ES2296987T3 - Procedimiento para la deteccion de estres oxidativo y kit para su implementacion. - Google Patents

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Abstract

Procedimiento para determinar marcadores de estrés oxidativo en un grupo de individuos, que comprende las etapas de: a. la determinación del factor de riesgo de un estrés oxidativo en dicho grupo; b. la medición de la cantidad de al menos 10 marcadores diferentes de estrés oxidativo de una muestra obtenida de cada uno de dicho grupo de individuos; y c. la comparación de la cantidad de cada uno de dichos marcadores de estrés oxidativo con la cantidad de cada uno de dichos marcadores de estrés oxidativo medidos en un grupo de individuos sanos, determinando así los marcadores de estrés oxidativo que hayan aumentado o disminuido en dicho grupo de individuos portadores de un factor de riesgo de estrés oxidativo respecto a individuos sanos.

Description

Procedimiento para la detección de estrés oxidativo y kit para su implementación.
La presente invención se refiere a un proceso destinado a la detección de estrés oxidativo en una muestra de sangre y a un procedimiento para determinar marcadores de estrés oxidativo en un grupo de individuos.
Definición de estrés oxidativo
Un 98% del oxígeno absorbido por nuestro organismo se reduce a agua a nivel de la cadena respiratoria mitocondrial, en reacciones catalizadas por complejos citocromo oxidasa. Una molécula de dioxígeno produce dos moléculas de agua, por captura directa de cuatro electrones y cuatro protones. Sin embargo, el oxígeno también puede sufrir una reducción gradual, electrón por electrón. Esto conduce a la formación de especies oxigenadas sumamente tóxicas, las especies de oxígeno activado (EOA), la primera de las cuales es el radical anión superóxido, (O_{2}\cdot^{-}). La estructura química del anión superóxido incluye un electrón "no apareado" (simbolizado por un punto), una característica esencial de los radicales libres. La presencia de un electrón libre hace que el radical sea sumamente inestable y muy reactivo como un poderoso oxidante. El anión superóxido puede a su vez capturar un electrón para convertirse en O^{2-} el cual, ante la presencia de dos protones, formará dos nuevas especies de oxígeno activado sumamente oxidantes: peróxido de hidrógeno (H_{2}O_{2}) y oxígeno puro (^{1}O_{2}). Estas dos moléculas no son radicales libres, dado que en estas estructuras químicas todos los electrones están apareados. El electrón capturado por el anión superóxido puede provenir de otro anión superóxido, lo cual conduce a una dismutación espontánea del anión superóxido. La coexistencia del anión superóxido y el peróxido de hidrógeno puede producir aún otra especie de oxígeno activada sumamente reactiva: el radical hidroxilo OH\cdot. Esta reacción requiere la presencia de un metal de transición como por ejemplo hierro o cobre, que actúe como catalizador. En la escena de los radicales libres, estos metales son jugadores clave que no pueden ser ignorados.
Al formar EOA, el oxígeno puede comprometer agresivamente la integridad celular. Las especies de oxígeno previamente mencionadas y en particular, los radicales libres de oxígeno, tienen un ciclo de vida extremadamente corto; interactúan con una amplia variedad de sustratos biológicos, tales como ácidos nucleicos, nucleótidos, proteínas, lípidos de membrana, y lipoproteínas. Las EOA pueden producir rupturas en el ácido desoxirribonucleico (ADN) y alterar así el mensaje genético. En el citoplasma, las EOA transforman moléculas tales como NADH o NADPH, y alterar así el estado redox de la célula y la actividad de los enzimas que utilizan estos sustratos. La acción de las EOA modifica significativamente la estructura primaria, secundaria y terciaria de las proteínas, hasta el punto de desnaturalizarlas y de formar agregados insolubles (residuos celulares) La despolimerización de proteínas tales como el colágeno o la elastina constituye un buen ejemplo de la acción nociva de las EOA. El inhibidor de proteasa \alpha-1-antitripsina, (el cual inhibe la elastasa y la tripsina) es rápidamente inactivado por los radicales libres de oxígeno. Cuando los glóbulos rojos entran en contacto con las EOA durante unos pocos minutos, su hemoglobina queda alterada; el hierro se libera del hemo, y se produce un aumento de la hemólisis de estas células. Las membranas de fosfolípidos son constituyentes esenciales de la arquitectura celular. Contienen ácidos grasos poliinsaturados (PUFA), dianas favoritas de los radicales libres de oxígeno. El hidrógeno ubicado entre los dobles enlaces PUFA se desprende fácilmente por acción del radical hidroxilo (OH\cdot), que de este modo convierte al ácido graso (RH) en un radical libre (R\cdot) En presencia de oxígeno y hierro, se induce la peroxidación lipídica que se propaga de ácido graso en ácido graso mediante la generación de radicales libres de alcoxilo de lípidos (RO\cdot), radicales peroxilo (ROO\cdot) y lipoperóxidos (ROOH). El resultado es una alteración considerable de la fluidez de la membrana, que posiblemente conduce a la muerte celular. Ricas en PUFA, las lipoproteínas son particularmente sensibles a la acción de las EOA. Las lipoproteínas oxidadas dejan de transportar el colesterol en forma adecuada. Además, son reconocidas por los macrófagos sanguíneos y se acumulan dentro de ellos. Los macrófagos adquieren entonces el aspecto de células espumosas, que se adhieren a las paredes arteriales. Este es el mecanismo mediante el cual las lipoproteínas oxidadas contribuyen a aumentar el riesgo de enfermedad cardiovascular.
Estudios recientes han demostrado que las EOA pueden también jugar un rol a nivel molecular. Un ejemplo es su actuación sobre el NF-kB, un factor de transcripción especifico del linfocitos B. Inactivo en el citoplasma, el NF-kB puede inducirse en una amplia variedad de tipos de células por numerosos factores, incluyendo citoquinas, agentes infecciosos, e incluso EOA que actúan como mensajeros secundarios. La tiorredoxina (TRX), una proteína inducida por estrés oxidativo, también aumenta la actividad del NF-kB mediante la modificación de la regulación redox del glutatión (GSH). Una vez activado, el NF-kB migra hacia el núcleo de la célula, donde puede transactivar genes diana. Por tanto, está implicado en la síntesis de numerosos mediadores de las respuestas inmunes e inflamatorias (citoquinas, complemento). Varios virus, tales como el VIH, también dependen del NF-kB para replicarse en la célula.
Nuestro organismo está siempre produciendo EOA pero, tal y como aparecerá en la próxima sección, esta producción está perfectamente regulada por sistemas protectores. Las EOA desempeña, por lo tanto, un importante papel fisiológico, tal como se ilustra en los siguientes ejemplos. Las células fagocitas, neutrófilos, eosinófilos, y monocitos/macrófagos aseguran la fagocitosis y la destrucción de microorganismos extraños. La citotoxicidad de estas células se debe a su capacidad para desplazarse de una forma inactiva a otra forma sumamente activada caracterizada por la producción de abundante EOA intracelular capaz de atacar la membrana del microorganismo fagocitado.
Estudios recientes han demostrado que en el proceso de fertilización, un espermatozoide segrega grandes cantidades de EOA para penetrar la pared membranosa del óvulo. Bajo condiciones fisiológicas, las células endoteliales liberan una sustancia llamada EDRF (factor de relajación derivado del endotelio), el cual desempeña un papel importante en la regulación del tono vascular, debido a sus propiedades relajantes del músculo. Se ha demostrado claramente que este EDRF actúa como el radical libre monóxido de nitrógeno NO\cdot.
Fuente de producción de EOA in vivo
La sobreproducción de EOA es atribuible a numerosos mecanismos bioquímicos:
Ciertamente, el mecanismo más importante consiste en la activación de glóbulos blancos mediante varios estímulos externos, tales como endotoxinas, interleuquinas o fragmentos complementarios, presentes en exceso en el organismo en varias condiciones patológicas. Las EOA producidas mediante esta activación son secretadas a continuación hacia el medio extracelular y pueden en consecuencia atacar órganos y tejidos sanos y desencadenar una inflamación aguda. Los glóbulos blancos también liberan un enzima llamado mieloperoxidasa (MPO). En presencia de peróxido de hidrógeno, este enzima cataliza la oxidación del ion cloruro a un poderoso oxidante, el ácido hipocloroso (HOCI), más conocido como "agua clorada".
Hemos visto que bajo condiciones fisiológicas, las mitocondrias transforman alrededor del 2% de su oxígeno en EOA. Incluso estudios efectuados en animales han demostrado que este porcentaje aumenta durante el envejecimiento, como resultado de la desregulación gradual del transporte de electrones en la cadena respiratoria.
La desregulación del transporte de electrones en las mitocondrias se observa también en todos los procesos de reperfusión isquémica. La isquemia, es decir la privación de oxígeno, en un tejido causa lesiones celulares en proporción a su duración. Con el fin de conservar la viabilidad tisular, la reperfusión debe acontecer dentro de un límite determinado de tiempo, el cual depende del tejido considerado. Varios estudios experimentales y clínicos han demostrado, no obstante, que el daño celular más significativo ocurre cuando se restaura el flujo sanguíneo, como resultado de la producción explosiva de EOA en los minutos siguientes a la reperfusión. La conversión de la xantina deshidrogenasa (XDH) en xantina oxidasa (XO), (estas dos enzimas actúan en las últimas etapas del catabolismo de la purina) es también una fuente principal de EOA. Desde el punto de vista clínico, la reperfusión isquémica constituye un aspecto importante de la apoplejía y el transplante de órgano.
En los casos de estrés oxidativo, las células endoteliales producen en abundancia tanto anión superóxido como radical monóxido de nitrógeno (NO\cdot). La interacción de ambos radicales tiene un doble efecto:
producción de peroxinitritos (HOONO) de alta toxicidad y vasoconstricción debida a la pérdida de las propiedades vasodilatadoras del NO\cdot.
Las EOA, y especialmente el anión superóxido, pueden "activar" el hierro, liberándolo de la proteína de almacenamiento ferritina; el hierro liberado puede entonces iniciar reacciones de radicales libres.
La hemoglobina puede convertirse en un oxidante potencial ya sea mediante la formación directa de EOA, o bien, mediante la liberación de hierro hemo en forma libre.
En las plaquetas sanguíneas, la conversión del ácido aracidónico en prostaglandinas o leucotrienos, catalizados respectivamente por ciclooxigenasa y lipooxigenasa, constituye una fuente potencial de producción de EOA y de lipoperóxido.
Defensas antioxidantes
A fin de protegerse de los efectos potencialmente nocivos del oxígeno, nuestro organismo ha desarrollado dos tipos de sistemas defensivos.
Un primer sistema defensivo, compuesto por enzimas y compuestos antioxidantes. La función de estos factores consiste en prevenir el inicio o la propagación de reacciones de radicales libres. La protección enzimática está asegurada por la superóxido dismutasa (SOD), que destruye el anión superóxido, la catalasa, que elimina peróxido de hidrógeno, la glutatión peroxidasa, un enzima dependiente de selenio, que convierte a los peróxido lipídicos en productos inofensivos, proteínas quelantes de hierro (ferritina, transferritina), las cuales mantienen al hierro en estado inactivo que de otro modo, sería capaz de catalizar las reacciones de radicales libres. Además, los radicales libres son destruidos por atrapadores que reaccionan directamente con los radicales para formar derivados oxidados. Por ejemplo, el glutatión (GSH) reacciona con el radical OH\cdot para formar glutatión oxidado (GSSG), mediante un mecanismo que implica la formación de un radical tiilo GS\cdot, seguido por la combinación de dos de tales radicales. Otros ejemplos de atrapadores incluyen ácido úrico, bilirrubina, glucosa, proteínas tiol (proteínas SH), y un grupo de cuatro vitaminas: vitamina A (\beta-caroteno), C (ácido ascórbico), E (\alpha-tocoferol) y Q (coenzima Q-10 o ubiquinona). De forma destacada, estos antioxidantes pueden actuar sinergísticamente contra los radicales libres. Un ejemplo la cooperación entre el glutatión y las vitaminas C y E. Al reaccionar con un radical de lípido R\cdot, el lípido se regenera y la vitamina E se convierte en un radical tocoferilo. La vitamina E se regenera a partir de este radical gracias a la acción de la vitamina C, la cual a su vez se convierte en radical. Este radical reacciona entonces con glutatión reducido, para formar vitamina C y un radical tiílo. Dos de estos últimos se combinan para producir GSSG.
Un segundo sistema defensivo está compuesto por enzimas proteolíticos. La función de este sistema consiste en prevenir la acumulación de proteínas oxidadas y ADN en la célula y en degradar sus fragmentos tóxicos. Fosfolipidasas, endonucleasas de ADN y ligasas y macroxiproteinasas, figuran entre las principales enzimas que conforman esta última línea defensiva contra las EOA.
Patologías asociadas al aumento de estrés oxidativo
Ciertas situaciones patológicas llevan a la sobreproducción de EOA. En dichas situaciones, los sistemas de defensa naturales de un organismo son rápidamente sometidos. En términos generales, el estrés oxidativo se define como un desequilibrio significativo entre antioxidantes y prooxidantes, en favor de estos últimos, que conduce a daño celular que a menudo resulta irreversible.
La sobreproducción de EOA es considerada como la responsable de aproximadamente unas cien patologías diferentes. Estas se dividen en 6 grandes categorías: efectos debidos a toxicidad química (ozono, paracuato) o toxicidad xenobiótica, efectos debidos a la radiación (rayos \gamma), el síndrome de hiperoxigenación (retinopatía del prematuro), condiciones inflamatorias (artritis reumatoide), efectos de reperfusión isquémica (transplante de órgano), condiciones degenerativas (envejecimiento, cáncer). Muchas situaciones/patologías están asociadas a la sobreproducción de
EOA:
Riñones: transplante, nefritis glomerular.
Pulmones: síndrome de insuficiencia respiratoria, asma.
Corazón: trombosis coronaria, transplante.
Piel: quemaduras, exposición al sol, psoriasis, dermatosis
Cerebro: trauma, enfermedad de Atkinson, neurotoxinas, demencia.
