ES2295037T3 - Procedimientos que utilizan el sistema toxina/antitoxina bacteriana pard kis/pard kid para destruir celulas eucariotas. - Google Patents
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Abstract
Composición que comprende: (i) la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, o (ii) ácido nucleico que codifica la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, para su uso en un método terapéutico de inhibición de la proliferación celular y/o la progresión del ciclo celular llevado a cabo sobre un cuerpo humano o animal, comprendiendo el método proporcionar la toxina y la antitoxina a células eucariotas del cuerpo humano o animal, bajo control apropiado para la inhibición selectiva del ciclo celular y/o la muerte de células diana.
Description
Procedimientos que utilizan el sistema
toxina/antitoxina bacteriana ParD kis/ParD kid para destruir células
eucariotas.
La presente invención está relacionada con la
destrucción de células, o al menos impedir la progresión del ciclo
celular. Más particularmente está relacionada con procedimientos y
medios para atacar células eucariotas, como por ejemplo células
tumorales, con agentes citostáticos, citotóxicos y/o citopáticos.
Específicamente, la presente invención utiliza la toxina ParD kid y
la antitoxina ParD kis bajo control apropiado para la inhibición
selectiva del ciclo celular y/o la muerte de células diana.
Existen varias situaciones en las que resulta
deseable matar células, en particular matar selectivamente ciertas
células dentro de una población de células. En algunas situaciones
puede ser suficiente la inhibición del crecimiento o la
proliferación celular, por ejemplo impidiendo la progresión del
ciclo celular. Para simplificar, en el presente documento las
referencias a la muerte de células también incluyen dicha
inhibición, excepto cuando el contexto sugiera lo contrario.
Un importante campo de aplicación es el
tratamiento de tumores, cáncer, soriasis, arteriosclerosis y otros
desórdenes hiperproliferativos. Otras aplicaciones de las
realizaciones de la presente invención incluyen marcar cualquier
célula eucariota para matarla o al menos para inhibir su
crecimiento. Esto puede incluir el
"knock-out" de linajes celulares y la
ablación celular dirigida, por ejemplo en el control del desarrollo,
o en estudios de organogénesis. Las aplicaciones in vitro
incluyen el estudio del control de la replicación en células
procariotas y/o eucariotas, el cribado de un antídoto para una
toxina, o de una toxina inhibida por un antídoto, el diseño de
cribado para factores de toxina y/o antídoto mejorados, y el
análisis de respuestas fisiológicas de diferentes tipos celulares
para la inhibición de la progresión celular y/o la inhibición de la
replicación del ADN.
Las respuestas de defensa a patógenos en las
plantas incluyen la necrosis celular, por ejemplo favorecidas en un
lugar de infección o de entrada de un patógeno. La resistencia
inducida está estrechamente relacionada con la respuesta
hipersensible (RH), y la respuesta inducida está asociada con la
muerte celular localizada en lugares en los que ha habido intentos
de entrada de un patógeno. La hipótesis es que mediante la RH la
planta priva al patógeno de células hospedadoras vivas.
Muchos mecanismos de defensa vegetales son
inducidos de manera intensa en respuesta a la agresión de un
patógeno infructuoso. Tal inducción de resistencia mejorada puede
ser sistémica. Se cree que cuando una planta es agredida por un
patógeno al que es resistente, esta provoca una RH en el lugar del
intento de ingreso del patógeno incompatible. La RH inducida lleva
a la mejora sistémica y a la adquisición por la planta de
resistencia a los patógenos virulentos que normalmente causarían
enfermedades en la planta no agredida.
La inducción artificial de la muerte celular en
plantas se ha mostrado capaz de proporcionar resistencia a
patógenos, incluso en casos donde el mecanismo que induce la muerte
celular no está facilitada por ningún gen de resistencia patógena.
Por ejemplo, los genes que codifican sustancias que llevan a la
muerte celular súbita, por ejemplo BARNASE o la toxina de difteria,
pueden utilizarse para inducir los cambios que llevan a la
resistencia adquirida incluso cuando la muerte celular en estos
últimos ejemplos no está provocada por la activación de la
respuesta de defensa. BARNASE es una ribonucleasa de Bacillus
amyloliquifaciens (Hartley (1988)) J. Mol. Biol. 202:
913-915; Hartley (1989) Trends Biochem. Sci.
14:450-454) y existe una proteína correspondiente
llamada BARSTAR que inhibe el BARNASE formando un complejo con
él.
El empleo de realizaciones de la presente
invención en plantas puede usarse para generar protección contra
ataques de hongos, bacterias, virus o nemátodos.
Las plantas particularmente interesantes para su
utilización en las realizaciones de la presente invención incluyen
cereales, maíz, trigo, cebada, avena, arroz, Brassicas, curcubitas,
patatas, tomates, algodón, semilla de soja, y zanahoria.
Otro uso de realizaciones de la presente
invención en plantas incluye la generación de esterilidad en machos
(Mariani et al. Nature 357 384-387). Por ejemplo
puede introducirse una toxina o un sistema de toxinas según la
presente invención en plantas bajo las condiciones de control
apropiadas para la expresión específica del tapete de las anteras
(Seurinck et al. (1990) Nucleic Acids Res. 18:3403; Koltunow et
al. (1990) Plant Cell 2, 1201-1224; Mariani
et al (1990) Nature 347:737-741). La
esterilidad masculina en plantas facilita la generación de semillas
híbridas mediante la prevención de la autopolinización, permitiendo
a los técnicos agrónomos aprovechar el llamado "vigor híbrido"
mediante el cual los cruces entre cepas de plantas cruzadas a
menudo resultan en una progenie con un mayor rendimiento y una
resistencia mejorada a las enfermedades. Disponer de plantas de
horticultura u ornamentales sin la capacidad de generar polen puede
utilizarse para reducir problemas alérgicos de los habitantes o por
razones estéticas (por ejemplo, en los lirios, donde los pistilos
en la actualidad deben eliminarse a mano).
Un uso adicional en plantas es la generación de
la ausencia de semillas, a menudo deseable por comodidad y sabor
cuando se producen, por ejemplo, sandias, uvas, naranjas y frutas
relacionadas, tomates, pimientas, pepinos y demás. La toxina puede
colocarse bajo el control de regulación de un promotor específico
para semillas, como por ejemplo el promotor de una proteína de
almacenamiento de semillas (Higgins et al, (1984) Ann. Rev.
Plant. Physiol. 35: 191-221; Goldberg et al
(1989) Cell 56:149-160). Los ejemplos de promotores
específicos de semillas incluyen los de la
\beta-faseolina de semilla
(Sengupta-Gopalan et al, (1985) PNAS US
82:3320-3324), lectina de semilla (Voelker et
al (1987) EMBO J. 6:3571-3577), lectina de
semilla de soja (Ocamuro et al. (1986) PNAS USA
83:8240-8344), napina de colza (Radke et al.
Theor. Appl. Genet. 75:685-694), zeína del maíz
(Hoffman et al (1987) EMBO J. 6:3213-3221),
\beta-hordeina de cebada (Marris et al
(1988) Plant Mol. Biol. 10:359-366) y glutenina de
trigo (Colot et al. (1987) EMBO J.
6:3559-3564).
Los plásmidos procariotas han desarrollado
diferentes sistemas genéticos que incrementan su mantenimiento
estable en hospedadores bacterianos. Estos sistemas se clasifican en
dos tipos diferentes: sistemas de partición, que aseguran un
reparto bien controlado de las copias de ADN plasmídico entre las
dos células hijas, y los sistemas asesinos, que eliminan de la
población bacteriana aquellas células hijas que han perdido el
plásmido durante la división (Yarmolinsky, Science (1995) Feb
10,267 (5199):836-7). Estos últimos están formados
de dos componentes: una toxina bacteriana (siempre una proteína), y
su antídoto (una proteína o un ARN antisentido que inhibe la
transcripción de su compañero asesino) (Jensen y Gerdes, Mol.
Microbiol. (1995) Jul. 17 (2):205-10; Thisted et
al. J. Mol. Biol. (1992). Jan. 5 223 (1):41-54).
Estos sistemas asesinos generalmente están organizados de manera
similar desde un punto de vista molecular, y varios mecanismos
aseguran que un sistema asesino normal no esté activado si la
estabilidad del plásmido que lo contiene no está en compromiso. Así,
tanto el antídoto proteico como los componentes tóxicos se
organizan en un operón bicistrónico, y el sistema está diseñado a
nivel molecular de manera que tanto los procesos transcripcionales
como traduccionales están optimizados para mantenerlo en estado
latente (es decir, en un estado en el que el componente tóxico se
neutraliza con su antídoto) (Jensen y Gerdes, Mol. Microbiol.
(1995) Jul 17 (2):205-10; Holcik and Iyer,
Microbiology (1997), 143:3403-3416).
En circunstancias normales, los dos componentes
de un sistema asesino se sintetizan en el hospedador mediante el
plásmido que los contiene a un nivel basal, permitiendo que el
hospedador sobreviva. Si después de la división celular aparece una
bacteria segregante (es decir, una bacteria que ha perdido el
plásmido), otra de las características de estos sistemas permite la
activación del proceso de muerte con el objetivo de señalar esa
célula específica: es decir, la estabilidad del antídoto es menor
que la toxina. Así, sin una síntesis continua del antídoto, su
degradación preferente lleva a la aparición de una toxina no
neutralizada que en ese momento es capaz de aplicar su efecto letal
sobre el hospedador. Este efecto tóxico puede aplicarse sobre
dianas celulares diferentes, dependiendo del sistema asesino
específico, por ejemplo replicación dependiente de DnaB (parD,
pem), complejo ADN-girasa (ccd), inhibición de la
síntesis de proteínas (KicB), y formación de septum (kil), (para
referencias ver Holcik y Iyer, Microbiology (1997), 143,
3403-3416). En Science, Vol. 267 (1995),
Yarmolinsky describe otras "moléculas adictivas" putativas como
los enzimas de restricción tipo II (toxinas putativas) Pae R7 y
EcoRI, y sus metilasas conocidas, que mejoran la estabilidad
aparente de sus plásmidos de unión (la referencia original para
estos módulos de adicción está en Naito et al. Science
267:897 (1995)). Yarmolinsky también describe en este trabajo una
pareja de sistemas asesinos putativos a partir del bacteriófago
lambda (proteína Rex) y una pareja de cadenas de E. coli que
tienen el clúster de genes prr, que codifica una nucleasa anticodón
que puede activarse mediante un polipéptido de 26 residuos del
bacteriófago T4 y que a continuación rompe un ARN de transferencia
importante para la incorporación de lisina a las proteínas. T4 es
invulnerable a esta proteína porque codifica una pareja de proteínas
no esenciales en otras situaciones que reparan el daño. También
describe cadenas de E. coli que tienen el profago e14
defectuoso, y que consigue la exclusión por rotura del factor de
elongación Tu e inhibe la traducción de manera global.
