
- Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Description
A találmány tárgyát a limfocita funkcióhoz kapcsolódó antigén 3 („LFA-3”) CD-2-höz kötődő doménjét tartalmazó polipeptidek és az ezeket a polipeptideket kódoló DNS szekvenciák, valamint az ezeket a polipeptideket expresszáló rekombináns DNS molekulák képezik. A találmány szerint egysejtes gazdaszervezetek készíthetők, amelyek a DNS szekvenciákkal és az ezeket a DNS szekvenciákat tartalmazó rekombináns DNS molekulákkal vannak transzformálva, és ezeket a sejteket arra használhatjuk, hogy az LFA-3 CD-2 kötő doménjét tartalmazó fehérjéket és polipeptideket állítsunk elő velük. A jelen találmány szerinti peptidek, polipeptidek és fehérjék jól használhatók a CD2 és LFA-3 közötti kölcsönhatások vizsgálatában, diagnosztikai és terápiás készítményekben, ellenanyag átvizsgálást vagy tisztítási módszerekben, valamint egyéb, a találmány szerinti módszerekben.
A T-limfociták fó szerepet játszanak az immunválaszban, azáltal, hogy kölcsönhatásba lépnek a megcélzott és az antigént bemutató sejtekkel. A célsejtek Tlimfociták által közvetített pusztulása egy többlépéses folyamat, amely magában foglalja citolitikus T-limfocitáknak a célsejtekhez való adhézióját. A legtöbb antigénnel szemben kialakuló immunválasz magában foglalja a segítő (helper) T-limfocitáknak az antigént bemutató sejtekhez való adhézióját.
A T-limfocitáknak ezek, a megcélzott és antigént bemutató sejtekkel való kölcsönhatásai erősen specifikusak, és függenek a megcélzott vagy antigént bemutató sejten található antigénnek a T-limfociták felszínén levő egy vagy több specifikus antigén receptor által való felismerésétől.
A T-limfocilák és egyéb sejtek receptor-antigén kölcsönhatását megkönnyítik a különböző T-limfocita felszíni fehérjék, azaz például a CD3 antigén-receptor komplex, és a CD4, LFA-1, CD8, CD2 járulékos molekulák. A T-limfociták és más sejtek kölcsönhatása is függ a járulékos molekuláktól, mint például az ICAM1, az I-es és Il-es MHC osztály és az LFA-3 molekuláktól, amelyek a megcélzott vagy antigént bemutató sejt felszínén expresszálódnak, és ennek következtében szerepet játszanak a T-limfociták akciójában. Egy általános hipotézis, hogy a T-limfocitákon és a megcélzott vagy antigént bemutató sejteken levő járulékos molekulák kölcsönhatásba lépnek egymással, így közvetítik az intercelluláris adhéziót. Ennek megfelelően ezekről a járulékos molekulákról az a vélemény alakult ki, hogy fokozzák a limfocita/antigént bemutató sejt és a limfocita/megcélzott sejt közötti kölcsönhatások hatékonyságát, és lényegesek a sejttapadás alapú patológiákban (ilyen például a leukocita/endoteliális sejt kölcsönhatás, amely kóros gyulladást eredményez) valamint a limfocita keringésben. A járulékos molekulák is részt vesznek a limfociták aktiválásában.
A járulékos molekulák által közvetített sejt-sejt kölcsönhatások egyik fontos példája a CD2 (egy T-limfocita járulékos molekula) és az LFA-3 (egy célsejt járulékos molekula) közötti specifikus kölcsönhatás. A CD2/LFA-3 kötődés lényegesnek tűnik számos fontos sejt-sejt reakcióban, beleértve a T-limfocita funkcionális válaszok iniciálását [Dustin és mtsai.: J. Exp. Med. 165, 677-92 (1987); Springer és mtsai.: Ann. Rév. Immunoi. 5, 223-52 (1987)]. ACD2/LFA-3 komplexnek a sejt-sejt tapadásban való fontosságát azok a megfigyelések is jelzik, hogy a tisztított LFA-3 kötődik a CD2-höz a T-limfociták felszínén [Dustin és mtsai.: J. Exp. Med. 165, 677-92 (1987)]; a T-limfocitákból tisztított CD2 kötődik az LFA-3-hoz a sejtek felszínén és gátolja az LFA-3-specifikus monoklonális ellenanyagok („MAb-ok”) LFA-3-hoz való kötődését [Selvaraj és mtsai.: Natúré 326, 400-403 (1987)], és az LFA-3at expresszáló humán eritrocitáknak a CD2-t expreszszáló sejtekhez való rozettálását gátolják az anti-LFA3 MAb-ok és az anti-CD2 MAb-ok [lásd például Seed és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 84, 3365-69 (1987)].
Az LFA-3, amely megtalálható számos különböző sejt felszínén, mint például a monociták, granulociták, T-limfociták, eritrociták, B-limfoblasztoid sejtvonalak, timuszos epiteliális sejtek és vaszkuláris endoteliális sejtek felszínén, nagyszámú vizsgálat tárgya volt, amelyeknek az volt a célja, hogy tovább tisztázzák a szerepét a különböző T-limfocita kölcsönhatásokban. Az LFA-3-nak két természetes formáját azonosították. Az LFA-3 egyik formája („transzmembrán LFA-3”) a sejtmembránban van rögzítve egy transzmembrán hidrofób dómén révén. Az LFA-3 ezen formáját kódoló cDNS-t klónozták és szekvenálták [Wallner és mtsai.: J. Exp. Med. 166, 923-32 (1987)]. Az LFA-3 egy másik formája a sejtmembránhoz kötődik a foszfatidilinozitolt („Pl”) tartalmazó glikolipiddel képzett kovalens kötésen keresztül. Ez utóbbi formát „Pl-kapcsolt LFA-3” néven említik, és az LFA-3 ezen formáját kódoló cDNS-t is klónozták és szekvenálták [Wallner és mtsai.: WO 90/02 181 számú PCT bejelentés].
Jóllehet az LFA-3 gén DNS szekvenciáját és az LFA-3 mindkét formájának a primer aminosav szekvenciáját meghatározták, az LFA-3 és a receptora, a CD2 közötti kölcsönhatás aktuális pontját korábban nem határozták meg. Ahhoz, hogy jobban megértsük a CD2 és az LFA-3 közötti specifikus kölcsönhatást, szükség van arra, hogy azonosítsuk az LFA-3-οη a CD2-specifikus domént, és ezek után befolyásoljuk, módosítsuk azokat a celluláris és immunológiai folyamatokat, amelyek a CD2/LFA-3 komplex képződésétől függenek. Ez az információ hasznos lehet számos egyéb alkalmazásban is, beleértve a diagnosztikai és terápiás készítményeket, a fehérjetisztítást, az ellenanyagok azonosítását és tisztítását, valamint az LFA-3 és egyéb fehérjék összehasonlító és szerkezeti vizsgálatát.
A jelen találmány megoldást ad a fenti célkitűzésekre. azáltal, hogy azonosítjuk az LFR-3 CD2-kölö doménjét. és megadjuk azokat a nukleotid szekvenciákat. amelyek meghatározzák az LFA-3 CD2-kötö régióját, és az ezek által a szekvenciák által kódolt CD2 kötő polipeptideket. A jelen találmány tárgyát képezik az alábbi aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidek: X|-X2-(I. számú szekvencia) Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly-Y, aholis:
HU 211 476 A9
Xj jelentése hidrogénatom vagy metionil csoport;
X2 jelentése, ha jelen van, akkor egy olyan polipeptid, amely az alábbi aminosav szekvenciával, vagy annak egy részével rendelkezik, és tartalmazza az 5. számú szekvencia 1-77-es C-terminális aminosavait: Val Alá Gly Ser Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly Val Leu Ser Val Val Cys Leu Leu His Cys Phe Gly Phe Ile Ser Cys Phe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu His Glu Val Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys;
Y jelentése hidroxilcsoport vagy egy alábbi aminosav szekvencia, illetve annak egy része, amely a 33. számú szekvencia N-terminális 1-32-es aminosavait tartalmazza: Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr Ser Ser Asp Glu Asp Glu Tyr Glu Met Glu Ser Pro Asn Ile Thr Asp Thr Met Lys Phe Phe Leu Tyr Val;
valamint ennek analógjai és származékai, azzal jellemezve, hogy az említett polipeptidek képesek a CD2höz kötődni.
Egy másik megvalósítási mód szerint a jelen találmány tárgyát az alábbi aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidek képezik: X]-X2-(l. számú aminosav szekvencia) Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly-Y, aholis:
Xj jelentése hidrogénatom vagy metionil-csoport;
X2 jelentése, ha jelen van, egy olyan polipeptid, amely az alábbi aminosav szekvenciával, vagy annak egy részével rendelkezik, tartalmazza a 2. számú szekvencia 1-50 C-terminális aminosavait: Phe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu Lys Glu Val Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys;
Y jelentése hidroxilcsoport vagy az alábbi aminosav szekvenciával vagy annak egy részével rendelkező polipeptid, amely a 3. számú szekvencia 1-10 Nterminális aminosavát tartalmazza: Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr Ser Ser;
valamint ennek analógjai és származékai, azzal jellemezve, hogy az említett polipeptidek képesek kötődni a CD2-höz.
A találmány tárgyát képezik továbbá a fenti polipeptideket kódoló DNS szekvenciák, az ezeket a DNS szekvenciákat tartalmazó rekombináns molekulák, az ezekkel a DNS szekvenciákkal transzferált gazdaszervezetek, valamint a polipeptidek rekombináns úton, szintetikusan vagy félszintetikusan való előállításához szükséges molekulák és módszerek.
A jelen találmány szerinti polipeptidek jól használhatók azoknak a betegségeknek a diagnosztizálásában, amelyeket a CD2-nek adott sejtek felszínén való megléte vagy hiánya jellemez, és azoknak a kóros állapotoknak a kezelésében, amelyek az LFA-3/CD2 komplex képződésétől függenek.
A jelen találmány szerinti polipeptidek, és az ezeket kódoló DNS szekvenciák szintén használhatók rekombináns vagy szintetikus fúziós fehérjék előállítására, amelyek tartalmaznak egy funkcionális CD2-kötő domént vagy LFA-3 polipeptidet, a fenti meghatározás szerint, és egy másik domént egy LFA-3-tól eltérő fehérjéből vagy polipeptidből. A fúziós fehérjék CD2kötő dómén része lehetővé teszi, hogy az egyéb polipeptideket specifikusan CD2-t expresszáló (CD2+) sejtekhez irányítsuk. Az ezeket a fúziós fehérjéket expresszáló DNS szekvenciák szintén a jelen találmány tárgyát képezik.
Ilyen példák a jelen találmány szerinti fúziós fehérjékre azok az új fúziós fehérjék, amelyek egy funkcionális CD2-kötő domént tartalmazó LFA-3 részt tartalmaznak, az immunglobulin (lg) Fc régiójának legalább egy részéhez fúzionáltatva. A jelen találmány szerinti LFA-3-Ig fúziós fehérjék váratlanul gátolják a T-limfocita aktiválást és a perifériális vér limfociták szaporodását.
A jelen találmány tárgya továbbá, hogy a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék használhatók CD2 molekulák, például oldható CD2 jelölésére, oldatban vagy a T-limfociták vagy egyéb, CD2-t expresszáló sejtek felszínén. A jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék használhatók még bármely egyéb, az LFA-3-at kötő CD2 domént tartalmazó fehérje, polipeptid vagy peptid jelölésére, például egy rekombináns DNS technikával előállított fúziós fehérjében.
A jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék felhasználhatók még affinitáskromatográfiában is, CD2 vagy bármely egyéb polipeptid vagy fehérjekonjugátum tisztítására, amely az LFA-3-at kötő CD2 domént tartalmazza.
A találmány tárgyát képezik továbbá az LFA-3 fehérje azon megváltoztatott (mutáns) formái, amelyekből hiányzik a CD2 kötő dómén, valamint az LFA3 ilyen „deléciós mutáns” formáit kódoló DNS szekvenciák. A mutáns fehérjék, amelyekből a fenti meghatározás szerint hiányzik az LFA-3 CD2-kötő doménje, használhatók in vivő vagy in vitro, hogy ellenanyagokat vagy más molekulákat generáljunk vagy kössünk meg velük, amelyek a CD2-kötő doméntől eltérő epitopokat vagy helyeket ismernek fel az LFA-3 molekulán.
A jelen találmány szerinti CD2-kötő polipeptidek és fúziós fehérjék monomer formái mellett a találmány a multimer formák előállítását is lehetővé teszi. Ezeknek a formáknak lehet fokozott CD2 affinitásuk, fokozott immunogenitásuk és/vagy fokozott képességük a T-limfocita funkcionális válaszok iniciálására, azaz például a T-sejt aktiválás serkentésére a CD2/LFA-3 komplexek hatékonyabb vagy multiplikált formáin keresztül. Az ilyen multimer formák emellett hatékonyabbak lehetnek a CD2 kompetitív megkötésében, ezzel immunszuppresszánsként sokkal hasznosabbá téve őket, diagnosztikumként vagy reagensként pedig érzékenyebbé téve őket.
Emellett a jelen találmány azokra az ellenanyagokra is vonatkozik, amelyek felismerik a jelen találmány szerinti polipeptideket és fúziós fehérjéket. A jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék elleni poliklonális és monoklonális ellenanyagokat úgy állíthatjuk elő, hogy egy állatot a jelen találmány szerinti polipeptidekkel vagy fúziós fehérjékkel immunizálunk.
HU 211 476 A9
A jelen találmány tárgyát képezik továbbá a CD2/LFA-3 komplex képződését gátló alacsony molekulasúlyt! (általában 1000 daltonnái kisebb molekulasúlyú) inhibitorok. Az ilyen „kis molekulájú” inhibitorokat in vitro, szintetikus módszerekkel állíthatjuk elő, és a jelen találmány szerinti polipeptidek aminosav szekvenciájának részét tartalmazhatják, illetve lehetnek teljesen nem-peptid jellegű szerves molekulák, amelyeknek a konformációja képes utánozni a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék CD2kötő kötő specifitását.
A jelen találmány tárgyát képezik továbbá a diagnosztikai és terápiás felhasználások módszerei, készítményei és kitjei, amelyekben az LFA-3 CD2-kötő doménjének jelenléte vagy hiánya szükséges.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a mellékelt ábrákat. Az
1. ábrán (az 1A. és 1B. ábra együtt) a transzmembrán
LFA-3 aminosav szekvenciája (1. számú szekvencia) és nukleotid szekvenciája (9. számú szekvencia) látható, aláhúzással jelezve az LFA-3 extracelluláris régiójában tett deléciókat. Az M53, M54, M55, M56, M57, M58, M59, M60, M61, M62, M63, M64, M65, M66, M90, M91 és M92 jelű régiókat kihurkoltuk, hogy olyan rekombináns géneket hozzunk létre, amelyek 17 különböző deléciós mutánst kódolnak. A deléciós mutánsok emlős sejtekben való expressziójával megváltozott LFA-3 felszíni fehérjék kaphatók, amelyekből hiányzik egy, a természetes LFA-3 fehérjében megtalálható aminosav szegment. Például az M57 jelű mutáns (azaz az 1. ábrán található LFA-3 DNS, amelyből az M57 régió ki van vágva) expressziója CHO sejtekben egy olyan LFA-3 mutánst eredményez, amely nem köti meg a CD2-t. Az N-terminális metionint (Met) -28-asnak jelezzük, jelezve ezzel, hogy ez a pre LFA-3 28 aminosavból álló szignálpeptid N-terminális csoportja. Az érett LFA-3 N-terminális aminosava egy fenilalanin (Phe), ennek sorszáma +1. A
2. ábrán (a 2A„ 2B„ 2C„ 2D„ 2E„ 2F„ 2G„ 2H„ 21.,
2J., 2K., 2L., 2M és 2N ábrák együtt) az M57-es deléciós mutáns (2A. és 2B. ábra), az M65-ös deléciós mutáns (2C. és 2D. ábra), az M63-as deléciós mutáns (2E. és 2F. ábra), az M54-es deléciós mutáns (2G és 2H. ábra), az M55-ös deléciós mutáns (21. és 2J. ábra), az M56-os deléciós mutáns (2K. és 2L. ábra) és az M58-as deléciós mutáns (2M. és 2N. ábra) által kódolt mutáns LFA3 fcrmákat expresszáló transzfektált CHO sejtek FACS-szal végzett immunfluoreszcenciás áramlási citometriai vizsgálatának eredményei láthatók. A transzfektált sejteket reagáltatjuk 202-es anti-LFA-3 poliklonális antiszérummal (szaggatott vonal, 2A., 2C., 2E„ 2G„ 21.. 2K„ 2M. ábrák), anti-LFA-3
Mab TS2/9-cel (szaggatott vonalak, 2B„ 2D„ 2F„ 2H„ 2J„ 2L„ 2N. ábrák) vagy antiLFA-3 M Ab 7A6-tal (pontozott vonalak, 2B„ 2D„ 2F„ 2H„ 2J„ 2L. és 2N. ábrák). Az egyes elemzésekben a kontroll csúcs (folyamatos vonal) jelenti azt a sejtpopulációt, amelynél a fluoreszcein-izotiocianáttal konjugált (FITC) kecske anti-egér vagy kecske anti-nyúl IgG kötés háttérszintet mutat. A
3. ábrán (a 3A„ 3B. és 3C. ábrák együtt) a Jurkat sejt kötési kísérlet eredményeit láthatjuk. A mikrofotográfiák olyan Jurkat sejteket mutatnak, amelyek CD2-t expresszálnak, normál CHO sejtekkel keverve (negatív kontroll) (3A. ábra), M57/CHO sejteket (3B. ábra) és P24/CHO sejteket, amelyek a Plhez kötött LFA-3-at expresszálják (pozitív kontroll) (3C. ábra). A
4. ábrán az M57/CHO sejtekben szintetizált LFA-3 gén átiratok Northern biot elemzése látható. A CHO negatív kontroll sejtekből (1. csík), az M57/CHO sejtekből (2. csík), és az M16.3/CHO pozitív kontroll sejtekből (3. csík) származó mRNS mintákat tartalmazó szűrőlapokat a pLFA3M54 plazmid NotI restrikciós fragmensével mint próbával vizsgáljuk át, amely tartalmazza az LFA-3 cDNS szekvencia (lásd 1. ábra) 1-153-as és 184— 1040-es nukleotidjait, nick-transzJációban 32P-vel jelezve. Az
5. ábrán egy autoradiogram látható, amely a 125I-vel felszínen jelzett M57/VHO sejtek (1-4 csíkok), normál CHO sejtek (negatív kontroll) (5-7 csíkok) és a P24/CHO sejtek (pozitív kontroll) (8-11 csíkok) differenciális immunprecipitációját mutatja. A felszínen jelzett sejtek lizátumait anti-LFA-3 MAb TS2/9-cel (2, 5,9 csík), anti-LFA-3 MAb 7A6-tal (3, 6, 10 csíkok) vagy 202-es anti-LFA-3 poliklonális antiszérummal (4, 7, 11 csíkok) reagáltatjuk. Az ellenanyaggal kicsapott fehérjéket elektroforézisnek vetjük alá SDS-poliakrilamid géleken, mielőtt autoradiográfiának vetjük alá. A
6. ábrán (a 6A. és 6B. ábrák együtt) a transzmembrán
LFA-3 aminosav szekvenciája (10. számú szekvencia) és nukleotid szekvenciája (9. számú szekvencia) látható, aláhúzással jelezve az LFA-3 extracelluláris régiójában levő deléciókat. Az Ml 00, Ml 01 és Ml02 régiókat kihurkol luk, hogy 3 különböző deléciós mutánst kódoló rekombináns géneket kapjunk. A
7. ábrán (7A., 7B„ 7C. és 7D. ábrák együtt) a Jurkat sejt kötő kísérletek eredményeit láthatjuk, amelyekben a CD2-t expresszáló Jurkat sejteket (a) normál CHO sejtekkel, (b) M100/CHO sejtekkel, (c) M101/CHO sejtekkel vagy (d) M102/CHO sejtekkel kevertük össze.A
8. ábrán (8A., 8B. és 8C. ábrák együtt) a Jurkat sejteknek az LF08/Affigel-10 gyöngyökhöz
HU 211 476 A9 való kötődése látható (lásd 8. példa). Az LF08/Affigel-10 gyöngyöket összekeverjük a Jurkat sejtekkel, majd a sejtek és a gyöngyök kötődését mikroszkóp alatt megfigyeljük (8A. és 8B. ábra). Összehasonlításképpen (negatív kontroll) egy hepatitisz B-ből származó nem-LFA-3 peptidet (azaz az „MXC 01,,-et (4. számú szekvencia: Thr Lys Pro Asp Leu Val Asp Lys Gly Thr Glu Asp Lys Val Val Asp Val Val Arg Asn) Affigel-10 gyöngyökhöz kötjük, a gyöngyöket Jurkat sejtekkel keverjük össze, majd a sejteknek a gyöngyökhöz való kötődését a 8C. ábrán mutatjuk be. A
9. ábrán a ΡΙ-hez kötött LFA-3 aminosav szekvenciája (12. számú szekvencia) és nukleotid szekvenciája (11. számú szekvencia) látható, aláhúzással jelezve a nukleotid szekvenciákban és a megfelelő ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3 fehérjében végrehajtott belső deléciót. A PIM3-mal jelzett DNS régiót kihurkoltuk, így egy olyan rekombináns gént kaptunk, amely egy olyan mutáns fehérjét kódol, amely tartalmazza a ΡΙ-hez kapcsolódó LFA-3 89 N-terminális aminosavát, de hiányzik belőle az ezt követő 71 aminosav. A PIM3 deléciós mutáns (azaz a 9. ábrának megfelelő ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3 DNS, amelyből a PIM3 régiót kihasítottuk) expressziója CHO sejtekben a ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3-nak egy olyan mutáns formáját eredményezi, amely megtartja a CD-2 kötő doménjét. A
10. ábrán (a 10A. és 10B. ábrák együtt) a PIM3 deléciós mutáns által kódolt, a ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3 mutáns formáját expresszáló, transzferált CHO sejtek FACS elemzéssel végzett immunfluoreszcenciás áramlási citometriás vizsgálatának eredményei láthatók. A transzfektált sejtek (PIM3.25.2 sejtek) egy olyan felszíni fehérjét expresszálnak, amelyiket felismeri a TS2/9 anti-LFA-3 MAb (10A. ábra, szaggatott vonal), és érzékeny a sejt felszínéről PI-PLC kezeléssel való felszabadításra (10A. ábra, pontozott vonal). A 10B. ábrán egy hasonló elemzés eredményei láthatók, amelyben a mutáns ΡΙ-hez kapcsolt fehéije expresszálására amplifikált, transzfektált CHO sejteket (PIM2.25.2.100.12 sejtek) használtunk. Ezek a sejtek egy olyan fehérjét termelnek a felszínükön, amelyet a MAb 7A6 felismer (10B., szaggatott vonal), és amelyek a sejt felszínéről való felszabadulásra érzékenyek a PI-PLC kezelés hatására (10B. pontozott vonal). Mindegyik elemzésben a kontroll (folyamatos vonal) egy olyan sejtpopulációt jelent, amely a FITC-vel konjugált kecske anti-egér IgG kötődés háttérszintjével rendelkezik. A
11. ábrán az LFA3TIP egy dimerjének a diagramját látjuk, amely az LFA-3-Ig fúziós fehérje különböző doménjeit ábrázolja. Amint ezen az ábrán látható, az „LFA-3” az érett LFA-3 92 N-terminális aminosavára vonatkozik. „H” jelentése az IgGl csuklórégió tíz aminosavára vonatkozik, amely két ciszteint tartalmaz, és ezzel két intermolekuláris hidat hoz létre. Mindegyik diszulfid hidat egy horizontális kettős SS jelzi. „Ch2” és „Ch3” a humán IgGl molekulában az Fc régióban levő két konstans domént jelzi a csuklórégió alatt. A
12. ábrán a preLFA3TIP aminosav szekvenciáját (43.
számú szekvencia) és nukleotid szekvenciáját (42. számú szekvencia) mutatja (azaz az LFA-3 szekvenciát (+1 - +92 aminosavak) és a 28 aminosavból álló szignálszekvenciát. A 12. ábrán látható nukleotid szekvencia is ugyanaz mint a pSAB 152 expressziós plazmidban található DNS szekvencia. A
13. ábrán látható fénykép nem-redukáló körülmények között (1-es és 2-es csíkok) és redukáló körülmények között (3-as és 4-es csíkok) között készített SDS-PAGE gélek Western biot elemzésének a képe. Az 1-es és 3-as csíkokban nagy molekulasúlyú markerek találhatók (BRL, Gaithersburg, Maryland). A 2-es és 4-es csíkok LFA3TIP-et tartalmaznak, amelyet a 13. példában leírtak alapján tisztítottunk. A
14. ábrán (a 14A. és 14B. ábrák együtt) FACS elemzéssel végzett immunfluoreszcenciás vizsgálat eredményei láthatók. A vizsgált rendszerek: Jurkat sejtek LFA3TIP plusz R-fikoeritrinnel konjugált anti-humán IgG F(ab’)2 (pontozott vonal) anti CD2 MAb TS2/18 plusz FITC-vel konjugált kecske antiegér IgG (H+L) F(ab’)2 jelenlétében (kis pontok a 14A. ábrán) vagy FITC-vel konjugált kecske anti-egér IgG (H+L) F(ab’)2, plusz vagy TI 11 anti-CD2 aszcitesz folyadék jelenlétében (szaggatott vonal a 14A. ábrán), vagy TI 12 jelenlétében (szaggatott vonal a 14B. ábrán), vagy TII3 jelenlétében (kis pontok a 14B. ábrán). A
15. ábrán humán T-sejt aktiválás vizsgálatára végzett allogén kevert limfocita reakció eredményei láthatók, amit 3H-timidinnek T-sejtekbe való beépülésével mérünk anti-LFA-3 MAb 1E6 (tele négyszögek), LFA3TIP (tele körök) és nemspecifikus humán IgGl (tele háromszögek) jelenlétében. A
16. ábrán T-sejt aktiválás gátlásának vizsgálatára kiválasztott fehérjékkel végzett MLR vizsgálatok eredményei láthatók. A „7A6” és „1E6” jelentése anti-LFA-3 monoklonális ellenanyag (MAb), amelyek az LFA-3 CD-2 kötő doménjére specifikusak. Az „LFA3IgGA” és az „LFA3IgG72A” jelentése LFA3TIP készítmény, amelyek csak a tisztaságuk fokában térnek el egymástól (azaz 75 illetve
HU 211 476 A9 százalékosak). AhlgG nemspecifikus humán IgG. A „PILFA3” jelentése multimer ΡΙ-hez kötött LFA-3. A „CD4-IgG” jelentése egy fúziós fehéije, amely a CD4 fehérjének egy részét tartalmazza, az IgG Fc régiójának egy részéhez fuzionáltatva. A „hamis” jelentése „hamis készítmény”, amelyet pSAB132 expressziós vektorral (ebből hiányzik az LFA3TIP-t kódoló DNS szekvencia) transzfektált COS7 sejtekből tisztítottunk. A
17. ábrán egy PBL proliferációs vizsgálat eredményei láthatók, amit 3H-timidin beépülésével mérünk. A PBL proliferációs vizsgálatot LFA3TIP (tele négyszögek), humán IgG (tele körök) és egy „hamis készítmény” jelenlétében végezzük. A „hamis készítmény” tartalmazza azt a szennyeződést („szennyeződés”), amely együtt tisztul az ebben a vizsgálatban használt LFA3TIP-vel (tele háromszögek). A
18. ábrán egy 0KT3 (anti-CD3 Mab) dependens PBL proliferációs vizsgálat eredményei láthatók, 3H-timidin beépülésével mérve. A PBL proliferációt 3 nmol/1 OKT3 (OKT3), 3 nmol/1 OKT3 plusz 1 nmol/1 vagy 10 nmol/1 LFA3TIP (OKT3+LFA3TIP), 3 nmol/1 OKT3 plusz 1 nmol/1 vagy 10 nmol/1 humán IgGl (OKT3+hIgGl), vagy tápközeg OKT3 nélkül (tápközeg) jelenlétében mérjük. A
19. ábrán láthatjuk egy fitohemagglutinin (PHA) dependens PBL proliferációs vizsgálat eredményeit, szuboptimális serkentő koncentrációjú (0,1 pg/ml) vagy optimális serkentő koncentrációjú (1 pg/ml) PHA jelenlétében. A PBL proliferációt úgy mérjük, mint azt akkor jeleztük, amikor csak PHA van jelen (PHA) valamint PHA plusz a következő anyagok vannak jelen: ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3 (+PILFA-3); monomer oldható LFA-3 (+mon LFA-3); LFA3TIP (+LFA3TIP); egy LFA-3-IgG fúziós fehérje, amelyről hiányzik a CD2 megkötésében részt vevő LFA-3 M57 régiójának 10 aminosava hiányzik (+M57IgG); anti-LFA-3 1E6 MAb (+1E6); anti CD2 TS2/18 MAb (+TS2/18); és egy teljes hosszúságú LFA3—lg fúziós fehérje (+FLIgG). Mindegyik hozzáadott molekula 5 pg/ml koncentrációban van jelen.