Articulaciones: artritis reumatoide.
Tracto gastrointestinal: diabetes, pancreatitis, endotoxemia, isquemia intestinal.
Ojos: cataratas, retinopatía (del prematuro), degeneración retinal.
Vasos sanguíneos: aterosclerosis
Glóbulos rojos: Anemia de Fanconi, malaria.
Órganos múltiples: inflamación, reperfusión isquémica, toxicidad a los medicamentos, sobrecarga de hierro, deficiencia nutricional (Se), alcohol, radiación, cáncer, envejecimiento, SIDA.
Hígado: Hepatitis C.
El exceso de ejercicio puede también generar un estrés oxidativo en atletas, asociado a fatiga muscular y lesiones.
Cuando se producen en pequeñas cantidades, las EOA desencadenan una respuesta celular adaptativa caracterizada por un sobrecrecimiento celular, sobreexpresión de enzimas antioxidantes (superóxido dismutasa), y expresión de genes que codifican para muchas proteínas. Las células expuestas a dosis bajas (5 umoles) de peróxido de hidrógeno, por ejemplo, se vuelven entonces muy resistentes a concentraciones más altas de este oxidante. Al producirse en exceso, las EOA atacan los sustratos previamente mencionados y en consecuencia ocasionan daño celular frecuentemente irreversible y la posterior necrosis tisular. Entre estas dos situaciones extremas, hay una en la cual el estrés oxidativo lleva a la apoptosis, es decir, a la muerte celular programada. Este fenómeno implica la proteolisis masiva y un cambio en la transcripción del gen, conduciendo a la condensación de cromatina y a la fragmentación del ADN en los endosomas. La integridad celular se conserva, contrariamente a lo que ocurre en el caso de muerte celular necrótica patológica. Antes del nacimiento, más de una de cada seis células muere por apoptosis. La apoptosis se caracteriza además por una fuga de GSH, volviendo a la célula más sensible al estrés oxidativo.
Terapia antioxidante
Cuando el estrés oxidativo supera ostensiblemente los sistemas de defensa naturales, se hace necesario recurrir a la terapia antioxidante a fin de restringir la acción nociva de las EOA. Además de los antioxidantes naturales mencionados anteriormente, existen antioxidantes exógenos, tanto naturales como sintéticos.
Cada antioxidante tiene su especificidad. Son diferentes y actúan en diferentes etapas en la producción de la cadena EOA. Se pueden distinguir cuatro grandes categorías:
1.
moléculas que interactúan con EOA tanto enzimáticamente (SOD, catalasa, glutatión, peroxidasa) o directamente (dimetilsulfóxido, vitaminas A, C y E, ubiquinona, 21-aminoesteroides, probucol, captopril, propofol, ácido lipoico, flavonoides o vitaminas P,
2.
Moléculas que refuerzan las defensas antioxidantes de las células. Algunos ejemplos incluyen N-acetilcisteína (NAC), la cual aumenta la concentración GSH intracelular, y ciertos metales que actúan como cofactores. La administración de cobre y/o zinc refuerza la actividad de SOD en los glóbulos rojos, mientras que el selenio refuerza la actividad del glutatión peroxidasa en estas células;
3.
Moléculas quelantes de hierro, uno de los mejores ejemplos es la desferrioxamina. Este es un compuesto notablemente usado para el tratamiento de la hemocromatosis idiopática. Tanto los 21-aminoesteroides como los flavonoides presentes en grandes cantidades en la Gingko biloba poseen esta interesante capacidad quelante del hierro;
4.
Inhibidores enzimáticos responsables de la formación de radicales libres. El más conocido es el allopurinol, un inhibidor de la xantina oxidasa utilizado habitualmente en cirugía para restringir los efectos de la reperfusión isquémica. Asimismo, vale la pena mencionar ciertos agentes anti-inflamatorios (sulfasalasina, 5-ácido aminosalicilico) y otros productos tales como la ceftazidina y la pentoxifillina, los cuales regulan la producción de EOA mediante glóbulos blancos activados.
Los individuos no poseen un potencial antioxidante idéntico, ya que dicho potencial es una función de los hábitos alimenticios, del estilo de vida, de las características genéticas, o del entorno en que uno vive. En la actualidad, la determinación del estatus de estrés oxidativo (SSO) de un individuo se ha convertido en un tema prioritario en términos de prevención de enfermedades, ya que numerosos estudios muestran claramente una fuerte relación entre la alteración del sistema defensivo antioxidante y el efecto creciente de las enfermedades cardiovasculares y cánceres.
En la actualidad, a partir del desarrollo de técnicas sensibles y específicas que se pueden utilizar de forma rutinaria (sobre una rutina basada en 20 ensayos que cubren la medición de los anti-oxidantes de los elementos traza, indicadores de estrés del metabolismo del hierro y de los marcadores de estrés oxidativo a nivel de los lípidos, de las proteínas y del ADN), es posible establecer un chequeo sanguíneo completo del SSO de un individuo.
Evidencia de estrés oxidativo in vivo: ensayos clásicos
En el suero o plasma, el estatus del estrés oxidativo (SSO) se calculará de cuatro modos: (i) mediante la medición de niveles antioxidantes, (ii) mediante la determinación de niveles de los elementos traza, (iii) mediante el análisis del estatus del hierro en sangre, y (iv) mediante la detección de daño oxidativo en varios sustratos biológicos.
A. Antioxidantes
Vitamina A: Ciertos carotenoides actúan como precursores de la vitamina A, conduciendo a la vitamina mediante degradación. La vitamina A desempeña un papel esencial en la percepción visual y previene la oxidación de diversos sustratos biológicos, por ejemplo, los ácidos grasos poliinsaturados de las membranas celulares.
Vitamina C: Esta vitamina reacciona con radicales libres que contienen oxígeno hidrofílico. Su nivel plasmático cae rápidamente durante el estrés oxidativo. La vitamina C también está implicada en la regeneración de la vitamina E. Dado que la vitamina C es sumamente lábil, no es posible analizarla en forma adecuada, a menos que se tomen las debidas precauciones para conservar la muestra (estabilización del plasma con ácido metafosfórico).
Vitamina E: Este término abarca un grupo de compuestos llamados tocoferoles (\alpha, \beta, \gamma, \delta). El \alpha-tocoferol es el isómero biológicamente más activo ensayado en este estudio. Reacciona con radicales de lípidos y por lo tanto previene la propagación de la peroxidación lipídica de las membranas celulares. Actúa en estrecha sinergia con la vitamina C. Su concentración plasmática debe ser estandarizada con respecto al colesterol.
Glutatión Reducido (GSH)/glutatión oxidado (GSSG): El glutatión es un tripéptido que actúa a varios niveles contra el estrés oxidativo. Puede interactuar en forma directa con especies de oxígeno activado (EOA), pero se la utiliza principalmente como un sustrato de la glutatión peroxidasa, que elimina los lípidos peroxidados. La relación GSH/GSSG constituye uno de los indicadores de estrés oxidativo más sensibles en un individuo.
Proteínas tiol (PSH): La mayoría de las proteínas poseen grupos tioles (-SH), los cuales reaccionan muy fácilmente con las EOA.
Glutatión peroxidasa (GPx): Ubicada en los glóbulos rojos, la GPx requiere la presencia de selenio y glutatión reducido para el desempeño de su actividad antioxidante. Su rol consiste en eliminar peróxido de hidrógeno y peróxidos lípídicos que se forman cuando las EOA reaccionan con ácidos grasos poliinsaturados.
Superóxido dismutasa (SOD): Éstas son metaloproteínas de las cuales se distinguen dos variedades en el hombre, en función del metal o de los metales presentes en el sitio activo. Un tipo contiene cobre y zinc, mientras que el otro requiere manganeso para ser activo. El rol de estos enzimas consiste en regular la producción del anión superóxido, la primera especie tóxica a ser formada a partir de oxígeno.
Capacidad antioxidante plasmática total (análisis de antioxidantes hidrofílicos y lipofílicos): Este test evalúa la capacidad del plasma para inhibir la producción de EOA generados a partir de un sistema in vitro (el método TRAP). Constituye por lo tanto un método de "screening" que calcula la suma de todas las actividades antioxidantes individuales presentes en varios entornos biológicos.
B. Elementos traza
Selenio, Cobre, Zinc: Estos tres oligoelementos son indispensables para la función de los enzimas antioxidantes (selenio para la GPx, cobre y zinc para la SOD). La absorción de zinc conduce a largo plazo, a la inducción de antioxidantes tales como las metalotioninas. Asimismo, el zinc protege también a los grupos tioles de proteínas. El zinc puede inhibir parcialmente reacciones en las que el cobre o el hierro inducen la formación de especies de oxígeno activado. Por esta razón, la relación de cobre con respecto a zinc en sangre puede proporcionar información interesante acerca del nivel de estrés oxidativo de un individuo.
C. Indicadores de estrés oxidativo
Peróxidos lípidicos - LDL Oxidada -anticuerpos contra la LDL Oxidada: Los ácidos grasos poliinsaturados (componentes esenciales de las membranas celulares y las lipoproteínas) son una diana preferencial de las EOA. Estos tres tests se utilizan para detectar la peroxidación lipídica. Numerosos estudios muestran una relación entre, por un lado, el aumento de la oxidación de LDL y un aumento del título de anticuerpos contra la LDL oxidada, y por otro lado, la aparición de enfermedad cardiovascular, la progresión de la aterosclerosis y la presencia de diabetes.
8-hidroxi-2'-desoxiguanosina (8-OH-dG): Las EOA reaccionan con gran afinidad con algunas de las bases que constituyen el ADN. La guanina se transforma fácilmente en 8-hidroxi-2'-desoxiguanosina (8-OH-dG), que es normalmente eliminada por los enzimas reparadores del ADN. Si estos sistemas son deficientes, la 8-OH-dG se acumula en el ADN, causando mutaciones implicadas en la formación de cáncer. En caso de estar presente en muestras de orina de 24 horas, este marcador debe ser estandarizado con respecto a la creatinina.
Ensayo de carbonilo: Se ha sugerido que las modificaciones oxidativas de las proteínas intracelulares desempeñan un papel clave en la causa de pérdidas asociadas a la senescencia en las funciones fisiológicas, ya que las proteínas oxidadas a menudo pierden su función catalítica y sufren una degradación selectiva. Podría decirse que la adición de aducto que contiene carbonilo a las cadenas laterales de residuos de aminoácidos (lisina, arginina,...) es la alteración estructural post-traduccional asociada con la edad mejor caracterizada.
Mieloperoxidasa: Cuando están activados, los neutrófilos aumentan su consumo de oxígeno al 400%. Esto conduce a la producción masiva de EOA y a la liberación de enzimas proteolíticos (elastasa) y mieloperoxidasa (MPO). La MPO interviene en el desarrollo del estrés oxidativo, siendo responsable de la formación del ácido hipocloroso, un poderoso oxidante. Un incremento del nivel de MPO en plasma es por lo tanto un indicador específico de activación neutrófila, y éste un indicador indirecto de la presencia de EOA, que tiene lugar en todos los procesos inflamatorios.
Glucosa: Mediante el proceso de auto-oxidación, la glucosa produce EOA y glioxal en grandes cantidades. El glioxal se enlaza a los grupos amino de las proteínas y por lo tanto, conduce a la aparición de "proteínas viejas" con residuos de carboximetillisina. Éstos tienen la capacidad de enlazar cobre y de inducir la peroxidación lipídica, la cual a su vez aumenta la producción de glioxal. La propia glucosa puede enlazarse a la hemoglobina para producir hemoglobina glicada. Estos marcadores aumentan, naturalmente, en pacientes diabéticos, considerada una situación de gran estrés oxidativo. Incluso el envejecimiento puede causar la acumulación de dichos marcadores.
D. Metabolismo del hierro
Proteínas que enlazan iones metálicos. Cuando el hierro o el cobre está en forma libre, éstos puede catalizar la peroxidación lipídica y la producción de EOA. La capacidad de algunas proteínas de enlazarse al hierro (transferrina, ferritina) o de transportar cobre (ceruloplasmina) constituye un factor antioxidante preventivo esencial. En ausencia de muestras hemolíticas, un aumento de saturación de transferritina en hierro es un indicador indirecto de estrés oxidativo.
E. Varios
Los niveles elevados de homocisteína en sangre (un aminoácido que contiene azufre) han sido asociados al mayor riesgo de enfermedad arterial coronaria prematura, infarto y tromboembolismo (coágulos sanguíneos venosos), incluso entre individuos con niveles normales de colesterol. Los niveles anormales de homocisteína parecen contribuir a la aterosclerosis al menos en tres formas: (1) un efecto tóxico directo que daña las células que recubren la cara interior de las arterias, (2) interferencia con factores de coagulación y (3) oxidación de lipoproteínas de baja densidad (LDL).
La detección del estrés oxidativo in vivo es un proceso largo, complejo y caro que limita su aplicación a la medicina, si bien existen medios para el tratamiento de un estrés oxidativo.
Además, estos tests de diagnóstico proporcionan poca información acerca de lo que acontece a nivel celular, especialmente a nivel de los linfocitos, cuyo metabolismo es muy dependiente de las EOA. Por lo tanto, no existe hasta el momento ningún test que permita obtener información a este nivel.
Pincernail J et al., "Determination of plasmatic concentrations in antioxidants, antibodies against oxidized LDL, and homocystein in a sampling of Liege population", Annales De Biologie Clinique, Vo. 58, No. 2 Marzo 2000 (2000-03), páginas 177-185, describe la determinación cuantitativa de marcadores de estrés oxidativo en un grupo de 123 donantes de sangre, como, por ejemplo, vitamina C, vitamina E, relación vitamina E/colesterol, selenio, proteínas con sulfhidrilo, ácido úrico, superóxido dismutasa, y glutatión peroxidasa. Además, también se han investigado autoanticuerpos contra LDL oxidada, como marcador del estrés oxidativo y homocisteína, como factor de riesgo de aterosclerosis implicada en el desarrollo del estrés oxidativo.