ParD es uno de esos sistemas asesinos (Bravo
et al. Mol. Gen. Genet. (1987) Nov. 210
(1):101-10; Bravo et al. Mol. Gen. Genet.
(1988). Dec. 215 (1):146-51). Está codificado
mediante un plásmido R1 Gram negativo y está compuesto de dos
genes: kis (como supresor letal) y kid (como determinante letal) que
codifican el antídoto (10 KDa) y la toxina (12 KDa)
respectivamente. ParD es un sistema asesino críptico que está
estrechamente regulado para evitar su activación bajo condiciones
que no comprometan la estabilidad de R1. Así, está controlado por
transcripción acoplada (Ruiz- Echevarria et al. Mol.
Microbiol. (1991) Nov. 5 (11): 2685-93), mediante
el procesamiento post-transcripcional de su ARNm
bicistrónico (Ruiz-Echevarria et al. Mol.
Gen. Genet. (1995) Sep. 20 248 (5):599-609),
mediante traducción solapada (Ruiz-Echevarria et
al. Mol. Gen. Genet. (1995) Sep. 20 248
(5):599-609), y mediante una interacción intensa
entre Kis y Kid para formar un complejo no tóxico que, a la vez, es
capaz de reprimir la transcripción de su propio promotor (Ruiz-
Echevarria et al. Mol. Microbiol. (1991) Nov. 5
(11):2685-93). La organización genética de ParD
favorece la transcripción acoplada, la traducción solapada y la
modificación post-transcripcional de algunos de los
ARNm obtenidos. Los complejos Kis/kid reprimen la transcripción de
los genes Kis y Kid.
Se han descrito homólogos de ParD, al menos en
el plásmido R100 (sistema pem) (Tsuchimoto et al. J.
Bacteriol. (1988) Apr. 170 (4):1461-6; Tsuchimoto
et al. J. Bacteriol. (1992) Jul. 174
(13):4205-11; Tsuchimoto et al. Mol. Gen.
Genet. (1993) Feb. 237 (1-2):
81-88); Masuda et al. J. Bacteriol. (1993)
Nov. 175 (21): 6850-6) y en cromosomas de E.
coli (sistemas ChpA y ChpB) (Tsuchimoto et al. Mol. Gen.
Genet. (1993) Feb. 237 (1-2):81-88).
Se han encontrado otros mediante la búsqueda en bases de datos.
Kid inhibe la iniciación de la replicación del
genoma de E. coli y de plásmidos DnaB de replicación
dependiente (es decir, la helicasa principal de E. coli)
(Ruiz-Echevarria et al. J. Mol. Biol. (1995)
Apr. 7 247 (4):568-77), y la
sobre-expresión de los últimos minimiza el efecto
tóxico del primero en el organismo in vivo
(Ruiz-Echevarria et al. J. Mol. Biol. (1995)
Apr. 7 247 (4): 568-77), sugiriendo que el DnaB está
involucrado en el mecanismo de inhibición por Kid. Observaciones
recientes en el laboratorio de los inventores sugieren de manera
muy clara que esta inhibición no es debida a la separación en
solución de los complejos hexaméricos de DnaB ni a la inhibición de
su actividad helicasa sobre una amplia variedad de sustratos
incluyendo oriC, el origen de replicación del genoma de E.
coli. Sin pretender limitar la invención a causa de suposiciones
teóricas, puede ser que la carga del origen de replicación con DnaB
sea el proceso inhibido por Kid, ya sea por interacción directa
entre ellos y/o mediados a través de un tercer componente (ADN o
proteína) no descrita todavía. Actualmente, la investigación está
enfocada a la identificación del mecanismo exacto de acción de Kid
desde un punto de vista molecular.
Antes del trabajo de los inventores descrito en
el presente documento no era obvio que los sistemas procariotas que
han evolucionado para funciones específicas en bacterias podían
tener función en células eucariotas.
Por ejemplo, en un sistema asesino de dos
componentes como el que implica a Kis/Kid, ambos componentes
necesitan ejercer sus funciones respectivas - la toxina matar
células en ausencia de antídoto (o cuando el antídoto está presente
en exceso), y el antídoto tanto para neutralizar la toxina como para
controlarla, por ejemplo mediante un mecanismo que implica un
recambio rápido. Preferiblemente, la toxina no tiene ningún efecto
secundario en la viabilidad de la célula. En cambio, la muerte
celular preferiblemente es través de un mecanismo programado de
muerte celular tal como la apoptosis. En plantas puede que sea
preferible para ciertas aplicaciones inducir una respuesta
necrótica, por ejemplo inducir o mejorar la resistencia
patógena.
Los presentes inventores han mostrado que la
toxina bacteriana y el antídoto son funcionales en células
eucariotas, levaduras, Xenopus y células de mamífero (en
particular de humano), y puede controlarse para inhibir la
progresión del ciclo celular y la proliferación celular y para matar
células. En los experimentos descritos más adelante se muestra que
las células pueden matarse mediante apoptosis.
La Figura 1 muestra los resultados de los
experimentos que muestran que un promotor inducido por Curl
utilizado más tarde para el control de la expresión del antídoto
Kis y un promotor diferente reprimido por metionina utilizado más
tarde para el control de la expresión de la toxina Kid son
funcionales en S. cerevisiae. La gráfica muestra unidades de
actividad \beta-galactosidasa a diferentes
concentraciones (\muM) de los factores de regulación Cu^{2+}
(círculos claros) y Met (círculos oscuros).
La Figura 2 muestra los resultados de los
experimentos que demuestran el efecto de la doxiciclina sobre la
actividad del promotor regulable de tetraciclina (Tet Pr) en células
HeLa (barras claras), este promotor utilizado más tarde para el
control de la expresión del antídoto Kis (en el vector
pTRE-Luc), y en ausencia de efecto de la
doxiciclina en la actividad del promotor temprano de citomegalovirus
(CMV Pr) (barras oscuras), siendo este promotor utilizado más tarde
para el control de la expresión de la toxina Kid
(pCMV-Luc). La actividad luciferasa está dibujada
en unidades arbitrarias.
La Figura 3 muestra varios constructos
utilizados para la expresión de Kis y/o Kid en células HeLa.
La Figura 4 muestra los resultados de los
experimentos en los que la expresión de kis se moduló mediante
doxiciclina en cultivos de células HeLa transfectadas establemente
con pNATHAIi y pNATHA2i (Figura 3). La expresión de Kid se controló
mediante CMV Pr la cual no está afectada por la doxiclina.
La Figura 5 muestra los resultados de los
experimentos (número de células muertas) en los que la expresión de
kis se moduló mediante doxiciclina en cultivos de células HeLa
transfectadas establemente con pNATHAIi y pNATHA2i (Figura 5). La
expresión de Kis se controló mediante Tet Pr que no está afectada
por la doxiciclina, mientras que la expresión de kid se controló
mediante CMV Pr que no está afectado por la doxiciclina.
La Figura 6 muestra la aparición del marcador de
apoptosis anexina V en células sujetas a los experimentos de los
que se muestran los resultados en la Figura 5, mostrando que la
muerte celular causada por Kid implica apoptosis.
De acuerdo con un aspecto de la presente
invención se proporciona una composición que comprende:
- (i)
- la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, o
- (ii)
- ácido nucleico que codifica la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis,
para su uso en un método
terapéutico de inhibición de la proliferación celular y/o de la
progresión del ciclo celular que se lleva a cabo sobre un cuerpo
animal o humano, comprendiendo el método proporcionar la toxina y
la antitoxina a las células eucariotas del cuerpo humano o animal,
bajo el control apropiado para la inhibición selectiva del ciclo
celular y/o para matar las células
diana.
Según un segundo aspecto de la invención, uso de
una composición que comprende:
- (i)
- la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, o
- (ii)
- ácido nucleico que codifica la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis,
en la fabricación de una
composición medicamentosa para su uso en un método terapéutico de
inhibición de la proliferación celular y/o la progresión del ciclo
celular llevado a cabo sobre el cuerpo humano o animal,
comprendiendo el método proporcionar la toxina y la antitoxina a las
células eucariotas en el cuerpo humano o animal, bajo el control
apropiado para la inhibición selectiva del ciclo celular y/o la
muerte de las células
diana.
Un tercer aspecto de la invención es un método
de inhibición de la proliferación celular y/o la progresión del
ciclo celular, comprendiendo el método proporcionar la toxina ParD
kid y la antitoxina ParD kis a las células eucariotas bajo el
control apropiado para la inhibición selectiva del ciclo celular y/o
la muerte de las células diana, donde las células son in
vitro y/o son células vegetales.
En aspectos de la presente invención
preferiblemente se utilizan algunas medidas de control de la acción
de la toxina. Los sistemas bacterianos de muerte celular que se
utilizan en la presente invención de manera natural utilizan la
antitoxina PaD kis. Los presentes inventores han mostrado que ambas
toxinas y antitoxinas son funcionales en varias células eucariotas
y que sus respectivas actividades pueden controlarse para la
inhibición selectiva de la proliferación celular o para impedir la
progresión del ciclo celular, y/o la inducción de la muerte celular
programada.
El sistema bacteriano de muerte celular
utilizado en la presente invención comprende una toxina y una
antitoxina que son proteínas. Tales sistemas asesinos se denominan
en el estado de la técnica "sistema proteico genético asesino"
- Jensen & Gerdes, 1995, Mol. Microbiol. (1995) Jul 17
(2):205-10). El sistema asesino bacteriano
utilizado en la invención es un sistema E. coli.
Ejemplos de sistemas bacterianos asesinos (para
referencias ver, Holcik y Iyer (1997), Microbiology,
143:3403-3416 y sus referencias, y "Horizontal
Gene Pool: Bacterial Plasmids and Gene Spread" (1999), Ed. C M
Thomas, Howard Academic Publishers, capítulo 2), incluyen un sistema
de genes asesinos proteicos con plásmido bacteriano terminal (en
inglés "bacterial plasmid-borne proteic killer
gene system") como por ejemplo ParD (o R1 u homólogos como
se describe arriba) ccdA (H o let A) del plásmido F (antídoto) y
toxina ccdB (G, letB o letD) que actúa envenenando complejos
ADNgirasa (Jaffé, et al. (1985), Bacteriol,
163:841-849) nótese que el sistema ParD es
notablemente similar a aquél del sistema Ccd), la proteína tóxica
del bacteriófago P1 Doc con antídoto Phd (Lehnherr, et al.
(1993), Mol. Biol., 233:414-428), parDE del plásmido
RK2 (Roberts et al., 1994 J. Mol. Biol. 268,
27109-27117), con proteína tóxica ParE y antídoto
ParD, y hig del plásmido Rtsl (Tian et al., 1996, Biochem
biophys Res Commun 220 280-284) con antídoto higA
para toxina higB.
