ES2286418T3 - Sintesis mejorada de analogos del cc-1065. - Google Patents

Sintesis mejorada de analogos del cc-1065. Download PDF

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Abstract

Un procedimiento para la preparación de un compuesto de fórmula (I) o de una sal del mismo, que comprende: (Ver fórmula) (a) proporcionar un compuesto de fórmula (II), en la que R es un grupo protector de forma que el grupo amino y el grupo hidroxilo están protegidos por el mismo compuesto; (Ver fórmula) (b) llevar a cabo reacciones de halogenación, alquilación y apertura de anillo sobre el compuesto (II) en condiciones adecuadas para proporcionar el racemato (III); (Ver fórmula) (c) aislar el isómero (-) del racemato (III) y (d) eliminar dichos grupos protectores R del isómero (-) aislado del compuesto (III) en condiciones adecuadas para producir el compuesto (I).

Description

Síntesis mejorada de análogos del CC-1065.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a la síntesis de antibióticos antitumorales citotóxicos tales como el CC-1065 y análogos de los mismos. En particular, la presente invención proporciona una síntesis mejorada para seco(-)CBI (5-hidroxi-3-amino-1-[S]-(clorometil)-1,2-dihidro-3H-benz(e)indol) y para la síntesis de análogos del CC-1065 a partir del mismo que comprende un resto alquilante de ciclopropanobenzoindol (CBI), que se puede incorporar dentro de agentes terapéuticos dirigidos a dianas celulares.
Antecedentes
El CC-1065 es un antibiótico antitumoral altamente citotóxico aislado a partir de cultivos de Streptomyces zelensis. La molécula de CC-1065 consta de tres subunidades de pirroloindol sustituidas unidas mediante enlaces amida. La subunidad "A" es el resto alquilante ciclopropanopirroloindol (CPI), mientras que las subunidades "B" y "C" son restos pirroloindol idénticos.
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Se han descrito nuevos combinados de agente citotóxico-agente de unión a células que comprenden un agente de unión a células unido químicamente a análogos del CC-1065 [patentes de EE.UU. Nº 5.475.092; 5.585.499; 5.846.545, R. V. J. Chari y col., Cancer Res., 55, 4079-4084 (1995)]. Estos combinados de agente citotóxico-agente de unión a células tienen uso terapéutico porque suministran el agente citotóxico a una población celular específica de una forma dirigida. En estos agentes citotóxicos, denominados en esta invención DC1 y sus derivados, la subunidad CPI alquilante "A" se sustituyó por el análogo benzofusionado ciclopropanobenzoindol (CBI).
La unidad CBI puede existir en la forma de ciclopropilo de anillo cerrado o en la forma seco (clorometilo) de anillo abierto. Las subunidades "B" y "C" se sustituyeron con unidades indol. Además, la unidad indol terminal lleva un sustituyente que permite el enlace a agentes de unión a células.
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El CBI es el precursor requerido para la síntesis de fármacos DC1 y de sus derivados. La síntesis original del compuesto CBI se describió por parte de D. L. Boger y col., [J. Org. Chem., 55, 5823-5833 (1990)]. Una síntesis "mejorada", también descrita por parte de D. L. Boger y col., [J. Org. Chem., 57, 2873-2876 (1992)] es un procedimiento de 15 etapas a partir de naftalenodiol. También se han descrito otros caminos para las síntesis del compuesto CBI a partir de diferentes materiales de partida [K. J. Drost y M. P. Cava, J. Org. Chem., 56, 2240-2244 (1991), P. A. Aristoff y P. D. Johnson, J. Org. Chem., 57, 6234-6239 (1992)]. Estas síntesis son largas, lentas, caras y proporcionan pobres rendimientos.
Una etapa clave en la síntesis de CBI es la resolución de los enantiómeros en la etapa seco-CBI. Solo es biológicamente activo el enantiómero seco(-) y es importante eliminar de forma eficaz el isómero (+) inactivo. La separación de los isómeros se puede lograr, por ejemplo, mediante HPLC quiral. Este procedimiento no es muy eficaz cuando se aplica al compuesto seco-CBI debido a que la separación entre los dos enantiómeros es mala. Además, incluso la separación optimizada en una columna quiral es mala (la diferencia en el tiempo de retención entre los dos isómeros es inferior a 5 minutos) y requiere un sistema de disolvente que sea muy apolar, tal como una mezcla del 95% de hexano y el 5% de isopropanol (Boger y col., 116, J. Am. Chem. Soc., 7996-8006 (1994)). En estas condiciones, el compuesto seco-CBI es pobremente soluble, lo que da como resultado una baja eficacia (cantidades de carga pequeñas) en la columna y, de este modo, tiempos de procesado largos. De forma alternativa, la mezcla enantiomérica se puede convertir en un conjunto de diastereoisómeros mediante esterificación con un ácido quiral, tal como ácido mandélico, seguido de separación mediante HPLC. Sin embargo, el éster separado tiene que hidrolizarse y a continuación purificarse de nuevo, lo que añade de esta forma una etapa de procesamiento adicional.
D. L. Boger y col. (Tet. Let., 39 2227-2230 (1998)) describe el uso de un radical de ciclización intramolecular 5 exo-trig en un cloruro de vinilo ligado para producir un compuesto seco-CBI protegido por bencilo y por t-BOC.
La utilidad y la promesa terapéutica de fármacos tales como el DC1 y sus derivados, por ejemplo en el tratamiento de varios tipos de cánceres, hace deseable que se desarrollen procedimientos sintéticos mejorados a fin de ser capaces de fabricar el compuesto CBI a gran escala, mediante un procedimiento simple, fácilmente escalable, con alto rendimiento y económico, que use materiales de partida económicos y fácilmente disponibles.
La presente invención proporciona un procedimiento sintético mejorado que se dirige a las deficiencias citadas de la técnica anterior. Todas estas desventajas y más se proporcionan por la invención descrita en esta solicitud, tal como será evidente para un experto en la materia tras la lectura de la siguiente descripción y de los siguientes ejemplos.
Resumen de la invención
Los inventores han descubierto una síntesis nueva, económica y eficaz para el compuesto seco(-)CBI que puede usar, por ejemplo, el compuesto 1,3-dihidroxinaftaleno disponible comercialmente y barato, como material de partida y que se puede llevar a cabo en sólo siete etapas.
Además, los inventores han proporcionado síntesis flexibles y eficaces compatibles para la conversión del compuesto seco(-)CBI en una amplia variedad de fármacos DC1. Aunque hay varias diferencias entre el esquema sintético para el compuesto seco(-)CBI descrito en esta invención y los procedimientos descritos anteriormente, una diferencia a título de ejemplo es el uso del mismo grupo protector para los grupos amino e hidroxi del precursor clave, la 4-hidroxi-2-naftilamina. Así, en una forma de realización del procedimiento descrito en esta invención, para el grupo hidroxilo se usa un compuesto protegido con di-terc-butiloxicarbonilo (di-t-boc) en lugar de un grupo protector bencilo independiente y para la función amina se usa un grupo protector terc-butiloxicarbonilo (t-boc), descrito anteriormente. Así, en las síntesis de la presente invención, se han eliminado algunas de las etapas redundantes de protección y de desprotección. Estos y otros cambios han acortado el tiempo de síntesis, han mejorado considerablemente el rendimiento de producto y también han mejorado la separación de los enantiómeros.
En la presente invención, se prefiere el uso de dos grupos protectores t-boc y se proporciona una mezcla enantiomérica del compuesto seco-CBI que se separa bien en una columna de HPLC quiral. Además, la columna puede ponerse a funcionar con una mezcla de disolventes con una polaridad mayor, por ejemplo con una mezcla que contenga el 20% de isopropanol, en la que el compuesto tenga buena solubilidad. Estas dos características aumentan mucho la capacidad de carga de la columna y por consiguiente la eficacia del procedimiento de separación y, de esta forma, disminuye considerablemente el tiempo de procesamiento.
Así, en un primer aspecto, la presente invención proporciona un procedimiento para la preparación del compuesto seco(-)CBI de fórmula (I):
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en el que se usa un compuesto di-protegido de fórmula (II), en la que R es un grupo protector de forma que el grupo amino y el grupo hidroxilo están protegidos por el mismo compuesto:
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y en el que el compuesto de fórmula (II) se convierte mediante reacciones de alquilación y de cierre de anillo para proporcionar una mezcla racémica representada por un compuesto de fórmula (III):
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El isómero (-) del racemato (III) se puede aislar, por ejemplo mediante cromatografía quiral y el isómero (-) aislado del compuesto de fórmula (III) se desprotege para producir el compuesto de fórmula (I).
En formas de realización preferidas, R es terc-butiloxicarbonilo y la etapa de alquilación emplea 1,3-dicloropropeno.
En ciertas formas de realización, un compuesto de fórmula (II) se puede preparar de forma conveniente a partir de un material de partida económico y fácilmente obtenible, tal como 1,3-dihidroxinaftaleno, mediante la aminación y la desprotección de los grupos hidroxilo y amino (Fig. 1).