WO9963341 A2 se refiere al uso de un gráfico de diagnóstico del estrés oxidativo como un indicador para la evaluación del estrés oxidativo y su control en humanos.
WO0132802 A describe un procedimiento y aparato para la predicción de la infertilidad masculina, y más particularmente, a un procedimiento y aparato para cuantificar el estrés oxidativo en una muestra física obtenida de un sujeto de prueba. Dicho procedimiento y aparato proporcionan información útil para un profesional médico en el diagnóstico de enfermedades que están asociadas o provocadas por el estrés oxidativo.
Napoli Claudio et al., "Múltiple role of reactive oxygen species in the arterial wall", Journal of Cellular Biochemistry, Vol. 82, No. 4, 19 Junio 2001 (19-06-2001), páginas 674-682 describe que el aumento de estrés oxidativo juega un papel importante en la disfunción vascular y aterogénesis y existe una gran evidencia que indica que las especies de oxígeno reactivas (ROS) regulan la expresión génica mediante la modulación de una gran número de factores de transcripción. Napoli Claudio et al. describen además que las técnicas de microarray ofrecen una manera de determinar un gran espectro de cambios asociados con el aumento del estrés oxidativo.
EP0229674 A describe la determinación de la predisposición o susceptibilidad de un individuo a enfermedades asociadas con el daño en el ADN que comprende el estrés oxidativo de células aisladas o el ADN celular del individuo para producir ADN dañado, a continuación, la determinación de un valor para la actividad del enzima celular adenosin difosfato ribosil transferasa (ADPRT); y a continuación, la comparación del valor con un valor estándar de actividad de ADPRT.
Kenneda C H Cueto R Belinsky S A Lechner J F Pryor W, "Overexpression of hMTH1 mRNA: a molecular marker of oxidative stress in lung cancer cells", FEBS Letters, Elsevier Science Publishers, Amsterdam, NL, Vol. 429, No. 1, 5 Junio 1998 (1998-06-05), páginas 17-20 describen que la sobreexpresión de ARNm de hMTH1 puede representar un marcador molecular del estrés oxidativo en células de pulmón, que podría utilizarse finalmente para elucidar las relaciones temporales entre el estrés oxidativo, la inestabilidad genómica y el desarrollo del cáncer de
pulmón.
Weigel A L et al, "Microarray analysis of tert-butyl hydroperoxide and hydrogen peroxide induced gene expression in ARPE-19 cells", IOVS, Vol. 42, No. 4, 15 Marzo 2001 (2001-03-15), página S754, describe un análisis de microarray de la expresión génica inducida por hidroperóxido de terc-butilo y peróxido de hidrógeno en células ARPE-19. Se clasificaron 53 genes como oxidantes específicos si estaban implicados en tBH o bien H_{2}O_{2}, pero no ambas respuestas génicas. Este documento describe además que existe un grupo común de genes que están implicados en una respuesta general al estrés oxidativo.
Un objetivo de la presente invención consiste en proporcionar un procedimiento de evaluación diagnóstica que permita evaluar de forma rápida y sencilla el estatus del estrés oxidativo (SSO) (preferiblemente a nivel celular).
Además, con la presente invención se describe un kit adecuado para realizar dicho procedimiento. Otros problemas técnicos serán evidentes a partir de la materia de las reivindicaciones, la descripción de los cuales se incorporan por la presente.
De acuerdo con la presente invención, el término "factor de riesgo" significa cualquier posible condición fisiológica y/o patológica en la cual un individuo podría estar afectado por estrés oxidativo. En particular, se consideran el ejercicio físico intenso, efectos debidos a toxicidad química o toxicidad xenobiótica, efectos debidos a la radiación, síndrome de hiperoxigenación, condiciones inflamatorias, efectos de reperfusión isquémica y condiciones degenerativas. Las condiciones fisiológicas y/o patológicas caracterizadas como un factor de riesgo para estrés oxidativo están ejemplificadas a continuación.
De acuerdo con la presente invención, el término "anti-oxidante" significa cualquier sustancia capaz de proteger de los efectos potencialmente nocivos del oxígeno; en particular, capaz de prevenir el desencadenamiento de las reacciones de radicales libres.
De acuerdo con la presente invención, el término "pro-oxidante" significa cualquier sustancia capaz de apoyar directa o indirectamente el inicio de la propagación de las reacciones de radicales libres.
De acuerdo con la presente invención, el término "marcador de estrés oxidativo" significa cualquier marcador de estrés oxidativo conocido en la técnica o tal y como se ha descrito en la presente invención.
De acuerdo con la presente invención, el término "proteína implicada en apoptosis" significa cualquier proteína capaz de inducir la apoptosis, es decir, muerte celular programada, o cualquier proteína o ARN que esté implicada en, o que regule, el mecanismo de la apoptosis. Se consideran en particular moléculas asociadas al ligando CD95/CD95 (ligando Fas/Fas).
De acuerdo con la presente invención, el término "chip de ADN" debería interpretarse como sinónimo de microarray o biochip, sin limitarse a una longitud determinada de ácidos nucleicos u oligonucleótidos unidos al mismo.
De acuerdo con la presente invención, el término "enzima" también abarca polipéptidos que no necesariamente exhiben actividad catalítica.
De acuerdo con la presente invención, el término "factores de transcripción" significa cualquier proteína de unión a ADN o ARN o ARN que regula la transcripción y traducción genética, o cualquier ARN, proteína o cascada de proteínas que los regula.
De acuerdo con la presente invención, el término "enzima reparador del ADN" significa cualquier proteína o ARN que reconoce las modificaciones producidas en el ADN o cualquier ARN, proteína o cascada de proteínas que los regula.
De acuerdo con la presente invención, el término "proteína de estrés" significa cualquier proteína o ARN, cuya expresión se modifica bajo un estrés celular inducido por condiciones físicas, químicas o biológicas que están fuera de sus valores fisiológicos normales.
Sorprendentemente, los presentes inventores han descubierto que el estrés oxidativo medido en individuos expuestos a diferentes grados y calidades de estrés oxidativo difiere en su perfil de marcadores de estrés oxidativo, es decir, en la cantidad de marcadores de estrés oxidativo cuando se evalúa una gran variedad de marcadores de estrés. Por ejemplo, los perfiles de los marcadores de estrés oxidativo se han obtenido a partir de individuos sanos, pacientes cardíacos, pacientes en hemodiálisis, sujetos habituados a ejercicio físico intenso (tales como atletas de media maratón y jugadores de fútbol de élite). Aunque hubiera sido esperable que la cantidad de marcadores de stress oxidativo aumentase del mismo modo en pacientes y atletas mostrando agotamiento debido al ejercicio físico, ha resultado que diferentes marcadores de estrés oxidativo son inducidos selectivamente una vez expuestos a diferentes fuentes de estrés oxidativo; véase Tabla III. Tal y como se observa en las Tablas I y III, algunos marcadores de estrés oxidativo aumentan bajo una determinada condición fisiológica y/o patológica, mientras que bajo la misma condición, diferentes marcadores de estrés oxidativo pueden disminuir, véase por ejemplo, el valor correspondiente a pacientes en hemodiálisis de la Tabla III, en la cual aumentan los valores promedios para el peróxido lipídico y la LDL oxidada, mientras que los valores promedio para la superóxido dismutasa (SOD) y el selenio disminuyen. Estos hallazgos tienen importantes repercusiones en el diagnóstico y la posible terapia de enfermedades basadas en estrés oxidativo.
La presente invención permite, por primera vez, una reducción significativa en el número de marcadores de estrés oxidativo a ser evaluados, dado que sólo algunos marcadores de estrés oxidativo de la literatura, realmente han aumentado o disminuido en individuos con una determinada condición fisiológica y/o patológica, al compararlos con individuos sanos. Adicionalmente, la selección de los marcadores de estrés oxidativo en los que se han observado que aumentan o disminuyen en una condición fisiológica y/o patológica determinada, reduce el número de falsos negativos de tests de estrés oxidativo previos que utilizaron ya sea marcadores que, en la condición fisiológica y/o patológica, no han aumentado ni disminuido, o que incluyeron aquellos marcadores en los que se han observado que aumentan o disminuyen en una condición fisiológica y/o patológica particular en un panel más amplio de marcadores invariables, computando un valor promedio que permanece dentro de su rango normal. La presente invención posibilita la evaluación del factor de riesgo específico en individuos lo que permite un diagnóstico más afinado y posiblemente también la terapia del síndrome de estrés oxidativo subyacente en la condición fisiológica y/o patológica. Además, la presente invención permite, por primera vez, una evaluación del factor de riesgo específico de los datos obtenidos a partir de la evaluación de los marcadores de estrés oxidativo seleccionados de acuerdo a la presente invención, la cual también facilita al médico la elección de un régimen de tratamiento específico para el paciente.
En una realización, la presente invención proporciona un procedimiento para determinar marcadores de estrés oxidativo en un grupo de individuos, que comprende las etapas de:
a) la determinación del factor de riesgo para el estrés oxidativo en dicho grupo;
b) la medición de la cantidad de al menos 10 marcadores diferentes de estrés oxidativo en una muestra obtenida de cada uno de dicho grupo de individuos; y
c) la comparación de la cantidad de cada uno de dichos marcadores de estrés oxidativo con la cantidad de cada uno de dichos marcadores de estrés oxidativo medida en un grupo de individuos sanos, determinando así los marcadores de estrés oxidativo que hayan aumentado o disminuido en dicho grupo de individuos portadores de un factor de riesgo para el estrés oxidativo respecto a individuos sanos.
El individuo puede ser humano o animal.
Los factores de riesgo para el estrés oxidativo se determinan por el médico de acuerdo a una anamnesis general. Los factores de riesgo de ejemplo se describen a continuación.
La medición de la cantidad de los marcadores de estrés oxidativo se determina tal y como se describe a continuación.
Preferiblemente, por razones estadísticas, el grupo comprende por lo menos 10 individuos, preferiblemente más de 50. Posteriormente a la medición de la cantidad de los diferentes marcadores de estrés oxidativo, se obtiene un valor promedio y se utiliza para la posterior etapa de comparación. También para el grupo de individuos sanos, deberían evaluarse al menos 10 individuos con el fin de obtener valores promedios fiables. Preferiblemente, el grupo consiste en un solo género (es decir, varón o hembra), dado que se han observado variaciones en la cantidad de marcadores de estrés oxidativo entre hombres y mujeres. Véase la Figura 1.
En otra realización, la presente invención proporciona un procedimiento para la detección de estrés oxidativo en un individuo que comprende:
a)
la determinación del factor de riesgo de dicho individuo;
b)
la selección de al menos dos marcadores de estrés oxidativo que hayan aumentado o disminuido para dicho factor de riesgo respecto a individuos sanos;
c)
la medición de la cantidad de al menos dos de dichos marcadores oxidativos de una muestra obtenida de dicho individuo.
Preferiblemente, los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen para dicho factor de riesgo se determinan mediante el procedimiento anterior según la presente invención. La muestra es preferiblemente una muestra de sangre obtenida por o bajo el control de un médico.
En una realización preferida, dicho procedimiento para la detección de estrés oxidativo en un individuo comprende además la etapa de evaluación del resultado en el contexto de dicho factor de riesgo sin restringir o limitar al médico en modo alguno. Se sugiere que los resultados para un marcador de estrés oxidativo particular en un cierto individuo portador de un factor de riesgo para estrés oxidativo deberían ser observados en relación al valor promedio para dicho marcador de estrés oxidativo del grupo de individuos portadores del mismo factor de riesgo para estrés oxidativo, posibilitando de este modo una estimación del grado de estrés oxidativo en dicho individuo portador del factor de riesgo particular.
El factor de riesgo mencionado en los procedimientos anteriores se puede seleccionar entre una dieta desequilibrada, tabaquismo, exposición a un entorno tóxico, una intervención quirúrgica, ejercicio físico intenso, y enfermedades que afecten a los riñones, pulmones, corazón, piel, cerebro, articulaciones, tracto gastrointestinal, ojos, vasos sanguíneos, glóbulos rojos, hígado y órganos múltiples.
Preferiblemente, las enfermedades se seleccionan entre: transplantes, nefritis glomerular, síndrome de insuficiencia respiratoria, asma, trombosis coronaria, quemaduras, exposición al sol, psoriasis, dermatosis, traumas, enfermedad de Parkinson, neurotoxinas, demencia, artritis reumatoide, diabetes, pancreatitis, endotoxemia, isquemia intestinal, cataratas, retinopatías, degeneración de la retina, aterosclerosis, anemia de Falconi, malaria, inflamación, reperfusión isquémica, toxicidad a los medicamentos, sobrecarga de hierro, deficiencia nutricional, alcoholismo, radiación, cáncer, envejecimiento, infección por VHC y el SIDA.
Cabe destacar que el listado de enfermedades anterior no se limita a las indicaciones para el uso de los procedimientos según la presente invención. Además de las enfermedades anteriores, cualquier situación fisiológica y/o patológica que conduce a la sobreproducción de EOA está prevista por la presente invención.
Los marcadores de estrés oxidativo de utilidad para la práctica de los procedimientos según la presente invención pueden seleccionarse del grupo consistente en antioxidantes, elementos traza, indicadores de estrés oxidativo, marcadores del metabolismo del hierro, homocisteína, enzimas con funciones antioxidantes, enzimas con funciones prooxidantes, enzimas reparadores del ADN, enzimas del metabolismo del glutatión, proteínas de estrés, proteínas implicadas en la apoptosis, factores de transcripción, citoquinas y quimioquinas.
Preferiblemente, el antioxidante se selecciona entre la vitamina A, vitamina C y vitamina E, glutatión reducido (GSH)/glutatión oxidado (GSSG), tioles proteicos, glutatión peroxidasa o superóxido dismutasa.
Preferiblemente, el elemento traza se selecciona entre el selenio, cobre o zinc.
En una realización preferida, el indicador de estrés oxidativo se selecciona entre anticuerpos contra las LDL (lipoproteínas de baja densidad) oxidadas, 8-hidroxi-2'-desoxiguanosina, mieloperoxidasa, glucosa, glioxal, y proteínas oxidadas.
