ES2325247T3 - Composiciones de oligonucleotidos y su uso para inducir apoptosis. - Google Patents

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Mario C. Filion
Zdenek Richard Holan
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Abstract

Uso de una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética de 3 a 9 bases de longitud que comprende al menos una base nebularina, al menos una base hipoxantina, o al menos una base uracilo, o una combinación de las mismas que induce inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis en la preparación de un medicamento para inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.

Description

Composiciones de oligonucleótidos y su uso para inducir apoptosis.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a nuevas composiciones de oligonucleótidos y métodos de utilización de las mismas para alteración de la función celular con inclusión de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular e inducción de apoptosis.
Antecedentes de la invención
La proliferación es la culminación de una progresión de la célula a través del ciclo celular dando como resultado la división de una célula en dos células. Las cinco fases principales del ciclo celular son G_{0}, G_{1}, S, G_{2}, y M. Durante la fase G_{0}, las células están en reposo. La mayoría de las células del cuerpo se encuentran en esta etapa en un momento dado. Durante la fase G_{1}, las células, respondiendo a señales para dividirse, producen el RNA y las proteínas necesarias para la síntesis del DNA. Durante la fase S (SE, fase S inicial; SM, fase S intermedia; y SL, fase S tardía) las células replican su DNA. Durante la fase G_{2}, las proteínas se elaboran en preparación para división celular. Durante la fase mitótica (M), la célula se divide en dos células hijas. Alteraciones en la progresión del ciclo celular ocurren en todos los cánceres y pueden ser resultado de la sobre-expresión de genes, mutación de genes reguladores, o anulación de los puntos de comprobación del deterioro del DNA (Hochhauser D., Anti-Cancer Chemotherapeutic Agents, 8:903, 1997).
La apoptosis o muerte celular programada es el proceso fisiológico para la destrucción y eliminación de células indeseables y el mecanismo por el cual los agentes quimioterapéuticos destruyen las células del cáncer. La apoptosis se caracteriza por cambios morfológicos distintivos en el interior de las células que incluyen condensación de la cromatina nuclear, contracción celular, desintegración nuclear, formación de ampollas en la membrana plasmática, y la formación de cuerpos apoptóticos unidos a la membrana (Wyllie et al., Int. Rev. Citol., 68:251, 1980). La translocación de fosfatidilserina desde la cara interna de la membrana plasmática a la cara externa coincide con la condensación de la cromatina y está considerada como un identificador de la apoptosis (Koopman, G. et al., Blood, 84:1415, 1994). Se sabe que el mecanismo real de la apoptosis está mediado por la activación de una familia de cisteína-proteinasas, conocidas como caspasas. Sin embargo, la mayoría de las terapias anti-cáncer de la técnica anterior, aun cuando dirigidas a la inducción de apoptosis, han resultado insuficientemente adecuadas para aplicaciones clínicas. Muchas de estas terapias son ineficientes o tóxicas, tienen efectos secundarios adversos, dan como resultado el desarrollo de resistencia a los fármacos o inmunosensibilización, y son debilitantes para el receptor. Muchas enfermedades o afecciones se caracterizan por proliferación celular indeseable y son conocidas por una persona con experiencia ordinaria en las técnicas médicas o veterinarias. Se necesitan nuevas composiciones y nuevos métodos para tratar estas enfermedades y afecciones.
Hughes et al. (Biochemistry 22 (1983), 2127-2135) describen composiciones que comprenden trímeros de inosina o uridina.
Los oligonucleótidos sintéticos son secuencias poli-aniónicas que se internalizan en las células (Vlassov et al., Biochim. Biophys. Acta, 11197:95, 1994). Se han dado a conocer oligonucleótidos sintéticos que se fijan selectivamente a ácidos nucleicos (Wagner, R., Nature, 372-333, 1994), a proteínas celulares específicas (Bates et al., J. Biol. Chem., 274:26369, 1999) y a proteínas nucleares específicas (Scaggiante et al., Eur. J. Biochem., 252:207, 1998) con objeto de inhibir la proliferación de las células del cáncer.
Se ha informado que secuencias sintéticas de 27 bases que contienen guanina (G) y cantidades variables de timina (T) (oligonucleótidos GTn) en donde n es \geq 1 o \leq 7 y en donde el número de bases es \geq 20 (Scaggiante et al., Eur. J. Biochem., 252:207, 1998), inhiben el crecimiento de líneas de células de cáncer por fijación específica de la secuencia a una proteína nuclear de 45 kDa, habiéndose informado en cambio que los GTn, en los cuales el número de bases es \leq 20, son inactivos frente a las líneas de células de cáncer (Morassutti et al., Nucleosides and Nucleotides, 18:1711, 1999). Se han dado a conocer dos oligonucleótidos sintéticos ricos en GT de 15 y 29 bases con modificaciones 3'-aminoalquilo que forman cuartetes G que se unen a nucleolina e inhiben la proliferación de líneas de células de cáncer (Bates, et al., J. Biol. Chem., 274:26369, 1999). Se ha publicado que el fosforotioato sintético de 6 bases TTAGGG, que tiene una secuencia idéntica a la de la secuencia de repetición telomérica de los mamíferos, inhibe la proliferación de las células del linfoma de Burkitt in vitro e in vivo (Mata et al., Toxicol. Applied Pharmacol., 144:189, 1997). Sin embargo, se ha comunicado que el fosfodiéster-nucleótido sintético de 6 bases TTAGGG no tiene actividad anti-telomerasa alguna (patente U.S. No: 5.643.890).
Los desoxirribonucleótidos con actividad biológica tales como DNA antisentido (DNA de unión a mRNA o formador de tríplex) o motivos CpG inmunoestimulantes se caracterizan por motivos lineales específicos de secuencia, estabilizados a menudo por unión intramolecular de pares de bases. La modificación de la cadena principal, tal como sustitución de fosforotioato, no afecta desfavorablemente y a menudo intensifica la actividad de estas moléculas.