Az alábbiakban részletesen ismertetjük a találmányt.
A jelen találmány szerinti polipeptideket, készítményeket és módszereket az X]-X2-(l. számú aminosav szekvencia) Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly-Y, aholis:
X, jelentése hidrogénatom vagy metionil csoport;
X2 jelentése, ha jelen van, akkor egy olyan polipeptid, amely az alábbi aminosav szekvenciával, vagy annak egy részével rendelkezik, és tartalmazza az 5.
számú szekvencia 1-77-es C terminális aminosavait: Val Alá Gly Ser Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly Val Leu Ser Val Val Cys Leu Leu His Cys Phe Gly Phe Ile Ser Cys Phe Ser Gin Gin He Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu His Glu Val Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys;
Y jelentése hidroxilcsoport vagy egy alábbi aminosav szekvencia, illetve annak egy része, amely a 33. számú szekvencia N-terminális 1-32-es aminosavait tartalmazza: Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr Ser Ser Asp Glu Asp Glu Tyr Glu Met Glu Ser Pro Asn Ile Thr Asp Thr Met Lys Phe Phe Leu Tyr Val;
valamint ennek analógjai és származékai jellemzik, azzal jellemezve, hogy az említett polipeptidek képesek a CD2-höz kötődni.
Egy másik megvalósítási mód szerint a jelen találmány tárgyát az alábbi aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidek képezik: XrX2-(l. számú aminosav szekvencia) Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly-Y, aholis:
Xi jelentése hidrogénatom vagy metionil-csoport;
X2 jelentése, ha jelen van, egy olyan polipeptid, amely az alábbi aminosav szekvenciával, vagy annak egy részével rendelkezik, tartalmazza a 2. számú szekvencia 1-50 C-terminális aminosavait: Phe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu Lys Glu Val Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys;
Y jelentése hidroxilcsoport vagy az alábbi aminosav szekvenciával vagy annak egy részével rendelkező polipeptid, amely a 3. számú szekvencia 1-10 Nterminális aminosavát tartalmazza: Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr Ser Ser;
valamint ennek analógjai és származékai, azzal jellemezve, hogy az említett polipeptidek képesek kötődni a CD2-höz.
A jelen találmány szerinti polipeptidek tartalmazzák a 10. aminosav szekvencia 29-120-as aminosavait, a 10. aminosav szekvencia 29-108-as aminosavait, a
10. aminosav szekvencia 48-108-as aminosavait és a 7. aminosav szekvenciát.
A leírásban és az igénypontokban az aminosavak és maradékaik jelölésére használt rövidítéseket a nevezéktan általánosan elfogadott szabályai szerint használjuk, amelyek az L-sorozatba tartozó a-aminosavakhoz és maradékaikhoz kötődnek.
Egy származékok aminosav egy természetes vagy nemtermészetes aminosav, amelyben a normális körülmények között előforduló oldalláncot vagy végcsoportot kémiai reakcióval módosítjuk. Ilyen módosítás például a gamma-karboxilezés, a hidroxilezés, szulfatálás, szulfonálás, foszforilezés, amidálás, észterezés, t-butoxi karbonilezés, N-acetilezés, karbobenzoxilezés, toxilezés, benzilezés és egyéb, a szakterületen ismert módosítás.
A derivatizált polipeptid egy olyan polipeptid, amely egy vagy több derivatizált aminosavat tartalmaz.
HU 211 476 A9
A jelen találmány szerinti polipeptidek analógjait például aminosav szubsztitúcióval, addícióval vagy delécióval lehet jellemezni, illetve D-aminosavak alkalmazásával. A jelen találmány szerinti polipeptidek szubsztitúciói közül azok előnyösek, amelyek a szakirodalomban konzervatívnak elismert aminosav helyettesítések. Például az alábbi csoportok egyikébe tartozó aminosavak konzervatív cserét jelentenek: ala, pro, gly, glu, asp, gin, asn, ser, thr; cys, ser, tyr, thr; val, ile, leu, met, ala, phe; lys, arg, his; és phe, tyr, trp, his. [Grantham, Science 185, 862-64 (1974); Dayhoff in Atlas of Protein Sequence and Structure 5, (1978); Argos, EMBOJ. 8, 779-785(1989)].
Az nyilvánvaló, hogy a jelen találmány szerinti összes analógot és származékot olyan biológiai aktivitások jellemzik, amelyek hasonlóak az itt ismertetett CD2-kötő polipeptidekhez. Ennek megfelelően ezeket az analógokat és származékokat használhatjuk készítményekben, kombinációkban és diagnosztikai módszerekben. terápiában és megelőzésben, ugyanúgy, mint a jelen találmány szerinti polipeptideket.
A jelen találmány szerinti polipeptideket számos különböző, a szakterületen ismert módszerrel előállíthatjuk. Például a polipeptidek származhatnak proteolízissel az intakt transzmembrán vagy PI-kapcsolt LFA3 molekulákból, specifikus endopeptidázokat alkalmazva exopeptidázokkal vagy Edman degradációval. vagy mindkettővel kombinálva. Ezzel szemben az intakt LFA-3 molekulákat tisztíthatjuk természetes forrásokból. szokványos módszerek alkalmazásával. Egy másik módszer szerint teljes hosszúságú vagy csonkított LFA-3-at ismert rekombináns DNS technikákkal állíthatunk elő, cDNS-eket alkalmazva [Wallner és mtsai., 4 956 281 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi leírás].
A jelen találmány szerinti polipeptideket előnyösen közvetlenül állítjuk elő, ezzel elkerüljük azt, hogy kiindulási anyagként nagyobb LFA-3-ra legyen szükség. Ezt megtehetjük szokványos kémiai peptidszintézis technikákkal vagy jól ismert rekombináns DNS technikákkal, mikoris csak a kívánt polipeptideket kódoló DNS szekvenciákat expresszáljuk egy transzformált gazdaszervezetben.
A gént, amely a jelen találmány szerinti kívánt LFA-3 polipeptidet kódolja, a kívánt polipeptid aminosav szekvenciája alapján tervezhetjük meg. Ezután standard módszerek alkalmazhatók a gén szintetizálására. Például az aminosav szekvenciát használhatjuk egy gén készítésére. Egy DNS oligomert, amelynek nukleotid szekvenciája egy jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidet kódol, egyetlen lépésben megszintetizálhatunk. Egy másik módszer szerint számos kisebb oligonukleotidot szintetizálhatunk, amelyek a kívánt polipeptid részeit kódolják, majd összeligálhatjuk őket. Előnyösen egy, a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidet kódoló DNS szekvenciát számos különböző oligonukleotid formájában szintetizálunk meg, amelyeket később egymáshoz ligálunk. Az egyes oligonukleotidok általában 5’ vagy 3’ túlnyúló végeket tartalmaznak a komplementer összeállításhoz.
Ha egyszer összeállítottuk őket, akkor az előnyös géneket olyan szekvenciák jellemzik, amelyeket felismernek a restrikciós endonukleázok (beleértve az olyan egyedi restrikciós hasítási helyeket, amelyeket klónozáshoz, vagy egy expressziós vektorhoz lehet használni), a használandó gazdaszervezet expressziós rendszere által előnyben részesített kodonokat tartalmaz, és egy olyan szekvenciát, amely, ha átíródik, akkor stabil, hatékonyan átíródó RNS-t eredményez. Az összeállítás helyességét nukleotid szekvenálással, restrikciós térképezéssel és a biológiailag aktív polipeptidnek egy megfelelő gazdaszervezetben való expresszálásával lehet ellenőrizni.
Egy, a találmány szerinti DNS szekvencia nukleinsav szekvenciája az érett LFA-3 1-70-es aminosavait kódolja, azaz az 1. ábra szerinti 94-303-as nukleotidokat. Egy másik előnyös megvalósítási mód szerint a DNS szekvencia a 6. számú nukleinsav szekvenciát tartalmazza: AATAGGGTTT ΑΓΓΓΑGAC TGTGTCAGGT, amely az érett LFA-3 51-60as aminosavait kódolja. A jelen találmány szerinti előnyös DNS szekvenciák azonban olyan polipeptideket is kódolnak, amelyeknek aminosav szekvenciája a 10. számú szekvencia 29-120-as, 29-108-as és 48-108-as aminosav szekvenciáit tartalmazza, valamint a 7. számú szekvenciát. A jelen találmány szerinti legelőnyösebb DNS szekvencia egy olyan polipeptidet kódol, amelynek aminosav szekvenciája a 10. számú szekvencia 1-120-as aminosavait tartalmazza. Ez a szekvencia, ha állati sejtekben alkalmazzuk, akkor lehetővé teszi egy olyan polipeptid termelését, szekretálását és érését, amelynek aminosav szekvenciája a 10. számú szekvencia 29-120-as aminosavaiból áll.
A szakterületen jártas szakember számára nyilvánvaló, hogy a genetikai kód degeneráltsága miatt számos egyéb nukleotid szekvenciát tartalmazó DNS molekula is képes a jelen találmány szerinti polipeptidek kódolására. A jelen találmány ezekre a degenerált szekvenciákra is vonatkozik.
A jelen találmány tárgyát képezik továbbá az olyan rekombináns DNS molekulák, amelyek az előzőkben említett DNS szekvenciákat tartalmazzák. A jelen találmány szerinti rekombináns DNS molekulák képesek a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptid expresszálásának irányítására az általuk transzformált gazdaszervezetekben. Egy DNS szekvenciát, amely a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidet kódolja, az expresszáláshoz működés szempontjából össze kell kapcsolni egy expressziós kontroll szekvenciával. A „működés szempontjából összekapcsolt” szakkifejezés a továbbiakban azt jelenti, hogy a szekvenciát úgy helyezzük el egy vektorban, hogy a kódoló szekvencia transzkripcióját és transzlációját a kontroll szekvencia irányítsa.
Egy olyan rekombináns DNS molekula készítéséhez, amely képes a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidek expresszálását irányítani, az ezeket a polipeptideket kódoló DNS szekvenciákat számos különböző vektorba beépíthetjük és azokban expresszálhatjuk. Emellett, min7
HU 211 476 A9 den egyes specifikus expressziós vektorban különböző helyeket választhatunk ki ezeknek a DNS szekvenciáknak a beépítésére. Ezeket a pontokat általában azoknak a restrikciós endonukleázoknak a nevével jelöljük, amelyek hasítják őket. A szakterületen jártas szakember számára ezek jól ismertek. Az azonban nyilvánvaló, hogy egy, a jelen találmányban jól használható expressziós vektornak nem kell tartalmaznia a kiválasztott DNS fragmens beépítéséhez szükséges endonukleáz hasítási helyet. Ehelyett a vektort más módszerekkel lehet a fragmenshez kapcsolni.
Az expressziós vektor, és főleg a kiválasztott DNS fragmens beépítéséhez valamint egy expressziós kontroll szekvenciához való kapcsoláshoz kiválasztott hasítási helyet számos különböző faktor határozza meg. Ezek közé a faktorok közé tartozik például az egy adott restrikciós enzimre érzékeny hasítási helyek száma, az expresszálandó polipeptid mérete, a kívánt polipeptid érzékenysége gazdasejt enzimei által való proteoltiikus lebontásra, az expresszálandó polipeptid szennyeződése vagy kötődése a tisztítás során nehezen eltávolítható gazdasejt fehérjékhez, az expresszió jellemzői, azaz például a startés stopkodonok elhelyezkedése a vektor szekvenciákhoz viszonyítva, valamint egyéb, a szakterületen jártas szakember számára nyilvánvaló faktorok. Egy DNS szekvenciához egy vektor és egy inszerciós hely megválasztását ezeknek a faktoroknak az egyensúlya határozza meg, és egy adott esetben nem mindegyik választási lehetőség lesz egyformán hatékony.
Az eukarióta gazdaszervezetekben jól használható expressziós vektorok közé tartoznak például azok a vektorok, amelyek az SV40, a szarvasmarha papillóma vírus, az adenovírus vagy a citomegalovírus expressziós kontroll szekvenciáját tartalmazzák, valamint azok a vektorok, amelyek főleg rovarsejtekben használhatók. Ilyen például a pVL941 vektor. A hasznos bakteriális expressziós vektorok közé tartoznak az ismert bakteriális plazmidok, mint például az Escherichia coli plazmidok, beleértve a colEl, pCRl, pBR322, pMB9 plazmidokat és származékaikat; a szélesebb gazdaspecifitású plazmidok, mint például az RP4, a lambda fág számos származéka, például az NM 989 és a lambda gt sorozat; egyéb DNS fágok, például az Ml3, valamint más fonalas egyszálú DNS fágok; a kereskedelmi forgalomban levő erős expressziós vektorok, például a pGEM sorozat és a lambda Zap vektorok. A használható emlőssejt expressziós vektorok közé tartozik például a pNUT. Az élesztőkben használható vektorok például a 2 μ-os plazmid és származékai.
Ezeket az expressziós vektorokat az is jellemzi, hogy legalább egy olyan expressziós kontroll szekvenciával rendelkeznek, amely működés szempontjából kapcsolódhat a vektorba beépített találmány szerinti szekvenciához, azzal a céllal, hogy a klónozott DNS szekvencia expresszióját kontrolláljuk és szabályozzuk. A hasznos expressziós kontroll szekvenciákra példakánt megemlíthetjük a malE rendszert, az OmpA rendszert, a lac rendszert, a trp rendszert, a tac rendszert, a trc rendszert, a lambda fág fő operátor és promoter régióit, az fd burokfehérje kontroll régióját, az élesztő glikolitikus promotereit, azaz például az élesztő savas foszfatázt (Pho5), az élesztő szexuális faktorok promotereit, és a poliómából, adenovírusból, retrovírusból és majomvírusból származó promotereket, azaz például az SV40 korai és késői promotereit, az eukarióta sejtek promotereit, mint például a metallotionein promotert és más szekvenciákat, amelyekről ismert, hogy ellenőrzik a prokarióta és eukarióta gének valamint vírusaik expresszióját. Az említett promoterek kombinációja is hasznos lehet.
A jelen találmány szerinti rekombináns DNS molekulák tartalmazhatnak más DNS szekvenciákat is, fúzionáltatva és leolvasási fázisban illesztve a jelen találmány szerinti DNS szekvenciákhoz. Az ilyen konstrukciókat például egy ATG startkodon jellemzi, amely közvetlenül az LFA-3 polipeptid első aminosavát kódoló nukleotidhoz van fuzionáltatva. Ezzel a konstrukcióval egy f-Met polipeptidet lehet előállítani. Az azonban nyilvánvaló, hogy az első metionin egy transzformált gazdaszervezetben lehasadhat az expresszió során, vagy később eltávolítható. Egy másik módszer szerint egy bakteriális vagy eukarióta szignálszekvenciát kódoló DNS szekvenciát fuzionáltathatunk egy, a jelen találmány szerinti KFA-3 polipeptidet kódoló DNS szekvenciához. Ez lehetővé teszi, hogy az expresszált termék vagy szekretálódjon, vagy egy specifikus szubcelluláris kompartmentbe irányuljon a gazdasejten belül. A legtöbb szignálszekvenciát a gazdasejt eltávolítja a célzási funkció végrehajtása után, ezáltal feleslegessé válik az eltávolítása a kívánt polipeptid tisztítása után. Számos szignálszekvencia, valamint az ezeket kódoló DNS szekvencia ismert a szakirodalomban. Az ilyen szignálszekvencia DNS-nek a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidet kódoló szekvenciával leolvasási fázisban való fúzióját standard molekuláris biológiai technikákkal érhetjük el.
Egy másik módszer szerint egy, a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidet kódoló DNS szekvenciát fúziós fehérjeként expresszálhatunk, egy gazdasejt polipeptidet kódoló második DNS szekvenciával leolvasási fázisban ligáivá. Egy fúziós fehérje expressziója számos előnnyel jár, azaz például a gazdasejt által való lebontással szembeni fokozott ellenállás, a gazdasejt polipeptid aktivitásán vagy antigén tulajdonságán alapuló azonosítás egyszerűsége, valamint a gazdasejt polipeptid fizikai vagy immunológiai tulajdonságán alapuló tisztítás egyszerűsége.
A találmány tárgyát képezik továbbá a fentiekben ismertetett rekombináns DNS molekulákkal transzformáit gazdaszervezetek. A hasznos gazdaszervezetek, amelyek ezekkel a rekombináns DNS molekulákkal transzformálhatok, és amelyeket a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptidek expresszálására használhatunk, lehetnek jól ismert eukarióta és prokarióta gazdaszervezetek, úgymint az Escherichia coli különböző törzsei, azaz például az Escherichia coli SG-936, az Escherichia coli HB101, az Escherichia coli W3110, az Escherichia coli XI776, az Escherichia coli X2282, az Escherichia coli DH1, az Escherichia coli DH-5alfa, az Escherichia coli MRC1; Pseudomonas törzsek, Ba8
HU 211 476 A9 cillus törzsek, például a Bacillus subtilis, Streptomyces törzsek, Saccharomyces törzsek, állati sejtek, azaz például a COS sejtek, CHO sejtek, BHK sejtek, humán szöveti sejtek; rovarsejtek [például a Spodoptera frugiperda (SF9)], valamint növényi szövettenyészetek sejtjei. Az igénypontokban szereplő polipeptidek előnyős gazdasejtjei a CHO sejtek.
Az nyilvánvaló, hogy nem mindegyik gazdasejt/expressziós vektor kombináció működik egyforma hatékonysággal a jelen találmány szerinti LFA-3 polipeptideket kódoló DNS szekvenciák expresszálásában. Azonban egy gazdasejt-expressziős vektor kombinációt a szakterületen jártas szakember az itt ismertetett elvek megfelelő megfontolása után megválaszthat, anélkül, hogy eltérne a jelen találmány oltalmi körétől. A választás például alapulhat számos faktor kiegyensúlyozásán. Ezek közé a faktorok közé tartozik például a gazdasejt és a vektor kompatibilitása, a DNS szekvencia által kódolt polipeptideknek a gazdaszervezetre gyakorolt toxicitása, a vektor kópiaszáma és az a képessége, hogy ezt a kópiaszámot szabályozni tudja, a vektor által kódolt egyéb fehérjék, úgymint az antibiotikum markerek expressziója, a kívánt polipeptid kinyerésének egyszerűsége, a DNS szekvenciák és a működés szempontjából hozzájuk kapcsolt expressziós kontroll szekvenciák expressziós jellemzői, a biológiai biztonság, a költségek, a térbeli szerkezet kialakítása, valamint bármely egyéb, a kívánt polipeptid expresszió után szükséges módosítása.
Jóllehet a rekombináns DNS technikák az előnyös módszerek a 20 aminosavnál többet tartalmazó találmány szerinti polipeptid előállítására, a jelen találmány szerinti rövidebb polipeptideket, amelyek 20 aminosavnál kevesebbet tartalmaznak, előnyösen szokványos szintetikus kémiai módszerekkel lehet előállítani. A jelen találmány szerinti szintetikus úton előállított polipeptidek előnyösen kiemelkedően magas kitermeléssel állíthatók elő és könnyen tisztíthatók.
A jelen találmány egy előnyös megvalósítási módja szerint a polipeptideket oldatban vagy szilárd fázison szintetizáljuk, majd adott esetben karboxipeptidázokkal emésztjük (a C-terminális aminosavak eltávolítása céljából) vagy manuális Edman degradációval bontjuk le (az N-terminális aminosavak eltávolítása céljából). A polipeptidek megfelelő térszerkezetének kialakulását oxidatív körülmények között érhetjük el, ami előnyben részesíti a diszulfid hidak kialakulását [S. B. H. Kent: „Chemical synthesis of polypeptides and proteins”, Ann. Rév. Biochem. 57, 957-89 (1988)]. Az így előállított polipeptideket a szakterületen széles körben ismert szeparációs technikákkal tisztíthatjuk, előnyösen fordított fázisú HPLC technikákat alkalmazhatunk. Az oldatban végzett szintézis alkalmazása előnyösen lehetővé teszi bizonyos derivatizált aminosavak hozzáadását a növekvő polipeptid lánchoz, azaz például a tirozin O-szulfát észterének hozzáadását. Ez szükségtelenné tesz egy következő derivatizálási lépést, a jelen találmány szerinti polipeptidek bármely csoportjának módosítására. A jelen találmány szerinti polipeptidek biológiai aktivitását, azaz például azt a képességüket, hogy blokkolni tudják az LFA-3/CD2 kölcsönhatást, egyszerű sejt kötődési vizsgálattal lehet mérni, amely lehetővé teszi az LFA-3 polipeptidet expresszáló sejtek CD2-expresszáló sejtekhez való kapcsolódásának vizuális (nagyítással) úton való értékelését. A Jurkat sejt az előnyös CD2+ szubsztrát (lásd példák). A találmány szerinti oldható polipeptidek kötődési tulajdonságait számos ismert módon vizsgálhatjuk, azaz például a polipeptid radioaktív izotópos jelölésével (például 35S izotóppal), majd a jelzett polipeptidet kölcsönhatásba hozva a CD2+ sejtekkel. Az enzimes jelzést vagy a rozettálási vizsgálatokat is használhatjuk [Seed és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA54, 3365-69 (1987)].
A jelen találmány tárgyát képezik továbbá a fúziós fehérjék és az azokat kódoló DNS szekvenciák. Ezeknek a fúziós fehérjéknek az N-terminális régióját az jellemzi, hogy a jelen találmány szerinti CD2-kötő polipeptid aminosav szekvenciáját tartalmazzák, a Cterminális régió egy, az LFA-3-tól eltérő fehérje vagy polipeptid egy doménjét tartalmazza. Ilyen dómén például egy immunglobulin Fc régiója.
A jelen találmány szerinti előnyös fúziós fehérjékben a jelen találmány szerinti CD2-kötő polipeptideket egy immunglobulin Fc régiója legalább egy részéhez fuzionáltatjuk. Ezekben a fúziós fehérjékben a CD2kötő polipeptidek képezik az N-terminális részt, az Fc régió képezi a C-terminális részt.
Ezekben a fúziós fehérjékben az Fc régiót előnyösen a csuklórégióra és a CH2 valamint a CH3 doménekre korlátozzuk. Még előnyösebb, ha a jelen találmány szerinti fúziós fehérjékben az Fc régió a CH2 valamint a Ch3 doménekre, valamint a csuklórégió egy részére korlátozódik, amely régió képes intermolekuláris diszulfid hidakat képezni (lásd például a 12. ábrát).
Egy, a jelen találmány szerinti hasznos LFA-3-Ig fúziós fehérje az LFA3TIP [szerepel még LFA3(92)IgG néven is], amelyet a pSAB152 expressziós plazmidot tartalmazó COS7 sejtek szekretálnak a sejttenyésztő közegbe (lásd a továbbiakban). Az LFA3TIP az érett LFA-3 N-terminális 92 aminosavát tartalmazza a humán IgGl csuklórégiójának egy részéhez és a CH2 valamint CH3 konstans doménekhez fuzionáltatva (lásd
11. ábra). A fúziós fehéije, az LFA3TIP, az LFA-3-nak egy funkcionális CD2-kötő doménjét tartalmazza, valamint az IgG-nek az Fc-kötő fehérje, a Protein A által felismerendő Fc régiójának egy elegendő részét. Az LFA3TIP képes a CD2-höz kötődni és gátolni a T-sejtek aktiválását.
Az nyilvánvaló, hogy a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék olyan módszerekben használhatók, amelyekkel szelektíven izolálni lehet a CD2 vagy CD2-t expresszáló sejteket, ami ezen polipeptidek CD2-kötő doménje és a CD2 között létrejövő komplexen alapul.
A jelen találmány egy másik megvalósítási módjában a jelen találmány szerinti polipeptideket és fúziós fehérjéket, azaz az LFA-3-Ig fúziós fehérjéket a CD2-t expresszáló sejtek vagy a CD2 LFA-3 kötő doménjét tartalmazó polipeptidek jelzésére lehet használni. Pél9
HU 211 476 A9 dául a jelen találmány szerinti polipeptideket és fúziós fehérjéket konjugáltathatjuk egy „riporter molekulához”, ami lehetővé teszi a CD2+ sejtekhez vagy az LFA-3 CD2-kötő doménjét tartalmazó polipeptidekhez kötődő polipeptidek vagy fúziós fehérjék kimutatását. Annak következtében, hogy az immunglobulin Fc régiójának egy része jelen van a jelen találmány szerinti fúziós fehérjékben, az ilyen fúziós fehérjéket konjugáltathatjuk ugyanazokhoz a „riporter molekulákhoz”, amelyek általában immunglobulinokhoz konjugálódnak vagy kötődnek, azzal a céllal, hogy kimutassuk az antigénekhez kötődő immunglobulinokat, azaz például 125I, enzimmel konjugált, Fc régió elleni szekunder ellenanyagok, vagy biotin-sztreptavidin alapú enzimkonjugált molekulák. Ennek megfelelően egy, a jelen találmány szerinti LFA-3-Ig fúziós fehérje konjugáltatható vagy hozzáköthető az ilyen riporter molekulákhoz, az Fc C-terminális részén keresztül. Emellett az ilyen riporter molekulák konjugáltathatók vagy hozzáköthetők a jelen találmány szerinti polipeptidekhez vagy fúziós fehérjékhez, mielőtt vagy miután a polipeptidek vagy a fúziós fehérjék kötődnek a CD2-höz vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjéhez.
A jelen találmány tárgya továbbá, hogy a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék használhatók diagnosztikai alkalmazásokban, hogy kimutassuk a CD2 vagy a CD2 LFA-3 kötő doménjét tartalmazó sejtek vagy molekulák jelenlétét vagy távollétét.
A jelen találmány szerinti polipeptidek vagy fúziós fehérjék használhatók gyógyászati készítményekben is, azzal a céllal, hogy gátoljuk a CD2/LFA-3 komplex kialakulását, amennyiben ez a kialakulás kóros állapothoz vezet. Egy másik módszer szerint használhatjuk őket terápiásán, hogy utánozzuk az LFA-3 szerepét a CD2/LFA-3 komplex képződésétől függő T-limfocita funkcionális válaszok iniciálásában [Dustin és mtsai.: J. Exp. Med. 165, 677-92 (1987); Springer és mtsai.: Ann. Rév. Immunoi. 5, 223-52 (1987)]. Például a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék használhatók akut és krónikus gyulladások, autoimmun betegségek kezelésére, valamint immunmodulációra, beleértve az olyan betegségek kezelését mint a szisztémás lupus erythematosus vagy lupus vulgáris, reumatóid artritisz és tiroiditisz. Emellett a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék használhatók arra, hogy gátoljuk a T-sejtek aktiválását vagy gátoljuk a perifériális vér limfociták szaporodását.
Ebből a szempontból az nyilvánvaló, hogy a sejtsejt tapadásban szerepet játszó molekulák általában sokkal hatékonyabbak egy bizonyos válasz kiváltásában a sejtekből, ha a molekulák multimer formában vannak jelen, mint hogy ha monomer formában vannak jelen ugyanazok a fehérjék. A sejtfelszíni adhéziós fehérjék multimer formái láthatóan sokkal jobban utánozzák az in vivő tipikus helyzetet, ahol például egy effektor sejt százával vagy ezrével mutatja be az adott adhéziós fehérjéket a felszínén, amelyek azután a célsejt felszínén több példányban jelenlevő ligandumhoz kötődnek. Ha több sejtfelszíni molekula vesz részt a kötődésben, akkor ezek szinergizálhatnak egymással, azaz egy sejtnek egy másikhoz való affinitása nagyobb, mint az egyes molekulák affinitásainak összege. Ennek megfelelően, a jelen találmány fontos tárgya az ismertetett CD2-kötő polipeptidek multimer formáinak előállítása és használata.
Számos módszer ismert a szakterületen fehérje monomerek multimer formáinak kialakítására. Ilyen módszer például keresztkötő ágensek (például glutáraldehid) alkalmazása [Reichlin: Methods in Enzymology 70, 159-65 (1980)]. Ha egy polipeptiden vagy polipeptideken tiolcsoportok találhatók, akkor ezek a csoportok oxidálhatók intermolekuláris diszulfid hidak kialakítására, aminek eredménye a polipeptid vagy polipeptidek multimer formája. Tiolcsoportok vagy tiol-reaktív csoportok vihetők be a polipeptidekbe, iminotiolán vagy heterobifunkcionális keresztkötők, mint például N-szukcinimidil-3-(2-piridiltio)-propionát (SPDP) alkalmazásával, amely egy amin-reaktív csoportot és egy tiolreaktív csoportot tartalmaz. A fehérjék kapcsolását azután diszulfidhidakon keresztül érhetjük el, amelyek vagy közvetlenül vagy homobifunkcionális keresztkötő ágenseken keresztül jönnek létre [Srinivasachar és mtsai.: Biochemistry 28, 2501-09 (1989); Ramakrishnan és mtsai.: Cancer Research 44, 201-08 (1984); Lambert és mtsai.: Journal of Biological Chemistry 260, 12035-41 (1985)]. A molekulák közötti diszulfidhidak képződésének hatékonyságát természetesen korlátozza a polipeptiden hozzáférhető tiolcsoportok száma (természetesen előforduló, vagy a fentiek szerint derivatizálással bevitt), valamint az, hogy az ilyen diszulfid kötés képződése kedvezőtlenül befolyásolja a keletkező multimer forma affinitását.