En un segundo aspecto, la presente invención proporciona un procedimiento para la preparación de DC1 mediante la reacción del grupo amino de un compuesto seco(-)CBI de fórmula (I) para formar un enlace peptídico, en el que el compuesto seco(-)CBI se puede preparar de acuerdo con el procedimiento de la presente invención.
Así, en una primera forma de realización de este segundo aspecto de la invención, se forma un enlace peptídico mediante la reacción del grupo amino del compuesto seco(-)CBI con el grupo carboxilo de, por ejemplo, un compuesto de fórmula (IV) en condiciones adecuadas,
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en el que R_{1} representa, en esta forma de realización, un grupo alquilo o arilo que forma un enlace disulfuro dentro de un compuesto de fórmula (IV) tal como, por ejemplo, un alquil o aril tiol, o, de forma más específica, -S-CH_{3} o -S-piridilo. Dichos disulfuros se pueden usar para enlazar el compuesto DC1 a, por ejemplo, un agente dirigido a dianas celulares a través de un enlace que se pueda romper en el interior de la célula diana.
Esta forma de realización no se limita solo a la síntesis del compuesto DC1 que se corresponde con el producto de la reacción que usa el compuesto (IV), sino que también se puede adaptar fácilmente para producir una amplia variedad de compuestos DC1, que incluye a aquellos en los que el grupo que es capaz de unirse a un agente dirigido a dianas celulares puede ser distinto de un grupo tio o disulfuro, tal como, por ejemplo, un grupo ácido-lábil, un grupo foto-lábil, un grupo peptidasa-lábil o un grupo esterasa-lábil, dependiendo del análogo del compuesto (IV) que se seleccione.
En una forma de realización adicional de este aspecto de la invención, no se requiere que tenga lugar el acoplamiento del compuesto seco(-)CBI como etapa terminal de la síntesis. Así, en esta forma de realización, el compuesto DC1 se sintetiza a partir de un resto bis-indolilo, de un resto que contiene disulfuro y del compuesto seco(-)CBI, mediante su acoplamiento a través de enlaces peptídicos y en el que el orden en el que estos tres componentes de DC1 se ensamblan no es crítico. Por ejemplo, el resto bis-indolilo y el compuesto seco(-)CBI se pueden unir antes del acoplamiento del resto que contiene disulfuro.
Breve descripción de las figuras
La Fig. 1 ilustra una síntesis del compuesto seco(-)CBI (5-hidroxi-3-amino-1-[S]-(clorometil)-1,2-dihidro-3H-benz(e)indol) de acuerdo con el procedimiento de la presente invención.
La Fig. 2 ilustra una síntesis a modo de ejemplo (ruta A) de DC1 de acuerdo con el procedimiento de la presente invención.
La Fig. 3 ilustra una segunda síntesis a modo de ejemplo (ruta B) de DC1 de acuerdo con el procedimiento de la presente invención.
Descripción detallada
La presente invención proporciona una síntesis mejorada del compuesto seco(-)CBI (5-hidroxi-3-amino-1-[S]-(clorometil)-1,2-dihidro-3H-benz(e)indol) (7) y también muestra síntesis mejoradas de DC1 y de sus compuestos derivados que usan el compuesto seco(-)CBI como reactivo.
De forma opcional, la síntesis del compuesto seco(-)CBI puede usar como material de partida 1,3-dihidroxinaftaleno, material que es económico y que se encuentra fácilmente disponible.
La presente invención también proporciona nuevos compuestos de fórmula (II):
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en la que R es un grupo protector tal como se define en esta invención.
La expresión "DC1 y sus derivados" tal como se usa en esta invención, se refiere a análogos del CC-1065 que tienen, como su subunidad alquilante "A", una subunidad de ciclopropanobenzoindol (CBI) en su forma abierta de clorometilo en lugar de la unidad de ciclopropanopirroloindol (CPI) del CC-1065. Además, los compuestos de DC1 comprenden subunidades "B" y "C" que son unidades indol o análogos de las mismas. Las subunidades "B" y "C" están unidas mediante un enlace amida y proporcionan grupos funcionales carboxilo y amino para el acoplamiento a través de enlaces amida a la subunidad "A" y de un resto que contiene disulfuro, respectivamente.
Así, las subunidades "B" y "C" no están limitadas en particular y pueden ser, por ejemplo, cualquiera de los compuestos de fórmulas (V)-(XII), o compuestos relacionados descritos en las patentes de EE.UU. Nº 5.585.499; 5.475.092 y 5.846.545.
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Así, las subunidades "B" y "C" de DC1 pueden incluir derivados de 2-carboxi-indol o de 2-carboxi-benzofurano, o ambos, tal como se representa mediante los compuestos de fórmulas (V)-(XII). Tal como se puede constatar a partir del CC-1065 natural y a partir de las propiedades de los análogos que se han publicado (por ejemplo, Warpehoski y col., 31 J. Med. Chem. 590-603 (1988), Boger y col., 66 J. Org. Chem. 6654-6661 (2001)), las subunidades "B" y "C" también pueden llevar diferentes sustituyentes en diferentes posiciones sobre los anillos indo) o benzofurano, correspondientes a las posiciones R_{1}-R_{6} de las fórmulas (V)-(XII) y mantener una actividad citotóxica potente.
Dentro de las formulas (V)-(XII), R_{1} a R_{6}, que pueden ser iguales o diferentes, representan de forma independiente hidrógeno, alquilo lineal C_{1}-C_{3}, metoxi, hidroxilo, amino primario, amino secundario, amino terciario o amido. Ejemplos de sustituyentes que contienen grupos amino son metilamino, etilamino e isopropilamino. Ejemplos de sustituyentes que contienen grupos amino secundarios son dimetilamino, dietilamino y etil-propilamino. Ejemplos de sustituyentes que contienen grupos amino terciarios son trimetilamino, trietilamino y etil-isopropil-metilamino. Ejemplos de grupos amido incluyen N-metil-acetamido, N-metil-propionamido, N-acetamido y N-propionamido.
Dentro de las formulas (V)-(XII), R'' representa una amina o una alquil amina C_{1}-C_{20} sustituida o no sustituida que es capaz de formar un enlace amida a un carboxilo del resto que contiene disulfuro del DC1. La forma de realización preferida de R'' es -NH_{2}.
El resto que contiene disulfuro que se usa en la síntesis de DC1 tiene la estructura HOOC-R_{7}-S-R_{8}, en la que R_{7} representa una región enlazante que no está limitada en particular y que puede ser, por ejemplo, un grupo alquilo C_{1}-C_{20} sustituido o no sustituido, un espaciador de polietilenglicol y similares. Así, R_{7} puede representar metilo, alquilo lineal, alquilo ramificado, alquilo cíclico, arilo o heterociclo simple o sustituido o una cadena de polietilenglicol. Los ejemplos de grupos alquilo lineales representados por R_{7} incluyen metilo, etilo, propilo, butilo, pentilo y hexilo. Los ejemplos de grupos alquilo ramificados representados por R_{7} incluyen isopropilo, isobutilo, sec-butilo, terc-butilo, isopentilo y 1-etil-propilo. Los ejemplos de grupos alquilo cíclicos representados por R_{7} incluyen ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo y ciclohexilo. Los ejemplos de grupos arilo simples representados por R_{7} incluyen fenilo y naftilo. Los ejemplos de grupos arilo sustituidos representados por R_{7} incluyen aritos tales como fenilo o naftilo sustituidos con grupos alquilo, con halógenos, tales como Cl, Br, F, grupos nitro, grupos amino, grupos de ácido sulfónico, grupos de ácido carboxílico, grupos hidroxi y grupos alcoxi. Los grupos heterocíclicos representados por R_{7} son compuestos en los que los heteroátomos se seleccionan entre O, N y S y los ejemplos incluyen furilo, pirrolilo, piridilo (por ejemplo un grupo pirimidina 2-sustituido) y tiofeno.
R_{8} representa cualquier grupo saliente de tiol adecuado que sea capaz de sufrir una reacción de intercambio de disulfuro mediante la cual se puede acoplar el DC1, por ejemplo, a un reactivo celular específico tal como a un anticuerpo o a cualquiera de los agentes de unión a células descritos en la patente de EE.UU. Nº 5.475.092. Las formas de realización preferidas de R_{8} incluyen -SCH_{3} y tiopiridilo. Otros ejemplos incluyen -S-alquilo, -S-arilo, glutatión, cisteina y similares.