Los autores de la presente invención han descrito previamente una composición y un método que comprenden oligonucleótidos sintéticos de 2 a 20 bases 3'-OH, 5'-OH seleccionados del grupo constituido por (G_{x}T_{y})_{n}, (T_{y}G_{x})_{n,} a(G_{x}T_{y})_{n}, a(T_{y}G_{x})_{n,} (G_{x}T_{y})_{n}b, (T_{y}G_{x})_{n}b, a(G_{x}T_{y})_{n}b, a(T_{y}G_{x})_{n}b, en donde x e y son números enteros entre 1 y 7, n es un número entero entre 1 y 12, a y b son uno o más de As, Cs, Gs o Ts, en donde la secuencia tiene entre 2 y 20 bases y en donde la secuencia induce una respuesta seleccionada del grupo constituido por inducción de la detención del ciclo celular, inhibición de la proliferación, inducción de la activación de las caspasas e inducción de apoptosis en cierto número de células de cáncer (PCT CA00/01467, WO 01/44465). Estos oligonucleótidos no están diseñados para tener actividad antisentido, para bloquear la actividad de la telomerasa o para formar una triple hélice con el DNA. No se ha comunicado que los oligonucleótidos que tengan bases distintas de DNA tales como nebularina, hipoxantina o uracilo induzcan apoptosis.
La mayoría de las terapias anti-cáncer de la técnica anterior, sea dirigidas a la inhibición de la proliferación, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis han demostrado ser insuficientemente adecuadas para aplicaciones clínicas. Muchas de estas terapias son ineficientes o tóxicas, tienen efectos adversos importantes, dan como resultado el desarrollo de resistencia a los fármacos o inmunosensibilización, y son debilitantes para el receptor.
Por consiguiente, existe una necesidad continuada de nuevas composiciones y nuevos métodos eficaces para el tratamiento de enfermedades y afecciones caracterizadas por proliferación celular indeseable, tales como enfermedad autoinmune, enfermedad linfoproliferativa, inflamación y cáncer. Tales composiciones y métodos son necesarios para inhibir la proliferación celular, inducir la detención del ciclo celular, e inducir apoptosis en las células, particularmente en las células de cáncer.
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Sumario de la invención
La presente invención proporciona el uso de una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética de 3 a 9 bases de longitud que comprende al menos una base nebularina, al menos una base hipoxantina, o al menos una base uracilo, o una combinación de las mismas que induce inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis en la preparación de un medicamento para inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis. Estas secuencias comprenden opcionalmente además una o más bases guanina o una o más bases timina, o combinaciones de las mismas.
La presente invención proporciona también métodos para utilizar estas secuencias sintéticas de oligonucleótidos por combinación de las mismas con un vehículo aceptable para producir una composición, y administrar la composición in vitro o in vivo a fin de inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis. Células preferidas para inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis son células de cáncer.
La presente invención proporciona un método para el tratamiento de una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable que comprende administración de una composición que comprende una secuencia de la presente invención y un vehículo farmacéuticamente aceptable a un animal o humano que sufre la enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable, en una cantidad eficaz para tratar la enfermedad. Cualquier enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable puede ser tratada con las composiciones de la presente invención. Tales enfermedades o afecciones caracterizadas por proliferación celular indeseable incluyen, pero sin carácter limitante, enfermedad autoinmune, inflamación, enfermedad linfoproliferativa, y
cáncer.
La presente invención proporciona el uso de estas secuencias sintéticas de oligonucleótidos en la preparación de un medicamento. Tales medicamentos son útiles para el tratamiento de una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable.
Una o más secuencias pueden administrarse con un vehículo aceptable como una composición in vitro o in vivo, adicionalmente, las composiciones pueden administrarse junto con uno o más agentes terapéuticos. Tal administración de las composiciones puede tener lugar antes, durante o después de la administración de uno o más agentes terapéuticos conocidos por quienes poseen una experiencia ordinaria en las técnicas médicas o veterinarias. Cualquier agente terapéutico conocido por una persona con experiencia ordinaria en las técnicas médicas o veterinarias, y empleado para tratar enfermedades, puede utilizarse en combinación con estas secuencias. Tales combinaciones pueden permitir el uso de dosis menores de agentes terapéuticos, reduciendo con ello los efectos secundarios deseables.
La administración de una composición que comprende una cantidad eficaz de una o más de las secuencias a un animal o humano es un tratamiento terapéutico que previene, trata o elimina una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable. Tales enfermedades y afecciones son conocidas por una persona con experiencia ordinaria en la técnicas médicas o veterinarias e incluyen, pero sin carácter limitante, cáncer, inflamación, artritis, trastornos linfoproliferativos, asma y restenosis de arterias subsiguiente a angioplastia.
Los cánceres incluyen, pero sin carácter limitante, carcinoma de células escamosas, fibrosarcoma, carcinoma sarcoideo, melanoma, cáncer de mama, cáncer de pulmón, cáncer colorrectal, cáncer renal, osteosarcoma, melanoma cutáneo, carcinoma de células basales, cáncer de páncreas, cáncer de vejiga, cáncer de cerebro, cáncer de ovario, cáncer de próstata, leucemia, linfoma y metástasis derivadas de los mismos.
Los métodos y rutas de administración de agentes terapéuticos para animales y humanos conocidos por una persona con experiencia ordinaria en la técnica pueden emplearse para administrar composiciones que comprenden las secuencias y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
La aptitud inesperada y sorprendente de las secuencias de oligonucleótidos utilizadas en la presente invención para inhibir la proliferación celular, detener la progresión del ciclo celular y/o inducir apoptosis en las células aborda una necesidad largamente insatisfecha en las técnicas médicas y proporciona un beneficio importante para animales y humanos. Estas composiciones pueden utilizarse para tratar afecciones de proliferación celular indeseable en animales y humanos, que incluyen, pero sin carácter limitante, enfermedad autoinmune, artritis, asma, restenosis de vasos sanguíneos subsiguiente a angioplastia, enfermedad linfoproliferativa, inflamación y cáncer.
