ES2660765T3 - Genes y rutas expresadas de forma diferencial en trastorno bipolar y/o trastorno depresivo mayor - Google Patents

Genes y rutas expresadas de forma diferencial en trastorno bipolar y/o trastorno depresivo mayor Download PDF

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Jun Li
Juan F. Lopez
David M. Lyons
Richard M. Myers
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Richard Stein
Robert C. Thompson
Hiroaki Tomita
Marquis P. Vawter
Stanley J. Watson
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Abstract

Un inhibidor de FGF9 para su uso en un método de prevención o de tratamiento de un trastorno de depresión mayor en un sujeto, en donde dicho inhibidor se une a FGF9 o hibrida con un transcrito de FGF9.

Description

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de secuencia son los algoritmos BLAST y BLAST2.0, que se describen en Altschul et al., (1977) Nuc. Acids Res. 25:3389-3402 y Altschul et al., (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410, respectivamente. El programa informático para realizar análisis BLAST está disponible al público a través del National Center for Biotechnology Information. Este algoritmo implica identificar en primer lugar pares de secuencia de alta valoración (HSP) identificando palabras cortas de longitud W en la secuencia de consulta, que coinciden o satisfacen algún valor umbral T de valor positivo cuando se alinea con una palabra de la misma longitud en una secuencia de base de datos. T se menciona como el umbral del valor de la palabra adyacente (Altschul et al., supra). Estos aciertos de palabra adyacente iniciales actúan como semillas para iniciar búsquedas para encontrar HSP más largos que los contengan. Estos aciertos de palabras se prolongan en ambas direcciones a lo largo de cada secuencia en la medida en que pueda aumentarse el valor de alineación acumulado. Los valores acumulados se calculan usando, para secuencias de nucleótidos, los parámetros M (valor de recompensa para un par de restos coincidentes; siempre > 0) y N (valor de penalización para restos mal emparejados; siempre < 0). Para secuencias de aminoácidos, se usa una matriz de valores para calcular el valor acumulado. La prolongación de los aciertos de palabra en cada dirección se detiene cuando: el valor de alineación acumulado está fuera en la cantidad X de su valor máximo conseguido; el valor acumulado llega a 0 o por debajo de 0, debido a la acumulación de una o más alineaciones de restos de valoración negativa; o se alcanza el final de cualquier secuencia. Los parámetros del algoritmo BLAST W, T y X determinan la sensibilidad y velocidad de la alineación. El programa BLASTN (para secuencias de nucleótidos) usa como defecto una longitud de palabra (W) de 11, una expectativa (E) de 10, M=5, N=-4 y una comparación de ambas hebras. Para secuencias de aminoácidos, el programa BLASTP usa como defecto una longitud de palabra de 3 y una expectativa (E) de 10, y la matriz de valores BLOSUM62 (véase, Henikoff y Henikoff (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915) para alineaciones (B) de 50, expectación (E) de 10, M=5, N=-4 y una comparación de ambas hebras.
El algoritmo BLAST también realiza un análisis estadístico de la similitud entre dos secuencias (véase, por ejemplo, Karlin y Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787). Una medida de similitud proporcionada por el algoritmo BLAST es la probabilidad de suma mínima (P(N)), que proporciona una indicación de la probabilidad por la que se produciría por casualidad una coincidencia entre dos secuencias de nucleótidos o aminoácidos. Por ejemplo, un ácido nucleico se considera similar a una secuencia de referencia si la probabilidad de suma mínima en una comparación del ácido nucleico de ensayo con el ácido nucleico de referencia es de menos de aproximadamente 0,2, más preferiblemente de menos de aproximadamente 0,01 y mucho más preferiblemente de menos de aproximadamente 0,001.
Una indicación de que dos secuencias de ácido nucleico o polipéptidos son sustancialmente idénticos es que el polipéptido codificado por el primer ácido nucleico tenga reacción cruzada inmunológicamente con los anticuerpos creados contra el polipéptido codificado por el segundo ácido nucleico, como se describe a continuación. Por tanto, un polipéptido normalmente es sustancialmente idéntico a un segundo polipéptido, por ejemplo, cuando los dos péptidos difieren únicamente por sustituciones conservativas. Otra indicación de que dos secuencias de ácido nucleico son sustancialmente idénticas es que las dos moléculas o sus complementos hibridan entre sí en condiciones rigurosas, como se describe a continuación. Otra indicación más de que dos secuencias de ácido nucleico son sustancialmente idénticas es que pueden usarse los mismos cebadores para amplificar la secuencia.
La expresión "hibrida selectivamente (o específicamente) con" se refiere a la unión, formación de dúplex o hibridación de una molécula únicamente con una secuencia de nucleótidos particular en condiciones rigurosas de hibridación cuando esa secuencia está presente en una mezcla compleja (por ejemplo, ADN o ARN celular total o de biblioteca).