La expresión "grupo protector" (R) tal como se usa en esta invención, representa cualquier grupo que sea capaz de proteger al grupo amino o al hidroxilo fenólico al que se acopla desde una reacción adicional y que además es capaz de la eliminación posterior controlada, por ejemplo mediante tratamiento con un ácido o con una base. Así, los grupos protectores estables al tratamiento con bases se eliminan de forma selectiva con tratamiento ácido y viceversa, y se pueden usar para proteger al grupo amino en esta invención en la síntesis del compuesto seco(-)CBI. Ejemplos de dichos grupos son el FMOC (E. Atherton y R. C. Sheppard in The Peptides, S. Udenfriend, J. Meienhofer, Eds., Academic Press, Orlando, 1987, volumen 9, p. 1) y varios carbamatos sulfoniletil sustituidos ejemplificados por el grupo Nsc (Samukov y col., Tetrahedron Left, 1994, 35:7821; Verhart y Tesser, Rec. Trav. Chimr. Pays-Bas, 1987, 107:621). Los grupos protectores de amino adicionales incluyen, pero no se limitan a ellos, grupos protectores de carbamato, tales como 2-trimetilsililetoxicarbonilo (Teoc), 1-metil-1-(4-bifenilil)etoxicarbonilo (Bpoc), t-butoxicarbonilo (BOC), aliloxicarbonilo (Alloc), 9-fluorenilmetiloxicarbonilo (Fmoc), difeniloxicarbonilo, 2,2,2-tricloroetil oxicarbonilo, diisopropilmetil oxicarbonilo, 1-adamantil oxicarbonilo, vinil oxicarbonilo, metoxi bencil oxicarbonilo, nitrobencil oxicarbonilo, ciclohexil oxicarbonilo, ciclopentil oxicarbonilo y benciloxicarbonilo (Cbz); grupos protectores de amida, tales como formilo, acetilo, trihaloacetilo, benzoilo y nitrofenilacetilo; grupos protectores de sulfonamida, tales como 2-nitrobencenosulfonilo y grupos protectores de imina y de imida cíclica, tales como ftalimido y ditiasuccinoilo. Los expertos en la materia están familiarizados con dichos grupos protectores de amino equivalentes. Como ejemplo, que no se pretende que sea limitante, se pueden usar los grupos protectores de amino tales como 2,6-dinitrobencenosulfonilo, 4-nitrobencenosulfonilo o 2,4-dinitrobencenosulfonilo. De forma alternativa, se puede usar otro grupo protector amino en lugar de un grupo protector sulfonilo.
En la presente invención se prefiere terc-butoxicarbonilo (BOC).
La formación de los enlaces amida en la síntesis del compuesto seco(-)CBI y de DC1 se puede catalizar mediante una variedad de agentes conocidos por los expertos en la materia. Por ejemplo, las carbodiimidas se usan para mediar en la formación de un enlace peptídico entre un carboxilato y una amina y se pueden seleccionar como apropiadas especies de carbodiimida solubles e insolubles en agua. Se prefiere el EDC (clorhidrato de 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)carbodiimida). Otros ejemplos de reactivos de acoplamiento de amida útiles en la presente invención incluyen al EDC junto con sulfo-NHS, CMC (1-ciclohexil-3-(2-morfolinoetil) carbodiimida), DCC (diciclohexil carbodiimida), DIC (diisopropil carbodiimida), reactivo K de Woodward, N,N'-carbonildiimidazol, PyBOP (hexafluorofosfato de benzotriazol-1-il-oxi-tris-pirrolidinofosfonio), TBTU (tetrafluoroborato de 2-(1H-benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tretrametiluronio), HBTU (hexafluorofosfato de 2-(1H-benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tretrametiluronio), BOP (hexafluorofosfato de benzotriazol-1-il-oxi-tris-(dimetilamino)-fosfonio), PyBrOP (hexafluorofosfato de bromo-tris-pirrolidino-fosfonio) y similares.
El aislamiento del enantiómero (-) del precursor del compuesto seco(-)CBI diprotegido, un compuesto de fórmula (III), es una etapa importante en la síntesis del compuesto seco(-)CBI. El aislamiento del enantiómero (-) se puede llevar a cabo mediante cualquier procedimiento conocido por los expertos en la materia para la separación de enantiómeros. Por ejemplo, se prefiere el uso de una matriz quiral y de cromatografía líquida. Lo más preferentemente, se usa HPLC sobre una columna quiral. Un beneficio de la presente invención es que la separación del enantiómero (-) se lleva a cabo bajo el precursor di-protegido, en lugar de bajo el compuesto seco(-)CBI (7), tal como se describió anteriormente. Las matrices quirales adecuadas incluyen, por ejemplo, una columna Chiralpak AD (Diacel), Chiralcel OD, Chiralcel OJ y similares.
La expresión "condiciones adecuadas", según se aplica en esta invención a aspectos específicos de la síntesis del compuesto seco(-)CBI y de DC1, tal como en referencia a las reacciones de alquilación o de cierre del anillo, representa tanto los procedimientos específicos descritos en los ejemplos de esta invención, como aquellos procedimientos equivalentes, adaptados de forma adecuada a las especies DC1 específicas que se van a sintetizar, conocidos por los expertos en la materia.
La síntesis de DC1 requiere el acoplamiento, a través de enlaces amida, del compuesto seco(-)CBI, una subunidad "B" y "C" y un resto que contenga disulfuro. El orden en el que se acoplen estos componentes no es crítico y la síntesis se puede adaptar fácilmente de manera que los acoplamientos tengan lugar en cualquier orden. Así, el compuesto seco
(-)CBI y las subunidades "B" y "C" se pueden acoplar primero y a continuación se puede acoplar el resto que contiene disulfuro, o primero se pueden acoplar el resto que contiene disulfuro y las subunidades "B" y "C" y a continuación se puede acoplar el compuesto seco(-)CBI. En los ejemplos de esta invención se ilustran ambos procedimientos.
Además, dentro del alcance de la presente invención está que las subunidades "B" y "C" no necesitan acoplarse primero a través de un enlace amida en la síntesis de DC1 de acuerdo con la presente invención. Así, dentro del alcance de la presente invención está que, por ejemplo, el compuesto seco(-)CBI y la subunidad "B" se acoplan, a continuación se acoplan la subunidad "C" y el resto que contiene disulfuro y a continuación se sintetiza el DC1 mediante acoplamiento a través de las subunidades "B" y "C". Debido a que el DC1 comprende una secuencia lineal de 4 partes, será evidente que de acuerdo con la presente invención son posibles fácilmente muchas permutaciones de la síntesis de DC1.
Ejemplos
A continuación la invención se ilustrará en referencia a ciertos ejemplos no limitantes. A no ser que se indique lo contrario, todos los porcentajes, proporciones, partes y similares son en peso. Un resumen de las síntesis a título de ejemplo (Figs. 1-3) viene seguido de una descripción detallada de cada etapa.
La síntesis mejorada del compuesto CBI ejemplificada en esta invención (Fig. 1) comienza con 1,3-dihidroxi-naftaleno (1). La aminación mediante el tratamiento con amoníaco a entre 125 y 140ºC en un recipiente a presión proporcionó 4-hidroxi-2-naftilamina 2, que se convirtió a continuación en el compuesto di-t-boc 3 mediante tratamiento con di-terc-butildicarbonato. La yodación con N-yodosuccinimida transcurrió con un 86% de rendimiento para producir el compuesto 4, que se alquiló para proporcionar el compuesto 5 con un rendimiento del 93%. El cierre del anillo del compuesto 5 usando hidruro de tributilestaño en presencia de 2,2'-azobisisobutironitrilo (AIBN) transcurre sin problemas con un rendimiento del 94% para proporcionar el di-t-boc-seco-CBI racémico. La separación de la mezcla racémica se lleva a cabo fácilmente usando una columna de HPLC quiral eluyendo con isopropanol al 20% en hexano, en la que los tiempos de retención de los dos isómeros difieren en 17 minutos, para proporcionar el isómero di-t-boc-seco (-) CBI 6b deseado. La desprotección con ácido clorhídrico proporcionó el compuesto seco(-)CBI, 7.
Se ejemplifican dos rutas sintéticas independientes para la conversión del compuesto seco(-)CBI 7 en el compuesto DC1-SMe 16a y se denominan Ruta A (Fig. 2) y ruta B (Fig. 3).
En la Ruta A (Fig. 2), se sintetizó el resto bis-indolilo que lleva un sustituyente que contiene disulfuro y a continuación se acopló en la etapa final al compuesto seco-CBI. En la Ruta B, el resto bis-indolilo se unió al compuesto seco-CBI y el sustituyente que contiene disulfuro se introdujo en la etapa final (Fig. 3).
En la Ruta A, se hidrolizó 5-nitroindol-2-carboxilato de etilo (8), que se encuentra disponible comercialmente, al ácido 9, el cual se convirtió a continuación en el éster terc-butílico 10. La reducción catalítica del compuesto 10 con hidrógeno proporcionó el amino éster 11 con un rendimiento cuantitativo. El acoplamiento del compuesto 11 con el ácido 5-nitroindol-2-carboxílico (9) en presencia de tetrafluoroborato de O-(benzotriazol-1-il)-N,N,N',N-tetrametiluronio (TBTU) proporcionó el éster nitro-bis-indolílico 12 con un rendimiento del 89%. La reducción del grupo nitro mediante hidrogenación catalítica, seguida del acoplamiento del compuesto amino 13 resultante con ácido 3-(metilditio)propanóico proporcionó el compuesto 14a. En el compuesto 14a el grupo éster se hidrolizó con ácido trifluoroacético para proporcionar el ácido carboxílico 15a. El acoplamiento del compuesto 15a con el compuesto seco-CBI, en presencia de EDC proporcionó el compuesto DC1-SMe (16a). La reducción del compuesto DC1SMe con ditiotreitol proporcionó el compuesto DC1 (17).