De acuerdo con ello, es un objeto de la invención proporcionar el uso de una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética (en lo sucesivo secuencia) de 3 a 9 bases de longitud, que comprende una o más bases nebularina, una o más bases hipoxantina, o una o más bases uracilo, o combinaciones de bases nebularina, hipoxantina y uracilo, que induce la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis en la preparación de un medicamento para inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis. Estas secuencias comprenden opcionalmente además una o más bases guanina o una o más bases timina, o combinaciones de las mismas. Preferiblemente, las bases guanina y timina son bases fosfodiéster.
La invención se refiere adicionalmente a una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en la cual la secuencia es NebTNeb, GNebG, NebNebGNebNebNeb, GGGNebGG, GGGTNebG, GGNebNebGG, GGNebTGG, NebGGTGG, NebGGTGNeb, GGGTGGNeb o NebGGGTGG para inducción de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis, o una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es GGITGG, GGGIGG, IIGTII, IGGGTGG, GGGTGGI, IGGGTGGI, GGGTGGIII o GIG para inducción de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis, o una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en la cual la secuencia es GGUTGG, GGGUGG, UUGTUU, UGGGTGG, GGGTGGU, UGGGTGGU, GGGTGGUUU o GUG para inducción de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
De acuerdo con ello, es un objeto de la presente invención proporcionar nuevas composiciones que inducen inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
Es un objeto de la presente invención proporcionar métodos de utilización de composiciones que inducen la inhibición de la proliferación celular, detención de la progresión del ciclo celular, o inducción de apoptosis.
Un objeto adicional de la presente invención es proporcionar métodos de utilización de composiciones que inducen la inhibición de la proliferación celular, detención de la progresión del ciclo celular, o inducción de apoptosis en células de cáncer.
Es otro objeto de la presente invención proporcionar métodos de utilización de las composiciones para tratar enfermedades en un animal o humano.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar composiciones para uso en la preparación de un medicamento para el tratamiento de enfermedades en un animal o humano.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método que comprende la administración de una o más de las composiciones de la presente invención en una cantidad eficaz para tratar una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable en un animal o humano.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método que comprende la administración de una o más de las composiciones de la presente invención en una cantidad eficaz para tratar una enfermedad o afección en un animal o humano, en donde la enfermedad o afección se caracteriza por proliferación celular indeseable y es una enfermedad autoinmune, inflamación, asma, una enfermedad linfoproliferativa, restenosis de vasos sanguíneos subsiguiente a angioplastia, o cáncer.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método que comprende administración de una o más de las composiciones utilizadas en la presente invención antes, durante o después de la administración de otra sustancia terapéutica para inducir una respuesta celular.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método que comprende administración de una o más de las composiciones utilizadas en la presente invención antes, durante o después de la administración de otra sustancia terapéutica para inducir la inhibición de la proliferación celular, detención de la progresión del ciclo celular, o inducción de apoptosis en células de cáncer.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método que comprende la administración de una o más de una de las composiciones utilizadas en la presente invención antes, durante o después de la administración de otra sustancia terapéutica para tratar una enfermedad en un animal o humano, en donde la enfermedad se caracteriza por proliferación celular indeseable.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar un método que comprende la administración de una o más de una de las composiciones utilizadas en la presente invención antes, durante o después de la administración de otra sustancia terapéutica para tratar una enfermedad o afección caracteriza por proliferación celular indeseable en un animal o humano, en donde la enfermedad o afección es una enfermedad autoinmune, inflamación, una enfermedad linfoproliferativa, artritis, asma, restenosis de vasos sanguíneos tales como arterias subsiguiente a angioplastia, o cáncer.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar una composición y método eficaces para tratar el cáncer.
Otro objeto adicional de la presente invención es proporcionar el uso de estas secuencias sintéticas de oligonucleótidos en la preparación de un medicamento, siendo el medicamento útil para tratar una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar una composición que es simple de preparar.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar una composición que es mínimamente tóxica para el receptor.
Estos y otros objetos, características y ventajas de la presente invención resultarán evidentes después de una revisión de la descripción detallada que sigue de la realización descrita y las reivindicaciones del apéndice.
Descripción detallada de la invención
La presente invención proporciona el uso de una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética de 3 a 9 bases de longitud que comprende al menos una base nebularina, al menos una base hipoxantina, o al menos una base uracilo, o una combinación de las mismas, que induce inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis en la preparación de un medicamento para inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
Estas secuencias sintéticas de oligonucleótidos (en lo sucesivo secuencia) de 3 a 9 bases de longitud comprenden una o más bases distintas de DNA que comprenden una o más bases nebularina, una o más bases hipoxantina, o una o más bases uracilo, o combinaciones de bases de nebularina, hipoxantina y uracilo. Estas secuencias pueden comprender opcionalmente además una o más bases guanina o una o más bases timina, o combinaciones de las mismas. Preferiblemente, las bases guanina y timina son bases fosfodiéster. Una o más de estas secuencias pueden combinarse con un vehículo aceptable, tal como un vehículo farmacéuticamente aceptable, para formar una composición. Adicionalmente, estas composiciones pueden combinarse con uno o más agentes terapéuticos conocidos.
Estas composiciones son útiles en la inducción de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis. En una realización, una composición que comprende una secuencia y un vehículo farmacéuticamente aceptable se administra a un animal o humano, en una cantidad eficaz para inducir la inhibición de la proliferación celular, inducir la detención del ciclo celular o inducir apoptosis en el animal o humano. En una realización preferida, las células son células de cáncer.
Las composiciones pueden ser utilizadas para tratar enfermedades o afecciones caracterizadas por proliferación celular indeseable.
En una realización preferida, una composición que comprende una secuencia y un portador farmacéuticamente aceptable, se administra a un animal o humano que padece cáncer en una cantidad eficaz para tratar el cáncer en el animal o humano. La aptitud inesperada de estas secuencias para inducción de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis, aborda una necesidad insatisfecha desde hace mucho tiempo en las técnicas médicas y proporciona un beneficio importante para animales y humanos.