Preferiblemente, el marcador del metabolismo del hierro se selecciona entre la transferrina, ferritina y ceruloplasmina.
Preferiblemente, los enzimas con funciones antioxidantes se pueden seleccionar entre la catalasa, superóxido dismutasa (SOD) que contiene Mn, SOD que contiene cobre y zinc, tiorredoxina-1, tiorredoxina reductasa-1, peroxirredoxina-1, metalotioneina-1, L-ferritina y receptor de transferrina, proteína antioxidante 2, ceruloplasmina, lactoferrina, selenoproteína P, selenoproteína W, frataxina, paraoxonasa sérica/aristelasa 1, paraoxonasa sérica/aristelasa 2, o paraoxonasa sérica/aristelasa 3.
Preferiblemente, los enzimas con función prooxidante se pueden seleccionar entre la ciclooxigenasa-2, 5-lipoxigenasa, c-fosfolipasa A2, fosfolipasa A alfa, fosfolipasa D-1, mieloperoxidasa, óxido nítrico sintetasa, proteína reactiva C, elastasa, haptoglobina, NADH-citocromo b5 reductasa o diaforasa A1.
Preferiblemente, el enzima reparador del ADN se puede seleccionar de la 8-oxoguanina ADN glicosilasa.
Preferiblemente, el enzima del metabolismo del glutatión se puede seleccionar entre la glutatión peroxidasa, fosfolípido hidroperóxido glutatión peroxidasa no-Se, fosfolípido, gama-glutamil cisteína sintetasa, y glucosa 6-fosfato deshidrogenasa, glutatión peroxidasa extracelular, glutatión peroxidasa, glutatión peroxidasa 2, glutatión peroxidasa 4, glutatión reductasa, glutatión S-transferasa, glutatión sintetasa, peroxidorredoxina 1, peroxidorredoxina 2, peroxidorredoxina 3, peroxidorredoxina 5, o tiorredoxina 2.
Preferiblemente, la proteína de estrés puede ser una proteína HSP, hemo-oxigenasa-1, hemo-oxigenasa-2, la proteína ORP150 de 150 kDa regulada por oxígeno, HSP27 de 27 kDa, HSP90A, HPS17, HPS40 o HPS110.
Preferiblemente, la proteína implicada en la apoptosis puede ser FasL, CD95, el factor 1 de necrosis tumoral, Bcl-2, GADD153, GADD45, RAD50, RAD51 B, RAD52, RAD54, p53 o el ligando Fas.
Preferiblemente, el factor de transcripción se selecciona entre la NFkB-\alpha, C-Fos, C-jun, IkB-\alpha, monoamina oxidasa A, monoamina oxidasa B, o el receptor alfa activado por el proliferador de peroxisoma.
Preferiblemente, la citoquina o la quimioquina se seleccionan entre la IL-1, IL-6, IL-8, IL-1beta, IL-2 o la proteína asociada al receptor de TNF1.
Las investigaciones efectuadas por los presentes inventores han revelado que determinados marcadores de estrés oxidativo aumentan o disminuyen en individuos portadores de ciertos factores de riesgo.
De acuerdo con una realización preferida, los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen cuando se evalúa el factor de riesgo de la hemodiálisis, son la catalasa, glucosa-6-fosfato deshidrogenasa, HSP70, 5-lipoxigenasa, vitamina C, glutatión peroxidasa, SOD, Se, peróxido lipídico, LDL oxidadas y homocisteína.
El aumento o disminución puede ser tanto a nivel transcripcional y/o a nivel de la proteína expresada.
De acuerdo con otra realización preferida, los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen cuando el factor de riesgo es la cirugía cardíaca, son la superóxido dismutasa que contiene manganeso, c-fosfolipasa A2, H-ferritina, IL-8, óxido nítrico sintetasa 2 (NOS2), vitamina C, vitamina E/colesterol, glutatión peroxidasa (GPx), anticuerpos contra las LDL y homocisteína.
De acuerdo con otra realización, los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen cuando se evalúa el factor de riesgo debido al ejercicio físico son HSP70, NFkB-\alpha, vitamina C, relación cobre/zinc, vitamina E/colesterol, GPx y ión sérico.
En el caso de los atletas portadores de factor de riesgo no sólo de ejercicio físico intenso, sino también expuestos a fatiga muscular y a lesiones, se ha observado también que los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen son la vitamina E, vitamina E/colesterol, GSH, relación GSH/GSSG, zinc, GPx, GSSG, relación cobre/zinc, anticuerpos contra las LDL oxidadas y proteínas oxidadas.
De acuerdo con otra realización preferida, los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen cuando el factor de riesgo está representado por el tabaquismo, son la vitamina C, Se, GPx, anticuerpos dirigidos contra las LDL oxidadas y homocisteína.
De acuerdo con otra realización preferida, los marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen cuando el factor de riesgo se debe a una dieta deficiente en consumo de frutas son, la vitamina C, tioles proteicos, Se, GPx, y homocisteína.
De acuerdo a la presente invención, cuando el procedimiento para la detección de estrés oxidativo en un individuo está determinado según los términos ya descriptos, preferiblemente se seleccionan no más de 22 marcadores diferentes de estrés oxidativo para efectuar la medición de la cantidad de marcadores de estrés oxidativo de una muestra obtenida a partir de dicho individuo. Preferiblemente, no más de 15, más preferiblemente no más de 10, y aún más preferiblemente, no más de 5 marcadores de estrés oxidativo que aumentan o disminuyen en el grupo de individuos portadores del factor de riesgo particular de dichos individuos. Tal y como se ha descrito previamente, los presentes inventores han observado que no todos los marcadores de estrés oxidativo conocidos en la técnica aumentan en individuos bajo condiciones de estrés oxidativo, sino que sólo algunos que dependen de la condición fisiológica y/o patológica, es decir, el factor de riesgo de los individuos aumenta. Sorprendentemente, se ha visto que varios de los marcadores de estrés oxidativo conocidos incluso disminuyen en dichos individuos, mientras que otros marcadores de estrés oxidativo diferentes de éstos pueden no presentar cambios con respecto a individuos sanos.
En los procedimientos implicados según la presente invención, la cantidad de marcador de estrés oxidativo puede ser determinada mediante la medición de la concentración del marcador de estrés oxidativo, o bien mediante la medición de la concentración de transcrito/ARNm del gen o el ADNc correspondiente que encodifica los marcadores de estrés oxidativo.
Cuando la concentración de marcador de estrés oxidativo se determina de forma directa, se comprende entonces cualquier procedimiento conocido en la técnica para la determinación de dicho marcador de estrés oxidativo. El procedimientos de determinación puede comprender procedimientos enzimáticos, inmunoquímicos o espectroscópicos. La presente invención prevé procedimientos de determinación directos o indirectos tales como por ejemplo, radioinmuno ensayos.
Cuando la cantidad de marcador de estrés oxidativo se mide mediante la determinación de la concentración del transcrito/ARNm del gen que codifica el marcador de estrés oxidativo, cualquier procedimiento para la determinación cuantitativa de transcritos del gen conocido en la técnica queda comprendido por la presente invención. Para la determinación cuantitativa, es preferible que el ARNm sea convertido al ADNc correspondiente mediante la reacción de transcriptasa inversa. Para determinar el producto de PCR correspondiente, se pueden aplicar procedimientos de PCR cuantitativos o semicuantitativos. El procedimiento de determinación puede también implicar la hibridación a genes o fragmentos o derivados de los mismos fijados a una matriz sólida, tal como por ejemplo, una Northern Blot. La presente invención también prevé el uso de procedimientos espectroscópicos.
Es particularmente preferible que la cantidad de por lo menos dos de los marcadores de estrés oxidativo sea determinada en paralelo. La realización en paralelo de la determinación ofrece la ventaja de una determinación de alta velocidad recomendada en la práctica clínica.
En lo que respecta a esta realización, es preferible que la determinación en paralelo de los marcadores de estrés oxidativo sea efectuada mediante el uso de un chip de ADN (microarray o biochip) como se conoce, por ejemplo, en van Berkum y Holstege, Current Opinión in Biotechnology 2001, 12: 48-52. El chip utilizado para la determinación puede presentar cualquier configuración, se prefiere que permita duplicar, triplicar o cuadruplicar las determina-
ciones.
En la presente invención se describe un kit de evaluación que es adecuado para realizar el procedimiento según la presente invención comprende reactivos capaces de determinar la cantidad de al menos dos marcadores de estrés oxidativo. Preferiblemente, el reactivo capaz de determinar la cantidad de dicho marcador de estrés oxidativo es específico para dicho marcador de estrés oxidativo.
El reactivo capaz de determinar la cantidad de dicho marcador de estrés oxidativo es un anticuerpo. Éste puede ser monoclonal o policlonal. Los anticuerpos monoclonales pueden ser obtenidos mediante la inmunización de animales de laboratorio, extrayendo los esplenocitos, y fusionándolos con células tumorales, a fines de obtener anticuerpos específicos de marcador de estrés oxidativo por selección según los procedimientos conocidos en la técnica. Los anticuerpos monoclonales, los fragmentos de anticuerpos o las moléculas de enlace, se pueden seleccionar también mediante el uso de técnicas de expresión molecular tales como la expresión de fagos.
El reactivo capaz de determinar la cantidad de dicho marcador de estrés oxidativo puede, en el caso en que el marcador de estrés oxidativo se determine mediante la concentración de transcrito/ARNm del gen o su correspondiente ADNc mediante una sonda que sea esencialmente complementaria a dicho transcrito/ARNm del gen o un fragmento del mismo. Es preferible que la sonda comprenda por lo menos 10 nucleótidos complementarios al transcrito/ARNm del gen o un fragmento del mismo. Con el fin de permitir la detección, la sonda puede comprender además un marcador adecuado para la detección. El marcador puede ser radiactivo o no radiactivo.
Por consiguiente, el kit de prueba puede comprender un anticuerpo y/o una sonda específica para dicho marcador de estrés oxidativo.
De acuerdo con una realización preferida, se proporciona un procedimiento para la detección de estrés oxidativo en una muestra de sangre, que comprende:
- la extracción de ARNm de las células de la muestra de sangre,
- la transcripción inversa de dicho ARNm en ADNc, con marcaje de estos compuestos de ADNc,
- la puesta en contacto de estos ADNc con una población de varios fragmentos de ADN sintético para realizar una hibridación molecular entre los ADNc y dichos fragmentos de ADN sintético en caso de expresión de estrés oxidativo en las células, y la detección simultánea de las señales de dicha hibridación, las cuales corresponden a algunos genes expresados
donde la población de los fragmentos de Adn sintético comprende al menos algunos fragmentos génicos que pertenecen a la familia de los genes de marcadores de estrés oxidativo seleccionados del grupo que consiste en:
a.
enzimas con funciones antioxidante, enzimas con funciones prooxidante,
b.
enzimas reparadores de ADN,
c.
enzimas del metabolismo del glutatión,
d.
proteínas de estrés,
e.
proteína simplicadas en la apoptosis,
f.
factores de transcripción,
g.
citoquinas,
h.
quimioquinas.
De acuerdo con una realización preferida, el ARNm se extrae de linfocitos purificados.
Este proceso resulta ventajoso para la evaluación en una sola etapa, mediante la genética, del SSO de un paciente.
Evidencia de estrés oxidativo in vivo: tecnología innovadora de microarrays de ADN
Una realización de la presente invención tiene por finalidad la detección de genes expresados durante el estrés oxidativo celular con una pluralidad de dichos ADN sintéticos dispuestos en un soporte sólido (arrays de ADN). Se han descrito varios soportes sólidos, y se conocen procedimientos de preparación y uso de arrays (Cheung et al. Nature Genetics Supplement 1999, 21:15-l9; Bowtell, Nature Genetics Supplement 1999, 21:25-32; Epstein and Butow, Current Opinion in Biotechnology 2000, 11:36-41; van Berkum and Holstege, Hedge et al., Biotechniques 2000, 29:548-560; Current Opinion in Biotechnology 2001, 12,:48-52,). Son varios los procedimientos conocidos que se pueden utilizar para aislar el ARN de una población de células, para preparar los ADNc, para post-amplificar los ADNc si es necesario (bajo cantidad de células), y para marcar los ADNc. (Ausubel et al., Short Protocols in Molecular Biology, Wiley 1999; Wang et al., Nature Biotechnology 2000, 18:457-459; Mansfield et al., Mol Cell Probes 1995, 9:145-56). Una serie de variables deben ser controladas en el análisis de expresión génica (tales como la cantidad de material inicial, eficacias enzimáticas, eficacias de marcaje, inhomogeneidades de la lámina portaobjetos,...) con el fin de asegurar resultados cuantitativos apropiados. Se conocen varios métodos de calibración que utilizan controles internos (por ejemplo, genes "domésticos" como la \beta-actina, ciclofilina, \beta2-microglobulina, hipoxantina fosforibosil-transferasa-1, ubiquitina C, GAPDH, hidroximetilbilano sintasa...) o controles externos ("de carga") (Schuchhardt et al., Nucleic Acids Research 1990, 28:e47; Tseng et al., Nucleic Acids Research 1991, 29:2549-2557; Yue et al Nucleic Acids Research 2001, 29:e41). El análisis de imagen, y la corrección y análisis de datos se encuentran integrados en una serie de herramientas de software disponibles (Bassett et al., Nature Genetics Supplement 1999, 21 51-55; Quackenbush, Nature Reviews Genetics 2001, 2:418-427).
Preferiblemente, la puesta en presencia se realiza en un chip de ADN que porta dichos fragmentos de ADN sintéticos según una topografía específica.
El proceso también se aplica a la tecnología de microarrays.