La expresión "condiciones rigurosas de hibridación" se refiere a condiciones en las que una sonda hibridará con secuencia diana, normalmente en una mezcla compleja de ácido nucleico, pero no con otras secuencias. Las condiciones rigurosas son dependientes de la secuencia y serán diferentes en diferentes circunstancias. Secuencias más largas hibridan específicamente a temperaturas mayores. Se encuentra una amplia guía respecto a la hibridación de ácido nucleicos en Tijssen, Techniques in Biochemistry and Molecular Biology--Hybridization with Nucleic Probes, "Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acid assays" (1993). En general, las condiciones rigurosas se seleccionan para que sean aproximadamente 5-10 ºC inferiores al punto de fusión térmica (Tm) para la secuencia específica a un pH de fuerza iónica definida. La Tm es la temperatura (a fuerza iónica, pH y concentración de ácido nucleico definidos) a la que un 50 % de las sondas complementarias a la diana hibridan con la secuencia diana en equilibrio (ya que las secuencias diana están presentes en exceso, a Tm, un 50 % de las sondas están ocupadas en equilibrio). Las condiciones rigurosas serán aquellas en las que la concentración salina sea menor de aproximadamente 1,0 M de iones sodio, normalmente de aproximadamente 0,01 a 1,0 M de concentración de iones sodio (u otras sales) a pH 7,0 a 8,3 y la temperatura es de al menos aproximadamente 30 ºC para sondas cortas (por ejemplo, de 10 a 50 nucleótidos) y de al menos aproximadamente 60 ºC para sondas largas (por ejemplo, mayor de 50 nucleótidos). Las condiciones rigurosas también pueden conseguirse con la adición de agentes desestabilizantes tales como formamida. Para hibridación selectiva o específica, una señal positiva es al menos dos veces la hibridación de fondo, opcionalmente 10 veces la hibridación de fondo. Las condiciones rigurosas de hibridación a modo de ejemplo pueden ser las siguientes: formamida a un 50 %, SSC 5X y SDS a un 1 %, incubación a 42 ºC o SSC 5X, SDS a un 1 %, incubación a 65 ºC, con lavado en SSC 0,2X y SDS a un 0,1 % a 65 ºC. Dichos lavados pueden realizarse durante 5, 15, 30, 60, 120 o más minutos. Los ácidos nucleicos que hibridan con los genes enumerados en las tablas 3-10 y la figura 14 están abarcados por la invención.
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De las 14 subunidades de V-ATPasa que se han investigado con micromatrices Affy y micromatrices Illumina, 7 subunidades (50 %) se expresan de forma diferencial (P < 0,05) en hipocampo de MDD frente al control en las matrices Affymetrix o Illumina. Tres de las siete subunidades se expresan de forma diferencial en hipocampo de MDD de matrices tanto Affymetrix como Illumina (véase la tabla 29). Dos de las subunidades de V-ATPasa también se expresan de forma diferencial (P < 0,05) en nuestro estudio de micromatriz Affy de hipocampo de mono (es decir, tabla 30, que muestra la comparación de tensión social crónica frente a ausencia de tensión). Estos hallazgos demuestran que los fármacos que se están desarrollando ahora para inhibir la V-ATPasa en pacientes con cáncer y osteoporosis también pueden demostrar ser útiles como novedosos antidepresivos.
Los ejemplos anteriores se proporcionan para ilustrar la invención, pero no limitar su alcance. Otras variantes de la invención serán fácilmente evidentes para un experto en la materia y quedan abarcadas por las reivindicaciones adjuntas.
Tabla 1a. Datos de sujetos para cohorte A.
Id del sujeto
género edad diagnóstico pH cerebral PMI AnCg 18S/28S relación AnCg 3'/5' relación DLPFC 3'/5'
1881
M 69 BPD 6,91 11 0,68 1,36 1,21
2311
M 23 BPD 7,12 9 1,80 1,47 1,13
2466
M 26 BPD 6,92 19 1,35 1,75 1,64
2566
F 56 BPD 6,83 29 1,05 1,48 1,34
3038
M 52 BPD 7,05 28 1,04 1,37 1,20
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2861
F 60 Ct 6,99 24 1,25 2,07 1,80
3018
M 70 Ct 7,03 27 0,91 1,57 1,20
2169
M 18 Ct 6,97 22 1,61 1,62 1,18
2316
M 58 Ct 7,02 26 1,27 1,47 1,27
2292
M 55 Ct 6,89 15 1,45 1,29 1,18
2805
M 45 Ct 6,86 21 1,84 1,61 1,06
imagen41
2208
F 72 MD 7,13 21 1,26 1,83 1,19
2267
M 19 MD 7,11 18 2,05 1,75 1,44
2315
M 58 MD 6,93 24 1,34 1,52 1,31
3071
M 49 MD 7,00 31 1,58 1,44 1,25
3064
M 46 MD 6,91 27 2,18 1,28 1,19
3031
M 49 MD 7,19 27 1,60 1,60 1,04
2944
M 52 MD 6,82 16 1,37 1,91 1,43
3004
F 48 MD 6,95 37 1,31 1,81 1,20
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Tabla 1b. Datos de los sujetos para la cohorte B.