La presente invención proporciona adicionalmente una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es NebTNeb, GNebG, NebNebGNebNebNeb, GGGNebGG, GGGTNebG, GGNebNebGG, GGNebTGG, NebGGTGG, NebGGTGNeb, GGGTGGNeb o NebGGGTGG para inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis, o una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es GGITGG, GGGIGG, IIGTII, IGGGTGG, GGGTGGI, IGGGTGGI, GGGTGGIII o GIG, o inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis, o una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es GGUTGG, GGGUGG, UUGTUU, UGGGTGG, GGGTGGU, UGGGTGGU, GGGTGGUUU o GUG para inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
La notación que sigue se utiliza para describir las secuencias de bases en las secuencias de oligonucleótidos utilizadas en la presente invención: G = Guanina, I = Hipoxantina; Neb = Nebularina; T = Timina; y U = uracilo. Como se utiliza en esta memoria, secuencia se refiere a un oligonucleótido sintético que comprende al menos una de las bases I, N o U, o combinaciones de las mismas, que contiene opcionalmente además al menos una de las bases G o T, o combinaciones de las mismas. La secuencia tiene preferiblemente una longitud de 3 a 9 bases.
Como se utiliza en esta memoria, el término "respuesta" se refiere a inhibición de la proliferación, inducción de la detención del ciclo celular, o inducción de apoptosis, en las células. Puede seleccionarse cualquier célula, incluyendo sin limitación células de cáncer, células inmunitarias, células sinoviales y células endoteliales. Una célula preferida para inducción de la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis es una célula de cáncer.
Como se utiliza en esta memoria, las expresiones "tratamiento terapéutico" y "cantidad eficaz para" hacen referencia a una cantidad de una secuencia eficaz para inducir la inhibición de la proliferación celular, detención de la progresión del ciclo celular, o inducción de apoptosis.
Como se utiliza en esta memoria, la expresión "eficaz en células sensibles" hace referencia a la aptitud de la secuencia para causar una respuesta en una célula, seleccionada de inhibición de la proliferación, inducción de la detención del ciclo celular, o inducción de apoptosis.
Como se utiliza en esta memoria, las expresiones "tratamiento terapéutico", "cantidad eficaz" y "cantidad eficaz para" se refieren a una cantidad de una secuencia eficaz para causar una respuesta en una célula o para tratar una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable.
Como se utiliza en esta memoria, el término "quimioterapéutico" es cualquier agente aprobado por una agencia reguladora de un gobierno de país o estado o incluido en la Farmacopea de los EE.UU. u otra farmacopea reconocida generalmente para tratar enfermedades en un animal o humano, particularmente cáncer.
Como se utiliza en esta memoria, el término "enfermedad" hace referencia a una condición en la cual la salud corporal está deteriorada. Enfermedad y afección se utilizan intercambiablemente a lo largo de esta memoria descriptiva.
Como se utiliza en esta memoria, el término "antineoplástico" hace referencia a la prevención del desarrollo, maduración, proliferación o propagación de células de cáncer.
La administración de una composición que comprende una cantidad eficaz de una secuencia utilizada en la presente invención y un portador aceptable a un animal o humano, es un tratamiento terapéutico que previene, trata o elimina una enfermedad o afección que incluye, pero sin carácter limitante, cáncer, artritis, trastornos linfoproliferativos, inflamación, asma, restenosis de vasos sanguíneos tales como arterias subsiguiente a angioplastia. Los cánceres incluyen, pero sin carácter limitante, carcinoma de células escamosas, fibrosarcoma, carcinoma sarcoideo, melanoma, cáncer de mama, cáncer de pulmón, cáncer colorrectal, cáncer renal, osteosarcoma, melanoma cutáneo, carcinoma de células basales, cáncer de páncreas, cáncer de vejiga, cáncer de cerebro, cáncer de ovario, cáncer de próstata, leucemia, linfoma y metástasis derivadas de los mismos. Formas de artritis incluyen, pero sin carácter limitante, artritis juvenil, osteoartritis y artritis reumatoide.
La eficacia terapéutica de estas secuencias puede incrementarse por métodos que incluyen, pero sin carácter limitante, modificación química de bases, azúcares o cadena principal de fosfato, suplementación química, amplificación biotecnológica de secuencias utilizando plásmidos bacterianos que contienen las secuencias apropiadas, complejación a portadores biológicos o químicos, o acoplamiento de las secuencias a ligandos o anticuerpos dirigidos a tipos de tejidos o tipos de células.
Composiciones que comprenden una o más secuencias y un portador farmacéuticamente aceptable se preparan poniendo en asociación uniforme e íntimamente la secuencia y el portador farmacéuticamente aceptable. Los términos "portador farmacéuticamente aceptable" o "vehículo farmacéuticamente aceptable" se utilizan en esta memoria para significar, sin limitación, cualquier líquido, sólido o semisólido, incluyendo, pero sin carácter limitante, agua o solución salina, un gel, crema, pomada, disolvente, diluyente, base fluida de ungüento, ungüento, pasta, implante, liposoma, micela, micela gigante, y análogos, que es adecuado para uso en contacto con los tejidos vivos animales o humanos sin causar respuestas fisiológicas adversas, y que no interacciona con los otros componentes de la composición de manera deletérea. Otros portadores o vehículos farmacéuticamente aceptables conocidos por una persona con experiencia en la técnica pueden emplearse para producir composiciones para suministro de las secuencias de oligonucleótidos de la presente invención. Portadores líquidos son portadores acuosos, portadores no acuosos o de ambos tipos e incluyen, pero sin carácter limitante, suspensiones acuosas, dimetil-sulfóxido, etanol, emulsiones de aceite, emulsiones de agua en aceite, emulsiones de agua en aceite en agua, emulsiones específicas del sitio, emulsiones de residencia prolongada, emulsiones pegajosas, microemulsiones y nanoemulsiones. Los portadores sólidos son portadores biológicos, portadores químicos o de ambos tipos e incluyen, pero sin carácter limitante, sistemas de vectores virales, partículas, micropartículas, nanopartículas, microesferas, nanoesferas, minibombas, extractos de pared de células bacterianas y polímeros biodegradables o no biodegradables naturales o sintéticos que permiten una liberación sostenida de las secuencias. Las emulsiones, minibombas y polímeros pueden implantarse en la proximidad del punto en el que se requiere el suministro. Métodos utilizados para complejar una o más secuencias a un portador sólido incluyen, pero sin carácter limitante, adsorción directa a la superficie del portador sólido, acoplamiento covalente a la superficie del portador sólido, sea directamente o a través de un resto enlazador, y acoplamiento covalente o acoplamiento electrostático al polímero utilizado para fabricar el portador sólido. Opcionalmente, una o más secuencias pueden estabilizarse por la adición de polímeros no iónicos o iónicos tales como monooleatos de polioxietilensorbitán (Tweens), ácido hialurónico o hidróxido de aluminio. Pueden emplearse otros portadores conocidos por una persona con experiencia ordinaria en la técnica.