Ha a polipeptidek vagy fehérjék szénhidrát csoportokat tartalmaznak, mint például a glikoproteinekben, akkor az ilyen csoportok cukor egységeit lehet felhasználni az egyik molekulát a másikhoz kötő reakcióban [Liao és mtsai.: Journal of Biological Chemistry 248, 8247-53 (1973); Moroney és mtsai.: Biochemistry 26, 8390-98 (1987)].
A jelen találmány szerinti CD2-kötő polipeptidek egyéb multimer formáit úgy állíthatjuk elő, hogy egy foszfatidilinozitol („Pl”) kapcsoló szekvenciát kapcsolunk, mint például amilyet a PCT/US90/01859 PCT találmányi bejelentésben írnak le, vagy C4 kötő fehérje szekvenciákat, amilyet például a PCT/US91/OO567 számú PCT találmányi bejelentésben írnak le. A hidrofób Pl horgony használható micellák képzésére, amelyek számos különböző aktív CD2-kötő domént vagy a PI-kötött LFA-3 multimer formáit mutatják be, amelyekben a különböző monomerek az egyes monomerek PI-kötő szekvenciái közötti hidrofób kölcsönhatások révén kapcsolódnak egymáshoz (a hozzáadott lipidek vagy membrán távollétében). Ez utóbbi esetben a multimer PI-kapcsolt LFA-3 molekulák általában oktamerek; jóllehet más polimer formákat is megfigyeltek (azaz például 6-12 asszociálódott monomert). Egy másik módszer szerint, ha egy, a Pl kapcsoló szekvenciát kódoló DNS szegmentet egy olyan DNS inszert után kapcsolunk, amely a találmány szerinti polipeptidet kódolja, majd ezzel a konstrukcióval megfelelő emlős
HU 211 476 A9 gazdasejteket transzfektálunk, olyan sejtek tenyészetét kapjuk, amelyek a felszínükön a CD2-kötő polipeptid számos példányát mutatják be (Pl horgonnyal hozzákapcsolva).
Egy másik módszer szerint a jelen találmány szerinti polipeptidek és fúziós fehérjék monomerjeiből több példány kapcsolható egy másik molekulához vagy szubsztráthoz vagy részecskéhez. Csakúgy, mint az LF08-nak az Affigel-10 gyöngyökhöz való kötődése (lásd az alábbiakban), a több CD2-kötő domént tartalmazó molekulák, vegyületek vagy részecskék készítése is a jelen találmány oltalmi körébe tartozik.
Emellett a találmány tárgyát képezik az LFA-3-Ig fúziós fehérjék is. Ezeket a multimereket az lg molekulákból azoknak az Fc régióknak, vagy részeiknek felhasználásával készíthetjük, amelyek általában multivalensek, mint például az IgM pentamerek és az IgA dimerek. Az persze nyilvánvaló, hogy egy J lánc polipeptidre lehet szükség az IgM pentamerek és IgA dimerek előállítására és stabilizálására. Egy másik módszer szerint az LFA-3-Ig fúziós fehérjék multimerjei úgy állíthatók elő, hogy olyan fehérjét használunk, amelynek affinitása van az lg molekulák Fc régiójához, mint például a Protein A. Például számos különböző LFA-3-Ig fúziós fehérjét, úgymint az LFA3TIP-t kapcsolhatjuk a Protein A-agaróz gyöngyökhöz, így olyan agaróz gyöngyök készíthetők, amelyeknek a felszínét a hozzákapcsolt LFA-3-Ig fúziós fehérjék többfunkciós CD2-kötő doménjei borítják.
A találmány tárgyát képezik továbbá azok a multimer fehérjék, amelyek képesek a CD2-höz kötődni, azzal jellemezve, hogy az alábbi komponenseket tartalmazzák (a) két vagy több, az alábbiakban ismertetett CD2-kötő polipeptidet, (b) két vagy több, az alábbiakban ismertetett CD2-kötő fúziós fehérjét, vagy (c) egy vagy több CD2-kötő polipeptidet és egy vagy több CD2-kötő fúziós fehérjét.
A jelen találmány szerinti polipeptideket emellett arra is használhatjuk, hogy kis molekulasúlyú (azaz a monomer molekulasúlya általában 1000 daltonnál kevesebb) nem-peptid vagy csak részleges peptid-tulajdonságokkal rendelkező CD2-kötő molekulákat tervezzünk, amelyek jól használhatók a CD2/LFA-3 komplexen keresztül megvalósuló sejt-sejt tapadás meggátlásában. Az alábbiakban ismertetett polipeptidek alapján olyan kis molekulák tervezhetők, amelyeknek megvan az a képességük, hogy kötik a CD2-t és tartalmazhatnak aminosavtól eltérő egységeket, és teljesen szintetikus módszerekkel állíthatók elő. Ezeknek a kis molekuláknak mint terápiás vagy gyógyászati ágenseknek az alkalmazása szintén a találmány oltalmi körébe tartozik.
A jelen találmány tárgya továbbá a CD2-kötő polipeptidek és fúziós fehérjék alkalmazása olyan ellenanyagok előállítására, amelyke felismerik az LFA-3 CD-2 kötő doménjét. A jelen találmány syerinti polipeptidek és fúziós fehérjék alkalmazásával mind a monoklonális mind a poliklonális ellenanyagokból előállítható olyan, amely nagyon specifikus az LFA-3 CD-2kötő doménjére.
Egy bizonyos antigén elleni monoklonális ellenanyagok és poliklonális antiszérum előállítási módszerei jól ismertek a szakirodalomban. A MAb-k előállításához egy örökéletű sejtvonalat (általában egy mielóma sejtvonalat) fuzionálattunk egy adott antigénnel (ebben az esetben az LFA-3 CD2-kötő doménjével) immunizált emlősből (például nyúlból) származó limfocitákkal (általában szplenocitákkal). Az ilyen fúziókkal általában hibridómák állíthatók elő, azaz a hidbrid sejtek örökéletű kiónjai, amelyek olyan ellenanyag molekulákat termelnek, amelyek az immunizáló antigén egyetlen epitopjára specifikus ellenanyag molekulákat termelnek [Kohler és mtsai.: Natúré 256, 495-97 (1975)]. A hatékony immunizáláshoz szükség lehet arra, hogy a CD2-kötő domént tartalmazó polipeptidet polimerizáljuk vagy derivatizáljuk és egy adjuvánssal keveijük össze.
Arra is szükség lehet, hogy a fúziókból származó számos potenciális hibridóma kiónt átvizsgáljuk, ahhoz hogy azonosítani tudjuk azokat a kiónokat, amelyek az LFA-3 CD2-kötő doménje elleni ellenanyagokat termelnek. Az ilyen vizsgálat például magában foglalja a hidridóma tenyészetek felülúszóinak átvizsgálását abból a szempontból, hogy képesek-e gátolni a CD2-t expresszáló sejteknek az LFA-3-at expresszáló sejtekhez való kötődését. Azok a vizsgálatok, amelyeket arra használtunk, hogy átvizsgáljuk a hibridómákat az LFA-3 MAb termelés szempontjából, használhatók primer szűrővizsgálatként azoknál a hibridómáknál, amelyek az LFA-3 CD2-kötő doménjére specifikus MAb-okat termelik [Sanchez-Madrid és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 79, 7489-93(1982)].
A jelen találmány szerinti CD2-kötő polipeptideket és az LFA-3 gén deléciós mutáns formáit kódoló DNS, mint amelyet az alábbiakban ismertetünk, használható plusz/mínusz próbaként is más, az LFA-3 CD2-kötő doménjét kódoló DNS szekvenciák kimutatására és izolálására.
Az LFA-3 fehérje deléciós mutáns formái, amelyekből hiányzik az érett LFA-3-nak legalább a +52től a +60-as aminosavig terjedő része; vagy legalább a +41-tői a +50-es aminosavig terjedő része, vagy legalább a +31-tői a +40-es aminosavig tetjedő része; (előnyösen mindhárom régió hiányzik), használható azon ellenanyagok poliklonális antiszérumainak a tisztítására, amelyek felismerik az LFA-3-nak azokat az epitopjait, amelyek eltérnek az LFA-3 CD2-doménjében levő epitopoktól. Az ilyen mutánsokat választhatjuk például az alábbi csoportból: M57, M55, M56, PIM3 és M100, valamint ezek kombinációi. Például egy poliklonális anti-LFA-3 antiszérumot előinkubálhatunk az LFA-3 fehérjének egy mutáns formájával, amelyet az M57 vagy Ml00 deléciós mutánsokat tartalmazó mutáns LFA-3 gén kódol (1. és 6. ábra). A poliklonális ellenanyagok felismerik és kötődnek a mutáns LFA-3 fehérjén levő LFA-3 epitopokhoz. Mivel azonban a CD2-kötő dómén nincs jelen, a poliklonális antiszérumban az ez ellen az epitop elleni ellenanyagok nem fognak kötődni. A keletkező komplexek
II
HU 211 476 A9 kicsapása azt eredményezi, hogy az antiszérumban feldúsulnak azok az ellenanyagok, amelyek a CD2-kötő dómén epitopra specifikusak.
A jelen találmány szerinti CD2-kötő dómén polipeptideket és fúziós fehérjéket szokványos módszerekkel gyógyászati készítményként formulázhatjuk, így gyógyászatilag elfogadható készítményeket és kombinációkat kapunk. Az ilyen készítmények előnyösen legalább egy gyógyászatilag elfogadható hordozót tartalmaznak [Remington’s Pharmaceutical Sciences (E. W. Martin)]. A jelen találmány szerinti gyógyászati készítmények általában az aktív polipeptid mellett tartalmaznak egy gyógyászatilag elfogadható puffért, előnyösen foszfáttal puffereit sóoldatot egy gyógyászatilag elfogadható, az izotóniás nyomást biztosító vegyülettel, azaz például nátrium-kloriddal, mannittal vagy szorbittal együtt. A jelen találmány szerinti gyógyászatilag elfogadható készítményeket és eljárásokat a jelen találmány szerinti polipeptid gyógyászatilag hatékony mennyisége jellemzi.
A jelen találmány szerinti gyógyászati készítmények és kombinációk, amelyek LFA-3-Ig fúziós fehérjéket tartalmaznak, használhatók például a T-limfociták aktiválásának gátlására vagy a perifériális vér limfocitái szaporodásának gátlására (lásd az alábbiakban).
A továbbiakban a „kombináció” szakkifejezés egy olyan egyszeri dózisformát jelent, amely legalább egy, a jelen találmány szerinti polipeptidet tartalmaz, valamint legalább egy másik gyógyászatilag aktív adalékanyagot, valamint egy többszörös dózisformát, amelyben a polipeptidet és a másik aktív adalékanyagot külön-külön, de egyidőben adjuk be, vagy egy olyan többszörös dózisformát, amelyben a két komponenst egymástól elkülönítve és egymás után adjuk be. Egy másik módszer szerint a jelen találmány szerinti polipeptidek és a többi aktív adalékanyag lehet egyetlen konjugált molekula formájában. A két komponens konjugációját a szakterületen jártas szakember számára jól ismert standard keresztkötési technikákkal végezhetjük el. Egyetlen molekula is felveheti egy rekombináns fúziós fehérje formáját.
A jelen találmány szerinti gyógyászati készítményeket és kombinációkat egy betegnek beadhatjuk bármely gyógyászatilag elfogadható dózisformában, beleértve, anélkül, hogy erre korlátoznánk magunkat, azokat, amelyeket intravénásán, bolus vagy folyamatos infúzió formájában, illetve intramuszkulárisan, szubkután, intrakután, intra-artikulárisan, orálisan vagy parenterálisan lehet beadni.
A szakterületen jártas szakember számára a gyógyászatilag hatékony dózis meghatározási módszerei jól ismertek. A dózis és a dózis-sebesség számos faktortól függ, mint például a specifikus összetételtől, a kezelés céljától, azaz például attól, hogy terápiáról vagy megelőzésről van szó, az adagolás módjától és a kezelőorvos megítélésétől.
A jelen találmány tárgya továbbá a CD2-kötő polipeptidek és fúziós fehérjék, vagy az ezeket tartalmazó készítmények alkalmazása bioanalitikai célokra, a CD2 fehérje koncentrációjának meghatározására, vagy a
CD2-t expresszáló sejtek kimutatására biológiai mintákban. Ezeket a polipeptideket és készítményeket hasonlóképpen lehet használni, mint a szokványos vizsgálatokban alkalmazott reagenseket. Emellett a találmány szerinti polipeptideket diagnosztikai kitekben használhatjuk, amelyeket arra terveznek, hogy kimutassák a CD2 vagy a CD2-t expresszáló sejtek jelenlétét és megmérjék azt.
Ahhoz, hogy ez a találmány jobban érthető legyen, az alábbi példákat adjuk meg. Ezek a példák csak szemléltető célúak, és semmiképp sem tekinthetők a jelen találmány oltalmi köre korlátozásának.
1. példa
Deléciós mutánsok készítése az LFA-3 génekben
Ahhoz, hogy az LFA-3 fehérje CD2-kötő doménjét feltérképezzük, az LFA-3 génből egy sorozat deléciós mutánst készítünk, tervezett módon, hely specifikus mutagenezissel, oligonukleotid heteroduplex módszer alkalmazásával. A transzmembránt kódoló cDNS-t izolálták és szekvenálták [Wallner és mtsai.: 4 956 281 számú amerikai egyesült államokbeli találmányi bejelentés), majd a transzmembrán LFA-3-at kódoló cDNS-t hordozó bakteriofágot az American Type Culture Collectionnél (Rockville, Maryland) helyeztük letétbe, 75 107 letéti számon. Egy plazmidot, jele pHT16-6, amely a transzmembrán LFA-3-at kódoló cDNS-t tartalmazza a Biogen, Inc.-tői kaptuk (Cambridge, Massachusetts), és az összes deléciós mutáns készítésénél ezt használtuk. A pHT16-6 plazmid készítését a WO 88/09 820 számú PCT találmányi publikációban ismertetik, amelyre a továbbiakban referenciaként hivatkozunk. A pHT16-6 plazmid egy olyan cDNS inszertet tartalmaz, amely LFA-3-at kódol, valamint tartalmaz egyetlen EcoRI hasítási helyet az LFA-3-at kódoló szekvencia 5' végéhez közel, valamint egyetlen BamHI hasítási helyet az LFA3 cDNS 5' végének közelében, egyetlen HindlII hasítási helyet az LFA-3 cDNS 3' végének közelében, két NotI hasítási helyet egymástól 1112 bázispár távolságban, amelyek közreveszik az LFA-3 cDNS-t, és egyetlen Seal hasítási helyet. A pHT16-6 cDNS inszertje, amely a transzmembrán LFA-3 teljes kódoló régióját tartalmazza, az 1. ábrán látható.
Ebben az eljárásban tizenhét LFA-3 kódoló szekvenciát választottunk ki a delécióhoz, mindegyik 30 bázispár méretű. Minden egyes javasolt delécióban egy 30 bázis méretű antiszensz oligonukleotidot szintetizálunk, amely tartalmazza a javasolt deléció előtti (5') komplementer 15 bázispárt és a javasolt deléció utáni (3') komplementer 15 bázispárt. Egy bizonyos szintetikus oligonukleotidnak az LFA-3 DNS egyik szálához való hibridizációja egy olyan heteroduplexet eredményez, amelyből egy 30 bp méretű specifikus szekvencia kihurkolódik. Ezzel a mutagenezis eljárással a heteroduplex replikációs termékei deléciós mutánsokat tartalmaznak, amelyekből a heteroduplex képződés következtében kihurkolódott a 30 bázispár méretű régió.
Az 1. ábrán bemutatott tizenhét deléciós mutáns készítésénél használt szintetikus oligonukleotidokat az alábbi táblázatban mutatjuk be:
HU 211 476 A9
Szekvencia | Az LFA-3 nukleotidokkal komplementer | Kivágott szegment |
13. számú szekvencia | 109-123+154-168 | M53 |
14. számú szekvencia | 139-153+184-198 | M54 |
15. számú szekvencia | 169-183+214-228 | M55 |
16. számú szekvencia | 199-213+244-258 | M56 |
17. számú szekvencia | 229-243+274-288 | M57 |
18. számú szekvencia | 259-273+304-318 | M58 |
19. számú szekvencia | 289-303+334-348 | M59 |
20. számú szekvencia | 319-333+364-378 | M60 |
21. számú szekvencia | 349-363+394-408 | M61 |
22. számú szekvencia | 379-393+424-438 | M62 |
23. számú szekvencia | 409-423+454—468 | M63 |
24. számú szekvencia | 439-453+484-498 | M64 |
25. számú szekvencia | 469-483+514-528 | M65 |
26. számú szekvencia | 499-513+544-558 | M66 |
27. számú szekvencia | 529-543+574-588 | M90 |
28. számú szekvencia | 559-573+604-618 | M91 |
29. számú szekvencia | 589-603+634-648 | M92 |
Minden egyes heteroduplex esetében egy pHT16-6 mintát (100 pg) emésztünk Hindin enzimmel (210 egység, New England Biolabs), majd vagy EcoRI enzimmel (300 egység, New England Biolabs), vagy BamHI enzimmel (300 egység, New England Biolabs). Egy másik pHT16-6 mintát (100 gg) linearizálunk Seal enzimes emésztéssel (300 egység, New England Biolabs). Az emésztési termékeket 1 tömeg/térf%-os agaróz gélen elektroforézisnek vetjük alá TAE pufferben (40 mmol/1 TRIS-acetát, 1 mmol/1 EDTA pH = 8,0), majd minden egyes emésztésnél a kívánt fragmenst elektroelúcióval kinyerjük a gélből [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: ALaboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)]. Az Seal emésztés esetében a linearizált pHT16-6 plazmidot elektroelúcióval nyerjük ki a gélből; a pHT16-6 plazmid HindUI/EcoRl vagy HindΙΠ/BamHI emésztéseinél az egyes esetekben a keletkező két restrikciós fragmens közül a nagyobbat elektroelúcióval kinyerjük.
A Seal restrikciós enzimmel linearizált pHT16-6 DNS-ből 100 ng-ot keverünk össze 100 ng izolált HindlII/EcoRI vagy HindlII/BamHI restrikciós fragmenssel és 8 pikomóllal a tizenhét, korábban ATP-vel foszforilezett [Sambrook és mtsai.; Molecular Cloning; A Laboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)] antiszensz oligonukleotid közül eggyel. Amint az az 1. ábrán látható, mivel az EcoRI hasítási hely az M56 régióban található, a HindlII/EcoRI nagy restrikciós fragmens nem használható deléciók készítésére az M53, M54, M55 és M56 régiókban. Ezért a HindlII/BamHI nagy restrikciós fragmenst használjuk ebben az eljárásban ezen négy deléció készítésére.
Ahhoz, hogy heteroduplexek keletkezzenek, egy szintetikus oligonukleotidot, az Scal-gyel linearizált pHT16-6-ot és a pHT16-6 HindlII/EcoRI vagy HindlII/BamHI emésztésének nagy fragmensét keverjük össze 100 mmol/1 NaCl, 80 mmol/1 MgCl2, 6,5 mmol/1 TRIS-HC1 pH = 7,6 összetételű oldatban, majd denaturálás céljából 3 percig forraljuk. A denaturált DNS-t 1 óra hosszat hagyjuk egymáshoz illeszkedni 37 ’C-on, majd 4 °C-on 1 óra hosszat, és végül 0 °C-on 10 percig.
Az egymáshoz való illesztés után a heteroduplexben levő lyukakat feltöltjük, majd a fragmenseket egyetlen reakcióelegyben összeligáljuk, az illeszkedett DNS-hez az alábbi komponenseket adva, hogy a jelzett végkoncentrációkat kapjuk: ATP (20 mmol/1); dATP, dTTP, dGTP, dCTP (mindegyik 10 mmol/1); Klenow (a DNS polimeráz I nagy fragmense, 2,5 egység, New England Biolabs); T4 DNS ligáz (200 egység, New England Biolabs). Az elegyeket azután éjszakán át 15 ’C-on inkubáljuk.
Az inkubálás után az egyes feltöltési/ligálási elegyek felét használjuk 100 μΐ Escherichia coli JA221 transzformálására [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)]. A transzformált sejteket 50 pg/ml ampicillinnel kiegészített LB lemezeken szelektáljuk [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA(1989)].
A transzformánsok telepeit átvizsgáljuk, hogy vane bennük egy bizonyos deléció. Ehhez telephibridizációt végzünk a heteroduplexben a deléció készítésére használt oligonukleotiddal mint próbával.
Próbaként való alkalmazáshoz az egyes oligonukleotidokból 80 pmol-t jelzünk 32P-ATP-vel, standard eljárásokat alkalmazva. A jelzett oligonukleotidokat 2 mol/1 ammónium-acetáttal csapjuk ki [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)]. A jelzett próbát hozzáadjuk a hibridizációs pufferhez, annyit, hogy végső aktivitása körülbelül 5xlO5 cpm/ml legyen a hibridizációs elegyben. Ahibridizációkat nitrocellulóz szűrőlapokon végezzük, 60 ’C-on, körülbelül 8 óra hosszat. Miután a szűrőlapokat 0,5XSSC-ben mostuk 60 ’C-on, autoradiográfiát végzünk, és a pozitív telepeket megjelöljük [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)]. A kívánt deléciós mutációk keletkezését a plazmid DNS szekvencia elemzésével igazoljuk [Maxam és Gilbert: Methods in Enzymology 65, 499-560 (1980) (Grossman és Moldave, szerk.)], azokban a telepekben, amelyek pozitívnak bizonyultak a hibridizációs vizsgálatokban.
Ezekkel az eljárásokkal plazmidokat állítunk elő, ezek mindegyike az előzőkben listázott és az 1. ábrán bemutatott 30 bp méretű deléciók egyikét tartalmazza. Az LFA-3 kódoló szekvenciában az M57 deléciót tartalmazó plazmid jele pLFA3MS7-4A.
HU 211 476 A9
2. példa
Rekomibnáns expressziós plazmidok készítése
Az 1. példa szerint előállított plazmidokat, amelyekből hiányoznak az LFA-3-ból sikeresen kivágott 30 bp méretű szegmensek, használjuk expressziós vektorok készítésére. Az M54, M55, M56, M57, M58, M63 és M65 deletált szegmenteket tartalmazó plazmidokból 100 μg alikvot részeket emésztünk NotI restrikciós enzimmel (100 egység, New England Nuclear, Beverly, Massachusetts). Az M57, M63 és M65 esetében az 5' túlnyúló végeket feltöltjük, standard Klenow (New England Nuclear) reakcióelegyet használva [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: ALaboratory Manual, 2. Edn., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)], hogy tompavégű restrikciós fragmenseket kapjunk. A fragmenseket 0,7%-os TAE agaróz gélekből tisztítjuk elektroelúcióval.
A gélből tisztított, tompavégű NotI fragmenseket azután egyenként klónozzuk a pBG368PY eukarióta expressziós vektor Smal hasítási helyére [Dailey és mtsai.: J. Virol. 54. 739-49 (1985)], T4 ligázt használva 15 °C-on éjszakán át. Az M54, M55, M56 és M58 NotI fragmenseit gélből tisztítjuk az előzőkben leírt módon, majd ligáljuk a Notl-gyel emésztett PMDR902 expressziós vektorba. A kapott ligáló elegyeket használjuk Escherichia coli JA221 transzformálására, majd a transzformánsok pozitív telepeit, amelyek a kívánt inszerteket tartalmazó rekombináns plazmidokat tartalmazzák, telephibridizálással azonosítjuk, az előzőkben leírt módon. A vektorban levő M57, M63 és M65 inszertek orientációját EcoRI emésztéssel ellenőrizzük, azaz a helyes orientációjú fragmensek esetében 6600, 4000 és 200 bázispár méretű fragmensek keletkeznek, amelyeket 0,7%-os agaróz gélen választunk el. Az M54, M55. M56 és M58 inszerteket tartalmazó plazmidok esetében az orientációt PvuII restrikciós enzimes elemzéssel határozzuk meg, mikoris a korrekt orientációjú inszertek esetében 6599, 1185 és 506 bázispár méretű fragmensek keletkeznek. Mindegyik fragmens szerkezetét DNS szekvenálással igazoljuk [Maxam és Gilbert, idézett mű].
Az M54, M55, M56 és M58 LFA-3 deléciós mutációkat kódoló DNS-t hordozó rekombináns expressziós plazmidokat AatlI restrikciós enzimmel linearizáljuk, majd aranyhörcsög petefészek (CHO) sejtekbe elektroporáljuk [J. Barsoum: DNA Cell Bioi. 9, 293-300 (1990)]. Az M57, M63 és M65 deléciós mutációkat Nrul restrikciós enzimmel linearizáljuk, majd CHO sejtekbe juttatjuk be elektroporációval, az előzőkben leírt módon, azzal az eltéréssel, hogy 19 pg Nrul restrikciós enzimmel emésztett DNS-t éjszakán át -20 °C-on inkubálva etanollal kicsapunk 1 μg EcoRI restrikciós enzimmel emésztett SV2 DNS-sel (DHFR+) és 380 μg ultrahanggal felaprított heringsperma DNS-sel együtt. lxlO7 CHO sejtbe elektroporációval bejuttatjuk az együtt kicsapott DNS-t (280 Volt, BioRad Gene Pulser).
Az elektroporáció után a sejteket két, 100 mm átmérőjű lemezre visszük ki, amelyek összetétele alpha+ MÉM, 10%-os borjúmagzat szérum (FCS), 4 mmol/1 L-glutamin, penicillin/sztreptomicin, majd 48 óra hosszat 37 °C-on inkubáljuk. A lemezeken levő sejteket azután öt 100 mm átmérőjű sejtre osztjuk szét, amelyek összetétele alpha- MÉM, 10% FCS, 4 mmol/1 L-glutamin, penicillin/sztreptomicin, majd öt napig 37 °C-on inkubáljuk. A sejteket azután alpha- komplett táptalajjal tápláljuk, amelyet az M57, M63 és M65 esetében 200 nmol/1 metotrexáttal egészítettünk ki, míg az M54, M55, M56 és M58 esetében 50 nmol/1 metotrexáttal egészítettük ki. Mindegyik lemezt 90%os egybefüggésig növesztjük, majd FACS-szal (fluoreszcencia aktivált sejtszortírozó) határozzuk meg, annak meghatározására, hogy bármelyik, az LFA-3 deléciós mutánssal CHO tenyészet expresszálja-e az LFA3 mutáns formáit.
3. példa
A transzfektált sejtek FACS elemzése
A 2. példa szerint előállított transzfektált CHO sejtek, amelyeket metotrexát jelenlétében 90%-os egybefüggésig növesztettünk, kétszer mossuk HANKS BSS táptalajjal (Ca*4 és Mg++ mentes, pH = 7,0), majd HANKS táptalajjal eltávolítjuk (Ca*4 és Mg++ mentes, 5 mmol/1 EDTA, pH = 7,0). Körülbelül 2xl05 sejtet szuszpendálunk 100 μΐ hideg (0 °C) mosópufferben [PBS, 0,1% NaN3, 0,5% szarvasmarha szérumalbumin (BSA), pH = 7,2], majd egy primer ellenanyagot adunk hozzá. A primer ellenanyag vagy TS2/9 anti-LFA3 MAb aszcitesz folyadék [Sanchez-Madrid és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 79, 7489-93 (1982)], amelyet a Dana Farber Cancer Inst.,-tól (Boston, Massachusetts) lehet beszerezni, vagy 7A6 anti-LFA-3 MAb (beszerezhető a Biogen Inc.-tői, Cambridge, MA; 1,6 pg/ml), vagy 202 anti-LFA-3 poliklonális nyúl antiszérum (beszerezhető a Biogen Inc.-tői). Az összes primer ellenanyagról ismert, hogy blokkolja a CD2 LFA3-hoz való tapadását. A használt primer ellenanyag mennyisége általában 1 és 2 μΐ. A sejteket 0 “C-on inkubáljuk 45 percig, majd kétszer mossuk mosópufferrel.
