HRP20040548A2 - A method for determining the biological activity of defibrotide - Google Patents

A method for determining the biological activity of defibrotide Download PDF

Info

Publication number
HRP20040548A2
HRP20040548A2 HR20040548A HRP20040548A HRP20040548A2 HR P20040548 A2 HRP20040548 A2 HR P20040548A2 HR 20040548 A HR20040548 A HR 20040548A HR P20040548 A HRP20040548 A HR P20040548A HR P20040548 A2 HRP20040548 A2 HR P20040548A2
Authority
HR
Croatia
Prior art keywords
plasmin
defibrotide
substrate
concentration
nitroaniline
Prior art date
Application number
HR20040548A
Other languages
English (en)
Inventor
Roberto Porta
Franco Cataneo
Laura Ferro
Original Assignee
Gentium Spa
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from PCT/EP2002/001337 external-priority patent/WO2002064404A1/de
Application filed by Gentium Spa filed Critical Gentium Spa
Publication of HRP20040548A2 publication Critical patent/HRP20040548A2/hr

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • C12Q1/37Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/02Antithrombotic agents; Anticoagulants; Platelet aggregation inhibitors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/56Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving blood clotting factors, e.g. involving thrombin, thromboplastin, fibrinogen
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/914Hydrolases (3)
    • G01N2333/948Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • G01N2333/968Plasmin, i.e. fibrinolysin