Portadores acuosos preferidos incluyen, pero sin carácter limitante, agua, solución salina y tampones farmacéuticamente aceptables. Portadores no acuosos preferidos incluyen, pero sin carácter limitante, un aceite mineral o un aceite neutro que incluye, pero sin carácter limitante, un diglicérido, un triglicérido, un fosfolípido, un lípido, un aceite y mezclas de los mismos, en donde el aceite contiene una mezcla apropiada de ácidos grasos poliinsaturados y saturados. Ejemplos incluyen, pero sin carácter limitante, aceite de soja, aceite de canola, aceite de palma, aceite de oliva y migliol, en donde los ácidos grasos pueden ser saturados o insaturados. Opcionalmente, pueden incluirse excipientes, con indiferencia del portador farmacéuticamente aceptable utilizado para presentar la secuencia a las células sensibles. Estos excipientes incluyen, pero sin carácter limitante, antioxidantes, tampones, y bacteriostáticos, y pueden incluir agentes de suspensión y agentes espesantes.
Las secuencias utilizadas en la presente invención pueden combinarse con portadores farmacéuticamente aceptables y administrarse como composiciones in vitro o in vivo. Formas de administración incluyen, pero sin carácter limitante, inyecciones, soluciones, cremas, geles, implantes, bombas, ungüentos, emulsiones, suspensiones, microesferas, partículas, micropartículas, nanopartículas, liposomas, pastas, parches, tabletas, dispositivos de suministro transdérmico, pulverizaciones, aerosoles, u otros medios familiares para una persona con experiencia ordinaria en la técnica. Tales portadores farmacéuticamente aceptables son comúnmente conocidos por una persona con experiencia ordinaria en la técnica. Pueden prepararse formulaciones farmacéuticas por procedimientos conocidos en la técnica utilizando ingredientes bien conocidos y fácilmente disponibles. Por ejemplo, los compuestos pueden formularse con excipientes, diluyentes, o portadores comunes, y conformarse en tabletas, cápsulas, suspensiones, polvos, y análogos. Ejemplos de excipientes, diluyentes, y portadores que son adecuados para tales formulaciones incluyen los siguientes: cargas y extendedores (v.g., almidón, azúcares, manitol, y derivados de sílice); agentes aglomerantes (v.g., carboximetil-celulosa y otros derivados de celulosa, alginatos, gelatina, y polivinilpirrolidona); agentes humectantes (v.g., glicerol); agentes desintegrantes (v.g., carbonato de calcio y bicarbonato de sodio); agentes para retardar la disolución (v.g., parafina), aceleradores de la resorción (v.g., compuestos de amonio cuaternario); agentes tensioactivos (v.g., alcohol cetílico, monoestearato de glicerol); portadores adsorbentes (v.g., caolín y bentonita); emulsionantes; conservantes; edulcorantes; estabilizadores; agentes colorantes; agentes perfumantes; agentes saborizantes; lubricantes (v.g., talco, estearato de calcio y magnesio); polietil-glicoles sólidos, y mezclas de los mismos.
Las formulaciones pueden estar constituidas de tal modo que liberen el ingrediente activo solo o preferiblemente en una localización particular, a ser posible a lo largo de un periodo de tiempo. Tales combinaciones proporcionan aún un mecanismo adicional para controlar la cinética de liberación. Los revestimientos, envolturas, y matrices protectoras pueden estar hechos, por ejemplo, de sustancias polímeras o ceras.
Una o más secuencias pueden administrarse solas, o en combinación con otras modalidades terapéuticas que incluyen, pero sin carácter limitante, agentes quimioterapéuticos, agentes inmunoterapéuticos, agentes antimicrobianos, agentes antivirales o en combinación con terapia de radiación. Los agentes quimioterapéuticos incluyen, pero sin carácter limitante, anti-metabolitos, y agentes dañinos para el DNA, desestabilizadores de los microtúbulos, estabilizadores de los microtúbulos, despolimerizantes de la actina, inhibidores del crecimiento, inhibidores de las topoisomerasas, inhibidores de HMG-CoA, inhibidores de las purinas, inhibidores de las pirimidinas, inhibidores de las metaloproteinasas, inhibidores de CDK, inhibidores de la angiogénesis, intensificadores de la diferenciación e inmunoterapéuticos. Los agentes anti-artríticos incluyen, pero sin carácter limitante, agentes anti-inflamatorios, anti-metabolitos, pro-apoptóticos, deteriorantes del DNA, desestabilizadores de los microtúbulos, estabilizadores de los microtúbulos, despolimerizantes de la actina, inhibidores del crecimiento, inhibidores de las topoisomerasas, inhibidores de las purinas, inhibidores de las pirimidinas, inhibidores de las metaloproteinasas, inhibidores de CDK, e inhibidores de la angiogénesis.
Las rutas de administración son conocidas por quienes poseen una experiencia ordinaria en la técnica e incluyen, pero sin carácter limitante, oral (v.g. bucal o sublingual), rectal, como supositorio, tópica, parenteral, subcutánea, transdérmica, sub-dérmica, intramuscular, intraperitoneal, intravesicular, intraarticular, intravenosa, intradérmica, intracraneal, intralesional, intratecal, intratumoral, intraocular, aerosol, intrapulmonar, intraespinal, intraprostática, sublingual, colocación en el interior de cavidades del cuerpo, inhalación nasal, inhalación pulmonar, impresión en la piel y electroporación, intrauterina, vaginal, en una cavidad del cuerpo, administración quirúrgica, en la localización de un tumor o lesión interna, directamente en los tumores, en el lumen o parénquima de un órgano, y en la médula ósea. Técnicas útiles en las diversas formas de administración arriba mencionadas incluyen, pero sin carácter limitante, aplicación tópica, ingestión, administración quirúrgica, inyecciones, pulverizaciones, dispositivos de suministro transdérmico, bombas osmóticas, electrodeposición directa en un sitio deseado, u otros medios familiares para una persona con experiencia ordinaria en la técnica. Los sitios de aplicación pueden ser externos, tales como en la epidermis, o internos, por ejemplo una úlcera gástrica, un campo quirúrgico, o cualquier otro lugar.