En la Ruta B, el ácido 5-nitroindol-2-carboxílico 9 se condensó primero con 5-aminoindol-2-carboxilato de etilo 18 para proporcionar el éster bis-indólico 19. La hidrólisis alcalina del compuesto 19, seguida por el acoplamiento con seco-CBI proporcionó el compuesto bis indolil-seco-CBI 21. La reducción del grupo nitro en el compuesto 21 con hidrógeno sobre Pd/C proporcionó el compuesto amino-bis-indolil-seco-CBI 22. El acoplamiento del compuesto 22 con ácido 3-(metilditio)propanóico proporcionó el compuesto DC1-SMe 16a.
Materiales y procedimientos
Los puntos de fusión se midieron usando un aparato Electrothermal y están sin corregir. Los espectros de RMN se registraron en un espectrómetro Bruker AVANCE400 (400 MHz). Los desplazamientos químicos se presentan en ppm en relación con TMS como patrón interno. Los espectros de masas se obtuvieron usando un sistema Bruker Esquire 3000. Los espectros ultravioleta se registraron en un espectrofotómetro Hitachi U1200. La HPLC analítica se llevó a cabo usando un sistema Beckman Coulter GOLD 125 equipado con un detector de longitud de onda variable Beckman Coulter system GOLD 168 y de una columna Chiralcel OD de 4,6 x 250 mm. La HPLC preparativa se llevó a cabo en un sistema R & S Technology Zonator equipado con un detector UV Hitachi, que usa una columna autoempaquetada Chiralcel OD de 7,5 x 50 cm. La cromatografía de capa fina se llevó a cabo en placas de CCF de gel de sílice Analtech GF. El gel de sílice para la cromatografía ultrarrápida en columna de gel de sílice era de Baker. Todos los disolventes usados tenían calidad de reactivo o calidad HPLC.
Ejemplos 1-5
Síntesis del compuesto seco(-)CBI (5-hidroxi-3-amino-1-[S]-(clorometil)-1,2-dihidro-3H-benz(e)indol) de acuerdo con el esquema de la figura 1
Ejemplo 1
Preparación de N-(terc-butiloxicarbonil)-4-O-(terc-butiloxicarbonil)-2-naftilamina (3)
Una disolución de 1,3-dihidroxinaftaleno (compuesto 1, 50 g, 0,312 mol) en amoníaco líquido (200 ml) a -78ºC se selló en una bomba de acero de 1 L que contenía un revestimiento de vidrio. La mezcla de reacción se calentó a 135 \pm 10ºC y a 8963,2 kPa (1300 psi) durante 14 h con agitación vigorosa. Se permitió que el recipiente enfriase a 60ºC y el amoníaco se liberó lentamente. Las trazas restantes del amoníaco se eliminaron mediante la co-evaporación con THE (2 x 150 ml) bajo una corriente de argón a 60ºC. El compuesto intermedio 4-hidroxi-2-naftilamina (2) no se aisló, sino que se convirtió inmediatamente en el compuesto protegido di-terc-butiloxicarbonilo 3. Se añadieron de forma secuencial a la bomba una disolución de dicarbonato de di-terc-butilo (175 g, 0,801 mol) en THF seco (300 ml) y N,N-diisopropiletilamina (140 ml, 0,803 mol). La bomba se selló de nuevo y los contenidos se calentaron a 100ºC con agitación durante 4 h. La bomba se enfrió a temperatura ambiente, se abrió y el residuo se repartió entre disolución acuosa saturada de NaCl (800 ml) y acetato de etilo (500 ml). La fase acuosa se extrajo con acetato de etilo (200 ml x 2). Las capas orgánicas combinadas se secaron (sulfato de magnesio), se filtraron y se concentraron a presión reducida. La purificación por cromatografía sobre gel de sílice (entre 1:8 y 1:4 de acetato de etilo/hexano) y la cristalización de nuevo con acetato de etilo/etanol/hexano proporcionó 77,41 g puros (69%) del compuesto del título (3). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 400 MHz) 8,14 (d, 1H, J = 8,1 Hz), 7,66 (d, 1H, J = 8,1 Hz), 7,43 (dd, 1H, J = 6,8, 8,2 Hz), 7,35 (dd, 1H, J = 6,8, 8,2 Hz), 7,22 (d, 1H, J = 1,8 Hz), 7,15 (a, 1H, NH), 6,69 (s, 1H), 1,59 (s, 9H), 1,37 (s, 9H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}) 153,71, 152,9, 136,11, 135,20, 128,12, 128,01, 126,81, 126,03, 123,61, 107,94, 102,95, 82,98, 82,10, 28,93, 27,69; EM m/z 382,52 (M+Na)^{+}.
Ejemplo 2
Preparación de N-(terc-butiloxicarbonil)-4-O-(terc-butiloxicarbonil)-1-yodo-2-naftilamina (4)
Una disolución del compuesto 3 (24,50 g, 68,24 mmol) y N-yodosuccinimida (NIS) (17,70 g, 74,73 mmol) en 250 ml de THF/metano) (1:1) se agitó en la oscuridad a -40ºC en atmósfera de argón durante 5 min. A continuación se añadió ácido toluenosulfónico (0,86 g, 4,52 mmol) y la mezcla de reacción se agitó en la oscuridad en atmósfera de argón a -40ºC durante 2 h y a continuación a temperatura ambiente durante 2 h. La mezcla se diluyó con éter (800 ml), se lavó con disolución acuosa saturada de NaHCO3 y con disolución acuosa saturada de NaCl, se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró y se concentró a vacío. La purificación mediante cromatografía ultrarrápida sobre gel de sílice (acetato de etilo/hexano 1:10) fue seguida del aislamiento del producto deseado. La cristalización en etanol/acetato de etilo/hexano proporcionó 28,46 g (86%) del compuesto del título 4. R_{f} = 0,48 (10% de acetato de etilo/hexano). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 400 MHz) 8,27 (d, 1H, J = 8,0 Hz), 7,98 (dd, 1H, J = 1,5, 8,1 Hz), 7,83 (s, 1H), 7,55 (m, 2H), 7,18 (a, 0,8H, NH), 1,62 (m, 18H); EM m/z 508,36 (M+Na)^{+}.
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Ejemplo 3
Preparación de 2-[N-(terc-butiloxicarbonil)-N-(3-cloro-2-propen-1-il)amino]-4-O-(terc-butiloxicarboniloxi)-1- yodonaftaleno (5)
A una disolución del compuesto 4 (940 mg, 1,86 mmol) en 20 ml de DMF seca se añadió NaH (60% en aceite mineral, 150 mg, 3,75 mmol) en atmósfera de argón. Después de agitar la mezcla a 0ºC durante 30 min, se añadió E, Z-1,3-dicloropropeno (1,50 ml, 14,57 mmol). La mezcla de reacción se agitó a 0ºC en atmósfera de argón durante 2 h, a continuación se neutralizó con NaH_{2}PO_{4} 1,0 M y se extrajo con acetato de etilo. La capa orgánica se secó sobre sulfato de magnesio, se filtró y se concentró a vacío. La purificación mediante cromatografía ultrarrápida sobre gel de sílice (acetato de etilo/hexano 1:9) proporcionó 1,01 g (93%) del compuesto deseado 5. R_{fZ} = 0,37, R_{fE} = 0,32 (1:8 acetato de hexilo/hexano). (rotámeros E:Z de cloruros de vinilo y de di-t-boc). ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 400 MHz) 8,26 (d, 2H, J = 7,7 Hz), 7,96 (m, 2H), 7,59 (a, 4H), 7,20 (s, 1H), 7,16 (s, 1H), 6,17-6,07 (m, 4H), 4,64 (dd, 1H, J = 6,2, 15,2 Hz), 4,53 (dd, 1H, J = 6,2, 14,7 Hz), 4,31 (dd, 1H, J = 6,0, 15,0 Hz), 3,84 (dd, 1H, J = 7,5, 15,0 Hz), 1,58 (S, 9H); 1,33 (s, 9H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}) 153,78, 151, 08, 150, 98, 133, 31, 133,29, 128,66, 128,61, 127, 50, 127,41, 126,41, 121,68, 119,03, 84,22, 84,11, 80,99, 77,20, 28,20, 27,66; EM m/z 582,8 (M+Na)^{+}.