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Description

Ovaj izum se odnosi na postupak određivanja biološke aktivnosti defibrotida, te naročito na indirektni enzimatski postupak određivanja biološke aktivnosti defibrotida.
Tehničko područje izuma
Defibrotid (Merck Index, 1996, broj 2915) je supstancija prirodnog porijekla koja se dobiva ekstrakcijom iz životinjskih organa, te koju sačinjava natrijeva sol polideoksiribonukleotida niske molekularne mase.
Defibrotid je bio predmet brojnih farmakoloških istraživanja koja sugeriraju njegovu primjenu u terapiji kao antitrombotskog sredstva (US 3,829, 567).
Dodatno, defibrotid se također uspješno rabio u liječenju periferne arteriopatije, akutne insuficijencije bubrega (US 4,694, 134) ili akutne ishemije miokarda (US 4,693, 995).
Kao i ostale biološke supstancije koje se dobivaju ekstrakcijom, defibrotid podliježe varijabilnosti sastava što je tipično za prirodne biopolimere. Klasični primjer ove situacije predstavlja heparin čija je varijabilnost iz serije u seriju, obzirom na duljinu lanca, molekularnu masu, sastav, stupanj sulfatacije, itd dobro poznata. Posljedica ovoga je da iste količine defibrotida po masi ne moraju biti ekvivalentne s točke specifične biološke aktivnosti.
Postupak ekstrakcije, izolacije i pročišćavanja ne može sam po sebi osigurati apsolutnu reproducibilnost produkta, upravo zbog njegove intrinzične biopolimerne prirode
Međutim, ako se dobro kontrolira, moguće je smanjiti ovu varijabilnost: u tu svrhu, napravljene su studije standardiziranih industrijskih procesa za izolaciju defibrotida ekstrakcijom iz organa, kao što je na primjer, ona opisana u US patentu US 4, 985,552.
Produkt dobiven prema gore spomenutom postupku karakteriziran je određivanjem nekih specifičnih fizičko-kemijskih parametara, kao što je na primjer, elektroforetska pokretljivost, koeficijent ekstinkcije, veličina optičke rotacije, reverzibilna hiperkromnost. Međutim, ovi parametri u osnovi ovise o strukturi defibrotida i nemaju mogućnost osiguravanja informacije o njegovoj biološkoj aktivnosti.
Koliko je poznato, jedini postupci koji su objavljeni za primjenu do sada za procjenu biološke aktivnosti defibrotida su test fibrinske ploče i tromboelastografsko snimanje vremena lize euglobulina [Prino G., Mantovani M., Niada R., Coccheri S., Butti A., Indagini preliminari sull'attivita fibrinolitica, nell'animale e nell'uomo, di una nuova sostanza presente in diversi organi animali, Simposio Internazionale: La ricerca scientifica nell'industria farmaceutica in Italia, Rim, 2-4 listopad 1975-I1 Farmaco, Ed. Prat. ) (1969), 24, 552-561].
Međutim, gore spomenuti postupci karakterizirani su znatnom eksperimentalnom složenosti, nezadovoljavajućom reproducibilnosti i preciznosti, te u specifičnim slučajevima tromboelastografskog snimanja, linearnosti odgovora koji je ograničen na vrlo suženo koncentracijsko područje.
Do sada stoga nisu bile poznate, uistinu valjane, precizne i reproducibilne metode za određivanje biološke aktivnosti defibrotida.
Mi smo razvili jednostavan i pouzdan postupak za određivanje biološke aktivnosti defibrotida, koji omogućuje kontrolu uzoraka dobivenih ekstrakcijom, te stoga omogućuju standardizirane medicinske pripravke temeljene na defibrotidu.
Postupak na koji se ovaj izum odnosi omogućuje da se odredi specifična biološka aktivnost defibrotida u usporedbi s referentnim standardom, uz visoki stupanj preciznosti, brzine i reproducibilnosti.
Detaljan opis izuma
Ovaj izum se prema tome odnosi na postupak određivanja specifične biološke aktivnosti uzoraka defibrotida, koja obuhvaća slijedeće korake:
a) dovođenje u kontakt defibrotida, plazmina i supstrata specifičnog za plazmin koji reakcijom s plazminom, osigurava mjerljiv produkt i
b) mjerenje količine produkta koji se stvara sukcesivno tijekom vremena.
Postupak izuma je indirektna in vitro metoda za određivanje aktivnosti defibrotida, koja se temelji na funkcionalnim interakcijama između defibrotida i plazmina.
Poznato je iz literature da je plazmin proteolitički enzim u koagulacijskom nizu/fibrinolizi koji omogućava cijepanje fibrina, fibrinogena i ostalih proteina plazme.
Enzimatska aktivnost plazmina normalno se određuje različitim standardnim in vitro testovima. Jedan od najviše rabljenih postupaka je određivanje spektrofotometrijom ili fluorimetrijom kromogenih ili fluorogenih spojeva koji se oslobađaju djelovanjem plazmina na prikladnim supstratima [Haemostasis, (1978),7, 138-145]. Peptidni supstrati s formulom A1-A2-A3-X koji se općenito rabe, u kojima A1 i A2 su aminkiseline koje su većinom nepolarne, A3 je lizin ili arginin i X predstavlja mjerljiv slobodni spoj, na primjer para-nitroanilin (pNa) ili 2-naftilamin (NA) [Haemostasis, (1978),7, 146-149]. Uz gore spomenute peptidne supstrate, postignut je uspjeh uporabom drugih, jednostavnijih spojeva kao što je, na primjer, p-nitrobenzil-p-toluensulfonil-1-arginin [Haemostasis, (1978), 7, 105-108].
U ovim testovima, brzina kojom se spoj X oslobađa u inkubacijski medij proporcionalna je aktivnosti (internacionalne jedinice) plazmina prisutnog u uzorku.
Sada je otkriveno, i ovo je princip na kojem se temelji ovaj izum, da u gore opisanim testovima procjene vrijednosti plazmina, defibrotid povećava brzinu oslobađanja spoja X proporcionalno koncentraciji.
Postupak na koji se ovaj izum odnosi osigurava ponajprije dovođenje u međusobni kontakt uzorka defibrotida, plazmina i supstrata za plazmin.
Uzorak defibrotida koji se rabi za određivanje prema izumu općenito se pripravlja ekstrakcijom iz organa u skladu s poznatim postupcima, kao što je na primjer, u U.S. patentu US 4,985, 552 koji je već bio spomenut.
Serija normalno industrijski proizvedenog defibrotida izabrana je kao referentni uzorak (standard), te se rabi za izradu kalibracijske krivulje prema postupku ovog izuma.
Općenito ovaj postupak osigurava precizna i točna mjerenja defibrotida čak i u prisutnosti zagađivača, kao što je na primjer, RNA, heparin, razgrađeni defibrotid (defibrotid iz kojeg su uklonjeni purin ili pirimidin) ili etanol, što osigurava da su u koncentracijama, općenito manjim od 10% (masenih), koje ne škode sistemu.