Id del sujeto
género edad diagnóstico pH cerebral PMI AnCg 18S/28S relación AnCg 3'/5' relación DLPFC 3'/5'
3145
M 77 Ct 6,62 7
3281
F 70 Ct 6,9 21
3516
M 41 Ct 7,01 23
3519
M 65 Ct 6,88 14
3523
M 40 Ct 7,07 37
3572
M 49 Ct 6,68 28
promedios para controles
57 6,86 21,67
3169
M 35 MD 7,04 25
3365
M 47 MD 7,25 29
3398
F 80 MD 6,68 15
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42
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TABLA 7 FACTOR DE CRECIMIENTO
MDD
BPD
ID UniGene
Símbolo del gen Ami AnCg DLPFC HC nAcc Ami AnCg DLPFC HC nAcc
Sistema del factor de crecimiento epidérmico
Hs.419815
EGF -1,1
Hs.79095
EPS15 1,3
Hs.147176
EPS15R
Hs.2132
EPS8 -1,2
Hs.799
DTR -1,1
Sistema del factor de crecimiento de fibroblastos
Hs.278954
FGF1 -1,2 -1,4
Hs.343809
FGF12 1,5 1,5
Hs.6540
FGF13 1,5 1,5
Hs.223851
FGF14 1,5 1,3 1,4
Hs.284244
FGF2 -1,4 -1,3 -1,4 -1,8
Hs.433252
FGF7 -1,1
Hs.111
FGF9 1,4 1,2 1,3 1,6
Hs.748
FGFR1
Hs.404081
FGFR2 -1,1 -1,3 -1,2 -1,3
Hs.1420
FGFR3 -1,2 -1,4 -1,5
Hs.7768
FIBP 1,3
Hs.194208
FRS3
Sistema del factor de crecimiento de tipo insulina
Hs.308053
IGF1
Hs.239176
IGF1R -1,2 -1,3
Hs.76473
IGF2R
Hs.839
IGFALS
Hs.433326
IGFBP2 1,4
Hs.450230
IGFBP3 -1,3 -1,4
Hs.1516
IGFBP4 -1,6
Hs.380833
IGFBP2 -1,2 -1,2 -1,2
Hs.274313
IGFBP6
Hs.435795
IGFBP7
Neurotrofinas
Hs.439027
BDNF
Hs.439109
NARK2 -1,2 -1,4 -1,3 -1,3
Hs.26776
NTRK3
Hs.194774
CNTFR
Sistema del factor de crecimiento opioideo
Hs.67896
OGFR
Hs.16512
OGFRL 1 -1,2 -1,2
Sistema del factor de crecimiento derivado de plaquetas
Hs.1976
PDGFB
Hs.43080
PDGFC
Hs.74615
PDGFR A -1,3 -1,3 -1,3 -1,2 -1,3
Hs.307783
PDGFR B
Sistema del factor de crecimiento transformante
Hs.25195
EBAF
Hs.435067
ECGF1
Hs.170009
TGFA -1,1
Hs.169300
TGFB2
Hs.421496
TGFBI -1,9
Hs.82028
TGFBR 2
Hs.342874
TGFBR 3 -1,3
Hs.446350
TGFBR AP1
Hs.114360
TSC22
Hs.241257
LTBP1 -1,2 -1,1
Hs.105689
LTBP2 -1,2
Hs.289019
LTBP3
Sistema del factor de crecimiento del endotelio vascular
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Hs.534385
THOC4 Complejo 4 de THO 17q25.3 1,545094715
Hs.114084
ENPP7 Ectonucleótido pirofosfatasa/fosfodiesterasa 7 17q25.3 1,490770143
Hs.315369
AQP4 Acuaporina 4 18q11.2q12.1 1,478027231
Hs.370410
KIAA1145 Proteína KIAA1145 12q22 1,435347843
Hs.75914
RNP24 Proteína de membrana de vesícula recubierta 12q24.31 1,419831899
Hs.406708
ILT7 Receptor de tipo inmunoglobulina de leucocitos, subfamilia A (sin dominio TM), miembro 4 19q13.4 1,410439598
Hs.234249
MAPK8IP1 Proteína 1 de interacción con proteína cinasa 8 activada por mitógenos 11p12-p11.2 1,371562585
Hs.534525
LOC114984 Proteína hipotética BC014089 16p13.3 1,368785293
Hs.212838
A2M Alfa-2-macroglobulina 12p13.3p12.3 1,365561844
Hs.402752
TAF15 ARN polimerasa II TAF15, factor asociado a proteína de unión a dominio TATA (TBP), 68 kDa 17q11.1q11.2 1,362205401
Hs.535415
ARNm de cadena gamma reordenada de Ig, subgrupo VH2, región V-D-J 1.355666889
Hs.467138
Locus transcrito, moderadamente similar a XP_507997.1 similar a la proteína 2 de interacción con el canal Kv isoforma 4; proteína 2 moduladora del canal de potasio de tipo A; subunidad moduladora del canal de potasio abierto por voltaje cardíaco; proteína 2 de interacción con el canal Kv [Pan tr] 1.351924341
Hs.513600
Locus transcrito 1,347512479