Ejemplos adicionales de sistemas bacterianos
asesinos donde el antídoto natural es un ARN antisentido incluyen
parB del plásmido R1 (Gerdes, et al., (1990a), New Biol,
2:946-956) con toxina Hok y antídoto Sok (Thisted
et al, 1994, EMBO J. 13, 1950-1959; el ARNm
de hok es muy estable pero el ARN de sok se desvanece muy
rápidamente), srnB (Onishi, (1975), Science,
187:257-258) flm (Loh, et al. (1988), Gene,
66:259-268) del plásmido F y pnd tanto de plásmido
R483 Incl como de plásmido R16 IncB (Akimoto y Ohnishi (1982),
Microbiol. Immunol., 26: 779-793), relF del operón
cromosómico relB de E. coli (la inducción del gen relF lleva
a la misma respuesta fisiológica que la expresión del gen hok -
Gerdes, et al. (1986a), EMBO J. 5:2023-2029),
homólogos relB (Gronlund y Gerdes, 1999, J. Mol. Biol. 285,
1401-1415) y Gef (también cromosómico) que es
estructural y funcionalmente similar a las proteínas codificadas
por hok y reIF (Poulsen, et al. (1989), Mol. Microbiol.,
3:1463-1472). La proteína Gef es tóxica y está
regulada mediante el ARN antisentido Sof.
Sistemas adicionales incluyen el operón epsilon
SegB (antídoto) y zeta (toxina) de pSM19035 y pDB101 (Ceglowski
et al. (1993) Mol. Gen. Genet. 241
(5-6):579-85; Ceglowski et
al. (1993) Gene 136 (1-2):1-12),
kicA (antídoto) y kicB (toxina) que se encuentran en el cromosoma
de E. coli (Feng, et al. (1984), Mol. Gen. Genet.,
243:136-147), y los sistemas kil/kor transportados
por plásmidos bacterianos de los grupos de incompatibilidad P: y N.
Ver Holcik y Iyer (Microbiology (1997)
143:3403-3416) para ejemplos y referencias. Ver
también Jensen y Gerdes (Mol. Microbiol. (1995) 17(2),
205-210) y Yarmolinsky (Science, (1995) 267,
836-837) para resúmenes de sistemas de sistemas
asesinos proteicos genéticos con sorprendentes similitudes tanto en
la estructura como en la función.
La toxina ParD Kid se utiliza en la presente
invención con el respectivo antídoto, la antitoxina ParD kis. Como
se describe en el presente documento, adicionalmente la toxina puede
emplearse con uno o más de otros elementos que inhiben o bloquean
su actividad (lo cual puede ocurrir mediante la inhibición o el
bloqueo de su producción).
Tanto la toxina como el antídoto se introducen
en las células eucariotas bajo el control apropiado de la
inhibición selectiva del ciclo y/o la muerte celular.
Un procedimiento de la invención puede incluir
proporcionar toxina ParD kid y antitoxina ParD kis a células
eucariotas y, en las células diana, eliminar o inhibir la antitoxina
para permitir que la toxina actúe. La producción o actividad de la
antitoxina puede inhibirse o bloquearse. Esto puede conseguirse
proporcionando un estímulo apropiado, por ejemplo una molécula
inductora o represora de un promotor que controla la producción de
antitoxina, o puede ocurrir bajo condiciones que sean predominantes
en las células diana. Tal como se discute a continuación, como
estímulo de control puede usarse la presencia de una forma diferente
de una proteína, como por ejemplo p53, en las células dianas frente
a las células no diana (por ejemplo, en las células p53 tumorales y
no tumorales). Puede proporcionarse una molécula inductora o
represora a las células diana para inhibir o bloquear la antitoxina
y/o sobre-regular ("upregulate") la
toxina.
Generalmente, el sistema de muerte celular es
proporcionado a las células mediante el ácido nucleico que codifica
los componentes relevantes y, cuando sea aplicable, elementos de
control (como se discute a continuación).
Los elementos de control pueden incluir
cualquiera, o más de uno, de los disponibles en la técnica que
permita la variación selectiva de la relación entre la toxina y la
antitoxina. Los ejemplos incluyen un promotor que pueda inducirse,
reprimirse, o que constitutivo, constructos antisentido y sus
activantes o represores, ribozimas, secuencias de unión y factores
de unión, sistemas recombinantes (por ejemplo,
Cre-lox o FLP); sitios internos de entrada al
ribosoma (IRES), naturales o modificados, (Schmid y Wimmer (1994),
Arch. Virol. Suppl., 9:279-89; Borman, et
al. (1994), EMBO J., 1:13 (13):3149-57) e
inhibidores IRES como por ejemplo ARN de una levadura que inhibe la
entrada de los ribosomas a ciertos IRES (Das, et al. (1996),
J. Virol., 70(3):1624-32; Das et al.
(1998), J. Virol., 72 (7):6638-47; Das, et
al. (1998), Front Biosci., 1:3:D1241-52;
Venkatosan, et al. (1999), Nucleic Acids Res.
15:27(2):562-72), elementos que permiten la
interferencia transcripcional entre promotores (Greger y Proudfoot
(1998), 17:17(16):4771-9; Eggermont y
Proudfoot (1993), EMBO J., 12(6):2539-48;
Bateman y Paule (1998), Cell,
23:54(7):985-92; Ponnambalam y Busby (1987),
FEBS Lett., 9:212 (1):21-7; Greger, et al.
(1998), Nucleic Acids Res., 1:26 (5):1294-301),
intrones proteicos (Chong et al. (1996) J. Biol Chem
271(16):22159-68).
Puede proporcionarse un vector eucariota, que
comprende ácido nucleico que codifica una toxina o un sistema de
muerte celular, tal como se ha descrito. Tal vector puede usarse
para proporcionar la toxina o el sistema de muerte celular a
células eucariotas.
El ácido nucleico que codifica una toxina
bacteriana y un antídoto puede proporcionarse como parte de un
vector o vectores apropiados para la transformación de células
eucariotas. Preferiblemente el vector es apropiado para la
transformación de células diana, puede ser apropiado por ejemplo
para la transformación de células vegetales (por ejemplo un vector
Agrobacterium). Cuando se emplean dos componentes de un sistema de
muerte celular bacteriano, o una toxina y un elemento de regulación
específicamente diseñado (por ejemplo, antisentido o ribozima), se
proporcionan preferiblemente en el mismo vector ambos componentes y
los elementos reguladores para el control de la expresión, aunque
pueden proporcionarse en vectores separados. Cada una o ambas
secuencias de codificantes de nucleótidos pueden estar bajo el
control transcripcional de un promotor específico y/o regulable.
Pueden proporcionarse secuencias de codificación de la toxina y el
antídoto que están orientadas cola a cola o invertidas, u
orientadas cabeza a cola.
Preferiblemente, por ejemplo en levadura, el
ácido nucleico que codifica la toxina se proporciona en un plásmido
multicopia, tal como, para levaduras 2 \mu (Christianson, et
al. (1992), Gene, 2:110 (1):119-22), para
células de mamífero un vector que incluye oriP del virus Epstein
Barr (que puede estar acompañado por la proteína de iniciación
EBNA1 Kirchmaier y Sugden (1995), J. Virol., 69
(2):1280-3; Wendelburg y Vos (1998), Gene Ther.,
Oct:5(10):1389-99), o el origen del virus
papiloma bovino (que necesita también dos proteínas víricas
codificadas para ser activas (Piirsoo, et al. (1996), EMBO
J., 2:15 (1):1-11), o un vector vírico.
Los vectores monocopia apropiados para la
presente invención incluyen, para levadura, ARS1 y ARSH4/CEN6
(Sikorski y Hieter (1986), Genetics, 122 (1):19-27;
Mumberg, et al. (1995), Gene,
14:156(1):119-22).
Los vectores apropiados pueden escogerse o
construirse conteniendo las secuencias reguladoras apropiadas,
incluyendo secuencias de promotor, fragmentos de terminación,
secuencias de poliadenilación, secuencias de potenciador, genes
marcadores y otras secuencias apropiadamente. Los vectores pueden
ser plasmídicos y/o virales y mantenerse en células como episomas o
integrados en el genoma. Para más detalles ver, por ejemplo,
Molecular Cloning: a Laboratory Manual: 2nd edition, Sambrook et
al., 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press. Muchas de las
técnicas conocidas y de los protocolos de manipulación de ácidos
nucleicos, por ejemplo en la preparación de constructos de ácido
nucleico, mutagénesis, secuenciación, introducción de ADN en células
y expresión génica, y análisis de proteínas, se describen en
detalle en Short Protocols in Molecular Biology, Second Edition,
Ausubel et al. eds., John Wiley & Sons, 1992.
Según la presente invención, la toxina ParD kid
y la antitoxina ParD Kis se pueden proporcionar a una célula
eucariota seleccionada entre mamífera, humana o no humana como por
ejemplo de conejo, de cerdo de guinea, de rata, de ratón u otro
roedor, gato, perro, cerdo, cordero, cabra, vacuno o caballo, ave,
como por ejemplo pollo, levadura, hongo, anfibio, pez, gusano, y
plantas. Las plantas que pueden utilizarse en la presente invención
ya se han indicado arriba.
Puede proporcionarse una célula eucariota que
comprende ácido nucleico que codifica una toxina bacteriana o un
sistema de muerte celular tal como se describe en el presente
documento, bajo el control de regulación apropiado. El ácido
nucleico puede estar integrado en el genoma (por ejemplo cromosoma)
de la célula. La integración puede estar promovida por la inclusión
de secuencias que promueven la recombinación con el genoma, según
las técnicas comunes. El ácido nucleico puede estar en un vector
extra-cromosómico dentro de la célula.
Un método de la invención puede comprender
introducir el ácido nucleico en una célula eucariota. La
introducción, que puede denominarse de manera general, sin que
suponga una limitación, como "transformación" (en particular
para la introducción in vitro), puede utilizar cualquier
técnica disponible. Para células eucariotas, las técnicas
apropiadas pueden incluir la transfección con fosfato de calcio,
dextrano DEAE, electroporación, transfección mediada por liposoma y
transducción utilizando retrovirus u otros virus, por ejemplo
vaccinia o, para células de insectos, baculovirus.
La introducción puede seguirse provocando o
permitiendo la expresión del ácido nucleico, por ejemplo cultivando
las células (que pueden comprender células realmente transformadas
aunque se prefiere que las células sean descendientes de las
células transformadas) bajo las condiciones para la expresión de uno
o más de los componentes del sistema, de manera que se produzca un
producto codificado. Las condiciones pueden facilitar la muerte
celular (o la inhibición de la progresión del ciclo celular, del
crecimiento o la proliferación celular, etc.), y/o la
neutralización del efecto tóxico cuando sea apropiado.
La introducción de ácido nucleico puede darse
in vivo mediante terapia génica, tal como se discute más
adelante. Una célula que contiene ácido nucleico codificando un
sistema de acuerdo con la presente invención, por ejemplo como
resultado de la introducción del ácido nucleico en la célula o en un
ancestro de la célula y/o la alteración genética de la secuencia
endógena de la célula o del ancestro (que puede introducirse o
alterarse in vivo o ex vivo), puede estar comprendida
en un organismo que sea animal, en particular mamífero, que puede
ser humano o no-humano, levadura, hongo, anfibio,
pez, gusano o planta, con los ejemplos ya indicados anteriormente.