El chip de ADN de alta densidad permite la evaluación de la expresión de un gran número de genes (por ejemplo, los genes completos contenidos en el genoma de un organismo), mientras que el chip de ADN de baja densidad permite la evaluación de la expresión de un número inferior de genes (frecuentemente aquellos asociados a patología). Estos chips de ADN se encuentran en pleno desarrollo tecnológico y posibilitan la determinación en unas pocas horas de la naturaleza y la calidad de algunos ARNm contenidos en una célula. El uso de los chips de ADN ya ha sido considerada no sólo en un gran número de áreas de investigación fundamental, sino también en ciencia aplicada, por ejemplo, en el seguimiento del cuidado de pacientes oncológicos, sujetos expuestos a acciones tóxicas ambientales, y en casos de resistencia a la terapia triple en pacientes infectados por el virus del SIDA. De este modo, estos chips de ADN conocidos están destinados al análisis de una determinada patología.
En el proceso de la invención, la población de fragmentos de ADN sintéticos puede estar compuesta de oligonucleótidos cuyo tamaño oscila entre 25 y 100 b, de productos de amplificación enzimática (PCR) in vitro, o una combinación de los mismos.
Preferiblemente, la población de fragmentos de ADN sintéticos comprende al menos unos 50 fragmentos de genes que pertenecen a la familia de genes seleccionados del grupo constituyente de los enzimas que codifican para:
- enzimas con funciones antioxidantes, enzimas con funciones prooxidantes, enzimas reparadores del ADN, enzimas del metabolismo del glutatión, proteínas de estrés, proteínas implicadas en apoptosis, factores de transcripción, citoquinas y quimioquinas.
Preferiblemente, la población de fragmentos de ADN sintéticos seleccionados comprende al menos dos genes, cada uno perteneciente a una familia distinta entre las familias mencionadas.
Más preferiblemente, la población de fragmentos de ADN sintéticos comprende uno o más fragmentos de cada una de las familias de genes mencionadas.
Como dichos enzimas antioxidantes, se encuentran los siguientes: catalasa XM006202, superóxido dismutasa X14322 que contiene manganeso, superóxido dismutasa X81859 que contiene cobre y zinc, tiorredoxina-1 XM-015718, tiorredoxina reductasa-1 XM-015673, peroxirredoxina-1 XM-011983, metalotionena-1 X97261, L-ferritina XM-016853, H-ferritina XM-017556, receptor de transferrina XM-002788, proteína antioxidante 2 NM-004905, ceruloplasmina M13699, lactoferrina M93150, selenoproteína P 211793, selenoproteína W U6717, frataxina U43747, paraoxonasa sérica/arilesterasa 3 L48516.
Como enzimas con funciones prooxidantes, se encuentran por ejemplo, los siguientes: ciclooxigenasa-2 M90100, 5-lipoxigenasa XM-005818, c-fosfolipasa A2 XM-007544, fosfolipasa A alfa D16234, fosfolipasa D-1 NM-002662, mieloperoxidasa XM-008160, óxido nítrico sintetasa-2 XM-008631, proteína-C-reactiva X56692, elastasa M34379, haptoglobina NM-005143, NADH citocromo b5 reductasa o diaforasa A1 Y09501.
Como dicho enzima para la reparación del ADN, puede haber, por ejemplo, 8-oxoguanina ADN glicosilasa humana BC000657.
Como enzimas del metabolismo del glutatión mencionados anteriormente, se puede mencionar, por ejemplo, los siguientes: glutatión peroxidasa X58295, fosfolípido hidroperóxido glutatión no-Se AF090194, gamma-glutamil cisteína sintetasa NM-001498, y glucosa-6-fosfato deshidrogenasa XM-013149, glutatión peroxidasa extracelular 2 NM-002083, glutatión peroxidasa 4 NM-002085, glutatión reductasa X1 5722, glutatión S-transferasa J03746, glutatión sintetasa U34683, peroxirredoxina 1 (PRDX1) NM-002574, peroxirredoxina 2 (PRDX2) XM-009063, peroxirredoxina 3 (PRDX3) XM-055573, peroxirredoxina 5 (PRDX5) AF197952, tiorredoxina 2 (TRX2) AF276920.
Como proteína de estrés previamente citada, se puede mencionar las siguientes, por ejemplo: proteína de choque térmico M1 171 7, hemo-oxigenasa-2 D21243, proteína ORP150 de 150 kDa regulada por oxígeno U65785, proteína de choque térmico (HSP17) de 27-kDa U15590, proteína de choque térmico 1 (HSP40) de 40-kDa D49547, proteína de choque térmico (HSP110) de 110-kDa D89956, ubiquitina M26880.
Como dicha proteína implicada en la apoptosis, se puede mencionar, por ejemplo, FasL AF287593, CD95 X89101, receptor del factor de necrosis tumoral 1 M32315, Bcl-2 NM-000633, GADD153 S40706, GADD45 M60974, RAD50 U63139, RAD51B Dl3804, RAD52 U12134, RAD54 X97795, p53 AF307851, Ligando Fas 38122.
Como dichos factores de transcripción, se pueden mencionar los siguientes: IkB-\alpha, C-Fos V01512, C-Jun J04111, IkB-\alpha-M69043, monoamina oxidasa A (MAOA) M68840, monoamina oxidasa B (MAOB) M69177, receptor alfa activado por el proliferador de peroxisoma (PPAR-alfa) L02932.
Como dichas citoquinas y quimioquinas, se pueden mencionar, por ejemplo, IL-1 BC-008678, IL-6 BC-015511, IL-8 AF-385628, 1L-1\beta M15330, IL-2 U25676, y la proteína asociada al receptor de TNF1 (TRAP1) U12595.
Dichas substancias son todas conocidas y algunas han recibido un número de acceso en las bases de datos PubMed Central y Gene Bank, citado previamente.
Cabe señalar que esta lista no es exhaustiva, pero sí permite, durante la aplicación de varios genes que codifican para varias de estas substancias, efectuar un solo análisis de un grupo de patologías diversas, teniendo cada uno un efecto que puede ser importante, dependiendo de los casos. Por consiguiente, esto aumenta la calidad del análisis y lo hace particularmente seguro, lo que hasta ahora era imposible sobre la base de un único test conocido.
En otra realización de la presente invención, la expresión de los grupos de genes identificados por el array de ADN se cuantifica utilizando tecnologías cuantitativas de RT-PCR que resultan más adecuadas cuando se deben cuantificar un número limitado de genes (habitualmente menos de 10), o bien cuando se comienza con menos materiales (por ejemplo, menos de 1 ml de sangre). El ARNm de los linfocitos totales se purifica tal como se ha mencionado previamente, y los genes se cuantifican utilizando una o una combinación de las tecnologías de RT-PCR, según se describe por S.A. Bustin (Journal of Molecular Endocrinology, 25, 169-193, 2000), ya sea en reacciones separadas o en formato múltiple. El diseño de los amplímeros y de las sondas, de las condiciones del PCR y de los controles del ARN, y las diferentes opciones de marcaje están descritas por S.A. Bustin (ibid.), Graber et al (Current Opinion in Biotechnology 1998, 9:14-18), Schweitzer y Kingsmore (Current Opinion in Biotechnology 2001, 12:21-27) y Lie y Petropoulos (Current Opinion in Biotechnology 1998, 9:43-48). Los datos se normalizan mediante la utilización de controles internos y externos, de modo similar a lo que se hace con los arrays de ADN. Los resultados se describen en concentraciones absolutas (por ejemplo, número promedio de ARNm por linfocito). El rango de valores normales en ausencia de estrés oxidativo se determinarán tal como se ha mencionado anteriormente.
Aunque se ha descrito como una realización independiente, la siguiente materia debería interpretarse como una realización preferida de la materia anterior. La presente invención se refiere además a un proceso que comprende además, la extracción de ARNm mencionada anteriormente, una exposición in vitro de las células de la muestra de sangre para factores generadores de estrés oxidativo, preferiblemente seleccionados entre H_{2}O_{2}, HOCI, xantina/xantina oxidasa, glucosa/glucosa oxidasa, forbol miristato acetato, componentes azo y estrés térmico (+41ºC), lo cual permite la evaluación de la eficacia de los fragmentos de ADN sintéticos seleccionados antes de su implementación en un test diagnóstico.
La presente invención se refiere además a una evaluación global del SSO mediante la realización en paralelo del test genómico único según la presente invención, de la cuantificación de los marcadores sanguíneos de estrés oxidativo presentes en la muestra.
En la presente invención se describe un kit para la detección de estrés oxidativo para la implementación del proceso caracterizado en que comprende:
- al menos un chip de ADN portador de dicha población de fragmentos de ADN sintéticos.
De forma ventajosa, este kit comprende además solución de hibridación adaptada al chip de ADN implementado, así como posiblemente, una solución de lavado adaptada. Como control, éste puede tener al menos un gen con un nivel de expresión constante en cada situación de estrés oxidativo, por ejemplo, ciclofilina, GAPDH, algo de beta-actina y ARN ribosomal o bien un promedio de varios genes. Preferiblemente, este kit presenta además un protocolo que detalla todos los pasos necesarios para realizar una hibridación y para proceder a la detección de señales de hibridación obtenidas, así como una tabla de valores de referencia de los niveles expresados de fragmentos de ADN depositados en dicho al menos un chip de ADN, estos niveles correspondiendo a un valor positivo de estrés oxidativo.
Otros procedimientos y formas de realización de la invención están indicados en las reivindicaciones.
La Figura 1 muestra la curva de distribución de anticuerpos contra las LDL oxidadas.
La Figura 2 muestra la determinación en paralelo de los marcadores de estrés oxidativo utilizando un ensayo de microarray.
A. Condiciones experimentales de estrés oxidativo y extracción de ARNm
Una muestra de sangre (1 ml) tomada con heparina como anticoagulante o linfocitos (10^{7} células/ml) aislados de muestras de sangre (provenientes del kit de Nycorned Lymphoprep, In VitroGen) se ponen en contacto a 37ºC mediante varios sistemas de producción de estrés oxidativo 1) peróxido de hidrógeno con una concentración que oscila entre 10^{-4} a 10^{-6}M; ii) xantina oxidasa 0,4 U/ml/hipoxantina 2 Mm; iii) clorhidrato de 2,2'-azobis (2-amidino propano) a una concentración de 50 Mm. El período de incubación puede variar entre 30 minutos y 3 horas. Al final del período de incubación, la extracción del ARN mensajero se efectúa de la sangre completa o bien, de linfocitos mediante la utilización del kit comercial: "\muMACS^{TM} mRNA Isolation Kit from Miltenyi Biotec, Germany".
B. Desarrollo de chips de ADN con SSO de baja densidad
Los chips de ADN con SSO se crean simultáneamente utilizando productos PCR generados por oligonucleótidos específicos a partir de secuencias candidatas de genes seleccionadas, por ejemplo, entre aquellas detalladas anteriormente, así como de polinucleótidos que representan fragmentos de estos genes. El tamaño de los productos PCR estará comprendido en este ejemplo entre 400 y 600 pares de bases y el tamaño de los polinucleótidos estará entre 60 y 80 bases. El sistema utilizado para la deposición de los productos en la lámina de vidrio es EuroGridder SDDC-2.
C. Preparación de sondas fluorescentes (ADN complementario) e hibridación de los chips de ADN con SSO
Los ARN mensajeros extraídos se transforman en ADN complementarios mediante transcripción inversa. La transcriptasa inversa es la Superscript I1 comercializada por Invitrogen/Life Technology. El protocolo de la transcripción inversa es el que viene con la enzima. Los ADN complementarios se amplifican a continuación mediante PCR utilizando los oligonucleótidos específicos de los genes seleccionados y la polimerasa Silverstar (Eurogentec) según el protocolo provisto con la enzima. El marcaje se efectúa durante la amplificación mediante la incorporación de dCTP acoplado a CY3 o a CY5 (de Amersham/Pharmacia). A continuación, los ADN complementarios se agrupan y se diluyen en una solución de hibridación "Dig Easy Hybridization solution", comercializado por Roche Boehringer, y se depositan sobre los chips de ADN (20 \mul por lámina portaobjetos cubierta por un cubreobjetos de 24 x 32 mm.). Las láminas se distribuyen a continuación individualmente en cámaras de hibridación comercializadas por Corning y se incuban durante 5 a 16 horas a 42ºC.
D. Lavado de chips de ADN, detección y análisis de las señales de hibridación
Después de la hibridación, los chips de ADN se lavan dos veces sucesivas durante 5 minutos en soluciones de 0,2 x SSC-0,1% SDS y de 0,2 x SSC a (1 x SSC = 0,15 M NaCl - 0,015 M citrato de sodio, pH: 7,5). Las señales de hibridación se miden con el escáner GenePix 4000A y los resultados se tratan con el software GenePix 0.3 de Axon Instruments.
E. Validación de los tests sobre chips de ADN de SSO de baja densidad
Para cada gen evaluado, se establecen valores de referencia a partir de un rango de muestras obtenidas de 50 pacientes en buena salud. La cuantificación de la expresión del gen se efectuará en comparación con la expresión básica de genes tales como la ciclofilina, GAPDH, la beta-actina y el ARN ribosomal. Estos valores se comparan con aquellos obtenidos de las muestras de sangre sometidas a estrés oxidativo in vitro, tal y como se ha descripto previamente.
La eficacia de los chips de ADN con SSO está siendo evaluada preferiblemente en pacientes que presentan un estrés oxidativo que se ha manifestado y éste en base a la dosificación clásica en sangre.
Una vez observada la eficacia de los chips de ADN, éstos se pueden aplicar directamente para diagnosticar una situación de estrés oxidativo en pacientes susceptibles de padecer dicha situación.
Material y procedimientos A. Detección de estrés oxidativo
Con el fin de observar estrés oxidativo in vivo, se utiliza una batería de 22 ensayos. Éstos incluyen la determinación del antioxidante y elementos traza, el análisis de daño oxidativo a lípidos y proteínas, y la investigación sobre el metabolismo del hierro. El rango normal para cada ensayo se estableció sobre una población de 123 individuos sanos y sedentarios (de 21 a 54 años). Las muestras de sangre se extrajeron con anticoagulantes apropiados e inmediatamente fueron centrifugadas. Las alícuotas plasmáticas se mantuvieron a -20ºC hasta el ensayo.