Ezután fluoreszceinnel jelzett szekunder ellenanyagot adunk hozzá, majd az elegyet 30 percig inkubáljuk 0 °C-on. A monoklonális ellenanyagokkal való elemzéshez a szekunder ellenanyag fluoreszceinnel konjugált (DTAF)-konjugált affinitás-tisztított kecske antiegér F(ab)2 IgG (H+L) (Jackson Immunoresearch Laboratories, Inc., West Grove, CA); a 202 poliklonális nyúl antiszérumhoz a szekunder ellenanyag fluoreszcein izotiocianát (FITC) kecske anti-nyúl IgG (H+L) (Fisher Biotech, Pittsburgh, Pennsylvania).
A szekunder ellenanyaggal való inkubálás után a sejteket felülrétegezzük 300 μΐ FCS-sel, kétszer mossuk mosópufferrel, újra szuszpendáljuk 300 μΐ lxPBSsel, majd Falcon 2052 csövekbe visszük át, hogy sejtszortírozóval leolvashatók legyenek.
A 2. ábrán látható, hogy a FACS elemzések jelzik, hogy az M57 (2A. és 2B. ábrák), M65 (2C. és 2D. ábrák), M63 (2E. és 2F. ábrák), M54 (2G. és 2H. ábrák), M55 (21. és 2J. ábrák), M56 (2K. és 2L. ábrák), valamint M58 (2M. és 2N. ábrák) deléciós mutációkat tartalmazó expressziós vektorokkal transzfektált sejtek
HU 211 476 A9 egy olyan sejtfelszíni fehérjét expresszálnak, amelyet a 202 antiALFA-3 poliklonális antiszérum felismer (2A., 2C., 2E., 2G., 21., 2K., 2M.) felismer. Azonban a TS2/9 és 7A6 anti-LFA-3 MAb-ok csak azokhoz a transzfektánsokhoz kötődnek, amelyek az M65 és M63 deléciós mutánsokat tartalmazzák, és nem kötődnek azokhoz a transzfektánsokhoz, amelyekből hiányzik az M57, M54, M55, M56 vagy M58 régió (lásd a 2B., 2H., 2J., 2L., 2N. ábrák összehasonlítása a 2D.-vel és 2F.-fel). Ezek az eredmények azt mutatják, hogy az M54, M55, M56, M57 és M58 szegmensek, amelyeket kivágtunk az LFA-3 M54, M55, M56, M57 és M58 deléciós mutánsokból (lásd 1. ábra), fontosak voltak az LFA-3 molekula CD2 felismerése szempontjából.
4. példa
Jurkat sejtkötődési vizsgálat
Az M57 deléciós mutánssal transzfektált CHO sejteket („M57/CHO” sejtek), a p24 plazmiddal transzfektált CHO sejteket [Wallner és mtsai.: WO 90/02 181 számú PCT szabadalom), amelyek ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3-at expresszálnak („P24/CHO” sejtek, pozitív kontroll), valamint normál CHO sejteket (negatív kontroll) vizsgálunk meg abból a szempontból, hogy képesek-e CD2-t expresszáló Jurkat sejtekhez kötődni.
Az M57/CHO sejteket, a P24/CHO sejteket és a CHO sejteket (1 xlO5) hatlyukú lemez (Corning) különböző lyukaihoz adjuk hozzá, majd kétszer mossuk RPMI komplett táptalajjal. A Jurkat sejteket (CD2+), amelyeket Dr. Timothy Springer-től kaptunk (Dana Farber Cancer Inst., Boston, Massachusetts), háromszor mossuk RPMI, 10% FCS, 4 mmol/1 L-glutamin összetételű oldattal, majd 5xl06 sejtet adunk az egyes lyukakhoz, majd 4 óra hosszat 0 ’C-on inkubáljuk. A sejteket azután óvatosan háromszor mossuk RPMIvel, majd mikroszkóp alatt 40X és 100X nagyítással vizsgáljuk a sejt-sejt kötődést.
A 3. ábrán látható, hogy míg a pozitív kontroll sejtek, amelyek ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3-at expresszálnak, megkötik a CD2-t expresszáló Jurkat sejteket (3C. ábra), az M57/CHO sejtek nem képesek megkötni a Jurkat sejteket (3B. ábra), csakúgy, mint a nem transzfektált (LFA-3-) CHO sejtek (3A. ábra).
5. ábra
Az M57/CHO sejtekből származó mRNS Northern biot elemzése
Az M57/CHO sejtek mRNS-ét Northern blot-tal elemezzük, ami egy további megerősítése annak, hogy a monoklonális ellenanyagoknak, azaz a TS2/9 és 7A6 monoklonális ellenanyagoknak az M57/CHO sejtekhez való kötődésre való képtelensége inkább az LFA-3 felszíni mutáns következménye, amelyből hiányzik az M57 CD2-kötő régió, és nem az, hogy a mutáns LFA-3 gén nem expresszálódik hatékonyan.
100 mm átmérőjű lemezen levő körülbelül lxlO7 M57/CHO sejtből az RNS-t az alábbiak szerint izoláljuk: a növesztő táptalajt eltávolítjuk, majd 2 ml extrakciós puffért (50 mmol/1 TRIS-HC1, pH = 7,5, 1% SDS, 5 mmol/1 EDTA, a 100 pg/ml proteináz K-t közvetlenül felhasználás előtt adjuk hozzá) adunk hozzá. A lemezeket 20 percig 37 ’C-on inkubáljuk enyhe rázatás közben. Viszkózus sejtlizátum keletkezik, ezt egy 50 ml-es tesztcsőben gyűjtjük össze. Azonos térfogatú fenol-kloroform-éter (50:50:1) elegyet adunk hozzá, majd a keveréket röviden összekeveijük. A keveréket egy Polutron mixerrel (Kinematica, Svájc) homogenizáljuk 15 másodpercig, a legnagyobb sebességi fokozattal, azzal a céllal, hogy összetörjük a DNS-t. A keveréket egy 15 ml-es Corex csőbe tesszük, majd 10 000/perc fordulatszámmal centrifugáljuk 10 percig 4 ’C-on.
Centrifugálás után a vizes fázist összegyűjtjük, NaCl-t adunk hozzá 0,25 mol/1 koncentrációban, majd 1 térfogat izopropanolt adunk hozzá. Ezt a keveréket 10 percre szárazjégre tesszük, majd felolvasztjuk és 15 percig 10 000/perc fordulatszámk.al centrifugáljuk 4 ’C-on.
Az üledéket 2,9 ml desztillált vízben szuszpendáljuk, majd vortexeljük. 0,9 ml 12 mol/1 koncentrációjú LiCl-t adunk hozzá (2,8 mol/1 végkoncentráció eléréséig), majd hagyjuk hogy a szuszpenzió legalább négy óra hosszat álljon 4 ’C-on. Az 5S RNS és a DNS oldatban marad, a többi RNS frakció kicsapódik. Ezt az oldatot centrifugáljuk legalább 15 percig 10 000/perc fordulatszámmal 4 ’C-on.
Az üledéket 360 μΐ desztillált vízben szuszpendáljuk, majd egy Eppendorf csőbe tesszük át. 40 μΐ 3 mol/1 nátrium-acetátot (pH = 5,2) és 1 ml etanolt adunk hozzá, majd az elegyet 5 percig 70 ’C-on tartjuk, 15 percig -20 ’C-ra tesszük, centrifugáljuk, etanollal öblítjük, majd 400 μΐ 0,3 mol/1 koncentrációjú nátriumacetátban szuszpendáljuk. 1 ml etanolt adunk hozzá, majd a kicsapást megismételjük. A centrifugálás után kinyert RNS-t 100 μΐ desztillált vízben szuszpendáljuk.
Az RNS-ből 10 pg-ot elektroforézisnek vetünk alá 1%-os agaróz-formaldehid gélen, majd egy GeneScreen nitrocellulóz membránra visszük át (New England Nuclear) és egy 32P-vel jelzett próbával hibridizáljuk. Kontrollként az M16.3/CHO sejtvonalból (amely rekombináns, oldódó LFA-3-at expresszál, beszerezhető a Biogen, Inc.,-tői, Cambridge, Massachusetts) extrahált RNS-t elemzünk ugyanazzal a Northern blottal. A Northern biot elemzés (4. ábra) azt mutatja, hogy az M57 RNS hatékonyan szintetizálódik az M57/CHO sejtekben.
6. példa
Az LFA-3 deléciós mutáns immunprecipitációja
Ahhoz, hogy igazoljuk a specifikus ellenanyag-kötő domének elvesztését az M57/CHO sejtek felszínén expresszált mutáns LFA-3-ban, M57/CHO transzfektánsokat, nem transzfektált CHO sejteket és P24/CHO transzfektánsokat (amelyek ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3-at expresszálnak) jelzünk ,25I-vel a felszínükön, majd mind a három primer ellenanyag készítményt (azaz a 202 poliklonális antiszérumot, a TS2/9 és 7A6 MAbot) használjuk az LFA-3 immunprecipitálására, a sejtfelszíni membrán detergenssel való elroncsolása után.
Az M57/CHO sejtekből, a normál CHO sejtekből
HU 211 476 A9 és a P24/CHO sejtekből körülbelül 107-et szuszpendálunk PBS*-ben (azaz Ca*4 és Mg++ nélküli PBS), amelyet 5 mmol/1 EDTA-val egészítettünk ki, majd háromszor mossuk PBS*-ben és 0,5 ml PBS-ben mossuk. A mosott sejteket üvegcsövekbe tesszük (12x75 mm2), amelyeket előzőleg 100 μΐ CHCl3-ban levő 50 μg l,3,4,6-tetraklór-3a,6a-difenilglikoluril oldattal borítottunk (Iodo-Gen, Pierce Bio-Research, Rockford, Illinois), majd nitrogénben szárítottunk. Közvetlenül felhasználás előtt a csöveket PBS-sel öblítjük, majd 125I-t (1 mCi) adunk hozzá, majd a csöveket 30 percig jégen inkubáljuk, minden 10 percben megforgatva.
Inkubálás után a jódozott sejteket hozzáadjuk 10 ml alpha-MEM, 10% FCS, 4 mmol/1 L-glutamin összetételű oldathoz. A sejteket lecentrifugáljuk, kétszer mossuk 5-5 ml fenti táptalajjal, majd 1 ml PBS-ben szuszpendáljuk és újra centrifugáljuk. A mosott sejteket azután lizáljuk, 1 ml DOC pufferben (20 mmol/1 TRISHC1 pH = 7,3; 50 mmol/1 nátrium-klorid, 0,5% dezoxikolát (DOC); 0,5% NP40), amely 20 μΐ PMSF proteáz inhibitort tartalmaz (Sigma Chemical Co., St. Louis, Missouri, 17 mg/ml etanolban), majd 30 percig jégen inkubáljuk. A lizátumot azután 10 percig mikrocentrifugáljuk 4 ’C-on, majd a l25I-vel jelzett sejtfelszíni molekulákat tartalmazó felülúszókat eltávolítjuk.
Az előző jódozásokból származó lizátumokat előzetesen tisztítjuk, oly módon, hogy érintkezésbe hozzuk 50 μΐ protein A-Sepharose-zal és egy rázón inkubáljuk 1 óra hosszat, szobahőmérsékleten. Minden egyes mintából 100 μΐ lizátumot távolítunk el, majd 300 μΐ DOC pufferrel keverjük össze. Ezt az elegyet centrifugáljuk, és a kapott tisztított felülúszót egy új csőbe visszük át.
Primer ellenanyagot adunk mindegyik tisztított felülúszóhoz: a 202 poliklonális anti-LFA-3 antiszérumot 40 g/ml végkoncentrációban használjuk; a TS2/9, 7A6 monoklonális ellenanyagokat, valamint egy kontroll monoklonális ellenanyagot a MOPC-21-et (IgGl, nem specifikus az LFA-3-ra) 5 μ g/ml koncentrációban használjuk. 100 1 DOC-ot és 2 μΙ PMSF proteáz inhibitort adunk hozzá, majd a keverékeket rázón 2 óra hosszat inkubáljuk 25 ’C-on, vagy éj szakán át 4 ’C-on.
Inkubálás után 30 μΐ protein A-Sepharose-t (a 202 poliklonális antiszérum mintákhoz) vagy 15 μΐ antiegér IgG-agarózt (Sigma Chemical Co. ) (a MAb mintákhoz) adunk a mintákhoz, majd szobahőmérsékleten rázógépen inkubáljuk 2 óra hosszat. A keverékeket azután 2 percig centrifugáljuk és a felülúszókat óvatosan eltávolítjuk, majd elöntjük. Ezután 1 ml DOC puffért adunk hozzá, és az üledéket vortexeléssel szuszpendáljuk. A szuszpendált anyagot azután háromszor mossuk DOC pufferrel.
A minták poliakrilamid gélelektroforézissel való előkészítéséhez 30 μΐ SDS mintafelvivő puffért adunk hozzájuk, majd a mintát 15 percig 65 ’C-on tartjuk. A mintát azután 2 percig centrifugáljuk, majd a felülúszót megtartjuk az elektroforézishez. 15 μΐ felülúszót futtatunk egy 15-20%-os denaturáló gradiens poliakrilamid gélen (Daiichi system, Enprotech), majd autoradiográfiát végzünk hogy azonosítsuk a kicsapott sejtfelszíni fehérjéket.
Az 5. ábra egy SDS poliakrilamid gél autoradiogramja, amelyen ellenanyaggal kicsapott LFA-3 sejtfelszíni fehérjék láthatók M57/CHO, normál CHO és P24/CHO sejtekből. Ebből a gélből látható, hogy a TS2/9, a 7A6 és a 202 poliklonális ellenanyag kicsapja a ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3-at expresszáló CHO sejtekből származó LFA-3at (9-es, 10-es és 11-es csík). Ezzel szemben csak a 202 poliklonális antiszérum csapja ki az LFA-3 sejtfelszíni fehéijét az M57/CHO sejtekből, amelyek expresszálják az M57 deléciós mutáns LFA-3 gént (4-es csík).
7. és 8. példa
Az M57 deléciós mutánsban hiányzó 10 aminosavas régió (lásd 1. ábra) szomszédos az N-kapcsolt glikozilezési hellyel, de nem tartalmazza azt. Annak vizsgálatára, hogy az M57 deléció régiója közvetlenül részt vesz-e a CD2-kötésben, vagy közvetve elrontja a CD2 kötődését, azáltal, hogy konformációs változást okoz az LFA-3 CD2-kötó doménjében, két további kísérletet végeztünk.
Először három nagy deléciós mutánst készítünk, amelyekből mindegyikből hiányzik egy 59 aminosavból álló rész, a természetes LFA-3 molekulával összehasonlítva. A kivágott régiókat aláhúzással jelezzük a 6. ábrán, jelzésük pedig M100, M101 és M102. Ennek a kísérletnek az a célja, hogy meghatározzuk, vajon a nagy Ml01 és Ml02 deléciókban levő konformációs változások megváltoztatják-e az M57 régió felismerési régiót (lásd 1. ábra), valamint annak kimutatása, hogy a teljes CD2 kötő dómén benne van az Ml00 régióban.
Másodszor egy szintetikus oligopeptidet, jele LF08, készítettünk, amelynek aminosav szekvenciája (7. számú szekvencia): Lys Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly Ser Leu Thr Ile Tyr [az érett LFA-3 +50 +65-ös aminosavai (lásd 1. ábra)], majd egy szilárd hordozóhoz rögzítettük és egy Jurkat sejt rozettáló vizsgálatban használtuk annak meghatározására, hogy a CD2-t expresszáló sejtek felismerik-e az LFA-3 izolált M57 régióját (lásd 1. ábra).
Nagy deléciós mutánsok készítése
A 6. ábrán a transzmembrán LFA-3 aminosav szekvenciája és nukleotid szekvenciája látható, amelyen aláhúzással jelöljük a három, M100, M101 és M102 régiót, amelyeket kivágtunk az LFA-3 cDNS-ből, így olyan géneket állítva elő, amelyek képesek a három nagy deléciós mutánst expresszálni.
Az 1. példában alkalmazott eljárást követve egy 30 bázisból álló antiszensz oligonukleotidot szintetizálunk, amely komplementer a kivágni szándékozott régiótól 5' és 3' irányban is 15-15 bázissal. A nagy deléciós mutációk készítésére használt szintetikus oligonukleotidokat az alábbiakban mutatjuk be:
Szekvencia | Az alábbi LFA-3 nukleotidokkal komplementer | Kivágott szegmens |
30. számú szekv. | 109-123+304-318 | M100 |
31. számú szekv. | 289-303+484-498 | M101 |
32. számú szekv. | 469-483-634-648 | M102 |
HU 211 476 A9
A heteroduplexek előállítását az 1. példában leírtak alapján végezzük, azzal a különbséggel, hogy 200 ng LFA-3 cDNS-t használunk. A telephibridizálást lxlO6 cpm/ml 32P-ATP-vel kinázolt oligonukleotidokkal végezzük 65 “C-on, majd 0,5xSSC-vel mossuk 60 °C-on. A pozitív telepeket EcoRI emésztéssel, valamint egy 2900 bp és egy 500 bp méretű fragmensnek 0,7%-os TAE agaróz gélen való izolálásával vizsgáljuk át.
Az expressziós vektorokat úgy készítjük, hogy az előzőek szerint előállított mutációs plazmidokból NotI enzimmel kivágjuk az LFA-3 cDNS-t. 50 pg PMDR902 eukarióta expressziós plazmidot (Biogen Inc., Cambridge, Massachusetts) 50 egység NotI restrikciós enzimmel emésztünk, majd az izolált NotI fragmenseket (0,06 pmol), amelyek az Ml00, Ml01 és Ml02 deléciós mutációkat tartalmazzák, 0,02 pmol PMDR902 DNS-sel ligáljuk, és a ligáló eleggyel Escherichia coli JA221 sejteket transzformálunk.
A pozitív telepeket telephibridizációval vizsgáljuk át. a 18-as, 19-es és 20-as oligonukleotidok próbaként való alkalmazásával, amelyeknek szekvenciája megfelel a 30. számú szekvenciának, a 31. számú szekvenciának és a 32. számú szekvenciának. Az inszertek orientációját PvuII restrikciós elemzéssel határozzuk meg, amely körülbelül 6559, 1737 és 500 bázispár méretű csíkokat eredményez 0,7%-os TAE agaróz gélen, a megfelelő orientációjú konstrukciók esetében. A kapott rekombináns expressziós plazmidokat, amelyek az M100, M101 és M102 deléciós mutációkat tartalmazzák, pPMDRM 100-4, pPMDRM 101-1 és pPMDRM 102-8 jelzéssel látjuk el. A kapott expressziós plazmidokat elektroporációval juttatjuk be CHO sejtekbe, a 2. példában leírtak alapján, azzal a különbséggel. hogy a sejteket 26 nmol/1 és 50 nmol/1 metotrexátot tartalmazó közegek között osztjuk meg.
Az M100/CHO, M101/CHO és M102/CHO transzfektánsokat Jurkat sejt kötődési vizsgálatnak vetjük alá, a 4. példában leírtak alapján. Az eredményeket a 7. ábrán mutatjuk be. Az Ml01/CHO sejtek (7C. ábra) és az M102/CHO sejtek (7D. ábra), amelyek egy olyan sejtfelszíni fehérjét expresszálnak, amely az LFA-3 érintetlen M57 CD2-kötő régiójával rendelkező sejtfelszíni fehérjével rendelkezik, a Jurkat/CHO sejtkötődési vizsgálatban összecsapódó tulajdonságokat mutatnak. A CHO kontroll sejtek (7A. ábra) és az M100/CHO sejtek (7B. ábra) nem mutatnak ilyen összecsapzódást, jelezve ezzel, hogy a CHO sejtek felszínéről hiányoznak azok a sejtfelszíni struktúrák, amelyeket a Jurkat sejtek felismernek.
Jurkat kötődés az immobilizált LF08 pepiidhez
Ionmentes vízben levő 1,4 mg szintetikus LF08 peptidet (7. számú szekvencia), vagy 2 mg/ml kontroll hepatitisz B MXC-01 peptidet (4. számú szekvencia) ΙΟΟμΙ agaróz gél gyöngyökhöz kapcsoljuk (Affi-Gel 10, BioRad, Richmond, Kalifornia), az alábbi leírás szerint: 100 μΐ Affi-Gel 10 iszapot egy kis Büchner tölcsérbe viszünk át, majd az oldószert leszívjuk. A gyöngyöket három ágytérfogatnyi hideg (4 ’C) ionmentes vízzel mossuk, majd 700 μΐ LF08 oldatba visszük át, és 4 óra hosszat 4 ’C-on inkubáljuk egy rázógépen. A felülúszóról az LF08-cal való kapcsolás előtt és után készített spektrum azt mutatja, hogy 80%os kapcsolási hatékonyságot sikerült elérni.
Kapcsolás után a nem reagált kapcsolási helyeket blokkoljuk, oly módon, hogy az LF08 vagy az MXC01 gyöngyöket etanolamin/HCl-lel (93 mmol/1, pH = 7,9) inkubáljuk 4 ’C-on, enyhe rázatás közben. A blokkolt gyöngyöket azután háromszor mossuk 0,5 mol/1 nátrium-kloriddal kiegészített PBS-sel, majd 10% FCS-sel kiegészített PBS-sel.
A Jurkat sejteket kétszer mossuk RPMI, 4 mmol/1 L-glutamin, 10% PBS összetételű oldattal, majd egyesítjük 2,5 vagy 15 μΐ LF08/Affi-Gel 10 gyöngyökkel vagy MXC-01/Affi-Gel 10 gyöngyökkel, 20 μΐ végtérfogatban. Az elegyet 30-60 percig inkubáljuk szobahőmérsékleten. Az inkubálás után a sejteket 200 μΐ RPMI-be visszük át egy 96-lyukas laposfenekű lemezen (Corning), majd 40X vagy 100X nagyítással mikroszkóp alatt vizsgáljuk. A 8A. és 8B. ábrák jellegzetes eredményeket mutatnak az LF08/Affigel gyöngyöknek a Jurkat sejtekkel való kapcsolódásáról, aminek az az eredménye, hogy a borított gyöngyök a Jurkat sejtek felszínéhez kapcsolódnak. A 8C. ábrán az MXC01 /Affigel gyöngyökkel kapott jellegzetes eredmények láthatók, amelyek azt mutatják, hogy nem képesek a Jurkat sejtek felszínéhez kötődni.
9. és 10. példa
Egy további deléciós mutánst készítettünk, amely olyan PI-kapcsolt sejtfelszíni polipeptidet eredményez a CHO sejtek felszínén, amely a természetes LFA-3 98 N-terminális aminosavát tartalmazza. A 9. ábrán a PIkapcsolt LFA-3-at kódoló cDNS-ből kivágott nukleotidokat az aláhúzott régió, a PIM3 mutatja. A PIM3 nukleotidokat az előzőkben ismertetett (1. példa) heteroduplex deléciós stratégiával vágjuk ki. Ebben az esetben egy 30 bázisból álló antiszensz oligonukleotidot (a 320.03-as oligonukleotidot) használjuk a deléciós mutagenezishez (8. számú szekvencia: TAATTGAATG CTAAGAAAGA ACTTCATGGT).
100 ng p24 plazmidot, amely a ΡΙ-hez kapcsolt LFA3-at tartalmazza, NotI enzimmel emésztünk, majd a nagy restrikciós fragmenst (amelyből hiányzik a ΡΙ-hez kapcsolt LFA-3-at kódoló szekvencia) izoláljuk. További p24 DNS-t linearizálunk Seal enzimmel. A nagy NotI restrikciós fragmenst és a Scal-gyel linearizált DNS-t denaturáljuk, összekeveijük a 320.03-as oligonukleotiddal, majd az 1. példában leírtak alapján hagyjuk újra egymáshoz illeszkedni őket. Az illeszkedés után a heteroduplexben levő lyukakat feltöltjük, majd a fragmenseket az 1. példában leírtak alapján ligáljuk.
A feltöltött, ligáit heteroduplexeket ezután Escherichia coli JA221-be transzformáljuk, és a transzformánsokat telephibridizálással vizsgáljuk át, 32P-vel jelzett 320.03 oligonukleotidot használva (lxlO6 cpm/ml) 60 ’C-on az előzőkben leírt módon. A hibridizációs szűrőket 0,5XSSC-ben mossuk 65 ’C-on, majd a pozitív telepeket autoradiográfiával azonosítjuk. Minden egyes pozitív telepből plazmid DNS-t izolálunk, majd
HU 211 476 A9
NotI enzimmel emésztjük. Az egyik plazmid, a pPIM6 NotI restrikciós enzimmel való emésztésével 2648 és 640 bázispár méretű fragmenseket kapunk, ami igazolja, hogy a pPIM-6 tartalmazza a keresett PIM3 deléciót a PI-kapcsolt LFA-3-at kódoló szekvenciában.
A pPIM-6 640 bp méretű NotI fragmensét a PMDR902 expressziós vektor (Dr. M. D. Rosa ajándéka, Biogen, Inc., Cambridge, Massachusetts) NotI hasítási helyére klónozzuk, majd Escherichia coli JA221 sejtek transzformálására használjuk. A transzformánsokat telephibridizálással vizsgáljuk át, a 32P-vel jelzett 320.3 oligonukleotidot használva próbaként. A pozitív telepekből származó plazmidokat azután izoláljuk, majd a DNS inszert orientációját restrikciós enzimes elemzéssel határozzuk meg, PvuII enzimet alkalmazva. A pPMDRM-3 rekombináns plazmid 6399, 1634 és 495 bázispár méretű Pvul! fragmenseket tartalmaz, jelezve ezzel, hogy ez a plazmid a mutált PI-kapcsolt LFA-3 gént a PMDR902 expressziós vektorban való expresszáláshoz megfelelő orientációban tartalmazza.
A P1M3 deléciós mutáns expressziója
A pPMDRM-3 plazmidot CHO DHFR“ sejtekbe juttatjuk be elektroporációval, majd 25 illetve 50 nmol/1 metotrexáttal amplifikáljuk, az előzőkben leírt módon. Az egybefüggő növekedést tartalmazó lemezekről származó sejteket FACS-szal elemezzük, TS2/9 és 7A6 MAb-okat használva, az előzőkben leírt módon. A sejtvonalban expresszált LFA-3 PIM3 deléciós mutánsa (PIM3.25.2-vel jelezzük), a CD2/LFA-3 komplex képződésben szerepet játszó epitopokat expresszál.
Annak meghatározására, hogy a TS2/9 és a 7A6 MAb-ok által felismert fehérje PI-kapcsolt-e, a PIM3.25.2 sejtek felszínén expresszált fehérjét megvizsgáljuk, hogy érzékeny-e a foszfatidilinozit-specifikus foszfolipáz C-vel (PI-PLC, beszerezhető a Biogen, Inc.-től) való kezelésre. A PIM3.25.2 sejteket 70%-os egybefüggő növekedésig szaporítjuk két 100 ram-es tenyésztő lemezen, majd 5 mmol/1 EDTA-val kiegészített PBS-sel távolítjuk el, az előzőkben leírt módon. Ezeknek a sejteknek az egyharmadát 45 percig PIPLC-vel kezeljük (1 μΐ; Biogen, Inc.) 37 ’C-on 100 μΐ alpha MEM-ben, amelyet 10% FCS-sel, 2 mmol/1 Lglutaminnal, IX penstrep mixszel és 25 nmol/1 metotrexáttal egészítettünk ki. A sejteket azután 15 másodpercig centrifugáljuk Eppendorf centrifugában, majd kétszer mossuk FACS pufferben (PBS, 0,5% BSA, 0,1% nátriumazid pH = 7,2). A mosott sejteket azután FACS pufferben szuszpendáljuk, amely FITC-vel jelzett kecske anti-egér IgG-t tartalmaz (l:50-es hígítás szérumból). A sejteket azután kétszer mossuk FACS pufferrel, 300 μΙ PBS-ben szuszpendáljuk és Falcon 2052 csövekbe visszük át FACS elemzéshez.
A 10. ábrán látható, hogy a PIM3.25.2 sejtek tisztán expresszálnak egy fehérjét a felszínükön, amelyet a TS2/9 felismer (10A. ábra, szaggatott vonal), és ez a fehérje a PI-PLC kezelés hatására fel is szabadul a sejt felszínéről (10A. ábra, pontozott vonal). Mivel a PIM3.25.2 klón sejtjeiben expresszált PIM3 fehérje a TS2/9 MAb (amely blokkolja a CD2/LFA-3 komplex képződését) által felismert LFA-3 epitopokat hordoz, ezért az a következtetésünk, hogy az érett LFA-3 89 N-terminális aminosava tartalmazza a CD2/LFA-3 komplex képződéséhez szükséges konformációs feltételeket.