También se proporcionan animales genéticamente modificados o
transgénicos, pájaros o plantas que comprenden dichas células.
Así, puede proporcionarse un animal
no-humano con ácido nucleico que codifica un sistema
bacteriano de muerte celular en su genoma (como se ha descrito). El
animal puede ser un roedor, por ejemplo un ratón, y puede
proporcionar un modelo animal para la investigación de aspectos del
control del ciclo celular, la muerte celular, la apoptosis u otros
procesos celulares, y el cribado de fármacos.
También puede proporcionarse una planta con
ácido nucleico que codifica un sistema bacteriano de muerte celular
en su genoma, una célula vegetal (que puede estar en cultivo, por
ejemplo un cultivo en callo, o comprendida en una planta o en una
parte de una planta), o una parte de una planta (por ejemplo, fruto,
hoja, semilla u otro propágulo).
Para la generación de material vegetal que
comprende ácido nucleico que codifica un sistema bacteriano de
muerte celular tal como se ha descrito, puede emplearse cualquier
medio de transformación apropiado. La transformación Agrobacterium
es ampliamente utilizada por el experto en la materia para
transformar tanto especies de dicotiledóneas y monodicotiledóneas.
Cuando la Agrobacterium es ineficiente o inefectiva, son preferidos
el bombardeo con microproyectiles, la electroporación y la captación
directa de ADN. Alternativamente, puede utilizarse una combinación
de diferentes técnicas, por ejemplo bombardeo con micropartículas
recubiertas con Agrobacterium o bombardeo con micropartículas para
inducir la penetración seguida del co-cultivo con
Agrobacterium. A continuación de la transformación, se puede
regenerar una planta, por ejemplo a partir de una célula, tejido de
callo o discos de hojas, como es conocido en la técnica. Casi la
totalidad de las plantas pueden regenerarse a partir de células,
tejidos y órganos de la planta.
Cuando se utiliza una toxina bacteriana de
muerte celular existen varias estrategias para controlar su
actividad. Generalmente, se utiliza el antídoto relevante para
neutralizar el efecto tóxico a menos que se desee la toxicidad o se
llegue al nivel de toxicidad deseado. Así, por ejemplo, tanto la
toxina como el antídoto pueden expresarse en células normales,
infra-regulando (downregulating) la producción del
antídoto en las células diana (por ejemplo las células tumorales).
La producción de la toxina puede infra-regularse en
las células normales y/o sobre-regularse en las
células diana. La producción de antídoto puede
sobre-regularse en las células normales y/o
infra-regularse en las células diana.
La sobre-regulación de la
producción de toxina y/o antídoto, dependiendo del contexto, puede
conseguirse de varios modos. Una aproximación preferida es emplear
un promotor u otro elemento regulador que pueda inducirse bajo
determinadas condiciones, permitiendo el control de la expresión
mediante la aplicación de un estímulo apropiado.
Puede emplearse un promotor tumoral específico
como el promotor ARN telomerasa. En plantas pueden utilizarse
promotores nematodos inducibles como TobRB7 (Opperman et al.,
Science 263:221-223) y PRP1 (proteína relacionada
con la patogénesis - ver, por ejemplo, Payne et al. (1989)
Plant Molecular Biology 12:595-596; también,
Memelink et al. (1990) Plant Molecular Biology
14:119-126 y Payne et al. (1990) Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 87:98-102).
La infra-regulación de la toxina
y/o el antídoto, de nuevo dependiendo del contexto, también puede
conseguirse mediante la regulación de la expresión génica utilizando
un promotor apropiado u otro elemento regulador, incluyendo un
elemento represor, como por ejemplo Tet.Pr. Otras aproximaciones que
pueden utilizarse incluyen la regulación antisentido y los
ribozimas (descrito más ampliamente más adelante).
Así, por ejemplo, la producción de antídoto
puede infra-regularse mediante la producción de un
transcrito antisentido o ribozima. El transcrito antisentido o
ribozima puede generarse mediante la aplicación de un estímulo
apropiado, y puede generarse mediante la expresión a partir de una
secuencia bajo el control transcripcional de un promotor inducible
u otro elemento regulador.
Por "promotor" se entiende una secuencia de
nucleótidos a partir de los cuales se puede iniciar la
transcripción de ADN unido operativamente en el sentido 3' (es
decir, en la dirección 3' de la cadena sentido del ADN de doble
cadena).
"Unido operativamente" significa que forma
parte de la misma molécula de ácido nucleico, posicionado y
orientado convenientemente para que la transcripción se inicie desde
el promotor. El ADN unido operativamente a un promotor está "bajo
la regulación de iniciación transcripcional" del promotor.
El término "inducible" referido a un
promotor es bien entendido por el experto en la materia. En esencia,
la expresión que se encuentra bajo el control de un promotor
inducible se "provoca" o se aumenta en respuesta a la
aplicación de un estímulo (que puede generarse en el interior de la
célula o proporcionarlo de manera exógena). La naturaleza de los
estímulos varía entre promotores. Algunos promotores inducibles
provocan niveles de expresión bajos o indetectables (o no provocan
expresión) en ausencia del estímulo apropiado. Otros promotores
inducibles provocan una expresión constitutiva detectable en
ausencia del estímulo. Sea cual sea el nivel de expresión en
ausencia del estímulo, la expresión de cualquier promotor inducible
se incrementa en presencia del estímulo correcto. La situación
preferida es cuando al aplicar el estímulo apropiado, el nivel de
expresión aumenta en una cantidad efectiva para proporcionar el
resultado deseado. Así, puede utilizarse un promotor inducible (o
"switchable") que provoca un nivel de expresión basal en
ausencia del estímulo que es demasiado bajo para dar el resultado
deseado (e incluso puede ser cero). A partir de la aplicación del
estímulo, la expresión se incrementa (o se conecta) hasta un nivel
que lleva al resultado
deseado.
deseado.
Los ejemplos de promotores inducibles para su
uso en aspectos de la presente invención incluyen un promotor
mínimo, tal como un promotor CMV mínimo, fusionado a un potenciador
para la activación de p53 de tipo natural o la represión del
mutante p53 tanto en el caso de que lleve la secuencia de unión de
ADN de consenso para el p53 de tipo natural, por ejemplo el
fragmento A (Kern, et al. (1991), Science, 252
(5013):1708-11) o CON (Chen, et al. (1993),
Oncogene, 8 (8):2159-66), como si no, por ejemplo
HIV 1-LTR (Subier, et al. (1994), J. Virol.,
68 (1):103-10; Gualberto y Baldwin (1995), J. Biol.
Chem., 25:270 (34):19680-3; Sawaya, et. al.
(1998), J. Biol. Chem., 7:273 (32):20052-7, se han
estudiado promotores inducibles o reprimibles tales como Tet Pr y
la galactosa activable GAL10-CYC1.Los promotores
apropiados para plantas incluyen el promotor inducible
GST-II del maíz (Jepson et al. (1994). Plant
Molecular Biology 26:1855-1866), promotor inducido
por alcohol (por ejemplo alcr - ver, por ejemplo, Gatz (1998)
Nature Biotechnology 16:140), y el promotor génico del virus 35S
del mosaico de la coliflor (CaMV 35S) que se expresa a niveles muy
altos en prácticamente todos los tejidos vegetales (Benfey et
al, (1990) EMBO J 9:1677-1684).
Como se indica, la producción de toxina puede
infra-regularse en las células no diana mediante el
uso de elementos para el control de la expresión. Alternativa o
adicionalmente a la infra-regulación se puede
utilizar ácido nucleico antisentido o ribozimas. Una o más de estas
aproximaciones pueden utilizarse adicionalmente al uso de la
antitoxina para neutralizar la actividad de la toxina. Como se ha
descrito, puede controlarse la propia producción de la toxina.
En una de las aproximaciones preferidas, la
selectividad por la expresión de la toxina en el interior de las
células diana según la presente invención está determinada por la
combinación de (i) la sobre-regulación de la
producción de la toxina en las células diana y (ii) la
infra-regulación de la producción de toxina en las
células no diana y/o la neutralización de la actividad de la toxina
en las células no diana (por ejemplo mediante la
sobre-regulación de la producción de antídoto en las
células no diana). El efecto (i) mediará la actividad deseada en
las células diana, mientras que el efecto (ii) reducirá las pérdidas
de expresión de dicha actividad en las células no diana.
Cuando las células diana son células tumorales,
y las células no diana son células normales, en un gran porcentaje
de tumores puede resultar una ventaja que p53 mute o que se inactive
su función. La proteína p53 es un activador de la transcripción en
células normales pero en los tumores humanos está presente en forma
de mutante en una proporción sustancial (40-80%).
Incluso en tumores en los que la secuencia p53 es de tipo natural,
su función normal en el control del ciclo celular, reparación del
ADN, diferenciación, plasticidad genómica o apoptosis puede
derogarse, por ejemplo mediante la interacción con proteína celular
(por ejemplo mdm2) o proteína oncoviral (por ejemplo antígeno SV40
T, proteína humana E6 de papilomavirus, proteína E1B de adenovirus,
proteína X del virus de la hepatitis B, y la proteína
BZLF-1 Epstein-Barr), o mediante el
secuestro en el citoplasma, donde la proteína p53 no es
funcional.
Así, la producción del antídoto (o el ARN
antisentido o un ribozima dirigido contra la toxina) puede
controlarse mediante un promotor la función del cual esté
sobre-regulada mediante p53 de tipo natural en las
células normales pero no por el mutante p53 en las células
tumorales. La proteína p53 de tipo natural se enlaza con dos copias
de la secuencia de consenso
5'-PuPuPuC(A/T)(A/T)GpyPyPy-3'
(SEQ ID NO. 1) y de esta manera transactiva el nivel de
transcripción de un promotor unido operativamente. La mayoría de las
mutaciones en el gen p53 llevan a la derogación de la función
activante transcripcional específica a la secuencia.
La producción de la toxina puede controlarse
mediante un promotor la función del cual esté suprimida mediante la
proteína p53 de tipo natural en las células normales, pero que no
esté suprimida o incluso esté sobre-regulada por la
proteína mutante p53, por ejemplo el promotor hsp70, promotor mdm2 y
otros. Ver, por ejemplo "The Oncogene and Tumour Suppressor Gene
Facts Book", Robin Hesketh, Academic Press, Second Edition
(1997) capítulo p53, páginas 446-463 y sus
referencias.
Los promotores de varios genes celulares están
regulados negativamente por p53 de tipo natural, incluyen FGF
básico (también activado por el mutante p53), Bcl-2,
interleuquina humana 6 y PCNA. De nuevo, como ejemplos vease "The
Oncogene and Tumour Suppressor Gene Facts Book", Robin Hesketh,
Academic Press, Second Edition (1997) capítulo p53, páginas
446-463 y sus referencias. Los promotores virales
inhibidos por p53 de tipo natural y en algunos casos activados por
versiones mutantes están descritos en Deb et al. (1992) J.