Antioxidantes
Debido a su alta labilidad, la vitamina C o ácido ascórbico plasmático se calculó espectrofotométricamente utilizando la reducción del colorante 2,6-diclorofenolindofenol (Merck, Alemania) después de la estabilización con una solución de ácido metafosfórico al 10% tal y como se ha descrito previamente (Omaye S et al., Methods Enzimol, 62: 3-1-1; 1979).
La concentración de vitamina E o \alpha-tocoferol plasmática se evaluó mediante cromatografía líquida de alta presión (HPLC) sobre una columna de fase inversa C-18 120 (100 X 4,5 mm i.d.) con una elución isocrática con metanol/agua (98:2) y detección de radiación ultravioleta (UV) a 280 nm, según Bieri et al. (Am. J. Clin. Nutr. 32:2143-2149; 1979). Dado que la vitamina E se transporta en los lípidos, el estatus de la vitamina E se expresó como la relación Vitamina E/colesterol.
La concentración de vitamina A plasmática se analizó por HPLC y detección UV a 325 nm, utilizando el kit provisto por Chromsystems (Munich, Alemania).
La glutatión reducida (GSH) y la glutatión oxidada (GSSG) se evaluaron mediante la determinación colorimétrica, utilizando el reactivo atrapador de tioles trifluorometanosulfonato de 1-metil-2-vinilpiridinio (Bioxytech GSH/GSSG-412, Oxis, USA).
La concentración de grupos sulfidrilos (P-SH) de las proteínas se evaluó en plasma mediante el método espectrofotométrico, utilizando una reducción del ácido 5,5'-ditio-bis-(2-nitrobenzoico) (Sigma, Steinheim, Alemania), según Ellman et al. (Arch. Biophys. 82: 70-77; 1959).
Los enzimas glutatión peroxidasa (GPx) y la superóxido dismutasa (SOD) se evaluaron en la sangre completa utilizando un método espectrofotométrico adaptado a ensayos de rutina (Randox Laboratories, Antrim, UK).
Elementos traza
El selenio, el cobre y el zinc se midieron en plasma en forma directa, mediante un procedimiento de espectroscopia de absorción atómica con horno de grafito en un SP IRAA-640 (Varian, Holanda) equipado con corrección de fondo por efecto Zeeman (Neve J. et al., in: Bratter P; Schamer P., eds. Trace elements analytical chemistry in medicine and biology. Berlin: Walter de Gruyter; 1987: 1-10). La relación cobre/zinc fue utilizada como un marcador sensible de la presencia de estrés oxidativo in vivo (Mezzetti A. et al., Free Rad. Biol. Med., 25; 676-681; 1998).
Marcadores de estrés oxidativo
La concentración de peróxido lípido se determinó mediante la reacción de los peróxidos biológicos con peroxidasa y una posterior reacción cromática, utilizando TMB como sustrato. Después de la adición de una solución de detención, el líquido coloreado se midió fotométricamente a 450 nm.
Las LDL oxidadas se determinaron mediante una técnica Elisa desarrollada por Mercodia (Uppsala, Suecia). Se basó en la técnica de sándwich directa, en la cual dos anticuerpos monoclonales son dirigidos contra determinantes antigénicos separados en la molécula de apolipoproteína B oxidada.
Los autoanticuerpos contra las LDL oxidadas (ox-LDL-Ab) se determinaron con un inmunoensayo enzimático comercialmente disponible (Biomedica Gruppe, Viena, Austria), originalmente desarrollado por Tatzber and Esterbauer (en: Rice-Evans, C.; Bellomo, G. eds. Free radicals IX. London: Richelieu Press; 1995: 245-262). Las tiras de microtitulación fueron recubiertas con LDL oxidada con cobre (Cu2+) como antígeno. En caso de estar presentes en plasma prediluido, los autoanticuerpos se unen específicamente al antígeno. Después de una etapa de lavado, un anticuerpo IgG anti-humano conjugado con peroxidasa específico detectó la presencia de autoanticuerpos ligados. Después de la extracción del conjugado no ligado mediante lavado, se adicionó tetrametilbenzidina a los pocillos como sustrato cromogénico no tóxico. La concentración de IgG específica en la muestra se cuantificó a través de un cambio de color catalizado por una enzima, detectable en un lector ELISA estándar.
El grado de oxidación de la proteína se monitorizó mediante el método de Levine et al. (Methods Enzymol. 186: 464-478; 1990), el cual utiliza la reacción de 2,4- dinitrofenilhidrazina (DNPH) con los grupos carbonilos de proteínas oxidadas. Los carbonilos de las proteínas se leyeron a continuación a 370 nm y se evaluaron utilizando un coeficiente de absorción molar de 22000 M^{-1}cm^{-1}.
F. Metabolismo del hierro
El ión sérico se determinó después de la reducción de iones férricos a iones ferrosos, los cuales reaccionan con el reactivo ferrozina para formar un complejo de coloración roja. La absorbancia se leyó a 572 y 660 nm (kit Merck no 19725).
La medición de ADVIA Centaur Ferritina es una inmunodosificación de dos sitios (sándwich), que utiliza una tecnología de quimioluminiscencia directa y una cantidad constante de anticuerpos anti-ferritina. El primer anticuerpo es un anticuerpo policlonal de cabra anti-ferritina, acoplado a éster de acridinio. El segundo anticuerpo es un anticuerpo monoclonal de ratón anti-ferritina unido de forma covalente a partículas paramagnéticas.
La transferrina se analizó mediante un test inmunoturbidimétrico utilizando un kit de Aptec, catálogo no 53-08004011.
G. Varios
La homocisteína total (tHcy) (umol/L) se midió mediante HPLC acoplada con detección de fluorescencia, tal y como se describe por Jacob et al. (Ann. Biol. Clin. (Paris), 55: 583-591; 1997).
H. Establecimiento de valores de referencia
Cuando el parámetro observado muestra una buena distribución normal en la población estudiada, su valor de referencia se define como la media \pm dos veces la desviación estándar (SD), obtenida a partir del histograma de frecuencias absolutas después de definir las clases adecuadas (distribución Gaussiana optimizada por iteraciones sucesivas). Las diferencias entre las concentraciones promedio registradas para diferentes sub-grupos (fumadores, consumidores de frutas...) se evaluaron mediante el "testm t de Student" para variables independientes. Las diferencias se consideraron estadísticamente significativas a p < 0,05. Las correlaciones se calcularon mediante regresión múltiple de las diversas variables independientes.
B. Experimentación con microarray
El uso de arrays de ADN (microarrays de ADNc o microarrays de oligonucleótidos) ha sido sugerida como una poderosa tecnología para evaluar la expresión génica antioxidante y prooxidante. Las muestras de sangre obtenidas en reposo de 16 adultos sanos se recogieron como población de control. Con respecto al análisis de sangre clásico, no se detectó estrés oxidativo significativo en esta población (un máximo de dos parámetros anormales sobre seis ensayos investigados, tal y como se muestra en la Tabla I).
Pusimos en marcha un diseño experimental para analizar los perfiles de expresión de linfocitos en tres condiciones in vivo de estrés oxidativo:
A. Paciente con insuficiencia renal crónica: se tomaron muestras de sangre antes de la hemodiálisis. Esta muestra evaluativa fue comparada con el perfil de expresión del gen hallado en la población control.
B. Paciente sometido a cirugía cardíaca asociada con procedimiento de bypass cardiopulmonar; se tomaron muestras de sangre antes (ADNc de referencia en la presente situación) y 24 h después de la cirugía cardíaca (muestra evaluativa).
C. Seis atletas bien entrenados (cinco varones y una mujer) participaron en una media maratón de carácter oficial; se tomaron muestras de sangre en reposo (ADNc de referencia en la presente situación) y 1 hora después de la competición. (muestra evaluativa).
La preparación de linfocitos se inició 1 hora después de la recogida de sangre.
Preparación del microarray
Preparación de los ADNc: se realizó una reacción en cadena de la polimerasa (PCR)primaria: 10 \mul de mezcla de cebadores específicos 1 y 2 (vol. 1:1; véase Tabla IIa) y 90 \mul de mezcla de PCR que contenía 20 ng de un grupo de ADNc humano, 10X tampón EuroTaq ADN Polimerasa, 2 mM de MgCl_{2}, 0,8 mM de dNTP y 0,02 U/\mul de EuroTaq ADN Polimerasa (Eurogentec, Bélgica). La amplificación se llevó a cabo a continuación con desnaturalización durante 5 minutos a 94ºC, seguida de 40 ciclos de desnaturalización a 94ºC durante 1 min, hibridación a 55ºC durante 30 segundos y extensión a 72ºC durante 1 min.
Las PCR amino modificadas se realizaron con 30 \mul de productos PCR primarios y 70 \mul de mezcla de PCR que contenía 10X tampón EuroTaq ADN Polimerasa, 2 mM MgCl_{2}, 0,8 mM dNTP y 0,02 U/\mul de EuroTaq ADN Polimerasa (Eurogentec, Bélgica), añadidos mediante 20 pmoles de cebador inverso: 5'-GTC-CGG-GAG-CCA-TG-3' (sec75) y 20 pmoles de cebador directo: 5'-CGA-CGC-CCG-CTG-ATA-3' (sec76). La amplificación se llevó a cabo a continuación con desnaturalización durante 5 min a 94ºC, seguida de 40 ciclos de desnaturalización a 94ºC durante 1 min, con una hibridación a 45ºC durante 30 segundos y extensión a 72ºC durante 1 minuto.
Los productos de PCR amino-modificados purificados y los oligos largos (-65 mer, a una concentración de 10 uM; véase la Tabla IIb) se dispusieron sobre láminas portaobjetos para microscopio Diaglass (Advanced Array technology, Namur, Bélgica), utilizando Eurogridder SDDC-2 robotics (Esl/Virtek).
Un total de 32 ADNc y 10 oligos largos se dispusieron en áreas de 1 cm^{2} (Tablas IIa y IIb). Los arrays impresos se lavaron una vez con 0,2% de SDS durante 2 min, dos veces con agua destilada durante 2 min, y se incubaron una vez durante 5 min en una solución de borohidruro de sodio (NaBH_{4} 2,5 mg/ml disueltos en una solución PBS/EtOH (75/25)). Los arrays se lavaron una vez con agua destilada durante 2 min y se sumergieron en agua destilada calentada a 95ºC durante 3 min, se secaron al aire y a continuación se almacenaron en la oscuridad a temperatura ambiente.
Preparación de leucocitos para hibridación de ADNc
La sangre con EDTA se diluyó en primer lugar en PBS de Dulbeco (Gibco) (1:1). Diez mililitros de sangre con EDTA-PBS se dispusieron cuidadosamente en capas sobre 5 ml de Lymphoprep (Axis-Shield/Oslo, Noruega) y se centrifugaron durante 20 min a 3000 rpm. Los eritrocitos se sedimentaron en el fondo del tubo. La mayor parte de los leucocitos permanecieron en la capa de plasma y se extrajeron. El revestimiento se lavó dos veces con PBS y el recuento de leucocitos se realizó en un Cell-Dyn 1600 (Sequoia-Turner).
Aislamiento de ARN e hibridación del array de ADNc
El ARN total fue aislado de los linfocitos utilizando el kit RNeasy (Qiagen, Alemania), según la descripción de los fabricantes. Las concentraciones finales se monitorizaron por espectrometría. Las transcripciones inversas (RT) se efectuaron con 1 \mug de ARN total, tampón de primera hebra 5X, 0,1 pmol/\mul de "Specific Primer Mix" (10 \mul de todos los cebadores 1 y los cebadores 2 añadidos mediante 290 \mul de agua libre de ARNasa), 1,5 mM de dNTP (w/o dCTP), 0,025 mM de dCTP, 1,25 nM de dCTP marcado con biotina y marcado con fluorescente (PerkinElmer-life sciences, USA), 0,01 M de DTT, 1,5 ug de oligo dT, 3 \mug de oligo-dT anclado, 1 \mul de enzima Transcriptasa Inversa Superscript II RNase H (Invitrogen, USA) y 1 \mul de Rnase OUT (Invitrogen, USA). Los ADNc marcados con fluorescencia y biotina se agruparon, se purificaron y se concentraron con un filtro microcon-YM30 (Milipore, MA, USA). Las sondas marcadas se resuspendieron a continuación en 20 \mul de tampón de hibridación (5X SSC, 2% SDS, 20% Formamida) añadidos mediante 0,5 ul de ADN de esperma de salmón y se aplicó lentamente bajo el cubreobjetos del microarray del ADN. La hibridación se llevó a cabo durante la noche a 42ºC en una cámara de hibridación (Corning, NY, USA)
Posthibridación y Cianina-3 (Cy3^{TM}) y Cianina-5 (Cy5^{TM}) TSA
Después de la hibridación, el microarray se lavó con 30 ml 0,5 x SSC, 0,01% SDS, y a continuación con 30 ml 0,06 x SSC, 0,01% SDS. Por último, el microarray se lavó con 0,06 x SSC. La señal se amplifica mediante el sistema MICROMAX de amplificación de la señal de tiramida (TSA) (Pekín Elmer-life sciences, USA) según la descripción del fabricante. En síntesis, la señal de hibridación del ADNc marcado con biotina se amplificó con peroxidasa de rábano (HRP)-estreptavidina y Cy5-tiramida, mientras que la señal de hibridación del ADNc marcado con fluorescencia se amplificó con HRP anti-fluorescente y Cy3-tiramida. Después de la amplificación de la señal y del lavado posthibridación, el microarray del ADN se secó al aire y se detectó mediante un escáner láser.
\global\parskip0.900000\baselineskip
Adquisición de Imagen y análisis de datos
La detección por láser de la señal Cy3 y Cy5 en el microarray se adquirió con un GenePix 4000 (Axon Instruments, CA, USA). Las intensidades de la señal fluorescente y las relaciones Cy3/Cy5 se analizaron mediante el software GenePix Pro 3.0 (Axon Instruments, CA, USA).
Las intensidades con el fondo sustraído de todas las hibridizaciones de ADNc y oligos se normalizaron mutuamente mediante las relaciones de los valores totales de fluorescencia Cy3 y Cy5.