Ahhoz, hogy az LFA-3 fehérje PIM3 mutánsának expresszióját fokozzuk, a PIM3.25.2 kiónt alpha* MEM-ben amplifikáljuk, amelyet 50, 100 és
200 nmol/1 metotrexátban levő 10% FCS-sel egészítünk ki. A sejteket 96-lyukas mikrotiter lemezekre szélesztjük, 20 sejt/ml koncentrációban, egybefüggő növekedésig szaporítjuk (12-17 nap), majd 100 mm-es lemezekre visszük a FACS elemzéshez (lásd a PIM3.25.2-nél), azzal az eltéréssel, hogy az LFA-3 PIM3 mutáns formáját a 7A5 MAb-bal követtük (10B. ábra, szaggatott vonal). A FACS elemzés eredményei azt mutatják, hogy az amplifikált sejtvonal, a PIM3.25.2.1OO.12, a PI-kapcsolt LFA-3 PIM3 mutáns formájából körülbelül tízszer többet expresszál. Ha a PIM3.25.2.100.12 sejteket PI-PLC-vel kezeljük, akkor az LFA-3 PIM3 mutánsoknak körülbelül 80%-a felszabadul (10B. pontozott vonal).
//. példa
A pSAB144 plazmid készítése
A pSAB 144 tartalmazza a humán IgG 1 konstans régió szekvenciáit, a CH1 régió kivételével, valamint a csuklórégió N-terminális részének első cisztein aminosavát. A humán IgG 1 nehéz lánc konstans régiót egy részleges Sau3A humán fibroblaszt genomiális könyvtárból izoláltuk (EMBL/5X. Dr. Mark Pasek ajándéka). A könyvtár DNS-t HindlII és PvuII restrikciós enzimmel emésztjük. A körülbelül 3 kb méretű fragmenseket a pSP65 vektor fragmenséhez ligáljuk (Promega, Madison, Wisconsin), amelyet a pSP65 HindlII és HincII enzimekkel való emésztésével állítunk elő. A kapott plazmid jele pAB 1. A pAB 1 plazmidot használjuk az IgG 1 nehéz lánc konstans régiót kódoló DNS forrásaként.
Ahhoz, hogy az IgGl nehéz lánc régió egy cDNS kópiáját izoláljuk, RNS-t készítünk azokból a COS7 sejtekből, amelyeket ideiglenesen transzfektáltunk a VCAMl-IgGl plazmiddal (másik jelzése pSAB133). A VCAMl-IgGl készítését a WO 90/13 300 PCT szabadalmi bejelentésben írják le. Az RNS-t reverz transzkripcióba visszük cDNS előállítása céljából, reverz transzkriptázt és random hexamereket használva indító molekulaként. 30 perces, 42 ’C-on végzett inkubálás után a reverz transzkriptáz reakciót leállítjuk, oly módon, hogy a reakcióelegyet 5 percig 95 ’C-on tartjuk. AcDNS-t azután PCR-rel (polimeráz láncreakció) amplifikáljuk [Sambrook és mtsai.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. Edn„ Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)], az alábbi, kinázozott indító molekulákat alkalmazva:
370-31:
(34. számú szekvencia):5'TCGTC GAC AAA ACT CAC ACATGCC (35. számú szekvencia): asp lys thr his thr cys amely egy Sáli hasítási helyet tartalmaz, és
HU 211 476 A9
370-32 (36. számú szekvencia):
5'GCAAATGAGT GCGGCGGCCG CCAA amely az IgGl nehéz lánc konstans régió C-terminális lizinjét kódolja, amelyet egy NotI hasítási hely követ.
A PCR-rel amplifikált cDNS-t agaróz gélelektroforézissel és üveggyöngy elúcióval tisztítjuk a pNN03 plazmidban való klónozáshoz. A pNN03 plazmidot úgy állítjuk elő, hogy restrikciós enzimes emésztéssel eltávolítjuk a kereskedelmi forgalomban levő pUC8 plazmidból (Pharmacia, Piscataway, New Jersey) a szintetikus polilinker szekvenciát, és a szintetikus polilinker szekvenciát az alábbi új szintetikus szekvenciával helyettesítjük (37. számú szekvencia):
GCGGCCGCGG TCCAACCACC AATCTCAAAG CTTGGTACCC GGGAATTCAG ATCTGCAGCA TGCTCGAGCT CTAGATATCG ATTCCATGGA TCCTCACATC CCAATCCGCG GCCGC.
A tisztított, PCR-rel amplifikált cDNS fragmenst pNN03-hoz Iigáljuk, amelyet EcoRV restrikciós enzimmel emésztettünk, defoszforileztünk és alacsony olvadáspontú agaróz gélen végzett elektroforézissel tisztítottunk. A ligálási reakcióelegyet használjuk Escherichia coli JA221 transzformálására, majd a kapott telepeket átvizsgáljuk, hogy tartalmaznak-e egy körülbelül 700 bázispár méretű inszertet hordozó plazmidot. A helyes inszertet DNS szekvencia elemzéssel azonosítottuk, majd a plazmid a pSAB 144 jelzést kapta.
A pSAB149 plazmid készítése
A pS AB 149 plazmidot az alábbiak szerint állítjuk elő. Az LFA-3-at kódoló pHT16-6 plazmidot PCR amplifikálásnak vetjük alá a 320-04 és 320-05 oligonukleotidok alkalmazásával; a 320-04 oligonukleotid tartalmaz egy NotI hasítási helyet és az LFA-3 szignálszekvencia 1-7es aminosavainak megfelelő nukleotidokat:
38. számú szekvencia: 5' GAGGCGGCCG CC ATG GTT GCT GGG AGC GAC GCG
39. számú szekvencia: met val ala gly ser asp ala.
A 320-05-ös oligonukleotid megfelel az LFA-3 8692-es aminosavainak, és tartalmaz egy Sáli hasítási helyet (40. számú szekvencia): 5' AAGTCGACAT AAAGAAAGAA ClÍCAT. Az amplifikált DNS fragmenst a pNN03 vektorfragmensbe Iigáljuk, amelyet EcoRV-tel hasítottunk.
A pSABI32 készítése
A pJOD-s plazmidot [Barsoum, J.: DNA and Cell Bioi. 9, 293-300 (1990)] úgy módosítjuk, hogy egy NotI hasítási helyet illesztünk az adenovírus fő késői promotere után, oly módon, hogy a NotI fragmenseket be tudjuk illeszteni az expressziós vektorba. A pJOD-S plazmidot a plazmid DNS NotI hasításával linearizáljuk. A túlnyúló 5' végeket tompavéggé alakítjuk Mung Beán nukleáz alkalmazásával, majd a linearizált DNS fragmenst alacsony olvadáspontú agaróz gélen tisztítjuk. A DNS fragmenst T4 DNS ligázzal religáljuk. A ligáit molekulákat azután Escherichia coli JA221 törzsbe transzformáljuk. A telepeket megvizsgáljuk, hogy a bennük levő plazmidokból hiányzik-e a NotI hasítási hely. A kapott vektor jelzése pJOD-S delta NotI. A pJOD-8 delta Notl-et Sáli restrikciós enzimmel linearizáljuk, majd az 5' végeket defoszforilezzük, borjúbél alkalikus foszfatáz alkalmazásával. A linearizált DNS fragmenst alacsony olvadáspontú agaróz gélen tisztítjuk, majd foszforilezett A CE175 oligonukleotid jelenlétében Iigáljuk, amelynek szekvenciája az alábbi: (41. számú szekvencia) TCGACGCGGC CGCG. A ligáló elegyet Escherichia coli JA221 sejtekbe transzformáljuk, majd megvizsgáljuk, hogy a telepekben levő plazmid hordozza-e a NotI hasítási helyet. A kapott plazmid jele pNMDR901.
Ahhoz, hogy az SV40 promoterben - amely a DHFR cDNS transzkripcióját szabályozza - levő két SV40 fokozó ismétlődést kivágjuk, a pMDR901 és pJODdeltae-tPA [Barsoum: DNA and Cell Bioi., 9, 293-300 (1990)] plazmidokat AatlI és DralII enzimekkel hasítjuk. ApMDR901-ből származó 2578 bázispár méretű AatlI-DralII fragmenst és a pJODdeltae-tPAból származó 5424 bázispár méretű fragmenst alacsony olvadáspontú agaróz gélelektroforézissel izoláljuk, majd összeligáljuk őket. Az Escherichia coli JA221 sejtekbe való transzformálás után a kapott plazmidot, a pMDR902-t izoláljuk. A pSAB132 plazmidot azután úgy alakítjuk ki, hogy elimináljuk a pMDR EcoRI-NotI fragmensét, amely az adenovírus fő késői promoterét tartalmazza, majd a pCMV-B plazmidból (Clontech, Palo Alto, Kalifornia) származó 839 bázispár méretű EcoRI-NotI ffagmenssel helyettesítjük, amely a humán citomegalovírus közvetlen koreai promoterét és fokozó szekvenciáját tartalmazza.
A pSAB 152 készítése
A pSAB 144 plazmidot Sáli és NotI restrikciós enzimmel emésztjük, majd a 693 bázispár méretű fragmenst izoláljuk. A pSAB 149 plazmidot Sáli és NotI restrikciós enzimmel emésztjük, majd a 365 bázispár méretű fragmenst izoláljuk. A két fragmenst összeligálva kapjuk a pSAB 132 plazmidot, amelyet NotI restrikciós enzimmel emésztünk, és az 5' végét borjúbél alkalikus foszfatázzal defoszforilezzük. A kapott plazmid, a pSAB 152 tartalmazza az LFA-3 szignálszekvenciát kódoló LFA-3 szekvenciát, az érett LFA-3 92 N-terminális aminosavát, tíz aminosavat az IgGl csuklórégiójából és az IgGl Ch2 és CH3 konstans doménjeit (lásd 12. ábra). A pSAB 152-vel transzformált Escherichia coli JA221 sejteket az American Type Culture Collection-nél helyezzük letétbe (Rockville, Maryland), 68 720 letéti számon.
A pNNM57-14 készítése
Amint azt az 1. példában említettük, a pLFA3M574A egy olyan DNS szekvenciát tartalmaz, amely egy 30 bázispár méretű, az M57 régióra (azaz a 9. számú szekvencia 244-273-as nukleotidjai) terjedő deléciót tartalmazó LFA-3-at kódol. A pLFA3M57-nek ezt a kódoló szekvenciáját PCR amplifikálásnak vetjük alá, a 320-04 oligonukleotidot (38. számú szekvencia) és a 320-05 oligonukleotidot (40. számú szekvencia) alkalmazva, azzal a céllal, hogy amplifikáljuk az LFA-3 M57 deléciós mutánsa szignálszekvenciáját és első 82
HU 211 476 A9 aminosavát kódoló DNS szekvenciát. ApCR-rel amplifikált DNS-t alacsony olvadáspontú agaróz gélelektroforézissel tisztítjuk.
A tisztított, PCR-rel amplifikált DNS-t azután a pNN03 plazmid EcoRV hasítási helyére ligáljuk. A ligáit DNS-t azután Escherichia coli JA221 sejtekbe transzformáljuk, és a kapott transzformánsokat átvizsgáljuk (NotI emésztéssel), hogy van-e bennük olyan plazmid, amely egy körülbelül 300 bázispár méretű inszertet tartalmaz. A keresett inszertet DNS szekvenciájának elemzésével azonosítjuk. A kapott plazmidot, amely a körülbelül 300 bázispár méretű inszertet tartalmazza, pNNM57-14 jelzéssel látjuk el.
Λ pNM57Ig-5 készítése
A pNNM57-14 plazmidot NotI és Sáli restrikciós enzimmel emésztjük, majd a 310 bázispár méretű fragmenst alacsony olvadáspontú agaróz gélelektroforézissel izoláljuk. Ezt a fragmenst és a pSAB144 plazmid (lásd fent) 693 bp méretű Sall-NotI fragmensét NotI restrikciós enzimmel emésztett, borjúbél alkalikus foszfatázzal kezelt pSAB132 plazmiddal (lásd fent) ligáljuk. A ligáló elegyet használjuk Escherichia coli JA221 transzformálására, majd a transzformáns telepeket hibridizálással vizsgáljuk át, egy y-32P-ATP-vel jelzett oligonukleotidot használva erre a célra, amelynek szekvenciája a 17. számú szekvencia. A SAB132ben az inszert kívánt orientációját PvuII restrikciós enzimes emésztés után egy 6913 és egy 2029 bázispár méretű fragmens azonosításával igazoljuk. A kapott plazmid jelzése pM57Ig-5. A DNS szekvencia elemzése megerősítette, hogy a pMI57Ig egy olyan DNS szekvenciát tartalmaz, amely tartalmazza az LFA-3 szignálszekvenciát, az LFA-3 M57-es deléciós mutánsa első 82 aminosavát, a humán IgGl csuklórégiójának tíz aminosavát, és az IgGl CH2 valamint CH3 konstans doménjét.
72. példa
Az LFA3T1P előállítása tranziensen transzfektált
COS7 sejtekből
Ahhoz, hogy az LFA-3-Ig fúziós fehérjét, az LFA3TIP-et előállítsuk [amelyet LFA-(92)IgG jelzéssel is elláttak], a pSAB 152 plazmid DNS-t elektroporációval COS7 sejtekbe transzfektáljuk, az alábbiak szerint. A pSAB152 plazmid DNS-ből négy 200 μΐ-es alikvot részt etanollal kicsapunk, 350 pg ultrahanggal kezelt heringspermával együtt. A DNS-t kicsapjuk, majd 0,8 ml lxHEBS-ben (20 mmol/1 HEPES/pH = 7,05, 137 mmol/1 NaCl, 5 mmol/1 KC1, 0,7 mmol/1 Na2HPO4 6 mmol/1 dextróz) oldjuk. 4 db egybefüggő növekedést mutató T150 lombikban levő COS7 sejteket (8xlO7 sejt) 10 borjúmagzat szérummal és 4 mmol/1 glutaminnal kiegészített DMEM-ben (Gibco, Gaithersburg, Maryland) oldott tripszinnel kezelve eltávolítjuk. Az egyes lombikokból származó sejteket 15 ml-es Corning polipropilén csövekbe visszük át, majd egy IEC centrifugában ülepítjük (1000/perc, 4 perc, szobahőmérséklet). A közeget leszívjuk, majd a sejteket DNA-HEBS oldatban szuszpendáljuk és BioRad (Richmond, Kalifornia) elektroporációs küvettába visszük át. A küvettákat egy Bio-Rad Gene Pulser-be tesszük, majd az elektroporációt 280 volt feszültség és 960 pFd kapacitás mellett végrehajtjuk. A sejteket 10 ml DMEM táptalajban szuszpendáljuk, majd az előzőkben leírt módon egy IEC centrifugában ülepítjük. Minden sejtet egy kétliteres sejtszaporítóba viszünk át (DMEM táptalajban), majd a tenyészközeget 72 óra elteltével kinyerjük, az LFA3TIP fehérje tisztításához.
A szekretált LFA3TIP-nek a transzfektált COS7 tenyésztő táptalajban levő koncentrációját ELISA-val határozzuk meg. Fisher 96-lyukas laposfenekű lemezeket (Corning 2580) 50 μΐ kecske anti-humán IgG-vel (H+L) borítunk (Jackson Immuno Research, West Grove, Pennsylvania, katalógusszám: 109-005-088), amelyet 5 pg/ml-re hígítunk lxPBS-ben. Ezeket a lemezeket éjszakán át 4 °C-on inkubáljuk. A lemezeket a következő napon hatszor mossuk desztillált vízzel, majd lyukanként 150 μΐ blokkpufferrel blokkoljuk (2%-os normál kecskeszérum lxPBS-ben). A puffért kétórás, szobahőmérsékleten végzett inkubálás után eltávolítjuk, majd különböző koncentrációjú kondicionált tápközeget adunk. Standard görbe készítéséhez kontrollként teljes humán IgG (Jackson Immuno Research, West Growe, Pennsylvania, katalógusszám: 099-000603) sorozathígítását is felvisszük ugyanarra a lemezre. Egyórás, szobahőmérsékleten történő inkubálás után a lemezeket négyszer mossuk 0,01% Tween 20 lxPBSben készített oldatával, majd alkalikus foszfatázzal konjugált, Fc-fragmensre specifikus anti-humán IgG (Jackson Immuno Research, West Growe, Pennsylvania, katalógusszám: 109-055-098) l:5000-es szérumhígítását adjuk az egyes lyukakhoz. Egy óra elteltével a lemezeket hatszor mossuk 0,1 % Tween 20-szal.
A lemezeket egy alábbi összetételű oldattal hívjuk elő: 10 mmol/1 Ca2+, Mg2+ 10%-os dietanolaminban készített oldatának 1:10 hígítása (pH = 9,6), plusz 5 mg/ml 4-nitro-fenil-foszfát (Boehringer Mannheim Biochemicals, Indianapolis, Indiana, katalógusszám: 738-352). A reakciói 3 mol/1 nátrium-hidroxid hozzáadásával állítjuk le, majd 405 nm-en leolvassuk, egy Microdevices mikrotiter-lemez leolvasóval.
LFA3T1P előállítása stabilan transzformált CHO sejtvonalbó!
Rekombináns LFA3TIP expressziós vektort készítünk az előzőkben leírt módon, amely képes stabilan fennmaradni CHO sejtekben, és ezáltal az LFA3TIP folyamatos expressziója érhető el.
A pSAB152 LFA3TIP kódoló szekvenciáját tartalmazó NotI fragmenst alacsony olvadáspontú agaróz gélelektroforézissel tisztítjuk. A fragmenst a pMDR902 expressziós vektor (lásd 11. példa) NotI klónozó helyére ligáljuk. A kapott ligáló elegyet használjuk Escherichia coli JA221 transzformálására, majd azokat a telepeket, amelyek a kívánt, helyes orientációjú inszertet tartalmazzák, ügy azonosítjuk, hogy belőlük PvuII restrikciós enzimmel való emésztés hatására 6599, 2058 és 487 bázispár méretű fragmenseknek kell keletkezni. A pMDR902 vektorban levő helyes inszertet
HU 211 476 A9
DNS szekvencia elemzés alapján azonosítjuk. A kapott rekombináns expressziós vektor jele pMDR(92)Ig-3.
A pMDR(92)Ig-3 rekombináns expressziós vektort CHO sejtekbe juttatjuk be elektroporációval, J. Barsoum publikált leírása szerint [DNA Cell Bioi. 9, 293300 (1990)], az alábbi eltérésekkel: 50 μg AatlI restrikciós enzimmel emésztett plazmid DNS-t és 350 μg ultrahanggal kezelt heringsperma DNS-t használunk az elektroporációs leírásban. Emellett, a sejteket 25 vagy 50 nmol/1 metotrexáttal (MTX) kiegészített alpha komplett táptalajban választjuk ki.
A szekretált LFA3TIP expressziós szintjének meghatározásához a kiónokat egy laposfenekű, 96 lyukas mikrotiter lemezre visszük, amelyben a sejteket egybefüggő növekedésig szaporítjuk, majd ELISA-val vizsgáljuk (lásd a továbbiakban). Egy klón növekedett 25 nmol/1 MTX jelenlétében, ennek jele LEA3TIP.25.11, és ez 510 pg LFA3TIP-et expresszált egy ml tenyészközegben. Ezt a kiónt elszaporítjuk. Az amplifikálást úgy hajtjuk végre, hogy egy 96-lyukas lemezre 1 sejt per lyuk koncentrációban felvisszük a sejteket. A lyukak komplett táptalajt tartalmaznak, 50 vagy 100 nmol/1 MTX-szel kiegészítve. A kiónokat egybefüggő növekedésig szaporítjuk, majd ELISA-val vizsgáljuk. Két klón, az LFA3TIP.25.11.50.10A és az LFA3TIP.25.il.50.5B nagyobb mennyiségű LFA3TIP-et szekretál (azaz 5060 pg LFA3TIP per ml tenyészközeg), ezeket a további vizsgálatok és tisztítás céljára elszaporítjuk.
A szekretált LFA3TIP koncentrációját a pMDR(92)Ig-3 plazmidot hordozó CHO sejtek tenyészközegében (azaz a kondicionált közegben) ELISAval határozzuk meg.
Immulon 2 lemezek (Dynatech, Chantilly, Virginia) lyukait TS2/9 anti-LFA3 MAb-val (Dr. Timothy Springer ajándéka) borítjuk, oly módon, hogy 50 pl TS2/9 anti-LFA-3 MAb-ot, amelyet 0,05 mol/1 nátrium-karbonát/bikarbonát pufferben (pH = 9,6) 25 pg/ml-re hígítunk, Parafilmmel borítjuk, majd éjszakán át szobahőmérsékleten tartjuk. A következő napon a lemezeket hatszor mossuk ionmentes vízzel és lyukanként 150 pl blokkoló pufferrel blokkoljuk (5% borjúmagzat szérum lxPBS-ben), amelyet egy 2 mikronos szűrőn szűrtünk át. A puffért kétórás, szobahőmérsékleten végrehajtott inkubálás után eltávolítjuk, majd kondicionált tápközeget adunk hozzá, különböző hígításokban. Standard görbe készítéséhez kontrollként LFA-3 sorozathígítását (50 pl per lyuk) is felvisszük. Tipikus esetben a legtöményebb LFA-3 standardot tartalmazó lyuk 50 pl LFA-3 oldatot tartalmaz, amely 10 ng LFR-3-at tartalmaz lxPBS-ben. A negatív kontroll az lxPBS-ben hígított blokkpuffer. A mintákat és a kontrollokat egy óra hosszat szobahőmérsékleten inkubáljuk.
A lemezeket azután hatszor mossuk ionmentesített vízzel. Mindegyik lyukat azután nyúl poliklonális antiLFA-3 anti szérum (azaz például az előzőkben említett 202 antiszérum) l:5000-es hígításával töltjük fel (a hígítás lxPBS-ben oldott 5%-os borjúmagzat szérummal történik). Egy óra hosszat tartjuk szobahőmérsékleten, majd a poliklonális anti-LFA-3 antiszérumot eltávolítjuk, és a lyukakat négyszer mossuk lxPBS-ben készített 0,05% Tween-20 oldattal. Ezután mindegyik lyukat 50 pl HRP-kecske anti-nyúl IgG (H+L) (Jackson Immuno Research Laboratories, Inc., West Growe, Pennsylvania; katalógusszám: 111-035-045) 1:10000es hígításával töltjük fel. A hígítást 2% teljes egérszérumot (Cappel, katalógusszám 5011-1380) tartalmazó blokkpufferrel végezzük. A lemezeket azután 50-60 percig inkubáljuk szobahőmérsékleten.
A HRP-kecske anti-nyúl IgG(H-t-L) oldatot eltávolítjuk, majd a lyukakat hatszor mossuk 0,05% Tween20 lxPBS-ben készített oldatával. Ezután 50 pl HRPszubsztrát puffért adunk az egyes lyukakhoz, szobahőmérsékleten. A HRP szubsztrát puffért az alábbiak szerint állítjuk elő: 0,5 ml 42 mmol/1 3,3',5,5'-tetrametilbenzidin (TMB), (ICN Immunobiologicals, Lisle, South Carolina, katalógusszám 980 501) DMSO-ban (Aldrich) készült oldatát lassan hozzáadjuk 50 ml szubsztrát pufferhez (0,1 mol/1 nátrium-acetát/citromsav pH = 4,9), majd hozzáadunk 7,3 pl 30%-os hidrogén-peroxidot (Sigma, katalógusszám: H-1009).
Az egyes lyukakban a kék szín kifejlődését 650 nm-en mérjük, mikrotiter-lemez leolvasóval. 7-10 perc elteltével a kifejlődést 50 μ] 1 mol/1 kénsav hozzáadásával állítjuk le. A kapott sárga színt 450 nm-en olvassuk le mikrotiter-lemez leolvasóval. A negatív kontroll lyukat használjuk a gép alapjelének beállítására.
Az M57IgG előállítása
Egy fúziós fehérjét, amely az LFA3TIP-nek egy olyan mutánsa, amelyből hiányzik az LFA-310 aminosavból álló M57-es régiója (M57IgG), lényegében az előzőkben az LFA3TIP-re ismertetett módszerrel állítunk elő.
13. példa
Az LFA3TIP tisztítása
A COS7 (pSAB152) kondicionált tenyészközeget tízszeresre töményítjük AMICON SÍ Y30 spirális cartridge rendszert alkalmazva (AMICON, Danvers, Massachusetts). A koncentrátumot 4x50 ml-es alikvot részekre osztjuk, majd éjszakán át 4 °C-on batch-abszorbciót végzünk alikvot részenként 200 μΐ Protein A Sepharose 4B-vel (SIGMA, St. Louis, Missouri). A gyöngyöket 1000/perc fordulatszámmal ülepítjük egy klinikai centrifugában, egyesítjük, majd egy 5 mm átmérőjű oszlopba töltjük. A gyantát 20 ml PBS-sel mossuk, amelyet 500 mmol/1 nátrium-kloriddal egészítettünk ki, majd tiszta PBS-sel mossuk. A megkötött fehérjéket 150 μΐ-es frakciókban eluáljuk 50 mmol/1 glicin, 250 mmol/1 NaCl (pH = 3,0) összetételű oldattal 15 μ] 1 mol/1 HEPES-t (pH = 7,8) tartalmazó csövekbe. Az egyes frakciókból 10 μΙ-t 12%-os nemredukáló SDS-poliakrilamid gélen futtatjuk. Az eluált fehérjét tartalmazó frakciókat egyesítjük, majd Superose-12 gélszűrő kromatográfiának vetjük alá, kifejlesztő oldószerként PBS-t alkalmazva (Pharmacia/LKB, Piscataway, New Jersey).
A fehérjecsúcsot tartalmazó frakciókból (meghatározása: az OD mérése 280 nm-en) 10 μΙ-es alikvot részeket futtatunk 12%-os SDS-poliakrilamid gélen,
HU 211 476 A9 nem-redukáló körülmények között, majd egyesítjük az LFA3TIP-et tartalmazó frakciókat, amelyekben alacsony a szennyező fehérjék koncentrációja (SDS-poliakrilamid gélek és Westem-blot elemzés alapján meghatározva) [Towbin és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 74, 4350-54 (1979); Antibodies: A Laboratory Manual 474-510 (Cold Spring Harbor Laboratory, 1988)], és egy YM30 Centricon berendezéssel (AMICON, Danvers, Massachusetts) töményítjük. Az LFA-3-at Western-blotokon mutatjuk ki, 202 nyúl anti-LFA-3 poliklonális antiszérumot (lásd a 3. példát), valamint kecske anti-nyúl IgG-t használva, amelyet tormaperoxidázzal jeleztünk (Sigma, St. Louis, Missouri). A biotokat Amersham ECL kimutatási kittel hívjuk elő (RPN 2106, Amersham, Arlington Heights, Illinois). A végül egyesített oldatot 12%-os SDS-poliakrilamid gélen futtatjuk, nem redukáló körülmények között, tisztaságának megállapítására. Az UV abszorbciós spektrumot vesszük fel, a koncentráció meghatározására. Az összes, Protein A-val tisztított készítményről kiderült, hogy egyetlen szenynyezést tartalmaznak, ami a legnagyobb valószínűséggel szarvasmarha IgG, és ami a tenyésztő közeg borjúmagzat szérumában található, és ami együtt tisztul az LFA3TIP-pel.
Az LFA3TIP tisztaságát denaturáló és nem-denaturáló SDS poliakrilamid gélelektroforézissel határozzuk meg (13. ábra). Az SDS poliakrilamid gélelektroforézis eredményei azt mutatják, hogy az LFA3TIP, amely a pSAB 152 plazmidok hordozó COS7 sejtek tenyészközegéből tisztítható, a sejttenyésztő közegben két LFA3-Ig fúziós fehérje monomer dimerjeként található meg, melyeket diszulfid hidak kötnek össze.
Az a tény, hogy az LFA3TIP a sejttenyésztő közegben található, arra utal, hogy csakúgy mint az LFR-3 esetében, a szignálpeptid szekvencia normálisan működik, azaz a szignálpeptid lehasad az LFA3TIP LFA-3 doménje N-terminális régiójáról az LFA3TIP fehérjének a sejtmembránon keresztül történő szekréciója során.
Az M571gG tisztítása
Az M57IgG-t a kondicionált tenyészközegből ugyanúgy tisztítjuk, mint azt az előzőkben az LFA3TIP-re leírtuk. Hasonló szennyeződések figyelhetők meg.