Virology, 66 (10):6164-6170.
Así, dicho promotor o un punto de unión de p53
de tipo natural para tal promotor puede estar unido operativamente
a ácido nucleico que codifica la toxina. En células normales la
proteína p53 de tipo natural suprime la producción de la toxina.
Sin embargo, la producción de la toxina no se reprime en tumores
donde p53 no es funcional y no se enlaza a su punto de unión en el
promotor.
De manera similar, se puede usar un elemento de
respuesta que esté activado por p53 mutante pero no por el tipo
natural, tales como los provenientes de las secuencias ADN
HIV1-LTR, para proporcionar la
sobre-regulación de la toxina en células tumorales,
o la infra-regulación del antídoto cuando se use un
tercer componente para controlar la producción del antídoto en
células tumorales. Se puede usar un elemento activado por el
elemento p53 mutante (por ejemplo) para
sobre-regular un ARN antisentido, ribozima u otro
factor que infra-regule la producción de antídoto
en células tumorales.
La producción de toxina en las células no diana
puede inhibirse mediante la utilización apropiada de ácido nucleico
para influir en la expresión mediante regulación antisentido. Tales
aproximaciones pueden usarse para disminuir la regulación de la
producción de antídoto en las células diana. Ahora está bien
establecido el uso de genes antisentido o de secuencias génicas
parciales para disminuir la regulación de la expresión génica. El
ADN de cadena doble se dispone en "orientación inversa" bajo el
control de un promotor de manera que la transcripción de la cadena
antisentido del ADN genere ARN complementario al ARNm normal
transcrito a partir de la cadena sentido del gen diana. Se supone
que la secuencia de ARN antisentido complementaria se une a
continuación con ARNm para formar una cadena doble, inhibiendo la
traducción del ARNm endógeno desde el gen diana a la proteína.
Todavía no se conoce si este es el mecanismo de acción real. Sin
embargo, es un hecho probado que la técnica da resultado.
Otra posibilidad es que el ácido nucleico sea
utilizado donde la transcripción genera un ribozima, permitiendo
cortar el ácido nucleico en un sitio específico - siendo así también
útil para influir en la expresión génica. El estado de la técnica
incluye referencias sobre ribozimas como
Kashani-Sabet y Scanlon (1995). Cancer Gene
Therapy, 2, (3) 213-223, y Mercola y Cohen (1995).
Cancer Gene Therapy 2, (1) 47-59.
Así, un ARN antisentido o ribozima dirigido
contra la expresión de la toxina puede usarse para
infra-regular la producción en células no diana. La
producción de ARN antisentido o ribozima puede ponerse bajo control
de un promotor regulable de manera que se pueda disminuir dicha
producción en las células diana (por ejemplo mediante un elemento
p53 tal como se describe arriba).
Además de la regulación de la producción de
antídoto o en vez de ella, puede utilizarse una aproximación a la
infra-regulación de la producción de toxina en
células no diana (por ejemplo, células normales), y/o a la
sobre-regulación de la producción de toxina en las
células diana (por ejemplo, células tumorales).
Otra posibilidad es usar ARN antisentido o un
ribozima u otra aproximación para infra-regular la
producción de antídoto en las células diana. La
sobre-regulación de la producción en las células
diana de un ARN antisentido o de un ribozima contra el antídoto
puede utilizarse para reducir los niveles de antídoto en las células
diana y de esta manera incrementar la actividad de la toxina en
esas células.
El control de la traducción puede emplearse, por
ejemplo mediante la secuencia interna de entrada al ribosoma (IRES)
que puede estar controlada mediante ARN de levadura (Das, et
al. (1996), J. Virol., 70(3):1624-32;
Das, et al. (1998), J. Virol., 72
(7):6638-47; Das, et al. (1998), Front
Biosci., 1:3:D1241-52; Venkatosan, et al.
(1999), Nucleic Acids Res. 15:27 (2):562-72) u otros
que inhiben la unión del ribosoma en el IRES.
En realizaciones adicionales, el sistema de
muerte, la toxina y/o el antídoto u otro inhibidor se proporciona a
las células como proteína, por ejemplo mediante la inyección directa
en las células diana, como por ejemplo en un tumor. En una
realización, se utiliza una molécula portadora para facilitar la
entrada a las células, por ejemplo una secuencia peptídica de 16 aa
derivada del homeodominio de Antennapedia (por ejemplo, en la forma
comercial conocida como "Penetratin"), que puede unirse a un
péptido mediante un residuo terminal Cys. La molécula
"Penetratin" y sus propiedades se describen en el documento WO
91/18981. Otro ejemplo es VP22 (Elliott y O'Hare (1999) Gene Ther
6(1):149-51; Dilber et al. (1999) Gene
Ther 6(1):12-21; Phelan et al. (1998)
Nat Biotechnol 16 (5):440-3).
La expresión y la purificación de un antídoto de
toxina son sencillas. Sin embargo, la naturaleza tóxica de una
toxina como la proteína Kid la hace más complicada de
sobre-expresar y purificar. Sin embargo, hay
estrategias apropiadas disponibles o pueden desarrollarse por los
expertos en la materia. En referencia a Kis/Kid, en ausencia de una
base genética resistente a Kid, el antídoto Kis puede
co-expresarse simultáneamente en las cepas
sobreproductoras de Kid. La íntima interacción que se da entre ambas
proteínas para generar un complejo neutralizado permite la
purificación y separación de los componentes a partir de un extracto
bacteriano completo seguido de la desnaturalización caotrópica y de
una purificación cromatográfica adicional y renaturalización del
componente tóxico. Se ha diseñado una aproximación basada en la
cromatografía de una o dos afinidades bacterianas para purificar
Kid y las variantes de Kid en grandes cantidades y se ha
estandarizado un protocolo de replegado para obtener preparaciones
de toxina de sistema ParD puras, activas y concentradas. Ver los
experimentos descritos más adelante. Tales aproximaciones pueden
utilizarse para purificar otros componentes tóxicos de diferentes
sistemas de estabilidad.
Una composición que comprende ácido nucleico,
proteína o células según la presente invención puede comprender al
menos un componente adicional, tal como un diluyente, vehículo o
portador farmacéuticamente aceptable, o un disolvente o portador
para la aplicación en el organismo diana, por ejemplo, una planta.
Los ácidos nucleicos, proteínas, células y composiciones descritos
en el presente documento pueden utilizarse en un método de
tratamiento del cuerpo humano o animal como terapia, por ejemplo
para el tratamiento de tumores, cáncer, soriasis, arteriosclerosis,
otros desórdenes hiperproliferativos, u otros desórdenes. Los ácidos
nucleicos, proteínas, células y composiciones también pueden
utilizarse en la fabricación de un medicamento para dichos
tratamientos, y métodos de tratamiento que comprenden la
administración de un medicamento o composición farmacéutica a una
eucariota. Los métodos pueden comprender tratar células eucariotas
con el ácido nucleico, la proteína, las células o las composiciones
descritas en el presente documento. Por ejemplo, las células
eucariotas pueden ser de cualquier levadura, mamífero, planta,
anfibio, ave, pez o gusano. Las células a tratar pueden ser in
vitro o en cultivo, o pueden estar comprendidas en el cuerpo de
un mamífero (por ejemplo un humano) o planta o parte de planta (por
ejemplo fruto, hoja, semilla u otros propágulos).
Las composiciones, células y métodos descritos
en el presente documento pueden utilizarse en métodos en los que la
expresión de un gen deseado se dirige a las células deseadas, por
ejemplo células tumorales en contraposición a células no tumorales.
Tales métodos pueden llevarse a cabo in vivo (por ejemplo, en
el tratamiento de un cuerpo humano o animal para fines
terapéuticos), ex vivo (por ejemplo en células retiradas de
un cuerpo humano o animal, previamente a la reposición de las
células en el cuerpo) o in vitro. Las composiciones y
células pueden utilizarse en la fabricación de un medicamento para
tratamientos en los que la expresión de un gen deseado se dirige a
células diana (por ejemplo células tumorales). Los constructos de
ácidos nucleicos pueden formar parte de un vector viral, por ejemplo
un vector viral diseñado para ser apropiado para su administración
a un individuo, tal como un humano, y preferiblemente de manera
adicional dirigido a un tumor.
Las composiciones proporcionadas pueden
administrarse a individuos. Preferiblemente la administración será
de "cantidades terapéuticamente efectivas", siendo la
suficiente para mostrar efectos beneficiosos en el paciente. Tales
efectos beneficiosos pueden ser al menos la mejoría de al menos un
síntoma. La cantidad real administrada, y la velocidad y los
regimenes de administración, dependerán de la naturaleza y la
severidad de la condición tratada. La prescripción del tratamiento,
por ejemplo las decisiones en relación a la dosis, etc., serán
responsabilidad del medico en general y otros doctores en
medicina.
Una composición puede administrarse sola o en
combinación con otros tratamientos, tanto simultáneamente o
secuencialmente dependiendo de la condición que vaya a ser
tratada.
Las composiciones farmacéuticas según la
presente invención, y para su uso según la presente invención,
pueden comprender, además de ingrediente activo, un excipiente
farmacéuticamente aceptable, portador, tampón, estabilizante u
otros materiales conocidos por el experto en la materia. Tales
materiales no deben ser tóxicos y no deben interferir con la
eficacia del ingrediente activo. La naturaleza concreta del portador
o de los otros materiales dependerá de la vía de
administración.
El soporte experimental a la presente invención
se describe a continuación a modo de ilustración. El experto en la
materia extraerá varios aspectos y realizaciones adicionales de la
presente invención.
En el presente documento "comprende" se
utiliza en el sentido de "incluye" lo que permite la presencia
de uno o más componentes o características adicionales EJEMPLO 1
Efecto de la expresión del sistema parD en Saccharomyces
cerevisiae.
Se probaron varios plásmidos con diferentes
promotores constitutivos y/o regulables para comprobar su capacidad
de expresar ambos componentes del sistema parD por separado de
manera controlada. Los resultados fueron similares con todos los
promotores utilizados. Adicionalmente a los promotores utilizados
como se describe en detalle en los siguientes experimentos, los
inventores llevaron a cabo experimentos utilizando el promotor ADH5
(constitutivo; Mumberg, et al. (1995), Gene, 14:156
(1):119.22) para kis y GAL10-CYC1 (galactosa
activable Guarente, et al. (1982), Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 79 (23):7410-4) para kid.
La transcripción del antídoto en S.
cerevisiae se controló mediante un promotor inducido por
Cu^{2+}, mientras la transcripción de la toxina se controló
mediante un promotor diferente reprimido por metionina. Con este
propósito, el primero se clonó en un plásmido monocopia (ARSH4/CEN6
origen de replicación) y el último se clonó en un plásmido
multicopia (2 \mu origen de replicación) que confiere a una
levadura transfectada auxotrofia para leucina y triptófano
respectivamente (Figure 1).