Hs.380218
Locus transcrito 1,327051286
Hs.458607
NOPE Probable ortólogo del vecino de ratón de Punc E11 15q22.31 1,324220424
Hs.42034
TCP10L Complejo-T de tipo 10 (ratón) 21q22.11 1,322514626
Hs.521286
RARRES2 Respondedor del receptor de ácido retinoico (inducido por tazaroteno) 2 7q36.1 1,31025151
Hs.25422
ADNc FLJ42519 fis, clon BRACE3000787 1,309835897
Hs.293379
Locus transcrito 1,307793259
Hs.356766
Similar a RPE-espondina 20q13.13 1,290259345
Hs.379010
PSCA Antígeno de células madre de próstata 8q24.2 1,287232595
Hs.511757
GJB6 Proteína de unión a gap, beta 6 (conexina 30) 13q11-q12.1 1,287226239
Hs.59106
CGRRF1 Regulador del crecimiento celular con dominio 1 de dedos cíclicos 14q22.2 1,284552431
Hs.83916
NDUFA5 Subcomplejo 1 alfa de NADH deshidrogenasa (ubiquinona), 5, 13 kDa 7q32 1,283862892
Hs.119878
FLJ34389 Proteína hipotética FLJ34389 16q22.3 1,28271805
Hs.494261
PSAT1 Fosfoserina aminotransferasa 1 9q21.2 1,276727208
Hs.75969
PNRC1 Coactivador 1 de receptor nuclear rico en prolina 6q15 1,273555895
Hs.467273
CACNG8 Canal de calcio, dependiente de voltaje, subunidad gamma 8 19q13.4 1,270119391
Hs.280805
MGC20579 Proteína hipotética MGC20579 13q34 1,269164507
Hs.145480
Locus transcrito 1,266189386
Hs.511454
PLXNA4 Plexina A4 7q32.3 1,263673467
Hs.80132
SNX15 Nexina 15 de clasificación 11q12 1,26259913
Hs.514819
AP2B1 Complejo 2 de proteína relacionada con adaptador, subunidad beta 1 17q11.2-q12 1,250901951
Hs.385772
LOC283914 Proteína hipotética LOC283914 16p11.1 1,247941693
Hs.151536
RAB13 RAB13, miembro de la familia del oncogén RAS 1q21.2 1,247404054
Hs.548424
Locus transcrito 1,245303451
Hs.519930
C6orf62 Fase de lectura abierta 62 del cromosoma 6 6p22.2 1,233111115
Hs.45140
TMEM35 Proteína transmembrana 35 Xq22.1 1,232645678
Hs.505295
MADP-1 Proteína MADP-1 12q12 1,226870897
Hs.513883
PELP1 Proteína 1 rica en leucina, en ácido glutámico, en prolina 17p13.2 1,224880728
Hs.474836
LOC387593 Seudogén TPTE/TPIP 22q13 1,223415544
Hs.115284
ZNF213 Proteína 213 con dedos de zinc 16p13.3 1,223309419
Hs.369624
15E1.2 Proteína hipotética 15E1.2 12q24.31 1,223144605
Hs.467960
RAB10 RAB10, miembro de la familia del oncogén RAS 2p23.3 1,222273799
Hs.533282
NONO Que contiene dominio Non-POU, de unión a octámero Xq13.1 1,219220007
Hs.181272
PKD2 Enfermedad renal poliquística 2 (dominante autosómica) 4q21-q23 1,212879872
110
Hs.80720
GAB1 Proteína 1 de unión asociada a GRB2 4q31.21 1,211569918
Hs.123464
P2RY5 Receptor P2Y, purinérgico, acoplado a proteína G, 5 13q14 1,210914564
Hs.507185
ZFPM1 Proteína con dedos de zinc, múltiple 1 16q24.2 1,210160133
Hs.5324
C2orf25 Fase de lectura abierta 25 del cromosoma 2 2q23.3 1,209212561
Hs.374847
LOC400794 Gen hipotético mantenido por BC030596 1q23.2 1,208951568
Hs.517792
C3orf10 Fase de lectura abierta 10 del cromosoma 3 3p25.3 1,208760837
Hs.517352
PRODH Prolina deshidrogenasa (oxidasa) 1 22q11.21 1,206253745
Hs.483561
ORF1-FL49 Proteína nuclear putativa ORF1-FL49 5q31.2 1,205748855
Hs.75640
NPPA Precursor A del péptido natriurético 1p36.21 1,20542617
Hs.491695
UBE2V2 Variante 2 de la enzima E2 de conjugación con ubiquitina 8q11.21 1,204850064
Hs.335057
NEDD5 Expresado en células precursoras neurales, regulada negativamente en el desarrollo 5 2q37 1,202774491