14. példa
Az LEA3T1P kötődés FACS elemzése
Jurkat sejteket viszünk át számos Eppendorf csőbe, lxlO5 sejt/cső koncentrációban. A sejteket 10 másodpercig ülepítjük Eppendorf mikrocentrifugában, a közeget leszívjuk, majd az üledéket 100 μΐ LFA3TIP-ben vagy TS2/18 anti-CD2 monoklonális ellenanyagban (MAb) [Sanchez-Madrid és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 79, 7489-93 (1982)] oldjuk, mindegyiket 10 μg/ml koncentrációban, FACS pufferben (PBS, 0,1% NaN3, 0,5% BSA pH = 7,2). A sejteket jégen inkubáljuk 30 percig, kétszer mossuk FACS pufferrel, majd 100 μΐ megfelelő szekunder ellenanyaggal inkubáljuk, hogy kimutassuk a
Jurkat sejtekhez kötődő MAb-ket. A FITC-konjugált kecske anti-egér IgG (H+L) F(ab')2-t (Jackson Immunoresearch) használjuk a TS2/18 anti-CD2 MAb kimutatására, és R-fikoeritrinnel konjugált AP kecske antihumán IgG F(ab')2-t (Jackson Immunoresearch) használunk a Jurkat sejtekhez kötődő LFA3TIP kimutatására. A FITC kecske anti-egér IgG F(ab')2-t 1:50 arányban hígítjuk FACS pufferben, majd az R fikokeritrinnel konjugált AP kecske anti-humán IgG F(ab')2-t 1:20 arányban hígítjuk FACS pufferben. A sejteket 30 percig inkubáljuk jégen, kétszer mossuk, majd szuszpendáljuk 300 μΐ lxPBS-ben és a fluoreszcenciát a sejtosztályozóval mutatjuk ki.
A kompetíciós vizsgálatokhoz a Jurkat sejteket Eppendorf csövekben szuszpendáljuk, az előzőkben leírt módon, majd LFA3TIP-t adunk hozzá 10 pg/ml koncentrációban, FACS pufferben. A sejteket 30 percig inkubáljuk jégen, majd kétszer mossuk FACS pufferrel. A sejteket 30 percig jégen inkubáljuk, majd kétszer mossuk FACS pufferrel. Az üledékeket azután 100 μΐ 1:100 hígítású (FACS pufferben) anti-CD2 MAb-t tartalmazó aszcitesz-folyadékokban szuszpendáljuk: Tll], TI 12 vagy TI 13 (mindegyik Dr. Ellis Reinherz ajándéka, Dana Farber Cancer Institute, Boston, Massachusetts). A sejteket 30 percig inkubáljuk jégen, kétszer mossuk, majd újra szuszpendáljuk 1:20 hígításban R-fikoeritrinnel konjugált AP kecske anti-humán IgG F(ab')2-ben, a megkötött LFA3TIP kimutatására. 30 perces jégen való inkubálás után a sejteket kétszer mossuk, majd újra szuszpendáljuk 300 μΙ lxPBS-ben, majd egy sejtosztályozóval elemezzük.
A TS2/18 monoklonális ellenanyagok és a Tűiben levő monoklonális ellenanyagok specifikusak a CD2 LFA-3-kötő doménjére. Tehát ezekről az ellenanyagokról elvárható, hogy kötődnek a Jurkat sejtek felszínén levő CD2 molekulákhoz, és ugyanazokat a helyeket foglalják el mint amelyekhez az LFA3TIP kötődik. Ennek megfelelően, amikor a Jurkat sejteket először feleslegben levő TS2/18 MAb vagy TI 1 j aszcitesz folyadékkal inkubáljuk, akkor várhatóan egyetlen dómén sem, vagy csak néhány dómén hozzáférhető az R-fikoeritrinnel konjugált LFA3TIP molekulák megkötődéséhez. Amint az a 14A. ábrán látható, ha a Jurkat sejteket vagy TS2/18 MAb-bal vagy Tll] aszcitesz folyadékkal előinkubáljuk, akkor csak néhány sejt jelölődik az LFA3TIP-pel. Afestetlen kontrollal közel azonos jel figyelhető meg. Ezzel szemben, akár a TS2/18 akár a Tll] aszcitesz folyadék távollétében az LFA3TIP kötődik a Jurkat sejtekhez, és a sejtek jelentős részét megjelöli ( 14A. ábra).
A Tll2 és Tll3 aszcitesz folyadékban jelenlevő MAb-ok specifikusak a CD2-re, de nem ugyanazokat az epitopokat ismerik fel, mint amelyek a CD2-nek a CD2/LFA-3 komplexképződésében játszanak szerepet. Amint a 14B. ábráról látható, ha a Jurkat sejteket TI 12 vagy TI 13 aszcitesz folyadékkal előinkubáljuk, ez nem akadályozza meg, hogy az LFA3TIP kötődjön a Jurkat sejtekhez. A 14A. és 14B. ábrákon látható eredmények azt mutatják, hogy az LFA3TIP tartalmazza a funkcionális CD2-kötő dómén LFA-3-at.
HU 211 476 A9
75. példa
Kevert limfocita reakció
A CD2/LFA-3 komplex képződésének és a T-sejt aktiválásnak egy funkcionális vizsgálati módszere a kevert limfocita reakció („MLR”) [Krensky és mtsai.: J. Immunoi. 131 (2), 611-616 (1983); Bradley: „Mixed Lynphocyte Responses”, Selected Methods in Cellular Immunology (szerk. Mishell és Shiigi), 162-164 (W. H. Freeman & Co„ San Francisco, 1980)]. Ez a vizsgálat a T limfociták aktiválásán alapul perifériális vér limfociták („PBL-ek”) egy populációjában, mikor a T-limfociták („válaszoló sejtek”) felismerik az alloantigéneket nem szaporodó allogén PBL-ekben („serkentő sejtek”). Ez az aktiválás a sejt-sejt tapadás következtében lép fel, és részben a T-limfocitákon levő CD2 molekuláknak az allogén PBL-eken levő LFA-3 molekulákhoz való kötődése közvetíti.
A PBL-eket két allogén humán donor 30 ml véréből tisztítjuk Ficoll-Paque gradiensen (Pharmacia, Piscataway. New Jersey, katalógusszám: 17-0840-02). A vért 1:2 arányban hígítjuk RPMI közegben, majd Ficoll gradiensen felülrétegezzük 2:1 arányban (30 ml vér:15 ml Ficoll). A sejteket a gradiensen centrifugáljuk át Sorvall RT6000 centrifugával (1600/perc, 20 °C, 30 perc). A PBL-eket tartalmazó interface-t 50 ml-es polipropilén centrifugacsövekbe (Corning 25331) gyűjtjük, majd RPMI közeggel felülrétegezzük. A sejteket azután centrifugálással ülepítjük (Sorvall RT6000 centrifuga, 1400/perc, 4 °C, 15 perc). Az üledékben levő sejteket kétszer mossuk 50 ml RPMI-vel, majd az előzőkben leírt módon ülepítjük. A PBL-eket RPMI komplett táptalajban szuszpendáljuk (RPMI, 10% Hyclone FCS, 4 mmol/Ι glutamin, Pen-Strep) 3xl06 sejt/ml koncentrációban. A serkentő sejtek előállításához az egyik donortól származó PBL-eket 2000 rad-dal besugározzuk egy Gammacell Irradiator-ban, majd 3x106 sejt/ml végkoncentrációt állítunk be.
Az ellenanyagokat vagy az LFA3TIP mintákat a 15. ábrán jelzett koncentrációban tesszük 96-lyukas, kerekfenekű polisztirol lemezekre (Corning 25850). Mind a MAb-ok mind az LFA3TIP esetében a legmagasabb használt koncentráció 5 pg/ml. Minden hígítást és inkubálást RPMI komplett táptalajban végzünk. A válaszoló sejteket (ezeket nem sugároztuk be) és a besugárzott serkentő sejteket 1:1 arányban adjuk a lyukakhoz, mindegyiknek Ι,όχΙΟ5 sejt/Iyuk a végkoncentrációja a lyukakban, és a lemezeket öt napig 37 °C-on inkubáljuk. Az ötödik napon a sejteket impulzusjelzésnek vetjük alá, 1 pCi [metil-3H)timidinnel (New England Nuclear, Boston, Massachusetts, NET-027) 15 órán át, majd egy Tomtech 96 lyukas harvesterrel nyerjük ki. A besugározatlan T-limfocita populáció szaporodását úgy mérjük, hogy meghatározzuk a 3H-timidin beépülését a sejtekbe, jelezve a jelzett timidin beépülését a T-limfocita szaporodás során. Ezt az MLR vizsgálatot használva, számos különböző MAb-ot és CD2kötő molekulát vizsgáltunk, abból a szempontból, hogy milyen hatással vannak a CD2/LFA-3 komplex képződésére és a T-sejtek aktiválására.
Az 1E6 anti-LFA-3 MAb (az 1E6-2C12 hibridómával előállítva, ATCC letéti száma HB 10693) specifikus az LFA-3 CD2-kötő doménjére. Amint az a 15. ábráról látható, ha MAb-ok vannak jelen az MLR vizsgálatban, akkor a T-sejt aktiválás dózisfüggő gátlása figyelhető meg. Ez az eredmény konzisztens azzal a véleménnyel, hogy az 1E6 MAb-ok kötődnek az LFA3 CD2-kötő doménjeihez, megakadályozzák, hogy CD2/LFA-3 komplexek keletkezzenek a serkentő és a válaszoló sejtek között, és ezáltal gátolják a T-sejtek aktiválódását a válaszoló sejtek populációjában.
Az LFA3TIP hasonló dózisfüggő módon gátolja a T-sejtek aktiválását az MLR vizsgálatban (lásd 15. ábra). Ahhoz, hogy kizárjuk annak a valószínűségét, hogy az 1E6 MAb-ok vagy az LFA3TIP IgG része hozzájárul a T-sejt aktiválás megfigyelt gátlásához, aspecifikus humán IgGl-et (Pierce, Rockford, IL) vizsgálunk az MLR vizsgálatban. Amint a 15. ábrán látható, az aspecifikus humán IgG nem mutatja a T-sejt aktiválás dózisfüggő gátlását, ami az LFA3TIP-nél vagy az 1E6 MAb-oknál megfigyelhető.
Ezeket az eredményeket összerakva azt láthatjuk, hogy az LFA3TIP-nek az MLR vizsgálatban a T-sejt aktiválásra kifejtett gátló hatása a fúziós fehérje LFA-3 doménjében gyökerezik, és nem az IgG doménjében.
Egyéb molekulák gátló aktivitása a T-sejt aktiválásra
Az LFA3TIP és 1E6 MAb-ok mellett az alábbi molekuláknak is megvizsgáltuk a T-sejt aktiválásra gyakorolt gátló hatását az MLR vizsgálatban: 7A6 MAb (az LFA-3 CD2-kötő doménjére specifikus MAb, amelyet a 7A6-2E5 hibridóma termel, ATCC letéti száma HB 10695), TS2/18 [anti-CD2 maB; Sanchez-Madrid és mtsai.: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 79, 7489-93 (1982)]; hlgG (aspecifikus össz-humán IgGl), PI-LFA3 (multimer ΡΙ-kapcsolt LFA-3, amely intermolekuláris hidrofób kölcsönhatásban keletkezik az egyes PI-LFA-3 monomer Pl horgonyrégiójában), és egy CD4-IgGl fúziós fehérje (az LFA3TIP analógja, de a CD4 egy részét tartalmazó N-terminális régiót tartalmaz, lásd például a WO 89/01 940 számú PCT szabadalmi bejelentést).
Minden egyes említett molekula gátló aktivitásának az összehasonlítása a 16. ábra oszlopgrafikonján látható. A 16. ábrán látható „LFA3IgGA” és „LFA3IgG72A” jelzés az LFA3TIP-nek a tisztasági fokban eltérő készítményeit jelöli, azaz 75 vagy 50%os tisztaságot. Kontrollként egy „hamis” készítményt, amelyet csak a vektor DNS-sel (azaz amely vektor nem tartalmazza az LFA3TIP-et kódoló inszertet) transzfektált COS7 sejtekből tisztítottunk, adunk a rendszerhez, hogy igazoljuk, hogy a T-sejt aktiválás gátló aktivitása nem egy olyan aspecifikus inhibitorból származik, amely a kondicionált COS7 sejttenyésztó közegből származik. A hamis készítmény tartalmazza azt a szennyeződést, amely, amint azt a 13. példában megtárgyaltunk, együtt tisztul az LFA3TIP-vel, és valószínűleg szarvasmarha IgG, amely a szaporító közegben levő borjúmagzat szérumban található. Minden MLR vizsgálatot az előzőkben leírt módon hajtunk végre,
HU 211 476 A9 azzal az eltéréssel, hogy minden egyes molekula készítményét 0,1 gg fehérje/ml koncentrációban vizsgáljuk.
Azok a MAb-ok, amelyek felismerik az LFA-3 CD2kötő doménjét (7A6 és 1E6), vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjét (TS2/18) hasonló gátló hatással vannak a T-sejtek aktiválására. Az LFA3TIP-nek az a képessége, hogy gátolja a T-sejt aktiválását, fokozódik a tisztaság növekedésével (látható, ha összehasonlítjuk az LFA3IgG72A-t, 50%-os tisztaság; és az LFA3IgGA-t, 75%-os tisztaság). Az aspecifikus humán IgGl és a CD4-IgGl fúziós fehérje nem képes gátolni a T-sejtek aktiválását.
A PI-kapcsolt LFA-3 multimer formája szintén képtelen a T-sejtek aktiválásának gátlására. Annak ellenére, hogy többféle CD2-kötö hely található a multimer PI-kapcsolt LFA-3-οη, úgy tűnik, hogy az ilyen típusú multimer se nem gátolja, se nem serkenti a humán allogén MLR-t.
16. példa
PBL szaporodási vizsgálat
Humán PBL-eket izolálunk 20 ml humán donorvérből Ficoll-Paque gradiensen, az előzőkben leírt módon. A tisztított LFA3TIP-et 96 lyukas, kerekfenekű polisztirol szövettenyésztő lemezekre visszük (Corning 25850), a 17. ábrán jelzett koncentrációban. lxlO5 PBL-t adunk minden egyes lyukhoz, majd a lemezeket 3 napig 37 °C-on inkubáljuk. Minden hígítást RPMI komplett táptalajban végzünk (lásd 15. példa). A sejteknek három nap elteltével lyukanként 1 gCi [metil3H]timidint adunk 15 óra időtartamra, majd Tomtech 96 lyukas automata harvesterrel kinyerjük. Kontrollként a PBL szaporodását mérjük csak szaporító tápközegben és mérjük nemspecifikus humán IgGl-gyei kiegészített szaporító tápközegben.
Amint az a 17. ábráról látható, az LFA3TIP készítmény gátolja a PBL-ek szaporodását. Az aspecifikus humán IgGl nem gátolja a PBL szaporodását.
Vizsgáljuk a fő szennyeződéseket is egy hamis készítményben, a 15. példában leírtak alapján. Amint a 13. és 15. példában említettük, ez a szennyezés valószínűleg szarvasmarha IgG, a szaporító tápközegből. A
17. ábrán látható, hogy ugyanúgy, mint az aspecifikus humán IgGl esetében, a szennyeződés szintén nem gátolja a PBL-ek szaporodását.
PHA és 0KT3 dependens PBS szaporodás
Ezután vizsgáljuk az LFA3TIP-nek azt a tulajdonságát, hogy gátolja-e az OKT3 dependens (azaz anti-CD2 dependens) T-sejt szaporodást. A PBL-eket az előzőkben leírt módon egy egészséges humán donorból izoláljuk. Az OKT3 dependens PBL szaporodáshoz lxlO5 donor PBL-t inkubálunk 2 napig csak 3 ng/ml 0KT3-mal (Ortho Pharmaceuticals, Raritan, New Jersey), valamint LFA3TIP jelenlétében (1 nmol/1 és 10 nmol/1), vagy tisztított humán IgGl jelenlétében (1 nmol/1 és 10 nmol/1, Pierce Chemical Co., Rockford, Illinois). A sejtek egy alikvot részét csak a táptalajban inkubáljuk, OKT3 nélkül. A sejteket azután impulzusjelezzük [metil-3H]timidinnel, az előzőkben leírt módon. Ennek a kísérletnek az eredményeit a 18. ábrán mutatjuk be.
A 18. ábrán látható eredmények azt mutatják, hogy az LFA3TIP jelentősen aktívabb mint az irreleváns specifitással rendelkező kontroll humán IgGl. Ami a 17. ábrán látható eredményeket illeti, ezek azt mutatják, hogy az LFA3TIP-nek az a képessége, hogy gátolja a PBL szaporodását, elsődlegesen a 92 aminosavas LFA-3 régióban található, amely a CD2-kötő domént tartalmazza, és nem az LFA3TIP IgG részében.
Vizsgáljuk emellett az LFA3TIP-nek és az egyéb különböző CD2-kötő molekuláknak, valamint az M57IgGnek azt a képességét, hogy gátolja a fitohemagglutinin (PHA) dependens PBL szaporodást, mind szuboptimális mind optimális PHA koncentráció mellett.
Ehhez a vizsgálathoz lxlO5 donorsejtet (humán PBL) inkubálunk 0,1 vagy 1,0 gg/ml PHA-val (Fisher), vagy egyedül, vagy PI-kapcsolt LFA-3 jelenlétében [„PILFA-3”, Wallner és mtsai.: WO 90/02 181 számú PCT szabadalmi bejelentés], monomer, oldható LFA-3 jelenlétében („mon LFA-3”, amely a 10. számú szekvencia 29-181-es aminosavait tartalmazza, lásd 11. példa), egy teljes hosszúságú oldható LFA-3-IgG fúziós fehérje jelenlétében („FLIgG”, amely a 10. számú szekvencia 29-181-es aminosavait tartalmazza a humán IgGl csuklórégiója egy részéhez és a CH2, CH3 doménjeihez fuzionáltatva), egy anti-CD2 MAb jelenlétében (TS2/18, T. Springer ajándéka), vagy egy antiLFA-3 MAb jelenlétében (11E6), amelyet az 1E62C12 hibridóma termel (ATCC HB 10 693). A FLIgG koncentrációja 2 pg/ml; az összes többi fehérje koncentrációja 5 μg/ml. A sejteket azután az előzőkben leírt módon [metil-3H]timidinnel impulzusjelezzük.
Amint az a 19. ábráról látható, ha PHA-t inkubálunk humán PBL-lel szuboptimális koncentrációban (azaz 0,1 μg/ml), csak a PI-kapcsolt LFA-3 (PILFA-3) képes serkenteni a PBL szaporodását. Az M57IgG, a monomer oldható LFA-3 és az FLIgG nincs hatással a szuboptimális PHA-val serkentett T-sejt szaporodására. Az 1E6 és TS2/18 MAb 80-90%-ban gátolja a szaporodást; az LFA3TIP 70%-ban gátolja a szaporodást.
Ha a PHA optimális szinten van jelen ahhoz, hogy serkentse a PBL szaporodását, akkor az LFA3TIP, az 1E6 és a TS2/18 MAb 41, 26 és 20%-ban gátolja a szaporodást.
A 19. ábrán látható eredmények azt mutatják, hogy az N-terminális 92 aminosav által meghatározott LFA-3 régió, amely tartalmazza az LFA-3 CD2-kötő doménjét, képes gátolni a PHL-dependens PBL szaporodást, de a CD2-kötő dómén egy részének hiánya, mint például az M57IgG-ben, vagy egy további LFA-3 aminosav szekvenciajelenléte, mint például a PI-kapcsolt LFA-3-ban, a monomer LFA-3-bán vagy a FLIgG-ben megszünteti az KFA-3 CD2-kötő doménjének azt a képességét, hogy gátolja a PHA-dependens PBL szaporodást.
A fentieket együtt értékelve, az eredmények azt mutatják, hogy a PBL szaporodás LFA3TIP-pel való gátlása az LFA-3 dómén következménye.
Az előző leírásból nyilvánvaló, hogy az előzőkben specifikusan említettek mellett számos különböző
CD2-kötő polipeptid, valamint azok fragmensei és analógjai hasznos megvalósítási módjai a jelen találmány24
HU 211 476 A9 nak. Minden ilyen megvalósítási mód, valamint az összes olyan megvalósítási mód, amely a kitanításból nyilvánvaló, specifikusan a találmány oltalmi körébe tartozik, az alább következő igénypontokban meghatározva.
Letétbe helyezések
A jelen találmány szerinti DNS szekvenciákat hordozó plazmidokat tartalmazó gazdasejteket a Budapesti Egyezmény alapján letétbe helyeztük az American Type Culture Collection-nél (ATCC), Rockville, Maryland, USA, 1995. március 5-én. A letétbe helyezett tenyészeteket az alábbiakban ismertetjük:
Plazmid | Gazda- sejt | Letéti szám | Leírás: (a plazmid az alábbi DNS-t tartalmazza:) |
pPYM57 | E.coli JA221 | 68 545 | M57 deléciós mutáns |
pPMDRM54-6 I | E.coli JA221 | 68 542 | M54 deléciós mutáns |
pPMDRM55-9 | E.coli JA221 | 68 546 | M55 deléciós mutáns |
pPMDRM56-C | E.coli JA22) | 68 551 | M56 deléciós mutáns |
pPMDRM58-l5 | E.coli JA221 | 68 547 | M58 deléciós mutáns |
pPYM63-4 | E.coli JA221 | 68 544 | M63 deléciós mutáns |
pPYM65-8 | E.coli JA221 | 68 552 | M65 deléciós mutáns |
pPMDRMlOO-4 | E.coli JA221 | 68 550 | Ml 00 deléciós mutáns |
pPMDRMl0l-l | E.coli JA221 | 68 543 | MIOl deléciós mutáns |
pPMDRMlO2-8 | E.coli JA221 | 68 548 | Μ102 deléciós mutáns |
pPMDMR3-10 | E.coli JA221 | 68 549 | P1M3 deléciós mutáns |
Egy, a jelen találmány szerinti plazmidot hordozó gazdasejtet helyeztünk letétbe a Budapesti egyezmény alapján az ATCC-nél 1991. október 1-jén, jelölése az alábbi:
Plazmid | Gazdasejt | Letéti szám | Leírás: |
pSABl52 | E.coli JA221 | 68 720 | Hibrid DNS szekvencia, amely az LFA-3 szignál szekvenciát, az LFA-392 N-terminális aminosavát, IgGl csuklórégió 10 aminosavát, a CH2ésCH3 IgGl konstans doméneket kódolja. |
Egy bakteriofág és egy baktérium törzset, amely egy ismertetett vektort hordoz, helyeztünk letétbe a Budapesti Egyezmény alapján az In Vitro International Inc.-nél, Linthicum, Maryland (USA), 1987. május 28án és 1988. május 24-én, IVI-10 133 valamint IVI10 170 letéti szám alatt. Ezeket a letéteket 1991. június 20-án átvittük az ATCC-hez. A letéteket az alábbiakban jellemezzük:
Jelölés | Letéti szám | Leírás |
XHT16]XgtlO/LFA-3] E.coli, BG8 | 75 107 | Teljes hosszúságú transzmembrán LFA-3-at kódoló DNS-t tartalmaz. |
Az alábbi hibridóma sejtvonalakat, amelyekre az előzőkben hivatkoztunk, a Budapesti Egyezmény alapján 1991. március 5-én letétbe helyeztük az ATCC-nél:
Hibridóma: | Letéti szám | Ellenanyag |
7A6-2E5 | HB 10 695 | 7A6 |
1E6-2C12 | HB 10 693 | 1E6 |
Az előzőkben a jelen találmány számos megvalósítási módját ismertettük, de nyilvánvaló, hogy az általunk ismertetett alap megvalósítási mód megváltoztatható, és léteznek más megvalósítási módok, amelyek hasznosítják a jelen találmány szerinti készítményeket és eljárásokat. Tehát az nyilvánvaló, hogy a jelen találmány oltalmi köre vonatkozik az összes alternatív megvalósítási módra és variációra, amelyeket az ismertetett specifikációk és a függelékben megadott igénypontok határoznak meg; a találmányt a példaként megadott specifikus megvalósítási módok nem korlátozzák.