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Ejemplo 4
Preparación de 5-(O-terc-butiloxicarbonil)oxi-3-[N-(terc-butiloxicarbonil)amino-1-(clorometil)-1,2-dihidro-3H-benz(e)indol (6)
A una disolución del compuesto 5 (1,36 g, 2,43 mmol) en benceno seco (100 ml) se añadieron hidruro de tri-n-butilestaño (0,70 ml, 2,52 mmol) y 2,2'-azobis(isobutironitrilo) (AIBN) (30 mg, 0,18 mmol). La mezcla se agitó en atmósfera de argón a temperatura ambiente durante 30 min y a continuación se calentó a reflujo a 80ºC durante 2 h. La mezcla de reacción se enfrió y el disolvente se eliminó a vacío. La purificación mediante cromatografía ultrarrápida sobre gel de sílice (acetato de etilo/hexano 1:9) proporcionó 1,01 g (94%) del compuesto deseado 6. R_{f} = 0,34 (1:9 acetato de etilo/hexano); ^{1}H RMN (CDCl_{3}, 400 MHz) 8,12 (a, 1H), 7,91 (d, 1H, J = 8,4 Hz), 7,69 (d, 1H, J = 8,4 Hz), 7,50 (dt, 1H, J = 1,0, 6,9, 7,0 Hz), 7,37 (dt, 1H, J = 0,9, 6,9, 6,9 Hz), 4,27 (a, 1H), 4,12 (t, 1H, J = 9,0 + 10,0 Hz), 3,99 (m, 1H), 3,90 (dd, 1H, J = 2,4, 11,0 Hz), 3,45 (t, 1H, J = 10,8 + 10,8 Hz), 1,58 (S, 18H); ^{13}C RMN (CDCl_{3}) 152,27, 151,84, 147,99, 130,17, 127,62, 124,33, 122,46, 122,22, 108,95, 83,78, 52,80, 46,13, 28,36, 27,79; EM m/z 456,9 (M+Na)^{+}.
Resolución del compuesto (6): La mezcla enantiomérica del compuesto 6 (1,0 g en 20 ml de acetato de etilo) se resolvió en una columna de HPLC preparativa (20 mm, 7,5 x 50 cm, empaquetada con Diacel Chiralcel OD) usando como eluyente isopropanol al 15%-hexano (180 ml/min). Los dos enantiómeros eluyeron con tiempos de retención de 18,5 minutos [enantiómero (+) 6a] y 35,8 minutos [enantiómero (1S) natural (-) 6b]. 6b (-)-(1S): [\alpha]^{25} = -49,6º (c = 5,25 CHCl_{3}).
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Ejemplo 5
Preparación de 5-hidroxi-3-amino-1-[S]-(clorometil)-1,2-dihidro-3H-benz(e)indol (7)
A una disolución del compuesto 6b (100 mg, 0,25 mmol) en 5 ml de acetato de etilo se añadió HCl concentrado (0,2 ml) y trietilsilano (0,2 ml). Después de agitar durante 6 h en atmósfera de argón, la mezcla se diluyó con 10 ml de diclorometano/tolueno 1:1 y se evaporó hasta sequedad. El sólido seco se co-evaporó tres veces con diclorometano/tolueno y a continuación se usó de inmediato para el acoplamiento a compuestos di-indol sin purificación adicional, (90% pureza), EM m/z 234,78 (M+H)^{+}.
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Ejemplos 6-15
Síntesis a Título de Ejemplo de DC1 de Acuerdo con el Esquema de la Ruta A (figura 2)
Ejemplo 6
Preparación de 5-nitroindol-2-carboxilato de terc-butilo (10)
A una disolución agitada de 5-nitroindol-2-carboxilato de etilo (8) (25,0 g, 106,8 mmol) en 500 ml de THF-metanol (1:1, v/v) a temperatura ambiente, se añadió una disolución de NaOH (40 g, 1,0 mmol) en 300 ml de agua. La disolución resultante de color rojo parduzco intenso se agitó durante 3 h, a continuación se inactivó mediante acidificación hasta pH 1 con HCl diluido. El producto precipitado se recogió mediante filtración a vacío y el producto disuelto restante se extrajo con THF/acetato de etilo (1:2, v/v, 2 x 400 ml). El precipitado se disolvió en THF y esta disolución se combinó con las capas orgánicas de las extracciones anteriores. El secado sobre sulfato de magnesio, la filtración, la concentración a vacío y la cristalización del residuo en THF/acetato de etilo/hexano proporcionó 21,1 g (96% de rendimiento) de ácido 5-nitroindol-2-carboxílico (9). 1H RMN (DMSO), 11,50 (s, 1H), 7,20 (d, 1H, J = 8,4 Hz), 6,85 (s, 1H), 6,70 (m, 2H).
A una disolución agitada del compuesto 9 (12,8 g, 61,2 mmol) en THE seco (200 ml) en atmósfera de argón se añadió cloruro de oxalilo (12,0 ml, 137,5 mmol) seguido de DMF (0,1 ml), lo que causó un vigoroso desprendimiento de gas. Después de 40 min, la mezcla de reacción se evaporó hasta sequedad. El sólido resultante se disolvió de nuevo en THE (150 ml), se enfrió a \sim30ºC y se agitó en atmósfera de argón. A continuación se añadió gota a gota una disolución de t-butóxido de potasio (1,0 M en THF, 140 ml, 140 mmol) durante 45 min y se mantuvo la agitación durante 45 min adicionales. La reacción se inactivó con 600 ml de agua, se neutralizó con unas pocas gotas de una disolución acuosa de H_{3}PO_{4} al 10% y se extrajo con acetato de etilo (3 x 400 ml). Los extractos orgánicos se lavaron con disolución acuosa saturada de NaHCO_{3}, con agua y a continuación se secaron sobre sulfato de magnesio, se filtraron, se concentraron y se cristalizaron con etanol/hexano para proporcionar el compuesto 10 (9,62 g, 85% de rendimiento). R_{f} = 0,35 (1:5 acetato de etilo/hexano); ^{1}H RMN (CDCl_{3}), 11,63 (s, 1H), 8,66 (dd, 1H, J = 0,5, 1,3 Hz), 8,20 (dd, 1H, J = 0,5, 9,0 Hz), 7,48 (dd, 1H, J = 0,5, 9,1 Hz), 7,28 (dd, 1H, J = 0,9, 11,1 Hz), 1,63 (s, 9H); ^{13}C RMN 160,39, 142,12, 138,11, 132,10, 126,78, 120,22, 119,83, 111,98, 109,82, 82,91, 28,26; EM m/z 285,43 (M+Na)^{+}.
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Ejemplo 7
Preparación de 5-aminoindol-2-carboxilato de terc-butilo (11)
Se cargó una botella de hidrogenación Parr de 500 ml con el compuesto 10 (5,80 g, 22,14 mmol), 10% Pd/C (0,6 g) y metanol/THF (150 ml, 1:4 v/v) y se purgó con hidrógeno. La mezcla de reacción se agitó en atmósfera de H2 a una presión de 344,7 kPa (50 psi) durante toda la noche. El catalizador se separó mediante filtración y el disolvente se evaporó para proporcionar 4,98 g (97% de rendimiento) del compuesto del título 11 en forma de un sólido de color marrón. ^{1}H RMN (DMSO), 11,42 (s, 1H), 7,18 (d, 1H, J = 8,3 Hz), 6,83 (s, 1H), 6,71 (s, 1H), 6,67 (d, 1H, J = 8,4 Hz), 1,62 (s, 9H). Este producto es inestable y por consiguiente se usó de inmediato en la siguiente etapa.
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Ejemplo 8
Preparación de 5-(5'-nitroindol-2'-il-carbonil amino)indol-2-carboxilato de terc-butilo (12)
A una mezcla de los compuestos 9 (4,70 g, 22,81 mmol) y 11 (5,20 g, 22,41 mmol) en DMF (200 ml) se añadieron en atmósfera de argón tetrafluoroborato de O-(benzotriazol-1-il)-N,N,N',N'-tetrametiluronio (TBTU), 10,5 g, 32,70 mmol) y diisopropiletilamina (DIEA, 8,0 ml, 45,83 mmol). La mezcla de reacción se agitó durante toda la noche. La mezcla se concentró y a continuación se puso en suspensión en acetato de etilo y en disolución acuosa de NaHCO_{3} (sat.). El compuesto sólido se filtró, se lavó con agua y a continuación se puso de nuevo en suspensión con disolución acuosa 1 M de NaH_{2}PO_{4}, pH 3,0, se filtró y se lavó de nuevo con agua. A continuación el sólido se secó a vacío para producir el compuesto 12 (8,40 g, 89% de rendimiento). R_{f} = 0,31 (1:2 THF/hexano); ^{1}H RMN (DMSO), 12,43 (s, 1H), 11,69 (s, 1H), 10,41 (s, 1H), 8,77 (d, 1H, J = 2,2 Hz), 8,13 (dd, 2H, J = 2,3, 9,0 Hz), 7,64 (t, 2H, J = 9,2 Hz), 7,47 (d, 1H, J = 8,9 Hz), 7,08 (s, 1H), 1,59 (s, 9H); ^{13}C RMN (DMSO), 161,48, 159,53, 142,19, 140,38, 136,30, 135,27, 132,28, 130,30, 127,43, 127,25, 120,57, 120,12, 114,08, 113,74, 108,22, 106,64, 81,74, 28,84; EM m/z 443,85 (M+Na)^{+}.