Hs.28280
SLC35F4 Familia 35 del transportador de solutos, miembro F4 14q22.2 1,201026204
Tabla 28.2
Grupo UG
Símbolo Nombre del gen Citobanda fc_AnCg
Hs.134974
GAP43 Proteína 43 asociada al crecimiento 3q13.1-q13.2 0,833001805
Hs.444637
LRP8 Proteína 8 relacionada con el receptor de lipoproteínas de baja densidad, receptor de apolipoproteína e 1p34 0,832591468
Hs.268849
GLO1 Glioxilasa I 6p21.3-p21.1 0,832479968
Hs.435952
CDK5RAP1 Proteína 1 asociada a la subunidad reguladora de CDK5 20pter-q11.23 0,831820461
Hs.360940
dJ222E13.1 De tipo kraken 22q13 0,828943053
Hs.500721
MMS19L De tipo MMS19 (homólogo de MET18, S. cerevisiae) 10q24-q25 0,827060597
Hs.200285
TCF4 Factor 4 de transcripción 18q21.1 0,826908526
Hs.2890
PRKCG Proteína cinasa C, gamma 19q13.4 0,82630472
Hs.153661
Locus transcrito 0,825857073
Hs.483924
MRPL22 Proteína ribosómica mitocondrial L22 5q33.1-q33.3 0,825300862
Hs.210385
HERC1 Dominio Hect (homólogo al extremo carboxilo de E6-AP (UBE3A)) y dominio de tipo RCC1 (CHC1) (RLD) 1 15q22 0,82523312
Hs.353454
FLJ10276 Proteína hipotética FLJ10276 1p35.1 0,825093453
Hs.157234
ARNm; ADNc DKFZp547A0515 (del clon DKFZp547A0515) 0,824586185
Hs.75667
SYP Sinaptofisina Xp11.23-p11.22 0,824282156
Hs.451353
Homo sapiens, clon IMAGE:5288537, ARNm 0,823552515
Hs.514373
MTMR4 Proteína 4 relacionada con miotubularina 17q22-q23 0,823152304
Hs.102696
MCTS1 Secuencia 1 amplificada en linfocitos T malignos Xq22-q24 0,822759185
Hs.445503
SYN2 Sinapsina II 3p25 0,822588683
Hs.524094
PS1D Proteína del dominio de unión a ARN S1 putativo 1p35.2 0,822570466
Hs.522668
UBQLN2 Ubiquilina 2 Xp11.23-p11.1 0,821156426
Hs.517148
TH1L De tipo TH1 (Drosophila) 20q13 0,821107397
Hs.380334
ZNF148 Proteína 148 con dedos de zinc (pHZ-52) 3q21 0,821027253
Hs.534575
MGC2198 Proteína hipotética MGC2198 5q35.2 0,819426558
Hs.47546
C6orf70 Fase de lectura abierta 70 del cromosoma 6 6q27 0,819049461
Hs.25601
CHD3 Proteína 3 de unión a ADN de helicasa de cromodominio 17p13.1 0,818740301
Hs.460978
APPBP1 Proteína 1 de unión a proteína precursora beta amiloide, 59 kDa 16q22 0,818504577
Hs.448851
USP6 Proteasa 6 específica de ubiquitina (oncogén Tre-2) 17q11 0,818420142
Hs.532755
GTL3 Probable ortólogo del locus 3 del gen trap de ratón 16q21 0,816593983
Hs.98510
WDR44 dominio 44 de repetición WD Xq24 0,815070227
Hs.189119
CXXC5 Dedos CXXC 5 5q31.2 0,814065874
Hs.134060
FNBP1L Proteína de unión a formina de tipo 1 1p22.1 0,813237448
Hs.549821
Datos no encontrados 0,812556603
Hs.78944
RGS2 Regulador de señalización de proteína G 2, 24 kDa 1q31 0,811942329
Hs.535060
LOC441385 9p24.1 0,811837917
Hs.549166
Datos no encontrados 0,811572937
Hs.224418
Locus transcrito 0,811556308
Hs.5258
MAGED1 Antígeno de melanoma, familia D, 1 Xp11.23 0,811035568
Hs.537449
Locus transcrito 0,810141577
111 112 113
Hs.515545
TBC1 D17 Familia del dominio TBC1, miembro 17 19q13.33 0,809453648
Hs.268122
LOC51321 Proteína hipotética LOC51321 17q24.2 0,808975121
Hs.502910
NKIRAS2 Inhibidor NFKB de la interacción de Ras de tipo 2 17q21.2 0,808919755
Hs.471876
ING5 Inhibidor de la familia de crecimiento, miembro 5 2q37.3 0,806159689
Hs.198612
GPR51 Receptor 51 acoplado a proteína G 9q22.1-q22.3 0,806097527
Hs.401509