Szekvenciák jegyzéke:
1. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 10 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 1. számú szekvencia Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly 15 10
2. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 50 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 2. számú szekvencia Phe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val 5 5
HU 211 476 A9
Tyr | Gly | Asn | Val | Thr | ||||
10 | ||||||||
Phe | His | Val | Pro | Ser | Asn | Val | Pro | Leu |
15 | 20 | |||||||
Lys | Glu | Val | Leu | Trp | ||||
25 | ||||||||
Lys | Lys | Gin | Lys | Asp | Lys | Val | Alá | Glu |
30 | 35 | |||||||
Leu | Glu | Asn | Ser | Glu | ||||
40 | ||||||||
Phe | Arg | Alá | Phe | Ser | Ser | Phe | Lys | |
45 | 50 |
3. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 10 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 3. számú szekvencia Ser Leu Thr He Tyr Asn Leu Thr Ser Ser 15 10
4. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 20 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 4. számú szekvencia
Thr Lys | Pro | Asp Leu | Val Asp |
1 | 5 | ||
Thr Glu | Asp | Lys Val | |
10 | |||
Val Asp | Val | Val Arg | Asn |
15 | 20 | ||
5. számú szekvenciavázlat |
(i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 77 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 5. számú szekvencia
Val | Alá | Gly | Ser | Asp | Alá | Gly | Arg | Alá |
1 | 5 | |||||||
Leu | Gly | Val | Leu | Ser | ||||
10 | ||||||||
Val | Val | Cys | Leu | Leu | His | Cys | Phe | Gly |
15 | 20 | |||||||
Phe | Ile | Ser | Cys | Phe | ||||
25 | ||||||||
Ser | Gin | Gin | Ile | Tyr | Gly | Val | Val | Tyr |
30 | 35 | |||||||
Gly | Asn | Val | Thr | Phe | ||||
40 |
His | Val | Pro 45 | Ser | Asn | Val | Pro | Leu 50 | His |
Glu | Val | Leu | Trp | Lys | ||||
55 | ||||||||
Lys | Gin | Lys | Asp | Lys | Val | Alá | Glu | Leu |
60 | 65 | |||||||
Glu | Asn | Ser | Glu | Phe | ||||
70 | ||||||||
Arg | Alá | Phe | Ser | Ser | Phe | Lys | ||
75 |
6. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: kétszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 6. számú szekvencia
AATAGGGTTT ATTTAGAC TGTGTCAGGT 30
7. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 16 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 7. számú szekvencia
Lys Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val 1 5
Ser Gly Ser Leu Thr 10
Ile Tyr
8. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 8. számú szekvencia
TAATTGAATG CTAAGAAAGA ACTTCATGGT 30
9. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 1040 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: kétszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 9. számú szekvencia
HU 211 476 A9
CGACGAGCC ATG GTT GCT GGG AGC Met Val Alá Gly Ser 1 5
GAC GCG GGG CGG GCC CTG GGG Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly
GTC | CTC | AGC | GTG | GTC | TGC | CTG | CTG | CAC | TGC | TTT | GGT | TTC | ATC |
Val | Leu | Ser 15 | Val | Val | Cys | Leu 20 | Leu | His | Cys | Phe | Gly 25 | Phe | Ile |
AGC | TGT | TTT | TCC | CAA | CAA | ATA | TAT | GGT | GTT | GTG | TAT | GGG | AAT |
Ser | Cys | Phe | Ser 30 | Gin | Gin | Ile | Tyr | Gly 35 | Val | Val | Tyr | Gly | Asn 40 |
GTA | ACT | TTC | CAT | GTA | CCA | AGC | AAT | GTG | CCT | TTA | AAA | GAG | GTC |
Val | Thr | Phe | His | Val 45 | Pro | Ser | Asn | Val | Pro 50 | Leu | Lys | Glu | Val |
CTA | TGG | AAA | AAA | CAA | AAG | GAT | AAA | GTT | GCA | GAA | CTG | GAA | AAT |
Leu 55 | Trp | Lys | Lys | Gin | Lys 60 | Asp | Lys | Val | Alá | Glu 65 | Leu | Glu | Asn |
TCT | GAA | TTC | AGA | GCT | TTC | TCA | TCT | TTT | AAA | AAT | AGG | GTT | TAT |
Ser | Glu 70 | Phe | Arg | Alá | Phe | Ser 75 | Ser | Phe | Lys | Asn | Arg 80 | Val | Tyr |
TTA | GAC | ACT | GTG | TCA | GGT | AGC | CTC | ACT | ATC | TAC | AAC | TTA | ACA |
Leu | Asp | Thr 85 | Val | Ser | Gly | Ser | Leu 90 | Thr | Ile | Tyr | Asn | Leu 95 | Thr |
TCA | TCA | GAT | GAA | GAT | GAG | TAT | GAA | ATG | GAA | TCG | CCA | AAT | ATT |
Ser | Ser | Asp | Glu 100 | Asp | Glu | Tyr | Glu | Met 105 | Glu | Ser | Pro | Asn | Ile 110 |
ACT | GAT | ACC | ATG | AAG | TTC | TTT | CTT | TAT | GTG | CTT | GAG | TCT | CTT |
Thr | Asp | Thr | Met | Lys 115 | Phe | Phe | Leu | Tyr | Val 120 | Leu | Glu | Ser | Leu |
CCA | TCT | CCC | ACA | CTR | RCT | TGT | GCA | TTG | ACT | AAT | GGA | AGC | RTT |
Pro 125 | Ser | Pro | Thr | Leu | Thr 130 | Cys | Alá | Leu | Thr | Asn 135 | Gly | Ser | Ile |
GAA | GTC | CAA | TGC | ATG | ATA | CCA | GAG | CAT | TAC | AAC | AGC | CAT | CGA |
Glu | Val 140 | Gin | Cys | Met | Ile | Pro 145 | Glu | His | Tyr | Asn | Ser 150 | His | Arg |
GGA | CTT | ATA | ATG | TAC | TCA | TGG | GAT | TGT | CCT | ATG | GAG | CAA | TGT |
Gly | Leu | Ile 155 | Met | Tyr | Ser | Trp | Asp 160 | Cys | Pro | Met | Glu | Gin 165 | Cys |
AAA | CGT | AAC | TCA | ACC | AGT | ATA | TAT | TTT | AAG | ATG | GAA | AAT | GAT |
Lys | Arg | Asn Ser 170 | Thr | Ser | Ile | Tyr | Phe 175 | Lys | Met | Glu | Asn | Asp 180 | |
CTT | CCA | CAA | AAA | ATA | CAG | TGT | ACT | CTT | AGC | AAT | CCA | TTA | TTT |
Leu | Pro | Gin | Lys | Ile 185 | Gin | Cys | Thr | Leu | Ser 190 | Asn | Pro | Leu | Phe |
AAT | ACA | ACA | TCA | TCA | ATC | ATT | TTG | ACA | ACC | TGT | ATC | CCA | AGC |
Asn 195 | Thr | Thr | Ser | Ser | Ile Ile 200 | Leu | Thr | Thr | Cys 205 | Ile | Pro | Ser |
HU 211 476 A9
AGC Ser | GGT Gly 210 | CAT His | TCA AGA CAC | AGA Arg 215 | TAT Tyr | GCA Alá | CTT ATA | CCC Pro 220 | ATA Ile | CCA Pro | |||
Ser | Arg | His | Leu | Ile | |||||||||
TTA | GCA | GTA | ATT | ACA | ACA | TGT | ATT | GTG | CTG | TAT | ATG | AAT | GGT |
Leu | Alá | Val | Ile | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Leu | Tyr | Met | Asn | Gly |
225 | 230 | 235 | |||||||||||
ATT | CTG | AAA | TGT | GAC | AGA | AAA | CCA | GAC | AGA | ACC | AAC | TGG | AAT |
Ile | Leu | Lys | Cys | Asp | Arg | Lys | Pro | Asp | Arg | Thr | Asn | Ser | Asn |
240 | 245 | 250 |
TGATTGGTAA CAGAAGATGA AGACAACAGC ATAACTAAAT TATTTTAAAA 809 ACTAAAAAGC CATCTGATTT CTCATTTGAG TATTACAATT TTTGARCAAC 859 TGTTGGAAAT GTAACTTGAA GCAGCTGCTT TAAGAAGAAA TACCCACTAA 909 CAAAGAACAA GCATTAGTTT TGGCTGTCAT CAACTTATTA TATGACTAGG 959 TGCTTGCTTT TTTTGTCAGT AAATTGTTTT TACTGATGAT GTAGATACTT 1009 TTGTAAATAA ATGTAAATAT GTACACAAGT G 1040
10. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 250 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (ii) Molekulatípus: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 10. számú szekvencia
Met Val Alá Gly Ser Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly 15 10
Val Leu Ser Val Val Cys Leu Leu His Cys Phe Gly Phe Ile 15 20 25
Ser Cys Phe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn 30 35 40
Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu Lys Glu Val 45 50
Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn 55 60 65
Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys Asn Arg Val Tyr 70 75 80
Leu Asp Thr Val Ser Gly Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr 85 90 95
Ser Ser Asp Glu Asp Glu Tyr Glu Met Glu Ser Pro Asn Ile 100 105 110
Thr Asp Thr Met Lys Phe Phe Leu Tyr Val Leu Glu Ser Leu 115 120
Pro Ser Pro Thr Leu Thr Cys Alá Leu Thr Asn Gly Ser Ile 125 130 135
Glu Val Gin Cys Met Ile Pro Glu His Tyr Asn Ser His Arg 140 145 150
HU 211 476 A9
Gly | Leu | Ile 155 | Met | Tyr | Ser | Trp | Asp 160 | Cys | Pro | Met | Glu | Gin 165 | Cys |
Lys | Arg | Asn | Ser 170 | Thr | Ser | Ile | Tyr | Phe 175 | Lys | Met | Glu | Asn | Asp 180 |
Leu | Pro | Gin | Lys | Ile 185 | Gin | Cys | Thr | Leu | Ser 190 | Asn | Pro | Leu | Phe |
Asn 195 | Thr | Thr | Ser | Ser | Ile 200 | Ile | Leu | Thr | Thr | Cys 205 | Ile | Pro | Ser |
Ser | Gly 210 | His | Ser | Arg | His | Arg 215 | Tyr | Alá | Leu | Ile | Pro 220 | Ile | Pro |
Leu | Alá | Val 225 | Ile | Thr | Thr | Cys | Ile 230 | Val | Leu | Tyr | Met | Asn 235 | Gly |
Ile | Leu | Lys | Cys | Asp | Arg | Lys | Pro | Asp | Arg | Thr | Asn | Ser | Asn |
240 245 250
11. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 863 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: kétszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 11. számú szekvencia
GCGGCCGCCG 10
ACGAGCC ATG GTT GCT GGG AGC GAC GCG GGG CGG GCC CTG GGG 53
Met Val Alá Gly Ser Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly 1 5 10
GTC CTC AGC GTG GTC TGC CTG CTG CAC TGC TTT· GGT TTC ATC 95
Val Leu Ser Val Val Cys Leu Leu His Cys Phe Gly Phe He
20 25
AGC TGT TTT TCC CAA CAA ATA TAT GGT GTT GTG TAT GGG AAT 137
Ser Cys Phe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn
35 40
GTA ACT TTC CAT GTA CCA AGC AAT GTG CCT TTA AAA GRG GTC 179
Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu Lys Glu Val
50
CTA TGG AAA AAA CAA AAG GAT ARA GTT GCA GAA CTG GAA AAT 221
Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn
60 65
TCT GAA TTC AGA GCT TTC TCA TCT TTT AAA AAT AGG GTT TAT 263
Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys Asn Arg Val Tyr
75 80
TTA GAC ACT GTG TCA GGT AGC CTC ACT ATC TAC AAC TTA ACA 305
Leu Asp Thr Val Ser Gly Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr
90 95
HU 211 476 A9
TCA TCA GAT | GAA Glu 100 | GAT Asp | GAG Glu | TAT Tyr | GAA Glu | ATG Met 105 | GAA Glu | TCG Ser | CCA Pro | AAT Asn | ATT Ile 110 | 347 | ||
Ser | Ser Asp | |||||||||||||
ACT | GAT | ACC | ATG | AAG | TTC | TTT | CTT | TAT | GTG | CTT | GAG | TCT | CTT | 389 |
Thr | Asp | Thr | Met | Lys | Phe | Phe | Leu | Tyr | Val | Leu | Glu | Ser | Leu | |
115 | 120 | |||||||||||||
CCA | TCT | CCC | ACA | CTA | ACT | TGT | GCA | TTG | ACT | AAT | GGA | AGC | ATT | 431 |
Pro | Ser | Pro | Thr | Leu | Thr | Cys | Alá | Leu | Thr | Asn | Gly | Ser | Ile | |
125 | 130 | 135 | ||||||||||||
GAA | GTC | CAA | TGC | ATG | ATA | CCA | GAG | CAT | TAC | AAC | AGC | CAT | CGA | 473 |
Glu | Val | Gin | Cys | Met | Ile | Pro | Glu | His | Tyr | Asn | Ser | His | Arg | |
140 | 145 | 150 | ||||||||||||
GGA | CTT | ATA | ATG | TAG | TCA | TGG | GAT | TGT | CCT | ATG | GRG | CAA | TGT | 515 |
Gly | Leu | Ile | Met | Tyr | Ser | Trp | Asp | Cys | Pro | Met | Glu | Gin | Cys | |
155 | 160 | 165 | ||||||||||||
AAA | CGT | AAC | TCA | ACC | AGT | ATA | TAT | TTT | AAG | ATG | GAA | AAT | GRT | 557 |
Lys | Arg | Asn | Ser | Thr | Ser | Ile | Tyr | Phe | Lys | Met | Glu | Asn | Asp | |
170 | 175 | 180 | ||||||||||||
CTT | CCA | CAA | AAA | ATA | CAG | TGT | ACT | CTT | AGC | AAT | CCA | TTA | TTT | 599 |
Leu | Pro | Gin | Lys | Ile | Gin | Cys | Thr | Leu | Ser | Asn | Pro | Leu | Phe | |
185 | 190 | |||||||||||||
AAT | ACA | ACA | TCA | TCA | ATC | ATT | TTG | ACA | ACC | TGT | ATC | CCR | AGC | 641 |
Asn | Thr | Thr | Ser | Ser | Ile | Ile | Leu | Thr | Thr | Cys | Ile | Pro | Ser | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||
AGC | GGT | CAT | TCA | AGA | CAC | AGA | TAT | GCA | CTT | ATA | CCC | ATA | CCA | 683 |
Ser | Gly | His | Ser | Arg | His | Arg | Tyr | Alá | Leu | Ile | Pro | Ile | Pro | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||
TTA | GCA | GTA | ATT | ACA | ACA | TGT | ATT | GTG | CTG | TAT | ATG | AAT | GGT | 725 |
Leu | Alá | Val | Ile | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Leu | Tyr | Met | Asn | Gly | |
225 | 230 | 235 |
ATG TAT GCT TTT TAAAACAAAA TAGTTTGAAA ACTTGCATTG TTTTCCAAAG 777 Met Tyr Alá Phe
240
GTCAGAAAAT AGTTTAAGGA TGAAAATAAA GTTTGAAATT TTAGACATTT 827
GAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAGC GGCCGC 863
12. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 240 aminosavmaradék (B) Típus: aminosav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (ii) Molekulatípus: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 12. számú szekvencia
Met Val Alá Gly Ser Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly 15 10
HU 211 476 A9
Val | Leu | Ser | Val | Val | Cys | Leu | Leu | His | Cys | Phe | Gly | Phe | Ile |
15 | 20 | 25 | |||||||||||
Ser | Cys | Phe | Ser | Gin | Gin | Ile | Tyr | Gly | Val | Val | Tyr | Gly | Asn |
30 | 35 | 40 | |||||||||||
Val | Thr | Phe | His | Val | Pro | Ser | Asn | Val | Pro | Leu | Lys | Glu | Val |
45 | 50 | ||||||||||||
Leu | Trp | Lys | Lys | Gin | Lys | Asp | Lys | Val | Alá | Glu | Leu | Glu | Asn |
55 | 60 | 65 | |||||||||||
Ser | Glu | Phe | Arg | Alá | Phe | Ser | Ser | Phe | Lys | Asn | Arg | Val | Tyr |
70 | 75 | 80 | |||||||||||
Leu | Asp | Thr | Val | Ser | Gly | Ser | Leu | Thr | Ile | Tyr | Asn | Leu | Thr |
85 | 90 | 95 | |||||||||||
Ser | Ser | Asp | Glu | Asp | Glu | Tyr | Glu | Met | Glu | Ser | Pro | Asn | Ile |
100 | 105 | 110 | |||||||||||
Thr | Asp | Thr | Met | Lys | Phe | Phe | Leu | Tyr | Val | Leu | Glu | Ser | Leu |
115 | 120 | ||||||||||||
Pro | Ser | Pro | Thr | Leu | Thr | Cys | Alá | Leu | Thr | Asn | Gly | Ser | Ile |
125 | 130 | 135 | |||||||||||
Glu | Val | Gin | Cys | Met | Ile | Pro | Glu | His | Tyr | Asn | Ser | His | Arg |
140 | 145 | 150 | |||||||||||
Gly | Leu | Ile | Met | Tyr | Ser | Trp | Asp | Cys | Pro | Met | Glu | Gin | Cys |
155 | 160 | 165 | |||||||||||
Lys | Arg | Asn | Ser | Thr | Ser | Ile | Tyr | Phe | Lys | Met | Glu | Asn | Asp |
170 | 175 | 180 | |||||||||||
Leu | Pro | Gin | Lys | Ile | Gin | Cys | Thr | Leu | Ser | Asn | Pro | Leu | Phe |
185 | 190 | ||||||||||||
Asn | Thr | Thr | Ser | Ser | Ile | Ile | Leu | Thr | Thr | Cys | Ile | Pro | Ser |
195 | 200 | 205 | |||||||||||
Ser | Gly | His | Ser | Arg | His | Arg | Tyr | Alá | Leu | Ile | Pro | Ile | Pro |
210 | 215 | 220 | |||||||||||
Leu | Alá | Val | Ile | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Leu | Tyr | Met | Asn | Gly |
225
230
235
Met Tyr Alá Phe 240
13. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 13. számú szekvencia
CTCTTTTAAA GGCACATACA CAACACCATA 30
14. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem
HU 211 476 A9 (xi) A szekvencia leírása: 14. számú szekvencia AACTTTATCC TTTTGATTGC TTGGTACATG 30
15. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 15. számú szekvencia AGCTCTGAAT TCAGATTTTT TCCATAGGAC 30
16. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 16. számú szekvencia TAAATAAACC CTATTATTTT CCAGTTCTGC 30
17. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 17. számú szekvencia GTAGATAGTG AGGCTTTTAA AAGATGAGAA 30
18. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 18. számú szekvencia ATACTCATCT TCATCACCTG ACACAGTGTC 30
19. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 19. számú szekvencia GGTATCAGTA ATATTTGATG ATGTTAAGTT 30
20. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 20. számú szekvencia AGACTCAAGC ACATAGGCG ATTCCATTTC 30
21. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 21. számú szekvencia CAATGCACAA GTTAGAAGAA AGAACTTCAT 30
22. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 22. számú szekvencia CATGCATTGG ACTTCTGTGG GAGATGGAAC 30
23. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 23. számú szekvencia TCCTCGATGG CTGTTAATGC TTCCATTAGT 30
24. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 24. számú szekvencia CATAGGACAA TCCCAGTAAT GCTCTGGTAT 30
25. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 25. számú szekvencia TATACTGGTT GAGTTTGAGT ACATTATAAG 30
26. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem
HU 211 476 A9 (xi)A szekvencia leírása: 26. számú szekvencia TTGTGGAAGA TCATTACGTT TACATTGCTC 30
27. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 27. számú szekvencia TAATGGATTG CTAAGTTCCA TCTTAAAATA 30
28. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői (A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 28. számú szekvencia TGTCAAAATG ATTGAAGTAC ACTGTATTT 30
29. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus : nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 29. számú szekvencia TCTTGAATGA CCGCTTGATG TTGTATTAAA 30
30. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 30. számú szekvencia ATACTCATCT TCATCATACA CAACACCATA 30
31. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 31. számú szekvencia CATAGGACAA TCCCATGATG ATGTTAAGTT 30
32. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 32. számú szekvencia TCTTGAATGA CCGCTTGAGT ACATTATAAG 30
33. számú szekvencia vázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 33 aminosav (B) Típus: aminosav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 33. számú szekvencia
Ser | Leu | Thr | He | Tyr | Asn | Leu | Thr | Ser |
1 | 5 | |||||||
Ser | Asp | Glu | Asp | Glu | ||||
10 | ||||||||
Tyr | Glu | Met | Glu | Ser | Pro | Asn | He | Thr |
15 | 20 | |||||||
Asp | Thr | Met | Lys | Phe | ||||
25 | ||||||||
Phe | Leu | Tyr | Val | |||||
30 |
34. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 24 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 34. számú szekvencia TCGTC GAC AAA ACT CAC ACA TGC C 24
Asp Lys Thr His Thr Cys 1 5
35. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 6 aminosav (B) Típus: aminosav (D) Topológia: lineáris (ii) Molekulatípus: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 35. számú szekvencia Asp Lys Thr His Thr Cys 1 5
36. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 24 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 36. számú szekvencia GCAAATGAGT GCGGCGGCCG CCAA 24
7. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 115 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem
HU 211 476 A9 (xi) A szekvencia leírása: 37. számú szekvencia GCGGCCGCGG TCCAACCACC AATCTCAAAG CTTGGTRCCC GGGAATTCAG 5 0
ATCTGCAGCA TGCTCGAGCT CTAGATATCG ATTCCATGGA TCCTCACATC 100
CCAATCCGCG GCCGC 115
38. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 33 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egy szálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 38. számú szekvencia GAGGCGGCCG CC ATG GTT GCT GGG AGC GAC GCG 3 3
Met Val Alá Gly Ser Asp Alá 1 5
39. számú szekvenciavázlal (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 7 aminosav (B) Típus: aminosav (D) Topológia: lineáris (ii) Molekulatípus: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 39. számú szekvencia
Met 1 | Val | Alá | Gly | Ser 5 | Asp | Alá | ||
ATG | GTT | GCT | GGG | AGC | GAC | GCG | ||
Met | Val | Alá | Gly | Ser | Asp | Alá | ||
1 | 5 | |||||||
GTC | CTC | AGC | GTG | GTC | TGC | CTG | CTG | CAC |
Val | Leu | Ser | Val | Val | Cys | Leu | Leu | His |
15 | 20 | |||||||
AGC | TGT | TTT | TCC | CAA | CAA | ATA | TAT | GGT |
Ser | Cys | Phe | Ser | Gin | Gin | Ile | Tyr | Gly |
30 | 35 | |||||||
GTA | ACT | TTC | CAT | GTA | CCA | AGC | AAT | GTG |
Val | Thr | Phe | His | Val | Pro | Ser | Asn | Val |
45 | ||||||||
CTA | TGG | AAA | AAA | CAA | AAG | GAT | AAA | GTT |
Leu | Trp | Lys | Lys | Gin | Lys | Asp | Lys | Val |
55 | 60 | |||||||
TCT | GAA | TTC | AGA | GCT | TTC | TCA | TCT | TTT |
Ser | Glu | Phe | Arg | Alá | Phe | Ser | Ser | Phe |
70 | 75 | |||||||
TTA | GAC | ACT | GTG | TCA | GGT | AGC | CTC | ACT |
Leu | Asp | Thr | Val | Ser | Gly | Ser | Leu | Thr |
85 | 90 | |||||||
TCA | TCA | GAT | GAA | GAT | GAG | TAT | GAA | ATG |
Ser | Ser | Asp | Glu | Asp | Glu | Tyr | Glu | Met |
100 | 105 |
40. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 26 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 40. számú szekvencia 10 AAGTCGACAT AAAGAAAGAA CTTCAT 26
41. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 14 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 41. számú szekvencia 20 TCGACGCGGC CGCG 14
42. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 1050 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szál: egyszálú (D) Topológia: lineáris (iii) Elméleti: nem; (iv) Antiszensz: nem (xi) A szekvencia leírása: 42. számú szekvencia
GGG Gly | CGG Arg | GCC Alá 10 | CTG Leu | GGG Gly | 36 |
TGC | TTT | GGT | TTC | ATC | 78 |
Cys | Phe | Gly | Phe 25 | Ile | |
GTT | GTG | TAT | GGG | AAT | 120 |
Val | Val | Tyr | Gly | Asn 40 | |
CCT | TTA | AAA | GAG | GTC | 162 |
Pro 50 | Leu | Lys | Glu | Val | |
GCA | GAA | CTG | GAA | AAT | 204 |
Alá | Glu 65 | Leu | Glu | Asn | |
AAA | AAT | AGG | GTT | TAT | 246 |
Lys | Asn | Arg 80 | Val | Tyr | |
ATC | TAC | AAC | TTA | ACA | 288 |
Ile | Tyr | Asn | Leu 95 | Thr | |
GAA | TCG | CCA | AAT | ATT | 330 |
Glu | Ser | Pro | Asn | Ile |
110
HU 211 476 A9
ACT GAT | ACC Thr | ATG Met | AAG Lys 115 | TTC Phe | TTT Phe | CTT Leu | TAT Tyr | GTC Val 120 | GAC Asp | AAA Lys | ACT Thr | CAC His | 372 | |
Thr | Asp | |||||||||||||
ACA | TGC | CCA | CCG | TGC | CCA | GCA | CCT | GAA | CTC | CTG | GGG | GGA | CCG | 414 |
Thr | Cys | Pro | Pro | Cys | Pro | Alá | Pro | Glu | Leu | Leu | Gly | Gly | Pro | |
125 | 130 | 135 | ||||||||||||
TCA | GTC | TTC | CTC | TTC | CCC | CCA | AAA | CCC | AAG | GAC | ACC | CTC | ATG | 456 |
Ser | Val | Phe | Leu | Phe | Pro | Pro | Lys | Pro | Lys | Asp | Thr | Leu | Met | |
140 | 145 | 150 | ||||||||||||
ATC | TTC | CGG | ACC | CCT | GAG | GTC | ACA | TGC | GTG | GTG | GTG | GAC | GTG | 498 |
He | Ser | Arg | Thr | Pro | Glu | Val | Thr | Cys | Val | Val | Val | Asp | Val | |
155 | 160 | 165 | ||||||||||||
AGC | CAC | GAA | GRC | CCT | GAG | GTC | AAG | TTC | AAC | TGG | TAC | GTG | GAC | 540 |
Ser | His | Glu | Asp | Pro | Glu | Val | Lys | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val | Asp | |
170 | 175 | 180 | ||||||||||||
GGC | GTG | GAG | GTG | CAT | AAT | GCC | AAG | ACA | AAG | CCG | CGG | GAG | GAG | 582 |
Gly | Val | Glu | Val | His | Asn | Alá | Lys | Thr | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu | |
185 | 190 | |||||||||||||
CAG | TAC | AAC | AGC | ACG | TAC | CGG | GTG | GTC | AGC | GTC | CTC | ACC | GTC | 624 |
Gin | Tyr | Asn | Ser | Thr | Tyr | Arg | Val | Val | Ser | Val | Leu | Thr | Val | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||
CTG | CAC | CAG | GAC | TGG | CTG | AAT | GGC | AAG | GAG | TAC | ARG | TGC | AAG | 666 |
Leu | His | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn | Gly | Lys | Glu | Tyr | Lys | Cys | Lys | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||
GTC | TCC | AAC | AAA | GCC | CTC | CCA | GCC | CCC | ATC | GAG | AAA | ACC | ATC | 708 |
Val | Ser | Asn | Lys | Alá | Leu | Pro | Alá | Pro | He | Glu | Lys | Thr | He | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||
TCC | AAA | GCC | AAA | GGG | CAG | CCC | CGA | GAA | CCA | CAG. | GTG | TAC | ACC | 750 |
Ser | Lys | Alá | Lys | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu | Pro | Gin | Val | Tyr | Thr | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||
CTG | CCC | CCA | TCC | CGG | GAT | GAG | CTG | AAC | AAG | AAC | CAG | GTC | AGC | 792 |
Leu | Pro | Pro | Ser | Arg | Asp | Glu | Leu | Thr | Lys | Asn | Gin | Val | Ser | |
255 | 260 | |||||||||||||
CTG | ACC | TGC | CTG | GTC | AAA | GGC | TTC | TAT | CCC | AGC | GAC | ATC | GCC | 834 |
Leu | Thr | Cys | Leu | Val | Lys | Gly | Phe | Tyr | Pro | Ser | Asp | He | Alá | |
265 | 270 | 275 | ||||||||||||
GTG | GAG | TGG | GAG | AGC | AAT | GGG | CAG | CCG | GAG | AAC | AAC | TAC | AAG | 876 |
Val | Glu | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly | Gin | Pro | Glu | Asn | Asn | Tyr | Lys | |
280 | 285 | 290 | ||||||||||||
ACC | ACG | CCT | CCC | GTG | CTG | GAC | TCC | GAC | GGC | TCC | TTC | TTC | CTC | 918 |
Thr | Thr | Pro | Pro | Val | Leu | Asp | Ser | Asp | Gly | Ser | Phe | Phe | Leu | |
295 | 300 | 305 | ||||||||||||
TAC | AGC | AAG | CTC | ACC | GTG | GAC | AAG | AGC | AGG | TGG | CAG | CAG | GGG | 960 |
Tyr | Ser | Lys | Leu | Thr | Val | Asp | Lys | Ser | Arg | Trp | Gin | Gin | Gly | |
310 | 315 | 320 |
HU 211 476 A9
AAC Asn | GTC Val | TTC Phe | TCA Ser | TGC Cys 325 | TCC Ser | GTG Val | ATG Met | CAT His | GAG Glu 330 | GCT Alá | CTG Leu | CAC His | AAC Asn | 1002 |
CAC | TAC | ACG | CAG | AAG | AGC | CTC | TCC | CTG | TCT | CCG | GGT | AAA | 1041 | |
His | Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser | Leu | Ser | Leu | Ser | Pro | Gly | Lys |
335 340 345
TGAGTGCGG 1050
43. számú szekvenciavázlat (i) A szekvencia jellemzői:
(A) Hosszúság: 347 aminosav (B) Típus: aminosav (D) Topológia: lineáris (ii) Molekulatípus: fehérje (xi) A szekvencia leírása: 43. számú szekvencia
Met 1 | Val | Alá | Gly | Ser 5 | Asp | Alá | Gly | Arg | Alá 10 | Leu | Gly | ||
Val | Leu | Ser | Val | Val | Cys | Leu | Leu | His | Cys | Phe | Gly | Phe | Ile |
15 | 20 | 25 | |||||||||||
Ser | Cys | Phe | Ser | Gin | Gin | Ile | Tyr | Gly | Val | Val | Tyr | Gly | Asn |
30 | 35 | 40 | |||||||||||
Val | Thr | Phe | His | Val | Pro | Ser | Asn | Val | Pro | Leu | Lys | Glu | Val |
45 | 50 | ||||||||||||
Leu | Trp | Lys | Lys | Gin | Lys | Asp | Lys | Val | Alá | Glu | Leu | Glu | Asn |
55 | 60 | 65 | |||||||||||
Ser | Glu | Phe | Arg | Alá | Phe | Ser | Ser | Phe | Lys | Asn | Arg | Val | Tyr |
70 | 75 | 80 | |||||||||||
Leu | Asp | Thr | Val | Ser | Gly | Ser | Leu | Thr | Ile | Tyr | Asn | Leu | Thr |
85 | 90 | 95 | |||||||||||
Ser | Ser | Asp | Glu | Asp | Glu | Tyr | Glu | Met | Glu | Ser | Pro | Asn | Ile |
100 | 105 | 110 | |||||||||||
Thr | Asp | Thr | Met | Lys | Phe | Phe | Leu | Tyr | Val | Asp | Lys | Thr | His |
115 | 120 | ||||||||||||
Thr | Cys | Pro | Pro | Cys | Pro | Alá | Pro | Glu | Leu | Leu | Gly | Gly | Pro |
125 | 130 | 135 | |||||||||||
Ser | Val | Phe | Leu | Phe | Pro | Pro | Lys | Pro | Lys | Asp | Thr | Leu | Met |
140 | 145 | 150 | |||||||||||
Ile | Ser | Arg | Thr | Pro | Glu | Val | Thr | Cys | Val | Val | Val | Asp | Val |
155 | 160 | 165 | |||||||||||
Ser | His | Glu | Asp | Pro | Glu | Val | Lys | Phe | Asn | Trp | Tyr | Val | Asp |
170 | 175 | 180 | |||||||||||
Gly | Val | Glu | Val | His | Asn | Alá | Lys | Thr | Lys | Pro | Arg | Glu | Glu |
185 190
HU 211 476 A9
Gin 195 | Tyr | Asn | Ser | Thr | Tyr 200 | Arg | Val | Val | Ser |
Leu | His 210 | Gin | Asp | Trp | Leu | Asn 215 | Gly | Lys | Glu |
Val | Ser | Asn 225 | Lys | Alá | Leu | Pro | Alá 230 | Pro | Ile |
Ser | Lys | Alá | Lys 240 | Gly | Gin | Pro | Arg | Glu 245 | Pro |
Leu | Pro | Pro | Ser | Arg 255 | Asp | Glu | Leu | Thr | Lys 260 |
Leu 265 | Thr | Cys | Leu | Val | Lys 270 | Gly | Phe | Tyr | Pro |
Val | Glu 280 | Trp | Glu | Ser | Asn | Gly 285 | Gin | Pro | Glu |
Thr | Thr | Pro 295 | Pro | Val | Leu | Asp | Ser 300 | Asp | Gly |
Tyr | Ser | Lys | Leu 310 | Thr | Val | Asp | Lys | Ser 315 | Arg |
Asn | Val | Phe | Ser | Cys 325 | Ser 1 | Val | Met | His | Glu 330 |
His 335 | Tyr | Thr | Gin | Lys | Ser 340 | Leu | Ser | Leu | Ser |
Val 205 | Leu | Thr | Val |
Tyr | Lys 220 | Cys | Lys |
Glu | Lys | Thr 235 | Ile |
Gin | Val | Tyr | Thr 250 |
Asn | Gin | Val | Ser |
Ser 275 | Asp | Ile | Alá |
Asn | Asn 290 | Tyr | Lys |
Ser | Phe | Phe 305 | Leu |
Trp | Gin | Gin | Gly 320 |
Alá | Leu | His | Asn |
Pro | Gly | Lys |
345
Claims (32)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1. Egy Xj-X2 - (1. számú szekvencia) - Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly - Y aminosavszek- 40 venciájú polipeptid, amelyben:X! jelentése hidrogénatom vagy metioni) csoport;X2 jelentése vegyértékkötés vagy egy olyan polipeptid, amely aVal Alá Gly Ser Asp Alá Gly Arg Alá Leu Gly Val Leu 45 Ser Val Val Cys Leu Leu His Cys Phe Gly Phe He Ser Cys Phe Ser Gin Gin He Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu His Glu Val Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys 50 szekvencia (5. számú szekvencia) karboxi-terminális 1-77 aminosavaiból álló aminosavszekvenciát vagy annak egy részét tartalmazza;Y jelentése hidroxicsoport vagy egy olyan polipeptid, amely a 55Ser Leu Thr Ile Tyr Asn Leu Thr Ser Ser Asp Glu AspGlu Tyr Glu Met Glu Ser Pro Asn Ile Thr Asp Thr MetLys Phe Phe Leu Tyr Val szekvencia (33. számú szekvencia) amino-terminális 1-32 aminosavaiból álló aminosavszekvenciát vagy annak egy részét tartalmazza; 60 és a polipeptid egy olyan variánsa, amelyben az előző aminosavak közül egy vagy több konzervatív módon szubsztituált, deletált vagy derivatizált, és az említett polipeptid képes a CD2-höz kötődni.