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Ejemplo 9
Preparación de 5-(5'-aminoindol-2'-il-carbonil amino)indol-2-carboxilato de terc-butilo (13)
Se cargó una botella de hidrogenación Parr de 250 ml con el compuesto 12 (2,40 g, 5,71 mmol), 10% Pd/C (0,3 g) y DMA (50 ml) y se purgó con hidrógeno. La mezcla de reacción se agitó con atmósfera de H_{2} a una presión de 275,8 kPa (40 psi) durante toda la noche. El catalizador se separó mediante filtración y el disolvente se evaporó para proporcionar 2,05 g (92% de rendimiento) del compuesto del título 13 en forma de un sólido de color marrón. ^{1}H RMN (DMSO), 11,75, (s, 1H), 11,67 (s, 1H), 10,17 (s, 1H), 8,10 (d, 1H, J = 1,2 Hz), 7,59 (t, 2H, J = 8,8 Hz), 7,45 (m, 1H), 7,35 (m, 1H), 7,17 (dd, 1H, J = 0,8, 8,0 Hz), 7,06 (d, 1H, J = 2,0 Hz), 1,57 (s, 9H); EM m/z 390,72 (M+Na)^{+}. Este producto es inestable y por consiguiente se usó de inmediato en la siguiente etapa.
Ejemplo 10
Preparación de 5-[5'-(3''-metilditiopropionil)indol-2'-il-carbonil amino]indol-2-carboxilato de terc-butilo (14a)
A una disolución del compuesto 13 (2,0 g, 5,12 mmol) en DMA (30 ml) se añadió ácido 3-(metilditio)propionico (0,90 g, 5,92 mmol), EDC (3,0 g, 15,33 mmol) y DIEA (0,90 ml, 5,12 mmol). La mezcla de reacción se agitó durante toda la noche en atmósfera de argón y a continuación se diluyó con 70 ml de NaH_{2}PO_{4} 1,0 M, pH 6,0 y se extrajo con THF/acetato de etilo (1:1, 4 x 70 ml). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron sobre sulfato de magnesio, se filtraron y se evaporaron. El residuo se purificó mediante cromatografía sobre gel de sílice (1:3 acetona/tolueno) y se cristalizó en THF/hexano para producir el compuesto 14a (2,30 g, 86% de rendimiento). Punto de fusión = 279-283ºC (desc.), R_{f} = 0,31 (1:3 THF/tolueno); ^{1}H RMN (CD_{3}COCD_{3}), 10,75 (d, 2H, J = 3,07 Hz), 9,50 (s, 1H), 9,14 (s, 1H), 8,20 (d, 1H, J = 2,0 Hz), 8,14 (d, 1H, J = 1,8 Hz), 7,62 (dd, 1H, J = 2,0, 8,9 Hz), 7,46 (dd, 2H, J = 0,7, 8,1 Hz), 7,34 (dd, 1H, J = 2,0, 10,8 Hz), 7,26 (d, 1H, J = 1,5 Hz), 7,07 (dd, 1H, J = 0,9, 2,1 Hz), 3,05 (t 2H, J = 7,1 Hz), 2,76 (t, 2H, J = 7,0 Hz), 2,42 (s, 3H), 1,57 (s, 9H); ^{13}C RMN 169,42, 161,58, 160,32, 135,31, 134,76, 133,56, 133,40, 133,12, 130,86, 128,72, 128,27, 120,27, 118,75, 113,69, 113,09, 113,02, 112,69, 108,27, 103,58, 81,66, 37,28, 34,00, 28,41; EM m/z 547,88 (M+Na)^{+}.
Ejemplo 11
Preparación de ácido 5-[5'-(3''-metilditiopropionil)indol-2'-il-carbonil amino]indol-2-carboxílico (15a)
Se agitó en atmósfera de argón una mezcla del compuesto 14a (300 mg, 0,57 mol) y Et_{3}SiH (1,5 ml) en diclorometano (30 ml). Se añadió ácido trifluoroacético (7,0 ml) y la mezcla se agitó durante 3 h y a continuación se diluyó con tolueno (25 ml). La mezcla se evaporó hasta sequedad y se cristalizó con THF/tolueno/hexano para producir el compuesto 15a (245 mg, 92% de rendimiento). ^{1}H RMN (DMSO), 11,71 (s, 1H), 11,61 (s, 1H), 10,10 (s, 1H), 9,92 (s, 1H), 8,11 (d, 1H, J = 1,9 Hz), 8,02 (d, J = 1,7 Hz), 7,55 (dd, 1H, 2,0, 11,0 Hz), 7,42 (d, 1H, J = 8,8 Hz), 7,39 (d, 1H, J = 8,8 Hz), 7,34 (d, 1H, J = 2,0 Hz), 7,31 (dd, 1H, J = 2,0, 8,8 Hz), 7,08 (d, 1H, J = 1,3 Hz), 3,06 (t, 2H, J = 7,0 Hz), 2,75 (t, 2H, J = 7,0 Hz), 2,45 (s, 3H); ^{13}C RMN (DMSO), 168,70, 162,79, 159,47, 134,37, 133,56, 132,44, 131,98, 131,64, 126,96, 126,75, 119,62, 117,74, 113,04, 112,46, 112,35, 111,44, 107,36, 103,37, 36,03, 33,01; EM 490,81 (M+Na)^{+}.
Ejemplo 12
Preparación de (S)-N-[2-{(1-clorometil)-1,2-dihidro-5-hidroxi-3H-benz(e)indol-3-il}carbonil]-1H-indol-5-il]-5-[(3-metilditio-1-oxopropil)-amino]-1H-indol-2-carboxamida (16a) (DC1SMe)
A una disolución de los compuestos 7 (55 mg, 0,20 mmol) y 15a (100 mg, 0,21 mmol) en DMA (7,0 ml) se añadió EDC (120 mg, 0,62 mmol) en atmósfera de argón. La mezcla de reacción se agitó durante toda la noche, a continuación se añadieron unas pocas gotas de ácido acético al 50% y la mezcla se evaporó hasta sequedad. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice (entre el 20% y el 30% de acetona en tolueno) y se cristalizó con THF/tolueno/hexano para proporcionar el compuesto DC1SMe (16a) (108 mg, 79% de rendimiento). R_{f} = 0,40 (3:7 acetona/tolueno); ^{1}H RMN (CD_{3}COCD_{3}) 10,91 (s, 1H), 10,88 (s, 1H), 9,64 (s, 1H), 9,56 (s, 1H), 9,27 (s, 1H), 8,35 (d, 1H, J = 1,9 Hz), 8,25 (d, 1H, J = 8,0 Hz), 8,17 (d, 1H, J = 1,9 Hz), 8,07 (s, 1H), 7,88 (d, 1H, J = 8,3 Hz), 7,64 (dd, 1H, J = 2,0, 8,1 Hz), 7,58-7,50 (m, 3H), 7,38-7,35 (m, 2H), 7,31 (d, 1H, J = 1,7 Hz), 7,26 (d, 1H, J = 1,7 Hz), 4,86 (dd, 1H, J = 8,7, 11,0 Hz), 4,80 (dd, 1H, J = 2,3, 10,9 Hz), 4,30 (m, 1H), 4,07 (dd, 1H, J = 3,1, 11,0 Hz), 3,83 (dd, 1H, J = 8,4, 11,2 Hz), 3,09 (t, 2H, J = 7,1 Hz), 2,83 (t, 2H, J = 7,1 Hz), 2,45 (s, 3H); ^{13}C RMN 169,56, 161,10, 160,43, 155,13, 143,50, 134,78, 134,46, 133,55, 133,34, 133,03, 132,57, 131,21, 128,80, 128,69, 128,21, 124,22, 124,02, 123,53, 123,44, 120,16, 118,79, 116,45, 113,91, 113,02, 112,95, 112,73, 106,78, 103,72, 101,63, 56,01, 47,73, 43,10, 37,25, 34,01, 23,00; EM m/z 706,71 (M+Na)+, 708,58, 707,71, 722,34 (M+K)^{+}, 724,42.