RBM10 Proteína 10 con motivo de unión a ARN Xp11.23 0,806076882
Hs.380857
TD-60 De tipo RCC1 1p36.13 0,805526827
Hs.49582
PPP1R12A Proteína fosfatasa 1, reguladora (inhibidora) subunidad 12A 12q15-q21 0,805427552
Hs.515162
CALR Calreticulina 19p13.3-p13.2 0,804252658
Hs.444558
KHDRBS3 Que contiene dominio KH, de unión a ARN, asociada a transducción de señales 3 8q24.2 0,803823019
Hs.317632
CDH18 Cadherina 18, tipo 2 5p15.2-p15.1 0,803613164
Hs.471104
NOP5/NOP58 Proteína nucleolar NOP5/NOP58 2q33.1 0,802352232
Hs.348526
LOC474358 Locus hipotético BC042079 10q23-q25 0,802291667
Hs.475018
TCF20 Factor 20 de transcripción (AR1) 22q13.3 0,801897074
Hs.463074
ATP6V0A1 ATPasa, transportadora de H+, subunidad V0 lisosómica a, isoforma 1 17q21 0,801766875
Hs.28144
FSD1 Fibronectina de tipo 3 y que contiene el domino SPRY 1 19p13.3 0,800329999
Hs.32309
INPP1 Inositol polifosfato-1-fosfatasa 2q32 0,796446965
Hs.512973
HSPC121 Transcrito 1 inducido por butirato 15q22.2 0,796376497
Hs.13245
LPPR4 Gen 1 relacionado con plasticidad 1p21.3 0,794472742
Hs.199743
ME3 Enzima málica 3, dependiente de NADP(+), mitocondrial 11cen-q22.3 0,794075417
Hs.523755
FLRT1 Proteína 1 transmembrana rica en leucina fibronectina 11q12-q13 0,792664481
Hs.515785
BLVRB Reductasa B biliverdina (flavina reductasa (NADPH)) 19q13.1-q13.2 0,792511112
Hs.437277
MGAT4B Manosil (alfa-1,3-)-glucoproteína beta-1,4-Nacetilglucosaminiltransferasa, isoenzima B 5q35 0,790721678
Hs.387982
Clon de ADNc IMAGE:5261489, cds parcial 0,789879979
Hs.136164
TSPYL2 TSPY de tipo 2 Xp11.2 0,788609957
Hs.332847
CRIM1 Neurona motora rica en cisteína 1 2p21 0,786568887
Hs.348493
GPRASP2 Proteína 2 de clasificación asociada al receptor acoplado a proteína G Xq22.1 0,786263129
Hs.7736
MRPL27 Proteína ribosómica mitocondrial L27 17q21.3-q22 0,785613917
Hs.177275
ANKRD6 Dominio 6 de repetición de anquirina 6q14.2-q16.1 0,783389812
Hs.124015
HAGHL De tipo hidroxiacilglutatión hidrolasa 16p13.3 0,782617204
Hs.79322
QARS Glutaminil ARNt sintetasa 3p21.3-p21.1 0,781931967
Hs.158748
SLC35F3 Familia 35 del transportador de solutos, miembro F3 1q42.2 0,780681609
Hs.158460
CDK5R2 Cinasa 5 dependiente de ciclina, subunidad reguladora 2 (p39) 2q35 0,779713574
Hs.337730
LCMT1 Leucina carboxil metiltransferasa 1 16p12.316p12.1 0,777655555
Hs.282998
RBM9 Proteína 9 de motivo de unión a ARN 22q13.1 0,775799713
Hs.60300
ZNF622 Proteína 622 con dedos de zinc 5p15.1 0,775473024
Hs.405590
EIF3S6 Factor 3 de inicio de la traducción eucariota, subunidad 6 48 kDa 8q22-q23 0,775166314
Hs.373952
CAMTA2 Activador 2 de la transcripción de unión a calmodulina 17p13.2 0,775135303
Hs.528187
Gen hipotético mantenido por AK096649 2q33.1 0,774877993
Hs.536326
Locus transcrito 0,774173869
Hs.532231
COPG2 Complejo de proteína coatomérica, subunidad gamma 2 7q32 0,773663441
Hs.114169
LRRTM2 Repetición rica en leucina transmembrana neuronal 2 5q31.3 0,773056562
Hs.496267
IGBP1 Proteína 1 de unión a inmunoglobulina (CD79A) Xq13.1-q13.3 0,771399953
Hs.190722
HSPC142 Proteína HSPC142 19p13.11 0,770969106
Hs.130197
KIAA1889 Proteína KIAA1889 8q12.1 0,770498302
Hs.436446
ARMET Rica en arginina, mutada en tumores en fase temprana 3p21.1 0,769942554
Hs.381300
MGC57858 Proteína hipotética MGC57858 6p21.31 0,769698647
Hs.33191