Los genes domésticos (ciclofilina, \beta-actina y GAPDH) se utilizaron como controles internos. Por lo tanto, las señales de hibridación de dichos genes control en dos muestras de ARN deberían ser teóricamente iguales. Las relaciones Cy3 con respecto a Cy5 para cada uno de estos genes control se deben aproximar a 1.
TABLA I Nivel de estrés oxidativo en una muestra de sangre de una población control de la cual los linfocitos fueron aislados para el ensayo del microarray del ADN
1
TABLA IIa
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Secuencias de cebadores seleccionados de genes humanos utilizados para la detección de estrés oxidativo
2
4
TABLA IIb Secuencias de oligos largos seleccionados de genes humanos utilizados para detectar el estrés oxidativo
5
\newpage
Correlación con la lista de secuencias
Secuencias de cebadores seleccionados de genes humanos utilizados para detectar el estrés oxidativo
6
7
Correlación con la lista de secuencias
Secuencias de oligos largos seleccionados de genes humanos utilizados para detectar el estrés oxidativo
8
Resultados A. Determinación de la concentración de sangre de referencia de marcadores relacionados con estrés oxidativo
Todos los antioxidantes estudiados mostraron una distribución normal. La Tabla III enumera los valores de referencia para todos los antioxidantes. La concentración media para la vitamina C resultó significativamente más elevada en las mujeres que en los varones (9,32 \pm 4,2 vs. 6,94 \pm 3,75 ug/ml; p < 0,00001), pero con inverso resultado para la SOD (710,5 \pm 94,5 IU/g Hb en los varones vs. 666,8 \pm 72,5 IU/g Hb en las mujeres; p < 0,05) y el ácido úrico (334,37 \pm 73,78 en los varones vs. 265,72 \pm 89,83 umol/L en las mujeres). No se observó diferencia significativa entre los sexos para cualquier otro de los parámetros (no mostrado).
La Figura 1 muestra una distribución levemente disimétrica para los anticuerpos contra las LDL oxidadas. La concentración media estimada \pm SD fue 424,19 \pm 231,26 mlU/ml. No se observó diferencia significativa entre varones y mujeres para este parámetro. Valores superiores a 650 mlU/ml fueron registrados en el 19,5% de los sujetos (el valor más alto fue 1580 mlU/ml). En cuanto a la homocisteína, la distribución fue también levemente disimétrica en los valores bajos. La media \pm DS fue 11,71\pm 3,58 umol/L. Se observó una concentración de homocisteína significativamente más elevada en las mujeres que en los varones (12,92 \pm 4,91 vs. 10,60 \pm 3,68 umol/L; p < 0,05). La mayoría de nuestros sujetos obtuvieron valores cercanos a la media, pero el 19,5% de ellos obtuvieron niveles que oscilaron entre 15 y 30 umol/L. Sólo un sujeto alcanzó un nivel superior a 30 umol/L.
El análisis regresivo reveló una correlación débil aunque negativamente significativa entre la edad, por un lado, y las vitaminas C (r^{2}= 0,042; p = 0,021) y E (r^{2} = 0,063; p < 0,005) por el otro. Mostró una correlación positiva entre la edad y el colesterol (r^{2} = 0,10; p < 0,0003). La edad no afectó el nivel de homocisteína o de anticuerpos contra las LDL oxidadas (datos no mostrados). Además, no se observó correlación alguna ya sea entre estos factores de riesgo para enfermedad cardiovascular y cualquier nivel antioxidante, el nivel de colesterol, o el nivel de colesterol-LDL.
La Tabla IV muestra la influencia del tabaquismo (el 25% de los sujetos fumaba entre 5 y 20 cigarrillos por día) sobre todos los parámetros examinados en este estudio. En los fumadores, el nivel medio de la vitamina C fue un 31% más bajo que en los no-fumadores. Los niveles de selenio y de GPx fueron también significativamente menores (al 9% y al 13% respectivamente), pero el efecto fue menos pronunciado. No se detectó diferencia significativa para los demás antioxidantes. En los fumadores, el nivel de anticuerpos contra las LDL oxidadas fue también más bajo que en los no fumadores, si bien la diferencia no fue significativa. Los fumadores mostraron, además, un nivel más elevado de tHcy (del orden del 13,5%) que los no fumadores, resultando esta diferencia casi significativa
(p = 0,066).
Los sujetos respondieron a un cuestionario relativo al consumo de frutas (véase la distribución en la Tabla V) y la ingesta de antioxidantes. La Tabla V muestra que los sujetos que consumen entre 1 y 4 frutas por día obtuvieron un nivel más elevado de vitamina C (del orden del 56,9%) (significancia: p < 0,0002) que aquellos que no consumen fruta, y un nivel más elevado que los sujetos que consumen de 3 a 4 frutas por día (del orden del 33,9%). (significancia: p < 0,05). De los parámetros bioquímicos restantes, sólo los niveles de PSH, selenio y GPx resultaron asimismo más elevados en los sujetos que consumen fruta en grandes cantidades. Por otra parte, el consumo de fruta regular se correlacionó con un nivel significativamente reducido de tHcy. Menos del 5% de los sujetos declaró haber ingerido complejos vitamínicos durante la semana previa a la toma de sangre. El efecto esencial fue un nivel de vitamina C (del orden del 29%) sobre la media, como lo muestra la Tabla I.
B. Detección de estrés oxidativo en 4 condiciones
Los parámetros descriptos en la sección "material y procedimientos" fueron evaluados en cuatro categorías de personas con riesgo de desarrollar estrés oxidativo: pacientes hospitalizados sometidos a cirugía cardiaca con procedimiento de bypass coronario (n = 41), pacientes con enfermedad sometidos a diálisis a razón de 3 veces por semana (n = 10), atletas que compiten regularmente en medias maratones (n = 6), y jugadores de fútbol de élite (n = 11), pertenecientes al equipo nacional francés. Las muestras sanguíneas fueron tomadas estando todos los participantes en condiciones basales y se trataron según los procedimientos, asumiendo la mayor exigencia de calidad posible de los parámetros a analizar. Todos los datos fueron comparados con aquellos obtenidos de un grupo control, integrado por 123 voluntarios sanos y sedentarios. Los números subrayados representan valores anormales medios del ensayo estudiado que son más bajos o más altos respecto al valor correspondiente observado en el grupo control. Los valores en negrita se encuentran dentro del rango normal. No obstante, el análisis individual de los datos reveló la presencia de un número considerable de valores anormales, reflejado por el sucesivo desvío estándar (SD).
La Tabla III muestra que el estrés oxidativo se evidenció en forma diferente respecto del grupo investigado.
En los pacientes cardíacos, se detectaron valores bajos en la vitamina C y en la SOD. En contraste, los niveles de la relación vitamina E/colesterol y GPx fueron subexpresados. En menor grado, se observó además un aumento en los anticuerpos contra las LDL oxidadas y la homocisteína.
Los pacientes en diálisis se caracterizan por concentraciones reducidas de la vitamina C, GPx, SOD y selenio, mientras se observaron niveles elevados en los peróxidos lípidicos, LDL Oxidada y homocisteína.
Los competidores de media maratón presentaron niveles elevados de vitamina C y en la relación cobre/zinc, pero concentraciones bajas en la relación Vitamina E/colesterol, GPx y ión sérico.
Los jugadores de fútbol de élite obtuvieron el peor perfil, tal como lo evidencia el gran número de parámetros anormales: disminución en la vitamina E, relación vitamina E/colesterol, GSH, relación GSH/GSSG, zinc y aumento en GPx, GSSG, Cu/Zn, anticuerpos contra las LDL oxidadas y proteínas oxidadas.
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TABLA III Estrés oxidativo en 4 poblaciones seleccionadas
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Los números subrayados representan valores medios anormales del ensayo estudiado que son inferiores o superiores al valor correspondiente observado en el grupo de control. Los números en negrita están dentro del rango normal. Sin embargo, el análisis individual de los datos revelaron la presencia de un gran número de valores anormales reflejados por la posterior desviación estándar (SD).
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TABLA IV Comparación de estrés oxidativo entre fumadores y no fumadores
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TABLA V Influencia de la ingesta de frutas en estado de estrés oxidativo
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C. Experimentación de microarrays
Las señales de hibridación de los genes de domésticos de control teóricamente deberían ser las mismas. Los experimentos revelaron que éste no es exactamente el caso. La relación varía de 0,3 a 2,1. Tal como propone Wong KK et al. (Biotechniques, 2001, 30: 670-675), este problema puede ser superado si se utiliza una relación promedio de los tres genes domésticos cercana a 1. Por lo tanto, el resultado del control interno para la normalización de la señal fue idéntico al de los genes que expresan a un nivel relativamente constante en condiciones diferentes.
A. Paciente con falla renal crónica (antes de la hemodiálisis)
Al compararlo con la población control, el paciente regularmente sometido a diálisis renal, mostró un aumento de la expresión del ARNm de catalasa (CAT), glucosa-6-fosfato deshidrogenasa (G6PDH), proteína-70 de choque térmico (HSP70) y 5-lipoxigenasa (5-LPO) (véase Tabla I).
B. Paciente sometido a cirugía cardíaca con procedimiento de bypass cardiopulmonar
Al compararlo con una condición basal, se observó una subregulación de 5 genes en los linfocitos aislados 24 h. después de la cirugía. Se incluyen: superóxido dismutasa (Mn-SOD), c-fosfolipasa A2, H-ferritina, Interleuquina-8 (IL-8), y óxido nítrico sintetasa 2 (NOS2). Entre estos genes, el IL-8 fue particularmente reprimido. En cambio, el nivel de la expresión del ARNm de catalasa (CAT), se sobrerreguló (véase Tabla VI).
C. Efecto de una media maratón sobre la expresión genética
La actividad física puede elevar la temperatura basal hasta 44ºC y las temperaturas musculares hasta 45ºC. La protección y/o tolerancia contra la oxidación inducida por el ejercicio, calor, citoquina, y estrés inflamatorio en leucocitos, puede ser proporcionada parcialmente por la familia de la proteínas de choque térmico (HPSs) (Fehrenbach E. and Niess AM. Exerc. Immunol. Rev. 5: 57-77; 1999). Mediante el uso de nuestro ensayo de microarray, hemos mostrado una fuerte sobrerregulación de la HSP70 (véase Tabla VI y Figura 2). En cambio, un gran número de genes están subrregulados, y más particularmente el IkB-\alpha.
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TABLA VI Expresión de los genes humanos que codifican las proteínas prooxidantes y antioxidantes modulada en diferentes situación de estrés in vivo
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15
Las intensidades con el ruido restado de todas las hibridaciones de ADNc y oligo se normalizaron entre sí mediante las relaciones de los valores totales de fluorescencia Cy3 y Cy5 (sólo los valores con una intensidad de fluorescencia de más de 1000 son significativas). Se han utilizado tres genes "domésticos" (ciclofilina, \beta-actina y GAPDH) como controles internos. La relación de Cy3 con respecto a Cy5 para cada uno de estos genes de control debe ser próxima a 1. Los números subrayados representan una subrregulación de los ARNm. Los números en negrita representan una sobrerregulación del ARNm.
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Referencias citadas en la descripción
Esta lista de referencias citadas por el solicitante se muestra únicamente para conveniencia del lector. No forma parte del documento de Patente Europea. Aunque se ha tenido una gran precaución a la hora de recopilar las referencias, no se pueden excluir errores u omisiones y la Oficina Europea de Patentes declina cualquier responsabilidad al respecto.