Usar un plásmido multicopia para la expresión de
la toxina tiene dos ventajas: primero, se reduce la posibilidad de
seleccionar células que han inactivado esa proteína por mutación de
su ADN, ya que cada célula debería haber inactivado todas las
copias (10-30 moléculas por genoma haploide en un
plásmido receptor de origen 2 \mu) del gen kid presentes en cada
célula. La mutación de este gen en condiciones de crecimiento en
las que el sistema está inactivado mediante la expresión del
antídoto es tan poco probable como en la situación en la que no se
fuerza selectivamente a las células a acumular mutaciones. Esto se
verifica por el hecho de que la inducción del sistema ejerce un
efecto claro de inhibición sobre el crecimiento de S.
cerevisae (ver más adelante). Segundo, esta aproximación mostró
que también es posible regular la cantidad de ARNm de cada
componente del sistema mediante el incremento o la disminución del
número de moléculas de ADN codificantes para cada uno (es decir su
número de cópia) sin modificar la fuerza de sus promotores. Esto
permite una mayor flexibilidad en el diseño de sistemas en
eucariotas, por ejemplo para levaduras, antihongos, etc.
\newpage
Se cultivaron diferentes cepas de S.
cerevisiae transfectadas con plásmidos kis+/kid+, kis+/kid- o
kis-/kid- en medio líquido selectivo (-Leu/-Trp) en presencia de
cantidades de Cu^{2+} y metionina que mantuvieron el sistema parD
en un estado inactivo, antes de poner en los platos diferentes
series de soluciones de estos cultivos en medio sólido con una
cantidad constante de metionina para dar una expresión constante de
kid (si la había) en todos los casos, pero con concentraciones
reducidas de Cu^{2+} para disminuir la expresión de su antídoto
de plato a plato. No se permitió que las células portadoras de kis y
kid crecieran en el medio sin Cu^{2+} y este efecto disminuyó al
aumentar la concentración de Cu^{2+} hasta que alcanzó
aproximadamente la misma velocidad de crecimiento que las células
naturales (kis-/ kid-). En contraste, tanto a las células kis+/kid-
como a las naturales (kis-/ kid-) se les permitió crecer normalmente
bajo todas las condiciones ensayadas.
Este experimento demostró que kid y kis son
activos como toxina y como su antídoto respectivamente en levaduras
y que es posible regular su actividad (y así la activación o
inactivación de parD) mediante el control transcripcional de sus
componentes en S. cerevisae. También proporciona una
indicación de que la expresión del antídoto por si sola no tiene
efectos secundarios y que el proceso biológico inhibido por la
toxina parD se conserva entre organismos alejados
evolutivamente.
Se inyectaron dos embriones de Xenopus
laevis en estadio celular en el polo animal de uno de los
blastómeros bien con kis, kid, ambas o ninguna de ellas (blanco) y
se siguieron a lo largo del tiempo sus efectos en las siguientes
divisiones celulares. Los embriones inyectados con kid sólo se
dividieron correctamente en el blastómero no inyectado, mientras
que los blastómeros de los embriones inyectados con kis-, kis/kid-
y blanco en todos los casos progresaron a través de las etapas de
desarrollo embrionario que se siguieron en el ensayo de la misma
manera que los no inyectados (al menos hasta la transición media de
blástula, MBT).
Este experimento además indica que la progresión
del ciclo celular está muy influida por la proteína Kid no
neutralizada y sugiere que este efecto no se da en ninguna de sus
fases gap (G1 o G2) ya que no están presentes en las primeras fases
de desarrollo de X. laevis. También confirma que afecta a un
proceso biológico conservado en especies evolutivamente alejadas y
ofrece algunas claves en relación con el posible mecanismo de
acción de kid (ya que la replicación embrionaria de Kid no necesita
secuencias específicas de ADN para iniciarse). El hecho de que la
progresión del ciclo celular de los blastómeros no inyectados en los
embriones inyectados con kid no se vea afectada en absoluto, junto
con la falta de efectos en ambas mitades de los otros embriones
inyectados (Kis, Kis/Kid y blanco), claramente indica que el
producto del gen Kid es el responsable de ese fenotipo en
eucariotas y que el producto del gen Kis es responsable de su
neutralización y no tiene efectos secundarios per se cuando se
utiliza solo.
Los resultados anteriores a partir de levadura y
anfibios muestran que Kid puede impedir la progresión del ciclo
celular en eucariotas de una manera controlada y que es posible que
en esos organismos se sustituyan los circuitos procariotas de
regulación que mantienen el sistema parD en estado latente bajo las
condiciones deseadas mediante la modulación de la transcripción del
antídoto y de la toxina con diferentes promotores.
Para los experimentos en células humanas se
construyó un grupo de plásmidos denominados pNATHA (para plásmidos
con actividad neutralizable que provocan la apoptosis HeLa,
"Neutralisable Activity that Triggers HeLa Apoptosis"). Su
mecanismo de acción se basa en la observación de que en las células
HeLa Tet Off un promotor temprano de Cytomegalovirus (CMV Pr)
mantiene un nivel constante de transcripción de un gen reportero
independientemente de la presencia o ausencia de tetraciclina (o
doxiciclina) en el medio de cultivo. Por otro lado, utilizando la
misma línea celular, un promotor regulable mediante tetraciclina
(Tet Pr) puede disminuir el nivel de transcripción de dicho gen
reportero más de tres órdenes de magnitud al añadir el regulador
transcripcional. En el estado inducido (es decir, en ausencia de
Dox) la transcripción del gen reportero dirigida por Tet Pr es casi
dos órdenes de magnitud mayor que la del mismo gen reportero bajo
control de CMV Pr. En el estado no inducido (es decir, en presencia
de Dox), los últimos transcriben casi dos órdenes de magnitud más
eficientemente que los primeros (Figura 2).
Este comportamiento transcripcional ofrece una
ventana que puede utilizarse para construir los plásmidos pNATHA,
en los que tanto los genes kis y kid están contenidos en la misma
molécula de ADN, la síntesis de ARNm del antídoto controlada por el
promotor reprimible Tet y los niveles de mensajero de la toxina
controlados por el CMV constitutivo. Se clonaron ambos Kis y Kid
contenidos en los casetes o en orientación directa o invertida
(Figura 5). La toxina y el antídoto pueden clonarse en una
orientación cola a cola o cola a cabeza cuando convenga y
aprovechar la interferencia transcripcional bajo el control
apropiado. Ambos pueden formar parte de la misma unidad
transcripcional si se pone un IRES entre las secuencias
codificadoras.
Se ensayaron en células HeLa otras variantes
tanto del antídoto como de la toxina, después de verificar su
actividad de tipo natural in vivo en E. coli. Se
fusionó una señal de localización nuclear (NLS) en Kid y Kis para
probar si esto conferiría un efecto más eficiente (si lo hay en
células humanas) tanto impidiendo el progreso del ciclo celular
como neutralizando dicho impedimento, respectivamente.
Todos los pNATHA se transfectaron establemente
en una línea celular HeLa Tet Off. El efecto in vivo de
ambos componentes del sistema parD en estas células se analizó antes
y después de la adición de doxiciclina a los diferentes cultivos.
La primera observación de este grupo de experimentos es que, de
nuevo, después de la inducción del sistema, la velocidad de
crecimiento celular se inhibió intensamente en las células HeLa
kis+/kid+ y nlskis+/kidnls+. Esto sugiere dos cosas diferentes:
Primero, que el transporte inmediato de la toxina en el núcleo
(verificado mediante la microscopía confocal de muestras de Kid
inmunoteñidas) no impide su efecto tóxico, indicando la
localización nuclear probable de su(s) diana(s)
celular(es); y segundo, que los componentes naturales del
sistema parD son tan activos como los fusionados en NLS- en las
células HeLa, que indican si bien esa entrada al núcleo no está
impedida para las proteínas de tipo natural, y/o que la
inactivación de la(s) diana(s) celular(es)
mediante Kid puede darse en el citosol. Después de uno o dos días
creciendo en presencia de doxiciclina, y hasta los diez días de
tratamiento, es detectable un estado inducido de parD, como si las
células kis+/kid+ hubieran incrementado el tiempo de duplicación,
comparado con los transfectantes kis+/kid- o con las células
kis+/kid+ crecidas en ausencia de doxiciclina (Figura 4). Debería
recalcarse que como sólo la transcripción de kis se modula
directamente, mientras se mantiene un nivel constante de kid, la
velocidad de crecimiento para aquellos transfectantes estabilizados
kis+/kid+ es inferior que la de sus correspondientes kis+/kid- en
las mismas condiciones. Esto puede darse a causa de una ligera fuga
del sistema al nivel de su capacidad de neutralización si la
transcripción de kid no se reduce de manera selectiva a la vez.
Los resultados mostraron una reducción
progresiva de las duplicaciones celulares de los transfectantes
estables kis+/kid+ bajo la exposición continuada a doxiciclina (es
decir a toxina no neutralizada). Los inventores se interesaron en
si pudiera ser posible proporcionar un efecto citostático y/o
citotóxico.
El porcentaje de células muertas se determinó
después del tratamiento con dosis sub-letales de
doxiciclina de los diferentes transfectantes estables analizados
previamente. Como se ha indicado anteriormente, las células
kis+/kid- HeLa mostraron una velocidad de crecimiento celular
exponencial respecto al tiempo tanto en presencia como en ausencia
de doxiciclina. Por el contrario, las células kis+/kid+ HeLa
mostraron una velocidad de crecimiento celular exponencial sólo
cuando se mantuvo la transcripción del antídoto (es decir, en
ausencia de doxiciclina) pero no en el caso contrario, en el que
redujeron continuamente su número de duplicaciones (Figura 5). Debe
recalcarse que la velocidad de crecimiento se redujo para las
células kis+/ kid- HeLa cultivadas en presencia de doxiciclina en
comparación con aquellas de la misma línea celular estable en su
ausencia. Este efecto puede deberse a una larga exposición a
doxiciclina incluso a dosis sub-letales y, en
cualquier caso, no lleva a la muerte celular. Cuando se contaron
las células muertas en todas las muestras, las células kis+/kid+
HeLa cultivadas en presencia de doxiciclina (es decir, en presencia
de toxina no neutralizada) mostraron un 32% y 65% de células
muertas en los días cinco y diez del tratamiento, respectivamente,
mientras todas las demás muestras no mostraron más del 9% incluso
después de 10 días de tratamiento (Figura 5). El teñido con Annexin
V (es decir, un marcador apoptótico temprano) de las diferentes
muestras analizadas, demostró que la muerte celular observada en la
línea celular no neutralizada HeLa fue debida a la activación de la
apoptosis (Figura 6).