Las composiciones utilizadas en la presente invención pueden aplicarse en la forma de cremas, geles, soluciones, suspensiones, liposomas, partículas u otros medios conocidos para una persona con experiencia en la técnica de la formulación y suministro de las composiciones. Pueden utilizarse tamaños de partícula ultrafinos para suministro de agentes terapéuticos por inhalación. Algunos ejemplos de formulaciones apropiadas para administración subcutánea incluyen, pero sin carácter limitante, implantes, depósitos, agujas, cápsulas, y bombas osmóticas. Algunos ejemplos de formulaciones apropiadas para administración vaginal incluyen, pero sin carácter limitante, cremas y anillos. Algunos ejemplos de formulaciones apropiadas para administración oral incluyen pero sin carácter limitante: píldoras, líquidos, jarabes, y suspensiones. Algunos ejemplos de formulaciones apropiadas para administración transdérmica incluyen, pero sin carácter limitante, geles, cremas, pastas, parches, pulverizaciones, y geles. Algunos ejemplos de mecanismos de suministro apropiados para administración subcutánea incluyen, pero sin carácter limitante, implantes, depósitos, agujas, cápsulas, y bombas osmóticas. Formulaciones adecuadas para administración parenteral incluyen, pero sin carácter limitante, soluciones de inyección estériles acuosas y no acuosas que pueden contener antioxidantes, tampones, bacteriostáticos y solutos que hacen la formulación isotónica con la sangre del receptor propuesto, y suspensiones estériles acuosas y no acuosas que pueden incluir agentes de suspensión y agentes espesantes. Soluciones y suspensiones de inyección extemporánea pueden prepararse a partir de polvos, gránulos y tabletas estériles utilizados comúnmente por una persona con experiencia ordinaria en la técnica.
Realizaciones en las cuales las composiciones utilizadas en la invención se combinan con, por ejemplo, uno o más portadores o excipientes farmacéuticamente aceptables pueden presentarse convenientemente en forma de dosis unitaria y se pueden preparar por técnicas farmacéuticas convencionales. Dichas técnicas incluyen el paso de puesta en asociación de las composiciones que contienen el ingrediente activo y el o los portadores o excipientes farmacéuticos. En general, las formulaciones se preparan poniendo en asociación uniforme e íntimamente el ingrediente activo con portadores líquidos. Formulaciones de dosificación unitaria preferidas son aquéllas que contienen una dosis o unidad, o una fracción apropiada de la misma, del ingrediente administrado. Debe entenderse que, además de los ingredientes mencionados particularmente arriba, las formulaciones que comprenden las composiciones de la presente invención pueden incluir otros agentes utilizados comúnmente por una persona con experiencia ordinaria en la técnica.
El volumen de administración variará dependiendo de la ruta de administración. Tales volúmenes son conocidos por una persona con experiencia ordinaria en la técnica de la administración de composiciones a animales o humanos. Dependiendo de la ruta de administración, el volumen por dosis es con preferencia aproximadamente 0,001 a 100 ml de dosis, de modo más preferible aproximadamente 0,01 a 50 ml de dosis, y de modo muy preferible aproximadamente 0,1 a 30 ml de dosis. Preferiblemente, la cantidad de secuencia administrada por dosis es de aproximadamente 0,001 a 100 mg/kg, de modo más preferible desde aproximadamente 0,01 a 10 mg/kg y de modo muy preferible desde aproximadamente 0,1 a 5 mg/kg. La secuencia, combinación de secuencias, y/o agentes terapéuticos adicionales pueden administrarse en tratamiento de una sola dosis, en tratamientos de dosis múltiples o por infusión continua de acuerdo con un protocolo y lo largo de un periodo de tiempo apropiados para la enfermedad que se esté tratando, el estado del receptor y la ruta de administración. Además, la secuencia puede administrarse antes, al mismo tiempo que o después de la administración del agente terapéutico. La secuencia particular y el agente terapéutico particular administrado, la cantidad por dosis, y la ruta de administración deben ser decididas por el profesional utilizando métodos conocidos por los expertos en la técnica y dependerán de la enfermedad o afección que se esté tratando, por ejemplo el tipo de cáncer, la gravedad del cáncer, la localización del cáncer y otros factores clínicos tales como tamaño, peso y estado físico del receptor.
Una secuencia en combinación con agente terapéutico, por ejemplo un agente quimioterapéutico, se administra a un animal que padece cáncer o artritis en una cantidad eficaz para mejorar el efecto antineoplástico de un agente quimioterapéutico o efecto anti-artrítico de un agente anti-artrítico. Preferiblemente, la cantidad de agente terapéutico administrada por dosis es de aproximadamente 0,001 a 1000 mg/m^{2} o desde aproximadamente 0,01 a 1000 mg/kg, de modo más preferible desde aproximadamente 0,01 a 500 mg/m^{2} o aproximadamente 0,01 a 500 mg/kg y de modo muy preferible desde aproximadamente 0,1 a 100 mg/m^{2} o aproximadamente 0,1 a 100 mg/kg. La secuencia particular y el agente terapéutico particular administrado, la cantidad por dosis, el protocolo de dosificación y la ruta de administración deberían ser decididos por el profesional utilizando métodos conocidos por los expertos de la técnica y dependerán del tipo de enfermedad, la gravedad de la enfermedad, la localización de la enfermedad y otros factores clínicos tales como el tamaño peso y estado físico del receptor. Adicionalmente, pueden emplearse de modo opcional ensayos in vitro para ayudar a identificar los intervalos óptimos para administración de la secuencia y de la secuencia más el agente terapéutico. Diversos ensayos útiles para este propósito se describen en PCT CA00/01467 (WO 01/44465).