Uz to što omogućuje određivanje defibrotida, postupak također dopušta određivanje ostalih biološki ekvivalentnih supstancija dobivenih iz defibrotida, kao što je na primjer, deaminirani defibrotid ili još jednostavnije, defibrotid denaturiran toplinom.
Ovaj postupak je dostatno osjetljiv za detekciju koncentracija defibrotida nižih od ili jednakih 0,1 μg/mL (konačna koncentracija u sistemu određivanja) i općenito, pokazuje dobru korelaciju do maksimalnih vrijednosti koncentracija većih od ili jednakih 100 μg/mL.
Uporabljeni plazmin je općenito bilo koji plazmin sisavaca, kao što je na primjer, goveđi, svinjski ili humani plazmin, s prioritetom za humani plazmin.
Međutim, iako je plazmin enzim izbora, uporaba ostalih sistema ekvivalentnih enzima, kao što je na primjer, prekurzor plazmina, kao što je plazminogen, ili enzimi plazmin-analoga koji su kemijski srodni i imaju sličnu funkcionalnost, je unutar područja ovog izuma.
U postupku ovog izuma, podrazumijeva se da je supstrat za plazmin bilo koji supstrat specifičan za plazmin koji, u uvjetima postupka, oslobađa produkt hidrolize X u količinama koje se mogu detektirati.
Ovisno o prirodi skupine X koja se može detektirati, jednako dobro se mogu prilagoditi alternativni sistemi detekcije koji su obično poznati stručnjacima. Spektrofotometrijski ili fluorimetrijski sistemi detekcije su posebice korisni, naročito spektrofotometrijski sistemi.
Supstrati koji se obično rabe su oni specifični za plazmin. Preferirano se rabe peptidi formule A1-A2-A3-X, u kojima Al i A2 su aminokiseline koje su uglavnom nepolarne, A3 je lizin ili arginin, i X je grupa koja se može detektirati. Primjeri ovih supstrata su Val-Leu-Liz-pNa, Val-Fe-Liz-pNa ili piroGlu-Fe-Liz-pNa u kojima grupa X koja se može detektirati spektrofotometrijski je para-nitroanilin (pNA). Ostali prikladni supstrati, na primjer Val-Gli-Arg-2NA, sadrži 2-naftilamin, koji se mjeri fluorimetrijski. Posebno preferirani supstrat je spoj H-D-Valil-1-Leucil-1-Lizin-p-nitroanilin (H-D-Val-Leu-Liz-pNA).
Plazmini i specifični supstrati koji se rabe za određivanje defibrotida općenito su komercijalno dostupni.
Postupak određivanja ovog izuma provodi se pripremanjem vodene otopine reagensa i uzorka defibrotida kod specifičnog pH i molarnosti.
Posebice, koncentracija plazmina može varirati, obično od 0,0016 do 0,20 i.j/mL, pogodno od 0,0064 do 0,050 i.j./mL, te čak pogodnije otprilike 0,0125 i.j./mL.
Međutim, obzirom na supstrat plazmina, koncentracija od oko 0,3 do 4 mM, pogodno od 2,5 do 3,5 mM te prikladno 3 mM, se općenito rabi u slučaju kromogenog supstrata, dok se koncentracije od 0,05 do 0,15 mM rabe u slučaju fluorogenog supstrata.
Postupak određivanja ovog izuma, kao i ostale enzimatske metode, osjetljiv je na pH medija.
Zapravo, ne može se općenito uporabiti na ekstremnim pH vrijednostima gdje se enzimatski sistemi inaktiviraju.
Također je pogodno da pH medija ne podliježe promjenama bilo kada tijekom perioda u kojem se provodi mjerenje, te je stoga otopina općenito puferirana s puferskim sistemima izabranim od onih koji se normalno rabe u testovima određivanja s plazminom. Prikladni puferski sitemi mogu biti, na primjer, fosfatni pufer, citratni pufer ili tris (hidroksimetil) aminometan hidroklorid (TRIS) pufer. Postupak se preferirano provodi u prisutnosti TRIS pufera.
U ovom postupku obično je preferirano održavati pH medija u području od otprilike 7 do 8, pogodnije na otprilike 7,4.
Dodatno, preferirano je održavati koncentraciju puferskog sistema u području od 10 do 200 mM, pogodnije na otprilike 50 mM.
Postupak izuma za određivanje defibrotida osigurava da se plazmin, supstrat za plazmin i defibrotid pomiješaju. Posebice, u svrhu omogućavanja da se mjerenja osigurana za postupak provode korektno, preferirano je dodati plazmin ili specifični supstrat, ili oboje, u puferiranu otopinu koja sadrži uzorak defibrotida prije početka koraka mjerenja. Supstrat za plazmin se preferirano dodaje posljednji.
Važan parametar u ovom postupku određivanja je temperatura. Preferirano je da se ista temperatura održava tijekom cjelokupnog trajanja mjerenja, te za sve uzorke za određivanje, i tijekom izrade referentne krivulje i tijekom koraka mjerenja. Konačno, preferirano je rabiti aparate s kontroliranom temperaturom, te također, gdje je potrebno, moguće je nastaviti s nekoliko setova mjerenja, mijenjajući odgovarajuće položaj uzoraka u svrhu osiguravanja da sistem ima maksimalnu temperaturnu stalnost.
Općenito, ovaj postupak određivanja primjenjuje se na temperaturnom području, na primjer, od 25 do 40°C, preferirano do 35 do 39°C, te čak još više preferirano na 37°C.
Prema ovom izumu, mjerenje koncentracije spoja X oslobođenog u medij djelovanjem plazmina počinje kada se dodaju svi reagensi, te se nastavlja prethodno određeno vrijeme i prethodno određenom frekvencijom kao funkcijom kemijske prirode spoja X i sistema detekcije.
Slično ostalim postupcima biološkog određivanja, postupak izuma također osigurava za kalibracijski korak i korak određivanja, preferirano provođenje u paraleli u svrhu smanjenja, pojave eksperimentalne varijabilnosti koliko je to moguće.
Korak kalibracije obuhvaća prikupljanje podataka o apsorbanciji koja se odnosi na uzorke poznate rastuće koncentracije defibrotida (standard), statističkog reprocesiranja navedenih podataka te ekstrapolacije kalibracijske krivulje, koja pokazuje korelaciju između povećanja brzine enzimatske reakcije ovog izuma i koncentracije defibrotida prisutnog u mediju.
U koraku mjerenja, uzimajući u obzir korelacije dobivene u koraku kalibracije, moguće je odrediti nepoznatu biološku aktivnost uzoraka defibrotida na temelju vrijednosti apsorbancija izmjerenih i procesiranih pod istim uvjetima.
Detaljnije, protokol eksperimenta općenito osigurava pripravljanje nekoliko uzoraka, i standarda i nepoznatog uzorka, u različitim poznatim koncentracijama defibrotida. Uzorci defibrotida se pripravljaju progresivnim razrjeđivanjem osnovne otopine prema prethodno određenom faktoru razrjeđivanja.
U ovom postupku, preferirano je pripravljanje najmanje 5 koncentracija standarda i 5 koncentracija uzorka koji se ispituje, pripravljanjem 5 replikata, ili čak pogodnije 10 replikata, za svaku koncentraciju standarda, te slično za svaku koncentraciju uzorka, općenito uzastopnim razrjeđivanjem osnovne otopine 1 : 2.