- 2. Az 1. igénypont szerinti polipeptid, amelyben X2 jelentése vegyértékkötés vagy egy olyan polipeptid, amely aPhe Ser Gin Gin Ile Tyr Gly Val Val Tyr Gly Asn Val Thr Phe His Val Pro Ser Asn Val Pro Leu Lys Glu Val Leu Trp Lys Lys Gin Lys Asp Lys Val Alá Glu Leu Glu Asn Ser Glu Phe Arg Alá Phe Ser Ser Phe Lys szekvencia (2. számú szekvencia) karboxi-terminális 1-50 aminosavaiból álló aminosavszekvenciát vagy annak egy részét tartalmazza;Y jelentése hidroxicsoport vagy egy olyan polipeptid, amely aSer Leu Thr He Tyr Asn Leu Thr Ser Ser szekvencia (3. számú szekvencia) amino-terminális 110 aminosavaiból álló aminosavszekvenciát vagy annak egy részét tartalmazza; és a polipeptid egy olyan variánsa, amelyben az előző aminosavak közül egy vagy több konzervatív módon szubsztituált, deletált vagy derivatizált, és az említett polipeptid képes a CD2-höz kötődni.HU 211 476 A9
- 3. Az 1. igénypont szerinti polipeptid a 10. számú szekvencia 29-120 aminosavai, a 10. számú szekvencia 29-108 aminosavai, a 10. számú szekvencia 48108 aminosavai és a 7. számú szekvencia aminosavai által meghatározott aminosavszekvenciájú polipeptidek által alkotott csoportból választva.
- 4. A 2. igénypont szerinti polipeptid, amely a Lys Asn Arg Val Tyr Leu Asp Thr Val Ser Gly Ser Leu Thr He Thr aminosavszekvenciát (7. számú szekvencia) tartalmazza.
- 5. Egy izolált DNS szekvencia, amely egy, az 1., 2., 3. vagy 4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet kódol.
- 6. Egy, az LFA-3 CD2-kötő doménjét kódoló izolált DNS szekvencia, amelynek szekvenciája:(5') (6. számú szekvencia): AATAGGGlTl ATTTAGAC TGTGTCAGGT (3').
- 7. Egy, az LFA-3 CD2-kötő doménjét kódoló DNS szekvenciát tartalmazó izolált DNS szekvencia a pPYM57. pPMDRM54-6, pPMDRM55-9, pPMDRM56-C. pPMDRM-15, pPYM63-4, pPYM65-8, pPMDRM 100-4, pPMDRM 101-1, pPMDRM 102-8 és pPMDRM3-10 DNS inszertumai által alkotott csoportból választva.
- 8. Egy, az 5., 6. vagy 7. igénypont szerinti DNS szekvenciát és egy expressziós kontroll szekvenciát tartalmazó rekombináns DNS molekula, amelyben az az expressziós kontroll szekvencia működőképesen kapcsolódik a DNS szekvenciához.
- 9. Egy, az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidek aminosavszekvenciáját tartalmazó aminoterminális régióval és egy, az LFA-3-tól eltérő fehérje vagy polipeptid egy doménjét tartalmazó karboxi-terminális régióval rendelkező fúziós fehérje.
- 10. A 9. igénypont szerinti fúziós fehérje, amelyben a karboxi-terminális régió egy immunglobulin Fc régiójának legalább egy részét tartalmazza.
- 11. A 10. igénypont szerinti fúziós fehérje, amelyben az immunglobulin Fc régiójának egy része egy csuklórégiót és a CH2 és CH3 konstans doméneket tartalmazza.
- 12. A 10. igénypont szerinti fúziós fehérje, amelyben az immunglobulin Fc régiójának egy része egy olyan csuklórégió egy részét tartalmazza, amely képes intermolekuláris diszulfidkötések kialakítására, és a Ch2 és Ch3 konstans doméneket.
- 13. A 12. igénypont szerinti fúziós fehérje, amely a 43. számú szekvencia 29-347 aminosavainak felel meg.
- 14. Egy, a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjét kódoló, izolált DNS szekvencia.
- 15. Egy, a 14. igénypont szerinti DNS szekvenciát és egy expressziós kontroll szekvenciát tartalmazó rekombináns DNS molekula, amelyben az expressziós kontroll szekvencia működőképesen kapcsolódik a DNS szekvenciához.
- 16. A 15. igénypont szerinti rekombináns DNS molekula, a pSAB152 plazmid és a pMDR(92)Ig-3 plazmid által alkotott csoportból választva.
- 17. Egy CD2-höz kötődni képes multimer fehérje, amely (a) két vagy több, az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidből, (b) két-vagy több, a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjéből vagy (c) egy vagy több, az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidből és egy vagy több, a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjéből áll.
- 18. Eljárás fehérje előállítására, azzal jellemezve, hogy azt a lépést tartalmazza, mely szerint a 8., 15. vagy 16. igénypont szerinti rekombináns DNS molekulával transzformált gazdasejtet szaporítunk.
- 19. A 8., 15. vagy 16. igénypont szerinti rekombináns DNS molekulával transzformált gazdasejt.
- 20. Eljárás CD2+ sejtek, vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjét hordozó fehérjék jelzésére, azzal jellemezve, hogy az említett eljárás tartalmazza azt a lépést, melyben a CD2+ sejteket vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjét tartalmazó fehérjéket az 1—4. igénypontok bármelyike szerinti polipepliddel, vagy a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjével inkubáljuk.
- 21. Eljárás oldatok tisztítására, beleértve az LFA-3 CD2-kötő doménjétől eltérő epitopokat felismerő antiLFA-3 ellenanyagokat tartalmazó szérumokat, azzal jellemezve, hogy tartalmazza azt a lépést, melyben az anti-LFA-3 ellenanyagok oldatát egy anti-LFA-3 deléciós mutáns fehérjével hozzuk érintkezésbe, amely fehérjét az alábbi csoportból választjuk: M57, M55, M56, PIM3, Ml00, vagy ezek kombinációja, olyan körülmények között, amelyek kedvezőek az ellenanyag-antitest komplex kialakulásához, majd az említett oldatból eltávolítunk minden keletkezett ellenanyag-fehérje komplexet.
- 22. Eljárás CD2+ sejtek, vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjét tartalmazó fehérjék izolálására, azzal jellemezve, hogy az alábbi lépést tartalmazza: egy, az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet vagy a9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjét egy kromatográfiás szubsztráthoz kapcsoljuk, majd a CD2+ sejteket tartalmazó sejtszuszpenziót, vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjét tartalmazó fehérjék oldatát érintkezésbe hozzuk az említett szubsztráttal, olyan körülmények között, amelyek kedveznek az LFA3/CD2 komplex kialakulásának.
- 23. Gyógyszerkészítmény, amely egy, az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet vagy egy, a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjét és egy gyógyszerészetileg elfogadható hordozót tartalmaz.
- 24. Diagnosztikai kit CD2+ sejtek vagy LFA-3-kötő fehérjék kimutatására, azzal jellemezve, hogy reagensként egy, az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti fehérjét vagy egy, a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti fúziós fehérjét tartalmaz.
- 25. Az 1—4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, vagy a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid alkalmazása T-sejt aktiválás gátlására.
- 26. Az 1—4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, vagy a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid alkalmazása perifériális vér limfociták szaporodásának gátlására.
- 27. Eljárás T-limfocita válaszok kiváltására in vivő,HU 211 476 A9 azzal jellemezve, hogy egy emlősállatnak az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet, vagy a 9-13. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet adjuk be.
- 28. Az 5., 6. vagy 7. igénypont szerinti DNS szekvenciát és egy expressziós kontroll szekvenciát tartalmazó rekombináns DNS molekula, azzal jellemezve, hogy a rekombináns DNS molekula lényegében ugyanaz, mint amit a 2. példában ismertettünk.
- 29. A 14. igénypont szerinti DNS szekvenciát és egy expressziós kontroll szekvenciát tartalmazó rekombináns DNS molekula, azzal jellemezve, hogy a rekombináns DNS molekula lényegében ugyanaz, mint amit all. példában ismertettünk.
- 30. Eljárás fehérje előállítására, azzal jellemezve, hogy az alábbi lépést tartalmazza: a 8., 15. vagy 16. igénypont szerinti rekombináns DNS molekulával transzformált gazdasejtet szaporítjuk, amely módszer5 lényegében azonos azzal, amelyet a 2. vagy 12. példában ismertettünk.
- 31. A 8., 15. vagy 16. igénypont szerinti rekombináns DNS molekulával transzformált gazdasejt, azzal jellemezve, hogy a gazdasejt lényegében ugyanaz,10 mint amelyet a 2. vagy 12. példában ismertettünk.
- 32. Eljárás CD2+ sejtek, vagy a CD2 LFA-3-kötő doménjét tartalmazó fehérjék jelzésére, azzal jellemezve, hogy az említett eljárás lényegében ugyanaz, mint amelyet a 14. példában ismertettünk.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US66797191A | 1991-03-12 | 1991-03-12 | |
US77096791A | 1991-10-07 | 1991-10-07 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU211476A9 true HU211476A9 (en) | 1995-11-28 |
Family
ID=27099806
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU95P/P00680P HU211476A9 (en) | 1991-03-12 | 1995-06-30 | Cd2-binding domain of lymphocyte function associated antigen 3 |
Country Status (15)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US5547853A (hu) |
EP (1) | EP0503648B1 (hu) |
JP (3) | JPH05508779A (hu) |
AT (1) | ATE193724T1 (hu) |
AU (1) | AU660981B2 (hu) |
CA (1) | CA2081028C (hu) |
DE (1) | DE69231135T2 (hu) |
DK (1) | DK0503648T3 (hu) |
ES (1) | ES2147178T3 (hu) |
GR (1) | GR3034140T3 (hu) |
HK (1) | HK1014030A1 (hu) |
HU (1) | HU211476A9 (hu) |
PT (1) | PT503648E (hu) |
SG (1) | SG47766A1 (hu) |
WO (1) | WO1992016622A1 (hu) |
Families Citing this family (57)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU660312B2 (en) * | 1991-06-06 | 1995-06-22 | Kanegafuchi Kagaku Kogyo Kabushiki Kaisha | LFA-3-like protein, derivatives thereof, genes thereof and processes for preparing the same |
DK0786255T3 (da) * | 1991-10-07 | 2002-04-15 | Biogen Inc | Fremgangsmåde til forbedring af tolerancen for allotransplantater og xenotransplantater ved administration af et LFA-3- eller CD2-bindingsprotein |
US6764681B2 (en) | 1991-10-07 | 2004-07-20 | Biogen, Inc. | Method of prophylaxis or treatment of antigen presenting cell driven skin conditions using inhibitors of the CD2/LFA-3 interaction |
ES2112335T3 (es) * | 1991-10-07 | 1998-04-01 | Biogen Inc | Procedimiento profilactico o terapeutico de enfermedades de la piel causadas por celulas que presentan antigenos por medio de inhibidores de la interaccion entre cd2 y lfa-3. |
US6162432A (en) * | 1991-10-07 | 2000-12-19 | Biogen, Inc. | Method of prophylaxis or treatment of antigen presenting cell driven skin conditions using inhibitors of the CD2/LFA-3 interaction |
US6037324A (en) | 1996-01-04 | 2000-03-14 | Leukosite, Inc. | Inhibitors of MAdCAM-1-mediated interactions and methods of use therefor |
CA2276046A1 (en) * | 1997-01-10 | 1998-07-16 | Epicyte Pharmaceutical, Inc. | Novel epithelial tissue targeting agent |
US6001651A (en) * | 1998-03-20 | 1999-12-14 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense modulation of LFA-3 |
ES2138565B1 (es) * | 1998-05-13 | 2000-08-16 | Inst Cientifico Tecnol Navarra | Uso del interferon alfa 5 en el tratamiento de las hepatopatias viral es. |
EP1109570B1 (en) * | 1998-08-31 | 2005-10-19 | Biogen, Inc. | Modulation of memory effector t-cells with a cd2 binding agent |
SI1109570T1 (sl) * | 1998-08-31 | 2006-04-30 | Biogen Idec Inc | Modulacija spominskih efektorskih T-celic z vezavnim sredstvom CD2 |
US6867203B2 (en) | 1998-12-29 | 2005-03-15 | Abbott Laboratories | Cell adhesion-inhibiting antiinflammatory and immune-suppressive compounds |
ATE489395T1 (de) | 2000-12-12 | 2010-12-15 | Medimmune Llc | Moleküle mit längeren halbwertszeiten, zusammensetzungen und deren verwendung |
JP2004536786A (ja) * | 2001-03-02 | 2004-12-09 | メディミューン,インコーポレイテッド | インテグリンαvβ3拮抗薬を他の予防薬もしくは治療薬と組み合わせて投与することによる炎症性疾患または自己免疫疾患の予防または治療方法 |
WO2002098370A2 (en) * | 2001-03-02 | 2002-12-12 | Medimmune, Inc. | Methods of administering/dosing cd2 antagonists for the prevention and treatment of autoimmune disorders or inflammatory disorders |
CA2454618C (en) | 2001-07-24 | 2012-04-03 | Biogen Idec Ma, Inc. | Methods for treating or preventing sclerotic disorders using cd2-binding agents |
WO2003046198A2 (de) * | 2001-11-28 | 2003-06-05 | Graffinity Pharmaceuticals Ag | Verfahren zur selektion und identifikation von peptid- oder proteinmolekülen mittels phage display |
AU2002352069A1 (en) * | 2001-11-28 | 2003-06-10 | Graffinity Pharmaceuticals Ag | Surface plasmon resonance (spr) sensor surface support |
DE10220602A1 (de) * | 2001-11-28 | 2003-06-26 | Graffinity Pharmaceuticals Ag | Verfahren zur Selektion und Identifikation von Peptid- oder Proteinmolekülen mittels Phage Display |
EP2075256A2 (en) | 2002-01-14 | 2009-07-01 | William Herman | Multispecific binding molecules |
WO2005035773A2 (en) * | 2003-10-08 | 2005-04-21 | Sanofi Pasteur, Inc. | Modified cea /b7 vector |
PT1496939E (pt) | 2002-04-09 | 2007-11-22 | Sanofi Pasteur Ltd | ''ácido nucleico de cea modificado e vectores de expressão'' |
CA2497628A1 (en) * | 2002-09-05 | 2004-03-18 | Medimmune, Inc. | Methods of preventing or treating cell malignancies by administering cd2 antagonists |
EP2025345A1 (en) | 2002-12-30 | 2009-02-18 | Biogen Idec MA Inc. | KIM-1 antagonists and use to modulate immune system |
DE602004030451D1 (de) * | 2003-07-15 | 2011-01-20 | Chugai Pharmaceutical Co Ltd | Produktion von igm durch transformierte zellen und verfahren zur quantifizierung dieser igm-produktion |
EP1688439A4 (en) * | 2003-10-08 | 2007-12-19 | Kyowa Hakko Kogyo Kk | HYBRID PROTEIN COMPOSITION |
EP1688432B1 (en) * | 2003-10-09 | 2011-08-03 | Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha | Igm high concentration stabilized solution |
US20070172478A1 (en) * | 2004-02-06 | 2007-07-26 | Astellas Us Llc | Methods of treating skin disorders |
US7381794B2 (en) | 2004-03-08 | 2008-06-03 | Zymogenetics, Inc. | Dimeric fusion proteins and materials and methods for producing them |
BRPI0510691A (pt) * | 2004-05-04 | 2007-12-26 | Genaissance Pharmaceuticals | marcadores de haplótipos e métodos de uso dos mesmos para determinar resposta ao tratamento |
CA2565259A1 (en) | 2004-05-07 | 2005-12-08 | Astellas Us Llc | Soluble lfa-3 polypeptide for treating viral disorders |
JP2010507394A (ja) * | 2006-10-24 | 2010-03-11 | トルービオン ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド | 改良免疫糖タンパク質のための物質および方法 |
US7846434B2 (en) | 2006-10-24 | 2010-12-07 | Trubion Pharmaceuticals, Inc. | Materials and methods for improved immunoglycoproteins |
CA2975228C (en) | 2008-05-02 | 2020-07-21 | Seattle Genetics, Inc. | Methods and compositions for making antibodies and antibody derivatives with reduced core fucosylation |
WO2010068722A1 (en) | 2008-12-12 | 2010-06-17 | Medimmune, Llc | Crystals and structure of a human igg fc variant with enhanced fcrn binding |
US20150231215A1 (en) | 2012-06-22 | 2015-08-20 | Randolph J. Noelle | VISTA Antagonist and Methods of Use |
US10745467B2 (en) | 2010-03-26 | 2020-08-18 | The Trustees Of Dartmouth College | VISTA-Ig for treatment of autoimmune, allergic and inflammatory disorders |
EP2552947A4 (en) | 2010-03-26 | 2013-11-13 | Dartmouth College | VISTA REGULATORY T CELL MEDIATOR PROTEIN, VISTA BINDING ACTIVE SUBSTANCES AND USE THEREOF |
BR112012031329A2 (pt) | 2010-06-09 | 2016-10-11 | Zymogenetics Inc | proteínas de fusão diméricas vstm3 e composições e métodos relacionados |
WO2016030888A1 (en) | 2014-08-26 | 2016-03-03 | Compugen Ltd. | Polypeptides and uses thereof as a drug for treatment of autoimmune disorders |
WO2012001647A2 (en) | 2010-06-30 | 2012-01-05 | Compugen Ltd. | Polypeptides and uses thereof as a drug for treatment of multiple sclerosis, rheumatoid arthritis and other autoimmune disorders |
WO2012035518A1 (en) | 2010-09-17 | 2012-03-22 | Compugen Ltd. | Compositions and methods for treatment of drug resistant multiple myeloma |
SG194099A1 (en) | 2011-04-15 | 2013-11-29 | Compugen Ltd | Polypeptides and polynucleotides, and uses thereof for treatment of immune related disorders and cancer |
WO2013001517A1 (en) | 2011-06-30 | 2013-01-03 | Compugen Ltd. | Polypeptides and uses thereof for treatment of autoimmune disorders and infection |
PL2764351T3 (pl) | 2011-09-29 | 2019-05-31 | Seattle Genetics Inc | Oznaczanie nienaruszonej masy związków środków sprzężonych z białkami |
US9890215B2 (en) | 2012-06-22 | 2018-02-13 | King's College London | Vista modulators for diagnosis and treatment of cancer |
WO2014025198A2 (ko) * | 2012-08-09 | 2014-02-13 | 주식회사 한독 | Lfa3 변이체 및 상기 변이체 또는 lfa3 cd2 결합영역과 이에 표적 특이적 폴리펩타이드가 연결된 융합단백질 및 그 용도 |
CA2884704C (en) | 2012-09-07 | 2023-04-04 | Randolph J. Noelle | Vista modulators for diagnosis and treatment of cancer |
CN106661107B (zh) | 2013-12-24 | 2021-12-24 | 杨森制药公司 | 抗vista抗体及片段 |
US11014987B2 (en) | 2013-12-24 | 2021-05-25 | Janssen Pharmaceutics Nv | Anti-vista antibodies and fragments, uses thereof, and methods of identifying same |
WO2015191881A2 (en) | 2014-06-11 | 2015-12-17 | Green Kathy A | Use of vista agonists and antagonists to suppress or enhance humoral immunity |
CN107405398A (zh) | 2014-12-05 | 2017-11-28 | 伊穆奈克斯特股份有限公司 | 鉴定vsig8作为推定vista受体及其用以产生vista/vsig8激动剂和拮抗剂的用途 |
DK3313882T3 (da) | 2015-06-24 | 2020-05-11 | Janssen Pharmaceutica Nv | Anti-VISTA antistoffer og fragmenter |
CA3014013A1 (en) | 2016-02-12 | 2017-08-17 | Janssen Pharmaceutica Nv | Anti-vista (b7h5) antibodies |
CR20180537A (es) | 2016-04-15 | 2019-03-04 | Immunext Inc | Anticuerpos vista antihumanos y su uso |
US10245320B2 (en) | 2016-09-30 | 2019-04-02 | Enzo Biochem, Inc. | Immunomodulatory pharmaceutical compositions and methods of use thereof |
AU2019242451B2 (en) * | 2018-03-29 | 2024-05-09 | Pfizer Inc. | LFA3 variants and compositions and uses thereof |
Family Cites Families (16)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4816567A (en) * | 1983-04-08 | 1989-03-28 | Genentech, Inc. | Recombinant immunoglobin preparations |
US5190859A (en) * | 1987-02-26 | 1993-03-02 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Purification of LFA-3 |
US4956281A (en) * | 1987-06-03 | 1990-09-11 | Biogen, Inc. | DNA sequences, recombinant DNA molecules and processes for producing lymphocyte function associated antigen-3 |
PT88641B (pt) * | 1987-10-02 | 1993-04-30 | Genentech Inc | Metodo para a preparacao de uma variante de adesao |
DE3801511C2 (de) * | 1988-01-20 | 1996-11-14 | Espe Stiftung | Verwendung von Photoinitiatoren zur Herstellung von in zwei Schritten härtbaren Dentalmassen |
ZA89430B (en) * | 1988-01-22 | 1989-10-25 | Gen Hospital Corp | Cloned genes encoding ig-cd4 fusion proteins and the use thereof |
EP0345466A3 (en) * | 1988-05-10 | 1991-04-17 | EASTMAN KODAK COMPANY (a New Jersey corporation) | Generation of chimeric antibodies in vivo by site-specific recombination |
US5185441A (en) * | 1988-08-26 | 1993-02-09 | Biogen, Inc. | Dna sequences, recombinant dna molecules and processes for producing pi-linked lymphocyte function associated antigen-3 |
DE68913658T3 (de) * | 1988-11-11 | 2005-07-21 | Stratagene, La Jolla | Klonierung von Immunglobulin Sequenzen aus den variablen Domänen |
AU633045B2 (en) * | 1988-12-23 | 1993-01-21 | Salk Institute For Biological Studies, The | Receptor transcription-repression activity compositions and methods |
WO1990008187A1 (en) * | 1989-01-19 | 1990-07-26 | Dana Farber Cancer Institute | Soluble two domain cd2 protein |
US5225538A (en) * | 1989-02-23 | 1993-07-06 | Genentech, Inc. | Lymphocyte homing receptor/immunoglobulin fusion proteins |
US5116964A (en) * | 1989-02-23 | 1992-05-26 | Genentech, Inc. | Hybrid immunoglobulins |
US5223394A (en) * | 1989-04-10 | 1993-06-29 | Biogen, Inc. | Recombinant dna molecule comprising lymphocyte function-associated antigen 3 phosphatidylinositol linkage signal sequence |
JPH04506460A (ja) * | 1990-01-26 | 1992-11-12 | バイオジェン,インコーポレイテッド | C4結合タンパク質の融合タンパク質 |
IL99864A (en) * | 1990-10-31 | 2000-11-21 | Autoimmune Inc | Compositions for suppressing transplant rejection in mammals which contain tissue donor derived MHC antigens |
-
1992
- 1992-03-12 US US07/940,861 patent/US5547853A/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-03-12 AT AT92104320T patent/ATE193724T1/de active
- 1992-03-12 AU AU17540/92A patent/AU660981B2/en not_active Ceased
- 1992-03-12 WO PCT/US1992/002050 patent/WO1992016622A1/en active Application Filing
- 1992-03-12 SG SG1996004272A patent/SG47766A1/en unknown
- 1992-03-12 DK DK92104320T patent/DK0503648T3/da active
- 1992-03-12 EP EP92104320A patent/EP0503648B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-03-12 JP JP92509428A patent/JPH05508779A/ja not_active Withdrawn
- 1992-03-12 DE DE69231135T patent/DE69231135T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1992-03-12 PT PT92104320T patent/PT503648E/pt unknown
- 1992-03-12 ES ES92104320T patent/ES2147178T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1992-03-12 CA CA002081028A patent/CA2081028C/en not_active Expired - Lifetime
-
1995
- 1995-06-02 US US08/459,512 patent/US5728677A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-02 US US08/459,657 patent/US5914111A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-06-30 HU HU95P/P00680P patent/HU211476A9/hu unknown
-
1998
- 1998-12-22 HK HK98114803A patent/HK1014030A1/xx not_active IP Right Cessation
-
2000
- 2000-08-07 GR GR20000401835T patent/GR3034140T3/el unknown
-
2001
- 2001-06-19 JP JP2001185681A patent/JP3520272B2/ja not_active Expired - Lifetime
-
2002
- 2002-06-18 JP JP2002177800A patent/JP2003089654A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP0503648A1 (en) | 1992-09-16 |
JP2002037800A (ja) | 2002-02-06 |
DE69231135T2 (de) | 2001-02-15 |
ES2147178T3 (es) | 2000-09-01 |
EP0503648B1 (en) | 2000-06-07 |
ATE193724T1 (de) | 2000-06-15 |
DK0503648T3 (da) | 2000-10-30 |
SG47766A1 (en) | 1998-04-17 |
CA2081028C (en) | 1999-12-14 |
AU660981B2 (en) | 1995-07-13 |
US5728677A (en) | 1998-03-17 |
GR3034140T3 (en) | 2000-11-30 |
DE69231135D1 (de) | 2000-07-13 |
HK1014030A1 (en) | 1999-09-17 |
US5914111A (en) | 1999-06-22 |
JP3520272B2 (ja) | 2004-04-19 |
PT503648E (pt) | 2000-10-31 |
CA2081028A1 (en) | 1992-09-13 |
AU1754092A (en) | 1992-10-21 |
JP2003089654A (ja) | 2003-03-28 |
JPH05508779A (ja) | 1993-12-09 |
WO1992016622A1 (en) | 1992-10-01 |
US5547853A (en) | 1996-08-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
HU211476A9 (en) | Cd2-binding domain of lymphocyte function associated antigen 3 | |
CA2308765C (en) | The use of an ox-2 protein or nucleic acid in immunomodulation | |
Linsley et al. | Binding of the B cell activation antigen B7 to CD28 costimulates T cell proliferation and interleukin 2 mRNA accumulation. | |
US6143273A (en) | Therapeutic composition containing antibodies to soluble polypeptide fractions of LAG-3 protein | |
US5885579A (en) | CTLA4 receptor and uses thereof | |
US7034121B2 (en) | Antibodies against CTLA4 | |
JP4373495B2 (ja) | Il−17受容体 | |
Biancone et al. | Inhibition of the CD40-CD40ligand pathway prevents murine membranous glomerulonephritis | |
AU764020B2 (en) | Method of modulating memory effector T-cells and compositions | |
US5928643A (en) | Method of using CD2-binding domain of lymphocyte function associated antigen 3 to initiate T cell activation | |
US5686582A (en) | Multimeric forms of human rhinovirus receptor protein | |
EP0503646A1 (en) | Monoclonal antibodies recognizing lymphocyte function associated antigen-3 | |
CA2220098A1 (en) | Cd6 ligand | |
WO1992001715A1 (en) | Soluble cell-surface dimeric proteins | |
US6107461A (en) | Multimeric forms of human rhinovirus receptor and fragments thereof, and method of use | |
WO1993005814A1 (en) | Competitive inhibition of t cell-b cell interactions | |
EP1249456A1 (en) | Novel peptide and screening method by using the same | |
AU748168B2 (en) | Viral encoded semaphorin protein receptor DNA and polypeptides |