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<110> Probiox SA
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<120> Proceso para la detección de estrés oxidativo y el kit para la implementación de este proceso
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<130> seqprobio
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<140>
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<141>
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<150> BE 2001/0545
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<151> 2001-08-14
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<160> 76
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1
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tgatatccag tttgatagtg aaaaagg
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gaagggagga aaatagggtt ctc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctcatcctgt cattggacta caacc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggttgttgca gacattgtaa tgtg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cattagtgat aaagatgcct ctatagtag
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cacatcatag taagcaataa gtaagtc
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctgacatgag taatatcata gaaaatctgg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccatgtgtta attcaatagt gtaaagatt
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gttcctacaa tgactcagtg gacc
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catactgctc catcagtttc ctc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cttcatgaag tacatgcaga atgaatac
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cctgtactta tccatgcaga caac
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caagtatgga cactgactca gactg
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atgtgccaca tatggacatc cac
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gacaagagaa gtcgaagatg gac
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcttcctgta gtgcattcag ttc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agactcatgg ggcattctct tct
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caggaccaaa aataaacacc acac
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catttataga aacatttact gaggatgatg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgtctattga gtcatatcgg gattt
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tctatgtgga gaatgagagg tggg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ataaatatag gggatgggct tgg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccatggtgct gaccaagatg aag
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctgatgtcc ttcttgtgtt ttc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccatgacgaa agacaacaat ctg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agatgacctc ttgacacttg tcc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caggcagagg gtgatagaag agg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagtgtaagg acccatcgga gaa
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tctacactta gcctctatcc atgg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgaaggtttt ctagtgtcag ctg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagacagacc aactagaaga tgaga
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atagaaggac ccagataggt cca
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ataaagacat actccaaacc tttcc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggtccactct caatcactct cag
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tttaaatatg tgaagctgag ttaatttatg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aatgccattt attggtataa aaacc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagaagaaag taatgacaaa atacctg
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aaattgcatg gtgaagtcag ttata
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtccgggagc catgccgtgt tcttcgacat t
\hfill
31
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LISTADO DE SECUENCIAS
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<110> Probiox SA
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<120> Proceso para la detección de estrés oxidativo y el kit para su implementación
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<130> seqprobio
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<140> EP 02762445.1
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<141> 2002-08-13
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<151> 2001-08-14
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<160> 76
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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\hfill
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tcttcaccaa tctcatgagg agagg
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\hfill
24
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\hfill
29
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caacatagtg atctggttct acaaag
\hfill
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\hfill
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\hfill
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctcatcctgt cattggacta caacc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggttgttgca gacattgtaa tgtg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cattagtgat aaagatgcct ctatagtag
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cacatcatag taagcaataa gtaagtc
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ctgacatgag taatatcata gaaaatctgg
\hfill
30
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<211> 29
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccatgtgtta attcaatagt gtaaagatt
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gttcctacaa tgactcagtg gacc
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catactgctc catcagtttc ctc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cttcatgaag tacatgcaga atgaatac
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cctgtactta tccatgcaga caac
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caagtatgga cactgactca gactg
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atgtgccaca tatggacatc cac
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gacaagagaa gtcgaagatg gac
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tcttcctgta gtgcattcag ttc
\hfill
23
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agactcatgg ggcattctct tct
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 24
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caggaccaaa aataaacacc acac
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
catttataga aacatttact gaggatgatg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgtctattga gtcatatcgg gattt
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tctatgtgga gaatgagagg tggg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ataaatatag gggatgggct tgg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccatggtgct gaccaagatg aag
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gctgatgtcc ttcttgtgtt ttc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ccatgacgaa agacaacaat ctg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
agatgacctc ttgacacttg tcc
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
caggcagagg gtgatagaag agg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagtgtaagg acccatcgga gaa
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tctacactta gcctctatcc atgg
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tgaaggtttt ctagtgtcag ctg
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagacagacc aactagaaga tgaga
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atagaaggac ccagataggt cca
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ataaagacat actccaaacc tttcc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ggtccactct caatcactct cag
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
tttaaatatg tgaagctgag ttaatttatg
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aatgccattt attggtataa aaacc
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gagaagaaag taatgacaaa atacctg
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
aaattgcatg gtgaagtcag ttata
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
gtccgggagc catgccgtgt tcttcgacat t
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
cgacgcccgc tgatatggcc tccacaatat t
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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<400> 61
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ctcttccagc cttccttcct
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20
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<210> 62
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 62
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caccttcacc gttccagttt
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20
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<210> 63
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 63
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cgagatccct ccaaaatcaa
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20
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<210> 64
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 64
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tgagcttgac aaagtggtcg
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20
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<210> 65
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<211> 65
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 65
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<210> 66
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<211> 65
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 66
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<210> 67
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<211> 62
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 67
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<210> 68
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<213> Homo sapiens
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<400> 68
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<210> 69
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<211> 63
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 69
114
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<210> 70
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<211> 65
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<213> Homo sapiens
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<400> 70
115
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<210> 71
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<211> 65
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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116
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<210> 72
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 72
117
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<210> 73
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<211> 65
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 73
118
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<210> 74
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<211> 65
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 74
119
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<210> 75
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 75
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gtccgggagc catg
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14
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<210> 76
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<213> Homo sapiens
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<400> 76
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cgacgcccgc tgata
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15

Claims (37)

1. Procedimiento para determinar marcadores de estrés oxidativo en un grupo de individuos, que comprende las etapas de:
a.
la determinación del factor de riesgo de un estrés oxidativo en dicho grupo;
b.
la medición de la cantidad de al menos 10 marcadores diferentes de estrés oxidativo de una muestra obtenida de cada uno de dicho grupo de individuos; y
c.
la comparación de la cantidad de cada uno de dichos marcadores de estrés oxidativo con la cantidad de cada uno de dichos marcadores de estrés oxidativo medidos en un grupo de individuos sanos, determinando así los marcadores de estrés oxidativo que hayan aumentado o disminuido en dicho grupo de individuos portadores de un factor de riesgo de estrés oxidativo respecto a individuos sanos.
2. Procedimiento para la detección de estrés oxidativo en un individuo portador de un factor de riesgo de estrés oxidativo, que comprende:
a.
la determinación del factor de riesgo de estrés oxidativo de dicho individuo;
b.
la selección de al menos dos marcadores de estrés oxidativo que hayan aumentado o disminuido para dicho factor de riesgo respecto a individuos sanos; y
c.
la medición de la cantidad de al menos dos de dichos marcadores oxidativos de una muestra obtenida de dicho individuo.
3. Procedimiento según la reivindicación 2, que comprende además la etapa de evaluación del resultado en el contexto de dicho factor de riesgo.
4. Procedimiento según la reivindicación 2 ó 3, en donde se seleccionan no más de 22, preferiblemente no más de 15, más preferiblemente no más de 10, y el más preferible no más de 5 marcadores diferentes de estrés oxidativo.
5. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en donde el factor de riesgo se selecciona entre: una dieta desequilibrada; tabaquismo, exposición a un entorno tóxico, una intervención quirúrgica; actividad física intensa, y enfermedades que afecten a los riñones, pulmones, corazón, piel, cerebro, articulaciones, tracto gastrointestinal, ojos, vasos sanguíneos, glóbulos rojos, hígado y órganos múltiples.
6. Procedimiento según la reivindicación 5, en donde las enfermedades se seleccionan entre un transplante, glomerulonefritis, síndrome de insuficiencia respiratoria, asma, trombosis coronaria, quemaduras, exposición al sol, psoriasis, dermatosis, traumas, enfermedad de Parkinson, neurotoxinas, demencia, artritis reumatoide, diabetes, pancreatitis, endotoxemia, isquemia intestinal, cataratas, retinopatía, degeneración de la retina, aterosclerosis, anemia de Falconi, malaria, inflamación, reperfusión isquémica, toxicidad a los medicamentos, sobrecarga de hierro, deficiencias nutricionales, alcoholismo, radiación, cáncer, envejecimiento, infección por VHC y el SIDA.
7. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en donde el marcador de estrés oxidativo se selecciona a partir del grupo consistente de: antioxidantes, elementos traza, indicadores de estrés oxidativo, marcadores del metabolismo del hierro, homocisteína, enzimas con funciones antioxidantes, enzimas con funciones prooxidantes, enzimas reparadores del ADN, enzimas del metabolismo del glutatión, proteínas de estrés, proteínas implicadas en apoptosis, factores de transcripción, citoquinas y quimioquinas.
8. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el antioxidante se selecciona entre: la vitamina A, vitamina C, vitamina E, glutatión reducido (GSH)/glutatión oxidado (GSSG), tioles proteicos, glutatión peroxidasa o superóxido dismutasa.
9. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el elemento traza se selecciona entre el selenio, cobre y zinc.
10. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el indicador de estrés oxidativo se selecciona entre: anticuerpos contra la LDL oxidada, 8-hidroxi 2'-desoxiguanosina, mieloperoxidasa, glucosa y glioxal.
11. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el marcador del metabolismo del hierro se selecciona entre la transferrina, ferritina y ceruloplasmina.
12. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde los enzimas con función antioxidante se pueden seleccionar entre: la catalasa, superóxido dismutasa (SOD) que contiene Mn, la SOD que contiene cobre y zinc, la tiorredoxina-1, tiorredoxina reductasa-1, peroxirredoxina-1, metalotionina-1, L-ferritina, H- ferritina y el receptor de la transferrina, proteína antioxidante 2, ceruloplasmina, lactoferrina, selenoproteína P, selenoproteína W, frataxina, paraoxonasa sérica/arilesterasa 1, paraoxonasa sérica/arilesterasa 2 o paraoxonasa sérica/arilesterasa 3.
13. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde los enzimas con funciones prooxidantes se pueden elegir entre: la ciclooxigenasa-2, 5-lipoxigenasa, c-fosfolipasa A2, fosfolipasa A alfa, fosfolipasa D-1, mieloperoxidasa, óxido nítrico sintetasa, proteína reactiva C, elastasa, haptoglobina, NADH-citocromo b5 reductasa o diaforasa A1.
14. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el enzima reparador del ADN se puede seleccionar de 8-oxoguanina ADN glicosilasa.
15. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el enzima del metabolismo del glutatión se puede seleccionar entre la glutatión peroxidasa, fosfolípido hidroperóxido glutatión peroxidasa no-Se, fosfolípido, gama-glutamil cisteína sintetasa, y glucosa 6-fosfato deshidrogenasa, glutatión peroxidasa extracelular, glutatión peroxidasa, glutatión peroxidasa 2, glutatión peroxidasa 4, glutatión reductasa, glutatión S-transferasa, glutatión sintetasa, peroxirredoxina 1, peroxirredoxina 2, peroxirredoxina 3, peroxirredoxina 5, o tiorredoxina 2.
16. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde la proteína de estrés puede ser una proteína HSP, hemo oxigenasa-1, hemo oxigenasa-2, la proteína ORP150 regulada por oxígeno de 150 kDa, o HSP27 de kDa, HSP90A, HPS17, HPS40 o HPS110.
17. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde la proteína implicada en la apoptosis puede ser FasL, CD95, el receptor 1 del factor de necrosis tumoral, Bcl-2, GADD153, GADD45, RAD50, RAD51 B, RAD52, RAD54, p53 o el ligando Fas.
18. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde el factor de transcripción se selecciona entre NFkB-\alpha, C-Fos, C-jun, IkB-\alpha, monoamina oxidasa A, monoamina oxidasa B, receptor alfa activado por el proliferador de peroxisoma.
19. Procedimiento según la reivindicación 7, en donde la citoquina o la quimioquina se selecciona entre IL-1, IL-6, IL-8, IL-1 beta, IL-2 o la proteína asociada al receptor de TNF1.
20. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, cuando el factor de riesgo de dicho individuo es la hemodiálisis, el marcador oxidativo se selecciona del grupo de: catalasa, glucosa-6-fosfato deshidrogenasa, HSP70, 5-lipoxigenasa, vitamina C, glutatión peroxidasa, SOD, Se, peróxido lipídico, LDL oxidada y homocisteína.
21. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, cuando el factor de riesgo de dicho individuo es una intervención quirúrgica cardíaca, el marcador oxidativo se selecciona entre el grupo de superóxido dismutasa que contiene manganeso, c-fosfolipasa A2, H-ferritina, IL-8, óxido nítrico sintasa 2 (NOS2), vitamina C, vitamina E/colesterol, glutatión peroxidasa (GPx), anticuerpos contra la LDL oxidada y homocisteína.
22. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, cuando el factor de riesgo de dicho individuo es un ejercicio físico intenso, el marcador oxidativo se selecciona del grupo de vitamina E, vitamina E/colesterol, GSH, relación GSH/GSSG, el zinc, GPx, GSSG, relación cobre/zinc, anticuerpos contra la LDL oxidada y proteínas oxidadas.
23. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, cuando el factor de riesgo de dicho individuo es la fatiga debida a un ejercicio físico y a lesiones, el marcador oxidativo se selecciona del grupo de vitamina E, vitamina E/colesterol, GSH, relación GSH/GSSG, zinc, GPx, GSSG, relación cobre/zinc, anticuerpos contra la LDL oxidada y proteínas oxidadas.
24. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, cuando el factor de riesgo de dicho individuo es el tabaquismo, el marcador oxidativo se selecciona del grupo de vitamina C, Se, GPx, anticuerpos contra la LDL oxidada y homocisteína.
25. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, en donde la cantidad de marcador de estrés oxidativo está determinada por la medición de la concentración del marcador oxidativo.
26. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 1 a 19, en donde la cantidad se determina mediante la medición de la concentración del producto de transcripción del gen/ARNm que codifica el marcador oxidativo.
27. Procedimiento según la reivindicación 26, en donde la cantidad de por lo menos dos de dichos marcadores de estrés oxidativo se determina en paralelo.
28. Procedimiento según la reivindicación 27, en donde la cantidad de marcador de estrés oxidativo se calcula mediante el uso de un chip de ADN.
29. Procedimiento para la detección de estrés oxidativo en una muestra de sangre, caracterizado porque comprende: a. la extracción de ARNm de células de la muestra de sangre, b. la transcripción inversa de dicho ARNm en ADNc, con marcaje de estos compuestos de ADNc, c. la puesta en contacto de estos ADNc con una población de varios fragmentos sintéticos de ADN a fin de realizar una hibridación molecular entre el ADNc y dichos fragmentos sintéticos de ADN en el caso de la expresión del estrés oxidativo en las células, y la detección simultánea de las señales de dicha hibridación, las cuales corresponden a ciertos genes expresados, en donde la población de fragmentos sintéticos de ADN comprende al menos ciertos fragmentos de genes perteneciente a la familia de genes de marcadores de estrés oxidativo, seleccionados del grupo consistente en:
a.
enzimas con funciones antioxidantes, enzimas con funciones prooxidantes,
b.
enzimas reparadores del ADN.
c.
enzimas del metabolismo del glutatión,
d.
proteínas de estrés,
e.
proteínas implicadas en apoptosis,
f.
factores de transcripción.
g.
citoquinas,
h.
quimioquinas.
30. Procedimiento según la reivindicación 29, en donde dicha muestra de sangre es una preparación de linfocitos.
31. Procedimiento según la reivindicación 29 ó 30, caracterizado porque la puesta en presencia se realiza sobre un conjunto de chips de ADN que transporta dichos fragmentos sintéticos de ADN según una topografía específica.
32. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 29 a 31, caracterizado porque la población de fragmentos sintéticos de ADN está compuesta por oligonucleótidos de tamaño entre 25 y 100 pb.
33. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 29 a 32, caracterizado porque la población de fragmentos sintéticos de ADN está compuesta por productos de una amplificación enzimática (PCR) in vitro.
34. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 29 a 33, caracterizado porque la población de fragmentos sintéticos de ADN está compuesta por oligonucleótidos de tamaño entre 25 y 100 pb, y por productos que provienen de una amplificación enzimática (PCR) in vitro.
35. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 29 a 34, caracterizado porque la población de fragmentos sintéticos de ADN seleccionados comprende al menos dos genes, cada uno de los cuales pertenece a una familia distinta entre las familias precitadas.
36. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 29 a 35, caracterizado porque comprende además, antes de dicha extracción de ARNm, una exposición in vitro de células de la muestra de sangre a factores generadores de estrés oxidativo.
37. Procedimiento según cualesquiera de las reivindicaciones 29 a 36, caracterizado porque comprende en paralelo una cuantificación de marcadores de estrés oxidativo en sangre.
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