Koncentracije defibrotida u standardu i uzorku za ispitivanje općenito su od 0,1 do 100 μg/mL, pogodnije od 0,3 do 50 μg/mL, još pogodnije od 0,5 do 8 μg/mL.
Koncentracije uzorka za ispitivanje su preferirano istog raspona nivoa koncentracija kao kod standarda.
U skladu s gornjom ilustracijom, mjerenja se za svaku koncentraciju preferirano provode na dvije mikroploče gdje je položaj svakog uzorka, standarda i uzorka za ispitivanje, odnosno odgovarajuće koncentracije preferirano obrnut između jedne i druge ploče. Prema ovoj shemi smještanja uzoraka, koja je detaljnije objašnjena u eksperimentalnom dijelu, za svaku koncentraciju defibrotida u standardu i uzorku za ispitivanje, izmjeri se najmanje 5 ili pogodnije 10 vrijednosti apsorbancija u svakom vremenu.
Set gore opisanih mjerenja se provede u prethodno određenim vremenima, to jest, najprije u vremenu t0, to jest, kada su sve komponente dodane, prije nego što započne enzimatska reakcija ovog izuma, te uzastopno u preciznim intervalima i u vremenskom periodu dostatnom za prikupljanje potrebnih podataka.
Pogodno je da se mjerenja apsorbancija nastave do najviše 90 minuta, s očitanjem svakih 1-10 minuta. Još pogodnije, očitanja se provedu u vremenu t0, te uzastopno u periodu od 20 do 50 minuta, svakih 5 minuta. Očitavanja fotometrijske apsorbancije provode se na valnoj duljini koji ovisi o prirodi grupe X koja se treba detektirati, oslobođene u enzimatskoj hidrolitičkoj reakciji. U specifičnom slučaju u kojem X je p-NA, apsorbancija se mjeri na 405 nm.
Očitanja apsorbancija uzoraka standarda i nepoznatog uzorka defibrotida, nazvana sirovim podacima, koji općenito potječu od istog aparata i osiguravaju operaciju očitavanja; prikazana su tablično na taj način da je vrijednost apsorbancije izražena za svako vrijeme i jažicu.
Sirovi podaci se zatim procesiraju, uporabom, na primjer, Spread Sheet-Microsoft Excel®. Ova prva operacija procesiranja vodi do izračunavanja prosječne apsorbancije i povezane standardne devijacije, u svakom vremenu i za svaki set očitanja, od kojih se svaki set sastoji od najmanje 5, te pogodnije 10 replikata za svaku koncentraciju standarda i test-uzorka defibrotida.
Daljnje statističko procesiranje podataka se provodi kompjuterskim programom tipa Sigma Plot Computer Program (SPSS, Chicago, USA) koje uzima u obzir matematički odnos koji postoji između vrijednosti apsorbancija uzoraka i vremena, za svaki set koncentracija defibrotida, da se dobije pravac čiji je nagib proporcionalan koncentraciji defibrotida.
Preciznije, u intervalu u kojem je odgovor linearan, preferirano od 20 do 50 minuta, te za svaki od 5 ili pogodnije 10 replikata iste koncentracije, program izračunava liniju regresije koja je karakterizirana koeficijentom linearne regresije «b», koeficijentom determinacije «r2» i odsječkom «a».
Pravci dobiveni prema ovom postupku općenito imaju dobru korelaciju izraženu visokom vrijednosti r2, općenito najmanje 0,97, pogodnije r2 > 0,99. Podaci dobiveni ovim programom mogu se reproducirati kao tablično prikazani digitalni podaci ili se mogu prikazati grafički, za svaki set koncentracija.
Kao što je prikazano na Slici 1, smještanjem vremena na apscisu i apsorbancije na ordinatu, dobit će se pravci čiji će nagib «b» biti proporcionalni brzini enzimatske reakcije: povećanjem koncentracije defibrotida povećat će se brzina hidrolize, te proporcionalno vrijednost «b».
Konačno, vrijednosti nagiba, izračunate kao što je gore opisano za svaki set replikata standarda defibrotida i test-uzoraka defibrotida, stavljene su u korelaciju s decimalnim logaritmom koncentracije defibrotida na koje se odnose.
Grafički, ovom korelacijom dobiva se sigmoid za standard i sigmoid za test uzorak (Slika 2); glavni dijelovi sigmoida imaju dva pravca koji su općenito paralelni i čiji razmak je funkcija razlike u biološkoj aktivnosti između test uzorka i standarda.
U ovom intervalu linearnosti jačina nepoznatog uzorka defibrotida u usporedbi s onom standarda odredi se u skladu s metodologijom biološkog određivanja paralelnih pravaca opisanom u Finney DJ, Statistical Method in Biological Assay, 2. izdanje, Ch. Griffin, London.
Ova metodologija može se primijeniti kada je, kao u ovom izumu, biološki odgovor linearna funkcija logaritma koncentracije supstancije koja se određuje, te gdje je prisutna paralelnost i linearnost između pravaca povezanih sa standardom, te odnosnih nepoznatih koncentracija.
Preferirano statističko procesiranje podataka, izračunavanje omjera jačina, te time određivanje nepoznate aktivnosti defibrotida provodi se uporabom namjenskog softwera konstruiranog na temelju gore spomenute metodologije.
Međutim, statističko procesiranje podataka, koje, u kemijskoj analizi općenito, i ovom postupku posebice, omogućuje smanjenje pojavnosti pogrešaka i eksperimentalne varijabilnosti, nije povezano s postupkom izuma i jednostavno predstavlja metodu procjene rezultata koja je dobro poznata stručnjaku, te koja se uobičajeno rabi na tom području.
Ovaj izum odnosi se također na komplete za određivanje biološke aktivnosti defibrotida prema postupku ovog izuma, koji se sastoji od najmanje:
a) odmjerene količine supstrata za plazmin kao što je gore definirano te
b) odmjerene količine plazmina.
Preferirani kompleti sadrže od 20 do 30 mg supstrata specifičnog za plazmin po jedinici plazmina, te pogodnije 25 mg supstrata po jedinici plazmina.
U skladu s ovim izumom, kompleti koji sadrže H-D-Val-Leu-Liz-pNA kao supstrat specifičan za plazmin, i humani plazmin, posebice su prikladni.
Kompleti u skladu s ovim izumom mogu također sadržavati puferirane vodene otopine, preferirano otopinu puferiranu s TRIS.HCl 50 mM, pri pH 7,4.
Moguće je da kompleti ovog izuma također sadrže odmjerenu količinu defibrotida (standard) u svrhu omogućavanja kontrolnih mjerenja.
U preferiranom ostvarenju ovog izuma, standardne otopine i otopine uzoraka defibrotida za određivanje uvedu se u odgovarajuće jažice mikroploča. Otopina plazmina pripravi se u trenutku primjene, te se raspodijeli u jažice koje sadrže defibrotid i konačno se doda otopina koja sadrži supstrat za plazmin. Mikroploča se zatim smjesti u termostatirani čitač te se, nakon brzog mućkanja, provede očitavanje apsorbancija sistema u prethodno određenim intervalima i u prethodno određenom vremenskom periodu. Dobiveni sirovi podaci se zatim procesiraju, određujući nepoznatu aktivnost uzoraka defibrotida.