Ensayos adicionales para evaluación de la eficacia de las secuencias de la presente invención, y para evaluación de la eficacia de estas secuencias en combinación con otros agentes terapéuticos se describen por Oncogene Research Products, P.O. Box 12087, La Jolla, California, 92039 (Apoptosis Catalog and Technical Guide 2002-2003, especialmente las páginas 5-295). Tales ensayos incluyen ensayos designados para analizar la fragmentación del DNA, apoptosis, marcadores mitocondriales, marcadores del retículo endoplásmico, nucleosomas libres, proteínas de la matriz nuclear, detección y actividad de numerosas caspasas y proteínas afines, con inclusión, pero sin carácter limitante, de las caspasas 1 a 14, glutatión, superóxido-dismutasa, miembros de la familia bcl-2, análisis de la superfamilia Fas/TNR-R, productos afines a PARP, análisis de transductores de señales apoptóticas, análisis de diversos receptores de señalización con inclusión de receptores de muerte, Apo2, receptores de reclamo, análisis de proteínas apoptóticas de membrana, marcadores apoptóticos del sistema nervioso, numerosos marcadores para el ciclo celular y la proliferación celular, quinasas mitóticas, ensayos de bromodesoxiuridina, y ensayos de p53. La evaluación de la eficacia de las secuencias de la presente invención puede evaluarse también en términos de otros agentes, y agentes terapéuticos, tales como inductores de apoptosis y reactivos de sincronización celular como se describen por Oncogene Research Products, P.O. Box 12087, La Jolla, California, 92039 (Apoptosis Catalog and Technical Guide 2002-2003, especialmente las páginas 99-104 y las páginas 214-255).
Tales agentes incluyen, pero sin carácter limitante, actinomicina D, amphidocolina, A23187, cafeína, camptotecina, cicloheximida, dexametasona, doxorrubicina, 5-fluorouracilo, hidroxiurea, paclitaxel, estaurosporina, timidina, vinblastina, ácido retinoico, etoposido, ácido okadaico, vincristina y metotrexato.
Los ejemplos que siguen servirán para ilustrar adicionalmente la presente invención sin constituir al mismo tiempo, no obstante, limitación alguna de la misma.
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Ejemplo 1
Preparación de las secuencias
Las secuencias fueron preparadas por Sigma-Genosys (Woodlands, TX, EE.UU.). Nebularina (2'-desoxinebulari-na), inosina y uracil-fosforamiditos se adquirieron de Glen Research, Sterling, VA, EE.UU. Las secuencias se dispersaron en agua desionizada en autoclave o en un tampón farmacéuticamente aceptable tal como, pero sin carácter limitante, solución salina inmediatamente antes de su utilización.
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Ejemplo 2
Células
Se obtuvieron células de leucemia humana de las células T Jurkat de la American Type Culture Collection (Rokville, MD). Las células T Jurkat se mantuvieron en medio RPMI 1640, suplementado con suero bovino fetal al 10% desactivado por calentamiento (56ºC, 30 min) (todo ello de Sigma Aldrich, Canadá) en una atmósfera con 5% de CO_{2} a 37ºC. Las células se sembraron a 2 x 10^{5} células/ml de medio en placas de cultivo de tejidos de 6 pocillos con fondo plano y se incubaron con las secuencias de la presente invención.
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Ejemplo 3
Inducción de apoptosis por las secuencias que contienen bases de nebularina
La redistribución de la fosfatidilserina en la membrana plasmática es una característica de las células que sufren apoptosis (Martin et al., J. Exp. Med., 182:1545, 1995). La redistribución de la fosfatidilserina en la membrana plasmática durante la apoptosis se midió por citometría de flujo utilizando annexina V conjugada con FITC (BD Pharmingen, San Diego, CA). Las células de leucemia de las células T Jurkat se incubaron a 2,5 x 10^{5} células/ml durante 48 horas con 53,0 \muM de las secuencias de la presente invención. El porcentaje de células en apoptosis después de exposición a las secuencias se consignó en la Tabla 1. El porcentaje de apoptosis en las células de leucemia de las células T Jurkat sin tratar era 5%.
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(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 1 Porcentaje de células positivas para la fosfatidilserina (células en apoptosis) en las células de leucemia de las células T Jurkat tratadas con composiciones de la presente invención
1
Como se muestra en la Tabla 1, todas las secuencias excepto NebNebNebNebNebNeb y NebNebTNebNeb inducían apoptosis de las células de la leucemia de las células T Jurkat.
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Ejemplo 4
Inhibición de la proliferación celular, detención del ciclo celular e inducción de apoptosis por secuencias que contienen bases hipoxantina
Se incubaron células de leucemia de las células T Jurkat a 2,5 x 10^{5} células/ml durante 48 horas con varias secuencias de la presente invención. Se midió la proliferación celular utilizando reducción con dimetiltiazol-difenil-tetrazolio (MTT) (Mosman et al. J. Immunol. Methods 65:55, 1983). La reducción con MTT se midió a una longitud de onda de 570 mm utilizando un lector espectrofotométrico múltiple. La etapa del ciclo celular se determinó utilizando un kit comercial (CycleTest^{TM} Plus DNA; Becton Dickinson). La acumulación de células en las fases G0/G1, inicial (SE), intermedia (SM), tardía (SL) o G2/M se analizó por citometría de flujo utilizando el software MODFIT LT (Verity Software House Inc., Topsham, MA, EE.UU.). El porcentaje de células en apoptosis se determinó por annexina-V FITC como se describe en el Ejemplo 3. La inhibición de la proliferación celular, la detención del ciclo celular y la inducción de apoptosis después del tratamiento con las secuencias se consigna en la Tabla 2.
TABLA 2 Inhibición de la proliferación, detención del ciclo celular e inducción de apoptosis por las secuencias que contienen bases hipoxantina
2
Como se muestra en la Tabla 2, todas estas secuencias o bien inhibían la proliferación celular, detenían el ciclo celular o inducían apoptosis de las células de leucemia de las células T Jurkat.