UNC5A Unc-5 homólogo A (C. elegans) 5q35.2 0,769489374
Hs.350065
PLXNA2 Plexina A2 1q32.2 0,767903428
Hs.48372
ADNc de inserto de longitud completa clon YZ87G11 0,766810973
Hs.3797
RAB26 RAB26, miembro de la familia del oncogén RAS 16p13.3 0,765394204
Hs.21925
Locus transcrito 0,764561674
Hs.336588
LOC147670 Proteína hipotética LOC147670 19q13.43 0,763351376
Hs.78466
PSMD8 Subunidad 26S del proteasoma (prosoma, macropaína), no ATPasa, 8 19q13.2 0,76234581
Hs.121520
AMIGO2 Gen 2 inducido por anfoterina 12q13.11 0,760653807
Hs.443731
USP8 Proteasa 8 específica de ubiquitina 15q21.2 0,75760815
Hs.171501
USP11 Proteasa 11 específica de ubiquitina Xp11.23 0,755609225
Hs.187861
THRB Receptor de hormonas tiroideas, beta (homólogo 2 del oncogén vírico de leucemia eritroblástica (verb-a), aviar) 3p24.3 0,755503889
Hs.272284
SLITRK4 Familia de tipo SLIT y NTRK, miembro 4 Xq27.3 0,755411535
Hs.509736
HSPCB Proteína 1 de choque térmico de 90 kDa, beta 6p12 0,755057388
Hs.188594
Locus transcrito 0,755026908
Hs.497806
MARK1 Cinasa 1 reguladora de MAP/afinidad de microtúbulos 1q41 0,751792399
Hs.549761
Datos no encontrados 0,749944
Hs.479867
CENPC1 Proteína C 1 del centrómero 4q12-q13.3 0,749713558
Hs.135736 Hs.463466
NGL-1 Ligando de netrina-G1 11p12 0,747993997
CA10
Anhidrasa carbónica X 17q21 0,746516358
Hs.143587
Locus transcrito 0,745018326
Hs.549196
Datos no encontrados 0,744120055
Hs.534913
Gen hipotético mantenido por BC019717 16p11.2 0,743499122
Hs.523550
ZNF364 Proteína 364 con dedos de zinc 1q21.1 0,742420643
Hs.90242
Homo sapiens, clon IMAGE:4796172, ARNm 0,741848633
Hs.475150
KIAA0767 Proteína KIAA0767 22q13.31 0,741559246
Hs.530698
CHD8 Proteína 8 de unión a ADN de helicasa de cromodominio 14q11.2 0,738476834
Hs.55879
ABCC10 Casete de unión a ATP, subfamilia C (CFTR/MRP), miembro 10 6p21.1 0,738455293
Hs.323537
FLJ12953 Proteína hipotética FLJ12953 similar a D3Mm3e de Mus musculus 2p13.1 0,737391028
Hs.301296
ADNc: FLJ23131 fis, clon LNG08502 0,737354551
Hs.502461
DGKZ Diacilglicerol cinasa, zeta 104 kDa 11p11.2 0,734852399
Hs.471096
ALS2 Esclerosis lateral amiotrófica (juvenil) 2q33.1 0,73175125
Hs.92732
PDZK4 Que contiene dominio PDZ 4 Xq28 0,727016153
Hs.537841
Locus transcrito 0,726748437
Hs.7744
NDUFV1 NADH deshidrogenasa (ubiquinona) flavoproteína 1, 51 kDa 11q13 0,726496223
Hs.100890
RPRM Reprimo, candidato mediador de la detención en G2 dependiente de TP53 2q23.3 0,719810824
Hs.6132
CPNE6 Copina VI (neuronal) 14q11.2 0,718586854
Hs.412019
C6orf80 Fase de lectura abierta 80 del cromosoma 6 6q23.1-q24.1 0,715749314
Hs.119594
CIT Citron (de interacción con rho, serina/treonina cinasa 21) 12q24 0,712998565
Hs.518460
AP2M1 Complejo 2 de proteína relacionada con adaptador, subunidad mu 1 3q28 0,709632072
Hs.65425
CALB1 Calbindina 1,28 kDa 8q21.3-q22.1 0,70924145
Hs.479116
SH3TC1 Dominio SH3 y repeticiones tetratricopeptídicas 1 4p16.1 0,704347818
Hs.173859
FZD7 Homólogo 7 de frizzled (Drosophila) 2q33 0,697933574
Hs.363137
ACAT2 Acetil-coenzima A acetiltransferasa 2 (acetoacetil coenzima A tiolasa) 6q25.3-q26 0,695447549
Hs.153648
PPFIA4 Proteína tirosina fosfatasa, de tipo receptor, polipéptido f (PTPRF), proteína de interacción (liprina), alfa 4 1q32.1 0,694615615
Hs.524071