Se utilizaron los oligonucleotidos XholKis
(5'CCGCTCGAGATGCATACCACCCGACTG3' - SEQ ID NO. 2) y
Kis-Ncol (5'CATGCCATGGTCAGATTTCCTCCTGACCAG3' - SEQ
ID NO. 3) para amplificar la región de codificación de kis mediante
PCR a partir de un derivado mini-R1. El producto
amplificado se digirió con Xhol y Ncol y se clonó en el plásmido
pSAL1 para construir pSAL1Kis (Mascorro-Gallardo,
et al. (1996), Gene, 172 (1):169-70). De
manera similar, los oligonucleotidos ATGKid
(5'ATGGAAAGAGGGGAAATCTG3' - SEQ ID NO. 4) y KidEcoRI
(5'CGGAATTCCCCATGTTCAAGTC3' - SEQ ID NO. 5) se utilizaron para
amplificar la región de codificación kid utilizando la misma
plantilla y el producto obtenido se dirgirió con EcoRI y se clonó
en el plásmido p424Met25 (Mumberg, et al. (1994), Nucleic
Acids Res., 25:22 (25):5767-8) digerido con SmaI y
EcoRI para construir el plásmido p424Met25Kid. Este plásmido se
amplificó en una cepa bacteriana que sobre-producía
Kis al mismo tiempo que eliminaba la selección de mutantes
inactivados durante el proceso de clonación.
La cepa W303\alpha de Saccharomyces
cerevisiae (MAT \alpha, ade2-1,
trpi-1, can1-100,
leu2-3, 112, his3-11, ura3, psi+)
se transformó con plásmidos pSALl y p424Met25 (ninguno), pSAL1Kis y
p424Met25 (kis+/kid-) y pSAL1Kis y p424Met25kid (kis+/kid+). Estas
células se cultivaron en un medio selectivo suplementado con 500
\muM de metionína y 200 \muM de CuSO_{4} para mantener a los
promotores kis y kid en un estado activado y reprimido,
respectivamente. Se permitió que los cultivos crecieran hasta la
fase media de crecimiento y a continuación se dispuso una gota de 3
\mul de disoluciones de cada cultivo que contenían 15000, 1500 o
150 células en platos de agar con medio selectivo suplementado con
200 \mum de metionina para mantener un nivel de expresión
constante del gen kid y 0, 1, 5, 10, 20, 40, 80, 100 y 200 \muM de
CuSO_{4} para incrementar el nivel de expresión del gen kis. Los
platos se incubaron 48 horas a 30ºC y la velocidad de crecimiento de
cada cultivo se analizó a posteriori en cada plato.
Se utilizaron los oligonucleotidos ATGKis
(5'ATGCATACCACCCGACTG3' - SEQ ID NO. 6) y KisEcoRI (5'TC
GGAATTCAGATTTCCTCCTG3' - SEQ ID NO. 7) para amplificar kis mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla. El producto amplificado se digirió con EcoRI y se clonó en el plásmido pMAL-c2 (Mumberg, et al. (1994), Nucleic Acids Res., 25:22(25):5767-8) entre los sitios Xmnl y EcoRI para obtener el sobreproductor MBP-(Proteína de unión a maltosa) Kis.
GGAATTCAGATTTCCTCCTG3' - SEQ ID NO. 7) para amplificar kis mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla. El producto amplificado se digirió con EcoRI y se clonó en el plásmido pMAL-c2 (Mumberg, et al. (1994), Nucleic Acids Res., 25:22(25):5767-8) entre los sitios Xmnl y EcoRI para obtener el sobreproductor MBP-(Proteína de unión a maltosa) Kis.
Se utilizaron oligonucleotidos NdeIkid
(5'GGAATTCCATATGCATACCACCCGACT3' - SEQ ID NO. 8) y kisBamH1
(5'CGGGATCCTCAAGTCAGAATAGT3' - SEQ ID NO. 9) para amplificar en
tándem las regiones codificantes de kis y kid a partir de un
derivado mini-R1. El producto de la PCR se digirió
con Ndel y BamHI y se clonó en pET15b (Invitrogen) entre estos
sitios. El plásmido resultante se digirió con NcoI y BamH1 y el
fragmento de ADN que codifica Hiskiskid se purifico y se subclonó
entre estos mismos lugares en pRG-recANHis (Giraldo,
et al. (1998), EMBO J., 3:17
(15):4511-26).
Se purificó la proteína Kis en forma de fusión
con la proteína de unión de maltosa (MBP). La cepa DH5a de
Escherichia transformada con el plásmido pMBPKis se inoculó en 2 L
de medio LB más ampicilina (100 \mug/ml) a 0,04 unidades de 600
nm de Abs y se cultivó con agitación a 37ºC hasta que se alcanzaron
0,4 unidades de 600 nm. La expresión de MBPKis se indujo a
continuación mediante la adición de 100 \muM de IPTG al medio de
cultivo. Las células se cultivaron durante 4 horas a 37ºC y a
continuación se peletizaron en un rotor GS3 y se resuspendieron en
10 ml de tampón lítico (20 mM Tris-HCl pH 8,0, 150
mM NaCl) y se congelaron en nitrógeno líquido. Después de
descongelar las células, se añadieron 2 mg de lisozimas a la
suspensión de células y se completó la lisis mediante la incubación
a 37ºC durante aproximadamente 10 minutos, enfriandola en hielo cada
3 minutos. Se obtuvo una fracción soluble mediante la adición de 40
ml de tampón 20 mM en Tris-HCl, pH 8,0, 600 mM NaCl
y centrifugación a 30 Krpm a 4ºC durante 45 min en un rotor 65 Ti.
La proteína MBPKis se purificó mediante cromatografía de afinidad a
través de una resina de amilosa (BioLabs) siguiendo las
instrucciones del fabricante con tampón 20 mM HEPES, pH 7,5, 100 mM
KCl, 1 mM DTT y 10% de etilenglicol. Las fracciones MBPKis se
juntaron y se determinó la pureza y la concentración de la proteína
mediante tinción de coomassie en un gel SDS-PAGE y
mediante análisis espectrofotométrico, respectivamente. Las
fracciones se almacenaron a -80ºC.
Se cultivaron las cepas C600 o TG1 de
Escherichia coli transformadas con el sobreproductor
pRGDHisKisKid en 2 L de medio LB más ampicilina (100 \mug/ml) a
0,04 unidades de 600 nm de Abs, y se cultivó con agitación a 37ºC
hasta que se alcanzaron 0,4 unidades de 600 nm. A continuación se
indujo la expresión de HisKis y Kid mediante la adición de 25
\mug/ml de ácido nalidíxico al medio de cultivo. Las células se
cultivaron durante 4 horas a 37ºC y a continuación se peletizaron
en un rotor GS3 y se resuspendieron en 10 ml de tampón lítico (20
mM Tris-HCl pH 8,0, 150 mM NaCl) y se congelaron en
nitrógeno líquido. Después de la descongelación, se añadieron 2 mg
de lisozimas a la suspensión de células y se completó la lisis
mediante la incubación a 37ºC. Se obtuvo una fracción soluble
mediante la adición de 40 ml de tampón 20 mM en
Tris-HCl, pH 8,0, 600 mM NaCl y centrifugación a 30
Krpm a 4ºC durante 15 min en un rotor 65 Ty. Esta fracción soluble
se precipitó mediante la adición de un 60% de sulfato de amonio y
centrifugación a 40 Krpm a 4ºC durante 60 min. La fracción
precipitada se resuspendió en 1 ml de 20 mM Tris- HCl pH 7,5, 500
mM KCl y se dializó contra el mismo tampón para eliminar el sulfato
de amonio. La fracción dializada se cargó en 5ml de sefarosa
quelante de flujo rápido (Pharmacia) activada con Ni^{2+} y
equilibrada con el tampón de diálisis en el que se retuvo el
complejo HisKis-Kid. Se aplicó un gradiente de 0 a
6 M de cloruro de guanidina (GnCl) en 20 mM de
Tris-HCl pH 7,5 a la columna y la desnaturalización
del complejo HisKis-Kid unido a la columna llevó a
la retención de HisKid y la elución de Kid a 5,5 M con agente
caotrópico. El Kid desnaturalizado puede almacenarse a -80ºC hasta
su utilización. Para la renaturalización, se diluyó Kid a 5
\mumol/\mul en 6 M GnCl, 150 mM CIK, 100 mM de tampón de fosfato
a pH 6,5, 20 mM en \beta-mercaptoetanol, 0,2 mM
en EDTA y 1,2% en CHAPS y se dializó 5 veces durante 6 horas a 4ºC
contra 200 ml (por 6 ml de proteína) de 100 mM de tampón de fosfato
pH 6,5, 150 mM KCl, 10 mM en \beta-mercaptoetanol,
0,1 mM en DTT y 10% en etilenglicol. La proteína soluble y
replegada se separó de la insoluble (desnaturalizada) mediante el
centrifugado de la mezcla a 40 Krpm durante 60 min a 4ºC en un rotor
65 Ty. El sobrenadante se concentró en tubos centricon (límite 3 K)
y se alicuotaron después de determinar la pureza y la concentración
de la proteína mediante tinción coomassie en un gel
SDS-PAGE y análisis espectrofométrico,
respectivamente, y se almacenó a -80ºC.
Las proteínas MBPKis y Kid se dializaron contra
tampón 20 mM Tri-HCl pH 8,0, 50 mM KCl y 2 \mul de
MBPKid (160 ng/\mul) y se mezclaron 2 \mul de MBPKis (720
ng/\mul) con cada uno o con 2 \mul de tampón de diálisis y se
incubaron en hielo durante 10 min. Se microinyectaron 50 nl of cada
mezcla (tampón, Kis, Kid y Kis/Kid) en dos embriones celulares
licuados de Xenopus laevis en el polo animal de una de sus
células. A continuación los embriones microinyectados y no
inyectados se incubaron en 4% de ficoll 400 en tampón MBS a 18ºC y
se permitió que progresaran a través del desarrollo embrionario
hasta que alcanzaron la etapa 8-9 (blástula) en el
caso de los controles no inyectados (7-8 horas).
Entonces se fotografiaron los embriones y después se analizó el
efecto de las microinyecciones.