Ejemplo 5
Inhibición de la proliferación celular, detención del ciclo celular e inducción de apoptosis por secuencias que contienen bases uracilo
Se incubaron células de leucemia de las células T Jurkat a 2,5 x 10^{5} células/ml durante 48 horas con las secuencias. La inhibición de la proliferación se midió por reducción con MTT, la detención del ciclo celular por medio del kit CycleTest^{TM} Plus DNA, y la apoptosis se determinó por annexina-V FITC como se describe en el Ejemplo 3. La inhibición de la proliferación celular, la detención del ciclo celular y la inducción de apoptosis después del tratamiento con las secuencias se consignaron en la Tabla 3.
TABLA 3 Inhibición de la proliferación, detención del ciclo celular e inducción de apoptosis por las secuencias que contienen bases uracilo
3
Como se muestra en la Tabla 3, todas estas secuencias inhibían la proliferación celular, detenían el ciclo celular o inducían apoptosis de las células de la leucemia de las células T Jurkat.

Claims (10)

1. Uso de una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética de 3 a 9 bases de longitud que comprende al menos una base nebularina, al menos una base hipoxantina, o al menos una base uracilo, o una combinación de las mismas que induce inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis en la preparación de un medicamento para inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
2. El uso de la reivindicación 1, en donde la secuencia comprende adicionalmente al menos una base guanina o al menos una base timina, o una combinación de las mismas.
3. El uso de la reivindicación 1 ó 2, en donde la célula es una célula de cáncer, una célula endotelial, una célula sinovial, o una célula del sistema inmunitario.
4. Uso de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en donde la composición comprende adicionalmente un portador aceptable.
5. Uso de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 en la preparación de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad o afección caracterizada por proliferación celular indeseable.
6. El uso de la reivindicación 5, en donde la enfermedad o afección es cáncer, artritis, una enfermedad linfoproliferativa, inflamación, asma, o restenosis de vasos sanguíneos subsiguiente a angioplastia.
7. Uso de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en donde la composición comprende un agente terapéutico adicional.
8. Una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es NebTNeb,
GNebG, NebNebGNebNebNeb, GGGNebGG, GGGTNebG, GGNebNebGG, GGNebTGG, NebGGTGG,
NebGGTGNeb, GGGTGGNeb o NebGGGTGG para inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
9. Una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es GGITGG, GGGIGG, IIGTII, IGGGTGG, GGGTGGI, IGGGTGGI, GGGTGGIII o GIG para inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
10. Una composición que comprende una secuencia oligonucleotídica sintética, en donde la secuencia es GGUTGG, GGGUGG, UUGTUU, UGGGTGG, GGGTGGU, UGGGTGGU, GGGTGGUUU o GUG para inducir la inhibición de la proliferación celular, inducción de la detención del ciclo celular o inducción de apoptosis.
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Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030032610A1 (en) * 1996-06-03 2003-02-13 Gilchrest Barbara A. Method to inhibit cell growth using oligonucleotides
AU2001251115A1 (en) * 2000-03-31 2001-10-15 Trustees Of Boston University Use of locally applied dna fragments
US7087586B2 (en) * 2001-04-24 2006-08-08 Bioniche Life Sciences, Inc. Oligonucleotide compositions and their use to induce differentiation of cells
CA2457783A1 (en) * 2001-08-17 2003-02-27 Bioniche Life Sciences Inc. Oligonucleotide compositions and their use to induce apoptosis
AU2003259735A1 (en) * 2002-08-08 2004-02-25 Sirna Therapeutics, Inc. Small-mer compositions and methods of use
US20060269924A1 (en) * 2003-04-11 2006-11-30 Trustees Of Boston University Modulation of telomere-initiated cell signaling
US20090087456A1 (en) * 2005-09-07 2009-04-02 James Edward Eyles Adjuvanted vaccine
GB0906234D0 (en) 2009-04-14 2009-05-20 Secr Defence Vaccine
KR100998365B1 (ko) 2009-06-29 2010-12-06 압타바이오 주식회사 치료 효능이 있는 변형핵산 및 구아노신을 함유하는 올리고뉴클레오티드 변형체
EP2498816A4 (en) * 2009-11-10 2013-12-18 Bioniche Life Sciences Inc POLYNUCLEOTIDE COMPOSITIONS CONTAINING NON-DNA BASES AND THEIR USE FOR MODULATING IMMUNE RESPONSES
CN106709925A (zh) * 2016-12-30 2017-05-24 上海联影医疗科技有限公司 医学图像中椎块的定位方法及其装置
CN107704697B (zh) * 2017-10-18 2019-08-20 西南交通大学 一种型材三维拉弯成形性预测评价优化方法

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5106727A (en) * 1989-04-27 1992-04-21 Life Technologies, Inc. Amplification of nucleic acid sequences using oligonucleotides of random sequences as primers
WO1993018187A1 (en) * 1992-03-13 1993-09-16 California Institute Of Technology Triple helix recognition of dna
US5962426A (en) * 1993-06-25 1999-10-05 Yale University Triple-helix forming oligonucleotides for targeted mutagenesis
AU689375B2 (en) * 1995-01-19 1998-03-26 Gen-Probe Incorporated Nucleic acid amplification oligonucleotides and probes to lyme disease associated borrelia
US5643890A (en) 1995-01-31 1997-07-01 The Board Of Regents Of The University Of Nebraska Synthetic oligonucleotides which mimic telomeric sequences for use in treatment of cancer and other diseases
CA2365980A1 (en) * 1999-04-08 2000-10-19 Oasis Biosciences, Inc. Amplification and sequencing primer pairs and use thereof
ES2340807T3 (es) 1999-12-13 2010-06-09 Bioniche Life Sciences Inc. Oligonucleotidos sinteticos utiles terapeuticamente.
WO2003070888A2 (en) * 2002-02-20 2003-08-28 Sirna Therapeutics, Inc. Rna interference mediated inhibition of checkpoint kinase-1 (chk-1) gene expression using short interfering nucleic acid
CA2457783A1 (en) 2001-08-17 2003-02-27 Bioniche Life Sciences Inc. Oligonucleotide compositions and their use to induce apoptosis

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