Locus transcrito, muy similar a XP_084672.3 similar a secuencia de ADNc de BC021608 [Homo sapiens] 0,691986755
Hs.506784
LNK Proteína adaptadora de linfocitos 12q24 0,688023619
Hs.516617
SATB2 Miembro 2 de la familia SATB 2q33 0,681642635
Hs.23406
KCTD4 Que contiene dominio de tetramerización del canal de potasio 4 13q14.12 0,676435668
Hs.220950
FOXO3A Dominio forkhead O3A 6q21 0,669990152
Hs.370549
BCL11A CLL de linfocitos B/linfoma 11A (proteína con dedos de zinc) 2p16.1 0,654002694
Hs.483239
ALDH7A1 Familia de aldehído deshidrogenasa 7, miembro A1 5q31 0,651849727
Hs.445733
GSK3B Glucógeno sintasa cinasa 3 beta 3q13.3 0,647879909
Hs.268515
MN1 Meningioma (alterada en traslocación equilibrada) 1 22q11 0,64462122
Hs.319503
PTCHD1 Que contiene dominio patched 1 Xp22.11 0,644497163
Hs.106511
PCDH17 Proteína hipotética LOC144997 13q21.1 0,644270897
Hs.91448
DUSP14 fosfatasa 14 de especificidad doble 17q12 0,639891125
Hs.448041
FLJ32363 Proteína FLJ32363 5p12 0,633100428
Hs.22584
PDYN Prodinorfina 20pter-p12 0,630525299
Hs.215839
DLG2 Discs, homólogo 2 grande, chapsina-110 (Drosophila) 11q21 0,620144715
Hs.11899
HMGCR 3-hidroxi-3-metilglutaril-coenzima A reductasa 5q13.3-q14 0,619486994
Hs.23539
ADNc FLJ42249 fis, clon TKIDN2007667 0,614085673
Hs.314436
NEDL2 Ubiquitina ligasa NEDL2 de E3 relacionada con NEDD4 2q32.3 0,605505392
Hs.490294
KIAA1549 Proteína KIAA1549 7q34 0,548338996
Hs.518469
FLJ10560 Proteína hipotética FLJ10560 3q27.3 0,498445319
Hs.546322
NOL4 Proteína nucleolar 4 18q12 0,491050809
Hs.282177
PIP5K1C fosfatidilinositol-4-fosfato 5-cinasa, tipo I, gamma 19p13.3 0,490622069
Hs.2785
KRT17 Queratina 17 17q12-q21 0,474185311
Hs.536506
Locus transcrito 0,467413109
Hs.435001
KLF10 Factor 10 de tipo Kruppel 8q22.2 0,463636382
Hs.537539
Locus transcrito 0,358666831
Tabla 29
Resultados de matriz de v-ATPasa en MDD humana frente a mono estresado
Cambio de
Ensayo-T
Ensayo-T
estrés en la
Ac. UGRep
Nombre Símbolo humano Affy HIP humano illu HIP edad
t2hcmdd.affy
tHCMdd.illu mediana del
momo
BQ230447
ATPasa, transportador de H+,
lisosómica 9 kDa, subunidad
V0 e
AF245517
ATPasa, transportador de H+,
lisosómica subunidad V0 a
isoforma 4
NM_012463 ATPasa, transportador de H+, lisosómica subunidad V0 a isoforma 2
CR607789 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 13 kDa, subunidad V1 G isoforma 1
AK127853 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 56/58 kDa, subunidad V1 B, isoforma 1 (acidosis tubular renal con sordera)
BF214530 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 31 kDa, subunidad V1 E isoforma 1
AK024101 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 34 kDa, subunidad V1 D
NM_001690 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 70 kDa, subunidad V1 A
NM_001695 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 42 kDa, subunidad V1 C, isoforma 1
AK128641 ATPasa, transportador de H+, lisosómica 38 kDa, subunidad V0 d isoforma 1
ATP6V0E
-2,8565 -2,2254 -1,07
ATP6V0A4
-1,6935 -1,5208 1,01
ATP6V0A2
-0,8322 -1,6802 -1,05
ATP6V1G1
-0,0535 -0,0440 -1,08
ATP6V1B1
0,3202 -0,8313 1,02
ATP6V1E1
1,3703 1,9643 -1,01
ATP6V1D
1,6380 2,6589 1,09
ATP6V1A
1,7837 2,4222 1,15
ATP6V1C1
1,7882 1,0692 -1,01
ATP6V0D1
1,8249 2,4330 1,03
114
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