Ejemplo 13
Preparación de 5-[5'-(3''-(2-piridilditio)propionil)indol-2'-il-carbonil amino]indol-2-carboxilato de terc-butilo (14b)
A una disolución del compuesto 13 (1,00 g, 2,56 mmol) en DMA (15 ml) se añadió ácido 3-(2-piridilditio)propiónico (0,475 g, 2,21 mmol), EDC (1,26 g, 6,56 mmol) y DIEA (0,20 ml). Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con 70 ml de NaH_{2}PO_{4} 1,0 M, pH 3,0 y se extrajo con THF/acetato de etilo (1:1, 4 x 60 ml). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron sobre sulfato de magnesio, se filtraron, se evaporaron y se purificaron mediante cromatografía sobre gel de sílice (1:5 THF/diclorometano). El producto se aisló y se cristalizó de nuevo con THF/acetato de etilo/hexano para producir 1,13 g (87% de rendimiento) del compuesto del título 14b. Punto de fusión = 285-290 (desc.), R_{f} = 0,31 (1:5 THF/tolueno); ^{1}H RMN (CD_{3}COCD_{3}), 10,78 (d, 2H, J = 14,3 Hz), 9,52 (s, 1H), 9,23 (s, 1H), 8,45 (dd, 1H, J = 0,9, 4,8 Hz), 3,23 (d, 1H, J = 1,9 Hz), 8,17 (d, 1H, J = 1,8 Hz), 7,84 (dd, 1H, J = 1,0, 8,1 Hz), 7,78 (m, 1H), 7,64 (dd, 1H, J = 2,1, 8,9 Hz), 7,49 (t, 2H, J = 8,8 Hz), 7,35 (dd, 1H, J = 2,0, 8,9 Hz), 7,29 (d, 1H, J = 1,5 Hz), 7,25 (m, 1H), 7,10 (dd, 1H, J = 0,8, 2,1 Hz), 3,21 (t, 2H, J = 7,0 Hz), 2,85 (t, 2H, J = 7,0 Hz), 1,60 (s, 9H); ^{13}C RMN 169,15, 161,57, 160,86, 150,44, 138,22, 135,30, 134,78, 133,58, 133,13, 130,86, 128,27, 125,75, 121,73, 120,26, 120,05, 118,75, 113,68, 113,09, 113,03, 112,70, 108,26, 103,56, 81,64, 36,74, 35,25, 28,41; EM m/z 610,48 (M+Na)+, 626,56 (M + K)^{+}.
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Ejemplo 14
Preparación de ácido 5-[5'-(3''-(2-piridilditio)propionil)indol-2'-il-carbonil amino]indol-2-carboxílico (15b)
Se agitó en atmósfera de argón una mezcla del compuesto 14b (115 mg, 0,195 mol) y Et_{3}SiH (0,30 ml) en diclorometano (4,0 ml). A la mezcla de aspecto lechoso se añadió ácido trifluoroacético (1,0 ml) y la mezcla se tornó transparente. Después de agitar durante 2 h, la mezcla de reacción se diluyó con 5 ml de tolueno. La mezcla se evaporó hasta sequedad y se cristalizó con THF/tolueno/hexano para producir 93 mg (90% de rendimiento) del compuesto 15b. ^{1}H RMN (DMSO), 12,92 (a, 0,7 H), 11,74 (s, 1H), 11,63 (s, 1H), 10,11 (s, 1H), 9,92 (s, 1H), 8,47 (dd, 1H, J = 0,9, 4,6 Hz), 8,13 (s, 1H), 8,02 (s, 1H), 7,81 (m, 2H), 7,56 (d, 1H, J = 9,0 Hz), 7,41 (m, 2H), 7,34 (s, 1H), 7,28 - 7,21 (m, 2H), 7,10 (s, 1H), 3,15 (t, 2H, J = 7,0 Hz), 2,77 (t, 2H, J = 6,9 Hz); ^{13}C RMN 168,34, 162,70, 159,42, 159,16, 149,61, 137,80, 134,34, 133,53, 132,41, 131,88, 131,63, 128,96, 126,90, 126,69, 121,18, 119,60, 119,19, 112,98, 112,42, 112,31, 111,42, 107,47, 35,53, 33,97; EM m/z 532,31, (M+H)^{+}, 553,41, 554,52 (M+Na)^{+}.
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Ejemplo 15
Preparación de (S)-N-[2-{(1-clorometil)-1,2-dihidro-5-hidroxi-3H-benz(e)indol-3-il}carbonil]-1H-indol-5-il]-5-[(3-piridilditio-1-oxopropil)-amino]-1H-indol-2-carboxamida, DC1SPy (16b)
A una disolución de los compuestos 7 (25 mg, 0,094 mmol) y 15b (50 mg, 0,094 mmol) en 10 ml de DMA se añadió EDC (120 mg, 0,62 mmol) en atmósfera de argón. Después de agitar durante toda la noche, se añadieron unas pocas gotas de ácido acético al 50% y tolueno (5 ml), la mezcla se evaporó hasta sequedad y el residuo se purificó mediante cromatografía sobre gel de sílice (acetona al 30% en tolueno). El producto se aisló y se cristalizó de nuevo en THF/tolueno/hexano para proporcionar 48 mg (68% de rendimiento) del compuesto del título 16b. EM m/z 769,43 (M+Na)^{+}, 771,51, 785,62 (M+K)^{+}.
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Ejemplos 16-20
Síntesis a título de ejemplo de DC1 de acuerdo con el esquema de la ruta B (figura 3)
Ejemplo 16
Preparación de 5-aminoindol-2-carboxilato de etilo (18)
Se cargó una botella de hidrogenación Parr de 500 ml con 5-nitroindol-2-carboxilato de etilo (8) (5,0 g, 21,36 mmol), 10% Pd/C (0,3 g) y metanol/THF (150 ml, 1:4 v/v) y se purgó con hidrógeno. La mezcla de reacción se agitó en atmósfera de H_{2} a una presión de 275,8 kPa (40 psi) durante toda la noche. El catalizador se separó mediante filtración y el disolvente se evaporó para proporcionar 4,10 g (94% de rendimiento) del compuesto del título 18 en forma de un sólido de color marrón. ^{1}H RMN (CDCl_{3}), 8,77 (s, 1H), 7,26 (s, 1H), 7,23 (t, 1H, J = 0,8 Hz), 7,21 (d, 1H, J = 0,7 Hz), 7,03 (dd, 1H, J = 0,7, 1,5 Hz), 6,93 (dd, 1H, J = 0,7, 1,6 Hz), 6,80 (dd, 1H, J = 2,2, 8,6 Hz), 4,38 (dd, 2H, J = 7,2, 14,3 Hz), 1,40 (t, 3H, J = 7,2 Hz); ^{13}C RMN (CDCl_{3}) 162,02, 140,30, 138,14, 131,87, 128,45, 127,77, 117,12, 112,50, 107,36, 105,86, 60,87, 14,41. Este producto es inestable y por consiguiente se usó de inmediato en la siguiente etapa.
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Ejemplo 17
Preparación de 5-(5'-nitroindol-2'-il-carbonil amino)indol-2-carboxilato de etilo (19)
A una mezcla de los compuestos 9 (1,020 g, 5,00 mmol) y 18 (1,02 g, 4,95 mmol) en DMF (30 ml) se añadió TBTU (4,0 g, 12,40 mmol) y DIEA (1,8 ml) en atmósfera de argón. La mezcla de reacción se agitó durante toda la noche. Después de la concentración, la mezcla se diluyó con acetato de etilo (30 ml) y con disolución saturada de NaHCO_{3} (150 ml) y el sólido se puso en suspensión entre las dos capas. El compuesto sólido se filtró, se lavó con agua y a continuación se puso de nuevo en suspensión con disolución 1 M de NaH_{2}PO_{4}, pH 3,0, se filtró y se lavó de nuevo con agua. El producto se secó a vacío para proporcionar el compuesto 19 (1,543 g, 79% de rendimiento). R_{f} = 0,31 (1:2 THF/hexano); ^{1}H RMN (DMSO), 12,45 (s, 1H), 11,90 (s, 1H), 10,43 (s, 1H), 8,77 (d, 1H, J = 1,9 Hz), 8,15 (s, 1H), 8,13 (dd, 1H, J = 2,2, 9,1 Hz), 7,70 (s, 1H), 7,61 (m, 2H), 7,46 (d, 1H, J = 8,9 Hz), 7,18 (s, 1H), 4,35 (dd, 2H, J = 7,1, 14,1 Hz), 1,35 (t, 3H, J = 7,1 Hz); ^{13}C RMN (DMSO), 161,22, 158,68, 141,32, 139,50, 135,37, 134,60, 131,47, 128,01, 126,56, 126,38, 119,92, 119,27, 118,59, 113,27, 112,87, 112,60, 107,77, 105,69, 60,43, 14,31; EM m/z 443,85 (M+Na)^{+}.