Se utilizaron los oligonucleotidos EcoRIKis
(5'CGGAATTCATGCATACTACCACCCGACTG3' - SEQ ID NO. 10) o EcoRINLSKis
(5'CGGAATTCATGGACAAGGTTCCTAAGAAGAAGAGGAAGGTTAGCAGCATGCA
TACCACC CGACTGAAG3' - SEQ ID NO. 11) y KisXbal (5'CTCTAGATCAGATTTCCTCCTGACC3' - SEQ ID NO. 12) para amplificar kis mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla. El producto amplificado se digirió con EcoRI y XbaI y se clonó en el plásmido pTRE (Clontech) entre los sitios EcoRI y Xbal para obtener los plásmidos pTREKis y pTRENLSKis, respectivamente. Por otro lado, los oligonucleotidos XholKid (5'CCGCTCGA
GATGGAAAGAGGGGAAATCT3' - SEQ ID NO. 13) y KidEcoRI (SEQ ID NO. 5) se utilizaron para amplificar kid mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla, y EcoRIKid (5'CGGAATTCATGGAAAGAGGG
GAAATCT3' - SEQ ID NO. 14) y KidNLSXbal (5'GCTCTAGATCAAACCTTCCTCTTCTTCTTAGGAGGCC
TGCTGCTAGTCAGAATAGTGGA CAGGCG3' - SEQ ID NO. 15) se utilizaron con el mismo objetivo para obtener un gen NLSKid mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla. Estos dos productos de PCR se digirieron con Xhol y EcoRI o EcoR1 y Xabl, respectivamente, y se clonaron entre esos sitios en el plásmido pClneo (Promega) para obtener los plásmidos pClneoKid y pClneoKidNLS. Esos plásmidos kid+ se amplificaron en una cepa bacteriana que sobreproduce Kis a la vez que elimina la selección de los mutantes inactivantes durante el proceso de clonación. El fragmento BsTXI-Smal se delecionó de pClneoKid y pClneoKidNLS para eliminar el gen de resistencia a la neomicina. Los plásmidos resultantes (pCIKid y pCIKidNLS) se digirieron con BgIII y BamHI y se trataron con Klenow, y el fragmento que contenía los genes kid o kidNLS se purificó y se clonó en los vectores pTRE y pTREKis digeridos con HindIII y se trataron con Klenow. Para cada una de estos constructos se seleccionaron ambas orientaciones, y se obtuvieron los plásmidos pNATHA1 (kis+), pNATHA2 (kis+/kid+), pNATHA4 (NLSkis+) y pNATHA8 (NLSkis+/ kidNLS+) tanto en las orientaciones kis-kid cola a cola (pNATHAi) y cola a cabeza (pNATHAd).
TACCACC CGACTGAAG3' - SEQ ID NO. 11) y KisXbal (5'CTCTAGATCAGATTTCCTCCTGACC3' - SEQ ID NO. 12) para amplificar kis mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla. El producto amplificado se digirió con EcoRI y XbaI y se clonó en el plásmido pTRE (Clontech) entre los sitios EcoRI y Xbal para obtener los plásmidos pTREKis y pTRENLSKis, respectivamente. Por otro lado, los oligonucleotidos XholKid (5'CCGCTCGA
GATGGAAAGAGGGGAAATCT3' - SEQ ID NO. 13) y KidEcoRI (SEQ ID NO. 5) se utilizaron para amplificar kid mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla, y EcoRIKid (5'CGGAATTCATGGAAAGAGGG
GAAATCT3' - SEQ ID NO. 14) y KidNLSXbal (5'GCTCTAGATCAAACCTTCCTCTTCTTCTTAGGAGGCC
TGCTGCTAGTCAGAATAGTGGA CAGGCG3' - SEQ ID NO. 15) se utilizaron con el mismo objetivo para obtener un gen NLSKid mediante PCR utilizando un plásmido mini-R1 como plantilla. Estos dos productos de PCR se digirieron con Xhol y EcoRI o EcoR1 y Xabl, respectivamente, y se clonaron entre esos sitios en el plásmido pClneo (Promega) para obtener los plásmidos pClneoKid y pClneoKidNLS. Esos plásmidos kid+ se amplificaron en una cepa bacteriana que sobreproduce Kis a la vez que elimina la selección de los mutantes inactivantes durante el proceso de clonación. El fragmento BsTXI-Smal se delecionó de pClneoKid y pClneoKidNLS para eliminar el gen de resistencia a la neomicina. Los plásmidos resultantes (pCIKid y pCIKidNLS) se digirieron con BgIII y BamHI y se trataron con Klenow, y el fragmento que contenía los genes kid o kidNLS se purificó y se clonó en los vectores pTRE y pTREKis digeridos con HindIII y se trataron con Klenow. Para cada una de estos constructos se seleccionaron ambas orientaciones, y se obtuvieron los plásmidos pNATHA1 (kis+), pNATHA2 (kis+/kid+), pNATHA4 (NLSkis+) y pNATHA8 (NLSkis+/ kidNLS+) tanto en las orientaciones kis-kid cola a cola (pNATHAi) y cola a cabeza (pNATHAd).
Se mezclaron 5 \mug de cada pNATHA con 0,5
\mug de plásmido pTKHyg y se transfectó la línea celular HeLa
Tet-Off (Clontech) con esas mezclas mediante el
método de la Lipofectamina (Gibco). Se seleccionaron los
transfectantes estables en medio DMEM suplementado con glutamax y
10% de suero fetal bovino aprobado para tetraciclina (Clontech) y
en la presencia de 200 \mug/ml de neomicina (Sigma) y 200
\mug/ml de higromicina (Clontech) (medio no tóxico; NTM).
Las células HeLa Tet Off establemente
transfectadas con pNATHAli+ y pNATHA2i+ se cultivaron en NTM hasta
que alcanzaron aproximadamente el 80% de confluencia. Se
tripsinizaron y 5 x 10 células establemente transfectadas con
pNATHAi1+ y 2 x 10^{4} de las células transfectadas establemente
con pNATHAi2+ se transfirieron a 4 pocillos de una placa de 6
multipocillos y se cultivaron durante 24 horas en NTM. Después, se
tripsinizó uno de los pocillos por muestra y sus células se
peletizaron y se tiñeron con azul de tripano. Se contaron las
células totales y las teñidas de azul (muertas) por pocillo con un
citometro. A continuación, se añadió 0,1 \mug/ml de doxiciclina
(Sigma) al resto de pocillos y se permitió que las células crecieran
en ese medio tóxico (TM) durante 2, 5 y 10 días, cambiándolo cada 4
días cuando fue necesario, pero manteniendo el flotante de células
(muertas y mitóticas) cada vez que se añadía TM fresco. La
tripsinación, la tinción con azul de tripano y el contado de
células se repitió para cada muestra para determinar el número
células muertas y totales por muestra.
Las células HeLa Tet Off establemente
transfectadas con pNATHA1+ y pNATHA2+ se cultivaron en NTM hasta
que alcanzaron aproximadamente el 80% de confluencia. Se
tripsinizaron y 10^{4} células establemente transfectadas con
pNATHA1+ y 5 X 10^{4} de las células establemente transfectadas
con pNATHA2+ se transfirieron a cuatro platos de 5 cm de diámetro
en los que se pusieron cuatro films recubiertos de polilisina. Se
dejó que las células se asentaran durante 24 h y a continuación se
añadió 0,1 \mug/ml de doxiciclina (Sigma) a uno de los platos por
muestra. Los films se sacaron antes (día 0) y 2, 5 y 10 días después
de la adición de doxiciclina a uno de ellos. Se añadió medio fresco
cada cuatro días cuando fue necesario. Las muestras cultivadas en
los films se tiñeron con FITC-Annexin V (Clontech),
como indica el fabricante, antes de fijarlas y se tiño el ADN con
ioduro de propidio y Hoerschts 33258. El análisis y el contado de
las células positivas a Annexin V se hizo mediante microscopía
confocal y se determino el número de células apoptópicas y
totales.
Claims (16)
1. Composición que comprende:
- (i)
- la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, o
- (ii)
- ácido nucleico que codifica la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis,
para su uso en un método
terapéutico de inhibición de la proliferación celular y/o la
progresión del ciclo celular llevado a cabo sobre un cuerpo humano
o animal, comprendiendo el método proporcionar la toxina y la
antitoxina a células eucariotas del cuerpo humano o animal, bajo
control apropiado para la inhibición selectiva del ciclo celular
y/o la muerte de células
diana.
2. Composición según la reivindicación 1, donde
dicha toxina es proporcionada a las células mediante un ácido
nucleico que codifica la toxina bajo el control de elementos
apropiados de control de la expresión.
3. Composición según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, para su uso en el método que comprende
proporcionar a las células la toxina y la antitoxina, y controlar la
actividad de dicha antitoxina sobre dicha toxina para controlar la
actividad de dicha toxina en las células.
4. Composición según la reivindicación 3, donde
la toxina es proporcionada a las células mediante un ácido nucleico
que codifica la antitoxina bajo el control de elementos de control
de la expresión apropiados.
5. Composición según la reivindicación 3 o la
reivindicación 4, donde la inhibición selectiva del ciclo celular
y/o muerte está afectada por la combinación de (i) la
sobre-regulación de la producción de toxina en las
células diana, y (ii) la infra-regulación de la
producción de toxinas en las células no diana y/o la neutralización
de la actividad de la toxina en las células no diana.
6. Composición según la reivindicación 5, donde
la neutralización de la actividad de la toxina en las células no
diana está afectada por la sobre-regulación de la
producción de antitoxina en las células no diana.
7. Composición según cualquiera de las
reivindicaciones 3 a 6, donde dichas células diana son células
tumorales.
8. Uso de una composición que comprende:
- (i)
- la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, o
- (ii)
- ácido nucleico que codifica la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis,
en la fabricación de una
composición medicamentosa de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 7 para el tratamiento de tumores, cáncer,
soriasis, arteriosclerosis u otro tipo de desorden
hiperproliferativo.
9. Procedimiento para la inhibición de la
proliferación celular y/o la progresión del ciclo celular,
comprendiendo el procedimiento proporcionar la toxina ParD kid y la
antitoxina ParD kis a células eucariotas bajo control apropiado
para la inhibición selectiva del ciclo celular y/o la muerte de las
células diana, donde las células son in vitro y/o son
células vegetales.
10. Procedimiento según la reivindicación 9,
donde dicha toxina es proporcionada a las células mediante un ácido
nucleico que codifica la toxina bajo el control de elementos de
control de expresión apropiados.
11. Procedimiento para la inhibición de la
proliferación celular y/o la progresión del ciclo celular,
comprendiendo el procedimiento proporcionar la toxina ParD kid y la
antitoxina ParD kis a células eucariotas, donde las células son
in vitro y/o son células vegetales.
12. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 9 a 11, que comprende proporcionar a dichas células
la toxina ParD kid y la antitoxina ParD kis, y controlar la
actividad de dicha antitoxina sobre dicha toxina para controlar la
actividad de la toxina en las células.
13. Procedimiento según la reivindicación 12,
donde la antitoxina es proporcionada a dichas células mediante un
ácido nucleico que codifica la antitoxina bajo el control de
elementos de control de expresión apropiados.
14. Procedimiento según la reivindicación 12 o
la reivindicación 13, donde la selectividad de la expresión de
dicha toxina en las células diana está afectada por la combinación
de (i) la sobre-regulación de la producción de
toxina en las células diana y (ii) la
infra-regulación de la producción de toxina en las
células no diana y/o la neutralización de la actividad de la toxina
en las células no diana.
\newpage
15. Procedimiento según la reivindicación 14,
donde la neutralización de la actividad de la toxina en las células
no diana está influida por la sobre-regulación de la
producción de antitoxina en las células no diana.
16. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 12 a 14, donde las células diana son células
tumorales.
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