Ovi i ostali aspekti izuma bit će bolje ilustrirani u slijedećim Primjerima, koji međutim nemaju namjeru ograničavati izum.
PRIMJERI
Slijedeći materijali uporabljeni u Primjerima navedeni su ovdje:
Aparati
-Detektor za mikroploče koje imaju 96 jažica MRX TCII (Dynex Technologies, Chantilly, VA, USA), termostatiran i opremljen programom za enzimatsku kinetiku.
-Mikroploče koje imaju 96 jažica ravnog dna (Greiner L., Kremunster, Austrija, kataloški broj 655101)
-Pipete s kontinuiranim podešavanjem volumena Pipetman P200 (30-200 μL) i 8x200 (20-200 μL) te 200-μL nastavcima certificirane kvalitete (Gilson, Milano, Italija)
-pH-metar PHM85 Radiometer (Analitica De Mori, Milano, Italija)
Programi
-Microsoft Excel® (Microsoft Corporation, Redmond, WA, USA)
-Sigma Plot Computer Program® (SPSS, Chicago, USA)
Supstancije
-Definbrotid (Gentium)
-Humani plazmin, 1 jedinica, P-4895 (Sigma Aldrich, Milano, Italija)
-Kromogeni supstrat S-2251,820332-39 (Chromogenix Instrumentation Laboratory S. p. A., Milano, Italija)
-Tris (hidroksimetil) aminometan (TRIS), 255285-9 (Sigma-Aldrich, Milano, Italija)
-1N HCl 1090571000 (Merck)
-1N NaOH 1091411000 (Merck)
Otopine
TRIS-HCl pufer
2,42 g TRIS otopi se u destiliranoj vodi i razrijedi na volumen od 100 mL. U otopinu se doda 16 mL 1N HCl te nakon toga još destilirane vode da se dobije konačni volumen od 400 mL. pH konačne otopine je 7,40. Ako se vrijednost razlikuje od navedenog, pH se korigira da se dobije željena vrijednost dodatkom 1N HCl ili 1N NaOH.
Otopina plazmina
Jedna jedinica (1 i.j.) humanog plazmina otopi se u 4 mL TRIS-HCl pufera pri 0°C. Uz provođenje postupka stalno u ledu, otopina se podijeli u alikvote od 200 μL koji se pohrane na -20°C u plastične kivete volumena 10 mL.
Otopina kromogenog supstrata S-2251
25 mg S-2251 otopi se u 15,15 mL destilirane vode i pohrani na +4/+8°C.
Standardne otopine defibrotida
Pripravljanje standardnih otopina
(Konačnih) koncentracija od 0,1 do 100 μg/mL
60 mg defibrotida otopi se u 3 mL TRIS-HCl pufera i razrijedi 1 : 15 s TRIS-HCl puferskom otopinom. Tako dobivena otopina, koncentracije 1,333 mg/mL, podvrgne se uzastopnom razrjeđivanju 1: 2 da se dobije otopina defibrotida koncentracije 666 μg/mL, 333 μg/mL i 166 μg/mL. Ova posljednja otopina, koja se rabi kao osnovna otopina, se dalje razrjeđuje da se dobiju otopine koncentracija 83,33 μg/mL, 41,67 μg/mL, 33,33 μg/mL, 25 μg/mL, 16,66 μg/mL, 8,33 μg/mL, 5 μg/mL, 2,5 μg/mL, 1,66 μg/mL, 0,83 μg/mL, 0,5 μg/mL te konačno 0,16 μg/ml.
(Konačnih) koncentracija od 0,5 do 8 μg/mL
60 mg defibrotida otopi se u 3 mL TRIS-HCl pufera i razrijedi 1 : 1500 s TRIS-HCl pufer otopinom. Tako dobivena otopina koncentracije 13,33 μg/mL, podvrgne se uzastopnom razrjeđivanju 1: 2 da se dobiju otopine defibrotida pojedinačnih koncentracija od 6,66 μg/mL, 3,33 μg/mL, 1,66 μg/mL i 0,83 μg/mL.
Procedure
150 μL svake gore opisane standardne otopine defibrotida uzme se i unese u jažice mikroploča.
Otopina plazmina se zatim pripravi brzo dodavanjem pri 0°C, 3,8 mL TRIS-HCl pufera u kivetu koja sadrži 0,2 mL otopine humanog plazmina. Sve se oprezno mućka dok se ne otopi, te se uzme 50 μ1 i nanese u jažice mikroploče, te nakon toga 50 μL S-2251 u svaku jažicu.
Mikroploča, smještena u MRX TCII čitač namješten na 37°C, mućka se otprilike 10 sekundi; očitanje apsorbancija provede se na 405 nm, na početnom vremenu t0 te uzastopno svake dvije minute u intervalu od 10 do 20 minuta, prema programu enzimatske kinetike.
Eksperimentalni podaci dobiveni mjerenjem koncentracija defibrotida od 0,1 do 100 μg /mL se zatim procesiraju (Excel i Sigma Plot programi) i prikažu na grafu (linije regresije) kao što je prikazano primjerom na slijedećim Slikama 1 i 2.
Vrijednosti kutnog koeficijenta b (nagib) pravaca koji se odnose na standard i test uzorak defibrotida (Slika 1) nanesu se uzimajući u obzir koncentracije defibrotida (logaritamska skala) (Slika 2).
Kao što je vidljivo iz grafa, linearni odgovor koji omogućava identifikaciju pravaca dobiva se u centralnom dijelu krivulje. U tom intervalu linearnosti, jačina nepoznatih uzoraka defibrotida odredi se u usporedbi sa standardom, prema već spomenutoj metodologiji bioloških određivanja paralelnih pravaca opisanoj u Finney DJ, Statistical Method in Biological Assay, 2. izdanje, Ch. Griffin, London. Da bi ova metodologija bila uporabljiva, važno je da postoji, uz linearnost, paralelnost između pravaca koji se odnose na standard te na defibrotid za ispitivanje.
Test za određivanje biološke aktivnosti nepoznatih uzorka defibrotida, usporedbom sa standardom defibrotida, provodi se pogodno uporabom koncentracija koje povećavaju pravocrtni dio gore određenog sigmoida. Posebice su preferirane koncentracije standarda i nepoznatog defibrotida u području od 0,5 do 8 μg/mL.
Raspored u jažicama ploče, replikata različitih koncentracija defibrotida za standard i za uzorak za ispitivanje je dalje prikazan.
[image]
Standardne otopine defibrotida smjeste se u kolone 2-6 dok se uzorci defibrotida za određivanje smjeste u kolone 7-11, u navedenim koncentracijama. Na drugoj ploči, preferirano je da je položaj uzoraka obrnut.
Vanjske kolone i redovi mikroploče ne rabe se za postupak određivanja, već se pune vodom u svrhu osiguravanja maksimalne temperaturne homogenosti u cijelom sistemu.
Mikroploča, smještena u MRX TCII čitač namješten na 37°C, mućka se otprilike 10 sekundi; apsorbancije očitaju na 405 nm, na početnom vremenu t0 te uzastopno svakih 5 minuta tijekom perioda od 20. do 50. minute, prema programu enzimatske kinetike.
Izmjerene vrijednosti apsorbancije se zatim procesiraju (Excel i Sigma Plot programi), prikažu tablično i grafički (linije regresije).
Tada je moguće izračunati omjer jačinu, te odrediti aktivnost nepoznatog uzorka defibrotida usporedbom sa standardom, uporabom istog sistema izračunavanja kao što je gore opisano.
Dalje su dane primjerom Tablice (1, 2 i 3) i grafovi (Slike 3, 4 i 5) koje se odnose na uzorke defibrotida, ispitane u koncentraciji od 0,5 μg/mL, 2,0 μg/mL i 8,0 μg/mL.