Ejemplo 18
Preparación de ácido 5-(5'-nitroindol-2'-il-carbonil amino)indol-2-carboxílico (20)
A una disolución del compuesto 19 (630 mg, 1,60 mmol) en DMSO (15 ml) se añadió NaOH (1,0 g) en 5,0 ml de H_{2}O. Después de agitar durante 1 h, la mezcla se concentró y se co-evaporó tres veces con 10 ml de H_{2}O a 60ºC a presión reducida. La disolución residual se diluyó con metanol frío y con H2O, lo que produjo un sólido. El compuesto sólido se filtró y se secó a vacío para proporcionar el compuesto 20 (530 mg, 90% de rendimiento). ^{1}H RMN (DMSO), 12,48 (s, 1H), 11,75 (s, 1H), 10,44 (s, 1H), 8,77 (s, 1H), 8,15 (s, 1H), 8,10 (d, 1H, J = 9,3 Hz), 7,69 (s, 1H), 7,60 (m, 2H), 7,44 (d, 1H, J = 8,9 Hz), 7,10 (s, 1H); ^{13}C RMN (DMSO), 161,91, 158,66, 141,32, 139,52, 135,45, 134,44, 131,26, 128,01, 126,72, 126,39, 119,47, 119,25, 118,02, 113,24, 112,88, 112,48, 107,23, 105,71; EM m/z 386,66 387,85 (M+Na)^{+}.
Ejemplo 19
Preparación de 1-[S]-(clorometil)-5-hidroxi-3-{{5-[5'-nitroindol-2'-il-carbonil amino]indol-2-il}carbonil}-1,2-dihidro-3H-benz[e]indol (21)
A una disolución de los compuestos 7 (20 mg, 0,072 mmol) y 20 (25 mg, 0,068 mmol) en DMA (3,0 ml) se añadió EDC (40 mg, 0,20 mmol) en atmósfera de argón. La mezcla de reacción se agitó durante toda la noche, se añadieron unas pocas gotas de ácido acético al 50% y la mezcla se evaporó hasta sequedad. El residuo se purificó mediante CCF preparativa sobre gel de sílice (acetona al 40% en tolueno) para proporcionar 25 mg del compuesto 21. ^{1}H RMN (DMF-d_{7}) 12,54 (s, 1H), 11,73 (s, 1H), 10,60 (s, 1H), 10,58 (s, 1H), 8,80 (d, 1H, J = 2,3 Hz), 8,42 (d, 1H, J = 1,9 Hz), 8,25 (d, 1H, J = 8,5 Hz), 8,19 (dd, 1H, J = 2,1, 9,1 Hz), 8,09 (a, 1H), 7,95 (d, 1H, J = 8,3 Hz), 7,82 (d, 1H, J = 1,5 Hz), 7,79 (d, 1H, J = 9,1 Hz), 7,74 (dd, 1H, J = 2,0, 8,9 Hz), 7,62 (d, 1H, J = 8,8 Hz), 7,58 (dt, 1H, J = 1,7, 7,0 + 7,0 Hz), 7,42 (dt, 1H, J = 1,2, 7,0 + 7,0 Hz), 7,33 (d, 1H, J = 1,7 Hz), 4,91 (t, 1H, J = 11,0 Hz), 4,77 (dd, 1H, J = 2,1, 11,1 Hz), 4,33 (m, 1H), 4,13 (dd, 1H, J = 3,1, 11,1 Hz), 3,97 (dd, 1H, J = 7,9, 11,1 Hz); ^{13}C RMN 163,35, 161,48, 160,05, 155,79, 142,98, 137,18, 135,03, 133,22, 133,16, 131,50, 128,85, 128,45, 128,11, 124,62, 124,02, 123,76, 120,33, 119,36, 118,70, 116,45, 114,00, 113,08, 106,97, 105,02, 101,53; EM m/z 602,96 (M+Na)^{+}, 604,78, 603,81, 618,64 (M + K)^{+}, 620,48.
Ejemplo 20
Preparación de (S)-N-[2-{(1-clorometil)-1,2-dihidro-5-hidroxi-3H-benz(e)indol-3-il}carbonil]-1H-indol-5-il]-5-[(3-metilditio-1-oxopropil)-amino]-1H-indol-2-carboxamida (16a) (DC1-SMe)
Una disolución del compuesto 21 (10 mg, 0,017 mmol) en DMA (2,5 ml) se trató con Pd/C (10 mg), 5 \mul de HCl (conc.) y DMA (2,5 ml). Después de que se eliminó el aire evacuándolo, se introdujo hidrógeno a través de un balón de hidrógeno durante toda la noche. El catalizador se eliminó mediante filtración y el disolvente se evaporó para proporcionar el compuesto 22 en forma de un sólido de color marrón. El compuesto sólido se usó directamente sin purificación adicional.
A una disolución del compuesto 22 en DMA (2 ml) en atmósfera de argón se añadió ácido 3-(metilditio)propiónico (5 mg, 0,032 mmol) y EDC (15 mg, 0,078 mmol). Después de agitar durante toda la noche, se añadieron a la mezcla dos gotas de ácido acético al 50% y la mezcla se evaporó hasta sequedad. El residuo se purificó mediante cromatografía preparativa sobre gel de sílice (acetona al 40% en tolueno) para proporcionar 6 mg de DC1-SMe (16b). EM m/z 706,66 (M+Na)^{+}, 708,79, 707,86; los datos de ^{1}H RMN son iguales que los del compuesto anterior DC1.

Claims (17)

1. Un procedimiento para la preparación de un compuesto de fórmula (I) o de una sal del mismo, que comprende:
13
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(a) proporcionar un compuesto de fórmula (II), en la que R es un grupo protector de forma que el grupo amino y el grupo hidroxilo están protegidos por el mismo compuesto;
14
\vskip1.000000\baselineskip
(b) llevar a cabo reacciones de halogenación, alquilación y apertura de anillo sobre el compuesto (II) en condiciones adecuadas para proporcionar el racemato (III);
15
(c) aislar el isómero (-) del racemato (III) y
(d) eliminar dichos grupos protectores R del isómero (-) aislado del compuesto (III) en condiciones adecuadas para producir el compuesto (I).
2. El procedimiento según la reivindicación 1, en el que R se selecciona entre el grupo constituido por terc-butiloxicarbonilo, difeniloxicarbonilo, fluorenilmetil oxicarbonilo, 2,2,2-tricloroetil oxicarbonilo, 2-trimetilsililetil oxicarbonilo, diisopropilmetil oxicarbonilo, 1-adamantil oxicarbonilo, vinil oxicarbonilo, alil oxicarbonilo, bencil oxicarbonilo, metoxi bencil oxicarbonilo, nitrobencil oxicarbonilo, ciclohexil oxicarbonilo, ciclopentil oxicarbonilo.
3. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 y 2, en el que R es terc-butiloxicarbonilo.
4. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en el que la etapa (b) comprende además la etapa de yodación de un compuesto de 2-naftilamina.
5. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que dicha alquilación usa Cl-CH=CH-CH_{2}-Cl.
6. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, en el que dicha apertura de anillo se lleva a cabo en presencia de hidruro de tributil estaño y de 2,2'-azobisisobutironitrilo.
7. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en el que dicho isómero (-) del racemato (III) se aísla usando una matriz quiral.
8. El procedimiento según la reivindicación 7, en el que dicho isómero (-) del racemato (III) se aísla mediante HPLC quiral.
9. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, en el que dicho compuesto de fórmula (II) se produce a partir de 1,3-dihidroxinaftaleno.
10. Un procedimiento para la preparación del compuesto DC1 o de un análogo del compuesto DC1, que comprende la etapa de la reacción del grupo amino de un compuesto de fórmula (I) para formar un enlace peptídico, en el que dicho compuesto de fórmula (I) se prepara de acuerdo con el procedimiento de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9.
11. El procedimiento según la reivindicación 10, en el que dicho enlace peptídico se forma mediante la reacción del grupo amino del compuesto (I) con el grupo carboxilo del compuesto (IV) en condiciones adecuadas, en el que R_{1} es un grupo tiol capaz de formar un enlace disulfuro en el interior del compuesto (IV) y mediante el cual se prepara el compuesto DC1.
16
12. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 10 y 11, en el que dicho enlace peptidico se forma usando EDC.
13. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 11 y 12, en el que R_{1} es un grupo alquiltio o ariltio.
14. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 11 a 13, en el que R_{1} es -S-CH_{3} o -S-piridilo.
15. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 10 a 14, que además comprende la unión, a través de enlaces peptídicos, en cualquier orden secuencial, del compuesto de fórmula (I), un resto bis-indolilo o bis-benzofurano, indolil benzofuranilo o benzofuranil indolilo y un resto que contiene disulfuro.
16. El compuesto de formula (II):
17
en el que R es un grupo protector seleccionado entre el grupo constituido por terc-butiloxicarbonilo, difeniloxicarbonilo, fluorenilmetil oxicarbonilo, 2,2,2-tricloroetil oxicarbonilo, 2-trimetilsililetil oxicarbonilo, diisopropilmetil oxicarbonilo, 1-adamantil oxicarbonilo, vinil oxicarbonilo, alil oxicarbonilo, bencil oxicarbonilo, metoxi bencil oxicarbonilo, nitrobencil oxicarbonilo, ciclohexil oxicarbonilo, ciclopentil oxicarbonilo; de forma que el grupo amino y el grupo hidroxilo están protegidos por el mismo compuesto.
17. El compuesto según la reivindicación 16, en el que R es terc- butiloxicarbonilo.
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