Claims (17)

1. Postupak za određivanje biološke aktivnosti defibrotida, naznačen time, da obuhvaća slijedeće korake: a) dovođenje u kontakt defibrotida, plazmina i supstrata specifičnog za plazmin koji reakcijom s plazminom osigurava mjerljivi produkt i b) mjerenje količine produkta stvorenog u uzastopnim vremenima.
2. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da plazmin je plazmin sisavaca, preferirano humani plazmin.
3. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da supstrat specifičan za plazmin je spoj formule A1-A2-A3-X u kojem Al i A2 su nepolarne aminokiseline, A3 je lizin ili arginin i X je mjerljivi produkt.
4. Postupak prema zahtjevu 3, naznačen time, da je mjerljivi produkt X izabran između para-nitroanilina i 2-naftilamina.
5. Postupak prema zahtjevu 3, naznačen time, da supstrat za plazmin je H-D-Valil-1-Leucil-1-Lizin-p-nitroanilin.
6. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da plazmin ima koncentraciju od 0,0064 do 0,050 i.j./mL i supstrat za plazmin ima koncentraciju od 2,5 do 3,5 mM.
7. Postupak prema zahtjevu 6, naznačen time, da je koncentracija plazmina 0,0125 i.j./mL i koncentracija supstrata za plazmin 3 mM.
8. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da se mjerljivi produkt X mjeri spektrofotometrijski.
9. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da je reakcijski medij vodena otopina puferirana na pH od 7 do 8, preferirano na pH 7,4.
10. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da se temperatura sistema održava na 35 do 39°C, preferirano na 37°C.
11. Postupak prema zahtjevu 1, naznačen time, da je koncentracija supstrata za plazmin od 0,3 do 4 mM, pogodno od 2,5 do 3,5 mM, još pogodnije 3 mM.
12. Postupak za određivanje biološke aktivnosti defibrotida prema zahtjevu 1, naznačen time, da postupak obuhvaća a) određivanje brzine oslobađanja mjerljivog produkta X tijekom trajanja enzimatske reakcije, za svaki uzorak defibrotida, standarda i test uzorka b) dovođenje u korelaciju, matematički i/ili grafički, gore spomenute brzine oslobađanja s odgovarajućim koncentracijama defibrotida c) dobivanje biološke aktivnosti test uzoraka defibrotida.
13. Komplet za određivanje biološke aktivnosti defibrotida prema prethodnim zahtjevima, naznačen time, da sadrži najmanje: a) odmjerenu količinu supstrata za plazmin i b) odmjerenu količinu plazmina, navedeni komplet sadrži 20 do 30 mg supstrata specifičnog za plazmin po jedinici plazmina.
14. Komplet prema zahtjevu 13, naznačen time, da supstrat za plazmin je H-D-Val-Leu-Liz-pNA i plazmin je humani plazmin.
15. Komplet prema zahtjevu 13, naznačen time, da sadrži 25 mg specifičnog supstrata po jedinici plazmina.
16. Defibrotid, naznačen time, da kada se podvrgne postupku iz zahtjeva 1-12, u koncentracijama 0,5, 2,0 i 8,0 μg/mL, pokazuje kinetiku oslobađanja para-nitroanilina kao što je pojedinačno prikazano na slikama 3,4 i 5, navedena kinetika oslobađanja odredi se pod slijedećim eksperimentalnim uvjetima: koncentracija humanog plazmina: 0,0125 i.j./mL; supstrat: H-D-Valil-1-Leucil-1-Lizin-p-nitroanilin; koncentracija supstrata: 3 mM; pufer: tris(hidroksimetil)amino metan hidroklorid, pH 7,4; temperatura reakcije: 37°C; spektrofotometrijska valna duljina: 405 nm.
17. Defibrotid, naznačen time, da kada se podvrgne postupku iz zahtjeva 1 do 12 pod slijedećim eksperimentalnim uvjetima: koncentracija humanog plazmina: 0,0125 i.j./mL; supstrat: H-D-Valil-1-Leucil-1-Lizin-p-nitroanilin; koncentracija supstrata: 3 mM; pufer: tris(hidroksimetil)amino metan hidroklorid, pH 7,4; temperatura reakcije: 37°C; spektrofotometrijska valna duljina: 405 nm, uzrokuje kinetiku oslobađanja para-nitroanilina (p-NA) prema jednadžbi pNA (μM/min)=a + b log X u kojoj a = 0,6908 ± 0,0291 b = 0,31490 ± 0,0437 X = koncentracija defibrotida (μg/mL).
HR20040548A 2001-12-17 2004-06-16 A method for determining the biological activity of defibrotide HRP20040548A2 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP01830770A EP1325962A1 (en) 2001-12-17 2001-12-17 A method for determining the biological activity of defibrotide
PCT/EP2002/001337 WO2002064404A1 (de) 2001-02-12 2002-02-08 Vorrichtung und verfahren zur abdeckung eines airbags

Publications (1)

Publication Number Publication Date
HRP20040548A2 true HRP20040548A2 (en) 2004-10-31

Family

ID=8184814

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HR20040548A HRP20040548A2 (en) 2001-12-17 2004-06-16 A method for determining the biological activity of defibrotide

Country Status (27)

Country Link
US (1) US7338777B2 (hr)
EP (2) EP1325962A1 (hr)
JP (1) JP4348192B2 (hr)
KR (1) KR100912424B1 (hr)
CN (1) CN100408690C (hr)
AR (1) AR037870A1 (hr)
AT (1) ATE480637T1 (hr)
AU (1) AU2002360945B2 (hr)
CA (1) CA2468877C (hr)
DE (1) DE60237639D1 (hr)
DK (1) DK1456404T3 (hr)
ES (1) ES2349509T3 (hr)
HK (1) HK1077332A1 (hr)
HR (1) HRP20040548A2 (hr)
HU (1) HUP0402231A3 (hr)
IL (2) IL162511A0 (hr)
IS (1) IS7312A (hr)
MX (1) MXPA04005958A (hr)
NO (1) NO20042972L (hr)
NZ (1) NZ533594A (hr)
PL (1) PL373243A1 (hr)
PT (1) PT1456404E (hr)
RS (1) RS63104A (hr)
RU (1) RU2323979C2 (hr)
UA (1) UA80104C2 (hr)
WO (1) WO2003052130A2 (hr)
ZA (1) ZA200404656B (hr)

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1325962A1 (en) 2001-12-17 2003-07-09 Gentium S.p.A. A method for determining the biological activity of defibrotide
EP1872787A1 (en) * 2006-06-27 2008-01-02 Gentium S.p.A. Use of defibrotide for the inhibition of heparanase
EP1982722A1 (en) * 2007-04-16 2008-10-22 Gentium S.p.A. Use of oligotide for the treatment of renal diseases
EP2103689A1 (en) * 2008-03-19 2009-09-23 Gentium S.p.A. Synthetic phosphodiester oligonucleotides and therapeutical uses thereof
JP6069209B2 (ja) 2010-11-12 2017-02-01 ジェンティウム ソシエタ ア レスポンサビリタ リミタータ 移植片対宿主病(gvhd)の予防および/または治療に使用するためのデフィブロタイド
RU2627177C2 (ru) * 2012-06-22 2017-08-03 Джентиум С.Р.Л. Способ определения биологической активности дефибротида, основанный на применении эуглобулина
US9655761B2 (en) 2012-11-12 2017-05-23 Djo, Llc Orthopedic back brace
TWI615473B (zh) * 2013-11-26 2018-02-21 金提恩責任有限公司 用於測定去纖維蛋白多核苷酸的生物活性之基於優球蛋白的方法
EP3026122A1 (en) 2014-11-27 2016-06-01 Gentium S.p.A. Cellular-based method for determining the potency of defibrotide
RU2766143C2 (ru) * 2017-07-26 2022-02-08 Джентиум С.Р.Л. Жидкая композиция дефибротида для лечения и профилактики веноокклюзионной болезни
KR20200121780A (ko) 2017-08-03 2020-10-26 재즈 파마슈티칼즈 아일랜드 리미티드 높은 농도에서 핵산을 포함하는 제제
KR20210008478A (ko) 2018-04-12 2021-01-22 재즈 파마슈티칼즈, 인코포레이티드 면역고갈과 관련된 사이토카인 방출 증후군 및 신경독성의 예방 및 치료를 위한 데피브로타이드
US20220023533A1 (en) 2018-12-07 2022-01-27 Jazz Phrmaceticals Ireland Limited Subcutaneous delivery of high concentration formulations
US20230190783A1 (en) 2020-02-28 2023-06-22 Jazz Pharmaceuticals Ireland Limited Delivery of low viscosity formulations
TW202308659A (zh) 2021-05-06 2023-03-01 愛爾蘭商爵士製藥愛爾蘭有限責任公司 用於急性呼吸窘迫症候群之治療及預防的去纖維蛋白多核苷酸

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE2154279A1 (de) * 1970-11-03 1972-05-25 Crinos Industria Farmaco Medikamente für das fibrinolytische System
DE2812943C3 (de) * 1978-03-23 1981-05-14 Boehringer Mannheim Gmbh, 6800 Mannheim Verfahren und Reagens zur Bestimmung der biologischen Aktivität von Heparin im Plasma
IT1170215B (it) * 1983-09-12 1987-06-03 Crinos Industria Farmaco Composizione farmaceutica per il trattamento di stati di insufficienza renale acuta
IT1206341B (it) * 1984-02-16 1989-04-14 Crinos Industria Farmaco Composizione farmaceutica per il trattamento dell'ischemia acuta del miocardio.
US5231006A (en) * 1986-10-16 1993-07-27 Behringwerke Aktiengesellschaft Method for the determination of plasminogen
US5321006A (en) * 1992-12-09 1994-06-14 International Flavors & Fragrances Inc. Flavor and fragrance compositions produced using process for quantitatively and qualitatively substantially continuously analyzing the aroma emitted from a living fruit
CN1187201A (zh) * 1995-05-05 1998-07-08 生物药物研究与发展有限公司 血纤维蛋白交联和/或转谷氨酰胺酶的抑制剂
GB9719161D0 (en) * 1997-09-09 1997-11-12 Glaxo Group Ltd New therapeutic method
EP1325962A1 (en) 2001-12-17 2003-07-09 Gentium S.p.A. A method for determining the biological activity of defibrotide

Also Published As

Publication number Publication date
RS63104A (en) 2006-10-27
EP1456404B1 (en) 2010-09-08
ATE480637T1 (de) 2010-09-15
KR100912424B1 (ko) 2009-08-14
HK1077332A1 (en) 2006-02-10
DE60237639D1 (de) 2010-10-21
CN1612938A (zh) 2005-05-04
IS7312A (is) 2004-06-14
CA2468877A1 (en) 2003-06-26
MXPA04005958A (es) 2004-11-01
US7338777B2 (en) 2008-03-04
JP4348192B2 (ja) 2009-10-21
WO2003052130A3 (en) 2004-01-15
AU2002360945B2 (en) 2007-11-08
ZA200404656B (en) 2005-06-13
EP1456404A2 (en) 2004-09-15
IL162511A0 (en) 2005-11-20
HUP0402231A2 (hu) 2005-01-28
PT1456404E (pt) 2010-12-03
AR037870A1 (es) 2004-12-09
NZ533594A (en) 2006-03-31
CA2468877C (en) 2012-03-20
NO20042972L (no) 2004-07-14
PL373243A1 (en) 2005-08-22
US20050009131A1 (en) 2005-01-13
AU2002360945A1 (en) 2003-06-30
UA80104C2 (en) 2007-08-27
EP1325962A1 (en) 2003-07-09
JP2005512547A (ja) 2005-05-12
RU2004121962A (ru) 2005-05-10
RU2323979C2 (ru) 2008-05-10
WO2003052130A2 (en) 2003-06-26
HUP0402231A3 (en) 2010-01-28
ES2349509T3 (es) 2011-01-04
DK1456404T3 (da) 2010-11-01
CN100408690C (zh) 2008-08-06
KR20040090959A (ko) 2004-10-27
IL162511A (en) 2010-02-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11746348B2 (en) Euglobulin-based method for determining the biological activity of defibrotide
HRP20040548A2 (en) A method for determining the biological activity of defibrotide
AU2002360945A2 (en) A method for determining the biological activity of defibrotide
RU2766143C2 (ru) Жидкая композиция дефибротида для лечения и профилактики веноокклюзионной болезни
US7244554B2 (en) Enzyme detection and measurement
TW201520339A (zh) 用於測定去纖維蛋白多核苷酸的生物活性之基於優球蛋白的方法

Legal Events

Date Code Title Description
A1OB Publication of a patent application
AIPI Request for the grant of a patent on the basis of a substantive examination of a patent application
ODRP Renewal fee for the maintenance of a patent

Payment date: 20081126

Year of fee payment: 7

OBST Application withdrawn